WO2022245000A1 - Amino acid-producing microorganism exhibiting enhanced agl protein activity, and amino acid production method using same - Google Patents

Amino acid-producing microorganism exhibiting enhanced agl protein activity, and amino acid production method using same Download PDF

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Abstract

The present application relates to an amino acid-producing microorganism exhibiting enhanced Agl protein activity, and an amino acid production method using same.

Description

AGL 단백질의 활성이 강화된, 아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용한 아미노산 생산 방법Microorganisms that produce amino acids with enhanced AGL protein activity and amino acid production methods using the same
본 출원은 Agl 단백질의 활성이 강화된, 아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용한 아미노산 생산 방법에 관한 것이다.The present application relates to an amino acid-producing microorganism with enhanced Agl protein activity and an amino acid production method using the same.
아미노산은 동물사료, 의약품 및 화장품 산업 등에 사용되고 있으며, 주로 코리네박테리움 속 균주나 에스케리키아 속 균주를 이용한 발효에 의해 생산되고 있다. 아미노산의 생산을 위하여, 고효율 생산균주 및 발효공정기술 개발과 같은 다양한 연구들이 수행되고 있다. Amino acids are used in animal feed, pharmaceutical and cosmetic industries, and are mainly produced by fermentation using strains of the genus Corynebacterium or strains of the genus Escherichia. For the production of amino acids, various studies such as development of high-efficiency production strains and fermentation process technology are being conducted.
구체적으로, 아미노산 생합성에 관여하는 효소를 코딩하는 유전자의 발현을 증가시키거나 또는 생합성에 불필요한 유전자를 제거하는 것과 같은 목적 물질 특이적 접근 방법이 주로 이용되고 있다 (US 8048650 B2). 그러나 미생물의 당 이용능과 아미노산 생합성의 연관성에 대해서는 아직 연구가 부족한 실정이다.Specifically, target material-specific approaches such as increasing the expression of genes encoding enzymes involved in amino acid biosynthesis or removing genes unnecessary for biosynthesis are mainly used (US 8048650 B2). However, studies on the relationship between sugar utilization and amino acid biosynthesis of microorganisms are still lacking.
본 출원의 과제는 Agl 단백질의 활성이 강화된, 아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용한 아미노산 생산 방법을 제공하는 것이다.An object of the present application is to provide an amino acid-producing microorganism with enhanced Agl protein activity and an amino acid production method using the same.
본 출원은 Agl 단백질의 활성이 강화된, 아미노산을 생산하는 코리네박테리움 속 미생물을 제공한다.The present application provides microorganisms of the genus Corynebacterium that produce amino acids with enhanced Agl protein activity.
본 출원은 상기 미생물을 배지에서 배양하는 단계를 포함하는, 아미노산의 생산 방법을 제공한다.The present application provides a method for producing amino acids, comprising culturing the microorganism in a medium.
본 출원은 상기 미생물의 제조방법을 제공한다.The present application provides a method for producing the microorganism.
본 출원은 상기 미생물 또는 이의 배양물을 포함하는 아미노산 생산용 조성물을 제공한다.The present application provides a composition for amino acid production comprising the microorganism or its culture.
본 출원의 미생물은 아미노산 생산에 유용하게 사용될 수 있다.The microorganism of the present application can be usefully used for amino acid production.
이를 구체적으로 설명하면 다음과 같다. 한편, 본 출원에서 개시된 각각의 설명 및 실시형태는 각각의 다른 설명 및 실시 형태에도 적용될 수 있다. 즉, 본 출원에서 개시된 다양한 요소들의 모든 조합이 본 출원의 범주에 속한다. 또한, 하기 기술된 구체적인 서술에 의하여 본 출원의 범주가 제한된다고 볼 수 없다.A detailed description of this is as follows. Meanwhile, each description and embodiment disclosed in this application may also be applied to each other description and embodiment. That is, all combinations of various elements disclosed in this application fall within the scope of this application. In addition, the scope of the present application is not to be construed as being limited by the specific descriptions described below.
또한, 당해 기술분야의 통상의 지식을 가진 자는 통상의 실험만을 사용하여 본 출원에 기재된 본 출원의 특정 양태에 대한 다수의 등가물을 인지하거나 확인할 수 있다. 또한, 이러한 등가물은 본 출원에 포함되는 것으로 의도된다.In addition, those skilled in the art will recognize, or be able to ascertain using no more than routine experimentation, many equivalents to the specific aspects of the present application described herein. Also, such equivalents are intended to be included in this application.
본 출원의 하나의 양태는 Agl 단백질의 활성이 강화된, 아미노산을 생산하는 코리네박테리움 속 미생물을 제공한다.One aspect of the present application provides a microorganism of the genus Corynebacterium that produces amino acids with enhanced Agl protein activity.
본 출원의 "Agl 단백질"은 글루코시다제 활성을 갖는 단백질의 일종을 지칭한다."Agl protein" in this application refers to a kind of protein having glucosidase activity.
본 출원에서, "글루코시다제(glucosidase)"는 글리코사이드 결합(glycosidic bond)의 절단을 촉매하고, 탄수화물(carbohydrate)을 단량체로 분해하는 데 관여하는 효소이다. 일 예로, 상기 글루코시다제는 EC 3.2.1로 분류되는 효소일 수 있으나, 이에 제한되지는 않는다. In this application, "glucosidase" is an enzyme that catalyzes the cleavage of glycosidic bonds and is involved in breaking down carbohydrates into monomers. For example, the glucosidase may be an enzyme classified as EC 3.2.1, but is not limited thereto.
일 구현예로, 본 출원의 Agl 단백질은 알파-글루코시다제 활성을 가질 수 있다.In one embodiment, the Agl protein of the present application may have alpha-glucosidase activity.
본 출원에서, "알파-글루코시다제 (α-glucosidase)"는 당을 글루코스로 분해하는 글루코시다제의 일종으로, 알파-글리코사이드 결합(alpha-glycosidic bond) 을 분해할 수 있는 효소를 의미한다. 상기 알파-글리코사이드 결합은 예를 들어 α(1→4), α(1→6), α(1→2) 등일 수 있으나 이에 제한되지 않는다. In the present application, "alpha-glucosidase" is a type of glucosidase that decomposes sugar into glucose, and means an enzyme capable of decomposing an alpha-glycosidic bond. . The alpha-glycosidic bond may be, for example, α(1→4), α(1→6), α(1→2), etc., but is not limited thereto.
일 구현예로, 본 출원의 알파-글루코시다제는 탄수화물(carbohydrate)을 글루코스로 분해하는 활성을 가질 수 있다. 다른 일 구현예로, 본 출원의 알파-글루코시다제는 α(1→4) 및/또는 α(1→6) 결합을 분해하는 활성을 가질 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. In one embodiment, the alpha-glucosidase of the present application may have an activity of decomposing carbohydrates into glucose. In another embodiment, the alpha-glucosidase of the present application may have an activity of cleaving α(1→4) and/or α(1→6) bonds, but is not limited thereto.
본 출원의 목적상 상기 Agl 단백질은 아미노산 생산능을 강화시킬 수 있는 것이면 어느 것이든 포함될 수 있다. For the purposes of the present application, the Agl protein may include any protein capable of enhancing amino acid production.
일 구현예로, 본 출원의 Agl 단백질은 맥아당(maltose) 및 맥아당 이성질체(isomaltose) 중 선택되는 하나 이상을 분해할 수 있는 효소일 수 있다. 따라서, 본 출원의 미생물은 맥아당(maltose) 및 맥아당 이성질체(isomaltose) 중 선택되는 하나 이상을 탄소원으로 이용하는 것일 수 있다. 상기 미생물은 그에 따라 맥아당 또는 맥아당 이성질체의 당 소모능 또는 당 이용능이 증가된 것일 수 있다. In one embodiment, the Agl protein of the present application may be an enzyme capable of degrading at least one selected from maltose and maltose isomers. Therefore, the microorganism of the present application may use at least one selected from maltose and maltose isomers as a carbon source. The microorganism may thus have increased sugar consumption or sugar utilization of maltose or isomers of maltose.
일 구현예로, 본 출원의 Agl 단백질은 서열번호 1 또는 이와 70% 이상의 상동성 또는 동일성을 갖는 아미노산 서열을 포함하거나, 가지거나, 이루어지거나, 상기 아미노산 서열로 필수적으로 이루어지는(essentially consisting of) 것일 수 있다. In one embodiment, the Agl protein of the present application comprises, has, consists of, or consists essentially of SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence having at least 70% homology or identity thereto, or consisting essentially of the amino acid sequence. can
구체적으로, 본 출원의 Agl 단백질의 아미노산 서열은 agl 유전자에 의해 코딩되는 글루코시다제 활성을 갖는 단백질 서열일 수 있다. 상기 아미노산 서열은 공지의 데이터 베이스인 NCBI의 GenBank 등 다양한 데이터 베이스에서 그 서열을 얻을 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. Specifically, the amino acid sequence of the Agl protein of the present application may be a protein sequence having a glucosidase activity encoded by the agl gene. The amino acid sequence may be obtained from various databases such as NCBI's GenBank, which is a known database, but is not limited thereto.
일 구현예로, 본 출원의 Agl 단백질은 비피도박테리움 아돌레센티스 (Bifidobacterium adolescentis) 유래일 수 있으나, 이에 제한되지 않고 상기 아미노산 서열과 동일한 활성을 갖는 서열은 제한 없이 포함 될 수 있다.In one embodiment, the Agl protein of the present application may be derived from Bifidobacterium adolescentis , but is not limited thereto, and a sequence having the same activity as the above amino acid sequence may be included without limitation.
또한, 본 출원의 Agl 단백질의 일 구현예를 서열번호 1을 포함하는 단백질로 기재하였으나, 서열번호 1의 아미노산 서열 앞뒤로의 무의미한 서열 추가 또는 자연적으로 발생할 수 있는 돌연변이, 또는 이의 잠재성 돌연변이(silent mutation)를 제외하는 것이 아니며, 상기 아미노산 서열을 포함하는 단백질과 서로 동일 또는 상응하는 활성을 가지는 경우라면 본 출원의 Agl 단백질에 해당됨은 당업자에게 자명하다.In addition, although one embodiment of the Agl protein of the present application was described as a protein containing SEQ ID NO: 1, meaningless sequence additions to and from the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, mutations that may occur naturally, or silent mutations thereof ), and it is apparent to those skilled in the art that the Agl protein of the present application corresponds to the protein having the same or corresponding activity as the protein containing the amino acid sequence.
구체적으로, 본 출원의 Agl 단백질은 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하거나, 또는 서열번호 1의 아미노산 서열과 적어도 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 상동성 또는 동일성을 가지는 아미노산 서열을 포함할 수 있다. 또한, 상기 상동성 또는 동일성을 가지며, 상기 단백질에 상응하는 효능을 나타내는 아미노산 서열이라면, 일부 서열이 결실, 변형, 치환 또는 부가된 아미노산 서열을 가지더라도 본 출원의 범위 내에 포함됨은 자명하다.Specifically, the Agl protein of the present application comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, or at least 70%, 75%, 80%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89% of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 %, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% homology or identity. In addition, it is obvious that any amino acid sequence having the above homology or identity and exhibiting efficacy corresponding to the protein is included within the scope of the present application even if some sequences have amino acid sequences that are deleted, modified, substituted or added.
본 출원에서 '특정 서열번호로 기재된 아미노산 서열을 포함하는 폴리펩티드 또는 단백질', '특정 서열번호로 기재된 아미노산 서열로 이루어진 폴리펩티드 또는 단백질' 또는 '특정 서열번호로 기재된 아미노산 서열을 갖는 폴리펩티드 또는 단백질'라고 기재되어 있더라도, 해당 서열번호의 아미노산 서열로 이루어진 폴리펩티드와 동일 혹은 상응하는 활성을 가지는 경우라면, 일부 서열이 결실, 변형, 치환, 보존적 치환 또는 부가된 아미노산 서열을 갖는 단백질도 본 출원에서 사용될 수 있음은 자명하다. 예를 들어, 상기 아미노산 서열 N-말단 그리고/또는 C-말단에 단백질의 기능을 변경하지 않는 서열 추가, 자연적으로 발생할 수 있는 돌연변이, 이의 잠재성 돌연변이 (silent mutation) 또는 보존적 치환을 가지는 경우이다.In this application, it is described as 'a polypeptide or protein comprising the amino acid sequence described in a specific sequence number', 'a polypeptide or protein consisting of the amino acid sequence described in a specific sequence number', or 'a polypeptide or protein having an amino acid sequence described in a specific sequence number' Even if it is, if it has the same or equivalent activity as the polypeptide consisting of the amino acid sequence of the corresponding sequence number, a protein having an amino acid sequence in which some sequence is deleted, modified, substituted, conservatively substituted, or added can also be used in this application. is self-explanatory. For example, it is a case of adding a sequence that does not change the function of the protein, a naturally occurring mutation, a silent mutation thereof, or a conservative substitution to the N-terminus and/or C-terminus of the amino acid sequence. .
상기 "보존적 치환(conservative substitution)"은 한 아미노산을 유사한 구조적 및/또는 화학적 성질을 갖는 또 다른 아미노산으로 치환시키는 것을 의미한다. 이러한 아미노산 치환은 일반적으로 잔기의 극성, 전하, 용해도, 소수성, 친수성 및/또는 양친매성(amphipathic nature)에서의 유사성에 근거하여 발생할 수 있다. 통상적으로, 보존적 치환은 폴리펩티드의 활성에 거의 영향을 미치지 않거나 또는 영향을 미치지 않을 수 있다.The "conservative substitution" refers to the substitution of one amino acid with another amino acid having similar structural and/or chemical properties. Such amino acid substitutions can generally occur based on similarities in polarity, charge, solubility, hydrophobicity, hydrophilicity and/or amphipathic nature of the residues. Typically, conservative substitutions may have little or no effect on the activity of the polypeptide.
본 출원에서 용어, '상동성 (homology)' 또는 '동일성 (identity)'은 두 개의 주어진 아미노산 서열 또는 염기 서열 상호간 동일 또는 유사한 정도를 의미하며 백분율로 표시될 수 있다. 용어 상동성 및 동일성은 종종 상호교환적으로 이용될 수 있다.In the present application, the term 'homology' or 'identity' refers to the degree of identical or similarity between two given amino acid sequences or base sequences and may be expressed as a percentage. The terms homology and identity are often used interchangeably.
보존된(conserved) 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드의 서열 상동성 또는 동일성은 표준 배열 알고리즘에 의해 결정되며, 사용되는 프로그램에 의해 확립된 디폴트 갭 페널티가 함께 이용될 수 있다. 실질적으로, 상동성을 갖거나(homologous) 또는 동일한(identical) 서열은 일반적으로 서열 전체 또는 전체-길이의 적어도 약 50%, 60%, 70%, 80% 또는 90%에 해당하는 일부분과 중간 또는 높은 엄격한 조건(stringent conditions)에서 하이브리드할 수 있다. 하이브리드화에는 폴리뉴클레오티드에서 일반 코돈 또는 코돈 축퇴성을 고려한 코돈을 함유하는 폴리뉴클레오티드와의 하이브리드화 역시 포함됨이 자명하다.Sequence homology or identity of conserved polynucleotides or polypeptides can be determined by standard alignment algorithms, together with default gap penalties established by the program used. Substantially homologous or identical sequences are generally the entire sequence or a portion corresponding to at least about 50%, 60%, 70%, 80% or 90% of the full-length and intermediate or It can hybridize under highly stringent conditions. It is obvious that hybridization also includes hybridization with polynucleotides containing common codons or codons considering codon degeneracy in polynucleotides.
임의의 두 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드 서열이 상동성, 유사성 또는 동일성을 갖는지 여부는, 예를 들어, Pearson et al (1988) [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85]: 2444에서와 같은 디폴트 파라미터를 이용하여 "FASTA" 프로그램과 같은 공지의 컴퓨터 알고리즘을 이용하여 결정될 수 있다. 또는, EMBOSS 패키지의 니들만 프로그램(EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite, Rice et al., 2000, Trends Genet. 16: 276-277)(버전 5.0.0 또는 이후 버전)에서 수행되는 바와 같은, 니들만-운치(Needleman-Wunsch) 알고리즘(Needleman and Wunsch, 1970, J. Mol. Biol. 48: 443-453)이 사용되어 결정될 수 있다(GCG 프로그램 패키지 (Devereux, J., et al, Nucleic Acids Research 12: 387 (1984)), BLASTP, BLASTN, FASTA (Atschul, [S.] [F.,] [ET AL, J MOLEC BIOL 215]: 403 (1990); Guide to Huge Computers, Martin J. Bishop, [ED.,] Academic Press, San Diego,1994, 및 [CARILLO et al.](1988) SIAM J Applied Math 48: 1073을 포함한다). 예를 들어, 국립 생물공학 정보 데이터베이스 센터의 BLAST, 또는 ClustalW를 이용하여 상동성, 유사성 또는 동일성을 결정할 수 있다.Whether any two polynucleotide or polypeptide sequences have homology, similarity or identity can be determined, for example, by Pearson et al (1988) [Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85]: can be determined using known computer algorithms such as the “FASTA” program using default parameters as in 2444. or, as performed in the Needleman program of the EMBOSS package (EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite, Rice et al., 2000, Trends Genet. 16: 276-277) (version 5.0.0 or later), It can be determined using the Needleman-Wunsch algorithm (Needleman and Wunsch, 1970, J. Mol. Biol. 48: 443-453) (GCG program package (Devereux, J., et al, Nucleic Acids Research 12: 387 (1984)), BLASTP, BLASTN, FASTA (Atschul, [S.] [F.,] [ET AL, J MOLEC BIOL 215]: 403 (1990); Guide to Huge Computers, Martin J. Bishop , [ED.,] Academic Press, San Diego, 1994, and [CARILLO et al.] (1988) SIAM J Applied Math 48: 1073. For example, BLAST of the National Center for Biotechnology Information Database, or ClustalW can be used to determine homology, similarity or identity.
폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드의 상동성, 유사성 또는 동일성은, 예를 들어, Smith and Waterman, Adv. Appl. Math (1981) 2:482 에 공지된 대로, 예를 들면, Needleman et al. (1970), J Mol Biol. 48:443과 같은 GAP 컴퓨터 프로그램을 이용하여 서열 정보를 비교함으로써 결정될 수 있다. 요약하면, GAP 프로그램은 두 서열 중 더 짧은 것에서의 기호의 전체 수로, 유사한 배열된 기호(즉, 뉴클레오티드 또는 아미노산)의 수를 나눈 값으로 정의할 수 있다. GAP 프로그램을 위한 디폴트 파라미터는 (1) 이진법 비교 매트릭스(동일성을 위해 1 그리고 비-동일성을 위해 0의 값을 함유함) 및 Schwartz and Dayhoff, eds., Atlas Of Protein Sequence And Structure, National Biomedical Research Foundation, pp. 353-358 (1979)에 의해 개시된 대로, Gribskov et al(1986) Nucl. Acids Res. 14: 6745의 가중된 비교 매트릭스 (또는 EDNAFULL (NCBI NUC4.4의 EMBOSS 버전) 치환 매트릭스); (2) 각 갭을 위한 3.0의 페널티 및 각 갭에서 각 기호를 위한 추가의 0.10 페널티 (또는 갭 개방 패널티 10, 갭 연장 패널티 0.5); 및 (3) 말단 갭을 위한 무 페널티를 포함할 수 있다.Homology, similarity or identity of polynucleotides or polypeptides can be found in, for example, Smith and Waterman, Adv. Appl. Math (1981) 2:482, eg, Needleman et al. (1970), J Mol Biol. It can be determined by comparing sequence information using a GAP computer program such as 48:443. In summary, the GAP program can define the total number of symbols in the shorter of the two sequences divided by the number of similarly arranged symbols (i.e., nucleotides or amino acids). The default parameters for the GAP program are (1) a binary comparison matrix (containing values of 1 for identity and 0 for non-identity) and Schwartz and Dayhoff, eds., Atlas Of Protein Sequence And Structure, National Biomedical Research Foundation , pp. 353-358 (1979), Gribskov et al (1986) Nucl. Acids Res. 14: weighted comparison matrix of 6745 (or EDNAFULL (EMBOSS version of NCBI NUC4.4) substitution matrix); (2) a penalty of 3.0 for each gap and an additional penalty of 0.10 for each symbol in each gap (or 10 gap opening penalty, 0.5 gap extension penalty); and (3) no penalty for end gaps.
또한, 임의의 두 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드 서열이 상동성, 유사성 또는 동일성을 갖는지 여부는 정의된 엄격한 조건하에서 써던 혼성화 실험에 의해 서열을 비교함으로써 확인할 수 있으며, 정의되는 적절한 혼성화 조건은 해당 기술 범위 내이고, 당업자에게 잘 알려진 방법(예컨대, J. Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Laboratory press, Cold Spring Harbor, New York, 1989; F.M. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., New York)으로 결정될 수 있다.In addition, whether any two polynucleotide or polypeptide sequences have homology, similarity or identity can be confirmed by comparing the sequences by Southern hybridization experiments under defined stringent conditions, and appropriate hybridization conditions defined are within the scope of the art , methods well known to those skilled in the art (e.g., J. Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Laboratory press, Cold Spring Harbor, New York, 1989; F.M. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., New York).
본 출원의 Agl 단백질의 활성이 강화된 미생물은, Agl 단백질; 이를 코딩하는 폴리뉴클레오티드; 및 상기 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터 중 1 이상을 포함하는 미생물일 수 있다.The microorganisms in which the activity of the Agl protein of the present application is enhanced include Agl protein; polynucleotides encoding them; And it may be a microorganism containing one or more of the vectors containing the polynucleotide.
본 출원에서 용어, "폴리뉴클레오티드"는 뉴클레오티드 단위체(monomer)가 공유결합에 의해 길게 사슬모양으로 이어진 뉴클레오티드의 중합체(polymer)로 일정한 길이 이상의 DNA 가닥이다.As used herein, the term "polynucleotide" is a DNA strand of a certain length or longer as a polymer of nucleotides in which nucleotide monomers are connected in a long chain shape by covalent bonds.
본 출원의 Agl 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열은 "agl 유전자"또는 "aglB 유전자" 로도 칭해질 수 있으며, 이는 상기 서열번호 1로 기재한 아미노산 서열을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함할 수 있다. The polynucleotide sequence encoding the Agl protein of the present application may also be referred to as " agl gene" or " aglB gene", which may include the polynucleotide sequence encoding the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 1 above.
상기 폴리뉴클레오티드는 코돈의 축퇴성(degeneracy)으로 인하여 또는 상기 폴리펩티드를 발현시키고자 하는 생물에서 선호되는 코돈을 고려하여, 폴리펩티드의 아미노산 서열을 변화시키지 않는 범위 내에서 코딩 영역에 다양한 변형이 이루어질 수 있다. 구체적으로, 상기 폴리뉴클레오티드는 서열번호 2 또는 이와 70% 이상의 상동성 또는 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하거나, 이루어지거나, 이로 필수적으로 이루어질 수 있으나 이에 제한되지 않는다. 예를 들면, 상기 폴리뉴클레오티드는 서열번호 2와 상동성 또는 동일성이 70% 이상, 80% 이상, 구체적으로 90% 이상, 보다 구체적으로 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상 또는 더욱 구체적으로 99% 이상인 염기서열로 이루어질 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the polynucleotide, various modifications may be made to the coding region within a range that does not change the amino acid sequence of the polypeptide due to codon degeneracy or in consideration of codons preferred in organisms in which the polypeptide is to be expressed. . Specifically, the polynucleotide may include, consist of, or consist essentially of SEQ ID NO: 2 or a polynucleotide sequence having 70% or more homology or identity thereto, but is not limited thereto. For example, the polynucleotide has 70% or more, 80% or more, specifically 90% or more, more specifically 95% or more, 96% or more, 97% or more, 98% or more homology or identity with SEQ ID NO: 2 More specifically, it may consist of a nucleotide sequence of 99% or more, but is not limited thereto.
또한, 본 출원의 폴리뉴클레오티드에는 프로브(Probe), 예를 들면, 상기 폴리뉴클레오티드 염기 서열의 전체 또는 일부에 대한 상보 서열과 엄격한 조건 하에 하이브리드화할 수 있는 서열이라면 제한없이 포함될 수 있다. 상기 "엄격한 조건(stringent condition)"이란 폴리뉴클레오티드 간의 특이적 혼성화를 가능하게 하는 조건을 의미한다. 이러한 조건은 문헌(예컨대, J. Sambrook et al., 상동)에 구체적으로 기재되어 있다. 예를 들어, 상동성 또는 동일성이 높은 폴리뉴클레오티드끼리, 40% 이상, 구체적으로 90% 이상, 보다 구체적으로 95% 이상, 96% 이상, 97% 이상, 98% 이상, 더욱 구체적으로 99% 이상의 상동성 또는 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드끼리 하이브리드화하고, 그보다 상동성 또는 동일성이 낮은 폴리뉴클레오티드끼리 하이브리드화하지 않는 조건, 또는 통상의 써던 하이브리드화(southern hybridization)의 세척 조건인 60℃, 1×SSC, 0.1% SDS, 구체적으로 60℃, 0.1×SSC, 0.1% SDS, 보다 구체적으로 68℃, 0.1×SSC, 0.1% SDS에 상당하는 염 농도 및 온도에서, 1회, 구체적으로 2회 내지 3회 세정하는 조건일 수 있다.In addition, the polynucleotide of the present application may include without limitation any sequence capable of hybridizing with a probe, for example, a sequence complementary to all or part of the polynucleotide base sequence under stringent conditions. The "stringent condition" means a condition that allows specific hybridization between polynucleotides. Such conditions are specifically described in the literature (eg, J. Sambrook et al., ibid.). For example, polynucleotides with high homology or identity, 40% or more, specifically 90% or more, more specifically 95% or more, 96% or more, 97% or more, 98% or more, more specifically 99% or more 60 ° C., 1 × SSC, 0.1 washing conditions for hybridization under conditions in which polynucleotides having the same identity or identity do not hybridize and polynucleotides having less homology or identity do not hybridize, or washing conditions for typical southern hybridization Washing once, specifically 2 to 3 times, at a salt concentration and temperature corresponding to % SDS, specifically 60 ° C, 0.1 × SSC, 0.1% SDS, more specifically 68 ° C, 0.1 × SSC, 0.1% SDS may be a condition.
혼성화는 비록 혼성화의 엄격도에 따라 염기 간의 미스매치(mismatch)가 가능할지라도, 두 개의 핵산이 상보적 서열을 가질 것을 요구한다. 용어, "상보적"은 서로 혼성화가 가능한 뉴클레오티드 염기 간의 관계를 기술하는데 사용된다. 예를 들면, DNA에 관하여, 아데닌은 티민에 상보적이며 시토신은 구아닌에 상보적이다. 따라서, 본 출원의 폴리뉴클레오티드는 또한 실질적으로 유사한 핵산 서열뿐만 아니라 전체 서열에 상보적인 단리된 핵산 단편을 포함할 수 있다. Hybridization requires that two nucleic acids have complementary sequences, although mismatches between bases are possible depending on the stringency of hybridization. The term "complementary" is used to describe the relationship between nucleotide bases that are capable of hybridizing to each other. For example, with respect to DNA, adenine is complementary to thymine and cytosine is complementary to guanine. Thus, the polynucleotides of the present application may also include substantially similar nucleic acid sequences as well as isolated nucleic acid fragments complementary to the entire sequence.
구체적으로, 상동성 또는 동일성을 가지는 폴리뉴클레오티드는 55℃의 Tm 값에서 혼성화 단계를 포함하는 혼성화 조건을 사용하고 상술한 조건을 사용하여 탐지할 수 있다. 또한, 상기 Tm 값은 60℃, 63℃ 또는 65℃일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니고 그 목적에 따라 당업자에 의해 적절히 조절될 수 있다.Specifically, polynucleotides having homology or identity can be detected using hybridization conditions including a hybridization step at a Tm value of 55° C. and using the above-described conditions. In addition, the Tm value may be 60 ° C, 63 ° C or 65 ° C, but is not limited thereto and may be appropriately adjusted by those skilled in the art according to the purpose.
폴리뉴클레오티드를 혼성화하는 적절한 엄격도는 폴리뉴클레오티드의 길이 및 상보성 정도에 의존하고 변수는 해당기술분야에 잘 알려져 있다(J. Sambrook et al., 상동).Appropriate stringency for hybridizing polynucleotides depends on the length of the polynucleotide and the degree of complementarity, parameters well known in the art (J. Sambrook et al., supra).
본 출원에서 "벡터"는 Agl 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 숙주의 염색체 내로 삽입하기 위한 DNA 제조물 또는 적합한 숙주 내에서 목적 폴리펩티드를 발현시킬 수 있도록 적합한 발현조절영역(또는 발현조절서열)에 작동 가능하게 연결된 상기 Agl 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드의 염기서열을 포함하는 DNA 제조물을 포함할 수 있다. 상기 발현조절영역은 전사를 개시할 수 있는 프로모터, 그러한 전사를 조절하기 위한 임의의 오퍼레이터 서열, 적합한 mRNA 리보좀 결합부위를 코딩하는 서열, 및 전사 및 해독의 종결을 조절하는 서열을 포함할 수 있다. 벡터는 적당한 숙주세포 내로 형질전환된 후, 숙주 게놈과 무관하게 복제되거나 기능할 수 있으며, 게놈 그 자체에 통합될 수 있다.In the present application, "vector" refers to a DNA preparation for inserting a polynucleotide encoding an Agl protein into a host chromosome or a suitable expression control region (or expression control sequence) so as to express a target polypeptide in a suitable host operably. It may include a DNA preparation containing the nucleotide sequence of the polynucleotide encoding the linked Agl protein. The expression control region may include a promoter capable of initiating transcription, an arbitrary operator sequence for regulating such transcription, a sequence encoding a suitable mRNA ribosome binding site, and a sequence regulating termination of transcription and translation. After transformation into a suitable host cell, the vector can replicate or function independently of the host genome and can integrate into the genome itself.
본 출원의 벡터는 본 출원의 Agl 단백질을 숙주세포에서 발현시키기 위한 발현 벡터일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.The vector of the present application may be an expression vector for expressing the Agl protein of the present application in a host cell, but is not limited thereto.
또한 본 출원의 벡터는 본 출원의 Agl 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 염색체 내로 삽입시키기 위한 삽입용 벡터일 수 있으나 이에 제한되지 않는다. 상기 폴리뉴클레오티드의 염색체 내로의 삽입은 당업계에 알려진 임의의 방법, 예를 들면, 상동재조합(homologous recombination)에 의하여 이루어질 수 있으나, 이에 한정되지는 않는다. 상기 염색체 삽입 여부를 확인하기 위한 선별 마커(selection marker)를 추가로 포함할 수 있다. 상기 선별 마커는 벡터로 형질전환된 세포를 선별, 즉 목적 핵산 분자의 삽입 여부를 확인하기 위한 것으로, 약물 내성, 영양 요구성, 세포 독성제에 대한 내성 또는 표면 폴리펩티드의 발현과 같은 선택가능 표현형을 부여하는 마커들이 사용될 수 있다. 선택제(selective agent)가 처리된 환경에서는 선별 마커를 발현하는 세포만 생존하거나 다른 표현 형질을 나타내므로, 형질전환된 세포를 선별할 수 있다. 상기 삽입용 벡터는 형질전환된 세포내에서 복제(replication)에 필요한 복제원점을 포함하지 않을 수 있다.In addition, the vector of the present application may be an insertion vector for inserting the polynucleotide encoding the Agl protein of the present application into a chromosome, but is not limited thereto. Insertion of the polynucleotide into the chromosome may be performed by any method known in the art, for example, homologous recombination, but is not limited thereto. A selection marker for determining whether the chromosome is inserted may be further included. The selectable marker is used to select cells transformed with a vector, that is, to determine whether a target nucleic acid molecule has been inserted, and can exhibit selectable phenotypes such as drug resistance, auxotrophy, resistance to cytotoxic agents, or surface polypeptide expression. markers may be used. In an environment treated with a selective agent, only cells expressing the selectable marker survive or exhibit other expression traits, so transformed cells can be selected. The insertion vector may not contain an origin of replication required for replication in the transformed cell.
본 출원에서 사용되는 벡터는 특별히 한정되지 않으며, 당업계에 알려진 임의의 벡터를 이용할 수 있다. 통상 사용되는 벡터의 예로는 천연 상태이거나 재조합된 상태의 플라스미드, 코스미드, 바이러스 및 박테리오파지를 들 수 있다. 예를 들어, 파지 벡터 또는 코스미드 벡터로서 pWE15, M13, MBL3, MBL4, IXII, ASHII, APII, t10, t11, Charon4A, 및 Charon21A 등을 사용할 수 있으며, 플라스미드 벡터로서 pDZ계, pBR계, pUC계, pBluescriptII계, pGEM계, pTZ계, pCL계 및 pET계 등을 사용할 수 있다. 구체적으로는 pDZ, pDC, pDCM2, pACYC177, pACYC184, pCL, pECCG117, pUC19, pBR322, pMW118, pCC1BAC 벡터 등을 사용할 수 있다.Vectors used in the present application are not particularly limited, and any vectors known in the art may be used. Examples of commonly used vectors include natural or recombinant plasmids, cosmids, viruses and bacteriophages. For example, pWE15, M13, MBL3, MBL4, IXII, ASHII, APII, t10, t11, Charon4A, and Charon21A can be used as phage vectors or cosmid vectors, and pDZ-based, pBR-based, and pUC-based plasmid vectors , pBluescriptII-based, pGEM-based, pTZ-based, pCL-based, pET-based, etc. can be used. Specifically, pDZ, pDC, pDCM2, pACYC177, pACYC184, pCL, pECCG117, pUC19, pBR322, pMW118, pCC1BAC vectors and the like can be used.
본 출원의 용어 "형질전환"은 상기 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터를 숙주세포 내에 도입하여 숙주세포 내에서 상기 폴리뉴클레오티드가 코딩하는 단백질이 발현할 수 있도록 하는 것을 의미한다. 형질전환된 폴리뉴클레오티드는 숙주세포 내에서 발현될 수 있기만 한다면, 숙주세포의 염색체 내에 삽입되어 위치하거나 염색체 외에 위치할 수 있다. 또한, 상기 폴리뉴클레오티드는 상기 단백질을 코딩하는 DNA 및/또는 RNA를 포함한다. 상기 폴리뉴클레오티드는 숙주세포 내로 도입되어 발현될 수 있는 것이면, 어떠한 형태로 도입되는 것이든 상관없다. 예를 들면, 상기 폴리뉴클레오티드는 자체적으로 발현되는데 필요한 모든 요소를 포함하는 유전자 구조체인 발현 카세트 (expression cassette)의 형태로 숙주세포에 도입될 수 있다. 상기 발현 카세트는 통상 상기 폴리뉴클레오티드에 작동 가능하게 연결되어 있는 프로모터 (promoter), 전사 종결신호, 리보좀 결합부위 및 번역 종결신호를 포함할 수 있다. 상기 발현 카세트는 자체 복제가 가능한 발현 벡터 형태일 수 있다. 또한, 상기 폴리뉴클레오티드는 그 자체의 형태로 숙주세포에 도입되어 숙주세포에서 발현에 필요한 서열과 작동 가능하게 연결되어 있는 것일 수도 있으며, 이에 한정되지 않는다.The term "transformation" in the present application means introducing a vector containing a polynucleotide encoding the protein into a host cell so that the protein encoded by the polynucleotide can be expressed in the host cell. The transformed polynucleotide may be inserted into and located in the chromosome of the host cell or located outside the chromosome, as long as it can be expressed in the host cell. In addition, the polynucleotide includes DNA and/or RNA encoding the protein. The polynucleotide may be introduced in any form as long as it can be introduced into a host cell and expressed. For example, the polynucleotide may be introduced into a host cell in the form of an expression cassette, which is a genetic construct containing all elements required for self-expression. The expression cassette may include a promoter operably linked to the polynucleotide, a transcription termination signal, a ribosome binding site, and a translation termination signal. The expression cassette may be in the form of an expression vector capable of self-replication. In addition, the polynucleotide may be introduced into a host cell in its own form and operably linked to a sequence necessary for expression in the host cell, but is not limited thereto.
또한, 본 출원의 용어 "작동 가능하게 연결"된 것이란 본원의 Agl 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드의 전사를 개시 및 매개하도록 하는 프로모터 서열과 상기 유전자 서열이 기능적으로 연결되어 있는 것을 의미한다.In addition, the term "operably linked" in the present application means that a promoter sequence that initiates and mediates transcription of a polynucleotide encoding the Agl protein of the present application and the gene sequence are functionally linked.
본 출원의 벡터를 형질전환 시키는 방법은 핵산을 세포 내로 도입하는 어떤 방법도 포함되며, 숙주세포에 따라 당 분야에서 공지된 바와 같이 적합한 표준 기술을 선택하여 수행할 수 있다. 예를 들어, 전기천공법 (electroporation), 인산칼슘 (CaPO4) 침전, 염화칼슘 (CaCl2) 침전, 미세주입법 (microinjection), 폴리에틸렌 글리콜 (PEG)법, DEAE-덱스트란법, 양이온 리포좀법, 및 초산 리튬-DMSO법 등이 있으나, 이에 제한되지 않는다.The method of transforming the vector of the present application includes any method of introducing nucleic acid into a cell, and can be performed by selecting an appropriate standard technique as known in the art according to the host cell. For example, electroporation, calcium phosphate (CaPO4) precipitation, calcium chloride (CaCl2) precipitation, microinjection, polyethylene glycol (PEG) method, DEAE-dextran method, cationic liposomal method, and lithium acetate -DMSO method, etc., but is not limited thereto.
본 출원에서 용어 "미생물" 또는 "균주"는 야생형 미생물이나 자연적 또는 인위적으로 유전적 변형이 일어난 미생물을 모두 포함하며, 외부 유전자가 삽입되거나 내재적 유전자의 활성이 강화되거나 불활성화되는 등의 원인으로 인해서 특정 기작이 약화되거나 강화된 미생물로서, 목적하는 폴리펩티드, 단백질 또는 산물의 생산을 위하여 유전적 변형(modification)을 포함하는 미생물일 수 있다.In this application, the term "microorganism" or "strain" includes both wild-type microorganisms and naturally or artificially genetically modified microorganisms, and is derived from causes such as insertion of foreign genes or enhancement or inactivation of endogenous gene activity. As a microorganism in which a specific mechanism is weakened or enhanced, it may be a microorganism that includes genetic modification for the production of a desired polypeptide, protein or product.
본 출원의 미생물은 아미노산 생산능을 가지는 미생물일 수 있다.The microorganism of the present application may be a microorganism having an amino acid production ability.
본 출원의 미생물은, 자연적으로 Agl 단백질 또는 아미노산 생산능을 가진 미생물, 또는 Agl 단백질 또는 아미노산 생산능이 없는 모균주에 본 출원의 Agl 단백질이 도입된 것일 수 있다. The microorganism of the present application may be one in which the Agl protein of the present application is introduced into a microorganism naturally having the ability to produce Agl protein or amino acid, or a mother strain having no ability to produce Agl protein or amino acid.
일 예로, 본 출원의 미생물은 본 출원의 Agl 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드로 형질전환되어 Agl 단백질의 활성이 강화된 세포 또는 미생물로서, 본 출원의 목적상 본 출원의 미생물은 본 출원의 Agl 단백질을 포함하여 아미노산을 생산할 수 있는 미생물을 모두 포함할 수 있다.For example, the microorganism of the present application is a cell or microorganism in which the activity of the Agl protein is enhanced by being transformed with a polynucleotide encoding the Agl protein of the present application. It may include all microorganisms capable of producing amino acids, including.
예를 들어, 본 출원의 미생물은 천연의 야생형 미생물, 또는 아미노산을 생산하는 미생물에 본 출원의 Agl 단백질을 코딩하는 폴리뉴클레오티드가 도입됨으로써 Agl 단백질의 활성이 강화되어 아미노산 생산능이 증가된 재조합 균주일 수 있다. 상기 아미노산 생산능이 증가된 재조합 균주는, 천연의 야생형 미생물 또는 본 출원의 Agl 단백질의 활성이 강화되지 않거나, Agl 단백질을 발현하지 않는 미생물에 비해 아미노산 생산능이 증가된 미생물일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다. For example, the microorganism of the present application may be a natural wild-type microorganism or a recombinant strain whose amino acid production ability is increased by enhancing the activity of the Agl protein by introducing a polynucleotide encoding the Agl protein of the present application into a natural wild-type microorganism or a microorganism producing amino acids. have. The recombinant strain with increased amino acid production ability may be a natural wild-type microorganism or a microorganism with increased amino acid production ability compared to a microorganism in which the activity of the Agl protein of the present application is not enhanced or does not express the Agl protein, but is not limited thereto. not.
그 예로, 상기 아미노산 생산능의 증가 여부를 비교하는 대상 균주인, 본 출원의 Agl 단백질을 발현하지 않는 미생물은 KCCM11016P (대한민국 등록특허 제10-0159812호) 또는 KCCM10770P (US 9109242 B2) 일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.For example, a microorganism that does not express the Agl protein of the present application, which is a target strain for comparing the increase in the amino acid production ability, may be KCCM11016P (Korean Patent No. 10-0159812) or KCCM10770P (US 9109242 B2), Not limited to this.
일 예로, 상기 생산능이 증가된 재조합 균주는 변이 전 모균주 또는 비변형 미생물의 아미노산 생산능에 비하여 약 0.001% 이상 또는 0.01% 이상 아미노산 생산능이 높아진 것일 수 있으나, 변이 전 모균주 또는 비변형 미생물의 생산능에 비해 +값의 증가량을 갖는 한, 이에 제한되지 않는다. 상기 용어 "약(about)"은 ±0.5, ±0.4, ±0.3, ±0.2, ±0.1 등을 모두 포함하는 범위로, 약 이란 용어 뒤에 나오는 수치와 동등하거나 유사한 범위의 수치를 모두 포함하나, 이에 제한되지 않는다.For example, the recombinant strain with increased production capacity may have an amino acid production capacity increased by about 0.001% or more or 0.01% or more compared to the amino acid production capacity of the parent strain or non-modified microorganism before mutation, but the production of the parent strain or non-modified microorganism before mutation As long as it has an increased amount of + value compared to the ability, it is not limited to this. The term “about” includes all ranges of ±0.5, ±0.4, ±0.3, ±0.2, ±0.1, etc., and includes all ranges equivalent to or similar to the ranges following the term “about”. Not limited.
본 출원에서 용어, "비변형 미생물"은 미생물에 자연적으로 발생할 수 있는 돌연변이를 포함하는 균주를 제외하는 것이 아니며, 야생형 균주 또는 천연형 균주 자체이거나, 자연적 또는 인위적 요인에 의한 유전적 변이로 형질이 변화되기 전 균주를 의미할 수 있다. 예를 들어, 상기 비변형 미생물은 본 출원의 Agl 단백질이 도입되지 않거나 도입되기 전의 균주를 의미할 수 있다. 상기 "비변형 미생물"은 "변형 전 균주", "변형 전 미생물", "비변이 균주", "비변형 균주", "비변이 미생물" 또는 "기준 미생물"과 혼용될 수 있다.In this application, the term "unmodified microorganism" does not exclude strains containing mutations that may occur naturally in microorganisms, and are wild-type strains or wild-type strains themselves, or are genetically modified by natural or artificial factors. It may mean a strain before change. For example, the unmodified microorganism may refer to a strain without or before the introduction of the Agl protein of the present application. The "unmodified microorganism" may be used interchangeably with "strain before transformation", "microorganism before transformation", "non-mutated strain", "unmodified strain", "non-mutated microorganism" or "reference microorganism".
본 출원의 미생물은 코리네박테리움 속 미생물일 수 있다. 본 출원에서 "코리네박테리움 속 미생물"은 모든 코리네박테리움 속 미생물을 포함할 수 있다. 구체적으로, 코리네박테리움 글루타미쿰(Corynebacterium glutamicum), 코리네박테리움 크루디락티스(Corynebacterium crudilactis), 코리네박테리움 데세르티(Corynebacterium deserti), 코리네박테리움 이피시엔스(Corynebacterium efficiens), 코리네박테리움 칼루내(Corynebacterium callunae), 코리네박테리움 스테셔니스(Corynebacterium stationis), 코리네박테리움 싱굴라레(Corynebacterium singulare), 코리네박테리움 할로톨레란스(Corynebacterium halotolerans), 코리네박테리움 스트리아툼(Corynebacterium striatum), 코리네박테리움 암모니아게네스(Corynebacterium ammoniagenes), 코리네박테리움 폴루티솔리(Corynebacterium pollutisoli), 코리네박테리움 이미탄스(Corynebacterium imitans), 코리네박테리움 테스투디노리스(Corynebacterium testudinoris) 또는 코리네박테리움 플라베스센스(Corynebacterium flavescens)일 수 있고, 더욱 구체적으로 코리네박테리움 글루타미쿰일 수 있다. The microorganism of the present application may be a microorganism of the genus Corynebacterium. In this application, "microbes of the genus Corynebacterium" may include all microorganisms of the genus Corynebacterium. Specifically, Corynebacterium glutamicum ( Corynebacterium glutamicum ), Corynebacterium crudilactis ( Corynebacterium crudilactis ), Corynebacterium deserti ( Corynebacterium deserti ), Corynebacterium efficiens ( Corynebacterium efficiens ) . _ _ _ Rium striatum ( Corynebacterium striatum ), Corynebacterium ammoniagenes ( Corynebacterium ammoniagenes ), Corynebacterium pollutisoli ( Corynebacterium pollutisoli ), Corynebacterium imitans ( Corynebacterium imitans ), Corynebacterium testudino It may be Corynebacterium testudinoris or Corynebacterium flavescens , and more specifically Corynebacterium glutamicum.
본 출원에서 용어, 폴리펩티드 활성의 "강화"는, 폴리펩티드의 활성이 내재적 활성에 비하여 증가되는 것을 의미한다. 상기 강화는 활성화(activation), 상향조절(up-regulation), 과발현(overexpression), 증가(increase) 등의 용어와 혼용될 수 있다. As used herein, the term "enhancement" of polypeptide activity means that the activity of the polypeptide is increased relative to the intrinsic activity. The enhancement may be used interchangeably with terms such as activation, up-regulation, overexpression, and increase.
여기서 활성화, 강화, 상향조절, 과발현, 증가는 본래 가지고 있지 않았던 활성을 나타내게 되는 것, 또는 내재적 활성 또는 변형 전 활성에 비하여 향상된 활성을 나타내게 되는 것을 모두 포함할 수 있다. Herein, activation, enhancement, upregulation, overexpression, and increase may include those that exhibit an activity that was not originally possessed, or those that exhibit enhanced activity compared to intrinsic activity or activity before modification.
따라서, Agl 단백질을 발현하는 미생물 또는 Agl 단백질이 도입된 미생물은, Agl 단백질의 활성이 강화된 미생물로도 표현할 수 있다.Therefore, a microorganism expressing the Agl protein or a microorganism into which the Agl protein is introduced can also be referred to as a microorganism in which the activity of the Agl protein is enhanced.
상기 "내재적 활성"은 자연적 또는 인위적 요인에 의한 유전적 변이로 형질이 변화하는 경우, 형질 변화 전 모균주 또는 비변형 미생물이 본래 가지고 있던 특정 폴리펩티드의 활성을 의미한다. 이는 "변형 전 활성"과 혼용되어 사용될 수 있다. 폴리펩티드의 활성이 내재적 활성에 비하여 "강화", "상향조절", "과발현" 또는 "증가"한다는 것은, 형질 변화 전 모균주 또는 비변형 미생물이 본래 가지고 있던 특정 폴리펩티드의 활성 및/또는 농도(발현량)에 비하여 향상된 것을 의미한다.The "intrinsic activity" refers to the activity of a specific polypeptide originally possessed by a parent strain or unmodified microorganism before transformation when a character is changed due to genetic mutation caused by natural or artificial factors. This may be used interchangeably with "activation before transformation". "Enhancement", "upregulation", "overexpression" or "increase" of the activity of a polypeptide compared to the intrinsic activity means that the activity and/or concentration (expression amount) is improved.
상기 강화는 외래의 폴리펩티드를 도입하거나, 내재적인 폴리펩티드의 활성 강화 및/또는 농도(발현량)를 통해 달성할 수 있다. 상기 폴리펩티드의 활성의 강화 여부는 해당 폴리펩티드의 활성 정도, 발현량 또는 해당 폴리펩티드로부터 배출되는 산물의 양의 증가로부터 확인할 수 있다.The enhancement can be achieved by introducing a foreign polypeptide or by enhancing the activity and/or concentration (expression level) of an endogenous polypeptide. Whether or not the activity of the polypeptide is enhanced can be confirmed from an increase in the activity level, expression level, or amount of a product released from the corresponding polypeptide.
상기 폴리펩티드의 활성의 강화는 당해 분야에 잘 알려진 다양한 방법의 적용이 가능하며, 목적 폴리펩티드의 활성을 변형전 미생물보다 강화시킬 수 있는 한, 제한되지 않는다. 구체적으로, 분자생물학의 일상적 방법인 당업계의 통상의 기술자에게 잘 알려진 유전자 공학 및/또는 단백질 공학을 이용한 것일 수 있으나, 이로 제한되지 않는다(예컨대, Sitnicka et al. Functional Analysis of Genes. Advances in Cell Biology. 2010, Vol. 2. 1-16, Sambrook et al. Molecular Cloning 2012 등).Enhancement of the activity of the polypeptide can be applied by various methods well known in the art, and is not limited as long as the activity of the target polypeptide can be enhanced compared to the microorganism before transformation. Specifically, it may be using genetic engineering and / or protein engineering, which is well known to those skilled in the art, which is a routine method of molecular biology, but is not limited thereto (e.g., Sitnicka et al. Functional Analysis of Genes. Advances in Cell Biology. 2010, Vol. 2. 1-16, Sambrook et al. Molecular Cloning 2012, etc.).
구체적으로, 본 출원의 폴리펩티드의 활성 강화는Specifically, enhancing the activity of the polypeptide of the present application
1) 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드의 세포 내 카피수 증가; 1) an increase in intracellular copy number of a polynucleotide encoding a polypeptide;
2) 폴리펩티드를 코딩하는 염색체상의 유전자 발현조절영역을 활성이 강력한 서열로 교체; 2) replacing the gene expression control region on the chromosome encoding the polypeptide with a highly active sequence;
3) 폴리펩티드를 코딩하는 유전자 전사체의 개시코돈 또는 5'-UTR 지역을 코딩하는 염기서열의 변형; 3) modification of the nucleotide sequence encoding the start codon or 5'-UTR region of the gene transcript encoding the polypeptide;
4) 폴리펩티드 활성이 강화되도록 상기 폴리펩티드의 아미노산 서열의 변형;4) modification of the amino acid sequence of the polypeptide to enhance the activity of the polypeptide;
5) 폴리펩티드 활성이 강화되도록 상기 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열의 변형 (예를 들어, 폴리펩티드의 활성이 강화되도록 변형된 폴리펩티드를 코딩하도록 상기 폴리펩티드 유전자의 폴리뉴클레오티드 서열의 변형);5) modification of the polynucleotide sequence encoding the polypeptide to enhance the activity of the polypeptide (eg, modification of the polynucleotide sequence of the polypeptide gene to encode the modified polypeptide to enhance the activity of the polypeptide);
6) 폴리펩티드의 활성을 나타내는 외래 폴리펩티드 또는 이를 코딩하는 외래 폴리뉴클레오티드의 도입; 6) introduction of a foreign polypeptide that exhibits the activity of the polypeptide or a foreign polynucleotide encoding the same;
7) 폴리펩티드를 암호화하는 폴리뉴클레오티드의 코돈 최적화; 7) codon optimization of polynucleotides encoding the polypeptide;
8) 폴리펩티드의 삼차구조를 분석하여 노출 부위를 선택하여 변형하거나 화학적으로 수식; 또는8) Analysis of the tertiary structure of the polypeptide to select exposed sites and modify or chemically modify them; or
9) 상기 1) 내지 8) 중 선택된 2 이상의 조합일 수 있으나, 이에, 특별히 제한되는 것은 아니다.9) It may be a combination of two or more selected from 1) to 8), but is not particularly limited thereto.
본 출원에서, "아미노산"은 아미노기와 카르복시기가 동일한 탄소 원자에 결합되어 있는 화합물을 지칭하며, 단백질의 기본 구성단위가 되는 단백질성 아미노산 및 생물체의 유전 암호(genetic code)에 의해 코딩되지 않는 비단백질성(non-proteinogenic) 아미노산을 모두 포함한다. In this application, "amino acid" refers to a compound in which an amino group and a carboxy group are bonded to the same carbon atom, and includes proteinaceous amino acids that are the basic building blocks of proteins and non-proteins that are not encoded by the genetic code of organisms. Includes all non-proteinogenic amino acids.
일 구현예로, 본 출원의 아미노산은 L-아미노산일 수 있다. 상기 L-아미노산은 예를 들어, L-알라닌, L-알지닌, L-아스파라긴, L-아스파르트산, L-시스테인, L-글루탐산, L-글루타민, L-글리신, L-히스티딘, L-이소류신, L-류신, L-라이신, L-메티오닌, L-페닐알라닌, L-프롤린, L-세린, L-쓰레오닌, L-트립토판, L-티로신 및 L-발린으로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나 이상일 수 있다. 상기 L-아미노산은, 보다 구체적인 예로서 L-라이신일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In one embodiment, an amino acid of the present application may be an L-amino acid. The L-amino acids are, for example, L-alanine, L-arginine, L-asparagine, L-aspartic acid, L-cysteine, L-glutamic acid, L-glutamine, L-glycine, L-histidine, L-isoleucine Any one selected from the group consisting of L-leucine, L-lysine, L-methionine, L-phenylalanine, L-proline, L-serine, L-threonine, L-tryptophan, L-tyrosine and L-valine may be ideal The L-amino acid may be, as a more specific example, L-lysine, but is not limited thereto.
일 구현예로, 본 출원의 아미노산은 비단백질성 아미노산일 수 있다. 상기 비단백질성 아미노산은 예를 들어, 시트룰린, 오르니틴, GABA로 이루어진 군에서 선택되는 어느 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. In one embodiment, an amino acid of the present application may be a non-proteinaceous amino acid. The non-proteinaceous amino acid may be, for example, one or more selected from the group consisting of citrulline, ornithine, and GABA, but is not limited thereto.
본 출원의 다른 하나의 양태는, 본 출원의 미생물을 배지에서 배양하는 단계를 포함하는 아미노산의 생산 방법을 제공한다. 상기 미생물에 대해서는 전술한 바와 같다.Another aspect of the present application provides a method for producing amino acids comprising culturing the microorganism of the present application in a medium. The microorganisms are as described above.
본 출원의 미생물의 배양에 사용되는 배지 및 기타 배양 조건은 통상의 코리네박테리움 속 미생물의 배양에 사용되는 배지라면 특별한 제한 없이 어느 것이나 사용될 수 있으며, 구체적으로는 본 출원의 미생물을 적당한 탄소원, 질소원, 인원, 무기화합물, 아미노산 및/또는 비타민 등을 함유한 통상의 배지 내에서 호기성 또는 혐기성 조건 하에서 온도, pH 등을 조절하면서 배양할 수 있다.Any medium and other culture conditions used for culturing the microorganism of the present application may be used without particular limitation as long as it is a medium used for culturing a common microorganism of the genus Corynebacterium. Specifically, the microorganism of the present application may be used as a suitable carbon source, It can be cultured while controlling temperature, pH, etc. under aerobic or anaerobic conditions in a conventional medium containing a nitrogen source, phosphorus, inorganic compounds, amino acids and/or vitamins.
본 출원에서 상기 탄소원으로는 포도당(glucose), 과당(fructose), 자당(sucrose), 맥아당(maltose) 및 이들의 이성질체 등과 같은 탄수화물; 만니톨, 소르비톨 등과 같은 당 알코올, 피루브산, 락트산, 시트르산 등과 같은 유기산; 글루탐산, 메티오닌, 리신 등과 같은 아미노산 등이 포함될 수 있다. 또한, 전분 가수분해물, 당밀, 블랙스트랩 당밀, 쌀겨울, 카사버, 사탕수수 찌꺼기 및 옥수수 침지액 같은 천연의 유기 영양원을 사용할 수 있으며, 구체적으로는 글루코오스 및 살균된 전처리 당밀(즉, 환원당으로 전환된 당밀) 등과 같은 탄수화물이 사용될 수 있으며, 그 외의 적정량의 탄소원을 제한 없이 다양하게 이용할 수 있다. 이들 탄소원은 단독으로 사용되거나 2 종 이상이 조합되어 사용될 수 있으나, 이에 한정되는 것은 아니다.In the present application, the carbon source includes carbohydrates such as glucose, fructose, sucrose, maltose and isomers thereof; sugar alcohols such as mannitol and sorbitol; organic acids such as pyruvic acid, lactic acid, citric acid and the like; Amino acids such as glutamic acid, methionine, lysine, and the like may be included. In addition, natural organic nutrients such as starch hydrolysate, molasses, blackstrap molasses, rice winter, cassava, sorghum pomace and corn steep liquor can be used, specifically glucose and sterilized pretreated molasses (i.e. converted to reducing sugar). Carbohydrates such as molasses) may be used, and other carbon sources in an appropriate amount may be used in various ways without limitation. These carbon sources may be used alone or in combination of two or more, but are not limited thereto.
구체적인 예로, 본 출원의 배양 배지에 포함될 수 있는 탄소원은 맥아당 또는 맥아당 이성질체를 포함할 수 있다. 보다 구체적으로, 포도당, 맥아당(말토오스: maltose) 및 맥아당 이성질체(이소말토오스: isomaltose) 중 선택된 1 이상, 또는 2 이상을 조합하여 포함할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다. As a specific example, the carbon source that may be included in the culture medium of the present application may include maltose or isomers of maltose. More specifically, it may include one or more selected from glucose, maltose (maltose), and maltose isomers (isomaltose), or a combination of two or more, but is not limited thereto.
상기 질소원으로는 암모니아, 황산암모늄, 염화암모늄, 초산암모늄, 인산암모늄, 탄산안모늄, 질산암모늄 등과 같은 무기질소원; 글루탐산, 메티오닌, 글루타민 등과 같은 아미노산, 펩톤, NZ-아민, 육류 추출물, 효모 추출물, 맥아 추출물, 옥수수 침지액, 카세인 가수분해물, 어류 또는 그의 분해생성물, 탈지 대두 케이크 또는 그의 분해 생성물 등과 같은 유기 질소원이 사용될 수 있다. 이들 질소원은 단독으로 사용되거나 2 종 이상이 조합되어 사용될 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.Examples of the nitrogen source include inorganic nitrogen sources such as ammonia, ammonium sulfate, ammonium chloride, ammonium acetate, ammonium phosphate, ammonium carbonate, and ammonium nitrate; Amino acids such as glutamic acid, methionine, glutamine, etc., organic nitrogen sources such as peptone, NZ-amine, meat extract, yeast extract, malt extract, corn steep liquor, casein hydrolysate, fish or degradation products thereof, defatted soybean cake or degradation products thereof, etc. can be used These nitrogen sources may be used alone or in combination of two or more, but are not limited thereto.
상기 인원으로는 인산 제1칼륨, 인산 제2칼륨, 또는 이에 대응되는 소디움-함유 염 등이 포함될 수 있다. 무기화합물로는 염화나트륨, 염화칼슘, 염화철, 황산마그네슘, 황산철, 황산망간, 탄산칼슘 등이 사용될 수 있다.The number of persons may include monopotassium phosphate, dipotassium phosphate, or a sodium-containing salt corresponding thereto. As the inorganic compound, sodium chloride, calcium chloride, iron chloride, magnesium sulfate, iron sulfate, manganese sulfate, calcium carbonate, and the like may be used.
또한, 배양 배지는 성장에 필요한 황산마그네슘 또는 황산철과 같은 금속염을 함유할 수 있다. 마지막으로, 상기 물질에 더하여 아미노산 및 비타민과 같은 필수 성장 물질이 사용될 수 있다. 또한, 배양 배지에 적절한 전구체들이 사용될 수 있다. 상기된 원료들은 배양과정에서 배양물에 적절한 방식에 의해 회분식으로 또는 연속식으로 첨가될 수 있으나 이에 제한되지 않는다.In addition, the culture medium may contain metal salts such as magnesium sulfate or iron sulfate necessary for growth. Finally, essential growth substances such as amino acids and vitamins may be used in addition to the above substances. In addition, precursors suitable for the culture medium may be used. The above raw materials may be added in a batchwise or continuous manner by a method suitable for the culture during the culture process, but is not limited thereto.
본 출원에서는 미생물의 배양 중에 수산화암모늄, 수산화칼륨, 암모니아, 인산, 황산 등과 같은 화합물을 배양물에 적절한 방식으로 첨가하여, 배양물의 pH를 조정할 수 있다. 또한, 배양 중에는 지방산 폴리글리콜 에스테르와 같은 소포제를 사용하여 기포 생성을 억제할 수 있다. 또한, 배양물의 호기 상태를 유지하기 위하여, 배양물 내로 산소 또는 산소 함유 기체를 주입하거나 혐기 및 미호기 상태를 유지하기 위해 기체의 주입 없이 혹은 질소, 수소 또는 이산화탄소 가스를 주입할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.In the present application, the pH of the culture may be adjusted by adding compounds such as ammonium hydroxide, potassium hydroxide, ammonia, phosphoric acid, sulfuric acid, etc. to the culture in an appropriate manner during the culture of the microorganism. In addition, during cultivation, the formation of bubbles can be suppressed by using an antifoaming agent such as a fatty acid polyglycol ester. In addition, in order to maintain the aerobic state of the culture, oxygen or oxygen-containing gas may be injected into the culture, or nitrogen, hydrogen or carbon dioxide gas may be injected without gas injection or nitrogen, hydrogen or carbon dioxide gas may be injected to maintain the anaerobic and non-aerobic state, but is limited thereto It doesn't work.
배양물의 온도는 25℃내지 40℃일 수 있으며, 보다 구체적으로는 28℃내지 37℃일 수 있으나 이에 제한되지 않는다. 배양 기간은 원하는 유용 물질의 생성량이 수득될 때까지 계속될 수 있으며, 구체적으로는 1 시간 내지 100 시간일 수 있으나 이에 제한되지 않는다.The temperature of the culture may be 25 °C to 40 °C, more specifically 28 °C to 37 °C, but is not limited thereto. The culturing period may be continued until a desired production amount of a useful substance is obtained, and specifically may be 1 hour to 100 hours, but is not limited thereto.
본 출원의 아미노산 생산방법은 상기 미생물 또는 배지로부터 아미노산을 회수하는 것을 포함할 수 있다. The amino acid production method of the present application may include recovering amino acids from the microorganism or medium.
본 출원의 미생물의 배양 방법, 예를 들어 회분식, 연속식 또는 유가식 배양 방법 등에 따라 당해 기술 분야에 공지된 적합한 방법을 이용하여 배지로부터 목적하는 아미노산을 회수할 수 있다. 예컨대 원심분리, 여과, 결정화 단백질 침전제에 의한 처리(염석법), 추출, 초음파 파쇄, 한외여과, 투석법, 분자체 크로마토그래피(겔여과), 흡착크로마토그래피, 이온교환 크로마토그래피, 친화도 크로마토그래피 등의 각종 크로마토그래피, HPLC 및 이들의 방법을 조합하여 사용될 수 있으나, 이들 예에 한정되는 것은 아니다.According to the culture method of the microorganism of the present application, for example, a batch, continuous or fed-batch culture method, a desired amino acid may be recovered from the medium using a suitable method known in the art. For example, centrifugation, filtration, treatment with a precipitating agent for crystallized protein (salting out method), extraction, ultrasonic disruption, ultrafiltration, dialysis method, molecular sieve chromatography (gel filtration), adsorption chromatography, ion exchange chromatography, affinity chromatography It may be used in combination of various chromatography, HPLC, and these methods, such as, but is not limited to these examples.
상기 방법은 추가적인 정제 공정을 포함할 수 있다. 상기 정제공정은 당해 기술분야에 공지된 적합한 방법을 이용할 수 있다.The method may include additional purification steps. The purification process may use a suitable method known in the art.
본 출원의 다른 하나의 양태는 코리네박테리움 속 미생물에서 Agl 단백질의 활성을 강화하는 단계를 포함하는, 아미노산을 생산하는 코리네박테리움 속 미생물의 제조방법을 제공한다. Another aspect of the present application provides a method for producing an amino acid-producing microorganism of the genus Corynebacterium, comprising enhancing the activity of the Agl protein in the microorganism of the genus Corynebacterium.
상기 Agl 단백질의 활성을 강화하는 단계는 Agl 단백질을 발현하도록 코리네박테리움 속 미생물을 변형하는 단계일 수 있으며, 이에 대해서는 전술한 바와 같다.The step of enhancing the activity of the Agl protein may be a step of modifying a microorganism of the genus Corynebacterium to express the Agl protein, as described above.
본 출원의 다른 하나의 양태는 Agl 단백질의 활성이 강화된 코리네박테리움 속 미생물 또는 이의 배양물을 포함하는, 아미노산 생산용 조성물을 제공한다.Another aspect of the present application provides a composition for amino acid production comprising a microorganism of the genus Corynebacterium or a culture thereof having enhanced Agl protein activity.
상기 조성물은 맥아당 및/또는 맥아당 이성질체를 포함할 수 있으나, 이에 제한되지 않는다.The composition may include maltose and/or maltose isomers, but is not limited thereto.
상기 Agl 단백질, 이의 활성이 강화된 코리네박테리움 속 미생물, 아미노산에 대해서는 전술한 바와 같다.The Agl protein, microorganisms of the genus Corynebacterium whose activity is enhanced, and amino acids are as described above.
본 출원의 다른 하나의 양태는 본 출원의 Agl 단백질의 아미노산 생산 증가 용도를 제공한다.Another aspect of the present application provides a use of the Agl protein of the present application to increase amino acid production.
본 출원의 다른 하나의 양태는 본 출원의 Agl 단백질의 활성이 강화된 코리네박테리움 속 미생물의, 아미노산 생산 용도를 제공한다. Another aspect of the present application provides a use of a microorganism of the genus Corynebacterium in which the activity of the Agl protein of the present application is enhanced, for amino acid production.
상기 Agl 단백질, 이의 활성이 강화된 코리네박테리움 속 미생물, 아미노산에 대해서는 전술한 바와 같다.The Agl protein, microorganisms of the genus Corynebacterium whose activity is enhanced, and amino acids are as described above.
이하 본 출원을 실시예 및 실험예를 통하여 보다 상세하게 설명한다. 그러나 이들 실시예 및 실험예는 본 출원을 예시적으로 설명하기 위한 것으로 본 출원의 범위가 이들 실시예 및 실험예에 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, the present application will be described in more detail through Examples and Experimental Examples. However, these examples and experimental examples are for illustrative purposes of the present application, and the scope of the present application is not limited to these examples and experimental examples.
실시예 1: 맥아당(maltose) 이용능 향상 유전자 탐색 및 선별Example 1: Maltose Utilization Improvement Gene Search and Screening
맥아당 이용능을 향상시키는 단백질을 탐색하기 위해 NCBI Protein Database를 이용하여 후보 단백질을 선정하였다.In order to search for proteins that improve maltose utilization, candidate proteins were selected using the NCBI Protein Database.
No.No. 균 주strain 단백질 등록 번호protein registration number
1One Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703 BAF40342BAF40342
22 Bifidobacterium breve KCTC3220Bifidobacterium breve KCTC3220 BAQ99133BAQ99133
33 Saccharomyces cerevisiaeSaccharomyces cerevisiae NP_011808NP_011808
44 Corynebacterium glutamicum ATCC 13032Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 NP_601497NP_601497
상기 비피도박테리움 아돌레센티스(Bifidobacterium adolescentis) 유래의 단백질은 서열번호 1의 아미노산 서열을 가진다. 미국 국립보건원 진뱅크(NIH GenBank)로 부터 상기 단백질을 코딩하는 유전자 및 주변 핵산서열에 대한 정보를 획득하였고, 해당 유전자는 서열번호 2의 뉴클레오타이드 서열을 가진다. 해당 서열을 기반으로 하여 비피도박테리움 아돌레센티스(Bifidobacterium adolescentis ATCC15703)의 genome을 주형으로 하여 서열번호 3과 4의 프라이머를 이용해 PCR(SolTM Pfu-X DNA polymerase)을 수행해 서열번호 2의 유전자를 증폭하였다. 서열번호 5와 6의 프라이머를 이용하여 코리네박테리움 암모니아게네스의 genome 을 주형으로 하여 CJ7 프로모터(한국 등록특허 제10-0620092) PCR을 수행해 증폭하였다. 수득한 유전자 단편들을 XbaI 제한효소로 절단된 벡터 pECCG117(대한민국 등록특허 제0057684호)에 깁슨 어셈블리 (DG Gibson et al., NATURE METHODS, VOL.6 NO.5, MAY 2009, NEBuilder HiFi DNA Assembly Master Mix) 방법을 이용하여 연결한 후, 대장균 DH5α에 형질 전환하여 카나마이신(25 mg/L)이 포함된 LB 고체배지에 도말 하였다. 목적한 유전자와 pECCG117이 연결된 벡터로 형질 전환된 콜로니를 선별하기 위하여 서열번호 7과 8의 프라이머로 PCR을 수행하였다. 선별된 콜로니로 부터 통상적으로 알려진 플라스미드 추출법을 이용하여 플라스미드를 획득하였고, 이를 pECCG117-Pcj7-agl(Bad) 로 명명하였다.The protein derived from Bifidobacterium adolescentis has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1. Information on the gene encoding the protein and the surrounding nucleic acid sequence was obtained from NIH GenBank, and the gene has a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2. Based on the sequence, PCR (SolTM Pfu-X DNA polymerase) was performed using the genome of Bifidobacterium adolescentis ATCC15703 as a template and the primers of SEQ ID NOs: 3 and 4 to obtain the gene of SEQ ID NO: 2. amplified. Using the primers of SEQ ID NOs: 5 and 6, the CJ7 promoter (Korean Patent No. 10-0620092) PCR was amplified using the genome of Corynebacterium ammoniagenes as a template. The obtained gene fragments were ligated into vector pECCG117 (Korean Patent No. 0057684) digested with XbaI restriction enzyme and subjected to Gibson assembly (DG Gibson et al., NATURE METHODS, VOL.6 NO.5, MAY 2009, NEBuilder HiFi DNA Assembly Master Mix ) method, E. coli DH5α was transformed and plated on LB solid medium containing kanamycin (25 mg/L). PCR was performed using primers of SEQ ID NOs: 7 and 8 to select colonies transformed with the vector linked to the gene of interest and pECCG117. A plasmid was obtained from the selected colonies using a commonly known plasmid extraction method, and was named pECCG117-Pcj7-agl (Bad).
상기 비피도박테리움 브레브(Bifidobacterium breve) 유래의 단백질은 서열번호 9의 아미노산 서열을 가진다. 미국 국립보건원 진뱅크(NIH GenBank)로부터 상기 단백질을 코딩하는 유전자 및 주변 핵산서열에 대한 정보를 획득하였고, 해당 유전자는 서열번호 10의 뉴클레오타이드 서열을 가진다. 해당 서열을 기반으로 비피도박테리움 브레브(Bifidobacterium breve KCTC3220)의 genome을 주형으로 하여 서열번호 11과 12의 프라이머를 이용해 PCR을 수행해 서열번호 10의 유전자를 증폭하였다. 수득한 유전자 단편을 상기 서술한 방법을 이용하여 플라스미드를 획득하였고, 이를 pECCG117-Pcj7-agl(Bbr) 로 명명하였다.The protein derived from Bifidobacterium breve has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 9. Information on the gene encoding the protein and its surrounding nucleic acid sequence was obtained from NIH GenBank, and the gene has a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 10. Based on the sequence, the gene of SEQ ID NO: 10 was amplified by performing PCR using the primers of SEQ ID NOs: 11 and 12 using the genome of Bifidobacterium breve (KCTC3220) as a template. A plasmid was obtained from the obtained gene fragment by the method described above, and it was named pECCG117-Pcj7-agl(Bbr).
상기 사카로마이세스 세레비제(Saccharomyces cerevisiae) 유래의 단백질은 서열번호 13의 아미노산 서열을 가진다. 미국 국립보건원 진뱅크(NIH GenBank)로 부터 상기 단백질을 코딩하는 유전자 및 주변 핵산서열에 대한 정보를 획득하였고, 해당 유전자의는 서열번호 14의 뉴클레오타이드 서열을 가진다. 해당 서열을 기반으로 하여 사카로마이세스 세레비제(Saccharomyces cerevisiae)의 genome을 주형으로 하여 서열번호 15과 16의 프라이머를 이용해 PCR(SolTM Pfu-X DNA polymerase)을 수행해 서열번호 14의 유전자를 증폭하였다. 수득한 유전자 단편을 상기 서술한 방법을 이용하여 플라스미드를 획득하였고, 이를 pECCG117-Pcj7-agl(Sce)로 명명하였다.The protein derived from Saccharomyces cerevisiae has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 13. Information on the gene encoding the protein and the surrounding nucleic acid sequence was obtained from NIH GenBank, and the gene has a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 14. Based on the sequence, the gene of SEQ ID NO: 14 was amplified by performing PCR (SolTM Pfu-X DNA polymerase) using the primers of SEQ ID NOs: 15 and 16 using the genome of Saccharomyces cerevisiae as a template. . A plasmid was obtained from the obtained gene fragment using the method described above, and it was named pECCG117-Pcj7-agl(Sce).
상기 코리네박테리움 글루타미쿰(Corynebacterium glutamicum) 유래의 단백질은 서열번호 17의 아미노산 서열을 가진다. 미국 국립보건원 진뱅크(NIH GenBank)로부터 상기 단백질을 코딩하는 유전자 및 주변 핵산서열에 대한 정보를 획득하였고, 해당 유전자의는 서열번호 18의 뉴클레오타이드 서열을 가진다. 해당 서열을 기반으로 하여 코리네박테리움 글루타미쿰(Corynebacterium glutamicum)의 genome을 주형으로 하여 서열번호 19과 20의 프라이머를 이용해 PCR(SolTM Pfu-X DNA polymerase)을 수행해 서열번호 18의 유전자를 증폭하였다. 수득한 유전자 단편을 상기 서술한 방법을 이용하여 플라스미드를 획득하였고, 이를 pECCG117-Pcj7-agl(cgl) 로 명명하였다.The protein derived from Corynebacterium glutamicum has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17. Information on the gene encoding the protein and the surrounding nucleic acid sequence was obtained from NIH GenBank, and the gene has a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 18. Based on the sequence, PCR (SolTM Pfu-X DNA polymerase) was performed using the genome of Corynebacterium glutamicum as a template and primers of SEQ ID NOs: 19 and 20 to amplify the gene of SEQ ID NO: 18 did A plasmid was obtained from the obtained gene fragment by the method described above, and it was named pECCG117-Pcj7-agl (cgl).
상기 사용된 프라이머의 핵산서열을 하기의 표 2에 정리하였다.The nucleic acid sequences of the primers used above are summarized in Table 2 below.
No.No. 명칭designation DNA 서열 (5'-3')DNA sequence (5'-3')
서열번호 3SEQ ID NO: 3 Bad-fBad-f caacgaaaggaaacactc ATGacagcaaacaacatgcgcaacgaaaggaaacactc ATGacagcaaacaacatgcg
서열번호 4SEQ ID NO: 4 Bad-rBad-r TGGCGGCCGCTCTAGA tcagcccagcagcagccagTGGCGGCCGCTCTAGA tcagcccagcagcagccag
서열번호 5SEQ ID NO: 5 Pcj7-fPcj7-f GGATCCACTAGTTCTAGA atcggagtgcctaaaaccGGATCCACTAGTTCTAGA atcggagtgcctaaaacc
서열번호 6SEQ ID NO: 6 Pcj7-rPcj7-r gagtgtttcctttcgttgggagtgtttcctttcgttgg
서열번호 7SEQ ID NO: 7 pECCG-fpECCG-f AGTACTGATCCTCCGGCGTTAGTACTGATCCTCCGGCGTT
서열번호 8SEQ ID NO: 8 pECCG-rpECCG-r GTGATATGGGGCAAATGGTGGTGATATGGGGCAAATGGTG
서열번호 11SEQ ID NO: 11 Bbr-fBbr-f caacgaaaggaaacactc atgaccgccaacaacctccaacgaaaggaaacactc atgaccgccaacaacctc
서열번호 12SEQ ID NO: 12 Bbr-rBbr-r TGGCGGCCGCTCTAGA ctacttgataacccacgcTGGCGGCCGCTCTAGA ctacttgataacccacgc
서열번호 15SEQ ID NO: 15 Sce-fSce-f caacgaaaggaaacactc atgactatttctgatcatcaacgaaaggaaacactc atgactatttctgatcat
서열번호 16SEQ ID NO: 16 Sce-rSce-r TGGCGGCCGCTCTAGA ttatttgacgaggtagatTGGCGGCCGCTCTAGA ttatttgacgaggtagat
서열번호 19SEQ ID NO: 19 Cgl-fCgl-f caacgaaaggaaacactc gtgactgctcgcagatttcaacgaaaggaaacactc gtgactgctcgcagattt
서열번호 20SEQ ID NO: 20 Cgl-rCgl-r TGGCGGCCGCTCTAGA ctaatctcgcttgcttgcTGGCGGCCGCTCTAGA ctaatctcgcttgcttgc
대조구인 pECCG117 벡터와 상기 제작한 벡터 4종 (pECCG117-Pcj7-agl(Bad), pECCG117-Pcj7-agl(Bbr), pECCG117-Pcj7-agl(Sce) 및 pECCG117-Pcj7-agl(cgl))을 코리네박테리움 글루타미쿰 야생형(Corynebacterium glutamicum ATCC13032)에 전기천공법 (Van der Rest et al., Appl. Microbiol. Biotecnol. 52:541-545, 1999)으로 형질 전환하여, 카나마이신 (25 mg/L)이 포함된 복합평판배지에 도말 하였고 48시간 30℃ 배양 후 콜로니를 획득하였다.The control pECCG117 vector and the above-constructed four vectors (pECCG117-Pcj7-agl (Bad), pECCG117-Pcj7-agl (Bbr), pECCG117-Pcj7-agl (Sce) and pECCG117-Pcj7-agl (cgl)) Transformation of Corynebacterium glutamicum ATCC13032 by electroporation (Van der Rest et al., Appl. Microbiol. Biotecnol. 52:541-545, 1999), kanamycin (25 mg/L) It was smeared on a complex plate medium containing this, and colonies were obtained after incubation at 30 ° C for 48 hours.
상기 사용된 복합평판배지 조성은 다음과 같다:The composite plate medium composition used above was as follows:
<복합 평판 배지 (pH 7.0)><Complex plate medium (pH 7.0)>
포도당 10 g, 펩톤 10 g, Beef extract 5 g, 효모 추출물 5 g, Brain Heart Infusion 18.5 g, NaCl 2.5 g, 요소 2 g, Sorbitol 91 g, 한천 20 g, 카나마이신 25 mg (증류수 1 리터 기준)Glucose 10 g, Peptone 10 g, Beef extract 5 g, Yeast extract 5 g, Brain Heart Infusion 18.5 g, NaCl 2.5 g, Urea 2 g, Sorbitol 91 g, Agar 20 g, Kanamycin 25 mg (based on 1 liter of distilled water)
상기 확보된 5종의 균주들을 13032::pECCG, 13032::pECCG-Pcj7-agl(Bad), 13032::pECCG-Pcj7-agl(Bbr), 13032::pECCG-Pcj7-agl(Sce), 13032::pECCG-Pcj7-agl(cgl)로 순서대로 명명하였다. 먼저, 카나마이신 25 mg/L 을 포함한 종 배지 25 ml을 함유하는 250 ml 코너-바플 플라스크에 각 균주를 접종하고, 32℃에서 24시간 동안, 200 rpm으로 진탕 배양하였다. 그 후 선별 배지 24 ml을 함유하는 250 ml 코너-바플 플라스크에 1 ml의 종 배양액을 접종하고 32℃에서 24 시간 동안, 200 rpm에서 진탕 배양하였다. 배양 종료 후 맥아당 잔류량 및 사용량을 측정하였다. 13032::pECCG, 13032::pECCG-Pcj7-agl (Bad), 13032::pECCG-Pcj7-agl (Bbr), 13032::pECCG-Pcj7-agl (Sce), 13032 ::pECCG-Pcj7-agl (cgl) was named sequentially. First, each strain was inoculated into a 250 ml corner-baffle flask containing 25 ml of a seed medium containing 25 mg/L of kanamycin, and cultured at 32° C. for 24 hours with shaking at 200 rpm. Thereafter, 1 ml of the seed culture was inoculated into a 250 ml corner-baffle flask containing 24 ml of the selection medium, and incubated at 32° C. for 24 hours with shaking at 200 rpm. After the completion of the culture, the residual amount and amount of maltose used were measured.
상기 사용된 선별 배지 조성은 다음과 같다.The composition of the selective medium used above is as follows.
<종 배지 (pH 7.0)><Species medium (pH 7.0)>
포도당 12 g, 펩톤 10 g, 효모추출물 10 g, 요소 1.5 g, KH2PO4 4 g, K2HPO4 8 g, MgSO4·7H2O 0.5 g, 바이오틴 0.1 mg, 티아민 염산염 5 mg, 칼슘-판토텐산 5 mg, 니코틴아미드 20 mg, 카나마이신 25 mg (증류수 1 리터 기준)Glucose 12 g, peptone 10 g, yeast extract 10 g, urea 1.5 g, KH2PO4 4 g, K2HPO4 8 g, MgSO4 7H2O 0.5 g, biotin 0.1 mg, thiamine hydrochloride 5 mg, calcium-pantothenic acid 5 mg, nicotinamide 20 mg , kanamycin 25 mg (based on 1 liter of distilled water)
<선별 배지 (pH 7.0)><Selection medium (pH 7.0)>
맥아당 12 g, 펩톤 10 g, 효모추출물 10 g, 요소 1.5 g, KH2PO4 4 g, K2HPO4 8 g, MgSO4·7H2O 0.5 g, 바이오틴 0.1 mg, 티아민 염산염 5 mg, 칼슘-판토텐산 5 mg, 니코틴아미드 20 mg, 카나마이신 25 mg (증류수 1 리터 기준)Maltose 12 g, peptone 10 g, yeast extract 10 g, urea 1.5 g, KH2PO4 4 g, K2HPO4 8 g, MgSO4 7H2O 0.5 g, biotin 0.1 mg, thiamine hydrochloride 5 mg, calcium-pantothenic acid 5 mg, nicotinamide 20 mg , kanamycin 25 mg (based on 1 liter of distilled water)
상기 실험은 3번 반복되었으며, 배양 결과(평균값)는 표 3에 나타내었다.The experiment was repeated three times, and the culture results (average values) are shown in Table 3.
균 주strain OD562 OD 562 맥아당 (g/L)Maltose (g/L) 맥아당 소모량(g/L)Maltose consumption (g/L)
13032::pECCG 13032::pECCG 16.916.9 2.12.1 9.99.9
13032::pECCG-Pcj7-agl(Bad)13032::pECCG-Pcj7-agl (Bad) 21.021.0 0.00.0 12.012.0
13032::pECCG-Pcj7-agl(Bbr)13032::pECCG-Pcj7-agl (Bbr) 18.018.0 1.11.1 10.910.9
13032::pECCG-Pcj7-agl(Sce)13032::pECCG-Pcj7-agl (Sce) 17.017.0 1.81.8 10.210.2
13032::pECCG-Pcj7-agl(cgl)13032::pECCG-Pcj7-agl (cgl) 17.817.8 1.61.6 10.410.4
표 3에 나타난 바와 같이, 비피도박테리움 아돌레센티스 (Bifidobacterium adolescentis)유래의 단백질이 도입된 13032::pECCG-Pcj7-agl(Bad) 균주가 가장 우수한 맥아당 이용능을 보였다.As shown in Table 3, the 13032::pECCG-Pcj7-agl(Bad) strain into which the Bifidobacterium adolescentis-derived protein was introduced showed the best maltose utilization ability.
실시예 2: Example 2: aglagl 유전자 도입 벡터 제작 Creation of transgenic vectors
상기 실시예 1에서 선정된 비피도박테리움 아돌레센티스 (Bifidobacterium adolescentis) 단백질을 코리네박테리움 글루타미쿰의 genome상에 도입하는 벡터를 제작하기 위하여 상기 실시예 1과 같은 방법으로 서열번호 21과 22의 프라이머를 이용해 PCR(SolTM Pfu-X DNA polymerase)을 수행해 서열번호 2의 유전자를 증폭하였다. 서열번호 23와 24의 프라이머를 이용하여 코리네박테리움 암모니아게네스의 genome 을 주형으로 하여 CJ7 프로모터(US 7662943 B2)와 서열번호 25과 26의 프라이머를 이용하여 코리네박테리움 글루타미쿰의 genome을 주형으로 하여 gapA (NCgl1526)의 프로모터를 PCR을 수행해 증폭하였다. In order to construct a vector introducing the Bifidobacterium adolescentis protein selected in Example 1 into the genome of Corynebacterium glutamicum, SEQ ID NO: 21 and PCR (SolTM Pfu-X DNA polymerase) was performed using the primers of 22 to amplify the gene of SEQ ID NO: 2. Using the primers of SEQ ID NOs: 23 and 24, the genome of Corynebacterium ammoniagenes as a template, the genome of Corynebacterium glutamicum using the CJ7 promoter (US 7662943 B2) and the primers of SEQ ID NOs: 25 and 26 Using as a template, the promoter of gapA (NCgl1526) was amplified by PCR.
상기 수득한 프로모터와 비피도박테리움 아돌레센티스 유래 유전자 단편 및 SpeI 제한효소로 절단된 벡터 pDZTn (US 8323933 B2)를 깁슨 어셈블리 (DG Gibson et al., NATURE METHODS, VOL.6 NO.5, MAY 2009, NEBuilder HiFi DNA Assembly Master Mix) 방법을 이용하여 연결한 후, 대장균 DH5α에 형질전환하고 카나마이신 (25 mg/L)이 포함된 LB 고체배지에 도말 하였다. 목적한 유전자와 pDZTn이 연결된 벡터로 형질 전환된 콜로니를 선별하기 위하여 서열번호 27과 28의 프라이머로 PCR을 수행하였다. 선별된 콜로니를 이용해 통상적으로 알려진 플라스미드 추출법을 이용하여 플라스미드를 획득하였고, 이 플라스미드를 순서대로 pDZTn-Pcj7-agl, pDZTn-PgapA-agl 로 명명하였다.The promoter obtained above, the gene fragment derived from Bifidobacterium adolescentis, and the vector pDZTn (US 8323933 B2) digested with SpeI restriction enzyme were prepared by Gibson assembly (DG Gibson et al., NATURE METHODS, VOL.6 NO.5, MAY). 2009, NEBuilder HiFi DNA Assembly Master Mix) method, and then transformed into E. coli DH5α and plated on LB solid medium containing kanamycin (25 mg/L). PCR was performed using the primers of SEQ ID NOs: 27 and 28 to select colonies transformed with the vector in which the target gene and pDZTn were ligated. Plasmids were obtained using a commonly known plasmid extraction method using the selected colonies, and these plasmids were named pDZTn-Pcj7-agl and pDZTn-PgapA-agl in that order.
No.No. 명칭designation DNA 서열 (5'-3')DNA sequence (5'-3')
서열번호 21SEQ ID NO: 21 Agl-FAgl-F AtgacagcaaacaacatgcgtAtgacagcaaacaacatgcgt
서열번호 22SEQ ID NO: 22 Agl-RAgl-R TAGATGTCGGGCCCACTAGT tcagcccagcagcagccagacTAGATGTCGGGCCCACTAGT tcagcccagcagcagccagac
서열번호 23SEQ ID NO: 23 Pcj7-F Pcj7-F  ATGAGTTCCTCGAGACTAGT agaaacatcccagcgctactATGAGTTCCTCGAGACTAGT agaaacatcccagcgctact
서열번호 24SEQ ID NO: 24 Pcj7-RPcj7-R cgcatgttgtttgctgtcaTgagtgtttcctttcgttgggcgcatgttgtttgctgtcaTgagtgtttcctttcgttggg
서열번호 25SEQ ID NO: 25 PgapA-FPgapA-F ATGAGTTCCTCGAGACTAGTTTGGGATTACCATTGAAGCCATGAGTTCCTCGAGACTAGTTTGGGATTACCATTGAAGCC
서열번호 26SEQ ID NO: 26 PgapA-RPgapA-R cgcatgttgtttgctgtCATGTGTCTCCTCTAAAGATTGTcgcatgttgtttgctgtCATGTGTCTCCTCTAAAGATTGT
서열번호 27SEQ ID NO: 27 pDZTn-1pDZTn-1 ACGACGCTGGTATTTCTCCCACGACGCTGGTATTTCTCCC
서열번호 28SEQ ID NO: 28 pDZTn-2pDZTn-2 TGATTGTCGATATGACCGGGTGATTGTCGATATGACCGGG
실시예 3: Example 3: aglagl 유전자 도입 균주 제작 Creation of transgenic strains
제작된 pDZTn-Pcj7-agl, pDZTn-PgapA-agl 벡터를 이용하여 L-라이신을 생산하는 코리네박테리움 글루타미쿰 KCCM11016P 균주 (대한민국 등록특허 제10-0159812호)를 전기천공법 (Appl. Microbiol.Biotechnol. (1999) 52:541-545) 으로 형질 전환한 후, 2차 교차 과정을 거쳐 트랜스포존 유전자의 사이에 Pcj7-agl, PgapA-agl 이 각각 삽입된 균주를 획득하였다. 해당 유전자가 삽입된 위치를 포함한 인접 부위를 증폭할 수 있는 서열번호 29와 30의 프라이머를 이용하여 PCR 및 염기서열 분석을 수행하였고, 해당 유전적 조작을 확인하였다. 이렇게 수득한 균주를 순서대로 코리네박테리움 글루타미쿰 KCCM11016P::Pcj7-agl, KCCM11016P::PgapA-agl 로 명명하였다.Electroporation (Appl. Microbiol Biotechnol. PCR and sequencing were performed using primers of SEQ ID NOs: 29 and 30 capable of amplifying adjacent regions including the site where the gene was inserted, and the corresponding genetic manipulation was confirmed. The strains thus obtained were named Corynebacterium glutamicum KCCM11016P::Pcj7-agl and KCCM11016P::PgapA-agl in order.
서열번호sequence number 명칭designation DNA 서열 (5'-3')DNA sequence (5'-3')
2929 Tn-1Tn-1 TAAGGCACCGCAGAATGTAGTAAGGCACCGCAGAATGTAG
3030 Tn-2Tn-2 TAGGACTCACCATCACCGGCTAGGACTCACCATCACCGGC
실시예 4: 포도당 포함 배지에서 Example 4: In medium containing glucose aglagl 유전자 도입 균주의 L-라이신 생산능 비교 Comparison of L-lysine production ability of transgenic strains
KCCM11016P::Pcj7-agl, KCCM11016P::PgapA-agl 균주와 대조구 KCCM11016P를 아래와 같은 방법으로 배양하여, 균체량, 당소모능, 라이신 생산능을 비교하였다.KCCM11016P::Pcj7-agl, KCCM11016P::PgapA-agl strains and control KCCM11016P were cultured in the following manner, and cell mass, sugar consumption, and lysine production were compared.
먼저, 종 배지 25 ml을 함유하는 250 ml 코너-바플 플라스크에 각 균주를 접종하고, 30℃에서 20시간 동안, 200 rpm으로 진탕 배양하였다. 생산 배지 24 ml을 함유하는 250 ml 코너-바플 플라스크에 1 ml의 종 배양액을 접종하고 37℃에서 42 시간 동안, 200 rpm에서 진탕 배양하였다. 배양 종료 후 HPLC에 의해 L-라이신의 생산량을 측정하였다.First, each strain was inoculated into a 250 ml corner-baffle flask containing 25 ml of seed medium, and cultured at 30° C. for 20 hours with shaking at 200 rpm. A 250 ml corner-baffle flask containing 24 ml of production medium was inoculated with 1 ml of the seed culture and incubated at 37° C. for 42 hours with shaking at 200 rpm. After completion of the culture, the production of L-lysine was measured by HPLC.
<종배지 (pH 7.0)><Seed medium (pH 7.0)>
포도당 20 g, 펩톤 10 g, 효모추출물 5 g, 요소 1.5 g, KH2PO4 4 g, K2HPO4 8g, MgSO4·7H2O 0.5 g, 바이오틴 0.1 mg, 티아민 HCl 1 mg, 칼슘-판토텐산 22 mg, 니코틴아미드 2 mg (증류수 1 리터 기준)Glucose 20 g, peptone 10 g, yeast extract 5 g, urea 1.5 g, KH2PO4 4 g, K2HPO4 8 g, MgSO4 7H2O 0.5 g, biotin 0.1 mg, thiamine HCl 1 mg, calcium-pantothenic acid 22 mg, nicotinamide 2 mg ( based on 1 liter of distilled water)
<생산배지 (pH 7.0)><Production medium (pH 7.0)>
포도당 45 g, (NH4)2SO4 15 g, 대두 단백질 10 g, 50% 당함유 당밀 10 g, KH2PO4 0.55 g, MgSO4·7H2O 0.6 g, 바이오틴 0.9 mg, 티아민 염산염 4.5 mg, 칼슘-판토텐산 4.5 mg, 니코틴아미드 30 mg, MnSO4 9 mg, FeSO4 9 mg, ZnSO4 0.45 mg, CuSO4 0.45 mg, CaCO3 30 g (증류수 1리터 기준).Glucose 45 g, (NH4)2SO4 15 g, soy protein 10 g, molasses containing 50% sugar 10 g, KH2PO4 0.55 g, MgSO4 7H2O 0.6 g, biotin 0.9 mg, thiamine hydrochloride 4.5 mg, calcium-pantothenic acid 4.5 mg, nicotine Amide 30 mg, MnSO4 9 mg, FeSO4 9 mg, ZnSO4 0.45 mg, CuSO4 0.45 mg, CaCO3 30 g (based on 1 liter of distilled water).
상기 실험은 3번 반복되었으며, 배양 결과(평균값)는 표 6에 나타내었다.The experiment was repeated three times, and the culture results (average values) are shown in Table 6.
L-라이신 생산능 비교 (KCCM11016P)Comparison of L-lysine production capacity (KCCM11016P)
균 주strain OD562 OD 562 소모당 (g/L)Consumed sugar (g/L) 라이신 생산량 (g/L)Lysine production (g/L) 라이신 수율(%)Lysine yield (%)
KCCM11016P KCCM11016P 33.633.6 50.050.0 12.112.1 24.224.2
KCCM11016P::Pcj7-aglKCCM11016P::Pcj7-agl 33.033.0 50.050.0 12.412.4 24.824.8
KCCM11016P::PgapA-aglKCCM11016P::PgapA-agl 33.133.1 50.050.0 12.312.3 24.624.6
표 6에 나타난 바와 같이, 본 출원의 Agl 단백질 활성이 강화된 KCCM11016P::Pcj7-agl, KCCM11016P::PgapA-agl 균주는 대조균주인 KCCM11016P와 비교하여 증가된 라이신 수율을 보였다. As shown in Table 6, KCCM11016P::Pcj7-agl and KCCM11016P::PgapA-agl strains with enhanced Agl protein activity of the present application showed increased lysine yield compared to the control strain KCCM11016P.
실시예 5: 맥아당 포함 배지에서 Example 5: In medium containing maltose agl agl 유전자 도입 균주의 L- 라이신 생산능 비교Comparison of L-lysine production ability of transgenic strains
KCCM11016P::Pcj7-agl, KCCM11016P::PgapA-agl 균주와 대조구 KCCM11016P를 실시예 4와 같은 방법으로 배양하되, 생산배지의 포도당 45g을 맥아당(maltose)으로 1g, 5g, 20g 대체하여 균체량, 당소모능, 라이신 생산능을 비교하였다.KCCM11016P::Pcj7-agl, KCCM11016P::PgapA-agl strains and control KCCM11016P were cultured in the same manner as in Example 4, but 45 g of glucose in the production medium was replaced with maltose by 1 g, 5 g, and 20 g, thereby increasing cell mass and sugar consumption. performance and lysine production ability were compared.
상기 실험은 3번 반복되었으며, 배양 결과(평균값)는 순서대로 표 7,8,9 에 나타내었다.The experiment was repeated three times, and the culture results (average values) are shown in Tables 7, 8, and 9 in order.
1g 맥아당(maltose) 대체, L-라이신 생산능 비교 (KCCM11016P) Alternative to 1g maltose, comparison of L-lysine production capacity (KCCM11016P)
균 주strain OD562 OD 562 소모당 (g/L)Consumed sugar (g/L) 라이신 생산량 (g/L)Lysine production (g/L) 라이신 수율(%)Lysine yield (%)
KCCM11016P KCCM11016P 33.933.9 50.050.0 11.911.9 23.823.8
KCCM11016P::Pcj7-aglKCCM11016P::Pcj7-agl 32.832.8 50.050.0 12.312.3 24.624.6
KCCM11016P::PgapA-aglKCCM11016P::PgapA-agl 33.033.0 50.050.0 12.312.3 24.624.6
5g 맥아당(maltose) 대체, L-라이신 생산능 비교 (KCCM11016P) 5g maltose substitute, comparison of L-lysine production capacity (KCCM11016P)
균 주strain OD562 OD 562 소모당 (g/L)Consumed sugar (g/L) 라이신 생산량 (g/L)Lysine production (g/L) 라이신 수율(%)Lysine yield (%)
KCCM11016P KCCM11016P 35.035.0 50.050.0 11.311.3 22.622.6
KCCM11016P::Pcj7-aglKCCM11016P::Pcj7-agl 33.033.0 50.050.0 12.412.4 24.824.8
KCCM11016P::PgapA-aglKCCM11016P::PgapA-agl 33.233.2 50.050.0 12.312.3 24.624.6
20g 맥아당(maltose) 대체, L-라이신 생산능 비교 (KCCM11016P) Alternative to 20g maltose, comparison of L-lysine production capacity (KCCM11016P)
균 주strain OD562 OD 562 소모당 (g/L)Consumed sugar (g/L) 라이신 생산량 (g/L)Lysine production (g/L) 라이신 수율(%)Lysine yield (%)
KCCM11016P KCCM11016P 36.836.8 50.050.0 10.110.1 20.220.2
KCCM11016P::Pcj7-aglKCCM11016P::Pcj7-agl 33.533.5 50.050.0 12.412.4 24.824.8
KCCM11016P::PgapA-aglKCCM11016P::PgapA-agl 34.034.0 50.050.0 12.212.2 24.424.4
표 7. 8, 9에 나타난 바와 같이, 본 출원의 Agl 단백질 활성이 강화된 KCCM11016P::Pcj7-agl, KCCM11016P::PgapA-agl 균주는 맥아당(maltose)이 포함된 생산배지에서 대조균주인 KCCM11016P 와 비교하여 증가된 라이신 수율을 보였다.As shown in Tables 7. 8 and 9, the KCCM11016P::Pcj7-agl and KCCM11016P::PgapA-agl strains with enhanced Agl protein activity of the present application were compared to the control strain KCCM11016P in a production medium containing maltose. Comparatively, it showed an increased lysine yield.
실시예 6: 맥아당 포함 배지에서 KCCM10770P 균주로의 Example 6: KCCM10770P strain in maltose containing medium agl agl 유전자 도입 효과 확인Confirmation of gene introduction effect
상기 실시예 3에 기술한 방법을 이용하여 코리네박테리움 글루타미쿰 KCCM10770P (US 9109242 B2) 균주의 게놈상 트랜스포존 위치에 PgapA-agl 유전자가 삽입된 균주를 획득하였다. 이렇게 수득한 균주를 코리네박테리움 글루타미쿰 KCCM10770P::PgapA-agl 로 명명하였다.Using the method described in Example 3, a strain in which the PgapA-agl gene was inserted at the transposon position on the genome of the Corynebacterium glutamicum KCCM10770P (US 9109242 B2) strain was obtained. The strain thus obtained was named Corynebacterium glutamicum KCCM10770P::PgapA-agl.
KCCM10770P::PgapA-agl 균주와 대조구 KCCM10770P를 배양하여, 균체량, 당소모능, 라이신 생산능을 비교하였다. 실시예 5와 마찬가지로 생산배지의 포도당 45g을 맥아당(maltose)으로 1g, 5g, 20g 대체하여 실험하였다. 상기 실험은 3번 반복되었으며, 배양 결과(평균값)는 표 10에 나타내었다.KCCM10770P::PgapA-agl strain and control KCCM10770P were cultured, and cell mass, sugar consumption, and lysine production were compared. As in Example 5, 45 g of glucose in the production medium was replaced with 1 g, 5 g, and 20 g of maltose. The experiment was repeated three times, and the culture results (average values) are shown in Table 10.
균 주strain 생산배지production badge OD562 OD 562 소모당 (g/L)Consumed sugar (g/L) 라이신 생산량 (g/L)Lysine production (g/L) 라이신 수율(%)Lysine yield (%)
KCCM10770PKCCM10770P Glucose 45Glucose 45 67.367.3 50.050.0 8.08.0 16.016.0
KCCM10770P::PgapA-aglKCCM10770P::PgapA-agl Glucose 45Glucose 45 66.966.9 50.050.0 8.18.1 16.216.2
KCCM10770PKCCM10770P Glucose 44
Maltose 1
Glucose 44
Maltose 1
67.967.9 50.050.0 7.97.9 15.815.8
KCCM10770P::PgapA-aglKCCM10770P::PgapA-agl Glucose 44
Maltose 1
Glucose 44
Maltose 1
67.167.1 50.050.0 8.18.1 16.216.2
KCCM10770PKCCM10770P Glucose 40
Maltose 5
Glucose 40
Maltose 5
68.368.3 50.050.0 7.17.1 14.214.2
KCCM10770P::PgapA-aglKCCM10770P::PgapA-agl Glucose 40
Maltose 5
Glucose 40
Maltose 5
67.067.0 50.050.0 8.28.2 16.416.4
KCCM10770PKCCM10770P Glucose 25
Maltose 20
Glucose 25
Maltose 20
70.070.0 50.050.0 6.06.0 12.012.0
KCCM10770P::PgapA-aglKCCM10770P::PgapA-agl Glucose 25
Maltose 20
Glucose 25
Maltose 20
66.966.9 50.050.0 8.28.2 16.416.4
표 10에 나타난 바와 같이, 본 출원의 Agl 단백질 활성이 강화된 KCCM10770P::PgapA-agl 균주는 맥아당(maltose)가 포함된 생산배지에서 대조균주인 KCCM10770P와 비교하여 증가된 라이신 수율을 보였다.As shown in Table 10, the KCCM10770P :: PgapA-agl strain with enhanced Agl protein activity of the present application showed an increased lysine yield compared to the control strain KCCM10770P in a production medium containing maltose.
실시예 7: 맥아당 이성질체 포함 배지에서 Example 7: In a medium containing maltose isomers aglagl 유전자 도입 균주의 L- 라이신 생산능 비교 Comparison of L-lysine production ability of transgenic strains
KCCM11016P::PgapA-agl , KCCM10770P::PgapA-agl 균주와 대조구를 실시예 4와 같은 방법으로 배양하되, 생산배지의 포도당 45g을 맥아당 이성질체(iso-maltose)으로 1g, 5g 대체하여 균체량, 당소모능, 라이신 생산능을 비교하였다.The KCCM11016P::PgapA-agl, KCCM10770P::PgapA-agl strains and the control were cultured in the same manner as in Example 4, but 45 g of glucose in the production medium was replaced with maltose isomers (iso-maltose) by 1 g and 5 g, thereby increasing cell mass and sugar consumption. performance and lysine production ability were compared.
상기 실험은 3번 반복되었으며, 배양 결과(평균값)는 순서대로 표 11 에 나타내었다.The experiment was repeated three times, and the culture results (average values) are shown in Table 11 in order.
균 주strain 생산배지production badge OD562 OD 562 소모당 (g/L)Consumed sugar (g/L) 라이신 생산량 (g/L)Lysine production (g/L) 라이신 수율(%)Lysine yield (%)
KCCM11016PKCCM11016P Glucose 44
Isomaltose 1
Glucose 44
Isomaltose 1
33.333.3 49.049.0 11.911.9 24.324.3
KCCM11016P::PgapA-aglKCCM11016P::PgapA-agl Glucose 44
Isomaltose 1
Glucose 44
Isomaltose 1
33.133.1 50.050.0 12.312.3 24.624.6
KCCM10770PKCCM10770P Glucose 44
Isomaltose 1
Glucose 44
Isomaltose 1
66.566.5 49.049.0 7.97.9 16.116.1
KCCM10770P::PgapA-aglKCCM10770P::PgapA-agl Glucose 44
Isomaltose 1
Glucose 44
Isomaltose 1
67.067.0 50.050.0 8.18.1 16.216.2
KCCM11016PKCCM11016P Glucose 40
Isomaltose 5
Glucose 40
Isomaltose 5
31.931.9 45.045.0 10.810.8 24.024.0
KCCM11016P::PgapA-aglKCCM11016P::PgapA-agl Glucose 40
Isomaltose 5
Glucose 40
Isomaltose 5
33.233.2 50.050.0 12.412.4 24.824.8
KCCM10770PKCCM10770P Glucose 40
Isomaltose 5
Glucose 40
Isomaltose 5
61.561.5 45.045.0 7.27.2 16.016.0
KCCM10770P::PgapA-aglKCCM10770P::PgapA-agl Glucose 40
Isomaltose 5
Glucose 40
Isomaltose 5
66.966.9 50.050.0 8.18.1 16.216.2
표 11에 나타난 바와 같이, 본 출원의 Agl 단백질의 활성이 강화된 KCCM11016P::PgapA-agl, KCCM10770P::PgapA-agl 균주는 맥아당 이성질체(iso-maltose)가 포함된 생산배지에서 대조균주인 KCCM11016P, KCCM10770P와 비교하여 맥아당 이성질체 이용능을 보였다.As shown in Table 11, KCCM11016P::PgapA-agl and KCCM10770P::PgapA-agl strains with enhanced Agl protein activity of the present application were prepared in a production medium containing iso-maltose, the control strain KCCM11016P, Compared to KCCM10770P, maltose isomer availability was shown.
실시예 8: Example 8: aglagl 분비형 유전자 도입 벡터 제작 Construction of secreted transgenic vectors
상기 실시예 2에 기술한 방법을 이용하여 agl 유전자를 분비형으로 발현하기 위하여 신호서열 NCgl0801 (서열번호 31) 및 NCgl2101(서열번호 32)을 gapA 프로모터와 agl 유전자 사이에 연결하여 벡터를 제작하였다. 미국 국립보건원 진뱅크(NIH GenBank)로 부터 상기 신호 서열을 코딩하는 유전자 및 주변 핵산서열에 대한 정보를 획득하여 코리네박테리움 글루타미쿰의 genome을 주형으로 하여 gapA 프로모터는 서열번호 25, 37을 이용하여 증폭하였고, 서열번호 31은 서열번호 33, 34의 프라이머를 이용, 서열번호 32는 서열번호 35, 36의 프라이머를 이용하여 증폭하였다. 제작한 플라스미드를 순서대로 pDZTn-PgapA-SP0801-agl, pDZTn-PgapA-SP2101-agl 로 명명하였다.To express the agl gene in a secreted form using the method described in Example 2, a vector was constructed by linking the signal sequences NCgl0801 (SEQ ID NO: 31) and NCgl2101 (SEQ ID NO: 32) between the gapA promoter and the agl gene. Information on the gene encoding the signal sequence and surrounding nucleic acid sequences was obtained from the National Institutes of Health GenBank (NIH GenBank), and the gapA promoter was prepared using SEQ ID NOs: 25 and 37 using the genome of Corynebacterium glutamicum as a template. SEQ ID NO: 31 was amplified using the primers of SEQ ID NOS: 33 and 34, and SEQ ID NO: 32 was amplified using the primers of SEQ ID NOS: 35 and 36. The prepared plasmids were named pDZTn-PgapA-SP0801-agl and pDZTn-PgapA-SP2101-agl in order.
No.No. 명칭designation DNA 서열 (5'-3')DNA sequence (5'-3')
서열번호 33SEQ ID NO: 33 SP0801-FSP0801-F CAATCTTTAGAGGAGACAC ATGCAAATAAACCGCCGAGCAATCTTTAGAGGAGACAC ATGCAAATAAACCGCCGAG
서열번호 34SEQ ID NO: 34 SP0801-RSP0801-R cacgcatgttgtttgctgtTGCTCCAAGGGCGTTGGCcacgcatgttgtttgctgtTGCTCCAAGGGCGTTGGC
서열번호 35SEQ ID NO: 35 SP2101-FSP2101-F ACAATCTTTAGAGGAGACAC ATGCATTCAAAGGAAGAGTTACAATCTTTAGAGGAGACAC ATGCATTCAAAGGAAGAGTT
서열번호 36SEQ ID NO: 36 SP2101-RSP2101-R tcacgcatgttgtttgctgt TTGAGCTGCTGCGATGCCGGtcacgcatgttgtttgctgt TTGAGCTGCTGCGATGCCGG
서열번호 37SEQ ID NO: 37 PgapA-RPgapA-R GTGTCTCCTCTAAAGATTGTGTGTCTCCTCTAAAGATTGT
실시예 9: Example 9: aglagl 분비형 유전자 도입 균주 제작 Production of secreted transgenic strain
상기 실시예 3 에 기술한 방법을 이용하여 실시예 8에서 제작된 pDZTn-PgapA-SP0801-agl, pDZTn-PgapA-SP2101-agl 벡터를 이용하여 KCCM11016P 균주에 PgapA-SP0801-agl, PgapA-SP2101-agl 이 각각 삽입된 균주를 획득하였다. 이렇게 수득한 균주를 순서대로 코리네박테리움 글루타미쿰 KCCM11016P::PgapA-SP0801-agl, KCCM11016P::PgapA-SP2101-agl 로 명명하였다. KCCM11016P::PgapA-SP0801-agl 균주는 CM03-1572로 명명한 후 2021년 3월 31일자로 부다페스트 조약하의 국제기탁기관인 한국미생물보존센터(KCCM)에 국제기탁하여 KCCM12968P로 기탁번호를 부여 받았다.Using the pDZTn-PgapA-SP0801-agl and pDZTn-PgapA-SP2101-agl vectors prepared in Example 8 using the method described in Example 3, PgapA-SP0801-agl and PgapA-SP2101-agl were added to the KCCM11016P strain. Each of these inserted strains was obtained. The strains thus obtained were named Corynebacterium glutamicum KCCM11016P::PgapA-SP0801-agl and KCCM11016P::PgapA-SP2101-agl in that order. The KCCM11016P::PgapA-SP0801-agl strain was named CM03-1572, and on March 31, 2021, it was internationally deposited at the Korea Center for Microorganism Conservation (KCCM), an international depository under the Budapest Treaty, and was given an accession number as KCCM12968P.
실시예 10: 맥아당 또는 맥아당 이성질체 포함 배지에서Example 10: In a medium containing maltose or maltose isomers agl agl 분비형 유전자 도입 균주의 L- 라이신 생산능 비교Comparison of L-lysine production ability of secretory transgenic strains
상기 실시예 9에서 제작된 균주를 상기 실시예 4에 기술한 방법으로 배양하여, 균체량, 당소모능, 라이신 생산능을 비교하였다 (실시예 4, 실시예 5, 실시예 7 참조). 상기 실험은 3번 반복되었으며, 배양 결과(평균값)는 표 13에 나타내었다.The strain prepared in Example 9 was cultured by the method described in Example 4, and the cell mass, sugar consumption capacity, and lysine production capacity were compared (see Example 4, Example 5, and Example 7). The experiment was repeated three times, and the culture results (average values) are shown in Table 13.
균 주strain 생산배지production badge OD562 OD 562 소모당 (g/L)Consumed sugar (g/L) 라이신 생산량 (g/L)Lysine production (g/L) 라이신 수율(%)Lysine yield (%)
KCCM11016PKCCM11016P Glucose 45Glucose 45 33.933.9 50.050.0 12.012.0 24.024.0
KCCM11016P::PgapA-SP0801-aglKCCM11016P::PgapA-SP0801-agl Glucose 45Glucose 45 33.533.5 50.050.0 12.212.2 24.424.4
KCCM11016P::PgapA-SP2101-aglKCCM11016P::PgapA-SP2101-agl Glucose 45Glucose 45 33.633.6 50.050.0 12.112.1 24.224.2
KCCM11016PKCCM11016P Glucose 40
Maltose 5
Glucose 40
Maltose 5
35.035.0 50.050.0 11.311.3 22.622.6
KCCM11016P::PgapA-SP0801-aglKCCM11016P::PgapA-SP0801-agl Glucose 40
Maltose 5
Glucose 40
Maltose 5
33.433.4 50.050.0 12.312.3 24.624.6
KCCM11016P::PgapA-SP2101-aglKCCM11016P::PgapA-SP2101-agl Glucose 40
Maltose 5
Glucose 40
Maltose 5
33.333.3 50.050.0 12.212.2 24.424.4
KCCM11016PKCCM11016P Glucose 40
Isomaltose 5
Glucose 40
Isomaltose 5
31.931.9 45.045.0 10.810.8 24.024.0
KCCM11016P::PgapA-SP0801-aglKCCM11016P::PgapA-SP0801-agl Glucose 40
Isomaltose 5
Glucose 40
Isomaltose 5
33.533.5 50.050.0 12.312.3 24.624.6
KCCM11016P::PgapA-SP2101-aglKCCM11016P::PgapA-SP2101-agl Glucose 40
Isomaltose 5
Glucose 40
Isomaltose 5
33.433.4 50.050.0 12.212.2 24.424.4
표 13에 나타난 바와 같이, 본 출원의 Agl 단백질 활성이 강화된 KCCM11016P::PgapA-SP0801-agl, KCCM11016P::PgapA-SP2101-agl 균주는 맥아당이 포함된 생산배지에서 대조균주와 비교하여 증가된 라이신 수율을 나타내었다. 또한 맥아당 이성질체(iso-maltose)가 포함된 생산배지에서 대조균주인 KCCM11016P와 비교하여 맥아당 이성질체 이용능을 보였다.As shown in Table 13, the KCCM11016P::PgapA-SP0801-agl and KCCM11016P::PgapA-SP2101-agl strains with enhanced Agl protein activity of the present application increased lysine compared to the control strain in a production medium containing maltose. Yield is shown. In addition, in the production medium containing maltose isomers (iso-maltose), maltose isomer availability was shown compared to the control strain, KCCM11016P.
이상의 설명으로부터, 본 출원이 속하는 기술분야의 당업자는 본 출원이 그 기술적 사상이나 필수적 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 실시될 수 있다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 이와 관련하여, 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적인 것이 아닌 것으로 이해해야만 한다. 본 출원의 범위는 상기 상세한 설명보다는 후술하는 특허 청구범위의 의미 및 범위 그리고 그 등가 개념으로부터 도출되는 모든 변경 또는 변형된 형태가 본 출원의 범위에 포함되는 것으로 해석되어야 한다.From the above description, those skilled in the art to which this application pertains will be able to understand that this application can be implemented in other specific forms without changing its technical spirit or essential features. In this regard, it should be understood that the embodiments described above are illustrative in all respects and not limiting. The scope of the present application should be construed as including all changes or modifications derived from the meaning and scope of the following patent claims and their equivalent concepts rather than the detailed description above.
[규칙 제91조에 의한 정정 26.05.2022] 
Figure WO-DOC-FIGURE-191
[Correction 26.05.2022 under Rule 91]
Figure WO-DOC-FIGURE-191

Claims (15)

  1. Agl 단백질의 활성이 강화된, 아미노산을 생산하는 코리네박테리움 속 (Corynebacterium sp.) 미생물.A microorganism of the genus Corynebacterium sp. that produces amino acids with enhanced Agl protein activity.
  2. 제1항에 있어서, 상기 Agl 단백질은 서열번호 1 또는 이와 90% 이상의 서열 상동성을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단백질인, 미생물.The microorganism according to claim 1, wherein the Agl protein is a protein comprising SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence having 90% or more sequence homology thereto.
  3. 제1항에 있어서, 상기 Agl 단백질은 비피도박테리움 아돌레센티스(Bifidobacterium adolescentis) 유래인 것인, 미생물.The microorganism according to claim 1, wherein the Agl protein is derived from Bifidobacterium adolescentis .
  4. 제1항에 있어서, 상기 단백질은 서열번호 2의 agl 유전자 또는 이와 90% 이상의 서열 상동성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열에 의해 코딩되는 것인, 미생물.The microorganism according to claim 1, wherein the protein is encoded by the agl gene of SEQ ID NO: 2 or a polynucleotide sequence having 90% or more sequence homology thereto.
  5. 제1항에 있어서, 상기 미생물은 맥아당(말토오스: maltose) 및 맥아당 이성질체(이소말토오스: isomaltose) 중 선택되는 하나 이상을 탄소원으로 이용하는 것인, 미생물.The microorganism according to claim 1, wherein the microorganism uses at least one selected from maltose (maltose) and maltose isomers (isomaltose) as a carbon source.
  6. 제1항에 있어서, 상기 코리네박테리움 속 미생물은 코리네박테리움 글루타미쿰(Corynebacterium glutamicum)인, 미생물.The microorganism according to claim 1, wherein the microorganism of the genus Corynebacterium is Corynebacterium glutamicum .
  7. 제1항에 있어서, 상기 아미노산은 L-라이신인, 미생물.The microorganism according to claim 1, wherein the amino acid is L-lysine.
  8. 제1항 내지 제7항 중 어느 한 항의 미생물을 배지에서 배양하는 단계를 포함하는, 아미노산의 생산 방법.A method for producing amino acids comprising culturing the microorganism of any one of claims 1 to 7 in a medium.
  9. 제8항에 있어서, 상기 배지는 맥아당(말토오스: maltose) 및 맥아당 이성질체(이소말토오스: isomaltose) 중 선택되는 하나 이상을 포함하는 것인, 아미노산의 생산 방법.The method of claim 8, wherein the medium contains at least one selected from maltose (maltose) and maltose isomers (isomaltose).
  10. 제8항에 있어서, 상기 생산 방법은 상기 배양된 배지 또는 미생물로부터 아미노산을 회수하는 단계를 포함하는, 아미노산의 생산 방법. The method of claim 8, wherein the production method comprises recovering the amino acid from the cultured medium or microorganism.
  11. 제8항에 있어서, 상기 아미노산은 L-라이신인, 아미노산의 생산 방법.The method of claim 8, wherein the amino acid is L-lysine.
  12. 코리네박테리움 속 미생물에서 Agl 단백질의 활성을 강화하는 단계를 포함하는, 아미노산을 생산하는 코리네박테리움 속 미생물의 제조방법. A method for producing an amino acid-producing microorganism of the genus Corynebacterium comprising enhancing the activity of an Agl protein in the microorganism of the genus Corynebacterium.
  13. Agl 단백질의 활성이 강화된 코리네박테리움 속 미생물 또는 이의 배양물을 포함하는, 아미노산 생산용 조성물.A composition for amino acid production comprising a microorganism of the genus Corynebacterium or a culture thereof having enhanced Agl protein activity.
  14. Agl 단백질의, 아미노산 생산을 증가시키는 용도.Use of Agl protein to increase amino acid production.
  15. Agl 단백질의 활성이 강화된 코리네박테리움 속 미생물의, 아미노산 생산을 증가시키는 용도.Use of microorganisms of the genus Corynebacterium with enhanced Agl protein activity to increase amino acid production.
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