WO2015104419A1 - Method for analysing a sample by means of a microscope - Google Patents

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WO2015104419A1
WO2015104419A1 PCT/EP2015/050447 EP2015050447W WO2015104419A1 WO 2015104419 A1 WO2015104419 A1 WO 2015104419A1 EP 2015050447 W EP2015050447 W EP 2015050447W WO 2015104419 A1 WO2015104419 A1 WO 2015104419A1
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sample
carrier elements
identification
microscope
slide
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PCT/EP2015/050447
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Inventor
Falk Schlaudraff
Christian Woditschka
Original Assignee
Leica Microsystems Cms Gmbh
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Publication date
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    • G01N1/286—Preparing specimens for investigation including physical details of (bio-)chemical methods covered elsewhere, e.g. G01N33/50, C12Q involving mechanical work, e.g. chopping, disintegrating, compacting, homogenising
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    • G01N2035/00831—Identification of carriers, materials or components in automatic analysers nature of coded information identification of the sample, e.g. patient identity, place of sampling

Definitions

  • the present invention relates to a method for analyzing a sample with a microscope, and to a microscope for analyzing a sample.
  • sample carrier elements In order to analyze or process biological samples or preparations with a microscope, different preparation carrier elements are used.
  • the sample is applied in particular to a slide.
  • the slide can be placed in the microscope and the sample analyzed.
  • Several such slides can in turn be applied to a sample holder.
  • certain cells, tissue areas or the like of the sample can be selected and cut out or "dissected out” for further analysis with the aid of a focused laser beam as a so-called dissectate.
  • the sample is usually on one
  • the dissected out drops under the influence of gravity in a suitable container.
  • a method for laser microdissection is known, for example, from DE 10 2004 051 508 A1.
  • a desired cutting line of an object, which is to be cut out of the sample determined based on the object contour and the object is cut along this desired cutting line by means of a relative movement between a laser beam and the sample.
  • the slide carrier elements can also be marked digitally.
  • an object carrier device for receiving an object to be examined by a microscope or to be processed with a laboratory analysis system is known.
  • the slide has a radio frequency identification (RFID) tag. On this a the slide and / or the object identifying information is stored.
  • RFID tags are to overcome the disadvantage of limited and non-changeable amounts of data that can be stored on a barcode.
  • a sample holder is known, which is connected to a transponder, which in turn is readable and writable. As a result, information about the samples on the sample holder can be stored and read out.
  • preparation carrier elements Although an identification of preparation carrier elements is possible by means of these methods, the preparation carrier elements must be actively marked thereby, for example by manual labeling or by storing information on the RFID tag. A (partially) automatic or fully automatic assignment of different preparation carrier elements to a sample is not or at least hardly possible.
  • preparation carrier elements which are used to analyze the sample, each provided with an identification mark.
  • Identification labels of the individual preparation carrier elements are detected by a detection device.
  • memory entries are detected in a computing unit. These memory entries are in each case assigned to the individual preparation carrier elements.
  • the memory entries in the computing unit are linked together. Memory entries belonging to the same sample (and thus preparation carrier elements) are assigned to one another and can be identified automatically.
  • preparation carrier elements is to be understood as meaning elements on which the sample or parts of the sample can be applied or introduced.
  • preparation carrier elements are slides, Petri dishes, multiwell containers or collecting containers for microdissection.
  • the invention makes possible a (partially) automatic, in particular fully automatic, assignment of the preparation carrier elements to the sample and to one another. If the sample is to be analyzed and if an identification tag of a specimen carrier element is detected, memory entries which are assigned to this specimen carrier element are automatically assigned in the arithmetic unit to the sample to be analyzed or linked thereto. All memory entries which are assigned to corresponding preparation carrier elements whose identification markings are detected during the analysis of the particular sample are linked together (in particular automatically). Thus, in particular all the preparation carrier elements which are used for the analysis of the particular sample are linked to each other and thus to the sample. This linkage is in particular fully automatic in the arithmetic unit, without intervention or intervention of a user.
  • every possible preparation carrier element that can be used for analyzing the sample is stored a priori in the arithmetic unit.
  • At least one memory entry is stored in the arithmetic unit for each possible carrier element.
  • This memory entry contains in particular useful information about the specimen carrier element.
  • the preparation carrier elements already have one a priori Identification mark on.
  • the individual preparation carrier elements are uniquely characterized or identified by the respective identifier.
  • This identification marking is also stored in particular in the corresponding memory entry assigned to the preparation carrier element or points (in the form of a pointer) to the memory entry.
  • each specimen carrier element can thus be unambiguously assigned to its corresponding memory entry.
  • the individual memory entries of all specimen carrier elements whose identification markings are detected in the course of the analysis can be automatically linked to one another and thus, for example, matching specimen carrier elements or specimen carrier elements that are suitable for a particular specimen can be determined or identified.
  • the sample is applied to a plurality of slides or several parts of the sample are applied to different slides.
  • the invention can be deposited in a simple manner that these slides belong to the same sample or the same patient.
  • Such preparation carrier elements can also be sample holders, on each of which several slides are applied.
  • both the sample holder and the individual slides each have an identification tag.
  • all slides on the sample holder and the sample holder can be linked to each other via their memory entries in the arithmetic unit. Different slides on the sample holder may belong to the same or different samples. The invention thus makes it possible to automatically deposit in a simple manner which slides belong to which sample.
  • the invention is suitable for a microscope with a slide scanner.
  • a plurality of preparation carrier elements especially on slides, are introduced.
  • up to 400 slides can be introduced in such a slide scanner.
  • These preparation carrier elements are automatically loaded one after the other into the microscope and analyzed.
  • the identification marking of each individual preparation carrier element can be detected in a simple manner when this preparation carrier element is loaded into the microscope.
  • this preparation carrier element is linked to the respective sample or all preparation carrier elements with which the same sample (or different parts of the same sample) are analyzed are linked to one another via the corresponding memory entries. Subsequently, the sample is automatically analyzed.
  • a fully automatic analysis of the sample is possible.
  • the preparation carrier elements can already be provided in a manufacturing process with the respective identification marking.
  • the associated memory entries of the individual preparation carrier elements can be supplied, for example, with the preparation carrier elements on a corresponding data carrier.
  • the data carrier for example CD, DVD, USB stick, flash memory
  • the data carrier can be connected to the corresponding arithmetic unit and the memory entries can be transferred to the arithmetic unit from the data carrier.
  • the specimen carrier elements are provided with the corresponding identification markings.
  • the arithmetic unit is designed in particular as a part of the microscope.
  • the arithmetic unit can be designed as a module which can be connected to the microscope.
  • the arithmetic unit is designed as part of a computer or control unit.
  • the arithmetic unit comprises a suitable database.
  • the corresponding memory entries of the individual specimen carrier elements are stored in this database as a function of their identification markings.
  • the analysis of the sample is carried out in particular by means of a control device and / or a control software for controlling the microscope.
  • This control unit or this control software is in particular with the computing unit in communication.
  • the control software can be executed in particular also on the arithmetic unit itself.
  • the arithmetic unit is used in particular for the analysis of the sample. For example, by means of the arithmetic unit an enlarged image of the sample or a region of the sample which is generated by the microscope can be displayed and / or stored as an image or video file. This enlarged image is forwarded in particular by the control unit or the control software for controlling the microscope to the arithmetic unit.
  • the microscope has at least one expedient detection device for detecting the identification markings.
  • this detection device is connected to the arithmetic unit and / or the control unit or the control software or can communicate with the same. If the detection device detects a specific identification tag, the control device or the control software is in particular provided with the respective allocated memory entries.
  • a laser microdissection of the sample is carried out in the course of the analysis of the sample.
  • the microscope has a suitable laser microdissection device.
  • the microscope and the laser microdissection device together form a laser microdissection system.
  • the laser microdissection device has a device for generating a laser beam, for example an infrared or ultraviolet laser beam. From the sample, a dissectate can be isolated by means of this laser beam, which preferably falls under the influence of gravity into a suitable collecting container.
  • the microscope has an incident light device in the beam path of which the laser beam is coupled.
  • the laser beam is focused by the respective microscope objective used on the sample, which rests for example on a motor-automatically movable microscope stage.
  • a cutting line is produced, for example, by moving the microscope stage during cutting in order to move the sample relative to the stationary laser beam.
  • the laser microdissection device can also have a laser deflection or laser scanning device, which is set up to move the laser beam or its point of impingement over a stationary sample.
  • a slide is advantageously used as a first slide carrier element for analyzing the sample.
  • the slide is provided with a first identification mark.
  • a collection container is used as a second sample carrier member for analyzing the sample and is provided with a second identification tag.
  • the first identifier of the slide and the second identifier of the collection container are detected. Based on the detected first identifier of the slide a memory entry, which is associated with the slide, detected in the arithmetic unit, so found and read. Based on the detected second identifier of the collection container, a memory entry, which is associated with the collecting container, detected in the arithmetic unit.
  • the storage entries of the slide and the collection container are linked together. In this way, the correct collection container for a slide can be automatically determined and used for analysis.
  • a selected object is cut out of the sample by means of the laser microdissection and transported as a dissectate into the collecting container.
  • All the preparation carrier elements which are used in the course of the laser microdissection of the sample are linked to one another in the arithmetic unit.
  • the dissectate in the corresponding collecting container belongs to the sample on the corresponding microscope slide.
  • each individual of these combined preparation carrier elements can also be provided with its own identification mark.
  • a plurality of microscope slides are preferably combined to form a sample holder as a higher-level preparation carrier element and provided with a first, higher-order identifier.
  • a plurality of collecting containers are combined to form an overall holder as a higher-level preparation carrier element and provided with a second, upper-level identification marking.
  • an automatic or fully automatic laser microdissection can be carried out in a simple manner, both from one and several different samples.
  • a method for (automatic) laser microdissection is known, for example, from DE 10 2004 051 508 A1 by the same Applicant.
  • a desired cutting line of an object which is to be cut out of a preparation or a sample is marked and cut out by means of a relative movement between a laser beam and the sample.
  • An electronic image of at least one image section of the sample is taken, the image section is processed by image analysis, wherein at least one object to be cut out is automatically determined.
  • the desired cutting line around the at least one object to be cut out is automatically determined.
  • the automatically determined desired cutting line is automatically imaged by a mathematical transformation on a laser cutting line and this laser cutting line is converted into a relative movement between the laser beam and the preparation, whereby a laser cut is produced.
  • the present invention makes it possible to carry out such an automatic laser microdissection on any number of samples fully automatically.
  • object carriers and collecting containers as well as optionally further preparation carrier elements which are used for the laser microdissection of a special sample are linked to this.
  • the arithmetic unit or a suitable control device can in particular carry out a method for (automatic) laser microdissection analogous to DE 10 2004 051 508 A1. Subsequently (especially automatically) new slides, collection containers, etc. are introduced, which belong to another sample. According to the invention, these new preparation carrier elements are linked to the new sample. An automatic laser microdissection of this new sample can then be performed.
  • the invention is also suitable for a laser Mikrodissetationsvorraum which is operated independently of collecting containers.
  • a sample catcher can be used for a laser microdissection device, for example a capillary catcher.
  • a capillary curtain is described, for example, in DE 10 2013 209 455 A1 of the same Applicant.
  • a collection chamber for receiving a dissectate communicates with a capillary line for transporting the dissectate from the collection area. After this forwarding, the dissectate can be sent for analysis.
  • the invention makes it possible to automatically operate such a laser microdissection device with a sample catcher, in particular a capillary catcher.
  • the capillary catcher and attached equipment or -ports or a device for controlling this capillary can be in particular with the arithmetic unit in communication or in communication.
  • the memory entries which are assigned to the individual preparation carrier elements preferably each contain a dimension, a position, coordinates and / or a dimension of the respective preparation carrier element and / or the sample itself.
  • the memory entries thus contain, in particular, information which the particular preparation carrier element and / or the Identify sample or describe its physical extent.
  • the memory entries contain data or information relating to the type and dimensions of the slide, the sample holder, the collection container and / or the total holder.
  • the memory entries contain position data of the sample or the sample surface on the respective slide and optionally on the respective sample holder.
  • the memory entries contain certain control steps or program steps according to which the analysis or the laser microdissection of the sample is carried out.
  • the sample can be automatically aligned relative to the microscope in a desired convenient manner and the analysis or laser microdissection can be performed automatically according to the stored control steps or program steps.
  • the memory entries that are assigned to the parent preparation carrier elements each contain a position and / or number of identification labels on the respective subordinate preparation carrier element.
  • the specimen carrier element is designed, for example, as a larger unit, which is composed of several specimen carrier elements (in particular a specimen holder comprising a plurality of specimen slides or a total holder comprising a plurality of trapping containers)
  • the memory entries may contain in particular at which position or at which coordinates the identification markings of the respective ones Carrier elements are located or at which position the individual specimen carrier elements or the samples thereon are or which dimensions they have.
  • the memory entries of the individual preparation carrier elements in the arithmetic unit each contain a storage location at which analysis data, which are acquired during the analysis of the sample, are stored.
  • this analysis data is used to document the analysis.
  • these analysis data may also contain results of the analysis.
  • these stored analysis data are uniquely assigned to the corresponding sample.
  • all analysis data can be stored to allow for later evaluation or to be able to trace the analysis at a later date.
  • the identification tag the analysis data can be uniquely assigned to the respective sample and clearly traced.
  • images and / or videos which are acquired during the analysis of the sample are stored as analysis data at the storage location.
  • images of the sample which are generated by the microscope, stored as an image or video.
  • the process of cutting can be stored in particular as a video.
  • images before and after the laser microdissection can be stored as analysis data.
  • a date and / or time is stored as an analysis file, in particular for which the analysis was or was started or ended.
  • parameter values are stored as an analysis file. These parameter values are adjusted in particular during the analysis of the data on the microscope or the laser microdissection device.
  • Such parameter values may be, for example, set values with respect to an illumination light of the microscope, with respect to a camera and / or with respect to the laser beam of the laser microdissection device (intensity, wavelength).
  • Such parameter values can be used in particular for a later evaluation or in order to be able to follow the analysis at a later time.
  • the storage location at which the analysis data is stored is identical for all slide support elements used to analyze the sample. This ensures that the same analysis data is not stored separately for all specimen carrier elements, which would unnecessarily require storage space. Furthermore, it is thus ensured that all analysis data of a sample are stored in the same storage location.
  • This analysis data of a particular sample can be linked to all the memory entries of the individual sample carrier elements used to analyze that particular sample.
  • the preparation carrier elements which are used to analyze the sample respectively provided with a barcode as an identification mark.
  • the barcodes of the individual preparation carrier elements are preferably detected by means of a barcode scanner.
  • the preparation carrier elements which are used for analyzing the sample each provided with a QR code ("Quick Response Code") as identification identification. QR code is less error prone.
  • the QR codes of the individual preparation carrier elements are preferably detected by means of a QR code scanner.
  • This bar code scanner or QR code scanner is designed in particular as a part of the microscope.
  • the bar code scanner or the QR code scanner can also be designed as a module that can be flexibly arranged at a suitable position of the microscope.
  • the microscope has a plurality of bar code scanners or a plurality of QR code scanners, which can each be arranged in particular at appropriate positions.
  • the bar code scanner or the QR code scanner can detect the bar codes or the QR codes of the preparation carrier elements without contact.
  • the bar code scanner or the QR code scanner can be arranged to save space on the microscope.
  • the bar codes or QR codes can be arranged to save space on the specimen carrier elements.
  • FIG. 1 schematically shows a preferred embodiment of a microscope according to the invention.
  • a preferred embodiment of a microscope according to the invention for analyzing a sample is shown schematically and designated 100.
  • the microscope 100 has an expedient microscope body 110.
  • Such a microscope body 1 10 is well known and will not be explicitly explained at this point.
  • the microscope 100 has a laser microdissection device 120, by means of which a laser beam is generated, coupled into the incident light device of the microscope 100 and can be moved on a sample.
  • a laser microdissection device 120 is also well known and will not be explained explicitly at this point.
  • a sample holder 140 is formed as a (higher-level) preparation carrier element. On the sample holder 140 a plurality of slides 141 and 142 are arranged as further (subordinate) preparation carrier elements. The sample holder 140 and the slides 141 and 142 each have an identification mark 140a, 141a, 142a. The identification marks 140a, 141a, 142a are formed as barcodes. These barcodes 140a, 141a, 142a uniquely characterize the respective specimen carrier element.
  • sample section 171 and 172 On the slide 141 and 142 are each a part (sample section) 171 and 172 of the same sample.
  • certain objects are cut out of the parts 171 and 171 of the sample by means of a laser beam generated by the laser microdissection device 200. These objects are collected in catch containers 151, 152 and 153.
  • the collecting container 151, 152 and 153 are arranged on a total holder 150.
  • the total holder 150 and the individual collecting containers 151, 152 and 153 are designed as further preparation carrier elements.
  • Both the total holder 150 and the individual collecting containers 151, 152 and 153 each have an identification marking designed as barcode 150a, 151a, 152a or 153a.
  • the identification markings 140a, 141a, 142a and 150a, 151a, 152a, 153a may also be designed as QR codes.
  • the sample holder 140 and thus the individual slides 141 and 142 are loaded into the microscope 100. This can be done manually by a user or in particular also automatically. Furthermore, the total holder 150 and thus the individual collection containers 151, 152 and 153 are loaded into the microscope 100. This can likewise be done by a user or in particular automatically.
  • the microscope 100 further has three detection devices designed as bar code scanners 161, 162, 163 for detecting the bar codes.
  • the detection devices 161, 162, 163 can also be designed as QR code scanners for detecting QR codes.
  • the bar code scanner 161, 162, 163 are expediently arranged on the microscope body 1 10.
  • the bar code scanners 161, 162, 163 are freely pivotable and / or freely rotatable.
  • the barcode scanners can also be designed as modules that can be flexibly adapted to the current application on the microscope body 110.
  • a computing unit 130 is configured as a computer with a database. For each of the specimen carrier elements 140, 141, 142, 150, 151, 152, 153, a corresponding memory entry is present in this arithmetic unit 130. In preparation for the laser microdissection, a database of the computing unit 130 is created at least with all important information about the sample including its origin.
  • the barcode 140a is automatically detected by at least one barcode scanner 161, 162, 163.
  • the corresponding memory entry here contains information about the number and positioning of the bar codes 141 a, 142 a of the slide 141, 142 on the sample holder 140. Based on this information, the bar codes 141 a, 142 a of these slides can be scanned / read. For example, these barcodes are linked to memory entries that contain important information about the particular sample on the slide.
  • a corresponding memory in the database for recording the application information and the analysis data can be reserved.
  • the total holder 150 is loaded into the system.
  • the barcode 150a of the total holder 150 is scanned / detected by at least one barcode scanner 161, 162, 163 and the barcodes 151a, 152a, 153a of the individual receptacles 151, 152, 153 are scanned / detected on the basis of the positions determined by the barcode 150a.
  • the associated memory entries of the slides and the receptacles are linked together to automatically assign each slide to the right or the collection container.
  • the memory entries each contain data or information relating to the type and dimensions of the slides 141 and 142, the sample holder 140, the collection containers 151, 152, 153 and the total holder 150.
  • the memory entries contain specific control steps or program steps according to which the Laser microdissection of the sample is performed.

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Abstract

The present invention relates to a method for analysing a sample by means of a microscope and to a microscope for analysing a sample, wherein preparation carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153), which are used for analysing the sample, are each provided with an identification marking (140a, 141a, 142a, 150a, 151a, 152a, 153a), wherein the identification markings (140a, 141a, 142a, 150a, 151a, 152a, 153a) of the individual preparation carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153) are detected by a detection device (161, 162, 163), wherein, based on the detected identification markings (140a, 141a, 142a, 150a, 151a, 152a, 153a) of the individual preparation carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153), memory entries in a processing unit (130) which are assigned to the individual preparation carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153) are recognised, and wherein the memory entries in the processing unit (130) are linked with one another in order to determine the preparation carrier elements to be used for analysing the sample.

Description

Verfahren zum Analysieren einer Probe mit einem Mikroskop  Method for analyzing a sample with a microscope
Beschreibung description
Die vorliegende Erfindung betrifft ein Verfahren zum Analysieren einer Probe mit einem Mikroskop sowie ein Mikroskop zum Analysieren einer Probe. The present invention relates to a method for analyzing a sample with a microscope, and to a microscope for analyzing a sample.
Stand der Technik State of the art
Um biologische Proben bzw. Präparate mit einem Mikroskop zu analysieren bzw. zu bearbeiten, werden unterschiedliche Präparatträgerelemente verwendet. Die Probe wird dabei insbesondere auf einen Objektträger aufgebracht. Der Objektträgers kann in das Mikroskop eingebracht und die Probe analysiert werden. Mehrere derartiger Objektträger können wiederum auf einen Probenhalter aufgebracht werden.  In order to analyze or process biological samples or preparations with a microscope, different preparation carrier elements are used. The sample is applied in particular to a slide. The slide can be placed in the microscope and the sample analyzed. Several such slides can in turn be applied to a sample holder.
Im Zuge einer Laser-Mikrodissektion können bestimmte Zellen, Gewebebereiche oder ähnliches der Probe ausgewählt und für die weitere Analyse mit Hilfe eines fokussierten Laserstrahls als sogenanntes Dissektat herausgetrennt bzw. herausgeschnitten ("dissektiert") werden. Die Probe befindet sich in der Regel auf einer In the course of a laser microdissection, certain cells, tissue areas or the like of the sample can be selected and cut out or "dissected out" for further analysis with the aid of a focused laser beam as a so-called dissectate. The sample is usually on one
Folie (Membran), die ihrerseits auf einen zweckmäßigen Objektträger aufgebracht ist.Film (membrane), which in turn is applied to a convenient slide.
Das herausgeschnittene Dissektat fällt unter dem Einfluss der Schwerkraft in einen geeigneten Auffangbehälter. The dissected out drops under the influence of gravity in a suitable container.
Ein Verfahren zur Laser-Mikrodissektion ist beispielsweise aus der DE 10 2004 051 508 A1 bekannt. Dabei wird eine Soll-Schnittlinie eines Objekts, welches aus der Probe ausgeschnitten werden soll, anhand der Objektkontur bestimmt und das Objekt wird entlang dieser Soll-Schnittlinie mittels einer Relativbewegung zwischen einem Laserstrahl und der Probe ausgeschnitten.  A method for laser microdissection is known, for example, from DE 10 2004 051 508 A1. In this case, a desired cutting line of an object, which is to be cut out of the sample, determined based on the object contour and the object is cut along this desired cutting line by means of a relative movement between a laser beam and the sample.
Um sämtliche derartigen Präparatträgerelemente, wie Objektträger und Auffangbehälter, welche für eine Analyse bzw. zum Bearbeiten einer Probe verwendet werden, im Zuge dieser Analyse bzw. Bearbeitung und auch zu einem späteren Zeitpunkt der Probe eindeutig zuordnen zu können, sind unterschiedliche Methoden bekannt. Die einfachste Methode ist dabei, dass ein Benutzer sämtliche Präparatträgerelemente manuell beschriftet und kennzeichnet. Diese Methode ist jedoch sehr zeitaufwendig und fehleranfällig. To be able to unambiguously assign all such preparation carrier elements, such as slides and collecting containers, which are used for an analysis or for processing a sample in the course of this analysis or processing and also at a later time of the sample, different methods are known. The simplest method is to have one user do all of them Carrier elements labeled and labeled manually. However, this method is very time consuming and error prone.
Die Präparatträgerelemente können auch auf digitale Weise gekennzeichnet werden. Aus der DE 10 2004 031 570 A1 ist beispielsweise eine Objektträgervorrichtung zur Aufnahme eines mit einem Mikroskop zu untersuchenden oder mit einem Laboranalysesystem zu bearbeitenden Objekts bekannt. Der Objektträger weist einen Radio-Frequency-Identification-Tag (RFID-Tag) auf. Auf diesem ist eine den Objektträger und/oder das Objekt identifizierende Information abspeicherbar. Die RFID-Tags sollen den Nachteil der begrenzten und nicht-veränderbaren Datenmengen überwinden, die auf einem Barcode gespeichert werden können.  The slide carrier elements can also be marked digitally. From DE 10 2004 031 570 A1, for example, an object carrier device for receiving an object to be examined by a microscope or to be processed with a laboratory analysis system is known. The slide has a radio frequency identification (RFID) tag. On this a the slide and / or the object identifying information is stored. The purpose of the RFID tags is to overcome the disadvantage of limited and non-changeable amounts of data that can be stored on a barcode.
Aus der DE 102 40 814 A1 ist ein Probenhalter bekannt, der mit einem Transponder verbunden ist, der seinerseits auslesbar und beschreibbar ist. Hierdurch können Informationen über die auf dem Probenhalter befindlichen Proben abgespeichert und ausgelesen werden.  From DE 102 40 814 A1, a sample holder is known, which is connected to a transponder, which in turn is readable and writable. As a result, information about the samples on the sample holder can be stored and read out.
Mittels dieser Methoden ist zwar eine Identifikation von Präparatträgerelementen möglich, jedoch müssen die Präparatträgerelemente dabei aktiv gekennzeichnet werden, beispielsweise durch manuelles Beschriften oder durch Abspeichern einer Information auf dem RFID-Tag. Eine (teil-) automatische oder vollautomatische Zuordnung von verschiedenen Präparatträgerelementen zu einer Probe ist dabei nicht oder zumindest kaum möglich. Although an identification of preparation carrier elements is possible by means of these methods, the preparation carrier elements must be actively marked thereby, for example by manual labeling or by storing information on the RFID tag. A (partially) automatic or fully automatic assignment of different preparation carrier elements to a sample is not or at least hardly possible.
Es ist daher wünschenswert, eine Möglichkeit bereitzustellen, um eine verbesserte und vereinfachte Zuordnung von verschiedenen Präparatträgerelementen einer zu analysierenden Probe durchzuführen, insbesondere (teil-) automatisch oder vollautomatisch.  It is therefore desirable to provide a way to perform an improved and simplified allocation of different preparation carrier elements of a sample to be analyzed, in particular (partially) automatically or fully automatically.
Offenbarung der Erfindung Disclosure of the invention
Erfindungsgemäß werden ein Verfahren zum Analysieren einer Probe mit einem Mikroskop sowie ein Mikroskop zum Analysieren einer Probe mit den Merkmalen der unabhängigen Patentansprüche vorgeschlagen. Vorteilhafte Ausgestaltungen sind Gegenstand der Unteransprüche sowie der nachfolgenden Beschreibung.  According to the invention, a method for analyzing a sample with a microscope as well as a microscope for analyzing a sample with the features of the independent patent claims are proposed. Advantageous embodiments are the subject of the dependent claims and the following description.
Dabei sind Präparatträgerelemente, welche zum Analysieren der Probe verwendet werden, jeweils mit einer Identifikationskennzeichnung versehen. Diese Identifikationskennzeichnungen der einzelnen Präparatträgerelemente werden durch eine Erfassungsvorrichtung erfasst. Anhand der erfassten Identifikationskennzeichnungen der einzelnen Präparatträgerelemente werden Speichereinträge in einer Recheneinheit erkannt. Diese Speichereinträge sind dabei jeweils den einzelnen Präparatträgerelementen zugeordnet. Um zu bestimmen, welche Präparatträgerelemente zur Analyse einer bestimmten Probe zu verwenden sind, werden die Speichereinträge in der Recheneinheit miteinander verknüpft. Zur selben Probe gehörige Speichereinträge (und somit Präparatträgerelemente) sind einander zugeordnet und können automatisch identifiziert werden. In this case, preparation carrier elements which are used to analyze the sample, each provided with an identification mark. These Identification labels of the individual preparation carrier elements are detected by a detection device. Based on the detected identification labels of the individual specimen carrier elements memory entries are detected in a computing unit. These memory entries are in each case assigned to the individual preparation carrier elements. In order to determine which slide carrier elements to use for analysis of a particular sample, the memory entries in the computing unit are linked together. Memory entries belonging to the same sample (and thus preparation carrier elements) are assigned to one another and can be identified automatically.
Unter "Präparatträgerelemente" sind dabei Elemente zu verstehen, auf welchen die Probe oder Teile der Probe aufgebracht oder eingebracht werden können. Insbesondere sind derartige Präparatträgerelemente Objektträger, Petrischalen, Multiwell-Behältnisse oder Auffangbehälter für die Mikrodissektion. The term "preparation carrier elements" is to be understood as meaning elements on which the sample or parts of the sample can be applied or introduced. In particular, such preparation carrier elements are slides, Petri dishes, multiwell containers or collecting containers for microdissection.
Vorteile der Erfindung  Advantages of the invention
Durch die Erfindung wird eine (teil-) automatische, insbesondere eine vollautomatische, Zuordnung der Präparatträgerelemente zu der Probe sowie zueinander ermöglicht. Wenn die Probe analysiert werden soll und wenn dabei eine Identifikationskennzeichnung eines Präparatträgerelementes erfasst wird, werden Speichereinträge, welche diesem Präparatträgerelement zugeordnet sind, in der Recheneinheit automatisch der zu analysierenden Probe zugewiesen bzw. mit dieser verknüpft. Sämtliche Speichereinträge, die entsprechenden Präparatträgerelementen zugeordnet sind, deren Identifikationskennzeichnung im Zuge der Analyse der bestimmten Probe erfasst werden, werden (insbesondere automatisch) miteinander verknüpft. Somit werden insbesondere sämtliche Präparatträgerelemente, die zur Analyse der bestimmten Probe verwendet werden, miteinander und somit mit der Probe verknüpft. Diese Verknüpfung erfolgt insbesondere vollautomatisch in der Recheneinheit, ohne Zutun bzw. Eingreifen eines Benutzers. The invention makes possible a (partially) automatic, in particular fully automatic, assignment of the preparation carrier elements to the sample and to one another. If the sample is to be analyzed and if an identification tag of a specimen carrier element is detected, memory entries which are assigned to this specimen carrier element are automatically assigned in the arithmetic unit to the sample to be analyzed or linked thereto. All memory entries which are assigned to corresponding preparation carrier elements whose identification markings are detected during the analysis of the particular sample are linked together (in particular automatically). Thus, in particular all the preparation carrier elements which are used for the analysis of the particular sample are linked to each other and thus to the sample. This linkage is in particular fully automatic in the arithmetic unit, without intervention or intervention of a user.
In der Recheneinheit ist insbesondere jedes mögliche Präparatträgerelement, welches zum Analysieren der Probe verwendet werden kann, a priori hinterlegt. Für jedes mögliche Präparatträgerelement ist dabei zumindest ein Speichereintrag in der Recheneinheit hinterlegt. Dieser Speichereintrag enthält dabei insbesondere zweckmäßige Informationen zu dem Präparatträgerelement. Die Präparatträgerelemente weisen bereits a priori jeweils eine Identifikationskennzeichnung auf. Insbesondere sind die einzelnen Präparatträgerelemente durch die jeweilige Identifikationskennzeichnung eindeutig charakterisiert bzw. identifiziert. Diese Identifikationskennzeichnung ist insbesondere auch in dem entsprechenden dem Präparatträgerelement zugeordneten Speichereintrag hinterlegt oder zeigt (in Form eines pointers) auf den Speichereintrag. Mittels der Identifikationskennzeichnung kann somit jedes Präparatträgerelement eindeutig seinem entsprechenden Speichereintrag zugeordnet werden. Auf diese Weise können die einzelnen Speichereinträge aller Präparatträgerelemente, deren Identifikationskennzeichnungen im Zuge der Analyse erfasst werden, automatisch miteinander verknüpft werden und somit beispielsweise zueinander passende Präparatträgerelemente oder zu einer bestimmten Probe passende Präparatträgerelemente bestimmt bzw. identifiziert werden. In particular, every possible preparation carrier element that can be used for analyzing the sample is stored a priori in the arithmetic unit. At least one memory entry is stored in the arithmetic unit for each possible carrier element. This memory entry contains in particular useful information about the specimen carrier element. The preparation carrier elements already have one a priori Identification mark on. In particular, the individual preparation carrier elements are uniquely characterized or identified by the respective identifier. This identification marking is also stored in particular in the corresponding memory entry assigned to the preparation carrier element or points (in the form of a pointer) to the memory entry. By means of the identification tag, each specimen carrier element can thus be unambiguously assigned to its corresponding memory entry. In this way, the individual memory entries of all specimen carrier elements whose identification markings are detected in the course of the analysis can be automatically linked to one another and thus, for example, matching specimen carrier elements or specimen carrier elements that are suitable for a particular specimen can be determined or identified.
Es ist beispielsweise auch möglich, eine Probe auf mehrere Präparatträgerelemente zu verteilen. Insbesondere wird die Probe auf mehrere Objektträger aufgebracht bzw. mehrere Teile der Probe werden auf unterschiedliche Objektträger aufgebracht. Durch die Erfindung kann auf einfache Weise hinterlegt werden, dass diese Objektträger zu derselben Probe bzw. demselben Patienten gehören.  For example, it is also possible to distribute a sample over several preparation carrier elements. In particular, the sample is applied to a plurality of slides or several parts of the sample are applied to different slides. By the invention can be deposited in a simple manner that these slides belong to the same sample or the same patient.
Derartige Präparatträgerelemente können auch Probenhalter sein, auf welchen jeweils mehrere Objektträger aufgebracht sind. Dabei können sowohl der Probenhalter als auch die einzelnen Objektträger jeweils eine Identifikationskennzeichnung aufweisen. Beispielsweise können sämtliche Objektträger auf dem Probenhalter und der Probenhalter über deren Speichereinträge in der Recheneinheit miteinander verknüpft werden. Dabei können unterschiedliche Objektträger auf dem Probenhalter zu gleichen oder unterschiedlichen Proben gehören. Durch die Erfindung wird es somit ermöglicht, auf einfache Weise automatisch zu hinterlegen, welche Objektträger zu welcher Probe gehören.  Such preparation carrier elements can also be sample holders, on each of which several slides are applied. In this case, both the sample holder and the individual slides each have an identification tag. For example, all slides on the sample holder and the sample holder can be linked to each other via their memory entries in the arithmetic unit. Different slides on the sample holder may belong to the same or different samples. The invention thus makes it possible to automatically deposit in a simple manner which slides belong to which sample.
Somit kann insbesondere eine (teil-)automatische bzw. vollautomatische Analyse der Probe bzw. unterschiedlicher Proben ermöglicht werden. Einzelne Proben (auf unterschiedlichen Objektträgern) können dabei automatisch in das Mikroskop eingebracht werden. Die Objektträger und etwaige weitere Präparatträgerelemente wie Auffangbehälter werden automatisch identifiziert und der Probe korrekt zugeordnet. Thus, in particular a (partially) automatic or fully automatic analysis of the sample or different samples can be made possible. Individual samples (on different slides) can be automatically inserted into the microscope. The slides and any other specimen support elements such as collection containers are automatically identified and assigned to the sample correctly.
Insbesondere eignet sich die Erfindung für ein Mikroskop mit einem Slidescanner. In einem derartigen Slidescanner kann eine Vielzahl an Präparatträgerelementen, insbesondere an Objektträgern, eingebracht werden. Insbesondere können dabei bis zu 400 Objektträger in einem derartigen Slidescanner eingebracht werden. Diese Präparatträgerelemente werden dabei nacheinander automatisch in das Mikroskop geladen und analysiert. Durch die Erfindung kann dabei auf einfache Weise die Identifikationskennzeichnung jedes einzelnen Präparatträgerelementes erfasst werden, wenn dieses Präparatträgerelement in das Mikroskop geladen wird. In der Recheneinheit wird dieses Präparatträgerelement mit der jeweiligen Probe verknüpft bzw. sämtliche Präparatträgerelemente, mit denen dieselbe Probe (oder unterschiedliche Teile derselben Probe) analysiert werden, werden miteinander über die entsprechenden Speichereinträge verknüpft. Anschließend wird die Probe automatisch analysiert. Somit wird eine vollautomatische Analyse der Probe ermöglicht. In particular, the invention is suitable for a microscope with a slide scanner. In such a slide scanner, a plurality of preparation carrier elements, especially on slides, are introduced. In particular, up to 400 slides can be introduced in such a slide scanner. These preparation carrier elements are automatically loaded one after the other into the microscope and analyzed. By means of the invention, the identification marking of each individual preparation carrier element can be detected in a simple manner when this preparation carrier element is loaded into the microscope. In the arithmetic unit, this preparation carrier element is linked to the respective sample or all preparation carrier elements with which the same sample (or different parts of the same sample) are analyzed are linked to one another via the corresponding memory entries. Subsequently, the sample is automatically analyzed. Thus, a fully automatic analysis of the sample is possible.
Die Präparatträgerelemente können dabei bereits in einem Herstellungsprozess mit der jeweiligen Identifikationskennzeichnung versehen werden. Die zugehörigen Speichereinträge der einzelnen Präparatträgerelemente können beispielsweise mit den Präparatträgerelementen auf einem entsprechenden Datenträger geliefert werden. Der Datenträger (z.B. CD, DVD, USB-Stick, Flash-Speicher) kann dabei an die entsprechende Recheneinheit angeschlossen werden und die Speichereinträge können auf die Recheneinheit von dem Datenträger übertragen werden. Alternativ ist es auch möglich, herkömmliche Präparatträgerelemente nachzurüsten. Dabei werden die Präparatträgerelemente mit der entsprechenden Identifikationskennzeichnungen versehen.  The preparation carrier elements can already be provided in a manufacturing process with the respective identification marking. The associated memory entries of the individual preparation carrier elements can be supplied, for example, with the preparation carrier elements on a corresponding data carrier. The data carrier (for example CD, DVD, USB stick, flash memory) can be connected to the corresponding arithmetic unit and the memory entries can be transferred to the arithmetic unit from the data carrier. Alternatively, it is also possible to retrofit conventional preparation carrier elements. The specimen carrier elements are provided with the corresponding identification markings.
Die Recheneinheit ist insbesondere als ein Teil des Mikroskops ausgebildet. Weiter insbesondere kann die Recheneinheit als ein Modul ausgebildet sein, welches mit dem Mikroskop verbindbar ist. Insbesondere ist die Recheneinheit als ein Teil eines Computers oder Steuergeräts ausgebildet. Weiter insbesondere umfasst die Recheneinheit eine zweckmäßige Datenbank. Insbesondere sind in dieser Datenbank die entsprechenden Speichereinträge der einzelnen Präparatträgerelemente in Abhängigkeit von deren Identifikationskennzeichnungen gespeichert.  The arithmetic unit is designed in particular as a part of the microscope. In particular, the arithmetic unit can be designed as a module which can be connected to the microscope. In particular, the arithmetic unit is designed as part of a computer or control unit. In particular, the arithmetic unit comprises a suitable database. In particular, the corresponding memory entries of the individual specimen carrier elements are stored in this database as a function of their identification markings.
Die Analyse der Probe wird insbesondere mittels eines Steuergeräts und/oder einer Steuersoftware zum Steuern des Mikroskops durchgeführt. Dieses Steuergerät bzw. diese Steuersoftware steht insbesondere mit der Recheneinheit in Kommunikation. Alternativ kann die Steuersoftware insbesondere auch auf der Recheneinheit selbst ausgeführt werden. The analysis of the sample is carried out in particular by means of a control device and / or a control software for controlling the microscope. This control unit or this control software is in particular with the computing unit in communication. Alternatively, the control software can be executed in particular also on the arithmetic unit itself.
Die Recheneinheit wird insbesondere für die Analyse der Probe verwendet. Beispielsweise kann mittels der Recheneinheit ein vergrößertes Abbild der Probe bzw. eines Bereichs der Probe, welches von dem Mikroskop erzeugt wird, angezeigt und/oder als Bild- bzw. Videodatei gespeichert werden. Dieses vergrößerte Abbild wird insbesondere von dem Steuergerät bzw. der Steuersoftware zum Steuern des Mikroskops an die Recheneinheit weitergeleitet.  The arithmetic unit is used in particular for the analysis of the sample. For example, by means of the arithmetic unit an enlarged image of the sample or a region of the sample which is generated by the microscope can be displayed and / or stored as an image or video file. This enlarged image is forwarded in particular by the control unit or the control software for controlling the microscope to the arithmetic unit.
Das Mikroskop weist dabei zumindest eine zweckmäßige Erfassungsvorrichtung zum Erfassen der Identifikationskennzeichnungen auf. Insbesondere ist diese Erfassungsvorrichtung mit der Recheneinheit und/oder der Steuergerät bzw. der Steuersoftware verbunden bzw. kann mit selbigen kommunizieren. Wenn die Erfassungsvorrichtung eine spezielle Identifikationskennzeichnung erfasst, steht dem Steuergerät bzw. der Steuersoftware insbesondere die jeweiligen zugordneten Speichereinträge zur Verfügung.  The microscope has at least one expedient detection device for detecting the identification markings. In particular, this detection device is connected to the arithmetic unit and / or the control unit or the control software or can communicate with the same. If the detection device detects a specific identification tag, the control device or the control software is in particular provided with the respective allocated memory entries.
Gemäß einer bevorzugten Ausführung der Erfindung wird im Zuge der Analyse der Probe eine Laser-Mikrodissektion der Probe durchgeführt. Dabei weist das Mikroskop eine geeignete Laser-Mikrodissektionsvorrichtung auf. Das Mikroskop und die Laser- Mikrodissektionsvorrichtung bilden dabei zusammen ein Laser- Mikrodissektionssystem. Die Laser-Mikrodissektionsvorrichtung weist insbesondere eine Vorrichtung zum Erzeugen eines Laserstrahls, beispielsweise eines Infrarot- oder Ultraviolettlaserstrahls, auf. Aus der Probe kann mittels dieses Laserstrahls ein Dissektat isoliert werden, das vorzugsweise unter dem Einfluss der Schwerkraft in einen geeigneten Auffangbehälter fällt. Das Mikroskop weist dabei insbesondere eine Auflichteinrichtung auf, in deren Strahlengang der Laserstrahl eingekoppelt wird.  According to a preferred embodiment of the invention, a laser microdissection of the sample is carried out in the course of the analysis of the sample. In this case, the microscope has a suitable laser microdissection device. The microscope and the laser microdissection device together form a laser microdissection system. In particular, the laser microdissection device has a device for generating a laser beam, for example an infrared or ultraviolet laser beam. From the sample, a dissectate can be isolated by means of this laser beam, which preferably falls under the influence of gravity into a suitable collecting container. In particular, the microscope has an incident light device in the beam path of which the laser beam is coupled.
Der Laserstrahl wird durch das jeweils verwendete Mikroskopobjektiv auf die Probe fokussiert, die beispielsweise auf einem motorisch-automatisch verfahrbaren Mikroskoptisch aufliegt. Eine Schnittlinie wird beispielsweise dadurch erzeugt, dass der Mikroskoptisch beim Schneiden verfahren wird, um die Probe relativ zu dem feststehenden Laserstrahl zu bewegen. Alternativ und bevorzugt kann die Laser- Mikrodissektionsvorrichtung auch eine Laserablenk- bzw. Laserscaneinrichtung aufweisen, die dazu eingerichtet ist, den Laserstrahl bzw. dessen Auftreffpunkt über eine feststehende Probe zu bewegen. Im Zuge einer derartigen Laser-Mikrodissektion der Probe wird vorteilhafterweise ein Objektträger als ein erstes Präparatträgerelement zum Analysieren der Probe verwendet. Der Objektträger ist mit einer ersten Identifikationskennzeichnung versehen. Ein Auffangbehälter wird als ein zweites Präparatträgerelement zum Analysieren der Probe verwendet und ist mit einer zweiten Identifikationskennzeichnung versehen. Die erste Identifikationskennzeichnung des Objektträgers und die zweite Identifikationskennzeichnungen des Auffangbehälters werden erfasst. Anhand der erfassten ersten Identifikationskennzeichnung des Objektträgers wird ein Speichereintrag, welcher dem Objektträger zugeordnet ist, in der Recheneinheit erkannt, also aufgefunden und gelesen. Anhand der erfassten zweiten Identifikationskennzeichnung des Auffangbehälters wird ein Speichereintrag, der dem Auffangbehälter zugeordnet ist, in der Recheneinheit erkannt. Die Speichereinträge des Objektträgers und des Auffangbehälters werden miteinander verknüpft. Auf diese Weise kann zu einem Objektträger der richtige Auffangbehälter automatisch ermittelt und zur Analyse verwendet werden. The laser beam is focused by the respective microscope objective used on the sample, which rests for example on a motor-automatically movable microscope stage. A cutting line is produced, for example, by moving the microscope stage during cutting in order to move the sample relative to the stationary laser beam. Alternatively and preferably, the laser microdissection device can also have a laser deflection or laser scanning device, which is set up to move the laser beam or its point of impingement over a stationary sample. In the course of such a laser microdissection of the sample, a slide is advantageously used as a first slide carrier element for analyzing the sample. The slide is provided with a first identification mark. A collection container is used as a second sample carrier member for analyzing the sample and is provided with a second identification tag. The first identifier of the slide and the second identifier of the collection container are detected. Based on the detected first identifier of the slide a memory entry, which is associated with the slide, detected in the arithmetic unit, so found and read. Based on the detected second identifier of the collection container, a memory entry, which is associated with the collecting container, detected in the arithmetic unit. The storage entries of the slide and the collection container are linked together. In this way, the correct collection container for a slide can be automatically determined and used for analysis.
Ein ausgewähltes Objekt wird mittels der Laser-Mikrodissektion aus der Probe herausgeschnitten und als Dissektat in den Auffangbehälter transportiert. In der Recheneinheit sind sämtliche Präparatträgerelemente, welche im Zuge der Laser- Mikrodissektion der Probe verwendet werden, miteinander verknüpft. Durch diese Verknüpfung ist in der Recheneinheit somit eindeutig hinterlegt, dass das Dissektat in dem entsprechenden Auffangbehälter zu der Probe auf dem entsprechenden Objektträger gehört. Somit kann auf einfache Weise eine automatische bzw. vollautomatische Laser-Mikrodissektion durchgeführt werden  A selected object is cut out of the sample by means of the laser microdissection and transported as a dissectate into the collecting container. All the preparation carrier elements which are used in the course of the laser microdissection of the sample are linked to one another in the arithmetic unit. As a result of this combination, it is thus clearly established in the arithmetic unit that the dissectate in the corresponding collecting container belongs to the sample on the corresponding microscope slide. Thus, an automatic or fully automatic laser microdissection can be performed in a simple manner
In einer vorteilhaften Ausgestaltung der Erfindung sind mehrere Präparatträgerelemente zu einem übergeordneten Präparatträgerelement zusammengefasst und mit einer (gemeinsamen) Identifikationskennzeichnung versehen. Zusätzlich kann auch jedes einzelne dieser zusammengefassten Präparatträgerelemente auch mit einer eigenen Identifikationskennzeichnung versehen sein. Bevorzugt sind dabei mehrere Objektträger zu einem Probenhalter als übergeordnetes Präparatträgerelement zusammengefasst und mit einer ersten übergeordneten Identifikationskennzeichnung versehen. Alternativ oder zusätzlich sind weiter bevorzugt mehrere Auffangbehälter zu einem Gesamthalter als übergeordnetes Präparatträgerelement zusammengefasst und mit einer zweiten übergeordneten Identifikationskennzeichnung versehen. Aus einer Probe können somit auch mehrere Dissektate herausgeschnitten werden, die insbesondere jeweils in einen eigenen Auffangbehälter eines Gesamthalters transportiert werden. Der entsprechende Objektträger und die einzelnen Auffangbehälter können dabei auf einfache Weise der Probe zugeordnet werden. Dabei werden automatisch sämtliche Speichereinträge miteinander verknüpft. In an advantageous embodiment of the invention, several preparation carrier elements are combined to form a parent preparation carrier element and provided with a (common) identification marking. In addition, each individual of these combined preparation carrier elements can also be provided with its own identification mark. In this case, a plurality of microscope slides are preferably combined to form a sample holder as a higher-level preparation carrier element and provided with a first, higher-order identifier. As an alternative or in addition, more preferably, a plurality of collecting containers are combined to form an overall holder as a higher-level preparation carrier element and provided with a second, upper-level identification marking. Thus, several dissectates can also be excised from one sample, which in particular are each transported into a separate collecting container of an overall holder. The corresponding slide and the individual collection containers can be assigned to the sample in a simple manner. In doing so, all memory entries are automatically linked with each other.
Es ist auch möglich, mehrere Teile der Probe bzw. mehrere Proben desselben Ursprungs (insbesondere desselben Patienten) auf mehrere Objektträger eines Probenhalters aufzubringen. Diese unterschiedlichen Teile der Probe und zugehörige Auffangbehälter (bzw. deren jeweiligen Speichereinträge) werden in der Recheneinheit miteinander verknüpft.  It is also possible to apply several parts of the sample or several samples of the same origin (in particular the same patient) to a plurality of slides of a sample holder. These different parts of the sample and associated collection container (or their respective memory entries) are linked together in the arithmetic unit.
Somit kann auf einfache Weise eine automatische bzw. vollautomatische Laser- Mikrodissektion durchgeführt werden, sowohl von einer, als auch von mehreren unterschiedlichen Proben. Ein Verfahren zur (automatischen) Laser-Mikrodissektion ist beispielsweise aus der DE 10 2004 051 508 A1 von derselben Anmelderin bekannt. Dabei wird eine Soll-Schnittlinie eines Objekts, welches aus einem Präparat bzw. einer Probe ausgeschnitten werden soll, markiert und mittels einer Relativbewegung zwischen einem Laserstrahl und der Probe ausgeschnitten. Ein elektronisches Bild zumindest eines Bildausschnittes der Probe wird aufgenommen, der Bildausschnitt wird bildanalytisch bearbeitet, wobei mindestens ein auszuschneidendes Objekt automatisch ermittelt wird. Die Soll-Schnittlinie um das mindestens eine auszuschneidende Objekt wird automatisch bestimmt. Insbesondere wird die automatisch bestimmte Soll-Schnittlinie durch eine mathematische Transformation automatisch auf eine Laserschnittlinie abgebildet und diese Laserschnittlinie wird in eine Relativbewegung zwischen Laserstrahl und Präparat umgesetzt, wodurch ein Laserschnitt entsteht.  Thus, an automatic or fully automatic laser microdissection can be carried out in a simple manner, both from one and several different samples. A method for (automatic) laser microdissection is known, for example, from DE 10 2004 051 508 A1 by the same Applicant. In this case, a desired cutting line of an object which is to be cut out of a preparation or a sample is marked and cut out by means of a relative movement between a laser beam and the sample. An electronic image of at least one image section of the sample is taken, the image section is processed by image analysis, wherein at least one object to be cut out is automatically determined. The desired cutting line around the at least one object to be cut out is automatically determined. In particular, the automatically determined desired cutting line is automatically imaged by a mathematical transformation on a laser cutting line and this laser cutting line is converted into a relative movement between the laser beam and the preparation, whereby a laser cut is produced.
Durch die vorliegende Erfindung wird es möglich, eine solche automatische Laser- Mikrodissektion an einer beliebigen Anzahl von Proben vollautomatisch durchzuführen. Durch die Erfindung werden dabei Objektträger und Auffangbehälter sowie gegebenenfalls weitere Präparatträgerelemente, welche zur Laser-Mikrodissektion einer speziellen Probe genutzt werden, mit dieser verknüpft. Die Recheneinheit oder ein zweckmäßiges Steuergerät kann insbesondere ein Verfahren zur (automatischen) Laser-Mikrodissektion analog zur DE 10 2004 051 508 A1 durchführen. Anschließend können (insbesondere automatisch) neue Objektträger, Auffangbehälter, usw. eingebracht werden, welche zu einer anderen Probe gehören. Erfindungsgemäß werden diese neuen Präparatträgerelemente mit der neuen Probe verknüpft. Daraufhin kann eine automatische Laser-Mikrodissektion dieser neuen Probe durchgeführt werden. The present invention makes it possible to carry out such an automatic laser microdissection on any number of samples fully automatically. By means of the invention, object carriers and collecting containers as well as optionally further preparation carrier elements which are used for the laser microdissection of a special sample are linked to this. The arithmetic unit or a suitable control device can in particular carry out a method for (automatic) laser microdissection analogous to DE 10 2004 051 508 A1. Subsequently (especially automatically) new slides, collection containers, etc. are introduced, which belong to another sample. According to the invention, these new preparation carrier elements are linked to the new sample. An automatic laser microdissection of this new sample can then be performed.
Insbesondere eignet sich die Erfindung auch für eine Laser- Mikrodissektionsvorrichtung, welche unabhängig von Auffangbehältern betrieben wird. Dabei kann beispielsweise ein Probenfänger für eine Laser- Mikrodissektionsvorrichtung genutzt werden, beispielsweise ein Kapillarfänger. Ein derartiger Kapillarfänger wird beispielsweise in der DE 10 2013 209 455 A1 derselben Anmelderin beschrieben. Darin steht eine Auffangkammer zum Aufnehmen eines Dissektats mit einer Kapillarleitung zum Transport des Dissektats aus dem Auffangbereich in Verbindung. Nach diesem Weiterleiten kann das Dissektat einer Analyse zugeführt werden. In particular, the invention is also suitable for a laser Mikrodissektionsvorrichtung which is operated independently of collecting containers. In this case, for example, a sample catcher can be used for a laser microdissection device, for example a capillary catcher. Such a capillary curtain is described, for example, in DE 10 2013 209 455 A1 of the same Applicant. Therein, a collection chamber for receiving a dissectate communicates with a capillary line for transporting the dissectate from the collection area. After this forwarding, the dissectate can be sent for analysis.
Durch die Erfindung wird es ermöglicht, ein derartiges Laser- Mikrodissektionsvorrichtung mit einem Probenfänger, insbesondere einem Kapillarfänger, automatisch zu betreiben. Dabei können der Kapillarfänger und daran angeschlossene Anlagegeräte oder -ports bzw. eine Vorrichtung zum Steuern dieses Kapillarfängers insbesondere mit der Recheneinheit in Verbindung bzw. in Kommunikation stehen. Dabei können insbesondere die Speichereinträge des Objektträgers und des Kapillarfängers mit den daran angeschlossenen Analysegeräten bzw. -ports miteinander und somit mit der Probe verknüpft werden.  The invention makes it possible to automatically operate such a laser microdissection device with a sample catcher, in particular a capillary catcher. In this case, the capillary catcher and attached equipment or -ports or a device for controlling this capillary can be in particular with the arithmetic unit in communication or in communication. In this case, in particular the memory entries of the slide and the Kapillarfängers with the connected analyzers or ports with each other and thus be associated with the sample.
Bevorzugt enthalten die Speichereinträge, die den einzelnen Präparatträgerelementen zugeordnet sind, jeweils eine Dimension, eine Position, Koordinaten und/oder eine Abmessung des jeweiligen Präparatträgerelementes und/oder der Probe selbst. Die Speichereinträge enthalten somit insbesondere Informationen, welche das jeweilige Präparatträgerelement und/oder die Probe kennzeichnen bzw. dessen physische Ausdehnung beschreiben. Insbesondere enthalten die Speichereinträge Daten bzw. Informationen bezüglich des Typs und der Abmessungen des Objektträgers, des Probenhalters, des Auffangbehälters und/oder des Gesamthalters. Weiter insbesondere enthalten die Speichereinträge Positionsdaten der Probe bzw. der Probenfläche auf dem jeweiligen Objektträger und gegebenenfalls auf dem jeweiligen Probenhalter. Mittels dieser in den Speichereinträgen enthaltenen Informationen, insbesondere mittels der Position der Identifikationskennzeichnungen auf dem jeweiligen Präparatträgerelement, kann insbesondere eine vollautomatische Analyse der Probe durchgeführt werden. The memory entries which are assigned to the individual preparation carrier elements preferably each contain a dimension, a position, coordinates and / or a dimension of the respective preparation carrier element and / or the sample itself. The memory entries thus contain, in particular, information which the particular preparation carrier element and / or the Identify sample or describe its physical extent. In particular, the memory entries contain data or information relating to the type and dimensions of the slide, the sample holder, the collection container and / or the total holder. In particular, the memory entries contain position data of the sample or the sample surface on the respective slide and optionally on the respective sample holder. By means of these information contained in the memory entries, in particular by means of the position of the identification markings on the particular preparation carrier element, in particular a fully automatic analysis of the sample can be performed.
Weiter bevorzugt enthalten die Speichereinträge bestimmte Steuerungsschritte bzw. Programmschritte, gemäß welcher die Analyse bzw. die Laser-Mikrodissektion der Probe durchgeführt wird. Mittels dieser Informationen der Speichereinträge kann die Probe automatisch relativ zu dem Mikroskop in einer gewünschten zweckmäßigen Weise ausgerichtet werden und die Analyse bzw. Laser-Mikrodissektion kann automatisch gemäß den hinterlegten Steuerungsschritten bzw. Programmschritten durchgeführt werden.  More preferably, the memory entries contain certain control steps or program steps according to which the analysis or the laser microdissection of the sample is carried out. By means of this information of the memory entries, the sample can be automatically aligned relative to the microscope in a desired convenient manner and the analysis or laser microdissection can be performed automatically according to the stored control steps or program steps.
Weiter bevorzugt enthalten die Speichereinträge, die den übergeordneten Präparatträgerelementen zugeordnet sind, jeweils eine Position und/oder Anzahl der Identifikationskennzeichnungen auf den jeweiligen untergeordneten Präparatträgerelement. Ist das Präparatträgerelement beispielsweise als eine größere Einheit ausgebildet, welche sich aus mehreren Präparatträgerelementen zusammensetzt (insbesondere ein Probenhalter aus mehreren Objektträgern oder ein Gesamthalter aus mehreren Auffangbehältern), können die Speichereinträge insbesondere enthalten, an welcher Position bzw. an welchen Koordinaten sich die Identifizierungskennzeichnungen der jeweiligen Präparatträgerelemente befinden oder auch an welcher Position sich die einzelnen Präparatträgerelemente oder die darauf befindlichen Proben befinden bzw. welche Abmessungen diese besitzen. More preferably, the memory entries that are assigned to the parent preparation carrier elements each contain a position and / or number of identification labels on the respective subordinate preparation carrier element. If the specimen carrier element is designed, for example, as a larger unit, which is composed of several specimen carrier elements (in particular a specimen holder comprising a plurality of specimen slides or a total holder comprising a plurality of trapping containers), the memory entries may contain in particular at which position or at which coordinates the identification markings of the respective ones Carrier elements are located or at which position the individual specimen carrier elements or the samples thereon are or which dimensions they have.
Vorzugsweise enthalten die Speichereinträge der einzelnen Präparatträgerelemente in der Recheneinheit jeweils einen Speicherort, an welchem Analysedaten, die im Zuge der Analyse der Probe erfasst werden, gespeichert werden. Diese Analysedaten dienen beispielsweise zur Dokumentation der Analyse. Des Weiteren können diese Analysedaten auch Ergebnisse der Analyse enthalten. Mittels der Erfindung werden diese gespeicherten Analysedaten eindeutig der entsprechenden Probe zugeordnet. Somit können sämtliche Analysedaten gespeichert werden, um eine spätere Auswertung zu ermöglichen oder um die Analyse zu einem späteren Zeitpunkt nachvollziehen zu können. Mittels der Identifikationskennzeichnung können die Analysedaten eindeutig der jeweiligen Probe wieder zugeordnet werden und eindeutig rückverfolgt werden.  Preferably, the memory entries of the individual preparation carrier elements in the arithmetic unit each contain a storage location at which analysis data, which are acquired during the analysis of the sample, are stored. For example, this analysis data is used to document the analysis. Furthermore, these analysis data may also contain results of the analysis. By means of the invention, these stored analysis data are uniquely assigned to the corresponding sample. Thus, all analysis data can be stored to allow for later evaluation or to be able to trace the analysis at a later date. By means of the identification tag, the analysis data can be uniquely assigned to the respective sample and clearly traced.
Bevorzugt werden Bilder und/oder Videos, welche im Zuge der Analyse von der Probe erfasst werden, als Analysedaten an dem Speicherort gespeichert. Insbesondere werden dabei Abbilder der Probe, welche von dem Mikroskop erzeugt werden, als Bild bzw. Video gespeichert. Im Zuge der Laser-Mikrodissektion kann der Vorgang des Ausschneidens insbesondere als Video gespeichert werden. Weiter insbesondere können zum Vergleich Bilder vor und nach der Laser-Mikrodissektion als Analysedaten gespeichert werden. Weiter bevorzugt wird ein Datum und/oder eine Uhrzeit als Analysedatei gespeichert, insbesondere zu welchem die Analyse durchgeführt wurde bzw. begonnen wurde bzw. beendet wurde. Preferably, images and / or videos which are acquired during the analysis of the sample are stored as analysis data at the storage location. Especially In this case images of the sample, which are generated by the microscope, stored as an image or video. In the course of laser microdissection, the process of cutting can be stored in particular as a video. In particular, for comparison, images before and after the laser microdissection can be stored as analysis data. Further preferably, a date and / or time is stored as an analysis file, in particular for which the analysis was or was started or ended.
Weiter bevorzugt werden Parameterwerte als Analysedatei gespeichert. Diese Parameterwerte werden insbesondere im Zuge der Analyse der Daten an dem Mikroskop bzw. der Laser-Mikrodissektionsvorrichtung eingestellt. Derartige Parameterwerte können beispielsweise eingestellte Werte bezüglich eines Beleuchtungslichts des Mikroskops, bezüglich einer Kamera und/oder bezüglich des Laserstrahls der Laser-Mikrodissektionsvorrichtung (Intensität, Wellenlänge) sein. Derartige Parameterwerte können insbesondere für eine spätere Auswertung genutzt werden bzw. um die die Analyse zu einem späteren Zeitpunkt nachvollziehen zu können.  More preferably, parameter values are stored as an analysis file. These parameter values are adjusted in particular during the analysis of the data on the microscope or the laser microdissection device. Such parameter values may be, for example, set values with respect to an illumination light of the microscope, with respect to a camera and / or with respect to the laser beam of the laser microdissection device (intensity, wavelength). Such parameter values can be used in particular for a later evaluation or in order to be able to follow the analysis at a later time.
Weiterhin wird dadurch ermöglicht, die Analyse zu einem späteren Zeitpunkt fortzusetzen. Werden die entsprechenden Präparatträgerelemente der Probe zu einem späteren Zeitpunkt erneut in das Mikroskop eingebracht, können an dem Mikroskop bzw. der Laser-Mikrodissektionsvorrichtung automatisch sämtliche an dem Speicherort hinterlegten Parameterwerte wieder eingestellt werden. Insbesondere kann dabei eine Laser-Mikrodissektion zu einem späteren Zeitpunkt fortgesetzt werden.  Furthermore, this makes it possible to continue the analysis at a later time. If the corresponding preparation carrier elements of the sample are again introduced into the microscope at a later time, all the parameter values stored at the storage location can be automatically readjusted on the microscope or the laser microdissection device. In particular, a laser microdissection can be continued at a later time.
Vorzugsweise ist der Speicherort, an welchem die Analysedaten gespeichert werden, für alle Präparatträgerelemente, welche zum Analysieren der Probe verwendet werden, identisch. Somit wird gewährleistet, dass dieselben Analysedaten nicht für alle Präparatträgerelemente separat gespeichert werden, was unnötig Speicherplatz benötigen würde. Weiterhin wird somit gewährleistet, dass sämtliche Analysedaten einer Probe an demselben Speicherort hinterlegt sind. Diese Analysedaten einer speziellen Probe können mit sämtlichen Speichereinträgen der einzelnen Präparatträgerelemente, welche zum Analysieren dieser speziellen Probe verwendet werden, verknüpft werden.  Preferably, the storage location at which the analysis data is stored is identical for all slide support elements used to analyze the sample. This ensures that the same analysis data is not stored separately for all specimen carrier elements, which would unnecessarily require storage space. Furthermore, it is thus ensured that all analysis data of a sample are stored in the same storage location. This analysis data of a particular sample can be linked to all the memory entries of the individual sample carrier elements used to analyze that particular sample.
Gemäß einer besonders bevorzugten Ausgestaltung der Erfindung sind die Präparatträgerelemente, welche zum Analysieren der Probe verwendet werden, jeweils mit einem Barcode als Identifikationskennzeichnung versehen. Die Barcodes der einzelnen Präparatträgerelemente werden bevorzugt mittels eines Barcodescanners erfasst. Gemäß einer weiteren bevorzugten Ausgestaltung der Erfindung sind die Präparatträgerelemente, welche zum Analysieren der Probe verwendet werden, jeweils mit einem QR-Code ("Quick Response-Code") als Identifikationskennzeichnung versehen. QR-Code ist weniger fehleranfällig. Die QR-Codes der einzelnen Präparatträgerelemente werden bevorzugt mittels eines QR-Codescanners erfasst.According to a particularly preferred embodiment of the invention, the preparation carrier elements which are used to analyze the sample, respectively provided with a barcode as an identification mark. The barcodes of the individual preparation carrier elements are preferably detected by means of a barcode scanner. According to a further preferred embodiment of the invention, the preparation carrier elements which are used for analyzing the sample, each provided with a QR code ("Quick Response Code") as identification identification. QR code is less error prone. The QR codes of the individual preparation carrier elements are preferably detected by means of a QR code scanner.
Dieser Barcodescanner bzw. dieser QR-Codescanner ist dabei insbesondere als ein Teil des Mikroskops ausgebildet. Alternativ kann der Barcodescanner bzw. der QR- Codescanner auch als ein Modul ausgebildet sein, der flexibel an einer zweckmäßigen Position des Mikroskops angeordnet werden kann. Insbesondere weist das Mikroskop dabei mehrere Barcodescanner bzw. mehrere QR-Codescanner auf, die jeweils insbesondere an zweckmäßigen Positionen angeordnet werden können. Die Barcodescanner bzw. die QR-Codescanner können die Barcodes bzw. die QR-Codes der Präparatträgerelemente dabei berührungslos erfassen. Die Barcodescanner bzw. die QR-Codescanner können platzsparend an dem Mikroskop angeordnet werden. Weiterhin können auch die Barcodes bzw. QR-Codes an den Präparatträgerelementen platzsparend angeordnet werden. This bar code scanner or QR code scanner is designed in particular as a part of the microscope. Alternatively, the bar code scanner or the QR code scanner can also be designed as a module that can be flexibly arranged at a suitable position of the microscope. In particular, the microscope has a plurality of bar code scanners or a plurality of QR code scanners, which can each be arranged in particular at appropriate positions. The bar code scanner or the QR code scanner can detect the bar codes or the QR codes of the preparation carrier elements without contact. The bar code scanner or the QR code scanner can be arranged to save space on the microscope. Furthermore, the bar codes or QR codes can be arranged to save space on the specimen carrier elements.
Weitere Vorteile und Ausgestaltungen der Erfindung ergeben sich aus der Beschreibung und der beiliegenden Zeichnung.  Further advantages and embodiments of the invention will become apparent from the description and the accompanying drawings.
Es versteht sich, dass die vorstehend genannten und die nachstehend noch zu erläuternden Merkmale nicht nur in der jeweils angegebenen Kombination, sondern auch in anderen Kombinationen oder in Alleinstellung verwendbar sind, ohne den Rahmen der vorliegenden Erfindung zu verlassen.  It is understood that the features mentioned above and those yet to be explained below can be used not only in the particular combination given, but also in other combinations or in isolation, without departing from the scope of the present invention.
Die Erfindung ist anhand eines Ausführungsbeispieles in der Zeichnung schematisch dargestellt und wird im Folgenden unter Bezugnahme auf die Zeichnung ausführlich beschrieben. The invention is illustrated schematically with reference to an embodiment in the drawing and will be described in detail below with reference to the drawing.
Figurenbeschreibung  figure description
Figur 1 zeigt schematisch eine bevorzugte Ausgestaltung eines erfindungsgemäßen Mikroskops. In der einzigen Figur 1 ist eine bevorzugte Ausgestaltung eines erfindungsgemäßen Mikroskops zum Analysieren einer Probe schematisch dargestellt und mit 100 bezeichnet. FIG. 1 schematically shows a preferred embodiment of a microscope according to the invention. In the sole FIGURE 1, a preferred embodiment of a microscope according to the invention for analyzing a sample is shown schematically and designated 100.
Das Mikroskop 100 weist einen zweckmäßigen Mikroskopkörper 1 10 auf. Ein derartiger Mikroskopkörper 1 10 ist hinreichend bekannt und wird an dieser Stelle nicht explizit erläutert.  The microscope 100 has an expedient microscope body 110. Such a microscope body 1 10 is well known and will not be explicitly explained at this point.
Das Mikroskop 100 weist eine Laser-Mikrodissektionsvorrichtung 120, mittels derer ein Laserstrahl erzeugt, in die Auflichteinrichtung des Mikroskops 100 eingekoppelt und auf einer Probe verschoben werden kann, auf. Auch eine derartige Laser- Mikrodissektionsvorrichtung 120 ist hinreichend bekannt und wird an dieser Stelle nicht explizit erläutert.  The microscope 100 has a laser microdissection device 120, by means of which a laser beam is generated, coupled into the incident light device of the microscope 100 and can be moved on a sample. Such a laser microdissection device 120 is also well known and will not be explained explicitly at this point.
Ein Probenhalter 140 ist als ein (übergeordnetes) Präparatträgerelement ausgebildet. Auf dem Probenhalter 140 sind mehrere Objektträger 141 und 142 als weitere (untergeordnete) Präparatträgerelemente angeordnet. Der Probenhalter 140 als auch die Objektträger 141 und 142 weisen jeweils eine Identifikationskennzeichnung 140a, 141 a, 142a auf. Die Identifikationskennzeichnungen 140a, 141 a, 142a sind dabei als Barcodes ausgebildet. Diese Barcodes 140a, 141 a, 142a charakterisieren das jeweilige Präparatträgerelement eindeutig.  A sample holder 140 is formed as a (higher-level) preparation carrier element. On the sample holder 140 a plurality of slides 141 and 142 are arranged as further (subordinate) preparation carrier elements. The sample holder 140 and the slides 141 and 142 each have an identification mark 140a, 141a, 142a. The identification marks 140a, 141a, 142a are formed as barcodes. These barcodes 140a, 141a, 142a uniquely characterize the respective specimen carrier element.
Auf dem Objektträger 141 bzw. 142 befindet sich jeweils ein Teil (Probenschnitt) 171 bzw. 172 derselben Probe. Im Zuge der Laser-Mikrodissektion werden bestimmte Objekte aus den Teilen 171 und 171 der Probe mittels eines von der Laser- Mikrodissektionsvorrichtung 200 erzeugten Laserstrahls herausgeschnitten. Diese Objekte werden in Auffangbehältern 151 , 152 und 153 gesammelt. Die Auffangbehälter 151 , 152 und 153 sind dabei auf einem Gesamthalter 150 angeordnet. Der Gesamthalter 150 und die einzelnen Auffangbehälter 151 , 152 und 153 sind dabei als weitere Präparatträgerelemente ausgebildet. Sowohl der Gesamthalter 150 als auch die einzelnen Auffangbehälter 151 , 152 und 153 weisen jeweils eine als Barcode 150a, 151 a, 152a bzw. 153a ausgebildete Identifikationskennzeichnung auf. Alternativ oder zusätzlich können die Identifikationskennzeichnungen 140a, 141 a, 142a sowie 150a, 151 a, 152a, 153a auch als QR-Codes ausgebildet sein.  On the slide 141 and 142 are each a part (sample section) 171 and 172 of the same sample. In the course of the laser microdissection, certain objects are cut out of the parts 171 and 171 of the sample by means of a laser beam generated by the laser microdissection device 200. These objects are collected in catch containers 151, 152 and 153. The collecting container 151, 152 and 153 are arranged on a total holder 150. The total holder 150 and the individual collecting containers 151, 152 and 153 are designed as further preparation carrier elements. Both the total holder 150 and the individual collecting containers 151, 152 and 153 each have an identification marking designed as barcode 150a, 151a, 152a or 153a. Alternatively or additionally, the identification markings 140a, 141a, 142a and 150a, 151a, 152a, 153a may also be designed as QR codes.
Um die Laser-Mikrodissektion der Probe durchzuführen, wird zunächst der Probenhalter 140 und somit die einzelnen Objektträger 141 und 142 in das Mikroskop 100 geladen. Dies kann manuell durch einen Benutzer erfolgen oder insbesondere auch automatisch. Weiterhin wird der Gesamthalter 150 und somit die einzelnen Auffangbehältern 151 , 152 und 153 in das Mikroskop 100 geladen. Dies kann ebenfalls durch einen Benutzer oder insbesondere automatisch erfolgen. To perform the laser microdissection of the sample, first the sample holder 140 and thus the individual slides 141 and 142 are loaded into the microscope 100. This can be done manually by a user or in particular also automatically. Furthermore, the total holder 150 and thus the individual collection containers 151, 152 and 153 are loaded into the microscope 100. This can likewise be done by a user or in particular automatically.
Das Mikroskop 100 weist weiterhin drei als Barcodescanner 161 , 162, 163 ausgebildete Erfassungsvorrichtungen zum Erfassen der Barcodes auf. Alternativ oder zusätzlich können die Erfassungsvorrichtungen 161 , 162, 163 auch als QR- Codescanner zum Erfassen von QR-Codes ausgebildet sein. Die Barcodescanner 161 , 162, 163 sind dabei zweckmäßig an dem Mikroskopkörper 1 10 angeordnet. Insbesondere sind die Barcodescanner 161 , 162, 163 dabei frei schwenkbar und/oder frei drehbar angeordnet. Weiter insbesondere können die Barcodescanner auch als Module ausgebildet sein, die flexibel an die aktuelle Anwendung angepasst an dem Mikroskopkörper 1 10 angeordnet werden können.  The microscope 100 further has three detection devices designed as bar code scanners 161, 162, 163 for detecting the bar codes. Alternatively or additionally, the detection devices 161, 162, 163 can also be designed as QR code scanners for detecting QR codes. The bar code scanner 161, 162, 163 are expediently arranged on the microscope body 1 10. In particular, the bar code scanners 161, 162, 163 are freely pivotable and / or freely rotatable. In particular, the barcode scanners can also be designed as modules that can be flexibly adapted to the current application on the microscope body 110.
Eine Recheneinheit 130 ist als ein Computer mit einer Datenbank ausgebildet. Zu jedem der Präparatträgerelemente 140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153 ist in dieser Recheneinheit 130 ein entsprechender Speichereintrag vorhanden. Zur Vorbereitung der Laser-Mikrodissektion wird eine Datenbank der Recheneinheit 130 zumindest mit allen wichtigen Informationen zu der Probe einschließlich deren Herkunft angelegt. Beim Laden des Probenhalters 140 wird automatisch der Barcode 140a von mindestens einem Barcodescanner 161 , 162, 163 erfasst. Der entsprechende Speichereintrag enthält hier Informationen über die Anzahl und die Positionierung der Barcodes 141 a, 142a der Objektträger 141 , 142 auf dem Probenhalter 140. Anhand dieser Informationen können auch die Barcodes 141 a, 142a dieser Objektträger gescannt/gelesen werden. Diese Barcodes sind beispielsweise mit Speichereinträgen verlinkt, die wichtige Informationen zu der jeweiligen Probe auf dem Objektträger enthalten. Gleichzeitig kann ein entsprechender Speicher in der Datenbank zur Aufnahme der Applikationsinformationen sowie der Analysedaten reserviert werden. A computing unit 130 is configured as a computer with a database. For each of the specimen carrier elements 140, 141, 142, 150, 151, 152, 153, a corresponding memory entry is present in this arithmetic unit 130. In preparation for the laser microdissection, a database of the computing unit 130 is created at least with all important information about the sample including its origin. When loading the sample holder 140, the barcode 140a is automatically detected by at least one barcode scanner 161, 162, 163. The corresponding memory entry here contains information about the number and positioning of the bar codes 141 a, 142 a of the slide 141, 142 on the sample holder 140. Based on this information, the bar codes 141 a, 142 a of these slides can be scanned / read. For example, these barcodes are linked to memory entries that contain important information about the particular sample on the slide. At the same time, a corresponding memory in the database for recording the application information and the analysis data can be reserved.
Anschließend wird der Gesamthalter 150 in das System geladen. Hierbei wird der Barcode 150a des Gesamthalters 150 von mindestens einem Barcodescanner 161 , 162, 163 gescannt/erfasst und anhand der durch den Barcode 150a ermittelten Positionen die Barcodes 151 a, 152a, 153a der einzelnen Auffangbehälter 151 , 152, 153 gescannt/erfasst. Die zugehörigen Speichereinträge der Objektträger und der Auffangbehälter werden miteinander verknüpft, um jedem Objektträger automatisch den bzw. die richtigen Auffangbehälter zuzuordnen. Die Speichereinträge enthalten jeweils insbesondere Daten bzw. Informationen bezüglich des Typs und der Abmessungen der Objektträger 141 und 142, des Probenhalters 140, der Auffangbehälter 151 , 152, 153 und des Gesamthalters 150. Weiterhin enthalten die Speichereinträge bestimmte Steuerungsschritte bzw. Programmschritte, gemäß welcher die Laser-Mikrodissektion der Probe durchgeführt wird. Subsequently, the total holder 150 is loaded into the system. In this case, the barcode 150a of the total holder 150 is scanned / detected by at least one barcode scanner 161, 162, 163 and the barcodes 151a, 152a, 153a of the individual receptacles 151, 152, 153 are scanned / detected on the basis of the positions determined by the barcode 150a. The associated memory entries of the slides and the receptacles are linked together to automatically assign each slide to the right or the collection container. In particular, the memory entries each contain data or information relating to the type and dimensions of the slides 141 and 142, the sample holder 140, the collection containers 151, 152, 153 and the total holder 150. Furthermore, the memory entries contain specific control steps or program steps according to which the Laser microdissection of the sample is performed.
Während der Laser-Mikrodissektion können aufgenommene Bilder, die Lasereinstellungen, die Mikroskopeinstellungen, die Kameraeinstellungen, Datum und Zeit der Mikrodissektion in der Datenbank gespeichert werden. Somit sind alle relevanten Daten jederzeit auch zu Dokumentationszwecken einer Probe eindeutig zuordenbar, rückverfolgbar und einzusehen. During laser microdissection, recorded images, laser settings, microscope settings, camera settings, date and time of microdissection can be stored in the database. This means that all relevant data can be clearly assigned, traced and viewed at any time for documentation purposes.
Bezuqszeichenliste LIST OF REFERENCES
Mikroskop microscope
Mikroskopkörper  microscope body
Laser-Mikrodissektionsvorrichtung Recheneinheit  Laser microdissection device arithmetic unit
Probenhalter, Präparatträgerelementa Barcode, Identifikationskennzeichnung, 142 Objektträger, Präparatträgerelementa, 142a Barcode, Identifikationskennzeichnung  Sample holder, drug delivery elementa barcode, identification tag, 142 slides, slide carrier elementa, 142a barcode, identification tag
Gesamthalter, Präparatträgerelementa Barcode, Identifikationskennzeichnung, 152, 153 Auffangbehälter, Präparatträgerelementa, 152a, 153a Barcode, Identifikationskennzeichnung, 162, 163 Barcodescanner Total holder, Carrier elementa Barcode, Identification marking, 152, 153 Collection container, Carrier elementa, 152a, 153a Barcode, Identification code, 162, 163 Barcode scanner
, 172 Teile der Probe , 172 parts of the sample

Claims

Patentansprüche claims
Verfahren zum Analysieren einer Probe mit einem Mikroskop (100),  Method for analyzing a sample with a microscope (100),
- wobei im Zuge der Analyse der Probe eine Laser-Mikrodissektion der Probe durchgeführt wird,  in the course of the analysis of the sample, a laser microdissection of the sample is carried out,
- wobei Präparatträgerelemente (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153), welche zum Analysieren der Probe verwendet werden, jeweils mit einer Identifikationskennzeichnung (140a, 141 a, 142a, 150a, 151 a, 152a, 153a) versehen sind,  - In which preparation carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153), which are used to analyze the sample, each with an identification marking (140 a, 141 a, 142 a, 150 a, 151 a, 152 a, 153 a) are provided .
- wobei ein Objektträger (141 , 142) als ein erstes Präparatträgerelement zum Analysieren der Probe verwendet wird, der mit einer ersten Identifikationskennzeichnung (141 a, 142a) versehen ist, und wobei ein Auffangbehälter (151 , 152, 153) als ein zweites Präparatträgerelement zum Analysieren der Probe verwendet wird, das mit einer zweiten Identifikationskennzeichnung (151 a, 152a, 153a) versehen ist,  - wherein a slide (141, 142) is used as a first slide member for analyzing the sample, which is provided with a first identification mark (141 a, 142 a), and wherein a collecting container (151, 152, 153) as a second slide support member to Analyzing the sample provided with a second identification mark (151a, 152a, 153a),
- wobei die Identifikationskennzeichnungen (140a, 141 a, 142a, 150a, 151 a, 152a, 153a) der einzelnen Präparatträgerelemente (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153) durch eine Erfassungsvorrichtung (161 , 162, 163) erfasst werden, - wherein the identification markings (140a, 141a, 142a, 150a, 151a, 152a, 153a) of the individual specimen carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153) by a detection device (161, 162, 163) detected become,
- wobei anhand der erfassten Identifikationskennzeichnungen (140a, 141 a, 142a, 150a, 151 a, 152a, 153a) der einzelnen Präparatträgerelemente (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153) Speichereinträge in einer Recheneinheit (130), die den einzelnen Präparatträgerelementen (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153) zugeordnet sind, erkannt werden, - Based on the detected identification marks (140a, 141a, 142a, 150a, 151a, 152a, 153a) of the individual specimen carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153) memory entries in a computing unit (130), the are associated with the individual specimen carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153),
- wobei die erste Identifikationskennzeichnung (141 a, 142a) des Objektträgers (141 , 142) und die zweite Identifikationskennzeichnung (151 a, 152a, 153a) des Auffangbehälters (151 , 152, 153) erfasst werden,  - wherein the first identification marking (141 a, 142 a) of the slide (141, 142) and the second identification marking (151 a, 152 a, 153 a) of the collecting container (151, 152, 153) are detected,
- wobei anhand der erfassten ersten Identifikationskennzeichnung (141 a, 142a) des Objektträger (141 , 142) ein Speichereintrag, der dem Objektträgers (141 , 142) zugeordnet ist, in der Recheneinheit (130) erkannt wird, und wobei anhand der erfassten zweiten Identifikationskennzeichnung (151 a, 152a, 153a) des Auffangbehälters (151 , 152, 153) ein Speichereintrag, der dem Auffangbehälter (151 , 152, 153) zugeordnet ist, in der Recheneinheit (130) erkannt wird, und - wobei zur Bestimmung der zur Analyse der Probe zu verwendenden Präparatträgerelemente die zugeordneten Speichereinträge in der Recheneinheit (130) miteinander verknüpft werden, - Based on the detected first identification marking (141 a, 142 a) of the slide (141, 142) a memory entry, which is associated with the slide (141, 142) is detected in the arithmetic unit (130), and wherein based on the detected second identification mark (151 a, 152 a, 153 a) of the collecting container (151, 152, 153) a memory entry, which is associated with the collecting container (151, 152, 153), in the computing unit (130) is detected, and wherein, for determining the sample carrier elements to be used for the analysis of the sample, the associated memory entries are linked to one another in the arithmetic unit (130),
- wobei anhand der Speichereinträge, die dem Objektträger (141 , 142) und dem Auffangbehälter (151 , 152, 153) zugeordnet sind, der Objektträger und der - Based on the memory entries associated with the slide (141, 142) and the collecting container (151, 152, 153), the slide and the
Auffangbehälter zum Analysieren der Probe bestimmt werden. Collection container for analyzing the sample can be determined.
2. Verfahren nach Anspruch 1 , wobei mehrere Präparatträgerelemente (141 , 142; 151 , 152, 153) zu einem übergeordneten Präparatträgerelement (140; 150) zusammengefasst werden und das übergeordnete Präparatträgerelement (140; 150) mit einer Identifikationskennzeichnung (140a; 150a) versehen wird.  2. The method according to claim 1, wherein a plurality of specimen carrier elements (141, 142, 151, 152, 153) are combined to form a parent specimen carrier element (140, 150) and the parent specimen carrier element (140, 150) is provided with an identification mark (140a, 150a) becomes.
3. Verfahren nach Anspruch 2, wobei mehrere Objektträger (141 , 142) zu einem Probenhalter (140) zusammengefasst werden und der Probenhalter (140) mit einer zugehörigen Identifikationskennzeichnung (140a) versehen wird und/oder wobei mehrere Auffangbehälter (151 , 152, 153) zu einem Gesamthalter (150) zusammengefasst werden und der Gesamthalter (150) mit einer zugehörigen Identifikationskennzeichnung (150a) versehen wird.  3. The method of claim 2, wherein a plurality of slides (141, 142) are combined to form a sample holder (140) and the sample holder (140) is provided with an associated identification mark (140a) and / or wherein a plurality of collecting containers (151, 152, 153 ) to a total holder (150) and the total holder (150) is provided with an associated identification mark (150a).
4. Verfahren nach einem der vorstehenden Ansprüche, wobei die Speichereinträge, die den einzelnen Präparatträgerelementen (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153) zugeordnet sind, jeweils eine Dimension, eine Position, Koordinaten und/oder eine Abmessung und/oder Informationen über den Typ des jeweiligen Präparatträgerelementes (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153) und/oder der Probe enthalten.  4. Method according to one of the preceding claims, wherein the memory entries assigned to the individual specimen carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153) each have a dimension, a position, coordinates and / or a dimension and / or or information about the type of the respective slide carrier element (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153) and / or the sample.
5. Verfahren nach einem der vorstehenden Ansprüche, wobei die Speichereinträge, die den einzelnen Präparatträgerelementen (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153) zugeordnet sind, jeweils bestimmte Steuerungsschritte enthalten, gemäß welcher die Analyse der Probe durchgeführt wird.  5. The method according to any one of the preceding claims, wherein the memory entries, which are assigned to the individual preparation carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153), each contain certain control steps, according to which the analysis of the sample is performed.
6. Verfahren nach einem der vorstehenden Ansprüche, soweit auf Anspruch 2 rückbezogen, wobei die Speichereinträge, die den einzelnen übergeordneten Präparatträgerelementen (140 150) zugeordnet sind, jeweils eine Position und/oder eine Anzahl der Identifikationskennzeichnungen (141 a, 142a, 151 a, 152a, 153a) auf den jeweiligen Präparatträgerelementen (141 , 142, 151 , 152, 153) enthalten.  6. Method according to one of the preceding claims, as far as dependent on claim 2, wherein the memory entries which are assigned to the individual superordinate preparation carrier elements (140-150) each have a position and / or a number of the identification markings (141a, 142a, 151a, 152a, 153a) on the respective preparation carrier elements (141, 142, 151, 152, 153).
7. Verfahren nach einem der vorstehenden Ansprüche, wobei die Speichereinträge, die den einzelnen Präparatträgerelementen (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153) zugeordnet sind, in der Recheneinheit (130) jeweils einen Speicherort besitzen, an welchem Analysedaten, die im Zuge der Analyse der Probe erfasst werden, gespeichert werden. 7. The method according to any one of the preceding claims, wherein the memory entries, the individual preparation carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153) are assigned, in the arithmetic unit (130), in each case a storage location at which analysis data which are acquired in the course of the analysis of the sample are stored.
8. Verfahren nach Anspruch 7, wobei Bilder, Videos, Parameterwerte, ein Datum und/oder eine Uhrzeit als Analysedaten an dem Speicherort gespeichert werden.  8. The method of claim 7, wherein images, videos, parameter values, a date and / or time are stored as analysis data at the storage location.
9. Verfahren nach Anspruch 7 oder 8, wobei der Speicherort, an welchem die Analysedaten gespeichert werden, für diejenigen Präparatträgerelemente (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153), welche zum Analysieren der jeweiligen Probe verwendet werden, identisch ist.  A method according to claim 7 or 8, wherein the storage location at which the analysis data is stored is identical to those preparation vehicle elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153) used to analyze the respective sample ,
10. Verfahren nach einem der vorstehenden Ansprüche, 10. The method according to any one of the preceding claims,
- wobei die Präparatträgerelemente (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153), welche zum Analysieren der Probe verwendet werden, jeweils mit einem Barcode (140a, 141 a, 142a, 150a, 151 a, 152a, 153a) als Identifikationskennzeichnung versehen sind und  - The sample carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153), which are used to analyze the sample, each with a bar code (140 a, 141 a, 142 a, 150 a, 151 a, 152 a, 153 a) as Identification marking are provided and
- wobei die Barcodes (140a, 141 a, 142a, 150a, 151 a, 152a, 153a) der einzelnen Präparatträgerelemente (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153) mittels eines Barcodescanners (161 , 162, 163) erfasst werden.  - The bar codes (140a, 141a, 142a, 150a, 151a, 152a, 153a) of the individual specimen carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153) by means of a bar code scanner (161, 162, 163) detected become.
1 1 . Verfahren nach einem der vorstehenden Ansprüche,  1 1. Method according to one of the preceding claims,
- wobei die Präparatträgerelemente (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153), welche zum Analysieren der Probe verwendet werden, jeweils mit einem QR-Code - The preparation carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153), which are used to analyze the sample, each with a QR code
(140a, 141 a, 142a, 150a, 151 a, 152a, 153a) als Identifikationskennzeichnung versehen sind und (140a, 141a, 142a, 150a, 151a, 152a, 153a) are provided as identification mark and
- wobei die Barcodes (140a, 141 a, 142a, 150a, 151 a, 152a, 153a) der einzelnen Präparatträgerelemente (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153) mittels eines QR- Codescanners (161 , 162, 163) erfasst werden.  - wherein the bar codes (140a, 141a, 142a, 150a, 151a, 152a, 153a) of the individual specimen carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153) by means of a QR code scanner (161, 162, 163 ).
12. Mikroskop (100) zum Analysieren einer Probe, aufweisend  12. A microscope (100) for analyzing a sample comprising
- eine Laser-Mikrodissektionsvorrichtung (120), die dazu eingerichtet ist, im Zuge der Analyse der Probe eine Laser-Mikrodissektion der Probe durchzuführen, a laser microdissection device (120) adapted to perform a laser microdissection of the sample as part of the analysis of the sample,
- eine Erfassungsvorrichtung (161 , 162, 163) zum Erfassen von Identifikationskennzeichnungen (140a, 141 a, 142a, 150a, 151 a, 152a, 153a) von Präparatträgerelementen (140, 141 , 142, 150, 151 , 152, 153), welche zum Analysieren der Probe verwendet werden und jeweils mit einer Identifikationskennzeichnung (140a, 141 a, 142a, 150a, 151 a, 152a, 153a) versehen sind, - A detection device (161, 162, 163) for detecting identification marks (140 a, 141 a, 142 a, 150 a, 151 a, 152 a, 153 a) of preparation carrier elements (140, 141, 142, 150, 151, 152, 153), which be used to analyze the sample and each with a Identification marking (140a, 141a, 142a, 150a, 151a, 152a, 153a) are provided,
wobei das Mikroskop (100) dazu eingerichtet ist, ein Verfahren zum Analysieren der Probe gemäß einem der vorstehenden Ansprüche durchzuführen. wherein the microscope (100) is adapted to perform a method of analyzing the sample according to any one of the preceding claims.
Mikroskop (100) nach Anspruch 12, wobei  A microscope (100) according to claim 12, wherein
die Erfassungsvorrichtung (161 , 162, 163) zum Erfassen von Identifikationskennzeichnungen (140a, 141 a, 142a, 150a, 151 a, 152a, 153a) als wenigstens ein Barcodescanner und/oder als wenigstens ein QR-Codescanner ausgebildet ist, the detection device (161, 162, 163) for detecting identification markings (140a, 141a, 142a, 150a, 151a, 152a, 153a) is designed as at least one bar code scanner and / or as at least one QR code scanner,
die Identifikationskennzeichnungen (140a, 141 a, 142a, 150a, 151 a, 152a, 153a) als Barcodes und/oder QR-Codes ausgebildet sind, the identification markings (140a, 141a, 142a, 150a, 151a, 152a, 153a) are designed as barcodes and / or QR codes,
mehrere Objektträger (141 , 142) zu einem Probenhalter (140) zusammengefasst sind, wobei jeder der Objektträger (141 , 142) mit einem eigenen Barcode (141 a, 142a) und/oder einem eigenen QR-Code versehen ist und wobei der Probenhalter (140) mit einem zugehörigen Barcode (140a) und/oder einem zugehörigen QR-Code versehen ist, und a plurality of microscope slides (141, 142) are combined to form a sample holder (140), wherein each of the microscope slides (141, 142) is provided with its own bar code (141 a, 142 a) and / or its own QR code and wherein the sample holder ( 140) is provided with an associated bar code (140a) and / or an associated QR code, and
mehrere Auffangbehälter (151 , 152, 153) zu einem Gesamthalter (150) zusammengefasst sind, wobei jeder der Auffangbehälter (151 , 152, 153) mit einem eigenen Barcode (151 a, 152a, 153a) und/oder einem eigenen QR-Code versehen ist und wobei der Gesamthalter (150) mit einem zugehörigen Barcode (150a) und/oder einem zugehörigen QR-Code versehen ist. a plurality of collecting containers (151, 152, 153) are combined to form a total holder (150), wherein each of the collecting container (151, 152, 153) provided with its own bar code (151 a, 152 a, 153 a) and / or its own QR code and wherein the total holder (150) is provided with an associated bar code (150a) and / or associated QR code.
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