WO2024145700A1 - Method of expanding virus-specific lymphocytes, composition, and use of a composition - Google Patents
Method of expanding virus-specific lymphocytes, composition, and use of a composition Download PDFInfo
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Definitions
- CD8 T lymphocytes also known as CTL
- CD8 T lymphocytes are to cause immune-mediated death and the active component released by CD8 T lymphocytes are perforins, granzyme A and granzyme B.
- CD4 cells also Known as helper T cells, they use the secretion of cytokines to influence other cells of the immune system to fulfill their role, such as inducing B cells to differentiate into plasma cells and produce antibodies or attracting CD8 T lymphocytes to the site of infection. 5 Based on this principle, it was understood that lymphocytes could be used as an adoptive immunity reference for the treatment of hCMV infection and new techniques for the development and in vitro isolation of T lymphocytes specific against hCMV emerged.
- the cells were infused into 14 patients via central catheter in 4 doses staggered weekly 3.3x10 7 , 1x10 8 , 3.3x10 8 and 10 9 cell./m two 4.1x10 5 , 3.3x10 5 and 1x10 6 /kg) in 100% compatible allogeneic patients and patients maintained CMV-specific responses for up to 8 weeks (60 days) after cell infusion. No serious adverse effects were noted in patients. Vital signs of all patients remained unchanged after all infusions and 3/14 patients developed grade I and II GvHD/GvHD after cell infusion.
- Cells were obtained from donors and 8 patients whose HLA compatibilities between donor and recipient were variable, 5 had complete compatibility, while 3 had partial compatibility. Of the 8 patients, 7 received a single dose of 1x10 7 cell./m two (equivalent to 1x10 4 /kg) intravenously and 5 patients out of 8 resolved CMV infection after an infusion of cells. One of the patients needed an extra infusion of cells and after the second infusion the infection was controlled. Two patients did not respond to cell treatment. No serious adverse effects or GvHD occurred in patients who received these cells.
- Peggs and colleagues isolated hCMV-specific lymphocytes from CMV-positive donors from peripheral blood and cultured them with autologous dendritic cells pulsed with CMV antigen for 14 to 21 days using X-Vivo 20 medium. with 10% human serum AB and IL-2. Cultures were restimulated on day 7 of cultivation. In this protocol, 16 patients were included who received intravenously around 1x 10 5 cells/kg after the first episode of CMV viremia. Of the 16 treated patients, 3 developed grade I GVHD/GvHD and 14/16 treated patients did not reactivate viremia.
- the cells were infused intravenously and the average dose of cells infused was 10 2.1x10 4 CD3/kg (ranging between 1x103 and 1.3x10 5 cell./kg) of specific T lymphocytes against CMV capsid protein (pp65).
- the results observed were that 83% of cases of infections had a complete response with a greatly reduced viral load, including 2 cases of hCMV encephalitis. In this study, no cases of GVHD/GvHD or acute side effects were observed.
- the pool of 138 synthetic peptides from the hCMV viral capsid was added to the culture. Two days later, a second stimulus with peptides was performed.
- Cells were expanded in vitro for another 6-10 days. The expanded cells were selected by the automatic cell capture system (CSS) (Miltenyi Biotec).
- CCS automatic cell capture system
- the dose of cells infused intravenously was on average 4x10 5 /kg for CD8 and 3x10 3 /kg for CD4.
- These cells were infused into 32 patients refractory to antiviral treatment and with hCMV reactivation after Bone marrow transplant. The cells were mostly from transplant cell donors, so compatibility was total or partial.
- Dendritic cells derived from donor monocytes were generated and pulsed with MACS GMP PepTivators (Miltenyi Biotec) pool of hCMV pp65, AdV5 Hexon, or EBV BZLF1/LMP2A/EBNA-1.
- the cells were cultured for up to 21 days and restimulated with the specific peptide on day 7 of culture and the cultures were also supplemented with IL-2. After cultivation, the cells were frozen. Participants were treated with partially compatible cells at a dose of approximately 1x10 4 /Kg intravenously and compatibility was partial up to 1 in 6 alleles for HLA A, B and C.
- Document EP 2718426 relates to a method for generating T lymphocyte preparations that are specific for at least one target antigen, comprising the steps of expanding lymphoid cells in vitro in the presence of a target antigen or peptide fragments thereof in a expansion step, 25 isolating cells that secrete IFN- ⁇ , IL-2 or TNF- ⁇ or express the activation markers CD137 or CD40L. After selection by cultivating these cells in the presence of IL-2 or IL-7, other examples being IL-15 or IL-21, with preference for the combination of IL-2 and IL-7 and an mTOR complex 1 inhibitor ( Rapamycin).
- Figure 4A-C shows the validation of the initial cell number and dose of cytokines for cell expansion.
- A CD4 T lymphocyte proliferation assay with different concentrations of cytokines.
- B CD8 T lymphocyte proliferation assay with different concentrations of cytokines.
- C Lymphocyte proliferation assay with different cell concentrations (IL-2500 UL/mL + IL-710 ng/mL).
- Figure 5A-D graphically shows the pattern of leukocyte expansion and metabolite detection in the Xuri and G-REX bioreactors over 15 days.
- A Expansion of leukocytes.
- B pH assessment.
- FIG. 6A-D graphically shows the pattern of 10 lymphocyte subpopulations in the Xuri and G-REX bioreactors over 15 days.
- A CD3+ lymphocytes.
- B CD3/CD8+ lymphocytes (CTLs).
- C CD3+CD45RO+CD45RA- Memory Lymphocytes.
- D CD3+CD45RA+CD45RO- na ⁇ ve lymphocytes.
- Figure 7A-B shows the comparison between the selected cells (TCB, target cell bag) in the column systems and PRODIGY system.
- TB total number of cells obtained in both systems.
- B Percentage of CD3 T lymphocytes obtained in both systems.
- Figure 8 shows analyzed purity data of TCBs from manual column and CliniMACS PRODIGY system.
- Figure 9A-B shows the average number of T lymphocytes (CD3) and CD3 20 T lymphocytes positive for INF- ⁇ in the depleted (NTCB - non target cell bag) and selected (TCB) fractions captured by the CliniMACS PRODIGY system.
- Figure 10A-D demonstrates the analysis of cells after the IFN- ⁇ capture assay. NTCB - Analysis of the cellular fraction discarded in the capture assay. (A) Selection of cells by SSC vs. FSC.
- the cryoprotectant solution comprises 50% Voluven® 6%, or a mixture of hydroxyethyl starch and 6% sodium chloride, 40% 20% human albumin and 10% dimethyl sulfoxide (DMSO), relative to the volume of the cryoprotectant solution.
- Voluven® 6% or a mixture of hydroxyethyl starch and 6% sodium chloride, 40% 20% human albumin and 10% dimethyl sulfoxide (DMSO), relative to the volume of the cryoprotectant solution.
- the supernatant of the TCB fraction can be sent for serological tests, including, but not limited to, serology, NAT, PCR and in situ hybridization, 20 and may also include testing for impurities through the quantification of IL-2 and IL-7 in the supernatant of the cells and potency testing, for example, through quantification of IFN- ⁇ in the co-culture supernatant of hCMV-specific lymphocytes and hCMV-infected fibroblasts.
- serological tests are available in the technique and are part of the routine activities of a professional in the field, such as the NAT test, from the English “Nucleic Acid Test”.
- the amplification and detection of nucleic acids can be carried out by polymerase chain reaction (PCR).
- serological test refers to any and all tests based on serology, that is, on the presence or absence of antibodies specific to pathogens, as well as biological materials and the pathogens themselves, in samples biological samples, particularly blood, to concretely determine their presence in the samples.
- the final number of selected cells (TCB) in the 2 systems was quite similar, the purity was above 80%, being 80.5% in the manual column system and 80.6% in the PRODIGY system ( Figure 8) .
- the CliniMACS PRODIGY equipment was evaluated and validated by 3 selections.
- the average number of T lymphocytes (CD3) in the depleted fraction – NTCB was on average 73.8 ⁇ 7.84%, while in the selected fraction – TCB it was on average 91 ⁇ 1.9%.
- CD3 T lymphocytes positive for IFN- ⁇ in the depleted fraction – NTCB the average was 36.7 ⁇ 7.08%, while in the selected cells it was an average of 83.63 ⁇ 2.20%, as shown in Figure 9.
- each 1x10 6 Cells were diluted in 15 mL of 0.9% saline solution containing 2.5% human albumin used in cell selection. This volume (15 mL) containing 1x10 6 Cells were transferred to each freezing bag.
- the bags containing the cells in 15 mL were placed in the refrigerator for 15 minutes and the freezing medium for the same volume of cells to be frozen was also prepared and added to the refrigerator for the same period as the cells (40% Voluven ® 6%, 40% human albumin 6% and 20% DMSO).
- one bag at a time was removed from the refrigerator and transferred to laminar flow to add the cryoprotectant solution, using a 50 mL syringe and bag adapter.
- Thawed cells from the following products/donors were used: product: B300121394945-donor: 18FSH4945 (Figure 13), product: B300121391223-donor: 59TPAA1223 ( Figure 14) and product: B300121327279-donor: 60GDD2727 ( Figure 15).
- the results of these assays were evaluated in the automatic spot counter (AID Advanced Imaging Devices GmbH Ebinger Str. 4 D72479 Strassberg Germany).
- the assays were also carried out using 03 different amounts of cells (1x10 3 /100 ⁇ L, 5x10 3 /100 ⁇ L and 1x10 4 /100 ⁇ L) in the product of selected cells (TCB) and also in discarded cells (NCTB).
- MCR-5 fibroblasts were seeded at a concentration of 2.84x10 4 /well in 24-well culture plate in NB2 culture room. After 24 h of culturing MCR-5 cells, the culture medium was removed and the cells were adsorbed with 0.1 MOI of strain CMV-AD169 for each cell in culture (2.84x10 3 MOIs) for 8 h. After this period, the supernatant was removed and new culture medium was added. After 4 days of culture, it was possible to observe cytopathic changes in MCR-5.
- hCMV-specific T lymphocytes isolated by the CliniMACs PRODIGY equipment, was analyzed by culturing MRC-5 fibroblasts (ATCC CCL-171) infected with CMV (ATCC VR-538) at concentration 10 -1 in the presence of different concentrations of CMV-specific lymphocytes (1:1 and 2:1) from 3 different donors/TCBs, with class I HLA compatibility between lymphocyte donors and MCR-5 cells varying as indicated below: - Product : B300121394945 - Donor: 18FSH4945 (HLA 3:6 compatibility); - Product: B300121391223 - Donor: 59TPAA1223 (HLA 1:6 compatibility); - Product: B300121327279 - Donor: 60GDD2727 (HLA compatibility 1:6).
- Co-cultures were evaluated after 24 and 48 hours. Triplicate supernatants from cocultures of hCMV-specific T lymphocytes with hCMV-infected MRC-5 fibroblasts were collected and the assay was performed using the CytoTox 96® Non-Radio kit (Promega Cat.: G1780; Lot.:430121). Specifically, this assay measures the concentration of LDH (lactate dehydrogenase), the enzyme released after cell lysis. The concentration of LDH is modified when cell death occurs, and as a death control, co-culture of lymphocytes with uninfected fibroblasts was used.
- LDH lactate dehydrogenase
- LDH released into culture supernatants was measured in a 30-minute enzymatic assay, which results in the conversion of a tetrazolium salt (violet iodonitrotetrazolium; INT) into a red formazan product, altering the optical density.
- Optical densities were obtained by colorimetric reading and their variation is proportional to cell lysis. The protocol follows the manufacturer's guidelines and optical densities were obtained using a spectrophotometer (Varioskan LUX - Thermo Scientific).
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Abstract
The present invention relates to a method for expanding virus-specific lymphocytes. The present invention also relates to a composition comprising virus-specific lymphocytes and the use of this composition to manufacture a cell therapy.
Description
MÉTODO DE EXPANSÃO DE LINFÓCITOS VÍRUS-ESPECÍFICOS, COMPOSIÇÃO E USO DE UMA COMPOSIÇÃO CAMPO DA INVENÇÃO A presente invenção está relacionada a um método de expansão de 5 linfócitos vírus-específicos. A presente invenção também está relacionada a uma composição que compreende linfócitos vírus-específicos e ao uso dessa composição para a fabricação de uma terapia celular. ANTECEDENTES DA INVENÇÃO É sabido que após o transplante de medula óssea, os pacientes 10 transplantados podem ser acometidos por diversas complicações, entre elas complicações decorrentes do regime de condicionamento prévio ao transplante, complicações relacionadas à doença do enxerto contra o hospedeiro (DECH/GvHD) aguda e crônica, e condições relacionadas à própria saúde do paciente, como a recidiva da doença de base. 15 Dentre essas complicações, as infecções e reativação de infecções virais, por exemplo como por citomegalovírus humano (hCMV), adenovírus, Epstein- barr (EBV) e poliomavírus (vírus BK) são causas frequentes de graves complicações em pacientes submetidos a transplantes alogênicos de medula óssea (TMO) (Düver et al., 2020). 20 A reativação/infecção por hCMV pode levar a sérias complicações aos pacientes, como alterações neurológicas irreversíveis, complicações pulmonares, gastrointestinais, oftalmológicas, entre outras, além de internações prolongadas, levando a morbidade e a mortalidade dos pacientes e ao consequente aumento de custos em saúde, tanto no setor público, como no setor privado. 25 O hCMV ou herpes vírus 5 (HHV-5) humano é um vírus pertencente à família Herpesviridae, subfamília Betaherpesviridae, do gênero Cytomegalovirus. A infecção por hCMV normalmente segue um curso assintomático ou oligossintomático quando se trata de indivíduos imunocompetentes. Entretanto, em pacientes imunossuprimidos, as manifestações clínicas, relacionadas à proliferação viral em 30 diferentes tecidos (células epiteliais, endoteliais, parenquimatosas e mononucleares) podem comprometer diversos sistemas (pulmão, trato gastrointestinal, sistema nervoso central, sistema reticuloendotelial), causando danos deletérios por vezes irreversíveis aos pacientes (Blümel et al., 2010).
Considerações específicas devem ser dadas a pacientes imunossuprimidos infectados por hCMV pós-TMO, uma vez que este é um agente infeccioso cujas taxas de prevalência são extremamente elevadas com soropositividade de quase 100% nas populações africana, asiática e do oriente médio 5 e cerca de 40-70% nos continentes americano e europeu (Zuhair et al., 2019). Logo, é de se esperar que os índices de reativação pós-transplante também o sejam. Foi estimada uma taxa de reativação de 70% nos pacientes pós-TMO alogênico, o que faz com que o controle e tratamento desta infecção mereçam especial atenção (Teria et al., 2015). 10 Pneumonia, úlceras em trato gastrointestinal e retinite são as principais manifestações clínicas neste subgrupo de pacientes. Múltiplos fatores favorecem a reativação do hCMV no cenário pós-transplante. Além dos agentes imunossupressores utilizados e da imunossupressão causada pelo regime de condicionamento, somam-se: (i) a interação com outros vírus (por exemplo: HHV-6); 15 (ii) o aumento da produção de citocinas durante infecções bacterianas e fúngicas; (iii) a ocorrência de doença do enxerto contra o hospedeiro e seu tratamento, realizado principalmente com corticoterapia; e (iv) o tratamento prévio com imunoglobulina anti- linfocítica (ATG). Tais situações clínicas são muito comuns nestes pacientes e propiciam um status imunológico que possibilita a disseminação do hCMV (Asano- 20 Mori et al., 2005, Frere et al., 2006). Para reduzir o período de internação dos pacientes transplantados de medula óssea acometidos por infecção hCMV, diversas estratégias vêm sendo desenvolvidas ao longo dos anos. Sabe-se que indivíduos saudáveis soropositivos para hCMV desenvolvem uma grande quantidade de linfócitos T citotóxicos (CTL) 25 específicos para o vírus no sangue periférico. Os linfócitos T são células que se diferenciam no timo humano e tem papel central na resposta imunológica. Os linfócitos T geralmente são distintos de outras células por apresentarem na sua superfície os receptores de células T (TCRs) e a proteína CD3. As células linfoides precursoras têm origem na medula óssea, mas 30 apenas se diferenciam nos subtipos CD4 e CD8 de linfócitos T após terem migrado para o timo. Uma das funções dos linfócitos T CD8, também conhecidos como CTL é de causar a morte imune-mediada e o componente ativo liberado pelos linfócitos T CD8 são as perforinas, granzima A e granzima B. Já as células CD4, também
conhecidas como células T auxiliares, usam a secreção de citocinas para influenciar outras células do sistema imune a cumprir seu papel, como induzir células B a se diferenciarem em plasmócitos e produzirem anticorpos ou atrair linfócitos T CD8 para o local de infecção. 5 Partindo desse princípio, entendeu-se que os linfócitos poderiam ser utilizados como referência adotiva de imunidade para o tratamento da infecção por hCMV e novas técnicas de desenvolvimento e isolamento in vitro de linfócitos T específicos contra hCMV surgiram. Foi demonstrado que a imunidade protetora pode ser transferida a pacientes imunossuprimidos mediante a infusão de clones de 10 linfócitos T CD4 e CD8 específicos contra o vírus, levando a supressão da viremia (Einsele et al., 2002; Hanley et al., 2015). Demonstrou-se também a eficácia da transferência imunoadotiva de clones de células T CD8 hCMV específicos aplicados de maneira profilática a pacientes imunossuprimidos. Esta terapia protegeu os pacientes contra o 15 aparecimento de complicações da doença, sendo as células clonais detectadas nos pacientes até 8 semanas após a infusão (Blyth et al., 2013). Dada a gravidade da infecção clínica, a inexistência de estratégias profiláticas que reduzam definitivamente o risco de infecção e os efeitos colaterais dos antivirais, a partir da década de 90 intensificou-se o desenvolvimento de métodos 20 alternativos para a expansão de linfócitos para o tratamento de infecções virais, principalmente para o hCMV. Alguns desses métodos são descritos abaixo. Riddell e seus colaboradores (Riddell et al., 1992) geraram linfócitos T citotóxicos a partir células de sangue periférico de doadores de medula óssea CMV positivos, cultivando estas células por 12 semanas com fibroblastos infectados com 25 hCMV (5 MOIs) a partir do vírus inteiro vivo, IL-2 e anti-CD3 e anti-CD28 em meio de cultura RPMI suplementado com soro AB humano. As células foram infundidas por via endovenosa em 3 pacientes. As células foram infundidas por 4 vezes em doses escalonadas por 4 semanas (3,3x104, 1x105, 3,3x105 e 1x106). O trabalho de Walters et al., 1995, gerou linfócitos T citotóxicos a partir 30 de células de sangue periférico dos doadores de medula óssea CMV positivos, cultivando estas células com fibroblastos infectados com hCMV (5 MOIs) a partir de vírus inteiro, IL-2 e anti-CD3 em meio de cultura RPMI suplementado com soro AB humano. As células foram infundidas em 14 pacientes via cateter central em 4 doses
escalonadas semanalmente de 3,3x107, 1x108, 3,3x108 e 109 cel./m2 de 4,1x105, 3,3x105 e 1x106/kg) em pacientes alogênicos 100% compatíveis e os pacientes mantiveram as respostas CMV-específicas por até 8 semanas (60 dias) após a infusão das células. Nenhum efeito adverso grave foi notado nos pacientes. Os sinais vitais de todos os pacientes permaneceram inalterados após todas as infusões e 3/14 pacientes desenvolveram DECH/GvHD grau I e II após a infusão das células. Para a DECH/GvHD, os pacientes foram tratados com prednisona de 1,0 a 1,5/kg por dia durante 3 semanas, os pacientes não apresentaram outras reações e as doses adicionais de células foram bem toleradas e não houve nova recorrência de DECH/GvHD. No trabalho de Einsele et al., 2002, os linfócitos CMV-específicos foram isolados a partir de 200 mL de sangue periférico de doadores de células-tronco. As células foram cultivadas e estimuladas com peptídeos virais durante 21 dias de cultura utilizando meio de cultura RPMI suplementado com soro humano AB, IL-2 e lisado viral/peptídeo viral. O trabalho menciona que após 4 estímulos com peptídeos específicos in vitro, as células em cultura perdem sua alorreatividade inicial contra o receptor, mesmo para os receptores parcialmente compatíveis. Obteve-se células dos doadores e 8 pacientes cujas compatibilidades HLA entre doador e receptor eram variáveis, 5 apresentavam compatibilidade total, enquanto 3 apresentavam compatibilidade parcial. Dos 8 pacientes, 7 receberam dose única de 1x107 cel./m2 (equivalente a 1x104/kg) endovenosa e 5 pacientes em 8 resolveram a infecção por CMV após uma infusão de células. Um dos pacientes precisou de uma infusão extra de células e depois da segunda infusão a infecção foi controlada.2 pacientes não responderam ao tratamento com células. Nenhum efeito adverso grave ou GvHD ocorreu nos pacientes que receberam estas células. Peggs e colaboradores (Peggs et al., 2003) isolaram linfócitos hCMV- específicos de doadores CMV-positivos a partir de sangue periférico e os cultivaram com células dendríticas autólogas pulsadas com antígeno de CMV por 14 a 21 dias usando o meio X-Vivo 20 com 10% de soro humano AB e IL-2. As culturas foram reestimuladas no dia 7 de cultivo. Neste protocolo foram incluídos 16 pacientes que receberam por via endovenosa cerca de 1x 105 cel./kg após o primeiro episódio de viremia por CMV. Dos 16 pacientes tratados, 3 desenvolveram DECH/GvHD grau I e 14/16 pacientes tratados não reativaram mais a viremia.
No trabalho de Feuchtinger e seus colaboradores (Feuchtinger et al., 2010), os linfócitos hCMV-específicos foram isolados de leucafereses ou a partir de 500mL de sangue total. As células foram cultivadas em meio RPMI com 10% de soro AB humano e 10 μL/mL da proteína pp65 (Miltenyi Biotec) por 16 horas a 37 °C. O 5 enriquecimento das células ocorreu utilizando a captura de células produtoras de IFN- γ no Sistema CliniMACS (Miltenyi Biotec). A pureza das seleções realizadas foi em média de cerca de 65% de células IFN-γ. Neste trabalho foram tratados 18 pacientes pós-transplantes haploidênticos ou transplantes com doadores não relacionados. As células foram infundidas por via endovenosa e a dose média de células infundidas foi 10 de 2,1x104 CD3/kg (variando entre 1x10³ e 1,3x105 cel./kg) de linfócitos T específicos contra a proteína do capsídeo do CMV (pp65). Os resultados observados foram que 83% dos casos de infecções tiveram resposta completa com carga viral bastante reduzida, inclusive em 2 casos de encefalite por hCMV. Neste estudo não foram observados nenhum caso de DECH/GvHD ou efeito colateral agudo. 15 No trabalho de Peggs e seus colaboradores de 2011 (Peggs et al., 2011), as células foram obtidas por leucafereses e cultivadas em meio RPMI com 10% de soro AB humano e 600 ng de peptídeos pp65 (CMV Peptivator; Miltenyi-Biotec) por 6 horas a 37 °C. O enriquecimento das células ocorreu utilizando o sistema de captura de células produtoras de IFN-γ CliniMACS (Miltenyi Biotec). As células obtidas na 20 seleção por IFN-γ foram criopreservadas em duas doses (1,3x104 e 3,3x104 linfócitos CD3/kg do receptor). As células foram infundidas após o resultado negativo das culturas microbiológicas e a pureza média das células obtidas no sistema de captura foi de 41,7%. No total, 18 pacientes receberam as células selecionadas e todos receberam dose única de células, a segunda dose não foi necessária. O número 25 médio de células infundidas foi cerca de 2840 CD4/kg (280-6880 CD4/kg) e 630 CD8/kg (60-3990 CD8/kg). Nenhuma toxicidade infusional foi detectada, cinco pacientes desenvolveram DECH/GvHD grau I e responderam ao uso tópico de corticosteroides. Outros 2 pacientes desenvolveram DECH/GvHD grau II e III e receberam tratamento oral e endovenoso. 30 Meij e seus colaboradores (Meij et al., 2012) cultivaram células de sangue periférico em meio de cultura IMDM, suplementado com L-glutamina, antibióticos e 10% de soro AB humano. Estas células foram cultivadas na concentração de 1x107 cel./mL na presença de peptídeos pp65 do capsídeo do hCMV
(1 mg/mL). Após incubação por 12 h, as células foram capturadas utilizando o CliniMACS Cytokine Capture System (IFN-γ) (Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, Germany). Após a captura, as células ainda foram cultivadas com meio de cultura e IL-2 por 14 dias. Seis células geradas neste sistema foram infundidas nos pacientes 5 transplantados com reativação por hCMV. Os pacientes receberam uma variação nas doses de 0,9x104 – 3,1x105 T cel./kg administradas por via endovenosa e esses 6 pacientes responderam ao tratamento. Os pacientes não apresentaram nenhum efeito adverso grave ou DECH/GvHD. Leen e seus colaboradores (Leen et al., 2013) utilizaram um vetor 10 adenoviral carregando a proteína pp65 do hCMV. As células dendríticas/monócitos foram transfectadas com este vetor, colocadas em cultura com linfócitos de doadores CMV, EBV e Adenovírus positivos e depois estas células foram congeladas. A intensidade de resposta ao CMV das células expandidas foi medida através do ensaio de ELISPOT para todos os vírus específicos. Neste protocolo, 50 pacientes foram 15 tratados para CMV, EBV e adenovírus, sendo 23 para CMV. Dos 23 pacientes, 17 eram do sexo masculino e a compatibilidade HLA foi parcial. Também se analisou 6 alelos e o número de células infundidas foi cerca de 1x104 cel./kg). Dos 23 pacientes incluídos, 5 morreram por causas não relacionadas a infusão das células e 18 pacientes que permaneceram vivos responderam ao tratamento. A resposta contra o 20 CMV foi avaliada in vitro pela resposta das células do sangue periférico dos pacientes. A infusão foi bem tolerada, sem reações no momento da infusão e GvHD grau I ocorreu em 2/50 pacientes parcialmente compatíveis e 3rd party (nem do paciente, nem do doador de medula). Pei e seus colaboradores (Pei et al., 2017) utilizaram células de 25 doadores de sangue CMV positivos. As células foram cultivadas com IFN-γ 1.000 UI/mL, seguida pela adição de 500 UI/mL de IL-2 e anti-CD3 (100 ng/mL). Após 4 dias de cultura, o pool de 138 peptídeos sintéticos do capsídeo viral do hCMV (pp65) foi adicionado à cultura. Dois dias mais tarde, foi realizado um segundo estímulo com peptídeos. As células foram expandidas in vitro por outros 6-10 dias. As células 30 expandidas foram selecionadas pelo sistema automático de captura de células (CSS) (Miltenyi Biotec). A dose de células infundidas por via endovenosa foi em média 4x105/kg para CD8 e 3x103/kg para CD4. Estas células foram infundidas em 32 pacientes refratários ao tratamento antiviral e com reativação por hCMV após
transplante de medula óssea. As células na sua maioria eram dos doadores de células do transplante, então a compatibilidade era total ou parcial. Dos pacientes que receberam as células, apenas 1 paciente desenvolveu DECH/GvHD grau II 2 semanas após a infusão das células, entretanto este paciente já estava com DECH/GvHD grau 5 I antes da infusão. Dos 32 pacientes tratados, 3 pacientes morreram após a infusão das células hCMV-específicas por causas não relacionadas às células infundidas, como recaída de doença, falha de enxertia e infecção bacteriana. Dos 32 pacientes tratados, 27 apresentaram resposta completa. Em Whiters et al., 2017, utilizou-se células de doadores de sangue CMV, 10 adenovírus (ADV) e Epstein-Barr (EBV) positivos. As células destes doadores de sangue foram utilizadas para a criação de um banco de 46 células monovalentes, sendo 17 hCMV, 14 EBV e 15 ADV. Células dendríticas derivadas dos monócitos dos dadores foram geradas e pulsadas com MACS GMP PepTivators (Miltenyi Biotec) pool de hCMV pp65, AdV5 Hexon ou EBV BZLF1/LMP2A/EBNA-1. As células foram 15 cultivadas por até 21 dias e reestimuladas com o peptídeo específico no dia 7 de cultivo e as culturas também foram suplementadas com IL-2. Após o cultivo, as células foram congeladas. Os participantes foram tratados com células parcialmente compatíveis com a dose aproximada de 1x104/Kg por via endovenosa e a compatibilidade foi parcial de até 1 em 6 alelos para HLA A, B e C. Dos 30 pacientes 20 incluídos no estudo, a grande maioria (28) foi tratada para a reativação por hCMV e apenas 1 para ADV e outro para EBV. Os pacientes foram infundidos com diferentes doses das células, sendo que 17 pacientes receberam dose única, 9 pacientes receberam 2 doses, 2 pacientes receberam 3 doses e 2 pacientes receberam 4 doses. Nenhum paciente apresentou toxicidade imediata à infusão das células. Um paciente 25 foi internado 24 h após a infusão com febre, mas se determinou que foi devido a contaminação do cateter central por bactérias. Os pacientes foram acompanhados por 12 meses e nenhum efeito adverso foi atribuído à infusão dos linfócitos. A maior causa de problemas não relacionados a infusão das células foram relacionados à infecção ou recaída de doença. GvHD agudo ocorreu em 2 pacientes, 1 paciente desenvolveu 30 grau II GvHD, mas foi tratado e respondeu ao tratamento, e o outro paciente que recebeu as células para ADV-específicas desenvolveu GvHD e morreu da infecção por adenovírus. Dos 27 pacientes tratados, 26 responderam ao tratamento com reposta total ou parcial.
Kallay e seus colaboradores (Kallay et al., 2018) coletaram linfócitos de doadores por leucaferese e os estimularam. As células foram submetidas a separação utilizando o equipamento CliniMACS PRODIGY Cytokine Capture System (IFN-γ; CCS). Os linfócitos foram obtidos pela captura de células secretando IFN-γ mediante 5 estímulo específico com pp65 para o hCMV. Neste protocolo foram tratados 9 pacientes pediátricos, sendo 4 do sexo feminino e 5 do sexo masculino. Entretanto, apenas 3 pacientes foram tratados para CMV, os outros pacientes foram tratados para EBV e adenovírus. O número de células infundidas foi 9,9x103/kg (variando entre 6,7 e 25) de CD4 e 32,6x103/kg (variando entre 16-125) de CD8. Neste protocolo não foi 10 observado nenhum caso de rejeição, DECH/GvHD ou recidiva de infecção. O documento US 2005/0221481 refere-se a um método de expansão ex vivo de células T neonatais de sangue de cordão umbilical que compreende a obtenção de células mononucleares de uma amostra de sangue de cordão umbilical e, em seguida, a cultura das referidas células mononucleares em um meio de cultura 15 privado de soro e suplementado com várias combinações de citocinas incluindo fator de células-tronco (SCF), interleucina-7, interleucina-4 e interleucina-2. Esses resultados indicaram que é possível, através da modulação das citocinas adicionadas às culturas, expandir subtipos específicos de linfócitos T para imunoterapia adotiva sem perder as células progenitoras mieloides necessárias para a recuperação de 20 neutrófilos após o transplante de sangue do cordão umbilical. O documento EP 2718426 refere-se a um método para geração de preparações de linfócitos T que são específicos para pelo menos um antígeno alvo, compreendendo as etapas de expansão de células linfoides in vitro na presença de um antígeno alvo ou fragmentos peptídicos do mesmo em uma etapa de expansão, 25 isolando células que secretam IFN-γ, IL-2 ou TNF-α ou expressem os marcadores de ativação CD137 ou CD40L. Após seleção cultivando essas células na presença de IL- 2 ou IL-7, sendo outros exemplos a IL-15 ou IL-21, com preferência para a combinação de IL-2 e IL-7 e um inibidor do complexo 1 de mTOR (Rapamicina). O documento WO 2009/053109 trata de um método para a geração de 30 preparações de linfócitos T antígeno-específicos para terapia adotiva, compreendendo as etapas de obtenção de células linfoides da medula óssea de um paciente em uma primeira etapa de estimulação, onde as células são incubadas com os antígenos de interesse e seguida da etapa de seleção das células estimuladas que
secretam IFN-γ, IL-2 ou TNF-α ou que são positivas para um tetrâmero relacionado ao antígeno alvo. As células selecionadas são submetidas a uma segunda etapa de expansão das células linfoides em meio de cultura celular ex vivo em a presença de IL-2 e/ou IL-7 e um ou mais antígenos. 5 Apesar do crescente interesse no desenvolvimento de metodologias para a expansão de linfócitos T citotóxicos que podem ser utilizados como referência adotiva de imunidade para o tratamento da infecções virais em pacientes imunossuprimidos, os métodos disponíveis até o presente momento apresentam características indesejáveis como a forma de obtenção, custo e a baixa 10 disponibilidade dos materiais de partida; o uso dos vírus vivos inteiros ou vetores virais, comprometendo a segurança do método; a necessidade de co-cultura de linfócitos com outras células, como células dendríticas e células apresentadoras de antígenos (APCs); a não utilização de IL-7 e/ou ausência re-estímulo na etapa de expansão ou até mesmo a ausência da etapa de expansão, o que diminui a eficiência 15 do método em relação ao número de células produzidas e em relação à pureza celular obtida; a ausência de seleção que compromete a segurança e especificidade dos linfócitos obtidos; a utilização de tipagem HLA-1 de baixa resolução que pode comprometer a eficiência do tratamento dada a rejeição do linfócito pelo paciente. Neste cenário, permanece a necessidade de se desenvolver uma 20 metodologia de expansão de linfócitos eficiente, vírus-específica e segura, assim como de um produto eficiente e seguro para tratar pacientes transplantados de medula óssea acometidos por infecção hCMV visando a redução do período de internação dos pacientes, diminuindo a morbidade e a mortalidade dos mesmos, além da redução de custos em saúde. 25 Com base no acima exposto, o objetivo da presente invenção é fornecer uma metodologia de expansão de linfócitos T específicos para hCMV mais eficiente, vírus-específica e segura para tratar pacientes transplantados de medula óssea que não respondem as terapias convencionais como aos antivirais, utilizando células que sejam capazes de responder especificamente a infecção do paciente por hCMV que 30 não é capaz de combater a infecção e reduzir o tempo de internação dos mesmos. Assim, os inventores conseguiram surpreendentemente superar o problema do estado da arte e desenvolveram uma metodologia de expansão de linfócitos T hCMV-específicos a partir de células linfomononucleares obtidas por
aférese de doadores de plaquetas saudáveis que são imunes ao hCMV e que foram isoladas do buffy-coat (concentrado celular) do kit de coleta, através de estímulos sucessivos com um pool de peptídeos derivados da fosfoproteína 65 (pp65) do capsídeo do hCMV em presença das citocinas IL-2 e IL-7, e selecionados de acordo 5 com sua capacidade de secretar interferon-γ (IFN-γ) em resposta ao estímulo dos peptídeos pp65 para o qual foram primados, ou seja, expostos em cultura. Os linfócitos obtidos pelo método da presente invenção podem ser expandidos por tempo prolongado e criopreservados, podendo ser utilizados no tratamento de diferentes pacientes transplantados de medula óssea que não respondem as terapias 10 convencionais, desde que sejam HLA de classe I relacionados. Os inventores ainda acreditam que a presente invenção será base para o desenvolvimento de terapias contra outras viroses e, futuramente, será base para terapias alternativas para o tratamento das reativações virais no contexto do transplante de medula óssea e imunossupressão. 15 DESCRIÇÃO RESUMIDA DA INVENÇÃO A presente invenção está relacionada a um método de expansão de linfócitos vírus-específicos. A presente invenção também está relacionada a uma composição que compreende linfócitos vírus-específicos e ao uso dessa composição para a fabricação 20 de uma terapia celular. BREVE DESCRIÇÃO DAS FIGURAS A Figura 1 identifica as subpopulações de leucócitos (%) presentes no material de partida após processamento (n=5). A Figura 2 representa a análise por citometria de fluxo das populações 25 leucocitárias presentes dentre as células isoladas do pião: (A) mostra a seleção de células CD45 (leucócitos) versus granulosidade; (B) mostra a seleção de linfócitos T (CD3+), linfócitos B e células Natural Killer (NK) (CD3-); (C) mostra a separação dos linfócitos T nos subtipos CD8 e CD4 (subpopulações de linfócitos T); (D) mostra a seleção dos linfócitos B (CD19+) dentro das células CD3-; e (E) mostra a seleção das 30 células NK (CD16+CD56+) dentro das células CD3-. A Figura 3 demonstra a viabilidade das células isoladas após separação por Ficoll-PaqueTM (n=5). A Figura 4A-C mostra a validação do número inicial de células e dose de
citocinas para a expansão das células. (A) Ensaio de proliferação de linfócitos T CD4 com diferentes concentrações de citocinas. (B) Ensaio de proliferação de linfócitos T CD8 com diferentes concentrações de citocinas. (C) Ensaio de proliferação de linfócitos com diferentes concentrações celulares (IL-2500 UL/mL + IL-710 ng/mL). 5 A Figura 5A-D mostra graficamente o padrão de expansão de leucócitos e a detecção de metabólitos nos biorreatores Xuri e G-REX durante 15 dias. (A) Expansão dos leucócitos. (B) Avaliação de pH. (C) Avaliação de glicose. (D) avaliação de lactato. A Figura 6A-D mostra graficamente o padrão de subpopulações de 10 linfócitos nos biorreatores Xuri e G-REX durante 15 dias. (A) Linfócitos CD3+. (B) Linfócitos CD3/CD8+ (CTLs). (C) Linfócitos de Memória CD3+CD45RO+CD45RA-. (D) Linfócitos naïve CD3+CD45RA+CD45RO-. A Figura 7A-B mostra a comparação entre as células selecionadas (TCB do inglês, target cell bag) nos sistemas de coluna e sistema PRODIGY. (A) Número 15 total de células obtidos nos dois sistemas. (B) Percentagem de linfócitos T CD3 obtidos nos dois sistemas. A Figura 8 mostra dados analisados de pureza dos TCBs de coluna manual e sistema CliniMACS PRODIGY. A Figura 9A-B mostra a média de linfócitos T (CD3) e linfócitos T CD3 20 positivos para INF-γ nas frações depletadas (NTCB - do inglês, non target cell bag) e selecionas (TCB) capturados pelo sistema CliniMACS PRODIGY. A Figura 10A-D demonstra a análise de células após o ensaio de captura por IFN-γ. NTCB - Análise da fração celular descartada no ensaio de captura. (A) Seleção das células por SSC vs. FSC. (B) Seleção de outras células pela ausência da 25 marcação de CD3 (21%), seleção dos linfócitos T pela expressão do CD3 (78,4%) e a seguir dos linfócitos T CD4 (48,6%) e CD8 (50,2%). (C) Seleção dos linfócitos T secretando INF-γ CD4 (0,44%) e CD8 (0,20%). (D) Seleção dentro de outras células: monócitos (30,4%), NK (36,4%) e linfócito B (21,8%). TCB - Análise da fração celular enriquecida no ensaio de captura. (A) Seleção das células por SSC vs. FSC. (B) 30 Seleção de outras células pela ausência da marcação de CD3 (6,52%), seleção dos linfócitos T pela expressão do CD3 (92,7%) e a seguir dos linfócitos T CD4 (33,7%) e CD8 (59,7%). (C) Seleção dos linfócitos T secretando INF-γ CD4 (99,2%) e CD8 (33,7%). (D) Seleção dentro de outras células: monócitos (32,6%), NK (13,5%) e
Linfócito B (31,5%). A Figura 11A-F demonstra a análise realizada pelo Laboratório de Patologia Clínica de células após o ensaio de captura por INF-γ. TCB - Análise da fração celular enriquecida no ensaio de captura. (A) Seleção das células por FSC-H 5 vs. FSC-A. (B) Seleção de outras células marcadas para CD45 - Leucócitos (80,1%). (C) Seleção das células viáveis pela exclusão de células marcadas com 7-AAD (74,4%) e a seguir (D) seleção dos linfócitos pela expressão de CD3 (99,5%), a seguir (E) dos linfócitos T CD4 (4,7%) e CD8 (92,2) e (F) Seleção dos linfócitos T (CD3) secretando INF-γ (100%). 10 A Figura 12 demonstra a análise de morte celular com Iodeto de propídeo por citometria de fluxo do produto. (A) Distribuição das células por tamanho (FSC) vs. granulosidade (SSC). (B) Variação da percentagem de células viáveis (iodeto de propídeo negativas) de acordo com o tempo de descongelamento das células do Doador 15IVN9083 que estavam congeladas por cerca de 7 dias. (C) 15 Variação da percentagem de células viáveis (iodeto de propídeo negativas) de acordo com o tempo de descongelamento das células do Doador 18FS4945 que estavam congeladas por cerca 6 meses. (D) Variação da percentagem de células viáveis (iodeto de propídeo negativas) de acordo com o tempo de descongelamento das células do Doador 24MAPM6923 que estavam congeladas por cerca 11 meses.20 A Figura 13 mostra o resultado do ELISpot do produto: B300121394945- doador: 18FSH4945. A Figura 14 mostra o resultado do ELISpot do produto: B300121391223- doador: 59TPAA1223. A Figura 15 mostra o resultado do ELISpot do produto: B300121327279- 25 doador: 60GDD2727. A Figura 16 mostra o resultado de citometria de fluxo referente à percentagem de fibroblastos MCR-5 positivos para infecção com CMV. A Figura 17 retrata a produção específica de IFN-γ pelos linfócitos T em co-cultivo de 24 e 48 h com fibroblastos infectados com a cepa AD169 do 30 citomegalovírus. Produto: B300121394945/Doador: 18FSH4945. A Figura 18 detalha a percentagem de morte de MCR-5 por linfócitos T de 3 produtos após 48 h em cultura. DESCRIÇÃO DETALHADA DA INVENÇÃO
A presente invenção está relacionada a um método de expansão de linfócitos vírus-específicos, que compreende as etapas de: (I) pré-expansão a partir de uma amostra de células linfomononucleares, que compreende as etapas de: 5 (a) separação das células mononucleares do sangue periférico (PBMCs); (b) centrifugação e descarte do sobrenadante; e (c) ressuspensão das PBMCs; (II) expansão das células in vitro, 10 (III) seleção de linfócitos positivos para INF-γ. Em uma realização preferencial, o método de expansão de linfócitos vírus-específicos compreende adicionalmente a etapa de (IV) congelamento a -80 °C. Em uma outra realização preferencial, a(s) amostra(s) de células linfomononucleares é(são) obtida(s) do buffy-coat (concentrado celular) gerado na 15 doação de plaquetas por aférese, que ficam retidas no centro do kit de coleta. Preferencialmente, as células linfomononucleares são obtidas partir de uma amostra de sangue total. Mais preferencialmente, o doador de plaquetas adequado para a presente invenção é imune ao hCMV (IgM negativo, IgG positivo). Particularmente, o referido doador é um doador regular de plaquetas. 20 Para a realização da etapa de separação (a), pode-se utilizar técnicas de separação corriqueiras. Em uma realização preferencial, a etapa (a) de separação das células mononucleares do sangue periférico (PBMCs), a partir da amostra, é realizada por gradiente de separação. Preferencialmente, a etapa (a) é seguida de uma etapa de contagem de 25 células e verificação de viabilidade das células, em que os critérios de aceitação da amostra são um número de pelo menos 6x108 células totais e de pelo menos 90% de viabilidade, tal qual de 90% a 100%. A contagem das células e a análise da viabilidade celular pode ser realizada de acordo com diversos protocolos e equipamentos disponíveis na técnica, como por exemplo, por meio de microscopia, diluição seriada, 30 contagem automática em leitor de hemograma, coloração e citometria de fluxo. A partir da amostra obtida em (a), realiza-se a etapa (b) de centrifugação e descarte do sobrenadante. Na etapa (c), parte da amostra obtida na etapa (b) é ressuspendida em
meio de cultura e/ou tampão, como por exemplo, mas não limitado a tampão-fosfato salino (PBS), e o restante da amostra é ressuspendido em solução crioprotetora para congelamento entre -75 °C e -95 °C. Em uma realização preferencial, a solução crioprotetora compreende Voluven® 6% ou uma mistura de hidroxietilamido e cloreto 5 de sódio 6%, albumina humana 20% e dimetilsulfóxido (DMSO). Em uma realização ainda mais preferencial, a solução crioprotetora compreende 50% de Voluven® 6%, ou uma mistura de hidroxietilamido e cloreto de sódio 6%, 40% de albumina humana 20% e 10% dimetilsulfóxido (DMSO), em relação ao volume total da solução crioprotetora. 10 Em uma realização preferencial, a etapa (II) de expansão das células in vitro compreende as etapas de: (d) inoculação das células obtidas na etapa (I) em biorreator compreendendo meio de cultura compreendendo IL-2 e IL-7 a uma temperatura de 37ºC+1oC (podendo ter variações maiores no momento da coleta de amostras 15 destinadas as análises aqui descritas), pH entre 7,0 e 7,5 e 5% de CO2; (e) estimulação das células com o peptídeo do capsídeo do vírus hCMV; e (f) reestimulação das células com o peptídeo do capsídeo do vírus hCMV e células PBMC da mesma amostra previamente congeladas na etapa (c). 20 Preferencialmente, a etapa (II) do método compreende ainda a etapa de: (g) adição de meio de cultura em volume adequado para manutenção da concentração celular. Mais preferencialmente, a etapa (II) do método compreende ainda a(s) etapa(s) de: 25 (h) avaliação do número de linfócitos T e da viabilidade das células, em que a expansão é considerada adequada quando o número de linfócitos final for pelo menos o dobro do número de linfócitos inicial e a viabilidade for de pelo menos 80%; e/ou (i) redução do volume de cultura, em que a redução é preferencialmente 30 realizada por filtração, centrifugação e/ou extrator de plasma. Demais técnicas para a redução do volume de cultura também são conhecidas da técnica e podem ser empregadas de forma alternativa e/ou conjunta com as técnicas de filtração, centrifugação e/ou extrator de plasma.
O biorreator pode ser um sistema aberto ou fechado. Preferencialmente, o biorreator é um sistema fechado. Em uma realização preferencial, o cultivo celular é realizado a uma temperatura preferencial de 37 ºC+1oC (podendo ter variações maiores no momento da coleta de amostras destinadas as análises aqui descritas), 5 mais preferencialmente a uma temperatura de 37°C. O cultivo celular pode ocorrer em pH neutro. Em uma realização preferencial, o pH está entre 7,0 e 7,5. Em uma realização preferencial, a concentração de CO2 do cultivo celular em biorreator é mantida estável. Preferencialmente, a concentração de CO2 é de 5% (v/v). Em uma realização preferencial, a etapa (e) de estimulação das células 10 com o peptídeo do capsídeo do vírus hCMV é realizada com o peptídeo pp65 do vírus hCMV (UniProt ID: P06725). Ainda mais preferencialmente, a estimulação das células com o peptídeo do capsídeo do vírus hCMV é realizada com o peptídeo PepTivator CMV pp65 obtido comercialmente da Miltenyi Biotec®. O PepTivator CMV pp65 é um pool de peptídeos que consiste principalmente em 15-mers com sobreposição de 11 15 aminoácidos (aa), cobrindo a sequência completa da proteína pp65 do citomegalovírus (UniProt ID: P06725). Preferencialmente, a etapa (f) de reestimulação das células é realizada através de estímulos sucessivos com o peptídeo do capsídeo do vírus hCMV e com as células PBMC da mesma amostra previamente congeladas na etapa (c), seguida 20 da adição de meio de cultura em volume adequado para manutenção da concentração celular e da (h) avaliação do número de linfócitos T e a viabilidade das células, em que a expansão é considerada adequada quando o número de linfócitos final for pelo menos o dobro do número de linfócitos inicial e a viabilidade for de pelo menos 80%. Em uma realização preferencial, a etapa (i) de redução do volume de 25 cultura é seguida de uma etapa adicional de amostragem para contagem de células, análise de viabilidade e análise de cariótipo; e/ou realização de ensaio de esterilidade. Os ensaios de esterilidade podem avaliar a presença de microrganismos aeróbicos e anaeróbicos, como por exemplo Mycoplasma pneumoniae. Ainda, podem ser realizados testes de endotoxina. Estão disponíveis na técnica diversas metodologias 30 para análise de cariótipo e realização de teste de esterilidade e de endotoxina que são conhecidas dos profissionais da área. Preferencialmente, a determinação de viabilidade e contagem de células utiliza-se o equipamento Contador de Células Automático Countess II (Thermo
Fisher), em que as células são coradas com azul de tripan 0,4%, transferidas para lâmina descartável e contadas automaticamente pelo equipamento. A contagem também pode ser feita no equipamento ABX Micros ES60 (Horiba) ou por microscopia. Em outra realização preferencial, a viabilidade celular é determinada por citometria de 5 fluxo. Em uma realização preferencial, a análise de cariótipo é feita através da cariotipagem de 10 metáfases e análise das demais, podendo ou não ser realizada hibridização in situ de fluorescência (FISH - do inglês, “fluorescent in situ hybridization”). Preferencialmente, caso anormalidades sejam encontradas, mais 10 10 metáfases são analisadas. Em uma realização preferencial, o teste de esterilidade é feito através da submissão das amostras celulares a testes microbiológicos podendo ser complementados por teste de pirogenicidade por meio da avaliação de endotoxinas. Diversos testes de esterilidade são conhecidos da técnica e podem ser usados de 15 forma alternativa ou aditiva para a comprovação da segurança da metodologia, da composição e do produto obtido pelo método da presente invenção. Preferencialmente, os testes microbiológicos são realizados em frascos Bactec (BD), os quais são acrescidos de meios para o crescimento de microrganismos específicos: BD Bactec plus aerobic medium (para microrganismos aeróbicos), BD Bactec plus 20 anaerobic medium (para microrganismos anaeróbicos) e BD Bactec Myco/F Lytic (para microrganismos especiais). Particularmente, os testes são realizados no equipamento BD Bactec FX. Preferencialmente, para os frascos Myco-F, o tempo de incubação é de 42 dias. Alternativa ou conjuntamente, as amostras também podem ser 25 analisadas através do teste de esterilidade compendial em meios fluidos de tioglicolato (THIO) e caldo de caseína-soja (TSB) cultivados por 14 dias. As condições específicas para cada meio são conhecidas de um técnico no assunto e fazem parte das atividades rotineiras de um laboratório. Preferencialmente, as amostras incubadas em meio THIO são cultivadas a 32,5±2,5°C por 14 dias e as amostras incubadas em meio 30 TSB são cultivadas a 22,5±2,5°C por 14 dias. Em uma realização preferencial, o teste de endotoxina é realizado através do equipamento Endosafe nexgen-PTS (Charles River) e os resultados são analisados no software LIMS ou Charles River Cortex. O critério de aceitação em
unidades internacionais é de < 5 UI/mL. Em uma realização preferencial, o teste de contaminação por Mycoplasma pneumoniae é realizado por biologia molecular. Preferencialmente, o DNA das amostras de meio de cultura inicial e final são extraídos utilizando o kit DSP 5 Virus/Pathogen mini kit da Qiagen (número de catálogo 937036) e os ácidos nucléicos podem ser usados diretamente para a análise por PCR. O processo de RT-PCR pode ser realizado de forma automatizada com a utilização do Universal Disc (Focus) e as amostras podem ser processadas no equipamento 3M Integrated Cycler (Focus/3M). Em uma realização preferencial, a etapa (III) compreende as etapas de 10 (j) captura de células produtoras de INF-γ em sistema de captura, (k) opcionalmente, o enriquecimento das células positivas para INF-γ; e (l) imunofenotipagem celular por citometria de fluxo. A captura de células produtoras de INF-γ podem ser realizadas em sistema aberto e/ou fechado. Ainda a captura pode ser realizada de forma manual ou 15 automática. Em uma realização preferencial, a etapa (j) de captura de células produtoras de INF-γ em sistema de captura é realizada em sistema aberto e manual. Em outra realização preferencial, a etapa (j) de captura de células produtoras de INF- γ em sistema de captura é realizada em sistema fechado e automático. Demais 20 técnicas de captura de células são conhecidas da técnica e podem ser utilizadas de forma alternativa a técnica aqui descrita. Preferencialmente, a captura em sistema aberto e manual é realizada após expansão de células específicas para CMV em biorreator, através do isolamento das células produtoras de IFN-γ utilizando o kit de detecção e enriquecimento de 25 células secretoras de IFN-γ (MACS Miltenyi Biotec) por meio de uma coluna LS descartável (Miltenyi Biotec). Preferencialmente, é realizada nova separação em outra coluna LS para garantir a pureza e enriquecimento de células positivas para IFN-γ (etapa (k)). O resultado da seleção positiva é a fração TCB, e as células não selecionadas ficam na fração NTCB. 30 Preferencialmente, a captura em sistema fechado e automático é realizada após expansão de células específicas para CMV em biorreator, através do equipamento CliniMACS PRODIGY (Miltenyi Biotec). O equipamento realiza de forma estéril e automática a seleção (enriquecimento) de células positivas para IFN-γ e a
separação das frações com células descartadas e com células enriquecidas em bolsas de controle de qualidade. Em uma realização preferencial, a etapa (l) de imunofenotipagem celular é feita por citometria de fluxo quanto à expressão de IFN-γ para verificação das 5 populações celulares isoladas e depletadas. Em uma realização preferencial, são utilizados marcadores celulares no painel: 7-Actinomicina D (7-AAD para viabilidade celular), e para as populações celulares os anticorpos: CD45, CD3, CD4, CD8, CD11b e INF-γ, em que os anticorpos são qualificados através de titulação para verificar sua função e especificidade. Demais técnicas de imunofenotipagem celular são 10 conhecidas da técnica e podem ser utilizadas de forma alternativa a técnica aqui descrita. Preferencialmente, no final da seleção o TCB apresenta um valor acima de 80% de células IFN-γ positivas e acima de 80% de linfócitos T com viabilidade também acima de 80%. Em uma realização preferencial, o sobrenadante da fração NTCB é 15 encaminhado para testes microbiológicos de cultura aeróbica, anaeróbica, de fungos e de microrganismos especiais, conforme descrito acima. Adicionalmente, o sobrenadante pode ser encaminhado para realização de teste de endotoxina e para o teste de esterilidade. O sobrenadante da fração TCB pode ser enviado para testes sorológicos, incluindo, mas não limitados a sorologia, NAT, PCR e hibridização in situ, 20 podendo incluir também testes de impurezas por meio da quantificação de IL-2 e IL-7 no sobrenadante das células e teste de potência, por exemplo, por meio quantificação de IFN-γ no sobrenadante do co-cultivo de linfócitos hCMV específicos e fibroblastos infectados por hCMV. Diversos testes sorológicos estão disponíveis na técnica e fazem parte 25 das atividades rotineiras de um profissional da área como o teste NAT, do inglês “Nucleic Acid Test”. Particularmente, a amplificação e detecção dos ácidos nucleicos podem ser feitas por reação em cadeia da polimerase (PCR, do inglês “polymerase chain reaction”). A técnica pode ser utilizada para qualquer patógeno de genoma conhecido, incluindo, mas não limitado a: vírus da imunodeficiência humana (HIV), 30 vírus linfotrópico da célula T humana (HTLV-I), vírus da hepatite C (HCV), vírus da hepatite B (HBV), citomegalovírus (CMV), vírus Epstein–Barr (EBV), parvovírus B19, Mycoplasma pneumoniae etc. O NAT pode ser realizado de forma manual ou automática. Também estão disponíveis comercialmente kits para a realização de NAT
para um ou mais patógenos de interesse. De forma alternativa ou complementar, a segurança dos linfócitos ao final de cada etapa do método da presente invenção pode ser avaliada por sorologia tradicional que investiga a presença ou ausência de anticorpos nas amostras. Em uma realização preferencial, as amostras de 5 sobrenadante do TCB são analisadas por sorologia NAT para HIV, HTLV-I, HCV, HBV e por PCR para CMV, EBV e Parvovírus B19 e Mycoplasma pneumoniae. Em uma realização preferencial, a etapa (IV) de congelamento das frações TCB e NTCB é realizada em solução crioprotetora e as células são mantidas em freezer a -80 ºC. Em uma realização preferencial, o método compreende ainda 10 uma etapa (V) de descongelamento. Ainda mais preferencialmente, a etapa de descongelamento acontece em uma temperatura de 20 a 40 °C, preferencialmente de 37 ºC+1oC (podendo ter variações maiores no momento da coleta de amostras destinadas as análises aqui descritas). Em uma realização preferencial, os linfócitos descongelados são selecionados por compatibilidade HLA e infusionados no paciente 15 por via endovenosa. A presente invenção também está relacionada a uma composição que compreende linfócitos T vírus-específicos e um ou mais componentes adicionais. Particularmente, a composição é uma composição farmacêutica. A expressão “composição farmacêutica” designa uma preparação que se encontra em uma forma 20 que permite que a atividade biológica de um ingrediente ativo nela contido seja efetiva. Preferencialmente, os linfócitos T vírus-específicos contidos na composição são obtidos pelo método da presente invenção. Ainda mais preferencialmente, os componentes adicionais compreendem, mas não estão limitados a um veículo farmaceuticamente aceitável, uma mistura de hidroxietilamido e cloreto de sódio 6%, 25 Voluven 6%, albumina humana 20%, dimetilsulfóxido (DSMO) e suas misturas. A expressão “veículo farmaceuticamente aceitável” designa um ingrediente em uma composição farmacêutica, diferente do ingrediente ativo, que é atóxico para o paciente. A definição de veículo farmaceuticamente aceitável inclui, mas sem limitações, tampão, excipiente, estabilizante ou conservante e são 30 conhecidos da técnica. Os profissionais da área são altamente capazes para determinar o veículo farmaceuticamente aceitável para cada composição e finalidade. De forma adicional, a presente invenção está relacionada ao uso de uma composição que compreende linfócitos T vírus-específicos e um ou mais
componentes adicionais para a fabricar uma terapia celular para tratar infecções virais. Preferencialmente, as infecções virais são selecionadas dentre citomegalovírus humano (hCMV), adenovírus, Epstein-barr (EBV), poliomavírus (vírus BK) e human herpesvirus 6 (HHV-6). 5 Preferencialmente, os pacientes a serem tratados são pacientes transplantados de medula óssea que não respondem as terapias convencionais como os antivirais. Preferencialmente, o grau de qualidade dos reagentes é grau clínico ou GMP (do inglês, Good Manufacturing Practice), cumprindo as Boas Práticas de 10 Produção e podendo ser produzidos em conformidade com o sistema de qualidade ISO 13485, com as normas determinadas pela Agência Nacional de Vigilância Sanitária (ANVISA) e/ou com as normas determinadas pela Food and Drug Administration (FDA) para dispositivos médicos (medical device). DEFINIÇÕES 15 Salvo indicação em contrário, os termos usados no presente pedido devem ser entendidos de acordo com uso convencional pelos técnicos no assunto. O termo “terapia celular”, conforme ora utilizado, é intercambiável com o termo “medicamento”, e pode ser compreendido como um produto usado para tratar doenças por meio da alteração ou restauração das células que podem ou não ser do 20 paciente em tratamento. Por “medicamento” ou “terapia celular”, deve-se entender a matéria da presente invenção em qualquer forma farmaceuticamente aceitável, podendo ser uma forma sólida ou líquida; exemplos não limitativos são comprimidos, cápsulas, solução, suspensão, entre outros. O termo “aférese” está relacionado à separação dos componentes do 25 sangue por centrifugação, por meio de um equipamento automatizado. O sangue do doador é captado e a máquina separa os componentes de interesse. O sangue retorna ao organismo do doador pelo mesmo acesso venoso e o material coletado passa por testes sorológicos. Durante a doação de plaquetas por aférese existe acúmulo de células linfomononucleares em um compartimento localizado na região central do kit 30 de coleta, a qual nós denominamos de “pião”. Neste compartimento, o volume de sangue acumulado varia ente 8 e 10 mL, que após diluição, pode resultar em volume médio de 30 mL e o número de células presentes no compartimento é em média 6,6x107 /mL, sendo o número total de leucócitos em média de 2x109 com cerca de
79% de linfócitos, enquanto a taxa de linfócitos em uma amostra de sangue total é de cerca de 30%. Além da alta taxa de linfócitos na amostra, o material de partida coletado no pião não envolve o custo da doação, pois se trata de material de descarte do procedimento de doação de plaquetas. Ainda, o material pode ser coletado de 5 forma segura e estéril. Preferencialmente, os doadores são doadores de repetição que possuem histórico de sorologia sequenciais. Ademais, durante o procedimento para doação de plaquetas são realizados o questionário de triagem clínica, a avaliação da triagem e testes sorológicos dos doadores para garantir a saúde e segurança tanto do doador como do receptor do material coletado. 10 O termo “teste sorológico”, como ora usado, refere-se a todo e qualquer teste baseado em sorologia, ou seja, na presença ou ausência de anticorpos específicos a patógenos, assim como dos materiais biológicos e dos patógenos em si, em amostras biológicas, particularmente sangue, para determinar concretamente suas presenças nas amostras. Os materiais biológicos dos patógenos incluindo, mas 15 não limitados a anticorpos, peptídeos, proteínas, ácidos nucleicos e antígenos podem ser identificados por técnicas bem difundidas no estado da técnica como imunocromatografia, imuno-histoquímica, reação em cadeia de polimerase (PCR), hibridização de sondas marcadas, testes imunoenzimáticos como ensaio de imunoabsorção enzimática (ELISA), teste de ácido nucleico (NAT), 20 quimioluminescência, entre outros. O termo “sangue total” está relacionado a uma amostra de sangue em que estão presentes todos os componentes: plasma, glóbulos vermelhos, glóbulos brancos e plaquetas. Os glóbulos brancos, também conhecidos como leucócitos, são as células de defesa que o organismo produz para que o corpo consiga se defender 25 de elementos estranhos que possam representar alguma ameaça e incluem, particularmente as células mononucleares do sangue periférico. O termo “célula mononuclear do sangue periférico” (PBMC), do inglês peripheral blood mononuclear cell, assim como o termo “célula linfomononuclear” se referem a qualquer célula do sangue periférico com um núcleo redondo, consistindo 30 em linfócitos (células T, células B, células Natural Killer (NK)) e monócitos, enquanto os eritrócitos e as plaquetas não têm núcleo, e os granulócitos (neutrófilos, basófilos e eosinófilos) têm núcleos multilobados. O termo “transplante alogênico”, como usado aqui, refere-se ao
transplante no qual as células ou órgãos provêm de outro indivíduo (doador), de acordo com o nível de compatibilidade do material sanguíneo. O termo “estéril” e seus variantes como aqui utilizados se referem a ambientes, objetos ou superfícies nos quais microrganismos estão ausentes ou são 5 incapazes de se reproduzir. Existem diversas técnicas de esterilização de materiais, como autoclave, chama, forno, produtos químicos bactericidas ou bacteriostáticos, radiação UV, ultrafiltração etc., assim como diversas técnicas para verificação de esterilidade adequadas também são conhecidas da técnica. O termo “cerca de” aqui utilizado refere-se a um valor de 5 a 10% para 10 mais ou para menos dos valores aos quais se refere. O termo “viabilidade celular” conforme aqui utilizado se refere à análise das células metabolicamente ativas em uma cultura celular e/ou amostra, a fim de avaliar sua atividade qualitativa e/ou quantitativamente. Diversas técnicas para determinar a viabilidade celular são conhecidas da técnica e podem ser utilizadas de 15 forma alternativa ou concomitante. As “citocinas” são proteínas que regulam a resposta imunológica, incluindo, mas não limitadas as interleucinas e interferon-γ (IFN-γ). As interleucinas (IL) são produzidas pelos leucócitos em resposta a microrganismos e outros antígenos. A IL-2 é o principal fator de estimulação de células T como um fator de 20 crescimento e ativação para todas as subpopulações de linfócitos T. Já a IL-7 é uma citocina que estimula o crescimento e maturação de linfócitos B e ativação de linfócitos T, sendo secretada por células do estroma da medula óssea e do timo. Já ao INF-γ é atribuída a função de atrair os macrófagos, que auxiliam na remoção de restos celulares e promovem a cicatrização e reorganização das áreas com inflamação. O 25 INF-γ é a principal citocina liberada após a indução da resposta imune adaptativa, sendo produzido pelos linfócitos T efetores. Demais estimuladores de linfócitos são conhecidos da técnica e podem ser utilizados de forma alternativa ou concomitante. Dentre eles estão anticorpos anti- CD3 e anti-CD28, que induzem a ativação dos linfócitos T pelo fato do receptor de 30 linfócitos T estar associado aos complexos das moléculas CD3 e CD28. O termo “linfócito naïve” como aqui utilizado corresponde as células T maduras provindas de órgãos linfoides que nunca reconheceram o antígeno ao qual são específicas, ou seja, nunca foram ativadas pelas células apresentadoras de
antígenos (APCs). Conforme aqui utilizado, o termo “expansão de linfócitos” corresponde à expansão clonal de linfócitos. A expansão clonal se inicia pela ativação dos linfócitos através da apresentação do antígeno de interesse por meio das moléculas do 5 complexo de histocompatibilidade de classe II (MHC II) das APCs para os receptores dos linfócitos T (TCRs). Essa apresentação promovida pela APC é chamada de “estímulo”. O reconhecimento do antígeno permite a interação dos complexos de moléculas coestimuladoras e a secreção de citocinas, que por sua vez, garantem a sobrevivência de células T específicas para o antígeno e ativam fatores que 10 promovem a exposição de segmentos gênicos específicos levando a diferenciação celular dos linfócitos subdivididos em subtipos (Th1, Th2 e Th17), que podem ser identificados de acordo com a citocina que mais produzem (INF-γ, IL-4 e IL-17, respectivamente). Na presente invenção, os “estímulos” são preferencialmente realizados pela exposição direta do linfócito a peptídeos do capsídeo viral do 15 citomegalovírus humano que podem ser apresentados via MHC a estes linfócitos pelas células mononucleares e linfócitos B presentes na cultura durante a expansão sob a influência das citocinas IL-2 e IL-7. O termo “cariótipo” conforme aqui utilizado se refere a análise do conjunto cromossômico diploide de uma espécie, representando o número total de 20 cromossomos de uma célula somática. Tipicamente, uma célula humana tem 46 cromossomos. O termo “infusão” conforme aqui utilizado se refere à administração de fluidos endovenosos em pacientes. O termo “produto” conforme aqui utilizado se refere ao produto do 25 método de expansão de linfócitos vírus-específicos da presente invenção, compreendendo os linfócitos vírus-específicos propriamente ditos ou a composição da presente invenção. SELEÇÃO DO DOADOR DE MATERIAL DE PARTIDA A) TRIAGEM CLÍNICA 30 Na presente invenção, a triagem clínica dos doadores é realizada cumprindo a Resolução Diretoria Colegiada - RDC no.214, de 7 de fevereiro de 2018. Brevemente, os doadores devem ser pessoas saudáveis e preencher todos os critérios para doação de sangue: peso acima de 55 kg, hemoglobina (Hb) e
hematócrito (Ht) (sendo o mínimo para mulheres Hb=12,5g/dl e Ht=38% e para homens o mínimo de Hb=13,0g/dl e Ht=39%), pressão arterial dentro dos limites (pressão arterial sistólica entre 120-180 mmHg e pressão arterial diastólica entre 70- 100 mmHg), pulsação entre 50 e 100 bpm, responder o questionário de doação de 5 sangue padrão que podem incluir um ou mais de histórico de saúde, incluindo gestação em curso; histórico de vacinação; histórico de viagens e exposição a agentes infecciosos, histórico de transfusão de hemocomponentes e uso de hemoderivados; histórico de transplante de tecidos, células ou órgãos e xenotransplante etc. O hematócrito (Ht) é a razão entre o volume eritrocitário em relação ao volume total de 10 sangue, sendo expresso em percentagem onde o valor de referência para doação de sangue de a homem adulto é de 39 a 54%, e para uma mulher adulta, de 38 a 48%. A hemoglobina (Hb) pode ser medida em uma amostra de sangue para indicar a capacidade do sangue de transportar oxigênio para os tecidos. Os valores de referência de Hb são: homens: 13 a 18 g/dL e mulheres: 12,5 a 16 g/dL. Os valores 15 de referência podem variar de acordo com os parâmetros e técnicas utilizados. Os doadores aptos a doação e que forem doar o kit de coleta de plaquetas para o estudo do CMV devem assinar um Termo de Consentimento Livre e Esclarecido (TCLE). B) TESTES SOROLÓGICOS Após a doação de plaquetas, o sangue do doador é avaliado quanto à 20 presença de marcadores para doenças infecciosas transmissíveis pelo sangue, segundo critérios determinados na Resolução Diretoria Colegiada - RDC no 214, de 7 de fevereiro de 2018 e demais legislações vigentes: Hepatite B e C, HIV 1 e 2, HLTV I e II, Sífilis e Chagas e NAT para Hepatite B e C e HIV 1 e 2. Como critério de inclusão, apenas os doadores que apresentarem a sorologia negativa 25 para tais doenças são elegíveis para expansão das células. No sangue destes doadores também deve ser avaliada a presença de imunoglubulinas IgM e IgG para CMV e realizada as tipagens HLA de alta resolução e ABO/Rh. Adicionalmente, os doadores devem responder ao questionátionário e avaliação clínica para análise de risco de transmissibilidade de encefalopatias 30 espongiformes (EET). C) TIPAGEM HLA DE ALTA RESOLUÇÃO O termo HLA (do inglês “Human Leukocyte Antigens”) representa um complexo de genes que codifica para proteínas do sistema imunológico únicas para
cada pessoa, que podem compreender loci de HLA I e II distintos. Os principais loci HLA são A, B, C (classe I), DR, DP e DQ (classe II) entre outros, e a resolução da tipagem por métodos de biologia molecular, incluindo sequenciamento, está relacionada à profundidade da análise. A Tipagem HLA de baixa/média resolução 5 identifica o grupo alélico a que o(s) gene(s) pertence(m) e o resultado é baseado em DNA ao nível dos dígitos que compõem o primeiro campo na nomenclatura. Já a tipagem de alta resolução identifica a proteína HLA específica ao nível dos dígitos que compõem os segundo e terceiro campos na nomenclatura baseada em DNA. A tipagem para HLA pode ser feita por amostras de sangue através de 10 sorologia, bioquimica ou PCR/sequenciamento do DNA. O exame de alta resolução é realizado por PCR ou pelo sequenciamento do DNA. D) TIPAGEM ABO/R O sistema ABO é uma classificação do sangue humano em quatro tipos: A, B, AB e O, enquanto o fator Rh é uma classificação do sangue humano de acordo 15 com a presença ou ausência de um grupo de antígenos D encontrados nas membranas das hemácias. A tipagem ABO/Rh é amplamente conhecida da técnica e pode ser realizada por meio de aglutinação em gel para verificar a presença/ausência de antígenos e anticorpos do sistema ABO e do antígeno D do sistema Rh. E) SOROLOGIA PARA CMV 20 A presença ou ausência de imunidade para hCMV pode ser determinada por sorologia ou demais técnicas conhecidas da literatura. Na presente invenção, a sorologia para CMV dos doadores de plaqueta é preferencialmente realizada pela avaliação de anticorpos dos isótipos IgM e IgG contra o vírus CMV. Idealmente, os doadores devem apresentar resultados para IgM não reagente (negativo) e IgG 25 reagente (positivo). A sorologia para CMV pode ser feita a partir de amostras de soro, plasma ou sangue total e através de diversas metodologias quantitativas e/ou qualitativas conhecidas da técnica, como imunocromatografia, ensaio de imunoabsorção enzimática (ELISA) ou quimioluminescência. 30 F) ANÁLISE DE TRANSMISSIBILIDADE DE ENCEFALOPATIAS ESPONGIFORMES (EET) As amostras dos doadores de plaquetas utilizadas na presente invenção são provenientes de doadores de sangue avaliados por meio de triagem clínica ausentes de risco para EET conforme Resoluções Diretoria Colegiada - RDC no214
de 7 de fevereiro de 2018, RDC n°305 de 14 de novembro de 2002 e Portaria 158, 04 de fevereiro de 2016. EXEMPLOS Os Exemplos a seguir não têm a intenção de limitar o escopo das reivindicações da invenção, mas especialmente têm a intenção de ser exemplares de certas realizações. Quaisquer variações dos métodos exemplificados que ocorram a um técnico no assunto têm a intenção ser incluídas no escopo da presente invenção. EXEMPLO 1 – ETAPA (I) DE PRÉ-EXPANSÃO 1.1 ORIGEM E CARACTERIZAÇÃO DO MATERIAL DE PARTIDA Os linfócitos T foram obtidos a partir de células linfomononucleares provenientes do buffy-coat gerado na doação de plaquetas por aférese por doadores de sangue regulares, submetidos ao questionário de triagem clínica, à avaliação de triagem e à assinatura de TCLE, e as amostras foram submetidas a testes sorológicos, tipagem HLA de alta resolução, tipagem ABO/Rh, sorologia para CMV e análise de EET, conforme descritos acima. A amostra de sangue, também denominada material de partida, fica retida no centro do kit de coleta em um compartimento central o qual denominamos “pião”, este compartimento acumula um volume de sangue de 8 a 10 mL. Após a doação de plaquetas, o kit de coleta foi selado de forma estéril e o pião foi removido sem a abertura do sistema de coleta de plaquetas e transportado em bolsa impermeável no interior da maleta térmica rígida adequada para transporte de material biológico a temperatura ambiente (20 a 24 ºC). As doações de plaquetas ocorreram no Setor de Hemoterapia do Hospital Israelita Albert Einstein. 1.2 ANÁLISE DO MATERIAL DE PARTIDA Após o transporte, o volume de células presente no pião foi removido de forma asséptica com o auxílio de seringa e agulha 21G em fluxo laminar. Após a aspiração por seringa e agulha, o volume integral das células contidas no pião é transferido para um tubo cônico de 50 mL e uma alíquota foi removida para realização de contagem das células no contador automático de células ABX Micros ES60. O número de células presentes no compartimento foi em média 6,6x107/mL e o número total de leucócitos foi em média de 2x109 cel. com cerca de 79% de linfócitos, como mostrado na Tabela 1.
COMPARTIMENTO “PIÃO” (N=5).
O volume de sangue foi diluído 15 vezes com tampão fosfato-salino (do inglês, “phosphate buffer saline” – PBS; disponível comercialmente pela ThermoFisher Scientific Gibco)) na proporção de 1 volume de sangue: 15 volumes de diluente, atingindo um volume médio de 30 mL. 1.3 PROCESSAMENTO DO MATERIAL DE PARTIDA - SEPARAÇÃO DAS CÉLULAS MONONUCLEARES DO SANGUE PERIFÉRICO (PBMCS) Para eliminação dos eritrócitos e da maioria dos granulócitos presentes nas amostras, as PBMCs foram separadas por gradiente de densidade com Ficoll- PaqueTM Premium (fabricado pela empresa Cytiva) no qual eritrócitos, granulócitos e células mortas passam através da camada de Ficoll, enquanto linfócitos e monócitos, devido a seu tamanho/densidade, acumulam-se na interface entre o plasma e o Ficoll- PaqueTM. As células diluídas (30 mL) foram colocadas sobre uma camada de 15 mL de Ficoll-PaqueTM Premium em tubos cônicos de 50 mL e centrifugadas em Centrífuga Thermo Scientific Sorvall ST 16R por 40 minutos, 500 G, temperatura de 20 a 24 ºC, sem breque. Foram necessários cerca de 4 tubos cônicos de 50 mL para realização da separação de todas as células. Após a centrifugação, as células mononucleadas presentes na interface entre o Ficoll-PaqueTM Premium e o soro diluído do doador foram removidas com auxílio de pipeta estéril e transferidas para novo tubo cônico de 50 mL. Uma nova alíquota foi removida para a contagem de células no equipamento ABX Micros ES60 e para análise de viabilidade no equipamento Countess. A partir do material isolado do pião, foram obtidos em média 1,00x108 leucócitos/mL. Para um volume de 10 mL, o total de leucócitos variou entre 0,8x109 e 2,5x109 (n=5) (Tabela 2). Os resultados das contagens automáticas de células em leitor de hemograma mostraram alta
concentração de linfócitos (80% ±13%) e monócitos (10% ±3,0%) e baixa frequência de granulócitos (13% ± 4%) com eliminação eficiente de eritrócitos demonstrada pelo hematócrito médio de 0,78% (Tabela 2). As frequências estão demonstradas na Figura 1. 5 TABELA 2 - CARACTERÍSTICAS GERAIS DE 5 AMOSTRAS PROCESSADAS POR GRADIENTE DE DENSIDADE (N=5)
A população de linfócitos totais apresentados em hemograma realizado em contadores automáticos células compreende linfócitos T (auxiliar e citotóxico), linfócitos B e células Natural Killer (NK). Estas células não podem ser diferenciadas 10 nos contadores automáticos por apresentarem características similares de tamanho e granulosidade. Portanto, para averiguar a percentagem de células distintas dentro dos linfócitos totais, realizou-se a imunofenotipagem por citometria de fluxo das populações de leucócitos (CD45+), linfócitos T (CD3+), linfócitos T auxiliadores (CD3+CD4+), citotóxicos (CD3+CD8+), linfócitos B (CD3-CD19+) e células NK (CD3- 15 CD16+CD56+) presentes na amostra, conforme mostrado na Figura 2. Dentro da população identificada como linfócitos totais, cerca de 60% são linfócitos T (dentre os linfócitos T, há cerca de 70% de linfócitos auxiliares (CD4+) e 22% de linfócitos T citotóxicos (CD8+), e 35% de outas células compostas por 20% de linfócitos B e 68% de células NK). 20 Estes dados mostraram que a amostra selecionada tem todas as células necessárias para o desenvolvimento do método e que a separação de PBMCs por Ficoll-PaqueTM contribui para o enriquecimento de linfócitos T na amostra. Para analisar a viabilidade celular das amostras após separação por gradiente de Ficoll-PaqueTM, foi realizada uma diluição 1:1 de PBMCs e Azul de
Tripan 0,4%, e avaliou-se por microscopia de luz a presença de células coradas em azul (mortas) e as translúcidas (vivas). A viabilidade das amostras de células isoladas manteve-se acima de 95% para todas as amostras testadas, como mostrado na Figura 3. As células que atenderam as características adequadas de número (igual ou maior ou igual a 6x108 células totais) e viabilidade (maior que 90%) foram centrifugadas novamente por 10 minutos, 500 G, a temperatura de 20 a 24°C. Após centrifugação, o sobrenadante foi descartado e aproximadamente 3,0 a 4,5x108 das células totais iniciais foram ressuspendidas em meio de cultura na concentração entre 1,0 e 1,5x106/mL (300 mL) para prosseguir para a fase de expansão em biorreator G- REX ou após validação no biorreator XURI cell expansion system W25 - GE Healthcare. 1.4 CONGELAMENTO DAS CÉLULAS EXCEDENTES PARA RE-ESTÍMULO As células excedentes que não foram expandidas foram congeladas em tubos de congelamento de células de 5 mL, ou em bolsa de congelamento utilizando 40% de Voluven® 6% (disponível comercialmente pela Fresenius), 40% de albumina humana 20% (disponível comercialmente pela Grifols) e 20% de DMSO (CryoPur disponível comercialmente pela Origen) na proporção de 1:1 para serem utilizadas posteriormente como re-estimulação dos linfócitos em cultura. Particularmente, um número de células totais igual ou superior a 3,5x108 foi congelado. O congelamento ocorreu depois da centrifugação das células em tubo cônico de 50 mL a 500 G por 5 minutos a uma temperatura entre 20 e 24 °C. O sobrenadante foi descartado e as células foram ressuspendidas na solução crioprotetora de 40% Voluven® 6%, 40% albumina humana 20% e 20% de DMSO, na proporção de 1:1 (células diluídas: solução crioprotetora), respeitando a condição de que a concentração das células para congelamento deve ser de 1x107/mL. As células foram transferidas para tubos de criopreservação de células de 5 mL devidamente identificados, colocados em sistema de congelamento sem álcool (Corning® CoolCell™ 5 mL LX Cell Freezing Container) e levados ao freezer com temperatura entre -75 e -90 °C por 24 h. Depois, os tubos foram transferidos para uma caixa devidamente identificada, podendo permanecer congelados por até 2 anos em temperatura entre -75 e -90 °C EXEMPLO 2 - ETAPA (II) DE EXPANSÃO EM SISTEMA DE BIORREATOR XURI
2.1 VALIDAÇÃO DO NÚMERO INICIAL DE CÉLULAS E DOSE DE CITOCINAS PARA A EXPANSÃO DAS CÉLULAS O número inicial de células para expansão foi definido após a padronização da expansão de células com várias doses de citocinas e várias concentrações celulares. Para IL-2 (IL-2 humana recombinante, disponível comercialmente pela R&D Systems), a concentração mínima foi determinada como 500 UI/mL, podendo ser utilizado até 1.000 UI/mL durante o processo de expansão. Para IL-7 (IL-7 humana recombinante, disponível comercialmente pela R&D Systems), foi definido como concentração ideal 10 ng/mL. Para concentração celular, foi definido o mínimo de 1x106 cel./mL e o número ideal de 1,5x106 cel./mL. Os resultados são mostrados na Figura 4A-C. 2.2 PREPARO ASSÉPTICO DO BIORREATOR XURI Pelo menos 4 horas antes do início da expansão, a bolsa Xuri cell bag - 2L foi instalada no sistema do biorreator XURI cell expansion system W25. A bolsa foi aberta em condições estéreis e verificou-se se todas as conexões estavam fechadas para que então a bolsa pudesse ser instalada no biorreator (rods, filter heater, pumíng tubing). O software Unicorn (Cytiva) foi iniciado de acordo com os parâmetros de tamanho da bolsa, densidade ótica (DO) e pH. O parâmetro “fast fill” foi ajustado para 30 minutos e o valor de CO2 foi ajustado para 5% (v/v). O meio de cultura AIM-V (disponível comercialmente pela ThermoFisher Scientific (Gibco)) suplementado com 10% Soro Humano AB (disponível comercialmente pela Valley Biomedical), 1% de L-glutamina 200 mM (disponível comercialmente pela ThermoFisher Scientific (Gibco)), 1% HEPES 1 M (disponível comercialmente pela ThermoFisher Scientific (Gibco)) e 1% aminoácidos não essenciais (disponível comercialmente pela ThermoFisher Scientific (Gibco)) foi preparado em fluxo laminar em bolsa de transferência estéril e conectado ao sistema por meio de conexão estéril. O meio necessário para a expansão dos linfócitos foi adicionado ao sistema para que seja equilibrado pela mistura de gases (CO2 e ar comprimido) por no mínimo 2 horas. No software Unicorn, também se determinou a inclinação da plataforma de agitação e a velocidade de agitação para semi-estática de 2 rpm, e ângulo de 2º. O fluxo de gás foi mantido a 0,05 Lpm para que esta cultura fique a temperatura de
37 °C e a percentagem de CO2 em 5%. Após pelo menos 2 horas de equilíbrio do meio de cultura no sistema, mediu-se o pH do meio da cultura que foi adicionado como parâmetro no software Unicorn. O pH deve foi mantido entre 7,0 e 7,5 e o volume mínimo para início de uma expansão de linfócitos no Biorreator XURI foi de 300 mL contendo o mínimo de 1,0x106 cel./mL, sendo o máximo 1,5x106 cel./mL. 2.3 EXPANSÕES DAS CÉLULAS EM BIORREATOR XURI COM ESTÍMULO DE CITOCINAS E PEPTÍDEOS CMV-ESPECÍFICOS Depois de estabilizar o sistema XURI cell expansion system W25 conforme descrito acima, as células foram adicionadas na concentração mínima de 1x106 cel./mL. Foram utilizadas as citocinas IL-2 (500 UI/mL) e IL-7 (10 ng/mL) no meio AIM-V suplementado e 1 μg do peptídeo do capsídeo do vírus hCMV pp65/mL (Peptivator pp65) (disponível comercialmente pela Miltenyi Biotec). O estímulo com o peptídeo ocorreu em uma bolsa de transferência de 150 mL contendo o volume final de 100 mL de células diluídas em meio de cultura, permanecendo por 2 horas na estufa de CO2 e após este período, o volume foi transferido via conexão estéril para a bolsa do XURI, que já continha 200 mL de meio previamente equilibrado. A cultura perdurou de 14 a 21 dias. Nos 3 primeiros dias, as condições da cultura foram mantidas como semi-estática (2 rpm e ângulo de 2º) e fluxo de gás de 0,05 Lpm. Para que esta cultura fique sem perturbações, não foi removida nenhuma amostra nos 3 primeiros dias de cultura. A partir do dia 5, modificou-se as condições de cultura para velocidade de agitação de 4 rpm e ângulo de agitação para 4º. No sétimo dia, a cultura retornou à condição semi-estática (2 rpm e ângulo de 2°) e as células foram reestimuladas com 1 μg do peptídeo do capsídeo do vírus hCMV pp65/mL e PBMC da mesma amostra que foi previamente congelada, conforme descrito no item “congelamento das células excedentes para o reestímulo” (Exemplo 1-1.4). O procedimento de reestímulo da cultura de células para o sistema XURI é descrito abaixo (item 2.4). A cultura foi suplementada com meio de cultivo fresco sempre de acordo com a dosagem de metabólitos no sobrenadante da cultura (glicose e lactato), medidos de forma rotineira para um técnico no assunto. Foi adicionado
o volume de meio adequado para que a concentração celular se mantivesse em 1x106 cel./mL via bolsa de transferência e conexão estéril com a via de entrada do biorreator XURI. A cultura não deve ultrapassar 21 dias e, ao final do cultivo, foram avaliados o número de linfócitos T e a viabilidade das células. Nesta etapa, considerou-se adequada a expansão cujo número de linfócitos final foi pelo menos o dobro do número de linfócitos inicial. 2.4 REESTÍMULO DA CULTURA DE CÉLULAS PARA O SISTEMA XURI Para o reestímulo da cultura, as PBMCs que foram previamente congeladas foram descongeladas em fluxo laminar, ressuspendidas em meio de cultura AIM-V suplementado e centrifugadas em centrífuga Thermo Scientific Sorvall ST 16R a 500 G por 10 minutos. Após centrifugação, o sobrenadante foi descartado e o pélete foi ressuspendido em meio de cultura AIM-V suplementado. A viabilidade das células foi verificada de acordo com os protocolos aqui descritos que deve ser acima de 80% e a concentração que pode variar entre 1:1 até 1:10 de novas células para cada célula em cultura dependendo do número de células disponíveis. Por exemplo, se houver cerca de 5x108 células em cultura, o reestímulo pode variar entre 5x107 e 5x108 células viáveis. Após verificar que as células estavam adequadas para o reestímulo, as células foram transferidas para uma bolsa de transferência de 150 mL com o auxílio de um acesso estéril e uma seringa e diluídas em 40 mL de meio de cultura AIM-V suplementado. Adicionou-se também 1 μg do peptídeo do capsídeo do vírus hCMV pp65/mL e a bolsa foi deixada em estufa de CO2 por 2 horas. Após este período, transferiu-se para o biorreator XURI por meio de sistema de conexão estéril, onde a cultura seguiu por mais 7 a 14 dias. 2.5 FINALIZAÇÃO DA EXPANSÃO E REDUÇÃO DO VOLUME DA CULTURA NO BIORREATOR XURI Ao final da cultura, o volume foi reduzido no próprio sistema XURI pela via de saída para a bolsa de descarte, uma vez que o filtro contido no interior da bolsa de 2 L utilizada para a expansão dos linfócitos era de 0,3 μM. Para bolsas que não continham filtro de 0,3 μM, a redução foi realizada de forma manual, onde todo o volume contido no biorreator XURI foi transferido para bolsas de transferência de 600 mL utilizando o sistema de conexão estéril ou pela
inversão do sistema feed. Para casos em que o volume já estava reduzido após a transferência do volume da bolsa do biorreator para uma bolsa de transferência em sistema fechado, seguiu-se com o preparo para a etapa de seleção. Para casos em que o volume excedeu 150 mL, as bolsas foram centrifugadas por 10 minutos a 700 G por 10 minutos. Ao final da centrifugação, colocou-se a bolsa de 600 mL em um extrator de plasma e transferiu-se o sobrenadante da cultura para outra bolsa de transferência, para a realização de controle de qualidade da manipulação das células. As células foram reunidas em uma única bolsa por sistema de conexão estéril e a contagem de células e a determinação da viabilidade celular foram realizadas. O número máximo de células que pode seguir para a etapa de seleção é de 1x109 células com viabilidade superior a 80%. Foram transferidas 1x109 células para uma bolsa de 250 mL e ajustou-se a concentração para cerca de 1x107 cel./mL, ou seja, em um volume final de 100 mL. Amostras foram retiradas para contagem de células, viabilidade e para análise de cariótipo e seguiu-se para a etapa (III) de seleção de linfócitos pela produção de INF-γ em sistema de captura da Miltenyi Biotec ou em equipamento CliniMACS PRODIGY. O sobrenadante reservado das células foi encaminhado para realização de ensaio de esterilidade e para controle de qualidade de processamento estéril. EXEMPLO 3 – ETAPA (II) EM SISTEMA DE BIORREATOR G-REX 3.1 EXPANSÕES DAS CÉLULAS EM BIORREATOR G-REX COM ESTÍMULO DE CITOCINAS E PEPTÍDEOS CMV-ESPECÍFICOS De forma alternativa ao biorreator XURI, os linfócitos foram expandidos em biorreator G-REX. As células foram colocadas na concentração mínima de 1x106 cel./mL e máxima de 1,5x106 cel./mL. Foram utilizadas as citocinas IL-2 (500 UI/mL) e IL-7 (10 ng/mL) no meio AIM-V suplementado após filtração esterilizante e 1 μg/mL do peptídeo do capsídeo do vírus hCMV pp65/mL. O estímulo com o peptídeo ocorreu em volume final de 100 mL de células diluídas em meio de cultura por 2 horas e, após este período, o volume foi ajustado para volume final de 300 mL. A cultura perdurou de 12 a 21 dias em estufa de CO2. Após o início da
cultura, a partir do quinto dia de cultivo, foram removidas amostras em dias alternados para verificação do número de células em cultura, pH, lactato e glicose. No sétimo dia de cultura, as células foram reestimuladas com 1 μg do peptídeo do capsídeo do vírus HCMV pp65/mL e PBMC da mesma amostra que foi previamente congelada, 5 conforme descrito abaixo. A cultura foi suplementada com meio de cultivo fresco sempre de acordo com a dosagem de metabólitos no sobrenadante da cultura (glicose e lactato) e com o número de cel./mL. O pH adequado deve estar entre 7.0 e 7.5, a concentração de glicose no sobrenadante da cultura deve ser maior que 150 g/dL, a dosagem de lactato 10 deve ser inferior a 150 mmol/dL e o número de células devem estar entre 1,0 e 1,5x106 cel./mL. Para casos em que o frasco G-REX atingiu sua capacidade máxima de volume (500 mL) e houve a necessidade de suplementação devido a alteração na dosagem de metabólitos, foi necessária a troca de meio de cultura pela remoção de 15 pelo menos 100 mL de meio de cultura para 02 tubos de 50 mL. Estes 2 tubos foram centrifugados a 500 G por 10 minutos. Após centrifugação, o meio contido nos tubos foi descartado e novo meio foi adicionado bem como as citocinas IL-2 (500 UI/mL) e IL-7 (10 ng/mL). Então, o novo meio de cultura foi transferido para o biorreator G-REX. Para casos em que o número de células excedeu a capacidade do frasco de cultura, 20 a cultura foi dividida em dois frascos. O tempo máximo de manutenção da cultura para expansão das células foi de 21 dias. Durante a expansão e ao final deste período foram avaliados o número total das células, a viabilidade das células e o número de linfócitos. A expansão foi finalizada ao se atingir 1x109 células ou quando o número de linfócitos T foi dobrado 25 com viabilidade superior a 80%. 3.2 REESTÍMULO DA CULTURA DE CÉLULAS PARA O SISTEMA G-REX Para o reestímulo da cultura, as PBMCs que foram previamente congeladas foram descongeladas em fluxo laminar, ressuspendidas em meio de cultura AIM-V suplementado e centrifugadas em centrífuga Thermo Scientific Sorvall 30 ST 16R a 500 G por 10 minutos. Após centrifugação, o sobrenadante foi descartado e o sedimento contendo as células foi ressuspendido em meio de cultura AIM-V suplementado. A viabilidade das células foi verificada de acordo com os protocolos aqui
descritos e deve ser acima de 80% e a concentração que pode variar entre 1:1 até 1:10 de novas células para cada célula em cultura dependendo do número de células disponíveis. Por exemplo, se houver cerca de 5x108 células em cultura, o reestímulo pode variar entre 5x107 e 5x108 células viáveis. Após verificar que as células estavam adequadas para o reestímulo, as mesmas, foram transferidas para uma bolsa de transferência de 150 mL com o auxílio de um acesso estéril e uma seringa e diluídas em 20 a 40 mL de meio de cultura AIM- V suplementado. Adicionou-se também 1 μg do peptídeo do capsídeo do vírus HCMV pp65/mL e a bolsa foi deixada em estufa de CO2 por 2 a 3 horas. Após este período, transferiu-se para o biorreator G-REX por meio de sistema de conexão estéril, onde a cultura seguiu por mais 7 a 14 dias. 3.3 FINALIZAÇÃO DA EXPANSÃO E REDUÇÃO DO VOLUME DA CULTURA NO BIORREATOR G- REX. Ao final da cultura, todo o volume contido no G-REX foi transferido para tubos de 50 mL em fluxo laminar. A seguir, os tubos foram centrifugados a 500 G por 10 minutos na centrífuga Thermo Scientific Sorvall ST 16R e o sobrenadante da cultura foi transferido para realização de controle de qualidade da manipulação estéril das células. As células foram reunidas em um único tubo e realizou-se a contagem das mesmas por meio dos protocolos aqui descritos. O número máximo de células que pode seguir para a etapa de seleção é de 1x109 células. Assim, foram transferidos 1x109 células para uma bolsa de 250 mL e a concentração foi ajustada para cerca de 1x107 cel./mL, ou seja, em um volume final de 100 mL. O volume para processamento no equipamento CliniMACS PRODIGY pode variar entre 100 e 150 mL e o número de células não deve exceder 1x109 células. Amostras foram retiradas para contagem de células, viabilidade e análise de cariótipo. Então, seguiu-se para a etapa (III) de seleção de linfócitos dada a produção de INF-γ em sistema de captura da Miltenyi Biotec ou em equipamento CliniMACS PRODIGY. O sobrenadante reservado das células foi encaminhado para realização de ensaio de esterilidade e para controle de qualidade de processamento estéril. EXEMPLO 4 – VALIDAÇÃO COMPARATIVA DA EXPANSÃO DE LINFÓCITOS NO BIORREATOR G- REX E XURI
4.1 COMPARAÇÃO DO PADRÃO DE EXPANSÃO DAS CÉLULAS E CONTROLE DE PH, GLICOSE E LACTATO NOS BIORREATORES XURI E G-REX Para a comparação dos biorreatores de expansão, foram utilizadas amostras nas duas plataformas com o mesmo volume e concentração celular inicial, mas que foram derivadas de doadores diferentes. O padrão de expansão entre os 2 biorreatores foi bastante similar, existindo uma queda no número de leucócitos totais nos primeiros dias da expansão e, a partir de 8 dias em cultura, as células em cultura iniciam sua proliferação em maior escala (Figura 5A). As variações no pH e níveis de glicose e lactato ocorreram em torno do oitavo dia de expansão, havendo diminuição no pH e glicose e aumento na produção de lactato, condizente com a fase log de expansão celular (Figura 5B-D). De acordo com o nível de glicose e lactato, ocorreu a reposição/troca de meio de cultura. As coletas de material para análise foram realizadas sempre antes da reposição/troca de meio de cultura que ocorreu 2 vezes por semana. 4.2 COMPARAÇÃO DO PERFIL DE LINFÓCITOS DURANTE A EXPANSÃO NOS BIORREATORES G-REX E XURI O perfil dos linfócitos durante a expansão por 15 dias nas duas plataformas também manteve o mesmo padrão. Observou-se um aumento na percentagem de linfócitos T CD3+ e resultados acima de 80% destas células após 15 dias de expansão nas duas plataformas (Figura 6A). Também foi observado um aumento nos linfócitos T CD3+CD8+ nas duas plataformas, com resultados acima de 50% de linfócitos T CD8 após 15 dias de expansão (Figura 6B). Ocorreu também um aumento na percentagem dos linfócitos T de memória (CD3+CD45RO+CD45RA-) e diminuição dos linfócitos T naïve (CD3+CD45RA+CD45RO-) durante os 15 dias de cultura nas duas plataformas. EXEMPLO 5 – ETAPA (III) DE SELEÇÃO DE CÉLULAS PRODUTORAS DE IFN-γ. 5.1 MÉTODO DE CAPTURA DE CÉLULAS PRODUTORAS DE IFN-γ EM SISTEMA ABERTO E MANUAL (COLUNA LS - MYLTENYI BIOTEC). Após a expansão de células específicas para CMV em biorreator, as células produtoras de IFN-γ foram isoladas utilizando o kit de detecção e enriquecimento de células secretoras de IFN-γ (MACS Miltenyi Biotec). O tampão PBS/EDTA foi completado com 0,5% de albumina humana antes do uso. As células não aderentes foram transferidas para tubos cônicos na
proporção de 108 células para cada 100 mL de tampão gelado (CliniMACS PBS/EDTA) e centrifugadas a 300 G, a 4°C por 10 minutos e o sobrenadante foi descartado. Posteriormente, as células foram ressuspendidas em 800 μL de tampão gelado (CliniMACS PBS/EDTA) e 200 μL de CliniMACS Capture IFN-γ para cada 108 de células e incubadas em gelo por 5 minutos. Foram adicionados 100 mL de meio de cultura TexMacs (disponível comercialmente pela Miltenyi Biotec) aquecido para cada 108 células, que permaneceram durante 45 minutos em incubadora de CO25% a 37°C, sob agitação periódica. A suspensão celular foi novamente centrifugada sob as mesmas condições anteriores em tampão gelado, depois incubadas a 4°C durante 15 minutos com 800 μL de tampão gelado e 200 μL de anti- IFN-γ para cada 108 células. Após esse período, as células foram novamente lavadas na proporção de 108 células para cada 100 mL de tampão gelado, centrifugadas sob as mesmas condições anteriores, depois ressuspendidas a 108 cel./mL de tampão gelado. Enquanto isso, as colunas LS foram lavadas por 3 vezes com 1 mL de tampão gelado (CliniMACS PBS/EDTA) e a suspensão celular foi aplicada na coluna que foi novamente lavada por 3 vezes para retirar qualquer célula negativa para IFN- γ. A coluna foi colocada em tubo cônico e rapidamente lavada com 3 mL de tampão com o auxílio de êmbolo para retirada das células retidas na coluna. Realizou-se a separação em outra coluna para garantir a pureza e enriquecimento de células positivas para IFN-γ. O resultado da seleção positiva foi chamado de fração TCB e as células não selecionadas ficaram na fração NTCB. Por fim, a imunofenotipagem celular foi realizada por citometria de fluxo quanto à expressão de IFN-γ para verificação das populações celulares isoladas e depletadas. No final da seleção, deve-se ter acima de 80% de células IFN-γ positivas e acima de 80% de linfócitos T com viabilidade também acima de 80% no TCB. O sobrenadante da fração NTCB foi encaminhado para cultura aeróbica, anaeróbica, de fungos e microrganismos especiais (25 mL), para realização de teste de endotoxina (1 mL) e para o teste de esterilidade do Laboratório BCQ (50 mL). O sobrenadante da fração TCB (15 mL) foi enviado para sorologia NAT para HIV, HCV, HBV e para PCR para CMV, EBV, Parvovírus B19 e Mycoplasma
pneumoniae, conforme protocolos descritos na presente invenção. Ainda, cerca de 1 mL das células foram enviadas para sorologia NAT HTLV-I. O restante do sobrenadante do TCB foi congelado para realização posterior dos testes de impurezas (determinação da concentração de IL-2 e IL-7). 5 Ao final da etapa, a fração TCB foi congelada. O número de células selecionadas variou de acordo com o número de células iniciais e devido à variação biológica entre indivíduos. A Tabela 3 resume todos os pontos críticos do processo de seleção em sistema aberto e a tomada de decisão a ser realizada. 10 TABELA 3 - PONTOS CRÍTICOS DO PROCESSO E RESULTADOS ACEITÁVEIS PARA O FINAL DO PROCESSO UTILIZANDO COLUNA LS
AUTOMÁTICO (CLINIMACS PRODIGY) Para captura de células em sistema fechado e automático, utilizou-se o sistema CliniMACS Cytokine Capture System (INF-γ) e o equipamento CliniMACS 5 PRODIGY, para a seleção das células se utilizou o programa “CCS_INF- γ_Enrichment”, de acordo com as orientações do fabricante. A bolsa contendo no máximo 1x109 células para a seleção foi conectada por meio do sistema de conexão estéril com a bolsa de amostra (100 a 150 mL), também foram conectados ao equipamento o sistema de tubos descartáveis TS500 10 (Miltenyi Biotec), meio de cultura TexMacs, PBS/EDTA acrescido de solução de albumina humana (0,5%), cytokine capture system (INF-γ), solução fisiológica 0,9% acrescida de solução de albumina humana (2,5%). O processo é iniciado e segue automaticamente até a separação de 02 bolsas, uma contendo as células selecionadas (TCB) e uma contendo o material descartado (NTCB). No final do 15 processamento, a bolsa com a fração de células descartadas (NTCB) e a bolsa com as células enriquecidas (TCB) foram seladas e duas alíquotas por fração foram coletadas para análise por citometria de fluxo, enquanto o restante das células foi estocado a 4 °C. Uma alíquota foi utilizada para determinar o número de células e a outra para verificar o rendimento de todo o processo. 20 O critério para determinar se a seleção foi adequada foi de acima de 80% de células IFN-γ positivas e acima de 80% de linfócitos T com viabilidade também acima de 80% no TCB. O sobrenadante da fração NTCB (25 mL) foi encaminhado para cultura
aeróbica, anaeróbica, de fungos e microrganismos especiais, 1 mL foi enviado para realização de teste de endotoxina, 50 mL para o teste de esterilidade no Laboratório BCQ, 10 ml para realização do teste de Mycoplasma sp. no Laboratório Invitrocell. O sobrenadante da fração TCB (15 mL) foi enviado para sorologia NAT 5 para HIV, HCV, HBV e para PCR para CMV, EBV, Parvovírus B19 e Mycoplasma pneumoniae. Cerca de 1 mL das células foram enviadas para sorologia NAT HTLV-I e o restante do sobrenadante do TCB foi congelado para realização posterior dos testes de impurezas e potência. A Tabela 4 resume todos os pontos críticos do processo de seleção em 10 sistema fechado e a tomada de decisão a ser realizada. TABELA 4 - PONTOS CRÍTICOS DO PROCESSO E RESULTADOS ACEITÁVEIS PARA O FINAL DO PROCESSO UTILIZANDO CLINIMACS PRODIGY
5.3 VALIDAÇÃO COMPARATIVA ENTRE A SELEÇÃO EM SISTEMA DE COLUNA ABERTA E SISTEMA DE COLUNA FECHADA (CLINIMACS PRODIGY) As células de um mesmo doador foram expandidas no biorreator G-REX, e após a expansão, 2x109 células foram utilizadas para as duas seleções, ou seja, 1x109 para cada seleção. Após a seleção, o número final de células selecionadas (TCB) nos 2 sistemas foi bastante similar (Figura 7A): 2,7x107 no sistema PRODIGY e 3,0x107 no sistema Coluna LS. A percentagem e número de linfócitos T nos 2 sistemas também foi bastante similar (Figura 7B): 93% no sistema PRODIGY e 97% no sistema Coluna LS, tendo ambos acima de 90% de linfócitos T. 5.4 COMPARAÇÃO DA PUREZA DA SELEÇÃO EM SISTEMAS ABERTO E FECHADO Para esta comparação, utilizou-se células de um mesmo doador, as quais foram expandidas no biorreator G-REX. Após a expansão, 1x109 células foram utilizadas para as duas seleções. Após a seleção, o número final de células selecionadas (TCB) nos 2 sistemas foi bastante similar, a pureza ficou acima de 80%, sendo 80,5 % no sistema de coluna manual e 80,6% no sistema PRODIGY (Figura 8). Adicionalmente, o equipamento CliniMACS PRODIGY foi avaliado e validado por 3 seleções. A média de linfócitos T (CD3) na fração depletada – NTCB foi em média de 73,8±7,84%, enquanto na fração selecionada – TCB foi em média de 91±1,9%. Referente aos linfócitos T CD3 positivos para IFN-γ na fração depletada – NTCB, a média foi de 36,7±7,08%, enquanto nas células selecionadas foi em média de 83,63±2,20%, conforme mostrado na Figura 9. 5.5 VERIFICAÇÃO DO RENDIMENTO DO PROCESSO DE SELEÇÃO POR CAPTURA DE CÉLULAS INF-YPELO LABORATÓRIO DE PESQUISA DO HOSPITAL ISRAELITA ALBERT EINSTEIN. O rendimento do processo foi realizado por citometria de fluxo (FORTESSA), em que as células das bolsas NTCB e TCB foram marcadas com anticorpos monoclonais para: CD45-PerCP-Cy5.5, CD3-PE-CF594, CD4 APC-Cy7,
CD8-Alexa 700 da BD Pharmingen e o anti-INF-γ-PE provisionado pelo kit (Milteniy Biotec). Em adição, as possíveis células contaminantes foram identificadas e denominadas de outras células CD3-, utilizando CD14-BV421 (BD Pharmingen) para identificar monócitos, CD19-FITC (BD Pharmingen) para identificar linfócitos B e 5 CD16-APC (BD Pharmingen) para identificar células NK. Para a marcação com os anticorpos, foi separada uma alíquota de 1x105 células (TCB e NTCB) e as quantidades previamente tituladas de anticorpos foram adicionadas em cada tubo. Para o controle de autofluorescência, realizou-se o tubo FMO, com marcação com todos os anticorpos menos 1. Neste tubo, determinou-se o 10 corte entre a população positiva e negativa para cada fluorescência que não foi adicionada ao tubo. Após marcação, as amostras foram incubadas por 30 minutos no escuro. Depois, adicionou-se 1 mL do tampão de citometria de fluxo e centrifugou-se as amostras por 10 minutos a temperatura ambiente (22 °C). O sobrenadante foi 15 descartado e pélete foi ressuspendido em 200 µL de tampão de citometria. A aquisição foi realizada na template preparada para esta marcação e a análise considerou a primeira seleção em FSC vs. SSC. A seguir, as células CD3 positivas, linfócitos T e a marcação para IFN-γ foram analisadas, assim como as subpopulações CD4 e CD8. Para a população CD3 negativa, analisou-se as 20 populações CD14 (monócitos), CD19 (linfócitos B) e CD16 (células NK). A Figura 10A-D mostra a análise da fração celular descartada pelo processo (NTCB) onde observou-se que apenas 78% das células eram linfócitos T, os quais eram compostos por 48% de linfócitos T CD4 e 50% de linfócitos T CD8. Destes linfócitos T, menos de 1% secretaram IFN-γ. Observou-se também que mais 25 de 20% de outras células estavam presentes, sendo que, dentro destes 20%, 30% eram de monócitos, 36% de NK e 21% de linfócitos B. Na fração celular enriquecida pelo processo (TCB) observou-se que 92% das células eram linfócitos T, os quais eram compostos por 34% de linfócitos T CD4 e 60% de linfócitos T CD8. Destes linfócitos T, quase 100% secretaram IFN-γ. 30 Observou-se também que apenas 6% de outras células estavam presentes, sendo que, dentro destes 6%, 32% eram de monócitos, 13% de células NK e 31% de linfócitos B. Uma alíquota também foi enviada ao Laboratório De Patologia Clínica
do Hospital Israelita Albert Einstein para determinação de viabilidade, (%) células CD3 e (%) de células CD3/ IFN-γ positivas (pureza da seleção). 5.6 ANÁLISE POR CITOMETRIA DE FLUXO NO LABORATÓRIO DE PATOLOGIA CLÍNICA DO HOSPITAL ISRAELITA ALBERT EINSTEIN O rendimento do processo foi realizado por citometria de fluxo (FACS CANTO), em que as células das bolsas NTCB e TCB foram marcadas com anticorpos monoclonais para: CD45-KO, CD3-PE-CF594, CD4 APC-Cy7, CD8-Alexa 700 da BD Pharmingen e o anti-INF-γ-PE provisionado pelo kit (Milteniy Biotec). A viabilidade foi determinada pelas células que não foram marcadas com 7-AAD, consideradas como células viáveis. Em adição, as possíveis células contaminantes foram identificadas e denominadas de outras células CD3-. Para esta análise, CD11b-BV421 (BD Pharmingen) foi utilizado para identificar contaminação com células mieloides. Para a marcação com os anticorpos, alíquotas de 1x105 células das frações TCB e NTCB foram separadas e adicionou-se as quantidades previamente tituladas de anticorpos em cada tubo. Para controle de autofluorescência, foi realizado tubo FMO, em que houve a marcação com todos os anticorpos menos 1. Neste tubo determina-se o corte entre a população positiva e negativa para cada fluorescência que não foi adicionada ao tubo. Após a marcação, as amostras foram incubadas por 30 minutos no escuro. Depois, adicionou-se 1 mL do tampão de citometria e as amostras foram centrifugadas por 10 minutos a temperatura ambiente (22 °C). O sobrenadante foi desprezado e o sedimento contendo as células foi ressuspendido em 200 µL de tampão de citometria. A aquisição foi realizada na template preparada para esta marcação. Para a análise, considerou-se a primeira seleção em FSC vs. SSC. A seguir, foram analisadas sequencialmente: as células CD45 positivas, as células viáveis 7AAD negativas e as células CD3 positivas (linfócitos T), e a marcação para IFN- γ, subpopulações CD4 e CD8. Para a população CD3 negativa, analisou-se as populações CD11b (células mieloides). O resultado da análise realizada pelo Laboratório de Patologia Clínica é ilustrado na Figura 11A-F. EXEMPLO 6 - ETAPA (IV) - CONGELAMENTO DAS CÉLULAS 6.1 CONGELAMENTO DE CÉLULAS HCMV-ESPECÍFICAS (TCB)
Para o congelamento das células hCMV-específicas (TCB), a bolsa contendo os linfócitos foi levada ao fluxo laminar e volume de aproximadamente de 6 mL foi diluído para o volume de 50 mL. Uma alíquota foi removida para contagem das células. A seguir, as células foram centrifugadas e o sobrenadante removido para realização das análises de viabilidade, esterilidade e sorologia, conforme os protocolos aqui descritos. As células foram congeladas em quantidades de 1x106 por dose/bolsa. Para isso, foram transferidas para uma bolsa de congelamento de 250 mL e cada 1x106 células foram diluídas em 15 mL de solução fisiológica 0,9% contendo 2,5% de albumina humana utilizada na seleção das células. Este volume (15 mL) contendo 1x106 células foi transferido para cada bolsa de congelamento. As bolsas contendo as células em 15 mL foram acondicionadas em geladeira por 15 minutos e o meio de congelamento para o mesmo volume de células a ser congeladas também foi preparado e adicionado na geladeira pelo mesmo período das células (40% de Voluven ® 6%, 40% de albumina humana 6% e 20% de DMSO). A seguir, uma bolsa por vez foi removida da geladeira e transferida para fluxo laminar para adição da solução crioprotetora, com auxílio de uma seringa de 50 mL e adaptador de bolsa. Após adição da solução crioprotetora, a bolsa foi selada e mantida em um seguimento com 4 fragmentos que podem ser removidos sem alterar o status da bolsa congelada para realização periódica de viabilidade celular. Após a selagem do tubo da bolsa, a mesma foi colocada em suporte metálico e então colocada em posição horizontal em freezer mecânico a -80 °C por 24 h. Após este período, as bolsas foram armazenadas na posição vertical. Uma bolsa foi descongelada para realização dos ensaios de ELISPOT (liberação de INF-γ) frente a estímulo com peptídeo e também foi utilizada para ensaio de co-cultivo com fibroblastos MCR-5 controle e infectados com a cepa AD169 de CMV (potência). Os ensaios e seus resultados estão descritos mais adiante na presente invenção. 6.2 CONGELAMENTO DE CÉLULAS NÃO SELECIONADAS (NTCB) O NTCB (cerca de 230 mL) foi transferido para tubos de 50 mL e centrifugados. O sobrenadante foi removido para as análises de viabilidade, esterilidade e sorologia, conforme os protocolos aqui descritos. As células do NTCB
foram congeladas em tubos de congelamento de 5 mL e foram utilizadas para controle de qualidade. EXEMPLO 7 – ETAPA (V) DE DESCONGELAMENTO 7.1 SELEÇÃO DE CÉLULAS CMV-ESPECÍFICA PARA INFUSÃO EM PACIENTE COMPATIBILIDADE HLA E NÚMERO DE CÉLULAS POR QUILOGRAMA A compatibilidade mínima entre os linfócitos e o receptor foi de 1 em 6 alelos (alta resolução), sendo considerados os alelos de classe I - loci HLA-A, HLA-B e HLA-C. Foi dada a preferência para a compatibilidade dos alelos de HLA de classe I listados a seguir: A*01:01, A*02:01, A*03:01, A*11:01, A*23:01, A*24:02, B*07:02, B*08:01, B*15:01, B*18:01, B*35:01, B*44:02 e B*44:03. Também se avaliou o número de células a ser infundido em cada paciente, para que este não ultrapasse o valor de 1 a 2x104 cel./kg de peso do receptor. A Tabela 5 abaixo resume a análise crítica realizada para a liberação dos linfócitos T (TCB) para a infusão das células. Após as análises, as células adequadas foram descongeladas em fluxo laminar a 37 °C. 7.2 ESTABILIDADE APÓS DESCONGELAMENTO Por meio da análise de morte celular com iodeto de propídeo por citometria de fluxo, analisou-se a estabilidade dos linfócitos após descongelamento. Foram testados 3 lotes de células proveniente de doadores diferentes. As células do Doador 15IVN9083 testadas estavam congeladas por cerca de 7 dias quando foram descongeladas para realização do teste. As células do Doador 18FS4945 estavam congeladas por cerca de 6 meses quando foram descongeladas para a realização do teste e as células do Doador 24MAPM692 estavam congeladas a cerca de 11 meses quando foram descongeladas para a realização do teste. A estabilidade dos linfócitos após descongelamento mantidos entre 2 e 6 °C mostrou que a viabilidade varia de acordo com o tempo de descongelamento. Mesmo após 2 horas do descongelamento, acima de 80% das células se mantiveram viáveis (Figura 12). TABELA 5 - ANÁLISE CRÍTICA REALIZADA PARA A LIBERAÇÃO DOS LINFÓCITOS T (TCB) PARA A INFUSÃO DAS CÉLULAS
EXEMPLO 8 – ESTUDO IN VITRO PARA SIMULAÇÃO DA RESPOSTA FRENTE AO ESTÍMULO ESPECÍFICO. Para a avaliação da função dos linfócitos T hCMV-específicos, foi realizado o teste de ELISPOT para produção de IFN frente ao estímulo específico. Estes ensaios 5 foram realizados em 03 lotes de produto (TCB) expandidos e selecionados no equipamento CliniMACS PRODIGY. Foram utilizadas as células descongeladas dos produtos/doadores a seguir:
produto: B300121394945-doador: 18FSH4945 (Figura 13), produto: B300121391223- doador: 59TPAA1223 (Figura 14) e produto: B300121327279-doador: 60GDD2727 (Figura 15). Os resultados destes ensaios foram avaliados no contador automático de spots (AID Advanced Imaging Devices GmbH Ebinger Str. 4 D72479 Strassberg Germany). Os ensaios também foram realizados utilizando 03 diferentes quantidades de células (1x103/100 μL, 5x103/100 μL e 1x104/100 μL) no produto de células selecionadas (TCB) e também nas células descartadas (NCTB). Todos os ensaios foram realizados em triplicatas. Neste ensaio, os linfócitos T CMV-específicos descongelados foram estimulados por cerca de 2 horas em presença do peptídeo viral (pp65) e observou- se que cerca de 10% das células foram capazes de secretar IFN-γ neste período, sendo mais acurado em concentrações menores de células. Definiu-se como adequada a capacidade de secretar IFN-γ em mais de 50 linfócitos para cada 103 linfócitos, considerando o tempo de estímulo e a baixa quantidade de células apresentadoras de antígeno no produto. Este ensaio mostrou que as células geradas em laboratório são funcionais. EXEMPLO 9 - SIMULAÇÃO DE RESPOSTA ENTRE INDIVÍDUOS PARCIALMENTE COMPATÍVEIS FRENTE ESTÍMULO ESPECÍFICO Para a avaliação de segurança in vitro, foi desenvolvido um ensaio de liberação de IFN-γ por linfócitos do TCB em presença das células comerciais (fibroblasto pulmonar MCR-5) infectadas pelo hCMV. 9.1 INFECÇÃO DOS FIBROBLASTOS MCR-5 COM A CEPA COMERCIAL DE CITOMEGALOVÍRUS - AD169 (CMVAD169). Para a infecção dos fibroblastos MCR-5 com cepa de CMV-AD169 (ATCC# VR-538) para expansão de carga viral, os fibroblastos MCR-5 foram semeados na concentração de 2,84x104/poço em placa de cultura de 24 poços em sala de cultivo NB2. Após 24 h de cultura das células MCR-5, o meio de cultivo foi removido e as células foram adsorvidas com 0,1 MOI da cepa CMV-AD169 para cada célula em cultura (2,84x103 MOIs) por 8 h. Após este período, o sobrenadante foi removido e novo meio de cultura foi adicionado. Após 4 dias de cultivo, foi possível observar mudança citopática nas MCR-5. Após 10 dias de cultivo, o sobrenadante foi removido e congelado com solução com 7% de DMSO em nitrogênio líquido. Para titular o CMV-AD169
congelado, o sobrenadante foi utilizado em diluições seriadas para infectar novamente as MCR-5. Em uma placa de cultura de 24 poços, as células foram mantidas sem infecção (CTRL) e também infectadas em triplicatas nas diluições virais de 10-1,10-2, 10-3, 10-4, 10-5, 10-6 e 10-7. Após 2 e 3 dias da infecção, foi avaliada a marcação com o anticorpo anti-CMV (verde) por microscopia e por citometria, confirmando a infecção de 17% dos fibroblastos MCR-5 com concentração viral de 10-1, e de 7,5% com concentração viral de 10-2. Foi possível verificar também a infecção até a concentração de 10-3 (Figura 16). Portanto, para os experimentos de co-cultivo com os linfócitos T vírus específicos, utilizou-se apenas as diluições virais de 10-1 e 10-2. 9.2 CO-CULTIVO DE FIBROBLASTOS MCR-5 INFECTADOS POR CMV-AD169 COM LINFÓCITOS T HCMV ESPECÍFICOS PARA ANÁLISE DE SECREÇÃO DE IFN Para o co-cultivo, os fibroblastos foram semeados na concentração de 1x104/poço e após 24 horas de cultura, a infecção foi realizada por 8 h. Após este período, o meio de cultura foi trocado. Após 3 dias de cultivo, foram realizados os co- cultivos de 24 h e 48 h com linfócitos T hCMV específicos gerados em sala limpa nas proporções (1x104 Linfócitos: 1x104 Fibroblastos), (5x103 Linfócitos: 1x104 Fibroblastos), (1x103 Linfócitos: 1x104 Fibroblastos), ou seja, 1 efetor:1 alvo, 1 efetor:2 alvos e 1 efetor:4 alvos com os controles de fibroblasto sem linfócito e apenas linfócito sem o fibroblasto. O sobrenadante do cultivo foi obtido em 24 h e 48 h para dosagem de INF-y. A compatibilidade do MHC de classe I entre os fibroblastos e os linfócitos T hCMV específicos foi de 3:6 conforme demonstrado na Tabela 6. TABELA 6 - DESCRIÇÃO DA TIPAGEM HLA DE CLASSE I DO FIBROBLASTO (MCR-5) E DAS CÉLULAS HCMV-ESPECIFICAS GERADAS DO PRODUTO/DOADOR B300121394945/18FSH4945 RESPECTIVAMENTE
A dosagem de IFN-γ dos linfócitos sem os fibroblastos e dos fibroblastos sem os linfócitos foi chamada de liberação espontânea. A dosagem de IFN-γ do controle fibroblasto não infectado e dos fibroblastos infectados pelo CMV nas
concentrações 10-1 e 10-2 por 24 e 48 h foi decrescida da liberação espontânea. Observou-se que para o produto: B300121394945-doador: 18FSH4945 no co-cultivo com fibroblasto MCR-5 na proporção (1:1) a secreção de IFN-γ foi: Em 24 h de co-cultivo: - 4,0 pg/mL na concentração viral de 10-2; - 34,2 pg/mL na concentração viral de 10-1. Em 48 h de co-cultivo: - 43,5 pg/mL na concentração viral de 10-2; - 45,0 pg/mL na concentração viral de 10-1. Não foi observada secreção de IFN-γ no controle fibroblasto MCR-5 não infectado com a cepa viral. Um resumo destes resultados é apresentado na Tabela 7 e na Figura 17, onde UI equivale a unidades internacionais. TABELA 7 - CONCENTRAÇÕES DE IFN-γ NOS CO-CULTIVO DE 24 H E 48 H.
9.3 CO-CULTIVO DE FIBROBLASTOS MCR-5 INFECTADOS POR CMV-AD169 COM LINFÓCITOS T HCMV ESPECÍFICOS PARA ANÁLISE DE MORTE DAS MCR-5 Para a avaliação de segurança também se realizou um ensaio de morte celular (citotoxicidade) de células MCR-5 infectadas pelo hCMV por linfócitos do produto. O potencial citotóxico dos linfócitos T específicos para hCMV, isolados pelo equipamento CliniMACs PRODIGY foi analisado por meio do cultivo de fibroblastos MRC-5 (ATCC CCL-171) infectados com CMV (ATCC VR-538) na concentração 10-1 na presença de diferentes concentrações de linfócitos CMV- específicos (1:1 e 2:1) de 3 doadores/TCBs diferentes sendo a compatibilidade HLA de classe I entre os doadores de linfócitos e as células MCR-5 variável conforme indicado abaixo: - Produto: B300121394945 - Doador: 18FSH4945 (Compatibilidade HLA 3:6);
- Produto: B300121391223 - Doador: 59TPAA1223 (compatibilidade HLA 1:6); - Produto: B300121327279 - Doador: 60GDD2727 (Compatibilidade HLA 1:6). Os co-cultivos foram avaliados após 24 e 48 horas. Os sobrenadantes em triplicata das coculturas dos linfócitos T específicos para hCMV com fibroblastos MRC-5 infectados com hCMV foram coletados e o ensaio foi realizado utilizando o kit CytoTox 96® Non-Radio (Promega Cat.: G1780; Lot.:430121). Especificamente, esse ensaio mede a concentração de LDH (lactato desidrogenase), a enzima liberada após lise celular. A concentração de LDH é modificada quando ocorre morte celular, e como controle de morte foi utilizado o co-cultivo dos linfócitos com o fibroblasto não infectado. O LDH liberado nos sobrenadantes de cultura foi medido em ensaio enzimático de 30 minutos, que resulta na conversão de um sal de tetrazólio (iodonitrotetrazolium violeta; INT) em um produto formazan Vermelho, alterando a densidade óptica. As densidades ópticas foram obtidas por leitura colorimétrica e sua variação é proporcional à lise celular. O protocolo segue as orientações do fabricante e as densidades ópticas foram obtidas em espectrofotômetro (Varioskan LUX - Thermo Scientific). Para avaliar a percentagem de citotoxicidade dos linfócitos em cada condição de cultivo, a fórmula fornecida pelo fabricante abaixo foi aplicada: % ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ = ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ − ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^â ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ − ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^â ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^á ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ − ^^á ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^â ^^ ^^ ^^ ^^ 100 Os resultados da citotoxicidade das células de 3 doadores em 48 h de co-cultivo com fibroblastos infectados foram em média de 3% quando a concentração celular é menor (1:2), e em média de 13% quando a concentração celular é maior (1:1), como demonstrados na Tabela 8 e na Figura 18. Em adição, observou-se que a percentagem de fibroblastos MCR-5 infectados na concentração viral de 10-1 foi cerca de 17% em 48 h. Logo, inferiu-se que na concentração de linfócitos menor (1:2), a morte de células infectadas pelo hCMV foi em média de 20%; e na concentração celular maior (1:1), a morte de células infectadas pelo hCMV foi em média de 75%. TABELA 8 - RESUMO DA CITOTOXICIDADE DOS LINFÓCITOS T CMV-ESPECIFICOS CONTRA FIBROBLASTOS MCR-5 INFECTADOS COM HCMV-AD169.
Em conclusão, este experimento demonstrou que in vitro não ocorre morte inespecífica dos fibroblastos MCR-5 por linfócitos T CMV-específicos mesmo em compatibilidades HLA de classe I (1:6). Nos co-cultivos, onde os fibroblastos não foram infectados, não houve detecção de morte na maior concentração celular (1:1). 5 A depender da concentração de linfócitos T, a morte específica de fibroblastos infectados foi em média de 17% para baixas concentrações (1:2) e 75% para concentrações mais altas (1:1), indicando a segurança e também eficácia do produto in vitro. REFERÊNCIAS 10 Düver F., Weißbrich B., Eyrich M., Wölfl M., Schlegel P.G., Wiegering V. Viral reactivations following hematopoietic stem cell transplantation in pediatric patients - A single center 11-year analysis. PLoS One. 2020;15(2): e0228451. Publicado em 4 de fevereiro de 2020. doi: 10.1371/journal.pone.0228451. Blümel J.V., Burger R., et al. Human Cytomegalovirus (HCMV) - Revised. 15 Transfus Med Hemother.2010;37(6):365-375. doi:10.1159/000322141. Zuhair M, Smit GSA, Wallis G, et al. Estimation of the worldwide seroprevalence of cytomegalovirus: A systematic review and meta-analysis. Rev Med
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METHOD OF EXPANSION OF VIRUS-SPECIFIC LYMPHOCYTES, COMPOSITION AND USE OF A COMPOSITION CAMPO DA INVENTION The present invention relates to a method of expanding virus-specific lymphocytes. The present invention also relates to a composition comprising virus-specific lymphocytes and the use of this composition for the manufacture of a cell therapy. BACKGROUND OF THE INVENTION It is known that after bone marrow transplantation, transplant patients may be affected by various complications, including complications arising from the conditioning regimen prior to transplantation, complications related to graft-versus-host disease (GVHD/GvHD) acute and chronic, and conditions related to the patient's own health, such as recurrence of the underlying disease. 15 Among these complications, infections and reactivation of viral infections, for example such as human cytomegalovirus (hCMV), adenovirus, Epstein-Barr virus (EBV) and polyomavirus (BK virus) are frequent causes of serious complications in patients undergoing allogeneic liver transplants. bone marrow (BMT) (Düver et al., 2020). 20 hCMV reactivation/infection can lead to serious complications for patients, such as irreversible neurological changes, pulmonary, gastrointestinal and ophthalmological complications, among others, in addition to prolonged hospitalizations, leading to patient morbidity and mortality and the consequent increase in costs in health, both in the public and private sectors. 25 hCMV or human herpes virus 5 (HHV-5) is a virus belonging to the Herpesviridae family, Betaherpesviridae subfamily, of the Cytomegalovirus genus. hCMV infection typically follows an asymptomatic or oligosymptomatic course in immunocompetent individuals. However, in immunosuppressed patients, clinical manifestations related to viral proliferation in 30 different tissues (epithelial, endothelial, parenchymal and mononuclear cells) can compromise several systems (lung, gastrointestinal tract, central nervous system, reticuloendothelial system), causing deleterious damage due to sometimes irreversible to patients (Blümel et al., 2010).
Specific considerations should be given to immunosuppressed patients infected with hCMV post-BMT, as this is an infectious agent whose prevalence rates are extremely high with seropositivity of almost 100% in African, Asian and Middle Eastern populations 5 and around 40 -70% on the American and European continents (Zuhair et al., 2019). Therefore, it is expected that post-transplant reactivation rates will also be the same. A reactivation rate of 70% was estimated in post-allogeneic BMT patients, which makes the control and treatment of this infection deserve special attention (Teria et al., 2015). 10 Pneumonia, gastrointestinal tract ulcers and retinitis are the main clinical manifestations in this subgroup of patients. Multiple factors favor hCMV reactivation in the post-transplant setting. In addition to the immunosuppressive agents used and the immunosuppression caused by the conditioning regimen, there are: (i) interaction with other viruses (for example: HHV-6); 15 (ii) increased production of cytokines during bacterial and fungal infections; (iii) the occurrence of graft-versus-host disease and its treatment, carried out mainly with corticosteroid therapy; and (iv) previous treatment with anti-lymphocytic immunoglobulin (ATG). Such clinical situations are very common in these patients and provide an immunological status that allows the spread of hCMV (Asano-20 Mori et al., 2005, Frere et al., 2006). To reduce the length of stay for bone marrow transplant patients suffering from hCMV infection, several strategies have been developed over the years. It is known that healthy individuals seropositive for hCMV develop a large number of cytotoxic T lymphocytes (CTL) 25 specific for the virus in peripheral blood. T lymphocytes are cells that differentiate in the human thymus and play a central role in the immune response. T lymphocytes are generally distinct from other cells because they have T cell receptors (TCRs) and the CD3 protein on their surface. Precursor lymphoid cells originate in the bone marrow, but only differentiate into the CD4 and CD8 subtypes of T lymphocytes after having migrated to the thymus. One of the functions of CD8 T lymphocytes, also known as CTL, is to cause immune-mediated death and the active component released by CD8 T lymphocytes are perforins, granzyme A and granzyme B. CD4 cells also
Known as helper T cells, they use the secretion of cytokines to influence other cells of the immune system to fulfill their role, such as inducing B cells to differentiate into plasma cells and produce antibodies or attracting CD8 T lymphocytes to the site of infection. 5 Based on this principle, it was understood that lymphocytes could be used as an adoptive immunity reference for the treatment of hCMV infection and new techniques for the development and in vitro isolation of T lymphocytes specific against hCMV emerged. It has been demonstrated that protective immunity can be transferred to immunosuppressed patients through the infusion of clones of 10 virus-specific CD4 and CD8 T lymphocytes, leading to suppression of viremia (Einsele et al., 2002; Hanley et al., 2015). The efficacy of immunoadoptive transfer of specific CD8 hCMV T cell clones applied prophylactically to immunosuppressed patients was also demonstrated. This therapy protected patients against the onset of disease complications, with clonal cells being detected in patients up to 8 weeks after infusion (Blyth et al., 2013). Given the severity of the clinical infection, the lack of prophylactic strategies that definitively reduce the risk of infection and the side effects of antivirals, from the 90s onwards the development of alternative methods for the expansion of lymphocytes for the treatment of viral infections, mainly hCMV. Some of these methods are described below. Riddell and colleagues (Riddell et al., 1992) generated cytotoxic T lymphocytes from peripheral blood cells from CMV-positive bone marrow donors by culturing these cells for 12 weeks with fibroblasts infected with 25 hCMV (5 MOIs) from the virus. live whole, IL-2 and anti-CD3 and anti-CD28 in RPMI culture medium supplemented with human AB serum. The cells were infused intravenously in 3 patients. Cells were infused 4 times in staggered doses for 4 weeks (3.3x104, 1x105, 3.3x105 and 1x106). The work of Walters et al., 1995, generated cytotoxic T lymphocytes from peripheral blood cells from CMV-positive bone marrow donors by culturing these cells with hCMV-infected fibroblasts (5 MOIs) from whole virus, IL- 2 and anti-CD3 in RPMI culture medium supplemented with human AB serum. The cells were infused into 14 patients via central catheter in 4 doses
staggered weekly 3.3x107, 1x108, 3.3x108 and 109 cell./mtwo 4.1x105, 3.3x105 and 1x106/kg) in 100% compatible allogeneic patients and patients maintained CMV-specific responses for up to 8 weeks (60 days) after cell infusion. No serious adverse effects were noted in patients. Vital signs of all patients remained unchanged after all infusions and 3/14 patients developed grade I and II GvHD/GvHD after cell infusion. For GVHD/GvHD, patients were treated with prednisone 1.0 to 1.5/kg per day for 3 weeks, patients had no other reactions and additional doses of cells were well tolerated and there was no new recurrence of GVHD /GvHD. In the work of Einsele et al., 2002, CMV-specific lymphocytes were isolated from 200 mL of peripheral blood from stem cell donors. Cells were cultured and stimulated with viral peptides for 21 days of culture using RPMI culture medium supplemented with human AB serum, IL-2 and viral lysate/viral peptide. The work mentions that after 4 stimuli with specific peptides in vitro, cultured cells lose their initial alloreactivity against the receptor, even for partially compatible receptors. Cells were obtained from donors and 8 patients whose HLA compatibilities between donor and recipient were variable, 5 had complete compatibility, while 3 had partial compatibility. Of the 8 patients, 7 received a single dose of 1x107 cell./mtwo (equivalent to 1x104/kg) intravenously and 5 patients out of 8 resolved CMV infection after an infusion of cells. One of the patients needed an extra infusion of cells and after the second infusion the infection was controlled. Two patients did not respond to cell treatment. No serious adverse effects or GvHD occurred in patients who received these cells. Peggs and colleagues (Peggs et al., 2003) isolated hCMV-specific lymphocytes from CMV-positive donors from peripheral blood and cultured them with autologous dendritic cells pulsed with CMV antigen for 14 to 21 days using X-Vivo 20 medium. with 10% human serum AB and IL-2. Cultures were restimulated on day 7 of cultivation. In this protocol, 16 patients were included who received intravenously around 1x 105 cells/kg after the first episode of CMV viremia. Of the 16 treated patients, 3 developed grade I GVHD/GvHD and 14/16 treated patients did not reactivate viremia.
In the work of Feuchtinger and his collaborators (Feuchtinger et al., 2010), hCMV-specific lymphocytes were isolated from leukapheresis or from 500mL of whole blood. Cells were cultured in RPMI medium with 10% human AB serum and 10 μL/mL pp65 protein (Miltenyi Biotec) for 16 hours at 37 °C. Cell enrichment occurred using the capture of IFN-γ-producing cells in the CliniMACS System (Miltenyi Biotec). The purity of the selections performed averaged around 65% of IFN-γ cells. In this study, 18 patients were treated post-haploidentical transplants or transplants with unrelated donors. The cells were infused intravenously and the average dose of cells infused was 10 2.1x104 CD3/kg (ranging between 1x10³ and 1.3x105 cell./kg) of specific T lymphocytes against CMV capsid protein (pp65). The results observed were that 83% of cases of infections had a complete response with a greatly reduced viral load, including 2 cases of hCMV encephalitis. In this study, no cases of GVHD/GvHD or acute side effects were observed. 15 In the 2011 work by Peggs and colleagues (Peggs et al., 2011), cells were obtained by leukapheresis and cultured in RPMI medium with 10% human AB serum and 600 ng of pp65 peptides (CMV Peptivator; Miltenyi-Biotec ) for 6 hours at 37 °C. Cell enrichment occurred using the CliniMACS IFN-γ-producing cell capture system (Miltenyi Biotec). The cells obtained from 20 selection by IFN-γ were cryopreserved in two doses (1.3x104 and 3.3x104 CD3 lymphocytes/kg of the recipient). The cells were infused after the negative result of the microbiological cultures and the average purity of the cells obtained in the capture system was 41.7%. In total, 18 patients received the selected cells and all received a single dose of cells, the second dose was not necessary. The average number of cells infused was about 2840 CD4/kg (280-6880 CD4/kg) and 630 CD8/kg (60-3990 CD8/kg). No infusion toxicity was detected, five patients developed grade I GVHD/GvHD and responded to topical corticosteroids. Another 2 patients developed grade II and III GVHD/GvHD and received oral and intravenous treatment. 30 Meij and colleagues (Meij et al., 2012) cultured peripheral blood cells in IMDM culture medium, supplemented with L-glutamine, antibiotics and 10% human AB serum. These cells were cultivated at a concentration of 1x107 cell./mL in the presence of pp65 peptides from the hCMV capsid
(1 mg/mL). After incubation for 12 h, cells were captured using the CliniMACS Cytokine Capture System (IFN-γ) (Miltenyi Biotec, Bergisch Gladbach, Germany). After capture, the cells were further cultured with culture medium and IL-2 for 14 days. Six cells generated in this system were infused into 5 transplant patients with hCMV reactivation. Patients received a dose variation of 0.9x104 – 3.1x105 T cell./kg administered intravenously and these 6 patients responded to treatment. Patients did not experience any serious adverse effects or GVHD/GvHD. Leen and colleagues (Leen et al., 2013) used an adenoviral vector carrying the hCMV pp65 protein. Dendritic cells/monocytes were transfected with this vector, placed in culture with lymphocytes from CMV, EBV and Adenovirus positive donors and then these cells were frozen. The intensity of the CMV response of the expanded cells was measured by ELISPOT assay for all specific viruses. In this protocol, 50 patients were treated for CMV, EBV and adenovirus, 23 for CMV. Of the 23 patients, 17 were male and HLA compatibility was partial. 6 alleles were also analyzed and the number of cells infused was approximately 1x104 cell/kg). Of the 23 patients included, 5 died from causes unrelated to cell infusion and 18 patients who remained alive responded to treatment. The response against CMV was evaluated in vitro by the response of the patients' peripheral blood cells. The infusion was well tolerated, with no reactions at the time of infusion and grade I GvHD occurred in 2/50 partially compatible and 3rd party patients (neither the patient nor the marrow donor). Pei and colleagues (Pei et al., 2017) used cells from 25 CMV-positive blood donors. Cells were cultured with 1,000 IU/mL IFN-γ, followed by the addition of 500 IU/mL IL-2 and anti-CD3 (100 ng/mL). After 4 days of culture, the pool of 138 synthetic peptides from the hCMV viral capsid (pp65) was added to the culture. Two days later, a second stimulus with peptides was performed. Cells were expanded in vitro for another 6-10 days. The expanded cells were selected by the automatic cell capture system (CSS) (Miltenyi Biotec). The dose of cells infused intravenously was on average 4x105/kg for CD8 and 3x103/kg for CD4. These cells were infused into 32 patients refractory to antiviral treatment and with hCMV reactivation after
Bone marrow transplant. The cells were mostly from transplant cell donors, so compatibility was total or partial. Of the patients who received the cells, only 1 patient developed grade II GVHD/GvHD 2 weeks after cell infusion, however this patient already had grade 5 I GVHD/GvHD before infusion. Of the 32 patients treated, 3 patients died after infusion of hCMV-specific cells from causes unrelated to the infused cells, such as disease relapse, graft failure, and bacterial infection. Of the 32 patients treated, 27 had a complete response. In Whiters et al., 2017, cells from CMV, adenovirus (ADV) and Epstein-Barr (EBV) positive blood donors were used. Cells from these blood donors were used to create a bank of 46 monovalent cells, 17 hCMV, 14 EBV and 15 ADV. Dendritic cells derived from donor monocytes were generated and pulsed with MACS GMP PepTivators (Miltenyi Biotec) pool of hCMV pp65, AdV5 Hexon, or EBV BZLF1/LMP2A/EBNA-1. The cells were cultured for up to 21 days and restimulated with the specific peptide on day 7 of culture and the cultures were also supplemented with IL-2. After cultivation, the cells were frozen. Participants were treated with partially compatible cells at a dose of approximately 1x104/Kg intravenously and compatibility was partial up to 1 in 6 alleles for HLA A, B and C. Of the 30 patients 20 included in the study, the vast majority (28) were treated for hCMV reactivation and only 1 for ADV and another for EBV. Patients were infused with different doses of the cells, with 17 patients receiving a single dose, 9 patients receiving 2 doses, 2 patients receiving 3 doses and 2 patients receiving 4 doses. No patient presented immediate toxicity to cell infusion. One patient 25 was admitted 24 h after the infusion with a fever, but it was determined that this was due to bacterial contamination of the central catheter. Patients were followed for 12 months and no adverse effects were attributed to the lymphocyte infusion. The biggest cause of problems unrelated to cell infusion were related to infection or disease relapse. Acute GvHD occurred in 2 patients, 1 patient developed grade II GvHD but was treated and responded to treatment, and the other patient who received the ADV-specific cells developed GvHD and died from the adenovirus infection. Of the 27 patients treated, 26 responded to treatment with a total or partial response.
Kallay and colleagues (Kallay et al., 2018) collected donor lymphocytes by leukapheresis and stimulated them. The cells were subjected to separation using the CliniMACS PRODIGY Cytokine Capture System (IFN-γ; CCS) equipment. Lymphocytes were obtained by capturing cells secreting IFN-γ upon specific stimulation with pp65 for hCMV. In this protocol, 9 pediatric patients were treated, 4 females and 5 males. However, only 3 patients were treated for CMV, the other patients were treated for EBV and adenovirus. The number of cells infused was 9.9x103/kg (ranging between 6.7 and 25) of CD4 and 32.6x103/kg (ranging from 16-125) of CD8. In this protocol, no cases of rejection, GVHD/GvHD or relapse of infection were observed. Document US 2005/0221481 relates to a method of ex vivo expansion of neonatal T cells from umbilical cord blood which comprises obtaining mononuclear cells from a sample of umbilical cord blood and then culturing said cells mononuclear cells in a serum-deprived culture medium supplemented with various combinations of cytokines including stem cell factor (SCF), interleukin-7, interleukin-4, and interleukin-2. These results indicated that it is possible, through modulation of cytokines added to cultures, to expand specific subtypes of T lymphocytes for adoptive immunotherapy without losing the myeloid progenitor cells necessary for the recovery of 20 neutrophils after umbilical cord blood transplantation. Document EP 2718426 relates to a method for generating T lymphocyte preparations that are specific for at least one target antigen, comprising the steps of expanding lymphoid cells in vitro in the presence of a target antigen or peptide fragments thereof in a expansion step, 25 isolating cells that secrete IFN-γ, IL-2 or TNF-α or express the activation markers CD137 or CD40L. After selection by cultivating these cells in the presence of IL-2 or IL-7, other examples being IL-15 or IL-21, with preference for the combination of IL-2 and IL-7 and an mTOR complex 1 inhibitor ( Rapamycin). Document WO 2009/053109 deals with a method for generating 30 preparations of antigen-specific T lymphocytes for adoptive therapy, comprising the steps of obtaining lymphoid cells from a patient's bone marrow in a first stage of stimulation, where the cells are incubated with the antigens of interest and followed by the selection stage of stimulated cells that
secrete IFN-γ, IL-2 or TNF-α or that are positive for a tetramer related to the target antigen. The selected cells are subjected to a second stage of lymphoid cell expansion in ex vivo cell culture medium in the presence of IL-2 and/or IL-7 and one or more antigens. 5 Despite the growing interest in the development of methodologies for the expansion of cytotoxic T lymphocytes that can be used as an adoptive immunity reference for the treatment of viral infections in immunosuppressed patients, the methods available to date present undesirable characteristics such as the way of obtaining , cost and low 10 availability of starting materials; the use of whole live viruses or viral vectors, compromising the safety of the method; the need to co-culture lymphocytes with other cells, such as dendritic cells and antigen-presenting cells (APCs); the non-use of IL-7 and/or the absence of restimulation in the expansion stage or even the absence of the expansion stage, which reduces the efficiency of the method in relation to the number of cells produced and in relation to the cell purity obtained ; the lack of selection that compromises the safety and specificity of the lymphocytes obtained; the use of low-resolution HLA-1 typing which can compromise the efficiency of the treatment given the rejection of the lymphocyte by the patient. In this scenario, there remains a need to develop an efficient, virus-specific and safe lymphocyte expansion methodology, as well as an efficient and safe product to treat bone marrow transplant patients affected by hCMV infection, aiming to reduce the length of hospital stay. of patients, reducing their morbidity and mortality, in addition to reducing healthcare costs. 25 Based on the above, the objective of the present invention is to provide a more efficient, virus-specific and safe hCMV-specific T lymphocyte expansion methodology to treat bone marrow transplant patients who do not respond to conventional therapies such as antivirals, using cells that are capable of specifically responding to the patient's hCMV infection that is not capable of combating the infection and reducing the patient's hospitalization time. Thus, the inventors surprisingly managed to overcome the problem of the state of the art and developed a methodology for expanding hCMV-specific T lymphocytes from lymphomononuclear cells obtained by
apheresis of healthy platelet donors who are immune to hCMV and who were isolated from the buffy-coat (cell concentrate) of the collection kit, through successive stimulation with a pool of peptides derived from the phosphoprotein 65 (pp65) of the hCMV capsid in the presence of the cytokines IL-2 and IL-7, and selected according to their ability to secrete interferon-γ (IFN-γ) in response to the stimulation of the pp65 peptides for which they were primed, that is, exposed in culture. The lymphocytes obtained by the method of the present invention can be expanded for a prolonged period of time and cryopreserved, and can be used in the treatment of different bone marrow transplant patients who do not respond to conventional therapies, as long as they are HLA class I related. The inventors further believe that the present invention will be the basis for the development of therapies against other viruses and, in the future, will be the basis for alternative therapies for the treatment of viral reactivations in the context of bone marrow transplantation and immunosuppression. 15 BRIEF DESCRIPTION OF THE INVENTION The present invention relates to a method of expanding virus-specific lymphocytes. The present invention also relates to a composition comprising virus-specific lymphocytes and the use of this composition for the manufacture of a cell therapy. BRIEF DESCRIPTION OF THE FIGURES Figure 1 identifies the leukocyte subpopulations (%) present in the starting material after processing (n=5). Figure 2 represents the flow cytometric analysis of the leukocyte populations present among the cells isolated from the spinning top: (A) shows the selection of CD45 cells (leukocytes) versus granularity; (B) shows the selection of T lymphocytes (CD3+), B lymphocytes and Natural Killer (NK) cells (CD3-); (C) shows the separation of T lymphocytes into CD8 and CD4 subtypes (T lymphocyte subpopulations); (D) shows the selection of B lymphocytes (CD19+) within CD3- cells; and (E) shows the selection of 30 NK cells (CD16+CD56+) within the CD3- cells. Figure 3 demonstrates the viability of isolated cells after separation by Ficoll-PaqueTM (n=5). Figure 4A-C shows the validation of the initial cell number and dose of
cytokines for cell expansion. (A) CD4 T lymphocyte proliferation assay with different concentrations of cytokines. (B) CD8 T lymphocyte proliferation assay with different concentrations of cytokines. (C) Lymphocyte proliferation assay with different cell concentrations (IL-2500 UL/mL + IL-710 ng/mL). 5 Figure 5A-D graphically shows the pattern of leukocyte expansion and metabolite detection in the Xuri and G-REX bioreactors over 15 days. (A) Expansion of leukocytes. (B) pH assessment. (C) Glucose assessment. (D) lactate assessment. Figure 6A-D graphically shows the pattern of 10 lymphocyte subpopulations in the Xuri and G-REX bioreactors over 15 days. (A) CD3+ lymphocytes. (B) CD3/CD8+ lymphocytes (CTLs). (C) CD3+CD45RO+CD45RA- Memory Lymphocytes. (D) CD3+CD45RA+CD45RO- naïve lymphocytes. Figure 7A-B shows the comparison between the selected cells (TCB, target cell bag) in the column systems and PRODIGY system. (A) Total number of cells obtained in both systems. (B) Percentage of CD3 T lymphocytes obtained in both systems. Figure 8 shows analyzed purity data of TCBs from manual column and CliniMACS PRODIGY system. Figure 9A-B shows the average number of T lymphocytes (CD3) and CD3 20 T lymphocytes positive for INF-γ in the depleted (NTCB - non target cell bag) and selected (TCB) fractions captured by the CliniMACS PRODIGY system. Figure 10A-D demonstrates the analysis of cells after the IFN-γ capture assay. NTCB - Analysis of the cellular fraction discarded in the capture assay. (A) Selection of cells by SSC vs. FSC. (B) Selection of other cells due to the absence of CD3 labeling (21%), selection of T lymphocytes by the expression of CD3 (78.4%) and then of CD4 (48.6%) and CD8 (50) T lymphocytes ,two%). (C) Selection of T lymphocytes secreting INF-γ CD4 (0.44%) and CD8 (0.20%). (D) Selection within other cells: monocytes (30.4%), NK (36.4%) and B lymphocytes (21.8%). TCB - Analysis of the cellular fraction enriched in the capture assay. (A) Selection of cells by SSC vs. FSC. (B) 30 Selection of other cells due to the absence of CD3 marking (6.52%), selection of T lymphocytes by expression of CD3 (92.7%) and then CD4 (33.7%) and CD8 T lymphocytes (59.7%). (C) Selection of T lymphocytes secreting INF-γ CD4 (99.2%) and CD8 (33.7%). (D) Selection within other cells: monocytes (32.6%), NK (13.5%) and
B lymphocyte (31.5%). Figure 11A-F demonstrates the analysis performed by the Clinical Pathology Laboratory of cells after the INF-γ capture assay. TCB - Analysis of the cellular fraction enriched in the capture assay. (A) Cell selection by FSC-H 5 vs. FSC-A. (B) Selection of other cells labeled for CD45 - Leukocytes (80.1%). (C) Selection of viable cells by exclusion of cells labeled with 7-AAD (74.4%) and then (D) selection of lymphocytes by expression of CD3 (99.5%), followed by (E) T lymphocytes CD4 (4.7%) and CD8 (92.2) and (F) Selection of T lymphocytes (CD3) secreting INF-γ (100%). 10 Figure 12 demonstrates the analysis of cell death with Propidium Iodide by product flow cytometry. (A) Distribution of cells by size (FSC) vs. granularity (SSC). (B) Variation in the percentage of viable cells (propidium iodide negative) according to the thawing time of cells from Donor 15IVN9083 that had been frozen for around 7 days. (C) 15 Variation in the percentage of viable cells (propidium iodide negative) according to the thawing time of cells from Donor 18FS4945 that had been frozen for approximately 6 months. (D) Variation in the percentage of viable cells (propidium iodide negative) according to the thawing time of cells from Donor 24MAPM6923 that had been frozen for around 11 months.20 Figure 13 shows the ELISpot result of the product: B300121394945- donor : 18FSH4945. Figure 14 shows the ELISpot result of the product: B300121391223- donor: 59TPAA1223. Figure 15 shows the ELISpot result of the product: B300121327279- 25 donor: 60GDD2727. Figure 16 shows the flow cytometry result regarding the percentage of MCR-5 fibroblasts positive for CMV infection. Figure 17 depicts the specific production of IFN-γ by T lymphocytes in co-culture for 24 and 48 h with fibroblasts infected with the AD169 strain of cytomegalovirus. Product: B300121394945/Donor: 18FSH4945. Figure 18 details the percentage of MCR-5 killing by T lymphocytes of 3 products after 48 h in culture. DWRITING DDETAILED OF INVENTION
The present invention relates to a method of expanding virus-specific lymphocytes, which comprises the steps of: (I) pre-expansion from a sample of lymphomononuclear cells, which comprises the steps of: 5 (a) separating the cells peripheral blood mononuclear cells (PBMCs); (b) centrifugation and discarding the supernatant; and (c) resuspension of PBMCs; (II) expansion of cells in vitro, 10 (III) selection of lymphocytes positive for INF-γ. In a preferred embodiment, the method of expanding virus-specific lymphocytes additionally comprises the step of (IV) freezing at -80 ° C. In another preferred embodiment, the sample(s) of lymphomononuclear cells is(are) obtained from the buffy-coat (cell concentrate) generated in the donation of platelets by apheresis, which are retained in the center of the kit. collect. Preferably, the lymphomononuclear cells are obtained from a whole blood sample. More preferably, the platelet donor suitable for the present invention is immune to hCMV (IgM negative, IgG positive). Particularly, said donor is a regular platelet donor. 20 To carry out the separation step (a), common separation techniques can be used. In a preferred embodiment, step (a) of separating peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) from the sample is carried out by gradient separation. Preferably, step (a) is followed by a step of counting 25 cells and checking cell viability, wherein the sample acceptance criteria are a number of at least 6x108 total cells and at least 90% viability, such as 90% to 100%. Cell counting and cell viability analysis can be carried out according to various protocols and equipment available in the art, such as by means of microscopy, serial dilution, automatic counting in a blood count reader, staining and flow cytometry. From the sample obtained in (a), step (b) of centrifugation and discarding of the supernatant is carried out. In step (c), part of the sample obtained in step (b) is resuspended in
culture medium and/or buffer, such as, but not limited to, phosphate-buffered saline (PBS), and the remainder of the sample is resuspended in cryoprotectant solution for freezing at -75 °C to -95 °C. In a preferred embodiment, the cryoprotectant solution comprises Voluven® 6% or a mixture of hydroxyethyl starch and 6% sodium chloride, 20% human albumin and dimethyl sulfoxide (DMSO). In an even more preferred embodiment, the cryoprotectant solution comprises 50% Voluven® 6%, or a mixture of hydroxyethyl starch and 6% sodium chloride, 40% 20% human albumin and 10% dimethyl sulfoxide (DMSO), relative to the volume of the cryoprotectant solution. 10 In a preferred embodiment, step (II) of expanding cells in vitro comprises the steps of: (d) inoculating the cells obtained in step (I) in a bioreactor comprising culture medium comprising IL-2 and IL-7 at a temperature of 37ºC+1OC (may have greater variations when collecting samples 15 for the analyzes described here), pH between 7.0 and 7.5 and 5% CO2; (e) stimulation of cells with the hCMV virus capsid peptide; and (f) restimulating the cells with the hCMV virus capsid peptide and PBMC cells from the same sample previously frozen in step (c). 20 Preferably, step (II) of the method further comprises the step of: (g) adding culture medium in a volume suitable for maintaining cell concentration. More preferably, step (II) of the method further comprises the step(s) of: 25 (h) evaluating the number of T lymphocytes and the viability of the cells, in which expansion is considered adequate when the number of lymphocytes final is at least double the initial number of lymphocytes and viability is at least 80%; and/or (i) reducing the culture volume, where the reduction is preferably carried out by filtration, centrifugation and/or plasma extractor. Other techniques for reducing the culture volume are also known in the art and can be used alternatively and/or in conjunction with filtration, centrifugation and/or plasma extractor techniques.
The bioreactor can be an open or closed system. Preferably, the bioreactor is a closed system. In a preferred embodiment, cell cultivation is carried out at a preferred temperature of 37°C+1OC (may have greater variations when collecting samples for the analyzes described here), 5 more preferably at a temperature of 37°C. Cell culture can occur at neutral pH. In a preferred embodiment, the pH is between 7.0 and 7.5. In a preferred embodiment, the CO2 concentration of the cell culture in the bioreactor is kept stable. Preferably, the CO2 concentration is 5% (v/v). In a preferred embodiment, step (e) of stimulating cells 10 with the hCMV virus capsid peptide is carried out with the hCMV virus pp65 peptide (UniProt ID: P06725). Even more preferably, stimulation of cells with the hCMV virus capsid peptide is performed with the PepTivator CMV pp65 peptide obtained commercially from Miltenyi Biotec®. PepTivator CMV pp65 is a peptide pool consisting mainly of 15-mers with overlapping 11 amino acids (aa), covering the complete sequence of the cytomegalovirus pp65 protein (UniProt ID: P06725). Preferably, step (f) of restimulating the cells is carried out through successive stimulation with the hCMV virus capsid peptide and with PBMC cells from the same sample previously frozen in step (c), followed by the addition of culture medium in adequate volume to maintain cell concentration and (h) assessment of the number of T lymphocytes and cell viability, in which expansion is considered adequate when the final number of lymphocytes is at least twice the initial number of lymphocytes and viability is at least 80%. In a preferred embodiment, step (i) of reducing the culture volume is followed by an additional sampling step for cell counting, viability analysis and karyotype analysis; and/or carrying out a sterility test. Sterility tests can evaluate the presence of aerobic and anaerobic microorganisms, such as Mycoplasma pneumoniae. Furthermore, endotoxin tests can be performed. Several methodologies 30 are available in the art for karyotype analysis and carrying out sterility and endotoxin testing that are known to professionals in the field. Preferably, the determination of viability and cell counting uses the Countess II Automatic Cell Counter equipment (Thermo
Fisher), in which the cells are stained with 0.4% trypan blue, transferred to a disposable slide and automatically counted by the equipment. Counting can also be done using the ABX Micros ES60 equipment (Horiba) or by microscopy. In another preferred embodiment, cell viability is determined by flow cytometry. In a preferred embodiment, the karyotype analysis is carried out by karyotyping 10 metaphases and analyzing the others, with or without fluorescence in situ hybridization (FISH). Preferably, if abnormalities are found, 10 more metaphases are analyzed. In a preferred embodiment, the sterility test is carried out by submitting cellular samples to microbiological tests, which can be complemented by a pyrogenicity test through the evaluation of endotoxins. Several sterility tests are known in the art and can be used in an alternative or additive way to prove the safety of the methodology, composition and product obtained by the method of the present invention. Preferably, microbiological tests are carried out in Bactec flasks (BD), which are added with media for the growth of specific microorganisms: BD Bactec plus aerobic medium (for aerobic microorganisms), BD Bactec plus 20 anaerobic medium (for anaerobic microorganisms) and BD Bactec Myco/F Lytic (for special microorganisms). Particularly, the tests are carried out on the BD Bactec FX equipment. Preferably, for Myco-F vials, the incubation time is 42 days. Alternatively or jointly, samples can also be analyzed using the compendial sterility test in fluid thioglycolate media (THIO) and casein-soy broth (TSB) cultured for 14 days. The specific conditions for each medium are known to a person skilled in the art and are part of routine laboratory activities. Preferably, samples incubated in THIO medium are cultured at 32.5±2.5°C for 14 days and samples incubated in 30 TSB medium are cultured at 22.5±2.5°C for 14 days. In a preferred embodiment, the endotoxin test is performed using the Endosafe nexgen-PTS (Charles River) equipment and the results are analyzed in the LIMS or Charles River Cortex software. The acceptance criteria in
international units is < 5 IU/mL. In a preferred embodiment, testing for Mycoplasma pneumoniae contamination is performed by molecular biology. Preferably, DNA from the initial and final culture medium samples is extracted using Qiagen's DSP 5 Virus/Pathogen mini kit (catalog number 937036) and the nucleic acids can be used directly for PCR analysis. The RT-PCR process can be carried out automatically using the Universal Disc (Focus) and the samples can be processed on the 3M Integrated Cycler equipment (Focus/3M). In a preferred embodiment, step (III) comprises the steps of (j) capturing INF-γ-producing cells in a capture system, (k) optionally, enriching INF-γ-positive cells; and (l) cellular immunophenotyping by flow cytometry. The capture of INF-γ-producing cells can be carried out in an open and/or closed system. The capture can also be carried out manually or automatically. In a preferred embodiment, step (j) of capturing INF-γ-producing cells in a capture system is carried out in an open and manual system. In another preferred embodiment, step (j) of capturing INF-γ-producing cells in a capture system is carried out in a closed and automatic system. A further 20 cell capture techniques are known in the art and can be used as an alternative to the technique described here. Preferably, capture in an open and manual system is carried out after expansion of CMV-specific cells in a bioreactor, through the isolation of IFN-γ-producing cells using the detection and enrichment kit for 25 IFN-γ-secreting cells (MACS Miltenyi Biotec ) using a disposable LS column (Miltenyi Biotec). Preferably, new separation is performed on another LS column to ensure purity and enrichment of IFN-γ positive cells (step (k)). The result of positive selection is the TCB fraction, and the unselected cells are in the NTCB fraction. 30 Preferably, capture in a closed and automatic system is carried out after expansion of CMV-specific cells in a bioreactor, using the CliniMACS PRODIGY equipment (Miltenyi Biotec). The equipment sterilely and automatically performs the selection (enrichment) of cells positive for IFN-γ and the
separation of fractions with discarded cells and cells enriched in quality control bags. In a preferred embodiment, step (l) of cellular immunophenotyping is done by flow cytometry for the expression of IFN-γ to verify the 5 isolated and depleted cell populations. In a preferred embodiment, cell markers are used in the panel: 7-Actinomycin D (7-AAD for cell viability), and for cell populations the antibodies: CD45, CD3, CD4, CD8, CD11b and INF-γ, in which the Antibodies are qualified through titration to verify their function and specificity. Other cellular immunophenotyping techniques are known in the art and can be used as an alternative to the technique described here. Preferably, at the end of the selection, the TCB presents a value above 80% of IFN-γ positive cells and above 80% of T lymphocytes with viability also above 80%. In a preferred embodiment, the supernatant of the NTCB fraction is sent for microbiological tests of aerobic, anaerobic, fungal and special microorganism cultures, as described above. Additionally, the supernatant can be sent for endotoxin testing and sterility testing. The supernatant of the TCB fraction can be sent for serological tests, including, but not limited to, serology, NAT, PCR and in situ hybridization, 20 and may also include testing for impurities through the quantification of IL-2 and IL-7 in the supernatant of the cells and potency testing, for example, through quantification of IFN-γ in the co-culture supernatant of hCMV-specific lymphocytes and hCMV-infected fibroblasts. Several serological tests are available in the technique and are part of the routine activities of a professional in the field, such as the NAT test, from the English “Nucleic Acid Test”. In particular, the amplification and detection of nucleic acids can be carried out by polymerase chain reaction (PCR). The technique can be used for any pathogen with a known genome, including, but not limited to: human immunodeficiency virus (HIV), human T-cell lymphotropic virus (HTLV-I), hepatitis C virus (HCV), hepatitis C virus (HCV), hepatitis B (HBV), cytomegalovirus (CMV), Epstein–Barr virus (EBV), parvovirus B19, Mycoplasma pneumoniae etc. NAT can be performed manually or automatically. Kits for performing NAT are also commercially available.
for one or more pathogens of interest. Alternatively or in a complementary way, the safety of lymphocytes at the end of each step of the method of the present invention can be assessed by traditional serology that investigates the presence or absence of antibodies in the samples. In a preferred embodiment, TCB supernatant samples are analyzed by NAT serology for HIV, HTLV-I, HCV, HBV and by PCR for CMV, EBV and Parvovirus B19 and Mycoplasma pneumoniae. In a preferred embodiment, step (IV) of freezing the TCB and NTCB fractions is carried out in a cryoprotectant solution and the cells are kept in a freezer at -80 ºC. In a preferred embodiment, the method further comprises a thawing step (V). Even more preferably, the defrosting step takes place at a temperature of 20 to 40 °C, preferably 37 °C+1OC (may have greater variations when collecting samples for the analyzes described here). In a preferred embodiment, thawed lymphocytes are selected by HLA compatibility and infused into patient 15 intravenously. The present invention also relates to a composition comprising virus-specific T lymphocytes and one or more additional components. Particularly, the composition is a pharmaceutical composition. The expression “pharmaceutical composition” designates a preparation that is in a form that allows the biological activity of an active ingredient contained therein to be effective. Preferably, the virus-specific T lymphocytes contained in the composition are obtained by the method of the present invention. Even more preferably, the additional components comprise, but are not limited to a pharmaceutically acceptable carrier, a mixture of hydroxyethyl starch and sodium chloride 6%, Voluven 6%, human albumin 20%, dimethyl sulfoxide (DSMO) and mixtures thereof. The term “pharmaceutically acceptable carrier” means an ingredient in a pharmaceutical composition, other than the active ingredient, that is non-toxic to the patient. The definition of a pharmaceutically acceptable carrier includes, but is not limited to, buffer, excipient, stabilizer or preservative and are known in the art. Professionals in the field are highly capable of determining the pharmaceutically acceptable vehicle for each composition and purpose. Additionally, the present invention relates to the use of a composition comprising virus-specific T lymphocytes and one or more
additional components to manufacture a cell therapy to treat viral infections. Preferably, viral infections are selected from human cytomegalovirus (hCMV), adenovirus, Epstein-barr virus (EBV), polyomavirus (BK virus) and human herpesvirus 6 (HHV-6). 5 Preferably, the patients to be treated are bone marrow transplant patients who do not respond to conventional therapies such as antivirals. Preferably, the quality grade of the reagents is clinical grade or GMP (Good Manufacturing Practice), complying with Good Production Practices and can be produced in accordance with the ISO 13485 quality system, with the standards determined by the National Agency of Health Surveillance (ANVISA) and/or with the standards determined by the Food and Drug Administration (FDA) for medical devices. DEFINITIONS 15 Unless otherwise indicated, terms used in the present application should be understood in accordance with conventional usage by those skilled in the art. The term “cell therapy”, as used herein, is interchangeable with the term “medicine”, and can be understood as a product used to treat diseases through the alteration or restoration of cells that may or may not belong to the patient being treated. By “medicine” or “cell therapy”, the subject matter of the present invention must be understood in any pharmaceutically acceptable form, which may be a solid or liquid form; Non-limiting examples are tablets, capsules, solution, suspension, among others. The term “apheresis” is related to the separation of blood components by centrifugation, using automated equipment. The donor's blood is collected and the machine separates the components of interest. The blood returns to the donor's body through the same venous access and the collected material undergoes serological tests. During platelet donation by apheresis, there is an accumulation of lymphomononuclear cells in a compartment located in the central region of the collection kit 30, which we call the “spinning top”. In this compartment, the volume of accumulated blood varies between 8 and 10 mL, which after dilution, can result in an average volume of 30 mL and the number of cells present in the compartment is on average 6.6x107 /mL, with the total number of leukocytes averaging 2x109 with about
79% lymphocytes, while the rate of lymphocytes in a whole blood sample is about 30%. In addition to the high rate of lymphocytes in the sample, the starting material collected in the spinning top does not involve the cost of donation, as it is waste material from the platelet donation procedure. Furthermore, the material can be collected in a safe and sterile way. Preferably, donors are repeat donors who have a history of sequential serology. Furthermore, during the platelet donation procedure, a clinical screening questionnaire, screening assessment and serological tests on donors are carried out to ensure the health and safety of both the donor and the recipient of the collected material. 10 The term “serological test”, as now used, refers to any and all tests based on serology, that is, on the presence or absence of antibodies specific to pathogens, as well as biological materials and the pathogens themselves, in samples biological samples, particularly blood, to concretely determine their presence in the samples. The biological materials of pathogens including, but not limited to, antibodies, peptides, proteins, nucleic acids and antigens can be identified by techniques well known in the art such as immunochromatography, immunohistochemistry, polymerase chain reaction (PCR), hybridization of labeled probes, immunoenzymatic tests such as enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA), nucleic acid test (NAT), chemiluminescence, among others. The term “whole blood” refers to a blood sample in which all components are present: plasma, red blood cells, white blood cells and platelets. White blood cells, also known as leukocytes, are the defense cells that the body produces so that the body can defend itself from foreign elements that may pose a threat and include, particularly, peripheral blood mononuclear cells. The term “peripheral blood mononuclear cell” (PBMC) as well as the term “lymphomononuclear cell” refer to any peripheral blood cell with a round nucleus, consisting of lymphocytes (T cells, B, Natural Killer (NK) cells) and monocytes, while erythrocytes and platelets lack a nucleus, and granulocytes (neutrophils, basophils, and eosinophils) have multilobed nuclei. The term “allogeneic transplant,” as used here, refers to the
transplant in which the cells or organs come from another individual (donor), according to the level of compatibility of the blood material. The term “sterile” and its variants as used herein refer to environments, objects or surfaces in which microorganisms are absent or are incapable of reproducing. There are several techniques for sterilizing materials, such as autoclave, flame, oven, bactericidal or bacteriostatic chemicals, UV radiation, ultrafiltration, etc., as well as several techniques for checking suitable sterility are also known in the art. The term “about” used herein refers to a value of 5 to 10% to 10 plus or minus the values to which it refers. The term “cell viability” as used herein refers to the analysis of metabolically active cells in a cell culture and/or sample in order to evaluate their activity qualitatively and/or quantitatively. Several techniques for determining cell viability are known in the art and can be used alternatively or concomitantly. “Cytokines” are proteins that regulate the immune response, including but not limited to interleukins and interferon-γ (IFN-γ). Interleukins (IL) are produced by leukocytes in response to microorganisms and other antigens. IL-2 is the main T cell stimulating factor as a growth and activation factor for all subpopulations of T lymphocytes. IL-7 is a cytokine that stimulates the growth and maturation of B lymphocytes and activation of lymphocytes T, being secreted by stromal cells of the bone marrow and thymus. INF-γ is responsible for attracting macrophages, which help remove cell debris and promote healing and reorganization of areas with inflammation. 25 INF-γ is the main cytokine released after the induction of the adaptive immune response, being produced by effector T lymphocytes. Other lymphocyte stimulators are known in the art and can be used alternatively or concomitantly. Among them are anti-CD3 and anti-CD28 antibodies, which induce the activation of T lymphocytes because the T lymphocyte receptor is associated with complexes of CD3 and CD28 molecules. The term “naïve lymphocyte” as used here corresponds to mature T cells originating from lymphoid organs that have never recognized the antigen to which they are specific, that is, they have never been activated by cells presenting
antigens (APCs). As used herein, the term “lymphocyte expansion” corresponds to the clonal expansion of lymphocytes. Clonal expansion begins with the activation of lymphocytes through the presentation of the antigen of interest through histocompatibility complex class II (MHC II) molecules from APCs to T lymphocyte receptors (TCRs). This presentation promoted by the APC is called “stimulus”. Antigen recognition allows the interaction of co-stimulatory molecule complexes and the secretion of cytokines, which in turn ensure the survival of T cells specific to the antigen and activate factors that promote the exposure of specific gene segments leading to cellular differentiation of the antigen. lymphocytes subdivided into subtypes (Th1, Th2 and Th17), which can be identified according to the cytokine they produce most (INF-γ, IL-4 and IL-17, respectively). In the present invention, the “stimuli” are preferably carried out by direct exposure of the lymphocyte to peptides from the human cytomegalovirus viral capsid that can be presented via MHC to these lymphocytes by mononuclear cells and B lymphocytes present in the culture during expansion under the influence of cytokines IL-2 and IL-7. The term “karyotype” as used here refers to the analysis of the diploid chromosome set of a species, representing the total number of 20 chromosomes in a somatic cell. Typically, a human cell has 46 chromosomes. The term “infusion” as used herein refers to the administration of intravenous fluids to patients. The term "product" as used herein refers to the product of the virus-specific lymphocyte expansion method of the present invention, comprising the virus-specific lymphocytes themselves or the composition of the present invention. SELECTION OF STARTING MATERIAL DONOR A) TRIAGEM WLINE 30 In the present invention, clinical screening of donors is carried out in compliance with Collegiate Board Resolution - RDC no.214, of February 7, 2018. Briefly, donors must be healthy people and meet all criteria for blood donation: overweight of 55 kg, hemoglobin (Hb) and
hematocrit (Ht) (with the minimum for women being Hb=12.5g/dl and Ht=38% and for men the minimum being Hb=13.0g/dl and Ht=39%), blood pressure within limits (blood pressure systolic blood pressure between 120-180 mmHg and diastolic blood pressure between 70-100 mmHg), pulse rate between 50 and 100 bpm, answer the 5 standard blood donation questionnaire that may include one or more health history, including ongoing pregnancy; vaccination history; travel history and exposure to infectious agents, history of transfusion of blood products and use of blood products; history of tissue, cell or organ transplantation and xenotransplantation, etc. Hematocrit (Ht) is the ratio between the erythrocyte volume in relation to the total volume of blood, expressed as a percentage where the reference value for blood donation for an adult man is 39 to 54%, and for an adult woman , from 38 to 48%. Hemoglobin (Hb) can be measured in a blood sample to indicate the blood's ability to carry oxygen to tissues. The Hb reference values are: men: 13 to 18 g/dL and women: 12.5 to 16 g/dL. Reference values may vary according to the parameters and techniques used. Donors eligible for donation and who are donating the platelet collection kit for the CMV study must sign an Informed Consent Form (TCLE). B) SEROLOGICAL TESTS After donating platelets, the donor's blood is evaluated for the presence of markers for infectious diseases transmitted by blood, according to criteria determined in Collegiate Board Resolution - RDC no. 214, of February 7, 2018 and other legislation current conditions: Hepatitis B and C, HIV 1 and 2, HLTV I and II, Syphilis and Chagas and NAT for Hepatitis B and C and HIV 1 and 2. As an inclusion criterion, only donors who present negative serology 25 for such diseases are eligible for cell expansion. The presence of IgM and IgG immunoglobulins for CMV must also be assessed in the blood of these donors and high-resolution HLA and ABO/Rh typing must be performed. Additionally, donors must respond to the questionnaire and clinical assessment to analyze the risk of transmissibility of spongiform encephalopathies (TSE). C) HIGH-RESOLUTION HLA TYPING The term HLA (from the English “Human Leukocyte Antigens”) represents a complex of genes that code for immune system proteins unique to
each person, which may comprise distinct HLA I and II loci. The main HLA loci are A, B, C (class I), DR, DP and DQ (class II) among others, and the resolution of typing by molecular biology methods, including sequencing, is related to the depth of the analysis. Low/medium resolution HLA Typing 5 identifies the allelic group to which the gene(s) belong and the result is based on DNA at the level of the digits that make up the first field in the nomenclature. High-resolution typing identifies the specific HLA protein at the level of the digits that make up the second and third fields in the DNA-based nomenclature. HLA typing can be done using blood samples through serology, biochemistry or PCR/DNA sequencing. The high-resolution exam is performed by PCR or DNA sequencing. D) ABO/R TYPING The ABO system is a classification of human blood into four types: A, B, AB and O, while the Rh factor is a classification of human blood according to the presence or absence of a group of D antigens found in red blood cell membranes. ABO/Rh typing is widely known in the art and can be performed using gel agglutination to verify the presence/absence of antigens and antibodies from the ABO system and D antigen from the Rh system. E) YOROLOGY FOR CMV 20 The presence or absence of immunity to hCMV can be determined by serology or other techniques known in the literature. In the present invention, serology for CMV of platelet donors is preferably carried out by evaluating antibodies of the IgM and IgG isotypes against the CMV virus. Ideally, donors should present results for non-reactive IgM (negative) and reactive IgG 25 (positive). Serology for CMV can be performed from serum, plasma or whole blood samples and through various quantitative and/or qualitative methodologies known in the art, such as immunochromatography, enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) or chemiluminescence. 30 FANANALYSIS OF TRANSMISSIBILITY OF ANDNCEPHALOPATHIES ANDSPONGIFORMES (EET) The platelet donor samples used in the present invention come from blood donors evaluated through clinical screening who are not at risk for EET in accordance with Collegiate Board Resolutions - RDC no.214
of February 7, 2018, RDC No. 305 of November 14, 2002 and Ordinance 158, February 4, 2016. AndEXAMPLES The following Examples are not intended to limit the scope of the claims of the invention, but are especially intended to be exemplary of certain embodiments. Any variations of the exemplified methods that occur to one skilled in the art are intended to be included within the scope of the present invention. EXAMPLE 1 – PRE-EXPANSION STAGE (I) 1.1RIGEM AND WARACTERIZATION DO MMATERIAL DAND PARTIDA T lymphocytes were obtained from lymphomononuclear cells from the buffy-coat generated in the donation of platelets by apheresis by regular blood donors, submitted to the clinical screening questionnaire, screening assessment and signing of informed consent form, and the samples were submitted to serological tests, high-resolution HLA typing, ABO/Rh typing, CMV serology and EET analysis, as described above. The blood sample, also called starting material, is retained in the center of the collection kit in a central compartment which we call “spinning top”, this compartment accumulates a blood volume of 8 to 10 mL. After platelet donation, the collection kit was sterile sealed and the spinning top was removed without opening the platelet collection system and transported in a waterproof bag inside the rigid thermal suitcase suitable for transporting biological material at room temperature ( 20 to 24 ºC). Platelet donations took place in the Hemotherapy Sector of Hospital Israelita Albert Einstein. 1.2 ANALYSIS OF STARTING MATERIAL After transport, the volume of cells present in the spinning top was removed aseptically with the aid of a syringe and 21G needle in laminar flow. After aspiration using a syringe and needle, the entire volume of cells contained in the spinning top was transferred to a 50 mL conical tube and an aliquot was removed to perform cell counting in the ABX Micros ES60 automatic cell counter. The number of cells present in the compartment was on average 6.6x107/mL and the total number of leukocytes was on average 2x109 cell. with about 79% lymphocytes, as shown in Table 1.
“PION” COMPARTMENT (N=5).
The volume of blood was diluted 15 times with phosphate buffer saline (PBS; commercially available from ThermoFisher Scientific Gibco)) in the proportion of 1 volume of blood: 15 volumes of diluent, reaching an average volume of 30 mL. 1.3 PROCESSING OF STARTING MATERIAL - SEPARATION OF PERIPHERAL BLOOD MONONUCLEAR CELLS (PBMCS) To eliminate erythrocytes and the majority of granulocytes present in the samples, PBMCs were separated by density gradient with Ficoll-PaqueTM Premium (manufactured by the company Cytiva) in which erythrocytes, granulocytes and dead cells pass through the Ficoll layer, while lymphocytes and monocytes, due to their size/density, accumulate at the interface between plasma and Ficoll-PaqueTM. The diluted cells (30 ml) were placed on a 15 ml layer of Ficoll-PaqueTM Premium in 50 mL conical tubes and centrifuged in a Thermo Scientific Sorvall ST 16R Centrifuge for 40 minutes, 500 G, temperature 20 to 24 ºC, without brake. Approximately four 50 mL conical tubes were needed to separate all the cells. After centrifugation, the mononucleated cells present at the interface between Ficoll-PaqueTM Premium and diluted donor serum were removed using a sterile pipette and transferred to a new 50 mL conical tube. A new aliquot was removed for cell counting on the ABX Micros ES60 equipment and for viability analysis on the Countess equipment. From the material isolated from the spinning top, an average of 1.00x108 leukocytes/mL. For a volume of 10 mL, the total number of leukocytes varied between 0.8x109 and 2.5x109 (n=5) (Table 2). The results of automatic cell counts in a blood count reader showed high
concentration of lymphocytes (80% ±13%) and monocytes (10% ±3.0%) and low frequency of granulocytes (13% ± 4%) with efficient elimination of erythrocytes demonstrated by the average hematocrit of 0.78% (Table 2 ). The frequencies are shown in Figure 1. 5 TABLE 2 - GENERAL CHARACTERISTICS OF 5 SAMPLES PROCESSED BY GRADIENT DAND DENSITY (N=5)
The population of total lymphocytes presented in blood counts performed on automatic cell counters comprises T lymphocytes (helper and cytotoxic), B lymphocytes and Natural Killer (NK) cells. These cells cannot be differentiated 10 in automatic counters because they have similar characteristics of size and granularity. Therefore, to determine the percentage of distinct cells within the total lymphocytes, immunophenotyping was performed by flow cytometry of the populations of leukocytes (CD45+), T lymphocytes (CD3+), helper T lymphocytes (CD3+CD4+), cytotoxic (CD3+ CD8+), B lymphocytes (CD3-CD19+) and NK cells (CD3- 15 CD16+CD56+) present in the sample, as shown in Figure 2. Within the population identified as total lymphocytes, around 60% are T lymphocytes (among the lymphocytes T, there are about 70% helper lymphocytes (CD4+) and 22% cytotoxic T lymphocytes (CD8+), and 35% other cells composed of 20% B lymphocytes and 68% NK cells). 20 These data showed that the selected sample has all the cells necessary for the development of the method and that the separation of PBMCs by Ficoll-PaqueTM contributes to the enrichment of T lymphocytes in the sample. To analyze the cell viability of the samples after separation by a Ficoll-PaqueTM gradient, a 1:1 dilution of PBMCs and Blue
Trypan 0.4%, and the presence of blue-stained (dead) and translucent (alive) cells was evaluated by light microscopy. The viability of the isolated cell samples remained above 95% for all samples tested, as shown in Figure 3. Cells that met the appropriate number characteristics (equal to or greater than or equal to 6x108 total cells) and viability (greater than 90%) were centrifuged again for 10 minutes, 500 G, at a temperature of 20 to 24°C. After centrifugation, the supernatant was discarded and approximately 3.0 to 4.5x108 of the initial total cells were resuspended in culture medium at a concentration between 1.0 and 1.5x106/mL (300 mL) to proceed to the expansion phase in the G-REX bioreactor or after validation in the XURI cell expansion system W25 - GE Healthcare bioreactor. 1.4CFREEZING DTO THE WCELLS ANDEXCEEDENTS PARA RAND-STIMULUS Surplus cells that were not expanded were frozen in 5 mL cell freezing tubes, or in a freezing bag using 40% Voluven® 6% (commercially available from Fresenius), 40% human albumin 20% (commercially available from Grifols) and 20% DMSO (CryoPur commercially available from Origen) in a 1:1 ratio to be used later to restimulate lymphocytes in culture. Particularly, a number of total cells equal to or greater than 3.5x108 was frozen. Freezing occurred after centrifuging the cells in a 50 mL conical tube at 500 G for 5 minutes at a temperature between 20 and 24 °C. The supernatant was discarded and the cells were resuspended in the cryoprotectant solution of 40% Voluven® 6%, 40% human albumin 20% and 20% DMSO, in a 1:1 ratio (diluted cells: cryoprotectant solution), respecting the condition of that the concentration of cells for freezing must be 1x107/mL. The cells were transferred to duly identified 5 mL cell cryopreservation tubes, placed in an alcohol-free freezing system (Corning® CoolCell™ 5 mL LX Cell Freezing Container) and placed in a freezer at a temperature between -75 and -90 °C for 24 hours. Afterwards, the tubes were transferred to a properly identified box and could remain frozen for up to 2 years at temperatures between -75 and -90 °C.EXAMPLE 2 - ETAPA (II) IN ANDXPANSION IN BIOREACTOR SYSTEM XURI
2.1 VALIDATION OF THE INITIAL NUMBER OF CELLS AND DOSE OF CYTOKINES FOR CELL EXPANSION The initial number of cells for expansion was defined after standardizing cell expansion with various doses of cytokines and various cell concentrations. For IL-2 (recombinant human IL-2, commercially available from R&D Systems), the minimum concentration was determined as 500 IU/mL, and up to 1,000 IU/mL could be used during the expansion process. For IL-7 (recombinant human IL-7, commercially available from R&D Systems), the ideal concentration was defined as 10 ng/mL. For cell concentration, a minimum of 1x10 was defined6 cell./mL and the ideal number of 1.5x106 cell./mL. The results are shown in Figure 4A-C. 2.2 ASEPTIC PREPARATION OF THE XURI BIOREACTOR At least 4 hours before the start of expansion, the Xuri cell bag - 2L was installed in the XURI cell expansion system W25 bioreactor system. The bag was opened under sterile conditions and it was checked that all connections were closed so that the bag could then be installed in the bioreactor (rods, filter heater, pumping tubing). Unicorn software (Cytiva) was started according to the parameters of pocket size, optical density (OD), and pH. The “fast fill” parameter was set to 30 minutes and the CO valuetwo was adjusted to 5% (v/v). AIM-V culture medium (commercially available from ThermoFisher Scientific (Gibco)) supplemented with 10% Human AB Serum (commercially available from Valley Biomedical), 1% 200 mM L-glutamine (commercially available from ThermoFisher Scientific (Gibco)) , 1% 1 M HEPES (commercially available from ThermoFisher Scientific (Gibco)) and 1% non-essential amino acids (commercially available from ThermoFisher Scientific (Gibco)) was prepared in laminar flow in a sterile transfer bag and connected to the system via connection sterile. The medium necessary for lymphocyte expansion was added to the system so that it was equilibrated by the gas mixture (CO2 and compressed air) for at least 2 hours. In the Unicorn software, the inclination of the stirring platform and the semi-static stirring speed of 2 rpm and an angle of 2º were also determined. The gas flow was maintained at 0.05 Lpm so that this culture was at temperature.
37 °C and the percentage of CO2 at 5%. After at least 2 hours of equilibration of the culture medium in the system, the pH of the culture medium was measured and added as a parameter in the Unicorn software. The pH must be maintained between 7.0 and 7.5 and the minimum volume to start lymphocyte expansion in the XURI Bioreactor was 300 mL containing a minimum of 1.0x106 cell./mL, the maximum being 1.5x106 cell./mL. 2.3 CELL EXPANSIONS IN XURI BIOREACTOR WITH STIMULATION OF CYTOKINES AND CMV-SPECIFIC PEPTIDES After stabilizing the XURI cell expansion system W25 as described above, cells were added at a minimum concentration of 1x106 cell./mL. The cytokines IL-2 (500 IU/mL) and IL-7 (10 ng/mL) were used in supplemented AIM-V medium and 1 μg of the hCMV virus capsid peptide pp65/mL (Peptivator pp65) (commercially available from Miltenyi Biotec). Stimulation with the peptide occurred in a 150 mL transfer bag containing the final volume of 100 mL of cells diluted in culture medium, remaining for 2 hours in the CO2 oven and after this period, the volume was transferred via sterile connection to the XURI bag, which already contained 200 mL of previously balanced medium. The culture lasted from 14 to 21 days. In the first 3 days, culture conditions were maintained as semi-static (2 rpm and 2º angle) and gas flow of 0.05 Lpm. In order for this culture to remain undisturbed, no samples were removed in the first 3 days of culture. From day 5 onwards, the culture conditions were changed to a shaking speed of 4 rpm and a shaking angle of 4º. On the seventh day, the culture returned to semi-static condition (2 rpm and 2° angle) and the cells were restimulated with 1 μg of the capsid peptide of the hCMV pp65/mL virus and PBMC from the same sample that was previously frozen, as per described in the item “freezing excess cells for restimulation” (Example 1-1.4). The cell culture restimulation procedure for the XURI system is described below (item 2.4). The culture was supplemented with fresh culture medium always in accordance with the dosage of metabolites in the culture supernatant (glucose and lactate), measured routinely by a technician in the field. Was added
the volume of medium suitable for the cell concentration to remain at 1x106 cell./mL via transfer bag and sterile connection to the XURI bioreactor inlet route. The culture should not exceed 21 days and, at the end of the culture, the number of T lymphocytes and cell viability were evaluated. At this stage, expansion whose final number of lymphocytes was at least twice the initial number of lymphocytes was considered adequate. 2.4 RESTIMULATION OF CELL CULTURE FOR THE 10 minutes. After centrifugation, the supernatant was discarded and the pellet was resuspended in supplemented AIM-V culture medium. Cell viability was checked according to the protocols described here, which must be above 80% and the concentration can vary between 1:1 and 1:10 of new cells for each cell in culture depending on the number of cells available. For example, if there are about 5x108 cells in culture, restimulation can vary between 5x107 and 5x108 viable cells. After verifying that the cells were suitable for restimulation, the cells were transferred to a 150 mL transfer bag with the aid of a sterile access and a syringe and diluted in 40 mL of supplemented AIM-V culture medium. 1 μg of the hCMV pp65/mL virus capsid peptide was also added and the bag was left in a CO oven.two for 2 hours. After this period, it was transferred to the XURI bioreactor using a sterile connection system, where the culture continued for another 7 to 14 days. 2.5 FCOMPLETION OF EXPANSION AND REDUCTION OF CULTURE VOLUME IN BIOREACTOR Xuri For bags that did not contain a 0.3 μM filter, the reduction was performed manually, where the entire volume contained in the XURI bioreactor was transferred to 600 mL transfer bags using the sterile connection system or by
inversion of the feed system. For cases in which the volume was already reduced after transferring the volume from the bioreactor bag to a transfer bag in a closed system, preparation for the selection stage continued. For cases where the volume exceeded 150 mL, the bags were centrifuged for 10 minutes at 700 G for 10 minutes. At the end of the centrifugation, the 600 mL bag was placed in a plasma extractor and the culture supernatant was transferred to another transfer bag, to perform quality control on cell manipulation. Cells were gathered into a single bag by sterile connection system and cell counting and cell viability determination were performed. The maximum number of cells that can proceed to the selection step is 1x109 cells with viability greater than 80%. 1x10 were transferred9 cells into a 250 mL bag and the concentration was adjusted to approximately 1x107 cell./mL, that is, in a final volume of 100 mL. Samples were taken for cell counting, viability and karyotype analysis and proceeded to step (III) of lymphocyte selection for the production of INF-γ in a Miltenyi Biotec capture system or in CliniMACS PRODIGY equipment. The reserved cell supernatant was sent for sterility testing and sterile processing quality control. EXAMPLE 3 – STAGE (II) IN G-REX 3.1 E BIOREACTOR SYSTEMCELL EXPANSIONS IN BIOREACTOR G-REX WITH CYTOKINE STIMULATION AND CMV-SPECIFIC PEPTIDES As an alternative to the XURI bioreactor, lymphocytes were expanded in a G-REX bioreactor. Cells were placed at a minimum concentration of 1x106 cell./mL and maximum of 1.5x106 cell./mL. The cytokines IL-2 (500 IU/mL) and IL-7 (10 ng/mL) were used in AIM-V medium supplemented after sterilizing filtration and 1 μg/mL of the hCMV virus capsid peptide pp65/mL. Stimulation with the peptide occurred in a final volume of 100 mL of cells diluted in culture medium for 2 hours and, after this period, the volume was adjusted to a final volume of 300 mL. The culture lasted from 12 to 21 days in a CO greenhousetwo. After the start of
culture, from the fifth day of cultivation, samples were removed every other day to check the number of cells in culture, pH, lactate and glucose. On the seventh day of culture, cells were restimulated with 1 μg of HCMV pp65/mL virus capsid peptide and PBMC from the same sample that was previously frozen, as described below. The culture was supplemented with fresh culture medium always according to the dosage of metabolites in the culture supernatant (glucose and lactate) and the number of cells/mL. The appropriate pH must be between 7.0 and 7.5, the glucose concentration in the culture supernatant must be greater than 150 g/dL, the lactate dosage 10 must be less than 150 mmol/dL and the number of cells must be between 1.0 and 1.5x106 cell./mL. For cases in which the G-REX bottle reached its maximum volume capacity (500 mL) and there was a need for supplementation due to a change in the dosage of metabolites, it was necessary to change the culture medium by removing at least 15 mL of culture medium into two 50 mL tubes. These 2 tubes were centrifuged at 500 G for 10 minutes. After centrifugation, the medium contained in the tubes was discarded and new medium was added as well as the cytokines IL-2 (500 IU/mL) and IL-7 (10 ng/mL). Then, the new culture medium was transferred to the G-REX bioreactor. For cases where the number of cells exceeded the capacity of the culture flask, the culture was divided into two flasks. The maximum culture maintenance time for cell expansion was 21 days. During expansion and at the end of this period, the total number of cells, cell viability and the number of lymphocytes were evaluated. The expansion was completed when reaching 1x109 cells or when the number of T lymphocytes was doubled 25 with viability greater than 80%. 3.2 RESTIMULUS DA WULTURE DAND WCELLS PARA YOUSYSTEM G-REX To restimulate the culture, the PBMCs that were previously frozen were thawed in laminar flow, resuspended in supplemented AIM-V culture medium and centrifuged in a Thermo Scientific Sorvall 30 ST 16R centrifuge at 500 G for 10 minutes. After centrifugation, the supernatant was discarded and the cell-containing pellet was resuspended in supplemented AIM-V culture medium. Cell viability was checked according to the protocols here
described and must be above 80% and the concentration can vary between 1:1 and 1:10 of new cells for each cell in culture depending on the number of cells available. For example, if there are about 5x108 cells in culture, restimulation can vary between 5x107 and 5x108 viable cells. After checking that the cells were suitable for restimulation, they were transferred to a 150 mL transfer bag with the aid of a sterile access and a syringe and diluted in 20 to 40 mL of supplemented AIM-V culture medium. 1 μg of the HCMV pp65/mL virus capsid peptide was also added and the bag was left in a CO2 oven for 2 to 3 hours. After this period, it was transferred to the G-REX bioreactor using a sterile connection system, where the culture continued for another 7 to 14 days. 3.3 COMPLETION OF EXPANSION AND REDUCTION OF CULTURE VOLUME IN THE G-REX BIOREACTOR. At the end of the culture, the entire volume contained in the G-REX was transferred to 50 mL tubes in laminar flow. Next, the tubes were centrifuged at 500 G for 10 minutes in the Thermo Scientific Sorvall ST 16R centrifuge and the culture supernatant was transferred to perform quality control for sterile manipulation of the cells. The cells were gathered in a single tube and counted using the protocols described here. The maximum number of cells that can proceed to the selection step is 1x109 cells. Thus, 1x10 were transferred9 cells into a 250 mL bag and the concentration was adjusted to about 1x107 cell./mL, that is, in a final volume of 100 mL. The volume for processing on the CliniMACS PRODIGY equipment can vary between 100 and 150 mL and the number of cells must not exceed 1x109 cells. Samples were taken for cell counting, viability and karyotype analysis. Then, we proceeded to step (III) of lymphocyte selection given the production of INF-γ in a Miltenyi Biotec capture system or in CliniMACS PRODIGY equipment. The reserved cell supernatant was sent for sterility testing and sterile processing quality control. EXAMPLE 4 – COMPARATIVE VALIDATION OF LYMPHOCYTE EXPANSION IN THE G-REX BIOREACTOR AND XURI
4.1 COMPARISON OF THE CELL EXPANSION PATTERN AND CONTROL OF PH, GLUCOSE AND LACTATE IN THE XURI AND G-REX BIOREACTORS To compare the expansion bioreactors, samples were used in both platforms with the same volume and initial cell concentration, but which were derived from different donors. The expansion pattern between the 2 bioreactors was quite similar, with a drop in the number of total leukocytes in the first days of expansion and, after 8 days in culture, the cells in culture began to proliferate on a larger scale (Figure 5A). Variations in pH and glucose and lactate levels occurred around the eighth day of expansion, with a decrease in pH and glucose and an increase in lactate production, consistent with the log phase of cell expansion (Figure 5B-D). According to the glucose and lactate level, the culture medium was replaced/changed. Material collection for analysis was always carried out before replacing/changing the culture medium, which occurred twice a week. 4.2 COMPARISON OF LYMPHOCYTE PROFILE DURING EXPANSION IN G-R BIOREACTORSEX E XURI The lymphocyte profile during expansion for 15 days on both platforms also maintained the same pattern. An increase in the percentage of CD3+ T lymphocytes and results above 80% of these cells was observed after 15 days of expansion on both platforms (Figure 6A). An increase in CD3+CD8+ T lymphocytes was also observed on both platforms, with results above 50% of CD8 T lymphocytes after 15 days of expansion (Figure 6B). There was also an increase in the percentage of memory T lymphocytes (CD3+CD45RO+CD45RA-) and a decrease in naïve T lymphocytes (CD3+CD45RA+CD45RO-) during the 15 days of culture on both platforms. ANDEXAMPLE 5 – ETAPA (III) SELECTION OF CELLS PRODUCING IFN-γ. 5.1 METHOD FOR CAPTURE OF CELLS PRODUCING IFN-γ IN AN OPEN AND MANUAL SYSTEM (LS COLUMN - MYLTENYI BIOTEC). After expansion of CMV-specific cells in a bioreactor, IFN-γ-producing cells were isolated using the IFN-γ-secreting cell detection and enrichment kit (MACS Miltenyi Biotec). The PBS/EDTA buffer was topped up with 0.5% human albumin before use. Non-adherent cells were transferred to conical tubes in the
ratio of 108 cells for each 100 mL of ice-cold buffer (CliniMACS PBS/EDTA) and centrifuged at 300 G at 4°C for 10 minutes and the supernatant was discarded. Subsequently, cells were resuspended in 800 μL of ice-cold buffer (CliniMACS PBS/EDTA) and 200 μL of CliniMACS Capture IFN-γ for every 108 of cells and incubated on ice for 5 minutes. 100 mL of heated TexMacs culture medium (commercially available from Miltenyi Biotec) was added for every 108 cells, which remained for 45 minutes in a CO25% incubator at 37°C, under periodic shaking. The cell suspension was centrifuged again under the same conditions as above in ice-cold buffer, then incubated at 4°C for 15 minutes with 800 μL of ice-cold buffer and 200 μL of anti-IFN-γ for every 108 cells. After this period, the cells were washed again at a rate of 108 cells for every 100 mL of ice-cold buffer, centrifuged under the same conditions as above, then resuspended at 108 cell./mL of ice-cold buffer. Meanwhile, the LS columns were washed 3 times with 1 mL of ice-cold buffer (CliniMACS PBS/EDTA) and the cell suspension was applied to the column, which was washed again 3 times to remove any IFN-γ-negative cells. The column was placed in a conical tube and quickly washed with 3 mL of buffer using a plunger to remove cells retained in the column. Separation was performed on another column to ensure purity and enrichment of cells positive for IFN-γ. The result of positive selection was called the TCB fraction and the unselected cells were in the NTCB fraction. Finally, cellular immunophenotyping was performed by flow cytometry for IFN-γ expression to verify the isolated and depleted cell populations. At the end of the selection, there must be above 80% of IFN-γ positive cells and above 80% of T lymphocytes with viability also above 80% in the TCB. The supernatant of the NTCB fraction was sent for aerobic, anaerobic, fungal and special microorganism cultures (25 mL), for endotoxin testing (1 mL) and for sterility testing at the BCQ Laboratory (50 mL). The supernatant of the TCB fraction (15 mL) was sent for NAT serology for HIV, HCV, HBV and for PCR for CMV, EBV, Parvovirus B19 and Mycoplasma
pneumoniae, according to protocols described in the present invention. Furthermore, approximately 1 mL of the cells were sent for NAT HTLV-I serology. The remainder of the TCB supernatant was frozen for later impurity tests (determination of IL-2 and IL-7 concentration). 5 At the end of the step, the TCB fraction was frozen. The number of cells selected varied according to the number of initial cells and due to biological variation between individuals. Table 3 summarizes all the critical points of the open system selection process and the decision making to be carried out. 10 TTHE BEAUTY 3 - PCRITICAL PROCESS OUTCOMES AND ACCEPTABLE RESULTS AT THE END OF THE PROCESS PROCESS USING LS COLUMN
AAUTOMATIC (WLINIMACS PRODIGY) To capture cells in a closed and automatic system, the CliniMACS Cytokine Capture System (INF-γ) and the CliniMACS 5 PRODIGY equipment were used; for cell selection, the “CCS_INF- γ_Enrichment” program was used. according to the manufacturer's guidelines. The bag containing a maximum of 1x109 Cells for selection were connected using the sterile connection system with the sample bag (100 to 150 mL), the TS500 10 disposable tube system (Miltenyi Biotec), TexMacs culture medium, PBS/EDTA were also connected to the equipment plus human albumin solution (0.5%), cytokine capture system (INF-γ), 0.9% saline solution plus human albumin solution (2.5%). The process starts and continues automatically until the separation of 02 bags, one containing the selected cells (TCB) and one containing the discarded material (NTCB). At the end of processing, the bag with the discarded cell fraction (NTCB) and the bag with the enriched cells (TCB) were sealed and two aliquots per fraction were collected for analysis by flow cytometry, while the rest of the cells were stored. at 4°C. One aliquot was used to determine the number of cells and the other to verify the yield of the entire process. 20 The criterion to determine whether the selection was adequate was above 80% of IFN-γ positive cells and above 80% of T lymphocytes with viability also above 80% in the TCB. The supernatant of the NTCB fraction (25 mL) was sent for culture
aerobic, anaerobic, fungal and special microorganisms, 1 mL was sent for endotoxin testing, 50 mL for sterility testing at the BCQ Laboratory, 10 ml for Mycoplasma sp. in the Invitrocell Laboratory. The supernatant of the TCB fraction (15 mL) was sent for NAT 5 serology for HIV, HCV, HBV and for PCR for CMV, EBV, Parvovirus B19 and Mycoplasma pneumoniae. Approximately 1 mL of the cells were sent for NAT HTLV-I serology and the remainder of the TCB supernatant was frozen for later impurity and potency tests. Table 4 summarizes all the critical points of the selection process in 10 closed system and the decision making to be carried out. TABLE 4 - CRITICAL POINTS OF THE PROCESS AND ACCEPTABLE RESULTS AT THE END OF THE PROCESS USING CLINIMACS PRODIGY
5.3 COMPARATIVE VALIDATION BETWEEN SELECTION IN OPEN COLUMN SYSTEM AND SCLOSED COLUMN SYSTEM (WLINIMACS PRODIGY) Cells from the same donor were expanded in the G-REX bioreactor, and after expansion, 2x109 cells were used for both selections, i.e. 1x109 for each selection. After selection, the final number of selected cells (TCB) in the 2 systems was quite similar (Figure 7A): 2.7x107 in the PRODIGY system and 3.0x107 in the LS Column system. The percentage and number of T lymphocytes in the 2 systems was also quite similar (Figure 7B): 93% in the PRODIGY system and 97% in the LS Column system, both having above 90% T lymphocytes. 5.4 COMPARISON OF SELECTION PURITY IN SYSTEMS OPEN AND CLOSED For this comparison, cells from the same donor were used, which were expanded in the G-REX bioreactor. After expansion, 1x109 cells were used for both selections. After selection, the final number of selected cells (TCB) in the 2 systems was quite similar, the purity was above 80%, being 80.5% in the manual column system and 80.6% in the PRODIGY system (Figure 8) . Additionally, the CliniMACS PRODIGY equipment was evaluated and validated by 3 selections. The average number of T lymphocytes (CD3) in the depleted fraction – NTCB was on average 73.8±7.84%, while in the selected fraction – TCB it was on average 91±1.9%. Regarding CD3 T lymphocytes positive for IFN-γ in the depleted fraction – NTCB, the average was 36.7±7.08%, while in the selected cells it was an average of 83.63±2.20%, as shown in Figure 9. 5.5VERIFICATION OF THE PERFORMANCE OF THE SELECTION PROCESS BY CELL CAPTURE INF-Y BY THE RESEARCH LABORATORY OF THE HOSPITAL ISRAELITA ALBERT EINSTEIN. The process yield was performed by flow cytometry (FORTESSA), in which cells from the NTCB and TCB pockets were labeled with monoclonal antibodies to: CD45-PerCP-Cy5.5, CD3-PE-CF594, CD4 APC-Cy7,
CD8-Alexa 700 from BD Pharmingen and the anti-INF-γ-PE provided by the kit (Milteniy Biotec). In addition, possible contaminating cells were identified and named other CD3- cells, using CD14-BV421 (BD Pharmingen) to identify monocytes, CD19-FITC (BD Pharmingen) to identify B lymphocytes and 5 CD16-APC (BD Pharmingen) to identify identify NK cells. For labeling with antibodies, an aliquot of 1x10 was separated5 cells (TCB and NTCB) and previously titrated amounts of antibodies were added to each tube. To control autofluorescence, the FMO tube was used, with labeling with all antibodies except 1. In this tube, the cutoff between the positive and negative population was determined for each fluorescence that was not added to the tube. After labeling, the samples were incubated for 30 minutes in the dark. Then, 1 mL of flow cytometry buffer was added and the samples were centrifuged for 10 minutes at room temperature (22 °C). The supernatant was discarded and the pellet was resuspended in 200 µL of cytometry buffer. The acquisition was carried out on the template prepared for this marking and the analysis considered the first selection in FSC vs. SSC. Next, positive CD3 cells, T lymphocytes and IFN-γ staining were analyzed, as well as the CD4 and CD8 subpopulations. For the CD3 negative population, the 20 populations CD14 (monocytes), CD19 (B lymphocytes) and CD16 (NK cells) were analyzed. Figure 10A-D shows the analysis of the cell fraction discarded by the process (NTCB) where it was observed that only 78% of the cells were T lymphocytes, which were composed of 48% CD4 T lymphocytes and 50% CD8 T lymphocytes. Of these T lymphocytes, less than 1% secreted IFN-γ. It was also observed that 25% more than 20% of other cells were present, of which, within this 20%, 30% were monocytes, 36% NK and 21% B lymphocytes. In the cell fraction enriched by the process (TCB) it was observed that 92% of the cells were T lymphocytes, which were composed of 34% CD4 T lymphocytes and 60% CD8 T lymphocytes. Of these T lymphocytes, almost 100% secreted IFN-γ. 30 It was also observed that only 6% of other cells were present, and within this 6%, 32% were monocytes, 13% NK cells and 31% B lymphocytes. An aliquot was also sent to the Pathology Laboratory Clinic
from Hospital Israelita Albert Einstein to determine viability, (%) CD3 cells and (%) positive CD3/IFN-γ cells (purity of selection). 5.6AANALYSIS BY FLOW CYTOMETRY IN THE LABORATORY DAND PATOLOGY WLINE OF HOSPITAL ISRAELITA ALBERT EINSTEIN The performance of the process was carried out by flow cytometry (FACS CANTO), in which cells from the NTCB and TCB pockets were labeled with monoclonal antibodies to: CD45-KO, CD3-PE-CF594, CD4 APC-Cy7, CD8-Alexa 700 from BD Pharmingen and the anti-INF-γ-PE provided by the kit (Milteniy Biotec). Viability was determined by cells that were not labeled with 7-AAD, considered viable cells. In addition, possible contaminating cells were identified and named other CD3- cells. For this analysis, CD11b-BV421 (BD Pharmingen) was used to identify contamination with myeloid cells. For labeling with antibodies, aliquots of 1x105 Cells from the TCB and NTCB fractions were separated and the previously titrated amounts of antibodies were added to each tube. To control autofluorescence, an FMO tube was created, in which there was labeling with all antibodies except 1. In this tube, the cutoff between the positive and negative population was determined for each fluorescence that was not added to the tube. After labeling, the samples were incubated for 30 minutes in the dark. Then, 1 mL of cytometry buffer was added and the samples were centrifuged for 10 minutes at room temperature (22 °C). The supernatant was discarded and the pellet containing the cells was resuspended in 200 µL of cytometry buffer. The acquisition was carried out on the template prepared for this marking. For the analysis, the first selection in FSC vs. SSC. Next, the following were analyzed sequentially: CD45 positive cells, viable 7AAD negative cells and CD3 positive cells (T lymphocytes), and staining for IFN-γ, CD4 and CD8 subpopulations. For the CD3 negative population, the CD11b populations (myeloid cells) were analyzed. The result of the analysis performed by the Clinical Pathology Laboratory is illustrated in Figure 11A-F. EXAMPLE 6 - STAGE (IV) - FREEZING OF CELLS 6.1 CFREEZING OF H CELLSCMV-SPECIFIC (TCB)
To freeze the hCMV-specific cells (TCB), the bag containing the lymphocytes was placed in laminar flow and a volume of approximately 6 mL was diluted to a volume of 50 mL. An aliquot was removed for cell counting. Next, the cells were centrifuged and the supernatant removed to perform viability, sterility and serology analyses, according to the protocols described here. Cells were frozen in amounts of 1x106 per dose/bag. To do this, they were transferred to a 250 mL freezing bag and each 1x106 Cells were diluted in 15 mL of 0.9% saline solution containing 2.5% human albumin used in cell selection. This volume (15 mL) containing 1x106 Cells were transferred to each freezing bag. The bags containing the cells in 15 mL were placed in the refrigerator for 15 minutes and the freezing medium for the same volume of cells to be frozen was also prepared and added to the refrigerator for the same period as the cells (40% Voluven ® 6%, 40% human albumin 6% and 20% DMSO). Next, one bag at a time was removed from the refrigerator and transferred to laminar flow to add the cryoprotectant solution, using a 50 mL syringe and bag adapter. After adding the cryoprotectant solution, the bag was sealed and kept in a compartment with 4 fragments that can be removed without changing the status of the frozen bag for periodic cell viability. After sealing the bag tube, it was placed on a metal support and then placed in a horizontal position in a mechanical freezer at -80 °C for 24 h. After this period, the bags were stored in a vertical position. A bag was thawed to perform ELISPOT assays (INF-γ release) against peptide stimulation and was also used for co-cultivation assay with control MCR-5 fibroblasts and those infected with CMV strain AD169 (potency). The assays and their results are described later in the present invention. 6.2 CFREEZING OF UNSELECTED CELLS (NTCB) NTCB (about 230 mL) was transferred to 50 mL tubes and centrifuged. The supernatant was removed for viability, sterility and serology analyses, according to the protocols described here. NTCB cells
were frozen in 5 mL freezing tubes and were used for quality control. ANDEXAMPLE 7 – ETAPA (V) IN DFREEZING 7.1 SELECTION OF CMV-SPECIFIC CELLS FOR PATIENT INFUSION HLA COMPATIBILITY AND NUMBER OF CELLS PER Kilogram The minimum compatibility between lymphocytes and the recipient was 1 in 6 alleles (high resolution), considering class I alleles - HLA loci- A, HLA-B and HLA-C. Preference was given to compatibility with the HLA class I alleles listed below: A*01:01, A*02:01, A*03:01, A*11:01, A*23:01, A* 24:02, B*07:02, B*08:01, B*15:01, B*18:01, B*35:01, B*44:02 and B*44:03. The number of cells to be infused into each patient was also evaluated, so that it did not exceed the value of 1 to 2x104 cell./kg of receiver weight. Table 5 below summarizes the critical analysis performed for the release of T lymphocytes (TCB) for cell infusion. After analysis, suitable cells were thawed in laminar flow at 37 °C. 7.2 STABILITY AFTER THAWING By analyzing cell death with propidium iodide using flow cytometry, the stability of lymphocytes after thawing was analyzed. 3 batches of cells from different donors were tested. The Donor 15IVN9083 cells tested had been frozen for approximately 7 days when they were thawed for testing. The cells from Donor 18FS4945 had been frozen for approximately 6 months when they were thawed for the test and the cells from Donor 24MAPM692 had been frozen for approximately 11 months when they were thawed for the test. The stability of lymphocytes after thawing kept between 2 and 6 °C showed that viability varies according to the thawing time. Even after 2 hours of thawing, over 80% of the cells remained viable (Figure 12). TTHE BEAUTY 5 - CRITICAL ANALYSIS PERFORMED FOR THE RELEASE OF LYMPHOCYTES T (TCB) FOR CELL INFUSION
EXAMPLE 8 – IN VITRO STUDY TO SIMULATE THE RESPONSE TO STIMULUS ANDSPECIFIC. To evaluate the function of hCMV-specific T lymphocytes, the ELISPOT test was performed for IFN production in response to the specific stimulus. These tests 5 were carried out on 03 expanded and selected batches of product (TCB) on the CliniMACS PRODIGY equipment. Thawed cells from the following products/donors were used:
product: B300121394945-donor: 18FSH4945 (Figure 13), product: B300121391223-donor: 59TPAA1223 (Figure 14) and product: B300121327279-donor: 60GDD2727 (Figure 15). The results of these assays were evaluated in the automatic spot counter (AID Advanced Imaging Devices GmbH Ebinger Str. 4 D72479 Strassberg Germany). The assays were also carried out using 03 different amounts of cells (1x103/100 μL, 5x103/100 μL and 1x104/100 μL) in the product of selected cells (TCB) and also in discarded cells (NCTB). All assays were performed in triplicates. In this assay, thawed CMV-specific T lymphocytes were stimulated for approximately 2 hours in the presence of the viral peptide (pp65) and it was observed that approximately 10% of the cells were capable of secreting IFN-γ during this period, being more accurate in lower concentrations of cells. The ability to secrete IFN-γ in more than 50 lymphocytes for every 10 lymphocytes was defined as adequate.3 lymphocytes, considering the stimulation time and the low quantity of antigen-presenting cells in the product. This assay showed that laboratory-generated cells are functional. EXAMPLE 9 - SIMULATION OF RESPONSE AMONG PARTIALLY COMPATIBLE INDIVIDUALS TO A SPECIFIC STIMULUS For the in vitro safety assessment, an assay of IFN-γ release by TCB lymphocytes was developed in the presence of commercial cells (MCR-5 lung fibroblast) infected by hCMV . 9.1 INFECTION OF MCR-5 FIBROBLASTS WITH THE COMMERCIAL STRAIN OF CYTOMEGALOVIRUS - AD169 (CMVAD169). For infection of MCR-5 fibroblasts with CMV-AD169 strain (ATCC# VR-538) for viral load expansion, MCR-5 fibroblasts were seeded at a concentration of 2.84x104/well in 24-well culture plate in NB2 culture room. After 24 h of culturing MCR-5 cells, the culture medium was removed and the cells were adsorbed with 0.1 MOI of strain CMV-AD169 for each cell in culture (2.84x103 MOIs) for 8 h. After this period, the supernatant was removed and new culture medium was added. After 4 days of culture, it was possible to observe cytopathic changes in MCR-5. After 10 days of cultivation, the supernatant was removed and frozen with a solution of 7% DMSO in liquid nitrogen. To titrate the CMV-AD169
frozen, the supernatant was used in serial dilutions to reinfect MCR-5. In a 24-well culture plate, cells were maintained without infection (CTRL) and also infected in triplicates at viral dilutions of 10-1.10-two, 10-3, 10-4, 10-5, 10-6 and 10-7. After 2 and 3 days of infection, staining with the anti-CMV antibody (green) was evaluated by microscopy and cytometry, confirming the infection of 17% of MCR-5 fibroblasts with a viral concentration of 10-1, and 7.5% with a viral concentration of 10-two. It was also possible to verify the infection up to a concentration of 10-3 (Figure 16). Therefore, for co-culture experiments with virus-specific T lymphocytes, only viral dilutions of 10 were used.-1 and 10-two. 9.2CO-CULTURE OF FIBROBLASTS MCR-5 INFECTED BY CMV-AD169 WITH SPECIFIC HCMV T LYMPHOCYTES FOR ANALYSIS OF IFN SECRETION For co-cultivation, fibroblasts were seeded at a concentration of 1x104/well and after 24 hours of culture, infection was carried out for 8 h. After this period, the culture medium was changed. After 3 days of cultivation, co-cultures were carried out for 24 h and 48 h with specific hCMV T lymphocytes generated in a clean room in proportions (1x104 Lymphocytes: 1x104 Fibroblasts), (5x103 Lymphocytes: 1x104 Fibroblasts), (1x103 Lymphocytes: 1x104 Fibroblasts), i.e., 1 effector:1 target, 1 effector:2 targets and 1 effector:4 targets with controls of fibroblast without lymphocyte and only lymphocyte without the fibroblast. The culture supernatant was obtained at 24 h and 48 h for INF-γ measurement. Class I MHC compatibility between fibroblasts and hCMV-specific T lymphocytes was 3:6 as shown in Table 6. TABLE 6 - DESCRIPTION OF FIBROBLAST CLASS I HLA TYPING (MCR-5) AND CH CELLSCMV-SPECIFICATIONS GENERATED FROM PRODUCT/DOADOR B300121394945/18FSH4945 RESPECTIVELY
The measurement of IFN-γ from lymphocytes without fibroblasts and from fibroblasts without lymphocytes was called spontaneous release. The dosage of IFN-γ in uninfected control fibroblasts and CMV-infected fibroblasts in
concentrations 10-1 and 10-two for 24 and 48 h, spontaneous release was decreased. It was observed that for the product: B300121394945-donor: 18FSH4945 in co-culture with MCR-5 fibroblast in the proportion (1:1) the secretion of IFN-γ was: In 24 h of co-culture: - 4.0 pg /mL at a viral concentration of 10-two; - 34.2 pg/mL at viral concentration of 10-1. In 48 h of co-cultivation: - 43.5 pg/mL at viral concentration of 10-two; - 45.0 pg/mL at viral concentration of 10-1. No IFN-γ secretion was observed in control MCR-5 fibroblasts not infected with the viral strain. A summary of these results is presented in Table 7 and Figure 17, where UI is equivalent to international units. TTHE BEAUTY 7 - CONCENTRATIONS OF IFN-γ IN CO-CULTIVATION OF 24 HE 48 H.
9.3 CO-CULTURE OF MCR-5 FIBROBLASTS INFECTED BY CMV-AD169 WITH LINFOCYTES T HCMV SPECIFIC FOR DEATH ANALYSIS OF MCR-5 For safety assessment, a cell death test (cytotoxicity) of MCR-5 cells infected by hCMV by lymphocytes of the product was also carried out. The cytotoxic potential of hCMV-specific T lymphocytes, isolated by the CliniMACs PRODIGY equipment, was analyzed by culturing MRC-5 fibroblasts (ATCC CCL-171) infected with CMV (ATCC VR-538) at concentration 10-1 in the presence of different concentrations of CMV-specific lymphocytes (1:1 and 2:1) from 3 different donors/TCBs, with class I HLA compatibility between lymphocyte donors and MCR-5 cells varying as indicated below: - Product : B300121394945 - Donor: 18FSH4945 (HLA 3:6 compatibility);
- Product: B300121391223 - Donor: 59TPAA1223 (HLA 1:6 compatibility); - Product: B300121327279 - Donor: 60GDD2727 (HLA compatibility 1:6). Co-cultures were evaluated after 24 and 48 hours. Triplicate supernatants from cocultures of hCMV-specific T lymphocytes with hCMV-infected MRC-5 fibroblasts were collected and the assay was performed using the CytoTox 96® Non-Radio kit (Promega Cat.: G1780; Lot.:430121). Specifically, this assay measures the concentration of LDH (lactate dehydrogenase), the enzyme released after cell lysis. The concentration of LDH is modified when cell death occurs, and as a death control, co-culture of lymphocytes with uninfected fibroblasts was used. LDH released into culture supernatants was measured in a 30-minute enzymatic assay, which results in the conversion of a tetrazolium salt (violet iodonitrotetrazolium; INT) into a red formazan product, altering the optical density. Optical densities were obtained by colorimetric reading and their variation is proportional to cell lysis. The protocol follows the manufacturer's guidelines and optical densities were obtained using a spectrophotometer (Varioskan LUX - Thermo Scientific). To evaluate the percentage of lymphocyte cytotoxicity in each culture condition, the formula provided by the manufacturer below was applied: % ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ = ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ − ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^â ^^ ^^ ^^ ^^ ^ ^ ^^ ^^ ^^ ^^ − ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^â ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^á ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ − ^^á ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^ ^^â ^^ ^^ ^^ ^^ 100 The results of the cytotoxicity of cells from 3 donors in 48 h of co-cultivation with infected fibroblasts was on average 3% when the cell concentration is lower (1:2), and on average 13% when the cell concentration is higher (1:1), as shown in Table 8 and in Figure 18. In addition, it was observed that the percentage of MCR-5 fibroblasts infected at the viral concentration of 10-1 it was about 17% in 48 h. Therefore, it was inferred that at the lowest lymphocyte concentration (1:2), the death of hCMV-infected cells was on average 20%; and at the highest cell concentration (1:1), the death of hCMV-infected cells averaged 75%. TABLE 8 - SUMMARY OF THE CYTOTOXICITY OF CMV-SPECIFIC T LYMPHOCYTES AGAINST MCR-5 FIBROBLASTS INFECTED WITH HCMV-AD169.
In conclusion, this experiment demonstrated that in vitro there is no nonspecific death of MCR-5 fibroblasts by CMV-specific T lymphocytes even in HLA class I matches (1:6). In co-cultures, where fibroblasts were not infected, there was no detection of death at the highest cell concentration (1:1). 5 Depending on the concentration of T lymphocytes, the specific death of infected fibroblasts was on average 17% for low concentrations (1:2) and 75% for higher concentrations (1:1), indicating the safety and efficacy of the product in vitro. REFERENCES 10 Düver F., Weißbrich B., Eyrich M., Wölfl M., Schlegel P.G., Wiegering V. Viral reactivations following hematopoietic stem cell transplantation in pediatric patients - A single center 11-year analysis. PLoS One. 2020;15(2): e0228451. Published on February 4, 2020. doi: 10.1371/journal.pone.0228451. Blümel J.V., Burger R., et al. Human Cytomegalovirus (HCMV) - Revised. 15 Transfus Med Hemother.2010;37(6):365-375. doi:10.1159/000322141. Zuhair M, Smit GSA, Wallis G, et al. Estimation of the worldwide seroprevalence of cytomegalovirus: A systematic review and meta-analysis. Rev Med
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Claims
REIVINDICAÇÕES 1. MÉTODO DE EXPANSÃO DE LINFÓCITOS VÍRUS- ESPECÍFICOS, caracterizado por compreender as etapas de: (I) pré-expansão a partir de uma amostra de células linfomononucleares, 5 que compreende as etapas de: (a) separação das células mononucleares do sangue periférico (PBMCs); (b) centrifugação e descarte do sobrenadante; e (c) ressuspensão das PBMCs; 0 (II) expansão das células in vitro, (III) seleção de linfócitos positivos para INF-γ. 2. MÉTODO, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado por compreender adicionalmente a etapa de (IV) congelamento a -80 °C. 3. MÉTODO, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pela5 amostra de células linfomononucleares ser obtida do buffy-coat (concentrado celular) gerado na doação de plaquetas por aférese, que fica retido no centro do kit de coleta. 4. MÉTODO, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pela etapa (a) ser realizada por gradiente de densidade. 5. MÉTODO, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado por0 compreender uma etapa de contagem de células e verificação de viabilidade das células após a etapa (a), em que os critérios de aceitação da amostra são um número de pelo menos 6 x 108 células totais e de pelo menos 90% de viabilidade. 6. MÉTODO, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado por parte da amostra na etapa (c) ser ressuspendida em meio de cultura, e o restante da5 amostra ser ressuspendido em solução crioprotetora para congelamento entre -75 °C e -95 °C. 7. MÉTODO, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pela etapa (II) compreender as etapas de: (d) inoculação das células obtidas na etapa (I) em biorreator0 compreendendo meio de cultura compreendendo IL-2 e IL-7 a uma temperatura de 37+1 ºC, pH entre 7,0 e 7,5 e 5% (v/v) de CO2; (e) estimulação das células com o peptídeo do capsídeo do vírus hCMV; e
(f) reestimulação das células com o peptídeo do capsídeo do vírus hCMV e células PBMC da mesma amostra previamente congeladas na etapa (c); preferencialmente, o método compreende ainda a etapa de: (g) adição de meio de cultura em volume adequado para manutenção da 5 concentração celular; mais preferencialmente, a etapa (II) compreende ainda a(s) etapa(s) de: (h) avaliação do número de linfócitos T e a viabilidade das células, em que a expansão é considerada adequada quando o número de linfócitos final for pelo menos o dobro do número de linfócitos inicial e a viabilidade for de pelo menos 80%;0 e/ou (i) redução do volume de cultura, em que a redução é preferencialmente realizada por filtração, centrifugação e/ou extrator de plasma. 8. MÉTODO, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pela etapa (III) compreender as etapas de: 5 (j) captura de células produtoras de INF-γ em sistema de captura; (k) opcionalmente, enriquecimento das células positivas para INF-γ; e (l) imunofenotipagem celular por citometria de fluxo. 9. MÉTODO, de acordo com a reivindicação 1, caracterizado pelos linfócitos serem específicos para a fosfoproteína 65 do capsídeo do citomegalovírus0 humano. 10. COMPOSIÇÃO, caracterizada por compreender linfócitos T vírus- específicos e um ou mais componentes adicionais, em que os linfócitos T vírus- específicos são obtidos pelo método, conforme definido na reivindicação 1. 11. COMPOSIÇÃO, de acordo com a reivindicação 11, caracterizada5 pelo um ou mais componentes adicionais serem selecionados de um veículo farmaceuticamente aceitável, uma mistura de hidroxietilamido e cloreto de sódio, albumina humana, dimetilsulfóxido (DSMO) e suas misturas. 12. USO DE UMA COMPOSIÇÃO, conforme definida em qualquer uma das reivindicações 10 a 11, caracterizado por ser para a fabricação de uma0 terapia celular para tratar infecções virais, em pacientes transplantados de medula óssea que não respondem às terapias convencionais. 13. USO, de acordo com a reivindicação 12, caracterizado pela infecção viral ser causada por citomegalovírus humano (hCMV), adenovírus, Epstein-
barr (EBV), HHV-6 ou poliomavírus (vírus BK).
CLAIMS 1. VIRUS-SPECIFIC LYMPHOCYTE EXPANSION METHOD, characterized by comprising the steps of: (I) pre-expansion from a sample of lymphomononuclear cells, which comprises the steps of: (a) separation of mononuclear cells from the blood peripheral (PBMCs); (b) centrifugation and discarding the supernatant; and (c) resuspension of PBMCs; 0 (II) expansion of cells in vitro, (III) selection of lymphocytes positive for INF-γ. 2. METHOD, according to claim 1, characterized by additionally comprising the step of (IV) freezing at -80 °C. 3. METHOD, according to claim 1, characterized in that the sample of lymphomononuclear cells is obtained from the buffy-coat (cell concentrate) generated in the donation of platelets by apheresis, which is retained in the center of the collection kit. 4. METHOD, according to claim 1, characterized in that step (a) is carried out by density gradient. 5. METHOD, according to claim 1, characterized in that it comprises a step of counting cells and checking the viability of cells after step (a), wherein the sample acceptance criteria are a number of at least 6 x 10 8 total cells and at least 90% viability. 6. METHOD, according to claim 1, characterized in that part of the sample in step (c) is resuspended in culture medium, and the remainder of the sample is resuspended in a cryoprotectant solution for freezing between -75 °C and -95 °C . 7. METHOD, according to claim 1, characterized by step (II) comprising the steps of: (d) inoculating the cells obtained in step (I) in a bioreactor comprising culture medium comprising IL-2 and IL-7 at a temperature of 37+1 ºC, pH between 7.0 and 7.5 and 5% (v/v) CO2; (e) stimulation of cells with the hCMV virus capsid peptide; It is (f) restimulation of cells with the hCMV virus capsid peptide and PBMC cells from the same sample previously frozen in step (c); Preferably, the method further comprises the step of: (g) adding culture medium in a volume suitable for maintaining cell concentration; more preferably, step (II) further comprises the step(s) of: (h) evaluating the number of T lymphocytes and the viability of the cells, in which expansion is considered adequate when the final number of lymphocytes is at least at least twice the initial number of lymphocytes and the viability is at least 80%;0 and/or (i) reduction of the culture volume, in which the reduction is preferably carried out by filtration, centrifugation and/or plasma extractor. 8. METHOD, according to claim 1, characterized by step (III) comprising the steps of: 5 (j) capturing cells producing INF-γ in a capture system; (k) optionally, enrichment of INF-γ-positive cells; and (l) cellular immunophenotyping by flow cytometry. 9. METHOD, according to claim 1, characterized in that lymphocytes are specific for phosphoprotein 65 of the human cytomegalovirus0 capsid. 10. COMPOSITION, characterized in that it comprises virus-specific T lymphocytes and one or more additional components, wherein the virus-specific T lymphocytes are obtained by the method, as defined in claim 1. 11. COMPOSITION, according to claim 11, characterized5 by the one or more additional components being selected from a pharmaceutically acceptable carrier, a mixture of hydroxyethyl starch and sodium chloride, human albumin, dimethyl sulfoxide (DSMO) and mixtures thereof. 12. USE OF A COMPOSITION, as defined in any one of claims 10 to 11, characterized in that it is for the manufacture of a cell therapy to treat viral infections, in bone marrow transplant patients who do not respond to conventional therapies. 13. USE, according to claim 12, characterized in that the viral infection is caused by human cytomegalovirus (hCMV), adenovirus, Epstein- barr (EBV), HHV-6 or polyomavirus (BK virus).
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