WO2001030988A8 - Procedes de fabrication et d'utilisation de reactifs de voies de synthese d'acides gras - Google Patents

Procedes de fabrication et d'utilisation de reactifs de voies de synthese d'acides gras

Info

Publication number
WO2001030988A8
WO2001030988A8 PCT/US2000/029451 US0029451W WO0130988A8 WO 2001030988 A8 WO2001030988 A8 WO 2001030988A8 US 0029451 W US0029451 W US 0029451W WO 0130988 A8 WO0130988 A8 WO 0130988A8
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
fatty acid
acp
making
methods
acid synthesis
Prior art date
Application number
PCT/US2000/029451
Other languages
English (en)
Other versions
WO2001030988A1 (fr
Inventor
Walter Dewolf Jr
Howard Kallender
John T Lonsdale
Original Assignee
Smithkline Beecham Corp
Smithkline Beecham Plc
Walter Dewolf Jr
Howard Kallender
John T Lonsdale
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Smithkline Beecham Corp, Smithkline Beecham Plc, Walter Dewolf Jr, Howard Kallender, John T Lonsdale filed Critical Smithkline Beecham Corp
Priority to US10/089,019 priority Critical patent/US6951729B1/en
Publication of WO2001030988A1 publication Critical patent/WO2001030988A1/fr
Publication of WO2001030988A8 publication Critical patent/WO2001030988A8/fr

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
    • C12Q1/025—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

L'invention concerne un procédé de criblage de composés influant sur la biosynthèse d'acides gras, le procédé consistant en ce qui suit: (A) fournir un mélange de réaction comprenant: (1) (a) un groupe fonctionnel transporteur d'enzymes ou (b) des enzymes ou précurseurs suffisants pour générer un groupe fonctionnel transporteur d'enzymes; (2) une voie de signalisation bactérienne enzymatique comprenant au moins deux (et de préférence trois, voire quatre ou cinq) enzymes agissant de manière consécutive, sélectionnée dans le groupe constitué de: (a) malonyl-CoA:ACP transacylase, (b) β-kétoacyl-ACP synthase III, (c) β-kétoacyl-ACP réductase dépendant de NADPH, (d) β-hydroxyacyl-ACP déhydrase et (e) enoyl-ACP réductase; et (3) des substrats et cofacteurs nécessaires au fonctionnement des enzymes; (B) mettre en contact le mélange de réaction avec un agent biologique prospecté; (C) effectuer des mesures haut débit de l'activité de la voie de signalisation enzymatique; et (D) déterminer si la mise en contact a modifié l'activité de la voie de signalisation enzymatique. L'invention concerne aussi un procédé de dosage des composés influençant la biosynthèse d'acides gras, qui consiste en ce qui suit: (A) fournir un mélange de réaction comprenant: (1) (a) un groupe fonctionnel transporteur d'acyles ou (b) des enzymes et précurseurs suffisant pour générer le groupe fonctionnel transporteur d'acyles; (2) une voie de signalisation bactérienne enzymatique comprenant au moins deux enzymes agissant de manière consécutive, sélectionnée dans le groupe constitué de: (a) malonyl-CoA:ACP transacylase, (b) β-kétoacyl-ACP synthase III, (c) β-kétoacyl-ACP réductase dépendant de NADPH, (d) β-hydroxyacyl-ACP déhydrase et (e) enoyl-ACP réductase; et (3) des substrats et cofacteurs nécessaires pour le fonctionnement des enzymes; (B) mettre en contact le mélange de réaction avec un agent biologique prospecté; (C) effectuer des mesures haut débit de l'activité de la voie de signalisation enzymatique; et (D) déterminer si la mise en contact a modifié l'activité de la voie de signalisation enzymatique, pourvu qu'au moins ce qui suit soit valable: (1) la réductase enoyl-ACP est une réductase enoyl-ACP spécifique au NADH; ou (2) la β-kétoacyl-ACP synthase III et une β-kétoacyl-ACP synthase III dérivée de E.coli ou H. influenzae; ou (3) NADPH est fourni au stade de réaction de façon constante de manière à ce que la consommation de NADH par enoyl-ACP réductase (FabI) peut être quantifiée avec précision et sans interférence, ou une quantité efficace pour réduire la consommation de NADH par des enzymes plus dépendantes de NADPH; ou (4) la β-kétoacyl-ACP réductase dépendant de NADPH est dérivée de Streptococcus, Staphylococcus or Pseudomonas.
PCT/US2000/029451 1999-10-27 2000-10-26 Procedes de fabrication et d'utilisation de reactifs de voies de synthese d'acides gras WO2001030988A1 (fr)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US10/089,019 US6951729B1 (en) 1999-10-27 2000-10-26 High throughput screening method for biological agents affecting fatty acid biosynthesis

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US16177599P 1999-10-27 1999-10-27
US60/161,775 1999-10-27

Publications (2)

Publication Number Publication Date
WO2001030988A1 WO2001030988A1 (fr) 2001-05-03
WO2001030988A8 true WO2001030988A8 (fr) 2001-09-07

Family

ID=22582667

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/US2000/029451 WO2001030988A1 (fr) 1999-10-27 2000-10-26 Procedes de fabrication et d'utilisation de reactifs de voies de synthese d'acides gras

Country Status (1)

Country Link
WO (1) WO2001030988A1 (fr)

Families Citing this family (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6010881A (en) 1996-02-20 2000-01-04 Smithkline Beecham Corporation RibG
WO1998006734A1 (fr) 1996-08-16 1998-02-19 Smithkline Beecham Corporation Nouveaux polynucleotides et polypeptides procaryotes et leurs utilisations
US6995254B1 (en) 1996-08-28 2006-02-07 Affinium Pharmaceuticals, Inc. Polynucleotide encoding the enoyl-acyl carrier protein reductase of Staphylococcus aureus, FAB I
JP2003524627A (ja) * 1999-05-06 2003-08-19 スミスクライン・ビーチャム・コーポレイション Ｆａｂｈ活性をモジュレートする方法
US6951729B1 (en) 1999-10-27 2005-10-04 Affinium Pharmaceuticals, Inc. High throughput screening method for biological agents affecting fatty acid biosynthesis
US7056697B2 (en) 2000-10-06 2006-06-06 Affinium Pharmaceuticals, Inc. FabK variant
US7048926B2 (en) 2000-10-06 2006-05-23 Affinium Pharmaceuticals, Inc. Methods of agonizing and antagonizing FabK
US6821746B2 (en) 2000-10-06 2004-11-23 Affinium Pharmaceuticals, Inc. Methods of screening for FabK antagonists and agonists
US7033795B2 (en) 2000-10-06 2006-04-25 Affinium Pharmaceuticals, Inc. FabK variant
WO2005005469A2 (fr) 2003-07-11 2005-01-20 Affinium Pharmaceuticals, Inc. Nouveaux polypeptides purifies provenant du staphylocoque dore
WO2015200335A1 (fr) * 2014-06-23 2015-12-30 Joule Unlimited Technologies, Inc. Microbes photosynthétiques obtenus par génie génétique et synthèse recombinante de produits à base de carbone

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5759837A (en) * 1989-01-17 1998-06-02 John Hopkins University Chemotherapy for cancer by inhibiting the fatty acid biosynthetic pathway
US5539132A (en) * 1994-01-24 1996-07-23 Johns Hopkins University Cerulenin compounds for fatty acid synthesis inhibition
US5614551A (en) * 1994-01-24 1997-03-25 The Johns Hopkins University Inhibitors of fatty acid synthesis as antimicrobial agents

Also Published As

Publication number Publication date
WO2001030988A1 (fr) 2001-05-03

Similar Documents

Publication Publication Date Title
WO2001030988A8 (fr) Procedes de fabrication et d'utilisation de reactifs de voies de synthese d'acides gras
Yoneyama et al. Hydroxyl carlactone derivatives are predominant strigolactones in Arabidopsis
Punyasiri et al. Flavonoid biosynthesis in the tea plant Camellia sinensis: properties of enzymes of the prominent epicatechin and catechin pathways
AU2001296778A1 (en) Methods for detection of a target nucleic acid using a probe comprising secondary structure
WO2003102214A3 (fr) Procede d'interference efficace par arn dans des cellules de mammifere
WO2003006652A3 (fr) Inhibition d'isoformes specifiques d'histone deacetylase
EP2100899A3 (fr) Composés pour inhibition d'enzyme
AU2001286202A1 (en) Method of culturing mesenchymal stem cells
ZA987555B (en) Prostaglandin endoperoxide H. synthase biosynthesis inhibitors
WO2003036256A3 (fr) Procede et appareil permettant d'augmenter la plage dynamique et la precision de titrages par liaison
DE60036477D1 (en) Isoprenoid biosynthese
WO2000001838A3 (fr) Procedes permettant de fabriquer des polycetides
WO2001092560A3 (fr) Dosage pour kinases et phosphatases
TR200402566T2 (tr) Bitki transformasyon yöntemleri.
AU2003213057A8 (en) Rna interference mediated inhibition of checkpoint kinase-1 (chk-1) gene expression using short interfering nucleic acid
WO2004056984A3 (fr) Procede enzymatique d'isolation d'adn de tissus vegetaux
Lin et al. Regulation of ammonium-induced proline accumulation in detached rice leaves
Hirai et al. Increase in the activity of phenylalanine ammonia-lyase during the non-photoperiodic induction of flowering in seedlings of morning glory (Pharbitis nil)
EP1011724A4 (fr) Regulation de la formation d'osteoclastes par inhibition du facteur de cellules souches osteoblastiques
Reichling et al. Biosynthesis of pseudoisoeugenols in tissue cultures of Pimpinella anisum: Phenylalanine ammonia lyase and cinnamic acid 4-hydroxylase activities
Bianchini et al. Induction of early mevalonate pathway enzymes and biosynthesis of end products in potato (Solanum tuberosum) tubers by wounding and elicitation
Ji et al. Expression of 3‐hydroxy‐3‐methylglutaryl coenzyme A reductase activity in maize tissues
IL133552A (en) Arylpyridazinones as prostaglandin endoperoxide h synthase biosynthesis inhibitors
AU2003242380A1 (en) Method of slective isolation or visualization of target cells differentiated from embryonic stem cells or kit for visualization
WO2001095691A3 (fr) Modification de la biosynthese de fructosane

Legal Events

Date Code Title Description
AK Designated states

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): JP US

AL Designated countries for regional patents

Kind code of ref document: A1

Designated state(s): AT BE CH CY DE DK ES FI FR GB GR IE IT LU MC NL PT SE

121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application
AK Designated states

Kind code of ref document: C1

Designated state(s): JP US

AL Designated countries for regional patents

Kind code of ref document: C1

Designated state(s): AT BE CH CY DE DK ES FI FR GB GR IE IT LU MC NL PT SE

WR Later publication of a revised version of an international search report
DFPE Request for preliminary examination filed prior to expiration of 19th month from priority date (pct application filed before 20040101)
WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 10089019

Country of ref document: US

122 Ep: pct application non-entry in european phase
NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: JP

DPE2 Request for preliminary examination filed before expiration of 19th month from priority date (pct application filed from 20040101)