WO2001008036A3 - Procede et systeme d'enregistrement dynamique et de validation de donnees de recherche - Google Patents

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Long Qu
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Abstract

La présente invention concerne un procédé et un système de partage de données expérimentales validées, telles que des données expérimentales de biologie cellulaire. Ces données expérimentales brutes sont prises en compte et divisées en une ou plusieurs composantes de données brutes par utilisation d'un modèle modifiable d'objet de données. Ce modèle modifiable d'objet de données comporte une petite structure hiérarchique qui ne gaspille pas l'espace en mémoire et qui peut être développée par les utilisateurs. Le modèle modifiable d'objet de données peut être modifié par un utilisateur de façon à ajouter des données expérimentales brutes pour virtuellement toute expérience menée par un utilisateur. La donnée expérimentale brute est validée, et si on le souhaite, elle est rendue disponible pour d'autres chercheurs via un serveur accessible de façon publique sur un réseau d'ordinateurs tel que l'Internet, ce qui permet le partage entre chercheurs des données expérimentales validées via le réseau d'ordinateurs. Ce serveur accessible de façon publique est associé à un fond d'archivage de connaissances destiné aux chercheurs d'un domaine particulier tel que la biologie cellulaire. Les données expérimentales brutes peuvent également être automatiquement validées au moyen d'un processus de validation préalablement défini, de façon à créer des données expérimentales validées. Les données expérimentales validées sont rendues disponibles immédiatement après validation sur un serveur accessible de façon publique sur un réseau d'ordinateurs. La présente invention permet également une meilleure compréhension par les utilisateurs de fonctions biologiques telles que les fonctions cellulaires, de façon à concevoir de façon plus intelligente les expériences, et pour analyser les résultats expérimentaux plus complètement en rendant les données expérimentales brutes et validées immédiatement disponible via un réseau d'ordinateurs après la saisie. De façon plus spécifique, la présente invention peut aider les chercheurs en pharmacie à mieux sélectionner les cibles des interventions pharmaceutiques dans avec l'espoir de guérir des maladies. Le procédé et le système peuvent également favoriser l'extraction de données biologiques expérimentales à partir des connaissances et procurer de nouvelles techniques de bioinformatique.
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2002230415A1 (en) 2000-11-17 2002-05-27 Universal Imaging Corporation Rapidly changing dichroic beamsplitter
US10467594B2 (en) * 2012-08-03 2019-11-05 Label Independent, Inc. Systems and methods for designing, developing, and sharing assays

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1994011838A1 (fr) * 1992-11-06 1994-05-26 Abbott Laboratories Systeme de commande automatique de test d'un fluide biologique
WO1996023078A1 (fr) * 1995-01-27 1996-08-01 Incyte Pharmaceuticals, Inc. Memorisation et analyse informatiques de donnees microbiologiques
US5841975A (en) * 1996-12-10 1998-11-24 The Regents Of The University Of California Method and apparatus for globally-accessible automated testing

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO1994011838A1 (fr) * 1992-11-06 1994-05-26 Abbott Laboratories Systeme de commande automatique de test d'un fluide biologique
WO1996023078A1 (fr) * 1995-01-27 1996-08-01 Incyte Pharmaceuticals, Inc. Memorisation et analyse informatiques de donnees microbiologiques
US5841975A (en) * 1996-12-10 1998-11-24 The Regents Of The University Of California Method and apparatus for globally-accessible automated testing

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
RIECHE B ET AL: "A federated DBMS-based integrated environment for molecular biology", SCIENTIFIC AND STATISTICAL DATABASE MANAGEMENT, 1994. PROCEEDINGS., SEVENTH INTERNATIONAL WORKING CONFERENCE ON CHARLOTTESVILLE, VA, USA 28-30 SEPT. 1994, LOS ALAMITOS, CA, USA,IEEE COMPUT. SOC, PAGE(S) 118-127, ISBN: 0-8186-6610-2, XP010100536 *

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