WO2015053402A1 - 脊髄小脳変性症を予防又は治療するための薬剤 - Google Patents

脊髄小脳変性症を予防又は治療するための薬剤 Download PDF

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岡澤　均
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国立大学法人東京医科歯科大学
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Definitions

  • the present invention relates to a drug for preventing or treating spinocerebellar degeneration.
  • the present invention also relates to a screening method for candidate compounds for preventing or treating spinocerebellar degeneration.
  • SCA Spinocerebellar degeneration
  • SCA1 spinocerebellar degeneration type 1
  • SCA1 RBM17 having an RNA recognition motif
  • ATXN1 SCA1 ataxin 1
  • polyQ polyglutamine chain
  • Non-patent Document 3 the dephosphorylation of ATXN1 occurs due to the binding of 14-3-3 and ATXN1 (Non-patent Document 3), and it has also been clarified that the phosphorylation plays an important role in the binding of RBM17 and ATXN.
  • Non-Patent Document 4 transcription repressor CIC / capicua, Sox2-like high mobility group protein (Sox2-like high mobility group (HMG)), HBP-1 and HMG box transcription factors are known to interact with the AXH domain of ATXN1.
  • HMG Sox2-like high mobility group
  • Non-patent Document 5 polyglutamine-binding protein-1 is a component of spliceosome (Non-patent Documents 6 and 7), binds to the polyglutamine chain of ATXN1, and is localized with ATXN1 in a specific nucleolus. It is known (Non-Patent Document 8).
  • Non-patent document 9 By the way, it is known that transcription and splicing and DNA damage repair are closely related. For example, when DNA damage occurs, transcription is stopped until the damaged genomic DNA is repaired, which also affects alternative splicing. It is also known that when DNA double-strand breaks (DSBs) occur in the transcription process, coiled double-stranded DNA is loosened and the transcription mechanism can be accessed.
  • DSBs DNA double-strand breaks
  • Non-Patent Document 10 the DNA structural proteins HMGB1 and HMGB2 are known to play an important role in a wide variety of DNA damage repair mechanisms, but the mutant ATXN1, which is the etiology of SCA1, is responsible for the expression of these DNA structural proteins. It has been clarified that it is reduced (Non-Patent Document 10). Further, regarding the above-mentioned RBM17, the Drosophila homologous protein is also a protein that binds to ATXN1, and is further known to be involved in DNA damage repair (Non-patent Document 11).
  • Non-patent Documents 12 and 13 DNA damage repair is also involved in the development of SCA other than SCA1 (Non-patent Documents 12 and 13).
  • telangiectasia ataxia is caused by dysfunction of an ATM gene involved in the control of DNA double-strand break repair (DSBR) (Non-patent Document 14).
  • DSBR DNA double-strand break repair
  • AOA1 ataxia type 1
  • SSBR single-strand DNA break repair
  • Senataxin is thought to eliminate DNA-RNA hybrids formed at sites where transcription is stopped (Non-patent Document 19), and is involved in various types of DNA repair such as transcription-coupled repair. Is also an ortholog of yeast RNA helicase (Non-patent Document 20).
  • DNA damage repair is performed through complicated processes, and there are various types such as DSBR, SSBR, base excision repair (BER) and nucleotide excision repair (NER). Therefore, it is extremely difficult to elucidate what DNA damage repair and what molecule contributes greatly to the pathology of SCA, and there are still no effective drugs or the like for treating or preventing SCA. The current situation is that it has not been developed.
  • the present invention has been made in view of the above-mentioned problems of the prior art, and provides a compound capable of treating or preventing spinocerebellar degeneration and a candidate compound for preventing or treating spinocerebellar degeneration.
  • An object of the present invention is to provide a screening method.
  • the present inventors prepared a SCA1 model fly in which Drosophila expressed human mutant ataxin 1 (mutant ATXN1), which is the etiology of spinocerebellar degeneration type 1 (SCA1). Furthermore, in this model fly, a Drosophila homologous gene related to DNA repair was overexpressed. Then, in vivo screening for DNA repair genes involved in the pathology of SCA was performed using as an index whether or not the short survival time, which is one of the symptoms of SCA1 model flies, was recovered.
  • Drosophila expressed human mutant ataxin 1 mutant ATXN1
  • SCA1 spinocerebellar degeneration type 1
  • RPA1, PNKP, XRCC3, XRCC4, CCNH, POLE, POLH and PER1 were identified as genes that restore the pathological condition of SCA.
  • CHK1, LIG3, FEN1, LIG1, ERCC5, XAB2, ERCC2, DMC1, RECQL5, MUS81, EME1, SPO11, and BLM are identified as genes that further shorten the survival period of SCA1 model flies, that is, genes that worsen the pathology of SCA It was done. These identified genes have not been previously known to be involved in the pathology of polyglutamine diseases such as SCA.
  • CHK1 which plays an important role in further worsening of the pathological condition of SCA
  • a CHK1-specific inhibitor is administered to SCA1 model flies in order to chemically or genetically inhibit its function, or CHK1 in SCA1 model flies SiRNA was expressed.
  • a drug for preventing or treating spinocerebellar degeneration comprising at least one of the following (a) to (d) as an active ingredient: (a) RPA1, BRCA1, BRCA2, PNKP, XRCC3, XRCC4, At least one protein selected from the group consisting of CCNH, POLE, POLH and PER1, or a nucleic acid encoding the protein (b) RPA1, BRCA1, BRCA2, PNKP, XRCC3, XRCC4, CCNH, POLE, POLH and PER1 A compound that promotes the expression or activity of at least one protein selected from (c) a compound that suppresses the binding of ATXN1 to at least one protein selected from the group consisting of RPA1, BRCA1, and BRCA2 (d) CHK1, LIG3, FEN1, LIG1, E A compound that suppresses the expression or activity of at least one protein selected from the group consisting of RCC5, DMC1, XAB2, ERCC2, RECQL5, MUS
  • a compound that suppresses the activity of the CHK1 protein as an active ingredient is 4-[((3S) -1-azabicyclo [2.2.2] oct-3-yl) amino] -3- (1H-benzimidazol-2-yl) -6-chloroquinolin-2 (1H) -one, (S) -1- (5-bromo-4-methyl-2- (morpholin-2-ylmethoxy) phenyl)- 3- (5-methylpyrazin-2-yl) urea, 6-bromo-3- (1-methyl-1H-pyrazol-4-yl) -5- (3R) -3-piperidinylpyrazolo [1,5- a] pyrimidin-7-amine, (R) - ⁇ -amino-N- [5,6-dihydro-2- (1-methyl-1H-pyrazol-4-yl) -6-oxo-1H-pyrrolo [4 , 3,2-ef] [2,3] benzodiazepin
  • a screening method for candidate compounds for preventing or treating spinocerebellar degeneration comprising the following steps (a) to (c): (a) comprising RPA1, BRCA1 and BRCA2 in the presence of a test compound Contacting ATXN1 with at least one protein selected from the group; (B) detecting the binding between ATXN1 and at least one protein selected from the group consisting of RPA1, BRCA1 and BRCA2, (C) A step of selecting a compound that suppresses the binding.
  • a method for screening candidate compounds for preventing or treating spinocerebellar degeneration comprising the following steps (a) and (b): (a) RPA1, BRCA1, BRCA2, PNKP, XRCC3, XRCC4, CCNH, POLE Applying the test compound to a system capable of detecting the expression or activity of at least one protein selected from the group consisting of POLH and PER1; (B) A step of selecting a compound that promotes the expression or activity of the protein.
  • a method for screening candidate compounds for preventing or treating spinocerebellar degeneration comprising the following steps (a) and (b): (a) CHK1, LIG3, FEN1, LIG1, ERCC5, DMC1, XAB2, ERCC2 Applying a test compound to a system capable of detecting the function of at least one protein selected from the group consisting of RECQL5, MUS81, EME1, SPO11 and BLM; (B) A step of selecting a compound that suppresses the expression or activity of the protein.
  • spinal cerebellar degeneration refers to a nerve that gradually destroys and disappears from the cerebellum and brain stem to the spinal cord, which is also called SCD (spinocerebellular degeneration) or SCA (spinocerebellar atrophy). Means degenerative disease.
  • Spinocerebellar degeneration can be broadly classified into two types, hereditary and non-hereditary. Examples of hereditary ones include hereditary olive bridge cerebellar atrophy and hereditary cortical cerebellar atrophy.
  • Machado-Joseph disease Friedreich ataxia, ataxia type 1 with eye movement ataxia (AOA1), AOA2, hereditary dentate nucleus red nucleus pallidal Louis atrophy, telangiectasia ataxia
  • non-inherited ones include olive bridge cerebellar atrophy, Shy Dräger syndrome, striatal nigra degeneration, and cortical cerebellar atrophy.
  • hereditary ones are classified into type 31 (SCA1-31) according to their causal genes.
  • spinocerebellar degeneration can be classified into a number of diseases according to accompanying symptoms, causative genes, etc., but any type of spinocerebellar degeneration, whether hereditary or non-hereditary, is SCA.
  • the major symptom of cerebellar is cerebellar or dorsal spinal ataxia with common pathological features.
  • RPA1 is a protein also referred to as RPA70, HSSB, MST075, REPA1, RF-A, or RP-A.
  • a protein derived from human is specified by RefSeq ID: NP_002936.
  • a typical example of a human-derived nucleic acid encoding RPA1 is a nucleic acid containing a coding region (CDS) described in RefSeq ID: NM_002945.
  • BRCA1 is a protein also referred to as IRIS, PSCP, BRCC1, PNCA4, RNF53, BROVCA1 or PPP1R53.
  • a protein derived from human is specified by RefSeq ID: NP_009225 Examples include proteins.
  • a typical example of a human-derived nucleic acid encoding BRCA1 is a nucleic acid containing CDS described in RefSeq ID: NM_007294.
  • BRCA2 is a protein also referred to as BRCC2, BROVCA2, FACD, FAD, FAD1, FANCB, FANCD, FANCD1, GLM3, or PNCA2, and typically includes a RefSeq ID if it is derived from human. : A protein specified by NP — 000050.
  • a typical example of a human-derived nucleic acid encoding BRCA2 is a nucleic acid containing CDS described in RefSeq ID: NM — 000059.
  • PNKP is a protein that is also referred to as EIEE10, MCSZ, or PNK. Typical examples include a protein that is specified by RefSeq ID: NP — 009185 if it is derived from human.
  • a typical example of a human-derived nucleic acid encoding PNKP is a nucleic acid containing CDS described in RefSeq ID: NM_007254.
  • XRCC3 is a protein also referred to as CMM6, and typical examples include a protein specified by RefSeq ID: NP — 001093588 if it is derived from human. Further, a typical example of a human-derived nucleic acid encoding XRCC3 includes a nucleic acid containing CDS described in RefSeq ID: NM_001100118.
  • XRCC4 is a protein specified by RefSeq ID: NP_003392 if it is derived from a human.
  • a typical example of a human-derived nucleic acid encoding XRCC4 is a nucleic acid containing CDS described in RefSeq ID: NM_003401.
  • CCNH is a protein also referred to as cyclin H, CAK, p34 or p37, and typical examples include a protein specified by RefSeq ID: NP — 001230 as long as it is derived from human.
  • a typical example of a human-derived nucleic acid encoding CCNH is a nucleic acid containing CDS described in RefSeq ID: NM_001239.
  • POLE is a protein also referred to as DNA polymerase epsilon, CRCS12, FILS or POLE1, and typically includes a protein specified by RefSeq ID: NP — 006222 if it is derived from human. .
  • a typical example of a human-derived nucleic acid encoding POLE includes a nucleic acid containing CDS described in RefSeq ID: NM_006231.
  • POLH is a protein also referred to as DNA polymerase eta, RAD30, RAD30A, XP-V or XPV, and is typically identified by RefSeq ID: NP_006493 if it is derived from human. Examples include proteins. Further, a typical example of a human-derived nucleic acid encoding POLH is a nucleic acid containing CDS described in RefSeq ID: NM_006502.
  • PER1 is a protein also referred to as hPER, PER, or RIGUI, and typical examples include a protein specified by RefSeq ID: NP_002607 as long as it is derived from a human. Moreover, a typical example of a human-derived nucleic acid encoding PER1 includes a nucleic acid containing CDS described in RefSeq ID: NM_002616.
  • CHK1 is a protein that is also referred to as CHEK1, and typically, if it is derived from human, the protein specified by RefSeq ID: NP_001107593 (RefSeq ID: NM — 001114121) Encoded protein).
  • LIG3 is a protein also referred to as DNA ligase 3 or LIG2.
  • a protein identified by RefSeq ID: NP — 039269 (described in RefSeq ID: NM — 013975) is human-derived. Protein encoded by the nucleotide sequence of
  • FEN1 is a protein that is also referred to as FEN-1, MF1, or RAD2. As a typical one, a protein specified by RefSeq ID: NP_004102 (RefSeq ID: NM_004111) if it is derived from human. And a protein encoded by the base sequence described in 1).
  • LIG1 is a protein that is also referred to as DNA ligase 1. Typically, a protein identified by RefSeq ID: NP — 00225 (RefSeq ID: NM — 000234) is a human-derived protein. Protein encoded by the sequence).
  • ERCC5 is a protein that is also referred to as COFS3, ERCM2, UVDR, XPG, or XPGC. Typically, if it is derived from a human, a protein (RefSeq ID) specified by RefSeq ID: NP_000114 : Protein encoded by the base sequence described in NM — 000123).
  • XAB2 is a protein that is also referred to as HCNP, HCRN, NTC90, or SYF1, and typically, if it is derived from a human, a protein identified by RefSeq ID: NP — 064581 (RefSeq ID: NM — 020196) And a protein encoded by the base sequence described in 1).
  • ERP2 is a protein that is also referred to as COFS2, EM9, TTD, or XPD.
  • a protein that is human-derived is specified by RefSeq ID: NP_000391 (RefSeq ID: NM_000400).
  • DMC1 is a protein also referred to as LIM15, dJ199H16.1, DMC1H, or HsLim15. Typically, if it is derived from human, a protein identified by RefSeq ID: NP_008999 (RefSeq ID) : A protein encoded by the base sequence described in NM_007068).
  • RECQL5 is a protein that is also referred to as RECQ5. Typically, if it is derived from human, the protein specified by RefSeq ID: NP_001003715 (RefSeq ID: NM_001003715 Encoded protein).
  • MUS81 is a protein also referred to as SLX3. Typically, if it is derived from a human, the protein identified by RefSeq ID: NP — 079404 (RefSeq ID: NM — 025128) Encoded protein).
  • EME1 is a protein that is also referred to as FLJ31364 or MMS4L. Typically, if it is derived from a human, a protein specified by RefSeq ID: NP — 688676 (a base described in RefSeq ID: NM — 152463) Protein encoded by the sequence).
  • SPO11 is a protein that is also referred to as CT35, SPATA43, or TOPVIA.
  • a protein that is human-derived is specified by RefSeq ID: NP — 0356576 (described in RefSeq ID: NM — 012444). Protein encoded by the nucleotide sequence of
  • BLM is a protein that is also referred to as BS, RECQ2, RECQL2, or RECQL3. Typically, if it is derived from a human, a protein identified by RefSeq ID: NP_000048 (RefSeq ID: NM_000057) And a protein encoded by the base sequence described in 1).
  • ATXN1 is a protein also referred to as ataxin 1, ATX1, D6S504E, or SCA1, and typically, a protein derived from a human being referred to as RefSeq ID: NP_000323 (RefSeq ID: And a protein encoded by the base sequence described in NM_000332.
  • FIG. 2 is a photomicrograph showing the result of detecting the expression of Atxn1 in motor nerves of OK6-drive Atxn1 transgenic flies by immunostaining using H21 anti-Atxn1 antibody. That is, it is a photomicrograph showing that the expression of ATXN1 was confirmed in the VNC of the transgenic fly compared to the control fly that expressed only DsRed. The fly was dissected on the 7th to 10th days and subjected to this analysis.
  • FIG. 2 shows DNA damage repair network-1 that contributes to the survival of SCA1 model flies as predicted by Ingenuity-IPA software using a human protein-protein interaction database.
  • the circled gene indicated as “NHEJ type DSBR” is a gene related to DNA double-strand break repair at the non-homologous end-joining type, and indicated as “HR type DSBR”.
  • Circled genes that are related to DNA double-strand break repair of homologous recombination, and genes surrounded by circles labeled “NER and BER” are nucleotide excision repair or A gene related to base excision repair and a circle surrounded by “transcription” is a gene related to transcription.
  • “Ku70” indicates XRCC6, and “Ku” with a double circle is distinguished from the Ku70 / Ku80 complex.
  • PARP1 is a gene related to single-strand DNA break repair (SSBR) and nucleotide excision repair (NER), and XRCC1, LIG3, and PARP1 are different types of DNA double-strand break repair (B-NHEJ). Is also a gene involved.
  • FIG. 2 shows DNA damage repair network-2 that contributes to the survival of SCA1 model flies predicted by Ingenuity-IPA software using a human protein-protein interaction database.
  • FIG. 2 shows DNA damage repair network-1 that contributes to shortening the survival time of SCA1 model flies, predicted by Ingenuity-IPA software using a human protein-protein interaction database.
  • FIG. 2 shows DNA damage repair network-2 that contributes to shortening the survival time of SCA1 model flies predicted by Ingenuity-IPA software using a human protein-protein interaction database.
  • FIG. 10 is a diagram for explaining the notation in FIGS. It is a photograph which shows the result analyzed by the western blotting which used the immunoprecipitation assay by anti- ATXN1 antibody regarding the interaction of ATXN1 and RPA1, and used anti-RPA1 antibody.
  • lane 1 shows the results of Hela cells co-expressed with EGFP and Myc
  • lane 2 shows the results of Hela cells co-expressed with EGFP and Atxn1-33Q-Myc
  • lane 3 shows EGFP and Myc.
  • the results of Hela cells co-expressed with Atxn1-86Q-Myc are shown
  • lane 4 shows the results of Hela cells expressing only EGFP-RpA1
  • lane 5 shows EGFP-RpA1 and Atxn1-33Q-Myc.
  • the result of the co-expressed Hela cells is shown
  • lane 6 shows the result of the Hela cells co-expressed with EGFP-RpA1 and Atxn1-86Q-Myc.
  • “Input” indicates the result before subjecting to immunoprecipitation with the anti-ATXN1 antibody
  • “IP” indicates the result of analyzing the precipitate with the anti-ATXN1 antibody. It is a photograph which shows the result of having analyzed the immunoprecipitation assay by an anti- RPA1 antibody regarding the interaction of ATXN1 and RPA1, and analyzing by Western blotting using an anti-ATXN1 antibody. In the figure, the notation of lanes is the same as in FIG. “Input” shows the result before subjecting to immunoprecipitation with anti-RPA1 antibody, and “IP” shows the result of analyzing the precipitate with anti-RPA1 antibody.
  • lane 1 shows the results of Hela cells co-expressed with EGFP and Myc
  • lane 2 shows the results of Hela cells co-expressed with EGFP and Atxn1-33Q-Myc
  • lane 3 shows EGFP and Myc. The results of Hela cells co-expressed with Atxn1-86Q-Myc are shown.
  • “Input” indicates the result before subjecting to immunoprecipitation with the anti-BRCA1 antibody
  • “IP” indicates the analysis result of the precipitate with the anti-BRCA1 antibody.
  • the left panel shows the result of detecting chemiluminescence in Western blotting after a short exposure
  • the right panel shows the result of detecting chemiluminescence in Western blotting after a long exposure. It is a photograph which shows the result of having analyzed the western blotting using an anti- ATXN1 antibody about the interaction of ATXN1 and BRCA2, performing the immunoprecipitation assay by an anti- BRCA2 antibody.
  • the notation of lanes is the same as in FIG.
  • “Input” indicates the result before subjecting to immunoprecipitation with the anti-BRCA2 antibody
  • “IP” indicates the result of analyzing the precipitate with the anti-BRCA2 antibody. It is a photograph showing the result of subjecting a mutant Atxn1-KI mouse (KI) and its non-transgenic mouse (WT) to an immunoprecipitation with an anti-RPA1 antibody or an anti-ATXN1 antibody. That is, it is a photograph showing that mutant ATXN1 binds to RPA1 more strongly than wild-type ATXN1.
  • the upper left panel shows the results of analysis of RPA1 expression in the mouse-derived sample before immunoprecipitation by Western blotting, and the results of analysis of ATXN1 expression in the lower left sample by Western blotting.
  • the upper right panel shows the precipitate from mouse IgG, anti-RPA1 antibody or anti-ATXN1 antibody (in the figure, “IP Mouse Normal IgG”, “IP Anti-RpA1 (H7)” or “IP Anti-Atxn1 (11NQ)”)
  • the results of analysis of RPA1 expression by Western blotting are shown, and the two panels on the lower right side show the results of analysis of ATXN1 expression in the precipitate by Western blotting.
  • BRCA1 and ATXN1 in the nuclei of neurons and cerebellum (Cerebellum) Purkinje cells in the cerebral cortex of wild-type mice (WT) and mutant Atxn1-KI mice (154Q) It is a microscope picture which shows that it colocalizes. In addition, several cortical neurons having inclusion bodies in which BRCA1 is isolated together with ATXN1 were observed (see arrows in the figure). It is a microscope picture which shows the result analyzed about the localization in the nucleus of BRCA2 and ATXN1.
  • BRCA2 is a photomicrograph showing that it was mainly localized in the cytoplasm of Purkinje cells of wild type mice (WT) and mutant Atxn1-KI mice (154Q).
  • the localization of ATXN1 stained with the 11NQ antibody partially overlaps the localization of BRCA2 in the nucleus.
  • Such partial co-localization was also observed in cortical neurons.
  • FIG. 6 is a micrograph showing the results of inducing linear DNA DSB by high energy UVA and observing the accumulation of VCP-EGFP at the linear DNA DSB site in U2OS cells expressing Atxn1-86Q-DsRed.
  • FIG. 20 is a graph showing the results of quantitative analysis of the EGFP signal at the linear DNA DSB site for 0 to 10 minutes after the micro-irradiation with respect to the results shown in FIG. NFU indicates a normalized fluorescence unit (normalized fluorescence units).
  • DSB increases were recovered by co-expression with RPA1 / RPA70 without being affected by ATXN1 stained with H21.
  • DSB was detected using ⁇ H2AV expression as an index.
  • FIG. 22 is a graph showing the results of quantifying the ⁇ H2Av signal in motor nerves with respect to the results shown in FIG. 21. That is, it is a graph showing the recovery effect of RPA1 / RPA70 in DSB. It is a photograph which shows the result of having analyzed about the genetic interaction in CHK1 / grp or RPA1 / RpA70, and ATXN1 by using the rough eye phenotype of SCA1 model fly as an index.
  • a weak signal derived from BrdU incorporated into deteriorated Purkinje cells was detected by double staining (“Merge” in the figure) with an anti-BrdU antibody (“BrdU” in the figure) and an anti-calbindin antibody (“Calbindin” in the figure) It is the microscope picture which shows having been done (refer the arrow in a figure). In normal Purkinje cells in which a strong signal derived from calbindin is detected, a signal derived from BrdU is not detected.
  • the signal intensity derived from 53BP1 in Atxn1-KI mice is comparable to that in wild-type mice (WT) with respect to Bergman glia (see arrow), and is a micrograph showing that it was enhanced in Purkinje cells.
  • No signal from BrdU was detected in Bergman glia of Atxn1-KI mice by double staining (“Merge” in the figure) with anti- ⁇ H2A antibody (“ ⁇ H2A” in the figure) and anti-Sox2 antibody (“Sox2” in the figure) It is a microscope picture which shows that.
  • medical agent for preventing or treating spinocerebellar degeneration containing the following (a) as at least 1 active ingredient is provided.
  • the protein such as RPA1 does not necessarily have to be a protein (wild type protein) specified by the above-mentioned RefSeq ID as a typical example, and the activity of each protein is As long as it is maintained, it may be a mutant in which an amino acid is substituted, deleted, or inserted, artificially or non-artificially, or may be a modified body with a modification. Whether the activity of the mutant and the modified form is maintained can be determined by using a screening method described later.
  • Examples of the protein mutant include a protein having an amino acid sequence in which one or a plurality of amino acids are substituted, deleted, added, and / or inserted in the wild-type protein described above.
  • the term “plurality” usually means within 50 amino acids, preferably within 40 amino acids, more preferably within 30 amino acids, still more preferably within 20 amino acids, particularly preferably within 10 amino acids (for example, within 5 amino acids, within 3 amino acids). Within 2 amino acids, 1 amino acid).
  • the amino acid substitution is preferably a conservative substitution.
  • “conservative substitution” means substitution with another amino acid residue having a chemically similar side chain. Groups of amino acid residues having chemically similar amino acid side chains are well known in the technical field to which the present invention belongs.
  • examples of the protein mutant include a polypeptide encoded by a nucleic acid that hybridizes with a nucleic acid encoding the above-mentioned wild-type protein under highly stringent conditions.
  • conditions for high stringency hybridization include conditions of 0.2 ⁇ SSC and 65 ° C.
  • examples of the protein added to RPA1 and the like include the IgG portion and serum albumin portion of the antibody.
  • such a protein can be directly or indirectly added to either one or both of the N-terminal and C-terminal such as RPA1.
  • a linker comprising an arbitrary amino acid sequence can be used.
  • modification examples include, for example, phosphorylation, acetylation, methylation, ADP ribosylation, ubiquitin bond, saccharification, carbonylation, sumoylation, and at least one polymer of polyethylene glycol, polypropylene glycol and polyoxyalkylene And a covalent bond.
  • the nucleic acid may be in any form as long as it can encode a protein such as RPA1. That is, it does not matter whether it is cDNA synthesized from mRNA, genomic DNA, or chemically synthesized DNA.
  • a nucleic acid having an arbitrary base sequence based on codon degeneracy is included as long as it can encode a protein such as RPA1.
  • the nucleic acid may be inserted into a vector.
  • the vector may be any vector as long as it can express the protein encoded by the nucleic acid within the administration subject of the drug of the present invention, and examples thereof include lentivirus, retrovirus, adenovirus, adeno-associated (AAV) virus, herpes virus. And virus vectors such as Sendai virus, episomal vectors, PiggyBac transposon vectors, and plasmid vectors.
  • virus vectors such as Sendai virus, episomal vectors, PiggyBac transposon vectors, and plasmid vectors.
  • the promoter used in such a vector include CAG promoter, SR ⁇ promoter, SV40 promoter, LTR promoter, CMV promoter, RSV promoter, and HSV-TK promoter.
  • the vector may further contain an enhancer, a poly A addition signal, and the like.
  • the nucleic acid thus prepared is inserted into an appropriate vector, the vector is introduced into a cell-free protein synthesis system (for example, reticulocyte extract, wheat germ extract), and incubated.
  • a cell-free protein synthesis system for example, reticulocyte extract, wheat germ extract
  • Is introduced into an appropriate cell for example, E. coli, yeast, insect cell, animal cell
  • the obtained transformant is cultured to prepare the aforementioned protein.
  • the protein can be purified by known methods. Examples of such methods include solvent extraction methods, salting out methods using ammonium sulfate, desalting methods, precipitation methods using organic solvents, DEAE-Sepharose, ion exchange chromatography methods, hydrophobic chromatography methods, gel filtration methods, affinity methods, and the like. A chromatographic method is mentioned.
  • the aforementioned proteins and nucleic acids can also be prepared by chemical synthesis using a commercially available synthesizer.
  • medical agent for preventing or treating spinocerebellar degeneration containing the following (b) as at least 1 active ingredient is provided.
  • B A compound that promotes the expression or activity of at least one protein selected from the group consisting of RPA1, BRCA1, BRCA2, PNKP, XRCC4, XRCC4, CCNH, POLE, POLH, and PER1.
  • the “activity” that is the target of the suppression of the compound described below means an activity related to DNA repair.
  • Such activity exhibits not only functions (DNA synthesis activity, DNA ligase activity, nuclease activity, topoisomerase activity, polynucleotide kinase activity, etc.) that are exhibited in DNA repair mechanisms involving RPA1 and the like, but also those functions.
  • the binding ability to other proteins, the modification activity for other proteins ubiquitin ligase activity, protein kinase activity, etc.
  • the ability to bind to DNA to be repaired, and the like are also included.
  • the “compound that promotes the expression or activity of RPA1” may be a known compound or may be identified by screening described below.
  • the base sequence of the nucleic acid encoding the protein to be promoted by the compound is mutated in nature (that is, non-artificially), and thus also mutates in the amino acid sequence of the protein. Therefore, the protein is not limited to the protein consisting of the amino acid sequence mentioned as the above typical example, and mutants that can occur in nature are also targets of promotion by the compound.
  • a drug for preventing or treating spinocerebellar degeneration comprising the following (c) as at least one active ingredient is provided.
  • RPA1, BRCA1, BRCA2, and ATXN1 are not limited to proteins having the amino acid sequences listed as typical examples above, and variants that can occur in nature are also targeted. Become. In particular, for ATXN1, ATXN1 having an abnormally elongated polyglutamine chain from the viewpoint of binding more strongly to RPA and BRCA1 and affecting the intracellular kinetics of these proteins, as shown in the Examples and the like described later.
  • ATXN1 having an abnormally extended polyglutamine chain is not particularly limited as long as it causes the pathogenesis of SCA1, but usually ATXN1 having a polyglutamine chain composed of 39 or more glutamines (preferably 82 glutamines).
  • a drug for preventing or treating spinocerebellar degeneration comprising the following (d) as at least one active ingredient is provided.
  • (D) A compound that suppresses the expression or activity of at least one protein selected from the group consisting of CHK1, LIG3, FEN1, LIG1, ERCC5, XAB2, ERCC2, DMC1, RECQL5, MUS81, EME1, SPO11, and BLM.
  • the “activity” that is the target of the suppression of the compound described below means an activity related to DNA repair as in the case of the active ingredient (b) described above.
  • suppression of protein expression means not only complete suppression (inhibition) of the expression but also partial suppression.
  • CHK1 and the like are not limited to proteins having the amino acid sequences listed as the above typical examples, and mutants that can occur in nature are also targeted.
  • the “compound that suppresses the expression or activity of CHK1” is not particularly limited, and may be a known compound or may be identified by screening described below. Such compounds include, for example, low molecular weight compounds that bind to CHK1, etc., RNA that binds to transcription products of genes encoding CHK1, etc., antibodies to CHK1, etc., peptides having dominant negative traits to CHK1, etc. Can be mentioned.
  • the low molecular weight compound for CHK1, for example, 4-[((3S) -1-azabicyclo [2.2.2] oct-3-yl) amino] -3- (1H-benzimidazol-2-yl ) -6-chloroquinolin-2 (1H) -one (CAS Registry Number: 405168-58-3, CHIR-124) and (S) -1- (5-bromo-4-methyl-2- (morpholine-2) -Ylmethoxy) phenyl) -3- (5-methylpyrazin-2-yl) urea (CAS registration number: 911222-25-2, IC-83, LY2603618) (Clin. Cancer Res., 2007, vol.
  • RNA that binds to the transcription product of a gene encoding CHK1 refers to a dsRNA (double-stranded RNA) such as siRNA or shRNA (short haipin RNA) that is complementary to the transcription product of a gene encoding a protein such as CHK1.
  • the dsRNA chain length is not particularly limited as long as it can suppress the expression of the target gene and does not exhibit toxicity, and is, for example, 15 to 49 base pairs, preferably 15 to 35 base pairs. More preferably, it is 21 to 30 base pairs.
  • the dsRNA need not be completely identical to the base sequence of the target gene, but is at least 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90% or more (for example, 95%, 96%, 97%, 98% , 99% or more). Sequence identity can be determined by the BLAST program.
  • RNA that binds to the transcription product of a gene encoding CHK1 etc.” include antisense RNA complementary to the transcription product of a gene encoding CHK1 etc. and ribozyme activity that specifically cleaves the transcription product RNA (ribozyme) having
  • RNA part or all of the RNA may be substituted with an artificial nucleic acid such as PNA, LNA, ENA or the like.
  • these RNAs may be in the form of an expression vector that holds DNA encoding the RNA so that the RNA is expressed in the administration subject of the drug of the present invention.
  • those skilled in the art can prepare such RNA by chemical synthesis using a commercially available synthesizer or the like.
  • the “antibody against CHK1 etc.” may be a polyclonal antibody, a monoclonal antibody, or a functional fragment of an antibody.
  • Antibodies include all classes and subclasses of immunoglobulins.
  • the “functional fragment” of an antibody means a part (partial fragment) of an antibody that specifically recognizes a protein such as CHK1. Specifically, Fab, Fab ′, F (ab ′) 2, variable region fragment (Fv), disulfide bond Fv, single chain Fv (scFv), sc (Fv) 2, diabody, multispecific antibody, And polymers thereof.
  • antibodies include chimeric antibodies, humanized antibodies, human antibodies, and functional fragments of these antibodies. Furthermore, these antibodies may have been subjected to alteration or modification of the amino acid sequence, if necessary. Such antibodies can be appropriately prepared by those skilled in the art by known antibody production methods.
  • Polypeptide having a dominant negative trait with respect to CHK1 etc.” means that on the protein such as CHK1 with respect to binding to DNA as a substrate during DNA repair and other proteins constituting the DNA repair mechanism. Examples thereof include polypeptides that compete with the binding site (for example, partial peptides of proteins such as CHK1).
  • the drug of the present invention may contain a pharmacologically acceptable carrier or medium in addition to the compounds described in the above (a) to (d).
  • carriers or media include surfactants, excipients, coloring agents, flavoring agents, preservatives, stabilizers, buffering agents, suspending agents, isotonic agents, binders, disintegrating agents, lubricants, Examples thereof include a fluidity promoter and a corrigent, but are not limited thereto, and other commonly used carriers or media can be appropriately used.
  • silicic acid lactose, crystalline cellulose, mannitol, starch, carmellose calcium, carmellose sodium, hydroxypropylcellulose, hydroxypropylmethylcellulose, polyvinylacetal diethylaminoacetate, polyvinylpyrrolidone, gelatin, medium chain fatty acid triglyceride, Examples thereof include polyoxyethylene hydrogenated castor oil 60, sucrose, carboxymethylcellulose, corn starch, and inorganic salts.
  • a carrier for introducing a nucleic acid or protein into a cell may also be contained in the drug of the present invention.
  • Carriers include positively charged substances such as cationic liposomes, new oily substances (cholesterol and its derivatives, lipids (eg, glycolipids, phospholipids, sphingolipids, etc.), vitamins such as vitamin E (tocopherol)) Is mentioned. Moreover, you may use together the chemical
  • the drug of the present invention can be used for animals including humans. There is no restriction
  • a suitable target disease of the drug of the present invention is spinocerebellar degeneration type 1 (SCA1).
  • SCA1 refers to a disease caused by the repetition and extension of a CAG trinucleotide encoding glutamine in the ataxin 1 (ATXN1) gene.
  • the number of CAG trinucleotide repeats is not particularly limited, but is usually 39 repeats or more.
  • the dosage form of the drug of the present invention for example, intravenous administration, intraarterial administration, intraperitoneal administration, subcutaneous administration, intradermal administration, intratracheal administration, rectal administration and intramuscular administration, administration by infusion, Direct administration to a target site (cerebellum, brain stem, spinal cord, etc.) can be mentioned, but it is preferable to administer directly to the target site from the viewpoint of high therapeutic effect and suppression of the amount of drug to be administered.
  • Administration to the target site can be performed using, for example, a cannula (catheter), incision, drug delivery system, injection, and the like. More specifically, a cannula or the like is inserted by a stereotaxic method, and the cannula is inserted.
  • a method of administering the drug of the present invention into the brain through, a method of craniotomy and implanting a sustained release drug delivery system (for example, an osmotic pump manufactured by ALZET) containing the drug of the present invention into the brain An example is a method of introducing a drug into cells in the brain by electroporation. Further, as shown in the examples described later, when the drug of the present invention takes the form of a viral vector, the drug can be directly injected into the target site.
  • a method in which a brain barrier permeating substance is bound to the compounds described in the above (a) to (d) and administered may be used.
  • the brain barrier permeating substance include, but are not limited to, a glycoprotein consisting of 29 amino acids derived from rabies virus (Nature, July 5, 2007, 448, pages 39-43).
  • the dose and frequency of administration of the drug of the present invention can be appropriately adjusted according to the type of compound as an active ingredient, the intended effect, the age and weight of the patient, etc. It can be adjusted as appropriate according to the conditions.
  • the present invention thus also provides a method for treating or preventing spinal cerebellar degeneration (SCA) in a subject, characterized by administering the agent of the present invention to the subject.
  • SCA spinal cerebellar degeneration
  • the product of the drug of the present invention or its instructions may be labeled with an indication that it will be used to treat or prevent SCA.
  • labeled product or instructions means that the product body, container, packaging, etc. are marked, or instructions, package inserts, promotional materials, or other printed materials that disclose product information. It means that the display is attached to.
  • ⁇ Method 1 for screening candidate compounds for preventing or treating spinocerebellar degeneration As shown in Examples below, ATXN1, which is the etiology of SCA1, binds to RPA1, BRCA1, and BRCA2, thereby adversely affecting the function or intracellular dynamics of RPA1 and the like in the DNA repair process, and thus the onset and progression of SCA It became clear that it contributed to. Therefore, based on this knowledge, the present invention can provide the following screening method.
  • a method for screening candidate compounds for preventing or treating spinocerebellar degeneration comprising the following steps (a) to (c): (a) selected from the group consisting of RPA1, BRCA1 and BRCA2 in the presence of the test compound Contacting at least one protein with ATXN1; (B) detecting the binding between ATXN1 and at least one protein selected from the group consisting of RPA1, BRCA1 and BRCA2, (C) A step of selecting a compound that suppresses the binding.
  • test compound used in the screening method of the present invention is not particularly limited.
  • RPA1, BRCA1, BRCA2, and ATXN1 used in this screening method are as described for the active ingredient (c) of the drug of the present invention, but from the viewpoint of easy detection of binding, A reporter protein (eg, GFP, luciferase), a purification tag protein (eg, histidine tag, FLAG tag, GST tag) or the like may be added to the protein. Moreover, as long as the coupling
  • step (a) RPA1 and the like that bind to each other and ATXN1 are brought into contact with each other in the presence of the test compound, but the contact is performed under the condition that the binding between RPA1 and the like and ATXN1 is not suppressed in the absence of the test compound. Can be done.
  • the binding between RPA1 and the like and ATXN1 is detected, but the detection of the binding is not particularly limited, and a known method can be appropriately employed.
  • a co-immunoprecipitation method yeast two-hybrid system, ELISA method, a method using a detection device using a surface plasmon resonance phenomenon (for example, BIAcore (manufactured by GE Healthcare)), using FRET (fluorescence resonance energy transfer) can be adopted.
  • a co-immunoprecipitation method yeast two-hybrid system
  • ELISA method a method using a detection device using a surface plasmon resonance phenomenon (for example, BIAcore (manufactured by GE Healthcare)
  • FRET fluorescence resonance energy transfer
  • a compound that suppresses the binding is selected.
  • ATXN1 is precipitated with its specific antibody in the presence of the test compound. It can be evaluated by comparing the amount of RPA1 and the like co-precipitated with the amount of RPA1 and the like in the absence of the test compound (control value). That is, when the amount of RPA1 or the like in the presence of the test compound is low compared to the amount in the absence of the test compound (for example, 80% or less, 50% or less, 30% or less of the control value), The test compound can be evaluated as a candidate compound for preventing or treating spinocerebellar degeneration. Similarly, when a method other than the immunoprecipitation method is used in the detection of the binding, the degree of binding in the absence of the test compound can be similarly evaluated as a control value.
  • Methods 2 and 3 for screening candidate compounds for preventing or treating spinocerebellar degeneration As shown in Examples described later, it was revealed that the pathological condition of SCA can be improved by enhancing the expression of RPA1, BRCA1, BRCA2, PNKP, XRCC3, XRCC4, CCNH, POLE, POLH or PER1. Therefore, based on this knowledge, the present invention can provide the following screening method.
  • RPA1, BRCA1, BRCA2, PNKP, XRCC3, XRCC4, CCNH, POLE, POLH, and a screening method for candidate compounds for preventing or treating spinocerebellar degeneration comprising the following steps (a) and (b): Applying a test compound to a system capable of detecting the expression or activity of at least one protein selected from the group consisting of PER1, (B) A step of selecting a compound that promotes the expression or activity of the protein.
  • the pathological condition of SCA is aggravated by enhancing the expression of CHK1, LIG3, FEN1, LIG1, ERCC5, XAB2, ERCC2, DMC1, RECQL5, MUS81, EME1, SPO11 or BLM. Became clear. Furthermore, it has also been clarified that by suppressing the expression or activity of CHK1, the pathological condition of SCA is improved. Therefore, based on this knowledge, the present invention can also provide the following screening method.
  • test compound to be used is not particularly limited, and examples thereof are mentioned above.
  • RPA1 etc. and CHK1 etc. used in these screening methods are as described for the active ingredients (b) and (d) of the drug of the present invention.
  • Examples of the “system capable of detecting protein expression” used in the step (a) of these screening methods include, for example, a reporter gene (luciferase gene, CAT gene, GFP) downstream of the promoter region of the gene encoding each protein.
  • a reporter gene luciferase gene, CAT gene, GFP
  • “functionally bound” means that the promoter region of each gene and the reporter gene are bound so that expression of the reporter gene is induced by binding of a transcription factor to the promoter region of each gene.
  • test compound is applied to the system, and the activity of the protein encoded by the reporter gene (luminescence by luciferase, acetylation by chloramphenicol, fluorescence of GFP protein, etc.) is measured, and in the absence of the test compound If the detected activity is high compared to the case detected by the test compound, the test compound is evaluated as having activity to promote the expression of each protein, whereas if the activity is low, the test compound is It will be evaluated that it has the activity of suppressing protein expression.
  • the protein encoded by the reporter gene luminescence by luciferase, acetylation by chloramphenicol, fluorescence of GFP protein, etc.
  • Examples of the "system capable of detecting protein expression” include systems that directly detect the expression of each protein in addition to the reporter system. With regard to this system, a test compound is applied to cells expressing each protein, and the expression of each protein in the cells is detected. And if the expression of each detected protein is high compared with the case where it is detected in the absence of the test compound, the test compound is evaluated as having activity to promote the expression of each protein, If the expression is low, the test compound is evaluated as having an activity of suppressing the expression of each protein. Regarding the detection of protein expression, when detecting the expression of the protein itself, ELISA method, radioimmunoassay, Western blotting method, immunoprecipitation method and the like can be used. When detecting protein expression through gene expression at the transcription level, Northern blotting, RT-PCR, dot blotting, or the like can be used.
  • the “system capable of detecting protein activity” used in the step (a) of these screening methods is known to those skilled in the art for the activity in DNA repair of a protein as an index, and a method for evaluating and measuring the activity.
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the binding of the protein to single-stranded DNA (Nature, January 1997). 9th, 385, 6612, pp. 176-181).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the E3 ubiquitin ligase activity of the protein (EMBO J., December 2002), for example. 16th, Volume 21, No. 24, see pages 6755-6762).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the binding of the protein to RAD51 or PALB2 (Nature, March 31, 2005). Day 434, 7033, 598-604, Mol Cell, June 23, 2006, Volume 22, No. 6, pages 719-729).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the polynucleotide kinase activity using oligo (dT) as a substrate (J Biol Chem. , August 20, 1999, 274, 34, 24176-24186).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the binding between the protein and RAD51 (Mol Cell, May 1998, 1 Vol. 6, No. 7, pages 783 to 793).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the binding between the protein and ligase 4 and the DNA binding of the protein (Cell). December 29, 1995, Volume 83, No. 7, pp. 1079-1089).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the binding between the protein and CDK7 (Nature, March 16, 1995, 374, 6519, pages 283-287).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the DNA synthesis activity of the protein (Proc Natl Acad Sci USA, September 1990). 87, No. 17, pages 6664-6668).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the DNA synthesis activity of the protein or the binding between the protein and RAD51 (Mol Cell). December 9, 2005, Volume 20, Issue 5, pages 783-792).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the binding between the protein and ATM or CHK2 (Mol Cell, May 2006). 5th, 22nd volume, No. 3, see pages 375-382).
  • the index protein is CHK1
  • the activity of the protein is evaluated (measured) by detecting phosphorylation of CDC25A by the protein or degradation of CDC25A induced by the phosphorylation. (See Science, May 26, 2000, 288, 5470, pages 1425-1429, Proc Natl Acad Sci USA, November 12, 2002, 99, 23, 14795-14800).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the ligation activity of the protein (Mol Cell Biol., June 1995). 15: 6, 3206-3216).
  • the activity of the protein is evaluated by detecting the activity of removing the flap structure by the protein using, for example, a double-stranded DNA having a 5 ′ terminal protruding structure as a substrate. (Measurement) (see Genomics, January 1, 1995, Vol. 25, No. 1, pages 220-225).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the ligation activity of the protein (Proc Natl Acad Sci USA, 1990, September). Month, Vol. 87, No. 17, pp. 6679-83).
  • the activity of the protein is evaluated (measured) by detecting the endonuclease activity of the protein using a partially double-stranded DNA having a bubble structure as a substrate. (Nature, September 29, 1994, Vol. 371, No. 6496, pages 432-435).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the interaction between the protein and XPA, CSA, CSB, or RNA polymerase II ( J Biol Chem., November 10, 2000, 275, 45, pp. 34931-34937).
  • the activity of the protein is evaluated (measured by detecting the binding between the protein and p44 or the 5 ′ ⁇ 3 ′ helicase activity induced by the binding. (See Nat Genet., October 1998, Volume 20, Issue 2, pages 184-188).
  • DMC1 When the protein to be used as an index is DMC1, for example, by detecting the binding of the protein to the gap structure of single-stranded DNA or double-stranded DNA, or the binding of the protein to RAD51, The activity can be evaluated (measured) (see EMBO J., 1999, Nov. 15, 18, No. 22, pages 6552-6560).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the binding between the protein and RAD51 (Genes Dev., December 1, 2007). Sun, Vol. 21, No. 23, pages 3073-3084).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the endonuclease activity of the complex consisting of MUS81 and EME1, for example (J Biol Chem., June 13, 2003, 278, 24, 21715-21720).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the type 2 topoisomerase activity of the protein (Nature, August 18, 2005, 436, 7053, pages 1053-1057).
  • the activity of the protein can be evaluated (measured) by detecting the binding between the protein and topoisomerase III ⁇ (J Biol Chem., March 2000). May 31, 275, No. 13, pages 9636-9644, Hum Mol Genet., June 1, 2001, Volume 10, No. 12, pages 1287-1298).
  • test compound is a compound that promotes the activity of the protein or a compound that suppresses the activity according to the type of activity of each protein used as an index.
  • the “application” of the test compound to the above system can be performed, for example, by contacting the cell with the test compound or introducing the test compound into the cell when the system is a cell. it can. Further, when the system is an extract from cells, the addition can be performed to the extract.
  • the compound selected by the above screening methods 1, 2, or 3 is administered to an SCA model animal, and spinal cerebellar degeneration is prevented or prevented using recovery of symptoms of the model animal as an index.
  • Candidate compounds for treatment can be further narrowed down.
  • SCA model animals include animals (Drosophila, nematodes, mice, marmosets, etc.) into which a causative gene of SCA (ATXN1-82Q, ATXN1-86Q, ATXN1-154Q, etc.) has been introduced, as shown in the Examples below. Is mentioned.
  • mice Fresh brains of Atxn1-154Q-KI (knock-in) heterozygous mice (32 weeks of age) were fixed with 4% paraformaldehyde-containing phosphate buffer and embedded in paraffin. Sections (thickness: 5 to 10 ⁇ m) prepared from these brains were immersed in xylene to deparaffinize, and further rehydrated stepwise with ethanol. Next, the sections were immersed in 10 mM citrate buffer (pH 6.0), boiled three times in a microwave oven, and then kept at room temperature for 30 minutes.
  • 10 mM citrate buffer pH 6.0
  • the primary antibodies used for immunohistochemical analysis and the dilution conditions for these antibodies are as follows.
  • Anti-CAG antibody (HD1, derived from rabbit, provided by Dr. Waker, diluted 1/100)
  • Anti-Atxn1 antibody 11NQ, clone N76 / 8, derived from mouse, manufactured by Millipore, diluted to 1/100
  • Anti-RpA1 antibody (H-7, derived from rabbit, manufactured by Santa Cruz Biotechnology, diluted to 1/100)
  • Anti-RpA1 antibody mouse monoclonal antibody, manufactured by Calbiochem, diluted 1/100
  • Anti-BRCA1 antibody (C-20, derived from rabbit, manufactured by Santa Cruz Biotechnology, diluted to 1/100)
  • Anti-BRCA2 antibody (ab123491, derived from rabbit, manufactured by Abcam, diluted to 1/100)
  • Anti-H2AX antibody (Ser139, derived from mouse, manufactured by Millipore, diluted 1/500).
  • the secondary antibodies used for immunohistochemical analysis and the dilution conditions for these antibodies are as follows. Alexa Fluor 488-labeled anti-mouse antibody (Molecular Probes, diluted 1000 times), Cy3-labeled anti-rabbit antibody (manufactured by Jackson Laboratory, diluted 1000 times).
  • the membrane was subjected to blocking treatment with 5% milk-containing Tween 20 (TBST) (10 mM Tris / Cl, pH 8.0, 150 mM NaCl and 0.05% Tween 20) and incubated with the primary antibody at 4 ° C. overnight. did.
  • Tween 20 5% milk-containing Tween 20
  • the primary antibodies used for immunoblotting analysis and the dilution conditions for these antibodies are as follows. Mouse anti-RPA-70 (H-7, manufactured by Santa Cruz, diluted 1/200), Mouse anti-actin (C4, manufactured by Chemicon, diluted 1: 1000).
  • HRP horseradish peroxidase
  • the primary and secondary antibodies and their dilution conditions in the immunoblotting analysis are as follows.
  • Mouse anti-phosphorylated histone H2AX ( ⁇ H2AX) (Ser-139, manufactured by Millipore, diluted 1/750), Anti-mouse polyglutamine (IC2) antibody (MAB1574, manufactured by Chemicon, diluted 1/2000), Anti-goat Atxn1 antibody (H-21, manufactured by Santa Cruz Biotechnology, diluted 1 / 1,000), Mouse anti-glyceraldehyde phosphate dehydrogenase antibody (GAPDH, manufactured by Millipore, diluted 1 / 10,000), Horseradish peroxidase (HRP) labeled anti-mouse IgG antibody (GE Healthcare, manufactured by Amersham), HRP-labeled anti-goat IgG antibody (manufactured by Dako, diluted 1/3000).
  • HRP horseradish peroxidase
  • HRP-labeled anti-goat IgG antibody manufactured by Dako
  • flies are corn meal medium (9.2% corn meal, 3.85% yeast, 3.8% sucrose, 1.05% potassium tartrate, 0.09% calcium chloride, 7.6% glucose, 2. 416% nippagin and 1% agar). Unless otherwise specified, all flies were maintained at 25 ° C., humidity 60% ⁇ 10%, and a light / dark cycle every 12 hours.
  • GS strain flies described below were obtained from the Drosophila Genetic Resource Center in Kyoto.
  • transgenic flies hAtxn1-82Q y1w1118UAS: Atxn1-82Q
  • UAS-mKu70 and OK6-Gal4 e.g., UAS-mKu70
  • OK6-Gal4 e.g., UAS-mKu70
  • Cantonised w1118 strain w (CS10) see the description of Non-Patent Documents 19 and 44. That.
  • Canonized w1118 strain w (CS10) is the parent strain of all transgenic flies.
  • the RNAi lines RpA70 (9633R-3) and grp (17161R-2) were obtained from the National Institute of Genetics in Mishima.
  • the collection of virgin females for each mating was performed within 8 hours after emergence, and was maintained at a maximum of 20 animals per vial for 3 to 4 days until used for mating.
  • the GS system is a method for efficiently detecting a gene in Drosophila and for quickly identifying the molecule.
  • the GS vector based on the P factor includes UAS, core promoter and marker gene “ It will have a “mini white” and will be randomly inserted into the Drosophila genome. Then, by inserting a P-factor on the side of the target gene (in this screening, a DNA repair gene), and mating a transgenic fly of the GS strain into which the P-factor has been inserted and a fly having a GAL4 driver, Flies in which overexpression of the gene is caused can be obtained (see Toba, G. et al. Genetics, 1999, 151, 725-737).
  • the SCA1 model fly to be crossed with the GS strain was prepared by introducing not only the human Atxn182Q (hAtxn182Q) gene, which is the etiology of SCA1, but also the OK6-GAL4 driver.
  • Drosophila obtained by crossing the GS strain prepared in this way with the SCA1 model fly was screened using the short survival time as one of the pathological conditions of SCA1 as an index.
  • the experiment on the survival period was performed on the same corn meal medium used to create the final generation under a light-dark cycle every 25 hours at 25 ° C., 60 ⁇ 10% humidity.
  • the flies subjected to the experiment were subjected to ether anesthesia only on the day they were born for the purpose of selection.
  • flies were maintained to 20 animals per vial and transferred to fresh medium every 2-3 days. Then, dead flies were removed every 2-3 days, and this experiment was performed 2-3 times independently. Escaped flies were excluded from the experiment. Further, based on the data thus obtained, the median and average values of the survival period were calculated, and the presence or absence of the influence of the DNA damage repair gene on the pathological condition of SCA was evaluated using the numerical value as an index.
  • EGFP-RpA1 In order to construct EGFP-RpA1, a B6 wild-type mouse fetal brain-derived RNA was used to amplify a cDNA fragment encoding the full length of RpA1 by PCR, and the EcoRI recognition site of pLVSIN-CMV-pur (manufactured by Takara) and XhoI recognition It was inserted between the sites and subcloned. Similarly to the above, the cDNA fragment was inserted between the EcoRI recognition site and the BamHI recognition site of pEGFP-C1 (manufactured by Takara) and subcloned.
  • ⁇ Chemotherapy for hSCA1 Drosophila> A specific inhibitor for CHK1 CHIR-124 (manufactured by AXON MEDCHEM) was dissolved in 1N hydrogen chloride to a concentration of 5 mg / mL, and diluted to a plurality of concentrations with a 0.05N solution. 3 mL of this solution was added to 1 g of Drosophila medium to the final concentration shown in FIG. The medium used at this time was a mixture of instant Drosophila medium D7670 (manufactured by Sigma Aldrich) and Formula 4-24 instant Drosophila medium (manufactured by Calolina) in a one-to-one relationship. As a control, a medium supplemented with an equal amount of 0.05 N hydrogen chloride solution was also prepared.
  • IP Immunoprecipitation
  • the supernatant was collected by centrifugation at 1 ⁇ 10 4 g for 20 minutes.
  • the collected supernatant was incubated with protein G agarose beads (manufactured by GE Healthcare) for 2 hours while rotating at 4 ° C. After removing the beads, the lysate was incubated overnight with rotation at 4 ° C. with 2-10 ⁇ g of anti-Myc antibody, anti-RpA1 antibody, anti-BRCA1 antibody or anti-BRCA2 antibody. In addition, it was then incubated with protein G agarose beads for 2 hours. The beads were washed 3 times with 500 ⁇ L of TNE buffer, dissolved in a sample buffer for SDS polyacrylamide gel electrophoresis, fractionated by SDS-PAGE, and subjected to Western blotting.
  • mice (20 weeks old) were homogenized in TNE buffer and centrifuged at 4 ° C. and 2,000 ⁇ g for 1 minute. Then, using the obtained supernatant, immunoprecipitation was performed in the same manner as for the Hela cells.
  • anti-RpA1 antibody H-7, Santa Cruz Biotechnology, diluted 1:20
  • anti-Atxn1 antibody 11 NQ, clone N76 / 8, Millipore, diluted 1: 100
  • Anti-Myc antibody 9E10, manufactured by Santa Cruz Biotechnology, diluted 1/500
  • Anti-RpA1 antibody H-7, manufactured by Santa Cruz Biotechnology, diluted 1/100
  • Anti-RpA1 antibody B-10, manufactured by Santa Cruz Biotechnology, diluted 1: 1000 and used for mouse samples
  • Anti-BRCA1 / 2 antibody manufactured by Abcam, diluted 1/2000
  • Anti-Atxn1 antibody 11NQ, clone N76 / 8, manufactured by Millipore, diluted 1/2000
  • HRP-labeled anti-mouse IgG or HRP-labeled anti-rabbit IgG manufactured by Amersham was used after being diluted 1/3000.
  • an expression cassette comprising a human early promoter (CMV promoter), cDNA encoding human growth hormone first int and RPA, woodchuck hepatitis virus post-transcriptional regulatory element (WPRE) and SV40 polyA signal sequence in this order
  • An adenovirus-associated virus (AAV) vector (hereinafter also referred to as RPA1-AAV) inserted into the inverted terminal sequence of the AAV3 genome was prepared according to a conventional method.
  • transfection and purification of this vector can be performed using Li XG. Ther. 2006, Volume 1, pages 160-166.
  • the virus vector thus prepared was injected into the cerebellum surface of Atxn1-154Q-KI mice by the method described below.
  • the 5-week-old mice were anesthetized by intraperitoneal administration of Nembutal and fixed on a stereotaxic apparatus (Narishige).
  • the front of the mouse was tilted 20 degrees, and an ELA steel bar (manufactured by Shofu) was used to make a hole with a diameter of 1 mm on the side of -9.2 mm from bregma and ⁇ 0 mm from the midline.
  • a glass syringe was inserted along the inner surface of the occipital bone, 3.5 mm from the outer surface of the hole formed in the bone.
  • mice were placed in 2-5 cages for each gender, given water and rodent data, bred and maintained under a 12 hour light / dark cycle. All tests were performed using 5-40 week old male mice during the light period (between 10-19 o'clock).
  • the mouse was placed on the rotarod (rotation speed: 3.5 rpm), the rotation speed was linearly increased to 35 rpm in 300 seconds, and then kept at a constant speed (35 rpm) until 600 seconds.
  • This test was performed four times a day for three consecutive days, and the average time to fall off the rotarod was calculated for each test day.
  • Example 1 Verification of DNA damage in spinocerebellar degeneration (SCA)> Survival shortened in a Drosophila model of human Huntington's disease (HD) (UAS-Htt103Q / +: OK6-GAL4 / + Drosophila) by Ku70, a key molecule in DNA double-strand break (DSB) type DNA repair It has been shown by the present inventors that the period is restored and that athletic activity is also improved (see Tamura, T. et al., PLoS One, 2011, 6, e27408).
  • HD Huntington's disease
  • DFB DNA double-strand break
  • DSB is increased in cerebellar neurons of the spinocerebellar degeneration type 1 (SCA1) mouse model (Fujita, K. et al., Nat Commun, 2013, 4, 1816).
  • SCA1 spinocerebellar degeneration type 1
  • DNA damage is associated with polyglutamine diseases such as SCA and Huntington's disease caused by abnormal elongation of polyglutamine chains. Furthermore, the present inventors have also shown that symptoms such as Huntington's disease can be recovered by factors related to the damage repair.
  • DSB is also known to be DNA damage that usually occurs in a wide variety of DNA damage cascades (Bohgaki, T., et al., Genome Integrr, 2010, 1, 15, Mladenov, E., et al., (See Mutat Res, 2011, 711, 61-72, Nowosielska, A., et al., DNA Repair (Amst), 2008, 7, 48-56)).
  • mutant ATXN1 is expressed in mammalian cerebellar neurons, and DSB-type DNA damage occurs. It was confirmed.
  • H2AX histone 2A
  • Example 2 ⁇ Screening using SCA1 model Drosophila>
  • a screening system was constructed to identify which type of DNA repair cascade is involved in the development of SCA.
  • the present inventor has focused on Drosophila which can shorten the generation time and can quantitatively evaluate the phenotype in order to appropriately narrow down candidates for a wide variety of factors and networks involving these factors.
  • the present inventor has found that the disease state of the Drosophila SCA1 model is similar to that of the mammalian SCA1 model.
  • DSB-type DNA damage is the final stage of other types of DNA damage, such as single-stranded DNA breaks (SSB) and oxidative base damage. Therefore, considering that together with the above results, it was determined that the Drosophila SCA1 model could be an effective tool for exploring the DNA damage repair cascade that contributes to the pathogenesis of SCA, and the model Drosophila was used. In vivo screening was performed.
  • Drosophila homologous genes related to all available DNA repairs are each overexpressed in the SCA1 model of Drosophila, and the effect on the shortness of survival, which is one of the symptoms of the Drosophila, is used as an indicator for short-term and quantitative analysis. Screening was conducted to enable practical analysis. Table 1 shows the relationship between human DNA repair genes to be screened and their Drosophila homologous genes.
  • Table 2 shows the average survival time of flies (OK6> Atxn1-82Q; GS) in which human Atxn1-82Q and a DNA damage repair gene whose expression is induced by the cassette of the GS strain are coexpressed. . Further, in Table 2, in order to determine the difference from the positive control UAS-Atxn1-82Q / +: OK6-GAL4 / + (OK6> Atxn1-82Q), P calculated using the Wilcoxon rank sum test The value is also shown.
  • BER indicates a gene related to base excision repair
  • NER indicates a gene related to nucleotide excision repair
  • DSBR indicates a DNA duplex
  • DSBR + CLR indicates a gene related to DNA double-strand break repair and DNA cross-link repair
  • MMR is a gene related to mismatch removal repair It shows that.
  • the multifunctional RPA 1 is provisionally classified as NER.
  • the positive control UAS-Atxn1-82Q / +: OK6-GAL4 / + (OK6> Atxn1) is the negative control Atxn1 / + or OK6 / Compared with +, it has been confirmed that the survival time is short.
  • the survival rate of the positive control fly (UAS-Atxn1-82Q / +: OK6-GAL4 / +) is 75%, whereas the Spn-B overexpression line is 85%, XRCC4 / CG12728
  • the high expression rate was 92% for the overexpression line, 86% for the DNA polymerase eta overexpression line, and 83% for the CycH overexpression line.
  • their survival rates remained higher than that of SCA1 model flies after 30 days.
  • the maximum survival time was significantly prolonged by RpA1, Per, Spn-B or XRCC4 / CG12728.
  • RecQ family proteins are highly conserved from bacteria to humans, and are known to have 3'-5 'DNA helicase activity.
  • human RecQ1 mus309 / BLM / RecQ2, WRN / RecQ3, RecQ4 and RecQ5
  • RecQ5 exhibits DNA strand annealing activity.
  • RpA1 see Garcia, P.L., EMBO J, 2004, Vol. 23, pages 2882-2891
  • RecQ5 and the above-mentioned RPA1 have the opposite effects. Is consistent with that shown.
  • Example 3 ⁇ Elucidation of DNA repair network involved in SCA pathology by system biology>
  • the results of the screening were analyzed using system biology. That is, to identify a central molecular network that induces shortening or prolonging survival time in SCA1 model flies, quantitative data on recovery by DNA repair genes and protein-protein interaction (PPI) data (BIND, BIOGID, Cognia, DIP, INTACT, Interact studies, MINT and MIPS).
  • PPI protein-protein interaction
  • segment 1 In network 1 created using the first algorithm, two gene products directly affect survival (segment 1), or two gene products affect survival through other proteins
  • the protein pathway was selected from the protein-protein interactome (PPI) database.
  • PPI protein-protein interactome
  • the network 1 map proteins that are bound to more proteins are arranged closer to the center.
  • the determinant genes are located at the outer edge of the network.
  • a closed triangle pathway was selected from the PPI database when proteins affecting survival were components of the triangle protein pathways 1 to 3. Also, if possible, the remaining proteins that had an impact on survival were also linked to the putative network.
  • the algorithm for creating the network 1 was useful for highlighting important gene groups that contribute to the extension of the survival period. That is, it has been clarified that RPA1 is centrally located in Network 1 (2 segments) relating to this extension of survival period and is linked to a variety of proteins related to DNA damage repair or transcription. In addition, genes linked to RPA1 could be classified into the following groups that are responsible for important control in specific types of DNA repair or transcription.
  • the first group is a group related to DNA repair of non-homologous end joining (NHEJ) type having a connection with XRCC4.
  • the second group is NHEJ (B-NHEJ), which is linked to bifunctional polynucleotide phosphatases / kinases (PNKPs) such as XRCC1, Ligate 3 (LIG3) and PolyADP ribose polymerase (PARP), and also SSBR, BER or This group is involved in the NER backup path.
  • PNKPs polynucleotide phosphatases / kinases
  • LIG3 Ligate 3
  • PARP PolyADP ribose polymerase
  • SSBR PolyADP ribose polymerase
  • BER BER
  • This group is involved in the NER backup path.
  • the third group is related to homologous recombination (HR) type DNA repair linked to XRCC3 and involved in repair of DSBs in genome replication.
  • RPA1 acts only on ATR. This suggests that the functional target of these gene groups is RPA1, and that RPA1 is extremely important as a base molecule in various systems in DSB and transcription.
  • Network 2 is an extract of close interactions between genes selected by screening (see FIG. 7). This network 2 suggests that the tumor protein TP53, hepatocyte nuclear factor 4 ⁇ (HNF4A), and Myc are involved in many proteins and are involved in various systems that contribute to prolonging survival. Interestingly, HNF4A is expressed in the adult cerebellar cortex according to the Allen brain map (http://developingmouse.brain-map.org/data/Hnf4a/100093888/thumnails.html).
  • HNF4A is a transcription factor that binds to CREB binding protein (CBP) and controls the expression of genes such as cytochrome P450 3A4 (CYP3A4), which is important in xenobiotic metabolism (Tirona, RG, et al., Nat Med. 2003, volume 9, pages 220-224). Therefore, HNF4A may control multiple systems that extend the life of SCA1 model flies (see FIG. 7). However, HNF4A itself did not become positive in the screening. In order to become a positive gene, it is necessary to participate in a plurality of pathways (see FIG. 7). Therefore, it is considered that HNF4A functions as an indirect modulator.
  • CBP CREB binding protein
  • FEN1, LIG1, CHK1, and BLM are located in the center of the network and have connections with many proteins (see FIG. 8).
  • RPA1 is also centrally located and has an association with BLM and FEN1.
  • RPA1 may be affected by these proteins (see FIG. 8).
  • the same gene is selected as a main player in the network 2 regarding the shortening of the survival period (see FIG. 9).
  • RPA (a complex containing RPA1 and RPA2) sends an inhibitory signal directly or indirectly to FEN1 and LIG1, while RPA1 receives feedback from FEN1. It was. It was also shown by this network analysis that ATM, ATR, and RNA polymerase II are involved in DSB repair and are linked to one or more proteins of FEN1, LIG1, CHK1, and BLM.
  • Example 4 Involvement of HR-DSBR molecules in the pathogenesis of SCA> As described above, molecular biology of genes involved in prolonging survival is predicted from analysis by system biology including many new subgroups targeting DNA damage repair genes that have not received attention in the past. (See FIG. 7).
  • RPA1 plays an important role in protecting bare single-stranded DNA that occurs after various types of DNA damage. It has also been clarified that DNA protected by RPA1 is repaired by homologous recombination with BRCA2 and RAD51.
  • Atxn1-KI mice cortical neurons that are resistant to SCA1 form inclusion bodies, but fragile Purkinje cells do not form inclusion bodies (Watase, K. et al., Neuron, 2002, 34, pp. 905-919).
  • BRCA1 was isolated in the inclusion body of cortical neurons.
  • BRCA1 and mutant ATXN1 were uniformly dispersed and colocalized in the nucleus of Purkinje cells.
  • BRCA2 and ATXN1 were partially colocalized at Purkinje cell nuclear focus (see FIG. 18).
  • RPA2 that forms an RPA complex with RPA1 is mainly localized in the cytoplasm of nerve cells. It was also revealed that.
  • mutant ATXN1 is involved in the onset and progression of SCA by impairing the dynamics of RPA1 as a base molecule and affecting many groups of DNA damage repair molecules became.
  • Example 6 ⁇ Verification 2 of treatment effect of SCA by RPA1> As described above, an attempt was made to confirm the therapeutic effect of RPA1 overexpression confirmed in SCA1 model flies also in SCA1 model mice. That is, according to the experimental schedule shown in FIG. 25, the RPA1-expressing viral vector was injected into the cerebellum of SCA1 model mice (5 weeks old), 4 months later (9 weeks old), 8 months later (13 weeks old), and A rotarod test was performed 35 months later (40 weeks of age) to evaluate the improvement of motor deficits in SCA1 model mice. The obtained results are shown in FIGS. In addition, it has been confirmed in advance that a 5-week-old SCA1 model mouse has a decrease in motility in the rotarod test.
  • Example 7 ⁇ Verification of therapeutic effects of SCA by inhibition of CHK1 function> From the results of constructing and analyzing a network of genes involved in shortening survival, CHK1 receives various signals directly or indirectly from BLM, FEN1 and LIG1, and promotes shortening of survival in SCA1 model flies. (See FIGS. 8 and 9). Furthermore, the results of the aforementioned screening and informatics analysis suggest that CHK1, which is one of the most important transducers of DNA damage signals, plays an important role in the pathology of SCA.
  • CHK1-specific inhibitor (CHIR-124) was used and added to the feed (corn meal medium) at various concentrations to feed adult flies.
  • CHK1-specific inhibitor (CHIR-124) was used and added to the feed (corn meal medium) at various concentrations to feed adult flies.
  • the survival time of OK6> SCA1 was improved at 0.00016 mg / mL and 0.02 mg / mL (see FIG. 29).
  • the improvement effect was more remarkable in the case of giving a high concentration of the inhibitor, and in the fly treated with 0.02 mg / mL CHIR-124, the survival period was extended by 35%. (See FIG. 29).
  • RPA1 has a connection with various DNA damage repair pathways such as non-homologous end joining (NHEJ) type DSBR, HR type DSBR, nucleotide excision repair (NER) and base excision repair (BER). is doing.
  • NHEJ non-homologous end joining
  • HR HR type DSBR
  • NER nucleotide excision repair
  • BER base excision repair
  • RPA1 is basically known to protect bare single-stranded DNA and to be involved mainly in HR, NER and BER generated in proliferating cells. Therefore, there is a possibility that the therapeutic effect of RPA1 described above is achieved through the following mechanism.
  • RPA1 is involved in non-cell-autonomous pathology via glial cells containing Bergmann glia or astrocytes.
  • the non-autonomous pathological condition is that a nerve cell causes dysfunction or cell death due to an abnormality of a cell other than the nerve cell, and many are caused by glial cells. That is, it is a pathological condition caused by modulation of glia that have a protective effect on nerve cells such as Bergmann glia.
  • RPA1 is involved in stem cell pathology via embryonic stem cells or adult stem cells.
  • RPA1 is involved in DNA damage repair in Purkinje cells in an abnormal cell cycle stage.
  • the first possibility is similar to the non-autonomous pathology in amyotrophic lateral sclerosis (Yamanaka, K. et al., Nat Neurosci, 2008, 11, 251-253, Yamanaka, K. et al. Proc Natl Acad Sci USA, 2008, 105, 7594-7599, Nagai, M., et al., Nat Neurosci, 2007, 10, 615-622, Di Giorgio et al., Nat Neurosci, 2007, 10 , Pp. 608 to 614) or a result indicating the involvement of Bergman glia in the pathology of SCA1 (Shiwaku, H. et al., Embo J, 2010, 29, pp. 2446 to 2460).
  • the second possibility is based on the previous observation that ROR ⁇ affects Purkinje cells in the progression of SCA pathology (See Serra, HG, et al., Cell, 2006, 127, pages 697-708). Based on.
  • the third possibility is that an abnormal cell cycle in a neurodegenerative disease, that is, in the neurodegenerative disease, there is a failure in the S-phase transition of neurons (Herrup, K. et al., Nat Rev Neurosci, 2007, 8) (see pages 368-378).
  • the pathological condition of SCA can be improved by promoting the expression of RPA1, BRCA1, BRCA2, PNKP, XRCC3, XRCC4, CCNH, POLE, POLH or PER1.
  • FORM Moreover, it becomes possible to improve the pathological condition of SCA by suppressing the binding between ATXN1 which causes SCA1 and RPA1, BRCA1 or BRCA2.
  • by suppressing the expression of CHK1, LIG3, FEN1, LIG1, ERCC5, XAB2, ERCC2, DMC1, RECQL5, MUS81, EME1, SPO11, or BLM it becomes possible to improve the pathological condition of SCA.
  • the drug of the present invention and the screening method for candidate compounds of the drug are useful in the treatment and prevention of SCA and the development of those methods.

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Abstract

　脊髄小脳変性症の治療又は予防を可能とする化合物を提供することを課題とし、脊髄小脳変性症１型（ＳＣＡ１）モデルバエを用いたスクリーニング等による解析を行った。その結果、脊髄小脳変性症の病態を回復させるタンパク質として、ＲＰＡ１、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ３、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ及びＰＥＲ１を同定した。一方、前記病態を悪化させるタンパク質として、ＣＨＫ１、ＬＩＧ３、ＦＥＮ１、ＬＩＧ１、ＥＲＣＣ５、ＸＡＢ２、ＥＲＣＣ２、ＤＭＣ１、ＲＥＣＱＬ５、ＭＵＳ８１、ＥＭＥ１、ＳＰＯ１１及びＢＬＭを同定した。また、ＳＣＡ１の病因となるＡＴＸＮ１は、ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２に結合することによって、これらタンパク質の活性が抑制され、前記病態が生じていることを明らかにした。

Description

脊髄小脳変性症を予防又は治療するための薬剤
　本発明は、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための薬剤に関する。また、本発明は、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物のスクリーニング方法に関する。
　脊髄小脳変性症（ＳＣＡ）は、運動失調を主な症状とし、小脳及び脳幹から脊髄にかけての神経細胞が徐々に破壊、消失していく疾患である。ＳＣＡは、アルツハイマー病、パーキンソン病に次いで患者数の多い神経変性疾患であるが、有効な治療法は確立されておらず、その病態解明と治療法の開発は、喫緊の社会的な課題となっている。
　また、ＳＣＡにおいては、病理上様々な生物学的異常が生じていることも明らかになっている。例えば、ＳＣＡの１種である脊髄小脳変性症１型（ＳＣＡ１）においては、ＲＮＡ認識モチーフを有するＲＢＭ１７は、スプライシンング因子４５（ＳＰＦ４５）とも称され、ＳＣＡ１の病因であるアタキシン１（ＡＴＸＮ１）に、そのタンパク質中のポリグルタミン鎖（ｐｏｌｙＱ）の鎖長依存的に結合することが明らかになっている（非特許文献１）。また、１４－３－３は、Ａｋｔによってリン酸化された際に、ＡＴＸＮ１のＣ末領域に結合することが明らかになっている（非特許文献２）。さらに、１４－３－３とＡＴＸＮ１との結合によって、ＡＴＸＮ１の脱リン酸化が生じ（非特許文献３）、該リン酸化が前記ＲＢＭ１７とＡＴＸＮの結合に重要な役割を果たしていることも明らかになっている（非特許文献１）。また、転写抑制因子ＣＩＣ／ｃａｐｉｃｕａ、Ｓｏｘ２様高速移動群タンパク質（Ｓｏｘ２－ｌｉｋｅ　ｈｉｇｈ　ｍｏｂｉｌｉｔｙ　ｇｒｏｕｐ（ＨＭＧ））、ＨＢＰ－１及びＨＭＧボックス転写因子は、ＡＴＸＮ１のＡＸＨドメインと相互作用することが知られている（非特許文献４）。また、レチノイン酸受容体関連オーファン受容体αは、プルキンエ細胞の発達に関与し、さらに変異型ＡＴＸＮ１によって、その効果が減弱することも明らかになっている（非特許文献５）。また、ポリグルタミン結合タンパク質－１は、スプライソソームの構成成分であり（非特許文献６及び７）、ＡＴＸＮ１のポリグルタミン鎖に結合し、ＡＴＸＮ１と共に特定の核小体に局在していることも知られている（非特許文献８）。
　そして、このようなＡＴＸＮ１と各種因子との相互作用は、それら因子が関与するスプライシング及び転写において機能不全を生じさせ、下流において様々な異常を引き起こし、最終的には典型的なＳＣＡ１の表現型に至ることになる（非特許文献９）
　ところで、転写及びスプライシングと、ＤＮＡ損傷修復とは密接に関連していることが知られている。例えば、ＤＮＡ損傷が生じた際には、その損傷を受けたゲノムＤＮＡが修復されるまで、転写は止められ、オルタナティブスプライシングにも影響を与える。また、ＤＮＡ二重鎖切断（ＤＳＢｓ）が転写の過程において生じることにより、コイルド二重鎖ＤＮＡが緩められ、転写機構のアクセスが可能となることも知られている。
　さらに、ＤＮＡ損傷修復はＳＣＡ１の病態にも関与していることが示唆されている。例えば、ＤＮＡ構造タンパク質であるＨＭＧＢ１及びＨＭＧＢ２は、多種多様なＤＮＡ損傷修復機構において重要な役割を担うことが知られているが、ＳＣＡ１の病因である変異型ＡＴＸＮ１は、これらＤＮＡ構造タンパク質の発現を減少させることが明らかになっている（非特許文献１０）。また、前述のＲＢＭ１７に関し、そのショウジョウバエ相同タンパク質もＡＴＸＮ１に結合するタンパク質であり、さらにＤＮＡ損傷修復に関与することが知られている（非特許文献１１）。
　また、ＳＣＡ１以外のＳＣＡの発症にも、ＤＮＡ損傷修復が関与していることが示唆されている（非特許文献１２及び１３）。例えば、毛細血管拡張性運動失調症は、ＤＮＡ二重鎖切断修復（ＤＳＢＲ）の制御に関与するＡＴＭ遺伝子の機能不全を原因とすることが示されている（非特許文献１４）。また、眼球運動失行を伴う失調症１型（ＡＯＡ１）は、一本鎖ＤＮＡ切断修復（ＳＳＢＲ）に主に関与するＨＩＴ遺伝子ファミリーのメンバーであるアプラタキシンの変異によって生じることが報告されている（非特許文献１２、１５～１７）。また、ＡＯＡ２の病態は、セナタキシンの変異と関連性を有していることが示されている（非特許文献１８）。セナタキシンは、転写が停止している部位において形成されるＤＮＡ－ＲＮＡハイブリットを解消すると考えられており（非特許文献１９）、また転写共役修復等の様々なタイプのＤＮＡ修復に関与していることが想定される、酵母ＲＮＡヘリケースのオーソログでもある（非特許文献２０）。
　そして、このような転写やスプライシング、さらにＤＮＡ損傷修復を通し、ＳＣＡの分子病態を解明することは、この疾患を治療又は予防するための薬剤等を開発する上で極めて重要である。
　しかしながら、特にＤＮＡ損傷修復は複雑な工程を経て行われるものであり、ＤＳＢＲ、ＳＳＢＲ、塩基除去修復（ＢＥＲ）及びヌクレオチド除去修復（ＮＥＲ）といった多種多様な種類が存在している。したがって、どのようなＤＮＡ損傷修復が、またどのような分子がＳＣＡの病態に大きく寄与するのかを解明することは極めて困難なことであり、ＳＣＡの治療又は予防するための有効な薬剤等はいまだ開発されていないのが現状である。
Ｌｉｍ，Ｊ．ら、Ｎａｔｕｒｅ、２００８年、４５２巻、７１３～７１８ページ Ｃｈｅｎ，Ｈ．Ｋ．ら、Ｃｅｌｌ、２００３年、１１３巻、４５７～４６８ページ Ｌａｉ，Ｓ．ら、Ｊ　Ｂｉｏｌ　Ｃｈｅｍ、２０１１年、２８６巻、３４６０６～３４６１６ページ ｄｅ　Ｃｈｉａｒａ，Ｃ．ら、ＦＥＢＳ　Ｌｅｔｔ、２００３年、５５１巻、１０７～１１２ページ Ｓｅｒｒａ，Ｈ．Ｇ．ら、Ｃｅｌｌ、２００６年、１２７巻、６９７～７０８ページ Ｍａｋａｒｏｖ，Ｅ．Ｍ．ら、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２００２年、２９８巻、２２０５～２２０８ページ Ｍａｋａｒｏｖａ，Ｏ．Ｖ．ら、Ｅｍｂｏ　Ｊ、２００４年、２３巻、２３８１～２３９１ページ Ｏｋａｚａｗａ，Ｈ．ら、Ｎｅｕｒｏｎ、２００２年、３４巻、７０１～７１３ページ Ｏｒｒ，Ｈ．Ｔ．、Ｊ　Ｃｅｌｌ　Ｂｉｏｌ、２０１２年、１９７巻、１６７～１７７ページ Ｑｉ，Ｍ．Ｌ．ら、Ｎａｔ　Ｃｅｌｌ　Ｂｉｏｌ、２００７年、９巻、４０２～４１４ページ Ｃｈａｏｕｋｉ，Ａ．Ｓ．ら、ＰＬｏＳ　Ｇｅｎｅｔ、２００６年、２、ｅ１７８． Ｒａｓｓ，Ｕ．ら、Ｃｅｌｌ、２００７年、１３０巻、９９１～１００４ページ Ｇｕｅｖｅｎ，Ｎ．ら、Ｎｅｕｒｏｓｃｉｅｎｃｅ、２００７年、１４５巻、１４１８～１４２５ページ Ｆｅｒｎａｎｄｅｚ－Ｆｕｎｅｚ，Ｐ．ら、Ｎａｔｕｒｅ、２０００年、４０８巻、１０１～１０６ページ Ｄａｔｅ，　Ｈ．ら、Ｎａｔ　Ｇｅｎｅｔ、２００１年、２９巻、１８４～１８８ページ Ｍｏｒｅｉｒａ，Ｍ．Ｃ．ら、Ｎａｔ　Ｇｅｎｅｔ、２００１年、２９巻、１８９～１９３ページ Ｄａｔｅ，Ｈ．ら、Ｂｉｏｃｈｅｍ　Ｂｉｏｐｈｙｓ　Ｒｅｓ　Ｃｏｍｍｕｎ、２００４年、３２５巻、１２７９～１２８５ページ Ｍｏｒｅｉｒａ，Ｍ．Ｃ．ら、Ｎａｔ　Ｇｅｎｅｔ、２００４年、３６巻、２２５～２２７ページ Ｓｋｏｕｒｔｉ－Ｓｔａｔｈａｋｉ，Ｋ．ら、Ｍｏｌ　Ｃｅｌｌ、２０１１年、４２巻、７９４～８０５ページ Ｓｕｒａｗｅｅｒａ，Ａ．ら、Ｈｕｍ　Ｍｏｌ　Ｇｅｎｅｔ、２００９年、１８巻、３３８４～３３９６ページ
　本発明は、上記従来技術の有する課題に鑑みてなされたものであり、脊髄小脳変性症の治療又は予防を可能とする化合物を提供すること及び脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物のスクリーニング方法を提供することを目的とする。
　本発明者らは、上記目的を達成すべく、脊髄小脳変性症１型（ＳＣＡ１）の病因であるヒト変異アタキシン１（変異型ＡＴＸＮ１）をショウジョウバエに発現させたＳＣＡ１モデルバエを調製した。さらに、このモデルバエにおいて、ＤＮＡ修復に関するショウジョウバエ相同遺伝子を過剰に発現させた。そして、ＳＣＡ１モデルバエの症状の１つである生存期間の短さが回復されるかどうかを指標として、ＳＣＡの病態に関与するＤＮＡ修復遺伝子のインビボスクリーニングを行った。
　その結果、ＳＣＡの病態を回復させる遺伝子として、ＲＰＡ１、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ３、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ及びＰＥＲ１が同定された。一方、ＳＣＡ１モデルバエの生存期間をさらに短くする遺伝子、すなわちＳＣＡの病態を悪化させる遺伝子として、ＣＨＫ１、ＬＩＧ３、ＦＥＮ１、ＬＩＧ１、ＥＲＣＣ５、ＸＡＢ２、ＥＲＣＣ２、ＤＭＣ１、ＲＥＣＱＬ５、ＭＵＳ８１、ＥＭＥ１、ＳＰＯ１１及びＢＬＭが同定された。なお、これら同定された遺伝子は、いずれもＳＣＡ等のポリグルタミン病の病態に関与することが、従前知られていなかった遺伝子である。
　さらに、これらＳＣＡの病態に関与することが示された遺伝子を対象とし、システム生物学的に解析を行った。その結果、これら遺伝子の間を結びつけるコアネットワークの存在が明らかになった。特に、ＳＣＡ１モデルバエの生存期間の延長において最も大きな影響を与えたＲＰＡ１は、相同組換え（ＨＲ）等のＤＮＡ修復システム間を結びつける中心点に位置していることが明らかになった。一方、生存期間の短縮に関与する遺伝子においては、ＣＨＫ１が、ＢＬＭ、ＦＥＮ１及びＬＩＧ１から直接又は間接的に様々なシグナルを受けていることから、ＣＨＫ１は、ＳＣＡ１モデルバエの生存期間の更なる短縮において重要な役割を果たしていることが明らかになった。
　次に、ＳＣＡの病態の改善において最も影響を与えるＲＰＡ１と、相同組換えによるＤＮＡ修復システムにおいてＲＰＡ１の重要なパートナーとなるＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２とを対象とし、ＳＣＡ１の病因となるＡＴＸＮ１との相互作用の有無について解析した。その結果、ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２、いずれのタンパク質もＡＴＸＮ１及びその変異体と結合できることが明らかになった。さらに、正常なＡＴＸＮ１（野生型ＡＴＸＮ１）ではなく、異常なＡＴＸＮ１（変異型ＡＴＸＮ１）は、ＤＮＡ損傷後において、ＤＮＡ修復に必要なＲＰＡ１の核内動態を損なわせることも明らかになった。
　また、ＳＣＡ１モデルバエにおいて、ＲＰＡ１を過剰に発現させることによって、ＳＣＡ１モデルバエの症状の１つである眼の変性状態が回復することを見出した。
　さらに、ＳＣＡ１モデルマウスにおいても、その小脳においてＲＰＡ１を過剰に発現させることによって、該モデルマウスの症状の１つである運動性欠陥が改善することも見出した。
　また、変異型ＡＴＸＮ１がノックインされたマウスのプルキンエ細胞において、Ｓ期への移行に異常がきたしていることが明らかになった。このことから、プルキンエ細胞における異常なＳ期への移行によって、該細胞におけるＤＮＡ損傷修復、ひいてはＲＰＡ１による相同組換え型ＤＮＡ修復が誘導されることにより、ＳＣＡの病態が改善されることが示唆された。
　また、ＳＣＡの病態の更なる悪化において重要な役割を担うＣＨＫ１に関し、その機能を化学的に又は遺伝学的に阻害すべく、ＳＣＡ１モデルバエにＣＨＫ１特異的阻害剤を投与し、又はＳＣＡ１モデルバエにおいてＣＨＫ１に対するｓｉＲＮＡを発現させた。その結果、ＳＣＡ１モデルバエの生存期間は延び、また眼の変性状態も回復することを見出し、本発明を完成するに至った。すなわち、本発明は以下を提供するものである。
（１）　下記（ａ）～（ｄ）のうちの少なくとも１つを有効成分とする、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための薬剤
（ａ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ３、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ及びＰＥＲ１からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質又は該タンパク質をコードする核酸
（ｂ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ３、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ及びＰＥＲ１からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質の発現又は活性を促進する化合物
（ｃ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質と、ＡＴＸＮ１との結合を抑制する化合物
（ｄ）ＣＨＫ１、ＬＩＧ３、ＦＥＮ１、ＬＩＧ１、ＥＲＣＣ５、ＤＭＣ１、ＸＡＢ２、ＥＲＣＣ２、ＲＥＣＱＬ５、ＭＵＳ８１、ＥＭＥ１、ＳＰＯ１１及びＢＬＭからなる群から選択される少なくとも一のタンパク質の発現又は活性を抑制する化合物。
（２）　ＣＨＫ１タンパク質の活性を抑制する化合物を有効成分とし、かつ該化合物が、４－［（（３Ｓ）－１－アザビシクロ［２．２．２］オクト－３－イル）アミノ］－３－（１Ｈ－ベンズイミダゾール－２－イル）－６－クロロキノリン－２（１Ｈ）－オン、（Ｓ）－１－（５－ブロモ－４－メチル－２－（モルホリン－２－イルメトキシ）フェニル）－３－（５－メチルピラジン－２－イル）ウレア、６－ブロモ－３－（１－メチル－１Ｈ－ピラゾール－４－イル）－５－（３Ｒ）－３－ピぺリジニルピラゾロ［１，５－ａ］ピリミジン－７－アミン、（Ｒ）－α－アミノ－Ｎ－［５，６－ジヒドロ－２－（１－メチル－１Ｈ－ピラゾール－４－イル）－６－オキソ－１Ｈ－ピロロ［４，３，２－ｅｆ］［２，３］ベンゾジアゼピン－８－イル］－シクロヘキサンアセトアミド、１－（２－（（Ｓ）－ピペリジン－３－イルカルバモイル）－５－（３－フルオロフェニル）チオフェン－３－イル）ウレア、ＸＬ８４４、７－ヒドロキシスタウロスポリン、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）ニコチンアミド、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）イソブチルアミド、（Ｒ）－Ｎ－（５－ブロモ－４－（３－（メチルアミノ）ピペリジン－１－イル）－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）ニコチンアミド、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）－５－メチルニコチンアミド、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）シクロプロパンカルボキサミド、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）－３－メチル－ブタンアミド及び（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）－２－シクロプロピルアセトアミドからなる群から選択される少なくとも一の化合物である、（１）に記載の薬剤。
（３）　下記（ａ）～（ｃ）の工程を含む、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物のスクリーニング方法
（ａ）被検化合物の存在下で、ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質と、ＡＴＸＮ１とを接触させる工程、
（ｂ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質と、ＡＴＸＮ１との結合を検出する工程、
（ｃ）前記結合を抑制する化合物を選択する工程。
（４）　下記（ａ）及び（ｂ）の工程を含む、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物のスクリーニング方法
（ａ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ３、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ及びＰＥＲ１からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質の発現又は活性を検出しうる系に被検化合物を適用させる工程、
（ｂ）該タンパク質の発現又は活性を促進する化合物を選択する工程。
（５）　下記（ａ）及び（ｂ）の工程を含む、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物のスクリーニング方法
（ａ）ＣＨＫ１、ＬＩＧ３、ＦＥＮ１、ＬＩＧ１、ＥＲＣＣ５、ＤＭＣ１、ＸＡＢ２、ＥＲＣＣ２、ＲＥＣＱＬ５、ＭＵＳ８１、ＥＭＥ１、ＳＰＯ１１及びＢＬＭからなる群から選択される少なくとも一のタンパク質の機能を検出しうる系に被検化合物を適用させる工程、
（ｂ）該タンパク質の発現又は活性を抑制する化合物を選択する工程。
　なお、本発明において、「脊髄小脳変性症」とは、ＳＣＤ（ｓｐｉｎｏｃｅｒｅｂｅｌｌａｒ　ｄｅｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ）又はＳＣＡ（ｓｐｉｎｏｃｅｒｅｂｅｌｌａｒ　ａｔｒｏｐｈｙ）とも称される、小脳及び脳幹から脊髄にかけての神経細胞が徐々に破壊、消失していく神経変性疾患を意味する。脊髄小脳変性症は遺伝性のものと非遺伝性のものとの２つに大きく分類することができ、遺伝性のものとしては、例えば、遺伝性オリーブ橋小脳萎縮症、遺伝性皮質小脳萎縮症、Ｍａｃｈａｄｏ－Ｊｏｓｅｐｈ病、フリードライヒ運動失調症、眼球運動失行を伴う失調症１型（ＡＯＡ１）、ＡＯＡ２、遺伝性歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症、毛細血管拡張性運動失調症等が挙げられ、非遺伝性のものとしては、例えば、オリーブ橋小脳萎縮症、シャイ・ドレーガー症候群、線条体黒質変性症、皮質性小脳萎縮症が挙げられる。さらに、遺伝性のものに関しては、それら原因遺伝子によって３１型（ＳＣＡ１～３１）に分類される。このように脊髄小脳変性症は、伴う症状、原因遺伝子等によって多数の疾患に分類され得るが、遺伝性のもの、非遺伝性のもの問わず、いずれの型の脊髄小脳変性症においても、ＳＣＡの主要症候は小脳性あるいは脊髄後索性の運動失調であり、病理学的特徴は共通している。
　「ＲＰＡ１」とは、ＲＰＡ７０、ＨＳＳＢ、ＭＳＴ０７５、ＲＥＰＡ１、ＲＦ－Ａ又はＲＰ－Ａとも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００２９３６で特定されるタンパク質が挙げられる。また、ＲＰＡ１をコードする核酸のヒト由来の典型例としては、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００２９４５に記載のコーディング領域（ＣＤＳ）を含む核酸が挙げられる。
　「ＢＲＣＡ１」とは、ＩＲＩＳ、ＰＳＣＰ、ＢＲＣＣ１、ＰＮＣＡ４、ＲＮＦ５３、ＢＲＯＶＣＡ１又はＰＰＰ１Ｒ５３とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００９２２５で特定されるタンパク質が挙げられる。また、ＢＲＣＡ１をコードする核酸のヒト由来の典型例としては、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００７２９４に記載のＣＤＳを含む核酸が挙げられる。
　「ＢＲＣＡ２」とは、ＢＲＣＣ２、ＢＲＯＶＣＡ２、ＦＡＣＤ、ＦＡＤ、ＦＡＤ１、ＦＡＮＣＢ、ＦＡＮＣＤ、ＦＡＮＣＤ１、ＧＬＭ３又はＰＮＣＡ２とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００００５０で特定されるタンパク質が挙げられる。また、ＢＲＣＡ２をコードする核酸のヒト由来の典型例としては、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００００５９に記載のＣＤＳを含む核酸が挙げられる。
　「ＰＮＫＰ」とは、ＥＩＥＥ１０、ＭＣＳＺ又はＰＮＫとも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００９１８５で特定されるタンパク質が挙げられる。また、ＰＮＫＰをコードする核酸のヒト由来の典型例としては、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００７２５４に記載のＣＤＳを含む核酸が挙げられる。
　「ＸＲＣＣ３」とは、ＣＭＭ６とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００１０９３５８８で特定されるタンパク質が挙げられる。また、ＸＲＣＣ３をコードする核酸のヒト由来の典型例としては、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００１１００１１８に記載のＣＤＳを含む核酸が挙げられる。
　「ＸＲＣＣ４」の典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００３３９２で特定されるタンパク質が挙げられる。また、ＸＲＣＣ４をコードする核酸のヒト由来の典型例としては、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００３４０１に記載のＣＤＳを含む核酸が挙げられる。
　「ＣＣＮＨ」とは、サイクリンＨ、ＣＡＫ、ｐ３４又はｐ３７とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００１２３０で特定されるタンパク質が挙げられる。また、ＣＣＮＨをコードする核酸のヒト由来の典型例としては、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００１２３９に記載のＣＤＳを含む核酸が挙げられる。
　「ＰＯＬＥ」とは、ＤＮＡポリメラーゼイプシロン、ＣＲＣＳ１２、ＦＩＬＳ又はＰＯＬＥ１とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００６２２２で特定されるタンパク質が挙げられる。また、ＰＯＬＥをコードする核酸のヒト由来の典型例としては、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００６２３１に記載のＣＤＳを含む核酸が挙げられる。
　「ＰＯＬＨ」とは、ＤＮＡポリメラーゼイータ、ＲＡＤ３０、ＲＡＤ３０Ａ、ＸＰ－Ｖ又はＸＰＶとも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００６４９３で特定されるタンパク質が挙げられる。また、ＰＯＬＨをコードする核酸のヒト由来の典型例としては、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００６５０２に記載のＣＤＳを含む核酸が挙げられる。
　「ＰＥＲ１」とは、ｈＰＥＲ、ＰＥＲ又はＲＩＧＵＩとも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００２６０７で特定されるタンパク質が挙げられる。また、ＰＥＲ１をコードする核酸のヒト由来の典型例としては、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００２６１６に記載のＣＤＳを含む核酸が挙げられる。
　「ＣＨＫ１」とは、ＣＨＥＫ１とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００１１０７５９３で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００１１１４１２１に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　「ＬＩＧ３」とは、ＤＮＡライゲース３又はＬＩＧ２とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿０３９２６９で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿０１３９７５に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　「ＦＥＮ１」とは、ＦＥＮ－１、ＭＦ１又はＲＡＤ２とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００４１０２で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００４１１１に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　「ＬＩＧ１」とは、ＤＮＡライゲース１とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿０００２２５で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿０００２３４に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　「ＥＲＣＣ５」とは、ＣＯＦＳ３、ＥＲＣＭ２、ＵＶＤＲ、ＸＰＧ又はＸＰＧＣとも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿０００１１４で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿０００１２３に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　「ＸＡＢ２」とは、ＨＣＮＰ、ＨＣＲＮ、ＮＴＣ９０又はＳＹＦ１とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿０６４５８１で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿０２０１９６に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　「ＥＲＣＣ２」とは、ＣＯＦＳ２、ＥＭ９、ＴＴＤ又はＸＰＤとも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿０００３９１で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿０００４００に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　「ＤＭＣ１」とは、ＬＩＭ１５、ｄＪ１９９Ｈ１６．１、ＤＭＣ１Ｈ又はＨｓＬｉｍ１５とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００８９９９で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００７０６８に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　「ＲＥＣＱＬ５」とは、ＲＥＣＱ５とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００１００３７１５で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００１００３７１５に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　「ＭＵＳ８１」とは、ＳＬＸ３とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿０７９４０４で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿０２５１２８に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　「ＥＭＥ１」とは、ＦＬＪ３１３６４又はＭＭＳ４Ｌとも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿６８９６７６で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿１５２４６３に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　「ＳＰＯ１１」とは、ＣＴ３５、ＳＰＡＴＡ４３又はＴＯＰＶＩＡとも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿０３６５７６で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿０１２４４４に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　「ＢＬＭ」とは、ＢＳ、ＲＥＣＱ２、ＲＥＣＱＬ２又はＲＥＣＱＬ３とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿００００４８で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿００００５７に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　「ＡＴＸＮ１」とは、アタキシン１、ＡＴＸ１、Ｄ６Ｓ５０４Ｅ又はＳＣＡ１とも称されるタンパク質であり、典型的なものとしては、ヒト由来のものであれば、ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＰ＿０００３２３で特定されるタンパク質（ＲｅｆＳｅｑ　ＩＤ：ＮＭ＿０００３３２に記載の塩基配列にコードされるタンパク質）が挙げられる。
　本発明によれば、脊髄小脳変性症を治療又は予防すること、又は脊髄小脳変性症を治療若しくは予防するための候補化合物を提供することが可能となる。
ヘテロ接合型変異Ａｔｘｎ１－ノックインマウス（ｍＡｔｘｎ１－ＫＩ）及びそれと同腹の非トランスジェニックマウス（ＷＴ）において、１週齢、４週齢及び３２週齢の小脳におけるγＨ２ＡＸの発現を免疫組織学的に解析した結果を示す顕微鏡写真である。なお、変異Ａｔｘｎ１－ノックインマウスにおいて、Ａｔｘｎ１－１５４Ｑタンパク質（全長）を発現させている。また図中「ｍｏｌ」は分子層を示し、「ｇｒａ」は顆粒層を示し、「ｅ－ｇｒａ」は外顆粒層を示す。矢印は、プルキンエ細胞におけるγＨ２ＡＸの活性化を示す。 １６週齢及び４０週齢の野生型マウス（ＷＴ）及びｍＡｔｘｎ１－ＫＩマウス（ＫＩ）の小脳タンパク質抽出物（７μｇ）におけるγＨ２ＡＸの発現レベルを、ウェスタンブロッティングにより解析した結果を示す写真である。 １６週齢及び４０週齢の野生型マウス（ＷＴ）３匹及びｍＡｔｘｎ１－ＫＩマウス（ＫＩ）３匹におけるγＨ２Ａのシグナル強度を、ウェスタンブロッティングにより定量的に解析した結果を示すグラフである。図中のエラーバーはＳＥＭを示す。アスタリスクは、スチューデントのｔ検定においてＰ＜０．０１であることを示す。 Ａｔｘｎ１－８２Ｑ／ＤｓＲｅｄ又はＤｓＲｅｄのみをＯＫ６ドライバーによりショウジョウバエの運動神経に発現させ、これらハエの胸部運動神経及び腹神経索（ＶＮＣ）におけるＤＮＡ二重鎖切断（ＤＳＢｓ）を、ＤＳＢマーカーであるγＨ２Ａｖの発現を介して解析した結果を示す顕微鏡写真である。すなわち、左側のパネルにおいて、ＤｓＲｅｄのみを発現させた対照バエと比較して、変異型ＡＴＸＮ１を発現させたハエのＶＮＣにおいて、γＨ２Ａｖシグナルの増強が見られたことを示す顕微鏡写真である。なお、ハエは７～１０日目に解剖してこの解析に供した。 ＯＫ６－ｄｒｉｖｅｎ　Ａｔｘｎ１トランスジェニックバエの運動神経におけるＡｔｘｎ１の発現を、Ｈ２１抗Ａｔｘｎ１抗体を用いた免疫染色により検出した結果を示す顕微鏡写真である。すなわち、ＤｓＲｅｄのみを発現させた対照バエと比較して、当該トランスジェニックバエのＶＮＣにおいて、ＡＴＸＮ１の発現が確認されたことを示す顕微鏡写真である。なお、ハエは７～１０日目に解剖してこの解析に供した。 ヒトタンパク質間相互作用データベースを用い、インジェヌイティー－ＩＰＡソフトウェアによって予測された、ＳＣＡ１モデルバエの生存期間延長に寄与するＤＮＡ損傷修復ネットワーク－１を示す図である。なお、図中「ＮＨＥＪ型ＤＳＢＲ」と表記されている円で囲まれた遺伝子は、非相同末端際結合型のＤＮＡ二重鎖切断修復に関連する遺伝子であり、「ＨＲ型ＤＳＢＲ」と表記されている円で囲まれた遺伝子は、相同組換え型のＤＮＡ二重鎖切断修復に関連する遺伝子であり、「ＮＥＲ及びＢＥＲ」と表記されている円で囲まれた遺伝子は、ヌクレオチド除去修復又は塩基除去修復に関連する遺伝子であり、「転写」と表記されている円で囲まれた遺伝子は、転写に関連する遺伝子である。「Ｋｕ７０」はＸＲＣＣ６を示し、二重円が付された「Ｋｕ」はＫｕ７０／Ｋｕ８０複合体とは区別される。また、ＰＡＲＰ１は一本鎖ＤＮＡ切断修復（ＳＳＢＲ）及びヌクレオチド除去修復（ＮＥＲ）に関連する遺伝子であり、ＸＲＣＣ１、ＬＩＧ３及びＰＡＲＰ１は、別のタイプのＤＮＡ二重鎖切断修復（Ｂ－ＮＨＥＪ）にも関与する遺伝子である。 ヒトタンパク質間相互作用データベースを用い、インジェヌイティー－ＩＰＡソフトウェアによって予測された、ＳＣＡ１モデルバエの生存期間延長に寄与するＤＮＡ損傷修復ネットワーク－２を示す図である。 ヒトタンパク質間相互作用データベースを用い、インジェヌイティー－ＩＰＡソフトウェアによって予測された、ＳＣＡ１モデルバエの生存期間短縮に寄与するＤＮＡ損傷修復ネットワーク－１を示す図である。図中、ＣＨＫ１は、生存期間短縮の拠点となる遺伝子から多数のシグナルを受けていることが示されている。また、ＲＰＡ１は生存期間短縮の拠点となる遺伝子ＢＬＭ及びＦＥＮ１とつながりがあることも示されている。 ヒトタンパク質間相互作用データベースを用い、インジェヌイティー－ＩＰＡソフトウェアによって予測された、ＳＣＡ１モデルバエの生存期間短縮に寄与するＤＮＡ損傷修復ネットワーク－２を示す図である。 図６～９における表記について説明した図である。 ＡＴＸＮ１とＲＰＡ１との相互作用に関し、抗ＡＴＸＮ１抗体による免疫沈降アッセイを行い、抗ＲＰＡ１抗体を用いたウェスタンブロッティングにより解析した結果を示す写真である。図中、レーン１はＥＧＦＰとＭｙｃとを共発現させたＨｅｌａ細胞の結果を示し、レーン２はＥＧＦＰとＡｔｘｎ１－３３Ｑ－Ｍｙｃとを共発現させたＨｅｌａ細胞の結果を示し、レーン３はＥＧＦＰとＡｔｘｎ１－８６Ｑ－Ｍｙｃとを共発現させたＨｅｌａ細胞の結果を示し、レーン４はＥＧＦＰ－ＲｐＡ１のみを発現させたＨｅｌａ細胞の結果を示し、レーン５はＥＧＦＰ－ＲｐＡ１とＡｔｘｎ１－３３Ｑ－Ｍｙｃとを共発現させたＨｅｌａ細胞の結果を示し、レーン６はＥＧＦＰ－ＲｐＡ１とＡｔｘｎ１－８６Ｑ－Ｍｙｃとを共発現させたＨｅｌａ細胞の結果を示す。また、「Ｉｎｐｕｔ」は抗ＡＴＸＮ１抗体による免疫沈降に供する前の結果を示し、「ＩＰ」は抗ＡＴＸＮ１抗体による沈降物について解析した結果を示す。 ＡＴＸＮ１とＲＰＡ１との相互作用に関し、抗ＲＰＡ１抗体による免疫沈降アッセイを行い、抗ＡＴＸＮ１抗体を用いたウェスタンブロッティングにより解析した結果を示す写真である。図中、レーンの表記については図１１と同じである。「Ｉｎｐｕｔ」は抗ＲＰＡ１抗体による免疫沈降に供する前の結果を示し、「ＩＰ」は抗ＲＰＡ１抗体による沈降物について解析した結果を示す。 ＡＴＸＮ１とＢＲＣＡ１との相互作用に関し、抗ＢＲＣＡ１抗体による免疫沈降アッセイを行い、抗ＡＴＸＮ１抗体を用いたウェスタンブロッティングにより解析した結果を示す写真である。図中、レーン１はＥＧＦＰとＭｙｃとを共発現させたＨｅｌａ細胞の結果を示し、レーン２はＥＧＦＰとＡｔｘｎ１－３３Ｑ－Ｍｙｃとを共発現させたＨｅｌａ細胞の結果を示し、レーン３はＥＧＦＰとＡｔｘｎ１－８６Ｑ－Ｍｙｃとを共発現させたＨｅｌａ細胞の結果を示す。また、「Ｉｎｐｕｔ」は抗ＢＲＣＡ１抗体による免疫沈降に供する前の結果を示し、「ＩＰ」は抗ＢＲＣＡ１抗体による沈降物について解析した結果を示す。また、左側のパネルはウェスタンブロッティングにおける化学発光を短時間露光にて検出した結果を示し、右側のパネルはウェスタンブロッティングにおける化学発光を長時間露光にて検出した結果を示す。 ＡＴＸＮ１とＢＲＣＡ２との相互作用に関し、抗ＢＲＣＡ２抗体による免疫沈降アッセイを行い、抗ＡＴＸＮ１抗体を用いたウェスタンブロッティングにより解析した結果を示す写真である。図中、レーンの表記については図１３と同じである。「Ｉｎｐｕｔ」は抗ＢＲＣＡ２抗体による免疫沈降に供する前の結果を示し、「ＩＰ」は抗ＢＲＣＡ２抗体による沈降物について解析した結果を示す。 変異型Ａｔｘｎ１－ＫＩマウス（ＫＩ）及びそれと同腹の非トランスジェニックマウス（ＷＴ）を、抗ＲＰＡ１抗体又は抗ＡＴＸＮ１抗体による免疫沈降に供して解析した結果を示す写真である。すなわち、変異型ＡＴＸＮ１は、野生型ＡＴＸＮ１よりも、より強固にＲＰＡ１に結合することを示す写真である。図中、左側上部のパネルは免疫沈降に供する前の前記マウス由来のサンプルにおけるＲＰＡ１の発現をウェスタンブロッティングにより解析した結果を示し、左側下部の該サンプルにおけるＡＴＸＮ１の発現をウェスタンブロッティングにより解析した結果を示す。右側上部のパネルは、マウスＩｇＧ、抗ＲＰＡ１抗体又は抗ＡＴＸＮ１抗体による沈降物（図中、「ＩＰ　Ｍｏｕｓｅ　Ｎｏｒｍａｌ　ＩｇＧ」、「ＩＰ　Ａｎｔｉ－ＲｐＡ１（Ｈ７）」又は「ＩＰ　Ａｎｔｉ－Ａｔｘｎ１（１１ＮＱ）」）におけるＲＰＡ１の発現をウェスタンブロッティングにより解析した結果を示し、右側下部の２パネルは、該沈降物におけるＡＴＸＮ１の発現をウェスタンブロッティングにより解析した結果を示す。 プルキンエ細胞におけるＲＰＡ１及びＡＴＸＮ１の共局在について解析した結果を示す顕微鏡写真である。すなわち、変異型Ａｔｘｎ１－ＫＩマウス（１５４Ｑ）のプルキンエ細胞を、ＲＰＡ１及びＢＲＣＡ１を対象として二重染色し、共焦点顕微鏡にて観察した結果、ＲＰＡ１及びＢＲＣＡ１が共局在していることを示す顕微鏡写真である（図中矢印参照）。なお、野生型マウス（ＷＴ）においては、かかる共局在は観察されなかった。 皮質神経細胞におけるＢＲＣＡ１及びＡＴＸＮ１の共局在について解析した結果を示す顕微鏡写真である。すなわち、野生型マウス（ＷＴ）及び変異型Ａｔｘｎ１－ＫＩマウス（１５４Ｑ）の大脳皮質（Ｃｅｒｅｂｒａｌ　Ｃｏｒｔｅｘ）における神経細胞及び小脳（Ｃｅｒｅｂｅｌｌｕｍ）のプルキンエ細胞の核において、二重染色の結果、ＢＲＣＡ１及びＡＴＸＮ１は共局在していることを示す顕微鏡写真である。なお、ＡＴＸＮ１と共にＢＲＣＡ１が隔離されている封入体を有する皮質神経細胞がいくつか観察された（図中の矢印参照）。 ＢＲＣＡ２及びＡＴＸＮ１の核内における局在について解析した結果を示す顕微鏡写真である。すなわち、ＢＲＣＡ２は主に、野生型マウス（ＷＴ）及び変異Ａｔｘｎ１－ＫＩマウス（１５４Ｑ）のプルキンエ細胞の細胞質に局在していたことを示す顕微鏡写真である。なお、１１ＮＱ抗体により染色されたＡＴＸＮ１の局在と核内におけるＢＲＣＡ２の局在とは一部重なっていた。また、このような部分的な共局在は皮質神経細胞においても同様に観察された。 Ａｔｘｎ１－８６Ｑ－ＤｓＲｅｄを発現しているＵ２ＯＳ細胞において、線状ＤＮＡ　ＤＳＢを高エネルギーＵＶＡにより誘導し、線状ＤＮＡ　ＤＳＢ部位におけるＶＣＰ－ＥＧＦＰの蓄積を観察した結果を示す顕微鏡写真である。Ａｔｘｎ１－３３Ｑ－ＤｓＲｅｄ発現細胞と比較した結果、変異型ＡＴＸＮ１（Ａｔｘｎ１－８６Ｑ）を発現している細胞において、ＤＮＡ損傷フォーカスへのＲＰＡ１のリクルートは阻害されていることが明らかになった。 図１９に示した結果に関し、マイクロ照射後０～１０分間における、線状ＤＮＡ　ＤＳＢ部位におけるＥＧＦＰシグナルを定量的に解析した結果を示すグラフである。ＮＦＵは正規化蛍光ユニット（ｎｏｒｍａｌｉｚｅｄ　ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ　ｕｎｉｔｓ）を示す。 変異型ＡＴＸＮ１が発現している運動神経において、ＤＳＢの増加は、Ｈ２１によって染色されたＡＴＸＮ１の影響を受けることなく、ＲＰＡ１／ＲＰＡ７０との共発現によって回復したことを示す顕微鏡写真である。なお、ＤＳＢはγＨ２ＡＶの発現を指標に検出した。 図２１に示した結果に関し、運動神経におけるγＨ２Ａｖシグナルを定量化した結果を示すグラフである。すなわち、ＤＳＢにおけるＲＰＡ１／ＲＰＡ７０による回復効果を示すグラフである。 ＣＨＫ１／ｇｒｐ又はＲＰＡ１／ＲｐＡ７０とＡＴＸＮ１とにおける遺伝的相互作用について、ＳＣＡ１モデルバエの粗い眼の表現型を指標として解析した結果を示す写真である。この解析には、ＧＳ系統ハエ（図中「ＧＳ－ｇｒｐ」若しくは「ＧＳ－ＲｐＡ７０」）又はＵＡＳ－ＲＮＡｉトランスジェニックハエ（図中「ｇｒｐ－ＲＮＡｉ」若しくは「ＲｐＡ７０－ＲＮＡｉ」）と、ＧＭＲ＞Ａｔｘｎ１－８２Ｑハエ（図中「Ａｔｘｎ１－８２Ｑ　＋」）とを交配させて得られた産子を対象とした。また、この解析の結果、ＣＨＫ１をノックダウンさせることにより眼の変性状態は改善され、一方、ＣＨＫ１を過剰発現させることにより、眼の変性状態は悪化することが明らかになった。さらに、ＲＰＡ１を過剰発現させることにより眼の変性状態は改善され、一方、ＲＰＡ１をノックダウンさせることにより、眼の変性状態は悪化することが明らかになった。 ＲＰＡ１／ＲｐＡ７０及び変異型ＡＴＸＮ１ダブルトランスジェニックバエにおける眼の変性状態の改善を示す写真である。すなわち、光受容細胞において変異ＡＴＸＮ１（Ａｔｘｎ１－８２Ｑ）の発現をＧＭＲによって誘導することによって、眼の変性が生し、粗い眼の表現型を示すことになるが、これら表現型はＲＰＡ１／ＲｐＡ７０を共発現させることによって回復されることを示す写真である。図中、下部のパネルは走査型電子顕微鏡による観察画像（ＳＥＭ画像）を示す。 ＲＰＡ１をコードするＡＡＶベクターを小脳に注入したＳＣＡ１モデルマウスにおける、ロータロッド試験の工程を示す概略図である。 ＲＰＡ１をコードするＡＡＶベクターを小脳に注入したＳＣＡ１モデルマウス（９週齢）における、ロータロッド試験の結果（平均値±標準偏差）を示すグラフである。図中、横軸は、３日間連続して行ったロータロッド試験の各試験日を示す。縦軸は、６００秒間回転させたロッドにマウスが落下せずに乗っていた時間（１日４回の試験の平均時間）を示す。「ＲＰＡ１」は、ＲＰＡ１をコードするＡＡＶベクターを小脳に注入したＳＣＡ１モデルマウスの結果を示し、「ＧＦＰ　ｏｒ　ｎｏ　ｖｉｒｕｓ」は、ＡＡＶベクターを小脳に注入していないＳＣＡ１モデルマウスとＧＦＰをコードするＡＡＶベクターを小脳に注入したＳＣＡ１モデルマウスとの結果（陰性対照群の結果）を示す。また、「ＲＰＡ１」及び「ＧＦＰ　ｏｒ　ｎｏ　ｖｉｒｕｓ」に併記した括弧内の数は、試験に供した用いた各マウスの数を示す。アスタリスクは、スチューデントのｔ検定（片側検定）においてＰ＜０．０５であることを示す。 ＲＰＡ１をコードするＡＡＶベクターを小脳に注入したＳＣＡ１モデルマウス（１３週齢）における、ロータロッド試験の結果を示すグラフである。図中の表記については図２６と同様である。 ＲＰＡ１をコードするＡＡＶベクターを小脳に注入したＳＣＡ１モデルマウス（４０週齢）における、ロータロッド試験の結果を示すグラフである。図中の表記については図２６と同様である。 ＣＨＫ１阻害剤（ＣＨＩＲ－１２４）を添加した培地にて飼育したＯＫ６＞ＳＣＡ１ハエの生存期間を解析した結果を示すグラフである。生存期間の平均値についての統計解析は、ログランク検定により行った。また、この解析の結果、０．０２ｍｇ／ｍＬのＣＨＩＲ－１２４を添加した培地にて飼育することによって、ＳＣＡ１モデルバエにおける生存期間の短さは改善された（ｐ＝０．０３０４）。 抗ＢｒｄＵ抗体（図中「ＢｒｄＵ」）及び抗カルビンディン抗体（図中「Ｃａｌｂｉｎｄｉｎ」）による二重染色（図中「Ｍｅｒｇｅ」）によって、悪化したプルキンエ細胞に取り込まれたＢｒｄＵ由来の弱いシグナルが検出されたことを示す顕微鏡写真である（図中、矢印参照）。なお、カルビンディン由来の強いシグナルが検出される正常なプルキンエ細胞においてはＢｒｄＵ由来のシグナルは検出されない。 抗ＢｒｄＵ抗体（図中「ＢｒｄＵ」）及び抗Ｓｏｘ２抗体（図中「Ｓｏｘ２」）による二重染色（図中「Ｍｅｒｇｅ」）によって、プルキンエ細胞層にあるＳｏｘ２陽性バーグマングリアはＲｒｄＵを取り込まないことを示す顕微鏡写真である（図中、矢印参照）。また、抗ＢｒｄＵ抗体及び抗Ｓｏｘ２抗体による二重染色によって、白質においてＢｒｄＵ／Ｓｏｘ２二重陽性細胞が存在していることも観察された（図中、矢印参照））。 Ａｔｘｎ１－ＫＩマウスにおける５３ＢＰ１由来のシグナル強度は、バーグマングリアに関しては野生型マウス（ＷＴ）と同程度であり（矢印参照）、プルキンエ細胞においては亢進していたことを示す顕微鏡写真である。 抗γＨ２Ａ抗体（図中「γＨ２Ａ」）及び抗Ｓｏｘ２抗体（図中「Ｓｏｘ２」）による二重染色（図中「Ｍｅｒｇｅ」）によって、Ａｔｘｎ１－ＫＩマウスのバーグマングリアにおいてＢｒｄＵ由来のシグナルは検出されなかったことを示す顕微鏡写真である。
　＜脊髄小脳変性症を予防又は治療するための薬剤＞
　後述の実施例において示す通り、ＳＣＡ１モデルバエ及びＳＣＡ１モデルマウスにおいて、ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ３、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ又はＰＥＲ１を過剰に発現させることによって、それらの症状が改善されることが明らかになった。したがって、本発明においては、下記（ａ）を少なくとも１の有効成分として含む、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための薬剤が提供される。
（ａ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ３、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ及びＰＥＲ１からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質又は該タンパク質をコードする核酸。
　本発明の薬剤の有効成分である（ａ）において、ＲＰＡ１等のタンパク質としては、各々典型例として上述のＲｅｆＳｅｑ　ＩＤによって特定されるタンパク質（野生型タンパク質）である必要はなく、各タンパク質の活性が維持されている限り、人工的に又は非人工的に、アミノ酸が置換、欠失、挿入された変異体であってもよく、修飾が施された修飾体であってもよい。変異体及び修飾体の活性が維持されているかどうかは、後述のスクリーニング方法を利用することにより、判定することができる。
　タンパク質の変異体としては、上述の野生型タンパク質において、１若しくは複数のアミノ酸が置換、欠失、付加、及び／又は挿入されたアミノ酸配列からなるタンパク質が挙げられる。ここで「複数」とは、通常、５０アミノ酸以内、好ましくは４０アミノ酸以内、より好ましくは３０アミノ酸以内、さらに好ましくは２０アミノ酸以内、特に好ましくは１０アミノ酸以内（例えば、５アミノ酸以内、３アミノ酸以内、２アミノ酸以内、１アミノ酸）である。また、アミノ酸の置換は、好ましくは保存的な置換である。本発明において「保存的な置換」とは、化学的に同様な側鎖を有する他のアミノ酸残基で置換することを意味する。化学的に同様なアミノ酸側鎖を有するアミノ酸残基のグループは、本発明の属する技術分野でよく知られている。
　また、タンパク質の変異体としては、上述の野生型タンパク質をコードする核酸と高ストリンジェントな条件でハイブリダイズする核酸がコードするポリペプチドが挙げられる。高ストリンジェンシーなハイブリダイズの条件として、例えば、０．２ｘＳＳＣ、６５℃という条件が挙げられる。
　さらに、タンパク質の変異体としては、上述の野生型タンパク質のアミノ酸配列と８０％以上（例えば、８５％、９０％、９５％、９７％、９９％以上）の相同性を有するアミノ酸配列からなるポリペプチドが挙げられる。配列の相同性は、ＮＣＢＩのＢＬＡＳＴＰ（アミノ酸レベル）のプログラム（ｈｔｔｐ：／／ｂｌａｓｔ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／Ｂｌａｓｔ．ｃｇｉ？ＰＲＯＧＲＡＭ＝ｂｌａｓｔｐ＆ＢＬＡＳＴ＿ＰＲＯＧＲＡＭＳ＝ｂｌａｓｔｐ＆ＰＡＧＥ＿ＴＹＰＥ＝ＢｌａｓｔＳｅａｒｃｈ＆ＳＨＯＷ＿ＤＥＦＡＵＬＴＳ＝ｏｎ＆ＬＩＮＫ＿ＬＯＣ＝ｂｌａｓｔｈｏｍｅ）を利用し、そのプログラムのデフォルトパラメーターを用いて決定することができる。
　また、ＲＰＡ１等に付加されるタンパク質としては、抗体のＩｇＧ部分、血清アルブミン部分等が挙げられる。また、このようなタンパク質は、ＲＰＡ１等のＮ末及びＣ末のいずれか一方又は両方に直接又は間接的に付加することができる。さらに、間接的に付加させる際には、任意のアミノ酸配列からなるリンカーを利用することができる。
　修飾としては、例えば、リン酸化、アセチル化、メチル化、ＡＤＰリボシル化、ユビキチン結合、糖化、カルボニル化、ＳＵＭＯ化、並びにポリエチレングルコール、ポリプロピレングリコール及びポリオキシアルキレンのうちの少なくともいずれか一のポリマーとの共有結合が挙げられる。
　また、本発明において、核酸の形態としては、ＲＰＡ１等のタンパク質をコードし得るものであればいかなる形態でもよい。すなわち、ｍＲＮＡから合成されたｃＤＮＡであるか、ゲノムＤＮＡであるか、化学合成ＤＮＡであるか等を問わない。また、ＲＰＡ１等のタンパク質をコードし得る限り、コドンの縮重に基づく任意の塩基配列を有する核酸が含まれる。
　さらに、核酸はベクターに挿入されている形態であってもよい。ベクターとしては、本発明の薬剤の投与対象内において、当該核酸にコードされているタンパク質を発現できるものであればよく、例えば、レンチウィルス、レトロウィルス、アデノウィルス、アデノ随伴（ＡＡＶ）ウィルス、ヘルペスウィルス、センダイウィルス等のウィルスベクター、エピソーマルベクター、ＰｉｇｇｙＢａｃトランスポゾンベクター、プラスミドベクターが挙げられる。かかるベクターにおいて使用されるプロモーターとしては、例えば、ＣＡＧプロモータ－、ＳＲαプロモーター、ＳＶ４０プロモーター、ＬＴＲプロモーター、ＣＭＶプロモーター、ＲＳＶプロモーター、ＨＳＶ－ＴＫプロモーターが挙げられる。また、ベクターは、プロモーターの他にさらに、エンハンサー、ポリＡ付加シグナル等を含有していてもよい。
　また、このような核酸は、当業者であれば、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、制限酵素処理、部位特異的変異誘発（ｓｉｔｅ－ｄｉｒｅｃｔｅｄ　ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ）法等の遺伝子増幅技術や遺伝子組換え技術を利用して調製することができる。
　そして、このようにして調製した核酸を適当なベクターに挿入し、該ベクターを無細胞タンパク質合成系（例えば、網状赤血球抽出液、小麦胚芽抽出液）に導入してインキュベーションすることにより、また該ベクターを適当な細胞（例えば、大腸菌、酵母、昆虫細胞、動物細胞）に導入し、得られた形質転換体を培養することにより、前述のタンパク質を調製することができる。さらに、タンパク質は、公知の方法により精製することができる。このような方法としては、例えば、溶媒抽出法、硫安等による塩析法脱塩法、有機溶媒による沈殿法、ＤＥＡＥ－セファロース、イオン交換クロマトグラフィー法、疎水性クロマトグラフィー法、ゲルろ過法、アフィニティークロマトグラフィー法が挙げられる。
　また、前述のタンパク質及び核酸は、市販の合成機を用い、化学合成することによっても調製することができる。
　前述の通り、ＳＣＡ１モデルバエ及びＳＣＡ１モデルマウスにおいて、ＲＰＡ１等を過剰に発現させることによって、それらの症状が改善されることが明らかになった。したがって、本発明においては、下記（ｂ）を少なくとも１の有効成分として含む、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための薬剤が提供される。
（ｂ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ４、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ及びＰＥＲ１からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質の発現又は活性を促進する化合物。
　後述の実施例において示す通り、ＲＰＡ１等のタンパク質は、ＤＮＡ修復を通してＳＣＡの病態に関与する。したがって、後述の化合物の抑制の対象となる「活性」とは、ＤＮＡ修復に関する活性を意味する。このような活性には、ＲＰＡ１等が関与するＤＮＡ修復機構において発揮される機能（ＤＮＡ合成活性、ＤＮＡライゲース活性、ヌクレアーゼ活性、トポイソメラーゼ活性、ポリヌクレオチドキナーゼ活性等）のみならず、当該機能を発揮するために必要な、他のタンパク質との結合能、他のタンパク質に対する修飾活性（ユビキチンライゲース活性、プロテインキナーゼ活性等）、修復の対象となるＤＮＡとの結合能等も含まれる。
　「ＲＰＡ１等の発現又は活性を促進する化合物」としては、公知の化合物であってもよく、後述のスクリーニングにより同定されるものであってもよい。
　また、該化合物の促進の対象となるタンパク質をコードする核酸の塩基配列は、自然界において（すなわち、非人工的に）変異し、ひいては当該タンパク質のアミノ酸配列においても変異が生じる。したがって、当該タンパク質は上記典型例として挙げているアミノ酸配列からなるタンパク質に各々限定されず、自然界において生じ得る変異体も当該化合物による促進の対象となる。
　後述の実施例において示す通り、ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１又はＢＲＣＡ２と、ＡＴＸＮ１又はその変異体とは結合できることが明らかになった。さらに、変異型ＡＴＸＮ１は、ＤＮＡ損傷後において、ＤＮＡ修復に必要なＲＰＡ１の核内動態を損なわせることにより、ＳＣＡ１の発症、症状の進行に寄与していることも明らかになった。したがって、本発明においては、下記（ｃ）を少なくとも１の有効成分として含む、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための薬剤が提供される。
（ｃ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質と、ＡＴＸＮ１との結合を抑制する化合物。
　本発明の薬剤の有効成分である（ｃ）において、ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２及びＡＴＸＮ１は、上記典型例として挙げているアミノ酸配列からなるタンパク質に各々限定されず、自然界において生じ得る変異体も対象となる。特に、ＡＴＸＮ１に関しては、後述の実施例等において示す通り、ＲＰＡ及びＢＲＣＡ１に対してより強く結合し、これらタンパク質の細胞内動態に影響を与えるという観点から、異常に伸長したポリグルタミン鎖を有するＡＴＸＮ１であることが好ましい。「異常に伸長したポリグルタミン鎖を有するＡＴＸＮ１」としては、ＳＣＡ１の病因となる限り特に制限はないが、通常、３９個以上のグルタミンからなるポリグルタミン鎖を有するＡＴＸＮ１（好ましくは、８２個のグルタミンからなるポリグルタミン鎖を有するＡＴＸＮ１（ＡＴＸＮ１－８２Ｑ）、８６個のグルタミンからなるポリグルタミン鎖を有するＡＴＸＮ１（ＡＴＸＮ１－８６Ｑ）、１５４個のグルタミンからなるポリグルタミン鎖を有するＡＴＸＮ１（ＡＴＸＮ１－１５４Ｑ））である。
　「ＲＰＡ１等とＡＴＸＮ１との結合を抑制する化合物」としては特に制限はなく、公知の化合物であってもよく、後述のスクリーニングにより同定される化合物であってもよい。なお、本発明において、ＲＰＡ１等とＡＴＸＮ１との結合の「抑制」は、当該結合の完全な抑制（阻害）のみならず、部分的な抑制も含む意味である。
　後述の実施例において示す通り、ＳＣＡ１モデルバエにおいて、ＣＨＫ１、ＬＩＧ３、ＦＥＮ１、ＬＩＧ１、ＥＲＣＣ５、ＸＡＢ２、ＥＲＣＣ２、ＤＭＣ１、ＲＥＣＱＬ５、ＭＵＳ８１、ＥＭＥ１、ＳＰＯ１１又はＢＬＭを過剰に発現させることによって、その症状が悪化されることが明らかになった。さらに、ＣＨＫ１の発現及び活性を、ＣＨＫ１に対するｓｉＲＮＡ及び阻害剤（ＣＨＩＲ－１２４）により各々抑制することによって、ＳＣＡ１モデルバエの症状は改善されることが明らかになった。したがって、本発明においては、下記（ｄ）を少なくとも１の有効成分として含む、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための薬剤が提供される。
（ｄ）ＣＨＫ１、ＬＩＧ３、ＦＥＮ１、ＬＩＧ１、ＥＲＣＣ５、ＸＡＢ２、ＥＲＣＣ２、ＤＭＣ１、ＲＥＣＱＬ５、ＭＵＳ８１、ＥＭＥ１、ＳＰＯ１１及びＢＬＭからなる群から選択される少なくとも一のタンパク質の発現又は活性を抑制する化合物。
　後述の実施例において示す通り、前記ＲＰＡ１同様に、ＣＨＫ１等のタンパク質もＤＮＡ修復を通してＳＣＡの病態に関与する。したがって、後述の化合物の抑制の対象となる「活性」とは、上述の有効成分（ｂ）同様に、ＤＮＡ修復に関する活性を意味する。
　また、本発明において、タンパク質の発現の「抑制」とは、該発現の完全な抑制（阻害）のみならず、部分的な抑制も含む意味である。
　本発明の薬剤の有効成分である（ｄ）において、ＣＨＫ１等は、上記典型例として挙げているアミノ酸配列からなるタンパク質に各々限定されず、自然界において生じ得る変異体も対象となる。
　「ＣＨＫ１等の発現又は活性を抑制する化合物」としては特に制限はなく、公知の化合物であってもよく、後述のスクリーニングにより同定されるものであってもよい。このような化合物としては、例えば、ＣＨＫ１等に結合する低分子化合物、ＣＨＫ１等をコードする遺伝子の転写産物に結合するＲＮＡ、ＣＨＫ１等に対する抗体、ＣＨＫ１等に対してドミナントネガティブの形質を有するペプチドが挙げられる。
　前記低分子化合物として、ＣＨＫ１に関しては、例えば、４－［（（３Ｓ）－１－アザビシクロ［２．２．２］オクト－３－イル）アミノ］－３－（１Ｈ－ベンズイミダゾール－２－イル）－６－クロロキノリン－２（１Ｈ）－オン（ＣＡＳ登録番号：４０５１６８－５８－３、ＣＨＩＲ－１２４）及び（Ｓ）－１－（５－ブロモ－４－メチル－２－（モルホリン－２－イルメトキシ）フェニル）－３－（５－メチルピラジン－２－イル）ウレア（ＣＡＳ登録番号：９１１２２２－４５－２、ＩＣ－８３、ＬＹ２６０３６１８）（Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ　Ｒｅｓ．、２００７年、１３巻、２号、５９１～６０２）ページ　参照）、６－ブロモ－３－（１－メチル－１Ｈ－ピラゾール－４－イル）－５－（３Ｒ）－３－ピぺリジニルピラゾロ［１，５－ａ］ピリミジン－７－アミン（ＣＡＳ登録番号：８９１４９４－６３－６、ＳＣＨ９００７７６、ＭＫ－８７７６）、（Ｒ）－α－アミノ－Ｎ－［５，６－ジヒドロ－２－（１－メチル－１Ｈ－ピラゾール－４－イル）－６－オキソ－１Ｈ－ピロロ［４，３，２－ｅｆ］［２，３］ベンゾジアゼピン－８－イル］－シクロヘキサンアセトアミド（ＣＡＳ登録番号：９５２０２１－６０－２、ＰＦ－００４７７７３６）、１－（２－（（Ｓ）－ピペリジン－３－イルカルバモイル）－５－（３－フルオロフェニル）チオフェン－３－イル）ウレア（ＣＡＳ登録番号：８６０３５２－０１－８、ＡＺＤ７７６２）、ＸＬ８４４（Ｅｘｉｌｉｘｉｓ社製、２００８　ＥＯＲＴＣ　ポスター＃３９５［ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｅｘｅｌｉｘｉｓ．ｃｏｍ／ｅｏｒｔｃ／ｐｏｓｔｅｒｓ／ＥＯＲＴＣ０８＿３９５＿ＸＬ８４４－００２．ｐｄｆ］　参照）及び７－ヒドロキシスタウロスポリン（ＣＡＳ登録番号：１１２９５３－１１－４、ＵＣＮ－０１）、並びに、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）ニコチンアミド、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）イソブチルアミド、（Ｒ）－Ｎ－（５－ブロモ－４－（３－（メチルアミノ）ピペリジン－１－イル）－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）ニコチンアミド、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）－５－メチルニコチンアミド、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）シクロプロパンカルボキサミド、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）－３－メチル－ブタンアミド及び（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）－２－シクロプロピルアセトアミド（国際公開第２０１０－１１８３９０号　参照）が挙げられる。
　「ＣＨＫ１等をコードする遺伝子の転写産物に結合するＲＮＡ」としては、ＣＨＫ１等のタンパク質をコードする遺伝子の転写産物と相補的な、ｓｉＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ（ｓｈｏｒｔ　ｈａｉｐｉｎ　ＲＮＡ）等のｄｓＲＮＡ（二重鎖ＲＮＡ）が挙げられる。ｄｓＲＮＡの鎖長としては、標的遺伝子の発現を抑制することができ、かつ、毒性を示さなければ特に制限はなく、例えば、１５～４９塩基対であり、好適には１５～３５塩基対であり、さらに好適には２１～３０塩基対である。ｄｓＲＮＡは、標的遺伝子の塩基配列と完全に同一である必要はないが、少なくとも７０％以上、好ましくは８０％以上、さらに好ましくは９０％以上（例えば、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％以上）の配列の同一性を有する。配列の同一性は、ＢＬＡＳＴプログラムにより決定することができる。
　「ＣＨＫ１等をコードする遺伝子の転写産物に結合するＲＮＡ」の他の態様としては、ＣＨＫ１等をコードする遺伝子の転写産物と相補的なアンチセンスＲＮＡや該転写産物を特異的に開裂するリボザイム活性を有するＲＮＡ（リボザイム）も挙げられる。
　以上のＲＮＡにおいては、その一部又は全部において、ＰＮＡ、ＬＮＡ、ＥＮＡ等の人工核酸によって、ＲＮＡが置換されているものであってもよい。また、これらＲＮＡに関しては、本発明の薬剤の投与対象内において発現させるべく、当該ＲＮＡをコードするＤＮＡを保持する発現ベクターの態様であってもよい。また、このようなＲＮＡは、当業者であれば、市販の合成機等を用い化学合成して調製することができる。
　「ＣＨＫ１等に対する抗体」は、ポリクローナル抗体であっても、モノクローナル抗体であってもよく、また、抗体の機能的断片であってもよい。抗体には、免疫グロブリンのすべてのクラス及びサブクラスが含まれる。抗体の「機能的断片」とは、抗体の一部分（部分断片）であって、ＣＨＫ１等のタンパク質を特異的に認識するものを意味する。具体的には、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、可変領域断片（Ｆｖ）、ジスルフィド結合Ｆｖ、一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）、ｓｃ（Ｆｖ）２、ダイアボディー、多特異性抗体、及びこれらの重合体等が挙げられる。また、抗体には、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、及びこれら抗体の機能的断片が含まれる。さらに、これら抗体は、必要に応じ、アミノ酸配列の改変、修飾等が施されているものであってもよい。また、このような抗体は、当業者であれば公知の抗体作製方法により適宜調製することができる。
　「ＣＨＫ１等に対してドミナントネガティブの形質を有するペプチド」としては、ＤＮＡ修復の際に基質等となるＤＮＡや、ＤＮＡ修復機構を構成する他のタンパク質等との結合に関して、ＣＨＫ１等のタンパク質上の結合部位と競合するようなポリペプチド（例えば、ＣＨＫ１等のタンパク質の部分ペプチド）等が挙げられる。
　本発明の薬剤は、上記（ａ）～（ｄ）に記載の化合物の他、薬理学上許容される担体又は媒体を含有してもよい。担体又は媒体としては、例えば、界面活性剤、賦形剤、着色料、着香料、保存料、安定剤、緩衝剤、懸濁剤、等張化剤、結合剤、崩壊剤、滑沢剤、流動性促進剤、矯味剤等が挙げられるが、これらに制限されず、その他常用の担体又は媒体を適宜使用することができる。具体的には、軽質無水ケイ酸、乳糖、結晶セルロース、マンニトール、デンプン、カルメロースカルシウム、カルメロースナトリウム、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ポリビニルアセタールジエチルアミノアセテート、ポリビニルピロリドン、ゼラチン、中鎖脂肪酸トリグリセライド、ポリオキシエチレン硬化ヒマシ油６０、白糖、カルボキシメチルセルロース、コーンスターチ、無機塩類等を挙げることができる。さらに、核酸又はタンパク質等を細胞に導入するための担体も、本発明の薬剤に含有されていてもよい。担体としては、カチオン性リポソーム等の正電荷を有する物質や、新油性物質（コレステロール及びその誘導体、脂質（例えば、糖脂質、リン脂質、スフィンゴ脂質等）、ビタミンＥ（トコフェロール）等のビタミン類）が挙げられる。また、本発明の薬剤は、ＳＣＡの治療又は予防に用いられる公知の医薬品と併用してもよい。
　本発明の薬剤は、ヒトを含む動物を対象として使用することができる。ヒト以外の動物としては特に制限はなく、種々の家畜、家禽、ペット、実験用動物等を対象とすることができる。また、本発明の薬剤の好適な対象疾患は、脊髄小脳変性症１型（ＳＣＡ１）である。ＳＣＡ１は、アタキシン１（ＡＴＸＮ１）遺伝子中にあるグルタミンをコードするＣＡＧトリヌクレオチドがリピートし、伸長することによって引き起こされる疾患を意味する。また、ＣＡＧトリヌクレオチドのリピート数としては特に制限はないが、通常３９リピート以上である。
　本発明の薬剤の投与形態としては特に制限はなく、例えば、静脈内投与、動脈内投与、腹腔内投与、皮下投与、皮内投与、気道内投与、直腸投与及び筋肉内投与、輸液による投与、標的部位（小脳、脳幹、脊髄等）への直接投与が挙げられるが、治療効果が高く、また投与する薬剤の量が抑えられるという観点から、標的部位に直接投与することが好ましい。標的部位への投与は、例えば、カニューレ（カテーテル）、切開術、ドラッグデリバリーシステム、注射等を用いて行うことができ、より具体的には、定位脳手術方法によってカニューレ等を挿入し、当該カニューレを通じて本発明の薬剤を脳内に投与する方法、開頭し、本発明の薬剤を入れた徐放系ドラッグデリバリーシステム（例えば、ＡＬＺＥＴ社製の浸透圧ポンプ）を脳内に埋め込む方法、本発明の薬剤を電気穿孔法により脳内の細胞に導入する方法が挙げられる。また、後述の実施例において示す通り、本発明の薬剤がウィルスベクターの形態をとる場合には、該薬剤を標的部位に直接注入することもできる。
　また、本発明の薬剤を脳内に直接投与しない場合には、上記（ａ）～（ｄ）に記載の化合物に脳関門透過物質を結合させて投与する方法を利用してもよい。なお、脳関門透過物質としては、例えば、狂犬病ウィルス由来の２９アミノ酸からなる糖タンパク質（Ｎａｔｕｒｅ、２００７年７月５日、４４８巻、３９～４３ページ　参照）が挙げられるが、これに制限されない。
　本発明の薬剤の投与量及び投与回数は、有効成分とする化合物の種類、目的とする効果、患者の年齢や体重等に応じて適宜調節することができ、投与回数は投与量、投与経路等に応じて適宜調節することができる。
　本発明は、このように、本発明の薬剤を対象に投与することを特徴とする、対象の脊髄小脳変性症（ＳＣＡ）を治療又は予防する方法をも提供するものである。
　本発明の薬剤の製品又はその説明書は、ＳＣＡを治療又は予防するために用いられる旨の表示を付したものであり得る。ここで「製品又は説明書に表示を付した」とは、製品の本体、容器、包装等に表示を付したこと、あるいは製品の情報を開示する説明書、添付文書、宣伝物、その他の印刷物等に表示を付したことを意味する。
　＜脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物のスクリーニング方法１＞
　後述の実施例において示す通り、ＳＣＡ１の病因となるＡＴＸＮ１は、ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２と結合することにより、ＤＮＡ修復過程におけるＲＰＡ１等の機能又は細胞内動態に悪影響を与え、ひいてはＳＣＡの発症、進行に寄与することが明らかになった。したがって、かかる知見に基づき、本発明は、下記スクリーニング方法を提供することができる。
　下記（ａ）～（ｃ）の工程を含む、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物のスクリーニング方法
（ａ）被検化合物の存在下で、ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質と、ＡＴＸＮ１とを接触させる工程、
（ｂ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質と、ＡＴＸＮ１との結合を検出する工程、
（ｃ）前記結合を抑制する化合物を選択する工程。
　本発明のスクリーニング方法において使用する被検化合物としては特に制限はなく、例えば、遺伝子ライブラリーの発現産物、合成低分子化合物ライブラリー、ペプチドライブラリー、抗体、細菌放出物質、細胞（微生物、植物細胞、動物細胞）の抽出液及び培養上清、精製又は部分精製ポリペプチド、海洋生物、植物又は動物由来の抽出物、土壌、ランダムファージペプチドディスプレイライブラリーが挙げられる。
　また、このスクリーニング方法において用いられる、ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２及びＡＴＸＮ１は、上述の本発明の薬剤の有効成分（ｃ）に関する記載の通りであるが、結合の検出のし易さという観点から、これらタンパク質には、レポータータンパク質（例えば、ＧＦＰ、ルシフェラーゼ）、精製用タグタンパク質（例えば、ヒスチジンタグ、ＦＬＡＧタグ、ＧＳＴタグ）等が付加されていてもよい。また、ＲＰＡ１等とＡＴＸＮ１との結合が損なわれない限り、これらタンパク質は部分ペプチドであってもよい。
　（ａ）の工程において、互いに結合するＲＰＡ１等とＡＴＸＮ１とを被検化合物存在下で接触させるが、接触は、被検化合物の非存在下において、ＲＰＡ１等とＡＴＸＮ１との結合が抑制されない条件下で行われればよい。
　（ｂ）の工程において、ＲＰＡ１等とＡＴＸＮ１との結合を検出するが、結合の検出は特に制限されることはなく、公知の手法を適宜採用することができる。例えば、免疫共沈降法、酵母ツーハイブリッドシステム、ＥＬＩＳＡ法、表面プラズモン共鳴現象を利用した検出装置（例えば、ＢＩＡｃｏｒｅ（ＧＥヘルスケア社製））を用いた方法、ＦＲＥＴ（蛍光共鳴エネルギー移動）を利用した方法を採用することができる。
　（ｃ）の工程において、前記結合を抑制する化合物を選択するが、例えば、免疫共沈降法を用いた場合においては、被検化合物存在下で、ＡＴＸＮ１をその特異的な抗体によって沈降させた際に共沈してくるＲＰＡ１等の量と、被検化合物非存在下におけるＲＰＡ１等の量（対照値）とを比較することにより評価することができる。すなわち、被検化合物存在下におけるＲＰＡ１等の量が被検化合物非存在下の量と比較して低い場合（例えば、対照値の８０％以下、５０％以下、３０％以下の場合）には、該被検化合物を、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物と評価することができる。前記結合の検出において免疫沈降法以外の方法を用いる場合も同様に、被検化合物非存在下における前記結合の程度を対照値として用いて評価することができる。
　＜脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物のスクリーニング方法２及び３＞
　後述の実施例において示す通り、ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ３、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ又はＰＥＲ１の発現を亢進させることによって、ＳＣＡの病態を改善できることが明らかになった。したがって、かかる知見に基づき、本発明は、下記スクリーニング方法を提供することができる。
　下記（ａ）及び（ｂ）の工程を含む、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物のスクリーニング方法
（ａ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ３、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ及びＰＥＲ１からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質の発現又は活性を検出しうる系に被検化合物を適用させる工程、
（ｂ）該タンパク質の発現又は活性を促進する化合物を選択する工程。
　一方、後述の実施例において示す通り、ＣＨＫ１、ＬＩＧ３、ＦＥＮ１、ＬＩＧ１、ＥＲＣＣ５、ＸＡＢ２、ＥＲＣＣ２、ＤＭＣ１、ＲＥＣＱＬ５、ＭＵＳ８１、ＥＭＥ１、ＳＰＯ１１又はＢＬＭの発現を亢進させることによって、ＳＣＡの病態は悪化することが明らかになった。さらに、ＣＨＫ１の発現又は活性を抑制することによって、ＳＣＡの病態は改善することも明らかになった。したがって、かかる知見に基づき、本発明は、下記スクリーニング方法も提供することができる。
　下記（ａ）及び（ｂ）の工程を含む、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物のスクリーニング方法
（ａ）ＣＨＫ１、ＬＩＧ３、ＦＥＮ１、ＬＩＧ１、ＥＲＣＣ５、ＸＡＢ２、ＥＲＣＣ２、ＤＭＣ１、ＲＥＣＱＬ５、ＭＵＳ８１、ＥＭＥ１、ＳＰＯ１１及びＢＬＭからなる群から選択される少なくとも一のタンパク質の機能を検出しうる系に被検化合物を適用させる工程、
（ｂ）該タンパク質の発現又は活性を抑制する化合物を選択する工程。
　これら本発明のスクリーニング方法の２つの態様において、使用する被検化合物としては特に制限はなく、前述の例が挙げられる。また、これらスクリーニング方法において用いられる、ＲＰＡ１等及びＣＨＫ１等は、各々上述の本発明の薬剤の有効成分（ｂ）及び（ｄ）に関する記載の通りである。
　これらスクリーニング方法の（ａ）の工程において用いられる「タンパク質の発現を検出しうる系」としては、例えば、各タンパク質をコードする遺伝子のプロモータ―領域の下流にレポーター遺伝子（ルシフェラーゼ遺伝子、ＣＡＴ遺伝子、ＧＦＰ遺伝子等）が機能的に結合したＤＮＡを有する細胞又はその細胞からの抽出液が挙げられる。ここで「機能的に結合した」とは、各遺伝子のプロモータ―領域に転写因子が結合することにより、レポーター遺伝子の発現が誘導されるように、各遺伝子のプロモーター領域とレポーター遺伝子とが結合していることをいう。そして、当該系に被検化合物を適用させ、レポーター遺伝子がコードするタンパク質の活性（ルシフェラーゼによる発光、クロラムフェニコールによるアセチル化、ＧＦＰタンパク質の蛍光等）を測定し、被検化合物の非存在下で検出した場合と比較して、検出される当該活性が高ければ、被検化合物は、各タンパク質の発現を促進する活性を有すると評価され、一方当該活性が低ければ、被検化合物は、各タンパク質の発現を抑制する活性を有すると評価されることになる。
　「タンパク質の発現を検出しうる系」の態様としては、前記レポーター系以外に、各タンパク質の発現を直接的に検出する系も挙げられる。当該系に関しては、各タンパク質を発現する細胞に被検化合物を適用させ、前記細胞における各タンパク質の発現を検出する。そして、被検化合物の非存在下で検出した場合と比較して、検出される各タンパク質の発現が高ければ、被検化合物は、各タンパク質の発現を促進する活性を有すると評価され、一方当該発現が低ければ、被検化合物は、各タンパク質の発現を抑制する活性を有すると評価されることになる。タンパク質の発現の検出に関し、タンパク質自体の発現を検出する場合には、ＥＬＩＳＡ法、ラジオイムノアッセイ、ウェスタンブロッティング法、免疫沈降法等を用いることができる。また、タンパク質の発現を転写レベルの遺伝子発現を通して検出する場合には、ノーザンブロッティング法、ＲＴ－ＰＣＲ法、ドットブロッティング法等を用いることができる。
　また、これらスクリーニング方法の（ａ）の工程において用いられる「タンパク質の活性を検出しうる系」は、当業者であれば、指標とするタンパク質のＤＮＡ修復における活性、及び当該活性の評価、測定方法についての情報を、文献データベース等（例えば、ＰｕｂＭｅｄ［ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｐｕｂｍｅｄ］）から適宜入手して参照しながら、構築することができる。かかる評価（測定）の例としては以下の通りである。
　指標とするタンパク質がＲＰＡ１である場合には、例えば、該タンパク質の一本鎖ＤＮＡへの結合を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｎａｔｕｒｅ、１９９７年１月９日、３８５巻、６６１２号、１７６～１８１ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＢＲＣＡ１である場合には、例えば、該タンパク質のＥ３ユビキチンライゲース活性を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（ＥＭＢＯ　Ｊ．、２００２年１２月１６日、２１巻、２４号、６７５５～６７６２ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＢＲＣＡ２である場合には、例えば、該タンパク質のＲＡＤ５１又はＰＡＬＢ２への結合を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｎａｔｕｒｅ、２００５年３月３１日、４３４巻、７０３３号、５９８－６０４ページ、Ｍｏｌ　Ｃｅｌｌ、２００６年６月２３日、２２巻、６号、７１９～７２９ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＰＮＫＰである場合には、例えば、ｏｌｉｇｏ（ｄＴ）を基質にしたポリヌクレオチドキナーゼ活性を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｊ　Ｂｉｏｌ　Ｃｈｅｍ．、１９９９年８月２０日、２７４巻、３４号、２４１７６～２４１８６ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＸＲＣＣ３である場合には、例えば、該タンパク質とＲＡＤ５１との結合を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｍｏｌ　Ｃｅｌｌ、１９９８年５月、１巻、６号、７８３～７９３ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＸＲＣＣ４である場合には、例えば、該タンパク質とライゲース４との結合、及び該タンパク質のＤＮＡ結合を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｃｅｌｌ、１９９５年１２月２９日、８３巻、７号、１０７９～１０８９ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＣＣＮＨである場合には、例えば、該タンパク質とＣＤＫ７との結合を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｎａｔｕｒｅ、１９９５年３月１６日、３７４巻、６５１９号、２８３～２８７ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＰＯＬＥである場合には、例えば、該タンパク質のＤＮＡ合成活性を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｐｒｏｃ　Ｎａｔｌ　Ａｃａｄ　Ｓｃｉ　ＵＳＡ、１９９０年９月、８７巻、１７号、６６６４～６６６８ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＰＯＬＨである場合には、例えば、該タンパク質のＤＮＡ合成活性若しくは該タンパク質とＲＡＤ５１との結合を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｍｏｌ　Ｃｅｌｌ、２００５年１２月９日、２０巻、５号、７８３～７９２ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＰＥＲ１である場合には、例えば、該タンパク質とＡＴＭ又はＣＨＫ２との結合を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｍｏｌ　Ｃｅｌｌ、２００６年５月５日、２２巻、３号、３７５～３８２ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＣＨＫ１である場合には、例えば、該タンパク質によるＣＤＣ２５Ａのリン酸化、又はそのリン酸化によって誘導されるＣＤＣ２５Ａの分解を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｓｃｉｅｎｃｅ、２０００年５月２６日、２８８巻、５４７０号、１４２５～１４２９ページ、Ｐｒｏｃ　Ｎａｔｌ　Ａｃａｄ　Ｓｃｉ　ＵＳＡ、２００２年１１月１２日、９９巻、２３号、１４７９５～１４８００ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＬＩＧ３である場合には、例えば、該タンパク質のライゲ―ション活性を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｍｏｌ　Ｃｅｌｌ　Ｂｉｏｌ．、１９９５年６月、１５巻、６号、３２０６～３２１６ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＦＥＮ１である場合には、例えば、５’末端突出構造を有する二本鎖ＤＮＡを基質とした、該タンパク質によるフラップ構造の除去活性を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｇｅｎｏｍｉｃｓ、１９９５年１月１日、２５巻、１号、２２０～２２５ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＬＩＧ１である場合には、例えば、該タンパク質のライゲ―ション活性を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｐｒｏｃ　Ｎａｔｌ　Ａｃａｄ　Ｓｃｉ　ＵＳＡ、１９９０年９月、８７巻、１７号、６６７９～８３ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＥＲＣＣ５である場合には、例えば、バブル構造を有する部分的二本鎖ＤＮＡを基質とし、該タンパク質のエンドヌクレアーゼ活性を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｎａｔｕｒｅ、１９９４年９月２９日、３７１巻、６４９６号、４３２～４３５ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＸＡＢ２である場合には、例えば、該タンパク質とＸＰＡ、ＣＳＡ、ＣＳＢ又はＲＮＡポリメラーゼＩＩとの相互作用を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｊ　Ｂｉｏｌ　Ｃｈｅｍ．、２０００年１１月１０日、２７５巻、４５号、３４９３１～３４９３７ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＥＲＣＣ２である場合には、例えば、該タンパク質とｐ４４との結合、又は該結合によって誘導される５’→３’ヘリケース活性を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｎａｔ　Ｇｅｎｅｔ．、１９９８年１０月、２０巻、２号、１８４～１８８ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＤＭＣ１である場合には、例えば、該タンパク質の一本鎖ＤＮＡ若しくは二本鎖ＤＮＡのギャップ構造への結合、又は該タンパク質とＲＡＤ５１との結合を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（ＥＭＢＯ　Ｊ．、１９９９年、１１月１５日、１８巻、２２号、６５５２～６５６０ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＲＥＣＱＬ５である場合には、例えば、該タンパク質とＲＡＤ５１との結合を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｇｅｎｅｓ　Ｄｅｖ．、２００７年１２月１日、２１巻、２３号、３０７３～３０８４ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＭＵＳ８１又はＥＭＥ１である場合には、例えば、ＭＵＳ８１及びＥＭＥ１からなる複合体が有するエンドヌクレアーゼ活性を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｊ　Ｂｉｏｌ　Ｃｈｅｍ．、２００３年６月１３日、２７８巻、２４号、２１７１５～２１７２０ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＳＰＯ１１である場合には、例えば、該タンパク質のタイプ２トポイソメラーゼ活性を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｎａｔｕｒｅ、２００５年８月１８日、４３６巻、７０５３号、１０５３～１０５７ページ　参照）。
　指標とするタンパク質がＢＬＭである場合には、例えば、該タンパク質とトポイソメラーゼIIIαとの結合を検出することによって、該タンパク質の活性を評価（測定）することができる（Ｊ　Ｂｉｏｌ　Ｃｈｅｍ．、２０００年３月３１日、２７５巻、１３号、９６３６～９６４４ページ、Ｈｕｍ　Ｍｏｌ　Ｇｅｎｅｔ．、２００１年６月１日、１０巻、１２号、１２８７～１２９８ページ　参照）。
　そして、このようにして得られた評価（測定）の結果に関し、被検化合物を適用させて検出した場合と被検化合物の非存在下で検出した場合とを比較することによって、当業者であれば、指標とする各タンパク質の活性の種類に応じ、当該被検化合物が当該タンパク質の活性を促進する化合物であるのか、又は抑制する化合物であるのかを判断することができる。
　なお、上記系への被検化合物の「適用」は、例えば、系が細胞である場合には、該細胞と被検化合物との接触、該細胞への被検化合物の導入等により行うことができる。また、系が細胞からの抽出液である場合には、該抽出液への添加により行うことができる。
　また、本発明のスクリーニング方法においては、上述のスクリーニング方法１、２又は３によって選択された化合物をＳＣＡモデル動物に投与し、そのモデル動物の症状の回復を指標として、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物をさらに絞り込むこともできる。ＳＣＡモデル動物としては、後述の実施例に示すように、例えば、ＳＣＡの原因遺伝子（ＡＴＸＮ１－８２Ｑ、ＡＴＸＮ１－８６Ｑ、ＡＴＸＮ１－１５４Ｑ等）を導入した動物（ショウジョウバエ、線虫、マウス、マーモセット等）が挙げられる。
　以下、実施例に基づいて本発明をより具体的に説明するが、本発明は以下の実施例に限定されるものではない。また、本実施例において用いた実験方法等は以下の通りである。
　＜ショウジョウバエについての免疫組織化学的解析＞
　雌のショウジョウバエ成体から吻、羽、脚及び腹部を除去し、残った頭部及び胸部を、４％パラホルムアルデヒド含有リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）に浸漬し、氷上にて３０分間固定した。固定したハエは、３０％スクロース含有ＰＢＳ中に、４℃にて一晩以上保管した。次に、頭部をドライアイス／ｎ－ヘキサンにて凍結させた後、クライオスタットミクロトームにて１０ｍｍ間隔の横断面を作製し、抗ヒストンＨ２Ａｖ　ｐＳｅｒ１３７抗体（Ａｃｒｉｓ社製、カタログ番号：ＡＰ０９３０７ＰＵ－Ｎ、ウサギ由来、２００分の１に希釈して使用）又は抗アタキシン－１（Ｈ２１）抗体（Ｓａｎｔａ　Ｃｒｕｚ社製、ヤギ由来、１００分の１に希釈して使用）と、Ａｌｅｘａ　Ｆｌｕｏｒ　４８８標識二次抗体又はＣｙ５－標識二次抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ社製、５０分の１に希釈して使用）とを用いて染色した。なお、全ての試料は、ＤＮＡ蛍光標識用の封入剤（製品名：ＶｅｃｔａＳｈｉｅｌｄ　ｗｉｔｈ　ＤＡＰＩ　Ｍｏｕｎｔｉｎｇ　Ｍｅｄｉｕｍ、Ｖｅｃｔｏｒ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ社製）に封入し、解析に供した。
　＜マウスについての免疫組織化学的解析＞
　Ａｔｘｎ１－１５４Ｑ－ＫＩ（ノックイン）ヘテロ接合体マウス（３２週齢）の新鮮な脳を、４％パラホルムアルデヒド含有リン酸緩衝液にて固定し、パラフィンにて包埋した。それら脳から調製した切片（厚さ：５～１０μｍ）をキシレンに浸して脱パラフィンし、さらにエタノールにて段階的に再水和した。次いで、切片を１０ｍＭクエン酸緩衝液（ｐＨ６．０）に浸け、電子レンジにて３回煮沸させた後、３０分間室温にて保持した。非特異的な結合を防ぐため、１％ウシ血清アルブミン及び０．０１％（Ｖ／Ｖ）ＴｒｉｔｏｎＸ－１００含有ＰＢＳにて３０分間インキュベーションした。このようにして調製したサンプルを１次抗体とともに４℃にて一晩インキュベーションした後、室温にて二次抗体とともに１時間インキュベーションした。次に、ＤＡＰＩにて２分間処理した後、脳由来のサンプルにフルオロマウントを載せ、さらにカバースリップにて覆った。そして、このようにして調製したサンプル中の細胞を、共焦点顕微鏡（Ｃａｒｌ　Ｚｅｉｓｓ社製、ＬＳＭ５１０）にて視覚化した。
　なお、免疫組織化学的解析に用いた一次抗体とそれら抗体の希釈条件は以下の通りである。
抗ＣＡＧ抗体（ＨＤ１、ウサギ由来、Ｄｒ．Ｗａｎｋｅｒから提供を受けたもの、１００分の１に希釈して使用）、
抗Ａｔｘｎ１抗体（１１ＮＱ、クローンＮ７６／８、マウス由来、Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ社製、１００分の１に希釈して使用）、
抗ＲｐＡ１抗体（Ｈ－７、ウサギ由来、Ｓａｎｔａ　Ｃｒｕｚ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ社製、１００分の１に希釈して使用）、
抗ＲｐＡ１抗体（マウスモノクローナル抗体、Ｃａｌｂｉｏｃｈｅｍ社製、１００分の１に希釈して使用）、
抗ＢＲＣＡ１抗体（Ｃ－２０、ウサギ由来、Ｓａｎｔａ　Ｃｒｕｚ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ社製、１００分の１に希釈して使用）、
抗ＢＲＣＡ２抗体（ａｂ１２３４９１、ウサギ由来、Ａｂｃａｍ社製、１００分の１に希釈して使用）、
抗Ｈ２ＡＸ　抗体（Ｓｅｒ１３９、マウス由来、Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ　社製、５００分の１に希釈して使用）。
　また、免疫組織化学的解析に用いた二次抗体とそれら抗体の希釈条件は以下の通りである。
Ａｌｅｘａ　Ｆｌｕｏｒ　４８８標識抗マウス抗体（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ　Ｐｒｏｂｅｓ社製、１０００分の１に希釈して使用）、
Ｃｙ３標識抗ウサギ抗体（Ｊａｃｋｓｏｎ　Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ社製、１０００分の１に希釈して使用）。
　＜ショウジョウバエについての免疫ブロッティング分析＞
　ウェスタンブロット用のサンプルを調製するため、６２．５ｍＭＴｒｉｓ／ＨＣｌ（ｐＨ６．８）、２％（ｗ／ｖ）ＳＤＳ、２．５％（ｖ／ｖ）２－メルカプトエタノール、５％（ｖ／ｖ）グリセリン及び０．００２５％（ｗ／ｖ）ブロモフェノールブルーからなる溶解用緩衝液５０μＬに、雌のハエ２５匹を溶かした。そして、得られたサンプルをＳＤＳ－ＰＡＧＥにて分画した後、イモビロン－Ｐトランスファーメンブレン（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ社製）に、セミドライ法により転写した。次に、そのメンブレンを、５％ミルク含有Ｔｗｅｅｎ２０（ＴＢＳＴ）（１０ｍＭＴｒｉｓ／Ｃｌ、ｐＨ８．０、１５０ｍＭＮａＣｌ及び０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０）にてブロッキング処理に施し、４℃にて一晩、一次抗体とともにインキュベーションした。免疫ブロッティング分析に用いた一次抗体とそれら抗体の希釈条件は以下の通りである。
マウス抗ＲＰＡ－７０（Ｈ－７、Ｓａｎｔａ　Ｃｒｕｚ社製、２００分の１に希釈して使用）、
マウス抗アクチン（Ｃ４、Ｃｈｅｍｉｃｏｎ社製、１０００分の１に希釈して使用）。
　次に、前記メンブレンを、西洋ワサビぺルオキシダーゼ（ＨＲＰ）標識抗マウスＩｇＧ（ＧＥ　Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ社製）を１００００分の１に希釈したものとともに、室温にて１時間インキュベーションした。そして最後に、増強化学発光ＷＢ検出システム（ＥＣＬ、ＧＥ　Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ社製）にて、目的とする分子を視覚化した。
　＜初代神経細胞についての免疫ブロッティング分析＞
　ウェスタンブロッティング用のサンプルを調製するため、後述のプラスミドＤＮＡを導入してから４日間培養した小脳顆粒神経細胞を回収した。回収した神経細胞サンプルを、氷冷ＰＢＳにて３回洗浄し、６２．５ｍＭＴｒｉｓ／ＨＣｌ（ｐＨ６．８）、２％（ｗ／ｖ）ＳＤＳ、２．５％（ｖ／ｖ）２－メルカプトエタノール及び５％（ｖ／ｖ）グリセリンからなる溶解用緩衝液に溶かした。このようにして調製した溶液中のタンパク質の濃度は、マイクロＢＣＡタンパク質アッセイ試薬キット（Ｐｉｅｒｃｅ　Ｃｈｅｍｉｃａｌ社製）を用い、ＢＣＡ法にて定量した。
　免疫ブロッティング分析の際の、一次及び二次抗体、並びにそれらの希釈条件は以下の通りである。
マウス抗リン酸化ヒストンＨ２ＡＸ（γＨ２ＡＸ）（Ｓｅｒ－１３９、Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ社製、７５０分の１に希釈して使用）、
抗マウスポリグルタミン（ＩＣ２）抗体（ＭＡＢ１５７４、Ｃｈｅｍｉｃｏｎ社製、２０００分の１に希釈して使用）、
抗ヤギＡｔｘｎ１抗体（Ｈ－２１、Ｓａｎｔａ　Ｃｒｕｚ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ社製、１０００分の１に希釈して使用）、
マウス抗グリセルアルデヒドリン酸デヒドロゲナーゼ抗体（ＧＡＰＤＨ、Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ社製、１００００分の１に希釈して使用）、
西洋ワサビぺルオキシダーゼ（ＨＲＰ）標識抗マウスＩｇＧ抗体（ＧＥ　Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ、Ａｍｅｒｓｈａｍ社製）、
ＨＲＰ標識抗ヤギＩｇＧ抗体（Ｄａｋｏ社製、３０００分の１に希釈して使用）。
なお、各抗体の希釈は、５％スキムミルク含有ＴＢＳＴ（Ｔｗｅｅｎ－２０含有トリス緩衝食塩水）にて行った。
　＜ハエのストックと養育条件＞
　全てのハエは、コーンミール培地（９．２％コーンミール、３．８５％酵母、３．８％スクロース、１．０５％酒石酸カリウム、０．０９％塩化カルシウム、７．６％グルコース、２．４１６％ニパギン及び１％アガー）にて育てた。また、特に断りのない限り、全てのハエは、２５℃、湿度６０％±１０％、１２時間毎の明暗周期下にて維持した。
　後述のＧＳ系統バエは、京都のショウジョウバエ遺伝資源センターより入手した。なお、トランスジェニックバエｈＡｔｘｎ１－８２Ｑ（ｙ１ｗ１１１８ＵＡＳ：Ａｔｘｎ１－８２Ｑ）、ＵＡＳ－ｍＫｕ７０及びＯＫ６－Ｇａｌ４、並びにそれらの遺伝的コントロール株Ｃａｎｔｏｎｉｓｅｄ　ｗ１１１８株ｗ（ＣＳ１０）は、非特許文献１９及び４４の記載を参照のこと。また、Ｃａｎｔｏｎｉｓｅｄ　ｗ１１１８株ｗ（ＣＳ１０）は、全てのトランスジェニックバエの親株である。また、ＲＮＡｉ系統　ＲｐＡ７０（９６３３Ｒ－３）及びｇｒｐ（１７１６１Ｒ－２）は、三島の国立遺伝学研究所から入手した。
　各交配用の処女雌の回収は羽化後８時間以内に行い、交配に用いる迄の３～４日間各バイアルあたり最大数２０匹になるよう維持した。
　後述の生存期間に関する実験においては、ｙ１ｗ１１１８ＵＡＳ－Ａｔｘｎ１－８２Ｑ／＋；＋／ＯＫ６－ＧＡＬ４；＋／＋の遺伝型のハエを陽性対照とし、ｙ１ｗ１１１８ＵＡＳ－Ａｔｘｎ１－８２Ｑ／＋；＋／＋；＋／＋及び＋／＋；＋／ＯＫ６－ＧＡＬ４；＋／＋の遺伝型のハエを陰性対照とした。また、全てのハエは処女雌を用いた。
　＜ＤＮＡ損傷修復遺伝子を対象とした、ＳＣＡの病態に寄与する因子のスクリーニング方法＞
　先ず、後述のスクリーニングの対象とする、ヒトＤＮＡ損傷修復遺伝子のショウジョウバエにおける相同遺伝子を抽出した。すなわち、ＤＮＡ損傷修復に関する利用可能なショウジョウバエ相同遺伝子を抽出するため、最新のヒトＤＮＡ修復遺伝子に関する包括的なリスト（テキサス州立大学ＭＤアンダーソンがんセンターのＷｏｏｄ　ＲＤらにより公開されているヒトＤＮＡ修復遺伝子に関するリスト（ｈｔｔｐ：／／ｓｃｉｅｎｃｅｐａｒｋ．ｍｄａｎｄｅｒｓｏｎ．ｏｒｇ／ｌａｂｓ／ｗｏｏｄ／ｄｎａ＿ｒｅｐａｉｒ＿ｇｅｎｅｓ．ｈｔｍｌ）において入手可能なヒトＤＮＡ修復遺伝子）と、ＮＣＢＩ　ＨｏｍｏｌｏＧｅｎｅとを比較した。
　次に、前記ＤＮＡ損傷修復に関するショウジョウバエ相同遺伝子について、ＦｌｙＢａｓｅ（ｈｔｔｐ：／／ｆｌｙｂａｓｅ．ｏｒｇ／）を検索し、当該遺伝子を過剰発現させたショウジョウバエを、ショウジョウバエ遺伝資源センターが提供しているジーンサーチ（ＧＳ）システムによって作製された変異体群から選択することにより用意した。
　なお、ＧＳシステムは、ショウジョウバエにおいて遺伝子を効率的に検出し、迅速に分子を同定するための方法であり、該方法において、Ｐ因子を基にするＧＳベクターは、ＵＡＳ、コアプロモーター及びマーカー遺伝子「ミニホワイト」を有し、ショウジョウバエゲノムにランダムに挿入されることになる。そして、標的遺伝子（本スクリーニングにおいては、ＤＮＡ修復遺伝子）の側にＰ因子が挿入され、そのＰ因子が挿入されたＧＳ系統のトランスジェニックバエとＧＡＬ４ドライバーを有するハエとを交配させることによって、その遺伝子の過剰発現が引き起こされているハエを得ることができる（Ｔｏｂａ，Ｇ．ら、Ｇｅｎｅｔｉｃｓ、１９９９年、１５１巻、７２５～７３７ページ　参照）。
　そのために、前記ＧＳ系統と交配させるＳＣＡ１モデルバエは、ＳＣＡ１の病因であるヒトＡｔｘｎ１８２Ｑ（ｈＡｔｘｎ１８２Ｑ）遺伝子のみならず、ＯＫ６－ＧＡＬ４ドライバーをも導入し、調製した。
　そして、このようにして調製した前記ＧＳ系統と、ＳＣＡ１モデルバエとを交配して得られたショウジョウバエについて、ＳＣＡ１の病態の一つである生存期間の短さを指標としてスクリーニングを行った。
　すなわち、生存期間に関する実験は、２５℃、湿度６０±１０％、１２時間毎の明暗周期下、最終世代を創出するために用いた同じコーンミール培地にて行った。また、実験に供したハエは、選択を目的とし、それらが生まれた日にのみエーテル麻酔をかけた。さらに、１バイアルあたり２０匹になるようハエを維持し、２～３日毎に新しい培地に移した。そして、２～３日毎に死んだハエを数えながら除去し、この実験を独立して２～３回行った。なお、逃げたハエは実験の対象外として除外した。また、このようにして得られたデータに基づき、生存期間の中央値及び平均値を算出し、当該数値を指標として、前記ＤＮＡ損傷修復遺伝子がＳＣＡの病態に与える影響の有無について評価した。
　＜システム生物学的解析＞
　後述のシステム生物学的解析は、ヒトデータベースに基づくインジェヌイティー－ＩＰＡソフトウェア（Ｉｎｇｅｎｕｉｔｙ　Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｉｎｃ．社製）を用いて行った。なお、経路探索分析（最短＋１（ｓｈｏｒｔｅｓｔ＋１））において、２遺伝子が同様の新規分子とつながりをもった際に、新規経路が現れることになる。
　また、前述のインビボスクリーニングで見出された遺伝子を高頻度で含むシグナル伝達経路を推定するため、インビボスクリーニングで見出された遺伝子及び経路探索分析についてコア分析を行った。さらに、ｑ値を算出するため、Ｂ－Ｈ多重検定補正とともにフィッシャーの正確確率検定を行うことによって、エンリッチメント解析を行った。なお、コア分析を行うため、タンパク質間相互作用（ＰＰＩ）に関する有名な８つのデータベース（ＢＩＮＤ、ＢＩＯＧＲＩＤ、Ｃｏｇｎｉａ、ＤＩＰ、ＩＮＴＡＣＴ、Ｉｎｔｅｒａｃｔｏｍｅ　ｓｔｕｄｉｅｓ、ＭＩＮＴ及びＭＩＰＳ）と、研究論文に基づくインジェヌイティーのオリジナルデータベース「間接的相互作用」（ｍｉＲｅｃｏｒｄｓ、ＴａｒＢａｓｅ、ＴａｒｇｅｔＳｃａｎ　Ｈｕｍａｎ、Ｃｌｉｎｉｃａｌ　Ｔｒｉａｌｓ．ｇｏｖ、Ｇｅｎｅ　Ｏｎｔｏｌｏｇｙ、ＧＶＫ　Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ、ＫＥＧＧ、ｍｉＲＢａｓｅ、ＭＧＤ、Ｏｂｅｓｉｔｙ　Ｇｅｎｅ　Ｍａｐ　Ｄａｔａｂａｓｅ）とを用いた。
　＜プラスミドの調製＞
　ｐＤｓＲｅｄ－モノマーＣ１、Ａｔｘｎ１－８６Ｑ－ｐＤｓＲｅｄ、ｍｙｃ－Ａｔｘｎ１－３３Ｑ及びｍｙｃ－Ａｔｘｎ１－８６Ｑについては、Ｆｕｊｉｔａ，Ｋ．ら、Ｎａｔ　Ｃｏｍｍｕｎ、２０１３年、４、１８１６　参照のこと。
　ＥＧＦＰ－ＲｐＡ１構築のため、Ｂ６野生型マウス胎児脳由来のＲＮＡを用い、ＲｐＡ１全長をコードするｃＤＮＡ断片をＰＣＲにて増幅し、ｐＬＶＳＩＮ－ＣＭＶ－ｐｕｒ（Ｔａｋａｒａ社製）のＥｃｏＲＩ認識部位とＸｈｏＩ認識部位との間に挿入し、サブクローニングした。また、前記同様に、前記ｃＤＮＡ断片をｐＥＧＦＰ－Ｃ１（Ｔａｋａｒａ社製）のＥｃｏＲＩ認識部位とＢａｍＨＩ認識部位との間に挿入し、サブクローニングした。
　＜レーザーマイクロ照射＞
　レーザーマイクロ照射及びＤＮＡ損傷領域からのシグナルの取得は、Ｆｕｊｉｔａ，Ｋ．ら、Ｎａｔ　Ｃｏｍｍｕｎ、２０１３年、４、１８１６に記載の方法に基づき行った。すなわち、２５ｍｍカバースリップ上にて培養したＵ２ＯＳ細胞に、ｐＤｓＲｅｄ－モノマーＣ１又はＡｔｘｎ１－８６Ｑ－ｐＤｓＲｅｄと、ＲｐＡ１－ＥＧＦＰとを導入した。導入してから２４時間後に、ＤＮＡ二重鎖切断（ＤＳＢｓ）を導入し易くするよう、細胞を２μＭのヘキスト３３２５８（Ｄｏｊｉｎｄｏ社製）にて２０分間処理した。ソフトウェア（ＡＩＭ４．２、Ｃａｒｌ　Ｚｅｉｓｓ社製）を備えた顕微鏡（ＬＳＭ５１０ＭＥＴＡ、Ｃａｒｌ　Ｚｅｉｓｓ社製）を用い、細胞の核に位置する長方形の形をした領域にＵＶを照射した（最大パワー：３０ｍＷ、レーザー出力：７５％、波長：４０５ｎｍ、反復：５、ピクセル時間：１２μ秒、ズーム６）。そして、３０秒毎に低速度撮影の画像を得た。また、白化した領域と完全に一致した関心領域（ＲＯＩ）をＡｄｏｂｅフォトショップＣＳ３にて決定した。そして、ＲＯＩにおけるＲｐＡ１のピクセルあたりのシグナル強度の平均値を得た。シグナル強度は、非照射領域におけるそれに基づき正規化した。そのデータは、正規化蛍光ユニット（ｎｏｒｍａｌｉｚｅｄ　ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ　ｕｎｉｔｓ）として示す。
　＜ｈＳＣＡ１ショウジョウバエに対する化学療法＞
　ＣＨＫ１に対する特異的阻害剤　ＣＨＩＲ－１２４（ＡＸＯＮ　ＭＥＤＣＨＥＭ社製）を１Ｎ塩化水素に５ｍｇ／ｍＬになるよう溶解させ、０．０５Ｎ溶液にて複数の濃度になるよう希釈した。この溶液３ｍＬをショウジョウバエの培地１ｇに、図２９に示す最終濃度になるよう添加した。なお、この際に使用した培地は、インスタントショウジョウバエ培地Ｄ７６７０（Ｓｉｇｍａ　Ａｌｄｒｉｃｈ社製）及びフォーミュラ　４－２４インスタントショウジョウバエ培地（Ｃａｌｏｌｉｎａ社製）を１対１にて混合したものである。対照として、０．０５　Ｎの塩化水素溶液を等量添加した培地も用意した。
　＜免疫沈降（ＩＰ）＞
　Ｈｅｌａ細胞（２×１０６）を１０ｃｍディッシュに播種し、リポフェクトアミン２０００（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ社製）を用い、その取り扱い説明書に従って、後述のタンパク質を発現させるためのプラスミドをトランスフェクションした後、３６時間インキュベーションした。ＰＢＳにて２回洗浄した後、ディッシュより細胞を回収し、２ｍＬのＴＮＥ緩衝液（１０ｍＭＴｒｉｓ－ＨＣｌ、ｐＨ７．５、１５０ｍＭＮａＣｌ、１ｍＭエチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ）、１％Ｎｏｎｉｄｅｔ　Ｐ－４０）中にてホモジェナイズした。そして、４℃にて回転させながらインキュベーションした。回転を開始してから３０分後、１×１０４ｇにて２０分間遠心して、上清を回収した。回収した上清をプロテインＧアガロースビーズ（ＧＥ　Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ社製）とともに、４℃にて回転させながら２時間インキュベーションした。ビーズを取り除いた後、溶解物を２～１０μｇの抗Ｍｙｃ抗体、抗ＲｐＡ１抗体、抗ＢＲＣＡ１抗体又は抗ＢＲＣＡ２抗体とともに４℃にて回転させながら一晩インキュベーションした。さらに、その後プロテインＧアガロースビーズとともに２時間インキュベーションした。ビーズをＴＮＥ緩衝液５００μＬにて３回洗浄した後、ＳＤＳポリアクリルアミドゲル泳動用サンプルバッファーに溶解し、ＳＤＳ－ＰＡＧＥにて分画した後、ウェスタンブロッティングに供した。
　また、マウス（２０週齢）の脳をＴＮＥ緩衝液中にてホモジェナイズし、４℃、２，０００×ｇにて１分間遠心した。そして、得られた上清を用い、前記Ｈｅｌａ細胞と同様の方法にて免疫沈降を行った。
　なお、抗ＲｐＡ１抗体（Ｈ－７、Ｓａｎｔａ　Ｃｒｕｚ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ社製、２０分の１に希釈して使用）又は抗Ａｔｘｎ１抗体（１１ＮＱ、クローンＮ７６／８、Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ社製、１００分の１に希釈して使用）とともに、４００μｇのタンパク質をインキュベーションした。
　また、ウェスタンブロッティングにおいては、一次抗体として、
抗Ｍｙｃ抗体（９Ｅ１０、Ｓａｎｔａ　Ｃｒｕｚ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ社製、５００分の１に希釈）、
抗ＲｐＡ１抗体（Ｈ－７、Ｓａｎｔａ　Ｃｒｕｚ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ社製、１００分の１に希釈）、
抗ＲｐＡ１抗体（Ｂ－１０、Ｓａｎｔａ　Ｃｒｕｚ　Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ社製、１０００分の１に希釈してマウスのサンプルに対して使用）、
抗ＢＲＣＡ１／２抗体（Ａｂｃａｍ社製、２０００分の１に希釈）、
抗Ａｔｘｎ１抗体（１１ＮＱ、クローンＮ７６／８、Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ社製、２０００分の１に希釈）を用いた。また、ＨＲＰ標識抗マウスＩｇＧ又はＨＲＰ標識抗ウサギＩｇＧ（Ａｍｅｒｓｈａｍ社製）は、３０００分の１に希釈して使用した。
　＜ＳＣＡ１モデルマウスに対する遺伝子治療＞
　ＳＣＡ１モデルマウスとして、Ａｔｘｎ１－１５４Ｑ－ＫＩマウスを用い、該マウスの小脳においてＲＰＡを過剰発現させることにより、その治療効果を評価した。
　すなわち先ず、ヒト最初期プロモーター（ＣＭＶプロモーター）、ヒト成長ホルモン第１イント及びＲＰＡをコードするｃＤＮＡ、ウッドチャック肝炎ウイルス転写後調節エレメント（ＷＰＲＥ）及びＳＶ４０のｐｏｌｙＡシグナル配列をこの順に含む発現カセットが、ＡＡＶ３ゲノムの逆位末端配列に挿入されてなる、アデノウィルス随伴ウィルス（ＡＡＶ）ベクター（以下、ＲＰＡ１－ＡＡＶとも称する）を常法に従って作製した。なお、このベクターのトランスフェクション及び精製は、Ｌｉ　ＸＧ.ら、Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．、２００６年、１巻、１６０～１６６ページに記載の方法に沿って行った。
　そして、このようにして調製して得られたウィルスベクターを、以下に記載の方法にてＡｔｘｎ１－１５４Ｑ－ＫＩマウスの小脳表面に注入した。５週齢の当該マウスにネンブタ―ルを腹腔内投与することにより麻酔し、定位固定装置（Ｎａｒｉｓｈｉｇｅ社製）上に固定した。該マウスの前頭を２０度傾け、ＥＬＡ棒鋼（Ｓｈｏｆｕ社製）を用い、ブレグマから－９．２ｍｍ、正中から±０ｍｍの側部に直径１ｍｍの穴を開けた。次いで、当該骨に空けた穴の外表面より３．５ｍｍ、後頭骨の内側面に沿ってガラスシリンジを挿入した。そして、ＲＰＡ１－ＡＡＶのウィルス溶液（～１×１０１２粒子数）８μＬを、計４回異なる位置（前方から後方にかけ時計回りに６０度、９０度、２７０度及び３３０度の位置）に、各２μＬずつマイクロポンプ（Ｎａｒｉｓｈｉｇｅ社製）を用いて０．５μＬ／分にて、注入した。この方法により、小脳表面にウィルスベクターの効率的な供給を再現性良く行うことができる、また、陰性対照群として、ＲＰＡの代わりにＧＦＰをコードするｃＤＮＡが挿入されたＡＡＶベクター（以下、ＧＦＰ－ＡＡＶとも称する）を、小脳表面に注入したＡｔｘｎ１－１５４Ｑ－ＫＩマウスも、前記同様に調製した。
　＜マウスの行動試験＞
　マウスは、性別毎に各ケージ２～５匹ずつ入れ、水とげっ歯類用資料とを与え、１２時間毎の明暗サイクル下にて飼育し、維持した。全ての試験は、明期（１０～１９時の間）に５～４０週齢の雄マウスを用いて行った。
　ロータロッド試験においては、マウスをロータロッド（回転速度：３．５ｒｐｍ）上に置き、３００秒間で回転速度を直線的に３５ｒｐｍまで上げ、その後６００秒まで一定速度（３５ｒｐｍ）を保った。この試験は、１日４回、３日間連続して行い、ロータロッドから落ちるまでの平均時間を各試験日毎に算出した。
　（実施例１）
　＜脊髄小脳変性症（ＳＣＡ）におけるＤＮＡ損傷についての検証＞
　ＤＮＡ二重鎖切断（ＤＳＢ）型のＤＮＡ修復において重要な分子であるＫｕ７０によって、ヒトハンチントン疾患（ＨＤ）のショウジョウバエモデル（ＵＡＳ－Ｈｔｔ１０３Ｑ／＋：ＯＫ６－ＧＡＬ４／＋ショウジョウバエ）において短縮されている生存期間が回復され、さらには運動行為も改善されることが、本発明者らによって明らかにされている（Ｔａｍｕｒａ，Ｔ．ら、ＰＬｏＳ　Ｏｎｅ、２０１１年、６、ｅ２７４０８　参照）。また、ＤＳＢ型のＤＮＡ修復に関与する他の分子ＴＥＲＡ／ＶＣＰ／ｐ９７は多種多様なポリグルタミン疾患においてその機能を阻害されており、またこのタンパク質を補充することによってショウジョウバエモデルの症状が回復されることも、本発明者らによって明らかにされている。さらには、脊髄小脳変性症１型（ＳＣＡ１）マウスモデルの小脳ニューロンにおいてＤＳＢが増加していることが、本発明者らによって明らかにされている（Ｆｕｊｉｔａ，Ｋ．ら、Ｎａｔ　Ｃｏｍｍｕｎ、２０１３年、４、１８１６　参照）。
　このように、ポリグルタミン鎖の異常な伸長を病因とするＳＣＡやハンチントン疾患等のポリグルタミン疾患と、ＤＮＡ損傷とは関連していることが示唆されている。さらには、その損傷修復に関わる因子によってハンチントン疾患等の症状は回復されることも、本発明者らによって示されている。また、ＤＳＢは多種多様なＤＮＡ損傷カスケードにおいて、通常最終的に生じるＤＮＡ損傷であることも知られている（Ｂｏｈｇａｋｉ，Ｔ．ら、Ｇｅｎｏｍｅ　Ｉｎｔｅｇｒ、２０１０年、１、１５、Ｍｌａｄｅｎｏｖ，Ｅ．ら、Ｍｕｔａｔ　Ｒｅｓ、２０１１年、７１１巻、６１～７２ページ、Ｎｏｗｏｓｉｅｌｓｋａ，Ａ．ら、ＤＮＡ　Ｒｅｐａｉｒ（Ａｍｓｔ）、２００８年、７巻、４８～５６ページ　参照）。
　そこで、かかる知見を鑑み、ＳＣＡの治療又は予防に有効な分子を探索するための足がかりを得るべく、先ずは、哺乳動物の小脳ニューロンに変異型ＡＴＸＮ１を発現させ、ＤＳＢ型のＤＮＡ損傷が生じるかを確認した。
　すなわち、Ａｔｘｎ１－１５４Ｑノックインマウスにおいて、ＤＳＢのマーカーであるヒストン２Ａ（Ｈ２ＡＸ）の１３９番目のセリンのリン酸化について解析した。その結果、図１に示す通り、プルキンエ細胞及び顆粒細胞において、沢山の小さな斑点状のシグナルが観察された。また、Ｈ２ＡＸリン酸化は、Ａｔｘｎ１－１５４Ｑノックインマウスはその症状を示す前から亢進していることが明らかになった（図２及び３　参照）。
　（実施例２）
　＜ＳＣＡ１モデルショウジョウバエを利用したスクリーニング＞
　次に、ＳＣＡの発症においてどのタイプのＤＮＡ修復カスケードが関与しているのかを同定すべく、スクリーニング系の構築を行った。スクリーニング系の構築にあたり、多種多様な因子及びそれら因子が関与するネットワークを対象として、適切に候補を絞り込むため、世代時間が短く、表現型を定量的に評価できるショウジョウバエに本発明者は着目した。なお、本発明者は、従前の研究成果に基づき、ショウジョウバエのＳＣＡ１モデルの病状と哺乳動物のＳＣＡ１モデルのそれとは似ていることを見出している。
　そこで、ショウジョウバエのＳＣＡ１モデルにおいても、前記マウス同様に、ＤＳＢ型のＤＮＡ損傷が亢進していることを先ずは確認した。すなわち、ＯＫ６－Ｇａｌ４／ＵＡＳシステムによりヒトＡｔｘｎ１－８２Ｑを運動神経において発現しているトランスジェニックハエを解析した結果、ショウジョウバエのＨ２ＡＸホモログであるＨ２Ａｖのリン酸化が亢進していることが確認された（図４及び５　参照）。なお、腹神経索（ＶＮＣ）において、ＯＫ６により誘導されＤｓＲｅｄを発現している細胞においてγＨ２Ａｖ由来の強いシグナルが観察され、ＤｓＲｅｄとγＨ２Ａｖとの局在は一致していることも明らかになった（図４　参照）。また、ＯＫ６により誘導されＤｓＲｅｄを発現している細胞において、実際に変異型Ａｔｘｎ１が発現していることも確認された（図５　参照）。
　前述の通り、ＤＳＢ型のＤＮＡ損傷は、一本鎖ＤＮＡ切断（ＳＳＢ）及び酸化的塩基損傷といった他のタイプのＤＮＡ損傷の最終段階である。したがって、そのことと上記結果とを併せ考えるに、ショウジョウバエのＳＣＡ１モデルは、ＳＣＡの病態に寄与するＤＮＡ損傷修復カスケードを探索するための有効なツールになり得ると判断し、当該モデルショウジョウバエを利用したインビボスクリーニングを行った。
　すなわち、利用可能な全てのＤＮＡ修復に関するショウジョウバエ相同遺伝子を各々
ショウジョウバエのＳＣＡ１モデルにおいて過剰発現させ、該モデルショウジョウバエの症状の一つである生存期間の短さへの影響を指標として、短期間かつ定量的な解析を可能とするスクリーニングを行った。スクリーニングの対象としたヒトＤＮＡ修復遺伝子と、それらのショウジョウバエ相同遺伝子との関係を表１に示す。
　また、ヒトＡｔｘｎ１－８２ＱとＧＳ系統のカセットによって発現が誘導されるＤＮＡ損傷修復遺伝子とを共発現させているハエ（ＯＫ６＞Ａｔｘｎ１－８２Ｑ；ＧＳ）の生存期間の平均値を、表２に示す。また、表２においては、陽性対照であるＵＡＳ－Ａｔｘｎ１－８２Ｑ／＋：ＯＫ６－ＧＡＬ４／＋（ＯＫ６＞Ａｔｘｎ１－８２Ｑ）との差異を判定するために、ウイルコクスン順位和検定を用い算出したＰ値も併せて示す。
　また、表１及び２において、「ＢＥＲ」は塩基除去修復に関連する遺伝子であることを示し、「ＮＥＲ」はヌクレオチド除去修復に関連する遺伝子であることを示し、「ＤＳＢＲ」はＤＮＡ二重鎖切断修復に関連する遺伝子であることを示し、「ＤＳＢＲ＋ＣＬＲ」はＤＮＡ二重鎖切断修復及びＤＮＡクロスリンク修復に関連する遺伝子であることを示し、「ＭＭＲ」はミスマッチ除去修復に関連する遺伝子であることを示す。なお、多機能を有するＲＰＡ１は暫定的にＮＥＲに分類してある。
　また、図には示さないが、このインビボスクリーニングの系において、陽性対照であるＵＡＳ－Ａｔｘｎ１－８２Ｑ／＋：ＯＫ６－ＧＡＬ４／＋（ＯＫ６＞Ａｔｘｎ１）は、陰性対照であるＡｔｘｎ１／＋又はＯＫ６／＋と比較して、生存期間が短いことを確認している。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000001
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000002
　このインビボスクリーニングを行った結果、表２に示す通り、ＰＮＫＰ、ＲｐＡ１、Ｓｐｎ－Ｂ、ＸＲＣＣ４、ＤＮＡポリメラーゼイータ、ＤＮＡポリメラーゼイプシロン、ＣｙｃＨ又はＰｅｒを過剰発現させることによって、ＳＣＡ１モデルバエの生存期間における短縮は回復されることが明らかになった。また、図には示さないが、これら遺伝子の殆どにおいて、ハエ成体の幼年期（ｙｏｕｎｇ　ｓｔａｇｅ）から熟年期（ａｇｅｄ　ｓｔａｇｅ）にかけて生存率が改善することも明らかになった。例えば、２１日目において、陽性対照バエ（ＵＡＳ－Ａｔｘｎ１－８２Ｑ／＋：ＯＫ６－ＧＡＬ４／＋）の生存率は７５％であるのに対し、Ｓｐｎ－Ｂ過剰発現系統は８５％、ＸＲＣＣ４／ＣＧ１２７２８過剰発現系統は９２％、ＤＮＡポリメラーゼイータ過剰発現系統は８６％、ＣｙｃＨ過剰発現系統は８３％というように、高い生存率を示した。さらに、それらの生存率は３０日以降も依然として、ＳＣＡ１モデルバエのそれよりも高いままであった。また、図には示さないが、ＲｐＡ１、Ｐｅｒ、Ｓｐｎ－Ｂ又はＸＲＣＣ４／ＣＧ１２７２８によって、生存期間の最大値も顕著に延長されることも明らかになった。
　一方、予期せぬことに、ＳＣＡ１モデルバエの生存期間をさらに短くする１２の遺伝子、Ｌｉｇ１、Ｌｉｇ３、Ｆｅｎ１、ｃｈｒａｃ－１４、ＸＡＢ２、Ｘｐｄ、ＣＧ８８４１、ＲｅｃＱ５、ｍｕｓ８１、ＥＭＥ１、ｍｅｉＷ６８、ｍｕｓ３０９／ＢＬＭ／ＲｅｃＱ２及びｇｒｐも同定された。なお、ＣＧ８８４１（ＤＭＣ１）過剰発現の例においては、成体バエが得られないほど毒性（ｔｏｘｉｃ）が強く、生存期間は極めて短かった。
　また、ＲｅｃＱファミリータンパク質は、細菌からヒトに至るまで高度に保存されており、３’－５’ＤＮＡヘリカーゼ活性を有することが知られている。ヒトＲｅｃＱ１の５つのメンバー（ｍｕｓ３０９／ＢＬＭ／ＲｅｃＱ２、ＷＲＮ／ＲｅｃＱ３、ＲｅｃＱ４及びＲｅｃＱ５）のうち、生存期間に悪影響を及ぼしたＲｅｃＱタンパク質は２つあった。特に、ＲｅｃＱ５はＤＮＡ鎖アニーリング活性を示す。さらにはその活性はＲｐＡ１によって阻害されることも示されており（Ｇａｒｃｉａ，Ｐ．Ｌ．、ＥＭＢＯ　Ｊ、２００４年、２３巻、２８８２～２８９１ページ　参照）、ＲｅｃＱ５と前述のＲＰＡ１とが逆の作用を示したことと一致している。
　また、前述の通り、本発明者らによって、変異ハンチンチントランスジェニックバエにおける生存期間の短縮は、Ｋｕ７０によって回復することが明らかになっている。しかしながら、このインビボスクリーニングにおいて、Ｋｕ７０の相同遺伝子を発現しているＩｒｂｐ　ＧＳ系統は、ＵＡＳ－Ａｔｘｎ１－８２Ｑ／＋：ＯＫ６－ＧＡＬ４／＋ショウジョウバエモデルにおける生存期間の短縮を有意に回復させることはなかった。しかしながら、図には示さないが、ヒトＫｕ７０を共発現させたトランスジェニックバエにおいては、若干ではあるが、はっきりと生存時間に好影響を与えることを確認している。このようなハンチントン病及びＳＣＡに対するＫｕ７０の矛盾した効果から、２つのポリグルタミン疾患において、ＤＮＡ損傷修復に用いられる分子が量的にも質的にも異なっていることが示唆される。
　（実施例３）
　＜システム生物学による、ＳＣＡの病態に関与するＤＮＡ修復ネットワークの解明＞
　次に、システム生物学を用い、前記スクリーニングの結果を解析した。すなわち、ＳＣＡ１モデルバエにおいて、生存時間の短縮又は延長を誘導する中心的な分子ネットワークを同定するため、ＤＮＡ修復遺伝子による回復についての定量的データと、タンパク質間相互作用（ＰＰＩ）データ（ＢＩＮＤ、ＢＩＯＧＲＩＤ、Ｃｏｇｎｉａ、ＤＩＰ、ＩＮＴＡＣＴ、Ｉｎｔｅｒａｃｔｏｍｅ　ｓｔｕｄｉｅｓ、ＭＩＮＴ及びＭＩＰＳ）とを統合した。また、同時に、ＳＣＡ１のショウジョウバエモデルの生存期間に影響するネットワークを構成する新規分子の探索を試みた。より具体的には、前記目的のため、２つのタイプのアルゴリズムを用いた。
　第一のアルゴリズムを用いて作成されたネットワーク１においては、２つの遺伝子産物が生存期間に直接影響を与える場合（セグメント１）に、または２つの遺伝子産物が他のタンパク質を介して生存期間に影響を与える場合（セグメント２）に、タンパク質間インタラクトーム（ＰＰＩ）データベースからタンパク質経路を選択した。また、ネットワーク１のマップにおいて、より多くのタンパク質と結合しているタンパク質をより中心に近付くよう配置した。さらに、この分析において、決定遺伝子（ｄｅｔｅｒｍｉｎａｎｔ　ｇｅｎｅｓ）はネットワークの外縁に位置することになる。
　第二のアルゴリズムを用い作成されたネットワーク２において、生存期間に影響を与えるタンパク質が、１～３のトライアングルタンパク質経路の構成要素である場合に、ＰＰＩデータベースから閉じられたトライアングル経路を選択した。また、可能である場合には、生存期間に影響期間を与える残りのタンパク質も推定ネットワークとつながりをもたせた。
　そして、これら２つのネットワークを用い、前述のインビボスクリーニングによって単離されたＤＮＡ損傷修復関連遺伝子において、生存期間を延長させる遺伝子及び生存期間を短縮させる遺伝子における機能的な相互作用について解析した。
　その結果、図６に示す通り、ネットワーク１を作成するためのアルゴリズムは、生存期間延長に寄与する重要な遺伝子群を強調するのに役立った。すなわち、この生存期間延長に関するネットワーク１（２セグメント）において、ＲＰＡ１は中心に位置し、多種多様なＤＮＡ損傷修復又は転写に関するタンパク質とつながりをもっていることが明らかになった。また、ＲＰＡ１とつながりのある遺伝子を、特定のタイプのＤＮＡ修復又は転写において重要な制御を担っている以下のグループに分類することができた。
　すなわち、第一のグループは、ＸＲＣＣ４とのつながりを有する非相同末端結合（ＮＨＥＪ）タイプのＤＮＡ修復に関連するグループである。第二のグループは、ＸＲＣＣ１、ライゲース３（ＬＩＧ３）及びＰｏｌｙＡＤＰリボースポリメラーゼ（ＰＡＲＰ）といった２機能性ポリヌクレオチドフォスファターゼ／キナーゼ（ＰＮＫＰｓ）とつながりを有する、ＮＨＥＪ（Ｂ－ＮＨＥＪ）、さらにはＳＳＢＲ、ＢＥＲ又はＮＥＲのバックアップ経路に関与するグループである。第三のグループは、ＸＲＣＣ３とのつながりを有する相同組換え（ＨＲ）タイプのＤＮＡ修復に関連し、ゲノム複製におけるＤＳＢｓの修復に関与するグループである。第四のグループは、サイクリンＨ（ＣＣＮＨ）とのつながりを有する主に転写に関与するグループである。
　また、ＰＡＲＰ１、ＲＡＤ５１、ＴＯＰＢＰ１、ＣＤＫ及びＫｕ７０等の多種多様なタンパク質がＲＰＡ１に作用するが、ＲＰＡ１が作用するのはＡＴＲのみである。このことから、これら遺伝子グループの機能的標的はＲＰＡ１であり、ＤＳＢ及び転写における多種多様なシステムにおいて、拠点となる分子としてＲＰＡ１は極めて重要であることが示唆された。
　ＲＰＡ１は、様々なタイプのＤＮＡ損傷修復及び転写障害（ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ　ｉｎｔｅｒｒｕｐｔｉｏｎ）において生じる１本鎖ＤＮＡを保護するのに中心的な役割を担っていることと、前記結果とは一致する。また、この結果は、前記モデルバエの解析結果において、ＲＰＡ１がＳＣＡの症状を最も回復させることの理由を説明するものである。
　ネットワーク２は、スクリーニングにより選択された遺伝子間の密な相互作用を摘出したものである(図７　参照)。そして、このネットワーク２から、腫瘍タンパク質ＴＰ５３、肝細胞核因子４α（ＨＮＦ４Ａ）及びＭｙｃは沢山のタンパク質に関与し、生存期間の延長に寄与する様々なシステムに関与していることが示唆される。興味深い事に、アレン脳地図（ｈｔｔｐ：／／ｄｅｖｅｌｏｐｉｎｇｍｏｕｓｅ．ｂｒａｉｎ－ｍａｐ．ｏｒｇ／ｄａｔａ／Ｈｎｆ４ａ／１０００９３８８８／ｔｈｕｍｎａｉｌｓ．ｈｔｍｌ）によれば、ＨＮＦ４Ａは成体の小脳皮質に発現している。ＨＮＦ４Ａは、ＣＲＥＢ結合タンパク質（ＣＢＰ）に結合する転写因子であり、生体異物の代謝において重要であるシトクロームＰ４５０　３Ａ４（ＣＹＰ３Ａ４）等の遺伝子の発現を制御する（Ｔｉｒｏｎａ，Ｒ．Ｇ．ら、Ｎａｔ　Ｍｅｄ、２００３年、９巻、２２０～２２４ページ　参照）。したがって、ＨＮＦ４ＡはＳＣＡ１モデルバエの生存期間を延長する複数のシステムを制御しているかもしれない(図７　参照)。しかしながら、ＨＮＦ４Ａ自体は前記スクリーニングにおいて陽性とはならなかった。また、陽性遺伝子となるためには、複数の経路への関与が必要である(図７　参照)。したがって、ＨＮＦ４Ａは間接的なモジュレーターとして機能していることが考えられる。
　生存期間の短縮に関するネットワーク１において、ＦＥＮ１、ＬＩＧ１、ＣＨＫ１及びＢＬＭはネットワークの中心に位置し、多数のタンパク質とのつながりを有している(図８　参照)。興味深いことに、ＲＰＡ１もまた中心に位置し、ＢＬＭ及びＦＥＮ１との関連性を有している。このようにこれらタンパク質によってＲＰＡ１は影響を受けているかもしれない(図８　参照)。また、生存期間の短縮に関するネットワーク２において、同様の遺伝子が主なプレーヤーとして選択されている(図９　参照)。また、ネットワーク２から、ＲＰＡ（ＲＰＡ１及びＲＰＡ２を含む複合体）はＦＥＮ１及びＬＩＧ１に直接又は間接的に抑制シグナルを送り、その一方で、ＦＥＮ１からのフィードバックをＲＰＡ１は受けていることが明らかになった。また、ＡＴＭ、ＡＴＲ及びＲＮＡポリメラーゼIIはＤＳＢ修復に関与し、ＦＥＮ１、ＬＩＧ１、ＣＨＫ１及びＢＬＭのうちの１又は複数のタンパク質とのつながりを有していることも、このネットワーク解析により示された。
　（実施例４）
　＜ＳＣＡの病態におけるＨＲ－ＤＳＢＲ分子の関与＞
　上述の通り、従前には注目されていなかったＤＮＡ損傷修復遺伝子を対象とした、沢山の新たなサブグループを含めたシステム生物学による解析から、生存期間の延長に関与する遺伝子の分子ネットワークが予測された（図７　参照）。
　特に、ＲＰＡ１は、様々なタイプのＤＮＡ損傷後に生じるむき出しの１本鎖ＤＮＡを保護するための重要な役割を担っている。また、ＲＰＡ１によって保護されたＤＮＡは、ＢＲＣＡ２及びＲＡＤ５１による相同組換えによって修復されることが明らかになっている。
　そこで、ＨＲ依存的なＤＳＢＲにおいて最も重要な経路であるＲＰＡ１／ＢＲＣＡ２／ＲＡＤ５１ネットワークが、ＳＣＡの病態に関与しているかどうかを調べるため、哺乳動物の細胞株のＢＲＣＡ２／ＲＡＤ５１経路において、ＲＰＡ１とＡＴＸＮ１とが物理的に相互作用するか否かを解析した。得られた結果を図１１～１５に示す。
　該解析の結果、Ｈｅｌａ細胞を用いた免疫沈降アッセイにより、外来的に発現させたＡＴＸＮ１と共発現させたＲＰＡ１とは相互作用することが明らかになった（図１１及び１２　参照）。また、ＡＴＸＮ１と内因性のＢＲＣＡ１とは弱く結合し（図１３　参照）、ＡＴＸＮ１とＢＲＣＡ２とは強く結合することが明らかになった（図１４　参照）。さらに、Ａｔｘｎ１－ＫＩマウスとその同腹の非トランスジェニックマウスを用いて、ＡＴＸＮ１とＲＰＡ１とが生体内においても相互作用することを確認した（図１５　参照）。
　また、変異型Ａｔｘｎ１－ＫＩマウスの脳を免疫組織化学的に解析した結果、プルキンエ細胞において、ＲＰＡ１及びＡＴＸＮ１は共局在化しており（図１６　参照）、さらに、ＢＲＣＡ１及びＡＴＸＮ１も共局在化していることも明らかになった（図１７　参照）。
　Ａｔｘｎ１－ＫＩマウスにおいて、ＳＣＡ１に対して抵抗性を示す皮質神経細胞は封入体を形成するが、脆弱なプルキンエ細胞は封入体を形成しないことが知られている（Ｗａｔａｓｅ，Ｋ．ら、Ｎｅｕｒｏｎ、２００２年、３４巻、９０５～９１９ページ　参照）。この点に関し、図１７において示す通り、ＢＲＣＡ１は皮質神経細胞の封入体に隔離されていた。一方、プルキンエ細胞の核内において、ＢＲＣＡ１と変異型ＡＴＸＮ１とは均一に分散し、共局在化していることが明らかになった。また、ＢＲＣＡ２及びＡＴＸＮ１はプルキンエ細胞の核内フォーカスにおいて部分的に共局在化していることが明らかになった（図１８　参照）。さらに、興味深いことに、図には示していないが、正常な状態においては、図１６に示したＲＰＡ１同様に、ＲＰＡ１と共にＲＰＡ複合体を形成するＲＰＡ２は、神経細胞の細胞質において主に局在していることも明らかにした。
　以上の結果から、ＲＰＡ１とそのパートナーであるＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２とに関し、変異型ＡＴＸＮ１により、それらの動態が抑制され、ＤＮＡ損傷修復機能が損なわれることが考えられる。
　そこで、変異型ＡＴＸＮ１を発現しているＵ２ＯＳ細胞において、線状ＤＮＡ　ＤＳＢｓに応じたＲＰＡ１の核内動態を直接調べた。その結果、対照とする、ＤｓＲｅｄ発現細胞又はＡｔｘｎ１－３３Ｑ－ＤｓＲｅｄ発現細胞と比較して、線状ＤＮＡ損傷部位におけるＲＰＡ１－ＥＧＦＰの蓄積は、Ａｔｘｎ１－８６Ｑ－ＤｓＲｅｄ発現細胞において遅かった（図１９及び２０　参照）。
　また、ＲＰＡ１のシグナル強度はＤＮＡ損傷を誘導してから７分後に減少した。このことから、ＲＰＡ１が２つの区画に蓄えられていることが示唆された。おそらくは、前期区画からのＲＰＡ１の移動が部分的に妨げられ、変異型ＡＴＸＮ１との相互作用によって後期区画からの解放がより一層おおいに妨げられていることが考えられる。実際、変異型ＡＴＸＮ１マウスのプルキンエ細胞における核封入体に、ＲＰＡ１が隔離されていることによって、この仮説は裏付けられた（図１６　参照）。
　さらに、ショウジョウバエの運動神経において、変異型ＡＴＸＮ１の凝集に影響を与えずに、変異型ＡＴＸＮ１によるＤＳＢの発生は、ＲＰＡ１によって緩和されることも明らかになった（図２１及び２２　参照）。
　以上の結果から、変異型ＡＴＸＮ１は、拠点分子となるＲＰＡ１の動態を損なわせ、ＤＮＡ損傷修復分子の多くのグループに影響を与えることにより、ＳＣＡの発症及び進行に関与していることが明らかになった。
　（実施例５）
　＜ＲＰＡ１によるＳＣＡの治療効果の検証１＞
　上述の通り、ＲＰＡ１を過剰発現させせることによって、ＳＣＡ１モデルバエの症状の１つである生存期間の短さは改善される。この点に関し、ＳＣＡ１モデルバエの他の症状である眼の変性を指標として、ＲＰＡ１／ＲｐＡ７０による治療効果を確認した。すなわち、ＧＭＲ－Ｇａｌ４ドライバーを用い、Ａｔｘｎ１－８２Ｑと、ＲｐＡ７０又はＲｐＡ７０に対するｓｉＲＮＡ(ＲｐＡ７０－ＲＮＡｉ)とを光受容細胞にて共発現させた。また、ＧＳ系統を過剰発現の例として用いた。一方、ＵＡＳ－ＲｐＡ７０－ＲＮＡｉトランスジェニックバエはノックダウンの例として用いた。その結果、ＲｐＡ７０との共発現によって、粗い眼（ｒｏｕｇｈ　ｅｙｅ）の表現型は明らかに回復した。一方、ＲｐＡ７０をノックダウンすることによって、ＳＣＡ１の症状は悪化した（図２３及び２４　参照）。
　（実施例６）
　＜ＲＰＡ１によるＳＣＡの治療効果の検証２＞
　前記の通り、ＳＣＡ１モデルバエにおいて確認されたＲＰＡ１過剰発現による治療効果を、ＳＣＡ１モデルマウスにおいても確認することを試みた。すなわち、図２５に記載の実験スケジュールの通り、ＳＣＡ１モデルマウス（５週齢）の小脳にＲＰＡ１発現ウィルスベクターを注入し、その４カ月後（９週齢）、８カ月後（１３週齢）及び３５カ月後（４０週齢）にロータロッド試験を行い、ＳＣＡ１モデルマウスにおける運動性欠陥の改善について評価した。得られた結果を図２６、２７及び２８に示す。なお、５週齢のＳＣＡ１モデルマウスについて、ロータロッド試験において、その運動性の低下が認められることは、事前に確認してある。
　図２６、２７及び２８に示した結果から明らかな通り、陰性対照群（図中の「ｎｏ　ｖｉｒｕｓ」及び「ＧＦＰ」、ＧＦＰ－ＡＡＶを注入したＳＣＡ１モデルマウス）と比較して、回転するロッドから落下する時間は、ＲＰＡ１－ＡＡＶを注入したＳＣＡ１モデルマウス（図中の「ＲＰＡ１」）の方が有意に長くなった。したがって、ＳＣＡ１モデルマウスにおいても、ＲＰＡ１過剰発現により、その症状（運動性欠陥）の改善、すなわち治療効果を確認することができた。
　（実施例７）
　＜ＣＨＫ１の機能阻害によるＳＣＡの治療効果の検証＞
　生存期間の短縮に関与する遺伝子のネットワークを構築し、解析した結果から、ＣＨＫ１は、ＢＬＭ、ＦＥＮ１及びＬＩＧ１から直接又は間接的に様々なシグナルを受け、ＳＣＡ１モデルバエにおける生存期間の短縮を促進していることが明らかになった（図８及び９　参照）。さらに、前述のスクリーニング及びインフォマティクス解析の結果から、ＤＮＡ損傷シグナルの最も重要なトランスドューサーの一つであるＣＨＫ１は、ＳＣＡの病状において重要な役割を果たしていることが示唆される。
　そこで、ＣＨＫ１が介するシグナルを阻害することによって、ＳＣＡ１モデルバエにおける生存期間の短縮は緩和されるかどうかを調べた。すなわち、ＣＨＫ１特異的阻害剤（ＣＨＩＲ－１２４）を用い、それを様々な濃度にて飼料（コーンミール培地）に添加し、ハエの成体に与えた。その結果、０．０００１６ｍｇ／ｍＬ及び０．０２ｍｇ／ｍＬにて、ＯＫ６＞ＳＣＡ１の生存期間は改善された（図２９　参照）。また、その改善効果は、高濃度の阻害剤を与えた例の方がより顕著であり、０．０２ｍｇ／ｍＬのＣＨＩＲ－１２４にて処理したハエにおいては、生存期間が３５％も延長された（図２９　参照）。
　さらに、ＣＨＫ１／ｇｒｐとＡＴＸＮ１との遺伝的相互作用についても調べた。すなわち、ＧＭＲ－Ｇａｌ４ドライバーを用い、Ａｔｘｎ１－８２Ｑと、ｇｒｐ又はｇｒｐ－ＲＮＡｉとを光受容細胞にて共発現させた。また、ＧＳ系統を過剰発現の例として用いた。一方、ＵＡＳ－ｇｒｐ－ＲＮＡｉトランスジェニックバエはノックダウンの例として用いた。その結果、ｇｒｐに対するｓｉＲＮＡを発現させることによって、ＳＣＡ１における症状（眼の変性状態）は少し改善された。一方、ｇｒｐを過剰発現させることによって、眼の変性は顕著に促進された（図２３　参照）。
　したがって、ＣＨＫ１の機能を阻害することによって、成体ＳＣＡ１バエにおける生存期間の短縮を緩和できることが明らかになった。
　（実施例８）
　＜プルキンエ細胞における細胞周期についての検証＞
　次に、ＲＰＡ１はどのようにしてＳＣＡの病態に関与しているのかを調べた。図６において示した通り、非相同末端結合（ＮＨＥＪ）型ＤＳＢＲ、ＨＲ型ＤＳＢＲ、ヌクレオチド除去修復（ＮＥＲ）及び塩基除去修復（ＢＥＲ）等の多種多様なＤＮＡ損傷修復経路と、ＲＰＡ１はつながりを有している。また、ＲＰＡ１は、基本的にはむき出しの１本鎖ＤＮＡを保護し、主に増殖細胞において生じるＨＲ、ＮＥＲ及びＢＥＲに関与していることが知られている。そのため、前述のＲＰＡ１による治療効果については、以下の機序を介して奏されている可能性が考えられる。
１）バーグマングリア又はアストロサイトを含むグリア細胞を介した非自律的病態（ｎｏｎ－ｃｅｌｌ－ａｕｔｏｎｏｍｏｕｓ　ｐａｔｈｏｌｏｇｙ）に、ＲＰＡ１は関与する。なお、非自律的病態とは、神経細胞以外の細胞の異常によって神経細胞が機能障害や細胞死を起こすことであり、多くはグリア細胞によるものである。すなわち、バーグマングリアのような神経細胞に対して保護的な作用を示すグリアが変調を来すために生じる病態のことである。
２）胚性幹細胞又は成体幹細胞を介した幹細胞病理（ｓｔｅｍ　ｃｅｌｌ　ｐａｔｈｏｌｏｇｙ）に、ＲＰＡ１は関与する。
３）異常な細胞周期段階にあるプルキンエ細胞におけるＤＮＡ損傷修復に、ＲＰＡ１は関与する。
　第１の可能性は、筋萎縮性側索硬化症における非自律的病態と類似していること（Ｙａｍａｎａｋａ，Ｋ．ら、Ｎａｔ　Ｎｅｕｒｏｓｃｉ、２００８年、１１巻、２５１～２５３ページ、Ｙａｍａｎａｋａ，Ｋ．ら、Ｐｒｏｃ　Ｎａｔｌ　Ａｃａｄ　Ｓｃｉ　ＵＳＡ、２００８年、１０５、７５９４～７５９９ページ、Ｎａｇａｉ，Ｍ．ら、Ｎａｔ　Ｎｅｕｒｏｓｃｉ、２００７年、１０巻、６１５～６２２ページ、Ｄｉ　Ｇｉｏｒｇｉｏら、Ｎａｔ　Ｎｅｕｒｏｓｃｉ、２００７年、１０巻、６０８～６１４ページ　参照）又はＳＣＡ１病態へのバーグマングリアの関与を示す結果（Ｓｈｉｗａｋｕ，Ｈ．ら、Ｅｍｂｏ　Ｊ、２０１０年、２９巻、２４４６～２４６０ページ　参照）に基づき想定される。第２の可能性は、ＳＣＡの病状進行において、ＲＯＲαがプルキンエ細胞に影響を与えるという従前の観察結果（Ｓｅｒｒａ，Ｈ．Ｇ．ら、Ｃｅｌｌ、２００６年、１２７巻、６９７～７０８ページ　参照）に基づき考えられる。第３の可能性は、神経変性疾患における異常な細胞周期、すなわち、神経変性疾患において、神経細胞のＳ期移行に障害が生じていること（Ｈｅｒｒｕｐ，Ｋ．ら、Ｎａｔ　Ｒｅｖ　Ｎｅｕｒｏｓｃｉ、２００７年、８巻、３６８～３７８ページ　参照）に基づき考えられる。
　そこで、上記３つの可能性に関し、小脳における増殖型の細胞又はＳ期にある細胞について調べた。すなわち、３２週齢のマウス成体にＢｒｄＵを注入し、様々なタイプの細胞への取り込みを解析した。その結果、抗カルビンディン抗体によって染色され、ＢｒｄＵを取り込んでいる、悪化したプルキンエ細胞が観察された（図３０～３２　参照）。したがって、３番目に挙げた、異常な細胞周期段階にあるプルキンエ細胞におけるＤＮＡ損傷修復にＲｐＡ１は関与していることが裏付けられた。
　一方、１番目と２番目の可能性に関しては、小脳においてＢｒｄＵ及びＳｏｘ２を対象とする二重染色を行った。なお、Ｓｏｘ２は幹細胞のマーカーであり、小脳における成体幹細胞を同定するために染色した。その結果、二重染色された２、３の細胞が、白質と小脳皮質の分子層とにおいて観察された（図３０～３２　参照）。また、バーグマングリアにおけるＢｒｄＵの取り込みは観察されなかった。さらに、γＨ２ＡＸシグナルはＳｏｘ２陽性のバーグマン細胞において増加していなかった（図３３　参照）。したがって、前記第１及び第２の可能性は低いことが考えられる。
　以上のことから、プルキンエ細胞における異常なＳ期への移行によって、該細胞におけるＤＮＡ損傷修復、ひいてはＲＰＡ１による相同組換えが誘導されることによって、ＳＣＡの病態が改善されることが示唆される。
　以上説明したように、本発明によれば、ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ３、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ又はＰＥＲ１の発現を促進等することにより、ＳＣＡの病態を改善することが可能となる。また、ＳＣＡ１の病因となるＡＴＸＮ１と、ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１又はＢＲＣＡ２との結合を抑制することにより、ＳＣＡの病態を改善することが可能となる。さらに、ＣＨＫ１、ＬＩＧ３、ＦＥＮ１、ＬＩＧ１、ＥＲＣＣ５、ＸＡＢ２、ＥＲＣＣ２、ＤＭＣ１、ＲＥＣＱＬ５、ＭＵＳ８１、ＥＭＥ１、ＳＰＯ１１又はＢＬＭの発現を抑制等することにより、ＳＣＡの病態を改善することが可能となる。
　したがって、本発明の薬剤、並びに該薬剤の候補化合物のスクリーニング方法は、ＳＣＡの治療及び予防、並びにそれらの方法の開発において有用である。

Claims (5)

  1. 　下記（ａ）～（ｄ）のうちの少なくとも１つを有効成分とする、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための薬剤
    （ａ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ３、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ及びＰＥＲ１からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質又は該タンパク質をコードする核酸
    （ｂ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ３、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ及びＰＥＲ１からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質の発現又は活性を促進する化合物
    （ｃ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質と、ＡＴＸＮ１との結合を抑制する化合物
    （ｄ）ＣＨＫ１、ＬＩＧ３、ＦＥＮ１、ＬＩＧ１、ＥＲＣＣ５、ＸＡＢ２、ＥＲＣＣ２、ＤＭＣ１、ＲＥＣＱＬ５、ＭＵＳ８１、ＥＭＥ１、ＳＰＯ１１及びＢＬＭからなる群から選択される少なくとも一のタンパク質の発現又は活性を抑制する化合物。
  2. 　ＣＨＫ１タンパク質の活性を抑制する化合物を有効成分とし、かつ該化合物が、４－［（（３Ｓ）－１－アザビシクロ［２．２．２］オクト－３－イル）アミノ］－３－（１Ｈ－ベンズイミダゾール－２－イル）－６－クロロキノリン－２（１Ｈ）－オン、（Ｓ）－１－（５－ブロモ－４－メチル－２－（モルホリン－２－イルメトキシ）フェニル）－３－（５－メチルピラジン－２－イル）ウレア、６－ブロモ－３－（１－メチル－１Ｈ－ピラゾール－４－イル）－５－（３Ｒ）－３－ピぺリジニルピラゾロ［１，５－ａ］ピリミジン－７－アミン、（Ｒ）－α－アミノ－Ｎ－［５，６－ジヒドロ－２－（１－メチル－１Ｈ－ピラゾール－４－イル）－６－オキソ－１Ｈ－ピロロ［４，３，２－ｅｆ］［２，３］ベンゾジアゼピン－８－イル］－シクロヘキサンアセトアミド、１－（２－（（Ｓ）－ピペリジン－３－イルカルバモイル）－５－（３－フルオロフェニル）チオフェン－３－イル）ウレア、ＸＬ８４４、７－ヒドロキシスタウロスポリン、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）ニコチンアミド、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）イソブチルアミド、（Ｒ）－Ｎ－（５－ブロモ－４－（３－（メチルアミノ）ピペリジン－１－イル）－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）ニコチンアミド、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）－５－メチルニコチンアミド、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）シクロプロパンカルボキサミド、（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）－３－メチル－ブタンアミド及び（Ｒ）－Ｎ－（４－（３－アミノピペリジン－１－イル）－５－ブロモ－１Ｈ－ピロロ［２，３－ｂ］ピリジン－３－イル）－２－シクロプロピルアセトアミドからなる群から選択される少なくとも一の化合物である、請求項１に記載の薬剤。
  3. 　下記（ａ）～（ｃ）の工程を含む、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物のスクリーニング方法
    （ａ）被検化合物の存在下で、ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質と、ＡＴＸＮ１とを接触させる工程、
    （ｂ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１及びＢＲＣＡ２からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質と、ＡＴＸＮ１との結合を検出する工程、
    （ｃ）前記結合を抑制する化合物を選択する工程。
  4. 　下記（ａ）及び（ｂ）の工程を含む、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物のスクリーニング方法
    （ａ）ＲＰＡ１、ＢＲＣＡ１、ＢＲＣＡ２、ＰＮＫＰ、ＸＲＣＣ３、ＸＲＣＣ４、ＣＣＮＨ、ＰＯＬＥ、ＰＯＬＨ及びＰＥＲ１からなる群から選択される少なくとも一のタンパク質の発現又は活性を検出しうる系に被検化合物を適用させる工程、
    （ｂ）該タンパク質の発現又は活性を促進する化合物を選択する工程。
  5. 　下記（ａ）及び（ｂ）の工程を含む、脊髄小脳変性症を予防又は治療するための候補化合物のスクリーニング方法
    （ａ）ＣＨＫ１、ＬＩＧ３、ＦＥＮ１、ＬＩＧ１、ＥＲＣＣ５、ＸＡＢ２、ＥＲＣＣ２、ＤＭＣ１、ＲＥＣＱＬ５、ＭＵＳ８１、ＥＭＥ１、ＳＰＯ１１及びＢＬＭからなる群から選択される少なくとも一のタンパク質の機能を検出しうる系に被検化合物を適用させる工程、
    （ｂ）該タンパク質の発現又は活性を抑制する化合物を選択する工程。
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