WO2022075747A1 - Genetic polymorphic markers related to elasticity and tensile strength of human hair and use thereof - Google Patents

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WO2022075747A1
WO2022075747A1 PCT/KR2021/013709 KR2021013709W WO2022075747A1 WO 2022075747 A1 WO2022075747 A1 WO 2022075747A1 KR 2021013709 W KR2021013709 W KR 2021013709W WO 2022075747 A1 WO2022075747 A1 WO 2022075747A1
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snp
elasticity
hair
tensile strength
low
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PCT/KR2021/013709
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권오상
김종일
온정윤
손호영
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서울대학교 산학협력단
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6827Hybridisation assays for detection of mutation or polymorphism

Abstract

The present invention relates to a prediction model for elasticity and tensile strength of hair on the basis of genetic polymorphic markers, etc., the present invention having an effect of being capable of, for respective individuals, predicting in advance and with high accuracy an individual with low-elasticity and low-tensile strength hair. In addition, on the basis of information obtained through a prediction method, prediction kit, and prediction model of the present invention, the present invention is expected to find application in the development of personalized medical devices, pharmaceuticals and cosmetics, and active ingredients, etc. capable of improving or maintaining in a current state the strength and elasticity of low-elasticity and low-tensile strength hair.

Description

인체 모발 탄력 인장강도 관련 유전자 다형성 마커 및 이의 용도Genetic polymorphic markers related to human hair elasticity and tensile strength and uses thereof
본 발명은 인체 모발 탄력 및 인장강도 관련 유전자 다형성 마커 및 이의 용도 등에 관한 것이다.The present invention relates to a genetic polymorphic marker related to human hair elasticity and tensile strength, and uses thereof.
본 발명은 2020년 10월 07일에 출원된 한국특허출원 제10-2020-0129071호에 기초한 우선권을 주장하며, 상기 출원의 명세서 및 도면에 개시된 모든 내용은 본 출원에 원용된다.The present invention claims priority based on Korean Patent Application No. 10-2020-0129071 filed on October 07, 2020, and all contents disclosed in the specification and drawings of the application are incorporated herein by reference.
최근 의료 서비스에 대한 수요가 질환의 치료에서 질환별 위험도 예측을 통한 예방으로 점차 옮겨 감에 따라, 질환이 발생할 가능성을 사전에 예측하는 기술에 대한 중요성이 더욱 높아지고 있다. 현재 개인별 질환 위험도 예측을 위한 도구로서 유전자가 주로 사용되고 있으며, 개인별 유전자 검사를 이용하여 질병의 위험도를 예측하고, 환경적 요인에 대한 선제적 관리를 통해 향후 의료비용을 절감하고자 하는 수요가 증가하고 있는 추세이다. 급증하고 있는 소비자 직접 의뢰 유전자 검사(direct to consumer genetic test; DTC) 수요는 이를 뒷받침한다고 볼 수 있다.Recently, as the demand for medical services gradually shifts from treatment of diseases to prevention through risk prediction for each disease, the importance of technology for predicting the possibility of disease in advance is increasing. Currently, genes are mainly used as a tool for predicting individual disease risk, and there is an increasing demand for predicting disease risk using individual genetic tests and reducing future medical expenses through preemptive management of environmental factors. is the trend The rapidly increasing demand for direct to consumer genetic test (DTC) can be seen as supporting this.
또한, 사람들의 외모에 대한 관심이 점차 늘면서, 피부 및 모발에 대한 웰니스(wellness)를 추구하는 사람들이 많아지고 있다. 특히, 사람의 외모를 결정하는 모발에 대한 관심이 증가하고 있으며, 모발의 특성 중의 모발의 탄력성과 인장강도를 개인별로 예측하고, 이를 개선하고자 하는 맞춤형 화장품에 대한 수요가 증가하고 있다. In addition, as people's interest in their appearance gradually increases, more and more people seek wellness for skin and hair. In particular, interest in hair, which determines the appearance of a person, is increasing, and the demand for customized cosmetics to predict and improve the elasticity and tensile strength of hair among the characteristics of hair for each individual is increasing.
한편, 유전체연구 기술 발달에 힘입어 한 사람에 존재하는 단일염기다형성(Single Nucleotide Polymorphism; SNP)과 질병 발생과의 관련성을 동시에 살펴보는 전장 유전체 연관 분석(Genome-wide association study; GWAS) 방법이 대세를 이루게 되었다. 전장 유전체 연관 분석은 약 50만-200만 개 SNP의 유전자형을 탐색하여 질병과의 연관성을 통계적으로 분석하는 방법을 일컫는다. 현재까지 이 방법으로 다양한 유전변이들이 전 세계적으로 발굴되었으며, GWAS를 이용한 질환에 대한 감수성 유전자들을 동정하고자 하는 시도가 이루어지고 있으나 아직까지 결정적 인자는 확인되지 않은 상태이다.On the other hand, thanks to the development of genome research technology, the genome-wide association study (GWAS) method, which simultaneously examines the relationship between single nucleotide polymorphism (SNP) and disease occurrence in a person, is trending has been achieved Whole genome association analysis refers to a method of statistically analyzing associations with diseases by searching for the genotypes of about 500,000 to 2 million SNPs. To date, various genetic mutations have been discovered worldwide by this method, and attempts have been made to identify susceptibility genes to diseases using GWAS, but the decisive factor has not yet been identified.
이에 본 발명자들은 개체 모발의 인장강도 및 탄력과 관련된 유전자형을 확인하기 위해 동일한 표본 크기를 이용하여 변이(variant)를 검출하는 데에 있어, GWAS 분석을 수행한 결과, 유의한 SNP들을 확인하여, 본 발명을 완성하였다.Accordingly, the present inventors performed GWAS analysis in detecting a variant using the same sample size to confirm the genotype related to the tensile strength and elasticity of individual hair. As a result, significant SNPs were identified, The invention was completed.
상기 과제를 해결하기 위하여, 본 발명자들은 인체 모발 탄력 및 인장강도와 유의적인 상관관계를 갖는 특정 유전자와 해당 유전자의 단일염기다형성(single nucleotide polymorphism; SNP) 마커를 선별하고, 이를 이용한 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측용 SNP 마커 조성물을 개발하여 본 발명을 완성하였다.In order to solve the above problem, the present inventors selected a specific gene having a significant correlation with human hair elasticity and tensile strength and a single nucleotide polymorphism (SNP) marker of the corresponding gene, and using the same, the elasticity of human hair Alternatively, the present invention was completed by developing a SNP marker composition for diagnosis or prediction of tensile strength.
따라서, 본 발명의 목적은 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측용 SNP 마커 조성물을 제공하는 것이다.Accordingly, it is an object of the present invention to provide a SNP marker composition for diagnosis or prediction of elasticity or tensile strength of human hair.
본 발명의 다른 목적은 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측용 조성물을 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a composition for diagnosis or prediction of elasticity or tensile strength of human hair.
본 발명의 또 다른 목적은 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측용 키트를 제공하는 것이다.Another object of the present invention is to provide a kit for diagnosing or predicting the elasticity or tensile strength of human hair.
그러나 본 발명이 이루고자 하는 기술적 과제는 이상에서 언급한 과제에 제한되지 않으며, 언급되지 않은 또 다른 과제들은 아래의 기재로부터 당해 기술분야의 통상의 기술자에게 명확하게 이해될 수 있을 것이다.However, the technical problem to be achieved by the present invention is not limited to the above-mentioned problems, and other problems not mentioned will be clearly understood by those skilled in the art from the following description.
상기 과제를 해결하기 위하여, 본 발명은 하기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP를 포함하는, 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측용 SNP 마커 조성물을 제공한다:In order to solve the above problems, the present invention provides a SNP marker composition for diagnosing or predicting elasticity or tensile strength of human hair, comprising at least one SNP selected from the group consisting of the following first SNPs to 135th SNPs:
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또한, 본 발명은 상기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP를 검출 또는 증폭하는 제제를 유효성분으로 포함하는, 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측용 조성물을 제공한다.In addition, the present invention provides a composition for diagnosing or predicting elasticity or tensile strength of human hair, comprising, as an active ingredient, an agent for detecting or amplifying one or more SNPs selected from the group consisting of the first SNP to the 135th SNP. .
또한, 본 발명은 상기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP를 검출 또는 증폭하는 제제를 유효성분으로 포함하는 조성물의 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측 용도를 제공한다.In addition, the present invention provides a use for diagnosing or predicting the elasticity or tensile strength of human hair of a composition comprising as an active ingredient an agent for detecting or amplifying one or more SNPs selected from the group consisting of the first SNP to the 135th SNP. .
본 발명의 일 구현예에서, 상기 SNP를 검출하는 제제는 상기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP를 검출할 수 있는 프로브(probe)일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다In one embodiment of the present invention, the agent for detecting the SNP may be a probe capable of detecting one or more SNPs selected from the group consisting of the first SNP to the 135th SNP, but is not limited thereto.
본 발명의 다른 구현예에서, 상기 SNP를 증폭하는 제제는 상기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP를 검출할 수 있는 프라이머(primer) 세트일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In another embodiment of the present invention, the agent amplifying the SNP may be a primer set capable of detecting one or more SNPs selected from the group consisting of the first SNP to the 135th SNP, but is not limited thereto. .
또한, 본 발명은 상기 조성물을 포함하는, 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측용 키트를 제공한다.In addition, the present invention provides a kit for diagnosing or predicting elasticity or tensile strength of human hair, comprising the composition.
본 발명의 일 구현예에서, 상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 마이크로어레이 칩 키트일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In one embodiment of the present invention, the kit may be an RT-PCR kit or a microarray chip kit, but is not limited thereto.
또한, 본 발명은 개체로부터 분리한 핵산 시료로부터 상기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP가 확인된 경우, 저탄력 저인장강도의 모발로 진단하거나, 저탄력 저인장강도의 모발이 발생할 것으로 예측하는 단계를 포함하는, 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측을 위한 정보제공방법을 제공한다.In addition, in the present invention, when one or more SNPs selected from the group consisting of the first SNPs to the 135th SNPs are identified from a nucleic acid sample isolated from an individual, the hair is diagnosed as having low elasticity and low tensile strength, or hair with low elasticity and low tensile strength. It provides an information providing method for diagnosing or predicting the elasticity or tensile strength of hair, including the step of predicting that hair will occur.
아울러, 본 발명은 개체로부터 분리한 핵산 시료로부터 상기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP가 확인된 경우, 저탄력 저인장강도의 모발로 진단하거나, 저탄력 저인장강도의 모발이 발생할 것으로 예측하는 단계를 포함하는, 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 방법 또는 예측 방법을 제공한다.In addition, in the present invention, when one or more SNPs selected from the group consisting of the first SNPs to the 135th SNPs are identified from a nucleic acid sample isolated from an individual, it is diagnosed as hair with low elasticity and low tensile strength, or with low elasticity and low tensile strength. It provides a method for diagnosing or predicting hair elasticity or tensile strength, comprising the step of predicting hair growth.
본 발명의 일 구현예에서, 상기 SNP는 시퀀싱(sequencing), 엑솜 시퀀싱(exome sequencing), 마이크로어레이에 의한 혼성화(microarray hybridization), 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 동적 대립유전자 혼성화 기법(dynamic allele-specific hybridization), PCR 연장 분석 및 Taqman 기법으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 방법에 의해 확인될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In one embodiment of the present invention, the SNP is sequencing, exome sequencing, microarray hybridization, allele specific PCR, dynamic allele hybridization technique ( dynamic allele-specific hybridization), PCR extension analysis, and Taqman technique, but may be identified by one or more methods selected from the group consisting of, but is not limited thereto.
본 발명의 단일염기다형성 마커를 이용한 저탄력 저인장강도 모발의 예측 방법, 예측용 키트 및 예측 모델은, 각각의 개체에 대하여 저탄력 저인장강도 모발을 가진 개체를 사전에 높은 정확도로 예측할 수 있다는 효과가 있다. 나아가, 본 발명의 예측 방법, 예측용 키트 및 예측 모델을 통해 얻은 정보를 토대로 저탄력 저인장강도 모발의 강도 및 탄력을 호전 또는 현상 유지 시킬 수 있는 개인 맞춤형 의료기기, 의약품 및 화장품, 유효성분 등의 개발에 응용될 수 있을 것으로 기대된다.The prediction method, prediction kit and prediction model of low-elasticity and low-tensile strength hair using the single nucleotide polymorphism marker of the present invention can predict individuals with low-elasticity and low tensile strength hair with high accuracy in advance for each individual. It works. Furthermore, based on the information obtained through the prediction method, prediction kit, and prediction model of the present invention, personalized medical devices, medicines and cosmetics, active ingredients, etc. that can improve or maintain the strength and elasticity of low-elasticity and low-tensile strength hair It is expected that it can be applied to the development of
도 1은 본 발명에 따른 저탄력 저인장강도 모발의 위험도를 기준으로 도출한 ROC(receiver operating characteristic) 곡선을 나타낸 도이다.1 is a view showing a ROC (receiver operating characteristic) curve derived based on the risk of low elasticity and low tensile strength hair according to the present invention.
본 발명자들은 특정 유전자 및 상기 유전자 상에 존재하는 수천 개의 단일염기 다형성(single nucleotide polymorphism; SNP)이 저탄력 저인장강도 모발과 연관성이 있음을 확인하였다. 보다 정확한 예측 시스템을 구축하기 위해 상기 수천 개의 SNP 중 135개의 SNP를 선별하였고, 다시 이들 중 15개의 SNP를 선별하여 저탄력 저인장강도 모발 위험 예측 모델을 구축하였다.The present inventors confirmed that a specific gene and thousands of single nucleotide polymorphisms (SNPs) present on the gene are associated with low elasticity and low tensile strength hair. In order to construct a more accurate prediction system, 135 SNPs out of the thousands of SNPs were selected, and 15 SNPs were selected again to construct a low elasticity, low tensile strength hair risk prediction model.
본 발명의 일 실시예에서는, 진단 또는 예측의 정확도를 높이기 위하여 두피에 손상을 입었거나 최근 3개월 내 모발에 파마, 염색 등을 시행하는 등 모발의 탄력 또는 인장강도에 영향을 줄 수 있는 과거력이 있거나 질환을 앓고 있는 자를 연구 대상자에서 제외하였고, 선별된 연구 대상자의 유전자를 분석하여 저탄력 저인장강도 모발과 연관된 SNP를 확보하였다(실시예 1 및 실시예 2 참조).In one embodiment of the present invention, in order to increase the accuracy of diagnosis or prediction, there is a history that can affect the elasticity or tensile strength of the hair, such as having damaged the scalp or performing a perm, dyeing, etc. on the hair within the last 3 months Those with or suffering from diseases were excluded from the study subjects, and SNPs associated with low elasticity and low tensile strength hair were obtained by analyzing the genes of the selected study subjects (see Examples 1 and 2).
본 발명의 다른 실시예에서는, 저탄력 저인장강도 모발과 연관된 유전자형을 검출하기 위하여 시험군/대조군들의 SNP 마커를 이용한 연관분석을 수행하였고, 정상 대조군과 비교하여 저탄력 저인장강도 모발을 가진 개체에서 통계적으로 유의하게 많이 관찰되는 135개의 SNP를 선별하였다(실시예 3 참조).In another embodiment of the present invention, association analysis using the SNP markers of the test group/control group was performed to detect the genotype associated with low elasticity and low tensile strength hair, and compared with the normal control group, individuals with low elasticity and low tensile strength hair 135 SNPs observed in a statistically significant number were selected (see Example 3).
이하, 본 발명을 상세히 설명한다.Hereinafter, the present invention will be described in detail.
본 명세서에서, “폴리뉴클레오티드(polynucleotide)” 또는 “핵산”은 단일 또는 이중 가닥의 형태로 된 데옥시리보핵산(deoxyribonucleic acid, DNA) 또는 리보핵산(ribonucleic acid, RNA)를 말한다. 다른 제한이 없는한, 자연적으로 생성되는 뉴클레오티드와 비슷한 방법으로 핵산에 혼성화되는 자연적 뉴클레오티드의 공지된 아날로그도 포함된다. 일반적으로 DNA는 아데닌(adenine, A), 구아닌(guanine, G), 시토신(cytosine, C), 티민(thymine, T) 등 네 가지 염기로 구성되어 있으며, RNA는 티민 대신 우라실(Uracil, U)을 가지고 있다. 핵산 이중 가닥에서 A는 T 또는 U, C는 G 염기와 수소결합을 이루는데, 이러한 염기의 관계를 '상보적(complementary)'이라고 한다.As used herein, "polynucleotide" or "nucleic acid" refers to deoxyribonucleic acid (DNA) or ribonucleic acid (RNA) in the form of single or double strands. Unless otherwise limited, known analogs of natural nucleotides that hybridize to nucleic acids in a manner analogous to naturally occurring nucleotides are also included. In general, DNA consists of four bases: adenine (A), guanine (G), cytosine (C), and thymine (T), and RNA consists of uracil (U) instead of thymine (Uracil, U). has a In a nucleic acid double strand, A forms a hydrogen bond with T or U, and C forms a hydrogen bond with the base G, and the relationship between these bases is called 'complementary'.
상기 용어 “상보적(complementary)”은 소정의 혼성화 또는 어닐링 조건, 구체적으로는 생리학적 조건하(세포 내)에서 핵산 분자 내 타겟팅 모이어티가 타겟(예컨대, EDN 유전자)에 선택적으로 혼성화할 정도로 충분히 상보적인 것을 의미하는 것으로 하나 또는 그 이상의 미스매치(mismatch) 염기서열을 가질 수 있으며, 실질적으로 상보적(substantially complementary) 및 완전히 상보적(perfectly complementary)인 것을 모두 포괄하는 의미를 가지며, 보다 구체적으로는 완전히 상보적인 것을 의미한다.The term “complementary” means that a targeting moiety in a nucleic acid molecule is sufficient to selectively hybridize to a target (eg, an EDN gene) under certain hybridization or annealing conditions, specifically physiological conditions (in a cell). It means complementary, which may have one or more mismatched nucleotide sequences, and has a meaning encompassing both substantially complementary and perfectly complementary, and more specifically means completely complementary.
본 명세서에서, 유전자의 변이를 표기할 때 'c.'은 단백질 코딩 부위의 변이를 의미하며, '(염기 위치)(염기일문자)(기호 >)(염기일문자)'는 해당 염기 위치에서 선행 표기된 염기가 후행 표기된 염기로 치환된다는 것을 의미한다.In the present specification, when expressing the mutation of a gene, 'c.' means a mutation in the protein coding region, and '(base position) (single nucleotide) (symbol >) (single nucleotide)' means at the base position It means that the preceding indicated base is replaced by the following indicated base.
본 명세서에서, '다형성(polymorphism)'이란 유전적으로 결정된 집단 내에서 2 이상의 대체적 서열 또는 대립형질(또는 대립유전자)의 발생을 의미하며, '단일염기다형성(single nucleotide polymorphism, SNP)'은 하나의 염기의 다형성을 의미한다. 구체적으로 유전체에서 단일염기(A, T, C 또는 G)가 종의 멤버들 간 또는 한 개체(individual)의 쌍 염색체 간에 발생하는 DNA 서열의 다양성을 의미한다. 예를 들어, 서로 다른 개체의 세 개의 DNA 단편들(예를 들어 AAGT[A/A]AG, AAGT[A/G]AG, AAGT[G/G]AG)처럼 단일염기에서 차이를 포함하는 경우, 두 개의 대립유전자(A 또는 G)라고 부르며, 일반적으로 거의 모든 SNP는 두 개의 대립 유전자를 가진다. 또한 SNP가 특정 질환과 유전적으로 밀접하게 연관되어 있는 경우에는, SNP는 확인된 정상인(normal) 또는 야생형(wild-type, WT) 개체 또는 대립유전자와 비교하여 특정 위치의 하나의 염기에 변이가 발생한 것을 의미하기도 한다.As used herein, 'polymorphism' refers to the occurrence of two or more alternative sequences or alleles (or alleles) within a genetically determined population, and 'single nucleotide polymorphism (SNP)' refers to one polymorphism of the base. Specifically, a single base (A, T, C, or G) in the genome refers to the diversity of DNA sequences that occur between members of a species or between chromosomes of an individual. For example, when three DNA fragments from different individuals (eg, AAGT[A/A]AG, AAGT[A/G]AG, AAGT[G/G]AG) contain differences in a single base , called two alleles (A or G), and in general almost all SNPs have two alleles. In addition, when the SNP is genetically closely related to a specific disease, the SNP is mutated in one base at a specific position compared to an identified normal or wild-type (WT) individual or allele. it also means
한편, 'mRNA(messenger RNA 또는 전령 RNA)'는 단백질 합성 과정에서 특정 유전자의 염기서열의 유전 정보를 리보솜(ribosome)으로 전달하여 폴리펩티드 합성(단백질 번역, translation)의 청사진 역할을 하는 RNA이다. 유전자를 주형(template)으로 하여 단일 가닥의 mRNA가 전사(transcription) 과정을 통하여 합성된다.On the other hand, 'mRNA (messenger RNA or messenger RNA)' is an RNA that serves as a blueprint for polypeptide synthesis (protein translation, translation) by transferring the genetic information of the base sequence of a specific gene to the ribosome during protein synthesis. Using the gene as a template, single-stranded mRNA is synthesized through the transcription process.
본 명세서에서 사용되는 용어 “마커(marker)”는, 유전적으로 불특정 연관된 유전자좌를 동정할 때 참고점으로 사용되는 염기서열을 말한다. 이 용어는 또한 마커 서열을 증폭할 수 있는 프라이머 세트로 사용되는 핵산과 같은 마커 서열에 상보적인 핵산 서열에도 적용된다. 유전자 마커(genetic marker)의 유전자 지도상의 위치는 유전자좌(genetic locus)로 일컬어진다.As used herein, the term “marker” refers to a nucleotide sequence used as a reference point when identifying genetically unspecifiedly related loci. The term also applies to nucleic acid sequences complementary to marker sequences, such as nucleic acids used as primer sets capable of amplifying the marker sequence. The location on the genetic map of a genetic marker is referred to as a genetic locus.
본 명세서에서 사용되는 용어 “유전자 마커”는, DNA 마커, 바이오마커, 분자마커 등의 용어와 상호 교환적으로 사용될 수 있다. 상기 마커는 작물의 재배 환경이나 성장 시기에 영향을 받지 않고 신속하게 형질을 구별할 수 있으므로 유용하게 사용될 수 있다. 유전자 마커는 유전현상의 본질인 DNA의 염기서열 차이를 대상으로 개체간 다형성(polymorphism)을 나타내는 방법으로서, 주로 반복되는 단순 염기서열로 이루어진 마이크로새틀라이트(microsatellite)나 유전자 염기서열을 이용한 마커 또는 RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism) 프로브나 SCAR(Sequence Characterised Amplified Region) 마커가 이용되고 있다.As used herein, the term “gene marker” may be used interchangeably with terms such as a DNA marker, a biomarker, and a molecular marker. The marker can be usefully used because it can rapidly distinguish traits without being affected by the cultivation environment or growth period of crops. A genetic marker is a method of indicating polymorphism between individuals by targeting differences in the nucleotide sequence of DNA, which is the essence of genetic phenomena. (Restriction Fragment Length Polymorphism) probes or SCAR (Sequence Characterized Amplified Region) markers are being used.
본 명세서에서 사용된 용어 “대립유전자”는 상동염색체의 동일한 유전자 좌위에 존재하는 한 유전자가 서로 다른 형질을 갖는 것을 의미한다.As used herein, the term “allele” means that one gene present at the same locus of a homologous chromosome has different traits.
본 명세서에서 사용된 용어 “탄력” 또는 “탄력도”는 모발이 두피 표면으로부터 직각으로 곧게(Straight) 지탱하려는 모발의 특성으로서, 훅의 법칙에서 탄성계수인 'k(Stiffness)'와 관계가 있으며, 모발이 두피 표면으로부터 직각의 상태를 유지하고자 중력의 반대방향으로 작용하는 복원력인 F 탄성력과는 차이가 있다. As used herein, the term “elasticity” or “elasticity” is a characteristic of hair that the hair tries to support at a right angle from the scalp surface, and is related to 'k (Stiffness)', which is the modulus of elasticity in Hooke's law, It is different from the F elastic force, which is a restoring force that acts in the opposite direction to gravity to keep the hair at a right angle from the scalp surface.
본 발명의 일 실시예에서는 401명의 연구대상자의 후두부 모발의 근위부 (약 3cm)를 획득하여, 레이저 스캔 마이크로미터 (LSM-6200)를 이용하여, 모발의 단면적을 측정하였다. 단면적을 측정한 모발의 양 끝을 고정쇠로 고정한 시료를 flexible Miniature Tensile Tester (MTT-175) 기계에 탑재하여, 모발 시료가 절단 될 때까지 양쪽 끝에서 당기는 힘을 증가시키고, 절단되는 시점의 힘을 측정하였다. In one embodiment of the present invention, the proximal part (about 3 cm) of the occipital hairs of 401 study subjects was obtained, and the cross-sectional area of the hair was measured using a laser scanning micrometer (LSM-6200). The sample, which has measured the cross-sectional area, is fixed at both ends of the hair with a clamp, mounted on a flexible Miniature Tensile Tester (MTT-175) machine, the pulling force is increased at both ends until the hair sample is cut, and the force at the time of cutting is increased. measured.
따라서, 본 명세서에서 사용된 용어 모발의 “탄력 및 인장강도”란 이 때 측정된 힘을 기준으로, 모발을 인장시켜 모발의 인장길이와 응력 및 인장력을 측정하는 방법으로 결정되며, 모발 단위면적당 힘 (gmf/sq micron)의 단위로 나타난다. Therefore, the term “elasticity and tensile strength” of hair as used herein is determined by a method of measuring the tensile length, stress, and tensile force of the hair by pulling the hair based on the force measured at this time, and the force per unit area of the hair It is expressed in units of (gmf/sq micron).
또한, 본 명세서에서 사용된 “저탄력 및 저인장강도 모발”이란, 상기 방법으로 측정한 수치가 중 하위 15% (401명 기준으로 하위 59명)을 구분할 수 있는 절단점 이하의 수치를 보이는 모발로 정의하였다. 본 발명에서는 제시한 절단 수치는 0.0285 (gmf/sq micron) 이었다.In addition, as used herein, “low elasticity and low tensile strength hair” refers to hair whose values measured by the above method are below the cut-off point that can distinguish the lower 15% (lower 59 people based on 401 people). was defined as The cut value suggested in the present invention was 0.0285 (gmf/sq micron).
따라서, 본 명세서에서, 상기 저탄력 저인장강도 모발은 측정 대상자의 하위 50%, 하위 40%, 하위 35%, 하위 30%, 하위 25%, 하위 20%, 하위 15%, 하위 10%, 하위 9%, 하위 8%, 하위 7%, 하위 6%, 하위 5%, 하위 4%, 하위 3%, 하위 2% 또는 하위 1%의 모발 단위면적당 힘을 갖는 모발을 의미하는 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.Therefore, in the present specification, the low elasticity and low tensile strength hair is lower 50%, lower 40%, lower 35%, lower 30%, lower 25%, lower 20%, lower 15%, lower 10%, lower 9%, lower 8%, lower 7%, lower 6%, lower 5%, lower 4%, lower 3%, lower 2%, or lower 1% may refer to hair having power per unit area of hair, but It is not limited.
본 명세서에서, 상기 저탄력 저인장강도 모발은 모발 단위면적당 힘이 0.05 (gmf/sq micron) 이하, 0.03 (gmf/sq micron) 이하, 0.028( gmf/sq micron) 이하, 또는 약 0.0285 (gmf/sq micron) 이하일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present specification, the low elasticity and low tensile strength hair has a strength per unit area of 0.05 (gmf / sq micron) or less, 0.03 (gmf / sq micron) or less, 0.028 ( gmf / sq micron) or less, or about 0.0285 (gmf / sq micron) or less sq micron) or less, but is not limited thereto.
본 명세서에서 사용된 용어 “진단”은 특정 질병 또는 질환에 대한 한 객체의 감수성(susceptibility)을 판정하는 것, 한 객체가 특정 질병 또는 질환을 현재 가지고 있는지 여부를 판정하는 것, 특정 질병 또는 질환에 걸린 한 객체의 예후(prognosis)를 판정하는 것, 또는 테라메트릭스(therametrics)(예컨대, 치료 효능에 대한 정보를 제공하기 위하여 객체의 상태를 모니터링 하는 것)를 모두 포함하는 개념이다.As used herein, the term “diagnosis” refers to determining a subject's susceptibility to a particular disease or condition, determining whether a subject currently has a particular disease or disorder, It is a concept that includes both determining the prognosis of an affected subject, or therametrics (eg, monitoring the condition of an object to provide information on treatment efficacy).
먼저, 본 발명은 하기 제1 SNP내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP를 포함하는 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측용 마커 조성물을 제공할 수 있다:First, the present invention can provide a marker composition for diagnosing or predicting elasticity or tensile strength of human hair comprising one or more SNPs selected from the group consisting of the following first SNPs to 135th SNPs:
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또한, 본 발명은 상기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP를 검출 또는 증폭하는 제제를 유효성분으로 포함하는, 저탄력 저인장강도 모발의 진단 또는 예측용 조성물을 제공한다.In addition, the present invention provides a composition for diagnosing or predicting low elasticity and low tensile strength hair, comprising as an active ingredient an agent for detecting or amplifying one or more SNPs selected from the group consisting of the first to 135th SNPs.
본 발명에서, 상기 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측용 조성물은 저탄력 저인장강도 모발의 진단 또는 예측용 조성물일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the composition for diagnosis or prediction of elasticity or tensile strength of human hair may be a composition for diagnosis or prediction of low elasticity and low tensile strength hair, but is not limited thereto.
상기 언급된 제1 SNP 내지 제135 SNP는 각각 서열번호 1 내지 서열번호 135의 염기서열 상에 위치할 수 있다. 상기 언급된 서열번호 1 내지 서열번호 135의 염기서열은 본 발명에 따른 SNP 위치에 해당하는 염기를 r로 표시하고, 상기 SNP 위치를 기준으로 하여, 5' 방향의 서열 100 nt, 3' 방향의 서열 100 nt를 표시한 것이다. 예를 들어, 서열번호 1(rs_id, rs74708245)의 염기서열은 SNP 위치를 r로 표시하고 이를 기준으로 각각 100 nt 길이의 염기서열을 양쪽으로 표시한 것으로서, 총 길이 201 nt의 서열이 표시된 것이다. 또한, r로 표시한 염기가 예를 들어, 다수 대립유전자인 T 또는 소수 대립유전자인 C로 확인된 경우 서열목록의 식별번호 <223> 항목에 r = t or c로 표시하였다. 상기 서열번호 1 내지 서열번호 135의 염기서열은 개체, 특히 인간에서 SNP의 위치를 특정하기 위한 목적으로 사용되는 것이며, 따라서 상기 서열번호 1 내지 서열번호 135의 염기서열이 갖는 길이나 표시한 범위에 의해 본 발명이 제한되는 것은 아니다.The above-mentioned first SNP to 135 SNP may be located on the base sequence of SEQ ID NO: 1 to SEQ ID NO: 135, respectively. In the above-mentioned nucleotide sequences of SEQ ID NO: 1 to SEQ ID NO: 135, the base corresponding to the SNP position according to the present invention is represented by r, and based on the SNP position, the sequence 100 nt in the 5' direction, the 3' direction The sequence 100 nt is indicated. For example, the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 (rs_id, rs74708245) indicates the SNP position as r, and the nucleotide sequence of 100 nt in length is indicated on both sides based on this, and a total length of 201 nt is indicated. In addition, when the base indicated by r is identified as, for example, the majority allele T or the minor allele C, r = t or c is indicated in the identification number <223> item of the sequence list. The nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 to SEQ ID NO: 135 is used for the purpose of specifying the position of the SNP in an individual, particularly a human, and therefore, the length of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 to SEQ ID NO: 135 is in the indicated range. The present invention is not limited by the
상기 언급된 제1 SNP 내지 제135 SNP의 rs_ID가 genebank dbSNP 상에서 검색되지 않는 경우, 기재순서에 따라 다음과 같이 해석될 수 있다: 예를 들어 제2 SNP, 6:147531955:CATT:C는 6번 염색체 상의 147531955번째 염기가 CATT에서 소수 대립유전자 C로 변이된 SNP를 의미할 수 있다. 예를 들어, 제30 SNP, 10:52789962:G:GT는 10번 염색체 상의 52789962번째 염기가 G에서 소수대립유전자 GT로 변이된 SNP를 의미할 수 있다.When the above-mentioned rs_IDs of the first to 135th SNPs are not searched on genebank dbSNP, they can be interpreted as follows according to the order of description: For example, the second SNP, 6:147531955:CATT:C is number 6 The 147531955th base on the chromosome may refer to a SNP mutated from CATT to the minor allele C. For example, the 30th SNP, 10:52789962:G:GT may refer to a SNP in which the 52789962th base on chromosome 10 is mutated from G to the minor allele GT.
본 명세서에서 사용된 용어 “검출”이란, 목적하는 물질(본 발명에서의 SNP)의 존재 여부를 측정 및 확인하는 것, 또는 목적하는 물질의 존재 수준의 변화를 측정 및 확인하는 것을 모두 포함하는 의미이다. 따라서 상기 “제제”는 본 발명에 따른 SNP가 포함된 부위에 특이적으로 결합하여 인식할 수 있도록 하거나 상기 SNP가 포함된 부위를 증폭시킬 수 있는 제제로서, 구체적으로는 상기 SNP가 포함된 부위에 특이적으로 결합할 수 있는 프로브(probe), 상기 SNP가 포함된 부위를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드를 특이적으로 증폭할 수 있는 프라이머(primer) 세트일 수 있다.As used herein, the term “detection” means measuring and confirming the presence or absence of a target substance (SNP in the present invention), or measuring and confirming a change in the presence level of a target substance am. Therefore, the “agent” according to the present invention is an agent capable of specifically binding to and recognizing the site containing the SNP according to the present invention or amplifying the site containing the SNP, specifically, at the site containing the SNP. It may be a set of primers capable of specifically amplifying a probe capable of specifically binding, a polynucleotide including a region including the SNP, or a polynucleotide complementary thereto.
본 명세서에서 사용된 용어 “프라이머(primer)”란, DNA 합성의 개시점(starting point)으로 작용하는 짧은 단일가닥 올리고뉴클레오타이드(single strand oligonucleotide)이다. 프라이머는 적합한 완충액(buffer)와 온도 조건에서 주형(template)인 폴리뉴클레오타이드에 특이적으로 결합하고, DNA 중합효소가 프라이머에 주형 DNA에 상보적인 염기를 갖는 뉴클레오사이드 트리포스페이트를 추가하여 연결함으로써 DNA가 합성된다. 프라이머는 일반적으로 15 내지 30개의 염기서열로 이루어져 있으며, 염기 구성과 길이에 따라 주형 가닥에 결합하는 온도(melting temperature, Tm)가 달라진다. 프라이머의 서열은 주형의 일부 염기 서열과 완전하게 상보적인 서열을 가질 필요는 없으며, 주형과 혼성화되어 프라이머 고유의 작용을 할 수 있는 범위 내에서의 충분한 상보성을 가지면 충분하다. 따라서 본 발명에서 상기 SNP 부위의 cDNA 또는 genomic DNA의 염기서열을 참조하여 본 발명에 따른 검출 제제인 프라이머 세트를 용이하게 디자인할 수 있다. SNP를 검출하기 위한 프라이머는 각 유전자 서열에 완벽하게 상보적인 서열을 가질 필요는 없으며, DNA 합성을 통해 mRNA 또는 cDNA의 특정 구간을 증폭하여 mRNA의 양을 측정하려는 목적에 맞는 길이와 상보성을 갖는 것이면 충분하다. 상기 증폭 반응을 위한 프라이머는 증폭하고자 하는 mRNA의 특정 구간의 양쪽 끝부분의 주형(또는 센스, sense)과 반대편(안티센스, antisense)에 각각 상보적으로 결합하는 한 세트(쌍)으로 구성된다. As used herein, the term “primer” is a short single-stranded oligonucleotide that serves as a starting point of DNA synthesis. A primer binds specifically to a polynucleotide as a template under suitable buffer and temperature conditions, and DNA polymerase adds a nucleoside triphosphate having a base complementary to the template DNA to the primer to link it. is synthesized A primer generally consists of a sequence of 15 to 30 bases, and the melting temperature (Tm) at which it binds to the template strand varies depending on the base composition and length. The sequence of the primer does not need to have a completely complementary sequence to a partial nucleotide sequence of the template, and it is sufficient if it hybridizes with the template and has sufficient complementarity within a range capable of performing an intrinsic function of the primer. Therefore, in the present invention, the primer set as the detection agent according to the present invention can be easily designed with reference to the nucleotide sequence of the cDNA or genomic DNA of the SNP site. A primer for detecting SNP does not need to have a sequence that is perfectly complementary to each gene sequence, and if it has a length and complementarity suitable for the purpose of measuring the amount of mRNA by amplifying a specific section of mRNA or cDNA through DNA synthesis Suffice. The primers for the amplification reaction are composed of a set (pair) that complementarily binds to the template (or sense) and the opposite side (antisense) of both ends of a specific section of the mRNA to be amplified.
본 명세서에서 사용된 용어 “프로브(probe)”란, 특정 유전자의 mRNA나 cDNA(complementary DNA), DNA 등에 특이적으로 결합할 수 있는 짧게는 수개 내지 길게는 수백 개의 염기(base pair) 길이의 RNA 또는 DNA 등의 폴리뉴클레오타이드 단편을 의미하며, 표지(labeling)되어 있어서 결합하는 대상 mRNA나 cDNA의 존재 유무, 발현량 등을 확인할 수 있다. 프로브의 선택 및 혼성화 조건은 당업계에 공지된 기술에 따라 적절하게 선택할 수 있다. 상기 프로브는 대립형질(또는 대립유전자, allele)을 검출하기 위한 진단 방법 등에 사용될 수 있다. 상기 진단 방법에는 서던 블롯 등과 같은 핵산의 혼성화에 근거한 검출 방법들이 포함되며, DNA 칩을 이용한 방법에서 DNA 칩의 기판에 미리 결합된 형태로 제공될 수도 있다. 본 발명에서 상기 프라이머 또는 프로브는 포스포아미다이트(phosphoramidite) 고체지지체 합성법이나 기타 널리 공지된 방법을 이용하여 화학적으로 합성할 수 있다. 또한, 프라이머 또는 프로브는 검출하고자 하는 표적이 되는 폴리뉴클레오타이드와의 혼성화를 방해하지 않는 범위에서 당해 기술분야에 공지된 방법에 따라 다양하게 변형시킬 수 있다. 이러한 변형의 예로는 메틸화, 캡화, 천연 뉴클레오타이드 하나 이상의 동족체로의 치환 및 뉴클레오타이드 간의 변형, 예를 들면 하전되지 않은 연결체(예: 메틸 포스포네이트, 포스포트리에스터, 포스포로아미데이트, 카바메이트 등) 또는 하전된 연결체(예: 포스포로싸이오에이트, 포스포로디싸이오에이트 등), 그리고 형광 또는 효소를 이용한 표지 물질(labeling material)의 결합 등이 있다.As used herein, the term “probe” refers to RNA having a length of several to hundreds of base pairs that can specifically bind to mRNA, cDNA (complementary DNA), DNA, etc. of a specific gene. Alternatively, it refers to a polynucleotide fragment such as DNA, and is labeled so that the presence or absence, expression level, etc. of the target mRNA or cDNA to be bound to can be checked. Probe selection and hybridization conditions can be appropriately selected according to techniques known in the art. The probe may be used in a diagnostic method for detecting an allele (or allele, allele). The diagnostic methods include detection methods based on hybridization of nucleic acids, such as Southern blot, and may be provided in a form previously bound to a substrate of a DNA chip in a method using a DNA chip. In the present invention, the primer or probe may be chemically synthesized using a phosphoramidite solid support synthesis method or other well-known methods. In addition, the primer or probe can be variously modified according to methods known in the art within the range that does not interfere with hybridization with the polynucleotide to be detected. Examples of such modifications include methylation, encapsulation, substitution of one or more homologues of natural nucleotides, and modifications between nucleotides, such as uncharged linkages such as methyl phosphonates, phosphoesters, phosphoroamidates, carbamates, etc. ) or charged linkages (eg, phosphorothioate, phosphorodithioate, etc.), and binding of a labeling material using fluorescence or enzymes.
상기 프로브는 이의 5' 말단에 리포터(reporter)가 추가로 더 접합될 수 있다. 상기 리포터는 FAM(6-carboxyfluorescein), 텍사스 레드(texas red), 플루오레신(fluorescein), 플루오레신 클로로트리아지닐(fluorescein chlorotriazinyl), HEX(2',4',5',7'-tetrachloro-6-carboxy-4,7-dichlorofluorescein), 로다민 그린(rhodamine green), 로다민 레드(rhodamine red), 테트라메틸로다민(tetramethylrhodamine), FITC(fluorescein isothiocyanate), 오레곤 그린(oregon green), 알렉사 플루오로(alexa fluor), JOE(6-Carboxy-4',5'-Dichloro-2',7'-Dimethoxyfluorescein), ROX(6-Carboxyl-X-Rhodamine), TET(Tetrachloro-Fluorescein), TRITC(tertramethylrodamine isothiocyanate), TAMRA(6-carboxytetramethyl-rhodamine), NED(N-(1-Naphthyl)ethylenediamine), 시아닌(Cyanine) 계열 염료 및 씨아디카르보시아닌(thiadicarbocyanine)으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상일 수 있으나, 이외에 당업계에서 리포터로 사용될 수 있는 물질이라고 알려진 것이라면 모두 사용할 수 있다.The probe may further have a reporter conjugated to its 5' end. The reporter is FAM (6-carboxyfluorescein), Texas red (texas red), fluorescein (fluorescein), fluorescein chlorotriazinyl (fluorescein chlorotriazinyl), HEX (2',4',5',7'-tetrachloro -6-carboxy-4,7-dichlorofluorescein), rhodamine green, rhodamine red, tetramethylrhodamine, fluorescein isothiocyanate (FITC), oregon green, Alexa alexa fluor, JOE (6-Carboxy-4',5'-Dichloro-2',7'-Dimethoxyfluorescein), ROX (6-Carboxyl-X-Rhodamine), TET (Tetrachloro-Fluorescein), TRITC ( It may be any one or more selected from the group consisting of tertramethylrodamine isothiocyanate), TAMRA (6-carboxytetramethyl-rhodamine), NED (N-(1-Naphthyl)ethylenediamine), cyanine-based dyes, and thiadicarbocyanine. However, any material known in the art that can be used as a reporter may be used.
상기 프로브는 이의 3' 말단에 소광자(quencher)가 추가로 더 접합될 수 있다. 상기 소광자는 TAMRA, BHQ(black hole quencher) 1, BHQ2, BHQ3, NFQ(nonfluorescent quencher), 답실(dabcyl), Eclipse, DDQ(deep dark quencher), 블랙베리 퀸처(Blackberry Quencher), 아이오와 블랙(Iowa black)으로 구성된 군으로부터 선택되는 어느 하나 이상일 수 있으나, 이외에 당업계에서 소광자로 사용될 수 있는 물질이라고 알려진 것이라면 모두 사용할 수 있다.The probe may further have a quencher conjugated to its 3' end. The quencher is TAMRA, BHQ (black hole quencher) 1, BHQ2, BHQ3, NFQ (nonfluorescent quencher), dabcyl, Eclipse, DDQ (deep dark quencher), Blackberry Quencher (Blackberry Quencher), Iowa black (Iowa black) ) may be any one or more selected from the group consisting of, but any known material that can be used as a quencher in the art may be used.
본 발명의 또 다른 양태로서, 본 발명은 본 발명에 따른 조성물을 포함하는 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측용 키트를 제공할 수 있다.As another aspect of the present invention, the present invention may provide a kit for diagnosing or predicting elasticity or tensile strength of human hair comprising the composition according to the present invention.
상기 키트는 상기 SNP 마커를 증폭을 통해 확인하거나, SNP 마커에서 특정 대립유전자, 예를 들어 소수 대립유전자의 존재 여부를 확인함으로써 저탄력 저인장강도 모발이라고 진단하거나 발생 위험성을 예측할 수 있다.The kit confirms the SNP marker through amplification or by confirming the presence of a specific allele, for example, a minor allele in the SNP marker, to diagnose low elasticity, low tensile strength hair or predict the risk of occurrence.
본 발명에 있어서, 상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 마이크로어레이 칩 키트일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the kit may be an RT-PCR kit or a microarray chip kit, but is not limited thereto.
상기 RT-PCR 키트는 상기 SNP 부위를 포함하는 핵산을 증폭할 수 있는 각각의 프라이머 세트를 포함할 수 있으며, 그 외 테스트 튜브 또는 다른 적절한 컨테이너, 반응 완충액, 디옥시뉴클레오타이드(dNTPs), Taq-중합효소 및 역전사효소와 같은 효소, DNase, RNAse 억제제, DEPC-물(DEPC-water), 멸균수 등을 포함할 수 있다. 또한 정량 대조군으로 사용되는 유전자에 특이적인 프라이머 세트를 함께 포함할 수 있다.The RT-PCR kit may include each primer set capable of amplifying a nucleic acid comprising the SNP site, in addition to a test tube or other suitable container, reaction buffer, deoxynucleotides (dNTPs), Taq-polymerization enzymes and enzymes such as reverse transcriptase, DNase, RNAse inhibitors, DEPC-water, sterile water, and the like. In addition, a primer set specific for a gene used as a quantitative control may be included together.
상기 마이크로어레이 칩 키트는 상기 SNP 부위를 포함하는 핵산이 고정화되어 있는 기판을 갖는 마이크로어레이를 포함할 수 있다. 상기 마이크로어레이는 본 발명의 폴리뉴클레오타이드, 프라이머 세트 또는 프로브를 포함하는 것을 제외하고는 통상적인 마이크로어레이로 이루어질 수 있다. 마이크로어레이 상에서 핵산의 혼성화 및 혼성화 결과의 검출은 당업계에 잘 알려져 있다. 상기 검출은 예를 들면, 핵산 시료를 형광 물질, 예를 들면, Cy3 및 Cy5와 같은 물질을 포함하는 검출 가능한 신호를 발생시킬 수 있는 표지 물질로 표지한 다음, 마이크로어레이 상에 혼성화하고 상기 표지 물질로부터 발생하는 신호를 검출함으로써 혼성화 결과를 검출할 수 있다.The microarray chip kit may include a microarray having a substrate on which a nucleic acid including the SNP site is immobilized. The microarray may be composed of a conventional microarray except that the polynucleotide, primer set, or probe of the present invention is included. Hybridization of nucleic acids on microarrays and detection of hybridization results are well known in the art. In the detection, for example, a nucleic acid sample is labeled with a fluorescent material, for example, a label capable of generating a detectable signal including a material such as Cy3 and Cy5, and then hybridized on a microarray and the labeling material A hybridization result can be detected by detecting a signal generated from
또한, 본 발명은 개체로부터 분리한 핵산 시료로부터 상기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP가 확인된 경우, 저탄력 저인장강도의 모발로 진단하거나, 저탄력 저인장강도의 모발이 발생할 것으로 예측하는 단계를 포함하는, 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측을 위한 정보제공방법을 제공할 수 있다.In addition, in the present invention, when one or more SNPs selected from the group consisting of the first SNPs to the 135th SNPs are identified from a nucleic acid sample isolated from an individual, the hair is diagnosed as having low elasticity and low tensile strength, or hair with low elasticity and low tensile strength. It is possible to provide an information providing method for diagnosing or predicting the elasticity or tensile strength of hair, including the step of predicting that hair will occur.
본 발명에 있어서, 본 발명에 따른 SNP 마커의 저탄력 저인장강도 모발 위험성 예측 및 진단 여부는 각 마커들의 빈도 수를 측정하여 판단하였다. 이와 같은 유의성은 0.05 미만, 0.01 미만, 0.001 미만, 0.0001 미만, 0.00001 미만, 0.000001 미만, 0.0000001 미만, 또는 0.00000001 미만의 p 값(p-value)을 갖는 것을 특징으로 하나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the prediction and diagnosis of the risk of low elasticity and low tensile strength hair of the SNP marker according to the present invention was determined by measuring the frequency of each marker. Such significance is characterized by having a p-value of less than 0.05, less than 0.01, less than 0.001, less than 0.0001, less than 0.00001, less than 0.000001, less than 0.0000001, or less than 0.00000001, but is not limited thereto.
일 구현예로서, 개체의 유전자를 확인하여 본 발명에 따른 SNP 부위의 염기가 소수 대립유전자(minor allele)인 경우, 정상 대조군(control)과 저탄력 저인장강도 모발인 시험군(case)의 빈도 값 중 빈도 값이 높은 군의 표현형으로 판단하며, SNP 부위의 염기가 다수 대립유전자(major allele)인 경우에는 정상 대조군과 저탄력 저인장강도 모발인 시험군의 빈도 값 중 빈도 값이 낮은 군의 표현형으로 판단할 수 있다. 예를 들면, 하기 실시예 3의 표 3에서 개체의 4번 염색체의 23,486,441번째 염기가 G인 경우에는 시험군의 빈도 값이 더 높으므로 소수 대립유전자인 G가 나온 상기 개체는 시험군인 저탄력 저인장강도 모발로 진단하거나 저탄력 저인장강도 모발 발생 위험이 높아진 것으로 예측할 수 있는 것이다. 다른 예로, 개체의 12번 염색체의 112,165,066번째 염기가 다수 대립유전자인 C인 경우에는 대조군의 빈도 값이 더 낮으므로 이는 대조군인 정상으로 볼 수 있다.In one embodiment, when the base of the SNP site according to the present invention is a minor allele by confirming the gene of the individual, the frequency of the normal control group and the test group having low elasticity and low tensile strength hair (case) Among the values, it is judged as the phenotype of the group with a high frequency value, and if the base of the SNP site is a major allele, the group with a low frequency value among the frequency values of the normal control group and the test group with low elasticity and low tensile strength hair It can be judged by the phenotype. For example, in Table 3 of Example 3 below, when the 23,486,441th base of chromosome 4 of the individual is G, the frequency value of the test group is higher, so the individual with the minor allele G is the test group, low elasticity It can be diagnosed as long-strength hair or predicted to have an increased risk of developing low-elasticity and low-tensile strength hair. As another example, when the 112,165,066th base of chromosome 12 of the individual is the majority allele C, the frequency value of the control group is lower, so it can be regarded as a normal control group.
본 명세서에서 사용된 용어 “개체” 또는 “대상체”는 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측을 하기 위한 피험자를 의미한다.As used herein, the term “subject” or “subject” refers to a subject for diagnosing or predicting hair elasticity or tensile strength.
본 명세서에서 사용된 용어 “시료”는 모발의 탄력 또는 인장강도를 진단 또는 예측하고자 하는 개체 또는 대상체로부터 채취된 것이라면 제한 없이 사용할 수 있으며, 예를 들어 생검 등으로 얻어진 세포나 조직, 혈액, 전혈, 혈청, 혈장, 타액, 뇌척수액, 각종 분비물, 소변, 대변 등일 수 있다. 바람직하게는 혈액, 혈장, 혈청, 타액, 비액, 객담, 복수, 질 분비물 및 소변으로 이루어진 군에서 선택될 수 있으며, 바람직하게는 혈액, 혈장 또는 혈청일 수 있다. 상기 시료는 검출 또는 진단에 사용하기 전에 전처리할 수 있다. 예를 들어, 균질화(homogenization), 여과, 증류, 추출, 농축, 방해 성분의 불활성화, 시약의 첨가 등을 포함할 수 있다.As used herein, the term “sample” can be used without limitation as long as it is collected from an individual or subject to diagnose or predict the elasticity or tensile strength of hair, for example, cells or tissues obtained by biopsy, blood, whole blood, It may be serum, plasma, saliva, cerebrospinal fluid, various secretions, urine, feces, and the like. Preferably, it may be selected from the group consisting of blood, plasma, serum, saliva, nasal fluid, sputum, ascites, vaginal secretion and urine, and preferably blood, plasma or serum. The sample may be pretreated prior to use for detection or diagnosis. For example, it may include homogenization, filtration, distillation, extraction, concentration, inactivation of interfering components, addition of reagents, and the like.
본 발명에 있어서, 상기 SNP는 시퀀싱(sequencing), 엑솜 시퀀싱(exome sequencing), 마이크로어레이에 의한 혼성화(microarray hybridization), 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 동적 대립유전자 혼성화 기법(dynamic allele-specific hybridization), PCR 연장 분석 및 Taqman 기법으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 방법에 의해 확인될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the SNP is sequencing, exome sequencing, microarray hybridization, allele specific PCR, dynamic allele hybridization technique (dynamic allele-) specific hybridization), PCR extension analysis, and Taqman technique may be identified by one or more methods selected from the group consisting of, but not limited thereto.
한편, 본 발명의 일 실시예에서는, 전술한 135개의 마커 중 15개의 SNP 마커를 재선별하여 리스크 스코어를 부여하고, 각 개체별로 유전자형을 검출하여 확보된 각 SNP 마커의 빈도에 따라 저탄력 저인장강도 모발의 위험도를 계산하였다. 이렇게 계산된 위험도 기준값에 따라 민감도와 특이도를 계산하였고, 이를 토대로 ROC 고선 및 AUC 값을 확보하였다. 상기와 같이 확보한 데이터를 이용하여 저탄력 저인장강도 모발의 위험도를 수치화하여 그 발생위험을 예측할 수 있는 모델을 구축하였다(실시예 4 참조).On the other hand, in one embodiment of the present invention, 15 SNP markers among the above-mentioned 135 markers are reselected to give a risk score, and the genotype is detected for each individual, and according to the frequency of each SNP marker secured, low elasticity, low tensile strength The risk of hair was also calculated. Sensitivity and specificity were calculated according to the calculated risk reference value, and the high ROC and AUC values were obtained based on this. Using the data obtained as described above, the risk of low-elasticity, low-tensile strength hair was quantified to construct a model that could predict the risk of occurrence (see Example 4).
따라서, 본 발명은 개체로부터 분리한 시료로부터 하기 단일염기다형성(SNP, single nucleotide polymorphism)들로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP의 위험도 스코어를 산출하는 단계를 포함하고,Accordingly, the present invention includes calculating the risk score of one or more SNPs selected from the group consisting of the following single nucleotide polymorphisms (SNPs) from a sample isolated from an individual,
상기 산출된 위험도 스코어의 합계가 0 보다 클수록 저탄력 저인장강도 모발일 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 저탄력 저인장강도 모발 진단 또는 예측을 위한 정보제공방법을 제공한다:Provides an information providing method for diagnosing or predicting low-elasticity and low-tensile-strength hair, characterized in that the higher the sum of the calculated risk scores is greater than 0, the higher the probability of low-elasticity-low-tensile-strength hair:
제1 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs74708245)의 대립 유전자가 소수 대립유전자(minor allele) C인 경우 위험도 스코어는 +2.14;If the allele of the first SNP (dbSNP database rs74708245) is minor allele C, the risk score is +2.14;
제2 SNP (dbSNP 데이터베이스 6:147531955:CATT:C)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 C인 경우 위험도 스코어는 +2.06;If the allele of the second SNP (dbSNP database 6:147531955:CATT:C) is the minor allele C, the risk score is +2.06;
제3 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs12340660)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 A인 경우 위험도 스코어는 +1.23;If the allele of the third SNP (dbSNP database rs12340660) is the minor allele A, the risk score is +1.23;
제4 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs147519695)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 G인 경우 위험도 스코어는 +1.49;If the allele of the fourth SNP (dbSNP database rs147519695) is the minor allele G, the risk score is +1.49;
제5 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs144535396)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 G인 경우 위험도 스코어는 +2.08;If the allele of the fifth SNP (dbSNP database rs144535396) is the minor allele G, the risk score is +2.08;
제6 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs2270006)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 A인 경우 위험도 스코어는 +1.84;If the allele of the 6th SNP (dbSNP database rs2270006) is minor allele A, the risk score is +1.84;
제7 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs139382928)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 G인 경우 위험도 스코어는 +2.08;If the allele of the 7th SNP (dbSNP database rs139382928) is the minor allele G, the risk score is +2.08;
제8 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs2722860)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 A인 경우 위험도 스코어는 +1.94;If the allele of SNP 8 (dbSNP database rs2722860) is minor allele A, the risk score is +1.94;
제9 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs111440321)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 C인 경우 위험도 스코어는 +1.13;If the allele of the ninth SNP (dbSNP database rs111440321) is the minor allele C, the risk score is +1.13;
제10 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs77427186)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 A인 경우 위험도 스코어는 +1.64;If the allele of SNP 10 (dbSNP database rs77427186) is minor allele A, the risk score is +1.64;
제11 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs57558501)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 C인 경우 위험도 스코어는 +1.17;If the allele of SNP 11 (dbSNP database rs57558501) is minor allele C, the risk score is +1.17;
제12 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs150186951)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 A인 경우 위험도 스코어는 +0.97;If the allele of SNP 12 (dbSNP database rs150186951) is minor allele A, the risk score is +0.97;
제13 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs73330846)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 A인 경우 위험도 스코어는 +1.69;If the allele of SNP 13 (dbSNP database rs73330846) is minor allele A, the risk score is +1.69;
제14 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs73206163)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 C인 경우 위험도 스코어는 +0.91; 및If the allele of SNP 14 (dbSNP database rs73206163) is minor allele C, the risk score is +0.91; and
제15 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs12959070)의 대립 유전자가 소수 대립유전자 A인 경우 위험도 스코어는 +1.02.If the allele of SNP 15 (dbSNP database rs12959070) is minor allele A, the risk score is +1.02.
또한, 본 발명은 개체로부터 분리한 시료로부터 하기 수식 1에 의해 저탄력 저인장 강도 모발의 위험도를 도출하는 단계를 포함하고, 상기 도출된 위험도가 0 보다 클수록 저탄력 저인장 강도 모발의 발생 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 저탄력 저인장강도 모발 진단 또는 예측을 위한 정보제공방법을 제공한다:In addition, the present invention includes the step of deriving the risk of low-elasticity and low-tensile-strength hair from the sample isolated from the subject by Equation 1 below, and the greater the derived risk is greater than 0, the higher the probability of occurrence of low-elasticity and low-tensile strength hair It provides an information providing method for diagnosing or predicting low elasticity and low tensile strength hair, characterized in that it is predicted to be high:
[수식 1][Formula 1]
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상기 Rn은 제n SNP의 소수 대립유전자가 하기 표 A의 소수 대립유전자인 경우 이에 대응하는 위험도 스코어이고,Wherein R n is a risk score corresponding to the minor allele of the nth SNP is the minor allele of Table A below,
상기 Fn은 제n SNP의 소수 대립유전자 빈도 값이며,Wherein F n is the frequency value of the minor allele of the nth SNP,
상기 n은 1 내지 15의 정수로 구성된 군에서 선택된 하나 이상의 정수이다;wherein n is one or more integers selected from the group consisting of 1 to 15 integers;
[표 A][Table A]
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본 발명에서, 상기 위험도는 본 발명의 선별된 15가지 SNP 마커 중 1개 또는 2개 이상의 조합을 확인하여 도출된다. 개체의 각 SNP 부위에서 소수 대립유전자(minor allele) 빈도에 따라, 상기 표 2에 표시된 해당 SNP 마커의 위험도 스코어를 모두 합산함으로써 위험도를 계산할 수 있다. 예를 들어, 상기 수식 1에서 n이 1이고 빈도 값이 2인 경우, 즉 개체에서 서열번호 1의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기가 C인 빈도가 2인 경우, 다시 말하면 개체의 12번 염색체의 2329141번째 염기(rs11831183)가 C인 빈도가 2인 경우, 2.14 × 2 만큼 위험도가 증가하며, 해당 마커의 염기 T의 빈도가 1인 경우는 2.14 × 1 만큼 위험도가 증가한다. 반면, 12번 염색체의 112,225,799번째 염기가 모두 C라면 위험도는 증가하지 않는다. 상기 위험도는 서열번호 1 내지 서열번호 15의 염기서열 중 어느 하나 이상의 염기서열 내에서 101번째 염기에 해당하는 SNP 위치의 염기 및 빈도 값을 확인하고, 이를 할당된 위험도 스코어를 곱한 값을 모두 합산하여 도출된다. 이와 같이 하나 이상의 SNP로부터 도출되는 위험도 스코어의 합산은 상기 수식 1에서 시그마(Σ)로 표현하였다.In the present invention, the risk is derived by identifying one or a combination of two or more of the 15 selected SNP markers of the present invention. According to the frequency of a minor allele in each SNP site of an individual, the risk can be calculated by summing all the risk scores of the corresponding SNP markers shown in Table 2 above. For example, in Equation 1, when n is 1 and the frequency value is 2, that is, when the frequency of the base C at the SNP position corresponding to the 101st base in the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 in the subject is 2, again In other words, when the frequency of the 2329141th base (rs11831183) of chromosome 12 of an individual is 2, the risk increases by 2.14 × 2, and when the frequency of the base T of the marker is 1, the risk increases by 2.14 × 1 do. On the other hand, if the 112, 225, 799 bases of chromosome 12 are all C, the risk does not increase. The risk is determined by checking the base and frequency value of the SNP position corresponding to the 101st base within any one or more of the base sequences of SEQ ID NO: 1 to SEQ ID NO: 15, and summing all the values multiplied by the assigned risk score. is derived As such, the summation of risk scores derived from one or more SNPs is expressed as sigma (Σ) in Equation 1 above.
본 발명에서, 상기 위험도는 상기 수식 1에 의해 도출된 위험도(LELTR)에 따라 하기 표 B에 의해 예측 민감도 및 특이도를 결정하는 것일 수 있다:In the present invention, the risk may be to determine the predicted sensitivity and specificity according to Table B below according to the risk (LELTR) derived by Equation 1:
[표 B][Table B]
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본 발명에서, 상기 위험도 기준 3.21에서 민감도 91.53%, 특이도 74.85%로 저탄력 저인장강도 모발을 예측할 수 있다.In the present invention, low elasticity and low tensile strength hair can be predicted with a sensitivity of 91.53% and a specificity of 74.85% at the risk standard of 3.21.
본 명세서에서 사용된 용어 “민감도”란, 최종 임상병리학적 진단이 저탄력 저인장강도 모발인 시료 또는 환자에 대하여 본 발명에 따른 정보제공방법 또는 방법을 통해 저탄력 저인장강도 모발의 위험도가 증가한 것으로 예측된 비율을 의미한다.As used herein, the term “sensitivity” refers to a sample or patient whose final clinical pathological diagnosis is low-elasticity and low-tensile-strength hair. percentage predicted to be
본 명세서에서 사용된 용어 “특이도”란, 최종 임상병리학적 진단이 정상인 시료 또는 환자에 대하여, 본 발명에 따른 정보제공방법 또는 방법을 통해 저탄력 저인장강도 모발의 위험도가 없는 것, 즉 정상으로 예측된 비율을 의미한다.As used herein, the term “specificity” means that there is no risk of low elasticity and low tensile strength hair through the information providing method or method according to the present invention for a sample or patient whose final clinical pathological diagnosis is normal, that is, normal is the predicted proportion.
본 발명에 있어서, 상기 SNP는 시퀀싱(sequencing), 엑솜 시퀀싱(exome sequencing), 마이크로어레이에 의한 혼성화(microarray hybridization), 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 동적 대립유전자 혼성화 기법(dynamic allele-specific hybridization), PCR 연장 분석 및 Taqman 기법으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 방법에 의해 확인될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the SNP is sequencing, exome sequencing, microarray hybridization, allele specific PCR, dynamic allele hybridization technique (dynamic allele-) specific hybridization), PCR extension analysis, and Taqman technique may be identified by one or more methods selected from the group consisting of, but not limited to.
본 발명에 있어서, 상기 저탄력 저인장강도 모발은 한국인에 대한 것일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the low elasticity and low tensile strength hair may be for Koreans, but is not limited thereto.
또한, 본 발명은 하기 단일염기다형성(SNP, single nucleotide polymorphism)으로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP를 검출 또는 증폭하는 제제를 유효성분으로 포함하는 저탄력 저인장강도 모발 진단 또는 예측용 키트로서,In addition, the present invention provides a kit for diagnosing or predicting low elastic and low tensile strength hair comprising an agent for detecting or amplifying one or more SNPs selected from the group consisting of the following single nucleotide polymorphisms (SNPs) as an active ingredient,
상기 키트는 상기 수식 1에 의해 저탄력 저인장 강도 모발의 위험도를 수치화하여 그 값이 0 보다 클수록 저탄력 저인장 강도 모발의 발생 확률이 높은 것으로 예측하는 것을 특징으로 하는, 저탄력 저인장강도 모발 진단 또는 예측용 키트를 제공한다:The kit quantifies the risk of low-elasticity, low-tensile strength hair according to Equation 1, and the higher the value is greater than 0, the higher the probability of occurrence of low-elasticity low-tensile strength hair. Kits for diagnosis or prediction are provided:
제1 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs74708245);first SNP (dbSNP database rs74708245);
제2 SNP (dbSNP 데이터베이스 6:147531955:CATT:C);second SNP (dbSNP database 6:147531955:CATT:C);
제3 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs12340660);third SNP (dbSNP database rs12340660);
제4 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs147519695);fourth SNP (dbSNP database rs147519695);
제5 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs144535396);5th SNP (dbSNP database rs144535396);
제6 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs2270006);6th SNP (dbSNP database rs2270006);
제7 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs139382928);7th SNP (dbSNP database rs139382928);
제8 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs2722860);8th SNP (dbSNP database rs2722860);
제9 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs111440321);9th SNP (dbSNP database rs111440321);
제10 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs77427186);10th SNP (dbSNP database rs77427186);
제11 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs57558501);11th SNP (dbSNP database rs57558501);
제12 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs150186951);12th SNP (dbSNP database rs150186951);
제13 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs73330846);13th SNP (dbSNP database rs73330846);
제14 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs73206163); 및14th SNP (dbSNP database rs73206163); and
제15 SNP (dbSNP 데이터베이스 rs12959070).15th SNP (dbSNP database rs12959070).
상기 서열번호, 키트 및 SNP에 대한 설명은 전술한 바와 같다.Descriptions of the SEQ ID NOs, kits and SNPs are the same as described above.
상기 “제제”는 본 발명에 따른 SNP가 포함된 부위에 특이적으로 결합하여 인식할 수 있도록 하거나 상기 SNP가 포함된 부위를 증폭시킬 수 있는 제제로서, 구체적으로는 상기 SNP가 포함된 부위에 특이적으로 결합할 수 있는 프로브(probe), 상기 SNP가 포함된 부위를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 또는 이의 상보적인 폴리뉴클레오타이드를 특이적으로 증폭할 수 있는 프라이머(primer) 세트일 수 있으며, 구체적인 설명은 전술한 바와 같으므로 생략한다.The “agent” according to the present invention is an agent capable of specifically binding to and recognizing a region containing a SNP according to the present invention or amplifying a region containing the SNP, specifically, specific to the region containing the SNP. It may be a set of primers capable of specifically amplifying a probe capable of binding positively, a polynucleotide including a region including the SNP, or a polynucleotide complementary thereto, and the detailed description is described above. As it is the same as bar, it is omitted.
본 발명에 있어서, 상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 마이크로어레이 칩 키트일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.In the present invention, the kit may be an RT-PCR kit or a microarray chip kit, but is not limited thereto.
또한, 본 발명은 상기 수식 1에 의해 산출된 저탄력 저인장 강도 모발의 위험도(LELTR)가 클수록 저탄력 저인장 강도 모발의 발생 확률이 높은 것으로 예측하고, 상기 수식 1에 의해 도출된 위험도(LELTR)에 따라 상기 표 3에 의해 예측 민감도 및 특이도를 갖는 것을 특징으로 하는, 저탄력 저인장강도 모발 위험 진단 또는 예측 모델을 제공한다.In addition, the present invention predicts that the higher the risk (LELTR) of low-elasticity and low-tensile-strength hair calculated by Equation 1, the higher the probability of occurrence of low-elasticity and low tensile strength hair, and the risk derived by Equation 1 (LELTR) ) according to Table 3 above, it provides a low-elasticity, low-tensile-strength hair risk diagnosis or prediction model, characterized in that it has a predictive sensitivity and specificity.
본 명세서에서 사용된 용어 “예측 모델”은 데이터를 수집한 것에 예측 방법을 적용함으로써 얻어지는 특정한 수학적 모델을 의미한다. 본 명세서에 기재된 실시예에서, 이러한 데이터는 개체의 시료, 보다 구체적으로 핵산 시료로부터 본 발명에 따른 SNP 위치의 염기가 소수 대립유전자인지 다수 대립유전자인지 여부 및 소수 대립유전자에 할당된 위험도 스코어와 빈도 값의 곱을 합산한 수치로 구성된다.As used herein, the term “predictive model” refers to a specific mathematical model obtained by applying a prediction method to collected data. In the examples described herein, such data is based on whether the base of the SNP position according to the present invention from a sample of an individual, more specifically a nucleic acid sample, is a minor allele or a majority allele, and the risk score and frequency assigned to the minor allele. It consists of the sum of the products of values.
본 발명은 다양한 변환을 가할 수 있고 여러 가지 실시예를 가질 수 있는 바, 특정 실시예들을 도면에 예시하고 상세한 설명에 상세하게 설명하고자 한다. 그러나 이는 본 발명을 특정한 실시 형태에 대해 한정하려는 것이 아니며, 본 발명의 사상 및 기술 범위에 포함되는 모든 변환, 균등물 내지 대체물을 포함하는 것으로 이해되어야 한다. 본 발명을 설명함에 있어서 관련된 공지 기술에 대한 구체적인 설명이 본 발명의 요지를 흐릴 수 있다고 판단되는 경우 그 상세한 설명을 생략한다.Since the present invention can apply various transformations and can have various embodiments, specific embodiments are illustrated in the drawings and described in detail in the detailed description. However, this is not intended to limit the present invention to specific embodiments, and should be understood to include all modifications, equivalents, and substitutes included in the spirit and scope of the present invention. In describing the present invention, if it is determined that a detailed description of a related known technology may obscure the gist of the present invention, the detailed description thereof will be omitted.
이하, 본 발명의 이해를 돕기 위하여 바람직한 실시예를 제시한다. 그러나 하기의 실시예는 본 발명을 보다 쉽게 이해하기 위하여 제공되는 것일 뿐, 하기 실시예에 의해 본 발명의 내용이 한정되는 것은 아니다.Hereinafter, preferred examples are presented to help the understanding of the present invention. However, the following examples are only provided for easier understanding of the present invention, and the contents of the present invention are not limited by the following examples.
[실시예][Example]
실시예 1. 개체의 분류 및 유전자 채취Example 1. Classification of individuals and gene collection
본 발명자들은 서울대학교병원 피부과에 내원한 여성 401 명을 대상으로 유전자 확보를 위한 혈액을 채취하였다.The present inventors collected blood to secure genes from 401 women who visited the Department of Dermatology, Seoul National University Hospital.
상기 연구 대상자 중 ① 두피에 손상을 입은 과거력이 있는 경우, ② 심각한 급성 신장 또는 심장 질환 또는 기타 만성질환(고혈압, 당뇨 등)을 앓고 있는 경우 혹은 현재 급성 질환을 앓고 있는 경우, ③ 혈우병과 같은 출혈성 경향의 질병을 앓고 있는 경우, ④ 임신 상태인 경우, ⑤ 채혈하기 어려운 사유가 있는 경우, ⑥ 최근 3개월 동안 모발에 파마, 염색 등을 시행한 경우, ⑦ 그 외 주 시험자의 판단으로 시험이 곤란하다고 판단되는 경우는 제외하였다. 자원자의 두피의 두정부에서 획득한 모발의 인장 강도를 기계 (MTT-175)로 측정하여 인장강도가 하위 15%에 해당하는 개체를 시험군으로, 그렇지 않은 경우를 대조군으로 분류하였다.Among the above study subjects, ① had a history of scalp damage, ② had severe acute kidney or heart disease or other chronic disease (high blood pressure, diabetes, etc.), or had an acute disease, ③ hemorrhagic If you are suffering from a disease of tendency, ④ If you are pregnant, ⑤ If there is a reason that makes it difficult to draw blood, ⑥ If you have permed or dyed your hair in the last 3 months, ⑦ Difficulty testing due to the judgment of the main investigator Cases judged to be so were excluded. The tensile strength of hair obtained from the parietal region of the volunteer's scalp was measured with a machine (MTT-175), and individuals whose tensile strength was in the lower 15% were classified as a test group, and those that did not were classified as a control group.
401명의 연구대상자에서 획득한 모발에서 측정한 수치 중 하위 15% (59명)을 구분할 수 있는 절단점 이하의 수치를 보이는 모발로 정의하였다. 본 발명에서는 제시한 절단 수치는 0.0285 (gmf/sq micron) 이었다.It was defined as hair showing a value below the cut-off point that could distinguish the lower 15% (59 persons) of the measured values from hair obtained from 401 study subjects. The cut value suggested in the present invention was 0.0285 (gmf/sq micron).
실시예 2. 유전자형 분석Example 2. Genotyping
연구 대상자의 혈액에서 gDNA를 추출하여 OD260/280 값 1.7 이상, 농도 10 ng/μl 이상, 그리고 1X TAE(Tris-acetate-EDTA) 1% 아가로스 겔에서 intact gDNA 밴드가 확인된 gDNA만 이후 분석에 사용하였다. 유전자형 분석을 위해, Affymetrix Axiom KORV1.1 chip (Ref 550769)를 이용하여 연구 대상자의 혈액에서 분리한 gDNA 시료들의 유전자형 분석(geno-typing)을 수행하였다. 상기 분석은 gDNA 증폭, DNA 단편화(fragmentation), 품질관리(quality control), 혼성화(hybridizaion), 염색(staining) 및 스캐닝(scanning)의 과정을 거쳐 수행하였다. 칩(chip)의 이미지는 GeneTitan MC(Affymetrix) 시스템과 Gene Chip Command Console Software(AGCC)를 이용하여 스캔한 이미지를 확보하고, 이를 기반으로 .cel 파일을 획득하였다. 획득한 .cel 파일은 genotyping console 4 프로그램을 이용하여 데이터 품질관리 및 genotype call을 수행하였다. 이를 통하여 827,783개의 SNP에 대한 유전자형을 획득하였다. 이때, 사용한 칩에 존재하는 단일염기 다형성(SNP) 외에 대치 방법(imputation method; NARD + 1KGp3 reference by Eagle v2.4.1 phasing, InfoScore > 0.9 filtering)을 통해 추가 SNP를 확보하였다. 확보한 유전형 분석의 오류를 최소화하기 위하여 SNP에 대한 품질관리(QC)를 하기와 같이 수행하였다:Only gDNA whose OD260/280 value of 1.7 or higher, concentration of 10 ng/μl or higher, and intact gDNA band confirmed on 1X TAE (Tris-acetate-EDTA) 1% agarose gel by extracting gDNA from the blood of the study subject is used for subsequent analysis. was used. For genotyping, geno-typing was performed on gDNA samples isolated from the blood of study subjects using the Affymetrix Axiom KORV1.1 chip (Ref 550769). The analysis was performed through the processes of gDNA amplification, DNA fragmentation, quality control, hybridization, staining, and scanning. For the image of the chip, a scanned image was obtained using the GeneTitan MC (Affymetrix) system and the Gene Chip Command Console Software (AGCC), and a .cel file was obtained based on this. For the obtained .cel file, data quality control and genotype call were performed using the genotyping console 4 program. Through this, genotypes for 827,783 SNPs were obtained. At this time, in addition to the single nucleotide polymorphism (SNP) present in the chip used, additional SNPs were obtained through the imputation method (NARD + 1KGp3 reference by Eagle v2.4.1 phasing, InfoScore > 0.9 filtering). In order to minimize the error of the obtained genotyping analysis, quality control (QC) for SNPs was performed as follows:
① QC1: 유전자형 0.05 미만 제거, Hardy-Weinberg equilibrium 0.000001 미만 제거;① QC1: genotype less than 0.05 elimination, Hardy-Weinberg equilibrium less than 0.000001 elimination;
② QC2: MAF 1% 미만 제거;② QC2: Remove less than 1% MAF;
③ 최종적으로 4,930,354 개의 단일염기 다형성(SNP)을 연구 대상자의 유전형 분석에 사용.③ Finally, 4,930,354 single nucleotide polymorphisms (SNPs) were used for genotyping of the study subjects.
실시예 3. 저탄력 저인장 강도의 모발과 관련된 단일염기 다형성 조사 및 선별Example 3. Investigation and screening of single nucleotide polymorphisms related to low elastic and low tensile strength hair
저탄력 저인장 강도와 연관된 유전자형을 검출하기 위하여 시험군/대조군들의 SNP 마커를 이용한 연관분석을 수행하였다. 연관분석을 수행하기 위해 PLINK 전장 유전체 데이터 분석 프로그램을 사용하여 카이제곱검정(Chi-squared test)을 수행하였으며 유의수준은 p 값(p-value)을 통해 확인하였다. 마커들 중 저탄력 저인장강도 모발 과 관련된 유의수준(p-value)이 0.01 이하인, 즉 정상 대조군과 비교하여 저탄력 저인장강도 모발 환자에서 통계적으로 유의하게 많이 관찰되는 SNP를 선별하였다. 상기 선별된 각 마커들에 대하여, 염색체내 위치, 염기서열, 빈도, 유의수준 등의 정보를 하기 표 1에 나타내었다. 하기 표 1에서 “rs_id”란 생물체의 유전정보를 축적하고 있는 NCBI(National Center for Biotechnology Information)에 등록된 단일염기 다형성(SNP)에 대하여 부여된 고유 표지자인 rs-ID를 의미한다.In order to detect the genotype associated with low elastic and low tensile strength, association analysis using SNP markers of the test group/control group was performed. To perform association analysis, a chi-squared test was performed using the PLINK whole genome data analysis program, and the significance level was confirmed through the p-value. Among the markers, SNPs with a p-value of 0.01 or less related to low-elasticity and low-tensile-strength hair, that is, a statistically significant number of SNPs observed in patients with low-elasticity and low-tensile-strength hair compared to the normal control group, were selected. For each of the selected markers, information such as a chromosome position, a nucleotide sequence, a frequency, a significance level, etc. is shown in Table 1 below. In Table 1 below, “rs_id” refers to rs-ID, a unique marker assigned to a single nucleotide polymorphism (SNP) registered with the National Center for Biotechnology Information (NCBI) that accumulates genetic information of living organisms.
저탄력 저인장강도 모발 실험군과 정상 대조군에서 통계학적으로 유의하게 많이 관찰되는 SNPSNP observed statistically significantly in the low elasticity, low tensile strength hair test group and the normal control group
Chr_#Chr_# rs_idrs_id 위치location 소수 대립유전자minority allele 정상 대조군에서의 빈도Frequency in normal controls 저탄력 저인장 강도 모발 개체에서의 빈도Frequency in subjects with low elastic low tensile strength hair 다수 대립유전자multiple alleles
55 rs74708245rs74708245 23291412329141 CC 0.013160.01316 0.10170.1017 TT
55 rs143163621rs143163621 23220082322008 TT 0.016080.01608 0.10170.1017 CC
66 6:147531955:CATT:C6:147531955:CATT:C 147531955147531955 CC 0.01170.0117 0.084750.08475 CATTCATT
99 rs12340660rs12340660 8016381480163814 AA 0.076020.07602 0.22030.2203 GG
55 rs147519695rs147519695 118742227118742227 GG 0.036550.03655 0.14410.1441 TT
99 rs11145471rs11145471 8015385480153854 TT 0.077490.07749 0.22030.2203 CC
99 rs112374661rs112374661 8015335280153352 GG 0.07310.0731 0.21190.2119 AA
22 rs144535396rs144535396 116250506116250506 GG 0.010230.01023 0.076270.07627 AA
77 rs2270006rs2270006 3069974730699747 AA 0.016080.01608 0.093220.09322 GG
77 rs139382928rs139382928 121538623121538623 GG 0.010230.01023 0.076270.07627 AA
99 rs2806099rs2806099 120792082120792082 AA 0.016080.01608 0.093220.09322 TT
99 rs2722866rs2722866 120839644120839644 CC 0.016080.01608 0.093220.09322 TT
99 rs2722860rs2722860 120850053120850053 AA 0.013160.01316 0.084750.08475 CC
1717 rs111440321rs111440321 7799144177991441 CC 0.095030.09503 0.24580.2458 TT
1717 rs59719579rs59719579 7799152477991524 TT 0.095030.09503 0.24580.2458 CC
1717 rs72848435rs72848435 7799153377991533 TT 0.095030.09503 0.24580.2458 CC
1717 rs72848437rs72848437 7799173877991738 TT 0.095030.09503 0.24580.2458 AA
1717 rs72848438rs72848438 7799175077991750 TT 0.095030.09503 0.24580.2458 CC
1717 rs113510869rs113510869 7799211977992119 CC 0.095030.09503 0.24580.2458 AA
1717 rs183995993rs183995993 7799212077992120 AA 0.095030.09503 0.24580.2458 GG
1010 rs73322628rs73322628 5278603452786034 CC 0.023390.02339 0.11020.1102 GG
1010 rs73322629rs73322629 5278638252786382 AA 0.023390.02339 0.11020.1102 GG
1010 rs12571742rs12571742 5278989352789893 AA 0.023390.02339 0.11020.1102 TT
1010 10:52789962:G:GT 10:52789962:G:GT 5278996252789962 GTGT 0.023390.02339 0.11020.1102 GG
1010 rs73322636rs73322636 5279115752791157 AA 0.023390.02339 0.11020.1102 GG
1212 rs77427186rs77427186 2725289727252897 AA 0.023390.02339 0.11020.1102 CC
1212 rs4964041rs4964041 2726501727265017 CC 0.023390.02339 0.11020.1102 TT
55 rs57558501rs57558501 18013456818013468 CC 0.080410.08041 0.22030.2203 TT
2222 rs150186951rs150186951 2071550820715508 AA 0.17250.1725 0.35590.3559 GG
1010 rs73330846rs73330846 5272798952727989 AA 0.020470.02047 0.10170.1017 TT
2222 rs2330333rs2330333 2335293323352933 TT 0.020470.02047 0.10170.1017 CC
2222 rs5996446rs5996446 2335673823356738 CC 0.020470.02047 0.10170.1017 TT
2222 rs9612207rs9612207 2335860823358608 CC 0.020470.02047 0.10170.1017 TT
2222 rs4300938rs4300938 2336458723364587 AA 0.020470.02047 0.10170.1017 CC
2222 rs5996451rs5996451 2336716923367169 TT 0.020470.02047 0.10170.1017 AA
2222 rs6003470rs6003470 2336741623367416 CC 0.020470.02047 0.10170.1017 AA
2222 rs6003471rs6003471 2336803323368033 GG 0.020470.02047 0.10170.1017 AA
88 rs73206163rs73206163 1821289018212890 CC 0.28650.2865 0.50.5 TT
1818 rs12959070rs12959070 5581297055812970 AA 0.13160.1316 0.29660.2966 TT
1818 rs7227001rs7227001 5581312555813125 AA 0.13160.1316 0.29660.2966 GG
1818 18:55813129:A:AT18:55813129:A:AT 5581312955813129 ATAT 0.13160.1316 0.29660.2966 AA
1818 rs77060043rs77060043 5581313755813137 TT 0.13160.1316 0.29660.2966 AA
1010 rs12762812rs12762812 8102130181021301 AA 0.11550.1155 0.27120.2712 GG
1010 rs150022658rs150022658 3453463134534631 AA 0.014620.01462 0.084750.08475 GG
1010 rs146884634rs146884634 3455495134554951 CC 0.014620.01462 0.084750.08475 TT
1818 rs12455559rs12455559 5581816055818160 AA 0.12720.1272 0.28810.2881 GG
1010 rs114234235rs114234235 5275099552750995 AA 0.024850.02485 0.11020.1102 CC
1010 rs12569866rs12569866 5275317352753173 AA 0.024850.02485 0.11020.1102 CC
1010 rs139339170rs139339170 5275822852758228 TT 0.024850.02485 0.11020.1102 CC
1010 10:52758361:A:AG10:52758361:A:AG 5275836152758361 AGAG 0.024850.02485 0.11020.1102 AA
1010 rs188128023rs188128023 5275836552758365 GG 0.024850.02485 0.11020.1102 AA
1010 rs191727181rs191727181 5275837052758370 CC 0.024850.02485 0.11020.1102 TT
1010 rs73332872rs73332872 5276177952761779 AA 0.024850.02485 0.11020.1102 GG
1010 rs56866455rs56866455 5276358852763588 TT 0.024850.02485 0.11020.1102 CC
1010 rs73334845rs73334845 5276818052768180 AA 0.024850.02485 0.11020.1102 GG
1010 rs73334849rs73334849 5277072752770727 TT 0.024850.02485 0.11020.1102 CC
1010 10:52774096:AGG:A10:52774096:AGG:A 5277409652774096 AA 0.024850.02485 0.11020.1102 AGGAGG
1010 rs12573170rs12573170 5277433252774332 TT 0.024850.02485 0.11020.1102 CC
1010 rs12569858rs12569858 5277440852774408 GG 0.024850.02485 0.11020.1102 AA
1010 rs79991453rs79991453 5277627352776273 TT 0.024850.02485 0.11020.1102 GG
1111 rs78572085rs78572085 70639827063982 AA 0.024850.02485 0.11020.1102 GG
2222 rs373236512rs373236512 2071573720715737 AA 0.17540.1754 0.35590.3559 TT
33 rs237898rs237898 88084958808495 TT 0.099420.09942 0.24580.2458 AA
33 rs237899rs237899 88085158808515 AA 0.099420.09942 0.24580.2458 GG
33 rs237900rs237900 88086968808696 AA 0.099420.09942 0.24580.2458 GG
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2222 rs4050472rs4050472 2337293823372938 CC 0.021930.02193 0.10170.1017 TT
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2222 rs6003478rs6003478 2337414323374143 TT 0.021930.02193 0.10170.1017 GG
2222 rs5996453rs5996453 2337420623374206 AA 0.021930.02193 0.10170.1017 GG
저탄력 저인장강도 인체모발 예측 모델에 사용되는 유전자 다형성 마커Genetic polymorphic marker used for predictive model of low elasticity and low tensile strength human hair
Chr_#Chr_# rs_idrs_id positionposition Minor_AlleleMinor_Allele Major_AlleleMajor_Allele Risk scorerisk score
55 rs74708245rs74708245 2,329,1412,329,141 CC TT 2.142.14
66 6:147531955:CATT:C6:147531955:CATT:C 147,531,955147,531,955 CC CATTCATT 2.062.06
99 rs12340660rs12340660 80,163,81480,163,814 AA GG 1.231.23
55 rs147519695rs147519695 118,742,227118,742,227 GG TT 1.491.49
22 rs144535396rs144535396 116,250,506116,250,506 GG AA 2.082.08
77 rs2270006rs2270006 30,699,74730,699,747 AA GG 1.841.84
77 rs139382928rs139382928 121,538,623121,538,623 GG AA 2.082.08
99 rs2722860rs2722860 120,850,053120,850,053 AA CC 1.941.94
1717 rs111440321rs111440321 77,991,44177,991,441 CC TT 1.131.13
1212 rs77427186rs77427186 27,252,89727,252,897 AA CC 1.641.64
55 rs57558501rs57558501 180,134,568180,134,568 CC TT 1.171.17
2222 rs150186951rs150186951 20,715,50820,715,508 AA GG 0.970.97
1010 rs73330846rs73330846 52,727,98952,727,989 AA TT 1.691.69
88 rs73206163rs73206163 18,212,89018,212,890 CC TT 0.910.91
1818 rs12959070rs12959070 55,812,97055,812,970 AA TT 1.021.02
유전자 다형성 마커를 기반으로 한 저탄력 저인장강도 모발 예측 모델의 위험도에 따른 민감도 및 특이도Sensitivity and specificity according to risk of low elasticity and low tensile strength hair prediction model based on genetic polymorphic markers
위험도 기준값risk threshold 민감도(%)responsiveness(%) 특이도(%)Specificity (%)
00 100.00%100.00% 0.00%0.00%
0.910.91 100.00%100.00% 12.57%12.57%
0.970.97 100.00%100.00% 21.93%21.93%
1.021.02 98.31%98.31% 27.19%27.19%
1.131.13 98.31%98.31% 29.53%29.53%
1.171.17 98.31%98.31% 31.58%31.58%
1.231.23 98.31%98.31% 33.33%33.33%
1.491.49 98.31%98.31% 35.67%35.67%
1.641.64 98.31%98.31% 36.55%36.55%
1.821.82 98.31%98.31% 37.13%37.13%
1.841.84 98.31%98.31% 38.01%38.01%
1.881.88 98.31%98.31% 38.30%38.30%
1.931.93 98.31%98.31% 40.94%40.94%
1.941.94 98.31%98.31% 44.44%44.44%
1.991.99 98.31%98.31% 45.32%45.32%
2.042.04 98.31%98.31% 46.49%46.49%
2.062.06 98.31%98.31% 48.54%48.54%
2.082.08 98.31%98.31% 48.83%48.83%
2.12.1 98.31%98.31% 50.29%50.29%
2.142.14 98.31%98.31% 52.05%52.05%
2.142.14 98.31%98.31% 53.22%53.22%
2.152.15 98.31%98.31% 54.39%54.39%
2.192.19 98.31%98.31% 54.68%54.68%
2.22.2 98.31%98.31% 55.56%55.56%
2.252.25 96.61%96.61% 55.85%55.85%
2.32.3 94.92%94.92% 56.14%56.14%
2.342.34 94.92%94.92% 57.02%57.02%
2.42.4 94.92%94.92% 57.31%57.31%
2.462.46 94.92%94.92% 58.77%58.77%
2.552.55 94.92%94.92% 59.06%59.06%
2.62.6 94.92%94.92% 60.53%60.53%
2.662.66 94.92%94.92% 60.82%60.82%
2.752.75 94.92%94.92% 61.11%61.11%
2.792.79 94.92%94.92% 61.40%61.40%
2.812.81 94.92%94.92% 61.99%61.99%
2.822.82 94.92%94.92% 62.57%62.57%
2.842.84 94.92%94.92% 62.87%62.87%
2.852.85 94.92%94.92% 63.74%63.74%
2.92.9 94.92%94.92% 65.20%65.20%
2.952.95 94.92%94.92% 66.37%66.37%
2.962.96 94.92%94.92% 67.25%67.25%
2.972.97 94.92%94.92% 67.84%67.84%
2.992.99 94.92%94.92% 68.13%68.13%
3.013.01 93.22%93.22% 69.01%69.01%
3.053.05 93.22%93.22% 69.59%69.59%
3.053.05 93.22%93.22% 71.05%71.05%
3.063.06 93.22%93.22% 71.35%71.35%
3.073.07 93.22%93.22% 72.22%72.22%
3.083.08 93.22%93.22% 72.51%72.51%
3.113.11 91.53%91.53% 72.81%72.81%
3.123.12 91.53%91.53% 73.68%73.68%
3.163.16 91.53%91.53% 74.27%74.27%
3.173.17 91.53%91.53% 74.56%74.56%
3.213.21 91.53%91.53% 74.85%74.85%
3.273.27 89.83%89.83% 74.85%74.85%
3.313.31 89.83%89.83% 76.32%76.32%
3.333.33 89.83%89.83% 76.61%76.61%
3.373.37 89.83%89.83% 76.90%76.90%
3.383.38 89.83%89.83% 77.49%77.49%
3.423.42 88.14%88.14% 77.49%77.49%
3.433.43 86.44%86.44% 77.49%77.49%
3.483.48 86.44%86.44% 77.78%77.78%
3.513.51 86.44%86.44% 78.07%78.07%
3.533.53 86.44%86.44% 78.36%78.36%
3.573.57 86.44%86.44% 78.95%78.95%
3.633.63 86.44%86.44% 79.82%79.82%
3.683.68 86.44%86.44% 80.41%80.41%
3.733.73 86.44%86.44% 80.99%80.99%
3.763.76 86.44%86.44% 81.29%81.29%
3.783.78 86.44%86.44% 81.58%81.58%
3.813.81 86.44%86.44% 81.87%81.87%
3.883.88 86.44%86.44% 82.75%82.75%
3.893.89 86.44%86.44% 83.04%83.04%
3.923.92 86.44%86.44% 83.33%83.33%
3.943.94 86.44%86.44% 83.92%83.92%
3.963.96 86.44%86.44% 84.21%84.21%
3.973.97 86.44%86.44% 84.80%84.80%
4.014.01 84.75%84.75% 84.80%84.80%
4.024.02 84.75%84.75% 85.09%85.09%
4.034.03 83.05%83.05% 85.38%85.38%
4.074.07 83.05%83.05% 85.67%85.67%
4.094.09 81.36%81.36% 85.67%85.67%
4.124.12 81.36%81.36% 85.96%85.96%
4.134.13 81.36%81.36% 86.55%86.55%
4.144.14 81.36%81.36% 87.13%87.13%
4.184.18 81.36%81.36% 87.43%87.43%
4.194.19 81.36%81.36% 87.72%87.72%
4.224.22 81.36%81.36% 88.01%88.01%
4.224.22 81.36%81.36% 88.60%88.60%
4.244.24 81.36%81.36% 88.89%88.89%
4.284.28 81.36%81.36% 89.47%89.47%
4.34.3 81.36%81.36% 90.06%90.06%
4.344.34 81.36%81.36% 90.35%90.35%
4.394.39 81.36%81.36% 90.64%90.64%
4.394.39 81.36%81.36% 90.94%90.94%
4.44.4 81.36%81.36% 91.23%91.23%
4.414.41 81.36%81.36% 91.52%91.52%
4.484.48 81.36%81.36% 91.81%91.81%
4.514.51 79.66%79.66% 91.81%91.81%
4.544.54 79.66%79.66% 92.11%92.11%
4.654.65 79.66%79.66% 92.69%92.69%
4.674.67 79.66%79.66% 92.98%92.98%
4.684.68 79.66%79.66% 93.27%93.27%
4.74.7 77.97%77.97% 93.57%93.57%
4.764.76 77.97%77.97% 93.86%93.86%
4.954.95 77.97%77.97% 94.15%94.15%
4.984.98 76.27%76.27% 94.15%94.15%
5.095.09 72.88%72.88% 94.15%94.15%
5.115.11 72.88%72.88% 94.44%94.44%
5.145.14 71.19%71.19% 94.74%94.74%
5.255.25 71.19%71.19% 95.03%95.03%
5.265.26 71.19%71.19% 95.32%95.32%
5.275.27 71.19%71.19% 95.61%95.61%
5.35.3 69.49%69.49% 95.61%95.61%
5.315.31 69.49%69.49% 95.91%95.91%
5.435.43 67.80%67.80% 95.91%95.91%
5.445.44 67.80%67.80% 96.20%96.20%
5.485.48 66.10%66.10% 96.20%96.20%
5.625.62 66.10%66.10% 96.49%96.49%
5.635.63 66.10%66.10% 96.78%96.78%
5.665.66 64.41%64.41% 96.78%96.78%
5.75.7 62.71%62.71% 96.78%96.78%
5.75.7 62.71%62.71% 97.08%97.08%
5.715.71 62.71%62.71% 97.37%97.37%
5.815.81 62.71%62.71% 97.66%97.66%
5.845.84 62.71%62.71% 97.95%97.95%
5.915.91 61.02%61.02% 97.95%97.95%
5.975.97 59.32%59.32% 97.95%97.95%
6.076.07 59.32%59.32% 98.25%98.25%
6.246.24 59.32%59.32% 98.54%98.54%
6.386.38 57.63%57.63% 98.54%98.54%
6.436.43 55.93%55.93% 98.54%98.54%
6.446.44 54.24%54.24% 98.54%98.54%
6.466.46 52.54%52.54% 98.54%98.54%
6.526.52 50.85%50.85% 98.83%98.83%
6.586.58 49.15%49.15% 98.83%98.83%
6.646.64 49.15%49.15% 99.12%99.12%
6.676.67 47.46%47.46% 99.12%99.12%
6.736.73 47.46%47.46% 99.42%99.42%
6.786.78 47.46%47.46% 99.71%99.71%
6.966.96 44.07%44.07% 99.71%99.71%
77 42.37%42.37% 99.71%99.71%
7.317.31 42.37%42.37% 100.00%100.00%
7.397.39 40.68%40.68% 100.00%100.00%
7.457.45 38.98%38.98% 100.00%100.00%
7.477.47 37.29%37.29% 100.00%100.00%
7.557.55 35.59%35.59% 100.00%100.00%
7.587.58 33.90%33.90% 100.00%100.00%
7.797.79 32.20%32.20% 100.00%100.00%
7.917.91 30.51%30.51% 100.00%100.00%
7.917.91 28.81%28.81% 100.00%100.00%
8.638.63 27.12%27.12% 100.00%100.00%
9.059.05 25.42%25.42% 100.00%100.00%
9.19.1 23.73%23.73% 100.00%100.00%
9.119.11 22.03%22.03% 100.00%100.00%
9.189.18 20.34%20.34% 100.00%100.00%
9.419.41 18.64%18.64% 100.00%100.00%
9.59.5 16.95%16.95% 100.00%100.00%
9.749.74 15.25%15.25% 100.00%100.00%
11.6711.67 13.56%13.56% 100.00%100.00%
12.0812.08 11.86%11.86% 100.00%100.00%
12.3112.31 10.17%10.17% 100.00%100.00%
12.3212.32 8.47%8.47% 100.00%100.00%
12.3612.36 6.78%6.78% 100.00%100.00%
12.5412.54 5.08%5.08% 100.00%100.00%
15.7815.78 3.39%3.39% 100.00%100.00%
17.0217.02 1.69%1.69% 100.00%100.00%
상기 실시예를 통해 개시한 결과들은 본 발명에 따른 15 가지의 SNP 유전자 마커를 이용하면, 모발의 탄력 또는 인장강도를 예측, 진단하거나 저탄력 저인장 강도 모발의 발생 위험이 있는 것으로 예측할 수 있을 것이다. 이러한 일련의 발견을 통해 모발의 탄력 또는 인장 강도를 개선시키거나 또는 현상을 유지시킬 수 있는 개인 맞춤형 의료기기, 의약품, 화장품 및 유효성분 등을 개발할 수 있을 것으로 기대된다.The results disclosed in the above examples show that using the 15 SNP gene markers according to the present invention, predicting and diagnosing hair elasticity or tensile strength, or predicting that there is a risk of low elasticity and low tensile strength hair. . Through this series of discoveries, it is expected to develop personalized medical devices, pharmaceuticals, cosmetics, and active ingredients that can improve or maintain the elasticity or tensile strength of hair.
전술한 본 발명의 설명은 예시를 위한 것이며, 본 발명이 속하는 기술분야의 통상의 지식을 가지는 자는 본 발명의 기술적 사상이나 필수적인 특징을 변경하지 않고서 다른 구체적인 형태로 쉽게 변형이 가능하다는 것을 이해할 수 있을 것이다. 그러므로 이상에서 기술한 실시예들은 모든 면에서 예시적인 것이며 한정적이 아닌 것으로 이해해야만 한다. The above description of the present invention is for illustration, and those of ordinary skill in the art to which the present invention pertains can understand that it can be easily modified into other specific forms without changing the technical spirit or essential features of the present invention. will be. Therefore, it should be understood that the embodiments described above are illustrative in all respects and not restrictive.
본 발명의 단일염기다형성 마커를 이용한 저탄력 저인장강도 모발의 예측 방법, 예측용 키트 및 예측 모델은, 각각의 개체에 대하여 저탄력 저인장강도 모발을 가진 개체를 사전에 높은 정확도로 예측할 수 있다는 효과가 있다. 나아가, 본 발명의 예측 방법, 예측용 키트 및 예측 모델을 통해 얻은 정보를 토대로 저탄력 저인장강도 모발의 강도 및 탄력을 호전 또는 현상 유지 시킬 수 있는 개인 맞춤형 의료기기, 의약품 및 화장품, 유효성분 등의 개발에 응용될 수 있을 것으로 기대된다.The prediction method, prediction kit and prediction model of low-elasticity and low-tensile strength hair using the single nucleotide polymorphism marker of the present invention can predict individuals with low-elasticity and low tensile strength hair with high accuracy in advance for each individual. It works. Furthermore, based on the information obtained through the prediction method, prediction kit, and prediction model of the present invention, personalized medical devices, medicines and cosmetics, active ingredients, etc. that can improve or maintain the strength and elasticity of low-elasticity and low-tensile strength hair It is expected that it can be applied to the development of

Claims (9)

  1. 하기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP를 포함하는, 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측용 SNP 마커 조성물:A SNP marker composition for diagnosis or prediction of elasticity or tensile strength of human hair, comprising at least one SNP selected from the group consisting of the following first SNPs to 135th SNPs:
    Figure PCTKR2021013709-appb-img-000043
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  2. 하기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP를 검출 또는 증폭하는 제제를 유효성분으로 포함하는, 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측용 조성물:A composition for diagnosing or predicting elasticity or tensile strength of human hair, comprising as an active ingredient an agent for detecting or amplifying one or more SNPs selected from the group consisting of the following first SNPs to 135th SNPs:
    Figure PCTKR2021013709-appb-img-000057
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  3. 제2항에 있어서,3. The method of claim 2,
    상기 SNP를 검출하는 제제는 상기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP를 검출할 수 있는 프로브(probe)인 것을 특징으로 하는, 조성물.The agent for detecting the SNP is a probe (probe) capable of detecting one or more SNPs selected from the group consisting of the first SNP to the 135th SNP, the composition.
  4. 제2항에 있어서,3. The method of claim 2,
    상기 SNP를 증폭하는 제제는 상기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP를 검출할 수 있는 프라이머(primer) 세트인 것을 특징으로 하는, 조성물.The agent for amplifying the SNP is a primer set capable of detecting one or more SNPs selected from the group consisting of the first SNP to the 135th SNP, the composition comprising.
  5. 제2항의 조성물을 포함하는, 인체 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측용 키트.A kit for diagnosis or prediction of elasticity or tensile strength of human hair, comprising the composition of claim 2 .
  6. 제5항에 있어서, 6. The method of claim 5,
    상기 키트는 RT-PCR 키트 또는 마이크로어레이 칩 키트인 것을 특징으로 하는, 키트.The kit is an RT-PCR kit or a microarray chip kit, characterized in that the kit.
  7. 개체로부터 분리한 핵산 시료로부터 하기 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 SNP가 확인된 경우, 저탄력 저인장강도의 모발로 진단하거나, 저탄력 저인장강도의 모발이 발생할 것으로 예측하는 단계를 포함하는, 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측을 위한 정보제공방법:When one or more SNPs selected from the group consisting of the following first SNPs to 135th SNPs are identified from a nucleic acid sample isolated from an individual, it is diagnosed as hair with low elasticity and low tensile strength, or hair with low elasticity and low tensile strength is predicted to occur An information providing method for diagnosing or predicting hair elasticity or tensile strength, comprising the step of:
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  8. 제7항에 있어서,8. The method of claim 7,
    상기 SNP는 시퀀싱(sequencing), 엑솜 시퀀싱(exome sequencing), 마이크로어레이에 의한 혼성화(microarray hybridization), 대립유전자 특이적인 PCR(allele specific PCR), 동적 대립유전자 혼성화 기법(dynamic allele-specific hybridization), PCR 연장 분석 및 Taqman 기법으로 이루어진 군으로부터 선택되는 하나 이상의 방법에 의해 확인되는 것을 특징으로 하는, 정보제공방법.The SNP is sequencing, exome sequencing, microarray hybridization, allele specific PCR, dynamic allele-specific hybridization, PCR A method for providing information, characterized in that it is identified by at least one method selected from the group consisting of extension analysis and Taqman technique.
  9. 개체로부터 분리한 핵산 시료로부터 제7항의 제1 SNP 내지 제135 SNP로 이루어진 군에서 선택된 하나 이상의 SNP가 확인된 경우, 저탄력 저인장강도의 모발로 진단하거나, 저탄력 저인장강도의 모발이 발생할 것으로 예측하는 단계를 포함하는, 모발의 탄력 또는 인장강도의 진단 또는 예측 방법.When one or more SNPs selected from the group consisting of the first SNP to 135 SNP of claim 7 are identified from a nucleic acid sample isolated from an individual, it is possible to diagnose low elasticity and low tensile strength hair or to develop low elasticity and low tensile strength hair. A method of diagnosing or predicting hair elasticity or tensile strength, comprising the step of predicting it.
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