WO2003057912A2 - Molecular trichogram - Google Patents

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WO2003057912A2
WO2003057912A2 PCT/EP2003/000061 EP0300061W WO03057912A2 WO 2003057912 A2 WO2003057912 A2 WO 2003057912A2 EP 0300061 W EP0300061 W EP 0300061W WO 03057912 A2 WO03057912 A2 WO 03057912A2
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Thomas Schlake
Thomas Boehm
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Max-Planck-Gesellschaft Zur Förderung Der Wissenschaften
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    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6893Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
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    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
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    • GPHYSICS
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    • G01N2800/00Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/20Dermatological disorders

Definitions

  • the invention relates to a method for diagnosing a hair growth disorder or for determining the likelihood of a hair growth disorder (predisposition) in a mammal, wherein the expression of at least two cyclically expressed genes in a sample is analyzed and wherein (a) one of the genes is the maximum expression level during the Anagen, while (b) the second gene has the maximum expression level during catagen or during telogen.
  • the invention relates to a method for diagnosing the effectiveness of treating a hair growth disorder in a mammal, analyzing the expression of at least two cyclically expressed genes in a sample and wherein (a) one of the genes has the maximum expression level during anagen, during the (b) second gene has the maximum level of expression during catagen or telogen.
  • the expression of further genes with a cyclic expression course is preferably analyzed in the method according to the invention.
  • the invention relates to methods for isolating inhibitors of hair growth disorders and for improving such inhibitors.
  • the invention relates to processes for the production of pharmaceuticals or medical products, in which the identified or improved inhibitor is formulated with a pharmaceutically acceptable carrier or diluent.
  • the skin and its appendages are subject to constant renewal.
  • a special feature of the hair follicle is that the renewal here is not continuous, but cyclical.
  • the so-called hair cycle. runs in three phases.
  • the The growth phase is called anagen and lasts about 2-6 years for human hair, during which the hair grows continuously.
  • the hair growth rate is about 0.3 mm a day.
  • the hair goes into a transition phase (catagen), which lasts about 1-2 weeks. This is followed by the resting phase (telogen), which lasts several months and at the end of which the hair is expelled.
  • vellus hair wool hair
  • the head At birth, the human body is covered with vellus hair (wool hair), on the head these hair transform into so-called terminal hair from childhood.
  • the coat In the young adult, the coat is formed in a "mature" form, i.e. there are hardly any wool hair left;
  • terminal hair With terminal hair, the body hair can be distinguished from the bristle hair (eyebrows, eyelashes, nose, ears) and the long hair on the head, beard, axils and genital area.
  • the long hair of the scalp especially in men, is subject to a gradual change back to wool hair, which is known as retrograde metamorphosis. This reverse transformation leads to the appearance of the bald head, significantly promoted by male sex hormones (androgens).
  • the so-called trichogram is currently used to diagnose hair growth disorders in humans. This is based on the morphological analysis of the hair shafts. Epilating a tuft of hair from the scalp can one can conclude from the microscopic structure of the hair root on the cycle phase of the hair. Although this examination method is possible without any particular technical effort, the condition of the hair cycle or the modification of the hair cycle by certain substances could only be determined by means of morphological or enzymatic parameters that are difficult to quantify. Recently, however, the procedure has been performed less and less because of the relatively low diagnostic value.
  • the invention thus relates to a method for diagnosing a hair growth disorder or for determining the likelihood of a hair growth disorder (predisposition) in a mammal, the expression of at least two cyclically expressed genes in a sample being analyzed and (a) one of the genes during the maximum expression level of the agent, while (b) the second gene has the maximum expression level during catagen or during telogen.
  • predisposition for hair growth disorder in a mammal preferably encompasses genetic as well as environmental, nutritional and iatrogenic conditions that can lead to hair growth disorder in a mammal.
  • cyclically expressed gene relates to a gene which has different levels of expression during the different stages of the hair cycle. These levels of expression are quantitatively comparable and ideally identical for different hairs from the same sample which are in the same stage of the hair cycle.
  • the hair cycle is divided into three stages, which are referred to as anagen, catagen and telogen, for example, if hair is epilated from one place on a subject's head, cyclic expressed the same genes from hair in telogen synthesized a comparable amount of mRNA.
  • hair is preferably removed from the same body regions.
  • the amount of mRNA synthesized serves as a measure of the level of expression.
  • the amount of translated or post-translationally modified protein is measured.
  • anagen as used in the present invention encompasses the early, middle and late anagen as well as the transition phase from anagen to catagen.
  • the phases named as anagen I-VI and catagen I are included (cf. Müller -Rover et al., J. Invest. Dermatol. 117 (2001), 3-15).
  • catagen as used in the present invention includes the phases referred to as catagen II-VIII (see FIG. Müller-Rover, loc. Cit.).
  • telogen as used in the present invention encompasses the phase referred to as telogen (see Müller-Rover, loc. Cit.).
  • the invention provides a new method which is easy to use with molecular biological methods and which provides the method mentioned above
  • the analysis of the expression level of only two genes makes it possible to diagnose the predisposition for a hair growth disorder, whereby one of the genes must have its maximum expression level during anagen, while the other gene has its maximum expression level during catagen or during telogen
  • the maximum expression level occurs is of secondary importance, for example the gene which has its maximum expression level in the anagen can be in the early anagen, in the middle anagen, in the late anagen or also in the transition phase from Have anagen to catagen te fluctuations possible with regard to the exact point in time of the maximum expression level of the same gene.
  • a gene that has its maximum expression level in the borderline between early and middle anagen in a sample of a mammal, in particular a mouse or a human, in another sample of the same mammal, which was taken at the same time or at a different time the have maximum expression level in the middle anagen.
  • This variation can also occur in samples from a mammal another species or from another mammal of the same species.
  • the fluctuations can occur with the same hair growth disorder or even in the absence of a predisposition for a hair growth disorder.
  • the border area between early and middle anagen is only to be understood as an example from the multitude of possibilities in which certain time-varying ranges can occur.
  • the - preferably relative - level of expression of the genes from the sample is compared with a standard which, for example, represents the level of expression of the same gene in a corresponding mammal and wherein the mammal has no hair growth disorder or, less preferably, another hair growth disorder.
  • the expression level can be compared with another standard, for example the expression level of a so-called house-keeping gene. Examples of house-keeping genes are mitochondrial genes, ubiquitin genes, polymerase genes or nuclear llamine genes.
  • the standard and the sample have been taken from corresponding samples of the body.
  • the donors of the sample and the standard are of the same gender and optionally also have the same age (+/- 5 years).
  • the standard of course no longer has to be a real sample, but is preferably a molecular trichogram stored on a data carrier, which can have a different complexity and be adapted to the needs.
  • the sample and the standard have been prepared with comparable methods or with methods providing comparable results in order to ensure the comparability of the results.
  • the expression levels of the at least two cyclically expressed genes are compared directly with one another, it being possible to make a diagnosis as mentioned above from the relative value determined in this way.
  • the corresponding expression levels of the genes for normal hair growth must be known.
  • a known level of expression of these genes can serve as a standard in the event of hair growth disorder.
  • the hair cycle can thus be described quantitatively in molecular detail in a hitherto unknown detail by determining the activity of individual genes.
  • the principle of this procedure is to select genes that are only active in one of the stages of the hair cycle.
  • This active stage e.g. anagen
  • a hair growth disorder may be due to a pending, even phenotypic visible hair growth disorder can be closed.
  • the method according to the invention is preferably validated in clinical studies.
  • Example 1 the expression of approximately 20,000 genes during the first and second hair cycle of the mouse (as an embodiment of the mammals which can be used in the method according to the invention) was measured by means of DNA chips and the expression levels were analyzed bioinformatically in such a way that groups of equally regulated genes were formed. The expression course of these groups was then compared with the individual phases of the hair cycle and those genes were defined which are characteristic of individual phases of the hair cycle. This procedure is explained in more detail in Example 1, which also shows that characteristic genes from the individual phases can have defined expression sites in the hair follicle.
  • the groups listed in Example 1 are, as is readily apparent to the person skilled in the art, arbitrarily divided.
  • the treating physician can take preventive measures (e.g. therapy) which suppress the hair growth disorder or limit or even reverse the phenotypic expression.
  • preventive measures e.g. therapy
  • the method according to the invention is easier to standardize than the methods available in the prior art, since the molecular trichograms, which represent the comparison standards, can be called up via data carriers. Since the actual analysis can also be carried out on the computer after tissue preparation and molecular biological processing, the method according to the invention is both easier to carry out than the known methods and more reliable in diagnosis. In addition, the method according to the invention is significantly more meaningful than the methods known in the prior art. Advantageous is also that for a relevant diagnostic statement only the expression profiles of two different genes need to be analyzed.
  • the present invention will thus contribute to improving the molecular knowledge of the hair cycle, as a result of which new analytical methods could be developed or to create the basis for the development of further new analytical methods which all allow the condition and quality of the hair cycle in molecular terms Describe the detail of the mouse and human being precisely. These findings can help pharmacological development to find and develop drugs more efficiently. In addition to new diagnostic procedures, molecular analysis will also increase the efficiency of clinical trials.
  • the invention relates to a method for diagnosing the effectiveness of the treatment of a hair growth disorder in a mammal, wherein the expression of at least two cyclically expressed genes in a sample is analyzed and wherein (a) one of the genes has the maximum expression level during anagen, during the (b) second gene has the maximum level of expression during catagen or telogen.
  • the method according to the invention can be used to test whether treatment with a medicament, a medicinal product or another substance or a mixture of substances (all of which can be known in the prior art) has the desired effect.
  • a molecular trichogram of the tissue or of hair with the hair growth disorder is optional created.
  • a sample is then taken one or more times during the treatment and the gene expression of the genes mentioned is analyzed. If the gene expression pattern changes to the normal state of a tissue, the normal state being a tissue without hair growth disorder or, in a worsened embodiment, without this hair growth disorder, the effectiveness of the treatment can be assumed. In the event that the gene expression pattern does not change or does not change to the desired or necessary extent, the effectiveness of the treatment cannot be assumed, at least not to the desired extent.
  • a major advantage of this embodiment of the method according to the invention is that the gene expression patterns change much faster than the observable phenotype. In other words, the diagnosis does not have to be waited until one observes a change in hair growth itself (or not). Possible harmful side effects of the medication, medical device etc. are therefore reduced to a minimum if they are not effective.
  • Another advantage is that you can use another drug after a relatively short period of time if it is ineffective or ineffective and test for effectiveness. This shortening of the test phases to the effectiveness of a medication etc. has obvious advantages. On the one hand, there is a chance that if a first drug is not effective, a drug can be found relatively quickly that has the desired effectiveness. This can stop the hair growth disorder at a relatively early stage and prevent irreversible damage. Losing head hair in particular has psychological disadvantages that should not be underestimated.
  • expression (c) of at least a third cyclically expressed gene is analyzed, this gene having the maximum expression level during anagens, during catagen or during telogen.
  • This embodiment is particularly preferred because the analysis of the expression of a third gene increases the meaningfulness of the trichogram obtained and at the same time reduces the risk of incorrect conclusions. It is advantageous if the third gene has its expression maximum in the anagen, but in a different subphase than the gene mentioned under (a) above.
  • the method according to the invention is designed in such a way that expression (d) of at least a fourth cyclically expressed gene is analyzed, this gene having the maximum expression level during anagens, during catagen or during telogen.
  • This preferred embodiment also harbors an even higher level of security in the diagnostic analysis. This also applies to all other embodiments described in the description below, which include the analysis of other genes.
  • At least two genes are preferably analyzed which have their maximum expression during anagen. If two genes with expression maxima in the anagen are analyzed, it is further preferred that one of the two other genes has its expression maximum in the catagen and in the telogen. It is also preferred that three genes have their maximum expression during anagen. In this case it is preferred that the gene mentioned in (b) has its expression maximum in the telogen. In all of the above combinations, it is advantageous if two or more genes that have their expression maximum at the same stage (ie in the anagen, in the catagen or in the telogen) have different sub-stages (e.g. one gene in early anagen, the second in late anagen etc) occurs.
  • an expression (e) of at least a fifth cyclically expressed gene is analyzed, this gene having the maximum level of expression during anagen, during catagen or during telogen. It also applies to this embodiment that the expression maxima of the genes analyzed originate from as many different stages or sub-phases as possible. It is particularly preferred that one of the genes has its maximum expression in the telogen, a second has its maximum expression in the catagen and the other three genes have their maximum expression in different subphases of the anagen. This particularly preferred embodiment is also reflected in the three preferred embodiments shown below.
  • At least one of the genes which have their maximum expression level in the anagen has this during the middle anagen.
  • a further preferred embodiment according to the invention relates to a method, wherein at least one of the genes which have their maximum expression level in anagen has this during early anagen.
  • the method shown is at least one of the genes that have its maximum
  • the genes listed under (a), (b), (c), (d) and (e) have representatives of different groups of cyclically expressed genes, the diversity of the groups being characterized in that that they have their expression maxima in different time periods (preferably different subphases) and that genes belonging to the same group have the same expression profiles.
  • the same expression profiles is not to be interpreted in such a way that the profiles must have an identical profile. Rather, it is sufficient that the expression profiles have a similar profile to that of the same group assigns. It is clear to the person skilled in the art that, in principle, the group assignment can also take place according to other standards. This can be done, for example, in such a way that the maximum or minimum permitted distances between the
  • Expression profiles of different genes can be changed compared to the classification used here without changing the group membership.
  • the parameters for belonging to a group can be classified in such a way that two, three, four, preferably five, but also six, seven, eight, nine, ten or even more groups are formed.
  • a change in the group membership of individual or a large number of genes has no influence on the feasibility of the method according to the invention.
  • the method according to the invention analyzes the expression of at least one further member from at least one and preferably from each group of the cyclically expressed genes.
  • the expression of at least two further members from at least one and preferably from each group of the cyclically expressed genes is analyzed.
  • a sample is used which consists of skin or epilated hair.
  • the epilated hair preferably comes from the scalp.
  • the sample is a skin sample, it is particularly preferred that it consists of scalp.
  • the mammal is a mouse.
  • the mouse is particularly suitable as a model system to collect experiences and values that can then be transferred to humans. With the mouse, it is particularly easy to analyze the various stages of hair development immediately after birth, as it is synchronized. An additional advantage is that the individual stages of hair development in the mouse and thus the overall cycle of a hair is / are relatively short.
  • a method according to the invention is also preferred, wherein the at least one gene (a) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Table 1 or the human homologues therefor. All Genbank accession numbers listed in this application are available at http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html.
  • the gene (a) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Tables 2 or 3 or the human homologues therefor.
  • the term "comprise” means that the genes are either identical to the sequences identified by the deposit numbers or that the sequences are (coding) parts of the genes, for example ESTs.
  • the invention relates to a method in which the at least one gene (b) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Table 4 or the human homologues therefor. Alternatively, it is preferred that gene (b) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Table 5 or the human homologues therefor.
  • the invention relates to a method in which the at least one gene (c) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Table 2 or the human homologues therefor.
  • the gene (c) is selected from the group of genes comprising the sequences represented by the gene bank accession numbers listed in Tables 1, 3, 4 or 5 or the human homologues therefor.
  • it is preferred in the method according to the invention that as many genes as possible are examined which have their maximum expression in different phases or sub-phases. This also applies to the preferred embodiments described below. In this respect, for example, a gene from Table 5 is only preferred if, in the previous preferred embodiment, a gene from Table 4 was analyzed with regard to the level of expression.
  • a method is also preferred, wherein the at least one gene (d) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Table 3 or the human homologues therefor.
  • the gene (d) is selected from the group of genes which the gene library listed in Tables 1, 2, 4 or 5 Accession numbers shown sequences or the human homologues include.
  • the at least one gene (s) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Table 5 or the human homologues therefor.
  • the gene (a) is selected from the group of genes comprising the sequences represented by the gene bank accession numbers listed in Tables 1, 2, 3 or 4 or the human homologues therefor.
  • a method is also preferred, wherein the at least one gene (a) is the human homologue to the mouse gene mentioned with reference to Table 1.
  • a method is also preferred, wherein the at least one gene (b) is the human homologue to the mouse gene mentioned with reference to Table 4.
  • the at least one gene (c) is the human homologue to the gene from the mouse mentioned with reference to Table 2.
  • the at least one gene (d) is the human homologue to the mouse gene mentioned with reference to Table 3.
  • the at least one gene (s) is the human homologue to the mouse gene referred to in Table 5.
  • the invention further relates to a method for isolating an inhibitor of a hair growth disorder, wherein
  • step (c) the gene whose expression differs by at least a factor 3 in a mammal with hair growth disturbance compared to a mammal without this or without a hair growth disturbance in step (b), the mRNA transcribed therefrom or the polypeptide encoded thereby or a skin sample, in which this gene is expressed at an abnormal level of expression in contact with one or more test substances under conditions which allow the test substance to bind to the gene, the mRNA or the polypeptide or to other genes, mRNAs or polypeptides in the skin sample; and
  • step (d) isolating the test substance (s) which leads to a reduction in the factor in the expression in step (b).
  • the method according to the invention is based on the principle that a deviation of the expression pattern of one of the genes listed above from the norm (see above) leads or can lead to a disturbance in hair growth and that a substance or a plurality of substances which this deviation from the Corrected norm, is an inhibitor of hair growth disorder.
  • the above-mentioned difference in expression makes up at least a factor of 3.
  • Such a difference can be regarded as significant in the sense of the invention and promises to isolate effective inhibitors of hair growth disorders.
  • the method according to the invention both reduces and increases Expression compared to the norm can be detected.
  • the inhibitors are to be regarded as activators or as expression inhibitors. With the method according to the invention it is also possible to isolate inhibitors or activators which act on the transcription as well as on the translation level.
  • a skin sample in which the gene is abnormally expressed is analyzed with the method according to the invention, the effect of the test substance (s) on other genes or their expression products, which in turn have an influence on the expression of the gene, can also be examined.
  • Such other genes can be, for example, regulatory genes or they can encode parts of a cascade in which the polypeptide encoded by the gene is also involved. Exposure of the test substance (s) to such other genes or their expression products can lead to a normalization of the abnormal expression of the gene.
  • care must be taken that the test substances become active intracellularly, i.e. can interact with the other genes etc. Methods that ensure this are known in the art.
  • the gene whose expression is listed in step (b) comes from a mammal that has no hair growth disorder.
  • the mammal is a human. This is particularly the case because people of both sexes often have more or less serious mental health problems due to hair loss. Successful diagnosis or, even better, successful isolation of an effective inhibitor should therefore lead to an improvement in subjective well-being.
  • the expression of the gene is normalized compared to the expression of a housekeeping gene.
  • This preferred embodiment of the invention is suitable for minimizing incorrect analyzes.
  • the normalization against the expression level of a housekeeping gene is particularly suitable for enabling a relatively precise finding of the factor with which the abnormally expressed gene differs from the reference gene.
  • the hair growth disorder is an alopecia.
  • alopecia is Alopecia androgenetica.
  • the hair growth disorder is hirsutism.
  • test substances or the gene is coupled to a readout system or a readout system is added to the test batch, the readout system after binding of the test substance (s) to the gene, the mRNA or (Poly) peptide provides a detectable signal.
  • test substances are low molecular weight substances, peptides, aptamers, antibodies or fragments or derivatives thereof.
  • fragments or derivatives of antibodies are well known in the art.
  • the fragments include Fab fragment, Fv fragments and F (ab 2 ) 'fragments.
  • the antibody derivatives include, for example, scFv fragments; cf. e.g. Harlow and Lane “Antibodies, A Laboratory Manual” CSH Press, Cold Spring Harbor 1988.
  • the peptides or low molecular weight substances can be isolated from commercially available substance libraries. It is also preferred according to the invention that the process is a high-throughput process.
  • High-throughput methods are particularly preferred because they accomplish the largest possible number of expression patterns to be examined with minimal expenditure of time.
  • the samples to be analyzed are placed on solid supports such as e.g. Transfer microchips and fix them there according to generally known methods or also transfer them into microtiter plates, where in vitro assays can also be carried out at the level of expression.
  • the method is computer-assisted.
  • the invention relates to a method, further comprising improving the pharmacological properties of the inhibitor identified by the method according to the invention, wherein
  • Steps (1) and (2) can be carried out according to conventional protocols.
  • a protocol for binding site-specific mutagenesis is described in Ling MM, Robinson BH. (1997) Anal. Biochem. 254: 157-178.
  • the use of homology modeling in connection with binding site-specific mutagenesis for the analysis of structure-function relationships is described in Szklarz and Halpert (1997) Life Sei. 61: 2507-2520.
  • Chimeric proteins are produced by ligation of the corresponding DNA fragments via a single restriction site using conventional cloning methods, as described in Sambrook, Fritsch, Maniatis "Molecular Cloning, a laboratory manual” (1989) Cold Spring Harbor Laboratory Press.
  • a fusion of two DNA fragments, from which a chimeric DNA fragment encoding a chimeric protein is formed, can also be generated with the gateway system (life technologies), a system which is based on DNA fusion by recombination.
  • An advantageous example of molecular modeling is the structure-based design of compositions that bind to HIV reverse transcriptase; this is described in Mao, Sudbeck, Venkatachalam and Uckun (2000). Biochem. Pharmacol. 60: 1251-1265.
  • the identification of the binding site of the drug by means of binding-specific mutagenesis and the analysis of chimeric proteins can take place, for example, by modifications in the primary (poly) peptide sequence which influence the affinity of the drug; this usually enables precise mapping of the binding pocket for the inhibitor or the drug constituted therefrom.
  • step (2) the following protocols can be used: Once the effector site for the inhibitor has been mapped, the exact residues that interact with different parts of the inhibitor can be identified using a combination of those from the mutagenesis studies and computer simulations of the Structure of the binding site information provided that the exact three-dimensional structure of the inhibitor / drug is known (if not, this can be calculated) Simulation can be calculated). If the inhibitor itself is a peptide, it can also be mutated to determine which residues interact with other residues in the desired polypeptide.
  • the inhibitor can be modified to increase its binding affinity or its potency and specificity. For example, if there are electrostatic interactions between a particular residue of the desired polypeptide and a region of the inhibitor / drug molecule, the total charge in that region can be modified, thereby increasing this particular interaction.
  • Computer programs can be helpful in identifying binding sites. Suitable computer programs can thus be used to identify interactive sites of a putative inhibitor and the polypeptide by computer-assisted searching for complementary structure motifs (Fassina, Immunomethods 5 (1994), 114-120). Other suitable computer systems for the computer-aided design of proteins and peptides are described in the prior art, for example in Berry, Biochem. Soc. Trans. 22: 1033-1036 (1994); Wodak, Ann. NY Acad. Be. 1987, 501: 1-13; Pabo, Biochemistry 25 (1986), 5987-5991. Modifications of the (poly) peptide can be produced, for example, by peptidomimetics.
  • inhibitors can also be identified by synthesizing combinatorial peptidomimetic libraries through successive chemical modification and testing of the compositions obtained. Methods for the production and use of combinatorial peptidomimetic libraries are described in the prior art, for example in Ostresh, Methods in Enzymology 267 (1996), 220-234 and Dorner, Bioorg. Med. Chem. 4 (1996), 709-715.
  • the three-dimensional and / or crystallographic structure of the activators of the expression of the (poly) peptide according to the invention can be used for the design of peptidomimetic activators, for example in connection with the (poly) peptide identified according to the invention (Rose, Biochemistry 35 (1996), 12933 - 12944; Rutenber, Bioorg. Med. Chem. 4 (1996), 1545-1558). It is particularly preferred in the method according to the invention that the binding sites in step (a) are determined by site-specific mutagenesis.
  • a further preferred embodiment of the method according to the invention further comprises the improvement of the pharmacological properties of the inhibitor identified according to the method according to the invention or of the inhibitor improved according to the method according to the invention, the inhibitor being further modified as a lead structure to include a modified active center, a modified activity spectrum, a modified organ specificity, improved activity, reduced toxicity (an improved therapeutic index), reduced side effects, a delayed start of therapeutic activity or the length of therapeutic activity, changed pharmacokinetic parameters (absorption, distribution, metabolism or excretion), modified physicochemical parameters (Solubility, hygroscopic properties, color, taste, smell, stability, condition), improved general specificity, organ / tissue specific icity and / or an optimized form and route of administration, which by the esterification of carboxyl groups, hydroxyl groups with carboxylic acids, hydroxyl groups, for example, phosphates, pyrophosphates, sulfates, "hemisuccinates" or the formation of pharmaceutically acceptable salts, pharmaceutically acceptable complexes
  • the identified or improved inhibitor is further pharmacologically improved by peptidomimetics.
  • the inhibitor of hair growth disturbance is an activator of the transcription or translation of the gene, the mRNA or an activator of the activity of the polypeptide.
  • the inhibitor of hair growth disturbance is an inhibitor of the transcription or translation of the gene, the mRNA or an inhibitor of the activity of the polypeptide.
  • the invention relates to a method further comprising the production of a medicament or medical preparation, the inhibitor obtained or improved by the method according to the invention being formulated with a pharmaceutically acceptable carrier or diluent.
  • suitable pharmaceutically acceptable carriers and / or diluents include, for example, phosphate-buffered saline solutions, water, emulsions such as, for example, oil / water emulsions, various types of wetting agents or detergents, sterile solutions, etc.
  • Medicaments which comprise such carriers can be formulated using known conventional methods. These drugs can be administered to an individual in an appropriate dose.
  • Administration can be oral or parenteral, for example intravenous, intraperitoneal, subcutaneous, intramuscular, local, intranasal, intrabronchial, oral or intradermal, or via a catheter at one location in an artery.
  • Preparations for parenteral administration include sterile aqueous or non-aqueous solutions, suspensions and emulsions.
  • non-aqueous solvents are propylene glycol, polyethylene glycol, vegetable oils such as olive oil, and organic ester compounds such as ethyl oleate, which are suitable for injections.
  • Aqueous carriers include water, alcoholic aqueous solutions, emulsions, suspensions, saline solutions and buffered media.
  • Parenteral carriers include sodium chloride solutions, Ringer's dextrose, dextrose and sodium chloride, Ringer's lactate, and bound oils.
  • Intravenous carriers include, for example, liquid, nutrient and electrolyte supplements (such as those based on Ringer's dextrose).
  • the drug may also include preservatives and other additives such as antimicrobial compounds, antioxidants, complexing agents and inert gases.
  • other active ingredients such as interleukins, growth factors, differentiation factors, interferons, chemotactic proteins or a non-specific immunomodulatory agent can be included. The treating doctor determines the type of dosage according to the clinical factors.
  • the type of dosage depends on various factors, such as, for example, the body size or weight, the body surface, the age, gender or general health of the patient, but also on the agent to be administered specifically, the duration and mode of administration, and other medications that may be administered in parallel.
  • a typical dose can be, for example, in a range between 0.001 and 1000 ⁇ g, with doses below or above this exemplary range, especially taking into account the factors mentioned above.
  • the dose should be in a range between 1 ⁇ g and 10 mg units per day.
  • the active substances in these preparations will usually be present in a concentration of greater than 10 ⁇ g / ml of a physiological buffer.
  • the active ingredient (s) can also be present in solid form in a concentration of 0.1 to 99.5% by weight of the total mixture.
  • the active ingredient (s) in total amounts of about 0.001 to 100 mg / kg, preferably in total amounts of about 0.01 to 10 mg / kg body weight per 24 hours, optionally as a continuous infusion or in the form of several Single doses to be administered to achieve the desired result.
  • the dose should be in the range between 1 ⁇ g and 10 mg units per kilogram of body weight per day.
  • the drug can be administered topically, locally or systemically.
  • the invention relates to the use of an inhibitor identified by the method according to the invention for the manufacture of a medicament or medical device for the prevention or treatment of hair growth disorders.
  • the invention relates to a composition comprising one or more of the inhibitors which have been identified or improved by the method according to the invention.
  • composition is preferably a pharmaceutical composition.
  • the composition contains a pharmaceutically acceptable carrier or diluent as described above.
  • the composition is a diagnostic composition.
  • the individual components of the diagnostic composition are preferred packed in one or more containers. These can in turn be packed in packaging intended for sale, provided with appropriate instructions for using the diagnostic composition (the diagnostic kit).
  • RNA in situ hybridization for two genes (AF020790 and X81581) during two stages of the hair cycle (anagen, catagen).
  • Example 1 Creation of a molecular trichogram in the mouse system
  • mRNA was isolated postnatally from the dorsal skin of BALB / c mice of different ages. After rewriting into cDNA, PCR amplifications were carried out using gene-specific primers. The amplification was done with 25 to 40 cycles performed to keep the products in a linear range and analyzed by separation on a 1.5% agarose gel.
  • AF020790 a member of Group 3, is expressed in the pre-cortex of the hair follicle during anagen. No gene expression is detectable in Catagen and Telogen. The maximum expression is reached in the middle to late days. Bottom: No significant expression is detectable for X81581 as a representative of group 4 in the anagen. In catagen, during which the expression maximum is reached, the gene is active in the cells of the dermal papilla. AA000708 AB002664 AI506524 AI854638 AW122355 M98530
  • Tables 6-10 below explicitly state the version numbers (if any) of the data listed in Tables 1-5 valid for the priority date. However, these data can already be unambiguously derived for the person skilled in the art from the generally known path outlined in Tables 1-5.
  • AI838320 AK005293. 1 AW210333 X04017. .1

Abstract

The invention relates to a method for diagnosing impaired hair growth or for determining the probability of impaired hair growth (predisposition) in mammalians. According to the invention, the expression of at least two cyclically expressed genes in a sample is analyzed and (a) one of the two genes has the maximum expression peak during the anagen phase while (b) the second gene has the maximum expression peak during the catagen phase or during the telogen phase. The invention further relates to a method for diagnosing the effectiveness of the treatment of impaired hair growth in mammalians, according to which the expression of at least two cyclically expressed genes in a sample is analyzed and (a) one of the two genes has the maximum expression peak during the anagen phase while (b) the second gene has the maximum expression peak during the catagen phase or during the telogen phase. Preferably, the expression of further genes with a cyclic expression curve is analyzed according to the inventive method. The invention also relates to a method for isolating inhibitors of impaired hair growth and for improving such inhibitors. Finally, the invention relates to methods for producing drugs or medicinal products in which the identified or improved inhibitor is formulated together with a pharmaceutically acceptable excipient or diluent.

Description

Molekulares Trichogramm Molecular trichogram
Die Erfindung betrifft ein Verfahren zur Diagnose einer Haarwuchsstorung oder zur Bestimmung der Wahrscheinlichkeit einer Haarwuchsstorung (Prädisposition) bei einem Säuger, wobei man die Expression von mindestens zwei zyklisch exprimierten Genen in einer Probe analysiert und wobei (a) eines der Gene die maximale Expressionshöhe während des Anagens aufweist, während (b) das zweite Gen die maximale Expressionshöhe während des Catagens oder während des Telogens aufweist. Darüber hinaus betrifft die Erfindung ein Verfahren zur Diagnose der Wirksamkeit der Behandlung einer Haarwuchsstorung bei einem Säuger, wobei man die Expression von mindestens zwei zyklisch exprimierten Genen in einer Probe analysiert und wobei (a) eines der Gene die maximale Expressionshöhe während des Anagens aufweist, während das (b) zweite Gen die maximale Expressionshöhe während des Catagens oder des Telogens aufweist. Vorzugsweise wird die Expression weiterer Gene mit zyklischem Expressionsverlauf in dem erfindungsgemäßen Verfahren analysiert. Darüber hinaus betrifft die Erfindung Verfahren zur Isolierung von Inhibitoren von Haarwuchsstorungen und zur Verbesserung solcher Inhibitoren. Schließlich betrifft die Erfindung Verfahren zur Herstellung von Arzneimitteln oder Medizinprodukten, in denen der identifizierte oder verbesserte Inhibitor mit einem pharmazeutisch verträglichen Träger oder Verdünnungsmittel formuliert wird.The invention relates to a method for diagnosing a hair growth disorder or for determining the likelihood of a hair growth disorder (predisposition) in a mammal, wherein the expression of at least two cyclically expressed genes in a sample is analyzed and wherein (a) one of the genes is the maximum expression level during the Anagen, while (b) the second gene has the maximum expression level during catagen or during telogen. In addition, the invention relates to a method for diagnosing the effectiveness of treating a hair growth disorder in a mammal, analyzing the expression of at least two cyclically expressed genes in a sample and wherein (a) one of the genes has the maximum expression level during anagen, during the (b) second gene has the maximum level of expression during catagen or telogen. The expression of further genes with a cyclic expression course is preferably analyzed in the method according to the invention. In addition, the invention relates to methods for isolating inhibitors of hair growth disorders and for improving such inhibitors. Finally, the invention relates to processes for the production of pharmaceuticals or medical products, in which the identified or improved inhibitor is formulated with a pharmaceutically acceptable carrier or diluent.
In der Beschreibung ist eine Anzahl von Dokumenten aus dem Stand der Technik zitiert. Der Offenbarungsgehalt dieser Dokumente, einschließlich der Gebrauchsanweisungen von Herstellern, ist hiermit per Referenz inkorporiert.A number of prior art documents are cited in the description. The disclosure content of these documents, including the manufacturer's instructions for use, is hereby incorporated by reference.
Die Haut und ihre Anhangsgebilde sind einer ständigen Erneuerung unterworfen. Eine Besonderheit des Haarfollikels ist, dass hier die Erneuerung nicht kontinuierlich, sondern zyklisch verläuft. Der sogenannte Haarzyklus. läuft in drei Phasen ab. Die Wachstumsphase wird als Anagen bezeichnet und dauert beim Kopfhaar des Menschen etwa 2-6 Jahre, in der das Haar ständig wächst. Die Wachstumsgeschwindigkeit des Haares beträgt etwa 0,3 mm am Tag. Nach Beendigung dieser Phase kommt das Haar in eine Übergangsphase (Catagen), welche etwa 1-2 Wochen dauert. Daran schließt sich die Ruhephase (Telogen) an, die mehrere Monate dauert und an deren Ende das Haar ausgestoßen wird. Auf der Kopfhaut befinden sich beim Menschen etwa 100.000 Haare, von denen sich etwa 85% im Anagen, 1% im Catagen und etwa 14% im Telogen befinden; damit ist der normale Haarverlust auf etwa 100 Haare pro Tag anzusetzen. Bei der Maus sind die Phasen des Haarzyklus kürzer.The skin and its appendages are subject to constant renewal. A special feature of the hair follicle is that the renewal here is not continuous, but cyclical. The so-called hair cycle. runs in three phases. The The growth phase is called anagen and lasts about 2-6 years for human hair, during which the hair grows continuously. The hair growth rate is about 0.3 mm a day. After this phase, the hair goes into a transition phase (catagen), which lasts about 1-2 weeks. This is followed by the resting phase (telogen), which lasts several months and at the end of which the hair is expelled. In humans there are about 100,000 hairs on the scalp, of which about 85% are in the anagen, 1% in the catagen and about 14% in the telogen; this means that normal hair loss can be estimated at around 100 hairs per day. The phases of the hair cycle are shorter with the mouse.
Bei der Geburt ist der Körper des Menschen mit Vellushaar (Wollhaar) überzogen, auf dem Kopf wandeln sich diese Haare schon in der Kindheit in sogenannte Terminalhaare um. Beim jungen Erwachsenen ist das Haarkleid in "reifer" Form ausgebildet, d.h. es gibt kaum noch Wollhaare; bei der Terminalbehaarung lassen sich die Körperhaare von den Borstenhaaren (Augenbrauen, Wimpern, Nase, Ohren) und den Langhaaren an Kopf, Bart, Axillen und Genitalbereich unterscheiden. Im Laufe des Alters sind die Langhaare der Kopfhaut vor allem beim Mann einem schrittweisen Wandel zurück in Wollhaare unterworfen, was man als retrograde Metamorphose bezeichnet. Diese Rückverwandlung führt zum Erscheinungsbild der Glatze, wesentlich gefördert durch männliche Geschlechtshormone (Androgene). Verursacht wird dies durch die schleichende Verlängerung der Ruhephase und der Verkürzung der Wachstumsphasen des Kopfhaares. Das vor allem bei Frauen im Gesicht verbleibende Wollhaar wandelt sich bei erhöhten Androgenspiegeln in Terminalhaar um und verursacht dadurch das Bild des Hirsutismus. Dies kann durch hormonelle Störungen, Veranlagung oder Alter bedingt sein. Die Prävalenz von Haarwuchsstorungen erfordert die Anwendung aussagekräftiger Diagnoseverfahren zum Zustand des Haarzyklus.At birth, the human body is covered with vellus hair (wool hair), on the head these hair transform into so-called terminal hair from childhood. In the young adult, the coat is formed in a "mature" form, i.e. there are hardly any wool hair left; With terminal hair, the body hair can be distinguished from the bristle hair (eyebrows, eyelashes, nose, ears) and the long hair on the head, beard, axils and genital area. Over the years, the long hair of the scalp, especially in men, is subject to a gradual change back to wool hair, which is known as retrograde metamorphosis. This reverse transformation leads to the appearance of the bald head, significantly promoted by male sex hormones (androgens). This is caused by the gradual prolongation of the resting phase and the shortening of the growth phases of the scalp hair. The wool hair that remains on the face, especially in women, is transformed into terminal hair with increased androgen levels, thereby causing the image of hirsutism. This can be due to hormonal disorders, predisposition or age. The prevalence of hair growth disorders requires the use of meaningful diagnostic procedures for the condition of the hair cycle.
Bei der Diagnose von Haarwuchsstorungen des Menschen wird derzeit das sogenannte Trichogramm herangezogen. Dies beruht auf der morphologischen Analyse der Haarschäfte. Epiliert man von der Kopfhaut einen Haarbüschel, so kann man aus der mikroskopischen Struktur der Haarwurzel auf die Zyklusphase des Haares schließen. Diese Untersuchungsmethode ist zwar ohne besonderen technischen Aufwand möglich, allerdings konnte der Zustand des Haarzyklus bzw. die Modifikation des Haarzyklus durch bestimmte Substanzen nur mittels schwer quantifizierbarer morphologischer oder enzymatischer Parameter bestimmt werden. Das Verfahren wird in letzter Zeit jedoch wegen relativ geringer diagnostischer Aussagekraft immer seltener durchgeführt.The so-called trichogram is currently used to diagnose hair growth disorders in humans. This is based on the morphological analysis of the hair shafts. Epilating a tuft of hair from the scalp can one can conclude from the microscopic structure of the hair root on the cycle phase of the hair. Although this examination method is possible without any particular technical effort, the condition of the hair cycle or the modification of the hair cycle by certain substances could only be determined by means of morphological or enzymatic parameters that are difficult to quantify. Recently, however, the procedure has been performed less and less because of the relatively low diagnostic value.
Daher besteht nach wie vor ein Bedarf an aussagekräftigen diagnostischen Verfahren, die einerseits eine bevorstehende Haarwuchsstorung, insbesondere eine Glatzenbildung voraussagen, andererseits aber auch eine Analyse der Wirksamkeit des Verlaufs der Behandlung einer Haarwuchsstorung zulassen. Aufgabe der vorliegenden Erfindung war, solche Verfahren bereitzustellen.Therefore, there is still a need for meaningful diagnostic methods which on the one hand predict an impending hair growth disorder, in particular baldness, but on the other hand also allow an analysis of the effectiveness of the course of treatment of a hair growth disorder. The object of the present invention was to provide such methods.
Die Erfindung betrifft somit ein Verfahren zur Diagnose einer Haarwuchsstorung oder zur Bestimmung der Wahrscheinlichkeit einer Haarwuchsstorung (Prädisposition) bei einem Säuger, wobei man die Expression von mindestens zwei zyklisch exprimierten Genen in einer Probe analysiert und wobei (a) eines der Gene die maximale Expressionshöhe während des Anagens aufweist, während (b) das zweite Gen die maximale Expressionshöhe während des Catagens oder während des Telogens aufweist.The invention thus relates to a method for diagnosing a hair growth disorder or for determining the likelihood of a hair growth disorder (predisposition) in a mammal, the expression of at least two cyclically expressed genes in a sample being analyzed and (a) one of the genes during the maximum expression level of the agent, while (b) the second gene has the maximum expression level during catagen or during telogen.
Der Begriff „Prädisposition" für eine Haarwuchsstorung bei einem Säuger umfaßt vorzugsweise genetische als auch umweltbedingte, ernährungsbedingte und iatrogene Zustände, die zu einer Haarwuchsstorung bei einem Säuger führen können.The term "predisposition" for hair growth disorder in a mammal preferably encompasses genetic as well as environmental, nutritional and iatrogenic conditions that can lead to hair growth disorder in a mammal.
Der Begriff „zyklisch exprimiertes Gen" betrifft ein Gen, welches während der verschiedenen Stadien des Haarzyklus unterschiedliche Expressionshöhen aufweist. Diese Expressionshöhen sind bei verschiedenen Haaren aus derselben Probe, die sich im selben Stadium des Haarzyklus befinden, quantitativ vergleichbar und im Idealfall identisch. Bekanntermaßen ist der Haarzyklus in drei Stadien unterteilt, die mit Anagen, Catagen und Telogen bezeichnet werden. Werden beispielsweise Kopfhaare von einer Stelle des Kopfes eines Probanden epiliert, so wird von zyklisch exprimierten gleichen Genen von im Telogen befindlichen Haaren eine vergleichbare Menge an mRNA synthetisiert. Vorzugsweise werden im erfindungsgemäßen Verfahren Haare aus den gleichen Körperregionen entnommen. In einer anderen bevorzugten Ausführungsform dient die Menge an synthetisierter mRNA als Maßstab für die Expressionshöhe. In einer weiteren bevorzugten Ausführungsform wird die Menge an translatiertem oder post-translational modifizierten Protein gemessen. Der Begriff „Anagen", so wie er in der vorliegenden Erfindung verwendet wird, umfaßt das frühe, mittlere und späte Anagen sowie die Übergangsphase von Anagen zu Catagen. Insbesondere umfaßt sind die als Anagen l-VI und Catagen I benannten Phasen (vgl. Müller-Rover et al., J. Invest. Dermatol. 117 (2001), 3-15). Der Begriff „Catagen", so wie er in der vorliegenden Erfindung verwendet wird, umfaßt die als Catagen ll-VIII bezeichneten Phasen (sh. Müller-Rover, a.a.O.). Der Begriff „Telogen", so wie er in der vorliegenden Erfindung verwendet wird, umfaßt die als Telogen bezeichnete Phase (sh. Müller-Rover, a.a.O.). Die Erfindung stellt ein neues und mit molekularbiologischen Methoden einfach zu handhabendes Verfahren bereit, das die obengenannte Aufgabe löst. Mit der Analyse der Expressionshöhe von lediglich zwei Genen ist eine Diagnose der Prädisposition für eine Haarwuchsstorung möglich. Dabei muß eines der Gene seine maximale Expressionshöhe während des Anagens aufweisen, während das andere Gen seine maximale Expressionshöhe während des Catagens oder während des Telogens aufweist. In welchen Subphasen der genannten Stadien die maximale Expressionshöhe auftritt, ist dabei von sekundärer Bedeutung. Beispielsweise kann das Gen, welches seine maximale Expressionshöhe im Anagen aufweist, diese im frühen Anagen, im mittleren Anagen, im späten Anagen oder aber auch in der Übergangsphase vom Anagen zum Catagen aufweisen. Dabei sind leichte Schwankungen betreffs des genauen Zeitpunktes der maximalen Expressionshöhe ein und desselben Gens möglich. Beispielsweise kann ein Gen, das in einer Probe eines Säuger, insbesondere einer Maus oder eines Menschen, seine maximale Expressionshöhe im Grenzbereich zwischen frühem und mittlerem Anagen aufweist, in einer anderen Probe desselben Säugers, die zum selben oder zu einem anderen Zeitpunkt genommen wurde, die maximale Expressionshöhe im mittleren Anagen aufweisen. Diese Schwankung kann auch bei Proben aus einem Säuger einer anderen Art oder aus einem anderen Säuger derselben Art auftreten. Bei den genannten Säugern können die Schwankungen bei derselben Haarwuchsstorung oder auch bei der Abwesenheit für eine Prädisposition für eine Haarwuchsstorung auftreten. Auch ist der Grenzbereich zwischen frühem und mittlerem Anagen nur als ein Beispiel aus der Vielzahl der Möglichkeiten zu verstehen, bei denen gewisse zeitliche Variationsbreiten auftreten können.The term "cyclically expressed gene" relates to a gene which has different levels of expression during the different stages of the hair cycle. These levels of expression are quantitatively comparable and ideally identical for different hairs from the same sample which are in the same stage of the hair cycle. As is known the hair cycle is divided into three stages, which are referred to as anagen, catagen and telogen, for example, if hair is epilated from one place on a subject's head, cyclic expressed the same genes from hair in telogen synthesized a comparable amount of mRNA. In the method according to the invention, hair is preferably removed from the same body regions. In another preferred embodiment, the amount of mRNA synthesized serves as a measure of the level of expression. In a further preferred embodiment, the amount of translated or post-translationally modified protein is measured. The term "anagen" as used in the present invention encompasses the early, middle and late anagen as well as the transition phase from anagen to catagen. In particular, the phases named as anagen I-VI and catagen I are included (cf. Müller -Rover et al., J. Invest. Dermatol. 117 (2001), 3-15). The term "catagen" as used in the present invention includes the phases referred to as catagen II-VIII (see FIG. Müller-Rover, loc. Cit.). The term "telogen" as used in the present invention encompasses the phase referred to as telogen (see Müller-Rover, loc. Cit.). The invention provides a new method which is easy to use with molecular biological methods and which provides the method mentioned above The analysis of the expression level of only two genes makes it possible to diagnose the predisposition for a hair growth disorder, whereby one of the genes must have its maximum expression level during anagen, while the other gene has its maximum expression level during catagen or during telogen In which sub-phases of the stated stages the maximum expression level occurs is of secondary importance, for example the gene which has its maximum expression level in the anagen can be in the early anagen, in the middle anagen, in the late anagen or also in the transition phase from Have anagen to catagen te fluctuations possible with regard to the exact point in time of the maximum expression level of the same gene. For example, a gene that has its maximum expression level in the borderline between early and middle anagen in a sample of a mammal, in particular a mouse or a human, in another sample of the same mammal, which was taken at the same time or at a different time, the have maximum expression level in the middle anagen. This variation can also occur in samples from a mammal another species or from another mammal of the same species. In the mammals mentioned, the fluctuations can occur with the same hair growth disorder or even in the absence of a predisposition for a hair growth disorder. The border area between early and middle anagen is only to be understood as an example from the multitude of possibilities in which certain time-varying ranges can occur.
Die zeitliche Grenzziehung zwischen Anagen, Catagen und Telogen ist im Stand der Technik festgelegt und insbesondere am Menschen und in der Maus erforscht; vgl z.B. Paus, a.a.O. So dauert das Anagen in der Maus ca.16 Tage, das Catagen ca. 3 Tage und das Telogen ca. 6 Tage (nach den Ergebnissen anderer Gruppen ca. 9 Tage). Diese im Stand der Technik auf der Basis morphologischer Kriterien vorgenommene Grenzziehung findet auch in der vorliegenden Erfindung Anwendung.The temporal demarcation between anagen, catagen and telogen is established in the state of the art and researched in particular on humans and mice; see e.g. Pause, op. Anagen in the mouse takes about 16 days, catagen about 3 days and telogen about 6 days (according to the results of other groups about 9 days). This demarcation made in the prior art on the basis of morphological criteria is also used in the present invention.
Die - bevorzugt relative - Expressionshöhe der Gene aus der Probe wird mit einem Standard verglichen, der z.B. die Expressionshöhe desselben Gens in einem entsprechenden Säuger darstellt und wobei der Säuger keine Haarwuchsstorung oder, weniger bevorzugt, eine andere Haarwuchsstorung aufweist. Alternativ dazu kann die Expressionshöhe mit einem anderen Standard, z.B. der Expressionshöhe eines sogenannten House-Keeping Gens verglichen werden. Beispiele für House- Keeping Gene sind mitochondriale Gene, Ubiquitingene, Polymerasegene oder Nuklearlamingene. Ferner bevorzugt ist, daß der Standard und die Probe an sich entsprechenden Proben des Körpers entnommen wurden. Darüber hinaus ist bevorzugt, daß die Spender der Probe und des Standards gleichen Geschlechts sind und optional auch noch das in etwa gleiche Alter (+/- 5 Jahre) aufweisen. Der Standard muß selbstverständlich keine reale Probe mehr sein, sondern ist vorzugsweise ein auf einem Datenträger gespeichertes molekulares Trichogramm, das eine unterschiedliche und dem Bedarf angepaßte Komplexität aufweisen kann. In diesem Zusammenhang ist auch empfehlenswert, daß die Probe und der Standard mit vergleichbaren Verfahren oder mit vergleichbare Ergebnisse liefernden Verfahren aufbereitet wurden, um die Vergleichbarkeit der Ergebnisse zu gewährleisten. Alternativ dazu werden die Expressionshöhen der mindestens zwei zyklisch exprimierten Gene direkt miteinander verglichen, wobei man aus dem so ermittelten relativen Wert eine wie oben genannte Diagnose stellen kann. In diesem Falle müssen die entsprechenden Expressionshöhen der Gene bei normalem Haarwuchs bekannt sein. Alternativ dazu kann auch eine bekannte Expressionshöhe dieser Gene im Falle einer Haarwuchsstorung als Standard dienen.The - preferably relative - level of expression of the genes from the sample is compared with a standard which, for example, represents the level of expression of the same gene in a corresponding mammal and wherein the mammal has no hair growth disorder or, less preferably, another hair growth disorder. Alternatively, the expression level can be compared with another standard, for example the expression level of a so-called house-keeping gene. Examples of house-keeping genes are mitochondrial genes, ubiquitin genes, polymerase genes or nuclear llamine genes. It is further preferred that the standard and the sample have been taken from corresponding samples of the body. In addition, it is preferred that the donors of the sample and the standard are of the same gender and optionally also have the same age (+/- 5 years). The standard of course no longer has to be a real sample, but is preferably a molecular trichogram stored on a data carrier, which can have a different complexity and be adapted to the needs. In this context, it is also recommended that the sample and the standard have been prepared with comparable methods or with methods providing comparable results in order to ensure the comparability of the results. Alternatively, the expression levels of the at least two cyclically expressed genes are compared directly with one another, it being possible to make a diagnosis as mentioned above from the relative value determined in this way. In this case, the corresponding expression levels of the genes for normal hair growth must be known. Alternatively, a known level of expression of these genes can serve as a standard in the event of hair growth disorder.
Erfindungsgemäß läßt sich der Haarzyklus somit über die Bestimmung der Aktivität einzelner Gene molekular in bisher nicht gekanntem Detail quantitativ beschreiben. Das Prinzip dieses Verfahrens ist es, solche Gene auszuwählen, welche nur in einem der Stadien des Haarzyklus aktiv sind. Dieses aktive Stadium (z.B. das Anagen) korreliert mit der maximalen Expressionshöhe, deren Analyse dem erfindungsgemäßen Verfahren zugrunde gelegt ist. Misst man nun vergleichend die Expressionshöhe solcher Gene, entsteht ein Muster, welches eine eindeutige Zuordnung zum Zyklusstadium erlaubt. Wird diese Analyse über mehrere Haare gemittelt, ergibt sich ein quantitatives Bild des Haarwachstums, was als "molekulares Trichogramm" bezeichnet werden kann. Da beim Menschen wie auch bei anderen behaarten Säugern eine entnommene Probe Haare in den unterschiedlichsten Entwicklungsstadien aufweist, werden für die Expressionshöhen der einzelnen Gene Mittelwerte ermittelt. Diese Mittelwerte bieten eine verläßliche Grundlage für die gewünschte Diagnose.According to the invention, the hair cycle can thus be described quantitatively in molecular detail in a hitherto unknown detail by determining the activity of individual genes. The principle of this procedure is to select genes that are only active in one of the stages of the hair cycle. This active stage (e.g. anagen) correlates with the maximum expression level, the analysis of which is the basis for the method according to the invention. If you now measure the level of expression of such genes in comparison, a pattern is created which allows a clear assignment to the cycle stage. If this analysis is averaged over several hairs, a quantitative picture of the hair growth results, which can be referred to as a "molecular trichogram". Since a sample taken from humans as well as from other hairy mammals shows hair in the most diverse stages of development, mean values are determined for the expression levels of the individual genes. These mean values provide a reliable basis for the desired diagnosis.
Sofern das Muster aus den mindestens zwei Genen von der Norm abweicht, wobei die Norm ein Säuger ohne Haarwuchsstorung oder ohne dieselbe Haarwuchsstorung bzw. eine Probe bzw. ein aus dieser Probe gewonnenes molekulares Trichogramm ist, kann auf eine Haarwuchsstorung ggf. eine anstehende, auch phänotypisch sichtbare Haarwuchsstorung geschlossen werden. Für die genannte Abweichung von dem Muster reicht bereits aus, daß ein Gen eine abweichende Expression aufweist. Vorzugsweise wird das erfindungsgemäße Verfahren in klinischen Studien validiert. In dem der Erfindung zugrunde liegenden praktischen Ansatz wurde mittels DNA-Chips die Expression von etwa 20.000 Genen während des ersten und zweiten Haarzyklus der Maus (als einer Ausführungsform der im erfindungsgemäßen Verfahren einsetzbaren Säuger) gemessen und die Expressionshöhen bioinformatisch so analysiert, dass Gruppen gleichregulierter Gene gebildet wurden. Der Expressionsverlauf dieser Gruppen wurde dann mit den einzelnen Phasen des Haarzyklus verglichen und solche Gene definiert, die für einzelne Phasen des Haarzyklus charakteristisch sind. Dieses Vorgehen ist im Beispiel 1 näher erläutert, das auch zeigt, dass charakteristische Gene aus den einzelnen Phasen definierte Expressionsorte im Haarfollikel aufweisen können. Die in Beispiel 1 aufgeführten Gruppen sind, wie dem Fachmann ohne weiteres einsichtig ist, willkürlich eingeteilt. Der Fachmann könnte auf der Basis seines allgemeinen Fachwissens in Kombination mit der in dieser Beschreibung dargestellten erfindungsgemäßen Lehre auch zu anderen Gruppeneinteilungen kommen. Wesentlich ist jedoch, daß auch eine andere Gruppeneinteilung nicht zu einer anderen Erfindung führt und das Wesen der Erfindung auch in einem solchen Fall erhalten bleibt.If the pattern from the at least two genes deviates from the norm, the norm being a mammal without a hair growth disorder or without the same hair growth disorder or a sample or a molecular trichogram obtained from this sample, a hair growth disorder may be due to a pending, even phenotypic visible hair growth disorder can be closed. For the aforementioned deviation from the pattern, it is sufficient that a gene has a different expression. The method according to the invention is preferably validated in clinical studies. In the practical approach on which the invention is based, the expression of approximately 20,000 genes during the first and second hair cycle of the mouse (as an embodiment of the mammals which can be used in the method according to the invention) was measured by means of DNA chips and the expression levels were analyzed bioinformatically in such a way that groups of equally regulated genes were formed. The expression course of these groups was then compared with the individual phases of the hair cycle and those genes were defined which are characteristic of individual phases of the hair cycle. This procedure is explained in more detail in Example 1, which also shows that characteristic genes from the individual phases can have defined expression sites in the hair follicle. The groups listed in Example 1 are, as is readily apparent to the person skilled in the art, arbitrarily divided. On the basis of his general specialist knowledge in combination with the teaching according to the invention presented in this description, the person skilled in the art could also come to other groupings. It is essential, however, that another grouping does not lead to another invention and that the essence of the invention is retained even in such a case.
Sofern eine Haarwuchsstorung mit dem erfindungsgemäßen Verfahren diagnostiziert wurde, können vom behandelnden Arzt präventive Maßnahmen (z.B. eine Therapie) ergriffen werden, die die Haarwuchsstorung zurückdrängen bzw. die phänotypische Ausprägung begrenzen oder gar rückgängig machen.If a hair growth disorder has been diagnosed with the method according to the invention, the treating physician can take preventive measures (e.g. therapy) which suppress the hair growth disorder or limit or even reverse the phenotypic expression.
Die Vorteile des erfindungsgemäßen Verfahrens gegenüber den im Stand der Technik bekannten Verfahren liegen auf der Hand. Zum einen ist das erfindungsgemäße Verfahren leichter standardisierbar als die im Stand der Technik verfügbaren Verfahren, da die molekularen Trichogramme, die die Vergleichsstandards darstellen, über Datenträger abrufbar sind. Da auch die eigentliche Analyse nach der Gewebeaufbereitung und molekularbiologischen Bearbeitung am Computer erfolgen kann, ist das erfindungsgemäße Verfahren sowohl einfacher durchführbar als die bekannten Verfahren als auch sicherer in der Diagnose. Hinzu kommt, dass das erfindungsgemäße Verfahren wesentlich aussagekräftiger ist als die im Stand der Technik bekannten Verfahren. Von Vorteil ist auch, daß für eine relevante diagnostische Aussage lediglich die Expressionsprofile zweier unterschiedlicher Gene analysiert werden müssen.The advantages of the method according to the invention over the methods known in the prior art are obvious. On the one hand, the method according to the invention is easier to standardize than the methods available in the prior art, since the molecular trichograms, which represent the comparison standards, can be called up via data carriers. Since the actual analysis can also be carried out on the computer after tissue preparation and molecular biological processing, the method according to the invention is both easier to carry out than the known methods and more reliable in diagnosis. In addition, the method according to the invention is significantly more meaningful than the methods known in the prior art. Advantageous is also that for a relevant diagnostic statement only the expression profiles of two different genes need to be analyzed.
Die vorliegende Erfindung wird somit dazu beitragen, die molekularen Kenntnisse über den Haarzyklus zu verbessern, wodurch neue analytische Verfahren entwickelt werden könnten bzw. um die Grundlage zu schaffen für die Entwicklung weiterer neuer analytischer Verfahren die es allesamt erlauben, Zustand und Qualität des Haarzyklus in molekularem Detail bei Maus und Mensch genau zu beschreiben. Diese Erkenntnisse können dazu dienen, bei der pharmakologischen Entwicklung zu einer effizienteren Wirkstoffsuche und Wirkstoffentwicklung zu kommen. Neben neuen diagnostischen Verfahren wird durch die molekulare Analyse zudem eine Effizienzsteigerung bei klinischen Prüfungen erreicht werden.The present invention will thus contribute to improving the molecular knowledge of the hair cycle, as a result of which new analytical methods could be developed or to create the basis for the development of further new analytical methods which all allow the condition and quality of the hair cycle in molecular terms Describe the detail of the mouse and human being precisely. These findings can help pharmacological development to find and develop drugs more efficiently. In addition to new diagnostic procedures, molecular analysis will also increase the efficiency of clinical trials.
Des weiteren betrifft die Erfindung ein Verfahren zur Diagnose der Wirksamkeit der Behandlung einer Haarwuchsstorung bei einem Säuger, wobei man die Expression von mindestens zwei zyklisch exprimierten Genen in einer Probe analysiert und wobei (a) eines der Gene die maximale Expressionshöhe während des Anagens aufweist, während das (b) zweite Gen die maximale Expressionshöhe während des Catagens oder des Telogens aufweist.Furthermore, the invention relates to a method for diagnosing the effectiveness of the treatment of a hair growth disorder in a mammal, wherein the expression of at least two cyclically expressed genes in a sample is analyzed and wherein (a) one of the genes has the maximum expression level during anagen, during the (b) second gene has the maximum level of expression during catagen or telogen.
Die zu der ersten erfindungsgemäßen Ausführungsform gemachten Aussagen gelten mutatis mutandis für diese Ausführungsform der Erfindung, mit der Ausnahme, daß hier keine Diagnose einer Haarwuchsstorung erstellt werden soll, sondern die Wirksamkeit der Behandlung einer Haarwuchsstorung bei einem Säuger getestet wird. Insbesondere in dieser Ausführungsform ist der Säuger ein Mensch, da hier in besonders starkem Maße auch kosmetische Gesichtspunkte eine Rolle spielen.The statements made regarding the first embodiment of the invention apply mutatis mutandis to this embodiment of the invention, with the exception that no diagnosis of a hair growth disorder is to be made here, but rather the effectiveness of the treatment of a hair growth disorder in a mammal is tested. In this embodiment in particular, the mammal is a human being, since cosmetic aspects also play an important role here.
Mit dem erfindungsgemäßen Verfahren kann getestet werden, ob eine Behandlung mit einem Medikament, einem Medizinpräparat oder einer anderen Substanz oder einem Gemisch von Substanzen (die alle im Stand der Technik bekannt sein können) die erhoffte Wirkung zeigt. Zunächst wird dabei optional ein molekulares Trichogramm des Gewebes oder von Haaren daraus mit der Haarwuchsstorung erstellt. Anschließend wird während der Behandlung ein oder mehrere Male eine Probe entnommen und die Genexpression der genannten Gene analysiert. Bei einer Veränderung des Genexpressionsmusters auf den Normzustand eines Gewebes hin, wobei der Normzustand ein Gewebe ohne Haarwuchsstorung oder, in einer verschlechterten Ausführungsform, ohne diese Haarwuchsstorung ist, kann von der Wirksamkeit der Behandlung ausgegangen werden. In dem Falle, daß das Genexpressionsmuster sich nicht oder nicht im erwünschten oder erforderlichen Umfang ändert, kann nicht von einer Wirksamkeit der Behandlung, zumindest nicht im gewünschten Umfang ausgegangen werden.The method according to the invention can be used to test whether treatment with a medicament, a medicinal product or another substance or a mixture of substances (all of which can be known in the prior art) has the desired effect. First of all, a molecular trichogram of the tissue or of hair with the hair growth disorder is optional created. A sample is then taken one or more times during the treatment and the gene expression of the genes mentioned is analyzed. If the gene expression pattern changes to the normal state of a tissue, the normal state being a tissue without hair growth disorder or, in a worsened embodiment, without this hair growth disorder, the effectiveness of the treatment can be assumed. In the event that the gene expression pattern does not change or does not change to the desired or necessary extent, the effectiveness of the treatment cannot be assumed, at least not to the desired extent.
Ein wesentlicher Vorteil dieser Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens besteht darin, daß sich die Genexpressionsmuster wesentlich schneller ändern als der beobachtbare Phänotyp. Mit anderen Worten muß nicht solange mit der Diagnose gewartet werden, bis man eine Veränderung im Haarwuchs selbst beobachtet (oder auch nicht). Möglicherweise schädliche Nebenwirkungen des Medikamentes, Medizinproduktes etc. werden bei NichtWirksamkeit daher auf ein Minimum reduziert. Ein anderer Vorteil ist, daß man nach relativ kurzer Zeit bei NichtWirksamkeit oder ungenügender Wirksamkeit ein anderes Medikament einsetzen und auf Wirksamkeit hin testen kann. Diese Verkürzung der Testphasen auf die Wirksamkeit eines Medikamentes etc. hat offensichtliche Vorteile. Zum einen besteht die Chance, daß bei NichtWirksamkeit eines ersten Medikamentes relativ rasch ein Medikament gefunden werden kann, das die gewünschte Wirksamkeit aufweist. Damit kann die Haarwuchsstorung gegebenenfalls in einem relativ frühen Stadium gestoppt und irreversible Schäden vermieden werden. Ein Verlust von insbesondere Kopfhaar hat zudem nicht zu unterschätzende psychologische Nachteile.A major advantage of this embodiment of the method according to the invention is that the gene expression patterns change much faster than the observable phenotype. In other words, the diagnosis does not have to be waited until one observes a change in hair growth itself (or not). Possible harmful side effects of the medication, medical device etc. are therefore reduced to a minimum if they are not effective. Another advantage is that you can use another drug after a relatively short period of time if it is ineffective or ineffective and test for effectiveness. This shortening of the test phases to the effectiveness of a medication etc. has obvious advantages. On the one hand, there is a chance that if a first drug is not effective, a drug can be found relatively quickly that has the desired effectiveness. This can stop the hair growth disorder at a relatively early stage and prevent irreversible damage. Losing head hair in particular has psychological disadvantages that should not be underestimated.
In einer bevorzugten Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens wird die Expression (c) mindestens eines dritten zyklisch exprimierten Gens analysiert, wobei dieses Gen die maximale Expressionshöhe während des Anagens, während des Catagens oder während des Telogens aufweist. Diese Ausführungsform ist vor allem deshalb bevorzugt, da die Analyse der Expression eines dritten Gens die Aussagekraft des erhaltenen Trichogramms erhöht und gleichzeitig die Gefahr fehlerhafter Schlußfolgerungen herabsetzt. Von Vorteil ist, wenn das dritte Gen sein Expressionsmaximum im Anagen hat, jedoch in einer anderen Subphase als das vorstehend unter (a) genannte Gen.In a preferred embodiment of the method according to the invention, expression (c) of at least a third cyclically expressed gene is analyzed, this gene having the maximum expression level during anagens, during catagen or during telogen. This embodiment is particularly preferred because the analysis of the expression of a third gene increases the meaningfulness of the trichogram obtained and at the same time reduces the risk of incorrect conclusions. It is advantageous if the third gene has its expression maximum in the anagen, but in a different subphase than the gene mentioned under (a) above.
In einer weiteren bevorzugten Ausführungsform ist das erfindungsgemäße Verfahren derart ausgestaltet, daß die Expression (d) mindestens eines vierten zyklisch exprimierten Gens analysiert wird, wobei dieses Gen die maximale Expressionshöhe während des Anagens, während des Catagens oder während des Telogens aufweist.In a further preferred embodiment, the method according to the invention is designed in such a way that expression (d) of at least a fourth cyclically expressed gene is analyzed, this gene having the maximum expression level during anagens, during catagen or during telogen.
Auch diese bevorzugte Ausführungsform birgt eine nochmals erhöhte Sicherheit in der diagnostischen Analyse. Dies gilt im übrigen auch auf alle weiteren in der Beschreibung nachfolgend dargestellten Ausführungsformen, welche die Analyse weiterer Gene einschließen.This preferred embodiment also harbors an even higher level of security in the diagnostic analysis. This also applies to all other embodiments described in the description below, which include the analysis of other genes.
In dieser Ausführungsform werden vorzugsweise mindestens zwei Gene analysiert, die ihr Expressionsmaximum während des Anagens aufweisen. Sofern zwei Gene mit Expressionsmaxima im Anagen analysiert werden, ist ferner bevorzugt, daß von den beiden anderen Genen jeweils eins sein Expressionsmaximum im Catagen und im Telogen hat. Bevorzugt ist auch, daß drei Gene ihr Expressionsmaximum während des Anagens aufweisen. In diesem Fall ist bevorzugt, daß das in (b) genannte Gen sein Expressionsmaximum im Telogen aufweist. In allen oben genannten Kombinationen ist von Vorteil, wenn zwei oder mehr Gene, die ihr Expressionsmaximum im selben Stadium aufweisen (d.h. im Anagen, im Catagen oder im Telogen), dieses in verschiedenen Substadien (z.B. das eine Gen im frühen Anagen, das zweite im späten Anagen etc) auftritt.In this embodiment, at least two genes are preferably analyzed which have their maximum expression during anagen. If two genes with expression maxima in the anagen are analyzed, it is further preferred that one of the two other genes has its expression maximum in the catagen and in the telogen. It is also preferred that three genes have their maximum expression during anagen. In this case it is preferred that the gene mentioned in (b) has its expression maximum in the telogen. In all of the above combinations, it is advantageous if two or more genes that have their expression maximum at the same stage (ie in the anagen, in the catagen or in the telogen) have different sub-stages (e.g. one gene in early anagen, the second in late anagen etc) occurs.
In einer anderen bevorzugten Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens wird eine Expression (e) mindestens eines fünften zyklisch exprimierten Gens analysiert, wobei dieses Gen die maximale Expressionshöhe während des Anagens, während des Catagens oder während des Telogens aufweist. Auch für diese Ausführungsform gilt, daß die Expressionsmaxima der analysierten Gene aus möglichst vielen unterschiedlichen Stadien bzw. Subphasen stammen. Besonders bevorzugt ist, daß eines der Gene sein Expressionsmaximum im Telogen, ein zweites sein Expressionsmaximum im Catagen aufweist und die übrigen drei Gene ihr Expressionsmaximum in verschiedenen Subphasen des Anagens haben. Diese besonders bevorzugte Ausführungsform spiegelt sich auch in den nachfolgend dargestellten drei bevorzugten Ausführungsformen wider.In another preferred embodiment of the method according to the invention, an expression (e) of at least a fifth cyclically expressed gene is analyzed, this gene having the maximum level of expression during anagen, during catagen or during telogen. It also applies to this embodiment that the expression maxima of the genes analyzed originate from as many different stages or sub-phases as possible. It is particularly preferred that one of the genes has its maximum expression in the telogen, a second has its maximum expression in the catagen and the other three genes have their maximum expression in different subphases of the anagen. This particularly preferred embodiment is also reflected in the three preferred embodiments shown below.
Somit weist in einer zusätzlich bevorzugten Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens mindestens eines der Gene, die ihre maximale Expressionshöhe im Anagen aufweisen, diese während des mittleren Anagens auf.Thus, in an additionally preferred embodiment of the method according to the invention, at least one of the genes which have their maximum expression level in the anagen has this during the middle anagen.
Eine weitere bevorzugte erfindungsgemäße Ausführungsform betrifft ein Verfahren, wobei mindestens eines der Gene, die ihre maximale Expressionshöhe im Anagen aufweisen, diese während des frühen Anagens aufweist.A further preferred embodiment according to the invention relates to a method, wherein at least one of the genes which have their maximum expression level in anagen has this during early anagen.
In einer anderen bevorzugten Ausführungsform wird ein erfindungsgemäßesIn another preferred embodiment, an inventive one
Verfahren gezeigt, wobei mindestens eines der Gene, die ihre maximaleThe method shown is at least one of the genes that have its maximum
Expressionshöhe im Anagen aufweisen, diese während des Übergangs Anagen- Catagen aufweist.Have expression level in the anagen, this has anagen-catagen during the transition.
Gemäß dem erfindungsgemäßen Verfahren ist ferner bevorzugt, daß die unter (a), (b), (c), (d) und (e) aufgeführten Gene Repräsentanten verschiedener Gruppen von zyklisch exprimierten Genen auf, wobei die Verschiedenheit der Gruppen dadurch gekennzeichnet ist, daß sie ihre Expressionsmaxima in unterschiedlichen Zeiträumen (vorzugsweise unterschiedlichen Subphasen) aufweisen und wobei Gene, die zur gleichen Gruppe gehören, die gleichen Expressionsprofile ausweisen.According to the method according to the invention it is further preferred that the genes listed under (a), (b), (c), (d) and (e) have representatives of different groups of cyclically expressed genes, the diversity of the groups being characterized in that that they have their expression maxima in different time periods (preferably different subphases) and that genes belonging to the same group have the same expression profiles.
Der Begriff „die gleichen Expressionsprofile" ist dabei nicht so zu deuten, daß die Profile einen identischen Verlauf haben müssen. Vielmehr ist ausreichend, daß die Expressionsprofile einen ähnlichen Verlauf haben, der sie derselben Gruppe zuordnet. Dabei ist dem Fachmann klar, daß im Prinzip die Gruppenzuordnung auch nach anderen Maßstäben erfolgen kann. Dies kann beispielsweise derart erfolgen, daß die maximal oder minimal erlaubten Abstände zwischen denThe term “the same expression profiles” is not to be interpreted in such a way that the profiles must have an identical profile. Rather, it is sufficient that the expression profiles have a similar profile to that of the same group assigns. It is clear to the person skilled in the art that, in principle, the group assignment can also take place according to other standards. This can be done, for example, in such a way that the maximum or minimum permitted distances between the
Expressionsprofilen verschiedener Gene im Vergleich zu der hier eingesetzten Einteilung geändert werden, ohne daß sich die Gruppenzugehörigkeit ändert. Beispielsweise können die Parameter zur Zugehörigkeit einer Gruppe so eingeteilt werden, daß zwei, drei, vier, wie hier bevorzugt fünf, aber auch sechs, sieben, acht neun, zehn oder noch mehr Gruppen entstehen. Es muß jedoch betont werden, daß eine Änderung der Gruppenzugehörigkeit einzelner oder auch einer Vielzahl von Genen keinen Einfluß auf die Durchführbarkeit des erfindungsgemäßen Verfahrens ausübt.Expression profiles of different genes can be changed compared to the classification used here without changing the group membership. For example, the parameters for belonging to a group can be classified in such a way that two, three, four, preferably five, but also six, seven, eight, nine, ten or even more groups are formed. However, it must be emphasized that a change in the group membership of individual or a large number of genes has no influence on the feasibility of the method according to the invention.
In einer besonders bevorzugten Ausführungsform wird mit dem erfindungsgemäßen Verfahren die Expression von mindestens einem weiteren Mitglied aus mindestens einer und vorzugsweise aus jeder Gruppe der zyklisch exprimierten Gene analysiert.In a particularly preferred embodiment, the method according to the invention analyzes the expression of at least one further member from at least one and preferably from each group of the cyclically expressed genes.
In einer weiteren besonders bevorzugten Ausführungsform wird die Expression von mindestens zwei weiteren Mitgliedern aus mindestens einer und vorzugsweise aus jeder Gruppe der zyklisch exprimierten Gene analysiert.In a further particularly preferred embodiment, the expression of at least two further members from at least one and preferably from each group of the cyclically expressed genes is analyzed.
Im Prinzip sind verschiedene Quellen für den Einsatz im erfindungsgemäßen Verfahren denkbar. In einer anderen bevorzugten Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahren wird eine Probe eingesetzt, die aus Haut oder aus epiliertem Haar besteht. Das epilierte Haar stammt vorzugsweise aus der Kopfhaut.In principle, various sources are conceivable for use in the method according to the invention. In another preferred embodiment of the method according to the invention, a sample is used which consists of skin or epilated hair. The epilated hair preferably comes from the scalp.
Sofern die Probe eine Hautprobe ist, ist besonders bevorzugt, daß diese aus Kopfhaut besteht.If the sample is a skin sample, it is particularly preferred that it consists of scalp.
Diese Ausführungsform ist auch deshalb besonders bevorzugt, da sich mit einer Kopfhautprobe (ebenso wie beim aus der Kopfhaut epilierten Haar) am besten und einfachsten Rückschlüsse auf Haarwuchsstorungen wie Alopezie herleiten lassen. In einer anderen bevorzugten Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens ist der Säuger eine Maus.This embodiment is also particularly preferred because a scalp sample (as well as hair epilated from the scalp) is the best and easiest way to draw conclusions about hair growth disorders such as alopecia. In another preferred embodiment of the method according to the invention, the mammal is a mouse.
Die Maus ist vor allem als Modellsystem geeignet, um Erfahrungen und Werte zu sammeln, die sich dann auf den Menschen übertragen lassen. Bei der Maus lassen sich direkt nach der Geburt besonders gut, da in synchronisierter Weise, die verschiedenen Stadien der Haarentwicklung analysieren. Hinzu kommt als Vorteil, daß die einzelnen Stadien der Haarentwicklung bei der Maus und damit der Gesamtzyklus eines Haares relativ kurz ist/sind.The mouse is particularly suitable as a model system to collect experiences and values that can then be transferred to humans. With the mouse, it is particularly easy to analyze the various stages of hair development immediately after birth, as it is synchronized. An additional advantage is that the individual stages of hair development in the mouse and thus the overall cycle of a hair is / are relatively short.
Erfindungsgemäß bevorzugt ist ferner ein Verfahren, wobei das mindestens eine Gen (a) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabelle 1 aufgeführten Genbank-Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen. Sämtliche in dieser Anmeldung aufgeführten Genbank-Hinterlegungsnummern sind verfügbar unter http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html.A method according to the invention is also preferred, wherein the at least one gene (a) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Table 1 or the human homologues therefor. All Genbank accession numbers listed in this application are available at http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/index.html.
Alternativ dazu ist bevorzugt, daß das Gen (a) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabellen 2 oder 3 aufgeführten Genbank- Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen.Alternatively, it is preferred that the gene (a) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Tables 2 or 3 or the human homologues therefor.
Der Begriff „umfassen" bedeutet dabei, daß die Gene entweder mit den durch die Hinterlegungsnummern gekennzeichneten Sequenzen identisch sind oder daß die Sequenzen (kodierende) Teile der Gene, z.B. ESTs sind.The term "comprise" means that the genes are either identical to the sequences identified by the deposit numbers or that the sequences are (coding) parts of the genes, for example ESTs.
Wie im Stand der Technik bekannt ist, lassen sich aus den mit Mäusegenen und deren Expressionsprodukten gefundene Daten in der Regel auf den Menschen bzw. die entsprechenden menschlichen Gene oder Expressionsprodukte übertragen. Darüber hinaus lassen sich aufgrund des in der Regel hohen Homologiegrades zwischen Maus- und menschlichen Genen bei Kenntnis ersterer ohne weiteres letztere ableiten. Dies liegt auch in den Ergebnissen des Humangenom-Projektes begründet. In einer anderen bevorzugten Ausführungsform betπfft die Erfindung ein Verfahren, wobei das mindestens eine Gen (b) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabelle 4 aufgeführten Genbank-Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen. Alternativ dazu ist bevorzugt, daß das Gen (b) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabelle 5 aufgeführten Genbank- Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen.As is known in the prior art, data found from the mouse genes and their expression products can generally be transferred to humans or the corresponding human genes or expression products. In addition, due to the generally high degree of homology between mouse and human genes, the latter can be derived readily if the latter is known. This is also due to the results of the human genome project. In another preferred embodiment, the invention relates to a method in which the at least one gene (b) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Table 4 or the human homologues therefor. Alternatively, it is preferred that gene (b) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Table 5 or the human homologues therefor.
In einer anderen bevorzugten Ausführungsform betrifft die Erfindung ein Verfahren, wobei das mindestens eine Gen (c) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabelle 2 aufgeführten Genbank-Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen. Alternativ dazu ist bevorzugt, daß das Gen (c) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabellen 1 , 3, 4 oder 5 aufgeführten Genbank- Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen. Wie bei den vorstehend beschriebenen bevorzugten Ausführungsformen ist im erfindungsgemäßen Verfahren bevorzugt, daß möglichst viele Gene untersucht werden, die ihr Expressionsmaximum in unterschiedlichen Phasen oder Subphasen haben. Dies gilt auch für die nachfolgend beschriebenen bevorzugten Ausführungsformen. Insofern ist beispielsweise ein Gen aus der Tabelle 5 nur dann bevorzugt, wenn in der vorherigen bevorzugten Ausführungsform ein Gen aus der Tabelle 4 hinsichtlich der Expressionshöhe analysiert wurde.In another preferred embodiment, the invention relates to a method in which the at least one gene (c) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Table 2 or the human homologues therefor. Alternatively, it is preferred that the gene (c) is selected from the group of genes comprising the sequences represented by the gene bank accession numbers listed in Tables 1, 3, 4 or 5 or the human homologues therefor. As with the preferred embodiments described above, it is preferred in the method according to the invention that as many genes as possible are examined which have their maximum expression in different phases or sub-phases. This also applies to the preferred embodiments described below. In this respect, for example, a gene from Table 5 is only preferred if, in the previous preferred embodiment, a gene from Table 4 was analyzed with regard to the level of expression.
Bevorzugt ist auch ein Verfahren, wobei das mindestens eine Gen (d) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabelle 3 aufgeführten Genbank- Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen.A method is also preferred, wherein the at least one gene (d) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Table 3 or the human homologues therefor.
Alternativ dazu ist bevorzugt, daß das Gen (d) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabellen 1 , 2, 4 oder 5 aufgeführten Genbank- Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen.As an alternative to this, it is preferred that the gene (d) is selected from the group of genes which the gene library listed in Tables 1, 2, 4 or 5 Accession numbers shown sequences or the human homologues include.
Ferner bevorzugt ist eine Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens, wobei das mindestens eine Gen (e) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabelle 5 aufgeführten Genbank-Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen. Alternativ dazu ist bevorzugt, daß das Gen (a) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabellen 1 , 2, 3 oder 4 aufgeführten Genbank- Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen.Also preferred is an embodiment of the method according to the invention, wherein the at least one gene (s) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Table 5 or the human homologues therefor. Alternatively, it is preferred that the gene (a) is selected from the group of genes comprising the sequences represented by the gene bank accession numbers listed in Tables 1, 2, 3 or 4 or the human homologues therefor.
Bevorzugt ist ferner ein Verfahren, wobei das mindestens eine Gen (a) das menschliche Homologe zu dem unter Bezug auf Tabelle 1 genannten Gen aus der Maus ist.A method is also preferred, wherein the at least one gene (a) is the human homologue to the mouse gene mentioned with reference to Table 1.
Auch ist ein Verfahren bevorzugt, wobei das mindestens eine Gen (b) das menschliche Homologe zu dem unter Bezug auf Tabelle 4 genannten Gen aus der Maus ist.A method is also preferred, wherein the at least one gene (b) is the human homologue to the mouse gene mentioned with reference to Table 4.
Alternativ dazu und ebenfalls bevorzugt ist ein Verfahren, wobei das mindestens eine Gen (c) das menschliche Homologe zu dem unter Bezug auf Tabelle 2 genannten Gen aus der Maus ist.As an alternative to this and also preferred is a method, wherein the at least one gene (c) is the human homologue to the gene from the mouse mentioned with reference to Table 2.
Darüber hinaus ist ein Verfahren bevorzugt, wobei das mindestens eine Gen (d) das menschliche Homologe zu dem unter Bezug auf Tabelle 3 genannten Gen aus der Maus ist.In addition, a method is preferred, wherein the at least one gene (d) is the human homologue to the mouse gene mentioned with reference to Table 3.
In dieser Reihe an bevorzugten Ausführungsformen ist schließlich ein Verfahren bevorzugt, wobei das mindestens eine Gen (e) das menschliche Homologe zu dem unter Bezug auf Tabelle 5 genannten Gen aus der Maus ist. Die Erfindung betrifft ferner ein Verfahren zur Isolierung eines Inhibitors einer Haarwuchsstorung, wobei manIn this series of preferred embodiments, a method is finally preferred, wherein the at least one gene (s) is the human homologue to the mouse gene referred to in Table 5. The invention further relates to a method for isolating an inhibitor of a hair growth disorder, wherein
(a) die Expression von mindestens einem der in den vorstehenden Ansprüchen unter (a) bis (e) aufgeführten Gene in einer Hautprobe oder in epiliertem Haar analysiert, die einem Säuger mit einer Haarwuchsstorung entnommen wurde(n);(a) analyzing the expression of at least one of the genes listed in the preceding claims under (a) to (e) in a skin sample or in epilated hair which was taken from a mammal with a hair growth disorder;
(b) das Analyseergebnis aus (a) mit der Expression des Gens in einer Hautprobe oder in epiliertem Haar vergleicht, die einem Säuger derselben Spezies entnommen wurde, wobei dieser Säuger nicht diese oder keine Haarwuchsstorung aufweist;(b) comparing the analysis result from (a) with the expression of the gene in a skin sample or in epilated hair taken from a mammal of the same species, which mammal does not have this or no hair growth disorder;
(c) das Gen, dessen Expression sich bei einem Säuger mit Haarwuchsstorung im Vergleich zu einem Säuger ohne diese oder ohne eine Haarwuchsstorung in Schritt (b) um mindestens einen Faktor 3 unterscheidet, die davon transkribierte mRNA oder das davon kodierte Polypeptid oder eine Hautprobe, in der dieses Gen in abnormer Expressionshöhe exprimiert ist mit einer oder mehreren Testsubstanzen unter Bedingungen in Kontakt bringt, die eine Bindung der Testsubstanz an das Gen, die mRNA oder das Polypeptid oder an andere Gene, mRNAs oder Polypeptide in der Hautprobe erlauben; und(c) the gene whose expression differs by at least a factor 3 in a mammal with hair growth disturbance compared to a mammal without this or without a hair growth disturbance in step (b), the mRNA transcribed therefrom or the polypeptide encoded thereby or a skin sample, in which this gene is expressed at an abnormal level of expression in contact with one or more test substances under conditions which allow the test substance to bind to the gene, the mRNA or the polypeptide or to other genes, mRNAs or polypeptides in the skin sample; and
(d) diejenige(n) Testsubstanz(en) isoliert, die in Schritt (b) zu einer Verminderung des Faktors in der Expression führt/führen.(d) isolating the test substance (s) which leads to a reduction in the factor in the expression in step (b).
Das erfindungsgemäße Verfahren beruht auf dem Prinzip, daß eine Abweichung des Expressionsmusters eines der oben aufgeführten Gene von der Norm (vgl. oben) zu einer Störung des Haarwuchses führt oder führen kann und daß eine Substanz oder eine Mehrzahl an Substanzen, die diese Abweichung von der Norm korrigiert, ein Inhibitor der Haarwuchsstorung ist.The method according to the invention is based on the principle that a deviation of the expression pattern of one of the genes listed above from the norm (see above) leads or can lead to a disturbance in hair growth and that a substance or a plurality of substances which this deviation from the Corrected norm, is an inhibitor of hair growth disorder.
Erfindungsgemäß wird festgelegt, daß der oben angeführte Unterschied in der Expression mindestens einen Faktor 3 ausmacht. Ein derartiger Unterschied kann als signifikant im Sinne der Erfindung angesehen werden und verspricht die Isolierung wirksamer Inhibitoren von Haarwuchsstorungen. Dabei ist beachtlich, daß mit dem erfindungsgemäßen Verfahren sowohl verminderte als auch vermehrte Expression im Vergleich zur Norm erfaßt werden. Entsprechend sind die Inhibitoren als Aktivatoren oder als Inhibitoren der Expression anzusehen. Mit dem erfindungsgemäßen Verfahren ist darüber hinaus möglich, Inhibitoren oder Aktivatoren zu isolieren, die auf der Transkriptions- wie auch auf der Translationsebene wirken.According to the invention, it is established that the above-mentioned difference in expression makes up at least a factor of 3. Such a difference can be regarded as significant in the sense of the invention and promises to isolate effective inhibitors of hair growth disorders. It is noteworthy here that the method according to the invention both reduces and increases Expression compared to the norm can be detected. Accordingly, the inhibitors are to be regarded as activators or as expression inhibitors. With the method according to the invention it is also possible to isolate inhibitors or activators which act on the transcription as well as on the translation level.
Sofern mit dem erfindungsgemäßen Verfahren eine Hautprobe analysiert wird, in der das Gen abnorm exprimiert ist, kann auch die Einwirkung der Testsubstanz(en) auf andere Gene bzw. deren Expressionsprodukte, die wiederum einen Einfluß auf die Expression des Gens haben, untersucht werden. Derartige andere Gene können beispielsweise regulatorische Gene sein oder sie können Teile einer Kaskade kodieren, an der auch das von dem Gen kodierte Polypeptid beteiligt ist. Eine Einwirkung der Testsubstanz(en) auf derartige andere Gene oder deren Expressionsprodukte kann zu einer Normalisierung der abnormen Expression des Gens führen. Bei der Analyse einer Hautprobe ist dafür Sorge zu tragen, daß die Testsubstanzen intrazellulär aktiv werden, d.h. mit den anderen Genen etc. interagieren können. Verfahren, die dies sicherstellen, sind im Stand der Technik bekannt.If a skin sample in which the gene is abnormally expressed is analyzed with the method according to the invention, the effect of the test substance (s) on other genes or their expression products, which in turn have an influence on the expression of the gene, can also be examined. Such other genes can be, for example, regulatory genes or they can encode parts of a cascade in which the polypeptide encoded by the gene is also involved. Exposure of the test substance (s) to such other genes or their expression products can lead to a normalization of the abnormal expression of the gene. When analyzing a skin sample, care must be taken that the test substances become active intracellularly, i.e. can interact with the other genes etc. Methods that ensure this are known in the art.
Gemäß dem erfindungsgemäßen Verfahren ist besonders vorteilhaft, wenn das Gen, dessen Expression in Schritt (b) aufgeführt wird (das „Referenzgen"), aus einem Säuger stammt, der keine Haarwuchsstorung aufweist.According to the method according to the invention, it is particularly advantageous if the gene whose expression is listed in step (b) (the “reference gene”) comes from a mammal that has no hair growth disorder.
Erfindungsgemäß ist ferner bevorzugt, daß der Säuger ein Mensch ist. Dies ist besonders deshalb der Fall, da Menschen beider Geschlechter aufgrund von Haarausfall oft mehr oder weniger schwerwiegende psychische Probleme haben. Eine erfolgreiche Diagnose oder besser noch eine erfolgreiche Isolierung eines wirksamen Inhibitors dürfte somit zu einer Verbesserung des subjektiven Wohlbefindens führen.According to the invention it is further preferred that the mammal is a human. This is particularly the case because people of both sexes often have more or less serious mental health problems due to hair loss. Successful diagnosis or, even better, successful isolation of an effective inhibitor should therefore lead to an improvement in subjective well-being.
Im erfindungsgemäßen Verfahren ist bevorzugt, daß die Expression des Gens gegenüber der Expression eines Housekeeping-Gens normalisiert wird. Diese bevorzugte Ausführungsform der Erfindung ist dazu geeignet, fehlerhafte Analysen zu minimieren. Die Normalisierung gegen das Expressionsniveau eines Housekeeping-Gens ist insbesondere dazu geeignet, eine relativ genaue Findung des Faktors zu ermöglichen, mit der das abnorm exprimierte Gen gegenüber dem Referenzgen abweicht.In the method according to the invention it is preferred that the expression of the gene is normalized compared to the expression of a housekeeping gene. This preferred embodiment of the invention is suitable for minimizing incorrect analyzes. The normalization against the expression level of a housekeeping gene is particularly suitable for enabling a relatively precise finding of the factor with which the abnormally expressed gene differs from the reference gene.
In einer anderen bevorzugten Ausführungsform der erfindungsgemaßen Verfahrens ist die Haarwuchsstorung eine Alopezie.In another preferred embodiment of the method according to the invention, the hair growth disorder is an alopecia.
Besonders bevorzugt ist, daß die Alopezie Alopecia androgenetica ist.It is particularly preferred that the alopecia is Alopecia androgenetica.
Alternativ dazu ist besonders bevorzugt, daß die Haarwuchsstorung Hirsutismus ist.Alternatively, it is particularly preferred that the hair growth disorder is hirsutism.
In einer weiteren bevorzugten Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens sind die Testsubstanzen oder ist das Gen an ein Readout-System gekoppelt oder ist dem Testansatz ein Readout-System zugesetzt, wobei das Readout-System nach Bindung der Testsubstanz(en) an das Gen, die mRNA oder (Poly)peptid ein nachweisbares Signal liefert.In a further preferred embodiment of the method according to the invention, the test substances or the gene is coupled to a readout system or a readout system is added to the test batch, the readout system after binding of the test substance (s) to the gene, the mRNA or (Poly) peptide provides a detectable signal.
Im erfindungsgemäßen Verfahren bevorzugt ist ferner, daß die Testsubstanzen niedermolekulare Substanzen, Peptide, Aptamere, Antikörper oder Fragmente oder Derivate davon sind.In the method according to the invention it is further preferred that the test substances are low molecular weight substances, peptides, aptamers, antibodies or fragments or derivatives thereof.
Die Begriffe „Fragmente oder Derivate" von Antikörpern sind im Stand der Technik wohl bekannt. Zu den Fragmenten werden Fab-Fragment, Fv- Fragmente und F(ab2)'-Fragmente gezählt. Zu den Antikörperderivaten gehören berspielsweise scFv- Fragmente; vgl. z.B. Harlow und Lane „Antibodies, A Laboratory Manual" CSH Press, Cold Spring Harbor 1988.The terms "fragments or derivatives" of antibodies are well known in the art. The fragments include Fab fragment, Fv fragments and F (ab 2 ) 'fragments. The antibody derivatives include, for example, scFv fragments; cf. e.g. Harlow and Lane "Antibodies, A Laboratory Manual" CSH Press, Cold Spring Harbor 1988.
Insbesondere die Peptide oder niedermolekularen Substanzen können aus im Handel erhältlichen Substanzbibliotheken isoliert werden. Auch ist erfindungsgemäß bevorzugt, daß das Verfahren ein Hochdurchsatzverfahren ist.In particular, the peptides or low molecular weight substances can be isolated from commercially available substance libraries. It is also preferred according to the invention that the process is a high-throughput process.
Hochdurchsatzverfahren sind insbesondere daher bevorzugt, da sie eine möglichst große Zahl an zu untersuchenden Expressionsmustern mit minimalem Zeitaufwand bewerkstelligen. Vorteilhafterweise werden in den erfindungsgemäßen Hochdurchsatzverfahren die zu analysierenden Proben auf feste Träger wie z.B. Mikrochips übertragen und dort nach allgemein bekannten Verfahren fixiert oder aber auch in Mikrotiterplatten übertragen, wo auch in vitro-Assays auf die Expressionhöhe durchgeführt werden können.High-throughput methods are particularly preferred because they accomplish the largest possible number of expression patterns to be examined with minimal expenditure of time. Advantageously, the samples to be analyzed are placed on solid supports such as e.g. Transfer microchips and fix them there according to generally known methods or also transfer them into microtiter plates, where in vitro assays can also be carried out at the level of expression.
Besonders bevorzugt ist, daß das Verfahren Computer-assistiert ist.It is particularly preferred that the method is computer-assisted.
Die Erfindung betrifft in einer anderen bevorzugten Ausführungsform ein Verfahren, ferner umfassend die Verbesserung der pharmakologischen Eigenschaften des nach dem erfindungsgemäßen Verfahren identifizierten Inhibitors, wobei manIn another preferred embodiment, the invention relates to a method, further comprising improving the pharmacological properties of the inhibitor identified by the method according to the invention, wherein
(a) die Bindungsstelle des Inhibitors an das Gen, die mRNA oder das Polypeptid und gegebenenfalls die Bindungsstelle des Gens, der mRNA oder des Polypeptids an den Inhibitor identifiziert;(a) the binding site of the inhibitor to the gene, the mRNA or the polypeptide and optionally the binding site of the gene, the mRNA or the polypeptide to the inhibitor are identified;
(b) die Bindungsstelle des Inhibitors und des Gens, der mRNA oder des Polypeptids durch molekulares Modellieren modifiziert; und(b) modifying the binding site of the inhibitor and the gene, mRNA or polypeptide by molecular modeling; and
(c) den Inhibitor dergestalt modifiziert, daß seine Bindungsspezifität oder Bindungsaffinität oder Bindungsavidität für das Gen, die mRNA oder das Polypeptid erhöht wird.(c) modifying the inhibitor so that its binding specificity or binding affinity or binding avidity for the gene, the mRNA or the polypeptide is increased.
Alle im erfindungsgemäßen Verfahren verwendeten Methoden sind herkömmlicher Art oder können vom Fachmann problemlos von herkömmlichen Methoden abgeleitet werden. So können beispielsweise auf der hier beschriebenen Beschaffenheit der Polypeptide basierende biologische Nachweise zur Bestimmung der Spezifizität oder Potenz der Arzneimittel verwendet werden, wobei eine Zunahme einer oder mehrerer Aktivitäten der Polypeptide zum Monitoring der Spezifizität oder Potenz dienen kann. Schritte (1) und (2) können gemäß herkömmlichen Protokollen ausgeführt werden. Ein Protokoll zur Bindungsstellen-spezifischen Mutagenese ist beschrieben in Ling MM, Robinson BH. (1997) Anal. Biochem. 254: 157-178. Die Verwendung von Homologie-Modellieren in Verbindung mit Bindungsstellen-spezifischer Mutagenese zur Analyse von Struktur-Funktions- Verhältnissen wird in Szklarz and Halpert (1997) Life Sei. 61 :2507-2520 untersucht. Chimäre Proteine entstehen durch Ligation der entsprechenden DNA-Fragmente über eine einzige Restriktionsstelle unter Verwendung herkömmlicher Kloniermethoden, wie sie in Sambrook, Fritsch, Maniatis "Molecular Cloning, a laboratory manual" (1989) Cold Spring Harbor Laboratory Press beschrieben sind. Eine Fusion zweier DNA-Fragmente, aus der ein ein chimäres Protein codierendes chimäres DNA-Fragment entsteht, kann auch mit dem Gateway-System (life technologies), einem System, das auf DNA-Fusion durch Rekombination basiert, erzeugt werden. Ein vorteilhaftes Beispiel des molekularen Modellierens ist das Struktur-basierte Design von Zusammensetzungen, die an die HIV reverse Transcriptase binden; dieses ist beschrieben in Mao, Sudbeck, Venkatachalam and Uckun (2000). Biochem. Pharmacol. 60: 1251 -1265.All methods used in the method according to the invention are conventional or can be easily derived from conventional methods by a person skilled in the art. For example, biological evidence based on the nature of the polypeptides described here can be used to determine the specificity or potency of the pharmaceuticals, with an increase in one or more Activities of the polypeptides can serve to monitor specificity or potency. Steps (1) and (2) can be carried out according to conventional protocols. A protocol for binding site-specific mutagenesis is described in Ling MM, Robinson BH. (1997) Anal. Biochem. 254: 157-178. The use of homology modeling in connection with binding site-specific mutagenesis for the analysis of structure-function relationships is described in Szklarz and Halpert (1997) Life Sei. 61: 2507-2520. Chimeric proteins are produced by ligation of the corresponding DNA fragments via a single restriction site using conventional cloning methods, as described in Sambrook, Fritsch, Maniatis "Molecular Cloning, a laboratory manual" (1989) Cold Spring Harbor Laboratory Press. A fusion of two DNA fragments, from which a chimeric DNA fragment encoding a chimeric protein is formed, can also be generated with the gateway system (life technologies), a system which is based on DNA fusion by recombination. An advantageous example of molecular modeling is the structure-based design of compositions that bind to HIV reverse transcriptase; this is described in Mao, Sudbeck, Venkatachalam and Uckun (2000). Biochem. Pharmacol. 60: 1251-1265.
Die Identifizierung der Bindungsstelle des Arzneimittels mittels Bindungs-spezifischer Mutagenese und die Analyse chimärer Proteine kann beispielsweise durch Modifikationen in der primären (Poly)peptidsequenz, die die Affinität des Arzneimittels beeinflussen, erfolgen; dies ermöglicht üblicherweise eine genaue Kartierung der Bindungstasche für den Inhibitor bzw. das daraus konstituierte Arzneimittel.The identification of the binding site of the drug by means of binding-specific mutagenesis and the analysis of chimeric proteins can take place, for example, by modifications in the primary (poly) peptide sequence which influence the affinity of the drug; this usually enables precise mapping of the binding pocket for the inhibitor or the drug constituted therefrom.
Bezüglich Schritt (2) können die folgenden Protokolle herangezogen werden: Sobald die Effektorstelle für den Inhibitor kartiert worden ist, können die genauen Reste, die mit verschiedenen Teilen des Inhibitors interagieren, identifiziert werden mittels einer Kombination aus der aus den Mutagenese-Untersuchungen und Computersimulationen der Struktur der Bindungsstelle erhaltenen Informationen, vorausgesetzt, daß die genaue drei-dimensionale Struktur des Inhibitors/ Arzneimittels bekannt ist (ist dies nicht der Fall, kann diese durch rechnerische Simulation kalkuliert werden). Wenn der Inhibitor selbst ein Peptid ist, kann es auch mutiert werden, um zu bestimmen, welche Resten mit anderen Reste in dem gewünschten Polypeptid interagieren.Regarding step (2), the following protocols can be used: Once the effector site for the inhibitor has been mapped, the exact residues that interact with different parts of the inhibitor can be identified using a combination of those from the mutagenesis studies and computer simulations of the Structure of the binding site information provided that the exact three-dimensional structure of the inhibitor / drug is known (if not, this can be calculated) Simulation can be calculated). If the inhibitor itself is a peptide, it can also be mutated to determine which residues interact with other residues in the desired polypeptide.
Schließlich kann in Schritt (3) der Inhibitor zur Erhöhung seiner Bindungsaffinität oder seiner Potenz und Spezifizität modifiziert werden. Wenn beispielsweise elektrostatische Wechselwirkungen zwischen einem bestimmten Rest des gewünschten Polypeptids und einem Bereich des Inhibitors/Arzneimittelmoleküls bestehen, kann die Gesamtladung in diesem Bereich modifiziert werden, wodurch sich diese spezielle Wechselwirkung erhöht.Finally, in step (3) the inhibitor can be modified to increase its binding affinity or its potency and specificity. For example, if there are electrostatic interactions between a particular residue of the desired polypeptide and a region of the inhibitor / drug molecule, the total charge in that region can be modified, thereby increasing this particular interaction.
Computerprogramme können bei der Identifizierung von Bindungsstellen hilfreich sein. So können geeignete Computerprogramme zur Identifizierung von interaktiven Stellen eines vermeintlichen Inhibitors und dem Polypeptid durch Computergestütztes Suchen nach Komplementärstrukturmotiven verwendet werden (Fassina, Immunomethods 5 (1994), 114-120). Weitere geeignete Computersysteme für das Computer-gestützte Design von Proteinen und Peptiden sind im Stand der Technik beschrieben, z.B. in Berry, Biochem. Soc. Trans. 22 (1994), 1033-1036; Wodak, Ann. N. Y. Acad. Sei. 501 (1987), 1-13; Pabo, Biochemistry 25 (1986), 5987-5991. Modifizierungen des (Poly)peptids können z.B. durch Peptidomimetics hergestellt werden. Andere Inhibitoren können auch mittels Synthese von kombinatorischen Peptidomimetic-Bibliotheken durch sukzessive chemische Modifizierung und Testen der erhaltenen Zusammensetzungen identifiziert werden. Verfahren zur Herstellung und Verwendung von kombinatorischen Peptidomimetic-Bibliotheken sind im Stand der Technik beschrieben , z.B. in Ostresh, Methods in Enzymology 267 (1996), 220- 234 and Dorner, Bioorg. Med. Chem. 4 (1996), 709-715. Darüber hinaus kann die dreidimensionale und/oder kristallographische Struktur der Aktivatoren der Expression des erfindungsgemäßen (Poly)peptids für das Design von peptidomimetischen Aktivatoren verwendet werden, z.B. in Verbindung mit dem erfindungsgemäß identifizierten (Poly)peptid (Rose, Biochemistry 35 (1996), 12933- 12944; Rutenber, Bioorg. Med. Chem. 4 (1996), 1545-1558). Besonders bevorzugt ist im erfindungsgemäßen Verfahren, daß die Bindungsstellen in Schritt (a) durch Stellen-spezifische Mutagenese ermittelt werden.Computer programs can be helpful in identifying binding sites. Suitable computer programs can thus be used to identify interactive sites of a putative inhibitor and the polypeptide by computer-assisted searching for complementary structure motifs (Fassina, Immunomethods 5 (1994), 114-120). Other suitable computer systems for the computer-aided design of proteins and peptides are described in the prior art, for example in Berry, Biochem. Soc. Trans. 22: 1033-1036 (1994); Wodak, Ann. NY Acad. Be. 1987, 501: 1-13; Pabo, Biochemistry 25 (1986), 5987-5991. Modifications of the (poly) peptide can be produced, for example, by peptidomimetics. Other inhibitors can also be identified by synthesizing combinatorial peptidomimetic libraries through successive chemical modification and testing of the compositions obtained. Methods for the production and use of combinatorial peptidomimetic libraries are described in the prior art, for example in Ostresh, Methods in Enzymology 267 (1996), 220-234 and Dorner, Bioorg. Med. Chem. 4 (1996), 709-715. In addition, the three-dimensional and / or crystallographic structure of the activators of the expression of the (poly) peptide according to the invention can be used for the design of peptidomimetic activators, for example in connection with the (poly) peptide identified according to the invention (Rose, Biochemistry 35 (1996), 12933 - 12944; Rutenber, Bioorg. Med. Chem. 4 (1996), 1545-1558). It is particularly preferred in the method according to the invention that the binding sites in step (a) are determined by site-specific mutagenesis.
Eine weitere bevorzugte Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens umfaßt ferner die Verbesserung der pharmakologischen Eigenschaften des nach dem erfindungsgemäßen Verfahren identifizierten Inhibitors oder des nach dem erfindungsgemäßen Verfahren verbesserten Inhibitors, wobei der Inhibitor als Leitstruktur weiter modifiziert wird, um ein modifiziertes aktives Zentrum, ein modifiziertes Aktivitätsspektrum, eine modifizierte Organspezifizität, eine verbesserte Aktivität, eine verminderte Toxizität (einen verbesserten therapeutischen Index), verminderte Nebenwirkungen, einen zeitlich versetzten Beginn der therapeutischen Wirksamkeit oder der Länge der therapeutischen Wirksamkeit, veränderte pharmakokinetische Parameter (Resorption, Distribution, Metabolismus oder Exkretion), modifizierte physikochemische Parameter (Löslichkeit, hygroskopische Eigenschaften, Farbe, Geschmack, Geruch, Stabilität, Zustandsform), verbesserte generelle Spezifizität, Organ-/Gewebespezifizität und/oder eine optimierte Verabreichungsform und -route aufweist, was durch die Veresterung von Carboxylgruppen, Hydoxylgruppen mit Carbonsäuren, Hydroxylgruppen zu bespielweise Phosphaten, Pyrophosphaten, Sulfaten, „Hemisukzinaten" oder die Bildung von pharmazeutisch verträglichen Salzen, pharmazeutisch verträglichen Komplexen oder die Synthese von pharmakologisch aktiven Polymeren oder die Einführung von hydrophilen Gruppen, die Einführung bzw. den Austausch von Substituenten in Aromaten oder Seitenketten, die Veränderung des Substituentenmusters oder der Modifikation durch die Einführung von isosterischen oder bioisosterischen Gruppen oder die Synthese von homologen Verbindungen, bzw. der Einführung von verzweigten Seitenketten, der Konversion von Alkylsubstituenten zu zyklischen Analogen, der Derivatisierung von Hydroxylgruppen zu Ketalen oder Acetalen, der N-Acetylierung zu Amiden, Phenylcarbamaten, der Synthese von Mannich-Basen bzw. Iminen oder durch die Umwandlung von Ketonen, Aldehyden in Schiffs-Basen, Oxime, Acetale, Ketale, Enolester, Oxaholidine, Thiozolidine oder deren Kombinationen erreicht wird. Die verschiedenen vorstehend dargestellten Schritte sind allgemein bekannt. Sie beziehen ein oder beruhen auf quantitativen Analysen von Struktur-Aktions- Beziehungen (QSAR); vgl. Kubinyi, „Hausch-Analysis and Related Approaches", VCH Verlag, Weinheim 1992, sowie kombinatorischer (Bio)chemie, klassischer Chemie und anderen Ansätzen; vgl. z.B. Holzgrabe und Bechtold, Deutsche Apotheker Zeitung 140(8) (2000), 813-823.A further preferred embodiment of the method according to the invention further comprises the improvement of the pharmacological properties of the inhibitor identified according to the method according to the invention or of the inhibitor improved according to the method according to the invention, the inhibitor being further modified as a lead structure to include a modified active center, a modified activity spectrum, a modified organ specificity, improved activity, reduced toxicity (an improved therapeutic index), reduced side effects, a delayed start of therapeutic activity or the length of therapeutic activity, changed pharmacokinetic parameters (absorption, distribution, metabolism or excretion), modified physicochemical parameters (Solubility, hygroscopic properties, color, taste, smell, stability, condition), improved general specificity, organ / tissue specific icity and / or an optimized form and route of administration, which by the esterification of carboxyl groups, hydroxyl groups with carboxylic acids, hydroxyl groups, for example, phosphates, pyrophosphates, sulfates, "hemisuccinates" or the formation of pharmaceutically acceptable salts, pharmaceutically acceptable complexes or the synthesis of pharmacologically active polymers or the introduction of hydrophilic groups, the introduction or exchange of substituents in aromatics or side chains, the change of the substituent pattern or the modification by the introduction of isosteric or bioisosteric groups or the synthesis of homologous compounds, or the introduction of branched side chains, the conversion of alkyl substituents to cyclic analogs, the derivatization of hydroxyl groups to ketals or acetals, the N-acetylation to amides, phenyl carbamates, the synthesis of Mannich bases or imines or by the conversion of ketones, aldehydes in ship bases, oximes, acetals, ketals, enol esters, oxaholidines, thiozolidines or combinations thereof. The various steps outlined above are well known. They involve or are based on quantitative analyzes of structure-action relationships (QSAR); see. Kubinyi, "Hausch-Analysis and Related Approaches", VCH Verlag, Weinheim 1992, as well as combinatorial (bio) chemistry, classical chemistry and other approaches; see e.g. Holzgrabe and Bechtold, Deutsche Apotheker Zeitung 140 (8) (2000), 813- 823rd
In einer anderen bevorzugten Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahrens wird der identifizierte oder verbesserte Inhibitor durch Peptidomimetics pharmakologisch weiter verbessert.In another preferred embodiment of the method according to the invention, the identified or improved inhibitor is further pharmacologically improved by peptidomimetics.
Auf Peptidomimetics beruhende Ansätze sind im Stand der Technik bekannt und beispielsweise in Rose, Biochemistry 35 (1996), 12933-12944 oder Rutenber, Bioorg. Med. Chem. 4 (1996), 1545-1558 beschrieben worden.Approaches based on peptidomimetics are known in the prior art and are described, for example, in Rose, Biochemistry 35 (1996), 12933-12944 or Rutenber, Bioorg. Med. Chem. 4 (1996), 1545-1558.
Erfindungsgemäß ist ferner bevorzugt, daß der Inhibitor der Haarwuchsstorung ein Aktivator der Transkription oder Translation des Gens, der mRNA oder ein Aktivator der Aktivität des Polypeptids ist.It is further preferred according to the invention that the inhibitor of hair growth disturbance is an activator of the transcription or translation of the gene, the mRNA or an activator of the activity of the polypeptide.
In einer anderen bevorzugten Ausführungsform des erfindungsgemäßen Verfahren ist der Inhibitor der Haarwuchsstorung ein Inhibitor der Transkription oder Translation des Gens, der mRNA oder ein Inhibitor der Aktivität des Polypeptids.In another preferred embodiment of the method according to the invention, the inhibitor of hair growth disturbance is an inhibitor of the transcription or translation of the gene, the mRNA or an inhibitor of the activity of the polypeptide.
Die beiden vorstehenden bevorzugten Ausführungsformen wurden bereits vorstehend näher erläutert.The two preferred embodiments described above have already been explained in more detail above.
Die Erfindung betrifft in einer weiteren bevorzugten Ausführungsform ein Verfahren ferner umfassend die Herstellung eines Arzneimittels oder Medizinpräparates, wobei der nach dem erfindungsgemäßen Verfahren erhaltene oder verbesserte Inhibitor mit einem pharmazeutisch verträglichen Träger oder Verdünnungsmittel formuliert wird. Beispiele für geeignete pharmazeutisch verträgliche Träger und/oder Verdünnungsmittel sind dem Fachmann bekannt und umfassen z.B. Phosphatgepufferte Kochsalzlösungen, Wasser, Emulsionen, wie z.B. Öl/Wasser-Emulsionen, verschiedene Arten von Netzmitteln oder Detergenzien, sterile Lösungen, etc. Arzneimittel, die solche Träger umfassen, können mittels bekannter konventioneller Methoden formuliert werden. Diese Arzneimittel können einem Individuum in einer geeigneten Dosis verabreicht werden. Die Verabreichung kann oral oder parenteral erfolgen, z.B. intravenös, intraperitoneal, subcutan, intramuskulär, lokal, intranasal, intrabronchial, oral oder intradermal, oder über einen Katheter an einer Stelle in einer Arterie. Präparate für eine parenterale Verabreichung umfassen sterile wäßrige oder nicht-wäßrige Lösungen, Suspensionen und Emulsionen. Beispiele für nicht-wäßrige Lösungsmittel sind Propylenglykol, Polyethylenglykol, pflanzliche Öle wie z.B. Olivenöl, und organische Esterverbindungen wie z.B. Ethyloleat, die für Injektionen geeignet sind. Wäßrige Träger umfassen Wasser, alkoholisch-wäßrige Lösungen, Emulsionen, Suspensionen, Salzlösungen und gepufferte Medien. Parenterale Träger umfassen Natriumchlorid-Lösungen, Ringer-Dextrose, Dextrose und Natriumchlorid, Ringer-Laktat und gebundene Öle. Intravenöse Träger umfassen z.B. Flüssigkeits-, Nährstoff- und Elektrolyt-Ergänzungsmittel (wie z.B. solche, die auf Ringer-Dextrose basieren). Das Arzneimittel kann außerdem Konservierungsmittel und andere Zusätze umfassen, wie z.B. antimikrobielle Verbindungen, Antioxidantien, Komplexbildner und inerte Gase. Des weiteren können, abhängig von der beabsichtigten spezifischen Verwendung, andere Wirkstoffe wie z.B. Interleukine, Wachstumsfaktoren, Differenzierungsfaktoren, Interferone, chemotaktische Proteine oder ein unspezifisches immunmodulatorisches Agens enthalten sein. Die Art der Dosierung wird vom behandelnden Arzt entsprechend den klinischen Faktoren bestimmt. Es ist dem Fachmann bekannt, daß die Art der Dosierung von verschiedenen Faktoren abhängig ist, wie z.B. der Körpergröße bzw. dem Gewicht, der Körperoberfläche, dem Alter, dem Geschlecht oder der allgemeinen Gesundheit des Patienten, aber auch von dem speziell zu verabreichenden Mittel, der Dauer und Art der Verabreichung, und von anderen Medikamenten, die möglicherweise parallel verabreicht werden. Eine typische Dosis kann z.B. in einem Bereich zwischen 0,001 und 1000 μg liegen, wobei Dosen unterhalb oder oberhalb dieses beispielhaften Bereiches, vor allem unter Berücksichtigung der oben erwähnten Faktoren, vorstellbar sind. Im allgemeinen sollte sich bei regelmäßiger Verabreichung der erfindungsgemäßen Zusammensetzung die Dosis in einem Bereich zwischen 1 μg- und 10 mg-Einheiten pro Tag befinden. Üblicherweise werden die Wirkstoffe in diesen Zubereitungen in einer Konzentration von größer als 10 μg/ml eines physiologischen Puffers vorliegen. Sie können aber auch in fester Form in einer Konzentration von 0,1 bis 99,5 Gew.% der Gesamtmischung vorhanden sein. Im allgemeinen hat es sich als vorteilhaft erwiesen, den oder die Wirkstoffe in Gesamtmengen von etwa 0,001 bis 100 mg/kg, bevorzugt in Gesamtmengen von etwa 0,01 bis 10 mg/kg Körpergewicht je 24 Stunden, gegebenenfalls als Dauerinfusion oder in Form von mehreren Einzelgaben, zur Erzielung des gewünschten Ergebnisses zu verabreichen. Wird die Zusammensetzung intravenös verabreicht, sollte sich die Dosis in einem Bereich zwischen 1 μg- und 10 mg-Einheiten pro Kilogramm Körpergewicht pro Tag befinden. Das Arzneimittel kann topisch, lokal oder systemisch verabreicht werden.In a further preferred embodiment, the invention relates to a method further comprising the production of a medicament or medical preparation, the inhibitor obtained or improved by the method according to the invention being formulated with a pharmaceutically acceptable carrier or diluent. Examples of suitable pharmaceutically acceptable carriers and / or diluents are known to the person skilled in the art and include, for example, phosphate-buffered saline solutions, water, emulsions such as, for example, oil / water emulsions, various types of wetting agents or detergents, sterile solutions, etc. Medicaments which comprise such carriers , can be formulated using known conventional methods. These drugs can be administered to an individual in an appropriate dose. Administration can be oral or parenteral, for example intravenous, intraperitoneal, subcutaneous, intramuscular, local, intranasal, intrabronchial, oral or intradermal, or via a catheter at one location in an artery. Preparations for parenteral administration include sterile aqueous or non-aqueous solutions, suspensions and emulsions. Examples of non-aqueous solvents are propylene glycol, polyethylene glycol, vegetable oils such as olive oil, and organic ester compounds such as ethyl oleate, which are suitable for injections. Aqueous carriers include water, alcoholic aqueous solutions, emulsions, suspensions, saline solutions and buffered media. Parenteral carriers include sodium chloride solutions, Ringer's dextrose, dextrose and sodium chloride, Ringer's lactate, and bound oils. Intravenous carriers include, for example, liquid, nutrient and electrolyte supplements (such as those based on Ringer's dextrose). The drug may also include preservatives and other additives such as antimicrobial compounds, antioxidants, complexing agents and inert gases. Furthermore, depending on the intended specific use, other active ingredients such as interleukins, growth factors, differentiation factors, interferons, chemotactic proteins or a non-specific immunomodulatory agent can be included. The treating doctor determines the type of dosage according to the clinical factors. It is known to the person skilled in the art that the type of dosage depends on various factors, such as, for example, the body size or weight, the body surface, the age, gender or general health of the patient, but also on the agent to be administered specifically, the duration and mode of administration, and other medications that may be administered in parallel. A typical dose can be, for example, in a range between 0.001 and 1000 μg, with doses below or above this exemplary range, especially taking into account the factors mentioned above. In general, with regular administration of the composition according to the invention, the dose should be in a range between 1 μg and 10 mg units per day. The active substances in these preparations will usually be present in a concentration of greater than 10 μg / ml of a physiological buffer. However, they can also be present in solid form in a concentration of 0.1 to 99.5% by weight of the total mixture. In general, it has proven to be advantageous to use the active ingredient (s) in total amounts of about 0.001 to 100 mg / kg, preferably in total amounts of about 0.01 to 10 mg / kg body weight per 24 hours, optionally as a continuous infusion or in the form of several Single doses to be administered to achieve the desired result. If the composition is administered intravenously, the dose should be in the range between 1 μg and 10 mg units per kilogram of body weight per day. The drug can be administered topically, locally or systemically.
Außerdem betrifft die Erfindung die Verwendung eines nach dem erfindungsgemäßen Verfahren identifizierten Inhibitors zur Herstellung eines Arzneimittels oder Medizinproduktes zur Vorsorge oder Behandlung von Haarwuchsstorungen.In addition, the invention relates to the use of an inhibitor identified by the method according to the invention for the manufacture of a medicament or medical device for the prevention or treatment of hair growth disorders.
Schließlich betrifft die Erfindung eine Zusammensetzung enthaltend einen oder mehrere der Inhibitoren, die nach dem erfindungsgemäßen Verfahren identifiziert oder verbessert wurden.Finally, the invention relates to a composition comprising one or more of the inhibitors which have been identified or improved by the method according to the invention.
Bevorzugt ist die Zusammensetzung eine pharmazeutische Zusammensetzung. In dieser Ausführungsform enthält die Zusammensetzung einen wie vorstehend beschriebenen pharmazeutisch verträglichen Träger oder ein pharmazeutisch verträgliches Verdünnungsmittel.The composition is preferably a pharmaceutical composition. In this embodiment, the composition contains a pharmaceutically acceptable carrier or diluent as described above.
Alternativ dazu ist die Zusammensetzung eine diagnostische Zusammensetzung. Die einzelnen Komponenten der diagnostischen Zusammensetzung sind in vorzugsweise einem oder mehreren Containern verpackt. Diese können wiederum in einer für den Verkauf gedachten Verpackung, versehen mit einer entsprechenden Anleitung zur Benutzung der diagnostischen Zusammensetzung (des diagnostischen Kits) verpackt sein.Alternatively, the composition is a diagnostic composition. The individual components of the diagnostic composition are preferred packed in one or more containers. These can in turn be packed in packaging intended for sale, provided with appropriate instructions for using the diagnostic composition (the diagnostic kit).
Die Figuren zeigen:The figures show:
Figur 1 :Figure 1:
RNA in situ Hybridisierung für zwei Gene (AF020790 und X81581 ) während zweier Stadien des Haarzyklus (Anagen, Catagen).RNA in situ hybridization for two genes (AF020790 and X81581) during two stages of the hair cycle (anagen, catagen).
Figur 2:Figure 2:
Darstellung untersuchter Zeitpunkte gemäß der Korrespondenzanalyse. Jedem Zeitpunkt (= Vektor, dessen Dimensionen durch die Expressionswerte für die untersuchten Gene zum gegebenen Zeitpunkt beschrieben werden) wird eine Koordinate im zweidimensionalen Raum zugeordnet.Presentation of examined points in time according to the correspondence analysis. A coordinate in two-dimensional space is assigned to each point in time (= vector, the dimensions of which are described by the expression values for the genes examined at the given point in time).
Figur 3:Figure 3:
Darstellung einzelner Gene gemäß der Korrespondenzanalyse. Jedem Gen (= Vektor, dessen Dimensionen durch die Expressionswerte zu den unterschiedlichen Zeitpunkten definiert werden) wird eine Koordinate im zweidimensionalen Raum zugeordnet.Representation of individual genes according to the correspondence analysis. A coordinate in two-dimensional space is assigned to each gene (= vector, the dimensions of which are defined by the expression values at the different times).
Figuren 4-9:Figures 4-9:
Standardisierte Expressionsprofile für ausgewählte Gengruppen, in Einzel- und kombinierter Darstellung.Standardized expression profiles for selected gene groups, in single and combined representation.
Betrachtet man die Expressionswerte für ein Gen über einen vollständigen Zyklus hinweg als Häufigkeiten, so legt dies eine Standardisierung der Werte auf Summe 1 nahe. Dadurch wird die graphische Darstellung der Genexpression lediglich durch deren zeitlichen Verlauf bestimmt, wohingegen die absoluten Expressionswerte unberücksichtigt bleiben. Dies macht die Expressionsmuster von Genen mit stark unterschiedlichen absoluten Expressionswerten vergleichbar. Die Tabellen A-D bilden die Grundlage für die Figuren 4-7. In den Figuren dargestellt sind standardisierte Expressionsprofile; aus Gründen der Übersichtlichkeit sind jeweils nur die ersten 10 Gene einer Liste (Tabelle) dargestellt.If one considers the expression values for a gene over a complete cycle as frequencies, this suggests a standardization of the values to sum 1. As a result, the graphical representation of the gene expression is only determined by its time course, whereas the absolute expression values are disregarded. This makes it possible to compare the expression patterns of genes with widely differing absolute expression values. The tables AD form the basis for Figures 4-7. Standardized expression profiles are shown in the figures; for reasons of clarity, only the first 10 genes of a list (table) are shown.
Figuren 10 und 11 :Figures 10 and 11:
Darstellung ausgewählter Gene und der untersuchten Zeitpunkte gemäß derRepresentation of selected genes and the examined times according to the
Korrespondenzanalyse.Correspondence Analysis.
In beiden Figuren wurde nur auf die in Tabellen A-D aufgeführten Gene zurückgegriffen und die Darstellung aus Gründen der Übersichtlichkeit auf jeweils nur 10 Gene beschränkt. Figur 11 kombiniert die Figuren 2 und 10.In both figures, only the genes listed in Tables A-D were used and the representation was limited to only 10 genes for reasons of clarity. Figure 11 combines Figures 2 and 10.
Die Beispiele erläutern die Erfindung.The examples illustrate the invention.
Beispiel 1 : Erstellung eines molekularen Trichogramms im MaussystemExample 1: Creation of a molecular trichogram in the mouse system
Genexpressionsprofilgene expression profile
Haut vom Rücken von BALB/c Mäusen verschiedenen postnatalen Alters, welche vollständig mit Haar bedeckt war, wurde isoliert. Dabei wurde ein vollständiger Haarzyklus vom ersten Anagen bis zum zweiten Anagen erfaßt. Für jede Microarray- Hybridisierung wurde Haut von 3 bis 4 Mäusen gesammelt, mRNA isoliert und zu markierter cRNA umgesetzt, welche hybridisiert wurde mit Mu19K Microarrays, die etwa 20.000 Gene nach Angaben des Herstellers (Affymetrix) repräsentieren. Zur Rohdatenanalyse wurde das Affymetrix Microarray Programm verwendet.Skin from the back of BALB / c mice of various postnatal ages, which was completely covered with hair, was isolated. A complete hair cycle was recorded from the first anagen to the second anagen. For each microarray hybridization, skin from 3 to 4 mice was collected, mRNA isolated and converted to labeled cRNA, which was hybridized with Mu19K microarrays which represent about 20,000 genes according to the manufacturer (Affymetrix). The Affymetrix microarray program was used for raw data analysis.
Statistische Analyse der DatenStatistical analysis of the data
Bei Verwendung des Affymetrix Microarray Programms wurden einige Datensätze ausgeschlossen, die definierte Werte für die Expression bestimmter Gene zeigten. Messung wurden als unzuverlässig oder uninteressant betrachtet, wenn das „Positive Signal" unter 0,35 lag, der Absolutwert A (Abwesenheit) oder der Differenzwert NC (keine Veränderung) war. Aus diesem Grund wurden Datensätze, in denen alle Datenpunkte eines dieser Kriterien erfüllen von der weiteren Analyse ausgeschlossen. Zusätzlich wurden Datensätze, bei denen alle Differenzwerte NC entsprachen von der statistischen Auswertung und einer unabhängigen Überprüfung ausgeschlossen. Unter Beachtung der Tatsache, daß es keine bestimmte Untergrenze für die durchschnittliche Differenz gibt, wurde diese willkürlich als 100 festgesetzt, wenn diese unter dem genannten Wert lag. Bei max als maximale und min als minimale durchschnittliche Differenz in einem Datensatz wurden nur solche Datensätze weiter analysiert, bei denen die Werte folgende Kriterien erfüllten: max > 500 und max/min > 5, max > 600 und max/min > 4, max > 700 und max/min > 3,5. Hierbei wurde der Teil Gene, mit denen keine zuverlässige Messung erhalten wurde, auf einem Minimum gehalten. Unter Verwendung der aufgeführten Kriterien wurden 2173 Gene mit signifikanter Änderung im Expressionsniveau während des Haarzyklus weiter analysiert. Gemäß ihres Expressionsmaximums während des Haarzyklus (frühes Anagen, mittleres Anagen, spätes Anagen / Beginn von Catagen, Catagen und Telogen) wurden sie in den Tabellen 1 -5 zusammengefaßt/gruppiert.When using the Affymetrix microarray program, some data sets were excluded that showed defined values for the expression of certain genes. Measurement were considered unreliable or uninteresting if that "Positive signal" was below 0.35, the absolute value was A (absence) or the difference value was NC (no change). For this reason, data records in which all data points meet one of these criteria were excluded from further analysis. where all difference values corresponded to NC from the statistical evaluation and an independent check .. Considering the fact that there is no certain lower limit for the average difference, this was arbitrarily set to 100 if it was below the mentioned value maximum and min as the minimum average difference in a data set, only those data sets were further analyzed in which the values met the following criteria: max> 500 and max / min> 5, max> 600 and max / min> 4, max> 700 and max / min> 3.5, the part of genes with which no reliable measurement was obtained was kept to a minimum. Using the criteria listed, 2173 genes with a significant change in expression level during the hair cycle were further analyzed. According to their maximum expression during the hair cycle (early anagen, medium anagen, late anagen / start of catagen, catagen and telogen), they were summarized / grouped in tables 1-5.
Für eine weitergehende Analyse wurde die gegenseitige Abhängigkeit von Zeitpunkten und Genexpressionsprofilen unter Verwendung der Korrespondenzanalyse (Greenacre, 1992) bestimmt. Beginnend mit einem Gen von Interesse wurden Gene mit ähnlichem Expressionmuster unter Verwendung von "jackknife"-Abständen (Heyer et al., 1999) bestimmt. Diese Analysen sind in Beispiel 2 exemplarisch dargestellt und sollen illustrieren, wie detailliertere Informationen aus dem Datenmaterial extrahiert werden können.For further analysis, the interdependency of times and gene expression profiles was determined using the correspondence analysis (Greenacre, 1992). Starting with a gene of interest, genes with a similar expression pattern were determined using "jackknife" distances (Heyer et al., 1999). These analyzes are shown as examples in Example 2 and are intended to illustrate how more detailed information can be extracted from the data.
RT-PCRRT-PCR
Zur Kontrolle der Ergebnisse der Microarray-Hybridisierungen wurde mRNA postnatal aus der Rückenhaut von BALB/c Mäusen verschiedenen Alters isoliert. Nach Umschreiben in cDNA wurden PCR-Amplifikationen unter Verwendung von Gen-spezifischen Primern durchgeführt. Die Amplifikation wurde mit 25 bis 40 Zyklen durchgeführt, um die Produkte in einem linearen Bereich zu halten und durch Auftrennung auf einem 1 ,5% Agarose-Gel analysiert.To check the results of the microarray hybridizations, mRNA was isolated postnatally from the dorsal skin of BALB / c mice of different ages. After rewriting into cDNA, PCR amplifications were carried out using gene-specific primers. The amplification was done with 25 to 40 cycles performed to keep the products in a linear range and analyzed by separation on a 1.5% agarose gel.
In-situ HybridisierungIn situ hybridization
Zur Bestimmung des Genexpressionsprofils in der Haut wurden postnatal Querschnitte von der Rückenhaut von BALB/c Mäusen verschiedenen Alters angefertigt. Im wesentlichen wurden nicht radioaktive in-situ Hybridisierungen durchgeführt wie bereits beschrieben (Beul und Boehm, 2000). Sowohl „sense" als auch „antisense" Stränge von genspezifischen Fragmenten wurden als Sonden verwendet. Diese Fragmente wurden durch PCR unter Verwendung genspezifischer Primer hergestellt.To determine the gene expression profile in the skin, cross-sections of the back skin of BALB / c mice of different ages were made postnatally. Essentially, non-radioactive in-situ hybridizations were carried out as already described (Beul and Boehm, 2000). Both "sense" and "antisense" strands of gene-specific fragments were used as probes. These fragments were generated by PCR using gene-specific primers.
In Figur 1 ist die RNA in situ Hybridisierung für 2 Gene mit entgegengesetztem Expressionsverlauf während des Haarzyklus dargestellt.In Figure 1, the RNA in situ hybridization is shown for 2 genes with opposite expression course during the hair cycle.
Figur 1 :Figure 1:
In situ Hybridisierung zur Bestimmung der Expressionsorte von Genen im Haarfollikel.In situ hybridization to determine the expression locations of genes in the hair follicle.
Oben: AF020790, ein Mitglied aus Gruppe 3, ist während des Anagens im Präkortex des Haarfollikels exprimiert. Im Catagen und Telogen ist keinerlei Genexpression nachweisbar. Das Maximum der Expression wird im mittleren bis späten Anagen erreicht. Unten: Für X81581 als Vertreter der Gruppe 4 ist im Anagen keine signifikante Expression nachweisbar. Im Catagen, während dessen das Expressionsmaximum erreicht wird, ist das Gen in den Zellen der Dermalpapille aktiv. AA000708 AB002664 AI506524 AI854638 AW122355 M98530Above: AF020790, a member of Group 3, is expressed in the pre-cortex of the hair follicle during anagen. No gene expression is detectable in Catagen and Telogen. The maximum expression is reached in the middle to late days. Bottom: No significant expression is detectable for X81581 as a representative of group 4 in the anagen. In catagen, during which the expression maximum is reached, the gene is active in the cells of the dermal papilla. AA000708 AB002664 AI506524 AI854638 AW122355 M98530
AA002843 AB007599 AI527642 AI877116 A 122433 U01915AA002843 AB007599 AI527642 AI877116 A 122433 U01915
AA032310 AB009615 AI550379 AI882309 AW122609 U02079AA032310 AB009615 AI550379 AI882309 AW122609 U02079
AA050985 AB010833 AI574275 AI891493 A 122632 U05837AA050985 AB010833 AI574275 AI891493 A 122632 U05837
AA096556 AB012727 AI585945 AI893814 AW123269 U20159AA096556 AB012727 AI585945 AI893814 AW123269 U20159
AA152809 AB020886 AI594294 AI956194 A 123386 U21906AA152809 AB020886 AI594294 AI956194 A 123386 U21906
AA154606 AB041587 AI594717 AJ001261 AW123514 U22324AA154606 AB041587 AI594717 AJ001261 AW123514 U22324
AA163960 AC002397 AI596121 AJ002522 AW123683 U44389AA163960 AC002397 AI596121 AJ002522 AW123683 U44389
AA170203 AF004666 AI642389 AJ132616 AW123695 U56819AA170203 AF004666 AI642389 AJ132616 AW123695 U56819
AA178128 AF006196 AI648998 AJ132771 AW124101 U57393AA178128 AF006196 AI648998 AJ132771 AW124101 U57393
AA183595 AF012710 AI663687 AJ133533 AW124306 U60884AA183595 AF012710 AI663687 AJ133533 AW124306 U60884
AA200617 AF013119 AI834796 AJ223087 AW124719 U72644AA200617 AF013119 AI834796 AJ223087 AW124719 U72644
AA204302 AF013486 AI834822 AJ223361 A 124952 U76618AA204302 AF013486 AI834822 AJ223361 A 124952 U76618
AA240251 AF017111 AI835646 AJ245569 A 125170 U86405AA240251 AF017111 AI835646 AJ245569 A 125170 U86405
AA267422 AF024637 AI835703 AK002240 AW125284 U93583AA267422 AF024637 AI835703 AK002240 AW125284 U93583
AA269694 AF029791 AI835826 AK003194 AW125710 V00817AA269694 AF029791 AI835826 AK003194 AW125710 V00817
AA277664 AF029843 AI836721 AK003524 A 125757 V00821AA277664 AF029843 AI836721 AK003524 A 125757 V00821
AA388082 AF038008 AI838112 AK003838 A 209229 X00496AA388082 AF038008 AI838112 AK003838 A 209229 X00496
AA433547 AF064749 AI838320 AK005293 A 210333 X04017AA433547 AF064749 AI838320 AK005293 A 210333 X04017
AA444309 AF076156 AI838737 A 006444 AW212915 X06368AA444309 AF076156 AI838737 A 006444 AW212915 X06368
AA444797 AF083032 AI839232 AK018686 AW214225 X13333AA444797 AF083032 AI839232 AK018686 AW214225 X13333
AA500406 AF084524 AI839841 AK019964 A 214617 X16426AA500406 AF084524 AI839841 AK019964 A 214617 X16426
AA512730 AF090334 AI840035 AV027479 A 215808 X52490AA512730 AF090334 AI840035 AV027479 A 215808 X52490
AA546705 AF132744 AI840437 AV028168 AW228933 X53247AA546705 AF132744 AI840437 AV028168 AW228933 X53247
AA560171 AF143955 AI840577 AV033602 AW491689 X54401AA560171 AF143955 AI840577 AV033602 AW491689 X54401
AA592182 AF237917 AI841087 AV076672 AW555641 X57687AA592182 AF237917 AI841087 AV076672 AW555641 X57687
AA615200 AF262985 AI842612 AV117844 D13543 X58609AA615200 AF262985 AI842612 AV117844 D13543 X58609
AA615624 AI019999 AI843031 AV160578 D37837 X60671AA615624 AI019999 AI843031 AV160578 D37837 X60671
AA617489 AI020480 AI843040 AV211554 D44456 X62154AA617489 AI020480 AI843040 AV211554 D44456 X62154
AA624041 AI021125 AI843182 AV228966 D50031 X67668AA624041 AI021125 AI843182 AV228966 D50031 X67668
AA647303 AI049139 AI843574 AV230737 D86726 X67809AA647303 AI049139 AI843574 AV230737 D86726 X67809
AA647507 AI049398 AI843864 AV231601 D88791 X76066AA647507 AI049398 AI843864 AV231601 D88791 X76066
AA656550 AI060627 AI844626 AV263513 J03298 X78936AA656550 AI060627 AI844626 AV263513 J03298 X78936
AA666504 AI115746 AI844864 AV331859 J04992 X78990AA666504 AI115746 AI844864 AV331859 J04992 X78990
AA672634 AI116463 AI845380 AV334573 J05277 X87128AA672634 AI116463 AI845380 AV334573 J05277 X87128
AA681764 AI117666 AI845988 AW045453 L12447 X94915AA681764 AI117666 AI845988 AW045453 L12447 X94915
AA682063 AI120758 AI846341 AW045665 L20315 Y00225AA682063 AI120758 AI846341 AW045665 L20315 Y00225
AA691890 AI121796 AI846739 AW046072 L20343 Y09864AA691890 AI121796 AI846739 AW046072 L20343 Y09864
AA693175 AI121807 AI847177 AW046136 L22550 Z24722AA693175 AI121807 AI847177 AW046136 L22550 Z24722
AA718842 AI131895 AI847230 AW046748 L35032 Z31689AA718842 AI131895 AI847230 AW046748 L35032 Z31689
AA727413 AI132585 AI847267 AW047156 M10937 Z54209AA727413 AI132585 AI847267 AW047156 M10937 Z54209
AA733594 AI152741 AI847483 AW047224 M12347 Z72486AA733594 AI152741 AI847483 AW047224 M12347 Z72486
AA733937 AI154017 AI848448 A 047331 M12660AA733937 AI154017 AI848448 A 047331 M12660
AA756724 AI154249 AI848671 A 047744 M13500AA756724 AI154249 AI848671 A 047744 M13500
AA764332 AI154452 AI848835 AW048601 M13963AA764332 AI154452 AI848835 AW048601 M13963
AA790307 AI156274 AI848915 A 048860 M15501AA790307 AI156274 AI848915 A 048860 M15501
AA790898 AI173274 AI849532 AW049181 M18837AA790898 AI173274 AI849532 AW049181 M18837
AA791012 AI196645 AI851309 AW049504 M19279AA791012 AI196645 AI851309 AW049504 M19279
AA792425 AI314784 AI851574 A 050335 M21285AA792425 AI314784 AI851574 A 050335 M21285
AA792643 AI315312 AI851714 A 060556 M22531AA792643 AI315312 AI851714 A 060556 M22531
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AA915460 AI426284 AI852387 A 107813 M31312AA915460 AI426284 AI852387 A 107813 M31312
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AA929330 AI452117 AI852679 A 121237 M64360AA929330 AI452117 AI852679 A 121237 M64360
AA930519 AI466326 AI852777 AW121291 M64817AA930519 AI466326 AI852777 AW121291 M64817
AA959852 AI466577 AI853127 AW121823 M69069AA959852 AI466577 AI853127 AW121823 M69069
AA967585 AI481642 AI853303 AW122024 M76987AA967585 AI481642 AI853303 AW122024 M76987
AA981032 AI505194 AI853685 AW122038 M77174AA981032 AI505194 AI853685 AW122038 M77174
AA981342 AI505484 AI853924 A 122077 M91380 eAA981342 AI505484 AI853924 A 122077 M91380 e
AA007891 AA764384 AI120142 AI842846 AJ009634 A 049504AA007891 AA764384 AI120142 AI842846 AJ009634 A 049504
AA015575 AA764577 AI121731 AI842969 AJ010984 A 049684AA015575 AA764577 AI121731 AI842969 AJ010984 A 049684
AA017860 AA790833 AI122538 AI843178 AJ223293 A 049829AA017860 AA790833 AI122538 AI843178 AJ223293 A 049829
AA030475 AA794499 AI152262 AI843686 AJ223834 AW050102AA030475 AA794499 AI152262 AI843686 AJ223834 AW050102
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AA000708 AB002664,.1 AI506524 AI854638 A 122355 M98530.1AA000708 AB002664, .1 AI506524 AI854638 A 122355 M98530.1
AA002843 AB007599. .1 AI527642 AI877116 AW122433 U01915 .1AA002843 AB007599. .1 AI527642 AI877116 AW122433 U01915 .1
AA032310 AB009615. .1 AI550379 AI882309 AW122609 U02079 .1AA032310 AB009615. .1 AI550379 AI882309 AW122609 U02079 .1
AA050985 AB010833. .1 AI574275 AI891493 AW122632 U05837 .1AA050985 AB010833. .1 AI574275 AI891493 AW122632 U05837 .1
AA096556 AB012727. ,1 AI585945 AI893814 AW123269 U20159 .1AA096556 AB012727. , 1 AI585945 AI893814 AW123269 U20159 .1
AA152809 AB020886. .1 AI594294 AI956194 AW123386 U21906 .1AA152809 AB020886. .1 AI594294 AI956194 AW123386 U21906 .1
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AA163960 AC002397. .1 AI596121 AJ002522. .1 AW123683 U44389 .1AA163960 AC002397. .1 AI596121 AJ002522. .1 AW123683 U44389 .1
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AA388082 AF038008. .1 AI838112 AK003838. 1 AW209229 X00496. .1AA388082 AF038008. .1 AI838112 AK003838. 1 AW209229 X00496. .1
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AA444309 AF076156. 1 AI838737 AK006444. 1 A 212915 X06368. .1AA444309 AF076156. 1 AI838737 AK006444. 1 A 212915 X06368. .1
AA444797 AF083032. .1 AI839232 AK018686. 1 A 214225 X13333. .1AA444797 AF083032. .1 AI839232 AK018686. 1 A 214225 X13333. .1
AA500406 AF084524. 1 AI839841 AK019964. 1 A 214617 X16426. .1AA500406 AF084524. 1 AI839841 AK019964. 1 A 214617 X16426. .1
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AA285779 AF000236. .1 AI553451 AI882298 AW049860 22550. .1AA285779 AF000236. .1 AI553451 AI882298 AW049860 22550. .1
AA289666 AF009513, .1 AI591439 AI882309 AW049969 27439 .1AA289666 AF009513, .1 AI591439 AI882309 AW049969 27439 .1
AA387637 AF010254. .1 AI593508 AI882416 AW060645 L31397. .1AA387637 AF010254. .1 AI593508 AI882416 AW060645 L31397. .1
AA389905 AF012916. .1 AI593827 AI931692 AW060770 L48989. .1AA389905 AF012916. .1 AI593827 AI931692 AW060770 L48989. .1
AA407176 AF017258. .1 AI605579 AJ001633. .1 A 061110 L49507. .1AA407176 AF017258. .1 AI605579 AJ001633. .1 A 061110 L49507. .1
AA435436 AF019564. .1 AI641819 AJ005621. ,1 A 108371 M10937. .1AA435436 AF019564. .1 AI641819 AJ005621. , 1 A 108371 M10937. .1
AA530125 AF022072. .1 AI642389 AJ006474. ,1 AW120505 M12566, .1AA530125 AF022072. .1 AI642389 AJ006474. , 1 AW120505 M12566, .1
AA544955 AF024637. .1 AI645484 AJ007376. .1 A 121167 M12660, .1AA544955 AF024637. .1 AI645484 AJ007376. .1 A 121167 M12660, .1
AA549533 AF026481. .1 AI646750 AJ007972. .1 AW121222 M13500, .1AA549533 AF026481. .1 AI646750 AJ007972. .1 AW121222 M13500, .1
AA597090 AF029843. .1 AI647933 AJ010108. ,1 A 121438 M14220, .1AA597090 AF029843. .1 AI647933 AJ010108. , 1 A 121438 M14220, .1
AA600647 AF030513. .1 AI663687 AJ012754. .1 AW121470 M15501. .1AA600647 AF030513. .1 AI663687 AJ012754. .1 AW121470 M15501. .1
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AA619807 AF049850. .1 AI747654 AJ223361. 1 AW122012 M18194. .1AA619807 AF049850. .1 AI747654 AJ223361. 1 AW122012 M18194. .1
AA638815 AF055638. .1 AI787183 AJ239082. 1 AW122039 M18837. .1AA638815 AF055638. .1 AI787183 AJ239082. 1 AW122039 M18837. .1
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AA647405 AF064749. .1 AI790592 AK003152. 1 A 122101 M22479. .1AA647405 AF064749. .1 AI790592 AK003152. 1 A 122101 M22479. .1
AA655199 AF076156. .1 AI834796 AK003194. 1 A 122625 M27008. .1AA655199 AF076156. .1 AI834796 AK003194. 1 A 122625 M27008. .1
AA667270 AF077742. ,1 AI836034 AK003712. 1 AW123051 M27034. .1AA667270 AF077742. , 1 AI836034 AK003712. 1 AW123051 M27034. .1
AA670908 AF079528. ,1 AI836555 AK003906. 1 A 123189 M29010. .1AA670908 AF079528. , 1 AI836555 AK003906. 1 A 123189 M29010. .1
AA673260 AF084524. .1 AI837737 AK004064. 1 A 123372 M31419. ,1AA673260 AF084524. .1 AI837737 AK004064. 1A 123372 M31419. ,1
AA675580 AF090334. .1 AI837984 AK004670. 1 AW123773 M31680. ,1AA675580 AF090334. .1 AI837984 AK004670. 1 AW123773 M31680. ,1
AA709944 AF090696. .1 AI838503 AK006444. 1 A 123857 M31775. .1AA709944 AF090696. .1 AI838503 AK006444. 1A 123857 M31775. .1
AA710564 AF091390. ,1 AI838567 AK007458. 1 A 124125 M32490. .1AA710564 AF091390. , 1 AI838567 AK007458. 1 A 124125 M32490. .1
AA717826 AF093624. ,1 AI839436 AK008069. 1 A 124961 M34896. .1AA717826 AF093624. , 1 AI839436 AK008069. 1 A 124961 M34896. .1
AA727857 AF098633. ,1 AI840267 AK009092. 1 A 124975 M35244. .1AA727857 AF098633. , 1 AI840267 AK009092. 1 A 124975 M35244. .1
AA756506 AF099973. ,1 AI840283 AK009223. 1 AW124988 M35247. .1AA756506 AF099973. , 1 AI840283 AK009223. 1 AW124988 M35247. .1
AA759582 AF148216. ,1 AI840643 AK010169. 1 AW125094 M36579. .1AA759582 AF148216. , 1 AI840643 AK010169. 1 AW125094 M36579. .1
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AA789365 AF349573. .1 AI841894 AK017447. 1 AW125440 M57696. ,1AA789365 AF349573. .1 AI841894 AK017447. 1 AW125440 M57696. ,1
AA790442 AI006773 AI842031 AK018585. 1 A 208678 M64086. ,1AA790442 AI006773 AI842031 AK018585. 1 A 208678 M64086. ,1
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AA792425 AI035425 AI843572 AV056976 AW211637 M74123. ,1AA792425 AI035425 AI843572 AV056976 AW211637 M74123. ,1
AA792643 AI036047 AI843866 AV099920 AW215831 M81086. .1AA792643 AI036047 AI843866 AV099920 AW215831 M81086. .1
AA796759 AI048265 AI844722 AV101646 A 228671 M98530. .1AA796759 AI048265 AI844722 AV101646 A 228671 M98530. .1
AA797286 AI115769 AI844749 AV134101 A 230891 U02313. .1AA797286 AI115769 AI844749 AV134101 A 230891 U02313. .1
AA823048 AI116109 AI845609 AV170775 A 231026 U03419. 1 U10484.1 X67469.1AA823048 AI116109 AI845609 AV170775 A 231026 U03419. 1 U10484.1 X67469.1
U13705.1 X69064.1U13705.1 X69064.1
U15012.1 X73230.1U15012.1 X73230.1
U15541.1 X78682.1U15541.1 X78682.1
U16163.1 X84797.1U16163.1 X84797.1
U18869.1 X89998.1U18869.1 X89998.1
U19119.1 X90875.1U19119.1 X90875.1
U20159.1 X97227.1U20159.1 X97227.1
U20365.1 Y00500U20365.1 Y00500
U20949.1 Y07611U20949.1 Y07611
U21906.1 Y09257U21906.1 Y09257
U22324.1 Y10875U22324.1 Y10875
U25096.1 Y17808U25096.1 Y17808
U25844.1 Z11974U25844.1 Z11974
U27195.1 Z18272U27195.1 Z18272
U35741.1 Z49204U35741.1 Z49204
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U49430.1 Z80833U49430.1 Z80833
U51196.1U51196.1
U59488.1U59488.1
U68064.1U68064.1
U72032.1U72032.1
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U73820.1U73820.1
U76758.1U76758.1
U86108.1U86108.1
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U87948.1U87948.1
U88567.1U88567.1
U89876.1U89876.1
U93291.1U93291.1
U96684.1U96684.1
V00829.1V00829.1
V00830.1V00830.1
W08276 12396 82382W08276 12396 82382
X00496.1X00496.1
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X06454.1X06454.1
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X13335.1X13335.1
X13460.1X13460.1
X14432.X14432.
X14972.X14972.
X15202.X15202.
X16202.X16202.
X52046.X52046.
X52490.X52490.
X52643.1X52643.1
X53929.1X53929.1
X56397.1X56397.1
X58196.1X58196.1
X58251.1X58251.1
X58609.1X58609.1
X58628.1X58628.1
X59274.1X59274.1
X59846.X59846.
X60676.X60676.
X61597.X61597.
X61940.X61940.
X62622. Beispiel 2: Auswertung der Daten zum HaarzyklusX62622. Example 2: Evaluation of the data on the hair cycle
1. Rohdaten1. Raw data
Expression von ca. 20000 Genen zu 9 Zeitpunkten: 9, 15,17,19,20.5,24,25,27 und 31.Expression of approx. 20,000 genes at 9 points in time: 9, 15, 17, 19, 20, 25, 24, 25, 27 and 31.
Gene g und Zeitpunkte /':Gen g and times / ' :
Positive Fraction: Pos{g, /)Positive fraction: Pos {g, /)
Absolute Call: AbsCall(flf, /)Absolute Call: AbsCall (flf, /)
Difference Call: DiffCall(g, /) (nur für /' ε {9, 15, 17, 19, 20.5, 24, 25, 27})Difference Call: DiffCall (g, /) (only for / ' ε {9, 15, 17, 19, 20.5, 24, 25, 27})
Average Difference:AvgDiff(g, /)Average Difference: AvgDiff (g, /)
Positive Fraction, Absolute Call, Difference Call und Average Difference sind von Affymetrix verwendete Parameter, deren Definition sich aus den Beschreibungen der in der Analyse-Software von Affymetrix verwendeten Algorithmen ergibt.Positive Fraction, Absolute Call, Difference Call and Average Difference are parameters used by Affymetrix, the definition of which results from the descriptions of the algorithms used in the analysis software by Affymetrix.
2. Ausschluß- und Einschlußregeln2. Exclusion and inclusion rules
2.1 Ausschluß unzuverlässiger/uninteressanter Beobachtungen2.1 Exclusion of unreliable / uninteresting observations
Die Messung der Expression des Genes g zum Zeitpunkt i gilt als unzuverlässig oder uninteressant fallsThe measurement of the expression of the gene g at time i is considered unreliable or uninteresting if
Figure imgf000049_0001
Figure imgf000049_0001
• AbsCall(gf, /) =A oder• AbsCall (gf, /) = A or
• DiffCall(sf, /) =NC.• DiffCall (sf, /) = NC.
Erste Ausschlußreqel:First exclusion rule:
Alle Gene g, für die alle Zeitpunkte i eine der obigen Bedingungen erfüllt ist, werden ausgeschlossen. Zweite Ausschlußreqel:All genes g for which all times i one of the above conditions are met are excluded. Second exclusion rule:
Alle Gene g, mit DiffCallfg, i) =NC für alle i e {9, 15, 17, 19, 20.5, 24, 25, 27} werden ausgeschlossen.All genes g, with DiffCallfg, i) = NC for all i e {9, 15, 17, 19, 20.5, 24, 25, 27} are excluded.
Bei den verbleibenden Genen werden alle Average Difference Werte unter 100 auf 100 gesetzt.For the remaining genes, all average difference values below 100 are set to 100.
2.2 Auswahl nach Variation der Expression2.2 Selection based on variation of expression
SeiBe
M{g) = max AvgDiff(g, /)M {g) = max AvgDiff (g, /)
/ e {9,15,17,19,20.5,24,25,27,31 }/ e {9,15,17,19,20.5,24,25,27,31}
undand
m(g) = min AvgDiff(g, /). i e {9,15,17,19,20.5,24,25,27,31}m (g) = min AvgDiff (g, /). i e {9,15,17,19,20.5,24,25,27,31}
Sei Q(g) =M(g)lm(g).Let Q (g) = M (g) lm (g).
Einschlußreqel:Einschlußreqel:
Nur solche Gene g werden betrachtet, für die entwederOnly those genes g are considered for which either
• M(g) ≥ 500 und Q(g) ≥ 5 oder• M (g) ≥ 500 and Q (g) ≥ 5 or
• M{g) ≥ 600 und Q{g) ≥ 4 oder• M {g) ≥ 600 and Q {g) ≥ 4 or
• M(g) ≥ 700 und Q{g) ≥ 3.5.• M (g) ≥ 700 and Q {g) ≥ 3.5.
gut. 3. KorrespondenzanalyseGood. 3. Correspondence analysis
Die Average Difference Werte lassen sich als Häufigkeiten auffassen. Dies legt die Korrespondenzanalyse ([2]) als Mittel zur Untersuchung der Abhängingkeiten zwischen Zeitpunkten und Genen nahe. Figur 2 im Anhang zeigt die Anordnung der Zeitpunkte; Figur 3 zeigt die Anordnung der Gene. Die ersten beiden Koordinaten erklären über 82% der Variation in den Daten. Dies ist hoch signifikant. Bei durch zufällige und unabhängige genweise Permutation erzeugte Testdaten ergab sich über 500 Läufe ein Mittelwert von 29% und ein Maximalwert von 32%.The average difference values can be understood as frequencies. Correspondence analysis ([2]) suggests this as a means of examining the interdependencies between times and genes. Figure 2 in the Appendix shows the arrangement of the times; Figure 3 shows the arrangement of the genes. The first two coordinates explain over 82% of the variation in the data. This is highly significant. Test data generated by random and independent genetic permutation resulted in an average value of 29% and a maximum value of 32% over 500 runs.
4. Ausgewählte Genumgebungen4. Selected gene environments
Um die Expressionsprofile verschiedener Gene zu vergleichen, ist es sinnvoll, diese geeignet zu standardisieren. Man kann sich die Average Difference Werte in einer Tafel (Matrix) geschrieben denken, bei der die Gene den Zeilen und die Zeitpunkte den Spalten entsprechen. Die Interpretation der Expressionswerte als Häufigkeiten legt es nahe (siehe [2]), die Zeilen jeweils auf Summe 1 zu standardisieren. SeiIn order to compare the expression profiles of different genes, it makes sense to standardize them appropriately. One can imagine the average difference values written in a blackboard (matrix), in which the genes correspond to the rows and the times correspond to the columns. The interpretation of the expression values as frequencies suggests (see [2]) to standardize the rows to sum 1. Be
rs(gf) = ∑ AvgDiff(sf, /)rs (gf) = ∑ AvgDiff (sf, /)
undand
cs(/) = ∑ AvgDiff(g, /). 9cs (/) = ∑ AvgDiff (g, /). 9
Sind Average Difference Werte in einer Matrix wie oben angeordnet, so entsprechen die rs{g) Werte den Zeilensummen und die cs(/) Werte den Spaltensummen. Die obige genweise Standardisierung der Expressionsprofile über die 9 Zeitpunkte ergibt sich zu:If Average Difference values are arranged in a matrix as above, the rs {g) values correspond to the row totals and the cs (/) values correspond to the column totals. The above genetic standardization of the expression profiles over the 9 points in time results in:
R(g, i) = AvgDiff(gf, /) / rs(gf). Diese Größe gibt die relative oder prozentuale Expression des Gens g zum Zeitpunkt / im Verhältnis zur Gesamtexpression über alle Zeitpunkte an. Es gilt damitR (g, i) = AvgDiff (gf, /) / rs (gf). This size indicates the relative or percentage expression of the gene g at the time / in relation to the total expression over all times. So it applies
Σ Fl(9, i) =1 ■Σ Fl (9, i) = 1 ■
Um zwei Genprofile R(g, i) und Rief, /) vergleichen zu können, benötigt man einen geeigneten Abstand zwischen ihnen. Ein solcher ist zunächst der χ2 -AbstandIn order to be able to compare two gene profiles R (g, i) and Rief, /), a suitable distance between them is required. One such is the χ 2 distance
d(g, et) = ∑ (R(g, i) - R(cf, i)f I Cs(ι) id (g, et) = ∑ (R (g, i) - R (cf, i) f I Cs (ι) i
wobei Cs(i) = cs(ι) I ∑, cs(i). Um den Einfluß einzelner Zeitpunkte zu eliminieren, kann man zur jackknife Variante dieses Abstandes übergehen ([3]). Diese entsteht dadurch, daß man den χ2 -Abstand unter Weglassen jeweils eines der 9 Zeitpunkte berechnet und dann das Maximum der erhaltenen Werte bestimmt. Seiwhere Cs (i) = cs (ι) I ∑, cs (i). In order to eliminate the influence of individual points in time, one can proceed to the jackknife variant of this distance ([3]). This arises from the fact that the χ 2 distance is calculated by omitting one of the 9 points in time and then determining the maximum of the values obtained. Be
rs_/Sy = Σ AvgDiff(g, /) i≠jrs_ / Sy = Σ AvgDiff (g, /) i ≠ j
und für i ≠jand for i ≠ j
R-j{g, i) = AvgDiff(gf, /) / rs_/g).R-j {g, i) = AvgDiff (gf, /) / rs_ / g).
Dann giltThen applies
ckte, g = max d_j{g, g1) jccts, g = max d_j {g, g 1 ) j
wobei d_{g, 0) = ∑ (R_j{g, i) - f?_/ \ i) I Cs(i). i≠jin which d_ {g, 0) = ∑ (R_j {g, i) - f? _ / \ i) I Cs (i). i ≠ j
Mit diesem Abstand wurden jeweils die zwanzig nächsten Gene zuWith this distance, the next 20 genes became each
• Ha5 Keratin AF 020 790Ha5 Keratin AF 020 790
• CDC 20 AB 045 313• CDC 20 AB 045 313
• Topoisomerase (DNA) II U 019 5• Topoisomerase (DNA) II U 019 5
• CD 53 X 97227• CD 53 X 97227
bestimmt. Die Ergebnisse finden sich in den Tabellen A bis D im Anhang.certainly. The results can be found in Tables A to D in the Appendix.
Die P-Werte sind durch Permutationsstatistiken (100 Läufe) berechnete simultane P- Werte nach [4] (siehe auch [1])). Sie beziehen sich auf die Nullhypothese der Unkorreliertheit der Genprofile von Zentrumsgen und den restlichen Genen. Der Abstand zwischen AF 020 790 und AB 045 313 beträgt 1.14 bei einem P-Wert von 0.63. Die beiden Gene zeigen deutlich verschiedenes Verhalten und sind nicht korreliert. Der Abstand zwischen AB 045 313 und U 01915 beträgt 0.19 bei einem P- Wert von 0.01. Damit zeigen die Expressionsprofile der beiden Gene eine deutliche Korrelation.The P values are simultaneous P values calculated from permutation statistics (100 runs) according to [4] (see also [1])). They relate to the null hypothesis that the gene profiles of central genes and the remaining genes are uncorrelated. The distance between AF 020 790 and AB 045 313 is 1.14 with a P value of 0.63. The two genes show clearly different behavior and are not correlated. The distance between AB 045 313 and U 01915 is 0.19 with a P value of 0.01. The expression profiles of the two genes thus show a clear correlation.
Die standardisierten Profile der 10 zum Zentrum nächsten Gene der entsprechenden Gruppen finden sich in den Figuren 4 bis 7. Figur 8 zeigt die Überlagerung der Profile der AF 020 790 Gruppe und der AB 045 313 Gruppe. Figur 9 zeigt die Überlagerung aller vier Gruppen. Figur 10 zeigt die vier Gruppen im Plot der Koordinaten der Korrespondenzanalyse.The standardized profiles of the 10 genes closest to the center of the corresponding groups can be found in FIGS. 4 to 7. FIG. 8 shows the superposition of the profiles of the AF 020 790 group and the AB 045 313 group. Figure 9 shows the superposition of all four groups. Figure 10 shows the four groups in the plot of the coordinates of the correspondence analysis.
Man kann deutlich die Phasenverschiebung erkennen. Figur 11 zeigt die Überlagerung von Figur 2 und Figur 10. Man sieht die ungefähre Zuordnung der Gengruppen zu den Zeitpunkten an denen ihre Expression ihr Maximum erreicht; so liegt die AF 020 790 Gruppe in Richtung dP9/dP15, die AB 045 313 Gruppe und die U 01915 Gruppe in Richtung dP27/dP31 und die X 97227 Gruppe in Richtung dP24. Literatur zu Beispiel 2You can clearly see the phase shift. FIG. 11 shows the superimposition of FIG. 2 and FIG. 10. One can see the approximate assignment of the gene groups at the times at which their expression reaches its maximum; the AF 020 790 group is in the direction of dP9 / dP15, the AB 045 313 group and the U 01915 group in the direction of dP27 / dP31 and the X 97227 group in the direction of dP24. Literature for Example 2
[1] Dudoit, S., Fridlyand, J. and Speed, T. P.: Comparison of dicrimination methods for the classification of tumors using gene expression data. Department of Statistics, University of California, Technical report # 576 (2000).[1] Dudoit, S., Fridlyand, J. and Speed, T. P .: Comparison of dicrimination methods for the classification of tumors using gene expression data. Department of Statistics, University of California, Technical report # 576 (2000).
[2] Greenacre, M.: Correspondence analysis in medical research. Statistical Methods in Medical Research 1 , 97-117 (1992).[2] Greenacre, M .: Correspondence analysis in medical research. Statistical Methods in Medical Research 1, 97-117 (1992).
[3] Heyer, L. J., Kruglyak, S. und Yooseph, S.: Exploring expression data: identification and analysis of coexpressed genes. Genome research 9, 1106- 1115 (1999).[3] Heyer, L.J., Kruglyak, S. and Yooseph, S .: Exploring expression data: identification and analysis of coexpressed genes. Genome research 9, 1106-1115 (1999).
[4] Westfall, P. H. und Young, S. S.: Resampling-based multiple testing: examples and methods for p-value adjustment. Wiley, (1993). [4] Westfall, PH and Young, SS: Resampling-based multiple testing: examples and methods for p-value adjustment. Wiley, (1993).
Tabelle A: 20 nächsten Gene, d.h. der Gene mit möglichst ähnlichem Expressionsverlauf, zu AF 020 790Table A: 20 next genes, i.e. of the genes with a similar expression course to AF 020 790
Dist PvaluesDist Pvalues
TC29428_at 0.00000 0 AF 020 790TC29428_at 0.00000 0 AF 020 790
TC30751_f_at 0.02478 0 AF 021 836TC30751_f_at 0.02478 0 AF 021 836
TC16554_at 0.04347 0 AI 642 522TC16554_at 0.04347 0 AI 642 522
TC27367_s_at 0.04836 0 X 59 252TC27367_s_at 0.04836 0 X 59 252
TC28346 f at 0.09910 0 M 277 34TC28346 f at 0.09910 0 M 277 34
TC30749_f_at 0.10118 0 M 920 88TC30749_f_at 0.10118 0 M 920 88
TC31893 at 0.10306 0 M 81 445TC31893 at 0.10306 0 M 81 445
TC21963_s_at 0.10969 0 U 08215TC21963_s_at 0.10969 0 U 08215
TC20645_at 0.11307 0 AA 144 272TC20645_at 0.11307 0 AA 144 272
TC30750 at 0.11928 0 M 92 088TC30750 at 0.11928 0 M 92 088
TC32900_at 0.12157 0 AI 642 522TC32900_at 0.12157 0 AI 642 522
TC21983 at 0.13572 0 AI 180 528TC21983 at 0.13572 0 AI 180 528
TC23080 f at 0.14349 0 M 31 690TC23080 f at 0.14349 0 M 31 690
TC31847 at 0.14400 0 AA 791 965TC31847 at 0.14400 0 AA 791 965
TC28163_f_at 0.14578 0 M 92 088TC28163_f_at 0.14578 0 M 92 088
TC28347_at 0.14599 0 M 277 34TC28347_at 0.14599 0 M 277 34
TC30747_at 0.15120 0 X 99 143TC30747_at 0.15120 0 X 99 143
TC30748 f at 0.15169 0 M 92 088TC30748 f at 0.15169 0 M 92 088
TC20781_at 0.16368 0 AI 157 167TC20781_at 0.16368 0 AI 157 167
TC25414_s_at 0.16374 0 X 14759TC25414_s_at 0.16374 0 X 14759
TC34643 at 0.16517 0 AB 033 744 TC34643 at 0.16517 0 FROM 033 744
Tabelle B: 20 nächsten Gene zu AB 045 313Table B: 20 closest genes to AB 045 313
Dist PvaluesDist Pvalues
TC28355_g_ 0.00000 0 AB 045 313TC28355_g_ 0.00000 0 FROM 045 313
TC33816_at 0.03130 0 X 62 154TC33816_at 0.03130 0 X 62 154
TC27570_g_at 0.03691 0 AC 002 397TC27570_g_at 0.03691 0 AC 002 397
TC20077_at 0.04312 0 AK 003 838TC20077_at 0.04312 0 AK 003 838
TC14788_s_at 0.06107 0 AF 012 710TC14788_s_at 0.06107 0 AF 012 710
TC18751_s_at 0.06289 0 X 75 483TC18751_s_at 0.06289 0 X 75 483
TC31432_at 0.06601 0 AI 574 275TC31432_at 0.06601 0 AI 574 275
TC34455_at 0.06776 0 AW 061 324TC34455_at 0.06776 0 AW 061 324
TC29394_at 0.07005 0 AF 107 296TC29394_at 0.07005 0 AF 107 296
TC34036_at 0.07321 0 AF 013 119TC34036_at 0.07321 0 AF 013 119
TC34235_at 0.08534 0 AW 209 229TC34235_at 0.08534 0 AW 209 229
TC26388_at 0.08759 0 AV 117 844TC26388_at 0.08759 0 AV 117 844
TC14392_f_at 0.09082 0 AI 838 080TC14392_f_at 0.09082 0 AI 838 080
TC34018 at 0.09420 0 AA 671 429TC34018 at 0.09420 0 AA 671 429
TC27894 at 0.09489 0 AW 045 665TC27894 at 0.09489 0 AW 045 665
TC23810_g_at 0.09545 0 AW 049 504TC23810_g_at 0.09545 0 AW 049 504
TC18819_i_at 0.10111 0 AI 606 257TC18819_i_at 0.10111 0 AI 606 257
TC27344_g_at 0.10685 0 D 86 726TC27344_g_at 0.10685 0 D 86 726
TC34455_g_at 0.11259 0 AW 061 324TC34455_g_at 0.11259 0 AW 061 324
TC16956_s_at 0.11376 0 AW227 345TC16956_s_at 0.11376 0 AW227 345
TC34515_s_at 0.11382 0 X 75 983 TC34515_s_at 0.11382 0 X 75 983
Tabelle C: 20 nächsten Gene zu U 01915Table C: 20 closest genes to U 01915
Dist PvaluesDist Pvalues
TC15204_s_at 0.00000 0 U 01915TC15204_s_at 0.00000 0 U 01915
TC23810_g_at 0.03057 0 AW 049 504TC23810_g_at 0.03057 0 AW 049 504
TC28934_at 0.03954 0 AA 691 890TC28934_at 0.03954 0 AA 691 890
TC34455_g_at 0.06010 0 AW061 324TC34455_g_at 0.06010 0 AW061 324
TC17247_at 0.06501 0 AW123 386TC17247_at 0.06501 0 AW123 386
TC18751_s_at 0.07500 0 X 75 483TC18751_s_at 0.07500 0 X 75 483
TC27570_g_at 0.09592 0 AC 002 397TC27570_g_at 0.09592 0 AC 002 397
TC19890_g_at 0.10362 0 AI 842 612TC19890_g_at 0.10362 0 AI 842 612
TC34036_at 0.10647 0 AF 013 119TC34036_at 0.10647 0 AF 013 119
TC18816_at 0.11960 0 AW 122 331TC18816_at 0.11960 0 AW 122 331
TC15641_at 0.12080 0 U 93 583TC15641_at 0.12080 0 U 93 583
TC34455_at 0.12338 0 AW 061 324TC34455_at 0.12338 0 AW 061 324
TC34515_s_at 0.12495 0 X 75 483TC34515_s_at 0.12495 0 X 75 483
TC20077_at 0.14660 0 AK 003 838TC20077_at 0.14660 0 AK 003 838
TC33816_at 0.14974 0 X 62 154TC33816_at 0.14974 0 X 62 154
TC34235_at 0.15473 0 AW 209 229TC34235_at 0.15473 0 AW 209 229
TC19381_at 0.15909 0 AA 152 809TC19381_at 0.15909 0 AA 152 809
TC26388_at 0.16076 0 AV 117 844TC26388_at 0.16076 0 AV 117 844
TC20005_at 0.17047 0 D 87 908TC20005_at 0.17047 0 D 87 908
TC14788_s_at 0.17370 0 AF 012 710TC14788_s_at 0.17370 0 AF 012 710
TC29394 at 0.18604 0 AF 107 296 TC29394 at 0.18604 0 AF 107 296
Tabelle D: 20 nächsten Gene zu X 97 227Table D: 20 closest genes to X 97 227
Dist PvaluesDist Pvalues
TC28894_s_at 0.0000 0 X 97 227TC28894_s_at 0.0000 0 X 97 227
TC22483_g_at 0.1049 0 AW 122 039TC22483_g_at 0.1049 0 AW 122 039
TC32158_at 0.1178 0 AI 116 109TC32158_at 0.1178 0 AI 116 109
TC33838_at 0.1303 0 AI 447 446TC33838_at 0.1303 0 AI 447 446
TC25563_at 0.1344 0 AA 170 203TC25563_at 0.1344 0 AA 170 203
TC26610_s_at 0.1462 0 D 76 440TC26610_s_at 0.1462 0 D 76 440
TC19112_at 0.1558 0 AF 051 583TC19112_at 0.1558 0 AF 051 583
TC31080_s_at 0.1583 0 U 188 69TC31080_s_at 0.1583 0 U 188 69
TC28487_at 0.1799 0 D 45 850TC28487_at 0.1799 0 D 45 850
TC32132_at 0.1811 0 AA 144 469TC32132_at 0.1811 0 AA 144 469
TC30937_g_at 0.1840 0 AA 183 595TC30937_g_at 0.1840 0 AA 183 595
TC23195_at 0.1851 0 AI 852 199TC23195_at 0.1851 0 AI 852 199
TC30596_s_at 0.1868 0 M 31312TC30596_s_at 0.1868 0 M 31312
TC25622_at 0.1878 0 AI 156 274TC25622_at 0.1878 0 AI 156 274
TC16835_s_at 0.1911 0 M 12 660TC16835_s_at 0.1911 0 M 12 660
TC29751_at 0.1920 0 AA 756 506TC29751_at 0.1920 0 AA 756 506
TC29692_at 0.1935 0 AI 120 960TC29692_at 0.1935 0 AI 120 960
TC32774_s_at 0.1942 0 Z 11 974TC32774_s_at 0.1942 0 Z 11 974
TC32891_at 0.1951 0 AW 910 263TC32891_at 0.1951 0 AW 910 263
TC30631_at 0.2025 0 U 56 819TC30631_at 0.2025 0 U 56 819
TC28732 s at 0.2031 0 AJ 223 361 TC28732 s at 0.2031 0 AJ 223 361

Claims

Patentansprüche claims
1. Verfahren zur Diagnose einer Haarwuchsstorung oder zur Bestimmung der Wahrscheinlichkeit einer Haarwuchsstorung (Prädisposition) bei einem Säuger, wobei man die Expression von mindestens zwei zyklisch exprimierten Genen in einer Probe analysiert und wobei (a) eines der Gene die maximale Expressionshöhe während des Anagens aufweist, während (b) das zweite Gen die maximale Expressionshöhe während des Catagens oder während des Telogens aufweist.1. A method for diagnosing a hair growth disorder or for determining the likelihood of a hair growth disorder (predisposition) in a mammal, wherein the expression of at least two cyclically expressed genes in a sample is analyzed and wherein (a) one of the genes has the maximum expression level during the anagen , while (b) the second gene has the maximum expression level during catagen or during telogen.
2. Verfahren zur Diagnose der Wirksamkeit der Behandlung einer Haarwuchsstorung bei einem Säuger, wobei man die Expression von mindestens zwei zyklisch exprimierten Genen in einer Probe analysiert und wobei (a) eines der Gene die maximale Expressionshöhe während des Anagens aufweist, während das (b) zweite Gen die maximale Expressionshöhe während des Catagens oder während des Telogens aufweist.2. A method of diagnosing the effectiveness of treating a hair growth disorder in a mammal by analyzing the expression of at least two cyclically expressed genes in a sample and wherein (a) one of the genes has the maximum level of expression during anagen, while (b) second gene has the maximum expression level during catagen or during telogen.
3. Verfahren nach Anspruch 1 oder 2, wobei die Expression (c) mindestens eines dritten zyklisch exprimierten Gens analysiert wird und wobei dieses Gen die maximale Expressionshöhe während des Anagens, während des Catagens oder während des Telogens aufweist.3. The method according to claim 1 or 2, wherein the expression (c) of at least a third cyclically expressed gene is analyzed and wherein this gene has the maximum expression level during anagen, during catagen or during telogen.
4. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 3, wobei die Expression (d) mindestens eines vierten zyklisch exprimierten Gens analysiert wird und wobei dieses Gen die maximale Expressionshöhe während des Anagens, während des Catagens oder während des Telogens aufweist. 4. The method according to any one of claims 1 to 3, wherein the expression (d) of at least a fourth cyclically expressed gene is analyzed and wherein this gene has the maximum level of expression during anagen, during catagen or during telogen.
5. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 4, wobei die Expression (e) mindestens eines fünften zyklisch exprimierten Gens analysiert wird und wobei dieses Gen die maximale Expressionshöhe während des Anagens, während des Catagens oder während des Telogens aufweist.5. The method according to any one of claims 1 to 4, wherein the expression (e) of at least a fifth cyclically expressed gene is analyzed and wherein this gene has the maximum expression level during anagen, during catagen or during telogen.
6. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 5, wobei mindestens eines der Gene, die ihre maximale Expressionshöhe im Anagen aufweisen, diese während des mittleren Anagens aufweist.6. The method according to any one of claims 1 to 5, wherein at least one of the genes which have their maximum expression level in the anagen, this has during the middle anagen.
7. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 6, wobei mindestens eines der Gene, die ihre maximale Expressionshöhe im Anagen aufweisen, diese während des frühen Anagens aufweist.7. The method according to any one of claims 1 to 6, wherein at least one of the genes which have their maximum expression level in the anagen, this has during the early anagen.
8. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 6, wobei mindestens eines der Gene, die ihre maximale Expressionshöhe im Anagen aufweisen, diese des Übergangs Anagen-Catagen aufweist.8. The method according to any one of claims 1 to 6, wherein at least one of the genes which have their maximum expression level in the anagen, this has the transition from anagen to catagen.
9. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 8, wobei die unter (a), (b), (c), (d) und (e) aufgeführten Gene Repräsentanten verschiedener Gruppen von zyklisch exprimierten Genen sind, wobei die Verschiedenheit der Gruppen dadurch gekennzeichnet ist, daß sie ihre Expressionsmaxima in unterschiedlichen Zeiträumen aufweisen und wobei Gene, die zur gleichen Gruppe gehören, die gleichen Expressionsprofile ausweisen.9. The method according to any one of claims 1 to 8, wherein the genes listed under (a), (b), (c), (d) and (e) are representatives of different groups of cyclically expressed genes, the diversity of the groups thereby is characterized in that they have their expression maxima in different time periods and wherein genes belonging to the same group have the same expression profiles.
10. Verfahren nach Anspruch 9, wobei die Expression von mindestens einem weiteren Mitglied aus jeder Gruppe der zyklisch exprimierten Gene analysiert wird.10. The method of claim 9, wherein the expression of at least one other member from each group of the cyclically expressed genes is analyzed.
11. Verfahren nach Anspruch 9 oder 10, wobei die Expression von mindestens zwei weiteren Mitglied aus jeder Gruppe der zyklisch exprimierten Gene analysiert wird. 11. The method of claim 9 or 10, wherein the expression of at least two other members from each group of the cyclically expressed genes is analyzed.
12. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 11 , wobei die Probe eine Hautprobe ist oder aus epilierten Haaren besteht.12. The method according to any one of claims 1 to 11, wherein the sample is a skin sample or consists of epilated hair.
13. Verfahren nach Anspruch 12, wobei die Hautprobe eine Kopfhautprobe ist.13. The method of claim 12, wherein the skin sample is a scalp sample.
14. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 13, wobei der Säuger eine Maus ist.14. The method according to any one of claims 1 to 13, wherein the mammal is a mouse.
15. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 14, wobei das mindestens eine Gen (a) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabelle 1 aufgeführten Genbank-Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen.15. The method according to any one of claims 1 to 14, wherein the at least one gene (a) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the Genbank accession numbers listed in Table 1 or the human homologues thereto.
16. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 15, wobei das mindestens eine Gen (b) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabelle 4 aufgeführten Genbank-Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen.16. The method according to any one of claims 1 to 15, wherein the at least one gene (b) is selected from the group of genes comprising the sequences represented by the Genbank accession numbers listed in Table 4 or the human homologues thereto.
17. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 16, wobei das mindestens eine Gen (c) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabelle 2 aufgeführten Genbank-Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen.17. The method according to any one of claims 1 to 16, wherein the at least one gene (c) is selected from the group of genes comprising the sequences shown by the Genbank accession numbers listed in Table 2 or the human homologues thereto.
18. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 17, wobei das mindestens eine Gen (d) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabelle 3 aufgeführten Genbank-Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen.18. The method according to any one of claims 1 to 17, wherein the at least one gene (d) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the Genbank accession numbers listed in Table 3 or the human homologues thereto.
19. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 18, wobei das mindestens eine Gen (e) ausgewählt ist aus der Gruppe der Gene, welche die durch die in Tabelle 5 aufgeführten Genbank-Hinterlegungsnummern dargestellten Sequenzen oder die menschlichen Homologen dazu umfassen. 19. The method according to any one of claims 1 to 18, wherein the at least one gene (s) is selected from the group of genes which comprise the sequences represented by the gene bank deposit numbers listed in Table 5 or the human homologues thereto.
20. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 19, wobei der Säuger eine Maus oder ein Mensch ist.20. The method according to any one of claims 1 to 19, wherein the mammal is a mouse or a human.
21. Verfahren nach Anspruch 20, wobei das mindestens eine Gen (a) das menschliche Homologe zu dem in Anspruch 15 genannten Gen aus der Maus ist.21. The method according to claim 20, wherein the at least one gene (a) is the human homologue to the mouse gene mentioned in claim 15.
22. Verfahren nach Anspruch 20, wobei das mindestens eine Gen (b) das menschliche Homologe zu dem in Anspruch 16 genannten Gen aus der Maus ist.22. The method according to claim 20, wherein the at least one gene (b) is the human homologue to the mouse gene mentioned in claim 16.
23. Verfahren nach Anspruch 20, wobei das mindestens eine Gen (c) das menschliche Homologe zu dem in Anspruch 17 genannten Gen aus der Maus ist.23. The method according to claim 20, wherein the at least one gene (c) is the human homologue to the mouse gene mentioned in claim 17.
24. Verfahren nach Anspruch 20, wobei das mindestens eine Gen (d) das menschliche Homologe zu dem in Anspruch 18 genannten Gen aus der Maus ist.24. The method of claim 20, wherein the at least one gene (d) is the human homologue to the mouse gene mentioned in claim 18.
25. Verfahren nach Anspruch 20, wobei das mindestens eine Gen (e) das menschliche Homologe zu dem in Anspruch 19 genannten Gen aus der Maus ist.25. The method of claim 20, wherein the at least one gene (s) is the human homologue to the mouse gene mentioned in claim 19.
26. Verfahren zur Isolierung eines Inhibitors einer Haarwuchsstorung, wobei man26. A method for isolating an inhibitor of hair growth disorder, wherein one
(a) die Expression von mindestens einem der in den vorstehenden Ansprüchen unter (a) bis (e) aufgeführten Gene in einer Hautprobe oder in epiliertem Haar analysiert, die einem Säuger mit einer Haarwuchsstorung entnommen wurde(n);(a) analyzing the expression of at least one of the genes listed in the preceding claims under (a) to (e) in a skin sample or in epilated hair which was taken from a mammal with a hair growth disorder;
(b) das Analyseergebnis aus (a) mit der Expression des Gens in einer Hautprobe oder in epiliertem Haar vergleicht, die einem Säuger derselben Spezies entnommen wurde, wobei dieser Säuger nicht diese oder keine Haarwuchsstorung aufweist;(b) compares the analysis result from (a) with the expression of the gene in a skin sample or in epilated hair, which is a mammal taken from the same species, this mammal not having this or no hair growth disorder;
(c) das Gen, dessen Expression sich bei einem Säuger mit Haarwuchsstorung im Vergleich zu einem Säuger ohne diese oder ohne eine Haarwuchsstorung in Schritt (b) um mindestens einen Faktor 3 unterscheidet, die davon transkribierte mRNA oder das davon kodierte Polypeptid oder eine Hautprobe, in der das Gen mit abnormer Expressionshöhe exprimiert ist mit einer oder mehreren Testsubstanzen unter Bedingungen in Kontakt bringt, die eine Bindung der Testsubstanz an das Gen, die mRNA oder das Polypeptid oder an andere Gene, mRNAs oder Polypeptide in der Hautprobe erlauben; und(c) the gene whose expression differs by at least a factor of 3 in a mammal with hair growth disturbance compared to a mammal without it or without a hair growth disturbance in step (b), the mRNA transcribed therefrom or the polypeptide encoded thereby or a skin sample, in which the gene is expressed with an abnormal level of expression in contact with one or more test substances under conditions which allow binding of the test substance to the gene, the mRNA or the polypeptide or to other genes, mRNAs or polypeptides in the skin sample; and
(d) diejenige(n) Testsubstanz(en) isoliert, die in Schritt (b) zu einer Verminderung des Faktors in der Expression führt/führen.(d) isolating the test substance (s) which leads to a reduction in the factor in the expression in step (b).
27. Verfahren nach Anspruch 26, wobei die Expression des Gens gegenüber der Expression eines Housekeeping-Gens normalisiert wird.27. The method of claim 26, wherein the expression of the gene is normalized against the expression of a housekeeping gene.
28. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 25, wobei die Haarwuchsstorung eine Alopezie ist.28. The method according to any one of claims 1 to 25, wherein the hair growth disorder is an alopecia.
29. Verfahren nach Anspruch 28, wobei die Alopezie Alopecia androgenetica ist.29. The method of claim 28, wherein the alopecia is Alopecia androgenetica.
30. Verfahren nach einem der Ansprüche 1 bis 27, wobei die Haarwuchsstorung Hirsutismus ist.30. The method according to any one of claims 1 to 27, wherein the hair growth disorder is hirsutism.
31. Verfahren nach einem der Ansprüche 24 bis 28, wobei die Testsubstanzen oder das Gen an ein Readout-System gekoppelt sind oder wobei dem Testansatz ein Readout-System zugesetzt ist und wobei das Readout-System nach Bindung der Testsubstanz(en) an das Gen, die mRNA oder (Poly)peptid ein nachweisbares Signal liefert. 31. The method according to any one of claims 24 to 28, wherein the test substances or the gene are coupled to a readout system or wherein a readout system is added to the test mixture and wherein the readout system after binding of the test substance (s) to the gene , the mRNA or (poly) peptide provides a detectable signal.
32. Verfahren nach einem der Ansprüche 26 bis 31 , wobei die Testsubstanzen niedermolekulare Substanzen, Peptide, Aptamere, Antikörper oder Fragmente oder Derivate davon sind.32. The method according to any one of claims 26 to 31, wherein the test substances are low molecular weight substances, peptides, aptamers, antibodies or fragments or derivatives thereof.
33. Verfahren nach einem der Ansprüche 26 bis 32, das ein Hochdurchsatzverfahren ist.33. The method according to any one of claims 26 to 32, which is a high-throughput method.
34. Verfahren nach Anspruch 33, das Computer-assistiert ist.34. The method of claim 33, which is computer-assisted.
35. Verfahren nach einem der Ansprüche 26 bis 34 weiter umfassend die Verbesserung der pharmakologischen Eigenschaften des identifizierten Inhibitors, wobei man35. The method according to any one of claims 26 to 34 further comprising improving the pharmacological properties of the identified inhibitor, wherein
(e) die Bindungsstelle des Inhibitors an das Gen, die mRNA oder das Polypeptid und gegebenenfalls die Bindungsstelle des Gens, der mRNA oder des Polypeptids an den Inhibitor identifiziert;(e) the binding site of the inhibitor to the gene, the mRNA or the polypeptide and optionally the binding site of the gene, the mRNA or the polypeptide to the inhibitor are identified;
(f) die Bindungsstelle des Inhibitors und des Gens, der mRNA oder des Polypeptids durch molekulares Modellieren modifiziert; und(f) modifying the binding site of the inhibitor and the gene, mRNA or polypeptide by molecular modeling; and
(g) den Inhibitor dergestalt modifiziert, daß seine Bindungsspezifität oder Bindungsaffinität oder Bindungsavidität für das Gen, die mRNA oder das Polypeptid erhöht wird.(g) modifies the inhibitor so that its binding specificity or binding affinity or binding avidity for the gene, the mRNA or the polypeptide is increased.
36. Verfahren nach Anspruch 35, wobei die Bindungsstellen in Schritt (a) durch Stellen-spezifische Mutagenese ermittelt werden.36. The method according to claim 35, wherein the binding sites in step (a) are determined by site-specific mutagenesis.
37. Verfahren nach einem der Ansprüche 26 bis 34 oder nach Anspruch 35 oder 36 weiter umfassend die Verbesserung der pharmakologischen Eigenschaften des identifizierten Inhibitors oder des verbesserten Inhibitors wobei das (Poly)peptid als Leitstruktur weiter modifiziert wird, um37. The method according to any one of claims 26 to 34 or according to claim 35 or 36 further comprising improving the pharmacological properties of the identified inhibitor or the improved inhibitor, wherein the (poly) peptide as the lead structure is further modified to
(i) ein modifiziertes aktives Zentrum, ein modifiziertes Aktivitätsspektrum, eine modifizierte Organspezifizität und/oder (ii) eine verbesserte Aktivität und/oder (iii) eine verminderte Toxizität (ein verbesserter therapeutische Index) und/oder (iv) verminderte Nebenwirkungen und/oder (v) ein zeitlich versetzter Beginn der therapeutischen Wirksamkeit, der(i) a modified active center, a modified activity spectrum, a modified organ specificity and / or (ii) an improved activity and / or (iii) a reduced toxicity (an improved therapeutic index) and / or (iv) reduced side effects and / or (v) a delayed start of the therapeutic efficacy, the
Länge der therapeutischen Wirksamkeit und/oder (vi) veränderte pharmakokinetische Parameter (Resorption, Distribution,Length of therapeutic efficacy and / or (vi) changed pharmacokinetic parameters (absorption, distribution,
Metabolismus oder Exkretion) und/oder (vii) modifizierte physikochemische Parameter (Löslichkeit, hygroskopischeMetabolism or excretion) and / or (vii) modified physicochemical parameters (solubility, hygroscopic
Eigenschaften, Farbe, Geschmack, Geruch, Stabilität, Zustandsform) und/oder (viii) verbesserte generelle Spezifität, Organ-/Gewebespezifität, und/oder (ix) optimierte Verabreichungsform und- route durchProperties, color, taste, smell, stability, condition) and / or (viii) improved general specificity, organ / tissue specificity, and / or (ix) optimized administration form and route through
(i) Veresterung von Carboxylgruppen oder (ii) Veresterung von Hydroxylgruppen mit Carbonsäuren oder (iii) Veresterung von Hydroxylgruppen zu beispielsweise Phosphaten,(i) esterification of carboxyl groups or (ii) esterification of hydroxyl groups with carboxylic acids or (iii) esterification of hydroxyl groups to, for example, phosphates,
Pyrophosphaten oder Sulfaten oder "Hemisukzinaten" oder (iv) Bildung von pharmazeutisch verträglichen Salzen oder (v) Bildung von pharmazeutisch verträglichen Komplexen oder (vi) Synthese von pharmakologisch aktiven Polymeren oder (vii) Einführung von hydrophilen Gruppen oder (viii) Einführung/Austausch von Substituenten in Aromaten oderPyrophosphates or sulfates or "hemisuccinates" or (iv) formation of pharmaceutically acceptable salts or (v) formation of pharmaceutically acceptable complexes or (vi) synthesis of pharmacologically active polymers or (vii) introduction of hydrophilic groups or (viii) introduction / exchange of Substituents in aromatics or
Seitenketten, Veränderung des Substituentenmusters oder (ix) Modifikation durch Einführung von isosterischen oder bioisosterischenSide chains, change of the substituent pattern or (ix) modification through the introduction of isosteric or bioisosteric
Gruppen oder (x) Synthese von homologen Verbindungen oder (xi) Einführung von verzweigten Seitenketten oder (xii) Konversion von Alkylsubstituenten zu zyklischen Analogen oder (xiii) Derivatisierung von Hydroxylgruppen zu Ketalen oder Acetalen oder (xiv) N-Acetylierung zu Amiden, Phenylcarbamaten oder (xv) Synthese von Mannich-Basen, Iminen oder (xvi) Umwandlung von Ketonen oder Aldehyden in Schiffs-Basen, Oxime,Groups or (x) synthesis of homologous compounds or (xi) introduction of branched side chains or (xii) conversion of alkyl substituents to cyclic analogues or (xiii) derivatization of hydroxyl groups to ketals or acetals or (xiv) N-acetylation to amides, phenyl carbamates or (xv) synthesis of Mannich bases, imines or (xvi) conversion of ketones or aldehydes into Schiff bases, oximes,
Acetale, Ketale, Enolester, Oxazolidine, Thiozolidine oder Kombinationen davon zu erreichen.Acetals, ketals, enol esters, oxazolidines, thiozolidines or combinations thereof.
38. Verfahren nach einem der Ansprüche 26 bis 37, wobei der identifizierte oder verbesserte Inhibitor durch Peptidomimetics pharmakologisch weiter verbessert wird.38. The method according to any one of claims 26 to 37, wherein the identified or improved inhibitor is further pharmacologically improved by peptidomimetics.
39. Verfahren nach einem der Ansprüche 26 bis 38 weiter umfassend die Herstellung eines Arzneimittels oder Medizinpräparates, wobei man den erhaltenen Inhibitor mit einem pharmazeutisch verträglichen Träger oder Verdünnungsmittel formuliert.39. The method according to any one of claims 26 to 38 further comprising the manufacture of a medicament or medical preparation, wherein the inhibitor obtained is formulated with a pharmaceutically acceptable carrier or diluent.
40. Verfahren nach einem der Ansprüche 26 bis 39, wobei der Inhibitor der Haarwuchsstorung ein Aktivator der Transkription oder Translation des Gens, der mRNA oder ein Aktivator der Aktivität des Polypeptids ist.40. The method according to any one of claims 26 to 39, wherein the inhibitor of hair growth disorder is an activator of the transcription or translation of the gene, the mRNA or an activator of the activity of the polypeptide.
41. Verfahren nach einem der Ansprüche 26 bis 39, wobei der Inhibitor der Haarwuchsstorung ein Inhibitor der Transkription oder Translation des Gens, der mRNA oder ein Inhibitor der Aktivität des Polypeptids ist.41. The method according to any one of claims 26 to 39, wherein the inhibitor of hair growth disorder is an inhibitor of the transcription or translation of the gene, the mRNA or an inhibitor of the activity of the polypeptide.
42. Verwendung eines nach dem Verfahren nach einem der vorstehenden Ansprüche identifizierten Inhibitors zur Herstellung eines Arzneimittel oder Medizinproduktes zur Vorsorge oder Behandlung von Haarwuchsstorungen.42. Use of an inhibitor identified by the method according to one of the preceding claims for the manufacture of a medicament or medical device for the prevention or treatment of hair growth disorders.
43. Zusammensetzung enthaltend einen oder mehrere der Inhibitoren, die nach dem Verfahren nach einem der Ansprüche 24 bis 38 identifiziert oder verbessert wurden.43. A composition comprising one or more of the inhibitors which have been identified or improved by the method according to any one of claims 24 to 38.
44. Zusammensetzung nach Anspruch 39, die eine pharmazeutische Zusammensetzung ist.44. The composition of claim 39 which is a pharmaceutical composition.
45. Zusammensetzung nach Anspruch 39, die eine diagnostische Zusammensetzung ist. 45. The composition of claim 39 which is a diagnostic composition.
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