CH659826A5 - PROCESS FOR OBTAINING A MICROORGANISM TRANSFORMED BY A PLASMID COMPRISING A GENE OF 27-DESAMIDOSECRETINE STRUCTURE. - Google Patents
PROCESS FOR OBTAINING A MICROORGANISM TRANSFORMED BY A PLASMID COMPRISING A GENE OF 27-DESAMIDOSECRETINE STRUCTURE. Download PDFInfo
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Description
La présente invention concerne un procédé d'obtention d'une souche d'un micro-organisme transformé par un plasmide comprenant un gène de structure d'une désamidosécrétine correspondant à un polypeptide dans lequel l'acide aminé situé à l'extrémité C de la sécrétine est la valine. The present invention relates to a process for obtaining a strain of a microorganism transformed by a plasmid comprising a structural gene for a deamidosecretin corresponding to a polypeptide in which the amino acid located at the C end of the secretin is valine.
L'invention concerne également une souche d"Escherichia coli transformé, obtenue par ce procédé, ainsi qu'un procédé de production de 27-désamidosécrétine comprenant la culture de cette souche à'Escherichia coli transformé et la récupération de la 27-désamidosécrétine produite. The invention also relates to a strain of transformed Escherichia coli obtained by this method, as well as a process for producing 27-desamidosecretin comprising culturing this strain to transformed Escherichia coli and recovering the produced 27-desamidosecretin.
En outre, l'invention concerne la 27-désamidosécrétine obtenue par le procédé qui vient d'être mentionné, ainsi qu'un plasmide chimère comprenant un gène de structure, exprimant la 27-désamidosécrétine, et un polydéoxyribonucléotide double-brin, en tant que produits intermédiaires du procédé d'obtention de la souche de micro-organisme transformé. Furthermore, the invention relates to 27-deamidosecretin obtained by the process which has just been mentioned, as well as a chimeric plasmid comprising a structural gene, expressing 27-deamidosecretin, and a double-stranded polydeoxyribonucleotide, as intermediates of the process for obtaining the transformed microorganism strain.
Il s'agit donc d'un procédé de production de 27-désamidosécrétine («27» étant parfois omis dans la désignation de ce composé dans la description ci-dessous) par une technique de génie génétique en utilisant un gène pour la désamidosécrétine. obtenu par synthèse chimique. It is therefore a process for the production of 27-desamidosecretin (“27” being sometimes omitted in the designation of this compound in the description below) by a technique of genetic engineering using a gene for desamidosecretin. obtained by chemical synthesis.
La sécrétine est un composé connu en tant qu'une des hormones gastro-intestinales. Jusqu'à présent, on connaît des activités physiologiques de ce composé, telles que son action promotrice de la sécrétion de l'eau et du bicarbonate par le pancréas et on l'a utilisé de manière pratique pour l'évaluation de la fonction pancréatique ou comme agent thérapeutique de traitement de l'ulcère duodenal. Secretin is a compound known as one of the gastrointestinal hormones. Hitherto, physiological activities of this compound are known, such as its action promoting the secretion of water and bicarbonate by the pancreas and it has been used in a practical way for the evaluation of the pancreatic function or as a therapeutic agent for the treatment of duodenal ulcer.
La sécrétine est un polypeptide ayant la formule suivante: Secretin is a polypeptide having the following formula:
5 10 5 10
His - Ser - Asp - Gly - Thr - Phe - Thr - Ser - Glu - Leu - Ser- His - Ser - Asp - Gly - Thr - Phe - Thr - Ser - Glu - Leu - Ser-
15 20 15 20
Arg - Leu - Arg - Asp - Ser - Ala - Arg - Leu - Gin - Arg - Leu - Arg - Leu - Arg - Asp - Ser - Ala - Arg - Leu - Gin - Arg - Leu -
25 27 25 27
Leu - Gin - Gly - Leu - Val - NH2 Leu - Gin - Gly - Leu - Val - NH2
En vue de l'obtention de cette sécrétine, on a mis en œuvre des procédés tels que l'extraction1 d'une sécrétine existant à l'état naturel (habituellement, la sécrétine porcine, mais on a également déterminé que la séquence des acides aminés de la sécrétine bovine est la même que celle de la sécrétine porcine) et la synthèse chimique2. Toutefois, chacun de ces procédés implique des difficultés concernant le coût, la rapidité, le rendement de la production, etc. En outre, selon le procédé de l'art antérieur dans lequel on extrait et on purifie la sécrétine provenant de l'intestin grêle des cochons, il se présente une difficulté résultant du fait que le grand nombre des hormones gastro-intestinales (motiline, VIP, CCK-PZ, GIP, GLI, etc.) In order to obtain this secretin, methods such as the extraction1 of a secretin existing in the natural state (usually porcine secretin, have been implemented, but it has also been determined that the amino acid sequence bovine secretin is the same as that of porcine secretin) and chemical synthesis2. However, each of these methods involves difficulties regarding cost, speed, production efficiency, etc. In addition, according to the method of the prior art in which the secretin from the small intestine of pigs is extracted and purified, there is a difficulty resulting from the fact that the large number of gastrointestinal hormones (motilin, VIP , CCK-PZ, GIP, GLI, etc.)
5 5
io io
15 15
20 20
25 25
30 30
35 35
40 40
45 45
50 50
55 55
60 60
65 65
659 826 659,826
4 4
fait obstacle a une détermination précise de la sécrétine par la méthode de détermination biologique ou radio-immunologique. obstructs precise determination of secretin by the biological or radioimmunological determination method.
Entre-temps, les progrès récents des techniques dites de génie génétique, dans lesquelles on utilise un gène synthétique, sont si importants que l'on commence maintenant à produire de manière commerciale, au moyen de ces techniques, différents polypeptides ayant une activité physiolgoique. En conséquence, la possibilité de produire la sécrétine par une technique de génie génétique permettrait de découvrir des indices pouvant mener à la solution des problèmes mentionnés ci-dessus qui sont rencontrés dans les procédés de production conformes à l'art antérieur. In the meantime, recent advances in so-called genetic engineering techniques, in which a synthetic gene is used, are so important that we are now beginning to produce commercially, by means of these techniques, different polypeptides having physiological activity. Consequently, the possibility of producing secretin by a genetic engineering technique would make it possible to discover clues which could lead to the solution of the problems mentioned above which are encountered in the production methods in accordance with the prior art.
Toutefois, bien que l'on ait, de manière générale, établi que la production d'un polypeptide par une technique de génie génétique, en utilisant un gène synthétique, est rendue possible grâce aux opérations consistant à effectuer la synthèse chimique d'un gène structural, à insérer ce gène en tant que vecteur dans un plasmide approprié, à transformer un hôte approprié et à produire et récupérer le polypeptide désiré par culture du produit de transformation, il n'est pas forcément possible de prévoir à coup sûr si l'on peut introduire un polypeptide donné, ayant une activité physiologique désirée, au moyen de ce procédé. However, although it has generally been established that the production of a polypeptide by a genetic engineering technique, using a synthetic gene, is made possible by the operations of performing the chemical synthesis of a gene structural, to insert this gene as a vector into an appropriate plasmid, to transform an appropriate host and to produce and recover the desired polypeptide by culturing the transformation product, it is not necessarily possible to predict with certainty whether the a given polypeptide having a desired physiological activity can be introduced by this method.
Dans le cas de la sécrétine, du fait que l'extrémité C de la sécrétine polypeptide est un amide de valine, comme mentionné ci-dessus, l'extrémité du gène structural d'ADN représentant le polypeptide doit nécessairement comprendre le codon corespondant à la valine et, par conséquent, on considère que le polypeptide produit a une extrémité C constituée par la valine. Avec un tel raisonnement, il n'est pas certain que le polypeptide obtenu présentera l'activité physiologique de la sécrétine. In the case of secretin, since the C end of the secretin polypeptide is a valine amide, as mentioned above, the end of the DNA structural gene representing the polypeptide must necessarily include the codon corresponding to the valine and, therefore, the polypeptide produced is considered to have a C-terminus consisting of valine. With such reasoning, it is not certain that the polypeptide obtained will exhibit the physiological activity of secretin.
La présente invention résulte de la confirmation du fait qu'un gène structural exprimant un dérivé de sécrétine dont l'extrémité C est constituée par de la valine ne se trouvant pas sous forme d'amide, à savoir la désamidosécrétine, peut être obtenu par synthèse chimique, qu'un tel gène peut être inséré en tant que vecteur dans un plasmide approprié pour former un plasmide chimère, que la transformation d'une cellule-hôte appropriée par le plasmide chimère ainsi que la production et la récupération de la désamidosécrétine par culture du produit de transformation sont possibles, que la désamidosécrétine ainsi produite a une activité similaire à celle de la sécrétine et, en outre, que le système d'expression de l'opéron de lactose peut être utilisé dans la production de la désamidosécrétine et que l'on peut augmenter le rendement de désamidosécrétine, dans une large mesure, grâce à l'utilisation de ce système d'expression. The present invention results from the confirmation of the fact that a structural gene expressing a secretin derivative the C end of which is constituted by valine which is not in the form of amide, namely desamidosecretin, can be obtained by synthesis chemical, that such a gene can be inserted as a vector into a suitable plasmid to form a chimeric plasmid, that the transformation of an appropriate host cell by the chimeric plasmid as well as the production and recovery of deamidosecretin by culture of the transformation product are possible, that the desamidosecretin thus produced has an activity similar to that of secretin and, moreover, that the expression system of the lactose operon can be used in the production of desamidosecretin and that the 'The yield of desamidosecretin can be increased to a large extent through the use of this expression system.
Ainsi, la 27-désamidosécrétine obtenue par le procédé selon l'invention comprend un polypeptide représenté par la séquence d'acide aminé: Thus, the 27-desamidosecretin obtained by the process according to the invention comprises a polypeptide represented by the amino acid sequence:
His - Ser - Asp - Gly - Thr - Phe - Thr - Ser - Glu - Leu - Ser -Arg - Leu - Arg - Asp - Ser - Ala - Arg - Leu - Gin - Arg - Leu -Leu - Gin - Gly - Leu - Val - OH His - Ser - Asp - Gly - Thr - Phe - Thr - Ser - Glu - Leu - Ser -Arg - Leu - Arg - Asp - Ser - Ala - Arg - Leu - Gin - Arg - Leu -Leu - Gin - Gly - Leu - Val - OH
dans laquelle Val-OH montre que l'extrémité C du polypeptide comprenant la valine est un acide carboxylique. wherein Val-OH shows that the C-terminus of the polypeptide comprising valine is a carboxylic acid.
La présente invention a également pour objet un procédé d'obtention d'une souche d'un micro-organisme transformé par un plasmide comprenant un gène de structure d'une désamidosécrétine correspondant à un polypeptide dans lequel l'acide aminé situé à l'extrémité C de la sécrétine est la valine, ce procédé étant caractérisé par le fait qu'il comprend les opérations suivantes: The present invention also relates to a process for obtaining a strain of a microorganism transformed by a plasmid comprising a structural gene for a deamidosecretin corresponding to a polypeptide in which the amino acid located at the end C of secretin is valine, this process being characterized by the fact that it comprises the following operations:
(1) synthèse chimique d'un gène de structure d'une désamidosécrétine correspondant à un polypeptide dans lequel l'acide aminé situé à l'extrémité C de la sécrétine est la valine, (1) chemical synthesis of a structural gene for a desamidosecretin corresponding to a polypeptide in which the amino acid located at the C end of the secretin is valine,
(2) insertion de ce gène dans un plasmide vecteur capable de proliférer dans une cellule-hôte prédéterminée, de façon à produire un plasmide chimère capable de proliférer dans cette cellule, et (2) insertion of this gene into a vector plasmid capable of proliferating in a predetermined host cell, so as to produce a chimeric plasmid capable of proliferating in this cell, and
(3) transformation de la cellule-hôte par ce plasmide chimère. (3) transformation of the host cell with this chimeric plasmid.
Le procédé de production de la 27-désamidosécrétine comprend la culture de la cellule transformée ainsi obtenue et la récupération de la désamidosécrétine produite. The process for producing 27-deamidosecretin comprises culturing the transformed cell thus obtained and recovering the deamidosecretin produced.
Une variante préférée du procédé d'obtention de la souche de micro-organisme transformé comprend les opérations suivantes: A preferred variant of the process for obtaining the strain of transformed microorganism comprises the following operations:
(1) synthèse chimique d'un gène de structure d'une désamidosécrétine correspondant à un polypeptide dans lequel l'acide aminé (1) chemical synthesis of a structural gene for a desamidosecretin corresponding to a polypeptide in which the amino acid
5 situé à l'extrémité C de la sécrétine est la valine, 5 located at the C end of the secretin is valine,
(2) obtention d'un plasmide vecteur capable d'utiliser l'opéron lactose et capable, en outre, de proliférer dans une cellule-hôte prédéterminée, (2) obtaining a vector plasmid capable of using the lactose operon and capable, moreover, of proliferating in a predetermined host cell,
(3) insertion de ce gène de structure dans le plasmide vecteur de 10 façon à produire un plasmide chimère capable de proliférer dans cette cellule, et (3) insertion of this structural gene into the vector plasmid so as to produce a chimeric plasmid capable of proliferating in this cell, and
(4) transformation de la cellule-hôte par ce plasmide chimère. (4) transformation of the host cell by this chimeric plasmid.
Ainsi, le procédé de production de 27-désamidosécrétine com- Thus, the process for producing 27-desamidosecretin includes
prend, de manière générale, les étapes suivantes: generally takes the following steps:
(1) obtention d'un plasmide chimère comprenant un fragment constitué par un gène structurel d'une désamidosécrétine correspondant à un polypeptide dans lequel l'acide aminé situé à l'extrémité C de la sécrétine est la valine, ce plasmide chimère étant capable de (1) obtaining a chimeric plasmid comprising a fragment consisting of a structural gene for a deamidosecretin corresponding to a polypeptide in which the amino acid located at the C end of the secretin is valine, this chimeric plasmid being capable of
20 proliférer dans une cellule-hôte prédéterminée et d'exprimer le gène de structure d'une désamidosécrétine dans la cellule-hôte, 20 proliferate in a predetermined host cell and express the structural gene for a desamidosecretin in the host cell,
(2) transformation de la cellule-hôte par ce plasmide chimère, et (2) transformation of the host cell with this chimeric plasmid, and
(3) culture des cellules transformées ainsi obtenues et récupération de la désamidosécrétine produite. (3) culture of the transformed cells thus obtained and recovery of the deamidosecretin produced.
25 Un exemple caractéristique des cellules-hôtes que l'on peut utiliser dans le procédé de transformation défini ci-dessus est constitué par Y Escherichia coli qui appartient au genre Escherichia, l'opéron lactose provenant de Y Escherichia coli. A typical example of the host cells which can be used in the transformation process defined above is constituted by Escherichia coli which belongs to the genus Escherichia, the lactose operon originating from Escherichia coli.
Ainsi, on peut définir la variante préférée du procédé de produc-30 tion de 27-désamidosécrétine comme un procédé comprenant la culture d'un micro-organisme producteur de désamidosécrétine, ce micro-organisme étant constitué par de Y Escherichia coli dans lequel on a incorporé un plasmide contenant le gène de structure de la désamidosécrétine et la récupération de la désamidosécrétine produite 35 lors de l'utilisation de l'opéron lactose dans Y Escherichia coli. Thus, the preferred variant of the process for the production of 27-deamidosecretin can be defined as a process comprising the culture of a microorganism producing deamidosecretin, this microorganism consisting of Escherichia coli in which incorporated a plasmid containing the structural gene for deamidosecretin and the recovery of deamidosecretin produced when using the lactose operon in Escherichia coli.
L'invention concerne également une culture à'Escherichia coli destinée à être utilisée pour la mise en œuvre du procédé, cet Escherichia coli ayant été transformé de manière à présenter un phénotype tel que la culture de ce micro-organisme produise la 27-désamidosé-40 crétine. Ainsi, l'invention concerne un Escherichia coli caractérisé par le fait qu'il a été transformé au moyen d'un plasmide dans lequel on a incorporé ou inséré un gène structurel, obtenu par synthèse chimique, de la désamidosécrétine correspondant au polypeptide dans lequel l'acide aminé à l'extrémité C consiste en valine, ce plasmide 45 étant capable d'utiliser l'opéron lactose et étant également capable de proliférer dans une cellule-hôte prédéterminée. The invention also relates to an Escherichia coli culture intended to be used for the implementation of the method, this Escherichia coli having been transformed so as to present a phenotype such that the culture of this microorganism produces 27-deamidosis- 40 moron. Thus, the invention relates to an Escherichia coli characterized in that it has been transformed by means of a plasmid in which a structural gene has been incorporated or inserted, obtained by chemical synthesis, of deamidosecretin corresponding to the polypeptide in which the the amino acid at the C end consists of valine, this plasmid 45 being capable of using the lactose operon and also being capable of proliferating in a predetermined host cell.
L'invention concerne également un polydéoxyribonucléotide double-brin comprenant le gène structurel exprimant la 27-désamidosécrétine. The invention also relates to a double-stranded polydeoxyribonucleotide comprising the structural gene expressing 27-deamidosecretin.
so L'invention concerne encore un plasmide comprenant le gène structurel exprimant la 27-désamidosécrétine. The invention also relates to a plasmid comprising the structural gene expressing 27-deamidosecretin.
Conformément à la description de l'invention donnée ci-dessus, on peut éliminer les difficultés d'extraction et de purification rencontrées dans le cas de l'extraction de la sécrétine naturelle qui a été 55 mise en œuvre, comme seul procédé commercialement exploitable, grâce à l'utilisation, comme matière première, de l'extrait de gène obtenu par recombinaison. In accordance with the description of the invention given above, it is possible to eliminate the extraction and purification difficulties encountered in the case of the extraction of the natural secretin which has been used, as the only commercially exploitable process, through the use, as raw material, of the gene extract obtained by recombination.
Lors de la mise en œuvre du procédé selon l'invention, il est possible de faire varier une ou plusieurs espèces d'acide aminé consti-«0 tuant un peptide, ce qui permet d'étudier les corrélations entre les structures et les activités des hormones peptidiques. En d'autres termes, on peut obtenir facilement tout dérivé désiré substitué par un acide aminé d'un peptide présentant une activité physiologique. On peut considérer que la formation d'un dérivé de polypeptide par 65 manipulation génétique constitue le meilleur procédé, compte tenu du fait que la formation par synthèse chimique d'un dérivé de polypeptide à masse moléculaire élevée est très difficile à effectuer selon les procédés dont on dispose actuellement. During the implementation of the method according to the invention, it is possible to vary one or more amino acid species constituting a peptide, which makes it possible to study the correlations between the structures and the activities of peptide hormones. In other words, any desired derivative substituted by an amino acid of a peptide exhibiting physiological activity can be easily obtained. It can be considered that the formation of a polypeptide derivative by genetic manipulation is the best method, taking into account that the formation by chemical synthesis of a polypeptide derivative of high molecular weight is very difficult to carry out according to the methods of which we currently have.
5 5
659 826 659,826
En outre, l'utilisation du système hôte-vecteur utilisé dans la variante préférée du procédé pour la production de la désamidosécrétine, comme mentionné ci-dessus, a rendu possible de produire de la désamidosécrétine ayant une activité de sécrétine correspondant à environ 3 x 104 molécules par cellule-hôte, ce qui peut être considéré comme un rendement approprié à une exploitation pratique. En outre, en ce qui concerne la protéine fusionnée qui sera décrite ci-dessous, on obtient un rendement de 2,85 x 105 molécules/cellule, ce qui constitue une valeur qui suggère que la production de la désamidosécrétine avec un rendement élevé est rendue possible par l'expression de caractère en utilisant le plasmide chimère selon l'invention dans une bactérie, sans effet destructeur (protéolytique) par les protéases. Furthermore, the use of the host-vector system used in the preferred variant of the process for the production of deamidosecretin, as mentioned above, has made it possible to produce deamidosecretin having a secretin activity corresponding to approximately 3 x 10 4 molecules per host cell, which can be considered a yield suitable for practical use. In addition, as regards the fused protein which will be described below, a yield of 2.85 x 105 molecules / cell is obtained, which constitutes a value which suggests that the production of deamidosecretin with a high yield is made. possible by the expression of character using the chimeric plasmid according to the invention in a bacterium, without destructive effect (proteolytic) by the proteases.
Il existe également des polypeptides différents de la sécrétine qui ont une extrémité C sous la forme d'un amide, et la présente invention fournit une suggestion concernant la production de dérivés des amidês de tels polypeptides ainsi que l'expression de leur activité physiologique. There are also polypeptides other than secretin which have a C-terminus in the form of an amide, and the present invention provides a suggestion regarding the production of amide derivatives of such polypeptides as well as the expression of their physiological activity.
La 27-désamidosécrétine obtenue par le procédé selon l'invention est un polypeptide correspondant à la séquence d'acide aminé représenté par la formule (I) indiquée ci-dessous: The 27-desamidosecretin obtained by the process according to the invention is a polypeptide corresponding to the amino acid sequence represented by the formula (I) indicated below:
His - Ser - Asp - Gly - Thr - Phe - Thr - Ser - Glu - Leu - Ser -Arg - Leu - Arg - Asp - Ser - Ala - Arg - Leu - Gin - Arg - Leu -Leu - Gin - Gly - Leu - Val - OH His - Ser - Asp - Gly - Thr - Phe - Thr - Ser - Glu - Leu - Ser -Arg - Leu - Arg - Asp - Ser - Ala - Arg - Leu - Gin - Arg - Leu -Leu - Gin - Gly - Leu - Val - OH
Dans la formule (I), le symbole His et les autres symboles du même genre sont les symboles habituels indiquant les acides aminés tels que l'histidine, etc. In the formula (I), the symbol His and the other symbols of the same kind are the usual symbols indicating amino acids such as histidine, etc.
Ce polypeptide diffère du polypeptide de la sécrétine par le fait que la valine à l'extrémité C n'est pas sous la forme d'un amide (Val-NH2) mais sous la forme d'un groupe carboxyle (Val-OH). This polypeptide differs from the secretin polypeptide in that the C-terminated valine is not in the form of an amide (Val-NH2) but in the form of a carboxyl group (Val-OH).
La désamidosécrétine, qui a une activité physiologique similaire à celle de la sécrétine, notamment l'effet de promotion de la sécrétion du suc pancréatique, peut elle-même être utilisée en tant que polypeptide ayant une activité physiologique analogue à celle de la sécrétine. D'autre part, on peut également utiliser la désamidosécrétine après amidation du groupe carboxyle à l'extrémité C de la sécrétine. L'amidation peut être effectuée par un procédé purement chimique ou bien par un procédé enzymatique ou par un procédé biologique in vivo. Deamidosecretin, which has a physiological activity similar to that of secretin, in particular the effect of promoting the secretion of pancreatic juice, can itself be used as a polypeptide having a physiological activity analogous to that of secretin. On the other hand, it is also possible to use desamidosecretin after amidation of the carboxyl group at the C end of the secretin. The amidation can be carried out by a purely chemical method or by an enzymatic method or by a biological method in vivo.
Bien que l'on puisse obtenir la désamidosécrétine par modification de l'extrémité C de la sécrétine, on produit de préférence ce composé par une technique de génie génétique, conformément à la présente invention, en effectuant la synthèse chimique d'un gène structurel pour ce polypeptide, la préparation d'un plasmide permettant d'exprimer le polypeptide, la transformation d'une cellule-hôte au moyen de ce plasmide, la production du polypeptide désiré par culture des cellules transformées et la récupération de la désamidosécrétine. Although desamidosecretin can be obtained by modification of the C-terminus of secretin, this compound is preferably produced by a genetic engineering technique, in accordance with the present invention, by performing the chemical synthesis of a structural gene for this polypeptide, the preparation of a plasmid making it possible to express the polypeptide, the transformation of a host cell by means of this plasmid, the production of the desired polypeptide by culturing the transformed cells and the recovery of deamidosecretin.
La séquence de bases de l'ADN dont est constitué le gène structurel de la sécrétine est inconnue. The DNA base sequence that makes up the structural gene for secretin is unknown.
Par conséquent, parmi les codons qui désignent l'acide aminé constituant le peptide, ceux qui satisfont aux conditions suivantes sont choisies pour la synthèe de l'ADN : Consequently, among the codons which designate the amino acid constituting the peptide, those which satisfy the following conditions are chosen for the synthesis of DNA:
(i) il doit être réglé de façon que la région enrichie en paires de bases A - T ne suivent pas immédiatement la région enrichie en paires de bases G - C, et (i) it must be set so that the region enriched in base pairs A - T does not immediately follow the region enriched in base pairs G - C, and
(ii) il doit également être réglé de façon que chaque fragment de synthèse, comme décrit ci-dessous, ne présente pas une séquence de bases complémentaire indésirable intramoléculairement ou intermo-léculairement. (ii) it must also be adjusted so that each synthetic fragment, as described below, does not exhibit an undesirable complementary base sequence intramolecularly or intermolecularly.
Il est également souhaitable, pour faciliter le choix des souches transformées, que le gène de structure soit agencé de manière à contenir une ou plusieurs séquences de base de reconnaissance d'enzyme de restriction. Dans le cas de la désamidosécrétine, il est préférable que le gène ait des séquences de bases de reconnaissance du type Hinf I et Hae II. It is also desirable, in order to facilitate the choice of the transformed strains, for the structural gene to be arranged so as to contain one or more restriction enzyme recognition base sequences. In the case of desamidosecretin, it is preferable that the gene has recognition base sequences of the Hinf I and Hae II type.
D'un point de vue de ce genre, des exemples caractéristiques de codons désignant des acides aminés dans le gène de structure de la désamidosécrétine sont les suivants: From this point of view, typical examples of codons designating amino acids in the structural gene for desamidosecretin are the following:
Acide aminé Codon Amino acid Codon
His CAC His CAC
Ser TCT, TCA Ser TCT, TCA
Asp GAT Asp GAT
Gly GGT Gly GGT
Thr ACT, ACC Thr ACT, ACC
Phe TTC Phe TTC
Glu GAA Glu GAA
Leu TTG, CTC, CTA, CTG, TT A, CTT Leu TTG, CTC, CTA, CTG, TT A, CTT
Arg CGT, CGC Arg CGT, CGC
Ala GCA Ala GCA
Gin CAA, CAG Gin CAA, CAG
Val GTT Val GTT
En conséquence, selon une forme préférée du gène de structure de la désamidosécrétine selon l'invention, la séquence de bases est celle qui est indiquée ci-dessous dans les exemples expérimentaux ainsi que dans le schéma représentatif de la structure du gène (dans ce schéma, la séquence de bases est bien entendu le groupement allant du triplet CAC, correspondant à His, au triplet GTT, correspondant à Val). Consequently, according to a preferred form of the structural gene for desamidosecretin according to the invention, the base sequence is that which is indicated below in the experimental examples as well as in the diagram representing the structure of the gene (in this diagram , the base sequence is of course the group going from the CAC triplet, corresponding to His, to the GTT triplet, corresponding to Val).
Plus précisément, l'invention porte, en particulier, à titre de produit intermédiaire, sur un polydéoxynucléotide double-brin comprenant un gène de structure exprimant la 27-désamidosécrétine, comme mentionné ci-dessus, une forme d'exécution particulièrement avantageuse du gène de structure ayant la séquence de bases repré- More specifically, the invention relates, in particular, as an intermediate product, to a double-stranded polydeoxynucleotide comprising a structural gene expressing 27-desamidosecretin, as mentioned above, a particularly advantageous embodiment of the gene for structure with the base sequence represented
sentée ci-dessous: felt below:
His His
Ser Ser
Asp Asp
Gly Gly
Thr Thr
Phe Phe
Thr Thr
CAC CAC
-TCA -TCA
-GAT -GAT
-GGT -GGT
-ACT - -ACT -
-TTC -TTC
- ACC- - ACC-
GTG GTG
-AGT -AGT
-CTA -CTA
-CCA -CCA
-TGA- -TGA-
-AAG -AAG
- TGG - - TGG -
Ser Ser
Glu Glue
Leu Leu
Ser Ser
Arg Arg
Leu Leu
Arg Arg
TCA TCA
-GAA -GAA
-CTA -CTA
-TCT -TCT
-CGT -CGT
-CTA -CTA
-CGT - -CGT -
AGT AGT
-CTT -CTT
-GAT -GAT
-AGA -AGA
-GCA -GCA
-GAT -GAT
-GCA - -GCA -
Asp Asp
Ser Ser
Ala To the
Arg Arg
Leu Leu
Gin Gin
Arg Arg
GAT GAT
-TCA -TCA
-GCA -GCA
-CGC -CGC
- CTC - CTC
-CAG -CAG
- CGC - - CGC -
CTA CTA
-AGT -AGT
-CGT -CGT
-GCG -GCG
-GAG -GAG
-GTC -GTC
- GCG - - GCG -
Leu Leu
Leu Leu
Gin Gin
Gly Gly
Leu Leu
Val Val
TTG TTG
-CTG -CTG
-CAA -CAA
-GGT -GGT
-CTC -CTC
-GTT -GTT
AAC AAC
-GAC -GAC
-GTT -GTT
-CCA -CCA
-GAG -GAG
-CAA -CAA
- -
La façon d'exprimer un tel gène de structure est décrite en détail, par exemple dans la demande de brevet japonais publiée N° 92696/ 1979. Dans le cas où l'on utilise le plasmide pBR 322 comme plasmide dans lequel le gène doit être incorporé, la désamidosécrétine devant être exprimée en tant que protéine fusionnée avec son opéron lactamase, le site dans lequel le gène doit être incorporé est avantageusement le site de reconnaissance de l'enzyme de restriction Pst I dans l'opéron. Plus précisément, le codon ATG de la méthionine qui constitue le site devant être attaqué par le bromure de cyanogène se trouve du côté de l'extrémité 5' du gène de structure, alors qu'un ou plusieurs codons d'arrêt se trouvent à l'extrémité 3'. Par la suite, de manière à être synchronisé3 avec le cadre commençant au codon de départ du gène lactamase, on confère au gène du côté 5' de l'ATG des bases choisies au hasard en nombre égal 2 + 3n (n = 0, 1, 2,...) ainsi qu'une séquence de bases de reconnaissance Pst I pour former des extrémités cohésives aux deux extrémités respectivement. En général, les gènes de structure sont conçus et synthétisés4 avec leurs deux extrémités cohésives non protégées mais, si désiré, on peut bloquer ces deux extrémités, ce qui rend nécessaire de fournir deux ou plusieurs bases choisies au hasard aux parties se trouvant encore plus à l'extérieur des séquences de bases de reconnaissance afin d'augmenter la capacité d'hydrolyse de l'enzyme de restriction. The manner of expressing such a structural gene is described in detail, for example in the published Japanese patent application No. 92696 / 1979. In the case where the plasmid pBR 322 is used as the plasmid in which the gene must be incorporated, the desamidosecretin having to be expressed as a protein fused with its lactamase operon, the site in which the gene must be incorporated is advantageously the site of recognition of the restriction enzyme Pst I in the operon. More specifically, the ATG codon of methionine which constitutes the site to be attacked by cyanogen bromide is located on the side of the 5 ′ end of the structural gene, while one or more stop codons are located at the 'end 3'. Subsequently, so as to be synchronized3 with the frame starting at the start codon of the lactamase gene, the gene on the 5 ′ side of the ATG is given bases chosen at random in equal numbers 2 + 3n (n = 0, 1 , 2, ...) as well as a sequence of Pst I recognition bases to form cohesive ends at the two ends respectively. In general, structural genes are designed and synthesized4 with their two unprotected cohesive ends but, if desired, these two ends can be blocked, which makes it necessary to provide two or more bases chosen at random to the parts even more distant. outside the recognition base sequences in order to increase the hydrolysis capacity of the restriction enzyme.
5 5
10 10
15 15
20 20
25 25
30 30
35 35
40 40
45 45
50 50
55 55
60 60
65 65
659 826 659,826
6 6
Les paires de bases facultatives devant être placées du côté 5' du codon ATG sont des paires 3m, (3m + 1) ou (3m + 2), m étant un nombre entier égal à 0,1 ou davantage. The optional base pairs to be placed on the 5 'side of the ATG codon are 3m pairs, (3m + 1) or (3m + 2), m being an integer equal to 0.1 or more.
Compte tenu des considérations qui précèdent, une forme d'exécution préférée du gène de désamidosécrétine qui convient pour la mise en œuvre de l'invention est telle que décrite ci-dessous dans les exemples expérimentaux. In view of the foregoing considerations, a preferred embodiment of the desamidosecretin gene which is suitable for carrying out the invention is as described below in the experimental examples.
Plus précisément, une forme particulièrement avantageuse du gène pour la désamidosécrétine a la structure représentée ci-dessous: More specifically, a particularly advantageous form of the gene for desamidosecretin has the structure shown below:
Met Met
ACCTGCAGCC - ATG -TGGACGTCGG-TAC- ACCTGCAGCC - ATG -TGGACGTCGG-TAC-
His His
Ser Ser
Asp Asp
Gly Gly
Thr Thr
Phe Phe
Thr Thr
CAC CAC
-TCA -TCA
-GAT -GAT
-GGT -GGT
-ACT- -ACT-
■TTC - ■ TTC -
ACC- ACC-
GTG GTG
-AGT -AGT
-CTA -CTA
-CCA -CCA
-TGA- -TGA-
- AAG- - AAG-
TGG - TGG -
Ser Ser
Glu Glue
Leu Leu
Ser Ser
Arg Arg
Leu Leu
Arg Arg
TCA TCA
-GAA -GAA
-CTA -CTA
-TCT -TCT
-CGT -CGT
-CTA - -CTA -
CGT - CGT -
AGT AGT
-CTT -CTT
-GAT -GAT
-AGA -AGA
-GCA -GCA
-GAT- -GAT-
GCA - GCA -
Asp Asp
Ser Ser
Ala To the
Arg Arg
Leu Leu
Gln Gln
Arg Arg
GAT GAT
-TCA -TCA
-GCA -GCA
-CGC -CGC
-CTC -CTC
-CAG- -CAG-
-CGC- -CGC-
CTA CTA
-AGT -AGT
-CGT -CGT
-GCG -GCG
-GAG -GAG
- GTC - - GTC -
GCG- GCG-
Leu Leu
Leu Leu
Gin Gin
Gly Gly
Leu Leu
Val Val
TTG TTG
-CTG -CTG
-CAA -CAA
-GGT -GGT
-CTC -CTC
- GTT - - GTT -
AAC AAC
-GAC -GAC
-GTT -GTT
-CCA -CCA
-GAG -GAG
-CAA- -CAA-
FIN END
FIN END
TGA TGA
-TAG -TAG
- GGCTGCAGGT - GGCTGCAGGT
ACT ACT
-ATC- -ATC-
•CCGACGTCCA • CCGACGTCCA
Pour la synthèse du gène désignée de la manière décrite ci-dessus, on peut diviser chacun des deux brins + et — en plusieurs fragments. Ces fragments peuvent être synthétisés chimiquement et on peut ensuite lier ensemble les fragments respectifs. De préférence, on divise chaque brin en environ 16 fragments dont chacun comprend de 9 à 16 bases, de sorte qu'il y aura un chevauchement de 6 à 7 bases. For the synthesis of the gene designated as described above, each of the two strands + and - can be divided into several fragments. These fragments can be chemically synthesized and then the respective fragments can be linked together. Preferably, each strand is divided into about 16 fragments, each of which comprises 9 to 16 bases, so that there will be an overlap of 6 to 7 bases.
Comme procédé de synthèse de chacun des fragments, on peut mentionner le procédé au diester5, le procédé au triester6, le procédé en phase solide4, le procédé en phase liquide ou le procédé dans lequel on utilise un enzyme7. Du point de vue du temps de synthèse, du rendement et de la purification, le procédé qui convient le mieux est le procédé en phase solide conformément au procédé au triester. As a method of synthesizing each of the fragments, mention may be made of the diester method 5, the triester method 6, the solid phase method 4, the liquid phase method or the method in which an enzyme is used 7. From the point of view of synthesis time, yield and purification, the most suitable method is the solid phase method according to the triester method.
En ce qui concerne les détails de la synthèse, il y a lieu de se reporter aux références indiquées ci-dessus, des exemples expérimentaux étant décrits ci-dessous. With regard to the details of the synthesis, reference should be made to the references indicated above, experimental examples being described below.
Lorsque que l'on effectue la synthèse d'un oligonucléotide, la séparation et la purification du produit final deviennent généralement plus difficiles lorsque la longueur du brin augmente. En particulier, selon le procédé de synthèse en phase solide, on condense par étapes successives des blocs oligonucléotides convenablement protégés et, par conséquent, on ne peut pas effectuer facilement la purification par les procédés usuels tels que la filtration de gel, Pélectrophorèse de gel, l'utilisation d'une colonne d'échangeuse d'ions, la Chromatographie en phase liquide à grande vitesse, etc. When synthesizing an oligonucleotide, separation and purification of the final product generally becomes more difficult as the length of the strand increases. In particular, according to the solid phase synthesis process, suitably protected oligonucleotide blocks are condensed in successive stages and, therefore, the purification cannot be easily carried out by the usual methods such as gel filtration, gel electrophoresis, the use of an ion exchange column, high speed liquid chromatography, etc.
Dans une colonne en phase inversée, le temps de rétention varie dans une large mesure suivant que l'oligonucléotide présente ou ne présente pas de groupe protecteur lipophile. En conséquence, lorsque l'on utilise, lors de l'étape de condensation finale, un bloc d'oligonucléotide ayant un groupe protecteur stable dans les conditions permettant l'élimination des autres groupes protecteurs" et que l'on enlève ensuite ces autres groupes protecteurs, on peut obtenir un mélange d'oligonucléotides ne comprenant que les groupes protecteurs stables dans le produit final désiré. En mettant à profit la nature lipophile du groupe protecteur, on peut séparer le produit final désiré du mélange des espèces n'ayant pas réagi, par passage à travers une colonne en phase inversée, opération qui est suivie de l'élimination du groupe protecteur, de façon à produire l'oligonucléotide désiré. In a reverse phase column, the retention time varies to a large extent depending on whether the oligonucleotide has or does not have a lipophilic protecting group. Consequently, when an oligonucleotide block having a stable protective group under the conditions allowing the elimination of the other protective groups is used, in the final condensation step, and then these other groups are removed protectants, a mixture of oligonucleotides containing only the stable protective groups can be obtained in the desired end product. By taking advantage of the lipophilic nature of the protective group, the desired end product can be separated from the mixture of unreacted species , by passage through a reverse phase column, an operation which is followed by removal of the protective group, so as to produce the desired oligonucleotide.
En procédant ainsi, on peut séparer et purifier avec une bonne efficacité l'oligonucléotide ainsi synthétisé du mélange des espèces n'ayant pas réagi. By proceeding in this way, the oligonucleotide thus synthesized can be separated and purified with good efficiency from the mixture of unreacted species.
On peut effectuer successivement la ligature mutuelle des fragments synthétiques ainsi préparés en utilisant une ADN ligase. Pour la préparation des substrats des fragments synthétiques pour l'enzyme, il est nécessaire de phosphoryler les groupes hydroxyle 5' dans les fragments. A cet effet, on utilise généralement une polynu-cléotide kinase, mais on peut également effectuer une phosphoryla-tion chimique5. Alors que la ligature des fragments est généralement effectuée en utilisant une ADN ligase, il est également possible de recourir au procédé selon lequel on inactive par un procédé approprié (par exemple, imidazolylation) les groupes acides phosphori-ques aux extrémités 5' et on effectue une ligature par voie chimique avec le brin du côté opposé servant de base9. Mutual ligation of the synthetic fragments thus prepared can be carried out successively using DNA ligase. For the preparation of the substrates of the synthetic fragments for the enzyme, it is necessary to phosphorylate the 5 'hydroxyl groups in the fragments. For this purpose, a polynucleotide kinase is generally used, but it is also possible to carry out chemical phosphoryla-tion5. While the ligation of the fragments is generally carried out using a DNA ligase, it is also possible to resort to the method according to which the phosphoric acid groups at the 5 'ends are inactivated by an appropriate method (for example, imidazolylation) and one performs chemically ligated with the strand on the opposite side serving as the base9.
Lors de la mise en œuvre de la variante préférée du procédé de production de 27-désamidosécrétine selon l'invention, on peut utiliser différents plasmides contenant la totalité ou une partie de l'opéron lactose de l'ADN du chromosome d'E. coli, ces plasmides étant également capables de proliférer dans YE. coli. On peut effectuer la préparation de ces plasmides par les procédés usuels bien connus dans le domaine de la biologie moléculaire. On peut obtenir l'ADN contenant l'opéron lactose directement à partir du chromosome d'E. coli mais on obtient également des phages transducteurs contenant la totalité ou une partie de l'opéron lactose (par exemple, Pldl, F'-lac, 080 dplac, Mi80 dlac, Xplac, etc.) et on peut, par conséquent, prélever de ces phages la partie nécessaire de l'opéron lactose. En outre, pour la préparation du plasmide capable de proliférer dans l'E. coli, il est nécessaire d'effectuer la ligature de la partie requise de l'opéron lactose indiqué ci-dessus avec un autre plasmide provenant de VE. coli (par exemple pBR 322, pSC 101, A.dVl) de manière à former un plasmide vecteur unique. When implementing the preferred variant of the process for the production of 27-deamidosecretin according to the invention, it is possible to use different plasmids containing all or part of the lactose operon of the DNA of the chromosome of E. coli, these plasmids also being able to proliferate in YE. coli. The preparation of these plasmids can be carried out by the usual methods well known in the field of molecular biology. DNA containing the lactose operon can be obtained directly from the chromosome of E. coli but also transducer phages containing all or part of the lactose operon are also obtained (for example, Pldl, F'-lac, 080 dplac, Mi80 dlac, Xplac, etc.) and can therefore be taken from these phages the necessary part of the lactose operon. In addition, for the preparation of the plasmid capable of proliferating in E. coli, it is necessary to ligate the required part of the lactose operon indicated above with another plasmid from VE. coli (eg pBR 322, pSC 101, A.dVl) so as to form a single vector plasmid.
Dans un exemple de mise en œuvre de l'invention, on utilise le phage transducteur Xplac523 comme opéron lactose contenant de l'ADN. On peut obtenir l'ADN du XplacS par exemple à partir de YE. coli PK 1512, qui est une bactérie lysogénique, en procédant selon un procédé connu20. Ce phage >.plac5 correspond à la région allant de la région médiane du gène i à la région médiane du gène y de l'opéron lactose et il ne présente, avantageusement, pas d'autres gènes d'£. coli que l'opéron lactose20. Par conséquent, ce phage convient particulièrement bien pour la mise en œuvre de l'invention. Comme plasmide provenant d'E. coli, on utilise le pBR 322 qui est choisi à cause du fait qu'il constitue l'un des plasmides les plus faciles à obtenir, que sa séquence de bases est bien connue et qu'il présente des gènes de marquage résistant à l'ampicilline et résistant à la tétracycline. En outre, lorsque l'on effectue la ligature de ces gènes, chacun des gènes (Xplac5 et pBR322) est traité par les enzymes de restriction EcoRI et HindIII et l'on prélève, respectivement, le fragment de 3,8 Md (mégadaltons15) pour Xplac5 et le fragment plus gros16 pour pBR322, que l'on ligature ensemble pour la préparation du plasmide vecteur désiré. On désigne, dans la présente description, ce vecteur par les lettres pRE. In an exemplary implementation of the invention, the transducer phage Xplac523 is used as the lactose operon containing DNA. The DNA of XplacS can be obtained, for example, from YE. coli PK 1512, which is a lysogenic bacterium, using a known method20. This phage> .plac5 corresponds to the region going from the middle region of the gene i to the middle region of the gene y of the lactose operon and it advantageously does not have any other £ genes. coli than the lactose operon20. Consequently, this phage is particularly suitable for implementing the invention. As a plasmid from E. coli, pBR 322 is used which is chosen because it is one of the easiest plasmids to obtain, its base sequence is well known and has labeling genes resistant to ampicillin and tetracycline resistant. In addition, when these genes are ligated, each of the genes (Xplac5 and pBR322) is treated with the restriction enzymes EcoRI and HindIII and the 3.8 Md fragment (megadaltons15) is taken respectively. for Xplac5 and the larger fragment16 for pBR322, which are ligated together for the preparation of the desired vector plasmid. In this description, this vector is designated by the letters pRE.
On a choisi l'opéron lactose du chromosome d'E. coli pour l'expression de la désamidosécrétine désirée en raison du fait qu'un gène étranger peut être inséré dans le gène z de l'opéron lactose, au site de reconnaissance de l'enzyme de restriction de l'EcoRI en vue de son expression sous la forme d'une protéine fusionnée avec la ß-galacto-sidase43'l7, qu'une protéine peut être produite en grande quantité, que la production induite peut être effectuée en utilisant un micro-organisme-hôte approprié et que le produit ainsi obtenu peut être récupéré facilement et de manière stable sous la forme d'une protéine fusionnée à l'état pratiquement pur. We chose the lactose operon from the chromosome of E. coli for expression of the desired desamidosecretin due to the fact that a foreign gene can be inserted into the z gene of the lactose operon, at the recognition site of the restriction enzyme of EcoRI for expression in the form of a protein fused with ß-galactosidase43'17, that a protein can be produced in large quantities, that the induced production can be carried out using an appropriate host microorganism and that the product thus obtained can be easily and stably recovered in the form of a fusion protein in the practically pure state.
Par conséquent, il est souhaitable que le vecteur préparé par le procédé selon l'invention présente un seul site de reconnaissance de l'enzyme de restriction EcoRI et, à cet effet, on utilise des fragments d'ADN obtenus par coupure du Xplac5 et du pBR322 au moyen de Consequently, it is desirable for the vector prepared by the method according to the invention to have a single recognition site for the restriction enzyme EcoRI and, for this purpose, use is made of DNA fragments obtained by cutting Xplac5 and pBR322 using
5 5
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35 35
40 40
45 45
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55 55
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65 65
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659 826 659,826
l'Eco RI et de HindIII, respectivement, comme décrit ci-dessus, ces fragments étant à leur tour ligaturés ensemble. Eco RI and HindIII, respectively, as described above, these fragments in turn being ligated together.
On effectue la préparation du plasmide chimère de la manière suivante: The chimeric plasmid is prepared in the following manner:
On incorpore le gène de structure de désamidosécrétine, indiqué ci-dessus, dans une position appropriée, dans le vecteur conçu pour l'expression d'un gène étranger, conformément à la description qui précède. On peut effectuer l'opération d'incorporation elle-même selon un procédé bien connu dans le domaine de la biologie moléculaire. En ce qui concerne les détails au sujet du procédé utilisé, il y a lieu de se reporter aux exemples expérimentaux donnés plus bas. The structural gene for desamidosecretin, indicated above, is incorporated in an appropriate position in the vector designed for the expression of a foreign gene, as described above. The incorporation operation itself can be carried out according to a process well known in the field of molecular biology. With regard to the details about the process used, reference should be made to the experimental examples given below.
Conformément à un mode de mise en œuvre de l'invention, on utilise le pBR322 comme plasmide vecteur et on incorpore le gène au site de reconnaissance PstI de ce plasmide de façon à produire un plasmide chimère. Dans la présente description, on désigne le plasmide chimère par pMG. Les principales raisons qui ont motivé le choix du PBR322 comme plasmide vecteur consistent dans le fait que ce plasmide est l'un de ceux que l'on obtient le plus facilement, que sa séquence de bases est bien connue et qu'il présente des gènes de marquage résistant à l'ampicilline et résistant à la tétracycline. Le plasmide pBR322 a été déposé auprès de l'American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland, 20852, U.S.A., sous le numéro de référence ATCC37017. Les principales raisons qui ont motivé le choix du site PstI comme lieu de l'incorporation du gène consiste dans le fait qu'il permet l'utilisation en tant que tel de l'opéron lactamase, qu'il permet une recherche facile du produit de transformation du fait que la résistance à l'ampicilline (Apr) est changée en sensibilité à l'ampicilline (Aps) et qu'il y a seulement un site PstI dans le plasmide pBR322. In accordance with an embodiment of the invention, pBR322 is used as the vector plasmid and the gene is incorporated at the PstI recognition site of this plasmid so as to produce a chimeric plasmid. In the present description, the chimeric plasmid is designated by pMG. The main reasons for choosing PBR322 as the vector plasmid are that this plasmid is one of the most easily obtained, that its base sequence is well known, and that it has genes ampicillin resistant and tetracycline resistant labeling. Plasmid pBR322 has been deposited with the American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland, 20852, U.S.A., under reference number ATCC37017. The main reasons which motivated the choice of the PstI site as the place of incorporation of the gene consists in the fact that it allows the use as such of the operon lactamase, that it allows an easy search for the product of transformation of the fact that resistance to ampicillin (Apr) is changed to sensitivity to ampicillin (Aps) and that there is only one PstI site in the plasmid pBR322.
Dans le mode de mise en œuvre préférentiel du procédé de production de la 27-désamidosécrétine, décrit ci-dessus, on utilise, comme plasmide vecteur, le pREl, qui sera décrit plus en détail ci-dessous, et on incorpore un gène, contenant le gène de structure de la désamidosécrétine, en son site de reconnaissance de l'EcoRl, de manière à produire un plasmide chimère. Dans la présente description, on désigne ce plasmide chimère par pLS. In the preferred embodiment of the process for producing 27-deamidosecretin, described above, pRE1, which will be described in more detail below, is used as vector plasmid, and a gene containing the structural gene for desamidosecretin, at its EcoRl recognition site, so as to produce a chimeric plasmid. In the present description, this chimeric plasmid is designated by pLS.
Toujours dans ce mode de mise en œuvre préféré du procédé, on utilise de préférence le gène contenant le gène de structure indiqué ci-dessus, c'est-à-dire, le gène ayant la séquence des bases indiquées dans le schéma. Afin d'incorporer ce gène, qui présente des sites de reconnaissance de l'enzyme de restriction PstI, à ses deux extrémités, dans le plasmide pREl, il est nécessaire de convertir les sites de reconnaissance de l'enzyme de restriction PstI en sites de reconnaissance de l'enzyme EcoRI. Still in this preferred embodiment of the method, the gene containing the structural gene indicated above is preferably used, that is to say, the gene having the base sequence indicated in the diagram. In order to incorporate this gene, which has recognition sites for the restriction enzyme PstI, at its two ends, into the plasmid pRE1, it is necessary to convert the recognition sites for the restriction enzyme PstI into sites for recognition of the EcoRI enzyme.
Ainsi, conformément à ce mode de mise en œuvre préférentiel du procédé de production de désamidosécrétine, un ADN double-brin est nécessaire pour constituer la séquence intercalaire (espaceur) Thus, in accordance with this preferred mode of implementation of the process for producing desamidosecretin, a double-stranded DNA is necessary to constitute the interlayer sequence (spacer)
entre le gène contenant le gène de structure et le plasmide pREl. Plus précisément, l'ADN double-brin est nécessaire afin d'avoir deux sites de reconnaissance des enzymes de restriction PstI et EcoRI, les paires de bases entre les deux sites de reconnaissance des enzymes de restriction étant 3n + 1 (n = 1, 2, 3, etc.) de manière à être synchronisé avec le cadre de lecture pour la traduction commençant avec le codon de départ du gène de la ß-galactosidase (la nature des paires de bases pouvant être choisie au hasard, du moment qu'aucun codon incohérent n'apparaît). between the gene containing the structural gene and the plasmid pRE1. More specifically, double-stranded DNA is necessary in order to have two recognition sites for the restriction enzymes PstI and EcoRI, the base pairs between the two recognition sites for the restriction enzymes being 3n + 1 (n = 1, 2, 3, etc.) so as to be synchronized with the reading frame for translation starting with the start codon of the β-galactosidase gene (the nature of the base pairs being able to be chosen at random, as long as no inconsistent codon appears).
Il est toutefois seulement nécessaire que la partie correspondant à l'espaceur présente finalement la fonction indiquée ci-dessus et il est possible d'obtenir l'espaceur par le procédé de synthèse du gène de structure indiqué ci-dessus. Conformément à un mode de mise en œuvre de l'invention, constituant un exemple d'un procédé de synthèse de ce genre, on a obtenu l'espaceur en procédant de la manière décrite ci-dessous. However, it is only necessary that the part corresponding to the spacer finally has the function indicated above and it is possible to obtain the spacer by the method of synthesis of the structural gene indicated above. In accordance with an embodiment of the invention, constituting an example of a synthesis process of this kind, the spacer was obtained by proceeding in the manner described below.
Tout d'abord, on élabore la structure d'un ADN simple-brin, conformément au schéma indiqué ci-dessous, cet ADN ayant des sites de reconnaissance des enzymes de restriction PstI et £coRI. First of all, the structure of a single-stranded DNA is worked out, in accordance with the scheme indicated below, this DNA having sites for recognition of the restriction enzymes PstI and £ coRI.
5' 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 3' CTGAATTCA G C TC TG CAGAG 5 '1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 3' CTGAATTCA G C TC TG CAGAG
Eco RI Eco RI
PstI PstI
Les bases en position 1, 2, 9-12, 19, 20 peuvent être choisies au hasard, du moment qu'elles satisfont aux conditions suivantes: The bases in position 1, 2, 9-12, 19, 20 can be chosen at random, as long as they satisfy the following conditions:
Condition (1): 1 et 10, 2 et 9, 11 et 20, et 12 et 19, sont chacune des paires de bases complémentaires aux autres; io Condition (2): la séquence de 9, 10, 11 n'est pas un codon incohérent. Condition (1): 1 and 10, 2 and 9, 11 and 20, and 12 and 19, are each base pairs complementary to the others; io Condition (2): the sequence of 9, 10, 11 is not an inconsistent codon.
L'ADN simple-brin ainsi conçu (désigné, dans la présente description, par le terme de; fragment de préliaison) permet, grâce à la complémentarité qui lui est propre, d'obtenir une structure d'ADN 15 double-brin à longue chaîne ayant un certain nombre de coudes (partie coupée sans intervalle vide formé sur l'un des deux bras de l'ADN). En conséquence, on peut former à partir de cette structure un ADN double-brin sans espace vide en faisant agir sur lui une ADN ligase. L'ADN double-brin ainsi préparé est un polyADN 20 double-brin présentant de manière alternée les sites de reconnaissance des enzymes de restriction Pst\ et iscoRI, c'est-à-dire la séquence des bases 1, 20 indiquée ci-dessus. The single-stranded DNA thus conceived (designated, in the present description, by the term “pre-binding fragment”) allows, thanks to its specific complementarity, to obtain a long double-stranded DNA structure. chain with a certain number of bends (part cut without empty gap formed on one of the two arms of DNA). Consequently, one can form from this structure a double-stranded DNA without empty space by making act on it a DNA ligase. The double-stranded DNA thus prepared is a double-stranded polyDNA alternately having the recognition sites of the restriction enzymes Pst \ and iscoRI, that is to say the sequence of bases 1, 20 indicated above. .
On peut donc obtenir, par traitement de l'ADN double-brin par l'enzyme de restriction PstI, un fragment de liaison de PstI - £t oRI -25 Pst I ayant des extrémités cohésives. It is therefore possible to obtain, by treatment of the double-stranded DNA with the restriction enzyme PstI, a binding fragment of PstI - £ t oRI -25 Pst I having cohesive ends.
De manière générale, un fragment de liaison présentant des sites de reconnaissance de deux enzymes de restriction est susceptible d'utilisations diverses qui ont été réalisées, conformément à l'art antérieur, en utilisant deux espèces différentes d'oligomère. Les indica-30 tions données dans la présente description permettent l'obtention du même résultat en utilisant une seule sorte d'oligomère, conformément au procédé décrit ci-dessus, l'ADN à brin unique étant capable d'expression comme représenté ci-dessous : In general, a binding fragment presenting recognition sites of two restriction enzymes is capable of various uses which have been carried out, in accordance with the prior art, using two different species of oligomer. The indications given in the present description allow the same result to be obtained using a single kind of oligomer, in accordance with the method described above, the single-stranded DNA being capable of expression as shown below. :
35 X'n...X'2X\ X^.. XnYm enzyme de restriction A site de reconnaissance 35 X'n ... X'2X \ X ^ .. XnYm restriction enzyme A recognition site
...Y2 Y, ... Y2 Y,
enzyme de restriction B site de reconnaissance restriction enzyme B recognition site
40 Y^YV.Y'm 40 Y ^ YV.Y'm
X et X', Y et Y' représentant chacun l'une quelconque des bases désirées (A, G, C, T) mutuellement complémentaires (n et m = 0, 1, 2, etc.). X and X ', Y and Y' each representing any of the desired bases (A, G, C, T) mutually complementary (n and m = 0, 1, 2, etc.).
45 En l'occurrence, A représente l'enzyme £coRI et B représente l'enzyme PstI, et n + m = 3p + 1 (p = 1,2, etc.), p étant de préférence égal à 1 ou 2. 45 In this case, A represents the enzyme co coRI and B represents the enzyme PstI, and n + m = 3p + 1 (p = 1.2, etc.), p being preferably equal to 1 or 2.
On peut déterminer la direction du gène de 27-désamidosécrétine incorporée dans le plasmide par coupure au site spécifique du gène 50 de structure au moyen d'un enzyme (Hae II) ayant la propriété de reconnaître ce site spécifique, coupure d'un autre site en une position donnée à l'extérieur du gène de structure et analyse des dimensions du fragment obtenu. The direction of the 27-desamidosecretin gene incorporated into the plasmid can be determined by cleavage at the specific site of the structural gene 50 by means of an enzyme (Hae II) having the property of recognizing this specific site, cleavage of another site. at a given position outside the structural gene and analysis of the dimensions of the fragment obtained.
Comme exemple caractéristique de la cellule-hôte que l'on peut 55 transformer en utilisant un plasmide chimère dans lequel est incorporé le gène de structure de la désamidosécrétine, comme décrit ci-dessus, tel que le pMG décrit plus haut, on peut citer par la souche d'E. coli Kl2C600 (FERM BP - 115, déposée auprès de l'Institute of Fermentation Research, Agency of Industriai Science and Techno-60 logy, Japan). La souche d'E. coli K12C600 est décrite dans la littérature24 et ses propriétés bactériologiques sont également décrites dans cette référence. As a characteristic example of the host cell which can be transformed using a chimeric plasmid in which the structural gene of desamidosecretin is incorporated, as described above, such as the pMG described above, mention may be made of: the strain of E. coli Kl2C600 (FERM BP - 115, filed with the Institute of Fermentation Research, Agency of Industriai Science and Techno-60 logy, Japan). The strain of E. coli K12C600 is described in the literature24 and its bacteriological properties are also described in this reference.
Un autre exemple de plasmide chimère dans lequel est incorporé le gène de structure de la désamidosécrétine, comme décrit plus 65 haut, est constitué par un pLS tel que le pLS58 qui peut être utilisé dans un mode de mise en œuvre préférentiel de l'invention pour la production de la désamidosécrétine. Un exemple caractéristique de la cellule-hôte que l'on peut transformer en utilisant le pLS58 est Another example of a chimeric plasmid in which the structural gene of desamidosecretin is incorporated, as described above, consists of a pLS such as pLS58 which can be used in a preferred embodiment of the invention for the production of desamidosecretin. A typical example of the host cell that can be transformed using pLS58 is
659 826 659,826
8 8
constitué par la souche d'E. coli XA35, appartenant au genre Escherichia coli, cette souche ayant été obtenue à partir de la souche connue, K12 d'Escherichia coli22 et ayant les propriétés indiquées ci-dessous, ses autres propriétés n'étant pas différentes de celles de la souche K.12: constituted by the strain of E. coli XA35, belonging to the genus Escherichia coli, this strain having been obtained from the known strain, K12 of Escherichia coli22 and having the properties indicated below, its other properties not being different from those of strain K. 12:
[Smr, Lac"" (i3~, z~)] [Smr, Lac "" (i3 ~, z ~)]
La transformation au moyen d'un plasmide chimère dans lequel est incorporé le gène de structure de la désamidosécrétine, selon l'invention, est possible dans le cas de toutes les souches d'i?, coli. Toutefois, afin d'obtenir la désamidosécrétine sous la forme d'une protéine fusionnée avec la ß-galactosidase, on utilise de préférence une souche dans laquelle le gène de la ß-galactosidase fait défaut, afin -d'éviter la présence de ß-galactosidase normale en mélange avec la protéine. De façon générale, la production de la protéine est réglée par le gène répresseur (gène i) d'opéron lactose. En conséquence, lorsque l'on utilise un genre d'E. coli sauvage, la production induite de la protéine fusionnée est possible au moyen d'un inducteur, par exemple l'IPTG (isopropyl thiogalactoside). Lorsque l'on utilise une souche présentant un gène de sensibilité aux températures élevées, on peut induire la production de la protéine fusionnée en élevant la température. Lorsque l'on utilise une souche dans laquelle la gène i fait défaut, on peut toujours produire la protéine fusionnée18. The transformation by means of a chimeric plasmid into which the structural gene of desamidosecretin, according to the invention, is incorporated, is possible in the case of all strains of i ?, coli. However, in order to obtain desamidosecretin in the form of a protein fused with ß-galactosidase, a strain is preferably used in which the gene for ß-galactosidase is lacking, in order to avoid the presence of ß- normal galactosidase mixed with protein. Generally, the production of the protein is regulated by the repressor gene (gene i) of the lactose operon. Consequently, when using a kind of E. wild coli, the induced production of the fused protein is possible by means of an inducer, for example IPTG (isopropyl thiogalactoside). When a strain with a gene for sensitivity to high temperatures is used, the production of the fused protein can be induced by raising the temperature. When you use a strain in which the i gene is lacking, you can still produce the fused protein18.
Conformément au mode préféré de mise en œuvre du procédé de production de désamidosécrétine selon l'invention, on utilise la souche XA35 d'E. coli qui est une souche dans laquelle les gènes de la ß-galactosidase et le gène i font défaut. In accordance with the preferred embodiment of the process for producing desamidosecretin according to the invention, the strain XA35 of E. is used. coli which is a strain in which the ß-galactosidase genes and the i gene are lacking.
Il est également à remarquer que la transformation avec le plasmide dans lequel est incorporé le gène de structure de la désamidosécrétine n'est pas limitée au cas où l'hôte est constitué par l'E. coli mais que l'on peut également choisir un hôte approprié dans une gamme plus étendue d'espèces bactériennes, en choisissant un vecteur approprié, comme il est bien connu dans le domaine de la biologie moléculaire. Un exemple caractéristique d'une telle cellule-hôte est décrit dans la demande de brevet publié N° 92696/1979, mentionnée plus haut. It should also be noted that the transformation with the plasmid into which the structural gene of desamidosecretin is incorporated is not limited to the case where the host is constituted by E. coli but that one can also choose an appropriate host in a wider range of bacterial species, by choosing an appropriate vector, as is well known in the field of molecular biology. A typical example of such a host cell is described in published patent application No. 92696/1979, mentioned above.
On peut effectuer l'opération de transformation elle-même selon les techniques usuelles bien connues dans le domaine de la biologie moléculaire. En ce qui concerne les détails au sujet du procédé utilisé, il y a lieu de se reporter aux exemples expérimentaux décrits ci-dessous. The transformation operation itself can be carried out according to the usual techniques well known in the field of molecular biology. With regard to the details about the process used, reference should be made to the experimental examples described below.
Un exemple caractéristique de cellules transformées est constitué par les cellules obtenues par transformation de la souche K12C600 par le plasmide chimère pMG. Dans la présente description, ces cellules transformées sont désignées par la dénomination K12C600 (pMG103). A typical example of transformed cells consists of the cells obtained by transformation of the strain K12C600 with the chimeric plasmid pMG. In the present description, these transformed cells are designated by the name K12C600 (pMG103).
Les propriétés génétiques des cellules transformées K12C600 (pMG103) sont les suivantes: The genetic properties of the transformed K12C600 (pMG103) cells are as follows:
[m-, r~, F-, lacY, Leu, Thr, tonA, supE, recBC] [m-, r ~, F-, lacY, Leu, Thr, tonA, supE, recBC]
Un autre exemple de cellules transformées est constitué par celles qui sont obtenues en transformant la souche XA35 d'E. coli, ces cellules transformées pouvant être utilisées dans le mode préférentiel de mise en œuvre du procédé de fabrication de désamidosécrétine selon l'invention, en utilisant le plasmide chimère pLS58. Ces cellules transformées sont désignées, dans la présente description, par le terme E. coli XA 35 (pLS 58). Another example of transformed cells consists of those obtained by transforming the XA35 strain of E. coli, these transformed cells can be used in the preferred mode of implementation of the process for the manufacture of desamidosecretin according to the invention, using the chimeric plasmid pLS58. These transformed cells are designated, in the present description, by the term E. coli XA 35 (pLS 58).
La souche XA35 (pLS58) d'E. coli transformée diffère de la souche XA35 d'E. coli en ce qui concerne les propriétés suivantes, comme cela a pu être mis en évidence dans les exemples expérimentaux décrits par la suite: The strain XA35 (pLS58) of E. transformed coli differs from strain XA35 of E. coli with regard to the following properties, as has been demonstrated in the experimental examples described below:
[Apr, Lac+] [Apr, Lac +]
On peut produire la désamidosécrétine en effectuant la culture, conformément à un procédé usuel, des bactéries transformées obtenues comme décrit ci-dessus. En ce qui concerne les détails au sujet de ce procédé, on peut se reporter aux exemples expérimentaux décrits par la suite. Deamidosecretin can be produced by culturing, according to a usual method, the transformed bacteria obtained as described above. With regard to the details about this process, reference can be made to the experimental examples described below.
Exemples expérimentaux Exemple 1: Experimental examples Example 1:
Elaboration de la structure du gène de désamidosécrétine Development of the structure of the desamidosecretin gene
On élabore la structure d'un gène ayant la séquence de bases constituée par la combinaison de blocs A, B et C, comme représenté dans le schéma annexé. Ces blocs comprennent respectivement les fragments indiqués ci-dessous: The structure of a gene having the base sequence constituted by the combination of blocks A, B and C is developed, as shown in the attached diagram. These blocks respectively include the fragments indicated below:
Bloc Block
A B C A B C
Fragment Fragment
S-l, S-4, S-6 S-5, S-7, - S-10, S-12 S-l 1, S-13 - S-16 S-l, S-4, S-6 S-5, S-7, - S-10, S-12 S-l 1, S-13 - S-16
15 Pour l'élaboration de la structure du gène, on procède comme décrit ci-dessous: 15 For the development of the gene structure, the procedure is as described below:
(1) Sélection des codons (1) Selection of codons
Les codons sont choisis comme représenté sur le schéma. The codons are chosen as shown in the diagram.
20 (2) On ajoute le codon ATG pour la méthionine à l'extrémité N de sorte que le polypeptide obtenu par synthèse sera coupé en ce site par le traitement chimique (+ CNBr). (2) The ATG codon for methionine is added to the N terminus so that the polypeptide obtained by synthesis will be cut at this site by chemical treatment (+ CNBr).
(3) On ajoute, à l'extrémité C, deux codons de terminaison de translation (TAG ou TGA) de sorte qu'il n'y a pas de production de (3) At the C end, two translation termination codons (TAG or TGA) are added so that there is no production of
25 peptides inutiles. 25 unnecessary peptides.
(4) Afin de permettre la synchronisation avec le cadre commençant avec le codon de départ du gène de lactamase, on ajoute, en amont de la méthionine, deux paires de bases convenablement choisies [en général, 2 + 3n (n = 0, 1, 2, 3,...)]. (4) In order to allow synchronization with the frame starting with the start codon of the lactamase gene, two suitably chosen base pairs are added upstream of the methionine [in general, 2 + 3n (n = 0, 1 , 2, 3, ...)].
30 (5) On ajoute aux deux extrémités des sites PstI. (5) PstI sites are added at both ends.
On peut également ajouter, immédiatement avant le site PstI, n'importe quel nombre voulu de paires de bases si cela est approprié lors de la synthèse de chacun des fragments. It is also possible to add, immediately before the PstI site, any desired number of base pairs if appropriate when synthesizing each of the fragments.
(6) Finalement, on ajoute, aux deux extrémités, deux paires de (6) Finally, two pairs of
35 bases choisies au hasard afin d'améliorer l'efficacité d'hydrolyse de l'enzyme de restriction PstI. 35 bases chosen at random to improve the hydrolysis efficiency of the restriction enzyme PstI.
Le gène désigné de la manière indiquée ci-dessus contient le site Hinfl et le site Hae II dans le gène de structure de la 27-désamidosé-crétine. The gene designated as indicated above contains the Hinfl site and the Hae II site in the structural gene for 27-deamidose-cretin.
40 40
Synthèse chimique du fragment Chemical synthesis of the fragment
1) Synthèse 1) Summary
On effectue la synthèse des fragments par la méthode en phase solide décrite dans la littérature63. Toutefois, on effectue l'isolation et la purification des fragments obtenus par synthèse en procédant selon le procédé amélioré décrit ci-dessous. The fragments are synthesized by the solid phase method described in the literature63. However, the fragments obtained by synthesis are isolated and purified by proceeding according to the improved method described below.
Les rendements de la synthèse des fragments respectifs sont indiqués dans le tableau ci-dessous: The yields of the synthesis of the respective fragments are indicated in the table below:
50 50
Longueur Length
de of
Rende Render
Fragment Fragment
Séquence des bases chaîne ment (%) Sequence of chain bases (%)
S-l S-l
ACCTGCAGCCATGCAC ACCTGCAGCCATGCAC
16 16
33 33
S-2 S-2
GCTGCAGGT GCTGCAGGT
9 9
52 52
S-3 S-3
TCAGATGGTACTT TCAGATGGTACTT
13 13
56 56
S-4 S-4
ATCTGAGTGCATG ATCTGAGTGCATG
13 13
42 42
S-5 S-5
TCACCTCAGAACTAT TCACCTCAGAACTAT
15 15
43 43
S-6 S-6
GAGGTGAAAGTACC GAGGTGAAAGTACC
14 14
47 47
S-7 S-7
CTCGTCTACGTGATT CTCGTCTACGTGATT
15 15
38 38
S-8 S-8
AGACGAGATAGTTCT AGACGAGATAGTTCT
15 15
27 27
S-9 S-9
CAGCACGCCTCCAGC CAGCACGCCTCCAGC
15 15
32 32
S-10 S-10
CGTGCTGAATCACGT CGTGCTGAATCACGT
15 15
43 43
S-ll S-ll
GCTTGCTGCAAGGT GCTTGCTGCAAGGT
14 14
22 22
S-12 S-12
AGCAAGCGCTGGAGG AGCAAGCGCTGGAGG
15 15
44 44
S-13 S-13
CTCGTTTGATAGG CTCGTTTGATAGG
13 13
47 47
S-14 S-14
AAACGAGACCTTGC AAACGAGACCTTGC
14 14
42 42
S-l 5 S-l 5
voir S-2 see S-2
S-16 S-16
ACCTGCAGCCCTATC ACCTGCAGCCCTATC
15 15
32 32
9 9
659 826 659,826
2) Purification 2) Purification
A 50 mg de résine ayant subi la synthèse en phase solide, on ajoute 0,5 M de tétraméthylguanidine d'aldoxime a-picolinique et 100 à 200 |il d'un mélange (1:1) de dioxanne et d'eau14 et on laisse reposer le mélange à la température ambiante pendant quelques heures. Ensuite, on ajoute au mélange 2 ml d'une solution concentrée aqueuse d'ammoniaque et on laisse reposer l'ensemble à 55° C, pendant une nuit, dans un récipient fermé hermétiquement au moyen d'un bouchon. On filtre le mélange résultant de manière à séparer la résine et on concentre le filtrat que l'on soumet ensuite à une filtration à travers un gel. On effectue l'élution au moyen de 50 mM de tampon TEAB (pH 7,5) et l'on recueille les fractions éluées dans le volume vide. On concentre ces fractions et on les introduit en «HPLC» d'une colonne en phase inversée C-18 (Waters: «Radial Pack A», diamètre 8 cm x 10 cm) de manière à effectuer l'élution dans un tampon de diacétate d'éthylène-amine 0,01 M (pH 7,8) avec un gradient de concentration d'acétonitrile de 10 à 32% avec un débit de 2 ml/min pendant 16 min. On recueille les fractions éluées pendant 11 à 12 min. Au cours de cette opération, des oligo-nucléotides ne présentant pas de groupe trityle sont élués sous la forme d'un pic d'injection. On concentre la fraction éluée, et après y avoir ajouté 1 ml d'acide acétique à 80%, on la laisse reposer à la température ambiante pendant 15 min. On élimine, par extraction, le tritanol, on concentre la couche aqueuse et on l'applique à nouveau sur la colonne en phase inversée. On effectue l'élution, dans les mêmes conditions que précédemment, avec un gradient de concentration d'acétonitrile de 0 à 20% et on recueille les fractions éluées pendant 12 à 13 min. To 50 mg of resin having undergone the synthesis in solid phase, 0.5 M of tetramethylguanidine of aldoxime α-picolinic and 100 to 200 μl of a mixture (1: 1) of dioxane and water are added, and let the mixture sit at room temperature for a few hours. Then, 2 ml of a concentrated aqueous ammonia solution are added to the mixture and the whole is left to stand at 55 ° C., overnight, in a hermetically sealed container with a stopper. The resulting mixture is filtered so as to separate the resin and the filtrate is concentrated, which is then subjected to filtration through a gel. The elution is carried out using 50 mM of TEAB buffer (pH 7.5) and the fractions eluted are collected in the empty volume. These fractions are concentrated and introduced into “HPLC” from a column in reverse phase C-18 (Waters: “Radial Pack A”, diameter 8 cm × 10 cm) so as to elute in a diacetate buffer. 0.01 M ethylene amine (pH 7.8) with a concentration gradient of acetonitrile from 10 to 32% with a flow rate of 2 ml / min for 16 min. The eluted fractions are collected for 11 to 12 min. During this operation, oligo-nucleotides without a trityl group are eluted in the form of an injection peak. The eluted fraction is concentrated, and after adding 1 ml of 80% acetic acid thereto, it is left to stand at room temperature for 15 min. Tritanol is removed by extraction, the aqueous layer is concentrated and it is applied again to the column in reverse phase. The elution is carried out, under the same conditions as above, with a concentration gradient of acetonitrile from 0 to 20% and the fractions eluted are collected for 12 to 13 min.
Phosphorylation Phosphorylation
On dissout chaque fragment (30 g) dans un tampon à 30 mM de Tris-HCl (pH 7,5) et on ajoute à la solution 60 Ci (19,8 pmol) Each fragment (30 g) is dissolved in a 30 mM buffer of Tris-HCl (pH 7.5) and added to the solution 60 Ci (19.8 pmol)
d'ATP [y32P] et 2 (il (9 unités) de polynucléotide kinase T4, de manière à porter la quantité totale à 50 |il, et l'on fait suivre cette opération par une incubation à 37° C pendant 20 min. On ajoute ensuite au mélange 10 équivalents, par rapport aux fragments, of ATP [y32P] and 2 (il (9 units) of polynucleotide kinase T4, so as to bring the total amount to 50 μl, and this operation is followed by an incubation at 37 ° C. for 20 min. 10 equivalents are then added to the mixture, relative to the fragments,
d'ATP et de polynucléotide kinase T4 (9 unités) et l'on fait suivre cette opération par une incubation à 37° C pendant 20 min. On arrête la réaction par chauffage à 100° C pendant 2 min et l'on purifie le produit par filtration sur gel. Chaque fragment est confirmé par une électrophorèse sur gel à 20%. ATP and T4 polynucleotide kinase (9 units) and this operation is followed by incubation at 37 ° C for 20 min. The reaction is stopped by heating at 100 ° C for 2 min and the product is purified by gel filtration. Each fragment is confirmed by 20% gel electrophoresis.
Ligature des fragments Ligation of fragments
On dissout chacun des 0,05A26O des fragments S-l, S-2, S-3, S-4 et S-6 dans un tampon (Tris-HCl 20mM, pH 7,5 MgCl2 lOmM, DTT lOmM [dithiothréitol, ATP (adénosine triphosphate) 0,2mM]) de manière à constituer une solution en quantité totale de 30 jj.1. On ajoute à la solution 1 (xl (150 unités) d'ADN ligase T4 et on laisse reposer le mélange à 10° C pendant une nuit. On confirme la réaction par électrophorèse sur gel de Polyacrylamide à 8%. On effectue de manière similaire la synthèse des blocs B et C. Each of the 0.05A26O fragments S1, S-2, S-3, S-4 and S-6 is dissolved in a buffer (20 mM Tris-HCl, pH 7.5 MgCl2 10 mM, 10 mM DTT [dithiothreitol, ATP (adenosine) triphosphate) 0.2mM]) so as to constitute a solution in a total quantity of 30 dj. 1. To the solution 1 (xl (150 units) of T4 DNA ligase is added and the mixture is left to stand at 10 ° C. overnight. The reaction is confirmed by electrophoresis on 8% polyacrylamide gel. synthesis of blocks B and C.
On mélange ensemble les mélange réactionnels des blocs A et B et, après addition de 3 ni d'ATP à 0,2mM et 1 (xl (150 unités) The reaction mixtures of blocks A and B are mixed together and, after addition of 3 µl of 0.2 mM ATP and 1 (xl (150 units)
d'ADN ligase T4, on laisse reposer le mélange à Î0°C pendant une nuit. Après confirmation de la réaction par électrophorèse sur gel de Polyacrylamide à 8%, on ajoute le mélange réactionnel du bloc C et on laisse la réaction s'effectuer, de manière similaire, pendant une nuit. L'avancement de la réaction est confirmé par électrophorèse sur gel de Polyacrylamide à 5%. of T4 DNA ligase, the mixture is allowed to stand at 10 ° C overnight. After confirmation of the reaction by electrophoresis on 8% polyacrylamide gel, the reaction mixture of block C is added and the reaction is allowed to proceed in a similar manner overnight. The progress of the reaction is confirmed by electrophoresis on 5% polyacrylamide gel.
On chauffe le mélange réactionnel à 68° C pendant 15 min, puis on le refroidit à la température ambiante. On ajoute ensuite 15 (4.1 de NaCl 0,5M et 80 unités de l'enzyme de restriction Pst I, puis on laisse le mélange reposer à 37° C pendant une nuit. On arrête la réaction par chauffage à 90° C pendant 1 min et on soumet le mélange réactionnel à une séparation par électrophorèse sur gel de Polyacrylamide à 5%. On découpe la bande ayant la plus grande longueur de chaîne et on la transfère sur une électrophorèse par un gel agarose à bas point de fusion à 1% afin d'effectuer l'extraction de la bande obtenue. The reaction mixture is heated to 68 ° C for 15 min, then cooled to room temperature. 15 (4.1 of 0.5 M NaCl and 80 units of the restriction enzyme Pst I are then added, then the mixture is left to stand at 37 ° C. overnight. The reaction is stopped by heating at 90 ° C. for 1 min. and the reaction mixture is subjected to separation by electrophoresis on 5% polyacrylamide gel. The strip having the longest chain length is cut and transferred to electrophoresis by a 1% low melting agarose gel in order to perform the extraction of the strip obtained.
Clonage Cloning
On ajoute le plasmide pBR322 (4 g) à un mélange (quantité totale: 50 (il) de tampon Tris-HCl lOOmM, MgCl2 5mM et NaCl 50mM et on effectue la réaction en utilisant 6 unités de l'enzyme de restriction Pst I, à 37° C pendant 2 heures. Après quoi on arrête la réaction par chauffage à 68°C, pendant 15 min. On ajoute le gène synthétique indiqué ci-dessus au mélange réactionnel et l'on effectue la réaction de ligature en procédant de manière similaire en utilisant de l'ADN ligase T4. Plasmid pBR322 (4 g) is added to a mixture (total amount: 50 (ll) of 100 mM Tris-HCl buffer, 5 mM MgCl2 and 50 mM NaCl and the reaction is carried out using 6 units of the restriction enzyme Pst I, at 37 ° C. for 2 hours, after which the reaction is stopped by heating at 68 ° C., for 15 min. The synthetic gene indicated above is added to the reaction mixture and the ligation reaction is carried out by carrying out the procedure similar using T4 DNA ligase.
On effectue la transformation de la souche d'E. coli K12C600, en procédant selon la méthode de Kuschner10, dans un dispositif d'enceinte du type P-3" en utilisant 50 (il du mélange réactionnel obtenu qui constitue l'équivalent de 0,68 ng d'ADN de pBR322. The E. strain is transformed. coli K12C600, proceeding according to the Kuschner10 method, in a P-3 "type enclosure device using 50 μl of the reaction mixture obtained which constitutes the equivalent of 0.68 ng of pBR322 DNA.
On choisit la souche transformée sur une plaque du type L (1 % Bactotripton, 0,5% extrait de Bactolevure, 0,5% NaCl, 1,5% Bac-toagar) contenant 10 (ig/ml de tétracycline (Te) et l'on étudie 50 souches, parmi les souches transformées obtenues, afin de déterminer leur résistance à l'ampicilline (Ap), et l'on isole 45 souches transformées ayant les propriétés Tc'/Ap*. A titre de référence, on désigne ces dernières souches par la dénomination C600 (pMG 101) -C600 (pMG 145). The strain transformed is chosen on a type L plate (1% Bactotripton, 0.5% Bactolevure extract, 0.5% NaCl, 1.5% Bac-toagar) containing 10 (ig / ml of tetracycline (Te) and 50 strains are studied, among the transformed strains obtained, in order to determine their resistance to ampicillin (Ap), and 45 transformed strains are isolated having the Tc '/ Ap * properties. the latter strains by the name C600 (pMG 101) -C600 (pMG 145).
Parmi les souches transformées ayant les propriétés Tcr/Aps, on choisit au hasard 8 souches [C600 (pMG 101) - C600 (pMG 108)] et l'on isole l'ADN du plasmide par sédimentation à l'équilibre à travers un gradient de densité de chlorure de césium contenant du bromure d'éthidium. A titre de référence, on désigne l'ADB du plasmide ainsi isolé par la dénomination pMG 101 - pMG 108. Among the transformed strains having the Tcr / Aps properties, 8 strains are randomly chosen [C600 (pMG 101) - C600 (pMG 108)] and the plasmid DNA is isolated by equilibrium sedimentation through a gradient density of cesium chloride containing ethidium bromide. By way of reference, the ADB of the plasmid thus isolated is designated by the name pMG 101 - pMG 108.
Confirmation de la direction Management confirmation
On dissout le plasmide (5 g) dans un mélange (30 (il) de tampons Tris-HCl lOmM, MgCl2 66mM, P-mercaptoéthanol 6mM et NaCl 60mM et l'on ajoute à la solution 30 unités de l'enzyme de restriction Hae III, cette opération étant suivie par un chauffage à 37; C pendant 1 heure. On extrait des fragments de 375 bp par électrophorèse sur gel d'agarose à bas point de fusion à 1,5%. On soumet à une hydrolyse, de manière similaire, les fragments ainsi extraits, en utilisant 18 unités de l'enzyme de restriction Hae II et l'on identifie le produit hydrolysé à 191 bp et 176 bp, comme déterminé par électrophorèse sur gel de Polyacrylamide à 5%, comme plasmide ayant la direction correcte. The plasmid (5 g) is dissolved in a mixture (30 (il) of 10 mM Tris-HCl buffers, 66 mM MgCl2, 6 mM P-mercaptoethanol and 60 mM NaCl and 30 units of the restriction enzyme Hae are added to the solution. III, this operation being followed by heating at 37 ° C. for 1 hour. Fragments of 375 bp are extracted by electrophoresis on agarose gel with low melting point at 1.5%. similar, the fragments thus extracted, using 18 units of the restriction enzyme Hae II and the hydrolyzed product is identified at 191 bp and 176 bp, as determined by electrophoresis on 5% polyacrylamide gel, as plasmid having the correct direction.
Identification de la protéine fusionnée au moyen de minicellules Identification of the fused protein using minicells
On transforme, au moyen des plasmides pMG 103 et pBR 322, selon la méthode de Kuschner10, un E. coli produisant des minicellules (F~, Thr+, ara+, Leu+, azis, tonA\ minA, minB, gal+, X', sfr'. malA, xyl, mtl, thi, sup~) de façon à obtenir un produit de transformation ayant les propriétés Tcr/Aps. We transform, by means of the plasmids pMG 103 and pBR 322, according to the method of Kuschner10, an E. coli producing minicells (F ~, Thr +, ara +, Leu +, azis, tonA \ minA, minB, gal +, X ', sfr '. malA, xyl, mtl, thi, sup ~) so as to obtain a transformation product having the Tcr / Aps properties.
On effectue une préculture du produit de transformation dans 20 ml de milieu de culture minimum de Davis contenant 0,5% de casamino acide, thymine (20 ng/ml), thiamine (2 ng/ml) et tétracycline (10 ng/ml) à 37" C pendant 16 heures et, après inoculation de 10 ml de la préculture dans 50 ml du même milieu (mais ne contenant pas de tétracycline), on effectue la culture jusqu'à ODS!0 = 0,6-0,8. On soumet le bouillon de culture à une centrifugation, au moyen d'une centrifugeuse refroidie de marque HITACHI (modèle RPR-9, à 3000 tours par min) pendant 12 min, afin de séparer les cellules-hôtes et, ensuite, à une centrifugation à 8500 tours/min pendant 25 min, de façon à obtenir des granules de minicellules. On lave les granules de minicellules en les suspendant dans 25 ml de tampon To (IM Tris-HCl pH 7,3, 150 mg MgS04, 7H,0, 1 ml gélatine à 1%, CaCl2 IM 0,25 ml/l-H20). On soumet la suspension à une centrifugation à 10000 tours/min (dans un rotor du type RPR-20), pendant 15 min, et l'on suspend, dans 1 ml de tampon Tl, le précipité de minicellules résultant. On soumet la suspension ainsi obtenue à une centrifugation dans un gradient de densité par paliers de 10% - 15% - 20% (à 4000 tours/min, dans un rotor du type RPRS-4, pendant 25 min) de manière à récupérer les minicellules. On suspend ensuite la suspension de minicellules dans 20 ml de tampons Tl et l'on répète les opérations similaires. A preculture of the transformation product is carried out in 20 ml of minimum Davis culture medium containing 0.5% of casamino acid, thymine (20 ng / ml), thiamine (2 ng / ml) and tetracycline (10 ng / ml) at 37 "C for 16 hours and, after inoculation of 10 ml of the preculture in 50 ml of the same medium (but not containing tetracycline), the culture is carried out until ODS! 0 = 0.6-0.8 The culture broth is subjected to centrifugation, using a cooled HITACHI brand centrifuge (model RPR-9, at 3000 revolutions per min) for 12 min, in order to separate the host cells and, then, to a centrifugation at 8500 rpm for 25 min, so as to obtain granules of minicells. The granules of minicells are washed by suspending them in 25 ml of buffer To (IM Tris-HCl pH 7.3, 150 mg MgSO 4, 7H, 0.1 ml 1% gelatin, CaCl2 IM 0.25 ml / l-H2O) The suspension is subjected to centrifugation at 10,000 rpm (in an RPR-20 type rotor) for 15 min, and l 'we suspend d, in 1 ml of buffer T1, the precipitate of minicells resulting. The suspension thus obtained is subjected to centrifugation in a density gradient in steps of 10% - 15% - 20% (at 4000 rpm, in an RPRS-4 type rotor, for 25 min) so as to recover the minicells. The suspension of minicells is then suspended in 20 ml of T1 buffers and the similar operations are repeated.
5 5
10 10
15 15
20 20
25 25
30 30
35 35
40 40
45 45
50 50
55 55
60 60
65 65
659 826 659,826
10 10
On suspend les minicellules dans 1 ml de milieu de culture minimum de Davis, contenant chacun des 18 acides aminés suivants (alanine, valine, isoleucine, proline, phénylalanine, tryptophane, glycine, sêrine, thréonine, cystine, tyrosine, asparagine, acide aspar-tique, glutamine, acide glutamique, lysine, arginine, histidine) en concentration finale de 50 ng/ml pour chacun de ces acides, 20 p.g/ml de thymine et 2 ng/ml de thiamine et l'on chauffe sous agitation à 37°C pendant 12 min. On chauffe encore le mélange pendant 10 min après adjonction à la suspension de 20 Ci(S35)-méthionine (NEN (New England Nuclear): 1260,1 Ci/mmol) et 5 nCi(H3)-leucine (NEN: 115,2 Ci/mmol). Immédiatement après, on ajoute au mélange le même tampon contenant 50mM NaN3, 100 ng/ml de méthionine et 100 ng/ml de leucine. On effectue ensuite une centrifugation à 3000 tours/min, pendant 20 min, de façon à récupérer les minicellules que l'on suspend à leur tour dans 20 ni d'un échantillon de tampon [H20 6 ml, 1,25M Tris-HCl (pH 6,8) 1 ml, 0,4 g SDS (do-décylsulfate de sodium), 2 ml glycérol, 1 ml 2-mercaptoéthanol, 4 mg BPB (bleu de bromophénol)] et chauffe à 100°C pendant 3 min. On soumet ensuite 18 ni de cette suspension à une séparation par électrophorèse sur SDS-poly-acrylamide. The minicells are suspended in 1 ml of Davis minimum culture medium, each containing the following 18 amino acids (alanine, valine, isoleucine, proline, phenylalanine, tryptophan, glycine, serine, threonine, cystine, tyrosine, asparagine, asparagine tick, glutamine, glutamic acid, lysine, arginine, histidine) in final concentration of 50 ng / ml for each of these acids, 20 pg / ml of thymine and 2 ng / ml of thiamine and heated with stirring to 37 ° C for 12 min. The mixture is further heated for 10 min after addition to the suspension of 20 Ci (S35) -methionine (NEN (New England Nuclear): 1260.1 Ci / mmol) and 5 nCi (H3) -leucine (NEN: 115.2 Ci / mmol). Immediately after, the same buffer is added to the mixture containing 50mM NaN3, 100 ng / ml of methionine and 100 ng / ml of leucine. A centrifugation is then carried out at 3000 revolutions / min, for 20 min, so as to recover the mini-cells which are in turn suspended in 20 μl of a buffer sample [H20 6 ml, 1.25M Tris-HCl ( pH 6.8) 1 ml, 0.4 g SDS (sodium do-decylsulfate), 2 ml glycerol, 1 ml 2-mercaptoethanol, 4 mg BPB (bromophenol blue)] and heated to 100 ° C for 3 min. 18 μl of this suspension are then subjected to separation by electrophoresis on SDS-poly-acrylamide.
Dans les cellules d'E. coli K12C600 (pBR322) (FERM-P 6017), on a synthétisé la ß-lactamase et une bande correspondant à un poids moléculaire d'environ 29 kilodaltons apparaît sur le gel d'élec-trophorèse, mais on ne détecte pas la présence d'une telle protéine d'environ 29 kilodaltons dans les extraits de cellules d'E. coli K12C600 (pMG 103). Au lieu de cette protéine, il apparaît un polypeptide d'environ 24 kilodaltons sous la forme d'une nouvelle bande. Il s'agit clairement du gène produit par codage par le pMG 103 en relation avec la disparition de la bande de la ß-lactamase. Le pMG 103 a une structure dans laquelle une partie du gène ß-lactamase du pBR322 (codant 182 acides aminés à partir de l'extrémité amino du peptide de signal de la protéine de structure de la ß-lacta-mase) est ligaturé en aval de ce dernier (pour la transcription) au gène de la 27-désamidosécrétine (codant 27 acides aminés), et son gène résultant peut être détecté en tant que protéine fusionnée du fragment de ß-lactamase (182 acides aminés) - 27-désamidosécrétine (27 acides aminés). La valeur calculée pour le poids moléculaire du produit fusionné est de 23,4 kilodaltons et l'on peut donc considérer que la nouvelle bande qui apparaît dans les extraits d'il, coli K12C600 (pMG 103) correspond à cette protéine fusionnée. In the cells of E. coli K12C600 (pBR322) (FERM-P 6017), ß-lactamase was synthesized and a band corresponding to a molecular weight of approximately 29 kilodaltons appears on the elec-trophoresis gel, but the presence of d is not detected such a protein of about 29 kilodaltons in extracts of E. cells. coli K12C600 (pMG 103). Instead of this protein, a polypeptide of about 24 kilodaltons appears in the form of a new band. It is clearly the gene produced by coding by pMG 103 in relation to the disappearance of the β-lactamase band. PMG 103 has a structure in which part of the pBR322 ß-lactamase gene (encoding 182 amino acids from the amino terminus of the signal protein of the ß-lacta-mase structural protein) is ligated downstream of the latter (for transcription) to the 27-deamidosecretin gene (encoding 27 amino acids), and its resulting gene can be detected as a fused protein of the ß-lactamase fragment (182 amino acids) - 27-deamidosecretin ( 27 amino acids). The value calculated for the molecular weight of the fused product is 23.4 kilodaltons and it can therefore be considered that the new band which appears in the extracts of it, coli K12C600 (pMG 103) corresponds to this fused protein.
Purification de la protéine Protein purification
On soumet Y E. coli K12C600 (pMG 103) à une culture sous agitation dans 3 litres de bouillon de culture de Luria à 37° C et on centrifuge lorsque la concentration en micro-organismes atteint environ 1 x 109 cellules/ml. On lave les agglomérats résultants au moyen de tampon Tris-HCl lOmM (pH 8,0)/fluorure de phénylméthylsulfonyle ImM et on effectue une nouvelle centrifugation. On remet les agglomérats en suspension dans le même tampon. On traite la suspension au moyen d'EDTA en concentration finale de lOmM, à 0°C pendant 5 min, puis on la traite au moyen de lysozyme de blanc d'oeuf, de concentration finale 0,1 mg/ml, à 0°C pendant 30 min, de manière à effectuer la formation-lyse du sphéroplaste. On traite le produit résultant au moyen d'un dispositif générateur d'ultrasons, de marque Kubota, modèle «Insonator 200 M», à la puissance maximale (200 W) pendant 10 min, de manière à détruire complètement les cellules bactériennes. Cette opération est suivie par une séparation par centrifugation (en utilisant une centrifugeuse refroidie de marque HITACHI, modèle 20 PR52, avec un rotor RPR 20-2, à 18 000 tours/ min pendant 30 min, à 0°C) de manière à éliminer les débris de cellules. On ajoute à la partie surnageante obtenue (110 ml) du chlorure de magnésium en concentration finale de 50mM, puis on soumet le mélange à une centrifugation (au moyen du rotor indiqué ci-dessus, à 8000 tours/min, pendant 10 min, à 0°C). A la partie surnageante, on ajoute 400 ng de DNase I et 5 mg de RNase I de façon à effectuer un traitement à 4° C pendant 1 heure, après quoi on sépare les protéines et les peptides par salification au moyen d'une solution saturée à 80% de sulfate d'ammonium. On dissout, dans un tampon Tris-HCl lOmM (pH 8,0), le précipité obtenu par centrifugation (en utilisant un rotor RPR 20-2, à 8000 tours/min, pendant 10 min, à 0C'C), puis on dessale au moyen du même tampon et on centrifuge dans les conditions indiquées ci-dessus. On ajoute ensuite 5 à la partie surnageante de l'acétone en concentration finale de 75% et on traite, pendant une nuit, le précipité formé, par 1,0 g de bromure de cyanogène dans 20 ml d'acide formique à 80%. Après évaporation, on extrait le résidu par 40 ml d'isopropanol, puis au moyen d'un volume égal de méthanol. On effectue ensuite une nou-îo velie évaporation et on dissout le résidu dans de l'acide acétique 0,1N. Après élimination par centrifugation des parties insolubles (3000-4000 G, pendant 5 min), on effectue une filtration sur gel à travers une colonne de «Sephadex G-25» (produite par la société Pharmacia CO.) et on recueille les fractions ayant des poids molécu-15 laires de 1000 à 10000, puis on les lyophilise. The E. coli K12C600 (pMG 103) is subjected to a culture with stirring in 3 liters of Luria culture broth at 37 ° C. and centrifuged when the concentration of microorganisms reaches approximately 1 × 10 9 cells / ml. The resulting agglomerates are washed with 10 mM Tris-HCl buffer (pH 8.0) / phenylmethylsulfonyl fluoride ImM and centrifugation is carried out again. The agglomerates are resuspended in the same buffer. The suspension is treated with EDTA in a final concentration of 10 mM, at 0 ° C for 5 min, then it is treated with lysozyme of egg white, with a final concentration of 0.1 mg / ml, at 0 ° C for 30 min, so as to perform the lysis formation of the spheroplast. The resulting product is treated by means of an ultrasound generator device, of the Kubota brand, “Insonator 200 M” model, at maximum power (200 W) for 10 min, so as to completely destroy the bacterial cells. This operation is followed by separation by centrifugation (using a cooled HITACHI brand centrifuge, model 20 PR52, with an RPR 20-2 rotor, at 18,000 rpm for 30 min, at 0 ° C) so as to eliminate cell debris. To the supernatant obtained (110 ml) is added magnesium chloride in a final concentration of 50 mM, then the mixture is subjected to centrifugation (by means of the rotor indicated above, at 8000 rpm, for 10 min, at 0 ° C). To the supernatant, 400 ng of DNase I and 5 mg of RNase I are added so as to carry out a treatment at 4 ° C. for 1 hour, after which the proteins and the peptides are separated by salification using a saturated solution. 80% ammonium sulfate. The precipitate obtained by centrifugation (using an RPR 20-2 rotor, at 8000 rpm, for 10 min, at 0 ° C.) is dissolved in 10 mM Tris-HCl buffer (pH 8.0). desalt using the same buffer and centrifuged under the conditions indicated above. Then added to the supernatant acetone at a final concentration of 75% and the precipitate formed is treated overnight with 1.0 g of cyanogen bromide in 20 ml of 80% formic acid. After evaporation, the residue is extracted with 40 ml of isopropanol, then with an equal volume of methanol. A further evaporation is then carried out and the residue is dissolved in 0.1N acetic acid. After elimination by centrifugation of the insoluble parts (3000-4000 G, for 5 min), gel filtration is carried out through a column of “Sephadex G-25” (produced by the company Pharmacia CO.) And the fractions having molecular weights from 1000 to 10,000, and then lyophilized.
Dosage biologique Biological assay
On dose les échantillons lyophilisés ainsi obtenus par un procédé de dosage biologique12 dans lequel on dissout l'échantillon lyopilisé 20 dans un volume total de 2 ml d'une solution de chlorure de sodium isotonique, on injecte par voie intraveineuse dans l'aine des parties aliquotes respectives de 0,25 ml à 5 rats, on mesure les quantités de suc pancréatique sécrété à travers un tube pancréatique artificiel, à des intervalles de 10 min, et l'on détermine l'augmentation de quan-25 tité de la sécrétion en tant qu'activité biologique de la sécrétine. Comme sécrétine de référence, on injecte auparavant, par voie intraveineuse, au même rat, du Secrepan (Eisài, Japon) en quantités de 0,25 U/kg et 0,50 U/kg et l'on mesure les quantités de suc pancréatique sécrété, afin de déterminer la correspondance avec les unités 30 Eisai (qui sont pratiquement égales à l'unité de Crick Harper Râper). On constate que les échantillons obtenus à patir d'E. coli K12C600 (pMG 103) provoquent une augmentation de la sécrétion du suc pancréatique de 202% ± 76 (moyenne + déviation standard), 10 min après injection, et de 180% + 87,6 20 min après l'in-35 jection. D'autre part, le Secrepan provoque une augmentation de 162% + 28 et 206% + 58, respectivement après 10 min et 20 min dans le cas d'une injection de 0,25 U/kg et de 159,8% ± 83,7 et 250,8% + 216,5, respectivement 10 min et 20 min après injection d'une dose de 0,5 U/kg. Ces valeurs, qui constituent le résultat d'un 40 essai du type t, révèlent une différence notable pour p < 0,05. D'autre part, lorsque l'échantillon obtenu en partant des extraits des cellules bactériennes obtenus à partir du clone ne contenant que le pBR322 et ne contenant pas de gène de la désamidosécrétine a été soumis à l'essai par le même procédé, on n'observe pas d'augmenta-45 tion de la quantité du suc pancréatique sécrété. Cela indique qu'une substance ayant une activité biologique similaire à celle de la sécrétine est poduite par les cellules d'E. coli K12C600 (pMG 103) alors qu'une telle substance n'est pas produite dans les cellules d'E. coli K12C600 (pBR 322). En reportant l'augmentation de la quantité de 50 suc pancréatique sécrété par les échantillons obtenus à partir d'E. coli K12C600 (pMG 103) sur une droite obtenue en reportant les points sur un graphique en échelle semi-logarithmique, l'augmentation de la quantité de suc pancréatique sécrété étant portée en ordonnées et les unités Secrepan en abscisses (échelle logarithmique), 55 on peut déterminer l'unité sécrétine par la méthode d'extrapolation (à condition d'obtenir une relation linéaire), la valeur ainsi obtenue étant de 0,17 à 0,24 unité Eisai (correspondant à 0,17 à 0,24 unité Crick Harper Raper)/0,25 ml/kg de rats. Lorsque l'on effectue le calcul en tenant compte des poids corporels des rats utilisés, cette 60 valeur est étalonnée de 0,051 à 0,072 U/0,25 ml/rat, l'activité totale s'élevant à 0,408 à 0,576 U pour la quantité totale de 2 ml. Du fait que l'on sait13 que la sécrétine purifiée ayant le plus grand degré de pureté à une activité spécifique de 16 000 unités CHR/mg, les valeurs de 0,408 à 0,576 U correspondent à une quantité de 25,5 à 36 ng de 65 sécrétine. Cela correspond à 7,15 à 10,1 pmol molécules de sécrétine, ce qui indique que l'on a effectué la synthèse biologique d'une désamidosécrétine ayant une activité correspondant à 4,3 à 6,1 x 1012 molécules de sécrétine. Du fait que la désamidosécrétine est préparée The lyophilized samples thus obtained are assayed by a biological assay method12 in which the lyopilised sample 20 is dissolved in a total volume of 2 ml of an isotonic sodium chloride solution, and is injected intravenously into the groin of the parts. respective 0.25 ml aliquots to 5 rats, the quantities of pancreatic juice secreted are measured through an artificial pancreatic tube, at intervals of 10 min, and the increase in quantity of secretion is determined by as the biological activity of secretin. As a reference secretin, Secrepan (Eisài, Japan) is injected intravenously, in the same rat, in quantities of 0.25 U / kg and 0.50 U / kg and the quantities of pancreatic juice are measured. secreted, to determine the correspondence with the 30 Eisai units (which are practically equal to the unit of Crick Harper Rasp). It can be seen that the samples obtained from E. coli K12C600 (pMG 103) cause an increase in the secretion of pancreatic juice of 202% ± 76 (mean + standard deviation), 10 min after injection, and 180% + 87.6 20 min after injection. On the other hand, Secrepan causes an increase of 162% + 28 and 206% + 58, respectively after 10 min and 20 min in the case of an injection of 0.25 U / kg and 159.8% ± 83 , 7 and 250.8% + 216.5, respectively 10 min and 20 min after injection of a dose of 0.5 U / kg. These values, which are the result of a t-type test, reveal a significant difference for p <0.05. On the other hand, when the sample obtained from extracts of the bacterial cells obtained from the clone containing only pBR322 and not containing the deamidosecretin gene was subjected to the test by the same method, there is n there is no increase in the amount of secreted pancreatic juice. This indicates that a substance with a biological activity similar to that of secretin is produced by E. cells. coli K12C600 (pMG 103) when such a substance is not produced in the cells of E. coli K12C600 (pBR 322). By postponing the increase in the amount of 50 pancreatic juice secreted by the samples obtained from E. coli K12C600 (pMG 103) on a line obtained by plotting the points on a semi-logarithmic scale graph, the increase in the quantity of secreted pancreatic juice being plotted on the ordinate and the Secrepan units on the x-axis (logarithmic scale), 55 on can determine the secretin unit by the extrapolation method (provided a linear relationship is obtained), the value thus obtained being from 0.17 to 0.24 Eisai unit (corresponding to 0.17 to 0.24 Crick unit Harper Raper) / 0.25 ml / kg of rats. When the calculation is made taking into account the body weights of the rats used, this value is calibrated from 0.051 to 0.072 U / 0.25 ml / rat, the total activity amounting to 0.408 to 0.576 U for the quantity 2 ml total. Since it is known13 that the purified secretin having the highest degree of purity at a specific activity of 16,000 CHR / mg units, the values of 0.408 to 0.576 U correspond to an amount of 25.5 to 36 ng of 65 secretin. This corresponds to 7.15 to 10.1 pmol molecules of secretin, which indicates that the biological synthesis of a desamidosecretin having an activity corresponding to 4.3 to 6.1 × 1012 molecules of secretin has been carried out. The fact that desamidosecretin is prepared
11 11
659 826 659,826
en utilisant environ 3 x 1012 cellules d'i?, coli K12C600 (pMG 103) comme produit de départ, on récupère au moins 1,4 à 2,0 équivalent moléculaire de sécrétine par cellule de bactérie. using about 3 x 1012 i ™ cells, coli K12C600 (pMG 103) as the starting material, at least 1.4 to 2.0 molecular equivalents of secretin are recovered per bacteria cell.
Dosage radio-immunologique Radioimmunoassay
On dilue l'échantillon dans un mélange de tampon Tris-HCl 50mM (pH 8,0) et albumine de sérum bovin à 0,1%. On effectue le dosage radio-immunologique de l'échantillon dilué en utilisant un ensemble de dosage «Secretin kit Daiichi» produit par la société japonaise Daiichi Radioisotope Research Institute, en suivant le procédé indiqué, de manière à confirmer l'activité de l'échantillon. The sample is diluted in a mixture of 50 mM Tris-HCl buffer (pH 8.0) and 0.1% bovine serum albumin. The radio-immunoassay of the diluted sample is carried out using a “Secretin kit Daiichi” assay set produced by the Japanese company Daiichi Radioisotope Research Institute, following the procedure indicated, so as to confirm the activity of the sample. .
Exemple 2: Example 2:
On effectue les opérations de ligature entre les fragments en procédant de manière similaire à celle qui est décrite dans l'exemple 1. Ligation operations are carried out between the fragments, proceeding in a similar manner to that described in example 1.
Préparation de l'ADN du XplacS et de l'ADN du pBR322 Preparation of XplacS DNA and pBR322 DNA
L'ADN du A,plac5 est obtenu à partir de bactéries lysogéniques E. Coli PK 1512 (IFO 14149), le mode de préparation suivi correspondant à la méthode d'Oshima20. The DNA of A, plac5 is obtained from lysogenic bacteria E. Coli PK 1512 (IFO 14149), the preparation method followed corresponding to the method of Oshima20.
L'ADN du pBR322 est obtenu à partir d'i?. Coli K-12 C600 (pBR322) (FERM-P 6017) en procédant conformément à la méthode de M. Kahn et al.21. PBR322 DNA is obtained from i ?. Coli K-12 C600 (pBR322) (FERM-P 6017) using the method of M. Kahn et al. 21.
Préparation du pREl Preparation of the pREl
On ajoute 10 Xg d'ADN de A,plac5 à un mélange (en quantité totale égale à 20 jj.1) de tampon Tris-HCl lOOmM, pH 7,5, MgCl2 7mM et NaCl 50mM, et on effectue la réaction en utilisant 10 unités de l'enzyme de restriction .EcoRI et 10 unités de l'enzyme de restriction Hindlll à 37° C, pendant 2 heures. On purifie ensuite, par électrophorèse sur gel d'agarose. à 1 %, des fragments d'ADN de 3,8 mé-gadaltons. 10 Xg of DNA from A, plac5 are added to a mixture (in total amount equal to 20 dj.1) of 100mM Tris-HCl buffer, pH 7.5, 7mM MgCl2 and 50mM NaCl, and the reaction is carried out using 10 units of the restriction enzyme .EcoRI and 10 units of the restriction enzyme HindIII at 37 ° C, for 2 hours. Then purified by electrophoresis on agarose gel. at 1%, DNA fragments of 3.8 mega-gadaltons.
On ajoute 1 p. d'ADN de pBR322 à un mélange (en quantité totale égale à 10 n) semblable à celui qui est indiqué ci-dessus et l'on effectue la réaction en utilisant une unité de l'enzyme de restriction £coRI et une unité de l'enzyme de restriction Hindlll, à 37°C, pendant 2 heures. Après quoi on purifie, par électrophorèse sur gel d'agarose à 1%, des fragments d'ADN de 2,6 mégadaltons. Add 1%. of pBR322 DNA to a mixture (in total amount equal to 10 n) similar to that indicated above and the reaction is carried out using a unit of the restriction enzyme £ coRI and a unit of l restriction enzyme HindIII, at 37 ° C, for 2 hours. After which, 2.6 megadalton DNA fragments are purified by electrophoresis on a 1% agarose gel.
On ajoute les fragments ainsi obtenus à un mélange (quantité totale: 10 (il) de tampon Tris-HCl 50mM (pH 7,8), MgCl2 lOmM, DTT 20mM et ATP ImM, et l'on effectue la réaction en utilisant 30 unités d'ADN ligase T4 à 14°C, pendant 24 heures. The fragments thus obtained are added to a mixture (total quantity: 10 (11) of 50 mM Tris-HCl buffer (pH 7.8), 10 mM MgCl 2, 20 mM DTT and ImM ATP, and the reaction is carried out using 30 units. T4 DNA ligase at 14 ° C for 24 hours.
On effectue, en utilisant le mélange réactionnel, la transformation de la souche XA 35 d'E. coli, conformément à la méthode de Kuschner10, dans un dispositif d'enceinte du type p-111. Transformation of strain XA 35 of E. is carried out using the reaction mixture. coli, in accordance with the method of Kuschner10, in an enclosure device of the p-111 type.
On choisit la souche transformée sur une plaque du type L (Bac-totrypton 1%, extrait de bactolevure 0,5%, NaCl 0,5%, Bactoagar 1,5%) contenant de l'Ap (20 ng/ml) et l'on réplique les souches transformées obtenues sur une plaque de EMB-lac (bouillon de culture de Bacto-EMB 2,25%, Bactoagar 1,5%). On choisit en outre les souches transformées en Lac+ (colonie rouge). Parmi ces souches, on en choisit 5 au hasard pour préparer un plasmide que l'on analyse avec différentes sortes d'enzymes de restriction, ce qui permet de constater que les quatre souches consistent en fragments de 3,8 mégadaltons d'ADN de \plac5 ligaturées avec des fragments EcoRI - Hind III d'ADN de pBR 322. On désigne l'une de ces souches par la dénomination E. coli XA 35 (pREl). Cela signifie que la souche transformée E. coli XA 35 (pREl) est différente de la souche XA 35 d'E. coli, indiquée plus haut en ce qui concerne les propriétés suivantes: The strain transformed is chosen on a type L plate (Bac-totrypton 1%, extract of bacteria yeast 0.5%, NaCl 0.5%, Bactoagar 1.5%) containing Ap (20 ng / ml) and the transformed strains obtained are replicated on an EMB-lac plate (Bacto-EMB 2.25% culture broth, Bactoagar 1.5%). The strains transformed into Lac + (red colony) are also chosen. Among these strains, 5 are chosen at random to prepare a plasmid which is analyzed with different kinds of restriction enzymes, which shows that the four strains consist of 3.8 megadalton fragments of DNA from \ plac5 ligated with EcoRI - Hind III DNA fragments from pBR 322. One of these strains is designated by the name E. coli XA 35 (pRE1). This means that the transformed strain E. coli XA 35 (pRE1) is different from the strain XA 35 of E. coli, indicated above with regard to the following properties:
Apr, Lac+ Apr, Lac +
Séquence de liaison Link sequence
On effectue la synthèse d'un fragment ayant la séquence de base CTGAATTCAGCTCTGCAGAG. On effectue la synthèse et la purification conformément au procédé de synthèse et purification des gènes de structure respectifs comme décrit ci-dessus (rendement: 40%). On désigne l'ADN simple-brin ainsi obtenu par le terme de «séquence de préliaison». The synthesis is carried out of a fragment having the basic sequence CTGAATTCAGCTCTGCAGAG. The synthesis and the purification are carried out according to the method of synthesis and purification of the respective structural genes as described above (yield: 40%). The single-stranded DNA thus obtained is designated by the term "prelink sequence".
La séquence de préliaison (15 ng) est mise à incuber en présence de 20 unités de polynucléotide kinase T4 à 37 C, pendant 40 min, dans un mélange (quantité totale: 30 nO de tampon Tris-HCl 50mM (pH 7,5), MgCl2 lOmM, spermidine 0,lmM, EDTA 0,lmM, DTT lOmM et ATP 0,2mM. On arrête la réaction par chauffage à 60 C pendant 2 min. Après avoir laissé reposer le mélange à la température ambiante pendant 1 heure, on ajoute 300 unités, 1 nU d'ADN ligase et on effectue la réaction à 14: C pendant une nuit. On arrête la réaction par chauffage à 60° C pendant 2 min. On laisse reposer le mélange à la température ambiante pendant 1 heure et on ajoute 20 unités d'enzyme de restriction Pst I de manière à effectuer la réaction pendant 5 heures. On arrête la réaction par chauffage à 60 C pendant 2 min. The pre-binding sequence (15 ng) is incubated in the presence of 20 units of T4 polynucleotide kinase at 37 C, for 40 min, in a mixture (total quantity: 30 nO of 50 mM Tris-HCl buffer (pH 7.5) , MgCl2 10mM, spermidine 0, lmM, EDTA 0, lmM, DTT 10MM and 0.2 mM ATP The reaction was stopped by heating at 60 ° C. for 2 min. After allowing the mixture to stand at room temperature for 1 hour, 300 units, 1 nU of DNA ligase are added and the reaction is carried out at 14: C. overnight. The reaction is stopped by heating at 60 ° C. for 2 min. The mixture is left to stand at room temperature for 1 hour and 20 units of restriction enzyme Pst I are added so as to carry out the reaction for 5 hours The reaction is stopped by heating at 60 ° C. for 2 min.
On obtient ainsi 15 ng de la séquence de liaision Pst I-£coRI-Pstl. 15 ng of the Pst I-coRI-Pstl binding sequence are thus obtained.
Préparation du gène de structure EcoRi-EcoRI Preparation of the EcoRi-EcoRI structural gene
On prépare la séquence de liaison Pst I-EcoRI-PSTI comme décrit ci-dessus (4 ng) et on ajoute le gène de structure Pstl-PstI mentionné dans l'exemple 1 (0,6 ng) à un mélange (quantité totale: 35 n0 de tampon Tris-HCl lOOmM, pH 7,5 MgCl2 7mM et NaCl 50mM, et on effectue la réaction en utilisant 300 unités d'ADN ligase T4, à 14°C, pendant 24 heures. The Pst I-EcoRI-PSTI binding sequence is prepared as described above (4 ng) and the Pstl-PstI structural gene mentioned in Example 1 (0.6 ng) is added to a mixture (total amount: 35 m of 100 mM Tris-HCl buffer, pH 7.5 7 mM MgCl 2 and 50 mM NaCl, and the reaction was carried out using 300 units of T4 DNA ligase, at 14 ° C, for 24 hours.
On arrête ensuite la réaction par chauffage à 68 C pendant 10 min et l'on refroidit progressivement le mélange réactionnel. The reaction is then stopped by heating at 68 ° C. for 10 min and the reaction mixture is gradually cooled.
On ajoute au mélange réactionnel ainsi obtenu l'enzyme de restriction i?coRI (100 unités) de manière à effectuer la réaction à 37 C pendant 5 heures, puis on purifie le fragment d'ADN ayant 120 paires de bases, par électrophorèse sur gel de Polyacrylamide à 5%. The restriction enzyme i? CoRI (100 units) is added to the reaction mixture thus obtained so as to carry out the reaction at 37 ° C. for 5 hours, then the DNA fragment having 120 base pairs is purified by gel electrophoresis. of 5% polyacrylamide.
Préparation du pLS et clonage PLS preparation and cloning
On ajoute 0,25 ng de pREl à un mélange (quantité totale: 4 n') de tampon Tris-HCl lOOmM, pH 7,5, MgCl2 7mM et NaCl 50mM et l'on effectue la réaction en utilisant une unité de l'enzyme de restriction EcoRI à 37° C, pendant 1 heure. 0.25 ng of pRE1 is added to a mixture (total amount: 4 n ′) of 100 mM Tris-HCl buffer, pH 7.5, 7 mM MgCl 2 and 50 mM NaCl and the reaction is carried out using one unit of the EcoRI restriction enzyme at 37 ° C, for 1 hour.
On ajoute le plasmide pRE 1 (coupé par EcoRI) ainsi préparé (0,25 ng) ainsi que 0,02 ng du gène de structure EcoRl-EcoRl à un mélange (quantité totale: 10 nO de tampon Tris-HCl 50mM, pH 7,8, MgCl2 lOmM, DTT 20mM, ATP ImM et l'on effectue la réaction en utilisant 30 unités d'ADN ligase T4, à 14 C, pendant 24 heures. Plasmid pRE 1 (cut with EcoRI) thus prepared (0.25 ng) and 0.02 ng of the EcoRl-EcoRl structural gene are added to a mixture (total amount: 10 nO of 50 mM Tris-HCl buffer, pH 7 , 8, MgCl2 10 mM, DTT 20 mM, ATP ImM and the reaction is carried out using 30 units of T4 DNA ligase, at 14 ° C., for 24 hours.
On transforme, en utilisant le mélang réactionnel ainsi obtenu, la souche XA 35 d'E. coli par la méthode de Kuschner10 dans un dispositif d'enceinte P-3. Using the reaction mixture thus obtained, strain XA 35 of E. coli by the method of Kuschner10 in a P-3 enclosure device.
On choisit la souche transformée sur une plaque de type L contenant Ap (20 ng/ml) comme décrit ci-dessus. On réplique les souches transformées obtenues sur la plaque EMB-lac, en procédant comme décrit ci-dessus, en vue d'effectuer la sélection ultérieure de la souche Lac+. Parmi ces souches, on en choisit 200 pour préparer l'ADN de plasmide dont on analyse la structure au moyen de l'enzyme de restriction Pst I ou Hae II, ce qui permet de confirmer que 11 souches présentent le gène de structure indiqué plus haut. The strain transformed is chosen on a type L plate containing Ap (20 ng / ml) as described above. The transformed strains obtained are replicated on the EMB-lac plate, using the procedure described above, with a view to carrying out the subsequent selection of the Lac + strain. Among these strains, 200 are chosen to prepare the plasmid DNA, the structure of which is analyzed using the restriction enzyme Pst I or Hae II, which confirms that 11 strains have the structural gene indicated above. .
Détermination de la direction Determination of direction
On effectue ces expériences suivantes sur chacun des plasmides des 11 souches présentant le gène de structure. The following experiments are carried out on each of the plasmids of the 11 strains having the structural gene.
On ajoute le plasmide (20 ng) à un mélange (quantité totale: 20 ni) de tampon Tris-HCl lOmM, pH 7,5, MgCl2 66mM et NaCl 60mM et l'on ajoute encore à la solution 20 unités d'enzyme de restriction Hae 11. On effectue l'incubation à 37' C pendant 2 heures. A partir du mélange ainsi obtenu on extrait, par électrophorèse sur gel d'agarose à 1%, des fragments d'environ 1 mégadalton et des fragments d'environ 0,7 mégadalton. On coupe les fragments respectifs au moyen de l'enzyme de restriction i?coRI, en procédant de la manière décrite plus haut, et on les soumet à une électrophorèse sur gel de Polyacrylamide à 15%. On identifie le plasmide dans lequel, par électrophorèse, on obtient des fragments d'ADN ayant 40 paires de bases à partir du fragment d'environ 1 mégadalton et du fragment d'ADN ayant 80 paires de bases, obtenu à partir du fragment The plasmid (20 ng) is added to a mixture (total amount: 20 μl) of 10 mM Tris-HCl buffer, pH 7.5, 66 mM MgCl 2 and 60 mM NaCl and 20 units of enzyme are added to the solution. Hae restriction 11. The incubation is carried out at 37 ° C. for 2 hours. From the mixture thus obtained, fragments of about 1 megadalton and fragments of about 0.7 megadalton are extracted by electrophoresis on a 1% agarose gel. The respective fragments are cut using the restriction enzyme i? CoRI, proceeding as described above, and subjected to electrophoresis on 15% polyacrylamide gel. The plasmid is identified in which, by electrophoresis, DNA fragments having 40 base pairs are obtained from the fragment of approximately 1 megadalton and from the DNA fragment having 80 base pairs, obtained from the fragment
5 5
10 10
15 15
20 20
25 25
30 30
35 35
40 40
45 45
50 50
55 55
60 60
65 65
659 826 659,826
12 12
d'environ 0,7 mégadalton, comme étant le plasmide dans lequel le gène de structure est inséré dans la direction correcte. about 0.7 megadalton, as being the plasmid in which the structural gene is inserted in the correct direction.
Ces expériences permettent de déduire que 5 des souches de plasmide parmi les 11 souches présentant le gène de structure ont la direction correcte. On choisit au hasard l'une de ces souches et on la désigne par la dénomination E. coli XA 35 (pLS 58). These experiments make it possible to deduce that 5 of the plasmid strains among the 11 strains presenting the structural gene have the correct direction. One of these strains is chosen at random and is designated by the name E. coli XA 35 (pLS 58).
Identification et purification de la protéine fusionnée Identification and purification of the fused protein
On soumet \'E. coliXA 35 (pLS 58) à une culture sous agitation dans 1 litre de bouillon Luria contenant 20 ng/ml d'ampicilline, à 37°C, jusqu'à ce que le nombre de bactéries atteigne 5 x 108 cellules/ml. On prélève alors les cellules de bactérie par centrifugation et on les suspend dans un mélange (quantité totale: 100 ml) de tampon Tris-HCl lOmM (pH 7,5) et MgCl2 lOmM et l'on traite la suspension en utiliant un appareil générateur d'ultrasons de marque Kubota, modèle «Insonator 200 M», pendant 30 minutes, de manière à détruire les cellules de bactérie. We submit \. coliXA 35 (pLS 58) to a culture with stirring in 1 liter of Luria broth containing 20 ng / ml of ampicillin, at 37 ° C, until the number of bacteria reaches 5 x 108 cells / ml. The bacteria cells are then removed by centrifugation and suspended in a mixture (total quantity: 100 ml) of 10 mM Tris-HCl buffer (pH 7.5) and 10 mM MgCl 2 and the suspension is treated using a generator Kubota brand ultrasound, “Insonator 200 M” model, for 30 minutes, so as to destroy the bacteria cells.
On soumet la solution ainsi obtenue (2 ni) à une électrophorèse sur gel de Polyacrylamide SDS 7,5%, ce qui permet d'observer une bande de protéine correspondant à 120 000 daltons. On n'observe pas de bande de ce genre dans l'extrait obtenu de manière similaire à partir des bactéries n'ayant pas de plasmide (souche XA 35 d'E. coli). On considère par conséquent que cette protéine est dérivée du plasmide pLS 58. The solution thus obtained (2 μl) is subjected to electrophoresis on 7.5% SDS polyacrylamide gel, which makes it possible to observe a protein band corresponding to 120,000 daltons. No such band is observed in the extract similarly obtained from bacteria having no plasmid (strain XA 35 of E. coli). It is therefore considered that this protein is derived from the plasmid pLS 58.
On confirme également que la protéine a pratiquement la même dimension que celle de la ß-galactosidase19 obtenue à partir d'E. coli, ce qui n'est pas en contradiction avec les dimensions (117 173 daltons) de la protéine fusionnée de désamidosécrétine et ß-galactosidase. It is also confirmed that the protein is substantially the same size as that of β-galactosidase19 obtained from E. coli, which is not in contradiction with the dimensions (117 173 daltons) of the fused protein desamidosecretin and ß-galactosidase.
On en conclut donc que cette protéine d'environ 120000 daltons constitue la protéine fusionnée et l'on procède à la purification de cette protéine. We therefore conclude that this protein of approximately 120,000 daltons constitutes the fused protein and we proceed to the purification of this protein.
On soumet à une centrifugation l'extrait obtenu par destruction aux ultrasons et l'on récupère le précipité. On récupère substantiellement la protéine fusionnée dans le précipité. On suspend le précipité dans un mélange (quantité totale: 100 ml) de tampon Tris-HCl (lOmM pH 7,5) et MgCl2 ImM et on le soumet à une centrifugation suivie par la récupération du précipité. On répète cette opération à deux reprises afin d'éliminer les parties solubles dans l'eau. The extract obtained by ultrasonic destruction is subjected to centrifugation and the precipitate is recovered. The fused protein is substantially recovered from the precipitate. The precipitate is suspended in a mixture (total amount: 100 ml) of Tris-HCl buffer (10 mM pH 7.5) and MgCl2 ImM and subjected to centrifugation followed by recovery of the precipitate. This operation is repeated twice to remove the water-soluble parts.
On dissout le précipité obtenu dans un mélange (quantité totale: 100 ml) de tampon Tris-HCl 20mM (pH 7,5), MgCl2 ImM, NaCl lOmM et urée 7M, et on le fait passer dans une colonne (diamètre: 5 cm x 3 cm) de cellulose DEAE équilibrée par le même tampon. The precipitate obtained is dissolved in a mixture (total quantity: 100 ml) of 20mM Tris-HCl buffer (pH 7.5), MgCl2 ImM, 10MM NaCl and 7M urea, and it is passed through a column (diameter: 5 cm x 3 cm) of DEAE cellulose balanced by the same buffer.
Après lavage au moyen de 20 ml du même tampon, on lave encore la colonne par 100 ml d'un tampon similaire dans lequel la concentration en NaCl est modifiée de manière à prendre la valeur 50mM. On élue ensuite la protéine fusionnée au moyen de 150 ml d'un tampon similaire dans lequel la concentration en NaCl est modifiée de façon à prendre la valeur 150mM. After washing with 20 ml of the same buffer, the column is further washed with 100 ml of a similar buffer in which the NaCl concentration is modified so as to take the value 50 mM. The fused protein is then eluted using 150 ml of a similar buffer in which the NaCl concentration is modified so as to take the value 150 mM.
On ajoute au produit d'élution ainsi obtenu du ß-mercaptoêtha-nol en concentration finale de 1 % et on dialyse 3 fois le mélange contre 5 litres d'eau. On centrifuge le produit de dialyse de façon à récupérer la protéine fusionnée en tant que précipité. Ss-mercaptoetha-nol is added to the elution product thus obtained in a final concentration of 1% and the mixture is dialyzed 3 times against 5 liters of water. The dialysis product is centrifuged so as to recover the fused protein as a precipitate.
La protéine fusionnée ainsi obtenue produit une bande pratiquement unique par électrophorèse sur gel de Polyacrylamide SDS, en quantité d'environ 28 mg par litre de bouillon de culture, calculée d'après l'absorption à 280 nm. On calcule que cette valeur correspond à environ 280 000 molécules/cellule. The thus-fused protein thus produced a practically unique band by SDS polyacrylamide gel electrophoresis, in an amount of about 28 mg per liter of culture broth, calculated from the absorption at 280 nm. It is calculated that this value corresponds to approximately 280,000 molecules / cell.
On dissout la protéine fuisonnée purifiée dans 2 ml d'acide for-mique à 70% et on la traite par 100 mg de bromure de cyanogène, pendant 18 heures. Après évaporation, on extrait le résidu par 5 ml d'isopropanol, puis par 5 ml de méthanol, et l'on fait suivre cette extraction par une lyophilisation. The purified protein is dissolved in 2 ml of 70% formic acid and treated with 100 mg of cyanogen bromide for 18 hours. After evaporation, the residue is extracted with 5 ml of isopropanol, then with 5 ml of methanol, and this extraction is followed by lyophilization.
Dosage biologique Biological assay
On procède, par la méthode de dosage biologique12, au dosage de l'échantillon lyophilisé en dissolvant celui-ci dans un volume total de 25 ml de solution isotonique de chlorure de sodium, on injecte à 5 rats, par voie intraveineuse dans l'aine, des parties aliquotes de 50 ni chacune, on mesure les quantités de suc pancréatique sécrété et s'écoulant par un tube pancréatique artificiel, à des intervalles de 5 min et on note l'augmentation de l'écoulement en tant qu'activité biologique de la sécrétine. Comme sécrétine de référence, on injecte au préalable par voie intraveineuse, aux mêmes rats, du Secrepan (Eisai, Japon) en quantité égale à 1 unité, 2 unités et 4 unités/rat et l'on mesure les quantités de suc pancréatique sécrété afin de déterminer la correspondance entre l'unité Eisai (pratiquement égale à l'unité Crick Harper Râper). Using the biological assay method12, the lyophilized sample is assayed by dissolving it in a total volume of 25 ml of isotonic sodium chloride solution, injecting 5 rats intravenously into the groin , aliquots of 50 μl each, the quantities of secreted pancreatic juice flowing through an artificial pancreatic tube are measured at 5 min intervals and the increase in flow is noted as biological activity of secretin. As the reference secretin, Secrepan (Eisai, Japan) is injected intravenously beforehand, in the same rats, in an amount equal to 1 unit, 2 units and 4 units / rat and the quantities of secreted pancreatic juice are measured in order to to determine the correspondence between the Eisai unit (practically equal to the Crick Harper Rasp unit).
On constate que les échantillons obtenus à partir d'E. coli XA 35 (pLS 58) conduisent à une augmentation de la sécrétion du suc pancréatique. D'autre part, lorsque l'on dose, suivant la même méthode l'échantillon obtenu à partir d'extraits de cellules de bactéries obtenues à partir du clone ne contenant que pREl et ne contenant pas de gène de désamidosécrétine, on n'observe pas d'augmentation de la quantité de suc pancréatique sécrété. Cela indique qu'une substance ayant une activité biologique similaire à celle de la sécrétine est produite dans les cellules d'E. coli XA 35 (pLS58), alors qu'il ne se produit pas de substance de ce genre dans les cellules d'E. coli XA 35 (pREl). It is found that the samples obtained from E. coli XA 35 (pLS 58) lead to an increase in the secretion of pancreatic juice. On the other hand, when we dose, using the same method, the sample obtained from extracts of bacteria cells obtained from the clone containing only pRE1 and not containing the deamidosecretin gene, we do not observe no increase in the amount of secreted pancreatic juice. This indicates that a substance with biological activity similar to that of secretin is produced in the cells of E. coli XA 35 (pLS58), whereas no such substance occurs in the cells of E. coli XA 35 (pREl).
En reportant les quantités augmentées de suc pancréatique sécrété par les échantillons obtenus à partir d'E. coli XA 35 (pLS 58) sur une ligne droite obtenue sur un graphique semi-logarithmique, les quantités augmentées de suc pancréatique sécrété étant portées en ordonnées et les unités Secrepan en abscisses (échelle logarithmique), on peut déterminer, par interpolation, que l'unité sécrétine est de 3 unités Eisai/50 nVrat> ce qui correspond à environ 1500 unités Eisai sous forme de 25 ml de solution isotonique de chlorure de sodium contenant l'échantillon lyophilisé. Etant donné que l'on sait que la sécrétine purifiée au maximum a une activité spécifique de 16 000 unités CHR/mg, 1500 unités correspondent à environ 26 nmoles de molécules de sécrétine, ce qui indique que l'on a effectué la synthèse biologique d'une désamidosécrétine ayant une activité correspondant à 1,6 x 1016 molécules de sécrétine. Du fait que la désamidosécrétine est préparée en utilisant environ 5 x 1011 cellules d'E. coli XA 35 (pLS 58), on récupère au moins 3 x 104 équivalents moléculaires de sécrétine par cellule de bactérie. By reporting the increased amounts of pancreatic juice secreted by the samples obtained from E. coli XA 35 (pLS 58) on a straight line obtained on a semi-logarithmic graph, the increased quantities of secreted pancreatic juice being plotted on the ordinate and the Secrepan units on the abscissa (logarithmic scale), it can be determined, by interpolation, that l he secretin unit is 3 Eisai units / 50 nVrat> which corresponds to approximately 1500 Eisai units in the form of 25 ml of isotonic sodium chloride solution containing the lyophilized sample. Since it is known that the maximum purified secretin has a specific activity of 16,000 CHR / mg units, 1,500 units correspond to approximately 26 nmol of secretin molecules, which indicates that biological synthesis has been carried out. '' a deamidosecretin having an activity corresponding to 1.6 x 1016 secretin molecules. Because desamidosecretin is prepared using approximately 5 x 1011 E. cells. coli XA 35 (pLS 58), at least 3 x 10 4 molecular equivalents of secretin are recovered per bacteria cell.
On peut en conclure que le gène de la 27-désamidosêcrêtine synthétique est exprimée par l'action du promoteur d'opéron lactose de l'E. coli dans les cellules d'E. coli XA 35 (pLS 58) et que son produit de translation, c'est-à-dire la 27-désamidosécrétine, présente une activité similaire à celle de la sécrétine. It can be concluded that the gene for synthetic 27-deamidosecretin is expressed by the action of the promoter of the lactose operon of E. coli in E. cells coli XA 35 (pLS 58) and that its translation product, that is to say 27-deamidosecretin, has an activity similar to that of secretin.
Dosage radio-immunologique Radioimmunoassay
On dilue l'échantillon dans un mélange de tampon Tris-HCl 50mM (pH 8,0) et d'albumine de sérum bovin à 0,1%. On effectue le dosage radio-immunologique de l'échantillon dilué en utilisant un ensemble de doage du type «Secretin Kit Daiichi» produit par la société japonaise Daiichi Radioisotope Research Institute, en procédant de la manière prescrite, de manière à confirmer son activité. The sample is diluted in a mixture of 50 mM Tris-HCl buffer (pH 8.0) and 0.1% bovine serum albumin. The radio-immunoassay of the diluted sample is carried out using a “Secretin Kit Daiichi” type test set produced by the Japanese company Daiichi Radioisotope Research Institute, in the prescribed manner, so as to confirm its activity.
Schéma de structure du gène Gene structure diagram
Le schéma suivant représente la séquence des bases du gène comprenant le gène de structure de la 27-désamidosécrétine sous forme de blocs séparés A, B et C, a étant une paire de bases choisie à volonté, b le site Pst I, c est une paire de bases choisie à volonté, d est un codon de départ, e est le site Hinf I, et f est le site Hae II. The following diagram represents the base sequence of the gene comprising the structural gene for 27-deamidosecretin in the form of separate blocks A, B and C, a being a base pair chosen at will, b the Pst I site, it is a base pair chosen at will, d is a start codon, e is the Hinf I site, and f is the Hae II site.
\ \
5 5
10 10
15 15
20 20
25 25
30 30
35 35
40 40
45 45
50 50
55 55
60 60
13 13
659 826 659,826
r r
SCHÉMA DE STRUCTURE DU GÈNE GENE STRUCTURE DIAGRAM
Bloc A__ Block A__
Mot Illa Sor Aap Gly Thr Plio S - / 1 | S - 3 1 Mot Illa Sor Aap Gly Thr Plio S - / 1 | S - 3 1
A C T G A C T G
C T G C A G G A C G T C C T G C A G G A C G T C
C C G G C C G G
A T G TAC A T G TAC
L L
b b
-S - J- -S - J-
c vs
_J L _J L
-C A C-T C A-G A T-G G T-A C T-T -C A C-T C A-G A T-G G T-A C T-T
-G T G-A G T-C T A-C C A-T G A-A A G-T G G-A G -G T G-A G T-C T A-C C A-T G A-A A G-T G G-A G
S - V- S - V-
Blœ Blo
Phe Thr Sor Glu Leu Ser Arc Lou Arg Asp Ser Ala -S - S H ~ 7 Phe Thr Sor Glu Leu Ser Arc Lou Arg Asp Ser Ala -S - S H ~ 7
S - 7- S - 7-
I b - J 11 o - ' [T I b - J 11 o - '[T
T C-A C C-T C A-G A A-C T A-T C T-C G T-C T A-C G T-G A T-T C T-C T T-G A T-A G A-G C A-G A T-G C A-lc T A-A G T C-A C C-T C A-G A A-C T A-T C T-C G T-C T A-C G T-G A T-T C T-C T T-G A T-A G A-G C A-G A T-G C A-lc T A-A G
Arg Lou Gin Arg -S - ? Arg Lou Gin Arg -S -?
-S - t- -S - t-
o o
-S -/£>■ -S - / £> ■
A-G C A-C G C-C T C-C T-C G T-G C G-G A G-G A-G C A-C G C-C T C-C T-C G T-G C G-G A G-G
I I I I
~! ~!
A G-C A G-C
T C-G C G-A T C-G C G-A
A C-G A A C-G A
- /2 ■ - / 2 ■
Bloc Block
Arg Lou Lou Gin Gly Lou Val FIN FIN i S -// n S - A?- Arg Lou Lou Gin Gly Lou Val FIN FIN i S - // n S - A? -
• Aî- • Have-
G C-T T G-C T G-C G C-T T G-C T G-C
A AT
A-G A-G
G G
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T-T T-T
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A-T AT
A AT
G-G G G-G G
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T T
G G
C VS
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G G
G G
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T-C T-C
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A-G A-G
A AT
G-C G-C
A AT
A-A A-A
C VS
T-A YOUR
T T
C-C C C-C C
G G
A AT
C VS
G G
T T
C VS
C VS
A AT
■ S -/V-- ■ S - / V--
_1L _1L
-S - /i -Yes
Dépôt des micro-organismes Deposit of microorganisms
Les souches E. coli K12C600, E. coli XA 35 et son produit de transformation E. coli XA 35 (pRE 1) par le plasmide pRE 1 sont déposées conformément aux dispositions du Traité de Budapest sur 35 la reconnaissance internationale des dépôts de micro-organismes en vue de la protection par brevet, auprès du Fermentation Research Institute, Agency of Industriai Science and Technology (FERM), 1-3, Higashi 1-chome, Yatabemachi, Tsukuba-gun, Ibaraki-ken, The E. coli K12C600, E. coli XA 35 and its E. coli XA 35 transformation product (pRE 1) by the plasmid pRE 1 are deposited in accordance with the provisions of the Budapest Treaty on the international recognition of micro- organizations for patent protection, at the Fermentation Research Institute, Agency of Industriai Science and Technology (FERM), 1-3, Higashi 1-chome, Yatabemachi, Tsukuba-gun, Ibaraki-ken,
Japon, sous le numéro de dépôt FERM BP-115, en date du 9 juin to 1981, FERM BP-116, en date du 7 janvier 1982 et FERM BP 117, Japan, under the deposit number FERM BP-115, dated June 9 to 1981, FERM BP-116, dated January 7, 1982 and FERM BP 117,
daté du 7 janvier 1982, respectivement. Le plasmide pBR 322 est déposé auprès du FERM sous forme du produit de transformation d'E. coli K12C600 par pBR 322, c'est-à-dire l'E. coli K12C600 (pBR 322), sous le numéro FERM P-6017, daté du 9 juin 1981. 45 dated January 7, 1982, respectively. The plasmid pBR 322 is deposited with the FERM in the form of the transformation product of E. coli K12C600 by pBR 322, i.e. E. coli K12C600 (pBR 322), under the number FERM P-6017, dated June 9, 1981. 45
L'E. coli K12C600 (pMG 103), qui est le produit de transformation par le plasmide chimère pMG, est déposé auprès d'American Type Culture Collection (ATCC), 12301, Parklawn Drive, Rock-ville, Maryland 20852, U.S.A., sous le numéro ATCC 39042, daté du 26 janvier 1982. 50 THE. coli K12C600 (pMG 103), which is the transformation product by the chimeric plasmid pMG, is deposited with the American Type Culture Collection (ATCC), 12301, Parklawn Drive, Rock-ville, Maryland 20852, USA, under the number ATCC 39042, dated January 26, 1982. 50
L'E. coli PK 1512, qui est la bactérie lysogénique A.plac5, est déposé auprès de l'Institute for Fermentation, Juso-Hommachi, 2-17-85, Yodogawa-Ku, Osaka-Shi, Japon, sous le numéro IFO 14149, daté du 1er février 1982. THE. coli PK 1512, which is the lysogenic bacterium A.plac5, is deposited with the Institute for Fermentation, Juso-Hommachi, 2-17-85, Yodogawa-Ku, Osaka-Shi, Japan, under the number IFO 14149, dated February 1, 1982.
L'E. coli XA 35 (pLS 58), qui est le produit de transformation 55 par lé plasmide chimère, est déposé conformément aux dispositions du Traité de Budapest auprès d'ATCC,sous le numéro ATCC 39040, en date du 11 janvier 1982. THE. coli XA 35 (pLS 58), which is the transformation product 55 by the chimeric plasmid, is deposited in accordance with the provisions of the Budapest Treaty with ATCC, under the number ATCC 39040, dated January 11, 1982.
60 60
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R R
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Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PL | Patent ceased |