UA73922C2 - Human neurotrophic growth factor (enovin), nucleic acid molecule coding it, vector, plasmid, pharmaceutical composition (variants), antibody, a method for revealing growth factor, set, a method for identification of agonist or antagonist (variants) - Google Patents
Human neurotrophic growth factor (enovin), nucleic acid molecule coding it, vector, plasmid, pharmaceutical composition (variants), antibody, a method for revealing growth factor, set, a method for identification of agonist or antagonist (variants) Download PDFInfo
- Publication number
- UA73922C2 UA73922C2 UA2001010334A UA2001010334A UA73922C2 UA 73922 C2 UA73922 C2 UA 73922C2 UA 2001010334 A UA2001010334 A UA 2001010334A UA 2001010334 A UA2001010334 A UA 2001010334A UA 73922 C2 UA73922 C2 UA 73922C2
- Authority
- UA
- Ukraine
- Prior art keywords
- growth factor
- enovin
- nucleic acid
- sequence
- specified
- Prior art date
Links
- 102100026376 Artemin Human genes 0.000 title claims abstract description 189
- 108010059258 enovin Proteins 0.000 title claims abstract description 175
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 title claims abstract description 68
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims abstract description 59
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims abstract description 51
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims abstract description 51
- 230000000508 neurotrophic effect Effects 0.000 title claims abstract description 32
- 239000000556 agonist Substances 0.000 title claims abstract description 17
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 title claims abstract description 17
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 title claims abstract description 12
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 54
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 title claims description 13
- 239000013598 vector Substances 0.000 title abstract description 28
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims abstract description 34
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims abstract description 34
- 230000003993 interaction Effects 0.000 claims abstract description 8
- 210000000653 nervous system Anatomy 0.000 claims abstract description 4
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 74
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 66
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 50
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims description 47
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 40
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 35
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 34
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 33
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 30
- 108010025020 Nerve Growth Factor Proteins 0.000 claims description 29
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 claims description 28
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims description 27
- 239000003900 neurotrophic factor Substances 0.000 claims description 26
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 25
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 19
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 15
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 14
- 102000007072 Nerve Growth Factors Human genes 0.000 claims description 13
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 claims description 10
- 230000004913 activation Effects 0.000 claims description 10
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 claims description 10
- 230000011664 signaling Effects 0.000 claims description 10
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims description 7
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 claims description 5
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 5
- 230000002265 prevention Effects 0.000 claims description 5
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 claims description 5
- 102000004022 Protein-Tyrosine Kinases Human genes 0.000 claims description 4
- 108090000412 Protein-Tyrosine Kinases Proteins 0.000 claims description 4
- 102000052575 Proto-Oncogene Human genes 0.000 claims description 3
- 108700020978 Proto-Oncogene Proteins 0.000 claims description 3
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims description 3
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 claims description 3
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 claims description 2
- 102000043136 MAP kinase family Human genes 0.000 claims description 2
- 108091054455 MAP kinase family Proteins 0.000 claims description 2
- 102000004278 Receptor Protein-Tyrosine Kinases Human genes 0.000 claims 1
- 108090000873 Receptor Protein-Tyrosine Kinases Proteins 0.000 claims 1
- 229940100514 Syk tyrosine kinase inhibitor Drugs 0.000 claims 1
- 239000013068 control sample Substances 0.000 claims 1
- 238000011161 development Methods 0.000 abstract description 7
- 208000015122 neurodegenerative disease Diseases 0.000 abstract description 5
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 abstract description 2
- 230000004770 neurodegeneration Effects 0.000 abstract description 2
- 238000011321 prophylaxis Methods 0.000 abstract 2
- 102000009465 Growth Factor Receptors Human genes 0.000 abstract 1
- 108010009202 Growth Factor Receptors Proteins 0.000 abstract 1
- 239000012620 biological material Substances 0.000 abstract 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 95
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 64
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 58
- 239000013615 primer Substances 0.000 description 51
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 40
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 33
- 229930012538 Paclitaxel Natural products 0.000 description 31
- 229960001592 paclitaxel Drugs 0.000 description 31
- RCINICONZNJXQF-MZXODVADSA-N taxol Chemical compound O([C@@H]1[C@@]2(C[C@@H](C(C)=C(C2(C)C)[C@H](C([C@]2(C)[C@@H](O)C[C@H]3OC[C@]3([C@H]21)OC(C)=O)=O)OC(=O)C)OC(=O)[C@H](O)[C@@H](NC(=O)C=1C=CC=CC=1)C=1C=CC=CC=1)O)C(=O)C1=CC=CC=C1 RCINICONZNJXQF-MZXODVADSA-N 0.000 description 31
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 28
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 27
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 25
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 25
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 25
- 208000025033 X-linked centronuclear myopathy Diseases 0.000 description 24
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 23
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 23
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 23
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 21
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 19
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 19
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 18
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 17
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 17
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 15
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 15
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 15
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 14
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 14
- 239000000047 product Substances 0.000 description 14
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 13
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 13
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 13
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 13
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 12
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 11
- 206010040030 Sensory loss Diseases 0.000 description 11
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 11
- 230000001186 cumulative effect Effects 0.000 description 11
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 11
- -1 RZR Proteins 0.000 description 10
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 10
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 10
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 10
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 10
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 10
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 10
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 9
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 9
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 9
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 9
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 9
- 208000002551 irritable bowel syndrome Diseases 0.000 description 9
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 9
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 9
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 8
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 8
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 8
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 8
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 8
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 8
- 201000006417 multiple sclerosis Diseases 0.000 description 8
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 8
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 8
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 8
- GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N triton Chemical compound [3H+] GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N 0.000 description 8
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 7
- 208000018737 Parkinson disease Diseases 0.000 description 7
- 210000001638 cerebellum Anatomy 0.000 description 7
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 7
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 7
- HKSZLNNOFSGOKW-UHFFFAOYSA-N ent-staurosporine Natural products C12=C3N4C5=CC=CC=C5C3=C3CNC(=O)C3=C2C2=CC=CC=C2N1C1CC(NC)C(OC)C4(C)O1 HKSZLNNOFSGOKW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 description 7
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 7
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 7
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 7
- 230000001953 sensory effect Effects 0.000 description 7
- HKSZLNNOFSGOKW-FYTWVXJKSA-N staurosporine Chemical compound C12=C3N4C5=CC=CC=C5C3=C3CNC(=O)C3=C2C2=CC=CC=C2N1[C@H]1C[C@@H](NC)[C@@H](OC)[C@]4(C)O1 HKSZLNNOFSGOKW-FYTWVXJKSA-N 0.000 description 7
- CGPUWJWCVCFERF-UHFFFAOYSA-N staurosporine Natural products C12=C3N4C5=CC=CC=C5C3=C3CNC(=O)C3=C2C2=CC=CC=C2N1C1CC(NC)C(OC)C4(OC)O1 CGPUWJWCVCFERF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 206010012735 Diarrhoea Diseases 0.000 description 6
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 6
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 6
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 101000987003 Homo sapiens Tumor protein 63 Proteins 0.000 description 6
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 6
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 6
- 208000002193 Pain Diseases 0.000 description 6
- 102100036660 Persephin Human genes 0.000 description 6
- 102100027881 Tumor protein 63 Human genes 0.000 description 6
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 6
- 210000003050 axon Anatomy 0.000 description 6
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 6
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 6
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 6
- VYFYYTLLBUKUHU-UHFFFAOYSA-N dopamine Chemical compound NCCC1=CC=C(O)C(O)=C1 VYFYYTLLBUKUHU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 6
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 6
- 210000000548 hind-foot Anatomy 0.000 description 6
- 210000001320 hippocampus Anatomy 0.000 description 6
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 6
- RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N imidazole Natural products C1=CNC=N1 RAXXELZNTBOGNW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 6
- 108010070453 persephin Proteins 0.000 description 6
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 6
- 208000024827 Alzheimer disease Diseases 0.000 description 5
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 5
- 108091035707 Consensus sequence Proteins 0.000 description 5
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 5
- 206010029260 Neuroblastoma Diseases 0.000 description 5
- 238000000636 Northern blotting Methods 0.000 description 5
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 5
- 206010002026 amyotrophic lateral sclerosis Diseases 0.000 description 5
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 5
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 5
- 210000003169 central nervous system Anatomy 0.000 description 5
- 210000003710 cerebral cortex Anatomy 0.000 description 5
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 5
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 5
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 5
- 208000033808 peripheral neuropathy Diseases 0.000 description 5
- 230000008569 process Effects 0.000 description 5
- 230000011514 reflex Effects 0.000 description 5
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 5
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 5
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 5
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 5
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108020005544 Antisense RNA Proteins 0.000 description 4
- 206010010539 Congenital megacolon Diseases 0.000 description 4
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 4
- 230000004568 DNA-binding Effects 0.000 description 4
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 4
- 208000004592 Hirschsprung disease Diseases 0.000 description 4
- 101000702718 Homo sapiens Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1 Proteins 0.000 description 4
- 102100021584 Neurturin Human genes 0.000 description 4
- 108010015406 Neurturin Proteins 0.000 description 4
- 102100030919 Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1 Human genes 0.000 description 4
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 4
- 208000025747 Rheumatic disease Diseases 0.000 description 4
- 241000181331 Saron Species 0.000 description 4
- 239000008049 TAE buffer Substances 0.000 description 4
- 108091023040 Transcription factor Proteins 0.000 description 4
- 102000040945 Transcription factor Human genes 0.000 description 4
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 4
- 206010047700 Vomiting Diseases 0.000 description 4
- 241000289690 Xenarthra Species 0.000 description 4
- HGEVZDLYZYVYHD-UHFFFAOYSA-N acetic acid;2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;2-[2-[bis(carboxymethyl)amino]ethyl-(carboxymethyl)amino]acetic acid Chemical compound CC(O)=O.OCC(N)(CO)CO.OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O HGEVZDLYZYVYHD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000003184 complementary RNA Substances 0.000 description 4
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 4
- 230000006735 deficit Effects 0.000 description 4
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 4
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 4
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 4
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 4
- 210000001652 frontal lobe Anatomy 0.000 description 4
- 229960003082 galactose Drugs 0.000 description 4
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 4
- 230000008991 intestinal motility Effects 0.000 description 4
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 4
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 4
- 230000001537 neural effect Effects 0.000 description 4
- 230000001272 neurogenic effect Effects 0.000 description 4
- 239000002581 neurotoxin Substances 0.000 description 4
- 231100000618 neurotoxin Toxicity 0.000 description 4
- 230000004044 response Effects 0.000 description 4
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 4
- 208000011580 syndromic disease Diseases 0.000 description 4
- PIEPQKCYPFFYMG-UHFFFAOYSA-N tris acetate Chemical compound CC(O)=O.OCC(N)(CO)CO PIEPQKCYPFFYMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 4
- 210000004885 white matter Anatomy 0.000 description 4
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 3
- 102000016911 Deoxyribonucleases Human genes 0.000 description 3
- 108010053770 Deoxyribonucleases Proteins 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 3
- 244000068988 Glycine max Species 0.000 description 3
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 description 3
- 206010021518 Impaired gastric emptying Diseases 0.000 description 3
- 108091092195 Intron Proteins 0.000 description 3
- 208000010886 Peripheral nerve injury Diseases 0.000 description 3
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 description 3
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 3
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 3
- 244000180577 Sambucus australis Species 0.000 description 3
- 235000018734 Sambucus australis Nutrition 0.000 description 3
- 208000006011 Stroke Diseases 0.000 description 3
- 108010009583 Transforming Growth Factors Proteins 0.000 description 3
- 102000009618 Transforming Growth Factors Human genes 0.000 description 3
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 3
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 3
- 208000026935 allergic disease Diseases 0.000 description 3
- WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N alpha-D-galactose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-PHYPRBDBSA-N 0.000 description 3
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 3
- 208000029028 brain injury Diseases 0.000 description 3
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 3
- 244000309466 calf Species 0.000 description 3
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 3
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 3
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 3
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 3
- 210000001612 chondrocyte Anatomy 0.000 description 3
- 230000014107 chromosome localization Effects 0.000 description 3
- 210000001072 colon Anatomy 0.000 description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 3
- 229960003638 dopamine Drugs 0.000 description 3
- 230000002124 endocrine Effects 0.000 description 3
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 description 3
- 230000006870 function Effects 0.000 description 3
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 3
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 3
- 229930182830 galactose Natural products 0.000 description 3
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 3
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 3
- 230000009610 hypersensitivity Effects 0.000 description 3
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 3
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 3
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 3
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 3
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 description 3
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 3
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 3
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 3
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 description 3
- 230000009826 neoplastic cell growth Effects 0.000 description 3
- 206010061311 nervous system neoplasm Diseases 0.000 description 3
- 230000009223 neuronal apoptosis Effects 0.000 description 3
- 230000000324 neuroprotective effect Effects 0.000 description 3
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 3
- 210000000963 osteoblast Anatomy 0.000 description 3
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 3
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 3
- 210000001428 peripheral nervous system Anatomy 0.000 description 3
- 210000002826 placenta Anatomy 0.000 description 3
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 3
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 3
- 230000000552 rheumatic effect Effects 0.000 description 3
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 3
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 3
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 3
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 3
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 3
- 239000012137 tryptone Substances 0.000 description 3
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- PTHLSIBOMNYSIS-UHFFFAOYSA-N 5-(4-aminophenyl)-8-chloro-3-methyl-1,2,4,5-tetrahydro-3-benzazepin-7-ol Chemical compound C1N(C)CCC2=CC(Cl)=C(O)C=C2C1C1=CC=C(N)C=C1 PTHLSIBOMNYSIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CJLHTKGWEUGORV-UHFFFAOYSA-N Artemin Chemical compound C1CC2(C)C(O)CCC(=C)C2(O)C2C1C(C)C(=O)O2 CJLHTKGWEUGORV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 2
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 2
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 2
- 208000014526 Conduction disease Diseases 0.000 description 2
- 206010010774 Constipation Diseases 0.000 description 2
- 208000011231 Crohn disease Diseases 0.000 description 2
- 206010052804 Drug tolerance Diseases 0.000 description 2
- PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N Fluorine Chemical compound FF PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000004961 Furin Human genes 0.000 description 2
- 108090001126 Furin Proteins 0.000 description 2
- 208000018522 Gastrointestinal disease Diseases 0.000 description 2
- WZUVPPKBWHMQCE-UHFFFAOYSA-N Haematoxylin Chemical compound C12=CC(O)=C(O)C=C2CC2(O)C1C1=CC=C(O)C(O)=C1OC2 WZUVPPKBWHMQCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001553014 Myrsine salicina Species 0.000 description 2
- 208000012902 Nervous system disease Diseases 0.000 description 2
- 208000025966 Neurological disease Diseases 0.000 description 2
- 101710138657 Neurotoxin Proteins 0.000 description 2
- 206010054048 Postoperative ileus Diseases 0.000 description 2
- 208000014675 Prion-associated disease Diseases 0.000 description 2
- 239000013614 RNA sample Substances 0.000 description 2
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 2
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 2
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 102000007238 Transferrin Receptors Human genes 0.000 description 2
- 108010033576 Transferrin Receptors Proteins 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000009471 action Effects 0.000 description 2
- 208000009956 adenocarcinoma Diseases 0.000 description 2
- 230000001270 agonistic effect Effects 0.000 description 2
- 230000003042 antagnostic effect Effects 0.000 description 2
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 2
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 2
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 230000002490 cerebral effect Effects 0.000 description 2
- 210000001175 cerebrospinal fluid Anatomy 0.000 description 2
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 2
- 230000035605 chemotaxis Effects 0.000 description 2
- ZPUCINDJVBIVPJ-LJISPDSOSA-N cocaine Chemical compound O([C@H]1C[C@@H]2CC[C@@H](N2C)[C@H]1C(=O)OC)C(=O)C1=CC=CC=C1 ZPUCINDJVBIVPJ-LJISPDSOSA-N 0.000 description 2
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 2
- 230000001054 cortical effect Effects 0.000 description 2
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 2
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 2
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 2
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 2
- 229960000935 dehydrated alcohol Drugs 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 229940042399 direct acting antivirals protease inhibitors Drugs 0.000 description 2
- 210000005064 dopaminergic neuron Anatomy 0.000 description 2
- 201000006549 dyspepsia Diseases 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 229960004756 ethanol Drugs 0.000 description 2
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000002458 fetal heart Anatomy 0.000 description 2
- 229910052731 fluorine Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011737 fluorine Substances 0.000 description 2
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 2
- 210000002683 foot Anatomy 0.000 description 2
- 210000005153 frontal cortex Anatomy 0.000 description 2
- 230000030136 gastric emptying Effects 0.000 description 2
- 230000007160 gastrointestinal dysfunction Effects 0.000 description 2
- 208000001288 gastroparesis Diseases 0.000 description 2
- 229930004094 glycosylphosphatidylinositol Natural products 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 230000026781 habituation Effects 0.000 description 2
- 210000002216 heart Anatomy 0.000 description 2
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000003917 human chromosome Anatomy 0.000 description 2
- 230000001771 impaired effect Effects 0.000 description 2
- 210000003000 inclusion body Anatomy 0.000 description 2
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 2
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 2
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 2
- NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N insulin Chemical compound N1C(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(NC(=O)CN)C(C)CC)CSSCC(C(NC(CO)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(=O)NC(CC=2C=CC(O)=CC=2)C(=O)NC(CSSCC(NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2C=CC(O)=CC=2)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(C)NC(=O)C(CCC(O)=O)NC(=O)C(C(C)C)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(CC=2NC=NC=2)NC(=O)C(CO)NC(=O)CNC2=O)C(=O)NCC(=O)NC(CCC(O)=O)C(=O)NC(CCCNC(N)=N)C(=O)NCC(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC=CC=3)C(=O)NC(CC=3C=CC(O)=CC=3)C(=O)NC(C(C)O)C(=O)N3C(CCC3)C(=O)NC(CCCCN)C(=O)NC(C)C(O)=O)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O)=O)NC(=O)C(C(C)CC)NC(=O)C(CO)NC(=O)C(C(C)O)NC(=O)C1CSSCC2NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(CCC(N)=O)NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)C(C)C)CC1=CN=CN1 NOESYZHRGYRDHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 210000001259 mesencephalon Anatomy 0.000 description 2
- 230000000394 mitotic effect Effects 0.000 description 2
- 230000004899 motility Effects 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 210000004498 neuroglial cell Anatomy 0.000 description 2
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 2
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 2
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 2
- 239000000137 peptide hydrolase inhibitor Substances 0.000 description 2
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 2
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 2
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 2
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 2
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 2
- 230000004224 protection Effects 0.000 description 2
- KIDHWZJUCRJVML-UHFFFAOYSA-N putrescine Chemical compound NCCCCN KIDHWZJUCRJVML-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 2
- 239000011535 reaction buffer Substances 0.000 description 2
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 2
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 2
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 239000013049 sediment Substances 0.000 description 2
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 2
- 210000002027 skeletal muscle Anatomy 0.000 description 2
- 210000000813 small intestine Anatomy 0.000 description 2
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 2
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 2
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 2
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 210000003523 substantia nigra Anatomy 0.000 description 2
- 230000002889 sympathetic effect Effects 0.000 description 2
- 238000010189 synthetic method Methods 0.000 description 2
- 210000002978 thoracic duct Anatomy 0.000 description 2
- 230000005026 transcription initiation Effects 0.000 description 2
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 2
- 238000010396 two-hybrid screening Methods 0.000 description 2
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 2
- 230000008673 vomiting Effects 0.000 description 2
- 238000005303 weighing Methods 0.000 description 2
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 1
- KPQFKCWYCKXXIP-XLPZGREQSA-N 1-[(2r,4s,5r)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-(methylamino)pyrimidine-2,4-dione Chemical compound O=C1NC(=O)C(NC)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 KPQFKCWYCKXXIP-XLPZGREQSA-N 0.000 description 1
- FMYBFLOWKQRBST-UHFFFAOYSA-N 2-[bis(carboxymethyl)amino]acetic acid;nickel Chemical compound [Ni].OC(=O)CN(CC(O)=O)CC(O)=O FMYBFLOWKQRBST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PMUNIMVZCACZBB-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxyethylazanium;chloride Chemical compound Cl.NCCO PMUNIMVZCACZBB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WOVKYSAHUYNSMH-RRKCRQDMSA-N 5-bromodeoxyuridine Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=O)C(Br)=C1 WOVKYSAHUYNSMH-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- RXGJTUSBYWCRBK-UHFFFAOYSA-M 5-methylphenazinium methyl sulfate Chemical compound COS([O-])(=O)=O.C1=CC=C2[N+](C)=C(C=CC=C3)C3=NC2=C1 RXGJTUSBYWCRBK-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 208000004998 Abdominal Pain Diseases 0.000 description 1
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- 108020004491 Antisense DNA Proteins 0.000 description 1
- 206010003011 Appendicitis Diseases 0.000 description 1
- 101100385565 Arabidopsis thaliana CTF7 gene Proteins 0.000 description 1
- 101710205806 Artemin Proteins 0.000 description 1
- 244000075850 Avena orientalis Species 0.000 description 1
- 235000007319 Avena orientalis Nutrition 0.000 description 1
- WOVKYSAHUYNSMH-UHFFFAOYSA-N BROMODEOXYURIDINE Natural products C1C(O)C(CO)OC1N1C(=O)NC(=O)C(Br)=C1 WOVKYSAHUYNSMH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 208000002881 Colic Diseases 0.000 description 1
- 206010009900 Colitis ulcerative Diseases 0.000 description 1
- 102000012422 Collagen Type I Human genes 0.000 description 1
- 108010022452 Collagen Type I Proteins 0.000 description 1
- 206010073207 Congenital intestinal obstruction Diseases 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 description 1
- 201000003066 Diffuse Scleroderma Diseases 0.000 description 1
- QXNVGIXVLWOKEQ-UHFFFAOYSA-N Disodium Chemical compound [Na][Na] QXNVGIXVLWOKEQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 1
- 101150010030 ECO1 gene Proteins 0.000 description 1
- 241000490229 Eucephalus Species 0.000 description 1
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 1
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- 102000034615 Glial cell line-derived neurotrophic factor Human genes 0.000 description 1
- 108091010837 Glial cell line-derived neurotrophic factor Proteins 0.000 description 1
- SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N Glutaraldehyde Chemical compound O=CCCCC=O SXRSQZLOMIGNAQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101000638044 Homo sapiens Neurogenic differentiation factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000634196 Homo sapiens Neurotrophin-3 Proteins 0.000 description 1
- 101000766306 Homo sapiens Serotransferrin Proteins 0.000 description 1
- 108090000144 Human Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003839 Human Proteins Human genes 0.000 description 1
- 206010020852 Hypertonia Diseases 0.000 description 1
- 206010062767 Hypophysitis Diseases 0.000 description 1
- 206010021333 Ileus paralytic Diseases 0.000 description 1
- 208000022559 Inflammatory bowel disease Diseases 0.000 description 1
- 102000004877 Insulin Human genes 0.000 description 1
- 108090001061 Insulin Proteins 0.000 description 1
- 108090000723 Insulin-Like Growth Factor I Proteins 0.000 description 1
- 102100037852 Insulin-like growth factor I Human genes 0.000 description 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 1
- 208000002720 Malnutrition Diseases 0.000 description 1
- 108010052285 Membrane Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000018697 Membrane Proteins Human genes 0.000 description 1
- 241000936077 Mogrus Species 0.000 description 1
- 102000016943 Muramidase Human genes 0.000 description 1
- 108010014251 Muramidase Proteins 0.000 description 1
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 1
- 101100059320 Mus musculus Ccdc85b gene Proteins 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 206010068871 Myotonic dystrophy Diseases 0.000 description 1
- 108010062010 N-Acetylmuramoyl-L-alanine Amidase Proteins 0.000 description 1
- 206010028813 Nausea Diseases 0.000 description 1
- 102000015336 Nerve Growth Factor Human genes 0.000 description 1
- 208000028389 Nerve injury Diseases 0.000 description 1
- 102100032063 Neurogenic differentiation factor 1 Human genes 0.000 description 1
- 206010029333 Neurosis Diseases 0.000 description 1
- 206010029350 Neurotoxicity Diseases 0.000 description 1
- 108091005461 Nucleic proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000016978 Orphan receptors Human genes 0.000 description 1
- 108070000031 Orphan receptors Proteins 0.000 description 1
- 238000009004 PCR Kit Methods 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 206010033963 Parathyroid tumour Diseases 0.000 description 1
- DPWPWRLQFGFJFI-UHFFFAOYSA-N Pargyline Chemical compound C#CCN(C)CC1=CC=CC=C1 DPWPWRLQFGFJFI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 1
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 1
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 1
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 1
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 1
- 102000001253 Protein Kinase Human genes 0.000 description 1
- 239000005700 Putrescine Substances 0.000 description 1
- 102000009572 RNA Polymerase II Human genes 0.000 description 1
- 108010009460 RNA Polymerase II Proteins 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 201000003604 Renal agenesis Diseases 0.000 description 1
- 206010064655 Renal aplasia Diseases 0.000 description 1
- 101001095983 Staphylococcus aureus Protein rep Proteins 0.000 description 1
- 201000009594 Systemic Scleroderma Diseases 0.000 description 1
- 206010042953 Systemic sclerosis Diseases 0.000 description 1
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 1
- 241000928104 Tetrias Species 0.000 description 1
- 206010044221 Toxic encephalopathy Diseases 0.000 description 1
- 239000007984 Tris EDTA buffer Substances 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- 201000006704 Ulcerative Colitis Diseases 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 1
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- 239000008351 acetate buffer Substances 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 1
- 230000010398 acute inflammatory response Effects 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 238000007605 air drying Methods 0.000 description 1
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminium Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 150000001450 anions Chemical class 0.000 description 1
- 208000022531 anorexia Diseases 0.000 description 1
- 230000003474 anti-emetic effect Effects 0.000 description 1
- 229940125683 antiemetic agent Drugs 0.000 description 1
- 239000002111 antiemetic agent Substances 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 239000003816 antisense DNA Substances 0.000 description 1
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 1
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 1
- 230000036528 appetite Effects 0.000 description 1
- 235000019789 appetite Nutrition 0.000 description 1
- 210000001188 articular cartilage Anatomy 0.000 description 1
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 description 1
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 230000037429 base substitution Effects 0.000 description 1
- 230000003542 behavioural effect Effects 0.000 description 1
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 230000006287 biotinylation Effects 0.000 description 1
- 238000007413 biotinylation Methods 0.000 description 1
- 230000008499 blood brain barrier function Effects 0.000 description 1
- 210000001218 blood-brain barrier Anatomy 0.000 description 1
- 210000005013 brain tissue Anatomy 0.000 description 1
- 239000007975 buffered saline Substances 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000022131 cell cycle Effects 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 230000003833 cell viability Effects 0.000 description 1
- 230000005889 cellular cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 210000003591 cerebellar nuclei Anatomy 0.000 description 1
- 230000003399 chemotactic effect Effects 0.000 description 1
- 238000003200 chromosome mapping Methods 0.000 description 1
- 238000011278 co-treatment Methods 0.000 description 1
- 229960003920 cocaine Drugs 0.000 description 1
- 201000010897 colon adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 239000003636 conditioned culture medium Substances 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002354 daily effect Effects 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 206010061428 decreased appetite Diseases 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 1
- 230000007850 degeneration Effects 0.000 description 1
- 230000018044 dehydration Effects 0.000 description 1
- 238000006297 dehydration reaction Methods 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 1
- 230000000741 diarrhetic effect Effects 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 230000001079 digestive effect Effects 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- BVTBRVFYZUCAKH-UHFFFAOYSA-L disodium selenite Chemical compound [Na+].[Na+].[O-][Se]([O-])=O BVTBRVFYZUCAKH-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 210000004002 dopaminergic cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000004064 dysfunction Effects 0.000 description 1
- 230000002500 effect on skin Effects 0.000 description 1
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 1
- 229940073579 ethanolamine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N ethidium bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 description 1
- 230000003203 everyday effect Effects 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 210000002950 fibroblast Anatomy 0.000 description 1
- 206010016766 flatulence Diseases 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 239000011888 foil Substances 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 1
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000011990 functional testing Methods 0.000 description 1
- 230000005989 gallbladder dysfunction Effects 0.000 description 1
- BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N gamma-aminobutyric acid Chemical compound NCCCC(O)=O BTCSSZJGUNDROE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000021302 gastroesophageal reflux disease Diseases 0.000 description 1
- 230000005176 gastrointestinal motility Effects 0.000 description 1
- 238000003209 gene knockout Methods 0.000 description 1
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000000227 grinding Methods 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 102000043827 human Smooth muscle Human genes 0.000 description 1
- 108700038605 human Smooth muscle Proteins 0.000 description 1
- 235000003642 hunger Nutrition 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002513 implantation Methods 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 230000036512 infertility Effects 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 229940125396 insulin Drugs 0.000 description 1
- 208000028774 intestinal disease Diseases 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- 230000031146 intracellular signal transduction Effects 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000007913 intrathecal administration Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 1
- 208000017169 kidney disease Diseases 0.000 description 1
- 201000006370 kidney failure Diseases 0.000 description 1
- 229940043355 kinase inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 238000011813 knockout mouse model Methods 0.000 description 1
- 238000011005 laboratory method Methods 0.000 description 1
- 210000002429 large intestine Anatomy 0.000 description 1
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 1
- 201000005296 lung carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000004325 lysozyme Substances 0.000 description 1
- 229960000274 lysozyme Drugs 0.000 description 1
- 235000010335 lysozyme Nutrition 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 230000001071 malnutrition Effects 0.000 description 1
- 235000000824 malnutrition Nutrition 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- OGFXBIXJCWAUCH-UHFFFAOYSA-N meso-secoisolariciresinol Natural products C1=2C=C(O)C(OC)=CC=2CC(CO)C(CO)C1C1=CC=C(O)C(OC)=C1 OGFXBIXJCWAUCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 230000002906 microbiologic effect Effects 0.000 description 1
- 230000005012 migration Effects 0.000 description 1
- 238000013508 migration Methods 0.000 description 1
- 230000002438 mitochondrial effect Effects 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N monoethanolamine hydrochloride Natural products NCCO HZAXFHJVJLSVMW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004660 morphological change Effects 0.000 description 1
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 1
- VMGAPWLDMVPYIA-HIDZBRGKSA-N n'-amino-n-iminomethanimidamide Chemical compound N\N=C\N=N VMGAPWLDMVPYIA-HIDZBRGKSA-N 0.000 description 1
- 230000008693 nausea Effects 0.000 description 1
- 230000008764 nerve damage Effects 0.000 description 1
- 229940053128 nerve growth factor Drugs 0.000 description 1
- 238000007857 nested PCR Methods 0.000 description 1
- 230000000626 neurodegenerative effect Effects 0.000 description 1
- 230000014511 neuron projection development Effects 0.000 description 1
- 230000004112 neuroprotection Effects 0.000 description 1
- 230000003018 neuroregenerative effect Effects 0.000 description 1
- 208000015238 neurotic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000007135 neurotoxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000228 neurotoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 1
- 238000010606 normalization Methods 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 208000015380 nutritional deficiency disease Diseases 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 229960003104 ornithine Drugs 0.000 description 1
- 229960001779 pargyline Drugs 0.000 description 1
- 239000013610 patient sample Substances 0.000 description 1
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 1
- 230000035515 penetration Effects 0.000 description 1
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 1
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 230000008855 peristalsis Effects 0.000 description 1
- 230000003285 pharmacodynamic effect Effects 0.000 description 1
- 208000028591 pheochromocytoma Diseases 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000035479 physiological effects, processes and functions Effects 0.000 description 1
- 210000003635 pituitary gland Anatomy 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 239000004417 polycarbonate Substances 0.000 description 1
- 229920000515 polycarbonate Polymers 0.000 description 1
- 108010040003 polyglutamine Proteins 0.000 description 1
- 229920000155 polyglutamine Polymers 0.000 description 1
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 1
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 1
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 1
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 1
- 230000016833 positive regulation of signal transduction Effects 0.000 description 1
- 230000029279 positive regulation of transcription, DNA-dependent Effects 0.000 description 1
- 230000002980 postoperative effect Effects 0.000 description 1
- 229940124606 potential therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 238000011533 pre-incubation Methods 0.000 description 1
- 230000002028 premature Effects 0.000 description 1
- 238000002203 pretreatment Methods 0.000 description 1
- 239000002987 primer (paints) Substances 0.000 description 1
- 108060006633 protein kinase Proteins 0.000 description 1
- 239000003909 protein kinase inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000004850 protein–protein interaction Effects 0.000 description 1
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 1
- XNSAINXGIQZQOO-SRVKXCTJSA-N protirelin Chemical compound NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H]1NC(=O)CC1)CC1=CN=CN1 XNSAINXGIQZQOO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 230000001107 psychogenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000012264 purified product Substances 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 238000003259 recombinant expression Methods 0.000 description 1
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 1
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 1
- 238000004153 renaturation Methods 0.000 description 1
- BOLDJAUMGUJJKM-LSDHHAIUSA-N renifolin D Natural products CC(=C)[C@@H]1Cc2c(O)c(O)ccc2[C@H]1CC(=O)c3ccc(O)cc3O BOLDJAUMGUJJKM-LSDHHAIUSA-N 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 1
- 108020004418 ribosomal RNA Proteins 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 230000036186 satiety Effects 0.000 description 1
- 235000019627 satiety Nutrition 0.000 description 1
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 201000009881 secretory diarrhea Diseases 0.000 description 1
- 210000000413 sensory ganglia Anatomy 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- BLFQGGGGFNSJKA-XHXSRVRCSA-N sertraline hydrochloride Chemical compound Cl.C1([C@@H]2CC[C@@H](C3=CC=CC=C32)NC)=CC=C(Cl)C(Cl)=C1 BLFQGGGGFNSJKA-XHXSRVRCSA-N 0.000 description 1
- 239000012679 serum free medium Substances 0.000 description 1
- 210000000329 smooth muscle myocyte Anatomy 0.000 description 1
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 1
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001509 sodium citrate Substances 0.000 description 1
- NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K sodium citrate Chemical compound O.O.[Na+].[Na+].[Na+].[O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O NLJMYIDDQXHKNR-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000001488 sodium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000162 sodium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 229960001471 sodium selenite Drugs 0.000 description 1
- 235000015921 sodium selenite Nutrition 0.000 description 1
- 239000011781 sodium selenite Substances 0.000 description 1
- 239000007909 solid dosage form Substances 0.000 description 1
- 238000000527 sonication Methods 0.000 description 1
- 210000000278 spinal cord Anatomy 0.000 description 1
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 1
- 108010068698 spleen exonuclease Proteins 0.000 description 1
- 206010041823 squamous cell carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 230000037351 starvation Effects 0.000 description 1
- 239000000021 stimulant Substances 0.000 description 1
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 238000011477 surgical intervention Methods 0.000 description 1
- 210000000331 sympathetic ganglia Anatomy 0.000 description 1
- 230000001360 synchronised effect Effects 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 1
- 210000001550 testis Anatomy 0.000 description 1
- 125000003831 tetrazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 238000009210 therapy by ultrasound Methods 0.000 description 1
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 1
- 210000001541 thymus gland Anatomy 0.000 description 1
- 238000002179 total cell area Methods 0.000 description 1
- 210000003437 trachea Anatomy 0.000 description 1
- 108091006106 transcriptional activators Proteins 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K trisodium phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[Na+].[O-]P([O-])([O-])=O RYFMWSXOAZQYPI-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 208000017997 tumor of parathyroid gland Diseases 0.000 description 1
- 125000001493 tyrosinyl group Chemical group [H]OC1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 210000003606 umbilical vein Anatomy 0.000 description 1
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 1
Landscapes
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
Опис винаходу
Даний винахід стосується нейротрофічного фактора та, зокрема, клонування та експресії нового члена 2 родини нейротрофічних факторів СОМЕ, який у даній заявці позначений як "еновін" (ЕММ).
Вступ
Нейротрофічні фактори втягнені у процеси диференціації, розвитку та підтримання діяльності нейронів. Ці білки можуть запобігати дегенерації та можуть сприяти виживанню різноманітних типів нейронних клітин і є, таким чином, потенційними терапевтичними агентами при лікуванні нейродегенеративних захворювань. 70 Нейротрофічний фактор, що походить від гліальної лінії клітин (ЗОМЕ), був першим членом підродини нейротрофічних факторів, що весь час збільшується, які структурно відрізняються від нейротрофінів. СООМЕ є представником трансформуючого ростового фактору Др (ТОБ-д) надродини ростових факторів, що характеризуються специфічною моделлю семи висококонсервативних цистеїнових залишків усередині амінокислотної послідовності (Кіпозіеу, 1994). (ЗОМЕ був спочатку очищений при використанні аналізу, що т грунтується на його здатності до підтримання виживання та функціонування ембріональних вентральних допамінергічних нейронів середнього мозку іп міо (Гіп еї аї., 1993). Інші типи нейронних клітин центральної (СМ5) або периферичної нервової систем (РМЗ) є також чутливими до впливу СООМЕ на процеси виживання
ІНепаегзоп еї аї.,, 1994, Виі-ВеМйо сеї аїЇ.,, 1995, Моипі еї аїЇ., 1995, Оррепіпейт сеї аї.,, 1995). СОМЕ продукується клітинами в неактивній проформі, яка розщеплюється специфічно у КХХК сайті впізнання фуріну для утворення активного (зрілого) ЗОМЕ |Сіп еї аІ., 1993). Екзогенне призначення ЗОМЕ демонструє потенційні нейропротективні ефекти на моделях тварин з хворобою Паркінсона, загальним нейродегенеративним розладом, що характеризується втратою більше 7095 допамінергічних клітин у чорній речовині мозку |Веск еї аї., 1995, Тотас еї аї., 1995, Саві еї аї., 1996, Споїі-І ипабего еї аї., 1997, Віїапо-Віенеї еї аї., 1997).
Нещодавно були відкриті додаткові нейротрофічні фактори родини ЗОМЕ. Неуртурін (МТМ) був очищений з с 29 умовного середовища, з культури клітин яєчника китайського хом'яка (СНО) при використанні методу, що Ге) грунтується на його здатності сприяти виживанню симпатичних нейронів у культурі (Кої26бацег еї аї., 19961.
Зрілий білок МТМ є на 5795 подібним до зрілого ОЗОМЕ. Персефін (РЗР) був відкритий шляхом клонування при використанні виродженого праймера ПЛР з геномною ДНК як шаблону. Зрілий РЗР, подібно до зрілого СООМЕ, сприяє виживанню вентральних допамінергічних нейронів середнього мозку та моторних нейронів у культурі сч
ІМІЇбгапай еї аї., 1998). Подібність зрілого білка РР до зрілого ООМЕ та МТМ складає приблизно 5095. Артемінй СУ (АКТМ) було відкрито шляхом дослідження бази даних ДНК, він є фактором виживання сенсорних та симпатичних нейронів у культурі ІВаїонй еї аї!., 199861. б
СОМЕ, МТМ, РОР та АКТМ вимагають гетеродимерного рецепторного комплексу для того, щоб виконувати со інтрацелюлярну сигнальну трансдукцію у прямому напрямку. СООМЕ зв'язується з субодиницею рецептора альфа 1 родини СОМЕ (СЕКо-1; СЕКо Комітет з номенклатури, 1997), (глікозил-РідІп5), зв'язаного з т глікозил-фосфатидил-інозітолом білка мембрани ЮМіпод еї аїЇ.,, 1996, Тгеапог еї аїЇ.,, 1996, Запісоїа еї аї., 1997). СОМЕКЗЕКоУ-1 комплекс далі зв'язується та активує СКЕТ протоонкоген, тирозин кіназу, зв'язану з мембраною |Ригрес еї а!., 1996, Тгирр еї а!., 1996), що приводить до фосфорилювання залишків тирозину у СКЕТ « 20 та подальшої активації шляхів сигнальної трансдукції у прямому напрямку |МУогру еї аї., 1996). Було -в охарактеризовано декілька інших членів родини СЕКо, рецепторів, що зв'язують ліганд ІВаїой еї аї., 1997, с запісоїа еї аї., 1997, КіІеїп еї аї!., 1997, Ви)-Веїо еї аЇ., 1997, Зумапо еї аі., 1997). СЕКо-2 та СЕКое-З Міпд еї :з» аі,, 1997, Мазиге еї аїЇ., 1998, МУору еї аїЇ.,, 1998, Мамейнат еї аїЇ.,, 1998, Ваюй еї аї., 1998а)| були ідентифіковані різними групами вчених. СОЕКо-1 та СЕКо-2 широко експресуються майже в усіх тканинах, та їх експресія може регулюватись на різних етапах розвитку |Запісоїа е! а!., 1997, УуідепгаїК еї а!., 1997). -І СЕКо-3 не експресується у центральній нервовій системі, що розвивається, або у центральній нервовій системі дорослого, але він інтенсивно експресується у декількох сенсорних та симпатичних гангліях о периферичної нервової системи, що розвиваються, або нервовій системі дорослого |МУідепіаї!кК еї аї., 1998, (Се) Мамеїйап еї а/!., 1998, Ван еї а/!., 1998а). Четвертий представник родини, СЕКо-4, був клонований з кДНК курки юю 5оОо |Потвгоп еї аї., 1998). бЕКа-1 є рецептором для ЗОМЕ, якому надається перевага, у той час як ОЕК 9-2 переважно зв'язується з МТМ |іпо еї аї., 1996, Тгеапог еї аї!., 1996, Кіеїп еї аі!., 1997). Курячий СЕК 7-4 утворює
Із функціональний рецепторний комплекс для РОР у комбінації з СКЕТ (ЕпокКідо еї аї!., 1998). Було показано, що клітини, які експресують як СЕК 9-3, так і СКЕТ, не відповідають ні ОЮОМЕ, ні МТМ, ні РР |(МУогбру еї аї., 1998,
Ван еї аї!., 199в8а). Нещодавно було показано, що АКТ посилає сигнал за допомогою СКЕТ, використовуючи СЗЕКо-3 як ліганд-зв'язуючий рецептор, якому надається перевага |Ваїй еї аї!., 19985). Взаємозв'язок між
ГФ) нейротрофічними факторами та СЕКо, можливий в умовах іп міго, так ЗОМЕ може зв'язуватись з ОЕКо-2 або
СЕКо-3 у присутності СКЕТ (|Запісоїа еї а|І., 1997, Тгирр еї аїЇ., 1998), а МТМ може зв'язуватись з ОЕК 9-1 з по низькою спорідненістю (КіІеїп еї аі., 1997). Таким чином, ЗОМЕ, МТМ, РЗР та АКТ є частиною нейротрофічної сигнальної системи, в якій різні ліганд-зв'язуючі субодиниці (ЗЕК 9-1 до -4) можуть знаходитись у взаємодії з бо тією самою тирозин-кіназною субодиницею (СКЕТ). Фізіологічне значення цих відкриттів, зроблених іп мікго, було нещодавно підтверджене у дослідженнях генних кноккоутів хогляд Козепіаї, 19991ї, що яскраво свідчить про те, що СОМЕ взаємодіє з ЗЕКо-1 іп мімо, у той час, як МТМ є лігандом для СЕКо-2, якому надається перевага.
Автори даного винаходу ідентифікували, клонували, експресували, показали хромосомну локалізацію та б охарактеризували еновін (ЕММ), четвертого представника родини СОМЕ. Знання про зрілий ЕММ білок було розширене завдяки відкриттю різних фукціональних та нефункціональних сплайсерних варіантів мРНК. Крім того,
ми представляємо дані стосовно експресії, зв'язування ЕММ з СОЕКо-3 та впливу ЕММ на ріст нейритів в умовах іп мйго та захист від індукованої таксолом нейротоксичності у стауроспорін-диференційованих ЗН-5У5У культурах клітин нейробластоми людини.
У даній заявці описана молекула нуклеїнової кислоти, що кодує новий людський нейротрофічний ростовий фактор, "еновін", експресійний вектор, що включає вказану молекулу нуклеїнової кислоти, хазяйська клітина, трансформована вказаним вектором, нейротрофічний ростовий фактор, що кодується вказаною молекулою нуклеїнової кислоти, ізольований еновін, сполуки, які діють як агоністи або антагоністи еновіну та фармацевтичні композиції, що містять нуклеїнову кислоту або білок еновіну або агоністи або антагоністи 7/0 останнього.
Згідно з першим аспектом даного винаходу він забезпечує молекулу нуклеїнової кислоти, яка кодує нейротрофічний ростовий фактор людини, позначений тут як еновін, що має амінокислотну послідовність, показану на Фігурі 21, або кодує функціональний еквівалент, похідну або біопопередник вказаного ростового фактору. Бажано, щоб вказана молекула нуклеїнової кислоти представляла собою ДНК, або навіть більш бажано 75 - молекулу КДНК.
Бажано, щоб нуклеїнова кислота згідно з винаходом включала послідовність від 81 до 419 позиції послідовності, представленої на Фігурі 1, більш бажано від 81 до 422 позиції, та більш бажано повну послідовність, представлену на Фігурі 1.
Передбачається, що молекула нуклеїнової кислоти від 81 до 419 позиції кодує послідовність зрілого білка го еновіну, одержаного після процесування проформи білка у ЕХХК процесуючому сайті, який присутній у стабільній проформі вказаного білка еновіну.
Винахід також забезпечує антисмислову молекулу, здатну до гібридизації з будь-якою послідовністю нуклеїнової кислоти згідно з даним винаходом, в умовах суворої жорсткості, що добре відомо спеціалісту у даній галузі. с
Жорсткість гібридизації у контексті даної заявки належить до умов, при яких полінуклеїнові кислоти є стабільними. Стабільність гібридів знаходить своє відображення у температурі плавлення (ТУ) гібридів. тя може о бути приблизно обчислена за такою формулою: 81,520-16,6(Іо910|Ма "140,41(900585С)-600/, в якій І представляє собою довжину гібридів у нуклеотидах. Тл зменшується приблизно на 1-1,590 з кожним С 195 зменшення гомології послідовності. сч
Бажано, щоб молекулу нуклеїнової кислоти згідно з винаходом можна було використовувати для експресії нейротрофічного ростового фактору людини згідно з винаходом, у хазяйській клітині тощо, при використанні Ге) придатного експресійного вектора. со
Експресійний вектор згідно з винаходом включає вектори, здатні до експресії ДНК, яка оперативно зв'язана з регуляторними послідовностями, такими як промоторні ділянки, що здатні впливати на експресію таких - фрагментів ДНК.
Регуляторні елементи, що необхідні для експресії, включають промоторні послідовності для зв'язування з
РНК-полімеразою та послідовності ініціації транскрипції для зв'язування з рибосомою. Наприклад, бактеріальний « експресійний вектор може включати промотор, такий як Іас-промотор та послідовність Шайно-Далгарно для ініціації транскрипції та стартовий кодон АОС. Подібно до цього, еукаріотичний експресійний вектор може - с включати гетерологічний або гомологічний промотор для РНК-полімерази ІІ, розміщений нижче сигнал и поліаденілування, стартовий кодон АОС, та кодон термінації для відокремлення від рибосоми. Такі вектори ,» можуть бути одержані комерційно або сконструйовані з описаних послідовностей методами, що добре знайомі у даній галузі.
Таким чином, експресійний вектор відноситься до рекомбінантної конструкції ДНК або РНК, такої як -і плазміда, фаг, рекомбінантний вірус або інший вектор, який після вбудовування у придатну хазяйську клітину сю приводить до експресії фрагментів ДНК або РНК. Придатні експресійні вектори добре знайомі спеціалістам у даній галузі та включають такі, що здатні до реплікації в еукаріотичних клітинах та/або прокаріотичних (се) клітинах та такі, що залишаються епісомальними, або такі, що вбудовуються в геном хазяйської клітини. 7 50 Антисмислова молекула, здатна до гібридизації з нуклеїновою кислотою згідно з даним винаходом, може бути використана як проба, або як ліки, або у фармацевтичній композиції. що) Молекули нуклеїнової кислоти згідно з даним винаходом можуть бути вбудовані в описані вектори в антисмисловій орієнтації для того, щоб забезпечити утворення антисмислової РНК. Антисмислова РНК або інші антисмислові нуклеїнові кислоти можуть бути одержані синтетичним методом.
Інший аспект даного винаходу включає хазяйську клітину, трансформовану, трансфіковану або інфіковану о експресійним вектором згідно з даним винаходом, бажано, щоб така клітина була еукаріотичною клітиною, та найбільш бажано - клітиною ссавця. іме) Вбудовування клонованої ДНК у прийнятний експресійний вектор для подальшої трансформації вказаної клітини та подальшої селекції трансформованих клітин добре відоме спеціалісту у даній галузі, як це описано у 60 |Затьгоок еї а/., (1989) Моіесшіаг Сіопіпоу, А Гарогагу Мапиаї, Соїа Зргіпуд Нагроиг І арогаюгу Ргеззі.
Ще один аспект даного винаходу включає молекулу нуклеїнової кислоти, що має, принаймі, 15 нуклеотидів молекули нуклеїнової кислоти згідно з даним винаходом, більш бажано від 15 до 50 нуклеотидів.
Такі послідовності можуть переважно використовуватись як проби або праймери для ініціації реплікації тощо. Такі молекули нуклеїнової кислоти можуть бути одержані згідно з методами, що добре відомі у даній 65 галузі такими як рекомбінантний або синтетичний методи. Вони можуть також використовуватись у діагностичних наборах чи пристроях або для методів визначення присутності нуклеїнової кислоти згідно з даним винаходом. Такі тести взагалі включають контакт проби зі зразком в умовах гібридизації та визначення присутності будь-якого подвійного утворення між пробою та будь-якою нуклеїновою кислотою у зразку.
Згідно з даним винаходом такі проби можуть бути прикріплені до твердої основи. Бажано, щоб вони були присутніми на основі у великій кількості так, щоб зразки мали змогу багатократно гібридизуватись з одним біологічним зразком. Проби можуть бути нанесені на основу або синтезуватись іп зіш на основі. Див. Іоснагі еї аїЇ., Маїшге Віоїесппоіоду, мої. 14, ЮОесетрег 1996 "Експресійний моніторінг шляхом гібридизації в олігонуклеотидних конструкціях високої щільності"|!. Одна конструкція може містити більше 100, 500 або навіть 1,000 різних проб у дискретних положеннях. 70 Молекули нуклеїнової кислоти згідно з даним винаходом можуть також бути одержані при використанні рекомбінантних та синтетичних методів, таких як, наприклад, використання методу ПЛР клонування, що загалом передбачає створення пари праймерів, які можуть мати розмір приблизно 10-50 нуклеотидів до ділянки гена, яка є бажаною для клонування, переведення праймерів у контакт з МРНК, кКДНК або геномною ДНК з людської клітини, проведення полімеразної ланцюгової реакції в умовах, які викликають ампліфікацію бажаної ділянки, 7/5 ізоляцію ампліфікованої ділянки або фрагменту та відновлення ампліфікованої ДНК. У загальних рисах такі методики, як зазначено вище, описані у |(Затргоок еї а!., (МоіІесшаг Сіопіпо, А І арогаїогу Мапиаї, 1989)|.
Нуклеїнові кислоти або олігонуклеотиди згідно з даним винаходом можуть нести мітку, що дає змогу їх виявляти. Прийнятні мітки включають радіоізотопи, такі як З2Р або 355, ферментні мітки або інші білкові мітки, такі як біотин або флуоресцентні маркери. Такі мітки можуть додаватись до нуклеїнових кислот або олігонуклеотидів згідно з винаходом та можуть виявлятись відомими методами рег зе.
Бажано, щоб людські алельні варіанти або поліморфізм молекули ДНК згідно з винаходом могли ідентифікуватись шляхом, наприклад, тестування кКДНК або геномних бібліотек з широкого інтервалу різних індивідуальних організмів, наприклад, з різних популяцій. Крім того, нуклеїнові кислоти та проби згідно з даним винаходом можуть використовуватись для секвенування геномної ДНК пацієнтів при використанні Га методів, добре знайомих у даній галузі, таких як Запдег метод дідеокси термінації ланцюга, який може переважно визначати будь-яку схильність пацієнта до певних розладів, асоційованих з ростовим фактором і) згідно з даним винаходом.
Даним винаходом забезпечується також трансгенна клітина, тканина або організм, що включає трансген, здатний до експресії людського нейротрофічного фактора еновіну згідно з даним винаходом. Ге
Термін "трансген, здатний до експресії" як такий, що використовується у даній заявці, означає прийнятну послідовність нуклеїнової кислоти, яка веде до експресії нейротрофічного фактору, що має такі самі функції с та/або активність, що і нейротрофічний фактор, згідно з даним винаходом. Трансген може включати, наприклад, Ге»! геномну нуклеїнову кислоту, ізольовану з клітин людини або синтетичну нуклеїнову кислоту, включаючи кДНК, інтегровану у хромосому або таку, що знаходиться у позахромосомному стані. о
Бажано, щоб трансген включав вектор згідно з даним винаходом, такий вектор містить молекулу нуклеїнової з кислоти, що кодує вказаний нейротрофічний фактор, або функціональний фрагмент вказаної молекули нуклеїнової кислоти. Термін "функціональний фрагмент" вказаної молекули може використовуватись для позначення фрагменту гена або кКДНК, що кодує вказаний нейротрофічний фактор або функціональний фрагмент « останнього, такий фрагмент здатний експресуватись для утворення функціонального нейротрофічного ростового фактора згідно з даним винаходом. Таким чином, наприклад, фрагменти нейротрофічного ростового фактора й) с згідно з винаходом, які відповідають специфічним амінокислотним залишкам, що взаємодіють з відповідним й рецептором, також утворюють частину даного винаходу, такі фрагменти можуть служити як агоністи, що "» активують відповідний рецептор ростового фактора згідно з даним винаходом так, що виявляють вплив на покращення росту та підтримання виживання клітин. Цей аспект винаходу також включає диференційно сплайсовані ізоформи та транскрипційні старти нуклеїнової кислоти згідно з винаходом. -І Згідно з даним винаходом вказана нуклеїнова кислота включає не тільки ідентичну нуклеїнову кислоту, але також будь-які мінорні варіації основ, що передбачають, зокрема, заміни в основах, що приводять до
Мамі синонимічного кодону (інший кодон, що кодує той самий амінокислотний залишок) завдяки виродженості коду у (Се) консервативних амінокислотних замінах. Термін "молекула нуклеїнової кислоти" також включає комплементарну будь-якому одному ланцюгу послідовність, наведену з врахуванням варіацій основ. ді Згідно ще з одним аспектом даний винахід забезпечує ізольований нейротрофічний ростовий фактор
Кз людини, що кодується молекулою нуклеїнової кислоти, як визначено у даній заявці. Бажано, щоб ростовий фактор включав амінокислотну послідовність від позиції 27 до позиції 139 амінокислотної послідовності, що представлена на Фігурі 1, або функціональний еквівалент, похідну або біопопередник останньої. "Функціональний еквівалент", як визначається у даній заявці, може використовуватись для позначення ростового фактору, який демонструє усі ростові властивості та функціональність, асоційовану з ростовим
Ф, фактором еновіном. Термін "похідна" еновіну, як визначається у даній заявці, використовується для визначення ко поліпептиду, в якому певні амінокислоти змінені, або ділетовані, або замінені іншими амінокислотами, при цьому цей поліпептид зберігає біологічну активність еновіну та/або цей поліпептид може реагувати з бо антитілами, одержаними при використанні еновіну згідно з даним винаходом як антигену, що викликає їх утворення.
Даний винахід охоплює також гібриди та модифіковані форми еновіну, включаючи злиті білки та фрагменти.
Гібридні та модифіковані форми включають, наприклад, випадки, коли певні амінокислоти піддають деяким модифікаціям або замінам, наприклад, шляхом точкової мутації, таким, що приводять до утворення білка, що 65 Зберігає біологічну активність еновіну згідно з винаходом. Специфічні послідовності нуклеїнової кислоти можуть бути змінені спеціалістами у даній галузі для створення ростового фактору, що демонструє такі самі або суттєво такі самі властивості еновіну.
Як добре відомо у даній галузі, багато білків утворюються іп мімо з (пре) сигнальною послідовностю на
М-термінальному кінці білка. Крім того, такі білюим можуть включати також про- послідовності, що утворюють стабільний попередник зрілого білка. Такі пре- та про- послідовності взагалі не є необхідними для біологічної активності. Молекула еновіну згідно з даним винаходом включає не тільки послідовність повної довжини, показану на Фігурі 21, але також послідовність від положення 27 до положення 139, що йде за КЕХХК протеолітичним процесуючим сайтом, присутнім у ростових факторах цього типу та які, як вважають є зрілою послідовністю еновіну. 70 Визначений білок, поліпептид або амінокислотна послідовність згідно з винаходом включає не тільки ідентичну амінокислотну послідовність, але також ізомери останньої у доповнення до мінорних варіацій амінокислот природної амінокислотної послідовності, включаючи консервативні амінокислотні заміни (заміна амінокислотою, що є спорідненою з нею своїм бічним ланцюгом). Такий білок також включає амінокислотні послідовності, які відрізняються від природної амінокислотної послідовності у поліпептиді, що є імунологічно /5 ідентичним або подібним до поліпептиду, що кодується одержаною з природи послідовністю.
Білки або поліпептиди згідно з винаходом також передбачають варіації таких послідовностей, включаючи природно одержані алельні варіанти, які є суттєво гомологічними вказаним білкам або поліпептидам. У цьому контексті, суттєва гомологія розглядається як послідовність, яка має, принаймі, 7095, бажано 8095, 9095 або 95906-ну амінокислотну гомологію з білками або поліпептидами, що кодуються молекулами нуклеїнової кислоти
Згідно з даним винаходом.
Нейротрофічні ростові фактори, що експресуються хазяйськими клітинами згідно з винаходом, також охоплюються даним винаходом.
Даний винахід також спрямовано на інгібування нейротрофічного ростового фактора згідно з винаходом іп мімо при використанні антисмислової технології. Антисмислова технологія може використовуватись для сч об Контролю генної експресії через конструкцію потрійної спіралі або антисмислової ДНК або РНК, кожний з цих методів грунтується на зв'язуванні полінуклеотиду з ДНК або РНК. Наприклад, частина послідовності ДНК, що і) кодує зрілий білок згідно з даним винаходом, використовується для визначення антисмислового олігонуклеотиду
РНК довжиною від 10 до 50 пар основ. ДНК олігонуклеотид призначений бути комплементарним до ділянки гена, що втягнений у транскрипцію (потрійна спіраль - див. ее еї а). Мисі. Асіав. Кевз., 6: 3073 (1979); Соопеу еї с зо аі, Зсіепсе, 241: 456 (1988); ЮОегумап сеї аїЇ.,, Зсіепсе, 251: 1360 (1991)) таким чином, запобігаючи транскрипції та утворенню еновіну. Антисмисловий олігонуклеотид РНК гібридизується з мРНК іп мімо та блокує с трансляцію молекули мРНК в еновін. Ге!
Оскільки існує подібність послідовностей ростового фактору, описаного у даній заявці, і раніше ідентифікованих ростових факторів родини СОМЕ, еновін, як очікується, також буде здатним до покращення ме)
З5 Виживання клітин та їх росту при лікуванні розладів, що призводять до дефектів у функціонуванні або експресії ї- вказаного нейротрофічного фактора.
Молекули нуклеїнової кислоти або нейротрофічний фактор згідно з даним винаходом можуть, таким чином, використовуватись для лікування або запобігання нервових розладів у суб'єкта шляхом призначення вказаному суб'єкту певної кількості молекули нуклеїнової кислоти або ростового фактора згідно з даним винаходом у « достатній концентрації для того, щоб усунути або послабити симптоми вказаного розладу. Таким чином, в с молекули нуклеїнової кислоти згідно з винаходом можуть використовуватись для покращення процесу підтримання росту та виживання нервових клітин та для лікування нервових розладів або нейродегенеративних ;» симптомів, включаючи хворобу Паркінсона, хворобу Альцгеймера, периферичну нейропатію, аміотрофічний латеральний склероз, периферичні та центральні нервові травми або пошкодженя дією нейротоксинів.
Нейротрофічний ростовий фактор згідно з даним винаходом досліджували для того, щоб підтвердити -І нейротрофічний або нейропротективний впливи на нейронні клітини або популяцію клітин, зокрема, ті нейронні клітини або клітинні популяції, що були індуковані для піддання апопоптозу. Відповідно до цього нуклеїнова о кислота або ростовий фактор еновін згідно з даним винаходом можуть додатково використовуватись при со лікування нейродегенеративних розладів, таких як удари, хвороба Хантінгдона, периферична невропатія, гостре 5р пошкодження мозку, пухлини нервової системи, розсіяний склероз, аміотрофічний латеральний склероз, о периферична нервова травма, пошкодження від впливу нейротоксинів, розсіянна ендокринна неоплазія, сімейна
Ге хвороба Хіршспрунга, захворювання, асоційовані з Пріоном, хвороба Крейцфельда-Якобса, шляхом призначення пацієнту, що потребує цього, певної кількості вказаної нуклеїнової кислоти або еновіну у достатній концентрації для того, щоб знищити або попередити симптоми нервових розладів, описаних у даній ов Заявці.
Крім того, як буде описано в усіх деталях у прикладі нижче, було показано, що еновін прискорює
Ф) відновлення індукованого сенсорного дефіциту, що дає змогу ідентифікувати еновін як кандидата для лікування ка або полегшення больових синдромів з периферичним або центральним нейрогенним компонентом, ревматичних/запальних захворювань, порушення поведінки шляхом призначення пацієнту, що потребує цього, во достатньої кількості для зникнення або запобігання симптомів цих розладів.
Альтернативний метод лікування нервових розладів, описаних вище, передбачає імплантацію цільових клітин, що експресують нейротрофічний ростовий фактор згідно з винаходом, таких, як наприклад, трансгенні клітини, описані у даній заявці.
Молекули нуклеїнової кислоти та нейротрофічний ростовий фактор згідно з винаходом можуть також бути 65 включені у фармацевтичні композиції разом з фармацевтично прийнятним носієм, розріджувачем або наповнювачем для останнього.
Антитіла до нейротрофічного фактора згідно з даним винаходом можуть, переважно, готуватись шляхом методів, які відомі у даній галузі. Наприклад, поліклональні антитіла можуть бути приготовані шляхом інокуляції хазяйського тваринного організму, такого, як миша, за допомогою ростового фактора або епітопа останнього, та одержання імуної сироватки. Моноклональні антитіла можуть бути приготовані згідно з відомими методами, такими як описані (Копіег К. та Міївівїп С, Майге (1975) 256, 495-497).
Антитіла згідно з винаходом можуть використовуватись у методі для визначення присутності ростового фактора згідно з винаходом, такий метод передбачає контакт антитіла зі зразком та ідентифікацію будь-якого білка, що зв'язується з вказаним антитілом. Винахід також стосується набору для забезпечення проведення /о вказаного методу, який включає антитіло згідно з винаходом та служить для проведення реакції антитіла з вказаним зразком.
Даний винахід також забезпечує набір або пристрій для визначення присутності нейротрофічного ростового фактора згідно з винаходом у зразку, що містить антитіло, яке описане вище, та служить для проведення реакції вказаного антитіла та вказаного зразка.
Білки, які взаємодіють з нейротрофічним фактором згідно з даним винаходом, таким, як наприклад, клітинний рецептор, що йому відповідає, можуть бути ідентифіковані шляхом дослідження білок-білкових взаємодій, при використанні двох-гібридної векторної системи, що добре відома спеціалістам з молекулярної біології (Гіеїд5 8
Зопа, Маїшге 340: 245 1989). Цей метод грунтується на функціональній перебудові іп мімо фактора транскрипції, який активує репортерний ген. Зокрема, метод передбачає забезпечення прийнятної хазяйської клітини з Конструкцією ДНК, що містить репортерний ген під контролем промотора, який регулюється транскрипційним фактором, що має ДНК-зв'язуючий домен та активуючий домен, експресуючи у хазяйській клітині першу гібридну послідовність ДНК, яка кодує злиття фрагменту, усієї послідовності нуклеїнової кислоти згідно з винаходом, або вказаного ДНК-зв'язуючого домену, або вказаного активуючого домену фактора транскрипції, що експресує у хазяйській клітині, принаймі, одну з двох гібридних послідовностей ДНК, таку як бібліотека тощо, яка кодує с ов Ппутативні зв'язуючі білки, що досліджуються разом з ДНК-зв'язуючим або активуючим доменами фактора транскрипції, який не є вбудованим у першу злиту послідовність; визначення та зв'язування білків, що і) досліджуються, з білком згідно з даним винаходом шляхом визначення присутності будь-якого продукта репортерного гена у хазяйській клітині; необов'язкову ізоляцію другої гібридної послідовності ДНК, що кодує зв'язуючий білок. с зо Прикладом такого методу може бути метод на основі утилізації СЗА/4 білка у дріжджах. САЇ4 є транскрипційним активатором метаболізму галактози у дріжджах та має окремий домен для зв'язування з с активаторами вище від генів метаболізму галактози, а також від білок-зв'язуючого домену. Можуть бути Ге! сконструйовані нуклеотидні вектори, один з них включає залишки нуклеотидів, що кодують ДНК-зв'язуючий домен СА 4. Ці залишки зв'язуючого домену можуть бути злиті з відомою послідовністю, що кодує білок, такою і) з5 як наприклад, нуклеїнові кислоти згідно з даним винаходом. Інший вектор включає залишки, що кодують ча білок-зв'язуючий домен СА 4. Ці залишки зливають із залишками, що кодують тестовий білок, бажано з шляху сигнальної трансдукції хребетних. Будь-яка взаємодія між нейротрофічним фактором, що кодується нуклеїновою кислотою згідно з винаходом, та білком, який визначають, веде до транскрипційної активації репортерної молекули у клітині дріжджів, дефектній по транскрипції ЗА! -4, в яку трансформують вектор. Бажано, щоб « репортерна молекула, така як р-галактозидаза, активувалась при відновленні транскрипції генів метаболізму пт») с галактози дріжджів. й Рецептор для еновіну був ідентифікований авторами даного винаходу як СЕК 43. Таким чином, можуть бути "» проведені аналізи для ідентифікації агоністичних або антагоністичних сполук еновіну. Такий аналіз може також використовуватись у сукупності з іншими нейротрофічними факторами росту та їх відповідними рецепторами.
Сполуки, що ідентифікуються, можуть використовуватись для лікування або запобігання розладів, таких як -І хвороба Паркінсона, хвороба Альцгеймера, нейронні розлади, асоційовані з розширеними послідовностями поліглутаміну, такими як хвороба Хантінгдона, периферична невропатія, гостра травма мозку, пухлини нервової о системи, розсіяний склероз, аміотрофічний латеральний склероз, периферична нервова травма або (Се) пошкодження від впливу нейротоксинів, розсіяна ендокринна неоплазія та сімейна хвороба Хіршспрунга, хвороби, асоційовані з Пріоном, хвороба Крейцфельда-Якобса, удар, больові синдроми зі суттєво о периферичним або центральним нейрогенним компонентом, ревматичні/запальні хвороби, а також для
ІЗ запобігання порушень шляхом призначення пацієнту певної кількості вказаного агоністу або антагоністу у достатній концентрації для запобігання або лікування вказаних нервових розладів. Такі сполуки можуть також включатись у фармацевтичні композиції разом з прийнятним носієм, розріджувачем або наповнювачем останнього.
Агоністи або антагоністи фактора росту (такого як, наприклад, еновін) можуть бути ідентифіковані в одному і) втіленні даного винаходу шляхом приведення у контакт клітин тканини або організму, що експресує прийнятний ко рецептор, та СКЕТ зі сполукою, у якої очікуюють виявити таку активність, у присутності ростового фактора та порівняння рівнів активації КЕТ у вказаній клітині, тканині або організмі з контролем, який не був приведений бо У контакт з вказаною сполукою, що є кандидатом на виявлення такої активності.
Альтернативне втілення даного винаходу передбачає спосіб ідентифікації агоністів або антагоністів нейротрофічного ростового фактора, вказаний метод передбачає приведення у контакт клітини, тканини або організму, що експресує прийнятний рецептор вказаного ростового фактора, та СКЕТ зі сполукою, що є кандидатом на виявлення такої активності, у присутності вказаного ростового фактора, вимірювання рівня 65 активації сигнальної кінази у шляху сигнальної трансдукції, компонентом якої є вказаний прийнятний рецептор, наступне додання антитіла, специфічного до вказаної сигнальної кінази, що кон'югована з репортерною молекулою, порівняння з клітиною, тканиною або організмом, який не було приведено у контакт з вказаною сполукою.
Ще один аспект винаходу передбачає використання сполуки, що була ідентифікована як антагоніст згідно з винаходом для виробництва медикаментів для лікування шлунково-кишкових захворювань або симптомів, що опосередковані збільшенням перистальтичного руху кишечника.
Сполуки, ідентифіковані у аналізах згідно з даним винаходом, можуть переважно використовуватись для покращення шлунково-кишкової рухливості і, таким чином, можуть бути корисними при лікуванні симптомів, пов'язаних з гальмуванням або пошкодженням проходження через шлунково-кишковий тракт. 70 Таким чином, такі сполуки можуть бути корисними у лікуванні теплокровних тварин, включаючи людину, що страждають на симптоми, пов'язані з пошкодженням або гальмуванням випорожнення шлунку або більш загально, що страждають від симптомів, пов'язаних з пошкодженням або гальмуванням проходження через шлунково-кишковий тракт. Таким чином, спосіб лікування забезпечує полегшення для пацієнтів з симптомами, такими як, наприклад, гастроезофагальний рефлюкс, диспепсія, гастропарез, після-операційний ілеус, кишкова /5 псевдо-обструкція.
Диспепсія є пошкодженням функції перетравлювання, що виникає як симптом первинної шлунково-кишкової дисфункції, особливо шлунково-кишкової дисфункції, пов'язаної зі збільшенням м'язового тонусу або як ускладнення, що виникає на основі інших розладів, таких як апендицит, порушення функції жовчного міхура або недоїдання. Диспептичними симптомами є, наприклад, відсутність апетиту, відчуття переповнення, передчасна 2о насиченість, нудота, блювання та метеоризм.
Гастропарези можуть бути викликані ненормальністю у шлунку або як ускладнення хвороб, таких як діабети, прогресуючий системний склероз, анорексія, невроз та міотонічна дистрофія.
Пост-оперативний ілеус є обструкцією або кінетичним розладом у кишечнику, що виникає на основі порушення м'язового тонусу, що спричинений хірургічним втручанням. с
Псевдорозлади кишечника є симптомом, що характеризується запором, коліковою біллю та блюванням, але без видимого фізичного пошкодження. і)
Сполуки згідно з винаходом можуть, таким чином, використовуватись для того, щоб або позбавитись актуальної причини симптому, або для того, щоб полегшити симптоми.
Крім того, деякі сполуки, що є стимуляторами кінетичної активності ободової кишки, можуть бути корисними с
Зо для нормалізації або покращення проходження крізь кишковий тракт у суб'єктів, що страждають на симптоми, пов'язані з порушеням рухливості, тобто зменшенням перистальтики тонкого та товстого кишечника як такого с або у поєднанні з порушенням випорожнення шлунку. б
З огляду на використання сполук згідно з даним винаходом, для покращення кінетичних характеристик ободової кишки даний винахід забезпечує спосіб лікування теплокровних тварин, включаючи людину, що о з5 страждають на розлади рухливості кишкової системи, такі як, наприклад, запор, псевдообструкція, кишкова ча атонія, постоперативна кишкова атонія, синдром підвищеної кишкової подразливості (ІВ5) та затримання проходження їжі через шлунково-кишковий тракт, індуковане ліками.
Сполуки, ідентифіковані як антагоністи у аналізах згідно з даним винаходом, можуть також знайти потенціальне використання при лікуванні або профілактиці шлунково-кишкових симптомів, що походять від « Збільшеного перистальтичного руху у кишечнику, таких як діарея (включаючи секреторну діарею, бактеріально в с індуковану діарею, жовчну діарею, пронос з несподіваним початком, що специфічно виникає у мандрівників, та . психогенна діарея), хвороба Крона, спастична ободова кишка (ІВ5), діареяпредомінантний синдром кишкової а подразливості, шлунково-кишкова гіперчутливість. З огляду на використання сполук згідно з даним винаходом випливає, що даний винахід також забезпечує спосіб лікування теплокровних тварин, включаючи людину, що страждають на шлунко-кишкові симптоми, такі як синдром підвищеної подразливості кишечника (ІВ5), особливо -І діарейні аспекти ІВ5. Тому забезпечується спосіб лікування пацієнтів, що страждають на такі симптоми, як синдром підвищеної подразливості кишечника (ІВ5), діареяпредомінантний синдром підвищеної подразливості о кишечника, кишкова гіперчутливість та зняття болю, асоційованого з шлунково-кишковою гіперчутливістю. со Вказані сполуки можуть також знайти потенціальне використання при інших шлунково-кишкових розладах, бор таких як ті, що асоційовані з рухливістю верхнього відділу кишечника, як протиблювотні препарати для о лікування блювання, а також блювання, що індуковане медикаментозною цитотоксичністю та радіацією.
Ге Запальні кишкові захворювання включають, наприклад, виразкові коліти, хворобу Крона тощо.
Ще один аспект даного винаходу також включає спосіб лікування розладу, опосередкованого експресією еновіну згідно з даним винаходом, шляхом призначення пацієнту певної кількості антисмислової молекули або ов антагоністу останнього згідно з винаходом у достатній концентрації для зменшення або зняття симптомів вказаного розладу.
Ф) Розлади, опосередковані інактивацією або інгібуванням експресії еновіну, можуть також лікуватись шляхом ка призначення індивідуальній особі кількості сполуки, ідентифікованої як агоніст еновіну у достатній концентрації для зменшення або запобігання симптомів цього розладу. во В іншому аспекті винахід забезпечує спосіб виробництва фармацевтичної композиції для лікування хвороб, асоційованих з людським нейротрофічним фактором росту еновіном, вказаний метод передбачає селекцію сполуки-кандидата, ідентифікованої як агоніст або антагоніст еновіну згідно з винаходом, виробництво великих об'ємів вказаної сполуки та введення виробленої сполуки у композицію, що містить фармацевтично прийнятний носій. 65 Як можно побачити більш детально з прикладів, що наведені нижче, еновін є перспективним для зняття індукованої таксолом сенсорної недостатності. Еновін може, таким чином, грати певну роль у больових синдромах з суттєво периферичним та центральним нейрогенним компонентом, ревматичних захворюваннях, а також при порушеннях провідності може грати модуляторну роль у сенсорних процесах після трансдермального, місцевого, локально-центрального (такого як епідуральне, інтратекальне, ІСМ, внутрішньосуглобове, введення усередину сплетення, внутрішньонейронне), орального, ректального та систематичного застосування. Таким чином, у такий же спосіб, як описано у даній заявці для інших симптомів, що опосередковані еновіном, цих симптомів можна уникнути або навіть запобіти шляхом призначення або антисмислової молекули, або нуклеїнової кислоти, білка еновіну, фармацевтичної композиції, або сполуки, ідентифікованої як агоніст або антагоніст, в залежності від того, що є бажаним, згідно з даним винаходом у достатніх концентраціях для 7/0 Зменшення або запобігання симптомів вказаного розладу(ів).
Терапевтичні та фармацевтичні композиції згідно з даним винаходом можуть бути призначені для введення будь-яким прийнятним шляхом, що відомий у даній галузі, включаючи, наприклад, внутрішньовенне, підшкірне, внутрішньом'язове, трансдермальне, внутрішньосуллобове або внутрішньоцеребральне введення, або призначення для клітин у прописах для лікування ех мімо. Призначення може бути або швидким як ін'єкція, або 7/5 протягом періоду часу шляхом повільної інфузії або призначення композиції, яка характеризується повільним вивільненням. Для лікування тканин центральної нервової системи, призначення може бути шляхом ін'єкцій або інфузії у цереброспінальну рідину (СЕ).
Еновін може також бути зв'язаним або кон'югованим з агентами, які забезпечують бажані фармацевтичні або фармакодинамічні властивості. Наприклад, він може бути злитим з будь-якою речовиною, що відома у даній 2о галузі для покращення пенетрації або транспорту через гемато-енцефалічний бар'єр, такий як антитіла для рецептора трансферріну, та призначені шляхом внутрішньовенної ін'єкції.
Еновін, антисмислові молекули або сполуки, ідентифіковані як агоністи або антагоністи еновіну згідно з даним винаходом, можуть використовуватись у формі фармацевтичної композиції, яку можна приготувати згідно з методами, що добре знайомі спеціалістам у даній галузі. Композиції, яким надається перевага, включають сч фармацевтично прийнятний вектор, розріджувач або наповнювач, такий як, наприклад, фізіологічний розчин.
Інші фармацевтично прийнятні носії, включаючи інші нетоксичні солі, стерильну воду, тощо, також можуть і) використовуватись. Прийнятний буфер може також бути присутнім у композиції, що дозволяє останній зберігатись у ліофілізованому вигляді у стерильних умовах до приготування до використання шляхом додання стерильної води для подальшого призначення. Введення еновіну у тверді або напівтверді біологічно сумісні с зо Мматрикси може бути виконане таким чином, що композиція буде імплантована у тканини, що потребують лікування. с
Носій також може містити інші фармацевтично прийнятні наповнювачі для модифікації інших умов, таких як Ге! рН, осмотичність, в'язкість, стерильність, ліпофільність, розчинність тощо. Фармацевтично прийнятні наповнювачі, що дозволяють підтримувати або сповільнювати вивільнення вказаних сполук, також можуть о
Зз5 Включатись у склад композиції. ї-
Білок еновіну, молекули нуклеїнової кислоти або сполуки згідно з винаходом можуть призначатися орально. У цьому втіленні вони можуть бути інкапсульовані або поєднані з прийнятними носіями у твердих дозованих формах, що добре відомі спеціалістам у даній галузі.
Як добре відомо спеціалісту у даній галузі, специфічний режим дозування може розраховуватись в « залежності від площі поверхні тіла пацієнта або об'єму простору, що займає, тіло, і залежить відособливостей пл») с способу введення, що використовується. Кількість композиції, що фактично призначається, буде, проте,
Й визначатись практикуючими медиками і базуватись на обставинах, що мають відношення до розладу, що и? лікується, таких як жорсткість симптомів, композиція, що призначається, вік, вага, відповідь індивідуального пацієнта та вибраний шлях введення.
Даний винахід може бути більш ясно зрозумілий з наступних прикладів та малюнків, що супроводжують опис: -І Фігура 1: частинна послідовність КДНК нейротрофічного фактора згідно з даним винаходом, позначеного як еновін. Консенсусна послідовність була одержана шляхом ПЛР ампліфікації з праймерами РМНе:гр3 та РМНар!1 і на різноманітних кКДНК та на геномній ДНК, одержаній шляхом клонування, секвенс-аналізу послідовності та со порівняння одержаних послідовностей. Передбачена амінокислотна послідовність, що зображена за допомогою 5р однолітерного коду, показана вище послідовності ДНК. Номера залишків нуклеотидів показані праворуч від ю послідовності ДНК, у той час як номера залишків амінокислот зображені праворуч від трансльованої білкової
Ге послідовності. Путативний КХХК сайт розщеплення для продомена чітко виділений і підкреслений. Путативний початок зрілого білка позначений стрілкою. Сім консервативних залишків цистеїну, що є характерними для усіх членів родини ТОЕ-р, виділені. Потенційний сайт М-глікозилування підкреслений двічі.
Фігура 2: вирівнювання передбачених послідовностей зрілих білків людських ЗОМЕ, МТМ, РБР та ЕММ.
Послідовності вирівнювали при використанні програми вирівнювання Сіивіа!1УУ. Залишки амінокислот, що є іФ) консервативними для усіх трьох білків, включені у чорні рамки. Залишки, що є консервативними для двох або ко трьох послідовностей, зображенії у сірому тоні. 7 консервативних залишків цистеїну, що характерні для членів родини ТОБ-р, зображені зірочкою над послідовністю. Залишки амінокислот пронумеровані праворуч. Тире бо позначає пробіли, позначені у послідовності для оптимізації вирівнювання.
Фігура 3: частинна послідовність КДНК еновіну. Консенсусна послідовність була одержана шляхом ПЛР ампліфікації (первинна ПЛР з праймерами РМН:зр1і та РМНар2 та подальшої ПЛР з праймерами РМН»р2 та
РМНар2) на різних кКДНК, одержаних шляхом клонування, секвенс-аналізу послідовності та порівняння одержаних послідовностей. Трансльована амінокислотна послідовність, зображена за допомогою однолітерного 65 Коду, для нуклеотидів від ЗО до 284 (рамка зчитування А) показана вище послідовності та пронумерована праворуч (від АТ до А85). Ця рамка зчитування містить амінокислотну послідовність, зображену за допомогою однолітерного коду, для нуклеотидів від 334 до 810 (рамка зчитування В) представлена вище послідовності та пронумерована направо (від ВІ! до В159). Ця рамка зчитування містить путативний АТО стартовий кодон трансляції. Трансльована амінокислотна послідовність, зображена за допомогою однолітерного коду, для нуклеотидів від 334 до 810 (рамка зчитування В) показана над послідовністю та пронумерована праворуч (від В1 до В159). Ця рамка зчитування містить ділянку, гомологічну СОМЕ, МТМ, РЗР. Номера залишків нуклеотидів показані праворуч від послідовності ДНК. Путативний КХХК сайт розщеплення для продомена виділено та підкреслено. Путативний початок зрілого білка позначений стрілкою. Сім залишків цистеїну, що є консервативними та характерні для усіх членів родини ТОРЕ- р, виділені. Потенційний сайт М-глікозилування 70 підкреслено двічі.
Фігура 4: ілюстрація хромосомної локалізації людського еновіну. (А) діаграма РІЗН картування дає результати для еновіну. Кожна точка представлює подвійні РІЗН-сигнали, визначені на людській хромосомі 1, ділянці р31.3-р32. (В) Приклад РІЗН-картування еновіну. Ліва панель показує РІЗН-сигнали у хромосомі 1. Права панель показує однакові мітотичні фігури, забарвлені за допомогою 4"-б-діамідино-2-феніліндолом для 75 ідентифікації хромосоми 1.
Фігура 5: є ілюстрацію експресії еновіну у різноманітних тканинах людини. (А), (В), (С) нозерн блоттінг-аналіз тканинної експресії еновіну. Експресію мРНК еновіну у різноманітних тканинах людини визначали при використанні зразка, що відповідає частині кодуючої ділянки еновіну (включаючи ділянку, що кодує зрілий білок еновін) для аналізу блотів людської РНК, збагаченої на роїу(А). (А) Тканинний нозерн-блот (МТМ); (В)
МТМ блот ІЇ) фетальний МТМ блот ІІ. Панель (0) показує авторадіографію людського РНК-мастер блота, що аналізується за допомогою того самого фрагменту ДНК еновіну. Панель (Е) показує локалізацію зразка мРНК у людських тканинах у РНК мастер-блоті з (0).
Фігура 6: є графічною ілюстрацією загального виживання ЗН-ЗУ5М клітин, нормалізованих до умов розчинника, після обробки протягом 72 годин 10-6М таксолом та впливу збільшених доз еновіну на це с виживання, ЗН-ЗУ5У клітини диференціюються через 5 днів з 25НМ стауроспоріну перед застосуванням таксолу.
Дані одержані з двох незалежних експериментів на планшеті, що містить 6 пробірок. Показані значення та о стандартний розподіл.
Фігура 7: є графічним відображенням впливу збільшених концентрацій еновіну протягом більше 48 годин на невритний ріст стауроспорін- диференційованих ЗН-5 У5 У клітин, нормалізованих до умов розчинника. ЗН-ЗУ5У су клітини диференціюються через 5 днів з 25нм стауроспоріну перед початком 48-годинного експерименту.
Позитивний контроль представлений диференціюючим впливом 25нНМ стауроспоріну. Довжина аксонів нервової с клітини підраховувалась на принаймі 5000 клітинах. Подані дані є результатом експерименту, що проводився у ду двократній повторності. Показані значення та стандартний розподіл.
Фігури з 8 по 18: є графічними відображеннями впливу еновіну на проліферацію різноманітних типів клітин. і.
Фігура 19: є графічним відображенням впливів еновіну на індуковану таксолом сенсорну недостатність при ї- використанні тесту уколом. Показані середні значення (-15Е)М) кумулятивних підрахунків протягом часу для пацюків, оброблених 2 різними дозами еновіну (23 або 13Омкг/мл; п-10 пацюків/група) або вектор/фізіологічний розчин (п-20 пацюків) після обробки таксолом. Еновін або фізіологічний розчин/вектор вводили в об'ємі 75мкл у « субплантарну ділянку правої задньої лапи.
Фігура 20: є графічним відображенням впливу еновіну на індуковану таксолом сенсорну недостатність при - с використанні тесту уколом. Подані середні значення (-15ЄЕМ) кумулятивних підрахунків протягом часу для а пацюків, оброблених 2 різними дозами еновіну (23 або 13Омкг/мл; п-10 пацюків/група) або вектор/фізіологічний "» розчин (п-20 пацюків) після обробки таксолом. Еновін або фізіологічний розчин/вектор вводили в об'ємі 75мкл у субплантарну ділянку правої задньої лапи.
Фігура 21: є послідовністю ДНК еновіну. Консенсусна послідовність була одержана шляхом ПЛР ампліфікації -і при використанні праймерів РМНегр5 та РМНар1 кДНК лобової частини кори головного мозку людини та людської о геномної ДНК, одержаної шляхом клонування, секвенування та порівняння одержаних послідовностей ДНК.
Передбачена амінокислотна послідовність наведена вище від послідовності ДНК тільки для одержаного (Се) сплайсованого варіанту функціонального білка еновіну після трансляції. Номер залишка нуклеотиду показаний юю 50 наліво від послідовності ДНК, у той час номер амінокислотного залишка показаний праворуч від трансльованої послідовності білка. 5' та 3 сайти сплайсингу, визначені шляхом порівняння секвенованих фрагментів кДНК з що) геномною послідовністю, позначені вертикальними лініями, що вигнуті ліворуч чи праворуч відповідно до нумерації. Путативний КХХК сайт розрізання фуріну для продомену виділено та підкреслено. Путативний початок зрілого білка позначено стрілкою. Сім консервативних залишків цистеїну, характерних для усіх членів родини ТОБЕ-Д, виділено. Потенційний М-зв'язаний сайт глікозилування підкреслено подвійною лінією 5' та З о сайти сплайсингу пронумеровані та обведені.
Фігура 22: є ілюстрацією експресії різноманітних сплайсинг-варіантів еновіну у тканинах людини. (А) їмо) схематична діаграма сплайсинг-варіантів еновіну, ідентифікованих шляхом КТ-ПЛР екпериментів з еновін-специфічними праймерами на РНК, що походить від різних тканин людини, одержаних клонуванням та 60о секвенс-аналізом продуктів ПЛР. Верхня лінія показує розмір (у п.о.). Друга лінія показує геномну послідовність еновіну. Позначені положення стартового кодону трансляції та стоп-кодону кодуючої послідовності попередньо одержаного та зрілого еновіну та 5' та 3' сайтів сплайсингу (див. Фігуру 21). Права частина фігури показує ПЛР-продукти, одержані шляхом КТ-ПЛР РНК з яєчника та лобної частини кори головного мозку разом з 100п.о. ладдерної ДНК. Положення різних варіантів мРНК показано разом з їх розміром (від стартового кодону б5 трансляції до стоп-кодону). Трансльовані білки показані з правої сторони. Бокси описаних ділянок подані у
КДНК. Пунктирні лінії показують сплайсовану геномну ДНК. Заштриховані ділянки відображують кодуючу послідовність зрілого еновіну. Точкові лінії помічають стартовий кодон кодуючої послідовності зрілого еновіну. Два транскрипти, здатні приводити до одержання функціонального білка еновіну, позначені зірочками з лівого боку. (В) Розподілення у тканинах основних сплайсованих варіантів. Фотографія показує фрагменти ПЛР, одержані шляхом КТ-ПЛР зі специфічними для еновіну праймерами на різних людських кКДНК людини. 4 основні сплайсинг-варіанти (від А до 0) позначені стрілками з лівого боку. Розміри, позначені з правого боку, грунтуються на 100п.о. ладдерної ДНК, що використовувалась як контроль розміру у гелі.
Фігура 23: передбачена послідовність білка довгого сплайсинг-варіанту еновіну, одержаного шляхом сплайсингу двох інтронів з послідовності ДНК Фігури 21. Сайти сплайсингу 5-1 та 3-1 використовувались для 7/0 вилучення першого інтрону, а сайти сплайсингу 5-2 та 3-3 використовувались для вилучення другого інтрону.
Це приводило до одержання послідовності кКДНК, яка мала відкриту рамку зчитування, що кодує 228 амінокислотних залишків білка, показаного вище.
Фігура 24: передбачена послідовність білка альтернативного (короткого) сплайсинг-варіанту еновіну, одержаного шляхом сплайсинга двох інтронів послідовності ДНК, зображеної на Фігурі 21. Сайти сплайсингу 5-1 /5 та 3-2 використовувались для вилучення першого інтрону, а сайти сплайсингу 5-2 та 3-3 використовувались для видалення другого інтрону. Це приводило до одержання послідовності КДНК, що мала відкриту рамку зчитування, яка кодує 220 амінокислотних залишків білка, показаного вище. У цій послідовності білка були відсутні 8 амінокислотних залишків порівняно з послідовністю, зображеною на Фігурі 23.
Фігура 25: є графічним відображенням результатів, одержаних з експериментів, призначених для порівняння рівнів експресії еновіну у нормальних та хворих тканинах. Еновін та САРОН експресія були представлені у тканині мозку відносно до розсіяного склерозу та хвороби Альцгеймера.
Фігура 26: є графічним зображенням результатів, одержаних для визначення рівнів експресії еновіну та
САРОН для хвороби Паркінсона та пухлин.
Депонування сч
Плазміда ЕММтауркЗЕТВ, яка включає послідовність ДНК, що кодує еновін, була депонована 6 травня 1999 року під депозитним номером І МВРЗ931 у Бельгійських координованих мікробіологічних колекціях (ВССМ) та і)
Лабораторії молекулярної колекції плазмід (І МВР) В9000, у Генті, Бельгія, згідно з положеннями Будапештського
Договору 28 квітня 1997 року.
Матеріали та методи с зо Матеріали
Нативна Тад-полімераза, ампіцилін, ІРТО (ізопропіл-Д-О-тіогалактозид), Х-здаї! с (5-бромо-4-хлоро-3-індоліл- Д-Ю-галактопіранози!) та усі ферменти рестрикції одержували з Берінгер Манхейм ду (Маппеїйп, Сегтапу). ТММ суміші ОМТР були придбані у Лайф Текнолоджіз (СайПегезриго, МО, ОБА). ТОРО-ТА клонуючий набір одержували з Інвітроген ВМ (І ееК, Меїпепіапаз). Плазмідний міні- або мідіднК очисний набір о Зіадеп, Оіаргер Зріп Міпіргер набір та Оіадціск набір для гель-екстракції одержували від Квіаген ГмбХ рч- (биззеїдоп, Сегтапу). Бібліотеки кКДНК, готові набори кКДНК Магаїйоптм, панелі людської кКДНК з різних тканин (МТС) | та ІІ, Нозерн-блоти різних тканин та Адуапіаде-СС набір КДНК ПЛР одержували з Клонеук Лебораторіз (Раїо Ай, СА, БА). Усі реакції ПЛР проводили у пристрої СепеАтр ПЛР-система 9600 (Регкіп ЕІтег, Ровіег «
СПУ, СА БА). І В (Лурія-Бертані) середовище складалося з 10г/л триптону, 5г/л дріжджового екстракту та 10г/л
Масі. Пластини 2х У Т/ампіцилін містили 16бг/л триптону, 1Ог/л дріжджового екстракту, 5г/л масі, 15г/л агару та - с 10Омг/л ампіциліну. и Дослідження послідовності на гомологію з послідовностями з бази даних є» Використовуючи повну людську гліальну клітинну лінію, що виробляє нейротрофічний фактор (СОМЕ; депозитний номер 099748), неуртурін (МТМ, депозитний номер РЗ9905) та персефін (РОР; депозитний номер АРО40962), послідовності білка, що походять від кДНК, як такі, що мають бути визначені, досліджували за -і допомогою ВІА5БТ (Вавіс І оса! Адптепі Зеагсп Тоо!; Аїеспці еї аїЇ.,, 32 1990) при використанні даних, що сю отримували кожного дня з ЕМВІ /ЗепрапкК стосовно цільових експресованих послідовностей (ЕЗТ) людини та даних з геномної бази даних. (се) Додаткові ВІ АЗТ-дослідження проводили при використанні геномної послідовності з депозитним номером 7 50 АСОО05038 та деякими Е5Т, що були присутніми у базі даних Сепрапк, при цьому виявляли гомологію до цих геномних послідовностей. що) Процент ідентичності та процент схожості між членами родини СОМЕ підраховували шляхом попарного порівняння послідовностей при використанні ВЕЗТЕРІТ програми (програмного забезпечення для аналізу послідовностей Сепеїййсв Сотршиіег (згоцр, версія 8.0, Університет штату Вісконсін, МІ, ОА). Вирівнювання послідовностей ДНК або послідовностей білка виконували за допомогою програми вирівнювання Сіивіаму о (ЕМВІ, Неїдеїбего, Сегтапу).
Олігонуклеотидний синтез за допомогою ПЛР та секвенування ДНК їмо) Усі олігонуклеотидні праймери замовляли з Еипгодепіес (Зегаіїпо, Веїдійт). Праймери, специфічні для послідовностей вставок (15- 16- мірні) та праймери для використання у реакціях ПЛР, визначали лабороторними бо методами. ДНК готували на Оіадеп-йр-20, або 100 аніонному обміннику, або ОіадцісК зріп колонках (Оіадеп
Стерн, Биззеїдоп, Септапу) знову вивільняли з колонок у ЗОмкл ТЕ-буфера (10ММ Трис-НСІ, їмММ ЕДТА (натрієва сіль), рН 8,0). Реакції секвенування виконували на обох ланцюгах, використовуючи АВІ ргізт Відбуе
Тептіпаюг Сусіе набір для клонування та розганяли на Арріїед Віозузіетвз 377 Хі. секвенсері (Регкіп ЕІтег, АВІ
Оімізіоп, Ровіег Спу, СА, БА). Програмне забезпечення бедцепспег тм використовували для поєднання 65 послідовностей та редагування (СепеСодевз, АппАгброг, МІ, О5А).
Клонування нових гомологів ЗОМЕ
Ділянка ДНК у проміжку нуклеотидів від 67411 до 68343 депозитного номера ЕМВІ АСОО5038, послідовність трансльованого білка якої була гомологічною до зрілого МТМ та РОР, використовували для визначення олігонуклеотидних праймерів для ПЛР ампліфікації. Різноманітні праймери, що використовувались, наведені у
Таблиці 1. то 6
Праймери РМНар 1 та РМНар2 використовували для ампліфікації фрагменту розміром 502п.о. на кДНК, що походить від різних тканин людини (КДНК фетального мозку, плоду, простати або легенів Магап-Кеадутм (Сіопіесі! І арогаюгіев), лобної частини кори головного мозку, гіпокампуса, мозочка) та на людській геномній
ДНК. Грунтуючись на геномній послідовності з ЕМВІ /ЗепВапкК бази даних (депозитний номер АСОО5038), було передбачено, що фрагмент, який піддавали ампліфікації, мав вміст СС на рівні 7695. Таким чином, ампліфікацію проводили при використанні Адмапіаде-С кДНК набору для ПЛР (Сіопіесі І арогайгієв, Раю А, СА, О5А), що був оптимізований для ампліфікації багатих на СС послідовностей ДНК. Реакції ПЛР проводили у загальному об'ємі 5бОмкл, що містив ЇХОС буфер для реакцій ПЛР для 34 кКДНК, 0,2мМ амтР, М ОС МЕЇТ тм, 200нМ сч ов праймерів РМНгрЗ та РМНарі, їмкл Адмапіаде КіепТад полімеразну суміш та від 1 до 5мкл кКДНК або 0,5мкг геномної ДНК. Зразки нагрівали до 959 протягом 5 хвилин та цикл виконували протягом 45сек при 95 2, 1 і) хвилину при 5892 та 40Осек при 722 протягом 35 циклів, з кінцевим етапом 7 хвилин при 722С. У кінці зразки обробляли 2,5 одиницями нативної ДНК полімерази для додання А. Продукти ПЛР аналізували у 190 (вага/об'єм) агарозному гелі у їх ТАЕ буфері (40мМ Трис-ацетату, 1ММ ЕДТА (натрієва сіль), рн 8,3). Фрагменти «СМ
ПЛР очікуваного розміру (495п.0.) вирізували з геля та піддавали очистці за допомогою Оіадціск набору для гель-екстракції. Фрагменти ПЛР піддавали секвенуванню для підтвердження їх ідентичності та клонували у сч плазмідний вектор рСК2.1-ТОРО, використовуючи ТОРО ТА набір для клонування згідно з інструкціями Ге) виробника. Приблизно 20нг очищеного фрагменту поєднували з їмкл рСК2.1-ТОРО вектора у загальному об'ємі бмкл. Реакції проводили при кімнатній температурі (2022) протягом 5 хвилин. 2мкл продукту реакції о трансформували у ТОРТІОР компетентні клітини (Іпийгодеп ВМ), використовуючи трансформацію шляхом ї- теплового шоку, та поміщали на 2х УТ/ампіцилін середовище, збагачене на 10мМ ІРТО та 295 (вага/об'єм) Х-даї! для скрінінгу на білі та голубі колонії. Білі колонії після вирощування протягом ночі збирали з чашок, вирощували у 5мл середовища І В, збагаченого 100Омг/л ампіциліну та готували плазмідну ДНК, використовуючи «
Оіаргер Зріп Міпіргер набір. Присутність вставки очікуваного розміру підтверджували шляхом перетравлювання рестрикційним ферментом ЕсоКІ. Плазмідну вставку декількох позитивних клонів секвенували та одержані - с послідовності порівнювали, використовуючи СіивіаМУ програму для вирівнювання. а Для одержання додаткової кодуючої послідовності для нового гомологу СОМЕ фрагмент з очікуваним "» розміром 931п.0о., що грунтується на послідовності ЕМВІ /ЗепВапк (депозитний номер АСОО5038), ампліфікували шляхом ПЛР, використовуючи праймери РМНгер!1 та РМНар!. Реакції ПЛР проводили у загальному об'ємі 50мкл, що містить їх С кДНК реакційного буфера для реакції ампліфікації, 0,2мММ амтР, М ОС-МЕЇ ТТ м, 200нМ -і праймерів РМНгер1 та РМНарії, Тмкл Адмапіаде КіепТад полімеразної суміші та від 1 до бмкл кДНК з мозочка, сю лобної частини головного мозку або гіпокампуса або 0,5мкг геномної ДНК. Зразки нагрівали до 9592 протягом 5 хвилин та цикл виконували 45сек при 959, 1 хвилину при 5892С та 1 хвилину ЗОсек при 7290 35 циклів, з ік кінцевим етапом 7 хвилин при 722С. Продукти ПЛР аналізували у 195 (вага/об'єм) агарозному гелі у їх ТАЕ ко 20 буфері (40ММ трис-ацетату, їмМ ЕДТА (натрієва сіль), рн 8,3). Друге коло ампліфікації проводили з нестед-праймерами (РМНзр2 та РМНар2). тІмкл продукту реакції ампліфікації першого кола використовували у їз загальному об'ємі 5Омкл, що містить їх ЗС кДНК буфера для реакції ампліфікації, 0,2мМ амтР, 1М ОС-МЕЇ Т м, 20О0НМ праймерів РМН:р2 та РМНар2, 1Імкл Адмапіаде КіепТад полімеразної суміші. Зразки нагрівали до 9590 протягом 5 хвилин та цикл виконували 45сек при 952С, 1 хвилину при 582С та 1 хвилину ЗОсек при 722С протягом 59 35 циклів, з кінцевим етапом 7 хвилин при 722С. Продукти ПЛР аналізували у 195 (вага/об'єм) агарозному гелі у (Ф) їх ТАЕ буфері. Фрагменти ПЛР очікуваного розміру (870п.0.) вирізували з геля та піддавали очистці за г допомогою ОіадціскК набору для гель-екстракції. Фрагменти ПЛР секвенували для підтвердження їх ідентичності, оброблювали 2,5 одиницями ТАС-полімерази та клонували у плазмідний вектор рСК2.1-ТОРО, використовуючи во ТОРО ТА набір для клонування згідно з інструкціями виробника. Приблизно 2О0нг очищеного фрагменту поєднували з їмкл рСК2.1-ТОРО вектора у загальному об'ємі 5мкл. Реакції проводили при кімнатній температурі (2022) протягом 5 хвилин. 2мкл продукту реакції трансформували у ТОР1ТОР" компетентні клітини (Іпуийгодеп ВМ), використовуючи трансформацію шляхом теплового шоку, та поміщали на 2х УТГ/ампіцилін чашки, що містили середовище, збагачене 10мММ ІРТО та 295 (вага/об'єм) Х-да!І для скрінінгу на білі та голубі колонії. Білі в5 колонії після вирощування протягом ночі збирали з чашок, вирощували у 5мл середовища ІВ, збагаченого 10Омг/л ампіциліну, та готували плазмідну ДНК, використовуючи Оіаргер Зріп Міпіргер набір. Присутність вставки очікуваного розміру підтверджували шляхом перетравлювання рестрикційним ферментом Есокі.
Плазмідну вставку декількох позитивних клонів секвенували та одержані послідовності порівнювали, використовуючи СіивіаМу програму для вирівнювання.
Аналіз генної експресії еновіну шляхом КТ-РСкК-аналізу
Олігонуклеотидні праймери РМН:згрЗ3 та РМНарі (див табл. 1) використовували для специфічної ПЛР ампліфікації фрагменту еновіну розміром 502п.о. ПЛР ампліфікацію проводили на панелях мультиплетної людської КДНК (МТСтм), нормалізованих до експресійних рівнів мРНК б різних генів. Реакції ПЛР з еновін-специфічними праймерами проводили у загальному об'ємі 5Омкл, що містить 5мкл кКДНК, їх С буфер для 70 реакції ампліфікації КДНК, 0,2мМ амтР, 1М С-МЕТтм, 400НМ праймерів РМН:вр2 та РМНар2, Тмкл Адмапіаде
КіепТад полімеразної суміші. Зразки нагрівали до 952 протягом 30 хвилин та цикл виконували протягом ЗОсек при температурі 959С та ЗОсек при 682С. Зразки аналізували у 1,295 (вага/об'єм) агарозному гелі у їх ТАЕ буфері (40мМ Трис-ацетату, 1мМ ЕДТА (натрієва сіль), рН 8,3) та візуалізували за допомогою забарвлювання гелю бромідом етідіуму, забарвлені гелі одержували при використанні системи Еадіе Еуе І! Мідео (Зігаї(адепе, 75 Гадоїа, СА, ОА).
Дослідження на подібність зразків, які одержували кожного дня з бази даних ЕМВІ «зепВапк та людських білкових послідовностей неуртиріну та персефіну, дало змогу отримати геномну послідовність ДНК, що кодує путативний новий білок, подібний до нейротрофічних факторів ЗОМЕ, МТМ та РЗР, цей білок позначали як еновін (ЕММ). Додаткове дослідження гомології з послідовностями, отриманими з бази даних, при використанні геномної послідовності ДНК, що охоплює ділянку, яка кодує еновін, дало змогу одержати декілька клонів, що експресують послідовність (ад (ЕТ), що походить від різних тканин людини (епітелія передміхурової залози (депозитний номер ААБ5З33512 (101322952)), карциноми легені (депозитний номер АА9З1637) та пухлини паращитовидної залози (депозитний номер АА844072)). Ці клони містять послідовність ДНК за межами ділянки гомології з ЗОМЕ,
МТМ або РБ5БР, що підтверджує, що мРНК еновіну експресується у нормальних та пухлинних тканинах. Ге
Початкова ПЛР ампліфікація при використанні праймерів (РМН:грЗ3 та РМНарі!), що грунтується на геномній (5) послідовності, дала змогу одержати фрагмент кКДНК розміром 500п.о. з плоду, мозку плоду, передміхурової залози, лобної частини кори головного мозку, гіпокампуса, мозочка та з геномної ДНК, але не з ДНК легені.
Клонування та секвенування цих фрагментів дало змогу одержати послідовність ДНК розміром 474п.0., що транслювалась в очікувану білкову послідовність, яка містила 139 амінокислотних залишків, включаючи 7 с консервативних залишків цистеїну, що характерні для усіх членів родини білків трансформуючого фактора сч росту ВД (ТОБ-рД) (Кіпозіеу, 1994) (Фігура 1). Послідовність також містила КЕХХК ділянку для розщеплення продомену (ВААБ, амінокислотні положення з 23 до 26) (Ваїт, 1991). Подібний сайт розщеплення бувпприсутнійв (3
СОМЕ, МТМ та РБ5Р білкових послідовностях у відповідній позиції послідовності продомена. Передбачуване со розщеплення продомену еновіну мало місце у цьому сайті іп мімо, послідовність зрілого білка ЕУМ містила 113 амінокислотних залишків (залишки від 27 до 139 на Фігурі 1) та мала підраховану молекулярну масу 11965Дата ї- ізоелектричну точку 11,8. У зрілій послідовності був присутній тільки один потенційний сайт М-глікозилування (М5Т в амінокислотних положеннях 121-123). Крім того, декілька консервативних ділянок між зрілими формами відомих нейротрофічних факторів СОМЕ, МТМ та РБОР також були присутніми в еновіні (Фігура 2). Таблиця 2 « підсумовує результати порівняння послідовностей зрілого білка членів родини СОМЕ за допомогою програми ВЕБ5ТРЕЇТ. Представлені процент ідентичності та процент подібності. Зрілі послідовності СООМЕ, МТМ, Р5Р та - с еновіну, що використовувались у цьому порівнянні, починались на першому амінокислотному залишку, що йде ч» за ЕХХК сайтом розщеплення. п 1 - с
Ф юю 1» 39 З цього порівняння видно, що зрілий білок еновін більш тісно пов'язаний з персефіном та неуртуріном,
Ніж з БОМЕ.
Ампліфікація, клонування та секвенування більшого фрагменту послідовності ДНК еновіну з кДНК лобної долі о кори головного мозку при використанні праймерів, що грунтуються на геномній послідовності ЕМВІ Хзепрапк іме) (депозитний номер АСО0О5038), дало змогу одержати розміром 819п.о. (Фігура 3). Ця послідовність містила путативний АТО стартовий кодон у нуклеотидному положенні 30-32 та мала відкриту рамку зчитування (рамка 60 зчитування А на Фігурі 3), що простягається до стоп-кодону в нуклеотидному положенні 285-287. Трансльована білкова послідовність цієї ділянки не виявляла подібності до будь-якого відомого білка з бази даних.
Трансляція послідовності КДНК у другій рамці зчитування (рамка зчитування В на Фігурі 3) давала очікувану послідовність білка, що складалася з 159 амінокислотних залишків. Ця послідовність містила КЕХХК сайт розщеплення (від положення В43 до В46; нуклеотидне положення 460-471) та послідовність, яка відповідає 65 послідовності зрілого еновіну (положення від В47 до В159; нуклеотидне положення 472-810). Відкрита рамка зчитування, що містила КХХК сайт розщеплення та кодуючу послідовність зрілого еновіну, простягалась від нуклеотидного положення 334 (що передує стоп-кодону, який знаходиться у рамці) до стоп-кодону у положенні 811-813, але не містила кодону АТО для стартового залишку метіоніну. По аналогії з персефіном (Мібгапа еї аІ.,, 1998), ми запропонували гіпотезу, що несплайсований інтрон присутній у більшості транскриптів мРНК з
Тена ЕММ. СОМЕ та МТМ також мали інтрони у своїх відповідних кодуючих послідовностях продомену |Маївивзпйа еї аї., 1997, НеисКегоп еї аї., 19971.
Для оцінки існування різних мРНК транскриптів для еновіну проводили КТК-ПЛР експерименти при використанні праймерів, розташованих на 5-кінці кодуючої послідовності еновіну безпосередньо після АТО стартового кодону, розміщеного вище 5' (праймер РМН:гер5 (5-ССА АОС ТОоС СТО ААС дос дос О-3), та /о Нестед праймер РМН:зрб (5-55 05050 ОСА АСА ОСТ САА ТОо-3), та розташованих на 3' кінці (праймер
РМНар! та нестед праймер РМНар?2? (див. Таблицю 1). Експерименти проводили на панелі кДНК, одержаних з багатьох тканин людини (Сіопіеспй МТС панель І та ІІ) на бібліотеці КДНК фетального серця (Сіопіесі) та на
КДНК, що походить від мозочку людини, гіпокампуса або лобної долі кори головного мозку (Мавзиге еї аї!., 19981.
Первинні реакції ПЛР проводили з праймерами РМНегр5 та РМНар! в умовах збагачення СС (Адмапіаде СОС-РСК набір, Сіопіесп) протягом ЗО циклів (95922 - ЗОсек., 602С - ЗОсек., 7220 - 1 хвилина), як було описано. Нестед реакції ПЛР проводили на мкл первинного продукту ПЛР, використовуючи праймери РМНезрб та РМНара, у тих самих умовах протягом 30 циклів. Одержані продукти ПЛР аналізували у 1,595 агарозному гелі та розподіляли по розмірам від -350п.о. до -800п.о. Декілька смужок очищали з гелю та безпосередньо секвенували фрагменти
ПЛР. Кілька очищених продуктів ПЛР також клонували у вектор рСК2.1-ТОРО (ТОРО-ТА набір для клонування,
Іпмігодеп) та потім піддавали секвенуванню. Секвенування підтвердило існування різних молекул мРНК, що містили послідовність еновіну. Одержані фрагменти послідовності порівнювали з геномною послідовністю еновіну. Це дозволило нам ідентифікувати декілька можливих 5 та 3 сайтів сплайсингу, що відповідають консенсусним послідовностям для донорного та акцепторного сайтів сплайсингу |(Зепараїну, Р., ЗПпаріго, М.В. 5
Наїтів, М.І. (1990)), сплайсинг-з'єднання, гілку точкового сайту та екзони: статистику послідовності, Га ідентифікацію та застосування проводили відповідно до геномної програми. Меїйодіз Епгутої. 183, 252-278. Різні сплайсинг-варіанти еновіну були ідентифіковані, їх присутність у різних тканинах людини підсумована на Фігурі і) 22. Тільки два з п'яти секвенованих транскриптів давали функціональний білок еновіну при трансляції від АТО стартового кодону.
Ці два транскрипти кодують білки розміром 228 або 220 амінокислот, відповідно, з очікуваними сигнальними є пептидами, що складаються з 47 та 39 амінокислотних залишків. Очікувані білкові послідовності цих двох варіантів представлені на Фігурі 23 (довгий варіант) та Фігурі 24 (короткий варіант). Довгий варіант може с бути дедукований з послідовності ДНК на Фігурі 21 шляхом сплайсингу першого інтрону у положенні 5-1 та 3-1 Ге») та другого інтрону у положенні 5-2 та 3-3. Очікувана послідовність білка, представлена на Фігурі 23, була одержана шляхом трансляції відкритої рамки зчитування. Більш короткий варіант може бути дедукований з о 3Зз5 послідовності ДНК Фігури 21 шляхом сплайсингу першого інтрону у положенні 5-1 та 3-2 та другого інтрону у ч- положенні 5-2 та 3-3. Очікувана послідовність білка, представлена на Фігурі 24, була одержана шляхом трансляції відкритої рамки зчитування.
Найдовший транскрипт, який, як виявилось, представлено у меншій кількості у більшості тканин, про що « можна судити з інтенсивності смуги на Фігурі 228. Коротші транскрипти, що походять від заміни рамки, давали змогу одержувати трансльований білок, що мав неправильну амінокислотну послідовність, гомологічної до й с СОМЕ, МТМ та РЗР. Два найменших транскрипти, в яких була відсутня частина кодуючої послідовності еновіну, ц включали два з семи високо консервативних залишків цистеїну. Фігура 228 показує розподіл основних варіантів "» сплайсингу в різних тканинах людини. Фукціональну мРНК еновіну експресували у більшості тканин, що піддавали тестуванню, включаючи мозок, серце, нирку, печінку, легені, підшлункову залозу, скелетні м'язи, ободову кишку, тонкий кишечник, лейкоцити периферичної крові, селезінку, тімусу, передміхурову залозу, яєчко, -І яєчник, плаценту та фетальне серце. У деяких тканинах людини (наприклад, у мозочку, гіпокампусі) тільки нефункціональні транскрипти можна було ампліфікувати шляхом ПЛР. Згідно з нашими знаннями, випадковість
Мн нефункціональних транскриптів мРНК відносно до існуючих не була описана раніше. Біологічне значення цих (Се) відкриттів необхідно вивчати. Хоча експрсія МТМ та РЗР у різних тканинах не була охарактеризована повністю, їх експресійні рівні, як виявилось, набагато нижчі, та експресія більш обмежена у певних тканинах (Кограцег о еї а!., 1996, Міїбгапаї еї аї, 1998).
ІЗ Рекомбінантна експресія еновіну в Е.соїї. Конструювання плазміди для експресії еновіну
Фрагмент ПЛР розміром 414п.о. ампліфікували з людської геномної ДНК з праймерами РМНзр4 та РМНар2 (Таблиця 1) та клонували у вектор рСК2.1-ТОРО, використовуючи ТА-клонування (Іпмийгодеп). Послідовність вставки підтверджували секвенуванням. Один клон, що містив вставку з еновін-консенсусною послідовністю (клон 36), використовували для подальшого конструювання експресійної плазміди. Два праймери були о призначені для внесення прийнятних рестрикційних сайтів на своїх 5--кінцях. Передній праймер РМНехр-зрі ко (5-580С6 АТ ССО ОСТ об ос ССО ос А-3), містив Ватні рестрикційний сайт (підкреслений), зворотний праймер РМНехр-арі (ОСС ТСО АСТ САС ССС АСОо САС ССО САс О-3) містив Хпої! рестрикційний сайт бо (також підкреслений). Використовуючи ці праймери, фрагмент розміром 343п.о., що кодує зрілий еновін (положення 81 до 422 на Фігурі 1), ампліфікували з клону 36. Реакцію ПЛР проводили у загальному об'ємі 50мкл, що містить їх С буфера для ПЛР кКДНК, 0,2мМ амтР, 1М ОС-МЕЇ ТТ тм (200нМ праймерів РМНехр-5рі та
РМНехр-арі, Імкл Адмапіаде КіІепіад полімеразної суміші та 1ТОнг плазмі дної ДНК з клону 36). Зразки нагрівали до 942С протягом 5 хвилин та цикл виконували протягом 45сек при 952С, 1 хвилину при 582С та ЗОсек при 72920 65 протягом 25 циклів, з кінцевим етапом 7 хвилин при 7220. Одержані 5Омкл продукта очищали, використовуючи
Оціадціск ПЛР очисний набір (Оціадеп), та ДНК елюювали у ЗОмкл. 25мкл цього очищеного продукта потім перетравлювали у ЗОмкл реакційної суміші з Тбод. ВатНі та 1Оод. Хо! у 1х буфері В (Военгіпдег Мапппеїіт) протягом 1 години при 372. Після електрофорезу у 195 (вага/об'єм) агарозному гелі у їх ТАЕ буфері (40ммМ
Трис-ацетату, ММ ЕДТА (натрієва сіль), рн 8,3) очікувану смужку, що характерна для фрагменту розміром З5Зп.о., вирізали з гелю та піддавали очистці за допомогою СіадціскК набору для гель-екстракції. Одержаний фрагмент лігували у вектор РК5ЕТ В (Іпмігодеп), лінеаризували за допомогою Ватні та Хпої. Вставку одержаної плазмідної конструкції (ПЕММтаурк5БЕТВ) підтверджували повним аналізом послідовності. Одержана конструкція кодувала білок розміром 146 амінокислот з очікуваною молекулярною масою 15704Да, включаючи
МН-2 термінальний 6 х Ніз-іад, злитий у рамці з кодуючою послідовностю зрілого еновіну. МН-2 термінальна 7/0 амінокислотна послідовність одержаного білка була, таким чином,
МкОоЗННННННОМАЗМТОоСООМОКО!І мпрОрКОРАСОРОЗ (послідовність зрілого еновіну виділена, бх Нів (ад підкреслено).
Експресія еновіну у ВІ 21(ОЕЗ) клітинах Е.соїї
Рекомбінантну продукцію білка еновіну проводили суттєво так, як описано для неуртиріну І(Стеедоп еї а). 75 (1997) з модифікаціями. Для продукції рекомбінантного білка еновіну плазміду пЕММтауркзЕТВ трансформували в Е.соїї штаму ВІ 21(ОЕЗ) (Момадеп) та вирощували на 2хХУТ/середовищі, що містить ампіцилін (1бг/л триптону, 10г/л дріжджового екстракту, 5г/л МасСі та 100мг/л ампіциліну) при 302С (225об/хв) та 372С (ЗОбоб/хв) до оптичної щільності 00600 приблизно 0,5 перед доданням ІРТО до кінцевої концентрації О0,2мММ для індукції експресії. Осади клітин збирали шляхом центрифугування, що проводили після 3-х годинної індукції, 20 промивали фізіологічним розчином, забуференим фосфатом, центрифугували та зберігали замороженими. Для очистки клітинні осади ресуспендували у буфері для ультразвукової обробки 20мММ Трис-НСІ, рН 8,0, ЗО0ММ масі, їмМ 2-меркаптоетанолу, інгібітори протеаз (Сотрієе(етм таблетки, що містили суміш протеазних інгібіторів (Воейгіпдег Мапппеійт, 1 таблетка на 5Омл буфера) та 1мг лізоциму на 500мг клітинного осаду).
Клітини руйнували шляхом обробки ультразвуком та тіла включення збирали центрифугуванням. Тілавключення С 25 розчиняли та інкубували у буфері А (8М сечовини, 20мМ Трис-НСЇ, рН 7,6, 200мМ масі, 1мМ 2-меркаптоетанолу) о протягом ЗО хвилин при 372 перед додаванням до Мі-МТА смоли (нікель нітрілотриоцтова кислота, Оіадеп).
Після 40 хвилин струшування при 372 зразки один раз промивали у буфері А та завантажували у 5мл МіІ-МТА колонку. Колонку промивали за допомогою буфера А у кількості 10 об'ємів колонки, буфером А з рН 7,2 у кількості 10 об'ємів колонки, та буфером А з рН 7,2, що містить 10ММ імідазолу у кількості 10 об'ємів ЄМ 30 колонки. Еновін елюювали з колонки при використанні буфера А, рН 7,2, що містить 200мММ імідазолу, у кількості сч 4 об'єми колонки.
Очищення еновіну проводили шляхом послідовного діалізу протягом ночі при 42С у ренатураційному буфері Ф) (01М фосфату натрію, 0,15М Масі, ЗмкМ цистеїну, 0,0290 Твіну-20, 1095 гліцеролу, 0,01М Трис-НСЇ, рН 8,3), що со містить кількості сечовини, що зменшуються на кожному етапі (від ЄМ до 4М до ЗМ до 2М до 1М до 0,5М до ОМ
Зо сечовини). Очищений білок аліквотували, зберігали при -202С та надалі використовували для функціональних в. аналізів.
Хромосомна локалізація гену еновіну
Фрагмент розміром 3,3кб гену еновіну був ампліфікований з кДНК мозочка при використанні праймерів ЕММ « (7)-врі (5-ТТО СО ТОТ СТА САА АСТ САА СТО СО-3)) та РМНар1 (5-ССА СБА АСА СС АСС ОСТ АдО О-3), 40 що походять від послідовності ЕМВІ. з депозитним номером АСО05038. Реакцію ПЛР проводили у загальному З с об'ємі 5Омкл, що містить їх Ехрапа Гопд Тетріаїе ПЛР реакційний буфер (Воепгіпдег МаппПеїт), 0,5ммМ амтРр, "з 1М ОС-МЕЇ Т (Сіопіесі І арогайогіеєв), 4Д00НМ праймерів ЕММ (7)-зрІ та РМНар1! та їмкл кДНК мозочка. Після " ініціації протягом 2 хвилин при температурі 94 С, додавали 0,75мкл Ехрапа /опд Тетріа(е полімерази (Воепгіпдег Мапппеійт) та цикл проводили протягом 1Осек при 942, ЗОсек при 582С та З хвилини при 682С протягом 10 циклів. Потім проводили 20 додаткових циклів, збільшуючи час експозиції при 682С на 20сек кожний їх цикл. У кінці проводили заключний цикл протягом 7 хвилин при 682С. Одержаний фрагмент розміром 3,3кб (65) очищали після електрофорезу у 0,895 агарозному/ТАЕ гелі та клонували у вектор рСК2.1-ТОРО, використовуючи с ТА-клонування (Іпийгодеп). Повний аналіз послідовності вставки 3,3кб одного клону підтвердив, що одержана послідовність КДНК відповідає геномній послідовності з бази даних ЕМВІ. (депозитний номер АСООБ5038). Ніяких 50. й й не ко інтронів не було сплайсовано у кКДНК, одержаній з кДНК мозочка.
КЗ Хромосомне картування виконували при використанні флуоресцентного іп зйи гібридизаційного (РІЗН) аналізу суттєво так, як описано |Непо еї аї!., 1992, Непд «5 Твиїі, 1993). Людські лімфоцити культивували при температурі 372С протягом 68-72 годин перед обробкою з 0,18мг/мл 5-бромо-2'і--деоксиуридину (Вга)) для синхронізації клітинних циклів у популяції клітин. Синхронізовані клітини промивали та рекультивували при 372 протягом б годин. Клітини збирали та готували мазки, використовуючи стандартну методику, що передбачає (Ф) гіпотонічну обробку, фіксацію та висушування на повітрі. Зразок З3,3кб еновіну піддавали біотинілуванню та ка використовували для визначення методом РІЗН. Мазки витримували при 552С протягом 1 години, оброблювали
РНКазою та денатурували у 70956 формаміді у 2х Масі/Сії (20х Масі/Сії, що містить ЗМ Масі, 0,3М дізодіум бо Ццитрату, рН 7,0) протягом 2 хвилин при 702С з подальшою дегідратацією етанолом. Після гібридизації протягом ночі, мазки промивали, сигнали РІЗН та 46-діамідіно-2-феніліндол зв'язані моделі розрізняли окремо на фотографічній плівці та дані РІЗН картування порівнювали з межами хромосоми, при цьому досягали суперімпозиції сигналів РІЗН з 4"б-діамідіно-2-феніліндол зв'язаних хромосом |Непуд 4 Твиці, 1993). В умовах, що використовувались, ефективність гібридизації була приблизно 72905 для цього зразка (серед 100 відібраних 65 Мітотичних фігур, 72 показали сигнали на одній парі хромосом). Оскільки -6-діамідіно-2-феніліндол зв'язування використовували для ідентифікації специфічної хромосоми, одержували вирівнювання між сигналом від зразка та короткою частиною хромосоми 1. Детальне розміщення далі визначали, базуючись на аналізі 10 фотографій (Фігура 4А). Не було знайдено додаткового локусу, визначеного за допомогою РІЗН-аналізу в умовах, що використовувались, таким чином, ми зробили висновок, що еновін знаходиться у хромосомі 1 людини, ділянка р31.3-р32. Приклад результатів картування представлено на Фігурі 48.
З даних генного картування Національного центру з біотехнологічної інформації «(«МСВІ, пЕр:/Лимлу. побрі.піт.пій.дом/депетар) було дедуковано, що геномний клон, який містить послідовність еновіну (ЕМВІ депозитний номер АСО0О5038), локалізовано у хромосомі 1, між маркерами 0152843 та 015417. Це відповідає хромосомі 1, ділянка р31.1 до р32.3, підтверджуючи дані, одержані за допомогою РІ5Н аналізу. 70 Розподіл еновіну у тканинах, визначений за допомогою нозерн-блотінг аналізу та доЇ-блоттінг аналізу
Нозерн-блоти, які містять 2мкг полі (А)-збагачених РНК, що походять з різних тканин людини (Сіопіесй
І арогаюгіез, Раїо Айо, СА, ОБА; МТМтм блот, МТМтм блот ІІ та фетальний МТМтм блот ІІ), гібридизували згідно з інструкціями виробника з (0-2Р-4СТР. рендомне-праймуюче мічення (НідпРгіте набір, Военгіпдег Мапппеїт) фрагментом еновіну розміром 897п.о. Цей фрагмент одержували шляхом ПЛР-ампліфікації з праймерами 75 РМНгр!1 та РМНар!1ї на кДНК лобної долі кори головного мозку та подальшого клонування у вектор рСК2.1-ТОРО.
Фрагмент містив 897п.о. послідовність еновіну вище від стоп-кодону та включав повну кодуючу послідовність зрілого білка еновіну.
МРНК еновіну визначали як основний транскрипт розміром приблизно 4,5Ккб (Фігура 5А-С). Еновін експресували у ряді тканин, особливо у тканинах серця, скелетних м'язів, підшлункової залози та передміхурової залози. Декілька транскриптів невеликого розміру були присутніми, наприклад, у плаценті (4кб, 2,4кб та 1,6кб) та передміхуровій залозі (4кб та 1,6кб). У фетальній тканині основний транскрипт розміром 2,4кб був присутній у печінці та у меншій кількості у легенях. Інші транскрипти були також присутніми у фетальній нирці, печінці, легенях та мозку.
У доповнення, РНК-мастер блоти (Сіопіесі І арогайогіев), що містили багату на полі(А) РНК з різних тканин Ге людини та на різних етапах розвитку, також гібридизували зі зразком еновіну розміром 897п.о. Збагачені на о полі(А) проби РНК, що використовували для створення цього блоту, нормалізували до рівнів експресії мРНК восьми генів, що мають походження від різноманітних тканин. мРНК еновіну експресували у всіх тканинах, але найвищі рівні мРНК були виявлені у передміхуровій залозі, гіпофізі, трахеї, плаценті, фетальних легенях, підшлунковій залозі та нирці (Фігура БОЖЕ). с
Конструювання СЕКа-Ідо-Ес злитих векторів
Ділянки КДНК СЕКо-1, СЕКо-2 та ОЕКо-3 (що кодують амінокислоти з 27 до 427, з 20 до 431 та з 28 до 371 с відповідно) за винятком послідовності, що кодує сигнальний пептид та СООН-термінальну гідрофобну ділянку, (о) втягнену у СОРІ-прикріплення, клонували у рамці в експресійний вектор Зідпаї! рід різ (КО Бувіетв Еийгоре Це). с
Одержані білки, експресовані з цих конструкцій, містили 17 амінокислот МНо-термінального СОЗЗ сигнального пептиду, ділянку СЕК у та 243 амінокислоти СООН-термінального ІдсС.-с злитого домену. СНО клітини /їч- трансфікували ЗЕКо, злитою конструкцією, стабільно трансфіковані клітини відбирали, використовуючи 500мкг 418. Стабільні клони відбирали, використовуючи Ес антитіло. Для очистки ЗЕК о злитих білків клітини вирощували на вільному від плазми середовищі та середовище збирали кожні З дні. Середовище « центрифугували та використовували для білкової А колонки (Ргоїеіп А Зерпагозе, Рпагтасіа Віоїесі). Зв'язаний білокелюювали за допомогою 0,1М цитрату натрію, рН 3,0, та збирали у 1М Трис-буфері, рН 8,4. Концентрацію З с білка оцінювали шляхом вимірювання поглинання при 28О0нм, використовуючи коефіцієнт екстинкції 1,5. Ці "» очищені розчинні СЕКо-1 до -3 Ес злиті білки використовували для подальшого вивчення зв'язування. " Поверхневий аналіз на основі плазмон-резонансу
Експерименти по поверхневому плазмон-резонансу (ЗРК) проводили при температурі 2523, використовуючи
ВіАсоге 3000 пристрій. Аналізи проводили з еновіном та МО як імобілізованими лігандами. Карбоксильований матрикс 1 сенсорного чіпа спочатку активували за допомогою 11 суміші 400ММ о М-етил-М-(диметиламінопропіл)-карбодіїміду та 100 мМ Бі-етил-БІ--диметиламінопротл)-карбодіїміду та 100ММ
М-гідрокси-сукциніміду протягом 10 хвилин. Потім рекомбінантний еновін та МОБ наносили на активовану ї-о поверхню у 10мММ ацетатному буфері, рН 4,5 при швидкості витікання бмкл/хв. Незв'язані реакційні групи ко 20 інактивували за допомогою 1М етаноламін гідрохлориду. Для експериментів по зв'язуванню розчинний "з СЕКо-1-3 Ес зливали при концентраціях 10-100НМ у НЕРЕ5 забуференому фізіологічному розчині (150мМ Масі,
З5ММ ЕДТА, 0,05956 Р-20, 10мММ НЕРЕБ5, рН 7,4) при швидкості витікання 1Омкл/хв. Асоціацію піддавали моніторингу протягом З хвилин та дисоціації протягом 1 хвилини, далі проводили регенерацію з 5ммМ Ммаон.
Дисоціацію ініцювали шляхом злиття з НЕРЕ5 забуференим фізіологічним розчином. ВІіАсоге програмне забезпечення оцінки, 3,0 використовували для обчислення значення асоціації (К 4), значення дисоціації (Ка) та
ГФ) константи рівноважної дисоціації Ку, що обчислювалась як Ка/Ку). з Результати
ЗРК використовували для вимірювання зв'язування розчинного СЕК /9-1-3 для імобілізації еновіну. во Специфічне зв'язування з еновіном може бути визначене тільки з розчинним СЕК 53. ЗЕКо-1 та ЗЕКо-2 не зв'язується з імобілізованим еновіном. Зв'язування, що спостерігали для СЕК 9-3, є специфічним, оскільки не спостерігали зв'язування з МОБ. В окремому контрольному експерименті специфічне зв'язування ТІкКА-Ес (рецептор МОБ) з імобілізованим МОБ визначали без зв'язування з імобілізованим еновіном.
З кривих зв'язування, одержаних при використанні трьох різних концентрацій СЕК о, були встановлені 65 наступні константи, наведені у Таблиці 3. Ці результати показують, що СЕКоЗ специфічно зв'язується з еновіном.
С Теомоу кою | емо
Оскільки СОМЕ, МТМ, та РБ5Р - усі сприяють існуванню та виживанню різних типів нейронних клітин, було передбачено, що еновін має такі самі біологічні ефекти на нервові клітини та, можливо, на інші типи клітин також. Таким чином, було передбачено, що еновін може бути корисним при лікуванні нервових розладів взагалі, включаючи хворобу Паркінсона, хворобу Альцгеймера, периферичну невропатію, аміотрофічний латеральний 70 склероз (АГ 5), хворобу Хантінгдона, гостре пошкодження мозку, пухлини нервової системи, розсіяний склероз, периферичну нервову травму та пошкодження від дії нейротоксинів.
Еновін може також бути корисним у різних аспектах нейропротекції. Зважаючи на його вплив на виживання різноманітних популяцій нейронних клітин та на протяжність аксонів нервових клітин, що спостерігали у нашій моделі ЗН5ЗУБУ клітин, ми запропонували, що ця сполука може мати нейропротективне та нейрогенеративне 7/5 застосування.
Це грунтується на наступних спостереженнях. Таксол-індукований нейронний апоптоз у
МОг-диференційованих РС12 клітинах феохромоцитоми пацюків (Миудепз еї аіІ., представлений до розгляду).
Таким чином, таксол-індукована цитотоксичність має риси нейронного апоптозу, як спостерігали при фрагментації ДНК, мічення за допомогою Аппехіп М та рсіІ-2 захисті. Таке подовження строку дії може бути дедуковане з того, що таксол індукує апоптоз у диференційованих ЗН-ЗУ5У клітинах. Еновін, як зараз показано, має здатність зменшувати загибель цих клітин та, таким чином, може сприяти зворотному розвитку нейронних апоптозів взагалі.
Сполука може, таким чином, бути корисною при таких нейродегенеративних симптомах, при яких спостерігається апоптоз, а саме удар (НаКкіт, 1998), хвороба Паркінсона (Магздеп еї аї!.,1998), хвороба Га
Альцгеймера (Маду еї аїІ., 1998), хвороба Хантінгдона (УМІїпдюп еї аїЇ.,, 1997), нейротравма (Зтігома еї аї., 1998), периферична нейропатія (5гіпімізап еї аї., 1998). і9)
Останніми клінічними випробуваннями ми показали, що цей нейротрофічний фактор фактично захищає диференційовані ЗН-5У5У клітини людської нейробластоми проти таксол-індукованої клітинної цитотоксичності.
Методика вимірювань життєздатності Ге
Клітинну життєздатність визначали шляхом додання до кожної пробірки 1ООмкл мг/мл розчину 2,3-біс|(2-метокси-4-нітро-5-сульфофеніл|-2Н-тетразоліум-5-карбоксаніліду (ХТТ, Зідта) у ОМЕМ (372С), с збагаченому 0,02мММ феназин метосульфату (РМ5, Зідта). Чашки потім інкубували при 372С протягом 2,5 Ге) годин. Оптичні щільності зчитували (молекулярні розподіли) при 45Онм, використовуючи б5Онм як контроль. с
ХТТ-аналіз базувався на перетворенні солі тетразолію ХТТ у продукт формазану, забарвлений у червоний колір.
Ця реакція відбувається за участю мітохондріальних ферментів. -
Методика нейронної диференціації 1. Диференціація клітин людської нейробластоми ЗНЗУБУ
ЗНЗУ5БУ клітини диференціювали протягом 5 днів з 25НМ стауроспоріну. Вплив еновіну визначали через 72 « години після початку експерименту (посилання ЙИалава та ін. "Протеїн-кіназний інгібітор стауроспорін індукує зрілий нейронний фенотип у ЗНЗУ5БУ клітинах людської нейробластоми шляхом а, Б, 2 РКС незалежного шляху" - с Уошгп. СеїЇ Рпузіо!. 155, 301-312 (1993)). и 2. Вимірювання протяжності аксонів нервових клітин ,» Морфологічні зміни у нейронах були автоматично кількісно оцінені як описано нижче. Стисло, у певний час, глютаральдегід додавали безпосередньо до середовища та залишали на 30 хвилин при кімнатній температурі.
Цим впевнювались, що морфологія клітин відображала реальну ситуацію на цей момент часу. Клітини -і спостерігали через модус, що передає світло, у Ахомегі мікроскоп (7еізв ОБрегкоспеп, Септапу), оснащений сю Маг2гпацвзег скануючим стейджем, що керується Іпау пристроєм (Зіїсоп (згарпісв, Моипіаіїйп Міем, ОЗА).
Зображення уловлювали, використовуючи МХ5 відеокамеру (НСЗ). Близько 3000 клітин оцінювали у 64 се) вистроєних у ряд зображень, що формували зображення площею 8 х8. Точне вирівнювання зображень 7 50 підтверджувало, що аксони нервових клітин можуть переходити з одного поля зображення на наступне.
Автоматичне визначення протяжності аксонів нервових клітин, мічених поліклональними (аи-антитілами,
Із проводили, використовуючи детектор для кривих та лінійних структур, що не виявляє впливу (Зіедег, 1998). За допомогою аналітичного програмного забезпечення автоматично підраховували загальну площу клітини, число клітин та загальну довжину аксонів нервових клітин.
Для оцінки впливу еновіну на різні типи клітин, проводили два аналізи: аналіз синтезу ДНК та аналіз о хемотаксису.
Аналіз синтезу ДНК іме) Клітини, включаючи людські шкірні фібробласти (39К5), людські ендотеліальні клітини пуповинної вени (НОМЕС), людські клітини гладеньких м'язів (НЕМС), людські хондроцити та остеобласти пацюка поміщали у бо ОМЕМ, що містить 1095 ЕВ5 (39-5К, НЗМС, остеобласти пацюка), або спеціальне середовище (хондроцити та
НОМЕС) при 372С з 5956 СО» та 9595 повітря. Для аналізу синтезу ДНК клітини засівали у 96 пробірок для культури тканин при щільності 5,000 клітин/пробірка у ОМЕМ, що містить 1095 ЕВ5, та інкубували протягом 24 годин. Культуральне середовище потім вилучали з ОМЕМ, що містить різні концентрації еновіну та 0,195 ВБА (для 39-5К, остеобластів, НЗМС, хондроцитів) або ОМЕМ, що містить 0,595 ЕВ (для НОМЕС), та клітини бо інкубували протягом 24 годин. Далі культуральне середовище вилучали з 100мкл ОМЕМ, що містить 595 ЕВ5 та б,їмкСі ІЗНІ-тимідину. Після 2 годин пульсуючого мічення, клітини фіксували за допомогою суміші метанол/оцтова кислота (3:1, об'єм/об'єм) протягом 71 години при кімнатній температурі. Фіксовані клітини двічі промивали 8095 метанолом. Клітини витримували у 0,05950 трипсині (10Омкл на пробірку) протягом 30 хвилин, а потім у 0,590 505 (100мкл на пробірку) протягом додаткових 30 хвилин. Аліквоти клітинних лізатів (180мкл) поєднували з 2мл сцинтиляційної суміші та радіоактивність клітинних лізатів вимірювали при використанні лічильника для рідкої сцинтиляції (У/аМас 1409).
Аналіз хемотаксису
Клітини підтримували так, як описано у "Аналізі синтезу ДНК". Хемотаксичну активність еновіну 70 аналізували, використовуючи модифіковану камеру Бойдена на 12-пробірок |МсОицйШап, О.9У., Напаіеу, С..,
Сатрреїї, М.А., Воїїв, 5., Мім/ау, М.Е., Негіпдіоп, А.С., (1986), "Стимуляція біосинтезу протеоглікану у сироватці за допомогою подібного до інсуліну ростового фактора-І культивованих суглобових хрящах теляти",
Віоспет. 9. 240: 423-430). Клітини піддавали трипсинізації, використовуючи 0,0595 трипсин та О,5ММ ЕДТА та ресуспендували у ОМЕМ. У пробірки камери Бойдена додавали аліквоти 150мкл середовища, що містило різні 75 концентрації еновіну. Полікарбонатні мембрани (8мкм), вкриті О,їмг/мл колагеном типу І, вносили на дно пробірок, далі збирали верхній шар пробірок. До верхнього шару пробірок додавали аліквоти 10Омкл клітин (70,000 клітин/мл). Після б-годинного періоду інкубації апарат роз'єднували. Клітини, що залишались зверху мембрани, вилучали. Мембрани фіксували 1095 формальдегідом протягом 15 хвилин, далі забарвлювали сильним гемотоксиліном Гілла. Клітини підраховували під мікроскопом (250 х збільшення), а середнє значення для клітин розраховували з п'яти ділянок кожної використаної пробірки. Кожний дослід повторювали, принаймі, чотири рази. Результати порівнювали з контролем (ОМЕМ, що містить 0,195 ВБА).
Як представлено результатами на Фігурах з 8 до 18, еновін не має впливу на проліферацію кожного з типів клітин, що використовували, або на міграцію НОМЕС клітин (Фігура 14), як описано вище. Спостерігали вплив еновіну на ЗН-5У-5 У клітини нейробластоми. Це показало селективний вплив еновіну на нейронні клітини. Га
Було показано, що як СОМЕ, так і МТМ, передають сигнали шляхом сигналізуючих комплексів, що складаються з ліганд-зв'язуючої субодиниці, а також ЗЕК 91 або сЕКа?г, сигналізуючої субодиниці, СКЕТ білка о тирозин кінази. Передбачається, що еновін виявляє свій біологічний вплив через подібний сигналізуючий комплекс, що складається з (зЕКо-зв'язуючого партнера (ЗЕКо-1, СЕКоУ-2, або нещодавно охарактеризованого орфанового рецептора ЗЕКо-3, або іншого ще неохарактризованого члена родини СЕКо) у поєднанні з СКЕТ С або іншим сигналізуючим партнером. Дійсно, наші дані показали, що еновін може специфічно зв'язуватись з сч
СЕКа-3.
У людини мутації зародкової лінії у ЗОМЕ або скЕТ можуть приводити до фенотипів деяких хвороб, (2) включаючи розсіяну ендокринну неоплазію та сімейну хворобу Хіршспрунга (НЗСК) |(Котео еї аї., 1994, Едегу еї со аІ,, 1994, Апагізі ей аїЇ.,, 1996). Обидва ці захворювання асоційовані з розладом кишкової рухливості, з хворобою Хіршспрунга найбільш часто зв'язують природжену кишкову обструкцію у немовлят. Цікаво, що СООМЕ в. та СКЕТ кноккоут миші демонструє подібну патологію з нирковою агенезією та кишковим аганліозом ІЗапспез еї аІ,, 1996, Мооге еї аї!., 1996, Ріснеї! еї аІ., 1996). Еновін може бути втягнений у подібні розлади кишечника або нирки, оскільки він експресується у всіх типах тканин і може бути важливим у розвитку інших периферичних « органів у людини.
Взаємодія лігандів зі своїми рецепторами, взагалі, досягається шляхом дії специфічного зв'язку, що т с складається з особливих залишків в обох білках. Фрагменти білка можуть служити як агоністи, що активують "» рецептор, виявляючи свій вплив на ріст та підтримання виживання клітин. Частини еновіну або синтетичні " пептиди, що базуються на білковій послідовності еновіну, можуть, таким чином, бути корисними як агоністи або антагоністи для регуляції рецептора СЕКо-3.
Використовуючи синтез пептидів або техніку рекомбінації, можуть бути одержані гібридні ростові фактори, ш- що складаються з частин ЗОМЕ, МТМ, Р5Р, або будь-якого іншого нейротрофічного, або ростового фактора, з оо частинами еновіну, для отримання нового синтетичного ростового фактора з новими властивостями.
Ставили два досліди для визначення, чи здатний еновін змінювати індуковану таксолом сенсорну і, недостатність у пацюків після субплантарного введення пацюкам. У першому експерименті визначали, чи може
ГІ 20 лікування одним еновіном реверсувати індуковану таксолом сенсорну недостатність, у той час як другий дослід визначав, чи може еновін запобігти розвитку таксол-індукованої сенсорної недостатності. г» Зворотний розвиток індукованої таксолом сенсорної дисфункції
Процедура
Використовували самців Зргадце-Оаумлеу пацюків, вагою 300-340 грамів. Тварин поміщали окремо та 5о забезпечували їжею та водою, як було бажано. Перед початком експерименту тварин поміщали у стандартні
ГФ) клітки для спостереження та після періоду привчання протягом 15 хвилин оцінювали рефлекс за допомогою тесту уколом. Для цього поверхню підошви правої лапи тварин стимулювали за допомогою голки та реактивність де цього тесту визначали як наявну (показник!) або відсутню (показник-0). Протягом одного експерименту процедуру повторювали тричі з інтервалом часу 1 хвилина між 2 послідовними стимулами; такий тест уколом 60 складався з трьох вимірювань реактивності. Тільки пацюки, які мали нормальні реакції на З тести уколом, включались в експеримент.
У З наступні дні уранці тварини одержували ін'єкцію таксолу (Змг/мл паклітаксену, розчиненому у кремафорі та дегідратованому спирті плюс вода) у праву задню лапу. Наступним ранком рефлекс на укол повторно оцінювали та тварин, що не виявили реактивності до З стимулів відбирали. Цих тварин грубо розподіляли на бо підгрупи (п-10/група), їм субплантарно вводили у праву задню лапу 75мкл носія або фізіологічного розчину, 23 або 1ЗОмкг/мл еновіну. Оскільки не спостерігали ніякої різниці між результатами для тварин, оброблених носієм та фізіологічним розчином, обидві групи поєднували (контрольна група). Через 1, 4, 5 та 7 днів після останньої обробки тести уколом проводили як уранці (між 8 та 9 годинами ранку), так і ввечері (між 3.30 та 4.30 вечора). Через 8 днів останній тест уколом проводили уранці. Для кожної тварини одержували кумулятивні дані реактивності до уколу протягом часу. Оскільки загалом 9 тестів уколом (кожний з яких складався з З тестів) проводили після останньої обробки ліками, максимальне значення, що було досягнуте протягом усього періоду часу експерименту, дорівнювало 27.
Результати 70 Повторювані субплантарні ін'єкції таксолу протягом З наступних днів призводили до гострої запальної реакції з відсутністю відповіді на стимуляцію уколом у більшості тварин. Субплантарна ін'єкція фізіологічного розчину або носія не впливала на індуковану таксолом сенсорну недостатність. У першому вимірюванні тільки 4 з 20 контролів показали, принаймі, 1 реакцію до трьох тестів, середнє значення (ЗЕМ) контролів у першому вимірюванні було 0,25 (40,12); на противагу до початку експерименту, коли значення було 3,0 (0,0), оскільки 75 усі тварини відповідали на тест уколом. Навіть після 8 днів вимірювання реактивність у контролях була порушена в 11 з 20 пацюків, що відповідали, принаймі, один раз, а середнє значенням тесту було 0,75 (--0,18).
Усередині цієї контрольної групи жоден з пацюків не демонстрував нормальної реактивності до усіх трьох стимулів. Кумулятивне значення для контролю протягом часу представлено на Фігурі 19. Оскільки усі тварини тестувались 9 разів протягом восьмиденного періоду, максимальне значення було досягнуте у З тестах уколом зі значенням у кожному тесті 27. Як видно з графіка, субплантарна ін'єкція фізіологічного розчину або носія була не в змозі реверсувати індуковану таксолом сенсорну недостатність протягом періоду часу тестування. Середнє значення кумулятивних даних контролів у кінці експерименту було 5,10 ( -0,87), що складало 18,990 максимального значення, яке було досягнуто.
Єдина субплантарна ін'єкція 75мкл 2Змкг/мл еновіну приводила після першого вимірювання у 4 з 10 пацюків Ге до середнього значення 0,70 (0,33). Через 8 днів усі 10 тварин відповідали, принаймі, один раз на тест (5) уколом, а нормальна реактивність була наявна у 5 з 10 пацюків. Середнє значення цього тесту для даної групи через 8 днів було 2,20 (140,29). При порівнянні з контролями середнє кумулятивне значення значно підвищувалось у кінці 8 дня вимірюваня (Мапп-У/піпеу О-тест, двохвостовий, р 0,01), досягаючи середнього значення 14,50 (--1,96) (Фігура 19). Це складало 53,796 максимального значення. с
За допомогою субплантарної ін'єкцією 13Омкг/мл еновіну була покращена дієвість у порівнянні з контролями. с
При першому вимірюванні після введення 1З3Омк/мл еновіну 6 з 10 пацюків відповідали, принаймі, один раз зі середнім значенням тесту 1,10 ( -0,35). Через 8 днів, усі 9 тварин відповідали, принаймі, один раз зі ме) середнім значенням 2,60 (40,22). Нормальна реактивність до З тестів уколом була присутня у 8 з 10 пацюків. со
Середнє кумулятивне значення тесту у кінці експерименту цієї групи було 17,20 (-1,94). Це складало 63,795 від максимально можливого значення та було значно вищим порівняно з контрольною групою (р«0,01). -
Запобігання індукованої таксолом сенсорної недостатності
Процедура
Використовували самців Зргадце-Оаумлеу пацюків, вагою 300-340 грамів. Тварин поміщали окремо та « дю забезпечували їжею та водою, як було бажано. Перед початком експерименту тварин поміщали у стандартних -о клітках для спостереження та після періоду привчання протягом 15 хвилин, оцінювали рефлекс за допомогою с тесту уколом. Для цього поверхню підошви правої лапи тварин стимулювали за допомогою голки та реактивність :з» цього тесту визначали як наявну (показник!) або відсутню (показник-0). Протягом одного експерименту процедуру повторювали тричі з інтервалом часу 1 хвилина між 2 послідовними стимулами; такий тест уколом складався з трьох вимірювань реактивності. Тільки пацюки, які мали нормальні реакції на З тести уколом, -1 15 включались в експеримент.
У З наступні дні уранці тварини одержували ін'єкцію таксолу (Змг/мл паклітаксену, розчиненому у кремафорі (95) та дегідратованому спирті плюс вода) у праву задню лапу. Наступним ранком рефлекс на укол повторно со оцінювали та тварин, що не виявили реактивності до З стимулів, відбирали. Цих тварин грубо розподіляли на підгрупи (п-10/група), їм субплантарно вводили у праву задню лапу 75мкл носія або фізіологічного розчину, 23 ко 50 або 13Омкг/мл еновіну. Оскільки не спостерігали ніякої різниці між результатами для тварин, оброблених носієм "з та фізіологічним розчином, обидві групи поєднували (контрольна група). Через 1, 4, 5 та 7 днів після останньої обробки тести уколом проводили як уранці (між 8 та 9 годинами ранку), так і ввечері (між 3.30 та 4.30 вечора). Через 8 днів останній тест уколом проводили уранці. Для кожної тварини одержували кумулятивні дані реактивності до уколу протягом часу. Оскільки загалом 9 тестів уколом (кожний з яких складався з З 59 тестів) проводили після останньої обробки ліками, максимальне значення, що було досягнуте протягом усього
ГФ) періоду часу експерименту, дорівнювало 27. 7 Результати
Субплантарна ін'єкція фізіологічного розчину або носія перед введенням таксолу не запобігала індукованій таксолом сенсорній недостатності у тесті уколом. При першому тестуванні після введення таксолу 8 з 20 пацюків бо відповідали, принаймі, один раз на тест уколом, з середнім значенням 0,60 (0,18). Через 8 днів таксол-індукований дефіцит все ще був присутнім, тільки 8 з 20 тварин відповідали на подразнення та мали середнє значення тесту уколом 0,8 (40,23). У двох тварин був наявний нормальний рефлекс на укол. Протягом часу кумулятивне значення також знижувалось і досягало середнього значення 6,55 ( 41,08), що складало 24,390 д5 максимального значення (Фігура 20).
Попередня обробка 2Змкг/мл еновіну зменшувала таксол-індуковану сенсорну недостатність у тесті уколом.
Через один день 8 з 10 тварин відповідали, принаймі, один раз, а середнє значення тесту було 1,70 (--0,40).
Через 8 днів усі тварини відповідали на тест, а середнє значення складало 2,50 (0,27). При цьому 7 тварин виявляли нормальну реактивність в усіх дослідах. Беручи до уваги кумулятивні значення, одержані протягом усього часу (Фігура 20), середнє значення було суттєво вищим (р 0,01) порівняно з контрольним рівнем 18,40 (4-1,73); це складало 68,195 максимального значення.
Порівняні результати були одержані після попередньої обробки 13Омкг/мл еновіну. При цьому 6 з 10 тварин відповідали протягом першого тестування зі значенням тесту 1,70 ( 40,31). Через 8 днів усі тварини реагували, принаймі, один раз на стимуляцію зі середнім значенням 2,40 ( 40,22), та усі три реакції були нормальними у 70 половини тварин. Беручи до уваги кумулятивні значення, одержані протягом усього періоду часу, середнє значення, одержане через 8 днів, було 17,70 (4-1,92), що складало 65,595 від загального.
Дана серія експериментів показала, що єдина субплантарна ін'єкція еновіну здатна зменшити таксол-індуковану сенсорну недостатність, що було підтверджено за допомогою тесту уколом. Активність було продемонстровано, коли ліки вводили або перед, або після обробки таксолом.
Еновін є можливим кандидатом для лікування больових синдромів з переважно периферичним та центральним нейрогенним компонентом, ревматичних/запальних захворювань, а також порушень провідності та може грати модуляторну роль у сенсорних процесах після трансдермального, місцевого, локального, центрального (такого як епідуральне, введення усередину суглоба, тощо) та системного застосувань.
Крім того, він може використовуватись як діагностичне знаряддя для відбору на фізіопатологічні зміни у сферах, що зазначені вище.
Порівняння експресії мРНК еновіну у нормальних на хворих тканинах
Експресію мРНК еновіну кількісно аналізували, використовуючи АВІ Ргізт 7700 систему для виявлення послідовностей (ТадМап; Регкіп ЕІтег), використовуючи пріоритетну технологію, запропоновану, розвинену та виконану РНпагтадепе І арогайгіеєз Ца, Коувіоп, Опіей Кіпддот. Система служила як флуоресцентна проба для с генерації специфічних для послідовності флуоресцентних сигналів під час ПЛР. Зразок представляв собою Ге) олігонуклеотид з флуоресцентним детектором та приєднаним до нього гасником, він розміщувався між прямим та зворотним праймерами ПЛР. При взаємодії інтенсивність детектора флуоресценції супресувалась за допомогою гасника. Якщо зразок формував частину реплікаційного комплексу, флуоресцентний детектор піддавали розсіканню з гасника шляхом 5 до 3 екзонуклеазної активності, що притаманна Тад полімеразі. с
Збільшення флуоресцентного детекторного сигналу при реакції вимірювали безпосередньо шляхом акумуляції с продукту ПЛР. Початкова кількість копій мРНК цільової послідовності (Сп) виявлялась за допомогою визначенням номера фракційного циклу ПЛР (СО, при якій продукт ПЛР вперше визначається як точка, при якій б» флуоресцентний сигнал проходить Через поріг базової лінії. Кількісне визначення кількості цільової МРНК в с кожній пробі визначали за допомогою порівняння експериментальних значень Сі зі стандартними кривими. 3о Приготування РНК та якісний контроль -
Загальну РНК ізолювали з цілої та роздрібленої тканин, використовуючи Тгі-2о! реагент (Ге Тесппоіодіев,
Сайпегриго, МО, О5БА) згідно з прописом постачальника. Способи якісного контролю для усіх зразків РНК включали як оцінку цілісності (інтактні 185 та 285 рибосомальні РНК), так і визначення присутності високого « надлишку (актин) та низького надлишку (рецептор трансферіновий рецептор) транскриптів.
Визначення праймер/проба З с Пара праймерів та ТадМап зразок були призначені для ампліфікації специфічної послідовності еновіну "» Праймер 1: У АСОСТТСТОСАСОТОСТОТт 3 " Праймер 3: УТОСТОССОА СССАСО 3
Праймер 5: 5 СТАССДАОСООСТСТОоСТТСАТОСАСО 3
Крім того, пара праймерів та ТадМап зразок були призначені для визначення діапазона інтрона, який - ампліфікували як частину людського гена СОАРОН 2) Праймер 2: 5 САСАСТТААААССАССССтТОСТ 3 і, Праймер 4: ма 70 5Б' ЗАДОСТОАДАОСТСОСАСТСААС 3
Проба 6: їз 5 ТТТООСТоСОтТАТТОСОСОССТт З
Пробу 5 мітили фтор Рат, у той час як пробу 6 мітили фтор МІС.
Обробка ДНКазою загальної РНК
Для кожної тканини, яку піддавали тестуванню, 2,2мкг загальної РНК перетравлювали з 2 одиницями вільної
ГФ) від РНКази ДНКазою (сСірсо ВКІ) протягом 15 хвилин при кімнатній температурі у 20мкл об'єму 1 х ДНКазного буфера (Сірсо ВК). Реакцію зупиняли доданням 2мкл 25мММ розчину ЕДТА. Зразки потім інкубували при 6592С о протягом 10 хвилин для інактивації ферменту.
Синтез першого ланцюга кДНК 60 Для кожної тканини, яку піддавали тестуванню, 1ООнг загальної РНК використовували як матрицю для синтезу першого ланцюга кДНК. РНК в об'ємі 4мл та в присутності БОНМ праймерів 1 та 2, 1 х буфер для ПЛР ІЇ (Регкіп ЕІтег) та 5мММ Маосі» підігрівали до 722С протягом 5 хвилин та повільно охолоджували до 5520. Після додання всіх реагентів бмл реакційної суміші інкубували при 482 протягом 30 хвилин, після чого проводили інактивацію ферменту за допомогою етапу прогрівання до 902С протягом 5 хвилин. Умови заключного етапу 65 були наступними: 1х буфер для ПЛР ІІ, 5хмМ Маосі», їмМ аАТР, аттР, астре, астр, 12,5 одиниць МиЇ М зворотної транскриптази (бібсо ВК).
ПЛР ампліфікація першого ланцюга продуктів КДНК
КДНК, що походить від 1ООнг загальної РНК, для кожного зразка піддавали ПЛР ампліфікації в єдиній реакції
Для ідентифікації як мішені, так транскриптів ЗАРОН. Кінцеві праймер/зразок концентрації для мішені були
ЗООНМ праймера 1, ЗООНМ праймера З та 200НМ зразка 5, те саме для ЗАРОН складало 20НМ праймера 2, 20нМ праймера 4 та 100нНМ зразка 6. Заключна концентрація інших реагентів у реакції складала наступною: 4,590 гліцеролу, 1 х ТадМап буфера А (Регкіп ЕІтег), 6,25ММ Маосі», 430ОМ ЗдАТР, ТР, асСТтР, астР, 2,5 одиниці
АтріїТад Соїд. ПЛР ампліфікацію виконували в АВІ 7700 системі для визначення послідовності, початковий етап 7/о інактивації ферменту проводили при 942С протягом 12 хвилин, після чого виконували 45 циклів при 9490 15 секунд та при 602С протягом 1 хвилини (мінімальний час).
Захворювання та тканини, що піддавали тестуванню
Транскрипцію мРНК еновіну порівнювали у тканинах, що походять від хворих пацієнтів та осіб, що були нормальним контролем (Фігури 25 та 26). Таблиця нижче показує захворювання та відповідні тканини, які 75 піддавали оцінці. Для кожних умов аналізували три зразка хворих та три контрольні проби.
Патологія Тканина 1 Тканина 2 Тканина З
Хвороба Темпоральна коркова речовина гіпокампус окципітальна коркова речовина
Альцгеймера
Розсіяний склероз спинний мозок перивентикулярна біла речовина мозочок
Хвороба Паркінсона чорна речовина Латерально розміщена частина сочевицеподібного мозочок ядра
Пухлина аденокарцинома ободової аденокарцинома грудної протоки сквамозні клітині карциноми кишки легенів с
Статистичний аналіз о
Для кожної групи з З тканин розраховували середнє значення та стандартне відхилення на Сі значеннях (які є нормально розподіленими), потім конвертували у Сп значення згідно з формулою Сп-10 «Сі-40,007/-3,625),
Аналіз варіації (АМОМА) виконували на Сі значеннях також для порівняння середнього значення експресійних рівнів еновіну у нормі проти хворих тканин. с
Фігури 25 та 26 показують середнє значення числа копій мРНК еновіну (450; п-3) у хворих тканинах проти сч контрольних тканин. Статистичний аналіз показав значне збільшення рівнів екпресії еновіну у перивентикулярній білій речовині у пацієнтів з розсіяним склерозом (р-0,013). Внутрішній ЗАРОН контроль не показав значної (22) різниці (р-0,79). Крім того, експресійний рівень еновіну у перивентикулярній білій речовині був значно нижчим со у нормальній тканині (при середньому значенні 270 копій на 10Онг загальної РНК проти 200000 копій САРОН),
Зо рівень був у три рази вищим (825) у пацієнтів з розсіяним склерозом. в.
Тільки одна з хворих тканин показала значну різницю проти нормального контролю: в аденокарциномі грудної протоки експресійний рівень мРНК еновіну був у б разів вищим (6000 проти 1000; р-0,007), але контрольне значення для САРОН було також дуже високим (165000 проти 440004 р-0,03), що дійсно представляло загальне « збільшення у рівнях мЕеНК.
Таким чином, ми знайшли, що рівні мРНК еновіну підвищуються у перивентикулярноїй білій речовині пацієнтів о) с з розсіяним склерозом. "» Фосфо-специфічного антитіла також можуть використовуватись у тесті ЕГІ5ЗА, що базується на використанні " клітин для відбору еновін-мімететичних на СЕКОУЗ/сСКЕТ рецепторного комплексу.
Метод може також використовуватись для ідентифікації агоністів або антагоністів інших нейротрофічних рецепторів, таких як СЕБо1, СЕБо2, СЕВой4, ТКА, ТгКв та ТКС. 7 Аналіз оз Використовуючи цей аналіз, ми можемо ідентифікувати агоністичні або антагоністичні сполуки нейротрофічного ростового фактору шляхом вимірювання активності ключових сигналізуючих кіназ, що о активуються у нейротрофічному шляху, або за допомогою вимірювання активації СКЕТ рецептора кінази. ка 20 Активація вимірюється шляхом визначення кількості фосфорильованої кінази або рецептора кінази при використанні фосфо-специфічних антитіл. Ми використовували МІН З3Т3З клітини, що експресують випадково або о постійно ТКА, ТтКкВ, ТКС, ЕКо1/скЕТ, СЕКог/сКЕТ, СЕКоЗ/сКЕТ або СЕКод/сКЕТ.
Активація р42/р44 МАР кінази, РКВ кінази, с-ї0п, СКЕВ, УМК/5АРК кінази та інших кіназ визначається при використанні комерційно доступних фосфо-специфічних антитіл. Крім того, СКЕТ активація може бути ділетована 99 при використанні фосфо-специфічного СКЕ Т-антитіла.
ГФ) Пропис, що використовували, полягає у наступному: з - Поміщали МІН ЗТ3З клітини у 96 пробірок з 1095 телячою сироваткою, клітини були на 8095 злитими перед стимуляцією. - Наступного дня замінювали середовище на вільне від сироватки середовище та виснажували клітини 60 протягом 18-24 годин. - Після голодування стимулювали клітини за допомогою сполук та нейротрофічних факторів як позитивний контроль (1Онг/мл для нейротрофічних факторів). - Фіксували клітини з 496 формальдегідом у РВЗ при 42С протягом 20 хвилин. - Промивали клітини Зх за допомогою 200мкл РВБЗ/О,195 Тритон протягом 5 хвилин. 65 - Насичували клітини за допомогою 1О0Омкл 0,695 Н2О» у РВЗ/О,196 Тритон протягом 20 хвилин.
- Промивали клітини Зх за допомогою 200мкл РВБЗ/О,195 Тритон протягом 5 хвилин. - Блокували клітини за допомогою 100мкл 1095 бичачої фетальної плазми у РВБЗ/0,196 Тритон протягом 60 хвилин. - Інкубували клітини з фосфо-специфічним антитілом у 5Омкл 595 ВБА// РВБ/О,195 Тритон протягом ночі при 49С. Розведення антитіл може бути експериментально визначене, найбільш бажане те, яке складає запропонований рівень 1:100-1:250. - Промивали клітини Зх за допомогою 200мкл РВЗ/0,196 Тритоном протягом 5 хвилин. - Інкубували клітини з вторинним антитілом, зв'язаним з НКР, у розведенні 1:100 у ббмкл ВЗА/РВЗ/О,190 70 Тритон протягом 1 години при кімнатній температурі. - Промивали клітини Зх за допомогою 200мкл РВБЗ/О,195 Тритон протягом 5 хвилин. - Розчиняли 1 таблетку ОРО (Зідта) у 25мл буфера (3,65г лимонної кислоти-НО та 5,9г МагНРО,-2Н.О у
О,51мл НО, рН 5,6) та додавали 12,5мкл Н»2О». Додавали 5Омкл до кожної пробірки та інкубували протягом 15 хвилин у шейкері (200об./хв), закритих алюмінієвою фольгою. - Зупиняли реакцію доданням 25мкл НьЗО»,. - Вимірювали оптичну щільність при довжині хвилі 490-65Она на пристрої для зчитування ЕГІ5А.
Мезенцефальна допамінергічна нейронна культура
Нейронна культура
Нейронні культури готували з вентрального середнього мозку зародка пацюка шляхом ферментативного та механічного роздрібнення. Тканину збирали, промивали в охолодженому за допомогою льоду вільному від Са?" та Ма?" забуференому фосфатом у фізіологічному розчині, що містить 0,696 глюкози (РВ5О) та інкубували протягом ЗО хвилин з РВ5О, що містить 0,190 трипсину при 372С. Клітинну суспензію поміщали при щільності 2,5х10Уклітин/см2 у 96 пробірочний МОМС планшет для культури тканин. Далі чашки з культурою покривали полі-І -орнітином та СОМ, що містить 1095 фетальної телячої плазми. Культури підтримували у хімічно чистому ЄМ середовищі (СОМ), що складалося з 1:1 суміші модифікованого Дюльбекко середовища Ігла та Е12 поживного о середовища, збагаченого глюкозою (0,690), глютаміном (2мМ), бікарбонатом натрія (ЗмМ), НЕРЕЗ (5ММ), інсуліном (25мкг/мл), людським трансферріном (10Омкг/мл), путресцином (бОмкг/мл), селенітом натрію (ЗОНМ), стрептоміцином (1ООмкг/мл) та пеніциліном (10010/мл).
Обробка нейротрофічними факторами с
Нейротрофіни розчиняли у 0,595 альбуміні бичачої сироватки. Нейротрофіни додавали через З години після с ініціюючого висаджування та через 5 днів культивування у культурі. Таку саму кількість 0,595 альбуміну бичачої сироватки додавали до контрольних пробірок. ме)
Високоафінне споживання допаміну со
Споживання допаміну вимірювали через 10 днів. Для цього клітини двічі промивали попередньо підігрітим
Зо РВ5, збагаченим глюкозою (5ММ), аскорбіновою кислотою (100мМ) і паргіліном (100ММ) та пре-інкубували - протягом 10 хвилин у тому самому розчині. Розчин для пре-інкубації замінювали тим самим розчином, що містить 5ОнНМ |ІЗНІДА та інкубацію продовжували протягом 15 хвилин при 372. Споживання зупиняли шляхом трьох швидких промивань охолодженим до нульової температури РВ5. Акумульований ІНІ допамін вивільняли « 20 інкубацією з підкисленим етанолом протягом 30 хвилин при кімнатній температурі. Радіоактивність визначали з після додання 4мл сцинтиляційної рідини (Раскага ишйіта дод ММ), використовуючи РасКага сцинтиляційний с лічильник. Неспецифічне споживання визначали шляхом додання 20мкМ кокаїну. ;» - с
Ф о де пз
Клітини вирощували протягом 10 днів у присутності або при відсутності еновіну. Необроблені контролі вв представляли як 10095. Результати були одержані у 1-5 незалежних експериментах.
Список скорочень (Ф; ВІ А5Т- базисний локальний метод дослідного вирівнювання г п.о. - пари основ
КДНК - комплементарна ДНК во ЦНО - центральна нервова система
Е5Т - експресована послідовність-мішень
ЕММ - еновін
СОМЕ - нейротрофічний фактор, що походить від гліальної лінії клітин
СЕК, - рецептор о для родини ООМЕ 65 ОРІ - глікозил фосфатидил інозітол
МТС - кДНК з різних тканин
МТМ - неуртурін
РОК - полімеразна ланцюгова реакція
РМЗ - периферична нервова система
Р5Р - персефін
КТ-ПЛР - зворотна ПЛР транскрипція
ТОР - трансформуючий ростовий фактор В
РІБН - флуоресцентна гібридизація іп ві
МТМ - нозерн з багатьох тканин 70 МО - нервовий ростовий фактор
ЗРК - поверхневий плазмон резонанс
Список посилань 1. Аїївспш, 5.Р., Сівй, МУ., МіШег, МУ., Муеге, Е.МУ. 5 ІГіртап, 0.3. (1990) Вавіс, Іоса! аїдптепі зеагсі (сої,
У. Мої. Віої. 215, 403-410. 2. Апагіві, М., Воїк, 5.,.НаїшзйКка, М., І арспак, Р.А. «5 СпакКгамагії, А. (1996) Сегтіїпе тшиайопз іп діа! сеї
Іпе-дегімей пеигоїгорпіс Тасіог (ЗОМЕ) апа КЕТ іп а Нігзсизргипд дізеазе райепі Майшге Сепеїйїсв 24, 341-344.
З. Вас, К.Н., Тапзеу, М.0., СоіІдеп, 9У.Р., Стеедоп, ОО.) НеисКегоїй, К.О., КескК, С.Ї., йітопіїс, О.В.
Рорезси, М.С., допйпзоп, Е.М. 5 Міїргапаї 9. (1997) ТтпК2, а поме! гесеріог (Шйаї тедіаєевз пешипигіп апа СОМЕ зідпаїїпу (пгоцд Кеї. Мешгоп 18, 793-802. 4. Ваїонй, К.Н., СогодіпезКу, А., СоіІдеп, 9У.Р., Тапзеу, М.б., Кеск, С.Ї., Рорезси, М.С., доппзоп, Е.М. «
МіїБгапає 3. (1998) СЕКаЗ ів ап огрпап тетрег ої (Ше СОМЕ/пешипигіп/регзерпіп гесеріог Тату. Ргос. Май.
Асаай. Зсі. ОБА 95, 5801-5806. 5. Ват, Р.). 1991 Маттаїап зиБбіівіпг: (пе Іопд-зоцдні аїбавіс ргосезвіпд епдоргоїеазевз. Сеї|. 66,1-3. 6. Веск, К.О., Маїмегає, .., АІехі, Т., Роцівзеп, К., МоїМаї, В., Мапаїіеп, КА., Козепіна!ї, А. 5 Нейі, Р. (1995) с Мезепсернаїїс доратіпегдієс пейгопз ргоїесієій Бу СОМЕ їот ахоїту-інпдисей дедепегайоп іп Ше айдишїє ргаїп.
Майшге 375, 339-341. о 7. Вііапо-ВіІецеї, А., Кеманй, Р., Соїіп, Р., Госацеї, І.., Кореп .9У., МайПеї, 9У. 5 НогеПои, Р. (1997) Іпігавігіайа! іпіесійоп ої апо адепомігаї месіог ехргезвіпуд // діїаІ-сеїІ-Іпе-дегімей пецгоїгорпіс Тасіог / ргемепів доратіпегдієс пейгоп дедепегайоп апа репаміога! ітраїптепі іп а гаї тоде! ої РагКіпвоп дівеавзе. Рос. Май. су
Асад. Зсі. ОБА 54, 8818-8823. 8. Виі-Вейо, А., Висптап, М.Г., Ногіоп, А., Козепійа!І, А. 5 ЮОаміез А.М. (19953 БОМЕ ів ап аде-зресійс с зигміма! Тасіог Тог зепзогу апа ашопотіс пешгопз Мешгоп 15, 821-828. Ф 9. Виі-Веїо, А. Ади, 9., Ріпоп, Г.О.Р., Ногіоп, А., Тпотрзоп, у., Козепіпаї!, А., Спіпспейги, М., Висптап, М... 5
Оаміез, А.М. (1997) Мешгіигіп гезропзімепевз5в гедцігез а ОРІ-йпКей гесеріог апа (пе Кеї гесеріог (уговіпе і.
Кіпазе. Маїиге 387, 721-724. ї- 10. Споі-Ї ипарего, О.Г., іп, О., Спапо, У.М., Спіапао, МУ.Г., Нау, СМ., Мопаїетгі, Н., Оамідзоп, В.Г. 5 Войпп, М.С. (1997) Ооратіпегдіс пейгопз ргоїесівед їот дедепегайоп бу СООМЕ депе (Пегару. Зсіепсе. 275, 838-841. 11. Сгеедоп, О0.)., Тапвеу, М.О., Ваїой, К.Н., ОзБрогпе, Р.А., Іатре, Р.А., Райгпег, Т.)., НеискКегоїйй,
Р.О., МіїЇргапаб У. 5 Оойпзоп, Е.М. (1997) Меипигіп 8зПпагез гесеріогз апа відпа! ігапздисіоп раїймжаув й « 0 Зіїа! сеї! Іпе-дегімей пепгокорпіс Тасюг іп зутравНеїйс пейгопв. Ргос. Май). Асад. зсі. ОЗА 94, 7018-7023. шщ с 12. ЮОигрес, Р., Магсовз-Сц(егте, С.М., КіКеппу, С, Огідогіош, М., УУапіомжаага, К., Зимапіо, Р., Зтйй, й О., Ропаег, В., Совіапііпі, Г., 5аагта, М., Загіоїа, Н. « Расіпів, м. (1996) СОМ відпаїйпо (годи (Ше КЕТ «» гесеріог іуговіпе Кіпазе. Маїиге 381, 789-793. 13. Едегу, Р., Гуоппеї, 5., МиїПдап, І.М., Реїеї, А ому, Е., Абеї Г., Ноїдег 5., Міпоці-РеКеїе, С, Ропаег, В.А. 5
Миппісн, А. (1994) Миїакопег ої (пе КЕТ ргою-опсодепе іп Нігеспзргипу з аізеазе. Маїцге 367, 378-380. -і 14. Сазп, О.М., 2папо, 7., Омадіа, А., Савзв, МУ.А., Мі, А Зіттегптап, І/., КизгзеїЇ, О., Мапіп, О., І арспак,
Р.А Соїіпв, Р., НоПег, В.У. 5 Сегпагаї, С.А. (1996) Рипсіопа! гесомегу іп рагкіпвопіап топКеуз ігеаіей м/п о СОМЕ. Маїшге 380, 252-255.
Те) 15. СгКа Мотепсіаїйге Соттшее (1997) Мотепсіацшге ої ОРІ-йпКей гесеріоге Тог Ше СОМЕ Іїдапа Тату.
Меншгоп 19, 485. де 16. НакКіт А "Івспетіс репитьга: (Пе (пегарешііс м/іпдом/" Мешигоіоду. 1998 Зер; 51 (З Биррі 3):5 44-6. з 17. Непаегзоп, С.Е., Рийірв, Н.5., РоїоскК, К.А., Юаміез, А.М., Іетецше, С, Аптапіпі, М., Зіттопв, Ї.,
Мопйеї, В., Мапаіеп, К.А., Коїїаїво5, М.Е. б Козепіпа!), А. (1994) СОМЕ: а роїепі зигмімаІ! Тасіопог тоїопеигопз ргезепі іп регірпега! пегуме апа тизсіе. Зсіепсе 266, 1062-1064. 18. Непо, Н.Н.О., Заціге, У. 8 Твиці, Ї.-С. (1992) Нідн гезоїшщіоп тарріпд ої таттаїййап депез ру іп віш
Нубгіаігавоп (юю їтее спготаїйп. Ргос. Май). Асад. Зсі. ОБА 89, 9509-9513. іФ) 19. Непо, Н.Н.О. 8 Твиії, Г.-С. (1993) Модез ої ОАРІ рапаїпод апа зітиМапеоиз іп зйши Пубгіаігакоп. ко Спготозота 102, 325-332. 20. НеисКегоїй, К.О., Кої2грацег, Р Сореїапа, М. йрег, 0.) ОепКіпв, М.А., 2ітопііс, О.В., Рорезси, во М.С., доппвоп, Е.М. 8 Міїбгапаєб 3. (1997) Меипигіп, а поме! пецйгоїгорніс Тасіог, із Іосаїйлей 0 тоизе спготозоте 17 апа питап спготозоте 19ріЗ.3. Сепотісв 44, 137-140. 21. діпду, 5., Меп, О., Ми, М., Ноївї Р.Ї., Го, МУ., Рапд, М, Татіг, К.. Апіопіо, Ї., Ни, -7, С.ирріев,
К., Гоців, 9У-С, Ни, 5., АйгосК, В.МУ. б Бох, .М. (1996) СОМЕ-іпдисей асіїмайоп ої (Ше геї ргоїеіп (угозвіпе
Кіпазе із тедіаєеай ру СООМЕК-а, а помеї гесеріог ог СОМЕ. Сеїї! 85, 1113-1124. 65 22. діпа, 5. Ми, У., Рапа, М, Ни. 72., Ноїві, Р. Воопе, Т., Оеєіапеу, 9У., Зспине, Н., 2пои, К. «5 Рох, О.М. 1997
СЕкКа-2 апа бЕКа-3 аге їмо пем/ гесеріогз ог Ідапаз ої (пе СООМЕ Татійу. У. Вісі. Спет. 272, 33111-33117.
23. Кіпозієу, О.М. (1994) Те ТОБ-рейа зирепатіу: пем/ тетрбегв5, пем/ гесеріогв, апа пем/ депеїйіс (евів ої
Типсфоп іп айегепі огдапізтв. Сепез 5 ЮемеІортепі 8, 133-146. 24. КіІвіп, К.О., Зпепгтап, О., Но, МУ-Н., ЗЮпе, ОО Веппей, .Ї., МоПаї, В.., Мапаієп, К., бБіттопе, ЇЇ си,
О., Нопдо, .-А., Юемаих, В., Роцівеп, К., Агтапіпі, М., Могакі, С, Аваї, М., Соадага, А., РпПйірв, К.,
Непдеггзоп, С.Е., Такапазнпі, М. « Козепінпа!Ї, А. (1997) А ОРІ-йпКей ргоїеіп (паї іпіегасів мйп Кеї Юю їогт а сапаїдаєе пешигпіигіп гесеріог Маїиге 387, 717-721. 25. Коіг6рацег, Р.Т., Ї атре, Р.А., НеисКегоїй, Р.О., Соїдеп, 9.Р., Стеедоп., Ю.)., допйпзоп, Е.М. 5 Міїргапаї, 9. (1996) Меигіигіп, а геіайме ої дііаІ-сеїІ-Іпе-дегімей пеигоїгорпіс Ттасіог. Майге 384, 467-470. 70 26. іп, Г-Р.Н.О, Оопепу, О.Н., Ше, 9У.О0., ВеКезви, 5. б Соїіпв, Р. (1993) СОМ: а діа! сеї! Іпе-дегімейд пешигоїгорпіс Тасіог Тог тідьгаіїп доратіпегдіс пешгопз Зсіепсе 260, 1130-1132. 27. Мапаєї, МК.)., Зргай, 5.К..Зпудег, К.О. й ей, 5.Е. (1997) Міадьгайїйп іпіесйоп ої гесотріпапі адепо-аззосіайвей мігоз епсодіпу гаї діїа! сеї Іпе-дегімей пецгоїгорпіс Тасіог ргоїесів підгаї пешгоп5 іп а ргодгеззіме 6-пудгохудоратіпе-іпдисед дедепегайоп тоде! ої РагКкіпвоп'з адівеазе іп гаїв. Ргос Масг2 Асад. 7/5 Зсі. ОА 94, 14083-14088. 28. Магедеп ей ан "Те сацйзев5, ої РагКіпзоп'є дізеазе аге Беїпуд ципгамеіей апа гайопа! пеийгоргоігесіїме
Іпегару із сіозе (о геаійу". Апп Меийгої!. 1998 Зер;44(3 5и,ррі. 1):5 189-96. 29. Мазиге, 5., Сік, М., Рапоа|оз, М.М., Вопамепінцге; Р., Мегпаззеї!, Р., І езаде, А.5., І еувеп, У.Е. 5 богдоп К.О. (1998) Моїесціаг сіопіпо, ехргезвіоп апа ііїзвце дівііршіоп ої дііаІ-сейІ-Іпле-дегімей пешгоіїгорпіс тТасіог 2о Татйу гесеріюг а-3 (5ЕКа-3). Ешг. у). Віоспет. 251, 622-630.
З0. Маївизпйа, М., Еційа, М., ТапаКа, М., Мадаїви, Т. 85 Кіиспі, К. (1997) Сіопіпд апа вігисішга| огдапігайоп ої (пе депе епсодіпд (Те тоизе діа! сеї Іле-дегімей пешигоїгорпіс Ттасіог, ЗОМЕ. Сепе 203, 149-157. 31. Міїргапаї, У. де Запймаде, БГ.)., Райпгпег, Т.)., Ваой, К.Н., Іейпег, М.Ї., Тапзеу, М.б., Іатре, Р.А.,
НеисКегоїй, К.О., Коїграцег, Р.Т., бітригдег, К.5., Соідеп, У.Р., ЮОаміез, 9У.А., Меізада, К., Ка, А.С. сч
Нупез, М., ЗПпегтап, О., Мівпітига, М., МУапо, Г.С., МапаІеп, К., Мойаї, В., Кієвїп, "К.О., Роцівзеп, К., Огау,
С, Сагсевз, А., Непдегвоп, С.Е., РПййїрв, Н.5. б доппзоп, Е.М. дуг. (1998) Регвгерпіп, а поме! пеигоїгорпіс Тасіог (8) геіаїед ю СОМЕ апа пеипигіп Мешйгоп 20, 245-253. 32. Мооге, М.МУ., КіІеіп, К.О., Рагіпавз, І., Бацег, Н., Аптапіпі, М., Рийірв, Н., Кеїіспагаб .Р., Куап,
А.М., Сагмег-Мооге, К. 5 Козепіпа!, А. (1996) Кепаї апа пешгопа! арпогтаїйіев іп тісе Іаскіпд СОМЕ Майшге с зо 382, 76-79. 33. Моипі, Н.Т., Оеап, О0.О., АїІрегсп, У, Огеутизв, С.г. б ВіасК, І.В. (1995) а! сеї| Ііпе-дегімей с пейгоїгорніс Тасіог рготоїез Ше зигмімаї апа тогрпоіодіс айегепнаноп ої Ригкіпіе сеїїв Ргос Май. Асай. ду
Зсі. ОБА 52, 9092-9096. 34. Маду 7. ей аі "Те сеї| аїмівіоп сусіе апа (Ше раїпорпузіоюду ої АІ2гПпеітегв аізеазе" Меийгозсіепсе. ме) з5 1998 Овес: 87(4):731-9. ча 35. Мамеїпап, Р., Вацаеї, С, Мікаєїв А., Зпеп, І. УМевірпа!, Н. 5 ЕЄтіогв, Р. (1998) Ехргезвіоп апа гедшайоп ої СЕКаз, а аа! сеї І пе-дегімед пеигоїгорпіс Тасіог Тату гесеріог. Ргос. Май). Асад. Зсі. ОБА 55, 1295-1300. 36. Миудепз К, Оіврегвуп б, Мап деп Кіероот б, Юе допуд М, Соппоге К, КатаекКегз Е, Вогдеге М, Сеегів Н "ВеІ-2 ргоїесів пешпигопаї! сеїЇв адаіпзі--ахоІ-іпдисейд ароріовіз Бу іпаисіпд тийі-писіеакоп", зибтінНеа. « 37. Орреппеїт, К.МУ., Ноцепои, І.)., доппвоп, 9У.Е., іп, С.Р., Гі, С, Го, А.С., Мемвоте, А.Ї., Ргемеце, О.М «к з с УУапао, 5. (1995) ЮОемеІоріпд тойог пешгопз гезсуед їот ргодгаттей апа ахоїту-іпдисей сеї! деайй ру СОМЕ.
Майшге 373, 344-346. з 38. РіспеІ У.0б., Зпеп, Ї., Зпепо, Н.2., ОСгаппоїт, А.С ЮОгадо, 9., Огіпрегд, А., ее, Е.)., Ниапо, З.Р.,
Заапта, М., НоїПег, В.9)., Загіоїа, Н. 5: МУевірнаї, Н. (1996) Оетесів іп епіегіс іппегмайоп апа Кідпеу демеюортепі іп тісе Іаскіпда СОМЕ. Маїшге 382, 73-76. -І 39. Котео, О., Копспено, Р., о, М., Вагопе, М., Зегі, М., СесспПегіпі, !., Равіпі, В., Воссіагаї, К.,
ІЇегопе, М., Каагіаїпеп, Н. еї аї. (1994) Роїпі тшайопз айпПесіїпд (Ше (уговіпе Кіпазе дотайїйп ої (Ше КЕТ о ргоїо-опсодепе іп Нігзспзргипу' з дізеазе. Маїшиге 5: 7,377378.
Ге) 40. Запспе, М.Р., 5йовз-Запііадо, І., Егізеп, у., Не, Б Гіга, 5.А. « Ваграсід, М. (1996) Кепаї! адепевзіз апа (ШТе арзепсе ої епіегіс пешгопв іп тісе І(аскіпда ЗОМЕ Маїшиге 382, 70-73. де 41. Запісоїа, М., Невзвіоп, С, МуУогіеу, О., Саптійо, Р ЕПгепіеів, С, УУаїш5, Ї., Кобріпзоп, 5., Чамогекі,
Ге б., МУеі Н., Тігага, МК. МУпіцу, А., РеріпзКу, К.В. 5 Саїе, К.І. (1997 МПа| сеї| Іпе-дегімей пеигоїгорпіс
Тасіог-дерепдепі КЕТ асіїмайоп сап Бе тедіагєйд ру йо айегепі сеї-зипасе ассезвогу ргоїеіпв. Ргос. Май.
Асай. Зсі. ОБА 94, 6238-6243. 42. Зтігпома ей а "Тиготріп ів ап ехігасеїШаг відпаІї (паї асіїмайез іпігасеїїшіаг деай ргоїеазе раїпжмауз іпдисіпд ароріовів іп тодеї! тоїог пейигопвг". ) Меийгобіо!. 1998 УиІ;36(1):64-80.
Ф) 43. Згіпімзап еї ан! "БЗегит їїот райепів м/ййп о їуре 2 адіарефев м/йй пецйгораїйу іпдисев ка сотріетепі-іпдерепадепі, саІсішт-дерепадепі ароріовів іп сийигей пешцгопа! сеїЇв". 9.СіІп. Іпмеві 1998 Осі 1; 102(7): 1454-62. во 44. З(едег С "Ап о ипріазей дефесіог ої сигмійпеаг вігисігез "СЕБЕ Ттапзасіопз оп рацЦегп апаїувзів таснпіпе іпіеїйїїдепсе", 20, 2, 113-125 (1998). 45. Зимапіо, Р., ММапіомаага, К., Гіпдані, М, Агитає, О., Мозппуаком, М, НогеїІї-Кийпеп, М. Аїігаквіпеп,
М.5. , Раїойе, А., Загіоїа, Н. 5 Заапта, М. (1997) Сіопіпд, тфМА аїзігіршщіоп апа спготозотаї! Іосайїізайоп ої
Ше де-пе їог діа! сеї| Іпле-дегімей пешйгоїгорпіс Тасіог гесеріог р, а Ппотоіодце о СОМЕкКа. Нитап Мо). 65 Зепеї. 6, 1267-1273. 46. Тотас, А., І іпддміві, Е., іп, .Р., Одгеп, 5.О0., Мошпо, О., Нопег, В.). 5 ОіІвоп, І. (1995) Ргоїесіоп апа гераїг ої (Не підговігіага! аоратіпегдіс зувіет Бу СОМЕ іп мімо. Маїиге 573, 335-339. 47. Тгеапог, 9У.3У.58., боодтап, Ї., де Запмаде Р., 5іопе О.М., Роцізеп, К.Т., Веск, СО., Сгау, С, Агтапіпі
М.Р., РоїйоскК, К.А., Нейі Р., РиШірв, Н.5., Содаага, А., Мооге М.МУ., Ви)і-В-ейо, А. , Оаміезв, А.М Аваї,
М., Такапазпі М., Мапаіеп, К, Непдегзоп, С Е 85 Козепіпа), А. (1996) СпПагасіегігайоп ої а тийісотропепі гесеріог ог ЗОМ. Майшге 382, 80-83. 48. Тгтирр М., Агепаз, БЕ., РаїпліЇрег, М., Міїввоп, А.5., Зіерег, В.А., Сгідогои, М., КіїКеппу, С
Заіагагогиево, Е., Расппів, М., Агитає, О., Загіоїа, Н., Заапта, М. 5 Ірапег, С.Е. (1996) Рипсіопа! гесеріог ог
СОМЕ епсодей ру (Пе с-геї ргоїо-опсодепе. Майте 382, 785-788 УММУейПпдюп еї аі "Тожага ипаегвіапаіїпд (Пе 7/0 тоїіесціаг раїпоіоду ої Нипііпдіюоп'в дізеазе" Вгаїп Раїпої. 1997 мі; 7(3): 979-1002. 49. М/ідептаІК, 9У., Мовзгаї, С, Тотас, А., МУевірпа!, Н., НоМег, В. 5 Оівоп, Ї. (1997) Мешпигіп апа діа! сеї
Іпе-дегімей пеийгоїгорпіс Тасіог гесеріог-? (БОМЕК-а), поме! ргоївеіпз геіаїеа ю СОМЕ апа сОМеЕмК-а мій зресіїс сеййшШаг райе-гпз ої ехргеззіоп зцПддевіїпо гоїез іп (Ше демеІоріпд апа адий пегмоиз зувіет апа іп регірпега! огдапв. у). Меишговсі. 27,8506-8519. 50. М/ідептаїК, 9У., Тотас, А., І іпадміві, Е., НопПег, В. 5 Оівоп, І. (1998) СЕКа-3, а ргоївіп геіаїей ю сгКа-1 ів ехргеззеай іп аемеіІоріпу регірнега! пепгопз апа епзпеаїййіпад сеїів. І г. 9). Мешговсі. 20,1508-1517. 51. Муогру, С.А., Меда, О.С., 2пао, М., Спао, Н. Н.-)., Зеазпоїй, А.Б. 5 Оіхоп, У.Е. (1996) Са! сеїЇ пе дегімей пецгоїгорпіс Тасіог зідпаіїєе (йгоцдпй ї(Ште КЕТ гесеріог апа асіїмаевз піодеп-асіїматей ргоївіп Кіпазе.
У. Вісі. Спет. 271, 23619-23622. 52. Могру, С.А., Меда, О.С., Спао, Н.Н.)., Зеазпоїї, А.Р., Тпотрзоп, К.С. 5 Оіхоп У.Е. (1998) Ідепійісабйоп апа спагасіегігайоп ої СгЕКа-3, а поме! со-гесеріог Беіопдіпд (о (Пе діа! сеї Іпе-дегімей пеигоїгорпіс гесеріог Тату. 9. Віої. Спет. 275, 3502-3508. 53. Мап, О., МаїШевзоп, С Ек І оре, О.Т. (1995) Іп мімо пеигоіїгорпіс еПесів ої СОМЕ оп пеопаїйїа| апа авдшї асіа! тоїог пешйгопе. Маїшге 373, 341-344, сч о
Claims (26)
1. Виділена молекула нуклеїнової кислоти, яка кодує нейротрофічний фактор росту людини (еновін) і має с зо Нуклеотидну послідовність, що відповідає амінокислотній послідовності, що показана на фіг. 1, або кодує послідовність, що має щонайменше 7095, а переважно 8095, 9095 або 9595 гомології з амінокислотною с послідовністю, що показана на фіг. 1. о
2. Молекула нуклеїнової кислоти за п.1, яка є молекулою ДНК.
3. Молекула нуклеїнової кислоти за п. 1 або 2, яка є молекулою кКДНК. со 35
4. Молекула нуклеїнової кислоти за будь-яким з пп.1-3, яка має послідовність нуклеїнової кислоти з чн положень 81-419 послідовності, що показана на фіг. 1.
5. Виділена молекула нуклеїнової кислоти за будь-яким з пп.1-4, яка має послідовність нуклеїнової кислоти, що відповідає послідовності будь-яких сплайсированих варіантів у положенні від 5-1 до 3-1 або 3-2 і від 5-1 або 5-2 до 3-2 або 3-3 послідовності, що показана на фіг. 21. «
6. Молекула нуклеїнової кислоти за будь-яким з пп.1-5, що має послідовність нуклеїнової кислоти, що з с показана на фіг. 21.
7. Виділений нейротрофічний фактор росту людини, що кодується молекулою нуклеїнової кислоти за :з» будь-яким з пп. 1-6.
8. Фактор росту за п./7, що містить амінокислотну послідовність із положень 27-139 амінокислотної послідовності, показаної на фіг. 1, або що має щонайменше 7095, а переважно 8095, 9095 або 9595 гомології з -І амінокислотною послідовністю, що показана на фіг.1.
9. Фактор росту за п.7 або 8, який містить амінокислотну послідовність, що показана на фіг.1. о
10. Фактор росту за п.7, що містить амінокислотні послідовності, що показані на фіг. 23 або 24. со
11. Експресійний вектор для експресії нейротрофічного фактора, що містить молекулу нуклеїнової кислоти за п.1, яка функціонально пов'язана з регуляторними послідовностями. їмо)
12. Експресійний вектор за п. 11, що містить додаткову послідовність нуклеїнової кислоти, що кодує ГК репортерну молекулу.
13. Фактор росту за п.7, що експресується клітиною, яка містить експресійний вектор за п.11 або 12.
14. Фармацевтична композиція для лікування або профілактики порушень нервової системи, що містить експресійний вектор за п.11 або 12 разом з фармацевтично прийнятним носієм, розріджувачем або наповнювачем. (Ф)
15. Фармацевтична композиція для лікування або профілактики порушень нервової системи, що містить ГІ фактор росту за будь-яким з пп.7-140 разом з фармацевтично прийнятним носієм, розріджувачем або наповнювачем. во
16. Антитіло, отримане за допомогою фактора росту за п.7.
17. Спосіб виявлення наявності фактора росту в зразку, який передбачає взаємодію із зазначеним зразком антитіла, здатного зв'язуватися з фактором росту за п.7, і детектування зв'язування зазначеного антитіла із зазначеним фактором росту.
18. Спосіб за п.17, у якому зазначене антитіло кон'юговано з репортерною молекулою. 65
19. Набір або пристрій для виявлення наявності нейротрофічного фактора росту в зразку, що містить антитіло, здатне зв'язуватися з фактором росту за п.7, і пристрій для здійснення взаємодії зазначеного антитіла із зазначеним зразком.
20. Спосіб ідентифікації агоніста або антагоніста нейротрофічного фактора росту людини за п.7, що включає взаємодію клітини, тканини або організму, що експресують рецептор зазначеного фактора росту, зі сполукою, що випробовується, у присутності зазначеного фактора росту і порівняння рівнів активації білка-попередника протоонкогенного рецептора геї тирозинової протеїнкінази (СКЕТ) у зазначеній клітині, тканині або організмі з контрольним зразком, що не піддавали взаємодії із зазначеною сполукою, що випробовується.
21. Спосіб ідентифікації агоністів або антагоністів нейротрофічного фактора росту людини за п.7, що передбачає взаємодію клітини, тканини або організму, що експресують відповідний рецептор зазначеного 7/0 фактора росту і білка-попередника протоонкогенного рецептора геї тирозинової протеїнкінази (СКЕТ), зі сполукою, що випробовується, у присутності зазначеного фактора росту, вимірювання рівня активації сигнальної кінази в каскаді трансдукції сигналу, частиною якого є зазначений рецептор, після додавання антитіла, специфічного до зазначеної сигнальної кінази і кон'югованого з репортерною молекулою, у порівнянні з клітиною, тканиною або організмом, які не піддавали взаємодії із зазначеною сполукою.
22. Спосіб за п. 20 або 21, у якому зазначений нейротрофічний фактор росту є еновіном.
23. Спосіб за будь-яким з пп. 20-22, у якому зазначена клітина, тканина або організм є клітинами МІН 373.
24. Спосіб за будь-яким з пп. 21-23, у якому зазначений рецептор є СЕКАЇ, СЕКА 2, СЕКА З або СЕКА 4.
25. Спосіб за будь-яким з пп. 21-24, у якому зазначене антитіло є специфічним до кожної з МАР-кінази рі2/р44, РКВ-кінази, с-ї0п, СКЕВ, УМК/ЗАРІС-кінази.
26. Плазміда ЕММтауркЗЕТВ, що депонована в колекції І МВР під номером доступу І МВР 3931, яка кодує нейротрофічний фактор росту людини за п.7. с щі 6) с с (о) (зе) і - -
с . и? -І (95) се) іме) Ко) іме) 60 б5
Applications Claiming Priority (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GBGB9815283.8A GB9815283D0 (en) | 1998-07-14 | 1998-07-14 | Neurotrophic growth factor |
PCT/EP1999/005031 WO2000004050A2 (en) | 1998-07-14 | 1999-07-14 | Neurotrophic growth factor |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
UA73922C2 true UA73922C2 (en) | 2005-10-17 |
Family
ID=10835508
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
UA2001010334A UA73922C2 (en) | 1998-07-14 | 1999-07-14 | Human neurotrophic growth factor (enovin), nucleic acid molecule coding it, vector, plasmid, pharmaceutical composition (variants), antibody, a method for revealing growth factor, set, a method for identification of agonist or antagonist (variants) |
Country Status (4)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN1803837B (uk) |
GB (1) | GB9815283D0 (uk) |
UA (1) | UA73922C2 (uk) |
ZA (1) | ZA200100330B (uk) |
-
1998
- 1998-07-14 GB GBGB9815283.8A patent/GB9815283D0/en not_active Ceased
-
1999
- 1999-07-14 UA UA2001010334A patent/UA73922C2/uk unknown
- 1999-07-14 CN CN 200510138188 patent/CN1803837B/zh not_active Expired - Lifetime
-
2001
- 2001-01-11 ZA ZA200100330A patent/ZA200100330B/en unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN1803837A (zh) | 2006-07-19 |
GB9815283D0 (en) | 1998-09-09 |
ZA200100330B (en) | 2002-01-11 |
CN1803837B (zh) | 2010-12-08 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
EP3006039B1 (en) | Alk7 polypeptides for use in promoting fat loss | |
JP4624476B2 (ja) | 神経栄養成長因子 | |
US8492336B2 (en) | Methods of treating neuropathic pain with an environ polypeptide | |
UA73922C2 (en) | Human neurotrophic growth factor (enovin), nucleic acid molecule coding it, vector, plasmid, pharmaceutical composition (variants), antibody, a method for revealing growth factor, set, a method for identification of agonist or antagonist (variants) | |
CN100480387C (zh) | Gbs毒素受体 | |
RU2238947C2 (ru) | Нейротрофический фактор роста человека (эновин), кодирующая его выделенная молекула нуклеиновой кислоты, вектор (варианты), фармацевтическая композиция (варианты), антитело, способ обнаружения фактора роста, набор, способ идентификации агониста или антагониста (варианты) | |
MXPA04012803A (es) | Osteopontina, oligodendrocitos y mielinizacion. | |
MXPA01000579A (en) | Neurotrophic growth factor |