TW202400797A - 腺相關病毒載體 - Google Patents

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莫莉 E 約翰遜
威廉 理查德 斯塔弗
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高等教育聯邦系統 匹茲堡大學
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Abstract

本文係關於腺相關病毒(adeno-associated virus, AAV)載體(例如AAV2載體)。舉例而言,AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,其包括表1A至表1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,本文提供了此類AAV殼體多肽、編碼此類載體之核酸分子、編碼此類AAV殼體多肽之核酸分子、含有及/或表現此類核酸分子之宿主細胞、以及用於製備或使用此類載體及/或AAV殼體多肽的方法及材料。

Description

腺相關病毒載體
本文係關於腺相關病毒(adeno-associated virus, AAV)載體,特別是提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該載體具有(a)遞送核酸至眼窩視錐之能力,(b)遞送核酸至視網膜細胞並驅動視網膜細胞內核酸之高表現水平之能力,(c)跨視網膜區域(例如,跨至少兩個視網膜區域)遞送核酸至視網膜細胞之能力,(d)遞送核酸至眼睛窩側(parafovea)區域之視網膜細胞之能力,(e)遞送核酸至眼睛內二或更多種不同視網膜細胞類型之能力,(f)遞送核酸至視網膜色素上皮(retinal pigment epithelial,RPE)細胞之能力,(g)提高之遞送核酸至視網膜之感光細胞之效率,(h)提高之遞送核酸至視網膜之視網膜神經節細胞之效率,(i)提高之遞送核酸至視網膜之雙極細胞之效率,(j)提高之遞送核酸至ON視網膜神經節細胞(ON-retinal ganglion cells)之效率,(k)提高之遞送核酸至OFF視網膜神經節細胞(OFF-retinal ganglion cells)之效率,及/或(l)提高之封裝效率及遞送核酸至細胞(例如,視網膜細胞)之能力。
病毒載體(諸如AAV載體)係體內核酸遞送之有效媒劑,且其在臨床中之用途正在擴增。改良之AAV載體及用於製備有效AAV載體製劑之AAV生產技術應進一步擴增AAV載體在實驗室及臨床中之使用。
相關申請案之交互參照
本申請案主張2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,562號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,540號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,542號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,543號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,544號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,548號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,550號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,551號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,553號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,555號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,557號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,558號、及2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,559號之優先權。先前申請案之揭示內容被視為本申請案之揭示內容的一部分(並以引用方式併入本文中)。
關於聯邦資金之陳述
本發明係在美國國家衛生研究院(National Institutes of Health)授予之MH120094政府支持下完成的。政府在本發明中享有某些權利。
本文提供腺相關病毒(adeno-associated virus, AAV)載體(例如AAV2載體)。舉例而言,本文提供含有殼體多肽(capsid polypeptide)之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1A中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1A中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼窩視錐(foveal cones)並向經感染之眼窩視錐遞送外源核酸使得經感染之眼窩視錐表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至眼窩視錐之能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1A中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼窩視錐並向經感染之眼窩視錐遞送外源核酸使得經感染之眼窩視錐表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有感染及驅動存在於哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之中央窩(fovea)中之視錐細胞(cone cells)中之外源核酸的mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之眼窩視錐中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之眼窩視錐中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1A中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至眼窩視錐。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜細胞以高水平表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至視網膜細胞並驅動視網膜細胞內核酸之高表現水平的能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜細胞以高水平表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛中至少2%(例如,至少2.5%、至少5%、至少7.5%、至少10%、或至少25%)之視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大2%、至少大2.5%、至少大5%、至少大7.5%、至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內跨視網膜區域(例如,跨至少兩個視網膜區域)感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有跨視網膜區域向視網膜細胞遞送核酸並驅動經遞送之核酸在視網膜細胞內表現的能力。舉例來說,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)可遞送核酸至中央窩區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞、窩側區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞、弓形血管(vascular arcade)區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞、及/或周邊區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內跨視網膜區域(例如,跨至少兩個視網膜區域)感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之中央窩區域(fovea region)中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中、窩側區域(parafovea region)中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中、弓形血管區域(vascular arcade region)中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中、及/或周邊區域(periphery region)中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及/或周邊區域之視網膜細胞中驅動外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)彼等區域之視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼睛之窩側區域之視網膜細胞並向窩側區域之經感染之視網膜細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至眼睛之窩側區域之視網膜細胞的能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼睛之窩側區域之視網膜細胞並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在存在於哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之窩側區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之窩側區域之視網膜細胞中驅動外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之窩側區域之視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至眼睛之窩側區域之視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同視網膜細胞類型並遞送外源核酸至經感染之視網膜細胞使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸的能力。本文亦提供用於製造及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同視網膜細胞類型並驅動經遞送之核酸在彼等視網膜細胞內表現的能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)可遞送核酸至眼睛之以下二個、三個、四個、五個、六個、或七個視網膜細胞類型:視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮(retinal pigment epithelial, RPE)細胞。在一些情況下,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)可在玻璃體內投予後遞送核酸至哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少一些(例如,至少2%、至少2.5%、至少5%、至少10%、或至少25%)視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有殼體多肽,該殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同視網膜細胞類型並遞送外源核酸至經感染之視網膜細胞使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有例如在玻璃體內投予後在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜神經節細胞(retinal ganglion cells)中、至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之無長突細胞(amacrine cell)中、至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之水平細胞(horizontal cells)中、至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之雙極細胞(bipolar cells)中、至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之穆勒神經膠質細胞(Muller glia cells)中、至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之感光細胞中、及/或至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜色素上皮細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及/或視網膜色素上皮細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之彼等視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽的比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同視網膜細胞類型。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜色素上皮細胞並向經感染之視網膜色素上皮細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜色素上皮細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有向視網膜色素上皮細胞遞送核酸並驅動經遞送之核酸在視網膜色素上皮細胞內表現的能力。舉例而言,在例如玻璃體內投予(intravitreal administration)之後,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)可遞送核酸至哺乳動物眼睛之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜色素上皮細胞。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜色素上皮細胞並向經感染之視網膜色素上皮細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜色素上皮細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜色素上皮細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之視網膜色素上皮細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之視網膜色素上皮細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜色素上皮細胞。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜之感光細胞並向經感染之感光細胞遞送外源核酸使得經感染之感光細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至視網膜之感光細胞之能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜之感光細胞並向經感染之感光細胞遞送外源核酸使得經感染之感光細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之感光細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)視網膜之感光細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)視網膜之感光細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜之感光細胞。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜神經節細胞並向經感染之視網膜神經節細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜神經節細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至視網膜神經節細胞之能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜神經節細胞並向經感染之視網膜神經節細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜神經節細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜神經節細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之視網膜神經節細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之視網膜神經節細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜之感光細胞。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜之雙極細胞並向經感染之雙極細胞遞送外源核酸使得經感染之雙極細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至視網膜之雙極細胞之能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜之雙極細胞並向經感染之雙極細胞遞送外源核酸使得經感染之雙極細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)視網膜之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之雙極細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)視網膜之雙極細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)視網膜之感光細胞中具有由SEQ ID NO:1的胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜之感光細胞。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染ON視網膜神經節細胞並向經感染之ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸使得經感染之ON視網膜神經節細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至ON視網膜神經節細胞之能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染ON視網膜神經節細胞並向經感染之ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸使得經感染之ON視網膜神經節細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之ON視網膜神經節細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之ON視網膜神經節細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之ON視網膜神經節細胞中具有由SEQ ID NO:1的胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜之感光細胞。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染OFF視網膜神經節細胞並向經感染之OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸使得經感染之OFF視網膜神經節細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至OFF視網膜神經節細胞之能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染OFF視網膜神經節細胞並向經感染之OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸使得經感染之OFF視網膜神經節細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之OFF視網膜神經節細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之OFF視網膜神經節細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之OFF視網膜神經節細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜之感光細胞。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有提高之封裝效率、在體內或體外感染細胞(例如,視網膜細胞)之能力、以及向經感染之細胞遞送外源核酸使得經感染之細胞表現外源核酸的能力。本文亦提供用於製造及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有提高之封裝效率、在體內或體外向細胞(例如,視網膜細胞)遞送核酸之能力、以及驅動經遞送之核酸在細胞內表現的能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)之封裝效率可大於具有由由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)的封裝效率。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有提高之封裝效率(例如,封裝效率大於具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)的封裝效率)、在體內或體外感染細胞(例如,視網膜細胞)之能力、以及驅動外源核酸至經感染之細胞使得經感染之細胞表現外源核酸的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)之封裝效率可大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)的封裝效率。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體之封裝效率可大於7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))之封裝效率。
一般而言,本文之一個態樣特徵在於包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價(titer)時,該載體可感染大於50%之眼窩視錐。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於50%之眼窩視錐。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼載體之核酸分子。核酸分子可係DNA。載體可係包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於50%之眼窩視錐。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼多肽之核酸分子。核酸分子可係DNA。多肽可係包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於50%之眼窩視錐。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含載體之宿主細胞。宿主細胞可係視網膜細胞。載體可係包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於50%之眼窩視錐。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含多肽之宿主細胞。宿主細胞可係視網膜細胞。多肽可係包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於50%之眼窩視錐。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含腺相關病毒(AAV)載體之組成物,該腺相關病毒載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於50%之眼窩視錐。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液(Hank’s Balanced Salt Solution)、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之眼窩視錐的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使眼窩視錐與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染眼窩視錐,從而向眼窩視錐遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於50%之眼窩視錐。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在眼窩視錐中的表現水平相比,該載體可在眼窩視錐中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使眼窩視錐與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文件提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的眼窩視錐與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染眼窩視錐並驅動外源核酸序列在眼窩視錐內之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症(blue cone monochromcy)、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於50%之眼窩視錐。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在眼窩視錐中的表現水平相比,該載體可在眼窩視錐中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使眼窩視錐與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染視網膜細胞,從而向視網膜細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染視網膜細胞並驅動外源核酸序列在視網膜細胞內之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由萊伯氏先天性黑蒙症(Leber's congenital amaurosis, LCA)、眼睛皮膚白化症第一型(Oculocutaneous albinism type I, OCA1)、視網膜色素變性(retinitis pigmentosa)、視桿/視錐失養症(rod/cone dystrophy)、視錐失養症(cone dystrophy)、斯特格氏病(Stargardt Disease)、尤塞氏症候群(usher syndrome)、X-性聯遺傳視網膜色素病變(X-linked retinitis pigmentosa, XLRP)、及先天性視網膜裂損症(X-linked juvenile retinoschisis, XLRS)所組成之群組。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID N O:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於向哺乳動物眼睛之至少兩個不同視網膜區域內之視網膜細胞遞送外源核酸序列的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染至少兩個不同視網膜區域內之視網膜細胞,從而向視網膜細胞遞送外源核酸序列,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染至少兩個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜細胞中的表現水平相比,該載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物眼睛的至少兩個視網膜區域的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染該至少兩個視網膜區域之視網膜細胞並驅動外源核酸序列在該至少兩個視網膜區域之視網膜細胞內之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由LCA、OCA1、視網膜色素變性、視桿/視錐失養症、視錐失養症、斯特格氏病、尤塞氏症候群、XLRP、及XLRS所組成之群組。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染至少兩個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中的表現水平相比,該載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使至少兩個視網膜區域之視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。至少兩個視網膜區域可選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於向哺乳動物眼睛之窩側區域之視網膜細胞遞送外源核酸序列的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染視網膜細胞,從而向視網膜細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在眼睛的窩側區域的視網膜細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使窩側區域之視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物眼睛的窩側區域的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染視網膜細胞並驅動外源核酸序列在視網膜細胞內之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變(macular degeneration)、全色盲(achromatopsia)、藍色視錐單色症(blue cone monochromcy)、及色盲(color blindness)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當玻璃體內投予至少1x10 7之個載體之效價時,該載體可感染大於2%之窩側區域之視網膜細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在窩側區域的視網膜細胞中的表現水平相比,該載體可在窩側區域之視網膜細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使窩側區域之視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於向哺乳動物眼睛之至少三種不同視網膜細胞類型遞送外源核酸序列的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使至少三種不同視網膜細胞類型與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染該至少三種不同視網膜細胞類型,從而向該至少三種不同視網膜細胞類型遞送外源核酸序列,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛內大於2%之至少三種不同視網膜細胞類型。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在至少三種不同視網膜細胞類型中的表現水平相比,該載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使至少三種不同視網膜細胞類型與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物眼睛的至少三種不同視網膜細胞類型與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染至少三種不同視網膜細胞類型並驅動至少三種不同視網膜細胞類型內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症(blue cone monochromcy)、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛內大於2%之至少三種不同視網膜細胞類型。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在至少三種不同視網膜細胞類型中的表現水平相比,該載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使至少三種不同視網膜細胞類型與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。該至少三種不同視網膜細胞類型可選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於向哺乳動物眼睛之視網膜色素上皮細胞遞送外源核酸序列的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使視網膜色素上皮細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染視網膜色素上皮細胞,從而向視網膜色素上皮細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之視網膜色素上皮細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜色素上皮細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜色素上皮細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物眼睛的視網膜色素上皮細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染視網膜色素上皮細胞並驅動視網膜色素上皮細胞內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜色素上皮細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜色素上皮細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在感光細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在感光細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在感光細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在感光細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在感光細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在感光細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在感光細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之感光細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使感光細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染感光細胞,從而向感光細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在感光細胞中的表現水平相比,該載體可在感光細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使感光細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的感光細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染感光細胞並驅動感光細胞內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之感光細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在感光細胞中的表現水平相比,該載體可在感光細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使感光細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜神經節細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染感光細胞,從而向感光細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜神經節細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜神經節細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染視網膜神經節細胞並驅動視網膜神經節細胞內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜神經節細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜神經節細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜神經節細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛視網膜雙極細胞之大於2%的感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛視網膜之大於2%的雙極細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛視網膜雙極細胞之大於2%的感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛視網膜之大於2%的雙極細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛視網膜雙極細胞之大於2%的感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛視網膜之大於2%的雙極細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛視網膜雙極細胞之大於2%的感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜雙極細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使雙極細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染雙極細胞,從而向雙極細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛視網膜雙極細胞之大於2%的感光細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜雙極細胞中的表現水平相比,該載體可在雙極細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使雙極細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的視網膜雙極細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染雙極細胞並驅動雙極細胞內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜雙極細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜雙極細胞中的表現水平相比,該載體可在雙極細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使雙極細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之ON視網膜神經節細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使ON視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染ON視網膜神經節細胞,從而向ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在ON視網膜神經節細胞中的表現水平相比,該載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使ON視網膜神經節細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的ON視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染ON視網膜神經節細胞並驅動ON視網膜神經節細胞內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之ON視網膜神經節細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在ON視網膜神經節細胞中的表現水平相比,該載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使ON視網膜神經節細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之OFF視網膜神經節細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使OFF視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染OFF視網膜神經節細胞,從而向OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在OFF視網膜神經節細胞中的表現水平相比,該載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使OFF視網膜神經節細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的OFF視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染OFF視網膜神經節細胞並驅動OFF視網膜神經節細胞內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之OFF視網膜神經節細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在OFF視網膜神經節細胞中的表現水平相比,該載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使OFF視網膜神經節細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染細胞,從而向細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染視網膜細胞並驅動外源核酸序列在視網膜細胞內之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10 7至約1x10 14個載體。
除非另有定義,否則本文中所使用之所有技術及科學用語皆具有本發明所屬之技術領域中具有通常知識者所共同理解的相同含義。儘管與本文中所述之彼等相似或等效之方法及材料可用以實踐本發明,但在下文描述適合的方法及方法。本文所提及之所有公開案、專利申請案、專利、及其他參考文獻以全文引用之方式併入本文中。在衝突之情況下,以本說明書(包括定義)為準。此外,材料、方法、及實例僅係說明性的且不意欲為限制性的。
本發明之一或多個實施例的細節在以下附圖中闡述。本發明之其他特徵、目的、及優點將自描述及申請專利範圍中顯而易見。
本文提供AAV載體(例如AAV2載體)。舉例而言,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。任何適當的AAV載體可經設計以包括本文中所述之殼體多肽(例如,該殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)。舉例而言,AAV2、AAV8、及AAV9可經設計以包括殼體多肽,該殼體多肽包括表1A至1L(或其變體)之任一或多者中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。在一些情況下,具有AAV Rep多肽之AVG起始密碼子代替ATG起始密碼子的AAV2(例如AAV2-M1T-REP)可經設計以包括殼體多肽,該殼體多肽包括表1或式A中所闡述之胺基酸序列(或其變體)。
任何適當的AAV殼體多肽可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。舉例而言,AAV2、AAV6、AAV8、及AAV9殼體多肽可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。在一些情況下,AAV2殼體多肽可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。在一些情況下,具有以下胺基酸序列之AAV2殼體多肽可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列:MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQ RG NRQA ATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSVNVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL (SEQ ID NO:1)。二個粗體胺基酸殘基在位置587及588,且加底線的胺基酸在位置585至590。
在一些情況下,具有以下胺基酸序列之AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)可經設計以包括表1中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或式A中所闡述之胺基酸序列:MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERH KDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVN X 1 ADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNRQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKS X 2 NVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL,其中X 1係E或A,且其中X 2係V或I (SEQ ID NO:2206)。
在一些情況下,與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)可經設計以包括表1中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或式A所闡述之胺基酸序列。
在一些情況下,本文所涵蓋之某些AAV2序列可包括SEQ ID NO:1之修飾或突變,諸如V708I取代。
當設計AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列時,所包括之胺基酸序列可位於沿著AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)之任何適當位置。舉例而言,在表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,諸如下列中任一者:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27,可位於AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)之天然存在的胺基酸殘基位置587及588之間、可位於AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)之天然存在的胺基酸殘基位置452及453之間、或可位於AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)之天然存在的胺基酸殘基位置453及454之間。
[表1A] 可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO:** 編碼胺基酸序列之核酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO:** 活性水平*
TGYSSTNG A2 2 ACCGGCTACAGCAGCACCAACGGC A20 1104 +++
LADLSDHHA A3 3 CTAGCAGACCTGAGCGACCACCACGCT A21 1105 +++
SGTEATRG A4 4 AGCGGCACCGAGGCCACCCGGGGC A22 1106 +++
TGQDKPTG A5 5 ACCGGCCAGGACAAGCCCACCGGC A23 1107 +++
SSMDPRHG A6 6 AGCAGCATGGACCCCCGGCACGGC A24 1108 +++
LANLKENEA A7 7 CTAGCAAACCTGAAGGAGAACGAGGCT A25 1109 +++
LAIKMIAYA A8 8 CTAGCAATCAAGATGATCGCCTACGCT A26 1110 ++
TGEGPTKG A9 9 ACCGGCGAGGGCCCCACCAAGGGC A27 1111 ++
SGSVGYVG A10 10 AGCGGCAGCGTGGGCTACGTGGGC A28 1112 ++
LAQVQVEGA A11 11 CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT A29 1113 ++
SGFDATKG A12 12 AGCGGCTTCGACGCCACCAAGGGC A30 1114 ++
TTDLNHKG A13 13 ACCACCGACCTGAACCACAAGGGC A31 1115 +
SSRAYQET A14 14 AGCAGCCGGGCCTACCAGGAGACC A32 1116 +
LAKVASMNA A15 15 CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT A32 1117 +
TSQEKQNS A16 16 ACCAGCCAGGAGAAGCAGAACAGC A34 1118 +
LAAHQMASA A17 17 CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT A35 1119 +
LAKGQAQNA A18 18 CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT A36 1120 +
RTGRNT A19 19 CGGACCGGCCGGAACACC A37 1121 ++
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平: +++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1B]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO:** 編碼胺基酸序列之核酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO:** 活性水平*
LATTTMGTA B 2 20 CTAGCAACCACCACCATGGGCACCGCT B 318 1122 +++
LARRKSNEA B 3 21 CTAGCACGGCGGAAGAGCAACGAGGCT B 319 1123 +++
LAHGGLREA B 4 22 CTAGCACACGGCGGCCTGCGGGAGGCT B 320 1124 +++
LAMFVWVPA B 5 23 CTAGCAATGTTCGTGTGGGTGCCCGCT B 321 1125 +++
LATDRTKTA B 6 24 CTAGCAACCGACCGGACCAAGACCGCT B 322 1126 +++
LAFNSCSYA B 7 25 CTAGCATTCAACAGCTGCAGCTACGCT B 323 1127 +++
LAYAEQSKA B 8 26 CTAGCATACGCCGAGCAGAGCAAGGCT B 324 1128 +++
LAWRIMKHA B 9 27 CTAGCATGGCGGATCATGAAGCACGCT B 325 1129 +++
LAVDNIWAA B 10 28 CTAGCAGTGGACAACATCTGGGCCGCT B 326 1130 +++
LAGQAMMQA B 11 29 CTAGCAGGCCAGGCCATGATGCAGGCT B 327 1131 +++
LAELALIKA B 12 30 CTAGCAGAGCTGGCCCTGATCAAGGCT B 328 1132 +++
LAMTKITDA B 13 31 CTAGCAATGACCAAGATCACCGACGCT B 329 1133 +++
LALENIGQA B 14 32 CTAGCACTGGAGAACATCGGCCAGGCT B 330 1134 +++
LAFTHGTNA B 15 33 CTAGCATTCACCCACGGCACCAACGCT B 331 1135 +++
LAKINAQPA B 16 34 CTAGCAAAGATCAACGCCCAGCCCGCT B 332 1136 +++
LADLSDHHA B 17 35 CTAGCAGACCTGAGCGACCACCACGCT B 333 1137 +++
LADPLYAVA B 18 36 CTAGCAGACCCCCTGTACGCCGTGGCT B 334 1138 +++
LAYVALFYA B 19 37 CTAGCATACGTGGCCCTGTTCTACGCT B 335 1139 +++
LAGGEYETA B 20 38 CTAGCAGGCGGCGAGTACGAGACCGCT B 336 1140 +++
LAALVDANA B 21 39 CTAGCAGCCCTGGTGGACGCCAACGCT B 337 1141 +++
LADPTETPA B 22 40 CTAGCAGACCCCACCGAGACCCCCGCT B 338 1142 +++
LAHRAPDSA B 23 41 CTAGCACACCGGGCCCCCGACAGCGCT B 339 1143 +++
LAEGQEDSA B 24 42 CTAGCAGAGGGCCAGGAGGACAGCGCT B 340 1144 +++
LAEEEKYGA B 25 43 CTAGCAGAGGAGGAGAAGTACGGCGCT B 341 1145 +++
LALNDNVGA B 26 44 CTAGCACTGAACGACAACGTGGGCGCT B 342 1146 +++
LAPDAKDWA B 27 45 CTAGCACCCGACGCCAAGGACTGGGCT B 343 1147 +++
LAPHIAKDA B 28 46 CTAGCACCCCACATCGCCAAGGACGCT B 344 1148 +++
LADPGWKYA B 29 47 CTAGCAGACCCCGGCTGGAAGTACGCT B 345 1149 +++
LASRTAVAA B 30 48 CTAGCAAGCCGGACCGCCGTGGCCGCT B 346 1150 +++
LAFCIKHCA B 31 49 CTAGCATTCTGCATCAAGCACTGCGCT B 347 1151 +++
LAEPDHTLA B 32 50 CTAGCAGAGCCCGACCACACCTTGGCT B 348 1152 +++
LAPMRGVYA B 33 51 CTAGCACCCATGCGGGGCGTGTACGCT B 349 1153 +++
LAAVTKDSA B 34 52 CTAGCAGCCGTGACCAAGGACAGCGCT B 350 1154 +++
LAITQSDIA B 35 53 CTAGCAATCACCCAGAGCGACATCGCT B 351 1155 +++
LAPNQGTPA B 36 54 CTAGCACCCAACCAGGGCACCCCCGCT B 352 1156 +++
LAVMGNMLA B 37 55 CTAGCAGTGATGGGCAACATGCTGGCT B 353 1157 +++
LASNMERIA B 38 56 CTAGCAAGCAACATGGAGCGGATCGCT B 354 1158 +++
LAHWQEEWA B 39 57 CTAGCACACTGGCAGGAGGAGTGGGCT B 355 1159 +++
LADDMIFVA B 40 58 CTAGCAGACGACATGATCTTCGTGGCT B 356 1160 +++
LAHEPMFNA B 41 59 CTAGCACACGAGCCCATGTTCAACGCT B 357 1161 +++
LATVYKSPA B 42 60 CTAGCAACCGTGTACAAGAGCCCCGCT B 358 1162 +++
LADNLNTPA B 43 61 CTAGCAGACAACCTGAACACCCCCGCT B 359 1163 +++
LAYVIENDA B 44 62 CTAGCATACGTGATCGAGAACGACGCT B 360 1164 +++
LALEVGDHA B 45 63 CTAGCACTGGAGGTGGGCGACCACGCT B 361 1165 +++
LAHEGRQAA B 46 64 CTAGCACACGAGGGCCGGCAGGCCGCT B 362 1166 +++
LASTTMNIA B 47 65 CTAGCAAGCACCACCATGAACATCGCT B 363 1167 +++
LAEFHIPTA B 48 66 CTAGCAGAGTTCCACATCCCCACCGCT B 364 1168 +++
LAEFRVGQA B 49 67 CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT B 365 1169 +++
LADAHSVTA B 50 68 CTAGCAGACGCCCACAGCGTGACCGCT B 366 1170 +++
LAKPPPKDA B 51 69 CTAGCAAAGCCCCCCCCCAAGGACGCT B 367 1171 +++
LAIGSDTSA B 52 70 CTAGCAATCGGCAGCGACACCAGCGCT B 368 1172 +++
LAFQQQRCA B 53 71 CTAGCATTCCAGCAGCAGCGGTGCGCT B 369 1173 +++
LAAVHLMGA B 54 72 CTAGCAGCCGTGCACCTGATGGGCGCT B 370 1174 +++
LACTYTYAA B 55 73 CTAGCATGCACCTACACCTACGCCGCT B 371 1175 +++
LAVRNEINA B 56 74 CTAGCAGTGCGGAACGAGATCAACGCT B 372 1176 +++
LADSSKWIA B 57 75 CTAGCAGACAGCAGCAAGTGGATCGCT B 373 1177 +++
LADYRNDKA B 58 76 CTAGCAGACTACCGGAACGACAAGGCT B 374 1178 +++
LANANTRPA B 59 77 CTAGCAAACGCCAACACCCGGCCCGCT B 375 1179 +++
LAPQNLDEA B 60 78 CTAGCACCCCAGAACCTGGACGAGGCT B 376 1180 +++
LAHPGTTFA B 61 79 CTAGCACACCCCGGCACCACCTTCGCT B 377 1181 +++
LAYDAGGHA B 62 80 CTAGCATACGACGCCGGCGGCCACGCT B 378 1182 +++
LAKALGMEA B 63 81 CTAGCAAAGGCCCTGGGCATGGAGGCT B 379 1183 +++
LAGENHISA B 64 82 CTAGCAGGCGAGAACCACATCAGCGCT B 380 1184 +++
LARDQLKLA B 65 83 CTAGCACGGGACCAGCTGAAGCTGGCT B 381 1185 +++
LACPVAEWA B 66 84 CTAGCATGCCCCGTGGCCGAGTGGGCT B 382 1186 +++
LAQVKQGPA B 67 85 CTAGCACAGGTGAAGCAGGGCCCCGCT B 383 1187 +++
LALPEGRFA B 68 86 CTAGCACTGCCCGAGGGCCGGTTCGCT B 384 1188 +++
LAMNEPVTA B 69 87 CTAGCAATGAACGAGCCCGTGACCGCT B 385 1189 +++
LAAVTEYVA B 70 88 CTAGCAGCCGTGACCGAGTACGTGGCT B 386 1190 +++
LADGGTRPA B 71 89 CTAGCAGACGGCGGCACCCGGCCCGCT B 387 1191 +++
LAPPGNPLA B 72 90 CTAGCACCCCCCGGCAACCCCCTGGCT B 388 1192 +++
LANIVQQDA B 73 91 CTAGCAAACATCGTGCAGCAGGACGCT B 389 1193 +++
LAVSRHGEA B 74 92 CTAGCAGTGAGCCGGCACGGCGAGGCT B 390 1194 +++
LANEAQGKA B 75 93 CTAGCAAACGAGGCCCAGGGCAAGGCT B 391 1195 +++
LAPMGQNMA B 76 94 CTAGCACCCATGGGCCAGAACATGGCT B 392 1196 +++
LAAYHDSAA B 77 95 CTAGCAGCCTACCACGACAGCGCCGCT B 393 1197 +++
LAGIQQHVA B 78 96 CTAGCAGGCATCCAGCAGCACGTGGCT B 394 1198 +++
LASVSTIQA B 79 97 CTAGCAAGCGTGAGCACCATCCAGGCT B 395 1199 +++
LAAVGMKMA B 80 98 CTAGCAGCCGTGGGCATGAAGATGGCT B 396 1200 +++
LAQVTEMRA B 81 99 CTAGCACAGGTGACCGAGATGCGGGCT B 397 1201 +++
LADTHTTYA B 82 100 CTAGCAGACACCCACACCACCTACGCT B 398 1202 +++
LAIGERTTA B 83 101 CTAGCAATCGGCGAGCGGACCACCGCT B 399 1203 +++
LANKNTAIA B 84 102 CTAGCAAACAAGAACACCGCCATCGCT B 400 1204 +++
LANLKENEA B 85 103 CTAGCAAACCTGAAGGAGAACGAGGCT B 401 1205 +++
LAEYHNNDA B 86 104 CTAGCAGAGTACCACAACAACGACGCT B 402 1206 +++
LAFNGSTSA B 87 105 CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT B 403 1207 +++
LAGFMEYYA B 88 106 CTAGCAGGCTTCATGGAGTACTACGCT B 404 1208 +++
LAMGHNYVA B 89 107 CTAGCAATGGGCCACAACTACGTGGCT B 405 1209 +++
LAGEFTGKA B 90 108 CTAGCAGGCGAGTTCACCGGCAAGGCT B 406 1210 ++
LAKGFKTEA B 91 109 CTAGCAAAGGGCTTCAAGACCGAGGCT B 407 1211 ++
LAWNKCPYA B 92 110 CTAGCATGGAACAAGTGCCCCTACGCT B 408 1212 ++
LAQEQNAAA B 93 111 CTAGCACAGGAGCAGAACGCCGCCGCT B 409 1213 ++
LAKDGMIGA B 94 112 CTAGCAAAGGACGGCATGATCGGCGCT B 410 1214 ++
LAPTTIGGA B 95 113 CTAGCACCCACCACCATCGGCGGCGCT B 411 1215 ++
LAVKGLVNA B 96 114 CTAGCAGTGAAGGGCCTGGTGAACGCT B 412 1216 ++
LALNSGKMA B 97 115 CTAGCACTGAACAGCGGCAAGATGGCT B 413 1217 ++
LALYQCDTA B 98 116 CTAGCACTGTACCAGTGCGACACCGCT B 414 1218 ++
LAPQKQPVA B 99 117 CTAGCACCCCAGAAGCAGCCCGTGGCT B 415 1219 ++
LAEHKNMHA B 100 118 CTAGCAGAGCACAAGAACATGCACGCT B 416 1220 ++
LAEFDGDGA B 101 119 CTAGCAGAGTTCGACGGCGACGGCGCT B 417 1221 ++
LASRLNSPA B 102 120 CTAGCAAGCCGGCTGAACAGCCCCGCT B 418 1222 ++
LAPCYEPPA B 103 121 CTAGCACCCTGCTACGAGCCCCCCGCT B 419 1223 ++
LALKLRTEA B 104 122 CTAGCACTGAAGCTGCGGACCGAGGCT B 420 1224 ++
LAAGQAQSA B 105 123 CTAGCAGCCGGCCAGGCCCAGAGCGCT B 421 1225 ++
LATPNVNAA B 106 124 CTAGCAACCCCCAACGTGAACGCCGCT B 422 1226 ++
LARAITNEA B 107 125 CTAGCACGGGCCATCACCAACGAGGCT B 423 1227 ++
LAEVTYTGA B 108 126 CTAGCAGAGGTGACCTACACCGGCGCT B 424 1228 ++
LAPSGDRHA B 109 127 CTAGCACCCAGCGGCGACCGGCACGCT B 425 1229 ++
LAYITEKSA B 110 128 CTAGCATACATCACCGAGAAGAGCGCT B 426 1230 ++
LAKDHHVIA B 111 129 CTAGCAAAGGACCACCACGTGATCGCT B 427 1231 ++
LASADHQPA B 112 130 CTAGCAAGCGCCGACCACCAGCCCGCT B 428 1232 ++
LATMHNFEA B 113 131 CTAGCAACCATGCACAACTTCGAGGCT B 429 1233 ++
LARGVAPIA B 114 132 CTAGCACGGGGCGTGGCCCCCATCGCT B 430 1234 ++
LAWKCKGTA B 115 133 CTAGCATGGAAGTGCAAGGGCACCGCT B 431 1235 ++
LAKGILMEA B 116 134 CTAGCAAAGGGCATCCTGATGGAGGCT B 432 1236 ++
LANIVSHDA B 117 135 CTAGCAAACATCGTGAGCCACGACGCT B 433 1237 ++
LAEFVHKGA B 118 136 CTAGCAGAGTTCGTGCACAAGGGCGCT B 434 1238 ++
LASAVMYWA B 119 137 CTAGCAAGCGCCGTGATGTACTGGGCT B 435 1239 ++
LAQKKLLEA B 120 138 CTAGCACAGAAGAAGCTGCTGGAGGCT B 436 1240 ++
LAGERETVA B 121 139 CTAGCAGGCGAGCGGGAGACCGTGGCT B 437 1241 ++
LAFLRGPEA B 122 140 CTAGCATTCCTGCGGGGCCCCGAGGCT B 438 1242 ++
LAAVGVGYA B 123 141 CTAGCAGCCGTGGGCGTGGGCTACGCT B 439 1243 ++
LADLGYPNA B 124 142 CTAGCAGACCTGGGCTACCCCAACGCT B 440 1244 ++
LAAKPKDGA B 125 143 CTAGCAGCCAAGCCCAAGGACGGCGCT B 441 1245 ++
LADKNRLQA B 126 144 CTAGCAGACAAGAACCGGCTGCAGGCT B 442 1246 ++
LADMTRFHA B 127 145 CTAGCAGACATGACCCGGTTCCACGCT B 443 1247 ++
LARSSTLNA B 128 146 CTAGCACGGAGCAGCACCCTGAACGCT B 444 1248 ++
LACYPPTCA B 129 147 CTAGCATGCTACCCCCCCACCTGCGCT B 445 1249 ++
LAKVSKGDA B 130 148 CTAGCAAAGGTGAGCAAGGGCGACGCT B 446 1250 ++
LAGGKQALA B 131 149 CTAGCAGGCGGCAAGCAGGCCCTGGCT B 447 1251 ++
LADIVGESA B 132 150 CTAGCAGACATCGTGGGCGAGAGCGCT B 448 1252 ++
LADFPSEKA B 133 151 CTAGCAGACTTCCCCAGCGAGAAGGCT B 449 1253 ++
LAHIQEPKA B 134 152 CTAGCACACATCCAGGAGCCCAAGGCT B 450 1254 ++
LAAANHDNA B 135 153 CTAGCAGCCGCCAACCACGACAACGCT B 451 1255 ++
LAALNSQTA B 136 154 CTAGCAGCCCTGAACAGCCAGACCGCT B 452 1256 ++
LAEPFPVAA B 137 155 CTAGCAGAGCCCTTCCCCGTGGCCGCT B 453 1257 ++
LAELDFKWA B 138 156 CTAGCAGAGCTGGACTTCAAGTGGGCT B 454 1258 ++
LAKFMWIHA B 139 157 CTAGCAAAGTTCATGTGGATCCACGCT B 455 1259 ++
LAQVQVEGA B 140 158 CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT B 456 1260 ++
LADILVGQA B 141 159 CTAGCAGACATCCTGGTGGGCCAGGCT B 457 1261 ++
LAQWFLWRA B 142 160 CTAGCACAGTGGTTCCTGTGGCGGGCT B 458 1262 ++
LALHQERQA B 143 161 CTAGCACTGCACCAGGAGCGGCAGGCT B 459 1263 ++
LACSSTWYA B 144 162 CTAGCATGCAGCAGCACCTGGTACGCT B 460 1264 ++
LAGSMAKLA B 145 163 CTAGCAGGCAGCATGGCCAAGCTGGCT B 461 1265 ++
LAPNTPKIA B 146 164 CTAGCACCCAACACCCCCAAGATCGCT B 462 1266 ++
LALDMWEPA B 147 165 CTAGCACTGGACATGTGGGAGCCCGCT B 463 1267 ++
LAGHAACFA B 148 166 CTAGCAGGCCACGCCGCCTGCTTCGCT B 464 1268 ++
LAVRTGSMA B 149 167 CTAGCAGTGCGGACCGGCAGCATGGCT B 465 1269 ++
LAGVVKTDA B 150 168 CTAGCAGGCGTGGTGAAGACCGACGCT B 466 1270 ++
LAKFAAKDA B 151 169 CTAGCAAAGTTCGCCGCCAAGGACGCT B 467 1271 ++
LAVNRVDMA B 152 170 CTAGCAGTGAACCGGGTGGACATGGCT B 468 1272 ++
LANNAEPSA B 153 171 CTAGCAAACAACGCCGAGCCCAGCGCT B 469 1273 ++
LAAKMYNGA B 154 172 CTAGCAGCCAAGATGTACAACGGCGCT B 470 1274 ++
LAEADKWYA B 155 173 CTAGCAGAGGCCGACAAGTGGTACGCT B 471 1275 ++
LARGTLMTA B 156 174 CTAGCACGGGGCACCCTGATGACCGCT B 472 1276 ++
LAKDKGLIA B 157 175 CTAGCAAAGGACAAGGGCCTGATCGCT B 473 1277 ++
LAQGNNTGA B 158 176 CTAGCACAGGGCAACAACACCGGCGCT B 474 1278 ++
LAWIERSMA B 159 177 CTAGCATGGATCGAGCGGAGCATGGCT B 475 1279 ++
LAYDNTAEA B 160 178 CTAGCATACGACAACACCGCCGAGGCT B 476 1280 ++
LAGFHAIEA B 161 179 CTAGCAGGCTTCCACGCCATCGAGGCT B 477 1281 ++
LAFGFSADA B 162 180 CTAGCATTCGGCTTCAGCGCCGACGCT B 478 1282 ++
LAEGMTGIA B 163 181 CTAGCAGAGGGCATGACCGGCATCGCT B 479 1283 ++
LAHDLHGGA B 164 182 CTAGCACACGACCTGCACGGCGGCGCT B 480 1284 ++
LAQAGDTAA B 165 183 CTAGCACAGGCCGGCGACACCGCCGCT B 481 1285 ++
LAGEVTKHA B 166 184 CTAGCAGGCGAGGTGACCAAGCACGCT B 482 1286 ++
LALNAAATA B 167 185 CTAGCACTGAACGCCGCCGCCACCGCT B 483 1287 ++
LADCMMINA B 168 186 CTAGCAGACTGCATGATGATCAACGCT B 484 1288 ++
LAYFHSYAA B 169 187 CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT B 485 1289 ++
LAISQPNPA B 170 188 CTAGCAATCAGCCAGCCCAACCCCGCT B 486 1290 ++
LAVAVDCFA B 171 189 CTAGCAGTGGCCGTGGACTGCTTCGCT B 487 1291 ++
LADHGNKPA B 172 190 CTAGCAGACCACGGCAACAAGCCCGCT B 488 1292 ++
LAAEHIGRA B 173 191 CTAGCAGCCGAGCACATCGGCCGGGCT B 489 1293 ++
LAVTPPWYA B 174 192 CTAGCAGTGACCCCCCCCTGGTACGCT B 490 1294 ++
LAVPKADAA B 175 193 CTAGCAGTGCCCAAGGCCGACGCCGCT B 491 1295 ++
LANMMAAGA B 176 194 CTAGCAAACATGATGGCCGCCGGCGCT B 492 1296 ++
LANVTLQSA B 177 195 CTAGCAAACGTGACCCTGCAGAGCGCT B 493 1297 ++
LAPIQLAQA B 178 196 CTAGCACCCATCCAGCTGGCCCAGGCT B 494 1298 ++
LANQGFLTA B 179 197 CTAGCAAACCAGGGCTTCCTGACCGCT B 495 1299 ++
LAPLQTQEA B 180 198 CTAGCACCCCTGCAGACCCAGGAGGCT B 496 1300 ++
LAEQVLEKA B 181 199 CTAGCAGAGCAGGTGCTGGAGAAGGCT B 497 1301 ++
LAVDIMRGA B 182 200 CTAGCAGTGGACATCATGCGGGGCGCT B 498 1302 ++
LACTFKPNA B 183 201 CTAGCATGCACCTTCAAGCCCAACGCT B 499 1303 ++
LATWCLVWA B 184 202 CTAGCAACCTGGTGCCTGGTGTGGGCT B 500 1304 +
LAKSAGILA B 185 203 CTAGCAAAGAGCGCCGGCATCCTGGCT B 501 1305 +
LAYGQQTTA B 186 204 CTAGCATACGGCCAGCAGACCACCGCT B 502 1306 +
LAHAGSSSA B 187 205 CTAGCACACGCCGGCAGCAGCAGCGCT B 503 1307 +
LAGKTISGA B 188 206 CTAGCAGGCAAGACCATCAGCGGCGCT B 504 1308 +
LASIGFSAA B 189 207 CTAGCAAGCATCGGCTTCAGCGCCGCT B 505 1309 +
LAFPCIKEA B 190 208 CTAGCATTCCCCTGCATCAAGGAGGCT B 506 1310 +
LAMLGGTSA B 191 209 CTAGCAATGCTGGGCGGCACCAGCGCT B 507 1311 +
LAGGSKLEA B 192 210 CTAGCAGGCGGCAGCAAGCTGGAGGCT B 508 1312 +
LAADPTFKA B 193 211 CTAGCAGCCGACCCCACCTTCAAGGCT B 509 1313 +
LAETTLTRA B 194 212 CTAGCAGAGACCACCCTGACCCGGGCT B 510 1314 +
LAHDWGAPA B 195 213 CTAGCACACGACTGGGGCGCCCCCGCT B 511 1315 +
LAMDREIKA B 196 214 CTAGCAATGGACCGGGAGATCAAGGCT B 512 1316 +
LAVFQETGA B 197 215 CTAGCAGTGTTCCAGGAGACCGGCGCT B 513 1317 +
LAQVEVSKA B 198 216 CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT B 514 1318 +
LAPGNDLWA B 199 217 CTAGCACCCGGCAACGACCTGTGGGCT B 515 1319 +
LAIPVEANA B 200 218 CTAGCAATCCCCGTGGAGGCCAACGCT B 516 1320 +
LAKDGGKIA B 201 219 CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT B 517 1321 +
LAERNHGYA B 202 220 CTAGCAGAGCGGAACCACGGCTACGCT B 518 1322 +
LAMLACKGA B 203 221 CTAGCAATGCTGGCCTGCAAGGGCGCT B 519 1323 +
LAHHKESIA B 204 222 CTAGCACACCACAAGGAGAGCATCGCT B 520 1324 +
LAYHQWDDA B 205 223 CTAGCATACCACCAGTGGGACGACGCT B 521 1325 +
LAKVASMNA B 206 224 CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT B 522 1326 +
LANEGTIRA B 207 225 CTAGCAAACGAGGGCACCATCCGGGCT B 523 1327 +
LAGKIEENA B 208 226 CTAGCAGGCAAGATCGAGGAGAACGCT B 524 1328 +
LAPVKHTWA B 209 227 CTAGCACCCGTGAAGCACACCTGGGCT B 525 1329 +
LADEGREHA B 210 228 CTAGCAGACGAGGGCCGGGAGCACGCT B 526 1330 +
LALNNDQSA B 211 229 CTAGCACTGAACAACGACCAGAGCGCT B 527 1331 +
LADVVSVSA B 212 230 CTAGCAGACGTGGTGAGCGTGAGCGCT B 528 1332 +
LAPSKMGLA B 213 231 CTAGCACCCAGCAAGATGGGCCTGGCT B 529 1333 +
LASACMRAA B 214 232 CTAGCAAGCGCCTGCATGCGGGCCGCT B 530 1334 +
LAGDIVRNA B 215 233 CTAGCAGGCGACATCGTGCGGAACGCT B 531 1335 +
LADTYKPYA B 216 234 CTAGCAGACACCTACAAGCCCTACGCT B 532 1336 +
LAFPDKSIA B 217 235 CTAGCATTCCCCGACAAGAGCATCGCT B 533 1337 +
LANADFPLA B 218 236 CTAGCAAACGCCGACTTCCCCCTGGCT B 534 1338 +
LAKEGYRDA B 219 237 CTAGCAAAGGAGGGCTACCGGGACGCT B 535 1339 +
LADPMPTHA B 220 238 CTAGCAGACCCCATGCCCACCCACGCT B 536 1340 +
LAQNQKQIA B 221 239 CTAGCACAGAACCAGAAGCAGATCGCT B 537 1341 +
LASENLNRA B 222 240 CTAGCAAGCGAGAACCTGAACCGGGCT B 538 1342 +
LAFCTPRYA B 223 241 CTAGCATTCTGCACCCCCCGGTACGCT B 539 1343 +
LANLKNFSA B 224 242 CTAGCAAACCTGAAGAACTTCAGCGCT B 540 1344 +
LANAMEKHA B 225 243 CTAGCAAACGCCATGGAGAAGCACGCT B 541 1345 +
LAMHESYNA B 226 244 CTAGCAATGCACGAGAGCTACAACGCT B 542 1346 +
LAMKYVFDA B 227 245 CTAGCAATGAAGTACGTGTTCGACGCT B 543 1347 +
LAKGQAQNA B 228 246 CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT B 544 1348 +
LAFRTMEYA B 229 247 CTAGCATTCCGGACCATGGAGTACGCT B 545 1349 +
LAKKVVDGA B 230 248 CTAGCAAAGAAGGTGGTGGACGGCGCT B 546 1350 +
LAKGMKEGA B 231 249 CTAGCAAAGGGCATGAAGGAGGGCGCT B 547 1351 +
LADDQAVNA B 232 250 CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT B 548 1352 +
LANTWCKGA B 233 251 CTAGCAAACACCTGGTGCAAGGGCGCT B 549 1353 +
LANQTTREA B 234 252 CTAGCAAACCAGACCACCCGGGAGGCT B 550 1354 +
LADGIQKNA B 235 253 CTAGCAGACGGCATCCAGAAGAACGCT B 551 1355 +
LAHQGAIIA B 236 254 CTAGCACACCAGGGCGCCATCATCGCT B 552 1356 +
LADNCWCCA B 237 255 CTAGCAGACAACTGCTGGTGCTGCGCT B 553 1357 +
LADVGCENA B 238 256 CTAGCAGACGTGGGCTGCGAGAACGCT B 554 1358 +
LAGSRVNFA B 239 257 CTAGCAGGCAGCCGGGTGAACTTCGCT B 555 1359 +
LATKSTGSA B 240 258 CTAGCAACCAAGAGCACCGGCAGCGCT B 556 1360 +
LAAHQMASA B 241 259 CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT B 557 1361 +
LAREDHRQA B 242 260 CTAGCACGGGAGGACCACCGGCAGGCT B 558 1362 +
LAYLPLKYA B 243 261 CTAGCATACCTGCCCCTGAAGTACGCT B 559 1363 +
LALETTQRA B 244 262 CTAGCACTGGAGACCACCCAGCGGGCT B 560 1364 +
LAEGLSQFA B 245 263 CTAGCAGAGGGCCTGAGCCAGTTCGCT B 561 1365 +
LADWRTTPA B 246 264 CTAGCAGACTGGCGGACCACCCCCGCT B 562 1366 +
LAETVKYMA B 247 265 CTAGCAGAGACCGTGAAGTACATGGCT B 563 1367 +
LAAVKAVVA B 248 266 CTAGCAGCCGTGAAGGCCGTGGTGGCT B 564 1368 +
LAKGQSQGA B 249 267 CTAGCAAAGGGCCAGAGCCAGGGCGCT B 565 1369 +
LAVEPGPPA B 250 268 CTAGCAGTGGAGCCCGGCCCCCCCGCT B 566 1370 +
LAAEHKQTA B 251 269 CTAGCAGCCGAGCACAAGCAGACCGCT B 567 1371 +
LAHYPSAPA B 252 270 CTAGCACACTACCCCAGCGCCCCCGCT B 568 1372 +
LATRADIFA B 253 271 CTAGCAACCCGGGCCGACATCTTCGCT B 569 1373 +
LAYLRALKA B 254 272 CTAGCATACCTGCGGGCCCTGAAGGCT B 570 1374 +
LAQNQWTDA B 255 273 CTAGCACAGAACCAGTGGACCGACGCT B 571 1375 +
LAGGAWDWA B 256 274 CTAGCAGGCGGCGCCTGGGACTGGGCT B 572 1376 +
LADENLQAA B 257 275 CTAGCAGACGAGAACCTGCAGGCCGCT B 573 1377 +
LANRLSNVA B 258 276 CTAGCAAACCGGCTGAGCAACGTGGCT B 574 1378 +
LAEPPDPPA B 259 277 CTAGCAGAGCCCCCCGACCCCCCCGCT B 575 1379 +
LAQEAKLTA B 260 278 CTAGCACAGGAGGCCAAGCTGACCGCT B 576 1380 +
LAHTPDTFA B 261 279 CTAGCACACACCCCCGACACCTTCGCT B 577 1381 +
LAGESSYLA B 262 280 CTAGCAGGCGAGAGCAGCTACCTGGCT B 578 1382 +
LADLTLRAA B 263 281 CTAGCAGACCTGACCCTGCGGGCCGCT B 579 1383 +
LAKRDKPTA B 264 282 CTAGCAAAGCGGGACAAGCCCACCGCT B 580 1384 +
LANRWAIDA B 265 283 CTAGCAAACCGGTGGGCCATCGACGCT B 581 1385 +
LACRSDCVA B 266 284 CTAGCATGCCGGAGCGACTGCGTGGCT B 582 1386 +
LAKPTGKDA B 267 285 CTAGCAAAGCCCACCGGCAAGGACGCT B 583 1387 +
LAGHKHDEA B 268 286 CTAGCAGGCCACAAGCACGACGAGGCT B 584 1388 +
LAAQDVSWA B 269 287 CTAGCAGCCCAGGACGTGAGCTGGGCT B 585 1389 +
LADVGCENA B 270 288 CTAGCAGACGTGGGCTGCGAGAACGCT B 586 1390 +
LAKGPASIA B 271 289 CTAGCAAAGGGCCCCGCCAGCATCGCT B 587 1391 +
LAGPQRFQA B 272 290 CTAGCAGGCCCCCAGCGGTTCCAGGCT B 588 1392 +
LAATICTEA B 273 291 CTAGCAGCCACCATCTGCACCGAGGCT B 589 1393 +
LAMTNTFLA B 274 292 CTAGCAATGACCAACACCTTCCTGGCT B 590 1394 +
LAKGMKEGA B 275 293 CTAGCAAAGGGCATGAAGGAGGGCGCT B 591 1395 +
LAKGVTTAA B 276 294 CTAGCAAAGGGCGTGACCACCGCCGCT B 592 1396 +
LARFRGMCA B 277 295 CTAGCACGGTTCCGGGGCATGTGCGCT B 593 1397 +
TSHVSTSS B 278 296 ACCAGCCACGTGAGCACCAGCAGC B 594 1398 +++
SGVLFTEG B 279 297 AGCGGCGTGCTGTTCACCGAGGGC B 595 1399 +++
TSGMGAIG B 280 298 ACCAGCGGCATGGGCGCCATCGGC B 596 1400 +++
TGDSEQQT B 281 299 ACCGGCGACAGCGAGCAGCAGACC B 597 1401 +++
SGPGTSGT B 282 300 AGCGGCCCCGGCACCAGCGGCACC B 598 1402 +++
SGSVGYVG B 283 301 AGCGGCAGCGTGGGCTACGTGGGC B 599 1403 +++
TGEGPTKG B 284 302 ACCGGCGAGGGCCCCACCAAGGGC B 600 1404 +++
TGDKWPQG B 285 303 ACCGGCGACAAGTGGCCCCAGGGC B 601 1405 +++
SGEMTKPG B 286 304 AGCGGCGAGATGACCAAGCCCGGC B 602 1406 ++
TTENHKPG B 287 305 ACCACCGAGAACCACAAGCCCGGC B 603 1407 ++
SGREIHFG B 288 306 AGCGGCCGGGAGATCCACTTCGGC B 604 1408 ++
SSENNKGG B 289 307 AGCAGCGAGAACAACAAGGGCGGC B 605 1409 ++
TSQEKQNS B 290 308 ACCAGCCAGGAGAAGCAGAACAGC B 606 1410 ++
GTMFNNST B 291 309 GGCACCATGTTCAACAACAGCACC B 607 1411 +
TTGMERPT B 292 310 ACCACCGGCATGGAGCGGCCCACC B 608 1412 +
SGPKETGG B 293 311 AGCGGCCCCAAGGAGACCGGCGGC B 609 1413 +
SGIDTRLG B 294 312 AGCGGCATCGACACCCGGCTGGGC B 610 1414 +
STVPLNMG B 295 313 AGCACCGTGCCCCTGAACATGGGC B 611 1415 +
TGIATSYS B 296 314 ACCGGCATCGCCACCAGCTACAGC B 612 1416 +
TGDERKPG B 297 315 ACCGGCGACGAGCGGAAGCCCGGC B 613 1417 +
TGPGTHNG B 298 316 ACCGGCCCCGGCACCCACAACGGC B 614 1418 +
STTKPM B 299 317 AGCACCACCAAGCCCATG B 615 1419 +++
CKEITR B 300 318 TGCAAGGAGATCACCCGG B 616 1420 +++
SKMRPA B 301 319 AGCAAGATGCGGCCCGCC B 617 1421 +++
PPNQYI B 302 320 CCCCCCAACCAGTACATC B 618 1422 +++
PDVSLL B 303 321 CCCGACGTGAGCCTGCTG B 619 1423 +++
HSKDGA B 304 322 CACAGCAAGGACGGCGCC B 620 1424 +++
KFRHTE B 305 323 AAGTTCCGGCACACCGAG B 621 1425 +++
LWMTTV B 306 324 CTGTGGATGACCACCGTG B 622 1426 +++
RPGRVS B 307 325 CGGCCCGGCCGGGTGAGC B 623 1427 +++
NIKKAA B 308 326 AACATCAAGAAGGCCGCC B 624 1428 +++
RLGRLS B 309 327 CGGCTGGGCCGGCTGAGC B 625 1429 ++
FNKVLH B 310 328 TTCAACAAGGTGCTGCAC B 626 1430 ++
RTGRNT B 311 329 CGGACCGGCCGGAACACC B 627 1431 ++
RALKIS B 312 330 CGGGCCCTGAAGATCAGC B 628 1432 ++
RLGKVP B 313 331 CGGCTGGGCAAGGTGCCC B 629 1433 +
KFTKAA B 314 332 AAGTTCACCAAGGCCGCC B 630 1434 +
HFPVFS B 315 333 CACTTCCCCGTGTTCAGC B 631 1435 +
NSKKLG B 316 334 AACAGCAAGAAGCTGGGC B 632 1436 +
KAMRTG B 317 335 AAGGCCATGCGGACCGGC B 633 1437 +
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**用於序列表之SEQ ID NO。
[表1C]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 編碼胺基酸序列之核酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 活性水平*
LAEFRVGQA C 2 336 CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT C 46 1438 +++
LAGIQQHVA C 3 337 CTAGCAGGCATCCAGCAGCACGTGGCT C 47 1439 +++
LAQVTEMRA C 4 338 CTAGCACAGGTGACCGAGATGCGGGCT C 48 1440 +++
LAFNGSTSA C 5 339 CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT C 49 1441 +++
LAKGFKTEA C 6 340 CTAGCAAAGGGCTTCAAGACCGAGGCT C 50 1442 +++
LAAGQAQSA C 7 341 CTAGCAGCCGGCCAGGCCCAGAGCGCT C 51 1443 +++
LAFLRGPEA C 8 342 CTAGCATTCCTGCGGGGCCCCGAGGCT C 52 1444 +++
LAQVQVEGA C 9 343 CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT C 53 1445 +++
LAGSMAKLA C 10 344 CTAGCAGGCAGCATGGCCAAGCTGGCT C 54 1446 +++
LAGHAACFA C 11 345 CTAGCAGGCCACGCCGCCTGCTTCGCT C 55 1447 +++
LAVNRVDMA C 12 346 CTAGCAGTGAACCGGGTGGACATGGCT C 56 1448 +++
LAGFHAIEA C 13 347 CTAGCAGGCTTCCACGCCATCGAGGCT C 57 1449 +++
LAYFHSYAA C 14 348 CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT C 58 1450 +++
LADHGNKPA C 15 349 CTAGCAGACCACGGCAACAAGCCCGCT C 59 1451 ++
LAPIQLAQA C 16 350 CTAGCACCCATCCAGCTGGCCCAGGCT C 60 1452 ++
LAPLQTQEA C 18 351 CTAGCACCCCTGCAGACCCAGGAGGCT C 61 1453 ++
LAEQVLEKA C 19 352 CTAGCAGAGCAGGTGCTGGAGAAGGCT C 62 1454 ++
LAFPCIKEA C 20 353 CTAGCATTCCCCTGCATCAAGGAGGCT C 63 1455 ++
LAQVEVSKA C 21 354 CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT C 64 1456 ++
LAKDGGKIA C 22 355 CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT C 65 1457 ++
LAKVASMNA C 23 356 CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT C 66 1458 ++
LADEGREHA C 24 357 CTAGCAGACGAGGGCCGGGAGCACGCT C 67 1459 ++
LASACMRAA C 25 358 CTAGCAAGCGCCTGCATGCGGGCCGCT C 68 1460 ++
LAGDIVRNA C 26 359 CTAGCAGGCGACATCGTGCGGAACGCT C 69 1461 ++
LADPMPTHA C 27 360 CTAGCAGACCCCATGCCCACCCACGCT C 70 1462 ++
LAFCTPRYA C 28 361 CTAGCATTCTGCACCCCCCGGTACGCT C 71 1463 ++
LANAMEKHA C 29 362 CTAGCAAACGCCATGGAGAAGCACGCT C 72 1464 +
LAMHESYNA C 30 363 CTAGCAATGCACGAGAGCTACAACGCT C 73 1465 +
LAKGQAQNA C 31 364 CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT C 74 1466 +
LADDQAVNA C 32 365 CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT C 75 1467 +
LADGIQKNA C 33 366 CTAGCAGACGGCATCCAGAAGAACGCT C 76 1468 +
LAAHQMASA C 34 367 CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT C 77 1469 +
LAETVKYMA C 35 368 CTAGCAGAGACCGTGAAGTACATGGCT C 78 1470 +
LAKGQSQGA C 36 369 CTAGCAAAGGGCCAGAGCCAGGGCGCT C 79 1471 +
LAVEPGPPA C 37 370 CTAGCAGTGGAGCCCGGCCCCCCCGCT C 80 1472 +
LAAEHKQTA C 38 371 CTAGCAGCCGAGCACAAGCAGACCGCT C 81 1473 +
LAEPPDPPA C 39 372 CTAGCAGAGCCCCCCGACCCCCCCGCT C 82 1474 +
LAHTPDTFA C 40 373 CTAGCACACACCCCCGACACCTTCGCT C 83 1475 +
LAKGPASIA C 41 374 CTAGCAAAGGGCCCCGCCAGCATCGCT C 84 1476 +
LAKGMKEGA C 42 375 CTAGCAAAGGGCATGAAGGAGGGCGCT C 85 1477 +
LAKGVTTAA C 43 376 CTAGCAAAGGGCGTGACCACCGCCGCT C 86 1478 +
NSKKLG C 44 377 AACAGCAAGAAGCTGGGC C 87 1479 +
KAMRTG C 45 378 AAGGCCATGCGGACCGGC C 88 1480 +
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1D]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 編碼胺基酸序列之核酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 活性水平*
LAKINAQPA D 2 379 CTAGCAAAGATCAACGCCCAGCCCGCT D 79 1481 +++
LAEEEKYGA D 3 380 CTAGCAGAGGAGGAGAAGTACGGCGCT D 80 1482 +++
LALEVGDHA D 4 381 CTAGCACTGGAGGTGGGCGACCACGCT D 81 1483 +++
LAIGSDTSA D 5 382 CTAGCAATCGGCAGCGACACCAGCGCT D 82 1484 +++
LAAVHLMGA D 6 383 CTAGCAGCCGTGCACCTGATGGGCGCT D 83 1485 +++
LAVRNEINA D 7 384 CTAGCAGTGCGGAACGAGATCAACGCT D 84 1486 +++
LAQVKQGPA D 8 385 CTAGCACAGGTGAAGCAGGGCCCCGCT D 85 1487 +++
LANKNTAIA D 9 386 CTAGCAAACAAGAACACCGCCATCGCT D 86 1488 +++
LAEHKNMHA D 10 387 CTAGCAGAGCACAAGAACATGCACGCT D 87 1489 +++
LAEVTYTGA D 11 388 CTAGCAGAGGTGACCTACACCGGCGCT D 88 1490 +++
LASADHQPA D 12 389 CTAGCAAGCGCCGACCACCAGCCCGCT D 89 1491 +++
LAEFDGDGA D 13 390 CTAGCAGAGTTCGACGGCGACGGCGCT D 90 1492 +++
LADFPSEKA D 14 391 CTAGCAGACTTCCCCAGCGAGAAGGCT D 91 1493 +++
LALDMWEPA D 15 392 CTAGCACTGGACATGTGGGAGCCCGCT D 92 1494 +++
LAKFAAKDA D 16 393 CTAGCAAAGTTCGCCGCCAAGGACGCT D 93 1495 +++
LANNAEPSA D 17 394 CTAGCAAACAACGCCGAGCCCAGCGCT D 94 1496 +++
LAHDWGAPA D 18 395 CTAGCACACGACTGGGGCGCCCCCGCT D 95 1497 +++
LAMDREIKA D 19 396 CTAGCAATGGACCGGGAGATCAAGGCT D 96 1498 +++
LAQGNNTGA D 20 397 CTAGCACAGGGCAACAACACCGGCGCT D 97 1499 +++
LADNLNTPA D 21 398 CTAGCAGACAACCTGAACACCCCCGCT D 98 1500 +++
LAAANHDNA D 22 399 CTAGCAGCCGCCAACCACGACAACGCT D 99 1501 +++
LAVPKADAA D 23 400 CTAGCAGTGCCCAAGGCCGACGCCGCT D 100 1502 +++
LAVFQETGA D 24 401 CTAGCAGTGTTCCAGGAGACCGGCGCT D 101 1503 +++
LAAVKAVVA D 25 402 CTAGCAGCCGTGAAGGCCGTGGTGGCT D 102 1504 +++
LADNCWCCA D 26 403 CTAGCAGACAACTGCTGGTGCTGCGCT D 103 1505 +++
LAHAGSSSA D 27 404 CTAGCACACGCCGGCAGCAGCAGCGCT D 104 1506 +++
LAGIQQHVA D 28 405 CTAGCAGGCATCCAGCAGCACGTGGCT D 105 1507 ++
LAHDLHGGA D 29 406 CTAGCACACGACCTGCACGGCGGCGCT D 106 1508 ++
LAMHESYNA D 30 407 CTAGCAATGCACGAGAGCTACAACGCT D 107 1509 ++
LATPNVNAA D 31 408 CTAGCAACCCCCAACGTGAACGCCGCT D 108 1510 ++
LAFNGSTSA D 32 409 CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT D 109 1511 ++
LAEGLSQFA D 33 410 CTAGCAGAGGGCCTGAGCCAGTTCGCT D 110 1512 ++
LAQVTEMRA D 34 411 CTAGCACAGGTGACCGAGATGCGGGCT D 111 1513 ++
LAAHQMASA D 35 412 CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT D 112 1514 ++
LASACMRAA D 36 413 CTAGCAAGCGCCTGCATGCGGGCCGCT D 113 1515 ++
LADGIQKNA D 37 414 CTAGCAGACGGCATCCAGAAGAACGCT D 114 1516 ++
LAHIQEPKA D 38 415 CTAGCACACATCCAGGAGCCCAAGGCT D 115 1517 ++
LAAGQAQSA D 39 416 CTAGCAGCCGGCCAGGCCCAGAGCGCT D 116 1518 ++
LADHGNKPA D 40 417 CTAGCAGACCACGGCAACAAGCCCGCT D 117 1519 ++
LAFLRGPEA D 41 418 CTAGCATTCCTGCGGGGCCCCGAGGCT D 118 1520 ++
LAETVKYMA D 42 419 CTAGCAGAGACCGTGAAGTACATGGCT D 119 1521 ++
LADEGREHA D 43 420 CTAGCAGACGAGGGCCGGGAGCACGCT D 120 1522 ++
LAGDIVRNA D 44 421 CTAGCAGGCGACATCGTGCGGAACGCT D 121 1523 ++
LAGSMAKLA D 45 422 CTAGCAGGCAGCATGGCCAAGCTGGCT D 122 1524 ++
LAKGMKEGA D 46 423 CTAGCAAAGGGCATGAAGGAGGGCGCT D 123 1525 ++
LAEPPDPPA D 47 424 CTAGCAGAGCCCCCCGACCCCCCCGCT D 124 1526 ++
LATWCLVWA D 48 425 CTAGCAACCTGGTGCCTGGTGTGGGCT D 125 1527 ++
LAFPCIKEA D 49 426 CTAGCATTCCCCTGCATCAAGGAGGCT D 126 1528 ++
LAKGFKTEA D 50 427 CTAGCAAAGGGCTTCAAGACCGAGGCT D 127 1529 +
LAKGQSQGA D 51 428 CTAGCAAAGGGCCAGAGCCAGGGCGCT D 128 1530 +
LAEQVLEKA D 52 429 CTAGCAGAGCAGGTGCTGGAGAAGGCT D 129 1531 +
LAKGPASIA D 53 430 CTAGCAAAGGGCCCCGCCAGCATCGCT D 130 1532 +
LAEFRVGQA D 54 431 CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT D 131 1533 +
LAVEPGPPA D 55 432 CTAGCAGTGGAGCCCGGCCCCCCCGCT D 132 1534 +
LAVNRVDMA D 56 433 CTAGCAGTGAACCGGGTGGACATGGCT D 133 1535 +
LAYFHSYAA D 57 434 CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT D 134 1536 +
LAHTPDTFA D 58 435 CTAGCACACACCCCCGACACCTTCGCT D 135 1537 +
LAFCTPRYA D 59 436 CTAGCATTCTGCACCCCCCGGTACGCT D 136 1538 +
LAAEHKQTA D 60 437 CTAGCAGCCGAGCACAAGCAGACCGCT D 137 1539 +
LAPIQLAQA D 61 438 CTAGCACCCATCCAGCTGGCCCAGGCT D 138 1540 +
LAQVEVSKA D 62 439 CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT D 139 1541 +
LAPLQTQEA D 63 440 CTAGCACCCCTGCAGACCCAGGAGGCT D 140 1542 +
LARAITNEA D 64 441 CTAGCACGGGCCATCACCAACGAGGCT D 141 1543 +
LAGHAACFA D 65 442 CTAGCAGGCCACGCCGCCTGCTTCGCT D 142 1544 +
LAGFHAIEA D 66 443 CTAGCAGGCTTCCACGCCATCGAGGCT D 143 1545 +
LAQVQVEGA D 67 444 CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT D 144 1546 +
LANAMEKHA D 68 445 CTAGCAAACGCCATGGAGAAGCACGCT D 145 1547 +
LADPMPTHA D 69 446 CTAGCAGACCCCATGCCCACCCACGCT D 146 1548 +
LAKVASMNA D 70 447 CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT D 147 1549 +
LAKGQAQNA D 71 448 CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT D 148 1550 +
LAKDGGKIA D 72 449 CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT D 149 1551 +
LADDQAVNA D 73 450 CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT D 150 1552 +
LAKGVTTAA D 74 451 CTAGCAAAGGGCGTGACCACCGCCGCT D 151 1553 +
SGPKETGG D 75 452 AGCGGCCCCAAGGAGACCGGCGGC D 152 1554 ++
TGPGTHNG D 76 453 ACCGGCCCCGGCACCCACAACGGC D 153 1555 ++
NSKKLG D 77 454 AACAGCAAGAAGCTGGGC D 154 1556 +
KAMRTG D 78 455 AAGGCCATGCGGACCGGC D 155 1557 +
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1E]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 編碼胺基酸序列之核酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 活性水平*
LAELALIKA E 2 456 CTAGCAGAGCTGGCCCTGATCAAGGCT E 84 1558 +++
LADLSDHHA E 3 457 CTAGCAGACCTGAGCGACCACCACGCT E 85 1559 +++
LADPLYAVA E 4 458 CTAGCAGACCCCCTGTACGCCGTGGCT E 86 1560 +++
LAPMRGVYA E 5 459 CTAGCACCCATGCGGGGCGTGTACGCT E 87 1561 +++
LAITQSDIA E 6 460 CTAGCAATCACCCAGAGCGACATCGCT E 88 1562 +++
LADDMIFVA E 7 461 CTAGCAGACGACATGATCTTCGTGGCT E 89 1563 +++
LAEFRVGQA E 8 462 CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT E 90 1564 +++
LAKALGMEA E 9 463 CTAGCAAAGGCCCTGGGCATGGAGGCT E 91 1565 +++
LACPVAEWA E 10 464 CTAGCATGCCCCGTGGCCGAGTGGGCT E 92 1566 +++
LANEAQGKA E 11 465 CTAGCAAACGAGGCCCAGGGCAAGGCT E 93 1567 +++
LAQVTEMRA E 12 466 CTAGCACAGGTGACCGAGATGCGGGCT E 94 1568 +++
LAIGERTTA E 13 467 CTAGCAATCGGCGAGCGGACCACCGCT E 95 1569 +++
LANLKENEA E 14 468 CTAGCAAACCTGAAGGAGAACGAGGCT E 96 1570 +++
LAFNGSTSA E 15 469 CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT E 97 1571 +++
LAQEQNAAA E 16 470 CTAGCACAGGAGCAGAACGCCGCCGCT E 98 1572 +++
LAPTTIGGA E 17 471 CTAGCACCCACCACCATCGGCGGCGCT E 99 1573 +++
LAPSGDRHA E 18 472 CTAGCACCCAGCGGCGACCGGCACGCT E 100 1574 +++
LAKDHHVIA E 19 473 CTAGCAAAGGACCACCACGTGATCGCT E 101 1575 +++
LAQKKLLEA E 20 474 CTAGCACAGAAGAAGCTGCTGGAGGCT E 102 1576 +++
LAFLRGPEA E 21 475 CTAGCATTCCTGCGGGGCCCCGAGGCT E 103 1577 ++
LARSSTLNA E 22 476 CTAGCACGGAGCAGCACCCTGAACGCT E 104 1578 ++
LAHIQEPKA E 23 477 CTAGCACACATCCAGGAGCCCAAGGCT E 105 1579 ++
LAQVQVEGA E 24 478 CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT E 106 1580 ++
LAPNTPKIA E 25 479 CTAGCACCCAACACCCCCAAGATCGCT E 107 1581 ++
LAVNRVDMA E 26 480 CTAGCAGTGAACCGGGTGGACATGGCT E 108 1582 ++
LAGFHAIEA E 27 481 CTAGCAGGCTTCCACGCCATCGAGGCT E 109 1583 ++
LAEGMTGIA E 28 482 CTAGCAGAGGGCATGACCGGCATCGCT E 110 1584 ++
LAGEVTKHA E 29 483 CTAGCAGGCGAGGTGACCAAGCACGCT E 111 1585 ++
LAYFHSYAA E 30 484 CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT E 112 1586 ++
LAPLQTQEA E 31 485 CTAGCACCCCTGCAGACCCAGGAGGCT E 113 1587 ++
LAFPCIKEA E 32 486 CTAGCATTCCCCTGCATCAAGGAGGCT E 114 1588 ++
LAQVEVSKA E 33 487 CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT E 115 1589 ++
LAPGNDLWA E 34 488 CTAGCACCCGGCAACGACCTGTGGGCT E 116 1590 ++
LAKDGGKIA E 35 489 CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT E 117 1591 ++
LAKVASMNA E 36 490 CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT E 118 1592 ++
LAGKIEENA E 37 491 CTAGCAGGCAAGATCGAGGAGAACGCT E 119 1593 ++
LAPVKHTWA E 38 492 CTAGCACCCGTGAAGCACACCTGGGCT E 120 1594 ++
LALNNDQSA E 39 493 CTAGCACTGAACAACGACCAGAGCGCT E 121 1595 ++
LAGDIVRNA E 40 494 CTAGCAGGCGACATCGTGCGGAACGCT E 122 1596 ++
LANADFPLA E 41 495 CTAGCAAACGCCGACTTCCCCCTGGCT E 123 1597 ++
LAKEGYRDA E 42 496 CTAGCAAAGGAGGGCTACCGGGACGCT E 124 1598 ++
LADPMPTHA E 43 497 CTAGCAGACCCCATGCCCACCCACGCT E 125 1599 ++
LAFCTPRYA E 44 498 CTAGCATTCTGCACCCCCCGGTACGCT E 126 1600 +
LANLKNFSA E 45 499 CTAGCAAACCTGAAGAACTTCAGCGCT E 127 1601 +
LANAMEKHA E 46 500 CTAGCAAACGCCATGGAGAAGCACGCT E 128 1602 +
LAKGQAQNA E 47 501 CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT E 129 1603 +
LADDQAVNA E 48 502 CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT E 130 1604 +
LANTWCKGA E 49 503 CTAGCAAACACCTGGTGCAAGGGCGCT E 131 1605 +
LADVGCENA E 50 504 CTAGCAGACGTGGGCTGCGAGAACGCT E 132 1606 +
LAGSRVNFA E 51 505 CTAGCAGGCAGCCGGGTGAACTTCGCT E 133 1607 +
LAAHQMASA E 52 506 CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT E 134 1608 +
LAREDHRQA E 53 507 CTAGCACGGGAGGACCACCGGCAGGCT E 135 1609 +
LAVEPGPPA E 54 508 CTAGCAGTGGAGCCCGGCCCCCCCGCT E 136 1610 +
LATRADIFA E 55 509 CTAGCAACCCGGGCCGACATCTTCGCT E 137 1611 +
LAQNQWTDA E 56 510 CTAGCACAGAACCAGTGGACCGACGCT E 138 1612 +
LADENLQAA E 57 511 CTAGCAGACGAGAACCTGCAGGCCGCT E 139 1613 +
LAEPPDPPA E 58 512 CTAGCAGAGCCCCCCGACCCCCCCGCT E 140 1614 +
LAQEAKLTA E 59 513 CTAGCACAGGAGGCCAAGCTGACCGCT E 141 1615 +
LAHTPDTFA E 60 514 CTAGCACACACCCCCGACACCTTCGCT E 142 1616 +
LADLTLRAA E 61 515 CTAGCAGACCTGACCCTGCGGGCCGCT E 143 1617 +
LANRWAIDA E 62 516 CTAGCAAACCGGTGGGCCATCGACGCT E 144 1618 +
LAKPTGKDA E 63 517 CTAGCAAAGCCCACCGGCAAGGACGCT E 145 1619 +
LAKGPASIA E 64 518 CTAGCAAAGGGCCCCGCCAGCATCGCT E 146 1620 +
LAKGVTTAA E 65 519 CTAGCAAAGGGCGTGACCACCGCCGCT E 147 1621 +
TSHVSTSS E 66 520 ACCAGCCACGTGAGCACCAGCAGC E 148 1622 +++
SGVLFTEG E 67 521 AGCGGCGTGCTGTTCACCGAGGGC E 149 1623 +++
SGPGTSGT E 68 522 AGCGGCCCCGGCACCAGCGGCACC E 150 1624 +++
TGEGPTKG E 69 523 ACCGGCGAGGGCCCCACCAAGGGC E 151 1625 +++
TGDKWPQG E 70 524 ACCGGCGACAAGTGGCCCCAGGGC E 152 1626 +++
SGREIHFG E 71 525 AGCGGCCGGGAGATCCACTTCGGC E 153 1627 ++
TSQEKQNS E 72 526 ACCAGCCAGGAGAAGCAGAACAGC E 154 1628 ++
GTMFNNST E 73 527 GGCACCATGTTCAACAACAGCACC E 155 1629 ++
TTGMERPT E 74 528 ACCACCGGCATGGAGCGGCCCACC E 156 1630 ++
TGDERKPG E 75 529 ACCGGCGACGAGCGGAAGCCCGGC E 157 1631 +
CKEITR E 76 530 TGCAAGGAGATCACCCGG E 158 1632 +++
PDVSLL E 77 531 CCCGACGTGAGCCTGCTG E 159 1633 +++
RLGRLS E 78 532 CGGCTGGGCCGGCTGAGC E 160 1634 +++
RLGKVP E 79 533 CGGCTGGGCAAGGTGCCC E 161 1635 +
KFTKAA E 80 534 AAGTTCACCAAGGCCGCC E 162 1636 +
HFPVFS E 81 535 CACTTCCCCGTGTTCAGC E 163 1637 +
NSKKLG E 82 536 AACAGCAAGAAGCTGGGC E 164 1638 +
KAMRTG E 83 537 AAGGCCATGCGGACCGGC E 165 1639 +
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1F]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 編碼胺基酸序列之核酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 活性水平*
LAFNSCSYA F 2 538 CTAGCATTCAACAGCTGCAGCTACGCT F 11 1640 +++
LAGGAWDWA F 3 539 CTAGCAGGCGGCGCCTGGGACTGGGCT F 12 1641 +++
LANADFPLA F 4 540 CTAGCAAACGCCGACTTCCCCCTGGCT F 13 1642 +++
LAAQDVSWA F 5 541 CTAGCAGCCCAGGACGTGAGCTGGGCT F 14 1643 ++
LADVGCENA F 6 542 CTAGCAGACGTGGGCTGCGAGAACGCT F 15 1644 ++
LAATICTEA F 7 543 CTAGCAGCCACCATCTGCACCGAGGCT F 16 1645 ++
LAEGLSQFA F 8 544 CTAGCAGAGGGCCTGAGCCAGTTCGCT F 17 1646 +
LAKPTGKDA F 9 545 CTAGCAAAGCCCACCGGCAAGGACGCT F 18 1647 +
LARFRGMCA F 10 546 CTAGCACGGTTCCGGGGCATGTGCGCT F 19 1648 +
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1G]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 編碼胺基酸序列之核酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 活性水平*
LARRKSNEA G 2 547 CTAGCACGGCGGAAGAGCAACGAGGCT G 78 1649 +++
LAPQNLDEA G 3 548 CTAGCACCCCAGAACCTGGACGAGGCT G 79 1650 +++
LAMFVWVPA G 4 549 CTAGCAATGTTCGTGTGGGTGCCCGCT G 80 1651 +++
LACTYTYAA G 5 550 CTAGCATGCACCTACACCTACGCCGCT G 81 1652 +++
LAKINAQPA G 6 551 CTAGCAAAGATCAACGCCCAGCCCGCT G 82 1653 +++
LADLSDHHA G 7 552 CTAGCAGACCTGAGCGACCACCACGCT G 83 1654 +++
LAHEGRQAA G 8 553 CTAGCACACGAGGGCCGGCAGGCCGCT G 84 1655 +++
LADAHSVTA G 9 554 CTAGCAGACGCCCACAGCGTGACCGCT G 85 1656 +++
LADLGYPNA G 10 555 CTAGCAGACCTGGGCTACCCCAACGCT G 86 1657 +++
LAQWFLWRA G 11 556 CTAGCACAGTGGTTCCTGTGGCGGGCT G 87 1658 +++
LAYAEQSKA G 12 557 CTAGCATACGCCGAGCAGAGCAAGGCT G 88 1659 +++
LAAKMYNGA G 13 558 CTAGCAGCCAAGATGTACAACGGCGCT G 89 1660 +++
LAEADKWYA G 14 559 CTAGCAGAGGCCGACAAGTGGTACGCT G 90 1661 +++
LATVYKSPA G 15 560 CTAGCAACCGTGTACAAGAGCCCCGCT G 91 1662 +++
LASRTAVAA G 16 561 CTAGCAAGCCGGACCGCCGTGGCCGCT G 92 1663 +++
LADDMIFVA G 17 562 CTAGCAGACGACATGATCTTCGTGGCT G 93 1664 +++
LAEFRVGQA G 18 563 CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT G 94 1665 +++
LAADPTFKA G 19 564 CTAGCAGCCGACCCCACCTTCAAGGCT G 95 1666 +++
LAVSRHGEA G 20 565 CTAGCAGTGAGCCGGCACGGCGAGGCT G 96 1667 +++
LAPMRGVYA G 21 566 CTAGCACCCATGCGGGGCGTGTACGCT G 97 1668 +++
LAFPDKSIA G 22 567 CTAGCATTCCCCGACAAGAGCATCGCT G 98 1669 +++
LAEFHIPTA G 23 568 CTAGCAGAGTTCCACATCCCCACCGCT G 99 1670 +++
LALNNDQSA G 24 569 CTAGCACTGAACAACGACCAGAGCGCT G 100 1671 +++
LAKALGMEA G 25 570 CTAGCAAAGGCCCTGGGCATGGAGGCT G 101 1672 ++
LAYLPLKYA G 26 571 CTAGCATACCTGCCCCTGAAGTACGCT G 102 1673 ++
LAHYPSAPA G 27 572 CTAGCACACTACCCCAGCGCCCCCGCT G 103 1674 ++
LANLKENEA G 28 573 CTAGCAAACCTGAAGGAGAACGAGGCT G 104 1675 ++
LARSSTLNA G 29 574 CTAGCACGGAGCAGCACCCTGAACGCT G 105 1676 ++
LAIGERTTA G 30 575 CTAGCAATCGGCGAGCGGACCACCGCT G 106 1677 ++
LAWIERSMA G 31 576 CTAGCATGGATCGAGCGGAGCATGGCT G 107 1678 ++
LAYDNTAEA G 32 577 CTAGCATACGACAACACCGCCGAGGCT G 108 1679 ++
LAERNHGYA G 33 578 CTAGCAGAGCGGAACCACGGCTACGCT G 109 1680 ++
LADILVGQA G 34 579 CTAGCAGACATCCTGGTGGGCCAGGCT G 110 1681 ++
LAFNGSTSA G 35 580 CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT G 111 1682 ++
LADWRTTPA G 36 581 CTAGCAGACTGGCGGACCACCCCCGCT G 112 1683 ++
LAPSGDRHA G 37 582 CTAGCACCCAGCGGCGACCGGCACGCT G 113 1684 ++
LAQEAKLTA G 38 583 CTAGCACAGGAGGCCAAGCTGACCGCT G 114 1685 ++
LAAEHKQTA G 39 584 CTAGCAGCCGAGCACAAGCAGACCGCT G 115 1686 ++
LAETTLTRA G 40 585 CTAGCAGAGACCACCCTGACCCGGGCT G 116 1687 ++
LAGESSYLA G 41 586 CTAGCAGGCGAGAGCAGCTACCTGGCT G 117 1688 ++
LAQVQVEGA G 42 587 CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT G 118 1689 +
LAVNRVDMA G 43 588 CTAGCAGTGAACCGGGTGGACATGGCT G 119 1690 +
LAFCTPRYA G 44 589 CTAGCATTCTGCACCCCCCGGTACGCT G 120 1691 +
LADDQAVNA G 45 590 CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT G 121 1692 +
LAREDHRQA G 46 591 CTAGCACGGGAGGACCACCGGCAGGCT G 122 1693 +
LAKVASMNA G 47 592 CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT G 123 1694 +
LAKDGGKIA G 48 593 CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT G 124 1695 +
LANRWAIDA G 49 594 CTAGCAAACCGGTGGGCCATCGACGCT G 125 1696 +
LADLTLRAA G 50 595 CTAGCAGACCTGACCCTGCGGGCCGCT G 126 1697 +
LAKEGYRDA G 51 596 CTAGCAAAGGAGGGCTACCGGGACGCT G 127 1698 +
LAGKIEENA G 52 597 CTAGCAGGCAAGATCGAGGAGAACGCT G 128 1699 +
LAPVKHTWA G 53 598 CTAGCACCCGTGAAGCACACCTGGGCT G 129 1700 +
LAQVEVSKA G 54 599 CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT G 130 1701 +
LAPLQTQEA G 55 600 CTAGCACCCCTGCAGACCCAGGAGGCT G 131 1702 +
LAAHQMASA G 56 601 CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT G 132 1703 +
LAKKVVDGA G 57 602 CTAGCAAAGAAGGTGGTGGACGGCGCT G 133 1704 +
LAKGPASIA G 58 603 CTAGCAAAGGGCCCCGCCAGCATCGCT G 134 1705 +
LAKGQAQNA G 59 604 CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT G 135 1706 +
SGVLFTEG G 60 605 AGCGGCGTGCTGTTCACCGAGGGC G 136 1707 +++
SGPGTSGT G 61 606 AGCGGCCCCGGCACCAGCGGCACC G 137 1708 ++
TGEGPTKG G 62 607 ACCGGCGAGGGCCCCACCAAGGGC G 138 1709 ++
SGSVGYVG G 63 608 AGCGGCAGCGTGGGCTACGTGGGC G 139 1710 ++
STVPLNMG G 64 609 AGCACCGTGCCCCTGAACATGGGC G 140 1711 ++
SGREIHFG G 65 610 AGCGGCCGGGAGATCCACTTCGGC G 141 1712 ++
GTMFNNST G 66 611 GGCACCATGTTCAACAACAGCACC G 142 1713 +
TGDKWPQG G 67 612 ACCGGCGACAAGTGGCCCCAGGGC G 143 1714 +
TSQEKQNS G 68 613 ACCAGCCAGGAGAAGCAGAACAGC G 144 1715 +
TTGMERPT G 69 614 ACCACCGGCATGGAGCGGCCCACC G 145 1716 +
TGDERKPG G 70 615 ACCGGCGACGAGCGGAAGCCCGGC G 146 1717 +
PDVSLL G 71 616 CCCGACGTGAGCCTGCTG G 147 1718 ++
RTGRNT G 72 617 CGGACCGGCCGGAACACC G 148 1719 ++
KFTKAA G 73 618 AAGTTCACCAAGGCCGCC G 149 1720 ++
RLGRLS G 74 619 CGGCTGGGCCGGCTGAGC G 150 1721 +
KAMRTG G 75 620 AAGGCCATGCGGACCGGC G 151 1722 +
HFPVFS G 76 621 CACTTCCCCGTGTTCAGC G 152 1723 +
RLGKVP G 77 622 CGGCTGGGCAAGGTGCCC G 153 1724 +
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1H]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 編碼胺基酸序列之核酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 活性水平*
LAHGGLREA H 2 623 CTAGCACACGGCGGCCTGCGGGAGGCT H 259 1725 +++
LATDRTKTA H 3 624 CTAGCAACCGACCGGACCAAGACCGCT H 260 1726 +++
LARRKSNEA H 4 625 CTAGCACGGCGGAAGAGCAACGAGGCT H 261 1727 +++
LAVDNIWAA H 5 626 CTAGCAGTGGACAACATCTGGGCCGCT H 262 1728 +++
LADPLYAVA H 6 627 CTAGCAGACCCCCTGTACGCCGTGGCT H 263 1729 +++
LAGQAMMQA H 7 628 CTAGCAGGCCAGGCCATGATGCAGGCT H 264 1730 +++
LAMTKITDA H 8 629 CTAGCAATGACCAAGATCACCGACGCT H 265 1731 +++
LAFTHGTNA H 9 630 CTAGCATTCACCCACGGCACCAACGCT H 266 1732 +++
LADPGWKYA H 10 631 CTAGCAGACCCCGGCTGGAAGTACGCT H 267 1733 +++
LAGGEYETA H 11 632 CTAGCAGGCGGCGAGTACGAGACCGCT H 268 1734 +++
LAALVDANA H 12 633 CTAGCAGCCCTGGTGGACGCCAACGCT H 269 1735 +++
LADPTETPA H 13 634 CTAGCAGACCCCACCGAGACCCCCGCT H 270 1736 +++
LALENIGQA H 14 635 CTAGCACTGGAGAACATCGGCCAGGCT H 271 1737 +++
LALNDNVGA H 15 636 CTAGCACTGAACGACAACGTGGGCGCT H 272 1738 +++
LAHRAPDSA H 16 637 CTAGCACACCGGGCCCCCGACAGCGCT H 273 1739 +++
LAMFVWVPA H 17 638 CTAGCAATGTTCGTGTGGGTGCCCGCT H 274 1740 +++
LAEGQEDSA H 18 639 CTAGCAGAGGGCCAGGAGGACAGCGCT H 275 1741 +++
LAPDAKDWA H 19 640 CTAGCACCCGACGCCAAGGACTGGGCT H 276 1742 +++
LAPHIAKDA H 20 641 CTAGCACCCCACATCGCCAAGGACGCT H 277 1743 +++
LAAVTEYVA H 21 642 CTAGCAGCCGTGACCGAGTACGTGGCT H 278 1744 +++
LAFCIKHCA H 22 643 CTAGCATTCTGCATCAAGCACTGCGCT H 279 1745 +++
LAPPGNPLA H 23 644 CTAGCACCCCCCGGCAACCCCCTGGCT H 280 1746 +++
LAHWQEEWA H 24 645 CTAGCACACTGGCAGGAGGAGTGGGCT H 281 1747 +++
LAEFRVGQA H 25 646 CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT H 282 1748 +++
LAYVIENDA H 26 647 CTAGCATACGTGATCGAGAACGACGCT H 283 1749 +++
LASTTMNIA H 27 648 CTAGCAAGCACCACCATGAACATCGCT H 284 1750 +++
LAEFHIPTA H 28 649 CTAGCAGAGTTCCACATCCCCACCGCT H 285 1751 +++
LASRTAVAA H 29 650 CTAGCAAGCCGGACCGCCGTGGCCGCT H 286 1752 +++
LAIGSDTSA H 30 651 CTAGCAATCGGCAGCGACACCAGCGCT H 287 1753 +++
LADDMIFVA H 31 652 CTAGCAGACGACATGATCTTCGTGGCT H 288 1754 +++
LAKPPPKDA H 32 653 CTAGCAAAGCCCCCCCCCAAGGACGCT H 289 1755 +++
LAYVALFYA H 33 654 CTAGCATACGTGGCCCTGTTCTACGCT H 290 1756 +++
LAFQQQRCA H 34 655 CTAGCATTCCAGCAGCAGCGGTGCGCT H 291 1757 +++
LAAVHLMGA H 35 656 CTAGCAGCCGTGCACCTGATGGGCGCT H 292 1758 +++
LACPVAEWA H 36 657 CTAGCATGCCCCGTGGCCGAGTGGGCT H 293 1759 +++
LAVRNEINA H 37 658 CTAGCAGTGCGGAACGAGATCAACGCT H 294 1760 +++
LADSSKWIA H 38 659 CTAGCAGACAGCAGCAAGTGGATCGCT H 295 1761 +++
LAVMGNMLA H 39 660 CTAGCAGTGATGGGCAACATGCTGGCT H 296 1762 +++
LANANTRPA H 40 661 CTAGCAAACGCCAACACCCGGCCCGCT H 297 1763 +++
LAPNQGTPA H 41 662 CTAGCACCCAACCAGGGCACCCCCGCT H 298 1764 +++
LAGENHISA H 42 663 CTAGCAGGCGAGAACCACATCAGCGCT H 299 1765 +++
LALNSGKMA H 43 664 CTAGCACTGAACAGCGGCAAGATGGCT H 300 1766 +++
LAYDAGGHA H 44 665 CTAGCATACGACGCCGGCGGCCACGCT H 301 1767 +++
LARAITNEA H 45 666 CTAGCACGGGCCATCACCAACGAGGCT H 302 1768 +++
LAWNKCPYA H 46 667 CTAGCATGGAACAAGTGCCCCTACGCT H 303 1769 +++
LANLKENEA H 47 668 CTAGCAAACCTGAAGGAGAACGAGGCT H 304 1770 +++
LAQVTEMRA H 48 669 CTAGCACAGGTGACCGAGATGCGGGCT H 305 1771 +++
LARDQLKLA H 49 670 CTAGCACGGGACCAGCTGAAGCTGGCT H 306 1772 +++
LAVSRHGEA H 50 671 CTAGCAGTGAGCCGGCACGGCGAGGCT H 307 1773 +++
LAAVGMKMA H 51 672 CTAGCAGCCGTGGGCATGAAGATGGCT H 308 1774 +++
LAEHKNMHA H 52 673 CTAGCAGAGCACAAGAACATGCACGCT H 309 1775 +++
LAMNEPVTA H 53 674 CTAGCAATGAACGAGCCCGTGACCGCT H 310 1776 +++
LAEFVHKGA H 54 675 CTAGCAGAGTTCGTGCACAAGGGCGCT H 311 1777 +++
LAAYHDSAA H 55 676 CTAGCAGCCTACCACGACAGCGCCGCT H 312 1778 +++
LAKALGMEA H 56 677 CTAGCAAAGGCCCTGGGCATGGAGGCT H 313 1779 +++
LAVKGLVNA H 57 678 CTAGCAGTGAAGGGCCTGGTGAACGCT H 314 1780 +++
LAGIQQHVA H 58 679 CTAGCAGGCATCCAGCAGCACGTGGCT H 315 1781 +++
LADGGTRPA H 59 680 CTAGCAGACGGCGGCACCCGGCCCGCT H 316 1782 +++
LAHEPMFNA H 60 681 CTAGCACACGAGCCCATGTTCAACGCT H 317 1783 +++
LASVSTIQA H 61 682 CTAGCAAGCGTGAGCACCATCCAGGCT H 318 1784 +++
LASAVMYWA H 62 683 CTAGCAAGCGCCGTGATGTACTGGGCT H 319 1785 +++
LADKNRLQA H 63 684 CTAGCAGACAAGAACCGGCTGCAGGCT H 320 1786 +++
LAPMGQNMA H 64 685 CTAGCACCCATGGGCCAGAACATGGCT H 321 1787 +++
LAAVGVGYA H 65 686 CTAGCAGCCGTGGGCGTGGGCTACGCT H 322 1788 +++
LAGEFTGKA H 66 687 CTAGCAGGCGAGTTCACCGGCAAGGCT H 323 1789 +++
LAGEVTKHA H 67 688 CTAGCAGGCGAGGTGACCAAGCACGCT H 324 1790 +++
LAITQSDIA H 68 689 CTAGCAATCACCCAGAGCGACATCGCT H 325 1791 +++
LANEAQGKA H 69 690 CTAGCAAACGAGGCCCAGGGCAAGGCT H 326 1792 +++
LAAKPKDGA H 70 691 CTAGCAGCCAAGCCCAAGGACGGCGCT H 327 1793 +++
LAAGQAQSA H 71 692 CTAGCAGCCGGCCAGGCCCAGAGCGCT H 328 1794 +++
LAPMRGVYA H 72 693 CTAGCACCCATGCGGGGCGTGTACGCT H 329 1795 +++
LASRLNSPA H 73 694 CTAGCAAGCCGGCTGAACAGCCCCGCT H 330 1796 +++
LACYPPTCA H 74 695 CTAGCATGCTACCCCCCCACCTGCGCT H 331 1797 +++
LAKVSKGDA H 75 696 CTAGCAAAGGTGAGCAAGGGCGACGCT H 332 1798 +++
LAGERETVA H 76 697 CTAGCAGGCGAGCGGGAGACCGTGGCT H 333 1799 ++
LAYITEKSA H 77 698 CTAGCATACATCACCGAGAAGAGCGCT H 334 1800 ++
LASADHQPA H 78 699 CTAGCAAGCGCCGACCACCAGCCCGCT H 335 1801 ++
LAHIQEPKA H 79 700 CTAGCACACATCCAGGAGCCCAAGGCT H 336 1802 ++
LAFNGSTSA H 80 701 CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT H 337 1803 ++
LAEFDGDGA H 81 702 CTAGCAGAGTTCGACGGCGACGGCGCT H 338 1804 ++
LAWKCKGTA H 82 703 CTAGCATGGAAGTGCAAGGGCACCGCT H 339 1805 ++
LAMGHNYVA H 83 704 CTAGCAATGGGCCACAACTACGTGGCT H 340 1806 ++
LAVTPPWYA H 84 705 CTAGCAGTGACCCCCCCCTGGTACGCT H 341 1807 ++
LAGHAACFA H 85 706 CTAGCAGGCCACGCCGCCTGCTTCGCT H 342 1808 ++
LAAANHDNA H 86 707 CTAGCAGCCGCCAACCACGACAACGCT H 343 1809 ++
LAKDHHVIA H 87 708 CTAGCAAAGGACCACCACGTGATCGCT H 344 1810 ++
LALHQERQA H 88 709 CTAGCACTGCACCAGGAGCGGCAGGCT H 345 1811 ++
LADMTRFHA H 89 710 CTAGCAGACATGACCCGGTTCCACGCT H 346 1812 ++
LATMHNFEA H 90 711 CTAGCAACCATGCACAACTTCGAGGCT H 347 1813 ++
LAEYHNNDA H 91 712 CTAGCAGAGTACCACAACAACGACGCT H 348 1814 ++
LAGKTISGA H 92 713 CTAGCAGGCAAGACCATCAGCGGCGCT H 349 1815 ++
LADFPSEKA H 93 714 CTAGCAGACTTCCCCAGCGAGAAGGCT H 350 1816 ++
LALKLRTEA H 94 715 CTAGCACTGAAGCTGCGGACCGAGGCT H 351 1817 ++
LAISQPNPA H 95 716 CTAGCAATCAGCCAGCCCAACCCCGCT H 352 1818 ++
LAFGFSADA H 96 717 CTAGCATTCGGCTTCAGCGCCGACGCT H 353 1819 ++
LAKDKGLIA H 97 718 CTAGCAAAGGACAAGGGCCTGATCGCT H 354 1820 ++
LAIGERTTA H 98 719 CTAGCAATCGGCGAGCGGACCACCGCT H 355 1821 ++
LAPQKQPVA H 99 720 CTAGCACCCCAGAAGCAGCCCGTGGCT H 356 1822 ++
LAKFMWIHA H 100 721 CTAGCAAAGTTCATGTGGATCCACGCT H 357 1823 ++
LAQEQNAAA H 101 722 CTAGCACAGGAGCAGAACGCCGCCGCT H 358 1824 ++
LAQVQVEGA H 102 723 CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT H 359 1825 ++
LAALNSQTA H 103 724 CTAGCAGCCCTGAACAGCCAGACCGCT H 360 1826 ++
LAHHKESIA H 104 725 CTAGCACACCACAAGGAGAGCATCGCT H 361 1827 ++
LAPCYEPPA H 105 726 CTAGCACCCTGCTACGAGCCCCCCGCT H 362 1828 ++
LANQTTREA H 106 727 CTAGCAAACCAGACCACCCGGGAGGCT H 363 1829 ++
LADTHTTYA H 107 728 CTAGCAGACACCCACACCACCTACGCT H 364 1830 ++
LAQKKLLEA H 108 729 CTAGCACAGAAGAAGCTGCTGGAGGCT H 365 1831 ++
LAVDIMRGA H 109 730 CTAGCAGTGGACATCATGCGGGGCGCT H 366 1832 ++
LAPIQLAQA H 110 731 CTAGCACCCATCCAGCTGGCCCAGGCT H 367 1833 ++
LANIVQQDA H 111 732 CTAGCAAACATCGTGCAGCAGGACGCT H 368 1834 ++
LAKSAGILA H 112 733 CTAGCAAAGAGCGCCGGCATCCTGGCT H 369 1835 ++
LAHDLHGGA H 113 734 CTAGCACACGACCTGCACGGCGGCGCT H 370 1836 ++
LAKGFKTEA H 114 735 CTAGCAAAGGGCTTCAAGACCGAGGCT H 371 1837 ++
LAGSMAKLA H 115 736 CTAGCAGGCAGCATGGCCAAGCTGGCT H 372 1838 ++
LAGFMEYYA H 116 737 CTAGCAGGCTTCATGGAGTACTACGCT H 373 1839 ++
LAQGNNTGA H 117 738 CTAGCACAGGGCAACAACACCGGCGCT H 374 1840 ++
LAVRTGSMA H 118 739 CTAGCAGTGCGGACCGGCAGCATGGCT H 375 1841 ++
LAYGQQTTA H 119 740 CTAGCATACGGCCAGCAGACCACCGCT H 376 1842 ++
LADCMMINA H 120 741 CTAGCAGACTGCATGATGATCAACGCT H 377 1843 ++
LAGVVKTDA H 121 742 CTAGCAGGCGTGGTGAAGACCGACGCT H 378 1844 ++
LASENLNRA H 122 743 CTAGCAAGCGAGAACCTGAACCGGGCT H 379 1845 ++
LAQAGDTAA H 123 744 CTAGCACAGGCCGGCGACACCGCCGCT H 380 1846 ++
LAMHESYNA H 124 745 CTAGCAATGCACGAGAGCTACAACGCT H 381 1847 ++
LAVNRVDMA H 125 746 CTAGCAGTGAACCGGGTGGACATGGCT H 382 1848 ++
LAVPKADAA H 126 747 CTAGCAGTGCCCAAGGCCGACGCCGCT H 383 1849 ++
LAPSGDRHA H 127 748 CTAGCACCCAGCGGCGACCGGCACGCT H 384 1850 ++
LAFRTMEYA H 128 749 CTAGCATTCCGGACCATGGAGTACGCT H 385 1851 ++
LATWCLVWA H 129 750 CTAGCAACCTGGTGCCTGGTGTGGGCT H 386 1852 ++
LAEGMTGIA H 130 751 CTAGCAGAGGGCATGACCGGCATCGCT H 387 1853 ++
LAKEGYRDA H 131 752 CTAGCAAAGGAGGGCTACCGGGACGCT H 388 1854 ++
LAAVTKDSA H 132 753 CTAGCAGCCGTGACCAAGGACAGCGCT H 389 1855 ++
LAPLQTQEA H 133 754 CTAGCACCCCTGCAGACCCAGGAGGCT H 390 1856 ++
LADHGNKPA H 134 755 CTAGCAGACCACGGCAACAAGCCCGCT H 391 1857 ++
LADVVSVSA H 135 756 CTAGCAGACGTGGTGAGCGTGAGCGCT H 392 1858 ++
LAQVEVSKA H 136 757 CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT H 393 1859 ++
LAPSKMGLA H 137 758 CTAGCACCCAGCAAGATGGGCCTGGCT H 394 1860 ++
LAWIERSMA H 138 759 CTAGCATGGATCGAGCGGAGCATGGCT H 395 1861 ++
LAYDNTAEA H 139 760 CTAGCATACGACAACACCGCCGAGGCT H 396 1862 ++
LAHDWGAPA H 140 761 CTAGCACACGACTGGGGCGCCCCCGCT H 397 1863 ++
LAMDREIKA H 141 762 CTAGCAATGGACCGGGAGATCAAGGCT H 398 1864 ++
LAVFQETGA H 142 763 CTAGCAGTGTTCCAGGAGACCGGCGCT H 399 1865 ++
LAKDGGKIA H 143 764 CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT H 400 1866 ++
LALNAAATA H 144 765 CTAGCACTGAACGCCGCCGCCACCGCT H 401 1867 ++
LAIPVEANA H 145 766 CTAGCAATCCCCGTGGAGGCCAACGCT H 402 1868 ++
LARGTLMTA H 146 767 CTAGCACGGGGCACCCTGATGACCGCT H 403 1869 ++
LAGDIVRNA H 147 768 CTAGCAGGCGACATCGTGCGGAACGCT H 404 1870 ++
LAMLACKGA H 148 769 CTAGCAATGCTGGCCTGCAAGGGCGCT H 405 1871 ++
LADLSDHHA H 149 770 CTAGCAGACCTGAGCGACCACCACGCT H 406 1872 ++
LANMMAAGA H 150 771 CTAGCAAACATGATGGCCGCCGGCGCT H 407 1873 ++
LALPEGRFA H 151 772 CTAGCACTGCCCGAGGGCCGGTTCGCT H 408 1874 ++
LAKGQAQNA H 152 773 CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT H 409 1875 +
LAAVKAVVA H 153 774 CTAGCAGCCGTGAAGGCCGTGGTGGCT H 410 1876 +
LANQGFLTA H 154 775 CTAGCAAACCAGGGCTTCCTGACCGCT H 411 1877 +
LAETTLTRA H 155 776 CTAGCAGAGACCACCCTGACCCGGGCT H 412 1878 +
LADGIQKNA H 156 777 CTAGCAGACGGCATCCAGAAGAACGCT H 413 1879 +
LANAMEKHA H 157 778 CTAGCAAACGCCATGGAGAAGCACGCT H 414 1880 +
LADIVGESA H 158 779 CTAGCAGACATCGTGGGCGAGAGCGCT H 415 1881 +
LANVTLQSA H 159 780 CTAGCAAACGTGACCCTGCAGAGCGCT H 416 1882 +
LAFPCIKEA H 160 781 CTAGCATTCCCCTGCATCAAGGAGGCT H 417 1883 +
LADEGREHA H 161 782 CTAGCAGACGAGGGCCGGGAGCACGCT H 418 1884 +
LAREDHRQA H 162 783 CTAGCACGGGAGGACCACCGGCAGGCT H 419 1885 +
LAQNQWTDA H 163 784 CTAGCACAGAACCAGTGGACCGACGCT H 420 1886 +
LAQNQKQIA H 164 785 CTAGCACAGAACCAGAAGCAGATCGCT H 421 1887 +
LATPNVNAA H 165 786 CTAGCAACCCCCAACGTGAACGCCGCT H 422 1888 +
LAPGNDLWA H 166 787 CTAGCACCCGGCAACGACCTGTGGGCT H 423 1889 +
LAMLGGTSA H 167 788 CTAGCAATGCTGGGCGGCACCAGCGCT H 424 1890 +
LAKKVVDGA H 168 789 CTAGCAAAGAAGGTGGTGGACGGCGCT H 425 1891 +
LAGGSKLEA H 169 790 CTAGCAGGCGGCAGCAAGCTGGAGGCT H 426 1892 +
LALYQCDTA H 170 791 CTAGCACTGTACCAGTGCGACACCGCT H 427 1893 +
LAHQGAIIA H 171 792 CTAGCACACCAGGGCGCCATCATCGCT H 428 1894 +
LAGFHAIEA H 172 793 CTAGCAGGCTTCCACGCCATCGAGGCT H 429 1895 +
LANEGTIRA H 173 794 CTAGCAAACGAGGGCACCATCCGGGCT H 430 1896 +
LADPMPTHA H 174 795 CTAGCAGACCCCATGCCCACCCACGCT H 431 1897 +
LAGKIEENA H 175 796 CTAGCAGGCAAGATCGAGGAGAACGCT H 432 1898 +
LAPVKHTWA H 176 797 CTAGCACCCGTGAAGCACACCTGGGCT H 433 1899 +
LARSSTLNA H 177 798 CTAGCACGGAGCAGCACCCTGAACGCT H 434 1900 +
LADDQAVNA H 178 799 CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT H 435 1901 +
LATKSTGSA H 179 800 CTAGCAACCAAGAGCACCGGCAGCGCT H 436 1902 +
LAFLRGPEA H 180 801 CTAGCATTCCTGCGGGGCCCCGAGGCT H 437 1903 +
LADENLQAA H 181 802 CTAGCAGACGAGAACCTGCAGGCCGCT H 438 1904 +
LANADFPLA H 182 803 CTAGCAAACGCCGACTTCCCCCTGGCT H 439 1905 +
LAPTTIGGA H 183 804 CTAGCACCCACCACCATCGGCGGCGCT H 440 1906 +
LASACMRAA H 184 805 CTAGCAAGCGCCTGCATGCGGGCCGCT H 441 1907 +
LAKVASMNA H 185 806 CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT H 442 1908 +
LALNNDQSA H 186 807 CTAGCACTGAACAACGACCAGAGCGCT H 443 1909 +
LAGGKQALA H 187 808 CTAGCAGGCGGCAAGCAGGCCCTGGCT H 444 1910 +
LAVAVDCFA H 188 809 CTAGCAGTGGCCGTGGACTGCTTCGCT H 445 1911 +
LALETTQRA H 189 810 CTAGCACTGGAGACCACCCAGCGGGCT H 446 1912 +
LAPNTPKIA H 190 811 CTAGCACCCAACACCCCCAAGATCGCT H 447 1913 +
LASIGFSAA H 191 812 CTAGCAAGCATCGGCTTCAGCGCCGCT H 448 1914 +
LADVGCENA H 192 813 CTAGCAGACGTGGGCTGCGAGAACGCT H 449 1915 +
LAGSRVNFA H 193 814 CTAGCAGGCAGCCGGGTGAACTTCGCT H 450 1916 +
LADLTLRAA H 194 815 CTAGCAGACCTGACCCTGCGGGCCGCT H 451 1917 +
LAKGQSQGA H 195 816 CTAGCAAAGGGCCAGAGCCAGGGCGCT H 452 1918 +
LAHTPDTFA H 196 817 CTAGCACACACCCCCGACACCTTCGCT H 453 1919 +
LAAHQMASA H 197 818 CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT H 454 1920 +
LACRSDCVA H 198 819 CTAGCATGCCGGAGCGACTGCGTGGCT H 455 1921 +
LANTWCKGA H 199 820 CTAGCAAACACCTGGTGCAAGGGCGCT H 456 1922 +
LAAEHKQTA H 200 821 CTAGCAGCCGAGCACAAGCAGACCGCT H 457 1923 +
LAAEHIGRA H 201 822 CTAGCAGCCGAGCACATCGGCCGGGCT H 458 1924 +
LAEQVLEKA H 202 823 CTAGCAGAGCAGGTGCTGGAGAAGGCT H 459 1925 +
LAYFHSYAA H 203 824 CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT H 460 1926 +
LAEPPDPPA H 204 825 CTAGCAGAGCCCCCCGACCCCCCCGCT H 461 1927 +
LATRADIFA H 205 826 CTAGCAACCCGGGCCGACATCTTCGCT H 462 1928 +
LADTYKPYA H 206 827 CTAGCAGACACCTACAAGCCCTACGCT H 463 1929 +
LANRLSNVA H 207 828 CTAGCAAACCGGCTGAGCAACGTGGCT H 464 1930 +
LAMTNTFLA H 208 829 CTAGCAATGACCAACACCTTCCTGGCT H 465 1931 +
LAGESSYLA H 209 830 CTAGCAGGCGAGAGCAGCTACCTGGCT H 466 1932 +
LANRWAIDA H 210 831 CTAGCAAACCGGTGGGCCATCGACGCT H 467 1933 +
LAETVKYMA H 211 832 CTAGCAGAGACCGTGAAGTACATGGCT H 468 1934 +
LAMKYVFDA H 212 833 CTAGCAATGAAGTACGTGTTCGACGCT H 469 1935 +
LAKRDKPTA H 213 834 CTAGCAAAGCGGGACAAGCCCACCGCT H 470 1936 +
LADWRTTPA H 214 835 CTAGCAGACTGGCGGACCACCCCCGCT H 471 1937 +
LAKGVTTAA H 215 836 CTAGCAAAGGGCGTGACCACCGCCGCT H 472 1938 +
LAFCTPRYA H 216 837 CTAGCATTCTGCACCCCCCGGTACGCT H 473 1939 +
LANLKNFSA H 217 838 CTAGCAAACCTGAAGAACTTCAGCGCT H 474 1940 +
LAHYPSAPA H 218 839 CTAGCACACTACCCCAGCGCCCCCGCT H 475 1941 +
LAQEAKLTA H 219 840 CTAGCACAGGAGGCCAAGCTGACCGCT H 476 1942 +
LAVEPGPPA H 220 841 CTAGCAGTGGAGCCCGGCCCCCCCGCT H 477 1943 +
LAKGPASIA H 221 842 CTAGCAAAGGGCCCCGCCAGCATCGCT H 478 1944 +
LAEGLSQFA H 222 843 CTAGCAGAGGGCCTGAGCCAGTTCGCT H 479 1945 +
LAKPTGKDA H 223 844 CTAGCAAAGCCCACCGGCAAGGACGCT H 480 1946 +
LAKGMKEGA H 224 845 CTAGCAAAGGGCATGAAGGAGGGCGCT H 481 1947 +
TSHVSTSS H 225 846 ACCAGCCACGTGAGCACCAGCAGC H 482 1948 +++
SGVLFTEG H 226 847 AGCGGCGTGCTGTTCACCGAGGGC H 483 1949 +++
TSGMGAIG H 227 848 ACCAGCGGCATGGGCGCCATCGGC H 484 1950 +++
TGDSEQQT H 228 849 ACCGGCGACAGCGAGCAGCAGACC H 485 1951 +++
SGSVGYVG H 229 850 AGCGGCAGCGTGGGCTACGTGGGC H 486 1952 +++
TGDKWPQG H 230 851 ACCGGCGACAAGTGGCCCCAGGGC H 487 1953 +++
SGEMTKPG H 231 852 AGCGGCGAGATGACCAAGCCCGGC H 488 1954 +++
SGPGTSGT H 232 853 AGCGGCCCCGGCACCAGCGGCACC H 489 1955 ++
SSENNKGG H 233 854 AGCAGCGAGAACAACAAGGGCGGC H 490 1956 ++
TTENHKPG H 234 855 ACCACCGAGAACCACAAGCCCGGC H 491 1957 ++
TSQEKQNS H 235 856 ACCAGCCAGGAGAAGCAGAACAGC H 492 1958 ++
GTMFNNST H 236 857 GGCACCATGTTCAACAACAGCACC H 493 1959 ++
SGPKETGG H 237 858 AGCGGCCCCAAGGAGACCGGCGGC H 494 1960 +
SGIDTRLG H 238 859 AGCGGCATCGACACCCGGCTGGGC H 495 1961 +
TTGMERPT H 239 860 ACCACCGGCATGGAGCGGCCCACC H 496 1962 +
TGEGPTKG H 240 861 ACCGGCGAGGGCCCCACCAAGGGC H 497 1963 +
TGPGTHNG H 241 862 ACCGGCCCCGGCACCCACAACGGC H 498 1964 +
SGREIHFG H 242 863 AGCGGCCGGGAGATCCACTTCGGC H 499 1965 +
TGDERKPG H 243 864 ACCGGCGACGAGCGGAAGCCCGGC H 500 1966 +
STTKPM H 244 865 AGCACCACCAAGCCCATG H 501 1967 +++
CKEITR H 245 866 TGCAAGGAGATCACCCGG H 502 1968 +++
PDVSLL H 246 867 CCCGACGTGAGCCTGCTG H 503 1969 +++
FNKVLH H 247 868 TTCAACAAGGTGCTGCAC H 504 1970 +++
RLGRLS H 248 869 CGGCTGGGCCGGCTGAGC H 505 1971 +++
RTGRNT H 249 870 CGGACCGGCCGGAACACC H 506 1972 ++
RALKIS H 250 871 CGGGCCCTGAAGATCAGC H 507 1973 ++
NIKKAA H 251 872 AACATCAAGAAGGCCGCC H 508 1974 ++
RPGRVS H 252 873 CGGCCCGGCCGGGTGAGC H 509 1975 ++
RLGKVP H 253 874 CGGCTGGGCAAGGTGCCC H 510 1976 +
NSKKLG H 254 875 AACAGCAAGAAGCTGGGC H 511 1977 +
KAMRTG H 255 876 AAGGCCATGCGGACCGGC H 512 1978 +
KFTKAA H 256 877 AAGTTCACCAAGGCCGCC H 513 1979 +
HSKDGA H 257 878 CACAGCAAGGACGGCGCC H 514 1980 +
HFPVFS H 258 879 CACTTCCCCGTGTTCAGC H 515 1981 +
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
**活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1I]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 編碼胺基酸序列之核酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 活性水平*
LAWRIMKHA I 2 880 CTAGCATGGCGGATCATGAAGCACGCT I 75 1982 +++
LASNMERIA I 3 881 CTAGCAAGCAACATGGAGCGGATCGCT I 76 1983 +++
LADYRNDKA I 4 882 CTAGCAGACTACCGGAACGACAAGGCT I 77 1984 +++
LAPNQGTPA I 5 883 CTAGCACCCAACCAGGGCACCCCCGCT I 78 1985 +++
LAKPPPKDA I 6 884 CTAGCAAAGCCCCCCCCCAAGGACGCT I 79 1986 +++
LALPEGRFA I 7 885 CTAGCACTGCCCGAGGGCCGGTTCGCT I 80 1987 +++
LAHPGTTFA I 8 886 CTAGCACACCCCGGCACCACCTTCGCT I 81 1988 +++
LARGVAPIA I 9 887 CTAGCACGGGGCGTGGCCCCCATCGCT I 82 1989 +++
LAHRAPDSA I 10 888 CTAGCACACCGGGCCCCCGACAGCGCT I 83 1990 +++
LAELALIKA I 11 889 CTAGCAGAGCTGGCCCTGATCAAGGCT I 84 1991 +++
LAVAVDCFA I 12 890 CTAGCAGTGGCCGTGGACTGCTTCGCT I 85 1992 +++
LACSSTWYA I 13 891 CTAGCATGCAGCAGCACCTGGTACGCT I 86 1993 +++
LAELDFKWA I 14 892 CTAGCAGAGCTGGACTTCAAGTGGGCT I 87 1994 +++
LAHEPMFNA I 15 893 CTAGCACACGAGCCCATGTTCAACGCT I 88 1995 +++
LAKDGMIGA I 16 894 CTAGCAAAGGACGGCATGATCGGCGCT I 89 1996 +++
LAHEGRQAA I 17 895 CTAGCACACGAGGGCCGGCAGGCCGCT I 90 1997 +++
LAEYHNNDA I 18 896 CTAGCAGAGTACCACAACAACGACGCT I 91 1998 +++
LAAEHIGRA I 19 897 CTAGCAGCCGAGCACATCGGCCGGGCT I 92 1999 +++
LAEPFPVAA I 20 898 CTAGCAGAGCCCTTCCCCGTGGCCGCT I 93 2000 +++
LAHIQEPKA I 21 899 CTAGCACACATCCAGGAGCCCAAGGCT I 94 2001 +++
LAFNGSTSA I 22 900 CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT I 95 2002 +++
LADNCWCCA I 23 901 CTAGCAGACAACTGCTGGTGCTGCGCT I 96 2003 +++
LACPVAEWA I 24 902 CTAGCATGCCCCGTGGCCGAGTGGGCT I 97 2004 ++
LAMGHNYVA I 25 903 CTAGCAATGGGCCACAACTACGTGGCT I 98 2005 ++
LANQGFLTA I 26 904 CTAGCAAACCAGGGCTTCCTGACCGCT I 99 2006 ++
LAPMRGVYA I 27 905 CTAGCACCCATGCGGGGCGTGTACGCT I 100 2007 ++
LANEAQGKA I 28 906 CTAGCAAACGAGGCCCAGGGCAAGGCT I 101 2008 ++
LAQKKLLEA I 29 907 CTAGCACAGAAGAAGCTGCTGGAGGCT I 102 2009 ++
LAPCYEPPA I 30 908 CTAGCACCCTGCTACGAGCCCCCCGCT I 103 2010 ++
LAISQPNPA I 31 909 CTAGCAATCAGCCAGCCCAACCCCGCT I 104 2011 ++
LAQVQVEGA I 32 910 CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT I 105 2012 ++
LAQAGDTAA I 33 911 CTAGCACAGGCCGGCGACACCGCCGCT I 106 2013 ++
LARSSTLNA I 34 912 CTAGCACGGAGCAGCACCCTGAACGCT I 107 2014 ++
LAEFRVGQA I 35 913 CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT I 108 2015 ++
LAGSMAKLA I 36 914 CTAGCAGGCAGCATGGCCAAGCTGGCT I 109 2016 ++
LAPIQLAQA I 37 915 CTAGCACCCATCCAGCTGGCCCAGGCT I 110 2017 ++
LAPSGDRHA I 38 916 CTAGCACCCAGCGGCGACCGGCACGCT I 111 2018 ++
LANRLSNVA I 39 917 CTAGCAAACCGGCTGAGCAACGTGGCT I 112 2019 ++
LADPMPTHA I 40 918 CTAGCAGACCCCATGCCCACCCACGCT I 113 2020 ++
LAVEPGPPA I 41 919 CTAGCAGTGGAGCCCGGCCCCCCCGCT I 114 2021 ++
LAYFHSYAA I 42 920 CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT I 115 2022 ++
LAMTNTFLA I 43 921 CTAGCAATGACCAACACCTTCCTGGCT I 116 2023 ++
LAFPCIKEA I 44 922 CTAGCATTCCCCTGCATCAAGGAGGCT I 117 2024 +
LAHTPDTFA I 45 923 CTAGCACACACCCCCGACACCTTCGCT I 118 2025 +
LAGEVTKHA I 46 924 CTAGCAGGCGAGGTGACCAAGCACGCT I 119 2026 +
LAGDIVRNA I 47 925 CTAGCAGGCGACATCGTGCGGAACGCT I 120 2027 +
LANRWAIDA I 48 926 CTAGCAAACCGGTGGGCCATCGACGCT I 121 2028 +
LANAMEKHA I 49 927 CTAGCAAACGCCATGGAGAAGCACGCT I 122 2029 +
LADENLQAA I 50 928 CTAGCAGACGAGAACCTGCAGGCCGCT I 123 2030 +
LATRADIFA I 51 929 CTAGCAACCCGGGCCGACATCTTCGCT I 124 2031 +
LAKDGGKIA I 52 930 CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT I 125 2032 +
LAGKIEENA I 53 931 CTAGCAGGCAAGATCGAGGAGAACGCT I 126 2033 +
LAPVKHTWA I 54 932 CTAGCACCCGTGAAGCACACCTGGGCT I 127 2034 +
LAKVASMNA I 55 933 CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT I 128 2035 +
LAQVEVSKA I 56 934 CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT I 129 2036 +
LANLKNFSA I 57 935 CTAGCAAACCTGAAGAACTTCAGCGCT I 130 2037 +
LAKGQAQNA I 58 936 CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT I 131 2038 +
LADDQAVNA I 59 937 CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT I 132 2039 +
TSQEKQNS I 60 938 ACCAGCCAGGAGAAGCAGAACAGC I 133 2040 ++
SGPGTSGT I 61 939 AGCGGCCCCGGCACCAGCGGCACC I 134 2041 ++
TGIATSYS I 62 940 ACCGGCATCGCCACCAGCTACAGC I 135 2042 ++
SGREIHFG I 63 941 AGCGGCCGGGAGATCCACTTCGGC I 136 2043 ++
SGIDTRLG I 64 942 AGCGGCATCGACACCCGGCTGGGC I 137 2044 +
GTMFNNST I 65 943 GGCACCATGTTCAACAACAGCACC I 138 2045 +
TTGMERPT I 66 944 ACCACCGGCATGGAGCGGCCCACC I 139 2046 +
TGDERKPG I 67 945 ACCGGCGACGAGCGGAAGCCCGGC I 140 2047 +
CKEITR I 68 946 TGCAAGGAGATCACCCGG I 141 2048 +++
PDVSLL I 69 947 CCCGACGTGAGCCTGCTG I 142 2049 +++
NIKKAA I 70 948 AACATCAAGAAGGCCGCC I 143 2050 ++
RLGRLS I 71 949 CGGCTGGGCCGGCTGAGC I 144 2051 +
KAMRTG I 72 950 AAGGCCATGCGGACCGGC I 145 2052 +
KFTKAA I 73 951 AAGTTCACCAAGGCCGCC I 146 2053 +
RLGKVP I 74 952 CGGCTGGGCAAGGTGCCC I 147 2054 +
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1J]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 編碼胺基酸序列之核酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 活性水平*
LAHGGLREA J 2 953 CTAGCACACGGCGGCCTGCGGGAGGCT J 65 2055 +++
LAFTHGTNA J 3 954 CTAGCATTCACCCACGGCACCAACGCT J 66 2056 +++
LADPTETPA J 4 955 CTAGCAGACCCCACCGAGACCCCCGCT J 67 2057 +++
LALNDNVGA J 5 956 CTAGCACTGAACGACAACGTGGGCGCT J 68 2058 +++
LAFCIKHCA J 6 957 CTAGCATTCTGCATCAAGCACTGCGCT J 69 2059 +++
LAHWQEEWA J 7 958 CTAGCACACTGGCAGGAGGAGTGGGCT J 70 2060 +++
LAYVIENDA J 8 959 CTAGCATACGTGATCGAGAACGACGCT J 71 2061 +++
LASTTMNIA J 9 960 CTAGCAAGCACCACCATGAACATCGCT J 72 2062 +++
LAYVALFYA J 10 961 CTAGCATACGTGGCCCTGTTCTACGCT J 73 2063 +++
LAFQQQRCA J 11 962 CTAGCATTCCAGCAGCAGCGGTGCGCT J 74 2064 +++
LADSSKWIA J 12 963 CTAGCAGACAGCAGCAAGTGGATCGCT J 75 2065 +++
LAVMGNMLA J 13 964 CTAGCAGTGATGGGCAACATGCTGGCT J 76 2066 +++
LANANTRPA J 14 965 CTAGCAAACGCCAACACCCGGCCCGCT J 77 2067 +++
LAGENHISA J 15 966 CTAGCAGGCGAGAACCACATCAGCGCT J 78 2068 +++
LASVSTIQA J 16 967 CTAGCAAGCGTGAGCACCATCCAGGCT J 79 2069 +++
LAAYHDSAA J 17 968 CTAGCAGCCTACCACGACAGCGCCGCT J 80 2070 +++
LAVKGLVNA J 18 969 CTAGCAGTGAAGGGCCTGGTGAACGCT J 81 2071 +++
LADGGTRPA J 19 970 CTAGCAGACGGCGGCACCCGGCCCGCT J 82 2072 +++
LACYPPTCA J 20 971 CTAGCATGCTACCCCCCCACCTGCGCT J 83 2073 +++
LAKVSKGDA J 21 972 CTAGCAAAGGTGAGCAAGGGCGACGCT J 84 2074 +++
LAWKCKGTA J 22 973 CTAGCATGGAAGTGCAAGGGCACCGCT J 85 2075 ++
LADMTRFHA J 23 974 CTAGCAGACATGACCCGGTTCCACGCT J 86 2076 ++
LAGKTISGA J 24 975 CTAGCAGGCAAGACCATCAGCGGCGCT J 87 2077 ++
LALKLRTEA J 25 976 CTAGCACTGAAGCTGCGGACCGAGGCT J 88 2078 ++
LAAVTKDSA J 26 977 CTAGCAGCCGTGACCAAGGACAGCGCT J 89 2079 ++
LAKDKGLIA J 27 978 CTAGCAAAGGACAAGGGCCTGATCGCT J 90 2080 ++
LAHHKESIA J 28 979 CTAGCACACCACAAGGAGAGCATCGCT J 91 2081 ++
LAVDIMRGA J 29 980 CTAGCAGTGGACATCATGCGGGGCGCT J 92 2082 ++
LANIVQQDA J 30 981 CTAGCAAACATCGTGCAGCAGGACGCT J 93 2083 ++
LAGERETVA J 31 982 CTAGCAGGCGAGCGGGAGACCGTGGCT J 94 2084 ++
LADVVSVSA J 32 983 CTAGCAGACGTGGTGAGCGTGAGCGCT J 95 2085 ++
LATPNVNAA J 33 984 CTAGCAACCCCCAACGTGAACGCCGCT J 96 2086 ++
LALNAAATA J 34 985 CTAGCACTGAACGCCGCCGCCACCGCT J 97 2087 ++
LADCMMINA J 35 986 CTAGCAGACTGCATGATGATCAACGCT J 98 2088 ++
LAMLACKGA J 36 987 CTAGCAATGCTGGCCTGCAAGGGCGCT J 99 2089 ++
LANMMAAGA J 37 988 CTAGCAAACATGATGGCCGCCGGCGCT J 100 2090 ++
LADKNRLQA J 38 989 CTAGCAGACAAGAACCGGCTGCAGGCT J 101 2091 ++
LAAVGMKMA J 39 990 CTAGCAGCCGTGGGCATGAAGATGGCT J 102 2092 ++
LADDMIFVA J 40 991 CTAGCAGACGACATGATCTTCGTGGCT J 103 2093 ++
LADIVGESA J 41 992 CTAGCAGACATCGTGGGCGAGAGCGCT J 104 2094 ++
LAGGKQALA J 42 993 CTAGCAGGCGGCAAGCAGGCCCTGGCT J 105 2095 +
LAQNQKQIA J 43 994 CTAGCACAGAACCAGAAGCAGATCGCT J 106 2096 +
LAETTLTRA J 44 995 CTAGCAGAGACCACCCTGACCCGGGCT J 107 2097 +
LAMLGGTSA J 45 996 CTAGCAATGCTGGGCGGCACCAGCGCT J 108 2098 +
LAGFMEYYA J 46 997 CTAGCAGGCTTCATGGAGTACTACGCT J 109 2099 +
LAYGQQTTA J 47 998 CTAGCATACGGCCAGCAGACCACCGCT J 110 2100 +
LALNNDQSA J 48 999 CTAGCACTGAACAACGACCAGAGCGCT J 111 2101 +
LAFLRGPEA J 49 1000 CTAGCATTCCTGCGGGGCCCCGAGGCT J 112 2102 +
LACPVAEWA J 50 1001 CTAGCATGCCCCGTGGCCGAGTGGGCT J 113 2103 +
LALETTQRA J 51 1002 CTAGCACTGGAGACCACCCAGCGGGCT J 114 2104 +
LADTYKPYA J 52 1003 CTAGCAGACACCTACAAGCCCTACGCT J 115 2105 +
LAKRDKPTA J 53 1004 CTAGCAAAGCGGGACAAGCCCACCGCT J 116 2106 +
LAYFHSYAA J 54 1005 CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT J 117 2107 +
LAMTNTFLA J 55 1006 CTAGCAATGACCAACACCTTCCTGGCT J 118 2108 +
LAGESSYLA J 56 1007 CTAGCAGGCGAGAGCAGCTACCTGGCT J 119 2109 +
LAAEHIGRA J 57 1008 CTAGCAGCCGAGCACATCGGCCGGGCT J 120 2110 +
LADWRTTPA J 58 1009 CTAGCAGACTGGCGGACCACCCCCGCT J 121 2111 +
LAEGLSQFA J 59 1010 CTAGCAGAGGGCCTGAGCCAGTTCGCT J 122 2112 +
LAKPTGKDA J 60 1011 CTAGCAAAGCCCACCGGCAAGGACGCT J 123 2113 +
TGEGPTKG J 61 1012 ACCGGCGAGGGCCCCACCAAGGGC J 124 2114 +
RALKIS J 62 1013 CGGGCCCTGAAGATCAGC J 125 2115 ++
NSKKLG J 63 1014 AACAGCAAGAAGCTGGGC J 126 2116 +
HFPVFS J 64 1015 CACTTCCCCGTGTTCAGC J 127 2117 +
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平: +++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1K]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 編碼胺基酸序列之核酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 活性水平*
LATDRTKTA K 2 1016 CTAGCAACCGACCGGACCAAGACCGCT K 64 2118 +++
LAVDNIWAA K 3 1017 CTAGCAGTGGACAACATCTGGGCCGCT K 65 2119 +++
LAGQAMMQA K 4 1018 CTAGCAGGCCAGGCCATGATGCAGGCT K 66 2120 +++
LAMTKITDA K 5 1019 CTAGCAATGACCAAGATCACCGACGCT K 67 2121 +++
LAGGEYETA K 6 1020 CTAGCAGGCGGCGAGTACGAGACCGCT K 68 2122 +++
LAALVDANA K 7 1021 CTAGCAGCCCTGGTGGACGCCAACGCT K 69 2123 +++
LALENIGQA K 8 1022 CTAGCACTGGAGAACATCGGCCAGGCT K 70 2124 +++
LAHRAPDSA K 9 1023 CTAGCACACCGGGCCCCCGACAGCGCT K 71 2125 +++
LAEGQEDSA K 10 1024 CTAGCAGAGGGCCAGGAGGACAGCGCT K 72 2126 +++
LAPHIAKDA K 11 1025 CTAGCACCCCACATCGCCAAGGACGCT K 73 2127 +++
LARDQLKLA K 12 1026 CTAGCACGGGACCAGCTGAAGCTGGCT K 74 2128 +++
LALNSGKMA K 13 1027 CTAGCACTGAACAGCGGCAAGATGGCT K 75 2129 +++
LAVSRHGEA K 14 1028 CTAGCAGTGAGCCGGCACGGCGAGGCT K 76 2130 +++
LAMNEPVTA K 15 1029 CTAGCAATGAACGAGCCCGTGACCGCT K 77 2131 +++
LAYITEKSA K 16 1030 CTAGCATACATCACCGAGAAGAGCGCT K 78 2132 ++
LAYDAGGHA K 17 1031 CTAGCATACGACGCCGGCGGCCACGCT K 79 2133 ++
LALHQERQA K 18 1032 CTAGCACTGCACCAGGAGCGGCAGGCT K 80 2134 ++
LAAKPKDGA K 19 1033 CTAGCAGCCAAGCCCAAGGACGGCGCT K 81 2135 ++
LAEYHNNDA K 20 1034 CTAGCAGAGTACCACAACAACGACGCT K 82 2136 ++
LATWCLVWA K 21 1035 CTAGCAACCTGGTGCCTGGTGTGGGCT K 83 2137 ++
LAFGFSADA K 22 1036 CTAGCATTCGGCTTCAGCGCCGACGCT K 84 2138 ++
LAGVVKTDA K 23 1037 CTAGCAGGCGTGGTGAAGACCGACGCT K 85 2139 ++
LAKFMWIHA K 24 1038 CTAGCAAAGTTCATGTGGATCCACGCT K 86 2140 ++
LANQGFLTA K 25 1039 CTAGCAAACCAGGGCTTCCTGACCGCT K 87 2141 ++
LAHDLHGGA K 26 1040 CTAGCACACGACCTGCACGGCGGCGCT K 88 2142 ++
LASENLNRA K 27 1041 CTAGCAAGCGAGAACCTGAACCGGGCT K 89 2143 ++
LAFRTMEYA K 28 1042 CTAGCATTCCGGACCATGGAGTACGCT K 90 2144 ++
LAAANHDNA K 29 1043 CTAGCAGCCGCCAACCACGACAACGCT K 91 2145 ++
LAPSKMGLA K 30 1044 CTAGCACCCAGCAAGATGGGCCTGGCT K 92 2146 ++
LANEGTIRA K 31 1045 CTAGCAAACGAGGGCACCATCCGGGCT K 93 2147 ++
LARGTLMTA K 32 1046 CTAGCACGGGGCACCCTGATGACCGCT K 94 2148 +
LATKSTGSA K 33 1047 CTAGCAACCAAGAGCACCGGCAGCGCT K 95 2149 +
LAALNSQTA K 34 1048 CTAGCAGCCCTGAACAGCCAGACCGCT K 96 2150 +
LANVTLQSA K 35 1049 CTAGCAAACGTGACCCTGCAGAGCGCT K 97 2151 +
LAAGQAQSA K 36 1050 CTAGCAGCCGGCCAGGCCCAGAGCGCT K 98 2152 +
LAHDWGAPA K 37 1051 CTAGCACACGACTGGGGCGCCCCCGCT K 99 2153 +
LAMDREIKA K 38 1052 CTAGCAATGGACCGGGAGATCAAGGCT K 100 2154 +
LANADFPLA K 39 1053 CTAGCAAACGCCGACTTCCCCCTGGCT K 101 2155 +
LAHQGAIIA K 40 1054 CTAGCACACCAGGGCGCCATCATCGCT K 102 2156 +
LAPNTPKIA K 41 1055 CTAGCACCCAACACCCCCAAGATCGCT K 103 2157 +
LAIPVEANA K 42 1056 CTAGCAATCCCCGTGGAGGCCAACGCT K 104 2158 +
LAIGERTTA K 43 1057 CTAGCAATCGGCGAGCGGACCACCGCT K 105 2159 +
LACRSDCVA K 44 1058 CTAGCATGCCGGAGCGACTGCGTGGCT K 106 2160 +
LANRLSNVA K 45 1059 CTAGCAAACCGGCTGAGCAACGTGGCT K 107 2161 +
LAQEQNAAA K 46 1060 CTAGCACAGGAGCAGAACGCCGCCGCT K 108 2162 +
LARSSTLNA K 47 1061 CTAGCACGGAGCAGCACCCTGAACGCT K 109 2163 +
LAMKYVFDA K 48 1062 CTAGCAATGAAGTACGTGTTCGACGCT K 110 2164 +
LAQEAKLTA K 49 1063 CTAGCACAGGAGGCCAAGCTGACCGCT K 111 2165 +
LAREDHRQA K 50 1064 CTAGCACGGGAGGACCACCGGCAGGCT K 112 2166 +
LAHYPSAPA K 51 1065 CTAGCACACTACCCCAGCGCCCCCGCT K 113 2167 +
LAKGMKEGA K 52 1066 CTAGCAAAGGGCATGAAGGAGGGCGCT K 114 2168 +
TSHVSTSS K 53 1067 ACCAGCCACGTGAGCACCAGCAGC K 115 2169 +++
SGVLFTEG K 54 1068 AGCGGCGTGCTGTTCACCGAGGGC K 116 2170 +++
TSGMGAIG K 55 1069 ACCAGCGGCATGGGCGCCATCGGC K 117 2171 +++
TGDSEQQT K 56 1070 ACCGGCGACAGCGAGCAGCAGACC K 118 2172 +++
SGSVGYVG K 57 1071 AGCGGCAGCGTGGGCTACGTGGGC K 119 2173 +++
SSENNKGG K 58 1072 AGCAGCGAGAACAACAAGGGCGGC K 120 2174 ++
SGPGTSGT K 59 1073 AGCGGCCCCGGCACCAGCGGCACC K 121 2175 ++
TTENHKPG K 60 1074 ACCACCGAGAACCACAAGCCCGGC K 122 2176 +
FNKVLH K 61 1075 TTCAACAAGGTGCTGCAC K 123 2177 ++
RTGRNT K 62 1076 CGGACCGGCCGGAACACC K 124 2178 ++
RLGKVP K 63 1077 CGGCTGGGCAAGGTGCCC K 125 2179 +
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平: +++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
** SEQ ID NO為用於序列表之序列編號
[表1L]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 編碼胺基酸序列之核酸序列 SEQ ID NO: SEQ ID NO: ** 活性水平*
LAWIERSMA L 2 1078 CTAGCATGGATCGAGCGGAGCATGGCT L 28 2180 +++
LAYDNTAEA L 3 1079 CTAGCATACGACAACACCGCCGAGGCT L 29 2181 +++
LAQVTEMRA L 4 1080 CTAGCACAGGTGACCGAGATGCGGGCT L 30 2182 ++
LATRADIFA L 5 1081 CTAGCAACCCGGGCCGACATCTTCGCT L 31 2183 ++
LAKDGGKIA L 6 1082 CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT L 32 2184 ++
LAQVEVSKA L 7 1083 CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT L 33 2185 ++
LADTYKPYA L 8 1084 CTAGCAGACACCTACAAGCCCTACGCT L 34 2186 ++
LAQEAKLTA L 9 1085 CTAGCACAGGAGGCCAAGCTGACCGCT L 35 2187 ++
LACRSDCVA L 10 1086 CTAGCATGCCGGAGCGACTGCGTGGCT L 36 2188 ++
LAKDHHVIA L 11 1087 CTAGCAAAGGACCACCACGTGATCGCT L 37 2189 +
LAEPPDPPA L 12 1088 CTAGCAGAGCCCCCCGACCCCCCCGCT L 38 2190 +
LACSSTWYA L 13 1089 CTAGCATGCAGCAGCACCTGGTACGCT L 39 2191 +
LADLTLRAA L 14 1090 CTAGCAGACCTGACCCTGCGGGCCGCT L 40 2192 +
LAKVASMNA L 15 1091 CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT L 41 2193 +
LAAQDVSWA L 16 1092 CTAGCAGCCCAGGACGTGAGCTGGGCT L 42 2194 +
LADVGCENA L 17 1093 CTAGCAGACGTGGGCTGCGAGAACGCT L 43 2195 +
TGPGTHNG L 18 1094 ACCGGCCCCGGCACCCACAACGGC L 44 2196 +++
STVPLNMG L 19 1095 AGCACCGTGCCCCTGAACATGGGC L 45 2197 ++
HSKDGA L 20 1096 CACAGCAAGGACGGCGCC L 46 2198 +++
RTGRNT L 21 1097 CGGACCGGCCGGAACACC L 47 2199 +++
NSKKLG L 22 1098 AACAGCAAGAAGCTGGGC L 48 2200 +++
RPGRVS L 23 1099 CGGCCCGGCCGGGTGAGC L 49 2201 +++
KFRHTE L 24 1100 AAGTTCCGGCACACCGAG L 50 2202 ++
KAMRTG L 25 1101 AAGGCCATGCGGACCGGC L 51 2203 +
NIKKAA L 26 1102 AACATCAAGAAGGCCGCC L 52 2204 +
KFTKAA L 27 1103 AAGTTCACCAAGGCCGCC L 53 2205 +
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平: +++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
表1A至1L之一或多者中所闡述之許多胺基酸序列以「LA」起始並以「A」結束。在此類情況下,「LA」序列可係第一連接子序列L1,且「A」胺基酸可係第二連接子序列L2,其中L1及L2連接子各獨立地係可選的胺基酸連接子,具有根據下式A之一、二、或三個胺基酸: -L1-插入物-L2-  (式A)
其中L1及L2各獨立地係可選的具有一、二、或三個胺基酸之胺基酸連接子,且其中插入物(insert)表示表1A至1L之任何序列識別符之序列,其不具有起始「LA」及結束「A」。例如,在一些情況下,AAV載體可經設計以具有包括SEQ ID NO:1093中所闡述之胺基酸序列的AAV殼體多肽,該胺基酸序列係LADVGCENA(SEQ ID NO:1093),或可經設計以具有根據式A的基於SEQ ID NO:1093的胺基酸序列的AAV殼體多肽,該胺基酸序列係L1-DVGCEN-L2(SEQ ID NO:2207),其中L1及L2如本文中所定義。
如本文中所述,AAV載體可經設計以具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括基於表1A至1L中所闡述之胺基酸序列中任一者的式A的胺基酸序列。例如,AAV載體可經設計以具有SEQ ID NO:1之AAV殼體多肽(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),該AAV殼體多肽包括基於表1A至1L中所闡述之位於SEQ ID NO:1的胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)的胺基酸序列中任一者的式A的胺基酸序列。在一些情況下,L1、L2、或L1及L2兩者可不存在。例如,包括基於SEQ ID NO:1093之式A的胺基酸序列的AAV殼體多肽可在不存在起始「LA」及結束「A」之情況下包括SEQ ID NO:1093之胺基酸序列。在一些情況下,L1可係一個胺基酸X1、兩個胺基酸X2-X1、或三個胺基酸X3-X2-X1。當存在X1時,其可係選自由A、V、I、及L所組成之群組的胺基酸殘基。當存在X2時,其可係選自由A、V、I、及L所組成之群組的胺基酸殘基。當存在X3時,其可係選自由A、V、I、及L所組成之群組的胺基酸殘基。在一些情況下,L2可係一個胺基酸Z1、兩個胺基酸Z1-Z2、或三個胺基酸Z1-Z2-Z3。當存在Z1時,其可係選自由A、V、I、及L所組成之群組的胺基酸殘基。當存在Z2時,其可係選自由A、V、I、及L所組成之群組的胺基酸殘基。當存在Z3時,其可係選自由A、V、I、及L所組成之群組的胺基酸殘基。L1連接子之實例包括但不限於A、V、I、L、AA、AV、AI、AL、VA、VV、VI、VL、IA、IV、II、IL、LA、LV、LI、LL、AAA、AAV、AAI、AAL、AVA、AVV、AVI、AVL、AIA、AIV、AII、AIL、ALA、ALV、ALI、ALL、VAA、VAV、VAI、VAL、VVA、VVV、VVI、VVL、VIA、VIV、VII、VIL、VLA、VLV、VLI、VLL、IAA、IAV、IAI,IAL、IVA、IVV、IVI、IVL、IIA、IIV、III、IIL、ILA、ILV、ILI、ILL、LAA、LAV、LAI、LAL、LVA、LVV、LVI、LVL、LIA、LIV、LII、LIL、LLA、LLV、LLI、及LLL。L2連接子之實例包括但不限於A、V、I、L、AA、AV、AI、AL、VA、VV、VI、VL、IA、IV、II、IL、LA、LV、LI、LL、AAA、AAV、AAI、AAL、AVA、AVV、AVI、AVL、AIA、AIV、AII、AIL、ALA、ALV、ALI、ALL、VAA、VAV、VAI、VAL、VVA、VVV、VVI、VVL、VIA、VIV、VII、VIL、VLA、VLV、VLI、VLL、IAA、IAV、IAI,IAL、IVA、IVV、IVI、IVL、IIA、IIV、III、IIL、ILA、ILV、ILI、ILL、LAA、LAV、LAI、LAL、LVA、LVV、LVI、LVL、LIA、LIV、LII、LIL、LLA、LLV、LLI、及LLL。
在一些情況下,本文所提供之AAV2殼體多肽可具有SEQ ID NO:1中所闡述之序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列)、及表1A至1L中任一或多者所闡述之胺基酸序列(或其變體)、或基於在天冬醯胺-587及精胺酸-588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)插入此類所闡述之序列的根據式A之胺基酸序列。在一些情況下,本文所提供之AAV2殼體多肽可具有SEQ ID NO:1中所闡述之序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列)以及下列中之任一者所闡述的胺基酸序列(或其變體):SEQ ID NO:A2至A18、SEQ ID NO:B2至B298、SEQ ID NO:C2至C43、SEQ ID NO:D2至D76、SEQ ID NO:E2至E75、SEQ ID NO:F2至F11、SEQ ID NO:G2至G70、SEQ ID NO:H2至H243、SEQ ID NO:I2至I67、SEQ ID NO:J2至J61、SEQ ID NO:K2至K60、及SEQ ID NO:L2至L19,該些胺基酸序列插入在天冬醯胺-587及精胺酸-588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。
在一些情況下,當設計AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列時,包括的胺基酸序列可用以置換位於沿著AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)的任何適當位置的一或多個天然存在的胺基酸殘基。舉例而言,在表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)諸如下列中任一者:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27,可用於置換AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)在位置585至590的天然存在的胺基酸殘基。
在一些情況下,本文所提供之AAV2殼體多肽可具有SEQ ID NO:1中所闡述之序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列)或基於此類所闡述之序列的根據式A的序列,除了用表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)置換位置585至590(或替代序列的適當胺基酸位置)的胺基酸殘基。在一些情況下,本文所提供之AAV2殼體多肽可具有SEQ ID NO:1中所闡述之序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了胺基酸殘基585至590(或替代序列之適當胺基酸位置)經置換成下列中任一者所闡述之胺基酸序列(或其變體):SEQ ID NO:A19、SEQ ID NO:B299至B317、SEQ ID NO:C44至C45、SEQ ID NO:D77至D78、SEQ ID NO:E76至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G71至G77、SEQ ID NO:H244至H258、SEQ ID NO:I68至I75、SEQ ID NO:J62至J64、SEQ ID NO:K61至K63、及SEQ ID NO:L20至L27。
在一些情況下,AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之二或更多個胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。舉例而言,AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之二、三、或四個胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。
如本文中所述,AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列的變體係指與表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列同一的胺基酸序列,除了其具有一、二、或三個胺基酸添加、缺失、取代、或其組合。舉例而言,SEQ ID NO:A2之變體可係SEQ ID NO:A2,除了其具有一、二、或三個胺基酸添加、缺失、取代、或其組合。在一些情況下,除其含有一、二、或三個胺基酸添加,否則本文所提供之變體可係下列任一者中所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。在一些情況下,除其含有一、二、或三個胺基酸缺失,否則本文所提供之變體可係下列任一者中所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。在一些情況下,除其含有一、二、或三個胺基酸取代,否則本文所提供之變體可係下列任一者中所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。在一些情況下,除其含有一個胺基酸添加、缺失、或取代,否則本文所提供之變體可係下列任一者中所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。在一些情況下,除其含有兩個胺基酸添加、缺失、取代、或其組合,否則本文所提供之變體可係下列任一者中所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。在一些情況下,除其含有三個胺基酸添加、缺失、取代、或其組合,否則本文所提供之變體可係下列任一者中所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
在一些情況下,存在於變體中之胺基酸取代可係保守胺基酸取代。例如,保守胺基酸取代可藉由用一個胺基酸殘基取代具有類似側鏈之另一胺基酸殘基來進行。具有類似側鏈之胺基酸殘基家族可包括具有下列側鏈之胺基酸:鹼性側鏈(例如離胺酸、精胺酸、組胺酸)、酸性側鏈(例如,天冬胺酸、麩胺酸)、未帶電荷之極性側鏈(例如,甘胺酸、天冬醯胺酸、麩醯胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸)、非極性側鏈(例如,丙胺酸、纈胺酸、白胺酸、異白胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸、色胺酸)、β-支鏈側鏈(例如,蘇胺酸、纈胺酸、異白胺酸)、及芳族側鏈(例如,酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸)。
在一些情況下,存在於變體中之胺基酸取代可係非保守胺基酸取代。非保守胺基酸取代可藉由用一個胺基酸殘基取代具有不同側鏈之另一胺基酸殘基來進行。非保守取代之實例包括但不限於(a)用親水性殘基(例如,絲胺酸或蘇胺酸)取代疏水性殘基(例如白胺酸、異白胺酸、苯丙胺酸、纈胺酸、或丙胺酸);(b)用半胱胺酸或脯胺酸取代任何其他殘基;(c)用具有鹼性側鏈(例如,離胺酸、精胺酸、或組胺酸)之殘基取代具有酸性側鏈(例如,天冬胺酸或麩胺酸)之殘基;及(d)用具有大側鏈(例如,苯丙胺酸)之殘基取代甘胺酸或具有小側鏈之其他殘基。
如下判定特定胺基酸序列與特定序列識別號所指之胺基酸序列之間的序列同一性百分比。首先,使用自含有BLASTP版本2.0.14之BLASTZ獨立版本的BLAST 2序列(Bl2seq)程序,將胺基酸序列與特定序列識別號中所示之序列進行比較。BLASTZ之獨立版本可獲自Fish & Richardson的網站(例如www.fr.com/blast/)或美國政府的National Center for Biotechnology Information網站(www.ncbi.nlm.nih.gov)。使用Bl2seq程式之說明可見於BLASTZ隨附的readme檔案中。Bl2seq使用BLASTN或BLASTP演算法對兩個序列進行比較。BLASTN用於比較核酸序列,而BLASTP用於比較胺基酸序列。為了比較兩個胺基酸序列,Bl2seq之選項設定如下:-i設定為含有待比較之第一胺基酸序列的檔案(例如C:\seq1.txt);-j設定為含有待比較之第二胺基酸序列的檔案(例如C:\seq2.txt);-p設定為blastp;-o設定為任何所欲檔案名稱(例如C:\output.txt);及所有其他選項皆保留其預設設定。例如,下列指令可用以產生含有兩個胺基酸序列比較的輸出檔案:C:\Bl2seq -i c:\seq1.txt -j c:\seq2.txt -p blastp -o c:\output.txt.。若兩個比較序列具有同源性,則指定之輸出檔案會將彼等同源區域呈現為比對序列。若兩個比較序列不具有同源性,則指定之輸出檔案將不會呈現比對序列。一旦經比對,藉由計數兩個序列中呈現同一胺基酸殘基之位置數目來判定匹配數目。匹配位置係指同一胺基酸殘基在比對序列中出現在相同位置的位置。序列同一性百分比係藉由將匹配數除以所識別序列(例如,SEQ ID NO:1)中所闡述之序列之長度,接著將所得值乘以100來判定。例如,當與SEQ ID NO:1中所闡述之序列比對時,具有725個匹配之胺基酸序列與SEQ ID NO:1中所闡述之序列係98.6%同一(亦即,725 ÷ 735 × 100 = 98.6)。應注意,序列同一性百分比值係四捨五入至最接近的十分之一。舉例而言,78.11、78.12、78.13、及78.14向下捨入至78.1,而78.15、78.16、78.17、78.18、及78.19向上捨入至78.2。亦應注意,長度值將始終為整數。
用於產生胺基酸序列變體之方法可包括編碼AAV殼體多肽之核酸的位點特異性突變或隨機突變(例如,藉由PCR)。參見例如Zoller, Curr. Opin. Biotechnol. 3: 348-354 (1992)。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)可經設計以包括一或多個外源核酸序列。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)可經設計以包括編碼所關注之RNA及/或多肽之外源核酸序列。外源核酸序列可經設計以編碼所關注之任何適當RNA。可由經設計以包括在本文提供之AAV載體內之外源核酸序列編碼之所關注之RNA的實例包括但不限於小分子干擾核糖核酸(siRNA)、用於基因編輯的RNA組分、及小分子核糖核酸(microRNA)。在一些情況下,可由包括在本文提供之AAV載體內之外源核酸序列編碼之所關注之RNA可係SIRNA-027以治療例如繼發於年齡相關性黃斑部病變(macular degeneration)的眼窩下脈絡膜新生血管膜(sub-foveal choroidal neovascular membrane, sub-foveal CNVM)(參見NCT00363714)、Cand5/Bevasiranib以治療例如糖尿病黃斑部水腫(diabetic macular edema)(參見NCT00306904)、PF-04523655以治療例如糖尿病黃斑部水腫(參見例如NCT01445899)、QPI-1007以治療例如非動脈性前部缺血性視神經病變(non-arteritic anterior ischemic optic neuropathy, NAION)中之視神經萎縮(參見例如NCT01064505)、阿加尼森(aganirsen)以治療例如缺血性中心視網膜靜脈阻塞(central retinal vein occulsion, CRVO)以預防新生血管性青光眼(參見例如NCT02947867)、QR-421a以治療例如視網膜色素變性/尤塞氏症候群2型(retinitis pigmentosa/Usher syndrome type 2)(參見例如NCT03780257)、QR-1123以治療例如常染色體顯性遺傳性視網膜色素變性(autosomal dominant retinitis pigmentosa)(參見例如NCT04123626)、IONIS-FB-LRx以治療例如繼發於年齡相關性黃斑部病變之地圖狀萎縮(geographic atrophy)(參見例如NCT03815825)、或Sepofarsen/QR-110以治療例如萊伯氏先天性黑蒙症(Leber’s congenital amaurosis)(參見例如NCT03913143)。
外源核酸序列可經設計以編碼所關注之任何適當多肽。可由經設計以包括在本文提供之AAV載體內之外源核酸序列編碼之所關注的多肽的實例包括但不限於治療性多肽(therapeutic polypeptides)、滋養因子多肽(trophic factor polypeptides)、基因編輯多肽(例如,Cas9多肽、TALEN多肽、或鋅指多肽)、酶、光遺傳學工具多肽(例如,ChR多肽、NhpR多肽、或ReachR多肽)、抗體、抗體域(例如,VH域)、細胞介素(cytokines)、抗血管生成多肽、及神經保護多肽。可由經設計以包括在本文提供之AAV載體內之外源核酸序列編碼之所關注的多肽的實例包括但不限於ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、NR2E3多肽、PDE6A多肽、PDE6B多肽、PDE6C多肽、PRPF31多肽、RPE65多肽、RPGR多肽、RS1多肽、TYR多肽、USH2A多肽、MYO7A多肽、REP1多肽、OPN1LW多肽、OPN1MW多肽、CNGA3多肽、CNGB3多肽、GUCY2D多肽、GACA1A多肽、GNAT2多肽、PDE6H多肽、PROM1多肽、PRPH2多肽、CRX多肽、NPHP5多肽、EYS多肽、ND4多肽、CLN1-14多肽(如CLN3多肽、CLN5多肽、CLN6多肽、或CLN8多肽)、NYX多肽、GRM6多肽、TRPM1多肽、GPR179多肽、LRIT3多肽、神經膠細胞營養因子(glial cell derived neurotrophic factor, GDNF)多肽、腦源性神經營養因子(brain-derived neurotrophic factor, BDNF)多肽、纖維母細胞生長因子(fibroblast growth factor, FGF)多肽、截短之源自視桿細胞的視錐細胞活性因子(truncated rod-derived cone viability factor, RdCVF)多肽、全長之源自視桿細胞的視錐細胞活性因子(full-length rod-derived cone viability factor, RdCVFL)多肽、X連鎖凋亡抑制(X-linked inhibit或of apoptosis, XIAP)多肽、可溶解之FMS相關受體酪氨酸激酶(soluble fms-related recept或tyrosine kinase 1, sFLT)多肽、CYP4V2多肽、棕梠酸脂蛋白酶(palmitoyl protein thioesterase 1)多肽、三肽基肽酶(tripeptidyl peptidase 1)多肽、DNAJC5多肽、MFSD8多肽、組織蛋白酶D(cathepsin D)多肽、顆粒蛋白(granulin)多肽、ATP13A2多肽、組織蛋白酶F(cathepsin F)多肽、KCTD7多肽、“P”基因多肽、TRP1多肽、MATP (SLC45A2)多肽、SLC24A5多肽、LRMDA多肽、GPR143多肽、RPGR-exon 1-ORF15多肽、USH2b多肽、USH1C多肽、CDH23多肽、PCDH15多肽、SANS多肽、USH1H多肽、CIB2多肽、USH1K多肽、ADGRV1多肽、WHRN多肽、PDZD7多肽、CLRN1多肽、HARS多肽、RP2多肽、FAM161多肽、DLK多肽、RHO多肽、CHM多肽、BEST1多肽、RP1多肽、OPA1多肽、CEP290多肽、RDH12多肽、CACNA1F多肽、BBS1多肽、FAM161A多肽、CERKL多肽、PRPF8多肽、RP1L1多肽、SNRNP200多肽、IMPG2多肽、CDHR1多肽、IMPDH1多肽、CNGB1多肽、MERTK多肽、KCNV2多肽、AIPL1多肽、RPGRIP1多肽、TULP1多肽、C2ORF71(PCARE)多肽、MAK多肽、TIMP3多肽、GUCA1A多肽、ALMS1多肽、BBS10多肽、IFT140多肽、CNGA1多肽、NMNAT1多肽、COL2A1多肽、EFEMP1多肽、WFS1多肽、RDH5多肽、PRPF3多肽、LRP5多肽、TOPORS多肽、DHDDS多肽、LCA5多肽、IQCB1多肽、RP9多肽、ATXN7多肽、BBS2多肽、SAG RLBP1多肽、ND6 (MT-ND6)多肽、C1QTNF5多肽、VPS13B多肽、KIF11多肽、MT-TL1多肽、KLHL7多肽、ACO2多肽、C21orf2 (CFAP410)多肽、AHI1多肽、KIZ多肽、SPATA7多肽、TTLL5多肽、HGSNAT多肽、NRL多肽、OAT多肽、FLVCR1多肽、ABCC6多肽、LRAT多肽、CEP78多肽、CDH3多肽、FZD4多肽、BBS12多肽、HK1多肽、PRDM13多肽、ADAM9多肽、BBS7多肽、CABP4多肽、ABHD12多肽、COL18A1多肽、MFRP多肽、RIMS1多肽、ROM1多肽、BBS4多肽、IMPG1多肽、INPP5E多肽、VCAN多肽、POC1B多肽、RAX2多肽、TSPAN12多肽、CACNA2D4多肽、JAG1多肽、MKKS多肽、NPHP4多肽、BBS9多肽、COL11A1多肽、ELOVL4多肽、NDP多肽、NPHP1多肽、RGR多肽、BBS5多肽、WDR19多肽、C8ORF37多肽、CTNNA1多肽、LAMP2多肽、PEX1多肽、PHYH多肽、ATF6多肽、PRPS1多肽、SEMA4A多肽、ARL6多肽、CNNM4多肽、OTX2多肽、PRPF6多肽、RBP3多肽、PNPLA6多肽、SLC24A1多肽、USH1G多肽、PITPNM3多肽、TTC8多肽、ARSG多肽、CWC27多肽、DRAM2多肽、PRCD多肽、REEP6多肽、SSBP1多肽、LAMA1多肽、RAB28多肽、ZNF408多肽、GNAT1多肽、IDH3A多肽、PDE6G多肽、PEX6多肽、TUB多肽、CEP250多肽、FSCN2多肽、GRK1多肽、RBP4多肽、RD3多肽、AGBL5多肽、CAPN5多肽、IFT172多肽、KCNJ13多肽、PAX2多肽、CC2D2A多肽、HMCN1多肽、MT-ATP6多肽、RCBTB1多肽、ARL2BP多肽、CA4多肽、DFNB31多肽、GNB3多肽、MMACHC多肽、PRPF4多肽、RGS9多肽、ARHGEF18多肽、KIAA1549多肽、MKS1多肽、MTTP (非MT-TP)多肽、PLK4多肽、RPGRIP1L多肽、SDCCAG8多肽、SRD5A3多肽、TUBB4B多肽、ADAMTS18多肽、ARL3多肽、COL11A2多肽、MVK多肽、NBAS多肽、OFD1多肽、P3H2多肽、RGS9BP多肽、CSPP1多肽、ITM2B多肽、PANK2多肽、PEX7多肽、POMGNT1多肽、SLC4A7多肽、TMEM231多肽、TRNT1多肽、TUBGCP6多肽、ZNF513多肽、AFG3L2多肽、ARL13B多肽、C5ORF42(CPLANE1)多肽、COL9A1多肽、CTSD多肽、DTHD1多肽、DYNC2H1多肽、IFT81多肽、KIAA0586多肽、MFN2多肽、NPHP3多肽、PCYT1A多肽、PEX12多肽、PLA2G5多肽、POC5多肽、SCAPER多肽、SLC25A46多肽、TMEM237多肽、TRAF3IP1多肽、TTC21B多肽、TUBGCP4多肽、ADIPOR1多肽、CEP164多肽、CLCC1多肽、COL9A2多肽、CTNNB1多肽、DHX38多肽、GNPTG多肽、GRN多肽、GUCA1B多肽、IFT27多肽、IFT74多肽、KIAA0556多肽、LRP2多肽、MAPKAPK3多肽、MIR204多肽、MT-ND3多肽、MT-RNR1多肽、MT-TS2多肽、ND5(MT-ND5)多肽、NEK2多肽、OPN1SW多肽、PEX13多肽、PEX2多肽、RHBDD2多肽、SAMD11多肽、SCLT1多肽、SLC7A14多肽、TCTN1多肽、TCTN2多肽、TLCD3B多肽、TREX1多肽、TTPA多肽、UNC119多肽、WDPCP多肽、ACBD5多肽、AHR多肽、ARMC9多肽、ASRGL1多肽、ATOH7多肽、B9D1多肽、B9D2多肽、BBIP1多肽、C12ORF65多肽、C2CD3多肽、C5AR2多肽、CCDC188多肽、CCT2多肽、CEP104多肽、CEP120多肽、CEP19多肽、CEP41多肽、CISD2多肽、CLUAP1多肽、COL9A3多肽、CRB2多肽、CTC1多肽、DACT2多肽、DDR1多肽、ENSA多肽、ESPN多肽、EXOSC2多肽、FBN3多肽、GDF6多肽、GPR125多肽、HKDC1多肽、HMX1多肽、IDH3B多肽、IFT43多肽、IFT80多肽、INVS多肽、KIAA0753多肽、KIF3B多肽、KIF7多肽、LRRTM4多肽、LZTFL1多肽、MT-ATP8多肽、MT-CO1多肽、MT-CO2多肽、MT-CO3多肽、MT-CYB多肽、MT-ND2多肽、MT-ND4L多肽、MT-RNR2多肽、MT-TA多肽、MT-TC多肽、MT-TD多肽、MT-TE多肽、MT-TF多肽、MT-TG多肽、MT-TH多肽、MT-TI多肽、MT-TK多肽、MT-TL2多肽、MT-TM多肽、MT-TN多肽、MT-TP(非MTTP)多肽、MT-TQ多肽、MT-TR多肽、MT-TS1多肽、MT-TT多肽、MT-TV多肽、MT-TW多肽、MT-TY多肽、NEUROD1多肽、PDE6D多肽、PEX10多肽、PEX11B多肽、PEX14多肽、PEX16多肽、PEX19多肽、PEX26多肽、PEX3多肽、PEX5多肽、PGK1多肽、PISD多肽、PPP2R3C多肽、PROS1多肽、PSEN1多肽、RDH11多肽、RRM2B多肽、SMARCA4多肽、SPP2多肽、TCTN3多肽、TEAD1多肽、TMEM107多肽、TMEM138多肽、TMEM216多肽、TMEM67多肽、TPP1多肽、TRIM32多肽、USP45多肽、及ZNF423多肽。在一些情況下,包含本文提供的AAV載體內的外源核酸序列編碼的目的多肽可以是MYO7A多肽、USH1C多肽、PCDH15多肽、USH2A多肽或CLRN1多肽,以治療例如亞瑟綜合症(Usher Syndrome)。
在一些情況下,本文所提供之一或多個AAV載體可經設計以在一或多個細胞(例如視網膜細胞)內進行基因編輯。此類基因編輯可導致一或多個細胞之基因體修飾。此類基因體修飾之實例包括但不限於,將編碼所關注之RNA及/或多肽之核酸靶向插入一或多個細胞、一或多個細胞之基因體序列之靶向修飾(例如靶向去活化或剔除)、及一或多個細胞內之核酸(例如,編碼RNA之核酸、調節核酸序列、及/或編碼所關注之多肽的核酸)的靶向置換。
任何適當的基因編輯組分可經工程改造至本文所提供之一或多個AAV載體,使得彼等一或多個AAV載體可以有效編輯彼等細胞之基因體的方式,向哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)內的目標細胞(例如,一或多個視網膜細胞)遞送基因編輯組分。通常,基因編輯組分包括但不限於能夠在所欲位置裂解基因體核酸之組分,以及設計成一旦裂解即插入該所欲位置之可選的供體核酸。任何適當的稀有切割(rare-cutting)核酸內切酶可用以在所欲位置裂解基因體核酸。此類稀有切割核酸內切酶之實例包括但不限於大範圍核酸酶(meganucleases)、轉錄活化因子樣效應物(transcription activator-like effector, TALE)核酸酶(TALENs™; Cellectis, Paris, France)、鋅指核酸酶(zinc-finger-nucleases, ZFN)、及成簇規律間隔短回文重複序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR)/Cas系統之核酸內切酶(例如CRISPR/Cas 9系統之核酸內切酶)。參見例如Baker, Nature Methods, 9:23-26 (2012);國際PCT專利申請公開案第WO 2004/067736號;國際PCT專利申請公開案第WO 2011/072246號;美國專利案第8,586,363號;Porteus and Carroll, Nature Biotechnol., 23:967-973 (2005);Jinek et al., Science, 337:816-821 (2012);Mali et al., Science, 339:823-826 (2013);Li et al., Nature Biotechnology, 31(8):688-691 (2013);及Makarova et al., Nat. Rev. Microbiol., 9(6):467-477 (2011))。
在一些情況下,為了促進基因置換,可靶向細胞(例如視網膜細胞)之基因體核酸中之兩個序列(一個位於待移除序列之任一側)以進行核酸內切酶裂解。舉例而言,相鄰於待移除之序列之5'端的第一目標序列及相鄰於待移除序列之3'端的第二目標序列可由引導RNA靶向,以使Cas9裂解,或可由旨在特異性識別彼等目標之TALEN所靶向。使用本文所提供之一或多種AAV載體遞送(a)靶向基因體DNA之核酸內切酶及(b)供體核酸構築體,可允許在兩個基因體目標處裂解、移除基因體目標之間的序列、以及將供體序列插入至缺失位置中。
本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可包括任何適當的啟動子及/或其他調節序列(例如,增強劑、轉錄起始位點、轉譯起始位點、及終止信號),其可操作地連接所設計用於表現的外源核酸序列。在一些情況下,用於驅動表現之啟動子可係組成型啟動子、可調節啟動子、組織特異性啟動子、或病毒啟動子。可如本文中所述使用之組成型啟動子之實例包括但不限於SV40啟動子、CMV啟動子、及E1ALPHA啟動子。可如本文中所述使用之可調節啟動子之實例包括但不限於誘導型啟動子及阻抑型啟動子。可如本文中所述使用之組織特異性啟動子之實例包括但不限於視紫質啟動子(rhodopsin promotors)、視錐抑制蛋白啟動子(cone arrestin promotors)、及突觸蛋白啟動子(synapsin promotors)。可如本文中所述使用之病毒啟動子之實例包括但不限於腺病毒啟動子、痘瘡病毒(vaccinia virus)啟動子、CMV啟動子(例如,即時早期CMV啟動子)、及AAV啟動子。
在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可包括總數目至多約5 kb之核苷酸。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可包括總數目約1 kb至約5 kb、約1 kb至約4 kb、約1 kb至約3 kb、約2 kb至約5 kb、約2 kb至約4 kb、約2 kb至約3 kb、約3 kb至約5 kb、約3 kb至約4 kb、或約4 kb至約5 kb之核苷酸。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1A中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼窩視錐並向經感染之眼窩視錐遞送外源核酸序列使得經感染之眼窩視錐表現外源核酸序列之能力。在一些情況下,當與野生型AAV2相比時,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有感染及驅動存在於哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之中央窩中更多視錐細胞中之外源核酸序列的RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之眼窩視錐中之外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於由具有AAV殼體多肽之對照AAV載體(例如野生型AAV2)驅動之外源核酸序列之RNA表現水平,其中該AAV殼體多肽由對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之眼窩視錐中的SEQ ID NO:1所闡述的胺基酸序列組成。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少2.5%、至少5%、至少7.5%、至少10%、或至少25%)之視網膜細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大2%、至少大2.5%、至少大5%、至少大7.5%、至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內跨視網膜區域(例如,跨二、三、或四個視網膜區域)感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之中央窩區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中、窩側區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中、弓形血管區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中、及/或周邊區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少二、三、或四個不同區域的視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)彼等區域之視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼睛之窩側區域之視網膜細胞並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸序列之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在存在於哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之窩側區域中至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之窩側區域之視網膜細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之窩側區域之視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同視網膜細胞類型並遞送外源核酸至經感染之視網膜細胞使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸的能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有感染以下二、三、四、五、六、或七種視網膜細胞類型之能力:視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞。在一些情況下,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有感染下列細胞之能力:(a)視網膜神經節細胞、無長突細胞、及水平細胞,(b)視網膜神經節細胞、無長突細胞、及雙極細胞,(c)視網膜神經節細胞、無長突細胞、及穆勒神經膠質細胞,(d)視網膜神經節細胞、無長突細胞、及感光細胞,(e)視網膜神經節細胞、無長突細胞、及視網膜色素上皮細胞,(f)無長突細胞、水平細胞、及雙極細胞,(g)無長突細胞、水平細胞、及穆勒神經膠質細胞,(h)無長突細胞、水平細胞、及感光細胞,(i)無長突細胞、水平細胞、及視網膜色素上皮細胞,(j)水平細胞、雙極細胞、及穆勒神經膠質細胞,(k)水平細胞、雙極細胞、及感光細胞,(l)水平細胞、雙極細胞、及視網膜色素上皮細胞,(m)雙極細胞、穆勒膠質細胞、及感光細胞,(n)雙極細胞、穆勒膠質細胞、及視網膜色素上皮細胞、或(o)穆勒膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有例如在玻璃體內投予後在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜神經節細胞中、至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之無長突細胞中、至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之水平細胞中、至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之雙極細胞中、至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之穆勒神經膠質細胞中、至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之感光細胞中、及/或至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜色素上皮細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1F中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜色素上皮細胞並向經感染之視網膜色素上皮細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜色素上皮細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜色素上皮細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之視網膜色素上皮細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之視網膜色素上皮細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1G中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染感光細胞並向經感染之感光細胞遞送外源核酸序列使得經感染之感光細胞表現外源核酸序列之能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有下列能力:與眼睛的任何其他視網膜細胞類型相比,在體內更大程度的感染感光細胞並向經感染之感光細胞遞送外源核酸序列使得經感染之感光細胞表現外源核酸序列。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之感光細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之感光細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之感光細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1H中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜神經節細胞並向經感染之視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜神經節細胞表現外源核酸序列之能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有下列能力:與眼睛的任何其他視網膜細胞類型相比,在體內更大程度的感染視網膜神經節細胞並向經感染之視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜神經節細胞表現外源核酸序列。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜神經節細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之視網膜神經節細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之視網膜神經節細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1I中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜之雙極細胞並向經感染之雙極細胞遞送外源核酸序列使得經感染之雙極細胞表現外源核酸序列之能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有下列能力:與眼睛的任何其他視網膜細胞類型相比,在體內更大程度的感染視網膜之雙極細胞並向經感染之雙極細胞遞送外源核酸序列使得經感染之雙極細胞表現外源核酸序列。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之視網膜之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之雙極細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之視網膜之雙極細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之視網膜之雙極細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1J中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染ON視網膜神經節細胞並向經感染之ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之ON視網膜神經節細胞表現外源核酸序列之能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有下列能力:與眼睛的任何其他視網膜細胞類型相比,在體內更大程度的感染ON視網膜神經節細胞(例如,比OFF視網膜神經節細胞更大程度)並向經感染之ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之ON視網膜神經節細胞表現外源核酸序列。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之ON視網膜神經節細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之ON視網膜神經節細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之ON視網膜神經節細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1K中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染OFF視網膜神經節細胞並向經感染之OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之OFF視網膜神經節細胞表現外源核酸序列之能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有下列能力:與眼睛的任何其他視網膜細胞類型相比,在體內更大程度的感染OFF視網膜神經節細胞(例如,比ON視網膜神經節細胞更大程度)並向經感染之OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之OFF視網膜神經節細胞表現外源核酸序列。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之OFF視網膜神經節細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之OFF視網膜神經節細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之OFF視網膜神經節細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有提高之封裝效率、在體內或體外感染細胞(例如,視網膜細胞)之能力、以及向經感染之細胞遞送外源核酸序列使得經感染之細胞(例如,以高水平)表現外源核酸序列的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)之封裝效率可大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)的封裝效率。
可由本文所述之含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)的AAV載體(例如AAV2載體)感染之視網膜細胞之實例包括但不限於視網膜神經節細胞、視網膜色素上皮細胞、感光細胞、雙極細胞、無長突細胞、穆勒神經膠質細胞、及水平細胞,其中該AAV殼體多肽包括表1中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或式A的胺基酸序列。
本文亦提供含有一或多個本文所提供之AAV載體(例如,一或多個本文所提供之AAV2載體)的組成物。舉例而言,本文所提供之一或多個AAV載體(例如,本文所提供之一或多個AAV2載體)可調配為醫藥組成物用於投予至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)以治療該哺乳動物。在一些情況下,本文所提供之一或多個AAV載體(例如,本文所提供之一或多個AAV2載體)可調配為醫藥組成物用於投予至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),以向眼窩視錐遞送外源核酸序列以在眼窩視錐內表現。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可調配為醫藥組成物用於投予至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)。在一些情況下,本文所提供之醫藥組成物可包括醫藥上可接受之載劑,諸如緩衝劑、鹽、界面活性劑、糖、張性改質劑、或其組合,例如如其他地方所述(Gervasi et al., Eur. J. Pharmaceutics and Biopharmaceutics, 131:8-24 (2018))。可用以製造本文所提供之醫藥組成物之醫藥上可接受之載劑的實例包括但不限於水、乳酸、檸檬酸、氯化鈉、檸檬酸鈉、琥珀酸鈉、磷酸鈉、界面活性劑(例如,聚山梨醇酯20、聚山梨醇酯80、或泊洛沙姆188)、葡聚醣40、或糖(例如,山梨糖醇、甘露醇、蔗糖、右旋糖、或海藻糖)、或其組合。舉例而言,經設計以包括本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)之醫藥組成物可經調配以包括緩衝劑(例如,乙酸鹽、檸檬酸鹽、組胺酸、琥珀酸鹽、磷酸鹽、或羥甲基-胺基甲烷(Tris)緩衝液)、界面活性劑(例如,聚山梨醇酯20、聚山梨醇酯80、或泊洛沙姆188)、及糖(諸如蔗糖)。可包括在本文所提供之醫藥組成物內的其他成分包括但不限於胺基酸(諸如甘胺酸或精胺酸)、抗氧化劑(諸如抗壞血酸)、甲硫胺酸、或乙二胺四乙酸(ethylenediaminetetraacetic acid, EDTA)、或其組合。
在一些情況下,當醫藥組成物經調配以包括本文所提供之一或多個AAV載體(例如,一或多個AAV2載體)時,可使用任何適當效價的AAV載體。舉例而言,本文所提供之醫藥組成物可經調配以具有大於1x10 7(例如,大於1x10 8、大於1x10 9、大於1x10 10、大於1x10 11、大於1x10 12、大於1x10 13、或大於1x10 14)效價的本文所提供的AAV載體(例如AAV2載體)。在一些情況下,本文所提供之醫藥組成物可經調配以具有效價為約1x10 7至約1x10 14(例如,約1x10 7至約1x10 13、約1x10 7至約1x10 12、約1x10 7至約1x10 11、約1x10 7至約1x10 10、約1x10 8至約1x10 14、約1x10 9至約1x10 14、約1x10 10至約1x10 14、約1x10 8至約1x10 12、或約1x10 9至約1x10 11)的本文所提供的AAV載體(例如AAV2載體)。
本文所提供之醫藥組成物可呈任何適當形式。舉例而言,本文所提供之醫藥組成物可經設計為液體、半固體、或固體。在一些情況下,本文所提供之醫藥組成物可係液體溶液(例如,可注射及/或可輸注之溶液)、分散液、懸浮液、錠劑、丸劑、粉末、微乳液、微脂體、或栓劑。在一些情況下,本文所提供之醫藥組成物可經凍乾。在一些情況下,本文所提供之醫藥組成物(例如,包括本文所提供之一或多個AAV載體(諸如本文所提供之一或多個AAV2載體)之醫藥組成物)可與經設計以防止快速釋放之載體或包衣一起調配。舉例而言,本文所提供之醫藥組成物可調配為控釋配方或調節釋放配方,如其他地方所述(美國專利申請公開案第2019/0241667號;第2019/0233522號;及第2019/0233498號)。
本文亦提供編碼AAV殼體多肽之核酸分子,該殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。在一些情況下,核酸分子可經設計以編碼AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括由表1A至1L之任一或多者中所闡述之DNA序列編碼的胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:A20至A37、SEQ ID NO:B318至B649、SEQ ID NO:C46至C88、SEQ ID NO:D79至D155、SEQ ID NO:E84至E165、SEQ ID NO:F11至F19、SEQ ID NO:G78至G153、SEQ ID NO:H259至H515、SEQ ID NO:I75至I147、SEQ ID NO:J65至J127、SEQ ID NO:K64至K125、及SEQ ID NOs:L28-L53中任一者)。
本文亦提供編碼本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)的核酸分子。舉例而言,經單離之核酸分子可經設計以編碼本文所提供之一或多個AAV載體(例如,具有AAV殼體多肽之AAV,該AAV衣殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)。在一些情況下,核酸分子可經設計以編碼具有AAV殼體多肽之AAV載體,該AAV殼體多肽包括由表1A至1L之任一或多者中所闡述之DNA序列編碼的胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:A20至A37、SEQ ID NO:B318至B649、SEQ ID NO:C46至C88、SEQ ID NO:D79至D155、SEQ ID NO:E84至E165、SEQ ID NO:F11至F19、SEQ ID NO:G78至G153、SEQ ID NO:H259至H515、SEQ ID NO:I75至I147、SEQ ID NO:J65至J127、SEQ ID NO:K64至K125、及SEQ ID NOs:L28-L53中任一者)。
本文亦提供含有本文所提供之核酸分子的宿主細胞。舉例而言,宿主細胞可經設計以包括編碼本文所述之AAV殼體多肽的核酸分子及/或編碼本文所述之AAV載體的核酸分子。在一些情況下,宿主細胞可經設計以包括編碼AAV殼體多肽之核酸分子,該AAV殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。在一些情況下,宿主細胞可經設計以包括編碼具有AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,該AAV殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。可經設計以包括編碼本文所述之AAV殼體多肽的核酸分子及/或編碼本文所述之AAV載體的核酸分子的宿主細胞的實例包括但不限於HEK293T細胞(ATCC)、293AAV細胞(Cell Biolabs)、NEB 5α細胞、TakaraBio Stellar細胞、及MegaX細胞。可使用任何適當方法將本文所提供之核酸分子(例如,編碼本文所述之AAV殼體多肽及/或本文所述之AAV載體的核酸分子)引入至細胞中。舉例而言,可使用病毒轉染(viral transfection)、電穿孔(electroporation)、暫態轉染(transient transfection)、及基因槍(gene gun)技術將本文所提供之核酸分子引入至細胞中。
本文亦提供用於製造本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)的方法及材料。舉例而言,本文提供用於製造含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體)的方法及材料,該殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。如本文中所述,AAV載體可經構築以包括AAV殼體多肽,該殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。可使用任何適當的方法來構築具有本文所提供之AAV殼體多肽(例如,AAV2殼體多肽)的AAV載體(例如,殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)。舉例而言,分子選殖及AAV載體生產技術,諸如其他地方所描述之彼等者,可用於構築及生產具有本文所提供之AAV殼體多肽(例如,AAV2殼體多肽)的AAV載體(參見例如Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory, NY (1989);Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, Green Publishing Associates and John Wiley & Sons, New York, N.Y. (1994);Grieger et al., Nat. Protoc., 1(3):1412-28 (2006);以及Flannery et al., Methods Mol. Biol., 935:351-69 (2013))。在一些情況下,AAV載體可使用雙重或三重轉染方法在HEK293T細胞(ATCC)或293AAV細胞(Cell Biolabs)中生產(參見例如Grieger et al., Nat. Protoc., 1(3):1412-28 (2006);以及Flannery et al., Methods Mol. Biol., 935:351-69 (2013))。
本文亦提供了使用本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)的方法及材料。舉例而言,本文提供了使用含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體)的方法及材料,該殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1A中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染眼窩視錐並向經感染之眼窩視錐遞送外源核酸序列使得經感染之眼窩視錐表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜細胞(例如,以高水平)表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內跨視網膜區域(例如,跨二、三、或四個不同的視網膜區域)感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列之能力。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以感染跨視網膜區域的視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞),使得該AAV載體感染哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之中央窩區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞、窩側區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞、弓形血管區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞、及/或周邊區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染眼睛之窩側區域之視網膜細胞並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同視網膜細胞類型並遞送外源核酸序列至經感染之視網膜細胞使得經感染之視網膜細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列。舉例而言,例如玻璃體內投予後,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以感染哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之(a)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜神經節細胞,(b)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的無長突細胞,(c)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的水平細胞,(d)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的雙極細胞,(e)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的穆勒神經膠質細胞,(f)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的感光細胞,(g)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜色素上皮細胞,(a)至(g)全部,或(a)至(g)中之二、三、四、五、或六個的任意組合。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染視網膜色素上皮細胞並向經感染之視網膜色素上皮細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜色素上皮細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以感染視網膜色素上皮細胞,使得該AAV載體感染哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜色素上皮細胞。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染感光細胞並向經感染之感光細胞遞送外源核酸序列使得經感染之感光細胞表現外源核酸序列。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地感染感光細胞,並向經感染之感光細胞遞送外源核酸序列,使得經感染之感光細胞比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染視網膜神經節細胞並向經感染之視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜神經節細胞表現外源核酸序列。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地感染視網膜神經節細胞,並向經感染之視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列,使得經感染之視網膜神經節細胞比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染視網膜之雙極細胞並向經感染之雙極細胞遞送外源核酸序列使得經感染之雙極細胞表現外源核酸序列。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地感染視網膜之雙極細胞,並向經感染之雙極細胞遞送外源核酸序列,使得經感染之雙極細胞比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染ON視網膜神經節細胞並向經感染之ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之ON視網膜神經節細胞表現外源核酸序列。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地感染ON視網膜神經節細胞(例如,比OFF視網膜神經節細胞更大程度),並向經感染之ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列,使得經感染之ON視網膜神經節細胞比眼睛的任何其他視網膜細胞類型(例如,OFF視網膜神經節細胞)更大程度地表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染OFF視網膜神經節細胞並向經感染之OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之OFF視網膜神經節細胞表現外源核酸序列。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地感染OFF視網膜神經節細胞(例如,比ON視網膜神經節細胞更大程度),並向經感染之OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列,使得經感染之OFF視網膜神經節細胞比眼睛的任何其他視網膜細胞類型(例如,ON視網膜神經節細胞)更大程度地表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以改良封裝效率。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內或體外感染細胞(例如視網膜細胞)並向經感染之細胞遞送外源核酸序列使得經感染之細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列。
在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以治療視網膜病況(例如視網膜疾病)。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1A中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染眼窩視錐及(b)在經感染之眼窩視錐中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)及(b)在經感染之視網膜細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染跨至少二、三、或四個不同視網膜區域之視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞)及(b)在經感染之視網膜細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染眼睛之窩側區域的視網膜細胞及(b)在窩側區域之經感染之視網膜細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同的視網膜細胞類型及(b)在經感染之視網膜細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現(例如以高水平),投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染視網膜色素上皮細胞及(b)驅動所遞送之外源核酸在經感染之視網膜色素上皮細胞中表現(例如以高水平),投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染感光細胞及(b)在經感染之感光細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染視網膜神經節細胞及(b)在經感染之視網膜神經節細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染視網膜之雙極細胞及(b)在經感染之雙極細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染ON視網膜神經節細胞及(b)在經感染之ON視網膜神經節細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染OFF視網膜神經節細胞及(b)在經感染之OFF視網膜神經節細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染視網膜細胞及(b)在經感染之視網膜細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現(例如以高水平),投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可經設計以包括並驅動編碼任何適當之所關注之RNA及/或所關注之多肽的外源核酸序列的表現。當本文所提供之AAV載體經設計以治療視網膜病況(例如視網膜疾病)時,編碼能夠治療視網膜病況之RNA及/或多肽的外源核酸序列可包括在AAV載體內。可由經設計以治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之外源核酸序列編碼並經設計以包括在本文所提供之AAV載體內的RNA的實例包括但不限於,SIRNA-027以治療例如繼發於年齡相關性黃斑部病變的眼窩下脈絡膜新生血管膜(sub-foveal choroidal neovascular membrane, sub-foveal CNVM)(參見例如NCT00363714)、Cand5/Bevasiranib以治療例如糖尿病黃斑部水腫(diabetic macular edema)(參見例如NCT00306904)、PF-04523655以治療例如糖尿病黃斑部水腫(參見例如NCT01445899)、QPI-1007以治療例如非動脈性前部缺血性視神經病變(non-arteritic anterior ischemic optic neuropathy, NAION)中之視神經萎縮(參見例如NCT01064505)、阿加尼森(aganirsen)以治療例如缺血性中心視網膜靜脈阻塞(central retinal vein occulsion, CRVO)以預防新生血管性青光眼(參見例如NCT02947867)、QR-421a以治療例如視網膜色素變性/尤塞氏症候群2型(retinitis pigmentosa/Usher syndrome type 2)(參見例如NCT03780257)、QR-1123以治療例如常染色體顯性遺傳性視網膜色素病變(autosomal dominant retinitis pigmentosa)(參見例如NCT04123626)、IONIS-FB-LRx以治療例如繼發於年齡相關性黃斑部病變之地圖狀萎縮(geographic atrophy)(參見例如NCT03815825)、及色普法生(Sepofarsen)/QR-110以治療例如萊伯氏先天性黑蒙症(Leber’s congenital amaurosis)(參見例如NCT03913143)。可由經設計以治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之外源核酸序列編碼並經設計以包括在本文所提供之AAV載體內的多肽的實例包括但不限於:ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、NR2E3多肽、PDE6A多肽、PDE6B多肽、PDE6C多肽、PRPF31多肽、RPE65多肽、RPGR多肽、RS1多肽、TYR多肽、USH2A多肽、MYO7A多肽、REP1多肽、OPN1LW多肽、OPN1MW多肽、CNGA3多肽、CNGB3多肽、GUCY2D多肽、GACA1A多肽、GNAT2多肽、PDE6H多肽、PROM1多肽、PRPH2多肽、CRX多肽、NPHP5多肽、EYS多肽、ND4多肽、CLN1-14多肽(如CLN3多肽、CLN5多肽、CLN6多肽、或CLN8多肽)、NYX多肽、GRM6多肽、TRPM1多肽、GPR179多肽、LRIT3多肽、神經膠細胞營養因子(glial cell derived neurotrophic factor, GDNF)多肽、腦源性神經營養因子(brain-derived neurotrophic factor, BDNF)多肽、纖維母細胞生長因子(fibroblast growth factor, FGF)多肽、截短之源自視桿細胞的視錐細胞活性因子(truncated rod-derived cone viability factor, RdCVF)多肽、全長之源自視桿細胞的視錐細胞活性因子(full-length rod-derived cone viability factor, RdCVFL)多肽、X連鎖凋亡抑制(X-linked inhibit或of apoptosis, XIAP)多肽、可溶解之FMS相關受體酪氨酸激酶(soluble fms-related recept或tyrosine kinase 1, sFLT)多肽、CYP4V2多肽、棕梠酸脂蛋白酶(palmitoyl protein thioesterase 1)多肽、三肽基肽酶(tripeptidyl peptidase 1)多肽、DNAJC5多肽、MFSD8多肽、組織蛋白酶D(cathepsin D)多肽、顆粒蛋白(granulin)多肽、ATP13A2多肽、組織蛋白酶F(cathepsin F)多肽、KCTD7多肽、“P”基因多肽、TRP1多肽、MATP (SLC45A2)多肽、SLC24A5多肽、LRMDA多肽、GPR143多肽、RPGR-exon 1-ORF15多肽、USH2b多肽、USH1C多肽、CDH23多肽、PCDH15多肽、SANS多肽、USH1H多肽、CIB2多肽、USH1K多肽、ADGRV1多肽、WHRN多肽、PDZD7多肽、CLRN1多肽、HARS多肽、RP2多肽、FAM161多肽、DLK多肽、RHO多肽、CHM多肽、BEST1多肽、RP1多肽、OPA1多肽、CEP290多肽、RDH12多肽、CACNA1F多肽、BBS1多肽、FAM161A多肽、CERKL多肽、PRPF8多肽、RP1L1多肽、SNRNP200多肽、IMPG2多肽、CDHR1多肽、IMPDH1多肽、CNGB1多肽、MERTK多肽、KCNV2多肽、AIPL1多肽、RPGRIP1多肽、TULP1多肽、C2ORF71(PCARE)多肽、MAK多肽、TIMP3多肽、GUCA1A多肽、ALMS1多肽、BBS10多肽、IFT140多肽、CNGA1多肽、NMNAT1多肽、COL2A1多肽、EFEMP1多肽、WFS1多肽、RDH5多肽、PRPF3多肽、LRP5多肽、TOPORS多肽、DHDDS多肽、LCA5多肽、IQCB1多肽、RP9多肽、ATXN7多肽、BBS2多肽、SAG RLBP1多肽、ND6 (MT-ND6)多肽、C1QTNF5多肽、VPS13B多肽、KIF11多肽、MT-TL1多肽、KLHL7多肽、ACO2多肽、C21orf2 (CFAP410)多肽、AHI1多肽、KIZ多肽、SPATA7多肽、TTLL5多肽、HGSNAT多肽、NRL多肽、OAT多肽、FLVCR1多肽、ABCC6多肽、LRAT多肽、CEP78多肽、CDH3多肽、FZD4多肽、BBS12多肽、HK1多肽、PRDM13多肽、ADAM9多肽、BBS7多肽、CABP4多肽、ABHD12多肽、COL18A1多肽、MFRP多肽、RIMS1多肽、ROM1多肽、BBS4多肽、IMPG1多肽、INPP5E多肽、VCAN多肽、POC1B多肽、RAX2多肽、TSPAN12多肽、CACNA2D4多肽、JAG1多肽、MKKS多肽、NPHP4多肽、BBS9多肽、COL11A1多肽、ELOVL4多肽、NDP多肽、NPHP1多肽、RGR多肽、BBS5多肽、WDR19多肽、C8ORF37多肽、CTNNA1多肽、LAMP2多肽、PEX1多肽、PHYH多肽、ATF6多肽、PRPS1多肽、SEMA4A多肽、ARL6多肽、CNNM4多肽、OTX2多肽、PRPF6多肽、RBP3多肽、PNPLA6多肽、SLC24A1多肽、USH1G多肽、PITPNM3多肽、TTC8多肽、ARSG多肽、CWC27多肽、DRAM2多肽、PRCD多肽、REEP6多肽、SSBP1多肽、LAMA1多肽、RAB28多肽、ZNF408多肽、GNAT1多肽、IDH3A多肽、PDE6G多肽、PEX6多肽、TUB多肽、CEP250多肽、FSCN2多肽、GRK1多肽、RBP4多肽、RD3多肽、AGBL5多肽、CAPN5多肽、IFT172多肽、KCNJ13多肽、PAX2多肽、CC2D2A多肽、HMCN1多肽、MT-ATP6多肽、RCBTB1多肽、ARL2BP多肽、CA4多肽、DFNB31多肽、GNB3多肽、MMACHC多肽、PRPF4多肽、RGS9多肽、ARHGEF18多肽、KIAA1549多肽、MKS1多肽、MTTP (非MT-TP)多肽、PLK4多肽、RPGRIP1L多肽、SDCCAG8多肽、SRD5A3多肽、TUBB4B多肽、ADAMTS18多肽、ARL3多肽、COL11A2多肽、MVK多肽、NBAS多肽、OFD1多肽、P3H2多肽、RGS9BP多肽、CSPP1多肽、ITM2B多肽、PANK2多肽、PEX7多肽、POMGNT1多肽、SLC4A7多肽、TMEM231多肽、TRNT1多肽、TUBGCP6多肽、ZNF513多肽、AFG3L2多肽、ARL13B多肽、C5ORF42(CPLANE1)多肽、COL9A1多肽、CTSD多肽、DTHD1多肽、DYNC2H1多肽、IFT81多肽、KIAA0586多肽、MFN2多肽、NPHP3多肽、PCYT1A多肽、PEX12多肽、PLA2G5多肽、POC5多肽、SCAPER多肽、SLC25A46多肽、TMEM237多肽、TRAF3IP1多肽、TTC21B多肽、TUBGCP4多肽、ADIPOR1多肽、CEP164多肽、CLCC1多肽、COL9A2多肽、CTNNB1多肽、DHX38多肽、GNPTG多肽、GRN多肽、GUCA1B多肽、IFT27多肽、IFT74多肽、KIAA0556多肽、LRP2多肽、MAPKAPK3多肽、MIR204多肽、MT-ND3多肽、MT-RNR1多肽、MT-TS2多肽、ND5(MT-ND5)多肽、NEK2多肽、OPN1SW多肽、PEX13多肽、PEX2多肽、RHBDD2多肽、SAMD11多肽、SCLT1多肽、SLC7A14多肽、TCTN1多肽、TCTN2多肽、TLCD3B多肽、TREX1多肽、TTPA多肽、UNC119多肽、WDPCP多肽、ACBD5多肽、AHR多肽、ARMC9多肽、ASRGL1多肽、ATOH7多肽、B9D1多肽、B9D2多肽、BBIP1多肽、C12ORF65多肽、C2CD3多肽、C5AR2多肽、CCDC188多肽、CCT2多肽、CEP104多肽、CEP120多肽、CEP19多肽、CEP41多肽、CISD2多肽、CLUAP1多肽、COL9A3多肽、CRB2多肽、CTC1多肽、DACT2多肽、DDR1多肽、ENSA多肽、ESPN多肽、EXOSC2多肽、FBN3多肽、GDF6多肽、GPR125多肽、HKDC1多肽、HMX1多肽、IDH3B多肽、IFT43多肽、IFT80多肽、INVS多肽、KIAA0753多肽、KIF3B多肽、KIF7多肽、LRRTM4多肽、LZTFL1多肽、MT-ATP8多肽、MT-CO1多肽、MT-CO2多肽、MT-CO3多肽、MT-CYB多肽、MT-ND2多肽、MT-ND4L多肽、MT-RNR2多肽、MT-TA多肽、MT-TC多肽、MT-TD多肽、MT-TE多肽、MT-TF多肽、MT-TG多肽、MT-TH多肽、MT-TI多肽、MT-TK多肽、MT-TL2多肽、MT-TM多肽、MT-TN多肽、MT-TP(非MTTP)多肽、MT-TQ多肽、MT-TR多肽、MT-TS1多肽、MT-TT多肽、MT-TV多肽、MT-TW多肽、MT-TY多肽、NEUROD1多肽、PDE6D多肽、PEX10多肽、PEX11B多肽、PEX14多肽、PEX16多肽、PEX19多肽、PEX26多肽、PEX3多肽、PEX5多肽、PGK1多肽、PISD多肽、PPP2R3C多肽、PROS1多肽、PSEN1多肽、RDH11多肽、RRM2B多肽、SMARCA4多肽、SPP2多肽、TCTN3多肽、TEAD1多肽、TMEM107多肽、TMEM138多肽、TMEM216多肽、TMEM67多肽、TPP1多肽、TRIM32多肽、USP45多肽、及ZNF423多肽。在一些情況下,包含本文提供的AAV載體內的外源核酸序列編碼的目的多肽可以是MYO7A多肽、USH1C多肽、PCDH15多肽、USH2A多肽或CLRN1多肽,以治療例如亞瑟綜合症(Usher Syndrome)。
任何適當的視網膜病況(例如視網膜疾病)可使用本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體,該AAV殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)及編碼治療性RNA及/或多肽的外源核酸序列進行治療。此類視網膜病況之實例包括但不限於萊伯氏先天性黑蒙症(Leber congenital amaurosis, LCA)、萊伯氏遺傳性視神經病變(Leber hereditary optic neuropathy, LHON)、眼皮膚白化症1型(oculocutaneous albinism type 1 , OCA1)、視網膜色素變性(retinitis pigmentosa)、視桿/視錐失養症(rod/cone dystrophy)、視錐失養症(cone dystrophy)、視桿失養症(rod dystrophy)、斯特格氏病(Stargardt Disease)、尤塞氏症候群(Usher syndrome)、X性聯視網膜色素變性(X-linked retinitis pigmentosa, XLRP)、X性聯視網膜裂損症(X-linked retinoschisis, XLRS)、無脈絡脈畸型(choroideremia)、全色盲(achromatopsia)、藍色視錐單色症(blue cone monochromacy)、色盲(color blindness)、青光眼(glaucoma)、視神經萎縮(optic atrophy)、巴登氏病(Batten disease)、先天性靜止性夜盲症(congenital stationary night blindness, CSNB)、黃斑部病變(macular degeneration)、CRB1相關視網膜失養症(CRB1-related retinal dystrophy)、及眼窩視錐失養症(foveal cone dystrophy)。
表2及表3中列出可使用本文所提供之AAV載體遞送以治療特定視網膜病況之治療性RNA及多肽的實例。表3中列出可使用本文所提供之經設計以遞送基因編輯組分的一或多個AAV載體,去活化及/或剔除以治療特定視網膜病況之基因體核酸的實例。表3中列出可使用本文所提供之經設計以遞送基因編輯組分的一或多個AAV載體,用健康等位基因置換以治療特定視網膜病況之致病等位基因之基因體核酸的實例。
[表2]用於治療視網膜病況之治療性多肽之實例。
視網膜病況 治療性多肽之實例
斯特格氏病 ABCA4
萊伯氏先天性黑蒙症8 CRB1
萊伯氏先天性黑蒙症 NPHP5
視網膜色素變性37 NR2E3
視桿/視錐失養症 PDE6A/PDE6B
視桿/視錐失養症 PDE6c
視網膜色素變性11 PRPF31
萊伯氏先天性黑蒙症2 RPE65
X性聯視網膜色素變性 RPGR
X性聯視網膜裂損症 RS1
眼皮膚白化症1型 TYR
尤塞氏症候群 PCDH15
尤塞氏症候群 USH2a
尤塞氏症候群 USH2b
尤塞氏症候群,由MYO7A基因突變引起之亞型IB MYO7A
尤塞氏症候群,由USH1C基因突變引起之亞型IC USH1C
尤塞氏症候群,由CDH23基因突變引起之亞型ID CDH23
尤塞氏症候群,由PCDH15及/或CDH23基因突變引起之亞型ID-F PCDH15 和/或 CDH23
尤塞氏症候群,由PCDH15基因突變引起之亞型IF PCDH15
尤塞氏症候群,由SANS基因突變引起之亞型IG SANS
尤塞氏症候群,由USH1H基因突變引起之亞型IH USH1H
尤塞氏症候群,由CIB2基因突變引起之亞型IJ CIB2
尤塞氏症候群,由USH1K基因突變引起之亞型IK USH1K
尤塞氏症候群,由USH2A突變引起之亞型IIA USH2A
尤塞氏症候群,由ADGRV1基因突變引起之亞型IIC ADGRV1
尤塞氏症候群,由WHRN基因突變引起之亞型IID WHRN
尤塞氏症候群,由GPR98及/或PDZD7基因突變引起之亞型IIC(ADGRV1亦稱為GPR98) GPR98和/或  PDZD7
尤塞氏症候群,由CLRN1基因突變引起之亞型IIIA CLRN1
尤塞氏症候群,由HARS基因突變引起之亞型IIIB IIIB,由 HARS 基因突變引起
視網膜色素變性 一種或多種營養因子(trophic factors)
萊伯氏先天性黑蒙症 一種或多種營養因子(trophic factors)
全色盲 CNGA3、CNGB3、和/或PDE6H
任何致盲性疾病 光遺傳學工具:Chr、NhpR、ReachR 和/或其他
藍色視錐單色症 OPN1LW 和/或 OPN1MW
視錐失養症 GNAT2
視錐-視桿失養症 PDE6C 和/或 PROM1
[表3]可經表現以治療視網膜病況之多肽的實例、可經剔除以治療視網膜病況之多肽的實例、及/或可經剔除(knocked out)並用替代物(例如,野生型或非疾病版本)置換以治療視網膜病況之多肽的實例。
疾病 多肽 基因表現 基因剔除 基因編輯-置換
全色盲 CNGA3 X
全色盲 CNGB3 X
全色盲 PDE6H X
任何致盲性疾病 光遺傳學工具:Chr、NhpR、ReachR X
巴登氏病 CTSD X
結晶樣視網膜色素變性(Bietti crystalline dystrophy) CYP4V2 X X
藍色視錐單色症 OPN1LW X
藍色視錐單色症 OPN1MW X
無脈絡脈畸型 (Choroideremia) REP1 X
視錐失養症 PDE6c X
視錐失養症 GNAT2 X
視錐-視桿失養症 PDE6C X
視錐-視桿失養症 PROM1 X
視錐/視桿失養症 PRPH2 X X X
先天性靜止性夜盲症(CSNB) NYX X
先天性靜止性夜盲症(CSNB) GRM6 X
先天性靜止性夜盲症(CSNB) TRPM1 X
先天性靜止性夜盲症(CSNB) GPR179 X
先天性靜止性夜盲症(CSNB) LRIT3 X
青光眼 營養因子(trophic factors) X
青光眼 補體抑制因子(Complement inhibition factors) X
青光眼 細胞凋亡抑制因子(Apoptosis inhibition factors) X
青光眼 生存因子(Survival factors) X
青光眼 神經保護因子(Neuroprotective factors) X
萊伯氏先天性黑蒙症(LCA) NPHP5 X
萊伯氏先天性黑蒙症(LCA) GUCY2D X
萊伯氏先天性黑蒙症 RPE65 X
萊伯氏先天性黑蒙症8 CRB1 X X
萊伯氏遺傳性視神經病變(LHON) ND4 X
黃斑部失養症 CRX X X X
眼皮膚白化症1型 TYR X
視神經萎縮 CLN1-14 X
視網膜色素變性 EYS X X
視網膜色素變性 RHO X X X
視網膜色素變性 PRPF31 X
視網膜色素變性 PDE6A X
斑萎蛋白病 (Bestrophinopathy) BEST1 X X
視網膜色素變性 PRPF3 X
視網膜色素變性 PRPF8 X
視網膜色素變性 TOPORS X X X
視網膜色素變性37 NR2E3 X X X
視桿/視錐失養症 PDE6B X
視網膜色素變性(RP)、萊伯氏先天性黑蒙症(LCA)、其他 營養因子(trophic factors) X
斯特格氏病 ABCA4 X X
尤塞氏症候群 PCDH15 X
尤塞氏症候群 USH2A X X
尤塞氏症候群 MYO7A X X
X性聯視網膜色素變性(XLRP) RPGR X
X性聯視網膜裂損症(XLRS) RS1 X
濕性老年性黃斑部退化(age-related macular degeneration, AMD) 生存因子(Survival factors) X
乾性老年性黃斑部退化(age-related macular degeneration, AMD) 生存因子(Survival factors) X
糖尿病視網膜病變 (diabetic retinopathy) 生存因子(Survival factors) X
糖尿病黃斑部水腫 (diabetic macular edema) 生存因子(Survival factors) X
視網膜色素變性 生存因子(Survival factors) X
濕性AMD 細胞凋亡抑制因子(Apoptosis inhibition factors) X
乾性AMD 細胞凋亡抑制因子(Apoptosis inhibition factors) X
糖尿病視網膜病變 細胞凋亡抑制因子(Apoptosis inhibition factors) X
糖尿病黃斑部水腫 細胞凋亡抑制因子(Apoptosis inhibition factors) X
視網膜色素變性 細胞凋亡抑制因子(Apoptosis inhibition factors) X
濕性AMD 補體抑制因子(Complement inhibition factors) X
乾性AMD 補體抑制因子(Complement inhibition factors) X
糖尿病視網膜病變 補體抑制因子(Complement inhibition factors) X
糖尿病黃斑部水腫 補體抑制因子(Complement inhibition factors) X
濕性AMD 神經保護因子(Neuroprotective factors) X
乾性AMD 神經保護因子(Neuroprotective factors) X
糖尿病視網膜病變 神經保護因子(Neuroprotective factors) X
糖尿病黃斑部水腫 神經保護因子(Neuroprotective factors) X
視網膜色素變性 神經保護因子(Neuroprotective factors) X
濕性AMD 抗血管內皮生長多肽(Anti-VEGF polypeptides) X
糖尿病視網膜病變 抗血管內皮生長多肽(Anti-VEGF polypeptides) X
糖尿病黃斑部水腫 抗血管內皮生長多肽(Anti-VEGF polypeptides) X
濕性AMD 光遺傳學工具:Chr、NhpR和/或ReachR X
乾性AMD 光遺傳學工具:Chr、NhpR和/或ReachR X
糖尿病視網膜病變 光遺傳學工具:Chr、NhpR和/或ReachR X
糖尿病黃斑部水腫 光遺傳學工具:Chr、NhpR和/或ReachR X
視網膜色素變性 光遺傳學工具:Chr、NhpR和/或ReachR X
在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療視網膜病況,該AAV載體經設計以表現具有抑制血管生成能力之一或多個多肽。可如本文所述使用之具有抑制血管生成能力之多肽的實例包括但不限於單株抗血管內皮生長因子(anti vascular endothelial growth factor, anti-VEGF)抗體多肽、血管張力素多肽(angiostatin polypeptide)、siRNA多肽、及內皮抑素多肽(endostatin polypeptide)。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療濕性AMD,該AAV載體經設計以表現單株抗血管內皮生長因子抗體多肽、血管張力素多肽、siRNA、及/或內皮抑素多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病視網膜病變,該AAV載體經設計以表現單株抗血管內皮生長因子抗體多肽、血管張力素多肽、siRNA、及/或內皮抑素多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病黃斑部水腫,該AAV載體經設計以表現單株抗血管內皮生長因子抗體多肽、血管張力素多肽、siRNA、及/或內皮抑素多肽。
在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療視網膜病況,該AAV載體經設計以表現具有神經保護能力之一或多個多肽。可如本文所述使用之具有神經保護活性能力之多肽的實例包括但不限於GDNF多肽、CNTF多肽、IGF-1多肽、VEGF多肽、及BDNF多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療濕性老年性黃斑部退化(age-related macular degeneration, AMD),該AAV載體經設計以表現GDNF多肽、CNTF多肽、IGF-1多肽、VEGF多肽、及BDNF多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療乾性老年性黃斑部退化(age-related macular degeneration, AMD),該AAV載體經設計以表現GDNF多肽、CNTF多肽、IGF-1多肽、VEGF多肽、及BDNF多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病視網膜病變,該AAV載體經設計以表現GDNF多肽、CNTF多肽、IGF-1多肽、VEGF多肽、及BDNF多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病黃斑部水腫,該AAV載體經設計以表現GDNF多肽、CNTF多肽、IGF-1多肽、VEGF多肽、及BDNF多肽。
在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療視網膜病況,該AAV載體經設計以表現具有提供光遺傳學能力之一或多個多肽。具有提供可如本文所述使用之光遺傳學能力之多肽的實例包括但不限於ChR多肽、ChR2多肽、ArchT多肽、NpHR多肽、及ChrimsonR多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療濕性AMD,該AAV載體經設計以表現ChR多肽、ChR2多肽、ArchT多肽、NpHR多肽、及/或ChrimsonR多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療乾性AMD,該AAV載體經設計以表現ChR多肽、ChR2多肽、ArchT多肽、NpHR多肽、及/或ChrimsonR多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病視網膜病變,該AAV載體經設計以表現ChR多肽、ChR2多肽、ArchT多肽、NpHR多肽、及/或ChrimsonR多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病黃斑部水腫,該AAV載體經設計以表現ChR多肽、ChR2多肽、ArchT多肽、NpHR多肽、及/或ChrimsonR多肽。
在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療視網膜病況,該AAV載體經設計以表現具有抑制細胞凋亡能力之一或多個多肽。可如本文所述使用之具有抑制細胞凋亡能力之多肽的實例包括但不限於XIAP多肽、cIAP1多肽、C-IAP2多肽、Livin多肽、及存活素(Survivin)多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療濕性AMD,該AAV載體經設計以表現XIAP多肽、cIAP1多肽、C-IAP2多肽、Livin多肽、及/或存活素多肽(Survivin polypeptide)。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病視網膜病變,該AAV載體經設計以表現XIAP多肽、cIAP1多肽、C-IAP2多肽、Livin多肽、及/或存活素多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病黃斑部水腫,該AAV載體經設計以表現XIAP多肽、cIAP1多肽、C-IAP2多肽、Livin多肽、及/或存活素多肽。
在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療視網膜病況,該AAV載體經設計以表現具有抑制補體能力之一或多個多肽。可如本文所述使用之具有抑制補體能力之多肽的實例包括但不限於補體因子I多肽(Complement Factor I polypeptides)、補體因子H多肽(Complement factor H polypeptides)、及sCD59多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療濕性AMD,該AAV載體經設計以表現補體因子I多肽、補體因子H多肽、及/或sCD59多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療乾性AMD,該AAV載體經設計以表現補體因子I多肽、補體因子H多肽、及/或sCD59多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病視網膜病變,該AAV載體經設計以表現補體因子I多肽、補體因子H多肽、及/或sCD59多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病黃斑部水腫,該AAV載體經設計以表現補體因子I多肽、補體因子H多肽、及/或sCD59多肽。
在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療視網膜病況,該AAV載體經設計以表現具有誘導存活因子之能力的一或多個多肽。具有誘導可如本文所述使用之存活因子之能力的多肽的實例包括但不限於RdCVF多肽、RdCVFL多肽、HIF-1多肽、IAP家族多肽、及BCL-2家族多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療濕性AMD,該AAV載體經設計以表現RdCVF多肽、RdCVFL多肽、HIF-1多肽、IAP家族多肽、及/或BCL-2家族多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療乾性AMD,該AAV載體經設計以表現RdCVF多肽、RdCVFL多肽、HIF-1多肽、IAP家族多肽、及/或BCL-2家族多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病視網膜病變,該AAV載體經設計以表現RdCVF多肽、RdCVFL多肽、HIF-1多肽、IAP家族多肽、及/或BCL-2家族多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病黃斑部水腫,該AAV載體經設計以表現RdCVF多肽、RdCVFL多肽、HIF-1多肽、IAP家族多肽、及/或BCL-2家族多肽。
可使用任何適當方法將本文所提供之AAV載體或本文所提供之組成物(例如醫藥組成物)投予至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)。舉例而言,本文所提供之組成物(例如,含有一或多個本文所提供之AAV載體之醫藥組成物)可以下列方式投予至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物):玻璃體內、靜脈內(例如,經由靜脈注射或輸注)、皮下(例如,經由皮下注射)、腹膜內(例如,經由腹膜注射)、經口、經由吸入、肌內(例如,經由肌內注射)、視網膜下、玻璃體內、全身性、或脈絡膜上腔(suprachoroidally)。在一些情況下,組成物(例如,本文所提供之醫藥組成物)之投予途徑及/或模式可針對經治療之哺乳動物進行調整。
在一些情況下,用於治療視網膜病況之含有本文所提供之AAV載體的組成物(例如,本文所提供之醫藥組成物)的有效量可係降低視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度及/或減緩視網膜病況之進展而不會對哺乳動物產生顯著毒性的量。舉例而言,本文所提供之AAV載體的有效量可係約1x10 7個病毒基因體至約1x10 14個病毒基因體(例如,約1x10 7個病毒基因體至約1x10 13個病毒基因體、約1x10 7個病毒基因體至約1x10 12個病毒基因體、約1x10 7個病毒基因體至約1x10 11個病毒基因體、約1x10 7個病毒基因體至約1x10 10個病毒基因體、約1x10 8個病毒基因體至約1x10 14個病毒基因體、約1x10 9個病毒基因體至約1x10 14個病毒基因體、約1x10 10個病毒基因體至約1x10 14個病毒基因體、約1x10 8個病毒基因體至約1x10 12個病毒基因體、或約1x10 9個病毒基因體至約1x10 11個病毒基因體)。在一些情況下,本文所提供之AAV載體的有效量可係約1x10 10個病毒基因體/kg體重至約1x10 14個病毒基因體/kg體重(例如,約1x10 10個病毒基因體/kg體重至約1x10 13個病毒基因體/kg體重、約1x10 10個病毒基因體/kg體重至約1x10 12個病毒基因體/kg體重、約1x10 10個病毒基因體/kg體重至約1x10 11個病毒基因體/kg體重)。有效量可保持恆定或可根據哺乳動物對治療之反應而調整為滑動比例或可變劑量。各種因素會影響用於特定應用之實際有效量。舉例而言,根據視網膜病況之嚴重程度、投予途徑、哺乳動物之年齡及一般健康狀況、賦形劑之使用、與其他治療劑或預防性治療(諸如使用其他視網膜藥物)共同使用之可能性、及治療醫師之判斷,可能需要增加或減少本文所提供之組成物(例如,含有本文所提供之AAV載體之醫藥組成物)的實際有效投予量。
在一些情況下,投予含有本文所提供之AAV載體的組成物(例如,本文所提供之醫藥組成物)的有效頻率可係降低視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度及/或減緩視網膜病況之進展而不會對哺乳動物產生顯著毒性的頻率。各種因素會影響用於特定應用之實際有效頻率。舉例而言,根據視網膜病況之嚴重程度、投予途徑、哺乳動物之年齡及一般健康狀況、賦形劑之使用、與其他治療劑或預防性治療(諸如使用其他視網膜藥物)共同使用之可能性、及治療醫師之判斷,可能需要增加或減少本文所提供之組成物(例如,含有本文所提供之AAV載體之醫藥組成物)的實際有效投予頻率。
在一些情況下,投予含有本文所提供之AAV載體的組成物(例如,本文所提供之醫藥組成物)的有效持續時間可係降低視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度及/或減緩視網膜病況之進展而不會對哺乳動物產生顯著毒性的持續時間。舉例而言,投予本文所提供之醫藥組成物之有效持續時間可自單一時間點投予至數週至數個月(例如,4至12週)。在一些情況下,持續時間可持續到哺乳動物仍存活。多種因素會影響用於特定應用之實際有效持續時間。舉例而言,根據視網膜病況之嚴重程度、投予途徑、哺乳動物之年齡及一般健康狀況、賦形劑之使用、與其他治療劑或預防性治療(諸如使用其他視網膜藥物)共同使用之可能性、及治療醫師之判斷,可能需要增加或減少本文所提供之組成物(例如,含有本文所提供之AAV載體之醫藥組成物)的實際有效投予持續時間。
在一些情況下,可將治療視網膜病況之有效量的含有本文所提供之AAV載體的組成物(例如,本文所提供之醫藥組成物)投予至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)一次或兩次,以治療該哺乳動物。
本發明將進一步描述於以下實例中,但不限制申請專利範圍中所描述之本發明之範疇。
實例
實例1:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜眼窩視錐之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝(repack)」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集(enriched)」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:A1之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物介導在眼窩細胞中之表現(表1A)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據眼窩細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後介導眼窩視錐中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1A中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例2:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1A中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:A2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10 7至約1x10 14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例3:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝(repack)」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集(enriched)」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物介導在視網膜細胞中之表現(表1B)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後介導視網膜細胞中之轉基因表現(例如,高表現)的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1B中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例4:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1B中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:B2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10 7至約1x10 14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例5:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物介導跨二或多個視網膜區域之視網膜細胞中的表現。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據跨視網膜區域中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有向至少兩個不同視網膜區域之視網膜細胞遞送核酸並在其中表現核酸的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1C中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例6:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1C中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:C2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10 7至約1x10 14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例7:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染眼睛窩側區域之視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物介導在窩側區域之視網膜細胞中的表現(表1D)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜窩側區域中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後介導窩側區域之視網膜細胞中的轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1D中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例8:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1D中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:D2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10 7至約1x10 14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例11:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物介導以下表現:將核酸遞送至眼睛內多種不同類型的視網膜細胞並在其中表現核酸的能力,從而提供一種有效方式來將核酸遞送至許多不同的視網膜細胞類型(表1E)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據跨細胞類型中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後介導眼睛內之多種不同視網膜細胞類型中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1E中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例10:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1E中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:E2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10 7至約1x10 14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例11:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列,介導視網膜色素上皮細胞中之表現(表1F)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜色素上皮細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後介導視網膜色素上皮細胞中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1F中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例12:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1F中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:F2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10 7至約1x10 14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例13:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物優先介導在感光細胞中之表現(表1G)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後優先介導感光細胞中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1G中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例14:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1G中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:G2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10 7至約1x10 14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例15:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物優先介導在視網膜神經節細胞中之表現(表1H)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後優先介導視網膜神經節細胞中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1H中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例16:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1H中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:H2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10 7至約1x10 14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例17:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物優先介導在雙極細胞中之表現(表1I)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後優先介導雙極細胞中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1I中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例18:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1I中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:I2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10 7至約1x10 14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例19:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:J62至J64中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物優先介導在ON視網膜神經節細胞中之表現(表1J)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後優先介導ON視網膜神經節細胞中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1J中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例20:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1J中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:J2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10 7至約1x10 14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例21:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物優先介導在OFF視網膜神經節細胞中之表現(表1K)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後優先介導OFF視網膜神經節細胞中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1K中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例22:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1K中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:K2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10 7至約1x10 14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例23:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。
AAV殼體多肽之封裝性能係在原始庫及「重新封裝」庫中成功封裝之基礎上進行評估,反映了AAV載體之封裝能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物介導之有效封裝(表1L)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後介導有效封裝之能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1L中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例24:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1L中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:L2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10 7至約1x10 14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例25:額外實施例
實施例1A:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列。
實施例2A:如實施例1A之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3A:如實施例1A之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4A:如實施例1A之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5A:如實施例1A之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換。
實施例6A:如實施例1A至5A中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7A:如實施例1A至6A中任一者之載體,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於50%之眼窩視錐。
實施例8A:如實施例1A至7A中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9A:如實施例8A之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10A:如實施例9A之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11A:如實施例8A之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12A:如實施例11A之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13A:如實施例1A至12A中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在眼窩視錐中表現更多的核酸。
實施例14A:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列。
實施例15A:如實施例14A之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16A:如實施例14A之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17A:如實施例14A之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18A:如實施例14A之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換。
實施例19A:如實施例14A至18A中任一者之多肽,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染大於50%之眼窩視錐。
實施例20A:如實施例14A至19A中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在眼窩視錐中表現更多的核酸。
實施例21A:一種核酸分子,其編碼如實施例1A至13A中任一者之載體或實施例14A至20A中任一者之多肽。
實施例22A:如實施例21A之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23A:一種宿主細胞,其包含如實施例21A至22A中任一者之核酸分子。
實施例24A:如實施例23A之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25A:如實施例23A之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26A:一種宿主細胞,其包含如實施例1A至13A中任一者之載體或實施例14A至20A中任一者之多肽。
實施例27A:如實施例23A至26A中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28A:一種組成物,其包含如實施例1A至13A中任一者之載體。
實施例29A:如實施例28A之組成物,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例30A:如實施例28A至29A中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31A:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之眼窩視錐的方法,其中所述方法包含使所述眼窩視錐與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述眼窩視錐,從而將所述外源核酸序列遞送至所述眼窩視錐。
實施例32A:如實施例31A之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33A:如實施例31A之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34A:如實施例A31之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35A:如實施例31A之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換。
實施例36A:如實施例31A至35A中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37A:如實施例31A至36A中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38A:如實施例31A至37A中任一者之方法,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於50%之眼窩視錐。
實施例39A:如實施例31A至38A中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40A:如實施例39A之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41A:如實施例40A之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42A:如實施例39A之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43A:如實施例42A之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44A:如實施例31A至43A中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在眼窩視錐的表現水平相比,所述載體在所述眼窩視錐中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45A:如實施例31A至44A中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述眼窩視錐與所述載體接觸。
實施例46A:如實施例45A之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例47A:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的眼窩視錐與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述眼窩視錐並驅動所述外源核酸序列在所述眼窩視錐內之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48A:如實施例47A之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49A:如實施例47A至48A中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50A:如實施例47A至49A中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51A:如實施例47A至49A中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52A:如實施例47A至49A中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53A:如實施例47A至49A中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換。
實施例54A:如實施例47A至53A中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55A:如實施例47A至54A中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於50%之眼窩視錐。
實施例56A:如實施例47A至55A中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57A:如實施例56A之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58A:如實施例47A至55A中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59A:如實施例58A之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。
實施例60A:如實施例47A至59A中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在眼窩視錐的表現水平相比,所述載體在所述眼窩視錐中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61A:如實施例47A至60A中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述眼窩視錐與所述載體接觸。
實施例62A:如實施例61A之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例1B:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。
實施例2B:如實施例1B之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3B:如實施例1B之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4B:如實施例1B之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5B:如實施例1B之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6B:如實施例1B至5B中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7B:如實施例1B至6B中任一者之載體,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2.5%之視網膜細胞。
實施例8B:如實施例1B至7B中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9B:如實施例8B之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10B:如實施例9B之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11B:如實施例8B之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12B:如實施例11B之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13B:如實施例1B至12B中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在視網膜細胞中表現更多的核酸。
實施例14B:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。
實施例15B:如實施例14B之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16B:如實施例14B之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17B:如實施例14B之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18B:如實施例14B之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19B:如實施例14B至18B中任一者之多肽,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染大於2.5%之視網膜細胞。
實施例20B:如實施例14B至19B中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在視網膜細胞中表現更多的核酸。
實施例21B:一種核酸分子,其編碼如實施例1B至13B中任一者之載體或實施例14B至20B中任一者之多肽。
實施例22B:如實施例21B之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23B:一種宿主細胞,其包含如實施例21B至22B中任一者之核酸分子。
實施例24B:如實施例23B之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25B:如實施例23B之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26B:一種宿主細胞,其包含如實施例1B至13B中任一者之載體或實施例14B至20B中任一者之多肽。
實施例27B:如實施例23B至26B中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28B:一種組成物,其包含如實施例1B至13B中任一者之載體。
實施例29B:如實施例28B之組成物,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例30B:如實施例28B至29B中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31B:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜細胞的方法,其中所述方法包含使所述視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述視網膜細胞。
實施例32B:如實施例31B之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33B:如實施例31B之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34B:如實施例31B之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35B:如實施例31B之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36B:如實施例31B至35B中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37B:如實施例31B至35B中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38B:如實施例31B至37B中任一者之方法,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2.5%之視網膜細胞。
實施例39B:如實施例31B至38B中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40B:如實施例39B之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41B:如實施例40B之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42B:如實施例39B之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43B:如實施例42B之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44B:如實施例31B至43B中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45B:如實施例31B至44B中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例46B:如實施例45B之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例47B:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞並驅動所述外源核酸序列在所述視網膜細胞內之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48B:如實施例47B之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49B:如實施例47B至48B中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由LCA、OCA1、視網膜色素變性、視桿/視錐失養症、視錐失養症、斯特格氏病、尤塞氏症候群、XLRP、及XLRS所組成之群組。
實施例50B:如實施例47B至49B中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51B:如實施例47B至49B中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52B:如實施例47B至49B中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53B:如實施例47B至49B中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54B:如實施例47B至53B中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55B:如實施例47B至54B中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2.5%之視網膜細胞。
實施例56B:如實施例47B至55B中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57B:如實施例56B之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58B:如實施例47B至55B中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59B:如實施例58B之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。
實施例60B:如實施例47B至59B中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61B:如實施例47B至60B中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例62B:如實施例61B之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例1C:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。
實施例2C:如實施例1C之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3C:如實施例1C之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4C:如實施例1C之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5C:如實施例1C之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6C:如實施例1C至5C中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7C:如實施例1C至6C中任一者之載體,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。
實施例8C:如實施例1C至7C中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9C:如實施例8C之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10C:如實施例9C之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11C:如實施例8C之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12C:如實施例11C之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13C:如實施例1C至12C中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中所述至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
實施例14C:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。
實施例15C:如實施例14C之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16C:如實施例14C之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17C:如實施例14C之多肽,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18C:如實施例14C之多肽,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19C:如實施例14C至18C中任一者之多肽,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。
實施例20C:如實施例14C至19C中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中所述至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
實施例21C:一種核酸分子,其編碼如實施例1C至13C中任一者之載體或實施例14C至20C中任一者之多肽。
實施例22C:如實施例21C之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23C:一種宿主細胞,其包含如實施例21C至22C中任一者之核酸分子。
實施例24C:如實施例23C之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25C:如實施例23C之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26C:一種宿主細胞,其包含如實施例1C至13C中任一者之載體或實施例14C至20C中任一者之多肽。
實施例27C:如實施例23C至26C中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28C:一種組成物,其包含如實施例1C至13C中任一者之載體。
實施例29C:如實施例28C之組成物,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例30C:如實施例28C至29C中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31C:一種用於向哺乳動物眼睛之至少兩個不同視網膜區域內之視網膜細胞遞送外源核酸序列的方法,其中所述方法包含使所述視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述至少兩個不同視網膜區域內之視網膜細胞,從而向所述視網膜細胞遞送所述外源核酸序列,其中所述至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
實施例32C:如實施例31C之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33C:如實施例31C之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34C:如實施例31C之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35C:如實施例31C之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36C:如實施例31C至35C中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37C:如實施例31C至36C中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38C:如實施例31C至37C中任一者之方法,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述至少兩個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。
實施例39C:如實施例31C至38C中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40C:如實施例39C之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41C:如實施例40C之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42C:如實施例39C之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43C:如實施例42C之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44C:如實施例31C至43C中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜細胞的表現水平相比,所述載體在所述至少兩個視網膜區域之所述視網膜細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45C:如實施例31C至44C中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例46C:如實施例45C之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例47C:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物眼睛的至少兩個視網膜區域的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述至少兩個視網膜區域之所述視網膜細胞並驅動所述外源核酸序列在所述至少兩個視網膜區域之所述視網膜細胞內之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48C:如實施例47C之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49C:如實施例47C至48C中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由LCA、OCA1、視網膜色素變性、視桿/視錐失養症、視錐失養症、斯特格氏病、尤塞氏症候群、XLRP、及XLRS所組成之群組。
實施例50C:如實施例47C至49C中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51C:如實施例47C至49C中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52C:如實施例47C至49C中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53C:如實施例47C至49C中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54C:如實施例47C至53C中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55C:如實施例47C至54C中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述至少兩個視網膜區域中大於2%之視網膜細胞。
實施例56C:如實施例47C至55C中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57C:如實施例56C之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58C:如實施例47C至55C中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59C:如實施例58C之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。
實施例60C:如實施例47C至59C中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在所述至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中的表現水平相比,所述載體在所述至少兩個視網膜區域之所述視網膜細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61C:如實施例47C至60C中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述至少兩個視網膜區域的所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例62C:如實施例61C之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例63C:如實施例C47至C62中任一者之方法,其中所述至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
實施例1D:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。
實施例2D:如實施例1D之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3D:如實施例1D之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4D:如實施例1D之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5D:如實施例1D之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6D:如實施例1D至5D中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7D:如實施例1D至6D中任一者之載體,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之眼睛窩側區域的視網膜細胞。
實施例8D:如實施例1D至7D中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9D:如實施例8D之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10D:如實施例9D之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11D:如實施例8D之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12D:如實施例11D之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13D:如實施例1D至12D中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在眼睛窩側區域之視網膜細胞中表現更多的核酸。
實施例14D:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。
實施例15D:如實施例14D之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16D:如實施例14D之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17D:如實施例14D之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18D:如實施例14D之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19D:如實施例14D至18D中任一者之多肽,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染大於2%之眼睛窩側區域的視網膜細胞。
實施例20D:如實施例14D至19D中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在眼睛窩側區域的視網膜細胞中表現更多的核酸。
實施例21D:一種核酸分子,其編碼如實施例1D至13D中任一者之載體或實施例14D至20D中任一者之多肽。
實施例22D:如實施例21D之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23D:一種宿主細胞,其包含如實施例21D至22D中任一者之核酸分子。
實施例24D:如實施例23D之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25D:如實施例23D之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26D:一種宿主細胞,其包含如實施例1D至13D中任一者之載體或實施例14D至20D中任一者之多肽。
實施例27D:如實施例23D至26D中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28D:一種組成物,其包含如實施例1D至13D中任一者之載體。
實施例29D:如實施例28D之組成物,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例30D:如實施例28D至29D中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31D:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物眼睛窩側區域之視網膜細胞的方法,其中所述方法包含使所述視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述視網膜細胞。
實施例32D:如實施例31D之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33D:如實施例31D之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34D:如實施例31D之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35D:如實施例31D之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36D:如實施例31D至35D中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37D:如實施例31D至36D中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38D:如實施例31D至37D中任一者之方法,其中當玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之所述窩側區域的大於2%的視網膜細胞。
實施例39D:如實施例31D至38D中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40D:如實施例39D之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41D:如實施例40D之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42D:如實施例39D之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43D:如實施例42D之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44D:如實施例31D至43D中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在眼睛窩側區域的視網膜細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45D:如實施例31D至44D中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述窩側區域的所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例46D:如實施例45D之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例47D:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物眼睛窩側區域的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞並驅動所述外源核酸序列在所述視網膜細胞內之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48D:如實施例47D之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49D:如實施例47D至48D中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50D:如實施例47D至49D中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51D:如實施例47D至49D中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52D:如實施例47D至49D中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53D:如實施例47D至49D中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54D:如實施例47D至53D中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55D:如實施例47D至54D中任一者之方法,其中當玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之所述窩側區域的視網膜細胞。
實施例56D:如實施例47D至55D中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57D:如實施例56D之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58D:如實施例47D至55D中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59D:如實施例58D之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。
實施例60D:如實施例47D至59D中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在窩側區域的視網膜細胞中的表現水平相比,所述載體在所述窩側區域之所述視網膜細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61D:如實施例47D至60D中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述窩側區域的所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例62D:如實施例61D之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例1E:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。
實施例2E:如實施例1E之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3E:如實施例1E之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4E:如實施例1E之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5E:如實施例1E之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6E:如實施例1E至5E中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7E:如實施例1E至6E中任一者之載體,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中所述至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
實施例8E:如實施例1E至7E中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9E:如實施例8E之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10E:如實施例9E之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11E:如實施例8E之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12E:如實施例11E之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13E:如實施例1E至12E中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中所述至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
實施例14E:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。
實施例15E:如實施例14E之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16E:如實施例14E之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17E:如實施例14E之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18E:如實施例14E之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19E:如實施例14E至18E中任一者之多肽,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中所述至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
實施例20E:如實施例14E至19E中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中所述至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
實施例21E:一種核酸分子,其編碼如實施例1E至13E中任一者之載體或實施例14E至20E中任一者之多肽。
實施例22E:如實施例21E之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23E:一種宿主細胞,其包含如實施例21E至22E中任一者之核酸分子。
實施例24E:如實施例23E之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25E:如實施例23E之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26E:一種宿主細胞,其包含如實施例1E至13E中任一者之載體或實施例14E至20E中任一者之多肽。
實施例27E:如實施例23E至26E中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28E:一種組成物,其包含如實施例1E至13E中任一者之載體。
實施例29E:如實施例28E之組成物,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例30E:如實施例28E至29E中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic E68。
實施例31E:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物眼睛之至少三種不同視網膜細胞類型的方法,其中所述方法包含使所述至少三種不同視網膜細胞類型與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述至少三種不同視網膜細胞類型,從而向所述至少三種不同視網膜細胞類型遞送所述外源核酸序列,其中所述至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
實施例32E:如實施例31E之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33E:如實施例31E之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34E:如實施例31E之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35E:如實施例31E之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36E:如實施例31E至35E中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37E:如實施例31E至36E中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38E:如實施例31E至37E中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛內大於2%的所述至少三種不同視網膜細胞類型。
實施例39E:如實施例31E至38E中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40E:如實施例39E之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41E:如實施例40E之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42E:如實施例39E之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43E:如實施例42E之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44E:如實施例31E至43E中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在所述至少三種不同視網膜細胞類型中的表現水平相比,所述載體在所述至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45E:如實施例31E至44E中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述至少三種不同視網膜細胞類型與所述載體接觸。
實施例46E:如實施例45E之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例47E:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物眼睛的至少三種不同視網膜細胞類型與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述至少三種不同視網膜細胞類型並驅動所述至少三種不同視網膜細胞類型內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48E:如實施例47E之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49E:如實施例47E至48E中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50E:如實施例47E至49E中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51E:如實施例47E至49E中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52E:如實施例47E至49E中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53E:如實施例47E至49E中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54E:如實施例47E至53E中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55E:如實施例47E至53E中任一者之方法,其中當玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛內大於2%的所述至少三種不同視網膜細胞類型。
實施例56E:如實施例47E至55E中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57E:如實施例56E之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58E:如實施例47E至55E中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59E:如實施例42E之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60E:如實施例47E至59E中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在所述至少三種不同視網膜細胞類型中的表現水平相比,所述載體在所述至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61E:如實施例47E至60E中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述至少三種不同視網膜細胞類型與所述載體接觸。
實施例62E:如實施例61E之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例63E:如實施例44E至62E中任一者之方法,其中所述至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
實施例1F:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。
實施例2F:如實施例1F之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3F:如實施例1F之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4F:如實施例1F之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例5F:如實施例1F之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6F:如實施例1F至5F中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7F:如實施例1F至6F中任一者之載體,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。
實施例8F:如實施例1F至7F中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9F:如實施例8F之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10F:如實施例9F之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11F:如實施例8F之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12F:如實施例11F之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13F:如實施例1F至12F中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。
實施例14F:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。
實施例15F:如實施例14F之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16F:如實施例14F之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17F:如實施例14F之多肽,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例18F:如實施例14F之多肽,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19F:如實施例14F至18F中任一者之多肽,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。
實施例20F:如實施例14F至19F中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。
實施例21F:一種核酸分子,其編碼如實施例1F至13F中任一者之載體或實施例14F至20F中任一者之多肽。
實施例22F:如實施例21F之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23F:一種宿主細胞,其包含如實施例21F至22F中任一者之核酸分子。
實施例24F:如實施例23F之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25F:如實施例23F之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26F:一種宿主細胞,其包含如實施例1F至13F中任一者之載體或實施例14F至20F中任一者之多肽。
實施例27F:如實施例23F至26F中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28F:一種組成物,其包含如實施例1F至13F中任一者之載體。
實施例29F:如實施例28F之組成物,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例30F:如實施例28F至29F中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31F:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物眼睛之視網膜色素上皮細胞的方法,其中所述方法包含使所述視網膜色素上皮細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染視網膜色素上皮細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述視網膜色素上皮細胞。
實施例32F:如實施例31F之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33F:如實施例31F之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34F:如實施例31F之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例35F:如實施例31F之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36F:如實施例31F至35F中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37F:如實施例31F至36F中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38F:如實施例31F至37F中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%之視網膜色素上皮細胞。
實施例39F:如實施例31F至38F中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40F:如實施例39F之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41F:如實施例40F之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42F:如實施例39F之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43F:如實施例42F之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44F:如實施例31F至43F中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜色素上皮細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜色素上皮細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45F:如實施例31F至44F中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜色素上皮細胞與所述載體接觸。
實施例46F:如實施例45F之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例47F:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物眼睛的視網膜色素上皮細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜色素上皮細胞並驅動所述視網膜色素上皮細胞內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48F:如實施例47F之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49F:如實施例47F至48F中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50F:如實施例47F至49F中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51F:如實施例47F至49F中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52F:如實施例47F至49F中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例53F:如實施例47F至49F中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54F:如實施例47F至53F中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55F:如實施例47F至54F中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。
實施例56F:如實施例47F至55F中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57F:如實施例56F之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58F:如實施例47F至55F中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59F:如實施例58F之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60F:如實施例47F至59F中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜色素上皮細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜色素上皮細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61F:如實施例47F至60F中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜色素上皮細胞與所述載體接觸。
實施例62F:如實施例61F之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例1G:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。
實施例2G:如實施例1G之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3G:如實施例1G之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4G:如實施例1G之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5G:如實施例1G之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6G:如實施例1G至5G中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7G:如實施例1G至6G中任一者之載體,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的感光細胞。
實施例8G:如實施例1G至7G中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9G:如實施例8G之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10G:如實施例9G之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11G:如實施例8G之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12G:如實施例11G之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13G:如實施例1G至12G中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在感光細胞中表現更多的核酸。
實施例14G:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。
實施例15G:如實施例14G之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16G:如實施例14G之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17G:如實施例14G之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18G:如實施例14G之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19G:如實施例14G至18G中任一者之多肽,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染所述眼睛之大於2%的感光細胞。
實施例20G:如實施例14G至19G中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在感光細胞中表現更多的核酸。
實施例21G:一種核酸分子,其編碼如實施例1G至13G中任一者之載體或實施例14G至20G中任一者之多肽。
實施例22G:如實施例21G之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23G:一種宿主細胞,其包含如實施例21G至22G中任一者之核酸分子。
實施例24G:如實施例23G之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25G:如實施例23G之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26G:一種宿主細胞,其包含如實施例1G至13G中任一者之載體或實施例14G至20G中任一者之多肽。
實施例27G:如實施例23G至26G中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28G:一種組成物,其包含如實施例1G至13G中任一者之載體。
實施例29G:如實施例28G之組成物,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例30G:如實施例28G至29G中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31G:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之感光細胞的方法,其中所述方法包含使所述感光細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述感光細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述感光細胞。
實施例32G:如實施例31G之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33G:如實施例31G之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34G:如實施例31G之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35G:如實施例31G之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36G:如實施例31G至35G中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37G:如實施例31G至36G中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38G:如實施例31G至37G中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的感光細胞。
實施例39G:如實施例31G至38G中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40G:如實施例39G之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41G:如實施例40G之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42G:如實施例39G之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43G:如實施例42G之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44G:如實施例31G至43G中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在感光細胞的表現水平相比,所述載體在所述感光細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45G:如實施例31G至44G中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述感光細胞與所述載體接觸。
實施例46G:如實施例45G之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例47G:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的感光細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述感光細胞並驅動所述感光細胞內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48G:如實施例47G之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49G:如實施例47G至48G中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50G:如實施例47G至49G中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51G:如實施例47G至49G中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52G:如實施例47G至49G中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53G:如實施例47G至49G中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54G:如實施例47G至53GF中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55G:如實施例47G至54G中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之感光細胞。
實施例56G:如實施例47G至55G中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57G:如實施例56G之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58G:如實施例47G至55G中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59G:如實施例58G之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60G:如實施例47G至59G中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在感光細胞中的表現水平相比,所述載體在所述感光細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61G:如實施例47G至60G中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述感光細胞與所述載體接觸。
實施例62G:如實施例61G之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例1H:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。
實施例2H:如實施例1H之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3H:如實施例1H之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4H:如實施例1H之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5H:如實施例1H之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6H:如實施例1H至5H中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7H:如實施例1H至6H中任一者之載體,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的視網膜神經節細胞。
實施例8H:如實施例1H至7H中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9H:如實施例8H之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10H:如實施例9H之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11H:如實施例8H之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12H:如實施例11H之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13H:如實施例1H至12H中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
實施例14H:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。
實施例15H:如實施例14H之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16H:如實施例14H之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17H:如實施例14H之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18H:如實施例14H之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19H:如實施例14H至18H中任一者之多肽,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染所述眼睛之大於2%的視網膜神經節細胞。
實施例20H:如實施例14H至19H中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
實施例21H:一種核酸分子,其編碼如實施例1H至13H中任一者之載體或實施例14H至20H中任一者之多肽。
實施例22H:如實施例21H之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23H:一種宿主細胞,其包含如實施例21H至22H中任一者之核酸分子。
實施例24H:如實施例23H之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25H:如實施例23H之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26H:一種宿主細胞,其包含如實施例1H至13H中任一者之載體或實施例14H至20H中任一者之多肽。
實施例27H:如實施例23H至26H中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28H:一種組成物,其包含如實施例1H至13H中任一者之載體。
實施例29H:如實施例28H之組成物,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例30H:如實施例28H至29H中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31H:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜神經節細胞的方法,其中所述方法包含使所述視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述感光細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述感光細胞。
實施例32H:如實施例31H之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33H:如實施例31H之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34H:如實施例31H之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35H:如實施例31H之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36H:如實施例31H至35H中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37H:如實施例31H至36H中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38H:如實施例31H至37H中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的視網膜神經節細胞。
實施例39H:如實施例31H至38H中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40H:如實施例39H之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41H:如實施例40H之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42H:如實施例39H之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43H:如實施例42H之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44H:如實施例31H至43H中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜神經節細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜神經節細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45H:如實施例31H至44H中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜神經節細胞與所述載體接觸。
實施例46H:如實施例45H之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例47H:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜神經節細胞並驅動所述視網膜神經節細胞內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48H:如實施例47H之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49H:如實施例47H至48H中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50H:如實施例47H至49H中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51H:如實施例47H至49H中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52H:如實施例47H至49H中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53H:如實施例47H至49H中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54H:如實施例47H至53H中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55H:如實施例47H至54H中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之視網膜神經節細胞。
實施例56H:如實施例47H至55H中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57H:如實施例56H之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58H:如實施例47H至55H中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59H:如實施例58H之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60H:如實施例47H至59H中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜神經節細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜神經節細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61H:如實施例47H至60H中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜神經節細胞與所述載體接觸。
實施例62H:如實施例61H之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例1I:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。
實施例2I:如實施例1I之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3I:如實施例1I之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4I:如實施例1I之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5I:如實施例1I之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6I:如實施例1I至5I中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7I:如實施例1I至6I中任一者之載體,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之視網膜之大於2%的雙極細胞。
實施例8I:如實施例1I至7I中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9I:如實施例8I之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10I:如實施例9I之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11I:如實施例8I之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12I:如實施例11I之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13I:如實施例1I至12I中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在視網膜之雙極細胞中表現更多的核酸。
實施例14I:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。
實施例15I:如實施例14I之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16I:如實施例14I之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17I:如實施例14I之多肽,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18I:如實施例14I之多肽,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19I:如實施例14I至18I中任一者之多肽,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染所述眼睛之視網膜之大於2%的雙極細胞。
實施例20I:如實施例14I至19I中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在視網膜的雙極細胞中表現更多的核酸。
實施例21I:一種核酸分子,其編碼如實施例1I至13I中任一者之載體或實施例14I至20I中任一者之多肽。
實施例22I:如實施例21I之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23I:一種宿主細胞,其包含如實施例21I至22I中任一者之核酸分子。
實施例24I:如實施例23I之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25I:如實施例23I之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26I:一種宿主細胞,其包含如實施例1I至13I中任一者之載體或實施例14I至20I中任一者之多肽。
實施例27I:如實施例23I至26I中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28I:一種組成物,其包含如實施例1I至13I中任一者之載體。
實施例29I:如實施例28I之組成物,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例30I:如實施例28I至29I中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31I:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內視網膜之雙極細胞的方法,其中所述方法包含使所述雙極細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述雙極細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述雙極細胞。
實施例32I:如實施例31I之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33I:如實施例31I之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34I:如實施例31I之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35I:如實施例31I之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36I:如實施例31I至35I中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37I:如實施例31I至36I中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38I:如實施例31I至37I中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之視網膜之大於2%的雙極細胞。
實施例39I:如實施例31I至38I中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40I:如實施例39I之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41I:如實施例40I之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42I:如實施例39I之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43I:如實施例42I之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44I:如實施例31I至43I中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜的雙極細胞中的表現水平相比,所述載體在所述雙極細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45I:如實施例31I至44I中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述雙極細胞與所述載體接觸。
實施例46I:如實施例45I之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例47I:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物視網膜的雙極細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述雙極細胞並驅動所述雙極細胞內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48I:如實施例47I之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49I:如實施例47I至48I中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50I:如實施例47I至49I中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51I:如實施例47I至49I中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52I:如實施例47I至49I中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53I:如實施例47I至49I中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54I:如實施例47I至53I中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55I:如實施例47I至54I中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之視網膜的雙極細胞。
實施例56I:如實施例47I至55I中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57I:如實施例56I之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58I:如實施例47I至55I中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59I:如實施例58I之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60I:如實施例47I至59I中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜的雙極細胞中的表現水平相比,所述載體在所述雙極細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61I:如實施例47I至60I中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述雙極細胞與所述載體接觸。
實施例62I:如實施例61I之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例1J:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。
實施例2J:如實施例1J之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3J:如實施例1J之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4J:如實施例1J之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5J:如實施例1J之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J62至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6J:如實施例1J至5J中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7J:如實施例1J至6J中任一者之載體,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的ON視網膜神經節細胞。
實施例8J:如實施例1J至7J中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9J:如實施例8J之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10J:如實施例9J之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11J:如實施例8J之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12J:如實施例11J之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13J:如實施例1J至12J中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
實施例14J:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。
實施例15J:如實施例14J之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16J:如實施例14J之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17J:如實施例14J之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18J:如實施例14J之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J62至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19J:如實施例14J至18J中任一者之多肽,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染所述眼睛之大於2%的ON視網膜神經節細胞。
實施例20J:如實施例14J至19J中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
實施例21J:一種核酸分子,其編碼如實施例1J至13J中任一者之載體或實施例14J至20J中任一者之多肽。
實施例22J:如實施例21J之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23J:一種宿主細胞,其包含如實施例21J至22J中任一者之核酸分子。
實施例24J:如實施例23J之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25J:如實施例23J之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26J:一種宿主細胞,其包含如實施例1J至13J中任一者之載體或實施例14J至20J中任一者之多肽。
實施例27J:如實施例23J至26J中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28J:一種組成物,其包含如實施例1J至13J中任一者之載體。
實施例29J:如實施例28J之組成物,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例30J:如實施例28J至29J中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31J:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之ON視網膜神經節細胞的方法,其中所述方法包含使所述ON視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:2J至64J中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述ON視網膜神經節細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述ON視網膜神經節細胞。
實施例32J:如實施例31J之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33J:如實施例31J之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34J:如實施例31J之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35J:如實施例J31之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J62至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36J:如實施例31J至35J中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37J:如實施例31J至36J中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38J:如實施例31J至37J中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的ON視網膜神經節細胞。
實施例39J:如實施例31J至38J中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40J:如實施例39J之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41J:如實施例40J之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42J:如實施例39J之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43J:如實施例42J之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44J:如實施例31J至43J中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在ON視網膜神經節細胞的表現水平相比,所述載體在所述ON視網膜神經節細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45J:如實施例31J至44J中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述ON視網膜神經節細胞與所述載體接觸。
實施例46J:如實施例45J之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例47J:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的ON視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述ON視網膜神經節細胞並驅動所述ON視網膜神經節細胞內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48J:如實施例47J之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49J:如實施例47J至48J中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50J:如實施例47J至49J中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51J:如實施例47J至49J中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52J:如實施例47J至49J中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53J:如實施例47J至49J中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J62至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54J:如實施例47J至53J中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55J:如實施例47J至54J中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之ON視網膜神經節細胞。
實施例56J:如實施例47J至55J中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57J:如實施例56J之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58J:如實施例47J至55J中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59J:如實施例58J之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60J:如實施例47J至59J中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在ON視網膜神經節細胞的表現水平相比,所述載體在所述ON視網膜神經節細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61J:如實施例47J至60J中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述ON視網膜神經節細胞與所述載體接觸。
實施例62J:如實施例61J之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例1K:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。
實施例2K:如實施例1K之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3K:如實施例1K之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4K:如實施例1K之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5K:如實施例1K之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6K:如實施例1K至5K中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7K:如實施例1K至6K中任一者之載體,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的OFF視網膜神經節細胞。
實施例8K:如實施例1K至7K中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9K:如實施例8K之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10K:如實施例9K之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11K:如實施例8K之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12K:如實施例11K之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13K:如實施例1K至12K中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
實施例14K:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。
實施例15K:如實施例14K之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16K:如實施例14K之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17K:如實施例14K之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18K:如實施例14K之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19K:如實施例14K至18K中任一者之多肽,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染所述眼睛之大於2%的OFF視網膜神經節細胞。
實施例20K:如實施例14K至19K中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
實施例21K:一種核酸分子,其編碼如實施例1K至13K中任一者之載體或實施例14K至20K中任一者之多肽。
實施例22K:如實施例21K之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23K:一種宿主細胞,其包含如實施例21K至22K中任一者之核酸分子。
實施例24K:如實施例23K之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25K:如實施例23K之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26K:一種宿主細胞,其包含如實施例1K至13K中任一者之載體或實施例14K至20K中任一者之多肽。
實施例27K:如實施例23K至26K中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28K:一種組成物,其包含如實施例1K至13K中任一者之載體。
實施例29K:如實施例28K之組成物,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例30K:如實施例28K至29K中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31K:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之OFF視網膜神經節細胞的方法,其中所述方法包含使所述OFF視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述OFF視網膜神經節細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述OFF視網膜神經節細胞。
實施例32K:如實施例31K之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33K:如實施例31K之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34K:如實施例31K之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35K:如實施例31K之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36K:如實施例31K至35K中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37K:如實施例31K至36K中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38K:如實施例31K至37K中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的OFF視網膜神經節細胞。
實施例39K:如實施例31K至38K中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40K:如實施例39K之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41K:如實施例40K之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42K:如實施例39K之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43K:如實施例42K之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44K:如實施例31K至43K中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在OFF視網膜神經節細胞中的表現水平相比,所述載體在所述OFF視網膜神經節細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45K:如實施例31K至44K中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述OFF視網膜神經節細胞與所述載體接觸。
實施例46K:如實施例45K之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例47K:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的OFF視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述OFF視網膜神經節細胞並驅動所述OFF視網膜神經節細胞內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48K:如實施例47K之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49K:如實施例47K至48K中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50K:如實施例47K至49K中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51K:如實施例47K至49K中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52K:如實施例47K至49K中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53K:如實施例47K至49K中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54K:如實施例47K至53K中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55K:如實施例47K至54K中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10 7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之OFF視網膜神經節細胞。
實施例56K:如實施例47K至55K中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57K:如實施例56K之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58K:如實施例47K至55K中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59K:如實施例58K之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60K:如實施例47K至59K中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在OFF視網膜神經節細胞中的表現水平相比,所述載體在所述OFF視網膜神經節細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61K:如實施例47K至60K中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述OFF視網膜神經節細胞與所述載體接觸。
實施例62K:如實施例61K之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例1L:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。
實施例2L:如實施例1L之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3L:如實施例1L之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4L:如實施例1L之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5L:如實施例1L之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6L:如實施例1L至5L中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7L:如實施例1L至6L中任一者之載體,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。
實施例8L:如實施例1L至7L中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9L:如實施例8L之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10L:如實施例9L之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11L:如實施例8L之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12L:如實施例11L之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13L:如實施例1L至12L中任一者之載體,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。
實施例14L:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。
實施例15L:如實施例14L之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16L:如實施例14L之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17L:如實施例14L之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18L:如實施例14L之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19L:如實施例14L至18L中任一者之多肽,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。
實施例20L:如實施例14L至19L中任一者之多肽,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。
實施例21L:一種核酸分子,其編碼如實施例1L至13L中任一者之載體或實施例14L至20L中任一者之多肽。
實施例22L:如實施例21L之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23L:一種宿主細胞,其包含如實施例21L至22L中任一者之核酸分子。
實施例24L:如實施例23L之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25L:如實施例23L之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26L:一種宿主細胞,其包含如實施例1L至13L中任一者之載體或實施例14L至20L中任一者之多肽。
實施例27L:如實施例23L至26L中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28L:一種組成物,其包含如實施例1L至13L中任一者之載體。
實施例29L:如實施例28L之組成物,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例30L:如實施例28L至29L中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31L:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之細胞的方法,其中所述方法包含使所述細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述細胞。
實施例32L:如實施例31L之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33L:如實施例31L之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34L:如實施例31L之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35L:如實施例31L之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36L:如實施例31L至35L中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37L:如實施例31L至36L中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38L:如實施例31L至37L中任一者之方法,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。
實施例39L:如實施例31L至38L中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40L:如實施例39L之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41L:如實施例40L之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42L:如實施例39L之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43L:如實施例42L之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44L:如實施例31L至43L中任一者之方法,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。
實施例45L:如實施例31L至44L中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述細胞與所述載體接觸。
實施例46L:如實施例45L之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例47L:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞並驅動所述外源核酸序列在所述視網膜細胞內之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48L:如實施例47L之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49L:如實施例47L至48L中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50L:如實施例47L至49L中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51L:如實施例47L至49L中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52L:如實施例47L至49L中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53L:如實施例47L至49L中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L19至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54L:如實施例47L至53L中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55L:如實施例47L至54L中任一者之方法,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。
實施例56L:如實施例47L至55L中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57L:如實施例56L之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58L:如實施例47L至55L中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59L:如實施例58L之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60L:如實施例47L至59L中任一者之方法,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。
實施例61L:如實施例47L至60L中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例62L:如實施例61L之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例1M:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含下列中任一者之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例2M:如實施例1M之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例3M:如實施例1M之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A18、SEQ ID NO:B2至B298、SEQ ID NO:C2至C43、SEQ ID NO:D2至D76、SEQ ID NO:E2至E75、SEQ ID NO:F2至F11、SEQ ID NO:G2至G70、SEQ ID NO:H2至H243、SEQ ID NO:I2至I67、SEQ ID NO:J2至J61、SEQ ID NO:K2至K60、及SEQ ID NO:L2至L19。
實施例4M:如實施例1M之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例5M:如實施例1M之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者所闡述之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A19、SEQ ID NO:B299至B317、SEQ ID NO:C44至C45、SEQ ID NO:D77至D78、SEQ ID NO:E76至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G71至G77、SEQ ID NO:H244至H258、SEQ ID NO:I68至I75、SEQ ID NO:J62至J64、SEQ ID NO:K61至K63、及SEQ ID NO:L20至L27。
實施例6M:如實施例1M至5M中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7M:如實施例1M至6M中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例8N:如實施例7N之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例9M:如實施例8M之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例10M:如實施例7M之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例11M:如實施例10M之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例12M:一種AAV殼體多肽,其包含下列中任一者所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例13M:如實施例12M之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例14M:如實施例12M之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A18、SEQ ID NO:B2至B298、SEQ ID NO:C2至C43、SEQ ID NO:D2至D76、SEQ ID NO:E2至E75、SEQ ID NO:F2至F11、SEQ ID NO:G2至G70、SEQ ID NO:H2至H243、SEQ ID NO:I2至I67、SEQ ID NO:J2至J61、SEQ ID NO:K2至K60、及SEQ ID NO:L2至L19。
實施例15M:如實施例12M之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例16M:如實施例12M之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者所闡述之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A19、SEQ ID NO:B299至B317、SEQ ID NO:C44至C45、SEQ ID NO:D77至D78、SEQ ID NO:E76至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G71至G77、SEQ ID NO:H244至H258、SEQ ID NO:I68至I75、SEQ ID NO:J62至J64、SEQ ID NO:K61至K63、及SEQ ID NO:L20至L27。
實施例17M:一種核酸分子,其編碼如實施例1M至11M中任一者之載體或實施例12M至16M中任一者之多肽。
實施例18M:如實施例17M之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例19M:一種宿主細胞,其包含如實施例17M至18M中任一者之核酸分子。
實施例20M:如實施例19M之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例21M:如實施例20M之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例22M:一種宿主細胞,其包含如實施例1M至11M中任一者之載體或實施例12M至16M中任一者之多肽。
實施例23M:如實施例19M至22M中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例24M:一種組成物,其包含如實施例1M至11M中任一者之載體。
實施例25M:如實施例24M之組成物,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例26M:如實施例24M至25M中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例27M:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜細胞的方法,其中所述方法包含使所述視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含下列中任一者之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述視網膜細胞。
實施例28M:如實施例27M之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之所述胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例29M:如實施例27M之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之所述胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A18、SEQ ID NO:B2至B298、SEQ ID NO:C2至C43、SEQ ID NO:D2至D76、SEQ ID NO:E2至E75、SEQ ID NO:F2至F11、SEQ ID NO:G2至G70、SEQ ID NO:H2至H243、SEQ ID NO:I2至I67、SEQ ID NO:J2至J61、SEQ ID NO:K2至K60、及SEQ ID NO:L2至L19。
實施例30M:如實施例27M之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例31M:如實施例27M之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者所闡述之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A19、SEQ ID NO:B299至B317、SEQ ID NO:C44至C45、SEQ ID NO:D77至D78、SEQ ID NO:E76至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G71至G77、SEQ ID NO:H244至H258、SEQ ID NO:I68至I75、SEQ ID NO:J62至J64、SEQ ID NO:K61至K63、及SEQ ID NO:L20至L27。
實施例32M:如實施例27M至31M中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例33M:如實施例27M至32M中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例34M:如實施例27M至33M中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例35M:如實施例34M之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例36M:如實施例35M之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例37M:如實施例34M之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例38M:如實施例37M之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例39M:如實施例27M至38M中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例40M:如實施例39M之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
實施例41M:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含下列中任一者之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞並驅動所述外源核酸序列在所述視網膜細胞內之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例42M:如實施例41M之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例43M:如實施例41M至42M中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例44M:如實施例41M至43M中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之所述胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例45M:如實施例41M至43M中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之所述胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A18、SEQ ID NO:B2至B298、SEQ ID NO:C2至C43、SEQ ID NO:D2至D76、SEQ ID NO:E2至E75、SEQ ID NO:F2至F11、SEQ ID NO:G2至G70、SEQ ID NO:H2至H243、SEQ ID NO:I2至I67、SEQ ID NO:J2至J61、SEQ ID NO:K2至K60、及SEQ ID NO:L2至L19。
實施例46M:如實施例41M至43M中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例47M:如實施例41M至43M中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者所闡述之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A19、SEQ ID NO:B299至B317、SEQ ID NO:C44至C45、SEQ ID NO:D77至D78、SEQ ID NO:E76至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G71至G77、SEQ ID NO:H244至H258、SEQ ID NO:I68至I75、SEQ ID NO:J62至J64、SEQ ID NO:K61至K63、及SEQ ID NO:L20至L27。
實施例48M:如實施例41M至47M中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例49M:如實施例41M至48M中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例50M:如實施例49M之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例51M:如實施例41M至50M中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例52M:如實施例51M之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。
實施例53M:如實施例41M至52M中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例54M:如實施例53M之方法,其中所述組成物包含約1x10 7至約1x10 14個所述載體。
其他實施例
應理解,雖然本發明已結合其詳細描述來描述,但前述描述意欲說明而不限制本發明之範疇,本發明之範疇由隨附申請專利範圍之範疇定義。其他態樣、優點及修改在以下申請專利範圍之範疇內。
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Claims (90)

  1. 一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列。
  2. 如請求項1所述之載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
  3. 如請求項1所述之載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列置換。
  4. 如請求項1至3中任一項所述之載體,其中該載體係AAV2載體。
  5. 如請求項1至4中任一項所述之載體,其中該載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
  6. 如請求項5所述之載體,其中該外源核酸編碼RNA。
  7. 如請求項6所述之載體,其中該RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
  8. 如請求項5所述之載體,其中該外源核酸編碼多肽。
  9. 如請求項8所述之載體,其中該多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
  10. 一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列。
  11. 如請求項10所述之多肽,其中該多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
  12. 如請求項10所述之多肽,其中該多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列置換。
  13. 一種核酸分子,其編碼如請求項1至9中任一項之載體或如請求項10至12中任一項之多肽。
  14. 如請求項13所述之核酸分子,其中該核酸分子係DNA。
  15. 一種宿主細胞,其包含如請求項13至14中任一項之核酸分子。
  16. 如請求項15所述之宿主細胞,其中該宿主細胞表現該載體。
  17. 如請求項15所述之宿主細胞,其中該宿主細胞表現該多肽。
  18. 一種宿主細胞,其包含如請求項1至9中任一項之載體或如請求項10至12中任一項之多肽。
  19. 如請求項15至18中任一項所述之宿主細胞,其中該宿主細胞係視網膜細胞。
  20. 一種組成物,其包含如請求項1至9中任一項所述之載體及醫藥上可接受之賦形劑。
  21. 如請求項20所述之組成物,其中該組成物包含約1x10 7至約1x10 14個該載體。
  22. 如請求項20至21中任一項所述之組成物,其中該醫藥上可接受之賦形劑包含以下中之一或多者:磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液(Hank’s Balanced Salt Solution)、及Pluronic F68。
  23. 一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜細胞的方法,其中該方法包含使該視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及該外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染該視網膜細胞,從而將該外源核酸序列遞送至該視網膜細胞。
  24. 如請求項23所述之方法,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
  25. 如請求項23所述之方法,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列置換。
  26. 如請求項23至25中任一項所述之方法,其中該哺乳動物係人類。
  27. 如請求項23至26中任一項所述之方法,其中該載體係AAV2載體。
  28. 如請求項23至27中任一項所述之方法,其中該外源核酸序列編碼RNA或多肽。
  29. 如請求項28所述之方法,其中該外源核酸編碼RNA。
  30. 如請求項29所述之方法,其中該RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
  31. 如請求項28所述之方法,其中該外源核酸編碼多肽。
  32. 如請求項31所述之方法,其中該多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
  33. 如請求項23至32中任一項所述之方法,其中該方法包含向該哺乳動物玻璃體內投予包含該載體之組成物,從而使該視網膜細胞與該載體接觸。
  34. 如請求項33所述之方法,其中該組成物包含約1x10 7至約1x10 14個該載體。
  35. 一種用於治療有需要之哺乳動物的視網膜病況之方法,其中該方法包含使患有該視網膜病況之哺乳動物的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列,其中該等AAV載體感染該等視網膜細胞並驅動該外源核酸序列在該等視網膜細胞內之表現,從而治療該視網膜病況。
  36. 如請求項35所述之方法,其中該哺乳動物係人類。
  37. 如請求項35至36中任一項所述之方法,其中該視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
  38. 如請求項35至37中任一項所述之方法,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
  39. 如請求項35至37中任一項所述之方法,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列置換。
  40. 如請求項35至39中任一項所述之方法,其中該等載體係AAV2載體。
  41. 如請求項35至40中任一項所述之方法,其中該外源核酸序列編碼RNA。
  42. 如請求項41所述之方法,其中該RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
  43. 如請求項35至40中任一項所述之方法,其中該外源核酸編碼多肽。
  44. 如請求項43所述之方法,其中該多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。
  45. 如請求項35至44中任一項所述之方法,其中該方法包含向該哺乳動物玻璃體內投予包含該等載體之組成物,從而使該等視網膜細胞與該等載體接觸。
  46. 如請求項45所述之方法,其中該組成物包含約1x10 7至約1x10 14個該等載體。
  47. 一種非天然存在之AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,其包含位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間的式A的胺基酸序列插入物,其中該式A係: -L1-插入物-L2- (式A); 其中,該L1及該L2各獨立地係可選的具有一、二、或三個胺基酸之胺基酸連接子,且其中插入物表示表1A至1L之任何序列識別符之胺基酸序列,其不具有起始之LA及結束之A。
  48. 如請求項47所述之殼體多肽,其中該L1係一個胺基酸X1。
  49. 如請求項48所述之殼體多肽,其中該X1係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
  50. 如請求項48所述之殼體多肽,其中該X1係A。
  51. 如請求項47所述之殼體多肽,其中該L1係兩個胺基酸X2-X1。
  52. 如請求項51所述之殼體多肽,其中該X1係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
  53. 如請求項51所述之殼體多肽,其中該X1係A。
  54. 如請求項51至53中任一項所述之殼體多肽,其中該X2係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
  55. 如請求項54所述之殼體多肽,其中該X2係L。
  56. 如請求項51所述之殼體多肽,其中該X2-X1係LA。
  57. 如請求項47所述之殼體多肽,其中該L1係三個胺基酸X3-X2-X1。
  58. 如請求項57所述之殼體多肽,其中該X1係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
  59. 如請求項58所述之殼體多肽,其中該X1係A。
  60. 如請求項57至59中任一項所述之殼體多肽,其中該X2係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
  61. 如請求項60所述之殼體多肽,其中該X2係L。
  62. 如請求項57所述之殼體多肽,其中該X2-X1係LA。
  63. 如請求項57至62中任一項所述之殼體多肽,其中該X3係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
  64. 如請求項47所述之殼體多肽,其中該L1不存在。
  65. 如請求項47至64中任一項所述之殼體多肽,其中該L2係一個胺基酸Z1。
  66. 如請求項65所述之殼體多肽,其中該Z1係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
  67. 如請求項66所述之殼體多肽,其中該Z1係A。
  68. 如請求項47至64中任一項所述之殼體多肽,其中該L2係兩個胺基酸Z1-Z2。
  69. 如請求項68所述之殼體多肽,其中該Z1係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
  70. 如請求項69所述之殼體多肽,其中該Z1係A。
  71. 如請求項68至70中任一項所述之殼體多肽,其中該Z2係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
  72. 如請求項71所述之殼體多肽,其中該Z2係L。
  73. 如請求項68所述之殼體多肽,其中該Z1-Z2係AL。
  74. 如請求項47至64中任一項所述之殼體多肽,其中該L2係三個胺基酸Z1-Z2-Z3。
  75. 如請求項74所述之殼體多肽,其中該Z1係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
  76. 如請求項75所述之殼體多肽,其中該Z1係A。
  77. 如請求項74至76中任一項所述之殼體多肽,其中該Z2係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
  78. 如請求項77所述之殼體多肽,其中該Z2係L。
  79. 如請求項74所述之殼體多肽,其中該Z1-Z2係AL。
  80. 如請求項74至79中任一項所述之殼體多肽,其中該Z3係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
  81. 如請求項47至64中任一項所述之殼體多肽,其中該L2不存在。
  82. 如請求項47所述之殼體多肽,其中該胺基酸序列插入物包含表1A至1L之序列識別符之胺基酸序列中任一者,以LA起始並以A結束。
  83. 一種非天然存在之腺相關病毒(AAV)載體,其包含如請求項47至82中任一項所述之AAV殼體多肽。
  84. 一種病毒顆粒,其包含如請求項47至82中任一項所述之殼體多肽。
  85. 一種用於投予外源核酸序列至有需要之哺乳動物的方法,其中該方法包含向該哺乳動物投予有效量的如請求項83所述之載體,其中該載體包含該外源核酸序列。
  86. 如請求項85所述之方法,其中該哺乳動物係人類。
  87. 如請求項85至86中任一項所述之方法,其中該投予包含向該哺乳動物之眼睛投予該有效量。
  88. 如請求項85至87中任一項所述之方法,其中該投予足以允許在該哺乳動物之細胞中表現該外源核酸序列。
  89. 如請求項85至88中任一項所述之方法,其中該外源核酸序列編碼治療性多肽。
  90. 一種治療有需要之患者之視網膜病症的方法,其包含向該患者之眼睛投予有效量的AAV載體,其中該AAV載體包含AAV殼體多肽及外源核酸序列,其中該AAV殼體多肽由式A表示。
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