WO2020221578A1 - Verbesserte reinigungsleistung gegenüber protein-empfindlichen anschmutzungen vi - Google Patents

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WO2020221578A1
WO2020221578A1 PCT/EP2020/060375 EP2020060375W WO2020221578A1 WO 2020221578 A1 WO2020221578 A1 WO 2020221578A1 EP 2020060375 W EP2020060375 W EP 2020060375W WO 2020221578 A1 WO2020221578 A1 WO 2020221578A1
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WO
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amino acid
protease
positions
acid substitution
position corresponding
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PCT/EP2020/060375
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Christian DEGERING
Susanne Wieland
Fabian Falkenberg
Nina Mussmann
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Henkel Ag & Co. Kgaa
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/52Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from bacteria or Archaea
    • C12N9/54Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from bacteria or Archaea bacteria being Bacillus
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C11ANIMAL OR VEGETABLE OILS, FATS, FATTY SUBSTANCES OR WAXES; FATTY ACIDS THEREFROM; DETERGENTS; CANDLES
    • C11DDETERGENT COMPOSITIONS; USE OF SINGLE SUBSTANCES AS DETERGENTS; SOAP OR SOAP-MAKING; RESIN SOAPS; RECOVERY OF GLYCEROL
    • C11D3/00Other compounding ingredients of detergent compositions covered in group C11D1/00
    • C11D3/16Organic compounds
    • C11D3/38Products with no well-defined composition, e.g. natural products
    • C11D3/386Preparations containing enzymes, e.g. protease or amylase
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y304/00Hydrolases acting on peptide bonds, i.e. peptidases (3.4)
    • C12Y304/21Serine endopeptidases (3.4.21)
    • C12Y304/21062Subtilisin (3.4.21.62)

Definitions

  • the invention is in the field of enzyme technology.
  • the invention relates to proteases from Bacillus pumilus, the amino acid sequence of which has been changed, in particular with regard to use in detergents and cleaning agents, in order to give them better cleaning performance, and the nucleic acids coding for them and their production.
  • the invention also relates to the uses of these proteases and processes in which they are used, as well as agents containing them, in particular washing and cleaning agents.
  • proteases are among the technically most important enzymes of all. They are the longest established enzymes for laundry detergents and cleaning agents and are contained in practically all modern, high-performance laundry detergents and cleaning agents. They cause the degradation of protein-containing soiling on the items to be cleaned.
  • proteases of the subtilisin type (subtilases, subtilopeptidases, EC 3.4.21.62) are particularly important, which are serine proteases due to the catalytically active amino acids. They act as non-specific endopeptidases and hydrolyze any acid amide bonds that are inside peptides or proteins. Their pH optimum is usually in the clearly alkaline range.
  • Subtilases Subtilisin-like Proteases
  • R. Siezen pages 75-95 in “Subtilisin enzymes”, edited by R. Bott and C. Betzel, New York, 1996.
  • Subtilases are natural formed by microorganisms. Among these, the subtilisins formed and secreted by Bacillus species should be mentioned as the most important group within the subtilases.
  • proteases of the subtilisin type preferably used in detergents and cleaning agents are the subtilisins BPN 'and Carlsberg, the protease PB92, the subtilisins 147 and 309, the protease from Bacillus lentus, in particular from Bacillus lentus DSM 5483, subtilisin DY and the the subtilases, but no longer the subtilisins in the narrower sense, the enzymes thermitase, proteinase K and the proteases TW3 and TW7, as well as variants of the proteases mentioned, which have a changed amino acid sequence compared to the starting protease.
  • Proteases are modified in a targeted or random manner by methods known from the prior art and thus optimized for use in detergents and cleaning agents, for example. These include point mutagenesis, deletion or insertion mutagenesis or fusion with other proteins or protein parts. For most of the proteases known from the prior art, correspondingly optimized variants are known.
  • protease from Bacillus pumilus intended for detergents and cleaning agents is disclosed.
  • only selected proteases are suitable for use in liquid surfactant-containing preparations.
  • Many proteases do not show sufficient catalytic properties in such preparations Power.
  • a high catalytic activity under conditions such as those presented during a wash cycle and a high storage stability are particularly desirable.
  • liquid formulations containing proteases and surfactants from the prior art have the disadvantage that the proteases contained do not have a satisfactory proteolytic activity or are not storage-stable under standard washing conditions (for example in a temperature range from 20 ° C. to 40 ° C.) the formulations therefore do not show optimal cleaning performance on protease-sensitive soils.
  • protease from Bacillus pumilus or a protease that is sufficiently similar to this which based on the numbering according to SEQ ID NO: 1 at the positions corresponding to positions 9, 133, 144, 252 and 271, which have amino acid substitutions selected from 9T, 133A, 144K, 252T and 271 E, and at least one further amino acid substitution in at least one of the positions corresponding to positions 3, 4, 82, 156, 162 and 218, with regard to cleaning performance on protein-sensitive soiling is improved compared to the wild-type form and / or the reference mutant and is therefore particularly suitable for use in detergents or cleaning agents.
  • the invention therefore relates to a protease comprising an amino acid sequence which has at least 70% sequence identity with the amino acid sequence indicated in SEQ ID NO: 1 over its entire length and in each case based on the numbering according to SEQ ID NO: 1:
  • (i) has amino acid substitutions at positions corresponding to positions 9, 133, 144, 252 and 271, preferably selected from amino acid substitutions 9T, 133A, 144K, 252T and 271 E;
  • (ii) has at least one further amino acid substitution in at least one of the positions corresponding to positions 3, 4, 82, 156, 162 and 218.
  • the invention also relates to a protease comprising an amino acid sequence which has at least 70% sequence identity with the amino acid sequence given in SEQ ID NO: 1 over its entire length and in each case based on the numbering according to SEQ ID NO: 1
  • (A) has at least one amino acid substitution in at least one of the positions which correspond to positions 3, 4 and 218, preferably selected from 3K, 3A, 3R, 3S, 4A, 4I, 4T and 218S and / or
  • the invention also relates to a method for producing a protease as defined above, comprising the substitution of amino acids in a starting protease which has at least 70% sequence identity to the amino acid sequence given in SEQ ID NO: 1 over its entire length (i) at the positions which correspond to positions 9, 133, 144, 252 and 271 in SEQ ID NO: 1, in such a way that the protease at the positions comprises amino acid substitutions, in particular the amino acid substitutions selected from 9T, 133A, 144K, 252T and 271 E; and (ii) has at least one further amino acid substitution in at least one of the positions corresponding to positions 3, 4, 82, 156, 162 and 218.
  • the protease obtainable by means of this method has at least 70% sequence identity to the amino acid sequence given in SEQ ID NO: 1 over its entire length.
  • a protease within the meaning of the present patent application therefore comprises both the protease as such and a protease produced using a method according to the invention. All statements about the protease therefore relate both to the protease as such and to the proteases produced by means of corresponding processes.
  • nucleic acids coding for these proteases relate to the nucleic acids coding for these proteases, proteases according to the invention or non-human host cells containing nucleic acids and agents comprising proteases according to the invention, in particular detergents and cleaning agents, washing and cleaning methods, and uses of the proteases according to the invention in washing or cleaning agents for removing protein-containing soiling.
  • At least one means one or more, i. 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 1 1, 12, 13, 14 or more.
  • the present invention is based on the surprising finding of the inventors that amino acid substitutions at the positions described herein bring about an improved cleaning performance of this modified protease in detergents and cleaning agents.
  • a protease according to the invention is characterized in that it comprises an amino acid sequence which has at least 70% sequence identity with the amino acid sequence given in SEQ ID NO: 1 over its entire length and in each case, based on the numbering according to SEQ ID NO: 1, has:
  • amino acid substitutions preferably selected from amino acid substitutions 9T, 133A, 144K, 252T and 271 E;
  • a protease as described herein additionally has an additional amino acid substitution at the position corresponding to position 130. In various embodiments, this additional amino acid substitution is 130D.
  • a protease according to the invention is characterized in that it comprises an amino acid sequence which has at least 70% sequence identity with the amino acid sequence given in SEQ ID NO: 1 over its entire length and in each case based on the numbering according to SEQ ID NO: 1
  • (A) has at least one amino acid substitution in at least one of the positions which correspond to positions 3, 4 and 218, preferably selected from 3K, 3A, 3R, 3S, 4A, 4I, 4T and 218S and / or
  • (B) has at least one amino acid substitution selected from 156D and 1621 in at least one of positions corresponding to positions 156 and 162.
  • the protease consequently has amino acid substitutions at the positions corresponding to positions 9, 133, 144, 252 and 271, preferably selected from 9T, 133A, 144K, 252T and 271 E, and additionally at the positions corresponding to Positions 3, 4, 9, 82, 156, 162 and 218 correspond to at least one, ie for example 1, 2, 3, 4, 5 or 6 amino acid substitution (s) selected from: 3K, 3A, 3R, 3S, 4A, 4I, 4T, 9T, 82F, 156D and 1621 and 218S.
  • a protease according to the invention is characterized in that
  • amino acid substitution at the position corresponding to position 3 is selected from 3K, 3A, 3R and 3S; and or
  • amino acid substitution at the position corresponding to position 4 is selected from 4A, 4I and 4T; or
  • amino acid substitution at the position corresponding to position 162 is selected from 1621;
  • a protease according to the invention is characterized in that a) the amino acid substitution at the position corresponding to position 3 is selected from 3K, 3A and 3S; and or b) the amino acid substitution at the position corresponding to position 4 is selected from 4A, 41 and 4T; or
  • a protease according to the invention is characterized in that the amino acid substitution at the position corresponding to position 3 is selected from 3K and the amino acid substitution at the position corresponding to position 4 is selected from 41.
  • has the protease according to the invention has substitutions at positions 3 and 4, these being preferably selected from those mentioned herein, preferably (i) 3K and 41, (ii) 3A and 41 or (iii) 3A and 4A.
  • the protease has amino acid substitutions, especially those at positions corresponding to positions 9, 133, 144, 252 and 271
  • a protease according to the invention additionally has an additional amino acid substitution at the position corresponding to position 130, this preferably being 130D.
  • Such proteases are disclosed, for example, as mutants 2-10 in the examples and are thus the subject of the invention.
  • the proteases according to the invention have an improved cleaning performance.
  • the proteases according to the invention can have a proteolytic activity which, based on the wild type (SEQ ID NO: 1), is at least 101%, preferably at least 102% or more.
  • Such performance-enhanced proteases enable improved washing results on proteolytically sensitive soiling in different temperature ranges, in particular a temperature range from 20 ° C to 40 ° C.
  • the proteases according to the invention can have an increased storage stability in detergents or cleaning agents independently of or in addition to the increased cleaning performance. This means that in comparison to the reference enzyme (according to SEQ ID NO: 1) and in particular also compared to the starting variant of the protease (mutant in examples), in particular when stored for 3 or more days, 4 or more days, 7 or more Days, 10 or more days, 12 or more days, 14 or more days, 21 or more days or 28 or more days can have an increased stability in detergents or cleaning agents.
  • the proteases according to the invention have enzymatic activity, that is to say they are capable of hydrolyzing peptides and proteins, in particular in a washing or cleaning agent.
  • a protease according to the invention is therefore an enzyme which catalyzes the hydrolysis of amide / peptide bonds in protein / peptide substrates and is thereby able to cleave proteins or peptides.
  • a protease according to the invention is preferably a mature protease, ie the catalytically active molecule without signal and / or propeptide (s). Unless stated otherwise, the specified sequences also relate to mature (processed) enzymes.
  • the protease is a free enzyme. This means that the protease can act directly with all components of an agent and, if the agent is a liquid agent, that the protease is in direct contact with the agent's solvent (e.g. water).
  • an agent can contain proteases that form an interaction complex with other molecules or that contain an “envelope”.
  • a single or multiple protease molecules can be separated from the other components of the agent by a structure surrounding them.
  • a separating structure can arise from, but is not limited to, vesicles such as a micelle or a liposome.
  • the surrounding structure can also be a virus particle, a bacterial cell or a eukaryotic cell.
  • an agent can contain cells from Bacillus pumilus or Bacillus subtilus which express the proteases according to the invention, or cell culture supernatants of such cells.
  • the protease comprises an amino acid sequence which is at least 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77% of the total length of the amino acid sequence given in SEQ ID NO: 1 , 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 90.5%, 91%, 91, 5%, 92%, 92.5%, 93%, 93.5%, 94%, 94.5%, 95%, 95.5%, 96%, 96.5%, 97%, 97.5% , 98%, 98.5% and 98.8% is identical, and in each case, based on the numbering according to SEQ ID NO: 1, has the amino acid substitutions given above.
  • a protease has the specified substitutions means that it contains one (of the specified) substitution (s) at the respective position, i.e. at least the positions indicated are not otherwise mutated or deleted, for example by fragmentation of the protease.
  • sequence comparison is based on the BLAST algorithm that is established and commonly used in the prior art (cf., for example, Altschul, SF, Gish, W., Miller, W., Myers, EW & Lipman, DJ (1990) "Basic local alignment search tool . "J. Mol. Biol. 215: 403-410, and Altschul, Stephan F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Hheng Zhang, Webb Miller, and David J.
  • Gapped BLAST and PSI-BLAST a new generation of protein database search programs "; Nucleic Acids Res., 25, S.3389-3402) and occurs principally in that similar sequences of nucleotides or amino acids in the nucleic acid or amino acid sequences are assigned to one another. A tabular assignment of the relevant positions is made Another algorithm available in the prior art is the FASTA algorithm. Sequence comparisons (alignments), in particular multiple sequence comparisons, are created with computer programs. The Clustal series, for example, is often used (cf. for example Chenna et al. (2003 ): Multiple sequence alignment with the Clustal series of programs.
  • T-Coffee see, for example, Notredame et al. (2000): T-Coffee: A novel method for multiple sequence alignments. J . Mol. Biol. 302, 205-217) or programs based on these programs or algorithms. Sequence comparisons are also possible (Alignments) with the computer program Vector NTI® Suite 10.3 (Invitrogen Corporation, 1600 Faraday Avenue, Carlsbad, California, USA) with the specified standard parameters, whose AlignX module for the sequence comparisons is based on ClustalW. Unless otherwise stated, the sequence identity given herein is determined using the BLAST algorithm.
  • Such a comparison also allows a statement about the similarity of the compared sequences to one another. It is usually given in percent identity, that is to say the proportion of identical nucleotides or amino acid residues in the same positions or in positions corresponding to one another in an alignment.
  • the broader term of homology includes conserved amino acid exchanges in the case of amino acid sequences, i.e. amino acids with similar chemical activity, since these usually exert similar chemical activities within the protein. Therefore, the similarity of the compared sequences can also be given as percent homology or percent similarity. Identity and / or homology information can be made over entire polypeptides or genes or only over individual areas. Homologous or identical regions of different nucleic acid or amino acid sequences are therefore defined by matches in the sequences.
  • Such areas often have identical functions. They can be small and only contain a few nucleotides or amino acids. Such small areas often have essential functions for the overall activity of the protein. It can therefore be useful to relate sequence matches only to individual, possibly small areas. Unless otherwise stated, the identity or homology information in the present application relates to the total length of the nucleic acid or amino acid sequence specified in each case.
  • the statement that an amino acid position corresponds to a numerically designated position in SEQ ID NO: 1 means that the corresponding position is assigned to the numerically designated position in SEQ ID NO: 1 in an alignment as defined above.
  • the protease is characterized in that its cleaning performance (after storage, for example over 4 weeks) is not significant compared to that of a protease which is characterized as mutant 1 in the examples of the present invention and has the correspondingly marked amino acid substitutions is reduced, ie has at least 80% of the reference washing performance, preferably at least 100%, more preferably at least 110% or more.
  • the cleaning performance can be determined in a washing system that contains a detergent in a dosage between 4.5 and 7.0 grams per liter of washing liquor as well as the protease, with the proteases to be compared being used in the same concentration (based on active protein) and the cleaning performance opposite Soiling on cotton is determined by measuring the degree of cleaning of the washed textiles.
  • the washing process can take place for 60 minutes at a temperature of 40 ° C and the water has a water hardness between 15.5 and 16.5 ° (German hardness).
  • the concentration of the protease in the detergent intended for this washing system is 0.001-0.1% by weight, preferably 0.01 to 0.06% by weight, based on active, purified protein.
  • a liquid reference detergent for such a washing system can be composed as follows (all data in percent by weight): 4.4% alkylbenzenesulfonic acid, 5.6% other anionic surfactants, 2.4% C12-C18 Na salts of fatty acids (soaps) , 4.4% non-ionic surfactants, 0.2% phosphonates, 1.4% citric acid, 0.95% NaOH, 0.01% defoamer, 2% glycerine, 0.08% preservatives, 1% ethanol, the remainder demineralized Water.
  • the dosage of the liquid detergent is preferably between 4.5 and 6.0 grams per liter of wash liquor, for example 4.7, 4.9 or 5.9 grams per liter of wash liquor. Washing is preferably carried out in a pH range between pH 7 and pH 10.5, preferably between pH 7.5 and pH 8.5.
  • the cleaning performance is determined, for example, at 20 ° C. or 40 ° C. using a liquid detergent as indicated above, the washing process preferably taking place for 60 minutes at 600 rpm.
  • the whiteness i.e. the lightening of the soiling, as a measure of the cleaning performance, is determined using optical measuring methods, preferably photometrically.
  • a suitable device for this is, for example, the Minolta CM508d spectrometer.
  • the devices used for the measurement are usually calibrated beforehand with a white standard, preferably a supplied white standard.
  • the respective protease By using the respective protease with the same activity, it is ensured that the respective enzymatic properties, e.g. the cleaning performance on certain soiling, are compared even if the ratio of active substance to total protein (the values of the specific activity) diverges. As a general rule, a low specific activity can be compensated for by adding a larger amount of protein.
  • the protease activity can be determined via the release of the chromophore para-nitroaniline (pNA) from the substrate suc-L-Ala-L-Ala-L-Pro-L-Phe-p-nitroanilide (AAPF).
  • pNA chromophore para-nitroaniline
  • the protease cleaves the substrate and releases pNA.
  • the release of the pNA causes an increase in the extinction at 410 nm, the course of which over time is a measure of the enzymatic activity (cf. Del Mar et al., 1979).
  • the measurement takes place at a temperature of 25 ° C., at pH 8.6, and a wavelength of 410 nm.
  • the measurement time is 5 minutes and the measurement interval is 20s to 60s.
  • the protease activity is usually given in protease units (PU). Suitable protease activities are, for example, 2.25, 5 or 10 PU per ml of wash liquor. However, the protease activity is not zero.
  • An alternative test for determining the proteolytic activity of the proteases according to the invention is an optical measuring method, preferably a photometric method.
  • the test suitable for this comprises the protease-dependent cleavage of the substrate protein casein. This is split into a large number of smaller partial products by the protease. The totality of these partial products has an increased absorption at 290 nm compared to non-split casein, this increased absorption being determined using a photometer and thus a conclusion about the enzymatic activity of the protease can be drawn.
  • the protein concentration can be determined using known methods, for example the BCA method (bicinchoninic acid; 2,2'-bichinolyl-4,4'-dicarboxylic acid) or the biuret method (AG Gornall, CS Bardawill and MM David, J. Biol. Chem., 177 (1948), pp. 751-766).
  • the active protein concentration can be determined by titrating the active centers using a suitable irreversible inhibitor and determining the residual activity (cf. M. Bender et al., J. Am. Chem. Soc. 88, 24 (1966), p. 5890 -5913).
  • proteases according to the invention can have further amino acid changes, in particular amino acid substitutions, insertions or deletions.
  • Such proteases are further developed, for example, by targeted genetic modification, ie by mutagenesis processes, and optimized for specific purposes or with regard to special properties (for example with regard to their catalytic activity, stability, etc.).
  • nucleic acids according to the invention can be introduced into recombination batches and thus used to generate completely new proteases or other polypeptides. The aim is to introduce specific mutations such as substitutions, insertions or deletions into the known molecules in order, for example, to improve the cleaning performance of enzymes according to the invention.
  • the surface charges and / or the isoelectric point of the molecules and thereby their interactions with the substrate can be changed.
  • the net charge of the enzymes can be changed in order to influence the substrate binding, especially for use in detergents and cleaning agents.
  • one or more corresponding mutations can increase the stability or catalytic activity of the protease and thereby improve its cleaning performance.
  • Advantageous properties of individual mutations, for example individual substitutions, can complement one another.
  • a protease that has already been optimized with regard to certain properties, for example with regard to its stability during storage, can therefore be further developed within the scope of the invention.
  • amino acid substitutions first the naturally present amino acid is designated in the form of the internationally common single-letter code, then the associated sequence position and finally the inserted amino acid. Multiple exchanges within the same polypeptide chain are separated from one another by slashes. In the case of insertions, additional amino acids are named after the sequence position. In the case of deletions, the missing amino acid is replaced by a symbol, for example an asterisk or a dash, or a D is given in front of the corresponding position.
  • P9T describes the substitution of proline at position 9 by threonine
  • P9TH the insertion of histidine after the amino acid threonine at position 9
  • P9 * or DR9 the deletion of proline at position 9.
  • the invention therefore also provides a protease which is characterized in that it can be obtained from a protease as described above as the starting molecule by single or multiple conservative amino acid substitutions, the protease being those described above in the number according to SEQ ID NO: 1 Has amino acid substitutions.
  • conservative amino acid substitution means the exchange (substitution) of an amino acid residue for another amino acid residue, this exchange not leading to a change in polarity or charge at the position of the exchanged amino acid, e.g. B. the exchange of a non-polar amino acid residue for another non-polar amino acid residue.
  • the protease is characterized in that it can be obtained from a protease according to the invention as a starting molecule by fragmentation, deletion, insertion or substitution mutagenesis and comprises an amino acid sequence which has a Length of at least 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273 or 274 contiguous amino acids with the starting molecule , where the amino acid substitutions described above, ie the substitutions 9T, 133A, 144K, 252T and 271 E or the substitutions at the positions corresponding to positions 3, 4, 82, 156, 162 and / or 218 and optionally 130, still available.
  • the proteases described herein are modified, the modification takes place in such a way that the substitutions according to the invention are retained.
  • the enzymes retain their proteolytic activity even after the mutagenesis, i. E. their proteolytic activity corresponds at least to that of the parent enzyme, i.e. In a preferred embodiment, the proteolytic activity is at least 80, preferably at least 90% of the activity of the starting enzyme. Further substitutions can also have advantageous effects. Both single and several connected amino acids can be exchanged for other amino acids.
  • the other amino acid positions are defined by an alignment of the amino acid sequence of a protease according to the invention with the amino acid sequence of the protease from Bacillus pumilus, as indicated in SEQ ID NO: 1. Furthermore, the allocation of the positions is based on the mature (mature) protein. This assignment is also to be used in particular if the amino acid sequence of a protease according to the invention comprises a higher number of amino acid residues than the protease from Bacillus pumilus according to SEQ ID NO: 1. Starting from the positions mentioned in the amino acid sequence of the protease from Bacillus pumilus, the change positions in a protease according to the invention are those which are assigned to these positions in an alignment.
  • Advantageous positions for sequence changes, in particular substitutions, of the protease from Bacillus pumilus which are preferably of importance when transferred to homologous positions of the proteases according to the invention and give the protease advantageous functional properties, are accordingly the positions which correspond to the positions described herein in an alignment, i.e. in the count according to SEQ ID NO: 1.
  • the following amino acid residues are located in the wild-type molecule of the protease from Bacillus pumilus at the positions mentioned: T3, V4, P9, L82, N130, T133, N144, S156, T162, T218, N252 and Q271.
  • an amino acid exchange in a certain position of the protease from Bacillus pumilus according to SEQ ID NO: 1 is accompanied by a change in an enzymatic parameter, for example with an increase in the K M value, and a corresponding change in the enzymatic parameter, for example also a
  • An increase in the K M value observed in a protease variant according to the invention, the amino acid exchange of which was achieved by the same introduced amino acid, is a confirmation of the correct assignment.
  • the protease or the protease produced using a method according to the invention is still at least 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80 %, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 90.5%, 91%, 91, 5%, 92%, 92, 5%, 93%, 93.5%, 94%, 94.5%, 95%, 95.5%, 96%, 96.5%, 97%, 97.5%, 98%, 98.5% , or 98.8% identical to the amino acid sequence given in SEQ ID NO: 1 over its entire length.
  • the protease or the protease produced by a method according to the invention has the amino acid substitutions selected from 9T, 133A, 144K, 252T and 271 E at the positions which correspond to positions 9, 133, 144, 252 and 271; as well as at least one amino acid substitution at least one of the positions which correspond to positions 3, 4, 82, 156, 162 and 218, each based on the numbering according to SEQ ID NO: 1.
  • the invention relates to proteases according to SEQ ID NO: 1 with the following amino acid substitution variants:
  • the invention also relates to a protease described above which is additionally stabilized, in particular by one or more mutations, for example substitutions, or by coupling to a polymer.
  • An increase in the stability during storage and / or during use, for example during the washing process, means that the enzymatic activity lasts longer and thus the cleaning performance is improved.
  • all stabilization options described and / or expedient in the prior art come into consideration. Stabilizations that are achieved via mutations of the enzyme itself are preferred, since such stabilizations do not require any further work steps following the recovery of the enzyme. Examples of sequence changes suitable for this are mentioned above. Further suitable sequence changes are known from the prior art.
  • Changing the binding of metal ions, in particular the calcium binding sites for example by replacing one or more of the amino acid (s) involved in calcium binding with one or more negatively charged amino acids and / or by introducing sequence changes in at least one of the consequences of the two amino acids arginine / glycine;
  • Preferred embodiments are those in which the enzyme is stabilized in several ways, since several stabilizing mutations act additively or synergistically.
  • Another object of the invention is a protease as described above, which is characterized in that it has at least one chemical modification.
  • a protease with such a change is called a derivative, i. the protease is derivatized.
  • derivatives are accordingly understood to mean those proteins whose pure amino acid chain has been chemically modified.
  • derivatizations can take place, for example, in vivo by the host cell expressing the protein.
  • couplings of low molecular weight compounds such as lipids or oligosaccharides should be particularly emphasized.
  • derivatizations can also be carried out in vitro, for example by chemically converting a side chain of an amino acid or by covalently binding another compound to the protein.
  • Such a different compound can also be a further protein which is bound to a protein according to the invention, for example via bifunctional chemical compounds.
  • derivatization is to be understood as the covalent bond to a macromolecular carrier, or also a non-covalent inclusion in suitable macromolecular cage structures.
  • Derivatizations can, for example, influence the substrate specificity or the strength of the binding to the substrate or bring about a temporary blocking of the enzymatic activity if the coupled substance is an inhibitor. This can be useful for the period of storage, for example.
  • Such modifications can also affect the stability or the enzymatic activity. They can also serve to reduce the allergenicity and / or immunogenicity of the protein and thus, for example, to increase its skin tolerance.
  • couplings with macromolecular compounds for example polyethylene glycol, can improve the protein in terms of stability and / or skin tolerance.
  • derivatives of a protein according to the invention can also be understood to mean preparations of these proteins.
  • a protein can be combined with various other substances, for example from the culture of the producing microorganisms.
  • a protein can also have been deliberately mixed with other substances, for example to increase its storage stability. All preparations of a protein according to the invention are therefore also in accordance with the invention. This is also independent of whether it actually displays this enzymatic activity in a particular preparation or not. This is because it may be desirable for it to have little or no activity during storage and only develop its enzymatic function at the time of use. This can be controlled, for example, via corresponding accompanying substances.
  • the joint preparation of proteases with specific inhibitors is possible in this regard.
  • the invention furthermore relates to a nucleic acid which codes for a protease according to the invention, and a vector containing such a nucleic acid, in particular a cloning vector or an expression vector.
  • RNA molecules can be DNA or RNA molecules. They can be present as a single strand, as a single strand complementary to this single strand, or as a double strand. In the case of DNA molecules in particular, the sequences of both complementary strands must be taken into account in all three possible reading frames. It should also be taken into account that different codons, that is to say base triplets, can code for the same amino acids, so that a certain amino acid sequence can be coded by several different nucleic acids. Because of this degeneracy of the genetic code, all nucleic acid sequences are included in this subject matter of the invention which can code for one of the proteases described above.
  • nucleic acid sequences unequivocally since, despite the degeneracy of the genetic code, defined amino acids have to be assigned to individual codons.
  • the person skilled in the art can therefore easily determine nucleic acids coding for this amino acid sequence on the basis of an amino acid sequence.
  • one or more codons in the nucleic acids according to the invention can be replaced by synonymous codons.
  • This aspect relates in particular to the heterologous expression of the enzymes according to the invention. Every organism, for example a host cell of a production strain, has a specific codon usage. Codon usage means the translation of the genetic code into amino acids by the respective organism.
  • Bottlenecks in protein biosynthesis can arise if the codons on the nucleic acid are compared to a comparatively small number of loaded tRNA molecules in the organism. Although coding for the same amino acid, this means that a codon is translated less efficiently in the organism than a synonymous codon which codes for the same amino acid. Due to the presence of a higher number of tRNA molecules for the synonymous codon, this can be translated more efficiently in the organism.
  • a person skilled in the art is able to use known DNA and / or amino acid sequences to identify the corresponding nucleic acids up to complete genes using known DNA and / or amino acid sequences, for example chemical synthesis or the polymerase chain reaction (PCR) in conjunction with standard molecular biological and / or protein chemical methods to manufacture.
  • PCR polymerase chain reaction
  • Such methods are for example from Sambrook, J., Fritsch, EF and Maniatis, T. 2001. Molecular cloning: a laboratory manual, 3rd Edition Cold Spring Laboratory Press.
  • vectors are understood to mean elements consisting of nucleic acids which contain a nucleic acid according to the invention as the characterizing nucleic acid region. They are able to establish this as a stable genetic element in a species or a cell line over several generations or cell divisions.
  • Vectors are special plasmids, i.e. circular genetic elements, especially when used in bacteria.
  • a nucleic acid according to the invention is cloned into a vector.
  • the vectors include, for example, those whose origin is bacterial plasmids, viruses or bacteriophages, or predominantly synthetic vectors or plasmids with elements of various origins. With the other genetic elements present in each case, vectors are able to establish themselves as stable units in the host cells concerned over several generations. They can exist extrachromosomally as separate units or integrate into a chromosome or chromosomal DNA.
  • Expression vectors comprise nucleic acid sequences which enable them to replicate in the host cells containing them, preferably microorganisms, particularly preferably bacteria, and to express a nucleic acid contained there.
  • the expression is influenced in particular by the promoter or promoters that regulate transcription.
  • expression can take place through the natural promoter originally located in front of the nucleic acid to be expressed, but also through a host cell promoter provided on the expression vector or also through a modified or completely different promoter from another organism or another host cell.
  • at least one promoter for the expression of a nucleic acid according to the invention is made available and used for its expression.
  • Expression vectors can also be regulatable, for example by changing the cultivation conditions or when the host cells they contain reach a certain cell density or by adding certain substances, in particular activators of gene expression.
  • An example of such a substance is the galactose derivative isopropyl- ⁇ -D-thiogalactopyranoside (IPTG), which is used as an activator of the bacterial lactose operon (lac operon).
  • IPTG galactose derivative isopropyl- ⁇ -D-thiogalactopyranoside
  • lac operon lactose operon
  • the invention also relates to a non-human host cell which contains a nucleic acid according to the invention or a vector according to the invention, or which contains a protease according to the invention, in particular one which secretes the protease into the medium surrounding the host cell.
  • a nucleic acid according to the invention or a vector according to the invention is preferably transformed into a microorganism which then represents a host cell according to the invention.
  • individual components, ie nucleic acid parts or fragments of a nucleic acid according to the invention can also be incorporated into a Host cell are introduced so that the host cell then resulting contains a nucleic acid according to the invention or a vector according to the invention.
  • This procedure is particularly suitable when the host cell already contains one or more components of a nucleic acid according to the invention or a vector according to the invention and the further components are then supplemented accordingly.
  • Methods for transforming cells are established in the prior art and are sufficiently known to the person skilled in the art. In principle, all cells, that is, prokaryotic or eukaryotic cells, are suitable as host cells. Preference is given to those host cells which can be manipulated in a genetically advantageous manner, for example with regard to the transformation with the nucleic acid or the vector and its stable establishment, for example unicellular fungi or bacteria. Furthermore, preferred host cells are characterized by good microbiological and biotechnological manageability.
  • Preferred host cells according to the invention secrete the (transgenically) expressed protein into the medium surrounding the host cells.
  • the proteases can be modified by the cells producing them after they have been produced, for example by attaching sugar molecules, formylations, aminations, etc. Such post-translational modifications can functionally influence the protease.
  • Further preferred embodiments are those host cells whose activity can be regulated on the basis of genetic regulatory elements, which are provided, for example, on the vector, but can also be present in these cells from the outset. For example, through the controlled addition of chemical compounds that serve as activators, by changing the cultivation conditions or when a certain cell density is reached, these can be stimulated to express. This enables the proteins according to the invention to be produced economically.
  • An example of such a connection is IPTG as described above.
  • Preferred host cells are prokaryotic or bacterial cells.
  • Bacteria are characterized by short generation times and low demands on the cultivation conditions. In this way, inexpensive cultivation processes or manufacturing processes can be established.
  • the specialist in bacteria in fermentation technology has a wealth of experience.
  • Gram-negative or gram-positive bacteria may be suitable for a special production for a wide variety of reasons, to be determined experimentally in individual cases, such as nutrient sources, product formation rate, time required, etc.
  • Gram-negative bacteria such as Escherichia coli
  • a large number of proteins are secreted into the periplasmic space, i.e. into the compartment between the two membranes enclosing the cells.
  • gram-negative bacteria can also be designed in such a way that they contain the expressed proteins not only into the periplasmic space, but into the medium surrounding the bacterium.
  • Gram-positive bacteria such as Bacilli or Actinomycetes or other representatives of the Actinomycetales, on the other hand, have no outer membrane, so that secreted proteins are immediately released into the medium surrounding the bacteria, usually the nutrient medium, from which the expressed proteins can be purified. They can be isolated directly from the medium or processed further.
  • Gram-positive bacteria are related or identical to most of the original organisms for technically important enzymes and usually form comparable enzymes themselves, so that they have a similar codon usage and their protein synthesis apparatus is naturally designed accordingly.
  • Host cells according to the invention can be changed with regard to their requirements for the culture conditions, have different or additional selection markers or also express other or additional proteins.
  • these host cells can also be those which transgenically express several proteins or enzymes.
  • the present invention is in principle applicable to all microorganisms, in particular to all fermentable microorganisms, particularly preferably to those of the genus Bacillus, and leads to the fact that proteins according to the invention can be produced by using such microorganisms. Such microorganisms then represent host cells within the meaning of the invention.
  • the host cell is characterized in that it is a bacterium, preferably one selected from the group of the genera Escherichia, Klebsiella, Bacillus, Staphylococcus, Corynebacterium, Arthrobacter, Streptomyces, Stenotrophomonas and Pseudomonas, more preferably one which is selected from the group of Escherichia coli, Klebsiella planticola, Bacillus licheniformis, Bacillus lentus, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus subtilis, Bacillus alcalophilus, Bacillus globigii, Bacillus gibsonii, Bacillus clausumum, Bacillus carnilus pacilocumlocus, Bacillus carnaphumlocumlocyans, Bacillus carnodurans , Arthrobacter oxidans, Streptomyces lividans, Streptomyces coeli
  • a bacterium
  • the host cell can also be a eukaryotic cell, which is characterized in that it has a cell nucleus.
  • the invention therefore also provides a host cell which is characterized in that it has a cell nucleus.
  • eukaryotic cells are able to post-translationally modify the protein formed. Examples are fungi such as Actinomycetes or yeasts such as Saccharomyces or Kluyveromyces. This can be particularly advantageous, for example, if the proteins are to undergo specific modifications in connection with their synthesis, which make such systems possible.
  • the eukaryotic systems perform especially in connection with protein synthesis, include, for example, the binding of low molecular weight compounds such as membrane anchors or oligosaccharides.
  • oligosaccharide modifications can be desirable, for example, to reduce the allergenicity of an expressed protein.
  • Coexpression with the enzymes naturally formed by such cells, such as cellulases, can also be advantageous.
  • thermophilic fungal expression systems can be particularly suitable for expressing temperature-resistant proteins or variants.
  • the host cells according to the invention are cultivated and fermented in the usual way, for example in discontinuous or continuous systems.
  • a suitable nutrient medium is inoculated with the host cells and the product is harvested from the medium after a period to be determined experimentally.
  • Continuous fermentations are characterized by the achievement of a steady state in which cells partially die off over a comparatively long period of time, but also grow back and at the same time the protein formed can be removed from the medium.
  • Host cells according to the invention are preferably used to produce proteases according to the invention.
  • the invention therefore also relates to a method for producing a protease
  • This subject matter of the invention preferably comprises fermentation processes. Fermentation processes are known per se from the prior art and represent the actual large-scale production step, usually followed by a suitable purification method for the product produced, for example the proteases according to the invention. All fermentation processes that are based on a corresponding process for the production of a protease according to the invention represent embodiments of this subject matter of the invention.
  • Fermentation processes which are characterized in that the fermentation is carried out using a feed strategy are particularly suitable.
  • the media components that are consumed by the continuous cultivation are fed in here. In this way, considerable increases can be achieved both in the cell density and in the cell mass or dry mass and / or in particular in the activity of the protease of interest.
  • the fermentation can also be designed in such a way that undesired metabolic products are filtered out or neutralized by adding buffer or suitable counterions.
  • the protease produced can be harvested from the fermentation medium.
  • Such a fermentation process is opposite to an isolation of the protease from the host cell, ie one Product preparation from the cell mass (dry matter) preferred, but requires the provision of suitable host cells or one or more suitable secretion markers or mechanisms and / or transport systems so that the host cells secrete the protease into the fermentation medium.
  • the protease can alternatively be isolated from the host cell, ie it can be purified from the cell mass, for example by precipitation with ammonium sulfate or ethanol, or by chromatographic purification.
  • the invention also relates to an agent which is characterized in that it contains a protease according to the invention as described above.
  • the agent is preferred as a washing or cleaning agent.
  • washing or cleaning agent both concentrates and agents to be used undiluted, for use on a commercial scale, in the washing machine or for hand washing or cleaning.
  • detergents for textiles, carpets, or natural fibers, for which the term detergent is used.
  • dishwashing detergents for dishwashers or manual dishwashing detergents or cleaners for hard surfaces such as metal, glass, porcelain, ceramics, tiles, stone, painted surfaces, plastics, wood or leather, for which the term detergent is used, i.e. in addition to manual and mechanical Dishwashing detergents, for example, also scouring agents, glass cleaners, toilet scented rinsing agents, etc.
  • the detergents and cleaning agents within the scope of the invention also include washing aids that are added to the actual washing agent during manual or machine laundry to achieve a further effect.
  • laundry detergents and cleaning agents in the context of the invention also include textile pretreatment and aftertreatment agents, i.e. those agents with which the item of laundry is brought into contact before the actual laundry, for example to loosen stubborn dirt, and also those agents that are in one of the actual Textile washing, the subsequent step, give the laundry further desirable properties such as a pleasant feel, crease resistance or low static charge.
  • the latter means include the fabric softener.
  • the detergents or cleaning agents according to the invention which can be present as pulverulent solids, in compacted particle form, as homogeneous solutions or suspensions, can contain, in addition to a protease according to the invention, all known ingredients that are customary in such agents, at least one further ingredient preferably being present in the agent .
  • the agents according to the invention can in particular contain surfactants, builders, peroxygen compounds or bleach activators. They can also be water-miscible contain organic solvents, further enzymes, sequestering agents, electrolytes, pH regulators and / or further auxiliaries such as optical brighteners, graying inhibitors, foam regulators and dyes and fragrances and combinations thereof.
  • a combination of a protease according to the invention with one or more further ingredient (s) of the agent is advantageous, since such an agent in preferred embodiments according to the invention has an improved cleaning performance due to the resulting synergisms.
  • Such a synergism can be achieved in particular through the combination of a protease according to the invention with a surfactant and / or a builder (builder) and / or a peroxygen compound and / or a bleach activator.
  • the agent according to the invention cannot contain any boric acid.
  • An agent according to the invention advantageously contains the protease in an amount of 2 pg to 20 mg, preferably 5 pg to 17.5 mg, particularly preferably 20 pg to 15 mg and very particularly preferably 50 pg to 10 mg per g of the agent.
  • the concentration of the protease (active enzyme) described herein in the agent is> 0 to 1% by weight, preferably 0.001 to 0.1% by weight, based on the total weight of the agent or the composition.
  • the protease contained in the agent and / or other ingredients of the agent can be coated with a substance which is impermeable to the enzyme at room temperature or in the absence of water and which becomes permeable to the enzyme under conditions of use of the agent.
  • Such an embodiment of the invention is thus characterized in that the protease is coated with a substance which is impermeable to the protease at room temperature or in the absence of water.
  • the washing or cleaning agent itself can be packaged in a container, preferably an air-permeable container, from which it is released shortly before use or during the washing process.
  • the agent is characterized in that it
  • (a) is in solid form, in particular as a free-flowing powder with a bulk density of 300 g / l to 1200 g / l, in particular 500 g / l to 900 g / l, or
  • (b) is present in pasty or liquid form, and / or
  • (e) is divided into several components.
  • These embodiments of the present invention include all solid, powdery, liquid, gel-like or pasty dosage forms of agents according to the invention, which can optionally also consist of several phases and can be in compressed or uncompressed form.
  • the agent can be in the form of a free-flowing powder, in particular with a bulk density of 300 g / l to 1200 g / l, in particular 500 g / l to 900 g / l or 600 g / l to 850 g / l.
  • the solid dosage forms of the agent also include extrudates, granules, tablets or pouches.
  • the agent can also be liquid, gel-like or pasty, for example in the form of a non-aqueous liquid detergent or a non-aqueous paste or in the form of an aqueous liquid detergent or a water-containing paste. Liquid funds are generally preferred.
  • the agent can be in the form of a one-component system. Such means consist of a phase. Alternatively, a remedy can also consist of several phases. Such a means is therefore divided into several components.
  • Washing or cleaning agents according to the invention can exclusively contain a protease. Alternatively, they can also contain further hydrolytic enzymes or other enzymes in an appropriate concentration for the effectiveness of the agent. A further embodiment of the invention thus represent agents which also comprise one or more further enzymes.
  • enzymes which can preferably be used are all enzymes which can develop a catalytic activity in the agent according to the invention, in particular a lipase, amylase, cellulase, hemicellulase, mannanase, tannase, xylanase, xanthanase, xyloglucanase, ⁇ -glucosidase, pectinase, carrageenase, perhydrolase, Oxidase, oxidoreductase or other proteases - distinguishable from the proteases according to the invention - and mixtures thereof.
  • each additional enzyme is in an amount of 1 x 10- 7 -3 wt .-%, of 0.00001-1 wt .-%, of from 0.00005 to 0.5 wt .-%, from 0.0001 up to 0.1% by weight and particularly preferably from 0.0001 to 0.05% by weight in agents according to the invention, based on active protein.
  • the enzymes particularly preferably show synergistic cleaning performance with respect to specific soiling or stains, ie the enzymes contained in the agent composition mutually support one another in their cleaning performance.
  • Such a synergism is particularly preferably present between the protease contained according to the invention and a further enzyme of an agent according to the invention, including in particular between said protease and an amylase and / or a lipase and / or a mannanase and / or a cellulase and / or a pectinase .
  • Synergistic effects can occur not only between different enzymes, but also between one or more enzymes and other ingredients of the agent according to the invention.
  • the enzymes to be used can also be packaged together with accompanying substances, for example from fermentation.
  • the enzymes are preferably used as liquid enzyme formulation (s).
  • the enzymes are not made available in the form of the pure protein, but rather in the form of stabilized, storable and transportable preparations.
  • These prefabricated preparations include, for example, the solid preparations obtained by granulation, extrusion or lyophilization or, in particular in the case of liquid or gel-like agents, solutions of the enzymes, advantageously as concentrated as possible, with little water and / or with stabilizers or other auxiliaries.
  • the enzymes can be encapsulated both for the solid and for the liquid dosage form, for example by spray drying or extrusion of the enzyme solution together with a preferably natural polymer or in the form of capsules, for example those in which the enzymes are enclosed as in a solidified gel or those of the core-shell type, in which an enzyme-containing core is coated with a protective layer impermeable to water, air and / or chemicals.
  • Additional active ingredients for example stabilizers, emulsifiers, pigments, bleaches or dyes, can also be applied in superimposed layers.
  • Such capsules are applied according to methods known per se, for example by pouring or rolling granulation or in fluid-bed processes. Such granules are advantageously low in dust, for example due to the application of polymeric film formers, and due to the coating are stable in storage.
  • water-soluble films such as those used, for example, in the formulation of detergents and cleaning agents in unit dose form.
  • Such a film enables the enzymes to be released after contact with water.
  • water soluble refers to a film structure that is preferably completely water soluble.
  • Such a film preferably consists of (completely or partially hydrolyzed) polyvinyl alcohol (PVA).
  • Another subject matter of the invention is a method for cleaning textiles or hard surfaces, which is characterized in that an agent according to the invention is used in at least one method step, or that a protease according to the invention becomes catalytically active in at least one method step, in particular such that the protease in an amount of 40 pg to 4 g, preferably 50 pg to 3 g, particularly preferably 100 pg to 2 g and very particularly preferably 200 pg to 1 g or the concentrations described herein.
  • the method described above is characterized in that the protease is used at a temperature of 0-100 ° C, preferably 0-60 ° C, more preferably 20-40 ° C and most preferably at 25 ° C.
  • Processes for cleaning textiles are generally characterized by the fact that various active cleaning substances are applied to the items to be cleaned in several process steps and washed off after the exposure time, or that the items to be cleaned are treated in some other way with a detergent or a solution or dilution of this agent.
  • All conceivable washing or cleaning processes can be enriched in at least one of the process steps by the use of a washing or cleaning agent according to the invention or a protease according to the invention and then represent embodiments of the present invention
  • Means are described are also applicable to this subject matter of the invention. Therefore, reference is expressly made at this point to the disclosure at the appropriate point with the note that this disclosure also applies to the above methods according to the invention.
  • proteases according to the invention already naturally have a hydrolytic activity and also develop this in media that otherwise have no cleaning power, such as, for example, in mere buffers, a single and / or the only step of such a process can consist in the fact that the only active cleaning component is a protease according to the invention is brought into contact with the soil, preferably in a buffer solution or in water. This represents a further embodiment of this subject matter of the invention.
  • Alternative embodiments of this subject matter of the invention also represent processes for treating raw textile materials or for textile care, in which a protease according to the invention becomes active in at least one process step.
  • processes for textile raw materials, fibers or textiles with natural components are preferred, and very particularly for those with wool or silk.
  • the invention also includes the use of the proteases described herein in washing or cleaning agents, for example as described above, for the (improved) removal of protein-containing soiling, for example from textiles or hard surfaces.
  • the protease is in the washing or cleaning agent before a washing or cleaning process 3 or more days, 4 or more days, 7 or more days, 10 or more days, 12 or more days, 14 or more days, 21 or more Stored for days or 28 days or more.
  • the activity of the protease is determined by the release of the chromophore para-nitroaniline from the substrate succinyl alanine-alanine-proline-phenylalanine-para-nitroanilide (AAPFpNA; Bachem L-1400).
  • AAPFpNA succinyl alanine-alanine-proline-phenylalanine-para-nitroanilide
  • the measurement was carried out at a temperature of 25 ° C., at pH 8.6 and a wavelength of 410 nm.
  • the measurement time was 5 minutes with a measurement interval of 20 to 60 seconds.

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Abstract

Die Erfindung betrifft Proteasen umfassend eine Aminosäuresequenz, die mindestens 70 % Sequenzidentität mit der in SEQ ID NO: 1 angegebenen Aminosäuresequenz über deren Gesamtlänge aufweist und jeweils bezogen auf die Nummerierung gemäß SEQ ID NO: 1 (i) an den Positionen, die den Positionen 9, 133, 144, 252 und 271 entsprechen, Aminosäuresubstitutionen aufweist, vorzugsweise ausgewählt aus den Aminosäuresubstitutionen 9T, 133A, 144K, 252T und 271E; sowie (ii) an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4, 82, 156, 162 und 218 entsprechen, mindestens eine weitere Aminosäuresubstitution aufweist; sowie deren Herstellung und Verwendung. Derartige Proteasen zeigen eine sehr gute Reinigungsleistung.

Description

„Verbesserte Reinigungsleistung gegenüber Protein-empfindlichen Anschmutzungen VI
Die Erfindung liegt auf dem Gebiet der Enzymtechnologie. Die Erfindung betrifft Proteasen aus Bacillus pumilus deren Aminosäuresequenz, insbesondere im Hinblick auf den Einsatz in Wasch- und Reinigungsmitteln verändert wurden, um ihnen eine bessere Reinigungsleistung zu verleihen, und die für sie codierende Nukleinsäuren sowie deren Herstellung. Die Erfindung betrifft ferner die Verwendungen dieser Proteasen und Verfahren, in denen sie eingesetzt werden sowie diese enthaltende Mittel, insbesondere Wasch- und Reinigungsmittel.
Proteasen gehören zu den technisch bedeutendsten Enzymen überhaupt. Für Wasch- und Reinigungsmittel sind sie die am längsten etablierten und in praktisch allen modernen, leistungsfähigen Wasch- und Reinigungsmitteln enthaltenen Enzyme. Sie bewirken den Abbau proteinhaltiger Anschmutzungen auf dem Reinigungsgut. Hierunter sind wiederum Proteasen vom Subtilisin-Typ (Subtilasen, Subtilopeptidasen, EC 3.4.21.62) besonders wichtig, welche aufgrund der katalytisch wirksamen Aminosäuren Serin-Proteasen sind. Sie wirken als unspezifische Endopeptidasen und hydrolysieren beliebige Säureamidbindungen, die im Inneren von Peptiden oder Proteinen liegen. Ihr pH-Optimum liegt meist im deutlich alkalischen Bereich. Einen Überblick über diese Familie bietet beispielsweise der Artikel „Subtilases: Subtilisin-like Proteases“ von R. Siezen, Seite 75-95 in„Subtilisin enzymes“, herausgegeben von R. Bott und C. Betzel, New York, 1996. Subtilasen werden natürlicherweise von Mikroorganismen gebildet. Hierunter sind insbesondere die von Bacillus-Spezies gebildeten und sezernierten Subtilisine als bedeutendste Gruppe innerhalb der Subtilasen zu erwähnen.
Beispiele für die in Wasch- und Reinigungsmitteln bevorzugt eingesetzten Proteasen vom Subtilisin-Typ sind die Subtilisine BPN' und Carlsberg, die Protease PB92, die Subtilisine 147 und 309, die Protease aus Bacillus lentus, insbesondere aus Bacillus lentus DSM 5483, Subtilisin DY und die den Subtilasen, nicht mehr jedoch den Subtilisinen im engeren Sinne zuzuordnenden Enzyme Thermitase, Proteinase K und die Proteasen TW3 und TW7, sowie Varianten der genannten Proteasen, die eine gegenüber der Ausgangsprotease veränderte Aminosäuresequenz aufweisen. Proteasen werden durch aus dem Stand der Technik bekannte Verfahren gezielt oder zufallsbasiert verändert und so beispielsweise für den Einsatz in Wasch- und Reinigungsmitteln optimiert. Dazu gehören Punktmutagenese, Deletions- oder Insertions- mutagenese oder Fusion mit anderen Proteinen oder Proteinteilen. So sind für die meisten aus dem Stand der Technik bekannten Proteasen entsprechend optimierte Varianten bekannt.
In der europäischen Patentanmeldung EP 2016175 A1 ist beispielsweise eine für Wasch- und Reinigungsmittel vorgesehene Protease aus Bacillus pumilus offenbart. Generell sind nur ausgewählte Proteasen für den Einsatz in flüssigen Tensid-haltigen Zubereitungen überhaupt geeignet. Viele Proteasen zeigen in derartigen Zubereitungen keine ausreichende katalytische Leistung. Für die Anwendung von Proteasen in Reinigungsmitteln ist daher eine hohe katalytische Aktivität unter Bedingungen wie sie sich während eines Waschgangs darstellen und eine hohe Lagerstabilität besonders wünschenswert.
Folglich haben Protease- und Tensid-haltige flüssige Formulierungen aus dem Stand der Technik den Nachteil, dass die enthaltenen Proteasen unter Standard-Waschbedingungen (z.B. in einem Temperaturbereich von 20°C bis 40°C) keine zufriedenstellende proteolytische Aktivität aufweisen oder nicht lagerstabil sind und die Formulierungen daher keine optimale Reinigungsleistung an Protease-sensitiven Anschmutzungen zeigen.
Überraschenderweise wurde jetzt festgestellt, dass eine Protease aus Bacillus pumilus oder eine hierzu hinreichend ähnliche Protease (bezogen auf die Sequenzidentität), die bezogen auf die Nummerierung gemäß SEQ ID NO:1 an den Positionen, die den Positionen 9, 133, 144, 252 und 271 entsprechen, die Aminosäuresubstitutionen ausgewählt aus 9T, 133A, 144K, 252T und 271 E, sowie an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4, 82, 156, 162 und 218 entsprechen, mindestens eine weitere Aminosäuresubstitution aufweist, hinsichtlich der Reinigungsleistung an Protein-empfindlichen Anschmutzungen gegenüber der Wildtypform und/oder der Referenzmutante verbessert ist und daher besonders für den Einsatz in Wasch- oder Reinigungsmitteln geeignet ist.
Gegenstand der Erfindung ist daher in einem ersten Aspekt eine Protease umfassend eine Aminosäuresequenz, die mindestens 70 % Sequenzidentität mit der in SEQ ID NO:1 angegebenen Aminosäuresequenz über deren Gesamtlänge aufweist und jeweils bezogen auf die Nummerierung gemäß SEQ ID NO:1 :
(i) an den Positionen, die den Positionen 9, 133, 144, 252 und 271 entsprechen, Aminosäuresubstitutionen aufweist, vorzugsweise ausgewählt aus den Aminosäuresubstitutionen 9T, 133A, 144K, 252T und 271 E;
sowie
(ii) an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4, 82, 156, 162 und 218 entsprechen, mindestens eine weitere Aminosäuresubstitution aufweist.
In einem zweiten Aspekt betrifft die Erfindung auch eine Protease umfassend eine Aminosäuresequenz, die mindestens 70 % Sequenzidentität mit der in SEQ ID NO:1 angegebenen Aminosäuresequenz über deren Gesamtlänge aufweist und jeweils bezogen auf die Nummerierung gemäß SEQ ID NO:1
(A) an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4 und 218 entsprechen, mindestens eine Aminosäuresubstitution aufweist, vorzugsweise ausgewählt aus 3K, 3A, 3R, 3S, 4A, 4I, 4T und 218S und/oder
(B) an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 156 und 162 entsprechen, mindestens eine Aminosäuresubstitution aufweist, ausgewählt aus 156D und 1621. Ein weiterer Gegenstand der Erfindung ist ein Verfahren zur Herstellung einer wie oben definierten Protease umfassend das Substituieren von Aminosäuren in einer Ausgangsprotease, die mindestens 70 % Sequenzidentität zu der in SEQ ID NO:1 angegebenen Aminosäuresequenz über deren Gesamtlänge aufweist (i) an den Positionen, die den Positionen 9, 133, 144, 252 und 271 in SEQ ID NO:1 entsprechen, derart, dass die Protease an den Positionen Aminosäuresubstitutionen, insbesondere die Aminosäuresubstitutionen ausgewählt aus 9T, 133A, 144K, 252T und 271 E umfasst; sowie (ii) an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4, 82, 156, 162 und 218 entsprechen, mindestens eine weitere Aminosäuresubstitution aufweist. Die mittels dieses Verfahrens erhältliche Protease weist mindestens 70% Sequenzidentität zu der in SEQ ID NO:1 angegebenen Aminosäuresequenz über deren Gesamtlänge auf.
Eine Protease im Sinne der vorliegenden Patentanmeldung umfasst daher sowohl die Protease als solche als auch eine mit einem erfindungsgemäßen Verfahren hergestellte Protease. Alle Ausführungen zur Protease beziehen sich daher sowohl auf die Protease als solche wie auch auf die mittels entsprechender Verfahren hergestellten Proteasen.
Weitere Aspekte der Erfindung betreffen die für diese Proteasen kodierenden Nukleinsäuren, erfindungsgemäße Proteasen oder Nukleinsäuren enthaltende nicht menschliche Wirtszellen sowie erfindungsgemäße Proteasen umfassende Mittel, insbesondere Wasch- und Reinigungsmittel, Wasch- und Reinigungsverfahren, und Verwendungen der erfindungsgemäßen Proteasen in Wasch- oder Reinigungsmitteln zur Entfernung von proteinhaltigen Anschmutzungen.
„Mindestens eine“, wie hierin verwendet, bedeutete eine oder mehrere, d.h. 1 , 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 1 1 , 12, 13, 14 oder mehr.
Die vorliegende Erfindung basiert auf der überraschenden Erkenntnis der Erfinder, dass Aminosäuresubstitutionen an den hierin beschriebenen Positionen eine verbesserte Reinigungsleistung dieser veränderten Protease in Wasch- und Reinigungsmitteln bewirkt.
In verschiedenen Ausführungsformen ist eine erfindungsgemäß Protease dadurch gekennzeichnet, dass sie eine Aminosäuresequenz umfasst, die mindestens 70 % Sequenzidentität mit der in SEQ ID NO:1 angegebenen Aminosäuresequenz über deren Gesamtlänge aufweist und jeweils bezogen auf die Nummerierung gemäß SEQ ID NO:1 aufweist:
(i) an den Positionen, die den Positionen 9, 133, 144, 252 und 271 entsprechen, Aminosäuresubstitutionen, vorzugsweise ausgewählt aus den Aminosäuresubstitutionen 9T, 133A, 144K, 252T und 271 E;
sowie
(ii) an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4, 82, 156, 162 und 218 entsprechen, mindestens eine weitere Aminosäuresubstitution. In verschiedenen weiteren Ausführungsformen weist eine wie hierin beschriebene Protease zusätzlich an der Position, die Position 130 entspricht, eine zusätzliche Aminosäuresubstitution auf. In verschiedenen Ausführungsformen ist diese zusätzliche Aminosäuresubstitution 130D.
In verschiedenen anderen Ausführungsformen zeichnet sich eine erfindungsgemäße Protease dadurch aus, dass sie eine Aminosäuresequenz umfasst, die mindestens 70 % Sequenzidentität mit der in SEQ ID NO:1 angegebenen Aminosäuresequenz über deren Gesamtlänge aufweist und jeweils bezogen auf die Nummerierung gemäß SEQ ID NO:1
(A) an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4 und 218 entsprechen, mindestens eine Aminosäuresubstitution aufweist, vorzugsweise ausgewählt aus 3K, 3A, 3R, 3S, 4A, 4I, 4T und 218S und/oder
(B) an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 156 und 162 entsprechen, mindestens eine Aminosäuresubstitution aufweist, ausgewählt aus 156D und 1621.
In verschiedenen Ausführungsformen weist die Protease folglich an den Positionen, die den Positionen 9, 133, 144, 252 und 271 entsprechen, Aminosäuresubstitutionen auf, vorzugsweise ausgewählt aus 9T, 133A, 144K, 252T und 271 E, und zusätzlich an den Positionen, die den Positionen 3, 4, 9, 82, 156, 162 und 218 entsprechen, mindestens eine, d.h. beispielsweise 1 , 2, 3, 4, 5 oder 6 Aminosäuresubstitution(en) auf, die ausgewählt sind aus: 3K, 3A, 3R, 3S, 4A, 4I, 4T, 9T, 82F, 156D und 1621 und 218S.
In verschiedenen anderen Ausführungsformen zeichnet sich eine erfindungsgemäße Protease dadurch aus, dass
a) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 3 entspricht, ausgewählt wird aus 3K, 3A, 3R und 3S; und/oder
b) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 4 entspricht, ausgewählt wird aus 4A, 4I und 4T; oder
c) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 82 entspricht, ausgewählt wird aus 82F; oder
d) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 156 entspricht, ausgewählt wird aus 156D; und/oder
e) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 162 entspricht, ausgewählt wird aus 1621; oder
f) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 218 entspricht, ausgewählt wird aus 218S.
In weiteren Ausführungsformen zeichnet sich eine erfindungsgemäße Protease dadurch aus, dass a) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 3 entspricht, ausgewählt wird aus 3K, 3A und 3S; und/oder b) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 4 entspricht, ausgewählt wird aus 4A, 41 und 4T; oder
c) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 3 entspricht, ausgewählt wird aus 3R.
In weiteren Ausführungsformen zeichnet sich eine erfindungsgemäße Protease dadurch aus, dass die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 3 entspricht, ausgewählt wird aus 3K und die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 4 entspricht, ausgewählt wird aus 41. In verschiedenen Ausführungsformen der Erfindung weist die erfindungsgemäße Protease an den Positionen 3 und 4 Substitutionen auf, wobei diese vorzugsweise aus den hierin genannten ausgewählt werden, vorzugsweise (i) 3K und 41, (ii) 3A und 41 oder (iii) 3A und 4A.
In verschiedenen Ausführungsformen weist die Protease an den Positionen, die den Positionen 9, 133, 144, 252 und 271 entsprechen, Aminosäuresubstitutionen, insbesondere die
Aminosäuresubstitutionen ausgewählt aus 9T, 133A, 144K, 252T und 271 E; und an einer oder mehreren der Positionen, die den Positionen 3, 4, 82, 156, 162 und 218 entsprechen, mindestens eine, beispielsweise 1 , 2, 3, 4, 5 oder 6, beispielsweise 1 , 2 oder 3 weitere Aminosäuresubstitution(en) auf, wobei diese vorzugsweise ausgewählt sind aus: 3K, 3A, 3R, 3S, 4A, 4I, 4T, 82F, 156D, 1621 und 218S. Darüber hinaus weist eine erfindungsgemäße Protease in verschiedenen weiteren Ausführungsformen zusätzlich an der Position, die Position 130 entspricht, eine zusätzliche Aminosäuresubstitution auf, wobei diese vorzugsweise 130D ist. Derartige Proteasen sind beispielsweise als Mutanten 2-10 in den Beispielen offenbart und damit Gegenstand der Erfindung.
Die erfindungsgemäßen Proteasen verfügen über eine verbesserte Reinigungsleistung. In vielfältigen Ausführungsformen können die erfindungsgemäßen Proteasen eine proteolytische Aktivität besitzen, die bezogen auf den Wildtyp (SEQ ID NO:1) mindestens 101 %, vorzugsweise mindestens 102% oder mehr. Solche leistungsverbesserten Proteasen ermöglichen verbesserte Waschergebnisse an proteolytisch-sensitiven Anschmutzungen in verschiedenen Temperaturbereichen, insbesondere einem Temperaturbereich von 20°C bis 40°C.
Die erfindungsgemäßen Proteasen können unabhängig von oder zusätzlich zur erhöhten Reinigungsleistung über eine erhöhte Lagerstabilität in Wasch- oder Reinigungsmitteln verfügen. Dies bedeutet, dass sie im Vergleich zu dem Referenzenzym (gemäß SEQ ID NO:1) sowie insbesondere auch gegenüber der Ausgangsvariante der Protease (Mutante in Beispielen), insbesondere bei einer Lagerung von 3 oder mehr Tagen, 4 oder mehr Tagen, 7 oder mehr Tagen, 10 oder mehr Tagen, 12 oder mehr Tagen, 14 oder mehr Tagen, 21 oder mehr Tagen oder 28 oder mehr Tagen über eine erhöhte Stabilität in Wasch- oder Reinigungsmitteln verfügen können. Die erfindungsgemäßen Proteasen weisen enzymatische Aktivität auf, das heißt, sie sind zur Hydrolyse von Peptiden und Proteinen befähigt, insbesondere in einem Wasch- oder Reinigungsmittel. Eine erfindungsgemäße Protease ist daher ein Enzym, welches die Hydrolyse von Amid/Peptidbindungen in Protein/Peptid-Substraten katalysiert und dadurch in der Lage ist, Proteine oder Peptide zu spalten. Ferner handelt es sich bei einer erfindungsgemäßen Protease vorzugsweise um eine reife (mature) Protease, d.h. um das katalytisch aktive Molekül ohne Signalund/oder Propeptid(e). Soweit nicht anders angegeben beziehen sich auch die angegebenen Sequenzen auf jeweils reife (prozessierte) Enzyme.
In verschiedenen Ausführungsformen der Erfindung ist die Protease ein frei vorliegendes Enzym. Dies bedeutet, dass die Protease mit allen Komponenten eines Mittels direkt agieren kann und, falls es sich bei dem Mittel um ein Flüssigmittel handelt, dass die Protease direkt mit dem Lösungsmittel des Mittels (z.B. Wasser) in Kontakt steht. In anderen Ausführungsformen kann ein Mittel Proteasen enthalten, die einen Interaktionskomplex mit anderen Molekülen bilden oder die eine„Umhüllung“ enthalten. Hierbei kann ein einzelnes oder mehrere Protease Moleküle durch eine sie umgebende Struktur von den anderen Bestandteilen des Mittels getrennt sein. Eine solche trennende Struktur kann entstehen durch, ist allerdings nicht beschränkt auf, Vesikel, wie etwa eine Micelle oder ein Liposom. Die umgebende Struktur kann aber auch ein Viruspartikel, eine bakterielle Zelle oder eine eukaryotische Zelle sein. In verschiedenen Ausführungsformen kann ein Mittel Zellen von Bacillus pumilus oder Bacillus subtilus, die die erfindungsgemäßen Proteasen exprimieren, oder Zellkulturüberstände solcher Zellen enthalten.
In verschiedenen Ausführungsformen der Erfindung umfasst die Protease eine Aminosäuresequenz, die zu der in SEQ ID NO:1 angegebenen Aminosäuresequenz über deren Gesamtlänge zu mindestens 70%, 71 %, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81 %, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 90,5%, 91 %, 91 ,5%, 92%, 92,5%, 93%, 93,5%, 94%, 94,5%, 95%, 95,5%, 96%, 96,5%, 97%, 97,5%, 98%, 98,5% und 98,8% identisch ist, und jeweils bezogen auf die Nummerierung gemäß SEQ ID NO:1 die oben angegebenen Aminosäuresubstitutionen aufweist. Im Zusammenhang mit der vorliegenden Erfindung bedeutet das Merkmal, dass eine Protease die angegebenen Substitutionen aufweist, dass sie an der jeweiligen Position eine (der angegebenen) Substitution(en) enthält, d.h. zumindest die angegebenen Positionen nicht anderweitig mutiert oder, beispielsweise durch Fragmentierung der Protease, deletiert sind.
Die Bestimmung der Identität von Nukleinsäure- oder Aminosäuresequenzen erfolgt durch einen Sequenzvergleich. Dieser Sequenzvergleich basiert auf dem im Stand der Technik etablierten und üblicherweise genutzten BLAST-Algorithmus (vgl. beispielsweise Altschul, S.F., Gish, W., Miller, W., Myers, E.W. & Lipman, D.J. (1990) "Basic local alignment search tool." J. Mol. Biol. 215:403- 410, und Altschul, Stephan F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer, Jinghui Zhang, Hheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997): "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs"; Nucleic Acids Res., 25, S.3389-3402) und geschieht prinzipiell dadurch, dass ähnliche Abfolgen von Nukleotiden oder Aminosäuren in den Nukleinsäure- oder Aminosäuresequenzen einander zugeordnet werden. Eine tabellarische Zuordnung der betreffenden Positionen wird als Alignment bezeichnet. Ein weiterer im Stand der Technik verfügbarer Algorithmus ist der FASTA-Algorithmus. Sequenzvergleiche (Alignments), insbesondere multiple Sequenzvergleiche, werden mit Computerprogrammen erstellt. Häufig genutzt werden beispielsweise die Clustal-Serie (vgl. beispielsweise Chenna et al. (2003): Multiple sequence alignment with the Clustal series of programs. Nucleic Acid Research 31 , 3497-3500), T- Coffee (vgl. beispielsweise Notredame et al. (2000): T-Coffee: A novel method for multiple sequence alignments. J. Mol. Biol. 302, 205-217) oder Programme, die auf diesen Programmen beziehungsweise Algorithmen basieren. Ferner möglich sind Sequenzvergleiche (Alignments) mit dem Computer-Programm Vector NTI® Suite 10.3 (Invitrogen Corporation, 1600 Faraday Avenue, Carlsbad, Kalifornien, USA) mit den vorgegebenen Standardparametern, dessen AlignX-Modul für die Sequenzvergleiche auf ClustalW basiert. Soweit nicht anders angegeben, wird die hierin angegebene Sequenzidentität mit dem BLAST-Algorithmus bestimmt.
Solch ein Vergleich erlaubt auch eine Aussage über die Ähnlichkeit der verglichenen Sequenzen zueinander. Sie wird üblicherweise in Prozent Identität, das heißt dem Anteil der identischen Nukleotide oder Aminosäurereste an denselben oder in einem Alignment einander entsprechenden Positionen angegeben. Der weiter gefasste Begriff der Homologie bezieht bei Aminosäuresequenzen konservierte Aminosäure-Austausche in die Betrachtung mit ein, also Aminosäuren mit ähnlicher chemischer Aktivität, da diese innerhalb des Proteins meist ähnliche chemische Aktivitäten ausüben. Daher kann die Ähnlichkeit der verglichenen Sequenzen auch Prozent Homologie oder Prozent Ähnlichkeit angegeben sein. Identitäts- und/oder Homologieangaben können über ganze Polypeptide oder Gene oder nur über einzelne Bereiche getroffen werden. Homologe oder identische Bereiche von verschiedenen Nukleinsäure- oder Aminosäuresequenzen sind daher durch Übereinstimmungen in den Sequenzen definiert. Solche Bereiche weisen oftmals identische Funktionen auf. Sie können klein sein und nur wenige Nukleotide oder Aminosäuren umfassen. Oftmals üben solche kleinen Bereiche für die Gesamtaktivität des Proteins essentielle Funktionen aus. Es kann daher sinnvoll sein, Sequenzübereinstimmungen nur auf einzelne, gegebenenfalls kleine Bereiche zu beziehen. Soweit nicht anders angegeben beziehen sich Identitäts- oder Homologieangaben in der vorliegenden Anmeldung aber auf die Gesamtlänge der jeweils angegebenen Nukleinsäure- oder Aminosäuresäuresequenz.
Im Zusammenhang mit der vorliegenden Erfindung bedeutet die Angabe, dass eine Aminosäureposition einer numerisch bezeichneten Position in SEQ ID NO:1 entspricht daher, dass die entsprechende Position der numerisch bezeichneten Position in SEQ ID NO:1 in einem wie oben definierten Alignment zugeordnet ist. ln einer weiteren Ausführungsform der Erfindung ist die Protease dadurch gekennzeichnet, dass ihre Reinigungsleistung (nach Lagerung, z.B. über 4 Wochen) gegenüber derjenigen einer Protease, welche als Mutante 1 in den Beispielen der vorliegenden Erfindung gekennzeichnet ist und die entsprechend gekennzeichneten Aminosäuresubstitutionen aufweist, nicht signifikant verringert ist, d.h. mindestens 80 % der Referenzwaschleistung besitzt, vorzugsweise mindestens 100 %, noch bevorzugter mindestens 110 % oder mehr. Die Reinigungsleistung kann in einem Waschsystem bestimmt werden, das ein Waschmittel in einer Dosierung zwischen 4,5 und 7,0 Gramm pro Liter Waschflotte sowie die Protease enthält, wobei die zu vergleichenden Proteasen konzentrationsgleich (bezogen auf aktives Protein) eingesetzt sind und die Reinigungsleistung gegenüber einer Anschmutzung auf Baumwolle bestimmt wird durch Messung des Reinigungsgrades der gewaschenen Textilien. Beispielsweise kann der Waschvorgang für 60 Minuten bei einer Temperatur von 40°C erfolgen und das Wasser eine Wasserhärte zwischen 15,5 und 16,5° (deutsche Härte) aufweisen. Die Konzentration der Protease in dem für dieses Waschsystem bestimmten Waschmittel beträgt 0,001-0,1 Gew.-%, vorzugsweise 0,01 bis 0,06 Gew.-%, bezogen auf aktives, gereinigtes Protein.
Ein flüssiges Referenzwaschmittel für ein solches Waschsystem kann wie folgt zusammengesetzt sein (alle Angaben in Gewichts-Prozent): 4,4% Alkylbenzolsulfonsäure, 5,6% weitere anionische Tenside, 2,4% C12-C18 Na-Salze von Fettsäuren (Seifen), 4,4% nicht-ionische Tenside, 0,2% Phosphonate, 1 ,4% Zitronensäure, 0,95% NaOH, 0,01 % Entschäumer, 2% Glycerin, 0,08% Konservierungsstoffe, 1 % Ethanol, Rest demineralisiertes Wasser. Bevorzugt beträgt die Dosierung des flüssigen Waschmittels zwischen 4,5 und 6,0 Gramm pro Liter Waschflotte, beispielsweise 4,7, 4,9 oder 5,9 Gramm pro Liter Waschflotte. Bevorzugt wird gewaschen in einem pH-Wertebereich zwischen pH 7 und pH 10,5, bevorzugt zwischen pH 7,5 und pH 8,5.
Im Rahmen der Erfindung erfolgt die Bestimmung der Reinigungsleistung beispielsweise bei 20°C oder 40°C unter Verwendung eines flüssigen Waschmittels wie vorstehend angegeben, wobei der Waschvorgang vorzugsweise für 60 Minuten bei 600 rpm erfolgt.
Der Weißegrad, d.h. die Aufhellung der Anschmutzungen, als Maß für die Reinigungsleistung wird mit optischen Messverfahren bestimmt, bevorzugt photometrisch. Ein hierfür geeignetes Gerät ist beispielsweise das Spektrometer Minolta CM508d. Üblicherweise werden die für die Messung eingesetzten Geräte zuvor mit einem Weißstandard, bevorzugt einem mitgelieferten Weißstandard, kalibriert.
Durch den aktivitätsgleichen Einsatz der jeweiligen Protease wird sichergestellt, dass auch bei einem etwaigen Auseinanderklaffen des Verhältnisses von Aktivsubstanz zu Gesamtprotein (die Werte der spezifischen Aktivität) die jeweiligen enzymatischen Eigenschaften, also beispielsweise die Reinigungsleistung an bestimmten Anschmutzungen, verglichen werden. Generell gilt, dass eine niedrige spezifische Aktivität durch Zugabe einer größeren Proteinmenge ausgeglichen werden kann.
Ansonsten sind Verfahren zur Bestimmung der Proteaseaktivität dem Fachmann auf dem Gebiet der Enzymtechnologie geläufig und werden von ihm routinemäßig angewendet. Beispielsweise sind solche Verfahren offenbart in Tenside, Band 7 (1970), S. 125-132. Alternativ kann die Protease-Aktivität über die Freisetzung des Chromophors para-Nitroanilin (pNA) aus dem Substrat suc-L-Ala-L-Ala-L-Pro-L-Phe-p-Nitroanilid (AAPF) bestimmt werden. Die Protease spaltet das Substrat und setzt pNA frei. Die Freisetzung des pNA verursacht eine Zunahme der Extinktion bei 410 nm, deren zeitlicher Verlauf ein Maß für die enzymatische Aktivität ist (vgl. Del Mar et al., 1979). Die Messung erfolgt bei einer Temperatur von 25°C, bei pH 8,6, und einer Wellenlänge von 410 nm. Die Messzeit beträgt 5 min und das Messintervall 20s bis 60s. Die Proteaseaktivität wird üblicherweise in Protease-Einheiten (PE) angegeben. Geeignete Proteaseaktivitäten betragen beispielsweise 2,25, 5 oder 10 PE pro ml Waschflotte. Die Proteaseaktivität ist jedoch nicht gleich Null.
Ein alternativer Test zur Feststellung der proteolytischen Aktivität der erfindungsgemäßen Proteasen ist ein optisches Messverfahren, bevorzugt ein photometrisches Verfahren. Der hierfür geeignete Test umfasst die Protease-abhängige Spaltung des Substratproteins Casein. Dieses wird durch die Protease in eine Vielzahl kleinerer Teilprodukte gespalten. Die Gesamtheit dieser Teilprodukte weist eine erhöhte Absorption bei 290 nm gegenüber nicht gespaltenem Casein auf, wobei diese erhöhte Absorption unter Verwendung eines Photometers ermittelt werden und somit ein Rückschluss auf die enzymatische Aktivität der Protease gezogen werden kann.
Die Proteinkonzentration kann mit Hilfe bekannter Methoden, zum Beispiel dem BCA-Verfahren (Bicinchoninsäure; 2,2‘-Bichinolyl-4,4‘-dicarbonsäure) oder dem Biuret-Verfahren (A. G. Gornall, C. S. Bardawill und M.M. David, J. Biol. Chem., 177 (1948), S. 751-766) bestimmt werden. Die Bestimmung der Aktivproteinkonzentration kann diesbezüglich über eine Titration der aktiven Zentren unter Verwendung eines geeigneten irreversiblen Inhibitors und Bestimmung der Restaktivität (vgl. M. Bender et al., J. Am. Chem. Soc. 88, 24 (1966), S. 5890-5913) erfolgen.
Zusätzlich zu den vorstehend erläuterten Aminosäureveränderungen können erfindungsgemäße Proteasen weitere Aminosäureveränderungen, insbesondere Aminosäure-Substitutionen, -Insertionen oder -Deletionen, aufweisen. Solche Proteasen sind beispielsweise durch gezielte genetische Veränderung, d.h. durch Mutageneseverfahren, weiterentwickelt und für bestimmte Einsatzzwecke oder hinsichtlich spezieller Eigenschaften (beispielsweise hinsichtlich ihrer katalytischen Aktivität, Stabilität, usw.) optimiert. Ferner können erfindungsgemäße Nukleinsäuren in Rekombinationsansätze eingebracht und damit zur Erzeugung völlig neuartiger Proteasen oder anderer Polypeptide genutzt werden. Das Ziel ist es, in die bekannten Moleküle gezielte Mutationen wie Substitutionen, Insertionen oder Deletionen einzuführen, um beispielsweise die Reinigungsleistung von erfindungsgemäßen Enzymen zu verbessern. Hierzu können insbesondere die Oberflächenladungen und/oder der isoelektrische Punkt der Moleküle und dadurch ihre Wechselwirkungen mit dem Substrat verändert werden. So kann beispielsweise die Nettoladung der Enzyme verändert werden, um darüber die Substratbindung insbesondere für den Einsatz in Wasch- und Reinigungsmitteln zu beeinflussen. Alternativ oder ergänzend kann durch eine oder mehrere entsprechende Mutationen die Stabilität oder katalytische Aktivität der Protease erhöht und dadurch ihre Reinigungsleistung verbessert werden. Vorteilhafte Eigenschaften einzelner Mutationen, z.B. einzelner Substitutionen, können sich ergänzen. Eine hinsichtlich bestimmter Eigenschaften bereits optimierter Proteasen, zum Beispiel hinsichtlich ihrer Stabilität bei Lagerung, kann daher im Rahmen der Erfindung zusätzlich weiterentwickelt sein.
Für die Beschreibung von Substitutionen, die genau eine Aminosäureposition betreffen (Aminosäureaustausche), wird hierin folgende Konvention angewendet: zunächst wird die natürlicherweise vorhandene Aminosäure in Form des international gebräuchlichen Einbuchstaben-Codes bezeichnet, dann folgt die zugehörige Sequenzposition und schließlich die eingefügte Aminosäure. Mehrere Austausche innerhalb derselben Polypeptidkette werden durch Schrägstriche voneinander getrennt. Bei Insertionen sind nach der Sequenzposition zusätzliche Aminosäuren benannt. Bei Deletionen ist die fehlende Aminosäure durch ein Symbol, beispielsweise einen Stern oder einen Strich, ersetzt oder vor der entsprechenden Position ein D angegeben. Beispielsweise beschreibt P9T die Substitution von Prolin an Position 9 durch Threonin, P9TH die Insertion von Histidin nach der Aminosäure Threonin an Position 9 und P9* oder DR9 die Deletion von Prolin an Position 9. Diese Nomenklatur ist dem Fachmann auf dem Gebiet der Enzymtechnologie bekannt.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung ist daher eine Protease, die dadurch gekennzeichnet ist, dass sie aus einer Protease wie vorstehend beschrieben als Ausgangsmolekül erhältlich ist durch ein- oder mehrfache konservative Aminosäuresubstitution, wobei die Protease in der Zählung gemäß SEQ ID NO:1 die vorstehend beschriebenen Aminosäuresubstitutionen aufweist. Der Begriff "konservative Aminosäuresubstitution" bedeutet den Austausch (Substitution) eines Aminosäurerestes gegen einen anderen Aminosäurerest, wobei dieser Austausch nicht zu einer Änderung der Polarität oder Ladung an der Position der ausgetauschten Aminosäure führt, z. B. der Austausch eines unpolaren Aminosäurerestes gegen einen anderen unpolaren Aminosäurerest. Konservative Aminosäuresubstitutionen im Rahmen der Erfindung umfassen beispielsweise: G=A=S, l=V=L=M, D=E, N=Q, K=R, Y=F, S=T, G=A=I=V=L=M=Y=F=W=P=S=T.
Alternativ oder ergänzend ist die Protease dadurch gekennzeichnet, dass sie aus einer erfindungsgemäßen Protease als Ausgangsmolekül erhältlich ist durch Fragmentierung, Deletions-, Insertions- oder Substitutionsmutagenese und eine Aminosäuresequenz umfasst, die über eine Länge von mindestens 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 261 , 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271 , 272, 273 oder 274 zusammenhängenden Aminosäuren mit dem Ausgangsmolekül übereinstimmt, wobei die oben beschriebenen Aminosäuresubstitutionen, d.h. die Substitutionen 9T, 133A, 144K, 252T und 271 E bzw. die Substitutionen an den Positionen, die den Positionen 3, 4, 82, 156, 162 und/oder 218 sowie optional 130 entsprechen, noch vorhanden sind. D.h. wenn die hierin beschriebenen Proteasen modifiziert werden, erfolgt die Modifizierung derart, dass die erfindungsgemäßen Substitutionen erhalten bleiben.
So ist es beispielsweise möglich, an den Termini oder in den Loops des Enzyms einzelne Aminosäuren zu deletieren, ohne dass dadurch die proteolytische Aktivität verloren oder vermindert wird. Ferner kann durch derartige Fragmentierung, Deletions-, Insertions- oder Substitutionsmutagenese beispielsweise auch die Allergenizität betreffender Enzyme gesenkt und somit insgesamt ihre Einsetzbarkeit verbessert werden. Vorteilhafterweise behalten die Enzyme auch nach der Mutagenese ihre proteolytische Aktivität, d.h. ihre proteolytische Aktivität entspricht mindestens derjenigen des Ausgangsenzyms, d.h. in einer bevorzugten Ausführungsform beträgt die proteolytische Aktivität mindestens 80, vorzugsweise mindestens 90 % der Aktivität des Ausgangsenzyms. Auch weitere Substitutionen können vorteilhafte Wirkungen zeigen. Sowohl einzelne wie auch mehrere zusammenhängende Aminosäuren können gegen andere Aminosäuren ausgetauscht werden.
Die weiteren Aminosäurepositionen werden hierbei durch ein Alignment der Aminosäuresequenz einer erfindungsgemäßen Protease mit der Aminosäuresequenz der Protease aus Bacillus pumilus, wie sie in SEQ ID NO:1 angegeben ist, definiert. Weiterhin richtet sich die Zuordnung der Positionen nach dem reifen (maturen) Protein. Diese Zuordnung ist insbesondere auch anzuwenden, wenn die Aminosäuresequenz einer erfindungsgemäßen Protease eine höhere Zahl von Aminosäurenresten umfasst als die Protease aus Bacillus pumilus gemäß SEQ ID NO:1 . Ausgehend von den genannten Positionen in der Aminosäuresequenz der Protease aus Bacillus pumilus sind die Veränderungspositionen in einer erfindungsgemäßen Protease diejenigen, die eben diesen Positionen in einem Alignment zugeordnet sind.
Vorteilhafte Positionen für Sequenzveränderungen, insbesondere Substitutionen, der Protease aus Bacillus pumilus, die übertragen auf homologe Positionen der erfindungsgemäßen Proteasen bevorzugt von Bedeutung sind und der Protease vorteilhafte funktionelle Eigenschaften verleihen, sind demnach die Positionen, die in einem Alignment den hierin beschriebenen Positionen entsprechen, d.h. in der Zählung gemäß SEQ ID NO:1 . An den genannten Positionen liegen in dem Wildtypmolekül der Protease aus Bacillus pumilus folgende Aminosäurereste: T3, V4, P9, L82, N130, T133, N144, S156, T162, T218, N252 und Q271 .
Eine weitere Bestätigung der korrekten Zuordnung der zu verändernden Aminosäuren, d.h. insbesondere deren funktionelle Entsprechung, können Vergleichsversuche liefern, wonach die beiden auf der Basis eines Alignments einander zugeordneten Positionen in beiden miteinander verglichenen Proteasen auf die gleiche Weise verändert werden und beobachtet wird, ob bei beiden die enzymatische Aktivität auf gleiche Weise verändert wird. Geht beispielsweise ein Aminosäureaustausch in einer bestimmten Position der Protease aus Bacillus pumilus gemäß SEQ ID NO:1 mit einer Veränderung eines enzymatischen Parameters einher, beispielsweise mit der Erhöhung des KM-Wertes, und wird eine entsprechende Veränderung des enzymatischen Parameters, beispielsweise also ebenfalls eine Erhöhung des KM-Wertes, in einer erfindungsgemäßen Protease-Variante beobachtet, deren Aminosäureaustausch durch dieselbe eingeführte Aminosäure erreicht wurde, so ist hierin eine Bestätigung der korrekten Zuordnung zu sehen.
Alle genannten Sachverhalte sind auch auf die erfindungsgemäßen Verfahren zur Herstellung einer Protease anwendbar. Demnach umfasst ein erfindungsgemäßes Verfahren ferner einen oder mehrere der folgenden Verfahrensschritte: a) Einbringen einer ein- oder mehrfachen konservativen Aminosäuresubstitution in die Protease, wobei die Protease an den Positionen, die den Positionen 9, 133, 144, 252 und 271 entsprechen, Aminosäuresubstitutionen, vorzugsweise die Aminosäuresubstitutionen ausgewählt aus 9T, 133A, 144K, 252T und 271 E; sowie an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4, 82, 156, 162 und 218 entsprechen, mindestens eine weitere Aminosäuresubstitution aufweist, umfasst; b) Veränderung der Aminosäuresequenz durch Fragmentierung, Deletions-, Insertions- oder Substitutionsmutagenese derart, dass die Protease eine Aminosäuresequenz umfasst, die über eine Länge von mindestens 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 261 , 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271 , 272, 273 oder 274 zusammenhängenden Aminosäuren mit dem Ausgangsmolekül übereinstimmt, wobei die Protease die Substitutionen 9T, 133A, 144K, 252T und 271 E an den Positionen, die den Positionen 9, 133, 144, 252 und 271 entsprechen; sowie mindestens eine weitere Aminosäuresubstitution an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4, 82, 156, 162 und 218 entsprechen, umfasst.
Sämtliche Ausführungsformen gelten auch für die erfindungsgemäßen Verfahren.
In weiteren Ausgestaltungen der Erfindung ist die Protease beziehungsweise die mit einem erfindungsgemäßen Verfahren hergestellte Protease noch mindestens zu 70%, 71 %, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81 %, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 90,5%, 91 %, 91 ,5%, 92%, 92,5%, 93%, 93,5%, 94%, 94,5%, 95%, 95,5%, 96%, 96,5%, 97%, 97,5%, 98%, 98,5%, oder 98,8% identisch zu der in SEQ ID NO:1 angegebenen Aminosäuresequenz über deren Gesamtlänge. Die Protease beziehungsweise die mit einem erfindungsgemäßen Verfahren hergestellte Protease weist die Aminosäuresubstitutionen ausgewählt aus 9T, 133A, 144K, 252T und 271 E an den Positionen, die den Positionen 9, 133, 144, 252 und 271 entsprechen; sowie mindestens eine Aminosäuresubstitution an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4, 82, 156, 162 und 218 entsprechen, jeweils bezogen auf die Nummerierung gemäß SEQ ID NO:1 , auf.
In verschiedenen Ausführungsformen betrifft die Erfindung Proteasen gemäß SEQ ID NO:1 mit den folgenden Aminosäuresubstitutionsvarianten:
P9T, T133A, N144K, N252T und Q271 E kombiniert mit
(i) N130D und T218S;
(ii) N130D und L82F;
(iii) N130D, S156D und T162I;
(iv) N130D, T3K und V4I;
(v) N130D, T3A und V4A;
(vi) N130D, T3A und V4I;
(vii) N130D und T3R;
(viii) N130D und V4A;
(ix) N130D, T3S und V4T,
wobei die Nummerierung jeweils bezogen ist auf die Nummerierung gemäß SEQ ID NO:1. Weitere Beispiele sind die in den Beispielen beschriebenen Varianten.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung ist eine zuvor beschriebene Protease, die zusätzlich stabilisiert ist, insbesondere durch eine oder mehrere Mutationen, beispielsweise Substitutionen, oder durch Kopplung an ein Polymer. Eine Erhöhung der Stabilität bei der Lagerung und/oder während des Einsatzes, beispielsweise beim Waschprozess, führt dazu, dass die enzymatische Aktivität länger anhält und damit die Reinigungsleistung verbessert wird. Grundsätzlich kommen alle im Stand der Technik beschriebenen und/oder zweckmäßigen Stabilisierungsmöglichkeiten in Betracht. Bevorzugt sind solche Stabilisierungen, die über Mutationen des Enzyms selbst erreicht werden, da solche Stabilisierungen im Anschluss an die Gewinnung des Enzyms keine weiteren Arbeitsschritte erfordern. Beispiele für hierfür geeignete Sequenzveränderungen sind vorstehend genannt. Weitere geeignete Sequenzveränderungen sind aus dem Stand der Technik bekannt.
Weitere Möglichkeiten der Stabilisierung sind beispielsweise:
Veränderung der Bindung von Metallionen, insbesondere der Calcium-Bindungsstellen, beispielsweise durch Austauschen von einer oder mehreren der an der Calcium-Bindung beteiligten Aminosäure(n) gegen eine oder mehrere negativ geladene Aminosäuren und/oder durch Einführen von Sequenzveränderungen in mindestens einer der Folgen der beiden Aminosäuren Arginin/Glycin;
Schutz gegen den Einfluss von denaturierenden Agentien wie Tensiden durch Mutationen, die eine Veränderung der Aminosäuresequenz auf oder an der Oberfläche des Proteins bewirken; Austausch von Aminosäuren, die nahe dem N-Terminus liegen, gegen solche, die vermutlich über nicht-kovalente Wechselwirkungen mit dem Rest des Moleküls in Kontakt treten und somit einen Beitrag zur Aufrechterhaltung der globulären Struktur leisten.
Bevorzugte Ausführungsformen sind solche, bei denen das Enzym auf mehrere Arten stabilisiert wird, da mehrere stabilisierende Mutationen additiv oder synergistisch wirken.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung ist eine Protease wie vorstehend beschrieben, die dadurch gekennzeichnet ist, dass sie mindestens eine chemische Modifikation aufweist. Eine Protease mit einer solchen Veränderung wird als Derivat bezeichnet, d.h. die Protease ist derivatisiert.
Unter Derivaten werden im Sinne der vorliegenden Anmeldung demnach solche Proteine verstanden, deren reine Aminosäurekette chemisch modifiziert worden ist. Solche Derivatisierungen können beispielsweise in vivo durch die Wirtszelle erfolgen, die das Protein exprimiert. Diesbezüglich sind Kopplungen niedrigmolekularer Verbindungen wie von Lipiden oder Oligosacchariden besonders hervorzuheben. Derivatisierungen können aber auch in vitro durchgeführt werden, etwa durch die chemische Umwandlung einer Seitenkette einer Aminosäure oder durch kovalente Bindung einer anderen Verbindung an das Protein. Beispielsweise ist die Kopplung von Aminen an Carboxylgruppen eines Enzyms zur Veränderung des isoelektrischen Punkts möglich. Eine solche andere Verbindung kann auch ein weiteres Protein sein, das beispielsweise über bifunktionelle chemische Verbindungen an ein erfindungsgemäßes Protein gebunden wird. Ebenso ist unter Derivatisierung die kovalente Bindung an einen makromolekularen Träger zu verstehen, oder auch ein nichtkovalenter Einschluss in geeignete makromolekulare Käfigstrukturen. Derivatisierungen können beispielsweise die Substratspezifität oder die Bindungsstärke an das Substrat beeinflussen oder eine vorübergehende Blockierung der enzymatischen Aktivität herbeiführen, wenn es sich bei der angekoppelten Substanz um einen Inhibitor handelt. Dies kann beispielsweise für den Zeitraum der Lagerung sinnvoll sein. Derartige Modifikationen können ferner die Stabilität oder die enzymatische Aktivität beeinflussen. Sie können ferner auch dazu dienen, die Allergen izität und/oder Immunogenizität des Proteins herabzusetzen und damit beispielsweise dessen Hautverträglichkeit zu erhöhen. Beispielsweise können Kopplungen mit makromolekularen Verbindungen, beispielsweise Polyethylenglykol, das Protein hinsichtlich der Stabilität und/oder Hautverträglichkeit verbessern.
Unter Derivaten eines erfindungsgemäßen Proteins können im weitesten Sinne auch Präparationen dieser Proteine verstanden werden. Je nach Gewinnung, Aufarbeitung oder Präparation kann ein Protein mit diversen anderen Stoffen kombiniert sein, beispielsweise aus der Kultur der produzierenden Mikroorganismen. Ein Protein kann auch, beispielsweise zur Erhöhung seiner Lagerstabilität, mit anderen Stoffen gezielt versetzt worden sein. Erfindungsgemäß sind deshalb auch alle Präparationen eines erfindungsgemäßen Proteins. Das ist auch unabhängig davon, ob es in einer bestimmten Präparation tatsächlich diese enzymatische Aktivität entfaltet oder nicht. Denn es kann gewünscht sein, dass es bei der Lagerung keine oder nur geringe Aktivität besitzt, und erst zum Zeitpunkt der Verwendung seine enzymatische Funktion entfaltet. Dies kann beispielsweise über entsprechende Begleitstoffe gesteuert werden. Insbesondere die gemeinsame Präparation von Proteasen mit spezifischen Inhibitoren ist diesbezüglich möglich.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung ist eine Nukleinsäure, die für eine erfindungsgemäße Protease codiert, sowie ein Vektor enthaltend eine solche Nukleinsäure, insbesondere ein Klonierungsvektor oder ein Expressionsvektor.
Hierbei kann es sich um DNA- oder RNA-Moleküle handeln. Sie können als Einzelstrang, als ein zu diesem Einzelstrang komplementärer Einzelstrang oder als Doppelstrang vorliegen. Insbesondere bei DNA-Molekülen sind die Sequenzen beider komplementärer Stränge in jeweils allen drei möglichen Leserastern zu berücksichtigen. Ferner ist zu berücksichtigen, dass verschiedene Codons, also Basentriplets, für die gleichen Aminosäuren codieren können, so dass eine bestimmte Aminosäuresequenz von mehreren unterschiedlichen Nukleinsäuren codiert werden kann. Auf Grund dieser Degeneriertheit des genetischen Codes sind sämtliche Nukleinsäuresequenzen in diesem Erfindungsgegenstand eingeschlossen, die eine der vorstehend beschriebenen Proteasen codieren können. Der Fachmann ist in der Lage, diese Nukleinsäuresequenzen zweifelsfrei zu bestimmen, da trotz der Degeneriertheit des genetischen Codes einzelnen Codons definierte Aminosäuren zuzuordnen sind. Daher kann der Fachmann ausgehend von einer Aminosäuresequenz für diese Aminosäuresequenz codierende Nukleinsäuren problemlos ermitteln. Weiterhin können bei erfindungsgemäßen Nukleinsäuren ein oder mehrere Codons durch synonyme Codons ersetzt sein. Dieser Aspekt bezieht sich insbesondere auf die heterologe Expression der erfindungsgemäßen Enzyme. So besitzt jeder Organismus, beispielsweise eine Wirtszelle eines Produktionsstammes, eine bestimmte Codon-Verwendung. Unter Codon-Verwendung wird die Übersetzung des genetischen Codes in Aminosäuren durch den jeweiligen Organismus verstanden. Es kann zu Engpässen in der Proteinbiosynthese kommen, wenn die auf der Nukleinsäure liegenden Codons in dem Organismus einer vergleichsweise geringen Zahl von beladenen tRNA-Molekülen gegenüberstehen. Obwohl für die gleiche Aminosäure codierend führt das dazu, dass in dem Organismus ein Codon weniger effizient translatiert wird als ein synonymes Codon, das für dieselbe Aminosäure codiert. Auf Grund des Vorliegens einer höheren Anzahl von tRNA-Molekülen für das synonyme Codon kann dieses in dem Organismus effizienter translatiert werden.
Einem Fachmann ist es über heutzutage allgemein bekannte Methoden, wie beispielsweise die chemische Synthese oder die Polymerase-Kettenreaktion (PCR) in Verbindung mit molekularbiologischen und/oder proteinchemischen Standardmethoden möglich, anhand bekannter DNA- und/oder Aminosäuresequenzen die entsprechenden Nukleinsäuren bis hin zu vollständigen Genen herzustellen. Derartige Methoden sind beispielsweise aus Sambrook, J., Fritsch, E.F. and Maniatis, T. 2001 . Molecular cloning: a laboratory manual, 3. Edition Cold Spring Laboratory Press bekannt.
Unter Vektoren werden im Sinne der vorliegenden Erfindung aus Nukleinsäuren bestehende Elemente verstanden, die als kennzeichnenden Nukleinsäurebereich eine erfindungsgemäße Nukleinsäure enthalten. Sie vermögen diese in einer Spezies oder einer Zellinie über mehrere Generationen oder Zellteilungen hinweg als stabiles genetisches Element zu etablieren. Vektoren sind insbesondere bei der Verwendung in Bakterien spezielle Plasmide, also zirkulare genetische Elemente. Im Rahmen der vorliegenden Erfindung wird eine erfindungsgemäße Nukleinsäure in einen Vektor kloniert. Zu den Vektoren zählen beispielsweise solche, deren Ursprung bakterielle Plasmide, Viren oder Bacteriophagen sind, oder überwiegend synthetische Vektoren oder Plasmide mit Elementen verschiedenster Herkunft. Mit den weiteren jeweils vorhandenen genetischen Elementen vermögen Vektoren sich in den betreffenden Wirtszellen über mehrere Generationen hinweg als stabile Einheiten zu etablieren. Sie können extrachromosomal als eigene Einheiten vorliegen oder in ein Chromosom oder chromosomale DNA integrieren.
Expressionsvektoren umfassen Nukleinsäuresequenzen, die sie dazu befähigen, in den sie enthaltenden Wirtszellen, vorzugsweise Mikroorganismen, besonders bevorzugt Bakterien, zu replizieren und dort eine enthaltene Nukleinsäure zur Expression zu bringen. Die Expression wird insbesondere von dem oder den Promotoren beeinflusst, welche die Transkription regulieren. Prinzipiell kann die Expression durch den natürlichen, ursprünglich vor der zu exprimierenden Nukleinsäure lokalisierten Promotor erfolgen, aber auch durch einen auf dem Expressionsvektor bereitgestellten Promotor der Wirtszelle oder auch durch einen modifizierten oder einen völlig anderen Promotor eines anderen Organismus oder einer anderen Wirtszelle. Im vorliegenden Fall wird zumindest ein Promotor für die Expression einer erfindungsgemäßen Nukleinsäure zur Verfügung gestellt und für deren Expression genutzt. Expressionsvektoren können ferner regulierbar sein, beispielsweise durch Änderung der Kultivierungsbedingungen oder bei Erreichen einer bestimmten Zelldichte der sie enthaltenen Wirtszellen oder durch Zugabe von bestimmten Substanzen, insbesondere Aktivatoren der Genexpression. Ein Beispiel für eine solche Substanz ist das Galactose-Derivat Isopropyl-ß-D-thiogalactopyranosid (IPTG), welches als Aktivator des bakteriellen Lactose-Operons (lac-Operons) verwendet wird. Im Gegensatz zu Expressionsvektoren wird die enthaltene Nukleinsäure in Klonierungsvektoren nicht exprimiert.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung ist eine nicht menschliche Wirtszelle, die eine erfindungsgemäße Nukleinsäure oder einen erfindungsgemäßen Vektor beinhaltet, oder die eine erfindungsgemäße Protease beinhaltet, insbesondere eine, die die Protease in das die Wirtszelle umgebende Medium sezerniert. Bevorzugt wird eine erfindungsgemäße Nukleinsäure oder ein erfindungsgemäßer Vektor in einen Mikroorganismus transformiert, der dann eine erfindungsgemäße Wirtszelle darstellt. Alternativ können auch einzelne Komponenten, d.h. Nukleinsäure-Teile oder -Fragmente einer erfindungsgemäßen Nukleinsäure derart in eine Wirtszelle eingebracht werden, dass die dann resultierende Wirtszelle eine erfindungsgemäße Nukleinsäure oder einen erfindungsgemäßen Vektor enthält. Dieses Vorgehen eignet sich besonders dann, wenn die Wirtszelle bereits einen oder mehrere Bestandteile einer erfindungsgemäßen Nukleinsäure oder eines erfindungsgemäßen Vektors enthält und die weiteren Bestandteile dann entsprechend ergänzt werden. Verfahren zur Transformation von Zellen sind im Stand der Technik etabliert und dem Fachmann hinlänglich bekannt. Als Wirtszellen eignen sich prinzipiell alle Zellen, das heißt prokaryotische oder eukaryotische Zellen. Bevorzugt sind solche Wirtszellen, die sich genetisch vorteilhaft handhaben lassen, was beispielsweise die Transformation mit der Nukleinsäure oder dem Vektor und dessen stabile Etablierung angeht, beispielsweise einzellige Pilze oder Bakterien. Ferner zeichnen sich bevorzugte Wirtszellen durch eine gute mikrobiologische und biotechnologische Handhabbarkeit aus. Das betrifft beispielsweise leichte Kultivierbarkeit, hohe Wachstumsraten, geringe Anforderungen an Fermentationsmedien und gute Produktions- und Sekretionsraten für Fremdproteine. Bevorzugte erfindungsgemäße Wirtszellen sezernieren das (transgen) exprimierte Protein in das die Wirtszellen umgebende Medium. Ferner können die Proteasen von den sie produzierenden Zellen nach deren Herstellung modifiziert werden, beispielsweise durch Anknüpfung von Zuckermolekülen, Formylierungen, Aminierungen, usw. Solche posttranslationale Modifikationen können die Protease funktionell beeinflussen.
Weitere bevorzugte Ausführungsformen stellen solche Wirtszellen dar, die aufgrund genetischer Regulationselemente, die beispielsweise auf dem Vektor zur Verfügung gestellt werden, aber auch von vornherein in diesen Zellen vorhanden sein können, in ihrer Aktivität regulierbar sind. Beispielsweise durch kontrollierte Zugabe von chemischen Verbindungen, die als Aktivatoren dienen, durch Änderung der Kultivierungsbedingungen oder bei Erreichen einer bestimmten Zelldichte können diese zur Expression angeregt werden. Dies ermöglicht eine wirtschaftliche Produktion der erfindungsgemäßen Proteine. Ein Beispiel für eine solche Verbindung ist IPTG wie vorstehend beschrieben.
Bevorzugte Wirtszellen sind prokaryontische oder bakterielle Zellen. Bakterien zeichnen sich durch kurze Generationszeiten und geringe Ansprüche an die Kultivierungsbedingungen aus. Dadurch können kostengünstige Kultivierungsverfahren oder Herstellungsverfahren etabliert werden. Zudem verfügt der Fachmann bei Bakterien in der Fermentationstechnik über einen reichhaltigen Erfahrungsschatz. Für eine spezielle Produktion können aus verschiedensten, im Einzelfall experimentell zu ermittelnden Gründen wie Nährstoffquellen, Produktbildungsrate, Zeitbedarf usw., gramnegative oder grampositive Bakterien geeignet sein.
Bei gramnegativen Bakterien wie beispielsweise Escherichia coli wird eine Vielzahl von Proteinen in den periplasmatischen Raum sezerniert, also in das Kompartiment zwischen den beiden die Zellen einschließenden Membranen. Dies kann für spezielle Anwendungen vorteilhaft sein. Ferner können auch gramnegative Bakterien so ausgestaltet werden, dass sie die exprimierten Proteine nicht nur in den periplasmatischen Raum, sondern in das das Bakterium umgebende Medium ausschleusen. Grampositive Bakterien wie beispielsweise Bacilli oder Actinomyceten oder andere Vertreter der Actinomycetales besitzen demgegenüber keine äußere Membran, so dass sezernierte Proteine sogleich in das die Bakterien umgebende Medium, in der Regel das Nährmedium, abgegeben werden, aus welchem sich die exprimierten Proteine aufreinigen lassen. Sie können aus dem Medium direkt isoliert oder weiter prozessiert werden. Zudem sind grampositive Bakterien mit den meisten Herkunftsorganismen für technisch wichtige Enzyme verwandt oder identisch und bilden meist selbst vergleichbare Enzyme, so dass sie über eine ähnliche Codon-Verwendung verfügen und ihr Protein-Syntheseapparat naturgemäß entsprechend ausgerichtet ist.
Erfindungsgemäße Wirtszellen können hinsichtlich ihrer Anforderungen an die Kulturbedingungen verändert sein, andere oder zusätzliche Selektionsmarker aufweisen oder noch andere oder zusätzliche Proteine exprimieren. Es kann sich insbesondere auch um solche Wirtszellen handeln, die mehrere Proteine oder Enzyme transgen exprimieren.
Die vorliegende Erfindung ist prinzipiell auf alle Mikroorganismen, insbesondere auf alle fermentierbaren Mikroorganismen, besonders bevorzugt auf solche der Gattung Bacillus, anwendbar und führt dazu, dass sich durch den Einsatz solcher Mikroorganismen erfindungsgemäße Proteine hersteilen lassen. Solche Mikroorganismen stellen dann Wirtszellen im Sinne der Erfindung dar.
In einer weiteren Ausführungsform der Erfindung ist die Wirtszelle dadurch gekennzeichnet, dass sie ein Bakterium ist, bevorzugt eines, das ausgewählt ist aus der Gruppe der Gattungen von Escherichia, Klebsiella, Bacillus, Staphylococcus, Corynebakterium, Arthrobacter, Streptomyces, Stenotrophomonas und Pseudomonas, weiter bevorzugt eines, das ausgewählt ist aus der Gruppe von Escherichia coli, Klebsiella planticola, Bacillus licheniformis, Bacillus lentus, Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus subtilis, Bacillus alcalophilus, Bacillus globigii, Bacillus gibsonii, Bacillus clausii, Bacillus halodurans, Bacillus pumilus, Staphylococcus carnosus, Corynebacterium glutamicum, Arthrobacter oxidans, Streptomyces lividans, Streptomyces coelicolor und Stenotrophomonas maltophilia.
Die Wirtszelle kann aber auch eine eukaryontische Zelle sein, die dadurch gekennzeichnet ist, dass sie einen Zellkern besitzt. Einen weiteren Gegenstand der Erfindung stellt daher eine Wirtszelle dar, die dadurch gekennzeichnet ist, dass sie einen Zellkern besitzt. Im Gegensatz zu prokaryontischen Zellen sind eukaryontische Zellen in der Lage, das gebildete Protein posttranslational zu modifizieren. Beispiele dafür sind Pilze wie Actinomyceten oder Hefen wie Saccharomyces oder Kluyveromyces. Dies kann beispielsweise dann besonders vorteilhaft sein, wenn die Proteine im Zusammenhang mit ihrer Synthese spezifische Modifikationen erfahren sollen, die derartige Systeme ermöglichen. Zu den Modifikationen, die eukaryontische Systeme besonders im Zusammenhang mit der Proteinsynthese durchführen, gehören beispielsweise die Bindung niedermolekularer Verbindungen wie Membrananker oder Oligosaccharide. Derartige Oligosaccharid-Modifikationen können beispielsweise zur Senkung der Allergenizität eines exprimierten Proteins wünschenswert sein. Auch eine Coexpression mit den natürlicherweise von derartigen Zellen gebildeten Enzymen, wie beispielsweise Cellulasen, kann vorteilhaft sein. Ferner können sich beispielsweise thermophile pilzliche Expressionssysteme besonders zur Expression temperaturbeständiger Proteine oder Varianten eignen.
Die erfindungsgemäßen Wirtszellen werden in üblicher Weise kultiviert und fermentiert, beispielsweise in diskontinuierlichen oder kontinuierlichen Systemen. Im ersten Fall wird ein geeignetes Nährmedium mit den Wirtszellen beimpft und das Produkt nach einem experimentell zu ermittelnden Zeitraum aus dem Medium geerntet. Kontinuierliche Fermentationen zeichnen sich durch Erreichen eines Fließgleichgewichts aus, in dem über einen vergleichsweise langen Zeitraum Zellen teilweise absterben aber auch nachwachsen und gleichzeitig aus dem Medium das gebildete Protein entnommen werden kann.
Erfindungsgemäße Wirtszellen werden bevorzugt verwendet, um erfindungsgemäße Proteasen herzustellen. Ein weiterer Gegenstand der Erfindung ist daher ein Verfahren zur Herstellung einer Protease umfassend
a) Kultivieren einer erfindungsgemäßen Wirtszelle, und
b) Isolieren der Protease aus dem Kulturmedium oder aus der Wirtszelle.
Dieser Erfindungsgegenstand umfasst bevorzugt Fermentationsverfahren. Fermentationsverfahren sind an sich aus dem Stand der Technik bekannt und stellen den eigentlichen großtechnischen Produktionsschritt dar, in der Regel gefolgt von einer geeigneten Aufreinigungsmethode des hergestellten Produktes, beispielsweise der erfindungsgemäßen Proteasen. Alle Fermentationsverfahren, die auf einem entsprechenden Verfahren zur Herstellung einer erfindungsgemäßen Protease beruhen, stellen Ausführungsformen dieses Erfindungsgegenstandes dar.
Fermentationsverfahren, die dadurch gekennzeichnet sind, dass die Fermentation über eine Zulaufstrategie durchgeführt wird, kommen insbesondere in Betracht. Hierbei werden die Medienbestandteile, die durch die fortlaufende Kultivierung verbraucht werden, zugefüttert. Hierdurch können beträchtliche Steigerungen sowohl in der Zelldichte als auch in der Zellmasse beziehungsweise Trockenmasse und/oder insbesondere in der Aktivität der interessierenden Protease erreicht werden. Ferner kann die Fermentation auch so gestaltet werden, dass unerwünschte Stoffwechselprodukte herausgefiltert oder durch Zugabe von Puffer oder jeweils passende Gegenionen neutralisiert werden.
Die hergestellte Protease kann aus dem Fermentationsmedium geerntet werden. Ein solches Fermentationsverfahren ist gegenüber einer Isolation der Protease aus der Wirtszelle, d.h. einer Produktaufbereitung aus der Zellmasse (Trockenmasse) bevorzugt, erfordert jedoch die Zurverfügungstellung von geeigneten Wirtszellen oder von einem oder mehreren geeigneten Sekretionsmarkern oder -mechanismen und/oder Transportsystemen, damit die Wirtszellen die Protease in das Fermentationsmedium sezernieren. Ohne Sekretion kann alternativ die Isolation der Protease aus der Wirtszelle, d.h. eine Aufreinigung derselben aus der Zellmasse, erfolgen, beispielsweise durch Fällung mit Ammoniumsulfat oder Ethanol, oder durch chromatographische Reinigung.
Alle vorstehend ausgeführten Sachverhalte können zu Verfahren kombiniert werden, um erfindungsgemäße Protease herzustellen.
Ein weiterer Gegenstand der Erfindung ist ein Mittel, das dadurch gekennzeichnet ist, dass es eine erfindungsgemäße Protease wie vorstehend beschrieben enthält. Bevorzugt ist das Mittel als ein Wasch- oder Reinigungsmittel.
Zu diesem Erfindungsgegenstand zählen alle denkbaren Wasch- oder Reinigungsmittelarten, sowohl Konzentrate als auch unverdünnt anzuwendende Mittel, zum Einsatz im kommerziellen Maßstab, in der Waschmaschine oder bei der Handwäsche beziehungsweise -reinigung. Dazu gehören beispielsweise Waschmittel für Textilien, Teppiche, oder Naturfasern, für die die Bezeichnung Waschmittel verwendet wird. Dazu gehören beispielsweise auch Geschirrspülmittel für Geschirrspülmaschinen oder manuelle Geschirrspülmittel oder Reiniger für harte Oberflächen wie Metall, Glas, Porzellan, Keramik, Kacheln, Stein, lackierte Oberflächen, Kunststoffe, Holz oder Leder, für die die Bezeichnung Reinigungsmittel verwendet wird, also neben manuellen und maschinellen Geschirrspülmitteln beispielsweise auch Scheuermittel, Glasreiniger, WC-Duftspüler, usw. Zu den Wasch- und Reinigungsmitteln im Rahmen der Erfindung zählen ferner Waschhilfsmittel, die bei der manuellen oder maschinellen Textilwäsche zum eigentlichen Waschmittel hinzudosiert werden, um eine weitere Wirkung zu erzielen. Ferner zählen zu Wasch- und Reinigungsmittel im Rahmen der Erfindung auch Textilvor- und Nachbehandlungsmittel, also solche Mittel, mit denen das Wäschestück vor der eigentlichen Wäsche in Kontakt gebracht wird, beispielsweise zum Anlösen hartnäckiger Verschmutzungen, und auch solche Mittel, die in einem der eigentlichen Textilwäsche nachgeschalteten Schritt dem Waschgut weitere wünschenswerte Eigenschaften wie angenehmen Griff, Knitterfreiheit oder geringe statische Aufladung verleihen. Zu letztgenannten Mittel werden u.a. die Weichspüler gerechnet.
Die erfindungsgemäßen Wasch- oder Reinigungsmittel, die als pulverförmige Feststoffe, in nachverdichteter Teilchenform, als homogene Lösungen oder Suspensionen vorliegen können, können neben einer erfindungsgemäßen Protease alle bekannten und in derartigen Mitteln üblichen Inhaltsstoffe enthalten, wobei bevorzugt mindestens ein weiterer Inhaltsstoff in dem Mittel vorhanden ist. Die erfindungsgemäßen Mittel können insbesondere Tenside, Builder (Gerüststoffe), Persauerstoffverbindungen oder Bleichaktivatoren enthalten. Ferner können sie wassermischbare organische Lösungsmittel, weitere Enzyme, Sequestrierungsmittel, Elektrolyte, pH-Regulatoren und/oder weitere Hilfsstoffe wie optische Aufheller, Vergrauungsinhibitoren, Schaumregulatoren sowie Färb- und Duftstoffe sowie Kombinationen hiervon enthalten.
Insbesondere eine Kombination einer erfindungsgemäßen Protease mit einem oder mehreren weiteren Inhaltsstoff(en) des Mittels ist vorteilhaft, da ein solches Mittel in bevorzugten erfindungsgemäßen Ausgestaltungen eine verbesserte Reinigungsleistung durch sich ergebende Synergismen aufweist. Insbesondere durch die Kombination einer erfindungsgemäßen Protease mit einem Tensid und/oder einem Builder (Gerüststoff) und/oder einer Persauerstoffverbindung und/oder einem Bleichaktivator kann ein solcher Synergismus erreicht werden. Allerdings kann in bevorzugten Ausführungsformen das erfindungsgemäße Mittel keine Borsäure enthalten.
Vorteilhafte Inhaltsstoffe erfindungsgemäßer Mittel sind offenbart in der internationalen Patentanmeldung WO2009/121725, dort beginnend auf Seite 5, vorletzter Absatz, und endend auf Seite 13 nach dem zweiten Absatz. Auf diese Offenbarung wird ausdrücklich Bezug genommen und der dortige Offenbarungsgehalt in die vorliegende Patentanmeldung einbezogen.
Ein erfindungsgemäßes Mittel enthält die Protease vorteilhafterweise in einer Menge von 2pg bis 20mg, vorzugsweise von 5pg bis 17,5mg, besonders bevorzugt von 20pg bis 15mg und ganz besonders bevorzugt von 50pg bis 10mg pro g des Mittels. In verschiedenen Ausführungsformen beträgt die Konzentration der hierin beschriebenen Protease (aktives Enzym) in dem Mittel >0 bis 1 Gew.-%, vorzugsweise 0,001 bis 0,1 Gew.-% bezogen auf das Gesamtgewicht des Mittels oder der Zusammensetzung. Ferner kann die in dem Mittel enthaltene Protease, und/oder weitere Inhaltsstoffe des Mittels, mit einer bei Raumtemperatur oder bei Abwesenheit von Wasser für das Enzym undurchlässigen Substanz umhüllt sein, welche unter Anwendungsbedingungen des Mittels durchlässig für das Enzym wird. Eine solche Ausführungsform der Erfindung ist somit dadurch gekennzeichnet, dass die Protease mit einer bei Raumtemperatur oder bei Abwesenheit von Wasser für die Protease undurchlässigen Substanz umhüllt ist. Weiterhin kann auch das Waschoder Reinigungsmittel selbst in einem Behältnis, vorzugsweise einem luftdurchlässigen Behältnis, verpackt sein, aus dem es kurz vor Gebrauch oder während des Waschvorgangs freigesetzt wird.
In weiteren Ausführungsformen der Erfindung ist das Mittel dadurch gekennzeichnet, dass es
(a) in fester Form vorliegt, insbesondere als rieselfähiges Pulver mit einem Schüttgewicht von 300 g/l bis 1200 g/l, insbesondere 500 g/l bis 900 g/l, oder
(b) in pastöser oder in flüssiger Form vorliegt, und/oder
(c) in gelförmiger oder dosierbeutelförmiger (Pouches) Form vorliegt, und/oder
(d) als Einkomponentensystem vorliegt, oder
(e) in mehrere Komponenten aufgeteilt ist. Diese Ausführungsformen der vorliegenden Erfindung umfassen alle festen, pulverförmigen, flüssigen, gelförmigen oder pastösen Darreichungsformen erfindungsgemäßer Mittel, die gegebenenfalls auch aus mehreren Phasen bestehen können sowie in komprimierter oder nicht komprimierter Form vorliegen können. Das Mittel kann als rieselfähiges Pulver vorliegen, insbesondere mit einem Schüttgewicht von 300 g/l bis 1200 g/l, insbesondere 500 g/l bis 900 g/l oder 600 g/l bis 850 g/l. Zu den festen Darreichungsformen des Mittels zählen ferner Extrudate, Granulate, Tabletten oder Pouches. Alternativ kann das Mittel auch flüssig, gelförmig oder pastös sein, beispielsweise in Form eines nicht-wässrigen Flüssigwaschmittels oder einer nicht-wässrigen Paste oder in Form eines wässrigen Flüssigwaschmittels oder einer wasserhaltigen Paste. Flüssige Mittel sind generell bevorzugt. Weiterhin kann das Mittel als Einkomponentensystem vorliegen. Solche Mittel bestehen aus einer Phase. Alternativ kann ein Mittel auch aus mehreren Phasen bestehen. Ein solches Mittel ist demnach in mehrere Komponenten aufgeteilt.
Erfindungsgemäße Wasch- oder Reinigungsmittel können ausschließlich eine Protease enthalten. Alternativ können sie auch weitere hydrolytische Enzyme oder andere Enzyme in einer für die Wirksamkeit des Mittels zweckmäßigen Konzentration enthalten. Eine weitere Ausführungsform der Erfindung stellen somit Mittel dar, die ferner eines oder mehrere weitere Enzyme umfassen. Als weitere Enzyme bevorzugt einsetzbar sind alle Enzyme, die in dem erfindungsgemäßen Mittel eine katalytische Aktivität entfalten können, insbesondere eine Lipase, Amylase, Cellulase, Hemicellulase, Mannanase, Tannase, Xylanase, Xanthanase, Xyloglucanase, ß-Glucosidase, Pektinase, Carrageenase, Perhydrolase, Oxidase, Oxidoreduktase oder andere - von den erfindungsgemäßen Proteasen unterscheidbare - Protease, sowie deren Gemische. Weitere Enzyme sind in dem Mittel vorteilhafterweise jeweils in einer Menge von 1 x 10 8 bis 5 Gewichts- Prozent bezogen auf aktives Protein enthalten. Zunehmend bevorzugt ist jedes weitere Enzym in einer Menge von 1 x 10-7-3 Gew.-%, von 0,00001-1 Gew.-%, von 0,00005-0,5 Gew.-%, von 0,0001 bis 0,1 Gew.-% und besonders bevorzugt von 0,0001 bis 0,05 Gew.-% in erfindungsgemäßen Mitteln enthalten, bezogen auf aktives Protein. Besonders bevorzugt zeigen die Enzyme synergistische Reinigungsleistungen gegenüber bestimmten Anschmutzungen oder Flecken, d.h. die in der Mittelzusammensetzung enthaltenen Enzyme unterstützen sich in ihrer Reinigungsleistung gegenseitig. Ganz besonders bevorzugt liegt ein solcher Synergismus vor zwischen der erfindungsgemäß enthaltenen Protease und einem weiteren Enzym eines erfindungsgemäßen Mittels, darunter insbesondere zwischen der genannten Protease und einer Amylase und/oder einer Lipase und/oder einer Mannanase und/oder einer Cellulase und/oder einer Pektinase. Synergistische Effekte können nicht nur zwischen verschiedenen Enzymen, sondern auch zwischen einem oder mehreren Enzymen und weiteren Inhaltsstoffen des erfindungsgemäßen Mittels auftreten.
In den hierin beschriebenen Reinigungsmitteln können die einzusetzenden Enzyme ferner zusammen mit Begleitstoffen, etwa aus der Fermentation, konfektioniert sein. In flüssigen Formulierungen werden die Enzyme bevorzugt als Enzymflüssigformulierung(en) eingesetzt. Die Enzyme werden in der Regel nicht in Form des reinen Proteins, sondern vielmehr in Form stabilisierter, lager- und transportfähiger Zubereitungen bereitgestellt. Zu diesen vorkonfektionierten Zubereitungen zählen beispielsweise die durch Granulation, Extrusion oder Lyophilisierung erhaltenen festen Präparationen oder, insbesondere bei flüssigen oder gelförmigen Mitteln, Lösungen der Enzyme, vorteilhafterweise möglichst konzentriert, wasserarm und/oder mit Stabilisatoren oder weiteren Hilfsmitteln versetzt.
Alternativ können die Enzyme sowohl für die feste als auch für die flüssige Darreichungsform verkapselt werden, beispielsweise durch Sprühtrocknung oder Extrusion der Enzymlösung zusammen mit einem vorzugsweise natürlichen Polymer oder in Form von Kapseln, beispielsweise solchen, bei denen die Enzyme wie in einem erstarrten Gel eingeschlossen sind oder in solchen vom Kern-Schale-Typ, bei dem ein enzymhaltiger Kern mit einer Wasser-, Luft- und/oder Chemikalien-undurchlässigen Schutzschicht überzogen ist. In aufgelagerten Schichten können zusätzlich weitere Wirkstoffe, beispielsweise Stabilisatoren, Emulgatoren, Pigmente, Bleich- oder Farbstoffe aufgebracht werden. Derartige Kapseln werden nach an sich bekannten Methoden, beispielsweise durch Schüttei- oder Rollgranulation oder in Fluid-bed-Prozessen aufgebracht. Vorteilhafterweise sind derartige Granulate, beispielsweise durch Aufbringen polymerer Filmbildner, staubarm und aufgrund der Beschichtung lagerstabil.
Weiterhin ist es möglich, zwei oder mehrere Enzyme zusammen zu konfektionieren, so dass ein einzelnes Granulat mehrere Enzymaktivitäten aufweist.
Die Enzyme können auch in wasserlösliche Filme, wie sie beispielsweise bei der Konfektionierung von Wasch- und Reinigungsmitteln in Einheitsdosisform verwendet werden, eingebracht werden. Ein derartiger Film ermöglicht die Freisetzung der Enzyme nach Kontakt mit Wasser. Wie hierin verwendet, bezieht sich „wasserlöslich“ auf eine Filmstruktur, die vorzugsweise vollständig wasserlöslich ist. Bevorzugt besteht ein solcher Film aus (vollständig oder teilweise hydrolysiertem) Polyvinylalkohol (PVA).
Ein weiterer Erfindungsgegenstand ist ein Verfahren zur Reinigung von Textilien oder harten Oberflächen, das dadurch gekennzeichnet ist, dass in mindestens einem Verfahrensschritt ein erfindungsgemäßes Mittel angewendet wird, oder dass in mindestens einem Verfahrensschritt eine erfindungsgemäße Protease katalytisch aktiv wird, insbesondere derart, dass die Protease in einer Menge von 40pg bis 4g, vorzugsweise von 50pg bis 3g, besonders bevorzugt von 100pg bis 2g und ganz besonders bevorzugt von 200pg bis 1g bzw. in den hierin beschriebenen Konzentrationen eingesetzt wird. ln verschieden Ausführungsformen zeichnet sich das oben beschriebene Verfahren dadurch aus, dass die Protease bei einer Temperatur von 0-100°C, bevorzugt 0-60°C, weiter bevorzugt 20-40°C und am meisten bevorzugt bei 25°C eingesetzt wird.
Hierunter fallen sowohl manuelle als auch maschinelle Verfahren, wobei maschinelle Verfahren bevorzugt sind. Verfahren zur Reinigung von Textilien zeichnen sich im Allgemeinen dadurch aus, dass in mehreren Verfahrensschritten verschiedene reinigungsaktive Substanzen auf das Reinigungsgut aufgebracht und nach der Einwirkzeit abgewaschen werden, oder dass das Reinigungsgut in sonstiger Weise mit einem Waschmittel oder einer Lösung oder Verdünnung dieses Mittels behandelt wird. Entsprechendes gilt für Verfahren zur Reinigung von allen anderen Materialien als Textilien, insbesondere von harten Oberflächen. Alle denkbaren Wasch- oder Reinigungsverfahren können in wenigstens einem der Verfahrensschritte um die Anwendung eines erfindungsgemäßen Wasch- oder Reinigungsmittels oder einer erfindungsgemäßen Protease bereichert werden und stellen dann Ausführungsformen der vorliegenden Erfindung dar. Alle Sachverhalte, Gegenstände und Ausführungsformen, die für erfindungsgemäße Protease und sie enthaltende Mittel beschrieben sind, sind auch auf diesen Erfindungsgegenstand anwendbar. Daher wird an dieser Stelle ausdrücklich auf die Offenbarung an entsprechender Stelle verwiesen mit dem Hinweis, dass diese Offenbarung auch für die vorstehenden erfindungsgemäßen Verfahren gilt.
Da erfindungsgemäße Proteasen natürlicherweise bereits eine hydrolytische Aktivität besitzen und diese auch in Medien entfalten, die sonst keine Reinigungskraft besitzen wie beispielsweise in bloßem Puffer, kann ein einzelner und/oder der einzige Schritt eines solchen Verfahrens darin bestehen, dass als einzige reinigungsaktive Komponente eine erfindungsgemäße Protease mit der Anschmutzung in Kontakt gebracht wird, bevorzugt in einer Pufferlösung oder in Wasser. Dies stellt eine weitere Ausführungsform dieses Erfindungsgegenstandes dar.
Alternative Ausführungsformen dieses Erfindungsgegenstandes stellen auch Verfahren zur Behandlung von Textil roh stoffen oder zur Textilpflege dar, bei denen in wenigstens einem Verfahrensschritt eine erfindungsgemäße Protease aktiv wird. Hierunter sind Verfahren für Textilrohstoffe, Fasern oder Textilien mit natürlichen Bestandteilen bevorzugt, und ganz besonders für solche mit Wolle oder Seide.
Schließlich erfasst die Erfindung auch die Verwendung der hierin beschriebenen Proteasen in Wasch- oder Reinigungsmitteln, beispielsweise wie oben beschrieben, zur (verbesserten) Entfernung von proteinhaltigen Anschmutzungen, beispielsweise von Textilien oder harten Oberflächen. In bevorzugten Ausführungsformen dieser Verwendung wird die Protease im Waschoder Reinigungsmittel vor einem Wasch- oder Reinigungsvorgang 3 oder mehr Tage, 4 oder mehr Tage, 7 oder mehr Tage, 10 oder mehr Tage, 12 oder mehr Tage, 14 oder mehr Tage, 21 oder mehr Tage oder 28 oder mehr Tage gelagert. Alle Sachverhalte, Gegenstände und Ausführungsformen, die für erfindungsgemäße Proteasen und sie enthaltende Mittel beschrieben sind, sind auch auf diesen Erfindungsgegenstand anwendbar. Daher wird an dieser Stelle ausdrücklich auf die Offenbarung an entsprechender stelle verwiesen mit dem Hinweis, dass diese Offenbarung auch für die vorstehende erfindungsgemäße Verwendung gilt.
Beispiele
Übersicht über die Mutationen:
Diese Erfindung betrifft eine alkalische Protease vom Subtilisin Typ aus Bacillus pumilus. Von dieser Protease (Wildtyp Bacillus pumilus DSM18097 Protease gemäß SEQ ID NO:1), wurden durch Zufallsmutagenese Varianten hergestellt, welche dann u.a. auf verbesserte Waschleistung und/oder Enzymstabilität gescreent wurden. Auf diesem Weg wurde aus der oben genannten Protease (SEQ ID NO:1) eine leistungsverbesserte Mutante (Mutante 1) generiert. Auf dieser Mutante bauen die erfindungsgemäßen Mutanten 2-10 auf.
Figure imgf000027_0001
Verwendete Waschmittelmatrix
Dies ist die Waschmittelmatrix (handelsüblich, ohne Enzyme, opt. Aufheller, Parfüm und Farbstoffe), die für den Test verwendet wurde:
Figure imgf000027_0002
Figure imgf000028_0001
Ohne opt. Aufheller, Parfüm und Enzyme; Dosierung 3, 17 g/L
Protease-Aktivitätsassavs
Die Aktivität der Protease wird durch die Freisetzung des Chromophors para-Nitroanilin aus dem Substrat Succinyl Alanin-Alanin-Prolin-Phenylalanin-para-Nitroanilid (AAPFpNA; Bachem L-1400) bestimmt. Die Freisetzung des pNA verursacht eine Zunahme der Extinktion bei 410 nm, deren zeitlicher Verlauf ein Maß für die enzymatische Aktivität ist.
Die Messung erfolgte bei einer Temperatur von 25°C, bei pH 8,6 und einer Wellenlänge von 410 nm. Die Messzeit betrug 5 min bei einem Messintervall von 20 bis 60 Sekunden.
Messansatz:
10 pL AAPF-Lösung (70 mg/ml_)
1000 pL Tris/HCI (0,1 M; pH 8,6 mit 0,1 % Brij 35)
10 pL verdünnte Proteaselösung
Kinetik erstellt über 5 min bei 25°C (410 nm)
Miniwaschtest und Ergebnisse
Waschtest mit Bacillus subtilis Kulturüberständen, welche die gescreenten Proteasemutanten durch heterologe Expression enthalten. Die Überstände werden aktivitätsgleich zum Referenzprotein (gemäß SEQ ID NO:1) mit einer marktüblichen Konzentration für Proteasen in Waschmittel eingesetzt. Die Mutanten werden alle auf die Waschleistung der Ausgangsvariante (Mutante 1) bezogen, die gleich 100% gesetzt wird (Summe der 6 Anschmutzungen, korrigiert durch die Leistung des Waschmittels allein).
Bedingungen: 40°C, 16°dH Wasser, 1 h
Anschmutzungen:
1. CFT CS038
2. CFT PC-10
3. WfK 10N
4. CFT C-03
5. CFT C-05 6. H-MR-B
Ausgestanzte Gewebe (Durchmesser = 10 mm) wurden in Mikrotiterplatten vorgelegt, Waschlauge auf 40°C vortemperiert, Endkonzentration 3,17 g/L, Lauge und Enzym auf die Anschmutzung gegeben, für 1 h bei 40°C und 600 rpm inkubiert, anschließend die Anschmutzung mehrmals mit klarem Wasser gespült, trocknen gelassen und mit einem Farbmessgerät die Helligkeit bestimmt. Je heller das Gewebe wird, desto besser ist die Reinigungsleistung. Gemessen wird hier der L- Wert = Helligkeit, je höher desto heller. Angegeben ist die Summe der 6 Anschmutzungen in % bezogen auf die Ausgangsvariante (Mutante 1) korrigiert durch die Leistung des Waschmittels ohne Protease.
Figure imgf000029_0001
Alle Varianten zeigen eine erhöhte Waschleistung im Vergleich zur Ausgangsmutante 1.
Weiterhin zeigen alle Varianten eine erhöhte Waschleistung im Vergleich zur Ausgangsvariante (Mutante 1).

Claims

Patentansprüche
1 . Protease umfassend eine Aminosäuresequenz, die mindestens 70 % Sequenzidentität mit der in SEQ ID NO:1 angegebenen Aminosäuresequenz über deren Gesamtlänge aufweist und jeweils bezogen auf die Nummerierung gemäß SEQ ID NO:1
(i) an den Positionen, die den Positionen 9, 133, 144, 252 und 271 entsprechen, Aminosäuresubstitutionen aufweist, vorzugsweise ausgewählt aus den
Aminosäuresubstitutionen 9T, 133A, 144K, 252T und 271 E;
sowie
(ii) an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4, 82, 156, 162 und 218 entsprechen, mindestens eine weitere Aminosäuresubstitution aufweist.
2. Protease nach Anspruch 2, wobei die Protease ferner eine zusätzliche Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 130 entspricht, aufweist, vorzugsweise 130D.
3. Protease umfassend eine Aminosäuresequenz, die mindestens 70 % Sequenzidentität mit der in SEQ ID NO:1 angegebenen Aminosäuresequenz über deren Gesamtlänge aufweist und jeweils bezogen auf die Nummerierung gemäß SEQ ID NO:1
(A) an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4 und 218 entsprechen, mindestens eine Aminosäuresubstitution aufweist, vorzugsweise ausgewählt aus 3K, 3A, 3R, 3S, 4A, 4I, 4T und 218S und/oder
(B) an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 156 und 162 entsprechen, mindestens eine Aminosäuresubstitution aufweist, ausgewählt aus 156D und 1621.
4. Protease nach Anspruch 1 , wobei
a) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 3 entspricht, ausgewählt wird aus
3K, 3A, 3R und 3S; und/oder
b) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 4 entspricht, ausgewählt wird aus
4A, 4I und 4T; oder
c) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 82 entspricht, ausgewählt wird aus
82F; oder
d) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 156 entspricht, ausgewählt wird aus 156D; und/oder
e) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 162 entspricht, ausgewählt wird aus 1621; oder
f) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 218 entspricht, ausgewählt wird aus 218S.
5. Protease nach Anspruch 3, wobei a) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 3 entspricht, ausgewählt wird aus 3K, 3A und 3S; und/oder
b) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 4 entspricht, ausgewählt wird aus 4A, 41 und 4T; oder
c) die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 3 entspricht, ausgewählt wird aus 3R.
6. Protease nach einem der Ansprüche 1 -4, wobei die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 3 entspricht, ausgewählt wird aus 3K und die Aminosäuresubstitution an der Position, die Position 4 entspricht, ausgewählt wird aus 4L
7. Protease, dadurch gekennzeichnet, dass
(a) sie aus einer Protease nach Anspruch 1 -6 als Ausgangsmolekül erhältlich ist durch ein- oder mehrfache konservative Aminosäuresubstitution, wobei die Protease an den Positionen, die den Positionen 9, 133, 144, 252 und 271 entsprechen,
Aminosäuresubstitutionen, vorzugsweise ausgewählt aus den Aminosäuresubstitutionen 9T, 133A, 144K, 252T und 271 E; sowie an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4, 82, 156, 162 und 218 entsprechen, mindestens eine weitere
Aminosäuresubstitution aufweist; oder
(b) sie aus einer Protease nach Anspruch 1 -6 als Ausgangsmolekül erhältlich ist durch
Fragmentierung, Deletions-, Insertions- oder Substitutionsmutagenese und eine
Aminosäuresequenz umfasst, die über eine Länge von mindestens 200, 210, 220, 230, 240, 250, 260, 261 , 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271 , 272, 273 oder 274 zusammenhängenden Aminosäuren mit dem Ausgangsmolekül übereinstimmt, wobei die Protease an den Positionen, die den Positionen 9, 133, 144, 252 und 271 entsprechen, Aminosäuresubstitutionen, vorzugsweise ausgewählt aus den Aminosäuresubstitutionen 9T, 133A, 144K, 252T und 271 E; sowie an mindestens einer der Positionen, die den Positionen 3, 4, 82, 156, 162 und 218 entsprechen, mindestens eine weitere
Aminosäuresubstitution aufweist.
8. Nukleinsäure kodierend für eine Protease nach einem der Ansprüche 1 -7.
9. Vektor enthaltend eine Nukleinsäure nach Anspruch 8, insbesondere ein Klonierungsvektor oder ein Expressionsvektor.
10. Nicht-menschliche Wirtszelle, die eine Nukleinsäure nach Anspruch 8 oder einen Vektor nach Anspruch 9 beinhaltet, oder die eine Protease nach einem der Ansprüche 1 -7 beinhaltet.
1 1 . Verfahren zur Herstellung einer Protease umfassend
a) Kultivieren einer Wirtszelle gemäß Anspruch 10; und b) Isolieren der Protease aus dem Kulturmedium oder aus der Wirtszelle.
12. Mittel, insbesondere ein Wasch- oder Reinigungsmittel, dadurch gekennzeichnet, dass es mindestens eine Protease nach einem der Ansprüche 1 -7 enthält.
13. Verfahren zur Reinigung von Textilien oder harten Oberflächen, dadurch gekennzeichnet, dass in mindestens einem Verfahrensschritt ein Mittel nach Anspruch 12 angewendet wird.
14. Verwendung einer Protease nach einem der Ansprüche 1 -7 in einem Wasch- oder
Reinigungsmittel zur Entfernung von peptid- oder proteinhaltigen Anschmutzungen.
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