CA2346146A1 - Amorces oligonucleotidiques destabilisant la formation de duplex non specifiques et leurs utilisations - Google Patents
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Abstract
L'invention constitue la preuve qu'en modifiant une extension homopolymère dans un oligonucléotide, ou amorce, on améliore la discrimination de la liaison dudit nucléotide ou de ladite amorce modifié(e) avec sa séquence cible homopolymère complémentaire par rapport à une liaison avec une séquence non homopolymère. Plus spécifiquement, on a utilisé une amorce oligo d(T), dans laquelle deux des bases thymine ont été substituées par un 3-nitropyrrole, pour réaliser une expérience de synthèse d'ADNc amorcée par un poly A prouvant que la discrimination de l'amorçage de la synthèse d'ADNc à partir de la séquence poly A bona fide est supérieure à celle obtenue avec des séquences internes riches en A. L'invention concerne des modifications de séquences homopolymères dans les oligos, diminuant la capacité de liaison par pontage, en général, puisqu'il a été démontré que d'autres modifications, telles que la substitution d'une amorce oligo d(T) par la 2' désoxy-inosine, améliorent également la discrimination de la liaison avec une queue poly A bona fide par rapport à une liaison avec des séquences riches en A. L'invention concerne donc des amorces universelles qui diminuent les erreurs d'amorçage lors de la création d'une banque d'ADNc, ce qui augmente la proportion de clones d'ADN amorcés à partir d'une queue 3' poly A bona fide. Elle concerne aussi l'utilisation des oligonucléotides discriminants de la présente invention dans d'autres techniques telles que la purification de l'ARNm, les méthodes de détection basées sur la PCR et le séquençage.
Priority Applications (1)
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|---|---|---|---|
| CA002346146A CA2346146A1 (fr) | 1998-10-07 | 1999-10-06 | Amorces oligonucleotidiques destabilisant la formation de duplex non specifiques et leurs utilisations |
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| CA 2246623 CA2246623A1 (fr) | 1998-10-07 | 1998-10-07 | Amorces oligonucleotidiques qui destabilisent la formation de double brin non specifique et reduisent les risques de choisir les mauvaises amorces pendant la construction de la banque d'adnc et leurs utilisations |
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| CA002346146A CA2346146A1 (fr) | 1998-10-07 | 1999-10-06 | Amorces oligonucleotidiques destabilisant la formation de duplex non specifiques et leurs utilisations |
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Publications (1)
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| CA2346146A1 true CA2346146A1 (fr) | 2000-04-13 |
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| CA002346146A Abandoned CA2346146A1 (fr) | 1998-10-07 | 1999-10-06 | Amorces oligonucleotidiques destabilisant la formation de duplex non specifiques et leurs utilisations |
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| CA (1) | CA2346146A1 (fr) |
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1999
- 1999-10-06 CA CA002346146A patent/CA2346146A1/fr not_active Abandoned
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| FZDE | Discontinued |