WO2015076545A1 - Rna 멤브레인 제조방법 및 이를 통해 제조된 rna 멤브레인 - Google Patents
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Definitions
- the present invention is composed of pure RNA, it is not toxic in vivo and can be controlled, and can be effectively used in biological organs such as the heart membrane as well as peptide or protein production.
- the present invention relates to a method for producing an RNA membrane and a method for producing an RNA membrane, which can be produced at a lower cost.
- long-stranded linear RNAs that do not form particles through induction of evaporation are concentrated on the surface of the tube.
- the present invention relates to an RNA membrane manufacturing method and an RNA membrane produced through the binding of the RNA membrane, which enables the vigorous binding of the RNA membrane to be actively controlled and changes in the roughness and thickness of the RNA membrane.
- DNA and RNA are biomaterials that are nontoxic in vivo and have the advantage of being freely controlled at the nanoscale using base pair binding. Accordingly, many technologies using DNA have been developed and active research is being conducted.
- RNA may play an important role than DNA in the transmission of genetic information, but RNA is easily degraded and expensive to synthesize compared to DNA, which limits the research and development.
- RNA film disclosed in the above (thesis literature) relates to mixing a RNA extracted from a yeast and a cationic material to produce a film made of RNA, but it is not purely made of RNA, but mixed with a cationic material to produce a film. Therefore, there is a problem that is unsuitable for use in medical applications. In addition, a complex process for extracting RNA from the yeast has a problem that the manufacturing cost increases.
- the present invention has been made to solve the above problems,
- the purpose of the present invention is because it consists of pure RNA, there is no toxicity in vivo and can be controlled, and can be effectively used for biological organs such as the pericardium as well as for the production of peptides and proteins, and also for drug delivery.
- the present invention provides an RNA membrane manufacturing method and an RNA membrane prepared through the RNA membrane which can be produced at a lower cost.
- Another object of the present invention is to provide a method for producing an RNA membrane which can be separated after the reaction and can be recycled and stably stored for a long time because of its macroscopic size, and an RNA membrane prepared through the same.
- Another object of the present invention is a method for producing an RNA membrane which allows the binding of base pairs to be actively progressed by concentrating long strands of linear RNAs that do not form particles through the induction of evaporation to the surface of the tube and the RNA membrane produced by the same To provide.
- Still another object of the present invention is to provide an RNA membrane manufacturing method capable of controlling the roughness and thickness of an RNA membrane prepared through a change of conditions, and an RNA membrane prepared through the same.
- RNA membrane production method and RNA membrane prepared through the above to achieve the object of the present invention includes the following configuration.
- RNA membrane manufacturing method comprises a first circular DNA generating step of producing a first circular DNA; A second circular DNA generation step of generating a second circular DNA having a nucleotide sequence opposite to the first circular DNA; A first linear RNA generation step of generating a first linear RNA using the first circular DNA through a transcription process; A second linear RNA generation step of generating a second linear RNA using the second circular DNA through a transcription process; And an RNA membrane generation step of generating an RNA membrane by inducing binding between base pairs of the first linear RNA and the second linear RNA.
- the RNA membrane generation step activates the binding between base pairs of RNAs by concentrating long strands of linear RNAs that do not form particles through evaporation. It characterized in that it comprises an evaporation step.
- the evaporation step removes the cover of the tube in which the RNA membrane is generated to induce evaporation to form a long strand of linear RNA. As they are concentrated on the surface of the tube, binding between base pairs is actively progressed.
- the RNA membrane production step controls the roughness of the RNA membrane by controlling the number of base pairs bound between the first linear RNA and the second linear RNA. It characterized in that it further comprises a membrane roughness adjusting step.
- the RNA membrane production step is a membrane thickness for controlling the thickness of the RNA membrane by adjusting the concentration of the first circular DNA and the second circular DNA Characterized in that it further comprises a control step.
- RNA membrane according to an embodiment of the present invention is characterized in that it is prepared by the manufacturing method as described above.
- the present invention can obtain the following effects by the configuration, combination, and use relationship described above with the present embodiment.
- RNA membrane membrane
- the reaction can be separated after the reaction and can be recycled and can be stably stored for a long time.
- the present invention has the effect that the binding between the base pairs is actively progressed as the long strands of linear RNA that do not form particles through the induction of evaporation is concentrated on the tube surface.
- the present invention has the effect of controlling the roughness and thickness of the RNA membrane produced through the change of conditions.
- 1 is a reference diagram showing a process for generating a first circular DNA
- FIG. 2 is a reference diagram showing a process for generating a first linear RNA
- FIG. 3 is a reference diagram showing a process for generating RNA membrane
- FIG. 13 shows RNA membrane SEM analysis result image
- the RNA membrane (membrane) manufacturing method comprises a first circular DNA generation step (S1) for producing a first circular DNA (11); A second circular DNA generation step (S2) of generating a second circular DNA (12) having a nucleotide sequence opposite to the first circular DNA (11); A first linear RNA generation step (S3) of generating a first linear RNA 21 using the first circular DNA 11 through a transcription process; A second linear RNA generation step (S4) of generating a second linear RNA 22 using the second circular DNA 12 through a transcription process; It may include; RNA membrane generation step (S5) to induce the binding between the base pairs of the first linear RNA 21 and the second linear RNA 22 to generate an RNA membrane.
- Rolling Circle Transcription produces long strands of RNA from circular DNA prepared using RNA polymerase, a low cost because RNA polymerase continues to produce RNA strands complementary to the sequence of the circular DNA. Can generate a large amount of RNA.
- the reaction is simple and economical because the reaction temperature is constant at 37 °C. Therefore, in the present invention, the RNA strand is generated using the RCT, and the RNA membrane is generated using the same.
- the first circular DNA production step (S1) is a process of generating the first circular DNA 11, and generates a circular DNA structure using two kinds of DNA. Referring to Figure 1, using a long linear DNA and T7 Promoter DNA through the hybridization (Hybridization) and Ligation (Ligation) between them to create a circular DNA structure of the first circular DNA (11).
- the second circular DNA generation step (S2) is a process of generating a second circular DNA (12), the same principle and process as the first circular DNA generation step (S1) of the first using a circular type of two types of DNA
- the second circular DNA 12, which is a DNA structure, is generated.
- the second circular DNA 12 is a circular DNA having a nucleotide sequence opposite to that of the first circular DNA 11.
- the first linear RNA generation step (S3) is a process of generating a first linear RNA 21 using the first circular DNA 11 through a transcription process.
- the first circular DNA The first linear RNA of the long circular strand complementary to the nucleotide sequence of the first circular DNA (11) through the transcription process using the T7 RNA polymerase generated through the production step (S1) ( 21).
- the second linear RNA generation step (S4) is a process of generating a second linear RNA (22) using the second circular DNA 12 in the same principle and process as the first linear RNA generation step (S3).
- a T7 RNA polymerase for the second circular DNA 12 generated through the second circular DNA production step (S2), a long complementary sequence to the base sequence of the second circular DNA 12 is transferred. It will generate a strand of the second linear RNA (22).
- the RNA membrane generation step (S5) is a process of generating an RNA membrane by inducing binding between base pairs of the first linear RNA 21 and the second linear RNA 22.
- Base pair binding is performed between the first linear RNA 21 generated through the linear RNA generation step (S3) and the second linear RNAs 22 generated through the second linear RNA generation step (S4).
- the main production principle of the RNA membrane is to generate RNA strands and induce binding of base pairs through transcription using two kinds of circular DNA.
- the RNA membrane generation step (S5) is the evaporation step (S51) (EISA: Evaporation-induced self-assembly, this evaporation process (EISA) is a concentrated RNA strands by concentrating the RNA strands present in the solution to the tube surface
- EISA Evaporation-induced self-assembly
- This evaporation process (EISA) is a concentrated RNA strands by concentrating the RNA strands present in the solution to the tube surface
- the long strands of the first linear RNA 21 and the second linear RNA 22 that are produced are twisted and entangled by themselves.
- the micro-sized particles are formed to sink to the bottom of the tube (vessel) in which the RNA membrane manufacturing process is performed.
- the evaporation step (S51) concentrates long strands of linear RNA that do not form particles by evaporation. It is the process of activating the binding between base pairs of RNA.
- the evaporation step (S51) is when the volume of the solution in the tube in which the RNA membrane is generated, such as when removing the cover of the tube to induce the evaporation of the solution to pay attention to the contamination of the solution (preferably the cover After 24 hours at 37 ° C.), long strands of linear RNA that do not form particles are concentrated on the tube surface, thereby allowing the binding between base pairs to be actively progressed.
- the test was performed by staining the RNA membrane using GelRed, which can stain RNA.
- the RNA membrane made in the tube has a hollow cylindrical shape according to the inner shape of the tube.
- it since it consists of RNA, it can be seen that a strong red fluorescence is emitted upon UV exposure.
- RNA membrane has a micro-size thickness, it can be seen that can be divided into several layers of nano-sized membrane.
- Figure 8 it can be seen that the inside of the RNA membrane is very compact (compact).
- RNA membrane produced according to the present invention was dyed using GelRed and SYBR Green II, which are RNA fluorescent dyes, and confirmed by fluorescence microscopy. The results are as shown in FIGS. 9 and 10. In FIG. 9 and FIG. 10, red stained GelRed, and green stained SYBR Green II.
- the RNA membrane produced according to the present invention is a membrane consisting of pure RNA. Therefore, the morphase can be stably maintained in an environment without RNase (an enzyme that degrades RNA).
- RNase an enzyme that degrades RNA
- the following three kinds of degradation experiments were conducted: an environment in which RNase exists, an environment in which only DNase (enzyme that degrades DNA), and an environment in which no enzyme is present.
- Figure 11 first in the environment where the RNase is present, it can be confirmed that the gelRed RNA staining agent is completely dissolved in the solution.
- the RNA membrane maintains its morphology in two other experiments, the environment containing only DNase and the absence of degrading enzyme.
- RNA membrane production step (S5) controlling the roughness of the membrane to control the roughness of the RNA membrane by controlling the number of base pairs coupled between the first linear RNA 21 and the second linear RNA 22
- It may further include (S53). That is, in the present invention, through the membrane roughness adjusting step (S53), it is possible to control the roughness of the RNA membrane by adjusting the number of base pairs coupled between the first linear RNA 21 and the second linear RNA 22. can do.
- 12 is a SEM and AFM images of the RNA membrane surface measured by adjusting the number of base pairs bound through the membrane roughness adjusting step (S53) (base pairs are 71 base pairs (TCRM)> 24 base pairs (24-). PCRM)> 8 base pairs (8-PCRM)).
- the RNA membrane production step (S5) further comprises a membrane thickness control step (S55) to adjust the thickness of the RNA membrane by adjusting the concentration of the first circular DNA (11) and the second circular DNA (12). can do. That is, in the present invention, through the membrane thickness adjusting step (S55), it is possible to control the thickness of the RNA membrane by adjusting the concentration of the newly generated first circular DNA 11 and the second circular DNA 12. can do.
- FIG. 13 is an SEM image of an RNA membrane made by adjusting the concentrations of newly formed first circular DNA 11 and second circular DNA 12 through the membrane thickness adjusting step (S55). As a result, it can be confirmed that as the concentration of newly generated circular DNA is lowered, a thinner RNA membrane can be generated. That is, it is possible to control the size of the micro-unit of the RNA membrane generated through the membrane thickness control step (S55).
- RNA membrane produced by the production method of the present invention is characterized by consisting of pure RNA, it is not toxic in vivo and can be controlled, and not only peptide or protein production but also the pericardium It can be effectively used in biological organs such as, it can be particularly useful for drug delivery to add and deliver drugs to the RNA membrane.
- RNA membrane prepared by the present invention confirms that Doxorubicin (Doxorubicin) drug contained in the RNA membrane is spread out to the solution (solution), thereby confirming that the RNA membrane can be used as a drug delivery material.
- TCRM 71 base pairs RNA membrane
- 24-PCRM were added to RNases solution and incubated at 37 ° C. for 24 hours.
- the fluorescence of the solution was measured using a microplate reader. The result is as shown in FIG.
- the line labeled Control in FIG. 14 is the result when TCRM was added to Nuclease free water instead of RNases solution. Through this, it was confirmed that TCRM and 24-PCRM can effectively deliver Doxorubicin in the presence of RNase.
- the RNA membrane produced by the present invention is that the RNA membrane can be contracted and expanded depending on the presence or absence of water, and is easy to manufacture as a drug.
- the RNA membrane formed in the tube according to the present invention has the same shape as the inner surface of the tube when in the solution, but outside the solution, the water escapes and contracts and splits into a stick-like shape. However, when it is put back into the solution, it expands again.
- This characteristic of the RNA membrane prepared by the present invention can be said to show more various applications as a material.
- the RNA membrane prepared by the present invention is made of pure RNA, there is no toxicity in vivo, and it is possible to control and apply in various fields. In addition, it is economical because it can be produced at a lower cost than the conventional method of directly synthesizing RNA. In particular, the large size of the RNA membrane and the high concentration of RNA can be evaluated that the potential of siRNA delivery of the RNA membrane is very large. In addition, since it is made of a biological material and can be controlled, it can be effectively used for biological organs such as the pericardium. Compared to the chemical materials used in existing biological organs, RNA is composed of biological materials and thus can be used more safely in toxicity.
- the RNA membrane has a macroscopic size, unlike the mRNA required for the production of a protein, so that it can be separated and recycled after a translation reaction, and is present in a larger structure than a conventional short RNA strand. It has the characteristic that it can be stored stably even for a long time.
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Abstract
본 발명은 순수한 RNA로 이루어져 있기 때문에 생체내에서 독성이 없으며 컨트롤(control)이 가능하며 펩타이드(peptide)나 단백질(protein) 생산뿐만 아니라 심장막과 같은 생체 기관에도 효과적으로 사용될 수 있는 RNA 멤브레인(membrane)을 보다 저렴한 비용으로 생산할 수 있도록 하는 RNA 멤브레인 제조방법 및 이를 통해 제조된 RNA 멤브레인에 관한 것으로, 특히 증발과정의 유도를 통해 미처 파티클을 형성하지 못한 긴 가닥의 선형RNA들이 튜브 표면으로 농축되면서 염기쌍들간의 결합이 활발히 진행되도록 하며, 조건변화를 통해 제조되는 RNA 멤브레인의 거칠기와 두께 조절이 가능하도록 하는 RNA 멤브레인 제조방법 및 이를 통해 제조된 RNA 멤브레인에 관한 것이다.
Description
본 발명은 순수한 RNA로 이루어져 있기 때문에 생체내에서 독성이 없으며 컨트롤(control)이 가능하며 펩타이드(peptide)나 단백질(protein) 생산뿐만 아니라 심장막과 같은 생체 기관에도 효과적으로 사용될 수 있는 RNA 멤브레인(membrane)을 보다 저렴한 비용으로 생산할 수 있도록 하는 RNA 멤브레인 제조방법 및 이를 통해 제조된 RNA 멤브레인에 관한 것으로, 특히 증발과정의 유도를 통해 미처 파티클을 형성하지 못한 긴 가닥의 선형RNA들이 튜브 표면으로 농축되면서 염기쌍들간의 결합이 활발히 진행되도록 하며, 조건변화를 통해 제조되는 RNA 멤브레인의 거칠기와 두께 조절이 가능하도록 하는 RNA 멤브레인 제조방법 및 이를 통해 제조된 RNA 멤브레인에 관한 것이다.
DNA와 RNA는 생체물질로, 생체 내에서 독성이 없으며 염기쌍 결합을 이용하여 나노 스케일에서 자유롭게 컨트롤(control) 할 수 있다는 장점을 가지고 있다. 이에 따라, DNA를 이용한 많은 기술들이 개발되어 왔고, 활발한 연구가 진행되고 있다.
RNA는 유전 정보 전달에 있어서 DNA보다 중요한 역할을 담당할 수 있으나, RNA의 경우 DNA에 비해 쉽게 분해되고 합성 가격이 비싸 연구와 개발에 한계가 있는 실정이다.
(논문 문헌)
"Preparations of a RNA-lipid complex film and its physical properties"(2001 Oxford University Press, Nucleic Acids Research Supplement No.1 61-62, Yu Hoshino외 2인)
위 (논문 문헌)에 개시된 RNA Film은, 효모에서 추출한 RNA와 양이온 물질을 혼합하여 RNA로 이루어진 필름을 생성하는 것에 관한 것이나, 이는 순수하게 RNA로만 이루어진 것이 아니라, 양이온 물질을 혼합하여 필름을 생성하였기 때문에, 의학적 용도로 사용하기게 부적합한 문제를 안고 있다. 또한 효모에서 RNA를 추출하기 위해 복잡한 과정을 거쳐야 하며 그로 인해 제조비용이 높아진다는 문제를 안고 있다.
이와 같이 RNA의 장점에도 불구하고, RNA로 이루어진 멤브레인(membrane)을 제조하는 기존 방법들은 합성 가격이 너무 비싸 연구와 개발에 한계가 있으며, 또한 순수한 RNA로만 이루어진 멤브레인(membrane)을 얻기 어려운 문제가 있었던바, 이와 같은 문제를 해결할 수 있는 새로운 제법에 대한 필요성이 대두되고 있는 실정이다.
본 발명은 상기와 같은 문제점을 해결하기 위해 안출된 것으로,
본 발명의 목적은 순수한 RNA로 이루어져 있기 때문에 생체내에서 독성이 없으며 컨트롤(control)이 가능하며 펩타이드(peptide)나 단백질(protein) 생산뿐만 아니라 심장막과 같은 생체 기관에도 효과적으로 사용될 수 있고 약물전달에도 활용될 수 있는 RNA 멤브레인(membrane)을 보다 저렴한 비용으로 생산할 수 있도록 하는 RNA 멤브레인 제조방법 및 이를 통해 제조된 RNA 멤브레인을 제공하는 것이다.
본 발명의 다른 목적은 거시적인 크기를 갖기 때문에 반응 후 분리가 가능하여 재활용할 수 있고 장시간에도 안정적으로 보관할 수 있는 RNA 멤브레인 제조방법 및 이를 통해 제조된 RNA 멤브레인을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 증발과정의 유도를 통해 미처 파티클을 형성하지 못한 긴 가닥의 선형RNA들이 튜브 표면으로 농축되면서 염기쌍들간의 결합이 활발히 진행되도록 하는 RNA 멤브레인 제조방법 및 이를 통해 제조된 RNA 멤브레인을 제공하는 것이다.
본 발명의 또 다른 목적은 조건변화를 통해 제조되는 RNA 멤브레인의 거칠기와 두께 조절이 가능한 RNA 멤브레인 제조방법 및 이를 통해 제조된 RNA 멤브레인을 제공하는 것이다.
상술한 본 발명의 목적을 달성하기 위한 RNA 멤브레인 제조방법 및 이를 통해 제조된 RNA 멤브레인은 다음과 같은 구성을 포함한다.
본 발명의 일 실시예에 따른 RNA 멤브레인 제조방법은 제1원형DNA를 생성하는 제1원형DNA생성단계; 상기 제1원형DNA와 반대되는 염기서열을 갖는 제2원형DNA를 생성하는 제2원형DNA생성단계; 전사과정을 통해 상기 제1원형DNA를 이용하여 제1선형RNA를 생성하는 제1선형RNA생성단계; 전사과정을 통해 상기 제2원형DNA를 이용하여 제2선형RNA를 생성하는 제2선형RNA생성단계; 상기 제1선형RNA와 제2선형RNA의 염기쌍들간의 결합을 유도하여 RNA 멤브레인을 생성하는 RNA멤브레인생성단계;를 포함하는 것을 특징으로 한다.
본 발명의 다른 실시예에 따르면, 본 발명에 따른 RNA 멤브레인 제조방법에 있어서 상기 RNA멤브레인생성단계는 미처 파티클을 형성하지 못한 긴 가닥의 선형RNA들을 증발을 통해 농축시켜 RNA들의 염기쌍들간의 결합을 활성화시키는 증발단계를 포함하는 것을 특징으로 한다.
본 발명의 또 다른 실시예에 따르면, 본 발명에 따른 RNA 멤브레인 제조방법에 있어서 상기 증발단계는 RNA 멤브레인 생성이 이루어지는 튜브의 커버를 제거하여 증발을 유도시켜 미처 파티클을 형성하지 못한 긴 가닥의 선형RNA들이 튜브 표면으로 농축되면서 염기쌍들간의 결합이 활발히 진행되는 것을 특징으로 한다.
본 발명의 또 다른 실시예에 따르면, 본 발명에 따른 RNA 멤브레인 제조방법에 있어서 상기 RNA멤브레인생성단계는 상기 제1선형RNA와 제2선형RNA 간의 결합되는 염기쌍 수를 조절하여 RNA 멤브레인의 거칠기를 조절하는 멤브레인거칠기조절단계를 추가로 포함하는 것을 특징으로 한다.
본 발명의 또 다른 실시예에 따르면, 본 발명에 따른 RNA 멤브레인 제조방법에 있어서 상기 RNA멤브레인생성단계는 상기 제1원형DNA와 제2원형DNA의 농도를 조절하여 RNA 멤브레인의 두께를 조절하는 멤브레인두께조절단계를 추가로 포함하는 것을 특징으로 한다.
본 발명의 일 실시예에 따른 RNA 멤브레인은 상기와 같은 제조방법에 의해 제조되는 것을 특징으로 한다.
본 발명은 앞서 본 실시예와 하기에 설명할 구성과 결합, 사용관계에 의해 다음과 같은 효과를 얻을 수 있다.
본 발명은 순수한 RNA로 이루어져 있기 때문에 생체내에서 독성이 없으며 컨트롤(control)이 가능하며 펩타이드(peptide)나 단백질(protein) 생산뿐만 아니라 심장막과 같은 생체 기관에도 효과적으로 사용될 수 있고 약물전달에도 활용될 수 있는 RNA 멤브레인(membrane)을 보다 저렴한 비용으로 생산할 수 있도록 하는 효과를 갖는다.
본 발명은 거시적인 크기를 갖기 때문에 반응 후 분리가 가능하여 재활용할 수 있고 장시간에도 안정적으로 보관할 수 있는 효과를 갖는다.
본 발명은 증발과정의 유도를 통해 미처 파티클을 형성하지 못한 긴 가닥의 선형RNA들이 튜브 표면으로 농축되면서 염기쌍들간의 결합이 활발히 진행되도록 하는 효과를 갖는다.
본 발명은 조건변화를 통해 제조되는 RNA 멤브레인의 거칠기와 두께 조절이 가능한 효과를 갖는다.
도 1은 제1원형DNA 생성 과정을 도시한 참고도
도 2는 제1선형RNA 생성 과정을 도시한 참고도
도 3은 RNA멤브레인 생성 과정을 도시한 참고도
도 4는 증발 과정을 도시한 참고도
도 5는 전기영동 실험결과 이미지
도 6은 RNA멤브레인 염색 실험결과 이미지
도 7은 RNA멤브레인 표면 SEM분석결과 이미지
도 8은 RNA멤브레인 내부 SEM분석결과 이미지
도 9 및 도 10은 RNA멤브레인 형광현미경 확인결과 이미지
도 11은 RNA멤브레인 분해 실험결과 그래프
도 12는 RNA멤브레인 표면 SEM 및 AFM 분석결과 이미지
도 13은 RNA멤브레인 SEM분석결과 이미지
도 14는 RNA멤브레인 약물전달능력 실험결과 그래프
이하에서는 본 발명에 따른 RNA 멤브레인 제조방법 및 이를 통해 제조된 RNA 멤브레인의 바람직한 실시예들을 첨부된 도면을 참조하여 상세히 설명한다. 하기에서 본 발명을 설명함에 있어서 공지 기능 또는 구성에 대한 구체적인 설명이 본 발명의 요지를 불필요하게 흐릴 수 있다고 판단되는 경우에는 그 상세한 설명을 생략하도록 한다. 명세서 전체에서, 어떤 부분이 어떤 구성요소를 "포함"한다고 할 때 이는 특별히 반대되는 기재가 없는 한 다른 구성요소를 제외하는 것이 아니라 다른 구성요소를 더 포함할 수 있는 것을 의미한다.
도 1 내지 도 14를 참조하면, 본 발명의 일 실시예에 따른 RNA 멤브레인(membrane) 제조방법은 제1원형DNA(11)를 생성하는 제1원형DNA생성단계(S1); 상기 제1원형DNA(11)와 반대되는 염기서열을 갖는 제2원형DNA(12)를 생성하는 제2원형DNA생성단계(S2); 전사과정을 통해 상기 제1원형DNA(11)를 이용하여 제1선형RNA(21)를 생성하는 제1선형RNA생성단계(S3); 전사과정을 통해 상기 제2원형DNA(12)를 이용하여 제2선형RNA(22)를 생성하는 제2선형RNA생성단계(S4); 상기 제1선형RNA(21)와 제2선형RNA(22)의 염기쌍들간의 결합을 유도하여 RNA 멤브레인을 생성하는 RNA멤브레인생성단계(S5);를 포함할 수 있다.
RCT(Rolling Circle Transcription)는 RNA polymerase(폴리머라제)를 이용하여 준비된 원형DNA로부터 긴 가닥의 RNA를 생성하는 것으로, RNA polymerase가 원형DNA의 염기서열과 상보적인 RNA 가닥들을 계속해서 생산해내기 때문에 낮은 비용으로 대량의 RNA를 생성할 수 있다. 또한, 반응온도가 37℃로 일정하기 때문에 반응이 간편하고 경제적이다. 따라서, 본 발명에서는 이와 같은 RCT를 활용하여 RNA 가닥을 생성하고 이를 이용하여 RNA 멤브레인을 생성하게 된다.
상기 제1원형DNA생성단계(S1)는 제1원형DNA(11)를 생성하는 과정으로, 두 종류의 DNA를 이용하여 원형의 DNA구조물을 생성해내게 된다. 도 1을 참조하면, 긴 선형의 DNA와 T7 Promoter DNA을 이용하여 이들 간의 교배(Hybridization)와 결합(Ligation)과정을 통해 원형의 DNA구조물인 제1원형DNA(11)를 생성하게 된다.
상기 제2원형DNA생성단계(S2)는 제2원형DNA(12)를 생성하는 과정으로, 앞서 상기 제1원형DNA생성단계(S1)와 동일한 원리와 과정으로 두 종류의 DNA를 이용하여 원형의 DNA구조물인 제2원형DNA(12)를 생성하게 된다. 상기 제2원형DNA(12)는 앞서 상기 제1원형DNA(11)의 염기서열과 반대되는 염기서열을 갖는 원형DNA 이다.
상기 제1선형RNA생성단계(S3)는 전사과정을 통해 상기 제1원형DNA(11)를 이용하여 제1선형RNA(21)를 생성하는 과정으로, 도 2를 참조하면, 상기 제1원형DNA생성단계(S1)를 통해 생성된 제1원형DNA(11)에 대해 T7 RNA polymerase를 이용하여 전사과정을 통해 상기 제1원형DNA(11)의 염기서열과 상보적인 긴 가닥의 제1선형RNA(21)를 생성하게 된다.
상기 제2선형RNA생성단계(S4)는 앞서 상기 제1선형RNA생성단계(S3)와 동일한 원리와 과정으로 상기 제2원형DNA(12)를 이용하여 제2선형RNA(22)를 생성하는 과정으로, 상기 제2원형DNA생성단계(S2)를 통해 생성된 제2원형DNA(12)에 대해 T7 RNA polymerase를 이용하여 전사과정을 통해 상기 제2원형DNA(12)의 염기서열과 상보적인 긴 가닥의 제2선형RNA(22)를 생성하게 된다.
상기 RNA멤브레인생성단계(S5)는 상기 제1선형RNA(21)와 제2선형RNA(22)의 염기쌍들간의 결합을 유도하여 RNA 멤브레인을 생성하는 과정으로, 도 3을 참조하면, 상기 제1선형RNA생성단계(S3)를 통해 생성된 제1선형RNA(21)와 상기 제2선형RNA생성단계(S4)를 통해 생성된 제2선형RNA(22)들 간에 염기쌍 결합이 진행되어 RNA 멤브레인이 생성되게 된다. 이와 같이 두 종류의 원형DNA를 이용하여 전사과정을 통해 RNA 가닥을 생성하고 염기쌍들의 결합을 유도하는 것이 RNA 멤브레인의 주요 생성 원리이다. 이때, 상기 RNA멤브레인생성단계(S5)는 증발단계(S51)(EISA:Evaporation-induced self-assembly, 이러한 증발과정(EISA)은 용액 내에 존재하는 RNA 가닥들을 튜브 표면으로 농축시켜 농축된 RNA 가닥들은 초기에 생성된 RNA 멤브레인과 결합되어 더 큰 크기의 RNA 멤브레인을 형성하게 된다)를 포함하는데, 생성된 상기 제1선형RNA(21)와 제2선형RNA(22)의 긴 가닥들은 스스로 꼬이고 엉켜짐을 통해 마이크로 사이즈의 파티클을 형성하여 RNA 멤브레인 제조과정이 이루어지는 튜브(용기)의 바닥에 가라앉게 되는데, 상기 증발단계(S51)는 이때 미처 파티클을 형성하지 못한 긴 가닥의 선형RNA들을 증발을 통해 농축시켜 RNA들의 염기쌍들간의 결합을 활성화시키는 과정이다. 도 4를 참조하면, 상기 증발단계(S51)를 통해 미처 파티클을 형성하지 못한 긴 가닥의 선형RNA들이 튜브 표면으로 농축되어지게 되고, 이때 RNA가닥들 간의 염기쌍 결합이 활발히 진행되어 RNA 멤브레인을 형성하게 된다.
이때, 상기 증발단계(S51)는 RNA 멤브레인 생성이 이루어지는 튜브 내의 용액의 부피가 많은 경우 등에 있어서, 상기 튜브의 커버를 제거하여 용액의 오염에 주의하여 용액의 증발을 유도시키게 되면(바람직하게는 커버를 연 상태로 37℃ 온도에서 24시간 정도 경과시킴), 미처 파티클을 형성하지 못한 긴 가닥의 선형RNA들이 튜브 표면으로 농축되면서 염기쌍들간의 결합이 활발히 진행될 수 있게 된다.
이하에서는, 본 발명에 따른 상기 과정들을 통해 생성되는 RNA 멤브레인의 생성, 형태 및 특성을 확인하기 위한 다양한 실험결과를 설명하도록 한다.
우선, 상기 제1원형DNA생성단계(S1) 및 제2원형DNA생성단계(S2)를 통해 원형 DNA가 잘 제작되었는지 확인하기 위해, 전기영동을 실시하였다. DNA는 강한 negative charge를 가지고 있기 때문에 전기영동을 통해 젤 안에서 positive charge 쪽으로 이동하게 되고, molecular weight에 따라 분류되어 지게 된다. 상기 과정을 통해 생성된 원형의 DNA는 두 가닥의 DNA가 결합하여 생성되기 때문에, molecular weight이 증가하게 되고, 이를 통해 원형 DNA가 효과적으로 제작 되었는지를 확인할 수 있다. 결과는 도 5에 나타내었다.
또한, 본 발명에 따라 생성된 RNA 멤브레인의 외형을 확인하기 위해 RNA를 염색할 수 있는 GelRed를 사용하여 RNA 멤브레인을 염색하여 확인하는 시험을 실시하였다. 이를 통해 도 6에 나타난 바와 같이, 튜브 내에서 만들어진 RNA 멤브레인은 튜브 내부 모양에 따라서 속이 빈 원통형 모양을 가지고 있음을 확인할 수 있다. 또한, RNA로 이루어져 있기 때문에 UV 노출시 강한 빨간 형광을 발하는 것을 확인할 수 있다.
또한, 본 발명에 따라 생성되는 RNA 멤브레인의 표면 및 특징을 확인하고자 SEM 분석을 실시하였다. 그 결과, 도 7에 나타난 바와 같이, 생성된 RNA 멤브레인은 마이크로 사이즈의 두께를 가지며, 여러 겹의 나노 사이즈 막으로 나뉘어 질 수 있음을 확인할 수 있다. 또한, 도 8에 나타난 바와 같이, RNA 멤브레인 내부가 굉장히 컴팩트(compact)하게 이루어져 있음을 확인할 수 있다.
또한, 본 발명에 따라 생성되는 RNA 멤브레인을 RNA 형광 염색약인 GelRed와 SYBR Green Ⅱ를 이용하여 염색한 뒤, 형광현미경을 통해 확인하였고. 그 결과는 도 9 및 도 10에 나타난 바와 같다. 도 9 및 도 10에서 붉은색으로 염색된 것이 GelRed이며, 녹색으로 염색된 것이 SYBR Green Ⅱ로 염색된 것이다.
한편, 본 발명에 따라 생성되는 RNA 멤브레인은 순수 RNA로 이루어진 멤브레인이다. 따라서, RNase(RNA를 분해하는 효소)가 없는 환경에서는 안정하게 그 형태를 유지할 수 있다. 이것을 확인하기 위해 다음과 같은 3가지 종류의 분해 실험(RNase가 존재하는 환경, DNase(DNA를 분해하는 효소) 만 있는 환경, 분해효소가 존재하지 않는 환경 하에서의 실험)을 실시하였다. 도 11에서 확인할 수 있듯이, 첫번째로 RNase가 존재하는 환경에서는, 완전히 분해되어 GelRed RNA 염색약이 용액으로 퍼져있음을 확인할 수 있다. 하지만, 다른 두 종류의 실험 즉, DNase만 있는 환경 및 분해효소가 존재하지 않는 환경에서는 RNA membrane이 그 형태를 계속해서 유지하고 있음을 확인할 수 있다. 심지어, DNase의 농도가 RNase의 농도보다 10배나 높았음에도 불구하고 DNase 환경에서는 RNA membrane이 형태를 유지하였음을 확인하였다. 조금 더 분명한 결과값을 얻고자, microplate reader를 이용하여 각 용액의 형광 강도를 측정하여 도표로 나타내었다. 측정 결과는 RNase 환경에서만 형광 강도가 크게 증가하는 것을 확인할 수 있었다(도 11 참조).
한편, 본 발명에서는 상기 RNA멤브레인생성단계(S5)에서, 상기 제1선형RNA(21)와 제2선형RNA(22) 간의 결합되는 염기쌍 수를 조절하여 RNA 멤브레인의 거칠기를 조절하는 멤브레인거칠기조절단계(S53)를 추가로 포함할 수 있다. 즉, 본 발명에서는 추가로 상기 멤브레인거칠기조절단계(S53)를 통해, 상기 제1선형RNA(21)와 제2선형RNA(22) 간의 결합되는 염기쌍 수를 조절하여 RNA 멤브레인의 거칠기를 조절할 수 있게 할 수 있다. 도 12는 상기 멤브레인거칠기조절단계(S53)를 통해 결합되는 염기쌍 수를 조절하여 만든 RNA 멤브레인 표면을 측정한 SEM 및 AFM이미지이다(염기쌍 결합수는 71 base pairs(TCRM)>24 base pairs(24-PCRM)>8 base pairs(8-PCRM) 순으로 많음). 이를 통해 염기쌍 결합수가 많을수록 생성되는 RNA 멤브레인의 표면이 더욱 매끈하게 할 수 있는 것을 확인할 수 있다.
또한 상기 RNA멤브레인생성단계(S5)는, 상기 제1원형DNA(11)와 제2원형DNA(12)의 농도를 조절하여 RNA 멤브레인의 두께를 조절하는 멤브레인두께조절단계(S55)를 추가로 포함할 수 있다. 즉, 본 발명에서는 추가로 상기 멤브레인두께조절단계(S55)를 통해, 새로이 생성되는 상기 제1원형DNA(11)와 제2원형DNA(12)의 농도를 조절하여 RNA 멤브레인의 두께를 조절할 수 있게 할 수 있다. 도 13은 상기 멤브레인두께조절단계(S55)를 통해 새로이 생성되는 제1원형DNA(11)와 제2원형DNA(12)의 농도를 조절하여 만든 RNA 멤브레인의 SEM이미지이다. 그 결과 새로이 생성되는 원형 DNA의 농도를 낮출수록 더 얇은 크기의 RNA 멤브레인을 생성할 수 있음을 확인할 수 있다. 즉, 상기 멤브레인두께조절단계(S55)를 통해 생성되는 RNA 멤브레인의 마이크로 단위의 크기조절이 가능하게 된다.
본 발명의 제조방법에 의해 생성된 상기 RNA 멤브레인은 순수한 RNA로 이루어져 있는 특징을 갖기 때문에, 생체내에서 독성이 없으며 컨트롤(control)이 가능하며 펩타이드(peptide)나 단백질(protein) 생산뿐만 아니라 심장막과 같은 생체 기관에도 효과적으로 사용될 수 있으며, 특히 약물을 RNA 멤브레인에 첨가하여 전달하는 약물전달에 유용하게 활용될 수 있다.
이하에서는, 본 발명에 의해 제조된 상기 RNA 멤브레인의 약물전달능력을 확인하기 위한 실험을 하였다. 실험은 RNA 멤브레인에 포함되어 있는 Doxorubicin(독소루비신) 약물이 solution(용액) 상으로 퍼져나가는 것을 확인함으로써, RNA 멤브레인이 약물전달 물질로서 사용될 수 있음을 확인한 실험이다. 먼저, TCRM(71 base pairs RNA 멤브레인)과 24-PCRM을 RNases 용액에 넣고, 37℃ 온도에서 24시간 인큐베이트(incubate) 하였다. 약물이 용액으로 전달됨을 확인하기 위해, microplate reader를 이용하여 용액의 형광을 측정하였다. 그 결과는 도 14에 도시된 바와 같다. 도 14에서 Control 이라고 적힌 선은 TCRM을 RNases 용액이 아닌 Nuclease free water에 넣었을 때의 결과이다. 이를 통해, TCRM과 24-PCRM은 RNase가 존재할 때 효과적으로 Doxorubicin을 전달할 수 있음을 확인할 수 있었다.
또 하나, 본 발명에 의해 제조된 RNA 멤브레인의 특징 중 하나는, 상기 RNA 멤브레인이 수분의 유무에 따라 수축과 팽창이 가능하여 약물로서 제작을 할 때 용이하다는 점이다. 즉, 본 발명을 통해 튜브안에서 형성된 RNA 멤브레인은 용액 안에 있을 때는 튜브 내부 표면과 같은 형태를 가지고 있지만, 용액 밖에서는 수분이 빠져나와 수축되어 막대기와 같은 형태로 쪼그라든다. 하지만, 이를 다시 용액 속에 넣어주게 되면, 다시 팽창하게 되는데, 본 발명에 의해 제조된 RNA 멤브레인의 이러한 특징은 재료로서 더욱 다양한 응용 가능성을 보여준다고 할 수 있다.
이와 같이, 본 발명에 의해 제조된 RNA 멤브레인은 순수한 RNA로 이루어져 있기 때문에, 생체 내에서 독성이 없으며, Control이 가능하여 다양한 분야에서 응용이 가능하다. 또한, 종래와 같은 RNA를 직접 합성하는 방법에 비해 저렴한 비용으로 생산될 수 있기 때문에 경제적이다. 특히, 상기 RNA 멤브레인의 큰 크기와 RNA의 높은 농도는 RNA 멤브레인의 siRNA delivery 적용 가능 잠재성이 매우 크다고 평가할 수 있다. 또한, 생체 소재로 이루어져 있고, control이 가능하기 때문에, 심장막과 같은 생체 기관에도 효과적으로 사용될 수 있다. 기존의 생체 기관에 사용되는 화학 재료들에 비해 RNA는 생체 물질로 이루어져 있기 때문에 독성에 있어서 보다 안전하게 사용되어 질 수 있다. 게다가, 상기 RNA 멤브레인은 기존의 protein 생성에 필요한 mRNA와 달리, 거시적인 크기를 가지고 있기 때문에, translation 반응 후, 분리가 가능하여 재활용이 가능하며, 기존의 짧은 RNA 가닥에 비해 거대한 형태의 구조물로 존재하고 있어, 장시간에도 안정하게 보관될 수 있다는 특징을 갖게 된다.
이상에서, 출원인은 본 발명의 바람직한 실시예들을 설명하였지만, 이와 같은 실시예들은 본 발명의 기술적 사상을 구현하는 일 실시예일 뿐이며 본 발명의 기술적 사상을 구현하는 한 어떠한 변경예 또는 수정예도 본 발명의 범위에 속하는 것으로 해석되어야 한다.
Claims (6)
- 제1원형DNA를 생성하는 제1원형DNA생성단계;상기 제1원형DNA와 반대되는 염기서열을 갖는 제2원형DNA를 생성하는 제2원형DNA생성단계;전사과정을 통해 상기 제1원형DNA를 이용하여 제1선형RNA를 생성하는 제1선형RNA생성단계;전사과정을 통해 상기 제2원형DNA를 이용하여 제2선형RNA를 생성하는 제2선형RNA생성단계;상기 제1선형RNA와 제2선형RNA의 염기쌍들간의 결합을 유도하여 RNA 멤브레인을 생성하는 RNA멤브레인생성단계;를 포함하는 것을 특징으로 하는 RNA 멤브레인 제조방법.
- 제 1 항에 있어서,상기 RNA멤브레인생성단계는 미처 파티클을 형성하지 못한 긴 가닥의 선형RNA들을 증발을 통해 농축시켜 RNA들의 염기쌍들간의 결합을 활성화시키는 증발단계를 포함하는 것을 특징으로 하는 RNA 멤브레인 제조방법.
- 제 2 항에 있어서,상기 증발단계는 RNA 멤브레인 생성이 이루어지는 튜브의 커버를 제거하여 증발을 유도시켜 미처 파티클을 형성하지 못한 긴 가닥의 선형RNA들이 튜브 표면으로 농축되면서 염기쌍들간의 결합이 활발히 진행되는 것을 특징으로 하는 RNA 멤브레인 제조방법.
- 제 2 항에 있어서,상기 RNA멤브레인생성단계는 상기 제1선형RNA와 제2선형RNA 간의 결합되는 염기쌍 수를 조절하여 RNA 멤브레인의 거칠기를 조절하는 멤브레인거칠기조절단계를 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는 RNA 멤브레인 제조방법.
- 제 2 항에 있어서,상기 RNA멤브레인생성단계는 상기 제1원형DNA와 제2원형DNA의 농도를 조절하여 RNA 멤브레인의 두께를 조절하는 멤브레인두께조절단계를 추가로 포함하는 것을 특징으로 하는 RNA 멤브레인 제조방법.
- 제 1 항 내지 제 5 항 중 어느 하나의 항의 제조방법에 의해 제조된 RNA 멤브레인.
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