CA2139431A1 - Polypeptides having serotoninergie activity (5ht6), nucleic acids coding for said polypeptides, and uses thereof - Google Patents
Polypeptides having serotoninergie activity (5ht6), nucleic acids coding for said polypeptides, and uses thereofInfo
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Abstract
Description
-` W O 94/01~6 213~3431. PCT/F~93/00651 POLYPEPTIDES AYANT UNE ACTIVITE DE RECEPTEUR SEROTONINERGIQUE (5HT6) AC~DES NUCLEIQUES CODANT POUR CES POLYPEPTIDES ET UTILISATIONS
. _ La présente invention concerne de nouveaux polypeptides et le matériel 5 génétique permettant leur expression. Plus particulièrement, elle concerne de nouveaux polypeptides ayant une activité de récepteur sérotoninergique.
La sérotonine est un neuromodulateur capable d'induire et de moduler une grande varihé de comportements tels que le sommeil, l'appetit, la locomotion, l'activité sexuelle ou encore la contMction vasculaire. Il est adrnis que l'activité de la 10 sérotonine est médiée par son intcraction avec des récepteurs, désignés récepteurs sérotoninergiques ou récepteurs 5-HT (pour S-hydroxytr,vptamine). Des études de biologie moléculaire ainsi que des études pharmacologiques ont révélé qu'il existait un grand nombre de sous-types de récepteurs 5-HT. Les récepteurs 5-HT qui ont été
décrits jusqu`à aujourd'hui appartiennent soit à la famille des récepteurs liés à des 1~ canaux ioniques (récepteurs S-HT33, soit à la famille des récepteurs qui interagissent avec des protéines G et qui possèdent sept domaines transrnembranaires. Par ailleurs, l'analyse des séquences d'acides aminés a montre que les récepteurs S-HT
interagissant avec des protéines G peuvent être sous-divisés en deux groupes distincts: Les récepteurs 5HT1, comprenant les sous-types mammifères 5HT1A, 20 5HT1B et SHTlD ainsi que trois récepteurs 5HT de drosophile; et les récepteurs SHT2 comprenant les sous-types 5HT2 et 5HTlC.
Ces récepteurs ne sont sans doute pas les seuls récepteurs 5HT existant, dans la mesure où des études pharmacologiques ont revéié d'autres sous-types tels que les recepteurs 5HT4 ainsi que certains récepteurs apparentés au sous-type 5HT1 25 (récepteurs "5HT1 l~ce"?. De plus, des études supplémentaires de biologie moléculaire ont également révélé des hétérogénéités au sein des sous-types 5HTlBtlD.
La présente invention résulte de la mise en évidence de nouveawc - polypeptides ayant une activité de récepteur sérotoninergique. Bien qu'appartenant à
30 la famille des récepteurs qui interagissent avec des protéines G, ces nouveaux polypeptides diffèrent des récepteurs sérotoninergiques déjà décrits (5HT1, SHT2, 5HT3 et 5HT4) du point de vue structural comme du point de vue pharmacologique.
P!us particulièrement, l'invention résulte de l'isolement et de la caractérisation de ces WO 94/015~6 X~;~9431 PCI/FR93/00651 ~ ~ ~
!,; .
nouveaux polypeptides, désignés 5HT6, ainsi que du matériel génétique perrnettant leur expr2~ssion ou leur identification.
Un premier objet de l'invention réside donc dans des polypep~ides comprenant tout ou partie de la séquence peptidique SEQ ID n 1 ou d'un dérivé de 5 celle-ci.
Au sens de la présente invention, le terme dérivé désigne toute molécule obtenue par modification de nature génétique et/ou chimique de la séquence peptidique SEQ II) n 1. Par modification de nature génétique et/ou chimique, onpeut entendre toute mutation, substitution, délétion, addition et/ou modification d'un 10 ou plusieurs résidus. De tels dérivés peuvent être générés dans des buts différents, tels que notamment celui d'augmenter l'affinité du peptide pour son(ses) ligand(s), celui d'améliorer ses niveaux de production, celui d'augmenter sa résistance à des protéases, celui d'augmenter et/ou de modifier son activité, ou celui de lui conférer de nouvelles propriétés pharrnacocinétiques et/ou biologiques. Parmi les dérivés 1~ résultant d'une addition, on peut citer par exemple les polypeptides chimèrescomportant une partie hétérologue supplémentaire liée à une extrêrnité. Le termedérivé comprend également les polypeptides homologues au polypeptide SEQ ID n 1, issus d'autres sources cellulaires et notamment de cellules d'origine humaine, ou d'autres organismes, et possédant une acti~ité de même type. De tels polypeptides 20 homologues peuvent être obtenus par des expériences d'hybridation comme décrit dans les exemples (Cf SEQ ID n 4).
Préférentiellement, les polypeptides de l'invention sont des polypeptides possédant la capacité de lier la sérotonine. Encore plus préférentiellement, il s'agit de polypeptides ayant une activité de récepteur sérotoninergique. Toujours selon un25 mode préféré, les polypeptides de l'invention sont susceptibles d'être reconnus par des anticorps reconnaissant la séquence peptidique complète SEQ ID n 1.
Un mode de réalisation pa~ticulier de l'invention est représenté par le - polypeptide 5HT6 comprenant toute la séquence peptidique SEQ ID n 1. Comme indiqué dans les exemples, ce ~olypeptide peut être exprimé dans différents types 30 cellulaires pour former un récepteur sérotoninergique fonctionnel.
Les polypeptides de l'invention peuvent être obtenus par expression dans un hôte cellulaire d'une séquence nucléotidique telle que décrite ci-dessous, par syn~èse WO 9~/01556 ;~'39~31 pcr/FR93/oo6sl i chimique, sur la base des séquences SEQ ID n 1 ou 4 en utilisant les techniquesconnues de l'homme du métier, ou par une combinaison de ces techniques.
Dans ce qui suit, les polypeptides de l'invention tels que définis ci-dessus sont désignés par polypeptides 5HT6.
La présente invention a également pour objet toute séquence nucléotidique codant pour un polypeptide SHT6. Plus préférent;ellement, il s'agit d'une sé~uence . . . ~
cholsle parml:
(a) tout ou partie de la séquence nucléotidique SE~Q ID n 1 ou de son brin complémentaire, (b) toute séquence hybridant avec une séquence (a) et codant pour un polypeptide tel que défini précédemment, et, (c) les séquences dérivees des séquences (a) et (b) en raison de la dégénércscence du code génétique.
Les différentes séquences nucléotidiques de l'invention peuvent être d'origine artificielle ou non. Il peut s`agir de séquences génomiques, d'ADNc, d'ARN, de séquences hybrides ou de séquences synthétiques ou semi-synthétiques. Ces séquences peuvent être obtenues par exemple par criblage de banques d`ADN ~banque d'ADNc, banque d'ADN génomique) au moyen de sondes élaborées sur la base de la séquence SEQ ID n 1. De telles banques peuvent être préparées à partir de cellules de différentes origines par des techniques classiques de biologie molé~ulaire connues de l'homme du métier. Les séquences nucléotidiques de l'invention peuvent également être préparées par synthèse chimique, notamment selon la méthode des phosphoramidites, ou encore par des méthodes mixtes incluant la modification chimique ou enzymatiqe de séquences obtenues par criblage de banques. -` WO 94/01 ~ 6 213 ~ 3431. PCT / F ~ 93/00651 POLYPEPTIDES HAVING SEROTONINERGIC RECEPTOR ACTIVITY (5HT6) AC ~ NUCLEICS ENCODING THESE POLYPEPTIDES AND USES
. _ The present invention relates to novel polypeptides and to the material 5 genetics allowing their expression. More particularly, it relates to new polypeptides having serotonergic receptor activity.
Serotonin is a neuromodulator capable of inducing and modulating a wide variety of behaviors such as sleep, appetite, locomotion, sexual activity or even vascular contMction. It is recognized that the activity of the 10 serotonin is mediated by its integration with receptors, designated receptors serotonergic or 5-HT receptors (for S-hydroxytr, vptamine). Studies of molecular biology as well as pharmacological studies revealed that it existed a large number of 5-HT receptor subtypes. 5-HT receptors that have been described so far belong either to the family of receptors linked to 1 ~ ion channels (S-HT33 receptors, i.e. to the family of receptors which interact with G proteins and which have seven trans-membrane domains. Otherwise, amino acid sequence analysis has shown that S-HT receptors interacting with G proteins can be subdivided into two groups distinct: 5HT1 receptors, including the mammalian subtypes 5HT1A, 5HT1B and SHTlD as well as three 5HT Drosophila receptors; and the receptors SHT2 including the 5HT2 and 5HTlC subtypes.
These receptors are probably not the only 5HT receptors existing in the extent to which pharmacological studies have revealed other subtypes such as 5HT4 receptors as well as certain receptors related to the 5HT1 subtype 25 ("5HT1 l ~ ce" receptors ?. In addition, additional biology studies also revealed heterogeneities within subtypes 5HTlBtlD.
The present invention results from the discovery of novelty - polypeptides having a serotonergic receptor activity. Although belonging to 30 family of receptors that interact with G proteins, these new polypeptides differ from the serotonergic receptors already described (5HT1, SHT2, 5HT3 and 5HT4) from the structural point of view as from the pharmacological point of view.
More particularly, the invention results from the isolation and characterization of these WO 94/015 ~ 6 X ~; ~ 9431 PCI / FR93 / 00651 ~ ~ ~
!,; .
new polypeptides, designated 5HT6, as well as genetic material allowing their expr2 ~ ssion or their identification.
A first object of the invention therefore resides in polypep ~ ides comprising all or part of the peptide sequence SEQ ID No. 1 or of a derivative of 5 this one.
Within the meaning of the present invention, the term derivative designates any molecule obtained by modification of genetic and / or chemical nature of the sequence peptide SEQ II) n 1. By modification of a genetic and / or chemical nature, one can hear any mutation, substitution, deletion, addition and / or modification of a 10 or more residues. Such derivatives can be generated for different purposes, such as that in particular that of increasing the affinity of the peptide for its ligand (s), that to improve its production levels, that of increasing its resistance to proteases, that of increasing and / or modifying its activity, or that of giving it new pharmacokinetic and / or biological properties. Among the derivatives 1 ~ resulting from an addition, mention may be made, for example, of chimeric polypeptides comprising an additional heterologous part linked to one end. The term derivative also includes polypeptides homologous to the polypeptide SEQ ID n 1, from other cellular sources and in particular from cells of human origin, or other organizations, and having an activity of the same type. Such polypeptides 20 homologs can be obtained by hybridization experiments as described in the examples (Cf SEQ ID n 4).
Preferably, the polypeptides of the invention are polypeptides possessing the ability to bind serotonin. Even more preferably, it is about polypeptides having serotonergic receptor activity. Still according to a preferred mode, the polypeptides of the invention are capable of being recognized by antibody recognizing the complete peptide sequence SEQ ID No. 1.
A specific embodiment of the invention is represented by the - 5HT6 polypeptide comprising the entire peptide sequence SEQ ID n 1. As indicated in the examples, this ~ polypeptide can be expressed in different types 30 cells to form a functional serotonin receptor.
The polypeptides of the invention can be obtained by expression in a cell host of a nucleotide sequence as described below, by syn ~ ese WO 9 ~ / 01556; ~ '39 ~ 31 pcr / FR93 / oo6sl i chemical, based on the sequences SEQ ID No. 1 or 4 using techniques known to a person skilled in the art, or by a combination of these techniques.
In the following, the polypeptides of the invention as defined above are designated by 5HT6 polypeptides.
The present invention also relates to any nucleotide sequence encoding a SHT6 polypeptide. More prefer; actually, it is a se ~ uence . . . ~
cholsle parml:
(a) all or part of the nucleotide sequence SE ~ Q ID n 1 or its strand complementary, (b) any sequence hybridizing with a sequence (a) and coding for a polypeptide as defined above, and, (c) the sequences derived from sequences (a) and (b) due to the degeneracy of the genetic code.
The different nucleotide sequences of the invention can be of artificial origin or not. It can be genomic sequences, cDNA, RNA, hybrid sequences or synthetic or semi-synthetic sequences. These sequences can be obtained for example by screening of DNA banks ~ bank cDNA, genomic DNA bank) using probes developed on the basis of sequence SEQ ID No. 1. Such libraries can be prepared from cells of different origins by conventional techniques of molar ~ ulary biology known of the skilled person. The nucleotide sequences of the invention can also be prepared by chemical synthesis, in particular according to the method of phosphoramidites, or by mixed methods including modification chemical or enzymatic sequence obtained by screening libraries.
2~ Les séquences nucléotidiques de l'invention peuvent être utilisées pour la production des polypeptides SHT6 tels que définis précédemment. Dans ce cas, la partie codant pour ledit polypeptide est généralement placée sous le contrôle de signaux pennettant son expression dans un hôte cellulaire. Le choix de ces signaux (promoteurs, terminateurs, etc) peut varier en fonction de l'hôte cellulaire utilisé. A
30 cet effet, les séquences nucléotidiques de l'invention peuvent faire partie d'un vecteur, qui peut être à réplication autonome ou intégratif. Plus particulièrement, des vecteurs à réplication autonome peuvent être préparés en utilisant des séquences à réplication autonome chez l'hote choisi. S'agissant des vecteurs intégratifs, ceux-ci peuvent être WO 94/01556 ~ 31. PCI/FR93/00651 préparés par exemple en utilisant des séquences homologues à certaines régions du génome de l'hôte, permettant, par recombinaison homologue, l'intégration du vecteur.
Les hôtes cellulaires utilisables pour la production des polypeptides 5HT6 de l'invention par voie recombinante sont aussi bien des hôtes eucaryotes que procaryotes. Parmi les hôtes eucaryotes qui conviennent, on peut citer les cellules animales, les levures, ou les champignons. En particulier, s'agissant de levures, on peut citer les levures du genre Saccharomyces, Kluyveromyces, Pichia, Schwanniomyces, ou Hansenula. S'agissant de cellules animales, on peut citer lescellules COS, CHO, Cl27, NIH-3T3, etc. Parmi les champignons, on peut citer pluslo particulièrement Aspergillus ssp. ou Trichoderma ssp. Comme hôtes procaryotes, on préfère utiliser les bactéries suivantes E.coli, Bacillus, ou Streptomyces.
Les séquences nucléotidiques de la présente invention sont également utilisables dans le domaine pharmaceutique, soit pour la réalisation de séquences , antisens utilisables dans le cadre d'une thérapie génique, soit encore pour la réalisation de sondes permettant là détection, par des expériences d'hybridation, de l'expression de récepteurs sérotoninergiques dans des échantillons biologiques et la mise en évidence d'anomalies génétiques (polymorphisme, mutations) ou d'expressions aberrantes.
: ~ L'inhibition de l'expression de certains gènes par des oligonucléotides -~ 20 antisens s'est avérée être une stratégie prometteuse dans le contrôle de l'activité d'un gène. Les oligonucléotides- antisens sont des oliogonucléotides de petite taille, - complémentaire du brin codant d'un gène donné, et de ce fait capables d'hybrider ; spécifiquement avec l'AR~m~transcrit, inhibant sa traduction en protéine. L'invention a ainsi pour objet les oligonucléotides antisens capables d'inhiber au moins 2~ partiellement la production de polypeptides 5HT6 tels que définis precédemment. De tels oligonucléotides peuvent être constitués par tout ou partie des séquences nucléotidiques définies ci-avant. Il s'agit généralement de sequences ou de fragments de séquences complémentaires de séquences codant pour des peptides de l'invention.
De tels oligonucléotides peuvent être obtenus à partir de la séquence SEQ ID n 1 ou 4, par fragmentation, etc, ou par synthèse chimique.
Comme indiqué ci-dessus, I'invention permet également la réalisation de sondes nucléotidiques, synthétiques ou non, capables de s'hydrider avec les séquences nucléotidiques définies ci-avant qui codent pour des polypeptides 5HT6 de O 94/01556 pcr/FR93/oo6sl X~g~
.
I'invention, ou avec les ARNm correspondant. De telles sondes peuvent être utilisées in vitro comrne outil de diagnostic, pour la détection de l'expression d'un récepteur sérotoninergique 5HT6, ou encore pour la mise en évidence d'anomalies génétiques(mauvais épissage, polymorphisme, mutations ponctuelles, etc). Compte tenu des , 5 activités multiples de la sérotonine, les sondes de l'invention peuvent ainsi permettre d'identifier des affections neurologique, cardiovasculaire ou psychiatrique comme étant liées aux récepteurs 5HT6. Ces sondes peuvent également être utilisées pour la mise en évidence et l'isolement de séquences d'acides nucléiques homologues codant pour des polypeptides 5HT6 tels que définis précédemment, à partir d'autres sources 0 cellulaires et préférentiellement de cellules d'origines humaines, ainsi qu'illustré dans les exemples. Les sondes de l'invention comportent généralement au moins 10 bases, et elles peuvent comporter jusqu'à l'intégralité de la séquence SEQ ID n 1 ou 4 ou de leur brin complémentaire. Préférentiellement, ces sondes sont, préalablement à leur utilisation, marquées. Pour cela, différentes techniques connues de l'homme du métier peuvent être employées (marquage radioactif, enzymatique, etc). Les conditions d'hybridation dans lesquelles ces sondes peuvent être utilisées sont indiquées dans les techniques générales de clonage ci-après ainsi que dans les exemples.
Un autre objet de l'invention concerne les cellules recombinées capables d'exprimer à leur surface un polypeptide SHT6 tel que défini ci-avant. Ces cellules peuvent être obtenues par introduction d'une séquence nucléotidique telle que définie ci-dessus codant pour un polypeptide de l'invention, puis culture desdites cellules dans des conditions d'expression de ladite séquence.
Les cellules recombinées selon l'invention peuvent être aussi bien des cellules eucaryotes que procaryotes. Parmi les cellules eucaryotes qui conviennent, on peut citer les cellules animales, les levures, ou les champignons. En particulier, s'agissant de levures, on peut citer les levures du genre Saccharomyces, Kluyveromyces, Pichia, Schwanniomyces, ou Hansenula. S'agissant de cellules animales, on peut citer les cellules COS, CHO, C127, NIH-3T3, etc. Parmi les champignons, on peut citer plus particulièrement Aspergillus ssp. ou Trichoderma 30 ssp. Comme cellules procaryotes, on préfère utiliser les bactéries suivsntes E.coli, Bacillus, ou Streptomyces. Les cellules ainsi obtenues peuvent être utilisées pour mesurer la capacité de différentes molécules à se comporter comme ligand ou comme rnodulateur de l'activité des polypeptides de l'invention. Plus particulièrement, elles peuvent ainsi être utilisées dans un procédé de mise en évidence et d'isolement de WO 94/015~6 2~L39431. PCl/FR93/00651 ligands ou de modulateur de l'activité des polypeptides de l'invention, et, pluspréférentiellement, d'agonistes et d'antagonistes de la sérotonine.
IJn autre objet de l'invention concerne donc un procédé de mise en évidence etJou d'isolement de ligands des polypeptides 5HT6 de l'invention, selon lequel on s réalise les étapes suivantes:
- on met en contact une molécule ou un mélange contenant différentes molécules, éventuellen ent non-identifiées, avec une cellule recombinée telle que décrite ci-dessus exprimant à sa surface un polypeptide de l'invention dans des conditions permettant l'interaction entre ledit polypeptide de l'invention et ladite ~o molécule dans le cas où celle-ci possèderait une affinité pour ledit polypeptide, et, - on détecte et/ou isole les molécules liées au dit polypeptide de l'invention.
Dans un mode particulier, ce procédé de l'invention est adapté à la mise en évidence et/ou l'isolement d'agonistes et d'antagonistes de la sérotonine pour les polypeptides 5HI'6 i Un autre objet de l'invention concerne un procédé de mise en évidence et/ou - d'isolement de modulateurs des polypeptides 5HT6 de l'invention, selon lequel on réalise les étapes suivantes:
- on met en contact une rnolécule ou un mélange contenant différentes molécules, éventuellement non^identifiées, avec une cellule recombinée telle que' 20 décrite ci-dessus exprimant à sa surface un polypeptide de l'invention, en présence de 5HT, dans des conditions permettant l'interaction entre ledit polypeptide de I'invention et le 5HT, et, - on détecte et/ou isole les molécules capables de moduler l'activité du 5HT
sur ledit polypeptide de l'invention.
2~ Un autre objet de l'invention concerne l'utilisation d'un ligand ou d'un modulateur identifié et/ou obtenu selon le procédé décrit ci-avant comme médicament. De tels li~gands ou modulateurs peuvent en effet permettre de traiter certaines affections neurologique, cardiovasculaire ou psychiatrique liées aux récepteurs SHT6.
L'invention concerne également tout médicament comprenant comme principe actif au moins une molécule agissant sur un polypeptide 5HT6 de l'in~ention. Préférentiellement la molé^ule est un li~and ou un modulateur identifié
et/ou isolé selon le procédé décrit précédemment.
- ` WO 9~/0l~56 ; . PCr/FR93/006~1 ` ~i3~ 3~
D'autres avantages de la présente invention apparaîtront à la lecture des exemples qui suivent, qui doivent être considérés comme illustratifs et non limitatifs.
Légende des figures SEO_ID n 1: Séquences nucléotidique et peptidique du récepteur 5HT6 murin.
L'ADNc de 1558 pb a été séquencé sur les 2 brins depuis le site EcoRI jusqu'au site XhoI. Les 92 premiers nucléotides ne sont pas représentés.
Fi~ure 2: Pourcentages d'homologie de séquence peptidique entre le récepteur 5HT6 présenté SEQ ID n 1 et d'autres récepteurs de la famille des récepteurs couplés à des protéines G. Les homologies ont été calculées sur les séquences conservées: le domaine transmembranaire et ses boucles de connection.
Figure 3: Courbe de saturation du ~l25I]-LSD aux membranes des cellules Cos-7 exprimant le récepteur 5HT6. Les membranes ont été incubées avec des concentrations de ligand allant de 50 pM à 1,25 nM, avec ou sans 10 ~ de 5HT. Laliaison spécifique est représentée. L'encart représente l'analyse en Scatchard des résultats.
Figure 4: Mise en évidence de séquences homologues par PCR sur des ARN totaux -(1 ilg) de différents tissus.
Table 1: Profil pharmacologique du récepteur 5HT6. Les résultats correspondent àdes expériences de compétition pour la liaison du [125I]-LSD aux membranes des . 20 cellules Cos-7 exprimant le récepteur 5HT6 de manière transitoire. Les valeurs d'IC50 (correspondant à la concentration en ligand nécessaire pour déplacer 50 ~o du [125I]-LSD lié) ont été calculées expérimentalement et converties en Ki selon l'équation suivante: Ki = IC50/(1 + ClKd) dans laquelle C est la concentration en ~125I~-LSD (150 pM) et Kd est la constante de dissociation du ~125I]-LSD (980 pM).
2s Les nombres entre parenthèses correspondent au nombre d'expériences indépendantes réalisées, chaque point étant réalisé en triple.
,.
. .
wO 94/015~6 21394:~1. pcr/FR93/oo65l Techniques généra~es de clona~e Les méthodes classiquement utilisées en biologie moléculaire telles que les extractions préparatives d'ADN plasmidique, la centrifugation d'ADN plasmidique en gradient de ch]orure de césium, l`électropho~èse sur gels d`agarose ou d'acrylamide, la purification de fragments d'ADN par électroélution, les extractions de protéines au phénol ou au phénol-chloroforme, la précipitation d'ADN en milieu salin par de l'éthanol ou de l'isopropanol, la transformation dans Escherichia coli, etc, sont bien connues de l'homme de métier et sont abondament décrites dans la littérature [Maniatis T. et al., "Molecular Cloning, a Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laborato~, Cold Spring Harbor, N.Y., 1982; Ausubel F.M. et al. (eds), "Current Protocols in Molecular Biology", John Wiley & Sons, New York, 1987].
Les enzymes de restriction ont été fournies par New England Biolabs (Biolabs), Bethesda Research Laboratories (BRL) ou Amersham et sont utilisées selon les recommandations des fournisseurs.
Pour les ligatures, les fragments d'ADN sont séparés selon leur taille par électrophorèse en gels d'agarose ou d'acrylamide, extraits au phénol ou par un mélange phénol/chloroforme, précipités à l'éthanol puis incubés en présence de l'ADN ligase du phage T4 (Biolabs) selon les recommandations du fournisseur.
Le remplissage des extrémités 5' proéminentes est effectué par le fragment de Klenow de l'ADN Polymérase I d'E. coli (Biolabs) selon les spécifications du fournisseur. La destruction dès extrémités 3' proéminentes est effectuée en présence de l'ADN Polymérase du phage T4 (Biolabs) utilisée selon les recommandations du fabricant. La destruction des extrémités 5' proeminentes est effectuée par un - traitement ménagé par la nucléase S1.
La mutagénèse dirigée in vitro par oligodéoxynucléotides syn~hétiques est effectuée selon la méthode développée par Taylor et al. [Nucleic Acids Res. 13 (1985) 8749-8764] en utilisant le kit distribué par Amersham.
L'amplification enzymatique de fragments d'ADN par la technique dite de PCR [~olymérase-catalyzed Chain Reaction, Saiki R.K. et al., Science ~Q (1985) 1350-1354; Mullis K.B. et Faloona F.A., Meth. Enzym. 155 (1987) 335-350] est effectuée en utilisant un "DNA thermal cycler" (Perkin Elmer Cetus) selon les spécifications du fabricant.
. , W O 94/01556 2~39~ PC~r/FR93/00651 La vérification des séquences nucléotidiques est effectuée par la méthode développée par Sanger et al. [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 74 (1977) 5463-5467] en utilisant le kit distribué par Amersham.
Pour les expériences d'hybridation, les conditions de stringence normales sont généralement les suivantes: hybridation: 3 x SCC en présence de 5 x Denhart's à
65C; lavage: 0,5 x SSC à 65C.
1. IsQ!~ment du récepteur ~HT6 Les comparaisons de séquences entre les différents récepteurs sérotoninergiques conrlus font apparaître une certaine conservation, particulièrement dans certaines régions transmembranaires potentielles telles que les domaines IIl et IV. Dans le but de mettre en évidence et d'isoler un nouYeau récepteur, les inYenteurs de la présente demande ont utilisé une sonde correspondant à un fragment génomique du récepteur 5HTlB~i [Maroteaux et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89 (1992) 3020]
pour cribler une banque d'~DN de cerveau de rat. Plus particulièrement, la sonde1~ utilisée correspond au fragment SacI-BglII de 2,3 kb du récepteur 5HT1BB, préalablement marqué par "random priming" lFeinberg et Vogelstein, Analytical Biochemistry ~ (1984) 6]. Cette sonde a été utilisée pour cribler une banque d'ADNc de cerveau de rat construite dans le phage UniZap (Stratagène), dans des conditio~s de stringence faible (formamide 30 %, 5 x SSC, 42C). Parmi les phages positifs obtenus, l'un d'entre-eux, hybridant faiblement à la sonde a été isolé. Ce phage, dénommé ASR et porté par le plasmide pSR, contenait un insert de 1,6 kb ,' environ qui a ensuite été introduit dans le plasmide Bluescript. La sequence de ce - fragment a été dé~erminée sur les 2 brins en utilisant la technique des dideoxynucléotides au moyen d'oligonucléotides synthétiques.
- 2s La séquence ainsi obtenue est présentée sur la SEQ ID n 1. Elle montre que l'ADNc isolé porte une phase de lecture ouverte de 367 acides aminés. Par ailleurs, l'analyse d'hydrophobicité montre que cette protéine porte sept domaines hydrophobes, une particularité rencontrée chez les membres de la famille des récepteurs couplés à des protéines G. L'extrémité N-terminale contient par ailleurs ~
sites de N-glycosylation, et le domaine cytoplasmique présumé contient les sitesconsensus de phosphorylation par les protéines kinases C et A.
WO 94/01~6 PCr/FR93/00651 , Z1394;~,~
2. Etude d'homolo~ies de séquence La séquence du récepteur 5HT6 isolé ci-dessus a été comparée avec les séquences des récepteurs couplés à des protéines G suivants: S31, 5HT1BB, 5HTlDa, 5HTlA, 5HT-dro2A, 5HT-drol, 5HTlC et 5HT2. Ces expériences ont 5 révélé une certaine homologie dans le domaine transmembranaire potentiel et dans les boucles de connection, mais pas dans les régions terminales ni dans là troisième boucle cytoplasmique. La figure 2 donne les ~o d'homologie au niveau des régionsconservées.
Comme il ressort de cette figure, l'homolgie, au niveau des régions 10 conservées, avec les récepteurs connus est faible, le meilleur résultat étant obtenu avec les récepteurs sérotoninergiques 5HTlBJ3 et SHTlDa (54 % d'homologie), et avec le récepteur S31 qui n'est pas encore caractérisé. 2 ~ The nucleotide sequences of the invention can be used for the production of SHT6 polypeptides as defined above. In this case part coding for said polypeptide is generally placed under the control of signals permitting its expression in a cellular host. The choice of these signals (promoters, terminators, etc.) may vary depending on the cell host used. AT
For this purpose, the nucleotide sequences of the invention can be part of a vector, which can be autonomous or integrative replication. More specifically, vectors replicable sequences can be prepared using replicating sequences autonomous at the chosen host. As regards integrative vectors, these can be WO 94/01556 ~ 31. PCI / FR93 / 00651 prepared for example by using sequences homologous to certain regions of the host genome, allowing, by homologous recombination, integration of the vector.
The cellular hosts which can be used for the production of the 5HT6 polypeptides of the invention by recombinant means are both eukaryotic hosts and prokaryotes. Examples of suitable eukaryotic hosts include cells animals, yeasts, or fungi. In particular, as regards yeasts, mention may be made of yeasts of the genus Saccharomyces, Kluyveromyces, Pichia, Schwanniomyces, or Hansenula. As regards animal cells, mention may be made of COS, CHO, Cl27, NIH-3T3 cells, etc. Among the fungi, there may be mentioned more particularly Aspergillus ssp. or Trichoderma ssp. As prokaryotic hosts, prefer to use the following bacteria E.coli, Bacillus, or Streptomyces.
The nucleotide sequences of the present invention are also usable in the pharmaceutical field, either for the production of sequences , antisense usable in the context of gene therapy, or even for the production of probes allowing the detection, by hybridization experiments, of expression of serotonergic receptors in biological samples and the highlighting of genetic anomalies (polymorphism, mutations) or outliers.
: ~ Inhibition of the expression of certain genes by oligonucleotides - ~ 20 antisense has proven to be a promising strategy in controlling the activity of a uncomfortable. Antisense oligonucleotides are small oliogonucleotides, - complementary to the strand coding for a given gene, and therefore capable of hybridizing ; specifically with AR ~ m ~ transcribed, inhibiting its translation into protein. The invention thus relates to antisense oligonucleotides capable of inhibiting at least 2 ~ partially the production of 5HT6 polypeptides as defined above. Of such oligonucleotides can consist of all or part of the sequences nucleotides defined above. These are usually sequences or fragments of sequences complementary to sequences coding for peptides of the invention.
Such oligonucleotides can be obtained from the sequence SEQ ID No. 1 or 4, by fragmentation, etc., or by chemical synthesis.
As indicated above, the invention also allows the realization of nucleotide probes, synthetic or not, capable of hydriding with the sequences nucleotides defined above which code for 5HT6 polypeptides of O 94/01556 pcr / FR93 / oo6sl X ~ g ~
.
The invention, or with the corresponding mRNAs. Such probes can be used in vitro as a diagnostic tool for detecting the expression of a receptor 5HT6 serotonergic, or for the detection of genetic anomalies (poor splicing, polymorphism, point mutations, etc.). take in account the , 5 multiple activities of serotonin, the probes of the invention can thus allow identify neurological, cardiovascular or psychiatric conditions such as being linked to 5HT6 receptors. These probes can also be used for the detection and isolation of homologous nucleic acid sequences encoding for 5HT6 polypeptides as defined above, from other sources 0 cells and preferably cells of human origin, as illustrated in the examples. The probes of the invention generally contain at least 10 bases, and they may contain up to the entire sequence SEQ ID No. 1 or 4 or their complementary strand. Preferably, these probes are, prior to their use, marked. For this, different techniques known to those skilled in the art can be used (radioactive, enzymatic labeling, etc.). Conditions in which these probes can be used are indicated in the general cloning techniques below as well as in the examples.
Another subject of the invention relates to recombinant cells capable to express on their surface a SHT6 polypeptide as defined above. These cells can be obtained by introducing a nucleotide sequence as defined above coding for a polypeptide of the invention, then culturing said cells under conditions of expression of said sequence.
The recombinant cells according to the invention can be either eukaryotic cells than prokaryotic. Among suitable eukaryotic cells are may cite animal cells, yeasts, or fungi. In particular, in the case of yeasts, mention may be made of yeasts of the genus Saccharomyces, Kluyveromyces, Pichia, Schwanniomyces, or Hansenula. Regarding cells animal, one can quote the cells COS, CHO, C127, NIH-3T3, etc. From mushrooms, there may be mentioned more particularly Aspergillus ssp. or Trichoderma 30 ssp. As prokaryotic cells, it is preferred to use the following bacteria E. coli, Bacillus, or Streptomyces. The cells thus obtained can be used for measure the ability of different molecules to behave as ligands or as modulator of the activity of the polypeptides of the invention. More specifically, they can thus be used in a process for highlighting and isolating WO 94/015 ~ 6 2 ~ L39431. PCl / FR93 / 00651 ligands or modulators of the activity of the polypeptides of the invention, and, more preferably, of agonists and antagonists of serotonin.
Another object of the invention therefore relates to a method of highlighting and or isolating ligands of the 5HT6 polypeptides of the invention, according to which s performs the following steps:
- we put in contact a molecule or a mixture containing different molecules, possibly unidentified, with a recombinant cell such as described above expressing on its surface a polypeptide of the invention in conditions allowing the interaction between said polypeptide of the invention and said ~ o molecule in the case where it has an affinity for said polypeptide, and, - Molecules linked to said polypeptide of the invention are detected and / or isolated.
In one particular mode, this method of the invention is suitable for implementing evidence and / or isolation of serotonin agonists and antagonists for 5HI'6 polypeptides i Another subject of the invention relates to a method of highlighting and / or - Isolation of modulators of the 5HT6 polypeptides of the invention, according to which performs the following steps:
- one puts in contact a molecule or a mixture containing different molecules, possibly unidentified, with a recombinant cell as described above expressing on its surface a polypeptide of the invention, in the presence of 5HT, under conditions allowing the interaction between said polypeptide of The invention and the 5HT, and, - molecules and molecules capable of modulating the activity of 5HT are detected and / or isolated on said polypeptide of the invention.
2 ~ Another object of the invention relates to the use of a ligand or of a modulator identified and / or obtained according to the process described above as drug. Such li ~ gands or modulators can indeed allow to treat certain neurological, cardiovascular or psychiatric conditions related to SHT6 receptors.
The invention also relates to any medicament comprising as active ingredient at least one molecule acting on a 5HT6 polypeptide of in ~ ention. Preferably the molé ^ ule is a li ~ and or an identified modulator and / or isolated according to the method described above.
- `WO 9 ~ / 0l ~ 56; . PCr / FR93 / 006 ~ 1 `~ i3 ~ 3 ~
Other advantages of the present invention will appear on reading the examples which follow, which should be considered as illustrative and not limiting.
Legend of figures SEO_ID n 1: Nucleotide and peptide sequences of the murine 5HT6 receptor.
The 1558 bp cDNA was sequenced on the 2 strands from the EcoRI site to the site XhoI. The first 92 nucleotides are not shown.
Fi ~ ure 2: Percentages of peptide sequence homology between the 5HT6 receptor presented SEQ ID No. 1 and other receptors of the receptor family coupled to G proteins. Homologies were calculated on the conserved sequences: the transmembrane domain and its connection loops.
Figure 3: Saturation curve of ~ l25I] -LSD to the membranes of Cos-7 cells expressing the 5HT6 receptor. The membranes were incubated with ligand concentrations ranging from 50 pM to 1.25 nM, with or without 10 ~ 5HT. The specific link is shown. The insert represents the Scatchard analysis of results.
Figure 4: Demonstration of homologous sequences by PCR on total RNA -(1 ilg) of different fabrics.
Table 1: Pharmacological profile of the 5HT6 receptor. The results correspond to competitive experiments for the binding of [125I] -LSD to the membranes of . 20 Cos-7 cells expressing the 5HT6 receptor transiently. Values IC50 (corresponding to the ligand concentration necessary to move 50 ~ o from [125I] -LSD linked) have been calculated experimentally and converted into Ki according to the following equation: Ki = IC50 / (1 + ClKd) in which C is the concentration ~ 125I ~ -LSD (150 pM) and Kd is the dissociation constant of ~ 125I] -LSD (980 pM).
2s The numbers in parentheses correspond to the number of independent experiments carried out, each point being carried out in triplicate.
,.
. .
wO 94/015 ~ 6 21394: ~ 1. pcr / FR93 / oo65l General clona techniques The methods conventionally used in molecular biology such as preparative plasmid DNA extractions, centrifugation of plasmid DNA into gradient of ch] cesium orure, the electrophoresis on agarose or acrylamide gels, purification of DNA fragments by electroelution, protein extractions at phenol or phenol-chloroform, the precipitation of DNA in a saline medium by ethanol or isopropanol, processing in Escherichia coli, etc., are fine known to those skilled in the art and are abundantly described in the literature [Maniatis T. et al., "Molecular Cloning, a Laboratory Manual", Cold Spring Harbor Laborato ~, Cold Spring Harbor, NY, 1982; Ausubel FM et al. (eds), "Current Protocols in Molecular Biology ", John Wiley & Sons, New York, 1987].
Restriction enzymes were supplied by New England Biolabs (Biolabs), Bethesda Research Laboratories (BRL) or Amersham and are used according to supplier recommendations.
For ligations, the DNA fragments are separated according to their size by electrophoresis in agarose or acrylamide gels, extracted with phenol or with a phenol / chloroform mixture, precipitated with ethanol and then incubated in the presence of phage T4 DNA ligase (Biolabs) according to the supplier's recommendations.
The filling of the protruding 5 ′ ends is carried out by the fragment of Klenow of E. DNA Polymerase I. coli (Biolabs) according to the specifications of provider. The destruction from the prominent 3 ′ ends is carried out in the presence of phage T4 DNA Polymerase (Biolabs) used according to the recommendations of the maker. The destruction of the protruding 5 ′ ends is carried out by a - gentle treatment with nuclease S1.
Mutagenesis directed in vitro by syn ~ hetic oligodeoxynucleotides is performed according to the method developed by Taylor et al. [Nucleic Acids Res. 13 (1985) 8749-8764] using the kit distributed by Amersham.
The enzymatic amplification of DNA fragments by the technique known as PCR [~ olymerase-catalyzed Chain Reaction, Saiki RK et al., Science ~ Q (1985) 1350-1354; Mullis KB and Faloona FA, Meth. Enzym. 155 (1987) 335-350] is performed using a "DNA thermal cycler" (Perkin Elmer Cetus) according to the manufacturer's specifications.
. , WO 94/01556 2 ~ 39 ~ PC ~ r / FR93 / 00651 Verification of nucleotide sequences is carried out by the method developed by Sanger et al. [Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 74 (1977) 5463-5467] in using the kit distributed by Amersham.
For hybridization experiments, the normal stringency conditions are generally the following: hybridization: 3 x SCC in the presence of 5 x Denhart's at 65C; washing: 0.5 x SSC at 65C.
1. IsQ! ~ Receptor ~ HT6 Sequence comparisons between different receptors serotonergic conrlus show a certain conservation, particularly in certain potential transmembrane regions such as domains IIl and IV. In order to identify and isolate a new receptor, the investigators of the present application used a probe corresponding to a genomic fragment of the 5HTlB ~ i receptor [Maroteaux et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89 (1992) 3020]
to screen a bank of rat brain ~ DN. More particularly, the probe 1 ~ used corresponds to the SacI-BglII fragment of 2.3 kb of the 5HT1BB receptor, previously marked with "random priming" lFeinberg and Vogelstein, Analytical Biochemistry ~ (1984) 6]. This probe was used to screen a bank of rat brain cDNA constructed in phage UniZap (Stratagene), in low stringency conditions (formamide 30%, 5 x SSC, 42C). Among the phages positive, one of them, weakly hybridizing to the probe, was isolated. This phage, called ASR and carried by the plasmid pSR, contained an insert of 1.6 kb , 'approximately which was then introduced into the plasmid Bluescript. The sequence of this - fragment has been determined on the 2 strands using the technique of dideoxynucleotides using synthetic oligonucleotides.
- 2s The sequence thus obtained is presented on SEQ ID No. 1. It shows that the isolated cDNA carries an open reading phase of 367 amino acids. Otherwise, hydrophobicity analysis shows that this protein carries seven domains hydrophobic, a peculiarity encountered in members of the family of receptors coupled to G proteins. The N-terminal end also contains ~
N-glycosylation sites, and the suspected cytoplasmic domain contains consensus phosphorylation sites by protein kinases C and A.
WO 94/01 - 6 PCr / FR93 / 00651, Z1394; ~, ~
2. Study of sequence homologies The sequence of the 5HT6 receptor isolated above was compared with the sequences of receptors coupled to the following G proteins: S31, 5HT1BB, 5HTlDa, 5HTlA, 5HT-dro2A, 5HT-drol, 5HTlC and 5HT2. These experiences have 5 revealed some homology in the potential transmembrane domain and in the connection loops, but not in the terminal regions or in the third cytoplasmic loop. Figure 2 gives the ~ o homology at the level of the preserved regions.
As this figure shows, homolgia, at the level of the regions 10 conserved, with known receptors is weak, the best result being obtained with the serotonergic receptors 5HTlBJ3 and SHTlDa (54% homology), and with the S31 receiver which is not yet characterized.
3. Expression transitoire du récepteur 5HT6 dans les c~llules Cos-7 et caractérisation pharmacologique ~ Le fragment d'ADNc isolé dans l'exemple 1 a été inséré dans un vecteur d'expression eucaryote, qui a été utilisé pour transfecter des cellules Cos-7. Les membranes des cellules transfectées obtenues ont ensuite été preparées et testées pour . ~ leur capacité à lier certains ligands sérotoninergiques marqués.
L'ADNc de 1,6 kb codant pour le récepteur 5HT6 a été isolé à partir du plasmide pSR~ sous forrne d'un fragrnent EcoRI-XhoI, puis inséré aux sites correspondants du vecteur p513. Le vecteur pS13 dérive du vecteur pSG5 [Green etal., Nucl. Acids Res. 1 (1988) 369] par addition d'un multisite de clonage. Le vecteur recombinant ainsi obtenu désigné p513SR a ensuite été utilisé (20 ~g parplaque de 10 cm) pour transfecter les cellules Cos-7 en présence de phosphate decalcium.
48 heures après la transfection, les cellules recombinantes sont récoltées et les membranes sont préparées selon la technique decrite par Amlaiky et Caron [J. Biol. Chem. ~Q (1985) 1983]. Des expériences de liaison à saturation et de compétition ont ensuite été réalisées sur ces membranes en présence des ligands radiomarqués suivants: [125I]-LSD; [l25I]-cyanopindolol; [3H~-8-oH-DPAT et [3H]-spiperone. Pour cela, les échantillons de membrane (10-20 ~g de protéines) ont été
incubés 10 minutes à 37C en présence du ligand dans un volume final de 250 ul de - WO 94/01556 PCr/FR93/00651 2~3~31 tampon Tris-HCl 50 mM (pH 7,4~. La réaction est ensuite stopée par filtration sous vide sur filtres en fibre de verre Whatman GF/C, et rinçage 4 fois avec 4 ml de tampon Tris-HCl 50 mM (pH 7,4). La liaison non-spécifique a été déterminée en présence de 10 IlM de 5HT. La radioactivité a été mesurée avec un compteur y.
Les résultats obtenus montrent que, bien que le [125I]-cyanopindolol; le ~3HJ-8-oH-DPAT et le 13H]-spiperone ne lient pas les membranes préparées, le ~125I~-LSD présente un site de liaison saturable avec un Kd = 980 pM et un Bmax =
2,2 pmoVmg de protéines membranaires (figure 3). Dans une exprérience contrôle, il a par ailleurs été montré que le [125I]-LSD ne liait pas les cellules Cos-7 transfectées lo par le plasmide p513.
Pour déterminer le profil pharmacologique de ce récepteur, le [l2~I]-LSD lié
aux membranes a été déplacé en présence de différentes drogues sérotoninergiques(table 1). Ces différentes drogues montrent l'ordre d'efficacité de déplacement suivant: méthylsergide > bufotenine > surnatriptan > 5HT (table 1). La kétansérine, le ~) cyanopindolol et le 5-CT possèdent une faible affinité, tant dis que la i norépinéphrine est inactive. 3. Transient expression of the 5HT6 receptor in the Cos-7 cells and characterization pharmacological ~ The cDNA fragment isolated in Example 1 was inserted into a vector eukaryotic expression, which was used to transfect Cos-7 cells. The membranes of the transfected cells obtained were then prepared and tested for . ~ their ability to bind certain labeled serotonergic ligands.
The 1.6 kb cDNA encoding the 5HT6 receptor was isolated from the plasmid pSR ~ in the form of an EcoRI-XhoI fragment, then inserted into the sites correspondents of vector p513. The vector pS13 is derived from the vector pSG5 [Green et al., Nucl. Acids Res. 1 (1988) 369] by adding a multisite of cloning. The recombinant vector thus obtained designated p513SR was then used (20 ~ 10 cm plate) to transfect Cos-7 cells in the presence of decalcium phosphate.
48 hours after transfection, the recombinant cells are harvested and the membranes are prepared according to the technique described by Amlaiky and Caron [J. Biol. Chem. ~ Q (1985) 1983]. Saturation binding experiments and competition were then carried out on these membranes in the presence of ligands following radiolabelled: [125I] -LSD; [125I] -cyanopindolol; [3H ~ -8-oH-DPAT and [3H] -spiperone. For this, the membrane samples (10-20 ~ g of protein) were incubated for 10 minutes at 37C in the presence of the ligand in a final volume of 250 μl of - WO 94/01556 PCr / FR93 / 00651 2 ~ 3 ~ 31 50 mM Tris-HCl buffer (pH 7.4 ~. The reaction is then stopped by filtration under vacuum on Whatman GF / C fiberglass filters, and rinse 4 times with 4 ml of 50 mM Tris-HCl buffer (pH 7.4). Non-specific binding was determined in presence of 10 IlM of 5HT. Radioactivity was measured with a y counter.
The results obtained show that, although [125I] -cyanopindolol; the ~ 3HJ-8-oH-DPAT and 13H] -spiperone do not bind the prepared membranes, the ~ 125I ~ -LSD has a saturable binding site with a Kd = 980 pM and a Bmax =
2.2 pmoVmg of membrane proteins (Figure 3). In a control experiment, he has also been shown that [125I] -LSD does not bind transfected Cos-7 cells lo by plasmid p513.
To determine the pharmacological profile of this receptor, the [12 ~ I] -LSD linked membranes was moved in the presence of different serotonergic drugs (Table 1). These different drugs show the order of movement efficiency next: methylsergide>bufotenine>surnatriptan> 5HT (table 1). Ketanserin, ~) cyanopindolol and 5-CT have a low affinity, as long as the i norepinephrine is inactive.
4. ~:xpression du ~écepteur 5HT6 dans lçs cellules l~IH-3T3 et étude pharrnacolo~ique L'ADNc cloné dans l'exemple 1 a également été exprimé dans les cellules NIH-3T3, qui n'expriment aucun récepteur sérotoninergique de manière endogène.
Pour cela, le vecteur d'expression recombinant décrit en 3. ci-dessus a été utilisé. Il a été introduit (20 ~g par plaque de 10 cm) dans les cellules NIH-3T3 par transfection en présence de phosphate de calcium, en même temps que le vecteur pRSVnéo [Gorman et al., Science 221 (1983) 551], portant le gène de résistance au G418 (1 ~g par plaque de 10 cm). Les clones transformants ont été sélectionnés en présence de 0,5 mg de G418. Les clones isolés ont ensuite été amplifiés et les RNA totaux de ces clones ont été préparés et analysés en Northern Blot pour l'expression d'ARNm du- 5HT6. Un clones a ainsi été sélectionné, SR4, exprimant des niveaux élevés d'ARNm du 5HT6.
Les membranes des cellules de ce clone ont ensuite ,~té préparées et testées dans les conditions décrites ci-dessus pour leur capacité à lier certains ligands W0 94/0l-~ZS6 . ! i ~ PCr/FR93/00651 2~3943i.
sérotoninergiques marqués, témoignan~ de la présence de récepteurs 5HT6 fonctionnels à leur surface. 4. ~: xpression of the 5HT6 receptor in the IH-3T3 cells and study pharrnacolo ~ ique The cDNA cloned in Example 1 was also expressed in cells NIH-3T3, which do not endogenously express any serotonergic receptor.
For this, the recombinant expression vector described in 3. above was used. He has was introduced (20 ~ g per 10 cm plate) into NIH-3T3 cells by transfection in the presence of calcium phosphate, at the same time as the vector pRSVnéo [Gorman et al., Science 221 (1983) 551], carrying the G418 resistance gene (1 ~ g per 10 cm plate). The transforming clones were selected in the presence of 0.5 mg G418. The isolated clones were then amplified and the total RNA of these clones were prepared and analyzed in Northern Blot for the expression of 5HT6 mRNA. A clone was thus selected, SR4, expressing high levels of mRNA
5HT6.
The cell membranes of this clone were then prepared and tested.
under the conditions described above for their ability to bind certain ligands W0 94/0l- ~ ZS6. ! i ~ PCr / FR93 / 00651 2 ~ 3943i.
marked serotonergic, testifying to the presence of 5HT6 receptors functional on their surface.
5. Recherche de séquences homologues dans d'autres tissus La séquence nucléotidique SEQ ID n 1 a ensuite été utilisée pour la mise en évidence de séquences homologues à partir d'autres tissus. Pour cela, deux technique~
ont été utilisées:
- la PCR
- l'hybridation in situ.
Les tissus utilisés pour la recherche de séquences homologues sont les 0 suivants d'origine murine: cerveau, cervelet, rein, foie, moelle épinière, rate, poumon, intestin et coeur.
5.1. Recherche par PCR
Pour la recherche par PCR, les sondes suivantes ont été utilisées:
Sonde (i): SEQ ID n 2 1~ Sonde (ii): SEQ ID n 3 La sonde (i) correspond à la position 1174 sur la SEQ ID n 1 et la sonde (ii) à la position 1394.
Les AR~ totaux ~nt été préparés à partir des différents tissus étudiés, en utilisant la technique décrite par Cathala et al. (DNA 2(4~ (lg83)). 1 ~g de ces ARN a été soumis à une transcription inverse en présence de 200 unités de transcriptase inverse MMLV et de 300 ng de la sonde (i~, pendant 1 heure à 37C. La moitié du " produit de cette réaction a ensuite été amplifiée (20 cycles) en présence de 5 unités de la polymérase Taq (Cetus) et de 500 ng des sondes (i) et ~ii). Les produits a nsi obtenus ont ensuite été transférés sur filtres de nitro-cellulose et hybridés dans les conditions de stringence élevée suivantes: 42C, dans un tampon phosphate de sodium 20 mM (pH 6,5) contenant 50 ~o de formamide, 5 x SSC, 1 x Denhardt's, 0,1% de SDS et 100 ~g/ml d'ARNt. Les lavages ont été effectués à 60C dans un tampon 0,1 x SSC, 0,1 % SDS.
wO 94/01~6PCr/FR93/0065 1 2~3943~
Cette étude a permis de mettre en évidence des fragments d'ADN specifiques homologues dans la moelle epinière et le cerveau (figure 4).
5.2. Recherche par hybridation in si~u Les experiences d'hybridation in sin~ ont été réalisées sur des sections 5 cryostatees de cerveau de rat adulte ~S semaines environ) selon la technique decrite par Hafen et al. [EMBO J. 2 (1983) 617]. La sonde utilisée pour ces experiences est un ARN simple brin obtenu par transcription en présence de polymérase T7, de ~35S]-CTP en utilisant le plasmide PSR comme matnce.
Cette étude a permis de mettre en évidence des séquences homologues selon 10 I'invention dans les couches CA1, CA2 et CA3 de l'hippocarnpe. Une experiencecontrole réalisée dans les mêmes conditions avec différentes sondes d'ARN de même longueur mais non specifique des récepteurs de l'invention n'a révélé aucun signal positif. 5. Search for homologous sequences in other tissues The nucleotide sequence SEQ ID No. 1 was then used for the implementation evidence of homologous sequences from other tissues. For this, two technique ~
were used:
- PCR
- in situ hybridization.
The tissues used for the search for homologous sequences are the 0 following of murine origin: brain, cerebellum, kidney, liver, spinal cord, spleen, lung, intestine and heart.
5.1. Research by PCR
For PCR research, the following probes were used:
Probe (i): SEQ ID n 2 1 ~ Probe (ii): SEQ ID n 3 The probe (i) corresponds to position 1174 on SEQ ID No. 1 and the probe (ii) at position 1394.
The total ARs were prepared from the different tissues studied, in using the technique described by Cathala et al. (DNA 2 (4 ~ (lg83)). 1 ~ g of these RNAs has been subjected to reverse transcription in the presence of 200 transcriptase units reverse MMLV and 300 ng of the probe (i ~, for 1 hour at 37C. Half the "product of this reaction was then amplified (20 cycles) in the presence of 5 units of Taq polymerase (Cetus) and 500 ng of probes (i) and ~ ii). Nsi products obtained were then transferred to nitro-cellulose filters and hybridized in the following high stringency conditions: 42C, in phosphate buffer 20 mM sodium (pH 6.5) containing 50 ~ o of formamide, 5 x SSC, 1 x Denhardt's, 0.1% SDS and 100 ~ g / ml tRNA. The washes were carried out at 60C in a buffer 0.1 x SSC, 0.1% SDS.
wO 94/01 ~ 6PCr / FR93 / 0065 1 2 ~ 3943 ~
This study made it possible to highlight specific DNA fragments counterparts in the spinal cord and brain (Figure 4).
5.2. Search by hybridization in si ~ u The hybridization experiments in sin ~ were carried out on sections 5 adult rat brain cryostats ~ S weeks approximately) according to the technique described by Hafen et al. [EMBO J. 2 (1983) 617]. The probe used for these experiments is a single-stranded RNA obtained by transcription in the presence of T7 polymerase, ~ 35S] -CTP using the PSR plasmid as a matnce.
This study made it possible to highlight homologous sequences according to 10 the invention in layers CA1, CA2 and CA3 of the hippocarnus. A control experiment carried out under the same conditions with different RNA probes in the same length but not specific of the receptors of the invention revealed no signal positive.
6. Isolement du~ce~teur humain 1~Selon la méthodologie décrite en 5. ci-dessus, le récepteur 6HT6 humain a été cloné.
Pour cela, une banque d'ADN génomique humain a été préparée à partir de placenta, par digestion partielle par l'enzyme Mbol, séparation sur gradients de sels, et sous clonage dans le vecteur Lamda GEM 12 linéarise par BarnHI (bacterie hôte:TAP
90)-La banque ainsi obtenue a ensuite été criblée en utilisant comme sonde le fragment EcoRI-XhoI de 1,6 kb décrit dans l'exemple 3., marque selon la technique de random priming. Les fragments de DNA qui hybrident avec cette sonde ont été isolés, sous clonés dans un plasmide Bluescript, amplifiés, puis séquencés dans les deux sens selon la technique dideoxynucleotide. L'arnplification a été réalisée par la technique PCR: 20 cycles en présence de Thermus aquaticus polymerase(2,5 unités; Cetus) etd'oligonucléotides I (SEQ ID n 5) et 2 (SEQ ID n 6). Le fragment obtenu a été
digeré par les enzymes BamHl et XhoI, puis sous clones dans un vecteur d'expression P513.
La séquence obtenue est présentée sur la séquence SEQ ID n 4.
WO94/01556 PCr/FR93/006~1 , .~ ., . ;
Z~39~
Il est entendu que les même expériences peuvent être répétées en utilisant dtautres tissus et notamment des tissus d'origine humaine, et d'autres sondes. Par ailleurs, les séquences homologues mises en évidene~e lors de ces expériences peuvent évidemment être ensuite isolées et/ou amplifiées par les techniques classiques de S biologiemoléculaire.
.
i . W 0 9~/01~6 PCT/FR93/00651 21394~
LISTE DE SEQUENCES
(1) INFORMATION GENERALE:
(i) DEPOSANT:
(A) NOM: INSERM
(B) RUE: 101, rue de Tolbiac (C) VILLE: PARIS
(E) PAYS: France ¦ (F) CODE POSTAL: 75654 ~(ii) TITRE DE L' INVENTION: Nouveaux polypeptides ayant une activite ¦de recepteur serotoniner~ique, acides nucleiques codant pour ces ,15 polypeptides et utilisations.
!( iii, NOMBRE DE SEQUENCES: 6 (iv) FORME LISIBLE PAR ORDINATEUR:
(A) TYPE DE SUPPORT: Tape (B) ORDINATEUR: IBM PC compatible (C) SYSTEME D' EXPLOITATION: PC-DOS/MS-DOS
(D) LOGICIEL: PatentIn Release #1.0, Version #1.25 (OEB) (2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 1:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 1557 paires de bases (B) TYPE: acide nucléique (C) NOMBRE DE BRINS: double (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc .3~
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(iii) ANTI-SENS: NON
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: Souris (ix) CARACTERISTIQUE ADDITIONELLE:
(A) NOM/CLE: CDS
(B) EMPLACEMENT: 310.. 1410 (D) AUTRES RENSEIGNEMENTS: /product= "Gene recepteur 5HT6 - souris"
'. .
~xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 1:
Met Asp Phe Leu Asn Ala Ser Asp Gln Asn Leu Thr Ser WO 94/01~56 , X~39431. PCr/FR93/00651 ! .
Glu Glu Leu Leu Asn Arg Met Pro Ser Lys Ile Leu Val Ser Leu Thr CTG TCT GGG CTG GCA TTG ATG ACA ACC ACC ATC AAC TCC CTC GTG ATC 4~4 Leu Ser Gly Leu Ala Leu Met Thr Thr Thr Ile Asn Ser Leu Val Ile Ala Ala Ile Ile Val Thr Arg Lys Leu His His Pro Ala Asn Tyr Leu 50 . 55 60 j 15 ATT TGT TCC TTG GCA GTT ACA GAT TTT CTT GTA GCT GTC CTG GTG ATG 540 Ile Cys Ser Leu Ala Val Thr Asp Phe.Leu Val Ala Val Leu Val Met ' 65 70 75 i CCC TTC AGT ATT GTG TAC ATT GTG AGA GAG AGC TGG ATT ATG GGA CAA 588 i 20 Pro Phe Ser Ile Val Tyr Ile Val Arg Glu Ser Trp Ile Met Gly Gln Val Leu Cys Asp Ile Trp Leu Ser Val Asp Ile Ile Cys Cys Thr Cys Ser Ile Leu His Leu Ser Ala Ile Ala Leu Asp Arg Tyr Arg Ala Ile Thr Asp Ala Val Glu Tyr Ala Arg Lys Arg Thr Pro Arg His Ala Gly 130 135 , 140 3~ ATC ATG ATC ACG ATC GTG TGG GTT ATA TCT GTG TTC ATC TCT ATG CCT 780 Ile Met Ile Thr Ile Val Trp Val Ile Ser Val Phe Ile Ser Met Pro : 40 Pro Leu Phe Trp Arg His Gln Gly Thr Ser Arg Asp Asp Glu Cys Val j ATC AAA CAT GAC CAC ATT GTT TCC ACA ATT ~AC TCC ACG TTT GGA GCT 876 Ile Lys His Asp His Ile Val Ser Thr Ile Tyr Ser Thr Phe Gly Ala 175 . 180 185 , TTC TAC ATC CCG CTT GTA TTG ATA TTG ATC CTC TAC TAC AAA ATA TAC 924 ~;
! Phe Tyr Ile Pro Leu Val Leu Ile Leu Ile Leu Tyr Tyr Lys Ile Tyr 1gO 195 200 205 , ` AGA GCA GCA AGG ACA CTG TAC CAC AAG AGA CAA GCG AGT CGG ATG ATA 972 Arg Ala Ala Arg Thr Leu Tyr His Lys Arg Gln Ala Ser Arg Met Ile Lys Glu Glu Leu Asn Gly Gln Val Phe Leu Glu Ser Gly Glu Lys Ser 60 Ile Lys Leu Val Ser Thr Ser Tyr Met Leu Glu Lys Ser Leu Ser Asp ~ WO 94/015~6 2139~3~. PCT/FR93tO06~ 1 I
1 ~
I
Pro Ser Thr Asp Phe Asp Arg Ile His Ser Thr Val Lys Ser Pro Arg 25s 260 265 . TCG GAA CTG AAG CAT GAG AAA TCT TGG AGA AGA CAG AAA ATC TCA GGC 1164 5 Ser Glu Leu Lys His Glu Lys Ser Trp Arg Arg Gln Lys Ile Ser Gly Thr Arg Glu Arg Lys Ala Ala Thr Thr Leu Gly Leu Ile Leu Gly Ala Phe Val Ile Cys Trp Leu Pro Phe Phe Val Lys Glu Leu Val Val Asn GTC TGT GAA AAA TGT AAA AT~ TCT GAA GAA ATG TCA AAC TTT TTG GCA 1308 Val Cvs Glu Lys Cys Lys Ile Ser Glu Glu Met Ser Asn Phe Leu Ala 2~ TGG CTT GGT TAC CTG AAT TCC CTT ATA AAT CCA CTG ATT TAT ACC ATC 1356 . Trp Leu Gly Tyr Leu Asn Ser Leu Ile Asn Pro Leu Ile Tyr Thr Ile ~ 335 340 345 ; TTT AAT GAA GAC TTC AAG AAA GCT TTC CAA AAA CTT GTA CGA TGC CGA 1404 25 Phe Asn Glu Asp Phe Lys Lys Ala Phe Gln Lys Leu Val Arg Cys Arg Tyr T~FORMATIoN POUR LA SEO ID_NO: 2:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 20 paires de bases (B) TYPE::acide nucléique (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire ! ( i i, TYPE DE MOLECULE: ADNc (vi) ORIGINE:
,45 (A) ORGANISME: Sonde (i) (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 2:
(2) INFORMATION POUR LA SEO Ip NO: 3:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
~A) LONGUEUR: 19 paires de bases (B) TYPE: acide nuclélque W O 94/01~56 2~ 394-31 PCT/FR93~0065l ~ !
¦ (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (v~) ORIGINE:
S (A) ORGANISME: Sonde (ii) ~xij DESCRIPTION DE 1A SEQUENCE: SEQ ID NO: 3:
(2) INFORMATION POUR LA SEQ ID NO: 4:
; (i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
, (A) LONGUEUR: 1101 paires de bases B) TYPE: acide nucléique ' ~C) NOMBRE DE BRINS: double ¦ ~D) CONFIGURATION: linéaire ~ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (iii) HYPOTHETIQUE: NON
¦ ~iii) ANTI-SENS: NON
! ~ 25 (vi) ORIGINE: -~ tA) ORGANISME: Homo sapiens ¦ (ix) CARACTERISTIQUE ADDITIONELLE:
(A) NOM/CLE: CDS
(B) EMPLACEMENT: 1.. 1101 (D) AUTRES RENSEIGNEMENTS: Jproduct= "Gene recepteur 5HT6 humain"
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 4:
¦ ATG GAT TTC TTA AAT TCA TCT GAT CAA AAC TTG ACC TCA GAG GAA CTG 48 Met Asp Phe Leu Asn Ser Ser Asp Gln Asn Leu Thr Ser Glu Glu Leu Leu Asn Arg Met Pro Ser Lys Ile Leu Val Ser Leu Thr Leu Ser Gly Leu Ala Leu Met Thr Thr Thr Ile Asn Ser Leu Val Ile Ala Ala Ile 50 Ile Val Thr Arg Lys Leu His His Pro Ala Asn Tyr Leu Ile Cys Ser CTT GCA GTC ACA GAT TTT CTT GTG GCT GTC CTG GTG ATG CCC TTC AGC 24 b Leu Ala Val Thr Asp Phe Leu Val Ala Val Leu Val Met Pro Phe Ser 6~ 70 75 80 Ile Val Tyr lle Val Arg Glu Ser Trp Ile Met Gly Gln Val Val Cys ~'0 94/01556 PCT/FR~3/00651 Z~3~
¦ Asp Ile Trp Leu Ser Val Asp Ile Thr Cys Cys Thr Cys Ser Ile Leu 5 CAT CT. TCA GCT ATA GCT TTG GAT CGG TAT CGA GCA ATC ACA GAT GCT 384 His Leu Ser Ala Ile Ala Leu Asp Arg Tyr Arg Ala Ile Thr Asp Ala 10 Val Glu Tyr Ala Arg Lys Arg Thr Pro Lys His Ala Gly Ile Met Ile Thr Ile Val Trp Ile Ile Ser Val Phe Ile Ser Met Pro Pro Leu Phe 1~ 145 150 155 160 Trp Arg His Gln Gly Thr Ser Arg Asp Asp Glu Cys Ile Ile Lys His Asp His Ile Val Ser Thr Ile Tyr Ser Thr Phe Gly Ala Phe Tyr Ile Pro Leu Ala Leu Ile Leu Ile Leu Tyr Tyr Lys Ile Tyr Arg Ala Ala 30 Lys Thr Leu Tyr His Lys Arg Gln Ala Ser Arg Ile Ala Lys Glu Glu :GTG AAT:GGC CAA GTC CTT TTG GAG AGT GGT GAG AAA AGC ACT AAA TCA 720 Val Asn:Gly Gln Val Leu Leu Glu Ser Gly Glu Lys Ser Thr Lys Ser 3~ 225 230 235 240 Val Ser Thr Ser Tyr Val Leu Glu Lys Ser Leu Ser Asp Pro Ser Thr 245 ` 250 255 Asp Phe Asp Lys Ile His Ser Thr Val Arg Ser Leu Arg Ser Glu Phe Lys His Glu Lys Ser Trp Arg Arg Gln Lys Ile Ser Gly Thr Arg Glu 50 Arg Lys Ala Ala Thr Thr Leu Gly Leu Ile Leu Gly Ala Phe Val Ile Cys Trp Leu Pro Phe Phe Val Lys Glu Leu Val Val Asn Val Cys Asp Lys Cys Lys Ile Ser Glu Glu Met Ser Asn Phe Leu Ala Trp Leu Gly 325 ~ 330 335 Tyr Leu Asn Ser Leu Ile Asn Pro Leu Ile Tyr Thr Ile Phe Asn Glu WO 94/01556 PCl /FR93/0065 1 -2~;~g4~
GAC TTC AAG AAA GCA TTC CAA AAG CT~ GTG CGA TG~ CGA TGT TA 1101 . Asp Phe Lys Lys Ala Phe Gln Lys Leu Val Arg Cys Arg Cys 2) INFORM~TION POUR LA SEO ID NO: ~:
CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 37 paires de bases (B) TYPE: acide nucléique (C) NOMBRE DE BRINS: simple (D) CONFIGURATION: linéaire (ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: Oligonucléotide 1 (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 5: -~ .
~2~ EORMATION POUR LA SEO ID NO: 6:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 37 paires de bases ~B) TYPE: acide nucléique (C) NOMBRE DE BRINS:.simple (D) CONFIGURATION: linéaire ii) TYPE DE MOLECULE: ADNc (vi) ORIGINE:
(A~ ORGANISME: Oligonucléotide 2 (xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO: 6:
WO 94/01~56 PCl/FR93/006~1 (cellules Cos-7)(cortex humain)(Calf caudate) 5-HT 6.9 (2) 8.5 8.4 5-C T 5.5 (4) 6.0 8.6 R U24969 6.8 (2) _ 7.3 TF M P P 6.1 (2) _ 6.2 6.2 8-O H-D P AT 5.8 (2) 6.1 5.9 Sumatriptan 7.1 (2) _ 7.5 Bu~otenine 7.5 (2) 8.1 Methvsergide 8.2 (2) 7.2 8.4 Ergotamine 7.3 (2) 6.8 7.6 Yohim blne 7.2 (2) 7.1 (+) Cyanopindolol 5.4 (2) 6.9 Ketanserin 5 5 (2) < 5 _ 5.7 Mianserin 7.0 (2) ~ 6.4 Spiperone 6.0 (2) 5.3 Dopamine 3.8 (2) (-)Norepinephrine 3.3 (2) . 6. Isolation of the human being 1 ~ According to the methodology described in 5. above, the 6HT6 receptor human has been cloned.
For this, a human genomic DNA bank was prepared from placenta, by partial digestion with the enzyme Mbol, separation on salt gradients, and under cloning in the vector Lamda GEM 12 linearized by BarnHI (host bacteria: TAP
90) -The bank thus obtained was then screened using as probe the 1.6 kb EcoRI-XhoI fragment described in Example 3. Marked using the technique of random priming. The DNA fragments which hybridize with this probe have been isolated, subcloned into a Bluescript plasmid, amplified, then sequenced in both directions according to the dideoxynucleotide technique. The amplification was carried out by the technique PCR: 20 cycles in the presence of Thermus aquaticus polymerase (2.5 units; Cetus) and oligonucleotides I (SEQ ID No. 5) and 2 (SEQ ID No. 6). The resulting fragment was digested with the enzymes BamHI and XhoI, then subcloned into an expression vector P513.
The sequence obtained is presented on the sequence SEQ ID No. 4.
WO94 / 01556 PCr / FR93 / 006 ~ 1 ,. ~.,. ;
Z ~ 39 ~
It is understood that the same experiences can be repeated using other tissues and in particular tissues of human origin, and other probes. By elsewhere, the homologous sequences brought to light during these experiments can obviously then be isolated and / or amplified by conventional techniques of Molecular biology.
.
i . W 0 9 ~ / 01 ~ 6 PCT / FR93 / 00651 21394 ~
LIST OF SEQUENCES
(1) GENERAL INFORMATION:
(i) DEPOSITOR:
(A) NAME: INSERM
(B) STREET: 101, rue de Tolbiac (C) CITY: PARIS
(E) COUNTRY: France ¦ (F) POSTAL CODE: 75654 ~ (ii) TITLE OF THE INVENTION: New polypeptides having an activity Serde ~ serotoniner receptor, nucleic acids encoding these , 15 polypeptides and uses.
! (iii, NUMBER OF SEQUENCES: 6 (iv) COMPUTER-READABLE FORM:
(A) TYPE OF SUPPORT: Tape (B) COMPUTER: IBM PC compatible (C) OPERATING SYSTEM: PC-DOS / MS-DOS
(D) SOFTWARE: PatentIn Release # 1.0, Version # 1.25 (EPO) (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 1:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 1557 base pairs (B) TYPE: nucleic acid (C) NUMBER OF STRANDS: double (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: cDNA
.3 ~
(iii) HYPOTHETIC: NO
(iii) ANTI-SENSE: NO
(vi) ORIGIN:
(A) ORGANIZATION: Mouse (ix) ADDITIONAL FEATURE:
(A) NAME / KEY: CDS
(B) LOCATION: 310 .. 1410 (D) OTHER INFORMATION: / product = "Gene receptor 5HT6 - mouse "
'. .
~ xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 1:
Met Asp Phe Leu Asn Ala Ser Asp Gln Asn Leu Thr Ser WO 94/01 - 56, X ~ 39431. PCr / FR93 / 00651! .
Glu Glu Leu Leu Asn Arg Met Pro Ser Lys Ile Leu Val Ser Leu Thr CTG TCT GGG CTG GCA TTG ATG ACA ACC ACC ATC AAC TCC CTC GTG ATC 4 ~ 4 Leu Ser Gly Leu Ala Leu Met Thr Thr Thr Ile Asn Ser Leu Val Ile Ala Ala Ile Ile Val Thr Arg Lys Leu His His Pro Ala Asn Tyr Leu 50. 55 60 j 15 ATT TGT TCC TTG GCA GTT ACA GAT TTT CTT GTA GCT GTC CTG GTG ATG 540 Ile Cys Ser Leu Ala Val Thr Asp Phe.Leu Val Ala Val Leu Val Met '65 70 75 i CCC TTC AGT ATT GTG TAC ATT GTG AGA GAG AGC TGG ATT ATG GGA CAA 588 i 20 Pro Phe Ser Ile Val Tyr Ile Val Arg Glu Ser Trp Ile Met Gly Gln Val Leu Cys Asp Ile Trp Leu Ser Val Asp Ile Ile Cys Cys Thr Cys Ser Ile Leu His Leu Ser Ala Ile Ala Leu Asp Arg Tyr Arg Arg Ala Ile Thr Asp Ala Val Glu Tyr Ala Arg Lys Arg Thr Pro Arg His Ala Gly 130 135, 140 3 ~ ATC ATG ATC ACG ATC GTG TGG GTT ATA TCT GTG TTC ATC TCT ATG CCT 780 Ile Met Ile Thr Ile Val Trp Val Ile Ser Val Phe Ile Ser Met Pro : 40 Pro Leu Phe Trp Arg His Gln Gly Thr Ser Arg Asp Asp Glu Cys Val j ATC AAA CAT GAC CAC ATT GTT TCC ACA ATT ~ AC TCC ACG TTT GGA GCT 876 Ile Lys His Asp His Ile Val Ser Thr Ile Tyr Ser Thr Phe Gly Ala 175. 180 185 , TTC TAC ATC CCG CTT GTA TTG ATA TTG ATC CTC TAC TAC AAA ATA TAC 924 ~;
! Phe Tyr Ile Pro Leu Val Leu Ile Leu Ile Leu Tyr Tyr Lys Ile Tyr 1gO 195 200 205 , `AGA GCA GCA AGG ACA CTG TAC CAC AAG AGA CAA GCG AGT CGG ATG ATA 972 Arg Ala Ala Arg Thr Leu Tyr His Lys Arg Gln Ala Ser Arg Met Ile Lys Glu Glu Leu Asn Gly Gln Val Phe Leu Glu Ser Gly Glu Lys Ser 60 Ile Lys Leu Val Ser Thr Ser Tyr Met Leu Glu Lys Ser Leu Ser Asp ~ WO 94/015 ~ 6 2139 ~ 3 ~. PCT / FR93tO06 ~ 1 I
1 ~
I
Pro Ser Thr Asp Phe Asp Arg Ile His Ser Thr Val Lys Ser Pro Arg 25s 260 265 . TCG GAA CTG AAG CAT GAG AAA TCT TGG AGA AGA CAG AAA ATC TCA GGC 1164 5 Ser Glu Leu Lys His Glu Lys Ser Trp Arg Arg Gln Lys Ile Ser Gly 270,275 280,285 Thr Arg Glu Arg Lys Ala Ala Thr Thr Leu Gly Leu Ile Leu Gly Ala Phe Val Ile Cys Trp Leu Pro Phe Phe Val Lys Glu Leu Val Val Asn GTC TGT GAA AAA TGT AAA AT ~ TCT GAA GAA ATG TCA AAC TTT TTG GCA 1308 Val Cvs Glu Lys Cys Lys Ile Ser Glu Glu Met Ser Asn Phe Leu Ala 2 ~ TGG CTT GGT TAC CTG AAT TCC CTT ATA AAT CCA CTG ATT TAT ACC ATC 1356 . Trp Leu Gly Tyr Leu Asn Ser Leu Ile Asn Pro Leu Ile Tyr Thr Ile ~ 335 340 345 ; TTT AAT GAA GAC TTC AAG AAA GCT TTC CAA AAA CTT GTA CGA TGC CGA 1404 25 Phe Asn Glu Asp Phe Lys Lys Ala Phe Gln Lys Leu Val Arg Cys Arg Tyr T ~ TRAINING FOR SEO ID_NO: 2:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 20 base pairs (B) TYPE :: nucleic acid (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear ! (ii, TYPE OF MOLECULE: cDNA
(vi) ORIGIN:
, 45 (A) ORGANIZATION: Probe (i) (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 2:
(2) INFORMATION FOR SEO Ip NO: 3:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
~ A) LENGTH: 19 base pairs (B) TYPE: nucleic acid WO 94/01 ~ 56 2 ~ 394-31 PCT / FR93 ~ 0065l ~!
¦ (C) NUMBER OF STRANDS: simple (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(v ~) ORIGIN:
S (A) ORGANIZATION: Probe (ii) ~ xij DESCRIPTION OF 1A SEQUENCE: SEQ ID NO: 3:
(2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 4:
; (i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
, (A) LENGTH: 1101 base pairs B) TYPE: nucleic acid '~ C) NUMBER OF STRANDS: double ¦ ~ D) CONFIGURATION: linear ii) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(iii) HYPOTHETIC: NO
¦ ~ iii) ANTI-SENSE: NO
! ~ 25 (vi) ORIGIN: -~ tA) ORGANIZATION: Homo sapiens ¦ (ix) ADDITIONAL FEATURE:
(A) NAME / KEY: CDS
(B) LOCATION: 1 .. 1101 (D) OTHER INFORMATION: Jproduct = "Gene receptor 5HT6 human"
(xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 4:
¦ ATG GAT TTC TTA AAT TCA TCT GAT CAA AAC TTG ACC TCA GAG GAA CTG 48 Met Asp Phe Leu Asn Ser Ser Asp Gln Asn Leu Thr Ser Glu Glu Leu Leu Asn Arg Met Pro Ser Lys Ile Leu Val Ser Leu Thr Leu Ser Gly Leu Ala Leu Met Thr Thr Ile Asn Ser Leu Val Ile Ala Ala Ile 50 Ile Val Thr Arg Lys Leu His His Pro Ala Asn Tyr Leu Ile Cys Ser CTT GCA GTC ACA GAT TTT CTT GTG GCT GTC CTG GTG ATG CCC TTC AGC 24 b Leu Ala Val Thr Asp Phe Leu Val Ala Val Leu Val Met Pro Phe Ser 6 ~ 70 75 80 Ile Val Tyr lle Val Arg Glu Ser Trp Ile Met Gly Gln Val Val Cys ~ '0 94/01556 PCT / FR ~ 3/00651 Z ~ 3 ~
¦ Asp Ile Trp Leu Ser Val Asp Ile Thr Cys Cys Thr Cys Ser Ile Leu 5 CAT CT. TCA GCT ATA GCT TTG GAT CGG TAT CGA GCA ATC ACA GAT GCT 384 His Leu Ser Ala Ile Ala Leu Asp Arg Tyr Arg Ala Ile Thr Asp Ala 10 Val Glu Tyr Ala Arg Lys Arg Thr Pro Lys His Ala Gly Ile Met Ile Thr Ile Val Trp Ile Ile Ser Val Phe Ile Ser Met Pro Pro Leu Phe 1 ~ 145 150 155 160 Trp Arg His Gln Gly Thr Ser Arg Asp Asp Glu Cys Ile Ile Lys His Asp His Ile Val Ser Thr Ile Tyr Ser Thr Phe Gly Ala Phe Tyr Ile Pro Leu Ala Leu Ile Leu Ile Leu Tyr Tyr Lys Ile Tyr Arg Ala Ala 30 Lys Thr Leu Tyr His Lys Arg Gln Ala Ser Arg Ile Ala Lys Glu Glu : GTG AAT: GGC CAA GTC CTT TTG GAG AGT GGT GAG AAA AGC ACT AAA TCA 720 Val Asn: Gly Gln Val Leu Leu Glu Ser Gly Glu Lys Ser Thr Lys Ser 3 ~ 225 230 235 240 Val Ser Thr Ser Tyr Val Leu Glu Lys Ser Leu Ser Asp Pro Ser Thr 245 to 250 255 Asp Phe Asp Lys Ile His Ser Thr Val Arg Ser Leu Arg Ser Glu Phe Lys His Glu Lys Ser Trp Arg Arg Gln Lys Ile Ser Gly Thr Arg Glu 50 Arg Lys Ala Ala Thr Thr Leu Gly Leu Ile Leu Gly Ala Phe Val Ile Cys Trp Leu Pro Phe Phe Val Lys Glu Leu Val Val Asn Val Cys Asp 55,305 310,315 320 Lys Cys Lys Ile Ser Glu Glu Met Ser Asn Phe Leu Ala Trp Leu Gly 325 ~ 330 335 Tyr Leu Asn Ser Leu Ile Asn Pro Leu Ile Tyr Thr Ile Phe Asn Glu WO 94/01556 PCl / FR93 / 0065 1 -2 ~; ~ g4 ~
GAC TTC AAG AAA GCA TTC CAA AAG CT ~ GTG CGA TG ~ CGA TGT TA 1101 . Asp Phe Lys Lys Ala Phe Gln Lys Leu Val Arg Cys Arg Cys 2) INFORMATION FOR SEO ID NO: ~:
FEATURES OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 37 base pairs (B) TYPE: nucleic acid (C) NUMBER OF STRANDS: single (D) CONFIGURATION: linear (ii) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(vi) ORIGIN:
(A) ORGANISM: Oligonucleotide 1 (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 5: -~.
~ 2 ~ EORMATION FOR SEO ID NO: 6:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 37 base pairs ~ B) TYPE: nucleic acid (C) NUMBER OF STRANDS: .simple (D) CONFIGURATION: linear ii) TYPE OF MOLECULE: cDNA
(vi) ORIGIN:
(A ~ ORGANISM: Oligonucleotide 2 (xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 6:
WO 94/01 - 56 PCl / FR93 / 006 ~ 1 (Cos-7 cells) (human cortex) (Calf caudate) 5-HT 6.9 (2) 8.5 8.4 5-CT 5.5 (4) 6.0 8.6 R U24969 6.8 (2) _ 7.3 TF MPP 6.1 (2) _ 6.2 6.2 8-O HD P AT 5.8 (2) 6.1 5.9 Sumatriptan 7.1 (2) _ 7.5 Bu ~ otenine 7.5 (2) 8.1 Methvsergide 8.2 (2) 7.2 8.4 Ergotamine 7.3 (2) 6.8 7.6 Yohim blne 7.2 (2) 7.1 (+) Cyanopindolol 5.4 (2) 6.9 Ketanserin 5 5 (2) <5 _ 5.7 Mianserin 7.0 (2) ~ 6.4 Spiperone 6.0 (2) 5.3 Dopamine 3.8 (2) (-) Norepinephrine 3.3 (2).
Claims (25)
n° 1 ou d'un dérivé de celle-ci. 1. Polypeptide comprising all or part of the peptide sequence SEQ ID
No. 1 or a derivative thereof.
(a) tout ou partie de la séquence nucléotidique SEQ ID n° 1 ou de son brin complémentaire, (b) toute séquence hybridant avec une séquence (a) et codant pour un polypeptide selon l'une des revendications 1 à 5, et, (c) les séquences dérivées des séquences (a) et (b) en raison de la dégénérescence du code génétique. 7. Sequence according to claim 6 characterized in that it is chosen among:
(a) all or part of the nucleotide sequence SEQ ID No. 1 or of its strand complementary, (b) any sequence hybridizing with a sequence (a) and coding for a polypeptide according to one of claims 1 to 5, and, (c) sequences derived from sequences (a) and (b) due to the degeneration of the genetic code.
- on met en contact une molécule ou un mélange contenant différentes molécules, éventuellement non-identifiées, avec une cellule recombinée selon la revendication 17 exprimant à sa surface un polypeptide tel que défini dans les revendications 1 à 5 dans des conditions permettant l'interaction entre ledit polypeptide et ladite molécule dans le cas où celle-ci possèderait une affinité pour ledit polypeptide, et, - on détecte et/ou isole les molécules liées au dit polypeptide. 19. Process for detecting and/or isolating ligands of polypeptides as defined in claims 1 to 5, characterized in that one performs the following steps:
- a molecule or a mixture containing different molecules, possibly unidentified, with a recombinant cell according to the claim 17 expressing at its surface a polypeptide as defined in claims 1 to 5 under conditions permitting the interaction between said polypeptide and said molecule in the event that the latter possesses an affinity for said polypeptide, and, - the molecules bound to said polypeptide are detected and/or isolated.
- on met en contact une molécule ou un mélange contenant différentes molécules, éventuellement non-identifiées, avec une cellule recombinée selon la revendication 17 exprimant à sa surface un polypeptide tel que défini dans les revendications 1 à 5, en présence de 5HT, dans des conditions permettant l'interaction entre ledit polypeptide et le 5HT, et, - on détecte et/ou isole les molécules capables de moduler l'activité du 5HT
sur ledit polypeptide. 21. Process for highlighting and/or isolating modulators of polypeptides as defined in claims 1 to 5, characterized in that one performs the following steps:
- a molecule or a mixture containing different molecules, possibly unidentified, with a recombinant cell according to the claim 17 expressing at its surface a polypeptide as defined in claims 1 to 5, in the presence of 5HT, under conditions permitting the interaction between said polypeptide and 5HT, and, - the molecules capable of modulating the activity of 5HT are detected and/or isolated on said polypeptide.
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WO (1) | WO1994001556A1 (en) |
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US6300087B1 (en) | 1992-11-03 | 2001-10-09 | Synaptic Pharmaceutical Corporation | DNA encoding a human serotonin receptor (5-HT4B) and uses thereof |
CA2274055A1 (en) * | 1996-12-19 | 1998-06-25 | Smithkline Beecham P.L.C. | N-piperazin-1-ylphenyl-benzamide derivatives |
Family Cites Families (2)
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- 1993-06-29 CA CA002139431A patent/CA2139431A1/en not_active Abandoned
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Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
FZDE | Dead |