CA2323831A1 - Nucleic acid transfer vectors, compositions containing same and uses - Google Patents

Nucleic acid transfer vectors, compositions containing same and uses Download PDF

Info

Publication number
CA2323831A1
CA2323831A1 CA002323831A CA2323831A CA2323831A1 CA 2323831 A1 CA2323831 A1 CA 2323831A1 CA 002323831 A CA002323831 A CA 002323831A CA 2323831 A CA2323831 A CA 2323831A CA 2323831 A1 CA2323831 A1 CA 2323831A1
Authority
CA
Canada
Prior art keywords
nucleic acid
sequence
acid transfer
transfer vector
oligonucleotide
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Abandoned
Application number
CA002323831A
Other languages
French (fr)
Inventor
Carole Ciolina
Daniel Scherman
Pierre Wils
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Aventis Pharma SA
Original Assignee
Individual
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from FR9803573A external-priority patent/FR2776669B1/en
Application filed by Individual filed Critical Individual
Publication of CA2323831A1 publication Critical patent/CA2323831A1/en
Abandoned legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • A61K48/0008Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'non-active' part of the composition delivered, e.g. wherein such 'non-active' part is not delivered simultaneously with the 'active' part of the composition
    • A61K48/0025Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy characterised by an aspect of the 'non-active' part of the composition delivered, e.g. wherein such 'non-active' part is not delivered simultaneously with the 'active' part of the composition wherein the non-active part clearly interacts with the delivered nucleic acid
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/04Immunostimulants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K48/00Medicinal preparations containing genetic material which is inserted into cells of the living body to treat genetic diseases; Gene therapy
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2310/00Structure or type of the nucleic acid
    • C12N2310/10Type of nucleic acid
    • C12N2310/15Nucleic acids forming more than 2 strands, e.g. TFOs

Abstract

The invention concerns novel vectors and their use for nucleic acid transfer. More particularly it concerns novel vectors capable of directing nucleic acids towards specific cells or cell compartments.

Description

VECTEURS DE TRANSFERT D'ACmES NUCLEIOUES. COMPOSITIONS LES
CONTENANT. ET LEURS UTILISATIONS
La présente invention concerne de nouveaux vecteurs et leur utilisation pour le transfert d'acides nucléiques. Plus particulièrement, l'invention concerne de nouveaux vecteurs capables de diriger des acides nucléiques vers des cellules ou des compartiments cellulaires spécifiques.
Le transfert d'acides nucléiques est une technique à la base de toutes les applications majeures de la biotechnologie et l'augmentation de l'efficacité
du transfert des acides nucléiques constitue un enjeu très important pour le développement de ces Io applications. L'efficacité du transfert des acides nucléiques dépend de nombreux facteurs parmi lesquels la capacité des acides nucléiques à atteindre la cellule cible, leur faculté à franchir la membrane plasmique et leur aptitude à être transportés au sein de la cellule jusqu'au noyau.
Un des obstacles majeurs à l'efficacité du transfert des acides nucléiques provient du fait que l'information génétique est souvent peu ou pas dirigée vers l'organe cible auquel elle est destinée. Par ailleurs, une fois que l'acide nucléique a pénétré dans la cellule cible, il doit encore être dirigé vers le noyau afin d'y être exprimé. De plus, dans le cas de transfert d'acides nucléiques dans des cellules différenciées ou quiescentes, le noyau est limité par une enveloppe nucléaire qui 2o constitue une barrière supplémentaire au passage de ces acides nucléiques.
Les virus recombinants utilisés comme vecteurs possèdent des mécanismes évolués et efficaces pour guider les acides nucléiques jusqu'au noyau.
Cependant, les vecteurs viraux présentent certains inconvénients inhérents à leur nature virale, qu'il n'est malheureusement pas possible d'exclure totalement. Une autre stratégie consiste donc soit à transfecter l'ADN nu, soit à utiliser des agents non viraux capables de promouvoir le transfert d'ADN dans des cellules eucaryotes. Mais les vecteurs non viraux ne possèdent pas de signaux de ciblage sub-cellulaires ou nucléaires.
Ainsi, le passage de l'ADN nu, ou en combinaison avec un agent non-viral, du cytoplasme vers
VECTORS FOR TRANSFERRING ACES NUCLEIOUES. COMPOSITIONS
CONTAINING. AND THEIR USES
The present invention relates to new vectors and their use for the transfer of nucleic acids. More particularly, the invention relates to new vectors capable of directing nucleic acids towards cells or specific cell compartments.
Nucleic acid transfer is a technique that underpins all major applications of biotechnology and increasing efficiency of the transfer nucleic acids is a very important issue for development of these Io applications. The efficiency of nucleic acid transfer depends on numerous factors including the ability of nucleic acids to reach the target cell their ability to cross the plasma membrane and their ability to be transported within the cell to the nucleus.
One of the major obstacles to the efficiency of nucleic acid transfer stems from the fact that genetic information is often little or not directed towards the target organ for which it is intended. By the way, once the acid nucleic a penetrated into the target cell it still has to be directed to the nucleus so to be there Express. In addition, in the case of transfer of nucleic acids into cells differentiated or quiescent, the nucleus is limited by a nuclear envelope who 2o constitutes an additional barrier to the passage of these nucleic acids.
Recombinant viruses used as vectors have mechanisms evolved and effective in guiding nucleic acids to the nucleus.
However, the viral vectors have certain inherent drawbacks viral, that it unfortunately is not possible to exclude completely. Another strategy consists either to transfect naked DNA, or to use non-viral agents able to promote the transfer of DNA into eukaryotic cells. But the vectors no Virals do not have subcellular or nuclear targeting signals.
So the passage of naked DNA, or in combination with a non-viral agent, from the cytoplasm towards

2 le noyau est par exemple une étape qui présente une efficacité très faible (Zabner et al., 1995).
Différentes tentatives d'attachement de signaux de ciblage ont ainsi été
faites.
Notamment, des fragments peptidiques pour le ciblage ont été attachés covaIemment à
des oligonucléotides dans une stratégie de ciblage d'un oligonucléotide antisense [Eritja et al., Synthesis of deftned peptide-oligonucleotide hybrids containing a nuclear transport signal seguence, Tetrahedron, Vol. 47, N° 24, pp.
4113-4120, 1991 ]. Les complexes ainsi formés sont de bons candidats comme inhibiteurs potentiels de l'expression de gènes endogènes.
1o Des vecteurs de transfection comprenant un polypeptide synthétique couplé
par des interactions électrostatiques à une séquence d'ADN ont également été
décrits dans la demande de brevet WO 95/31557, ledit polypeptide étant constitué d'une chaîne polymère d'acides aminés basiques, d'un peptide NLS, et d'une région charnière qui connecte le peptide NLS à 1a chaîne polymérique et permet d'éviter les interactions 1s stériques. Mais ce genre de constructions pose un problème de stabilité car les interactions mises en jeu entre l'ADN et le signal de ciblage sont de nature électrostatique.
Il existe par ailleurs des chimères acide nucléique-peptide de ciblage spécifique décrites dans la demande de brevet WO 95/34664, la liaison entre les deux étant de 2o nature chimique. Mais cette méthode passe notamment par des étapes enzymatiques difficilement contrôlables et ne permettant pas de produire de grandes quantités d'acides nucléiques.
Enfin, il a été montré qu'il est possible d'attacher une séquence NLS («
Nuclear Localisation Signal ») à un ADN plasmidique par l'intermédiaire d'un 25 cyclopropapyrroloindole (Nature Biotechnoiogy, Volume 16, pp. 80-85, janvier 1998).
Mais une inhibition totale de la transcription du gène d'intérêt du fait de l'attachement au hasard de plusieurs centaines de séquences NLS sur le plasmide a été
observée. Une solution proposée par les auteurs pour y remédier consiste à lier les séquences NLS
sur des fragments linéaires d'ADN, puis à coupler ces fragments modifiés avec d'autres
2 the nucleus is for example a step which has a very low efficiency (Zabner et al., 1995).
Different attempts to attach targeting signals have thus been do.
In particular, peptide fragments for targeting have been attached covaIently to oligonucleotides in an oligonucleotide targeting strategy antisense [Eritja et al., Synthesis of deftned peptide-oligonucleotide hybrids containing a nuclear transport signal seguence, Tetrahedron, Vol. 47, No. 24, pp.
4113-4120, 1991]. The complexes thus formed are good candidates as inhibitors endogenous gene expression potentials.
1o Transfection vectors comprising a synthetic polypeptide coupled through electrostatic interactions to a DNA sequence have also been described in patent application WO 95/31557, said polypeptide consisting of chain polymer of basic amino acids, an NLS peptide, and a hinge region who connects the NLS peptide to the polymer chain and makes it possible to avoid interactions 1s sterics. But this kind of construction poses a problem of stability because the interactions between DNA and the targeting signal are of a nature electrostatic.
There are also nucleic acid-targeting peptide chimeras specific described in patent application WO 95/34664, the connection between the two being from 2o chemical nature. But this method notably involves steps enzymatic difficult to control and unable to produce large quantities nucleic acids.
Finally, it has been shown that it is possible to attach an NLS sequence ("
Nuclear Signal Localization ”) to a plasmid DNA via a 25 cyclopropapyrroloindole (Nature Biotechnoiogy, Volume 16, pp. 80-85, January 1998).
But total inhibition of the transcription of the gene of interest due to attachment randomly several hundred NLS sequences on the plasmid has been observed. A
solution proposed by the authors to remedy this consists in linking the NLS sequences on linear DNA fragments and then to couple these modified fragments with others

3 fragments non-modifiés. Cependant, cette technique présente comme précédemment l'inconvénient de passer par au moins une étape enzymatique.
Ainsi, toutes les méthodes proposées jusqu'à présent ne permettent pas de résoudre de manière satisfaisante les difficultés liées au ciblage des ADN
double brin.
La présente invention propose une solution avantageuse à ces problèmes. Plus particulièrement, la présente invention met en oeuvre des oügonucléotides conjugués à
des signaux de ciblage et capables de former des triples hélices avec une/des séquences) spécifiques) présentes) sur une molécule d'ADN double brin.
Un tel vecteur présente l'avantage de pouvoir diriger un ADN double brin vers 1o des cellules ou des compartiments cellulaires spécifiques grâce au signal de ciblage, sans que l'expression génétique ne soit inhibée. La demanderesse a en effet montré
que, grâce à la formation de triples hélices site-spécifiques stables, il est désormais possible de lier un signal de ciblage à un ADN double brin de façon site-spécifique. En conséquence, il est possible de fixer le signal de ciblage en dehors de la cassette d'expression du gène à transférer. La demanderesse a ainsi montré que l'expression génétique dans la cellule n'est pas inhibée malgré la modification chimique de l'ADN.
De plus, la présence d'une triple hélice comme moyen pour lier le signal de ciblage à
l'ADN est particulièrement avantageuse car cela permet de conserver une taille d'ADN
adaptée à la transfection.
Le vecteur obtenu présente de plus l'avantage d'incorporer des signaux de ciblage qui sont liés de façon très stable à l'ADN double brin, en particulier lorsque l'oligonucléotide susceptible de former la triple hélice est modifié par la présence d'un agent alkylant.
Un autre avantage de l'invention est de permettre de coupler l'ADN à
transférer à des signaux de ciblage dont on contrôle à la fois le nombre et la nature. En effet, il est possible de contrôler le nombre de signaux de ciblage liés à chaque molécule d'ADN double brin en introduisant un nombre adapté de séquences spécifiques propices à la formation de triples hélices sur ladite molécule d'ADN double brin. De la
3 unmodified fragments. However, this technique presents as before the disadvantage of going through at least one enzymatic step.
Thus, all the methods proposed so far do not allow satisfactorily resolve the challenges of targeting DNA
double strand.
The present invention provides an advantageous solution to these problems. More in particular, the present invention uses ogonucleotides combined with targeting signals and capable of forming triple helices with one / more sequences) specific) present) on a double-stranded DNA molecule.
Such a vector has the advantage of being able to direct double-stranded DNA towards 1o specific cells or cell compartments thanks to the signal targeting, without gene expression being inhibited. The plaintiff has indeed shown that through the formation of stable site-specific triple helices it is from now on possible to link targeting signal to double stranded DNA site-specific. In consequence, it is possible to set the targeting signal outside the cassette expression of the gene to be transferred. The plaintiff has thus shown that the expression genetics in the cell is not inhibited despite the chemical modification of DNA.
In addition, the presence of a triple helix as a means to link the signal targeting at DNA is particularly advantageous because it keeps a size DNA
suitable for transfection.
The vector obtained also has the advantage of incorporating targeting that are very stably linked to double stranded DNA, especially when the oligonucleotide capable of forming the triple helix is modified by the presence of a alkylating agent.
Another advantage of the invention is that it makes it possible to couple the DNA to to transfer targeting signals whose number and nature are controlled at the same time. In effect it is possible to control the number of targeting signals linked to each molecule double stranded DNA by introducing an appropriate number of specific sequences conducive to the formation of triple helices on said double DNA molecule strand. Of the

4 même façon, il est possible d'introduire sur une même molécule d'ADN double brin plusieurs oligonucléotides liés à des signaux de ciblage différents (intracellulaires et/ou extracellulaires), et dans ce cas il est également possible d'en déterminer préalablement les proportions respectives. En outre, ces différents signaux de ciblage peuvent être fixés à la molécules d'ADN double brin de façon plus ou moins stable selon que la triple hélice est formée avec ou sans liaison covalente (c'est-à-dire avec ou sans l'utilisation d'un agent alkylant).
Enfin, la triple hélice fonctionnalisée obtenue ne résulte que d'étapes de transformations chimiques et peut donc être obtenue de façon simple, reproductible, et lo en très grandes quantités, notamment industrielles.
Un premier objet de l'invention concerne donc un vecteur utile en transfection capable de cibler une cellule et/ou un compartiment cellulaire spécifique.
Plus particulièrement, le vecteur selon l'invention comprend une molécule d'ADN
double brin et au moins un oligonucléotide couplé à un signal de ciblage et capable de former par hybridation une triple hélice avec une séquence spécifique présente sur ladite molécule d'ADN double brin.
On entend au sens de l'invention par "ADN double brin" un acide désoxyribonucléique double brin qui peut être d'origine humaine, animale, végétale, bactérienne, virale, etc...Il peut être obtenu par toute technique connue de l'homme du métier, et notamment par criblage de banque, par synthèse chimique ou enzymatique de séquences obtenues par criblage de banques. II peut être modifié chimiquement ou enzymat~quement.
Cet ADN double brin peut être sous forme linéaire ou circulaire. Dans ce dernier cas, l'ADN double brin peut être dans un état superenroulé ou relâché.
Préférentiellement, la molécule d'ADN est de forme circulaire et dans une conformation superenroulée.
L'ADN double brin peut également porter une origine de réplication fonctionnelle ou non dans la cellule cible, un ou plusieurs gènes marqueurs, des séquences régulatrices de la transcription ou de la réplication, des gènes d'intérêt WO 99!49067 PCT/FR99/00643 thérapeutique, des séquences antisens modifiées ou non, des régions de liaison à
d'autres composants cellulaires, etc... De préférence, l'ADN double brin comprend une cassette d'expression constituée d'un ou plusieurs gènes d'intérêt sous contrôle d'un ou plusieurs promoteurs et d'un terminateur transcriptionnel actifs dans les cellules cibles.
4 same way, it is possible to introduce on the same double DNA molecule strand several oligonucleotides linked to different targeting signals (intracellular and / or extracellular), and in this case it is also possible to determine previously the respective proportions. In addition, these different targeting signals can be more or less stable attached to the double-stranded DNA molecules the triple helix is formed with or without covalent bond (i.e. with or without the use of an alkylating agent).
Finally, the functionalized triple helix obtained is only the result of chemical transformations and can therefore be obtained in a simple way, reproducible, and lo in very large quantities, especially industrial.
A first object of the invention therefore relates to a vector useful in transfection capable of targeting a specific cell and / or cell compartment.
More in particular, the vector according to the invention comprises a DNA molecule double strand and at least one oligonucleotide coupled to a targeting signal and capable to train by hybridization a triple helix with a specific sequence present on said double stranded DNA molecule.
For the purposes of the invention, the expression “double-stranded DNA” means an acid deoxyribonucleic double strand which can be of human, animal, vegetable, bacterial origin, viral, etc ... It can be obtained by any technique known to those skilled in the art, and in particular by bank screening, by chemical or enzymatic synthesis of sequences obtained by screening of libraries. II can be chemically modified or enzymat ~ cally.
This double stranded DNA can be in linear or circular form. In this last case, double stranded DNA may be in a supercoiled or relaxed state.
Preferably, the DNA molecule is circular in shape and in a supercoiled conformation.
Double stranded DNA can also carry an origin of replication functional or not in the target cell, one or more marker genes, of regulatory sequences for transcription or replication, genes of interest WO 99! 49067 PCT / FR99 / 00643 therapeutic, antisense sequences modified or not, binding regions at other cellular components, etc. Preferably double stranded DNA
includes a expression cassette consisting of one or more genes of interest under control of one or several promoters and a transcriptional terminator active in the target cells.

5 On entend au sens de l'invention par « cassette d'expression d'un gène d'intérêt » un fragment d'ADN qui peut être inséré dans un vecteur à des sîtes de restriction spécifiques. Le fragment d'ADN comprend une séquence d'acide nucléique codant pour un ARN ou un polypeptide d'intérêt et comprend en outre les séquences nécesaires à l'expression (enhanceur(s), promoteur(s), séquences de polyadénylation...) de ladite séquence. La cassette et les sîtes de restriction sont conçus pour assurer une insertion de la cassette d'expression dans un cadre de lecture approprié pour la transcription et la traduction.
Il s'agit généralement d'un plasmide ou d'un épisome portant un ou plusieurs gènes d'intérêt thérapeutique. A titre d'exemple on peut citer les plasmides décrits dans les demandes de brevet WO 96/26270 et WO 97/10343 incorporées à la présente par référence.
Au sens de l'invention, on entend par gëne d'intérêt thérapeutique notamment tout gène codant pour un produit protéique ayant un effet thérapeutique. Le produit thérapeutique ainsi codé peut être notamment une protéine ou un peptide. Ce produit 2o protéique peut être homologue vis-à-vis de la cellule cible (c'est-à-dire un produit qui est normalement exprimé dans la cellule cible lorsque celle-ci ne présente aucune pathologie). Dans ce cas, l'expression d'une protéine permet par exemple de pallier une expression insuffisante dans la cellule ou l'expression d'une protéine inactive ou faiblement active en raison d'une modification, ou encore de surexprimer ladite protéine. Le gène d'intérêt thérapeutique peut aussi coder pour un mutant d'une protéine cellulaire, ayant une stabilité accrue, une activité modifiée, etc...
Le produit protéique peut également être hétérologue vis-à-vis de la cellule cible. Dans ce cas, une protéine exprimée peut par exemple compléter ou apporter une activité
déficiente
5 For the purposes of the invention, the expression “gene expression cassette”
of interest "a DNA fragment that can be inserted into a vector at sites of specific restrictions. DNA fragment includes an acid sequence nucleic encoding an RNA or a polypeptide of interest and further comprises the sequences necessary for expression (enhancer (s), promoter (s), sequences of polyadenylation ...) of said sequence. The cassette and the restriction are designed to ensure insertion of the expression cassette into a frame reading suitable for transcription and translation.
It is generally a plasmid or an episome carrying one or more genes of therapeutic interest. By way of example, mention may be made of the plasmids described in patent applications WO 96/26270 and WO 97/10343 incorporated herein through reference.
Within the meaning of the invention, the term gene of therapeutic interest in particular any gene encoding a protein product having a therapeutic effect. The product therapeutic thus coded can be in particular a protein or a peptide. This product 2o protein can be homologous with respect to the target cell (i.e.
a product that is normally expressed in the target cell when it does any pathology). In this case, the expression of a protein allows for example overcome a insufficient expression in the cell or expression of a protein inactive or weakly active due to modification, or overexpression said protein. The gene of therapeutic interest can also code for a mutant of a cellular protein, having increased stability, modified activity, etc.
The product protein can also be heterologous towards the target cell. In this case, an expressed protein can for example supplement or provide an activity deficient

6 dans le cellule, lui permettant de lutter contre une pathologie, ou stimuler une réponse immunitaire.
Parmi les produits thérapeutiques au sens de la présente invention, on peut citer plus particulièrement les enzymes, les dérivés sanguins, les hormones, les iymphokines [interleukines, interférons, TNF, etc (FR 92/03120)], les facteurs de croissance, les neurotransmetteurs ou leurs précurseurs ou enzymes de synthèse, les facteurs trophiques [BDNF, CNTF, NGF, IGF, GMF, aFGF, bFGF, NT3, NTS, HARP/pléiotrophine, etc, la dystrophine ou une minidystrophine (FR 91/11947)], la protéine CFTR associée à la mucoviscidose, les gènes suppresseurs de tumeurs [p53, 1o Rb, RaplA, DCC, k-rev, etc (FR 93/04745)], les gènes codant pour des facteurs impliqués dans la coagulation [Facteurs VII, VIII, IX], les gènes intervenant dans la réparation de l'ADN, les gènes suicides [thymidine kinase, cytosine déaminase], les gènes de l'hémoglobine ou d'autres transporteurs protéiques, les gènes correspondant aux protéines impliquées dans le métabolisme des lipides, de type apolipoprotéine l3 choisie parmi les apolipoprotéines A-I, A-II, A-IV, B, C-I, C-II, C-III, D, E, F, G, H, J et apo(a), les enzymes du métabolisme comme par exemple la lipoprotéine lipase, la Iipase hépatique, la lécithine cholestérol acyltransférase, la 7 alpha cholestérol hydroxylase, la phosphatidique acide phosphatase, ou encore des protéines de transfert de lipides comme la protéine de transfert des esters de cholestérol et la protéine de 2o transfert des phospholipides, une protéine de liaisons des HDL ou encore un récepteur choisi par exemple parmi les récepteurs LDL, récepteurs des chylomicrons-remnants et les récepteurs scavenger, etc...
L'ADN d'intérêt thérapeutique peut également être un gène ou une séquence antisens, dont l'expression dans la cellule cible permet de contrôler l'expression de 25 gènes ou la transcription d'ARNm cellulaires. De telles séquences peuvent, par exemple, être transcrites dans la cellule cible en ARN complémentaires d'ARNm cellulaires et bloquer ainsi leur traduction en protéine, selon la technique décrite dans le brevet EP 140 308. Les gènes d'intérêt thérapeutique comprennent également les séquences codant pour des ribozymes, qui sont capables de détruire sélectivement des WO 99/4906
6 in the cell, allowing it to fight against a pathology, or stimulate answer immune.
Among the therapeutic products within the meaning of the present invention, one can more particularly mention enzymes, blood derivatives, hormones, the iymphokines [interleukins, interferons, TNF, etc. (FR 92/03120)], the factors of neurotransmitters or their precursors or enzymes synthesis, the trophic factors [BDNF, CNTF, NGF, IGF, GMF, aFGF, bFGF, NT3, NTS, HARP / pleiotrophin, etc., dystrophin or a minidystrophin (FR 91/11947)], the CFTR protein associated with cystic fibrosis, tumor suppressor genes [p53, 1o Rb, RaplA, DCC, k-rev, etc. (FR 93/04745)], the genes coding for factors involved in coagulation [Factors VII, VIII, IX], the genes involved in the DNA repair, suicide genes [thymidine kinase, cytosine deaminase], the genes for hemoglobin or other protein transporters, the genes corresponding proteins involved in lipid metabolism, such as apolipoprotein l3 chosen from apolipoproteins AI, A-II, A-IV, B, CI, C-II, C-III, D, E F G H, J and apo (a), metabolism enzymes such as lipoprotein lipase, the Hepatic lipase, lecithin cholesterol acyltransferase, 7 alpha cholesterol hydroxylase, phosphatidic acid phosphatase, or even proteins transfer lipids such as the cholesterol ester transfer protein and the protein 2o transfer of phospholipids, an HDL binding protein or even a receiver chosen for example from LDL receptors, chylomicron receptors-remnants and scavenger receivers, etc ...
The DNA of therapeutic interest can also be a gene or a sequence antisense, whose expression in the target cell makes it possible to control the expression of 25 genes or transcription of cellular mRNA. Such sequences can, through example, be transcribed in the target cell into RNA complementary to mRNA
cells and thus block their translation into protein, according to the technique described in Patent EP 140,308. Genes of therapeutic interest also include the sequences encoding ribozymes, which are capable of destroying selectively WO 99/4906

7 PCT/FR99/00643 ARN cibles (EP 321 20I ), ou les séquences codant des anticorps intracellulaires à
simple chaîne comme par exemple les ScFv.
Comme indiqué plus haut, l'acide désoxyribonucléique peut également comporter un ou plusieurs gènes codant pour un peptide antigénique, capable de générer chez l'homme ou l'animal une réponse immunitaire. Dans ce mode particulier de mise en oeuvre, l'invention permet donc la réalisation soit de vaccins soit de traitements immunothérapeutiques appliqués à l'homme ou à l'animal, notamment contre des micro-organismes, des virus ou des cancers. II peut s'agir notamment de peptides antigéniques spécifiques du virus d'Epstein Barr, du virus HIV, du virus de 1o l'hépatite B (EP 185 573), du virus de la pseudo-rage, du "syncitia forming virus", du virus de la grippe, du cytomégalovirus (CMV), d'autres virus ou encore spécifiques de tumeurs (EP 259 212).
Préférentiellement, l'acide désoxyribonucléique comprend également des séquences permettant l'expression du gène d'intérêt thérapeutique et/ou du gène codant pour le peptide antigénique dans la cellule ou l'organe désiré. Il peut s'agir des séquences qui sont naturellement responsables de l'expression du gène considéré
lorsque ces séquences sont susceptibles de fonctionner dans la cellule transfectée. Il peut également s'agir de séquences d'origine différente (responsables de l'expression d'autres protéines, ou même synthétiques). Notamment, il peut s'agir de séquences promotrices de gènes eucaryotes ou viraux. Par exemple, iI peut s'agir de séquences promotrices issues du génome de la cellule que l'on désire infecter. De même, il peut s'agir de séquences promotrices issues du génome d'un virus. A cet égard, on peut citer par exemple les promoteurs des gènes E 1 A, MLP, CMV, RS V, etc. En outre, ces séquences d'expression peuvent être modifiées par addition de séquences d'activation, de régulation, etc... Il peut aussi s'agir de promoteur, inductible ou répressible.
Une triple hélice correspond à la fixation d'un oligonucléotide modifié ou non sur de l'ADN double brin par des liaisons hydrogènes dites "de Hoogsteen"
entre les bases du troisième brin et celles de la région en double hélice. Ces appariements se produisent dans le grand sillon de la double hélice et sont spécifiques de la séquence 3o considérée [Frank-Kamenetski, M.D., Triplex DNA Structures, Ann. Rev.
Biochem.,
7 PCT / FR99 / 00643 Target RNA (EP 321 20I), or the sequences encoding antibodies intracellular to simple chain like for example the ScFv.
As indicated above, deoxyribonucleic acid can also contain one or more genes coding for an antigenic peptide capable of generate an immune response in humans or animals. In this mode particular implementation, the invention therefore allows the production of either vaccines or of immunotherapeutic treatments applied to humans or animals, in particular against microorganisms, viruses or cancers. It can be especially from antigenic peptides specific for Epstein Barr virus, HIV virus, virus 1o hepatitis B (EP 185 573), of the pseudo-rabies virus, of "syncitia forming virus ", from influenza virus, cytomegalovirus (CMV), other viruses or specific of tumors (EP 259,212).
Preferably, deoxyribonucleic acid also comprises sequences allowing the expression of the gene of therapeutic interest and / or of the uncomfortable encoding the antigenic peptide in the desired cell or organ. he can to be sequences that are naturally responsible for gene expression considered when these sequences are likely to work in the cell transfected. he may also be sequences of different origin (responsible for the expression other proteins, or even synthetic). In particular, it may be sequences promoters of eukaryotic or viral genes. For example, it could be sequences promoters from the genome of the cell to be infected. Likewise, he can be promoter sequences from the genome of a virus. In this regard, we can cite for example the promoters of the genes E 1 A, MLP, CMV, RS V, etc. In Besides, these expression sequences can be modified by adding sequences activation, regulation, etc ... It can also be promoter, inducible or repressible.
A triple helix corresponds to the binding of a modified or unmodified oligonucleotide on double stranded DNA by so-called "Hoogsteen" hydrogen bonds between the bases of the third strand and those of the region in double helix. These pairings occur in the large groove of the double helix and are specific to the sequence 3o considered [Frank-Kamenetski, MD, Triplex DNA Structures, Ann. Rev.
Biochem.,

8 1995, 64, pp. 65-95). La séquence spécifique en double hélice peut notamment être une séquence homopurique-homopyrimidique. On distingue deux catégories de triples hélices suivant la nature des bases du troisième brin [Sun, J. and C. Hélène, Oligorrucleotide,directed triple-helix formation, Curr. Opin. Struct. Biol., 1993, 3, pp.
345-356] : les bases puriques permettent d'obtenir des appariements C-G*G et T-A*A, et les bases pyrimidiques permettent d'obtenir des appariements C-G*C+ et T-A*T (le symbole * correspond à l'appariement avec le troisième brin).
Ces structures ont été caractérisées du point de vue physico-chimique grâce à
de nombreuses études de RMN (Résonance Magnétique Nucléaire), de température 1o d'hybridation ou de protection à des nucléases, ce qui a permis de définir leurs propriétés et leurs conditions de stabilité. Pour les triples hélices avec un troisième brin purique, ce brin est antiparallèle par rapport au brin purique de l'ADN et la formation de la triple hélice dépend fortement de la concentration en ions divalents :
les ions tels que Mg2+ stabilisent la structure formée avec le troisième brin. Pour les triples hélices avec un troisième brin homopyrimidique, celui-ci est parallèle par rapport au brin purique, et la formation de la triple hélice est dépendante du pH : un pH
acide inférieur à six permet la protonation des cytosines et la formation d'une liaison hydrogène supplémentaire stabilisant le triplet C-G*C+. Il existe également des triples hélices "mixtes" pour lesquelles le troisième brin porte des bases puriques et pyrimidiques.
2o Dans ce cas, l'orientation du troisième brin dépend de la séquence de bases de la région homopurique.
Les oIigonucléotides utilisés dans la présente invention sont des oligonucléotides hybridant directement avec l'ADN double brin. Ces oligonucléotides peuvent contenir les bases suivantes - thymidine (T), qui est capable de former des triplets avec les doublets A.T
de l'ADN double brin (Rajagopal et al, Biochem 28 (1989) 7859), - adénine (A), qui est capable de former des triplets avec les doublets A.T de l'ADN double brin, - guanine (G), qui est capable de former des triplets avec les doublets G.C de l'ADN double brin,
8 1995, 64, pp. 65-95). The specific double helix sequence can in particular to be a homopuric-homopyrimidic sequence. There are two categories of triplets propellers according to the nature of the bases of the third strand [Sun, J. and C. Hélène, Oligorrucleotide, directed triple-helix formation, Curr. Opin. Struct. Biol., 1993, 3, pp.
345-356]: the purine bases make it possible to obtain CG * G and T- pairings A * A, and the pyrimidine bases make it possible to obtain CG * C + and T- pairings A * T (the symbol * corresponds to the pairing with the third strand).
These structures have been characterized from the physico-chemical point of view thanks to numerous NMR (Nuclear Magnetic Resonance), temperature studies 1o of hybridization or protection to nucleases, which made it possible to define their properties and their stability conditions. For triple propellers with a third strand purine, this strand is antiparallel compared to the purine strand of DNA and the training of the triple helix strongly depends on the concentration of divalent ions:
ions such that Mg2 + stabilize the structure formed with the third strand. For the triple propellers with a third homopyrimide strand, this is parallel to the strand purine, and the formation of the triple helix is dependent on pH: a pH
lower acid at six allows protonation of cytosines and bond formation hydrogen additional stabilizing triplet CG * C +. There are also triples propellers "mixed" for which the third strand carries purine bases and pyrimides.
2o In this case, the orientation of the third strand depends on the base sequence of the region homopuric.
The oligonucleotides used in the present invention are oligonucleotides hybridizing directly with double stranded DNA. These oligonucleotides may contain the following bases - thymidine (T), which is able to form triplets with AT doublets double stranded DNA (Rajagopal et al, Biochem 28 (1989) 7859), - adenine (A), which is capable of forming triplets with the AT doublets of double stranded DNA, - guanine (G), which is capable of forming triplets with the GC doublets of double stranded DNA,

9 - cytosine protonée (C+), qui est capable de former des triplets avec les doublets G. C de l'ADN double brin (Rajagopal et al précitée), - uracile (U) qui est capable de former des triplets avec les paires de bases A.U ou A.T.
Pour permettre la formation d'une triple hélice par hybridation, il est important que l'oligonucléotide et la séquence spécifique présente sur l'ADN soient complémentaires. A cet égard, pour obtenir les meilleures fixations et la meilleure sélectivité, on utilise pour le vecteur selon l'invention un oligonucléotide et une séquence spécifique parfaitement complémentaires. Il peut s'agir en particulier d'un oligonucléotide poly-CTT et d'une séquence spécifique poly-GAA. A titre d'exemple, on peut citer foligonucléotide de séquence 5'-GAGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT-3' (GAGG(CTT),, SEQ ID N° 1 ), dans lequel les bases GAGG ne forment pas de triples hélice mais permettent d'espacer l'oligonucléotide du bras de couplage. On peut également citer la séquence (CTT), (SEQ ID N°2). Ces oligonucléotides sont capables de former une triple hélice avec une séquence spécif que comportant des motifs complémentaires (GAA). Il peut s'agir en particulier d'une région comportant 7, 14, ou 17 motifs GA.A. Une autre séquence d'intérët spécifique est la séquence : S'-AAGGGAGGGAGGAGAGGAA-3' (SEQ ID
N°3). Cette séquence forme une triple hélice avec les oligonucléotides 5'-AAGGAGAGGAGGGAGGGAA-3' (SEQ ID N°4) ou 5'-TTGGTGTGGTGGGTGGGTT-3' (SEQ ID N°5).
Dans ce cas, l'oligonucléotide se fixe dans une orientation antiparallèle au brin polypurique. Ces triples hélices ne sont stables qu'en présence de Mg2+ comme cela a été précisé précédemment (Vasquez et al., Biochemistry, 1995, 34, 7243-7251 ;
Beal et Dervan, Science, 1991, 251, 1360-1363).
La séquence spécifique peut être une séquence présente naturellement sur l'ADN double brin, ou une séquence synthétique ou d'origine naturelle introduite artificiellement dans celui-ci. Il est particulièrement intéressant d'utiliser un oligonucléotide capable de former une triple hélice avec une séquence présente naturellement sur l'ADN double brin. En effet, cela permet avantageusement d'obtenir les vecteurs selon l'invention avec des plasmides non-modifiés, notamment des plasmides commerciaux de type pUC, pBR322, pSV, etc... Parmi les séquences homopuriques-homopyrimidiques naturelles présentes sur l'ADN double brin, on peut 5 citer une séquence comprenant tout ou partie de la séquence 5'-CTTCCCGAAGGGAGAAAGG-3' (SEQ m N°6) présente dans l'origine de réplication ColEl de E. coli. Dans ce cas, l'oligonucléotide formant la triple hélice possède la séquence : 5'-GAAGGGTTCTTCCCTCTTTCC-3' (SEQ 1D N°7) et se fixe alternativement sur les deux brins de la double hélice, comme décrit par Beal et lo Dervan (J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4976-4982) et Jayasena et Johnston (Nucleic Acids Res. 1992, 20, 5279-5288). On peut aussi citer. la séquence 5'-GAA.AAAGGAAGAG-3' (SEQ ID N°8) du gène de la ~3-lactamase du plasmide pBR322 (Duval-Valentin et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1992, 89, 504-508).
Une autre séquence est AAGAAAAAAAAGAA (SEQ 1D N° 9) présente dans l'origine de réplication y des plasmides à origine de réplication conditionnelle tel que pCOR.
Bien que des séquences parfaitement complémentaires soient préférées, il est entendu toutefois que certains mésappariements peuvent être toiérés entre la séquence de l'oligonucléotide et la séquence présente sur l'ADN, dès lors qu'ils ne conduisent pas à une trop grande perte d'affinité. On peut citer la séquence 5'-2o AAAAAAGGGAATAAGGG-3' (SEQ m n°10) présente dans le gène de la J3-lactamase de E. coli. Dans ce cas, la thymine interrompant la séquence polypurique peut être reconnue par une guanine du troisième brin, formant ainsi un triplet ATG qui est stable quand il est encadré par deux triplets TAT (Kiessling et al., Biochemistry, 1992, 31, 2829-2834).
L'oligonucléotide utilisé peut être naturel (composé de bases naturelles, non modifiées) ou modifiées chimiquement. En particulier, foligonucléotide peut présenter avantageusement certaines modifications chimiques permettant d'augmenter sa résistance, sa protection vis-à-vis des nucléases, son affinité vis-à-vis de la séquence spécifique ou permettant encore d'apporter d'autres propriétés additionnelles (J.
3U Goodchild, Corrjugates of Oligonucleotides a»d Modified Oligoriucleotides :
A

Review of their Synthesis and Properties, Bioconjugate Chemistry, Vol. 1 N°3, 1990, pp. 165-187).
Selon la présente invention on entend aussi par oligonucléotide tout enchaînement de nucléosides ayant subi une modification du squelette. Parmi les modifications possibles on peut citer, les oligonucléotides phosphorothioates gui sont capable de former des triples hélices avec l'ADN (Xodo et al., Nucleic Acids Res., 1994, 22, 3322-3330), de même que les oligonucléotides possédant des squelettes formacétal ou méthylphosphonate (Matteucci et al., J. Am. Chem. Soc., 1991, 113.
7767-7768). On peut également utiliser les oligonucléotides synthétisés avec des a lo anomères de nucléotides, qui forment également des triples hélices avec l'ADN (Le Doan et al., Nucleic Acids Res., 1987, 15, 7749-7760). Une autre modification du squelette est la liaison phosphoramidate. On peut citer par exemple la liaison internucléotidique N3'-P5' phosphoramidate décrite par Gryaznov et Chen, qui donne des oligonucléotides formant avec l'ADN des triples hélices particulièrement stables (J.
Am. Chem. Soc., 1994, 116. 3143-3144). Parmi les autres modifications du squelette, on peut citer également l'utilisation de ribonucléotides, de 2'-O-méthylribose, de phosphotriester,...(Sun et Hélène, Curr. Opinion Struct. Biol., 116. 3143-3144). Le squelette phosphoré peut enfin être remplacé par un squelette polyamide comme dans les PNA (Peptide Nucleic Acid), qui peuvent également former des triples hélices (Nielsen et al., Science, 1991, 254. 1497-1500 ; Kim et al., J. Am. Chem.
Soc., 1993, 115. 6477-6481 ) ou par un squelette à base de guanidine, comme dans les DNG
(déoxyribonucleic guanidine, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1995, 92 6097-6101), analogues polycationiques de l'ADN, qui forment également des triples hélices.
La thymine du troisième brin peut aussi être remplacée par une 5-bromouracile, ce qui augmente l'a~nité de foligonucléotide pour l'ADN (Povsic et Dervan, J.
Am.
Chem. Soc., 1989, l I l, 3059-3061). Le troisième brin peut également contenir des bases non naturelles, parmi lesquelles on peut citer la 7-déaza-2'-déoxyxanthosine (Milligan et al., ~ Nucleic Acids Res., 1993, 21, 327-333), la I-(2-déoxy-b-D-ribofuranosyl)-3-méthyl-5-amino-lH-pyrazolo[4,3-d]pyrimidine-7-one (Koh et Dervan, J. Am. Chem. Soc., 1992, 114, 1470-1478), la 8-oxoadénine, la 2-WO 99/49067 PCT/FR99/OOb43 aminopurine, la 2'-O-méthyl-pseudoisocytidine, ou toute autre modification connue de l'homme du métier (voir pour revue Sun et Hélène, Curr. Opinion Struct. Biol., 1993, 3 345-356).
Un autre type de modification de l'oligonucléotide a plus particulièrement pour objet d'améliorer l'interaction etlou l'affinité entre l'oligonucléotide et la séquence spécifique. En particulier, une modification tout à fait avantageuse consiste à coupler un agent alkylant à l'oligonucléotide. La liaison peut se faire soit chimiquement, soit photochimiquement par l'intermédiaire d'un groupement fonctionnel photoréactif. Des agents alkylants avantageux sont notamment les agents alkylants photoactivables, par lo exemple les psoralènes. Sous l'action de la lumière, ils forment des liaisons covalentes au niveau de bases pyrimidiques de l'ADN. Quand ces molécules sont intercalées au niveau de séquences 5'-ApT-3' ou 5'-TpA-3' dans un fragment d'ADN double brin, ils forment des liens avec les deux brins. Cette réaction de liaison induite par la lumière peut se produire sur un site spécifique du plasmide.
1~ Comme cela a été souligné précédemment, un avantage de la présente invention est donc la possibilité de former des triples hélices très stables et site-spécifiques entre l'oligonucléotide et une séquence spécifique de l'ADN double brin grâce à une liaison covalente formée via un agent alkylant.
La longueur de l'oligonucléotide utilisé dans le procédé de l'invention est d'au 2o moins 3 bases, et de préférence, comprise entre 5 et 30 bases. On utilise de manière avantageuse un oligonucléotide de longueur comprise entre 10 et 30 bases. La longueur peut bien entendu être adaptée au cas par cas par l'homme du métier en fonction de la sélectivité et de la stabilité de l'interaction recherchées.
Les oligonucléotides selon l'invention peuvent être synthétisés par toute 25 technique connue. En particulier, ils peuvent être préparés au moyen de synthétiseurs d'acides nucléiques. Toute autre méthode connue de l'homme du métier peut également être utilisée.

Au sens de l'invention, on entend par « signal de ciblage » des molécules de ciblage de nature variée. Il s'agit dans la plupart des cas de peptides connus pour le ciblage. Ils peuvent être utilisés pour interagir avec un composant de la matrice extracellulaire, un récepteur de la membrane plasmique, pour cibler un compartiment intracellulaire ou pour améliorer le trafic intracellulaire d'ADN, lors du transfert non viral de gènes en thérapie génique.
Ces signaux de ciblage peuvent comprendre par exemple les facteurs de croissance (EGF, PDGF, TGFb, NGF, IGF I, FGF), les cytokines (IL-l, IL-2, TNF, Interferon, CSF), les hormones (insuline, hormone de croissance, prolactine, glucagon, lo hormone thyroïdienne, hormones stéroidiennes), les sucres qui reconnaissent des lectines, les immunoglobulines, les ScFv, la transferrine, les lipoprotéines, les vitamines telles que la vitamine B 12, les hormones peptidiques ou les neuropeptides (tachykinines, neurotensine, VIP, endothéline, CGRP, CCK, ...), ou tout motif reconnu par les intégrines, par exemple le peptide RGD, ou par d'autres protéines extrinsèques de la membrane cellulaire.
On peut utiliser des protéines entières, ou des séquences peptidiques dérivées de ces protéines, ou encore des peptides se fixant sur leur récepteur et obtenus par la technique de "phage display" ou par synthèse combinatoire.
Des signaux de cibiage intracellulaires peuvent être envisagés. Beaucoup de 2o séquences d'adressage nucléaire (NLS) de composition en acides aminés variée ont été
identifiées et permettent de cibler différentes protéines impliquées dans le transport nucléaire de protéines ou d'acides nucléiques. Parmi ces séquences figurent notamment des séquences courtes (le NLS de l'antigène T de SV40 (PKKICRICV, SEQ 117 N° I 1 ) est un exemple), des séquences bipartites (le NLS de la nucléoplasmine qui contient deux domaines essentiels pour le transport nucléaire KRPAATKKAGQAKKKKLDK, SEQ ID N°12), ou ia séquence M9 (NQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGY, SEQ ID N°13) de la protéine hnRNPAI. Les protéines portant ces séauencec NT.C ~P ~YP.,r ~",~
,~p~
récepteurs spécifiques, tels que les récepteurs de la famille des importines ou karyophérines par exemple. Le rôle de ces séquence est de diriger l'ADN à
l'intérieur du noyau, où il est alors immédiatement disponible pour Ia machinerie de transcription, et peut être exprimé.
Les signaux de ciblage "mixtes", c'est-à-dire qui peuvent à la fois servir pour le ciblage intracellulaire et extracellulaire, entrent également dans le cadre de la présente invention. On peut par exemple citer les sucres qui ciblent des lectines qui se situent sur la membrane cellulaire mais également au niveau des pores nucléaire. Le ciblage par ces sucres concerne donc aussi bien le ciblage extraceIlulaire que l'import nucléaire.
D'autres signaux sont impliqués dans le ciblage mitochondrial (par exemple, la partie N-terminale de l'ornithine transcarbamylase (OTC) de rat permet le ciblage des mitochondries) ou dans l'adressage vers le réticulum endoplasmique. Enfin, certains signaux permettent la rétention nucléaire ou au niveau du réticulum endoplasmique (tels que la séquence KDEL).
Avantageusement, les signaux de ciblage selon l'invention permettent de diriger spécifiquement l'ADN double brin vers certaines cellules ou certains compartiments cellulaires. A titre d'exemple, les signaux de ciblage selon l'invention peuvent cibler des récepteurs ou des ligands à la surface de la cellule, notamment les récepteurs de l'insuline, de la transferrine, de l'acide folique, ou tout autre facteur de croissance, 2o cytokines, ou vitamines, ou des polysaccharides particuliers à la surface de la cellule ou sur la matrice extracellulaire avoisinante.
La synthèse de chimères oligonucléotide-signal de ciblage se fait en phase soude ou en solution et tient compte des propriétés de stabilité chimique très différentes des oligonucléotides et des signaux de ciblage [Erijita, R. et al., Synthesis 2s of defrned peptide-oligonucleotide hybrids containing a nuclear transport signal sequence, Tetrahedron, 1991, 47(24), pp. 4113-4120]. En solution, des couplages en une étape sont envisageables : le signal de ciblage peut par exemple être synthétisé
avec un groupement portant des fonctions disulfirre, maléimide, amine, carboxyle, ester, époxyde, bromure de cyanogène, ou aldéhyde, et être couplé à un oligonucléotide modifié par un groupement terminal thiol, amine, ou carboxyle en position 3' ou 5'. Ces couplages se forment par établissement de liaisons disulfure, thioéther, ester, amide, ou amine entre I'oligonucléotide et le signal de ciblage. Toute autre méthode connue de l'homme du métier peut être utilisée, telle que les réactifs de 5 couplage bifonctionnel par exempie.
Un autre objet de l'invention concerne les compositions comprenant un vecteur tel que défini précédemment.
Avantageusement, les vecteurs selon l'invention peuvent également être associés à un ou plusieurs agents connus pour transfecter l'ADN. On peut citer à titre
9 - protonated cytosine (C +), which is able to form triplets with doublets G. C of double stranded DNA (Rajagopal et al above), - uracil (U) which is able to form triplets with base pairs AU or AT
To allow the formation of a triple helix by hybridization, it is important that the oligonucleotide and the specific sequence present on the DNA are complementary. In this regard, to obtain the best fixings and the better selectivity, an oligonucleotide is used for the vector according to the invention and an specific sequence perfectly complementary. It can be in particular of a poly-CTT oligonucleotide and a specific poly-GAA sequence. As example, mention may be made of the foligonucleotide of sequence 5'-GAGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT-3 '(GAGG (CTT) ,, SEQ ID N ° 1), in which the GAGG bases do not form triple helices but allow to space the oligonucleotide of the coupling arm. We can also cite the sequence (CTT), (SEQ ID N ° 2). These oligonucleotides are capable of forming a triple propeller with a specific sequence that includes complementary patterns (GAA). he can act in particular of a region comprising 7, 14, or 17 GA.A. Another sequence of specific interest is the sequence: S'-AAGGGAGGGAGGAGAGGAA-3 '(SEQ ID
N ° 3). This sequence forms a triple helix with the oligonucleotides 5'-AAGGAGAGGAGGGAGGGAA-3 '(SEQ ID N ° 4) or 5'-TTGGTGTGGTGGGTGGGTT-3 '(SEQ ID N ° 5).
In this case, the oligonucleotide binds in an antiparallel orientation to the strand polypuric. These triple helices are only stable in the presence of Mg2 + as this has was previously specified (Vasquez et al., Biochemistry, 1995, 34, 7243-7251;
Beal & Dervan, Science, 1991, 251, 1360-1363).
The specific sequence can be a sequence naturally present on double stranded DNA, or a synthetic or naturally occurring sequence introduced artificially in this one. It is particularly interesting to use a oligonucleotide capable of forming a triple helix with a sequence present naturally on double stranded DNA. Indeed, this advantageously allows to get the vectors according to the invention with unmodified plasmids, in particular commercial plasmids of pUC, pBR322, pSV type, etc. Among the sequences natural homopuric-homopyrimidine present on double stranded DNA, we can 5 cite a sequence comprising all or part of the sequence 5'-CTTCCCGAAGGGAGAAAGG-3 '(SEQ m N ° 6) present in the origin of ColEl replication of E. coli. In this case, the oligonucleotide forming the triple propeller has the sequence: 5'-GAAGGGTTCTTCCCTCTTTCC-3 '(SEQ 1D N ° 7) and is fixed alternately on the two strands of the double helix, as described by Beal and lo Dervan (J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 4976-4982) and Jayasena and Johnston (Nucleic Acids Res. 1992, 20, 5279-5288). We can also cite. the sequence 5'-GAA.AAAGGAAGAG-3 '(SEQ ID No. 8) of the ~ 3-lactamase gene from plasmid pBR322 (Duval-Valentin et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1992, 89, 504-508).
A
other sequence is AAGAAAAAAAAGAA (SEQ 1D N ° 9) present in the origin of y replication of plasmids from conditional replication such as pCOR.
Although perfectly complementary sequences are preferred, it is understood however that some mismatches may be iterated between the sequence of the oligonucleotide and the sequence present on the DNA, since they do not drive not too much loss of affinity. We can quote the sequence 5'-2o AAAAAAGGGAATAAGGG-3 '(SEQ mn ° 10) present in the gene for J3-lactamase from E. coli. In this case, the thymine interrupting the sequence polypuric can be recognized by a third strand guanine, thus forming a triplet ATG who is stable when it is framed by two TAT triplets (Kiessling et al., Biochemistry, 1992, 31, 2829-2834).
The oligonucleotide used can be natural (composed of natural bases, not modified) or chemically modified. In particular, foligonucleotide can present advantageously certain chemical modifications making it possible to increase its resistance, its protection against nucleases, its affinity for the sequence specific or allowing to bring other additional properties (J.
3U Goodchild, Corrjugates of Oligonucleotides a »d Modified Oligoriucleotides:
AT

Review of their Synthesis and Properties, Bioconjugate Chemistry, Vol. 1 N ° 3, 1990, pp. 165-187).
According to the present invention, the term “oligonucleotide” also means any sequence of skeleton-modified nucleosides. Among the possible modifications include, phosphorothioate oligonucleotides mistletoe are capable of forming triple helices with DNA (Xodo et al., Nucleic Acids Res., 1994, 22, 3322-3330), as well as the oligonucleotides having skeletons formacetal or methylphosphonate (Matteucci et al., J. Am. Chem. Soc., 1991, 113.
7767-7768). It is also possible to use the oligonucleotides synthesized with of his lo nucleotide anomers, which also form triple helices with DNA (The Doan et al., Nucleic Acids Res., 1987, 15, 7749-7760). Another modification of backbone is the phosphoramidate bond. One can quote for example the connection internucleotide N3'-P5 'phosphoramidate described by Gryaznov and Chen, who given oligonucleotides which, with DNA, form particularly triple helices stable (J.
Am. Chem. Soc., 1994, 116. 3143-3144). Among the other modifications of the skeleton, we can also cite the use of ribonucleotides, 2'-O-methylribose, of phosphotriester, ... (Sun and Hélène, Curr. Opinion Struct. Biol., 116. 3143-3144). The phosphorus skeleton can finally be replaced by a polyamide skeleton like in PNA (Peptide Nucleic Acid), which can also form triples propellers (Nielsen et al., Science, 1991, 254. 1497-1500; Kim et al., J. Am. Chem.
Soc., 1993, 115. 6477-6481) or by a guanidine-based skeleton, as in the DNG
(deoxyribonucleic guanidine, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1995, 92 6097-6101), polycationic analogs of DNA, which also form triple helices.
The third strand thymine can also be replaced by a 5-bromouracil, which increases the f ~ oligonucleotide for DNA (Povsic and Dervan, J.
Am.
Chem. Soc., 1989, l I l, 3059-3061). The third strand may also contain of non-natural bases, among which we can cite 7-deaza-2'-deoxyxanthosine (Milligan et al., ~ Nucleic Acids Res., 1993, 21, 327-333), I- (2-deoxy-bD-ribofuranosyl) -3-methyl-5-amino-1H-pyrazolo [4,3-d] pyrimidine-7-one (Koh and Dervan, J. Am. Chem. Soc., 1992, 114, 1470-1478), 8-oxoadenine, 2-WO 99/49067 PCT / FR99 / OOb43 aminopurine, 2'-O-methyl-pseudoisocytidine, or any other modification known to a person skilled in the art (see Sun and Hélène for review, Curr. Opinion Struct. Biol., 1993, 3 345-356).
Another type of modification of the oligonucleotide has more particularly for object of improving the interaction and / or the affinity between the oligonucleotide and the sequence specific. In particular, an entirely advantageous modification consists of to couple an oligonucleotide alkylating agent. The connection can be made either chemically either photochemically via a functional group photoreactive. Of advantageous alkylating agents are in particular alkylating agents photoactivable, by lo example psoralens. Under the action of light, they form covalent bonds at the level of pyrimidine bases of DNA. When these molecules are interposed at 5'-ApT-3 'or 5'-TpA-3' sequence level in a double-stranded DNA fragment, they form links with the two strands. This induced binding reaction by light can occur at a specific site on the plasmid.
1 ~ As noted earlier, an advantage of this invention is therefore the possibility of forming very stable triple helices and site-between the oligonucleotide and a specific sequence of double DNA
strand thanks to a covalent bond formed via an alkylating agent.
The length of the oligonucleotide used in the process of the invention is from at 2o minus 3 bases, and preferably between 5 and 30 bases. We use so advantageous an oligonucleotide of length between 10 and 30 bases. The length can of course be adapted on a case-by-case basis by a person skilled in the art in function of the selectivity and the stability of the interaction sought.
The oligonucleotides according to the invention can be synthesized by any 25 known technique. In particular, they can be prepared by means of synthesizers nucleic acids. Any other method known to a person skilled in the art can also be used.

Within the meaning of the invention, the term “targeting signal” means molecules of targeting of various kinds. In most cases, these are known peptides for the targeting. They can be used to interact with a component of the matrix extracellular, a plasma membrane receptor, to target a compartment intracellular or to improve intracellular DNA trafficking, when transfer no viral gene therapy in gene therapy.
These targeting signals may include, for example, growth (EGF, PDGF, TGFb, NGF, IGF I, FGF), cytokines (IL-1, IL-2, TNF, Interferon, CSF), hormones (insulin, growth hormone, prolactin, glucagon, lo thyroid hormone, steroid hormones), sugars that recognize of lectins, immunoglobulins, ScFv, transferrin, lipoproteins, vitamins such as vitamin B 12, peptide hormones or neuropeptides (tachykinins, neurotensin, VIP, endothelin, CGRP, CCK, ...), or any reason recognized by integrins, for example the peptide RGD, or by others protein extrinsic of the cell membrane.
We can use whole proteins, or peptide sequences derived of these proteins, or peptides that bind to their receptor and obtained by the "phage display" technique or by combinatorial synthesis.
Intracellular targeting signals can be considered. A lot of 2o nuclear addressing sequences (NLS) of amino acid composition varied have been identified and allow to target different proteins involved in the transport nuclear of proteins or nucleic acids. Among these sequences are in particular short sequences (the NLS of the SV40 T antigen (PKKICRICV, SEQ 117 N ° I 1) is an example), bipartite sequences (the NLS of nucleoplasmin which contains two essential areas for nuclear transport KRPAATKKAGQAKKKKLDK, SEQ ID No. 12), or ia sequence M9 (NQSSNFGPMKGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPRNQGGY, SEQ ID N ° 13) from hnRNPAI protein. The proteins carrying these sequences are NT.C ~ P ~ YP., R ~ ", ~
, ~ p ~
specific receptors, such as the importin family receptors or karyopherins for example. The role of these sequences is to direct DNA to the interior of the nucleus, where it is then immediately available for the machinery of transcription, and can be expressed.
Targeting signals "mixed", that is to say that can both serve for the intracellular and extracellular targeting, are also part of the current invention. We can for example quote sugars which target lectins which situate on the cell membrane but also at the nuclear pore level. The targeting by these sugars therefore concerns both extracellular targeting and the import nuclear.
Other signals are involved in mitochondrial targeting (for example, N-terminal part of rat ornithine transcarbamylase (OTC) allows the targeting mitochondria) or in addressing to the endoplasmic reticulum. Finally, some signals allow nuclear retention or at the reticulum level endoplasmic (such as the KDEL sequence).
Advantageously, the targeting signals according to the invention make it possible to lead specifically double stranded DNA to certain cells or certain compartments cellular. By way of example, the targeting signals according to the invention can target receptors or ligands on the cell surface, especially receptors of insulin, transferrin, folic acid, or any other factor growth, 2o cytokines, or vitamins, or specific polysaccharides on the surface of the cell or on the surrounding extracellular matrix.
The synthesis of oligonucleotide-targeting signal chimeras takes place in phase soda or in solution and takes into account the properties of chemical stability very different from oligonucleotides and targeting signals [Erijita, R. and al., Synthesis 2s of defrned peptide-oligonucleotide hybrids containing a nuclear transport signal sequence, Tetrahedron, 1991, 47 (24), pp. 4113-4120]. In solution, couplings in a step can be envisaged: the targeting signal can for example be synthesized with a group carrying disulfirre, maleimide, amine functions, carboxyl, ester, epoxide, cyanogen bromide, or aldehyde, and be coupled to a oligonucleotide modified by a terminal thiol, amine or carboxyl group in position 3 'or 5'. These couplings are formed by establishing links disulfide, thioether, ester, amide, or amine between the oligonucleotide and the signal targeting. Any other method known to those skilled in the art can be used, such as reagents 5 bifunctional coupling for example.
Another subject of the invention relates to the compositions comprising a vector as defined above.
Advantageously, the vectors according to the invention can also be associated with one or more agents known to transfect DNA. We can cite as

10 d'exemple les lipides cationiques qui possèdent des propriétés intéressantes. Ces vecteurs sont en effet constitués d'une partie polaire, cationique, interagissant avec l'ADN, et d'une partie lipidique, hydrophobe, favorisant la pénétration cellulaire et rendant l'interraction ionique avec l'ADN insensible au milieu externe. Des exemples particuliers de lipides cationiques sont notamment les lipides monocationiques 15 (DOTMA : Lipofectin~), certains détergents cationiques (DDAB), les lipopolyamines et en particulier ta dioctadécylamidoglycyl spermine (DOGS) ou la 5-carboxyspermylamide de la palmitoylphosphatidyléthanolamine (DPPES) dont la préparation a été décrite par exemple dans la demande de brevet EP 394 111.
Une autre famille intéressante de lipopolyamines est représentée par les composés décrits dans la demande de brevet WO 97/18185 incorporée à la présente par référence.
De nombreux autres lipides cationiques ont été développés et peuvent être utilisés avec les vecteurs selon l'invention.
Parmi les agents de transfection synthétiques développés, les polymères cationiques de type polylysine et DEAE dextran sont également avantageux. II
est aussi possible d'utiliser les polymères de polyéthylène imine (PEI) et de polypropylène imine (PPI) qui sont accessibles commercialement et peuvent être préparés selon le procédé décrit dans la demande de brevet WO 96/02655.
D'une manière générale, tout agent synthétique connu pour transfecter l'acide nucléique peut être associé aux vecteurs selon l'invention.

WO 99!49067 PCT/FR99/00643 Les compositions peuvent en outre comporter des adjuvants capables de s'associer aux complexes vecteur selon l'invention/agent de transfection et d'en améliorer le pouvoir transfectant. Dans un autre mode de mise en oeuvre, la présente invention concerne donc des compositions comprenant un vecteur tel que défini précédemment, un ou plusieurs agents de transfection tels que définis ci-avant et un ou plusieurs adjuvants capables de s'associer aux complexes vecteur selon l'invention/agent(s) de transfection et d'en améliorer le pouvoir transfectant. La présence de ce type d'adjuvant (lipides, peptides ou protéines par exemple) peut permettre avantageusement d'augmenter le pouvoir transfectant des composés.
1o Dans cette optique, les compositions de l'invention peuvent comprendre comme adjuvant, un ou plusieurs lipides neutres dont l'utilisation est particulièrement avantageuse. La demanderesse a en effet montré que l'addition d'un lipide neutre permet d'améliorer la formation des particules nucléolipidiques et de favoriser la pénétration de la particule dans la cellule en déstabilisant sa membrane.
Plus préférentiellement, les lipides neutres utilisés dans le cadre de la présente invention sont des lipides à 2 chaînes grasses. De manière particulièrement avantageuse, on utilise des lipides naturels ou synthétiques, zwitterioniques ou dépourvus de charge ionique dans les conditions physiologique. Il peuvent être choisis plus particulièrement parmi la dioleoylphosphatidyléthanolamine (DOPE), l'oléoyl-2U palmitoylphosphatidyléthanolamine (POPE), les di-stéaroyl, -palmitoyl, -mirystoyl phosphatidyléthanolamines ainsi que leurs dérivé N-méthylés 1 à 3 fois, les phosphatidylglycérols, les diacylglycérols, les glycosyldiacylglycérols, les cérébrosides (tels que notamment les galactocérébrosides), les sphingolipides (tels que notamment les sphingomyélines) ou encore les asialogangliosides {tels que notamment les asialoGM 1 et GM2).
Ces différents lipides peuvent être obtenus soit par synthèse, soit par extraction à partir d'organes (exemple : le cerveau) ou d'oeufs, par des techniques classiques bien connues de l'homme du métier. En particulier, l'extraction des lipides naturels peut être réalisée au moyen de solvants organiques (voir également Lehninger, 3o Biochemistry).

La demanderesse a démontré qu'il était également particulièrement avantageux d'employer à titre d'adjuvant, un composé intervenant ou non directement au niveau de la condensation de l'ADN (WO 96/25508). La présence d'un tel composé, au sein d'une composition selon l'invention permet de diminuer la quantité de composé
s transfectant, avec les conséquences bénéfiques qui en découlent sur le plan toxicologique, sans porter un préjudice quelconque à l'activité transfectante.
Par composé intervenant au niveau de la condensation de l'acide nucléique, on entend définir un composé compactant, directement ou non, l'ADN. Plus précisément, ce composé peut soit agir directement au niveau de l'ADN à transfecter soit intervenir au 1o niveau d'un composé annexe qui lui est directement impliqué dans la condensation de cet acide nucléique. De préférence, il agit directement au . niveau de l'ADN.
Notamment, cet agent intervenant dans la condensation de l'ADN peut être tout polycation, par exemple la polylysine. Selon un mode de réalisation préféré, cet agent peut aussi être tout composé dérivant en tout ou partie d'une histone, d'une nucléoline, 15 d'une protamine et/ou de l'un de leurs dérivés. Un tel agent peut également être constitué, en tout ou partie, de motifs peptidiques (KTPKKAICKP) et/ou (ATPAKKAA), le nombre des motifs pouvant varier entre 2 et 10. Dans la structure du composé selon l'invention, ces motifs peuvent être répétés de manière continue ou non. C'est ainsi qu'ils peuvent être séparés par des liens de nature biochimique, par 2o exemple par un ou plusieurs acides aminés, ou de nature chimique.
L'invention a également pour objet l'utilisation des vecteurs tels que définis ci-avant pour fabriquer un médicament destiné à soigner les maladies par transfection d'ADN dans des cellules primaires ou dans des lignées cellulaires établies. Il peut s'agir de cellules fibroblastiques, musculaires, nerveuses (neurones, astrocytes, cellules 25 gliales), hépatiques, de la lignée hématopoiétique (lymphocytes, CD34, dendritiques, etc...), épithéliales, etc..., sous formes différenciées ou pluripotentes (précurseurs).
Les vecteurs de l'invention peuvent à titre illustratif ëtre utilisés pour la transfection in vitro, ex vivo ou in vivo d'ADN codant pour des protéines ou des polypeptides.

Pour des utilisations in vivo, soit en thérapie soit pour l'étude de la régulation de gènes ou la création de modèles animaux de pathologies, les compositions selon l'invention peuvent être formulées en vue d'administrations par voie topique, cutanée, orale, rectale, vaginale, parentérale, intranasale, intraveineuse, intramusculaire, sous-cutanée, intraoculaire, transdermique, intratrachéale, intrapéritonéale, etc... De préférence, les compositions de l'invention contiennent un véhicule pharmaceutiquement acceptable pour une formulation injectable, notamment pour une injection directe au niveau de l'organe désiré, ou pour une administration par voie topique (sur peau et/ou muqueuse). Il peut s'agir en particulier de solutions stériles, isotoniques, ou de compositions sèches, notamment lyophilisées, qui, par addition selon le cas d'eau stérilisée ou de sérum physiologique, permettent la constitution de solutés injectables. Les doses d'acide nucléique utilisées pour l'injection ainsi que le nombre d'administrations peuvent être adaptées en fonction de différents paramètres, et notamment en fonction du mode d'administration utilisé, de la pathologie concernée, du gène à exprimer, ou encore de la durée du traitement recherchée. En ce qui concerne plus particulièrement le mode d'administration, il peut s'agir soit d'une injection directe dans les tissus ou les voies circulatoires, soit d'un traitement de cellules en culture suivi de leur réimplantation in vivo, par injection ou greffe.
L'invention concerne en outre une méthode de transfection d'ADN dans les 2o cellules comprenant les étapes suivantes (1) synthèse de la chimère oligonucléotide - signal de ciblage selon le procédé
décrit précédemment, (2) mise en contact de la chimère synthétisée en (1) avec un ADN double brin pour former des triples hélices, (3) éventuellement, complexation du vecteur obtenu en (2) avec un ou plusieurs agents de transfection et/ou un ou plusieurs adjuvant(s), et (4) mise en contact des cellules avec le complexe formé en (2) ou le cas échéant en (3 ).

La mise en contact des cellules avec le complexe peut être réalisée par incubation des cellules avec ledit complexe (pour de utilisations in vitro ou ex vivo), ou par injection du complexe dans un organisme (pour des utilisations in vivo).
La présente invention fournit ainsi une méthode particulièrement avantageuse s pour le traitement de maladies par administration d'un vecteur selon l'invention contenant un acide nucléique apte à corriger ladite maladie. Plus particulièrement, cette méthode est applicable aux maladies résultant d'une déficience en un produit protéique ou peptidique, l'ADN administré codant pour ledit produit protéique ou peptidique. La présente invention s'étend à toute utilisation d'un vecteur selon lo l'invention pour la transfection in vivo, ex vivo ou in vitro de cellules.
L'invention concerne également toute cellule recombinante contenant un vecteur tel que défini ci-avant. II s'agit préférentiellement de cellules eucaryotes, par exemple des levures, des cellules animales, etc... Ces cellules sont obtenues par toute technique permettant l'introduction d'un ADN dans une cellule donnée et connue de 15 l'homme du métier.
Les exemples suivants destinés à illustrer l'invention sans en limiter la portée"
permettent de mettre en évidence d'autres caractéristiques et avantages de la présente invention.
FIG- URSS
2o Fi~~ure 1 : Couplage d'un oligonucléotide (ODN) et du peptide maléimide-NLS.
Fi ure 2 : Analyse sur gel de polyacrylamide 15 % de la chimère oligonucléotide -peptide (Pso-GA19-NLS) par action protéolytique de la trypsine.
1 = oligo Pso-GA~9-SH
2 = chimère oligonucléotide-peptide Pso-GA,9-NLS
25 3 = chimère oIigonucléotide-peptide Pso-GA,9-NLS après digestion par la trypsine Fi ure 3 : représentation schématique du plasmide pXL2813.

Figure 4 : représentation schématique du plasmide pXL2652.
Figure 5 : Analyse sur gel de polyacrylamide 15 % de la formation de triples hélices entre le plasmide pXI,2813 et la chimère oligonucléotide-peptide Pso-GAl9-NLS.
L'oligonucléotide pso-GA,9-NLS et le plasmide sont mélangés dans un tampon s contenant 100 mM de MgCl2. L'excès en molarité de l'oligonucléotide par rapport au plasmide varie de 0 à 200. Le mélange est photoactivé, après une nuit à
37°C, puis digéré par deux enzymes de restriction qui coupent le plasmide de part et d'autre de la région de formation des triples hélices.
1 = pas d'oligonucléotide 2 = excès en molarité d'oligonucléotide par rapport au plasmide de I S
3 = excès en molarité d'oligonucléotide par rapport au plasmide de 50 4 = excès en molarité d'oligonucléotide par rapport au plasmide de 100 5 = excès en molarité d'oligonucléotide par rapport au plasmide de 200 6 = oligonucléotide seul photoactivé
15 7 = oligonucléotide seul non photoactivé
8 = excès en molarité d'oligonucléotide par rapport au plasmide de 30, le mélange n'ayant pas été photoactivé.
Fi ure 6 : Expression in vitro du transgène (J3-galactosidase) pour des essais effectués avec le plasmide pXL2813 seul, le vecteur pXL,2813-Pso-GA,9-NLS, et sans plasmide.
2o Fi ure 7 : Caractérisation de la partie peptidique de la chimère oligonucléotide-peptide Pso-GA,9-NLS par interaction avec l'importine 60-GST (analyse sur gel de polyacrylamide I S %).
1 = oligo Pso-GA19 ( I pg) 2 = chimère oligonucléotide-peptide Pso-GAl9-NLS (l~cg) 3 = surnageant récupéré après incubation des billes-glutathion recouvertes d'impor-tines 60 et de l'oligonucléotide Pso-GA,9, et séparation du culot de billes (contenant les éléments interagissant avec les importines) du surnageant 4 = culot récupéré après incubation des billes-glutathion recouvertes d'importines 60 et de l'oligonucléotide Pso-GA19, et séparation du culot de billes (contenant les éléments interagissant avec les importines) du surnageant = surnageant récupéré après incubation des billes-glutathion recouvertes d'impor-5 tines 60 et de la chimère oligonucléotide-peptide Pso-GA~9-NLS, et séparation du culot de billes (contenant les éléments interagissant avec les importines) du surnageant 6 = culot récupéré après incubation des billes-glutathion recouvertes d'importines 60 et de la chimère oligonucléotide-peptide Pso-GA19-NLS, et séparation du culot de billes (contenant les éléments interagissant avec les importines) du surnageant.
Io Fi ure 8 : Analyse sur gel de polyacrylamide 15 % de la chimère oIigonucIéotide-peptide (GA,9-NLS) par action protéolytique de la trypsine.
1 = oligo GA,9-SH (200 ng) 2 = chimère oligonucléotide-peptide GA,9-NLS ( 1 pg) avant purification par chroma-tographie liquide à haute pression 3 = chimère oligonucléotide-peptide GA~9-NLS ( 1 pg) après purification 4 = chimère oligonucléotide-peptide GA19-NLS après digestion par la trypsine ( 1 ~tg).
Fitxure 9 : Représentation graphique de la cinétique de formation des triples hélices (%
de sites de triples hélices occupé en fonction du temps) entre le plasmide pXL2813 et la chimère GA~9-NLS.
2o F_iRure 10 : Caractérisation de la partie peptidique de la chimère oligonucléotide-peptide GAl9-NLS par interaction avec l'importine 60-GST.
1 = chimère oligonucléotide-peptide GA~9-NLS, 2 = oligo GA,9, 3 - surnageant récupéré après incubation des billes-glutathion recouvertes d'importines 60 et de la chimère oligonucléotide-peptide GAIS-NLS, et séparation du culot de billes (contenant les éléments interagissant avec les importines) du surnageant, 4 = culot récupéré après incubation des billes-glutathion recouvertes d'importines 60 et de la chimère oligonucléotide-peptide GA19-NLS, et séparation du culot de billes (contenant les éléments interagissant avec ies importines) du surnageant, - surnageant récupéré après incubation des billes-glutathion recouvertes d'importines 60 et de l'oligonucléotide GA,9 et séparation du culot de billes (contenant tes éléments interagissant avec les importines) du surnageant, 6 = culot récupéré après incubation des billes-glutathion recouvertes d'importines 60 5 et de l'oligonucléotide GA,9, et séparation du culot de billes (contenant les éléments interagissant avec ies importines) du surnageant.
Figuure 1 I : représentation schématique du plasmide pXL,2997.
Figure 12 : Représentation graphique de la cinétique de formation des triples hélices (% de sites de triples hélices occupé en fonction du temps) entre le plasmide pXL2997 et la chimëre pim-NLS.
Figure 13 : histogramme représentant l'activité ~3-galactosidase in vivo dans des tumeurs pulmonaires humaines H1299 des plasmides pXI,2813 (indiqué Bgal sur la figure) et pXL,2813-Pso-GA,9-NLS (indiqué NLS-Bgal sur la figure) en RLU
(« Relative Light Unit ») par tumeur.
La transfection a été faite en utilisant les techniques d'électrotransfert telles que décrites dans les demandes W099/01157 et WO 99/01158.
MATERIEL ET METAODES
1. Couplage des oligonucléotides et des peptides Les olitxonucléotides 2o Les oligonucléotides utilisés sont soit la séquence 5' AAGGAGAGGAGGGAGGGAA-3' (SEQ m N°4) d'une longueur de 19 bases et référencée sous le nom de « GA,9 » dans la suite du texte, soit la séquence 5' GGGGAGGGGGAGG-3' (SEQ )D N°15) d'une longueur de 13 bases et référencée sous le nom « pim » dans la suite du texte (car il s'agit de la séquence du protooncogène pim-1).
Les oligonucléotides notés GA,9-SH ou pim-SH ont les mêmes séquences que GA,9 et pim respectivement et un groupement thiol à l'extrémité 5', avec un espaceur de six carbones entre le tlliol et le phosphate de l'extrémité 5'. Les oligonucléotides notés Pso-GA19-SH ont un groupement thiol à l'extrémité 3' (SH), et en plus, un psoraiène à
l'extrémité 5' (Pso), avec un espaceur de six carbones entre le psoralène et le phosphate de l'extrémité 5'. Les oligonucléotides notés Pso-GA,9 n'ont pas de groupement thiol.
La nomenclature utilisée est résumée dans le tableau I ci-dessous nom de l'oligonuclotidemodification de l'extrmitmodification de l'extrmit 3' 5' GA,9 aucune aucune Pim aucune aucune GA,9-SH aucune ~ groupement thiol pim-SH aucune groupement thiol Pso-GA,9 aucune psoralne Pso-GA~9-SH groupement thiol psoralne Tableau I
Ces oligonucléotides lyophilisés sont repris dans un tampon acétate de triéthylammonium 100 mM, pH = 7.
Les peptides lo Les peptides utilisés pour les couplages sont synthétisés par un automate en phase solide. Ils contiennent - soit la séquence de localisation nucléaire de l'antigène T de SV40 (PKICKRKV, SEQ
ID N°11), - soit la même séquence mutée (PK1VICRKV, SEQ l'D N° 14) qui ne permet ni ie ciblage ni le transport nucléaire (du fait de la mutation).
Ces peptides portent également un espaceur de quatre acides aminés à
l'extrémité N-terminale : KGAG. La lysine N-terminale est modifiée chimiquement: elle contient un groupement maléimide sur le carbone E et un groupement protecteur 9-fluorenylméthyloxycarbonyl (Fmoc) sur l'amine du carbone a. Ce groupement Fmoc absorbe à 260 nm ce qui permet de suivre le peptide par chromatographie liquide à
haute pression en phase inverse. Le groupement C-terminal est également protégé
(groupement CONHZ), la protection étant ajoutée en fin de synthèse peptidique.
La représentation des peptides est indiquée dans le tableau II ci-dessous nom du peptide squence et modifications malimide-~GAGPKKKRK~-CONHz malimide-NL
S

FF'' moc malimide- KGAGPKNKRKV~--CONHz malimide-NLSmut ' ~
Fmoc Tableau II
Les peptides lyophilisés sont repris dans un tampon acétate de triéthylammonium 100 mM, pH = 7. La concentration est de 0,4 mglml.
Les coula es Pour le couplage avec les oligonucléotides, la stratégie utilisée consiste à
faire réagir le groupement thiol porté par l'oligonucléotide et le groupement maléimide porté
par le peptide [Eritja, R., et al., Synthesis of defrned peptide-oligonucleotide hybrids containing a nuclear transport signal sequence, Tetrahedron, 1991, 47(24), pp.

4120].
L'oligonucléotide est ajouté à la solution de peptide de façon équimolaire et le milieu réactionnel est laissé deux heures à température ambiante. La chimère oligonucléotide-peptide est purifiée par chromatographie liquide à haute pression en phase inverse, sur colonne Vydac C8 contenant de la silice sphéroïdale de diamètre 5 pm et de porosité
300 A. On utilise un tampon acétate de triéthylammonium (TEAA) 0,1 M et un 2o gradient d'acétonitrile passant de 5 % à 50 % en 35 minutes. Les produits sont détectés à 260 nm.

Analyse des chimères par digestion à la trv,_psine Les conjugués oligonucléotide-peptide sont soumis à l'action protéolytique de la trypsine qui permet de mettre en évidence la partie peptidique de la chimère [Reed, M.W. et al, Synthesis and eraluation of nuclear targeting peptide-antisens 5 oligodeoxynucleotide conjugales, Bioconjugate Chemistry, 1995, 6, pp.101-108J. Des solutions contenant 1 pg d'oligonucléotide-peptide dans 7 111 de tampon de purification tréthylammonium (TEAA) 0,1 M sont mélangés à 1 pl d'une solution de trypsine (5 mg/ml). On y ajoute 1 pl de tampon Tris 100 mM, HCl pH = 9, et 1 pl d'EDTA 500 mM. Après une digestion d'une heure, les échantillons sont déposés dans 10 les puits d'un gel de polyacrylamide à 15 %, urée 7 M. L'électrophorèse est faite en tampon Tris 100 mM, acide borique 90 mM, EDTA 1 mM, pH = 8,3. Les acides nucléiques sont révélés par une coloration à l'argent grâce à un kit Biorad.
2 . Formation de triples hélices avec les chimères Le plasmide 15 Le plasmide utilisé pour étudier la formation de triples hélices avec les chimères GA,9-peptide est appelé pXi,2813 (7257 pb, voir figure 3). Ce plasmide exprime le gène de Ia (3-galactosidase sous contrôle du promoteur fort des gènes précoces du Cytomégalovirus (CMV), ainsi que le gène de résistance à l'Ampicilline.
En amont du promoteur, entre les positions 7238 et 7256, la séquence GA19 (5'-2o AAGGAGAGGAGGGAGGGAA-3', SEQ ID N°4) a été clonée selon les méthodes classiques de biologie moléculaire.
Elle a été clonée dans le plasmide pXL2652 (de 7391 pb et dont la représentation est schématisée dans la figure 4) qui exprime le gène de la [3-Galactosidase sous contrôle du promoteur fort des gènes précoces du Cytomégalovirus (CMV), ainsi que le gène 25 de résistance à l'Ampicilline. Ce promoteur provient de pCDNA3, le gène LacZ et son polyA proviennent de pCH110, et le reste provient de pGL2.
Les séquences ont été clonées en amont du promoteur entre les sites uniques de coupure des enzymes Muni et XmaI. Pour cela, les deux oligonucléotides complémentaires contenant la séquence à cloner 6651 (5'-3o AATTGATTCCTCTCCTCCCTCCCTTAC-3') et 6652 (3'-CTAAGGAGAGGAGGGAGGGAATGGG-5') ont été chauffés pendant 5 minutes à
95°C, puis hybridés en laissant la température redescendre lentement.
Le plasmide pXL2652 a ensuite été digéré par les enzymes Muni et XmaI, pendant 2 heures à
37°C, et les produits de cette double digestion ont été séparés par électrophorèse sur gel d'agarose à 1 % et coloration au bromure d'éthidium.
Le fragment d'intérêt pour la suite du clonage a été élué selon le protocole Jetsorb (Genomed) et 200 ng de ce fragment ont été reliés à 10 ng du mélange d'oligonucléotides hybridés par la T4 ligase, pendant 16 heures à 16°C.
Des bactéries E.Coli, compétentes, de souche DHSoc ont été transformées par électroporation avec Ie produit de la réaction, étalées sur des boîtes de Pétri contenant du milieu LB et de l'Ampicilline. Les clones résistants à l'Ampicilline ont été
sélectionnés et l'ADN a été extrait par lyse alcaline et analysé sur gel d'agarose à 1 %.
Un clone correspondant, en taille, au produit attendu a été séquencé.
Dans les cas où l'oligonucléotide est pim, le plasmide utilisé pour étudier la formation de priple hélice est pXL2997 représenté à la figure 11. Ce plasmide exprime le gène de la (3-galactosidase sous contrôle du promoteur fort des gènes précoces du Cytomégalovin.~s (CM~, ainsi que le gène de résistance à l'Ampicilline.
En amont du promoteur, la séquence pim (SEQ ID N°15) a été clonée selon les méthodes classiques de biologie moléculaire.
zo Formation des triples hélices La formation des triples hélices s'effectue par mélange du plasmide pXL2813 (3 pmol de plasmide soit encore 15 pg) ou pXL2997 selon les cas et de quantités variables d'oügonucléotides ou de chimères dans un tampon Tris 100 mM, HCl pH = 7,5 , et MgCl2 I 00 mM.
2s La nhotoactivation des triples hélices Après une nuit d'incubation, le mélange est irradié, dans la glace, pendant 15 minutes, en utilisant une lampe monochromatique de longueur d'onde 365 nm (Biorad). Le produit de la photoactivation est digéré par les enzymes de restriction MfeI
et SpeI et analysé sur un gel de polyacrylamide 15 %, urée 7 M avec un tampon de migration 3o Tris 100 mM, acide borique 90 mM, EDTA 1 mM, et pH = 8,3. Les acides nucléiques sont révélés par une coloration à l'argent grâce à un kit Biorad [Musso, M., J.C.
Wang, and M. W. V. Dyke, Ilt VIVO persistence of DNA triple helices containi»g psoraleu-col jugated oligodeoxyribonucleotides, Nucleic Acid Research, 1996, 24(24), pp.4924-4932].
La méthode d'étude des triple hélices Cette méthode est basée sur le principe de chromatographie d'exclusion de solutions contenant le plasmide et l'oligonucléotide susceptibles de former une triple hélice. Les colonnes d'exclusion utilisées (Columns, Linkers 6, Boehringer Mannheim) sont composées de billes de sépharose et ont pour limite d'exclusion 194 paires de bases ce qui permet de retenir dans la colonne les oligonucléotides non appariés aux plasmides.
Dans un premier temps, les oligonucléotides sont marqués radioactivement en leur extrémité 3' par la Terminal Transferase à l'aide de dATPa35S. Le protocole utilisé
provient d'Amersham : 10 pmol d'oligonucléotides sont incubés pendant 2 heures à
37°C, avec 50 pCi de dATPa35S en présence de 10 unités de Terminal Transferase, dans un volume de 50 ui de tampon contenant du cacodylate de sodium. Le pourcentage d'oligonucléotides marqués est évalué selon la méthode suivante :

d'un échantillon dilué au 1/100 de la solution après marquage est déposé sur papier Whatman DE81, en double. L'un des deux papiers est lavé deux fois pendant 5 minutes avec du 2xSSC, pendant 30 secondes avec de l'eau et pendant 2 minutes avec 2o de l'éthanol. Les radioactivités des deux papiers sont comparées. La radioactivité du papier lavé correspond au 35S effectivement incorporé.
La formation des triple hélices se fait dans un volume de 35 ul. Les concentrations de plasmides (40 nM) et d'oligonucléotides (20 nNn, ie tampon utilisé (100 mM de Tris HCI pH = 7,5, 50 mM de MgCl2) et la température (37°C) sont fixes tandis que le temps d'incubation varie de 1 à 24 heures. Les colonnes de sépharose sont équilibrées, avant utilisation, avec le tampon de réaction et centrifugées à 2200 tr/min pendant 4 minutes, pour les tasser. 25 pl du milieu réactionnel sont déposés sur ies colonnes et celles-ci sont centrifugées dans les mêmes conditions que précédemment. 25 pl du WO 99149067 PC'T/FR99/00643 tampon de réaction sont ensuite déposés sur ies colonnes qui sont à nouveau centrifugées. L'éluat est récupéré.
La radioactivité contenue dans 5 pl du milieu réactionnel, notée cpm(dépôt), et celle contenue dans l'éluat, notée cpm(éluat), sont évaluées ce qui permet d'estimer le pourcentage d'oligonucléotides élués d'oligonucléotides élués = cpm(éluat) / [5 x cpm(dépôt}]x100.
Le pourcentage de plasmides qui sont effectivement élués au cours des expériences est évalué en estimant la densité optique à 260 nm de l'éluat et celle du dépôt, ce qui permet de calculer le pourcentage d'oligonucléotides fixés sur la totalité des plasmides d'oligonucléotides fixés = [% oligonucléotides élués / % plasmides élués]x100.
Ce paramètre permet d'évaluer le pourcentage de sites de formation de triples hélices (il en existe un par plasnûde pXL2813 ou pXL2997) qui sont effectivement occupés en tenant compte des concentrations de plasmides (notée [plasmide]) et d'oligonucléotides (notée [oligo]) utilisés lors de ia réaction de formation des triple hélices sites triple hélice occupés = % d'oligonucléotides fixés x [oligo] /
[plasmide].
3. Interaction avec les imnortines Les protéines recombinantes 2o La sous-unité importine 60 utilisée pour étudier l'interaction avec les conjugués oligonuciéotide-peptide (NLS ou NLSmuté) est d'origine murine et fusionnée à
la Glutathion S-Transferase (GST). La séquence de l'importine 60 a été clonée dans un vecteur pGEX-2T pour la fusionner à la GST. La protéine recombinante a été
produite dans Escherichia coli [Imamoto, N. et al., In vivo evidence for involvement of a 58kDa composent of nuclearpore-targeting complex in rruclear protein import, The EMBO
Journal, 1995, 14(15), pp. 3617-3626].
Les interactions avec les protéines recombinantes Toutes les expériences d'interaction sont menées dans le tampon de fixation (HEPES
20 mM, pH = 6,8, acétate de potassium 150 mM, acétate de magnésium 2 mM, DTT
2 mM, et BSA 100 pg/ml).
Dans un premier temps, les protéines recombinantes sont incubées en présence de billes de sépharose recouvertes de groupements glutathion (Pharmacie Biotech) 1 ug de protéine recombinante est utilisé pour 10 pl de billes. Après une incubation de 30 minutes, à température ambiante, dans 500 ul de tampon de fixation, le mélange est centrifugé à 2000 G pendant 30 secondes, et le surnageant est enlevé. Les billes sont lavées cinq fois par resuspension dans 500 pl de tampon de fixation et centrifi.~gation, to comme décrit ci-avant. Les billes sont resuspendues dans du tampon de fixation pour obtenir une suspension contenant SO % de billes recouvertes de protéines recombinantes.
Dans un second temps, 60 pl de la suspension contenant 50 % de billes recouvertes de protéines recombinantes sont incubés avec 2 ug d'oligonucléotide ou d'oligonucléotide-peptide, dans un volume de 500 pl de tampon de fixation.
Après une incubation de 30 minutes, à température ambiante, le mélange est centrifugé à

pendant 30 secondes, et le surnageant est enlevé. 30 pl du surnageant sont collectés pour analyser la fraction non fixée sur les billes. Les billes sont lavées cinq fois par resuspension dans 500 ul de tampon de fixation et centrifugation, comme décrit ci-2o avant. Les billes sont resuspendues dans 15 pl de tampon de charge (bleu de bromophénol 0,05 %, saccharose 40 %, EDTA 0,1 M, pH = 8, sodium lauryl sulfate 0,5 %) et chauffées 10 minutes à 90°C. Le contenu du surnageant et du culot est analysé sur un gel de polyacrylamide à 15 %, urée 7 M, avec un tampon de migration Tris 100 mM, acide borique 90 mM, EDTA I mM, pH = 8,3. Les acides nucléiques sont révélés par une coloration à l'argent grâce à un kit Biorad [Rexach, M.
and G.
Blobel, Protein import into nuclei : association a~:d dissociation reactions involving transport substrate, transport factors, and nucleoporins, Cell, 1995, 83, pp.
683-692).
4. Transfection de cellules Culture cellulaire Le type cellulaire utilisé est NIH3T3 (ATCC CRL-1658). Il s'agit de fibroblastes de souris. Ces cellules sont cultivées dans un milieu Dulbecco modifié, avec du glucose 4,5 g/1 (DMEM - Gibco), de la glutamine 2 mM, de la pénicilline (I00 U/ml) et de la streptomycine ( 100 pg/ml), et 10 % de sérum de veau foetal (Gibco). Elles sont 5 incubées à 37°C dans une étuve à 5 % de COz.
La transfection Un jour avant ia transfection, les puits d'une plaque de 24 puits sont ensemencés avec 50000 cellules par puit. Les vecteurs sont dilués dans du NaCI 1 SO mM et mélangés à
un lipide cationique (le composé de formule condensée 1o H2N(CH2)3NH(CH2)4NH(CH2)3NHCH2COGlyN[(CH2)~~CH3]2 décrit dans la demande brevet WO 97/18185 sous le numéro (6)), dilué dans dù NaCI 150 mM. Le mélange se fait avec 6 nmol de lipide par microgramme de plasmide. Ce mélange est dilué au 1/10 dans du milieu de culture sans sérum et déposé sur les cellules.
Après une incubation à 37°C dans une étuve à 5 % de COz pendant deux heures, on ajoute 15 I O % de sérum de veau foetal.
La quantification de la (3-galactosidase Après une incubation de 48 heures, les cellules sont lavées deux fois avec du PBS et lysées avec 250 111 de tampon de lyse (Promega). La (3-galactosidase est quantifiée selon le protocole « Lumigal (i-Galactosidase genetic reporter system »
(Clontech).
2o L'activité est mesurée sur un luminomètre Lumat LB9501 (Berthold). La quantité de protéines est mesurée avec le kit BCA (Pierre).
EXEMPLES
Exemple 1 Cet exemple illustre la possibilité de coupler l'oligonucléotide Pso-GA19-SH
au 25 peptide maléimide-NLS.
L'oligonucléotide Pso-GA,9-SH, de séquence 5'-AAGGAGAGGAGGGAGGGAA-3', avec un groupement thiol à l'extrémité 3', a été couplé au peptide NLS qui porte un groupement maléimide à son extrémité N-terminale selon la méthode décrite précédemment dans la partie "Matériel et Méthodes" sous la section "couplage des oligonucléotides et des peptides".
Le couplage est suivi par chromatographie liquide à haute pression (CLHP) en phase inverse. II s'effectue avec une stoechiométrie équimolaire : en deux heures, le couplage est total, et la chimère est purifiée par CLHP.
Le schéma réactionnel du couplage est représenté à la figure 1.
La chimère oligonucléotide-peptide (Pso-GA,9-NLS) a été analysée par électrophorèse en gel de polyacrylamide après action protéolytique de la trypsine qui permet de mettre en évidence la présence de la partie peptidique de la chimère, après migration sur gel 1o de polyacrylamide dénaturant et coloration des acides nucléiques par l'argent (comme indiqué dans la partie "Matériel et méthodes" sous la section "Analyse des chimères par digestion à ia trypsine").
La chimère Pso-GA~9-IVI,S présente une migration électrophorétique retardée par rapport à l'oligonucléotide Pso-GA19-SH, et le produit de la digestion protéolytique est visualisé à un niveau intermédiaire entre les niveaux de migration de Pso-NLS et de Pso-GA,9-SH, comme cela apparaît sur la figure 2.
La chimère Pso-GA19-NLS contient donc une partie peptidique accessible à la trypsine. Ces résultats montrent clairement que le couplage entre l'oIigonucléotide et le peptide s'est opéré, et le rendement du couplage est important.
2o Exemple 2 Cet exemple illustre la formation de triples hélices entre le plasmide pXL2813 et ia chimère Pso-GA19-NLS qui est modifiée par un agent alkylant photoactivable.
Cet exemple indique également quelle est la proportion de plasmides modifiés selon l'excès en molarité d'oligonucléotides par rapport au plasmide:
Le plasmide pXL2813, représenté à la figure 3, comporte la séquence homopurique complémentaire de GA19 qui est susceptible de former une triple hélice avec les oligonucléotides GA,9, Pso-GA19, Pso-GA~9-SH ou Pso-GA,9-NLS. Les cations divalents, tel que Mg2', stabilisent ces triples hélices. L'oligonucléotide Pso-GA,9-NLS

et le plasmide sont mélangés dans un tampon contenant 100 mM de MgCl2. L'excès en molarité d'oligonucléotide par rapport au plasmide varie de 0 à 200.
Après incubation pendant 12 heures à 37°C, le mélange est photoactivé
pendant 1 S
minutes (comme indiqué dans la partie "matériel et méthodes" sous la section "Photoactivation des triples hélices"), puis digéré par les deux enzymes de restriction MfeI et SpeI qui coupent le plasmide de part et d'autre de la région de formation des triples hélices. On libère ainsi un fragment d'acides nucléiques qui contient 70 paires de bases après digestion du plasmide pXL2813 non modifié. Le fragment obtenu avec le plasmide et l'oligonucléotide formant une triple hélice lié covalemment à
la double to hélice compte 70 paires de bases plus 19 bases de l'oligonucléotide. Par migration sur un gel de polyacrylamide dénaturant, on peut ainsi séparer ces fragments de taille différente: les fragments provenant de plasmides modifiés par une triple hélice ont une distance de migration plus courte que les fragments provenant de plasmides non modifié. On peut donc, par électrophorèse sur gel de polyacrylamide dénaturant, quantifier la proportion de plasmides modifiés selon l'excès en molarité
d'oligonucléotide par rapport au plasmide.
Les résultats sont indiqués à la figure 5. Pour un excès en molarité
d'oligonucléotide par rapport au plasmide supérieur à 50, tous les plasmides sont modifiés et sont associés à un oligonucléotide Pso-GA,9-NLS. Sans photoactivation, on perd le 2o retardement du fragment de digestion en gel dénaturant.
II apparaît ainsi que les triples hélices formées avec les oligonucléotides Pso-GA,9-SH
ou Pso-GA,9-NLS sont donc bien liées covalemment à la double hélice après photoactivation.
Par ailleurs, en digérant le reste du squelette plasmidique et en l'analysant comme précédemment, on peut vérifier que la photoactivation n'entraîne pas de liaison covalente non spécifique de l'oligonucléotide Pso-GA,9-NLS en dehors de la région contenant la séquence susceptible de former une triple hélice.
Ces résultats mettent clairement en évidence les conditions permettant d'associer spécifiquement et covalemment une séquence peptidique à un plasmide, et ce en dehors du promoteur régulant l'expression du transgène, ce qui évite que l'expression du transgène n'en soit affectée.
Exemple 3 Cet exemple illustre la capacité du transgène à être exprimé in vitro bien que le plasmide soit modifié.
L'expression de la /3-galactosidase par les plasmides pXL2813 non modifiés ou associés à un oligonucléotide Pso-GA,9-NLS a ainsi été comparée par transfection de cellules lVIFi3T3.
Les résultats sont reportés dans la figure 6, et les moyennes des valeurs obtenues (~ écart type) sont rassemblées dans le tableau III suivant expression du transgne plasmide (en RLU/pg de protine) pXL2813 253759 48545 pXL2813-Pso-GA19-NLS473984 111476 sans plasmide 129 85 Tableau III
On constate que l'expression du transgène augmente suite à la modification apportée par la fixation covalente d'une triple hélice en amont du promoteur.
Ces résultats mettent clairement en évidence que la formation des triples hélices n'affecte pas l'expression du transgène in vitro. Au contraire, grâce à
l'adressage nucléaire du plasmide du fait de son couplage à la séquence de ciblage NLS, davantage de plasmides ont atteint le noyau, et il en résulte une augmentation de l'efficacité de transfection.
Exemple 4 2o Get exemple a pour but de vérifier que l'expression in vivo n'est pas inhibée par la présence d'un signal de ciblage associé au plasmide via une triple hélice.

L'expérience consiste à transfecter pXL2813 et pXI,2813-Pso-GA19-NLS dans des tumeurs pulmonaires humaines H1299 en utilisant les techniques d'électrotransfert décrites dans les demandes WO 99/01157 et WO 99/01158. L'expérience a été
réalisée chez la souris nude femelle de 18 à 20 g.
Les souris sont implantées monolatéralement avec des greffons de tumeurs H1299 de 20 mm3. Les tumeurs se développent pour atteindre un volume de 200 à 300 mm3.
Les souris sont triées en fonction de leur tailles tumorales et réparties en lots homogènes.
Puis les souris sont anesthésiées avec un mélange Kétamine/Xylazine (disponible commercialement). La solution de plasmide (8 pg d'ADN/40 pl de chlorure de sodium lo I50 mM) est injectée longitudinalement en périphérie de la tumeur à l'aide d'une seringue Hamilton.
Les faces latérales de la tumeur sont enduites de gel conducteur et la tumeur est placée entre deux électrodes plates en acier inoxydable distante de 0,45 à 0,7 em.
Les impulsions électriques sont appliquées à l'aide d'un générateur d'impulsions carrées du commerce (Electro-puisateur PS 15, Jouan, France) 20 à 30 secondes après l'injection.
Un oscilloscope permet de contrôler l'intensité en volts, la durée en millisecondes et la fréquence en hertz des impulsions qui doivent ëtre délivrées à 500 V/cm pendant 20 millisecondes et à 1 hertz.
Pour l'évaluation de la transfection tumorale, 10 et 7 souris respectivement pour le plasmide pXL,2813 et pXL2813-Pso-GAl9-NLS sont euthanasiées 2 jours après l'injection du plasmide. Les tumeurs sont prélevées, pesées et boyées dans un tampon de lyse (Promega) additionné d'antiprotéases (Complete, Boehringer). La suspension obtenue est centrifugée afin d'obtenir un surnageant clair. Après avoir incubé
10 ltl de ce surnageant avec 250 pl de tampon de réaction (Clontech) pendant 1 heure à
l'obscurité, l'activité ~i-galactosidase est mesurée à l'aide d'un luminomètre du commerce. Les résultats sont exprimés en RLU (« Relative Light Unit ») totaux par tumeur.
On constate que le plasmide pXL2813-Pso- GA,9-NLS exprime le transgène in vivo à
un niveau supérieur ou égal à celui obtenu avec ie plasmide pXL2813 non-modifié
(voir figure 13).

Exemple 5 Cet exemple illustre la caractérisation de la partie peptidique des conjugués Pso-GA~9-NLS, c'est-à-dire la vérification des propriétés de ciblage du peptide NLS
associé aux constructions selon l'invention.
5 La séquence peptidique utilisée, ie signal NLS de l'antigène T de SV40, est reconnue par des récepteurs de la famille des karyophérines a. L'équivalent murin, appelé
importine 60, fusionné à un groupement glutathion S-transferase, a été utilisé
pour caractériser les conjugués oligonucléotide-peptide. Il a été opéré selon la méthode décrite dans la partie "Matériel et Méthodes" sous la section "Interactions avec les 10 importines".
Les interactions entre des billes-glutathion recouvertes d'importines 60 et les oligonucléotides GA,9-NLS ou Pso-GA19-NLS ont été étudiées. Après une incubation de 30 minutes à température ambiante, on sépare le culot de billes (contenant les éléments interagissant avec les importines) du surnageant 15 Le résultat de cette caractérisation est reporté à la figure 7. Cette figure indique que l'oligonucléotide Pso-GA,9-NLS est associé aux billes de glutathion, tandis que l'oligonucléotide Pso-GA,9 reste dans le surnageant.
Ceci montre clairement la capacité de l'oligonucléotide Pso-GA,9-NLS à
interagir avec l'importine a. La partie peptidique des chimères oligonucléotide-peptide est donc bien 2o reconnue par son récepteur, ce qui signifie que le peptide remplit effectivement son rôle de signal de ciblage.
Exemple 6 Cet exemple illustre la possibilité de coupler l'oligonucléotide GA19-SH au peptide maléimide-NLS. Contrairement à l'exemple 1, Ia chimère n'est pas modifiée par un 25 agent alkylant photoactivable.
L'oligonucléotide GA,9-SH, de séquence 5'-AAGGAGAGGAGGGAGGGAA-3' (SEQ m N° 4), avec un groupement thiol à l'extrémité 5', a été couplé
au peptide maléimide-NLS qui possède un groupement maléimide à son extrémité N-terminale dans les mêmes conditions que pour l'oligonucléotide Pso-GA,9-SH (voir exemple 1), WO 99/49067 PCT/E'R99/00643 Le couplage est suivi par chromatographie liquide à haute pression (CLHP) en phase inverse. Il s'effectue avec une stoechiométrie équimolaire : en deux heures, le couplage est total. La chimère est ensuite purifiée par CLHP.
La chimère oligonucléotide-peptide a été analysée par action protéolytique de la trypsine comme décrit dans la partie "Matériel et méthodes".
Le résultat est représenté sur la Figure 8. Il est comparable à celui obtenu avec l'oligonucléotide Pso-GAt9-SH.
Exemple 7 Cet exemple illustre la possibilité de former des triples hélices entre le plasmide l0 pXL2813 et la chimère GA,9-NLS en l'absence d'agent alkylant.
Une cinétique de formation de triples hélices entre le plasmide pXL,2813 et la chimère GA,9-NLS obtenue comme décrit dans l'exemple 5, a été menée et étudiée selon la technique décrite dans la partie"Matériel et Méthodes", sous la section "Formation des triples hélices avec la chimère".
La figure 9 représente la cinétique de formation des triples hélices.
Il apparaît que dans les conditions de concentrations en plasmide de 40 nM et en oligonucléotide de 20 nM, on forme une triple hélice stable.
Exemple 8 Cet exemple illustre ia caractérisation de la partie peptidique de la chimère GAl9-NLS.
2o La séquence peptidique utilisée, le signal IVLS de l'antigène T de SV40, est reconnue par des récepteurs de la famille des karyophérines a, comme cela a déjà été
mentionné
à i'exemple 4. L'équivalent murin, appelé importine 60, fusionné à un groupement glutathion S-transferase, a été utilisé pour caractériser les conjugués oligonucléotide peptide. Il a été opéré comme décrit dans "Matériel et Méthodes" sous la section "Interactions avec les importines".
Les interactions entre des billes-glutathion recouvertes d'importines 60 et les oligonucléotides GA,9 ou GA,9-NLS ont été étudiées. Après une incubation de 30 minutes à température ambiante, on sépare le culot de billes (contenant ies éléments interagissant avec Ies importines) du surnageant.
Les résultats sont indiqués sur la figure 10. II aparait que l'oligonucléotide GA~9-NLS
est associé aux billes de glutathion, tandis que l'oligonucléotide GA19 reste dans le surnageant.
Ceci montre clairement la capacité de l'oligonucléotide GA~9-NLS à interagir avec l'importine a. La partie peptidique des chimères oligonucléotide-peptide est donc bien reconnue par son récepteur, et remplie là encore son rôle de signal de ciblage.
Exemple 9 lo Cet exemple illustre la possibilité de coupler l'oligonucléotide' pim-SH au peptide maléimide-NLS.
L'oligonucléotide pim-SH, de séquence 5'-GGGGAGGGGGAGG-3' (SEQ ID
N°15), avec un groupement thiol à l'extrémité 5', a été couplé au peptide maléimide-NLS qui possède un groupement maléimide à son extrémité N-terminale dans les mêmes conditions que pour l'oligonucléotide GAIS-SH (voir exemple 5).
Le couplage est suivi par chromatographie liquide à haute pression (CLHP) en phase inverse. Il s'effectue avec une stoechiométrie équimolaire : en deux heures, le couplage est total. La chimère est ensuite purifiée par CLHP.
Exem,- ple 10 2o Cet exemple illustre la possibilité de former des triples hélices entre le plasmide pXL2997 et la chimère pim-NLS en l'absence d'agent allrylant.
Une cinétique de formation de triples hélices entre le plasmide pXL2997 et la chimère pim-NLS (formation obtenue comme décrit dans l'exemple 8), a été menée et étudiée selon la technique décrite dans la partie "Matériel et Méthodes", sous la section 2s "Formation des triples hélices avec la chimère".
La figure 12 représente la cinétique de formation des triples hélices.
Il apparaît que dans les conditions de concentrations en plasmide de 40 nM et en oligonucléotide de 20 rtM, on forme une triple hélice stable.

L'invention étant à présent complètement décrite, il est évident que de nombreuses modifications peuvent être apportées à la présente invention sans pour autant s'écarter de l'esprit de l'invention et de la portée des revendications qui suivent.

WO 99/49067 , PCT/FR99/00643 LISTE DE SÉQUENCES
(1) INFORMATIONS GÉNÉRALES:
( i. ) DÉPOSANT:
in) NOM: RHONE POULENC ROBER
(D) RUE: 20 AVENUE RAYMOND ARON
(C) VILLE: ANTONY CEDEX
( E) PAYS : FRANCE
(F) CODE POSTAL: 92165 (G) TÉLÉPHONE: Oï.55.71.73.26 (H) TÉLÉCOPIE: 01.55.71.72.91 (ü ) TITRE DE L'INVENTION: VECTEURS DE TRANSFERT D'ACIDES NUCLÉIQUES, COMPOSITIONS LES CONTENANT, ET LEURS UTILISATIOlJS.
(iii) NOMBRE DE SEQUENCES:15 (iv) FORME DÉCHIFFRABLE PAR ORDINATEUR:
(A) TYPE DE SUPPORT: Tape (B) ORDINATEUR: IBM PC compatible ' (C) SYSTEME D' EXPLOITATION: PC-DOS/MS-DOS
(D) LOGICIEL: Pater.tIn Release I(1.0, Version N1.30 (OEB) (2) INFORMATIONS POUR IA SEQ ID NO: 1:
(i) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 25 paires de bases (B) TYPE: nucléotide (C) NOhIBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGUR.~TION: linéaire (ii) TYPE DE MOLÉCULE: ADNc (ai) DESCRIPTIOl4 DE LA SÉQUENCE: SEQ ID NO: 1:

(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 2:
(i) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 21 paires de bases (B) TYPE: nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ü) TYPE DE MOLÉCULE: ADNc (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID NO: 2:

FEUILLE DE REMPLACEMENT (RÉGLÉ 26) (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 3:
(i) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 21 paires de bases (B) TYPE: nucléotide (CI NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ü ) TYPE DE MOLÉCULE: ADNc (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID NO: 3:

(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: A:
(i) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 29 paires de bases (B) TYPE: nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ü ) TYPE DE MOLÉCULE: ADNc (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID NO: 4:
AAGGAGAGGA GGGAGGGAA . 19 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 5:
(i) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 19 paires de bases (B) TYPE: nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ü ) TYPE DE MOLÉCULE: ADNc (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID N0: 5:
TTGGTGTGGT GGGTGGGTT lg (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 6:
(i) CARACTERTSTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 19 paires de bases (B) TYPE: nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire FEUILLE DE REMPLACEMENT (RÉGIE 26) WO 99!49067 PCT/FR99/00643 (ii) TYPE DE MOLÉCULE: ADNc (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID NO: 6:

(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 7:
(i) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 21 paires de bases (B) TYPE: nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLÉCULE: ADNc (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID NO: 7:

(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 8:
(i) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 13 paires de bases (B) TYPE: nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLÉCULE: ADNc (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID NO: 8:

(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 9:
(i) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 14 paires de bases (B) TYPE: nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire ü ) TYPE DE MOLÉCULE: ADNc (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID NO: 9:

FEUILLE DE REMPLACEMENT (RÉGLÉ 26) (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID N0: 10:
(i) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 17 paires de bases (B) TYPE: nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ü ) TYPE DE MOLÉCULE: ADNc (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID NO: 10:

(2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 11:
(1) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 7 acides aminés (B) TYPE: acide aminé
(C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLÉCULE: peptide (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID NO: 11:
Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 12:
(i) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 19 acides aminés (B) TYPE: acide aminé
(C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ü) TYPE DE MOLÉCULE: peptide (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID NO: 12:
Lys Arg Pro Ala Ala Thr Lys Lys Ala Gly Gln Ala Lys Lys Lys Lys Leu Asp Lys (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID N0: 13:
FEUILLE DE REMPLACEMENT (RÉGLÉ 26) (i) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 38 acides aminés (B1 TYPE: acide aminé
(C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLÉCULE: peptide (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID NO: 13:
Asn Gln Ser Ser Asn Phe Gly Pro Met Lys Gly Gly Asn Phe Gly Gly Azg Ser Ser Gly Pro Tyr Gly Gly Gly Gly Gln Tyr Phe Ala Lys Pro Arg Asn Gln Gly Gly Tyr (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID N0: 14:
(i) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 7 acides aminés fB) TYPE: acide aminé
(C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLÉCULE: peptide (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID NO: 14:
Pro Lys Asn Lys Arg Lys Val (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID N0: 15:
fi) CARACTÉRISTIQUES DE LA SÉQUENCE:
(A) LONGUEUR: 13 paires de bases (B) TYPE: nucléotide (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLÉCULE: ADNc (xi) DESCRIPTION DE LA SÉQUENCE: SEQ ID N0: 15:

FEUILLE DE REMPLACEMENT (RÉGIE 26)
10 example cationic lipids which have properties interesting. These vectors are in fact made up of a polar, cationic part, interacting with DNA, and a lipid, hydrophobic part, promoting penetration cell and making the ionic interaction with DNA insensitive to the external environment. Of examples particular of cationic lipids are in particular monocationic lipids 15 (DOTMA: Lipofectin ~), certain cationic detergents (DDAB), lipopolyamines and in particular your dioctadecylamidoglycyl spermine (DOGS) or 5-palmitoylphosphatidylethanolamine carboxyspermylamide (DPPES), the preparation has been described for example in patent application EP 394 111.
A
another interesting family of lipopolyamines is represented by the compounds described in patent application WO 97/18185 incorporated herein by reference.
Of many other cationic lipids have been developed and can be used with vectors according to the invention.
Among the synthetic transfection agents developed, polymers cationic polylysine and DEAE dextran are also advantageous. II
East also possible to use polymers of polyethylene imine (PEI) and polypropylene imine (PPI) which are commercially available and can be prepared according to process described in patent application WO 96/02655.
Generally, any synthetic agent known to transfect acid nucleic acid can be associated with the vectors according to the invention.

WO 99! 49067 PCT / FR99 / 00643 The compositions can also comprise adjuvants capable of associate with the vector complexes according to the invention / transfection agent and from improve the transfecting power. In another embodiment, the present the invention therefore relates to compositions comprising a vector as defined previously, one or more transfection agents as defined above and one or several adjuvants capable of associating with the vector complexes according to the invention / transfection agent (s) and improve its potency transfectant. The presence of this type of adjuvant (lipids, peptides or proteins for example) can advantageously allow to increase the transfecting power of the compounds.
1o With this in mind, the compositions of the invention can comprise as an adjuvant, one or more neutral lipids the use of which is particularly advantageous. The Applicant has indeed shown that the addition of a lipid neutral improves the formation of nucleolipid particles and promote the penetration of the particle into the cell by destabilizing its membrane.
More preferably, the neutral lipids used in the context of present invention are lipids with 2 fatty chains. Particularly advantageous, natural or synthetic, zwitterionic lipids are used or free of ionic charge under physiological conditions. They can be choose more particularly among dioleoylphosphatidylethanolamine (DOPE), oleoyl-2U palmitoylphosphatidylethanolamine (POPE), di-stearoyl, -palmitoyl, -mirystoyl phosphatidylethanolamines as well as their N-methylated derivative 1 to 3 times, the phosphatidylglycerols, diacylglycerols, glycosyldiacylglycerols, cerebrosides (such as in particular galactocerebrosides), sphingolipids (such as especially sphingomyelins) or asialogangliosides {such as in particular asialoGM 1 and GM2).
These different lipids can be obtained either by synthesis or by extraction from organs (example: the brain) or eggs, by techniques well known to those skilled in the art. In particular, the extraction of lipids natural can be carried out using organic solvents (see also Lehninger, 3o Biochemistry).

The Applicant has demonstrated that it is also particularly advantageous to use as an adjuvant, a compound intervening or not directly at the level of DNA condensation (WO 96/25508). The presence of such compound, within a composition according to the invention makes it possible to reduce the amount of compound s transfectant, with the resulting beneficial consequences toxicological, without causing any harm to the transfecting activity.
Through compound involved in the condensation of nucleic acid, we hears define a compacting compound, directly or indirectly, DNA. Specifically, this compound can either act directly on the DNA to be transfected or intervene at 1o level of an annexed compound which is directly involved in the condensation of this nucleic acid. Preferably, it acts directly on. DNA level.
In particular, this agent involved in the condensation of DNA can be any polycation, for example polylysine. According to a preferred embodiment, this agent can also be any compound derived in whole or in part from a histone, a nucleolin, 15 of a protamine and / or one of their derivatives. Such an agent may also to be consisting, in whole or in part, of peptide motifs (KTPKKAICKP) and / or (ATPAKKAA), the number of patterns can vary between 2 and 10. In the structure of the compound according to the invention, these units can be repeated so continue or no. This is how they can be separated by nature links biochemical, by 2o for example with one or more amino acids, or of a chemical nature.
The subject of the invention is also the use of the vectors as defined this-before to make a medicine to treat illnesses by transfection of DNA in primary cells or in established cell lines. he can be fibroblast, muscle, nerve cells (neurons, astrocytes, cells 25 glial), hepatic, of the hematopoietic line (lymphocytes, CD34, dendritics, etc ...), epithelial, etc ..., in differentiated or pluripotent forms (precursors).
The vectors of the invention may, by way of illustration, be used for the in vitro, ex vivo or in vivo transfection of DNA encoding proteins or of polypeptides.

For in vivo uses, either in therapy or for the study of regulation of genes or the creation of animal models of pathologies, the compositions according to the invention can be formulated for topical administration, skin, oral, rectal, vaginal, parenteral, intranasal, intravenous, intramuscular, sub-cutaneous, intraocular, transdermal, intratracheal, intraperitoneal, etc ... From preferably, the compositions of the invention contain a vehicle pharmaceutically acceptable for an injectable formulation, especially for a direct injection at the level of the desired organ, or for administration by track topical (on skin and / or mucosa). These may in particular be solutions sterile, isotonic, or dry compositions, in particular lyophilized, which, by addition depending on the case of sterilized water or physiological saline, allow the constitution of injectable solutions. The doses of nucleic acid used for injection as well as the number of administrations can be adapted according to different settings, and in particular depending on the mode of administration used, the pathology concerned, the gene to be expressed, or the duration of the treatment sought. In what relates more particularly to the mode of administration, it can be either of a direct injection into the tissues or circulatory tract, either of Treatment of cells in culture followed by their reimplantation in vivo, by injection or graft.
The invention further relates to a method for transfection of DNA into 2o cells comprising the following steps (1) synthesis of the oligonucleotide chimera - targeting signal according to the process previously described, (2) bringing the chimera synthesized in (1) into contact with double-stranded DNA
to form triple helices, (3) optionally, complexation of the vector obtained in (2) with one or several transfection agents and / or one or more adjuvant (s), and (4) bringing the cells into contact with the complex formed in (2) or the case appropriate in (3).

The bringing of the cells into contact with the complex can be carried out by incubation of the cells with said complex (for in vitro uses or ex vivo), or by injection of the complex into an organism (for uses in vivo).
The present invention thus provides a particularly advantageous method s for the treatment of diseases by administration of a vector according to the invention containing a nucleic acid capable of correcting said disease. More particularly, this method is applicable to diseases resulting from a deficiency in a product protein or peptide, the administered DNA coding for said protein product or peptide. The present invention extends to any use of a vector according to lo the invention for the in vivo, ex vivo or in vitro transfection of cells.
The invention also relates to any recombinant cell containing a vector as defined above. They are preferably cells eukaryotes, by example of yeasts, animal cells, etc. These cells are obtained by any technique allowing the introduction of DNA into a given and known cell of 15 skilled in the art.
The following examples are intended to illustrate the invention without limiting its scope"
allow to highlight other characteristics and advantages of the present invention.
FIG- USSR
2o Fi ~~ ure 1: Coupling of an oligonucleotide (ODN) and the maleimide peptide-NLS.
Fi ure 2: Analysis on 15% polyacrylamide gel of the chimera oligonucleotide -peptide (Pso-GA19-NLS) by proteolytic action of trypsin.
1 = oligo Pso-GA ~ 9-SH
2 = oligonucleotide-peptide chimera Pso-GA, 9-NLS
25 3 = oligonucleotide-peptide chimera Pso-GA, 9-NLS after digestion with trypsin Figure 3: schematic representation of the plasmid pXL2813.

Figure 4: schematic representation of the plasmid pXL2652.
Figure 5: Analysis on 15% polyacrylamide gel of triple formation propellers between the plasmid pXI, 2813 and the oligonucleotide-peptide chimera Pso-GAl9-NLS.
The oligonucleotide pso-GA, 9-NLS and the plasmid are mixed in a buffer s containing 100 mM MgCl2. The excess in molarity of the oligonucleotide by compared to plasmid ranges from 0 to 200. The mixture is photoactivated, after overnight 37 ° C, then digested by two restriction enzymes which cut the plasmid apart and else from the triple helix formation region.
1 = no oligonucleotide 2 = excess in molarity of oligonucleotide relative to the plasmid of IS
3 = excess in molarity of oligonucleotide relative to the plasmid by 50 4 = excess in molarity of oligonucleotide relative to the plasmid of 100 5 = excess molarity of oligonucleotide compared to the plasmid of 200 6 = single photoactivated oligonucleotide 15 7 = oligonucleotide alone not photoactivated 8 = excess in molarity of oligonucleotide relative to the plasmid of 30, the mixed have not been photoactivated.
Figure 6: In vitro expression of the transgene (J3-galactosidase) for tests made with the plasmid pXL2813 alone, the vector pXL, 2813-Pso-GA, 9-NLS, and without plasmid.
2o Fi ure 7: Characterization of the peptide part of the chimera oligonucleotide-peptide Pso-GA, 9-NLS by interaction with importine 60-GST (gel analysis of polyacrylamide IS%).
1 = oligo Pso-GA19 (I pg) 2 = oligonucleotide-peptide chimera Pso-GAl9-NLS (l ~ cg) 3 = supernatant recovered after incubation of the coated glutathione beads important tines 60 and the oligonucleotide Pso-GA, 9, and separation of the pellet from beads (containing elements interacting with importines) of the supernatant 4 = pellet recovered after incubation of the coated glutathione beads important 60 and the oligonucleotide Pso-GA19, and separation of the pellet from beads (containing the elements interacting with the importines) of the supernatant = supernatant recovered after incubation of the coated glutathione beads important 5 tines 60 and of the oligonucleotide-peptide chimera Pso-GA ~ 9-NLS, and separation of pellet of balls (containing the elements interacting with importines) of supernatant 6 = pellet recovered after incubation of the coated glutathione beads important 60 and the oligonucleotide-peptide chimera Pso-GA19-NLS, and separation of the pellet of beads (containing elements interacting with importines) from supernatant.
Io Fi ure 8: Analysis on 15% polyacrylamide gel of the chimera oIigonucIéotide-peptide (GA, 9-NLS) by proteolytic action of trypsin.
1 = oligo GA, 9-SH (200 ng) 2 = oligonucleotide-peptide GA, 9-NLS chimera (1 pg) before purification by chroma-high pressure liquid tography 3 = oligonucleotide-peptide GA ~ 9-NLS chimera (1 pg) after purification 4 = oligonucleotide-peptide GA19-NLS chimera after digestion with trypsin ( 1 ~ tg).
Fitxure 9: Graphical representation of the kinetics of triple formation propellers (%
of triple helix sites occupied as a function of time) between the plasmid pXL2813 and the chimera GA ~ 9-NLS.
2o F_iRure 10: Characterization of the peptide part of the chimera oligonucleotide-GA19-NLS peptide by interaction with importin 60-GST.
1 = oligonucleotide-peptide GA ~ 9-NLS chimera, 2 = oligo GA, 9, 3 - supernatant recovered after incubation of the coated glutathione beads of importines 60 and of the chimeric oligonucleotide-peptide GAIS-NLS, and separation of pellet of balls (containing the elements interacting with importines) of supernatant, 4 = pellet recovered after incubation of the coated glutathione beads important 60 and of the oligonucleotide-peptide chimera GA19-NLS, and separation of the pellet from marbles (containing the elements interacting with the importins) of the supernatant, - supernatant recovered after incubation of the coated glutathione beads of imports 60 and of the oligonucleotide GA, 9 and separation of the pellet from beads (containing your elements interacting with importines) of the supernatant, 6 = pellet recovered after incubation of the coated glutathione beads important 60 5 and oligonucleotide GA, 9, and separation of the pellet from beads (containing the elements interacting with the importins) of the supernatant.
Figure 1 I: schematic representation of the plasmid pXL, 2997.
Figure 12: Graphical representation of the kinetics of triple formation propellers (% of triple helix sites occupied as a function of time) between the plasmid pXL2997 and the chimera pim-NLS.
Figure 13: histogram representing the ~ 3-galactosidase activity in vivo in of human lung tumors H1299 from plasmids pXI, 2813 (indicated Bgal on the figure) and pXL, 2813-Pso-GA, 9-NLS (indicated NLS-Bgal in the figure) in RLU
("Relative Light Unit") per tumor.
The transfection was done using electrotransfer techniques as described in applications W099 / 01157 and WO 99/01158.
MATERIALS AND METAODS
1. Coupling of oligonucleotides and peptides Olitxonucleotides 2o The oligonucleotides used are either the 5 'sequence AAGGAGAGGAGGGAGGGAA-3 '(SEQ m N ° 4) with a length of 19 bases and referred to as “GA, 9” in the remainder of the text, ie the sequence 5 ′
GGGGAGGGGGAGG-3 '(SEQ) DN ° 15) with a length of 13 bases and referenced under the name "pim" in the rest of the text (because it is the sequence of protooncogene pim-1).
The oligonucleotides noted GA, 9-SH or pim-SH have the same sequences as GA, 9 and pim respectively and a thiol group at the 5 'end, with a spacer of six carbons between tlliol and phosphate at the 5 'end. The oligonucleotides noted Pso-GA19-SH have a thiol group at the 3 'end (SH), and in addition, a psoraiene at the 5 'end (Pso), with a six-carbon spacer between the psoralen and the phosphate from the 5 'end. The oligonucleotides noted Pso-GA, 9 have no thiol group.
The nomenclature used is summarized in Table I below name of oligonucleotide change of end change of end 3 '5' GA, 9 none none Pim none none GA, 9-SH none ~ thiol group pim-SH no thiol group Pso-GA, 9 no psoralne Pso-GA ~ 9-SH psoral thiol group Table I
These lyophilized oligonucleotides are taken up in an acetate buffer of 100 mM triethylammonium, pH = 7.
Peptides lo The peptides used for the couplings are synthesized by an automaton phase solid. They contain - or the nuclear localization sequence of the SV40 T antigen (PKICKRKV, SEQ
ID No. 11), - or the same mutated sequence (PK1VICRKV, SEQ l'D N ° 14) which does not allow neither ie targeting or nuclear transport (due to the mutation).
These peptides also carry a spacer of four amino acids to the N- end Terminal: KGAG. N-terminal lysine is chemically modified: it contains a maleimide group on carbon E and a protective group 9-fluorenylmethyloxycarbonyl (Fmoc) on the carbon amine a. This Fmoc group absorbs at 260 nm which makes it possible to follow the peptide by chromatography liquid to high pressure in reverse phase. The C-terminal group is also protected (CONHZ group), the protection being added at the end of peptide synthesis.
The representation of the peptides is indicated in Table II below peptide sequence name and modifications malimide- ~ GAGPKKKRK ~ -CONHz malimide-NL
S

FF '' moc malimide- KGAGPKNKRKV ~ --CONHz malimide-NLSmut ' ~
Fmoc Table II
The lyophilized peptides are taken up in an acetate buffer of triethylammonium 100 mM, pH = 7. The concentration is 0.4 mglml.
The colors For the coupling with the oligonucleotides, the strategy used consists in react the thiol group carried by the oligonucleotide and the maleimide group carried speak peptide [Eritja, R., et al., Synthesis of defrned peptide-oligonucleotide hybrids containing a nuclear transport signal sequence, Tetrahedron, 1991, 47 (24), pp.

4120].
The oligonucleotide is added to the peptide solution equimolarly and the middle reaction is left for two hours at room temperature. The chimera oligonucleotide-peptide is purified by high pressure liquid chromatography in phase reverse, on Vydac C8 column containing spheroidal silica with a diameter of 5 μm and porosity 300 A. 0.1 M triethylammonium acetate buffer (TEAA) and a 2o gradient of acetonitrile passing from 5% to 50% in 35 minutes. Products are detected at 260 nm.

Analysis of chimeras by digestion with trv, _psine The oligonucleotide-peptide conjugates are subjected to the proteolytic action of the trypsin which allows to highlight the peptide part of the chimera [Reed, MW et al, Synthesis and eraluation of nuclear targeting peptide-antisense 5 conjugal oligodeoxynucleotide, Bioconjugate Chemistry, 1995, 6, pp.101-108J. Of solutions containing 1 µg of oligonucleotide-peptide in 7,111 of buffer 0.1 M trethylammonium purification (TEAA) are mixed with 1 μl of a solution of trypsin (5 mg / ml). Add 1 μl of 100 mM Tris buffer, HCl pH = 9, and 1 pl of 500 mM EDTA. After an hour's digestion, the samples are deposited in 10 wells of 15% polyacrylamide gel, 7 M urea. Electrophoresis is made in 100 mM Tris buffer, 90 mM boric acid, 1 mM EDTA, pH = 8.3. Acids nucleic acids are revealed by silver staining using a Biorad kit.
2. Formation of triple helices with chimeras The plasmid The plasmid used to study the formation of triple helices with the chimeras GA, 9-peptide is called pXi, 2813 (7257 bp, see Figure 3). This plasmid expresses the gene Ia (3-galactosidase under the control of the strong promoter of the early genes of Cytomegalovirus (CMV), as well as the Ampicillin resistance gene.
Upstream of the promoter, between positions 7238 and 7256, the sequence GA19 (5'-2o AAGGAGAGGAGGGAGGGAA-3 ', SEQ ID N ° 4) was cloned according to the methods molecular biology classics.
It was cloned into the plasmid pXL2652 (7391 bp and whose representation is shown diagrammatically in FIG. 4) which expresses the gene for [3-Galactosidase under control of the strong promoter of the early genes of Cytomegalovirus (CMV), as well as the uncomfortable 25 resistance to Ampicillin. This promoter comes from pCDNA3, the gene LacZ and his polyA are from pCH110, and the rest are from pGL2.
The sequences were cloned upstream of the promoter between the unique sites of cutting of the Muni and XmaI enzymes. For this, the two oligonucleotides complementary containing the sequence to be cloned 6651 (5'-3o AATTGATTCCTCTCCTCCCTCCCTTAC-3 ') and 6652 (3'-CTAAGGAGAGGAGGGAGGGAATGGG-5 ') were heated for 5 minutes to 95 ° C, then hybridized, allowing the temperature to drop slowly.
The plasmid pXL2652 was then digested with the enzymes Muni and XmaI, for 2 hours at 37 ° C, and the products of this double digestion were separated by electrophoresis on 1% agarose gel and staining with ethidium bromide.
The fragment of interest for the further cloning was eluted according to the protocol Jetsorb (Genomed) and 200 ng of this fragment have been linked to 10 ng of the mixture of oligonucleotides hybridized by T4 ligase, for 16 hours at 16 ° C.
Competent E. Coli bacteria of DHSoc strain have been transformed by electroporation with the reaction product, spread on cans Petri dish LB medium and Ampicillin. Ampicillin resistant clones have summer selected and DNA was extracted by alkaline lysis and analyzed on gel 1% agarose.
A clone corresponding in size to the expected product was sequenced.
In cases where the oligonucleotide is pim, the plasmid used to study the training of helical priple is pXL2997 represented in FIG. 11. This plasmid expresses the gene (3-galactosidase under the control of the strong promoter of the early genes of Cytomegalovin. ~ S (CM ~, as well as the Ampicillin resistance gene.
Upstream of the promoter, the pim sequence (SEQ ID No. 15) has been cloned according to classical methods of molecular biology.
zo Formation of triple helices The formation of the triple helices is carried out by mixing the plasmid pXL2813 (3 pmol of plasmid is still 15 pg) or pXL2997 depending on the case and quantities variables of egg or chimeras in 100 mM Tris buffer, HCl pH = 7.5, and MgCl2 I 00 mM.
2s Nhotoactivation of triple propellers After an overnight incubation, the mixture is irradiated, in ice, for 15 minutes, using a 365 nm wavelength monochromatic lamp (Biorad). The photoactivation product is digested by restriction enzymes MfeI
and SpeI and analyzed on a 15% polyacrylamide gel, 7 M urea with a buffer of migration 3o Tris 100 mM, boric acid 90 mM, EDTA 1 mM, and pH = 8.3. Acids nucleic are revealed by a silver coloration thanks to a Biorad kit [Musso, M., JC
Wang, and MWV Dyke, Ilt VIVO persistence of DNA triple helices containi »g psoraleu-col jugated oligodeoxyribonucleotides, Nucleic Acid Research, 1996, 24 (24), pp. 4924-4932].
The triple helix study method This method is based on the principle of exclusion chromatography.
solutions containing the plasmid and the oligonucleotide capable of forming a triple propeller. The exclusion columns used (Columns, Linkers 6, Boehringer Mannheim) are composed of sepharose beads and have as exclusion limit 194 pairs of basics this which allows to retain in the column the oligonucleotides not paired with plasmids.
First, the oligonucleotides are radioactively labeled in their 3 'end by Terminal Transferase using dATPa35S. The protocol used comes from Amersham: 10 pmol of oligonucleotides are incubated for 2 hours at 37 ° C, with 50 pCi of dATPa35S in the presence of 10 Terminal units Transferase, in a volume of 50 IU of buffer containing sodium cacodylate. The percentage of labeled oligonucleotides is evaluated according to the following method:

of a sample diluted to 1/100 of the solution after marking is deposited on paper Whatman DE81, in duplicate. One of the two papers is washed twice for 5 minutes with 2xSSC, for 30 seconds with water and for 2 minutes with 2o of ethanol. The radioactivities of the two papers are compared. The radioactivity washed paper corresponds to the 35S actually incorporated.
The formation of the triple helices takes place in a volume of 35 μl. The concentrations of plasmids (40 nM) and oligonucleotides (20 nNn, ie buffer used (100 mM
Tris HCI pH = 7.5, 50 mM MgCl2) and the temperature (37 ° C) are fixed while the incubation time varies from 1 to 24 hours. The sepharose columns are balanced, before use, with the reaction buffer and centrifuged at 2200 rpm for 4 minutes, to pack them. 25 μl of the reaction medium are deposited on ies columns and these are centrifuged under the same conditions as above. 25 pl of WO 99149067 PC'T / FR99 / 00643 reaction buffer are then deposited on the columns which are again centrifuged. The eluate is recovered.
The radioactivity contained in 5 μl of the reaction medium, denoted cpm (deposit), and that contained in the eluate, noted cpm (eluate), are evaluated which makes it possible to estimate the percentage of oligonucleotides eluted eluted oligonucleotides = cpm (eluate) / [5 x cpm (deposit}) x100.
The percentage of plasmids that are effectively eluted during experiences is evaluated by estimating the optical density at 260 nm of the eluate and that of the deposit, what calculates the percentage of oligonucleotides attached to all of the plasmids fixed oligonucleotides = [% eluted oligonucleotides /% eluted plasmids] x100.
This parameter is used to evaluate the percentage of triple training sites propellers (there is one by plasnûde pXL2813 or pXL2997) which are actually busy taking into account the concentrations of plasmids (denoted [plasmid]) and oligonucleotides (denoted [oligo]) used during the formation reaction triple propellers occupied triple helix sites =% of fixed oligonucleotides x [oligo] /
[plasmid].
3. Interaction with imnortins Recombinant proteins 2o The importine subunit 60 used to study the interaction with conjugates oligonucleotide-peptide (NLS or NLSmuted) is of murine origin and fused to the Glutathione S-Transferase (GST). Importin sequence 60 has been cloned in one vector pGEX-2T to merge it with the GST. The recombinant protein has been produced in Escherichia coli [Imamoto, N. et al., In vivo evidence for involvement of at 58kDa compose of nuclearpore-targeting complex in rruclear protein import, The EMBO
Journal, 1995, 14 (15), pp. 3617-3626].
Interactions with recombinant proteins All interaction experiments are carried out in the fixation buffer (HEPES
20 mM, pH = 6.8, 150 mM potassium acetate, 2 mM magnesium acetate, DTT
2 mM, and BSA 100 pg / ml).
Initially, the recombinant proteins are incubated in the presence of sepharose beads covered with glutathione groups (Biotech Pharmacy) 1 ug of recombinant protein is used for 10 μl of beads. After one 30 incubation minutes, at room temperature, in 500 µl of fixing buffer, the mixture East centrifuged at 2000 G for 30 seconds, and the supernatant is removed. The balls are washed five times by resuspension in 500 μl of fixing buffer and centrifi. ~ gation, to as described above. The beads are resuspended in buffer of fixing for obtain a suspension containing SO% of protein-coated beads recombinant.
Secondly, 60 μl of the suspension containing 50% of beads covered with recombinant proteins are incubated with 2 µg of oligonucleotide or oligonucleotide-peptide, in a volume of 500 μl of fixing buffer.
After one incubation for 30 minutes, at room temperature, the mixture is centrifuged at for 30 seconds, and the supernatant is removed. 30 µl of the supernatant are collected to analyze the fraction not fixed on the beads. The beads are washed five times a resuspension in 500 μl of fixation buffer and centrifugation, as described this-2o before. The beads are resuspended in 15 μl of loading buffer (blue bromophenol 0.05%, sucrose 40%, EDTA 0.1 M, pH = 8, sodium lauryl sulfate 0.5%) and heated for 10 minutes at 90 ° C. The contents of the supernatant and base is analyzed on a 15% polyacrylamide gel, 7 M urea, with a buffer of migration Tris 100 mM, boric acid 90 mM, EDTA I mM, pH = 8.3. Nucleic acids are revealed by a silver coloration thanks to a Biorad kit [Rexach, M.
and G.
Blobel, Protein import into nuclei: association a ~: d dissociation reactions involving transport substrate, transport factors, and nucleoporins, Cell, 1995, 83, pp.
683-692).
4. Cell transfection Cellular culture The cell type used is NIH3T3 (ATCC CRL-1658). It is fibroblasts mouse. These cells are cultured in a modified Dulbecco medium, with glucose 4.5 g / 1 (DMEM - Gibco), 2 mM glutamine, penicillin (10,000 U / ml) and of the streptomycin (100 pg / ml), and 10% fetal calf serum (Gibco). They are 5 incubated at 37 ° C in an oven with 5% COz.
Transfection One day before transfection, the wells of a 24-well plate are seeded with 50,000 cells per well. The vectors are diluted in NaCI 1 SO mM and mixed with a cationic lipid (the compound of condensed formula 1o H2N (CH2) 3NH (CH2) 4NH (CH2) 3NHCH2COGlyN [(CH2) ~~ CH3] 2 described in Patent application WO 97/18185 under number (6)), diluted in dù 150 mM NaCl. The mixing takes place with 6 nmol of lipid per microgram of plasmid. This mixture East diluted 1/10 in culture medium without serum and deposited on the cells.
After incubation at 37 ° C in an oven at 5% COz for two hours, we add 15 IO% fetal calf serum.
Quantification of (3-galactosidase After a 48 hour incubation, the cells are washed twice with PBS and lysed with 250 111 lysis buffer (Promega). (3-galactosidase is quantified according to the "Lumigal (i-Galactosidase genetic reporter system") protocol (Clontech).
2o The activity is measured on a Lumat LB9501 luminometer (Berthold). The number of protein is measured with the BCA kit (Pierre).
EXAMPLES
Example 1 This example illustrates the possibility of coupling the oligonucleotide Pso-GA19-SH
at 25 maleimide-NLS peptide.
The oligonucleotide Pso-GA, 9-SH, of sequence 5'-AAGGAGAGGAGGGAGGGAA-3 ', with a thiol group at the 3 ′ end, was coupled to the NLS peptide which wear one maleimide group at its N-terminal end according to the method described previously in the "Materials and Methods" section under the "coupling" section of oligonucleotides and peptides ".
The coupling is monitored by high pressure liquid chromatography (HPLC) in phase reverse. It is carried out with an equimolar stoichiometry: in two hours, the coupling is complete, and the chimera is purified by HPLC.
The coupling reaction scheme is shown in Figure 1.
The oligonucleotide-peptide chimera (Pso-GA, 9-NLS) was analyzed by electrophoresis polyacrylamide gel after proteolytic action of trypsin which allows to put highlight the presence of the peptide part of the chimera, after migration on gel 1o of denaturing polyacrylamide and staining of nucleic acids by money (like indicated in the section "Materials and methods" under the section "Analysis of chimeras by trypsin digestion ").
The chimera Pso-GA ~ 9-IVI, S exhibits a delayed electrophoretic migration through compared to the oligonucleotide Pso-GA19-SH, and the product of digestion proteolytic is displayed at an intermediate level between the migration levels of Pso-NLS and Pso-GA, 9-SH, as shown in Figure 2.
The chimera Pso-GA19-NLS therefore contains a peptide part accessible to the trypsin. These results clearly show that the coupling between the oligonucleotide and the peptide has operated, and the coupling yield is important.
2o Example 2 This example illustrates the formation of triple helices between the plasmid pXL2813 and ia Pso-GA19-NLS chimera which is modified by a photoactivatable alkylating agent.
This example also indicates what is the proportion of plasmids modified according to excess in molarity of oligonucleotides relative to the plasmid:
Plasmid pXL2813, shown in Figure 3, has the sequence homopuric complementary to GA19 which is likely to form a triple helix with the oligonucleotides GA, 9, Pso-GA19, Pso-GA ~ 9-SH or Pso-GA, 9-NLS. Cations divalents, such as Mg2 ', stabilize these triple helices. The oligonucleotide Pso-GA, 9-NLS

and the plasmid are mixed in a buffer containing 100 mM MgCl2. Excess in oligonucleotide molarity with respect to the plasmid varies from 0 to 200.
After incubation for 12 hours at 37 ° C, the mixture is photoactivated for 1 S
minutes (as indicated in the "materials and methods" part under the section "Photoactivation of triple helices"), then digested by the two enzymes of restriction MfeI and SpeI which cut the plasmid on either side of the region of training of triple propellers. A nucleic acid fragment which contains 70 pairs of bases after digestion of the plasmid pXL2813 unmodified. The fragment obtained with the plasmid and the oligonucleotide forming a triple helix covalently linked to the double the helix has 70 base pairs plus 19 bases of the oligonucleotide. Through migration on a denaturing polyacrylamide gel, we can thus separate these fragments from cut different: fragments from plasmids modified by a triple propeller have a shorter migration distance than fragments from non-plasmids amended. It is therefore possible, by electrophoresis on polyacrylamide gel denaturing, quantify the proportion of modified plasmids according to excess molarity oligonucleotide relative to the plasmid.
The results are shown in Figure 5. For excess molarity oligonucleotide compared to the plasmid greater than 50, all the plasmids are modified and are associated with an oligonucleotide Pso-GA, 9-NLS. Without photoactivation, we lose the 2o delaying the digestion fragment in denaturing gel.
It thus appears that the triple helices formed with the oligonucleotides Pso-GA, 9-SH
or Pso-GA, 9-NLS are therefore well covalently linked to the double helix after photoactivation.
Furthermore, by digesting the rest of the plasmid skeleton and analyzing it as previously, we can verify that photoactivation does not cause bond non-specific covalent of the oligonucleotide Pso-GA, 9-NLS outside the region containing the sequence capable of forming a triple helix.
These results clearly highlight the conditions allowing to associate specifically and covalently a peptide sequence to a plasmid, and this outside of the promoter regulating the expression of the transgene, which prevents the expression transgene is affected.
Example 3 This example illustrates the ability of the transgene to be expressed in vitro, although the plasmid be modified.
Expression of / 3-galactosidase by unmodified pXL2813 or associated with an oligonucleotide Pso-GA, 9-NLS was thus compared by transfection of lVIFi3T3 cells.
The results are shown in Figure 6, and the means of the values obtained (~ standard deviation) are collated in the following table III
expression of the transgender plasmid (in RLU / pg of protein) pXL2813 253759 48545 pXL2813-Pso-GA19-NLS473984 111476 without plasmid 129 85 Table III
It is noted that the expression of the transgene increases following the modification brought by covalent attachment of a triple helix upstream of the promoter.
These results clearly show that the training of triples propellers does not affect expression of the transgene in vitro. On the contrary, thanks to addressing nuclear of the plasmid due to its coupling to the NLS targeting sequence, more of plasmids have reached the nucleus, and this results in an increase in the effectiveness of transfection.
Example 4 2o Get example aims to verify that the expression in vivo is not inhibited by presence of a targeting signal associated with the plasmid via a triple helix.

The experiment consists in transfecting pXL2813 and pXI, 2813-Pso-GA19-NLS in H1299 human lung tumors using techniques electrotransfer described in applications WO 99/01157 and WO 99/01158. The experience was performed in nude female mice from 18 to 20 g.
Mice are implanted monolaterally with H1299 tumor grafts of 20 mm3. Tumors grow to reach a volume of 200 to 300 mm3.
The mice are sorted according to their tumor sizes and divided into lots homogeneous.
Then the mice are anesthetized with a Ketamine / Xylazine mixture (available commercially). The plasmid solution (8 μg of DNA / 40 μl of chloride sodium lo I50 mM) is injected longitudinally at the periphery of the tumor using of a Hamilton syringe.
The lateral sides of the tumor are coated with conductive gel and the tumor is placed between two flat stainless steel electrodes 0.45 to 0.7 em apart.
The electrical pulses are applied using a pulse generator squares of trade (PS 15 electro-drainer, Jouan, France) 20 to 30 seconds after injection.
An oscilloscope allows you to control the intensity in volts, the duration in milliseconds and the frequency in hertz of the pulses which must be delivered at 500 V / cm for 20 milliseconds and 1 hertz.
For the evaluation of tumor transfection, 10 and 7 mice respectively for the plasmid pXL, 2813 and pXL2813-Pso-GAl9-NLS are euthanized 2 days after injection of the plasmid. Tumors are removed, weighed and boyaged in a buffer of lysis (Promega) supplemented with antiproteases (Complete, Boehringer). The suspension obtained is centrifuged to obtain a clear supernatant. After incubating 10 ltl of this supernatant with 250 μl of reaction buffer (Clontech) for 1 hour at darkness, ~ i-galactosidase activity is measured using a luminometer of trade. The results are expressed in total Relative Light Unit (RLU) through tumor.
It is found that the plasmid pXL2813-Pso-GA, 9-NLS expresses the transgene in vivo at a level greater than or equal to that obtained with the plasmid pXL2813 not amended (see figure 13).

Example 5 This example illustrates the characterization of the peptide part of the conjugates Pso-GA ~ 9-NLS, i.e. verification of the targeting properties of the NLS peptide associated with constructions according to the invention.
5 The peptide sequence used, ie the NLS signal of the SV40 T antigen, is recognized by receptors of the karyopherin family a. The murine equivalent, called importine 60, fused to a glutathione S-transferase group, was used for characterize the oligonucleotide-peptide conjugates. He was operated according to the method described in the "Materials and Methods" section under the "Interactions" section with the 10 importines ".
Interactions between glutathione beads coated with 60 and the GA, 9-NLS or Pso-GA19-NLS oligonucleotides were studied. After one incubation 30 minutes at room temperature, the pellet is separated from the beads (containing the elements interacting with the importines) of the supernatant The result of this characterization is given in FIG. 7. This figure indicates that the oligonucleotide Pso-GA, 9-NLS is associated with the glutathione beads, while than the oligonucleotide Pso-GA, 9 remains in the supernatant.
This clearly shows the capacity of the oligonucleotide Pso-GA, 9-NLS to interact with the import a. The peptide part of the oligonucleotide-peptide chimeras is so good 2o recognized by its receptor, which means that the peptide fills actually its targeting signal role.
Example 6 This example illustrates the possibility of coupling the oligonucleotide GA19-SH to the peptide maleimide-NLS. Unlike Example 1, the chimera is not modified by a 25 photoactivatable alkylating agent.
The oligonucleotide GA, 9-SH, of sequence 5'-AAGGAGAGGAGGGAGGGAA-3 ' (SEQ m No. 4), with a thiol group at the 5 'end, was coupled with peptide maleimide-NLS which has a maleimide group at its N-terminal end under the same conditions as for the oligonucleotide Pso-GA, 9-SH (see example 1), WO 99/49067 PCT / E'R99 / 00643 The coupling is monitored by high pressure liquid chromatography (HPLC) in phase reverse. It is performed with an equimolar stoichiometry: in two hours, the coupling is total. The chimera is then purified by HPLC.
The oligonucleotide-peptide chimera was analyzed by proteolytic action of the trypsin as described in the "Materials and Methods" section.
The result is shown in Figure 8. It is comparable to that obtained with the oligonucleotide Pso-GAt9-SH.
Example 7 This example illustrates the possibility of forming triple helices between the plasmid 10 pXL2813 and the chimera GA, 9-NLS in the absence of an alkylating agent.
Kinetics of formation of triple helices between the plasmid pXL, 2813 and the chimera GA, 9-NLS obtained as described in Example 5, was carried out and studied according to the technique described in the "Materials and Methods" part, under the section "Training of triple helices with chimera ".
FIG. 9 represents the kinetics of formation of the triple helices.
It appears that under the conditions of plasmid concentrations of 40 nM and in 20 nM oligonucleotide, a stable triple helix is formed.
Example 8 This example illustrates the characterization of the peptide part of the chimera GAl9-NLS.
2o The peptide sequence used, the IVLS signal of the SV40 T antigen, is recognized by receptors of the karyopherin family a, as has already been mentionned in example 4. The murine equivalent, called importine 60, fused to a group glutathione S-transferase, has been used to characterize conjugates oligonucleotide peptide. It was operated as described in "Materials and Methods" under the section "Interactions with importines".
Interactions between glutathione beads coated with 60 and the GA, 9 or GA, 9-NLS oligonucleotides were studied. After an incubation of 30 minutes at room temperature, the pellet of beads is separated (containing ies elements interacting with the importins) of the supernatant.
The results are shown in Figure 10. It appears that the oligonucleotide GA ~ 9-NLS
is associated with the glutathione beads, while the oligonucleotide GA19 remains in the supernatant.
This clearly shows the ability of the oligonucleotide GA ~ 9-NLS to interact with the import a. The peptide part of the oligonucleotide-peptide chimeras is so good recognized by its receiver, and again fulfills its role of signal of targeting.
Example 9 lo This example illustrates the possibility of coupling the oligonucleotide 'pim-SH to the peptide maleimide-NLS.
The oligonucleotide pim-SH, of sequence 5'-GGGGAGGGGGAGG-3 '(SEQ ID
N ° 15), with a thiol group at the 5 ′ end, was coupled to the maleimide peptide-NLS who has a maleimide group at its N-terminal end in the same conditions as for the GAIS-SH oligonucleotide (see example 5).
The coupling is monitored by high pressure liquid chromatography (HPLC) in phase reverse. It is performed with an equimolar stoichiometry: in two hours, the coupling is total. The chimera is then purified by HPLC.
Example, - ple 10 2o This example illustrates the possibility of forming triple helices between the plasmid pXL2997 and the pim-NLS chimera in the absence of an allryling agent.
Kinetics of formation of triple helices between the plasmid pXL2997 and the chimera pim-NLS (training obtained as described in Example 8), was carried out and studied using the technique described in the "Materials and Methods" section, under the section 2s "Formation of triple helices with chimera".
FIG. 12 represents the kinetics of formation of the triple helices.
It appears that under the conditions of plasmid concentrations of 40 nM and in oligonucleotide of 20 rtM, a stable triple helix is formed.

The invention now being fully described, it is obvious that many modifications may be made to the present invention without, however, step aside the spirit of the invention and the scope of the claims which follow.

WO 99/49067, PCT / FR99 / 00643 SEQUENCE LIST
(1) GENERAL INFORMATION:
(i.) DEPOSITOR:
in) NAME: RHONE POULENC ROBER
(D) STREET: 20 AVENUE RAYMOND ARON
(C) CITY: ANTONY CEDEX
(E) COUNTRY: FRANCE
(F) POSTAL CODE: 92165 (G) PHONE: O.55.71.73.26 (H) FAX: 01.55.71.72.91 (ü) TITLE OF THE INVENTION: NUCLEIC ACID TRANSFER VECTORS, COMPOSITIONS CONTAINING THEM, AND USES THEREOF.
(iii) NUMBER OF SEQUENCES: 15 (iv) COMPUTER-DETACHABLE FORM:
(A) TYPE OF SUPPORT: Tape (B) COMPUTER: IBM PC compatible ' (C) OPERATING SYSTEM: PC-DOS / MS-DOS
(D) SOFTWARE: Pater.tIn Release I (1.0, Version N1.30 (EPO) (2) INFORMATION FOR IA SEQ ID NO: 1:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 25 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NOHIBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION ~ TION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(ai) DESCRIPTIOl4 OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 1:

(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 2:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 21 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear (ü) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 2:

SUBSTITUTE SHEET (SET 26) (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 3:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 21 base pairs (B) TYPE: nucleotide (CI NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ü) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 3:

(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: A:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 29 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear (ü) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 4:
AAGGAGAGGA GGGAGGGAA. 19 (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 5:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 19 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear (ü) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID N0: 5:
TTGGTGTGGT GGGTGGGTT lg (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 6:
(i) FEATURES OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 19 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear SUBSTITUTE SHEET (GOVERNMENT 26) WO 99! 49067 PCT / FR99 / 00643 (ii) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 6:

(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 7:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 21 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 7:

(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 8:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 13 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 8:

(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 9:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 14 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear ü) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 9:

SUBSTITUTE SHEET (SET 26) (2) INFORMATION FOR SEQ ID N0: 10:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 17 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear (ü) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 10:

(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 11:
(1) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 7 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: peptide (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 11:
Pro Lys Lys Lys Arg Lys Val (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 12:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 19 amino acids (B) TYPE: amino acid (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear (ü) TYPE OF MOLECULE: peptide (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 12:
Lys Arg Pro Ala Ala Thr Lys Lys Ala Gly Gln Ala Lys Lys Lys Lys Leu Asp Lys (2) INFORMATION FOR SEQ ID N0: 13:
SUBSTITUTE SHEET (SET 26) (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 38 amino acids (B1 TYPE: amino acid (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: peptide (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 13:
Asn Gln Ser Ser Asn Phe Gly Pro Met Lys Gly Gly Asn Phe Gly Gly Azg Ser Ser Gly Pro Tyr Gly Gly Gly Gly Gln Tyr Phe Ala Lys Pro Arg Asn Gln Gly Gly Tyr (2) INFORMATION FOR SEQ ID N0: 14:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 7 amino acids fB) TYPE: amino acid (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: peptide (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 14:
Pro Lys Asn Lys Arg Lys Val (2) INFORMATION FOR SEQ ID N0: 15:
fi) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 13 base pairs (B) TYPE: nucleotide (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID N0: 15:

SUBSTITUTE SHEET (GOVERNMENT 26)

Claims (42)

REVENDICATIONS 39 1. Vecteur de transfert d'acides nucléiques caractérisé en ce qu'il comprend une molécule d'ADN double brin et au moins un oligonucléotide couplé à un signal de ciblage et capable de former une triple hélice avec une séquence spécifique présente sur ladite molécule d'ADN double brin. 1. Nucleic acid transfer vector characterized in that it comprises a double-stranded DNA molecule and at least one signal-coupled oligonucleotide of targeting and capable of forming a triple helix with a specific sequence present on said double-stranded DNA molecule. 2. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon la revendication 1 caractérisé en ce que la molécule d'ADN double brin est un plasmide ou un épisome. 2. Nucleic acid transfer vector according to claim 1 characterized in that whether the double-stranded DNA molecule is a plasmid or an episome. 3. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon la revendication 2 caractérisé en ce que la molécule d'ADN double brin est un plasmide sous forme circulaire et dans un état superenroulé. 3. Nucleic acid transfer vector according to claim 2 characterized in that that the double-stranded DNA molecule is a plasmid in circular form and in a supercoiled state. 4. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon les revendications 1 à 3 caractérisé en ce que la molécule d'ADN double brin comprend une cassette d'expression constituée d'un ou plusieurs gènes d'intérêt sous contrôle d'un ou plusieurs promoteurs et d'un terminateur transcriptionnel actif dans les cellules de mammifères. 4. Nucleic acid transfer vector according to claims 1 to 3 characterized in what the double stranded DNA molecule includes an expression cassette incorporated of one or more genes of interest under the control of one or more promoters and a active transcriptional terminator in mammalian cells. 5. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon la revendication 4 caractérisé en ce que le gène d'intérêt est un acide nucléique codant pour un produit thérapeutique. 5. Nucleic acid transfer vector according to claim 4 characterized in that that the gene of interest is a nucleic acid encoding a product therapeutic. 6. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon l'une des revendications 1 à

caractérisé en ce que la séquence spécifique présente sur la molécule d'ADN
double brin est une séquence homopurique-homopyrimidique.
6. Nucleic acid transfer vector according to one of claims 1 to characterized in that the specific sequence present on the DNA molecule double strand is a homopurine-homopyrimidine sequence.
7. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon l'une des revendications 1 à

caractérisé en ce que la séquence spécifique présente sur la molécule d'ADN
double brin est une séquence présente naturellement sur l'ADN double brin ou une séquence synthétique ou naturelle introduite artificiellement dans l'ADN double brin.
7. Nucleic acid transfer vector according to one of claims 1 to characterized in that the specific sequence present on the DNA molecule double strand is a sequence naturally present on double-stranded DNA or a sequence synthetic or natural artificially introduced into the double-stranded DNA.
8. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon l'une des revendications 1 à

caractérisé en ce que l'oligonucléotide comprend une séquence poly-CTT et la séquence spécifique présente sur la molécule d'ADN double brin est une séquence poly-GAA.
8. Nucleic acid transfer vector according to one of claims 1 to characterized in that the oligonucleotide comprises a poly-CTT sequence and the specific sequence present on the double-stranded DNA molecule is a sequence poly-GAA.
9. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon l'une des revendications 1 à

caractérisé en ce que l'oligonucléotide comprend la séquence GAGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT (SEQ ID NO 1 ) ou bien la séquence (CTT)7 (SEQ ID NO 2).
9. Nucleic acid transfer vector according to one of claims 1 to characterized in that the oligonucleotide comprises the sequence GAGGCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT (SEQ ID NO 1) or the sequence (CTT)7 (SEQ ID NO 2).
10. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon l'une des revendications 1 à 7 caractérisé en ce que la séquence spécifique présente sur la molécule d'ADN
double brin comprend la séquence 5'-AAGGGAGGGAGGAGAGGAA-3' (SEQ ID NO 3) et l'oligonucléotide comprend la séquence 5'-AAGGAGAGGAGGGAGGGAA-3' (SEQ
ID NO 4) ou 5'-TTGGTGTGGTGGGTGGGTT-3' (SEQ ID NO 5).
10. Nucleic acid transfer vector according to one of claims 1 at 7 characterized in that the specific sequence present on the DNA molecule double strand comprises the sequence 5'-AAGGGAGGGAGGAGGAGAA-3' (SEQ ID NO 3) and the oligonucleotide comprises the sequence 5'-AAGGAGAGGAGGGAGGGAA-3' (SEQ
ID NO 4) or 5'-TTGGTGTGGTGGGTGGGTT-3' (SEQ ID NO 5).
11. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon l'une des revendications 1 à 7 caractérisé en ce que la séquence spécifique présente sur la molécule d'ADN
double brin comprend tout ou partie de la séquence 5'-CTTCCCGAAGGGAGAAAGG-3' (SEQ ID NO 6) comprise dans l'origine de réplication CoIE 1 de E. coli, et l'oligonucléotide possède la séquence 5'-GAAGGGTTCTTCCCTCTTTCC-3' (SEQ
ID NO 7).
11. Nucleic acid transfer vector according to one of claims 1 at 7 characterized in that the specific sequence present on the DNA molecule double strand comprises all or part of the sequence 5'-CTTCCCGAAGGGAGAAAGG-3' (SEQ ID NO 6) included in the CoIE 1 origin of replication of E. coli, and the oligonucleotide has the sequence 5'-GAAGGGTTCTTCCCTCTTTCC-3' (SEQ
ID NO 7).
12. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon l'une des revendications 1 à 7 caractérisé en ce que la séquence spécifique présente sur la molécule d'ADN
double brin comprend la séquence 5'-GAAAAAGGAAGAG-3' (SEQ ID NO 8) ou la séquence 5'-AAAAAAGGGAATAAGGG-3' (SEQ ID NO 10) comprises dans le gène .beta.-lactamase du plasmide pBR322 et de E. Coli respectivement.
12. Nucleic acid transfer vector according to one of claims 1 at 7 characterized in that the specific sequence present on the DNA molecule double strand comprises the sequence 5'-GAAAAAGGAAGAG-3' (SEQ ID NO 8) or the sequence 5'-AAAAAAGGGAATAAGGG-3' (SEQ ID NO 10) included in the gene .beta.-lactamase from plasmid pBR322 and E. Coli respectively.
13. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon l'une des revendications 1 à 7 caractérisé en ce que la séquence spécifique présente sur la molécule d'ADN
double brin comprend la séquence 5'-AAGAAAAAAAAGAA-3' (SEQ ID no 9) présente dans l'origine de réplication .gamma. des plasmides à origine de réplication conditionnelle tel que pCOR.
13. Nucleic acid transfer vector according to one of claims 1 at 7 characterized in that the specific sequence present on the DNA molecule double strand comprises the sequence 5'-AAGAAAAAAAAGAA-3' (SEQ ID no 9) present in the .gamma origin of replication. origin of replication plasmids conditional such that pCOR.
14. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon l'une des revendications 1 à 13 caractérisé en ce que l'oligonucléotide comprend au moins 3 bases. 14. Nucleic acid transfer vector according to one of claims 1 at 13 characterized in that the oligonucleotide comprises at least 3 bases. 15. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon 1a revendication 14 caractérisé en ce que l'oligonucléotide comprend 5 à 30 bases. 15. Nucleic acid transfer vector according to claim 14 characterized in that that the oligonucleotide comprises 5 to 30 bases. 16. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon l'une des revendications 1 à 15 caractérisé en ce que l'oligonucléotide présente au moins une modification chimique le rendant résistant aux, ou protégé vis-à-vis des nucléases, ou augmentant son affinité
vis-à-vis de la séquence spécifique présente sur la molécule d'ADN double brin.
16. Nucleic acid transfer vector according to one of claims 1 at 15 characterized in that the oligonucleotide has at least one modification chemical the making it resistant to, or protected against nucleases, or increasing its affinity against the specific sequence present on the double DNA molecule strand.
17. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon l'une des revendications 1 à 16 caractérisé en ce que l'oligonucléotide est un enchaînement de nucléosides ayant subi une modification du squelette. 17. Nucleic acid transfer vector according to one of claims 1 at 16 characterized in that the oligonucleotide is a chain of nucleosides having suffered skeletal modification. 18. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon l'une des revendications 1 à 16 caractérisé en ce que l'oligonucléotide est couplé à un agent alkylant formant une liaison covalente au niveau des bases de l'ADN double brin. 18. Nucleic acid transfer vector according to one of claims 1 at 16 characterized in that the oligonucleotide is coupled to an alkylating agent forming a covalent bond at the bases of double-stranded DNA. 19. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon la revendication 18 caractérisé en ce que ledit agent alkylant est photoactivable. 19. Nucleic acid transfer vector according to claim 18 characterized in that that said alkylating agent is photoactivatable. 20. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon les revendications 18 et 19 caractérisé en ce que ledit agent alkylant est un psoralène. 20. Nucleic acid transfer vector according to claims 18 and 19 characterized in that said alkylating agent is a psoralen. 21. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon les revendications 1 à 20 caractérisé
en ce que le signal de ciblage interagit avec un composant de la matrice extracellulaire, un récepteur de la membrane plasmique, cible un compartiment intracellulaire, et/ou améliore le trafic intracellulaire de l'ADN double brin.
21. Nucleic acid transfer vector according to claims 1 to 20 characterized in that the targeting signal interacts with a component of the matrix extracellular, a plasma membrane receptor, targets an intracellular compartment, and or improves intracellular traffic of double-stranded DNA.
22. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon la revendication 21 caractérisé en ce que ledit signal de ciblage comprend les facteurs de croissance (EGF, PDGF, TGFb, NGF, IGF I, FGF), les cytokines (IL-1, IL-2, TNF, Interferon, CSF), les hormones (insuline, hormone de croissance, prolactine, glucagon, hormone thyroïdienne, hormones stéroidiennes), les sucres qui reconnaissent des lectines, les immunoglobulines, la transferrine, les lipoprotéines, les vitamines telles que la vitamine B12, les hormones peptidiques ou les neuropeptides (tachykinines, neurotensine, VIP, endothéline, CGRP, CCK, ...), ou tout motif reconnu par les intégrines, par exemple le peptide RGD, ou par d'autres protéines extrinsèques de la membrane cellulaire. 22. Nucleic acid transfer vector according to claim 21 characterized in that that said targeting signal comprises growth factors (EGF, PDGF, TGFb, NGF, IGF I, FGF), cytokines (IL-1, IL-2, TNF, Interferon, CSF), hormone (insulin, growth hormone, prolactin, glucagon, thyroid hormone, steroid hormones), sugars that recognize lectins, immunoglobulins, transferrin, lipoproteins, vitamins such as vitamin B12, peptide hormones or neuropeptides (tachykinins, neurotensin, VIP, endothelin, CGRP, CCK, ...), or any motif recognized by integrins, by example the RGD peptide, or by other extrinsic cell membrane proteins. 23. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon la revendication 21 caractérisé en ce que le signal de ciblage est un signal de ciblage intracellulaire, tel qu'une séquence d'adressage nucléaire (NLS). 23. Nucleic acid transfer vector according to claim 21 characterized in that that the targeting signal is an intracellular targeting signal, such as a sequence Nuclear Addressing System (NLS). 24. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon la revendication 23 caractérisée en ce que ledit signal d'adressage nucléaire est la séquence NLS de l'antigène T
de SV40.
24. Nucleic acid transfer vector according to claim 23 characterized in that said nuclear targeting signal is the NLS sequence of the T antigen of SV40.
25. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon la revendication 21 caractérisée en ce que le signal de ciblage permet à la fois le ciblage extracellulaire et le ciblage intracellulaire. 25. Nucleic acid transfer vector according to claim 21 characterized in that the targeting signal allows both extracellular targeting and the targeting intracellular. 26. Vecteur de transfert d'acides nucléiques selon les revendications 1 à 25 caractérisé
en ce que le couplage du signai de ciblage à l'oligonucléotide est obtenu par synthèse en phase solide ou en solution, notamment par l'établissement de liaisons disulfure, thioéther, ester, amide, ou amine.
26. Nucleic acid transfer vector according to claims 1 to 25 characterized in that the coupling of the targeting signal to the oligonucleotide is obtained by synthesis in solid phase or in solution, in particular by the establishment of bonds disulfide, thioether, ester, amide, or amine.
27. Composition caractérisée en ce qu'elle contient au moins un vecteur tel que défini dans l'une des revendication 1 à 26. 27. Composition characterized in that it contains at least one vector such than defined in one of claims 1 to 26. 28. Composition selon la revendication 27 caractérisée en ce qu'elle contient en outre un ou plusieurs agents transfectant. 28. Composition according to claim 27, characterized in that it contains in addition one or more transfecting agents. 29. Composition selon la revendication 28 caractérisée en ce que l'agent transfectant est un lipide cationique, une lipopolyamine, ou un polymère cationique. 29. Composition according to claim 28, characterized in that the agent transfecting is a cationic lipid, a lipopolyamine, or a cationic polymer. 30. Composition selon les revendications 27 à 29 caractérisée en ce qu'elle contient en outre un ou plusieurs adjuvant(s) capable de s'associer aux complexes vecteur tel que défini dans l'une des revendications 1 à 25/agent transfectant. 30. Composition according to claims 27 to 29, characterized in that it contains in in addition to one or more adjuvant(s) capable of associating with the vector complexes such as defined in one of claims 1 to 25/transfecting agent. 31. Composition selon la revendication 30 caractérisée en ce que l'adjuvant est un ou plusieurs lipides neutres choisis parmi les lipides synthétiques ou naturels, zwitterioniques ou dépourvus de charge ionique dans les conditions physiologiques. 31. Composition according to claim 30, characterized in that the adjuvant is a or several neutral lipids chosen from synthetic or natural lipids, zwitterionic or devoid of ionic charge under the conditions physiological. 32. Composition selon l'une des revendications 30 ou 31 caractérisée en ce que le ou les lipides neutres sont choisis parmi les lipides à deux chaînes grasses. 32. Composition according to one of Claims 30 or 31, characterized in that the OR
the neutral lipids are chosen from lipids with two fatty chains.
33. Composition selon les revendications 30 à 32 caractérisée en ce que le ou les lipides neutres sont choisis parmi les dioléoylphosphatidyléthanolamine (DOPE), l'oléylpalmitoylphosphatidyléthanolamine (POPE), le di-stéaroyl, -palmitoyl, -mirystoyl phosphatidyléthanolamine ainsi que leurs dérivés N-méthylés 1 à 3 fois, les phosphatidylglycérols, les diacylglycérols, les glycosyldiacylglycérols, les cérébrosides (tels que notamment les galactocérébrosides), les sphingolipides (tels que notamment les sphingomyélines), et les asialogangliosides (tels que notamment les asialoGM1 et GM2). 33. Composition according to claims 30 to 32, characterized in that the or them neutral lipids are chosen from dioleoylphosphatidylethanolamine (DOPE), oleylpalmitoylphosphatidylethanolamine (POPE), di-stearoyl, -palmitoyl, -mirystoyl phosphatidylethanolamine and their N-methylated derivatives 1 to 3 times, phosphatidylglycerols, diacylglycerols, glycosyldiacylglycerols, cerebrosides (such as in particular galactocerebrosides), sphingolipids (such as notably sphingomyelins), and asialogangliosides (such as in particular asialoGM1 and GM2). 34. Composition selon la revendication 30 caractérisée en ce que l'adjuvant est ou comprend un composé intervenant au niveau de la condensation de l'ADN. 34. Composition according to claim 30, characterized in that the adjuvant is where includes a compound involved in DNA condensation. 35. Composition selon la revendication 34 caractérisée en ce que ledit composé
dérive en tout ou en partie d'une histone, d'une nucléoline, et/ou d'une protamine, ou est constitué en tout ou en partie de motifs peptidiques (KTPKKAKKP) et/ou (ATPAKKAA) répétés de manière continue ou non, le nombre de motifs pouvant varier entre 2 et 10.
35. Composition according to Claim 34, characterized in that the said compound derivative in whole or in part of a histone, a nucleolin, and/or a protamine, west consisting in whole or in part of peptide units (KTPKKAKKKP) and/or (ATPAKKAA) repeated continuously or not, the number of patterns can vary between 2 and 10.
36. Composition selon l'une quelconque des revendications 27 à 35 caractérisée en ce qu'elle comprend un véhicule pharmaceutiquement acceptable pour une formulation injectable. 36. Composition according to any one of claims 27 to 35 characterized in this that it comprises a pharmaceutically acceptable carrier for a formulation injectable. 37. Composition selon l'une quelconque des revendications 27 à 35 caractérisée en ce qu'elle comprend un véhicule pharmaceutiquement acceptable pour une application sur la peau et/ou sur les muqueuses. 37. Composition according to any one of claims 27 to 35 characterized in this that it comprises a pharmaceutically acceptable carrier for a application on skin and/or mucous membranes. 38. Utilisation d'un vecteur de transfert d'acides nucléiques tel que défini dans l'une des revendications 1 à 26 pour la fabrication d'un médicament destiné à soigner les maladies. 38. Use of nucleic acid transfer vector as defined in one of claims 1 to 26 for the manufacture of a medicament intended to treat them diseases. 39. Méthode de transfection d'acides nucléiques dans des cellules caractérisée en ce qu'elle comprend les étapes suivantes:
(1) synthèse de la chimère oligonucléotide - signal de ciblage, (2) mise en contact de la chimère synthétisée en (1) avec un ADN double brin pour former des triples hélices, (3) éventuellement, complexation du vecteur obtenu en (2) avec un ou plusieurs agent de transfection et/ou un ou plusieurs adjuvant(s), et (4) mise en contact des cellules avec le complexe formé en (2) ou le cas échéant en (3).
39. Method for Transfection of Nucleic Acids into Cells Characterized in this that it includes the following steps:
(1) synthesis of the oligonucleotide-targeting signal chimera, (2) bringing the chimera synthesized in (1) into contact with a double-stranded DNA
to form triple helices, (3) optionally, complexation of the vector obtained in (2) with one or several transfection agents and/or one or more adjuvant(s), and (4) bringing the cells into contact with the complex formed in (2) or the case applicable in (3).
40. Méthode de traitement de maladies par administration d'un vecteur de transfert d'acides nucléiques tel que défini dans l'une des revendications 1 à 26 contenant un ADN double brin apte à corriger ladite maladie. 40. Method of treating diseases by administering a vector of transfer of nucleic acids as defined in one of claims 1 to 26 containing a Double-stranded DNA capable of correcting said disease. 41. Cellule recombinante contenant un vecteur de transfert d'acides nucléiques tel que défini dans l'une des revendications 1 à 26. 41. Recombinant Cell Containing Nucleic Acid Transfer Vector such as defined in one of claims 1 to 26. 42. Cellule recombinante selon la revendication 41 caractérisée en ce qu'il s'agit d'une cellule eucaryote. 42. Recombinant cell according to claim 41 characterized in that it it is a eukaryotic cell.
CA002323831A 1998-03-24 1999-03-19 Nucleic acid transfer vectors, compositions containing same and uses Abandoned CA2323831A1 (en)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FR9803573A FR2776669B1 (en) 1998-03-24 1998-03-24 NUCLEIC ACID TRANSFER VECTORS, COMPOSITIONS CONTAINING SAME, AND USES THEREOF
FR9803573 1998-03-24
US8584898P 1998-05-18 1998-05-18
US60/085848 1998-05-18
PCT/FR1999/000643 WO1999049067A1 (en) 1998-03-24 1999-03-19 Nucleic acid transfer vectors, compositions containing same and uses

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CA2323831A1 true CA2323831A1 (en) 1999-09-30

Family

ID=26234216

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CA002323831A Abandoned CA2323831A1 (en) 1998-03-24 1999-03-19 Nucleic acid transfer vectors, compositions containing same and uses

Country Status (12)

Country Link
EP (1) EP1066396A1 (en)
JP (1) JP2002507429A (en)
KR (1) KR20010074456A (en)
CN (1) CN1292827A (en)
AU (1) AU758406B2 (en)
BR (1) BR9909044A (en)
CA (1) CA2323831A1 (en)
HU (1) HUP0102413A3 (en)
IL (1) IL138624A0 (en)
NO (1) NO20004648D0 (en)
PL (1) PL342944A1 (en)
WO (1) WO1999049067A1 (en)

Families Citing this family (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2315104C2 (en) * 2000-05-26 2008-01-20 Сантелион С.А.С. Method for purification of double-stranded dna molecule, backing for its realization and method for preparing support
FR2871465B1 (en) * 2004-06-15 2006-09-08 Centre Nat Rech Scient Cnrse COLLECTIONS OF TRACEABLE COMPOUNDS AND USES THEREOF
US7943589B2 (en) 2005-06-03 2011-05-17 President And Fellows Of Harvard College siRNA microbicides for preventing and treating diseases
US7795380B2 (en) 2006-06-02 2010-09-14 University Of Iowa Research Foundation Compositions and methods for nucleic acid delivery
EP3427054A4 (en) * 2016-03-07 2019-12-04 Quidel Cardiovascular Inc. Immunoassay controls and the use thereof
RU2731513C2 (en) * 2018-12-21 2020-09-03 Селл энд Джин Терапи Лтд Gene-therapeutic dna-vector based on gene-therapeutic dna-vector vtvaf17, carrying target gene selected from group of genes nos2, nos3, vip, kcnma1, cgrp, to increase expression level of these target genes, method for production and use thereof, strain escherichia coli scs110-af/vtvaf17-nos2, or escherichia coli scs110-af/vtvaf17-nos3, or escherichia coli scs110-af/vtvaf17-vip, or escherichia coli scs110-af/vtvaf17-kcnma1, or escherichia coli scs110-af/vtvaf17-cgrp, carrying gene-therapeutic dna vector, method for production thereof, method for industrial production of gene-therapeutic dna vector

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2028792A (en) * 1991-05-17 1992-12-30 Uab Research Foundation Sequence specific dna binding drugs
US5670347A (en) * 1994-05-11 1997-09-23 Amba Biosciences Llc Peptide-mediated gene transfer
FR2731014B1 (en) * 1995-02-23 1997-03-28 Rhone Poulenc Rorer Sa DNA MOLECULES, PREPARATION AND USE IN GENE THERAPY

Also Published As

Publication number Publication date
AU758406B2 (en) 2003-03-20
KR20010074456A (en) 2001-08-04
CN1292827A (en) 2001-04-25
HUP0102413A3 (en) 2003-09-29
WO1999049067A1 (en) 1999-09-30
AU3406200A (en) 2000-12-14
HUP0102413A1 (en) 2001-10-28
NO20004648L (en) 2000-09-18
PL342944A1 (en) 2001-07-16
NO20004648D0 (en) 2000-09-18
JP2002507429A (en) 2002-03-12
EP1066396A1 (en) 2001-01-10
IL138624A0 (en) 2001-10-31
BR9909044A (en) 2000-12-05

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP0809705B1 (en) Nucleic acid-containing composition, preparation and use thereof
CA2194797C (en) Nucleic acid containing composition, preparation and uses of same
EP0738328B1 (en) Composition containing nucleic acids, preparation and uses
ES2656904T3 (en) Method for effective exon skipping (44) in Duchenne muscular dystrophy and associated media
US7279326B2 (en) Composition for delivery of a mitochondrial genome to a cell
KR20010034493A (en) Methods and compounds for the genetic treatment of hyperlipidemia
AU2002255285A1 (en) Circular dumbbell decoy oligodeoxynucleotides (cdodn) containing dna bindings sites of transcription
FR2750704A1 (en) PROCESS FOR PRODUCING THERAPEUTIC DNA
EP0854930A1 (en) Pharmaceutical composition useful for nucleic acid transfection, and use thereof
JP2002533088A (en) Nonpathogenic transfection vector
US20210322577A1 (en) Methods and systems for modifying dna
CA2323831A1 (en) Nucleic acid transfer vectors, compositions containing same and uses
FR2776669A1 (en) New nucleic acid transfer vector comprising double-stranded DNA linked to oligonucleotide, used for gene therapy
WO2023283246A1 (en) Modular prime editor systems for genome engineering
AU2018286393A2 (en) Genome editing system for repeat expansion mutation
Sierakowska et al. Restoration of ß-globin gene expression in mammalian cells by antisense oligonucleotides that modify the aberrant splicing patierns of thalassemic pre-mRNAs
Weber-Lotfi et al. Targeting Therapeutic Nucleic Acids into Mitochondria: A Long Challenge
WO2010023544A1 (en) Compositions and methods for delivery of protein-coding rnas to correct mitochondrial dysfunction
WO1997040172A1 (en) Derived tyrosine hydroxylase gene expression system
MXPA00009046A (en) Nucleic acid transfer vectors, compositions containing same and uses
CZ20003441A3 (en) Vectors for transfer of nucleic acids, preparations in which they are comprised and their use
WO2002096928A2 (en) Peptide vector for transferring molecules of interest to eurocaryotic cells

Legal Events

Date Code Title Description
EEER Examination request
FZDE Discontinued