JP5263729B2 - Preventive and therapeutic agent for feline infectious peritonitis virus (FIPV) - Google Patents

Preventive and therapeutic agent for feline infectious peritonitis virus (FIPV) Download PDF

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本発明は、ネコ伝染性腹膜炎ウイルス(FIPV)のマトリックス遺伝子(M遺伝子)のmRNAを標的とする二本鎖RNA(dsRNA)分子に関するものである。また本発明は、当該dsRNA分子を含む、FIPVの複製を阻害するための組成物に関する。   The present invention relates to a double-stranded RNA (dsRNA) molecule that targets the mRNA of a matrix gene (M gene) of feline infectious peritonitis virus (FIPV). The present invention also relates to a composition for inhibiting FIPV replication comprising the dsRNA molecule.

ネコ伝染性腹膜炎(Feline Infectious Peritonitis:FIP)は、コロナウイルスがネコ体内で突然変異したネコ伝染性腹膜炎ウイルス(FIPV)によって起こる病気で、発症すると非治療時の致死率はほぼ100%と非常に高い恐ろしい疾患である。   Feline Infectious Peritonitis (FIP) is a disease caused by feline infectious peritonitis virus (FIPV) in which coronavirus has been mutated in the cat. It is a high and terrible disease.

FIPの特徴的な症状には、「ウエットタイプ」と「ドライタイプ」という二つの型があ
る。症例の多い「ウエットタイプ」は、発熱や下痢、貧血などとともに腹部や胸部にひどい血管炎を起こし、腹水や胸水がたまって腹部が膨れたり、呼吸困難がみられる。「ドライタイプ」は、腹部にリンパ腫のような、大きなしこりができる。さらにこのタイプは脳内に炎症を起こして、麻痺や痙攣などの神経症状を引き起こすこともある。
There are two types of symptoms of FIP: “wet type” and “dry type”. The “wet type”, which has many cases, causes severe vasculitis in the abdomen and chest along with fever, diarrhea, anemia, etc., ascites and pleural effusion accumulate, abdomen swells, and difficulty breathing. The “dry type” has a large lump like lymphoma in the abdomen. In addition, this type may cause inflammation in the brain, causing neurological symptoms such as paralysis and convulsions.

現在のところ、FIPの根治療法は存在せず、いったんFIPが発症すると、インターフェロンやステロイド剤を投与して症状を緩和する対症療法しか方法はなく、ほとんどの場合助からない。また、有効なワクチンも存在しないため、十分な治療効果を得ることは難しい(非特許文献1)。   At present, there is no radical cure for FIP, and once FIP develops, there is only symptomatic treatment to relieve symptoms by administering interferon or steroids, and in most cases it does not help. Moreover, since there is no effective vaccine, it is difficult to obtain a sufficient therapeutic effect (Non-patent Document 1).

Journal of Virological Methods, 124 (2005), p.111-116.Journal of Virological Methods, 124 (2005), p.111-116.

従来法では、FIPを十分に予防および/または治療することができなかったため、FIPを有効に治療することができる新たな方法が望まれていた。そこで、本発明では、FIPVの増殖を阻害する、FIPVのM遺伝子のmRNAを標的とするdsRNA分子を提供する。また、当該dsRNA分子を含む、FIPVの複製を阻害するための組成物も提供する。   In the conventional method, since FIP could not be sufficiently prevented and / or treated, a new method capable of effectively treating FIP has been desired. Therefore, the present invention provides a dsRNA molecule that targets the M gene mRNA of FIPV that inhibits the growth of FIPV. Also provided is a composition for inhibiting FIPV replication comprising the dsRNA molecule.

FIPVは、図1に示す構造を有するポジティブセンスの一本鎖RNAウイルスである。M遺伝子はMタンパク質をコードする。Mタンパク質は、Eタンパク質と共にウイルスエン
ベロープの形成に必須のタンパク質である。また、Mタンパク質は、Nタンパク質に結合して、ウイルスヌクレオカプシッドをウイルス粒子に取り込ませる機能を有する(J. Virology, 75: 1312-1324, 2001, J. Virology, 75: 9059-9067, 2001, J. Virology, 76: 4987-4999, 2002)。
FIPV is a positive-sense single-stranded RNA virus having the structure shown in FIG. The M gene encodes the M protein. The M protein is a protein essential for the formation of the viral envelope together with the E protein. In addition, the M protein has a function of binding to the N protein and allowing the virus nucleocapsid to be incorporated into the virus particle (J. Virology, 75: 1312-1324, 2001, J. Virology, 75: 9059-9067, 2001). , J. Virology, 76: 4987-4999, 2002).

そこで、本願発明者らは、Mタンパク質の発現を抑制することによって、感染細胞からのウイルス放出を抑制し、病原性を抑制することができるものと考えた。そして、上記課題を解決すべく鋭意検討した結果、FIPVのM遺伝子配列またはその一部に同一な塩基配列を有するセンス鎖と該センス鎖の塩基配列に相補的な塩基配列を有するアンチセンス鎖からなるdsRNA分子が、M遺伝子の発現を特異的に抑制することを見出し、本発明を完成さ
せるに至った。
Therefore, the present inventors considered that by suppressing the expression of M protein, virus release from infected cells can be suppressed and pathogenicity can be suppressed. As a result of diligent investigations to solve the above-mentioned problems, a sense strand having the same base sequence as the M gene sequence of FIPV or a part thereof and an antisense strand having a base sequence complementary to the base sequence of the sense strand And dsRNA molecules specifically found to suppress the expression of the M gene, thereby completing the present invention.

すなわち、本発明は以下のとおりである。
[1] ネコ伝染性腹膜炎ウイルス(FIPV)のマトリックス遺伝子(M遺伝子)のmRNAを
標的とする二本鎖RNA(dsRNA)分子であって、一方の鎖が配列番号1で表されるM遺伝子配列中の少なくとも19個以上の連続した塩基を有する配列に同一なセンス鎖であり、他方の鎖が該センス鎖の塩基配列に相補的な塩基配列を有するアンチセンス鎖である、dsRNA分子。
That is, the present invention is as follows.
[1] A double-stranded RNA (dsRNA) molecule that targets the mRNA of a feline infectious peritonitis virus (FIPV) matrix gene (M gene), one strand of which is represented by SEQ ID NO: 1 A dsRNA molecule, wherein the dsRNA molecule is a sense strand identical to a sequence having at least 19 consecutive bases therein, and the other strand is an antisense strand having a base sequence complementary to the base sequence of the sense strand.

[2] dsRNA分子が、一方の鎖が配列番号1で表されるM遺伝子配列の695〜717
番目の塩基を有する配列、527〜549番目の塩基を有する配列、および400〜422番目の塩基を有する配列からなる群から選択されるいずれかの塩基配列に同一なセンス鎖であり、他方の鎖が該センス鎖の塩基配列に相補的な塩基配列を有するアンチセンス鎖である、[1]のdsRNA分子。
[2] The dsRNA molecule is 695 to 717 of the M gene sequence whose one strand is represented by SEQ ID NO: 1.
A sense strand that is identical to any one of the base sequences selected from the group consisting of a sequence having the base 527th, a sequence having the 527th to 549th base, and a sequence having the 400th to 422nd base, and the other strand The dsRNA molecule according to [1], wherein is an antisense strand having a base sequence complementary to the base sequence of the sense strand.

[3] dsRNA分子が、配列番号2で表されるセンス鎖と配列番号3で表されるアンチセ
ンス鎖、配列番号4で表されるセンス鎖と配列番号5で表されるアンチセンス鎖、および配列番号8で表されるセンス鎖と配列番号9で表されるアンチセンス鎖からなる群より選択されるいずれかの塩基対からなる、[2]のdsRNA分子。
[4] センス鎖とアンチセンス鎖がリンカー分子を介して連結されている、[1]〜[3]のいずれかのdsRNA分子。
[3] The dsRNA molecule comprises a sense strand represented by SEQ ID NO: 2 and an antisense strand represented by SEQ ID NO: 3, a sense strand represented by SEQ ID NO: 4 and an antisense strand represented by SEQ ID NO: 5, and The dsRNA molecule of [2], comprising any base pair selected from the group consisting of a sense strand represented by SEQ ID NO: 8 and an antisense strand represented by SEQ ID NO: 9.
[4] The dsRNA molecule according to any one of [1] to [3], wherein the sense strand and the antisense strand are linked via a linker molecule.

[5] [4]のdsRNA分子の鋳型DNAを含み該dsRNA分子を発現するベクター。
[6] FIPVの複製を阻害するための、[1]〜[4]のいずれかのdsRNA分子を1つま
たは複数含む組成物。
[7] FIPVの複製を阻害するための、[5]のベクターを含む組成物。
[5] A vector comprising the template DNA of the dsRNA molecule of [4] and expressing the dsRNA molecule.
[6] A composition comprising one or more dsRNA molecules according to any one of [1] to [4] for inhibiting FIPV replication.
[7] A composition comprising the vector of [5] for inhibiting FIPV replication.

本発明によるdsRNA分子を用いて、FIPVのM遺伝子の発現を特異的に抑制することがで
き、それによってFIPVの複製を阻害することができる。本発明のdsRNAは、ネコFIPの予防または治療剤として用いることができる。
The dsRNA molecule according to the present invention can be used to specifically suppress the expression of the FIPV M gene, thereby inhibiting FIPV replication. The dsRNA of the present invention can be used as a prophylactic or therapeutic agent for cat FIP.

一実施形態において、本発明はFIPVのM遺伝子のmRNAを標的とするdsRNA分子であって
、該dsRNA分子の一方の鎖はFIPVのM遺伝子配列またはその一部に同一な塩基配列を有す
るセンス鎖であり、他方の鎖は該センス鎖の塩基配列に相補的な塩基配列を有するアンチセンス鎖である、上記dsRNA分子に関する。
In one embodiment, the present invention relates to a dsRNA molecule that targets mRNA of FIPV M gene, wherein one strand of the dsRNA molecule has a sense strand having a base sequence identical to the M gene sequence of FIPV or a part thereof. And the other strand is related to the above dsRNA molecule, which is an antisense strand having a base sequence complementary to the base sequence of the sense strand.

本発明のdsRNA分子は、配列特異的にFIPVのM遺伝子のmRNAを切断し、その結果M遺伝
子の発現を抑制するRNA干渉(RNAi)を引き起こすことができる。
The dsRNA molecule of the present invention can cause RNA interference (RNAi) that cleaves the M gene mRNA of FIPV in a sequence-specific manner and consequently suppresses the expression of the M gene.

本発明のdsRNA分子は、30塩基以上の長さで提供される場合、ダイサー(Dicer)と呼ばれるRNaseIII様酵素の作用によってプロセッシングされ、3’末端に2塩基のオーバーハ
ングを有する21〜27塩基のsiRNA(small interfering RNA)分子を生じ得る。このsiRNA
分子が、RISC(RNA-induced silencing complex)と呼ばれるタンパク質複合体に取り込ま
れ、M遺伝子 mRNAをsiRNA分子との相同性により認識し分解し、発現抑制を行う。
When the dsRNA molecule of the present invention is provided with a length of 30 bases or more, it is processed by the action of an RNase III-like enzyme called Dicer and has 21 to 27 bases having a 2 base overhang at the 3 ′ end. Can generate siRNA (small interfering RNA) molecules. This siRNA
Molecules are incorporated into a protein complex called RISC (RNA-induced silencing complex), and the M gene mRNA is recognized and decomposed by homology with siRNA molecules to suppress expression.

本発明においてdsRNA分子は、siRNA分子を含む。
本発明のdsRNA分子の塩基数は、特に限定されないが、15〜50塩基、好ましくは19塩基
以上、さらに好ましくは19〜35塩基、特に好ましくは21塩基である。
In the present invention, the dsRNA molecule includes an siRNA molecule.
The number of bases of the dsRNA molecule of the present invention is not particularly limited, but is 15 to 50 bases, preferably 19 bases or more, more preferably 19 to 35 bases, and particularly preferably 21 bases.

本発明において、M遺伝子の遺伝子配列に同一なセンス鎖とは、配列番号1で表されるM遺伝子配列中のチミンがウラシルに置換された塩基配列を有するRNA鎖を意味する。本
発明のdsRNA分子を構成するセンス鎖は、M遺伝子の遺伝子配列と同一であることが望ま
しいが、実質的に同一、すなわち相同な配列であってもよい。すなわち、dsRNA分子のセ
ンス鎖と実際に標的となるM遺伝子のmRNA配列がハイブリダイズする限り1または複数、すなわち、1〜10個、好ましくは1〜5個、さらに好ましくは、1〜3個、2個もしくは1個のミスマッチがあってもよい。したがって、本発明のdsRNA分子のセンス鎖配列と
M遺伝子の遺伝子配列は、90%以上、好ましくは95%以上、さらに好ましくは95、96、97、98もしくは99%以上の配列相同性を有する。
In the present invention, the sense strand identical to the gene sequence of the M gene means an RNA strand having a base sequence in which thymine in the M gene sequence represented by SEQ ID NO: 1 is replaced with uracil. The sense strand constituting the dsRNA molecule of the present invention is preferably the same as the gene sequence of the M gene, but may be a substantially identical sequence, that is, a homologous sequence. That is, as long as the sense strand of the dsRNA molecule and the mRNA sequence of the actually targeted M gene hybridize, one or more, that is, 1 to 10, preferably 1 to 5, more preferably 1 to 3, There may be two or one mismatch. Therefore, the sense strand sequence of the dsRNA molecule of the present invention and the gene sequence of the M gene have a sequence homology of 90% or more, preferably 95% or more, more preferably 95, 96, 97, 98 or 99% or more.

本発明において、好ましくはセンス鎖が、配列番号1で表されるM遺伝子配列の695−717番目の塩基を有する配列、527−549番目の塩基を有する配列および400−422番目の塩基を有する配列からなる群から選択される塩基配列と同一であることが好ましく、特に695−717番目の塩基を有する配列および400−422番目の塩基を有する配列と同一であることが好ましい。   In the present invention, the sense strand preferably has a sequence having the 695th to 717th bases of the M gene sequence represented by SEQ ID NO: 1, a sequence having the 527th to 549th bases, and a sequence having the 400th to 422th bases Preferably, it is the same as the base sequence selected from the group consisting of: The sequence having the 695th-717th base and the sequence having the 400th-422th base are particularly preferred.

dsRNA分子を構成するセンス鎖およびアンチセンス鎖は、公知の方法に基づいて、化学
合成や、プロモーターおよびRNAポリメラーゼを用いた転写系によってin vitroで合成す
ることができる。また、適当な発現ベクターに当該アンチセンス鎖およびセンス鎖の鋳型DNAを導入し、当該ベクターを適当な宿主細胞内に投与することによってin vivoで合成することも可能である。合成されたセンス鎖およびアンチセンス鎖のアニーリングは、当業者に公知である一般的な方法によって行うことができる。合成したセンス鎖およびアンチセンス鎖をそれぞれdsRNA用アニーリングバッファーに溶解し、等量(等モル数)を混合
し、二本鎖が解離するまで温度を加熱し、その後徐々に冷却してインキュベートすることによって行う。アニーリング条件は、例えば、90℃にて1分間、続いて37℃にて1時間静置することによって行う。その後、フェノール/クロロホルム抽出・エタノール沈殿を行うことによって、dsRNA分子を得ることができる。
The sense strand and antisense strand constituting the dsRNA molecule can be synthesized in vitro by chemical synthesis or a transcription system using a promoter and RNA polymerase based on a known method. It is also possible to synthesize in vivo by introducing the antisense strand and the template DNA of the sense strand into an appropriate expression vector and administering the vector into an appropriate host cell. Annealing of the synthesized sense strand and antisense strand can be performed by a general method known to those skilled in the art. Dissolve the synthesized sense strand and antisense strand in dsRNA annealing buffer, mix the same amount (equal number of moles), heat the temperature until the double strands dissociate, and then gradually cool and incubate. Do by. Annealing conditions are performed, for example, by leaving still at 90 ° C. for 1 minute and then at 37 ° C. for 1 hour. Then, dsRNA molecules can be obtained by phenol / chloroform extraction / ethanol precipitation.

一実施形態において、本願発明のdsRNA分子は、配列番号2で表されるセンス鎖と配列
番号3で表されるアンチセンス鎖、配列番号4で表されるセンス鎖と配列番号5で表されるアンチセンス鎖、および配列番号8で表されるセンス鎖と配列番号9で表されるアンチセンス鎖からなる群より選択されるいずれかの塩基対からなり、特に配列番号2で表されるセンス鎖と配列番号3で表されるアンチセンス鎖および配列番号8で表されるセンス鎖と配列番号9で表されるアンチセンス鎖からなるdsRNA分子が好ましい。
In one embodiment, the dsRNA molecule of the present invention is represented by the sense strand represented by SEQ ID NO: 2 and the antisense strand represented by SEQ ID NO: 3, the sense strand represented by SEQ ID NO: 4 and SEQ ID NO: 5. An antisense strand and any one of the base pairs selected from the group consisting of the sense strand represented by SEQ ID NO: 8 and the antisense strand represented by SEQ ID NO: 9, in particular, the sense strand represented by SEQ ID NO: 2 And a dsRNA molecule comprising an antisense strand represented by SEQ ID NO: 3, a sense strand represented by SEQ ID NO: 8, and an antisense strand represented by SEQ ID NO: 9.

また、本発明のdsRNA分子は、上に定義されたセンス鎖とアンチセンス鎖がリンカー分
子を介して連結され、そのリンカー部でループ構造を形成し折りたたまれたshRNA(short hairpin RNA)分子として提供され得る。shRNA分子もまた、ダイサーによってプロセッシングされ、siRNA分子を生じ得る。
In addition, the dsRNA molecule of the present invention is provided as a folded shRNA (short hairpin RNA) molecule in which the sense strand and the antisense strand defined above are linked via a linker molecule and a loop structure is formed at the linker portion. Can be done. shRNA molecules can also be processed by Dicer to produce siRNA molecules.

shRNA分子に含まれるリンカー分子は、センス鎖とアンチセンス鎖を連結しステムルー
プ構造を形成し得る限り、ポリヌクレオチドリンカーであっても、非ポリヌクレオチドリンカーであってもよく、特に限定しないが、当業者に公知であるポリヌクレオチドリンカーが好ましい。
The linker molecule contained in the shRNA molecule may be a polynucleotide linker or a non-polynucleotide linker as long as it can link the sense strand and the antisense strand to form a stem loop structure, and is not particularly limited. Polynucleotide linkers known to those skilled in the art are preferred.

shRNA分子も、上記したように公知の方法に基づいて、in vitroまたはin vivoにて合成することが可能である。合成に際しては、センス鎖とアンチセンス鎖を逆方向配列として含む1本のRNA鎖を合成し、その後この1本のRNA鎖を自己相補的結合によって二本鎖構造を形成させshRNA分子を得ることができる。   shRNA molecules can also be synthesized in vitro or in vivo based on known methods as described above. When synthesizing, a single RNA strand containing the sense strand and antisense strand as reverse sequences is synthesized, and then a single strand of RNA is formed by self-complementary binding to obtain an shRNA molecule. Can do.

dsRNA分子を構成するセンス鎖またはアンチセンス鎖は必要に応じて、3'末端にオーバ
ーハングを有していてもよく、該オーバーハングの塩基の種類、数は限定されず、例えば、1〜5、好ましくは1〜3、さらに好ましくは1もしくは2塩基からなる配列が挙げら
れ、例えば、TTT、UUやTTが挙げられる。本発明において、オーバーハングとは、dsRNA分子の一方の鎖の末端に付加された塩基であって、もう一方の鎖の対応する位置に相補的に結合し得る塩基が存在しない塩基をいう。オーバーハングはDNAを構成する塩基であって
もよい。さらに、dsRNA分子を構成するセンス鎖またはアンチセンス鎖は、遺伝子の配列
決定など種々の実験操作を円滑に行うために、siRNA活性に対して影響を与えない範囲で
必要に応じて1〜3塩基、さらに好ましくは1もしくは2塩基の置換、付加、欠失をさらに含んでも良い。
The sense strand or antisense strand constituting the dsRNA molecule may optionally have an overhang at the 3 ′ end, and the type and number of bases of the overhang are not limited. For example, 1-5 , Preferably 1 to 3, more preferably 1 or 2 base sequences, for example, TTT, UU and TT. In the present invention, the term “overhang” refers to a base that is added to the end of one strand of a dsRNA molecule and does not have a base that can complementarily bind to the corresponding position of the other strand. The overhang may be a base constituting DNA. Furthermore, the sense strand or the antisense strand constituting the dsRNA molecule has 1 to 3 bases as necessary within a range not affecting siRNA activity in order to smoothly perform various experimental operations such as gene sequencing. More preferably, it may further include substitution, addition or deletion of 1 or 2 bases.

また、センス鎖またはアンチセンス鎖は必要に応じて、5'末端がリン酸化されていてもよく、shRNA分子については5'末端に三リン酸(ppp)が結合していても良い。
また、一実施形態において、本発明は、上記shRNA分子を発現するベクターに関する。
Further, the sense strand or the antisense strand may be phosphorylated at the 5 ′ end as necessary, and for the shRNA molecule, triphosphate (ppp) may be bound to the 5 ′ end.
In one embodiment, the present invention also relates to a vector that expresses the shRNA molecule.

本願発明に用いることができるベクターとしては、プラスミドベクター、ウイルスベクター、非ウイルスベクターなどを用いることができる。プラスミドベクターとしては、pBAsiベクター、pSUPERベクター等を用いることができる。ウイルスベクターとしては、アデノウイルスベクター、レトロウイルスベクター、レンチウイルスベクター等を用いることができる。非ウイルスベクターとしては、リポソームベクター等を用いることができ、特にセンダイウイルス−リポソームベクターが好ましい。   As vectors that can be used in the present invention, plasmid vectors, viral vectors, non-viral vectors, and the like can be used. As a plasmid vector, a pBAsi vector, a pSUPER vector, or the like can be used. As a viral vector, an adenovirus vector, a retrovirus vector, a lentivirus vector, or the like can be used. As the non-viral vector, a liposome vector or the like can be used, and a Sendai virus-liposome vector is particularly preferable.

ベクターには、プロモーターおよび/またはその他の制御配列を機能し得るかたちで連結して挿入しても良い。「機能し得るかたちで連結して挿入する」とは、当該ベクターが導入された細胞において、プロモーターおよび/またはその他の制御配列の制御の下、上記shRNA分子が発現され標的となるM遺伝子のmRNAが分解されるように、プロモーターお
よび/またはその他の制御配列を連結してベクターに組み込むことを意味する。ベクターに組み込むことができるプロモーターおよび/またはその他の制御配列は特に限定されないが、構成的プロモーター、組織特異的プロモーター、時期特異的プロモーター、その他の調節エレメントなど、当該分野で公知のプロモーターおよび/またはその他の制御配列を適宜選択することが可能である。
The vector may be inserted with a promoter and / or other regulatory sequences linked in a functional manner. “Functionally linked and inserted” means that the shRNA molecule is expressed and targeted in the M gene mRNA under the control of a promoter and / or other control sequences in the cell into which the vector is introduced. Means that the promoter and / or other regulatory sequences are linked and incorporated into the vector so that is degraded. Promoters and / or other regulatory sequences that can be incorporated into the vector are not particularly limited, but promoters and / or other known in the art such as constitutive promoters, tissue-specific promoters, time-specific promoters, other regulatory elements, etc. These control sequences can be appropriately selected.

このように作製された上記shRNA分子を発現するベクターは、導入された細胞内でshRNA分子を発現し、M遺伝子のmRNAを特異的に分解する。   The thus-produced vector expressing the shRNA molecule expresses the shRNA molecule in the introduced cell and specifically degrades the M gene mRNA.

また、一実施形態において、本発明は、FIPVの複製を阻害するための、本発明のdsRNA
分子を含む組成物および本発明のベクターを含む組成物に関する。本発明の組成物は、本発明のdsRNA分子またはベクターを1種または複数種を組み合わせて含んでも良い。例え
ば、配列番号2で表されるセンス鎖と配列番号3で表されるアンチセンス鎖、配列番号4で表されるセンス鎖と配列番号5で表されるアンチセンス鎖、または配列番号8で表されるセンス鎖と配列番号9で表されるアンチセンス鎖からなるdsRNA分子の1種、2種、ま
たは3種を含んでも良い。本発明の組成物はまた、本発明のdsRNA分子またはベクターと
共に、適当なキャリア、希釈剤、エマルジョンなどを含んでも良い。例えば、生理的食塩水、リン酸緩衝生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水グルコース液、および緩衝生理食塩水などを組成物中に含めることができる。本発明の組成物が、医薬的組成物として用いられる場合には、組成物は、経口ルート、ならびに静脈内、筋肉内、皮下および腹腔内の注射または非経腸的ルートで投与することに適した形態で調製することが可能である。
In one embodiment, the present invention also provides a dsRNA of the present invention for inhibiting FIPV replication.
It relates to a composition comprising a molecule and a composition comprising a vector of the invention. The composition of the present invention may contain one or a combination of the dsRNA molecules or vectors of the present invention. For example, the sense strand represented by SEQ ID NO: 2 and the antisense strand represented by SEQ ID NO: 3, the sense strand represented by SEQ ID NO: 4 and the antisense strand represented by SEQ ID NO: 5, or the sequence represented by SEQ ID NO: 8 1 type, 2 types, or 3 types of dsRNA molecules consisting of the sense strand and the antisense strand represented by SEQ ID NO: 9 may be included. The compositions of the present invention may also contain suitable carriers, diluents, emulsions and the like with the dsRNA molecules or vectors of the present invention. For example, physiological saline, phosphate buffered saline, phosphate buffered saline glucose solution, buffered saline, and the like can be included in the composition. When the composition of the present invention is used as a pharmaceutical composition, the composition is suitable for administration by the oral route, as well as intravenous, intramuscular, subcutaneous and intraperitoneal injection or parenteral route. Can be prepared in different forms.

本発明は、上記dsRNA分子または発現ベクターを有効成分として含むFIPの予防または治療剤を提供し得る。該予防または治療剤は正常ネコ、FIPVに感染しているネコまたはFIP
を発症しているネコに投与することにより、FIPVの感染を予防し、感染したFIPVの増殖を抑制しFIPVの発症を予防し、またはFIPV感染症を治療することができる。該予防または治療剤の投与量は限定されないが、例えば、腸上皮細胞やマクロファージなどの場合、一細
胞あたり少なくとも1コピーのdsRNA分子が導入されるように投与することができ、例え
ば1投与単位あたり、dsRNA分子量で1nM〜100μM、好ましくは10nM〜50μM、より好まし
くは100nM〜20μMである。投与量は、患者ネコの状態、年齢、性別、重篤度などに応じて変化させることができ、専門獣医の判断により決定される。さらに、本発明は上記dsRNA
分子または発現ベクターをネコに投与してネコFIPVを予防または治療する方法を提供し得る。
The present invention can provide a prophylactic or therapeutic agent for FIP comprising the above dsRNA molecule or expression vector as an active ingredient. The prophylactic or therapeutic agent is a normal cat, a cat infected with FIPV, or FIP
Is administered to cats that are developing FIPV to prevent infection of FIPV, inhibit the growth of infected FIPV, prevent the development of FIPV, or treat FIPV infection. The dose of the prophylactic or therapeutic agent is not limited. For example, in the case of intestinal epithelial cells, macrophages, etc., it can be administered such that at least one copy of dsRNA molecule is introduced per cell, for example, per dosage unit. The molecular weight of dsRNA is 1 nM to 100 μM, preferably 10 nM to 50 μM, more preferably 100 nM to 20 μM. The dose can be changed according to the condition, age, sex, severity, etc. of the patient cat, and is determined by the judgment of a specialist veterinarian. Furthermore, the present invention provides the above dsRNA.
A molecule or expression vector can be administered to a cat to provide a method for preventing or treating feline FIPV.

本発明の組成物は、その成分として含まれるdsRNA分子またはベクターの働きにより、FIPVのM遺伝子の発現を抑制し、その結果FIPVの複製を阻害し得る。   The composition of the present invention can suppress the expression of the M gene of FIPV and, as a result, inhibit the replication of FIPV by the action of the dsRNA molecule or vector contained as a component thereof.

また、本発明は、上記組成物を用いた、FIPVの複製阻害方法を提供し得る。本方法において、上記組成物をFIPVに感染した細胞、組織または個体に投与し、組成物中に含まれる本発明のdsRNA分子および発現ベクターを送達する。送達されたdsRNA分子および発現ベクターは、FIPVのM遺伝子の発現を抑制し、その結果FIPVの複製を阻害し得る。   Moreover, this invention can provide the replication inhibition method of FIPV using the said composition. In this method, the composition is administered to a cell, tissue or individual infected with FIPV to deliver the dsRNA molecules and expression vectors of the invention contained in the composition. The delivered dsRNA molecules and expression vectors can suppress the expression of the FIPV M gene and consequently inhibit FIPV replication.

dsRNA分子および発現ベクターは、当業者に公知である核酸導入法、例えば、これらに
限定さないがHydrodynamic法、カルシウムイオンを用いる方法、エレクトロポレーション法、スフェロプラスト法、酢酸リチウム法、リン酸カルシウム法、リポフェクション法、マイクロインジェクション法、遺伝子銃を用いた方法などを用いて細胞や組織に導入することが可能である。被験体が動物個体である場合には、dsRNA分子および発現ベクターは
、適当なキャリア、希釈剤、エマルジョンなどと共に含む組成物の形態で、経口ルート、ならびに静脈内、筋肉内、皮下および腹腔内の注射または非経腸的ルートで投与することが可能である。
dsRNA molecules and expression vectors include nucleic acid introduction methods known to those skilled in the art, such as, but not limited to, Hydrodynamic method, method using calcium ions, electroporation method, spheroplast method, lithium acetate method, calcium phosphate method It can be introduced into cells and tissues using a lipofection method, a microinjection method, a method using a gene gun, and the like. If the subject is an animal individual, the dsRNA molecule and expression vector are in the form of a composition comprising appropriate carriers, diluents, emulsions, and the like in the oral route, as well as intravenous, intramuscular, subcutaneous and intraperitoneal. It can be administered by injection or parenteral route.

本発明のdsRNA分子の効果は、dsRNA分子を導入された細胞や組織、および個体におけるM遺伝子のmRNAまたはタンパク質の発現量が、当該dsRNA分子を導入していない(または
導入前の)細胞や組織、および個体におけるM遺伝子のmRNAまたはタンパク質の発現量と比較して低下していることを指標にして評価することが可能である。ここで測定されるM遺伝子は、予めおよび/または同時に導入されたM遺伝子を発現する発現ベクターより発現されたものであっても、FIPV感染により検出されるものであってもよい。発現量が低下しているとは、対照と比較して9割以上発現量が減少している場合のみならず、5割以上あるいは1割以上発現量が減少している場合も含まれる。測定対象がmRNAである場合には、
ノザンハイブリダイゼーション、RT-PCR、in situ hybridizationなどによって測定する
ことができる。また、測定対象がタンパク質である場合には、ウエスタンブロッティング、ELISA、抗体を結合させたプロテインチップを用いた測定、タンパク質の活性測定などによって測定することができる。検出されるM遺伝子が、予めおよび/または同時に導入したベクターに由来するものである場合には、当該ベクターにM遺伝子と共に検出可能な標識(例えば、EGFPなど)遺伝子を組み込み、M遺伝子と該標識からなる発現された融合タンパク質を適当な手段で検出して、比較することができる。
The effect of the dsRNA molecule of the present invention is that cells and tissues into which the dsRNA molecule has been introduced, and cells or tissues in which the expression level of mRNA or protein of the M gene in the individual does not introduce the dsRNA molecule (or before introduction). , And the expression level of the M gene mRNA or protein in the individual is decreased. The M gene measured here may be expressed from an expression vector that expresses the M gene introduced in advance and / or simultaneously, or may be detected by FIPV infection. The expression level is reduced not only when the expression level is reduced by 90% or more compared to the control, but also when the expression level is reduced by 50% or more or 10% or more. When the measurement target is mRNA,
It can be measured by Northern hybridization, RT-PCR, in situ hybridization and the like. When the measurement target is a protein, it can be measured by Western blotting, ELISA, measurement using a protein chip to which an antibody is bound, measurement of protein activity, or the like. When the M gene to be detected is derived from a vector introduced in advance and / or at the same time, a detectable label gene (for example, EGFP) is incorporated into the vector together with the M gene, and the M gene and the label are incorporated. The expressed fusion protein consisting of can be detected and compared by suitable means.

本発明を以下の実施例によって具体的に説明するが、本発明はこれらの実施例によって限定されるものではない。   The present invention will be specifically described by the following examples, but the present invention is not limited to these examples.

実施例1.M遺伝子−EGFP発現ベクターの作製
FIPVは、腸コロナウイルスの変異株でありその多くは公知である。このうち、FIP 79-1146系統は感染性が強く、日本国内でいちばん発症しているFIPの原因ウイルスと同じ血清型であると考えられている。そこで本実施例では、感染性が強く、日本国内で多発するFIPの原因ウイルスと同血清型のFIP79-1146株の遺伝子を用いて、実験を行った。FIP79-1146株のM遺伝子(配列番号1:AY994055)の配列を基に、FLAG tag 配列および制限酵素(NheIおよびBamHI)認識配列を含む以下のプライマーを作製し:
[Nhe-FLAG FW] 5'-CCCGCTAGCATGGTGGACTACAAGGACGACGATGACAAGAAGTACATTTTGCTAATAC
-3' (配列番号10)
[FIP79-1146M-Bam RV] 5'-GCGGGATCCCACCATATGTAATAATTTTT-3' (配列番号11)
これらプライマーと鋳型DNAとしてpBRDI-1(Peter J. M. Rottier博士(Utrecht University, Netherlands)より分与された(J. Virol. 77 (8), 4528-4538 (2003)))を用いてPCRを行い、M遺伝子をクローニングした。クローニングしたM遺伝子を、NheIおよびBamHIで制限酵素処理し、断片を精製した後、pACGFP1-N1(タカラバイオ株式会社製)のNheI- BamHI 部位にクローニングした。当該ベクターより発現されたM遺伝子タンパク質は、EGFPとの融合体であるため、蛍光顕微鏡下で可視化できる。
Example 1. Preparation of M gene-EGFP expression vector
FIPV is a mutant strain of intestinal coronavirus, many of which are known. Of these, the FIP 79-1146 strain is highly infectious, and is considered to have the same serotype as the causative virus of FIP that has developed most in Japan. Therefore, in this example, an experiment was conducted using a gene of FIP79-1146 strain having the same serotype as the causative virus of FIP which is highly infectious and occurs frequently in Japan. Based on the sequence of the M gene of FIP79-1146 strain (SEQ ID NO: 1 AY994055), the following primers containing the FLAG tag sequence and restriction enzyme (NheI and BamHI) recognition sequences were prepared:
[Nhe-FLAG FW] 5'-CCCGCTAGCATGGTGGACTACAAGGACGACGATGACAAGAAGTACATTTTGCTAATAC
-3 '(SEQ ID NO: 10)
[FIP79-1146M-Bam RV] 5'-GCGGGATCCCACCATATGTAATAATTTTT-3 '(SEQ ID NO: 11)
PCR was performed using pBRDI-1 (provided by Dr. Peter JM Rottier (Utrecht University, Netherlands) (J. Virol. 77 (8), 4528-4538 (2003))) as the primer and template DNA. The M gene was cloned. The cloned M gene was treated with restriction enzymes with NheI and BamHI, the fragment was purified, and then cloned into the NheI-BamHI site of pACGFP1-N1 (Takara Bio Inc.). Since the M gene protein expressed from the vector is a fusion with EGFP, it can be visualized under a fluorescence microscope.

実施例2.siRNAの選択および合成
FIP79-1146株のM遺伝子配列(配列番号1:AY994055)
を基に、M遺伝子を特異的標的とする以下のセンス鎖およびアンチセンス鎖からなる4種類のsiRNAをコンピュータープログラムにより選定し(RNAi社に委託)、それぞれ合成し
た(PROLIGO社に委託)。
siRNA1:標的遺伝子領域695〜717塩基
センス鎖 :GCUUACUACGUAAAAUCUAAA (配列番号2)
アンチセンス鎖:UAGAUUUUACGUAGUAAGCCC (配列番号3)
siRNA2:標的遺伝子領域527〜549塩基
センス鎖 :GUUACCCUUACUCUACUUUCA (配列番号4)
アンチセンス鎖:AAAGUAGAGUAAGGGUAACAC (配列番号5)
siRNA3:標的遺伝子領域253〜275塩基
センス鎖 :GCUGAUCAUGUGGCUAUUAUG (配列番号6)
アンチセンス鎖:UAAUAGCCACAUGAUCAGCAU (配列番号7)
siRNA4:標的遺伝子領域400〜422塩基
センス鎖 :GAGAUCUGUUCAGCUAUAUAG (配列番号8)
アンチセンス鎖:AUAUAGCUGAACAGAUCUCAC (配列番号9)
ネガティブコントロール(非対象siRNA):対応部位なし
センス鎖 :CACACAGGUUGAGAUGAUUGA (配列番号12)
アンチセンス鎖:AAUCAUCUCAACCUGUGUGUC (配列番号13)
Example 2 siRNA selection and synthesis
M gene sequence of FIP79-1146 strain (SEQ ID NO: 1 AY994055)
Based on the above, four types of siRNA consisting of the following sense strands and antisense strands specifically targeting the M gene were selected by a computer program (consigned to RNAi) and synthesized respectively (consigned to PROLIGO).
siRNA1: Target gene region 695 to 717 bases Sense strand: GCUUACUACGUAAAAUCUAAA (SEQ ID NO: 2)
Antisense strand: UAGAUUUUACGUAGUAAGCCC (SEQ ID NO: 3)
siRNA2: Target gene region 527 to 549 bases Sense strand: GUUACCCUUACUCUACUUUCA (SEQ ID NO: 4)
Antisense strand: AAAGUAGAGUAAGGGUAACAC (SEQ ID NO: 5)
siRNA3: Target gene region 253-275 bases Sense strand: GCUGAUCAUGUGGCUAUUAUG (SEQ ID NO: 6)
Antisense strand: UAAUAGCCACAUGAUCAGCAU (SEQ ID NO: 7)
siRNA4: target gene region 400 to 422 bases sense strand: GAGAUCUGUUCAGCUAUAUAG (SEQ ID NO: 8)
Antisense strand: AUAUAGCUGAACAGAUCUCAC (SEQ ID NO: 9)
Negative control (non-target siRNA): no corresponding site Sense strand: CACACAGGUUGAGAUGAUUGA (SEQ ID NO: 12)
Antisense strand: AAUCAUCUCAACCUGUGUGUC (SEQ ID NO: 13)

実施例3.siRNA分子によるM遺伝子発現抑制効果の解析
上記4種類の各siRNA分子をM遺伝子−EGFP発現ベクターとともに、培養細胞にトラン
スフェクションし、各siRNA分子によるM遺伝子発現抑制効果を以下の解析系を用いて調
べた。
Example 3 Analysis of M gene expression inhibitory effect by siRNA molecules The above four types of siRNA molecules were transfected into cultured cells together with M gene-EGFP expression vector, and the M gene expression inhibitory effect by each siRNA molecule was analyzed using the following analysis system. Examined.

(I)共焦点レーザー顕微鏡およびFACSによるM遺伝子タンパク質の発現量低下の確認
(i)M遺伝子−EGFP発現ベクターおよび各siRNA分子の導入
AD293細胞株を、10%ウシ胎児血清(FCS)含有Dulbecco’s modified Eagle’s medium
(D-MEM)中で37℃,5% CO2環境下にて培養及び維持した。当該細胞株を、6ウェルプレートに4×105/wellの密度で播き、20時間後細胞が80〜90%コンフルエントの状態になったところで、培地を1 mlの5% FCS 含有D-MEMに置換し、上記M遺伝子−EGFP発現ベクターと各種siRNAをトランスフェクトした。トランスフェクションは以下の通りに行った:M遺
伝子−EGFP発現ベクターを1.0μgと各種siRNA 1.0μl (終濃度50 nM)およびDsRed発現ベ
クター(pDsRed2-N1ベクター,Clontech)0.5μgを0pti-MEM 50μlに混合し、一方、Lipofectamine 2000(Invitrogen) 4μlと50μlのOpti-MEM 培地を混合して、それぞれ5分間室温で静置した後に両者を混合し、20分間室温でインキュベートした。この混合液を各ウェルに添加し、37℃にて培養した。
(I) Confirmation of decrease in expression level of M gene protein by confocal laser microscope and FACS (i) Introduction of M gene-EGFP expression vector and each siRNA molecule
AD293 cell line containing 10% fetal bovine serum (FCS) and Dulbecco's modified Eagle's medium
The cells were cultured and maintained in (D-MEM) at 37 ° C. in a 5% CO 2 environment. The cell line is seeded at a density of 4 × 10 5 / well in a 6-well plate. After 20 hours, when the cells are 80-90% confluent, the medium is placed in 1 ml of D-MEM containing 5% FCS. The M gene-EGFP expression vector and various siRNAs were transfected. Transfection was performed as follows: 1.0 μg of M gene-EGFP expression vector, 1.0 μl of various siRNAs (final concentration 50 nM) and 0.5 μg of DsRed expression vector (pDsRed2-N1 vector, Clontech) in 50 μl of 0 pti-MEM On the other hand, 4 μl of Lipofectamine 2000 (Invitrogen) and 50 μl of Opti-MEM medium were mixed, allowed to stand at room temperature for 5 minutes, and then both were mixed and incubated at room temperature for 20 minutes. This mixed solution was added to each well and cultured at 37 ° C.

トランスフェクションから48時間後に、各ウェルの細胞を回収した。培養上清を除いた後、EDTAトリプシンにて細胞を剥離した。その後PBS(−)で洗浄し,10%ホルマリン含有PBS(−)にて固定した。遠心して上清を除いた後、1mlの0.1% BSA-PBS (-)を加えて遮光保存した。   Cells in each well were harvested 48 hours after transfection. After removing the culture supernatant, the cells were detached with EDTA trypsin. Thereafter, the plate was washed with PBS (−) and fixed with PBS (−) containing 10% formalin. After removing the supernatant by centrifugation, 1 ml of 0.1% BSA-PBS (-) was added and stored in the dark.

回収した細胞のFIP79-1146株M遺伝子発現量をEGFPの蛍光強度として解析した。DsRedは、トランスフェクション効率を各siRNA導入細胞で比較するために用いた。   The FIP79-1146 strain M gene expression level of the collected cells was analyzed as the fluorescence intensity of EGFP. DsRed was used to compare transfection efficiency in each siRNA transfected cell.

(ii)解析結果
a.共焦点レーザー顕微鏡によるM遺伝子タンパク質の発現量低下の確認
M遺伝子−EGFP融合タンパク質の発現量を、EGFPの蛍光強度を共焦点レーザー顕微鏡によって解析することによって調べた結果を図2に示す。siRNA分子を導入していない系の
蛍光強度に比べて、各種siRNA分子を導入した系では蛍光強度が低下していることが観察
された。特に、siRNA1分子またはsiRNA4分子を導入した系では顕著に蛍光強度が低下した。
(ii) Analysis results a. Confirmation of decrease in expression level of M gene protein by confocal laser microscope FIG. 2 shows the result of examining the expression level of M gene-EGFP fusion protein by analyzing the fluorescence intensity of EGFP with a confocal laser microscope. It was observed that the fluorescence intensity decreased in the system in which various siRNA molecules were introduced, compared to the fluorescence intensity in the system in which no siRNA molecules were introduced. In particular, the fluorescence intensity decreased significantly in the system into which siRNA1 molecule or siRNA4 molecule was introduced.

b.FACSによるM遺伝子タンパク質の発現量低下の確認
M遺伝子−EGFP融合タンパク質の発現量を、EGFPの蛍光強度をFACSよって定量解析した結果を、図3に示す。この定量解析から、siRNA分子を導入していない系と比較して、各
種siRNA分子を導入した系では検出されるM遺伝子−EGFP融合タンパク質量が減少してい
ることが示された。特にsiRNA1およびsiRNA4を導入した系では、siRNA分子を導入してい
ない系と比べてM遺伝子−EGFP融合タンパク質の発現量が約70%抑制されることが示された。
b. Confirmation of decrease in expression level of M gene protein by FACS FIG. 3 shows the result of quantitative analysis of the expression level of the M gene-EGFP fusion protein by the fluorescence intensity of EGFP by FACS. From this quantitative analysis, it was shown that the amount of M gene-EGFP fusion protein detected in the system into which various siRNA molecules were introduced was reduced as compared with the system into which no siRNA molecules were introduced. In particular, it was shown that the expression level of the M gene-EGFP fusion protein was suppressed by about 70% in the system in which siRNA1 and siRNA4 were introduced, compared to the system in which no siRNA molecule was introduced.

(II)リアルタイムPCR法によるM遺伝子−EGFP mRNAの発現量低下の確認
AD293細胞を4×105/wellの密度で12ウェルプレートに播き、16時間後に、各ウェルあ
たり、1.0μgのM遺伝子−EGFP発現ベクターおよび1.0μl(終濃度50 nM)の各種siRNAを
上記(I)(i)と同様の方法で細胞にトランスフェクションした。
(II) Confirmation of decreased expression of M gene-EGFP mRNA by real-time PCR
AD293 cells were seeded in a 12-well plate at a density of 4 × 10 5 / well, and after 16 hours, 1.0 μg of M gene-EGFP expression vector and 1.0 μl (final concentration 50 nM) of various siRNAs were added to each well (see above). I) Cells were transfected by the same method as (i).

(i)細胞の回収とRNA 抽出
遺伝子導入から20時間後に共焦点レーザー顕微鏡 (Leica)にて79-1146株M遺伝子の発
現を確認し、その後、細胞の回収を行った。培養上清を捨てて、各ウェルにISOGEN (ニッポンジーン)を1ml加え、シリンジと18 G 針を用いてウェル内の細胞を良く溶かした。そ
の後1.5 mlチューブにサンプルを回収し、再度細胞を良く溶かし室温にて5分間静置した
。チューブにクロロホルム(Wako)を200μl加え攪拌し室温にて2分間静置した後、14000rpm、4℃、15分間遠心分離をし、水層を別の1.5mlチューブに移した。これにイソプロパノール(Wako)を500μl加え、静かに転倒混和をした後室温にて5〜10分間静置した。14000rpm、4℃、10分間遠心分離をして上清を除去した。残ったペレットを70%エタノール1000μlにて2回洗い、最後に4℃、5分間、14000rpmにて遠心分離後、上清を除去しペレットを自然乾燥した。このペレットに、DEPC処理水を16μl、DNaseI Enzyme (Wako)を1μl、10×DNase buffer(Wako)を2μl、RNase out (Wako)を1μl加えてペレットを溶かし37℃にて15分間静置した後、STOP solution (Wako)を1μl加えて氷上に置いた。これにDEPC処理水を80 μl、フェノール(Wako)を50μl加えた後、1分間攪拌し、12000rpm、23℃、1分間遠心分離を行い、別の1.5 mlチューブに水層を回収した。その後エタノール沈殿により得られたペレットにDEPC処理水を20 μl加えた後、RNA濃度測定を行った。
(I) Cell recovery and RNA extraction 20 hours after gene introduction, the expression of the 79-1146 strain M gene was confirmed with a confocal laser microscope (Leica), and then the cells were recovered. The culture supernatant was discarded, 1 ml of ISOGEN (Nippon Gene) was added to each well, and the cells in the well were thoroughly dissolved using a syringe and an 18 G needle. Thereafter, the sample was collected in a 1.5 ml tube, and the cells were thoroughly dissolved again and allowed to stand at room temperature for 5 minutes. 200 μl of chloroform (Wako) was added to the tube, stirred and allowed to stand at room temperature for 2 minutes, then centrifuged at 14000 rpm, 4 ° C. for 15 minutes, and the aqueous layer was transferred to another 1.5 ml tube. To this, 500 μl of isopropanol (Wako) was added, gently mixed by inversion, and allowed to stand at room temperature for 5 to 10 minutes. The supernatant was removed by centrifugation at 14000 rpm, 4 ° C. for 10 minutes. The remaining pellet was washed twice with 1000 μl of 70% ethanol, and finally centrifuged at 4 ° C. for 5 minutes at 14000 rpm, the supernatant was removed, and the pellet was naturally dried. Add 16 μl of DEPC-treated water, 1 μl of DNaseI Enzyme (Wako), 2 μl of 10 × DNase buffer (Wako), and 1 μl of RNase out (Wako) to this pellet. 1 μl of STOP solution (Wako) was added and placed on ice. After adding 80 μl of DEPC-treated water and 50 μl of phenol (Wako) to this, the mixture was stirred for 1 minute, centrifuged at 12000 rpm, 23 ° C. for 1 minute, and the aqueous layer was collected in another 1.5 ml tube. Thereafter, 20 μl of DEPC-treated water was added to the pellet obtained by ethanol precipitation, and RNA concentration was measured.

(ii) cDNA 合成
PrimeScriptTM cDNA合成キット(Takara Bio)を用いてcDNA合成を行った。まず1μg
分のRNAを含むようにDEPC処理水にてRNAを希釈した。希釈した液を65℃にて3分反応させ
、その後すぐに氷上にて2分間急冷した。その後、2×RT Reaction Mixを2 μl、RT Enzyme Mix を0.5μl、Oligo (dT) primer を0.5μl、Random primer を0.5μl を加えて混和後、25℃にて10 分、50℃にて30 分、85℃にて5 秒間反応させた後、速やかに氷上に静置した。
(ii) cDNA synthesis
CDNA synthesis was performed using PrimeScript cDNA synthesis kit (Takara Bio). First 1μg
The RNA was diluted with DEPC-treated water so as to contain the minute RNA. The diluted solution was reacted at 65 ° C. for 3 minutes, and then immediately cooled on ice for 2 minutes. Then add 2 μl of 2 × RT Reaction Mix, 0.5 μl of RT Enzyme Mix, 0.5 μl of Oligo (dT) primer and 0.5 μl of Random primer, mix at 25 ° C for 10 minutes, and 30 at 50 ° C. The mixture was allowed to react at 85 ° C. for 5 seconds, and then immediately left on ice.

(iii)反応と解析
合成したcDNAと、2×Premix EXTaq (Takara Bio)、Forwardプライマー(10 pmol/μl)、Reverseプライマー(10 pmol/μl)、プローブ (5 pmol/μl)、Rox dye II(原液)、RNase
free water を以下の容量で混合した。
(Iii) Reaction and analysis The synthesized cDNA, 2 × Premix EXTaq (Takara Bio), Forward primer (10 pmol / μl), Reverse primer (10 pmol / μl), probe (5 pmol / μl), Rox dye II ( Stock solution), RNase
Free water was mixed in the following volume.

使用したプライマーとプローブの配列は以下の通りである。
順方向プライマー:AATGCTGATCATGTGGCTATTATGG(配列番号14)
逆方向プライマー:AAATACATCATCCAAAGTGCAAACG(配列番号15)
プローブ:GTGCACCTGCAACACTAAAGCCGAACA(配列番号16)
The primer and probe sequences used are as follows.
Forward primer: AATGCTGATCATGTGGCTATTATGG (SEQ ID NO: 14)
Reverse primer: AAATACATCATCCAAAGTGCAAACG (SEQ ID NO: 15)
Probe: GTGCACCTGCAACACTAAAGCCGAACA (SEQ ID NO: 16)

Figure 0005263729
Figure 0005263729

調製済みのサンプルを96穴プレートに入れた後にReal Time PCR 7500 Systemを用いて
反応させた。反応条件として、初期変性として95℃にて10秒ののち、95℃にて5秒、60℃
にて34秒を40サイクル行った。
解析は、Real Time PCR SystemのSDS システムソフトウェアを用いて行った。
The prepared sample was placed in a 96-well plate and reacted using Real Time PCR 7500 System. As reaction conditions, initial denaturation at 95 ° C for 10 seconds, then 95 ° C for 5 seconds, 60 ° C
At 34 seconds, 40 cycles were performed.
The analysis was performed using the SDS system software of Real Time PCR System.

(iv)解析結果
M遺伝子−EGFP mRNAの発現量を、リアルタイムPCR法によって定量解析した結果を、図4に示す。この定量解析から、siRNA分子を導入していない系と比較して、各種siRNA分子を導入した系では検出されるM遺伝子−EGFP融合タンパク質量が減少していることが示された。特にsiRNA1、siRNA2およびsiRNA4を導入した系では、siRNA分子を導入していない
系と比べてM遺伝子−EGFP mRNAの発現量が有意に抑制されることが示された。
(Iv) Analysis Results FIG. 4 shows the results of quantitative analysis of the expression level of M gene-EGFP mRNA by the real-time PCR method. From this quantitative analysis, it was shown that the amount of M gene-EGFP fusion protein detected in the system into which various siRNA molecules were introduced was reduced as compared with the system into which no siRNA molecules were introduced. In particular, it was shown that the expression level of M gene-EGFP mRNA was significantly suppressed in the system in which siRNA1, siRNA2, and siRNA4 were introduced, compared to the system in which no siRNA molecule was introduced.

本発明のFIPVのM遺伝子 mRNAを標的とするdsRNA分子は、M遺伝子のタンパク質の発現量を有効に抑制することが可能であり、それによってFIPVの複製を阻害し得る。また、本発明のdsRNA分子を用いてFIPVの複製を阻害することによって、ネコ伝染性腹膜炎を有効
に予防および/または治療することができる。
The dsRNA molecule targeting the M gene mRNA of FIPV of the present invention can effectively suppress the expression level of the M gene protein, thereby inhibiting FIPV replication. Moreover, feline infectious peritonitis can be effectively prevented and / or treated by inhibiting FIPV replication using the dsRNA molecule of the present invention.

FIPVの一本鎖RNAを示す模式図である。It is a schematic diagram which shows single-stranded RNA of FIPV. 共焦点レーザー顕微鏡によるM遺伝子−EGFP融合タンパク質の解析結果を示す図である。図中a-gは、それぞれ以下の発現系を示すa:MOCK、b: M遺伝子−EGFP+DsRedのみ、c: M遺伝子−EGFP+DsRed+siRNA1、d: M遺伝子−EGFP+DsRed+siRNA2、e: M遺伝子−EGFP+DsRed+siRNA3、f: M遺伝子−EGFP+DsRed+siRNA4、g: M遺伝子−EGFP+DsRed+非対象siRNA。それぞれ左の写真はEGFP、右の写真はDsRedの蛍光像を示す。It is a figure which shows the analysis result of M gene-EGFP fusion protein by a confocal laser microscope. In the figure, ag represents the following expression systems: a: MOCK, b: M gene-EGFP + DsRed only, c: M gene-EGFP + DsRed + siRNA1, d: M gene-EGFP + DsRed + siRNA2, e: M gene-EGFP + DsRed + siRNA3, f: M gene- EGFP + DsRed + siRNA4, g: M gene-EGFP + DsRed + non-target siRNA. Each photo on the left shows a fluorescent image of EGFP, and the photo on the right shows a fluorescent image of DsRed. FACS法によるM遺伝子−EGFP融合タンパク質の発現解析結果を示す図である。M遺伝子−EGFP発現ベクターを単独で導入した際のM遺伝子−EGFP融合タンパク質の発現量を100%として、各系におけるM遺伝子−EGFP融合タンパク質の発現量を相対的に示す。横軸は左より、それぞれ以下の発現系を示す:MOCK;M遺伝子−EGFP+DsRedのみ;M遺伝子−EGFP+DsRed+siRNA1;M遺伝子−EGFP+DsRed+siRNA2;M遺伝子−EGFP+DsRed+siRNA3;M遺伝子−EGFP+DsRed+siRNA4;M遺伝子−EGFP+DsRed+非対象siRNA。It is a figure which shows the expression analysis result of the M gene-EGFP fusion protein by FACS method. The expression level of the M gene-EGFP fusion protein when the M gene-EGFP expression vector is introduced alone is defined as 100%, and the expression level of the M gene-EGFP fusion protein in each system is relatively shown. The horizontal axis represents the following expression systems from the left: MOCK; M gene-EGFP + DsRed only; M gene-EGFP + DsRed + siRNA1; M gene-EGFP + DsRed + siRNA2; M gene-EGFP + DsRed + siRNA3; M gene-EGFP + DsRed + siRNA4; リアルタイムPCR法によるM遺伝子−EGFP mRNAの発現解析結果を示す図である。Real Time PCR System のSDSシステムソフトウェアにて解析を行い、M遺伝子−EGFP mRNA量を縦軸に示す。横軸は左より、それぞれ以下の発現系を示す:MOCK; M遺伝子−EGFPのみ; M遺伝子−EGFP+siRNA1; M遺伝子−EGFP+siRNA2; M遺伝子−EGFP+siRNA3; M遺伝子−EGFP+siRNA4; M遺伝子−EGFP+非対象siRNA。It is a figure which shows the expression analysis result of M gene-EGFP mRNA by real-time PCR method. The analysis is performed with the SDS system software of Real Time PCR System, and the M gene-EGFP mRNA amount is shown on the vertical axis. The horizontal axis represents the following expression systems from the left: MOCK; M gene-EGFP only; M gene-EGFP + siRNA1; M gene-EGFP + siRNA2; M gene-EGFP + siRNA3; M gene-EGFP + siRNA4; M gene-EGFP + non-target siRNA.

配列番号2〜16は、合成オリゴヌクレオチド配列を示す。   SEQ ID NOs: 2-16 show synthetic oligonucleotide sequences.

Claims (3)

ネコ伝染性腹膜炎ウイルス(FIPV)のマトリックス遺伝子(M遺伝子)のmRNAを標的とする二本鎖RNA(dsRNA)分子であって、配列番号2で表されるセンス鎖と配列番号3で表されるアンチセンス鎖、配列番号4で表されるセンス鎖と配列番号5で表されるアンチセンス鎖、および配列番号8で表されるセンス鎖と配列番号9で表されるアンチセンス鎖からなる群より選択されるいずれかの塩基対からなる、dsRNA分子。 A double-stranded RNA (dsRNA) molecule targeting the mRNA of a matrix gene (M gene) of feline infectious peritonitis virus (FIPV), which is represented by a sense strand represented by SEQ ID NO: 2 and SEQ ID NO: 3 From the group consisting of an antisense strand, a sense strand represented by SEQ ID NO: 4 and an antisense strand represented by SEQ ID NO: 5, and a sense strand represented by SEQ ID NO: 8 and an antisense strand represented by SEQ ID NO: 9 A dsRNA molecule consisting of any selected base pair . センス鎖とアンチセンス鎖がリンカー分子を介して連結されている、請求項1に記載のdsRNA分子。 The dsRNA molecule according to claim 1, wherein the sense strand and the antisense strand are linked via a linker molecule. 請求項に記載のdsRNA分子の鋳型DNAを含み該dsRNA分子を発現するベクター。 A vector comprising the template DNA of the dsRNA molecule according to claim 2 and expressing the dsRNA molecule.
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