WO2008109490A2 - Composés d'acides nucléiques conçus pour inhiber l'expression du gène chek1 et utilisations de ceux-ci - Google Patents

Composés d'acides nucléiques conçus pour inhiber l'expression du gène chek1 et utilisations de ceux-ci Download PDF

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Abstract

La présente invention concerne des molécules d'acide ribonucléique méroduplex (ARNmd) capables d'induire la réduction ou le silençage de l'expression du gène CHEK1. Un ARNmd selon cette invention comporte au moins trois brins se combinant pour former au moins deux régions à double brin qui ne se chevauchent pas et qui sont séparées par une rupture ou une brèche, un brin étant complémentaire d'un ARNm de CHEK1. De plus, le méroduplex peut présenter au moins une uridine qui est remplacée par une 5-méthyluridine, un nucléoside qui est remplacé par un acide nucléique bloqué, ou éventuellement d'autres modifications, et toute combinaison de celles-ci. Cette invention concerne également des procédés permettant de réduire l'expression d'un gène CHEK1 dans une cellule ou chez un patient, afin de traiter une maladie liée à CHEK1.
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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US9074205B2 (en) 2006-10-18 2015-07-07 Marina Biotech, Inc. Nicked or gapped nucleic acid molecules and uses thereof

Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2003070888A2 (fr) * 2002-02-20 2003-08-28 Sirna Therapeutics, Inc. Inhibition de l'expression du gene checkpoint kinase-1 (chk-1) mediee par l'arn i a l'aide d'un acide nucleique a interference proche
WO2007056153A2 (fr) * 2005-11-04 2007-05-18 Nastech Pharmaceutical Company Inc. Conjugues de peptide-arn substrat dicer utilises comme excipients d'administration pour arnsi
WO2007107162A2 (fr) * 2006-03-23 2007-09-27 Santaris Pharma A/S Arn interférant court segmenté à l'intérieur
WO2008049078A1 (fr) * 2006-10-18 2008-04-24 Nastech Pharmaceutical Company Inc. Molécules d'acide nucléique ouvertes ou coupées et leurs utilisations

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2003070888A2 (fr) * 2002-02-20 2003-08-28 Sirna Therapeutics, Inc. Inhibition de l'expression du gene checkpoint kinase-1 (chk-1) mediee par l'arn i a l'aide d'un acide nucleique a interference proche
WO2007056153A2 (fr) * 2005-11-04 2007-05-18 Nastech Pharmaceutical Company Inc. Conjugues de peptide-arn substrat dicer utilises comme excipients d'administration pour arnsi
WO2007107162A2 (fr) * 2006-03-23 2007-09-27 Santaris Pharma A/S Arn interférant court segmenté à l'intérieur
WO2008049078A1 (fr) * 2006-10-18 2008-04-24 Nastech Pharmaceutical Company Inc. Molécules d'acide nucléique ouvertes ou coupées et leurs utilisations

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
BRAMSEN JESPER B. ET AL.: "Improved silencing properties using small internally segmented interfering RNAs" NUCLEIC ACIDS RESEARCH, OXFORD UNIVERSITY PRESS, SURREY, GB, vol. 35, no. 17, 28 July 2007 (2007-07-28), pages 5886-5897, XP002458184 ISSN: 0305-1048 *
HAGERMAN K.R. AND HAGERMAN P.J.: "Helix rigidity of DNA: the meroduplex as an experimental paradigm" JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, vol. 260, 1996, pages 207-223, XP002484999 *
LEUSCHNER P J F ET AL: "Cleavage of the siRNA passenger strand during RISC assembly in human cells" EMBO REPORTS, XX, XX, vol. 7, no. 3, 1 March 2006 (2006-03-01), pages 314-320, XP002467845 *
MILLS JANINE B. ET AL.: "Origin of the intrinsic rigidity of DNA" NUCLEIC ACIDS RESEARCH,, vol. 32, no. 13, 1 January 2004 (2004-01-01), pages 4055-4059, XP002484664 *

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US9074205B2 (en) 2006-10-18 2015-07-07 Marina Biotech, Inc. Nicked or gapped nucleic acid molecules and uses thereof

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