WO1999032658A1 - Overlapping nucleotide sequences, and their use for detecting xenohormones and in pharmaceutical compositions - Google Patents
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- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6897—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids involving reporter genes operably linked to promoters
Definitions
- the subject of the present invention is the use of nucleotide sequences derived from the glucocorticoid and / or estrogen response elements, for the implementation of methods of in vitro detection of xenohormones.
- a subject of the invention is also pharmaceutical compositions containing such nucleotide sequences.
- the illegitimate activation of these hormone receptors can have various consequences on cell metabolism, differentiation and / or proliferation.
- a typical example is that of pesticides and certain air pollutants which, by activating the estradiol receptor, will trigger an estrogenic response.
- a functional assay can be considered in animals using the physiological properties of activated receptors, but this approach would be too cumbersome and too expensive if it were to be used routinely.
- the principle consists in cloning a promoter regulated by a given nuclear receptor upstream of a reporter gene coding for an enzyme whose assay is simple and sensitive. If the cell has the receptor in question, the addition of xenohormone will activate the promoter which would be revealed by the reporter gene.
- the promoters used are natural promoters, for example that of the vitellogenin gene for estrogens and that of the MMTV virus (Mouse Mammary & Tumor Virus) for glucocorticoids.
- promoters have a certain number of drawbacks: i) they are not necessarily the most sensitive to the receptor studied, ii) they can be regulated by other effectors; indeed, genes are often subject to multiple regulations and it is frequent that these regulations are colocalized in the promoter in a regulatory unit (or regulatory domain) (Lucas and Granner, 1992).
- Nuclear receptors are the intermediaries at the cellular level of the action of several hormones and effectors such as steroid hormones, triodothyronine, retinoic acid, and 1-25 (OH) 2 vitamin D3 (Evans, 1988).
- hormonal receptors take on such a configuration, when they are linked to hormones, that they then recognize DNA sequences designated as response elements to said receptors, and that they thus activate the various promoters comprising said response elements.
- glucocorticoid receptors the family of glucocorticoid, mineralocorticoid, androgen and progestin receptors (also called glucocorticoid receptors),
- receptors of the latter family bind DNA in the form of heterodimers with the cis-retinoic acid receptor, RXR.
- Their response elements generally consist of direct repetitions of the AGGTCA half-site (Mangelsdorf and Evans, 1995).
- the element of response to estrogens is, interestingly, different in that it is usually palindromic and formed of two inverted half-sites separated by three base pairs (Klein-Hitpa ⁇ et al., 1988a).
- This structure is also that of the response elements of the glucocorticoid receptor family (Martinez et al., 1987), but in this case, the sequence of the half-sites is different.
- Nuclear receptors have a common domain structure with two highly conserved regions: the central DNA binding domain and the C-terminal hormone binding domain (Kumar et al., 1987; Fawell et al., 1990 ; Kumar et al., 1986; Tora et al., 1989; Tasset et al., 1990; Webster et al., 1988; Lees et al., 1989).
- the estrogen receptor (ER) binds an element of response to estrogens, ERE, in the form of a homodimer thus modulating the genetic expression (Brandt et al., 1997; Kumar et al., 1988; Beato, 1989; Dean et al., 1996).
- the efficiency and specificity of the regulation of a gene by a hormone depends on the sequence, the orientation and the spacing of the half-sites but also on the number and the localization of the elements of response (Kraus et al ., 1994; Anolik et al., 1995; Discroll et al., 1996). Indeed, a characteristic common to a large number of promoters regulated by hormones is the presence of several adjacent response elements. In many cases, these elements have a synergistic effect on the transcription of the gene (Klein-Hitpa ⁇ et al., 1988b; Martinez et al., 1989).
- GRE A glucocorticoid response unit, also referred to hereinafter as GRE A, containing two elements of response to glucocorticoids arranged in an overlapping manner has been demonstrated in the context of work on the regulation of the promoter of the cytosolic aspartate aminotransferase gene ( AspATc) (Garlatti et al., 1994). This sequence is recognized by a receptor tetramer, which forms in a highly cooperative manner. Work to modify this GRE A sequence has been carried out in order to increase its affinity for the tetramer, and has resulted in the sequence designated below GRE A up (Garlatti et al., 1994).
- the aim of this article was that of the study, on a fundamental level, of a promoter, namely the promoter of the AspATc gene, and of the glucocorticoid response element activating this promoter, when said element of response is recognized by glucocorticoid receptors.
- dexamethasone namely a synthetic analogue of cortisone.
- dexamethasone is a very powerful agonist of glucocorticoid receptors, and as such represents the most effective synthetic analogue of cortisone.
- the elements for responding to estrogens can also be arranged artificially so as to overlap within the framework of an estrogen response unit, as had been highlighted above in the case of a natural glucocorticoid response element, namely the GRE A element, and this despite the differences, both in their amino acid sequences and in their three-dimensional structure, existing between the estrogen response elements , and those with glucocorticoids,
- glucocorticoid and estrogen response units comprising overlapping response elements, make it possible to detect xenohormones at doses up to approximately 10 to 100 times weaker than the allow the corresponding non-overlapping response elements.
- One of the aims of the present invention is to provide new methods for detecting xenohormones present in the environment or in the body. human or animal, or screening methods for compounds capable of being xenohormones, these methods being simple to use and more specific for said xenohormones than the existing methods of the prior art.
- the present invention also aims to provide new pharmaceutical compositions which can be used in the treatment of pathologies wholly or partly associated with the presence of such xenohormones in the environment, and therefore with the activity of glucocorticoid and mineralocorticoid receptors, androgens and progestins, and / or estrogen receptors.
- Another object of the present invention is to provide new response units capable of being used in a detection method as described above, or in the abovementioned pharmaceutical compositions.
- the subject of the present invention is the use of nucleotide sequences comprising one or more glucocorticoid, mineralocorticoid, androgen and progestin response units (also called glucocorticoid response units, or GRU), and / or one or more response units to estrogens (also called ERU), said units being such that they include:
- glucocorticoid response elements (or GRE elements)
- CCATGT X 4 X 5 X 6 ACAAGA 5 in which Xi, X2, and X3, independently of each other, represent any nucleotide, while X4, X5, and Xg, represent a nucleotide capable of pairing with Xi, X2, and X3, respectively,
- nucleotide sequences capable of activating the promoters by estrogens, when they are recognized by the receptors associated with the latter these two sequences, also known as elements of response to estrogens (or ERE elements), being sequences derived by modification of one or more nucleotides of the GRE response element corresponding to the DNA sequence of the following formula:
- glucocorticoid response element means any nucleotide sequence capable of activating the promoters by the glucocorticoids, when they are recognized by the receptors associated with the latter.
- element of response to estrogens is meant any nucleotide sequence capable of activating the promoters by estrogens, when they are recognized by the receptors associated with the latter.
- the modifications made to the GRE or ERE response elements are essentially such that they allow said response units to activate the promoters comprising them, when these units are recognized by the associated receptors to glucocorticoids, mineralocorticoids, androgens and progestins, or by estrogen receptors.
- the invention relates more particularly to the abovementioned use of nucleotide sequences comprising, as GRU unit:
- the GRE response elements are indicated, on one of the DNA strands, in bold and italic type,
- X a ⁇ to Xgi independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X a 2 to Xg2 * represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a ⁇ to X ⁇ ⁇ respectively, - or a succession of at least two nucleotide sequences of formula (I) above, each of the nucleotide sequences of formula (I) being spaced by a distance between lOn and l in base pairs, center to center, n being a whole number greater than or equal to 2.
- nucleotide sequences comprising, as GRU unit, the nucleotide sequence of formula (I), or a succession of at least two nucleotide sequences of formula (I), mentioned above, are characterized in that:
- X a ⁇ , X D ⁇ , Xfi, and Xgi independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X a 2, X D 2 ' Xf2 > and g2 > represent a nucleotide or derivative capable of s '' pair with X ⁇ , X51, Xfi, and Xgi, respectively,
- - X e ⁇ represents A or T, while X e 2 represents T or A respectively.
- a more particular subject of the invention is the abovementioned use of nucleotide sequences comprising, as GRU unit:
- n an integer greater than or equal to 2
- X a represents any nucleotide or derivative
- X represents a nucleotide or derivative capable of pairing with X a
- X a represents C
- X5 represents G
- GRE A 5 'GGT ACA GAA
- AGA CCT GTT CTX a GGT ACA GAA
- AGA CCT GTT CT 3 ' 3 CCA TGT CTT TCT GGA CAA GAX h
- CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5 is the following sequence (GRE A) 4: 5 'GGT ACA GAA AGA CCT GTT CTX a GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ' 3 .
- CCA TGT CTT TCT GGA CAA GAX h CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5 .
- X a , X c , and X e independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X D , X, and Xf, represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , X c , and X e , respectively, in particular X a , X c , and X e represent C and X a , X c , and X e represent G.
- a more particular subject of the invention is also the abovementioned use of nucleotide sequences comprising, as GRU unit:
- n an integer greater than or equal to 2
- X a represents any nucleotide or derivative
- X5 represents a nucleotide or derivative capable of pairing with X a
- X a represents C
- X5 represents G
- X a , X c , and X e independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X, X ⁇ j, and Xf, represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , X c , and X e , respectively, in particular X a , X c , and X e represent C and X a , X c , and X e represent G.
- the invention also relates to the abovementioned use of nucleotide sequences comprising, as ERU unit:
- ERE response elements are indicated, on one of the DNA strands, in bold and italic type,
- Xal to Xdi independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X a 2 to X ⁇ , represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a ⁇ to XJI respectively,
- nucleotide sequences of formula (II) above spaced by a distance between lOn and l in base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2.
- a more particular subject of the invention is the abovementioned use of nucleotide sequences comprising, as ERU unit:
- n an integer greater than or equal to 2
- X a represents any nucleotide or derivative
- X represents a nucleotide or derivative capable of pairing with X a
- X a represents C and X1 represents G
- X a , X c , and X e independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X, X ⁇ - ⁇ , and Xf, represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , X c , and X e , respectively, in particular X a , X c , and X e represent C and X a , X c , and X e represent G.
- the subject of the invention is also any nucleotide sequence characterized in that it comprises a succession of at least two GRE A nucleotide sequences, and / or a succession of at least two GRE A up nucleotide sequences, as defined above. above.
- the invention also relates to any nucleotide sequence characterized in that it comprises, as ERU unit:
- ERE response elements are indicated, on one of the DNA strands, in bold and italic type,
- X a ⁇ to Xdi independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X a 2 to Xd2 > represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a j to X ⁇ i respectively,
- nucleotide sequences of formula (II) above spaced by a distance between lOn and l in base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2.
- the invention more particularly relates to any nucleotide sequence as described above, and characterized in that it comprises, as ERU unit: - the following nucleotide over ERE sequence:
- n an integer greater than or equal to 2
- X a represents any nucleotide or derivative
- X5 represents a nucleotide or derivative capable of pairing with X a
- X a represents C
- X5 represents G
- X a , X c , and X e independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X5, X ⁇ , and Xf, represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , X c , and X e , respectively, in particular X a , X c , and X e represent C and X a , X c , and X e represent G.
- the subject of the invention is also any nucleotide sequence comprising one or more ERU units, as defined above, and also comprising one or more GRU units defined above.
- the invention also relates to the nucleotide sequences defined above, in which the ERU unit (s), and, where appropriate the GRU unit (s), are located upstream of a basal promoter controlling the transcription of a reporter gene.
- the basai promoter is chosen from the following:
- the TK promoter corresponding to the promoter of the viral thymidine kinase
- the promoter reduced to the TATA box corresponding to a fragment of the promoter of the viral thymidine kinase.
- the reporter gene is chosen from the following genes:
- the subject of the invention is also any vector, in particular any plasmid, characterized in that it comprises at least one nucleotide sequence as described above according to the invention.
- the subject of the invention is more particularly any vector, in particular any plasmid, characterized in that it comprises at least one nucleotide sequence comprising an ERU unit, as described above according to the invention.
- a vector particularly preferred in the context of the present invention is that containing, as ERU unit, the over ERE sequence described above, or a succession of at least two over ERE sequences.
- the invention also relates to any human or animal cell transformed by a vector as defined above.
- the above cells are chosen from the following cells (referenced in the ATCC catalog: American Type Culture Collection):
- Hep G2 Hep 3B
- TONG / HCC human hepatomatous cells
- the invention also relates to any method of detection or in vitro screening of xenohormones capable of interacting with glucocorticoid receptors, and / or estrogen receptors in the human or animal organism, characterized in that it comprises:
- the biological sample likely to contain xenohormones is water, plant extracts, extracts from soil samples, in the case of the implementation of a method for detecting these xenohormones in the environment, or a blood sample in the case of the implementation of a method of in vitro detection of these xenohormones in the human or animal body.
- a preferred in vitro detection method according to the invention, of xenohormones capable of interacting with glucocorticoid receptors, is that comprising:
- a preferred in vitro detection method according to the invention, of xenohormones capable of interacting with estrogen receptors, is that comprising:
- the invention also relates to any pharmaceutical composition characterized in that it comprises, in association with a physiologically acceptable vehicle, at least one GRU and / or ERU unit as defined above.
- Preferred pharmaceutical compositions in the context of the present invention are those comprising, as GRU unit, the GRE A up sequence described above, or a succession of at least two GRE A up sequences.
- compositions preferred in the context of the present invention are those comprising, as ERU unit, the over ERE sequence described above, or a succession of at least two over ERE sequences.
- compositions of the invention are characterized in that the GRU unit (s), and / or the ERU unit (s) are preceded and followed by a succession of at least about 5 nucleotides or derivatives.
- the abovementioned pharmaceutical compositions of the invention are presented in a form which can be administered by the parenteral route, in particular by the intravenous route, or by the oral or local route. , in particular at a rate of approximately 0.1 mg / kg to approximately 10 mg / kg per day of treatment.
- the subject of the invention is also any vector for gene therapy, characterized in that it comprises at least one GRU and / or ERU unit, as defined above.
- Vectors for gene therapy which are particularly preferred in the context of the present invention are those comprising, as GRU unit, the GRE A up sequence described above, or a succession of at least two GRE A up sequences, or ERU unit title, the over ERE sequence described above, or a succession of at least two over ERE sequences.
- the invention also relates to any pharmaceutical composition
- a pharmaceutical composition comprising a vector for gene therapy as defined above, in association with a physiologically acceptable vehicle.
- the invention also relates to the use of pharmaceutical compositions comprising at least one GRU unit, as described above, in the context of the treatment of pathologies associated with the function of a receptor to steroids, including prostate cancer or Cushing's syndrome.
- the invention also relates to the use of pharmaceutical compositions comprising at least one ERU unit, as described above, in the context of the treatment of pathologies associated with the activity of the function of an estrogen receptor, in particular the breast, cervical and ovarian cancers.
- kits or kits for the implementation of a method of in vitro detection of xenohormones comprising:
- cells as defined above, transformed with a vector containing one or more GRU and / or ERU units, said cells being advantageously cultured at 37 ° C. and stored at -80 ° C.,
- He ⁇ G2 cells (Knowles et al., 1980), MCF-7 cells (breast tumor cells) and CMT cells are maintained in DMEM (Dulbecco's minimal essential medium) medium without phenol red, and containing 10% serum fetal calf (Gibco), penicillin (100 U / ml), streptomycin (100 ⁇ l / ml) (Diamond) and fungizone (0.5 ⁇ g / ml) (Squibb).
- DMEM Disbecco's minimal essential medium
- penicillin 100 U / ml
- streptomycin 100 ⁇ l / ml
- fungizone 0.5 ⁇ g / ml
- the vectors for expression of the human estradiol receptor (ER) as well as the truncated fragments of the receptor (HE13, HE15, HE19, HE21, HE38, HE70, and HE72) have been described by Green et al., 1987, and T. Ylicomi et al. , 1992.
- the plasmid ⁇ MTV-CAT derives from the plasmid MMTV-CAT, however the regulatory sequences sensitive to glucocorticoids have been deleted (Umesono et al. 1988).
- a Hind III site has been created at this position. It will serve as a cloning site for oligonucleotides.
- the oligonucleotides were also subcloned into the HindIII site of the Tk-CAT plasmid.
- the oligomers ⁇ ERE, (ERE) 2, over ERE, and (over ERE) 2 ⁇ have 5 'ends compatible with the HindIII site. However, the restriction site is lost after the subcloning.
- the sequence (ERE) 2 was obtained by the ligation of two ERE oligonucleotides.
- ERE strand A: 5 'AGCTGCTC AGCT AGGTCA CTG CGACCT CTACT 3 '
- strand B 5 ' AGCTAGTAG AGGGCT GAG TGACCT AGCTGAGC 3 '
- sequence 2 strand A: 5 'AGCTGCTC AGCT AGGTCAGGTCGACCTGACCT C AGGTCAGGTCGACCTGACCT CTACT 3 ', strand B: 5 ' AG CTAGTAG AGGTCAGGTCGACCTGACCT G AGGTCAGGTCGACCTGACCT
- the GRE sequence used is derived from the promoter of the cytosolic aspartate aminotransferase gene (Garlatti et al., 1994). This sequence has a transcriptional efficiency comparable to the consensus GRE.
- the luciferase-expressing plasmid (RSV-Luc) was purchased from Promega.
- MCF-7 cells A similar protocol is used for MCF-7 cells.
- the cells are seeded at 10 ° "cells per 6 cm in diameter and transfected according to the technique calcium phosphate (Jiang et al., 1992).
- estradiol (10 ⁇ 7 M final concentration) antihormone ICI 164386
- xenohormones xenohormones
- Chloramphenicol acetyltransferase ensures the transfer of an acetyl group to the hydroxyl in position 3 of chloramphenicol (antibiotic).
- the quantification of the acetylated product allows direct measurement of the regulatory activity of a promoter.
- the classical technique consists in extracting the product and the substrate, in separating them by chromatography (TLC) and autoradiography.
- TLC chromatography
- the scintillating liquid used is econofluor which is hydrophobic. However acetylated chloramphenicol diffuses in the econofluor while acetyl CoA remains in the aqueous phase. Thus, only the product of the reaction is in an environment allowing its detection by the scintillation counter.
- lysis buffer IX Promega's Reporter Lysis Buffer
- One hundred ⁇ l of supernatant are heated at 65 ° C. for 5 minutes in order to denature the endogenous acetylases, then centrifuged for 20 minutes at 15,000 rpm.
- Twenty ⁇ l of Premix (5 mM EDTA, 250 mM Tris-HCl pH 7.5, cold acetyl CoA 30 ⁇ M, 3 H acetyl CoA 0.5 ⁇ Ci, chloramphenicol ImM) and 20 ⁇ l of chloramphenicol (5 mM) are added to 60 ⁇ l samples. The samples are then incubated for 30 minutes at 37 ° C. Eighty ⁇ l of this mixture are added to 4 ml of Econofluor '.
- Luciferase The dosage of luciferase is extremely sensitive, fast and simple. Luciferase is a monomeric protein with a molecular weight of 62 KDa. It catalyzes the oxidation of luciferin (peroxide) accompanied by the production of photons.
- the conventional luciferase test generates a brief flash of light which appears upon contact of the enzyme with the substrate. But the system we used (Promega's luciferase assay system) has a slower enzymatic "turnover" allowing to visualize a constant light intensity for several minutes; this eliminates the need for an automatic injection luminometer.
- the detection sensitivity of this method is of the order of 10 ⁇ 20 moles of luciferase. This test is therefore approximately 100 times more sensitive than the CAT assay.
- the luciferase assay is carried out on a calibrated luminometer (model: BIOORBIT 1250). One hundred ⁇ l of reagent (Luciferase assay reagent- Promega) are vigorously mixed with the 20 ⁇ l of the sample to be assayed. The counting is carried out 10 seconds then 20 seconds after. The results are expressed in mVolts (De Wet et al., 1987).
- CMT cells are transfected according to the DEAE technique described by Ishikawa et al., 1992. Briefly, the cells are seeded at 2 10 "cells / dish 10 cm in diameter. Twenty-four hours later, the cells are washed twice. times with PBS, then 500 ⁇ l of trypsin are added The cells are incubated for 10 min at room temperature, then 4 ml of culture medium, containing 20 ⁇ g of the ER expression vector, 400 ⁇ g of DEAE dextran and 0.1 mM chloroquine is added The cells are incubated for 4 hours at 37 ° C followed by a 2 min shock with DMSO (dimethyl sulfoxide).
- DMSO dimethyl sulfoxide
- estradiol (10 " ⁇ M) is added.
- the cells are washed twice with cold PBS, then harvested in the binding buffer (20 mM Tris-HCl (pH 7.5), DTT 2mM, 20% glycerol (v / v) and 0.4 M KC1.
- Total cell extracts are prepared by freezing the cells at -80 ° C. and then heating them on ice. This is followed by centrifugation at 10000 g for 15 min at 0 ° C. in a Sigma centrifuge The supernatant is stored at -80 ° C.
- the ER was prepared using the in vitro transcription and translation kit in a reticulocyte system (TNT -Promega). Briefly, 4 ⁇ g of ER expression vector is incubated with the TNT lysate, the T7 RNA polymerase, the mixture of amino acids (1 mM), and the RNAsin (40 IU). The reaction is incubated for two hours at 30 ° C.
- the oligonucleotides are hybrid then radiolabeled using the Klenow fragment of DNA polymerase I.
- the tests are carried out as described by Cao et al., 1993.
- the binding reactions were carried out in binding buffer (20 mM Tris-HCl (pH 7.8), 1 mM dithiothreitol, 1 mM EDTA, 10% glycerol (vol / vol), bovine albumin 3 ⁇ g / ⁇ l, 100 mM NaCl), 0.3 ng of radiolabelled DNA and l ⁇ g of dldC.
- binding buffer (20 mM Tris-HCl (pH 7.8), 1 mM dithiothreitol, 1 mM EDTA, 10% glycerol (vol / vol), bovine albumin 3 ⁇ g / ⁇ l, 100 mM NaCl
- Nonidet P40 0.1% is added to the reaction in order to minimize the binding of accessory proteins to the ER.
- the ER is added to the concentrations indicated in the legend figures.
- the reaction mixture is deposited on an electrophoresis gel consisting of polyacrylamide 6% (acrylamide / bisacrylamide, 29: 1) and TBE 0.25 X, preheated (100 V / 12 cm , 30 min); migration continues for 90 min (200 V / 12 cm).
- the gel is then dried and then exposed with a film.
- the monoclonal antibody, H222 is incubated with the receptor during the binding reaction.
- the densitometric study is carried out using NIH Image software.
- the experiment is carried out as described by Truss et al. , 1991. Briefly, the oligonucleotides labeled with T4 polynucleotide kinase are treated with dimethyl sulfate (DMS). The methylated DNA is then added to 15 ⁇ l of ER purified recombinant (purchased from PanVera). The reaction mixture is then deposited on an electrophoresis gel composed of 6% acrylamide. After the self-radiography, the interesting bands are excised and then eluted overnight at 37 ° C. in 500 ⁇ l of buffer (Tris-EDTA, 1.5 M NaCl). After washing with phenol and chloroform and precipitation with ethanol, the DNA is cleaved with piperidine and then deposited on a denaturing gel of 10% polyacrylamide-8M urea. The gel is then dried and then autoradiographed.
- DMS dimethyl sulfate
- complexes II and complexes IV are formed respectively by the dimer and the tetramer of ER linked to the sequence over ERE.
- the slowly migrating complex observed in the case of over ERE, would be formed of two dimers of ER.
- experiments of interference by methylation were carried out.
- the radiolabelled DNA is partially methylated following treatment with DMS; a connection between the DNA and the ER is then carried out.
- the slowly migrating complex is excised from the gel, then the DNA is cleaved by piperidine. Finally, the DNA resulting from digestion is deposited on a sequence gel.
- Kd dissociation constants
- This promoter is derived from the MMTV promoter but it is deleted from the -190 / -88 fragment sensitive to induction by glucocorticoids (Umesono et al., 1988).
- the CAT activity of cells transfected with this plasmid is not regulated by oestradiol.
- the HepG2 cells were cotransfected with increasing concentrations of ER expression vector (0 ng to 100 ng), and either by the plasmid ⁇ MTV-ERE-CAT, or by the plasmid ⁇ MTV- (ERE) 2-CAT containing two ERE in tandem, or finally by the plasmid ⁇ MTV-over ERE-CAT.
- the hormone, 17- ⁇ Estradiol (10 " ⁇ M) is added to the culture medium 24 hours later.
- the transcriptional activity of the plasmid ⁇ MTV-ERE-CAT increases then reaches a plateau at 30 ng of ER transfected.
- the shape of the curve is similar to the first, however the transcriptional activity is twice greater than the plasmid ⁇ MTV-ERE-CAT.
- the transcriptional activity is 3 to 4 times higher than that obtained for the plasmid ⁇ MTV-ERE-CAT
- the ER is activated by estrogens as well as by many natural or chemical compounds having an estrogenomimetic activity. These compounds are called xenoestrogens.
- the response of the promoters containing the ERE and over ERE sequences was compared with various classes of xenoestrogens.
- Phenol red a known colorant mimicking the effect of estrogens, was added, at different concentrations, to HepG2 cells transfected either by the ERE plasmid or by the over ERE plasmid.
- the transcriptional activity of the over ERE sequence is 4 to 5 times higher than that of the over ERE sequence, and this for the same concentrations of added phenol red. Consequently, using the ERE sequence, we can detect the effect of phenol red at a concentration of 10 ⁇ 4 M, while the over ERE sequence allows us to detect the estrogenic activity of this compound at a lower concentration. (10 "6 M).
- Chlordane The estrogenic activity of a compound formed from two polychlorinated phenolic nuclei (Chlordane) was tested using the same test as that described for phenol red. Chlordane activated the transcription of the plasmid ERE-CAT at a concentration of 10 ⁇ 5 M. On the other hand, one can detect the estrogenic activity of this molecule at a concentration of 10 " ⁇ M thanks to the plasmid over ERE-CAT In this case also the transcriptional activity of the sequence over ERE is very synergistic.
- the basal activity of the ⁇ MTV-over ERE-CAT plasmid is higher than that of the ⁇ MTV- (ERE) 2-CAT and ⁇ MTV-ERE-CAT plasmids. These differences in basal activities could be due either to the intrinsic properties of these promoters, or to an endogenous stimulation of the ER by compounds having an oestrogenomimetic activity.
- the HepG2 cells were transfected with one of these three plasmids mentioned above and then incubated either with oestradiol or with an ER antagonist ICI 168134 or with both.
- ICI 168134 strongly inhibited induction by esradiol, but this compound also inhibited the basal activity of these three constructions.
- Areas A / B and E are responsible for the cooperative link of the ER to the sequence over ERE:
- the cooperativity ratio (KdlI / KdIV) is close to 5, which indicates that the HEO binds cooperatively to the sequence over ERE.
- HE19 a truncated N-terminal receptor, is also capable of binding to the over ERE sequence in tetrameric form. Therefore the deletion of the A / B domain did not prevent the formation of the tetramer. However in this case, the cooperative relationship is close to 1, which suggests that this domain contributes in the cooperative link of the ER to the sequence over ERE.
- Several deletions of the C-terminal domain have been tested.
- HE38 which is truncated from domain E, binds mainly in dimeric form.
- a weak band observed only at high concentrations of added HE38, corresponds to the tetrameric form of the receptor. This was confirmed by the truncated HE15 receiver.
- HE70 C-terminal and N-terminal domains are deleted (HE70)
- no tetramer is observed, even if large quantities of HE70 are used, and when the majority of the probe is complexed.
- the functionality of some of the deleted ER fragments has been tested.
- the HepG2 cells were transfected with either the Tk-ERE-CAT plasmid or the Tk-over ERE-CAT plasmid and increasing amounts of one of the deleted ER expression vectors.
- HEO and HE13 have the same induction profile, ie the transactivation performed by the over ERE sequence is approximately 5 times higher than that performed by the ERE sequence.
- the activation of the transcription carried out by the over ERE sequence is 2 to 3 times greater than that carried out by the ERE. So HE19 has lost the ability to perform synergistic transcriptional activation.
- HE 15 and HE21 have a very weak transcriptional activity and this for the two ERE or over ERE sequences. These results are in agreement with the gel retardation experiments, in which HEO and HE13 bind in a cooperative manner to the sequence over ERE. In conclusion, the cooperative binding of the estradiol receptor to the over ERE sequence in vitro correlates with the activation of synergistic transcription in vivo.
- estradiol receptor to bind to two overlapping estradiol response elements (over ERE) has been assessed.
- the binding and functional properties of the over ERE sequence have been studied. In addition to the dimeric complex, this sequence specifically binds a high molecular weight complex recognized by an antibody directed against ER.
- the structure of the over ERE sequence (4 half-sites) and the mobility of the complex show that it is a complex formed of a tetramer of ER linked to the over ERE sequence.
- the link of the ER to the sequence over ERE is cooperative.
- the dissociation constant (Kd) of the tetrameric complex (ER4-over ERE) is 5 to 15 times lower than that of the dimeric complex (ER2-over ERE), this depends on the extract used.
- the receptor When the two domains are deleted, the receptor therefore retains only the DNA binding domain, the binding of ER to sequences over ERE or ERE is identical, even at high ER concentrations.
- the binding of the binding domain to the DNA of the ER prevents the binding of a second dimer, the E domain is therefore critical. This domain would therefore help the DNA-receptor complex to get into a conformation which allows it to bind a second receptor dimer; this therefore constitutes an additional role for domain E.
- the curvature of the DNA following interaction with the receptor could explain the observations mentioned above.
- the binding of a dimer of the DNA binding domain of the ER is sufficient to induce a curvature of the DNA (Nardulli et al., 1993; Schwabe et al., 1993). This could prevent the binding of a DNA binding domain dimer at the overlapping site.
- the addition of the E domain makes it possible to overcome this inhibition, and the entire receptor binds cooperatively. As the E domain interacts with various proteins, the cooperative bond could be due to an interaction of the receptor-receptor type.
- GR nuclear receptor family
- Another member of the nuclear receptor family, GR is capable of forming a tetramer by interacting with overlapping GREs located in the promoter of the aspartate aminotransferase gene (Garlatti et al., 1994).
- the binding of the GR tetramer to overlapping response elements appears to be more cooperative than in the case of ER. This could be due to the fact that the GR does not curve the DNA following its binding (Luisi et al., 1991).
- a 13 bp palindrome is a functional estrogen responsive element and interacts specifically with estrogen receptor. Nucl. Acids Res. 16: 647-663.
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Abstract
The invention concerns the use of nucleotide sequences comprising one or several units responsive to glucocorticoids, mineralocorticoids, androgens and progestogens (also referred to as GRU), and/or one or several estrogen-responsive units (also referred to as ERU), said responsive units being characterised in that their two response elements overlap each other such that the centre of one of these two elements is offset by a distance of five base pairs relative to the centre of the other of these two elements, for implementing a method for detecting in vitro xenohormones, or in preparing medicines for treating pathologies related to the activity of glucocorticoid, mineralocorticoid, androgen and progestogen receptors, and/or estrogen receptors.
Description
SEQUENCES NUCLEOTIDIQUES CHEVAUCHANTES, ET LEUR UTILISATION DANS LE CADRE DE LA DETECTION DE XENOHORMONES AINSI QUE DANS DES COMPOSITIONS PHARMACEUTIQUESOVERLAP NUCLEOTIDE SEQUENCES, AND THEIR USE IN THE CONTEXT OF DETECTION OF XENOHORMONES AND IN PHARMACEUTICAL COMPOSITIONS
La présente invention a pour objet l'utilisation de séquences nucléotidiques dérivées des éléments de réponse aux glucocorticoïdes et/ou aux oestrogènes, pour la mise en oeuvre de méthodes de détection in vitro de xénohormones.The subject of the present invention is the use of nucleotide sequences derived from the glucocorticoid and / or estrogen response elements, for the implementation of methods of in vitro detection of xenohormones.
L'invention a également pour objet des compositions pharmaceutiques contenant de telles séquences nucléotidiques.A subject of the invention is also pharmaceutical compositions containing such nucleotide sequences.
La toxicité de nombreux composés retrouvés dans l'environnement ainsi que d'un certain nombre de médicaments est due à leur interaction avec des récepteurs hormonaux. De tels composés sont encore désignés xénohormones.The toxicity of many compounds found in the environment as well as of a certain number of drugs is due to their interaction with hormone receptors. Such compounds are also designated xenohormones.
L'activation illégitime de ces récepteurs hormonaux peut avoir diverses conséquences sur le métabolisme, la différenciation et/ou la prolifération cellulaires.The illegitimate activation of these hormone receptors can have various consequences on cell metabolism, differentiation and / or proliferation.
Un exemple typique est celui de pesticides et de certains polluants atmosphériques qui, en activant le récepteur à l'oestradiol, vont déclencher une réponse de type oestrogénique.A typical example is that of pesticides and certain air pollutants which, by activating the estradiol receptor, will trigger an estrogenic response.
Ces xénoestrogènes ont été suspectés d'être à l'origine de la diminution de la fertilité masculine et de l'augmentation de la fréquence de certains cancers ces dernières années comme le cancer du testicule et le cancer du sein (Auger et al. ; Jensen et al., 1995).These xenoestrogens have been suspected to be responsible for the decline in male fertility and the increase in the frequency of certain cancers in recent years such as testicular cancer and breast cancer (Auger et al.; Jensen et al., 1995).
D'autres composés semblent avoir des effets de type glucocorticoïdes, et pourraient ainsi entraîner des perturbations du système immunitaire (Tanaka et al., 1996).Other compounds seem to have glucocorticoid-like effects, and could thus lead to disturbances of the immune system (Tanaka et al., 1996).
Les xénohormones ayant des structures très diverses, il est difficile de proposer un dosage structural direct. Un dosage fonctionnel peut être envisagé chez l'animal en utilisant les propriétés physiologiques des récepteurs activés, mais cette approche serait trop lourde et trop coûteuse si elle devait être utilisée en routine.Xenohormones having very diverse structures, it is difficult to propose a direct structural assay. A functional assay can be considered in animals using the physiological properties of activated receptors, but this approach would be too cumbersome and too expensive if it were to be used routinely.
On peut donc s'orienter vers les systèmes de cellules en culture, en particulier en utilisant les transfections cellulaires (les différentes approches sont discutées dans Sonnenschein et al. , 1995).We can therefore focus on cell systems in culture, in particular using cell transfections (the different approaches are discussed in Sonnenschein et al., 1995).
Le principe consiste à cloner un promoteur régulé par un récepteur nucléaire donné en amont d'un gène rapporteur codant pour une enzyme dont le dosage est simple et sensible.
Si la cellule possède le récepteur en question, l'addition de la xénohormone entraînera une activation du promoteur qui serait révélée par le gène rapporteur.The principle consists in cloning a promoter regulated by a given nuclear receptor upstream of a reporter gene coding for an enzyme whose assay is simple and sensitive. If the cell has the receptor in question, the addition of xenohormone will activate the promoter which would be revealed by the reporter gene.
Il existe plusieurs variantes de cette approche utilisant soit des cellules de mammifère, soit des levures.There are several variants of this approach using either mammalian cells or yeasts.
Les promoteurs utilisés sont des promoteurs naturels, par exemple celui du gène de la vitellogénine pour les oestrogènes et celui du virus MMTV (Mouse Mammary & Tumor Virus) pour les glucocorticoïdes.The promoters used are natural promoters, for example that of the vitellogenin gene for estrogens and that of the MMTV virus (Mouse Mammary & Tumor Virus) for glucocorticoids.
Malgré leur intérêt, ces promoteurs présentent un certain nombre d'inconvénients : i) ils ne sont pas nécessairement les plus sensibles au récepteur étudié, ii) ils peuvent être régulés par d'autres effecteurs ; en effet, les gènes sont souvent soumis à des régulations multiples et il est fréquent que ces régulations soient colocalisees dans le promoteur dans une unité de régulation (ou domaine de régulation) (Lucas et Granner, 1992).Despite their interest, these promoters have a certain number of drawbacks: i) they are not necessarily the most sensitive to the receptor studied, ii) they can be regulated by other effectors; indeed, genes are often subject to multiple regulations and it is frequent that these regulations are colocalized in the promoter in a regulatory unit (or regulatory domain) (Lucas and Granner, 1992).
L'utilisation de ces promoteurs peut donc poser un problème de spécificité de l'effet observé.The use of these promoters can therefore pose a problem of specificity of the effect observed.
Les récepteurs nucléaires sont les intermédiaires au niveau cellulaire de l'action de plusieurs hormones et effecteurs comme les hormones stéroïdes, la triodothyronine, l'acide rétinoïque, et la 1-25 (OH)2 vitamine D3 (Evans, 1988).Nuclear receptors are the intermediaries at the cellular level of the action of several hormones and effectors such as steroid hormones, triodothyronine, retinoic acid, and 1-25 (OH) 2 vitamin D3 (Evans, 1988).
Ces récepteurs hormonaux prennent une configuration telle, lorsqu'ils sont liés aux hormones, qu'ils reconnaissent alors des séquences d'ADN désignées éléments de réponse auxdits récepteurs, et qu'ils activent ainsi les différents promoteurs comprenant desdits éléments de réponse.These hormonal receptors take on such a configuration, when they are linked to hormones, that they then recognize DNA sequences designated as response elements to said receptors, and that they thus activate the various promoters comprising said response elements.
Il existe deux grandes familles de récepteurs nucléaires activés par un ligand (Beato et al., 1995; Mangelsdorf et al., 1995) :There are two main families of nuclear receptors activated by a ligand (Beato et al., 1995; Mangelsdorf et al., 1995):
- la famille des récepteurs aux glucocorticoïdes, minéralocorticoïdes, androgènes et progestatifs (encore désignés récepteurs aux glucocorticoïdes),- the family of glucocorticoid, mineralocorticoid, androgen and progestin receptors (also called glucocorticoid receptors),
- la famille des récepteurs aux oestrogènes et à la triodothyronine.- the family of estrogen and triodothyronine receptors.
La plupart des récepteurs de cette dernière famille lient l'ADN sous la forme d'hétérodimères avec le récepteur à l'acide cis-rétinoïque, RXR. Leurs éléments de réponse se composent généralement de répétitions directes du demi- site AGGTCA (Mangelsdorf and Evans, 1995). L'élément de réponse aux oestrogènes est, de manière intéressante, différent en ce sens qu'il est habituellement palindromique et formé de deux demi-sites inversés séparés par trois paires de bases (Klein-Hitpaβ et al., 1988a). Cette structure est également
celle des éléments de réponse de la famille du récepteur aux glucocorticoïdes (Martinez et al. , 1987), mais dans ce cas, la séquence des demi-sites est différente.Most receptors of the latter family bind DNA in the form of heterodimers with the cis-retinoic acid receptor, RXR. Their response elements generally consist of direct repetitions of the AGGTCA half-site (Mangelsdorf and Evans, 1995). The element of response to estrogens is, interestingly, different in that it is usually palindromic and formed of two inverted half-sites separated by three base pairs (Klein-Hitpaβ et al., 1988a). This structure is also that of the response elements of the glucocorticoid receptor family (Martinez et al., 1987), but in this case, the sequence of the half-sites is different.
Les récepteurs nucléaires ont une structure en domaine commune avec deux régions hautement conservées : le domaine central de liaison à l'ADN et le domaine C-terminal de liaison de l'hormone (Kumar et al. , 1987; Fawell et al. , 1990; Kumar et al. , 1986; Tora et al., 1989; Tasset et al., 1990; Webster et al., 1988; Lees et al., 1989). Après stimulation hormonale, le récepteur aux oestrogènes (ER), lie un élément de réponse aux oestrogènes, ERE, sous la forme d'un homodimère modulant ainsi l'expression génétique (Brandt et al., 1997; Kumar et al., 1988; Beato, 1989; Dean et al., 1996).Nuclear receptors have a common domain structure with two highly conserved regions: the central DNA binding domain and the C-terminal hormone binding domain (Kumar et al., 1987; Fawell et al., 1990 ; Kumar et al., 1986; Tora et al., 1989; Tasset et al., 1990; Webster et al., 1988; Lees et al., 1989). After hormonal stimulation, the estrogen receptor (ER), binds an element of response to estrogens, ERE, in the form of a homodimer thus modulating the genetic expression (Brandt et al., 1997; Kumar et al., 1988; Beato, 1989; Dean et al., 1996).
L'efficacité et la spécificité de la régulation d'un gène par une hormone dépend de la séquence, de l'orientation et de l'espacement des demi-sites mais aussi du nombre et de la localisation des éléments de réponse (Kraus et al. , 1994; Anolik et al. , 1995; Discroll et al., 1996). En effet, un caractère commun à un grand nombre de promoteurs régulés par les hormones est la présence de plusieurs éléments de réponse adjacents. Dans de nombreux cas, ces éléments ont un effet synergique sur la transcription du gène (Klein-Hitpaβ et al., 1988b; Martinez et al., 1989). Il est aussi connu que dans le cas de certains récepteurs nucléaires et de facteurs de transcription, une liaison coopérative est observée sur des éléments adjacents (Martinez et al., 1989; Tsai et al. , 1989). La distance entre ces éléments est critique. Elle devient optimale quand elle correspond à un multiple de tours d'hélice ce qui permet alors la liaison des récepteurs sur le même côté de la double hélice d'ADN. Cependant, cette distance peut aussi être très longue. Dans ce cas, la boucle formé par l'ADN permettrait l'interaction entre récepteurs et la stabilisation du complexe (Ptashne, 1986). La flexibilité de la protéine serait critique pour que de telles interactions puissent se produire.The efficiency and specificity of the regulation of a gene by a hormone depends on the sequence, the orientation and the spacing of the half-sites but also on the number and the localization of the elements of response (Kraus et al ., 1994; Anolik et al., 1995; Discroll et al., 1996). Indeed, a characteristic common to a large number of promoters regulated by hormones is the presence of several adjacent response elements. In many cases, these elements have a synergistic effect on the transcription of the gene (Klein-Hitpaβ et al., 1988b; Martinez et al., 1989). It is also known that in the case of certain nuclear receptors and transcription factors, a cooperative bond is observed on adjacent elements (Martinez et al., 1989; Tsai et al., 1989). The distance between these elements is critical. It becomes optimal when it corresponds to a multiple of helix turns which then allows the binding of receptors on the same side of the DNA double helix. However, this distance can also be very long. In this case, the loop formed by DNA would allow interaction between receptors and stabilization of the complex (Ptashne, 1986). The flexibility of the protein would be critical for such interactions to occur.
Une unité de réponse aux glucocorticoïdes, encore désignée ci-après GRE A, contenant deux éléments de réponse aux glucocorticoïdes agencés de manière chevauchante a été mise en évidence dans le cadre de travaux sur la régulation du promoteur du gène de l'aspartate aminotransférase cytosolique (AspATc) (Garlatti et al. , 1994). Cette séquence est reconnue par un tétramère du récepteur, qui se forme de manière fortement coopérative. Des travaux de modification de cette séquence GRE A, ont été effecmés afin d'augmenter son affinité pour le tétramère, et ont abouti à la séquence désignée ci-après GRE A up (Garlatti et al. , 1994).A glucocorticoid response unit, also referred to hereinafter as GRE A, containing two elements of response to glucocorticoids arranged in an overlapping manner has been demonstrated in the context of work on the regulation of the promoter of the cytosolic aspartate aminotransferase gene ( AspATc) (Garlatti et al., 1994). This sequence is recognized by a receptor tetramer, which forms in a highly cooperative manner. Work to modify this GRE A sequence has been carried out in order to increase its affinity for the tetramer, and has resulted in the sequence designated below GRE A up (Garlatti et al., 1994).
Toutefois, aucune corrélation entre, d'une part, la mise en évidence de ces unités de réponse GRE A et GRE A up susmentionnées, et, d'autre part, la
possibilité d'utiliser de tels éléments de réponse chevauchants dans le cadre de la mise en oeuvre d'une méthode de détection de xénohormones, n'a été faite, ni même suggérée dans l'article de Garlatti et al susmentionné.However, no correlation between, on the one hand, the highlighting of these GRE A and GRE A up response units mentioned above, and, on the other hand, the The possibility of using such overlapping response elements in the context of implementing a method for detecting xenohormones has not been made, nor even suggested in the article by Garlatti et al mentioned above.
En effet, le but de cet article était celui de l'étude, sur le plan fondamental, d'un promoteur, à savoir le promoteur du gène AspATc, et de l'élément de réponse aux glucocorticoïdes activant ce promoteur, lorsque ledit élément de réponse est reconnu par les récepteurs aux glucocorticoïdes.Indeed, the aim of this article was that of the study, on a fundamental level, of a promoter, namely the promoter of the AspATc gene, and of the glucocorticoid response element activating this promoter, when said element of response is recognized by glucocorticoid receptors.
Le glucocorticoïde utilisé dans les expériences d'activation du promoteur du gène AspATc décrites dans l'article Garlatti et al. susmentionné, est la dexaméthasone, à savoir un analogue de synthèse de la cortisone. A la différence des xénohormones susceptibles d'être retrouvées dans l'environnement, la dexaméthasone est un agoniste très puissant des récepteurs aux glucocorticoïdes, et à ce titre représente l'analogue de synthèse le plus efficace de la cortisone.The glucocorticoid used in the activation experiments of the promoter of the AspATc gene described in the article Garlatti et al. mentioned above, is dexamethasone, namely a synthetic analogue of cortisone. Unlike xenohormones likely to be found in the environment, dexamethasone is a very powerful agonist of glucocorticoid receptors, and as such represents the most effective synthetic analogue of cortisone.
Par conséquent, aucune corrélation n'a été faite ni suggérée dans cet article, entre, d'une part, les unités de réponse GRE A et GRE A up susmentionnées, et, d'autre part, l'utilisation de ces unités pour la détection de xénohormones dans des échantillons, tels que de l'eau ou des extraits de plantes ou de sol, car rien ne pouvait laisser supposer que les quantités de xénohormones présentes dans de tels échantillons étaient susceptibles d'être suffisantes pour activer des promoteurs par les unités de réponse susmentionnées.Consequently, no correlation has been made or suggested in this article, between, on the one hand, the GRE A and GRE A up response units mentioned above, and, on the other hand, the use of these units for the detection of xenohormones in samples, such as water or plant or soil extracts, as there was nothing to suggest that the amounts of xenohormones present in such samples were likely to be sufficient to activate promoters by above response units.
La présente invention découle de la mise en évidence par les Inventeurs :The present invention follows from the discovery by the Inventors:
- d'une part, du fait que les éléments de réponse aux oestrogènes peuvent également être disposés de façon artificielle de manière à se chevaucher dans le cadre d'une unité de réponse aux oestrogènes, comme cela avait été mis en évidence ci-dessus dans le cas d'un élément naturel de réponse aux glucocorticoïdes, à savoir l'élément GRE A, et ce malgré les différences, tant au niveau de leurs séquences en acides aminés, que dans leur structure tridimensionnelle, existant entre les éléments de réponse aux oestrogènes, et ceux aux glucocorticoïdes,- on the one hand, the fact that the elements for responding to estrogens can also be arranged artificially so as to overlap within the framework of an estrogen response unit, as had been highlighted above in the case of a natural glucocorticoid response element, namely the GRE A element, and this despite the differences, both in their amino acid sequences and in their three-dimensional structure, existing between the estrogen response elements , and those with glucocorticoids,
- et, d'autre part, du fait que les unités de réponse aux glucocorticoïdes et celles aux oestrogènes, comprenant des éléments de réponse chevauchants, permettent de détecter des xénohormones à des doses jusqu'à environ 10 à 100 fois plus faibles que ne le permettent les éléments de réponse non chevauchants correspondants.- and, secondly, the fact that the glucocorticoid and estrogen response units, comprising overlapping response elements, make it possible to detect xenohormones at doses up to approximately 10 to 100 times weaker than the allow the corresponding non-overlapping response elements.
Un des buts de la présente invention est de fournir de nouvelles méthodes de détection de xénohormones présentes dans l'environnement ou dans le corps
humain ou animal, ou de méthodes de criblage de composés susceptibles d'être des xénohormones, ces méthodes étant simples de mise en oeuvre et plus spécifiques desdites xénohormones que les méthodes existantes de l'état de la technique.One of the aims of the present invention is to provide new methods for detecting xenohormones present in the environment or in the body. human or animal, or screening methods for compounds capable of being xenohormones, these methods being simple to use and more specific for said xenohormones than the existing methods of the prior art.
La présente invention a également pour but de fournir de nouvelles compositions pharmaceutiques utilisables dans le cadre du traitement de pathologies en tout ou partie associées à la présence de telles xénohormones dans l'environnement, et donc à l'activité des récepteurs aux glucocorticoïdes, minéralocorticoïdes, androgènes et progestatifs, et/ou des récepteurs aux oestrogènes.The present invention also aims to provide new pharmaceutical compositions which can be used in the treatment of pathologies wholly or partly associated with the presence of such xenohormones in the environment, and therefore with the activity of glucocorticoid and mineralocorticoid receptors, androgens and progestins, and / or estrogen receptors.
Un autre but de la présente invention est de fournir de nouvelles unités de réponse susceptibles d'être utilisées dans une méthode de détection telle que décrite ci-dessus, ou dans les compositions pharmaceutiques susmentionnées.Another object of the present invention is to provide new response units capable of being used in a detection method as described above, or in the abovementioned pharmaceutical compositions.
La présente invention a pour objet l'utilisation de séquences nucléotidiques comprenant une ou plusieurs unités de réponse aux glucocorticoïdes, minéralocorticoïdes, androgènes et progestatifs (encore désignées unités de réponse aux glucocorticoïdes, ou GRU), et/ou une ou plusieurs unités de réponse aux œstrogènes (encore désignées ERU), lesdites unités étant telles qu'elles comprennent :The subject of the present invention is the use of nucleotide sequences comprising one or more glucocorticoid, mineralocorticoid, androgen and progestin response units (also called glucocorticoid response units, or GRU), and / or one or more response units to estrogens (also called ERU), said units being such that they include:
- pour l'unité GRU : deux séquences nucléotidiques capables d'activer les promoteurs par les glucocorticoïdes, lorsqu'elles sont reconnues par les récepteurs associés à ces derniers, ces deux séquences, encore désignées éléments de réponse aux glucocorticoïdes (ou éléments GRE), étant des séquences dérivées par modification d'un ou plusieurs nucléotides de l'élément de réponse GRE correspondant à la séquence d'ADN de formule suivante :- for the GRU unit: two nucleotide sequences capable of activating the promoters by the glucocorticoids, when they are recognized by the receptors associated with the latter, these two sequences, also known as glucocorticoid response elements (or GRE elements), being sequences derived by modification of one or more nucleotides of the GRE response element corresponding to the DNA sequence of the following formula:
5 ' GGTACA X!X2 3 TGTTCT 3 ' 5 'GGTACA X! X 2 3 TGTTCT 3 '
3 , CCATGT X4X5X6 ACAAGA 5 , dans laquelle Xi , X2, et X3, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque, tandis que X4, X5, et Xg, représentent un nucleotide capable de s'apparier avec Xi , X2, et X3, respectivement, 3 , CCATGT X 4 X 5 X 6 ACAAGA 5 , in which Xi, X2, and X3, independently of each other, represent any nucleotide, while X4, X5, and Xg, represent a nucleotide capable of pairing with Xi, X2, and X3, respectively,
- pour l'unité ERU : deux séquences nucléotidiques capables d'activer les promoteurs par les oestrogènes, lorsqu'elles sont reconnues par les récepteurs associés à ces derniers, ces deux séquences, encore désignées éléments de réponse aux oestrogènes (ou éléments ERE), étant des séquences dérivées par modification d'un ou plusieurs nucléotides de l'élément de réponse GRE correspondant à la séquence d'ADN de formule suivante :- for the ERU unit: two nucleotide sequences capable of activating the promoters by estrogens, when they are recognized by the receptors associated with the latter, these two sequences, also known as elements of response to estrogens (or ERE elements), being sequences derived by modification of one or more nucleotides of the GRE response element corresponding to the DNA sequence of the following formula:
5' AGGTCA X!X2X3 TGACCT 3' 3, TCCACT X X5X6 ACTGGA 5,
dans laquelle Xi , X , et X3, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque, tandis que X4, X5, et Xg, représentent un nucleotide capable de s'apparier avec Xi , X , et X3, respectivement, lesdites unités de réponse GRU et ERU étant caractérisées en ce que leurs deux éléments de réponse respectifs, GRE et ERE, se chevauchent de telle façon que le centre de l'un des éléments GRE ou ERE, est respectivement décalé d'une distance de 5 paires de bases par rapport au centre de l'autre élément GRE ou ERE, pour la mise en œuvre d'une méthode de détection in vitro de xénohormones, ou pour la préparation de médicaments destinés au traitement de pathologies associées à l'activité des récepteurs aux glucocorticoïdes et/ ou aux œstrogènes. 5 'AGGTCA X ! X 2 X 3 TGACCT 3 ' 3 , TCCACT XX 5 X 6 ACTGGA 5 , in which Xi, X, and X3, independently of each other, represent any nucleotide, while X4, X5, and Xg, represent a nucleotide capable of pairing with Xi, X, and X3, respectively, said units of response GRU and ERU being characterized in that their two respective response elements, GRE and ERE, overlap in such a way that the center of one of the elements GRE or ERE, is respectively offset by a distance of 5 base pairs relative to the center of the other GRE or ERE element, for the implementation of a method of in vitro detection of xenohormones, or for the preparation of medicaments intended for the treatment of pathologies associated with the activity of glucocorticoid receptors and / or estrogen.
Par l'expression "élément de réponse aux glucocorticoïdes", on entend toute séquence nucléotidique capable d'activer les promoteurs par les glucocorticoïdes, lorsqu'elles sont reconnues par les récepteurs associés à ces derniers.The expression "glucocorticoid response element" means any nucleotide sequence capable of activating the promoters by the glucocorticoids, when they are recognized by the receptors associated with the latter.
Par l'expression "élément de réponse aux oestrogènes", on entend toute séquence nucléotidique capable d'activer les promoteurs par les oestrogènes, lorsqu'elles sont reconnues par les récepteurs associés à ces derniers.By the expression "element of response to estrogens" is meant any nucleotide sequence capable of activating the promoters by estrogens, when they are recognized by the receptors associated with the latter.
Avantageusement, les modifications apportées aux éléments de réponse GRE ou ERE, dont les formules sont indiquées ci-dessus, sont essentiellement telles qu'elles permettent auxdites unités de réponse d'activer les promoteurs les comprenant, lorsque ces unités sont reconnues par les récepteurs associés aux glucocorticoïdes, minéralocorticoïdes, androgènes et progestatifs, ou par les récepteurs aux oestrogènes.Advantageously, the modifications made to the GRE or ERE response elements, the formulas of which are given above, are essentially such that they allow said response units to activate the promoters comprising them, when these units are recognized by the associated receptors to glucocorticoids, mineralocorticoids, androgens and progestins, or by estrogen receptors.
L'invention concerne plus particulièrement l'utilisation susmentionnée de séquences nucléotidiques comprenant à titre d'unité GRU :The invention relates more particularly to the abovementioned use of nucleotide sequences comprising, as GRU unit:
- la séquence nucléotidique de formule (I) suivante :the nucleotide sequence of formula (I) below:
XalGT ACXbl GXciA XdlGXel CCXfl GTT CXgX 3 , Xa2CA τGXb2 CXc2T Xd2C e2 GGXf2 CAA GXg2 g ι XalGT ACX bl GX ci AX dl GX el CCX fl GTT CX gX 3 , X a2 CA τGX b2 CX c2 TX d 2C e2 GGX f2 CAA GX g2 g ι
dans laquelle :in which :
. les éléments de réponse GRE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras et italiques,. the GRE response elements are indicated, on one of the DNA strands, in bold and italic type,
. Xaι à Xgi , indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que Xa2 à Xg2* représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xaι à Xει respectivement,
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques de formule (I) susmentionnée, chacune des séquences nucléotidiques de formule (I) étant espacées d'une distance comprise entre lOn et l in paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2.. X a ι to Xgi, independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X a 2 to Xg2 * represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a ι to X ε ι respectively, - or a succession of at least two nucleotide sequences of formula (I) above, each of the nucleotide sequences of formula (I) being spaced by a distance between lOn and l in base pairs, center to center, n being a whole number greater than or equal to 2.
Avantageusement, les séquences nucléotidiques comprenant, à titre d'unité GRU, la séquence nucléotidique de formule (I), ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques de formule (I), susmentionnées, sont caractérisées en ce que :Advantageously, the nucleotide sequences comprising, as GRU unit, the nucleotide sequence of formula (I), or a succession of at least two nucleotide sequences of formula (I), mentioned above, are characterized in that:
- Xaι , XDι , Xfi , et Xgi, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que Xa2, XD2' Xf2> et g2> représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec X^, X51, Xfi , et Xgi , respectivement,- X a ι, X D ι, Xfi, and Xgi, independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X a 2, X D 2 ' Xf2 > and g2 > represent a nucleotide or derivative capable of s '' pair with X ^, X51, Xfi, and Xgi, respectively,
- Xcι représente A ou T, tandis que Xc2 représente T ou A respectivement,- X c ι represents A or T, while X c 2 represents T or A respectively,
- Xdi représente A ou C, tandis que X^β représente T ou G respectivement,- Xdi represents A or C, while X ^ β represents T or G respectively,
- Xeι représente A ou T, tandis que Xe2 représente T ou A respectivement.- X e ι represents A or T, while X e 2 represents T or A respectively.
L'invention a plus particulièrement pour objet l'utilisation susmentionnée de séquences nucléotidiques comprenant à titre d'unité GRU :A more particular subject of the invention is the abovementioned use of nucleotide sequences comprising, as GRU unit:
- la séquence nucléotidique désignée "GRE A" suivante:- the following nucleotide sequence designated "GRE A":
5 ' GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ' 3. CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5. 5 'GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ' 3. CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5.
dans laquelle les éléments de réponse GRE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras, italiques, et soulignés,in which the GRE response elements are indicated, on one of the strands of DNA, in bold type, italics, and underlined,
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques GRE A, espacées d'une distance comprise entre lOn et l in paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2, notamment :- or a succession of at least two GRE A nucleotide sequences, spaced by a distance between lOn and l in base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2, in particular:
. la séquence (GRE A)2 suivante :. the following sequence (GRE A) 2:
' GGT ACA GAA AGA CCT GTT CTXa GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 1 CCA TGT CTT TCT GGA CAA GAXb CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5 '' GGT ACA GAA AGA CCT GTT CTX a GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 1 CCA TGT CTT TCT GGA CAA GAX b CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5
dans laquelle Xa représente un nucleotide quelconque ou dérivé, et X représente un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, notamment Xa représente C et X5 représente G,
. la séquence (GRE A)4 suivante : 5 ' GGT ACA GAA AGA CCT GTT CTXa GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ' 3. CCA TGT CTT TCT GGA CAA GAXh CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5. 5 ' XCGGT ACA GAA AGA CCT GTT CTXe GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ' 3 ι XdCCA TGT CTT TCT GGA CAA GAXf CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5 ,in which X a represents any nucleotide or derivative, and X represents a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , in particular X a represents C and X5 represents G, . the following sequence (GRE A) 4: 5 'GGT ACA GAA AGA CCT GTT CTX a GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ' 3 . CCA TGT CTT TCT GGA CAA GAX h CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5 . 5 'X C GGT ACA GAA AGA CCT GTT CTX e GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ' 3 ι X d CCA TGT CTT TCT GGA CAA GAX f CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5 ,
dans laquelle Xa, Xc, et Xe, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que XD, X , et Xf, représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, Xc, et Xe, respectivement, notamment Xa, Xc, et Xe représentent C et Xa, Xc, et Xe représentent G.in which X a , X c , and X e , independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X D , X, and Xf, represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , X c , and X e , respectively, in particular X a , X c , and X e represent C and X a , X c , and X e represent G.
L'invention a plus particulièrement encore pour objet l'utilisation susmentionnée de séquences nucléotidiques comprenant à titre d'unité GRU :A more particular subject of the invention is also the abovementioned use of nucleotide sequences comprising, as GRU unit:
- la séquence nucléotidique désignée "GRE A up" suivante:- the following nucleotide sequence designated "GRE A up":
5' GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3 '5 'GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3'
3 ' CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 5 '3 'CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 5'
dans laquelle les éléments de réponse GRE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras, italiques, et soulignés,in which the GRE response elements are indicated, on one of the strands of DNA, in bold type, italics, and underlined,
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques GRE A up, espacées d'une distance comprise entre lOn et lin paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2, notamment :- or a succession of at least two GRE A up nucleotide sequences, spaced by a distance between lOn and lin base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2, in particular:
. la séquence (GRE A up)2 suivante :. the following sequence (GRE A up) 2:
5 ' GGT ACA GTA CGT CCT GTT CTXa GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3 ' 3 ι CCA TGT CAT GCA GGA CAA GAXb CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 5. 5 'GGT ACA GTA CGT CCT GTT CTX a GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3 ' 3 ι CCA TGT CAT GCA GGA CAA GAX b CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 5.
dans laquelle Xa représente un nucleotide quelconque ou dérivé, et X5 représente un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, notamment Xa représente C et X5 représente G,in which X a represents any nucleotide or derivative, and X5 represents a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , in particular X a represents C and X5 represents G,
. la séquence (GRE A up)4 suivante :. the following sequence (GRE A up) 4:
5 ' GGT ACA GTA CGT CCT GTT CTXa GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3 ' 5 'GGT ACA GTA CGT CCT GTT CTX a GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3 '
3. CCA TGT CAT GCA GGA CAA GAXh CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 51 3 . CCA TGT CAT GCA GGA CAA GAX h CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 51
5 ' XCGGT ACA GTA CGT CCT GTT CTXe GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3 5 'X C GGT ACA GTA CGT CCT GTT CTX e GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3
31 XdCCA TGT CAT GCA GGA CAA GAX£ CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 5
dans laquelle Xa, Xc, et Xe, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que X , X<j, et Xf, représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, Xc, et Xe, respectivement, notamment Xa, Xc, et Xe représentent C et Xa, Xc, et Xe représentent G. 3 1 X d CCA TGT CAT GCA GGA CAA GAX £ CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 5 in which X a , X c , and X e , independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X, X <j, and Xf, represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , X c , and X e , respectively, in particular X a , X c , and X e represent C and X a , X c , and X e represent G.
L'invention concerne également l'utilisation susmentionnée de séquences nucléotidiques comprenant à titre d'unité ERU :The invention also relates to the abovementioned use of nucleotide sequences comprising, as ERU unit:
- la séquence nucléotidique de formule (II) suivante :the nucleotide sequence of formula (II) below:
XalGG TCXhl GGT CGA CCXcl GAC CXdι Xa2CC AGXb2 CCA GCT GGXc2 CTG GXd2 X al GG TCX hl GGT CGA CCX cl GAC CX d ι X a2 CC AGX b2 CCA GCT GGX c2 CTG GX d2
dans laquelle :in which :
. les éléments de réponse ERE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras et italiques,. the ERE response elements are indicated, on one of the DNA strands, in bold and italic type,
• Xal à Xdi, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que Xa2 à X<χ , représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xaι à XJI respectivement,• Xal to Xdi, independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X a 2 to X <χ, represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a ι to XJI respectively,
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques de formule (II) susmentionnée, espacées d'une distance comprise entre lOn et l in paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2.- or a succession of at least two nucleotide sequences of formula (II) above, spaced by a distance between lOn and l in base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2.
L'invention a plus particulièrement pour objet l'utilisation susmentionnée de séquences nucléotidiques comprenant à titre d'unité ERU :A more particular subject of the invention is the abovementioned use of nucleotide sequences comprising, as ERU unit:
- la séquence nucléotidique désignée "over ERE" suivante :- the following nucleotide sequence designated "over ERE":
5 ' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 3. TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 51 5 'AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 3. TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 51
dans laquelle les éléments de réponse ERE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras, italiques et soulignés,in which the ERE response elements are indicated, on one of the strands of DNA, in bold, italic and underlined characters,
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques over ERE, espacées d'une distance comprise entre lOn et lin paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2, notamment :- or a succession of at least two nucleotide sequences over ERE, spaced by a distance between lOn and lin base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2, in particular:
. la séquence (over ERE)2 suivante :. the following sequence (over ERE) 2:
' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTXa AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 1 TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAXb TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5.
dans laquelle Xa représente un nucleotide quelconque ou dérivé, et X représente un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, notamment Xa représente C et X1 représente G,'AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTX a AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 1 TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAX b TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5. in which X a represents any nucleotide or derivative, and X represents a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , in particular X a represents C and X1 represents G,
. la séquence (over ERE)4 suivante :. the following sequence (over ERE) 4:
' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTXa AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 1 TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAXh TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5. ' XCAGG_TÇA GGT CGA CCT GAC CTXe AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 1 XdTCC AGT CCA GCT GGA CTG GAXf TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5.'AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTX a AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 1 TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAX h TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5. 'X C AGG_TÇA GGT CGA CCT GAC CTX e AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 '1 X d TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAX f TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5.
dans laquelle Xa, Xc, et Xe, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que X , X<-\, et Xf, représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, Xc, et Xe, respectivement, notamment Xa, Xc, et Xe représentent C et Xa, Xc, et Xe représentent G.in which X a , X c , and X e , independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X, X <- \, and Xf, represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , X c , and X e , respectively, in particular X a , X c , and X e represent C and X a , X c , and X e represent G.
L'invention a également pour objet toute séquence nucléotidique caractérisée en ce qu'elle comprend une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques GRE A, et /ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques GRE A up, telles que définies ci-dessus.The subject of the invention is also any nucleotide sequence characterized in that it comprises a succession of at least two GRE A nucleotide sequences, and / or a succession of at least two GRE A up nucleotide sequences, as defined above. above.
L'invention concerne également toute séquence nucléotidique caractérisée en ce qu'elle comprend à titre d'unité ERU :The invention also relates to any nucleotide sequence characterized in that it comprises, as ERU unit:
- la séquence nucléotidique de formule (II) suivante :the nucleotide sequence of formula (II) below:
XalGG TCXbl GGT CGA CCXcl GAC CXdl 3, Xa2CC AGXi CCA GCT GGXc2 CTG GXd2 gι X al GG TCX bl GGT CGA CCX cl GAC CX dl 3 , Xa2CC AGXi CCA GCT GGX c2 CTG GX d2 gι
dans laquelle :in which :
. les éléments de réponse ERE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras et italiques,. the ERE response elements are indicated, on one of the DNA strands, in bold and italic type,
. Xaι à Xdi, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que Xa2 à Xd2> représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xaj à X^i respectivement,. X a ι to Xdi, independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X a 2 to Xd2 > represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a j to X ^ i respectively,
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques de formule (II) susmentionnée, espacées d'une distance comprise entre lOn et l in paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2.- or a succession of at least two nucleotide sequences of formula (II) above, spaced by a distance between lOn and l in base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2.
L'invention a plus particulièrement pour objet toute séquence nucléotidique telle que décrite ci-dessus, et caractérisée en ce qu'elle comprend à titre d'unité ERU:
- la séquence nucléotidique over ERE suivante:The invention more particularly relates to any nucleotide sequence as described above, and characterized in that it comprises, as ERU unit: - the following nucleotide over ERE sequence:
5 ' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 3 ι TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5. 5 'AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 3 ι TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5.
dans laquelle les éléments de réponse ERE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras, italiques et soulignés,in which the ERE response elements are indicated, on one of the strands of DNA, in bold, italic and underlined characters,
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques over ERE, espacées d'une distance comprise entre lOn et l in paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2, notamment :- or a succession of at least two nucleotide sequences over ERE, spaced by a distance between lOn and l in base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2, in particular:
. la séquence (over ERE)2 suivante :. the following sequence (over ERE) 2:
' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTXa AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 1 TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAXh TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 51'AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTX a AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 1 TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAX h TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 51
dans laquelle Xa représente un nucleotide quelconque ou dérivé, et X5 représente un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, notamment Xa représente C et X5 représente G,in which X a represents any nucleotide or derivative, and X5 represents a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , in particular X a represents C and X5 represents G,
. la séquence (over ERE)4 suivante :. the following sequence (over ERE) 4:
' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTXa AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 1 TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAXh TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 51 ' XçAGG TCA GGT CGA CCT GAC CTXe AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 1 XdTCC AGT CCA GCT GGA CTG GAXf TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5 'AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTX a AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 1 TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAX h TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 51 'X ç AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTX e AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 1 X d TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAX f TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5
dans laquelle Xa, Xc, et Xe, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que X5, X^, et Xf, représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, Xc, et Xe, respectivement, notamment Xa, Xc, et Xe représentent C et Xa, Xc, et Xe représentent G.in which X a , X c , and X e , independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X5, X ^, and Xf, represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , X c , and X e , respectively, in particular X a , X c , and X e represent C and X a , X c , and X e represent G.
L'invention a également pour objet toute séquence nucléotidique comprenant une ou plusieurs unités ERU, telle que définie ci-dessus, et comprenant également une ou plusieurs unités GRU définies ci-dessus.The subject of the invention is also any nucleotide sequence comprising one or more ERU units, as defined above, and also comprising one or more GRU units defined above.
L'invention concerne également les séquences nucléotidiques définies ci- dessus, dans lesquelles la ou les unités ERU, et, le cas échéant la ou les unités GRU, sont situées en amont d'un promoteur basai contrôlant la transcription d'un gène rapporteur.
Avantageusement, le promoteur basai est choisi parmi les suivants :The invention also relates to the nucleotide sequences defined above, in which the ERU unit (s), and, where appropriate the GRU unit (s), are located upstream of a basal promoter controlling the transcription of a reporter gene. Advantageously, the basai promoter is chosen from the following:
- le promoteur ΔMTV correspondant au promoteur du virus MMTV délété, décrit dans Umesono et al. , 1988, Nature, 336, 262-265,- the ΔMTV promoter corresponding to the promoter of the deleted MMTV virus, described in Umesono et al. , 1988, Nature, 336, 262-265,
- le promoteur TK correspondant au promoteur de la thymidine kinase virale,the TK promoter corresponding to the promoter of the viral thymidine kinase,
- le promoteur réduit à la boîte TATA, correspondant à un fragment du promoteur de la thymidine kinase virale.- the promoter reduced to the TATA box, corresponding to a fragment of the promoter of the viral thymidine kinase.
Avantageusement encore, le gène rapporteur est choisi parmi les gènes suivants :Advantageously also, the reporter gene is chosen from the following genes:
- le gène codant pour la luciferase,- the gene coding for luciferase,
- le gène codant pour la β-galactosidase,- the gene coding for β-galactosidase,
- le gène codant pour la chloramphénicol acétyl transférase,- the gene coding for chloramphenicol acetyl transferase,
- le gène codant pour le cytochrome P450 1A1 métabolisant l'éthoxycoumarine en hydroxycoumarine fluorescente, susceptible d'être détectée directement dans le milieu de culture,- the gene coding for the cytochrome P450 1A1 metabolizing ethoxycoumarin into fluorescent hydroxycoumarin, capable of being detected directly in the culture medium,
- le gène codant pour le cytochrome P450 2A6 métabolisant la coumarine en hydroxycoumarine fluorescente, susceptible d'être détectée directement dans le milieu de culture.- the gene coding for cytochrome P450 2A6 metabolizing coumarin into fluorescent hydroxycoumarin, capable of being detected directly in the culture medium.
L'invention a également pour objet tout vecteur, notamment tout plasmide, caractérisé en ce qu'il comprend au moins une séquence nucléotidique telle que décrite ci-dessus selon l'invention.The subject of the invention is also any vector, in particular any plasmid, characterized in that it comprises at least one nucleotide sequence as described above according to the invention.
L'invention a plus particulièrement pour objet tout vecteur, notamment tout plasmide, caractérisé en ce qu'il comprend au moins une séquence nucléotidique comprenant une unité ERU, telle que décrite ci-dessus selon l'invention.The subject of the invention is more particularly any vector, in particular any plasmid, characterized in that it comprises at least one nucleotide sequence comprising an ERU unit, as described above according to the invention.
Un vecteur particulièrement préféré dans le cadre de la présente invention est celui contenant, à titre d'unité ERU, la séquence over ERE décrite ci-dessus, ou une succession d'au moins deux séquences over ERE.A vector particularly preferred in the context of the present invention is that containing, as ERU unit, the over ERE sequence described above, or a succession of at least two over ERE sequences.
L'invention concerne également toute cellule humaine ou animale transformée par un vecteur tel que défini ci-dessus.The invention also relates to any human or animal cell transformed by a vector as defined above.
De préférence, les cellules susmentionnées sont choisies parmi les cellules suivantes (référencées dans le catalogue ATCC : American Type Culture Collection) :Preferably, the above cells are chosen from the following cells (referenced in the ATCC catalog: American Type Culture Collection):
- les cellules Hep G2, Hep 3B, TONG/HCC, hépatomateuses humaines,- Hep G2, Hep 3B, TONG / HCC, human hepatomatous cells,
- les fibroblastes CV1 de rein de singe,- CV1 monkey kidney fibroblasts,
- les hépatocytes humains,- human hepatocytes,
- les cellules MCF7 du carcinome mammaire,- MCF7 cells of breast carcinoma,
- les cellules LNCaP du carcinome prostatique.
L'invention concerne également toute méthode de détection ou de criblage in vitro de xénohormones susceptibles d' interagir avec des récepteurs aux glucocorticoïdes, et/ou des récepteurs aux oestrogènes dans l'organisme humain ou animal, caractérisée en ce qu'elle comprend :- LNCaP cells of prostatic carcinoma. The invention also relates to any method of detection or in vitro screening of xenohormones capable of interacting with glucocorticoid receptors, and / or estrogen receptors in the human or animal organism, characterized in that it comprises:
- la mise en culture de cellules humaines ou animales telles que décrites ci- dessus, dans un milieu de culture en présence d'un échantillon biologique susceptible de contenir lesdites xénohormones,the cultivation of human or animal cells as described above, in a culture medium in the presence of a biological sample capable of containing said xenohormones,
- la détection de la présence du polypeptide codé par ledit gène rapporteur dans lesdites cellules ou le milieu de culture de ces dernières, notamment par colorimétrie dans le cas où le polypeptide codé par le gène rapporteur réagit avec son substrat dans le cadre d'une réaction colorée, ou par fluorimétrie dans le cas où le polypeptide codé par le gène rapporteur est fluorescent, ou susceptible d'être reconnu par une molécule fluorescente, ou par chimioluminescence, ou encore par une méthode radioactive.- detecting the presence of the polypeptide encoded by said reporter gene in said cells or the culture medium thereof, in particular by colorimetry in the case where the polypeptide encoded by the reporter gene reacts with its substrate in the context of a reaction colored, or by fluorimetry in the case where the polypeptide coded by the reporter gene is fluorescent, or capable of being recognized by a fluorescent molecule, or by chemiluminescence, or even by a radioactive method.
Avantageusement, l'échantillon biologique susceptible de contenir les xénohormones est l'eau, des extraits de plantes, des extraits de prélèvements de sol, dans le cas de la mise en oeuvre d'une méthode de détection de ces xénohormones dans l'environnement, ou un prélèvement sanguin dans le cas de la mise en oeuvre d'une méthode de détection in vitro de ces xénohormones dans le corps humain ou animal.Advantageously, the biological sample likely to contain xenohormones is water, plant extracts, extracts from soil samples, in the case of the implementation of a method for detecting these xenohormones in the environment, or a blood sample in the case of the implementation of a method of in vitro detection of these xenohormones in the human or animal body.
Une méthode de détection in vitro préférée selon l'invention, de xénohormones susceptibles d' interagir avec des récepteurs aux glucocorticoïdes, est celle comprenant :A preferred in vitro detection method according to the invention, of xenohormones capable of interacting with glucocorticoid receptors, is that comprising:
- la mise en culture de cellules humaines ou animales telles que décrites ci- dessus, transformées par un vecteur contenant, à titre d'unité GRU, la séquence GRE A up décrite ci-dessus, ou une succession d'au moins deux séquences GRE A up, dans un milieu de culture en présence d'un échantillon biologique susceptible de contenir lesdites xénohormones,- culturing human or animal cells as described above, transformed with a vector containing, as GRU unit, the GRE A up sequence described above, or a succession of at least two GRE sequences A up, in a culture medium in the presence of a biological sample capable of containing said xenohormones,
- la détection de la présence du polypeptide codé par ledit gène rapporteur dans lesdites cellules ou le milieu de culture de ces dernières, notamment de la manière indiquée ci-dessus.- Detecting the presence of the polypeptide encoded by said reporter gene in said cells or the culture medium of the latter, in particular in the manner indicated above.
Une méthode de détection in vitro préférée selon l'invention, de xénohormones susceptibles d' interagir avec des récepteurs aux oestrogènes, est celle comprenant :A preferred in vitro detection method according to the invention, of xenohormones capable of interacting with estrogen receptors, is that comprising:
- la mise en culture de cellules humaines ou animales telles que décrites ci- dessus, transformées par un vecteur contenant, à titre d'unité ERU, la séquence over ERE décrite ci-dessus, ou une succession d'au moins deux séquences over
ERE. dans un milieu de culture en présence d'un échantillon biologique susceptible de contenir lesdites xénohormones,the cultivation of human or animal cells as described above, transformed with a vector containing, as ERU unit, the over ERE sequence described above, or a succession of at least two over sequences TIME. in a culture medium in the presence of a biological sample capable of containing said xenohormones,
- la détection de la présence du polypeptide codé par ledit gène rapporteur dans lesdites cellules ou le milieu de culture de ces dernières, notamment de la manière indiquée ci-dessus.- Detecting the presence of the polypeptide encoded by said reporter gene in said cells or the culture medium of the latter, in particular in the manner indicated above.
L'invention a également pour objet toute composition pharmaceutique caractérisée en ce qu'elle comprend, en association avec un véhicule physiologiquement acceptable, au moins une unité GRU et/ou ERU telles que définies ci-dessus.The invention also relates to any pharmaceutical composition characterized in that it comprises, in association with a physiologically acceptable vehicle, at least one GRU and / or ERU unit as defined above.
Des compositions pharmaceutiques préférées dans le cadre de la présente invention, sont celles comprenant à titre d'unité GRU, la séquence GRE A up décrite ci-dessus, ou une succession d'au moins deux séquences GRE A up.Preferred pharmaceutical compositions in the context of the present invention are those comprising, as GRU unit, the GRE A up sequence described above, or a succession of at least two GRE A up sequences.
D'autres compositions pharmaceutiques préférées dans le cadre de la présente invention, sont celles comprenant à titre d'unité ERU, la séquence over ERE décrite ci-dessus, ou une succession d'au moins deux séquences over ERE.Other pharmaceutical compositions preferred in the context of the present invention are those comprising, as ERU unit, the over ERE sequence described above, or a succession of at least two over ERE sequences.
Avantageusement, les compositions pharmaceutiques susmentionnées de l'invention, sont caractérisées en ce que la ou les unités GRU, et/ou la ou les unités ERU, sont précédées et suivies par une succession d'au moins environ 5 nucléotides ou dérivés.Advantageously, the abovementioned pharmaceutical compositions of the invention are characterized in that the GRU unit (s), and / or the ERU unit (s) are preceded and followed by a succession of at least about 5 nucleotides or derivatives.
De préférence, les compositions pharmaceutiques susmentionnées de l'invention, se présentent sous une forme administrable par voie parentérale, notamment par voie intraveineuse, ou par voie orale ou locale. , notamment à raison d'environ 0,1 mg/kg à environ 10 mg/kg par jour de traitement.Preferably, the abovementioned pharmaceutical compositions of the invention are presented in a form which can be administered by the parenteral route, in particular by the intravenous route, or by the oral or local route. , in particular at a rate of approximately 0.1 mg / kg to approximately 10 mg / kg per day of treatment.
L'invention a également pour objet tout vecteur pour la thérapie génique caractérisé en ce qu'il comprend au moins une unité GRU et/ou ERU, telles que définies ci-dessus.The subject of the invention is also any vector for gene therapy, characterized in that it comprises at least one GRU and / or ERU unit, as defined above.
Des vecteurs pour la thérapie génique particulièrement préférés dans le cadre de la présente invention sont ceux comprenant à titre d'unité GRU, la séquence GRE A up décrite ci-dessus, ou une succession d'au moins deux séquences GRE A up, ou à titre d'unité ERU, la séquence over ERE décrite ci- dessus, ou une succession d'au moins deux séquences over ERE.Vectors for gene therapy which are particularly preferred in the context of the present invention are those comprising, as GRU unit, the GRE A up sequence described above, or a succession of at least two GRE A up sequences, or ERU unit title, the over ERE sequence described above, or a succession of at least two over ERE sequences.
L'invention concerne également toute composition pharmaceutique comprenant un vecteur pour la thérapie génique tel que défini ci-dessus, en association avec un véhicule physiologiquement acceptable.The invention also relates to any pharmaceutical composition comprising a vector for gene therapy as defined above, in association with a physiologically acceptable vehicle.
L'invention a également pour objet l'utilisation des compositions pharmaceutiques comprenant au moins une unité GRU, telles que décrites ci- dessus, dans le cadre du traitement des pathologies associées à la fonction d'un
récepteur aux stéroïdes, notamment du cancer de la prostate ou du syndrome de Cushing.The invention also relates to the use of pharmaceutical compositions comprising at least one GRU unit, as described above, in the context of the treatment of pathologies associated with the function of a receptor to steroids, including prostate cancer or Cushing's syndrome.
L'invention a également pour objet l'utilisation des compositions pharmaceutiques comprenant au moins une unité ERU, telles que décrites ci- dessus, dans le cadre du traitement des pathologies associées à l'activité la fonction d'un récepteur aux oestrogènes, notamment les cancers du sein, du col de l'utérus et de l'ovaire.The invention also relates to the use of pharmaceutical compositions comprising at least one ERU unit, as described above, in the context of the treatment of pathologies associated with the activity of the function of an estrogen receptor, in particular the breast, cervical and ovarian cancers.
L'invention a également pour objet les trousses ou kits pour la mise en oeuvre d'une méthode de détection in vitro de xénohormones, telle que décrite ci-dessus, comprenant :A subject of the invention is also the kits or kits for the implementation of a method of in vitro detection of xenohormones, as described above, comprising:
- des cellules, telles que définies ci-dessus, transformées par un vecteur contenant une ou plusieurs unités GRU et/ou ERU, lesdites cellules étant avantageusement cultivées à 37 °C, et conservées à -80 °C,cells, as defined above, transformed with a vector containing one or more GRU and / or ERU units, said cells being advantageously cultured at 37 ° C. and stored at -80 ° C.,
- le cas échéant, un milieu de culture desdites cellules,- where appropriate, a culture medium for said cells,
- le cas échéant, les réactifs nécessaires à la détection du polypeptide codé par le gène rapporteur.- where appropriate, the reagents necessary for the detection of the polypeptide encoded by the reporter gene.
L'invention sera davantage illustrée à l'aide de la description détaillée qui suit de la construction de la séquence over ERE, et de son utilisation dans le cadre de la détection de xénohormones.The invention will be further illustrated with the aid of the following detailed description of the construction of the over ERE sequence, and of its use in the context of the detection of xenohormones.
I) MATERIELS ET METHODESI) MATERIALS AND METHODS
1) Culture cellulaire1) Cell culture
Les cellules HeρG2 (Knowles et al., 1980), les cellules MCF-7 (cellules de tumeur mammaires) et les cellules CMT sont maintenues dans le milieu DMEM (Dulbecco's minimal essential médium) sans rouge de phénol, et contenant 10% de sérum de veau fœtal (Gibco), de la pénicilline (100 U/ml), de la streptomycine (100 μl/ml) (Diamant) et de la fungizone (0.5 μg/ml) (Squibb).HeρG2 cells (Knowles et al., 1980), MCF-7 cells (breast tumor cells) and CMT cells are maintained in DMEM (Dulbecco's minimal essential medium) medium without phenol red, and containing 10% serum fetal calf (Gibco), penicillin (100 U / ml), streptomycin (100 μl / ml) (Diamond) and fungizone (0.5 μg / ml) (Squibb).
2) Plasmides2) Plasmids
Les vecteurs d'expression du récepteur à l'œstradiol humain (ER) ainsi que les fragments tronqués du récepteur (HE13, HE15, HE19, HE21, HE38, HE70, et HE72) ont été décrits par Green et al., 1987, et T. Ylicomi et al. , 1992. Le plasmide ΔMTV-CAT dérive du plasmide MMTV-CAT, cependant les séquences régulatrices sensibles aux glucocorticoïdes ont été délétées (Umesono et al.. 1988). Un site Hind III a été créé à cette position. Il servira comme site de clonage des oligonucléotides. Les oligonucléotides ont été sous-clonés aussi dans le site HindIII du plasmide Tk-CAT. Les oligomères {ERE, (ERE)2, over
ERE, and (over ERE)2} possèdent des extrémités 5' compatibles avec le site HindIII. Cependant le site de restriction est perdu après le sous-clonage. La séquence (ERE)2 a été obtenue par la ligation de deux oligonucléotides ERE. Séquence du ERE : brin A : 5 'AGCTGCTC AGCT AGGTCA CTG CGACCT CTACT3' , brin B: 5 'AGCTAGTAG AGGGCT GAG TGACCT AGCTGAGC3' - Séquence du over ERE: brin A : 5 'AGCTGCTC AGCT AGGTCAGGTCGACCTGACCT CTACT3' , brin B : 5'AGCTAGTAG AGGTCAGGTCGACCT GACCT AGCTGAGC3' . Séquence du (over ERE)2: brin A : 5' AGCTGCTC AGCT AGGTCAGGTCGACCTGACCT C AGGTCAGGTCGACCTGACCT CTACT3' , brin B : 5'AGCTAGTAG AGGTCAGGTCGACCTGACCT G AGGTCAGGTCGACCTGACCTThe vectors for expression of the human estradiol receptor (ER) as well as the truncated fragments of the receptor (HE13, HE15, HE19, HE21, HE38, HE70, and HE72) have been described by Green et al., 1987, and T. Ylicomi et al. , 1992. The plasmid ΔMTV-CAT derives from the plasmid MMTV-CAT, however the regulatory sequences sensitive to glucocorticoids have been deleted (Umesono et al. 1988). A Hind III site has been created at this position. It will serve as a cloning site for oligonucleotides. The oligonucleotides were also subcloned into the HindIII site of the Tk-CAT plasmid. The oligomers {ERE, (ERE) 2, over ERE, and (over ERE) 2} have 5 'ends compatible with the HindIII site. However, the restriction site is lost after the subcloning. The sequence (ERE) 2 was obtained by the ligation of two ERE oligonucleotides. Sequence of ERE: strand A: 5 'AGCTGCTC AGCT AGGTCA CTG CGACCT CTACT 3 ', strand B: 5 ' AGCTAGTAG AGGGCT GAG TGACCT AGCTGAGC 3 ' - Sequence of over ERE: strand A: 5 'AGCTGCTC AGCT AGGTCAGGTCGACCTGACCT CTACT 3 ' : 5 ' AGCTAG TAG AGGTCAGGTCGACCT GACCT AGCTGAGC 3 '. (Over ERE) sequence 2: strand A: 5 'AGCTGCTC AGCT AGGTCAGGTCGACCTGACCT C AGGTCAGGTCGACCTGACCT CTACT 3 ', strand B: 5 ' AG CTAGTAG AGGTCAGGTCGACCTGACCT G AGGTCAGGTCGACCTGACCT
AGCTGAGC3' . (les sites ERE sont soulignés). La séquence GRE utilisée dérive du promoteur du gène de l'aspartate aminotransférase cytosolique (Garlatti et al., 1994). Cette séquence possède une efficacité transcriptionnelle comparable au GRE consensus. Le plasmide exprimant la luciferase (RSV-Luc) a été acheté chez Promega.AGCTGAGC 3 '. (ERE sites are underlined). The GRE sequence used is derived from the promoter of the cytosolic aspartate aminotransferase gene (Garlatti et al., 1994). This sequence has a transcriptional efficiency comparable to the consensus GRE. The luciferase-expressing plasmid (RSV-Luc) was purchased from Promega.
3) Transfection transitoire3) Transient transfection
Les expériences de transfections ont été décrites par Massaad et al., 1997. Un jour avant la transfection les cellules HepG2 sont ensemencées à 10" cellules dans une boîte de culture de 10 cm de diamètre. Le milieu de culture est remplacé par du milieu ne contenant pas de stéroïdes 2 à 3 heures avant la transfection. Pour éliminer les stéroïdes, le sérum est chauffé à deux reprises pendant 20 minutes à 65 °C sur du charbon actif piégeant les stéroïdes.Transfection experiments have been described by Massaad et al., 1997. One day before transfection, the HepG2 cells are seeded at 10 "cells in a culture dish 10 cm in diameter. The culture medium is replaced with medium. containing no steroids 2 to 3 hours before transfection To remove the steroids, the serum is heated twice for 20 minutes at 65 ° C on activated charcoal trapping the steroids.
Dans un tube stérile, 5 μg du plasmide à étudier (ERE-CAT, over ERE- CAT...), différentes quantités du plasmide d'expression du ER (récepteur aux oestrogènes) et 1 μg du plasmide codant pour la luciferase sont mélangés dans un volume final de 500μl contenant 62,5 μl de CaCl2 (2M). Ce mélange est ajouté goutte à goutte et avec bullage à 500 μl de HBS 2X (Nacl 280 mM, Hepes 50 mM, Na2HPθ4 1,5 mM pH 7,1). Ce pH est primordial pour la formation d'un précipité stable ADN-phosphate de calcium. Trente minutes sont nécessaires pour le déroulement de la réaction de complexation. Ce mélange est ensuite ajouté goutte à goutte aux cellules qui sont incubées pendant 3h 30 min. Cette incubation favorise la précipitation de l'ADN et son adhérence aux cellules. Par la suite, le traitement par du PBS IX contenant 20% en volume de glycérol permet l'internalisation des grains d'ADN-calcium. Deux minutes plus tard, 5 ml de PBS IX, pH 7,5, sont ajoutés afin de diluer le glycérol. Un second lavage au PBS est nécessaire pour éliminer toute trace de glycérol. Dix
ml de milieu complet sont ajoutés aux cellules et les boîtes sont incubées durant 24 heures afin que les plasmides transfectés soient exprimés.In a sterile tube, 5 μg of the plasmid to be studied (ERE-CAT, over ERE-CAT ...), different quantities of the ER expression plasmid (estrogen receptor) and 1 μg of the plasmid coding for luciferase are mixed in a final volume of 500 μl containing 62.5 μl of CaCl2 (2M). This mixture is added dropwise and with bubbling to 500 μl of HBS 2X (Nacl 280 mM, Hepes 50 mM, Na2HPθ4 1.5 mM pH 7.1). This pH is essential for the formation of a stable DNA-calcium phosphate precipitate. Thirty minutes are necessary for the course of the complexing reaction. This mixture is then added dropwise to the cells which are incubated for 3 h 30 min. This incubation promotes the precipitation of DNA and its adhesion to cells. Thereafter, treatment with PBS IX containing 20% by volume of glycerol allows the internalization of the DNA-calcium grains. Two minutes later, 5 ml of PBS IX, pH 7.5, are added in order to dilute the glycerol. A second washing with PBS is necessary to remove all traces of glycerol. Ten ml of complete medium are added to the cells and the dishes are incubated for 24 hours so that the transfected plasmids are expressed.
Un protocole similaire est utilisé pour les cellules MCF-7. Les cellules sont ensemencées à 10°" cellules par boîte de 6 cm de diamètre, et transfectées selon la technique au phosphate de calcium (Jiang et al. , 1992).A similar protocol is used for MCF-7 cells. The cells are seeded at 10 ° "cells per 6 cm in diameter and transfected according to the technique calcium phosphate (Jiang et al., 1992).
Seize heures plus tard, le milieu est remplacé par un milieu 5 % SVF sans stéroïdes; puis les boîtes sont traitées par les hormones à tester: l'œstradiol (10~7 M de concentration finale) l' antihormone (ICI 164386) ou les xénohormones. Une incubation de 24 heures permet l'induction hormonale.Sixteen hours later, the medium is replaced by a 5% FCS medium without steroids; then the boxes are treated with the hormones to be tested: estradiol (10 ~ 7 M final concentration) antihormone (ICI 164386) or xenohormones. A 24 hour incubation allows hormonal induction.
4) Dosage de l'activité CAT:4) Assay of CAT activity:
La chloramphénicol acétyltransférase assure le transfert d'un groupement acétyl vers l'hydroxyle en position 3 du chloramphénicol (antibiotique). La quantification du produit acétylé permet la mesure directe de l'activité régulatrice d'un promoteur.Chloramphenicol acetyltransferase ensures the transfer of an acetyl group to the hydroxyl in position 3 of chloramphenicol (antibiotic). The quantification of the acetylated product allows direct measurement of the regulatory activity of a promoter.
La technique classique consiste à extraire le produit et le substrat, à les séparer par une chromatographie (TLC) et d'une autoradiographie. La méthode que nous avons utilisée, plus rapide, consiste en un transfert de la radioactivité de l' acétyl CoA (3H ou 14 vers ιe chloramphénicol aisément détectable grâceThe classical technique consists in extracting the product and the substrate, in separating them by chromatography (TLC) and autoradiography. The method we have used, faster, is a transfer of radioactivity of acetyl CoA (3 H or 14 to ι e chloramphenicol easily detectable thanks
(g) à un compteur à scintillation. Le liquide scintillant utilisé est l'éconofluor qui est hydrophobe. Or le chloramphénicol acétylé diffuse dans l'éconofluor alors que l' acétyl CoA demeure dans la phase aqueuse. Ainsi, seul le produit de la réaction est dans un environnement permettant sa détection par le compteur à scintillation.(g ) to a scintillation counter. The scintillating liquid used is econofluor which is hydrophobic. However acetylated chloramphenicol diffuses in the econofluor while acetyl CoA remains in the aqueous phase. Thus, only the product of the reaction is in an environment allowing its detection by the scintillation counter.
Protocole expérimental:Experimental protocol:
Après l'aspiration du milieu de culture, deux lavages au PBS IX sans calcium ni magnésium sont réalisés. Cinq cents μl de tampon de lyse IX (Promega's Reporter Lysis Buffer ) sont ajoutés aux boîtes de culture après deux rinçages au PBS IX sans Ca^+ ni Mg2 + . Quinze minutes plus tard, les cellules sont détachées par grattage puis centrifugées à 8000 g. L'échantillon est séparé en 3 fractions: 100 μl serviront pour le dosage CAT, 20 μl serviront pour le dosage de la luciferase et 80 μl seront utilisés pour le dosage des protéines.After the aspiration of the culture medium, two washes with PBS IX without calcium or magnesium are carried out. Five hundred μl of lysis buffer IX (Promega's Reporter Lysis Buffer) are added to the culture dishes after two rinses with PBS IX without Ca ^ + or Mg2 +. Fifteen minutes later, the cells are detached by scraping and then centrifuged at 8000 g. The sample is separated into 3 fractions: 100 μl will be used for the CAT assay, 20 μl will be used for the luciferase assay and 80 μl will be used for the assay of the proteins.
Cent μl de surnageant sont chauffés à 65 °C durant 5 minutes afin de dénaturer les acétylases endogènes, puis centrifugés pendant 20 minutes à 15000 tours/min. Vingt μl de Premix (EDTA 5mM, Tris-HCl 250 mM pH 7,5, acétyl CoA froid 30 μM, 3H acétyl CoA 0,5 μCi, chloramphénicol ImM) et 20 μl de chloramphénicol (5 mM) sont ajoutés à 60 μl d'échantillons. Les échantillons sont ensuite incubés durant 30 minutes à 37°C. Quatre-vingt μl de ce mélange
réactionnel sont ajoutés à 4 ml d'Econofluor '. Un mélange vigoureux permet la diffusion du chloramphénicol vers la phase hydrophobe; puis les échantillons sont incubés durant 30 minutes à température ambiante; ceci permet la séparation des deux phases et la diffusion de la radioactivité vers l'Econofluor® où le comptage est réalisé. La radioactivité est mesurée grâce au compteur à scintillation Beckman (modèle: LS 5000 CE). Il est à noter que la diffusion de la radioactivité est une fonction linéaire du temps (Neumann et al., 1987).One hundred μl of supernatant are heated at 65 ° C. for 5 minutes in order to denature the endogenous acetylases, then centrifuged for 20 minutes at 15,000 rpm. Twenty μl of Premix (5 mM EDTA, 250 mM Tris-HCl pH 7.5, cold acetyl CoA 30 μM, 3 H acetyl CoA 0.5 μCi, chloramphenicol ImM) and 20 μl of chloramphenicol (5 mM) are added to 60 μl samples. The samples are then incubated for 30 minutes at 37 ° C. Eighty μl of this mixture are added to 4 ml of Econofluor '. A vigorous mixing allows the diffusion of chloramphenicol towards the hydrophobic phase; then the samples are incubated for 30 minutes at room temperature; this allows the separation of the two phases and the diffusion of radioactivity towards the Econofluor ® where the counting is carried out. Radioactivity is measured using the Beckman scintillation counter (model: LS 5000 CE). It should be noted that the diffusion of radioactivity is a linear function of time (Neumann et al., 1987).
5) Dosage de la luciferase:5) Determination of luciferase:
Le dosage de la luciferase est extrêmement sensible, rapide et simple. La luciferase est une protéine monomérique de poids moléculaire de 62 KDa. Elle catalyse l'oxydation de la luciférine (peroxyde) accompagnée de la production de photons.The dosage of luciferase is extremely sensitive, fast and simple. Luciferase is a monomeric protein with a molecular weight of 62 KDa. It catalyzes the oxidation of luciferin (peroxide) accompanied by the production of photons.
Le test conventionnel de la luciferase génère un bref éclair lumineux qui apparaît dès le contact de l'enzyme avec le substrat. Mais le système que nous avons utilisé (Promega's luciferase assay system) possède un "turnover" enzymatique plus lent permettant de visualiser une intensité lumineuse constante durant plusieurs minutes; on s'affranchit ainsi d'un luminomètre à injection automatique. La sensibilité de détection de cette méthode est de l'ordre de 10~20 moles de luciferase. Ce test est donc environ 100 fois plus sensible que le dosage CAT.The conventional luciferase test generates a brief flash of light which appears upon contact of the enzyme with the substrate. But the system we used (Promega's luciferase assay system) has a slower enzymatic "turnover" allowing to visualize a constant light intensity for several minutes; this eliminates the need for an automatic injection luminometer. The detection sensitivity of this method is of the order of 10 ~ 20 moles of luciferase. This test is therefore approximately 100 times more sensitive than the CAT assay.
Protocole expérimental:Experimental protocol:
Le dosage de la luciferase est réalisé sur un luminomètre calibré (modèle: BIOORBIT 1250). Cent μl de réactif (Luciferase assay reagent- Promega ) sont mélangés vigoureusement aux 20 μl de l'échantillon à doser. Le comptage est réalisé 10 secondes puis 20 secondes après. Les résultats sont exprimés en mVolts (De Wet et al., 1987).The luciferase assay is carried out on a calibrated luminometer (model: BIOORBIT 1250). One hundred μl of reagent (Luciferase assay reagent- Promega) are vigorously mixed with the 20 μl of the sample to be assayed. The counting is carried out 10 seconds then 20 seconds after. The results are expressed in mVolts (De Wet et al., 1987).
6) Préparation des extraits cellulaires6) Preparation of cell extracts
Les cellules CMT sont transfectées selon la technique au DEAE décrit par Ishikawa et al., 1992. Brièvement, les cellules sont ensemencées à 2 10" cellules/boîte de 10 cm de diamètre. Vingt-quatre heures plus tard, les cellules sont lavées deux fois avec le PBS, puis 500 μl de trypsine sont ajoutées. Les cellules sont incubées durant 10 min à température ambiante, ensuite 4 ml de milieu de culture, contenant 20 μg du vecteur d'expression du ER, 400 μg de DEAE dextran et 0.1 mM de chloroquine, est ajouté. Les cellules sont incubées durant 4 heures à 37°C suivi d'un choc de 2 min au DMSO
(diméthylsulfoxyde). Une heure avant la récolte des cellules, l'œstradiol (10"^M) est rajoutée. Les cellules sont lavées à deux reprises au PBS froid, puis récoltées dans le tampon de liaison (Tris-HCl 20 mM(pH 7.5), DTT 2mM, glycérol 20% (v/v) et KC1 0,4 M). Des extraits cellulaires totaux sont préparés en congelant les cellules à -80 °C puis en les réchauffant sur la glace. Ceci est suivi par une centrifugation à 10000g pendant 15 min à 0°C dans une centrifugeuse Sigma. Le surnageant est conservé à -80°C.CMT cells are transfected according to the DEAE technique described by Ishikawa et al., 1992. Briefly, the cells are seeded at 2 10 "cells / dish 10 cm in diameter. Twenty-four hours later, the cells are washed twice. times with PBS, then 500 μl of trypsin are added The cells are incubated for 10 min at room temperature, then 4 ml of culture medium, containing 20 μg of the ER expression vector, 400 μg of DEAE dextran and 0.1 mM chloroquine is added The cells are incubated for 4 hours at 37 ° C followed by a 2 min shock with DMSO (dimethyl sulfoxide). One hour before harvesting the cells, estradiol (10 " ^ M) is added. The cells are washed twice with cold PBS, then harvested in the binding buffer (20 mM Tris-HCl (pH 7.5), DTT 2mM, 20% glycerol (v / v) and 0.4 M KC1. Total cell extracts are prepared by freezing the cells at -80 ° C. and then heating them on ice. This is followed by centrifugation at 10000 g for 15 min at 0 ° C. in a Sigma centrifuge The supernatant is stored at -80 ° C.
Le ER a été aussi exprimé dans les cellules SF9 en utilisant le kitER was also expressed in SF9 cells using the kit
"pBlueBac-His baculovirus expression System" acheté chez Invitrog n."pBlueBac-His baculovirus expression System" purchased from Invitrog n.
Le ER a été préparé grâce au kit de transcription et de traduction in vitro dans un système de réticulocytes (TNT -Promega). Brièvement, 4 μg de vecteur d'expression du ER est incubé avec le lysat TNT , la RNA polymérase T7, le mélange d'acides aminés (1 mM), et la RNAsine (40 UI). La réaction est incubée durant deux heures à 30°C.The ER was prepared using the in vitro transcription and translation kit in a reticulocyte system (TNT -Promega). Briefly, 4 μg of ER expression vector is incubated with the TNT lysate, the T7 RNA polymerase, the mixture of amino acids (1 mM), and the RNAsin (40 IU). The reaction is incubated for two hours at 30 ° C.
7) Expériences de retardement sur gel (EMSA) :7) Gel retardation experiments (EMSA):
Les oligonucléotides sont hybrides puis radiomarqués en utilisant le fragment Klenow de l'ADN polymérase I. Les tests sont réalisés comme décrit par Cao et al., 1993. Les réactions de liaison ont été réalisées dans un tampon de liaison (Tris-HCl 20 mM (pH 7.8), dithiothreitol 1 mM, EDTA1 mM, glycérol 10 % (vol/vol), albumine bovine 3 μg/μl, NaCl 100 mM), 0,3 ng d'ADN radiomarqué et lμg de dldC. Dans le cas des extraits de baculovirus enrichis en ER, le Nonidet P40 (Sigma) 0.1 % est ajouté à la réaction dans le but de minimiser la liaison de protéines accessoires au ER. Finalement, le ER est ajouté aux concentrations indiquées dans les figures des légendes. Trente minutes après l'incubation à température ambiante, le mélange réactionnel est déposé sur un gel d'électrophorèse constitué de polyacrylamide 6% (acrylamide/bisacrylamide, 29:1) et de TBE 0,25 X, préchauffé (100 V/12 cm, 30 min); la migration se poursuit durant 90 min (200 V/12 cm). Le gel est ensuite séché puis mis à exposer avec un film. L'anticorps monoclonal, H222, est incubé avec le récepteur durant la réaction de liaison. L'étude densitométrique est réalisée grâce au logiciel NIH Image.The oligonucleotides are hybrid then radiolabeled using the Klenow fragment of DNA polymerase I. The tests are carried out as described by Cao et al., 1993. The binding reactions were carried out in binding buffer (20 mM Tris-HCl (pH 7.8), 1 mM dithiothreitol, 1 mM EDTA, 10% glycerol (vol / vol), bovine albumin 3 μg / μl, 100 mM NaCl), 0.3 ng of radiolabelled DNA and lμg of dldC. In the case of baculovirus extracts enriched with ER, Nonidet P40 (Sigma) 0.1% is added to the reaction in order to minimize the binding of accessory proteins to the ER. Finally, the ER is added to the concentrations indicated in the legend figures. Thirty minutes after incubation at room temperature, the reaction mixture is deposited on an electrophoresis gel consisting of polyacrylamide 6% (acrylamide / bisacrylamide, 29: 1) and TBE 0.25 X, preheated (100 V / 12 cm , 30 min); migration continues for 90 min (200 V / 12 cm). The gel is then dried and then exposed with a film. The monoclonal antibody, H222, is incubated with the receptor during the binding reaction. The densitometric study is carried out using NIH Image software.
8) Expérience d'interférence par méthylation:8) Methylation interference experiment:
L'expérience est réalisée comme décrit par Truss et al. , 1991. Brièvement, les oligonucléotides marqués à la T4 polynucléotide kinase sont traités au diméthyl sulfate (DMS). L'ADN méthylé est ensuite ajouté à 15 μl de ER
recombinant purifié (acheté chez PanVera). Le mélange réactionnel est ensuite déposé sur un gel d'électrophorese composé d'acrylamide 6% . Après l'auto radiographie, les bandes intéressantes sont excisées puis mises à éluer durant la nuit à 37°C dans 500 μl de tampon (Tris-EDTA, NaCl 1 ,5M). Après lavage au phénol et au chloroforme et précipitation à l'éthanol, l'ADN est clivé par la pipéridine puis déposé sur un gel dénaturant de polyacrylamide 10% -urée 8M. Le gel est ensuite séché puis autoradiographié.The experiment is carried out as described by Truss et al. , 1991. Briefly, the oligonucleotides labeled with T4 polynucleotide kinase are treated with dimethyl sulfate (DMS). The methylated DNA is then added to 15 μl of ER purified recombinant (purchased from PanVera). The reaction mixture is then deposited on an electrophoresis gel composed of 6% acrylamide. After the self-radiography, the interesting bands are excised and then eluted overnight at 37 ° C. in 500 μl of buffer (Tris-EDTA, 1.5 M NaCl). After washing with phenol and chloroform and precipitation with ethanol, the DNA is cleaved with piperidine and then deposited on a denaturing gel of 10% polyacrylamide-8M urea. The gel is then dried and then autoradiographed.
9) Calcul du rapport de coopérativité:9) Calculation of the cooperative relationship:
Les équations décrites par Martinez et al (22) ont été adaptées pour la séquence over ERE. Le modèle suivant pour l'interaction du ER avec la séquence over ERE est proposé :The equations described by Martinez et al (22) have been adapted for the sequence over ERE. The following model for the interaction of ER with the sequence over ERE is proposed:
(HA)(HA)
σm) les complexes II et complexes IV sont formés respectivement par le dimère et le tétramère de ER liés à la séquence over ERE. σm) complexes II and complexes IV are formed respectively by the dimer and the tetramer of ER linked to the sequence over ERE.
(ovERE) (ER2) (ovERE) (ER2) 2 (ovERE) (ER2) κdπ=(ovERE) (ER2) (ovERE) (ER2) 2 (ovERE) (ER2) κdπ =
(HA) (IIB) (H) comme la séquence ovERE est formée de deux ERE identiques :(HA) (IIB) (H) like the overe sequence is formed by two identical EREs:
(ΠA)=(ΠB)=I/2 (Π)(ΠA) = (ΠB) = I / 2 (Π)
(H) (ER2)(H) (ER2)
KdIV=KdIV =
2 (IV)2 (IV)
Kdïï 4 (ovERE) (IV)Kdïï 4 (ovERE) (IV)
Rapport de coopérativité= = -Cooperativity report = = -
KdIV 2 (H)
La radioactivité contenue dans les complexes IV et II est déterminée en coupant les bandes correspondantes et en les comptant grâce à un compteur à scintillation.KdIV 2 (H) The radioactivity contained in complexes IV and II is determined by cutting the corresponding bands and counting them using a scintillation counter.
II) RESULTATSII) RESULTS
1) Liaison du ER à la séquence over ERE1) Linking the ER to the sequence over ERE
Une nouvelle séquence d'ADN, appelée over ERE, formée de deux ERE chevauchants, a été mise au point . Ce chevauchement a été possible car le ERE est formé de deux demi-sites séparés par 3 pb. Ces trois nucléotides ont été transformés de manière à créer deux ERE chevauchants identiques.A new DNA sequence, called over ERE, consisting of two overlapping EREs, has been developed. This overlap was possible because the ERE consists of two half-sites separated by 3 bp. These three nucleotides have been transformed to create two identical overlapping EREs.
Dans le but de déterminer si cette séquence lie le ER, des expériences de retardement sur gel ont été effectuées en utilisant les séquences ERE et over ERE. Dans ces expériences, des extraits de cellules infectées par baculovirus enrichis en ER et purifiés sur une colonne de DEAE-dextran, ont été utilisées. Dans le cas de la séquence ERE, deux bandes sont observées; ces bandes correspondent probablement à des états de protéolyse différents de la forme dimérique du ER. Dans le cas de la séquence over ERE, trois bandes sont observées : les bandes 1 et 2 sont identiques à celles observées pour le ERE. Cependant une troisième bande majoritaire, migrant plus lentement, est observée uniquement pour la séquence over ERE. Ce complexe pourrait contenir des molécules additionnelles de ER. L'addition de l'anticorps H222, dirigé contre l'extrémité C terminale du ER, a causé un retardement supplémentaire des 3 bandes. Ces résultats montrent, donc, que la séquence over ERE lie le ER. La compétition avec un excès de 1000 fois de la séquence GRE n'a pas altérée la liaison du ER sur la séquence over ERE. Par contre, un excès de 1000 fois de la séquence ERE non radiomarquée a aboli la formation du complexe over ERE- ER. Ces résultats montrent que la liaison entre le ER et la séquence over ERE est spécifique. Des résultats similaires sont obtenus en utilisant des extraits ER purifiés.In order to determine whether this sequence binds the ER, gel retardation experiments were performed using the ERE and over ERE sequences. In these experiments, extracts of baculovirus infected cells enriched in ER and purified on a DEAE-dextran column were used. In the case of the ERE sequence, two bands are observed; these bands probably correspond to proteolysis states different from the dimeric form of the ER. In the case of the sequence over ERE, three bands are observed: bands 1 and 2 are identical to those observed for the ERE. However, a third majority band, migrating more slowly, is observed only for the sequence over ERE. This complex could contain additional ER molecules. The addition of the antibody H222, directed against the C terminal end of the ER, caused an additional delay of the 3 bands. These results therefore show that the sequence over ERE binds the ER. Competition with a 1000-fold excess of the GRE sequence did not alter the binding of the ER to the over ERE sequence. On the other hand, a 1000-fold excess of the non-radiolabelled ERE sequence abolished the formation of the complex over ERE-ER. These results show that the link between the ER and the over ERE sequence is specific. Similar results are obtained using purified ER extracts.
Comme la séquence over ERE est composée de deux ERE, il est possible que le complexe migrant lentement, observé dans le cas du over ERE, serait formé de deux dimères de ER. Dans le but de savoir si les quatre demi-sites de la séquence over ERE sont occupés par le ER, des expériences d'interférence par méthylation ont été réalisées. L'ADN radiomarqué est partiellement méthylé suite à un traitement par le DMS; une liaison entre l'ADN et le ER est ensuite réalisée. Après retardement sur gel, le complexe migrant lentement est excisé du
gel, puis l'ADN est clivé par la pipéridine. Finalement, l'ADN résultant de la digestion est déposé sur un gel de séquence. Le G en position 2 de la séquence (AGGTC (A/G) ou le G sur le brin opposé du C en position 5 sont importants pour la formation du complexe ADN-ER. A l'opposé, les G situés à l'extérieur du demi-site ERE ne sont pas essentiels pour la liaison. Le G en position 3 a interféré partiellement. En conclusion, ces résultats montrent que chacun des 4 demi-sites de la séquence over ERE lient un monomère de ER; ceci traduit la liaison d'un tétramère de ER à la séquence over ERE.As the over ERE sequence is composed of two EREs, it is possible that the slowly migrating complex, observed in the case of over ERE, would be formed of two dimers of ER. In order to know if the four half-sites of the sequence over ERE are occupied by the ER, experiments of interference by methylation were carried out. The radiolabelled DNA is partially methylated following treatment with DMS; a connection between the DNA and the ER is then carried out. After retardation on gel, the slowly migrating complex is excised from the gel, then the DNA is cleaved by piperidine. Finally, the DNA resulting from digestion is deposited on a sequence gel. The G in position 2 of the sequence (AGGTC (A / G) or the G on the opposite strand of C in position 5 are important for the formation of the DNA-ER complex. Conversely, the G located outside of the ERE half-site are not essential for binding. The G at position 3 partially interfered. In conclusion, these results show that each of the 4 half-sites of the sequence over ERE binds a monomer of ER; this translates the binding from an ER tetramer to the over ERE sequence.
2) Le ER se lie de manière coopérative à la séquence over ERE2) The ER binds cooperatively to the sequence over ERE
La liaison coopérative du ER à la séquence over ERE a été démontrée grâce aux expériences de liaison entre la séquence over ERE radiomarquée et des quantités croissantes de ER. Le complexe migrant rapidement, correspondant au dimère de ER, apparaît dès les faibles concentrations de ER ajoutées (complexe II). Dès que la quantité de ER devient plus importante, le complexe migrant lentement (complexe IV) apparaît, puis devient progressivement le complexe majoritaire. Les quantités de complexes II et IV et d'ADN libre ont été déterminées grâce à la radioactivité présente dans chaque bande. La quantité d'ADN présente dans le complexe II augmente en premier, mais ne devient jamais supérieure à 20% de la radioactivité totale de l'ADN. A contrario, le complexe IV, présent à des concentrations supérieures, devient rapidement la forme prédominante de radioactivité. En utilisant ces résultats et les équations présentées dans les matériels et méthodes, les constantes de dissociation (Kd) des complexes II et IV, ont été déterminées. Kdll est approximativement 15 fois plus élevé que KdIV. Ainsi, le second dimère se lie avec une meilleure affinité, si la séquence avoisinante est occupée par le premier dimère. Ces caractéristiques de liaison montrent que le ER se lie d'une manière coopérative à la séquence over ERE.The cooperative binding of ER to the over ERE sequence has been demonstrated by means of binding experiments between the radiolabelled over ERE sequence and increasing amounts of ER. The rapidly migrating complex, corresponding to the ER dimer, appears from the low concentrations of ER added (complex II). As soon as the amount of ER becomes greater, the slowly migrating complex (IV complex) appears, then gradually becomes the majority complex. The amounts of complexes II and IV and of free DNA were determined by means of the radioactivity present in each band. The amount of DNA present in complex II increases first, but never becomes more than 20% of the total radioactivity of DNA. Conversely, complex IV, present at higher concentrations, quickly becomes the predominant form of radioactivity. Using these results and the equations presented in the materials and methods, the dissociation constants (Kd) of complexes II and IV, were determined. Kdll is approximately 15 times higher than KdIV. Thus, the second dimer binds with better affinity, if the neighboring sequence is occupied by the first dimer. These binding characteristics show that the ER binds cooperatively to the over ERE sequence.
Dans le but de comparer les affinités apparentes de liaison du ER aux séquences ERE ou over ERE, des expériences de liaison par retardement sur gel entre la séquence over ERE radiomarquée et le ER ont été réalisées, lorsque des quantités croissantes de ERE ou de over ERE froids sont rajoutées. L'addition d'un excès d'oligonucléotide over ERE froid a empêché la formation du complexe avec une efficacité 3 fois supérieure à celle de l'oligonucléotide ERE.
3) Fonctionnalité de la séquence over ERE:In order to compare the apparent affinities of binding of ER to the ERE or over ERE sequences, experiments on gel retardation binding between the radiolabelled over ERE sequence and the ER were performed, when increasing amounts of ERE or over ERE cold are added. The addition of an excess of oligonucleotide over cold ERE prevented the formation of the complex with an efficiency 3 times greater than that of the oligonucleotide ERE. 3) Functionality of the sequence over ERE:
Il a ensuite été examiné si la séquence over ERE est fonctionnelle dans le contexte du promoteur ΔMTV. Ce promoteur dérive du promoteur MMTV mais il est délété du fragment -190/-88 sensible à l'induction par les glucocorticoïdes (Umesono et al. , 1988). L'activité CAT des cellules transfectées par ce plasmide n'est pas régulée par l'œstradiol.It was then examined whether the over ERE sequence is functional in the context of the ΔMTV promoter. This promoter is derived from the MMTV promoter but it is deleted from the -190 / -88 fragment sensitive to induction by glucocorticoids (Umesono et al., 1988). The CAT activity of cells transfected with this plasmid is not regulated by oestradiol.
Les cellules HepG2 ont été cotransfectées avec des concentrations croissantes de vecteur d'expression du ER (0 ng à 100 ng), et soit par le plasmide ΔMTV-ERE-CAT, soit par le plasmide ΔMTV-(ERE)2-CAT contenant deux ERE en tandem, ou finalement par le plasmide ΔMTV-over ERE-CAT. L'hormone, 17-β Estradiol (10"^M), est ajoutée au milieu de culture 24 heures plus tard. L'activité transcriptionnelle du plasmide ΔMTV-ERE-CAT augmente puis atteint un plateau à 30 ng de ER transfecté. Dans le cas du plasmide ΔMTV-(ERE)2-CAT, l'allure de la courbe est similaire au premier, cependant l'activité transcriptionnelle est deux fois supérieure au plasmide ΔMTV-ERE- CAT. Pour le plasmide ΔMTV-over ERE-CAT, l'activité transcriptionnelle est 3 à 4 fois supérieure à celle obtenue pour le plasmide ΔMTV-ERE-CAT. Ces résultats montrent que deux ERE liés en tandem ont une activité transcriptionnelle additive, alors que deux ERE chevauchants ont une activité transcriptionnelle synergique.The HepG2 cells were cotransfected with increasing concentrations of ER expression vector (0 ng to 100 ng), and either by the plasmid ΔMTV-ERE-CAT, or by the plasmid ΔMTV- (ERE) 2-CAT containing two ERE in tandem, or finally by the plasmid ΔMTV-over ERE-CAT. The hormone, 17-β Estradiol (10 " ^ M), is added to the culture medium 24 hours later. The transcriptional activity of the plasmid ΔMTV-ERE-CAT increases then reaches a plateau at 30 ng of ER transfected. in the case of the plasmid ΔMTV- (ERE) 2-CAT, the shape of the curve is similar to the first, however the transcriptional activity is twice greater than the plasmid ΔMTV-ERE- CAT. For the plasmid ΔMTV-over ERE-CAT , the transcriptional activity is 3 to 4 times higher than that obtained for the plasmid ΔMTV-ERE-CAT These results show that two EREs linked in tandem have an additive transcriptional activity, while two overlapping EREs have a synergistic transcriptional activity.
La possibilité que les éléments du promoteur ΔMTV-CAT contribuent aux propriétés du over ERE a été testée. Les séquences ERE et over ERE ont été sous-clonées en amont du promoteur différent, celui de la thymidine kinase (Tk). L'activité transcriptionnelle de la séquence over ERE est 4 à 5 fois supérieure à celle de la séquence ERE. Une fois de plus, ces résultats montrent une synergie fonctionnelle entre deux ERE chevauchants et ceci indépendamment du contexte du promoteur. Des résultats similaires ont été obtenus dans les cellules MCF-7.The possibility that the elements of the ΔMTV-CAT promoter contribute to the properties of over ERE has been tested. The ERE and over ERE sequences have been subcloned upstream of the different promoter, that of thymidine kinase (Tk). The transcriptional activity of the over ERE sequence is 4 to 5 times greater than that of the ERE sequence. Once again, these results show a functional synergy between two overlapping EREs, regardless of the context of the promoter. Similar results were obtained in MCF-7 cells.
Comme deux ERE chevauchants ont une activité transcriptionnelle synergique et deux ERE adjacents ont une activité additive, une nouvelle séquence a été construite, (over ERE)2, formée de deux over ERE adjacents, séparés par 21 pb (centre à centre). Les expériences de transfection transitoires ont montré que l'activité transcriptionnelle de la séquence (over ERE)2 est similaire à celle de la séquence over ERE. Ces résultats montrent qu'un tétramère de ER lié à la séquence over ERE est suffisant pour induire la transcription de manière optimale, au moins dans ces conditions.
4) Effet des xénoestrogènesAs two overlapping EREs have synergistic transcriptional activity and two adjacent EREs have additive activity, a new sequence has been constructed, (over ERE) 2, formed of two adjacent over EREs, separated by 21 bp (center to center). Transient transfection experiments have shown that the transcriptional activity of the sequence (over ERE) 2 is similar to that of the sequence over ERE. These results show that an ER tetramer linked to the over ERE sequence is sufficient to induce transcription in an optimal manner, at least under these conditions. 4) Effect of xenoestrogens
Le ER est activé par les œstrogènes ainsi que par de nombreux composés naturels ou chimiques ayant une activité œstrogéno-mimétique. Ces composés sont appelés xénœstrogènes. La réponse des promoteurs contenant les séquences ERE et over ERE a été comparée à diverses classes de xénœstrogènes.The ER is activated by estrogens as well as by many natural or chemical compounds having an estrogenomimetic activity. These compounds are called xenoestrogens. The response of the promoters containing the ERE and over ERE sequences was compared with various classes of xenoestrogens.
Le rouge de phénol, un colorant connu mimant l'effet des œstrogènes, a été ajouté, à différentes concentrations, aux cellules HepG2 transfectées soit par le plasmide ERE soit par le plasmide over ERE. L'activité transcriptionnelle de la séquence over ERE est 4 à 5 fois plus élevée que celle de la séquence over ERE, et ceci pour les mêmes concentrations de rouge de phénol ajoutée. En conséquence, en utilisant la séquence ERE, on peut détecter l'effet du rouge de phénol à une concentration de 10~4 M, alors que la séquence over ERE nous permet de détecter l'activité œstrogénique de ce composé à une concentration plus faible (10"6M).Phenol red, a known colorant mimicking the effect of estrogens, was added, at different concentrations, to HepG2 cells transfected either by the ERE plasmid or by the over ERE plasmid. The transcriptional activity of the over ERE sequence is 4 to 5 times higher than that of the over ERE sequence, and this for the same concentrations of added phenol red. Consequently, using the ERE sequence, we can detect the effect of phenol red at a concentration of 10 ~ 4 M, while the over ERE sequence allows us to detect the estrogenic activity of this compound at a lower concentration. (10 "6 M).
L'activité œstrogénique d'un composé formé de deux noyaux phénoliques polychlorinés (Chlordane) a été testée en utilisant le même test que celui décrit pour le rouge de phénol. Le chlordane a activé la transcription du plasmide ERE-CAT à une concentration de 10~5 M. A l'opposé, on peut détecter l'activité œstrogénique de cette molécule à une concentration de 10"^ M grâce au plasmide over ERE-CAT. Dans ce cas aussi l'activité transcriptionnelle de la séquence over ERE est très synergique.The estrogenic activity of a compound formed from two polychlorinated phenolic nuclei (Chlordane) was tested using the same test as that described for phenol red. Chlordane activated the transcription of the plasmid ERE-CAT at a concentration of 10 ~ 5 M. On the other hand, one can detect the estrogenic activity of this molecule at a concentration of 10 " ^ M thanks to the plasmid over ERE-CAT In this case also the transcriptional activity of the sequence over ERE is very synergistic.
Donc, l'activation synergique de la transcription de la séquence over ERE est observée dans le cas de l'hormone namrelle et des composés chimiques ayant une activité oestrogénique.Therefore, synergistic activation of the transcription of the over ERE sequence is observed in the case of hormone hormone and of chemical compounds having an estrogenic activity.
5) Effet des antioestrogènes :5) Effect of antioestrogens:
L'activité basale du plasmide ΔMTV-over ERE-CAT est plus élevée que celles des plasmides ΔMTV-(ERE)2-CAT et ΔMTV-ERE-CAT. Ces différences d'activités basales pourraient être dues soit aux propriétés intrinsèques de ces promoteurs, soit à une stimulation endogène du ER par des composés ayant une activité œstrogénomimétique. Dans le but de tester la deuxième hypothèse, les cellules HepG2 ont été transfectées par l'un de ces trois plasmides sus-cités puis incubées soit avec l'œstradiol soit avec un antagoniste du ER le ICI 168134 soit avec les deux. Comme prévu, le ICI 168134 a fortement inhibé l'induction par l'œsradiol, mais ce composé a aussi bien inhibé l'activité basale de ces trois
constructions. Ces résultats montrent que l'activité basale élevée du over ERE serait due à une stimulation endogène du ER.The basal activity of the ΔMTV-over ERE-CAT plasmid is higher than that of the ΔMTV- (ERE) 2-CAT and ΔMTV-ERE-CAT plasmids. These differences in basal activities could be due either to the intrinsic properties of these promoters, or to an endogenous stimulation of the ER by compounds having an oestrogenomimetic activity. In order to test the second hypothesis, the HepG2 cells were transfected with one of these three plasmids mentioned above and then incubated either with oestradiol or with an ER antagonist ICI 168134 or with both. As expected, ICI 168134 strongly inhibited induction by esradiol, but this compound also inhibited the basal activity of these three constructions. These results show that the high basal activity of over ERE is due to endogenous stimulation of ER.
6) Les domaines A/B et E sont responsables de la liaison coopérative du ER à la séquence over ERE:6) Areas A / B and E are responsible for the cooperative link of the ER to the sequence over ERE:
La liaison coopérative du ER à la séquence over ERE serait due soit à une propriété intrinsèque à la séquence over ERE, soit à des domaines spécifique du ER. Dans le but de tester la deuxième hypothèse, des récepteurs à l'œstradiol tronqués ont été utilisés. Des extraits cellulaires de cellules CMT transfectées soit par l'un des vecteurs d'expression du ER tronqués soit par le ER sauvage sont incubés avec les séquences ERE ou over ERE radiomarquées. La migration du complexe contenant le dimère ERE a été déterminée grâce à la sonde ERE. En utilisant la sonde over ERE, le ER sauvage (HEO) a formé un complexe tétramérique dès les faibles concentrations en ER ajoutées. Ce complexe devient prédominant à des concentrations supérieures en ER. Le rapport de coopérativité (KdlI/KdIV) est proche de 5 ce qui indique que le HEO se lie de manière coopérative à la séquence over ERE. Le HE19, récepteur tronqué de la partie N-terminale, est aussi capable de se lier à la séquence over ERE sous forme tétramérique. Donc la délétion du domaine A/B n'a pas empêché la formation du tétramère. Cependant dans ce cas, le rapport de coopérativité est proche de 1, ce qui suggère que ce domaine contribue dans la liaison coopérative du ER à la séquence over ERE. Plusieurs délétions du domaines C- terminal ont été testées. Le HE13, récepteur délété du domaine F a les mêmes propriétés de liaison que le HEO (KdII/KdIV=4,9). A contrario, le HE38, qui est tronqué du domaine E, se lie majoritairement sous forme dimérique. Une faible bande, observée uniquement aux fortes concentrations en HE38 ajoutées, correspond à la forme tétramérique du récepteur. Ceci a été confirmé par le récepteur tronqué HE15. Quand les domaines C-terminal and N-terminal sont délétés (HE70), aucun tétramère n'est observé, même si des quantités importantes de HE70 sont utilisées, et quand la majorité de la sonde est complexée. Ces résultats montrent que les domaines C-terminal et N-terminal du ER sont essentiels à la formation du tétramère et à la liaison coopérative du ER à la séquence over ERE.The cooperative binding of the ER to the over ERE sequence would be due either to an intrinsic property in the over ERE sequence, or to specific domains of the ER. In order to test the second hypothesis, truncated estradiol receptors were used. Cell extracts of CMT cells transfected either with one of the truncated ER expression vectors or with wild-type ER are incubated with the radiolabeled ERE or over ERE sequences. The migration of the complex containing the ERE dimer was determined using the ERE probe. Using the over ERE probe, wild ER (HEO) formed a tetrameric complex from the low ER concentrations added. This complex becomes predominant at higher ER concentrations. The cooperativity ratio (KdlI / KdIV) is close to 5, which indicates that the HEO binds cooperatively to the sequence over ERE. HE19, a truncated N-terminal receptor, is also capable of binding to the over ERE sequence in tetrameric form. Therefore the deletion of the A / B domain did not prevent the formation of the tetramer. However in this case, the cooperative relationship is close to 1, which suggests that this domain contributes in the cooperative link of the ER to the sequence over ERE. Several deletions of the C-terminal domain have been tested. HE13, a deleted F domain receptor has the same binding properties as HEO (KdII / KdIV = 4.9). Conversely, HE38, which is truncated from domain E, binds mainly in dimeric form. A weak band, observed only at high concentrations of added HE38, corresponds to the tetrameric form of the receptor. This was confirmed by the truncated HE15 receiver. When the C-terminal and N-terminal domains are deleted (HE70), no tetramer is observed, even if large quantities of HE70 are used, and when the majority of the probe is complexed. These results show that the C-terminal and N-terminal domains of ER are essential for the formation of the tetramer and for the cooperative binding of ER to the sequence over ERE.
La fonctionnalité de certains des fragments de ER délétés, a été testée. Les cellules HepG2 ont été transfectées soit par le plasmide Tk-ERE-CAT ou par le plasmide Tk-over ERE-CAT et des quantités croissantes de l'un des vecteurs d'expression du ER délété. HEO et HE13 ont le même profil d'induction, i.e. la
transactivation effectuée par la séquence over ERE est approximativement 5 fois plus élevée que celle effectuée par la séquence ERE. Dans le cas de HE19, l'activation de la transcription effectuée par la séquence over ERE est 2 à 3 fois supérieure à celle effectuée par le ERE. Donc le HE19 a perdu la faculté d'effectuer une activation transcriptionnelle synergique. HE 15 et HE21 ont une activité transcriptionnelle très faible et ceci pour les deux séquences ERE ou over ERE. Ces résultats sont en accord avec les expériences de retardement sur gel, dans lesquelles HEO et HE13 se lient d'une manière coopérative à la séquence over ERE. En conclusion, la liaison coopérative du récepteur à l'œstradiol à la séquence over ERE in vitro corrèle avec l'activation de la transcription synergique in vivo.The functionality of some of the deleted ER fragments has been tested. The HepG2 cells were transfected with either the Tk-ERE-CAT plasmid or the Tk-over ERE-CAT plasmid and increasing amounts of one of the deleted ER expression vectors. HEO and HE13 have the same induction profile, ie the transactivation performed by the over ERE sequence is approximately 5 times higher than that performed by the ERE sequence. In the case of HE19, the activation of the transcription carried out by the over ERE sequence is 2 to 3 times greater than that carried out by the ERE. So HE19 has lost the ability to perform synergistic transcriptional activation. HE 15 and HE21 have a very weak transcriptional activity and this for the two ERE or over ERE sequences. These results are in agreement with the gel retardation experiments, in which HEO and HE13 bind in a cooperative manner to the sequence over ERE. In conclusion, the cooperative binding of the estradiol receptor to the over ERE sequence in vitro correlates with the activation of synergistic transcription in vivo.
III) CONCLUSIONIII) CONCLUSION
La capacité du récepteur à l'œstradiol de se lier à deux éléments de réponse à l'œstradiol chevauchants (over ERE), a été évaluée. La liaison et les propriétés fonctionnelles de la séquence over ERE, ont été étudiées. En plus du complexe dimérique, cette séquence lie spécifiquement un complexe de haut poids moléculaire reconnu par un anticorps dirigé contre le ER. La structure de la séquence over ERE (4 demi-sites) et la mobilité du complexe montrent que c'est un complexe formé d'un tétramère de ER lié à la séquence over ERE. Ceci est renforcé par plusieurs arguments, (i) Il est improbable que le complexe migrant lentement soit formé par des contaminations de protéines qui retarderaient le migration du complexe over ERE-ER, ceci car un profil identique de migration est observé pour différentes préparations de ER : ER préparé dans des cellules infectées par baculovirus, ER purifié trouvé sur le commerce, ER préparé par un système de transcription / traduction in vitro, et finalement des extraits cellulaires de cellules CMT transfectées par le ER. (ii) Les expériences d'interférence par méthylation ont montré que les résidus G localisés dans les quatre demi-sites ERE sont totalement ou partiellement protégés. Cependant, les résidus G se situant à l'extérieur des demi-sites ERE n'ont pas été protégés par la liaison. Comme chaque demi-site ERE est occupé par un monomère de ER, la séquence over ERE lie un tétramère de ER.The ability of the estradiol receptor to bind to two overlapping estradiol response elements (over ERE) has been assessed. The binding and functional properties of the over ERE sequence have been studied. In addition to the dimeric complex, this sequence specifically binds a high molecular weight complex recognized by an antibody directed against ER. The structure of the over ERE sequence (4 half-sites) and the mobility of the complex show that it is a complex formed of a tetramer of ER linked to the over ERE sequence. This is reinforced by several arguments, (i) It is unlikely that the slowly migrating complex is formed by contamination of proteins which would delay the migration of the complex over ERE-ER, this because an identical migration profile is observed for different preparations of ER : ER prepared in cells infected with baculovirus, purified ER found on the market, ER prepared by an in vitro transcription / translation system, and finally cellular extracts of CMT cells transfected by ER. (ii) The methylation interference experiments have shown that the G residues located in the four ERE half-sites are totally or partially protected. However, the G residues located outside the ERE half-sites were not protected by the binding. As each ERE half site is occupied by an ER monomer, the over ERE sequence binds an ER tetramer.
La liaison du ER à la séquence over ERE est coopérative. La constante de dissociation (Kd) du complexe tétramérique (ER4-over ERE) est 5 à 15 fois plus faible que celle du complexe dimérique (ER2-over ERE), ceci dépend de l'extrait utilisé. Ces résultats montrent que la liaison du premier dimère facilite
la liaison du second dimère, et ceci de part et d'autre de la double hélice d'ADN.The link of the ER to the sequence over ERE is cooperative. The dissociation constant (Kd) of the tetrameric complex (ER4-over ERE) is 5 to 15 times lower than that of the dimeric complex (ER2-over ERE), this depends on the extract used. These results show that the binding of the first dimer facilitates the binding of the second dimer, and this on either side of the DNA double helix.
Deux mécanismes éventuels peuvent conduire à la coopérativité de liaison du ER à la séquence over ERE : (i) Des interactions entre les récepteurs pourraient stabiliser la formation du tétramère en augmentant l'affinité du second dimère. (ii) La liaison du premier dimère pourrait modifier la structure de l'ADN de façon à augmenter l'affinité du second dimère. L'utilisation de fragments de récepteurs a permis de préciser le mécanisme mis en jeu. La délétion du domaine A/B n'a pas empêché la formation du tétramère ER-over ERE, mais ceci a altéré les cinétiques de liaison. A contrario, la délétion du domaine E a donné des résultats plus frappants. Dans ce cas, la formation du tétramère a été sévèrement altérée. Quand les deux domaines sont délétés, le récepteur conserve donc uniquement le domaine de liaison à l'ADN, la liaison du ER aux séquences over ERE ou ERE est identique, et ceci même à des concentrations élevées en ER. A l'opposé du récepteur sauvage, la liaison du domaine de liaison à l'ADN du ER empêche la liaison d'un second dimère, le domaine E est donc critique. Ce domaine aiderait donc le complexe ADN- récepteur à se mettre dans une conformation qui lui permet de lier un second dimère de récepteur; ceci constitue donc un rôle supplémentaire du domaine E.Two possible mechanisms can lead to the cooperative nature of binding of the ER to the sequence over ERE: (i) Interactions between the receptors could stabilize the formation of the tetramer by increasing the affinity of the second dimer. (ii) The binding of the first dimer could modify the structure of DNA so as to increase the affinity of the second dimer. The use of receptor fragments made it possible to specify the mechanism involved. The deletion of the A / B domain did not prevent the formation of the ER-over ERE tetramer, but this altered the binding kinetics. Conversely, the deletion of domain E has given more striking results. In this case, the formation of the tetramer was severely impaired. When the two domains are deleted, the receptor therefore retains only the DNA binding domain, the binding of ER to sequences over ERE or ERE is identical, even at high ER concentrations. In contrast to the wild-type receptor, the binding of the binding domain to the DNA of the ER prevents the binding of a second dimer, the E domain is therefore critical. This domain would therefore help the DNA-receptor complex to get into a conformation which allows it to bind a second receptor dimer; this therefore constitutes an additional role for domain E.
La courbure de l'ADN suite à l'interaction avec le récepteur pourrait expliquer les observations mentionnées ci-dessus. D'ailleurs, la liaison d'un dimère du domaine de liaison à l'ADN du ER suffit pour induire une courbure de l'ADN (Nardulli et al., 1993; Schwabe et al., 1993). Ceci pourrait empêcher la liaison d'un dimère de domaine de liaison à l'ADN sur le site chevauchant. L'addition du domaine E permet de vaincre cette inhibition, et le récepteur entier se lie de manière coopérative. Comme le domaine E interagit avec diverses protéines, la liaison coopérative pourrait être due à une interaction du type récepteur-récepteur.The curvature of the DNA following interaction with the receptor could explain the observations mentioned above. Moreover, the binding of a dimer of the DNA binding domain of the ER is sufficient to induce a curvature of the DNA (Nardulli et al., 1993; Schwabe et al., 1993). This could prevent the binding of a DNA binding domain dimer at the overlapping site. The addition of the E domain makes it possible to overcome this inhibition, and the entire receptor binds cooperatively. As the E domain interacts with various proteins, the cooperative bond could be due to an interaction of the receptor-receptor type.
La capacité de former un tétramère n'est pas une propriété unique du ER. Un autre membre de la famille des récepteurs nucléaires, le GR, est capable de former un tétramère en interagissant avec des GREs chevauchants localisés dans le promoteur du gène de l'aspartate aminotransférase (Garlatti et al. , 1994). La liaison du tétramère de GR à des éléments de réponse chevauchants semble être plus coopérative que dans le cas du ER. Ceci pourrait être du au fait que le GR ne courbe pas l'ADN à la suite de sa liaison (Luisi et al. , 1991).The ability to form a tetramer is not a unique property of ER. Another member of the nuclear receptor family, GR, is capable of forming a tetramer by interacting with overlapping GREs located in the promoter of the aspartate aminotransferase gene (Garlatti et al., 1994). The binding of the GR tetramer to overlapping response elements appears to be more cooperative than in the case of ER. This could be due to the fact that the GR does not curve the DNA following its binding (Luisi et al., 1991).
Les deux sites ERE chevauchants du over ERE ont une activité transcriptionnelle synergique. Les expériences de liaison par retardement sur gel, ainsi que les expériences de transfections réalisées sur le ER sauvage et
délété, suggèrent que la liaison coopérative pourrait expliquer la synergie fonctionnelle observée ex vivo (Ptashne, 1986).The two overlapping ERE sites in over ERE have synergistic transcriptional activity. The gel retardation binding experiments, as well as the transfection experiments carried out on wild ER and deleted, suggest that the cooperative link could explain the functional synergy observed ex vivo (Ptashne, 1986).
En conclusion, il est démontré ci-dessus que deux éléments de réponse à l'œstradiol peuvent lier d'une manière coopérative un tétramère de ER, ce qui conduit à une forte induction hormonale. La formation d'interaction entre deux dimères de récepteur lors de la liaison sur des éléments chevauchants, révèle une bonne flexibilité de la molécule de récepteur. Il est possible que de telles interactions soient mises en jeu entre récepteurs se liant à des demi sites parfaits, ou même à des demi-sites imparfaits, ces interactions pourraient stabiliser ce genre de complexe ADN-ER. Ceci expliquerait l'efficacité de ces séquences dans la régulation hormonale.
In conclusion, it is shown above that two elements of response to oestradiol can co-operatively bind a tetramer of ER, which leads to a strong hormonal induction. The formation of interaction between two receptor dimers during the binding on overlapping elements, reveals a good flexibility of the receptor molecule. It is possible that such interactions are brought into play between receptors binding to perfect half sites, or even to imperfect half sites, these interactions could stabilize this kind of DNA-ER complex. This would explain the effectiveness of these sequences in hormonal regulation.
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Claims
1. Utilisation de séquences nucléotidiques comprenant une ou plusieurs unités de réponse aux glucocorticoïdes, minéralocorticoïdes, androgènes et progestatifs (encore désignées GRU), et/ou une ou plusieurs unités de réponse aux œstrogènes (encore désignées ERU), lesdites unités étant telles qu'elles comprennent :1. Use of nucleotide sequences comprising one or more response units to glucocorticoids, mineralocorticoids, androgens and progestins (also designated GRU), and/or one or more response units to estrogens (also designated ERU), said units being such that they understand :
- pour l'unité GRU : deux séquences nucléotidiques, encore désignées éléments de réponse aux glucocorticoïdes (ou éléments GRE), ces deux séquences nucléotidiques étant dérivées par modification d'un ou plusieurs nucléotides de l'élément de réponse GRE correspondant à la séquence d'ADN de formule suivante :- for the GRU unit: two nucleotide sequences, also called glucocorticoid response elements (or GRE elements), these two nucleotide sequences being derived by modification of one or more nucleotides of the GRE response element corresponding to the sequence d DNA of the following formula:
5 ' GGTACA XiX2X3 TGTTCT 3 ' 5 ' GGTACA XiX 2 X 3 TGTTCT 3 '
3 , CCATGT X4X5X6 ACAAGA 5 , dans laquelle X , X2, et X3, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque, tandis que X4, X5, et X5, représentent un nucleotide capable de s'apparier avec X , X2, et X3, respectivement, 3 , CCATGT X 4 X, X2, and X3, respectively,
- pour l'unité ERU : deux séquences nucléotidiques, encore désignées éléments de réponse aux oestrogènes (ou éléments ERE), ces deux séquences nucléotidiques étant dérivées par modification d'un ou plusieurs nucléotides de l'élément de réponse ERE correspondant à la séquence d'ADN de formule suivante :- for the ERU unit: two nucleotide sequences, also called estrogen response elements (or ERE elements), these two nucleotide sequences being derived by modification of one or more nucleotides of the ERE response element corresponding to the sequence d DNA of the following formula:
5' AGGTCA X!X2X3 TGACCT 3' 5 ' AGGTCA X ! X 2 X 3 TGACCT 3 '
3, TCCACT X4X5X6 ACTGGA 5, dans laquelle X à Xg ont la signification indiquée ci-dessus, lesdites unités de réponse étant caractérisées en ce que leurs deux éléments de réponse se chevauchent de telle façon que le centre de l'un de ces deux éléments est décalé d'une distance de 5 paires de bases par rapport au centre de l'autre de ces deux éléments, pour la mise en œuvre d'une méthode de détection ou de criblage in vitro de xénohormones, ou pour la préparation de médicaments destinés au traitement de pathologies associées à l'activité des récepteurs aux glucocorticoïdes, minéralocorticoïdes, androgènes et progestatifs, et/ou des récepteurs aux œstrogènes. 3 , TCCACT X 4 one of these two elements is offset by a distance of 5 base pairs relative to the center of the other of these two elements, for the implementation of an in vitro detection or screening method of xenohormones, or for the preparation of drugs intended for the treatment of pathologies associated with the activity of glucocorticoid, mineralocorticoid, androgen and progestogen receptors, and/or estrogen receptors.
2. Utilisation de séquences nucléotidiques selon la revendication 1 , lesdites séquences nucléotidiques étant caractérisées en ce qu'elles comprennent à titre d'unité GRU :
- la séquence nucléotidique de formule (I) suivante :2. Use of nucleotide sequences according to claim 1, said nucleotide sequences being characterized in that they comprise as a GRU unit: - the following nucleotide sequence of formula (I):
XalGT ACXbl GXciA XdlGXel CCXfl GTT CXgi 3 , Xa2CA TGXjb2 CXc2T Xd2CXe2 GGXf2 CAA GXg2 5 , XalGT ACX bl GXciA X dl GX el CCX fl GTT CX gi 3 ,
dans laquelle :in which :
. les éléments de réponse GRE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras et italiques,. the GRE response elements are indicated, on one of the DNA strands, in bold and italic characters,
. Xa à Xgi , indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que Xa2 à Xg2, représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xaι à Xg respectivement,. X a to Xgi, independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X a 2 to Xg2, represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a ι to
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques de formule (I) susmentionnée, chacune des séquences nucléotidiques de formule (I) étant espacées d'une distance comprise entre lOn et l in paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2.- or a succession of at least two nucleotide sequences of formula (I) mentioned above, each of the nucleotide sequences of formula (I) being spaced by a distance of between lOn and l in base pairs, center to center, n being a integer greater than or equal to 2.
3. Utilisation de séquences nucléotidiques selon la revendication 2, lesdites séquences nucléotidiques étant caractérisées en ce que :3. Use of nucleotide sequences according to claim 2, said nucleotide sequences being characterized in that:
- Xaι, X51, Xf , et Xgi, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que Xa2, X 2> Xf2> et g2' représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xaι, XD , Xf\, et Xgi, respectivement,- X a ι, X51, Xf, and Xgi, independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X a 2 , X a ι, X D , Xf\, and Xgi, respectively,
- Xcι représente A ou T, tandis que Xc2 représente T ou A respectivement,- X c ι represents A or T, while X c 2 represents T or A respectively,
- Xdi représente A ou C, tandis que Xd2 représente T ou G respectivement,- Xdi represents A or C, while Xd2 represents T or G respectively,
- Xe représente A ou T, tandis que Xe2 représente T ou A respectivement.- X e represents A or T, while X e 2 represents T or A respectively.
4. Utilisation de séquences nucléotidiques selon l'une des revendications 1 à 3, lesdites séquences nucléotidiques étant caractérisées en ce qu'elles comprennent à titre d'unité GRU :4. Use of nucleotide sequences according to one of claims 1 to 3, said nucleotide sequences being characterized in that they comprise as GRU unit:
- la séquence nucléotidique désignée "GRE A" suivante:- the following nucleotide sequence designated “GRE A”:
5 ' GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ' 31 CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 51
dans laquelle les éléments de réponse GRE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras, italiques, et soulignés, 5 ' GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ' 31 CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 51 in which the GRE response elements are indicated, on one of the DNA strands, in bold, italic, and underlined characters,
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques GRE A, espacées d'une distance comprise entre lOn et l in paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2, notamment : . la séquence (GRE A)2 suivante :- or a succession of at least two GRE A nucleotide sequences, spaced at a distance between lOn and l in base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2, in particular: . the following sequence (GRE A)2:
' GGT ACA GAA AGA CCT GTT CTXa GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ' , CCA TGT CTT TCT GGA CAA GAXh CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5 ,'GGT ACA GAA AGA CCT GTT CTX a GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ', CCA TGT CTT TCT GGA CAA GAX h CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5 ,
dans laquelle Xa représente un nucleotide quelconque ou dérivé, et X^ représente un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, notamment Xa représente C et X^ représente G,in which X a represents any nucleotide or derivative, and X^ represents a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , in particular X a represents C and X^ represents G,
. la séquence (GRE A)4 suivante :. the following sequence (GRE A)4:
' GGT ACA GAA AGA CCT GTT CTXa GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ' ι CCA TGT CTT TCT GGA CAA GAXb CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5. ' XCGGT ACA GAA AGA CCT GTT CTXe GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ' ι XdCCA TGT CTT TCT GGA CAA GAXf CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5.' GGT ACA GAA AGA CCT GTT CTX a GGT ACA GAA AGA CCT GTT CT 3 ' ι CCA TGT CTT TCT GGA CAA GAX b CCA TGT CTT TCT GGA CAA GA 5 . ' _ _ _ _ _
dans laquelle Xa, Xc, et Xe, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que X y, Xj, et Xf, représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, Xc, et Xe, respectivement, notamment Xa, Xc, et Xe représentent C et Xa, Xc, et Xe représentent G.in which X a , X c , and X e , independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X y , Xj, and c , and X e , respectively, in particular X a , X c , and X e represent C and X a , X c , and X e represent G.
5. Utilisation de séquences nucléotidiques selon l'une des revendications 1 à 3, lesdites séquences nucléotidiques étant caractérisées en ce qu'elles comprennent à titre d'unité GRU :5. Use of nucleotide sequences according to one of claims 1 to 3, said nucleotide sequences being characterized in that they comprise as GRU unit:
- la séquence nucléotidique désignée "GRE A up" suivante:- the following nucleotide sequence designated “GRE A up”:
5 ' GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3 ' 3. CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 51 5 ' GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3 ' 3 . CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 51
dans laquelle les éléments de réponse GRE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras, italiques, et soulignés,
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques GRE A up, espacées d'une distance comprise entre lOn et l in paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2, notamment : . la séquence (GRE A up)2 suivante :in which the GRE response elements are indicated, on one of the DNA strands, in bold, italic, and underlined characters, - or a succession of at least two GRE A up nucleotide sequences, spaced at a distance between lOn and l in base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2, in particular: . the following sequence (GRE A up)2:
' GGT ACA GTA CGT CCT GTT CTXa GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3 ' ι CCA TGT CAT GCA GGA CAA GAXb CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 5.' GGT ACA GTA CGT CCT GTT CTX a GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3 ' ι CCA TGT CAT GCA GGA CAA GAX b CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 5 .
dans laquelle Xa représente un nucleotide quelconque ou dérivé, et X représente un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, notamment Xa représente C et X5 représente G,in which X a represents any nucleotide or derivative, and X represents a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , in particular X a represents C and X5 represents G,
. la séquence (GRE A up)4 suivante :. the following sequence (GRE A up)4:
' GGT ACA GTA CGT CCT GTT CTXa GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3 ' 1 CCA TGT CAT GCA GGA CAA GAXb CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 5. ' XCGGT ACA GTA CGT CCT GTT CTXe GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3 ' 1 XdCCA TGT CAT GCA GGA CAA GAXf CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 51' GGT ACA GTA CGT CCT GTT CTX a GGT ACA GTA CGT CCT GTT CT 3 ' 1 CCA TGT CAT GCA GGA CAA GAX b CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 5. ' CGT CCT GTT CT 3 ' 1 X d CCA TGT CAT GCA GGA CAA GAX f CCA TGT CAT GCA GGA CAA GA 51
dans laquelle Xa, Xc, et Xe, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que XD, Xj, et Xf, représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, Xc, et Xe, respectivement, notamment Xa, Xc, et Xe représentent C et Xa, Xc, et Xe représentent G.in which X a , X c , and X e , independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X D , Xj, and c , and X e , respectively, in particular X a , X c , and X e represent C and X a , X c , and X e represent G.
6. Utilisation de séquences nucléotidiques selon la revendication 1 , lesdites séquences nucléotidiques étant caractérisées en ce qu'elles comprennent à titre d'unité ERU :6. Use of nucleotide sequences according to claim 1, said nucleotide sequences being characterized in that they comprise as an ERU unit:
- la séquence nucléotidique de formule (II) suivante :- the following nucleotide sequence of formula (II):
XalGG TCXbl GGT CGA CCXcl GAC CXdx 3 , Xa2CC AGXjb2 CCA GCT GGXc2 CTG GXd2 X al GG TCX bl GGT CGA CCX cl GAC CX dx 3 ,
dans laquelle :in which :
. les éléments de réponse ERE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras et italiques,. the ERE response elements are indicated, on one of the DNA strands, in bold and italic characters,
• al à ^dl> indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que Xa2 à X<}2' représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xaι à X^i respectivement,
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques de formule (II) susmentionnée, espacées d'une distance comprise entre lOn et l in paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2.• al to ^dl > independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X a 2 to X<}2 ' represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a ι to X^i respectively, - or a succession of at least two nucleotide sequences of formula (II) above, spaced at a distance between lOn and l in base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2.
7. Utilisation de séquences nucléotidiques selon la revendication 6, lesdites séquences nucléotidiques étant caractérisées en ce qu'elles comprennent à titre d'unité ERU :7. Use of nucleotide sequences according to claim 6, said nucleotide sequences being characterized in that they comprise as an ERU unit:
- la séquence nucléotidique désignée "over ERE" suivante :- the following nucleotide sequence designated “over ERE”:
5 ' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 3. TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5. 5 ' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 3 . TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5 .
dans laquelle les éléments de réponse ERE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras, italiques et soulignés,in which the ERE response elements are indicated, on one of the DNA strands, in bold, italic and underlined characters,
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques over ERE, espacées d'une distance comprise entre lOn et l in paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2, notamment :- or a succession of at least two nucleotide sequences over ERE, spaced at a distance between lOn and l in base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2, in particular:
. la séquence (over ERE)2 suivante :. the following sequence (over ERE)2:
5 ' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTXa AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 3. TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAXb TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5. 5 ' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTX a AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 3 . TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAX b TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5 .
dans laquelle Xa représente un nucleotide quelconque ou dérivé, et XD représente un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, notamment Xa représente C et X représente G,in which X a represents any nucleotide or derivative, and X D represents a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , in particular X a represents C and X represents G,
. la séquence (over ERE)4 suivante :. the following sequence (over ERE)4:
5 ' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTXa AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 5 ' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTX a AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 '
31 TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAX TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5131 TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAX TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 51
5 ' XCAGG_TÇA GGT CGA CCT GAC CTXe AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 5 ' X C AGG_TÇA GGT CGA CCT GAC CTX e AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3
3. XdTCC AGT CCA GCT GGA CTG GAXf TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 53. X d TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAX f TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5
dans laquelle Xa, Xc, et Xe, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que X , X^, et Xf, représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, Xc, et Xe, respectivement, notamment Xa, Xc, et Xe représentent C et Xa, Xc, et Xe représentent G.
in which X a , X c , and X e , independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X, X ^ , and c , and X e , respectively, in particular X a , X c , and X e represent C and X a , X c , and X e represent G.
8. Séquence nucléotidique caractérisée en ce qu'elle comprend une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques GRE A telle que définie dans la revendication 4, et/ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques GRE A up telle que définie dans la revendication 5.8. Nucleotide sequence characterized in that it comprises a succession of at least two GRE A nucleotide sequences as defined in claim 4, and/or a succession of at least two GRE A up nucleotide sequences as defined in claim 4. claim 5.
9. Séquence nucléotidique caractérisée en ce qu'elle comprend à titre d'unité ERU :9. Nucleotide sequence characterized in that it comprises as an ERU unit:
- la séquence nucléotidique de formule (II) suivante :- the following nucleotide sequence of formula (II):
XalGG TCXbl GGT CGA CCXcl GAC CXdi Xa2 CC AGXjb2 CCA GCT GGXC2 CTG GXd2 X al GG TCX bl GGT CGA CCX cl GAC CX di
dans laquelle :in which :
. les éléments de réponse ERE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras et italiques,. the ERE response elements are indicated, on one of the DNA strands, in bold and italic characters,
. Xa à Xdl, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que Xa2 à Xj2> représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa à X^i respectivement,. X a to Xdl, independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X a 2 to Xj2 > represent a nucleotide or derivative capable of pairing with X a to
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques de formule (II) susmentionnée, espacées d'une distance comprise entre lOn et Un paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2.- or a succession of at least two nucleotide sequences of formula (II) above, spaced at a distance between lOn and One base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2.
10. Séquence nucléotidique selon la revendication 9, caractérisée en ce qu'elle comprend à titre d'unité ERU :10. Nucleotide sequence according to claim 9, characterized in that it comprises as an ERU unit:
- la séquence nucléotidique over ERE suivante:- the following nucleotide sequence over ERE:
5 ' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 3. TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 51 5 ' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 3. TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 51
dans laquelle les éléments de réponse ERE sont indiqués, sur l'un des brins d'ADN, en caractères gras, italiques et soulignés,in which the ERE response elements are indicated, on one of the DNA strands, in bold, italic and underlined characters,
- ou une succession d'au moins deux séquences nucléotidiques over ERE, espacées d'une distance comprise entre lOn et Un paires de bases, centre à centre, n étant un nombre entier supérieur ou égal à 2, notamment :- or a succession of at least two nucleotide sequences over ERE, spaced at a distance between lOn and One base pairs, center to center, n being an integer greater than or equal to 2, in particular:
. la séquence (over ERE)2 suivante :. the following sequence (over ERE)2:
' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTXΛ AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 1 TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAXb TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5.
dans laquelle Xa représente un nucleotide quelconque ou dérivé, et X représente un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, notamment Xa représente C et X représente G,' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTX Λ AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 1 TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAX b TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5. in which X a represents any nucleotide or derivative, and X represents a nucleotide or derivative capable of pairing with X a , in particular X a represents C and X represents G,
. la séquence (over ERE)4 suivante :. the following sequence (over ERE)4:
5 ' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTXa AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 5 ' AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTX a AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 '
3. TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAXb TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 513. TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAX b TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 51
5 ' XçAGG TCA GGT CGA CCT GAC CTXe AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 ' 5 ' X ç AGG TCA GGT CGA CCT GAC CTX e AGG TCA GGT CGA CCT GAC CT 3 '
31 XdTCC AGT CCA GCT GGA CTG GAXf TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 5131 X d TCC AGT CCA GCT GGA CTG GAX f TCC AGT CCA GCT GGA CTG GA 51
dans laquelle Xa, Xc, et Xe, indépendamment les uns des autres, représentent un nucleotide quelconque ou dérivé, tandis que X^, Xςj, et Xf, représentent un nucleotide ou dérivé capable de s'apparier avec Xa, Xc, et Xe, respectivement, notamment Xa, Xc, et Xe représentent C et Xa, Xc, et Xe représentent G.in which X a , X c , and X e , independently of each other, represent any nucleotide or derivative, while X^ , Xςj, and c , and X e , respectively, in particular X a , X c , and X e represent C and X a , X c , and X e represent G.
11. Séquence nucléotidique selon la revendication 9 ou 10, caractérisée en ce qu'elle comprend une ou plusieurs unités GRU définies dans l'une des revendications 1 à 5.11. Nucleotide sequence according to claim 9 or 10, characterized in that it comprises one or more GRU units defined in one of claims 1 to 5.
12. Séquence nucléotidique selon l'une des revendications 9 à 11, caractérisée en ce que la ou les unités ERU, et, le cas échéant la ou les unités GRU, sont situées en amont d'un promoteur contrôlant la transcription d'un gène rapporteur.12. Nucleotide sequence according to one of claims 9 to 11, characterized in that the ERU unit(s), and, where appropriate the GRU unit(s), are located upstream of a promoter controlling the transcription of a gene rapporteur.
13. Vecteur, notamment plasmide, caractérisé en ce qu'il comprend une séquence nucléotidique selon l'une des revendications 9 à 12.13. Vector, in particular plasmid, characterized in that it comprises a nucleotide sequence according to one of claims 9 to 12.
14. Cellule humaine ou animale transformée par un vecteur selon la revendication 13.14. Human or animal cell transformed by a vector according to claim 13.
15. Méthode de détection ou de criblage in vitro de xénohormones susceptibles d' interagir avec des récepteurs aux glucocorticoïdes, des minéralocorticoïdes, des androgènes et de la progestérone, et/ou des récepteurs aux oestrogènes dans l'organisme humain, caractérisée en ce qu'elle comprend la mise en culture respectivement de cellules humaines ou animales transformées par un vecteur comprenant au moins une unité GRU définie dans l'une des
revendications 1 à 5, et/ou de cellules humaines ou animales selon la revendication 14, dans un milieu de culture en présence d'un échantillon biologique susceptible de contenir lesdites xénohormones,15. Method for in vitro detection or screening of xenohormones capable of interacting with glucocorticoid receptors, mineralocorticoids, androgens and progesterone, and/or estrogen receptors in the human body, characterized in that it comprises the culturing respectively of human or animal cells transformed by a vector comprising at least one GRU unit defined in one of the claims 1 to 5, and/or human or animal cells according to claim 14, in a culture medium in the presence of a biological sample capable of containing said xenohormones,
- la détection de la présence du polypeptide codé par ledit gène rapporteur dans lesdites cellules ou le milieu de culture de ces dernières, notamment par colorimétrie dans le cas où le polypeptide codé par le gène rapporteur réagit avec son substrat dans le cadre d'une réaction colorée, ou par fluorimétrie dans le cas où le polypeptide codé par le gène rapporteur est fluorescent, ou susceptible d'être reconnu par une molécule fluorescente, ou encore par une méthode radioactive.- detecting the presence of the polypeptide encoded by said reporter gene in said cells or the culture medium thereof, in particular by colorimetry in the case where the polypeptide encoded by the reporter gene reacts with its substrate as part of a reaction colored, or by fluorimetry in the case where the polypeptide encoded by the reporter gene is fluorescent, or capable of being recognized by a fluorescent molecule, or by a radioactive method.
16. Vecteur pour la thérapie génique caractérisé en ce qu'il comprend au moins une unité GRU définie dans l'une des revendications 1 à 5, et/ ou au moins une unité ERU définie dans l'une des revendications 1, 6 et 7.16. Vector for gene therapy characterized in that it comprises at least one GRU unit defined in one of claims 1 to 5, and/or at least one ERU unit defined in one of claims 1, 6 and 7 .
17. Composition pharmaceutique caractérisée en ce qu'elle comprend, en association avec un véhicule physiologiquement acceptable, au moins une unité GRU définie dans l'une des revendications 1 à 5, et/ou au moins une unité ERU définie dans l'une des revendications 1, 6 et 7, lesdites unités étant le cas échéant précédées et suivies par une succession d'au moins environ 5 nucléotides ou dérivés, ou un vecteur selon la revendication 16.
17. Pharmaceutical composition characterized in that it comprises, in association with a physiologically acceptable vehicle, at least one GRU unit defined in one of claims 1 to 5, and/or at least one ERU unit defined in one of claims 1, 6 and 7, said units being where appropriate preceded and followed by a succession of at least approximately 5 nucleotides or derivatives, or a vector according to claim 16.
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WO1993020218A1 (en) * | 1992-03-30 | 1993-10-14 | Connaught Laboratories Limited | Synthetic eukaryotic promoters containing two inducible elements |
US5445941A (en) * | 1993-06-21 | 1995-08-29 | Eli Lilly And Company | Method for screening anti-osteoporosis agents |
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US5445941A (en) * | 1993-06-21 | 1995-08-29 | Eli Lilly And Company | Method for screening anti-osteoporosis agents |
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