TW202400797A - 腺相關病毒載體 - Google Patents
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Abstract
本文係關於腺相關病毒(adeno-associated virus, AAV)載體(例如AAV2載體)。舉例而言,AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,其包括表1A至表1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,本文提供了此類AAV殼體多肽、編碼此類載體之核酸分子、編碼此類AAV殼體多肽之核酸分子、含有及/或表現此類核酸分子之宿主細胞、以及用於製備或使用此類載體及/或AAV殼體多肽的方法及材料。
Description
本文係關於腺相關病毒(adeno-associated virus, AAV)載體,特別是提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該載體具有(a)遞送核酸至眼窩視錐之能力,(b)遞送核酸至視網膜細胞並驅動視網膜細胞內核酸之高表現水平之能力,(c)跨視網膜區域(例如,跨至少兩個視網膜區域)遞送核酸至視網膜細胞之能力,(d)遞送核酸至眼睛窩側(parafovea)區域之視網膜細胞之能力,(e)遞送核酸至眼睛內二或更多種不同視網膜細胞類型之能力,(f)遞送核酸至視網膜色素上皮(retinal pigment epithelial,RPE)細胞之能力,(g)提高之遞送核酸至視網膜之感光細胞之效率,(h)提高之遞送核酸至視網膜之視網膜神經節細胞之效率,(i)提高之遞送核酸至視網膜之雙極細胞之效率,(j)提高之遞送核酸至ON視網膜神經節細胞(ON-retinal ganglion cells)之效率,(k)提高之遞送核酸至OFF視網膜神經節細胞(OFF-retinal ganglion cells)之效率,及/或(l)提高之封裝效率及遞送核酸至細胞(例如,視網膜細胞)之能力。
病毒載體(諸如AAV載體)係體內核酸遞送之有效媒劑,且其在臨床中之用途正在擴增。改良之AAV載體及用於製備有效AAV載體製劑之AAV生產技術應進一步擴增AAV載體在實驗室及臨床中之使用。
相關申請案之交互參照
本申請案主張2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,562號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,540號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,542號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,543號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,544號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,548號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,550號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,551號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,553號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,555號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,557號、2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,558號、及2022年3月30日申請之美國專利申請案第63/325,559號之優先權。先前申請案之揭示內容被視為本申請案之揭示內容的一部分(並以引用方式併入本文中)。
關於聯邦資金之陳述
本發明係在美國國家衛生研究院(National Institutes of Health)授予之MH120094政府支持下完成的。政府在本發明中享有某些權利。
本文提供腺相關病毒(adeno-associated virus, AAV)載體(例如AAV2載體)。舉例而言,本文提供含有殼體多肽(capsid polypeptide)之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1A中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1A中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼窩視錐(foveal cones)並向經感染之眼窩視錐遞送外源核酸使得經感染之眼窩視錐表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至眼窩視錐之能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1A中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼窩視錐並向經感染之眼窩視錐遞送外源核酸使得經感染之眼窩視錐表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有感染及驅動存在於哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之中央窩(fovea)中之視錐細胞(cone cells)中之外源核酸的mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之眼窩視錐中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之眼窩視錐中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1A中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至眼窩視錐。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜細胞以高水平表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至視網膜細胞並驅動視網膜細胞內核酸之高表現水平的能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜細胞以高水平表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛中至少2%(例如,至少2.5%、至少5%、至少7.5%、至少10%、或至少25%)之視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大2%、至少大2.5%、至少大5%、至少大7.5%、至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內跨視網膜區域(例如,跨至少兩個視網膜區域)感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有跨視網膜區域向視網膜細胞遞送核酸並驅動經遞送之核酸在視網膜細胞內表現的能力。舉例來說,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)可遞送核酸至中央窩區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞、窩側區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞、弓形血管(vascular arcade)區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞、及/或周邊區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內跨視網膜區域(例如,跨至少兩個視網膜區域)感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之中央窩區域(fovea region)中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中、窩側區域(parafovea region)中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中、弓形血管區域(vascular arcade region)中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中、及/或周邊區域(periphery region)中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及/或周邊區域之視網膜細胞中驅動外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)彼等區域之視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼睛之窩側區域之視網膜細胞並向窩側區域之經感染之視網膜細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至眼睛之窩側區域之視網膜細胞的能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼睛之窩側區域之視網膜細胞並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在存在於哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之窩側區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之窩側區域之視網膜細胞中驅動外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之窩側區域之視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至眼睛之窩側區域之視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同視網膜細胞類型並遞送外源核酸至經感染之視網膜細胞使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸的能力。本文亦提供用於製造及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同視網膜細胞類型並驅動經遞送之核酸在彼等視網膜細胞內表現的能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)可遞送核酸至眼睛之以下二個、三個、四個、五個、六個、或七個視網膜細胞類型:視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮(retinal pigment epithelial, RPE)細胞。在一些情況下,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)可在玻璃體內投予後遞送核酸至哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少一些(例如,至少2%、至少2.5%、至少5%、至少10%、或至少25%)視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有殼體多肽,該殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同視網膜細胞類型並遞送外源核酸至經感染之視網膜細胞使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有例如在玻璃體內投予後在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜神經節細胞(retinal ganglion cells)中、至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之無長突細胞(amacrine cell)中、至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之水平細胞(horizontal cells)中、至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之雙極細胞(bipolar cells)中、至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之穆勒神經膠質細胞(Muller glia cells)中、至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之感光細胞中、及/或至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜色素上皮細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及/或視網膜色素上皮細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之彼等視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽的比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同視網膜細胞類型。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜色素上皮細胞並向經感染之視網膜色素上皮細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜色素上皮細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有向視網膜色素上皮細胞遞送核酸並驅動經遞送之核酸在視網膜色素上皮細胞內表現的能力。舉例而言,在例如玻璃體內投予(intravitreal administration)之後,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)可遞送核酸至哺乳動物眼睛之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜色素上皮細胞。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜色素上皮細胞並向經感染之視網膜色素上皮細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜色素上皮細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜色素上皮細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之視網膜色素上皮細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之視網膜色素上皮細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜色素上皮細胞。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜之感光細胞並向經感染之感光細胞遞送外源核酸使得經感染之感光細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至視網膜之感光細胞之能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜之感光細胞並向經感染之感光細胞遞送外源核酸使得經感染之感光細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之感光細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)視網膜之感光細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)視網膜之感光細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜之感光細胞。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜神經節細胞並向經感染之視網膜神經節細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜神經節細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至視網膜神經節細胞之能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜神經節細胞並向經感染之視網膜神經節細胞遞送外源核酸使得經感染之視網膜神經節細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜神經節細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之視網膜神經節細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之視網膜神經節細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜之感光細胞。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜之雙極細胞並向經感染之雙極細胞遞送外源核酸使得經感染之雙極細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至視網膜之雙極細胞之能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜之雙極細胞並向經感染之雙極細胞遞送外源核酸使得經感染之雙極細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)視網膜之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之雙極細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)視網膜之雙極細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)視網膜之感光細胞中具有由SEQ ID NO:1的胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜之感光細胞。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染ON視網膜神經節細胞並向經感染之ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸使得經感染之ON視網膜神經節細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至ON視網膜神經節細胞之能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染ON視網膜神經節細胞並向經感染之ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸使得經感染之ON視網膜神經節細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之ON視網膜神經節細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之ON視網膜神經節細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之ON視網膜神經節細胞中具有由SEQ ID NO:1的胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜之感光細胞。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染OFF視網膜神經節細胞並向經感染之OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸使得經感染之OFF視網膜神經節細胞表現外源核酸之能力。本文亦提供用於製備及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有遞送核酸至OFF視網膜神經節細胞之能力。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染OFF視網膜神經節細胞並向經感染之OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸使得經感染之OFF視網膜神經節細胞表現外源核酸之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之OFF視網膜神經節細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之OFF視網膜神經節細胞中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之OFF視網膜神經節細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸之mRNA表現水平。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可用於代替7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或代替K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))遞送核酸至視網膜之感光細胞。
在另一態樣中,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有殼體多肽,該殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有提高之封裝效率、在體內或體外感染細胞(例如,視網膜細胞)之能力、以及向經感染之細胞遞送外源核酸使得經感染之細胞表現外源核酸的能力。本文亦提供用於製造及使用AAV載體(例如AAV2載體)之方法及材料,該AAV載體具有提高之封裝效率、在體內或體外向細胞(例如,視網膜細胞)遞送核酸之能力、以及驅動經遞送之核酸在細胞內表現的能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)之封裝效率可大於具有由由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)的封裝效率。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有提高之封裝效率(例如,封裝效率大於具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)的封裝效率)、在體內或體外感染細胞(例如,視網膜細胞)之能力、以及驅動外源核酸至經感染之細胞使得經感染之細胞表現外源核酸的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)之封裝效率可大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)的封裝效率。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體之封裝效率可大於7m8 AAV2載體(Dalkara et al., Sci. Transl. Med., 5(189):189ra76 (2013)及Bennett et al., J. Struct. Biol., 209(2):107433 (2020))或K912 AAV2載體(Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021))之封裝效率。
一般而言,本文之一個態樣特徵在於包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價(titer)時,該載體可感染大於50%之眼窩視錐。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於50%之眼窩視錐。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼載體之核酸分子。核酸分子可係DNA。載體可係包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於50%之眼窩視錐。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼多肽之核酸分子。核酸分子可係DNA。多肽可係包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於50%之眼窩視錐。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含載體之宿主細胞。宿主細胞可係視網膜細胞。載體可係包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於50%之眼窩視錐。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含多肽之宿主細胞。宿主細胞可係視網膜細胞。多肽可係包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於50%之眼窩視錐。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含腺相關病毒(AAV)載體之組成物,該腺相關病毒載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於50%之眼窩視錐。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼窩視錐中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液(Hank’s Balanced Salt Solution)、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之眼窩視錐的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使眼窩視錐與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染眼窩視錐,從而向眼窩視錐遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於50%之眼窩視錐。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在眼窩視錐中的表現水平相比,該載體可在眼窩視錐中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使眼窩視錐與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文件提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的眼窩視錐與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染眼窩視錐並驅動外源核酸序列在眼窩視錐內之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症(blue cone monochromcy)、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於50%之眼窩視錐。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在眼窩視錐中的表現水平相比,該載體可在眼窩視錐中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使眼窩視錐與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染視網膜細胞,從而向視網膜細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染視網膜細胞並驅動外源核酸序列在視網膜細胞內之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由萊伯氏先天性黑蒙症(Leber's congenital amaurosis, LCA)、眼睛皮膚白化症第一型(Oculocutaneous albinism type I, OCA1)、視網膜色素變性(retinitis pigmentosa)、視桿/視錐失養症(rod/cone dystrophy)、視錐失養症(cone dystrophy)、斯特格氏病(Stargardt Disease)、尤塞氏症候群(usher syndrome)、X-性聯遺傳視網膜色素病變(X-linked retinitis pigmentosa, XLRP)、及先天性視網膜裂損症(X-linked juvenile retinoschisis, XLRS)所組成之群組。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2.5%之視網膜細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID N O:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於向哺乳動物眼睛之至少兩個不同視網膜區域內之視網膜細胞遞送外源核酸序列的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染至少兩個不同視網膜區域內之視網膜細胞,從而向視網膜細胞遞送外源核酸序列,其中該至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染至少兩個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜細胞中的表現水平相比,該載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物眼睛的至少兩個視網膜區域的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染該至少兩個視網膜區域之視網膜細胞並驅動外源核酸序列在該至少兩個視網膜區域之視網膜細胞內之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由LCA、OCA1、視網膜色素變性、視桿/視錐失養症、視錐失養症、斯特格氏病、尤塞氏症候群、XLRP、及XLRS所組成之群組。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染至少兩個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中的表現水平相比,該載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使至少兩個視網膜區域之視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。至少兩個視網膜區域可選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在眼睛窩側之視網膜細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於向哺乳動物眼睛之窩側區域之視網膜細胞遞送外源核酸序列的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染視網膜細胞,從而向視網膜細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之眼睛窩側區域之視網膜細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在眼睛的窩側區域的視網膜細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使窩側區域之視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物眼睛的窩側區域的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染視網膜細胞並驅動外源核酸序列在視網膜細胞內之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變(macular degeneration)、全色盲(achromatopsia)、藍色視錐單色症(blue cone monochromcy)、及色盲(color blindness)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當玻璃體內投予至少1x10
7之個載體之效價時,該載體可感染大於2%之窩側區域之視網膜細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在窩側區域的視網膜細胞中的表現水平相比,該載體可在窩側區域之視網膜細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使窩側區域之視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於向哺乳動物眼睛之至少三種不同視網膜細胞類型遞送外源核酸序列的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使至少三種不同視網膜細胞類型與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染該至少三種不同視網膜細胞類型,從而向該至少三種不同視網膜細胞類型遞送外源核酸序列,其中該至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛內大於2%之至少三種不同視網膜細胞類型。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在至少三種不同視網膜細胞類型中的表現水平相比,該載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使至少三種不同視網膜細胞類型與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物眼睛的至少三種不同視網膜細胞類型與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染至少三種不同視網膜細胞類型並驅動至少三種不同視網膜細胞類型內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症(blue cone monochromcy)、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛內大於2%之至少三種不同視網膜細胞類型。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在至少三種不同視網膜細胞類型中的表現水平相比,該載體可在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使至少三種不同視網膜細胞類型與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。該至少三種不同視網膜細胞類型可選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於向哺乳動物眼睛之視網膜色素上皮細胞遞送外源核酸序列的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使視網膜色素上皮細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染視網膜色素上皮細胞,從而向視網膜色素上皮細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之視網膜色素上皮細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜色素上皮細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜色素上皮細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物眼睛的視網膜色素上皮細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染視網膜色素上皮細胞並驅動視網膜色素上皮細胞內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜色素上皮細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜色素上皮細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜色素上皮細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在感光細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在感光細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在感光細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在感光細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在感光細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在感光細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在感光細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之感光細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使感光細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染感光細胞,從而向感光細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之感光細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在感光細胞中的表現水平相比,該載體可在感光細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使感光細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的感光細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染感光細胞並驅動感光細胞內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之感光細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在感光細胞中的表現水平相比,該載體可在感光細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使感光細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜神經節細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染感光細胞,從而向感光細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之視網膜神經節細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜神經節細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜神經節細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染視網膜神經節細胞並驅動視網膜神經節細胞內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜神經節細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜神經節細胞中的表現水平相比,該載體可在視網膜神經節細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜神經節細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛視網膜雙極細胞之大於2%的感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛視網膜之大於2%的雙極細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛視網膜雙極細胞之大於2%的感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛視網膜之大於2%的雙極細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛視網膜雙極細胞之大於2%的感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛視網膜之大於2%的雙極細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛視網膜雙極細胞之大於2%的感光細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在視網膜雙極細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜雙極細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使雙極細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染雙極細胞,從而向雙極細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛視網膜雙極細胞之大於2%的感光細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜雙極細胞中的表現水平相比,該載體可在雙極細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使雙極細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的視網膜雙極細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染雙極細胞並驅動雙極細胞內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之視網膜雙極細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜雙極細胞中的表現水平相比,該載體可在雙極細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使雙極細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之ON視網膜神經節細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使ON視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染ON視網膜神經節細胞,從而向ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之ON視網膜神經節細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在ON視網膜神經節細胞中的表現水平相比,該載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使ON視網膜神經節細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的ON視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染ON視網膜神經節細胞並驅動ON視網膜神經節細胞內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之ON視網膜神經節細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在ON視網膜神經節細胞中的表現水平相比,該載體可在ON視網膜神經節細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使ON視網膜神經節細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,包含多肽之AAV載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含多肽之AAV載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,該載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之OFF視網膜神經節細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使OFF視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染OFF視網膜神經節細胞,從而向OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染眼睛之大於2%之OFF視網膜神經節細胞。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在OFF視網膜神經節細胞中的表現水平相比,該載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使OFF視網膜神經節細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的OFF視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染OFF視網膜神經節細胞並驅動OFF視網膜神經節細胞內外源核酸序列之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。當向哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個載體之效價時,該載體可感染大於2%之OFF視網膜神經節細胞。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在OFF視網膜神經節細胞中的表現水平相比,該載體可在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的外源核酸序列。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使OFF視網膜神經節細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。
在另一態樣中,本文提供一種包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。
在另一態樣中,本文提供一種編碼包含AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種核酸分子,其編碼包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列的AAV殼體多肽。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。核酸分子可係DNA。
在另一態樣中,本文提供一種包含前述二個段落中任一者之核酸分子的宿主細胞。宿主細胞可表現載體。宿主細胞可表現多肽。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之宿主細胞,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV殼體多肽之宿主細胞,該AAV殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。宿主細胞可係視網膜細胞。
在另一態樣中,本文提供一種包含AAV載體之組成物,該AAV載體包含AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。載體可包含編碼RNA或多肽之外源核酸。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。組成物可包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
在另一態樣中,本文提供一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之細胞的方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染細胞,從而向細胞遞送外源核酸序列。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。載體可係AAV2載體。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。外源核酸序列可編碼RNA或多肽。外源核酸可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
在另一態樣中,本文提供一種治療視網膜病況之方法。該方法包含(或基本上由以下組成、或由以下組成)使患有視網膜病況之哺乳動物的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列,其中AAV載體感染視網膜細胞並驅動外源核酸序列在視網膜細胞內之表現,從而治療視網膜病況。哺乳動物可係人類(或非人類靈長類動物)。視網膜病況可選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。殼體多肽可包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列(或替代序列係SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列,或與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了用SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590。載體可係AAV2載體。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。外源核酸序列可編碼RNA。RNA可係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。外源核酸可編碼多肽。多肽可係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。載體之封裝效率可大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。該方法可包含向哺乳動物玻璃體內投予包含載體之組成物,從而使視網膜細胞與載體接觸。組成物可包含約1x10
7至約1x10
14個載體。
除非另有定義,否則本文中所使用之所有技術及科學用語皆具有本發明所屬之技術領域中具有通常知識者所共同理解的相同含義。儘管與本文中所述之彼等相似或等效之方法及材料可用以實踐本發明,但在下文描述適合的方法及方法。本文所提及之所有公開案、專利申請案、專利、及其他參考文獻以全文引用之方式併入本文中。在衝突之情況下,以本說明書(包括定義)為準。此外,材料、方法、及實例僅係說明性的且不意欲為限制性的。
本發明之一或多個實施例的細節在以下附圖中闡述。本發明之其他特徵、目的、及優點將自描述及申請專利範圍中顯而易見。
本文提供AAV載體(例如AAV2載體)。舉例而言,本文提供含有殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。任何適當的AAV載體可經設計以包括本文中所述之殼體多肽(例如,該殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)。舉例而言,AAV2、AAV8、及AAV9可經設計以包括殼體多肽,該殼體多肽包括表1A至1L(或其變體)之任一或多者中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。在一些情況下,具有AAV Rep多肽之AVG起始密碼子代替ATG起始密碼子的AAV2(例如AAV2-M1T-REP)可經設計以包括殼體多肽,該殼體多肽包括表1或式A中所闡述之胺基酸序列(或其變體)。
任何適當的AAV殼體多肽可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。舉例而言,AAV2、AAV6、AAV8、及AAV9殼體多肽可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。在一些情況下,AAV2殼體多肽可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。在一些情況下,具有以下胺基酸序列之AAV2殼體多肽可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列:MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQ
RG
NRQA
ATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSVNVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL (SEQ ID NO:1)。二個粗體胺基酸殘基在位置587及588,且加底線的胺基酸在位置585至590。
在一些情況下,具有以下胺基酸序列之AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)可經設計以包括表1中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或式A中所闡述之胺基酸序列:MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERH KDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVN
X
1 ADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNRQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKS
X
2 NVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL,其中X
1係E或A,且其中X
2係V或I (SEQ ID NO:2206)。
在一些情況下,與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)可經設計以包括表1中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或式A所闡述之胺基酸序列。
在一些情況下,本文所涵蓋之某些AAV2序列可包括SEQ ID NO:1之修飾或突變,諸如V708I取代。
當設計AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列時,所包括之胺基酸序列可位於沿著AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)之任何適當位置。舉例而言,在表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,諸如下列中任一者:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27,可位於AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)之天然存在的胺基酸殘基位置587及588之間、可位於AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)之天然存在的胺基酸殘基位置452及453之間、或可位於AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)之天然存在的胺基酸殘基位置453及454之間。
[表1A] 可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO:** | 編碼胺基酸序列之核酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO:** | 活性水平* |
TGYSSTNG | A2 | 2 | ACCGGCTACAGCAGCACCAACGGC | A20 | 1104 | +++ |
LADLSDHHA | A3 | 3 | CTAGCAGACCTGAGCGACCACCACGCT | A21 | 1105 | +++ |
SGTEATRG | A4 | 4 | AGCGGCACCGAGGCCACCCGGGGC | A22 | 1106 | +++ |
TGQDKPTG | A5 | 5 | ACCGGCCAGGACAAGCCCACCGGC | A23 | 1107 | +++ |
SSMDPRHG | A6 | 6 | AGCAGCATGGACCCCCGGCACGGC | A24 | 1108 | +++ |
LANLKENEA | A7 | 7 | CTAGCAAACCTGAAGGAGAACGAGGCT | A25 | 1109 | +++ |
LAIKMIAYA | A8 | 8 | CTAGCAATCAAGATGATCGCCTACGCT | A26 | 1110 | ++ |
TGEGPTKG | A9 | 9 | ACCGGCGAGGGCCCCACCAAGGGC | A27 | 1111 | ++ |
SGSVGYVG | A10 | 10 | AGCGGCAGCGTGGGCTACGTGGGC | A28 | 1112 | ++ |
LAQVQVEGA | A11 | 11 | CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT | A29 | 1113 | ++ |
SGFDATKG | A12 | 12 | AGCGGCTTCGACGCCACCAAGGGC | A30 | 1114 | ++ |
TTDLNHKG | A13 | 13 | ACCACCGACCTGAACCACAAGGGC | A31 | 1115 | + |
SSRAYQET | A14 | 14 | AGCAGCCGGGCCTACCAGGAGACC | A32 | 1116 | + |
LAKVASMNA | A15 | 15 | CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT | A32 | 1117 | + |
TSQEKQNS | A16 | 16 | ACCAGCCAGGAGAAGCAGAACAGC | A34 | 1118 | + |
LAAHQMASA | A17 | 17 | CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT | A35 | 1119 | + |
LAKGQAQNA | A18 | 18 | CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT | A36 | 1120 | + |
RTGRNT | A19 | 19 | CGGACCGGCCGGAACACC | A37 | 1121 | ++ |
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平: +++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1B]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO:** | 編碼胺基酸序列之核酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO:** | 活性水平* | ||
LATTTMGTA | B | 2 | 20 | CTAGCAACCACCACCATGGGCACCGCT | B | 318 | 1122 | +++ |
LARRKSNEA | B | 3 | 21 | CTAGCACGGCGGAAGAGCAACGAGGCT | B | 319 | 1123 | +++ |
LAHGGLREA | B | 4 | 22 | CTAGCACACGGCGGCCTGCGGGAGGCT | B | 320 | 1124 | +++ |
LAMFVWVPA | B | 5 | 23 | CTAGCAATGTTCGTGTGGGTGCCCGCT | B | 321 | 1125 | +++ |
LATDRTKTA | B | 6 | 24 | CTAGCAACCGACCGGACCAAGACCGCT | B | 322 | 1126 | +++ |
LAFNSCSYA | B | 7 | 25 | CTAGCATTCAACAGCTGCAGCTACGCT | B | 323 | 1127 | +++ |
LAYAEQSKA | B | 8 | 26 | CTAGCATACGCCGAGCAGAGCAAGGCT | B | 324 | 1128 | +++ |
LAWRIMKHA | B | 9 | 27 | CTAGCATGGCGGATCATGAAGCACGCT | B | 325 | 1129 | +++ |
LAVDNIWAA | B | 10 | 28 | CTAGCAGTGGACAACATCTGGGCCGCT | B | 326 | 1130 | +++ |
LAGQAMMQA | B | 11 | 29 | CTAGCAGGCCAGGCCATGATGCAGGCT | B | 327 | 1131 | +++ |
LAELALIKA | B | 12 | 30 | CTAGCAGAGCTGGCCCTGATCAAGGCT | B | 328 | 1132 | +++ |
LAMTKITDA | B | 13 | 31 | CTAGCAATGACCAAGATCACCGACGCT | B | 329 | 1133 | +++ |
LALENIGQA | B | 14 | 32 | CTAGCACTGGAGAACATCGGCCAGGCT | B | 330 | 1134 | +++ |
LAFTHGTNA | B | 15 | 33 | CTAGCATTCACCCACGGCACCAACGCT | B | 331 | 1135 | +++ |
LAKINAQPA | B | 16 | 34 | CTAGCAAAGATCAACGCCCAGCCCGCT | B | 332 | 1136 | +++ |
LADLSDHHA | B | 17 | 35 | CTAGCAGACCTGAGCGACCACCACGCT | B | 333 | 1137 | +++ |
LADPLYAVA | B | 18 | 36 | CTAGCAGACCCCCTGTACGCCGTGGCT | B | 334 | 1138 | +++ |
LAYVALFYA | B | 19 | 37 | CTAGCATACGTGGCCCTGTTCTACGCT | B | 335 | 1139 | +++ |
LAGGEYETA | B | 20 | 38 | CTAGCAGGCGGCGAGTACGAGACCGCT | B | 336 | 1140 | +++ |
LAALVDANA | B | 21 | 39 | CTAGCAGCCCTGGTGGACGCCAACGCT | B | 337 | 1141 | +++ |
LADPTETPA | B | 22 | 40 | CTAGCAGACCCCACCGAGACCCCCGCT | B | 338 | 1142 | +++ |
LAHRAPDSA | B | 23 | 41 | CTAGCACACCGGGCCCCCGACAGCGCT | B | 339 | 1143 | +++ |
LAEGQEDSA | B | 24 | 42 | CTAGCAGAGGGCCAGGAGGACAGCGCT | B | 340 | 1144 | +++ |
LAEEEKYGA | B | 25 | 43 | CTAGCAGAGGAGGAGAAGTACGGCGCT | B | 341 | 1145 | +++ |
LALNDNVGA | B | 26 | 44 | CTAGCACTGAACGACAACGTGGGCGCT | B | 342 | 1146 | +++ |
LAPDAKDWA | B | 27 | 45 | CTAGCACCCGACGCCAAGGACTGGGCT | B | 343 | 1147 | +++ |
LAPHIAKDA | B | 28 | 46 | CTAGCACCCCACATCGCCAAGGACGCT | B | 344 | 1148 | +++ |
LADPGWKYA | B | 29 | 47 | CTAGCAGACCCCGGCTGGAAGTACGCT | B | 345 | 1149 | +++ |
LASRTAVAA | B | 30 | 48 | CTAGCAAGCCGGACCGCCGTGGCCGCT | B | 346 | 1150 | +++ |
LAFCIKHCA | B | 31 | 49 | CTAGCATTCTGCATCAAGCACTGCGCT | B | 347 | 1151 | +++ |
LAEPDHTLA | B | 32 | 50 | CTAGCAGAGCCCGACCACACCTTGGCT | B | 348 | 1152 | +++ |
LAPMRGVYA | B | 33 | 51 | CTAGCACCCATGCGGGGCGTGTACGCT | B | 349 | 1153 | +++ |
LAAVTKDSA | B | 34 | 52 | CTAGCAGCCGTGACCAAGGACAGCGCT | B | 350 | 1154 | +++ |
LAITQSDIA | B | 35 | 53 | CTAGCAATCACCCAGAGCGACATCGCT | B | 351 | 1155 | +++ |
LAPNQGTPA | B | 36 | 54 | CTAGCACCCAACCAGGGCACCCCCGCT | B | 352 | 1156 | +++ |
LAVMGNMLA | B | 37 | 55 | CTAGCAGTGATGGGCAACATGCTGGCT | B | 353 | 1157 | +++ |
LASNMERIA | B | 38 | 56 | CTAGCAAGCAACATGGAGCGGATCGCT | B | 354 | 1158 | +++ |
LAHWQEEWA | B | 39 | 57 | CTAGCACACTGGCAGGAGGAGTGGGCT | B | 355 | 1159 | +++ |
LADDMIFVA | B | 40 | 58 | CTAGCAGACGACATGATCTTCGTGGCT | B | 356 | 1160 | +++ |
LAHEPMFNA | B | 41 | 59 | CTAGCACACGAGCCCATGTTCAACGCT | B | 357 | 1161 | +++ |
LATVYKSPA | B | 42 | 60 | CTAGCAACCGTGTACAAGAGCCCCGCT | B | 358 | 1162 | +++ |
LADNLNTPA | B | 43 | 61 | CTAGCAGACAACCTGAACACCCCCGCT | B | 359 | 1163 | +++ |
LAYVIENDA | B | 44 | 62 | CTAGCATACGTGATCGAGAACGACGCT | B | 360 | 1164 | +++ |
LALEVGDHA | B | 45 | 63 | CTAGCACTGGAGGTGGGCGACCACGCT | B | 361 | 1165 | +++ |
LAHEGRQAA | B | 46 | 64 | CTAGCACACGAGGGCCGGCAGGCCGCT | B | 362 | 1166 | +++ |
LASTTMNIA | B | 47 | 65 | CTAGCAAGCACCACCATGAACATCGCT | B | 363 | 1167 | +++ |
LAEFHIPTA | B | 48 | 66 | CTAGCAGAGTTCCACATCCCCACCGCT | B | 364 | 1168 | +++ |
LAEFRVGQA | B | 49 | 67 | CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT | B | 365 | 1169 | +++ |
LADAHSVTA | B | 50 | 68 | CTAGCAGACGCCCACAGCGTGACCGCT | B | 366 | 1170 | +++ |
LAKPPPKDA | B | 51 | 69 | CTAGCAAAGCCCCCCCCCAAGGACGCT | B | 367 | 1171 | +++ |
LAIGSDTSA | B | 52 | 70 | CTAGCAATCGGCAGCGACACCAGCGCT | B | 368 | 1172 | +++ |
LAFQQQRCA | B | 53 | 71 | CTAGCATTCCAGCAGCAGCGGTGCGCT | B | 369 | 1173 | +++ |
LAAVHLMGA | B | 54 | 72 | CTAGCAGCCGTGCACCTGATGGGCGCT | B | 370 | 1174 | +++ |
LACTYTYAA | B | 55 | 73 | CTAGCATGCACCTACACCTACGCCGCT | B | 371 | 1175 | +++ |
LAVRNEINA | B | 56 | 74 | CTAGCAGTGCGGAACGAGATCAACGCT | B | 372 | 1176 | +++ |
LADSSKWIA | B | 57 | 75 | CTAGCAGACAGCAGCAAGTGGATCGCT | B | 373 | 1177 | +++ |
LADYRNDKA | B | 58 | 76 | CTAGCAGACTACCGGAACGACAAGGCT | B | 374 | 1178 | +++ |
LANANTRPA | B | 59 | 77 | CTAGCAAACGCCAACACCCGGCCCGCT | B | 375 | 1179 | +++ |
LAPQNLDEA | B | 60 | 78 | CTAGCACCCCAGAACCTGGACGAGGCT | B | 376 | 1180 | +++ |
LAHPGTTFA | B | 61 | 79 | CTAGCACACCCCGGCACCACCTTCGCT | B | 377 | 1181 | +++ |
LAYDAGGHA | B | 62 | 80 | CTAGCATACGACGCCGGCGGCCACGCT | B | 378 | 1182 | +++ |
LAKALGMEA | B | 63 | 81 | CTAGCAAAGGCCCTGGGCATGGAGGCT | B | 379 | 1183 | +++ |
LAGENHISA | B | 64 | 82 | CTAGCAGGCGAGAACCACATCAGCGCT | B | 380 | 1184 | +++ |
LARDQLKLA | B | 65 | 83 | CTAGCACGGGACCAGCTGAAGCTGGCT | B | 381 | 1185 | +++ |
LACPVAEWA | B | 66 | 84 | CTAGCATGCCCCGTGGCCGAGTGGGCT | B | 382 | 1186 | +++ |
LAQVKQGPA | B | 67 | 85 | CTAGCACAGGTGAAGCAGGGCCCCGCT | B | 383 | 1187 | +++ |
LALPEGRFA | B | 68 | 86 | CTAGCACTGCCCGAGGGCCGGTTCGCT | B | 384 | 1188 | +++ |
LAMNEPVTA | B | 69 | 87 | CTAGCAATGAACGAGCCCGTGACCGCT | B | 385 | 1189 | +++ |
LAAVTEYVA | B | 70 | 88 | CTAGCAGCCGTGACCGAGTACGTGGCT | B | 386 | 1190 | +++ |
LADGGTRPA | B | 71 | 89 | CTAGCAGACGGCGGCACCCGGCCCGCT | B | 387 | 1191 | +++ |
LAPPGNPLA | B | 72 | 90 | CTAGCACCCCCCGGCAACCCCCTGGCT | B | 388 | 1192 | +++ |
LANIVQQDA | B | 73 | 91 | CTAGCAAACATCGTGCAGCAGGACGCT | B | 389 | 1193 | +++ |
LAVSRHGEA | B | 74 | 92 | CTAGCAGTGAGCCGGCACGGCGAGGCT | B | 390 | 1194 | +++ |
LANEAQGKA | B | 75 | 93 | CTAGCAAACGAGGCCCAGGGCAAGGCT | B | 391 | 1195 | +++ |
LAPMGQNMA | B | 76 | 94 | CTAGCACCCATGGGCCAGAACATGGCT | B | 392 | 1196 | +++ |
LAAYHDSAA | B | 77 | 95 | CTAGCAGCCTACCACGACAGCGCCGCT | B | 393 | 1197 | +++ |
LAGIQQHVA | B | 78 | 96 | CTAGCAGGCATCCAGCAGCACGTGGCT | B | 394 | 1198 | +++ |
LASVSTIQA | B | 79 | 97 | CTAGCAAGCGTGAGCACCATCCAGGCT | B | 395 | 1199 | +++ |
LAAVGMKMA | B | 80 | 98 | CTAGCAGCCGTGGGCATGAAGATGGCT | B | 396 | 1200 | +++ |
LAQVTEMRA | B | 81 | 99 | CTAGCACAGGTGACCGAGATGCGGGCT | B | 397 | 1201 | +++ |
LADTHTTYA | B | 82 | 100 | CTAGCAGACACCCACACCACCTACGCT | B | 398 | 1202 | +++ |
LAIGERTTA | B | 83 | 101 | CTAGCAATCGGCGAGCGGACCACCGCT | B | 399 | 1203 | +++ |
LANKNTAIA | B | 84 | 102 | CTAGCAAACAAGAACACCGCCATCGCT | B | 400 | 1204 | +++ |
LANLKENEA | B | 85 | 103 | CTAGCAAACCTGAAGGAGAACGAGGCT | B | 401 | 1205 | +++ |
LAEYHNNDA | B | 86 | 104 | CTAGCAGAGTACCACAACAACGACGCT | B | 402 | 1206 | +++ |
LAFNGSTSA | B | 87 | 105 | CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT | B | 403 | 1207 | +++ |
LAGFMEYYA | B | 88 | 106 | CTAGCAGGCTTCATGGAGTACTACGCT | B | 404 | 1208 | +++ |
LAMGHNYVA | B | 89 | 107 | CTAGCAATGGGCCACAACTACGTGGCT | B | 405 | 1209 | +++ |
LAGEFTGKA | B | 90 | 108 | CTAGCAGGCGAGTTCACCGGCAAGGCT | B | 406 | 1210 | ++ |
LAKGFKTEA | B | 91 | 109 | CTAGCAAAGGGCTTCAAGACCGAGGCT | B | 407 | 1211 | ++ |
LAWNKCPYA | B | 92 | 110 | CTAGCATGGAACAAGTGCCCCTACGCT | B | 408 | 1212 | ++ |
LAQEQNAAA | B | 93 | 111 | CTAGCACAGGAGCAGAACGCCGCCGCT | B | 409 | 1213 | ++ |
LAKDGMIGA | B | 94 | 112 | CTAGCAAAGGACGGCATGATCGGCGCT | B | 410 | 1214 | ++ |
LAPTTIGGA | B | 95 | 113 | CTAGCACCCACCACCATCGGCGGCGCT | B | 411 | 1215 | ++ |
LAVKGLVNA | B | 96 | 114 | CTAGCAGTGAAGGGCCTGGTGAACGCT | B | 412 | 1216 | ++ |
LALNSGKMA | B | 97 | 115 | CTAGCACTGAACAGCGGCAAGATGGCT | B | 413 | 1217 | ++ |
LALYQCDTA | B | 98 | 116 | CTAGCACTGTACCAGTGCGACACCGCT | B | 414 | 1218 | ++ |
LAPQKQPVA | B | 99 | 117 | CTAGCACCCCAGAAGCAGCCCGTGGCT | B | 415 | 1219 | ++ |
LAEHKNMHA | B | 100 | 118 | CTAGCAGAGCACAAGAACATGCACGCT | B | 416 | 1220 | ++ |
LAEFDGDGA | B | 101 | 119 | CTAGCAGAGTTCGACGGCGACGGCGCT | B | 417 | 1221 | ++ |
LASRLNSPA | B | 102 | 120 | CTAGCAAGCCGGCTGAACAGCCCCGCT | B | 418 | 1222 | ++ |
LAPCYEPPA | B | 103 | 121 | CTAGCACCCTGCTACGAGCCCCCCGCT | B | 419 | 1223 | ++ |
LALKLRTEA | B | 104 | 122 | CTAGCACTGAAGCTGCGGACCGAGGCT | B | 420 | 1224 | ++ |
LAAGQAQSA | B | 105 | 123 | CTAGCAGCCGGCCAGGCCCAGAGCGCT | B | 421 | 1225 | ++ |
LATPNVNAA | B | 106 | 124 | CTAGCAACCCCCAACGTGAACGCCGCT | B | 422 | 1226 | ++ |
LARAITNEA | B | 107 | 125 | CTAGCACGGGCCATCACCAACGAGGCT | B | 423 | 1227 | ++ |
LAEVTYTGA | B | 108 | 126 | CTAGCAGAGGTGACCTACACCGGCGCT | B | 424 | 1228 | ++ |
LAPSGDRHA | B | 109 | 127 | CTAGCACCCAGCGGCGACCGGCACGCT | B | 425 | 1229 | ++ |
LAYITEKSA | B | 110 | 128 | CTAGCATACATCACCGAGAAGAGCGCT | B | 426 | 1230 | ++ |
LAKDHHVIA | B | 111 | 129 | CTAGCAAAGGACCACCACGTGATCGCT | B | 427 | 1231 | ++ |
LASADHQPA | B | 112 | 130 | CTAGCAAGCGCCGACCACCAGCCCGCT | B | 428 | 1232 | ++ |
LATMHNFEA | B | 113 | 131 | CTAGCAACCATGCACAACTTCGAGGCT | B | 429 | 1233 | ++ |
LARGVAPIA | B | 114 | 132 | CTAGCACGGGGCGTGGCCCCCATCGCT | B | 430 | 1234 | ++ |
LAWKCKGTA | B | 115 | 133 | CTAGCATGGAAGTGCAAGGGCACCGCT | B | 431 | 1235 | ++ |
LAKGILMEA | B | 116 | 134 | CTAGCAAAGGGCATCCTGATGGAGGCT | B | 432 | 1236 | ++ |
LANIVSHDA | B | 117 | 135 | CTAGCAAACATCGTGAGCCACGACGCT | B | 433 | 1237 | ++ |
LAEFVHKGA | B | 118 | 136 | CTAGCAGAGTTCGTGCACAAGGGCGCT | B | 434 | 1238 | ++ |
LASAVMYWA | B | 119 | 137 | CTAGCAAGCGCCGTGATGTACTGGGCT | B | 435 | 1239 | ++ |
LAQKKLLEA | B | 120 | 138 | CTAGCACAGAAGAAGCTGCTGGAGGCT | B | 436 | 1240 | ++ |
LAGERETVA | B | 121 | 139 | CTAGCAGGCGAGCGGGAGACCGTGGCT | B | 437 | 1241 | ++ |
LAFLRGPEA | B | 122 | 140 | CTAGCATTCCTGCGGGGCCCCGAGGCT | B | 438 | 1242 | ++ |
LAAVGVGYA | B | 123 | 141 | CTAGCAGCCGTGGGCGTGGGCTACGCT | B | 439 | 1243 | ++ |
LADLGYPNA | B | 124 | 142 | CTAGCAGACCTGGGCTACCCCAACGCT | B | 440 | 1244 | ++ |
LAAKPKDGA | B | 125 | 143 | CTAGCAGCCAAGCCCAAGGACGGCGCT | B | 441 | 1245 | ++ |
LADKNRLQA | B | 126 | 144 | CTAGCAGACAAGAACCGGCTGCAGGCT | B | 442 | 1246 | ++ |
LADMTRFHA | B | 127 | 145 | CTAGCAGACATGACCCGGTTCCACGCT | B | 443 | 1247 | ++ |
LARSSTLNA | B | 128 | 146 | CTAGCACGGAGCAGCACCCTGAACGCT | B | 444 | 1248 | ++ |
LACYPPTCA | B | 129 | 147 | CTAGCATGCTACCCCCCCACCTGCGCT | B | 445 | 1249 | ++ |
LAKVSKGDA | B | 130 | 148 | CTAGCAAAGGTGAGCAAGGGCGACGCT | B | 446 | 1250 | ++ |
LAGGKQALA | B | 131 | 149 | CTAGCAGGCGGCAAGCAGGCCCTGGCT | B | 447 | 1251 | ++ |
LADIVGESA | B | 132 | 150 | CTAGCAGACATCGTGGGCGAGAGCGCT | B | 448 | 1252 | ++ |
LADFPSEKA | B | 133 | 151 | CTAGCAGACTTCCCCAGCGAGAAGGCT | B | 449 | 1253 | ++ |
LAHIQEPKA | B | 134 | 152 | CTAGCACACATCCAGGAGCCCAAGGCT | B | 450 | 1254 | ++ |
LAAANHDNA | B | 135 | 153 | CTAGCAGCCGCCAACCACGACAACGCT | B | 451 | 1255 | ++ |
LAALNSQTA | B | 136 | 154 | CTAGCAGCCCTGAACAGCCAGACCGCT | B | 452 | 1256 | ++ |
LAEPFPVAA | B | 137 | 155 | CTAGCAGAGCCCTTCCCCGTGGCCGCT | B | 453 | 1257 | ++ |
LAELDFKWA | B | 138 | 156 | CTAGCAGAGCTGGACTTCAAGTGGGCT | B | 454 | 1258 | ++ |
LAKFMWIHA | B | 139 | 157 | CTAGCAAAGTTCATGTGGATCCACGCT | B | 455 | 1259 | ++ |
LAQVQVEGA | B | 140 | 158 | CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT | B | 456 | 1260 | ++ |
LADILVGQA | B | 141 | 159 | CTAGCAGACATCCTGGTGGGCCAGGCT | B | 457 | 1261 | ++ |
LAQWFLWRA | B | 142 | 160 | CTAGCACAGTGGTTCCTGTGGCGGGCT | B | 458 | 1262 | ++ |
LALHQERQA | B | 143 | 161 | CTAGCACTGCACCAGGAGCGGCAGGCT | B | 459 | 1263 | ++ |
LACSSTWYA | B | 144 | 162 | CTAGCATGCAGCAGCACCTGGTACGCT | B | 460 | 1264 | ++ |
LAGSMAKLA | B | 145 | 163 | CTAGCAGGCAGCATGGCCAAGCTGGCT | B | 461 | 1265 | ++ |
LAPNTPKIA | B | 146 | 164 | CTAGCACCCAACACCCCCAAGATCGCT | B | 462 | 1266 | ++ |
LALDMWEPA | B | 147 | 165 | CTAGCACTGGACATGTGGGAGCCCGCT | B | 463 | 1267 | ++ |
LAGHAACFA | B | 148 | 166 | CTAGCAGGCCACGCCGCCTGCTTCGCT | B | 464 | 1268 | ++ |
LAVRTGSMA | B | 149 | 167 | CTAGCAGTGCGGACCGGCAGCATGGCT | B | 465 | 1269 | ++ |
LAGVVKTDA | B | 150 | 168 | CTAGCAGGCGTGGTGAAGACCGACGCT | B | 466 | 1270 | ++ |
LAKFAAKDA | B | 151 | 169 | CTAGCAAAGTTCGCCGCCAAGGACGCT | B | 467 | 1271 | ++ |
LAVNRVDMA | B | 152 | 170 | CTAGCAGTGAACCGGGTGGACATGGCT | B | 468 | 1272 | ++ |
LANNAEPSA | B | 153 | 171 | CTAGCAAACAACGCCGAGCCCAGCGCT | B | 469 | 1273 | ++ |
LAAKMYNGA | B | 154 | 172 | CTAGCAGCCAAGATGTACAACGGCGCT | B | 470 | 1274 | ++ |
LAEADKWYA | B | 155 | 173 | CTAGCAGAGGCCGACAAGTGGTACGCT | B | 471 | 1275 | ++ |
LARGTLMTA | B | 156 | 174 | CTAGCACGGGGCACCCTGATGACCGCT | B | 472 | 1276 | ++ |
LAKDKGLIA | B | 157 | 175 | CTAGCAAAGGACAAGGGCCTGATCGCT | B | 473 | 1277 | ++ |
LAQGNNTGA | B | 158 | 176 | CTAGCACAGGGCAACAACACCGGCGCT | B | 474 | 1278 | ++ |
LAWIERSMA | B | 159 | 177 | CTAGCATGGATCGAGCGGAGCATGGCT | B | 475 | 1279 | ++ |
LAYDNTAEA | B | 160 | 178 | CTAGCATACGACAACACCGCCGAGGCT | B | 476 | 1280 | ++ |
LAGFHAIEA | B | 161 | 179 | CTAGCAGGCTTCCACGCCATCGAGGCT | B | 477 | 1281 | ++ |
LAFGFSADA | B | 162 | 180 | CTAGCATTCGGCTTCAGCGCCGACGCT | B | 478 | 1282 | ++ |
LAEGMTGIA | B | 163 | 181 | CTAGCAGAGGGCATGACCGGCATCGCT | B | 479 | 1283 | ++ |
LAHDLHGGA | B | 164 | 182 | CTAGCACACGACCTGCACGGCGGCGCT | B | 480 | 1284 | ++ |
LAQAGDTAA | B | 165 | 183 | CTAGCACAGGCCGGCGACACCGCCGCT | B | 481 | 1285 | ++ |
LAGEVTKHA | B | 166 | 184 | CTAGCAGGCGAGGTGACCAAGCACGCT | B | 482 | 1286 | ++ |
LALNAAATA | B | 167 | 185 | CTAGCACTGAACGCCGCCGCCACCGCT | B | 483 | 1287 | ++ |
LADCMMINA | B | 168 | 186 | CTAGCAGACTGCATGATGATCAACGCT | B | 484 | 1288 | ++ |
LAYFHSYAA | B | 169 | 187 | CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT | B | 485 | 1289 | ++ |
LAISQPNPA | B | 170 | 188 | CTAGCAATCAGCCAGCCCAACCCCGCT | B | 486 | 1290 | ++ |
LAVAVDCFA | B | 171 | 189 | CTAGCAGTGGCCGTGGACTGCTTCGCT | B | 487 | 1291 | ++ |
LADHGNKPA | B | 172 | 190 | CTAGCAGACCACGGCAACAAGCCCGCT | B | 488 | 1292 | ++ |
LAAEHIGRA | B | 173 | 191 | CTAGCAGCCGAGCACATCGGCCGGGCT | B | 489 | 1293 | ++ |
LAVTPPWYA | B | 174 | 192 | CTAGCAGTGACCCCCCCCTGGTACGCT | B | 490 | 1294 | ++ |
LAVPKADAA | B | 175 | 193 | CTAGCAGTGCCCAAGGCCGACGCCGCT | B | 491 | 1295 | ++ |
LANMMAAGA | B | 176 | 194 | CTAGCAAACATGATGGCCGCCGGCGCT | B | 492 | 1296 | ++ |
LANVTLQSA | B | 177 | 195 | CTAGCAAACGTGACCCTGCAGAGCGCT | B | 493 | 1297 | ++ |
LAPIQLAQA | B | 178 | 196 | CTAGCACCCATCCAGCTGGCCCAGGCT | B | 494 | 1298 | ++ |
LANQGFLTA | B | 179 | 197 | CTAGCAAACCAGGGCTTCCTGACCGCT | B | 495 | 1299 | ++ |
LAPLQTQEA | B | 180 | 198 | CTAGCACCCCTGCAGACCCAGGAGGCT | B | 496 | 1300 | ++ |
LAEQVLEKA | B | 181 | 199 | CTAGCAGAGCAGGTGCTGGAGAAGGCT | B | 497 | 1301 | ++ |
LAVDIMRGA | B | 182 | 200 | CTAGCAGTGGACATCATGCGGGGCGCT | B | 498 | 1302 | ++ |
LACTFKPNA | B | 183 | 201 | CTAGCATGCACCTTCAAGCCCAACGCT | B | 499 | 1303 | ++ |
LATWCLVWA | B | 184 | 202 | CTAGCAACCTGGTGCCTGGTGTGGGCT | B | 500 | 1304 | + |
LAKSAGILA | B | 185 | 203 | CTAGCAAAGAGCGCCGGCATCCTGGCT | B | 501 | 1305 | + |
LAYGQQTTA | B | 186 | 204 | CTAGCATACGGCCAGCAGACCACCGCT | B | 502 | 1306 | + |
LAHAGSSSA | B | 187 | 205 | CTAGCACACGCCGGCAGCAGCAGCGCT | B | 503 | 1307 | + |
LAGKTISGA | B | 188 | 206 | CTAGCAGGCAAGACCATCAGCGGCGCT | B | 504 | 1308 | + |
LASIGFSAA | B | 189 | 207 | CTAGCAAGCATCGGCTTCAGCGCCGCT | B | 505 | 1309 | + |
LAFPCIKEA | B | 190 | 208 | CTAGCATTCCCCTGCATCAAGGAGGCT | B | 506 | 1310 | + |
LAMLGGTSA | B | 191 | 209 | CTAGCAATGCTGGGCGGCACCAGCGCT | B | 507 | 1311 | + |
LAGGSKLEA | B | 192 | 210 | CTAGCAGGCGGCAGCAAGCTGGAGGCT | B | 508 | 1312 | + |
LAADPTFKA | B | 193 | 211 | CTAGCAGCCGACCCCACCTTCAAGGCT | B | 509 | 1313 | + |
LAETTLTRA | B | 194 | 212 | CTAGCAGAGACCACCCTGACCCGGGCT | B | 510 | 1314 | + |
LAHDWGAPA | B | 195 | 213 | CTAGCACACGACTGGGGCGCCCCCGCT | B | 511 | 1315 | + |
LAMDREIKA | B | 196 | 214 | CTAGCAATGGACCGGGAGATCAAGGCT | B | 512 | 1316 | + |
LAVFQETGA | B | 197 | 215 | CTAGCAGTGTTCCAGGAGACCGGCGCT | B | 513 | 1317 | + |
LAQVEVSKA | B | 198 | 216 | CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT | B | 514 | 1318 | + |
LAPGNDLWA | B | 199 | 217 | CTAGCACCCGGCAACGACCTGTGGGCT | B | 515 | 1319 | + |
LAIPVEANA | B | 200 | 218 | CTAGCAATCCCCGTGGAGGCCAACGCT | B | 516 | 1320 | + |
LAKDGGKIA | B | 201 | 219 | CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT | B | 517 | 1321 | + |
LAERNHGYA | B | 202 | 220 | CTAGCAGAGCGGAACCACGGCTACGCT | B | 518 | 1322 | + |
LAMLACKGA | B | 203 | 221 | CTAGCAATGCTGGCCTGCAAGGGCGCT | B | 519 | 1323 | + |
LAHHKESIA | B | 204 | 222 | CTAGCACACCACAAGGAGAGCATCGCT | B | 520 | 1324 | + |
LAYHQWDDA | B | 205 | 223 | CTAGCATACCACCAGTGGGACGACGCT | B | 521 | 1325 | + |
LAKVASMNA | B | 206 | 224 | CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT | B | 522 | 1326 | + |
LANEGTIRA | B | 207 | 225 | CTAGCAAACGAGGGCACCATCCGGGCT | B | 523 | 1327 | + |
LAGKIEENA | B | 208 | 226 | CTAGCAGGCAAGATCGAGGAGAACGCT | B | 524 | 1328 | + |
LAPVKHTWA | B | 209 | 227 | CTAGCACCCGTGAAGCACACCTGGGCT | B | 525 | 1329 | + |
LADEGREHA | B | 210 | 228 | CTAGCAGACGAGGGCCGGGAGCACGCT | B | 526 | 1330 | + |
LALNNDQSA | B | 211 | 229 | CTAGCACTGAACAACGACCAGAGCGCT | B | 527 | 1331 | + |
LADVVSVSA | B | 212 | 230 | CTAGCAGACGTGGTGAGCGTGAGCGCT | B | 528 | 1332 | + |
LAPSKMGLA | B | 213 | 231 | CTAGCACCCAGCAAGATGGGCCTGGCT | B | 529 | 1333 | + |
LASACMRAA | B | 214 | 232 | CTAGCAAGCGCCTGCATGCGGGCCGCT | B | 530 | 1334 | + |
LAGDIVRNA | B | 215 | 233 | CTAGCAGGCGACATCGTGCGGAACGCT | B | 531 | 1335 | + |
LADTYKPYA | B | 216 | 234 | CTAGCAGACACCTACAAGCCCTACGCT | B | 532 | 1336 | + |
LAFPDKSIA | B | 217 | 235 | CTAGCATTCCCCGACAAGAGCATCGCT | B | 533 | 1337 | + |
LANADFPLA | B | 218 | 236 | CTAGCAAACGCCGACTTCCCCCTGGCT | B | 534 | 1338 | + |
LAKEGYRDA | B | 219 | 237 | CTAGCAAAGGAGGGCTACCGGGACGCT | B | 535 | 1339 | + |
LADPMPTHA | B | 220 | 238 | CTAGCAGACCCCATGCCCACCCACGCT | B | 536 | 1340 | + |
LAQNQKQIA | B | 221 | 239 | CTAGCACAGAACCAGAAGCAGATCGCT | B | 537 | 1341 | + |
LASENLNRA | B | 222 | 240 | CTAGCAAGCGAGAACCTGAACCGGGCT | B | 538 | 1342 | + |
LAFCTPRYA | B | 223 | 241 | CTAGCATTCTGCACCCCCCGGTACGCT | B | 539 | 1343 | + |
LANLKNFSA | B | 224 | 242 | CTAGCAAACCTGAAGAACTTCAGCGCT | B | 540 | 1344 | + |
LANAMEKHA | B | 225 | 243 | CTAGCAAACGCCATGGAGAAGCACGCT | B | 541 | 1345 | + |
LAMHESYNA | B | 226 | 244 | CTAGCAATGCACGAGAGCTACAACGCT | B | 542 | 1346 | + |
LAMKYVFDA | B | 227 | 245 | CTAGCAATGAAGTACGTGTTCGACGCT | B | 543 | 1347 | + |
LAKGQAQNA | B | 228 | 246 | CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT | B | 544 | 1348 | + |
LAFRTMEYA | B | 229 | 247 | CTAGCATTCCGGACCATGGAGTACGCT | B | 545 | 1349 | + |
LAKKVVDGA | B | 230 | 248 | CTAGCAAAGAAGGTGGTGGACGGCGCT | B | 546 | 1350 | + |
LAKGMKEGA | B | 231 | 249 | CTAGCAAAGGGCATGAAGGAGGGCGCT | B | 547 | 1351 | + |
LADDQAVNA | B | 232 | 250 | CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT | B | 548 | 1352 | + |
LANTWCKGA | B | 233 | 251 | CTAGCAAACACCTGGTGCAAGGGCGCT | B | 549 | 1353 | + |
LANQTTREA | B | 234 | 252 | CTAGCAAACCAGACCACCCGGGAGGCT | B | 550 | 1354 | + |
LADGIQKNA | B | 235 | 253 | CTAGCAGACGGCATCCAGAAGAACGCT | B | 551 | 1355 | + |
LAHQGAIIA | B | 236 | 254 | CTAGCACACCAGGGCGCCATCATCGCT | B | 552 | 1356 | + |
LADNCWCCA | B | 237 | 255 | CTAGCAGACAACTGCTGGTGCTGCGCT | B | 553 | 1357 | + |
LADVGCENA | B | 238 | 256 | CTAGCAGACGTGGGCTGCGAGAACGCT | B | 554 | 1358 | + |
LAGSRVNFA | B | 239 | 257 | CTAGCAGGCAGCCGGGTGAACTTCGCT | B | 555 | 1359 | + |
LATKSTGSA | B | 240 | 258 | CTAGCAACCAAGAGCACCGGCAGCGCT | B | 556 | 1360 | + |
LAAHQMASA | B | 241 | 259 | CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT | B | 557 | 1361 | + |
LAREDHRQA | B | 242 | 260 | CTAGCACGGGAGGACCACCGGCAGGCT | B | 558 | 1362 | + |
LAYLPLKYA | B | 243 | 261 | CTAGCATACCTGCCCCTGAAGTACGCT | B | 559 | 1363 | + |
LALETTQRA | B | 244 | 262 | CTAGCACTGGAGACCACCCAGCGGGCT | B | 560 | 1364 | + |
LAEGLSQFA | B | 245 | 263 | CTAGCAGAGGGCCTGAGCCAGTTCGCT | B | 561 | 1365 | + |
LADWRTTPA | B | 246 | 264 | CTAGCAGACTGGCGGACCACCCCCGCT | B | 562 | 1366 | + |
LAETVKYMA | B | 247 | 265 | CTAGCAGAGACCGTGAAGTACATGGCT | B | 563 | 1367 | + |
LAAVKAVVA | B | 248 | 266 | CTAGCAGCCGTGAAGGCCGTGGTGGCT | B | 564 | 1368 | + |
LAKGQSQGA | B | 249 | 267 | CTAGCAAAGGGCCAGAGCCAGGGCGCT | B | 565 | 1369 | + |
LAVEPGPPA | B | 250 | 268 | CTAGCAGTGGAGCCCGGCCCCCCCGCT | B | 566 | 1370 | + |
LAAEHKQTA | B | 251 | 269 | CTAGCAGCCGAGCACAAGCAGACCGCT | B | 567 | 1371 | + |
LAHYPSAPA | B | 252 | 270 | CTAGCACACTACCCCAGCGCCCCCGCT | B | 568 | 1372 | + |
LATRADIFA | B | 253 | 271 | CTAGCAACCCGGGCCGACATCTTCGCT | B | 569 | 1373 | + |
LAYLRALKA | B | 254 | 272 | CTAGCATACCTGCGGGCCCTGAAGGCT | B | 570 | 1374 | + |
LAQNQWTDA | B | 255 | 273 | CTAGCACAGAACCAGTGGACCGACGCT | B | 571 | 1375 | + |
LAGGAWDWA | B | 256 | 274 | CTAGCAGGCGGCGCCTGGGACTGGGCT | B | 572 | 1376 | + |
LADENLQAA | B | 257 | 275 | CTAGCAGACGAGAACCTGCAGGCCGCT | B | 573 | 1377 | + |
LANRLSNVA | B | 258 | 276 | CTAGCAAACCGGCTGAGCAACGTGGCT | B | 574 | 1378 | + |
LAEPPDPPA | B | 259 | 277 | CTAGCAGAGCCCCCCGACCCCCCCGCT | B | 575 | 1379 | + |
LAQEAKLTA | B | 260 | 278 | CTAGCACAGGAGGCCAAGCTGACCGCT | B | 576 | 1380 | + |
LAHTPDTFA | B | 261 | 279 | CTAGCACACACCCCCGACACCTTCGCT | B | 577 | 1381 | + |
LAGESSYLA | B | 262 | 280 | CTAGCAGGCGAGAGCAGCTACCTGGCT | B | 578 | 1382 | + |
LADLTLRAA | B | 263 | 281 | CTAGCAGACCTGACCCTGCGGGCCGCT | B | 579 | 1383 | + |
LAKRDKPTA | B | 264 | 282 | CTAGCAAAGCGGGACAAGCCCACCGCT | B | 580 | 1384 | + |
LANRWAIDA | B | 265 | 283 | CTAGCAAACCGGTGGGCCATCGACGCT | B | 581 | 1385 | + |
LACRSDCVA | B | 266 | 284 | CTAGCATGCCGGAGCGACTGCGTGGCT | B | 582 | 1386 | + |
LAKPTGKDA | B | 267 | 285 | CTAGCAAAGCCCACCGGCAAGGACGCT | B | 583 | 1387 | + |
LAGHKHDEA | B | 268 | 286 | CTAGCAGGCCACAAGCACGACGAGGCT | B | 584 | 1388 | + |
LAAQDVSWA | B | 269 | 287 | CTAGCAGCCCAGGACGTGAGCTGGGCT | B | 585 | 1389 | + |
LADVGCENA | B | 270 | 288 | CTAGCAGACGTGGGCTGCGAGAACGCT | B | 586 | 1390 | + |
LAKGPASIA | B | 271 | 289 | CTAGCAAAGGGCCCCGCCAGCATCGCT | B | 587 | 1391 | + |
LAGPQRFQA | B | 272 | 290 | CTAGCAGGCCCCCAGCGGTTCCAGGCT | B | 588 | 1392 | + |
LAATICTEA | B | 273 | 291 | CTAGCAGCCACCATCTGCACCGAGGCT | B | 589 | 1393 | + |
LAMTNTFLA | B | 274 | 292 | CTAGCAATGACCAACACCTTCCTGGCT | B | 590 | 1394 | + |
LAKGMKEGA | B | 275 | 293 | CTAGCAAAGGGCATGAAGGAGGGCGCT | B | 591 | 1395 | + |
LAKGVTTAA | B | 276 | 294 | CTAGCAAAGGGCGTGACCACCGCCGCT | B | 592 | 1396 | + |
LARFRGMCA | B | 277 | 295 | CTAGCACGGTTCCGGGGCATGTGCGCT | B | 593 | 1397 | + |
TSHVSTSS | B | 278 | 296 | ACCAGCCACGTGAGCACCAGCAGC | B | 594 | 1398 | +++ |
SGVLFTEG | B | 279 | 297 | AGCGGCGTGCTGTTCACCGAGGGC | B | 595 | 1399 | +++ |
TSGMGAIG | B | 280 | 298 | ACCAGCGGCATGGGCGCCATCGGC | B | 596 | 1400 | +++ |
TGDSEQQT | B | 281 | 299 | ACCGGCGACAGCGAGCAGCAGACC | B | 597 | 1401 | +++ |
SGPGTSGT | B | 282 | 300 | AGCGGCCCCGGCACCAGCGGCACC | B | 598 | 1402 | +++ |
SGSVGYVG | B | 283 | 301 | AGCGGCAGCGTGGGCTACGTGGGC | B | 599 | 1403 | +++ |
TGEGPTKG | B | 284 | 302 | ACCGGCGAGGGCCCCACCAAGGGC | B | 600 | 1404 | +++ |
TGDKWPQG | B | 285 | 303 | ACCGGCGACAAGTGGCCCCAGGGC | B | 601 | 1405 | +++ |
SGEMTKPG | B | 286 | 304 | AGCGGCGAGATGACCAAGCCCGGC | B | 602 | 1406 | ++ |
TTENHKPG | B | 287 | 305 | ACCACCGAGAACCACAAGCCCGGC | B | 603 | 1407 | ++ |
SGREIHFG | B | 288 | 306 | AGCGGCCGGGAGATCCACTTCGGC | B | 604 | 1408 | ++ |
SSENNKGG | B | 289 | 307 | AGCAGCGAGAACAACAAGGGCGGC | B | 605 | 1409 | ++ |
TSQEKQNS | B | 290 | 308 | ACCAGCCAGGAGAAGCAGAACAGC | B | 606 | 1410 | ++ |
GTMFNNST | B | 291 | 309 | GGCACCATGTTCAACAACAGCACC | B | 607 | 1411 | + |
TTGMERPT | B | 292 | 310 | ACCACCGGCATGGAGCGGCCCACC | B | 608 | 1412 | + |
SGPKETGG | B | 293 | 311 | AGCGGCCCCAAGGAGACCGGCGGC | B | 609 | 1413 | + |
SGIDTRLG | B | 294 | 312 | AGCGGCATCGACACCCGGCTGGGC | B | 610 | 1414 | + |
STVPLNMG | B | 295 | 313 | AGCACCGTGCCCCTGAACATGGGC | B | 611 | 1415 | + |
TGIATSYS | B | 296 | 314 | ACCGGCATCGCCACCAGCTACAGC | B | 612 | 1416 | + |
TGDERKPG | B | 297 | 315 | ACCGGCGACGAGCGGAAGCCCGGC | B | 613 | 1417 | + |
TGPGTHNG | B | 298 | 316 | ACCGGCCCCGGCACCCACAACGGC | B | 614 | 1418 | + |
STTKPM | B | 299 | 317 | AGCACCACCAAGCCCATG | B | 615 | 1419 | +++ |
CKEITR | B | 300 | 318 | TGCAAGGAGATCACCCGG | B | 616 | 1420 | +++ |
SKMRPA | B | 301 | 319 | AGCAAGATGCGGCCCGCC | B | 617 | 1421 | +++ |
PPNQYI | B | 302 | 320 | CCCCCCAACCAGTACATC | B | 618 | 1422 | +++ |
PDVSLL | B | 303 | 321 | CCCGACGTGAGCCTGCTG | B | 619 | 1423 | +++ |
HSKDGA | B | 304 | 322 | CACAGCAAGGACGGCGCC | B | 620 | 1424 | +++ |
KFRHTE | B | 305 | 323 | AAGTTCCGGCACACCGAG | B | 621 | 1425 | +++ |
LWMTTV | B | 306 | 324 | CTGTGGATGACCACCGTG | B | 622 | 1426 | +++ |
RPGRVS | B | 307 | 325 | CGGCCCGGCCGGGTGAGC | B | 623 | 1427 | +++ |
NIKKAA | B | 308 | 326 | AACATCAAGAAGGCCGCC | B | 624 | 1428 | +++ |
RLGRLS | B | 309 | 327 | CGGCTGGGCCGGCTGAGC | B | 625 | 1429 | ++ |
FNKVLH | B | 310 | 328 | TTCAACAAGGTGCTGCAC | B | 626 | 1430 | ++ |
RTGRNT | B | 311 | 329 | CGGACCGGCCGGAACACC | B | 627 | 1431 | ++ |
RALKIS | B | 312 | 330 | CGGGCCCTGAAGATCAGC | B | 628 | 1432 | ++ |
RLGKVP | B | 313 | 331 | CGGCTGGGCAAGGTGCCC | B | 629 | 1433 | + |
KFTKAA | B | 314 | 332 | AAGTTCACCAAGGCCGCC | B | 630 | 1434 | + |
HFPVFS | B | 315 | 333 | CACTTCCCCGTGTTCAGC | B | 631 | 1435 | + |
NSKKLG | B | 316 | 334 | AACAGCAAGAAGCTGGGC | B | 632 | 1436 | + |
KAMRTG | B | 317 | 335 | AAGGCCATGCGGACCGGC | B | 633 | 1437 | + |
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**用於序列表之SEQ ID NO。
[表1C]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 編碼胺基酸序列之核酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 活性水平* | ||
LAEFRVGQA | C | 2 | 336 | CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT | C | 46 | 1438 | +++ |
LAGIQQHVA | C | 3 | 337 | CTAGCAGGCATCCAGCAGCACGTGGCT | C | 47 | 1439 | +++ |
LAQVTEMRA | C | 4 | 338 | CTAGCACAGGTGACCGAGATGCGGGCT | C | 48 | 1440 | +++ |
LAFNGSTSA | C | 5 | 339 | CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT | C | 49 | 1441 | +++ |
LAKGFKTEA | C | 6 | 340 | CTAGCAAAGGGCTTCAAGACCGAGGCT | C | 50 | 1442 | +++ |
LAAGQAQSA | C | 7 | 341 | CTAGCAGCCGGCCAGGCCCAGAGCGCT | C | 51 | 1443 | +++ |
LAFLRGPEA | C | 8 | 342 | CTAGCATTCCTGCGGGGCCCCGAGGCT | C | 52 | 1444 | +++ |
LAQVQVEGA | C | 9 | 343 | CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT | C | 53 | 1445 | +++ |
LAGSMAKLA | C | 10 | 344 | CTAGCAGGCAGCATGGCCAAGCTGGCT | C | 54 | 1446 | +++ |
LAGHAACFA | C | 11 | 345 | CTAGCAGGCCACGCCGCCTGCTTCGCT | C | 55 | 1447 | +++ |
LAVNRVDMA | C | 12 | 346 | CTAGCAGTGAACCGGGTGGACATGGCT | C | 56 | 1448 | +++ |
LAGFHAIEA | C | 13 | 347 | CTAGCAGGCTTCCACGCCATCGAGGCT | C | 57 | 1449 | +++ |
LAYFHSYAA | C | 14 | 348 | CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT | C | 58 | 1450 | +++ |
LADHGNKPA | C | 15 | 349 | CTAGCAGACCACGGCAACAAGCCCGCT | C | 59 | 1451 | ++ |
LAPIQLAQA | C | 16 | 350 | CTAGCACCCATCCAGCTGGCCCAGGCT | C | 60 | 1452 | ++ |
LAPLQTQEA | C | 18 | 351 | CTAGCACCCCTGCAGACCCAGGAGGCT | C | 61 | 1453 | ++ |
LAEQVLEKA | C | 19 | 352 | CTAGCAGAGCAGGTGCTGGAGAAGGCT | C | 62 | 1454 | ++ |
LAFPCIKEA | C | 20 | 353 | CTAGCATTCCCCTGCATCAAGGAGGCT | C | 63 | 1455 | ++ |
LAQVEVSKA | C | 21 | 354 | CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT | C | 64 | 1456 | ++ |
LAKDGGKIA | C | 22 | 355 | CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT | C | 65 | 1457 | ++ |
LAKVASMNA | C | 23 | 356 | CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT | C | 66 | 1458 | ++ |
LADEGREHA | C | 24 | 357 | CTAGCAGACGAGGGCCGGGAGCACGCT | C | 67 | 1459 | ++ |
LASACMRAA | C | 25 | 358 | CTAGCAAGCGCCTGCATGCGGGCCGCT | C | 68 | 1460 | ++ |
LAGDIVRNA | C | 26 | 359 | CTAGCAGGCGACATCGTGCGGAACGCT | C | 69 | 1461 | ++ |
LADPMPTHA | C | 27 | 360 | CTAGCAGACCCCATGCCCACCCACGCT | C | 70 | 1462 | ++ |
LAFCTPRYA | C | 28 | 361 | CTAGCATTCTGCACCCCCCGGTACGCT | C | 71 | 1463 | ++ |
LANAMEKHA | C | 29 | 362 | CTAGCAAACGCCATGGAGAAGCACGCT | C | 72 | 1464 | + |
LAMHESYNA | C | 30 | 363 | CTAGCAATGCACGAGAGCTACAACGCT | C | 73 | 1465 | + |
LAKGQAQNA | C | 31 | 364 | CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT | C | 74 | 1466 | + |
LADDQAVNA | C | 32 | 365 | CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT | C | 75 | 1467 | + |
LADGIQKNA | C | 33 | 366 | CTAGCAGACGGCATCCAGAAGAACGCT | C | 76 | 1468 | + |
LAAHQMASA | C | 34 | 367 | CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT | C | 77 | 1469 | + |
LAETVKYMA | C | 35 | 368 | CTAGCAGAGACCGTGAAGTACATGGCT | C | 78 | 1470 | + |
LAKGQSQGA | C | 36 | 369 | CTAGCAAAGGGCCAGAGCCAGGGCGCT | C | 79 | 1471 | + |
LAVEPGPPA | C | 37 | 370 | CTAGCAGTGGAGCCCGGCCCCCCCGCT | C | 80 | 1472 | + |
LAAEHKQTA | C | 38 | 371 | CTAGCAGCCGAGCACAAGCAGACCGCT | C | 81 | 1473 | + |
LAEPPDPPA | C | 39 | 372 | CTAGCAGAGCCCCCCGACCCCCCCGCT | C | 82 | 1474 | + |
LAHTPDTFA | C | 40 | 373 | CTAGCACACACCCCCGACACCTTCGCT | C | 83 | 1475 | + |
LAKGPASIA | C | 41 | 374 | CTAGCAAAGGGCCCCGCCAGCATCGCT | C | 84 | 1476 | + |
LAKGMKEGA | C | 42 | 375 | CTAGCAAAGGGCATGAAGGAGGGCGCT | C | 85 | 1477 | + |
LAKGVTTAA | C | 43 | 376 | CTAGCAAAGGGCGTGACCACCGCCGCT | C | 86 | 1478 | + |
NSKKLG | C | 44 | 377 | AACAGCAAGAAGCTGGGC | C | 87 | 1479 | + |
KAMRTG | C | 45 | 378 | AAGGCCATGCGGACCGGC | C | 88 | 1480 | + |
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1D]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 編碼胺基酸序列之核酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 活性水平* | ||
LAKINAQPA | D | 2 | 379 | CTAGCAAAGATCAACGCCCAGCCCGCT | D | 79 | 1481 | +++ |
LAEEEKYGA | D | 3 | 380 | CTAGCAGAGGAGGAGAAGTACGGCGCT | D | 80 | 1482 | +++ |
LALEVGDHA | D | 4 | 381 | CTAGCACTGGAGGTGGGCGACCACGCT | D | 81 | 1483 | +++ |
LAIGSDTSA | D | 5 | 382 | CTAGCAATCGGCAGCGACACCAGCGCT | D | 82 | 1484 | +++ |
LAAVHLMGA | D | 6 | 383 | CTAGCAGCCGTGCACCTGATGGGCGCT | D | 83 | 1485 | +++ |
LAVRNEINA | D | 7 | 384 | CTAGCAGTGCGGAACGAGATCAACGCT | D | 84 | 1486 | +++ |
LAQVKQGPA | D | 8 | 385 | CTAGCACAGGTGAAGCAGGGCCCCGCT | D | 85 | 1487 | +++ |
LANKNTAIA | D | 9 | 386 | CTAGCAAACAAGAACACCGCCATCGCT | D | 86 | 1488 | +++ |
LAEHKNMHA | D | 10 | 387 | CTAGCAGAGCACAAGAACATGCACGCT | D | 87 | 1489 | +++ |
LAEVTYTGA | D | 11 | 388 | CTAGCAGAGGTGACCTACACCGGCGCT | D | 88 | 1490 | +++ |
LASADHQPA | D | 12 | 389 | CTAGCAAGCGCCGACCACCAGCCCGCT | D | 89 | 1491 | +++ |
LAEFDGDGA | D | 13 | 390 | CTAGCAGAGTTCGACGGCGACGGCGCT | D | 90 | 1492 | +++ |
LADFPSEKA | D | 14 | 391 | CTAGCAGACTTCCCCAGCGAGAAGGCT | D | 91 | 1493 | +++ |
LALDMWEPA | D | 15 | 392 | CTAGCACTGGACATGTGGGAGCCCGCT | D | 92 | 1494 | +++ |
LAKFAAKDA | D | 16 | 393 | CTAGCAAAGTTCGCCGCCAAGGACGCT | D | 93 | 1495 | +++ |
LANNAEPSA | D | 17 | 394 | CTAGCAAACAACGCCGAGCCCAGCGCT | D | 94 | 1496 | +++ |
LAHDWGAPA | D | 18 | 395 | CTAGCACACGACTGGGGCGCCCCCGCT | D | 95 | 1497 | +++ |
LAMDREIKA | D | 19 | 396 | CTAGCAATGGACCGGGAGATCAAGGCT | D | 96 | 1498 | +++ |
LAQGNNTGA | D | 20 | 397 | CTAGCACAGGGCAACAACACCGGCGCT | D | 97 | 1499 | +++ |
LADNLNTPA | D | 21 | 398 | CTAGCAGACAACCTGAACACCCCCGCT | D | 98 | 1500 | +++ |
LAAANHDNA | D | 22 | 399 | CTAGCAGCCGCCAACCACGACAACGCT | D | 99 | 1501 | +++ |
LAVPKADAA | D | 23 | 400 | CTAGCAGTGCCCAAGGCCGACGCCGCT | D | 100 | 1502 | +++ |
LAVFQETGA | D | 24 | 401 | CTAGCAGTGTTCCAGGAGACCGGCGCT | D | 101 | 1503 | +++ |
LAAVKAVVA | D | 25 | 402 | CTAGCAGCCGTGAAGGCCGTGGTGGCT | D | 102 | 1504 | +++ |
LADNCWCCA | D | 26 | 403 | CTAGCAGACAACTGCTGGTGCTGCGCT | D | 103 | 1505 | +++ |
LAHAGSSSA | D | 27 | 404 | CTAGCACACGCCGGCAGCAGCAGCGCT | D | 104 | 1506 | +++ |
LAGIQQHVA | D | 28 | 405 | CTAGCAGGCATCCAGCAGCACGTGGCT | D | 105 | 1507 | ++ |
LAHDLHGGA | D | 29 | 406 | CTAGCACACGACCTGCACGGCGGCGCT | D | 106 | 1508 | ++ |
LAMHESYNA | D | 30 | 407 | CTAGCAATGCACGAGAGCTACAACGCT | D | 107 | 1509 | ++ |
LATPNVNAA | D | 31 | 408 | CTAGCAACCCCCAACGTGAACGCCGCT | D | 108 | 1510 | ++ |
LAFNGSTSA | D | 32 | 409 | CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT | D | 109 | 1511 | ++ |
LAEGLSQFA | D | 33 | 410 | CTAGCAGAGGGCCTGAGCCAGTTCGCT | D | 110 | 1512 | ++ |
LAQVTEMRA | D | 34 | 411 | CTAGCACAGGTGACCGAGATGCGGGCT | D | 111 | 1513 | ++ |
LAAHQMASA | D | 35 | 412 | CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT | D | 112 | 1514 | ++ |
LASACMRAA | D | 36 | 413 | CTAGCAAGCGCCTGCATGCGGGCCGCT | D | 113 | 1515 | ++ |
LADGIQKNA | D | 37 | 414 | CTAGCAGACGGCATCCAGAAGAACGCT | D | 114 | 1516 | ++ |
LAHIQEPKA | D | 38 | 415 | CTAGCACACATCCAGGAGCCCAAGGCT | D | 115 | 1517 | ++ |
LAAGQAQSA | D | 39 | 416 | CTAGCAGCCGGCCAGGCCCAGAGCGCT | D | 116 | 1518 | ++ |
LADHGNKPA | D | 40 | 417 | CTAGCAGACCACGGCAACAAGCCCGCT | D | 117 | 1519 | ++ |
LAFLRGPEA | D | 41 | 418 | CTAGCATTCCTGCGGGGCCCCGAGGCT | D | 118 | 1520 | ++ |
LAETVKYMA | D | 42 | 419 | CTAGCAGAGACCGTGAAGTACATGGCT | D | 119 | 1521 | ++ |
LADEGREHA | D | 43 | 420 | CTAGCAGACGAGGGCCGGGAGCACGCT | D | 120 | 1522 | ++ |
LAGDIVRNA | D | 44 | 421 | CTAGCAGGCGACATCGTGCGGAACGCT | D | 121 | 1523 | ++ |
LAGSMAKLA | D | 45 | 422 | CTAGCAGGCAGCATGGCCAAGCTGGCT | D | 122 | 1524 | ++ |
LAKGMKEGA | D | 46 | 423 | CTAGCAAAGGGCATGAAGGAGGGCGCT | D | 123 | 1525 | ++ |
LAEPPDPPA | D | 47 | 424 | CTAGCAGAGCCCCCCGACCCCCCCGCT | D | 124 | 1526 | ++ |
LATWCLVWA | D | 48 | 425 | CTAGCAACCTGGTGCCTGGTGTGGGCT | D | 125 | 1527 | ++ |
LAFPCIKEA | D | 49 | 426 | CTAGCATTCCCCTGCATCAAGGAGGCT | D | 126 | 1528 | ++ |
LAKGFKTEA | D | 50 | 427 | CTAGCAAAGGGCTTCAAGACCGAGGCT | D | 127 | 1529 | + |
LAKGQSQGA | D | 51 | 428 | CTAGCAAAGGGCCAGAGCCAGGGCGCT | D | 128 | 1530 | + |
LAEQVLEKA | D | 52 | 429 | CTAGCAGAGCAGGTGCTGGAGAAGGCT | D | 129 | 1531 | + |
LAKGPASIA | D | 53 | 430 | CTAGCAAAGGGCCCCGCCAGCATCGCT | D | 130 | 1532 | + |
LAEFRVGQA | D | 54 | 431 | CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT | D | 131 | 1533 | + |
LAVEPGPPA | D | 55 | 432 | CTAGCAGTGGAGCCCGGCCCCCCCGCT | D | 132 | 1534 | + |
LAVNRVDMA | D | 56 | 433 | CTAGCAGTGAACCGGGTGGACATGGCT | D | 133 | 1535 | + |
LAYFHSYAA | D | 57 | 434 | CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT | D | 134 | 1536 | + |
LAHTPDTFA | D | 58 | 435 | CTAGCACACACCCCCGACACCTTCGCT | D | 135 | 1537 | + |
LAFCTPRYA | D | 59 | 436 | CTAGCATTCTGCACCCCCCGGTACGCT | D | 136 | 1538 | + |
LAAEHKQTA | D | 60 | 437 | CTAGCAGCCGAGCACAAGCAGACCGCT | D | 137 | 1539 | + |
LAPIQLAQA | D | 61 | 438 | CTAGCACCCATCCAGCTGGCCCAGGCT | D | 138 | 1540 | + |
LAQVEVSKA | D | 62 | 439 | CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT | D | 139 | 1541 | + |
LAPLQTQEA | D | 63 | 440 | CTAGCACCCCTGCAGACCCAGGAGGCT | D | 140 | 1542 | + |
LARAITNEA | D | 64 | 441 | CTAGCACGGGCCATCACCAACGAGGCT | D | 141 | 1543 | + |
LAGHAACFA | D | 65 | 442 | CTAGCAGGCCACGCCGCCTGCTTCGCT | D | 142 | 1544 | + |
LAGFHAIEA | D | 66 | 443 | CTAGCAGGCTTCCACGCCATCGAGGCT | D | 143 | 1545 | + |
LAQVQVEGA | D | 67 | 444 | CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT | D | 144 | 1546 | + |
LANAMEKHA | D | 68 | 445 | CTAGCAAACGCCATGGAGAAGCACGCT | D | 145 | 1547 | + |
LADPMPTHA | D | 69 | 446 | CTAGCAGACCCCATGCCCACCCACGCT | D | 146 | 1548 | + |
LAKVASMNA | D | 70 | 447 | CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT | D | 147 | 1549 | + |
LAKGQAQNA | D | 71 | 448 | CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT | D | 148 | 1550 | + |
LAKDGGKIA | D | 72 | 449 | CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT | D | 149 | 1551 | + |
LADDQAVNA | D | 73 | 450 | CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT | D | 150 | 1552 | + |
LAKGVTTAA | D | 74 | 451 | CTAGCAAAGGGCGTGACCACCGCCGCT | D | 151 | 1553 | + |
SGPKETGG | D | 75 | 452 | AGCGGCCCCAAGGAGACCGGCGGC | D | 152 | 1554 | ++ |
TGPGTHNG | D | 76 | 453 | ACCGGCCCCGGCACCCACAACGGC | D | 153 | 1555 | ++ |
NSKKLG | D | 77 | 454 | AACAGCAAGAAGCTGGGC | D | 154 | 1556 | + |
KAMRTG | D | 78 | 455 | AAGGCCATGCGGACCGGC | D | 155 | 1557 | + |
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1E]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 編碼胺基酸序列之核酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 活性水平* | ||
LAELALIKA | E | 2 | 456 | CTAGCAGAGCTGGCCCTGATCAAGGCT | E | 84 | 1558 | +++ |
LADLSDHHA | E | 3 | 457 | CTAGCAGACCTGAGCGACCACCACGCT | E | 85 | 1559 | +++ |
LADPLYAVA | E | 4 | 458 | CTAGCAGACCCCCTGTACGCCGTGGCT | E | 86 | 1560 | +++ |
LAPMRGVYA | E | 5 | 459 | CTAGCACCCATGCGGGGCGTGTACGCT | E | 87 | 1561 | +++ |
LAITQSDIA | E | 6 | 460 | CTAGCAATCACCCAGAGCGACATCGCT | E | 88 | 1562 | +++ |
LADDMIFVA | E | 7 | 461 | CTAGCAGACGACATGATCTTCGTGGCT | E | 89 | 1563 | +++ |
LAEFRVGQA | E | 8 | 462 | CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT | E | 90 | 1564 | +++ |
LAKALGMEA | E | 9 | 463 | CTAGCAAAGGCCCTGGGCATGGAGGCT | E | 91 | 1565 | +++ |
LACPVAEWA | E | 10 | 464 | CTAGCATGCCCCGTGGCCGAGTGGGCT | E | 92 | 1566 | +++ |
LANEAQGKA | E | 11 | 465 | CTAGCAAACGAGGCCCAGGGCAAGGCT | E | 93 | 1567 | +++ |
LAQVTEMRA | E | 12 | 466 | CTAGCACAGGTGACCGAGATGCGGGCT | E | 94 | 1568 | +++ |
LAIGERTTA | E | 13 | 467 | CTAGCAATCGGCGAGCGGACCACCGCT | E | 95 | 1569 | +++ |
LANLKENEA | E | 14 | 468 | CTAGCAAACCTGAAGGAGAACGAGGCT | E | 96 | 1570 | +++ |
LAFNGSTSA | E | 15 | 469 | CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT | E | 97 | 1571 | +++ |
LAQEQNAAA | E | 16 | 470 | CTAGCACAGGAGCAGAACGCCGCCGCT | E | 98 | 1572 | +++ |
LAPTTIGGA | E | 17 | 471 | CTAGCACCCACCACCATCGGCGGCGCT | E | 99 | 1573 | +++ |
LAPSGDRHA | E | 18 | 472 | CTAGCACCCAGCGGCGACCGGCACGCT | E | 100 | 1574 | +++ |
LAKDHHVIA | E | 19 | 473 | CTAGCAAAGGACCACCACGTGATCGCT | E | 101 | 1575 | +++ |
LAQKKLLEA | E | 20 | 474 | CTAGCACAGAAGAAGCTGCTGGAGGCT | E | 102 | 1576 | +++ |
LAFLRGPEA | E | 21 | 475 | CTAGCATTCCTGCGGGGCCCCGAGGCT | E | 103 | 1577 | ++ |
LARSSTLNA | E | 22 | 476 | CTAGCACGGAGCAGCACCCTGAACGCT | E | 104 | 1578 | ++ |
LAHIQEPKA | E | 23 | 477 | CTAGCACACATCCAGGAGCCCAAGGCT | E | 105 | 1579 | ++ |
LAQVQVEGA | E | 24 | 478 | CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT | E | 106 | 1580 | ++ |
LAPNTPKIA | E | 25 | 479 | CTAGCACCCAACACCCCCAAGATCGCT | E | 107 | 1581 | ++ |
LAVNRVDMA | E | 26 | 480 | CTAGCAGTGAACCGGGTGGACATGGCT | E | 108 | 1582 | ++ |
LAGFHAIEA | E | 27 | 481 | CTAGCAGGCTTCCACGCCATCGAGGCT | E | 109 | 1583 | ++ |
LAEGMTGIA | E | 28 | 482 | CTAGCAGAGGGCATGACCGGCATCGCT | E | 110 | 1584 | ++ |
LAGEVTKHA | E | 29 | 483 | CTAGCAGGCGAGGTGACCAAGCACGCT | E | 111 | 1585 | ++ |
LAYFHSYAA | E | 30 | 484 | CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT | E | 112 | 1586 | ++ |
LAPLQTQEA | E | 31 | 485 | CTAGCACCCCTGCAGACCCAGGAGGCT | E | 113 | 1587 | ++ |
LAFPCIKEA | E | 32 | 486 | CTAGCATTCCCCTGCATCAAGGAGGCT | E | 114 | 1588 | ++ |
LAQVEVSKA | E | 33 | 487 | CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT | E | 115 | 1589 | ++ |
LAPGNDLWA | E | 34 | 488 | CTAGCACCCGGCAACGACCTGTGGGCT | E | 116 | 1590 | ++ |
LAKDGGKIA | E | 35 | 489 | CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT | E | 117 | 1591 | ++ |
LAKVASMNA | E | 36 | 490 | CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT | E | 118 | 1592 | ++ |
LAGKIEENA | E | 37 | 491 | CTAGCAGGCAAGATCGAGGAGAACGCT | E | 119 | 1593 | ++ |
LAPVKHTWA | E | 38 | 492 | CTAGCACCCGTGAAGCACACCTGGGCT | E | 120 | 1594 | ++ |
LALNNDQSA | E | 39 | 493 | CTAGCACTGAACAACGACCAGAGCGCT | E | 121 | 1595 | ++ |
LAGDIVRNA | E | 40 | 494 | CTAGCAGGCGACATCGTGCGGAACGCT | E | 122 | 1596 | ++ |
LANADFPLA | E | 41 | 495 | CTAGCAAACGCCGACTTCCCCCTGGCT | E | 123 | 1597 | ++ |
LAKEGYRDA | E | 42 | 496 | CTAGCAAAGGAGGGCTACCGGGACGCT | E | 124 | 1598 | ++ |
LADPMPTHA | E | 43 | 497 | CTAGCAGACCCCATGCCCACCCACGCT | E | 125 | 1599 | ++ |
LAFCTPRYA | E | 44 | 498 | CTAGCATTCTGCACCCCCCGGTACGCT | E | 126 | 1600 | + |
LANLKNFSA | E | 45 | 499 | CTAGCAAACCTGAAGAACTTCAGCGCT | E | 127 | 1601 | + |
LANAMEKHA | E | 46 | 500 | CTAGCAAACGCCATGGAGAAGCACGCT | E | 128 | 1602 | + |
LAKGQAQNA | E | 47 | 501 | CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT | E | 129 | 1603 | + |
LADDQAVNA | E | 48 | 502 | CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT | E | 130 | 1604 | + |
LANTWCKGA | E | 49 | 503 | CTAGCAAACACCTGGTGCAAGGGCGCT | E | 131 | 1605 | + |
LADVGCENA | E | 50 | 504 | CTAGCAGACGTGGGCTGCGAGAACGCT | E | 132 | 1606 | + |
LAGSRVNFA | E | 51 | 505 | CTAGCAGGCAGCCGGGTGAACTTCGCT | E | 133 | 1607 | + |
LAAHQMASA | E | 52 | 506 | CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT | E | 134 | 1608 | + |
LAREDHRQA | E | 53 | 507 | CTAGCACGGGAGGACCACCGGCAGGCT | E | 135 | 1609 | + |
LAVEPGPPA | E | 54 | 508 | CTAGCAGTGGAGCCCGGCCCCCCCGCT | E | 136 | 1610 | + |
LATRADIFA | E | 55 | 509 | CTAGCAACCCGGGCCGACATCTTCGCT | E | 137 | 1611 | + |
LAQNQWTDA | E | 56 | 510 | CTAGCACAGAACCAGTGGACCGACGCT | E | 138 | 1612 | + |
LADENLQAA | E | 57 | 511 | CTAGCAGACGAGAACCTGCAGGCCGCT | E | 139 | 1613 | + |
LAEPPDPPA | E | 58 | 512 | CTAGCAGAGCCCCCCGACCCCCCCGCT | E | 140 | 1614 | + |
LAQEAKLTA | E | 59 | 513 | CTAGCACAGGAGGCCAAGCTGACCGCT | E | 141 | 1615 | + |
LAHTPDTFA | E | 60 | 514 | CTAGCACACACCCCCGACACCTTCGCT | E | 142 | 1616 | + |
LADLTLRAA | E | 61 | 515 | CTAGCAGACCTGACCCTGCGGGCCGCT | E | 143 | 1617 | + |
LANRWAIDA | E | 62 | 516 | CTAGCAAACCGGTGGGCCATCGACGCT | E | 144 | 1618 | + |
LAKPTGKDA | E | 63 | 517 | CTAGCAAAGCCCACCGGCAAGGACGCT | E | 145 | 1619 | + |
LAKGPASIA | E | 64 | 518 | CTAGCAAAGGGCCCCGCCAGCATCGCT | E | 146 | 1620 | + |
LAKGVTTAA | E | 65 | 519 | CTAGCAAAGGGCGTGACCACCGCCGCT | E | 147 | 1621 | + |
TSHVSTSS | E | 66 | 520 | ACCAGCCACGTGAGCACCAGCAGC | E | 148 | 1622 | +++ |
SGVLFTEG | E | 67 | 521 | AGCGGCGTGCTGTTCACCGAGGGC | E | 149 | 1623 | +++ |
SGPGTSGT | E | 68 | 522 | AGCGGCCCCGGCACCAGCGGCACC | E | 150 | 1624 | +++ |
TGEGPTKG | E | 69 | 523 | ACCGGCGAGGGCCCCACCAAGGGC | E | 151 | 1625 | +++ |
TGDKWPQG | E | 70 | 524 | ACCGGCGACAAGTGGCCCCAGGGC | E | 152 | 1626 | +++ |
SGREIHFG | E | 71 | 525 | AGCGGCCGGGAGATCCACTTCGGC | E | 153 | 1627 | ++ |
TSQEKQNS | E | 72 | 526 | ACCAGCCAGGAGAAGCAGAACAGC | E | 154 | 1628 | ++ |
GTMFNNST | E | 73 | 527 | GGCACCATGTTCAACAACAGCACC | E | 155 | 1629 | ++ |
TTGMERPT | E | 74 | 528 | ACCACCGGCATGGAGCGGCCCACC | E | 156 | 1630 | ++ |
TGDERKPG | E | 75 | 529 | ACCGGCGACGAGCGGAAGCCCGGC | E | 157 | 1631 | + |
CKEITR | E | 76 | 530 | TGCAAGGAGATCACCCGG | E | 158 | 1632 | +++ |
PDVSLL | E | 77 | 531 | CCCGACGTGAGCCTGCTG | E | 159 | 1633 | +++ |
RLGRLS | E | 78 | 532 | CGGCTGGGCCGGCTGAGC | E | 160 | 1634 | +++ |
RLGKVP | E | 79 | 533 | CGGCTGGGCAAGGTGCCC | E | 161 | 1635 | + |
KFTKAA | E | 80 | 534 | AAGTTCACCAAGGCCGCC | E | 162 | 1636 | + |
HFPVFS | E | 81 | 535 | CACTTCCCCGTGTTCAGC | E | 163 | 1637 | + |
NSKKLG | E | 82 | 536 | AACAGCAAGAAGCTGGGC | E | 164 | 1638 | + |
KAMRTG | E | 83 | 537 | AAGGCCATGCGGACCGGC | E | 165 | 1639 | + |
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1F]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 編碼胺基酸序列之核酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 活性水平* | ||
LAFNSCSYA | F | 2 | 538 | CTAGCATTCAACAGCTGCAGCTACGCT | F | 11 | 1640 | +++ |
LAGGAWDWA | F | 3 | 539 | CTAGCAGGCGGCGCCTGGGACTGGGCT | F | 12 | 1641 | +++ |
LANADFPLA | F | 4 | 540 | CTAGCAAACGCCGACTTCCCCCTGGCT | F | 13 | 1642 | +++ |
LAAQDVSWA | F | 5 | 541 | CTAGCAGCCCAGGACGTGAGCTGGGCT | F | 14 | 1643 | ++ |
LADVGCENA | F | 6 | 542 | CTAGCAGACGTGGGCTGCGAGAACGCT | F | 15 | 1644 | ++ |
LAATICTEA | F | 7 | 543 | CTAGCAGCCACCATCTGCACCGAGGCT | F | 16 | 1645 | ++ |
LAEGLSQFA | F | 8 | 544 | CTAGCAGAGGGCCTGAGCCAGTTCGCT | F | 17 | 1646 | + |
LAKPTGKDA | F | 9 | 545 | CTAGCAAAGCCCACCGGCAAGGACGCT | F | 18 | 1647 | + |
LARFRGMCA | F | 10 | 546 | CTAGCACGGTTCCGGGGCATGTGCGCT | F | 19 | 1648 | + |
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1G]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 編碼胺基酸序列之核酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 活性水平* | ||
LARRKSNEA | G | 2 | 547 | CTAGCACGGCGGAAGAGCAACGAGGCT | G | 78 | 1649 | +++ |
LAPQNLDEA | G | 3 | 548 | CTAGCACCCCAGAACCTGGACGAGGCT | G | 79 | 1650 | +++ |
LAMFVWVPA | G | 4 | 549 | CTAGCAATGTTCGTGTGGGTGCCCGCT | G | 80 | 1651 | +++ |
LACTYTYAA | G | 5 | 550 | CTAGCATGCACCTACACCTACGCCGCT | G | 81 | 1652 | +++ |
LAKINAQPA | G | 6 | 551 | CTAGCAAAGATCAACGCCCAGCCCGCT | G | 82 | 1653 | +++ |
LADLSDHHA | G | 7 | 552 | CTAGCAGACCTGAGCGACCACCACGCT | G | 83 | 1654 | +++ |
LAHEGRQAA | G | 8 | 553 | CTAGCACACGAGGGCCGGCAGGCCGCT | G | 84 | 1655 | +++ |
LADAHSVTA | G | 9 | 554 | CTAGCAGACGCCCACAGCGTGACCGCT | G | 85 | 1656 | +++ |
LADLGYPNA | G | 10 | 555 | CTAGCAGACCTGGGCTACCCCAACGCT | G | 86 | 1657 | +++ |
LAQWFLWRA | G | 11 | 556 | CTAGCACAGTGGTTCCTGTGGCGGGCT | G | 87 | 1658 | +++ |
LAYAEQSKA | G | 12 | 557 | CTAGCATACGCCGAGCAGAGCAAGGCT | G | 88 | 1659 | +++ |
LAAKMYNGA | G | 13 | 558 | CTAGCAGCCAAGATGTACAACGGCGCT | G | 89 | 1660 | +++ |
LAEADKWYA | G | 14 | 559 | CTAGCAGAGGCCGACAAGTGGTACGCT | G | 90 | 1661 | +++ |
LATVYKSPA | G | 15 | 560 | CTAGCAACCGTGTACAAGAGCCCCGCT | G | 91 | 1662 | +++ |
LASRTAVAA | G | 16 | 561 | CTAGCAAGCCGGACCGCCGTGGCCGCT | G | 92 | 1663 | +++ |
LADDMIFVA | G | 17 | 562 | CTAGCAGACGACATGATCTTCGTGGCT | G | 93 | 1664 | +++ |
LAEFRVGQA | G | 18 | 563 | CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT | G | 94 | 1665 | +++ |
LAADPTFKA | G | 19 | 564 | CTAGCAGCCGACCCCACCTTCAAGGCT | G | 95 | 1666 | +++ |
LAVSRHGEA | G | 20 | 565 | CTAGCAGTGAGCCGGCACGGCGAGGCT | G | 96 | 1667 | +++ |
LAPMRGVYA | G | 21 | 566 | CTAGCACCCATGCGGGGCGTGTACGCT | G | 97 | 1668 | +++ |
LAFPDKSIA | G | 22 | 567 | CTAGCATTCCCCGACAAGAGCATCGCT | G | 98 | 1669 | +++ |
LAEFHIPTA | G | 23 | 568 | CTAGCAGAGTTCCACATCCCCACCGCT | G | 99 | 1670 | +++ |
LALNNDQSA | G | 24 | 569 | CTAGCACTGAACAACGACCAGAGCGCT | G | 100 | 1671 | +++ |
LAKALGMEA | G | 25 | 570 | CTAGCAAAGGCCCTGGGCATGGAGGCT | G | 101 | 1672 | ++ |
LAYLPLKYA | G | 26 | 571 | CTAGCATACCTGCCCCTGAAGTACGCT | G | 102 | 1673 | ++ |
LAHYPSAPA | G | 27 | 572 | CTAGCACACTACCCCAGCGCCCCCGCT | G | 103 | 1674 | ++ |
LANLKENEA | G | 28 | 573 | CTAGCAAACCTGAAGGAGAACGAGGCT | G | 104 | 1675 | ++ |
LARSSTLNA | G | 29 | 574 | CTAGCACGGAGCAGCACCCTGAACGCT | G | 105 | 1676 | ++ |
LAIGERTTA | G | 30 | 575 | CTAGCAATCGGCGAGCGGACCACCGCT | G | 106 | 1677 | ++ |
LAWIERSMA | G | 31 | 576 | CTAGCATGGATCGAGCGGAGCATGGCT | G | 107 | 1678 | ++ |
LAYDNTAEA | G | 32 | 577 | CTAGCATACGACAACACCGCCGAGGCT | G | 108 | 1679 | ++ |
LAERNHGYA | G | 33 | 578 | CTAGCAGAGCGGAACCACGGCTACGCT | G | 109 | 1680 | ++ |
LADILVGQA | G | 34 | 579 | CTAGCAGACATCCTGGTGGGCCAGGCT | G | 110 | 1681 | ++ |
LAFNGSTSA | G | 35 | 580 | CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT | G | 111 | 1682 | ++ |
LADWRTTPA | G | 36 | 581 | CTAGCAGACTGGCGGACCACCCCCGCT | G | 112 | 1683 | ++ |
LAPSGDRHA | G | 37 | 582 | CTAGCACCCAGCGGCGACCGGCACGCT | G | 113 | 1684 | ++ |
LAQEAKLTA | G | 38 | 583 | CTAGCACAGGAGGCCAAGCTGACCGCT | G | 114 | 1685 | ++ |
LAAEHKQTA | G | 39 | 584 | CTAGCAGCCGAGCACAAGCAGACCGCT | G | 115 | 1686 | ++ |
LAETTLTRA | G | 40 | 585 | CTAGCAGAGACCACCCTGACCCGGGCT | G | 116 | 1687 | ++ |
LAGESSYLA | G | 41 | 586 | CTAGCAGGCGAGAGCAGCTACCTGGCT | G | 117 | 1688 | ++ |
LAQVQVEGA | G | 42 | 587 | CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT | G | 118 | 1689 | + |
LAVNRVDMA | G | 43 | 588 | CTAGCAGTGAACCGGGTGGACATGGCT | G | 119 | 1690 | + |
LAFCTPRYA | G | 44 | 589 | CTAGCATTCTGCACCCCCCGGTACGCT | G | 120 | 1691 | + |
LADDQAVNA | G | 45 | 590 | CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT | G | 121 | 1692 | + |
LAREDHRQA | G | 46 | 591 | CTAGCACGGGAGGACCACCGGCAGGCT | G | 122 | 1693 | + |
LAKVASMNA | G | 47 | 592 | CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT | G | 123 | 1694 | + |
LAKDGGKIA | G | 48 | 593 | CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT | G | 124 | 1695 | + |
LANRWAIDA | G | 49 | 594 | CTAGCAAACCGGTGGGCCATCGACGCT | G | 125 | 1696 | + |
LADLTLRAA | G | 50 | 595 | CTAGCAGACCTGACCCTGCGGGCCGCT | G | 126 | 1697 | + |
LAKEGYRDA | G | 51 | 596 | CTAGCAAAGGAGGGCTACCGGGACGCT | G | 127 | 1698 | + |
LAGKIEENA | G | 52 | 597 | CTAGCAGGCAAGATCGAGGAGAACGCT | G | 128 | 1699 | + |
LAPVKHTWA | G | 53 | 598 | CTAGCACCCGTGAAGCACACCTGGGCT | G | 129 | 1700 | + |
LAQVEVSKA | G | 54 | 599 | CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT | G | 130 | 1701 | + |
LAPLQTQEA | G | 55 | 600 | CTAGCACCCCTGCAGACCCAGGAGGCT | G | 131 | 1702 | + |
LAAHQMASA | G | 56 | 601 | CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT | G | 132 | 1703 | + |
LAKKVVDGA | G | 57 | 602 | CTAGCAAAGAAGGTGGTGGACGGCGCT | G | 133 | 1704 | + |
LAKGPASIA | G | 58 | 603 | CTAGCAAAGGGCCCCGCCAGCATCGCT | G | 134 | 1705 | + |
LAKGQAQNA | G | 59 | 604 | CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT | G | 135 | 1706 | + |
SGVLFTEG | G | 60 | 605 | AGCGGCGTGCTGTTCACCGAGGGC | G | 136 | 1707 | +++ |
SGPGTSGT | G | 61 | 606 | AGCGGCCCCGGCACCAGCGGCACC | G | 137 | 1708 | ++ |
TGEGPTKG | G | 62 | 607 | ACCGGCGAGGGCCCCACCAAGGGC | G | 138 | 1709 | ++ |
SGSVGYVG | G | 63 | 608 | AGCGGCAGCGTGGGCTACGTGGGC | G | 139 | 1710 | ++ |
STVPLNMG | G | 64 | 609 | AGCACCGTGCCCCTGAACATGGGC | G | 140 | 1711 | ++ |
SGREIHFG | G | 65 | 610 | AGCGGCCGGGAGATCCACTTCGGC | G | 141 | 1712 | ++ |
GTMFNNST | G | 66 | 611 | GGCACCATGTTCAACAACAGCACC | G | 142 | 1713 | + |
TGDKWPQG | G | 67 | 612 | ACCGGCGACAAGTGGCCCCAGGGC | G | 143 | 1714 | + |
TSQEKQNS | G | 68 | 613 | ACCAGCCAGGAGAAGCAGAACAGC | G | 144 | 1715 | + |
TTGMERPT | G | 69 | 614 | ACCACCGGCATGGAGCGGCCCACC | G | 145 | 1716 | + |
TGDERKPG | G | 70 | 615 | ACCGGCGACGAGCGGAAGCCCGGC | G | 146 | 1717 | + |
PDVSLL | G | 71 | 616 | CCCGACGTGAGCCTGCTG | G | 147 | 1718 | ++ |
RTGRNT | G | 72 | 617 | CGGACCGGCCGGAACACC | G | 148 | 1719 | ++ |
KFTKAA | G | 73 | 618 | AAGTTCACCAAGGCCGCC | G | 149 | 1720 | ++ |
RLGRLS | G | 74 | 619 | CGGCTGGGCCGGCTGAGC | G | 150 | 1721 | + |
KAMRTG | G | 75 | 620 | AAGGCCATGCGGACCGGC | G | 151 | 1722 | + |
HFPVFS | G | 76 | 621 | CACTTCCCCGTGTTCAGC | G | 152 | 1723 | + |
RLGKVP | G | 77 | 622 | CGGCTGGGCAAGGTGCCC | G | 153 | 1724 | + |
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1H]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 編碼胺基酸序列之核酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 活性水平* | ||
LAHGGLREA | H | 2 | 623 | CTAGCACACGGCGGCCTGCGGGAGGCT | H | 259 | 1725 | +++ |
LATDRTKTA | H | 3 | 624 | CTAGCAACCGACCGGACCAAGACCGCT | H | 260 | 1726 | +++ |
LARRKSNEA | H | 4 | 625 | CTAGCACGGCGGAAGAGCAACGAGGCT | H | 261 | 1727 | +++ |
LAVDNIWAA | H | 5 | 626 | CTAGCAGTGGACAACATCTGGGCCGCT | H | 262 | 1728 | +++ |
LADPLYAVA | H | 6 | 627 | CTAGCAGACCCCCTGTACGCCGTGGCT | H | 263 | 1729 | +++ |
LAGQAMMQA | H | 7 | 628 | CTAGCAGGCCAGGCCATGATGCAGGCT | H | 264 | 1730 | +++ |
LAMTKITDA | H | 8 | 629 | CTAGCAATGACCAAGATCACCGACGCT | H | 265 | 1731 | +++ |
LAFTHGTNA | H | 9 | 630 | CTAGCATTCACCCACGGCACCAACGCT | H | 266 | 1732 | +++ |
LADPGWKYA | H | 10 | 631 | CTAGCAGACCCCGGCTGGAAGTACGCT | H | 267 | 1733 | +++ |
LAGGEYETA | H | 11 | 632 | CTAGCAGGCGGCGAGTACGAGACCGCT | H | 268 | 1734 | +++ |
LAALVDANA | H | 12 | 633 | CTAGCAGCCCTGGTGGACGCCAACGCT | H | 269 | 1735 | +++ |
LADPTETPA | H | 13 | 634 | CTAGCAGACCCCACCGAGACCCCCGCT | H | 270 | 1736 | +++ |
LALENIGQA | H | 14 | 635 | CTAGCACTGGAGAACATCGGCCAGGCT | H | 271 | 1737 | +++ |
LALNDNVGA | H | 15 | 636 | CTAGCACTGAACGACAACGTGGGCGCT | H | 272 | 1738 | +++ |
LAHRAPDSA | H | 16 | 637 | CTAGCACACCGGGCCCCCGACAGCGCT | H | 273 | 1739 | +++ |
LAMFVWVPA | H | 17 | 638 | CTAGCAATGTTCGTGTGGGTGCCCGCT | H | 274 | 1740 | +++ |
LAEGQEDSA | H | 18 | 639 | CTAGCAGAGGGCCAGGAGGACAGCGCT | H | 275 | 1741 | +++ |
LAPDAKDWA | H | 19 | 640 | CTAGCACCCGACGCCAAGGACTGGGCT | H | 276 | 1742 | +++ |
LAPHIAKDA | H | 20 | 641 | CTAGCACCCCACATCGCCAAGGACGCT | H | 277 | 1743 | +++ |
LAAVTEYVA | H | 21 | 642 | CTAGCAGCCGTGACCGAGTACGTGGCT | H | 278 | 1744 | +++ |
LAFCIKHCA | H | 22 | 643 | CTAGCATTCTGCATCAAGCACTGCGCT | H | 279 | 1745 | +++ |
LAPPGNPLA | H | 23 | 644 | CTAGCACCCCCCGGCAACCCCCTGGCT | H | 280 | 1746 | +++ |
LAHWQEEWA | H | 24 | 645 | CTAGCACACTGGCAGGAGGAGTGGGCT | H | 281 | 1747 | +++ |
LAEFRVGQA | H | 25 | 646 | CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT | H | 282 | 1748 | +++ |
LAYVIENDA | H | 26 | 647 | CTAGCATACGTGATCGAGAACGACGCT | H | 283 | 1749 | +++ |
LASTTMNIA | H | 27 | 648 | CTAGCAAGCACCACCATGAACATCGCT | H | 284 | 1750 | +++ |
LAEFHIPTA | H | 28 | 649 | CTAGCAGAGTTCCACATCCCCACCGCT | H | 285 | 1751 | +++ |
LASRTAVAA | H | 29 | 650 | CTAGCAAGCCGGACCGCCGTGGCCGCT | H | 286 | 1752 | +++ |
LAIGSDTSA | H | 30 | 651 | CTAGCAATCGGCAGCGACACCAGCGCT | H | 287 | 1753 | +++ |
LADDMIFVA | H | 31 | 652 | CTAGCAGACGACATGATCTTCGTGGCT | H | 288 | 1754 | +++ |
LAKPPPKDA | H | 32 | 653 | CTAGCAAAGCCCCCCCCCAAGGACGCT | H | 289 | 1755 | +++ |
LAYVALFYA | H | 33 | 654 | CTAGCATACGTGGCCCTGTTCTACGCT | H | 290 | 1756 | +++ |
LAFQQQRCA | H | 34 | 655 | CTAGCATTCCAGCAGCAGCGGTGCGCT | H | 291 | 1757 | +++ |
LAAVHLMGA | H | 35 | 656 | CTAGCAGCCGTGCACCTGATGGGCGCT | H | 292 | 1758 | +++ |
LACPVAEWA | H | 36 | 657 | CTAGCATGCCCCGTGGCCGAGTGGGCT | H | 293 | 1759 | +++ |
LAVRNEINA | H | 37 | 658 | CTAGCAGTGCGGAACGAGATCAACGCT | H | 294 | 1760 | +++ |
LADSSKWIA | H | 38 | 659 | CTAGCAGACAGCAGCAAGTGGATCGCT | H | 295 | 1761 | +++ |
LAVMGNMLA | H | 39 | 660 | CTAGCAGTGATGGGCAACATGCTGGCT | H | 296 | 1762 | +++ |
LANANTRPA | H | 40 | 661 | CTAGCAAACGCCAACACCCGGCCCGCT | H | 297 | 1763 | +++ |
LAPNQGTPA | H | 41 | 662 | CTAGCACCCAACCAGGGCACCCCCGCT | H | 298 | 1764 | +++ |
LAGENHISA | H | 42 | 663 | CTAGCAGGCGAGAACCACATCAGCGCT | H | 299 | 1765 | +++ |
LALNSGKMA | H | 43 | 664 | CTAGCACTGAACAGCGGCAAGATGGCT | H | 300 | 1766 | +++ |
LAYDAGGHA | H | 44 | 665 | CTAGCATACGACGCCGGCGGCCACGCT | H | 301 | 1767 | +++ |
LARAITNEA | H | 45 | 666 | CTAGCACGGGCCATCACCAACGAGGCT | H | 302 | 1768 | +++ |
LAWNKCPYA | H | 46 | 667 | CTAGCATGGAACAAGTGCCCCTACGCT | H | 303 | 1769 | +++ |
LANLKENEA | H | 47 | 668 | CTAGCAAACCTGAAGGAGAACGAGGCT | H | 304 | 1770 | +++ |
LAQVTEMRA | H | 48 | 669 | CTAGCACAGGTGACCGAGATGCGGGCT | H | 305 | 1771 | +++ |
LARDQLKLA | H | 49 | 670 | CTAGCACGGGACCAGCTGAAGCTGGCT | H | 306 | 1772 | +++ |
LAVSRHGEA | H | 50 | 671 | CTAGCAGTGAGCCGGCACGGCGAGGCT | H | 307 | 1773 | +++ |
LAAVGMKMA | H | 51 | 672 | CTAGCAGCCGTGGGCATGAAGATGGCT | H | 308 | 1774 | +++ |
LAEHKNMHA | H | 52 | 673 | CTAGCAGAGCACAAGAACATGCACGCT | H | 309 | 1775 | +++ |
LAMNEPVTA | H | 53 | 674 | CTAGCAATGAACGAGCCCGTGACCGCT | H | 310 | 1776 | +++ |
LAEFVHKGA | H | 54 | 675 | CTAGCAGAGTTCGTGCACAAGGGCGCT | H | 311 | 1777 | +++ |
LAAYHDSAA | H | 55 | 676 | CTAGCAGCCTACCACGACAGCGCCGCT | H | 312 | 1778 | +++ |
LAKALGMEA | H | 56 | 677 | CTAGCAAAGGCCCTGGGCATGGAGGCT | H | 313 | 1779 | +++ |
LAVKGLVNA | H | 57 | 678 | CTAGCAGTGAAGGGCCTGGTGAACGCT | H | 314 | 1780 | +++ |
LAGIQQHVA | H | 58 | 679 | CTAGCAGGCATCCAGCAGCACGTGGCT | H | 315 | 1781 | +++ |
LADGGTRPA | H | 59 | 680 | CTAGCAGACGGCGGCACCCGGCCCGCT | H | 316 | 1782 | +++ |
LAHEPMFNA | H | 60 | 681 | CTAGCACACGAGCCCATGTTCAACGCT | H | 317 | 1783 | +++ |
LASVSTIQA | H | 61 | 682 | CTAGCAAGCGTGAGCACCATCCAGGCT | H | 318 | 1784 | +++ |
LASAVMYWA | H | 62 | 683 | CTAGCAAGCGCCGTGATGTACTGGGCT | H | 319 | 1785 | +++ |
LADKNRLQA | H | 63 | 684 | CTAGCAGACAAGAACCGGCTGCAGGCT | H | 320 | 1786 | +++ |
LAPMGQNMA | H | 64 | 685 | CTAGCACCCATGGGCCAGAACATGGCT | H | 321 | 1787 | +++ |
LAAVGVGYA | H | 65 | 686 | CTAGCAGCCGTGGGCGTGGGCTACGCT | H | 322 | 1788 | +++ |
LAGEFTGKA | H | 66 | 687 | CTAGCAGGCGAGTTCACCGGCAAGGCT | H | 323 | 1789 | +++ |
LAGEVTKHA | H | 67 | 688 | CTAGCAGGCGAGGTGACCAAGCACGCT | H | 324 | 1790 | +++ |
LAITQSDIA | H | 68 | 689 | CTAGCAATCACCCAGAGCGACATCGCT | H | 325 | 1791 | +++ |
LANEAQGKA | H | 69 | 690 | CTAGCAAACGAGGCCCAGGGCAAGGCT | H | 326 | 1792 | +++ |
LAAKPKDGA | H | 70 | 691 | CTAGCAGCCAAGCCCAAGGACGGCGCT | H | 327 | 1793 | +++ |
LAAGQAQSA | H | 71 | 692 | CTAGCAGCCGGCCAGGCCCAGAGCGCT | H | 328 | 1794 | +++ |
LAPMRGVYA | H | 72 | 693 | CTAGCACCCATGCGGGGCGTGTACGCT | H | 329 | 1795 | +++ |
LASRLNSPA | H | 73 | 694 | CTAGCAAGCCGGCTGAACAGCCCCGCT | H | 330 | 1796 | +++ |
LACYPPTCA | H | 74 | 695 | CTAGCATGCTACCCCCCCACCTGCGCT | H | 331 | 1797 | +++ |
LAKVSKGDA | H | 75 | 696 | CTAGCAAAGGTGAGCAAGGGCGACGCT | H | 332 | 1798 | +++ |
LAGERETVA | H | 76 | 697 | CTAGCAGGCGAGCGGGAGACCGTGGCT | H | 333 | 1799 | ++ |
LAYITEKSA | H | 77 | 698 | CTAGCATACATCACCGAGAAGAGCGCT | H | 334 | 1800 | ++ |
LASADHQPA | H | 78 | 699 | CTAGCAAGCGCCGACCACCAGCCCGCT | H | 335 | 1801 | ++ |
LAHIQEPKA | H | 79 | 700 | CTAGCACACATCCAGGAGCCCAAGGCT | H | 336 | 1802 | ++ |
LAFNGSTSA | H | 80 | 701 | CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT | H | 337 | 1803 | ++ |
LAEFDGDGA | H | 81 | 702 | CTAGCAGAGTTCGACGGCGACGGCGCT | H | 338 | 1804 | ++ |
LAWKCKGTA | H | 82 | 703 | CTAGCATGGAAGTGCAAGGGCACCGCT | H | 339 | 1805 | ++ |
LAMGHNYVA | H | 83 | 704 | CTAGCAATGGGCCACAACTACGTGGCT | H | 340 | 1806 | ++ |
LAVTPPWYA | H | 84 | 705 | CTAGCAGTGACCCCCCCCTGGTACGCT | H | 341 | 1807 | ++ |
LAGHAACFA | H | 85 | 706 | CTAGCAGGCCACGCCGCCTGCTTCGCT | H | 342 | 1808 | ++ |
LAAANHDNA | H | 86 | 707 | CTAGCAGCCGCCAACCACGACAACGCT | H | 343 | 1809 | ++ |
LAKDHHVIA | H | 87 | 708 | CTAGCAAAGGACCACCACGTGATCGCT | H | 344 | 1810 | ++ |
LALHQERQA | H | 88 | 709 | CTAGCACTGCACCAGGAGCGGCAGGCT | H | 345 | 1811 | ++ |
LADMTRFHA | H | 89 | 710 | CTAGCAGACATGACCCGGTTCCACGCT | H | 346 | 1812 | ++ |
LATMHNFEA | H | 90 | 711 | CTAGCAACCATGCACAACTTCGAGGCT | H | 347 | 1813 | ++ |
LAEYHNNDA | H | 91 | 712 | CTAGCAGAGTACCACAACAACGACGCT | H | 348 | 1814 | ++ |
LAGKTISGA | H | 92 | 713 | CTAGCAGGCAAGACCATCAGCGGCGCT | H | 349 | 1815 | ++ |
LADFPSEKA | H | 93 | 714 | CTAGCAGACTTCCCCAGCGAGAAGGCT | H | 350 | 1816 | ++ |
LALKLRTEA | H | 94 | 715 | CTAGCACTGAAGCTGCGGACCGAGGCT | H | 351 | 1817 | ++ |
LAISQPNPA | H | 95 | 716 | CTAGCAATCAGCCAGCCCAACCCCGCT | H | 352 | 1818 | ++ |
LAFGFSADA | H | 96 | 717 | CTAGCATTCGGCTTCAGCGCCGACGCT | H | 353 | 1819 | ++ |
LAKDKGLIA | H | 97 | 718 | CTAGCAAAGGACAAGGGCCTGATCGCT | H | 354 | 1820 | ++ |
LAIGERTTA | H | 98 | 719 | CTAGCAATCGGCGAGCGGACCACCGCT | H | 355 | 1821 | ++ |
LAPQKQPVA | H | 99 | 720 | CTAGCACCCCAGAAGCAGCCCGTGGCT | H | 356 | 1822 | ++ |
LAKFMWIHA | H | 100 | 721 | CTAGCAAAGTTCATGTGGATCCACGCT | H | 357 | 1823 | ++ |
LAQEQNAAA | H | 101 | 722 | CTAGCACAGGAGCAGAACGCCGCCGCT | H | 358 | 1824 | ++ |
LAQVQVEGA | H | 102 | 723 | CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT | H | 359 | 1825 | ++ |
LAALNSQTA | H | 103 | 724 | CTAGCAGCCCTGAACAGCCAGACCGCT | H | 360 | 1826 | ++ |
LAHHKESIA | H | 104 | 725 | CTAGCACACCACAAGGAGAGCATCGCT | H | 361 | 1827 | ++ |
LAPCYEPPA | H | 105 | 726 | CTAGCACCCTGCTACGAGCCCCCCGCT | H | 362 | 1828 | ++ |
LANQTTREA | H | 106 | 727 | CTAGCAAACCAGACCACCCGGGAGGCT | H | 363 | 1829 | ++ |
LADTHTTYA | H | 107 | 728 | CTAGCAGACACCCACACCACCTACGCT | H | 364 | 1830 | ++ |
LAQKKLLEA | H | 108 | 729 | CTAGCACAGAAGAAGCTGCTGGAGGCT | H | 365 | 1831 | ++ |
LAVDIMRGA | H | 109 | 730 | CTAGCAGTGGACATCATGCGGGGCGCT | H | 366 | 1832 | ++ |
LAPIQLAQA | H | 110 | 731 | CTAGCACCCATCCAGCTGGCCCAGGCT | H | 367 | 1833 | ++ |
LANIVQQDA | H | 111 | 732 | CTAGCAAACATCGTGCAGCAGGACGCT | H | 368 | 1834 | ++ |
LAKSAGILA | H | 112 | 733 | CTAGCAAAGAGCGCCGGCATCCTGGCT | H | 369 | 1835 | ++ |
LAHDLHGGA | H | 113 | 734 | CTAGCACACGACCTGCACGGCGGCGCT | H | 370 | 1836 | ++ |
LAKGFKTEA | H | 114 | 735 | CTAGCAAAGGGCTTCAAGACCGAGGCT | H | 371 | 1837 | ++ |
LAGSMAKLA | H | 115 | 736 | CTAGCAGGCAGCATGGCCAAGCTGGCT | H | 372 | 1838 | ++ |
LAGFMEYYA | H | 116 | 737 | CTAGCAGGCTTCATGGAGTACTACGCT | H | 373 | 1839 | ++ |
LAQGNNTGA | H | 117 | 738 | CTAGCACAGGGCAACAACACCGGCGCT | H | 374 | 1840 | ++ |
LAVRTGSMA | H | 118 | 739 | CTAGCAGTGCGGACCGGCAGCATGGCT | H | 375 | 1841 | ++ |
LAYGQQTTA | H | 119 | 740 | CTAGCATACGGCCAGCAGACCACCGCT | H | 376 | 1842 | ++ |
LADCMMINA | H | 120 | 741 | CTAGCAGACTGCATGATGATCAACGCT | H | 377 | 1843 | ++ |
LAGVVKTDA | H | 121 | 742 | CTAGCAGGCGTGGTGAAGACCGACGCT | H | 378 | 1844 | ++ |
LASENLNRA | H | 122 | 743 | CTAGCAAGCGAGAACCTGAACCGGGCT | H | 379 | 1845 | ++ |
LAQAGDTAA | H | 123 | 744 | CTAGCACAGGCCGGCGACACCGCCGCT | H | 380 | 1846 | ++ |
LAMHESYNA | H | 124 | 745 | CTAGCAATGCACGAGAGCTACAACGCT | H | 381 | 1847 | ++ |
LAVNRVDMA | H | 125 | 746 | CTAGCAGTGAACCGGGTGGACATGGCT | H | 382 | 1848 | ++ |
LAVPKADAA | H | 126 | 747 | CTAGCAGTGCCCAAGGCCGACGCCGCT | H | 383 | 1849 | ++ |
LAPSGDRHA | H | 127 | 748 | CTAGCACCCAGCGGCGACCGGCACGCT | H | 384 | 1850 | ++ |
LAFRTMEYA | H | 128 | 749 | CTAGCATTCCGGACCATGGAGTACGCT | H | 385 | 1851 | ++ |
LATWCLVWA | H | 129 | 750 | CTAGCAACCTGGTGCCTGGTGTGGGCT | H | 386 | 1852 | ++ |
LAEGMTGIA | H | 130 | 751 | CTAGCAGAGGGCATGACCGGCATCGCT | H | 387 | 1853 | ++ |
LAKEGYRDA | H | 131 | 752 | CTAGCAAAGGAGGGCTACCGGGACGCT | H | 388 | 1854 | ++ |
LAAVTKDSA | H | 132 | 753 | CTAGCAGCCGTGACCAAGGACAGCGCT | H | 389 | 1855 | ++ |
LAPLQTQEA | H | 133 | 754 | CTAGCACCCCTGCAGACCCAGGAGGCT | H | 390 | 1856 | ++ |
LADHGNKPA | H | 134 | 755 | CTAGCAGACCACGGCAACAAGCCCGCT | H | 391 | 1857 | ++ |
LADVVSVSA | H | 135 | 756 | CTAGCAGACGTGGTGAGCGTGAGCGCT | H | 392 | 1858 | ++ |
LAQVEVSKA | H | 136 | 757 | CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT | H | 393 | 1859 | ++ |
LAPSKMGLA | H | 137 | 758 | CTAGCACCCAGCAAGATGGGCCTGGCT | H | 394 | 1860 | ++ |
LAWIERSMA | H | 138 | 759 | CTAGCATGGATCGAGCGGAGCATGGCT | H | 395 | 1861 | ++ |
LAYDNTAEA | H | 139 | 760 | CTAGCATACGACAACACCGCCGAGGCT | H | 396 | 1862 | ++ |
LAHDWGAPA | H | 140 | 761 | CTAGCACACGACTGGGGCGCCCCCGCT | H | 397 | 1863 | ++ |
LAMDREIKA | H | 141 | 762 | CTAGCAATGGACCGGGAGATCAAGGCT | H | 398 | 1864 | ++ |
LAVFQETGA | H | 142 | 763 | CTAGCAGTGTTCCAGGAGACCGGCGCT | H | 399 | 1865 | ++ |
LAKDGGKIA | H | 143 | 764 | CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT | H | 400 | 1866 | ++ |
LALNAAATA | H | 144 | 765 | CTAGCACTGAACGCCGCCGCCACCGCT | H | 401 | 1867 | ++ |
LAIPVEANA | H | 145 | 766 | CTAGCAATCCCCGTGGAGGCCAACGCT | H | 402 | 1868 | ++ |
LARGTLMTA | H | 146 | 767 | CTAGCACGGGGCACCCTGATGACCGCT | H | 403 | 1869 | ++ |
LAGDIVRNA | H | 147 | 768 | CTAGCAGGCGACATCGTGCGGAACGCT | H | 404 | 1870 | ++ |
LAMLACKGA | H | 148 | 769 | CTAGCAATGCTGGCCTGCAAGGGCGCT | H | 405 | 1871 | ++ |
LADLSDHHA | H | 149 | 770 | CTAGCAGACCTGAGCGACCACCACGCT | H | 406 | 1872 | ++ |
LANMMAAGA | H | 150 | 771 | CTAGCAAACATGATGGCCGCCGGCGCT | H | 407 | 1873 | ++ |
LALPEGRFA | H | 151 | 772 | CTAGCACTGCCCGAGGGCCGGTTCGCT | H | 408 | 1874 | ++ |
LAKGQAQNA | H | 152 | 773 | CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT | H | 409 | 1875 | + |
LAAVKAVVA | H | 153 | 774 | CTAGCAGCCGTGAAGGCCGTGGTGGCT | H | 410 | 1876 | + |
LANQGFLTA | H | 154 | 775 | CTAGCAAACCAGGGCTTCCTGACCGCT | H | 411 | 1877 | + |
LAETTLTRA | H | 155 | 776 | CTAGCAGAGACCACCCTGACCCGGGCT | H | 412 | 1878 | + |
LADGIQKNA | H | 156 | 777 | CTAGCAGACGGCATCCAGAAGAACGCT | H | 413 | 1879 | + |
LANAMEKHA | H | 157 | 778 | CTAGCAAACGCCATGGAGAAGCACGCT | H | 414 | 1880 | + |
LADIVGESA | H | 158 | 779 | CTAGCAGACATCGTGGGCGAGAGCGCT | H | 415 | 1881 | + |
LANVTLQSA | H | 159 | 780 | CTAGCAAACGTGACCCTGCAGAGCGCT | H | 416 | 1882 | + |
LAFPCIKEA | H | 160 | 781 | CTAGCATTCCCCTGCATCAAGGAGGCT | H | 417 | 1883 | + |
LADEGREHA | H | 161 | 782 | CTAGCAGACGAGGGCCGGGAGCACGCT | H | 418 | 1884 | + |
LAREDHRQA | H | 162 | 783 | CTAGCACGGGAGGACCACCGGCAGGCT | H | 419 | 1885 | + |
LAQNQWTDA | H | 163 | 784 | CTAGCACAGAACCAGTGGACCGACGCT | H | 420 | 1886 | + |
LAQNQKQIA | H | 164 | 785 | CTAGCACAGAACCAGAAGCAGATCGCT | H | 421 | 1887 | + |
LATPNVNAA | H | 165 | 786 | CTAGCAACCCCCAACGTGAACGCCGCT | H | 422 | 1888 | + |
LAPGNDLWA | H | 166 | 787 | CTAGCACCCGGCAACGACCTGTGGGCT | H | 423 | 1889 | + |
LAMLGGTSA | H | 167 | 788 | CTAGCAATGCTGGGCGGCACCAGCGCT | H | 424 | 1890 | + |
LAKKVVDGA | H | 168 | 789 | CTAGCAAAGAAGGTGGTGGACGGCGCT | H | 425 | 1891 | + |
LAGGSKLEA | H | 169 | 790 | CTAGCAGGCGGCAGCAAGCTGGAGGCT | H | 426 | 1892 | + |
LALYQCDTA | H | 170 | 791 | CTAGCACTGTACCAGTGCGACACCGCT | H | 427 | 1893 | + |
LAHQGAIIA | H | 171 | 792 | CTAGCACACCAGGGCGCCATCATCGCT | H | 428 | 1894 | + |
LAGFHAIEA | H | 172 | 793 | CTAGCAGGCTTCCACGCCATCGAGGCT | H | 429 | 1895 | + |
LANEGTIRA | H | 173 | 794 | CTAGCAAACGAGGGCACCATCCGGGCT | H | 430 | 1896 | + |
LADPMPTHA | H | 174 | 795 | CTAGCAGACCCCATGCCCACCCACGCT | H | 431 | 1897 | + |
LAGKIEENA | H | 175 | 796 | CTAGCAGGCAAGATCGAGGAGAACGCT | H | 432 | 1898 | + |
LAPVKHTWA | H | 176 | 797 | CTAGCACCCGTGAAGCACACCTGGGCT | H | 433 | 1899 | + |
LARSSTLNA | H | 177 | 798 | CTAGCACGGAGCAGCACCCTGAACGCT | H | 434 | 1900 | + |
LADDQAVNA | H | 178 | 799 | CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT | H | 435 | 1901 | + |
LATKSTGSA | H | 179 | 800 | CTAGCAACCAAGAGCACCGGCAGCGCT | H | 436 | 1902 | + |
LAFLRGPEA | H | 180 | 801 | CTAGCATTCCTGCGGGGCCCCGAGGCT | H | 437 | 1903 | + |
LADENLQAA | H | 181 | 802 | CTAGCAGACGAGAACCTGCAGGCCGCT | H | 438 | 1904 | + |
LANADFPLA | H | 182 | 803 | CTAGCAAACGCCGACTTCCCCCTGGCT | H | 439 | 1905 | + |
LAPTTIGGA | H | 183 | 804 | CTAGCACCCACCACCATCGGCGGCGCT | H | 440 | 1906 | + |
LASACMRAA | H | 184 | 805 | CTAGCAAGCGCCTGCATGCGGGCCGCT | H | 441 | 1907 | + |
LAKVASMNA | H | 185 | 806 | CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT | H | 442 | 1908 | + |
LALNNDQSA | H | 186 | 807 | CTAGCACTGAACAACGACCAGAGCGCT | H | 443 | 1909 | + |
LAGGKQALA | H | 187 | 808 | CTAGCAGGCGGCAAGCAGGCCCTGGCT | H | 444 | 1910 | + |
LAVAVDCFA | H | 188 | 809 | CTAGCAGTGGCCGTGGACTGCTTCGCT | H | 445 | 1911 | + |
LALETTQRA | H | 189 | 810 | CTAGCACTGGAGACCACCCAGCGGGCT | H | 446 | 1912 | + |
LAPNTPKIA | H | 190 | 811 | CTAGCACCCAACACCCCCAAGATCGCT | H | 447 | 1913 | + |
LASIGFSAA | H | 191 | 812 | CTAGCAAGCATCGGCTTCAGCGCCGCT | H | 448 | 1914 | + |
LADVGCENA | H | 192 | 813 | CTAGCAGACGTGGGCTGCGAGAACGCT | H | 449 | 1915 | + |
LAGSRVNFA | H | 193 | 814 | CTAGCAGGCAGCCGGGTGAACTTCGCT | H | 450 | 1916 | + |
LADLTLRAA | H | 194 | 815 | CTAGCAGACCTGACCCTGCGGGCCGCT | H | 451 | 1917 | + |
LAKGQSQGA | H | 195 | 816 | CTAGCAAAGGGCCAGAGCCAGGGCGCT | H | 452 | 1918 | + |
LAHTPDTFA | H | 196 | 817 | CTAGCACACACCCCCGACACCTTCGCT | H | 453 | 1919 | + |
LAAHQMASA | H | 197 | 818 | CTAGCAGCCCACCAGATGGCCAGCGCT | H | 454 | 1920 | + |
LACRSDCVA | H | 198 | 819 | CTAGCATGCCGGAGCGACTGCGTGGCT | H | 455 | 1921 | + |
LANTWCKGA | H | 199 | 820 | CTAGCAAACACCTGGTGCAAGGGCGCT | H | 456 | 1922 | + |
LAAEHKQTA | H | 200 | 821 | CTAGCAGCCGAGCACAAGCAGACCGCT | H | 457 | 1923 | + |
LAAEHIGRA | H | 201 | 822 | CTAGCAGCCGAGCACATCGGCCGGGCT | H | 458 | 1924 | + |
LAEQVLEKA | H | 202 | 823 | CTAGCAGAGCAGGTGCTGGAGAAGGCT | H | 459 | 1925 | + |
LAYFHSYAA | H | 203 | 824 | CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT | H | 460 | 1926 | + |
LAEPPDPPA | H | 204 | 825 | CTAGCAGAGCCCCCCGACCCCCCCGCT | H | 461 | 1927 | + |
LATRADIFA | H | 205 | 826 | CTAGCAACCCGGGCCGACATCTTCGCT | H | 462 | 1928 | + |
LADTYKPYA | H | 206 | 827 | CTAGCAGACACCTACAAGCCCTACGCT | H | 463 | 1929 | + |
LANRLSNVA | H | 207 | 828 | CTAGCAAACCGGCTGAGCAACGTGGCT | H | 464 | 1930 | + |
LAMTNTFLA | H | 208 | 829 | CTAGCAATGACCAACACCTTCCTGGCT | H | 465 | 1931 | + |
LAGESSYLA | H | 209 | 830 | CTAGCAGGCGAGAGCAGCTACCTGGCT | H | 466 | 1932 | + |
LANRWAIDA | H | 210 | 831 | CTAGCAAACCGGTGGGCCATCGACGCT | H | 467 | 1933 | + |
LAETVKYMA | H | 211 | 832 | CTAGCAGAGACCGTGAAGTACATGGCT | H | 468 | 1934 | + |
LAMKYVFDA | H | 212 | 833 | CTAGCAATGAAGTACGTGTTCGACGCT | H | 469 | 1935 | + |
LAKRDKPTA | H | 213 | 834 | CTAGCAAAGCGGGACAAGCCCACCGCT | H | 470 | 1936 | + |
LADWRTTPA | H | 214 | 835 | CTAGCAGACTGGCGGACCACCCCCGCT | H | 471 | 1937 | + |
LAKGVTTAA | H | 215 | 836 | CTAGCAAAGGGCGTGACCACCGCCGCT | H | 472 | 1938 | + |
LAFCTPRYA | H | 216 | 837 | CTAGCATTCTGCACCCCCCGGTACGCT | H | 473 | 1939 | + |
LANLKNFSA | H | 217 | 838 | CTAGCAAACCTGAAGAACTTCAGCGCT | H | 474 | 1940 | + |
LAHYPSAPA | H | 218 | 839 | CTAGCACACTACCCCAGCGCCCCCGCT | H | 475 | 1941 | + |
LAQEAKLTA | H | 219 | 840 | CTAGCACAGGAGGCCAAGCTGACCGCT | H | 476 | 1942 | + |
LAVEPGPPA | H | 220 | 841 | CTAGCAGTGGAGCCCGGCCCCCCCGCT | H | 477 | 1943 | + |
LAKGPASIA | H | 221 | 842 | CTAGCAAAGGGCCCCGCCAGCATCGCT | H | 478 | 1944 | + |
LAEGLSQFA | H | 222 | 843 | CTAGCAGAGGGCCTGAGCCAGTTCGCT | H | 479 | 1945 | + |
LAKPTGKDA | H | 223 | 844 | CTAGCAAAGCCCACCGGCAAGGACGCT | H | 480 | 1946 | + |
LAKGMKEGA | H | 224 | 845 | CTAGCAAAGGGCATGAAGGAGGGCGCT | H | 481 | 1947 | + |
TSHVSTSS | H | 225 | 846 | ACCAGCCACGTGAGCACCAGCAGC | H | 482 | 1948 | +++ |
SGVLFTEG | H | 226 | 847 | AGCGGCGTGCTGTTCACCGAGGGC | H | 483 | 1949 | +++ |
TSGMGAIG | H | 227 | 848 | ACCAGCGGCATGGGCGCCATCGGC | H | 484 | 1950 | +++ |
TGDSEQQT | H | 228 | 849 | ACCGGCGACAGCGAGCAGCAGACC | H | 485 | 1951 | +++ |
SGSVGYVG | H | 229 | 850 | AGCGGCAGCGTGGGCTACGTGGGC | H | 486 | 1952 | +++ |
TGDKWPQG | H | 230 | 851 | ACCGGCGACAAGTGGCCCCAGGGC | H | 487 | 1953 | +++ |
SGEMTKPG | H | 231 | 852 | AGCGGCGAGATGACCAAGCCCGGC | H | 488 | 1954 | +++ |
SGPGTSGT | H | 232 | 853 | AGCGGCCCCGGCACCAGCGGCACC | H | 489 | 1955 | ++ |
SSENNKGG | H | 233 | 854 | AGCAGCGAGAACAACAAGGGCGGC | H | 490 | 1956 | ++ |
TTENHKPG | H | 234 | 855 | ACCACCGAGAACCACAAGCCCGGC | H | 491 | 1957 | ++ |
TSQEKQNS | H | 235 | 856 | ACCAGCCAGGAGAAGCAGAACAGC | H | 492 | 1958 | ++ |
GTMFNNST | H | 236 | 857 | GGCACCATGTTCAACAACAGCACC | H | 493 | 1959 | ++ |
SGPKETGG | H | 237 | 858 | AGCGGCCCCAAGGAGACCGGCGGC | H | 494 | 1960 | + |
SGIDTRLG | H | 238 | 859 | AGCGGCATCGACACCCGGCTGGGC | H | 495 | 1961 | + |
TTGMERPT | H | 239 | 860 | ACCACCGGCATGGAGCGGCCCACC | H | 496 | 1962 | + |
TGEGPTKG | H | 240 | 861 | ACCGGCGAGGGCCCCACCAAGGGC | H | 497 | 1963 | + |
TGPGTHNG | H | 241 | 862 | ACCGGCCCCGGCACCCACAACGGC | H | 498 | 1964 | + |
SGREIHFG | H | 242 | 863 | AGCGGCCGGGAGATCCACTTCGGC | H | 499 | 1965 | + |
TGDERKPG | H | 243 | 864 | ACCGGCGACGAGCGGAAGCCCGGC | H | 500 | 1966 | + |
STTKPM | H | 244 | 865 | AGCACCACCAAGCCCATG | H | 501 | 1967 | +++ |
CKEITR | H | 245 | 866 | TGCAAGGAGATCACCCGG | H | 502 | 1968 | +++ |
PDVSLL | H | 246 | 867 | CCCGACGTGAGCCTGCTG | H | 503 | 1969 | +++ |
FNKVLH | H | 247 | 868 | TTCAACAAGGTGCTGCAC | H | 504 | 1970 | +++ |
RLGRLS | H | 248 | 869 | CGGCTGGGCCGGCTGAGC | H | 505 | 1971 | +++ |
RTGRNT | H | 249 | 870 | CGGACCGGCCGGAACACC | H | 506 | 1972 | ++ |
RALKIS | H | 250 | 871 | CGGGCCCTGAAGATCAGC | H | 507 | 1973 | ++ |
NIKKAA | H | 251 | 872 | AACATCAAGAAGGCCGCC | H | 508 | 1974 | ++ |
RPGRVS | H | 252 | 873 | CGGCCCGGCCGGGTGAGC | H | 509 | 1975 | ++ |
RLGKVP | H | 253 | 874 | CGGCTGGGCAAGGTGCCC | H | 510 | 1976 | + |
NSKKLG | H | 254 | 875 | AACAGCAAGAAGCTGGGC | H | 511 | 1977 | + |
KAMRTG | H | 255 | 876 | AAGGCCATGCGGACCGGC | H | 512 | 1978 | + |
KFTKAA | H | 256 | 877 | AAGTTCACCAAGGCCGCC | H | 513 | 1979 | + |
HSKDGA | H | 257 | 878 | CACAGCAAGGACGGCGCC | H | 514 | 1980 | + |
HFPVFS | H | 258 | 879 | CACTTCCCCGTGTTCAGC | H | 515 | 1981 | + |
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
**活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1I]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 編碼胺基酸序列之核酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 活性水平* | ||
LAWRIMKHA | I | 2 | 880 | CTAGCATGGCGGATCATGAAGCACGCT | I | 75 | 1982 | +++ |
LASNMERIA | I | 3 | 881 | CTAGCAAGCAACATGGAGCGGATCGCT | I | 76 | 1983 | +++ |
LADYRNDKA | I | 4 | 882 | CTAGCAGACTACCGGAACGACAAGGCT | I | 77 | 1984 | +++ |
LAPNQGTPA | I | 5 | 883 | CTAGCACCCAACCAGGGCACCCCCGCT | I | 78 | 1985 | +++ |
LAKPPPKDA | I | 6 | 884 | CTAGCAAAGCCCCCCCCCAAGGACGCT | I | 79 | 1986 | +++ |
LALPEGRFA | I | 7 | 885 | CTAGCACTGCCCGAGGGCCGGTTCGCT | I | 80 | 1987 | +++ |
LAHPGTTFA | I | 8 | 886 | CTAGCACACCCCGGCACCACCTTCGCT | I | 81 | 1988 | +++ |
LARGVAPIA | I | 9 | 887 | CTAGCACGGGGCGTGGCCCCCATCGCT | I | 82 | 1989 | +++ |
LAHRAPDSA | I | 10 | 888 | CTAGCACACCGGGCCCCCGACAGCGCT | I | 83 | 1990 | +++ |
LAELALIKA | I | 11 | 889 | CTAGCAGAGCTGGCCCTGATCAAGGCT | I | 84 | 1991 | +++ |
LAVAVDCFA | I | 12 | 890 | CTAGCAGTGGCCGTGGACTGCTTCGCT | I | 85 | 1992 | +++ |
LACSSTWYA | I | 13 | 891 | CTAGCATGCAGCAGCACCTGGTACGCT | I | 86 | 1993 | +++ |
LAELDFKWA | I | 14 | 892 | CTAGCAGAGCTGGACTTCAAGTGGGCT | I | 87 | 1994 | +++ |
LAHEPMFNA | I | 15 | 893 | CTAGCACACGAGCCCATGTTCAACGCT | I | 88 | 1995 | +++ |
LAKDGMIGA | I | 16 | 894 | CTAGCAAAGGACGGCATGATCGGCGCT | I | 89 | 1996 | +++ |
LAHEGRQAA | I | 17 | 895 | CTAGCACACGAGGGCCGGCAGGCCGCT | I | 90 | 1997 | +++ |
LAEYHNNDA | I | 18 | 896 | CTAGCAGAGTACCACAACAACGACGCT | I | 91 | 1998 | +++ |
LAAEHIGRA | I | 19 | 897 | CTAGCAGCCGAGCACATCGGCCGGGCT | I | 92 | 1999 | +++ |
LAEPFPVAA | I | 20 | 898 | CTAGCAGAGCCCTTCCCCGTGGCCGCT | I | 93 | 2000 | +++ |
LAHIQEPKA | I | 21 | 899 | CTAGCACACATCCAGGAGCCCAAGGCT | I | 94 | 2001 | +++ |
LAFNGSTSA | I | 22 | 900 | CTAGCATTCAACGGCAGCACCAGCGCT | I | 95 | 2002 | +++ |
LADNCWCCA | I | 23 | 901 | CTAGCAGACAACTGCTGGTGCTGCGCT | I | 96 | 2003 | +++ |
LACPVAEWA | I | 24 | 902 | CTAGCATGCCCCGTGGCCGAGTGGGCT | I | 97 | 2004 | ++ |
LAMGHNYVA | I | 25 | 903 | CTAGCAATGGGCCACAACTACGTGGCT | I | 98 | 2005 | ++ |
LANQGFLTA | I | 26 | 904 | CTAGCAAACCAGGGCTTCCTGACCGCT | I | 99 | 2006 | ++ |
LAPMRGVYA | I | 27 | 905 | CTAGCACCCATGCGGGGCGTGTACGCT | I | 100 | 2007 | ++ |
LANEAQGKA | I | 28 | 906 | CTAGCAAACGAGGCCCAGGGCAAGGCT | I | 101 | 2008 | ++ |
LAQKKLLEA | I | 29 | 907 | CTAGCACAGAAGAAGCTGCTGGAGGCT | I | 102 | 2009 | ++ |
LAPCYEPPA | I | 30 | 908 | CTAGCACCCTGCTACGAGCCCCCCGCT | I | 103 | 2010 | ++ |
LAISQPNPA | I | 31 | 909 | CTAGCAATCAGCCAGCCCAACCCCGCT | I | 104 | 2011 | ++ |
LAQVQVEGA | I | 32 | 910 | CTAGCACAGGTGCAGGTGGAGGGCGCT | I | 105 | 2012 | ++ |
LAQAGDTAA | I | 33 | 911 | CTAGCACAGGCCGGCGACACCGCCGCT | I | 106 | 2013 | ++ |
LARSSTLNA | I | 34 | 912 | CTAGCACGGAGCAGCACCCTGAACGCT | I | 107 | 2014 | ++ |
LAEFRVGQA | I | 35 | 913 | CTAGCAGAGTTCCGGGTGGGCCAGGCT | I | 108 | 2015 | ++ |
LAGSMAKLA | I | 36 | 914 | CTAGCAGGCAGCATGGCCAAGCTGGCT | I | 109 | 2016 | ++ |
LAPIQLAQA | I | 37 | 915 | CTAGCACCCATCCAGCTGGCCCAGGCT | I | 110 | 2017 | ++ |
LAPSGDRHA | I | 38 | 916 | CTAGCACCCAGCGGCGACCGGCACGCT | I | 111 | 2018 | ++ |
LANRLSNVA | I | 39 | 917 | CTAGCAAACCGGCTGAGCAACGTGGCT | I | 112 | 2019 | ++ |
LADPMPTHA | I | 40 | 918 | CTAGCAGACCCCATGCCCACCCACGCT | I | 113 | 2020 | ++ |
LAVEPGPPA | I | 41 | 919 | CTAGCAGTGGAGCCCGGCCCCCCCGCT | I | 114 | 2021 | ++ |
LAYFHSYAA | I | 42 | 920 | CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT | I | 115 | 2022 | ++ |
LAMTNTFLA | I | 43 | 921 | CTAGCAATGACCAACACCTTCCTGGCT | I | 116 | 2023 | ++ |
LAFPCIKEA | I | 44 | 922 | CTAGCATTCCCCTGCATCAAGGAGGCT | I | 117 | 2024 | + |
LAHTPDTFA | I | 45 | 923 | CTAGCACACACCCCCGACACCTTCGCT | I | 118 | 2025 | + |
LAGEVTKHA | I | 46 | 924 | CTAGCAGGCGAGGTGACCAAGCACGCT | I | 119 | 2026 | + |
LAGDIVRNA | I | 47 | 925 | CTAGCAGGCGACATCGTGCGGAACGCT | I | 120 | 2027 | + |
LANRWAIDA | I | 48 | 926 | CTAGCAAACCGGTGGGCCATCGACGCT | I | 121 | 2028 | + |
LANAMEKHA | I | 49 | 927 | CTAGCAAACGCCATGGAGAAGCACGCT | I | 122 | 2029 | + |
LADENLQAA | I | 50 | 928 | CTAGCAGACGAGAACCTGCAGGCCGCT | I | 123 | 2030 | + |
LATRADIFA | I | 51 | 929 | CTAGCAACCCGGGCCGACATCTTCGCT | I | 124 | 2031 | + |
LAKDGGKIA | I | 52 | 930 | CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT | I | 125 | 2032 | + |
LAGKIEENA | I | 53 | 931 | CTAGCAGGCAAGATCGAGGAGAACGCT | I | 126 | 2033 | + |
LAPVKHTWA | I | 54 | 932 | CTAGCACCCGTGAAGCACACCTGGGCT | I | 127 | 2034 | + |
LAKVASMNA | I | 55 | 933 | CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT | I | 128 | 2035 | + |
LAQVEVSKA | I | 56 | 934 | CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT | I | 129 | 2036 | + |
LANLKNFSA | I | 57 | 935 | CTAGCAAACCTGAAGAACTTCAGCGCT | I | 130 | 2037 | + |
LAKGQAQNA | I | 58 | 936 | CTAGCAAAGGGCCAGGCCCAGAACGCT | I | 131 | 2038 | + |
LADDQAVNA | I | 59 | 937 | CTAGCAGACGACCAGGCCGTGAACGCT | I | 132 | 2039 | + |
TSQEKQNS | I | 60 | 938 | ACCAGCCAGGAGAAGCAGAACAGC | I | 133 | 2040 | ++ |
SGPGTSGT | I | 61 | 939 | AGCGGCCCCGGCACCAGCGGCACC | I | 134 | 2041 | ++ |
TGIATSYS | I | 62 | 940 | ACCGGCATCGCCACCAGCTACAGC | I | 135 | 2042 | ++ |
SGREIHFG | I | 63 | 941 | AGCGGCCGGGAGATCCACTTCGGC | I | 136 | 2043 | ++ |
SGIDTRLG | I | 64 | 942 | AGCGGCATCGACACCCGGCTGGGC | I | 137 | 2044 | + |
GTMFNNST | I | 65 | 943 | GGCACCATGTTCAACAACAGCACC | I | 138 | 2045 | + |
TTGMERPT | I | 66 | 944 | ACCACCGGCATGGAGCGGCCCACC | I | 139 | 2046 | + |
TGDERKPG | I | 67 | 945 | ACCGGCGACGAGCGGAAGCCCGGC | I | 140 | 2047 | + |
CKEITR | I | 68 | 946 | TGCAAGGAGATCACCCGG | I | 141 | 2048 | +++ |
PDVSLL | I | 69 | 947 | CCCGACGTGAGCCTGCTG | I | 142 | 2049 | +++ |
NIKKAA | I | 70 | 948 | AACATCAAGAAGGCCGCC | I | 143 | 2050 | ++ |
RLGRLS | I | 71 | 949 | CGGCTGGGCCGGCTGAGC | I | 144 | 2051 | + |
KAMRTG | I | 72 | 950 | AAGGCCATGCGGACCGGC | I | 145 | 2052 | + |
KFTKAA | I | 73 | 951 | AAGTTCACCAAGGCCGCC | I | 146 | 2053 | + |
RLGKVP | I | 74 | 952 | CGGCTGGGCAAGGTGCCC | I | 147 | 2054 | + |
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平:+++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1J]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 編碼胺基酸序列之核酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 活性水平* | ||
LAHGGLREA | J | 2 | 953 | CTAGCACACGGCGGCCTGCGGGAGGCT | J | 65 | 2055 | +++ |
LAFTHGTNA | J | 3 | 954 | CTAGCATTCACCCACGGCACCAACGCT | J | 66 | 2056 | +++ |
LADPTETPA | J | 4 | 955 | CTAGCAGACCCCACCGAGACCCCCGCT | J | 67 | 2057 | +++ |
LALNDNVGA | J | 5 | 956 | CTAGCACTGAACGACAACGTGGGCGCT | J | 68 | 2058 | +++ |
LAFCIKHCA | J | 6 | 957 | CTAGCATTCTGCATCAAGCACTGCGCT | J | 69 | 2059 | +++ |
LAHWQEEWA | J | 7 | 958 | CTAGCACACTGGCAGGAGGAGTGGGCT | J | 70 | 2060 | +++ |
LAYVIENDA | J | 8 | 959 | CTAGCATACGTGATCGAGAACGACGCT | J | 71 | 2061 | +++ |
LASTTMNIA | J | 9 | 960 | CTAGCAAGCACCACCATGAACATCGCT | J | 72 | 2062 | +++ |
LAYVALFYA | J | 10 | 961 | CTAGCATACGTGGCCCTGTTCTACGCT | J | 73 | 2063 | +++ |
LAFQQQRCA | J | 11 | 962 | CTAGCATTCCAGCAGCAGCGGTGCGCT | J | 74 | 2064 | +++ |
LADSSKWIA | J | 12 | 963 | CTAGCAGACAGCAGCAAGTGGATCGCT | J | 75 | 2065 | +++ |
LAVMGNMLA | J | 13 | 964 | CTAGCAGTGATGGGCAACATGCTGGCT | J | 76 | 2066 | +++ |
LANANTRPA | J | 14 | 965 | CTAGCAAACGCCAACACCCGGCCCGCT | J | 77 | 2067 | +++ |
LAGENHISA | J | 15 | 966 | CTAGCAGGCGAGAACCACATCAGCGCT | J | 78 | 2068 | +++ |
LASVSTIQA | J | 16 | 967 | CTAGCAAGCGTGAGCACCATCCAGGCT | J | 79 | 2069 | +++ |
LAAYHDSAA | J | 17 | 968 | CTAGCAGCCTACCACGACAGCGCCGCT | J | 80 | 2070 | +++ |
LAVKGLVNA | J | 18 | 969 | CTAGCAGTGAAGGGCCTGGTGAACGCT | J | 81 | 2071 | +++ |
LADGGTRPA | J | 19 | 970 | CTAGCAGACGGCGGCACCCGGCCCGCT | J | 82 | 2072 | +++ |
LACYPPTCA | J | 20 | 971 | CTAGCATGCTACCCCCCCACCTGCGCT | J | 83 | 2073 | +++ |
LAKVSKGDA | J | 21 | 972 | CTAGCAAAGGTGAGCAAGGGCGACGCT | J | 84 | 2074 | +++ |
LAWKCKGTA | J | 22 | 973 | CTAGCATGGAAGTGCAAGGGCACCGCT | J | 85 | 2075 | ++ |
LADMTRFHA | J | 23 | 974 | CTAGCAGACATGACCCGGTTCCACGCT | J | 86 | 2076 | ++ |
LAGKTISGA | J | 24 | 975 | CTAGCAGGCAAGACCATCAGCGGCGCT | J | 87 | 2077 | ++ |
LALKLRTEA | J | 25 | 976 | CTAGCACTGAAGCTGCGGACCGAGGCT | J | 88 | 2078 | ++ |
LAAVTKDSA | J | 26 | 977 | CTAGCAGCCGTGACCAAGGACAGCGCT | J | 89 | 2079 | ++ |
LAKDKGLIA | J | 27 | 978 | CTAGCAAAGGACAAGGGCCTGATCGCT | J | 90 | 2080 | ++ |
LAHHKESIA | J | 28 | 979 | CTAGCACACCACAAGGAGAGCATCGCT | J | 91 | 2081 | ++ |
LAVDIMRGA | J | 29 | 980 | CTAGCAGTGGACATCATGCGGGGCGCT | J | 92 | 2082 | ++ |
LANIVQQDA | J | 30 | 981 | CTAGCAAACATCGTGCAGCAGGACGCT | J | 93 | 2083 | ++ |
LAGERETVA | J | 31 | 982 | CTAGCAGGCGAGCGGGAGACCGTGGCT | J | 94 | 2084 | ++ |
LADVVSVSA | J | 32 | 983 | CTAGCAGACGTGGTGAGCGTGAGCGCT | J | 95 | 2085 | ++ |
LATPNVNAA | J | 33 | 984 | CTAGCAACCCCCAACGTGAACGCCGCT | J | 96 | 2086 | ++ |
LALNAAATA | J | 34 | 985 | CTAGCACTGAACGCCGCCGCCACCGCT | J | 97 | 2087 | ++ |
LADCMMINA | J | 35 | 986 | CTAGCAGACTGCATGATGATCAACGCT | J | 98 | 2088 | ++ |
LAMLACKGA | J | 36 | 987 | CTAGCAATGCTGGCCTGCAAGGGCGCT | J | 99 | 2089 | ++ |
LANMMAAGA | J | 37 | 988 | CTAGCAAACATGATGGCCGCCGGCGCT | J | 100 | 2090 | ++ |
LADKNRLQA | J | 38 | 989 | CTAGCAGACAAGAACCGGCTGCAGGCT | J | 101 | 2091 | ++ |
LAAVGMKMA | J | 39 | 990 | CTAGCAGCCGTGGGCATGAAGATGGCT | J | 102 | 2092 | ++ |
LADDMIFVA | J | 40 | 991 | CTAGCAGACGACATGATCTTCGTGGCT | J | 103 | 2093 | ++ |
LADIVGESA | J | 41 | 992 | CTAGCAGACATCGTGGGCGAGAGCGCT | J | 104 | 2094 | ++ |
LAGGKQALA | J | 42 | 993 | CTAGCAGGCGGCAAGCAGGCCCTGGCT | J | 105 | 2095 | + |
LAQNQKQIA | J | 43 | 994 | CTAGCACAGAACCAGAAGCAGATCGCT | J | 106 | 2096 | + |
LAETTLTRA | J | 44 | 995 | CTAGCAGAGACCACCCTGACCCGGGCT | J | 107 | 2097 | + |
LAMLGGTSA | J | 45 | 996 | CTAGCAATGCTGGGCGGCACCAGCGCT | J | 108 | 2098 | + |
LAGFMEYYA | J | 46 | 997 | CTAGCAGGCTTCATGGAGTACTACGCT | J | 109 | 2099 | + |
LAYGQQTTA | J | 47 | 998 | CTAGCATACGGCCAGCAGACCACCGCT | J | 110 | 2100 | + |
LALNNDQSA | J | 48 | 999 | CTAGCACTGAACAACGACCAGAGCGCT | J | 111 | 2101 | + |
LAFLRGPEA | J | 49 | 1000 | CTAGCATTCCTGCGGGGCCCCGAGGCT | J | 112 | 2102 | + |
LACPVAEWA | J | 50 | 1001 | CTAGCATGCCCCGTGGCCGAGTGGGCT | J | 113 | 2103 | + |
LALETTQRA | J | 51 | 1002 | CTAGCACTGGAGACCACCCAGCGGGCT | J | 114 | 2104 | + |
LADTYKPYA | J | 52 | 1003 | CTAGCAGACACCTACAAGCCCTACGCT | J | 115 | 2105 | + |
LAKRDKPTA | J | 53 | 1004 | CTAGCAAAGCGGGACAAGCCCACCGCT | J | 116 | 2106 | + |
LAYFHSYAA | J | 54 | 1005 | CTAGCATACTTCCACAGCTACGCCGCT | J | 117 | 2107 | + |
LAMTNTFLA | J | 55 | 1006 | CTAGCAATGACCAACACCTTCCTGGCT | J | 118 | 2108 | + |
LAGESSYLA | J | 56 | 1007 | CTAGCAGGCGAGAGCAGCTACCTGGCT | J | 119 | 2109 | + |
LAAEHIGRA | J | 57 | 1008 | CTAGCAGCCGAGCACATCGGCCGGGCT | J | 120 | 2110 | + |
LADWRTTPA | J | 58 | 1009 | CTAGCAGACTGGCGGACCACCCCCGCT | J | 121 | 2111 | + |
LAEGLSQFA | J | 59 | 1010 | CTAGCAGAGGGCCTGAGCCAGTTCGCT | J | 122 | 2112 | + |
LAKPTGKDA | J | 60 | 1011 | CTAGCAAAGCCCACCGGCAAGGACGCT | J | 123 | 2113 | + |
TGEGPTKG | J | 61 | 1012 | ACCGGCGAGGGCCCCACCAAGGGC | J | 124 | 2114 | + |
RALKIS | J | 62 | 1013 | CGGGCCCTGAAGATCAGC | J | 125 | 2115 | ++ |
NSKKLG | J | 63 | 1014 | AACAGCAAGAAGCTGGGC | J | 126 | 2116 | + |
HFPVFS | J | 64 | 1015 | CACTTCCCCGTGTTCAGC | J | 127 | 2117 | + |
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平: +++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
[表1K]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 編碼胺基酸序列之核酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 活性水平* | ||
LATDRTKTA | K | 2 | 1016 | CTAGCAACCGACCGGACCAAGACCGCT | K | 64 | 2118 | +++ |
LAVDNIWAA | K | 3 | 1017 | CTAGCAGTGGACAACATCTGGGCCGCT | K | 65 | 2119 | +++ |
LAGQAMMQA | K | 4 | 1018 | CTAGCAGGCCAGGCCATGATGCAGGCT | K | 66 | 2120 | +++ |
LAMTKITDA | K | 5 | 1019 | CTAGCAATGACCAAGATCACCGACGCT | K | 67 | 2121 | +++ |
LAGGEYETA | K | 6 | 1020 | CTAGCAGGCGGCGAGTACGAGACCGCT | K | 68 | 2122 | +++ |
LAALVDANA | K | 7 | 1021 | CTAGCAGCCCTGGTGGACGCCAACGCT | K | 69 | 2123 | +++ |
LALENIGQA | K | 8 | 1022 | CTAGCACTGGAGAACATCGGCCAGGCT | K | 70 | 2124 | +++ |
LAHRAPDSA | K | 9 | 1023 | CTAGCACACCGGGCCCCCGACAGCGCT | K | 71 | 2125 | +++ |
LAEGQEDSA | K | 10 | 1024 | CTAGCAGAGGGCCAGGAGGACAGCGCT | K | 72 | 2126 | +++ |
LAPHIAKDA | K | 11 | 1025 | CTAGCACCCCACATCGCCAAGGACGCT | K | 73 | 2127 | +++ |
LARDQLKLA | K | 12 | 1026 | CTAGCACGGGACCAGCTGAAGCTGGCT | K | 74 | 2128 | +++ |
LALNSGKMA | K | 13 | 1027 | CTAGCACTGAACAGCGGCAAGATGGCT | K | 75 | 2129 | +++ |
LAVSRHGEA | K | 14 | 1028 | CTAGCAGTGAGCCGGCACGGCGAGGCT | K | 76 | 2130 | +++ |
LAMNEPVTA | K | 15 | 1029 | CTAGCAATGAACGAGCCCGTGACCGCT | K | 77 | 2131 | +++ |
LAYITEKSA | K | 16 | 1030 | CTAGCATACATCACCGAGAAGAGCGCT | K | 78 | 2132 | ++ |
LAYDAGGHA | K | 17 | 1031 | CTAGCATACGACGCCGGCGGCCACGCT | K | 79 | 2133 | ++ |
LALHQERQA | K | 18 | 1032 | CTAGCACTGCACCAGGAGCGGCAGGCT | K | 80 | 2134 | ++ |
LAAKPKDGA | K | 19 | 1033 | CTAGCAGCCAAGCCCAAGGACGGCGCT | K | 81 | 2135 | ++ |
LAEYHNNDA | K | 20 | 1034 | CTAGCAGAGTACCACAACAACGACGCT | K | 82 | 2136 | ++ |
LATWCLVWA | K | 21 | 1035 | CTAGCAACCTGGTGCCTGGTGTGGGCT | K | 83 | 2137 | ++ |
LAFGFSADA | K | 22 | 1036 | CTAGCATTCGGCTTCAGCGCCGACGCT | K | 84 | 2138 | ++ |
LAGVVKTDA | K | 23 | 1037 | CTAGCAGGCGTGGTGAAGACCGACGCT | K | 85 | 2139 | ++ |
LAKFMWIHA | K | 24 | 1038 | CTAGCAAAGTTCATGTGGATCCACGCT | K | 86 | 2140 | ++ |
LANQGFLTA | K | 25 | 1039 | CTAGCAAACCAGGGCTTCCTGACCGCT | K | 87 | 2141 | ++ |
LAHDLHGGA | K | 26 | 1040 | CTAGCACACGACCTGCACGGCGGCGCT | K | 88 | 2142 | ++ |
LASENLNRA | K | 27 | 1041 | CTAGCAAGCGAGAACCTGAACCGGGCT | K | 89 | 2143 | ++ |
LAFRTMEYA | K | 28 | 1042 | CTAGCATTCCGGACCATGGAGTACGCT | K | 90 | 2144 | ++ |
LAAANHDNA | K | 29 | 1043 | CTAGCAGCCGCCAACCACGACAACGCT | K | 91 | 2145 | ++ |
LAPSKMGLA | K | 30 | 1044 | CTAGCACCCAGCAAGATGGGCCTGGCT | K | 92 | 2146 | ++ |
LANEGTIRA | K | 31 | 1045 | CTAGCAAACGAGGGCACCATCCGGGCT | K | 93 | 2147 | ++ |
LARGTLMTA | K | 32 | 1046 | CTAGCACGGGGCACCCTGATGACCGCT | K | 94 | 2148 | + |
LATKSTGSA | K | 33 | 1047 | CTAGCAACCAAGAGCACCGGCAGCGCT | K | 95 | 2149 | + |
LAALNSQTA | K | 34 | 1048 | CTAGCAGCCCTGAACAGCCAGACCGCT | K | 96 | 2150 | + |
LANVTLQSA | K | 35 | 1049 | CTAGCAAACGTGACCCTGCAGAGCGCT | K | 97 | 2151 | + |
LAAGQAQSA | K | 36 | 1050 | CTAGCAGCCGGCCAGGCCCAGAGCGCT | K | 98 | 2152 | + |
LAHDWGAPA | K | 37 | 1051 | CTAGCACACGACTGGGGCGCCCCCGCT | K | 99 | 2153 | + |
LAMDREIKA | K | 38 | 1052 | CTAGCAATGGACCGGGAGATCAAGGCT | K | 100 | 2154 | + |
LANADFPLA | K | 39 | 1053 | CTAGCAAACGCCGACTTCCCCCTGGCT | K | 101 | 2155 | + |
LAHQGAIIA | K | 40 | 1054 | CTAGCACACCAGGGCGCCATCATCGCT | K | 102 | 2156 | + |
LAPNTPKIA | K | 41 | 1055 | CTAGCACCCAACACCCCCAAGATCGCT | K | 103 | 2157 | + |
LAIPVEANA | K | 42 | 1056 | CTAGCAATCCCCGTGGAGGCCAACGCT | K | 104 | 2158 | + |
LAIGERTTA | K | 43 | 1057 | CTAGCAATCGGCGAGCGGACCACCGCT | K | 105 | 2159 | + |
LACRSDCVA | K | 44 | 1058 | CTAGCATGCCGGAGCGACTGCGTGGCT | K | 106 | 2160 | + |
LANRLSNVA | K | 45 | 1059 | CTAGCAAACCGGCTGAGCAACGTGGCT | K | 107 | 2161 | + |
LAQEQNAAA | K | 46 | 1060 | CTAGCACAGGAGCAGAACGCCGCCGCT | K | 108 | 2162 | + |
LARSSTLNA | K | 47 | 1061 | CTAGCACGGAGCAGCACCCTGAACGCT | K | 109 | 2163 | + |
LAMKYVFDA | K | 48 | 1062 | CTAGCAATGAAGTACGTGTTCGACGCT | K | 110 | 2164 | + |
LAQEAKLTA | K | 49 | 1063 | CTAGCACAGGAGGCCAAGCTGACCGCT | K | 111 | 2165 | + |
LAREDHRQA | K | 50 | 1064 | CTAGCACGGGAGGACCACCGGCAGGCT | K | 112 | 2166 | + |
LAHYPSAPA | K | 51 | 1065 | CTAGCACACTACCCCAGCGCCCCCGCT | K | 113 | 2167 | + |
LAKGMKEGA | K | 52 | 1066 | CTAGCAAAGGGCATGAAGGAGGGCGCT | K | 114 | 2168 | + |
TSHVSTSS | K | 53 | 1067 | ACCAGCCACGTGAGCACCAGCAGC | K | 115 | 2169 | +++ |
SGVLFTEG | K | 54 | 1068 | AGCGGCGTGCTGTTCACCGAGGGC | K | 116 | 2170 | +++ |
TSGMGAIG | K | 55 | 1069 | ACCAGCGGCATGGGCGCCATCGGC | K | 117 | 2171 | +++ |
TGDSEQQT | K | 56 | 1070 | ACCGGCGACAGCGAGCAGCAGACC | K | 118 | 2172 | +++ |
SGSVGYVG | K | 57 | 1071 | AGCGGCAGCGTGGGCTACGTGGGC | K | 119 | 2173 | +++ |
SSENNKGG | K | 58 | 1072 | AGCAGCGAGAACAACAAGGGCGGC | K | 120 | 2174 | ++ |
SGPGTSGT | K | 59 | 1073 | AGCGGCCCCGGCACCAGCGGCACC | K | 121 | 2175 | ++ |
TTENHKPG | K | 60 | 1074 | ACCACCGAGAACCACAAGCCCGGC | K | 122 | 2176 | + |
FNKVLH | K | 61 | 1075 | TTCAACAAGGTGCTGCAC | K | 123 | 2177 | ++ |
RTGRNT | K | 62 | 1076 | CGGACCGGCCGGAACACC | K | 124 | 2178 | ++ |
RLGKVP | K | 63 | 1077 | CGGCTGGGCAAGGTGCCC | K | 125 | 2179 | + |
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平: +++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
** SEQ ID NO為用於序列表之序列編號
[表1L]可插入AAV殼體多肽之胺基酸序列。
胺基酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 編碼胺基酸序列之核酸序列 | SEQ ID NO: | SEQ ID NO: ** | 活性水平* | ||
LAWIERSMA | L | 2 | 1078 | CTAGCATGGATCGAGCGGAGCATGGCT | L | 28 | 2180 | +++ |
LAYDNTAEA | L | 3 | 1079 | CTAGCATACGACAACACCGCCGAGGCT | L | 29 | 2181 | +++ |
LAQVTEMRA | L | 4 | 1080 | CTAGCACAGGTGACCGAGATGCGGGCT | L | 30 | 2182 | ++ |
LATRADIFA | L | 5 | 1081 | CTAGCAACCCGGGCCGACATCTTCGCT | L | 31 | 2183 | ++ |
LAKDGGKIA | L | 6 | 1082 | CTAGCAAAGGACGGCGGCAAGATCGCT | L | 32 | 2184 | ++ |
LAQVEVSKA | L | 7 | 1083 | CTAGCACAGGTGGAGGTGAGCAAGGCT | L | 33 | 2185 | ++ |
LADTYKPYA | L | 8 | 1084 | CTAGCAGACACCTACAAGCCCTACGCT | L | 34 | 2186 | ++ |
LAQEAKLTA | L | 9 | 1085 | CTAGCACAGGAGGCCAAGCTGACCGCT | L | 35 | 2187 | ++ |
LACRSDCVA | L | 10 | 1086 | CTAGCATGCCGGAGCGACTGCGTGGCT | L | 36 | 2188 | ++ |
LAKDHHVIA | L | 11 | 1087 | CTAGCAAAGGACCACCACGTGATCGCT | L | 37 | 2189 | + |
LAEPPDPPA | L | 12 | 1088 | CTAGCAGAGCCCCCCGACCCCCCCGCT | L | 38 | 2190 | + |
LACSSTWYA | L | 13 | 1089 | CTAGCATGCAGCAGCACCTGGTACGCT | L | 39 | 2191 | + |
LADLTLRAA | L | 14 | 1090 | CTAGCAGACCTGACCCTGCGGGCCGCT | L | 40 | 2192 | + |
LAKVASMNA | L | 15 | 1091 | CTAGCAAAGGTGGCCAGCATGAACGCT | L | 41 | 2193 | + |
LAAQDVSWA | L | 16 | 1092 | CTAGCAGCCCAGGACGTGAGCTGGGCT | L | 42 | 2194 | + |
LADVGCENA | L | 17 | 1093 | CTAGCAGACGTGGGCTGCGAGAACGCT | L | 43 | 2195 | + |
TGPGTHNG | L | 18 | 1094 | ACCGGCCCCGGCACCCACAACGGC | L | 44 | 2196 | +++ |
STVPLNMG | L | 19 | 1095 | AGCACCGTGCCCCTGAACATGGGC | L | 45 | 2197 | ++ |
HSKDGA | L | 20 | 1096 | CACAGCAAGGACGGCGCC | L | 46 | 2198 | +++ |
RTGRNT | L | 21 | 1097 | CGGACCGGCCGGAACACC | L | 47 | 2199 | +++ |
NSKKLG | L | 22 | 1098 | AACAGCAAGAAGCTGGGC | L | 48 | 2200 | +++ |
RPGRVS | L | 23 | 1099 | CGGCCCGGCCGGGTGAGC | L | 49 | 2201 | +++ |
KFRHTE | L | 24 | 1100 | AAGTTCCGGCACACCGAG | L | 50 | 2202 | ++ |
KAMRTG | L | 25 | 1101 | AAGGCCATGCGGACCGGC | L | 51 | 2203 | + |
NIKKAA | L | 26 | 1102 | AACATCAAGAAGGCCGCC | L | 52 | 2204 | + |
KFTKAA | L | 27 | 1103 | AAGTTCACCAAGGCCGCC | L | 53 | 2205 | + |
AAV2載體經設計以包括SEQ ID NO:1,其中包括指示序列(indicated sequence)。將8聚體(8-mers)及9聚體(9-mers)插入SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間,且將6聚體(6-mers)用作SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物。
*活性水平: +++意指經修飾之AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的前1/3;++意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的中間1/3;且+意指AAV2載體之效能使其位於經拯救之AAV載體的後1/3。
**SEQ ID NO為用於序列表之序列編號。
表1A至1L之一或多者中所闡述之許多胺基酸序列以「LA」起始並以「A」結束。在此類情況下,「LA」序列可係第一連接子序列L1,且「A」胺基酸可係第二連接子序列L2,其中L1及L2連接子各獨立地係可選的胺基酸連接子,具有根據下式A之一、二、或三個胺基酸:
-L1-插入物-L2- (式A)
其中L1及L2各獨立地係可選的具有一、二、或三個胺基酸之胺基酸連接子,且其中插入物(insert)表示表1A至1L之任何序列識別符之序列,其不具有起始「LA」及結束「A」。例如,在一些情況下,AAV載體可經設計以具有包括SEQ ID NO:1093中所闡述之胺基酸序列的AAV殼體多肽,該胺基酸序列係LADVGCENA(SEQ ID NO:1093),或可經設計以具有根據式A的基於SEQ ID NO:1093的胺基酸序列的AAV殼體多肽,該胺基酸序列係L1-DVGCEN-L2(SEQ ID NO:2207),其中L1及L2如本文中所定義。
如本文中所述,AAV載體可經設計以具有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括基於表1A至1L中所闡述之胺基酸序列中任一者的式A的胺基酸序列。例如,AAV載體可經設計以具有SEQ ID NO:1之AAV殼體多肽(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),該AAV殼體多肽包括基於表1A至1L中所闡述之位於SEQ ID NO:1的胺基酸位置587及588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)的胺基酸序列中任一者的式A的胺基酸序列。在一些情況下,L1、L2、或L1及L2兩者可不存在。例如,包括基於SEQ ID NO:1093之式A的胺基酸序列的AAV殼體多肽可在不存在起始「LA」及結束「A」之情況下包括SEQ ID NO:1093之胺基酸序列。在一些情況下,L1可係一個胺基酸X1、兩個胺基酸X2-X1、或三個胺基酸X3-X2-X1。當存在X1時,其可係選自由A、V、I、及L所組成之群組的胺基酸殘基。當存在X2時,其可係選自由A、V、I、及L所組成之群組的胺基酸殘基。當存在X3時,其可係選自由A、V、I、及L所組成之群組的胺基酸殘基。在一些情況下,L2可係一個胺基酸Z1、兩個胺基酸Z1-Z2、或三個胺基酸Z1-Z2-Z3。當存在Z1時,其可係選自由A、V、I、及L所組成之群組的胺基酸殘基。當存在Z2時,其可係選自由A、V、I、及L所組成之群組的胺基酸殘基。當存在Z3時,其可係選自由A、V、I、及L所組成之群組的胺基酸殘基。L1連接子之實例包括但不限於A、V、I、L、AA、AV、AI、AL、VA、VV、VI、VL、IA、IV、II、IL、LA、LV、LI、LL、AAA、AAV、AAI、AAL、AVA、AVV、AVI、AVL、AIA、AIV、AII、AIL、ALA、ALV、ALI、ALL、VAA、VAV、VAI、VAL、VVA、VVV、VVI、VVL、VIA、VIV、VII、VIL、VLA、VLV、VLI、VLL、IAA、IAV、IAI,IAL、IVA、IVV、IVI、IVL、IIA、IIV、III、IIL、ILA、ILV、ILI、ILL、LAA、LAV、LAI、LAL、LVA、LVV、LVI、LVL、LIA、LIV、LII、LIL、LLA、LLV、LLI、及LLL。L2連接子之實例包括但不限於A、V、I、L、AA、AV、AI、AL、VA、VV、VI、VL、IA、IV、II、IL、LA、LV、LI、LL、AAA、AAV、AAI、AAL、AVA、AVV、AVI、AVL、AIA、AIV、AII、AIL、ALA、ALV、ALI、ALL、VAA、VAV、VAI、VAL、VVA、VVV、VVI、VVL、VIA、VIV、VII、VIL、VLA、VLV、VLI、VLL、IAA、IAV、IAI,IAL、IVA、IVV、IVI、IVL、IIA、IIV、III、IIL、ILA、ILV、ILI、ILL、LAA、LAV、LAI、LAL、LVA、LVV、LVI、LVL、LIA、LIV、LII、LIL、LLA、LLV、LLI、及LLL。
在一些情況下,本文所提供之AAV2殼體多肽可具有SEQ ID NO:1中所闡述之序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列)、及表1A至1L中任一或多者所闡述之胺基酸序列(或其變體)、或基於在天冬醯胺-587及精胺酸-588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)插入此類所闡述之序列的根據式A之胺基酸序列。在一些情況下,本文所提供之AAV2殼體多肽可具有SEQ ID NO:1中所闡述之序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列)以及下列中之任一者所闡述的胺基酸序列(或其變體):SEQ ID NO:A2至A18、SEQ ID NO:B2至B298、SEQ ID NO:C2至C43、SEQ ID NO:D2至D76、SEQ ID NO:E2至E75、SEQ ID NO:F2至F11、SEQ ID NO:G2至G70、SEQ ID NO:H2至H243、SEQ ID NO:I2至I67、SEQ ID NO:J2至J61、SEQ ID NO:K2至K60、及SEQ ID NO:L2至L19,該些胺基酸序列插入在天冬醯胺-587及精胺酸-588之間(或替代序列之適當胺基酸位置)。
在一些情況下,當設計AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列時,包括的胺基酸序列可用以置換位於沿著AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)的任何適當位置的一或多個天然存在的胺基酸殘基。舉例而言,在表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)諸如下列中任一者:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27,可用於置換AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)在位置585至590的天然存在的胺基酸殘基。
在一些情況下,本文所提供之AAV2殼體多肽可具有SEQ ID NO:1中所闡述之序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列)或基於此類所闡述之序列的根據式A的序列,除了用表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)置換位置585至590(或替代序列的適當胺基酸位置)的胺基酸殘基。在一些情況下,本文所提供之AAV2殼體多肽可具有SEQ ID NO:1中所闡述之序列(或為SEQ ID NO:2206中所闡述之胺基酸序列的替代序列,或為與SEQ ID NO:1中所闡述之胺基酸序列至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%同一的胺基酸序列),除了胺基酸殘基585至590(或替代序列之適當胺基酸位置)經置換成下列中任一者所闡述之胺基酸序列(或其變體):SEQ ID NO:A19、SEQ ID NO:B299至B317、SEQ ID NO:C44至C45、SEQ ID NO:D77至D78、SEQ ID NO:E76至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G71至G77、SEQ ID NO:H244至H258、SEQ ID NO:I68至I75、SEQ ID NO:J62至J64、SEQ ID NO:K61至K63、及SEQ ID NO:L20至L27。
在一些情況下,AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之二或更多個胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。舉例而言,AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之二、三、或四個胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。
如本文中所述,AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)可經設計以包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列的變體係指與表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列同一的胺基酸序列,除了其具有一、二、或三個胺基酸添加、缺失、取代、或其組合。舉例而言,SEQ ID NO:A2之變體可係SEQ ID NO:A2,除了其具有一、二、或三個胺基酸添加、缺失、取代、或其組合。在一些情況下,除其含有一、二、或三個胺基酸添加,否則本文所提供之變體可係下列任一者中所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。在一些情況下,除其含有一、二、或三個胺基酸缺失,否則本文所提供之變體可係下列任一者中所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。在一些情況下,除其含有一、二、或三個胺基酸取代,否則本文所提供之變體可係下列任一者中所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。在一些情況下,除其含有一個胺基酸添加、缺失、或取代,否則本文所提供之變體可係下列任一者中所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。在一些情況下,除其含有兩個胺基酸添加、缺失、取代、或其組合,否則本文所提供之變體可係下列任一者中所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。在一些情況下,除其含有三個胺基酸添加、缺失、取代、或其組合,否則本文所提供之變體可係下列任一者中所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
在一些情況下,存在於變體中之胺基酸取代可係保守胺基酸取代。例如,保守胺基酸取代可藉由用一個胺基酸殘基取代具有類似側鏈之另一胺基酸殘基來進行。具有類似側鏈之胺基酸殘基家族可包括具有下列側鏈之胺基酸:鹼性側鏈(例如離胺酸、精胺酸、組胺酸)、酸性側鏈(例如,天冬胺酸、麩胺酸)、未帶電荷之極性側鏈(例如,甘胺酸、天冬醯胺酸、麩醯胺酸、絲胺酸、蘇胺酸、酪胺酸、半胱胺酸)、非極性側鏈(例如,丙胺酸、纈胺酸、白胺酸、異白胺酸、脯胺酸、苯丙胺酸、甲硫胺酸、色胺酸)、β-支鏈側鏈(例如,蘇胺酸、纈胺酸、異白胺酸)、及芳族側鏈(例如,酪胺酸、苯丙胺酸、色胺酸、組胺酸)。
在一些情況下,存在於變體中之胺基酸取代可係非保守胺基酸取代。非保守胺基酸取代可藉由用一個胺基酸殘基取代具有不同側鏈之另一胺基酸殘基來進行。非保守取代之實例包括但不限於(a)用親水性殘基(例如,絲胺酸或蘇胺酸)取代疏水性殘基(例如白胺酸、異白胺酸、苯丙胺酸、纈胺酸、或丙胺酸);(b)用半胱胺酸或脯胺酸取代任何其他殘基;(c)用具有鹼性側鏈(例如,離胺酸、精胺酸、或組胺酸)之殘基取代具有酸性側鏈(例如,天冬胺酸或麩胺酸)之殘基;及(d)用具有大側鏈(例如,苯丙胺酸)之殘基取代甘胺酸或具有小側鏈之其他殘基。
如下判定特定胺基酸序列與特定序列識別號所指之胺基酸序列之間的序列同一性百分比。首先,使用自含有BLASTP版本2.0.14之BLASTZ獨立版本的BLAST 2序列(Bl2seq)程序,將胺基酸序列與特定序列識別號中所示之序列進行比較。BLASTZ之獨立版本可獲自Fish & Richardson的網站(例如www.fr.com/blast/)或美國政府的National Center for Biotechnology Information網站(www.ncbi.nlm.nih.gov)。使用Bl2seq程式之說明可見於BLASTZ隨附的readme檔案中。Bl2seq使用BLASTN或BLASTP演算法對兩個序列進行比較。BLASTN用於比較核酸序列,而BLASTP用於比較胺基酸序列。為了比較兩個胺基酸序列,Bl2seq之選項設定如下:-i設定為含有待比較之第一胺基酸序列的檔案(例如C:\seq1.txt);-j設定為含有待比較之第二胺基酸序列的檔案(例如C:\seq2.txt);-p設定為blastp;-o設定為任何所欲檔案名稱(例如C:\output.txt);及所有其他選項皆保留其預設設定。例如,下列指令可用以產生含有兩個胺基酸序列比較的輸出檔案:C:\Bl2seq -i c:\seq1.txt -j c:\seq2.txt -p blastp -o c:\output.txt.。若兩個比較序列具有同源性,則指定之輸出檔案會將彼等同源區域呈現為比對序列。若兩個比較序列不具有同源性,則指定之輸出檔案將不會呈現比對序列。一旦經比對,藉由計數兩個序列中呈現同一胺基酸殘基之位置數目來判定匹配數目。匹配位置係指同一胺基酸殘基在比對序列中出現在相同位置的位置。序列同一性百分比係藉由將匹配數除以所識別序列(例如,SEQ ID NO:1)中所闡述之序列之長度,接著將所得值乘以100來判定。例如,當與SEQ ID NO:1中所闡述之序列比對時,具有725個匹配之胺基酸序列與SEQ ID NO:1中所闡述之序列係98.6%同一(亦即,725 ÷ 735 × 100 = 98.6)。應注意,序列同一性百分比值係四捨五入至最接近的十分之一。舉例而言,78.11、78.12、78.13、及78.14向下捨入至78.1,而78.15、78.16、78.17、78.18、及78.19向上捨入至78.2。亦應注意,長度值將始終為整數。
用於產生胺基酸序列變體之方法可包括編碼AAV殼體多肽之核酸的位點特異性突變或隨機突變(例如,藉由PCR)。參見例如Zoller, Curr. Opin. Biotechnol. 3: 348-354 (1992)。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)可經設計以包括一或多個外源核酸序列。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)可經設計以包括編碼所關注之RNA及/或多肽之外源核酸序列。外源核酸序列可經設計以編碼所關注之任何適當RNA。可由經設計以包括在本文提供之AAV載體內之外源核酸序列編碼之所關注之RNA的實例包括但不限於小分子干擾核糖核酸(siRNA)、用於基因編輯的RNA組分、及小分子核糖核酸(microRNA)。在一些情況下,可由包括在本文提供之AAV載體內之外源核酸序列編碼之所關注之RNA可係SIRNA-027以治療例如繼發於年齡相關性黃斑部病變(macular degeneration)的眼窩下脈絡膜新生血管膜(sub-foveal choroidal neovascular membrane, sub-foveal CNVM)(參見NCT00363714)、Cand5/Bevasiranib以治療例如糖尿病黃斑部水腫(diabetic macular edema)(參見NCT00306904)、PF-04523655以治療例如糖尿病黃斑部水腫(參見例如NCT01445899)、QPI-1007以治療例如非動脈性前部缺血性視神經病變(non-arteritic anterior ischemic optic neuropathy, NAION)中之視神經萎縮(參見例如NCT01064505)、阿加尼森(aganirsen)以治療例如缺血性中心視網膜靜脈阻塞(central retinal vein occulsion, CRVO)以預防新生血管性青光眼(參見例如NCT02947867)、QR-421a以治療例如視網膜色素變性/尤塞氏症候群2型(retinitis pigmentosa/Usher syndrome type 2)(參見例如NCT03780257)、QR-1123以治療例如常染色體顯性遺傳性視網膜色素變性(autosomal dominant retinitis pigmentosa)(參見例如NCT04123626)、IONIS-FB-LRx以治療例如繼發於年齡相關性黃斑部病變之地圖狀萎縮(geographic atrophy)(參見例如NCT03815825)、或Sepofarsen/QR-110以治療例如萊伯氏先天性黑蒙症(Leber’s congenital amaurosis)(參見例如NCT03913143)。
外源核酸序列可經設計以編碼所關注之任何適當多肽。可由經設計以包括在本文提供之AAV載體內之外源核酸序列編碼之所關注的多肽的實例包括但不限於治療性多肽(therapeutic polypeptides)、滋養因子多肽(trophic factor polypeptides)、基因編輯多肽(例如,Cas9多肽、TALEN多肽、或鋅指多肽)、酶、光遺傳學工具多肽(例如,ChR多肽、NhpR多肽、或ReachR多肽)、抗體、抗體域(例如,VH域)、細胞介素(cytokines)、抗血管生成多肽、及神經保護多肽。可由經設計以包括在本文提供之AAV載體內之外源核酸序列編碼之所關注的多肽的實例包括但不限於ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、NR2E3多肽、PDE6A多肽、PDE6B多肽、PDE6C多肽、PRPF31多肽、RPE65多肽、RPGR多肽、RS1多肽、TYR多肽、USH2A多肽、MYO7A多肽、REP1多肽、OPN1LW多肽、OPN1MW多肽、CNGA3多肽、CNGB3多肽、GUCY2D多肽、GACA1A多肽、GNAT2多肽、PDE6H多肽、PROM1多肽、PRPH2多肽、CRX多肽、NPHP5多肽、EYS多肽、ND4多肽、CLN1-14多肽(如CLN3多肽、CLN5多肽、CLN6多肽、或CLN8多肽)、NYX多肽、GRM6多肽、TRPM1多肽、GPR179多肽、LRIT3多肽、神經膠細胞營養因子(glial cell derived neurotrophic factor, GDNF)多肽、腦源性神經營養因子(brain-derived neurotrophic factor, BDNF)多肽、纖維母細胞生長因子(fibroblast growth factor, FGF)多肽、截短之源自視桿細胞的視錐細胞活性因子(truncated rod-derived cone viability factor, RdCVF)多肽、全長之源自視桿細胞的視錐細胞活性因子(full-length rod-derived cone viability factor, RdCVFL)多肽、X連鎖凋亡抑制(X-linked inhibit或of apoptosis, XIAP)多肽、可溶解之FMS相關受體酪氨酸激酶(soluble fms-related recept或tyrosine kinase 1, sFLT)多肽、CYP4V2多肽、棕梠酸脂蛋白酶(palmitoyl protein thioesterase 1)多肽、三肽基肽酶(tripeptidyl peptidase 1)多肽、DNAJC5多肽、MFSD8多肽、組織蛋白酶D(cathepsin D)多肽、顆粒蛋白(granulin)多肽、ATP13A2多肽、組織蛋白酶F(cathepsin F)多肽、KCTD7多肽、“P”基因多肽、TRP1多肽、MATP (SLC45A2)多肽、SLC24A5多肽、LRMDA多肽、GPR143多肽、RPGR-exon 1-ORF15多肽、USH2b多肽、USH1C多肽、CDH23多肽、PCDH15多肽、SANS多肽、USH1H多肽、CIB2多肽、USH1K多肽、ADGRV1多肽、WHRN多肽、PDZD7多肽、CLRN1多肽、HARS多肽、RP2多肽、FAM161多肽、DLK多肽、RHO多肽、CHM多肽、BEST1多肽、RP1多肽、OPA1多肽、CEP290多肽、RDH12多肽、CACNA1F多肽、BBS1多肽、FAM161A多肽、CERKL多肽、PRPF8多肽、RP1L1多肽、SNRNP200多肽、IMPG2多肽、CDHR1多肽、IMPDH1多肽、CNGB1多肽、MERTK多肽、KCNV2多肽、AIPL1多肽、RPGRIP1多肽、TULP1多肽、C2ORF71(PCARE)多肽、MAK多肽、TIMP3多肽、GUCA1A多肽、ALMS1多肽、BBS10多肽、IFT140多肽、CNGA1多肽、NMNAT1多肽、COL2A1多肽、EFEMP1多肽、WFS1多肽、RDH5多肽、PRPF3多肽、LRP5多肽、TOPORS多肽、DHDDS多肽、LCA5多肽、IQCB1多肽、RP9多肽、ATXN7多肽、BBS2多肽、SAG RLBP1多肽、ND6 (MT-ND6)多肽、C1QTNF5多肽、VPS13B多肽、KIF11多肽、MT-TL1多肽、KLHL7多肽、ACO2多肽、C21orf2 (CFAP410)多肽、AHI1多肽、KIZ多肽、SPATA7多肽、TTLL5多肽、HGSNAT多肽、NRL多肽、OAT多肽、FLVCR1多肽、ABCC6多肽、LRAT多肽、CEP78多肽、CDH3多肽、FZD4多肽、BBS12多肽、HK1多肽、PRDM13多肽、ADAM9多肽、BBS7多肽、CABP4多肽、ABHD12多肽、COL18A1多肽、MFRP多肽、RIMS1多肽、ROM1多肽、BBS4多肽、IMPG1多肽、INPP5E多肽、VCAN多肽、POC1B多肽、RAX2多肽、TSPAN12多肽、CACNA2D4多肽、JAG1多肽、MKKS多肽、NPHP4多肽、BBS9多肽、COL11A1多肽、ELOVL4多肽、NDP多肽、NPHP1多肽、RGR多肽、BBS5多肽、WDR19多肽、C8ORF37多肽、CTNNA1多肽、LAMP2多肽、PEX1多肽、PHYH多肽、ATF6多肽、PRPS1多肽、SEMA4A多肽、ARL6多肽、CNNM4多肽、OTX2多肽、PRPF6多肽、RBP3多肽、PNPLA6多肽、SLC24A1多肽、USH1G多肽、PITPNM3多肽、TTC8多肽、ARSG多肽、CWC27多肽、DRAM2多肽、PRCD多肽、REEP6多肽、SSBP1多肽、LAMA1多肽、RAB28多肽、ZNF408多肽、GNAT1多肽、IDH3A多肽、PDE6G多肽、PEX6多肽、TUB多肽、CEP250多肽、FSCN2多肽、GRK1多肽、RBP4多肽、RD3多肽、AGBL5多肽、CAPN5多肽、IFT172多肽、KCNJ13多肽、PAX2多肽、CC2D2A多肽、HMCN1多肽、MT-ATP6多肽、RCBTB1多肽、ARL2BP多肽、CA4多肽、DFNB31多肽、GNB3多肽、MMACHC多肽、PRPF4多肽、RGS9多肽、ARHGEF18多肽、KIAA1549多肽、MKS1多肽、MTTP (非MT-TP)多肽、PLK4多肽、RPGRIP1L多肽、SDCCAG8多肽、SRD5A3多肽、TUBB4B多肽、ADAMTS18多肽、ARL3多肽、COL11A2多肽、MVK多肽、NBAS多肽、OFD1多肽、P3H2多肽、RGS9BP多肽、CSPP1多肽、ITM2B多肽、PANK2多肽、PEX7多肽、POMGNT1多肽、SLC4A7多肽、TMEM231多肽、TRNT1多肽、TUBGCP6多肽、ZNF513多肽、AFG3L2多肽、ARL13B多肽、C5ORF42(CPLANE1)多肽、COL9A1多肽、CTSD多肽、DTHD1多肽、DYNC2H1多肽、IFT81多肽、KIAA0586多肽、MFN2多肽、NPHP3多肽、PCYT1A多肽、PEX12多肽、PLA2G5多肽、POC5多肽、SCAPER多肽、SLC25A46多肽、TMEM237多肽、TRAF3IP1多肽、TTC21B多肽、TUBGCP4多肽、ADIPOR1多肽、CEP164多肽、CLCC1多肽、COL9A2多肽、CTNNB1多肽、DHX38多肽、GNPTG多肽、GRN多肽、GUCA1B多肽、IFT27多肽、IFT74多肽、KIAA0556多肽、LRP2多肽、MAPKAPK3多肽、MIR204多肽、MT-ND3多肽、MT-RNR1多肽、MT-TS2多肽、ND5(MT-ND5)多肽、NEK2多肽、OPN1SW多肽、PEX13多肽、PEX2多肽、RHBDD2多肽、SAMD11多肽、SCLT1多肽、SLC7A14多肽、TCTN1多肽、TCTN2多肽、TLCD3B多肽、TREX1多肽、TTPA多肽、UNC119多肽、WDPCP多肽、ACBD5多肽、AHR多肽、ARMC9多肽、ASRGL1多肽、ATOH7多肽、B9D1多肽、B9D2多肽、BBIP1多肽、C12ORF65多肽、C2CD3多肽、C5AR2多肽、CCDC188多肽、CCT2多肽、CEP104多肽、CEP120多肽、CEP19多肽、CEP41多肽、CISD2多肽、CLUAP1多肽、COL9A3多肽、CRB2多肽、CTC1多肽、DACT2多肽、DDR1多肽、ENSA多肽、ESPN多肽、EXOSC2多肽、FBN3多肽、GDF6多肽、GPR125多肽、HKDC1多肽、HMX1多肽、IDH3B多肽、IFT43多肽、IFT80多肽、INVS多肽、KIAA0753多肽、KIF3B多肽、KIF7多肽、LRRTM4多肽、LZTFL1多肽、MT-ATP8多肽、MT-CO1多肽、MT-CO2多肽、MT-CO3多肽、MT-CYB多肽、MT-ND2多肽、MT-ND4L多肽、MT-RNR2多肽、MT-TA多肽、MT-TC多肽、MT-TD多肽、MT-TE多肽、MT-TF多肽、MT-TG多肽、MT-TH多肽、MT-TI多肽、MT-TK多肽、MT-TL2多肽、MT-TM多肽、MT-TN多肽、MT-TP(非MTTP)多肽、MT-TQ多肽、MT-TR多肽、MT-TS1多肽、MT-TT多肽、MT-TV多肽、MT-TW多肽、MT-TY多肽、NEUROD1多肽、PDE6D多肽、PEX10多肽、PEX11B多肽、PEX14多肽、PEX16多肽、PEX19多肽、PEX26多肽、PEX3多肽、PEX5多肽、PGK1多肽、PISD多肽、PPP2R3C多肽、PROS1多肽、PSEN1多肽、RDH11多肽、RRM2B多肽、SMARCA4多肽、SPP2多肽、TCTN3多肽、TEAD1多肽、TMEM107多肽、TMEM138多肽、TMEM216多肽、TMEM67多肽、TPP1多肽、TRIM32多肽、USP45多肽、及ZNF423多肽。在一些情況下,包含本文提供的AAV載體內的外源核酸序列編碼的目的多肽可以是MYO7A多肽、USH1C多肽、PCDH15多肽、USH2A多肽或CLRN1多肽,以治療例如亞瑟綜合症(Usher Syndrome)。
在一些情況下,本文所提供之一或多個AAV載體可經設計以在一或多個細胞(例如視網膜細胞)內進行基因編輯。此類基因編輯可導致一或多個細胞之基因體修飾。此類基因體修飾之實例包括但不限於,將編碼所關注之RNA及/或多肽之核酸靶向插入一或多個細胞、一或多個細胞之基因體序列之靶向修飾(例如靶向去活化或剔除)、及一或多個細胞內之核酸(例如,編碼RNA之核酸、調節核酸序列、及/或編碼所關注之多肽的核酸)的靶向置換。
任何適當的基因編輯組分可經工程改造至本文所提供之一或多個AAV載體,使得彼等一或多個AAV載體可以有效編輯彼等細胞之基因體的方式,向哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)內的目標細胞(例如,一或多個視網膜細胞)遞送基因編輯組分。通常,基因編輯組分包括但不限於能夠在所欲位置裂解基因體核酸之組分,以及設計成一旦裂解即插入該所欲位置之可選的供體核酸。任何適當的稀有切割(rare-cutting)核酸內切酶可用以在所欲位置裂解基因體核酸。此類稀有切割核酸內切酶之實例包括但不限於大範圍核酸酶(meganucleases)、轉錄活化因子樣效應物(transcription activator-like effector, TALE)核酸酶(TALENs™; Cellectis, Paris, France)、鋅指核酸酶(zinc-finger-nucleases, ZFN)、及成簇規律間隔短回文重複序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats, CRISPR)/Cas系統之核酸內切酶(例如CRISPR/Cas 9系統之核酸內切酶)。參見例如Baker, Nature Methods, 9:23-26 (2012);國際PCT專利申請公開案第WO 2004/067736號;國際PCT專利申請公開案第WO 2011/072246號;美國專利案第8,586,363號;Porteus and Carroll, Nature Biotechnol., 23:967-973 (2005);Jinek et al., Science, 337:816-821 (2012);Mali et al., Science, 339:823-826 (2013);Li et al., Nature Biotechnology, 31(8):688-691 (2013);及Makarova et al., Nat. Rev. Microbiol., 9(6):467-477 (2011))。
在一些情況下,為了促進基因置換,可靶向細胞(例如視網膜細胞)之基因體核酸中之兩個序列(一個位於待移除序列之任一側)以進行核酸內切酶裂解。舉例而言,相鄰於待移除之序列之5'端的第一目標序列及相鄰於待移除序列之3'端的第二目標序列可由引導RNA靶向,以使Cas9裂解,或可由旨在特異性識別彼等目標之TALEN所靶向。使用本文所提供之一或多種AAV載體遞送(a)靶向基因體DNA之核酸內切酶及(b)供體核酸構築體,可允許在兩個基因體目標處裂解、移除基因體目標之間的序列、以及將供體序列插入至缺失位置中。
本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可包括任何適當的啟動子及/或其他調節序列(例如,增強劑、轉錄起始位點、轉譯起始位點、及終止信號),其可操作地連接所設計用於表現的外源核酸序列。在一些情況下,用於驅動表現之啟動子可係組成型啟動子、可調節啟動子、組織特異性啟動子、或病毒啟動子。可如本文中所述使用之組成型啟動子之實例包括但不限於SV40啟動子、CMV啟動子、及E1ALPHA啟動子。可如本文中所述使用之可調節啟動子之實例包括但不限於誘導型啟動子及阻抑型啟動子。可如本文中所述使用之組織特異性啟動子之實例包括但不限於視紫質啟動子(rhodopsin promotors)、視錐抑制蛋白啟動子(cone arrestin promotors)、及突觸蛋白啟動子(synapsin promotors)。可如本文中所述使用之病毒啟動子之實例包括但不限於腺病毒啟動子、痘瘡病毒(vaccinia virus)啟動子、CMV啟動子(例如,即時早期CMV啟動子)、及AAV啟動子。
在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可包括總數目至多約5 kb之核苷酸。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可包括總數目約1 kb至約5 kb、約1 kb至約4 kb、約1 kb至約3 kb、約2 kb至約5 kb、約2 kb至約4 kb、約2 kb至約3 kb、約3 kb至約5 kb、約3 kb至約4 kb、或約4 kb至約5 kb之核苷酸。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1A中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼窩視錐並向經感染之眼窩視錐遞送外源核酸序列使得經感染之眼窩視錐表現外源核酸序列之能力。在一些情況下,當與野生型AAV2相比時,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有感染及驅動存在於哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之中央窩中更多視錐細胞中之外源核酸序列的RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之眼窩視錐中之外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於由具有AAV殼體多肽之對照AAV載體(例如野生型AAV2)驅動之外源核酸序列之RNA表現水平,其中該AAV殼體多肽由對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之眼窩視錐中的SEQ ID NO:1所闡述的胺基酸序列組成。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少2.5%、至少5%、至少7.5%、至少10%、或至少25%)之視網膜細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有驅動哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)之視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)中之外源核酸之mRNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大2%、至少大2.5%、至少大5%、至少大7.5%、至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)之視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內跨視網膜區域(例如,跨二、三、或四個視網膜區域)感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之中央窩區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中、窩側區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中、弓形血管區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中、及/或周邊區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少二、三、或四個不同區域的視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)彼等區域之視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼睛之窩側區域之視網膜細胞並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸序列之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在存在於哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之窩側區域中至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之窩側區域之視網膜細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之窩側區域之視網膜細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體(例如,野生型AAV2載體)驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同視網膜細胞類型並遞送外源核酸至經感染之視網膜細胞使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸的能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有感染以下二、三、四、五、六、或七種視網膜細胞類型之能力:視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞。在一些情況下,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有感染下列細胞之能力:(a)視網膜神經節細胞、無長突細胞、及水平細胞,(b)視網膜神經節細胞、無長突細胞、及雙極細胞,(c)視網膜神經節細胞、無長突細胞、及穆勒神經膠質細胞,(d)視網膜神經節細胞、無長突細胞、及感光細胞,(e)視網膜神經節細胞、無長突細胞、及視網膜色素上皮細胞,(f)無長突細胞、水平細胞、及雙極細胞,(g)無長突細胞、水平細胞、及穆勒神經膠質細胞,(h)無長突細胞、水平細胞、及感光細胞,(i)無長突細胞、水平細胞、及視網膜色素上皮細胞,(j)水平細胞、雙極細胞、及穆勒神經膠質細胞,(k)水平細胞、雙極細胞、及感光細胞,(l)水平細胞、雙極細胞、及視網膜色素上皮細胞,(m)雙極細胞、穆勒膠質細胞、及感光細胞,(n)雙極細胞、穆勒膠質細胞、及視網膜色素上皮細胞、或(o)穆勒膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有例如在玻璃體內投予後在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜神經節細胞中、至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之無長突細胞中、至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之水平細胞中、至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之雙極細胞中、至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之穆勒神經膠質細胞中、至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之感光細胞中、及/或至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜色素上皮細胞中感染及驅動外源核酸之mRNA表現的能力。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1F中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜色素上皮細胞並向經感染之視網膜色素上皮細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜色素上皮細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列之能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜色素上皮細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之視網膜色素上皮細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之視網膜色素上皮細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1G中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染感光細胞並向經感染之感光細胞遞送外源核酸序列使得經感染之感光細胞表現外源核酸序列之能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有下列能力:與眼睛的任何其他視網膜細胞類型相比,在體內更大程度的感染感光細胞並向經感染之感光細胞遞送外源核酸序列使得經感染之感光細胞表現外源核酸序列。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之感光細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之感光細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之感光細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1H中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜神經節細胞並向經感染之視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜神經節細胞表現外源核酸序列之能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有下列能力:與眼睛的任何其他視網膜細胞類型相比,在體內更大程度的感染視網膜神經節細胞並向經感染之視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜神經節細胞表現外源核酸序列。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之視網膜神經節細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之視網膜神經節細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之視網膜神經節細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1I中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染視網膜之雙極細胞並向經感染之雙極細胞遞送外源核酸序列使得經感染之雙極細胞表現外源核酸序列之能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有下列能力:與眼睛的任何其他視網膜細胞類型相比,在體內更大程度的感染視網膜之雙極細胞並向經感染之雙極細胞遞送外源核酸序列使得經感染之雙極細胞表現外源核酸序列。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之視網膜之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之雙極細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之視網膜之雙極細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之視網膜之雙極細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1J中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染ON視網膜神經節細胞並向經感染之ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之ON視網膜神經節細胞表現外源核酸序列之能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有下列能力:與眼睛的任何其他視網膜細胞類型相比,在體內更大程度的感染ON視網膜神經節細胞(例如,比OFF視網膜神經節細胞更大程度)並向經感染之ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之ON視網膜神經節細胞表現外源核酸序列。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之ON視網膜神經節細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之ON視網膜神經節細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之ON視網膜神經節細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)包括表1K中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有在體內感染OFF視網膜神經節細胞並向經感染之OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之OFF視網膜神經節細胞表現外源核酸序列之能力。舉例而言,本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有下列能力:與眼睛的任何其他視網膜細胞類型相比,在體內更大程度的感染OFF視網膜神經節細胞(例如,比ON視網膜神經節細胞更大程度)並向經感染之OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之OFF視網膜神經節細胞表現外源核酸序列。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)之OFF視網膜神經節細胞中感染及驅動外源核酸序列之RNA表現的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可具有在哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之OFF視網膜神經節細胞中驅動外源核酸序列之RNA表現水平的能力,其大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)在對照哺乳動物(例如,對照人類或對照非人類靈長類動物)眼睛之OFF視網膜神經節細胞中具有由SEQ ID NO:1所闡述之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之對照AAV載體驅動之外源核酸序列之RNA表現水平。
本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽),該AAV殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列,該AAV載體可具有提高之封裝效率、在體內或體外感染細胞(例如,視網膜細胞)之能力、以及向經感染之細胞遞送外源核酸序列使得經感染之細胞(例如,以高水平)表現外源核酸序列的能力。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)之封裝效率可大於(例如,至少大10%、至少大25%、至少大50%、至少大75%、或至少大100%)具有由SEQ ID NO:1之胺基酸序列所組成之AAV殼體多肽之比較性AAV載體(例如,野生型AAV2載體)的封裝效率。
可由本文所述之含有AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)的AAV載體(例如AAV2載體)感染之視網膜細胞之實例包括但不限於視網膜神經節細胞、視網膜色素上皮細胞、感光細胞、雙極細胞、無長突細胞、穆勒神經膠質細胞、及水平細胞,其中該AAV殼體多肽包括表1中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或式A的胺基酸序列。
本文亦提供含有一或多個本文所提供之AAV載體(例如,一或多個本文所提供之AAV2載體)的組成物。舉例而言,本文所提供之一或多個AAV載體(例如,本文所提供之一或多個AAV2載體)可調配為醫藥組成物用於投予至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)以治療該哺乳動物。在一些情況下,本文所提供之一或多個AAV載體(例如,本文所提供之一或多個AAV2載體)可調配為醫藥組成物用於投予至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),以向眼窩視錐遞送外源核酸序列以在眼窩視錐內表現。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可調配為醫藥組成物用於投予至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)。在一些情況下,本文所提供之醫藥組成物可包括醫藥上可接受之載劑,諸如緩衝劑、鹽、界面活性劑、糖、張性改質劑、或其組合,例如如其他地方所述(Gervasi et al., Eur. J. Pharmaceutics and Biopharmaceutics, 131:8-24 (2018))。可用以製造本文所提供之醫藥組成物之醫藥上可接受之載劑的實例包括但不限於水、乳酸、檸檬酸、氯化鈉、檸檬酸鈉、琥珀酸鈉、磷酸鈉、界面活性劑(例如,聚山梨醇酯20、聚山梨醇酯80、或泊洛沙姆188)、葡聚醣40、或糖(例如,山梨糖醇、甘露醇、蔗糖、右旋糖、或海藻糖)、或其組合。舉例而言,經設計以包括本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)之醫藥組成物可經調配以包括緩衝劑(例如,乙酸鹽、檸檬酸鹽、組胺酸、琥珀酸鹽、磷酸鹽、或羥甲基-胺基甲烷(Tris)緩衝液)、界面活性劑(例如,聚山梨醇酯20、聚山梨醇酯80、或泊洛沙姆188)、及糖(諸如蔗糖)。可包括在本文所提供之醫藥組成物內的其他成分包括但不限於胺基酸(諸如甘胺酸或精胺酸)、抗氧化劑(諸如抗壞血酸)、甲硫胺酸、或乙二胺四乙酸(ethylenediaminetetraacetic acid, EDTA)、或其組合。
在一些情況下,當醫藥組成物經調配以包括本文所提供之一或多個AAV載體(例如,一或多個AAV2載體)時,可使用任何適當效價的AAV載體。舉例而言,本文所提供之醫藥組成物可經調配以具有大於1x10
7(例如,大於1x10
8、大於1x10
9、大於1x10
10、大於1x10
11、大於1x10
12、大於1x10
13、或大於1x10
14)效價的本文所提供的AAV載體(例如AAV2載體)。在一些情況下,本文所提供之醫藥組成物可經調配以具有效價為約1x10
7至約1x10
14(例如,約1x10
7至約1x10
13、約1x10
7至約1x10
12、約1x10
7至約1x10
11、約1x10
7至約1x10
10、約1x10
8至約1x10
14、約1x10
9至約1x10
14、約1x10
10至約1x10
14、約1x10
8至約1x10
12、或約1x10
9至約1x10
11)的本文所提供的AAV載體(例如AAV2載體)。
本文所提供之醫藥組成物可呈任何適當形式。舉例而言,本文所提供之醫藥組成物可經設計為液體、半固體、或固體。在一些情況下,本文所提供之醫藥組成物可係液體溶液(例如,可注射及/或可輸注之溶液)、分散液、懸浮液、錠劑、丸劑、粉末、微乳液、微脂體、或栓劑。在一些情況下,本文所提供之醫藥組成物可經凍乾。在一些情況下,本文所提供之醫藥組成物(例如,包括本文所提供之一或多個AAV載體(諸如本文所提供之一或多個AAV2載體)之醫藥組成物)可與經設計以防止快速釋放之載體或包衣一起調配。舉例而言,本文所提供之醫藥組成物可調配為控釋配方或調節釋放配方,如其他地方所述(美國專利申請公開案第2019/0241667號;第2019/0233522號;及第2019/0233498號)。
本文亦提供編碼AAV殼體多肽之核酸分子,該殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。在一些情況下,核酸分子可經設計以編碼AAV殼體多肽,該AAV殼體多肽包括由表1A至1L之任一或多者中所闡述之DNA序列編碼的胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:A20至A37、SEQ ID NO:B318至B649、SEQ ID NO:C46至C88、SEQ ID NO:D79至D155、SEQ ID NO:E84至E165、SEQ ID NO:F11至F19、SEQ ID NO:G78至G153、SEQ ID NO:H259至H515、SEQ ID NO:I75至I147、SEQ ID NO:J65至J127、SEQ ID NO:K64至K125、及SEQ ID NOs:L28-L53中任一者)。
本文亦提供編碼本文所述之AAV載體(例如AAV2載體)的核酸分子。舉例而言,經單離之核酸分子可經設計以編碼本文所提供之一或多個AAV載體(例如,具有AAV殼體多肽之AAV,該AAV衣殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)。在一些情況下,核酸分子可經設計以編碼具有AAV殼體多肽之AAV載體,該AAV殼體多肽包括由表1A至1L之任一或多者中所闡述之DNA序列編碼的胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:A20至A37、SEQ ID NO:B318至B649、SEQ ID NO:C46至C88、SEQ ID NO:D79至D155、SEQ ID NO:E84至E165、SEQ ID NO:F11至F19、SEQ ID NO:G78至G153、SEQ ID NO:H259至H515、SEQ ID NO:I75至I147、SEQ ID NO:J65至J127、SEQ ID NO:K64至K125、及SEQ ID NOs:L28-L53中任一者)。
本文亦提供含有本文所提供之核酸分子的宿主細胞。舉例而言,宿主細胞可經設計以包括編碼本文所述之AAV殼體多肽的核酸分子及/或編碼本文所述之AAV載體的核酸分子。在一些情況下,宿主細胞可經設計以包括編碼AAV殼體多肽之核酸分子,該AAV殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。在一些情況下,宿主細胞可經設計以包括編碼具有AAV殼體多肽之AAV載體的核酸分子,該AAV殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。可經設計以包括編碼本文所述之AAV殼體多肽的核酸分子及/或編碼本文所述之AAV載體的核酸分子的宿主細胞的實例包括但不限於HEK293T細胞(ATCC)、293AAV細胞(Cell Biolabs)、NEB 5α細胞、TakaraBio Stellar細胞、及MegaX細胞。可使用任何適當方法將本文所提供之核酸分子(例如,編碼本文所述之AAV殼體多肽及/或本文所述之AAV載體的核酸分子)引入至細胞中。舉例而言,可使用病毒轉染(viral transfection)、電穿孔(electroporation)、暫態轉染(transient transfection)、及基因槍(gene gun)技術將本文所提供之核酸分子引入至細胞中。
本文亦提供用於製造本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)的方法及材料。舉例而言,本文提供用於製造含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體)的方法及材料,該殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。如本文中所述,AAV載體可經構築以包括AAV殼體多肽,該殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。可使用任何適當的方法來構築具有本文所提供之AAV殼體多肽(例如,AAV2殼體多肽)的AAV載體(例如,殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)。舉例而言,分子選殖及AAV載體生產技術,諸如其他地方所描述之彼等者,可用於構築及生產具有本文所提供之AAV殼體多肽(例如,AAV2殼體多肽)的AAV載體(參見例如Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory, NY (1989);Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, Green Publishing Associates and John Wiley & Sons, New York, N.Y. (1994);Grieger et al., Nat. Protoc., 1(3):1412-28 (2006);以及Flannery et al., Methods Mol. Biol., 935:351-69 (2013))。在一些情況下,AAV載體可使用雙重或三重轉染方法在HEK293T細胞(ATCC)或293AAV細胞(Cell Biolabs)中生產(參見例如Grieger et al., Nat. Protoc., 1(3):1412-28 (2006);以及Flannery et al., Methods Mol. Biol., 935:351-69 (2013))。
本文亦提供了使用本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)的方法及材料。舉例而言,本文提供了使用含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體)的方法及材料,該殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列。如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1A中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染眼窩視錐並向經感染之眼窩視錐遞送外源核酸序列使得經感染之眼窩視錐表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜細胞(例如,以高水平)表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內跨視網膜區域(例如,跨二、三、或四個不同的視網膜區域)感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列之能力。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以感染跨視網膜區域的視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞),使得該AAV載體感染哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之中央窩區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞、窩側區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞、弓形血管區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞、及/或周邊區域中至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜細胞。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染眼睛之窩側區域之視網膜細胞並向經感染之視網膜細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜細胞表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同視網膜細胞類型並遞送外源核酸序列至經感染之視網膜細胞使得經感染之視網膜細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列。舉例而言,例如玻璃體內投予後,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以感染哺乳動物(例如,人類或非人類靈長類動物)眼睛之(a)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜神經節細胞,(b)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的無長突細胞,(c)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的水平細胞,(d)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的雙極細胞,(e)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的穆勒神經膠質細胞,(f)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的感光細胞,(g)至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜色素上皮細胞,(a)至(g)全部,或(a)至(g)中之二、三、四、五、或六個的任意組合。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染視網膜色素上皮細胞並向經感染之視網膜色素上皮細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜色素上皮細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以感染視網膜色素上皮細胞,使得該AAV載體感染哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)眼睛之至少約2%(例如,至少約2.5%、至少約5%、至少約7.5%、至少約10%、或至少約25%)的視網膜色素上皮細胞。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染感光細胞並向經感染之感光細胞遞送外源核酸序列使得經感染之感光細胞表現外源核酸序列。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地感染感光細胞,並向經感染之感光細胞遞送外源核酸序列,使得經感染之感光細胞比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染視網膜神經節細胞並向經感染之視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之視網膜神經節細胞表現外源核酸序列。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地感染視網膜神經節細胞,並向經感染之視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列,使得經感染之視網膜神經節細胞比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染視網膜之雙極細胞並向經感染之雙極細胞遞送外源核酸序列使得經感染之雙極細胞表現外源核酸序列。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地感染視網膜之雙極細胞,並向經感染之雙極細胞遞送外源核酸序列,使得經感染之雙極細胞比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染ON視網膜神經節細胞並向經感染之ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之ON視網膜神經節細胞表現外源核酸序列。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地感染ON視網膜神經節細胞(例如,比OFF視網膜神經節細胞更大程度),並向經感染之ON視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列,使得經感染之ON視網膜神經節細胞比眼睛的任何其他視網膜細胞類型(例如,OFF視網膜神經節細胞)更大程度地表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內感染OFF視網膜神經節細胞並向經感染之OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列使得經感染之OFF視網膜神經節細胞表現外源核酸序列。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內比眼睛的任何其他視網膜細胞類型更大程度地感染OFF視網膜神經節細胞(例如,比ON視網膜神經節細胞更大程度),並向經感染之OFF視網膜神經節細胞遞送外源核酸序列,使得經感染之OFF視網膜神經節細胞比眼睛的任何其他視網膜細胞類型(例如,ON視網膜神經節細胞)更大程度地表現外源核酸序列。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以改良封裝效率。在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以在體內或體外感染細胞(例如視網膜細胞)並向經感染之細胞遞送外源核酸序列使得經感染之細胞(例如以高水平)表現外源核酸序列。
在一些情況下,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)可用以治療視網膜病況(例如視網膜疾病)。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1A中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染眼窩視錐及(b)在經感染之眼窩視錐中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1B中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞、感光細胞、及雙極細胞)及(b)在經感染之視網膜細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1C中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染跨至少二、三、或四個不同視網膜區域之視網膜細胞(例如,視網膜神經節細胞)及(b)在經感染之視網膜細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1D中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染眼睛之窩側區域的視網膜細胞及(b)在窩側區域之經感染之視網膜細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1E中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染眼睛內之二或更多種(例如,二或更多種、三或更多種、四或更多種、五或更多種、六或更多種、或七或更多種)不同的視網膜細胞類型及(b)在經感染之視網膜細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現(例如以高水平),投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1F中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染視網膜色素上皮細胞及(b)驅動所遞送之外源核酸在經感染之視網膜色素上皮細胞中表現(例如以高水平),投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1G中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染感光細胞及(b)在經感染之感光細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1H中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染視網膜神經節細胞及(b)在經感染之視網膜神經節細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1I中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染視網膜之雙極細胞及(b)在經感染之雙極細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1J中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染ON視網膜神經節細胞及(b)在經感染之ON視網膜神經節細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1K中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染OFF視網膜神經節細胞及(b)在經感染之OFF視網膜神經節細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現,投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。舉例而言,本文所提供之AAV載體(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體(例如AAV2載體),該AAV殼體多肽包括表1L中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)經設計以含有及驅動編碼能夠治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之RNA及/或多肽之外源核酸序列的表現,可使得該AAV載體以下列方式(a)感染視網膜細胞及(b)在經感染之視網膜細胞中驅動所遞送之外源核酸的表現(例如以高水平),投予至患有視網膜病況之哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物),從而降低視網膜病況之一或多種症狀的嚴重性及/或延緩視網膜病況之進展。
如本文中所述,本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)可經設計以包括並驅動編碼任何適當之所關注之RNA及/或所關注之多肽的外源核酸序列的表現。當本文所提供之AAV載體經設計以治療視網膜病況(例如視網膜疾病)時,編碼能夠治療視網膜病況之RNA及/或多肽的外源核酸序列可包括在AAV載體內。可由經設計以治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之外源核酸序列編碼並經設計以包括在本文所提供之AAV載體內的RNA的實例包括但不限於,SIRNA-027以治療例如繼發於年齡相關性黃斑部病變的眼窩下脈絡膜新生血管膜(sub-foveal choroidal neovascular membrane, sub-foveal CNVM)(參見例如NCT00363714)、Cand5/Bevasiranib以治療例如糖尿病黃斑部水腫(diabetic macular edema)(參見例如NCT00306904)、PF-04523655以治療例如糖尿病黃斑部水腫(參見例如NCT01445899)、QPI-1007以治療例如非動脈性前部缺血性視神經病變(non-arteritic anterior ischemic optic neuropathy, NAION)中之視神經萎縮(參見例如NCT01064505)、阿加尼森(aganirsen)以治療例如缺血性中心視網膜靜脈阻塞(central retinal vein occulsion, CRVO)以預防新生血管性青光眼(參見例如NCT02947867)、QR-421a以治療例如視網膜色素變性/尤塞氏症候群2型(retinitis pigmentosa/Usher syndrome type 2)(參見例如NCT03780257)、QR-1123以治療例如常染色體顯性遺傳性視網膜色素病變(autosomal dominant retinitis pigmentosa)(參見例如NCT04123626)、IONIS-FB-LRx以治療例如繼發於年齡相關性黃斑部病變之地圖狀萎縮(geographic atrophy)(參見例如NCT03815825)、及色普法生(Sepofarsen)/QR-110以治療例如萊伯氏先天性黑蒙症(Leber’s congenital amaurosis)(參見例如NCT03913143)。可由經設計以治療視網膜病況(例如視網膜疾病)之外源核酸序列編碼並經設計以包括在本文所提供之AAV載體內的多肽的實例包括但不限於:ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、NR2E3多肽、PDE6A多肽、PDE6B多肽、PDE6C多肽、PRPF31多肽、RPE65多肽、RPGR多肽、RS1多肽、TYR多肽、USH2A多肽、MYO7A多肽、REP1多肽、OPN1LW多肽、OPN1MW多肽、CNGA3多肽、CNGB3多肽、GUCY2D多肽、GACA1A多肽、GNAT2多肽、PDE6H多肽、PROM1多肽、PRPH2多肽、CRX多肽、NPHP5多肽、EYS多肽、ND4多肽、CLN1-14多肽(如CLN3多肽、CLN5多肽、CLN6多肽、或CLN8多肽)、NYX多肽、GRM6多肽、TRPM1多肽、GPR179多肽、LRIT3多肽、神經膠細胞營養因子(glial cell derived neurotrophic factor, GDNF)多肽、腦源性神經營養因子(brain-derived neurotrophic factor, BDNF)多肽、纖維母細胞生長因子(fibroblast growth factor, FGF)多肽、截短之源自視桿細胞的視錐細胞活性因子(truncated rod-derived cone viability factor, RdCVF)多肽、全長之源自視桿細胞的視錐細胞活性因子(full-length rod-derived cone viability factor, RdCVFL)多肽、X連鎖凋亡抑制(X-linked inhibit或of apoptosis, XIAP)多肽、可溶解之FMS相關受體酪氨酸激酶(soluble fms-related recept或tyrosine kinase 1, sFLT)多肽、CYP4V2多肽、棕梠酸脂蛋白酶(palmitoyl protein thioesterase 1)多肽、三肽基肽酶(tripeptidyl peptidase 1)多肽、DNAJC5多肽、MFSD8多肽、組織蛋白酶D(cathepsin D)多肽、顆粒蛋白(granulin)多肽、ATP13A2多肽、組織蛋白酶F(cathepsin F)多肽、KCTD7多肽、“P”基因多肽、TRP1多肽、MATP (SLC45A2)多肽、SLC24A5多肽、LRMDA多肽、GPR143多肽、RPGR-exon 1-ORF15多肽、USH2b多肽、USH1C多肽、CDH23多肽、PCDH15多肽、SANS多肽、USH1H多肽、CIB2多肽、USH1K多肽、ADGRV1多肽、WHRN多肽、PDZD7多肽、CLRN1多肽、HARS多肽、RP2多肽、FAM161多肽、DLK多肽、RHO多肽、CHM多肽、BEST1多肽、RP1多肽、OPA1多肽、CEP290多肽、RDH12多肽、CACNA1F多肽、BBS1多肽、FAM161A多肽、CERKL多肽、PRPF8多肽、RP1L1多肽、SNRNP200多肽、IMPG2多肽、CDHR1多肽、IMPDH1多肽、CNGB1多肽、MERTK多肽、KCNV2多肽、AIPL1多肽、RPGRIP1多肽、TULP1多肽、C2ORF71(PCARE)多肽、MAK多肽、TIMP3多肽、GUCA1A多肽、ALMS1多肽、BBS10多肽、IFT140多肽、CNGA1多肽、NMNAT1多肽、COL2A1多肽、EFEMP1多肽、WFS1多肽、RDH5多肽、PRPF3多肽、LRP5多肽、TOPORS多肽、DHDDS多肽、LCA5多肽、IQCB1多肽、RP9多肽、ATXN7多肽、BBS2多肽、SAG RLBP1多肽、ND6 (MT-ND6)多肽、C1QTNF5多肽、VPS13B多肽、KIF11多肽、MT-TL1多肽、KLHL7多肽、ACO2多肽、C21orf2 (CFAP410)多肽、AHI1多肽、KIZ多肽、SPATA7多肽、TTLL5多肽、HGSNAT多肽、NRL多肽、OAT多肽、FLVCR1多肽、ABCC6多肽、LRAT多肽、CEP78多肽、CDH3多肽、FZD4多肽、BBS12多肽、HK1多肽、PRDM13多肽、ADAM9多肽、BBS7多肽、CABP4多肽、ABHD12多肽、COL18A1多肽、MFRP多肽、RIMS1多肽、ROM1多肽、BBS4多肽、IMPG1多肽、INPP5E多肽、VCAN多肽、POC1B多肽、RAX2多肽、TSPAN12多肽、CACNA2D4多肽、JAG1多肽、MKKS多肽、NPHP4多肽、BBS9多肽、COL11A1多肽、ELOVL4多肽、NDP多肽、NPHP1多肽、RGR多肽、BBS5多肽、WDR19多肽、C8ORF37多肽、CTNNA1多肽、LAMP2多肽、PEX1多肽、PHYH多肽、ATF6多肽、PRPS1多肽、SEMA4A多肽、ARL6多肽、CNNM4多肽、OTX2多肽、PRPF6多肽、RBP3多肽、PNPLA6多肽、SLC24A1多肽、USH1G多肽、PITPNM3多肽、TTC8多肽、ARSG多肽、CWC27多肽、DRAM2多肽、PRCD多肽、REEP6多肽、SSBP1多肽、LAMA1多肽、RAB28多肽、ZNF408多肽、GNAT1多肽、IDH3A多肽、PDE6G多肽、PEX6多肽、TUB多肽、CEP250多肽、FSCN2多肽、GRK1多肽、RBP4多肽、RD3多肽、AGBL5多肽、CAPN5多肽、IFT172多肽、KCNJ13多肽、PAX2多肽、CC2D2A多肽、HMCN1多肽、MT-ATP6多肽、RCBTB1多肽、ARL2BP多肽、CA4多肽、DFNB31多肽、GNB3多肽、MMACHC多肽、PRPF4多肽、RGS9多肽、ARHGEF18多肽、KIAA1549多肽、MKS1多肽、MTTP (非MT-TP)多肽、PLK4多肽、RPGRIP1L多肽、SDCCAG8多肽、SRD5A3多肽、TUBB4B多肽、ADAMTS18多肽、ARL3多肽、COL11A2多肽、MVK多肽、NBAS多肽、OFD1多肽、P3H2多肽、RGS9BP多肽、CSPP1多肽、ITM2B多肽、PANK2多肽、PEX7多肽、POMGNT1多肽、SLC4A7多肽、TMEM231多肽、TRNT1多肽、TUBGCP6多肽、ZNF513多肽、AFG3L2多肽、ARL13B多肽、C5ORF42(CPLANE1)多肽、COL9A1多肽、CTSD多肽、DTHD1多肽、DYNC2H1多肽、IFT81多肽、KIAA0586多肽、MFN2多肽、NPHP3多肽、PCYT1A多肽、PEX12多肽、PLA2G5多肽、POC5多肽、SCAPER多肽、SLC25A46多肽、TMEM237多肽、TRAF3IP1多肽、TTC21B多肽、TUBGCP4多肽、ADIPOR1多肽、CEP164多肽、CLCC1多肽、COL9A2多肽、CTNNB1多肽、DHX38多肽、GNPTG多肽、GRN多肽、GUCA1B多肽、IFT27多肽、IFT74多肽、KIAA0556多肽、LRP2多肽、MAPKAPK3多肽、MIR204多肽、MT-ND3多肽、MT-RNR1多肽、MT-TS2多肽、ND5(MT-ND5)多肽、NEK2多肽、OPN1SW多肽、PEX13多肽、PEX2多肽、RHBDD2多肽、SAMD11多肽、SCLT1多肽、SLC7A14多肽、TCTN1多肽、TCTN2多肽、TLCD3B多肽、TREX1多肽、TTPA多肽、UNC119多肽、WDPCP多肽、ACBD5多肽、AHR多肽、ARMC9多肽、ASRGL1多肽、ATOH7多肽、B9D1多肽、B9D2多肽、BBIP1多肽、C12ORF65多肽、C2CD3多肽、C5AR2多肽、CCDC188多肽、CCT2多肽、CEP104多肽、CEP120多肽、CEP19多肽、CEP41多肽、CISD2多肽、CLUAP1多肽、COL9A3多肽、CRB2多肽、CTC1多肽、DACT2多肽、DDR1多肽、ENSA多肽、ESPN多肽、EXOSC2多肽、FBN3多肽、GDF6多肽、GPR125多肽、HKDC1多肽、HMX1多肽、IDH3B多肽、IFT43多肽、IFT80多肽、INVS多肽、KIAA0753多肽、KIF3B多肽、KIF7多肽、LRRTM4多肽、LZTFL1多肽、MT-ATP8多肽、MT-CO1多肽、MT-CO2多肽、MT-CO3多肽、MT-CYB多肽、MT-ND2多肽、MT-ND4L多肽、MT-RNR2多肽、MT-TA多肽、MT-TC多肽、MT-TD多肽、MT-TE多肽、MT-TF多肽、MT-TG多肽、MT-TH多肽、MT-TI多肽、MT-TK多肽、MT-TL2多肽、MT-TM多肽、MT-TN多肽、MT-TP(非MTTP)多肽、MT-TQ多肽、MT-TR多肽、MT-TS1多肽、MT-TT多肽、MT-TV多肽、MT-TW多肽、MT-TY多肽、NEUROD1多肽、PDE6D多肽、PEX10多肽、PEX11B多肽、PEX14多肽、PEX16多肽、PEX19多肽、PEX26多肽、PEX3多肽、PEX5多肽、PGK1多肽、PISD多肽、PPP2R3C多肽、PROS1多肽、PSEN1多肽、RDH11多肽、RRM2B多肽、SMARCA4多肽、SPP2多肽、TCTN3多肽、TEAD1多肽、TMEM107多肽、TMEM138多肽、TMEM216多肽、TMEM67多肽、TPP1多肽、TRIM32多肽、USP45多肽、及ZNF423多肽。在一些情況下,包含本文提供的AAV載體內的外源核酸序列編碼的目的多肽可以是MYO7A多肽、USH1C多肽、PCDH15多肽、USH2A多肽或CLRN1多肽,以治療例如亞瑟綜合症(Usher Syndrome)。
任何適當的視網膜病況(例如視網膜疾病)可使用本文所提供之AAV載體(例如AAV2載體)(例如,含有AAV殼體多肽之AAV載體,該AAV殼體多肽包括表1A至1L之任一或多者中所闡述之胺基酸序列(或其變體)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列)及編碼治療性RNA及/或多肽的外源核酸序列進行治療。此類視網膜病況之實例包括但不限於萊伯氏先天性黑蒙症(Leber congenital amaurosis, LCA)、萊伯氏遺傳性視神經病變(Leber hereditary optic neuropathy, LHON)、眼皮膚白化症1型(oculocutaneous albinism type 1 , OCA1)、視網膜色素變性(retinitis pigmentosa)、視桿/視錐失養症(rod/cone dystrophy)、視錐失養症(cone dystrophy)、視桿失養症(rod dystrophy)、斯特格氏病(Stargardt Disease)、尤塞氏症候群(Usher syndrome)、X性聯視網膜色素變性(X-linked retinitis pigmentosa, XLRP)、X性聯視網膜裂損症(X-linked retinoschisis, XLRS)、無脈絡脈畸型(choroideremia)、全色盲(achromatopsia)、藍色視錐單色症(blue cone monochromacy)、色盲(color blindness)、青光眼(glaucoma)、視神經萎縮(optic atrophy)、巴登氏病(Batten disease)、先天性靜止性夜盲症(congenital stationary night blindness, CSNB)、黃斑部病變(macular degeneration)、CRB1相關視網膜失養症(CRB1-related retinal dystrophy)、及眼窩視錐失養症(foveal cone dystrophy)。
表2及表3中列出可使用本文所提供之AAV載體遞送以治療特定視網膜病況之治療性RNA及多肽的實例。表3中列出可使用本文所提供之經設計以遞送基因編輯組分的一或多個AAV載體,去活化及/或剔除以治療特定視網膜病況之基因體核酸的實例。表3中列出可使用本文所提供之經設計以遞送基因編輯組分的一或多個AAV載體,用健康等位基因置換以治療特定視網膜病況之致病等位基因之基因體核酸的實例。
[表2]用於治療視網膜病況之治療性多肽之實例。
視網膜病況 | 治療性多肽之實例 |
斯特格氏病 | ABCA4 |
萊伯氏先天性黑蒙症8 | CRB1 |
萊伯氏先天性黑蒙症 | NPHP5 |
視網膜色素變性37 | NR2E3 |
視桿/視錐失養症 | PDE6A/PDE6B |
視桿/視錐失養症 | PDE6c |
視網膜色素變性11 | PRPF31 |
萊伯氏先天性黑蒙症2 | RPE65 |
X性聯視網膜色素變性 | RPGR |
X性聯視網膜裂損症 | RS1 |
眼皮膚白化症1型 | TYR |
尤塞氏症候群 | PCDH15 |
尤塞氏症候群 | USH2a |
尤塞氏症候群 | USH2b |
尤塞氏症候群,由MYO7A基因突變引起之亞型IB | MYO7A |
尤塞氏症候群,由USH1C基因突變引起之亞型IC | USH1C |
尤塞氏症候群,由CDH23基因突變引起之亞型ID | CDH23 |
尤塞氏症候群,由PCDH15及/或CDH23基因突變引起之亞型ID-F | PCDH15 和/或 CDH23 |
尤塞氏症候群,由PCDH15基因突變引起之亞型IF | PCDH15 |
尤塞氏症候群,由SANS基因突變引起之亞型IG | SANS |
尤塞氏症候群,由USH1H基因突變引起之亞型IH | USH1H |
尤塞氏症候群,由CIB2基因突變引起之亞型IJ | CIB2 |
尤塞氏症候群,由USH1K基因突變引起之亞型IK | USH1K |
尤塞氏症候群,由USH2A突變引起之亞型IIA | USH2A |
尤塞氏症候群,由ADGRV1基因突變引起之亞型IIC | ADGRV1 |
尤塞氏症候群,由WHRN基因突變引起之亞型IID | WHRN |
尤塞氏症候群,由GPR98及/或PDZD7基因突變引起之亞型IIC(ADGRV1亦稱為GPR98) | GPR98和/或 PDZD7 |
尤塞氏症候群,由CLRN1基因突變引起之亞型IIIA | CLRN1 |
尤塞氏症候群,由HARS基因突變引起之亞型IIIB | IIIB,由 HARS 基因突變引起 |
視網膜色素變性 | 一種或多種營養因子(trophic factors) |
萊伯氏先天性黑蒙症 | 一種或多種營養因子(trophic factors) |
全色盲 | CNGA3、CNGB3、和/或PDE6H |
任何致盲性疾病 | 光遺傳學工具:Chr、NhpR、ReachR 和/或其他 |
藍色視錐單色症 | OPN1LW 和/或 OPN1MW |
視錐失養症 | GNAT2 |
視錐-視桿失養症 | PDE6C 和/或 PROM1 |
[表3]可經表現以治療視網膜病況之多肽的實例、可經剔除以治療視網膜病況之多肽的實例、及/或可經剔除(knocked out)並用替代物(例如,野生型或非疾病版本)置換以治療視網膜病況之多肽的實例。
疾病 | 多肽 | 基因表現 | 基因剔除 | 基因編輯-置換 |
全色盲 | CNGA3 | X | ||
全色盲 | CNGB3 | X | ||
全色盲 | PDE6H | X | ||
任何致盲性疾病 | 光遺傳學工具:Chr、NhpR、ReachR | X | ||
巴登氏病 | CTSD | X | ||
結晶樣視網膜色素變性(Bietti crystalline dystrophy) | CYP4V2 | X | X | |
藍色視錐單色症 | OPN1LW | X | ||
藍色視錐單色症 | OPN1MW | X | ||
無脈絡脈畸型 (Choroideremia) | REP1 | X | ||
視錐失養症 | PDE6c | X | ||
視錐失養症 | GNAT2 | X | ||
視錐-視桿失養症 | PDE6C | X | ||
視錐-視桿失養症 | PROM1 | X | ||
視錐/視桿失養症 | PRPH2 | X | X | X |
先天性靜止性夜盲症(CSNB) | NYX | X | ||
先天性靜止性夜盲症(CSNB) | GRM6 | X | ||
先天性靜止性夜盲症(CSNB) | TRPM1 | X | ||
先天性靜止性夜盲症(CSNB) | GPR179 | X | ||
先天性靜止性夜盲症(CSNB) | LRIT3 | X | ||
青光眼 | 營養因子(trophic factors) | X | ||
青光眼 | 補體抑制因子(Complement inhibition factors) | X | ||
青光眼 | 細胞凋亡抑制因子(Apoptosis inhibition factors) | X | ||
青光眼 | 生存因子(Survival factors) | X | ||
青光眼 | 神經保護因子(Neuroprotective factors) | X | ||
萊伯氏先天性黑蒙症(LCA) | NPHP5 | X | ||
萊伯氏先天性黑蒙症(LCA) | GUCY2D | X | ||
萊伯氏先天性黑蒙症 | RPE65 | X | ||
萊伯氏先天性黑蒙症8 | CRB1 | X | X | |
萊伯氏遺傳性視神經病變(LHON) | ND4 | X | ||
黃斑部失養症 | CRX | X | X | X |
眼皮膚白化症1型 | TYR | X | ||
視神經萎縮 | CLN1-14 | X | ||
視網膜色素變性 | EYS | X | X | |
視網膜色素變性 | RHO | X | X | X |
視網膜色素變性 | PRPF31 | X | ||
視網膜色素變性 | PDE6A | X | ||
斑萎蛋白病 (Bestrophinopathy) | BEST1 | X | X | |
視網膜色素變性 | PRPF3 | X | ||
視網膜色素變性 | PRPF8 | X | ||
視網膜色素變性 | TOPORS | X | X | X |
視網膜色素變性37 | NR2E3 | X | X | X |
視桿/視錐失養症 | PDE6B | X | ||
視網膜色素變性(RP)、萊伯氏先天性黑蒙症(LCA)、其他 | 營養因子(trophic factors) | X | ||
斯特格氏病 | ABCA4 | X | X | |
尤塞氏症候群 | PCDH15 | X | ||
尤塞氏症候群 | USH2A | X | X | |
尤塞氏症候群 | MYO7A | X | X | |
X性聯視網膜色素變性(XLRP) | RPGR | X | ||
X性聯視網膜裂損症(XLRS) | RS1 | X | ||
濕性老年性黃斑部退化(age-related macular degeneration, AMD) | 生存因子(Survival factors) | X | ||
乾性老年性黃斑部退化(age-related macular degeneration, AMD) | 生存因子(Survival factors) | X | ||
糖尿病視網膜病變 (diabetic retinopathy) | 生存因子(Survival factors) | X | ||
糖尿病黃斑部水腫 (diabetic macular edema) | 生存因子(Survival factors) | X | ||
視網膜色素變性 | 生存因子(Survival factors) | X | ||
濕性AMD | 細胞凋亡抑制因子(Apoptosis inhibition factors) | X | ||
乾性AMD | 細胞凋亡抑制因子(Apoptosis inhibition factors) | X | ||
糖尿病視網膜病變 | 細胞凋亡抑制因子(Apoptosis inhibition factors) | X | ||
糖尿病黃斑部水腫 | 細胞凋亡抑制因子(Apoptosis inhibition factors) | X | ||
視網膜色素變性 | 細胞凋亡抑制因子(Apoptosis inhibition factors) | X | ||
濕性AMD | 補體抑制因子(Complement inhibition factors) | X | ||
乾性AMD | 補體抑制因子(Complement inhibition factors) | X | ||
糖尿病視網膜病變 | 補體抑制因子(Complement inhibition factors) | X | ||
糖尿病黃斑部水腫 | 補體抑制因子(Complement inhibition factors) | X | ||
濕性AMD | 神經保護因子(Neuroprotective factors) | X | ||
乾性AMD | 神經保護因子(Neuroprotective factors) | X | ||
糖尿病視網膜病變 | 神經保護因子(Neuroprotective factors) | X | ||
糖尿病黃斑部水腫 | 神經保護因子(Neuroprotective factors) | X | ||
視網膜色素變性 | 神經保護因子(Neuroprotective factors) | X | ||
濕性AMD | 抗血管內皮生長多肽(Anti-VEGF polypeptides) | X | ||
糖尿病視網膜病變 | 抗血管內皮生長多肽(Anti-VEGF polypeptides) | X | ||
糖尿病黃斑部水腫 | 抗血管內皮生長多肽(Anti-VEGF polypeptides) | X | ||
濕性AMD | 光遺傳學工具:Chr、NhpR和/或ReachR | X | ||
乾性AMD | 光遺傳學工具:Chr、NhpR和/或ReachR | X | ||
糖尿病視網膜病變 | 光遺傳學工具:Chr、NhpR和/或ReachR | X | ||
糖尿病黃斑部水腫 | 光遺傳學工具:Chr、NhpR和/或ReachR | X | ||
視網膜色素變性 | 光遺傳學工具:Chr、NhpR和/或ReachR | X |
在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療視網膜病況,該AAV載體經設計以表現具有抑制血管生成能力之一或多個多肽。可如本文所述使用之具有抑制血管生成能力之多肽的實例包括但不限於單株抗血管內皮生長因子(anti vascular endothelial growth factor, anti-VEGF)抗體多肽、血管張力素多肽(angiostatin polypeptide)、siRNA多肽、及內皮抑素多肽(endostatin polypeptide)。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療濕性AMD,該AAV載體經設計以表現單株抗血管內皮生長因子抗體多肽、血管張力素多肽、siRNA、及/或內皮抑素多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病視網膜病變,該AAV載體經設計以表現單株抗血管內皮生長因子抗體多肽、血管張力素多肽、siRNA、及/或內皮抑素多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病黃斑部水腫,該AAV載體經設計以表現單株抗血管內皮生長因子抗體多肽、血管張力素多肽、siRNA、及/或內皮抑素多肽。
在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療視網膜病況,該AAV載體經設計以表現具有神經保護能力之一或多個多肽。可如本文所述使用之具有神經保護活性能力之多肽的實例包括但不限於GDNF多肽、CNTF多肽、IGF-1多肽、VEGF多肽、及BDNF多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療濕性老年性黃斑部退化(age-related macular degeneration, AMD),該AAV載體經設計以表現GDNF多肽、CNTF多肽、IGF-1多肽、VEGF多肽、及BDNF多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療乾性老年性黃斑部退化(age-related macular degeneration, AMD),該AAV載體經設計以表現GDNF多肽、CNTF多肽、IGF-1多肽、VEGF多肽、及BDNF多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病視網膜病變,該AAV載體經設計以表現GDNF多肽、CNTF多肽、IGF-1多肽、VEGF多肽、及BDNF多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病黃斑部水腫,該AAV載體經設計以表現GDNF多肽、CNTF多肽、IGF-1多肽、VEGF多肽、及BDNF多肽。
在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療視網膜病況,該AAV載體經設計以表現具有提供光遺傳學能力之一或多個多肽。具有提供可如本文所述使用之光遺傳學能力之多肽的實例包括但不限於ChR多肽、ChR2多肽、ArchT多肽、NpHR多肽、及ChrimsonR多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療濕性AMD,該AAV載體經設計以表現ChR多肽、ChR2多肽、ArchT多肽、NpHR多肽、及/或ChrimsonR多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療乾性AMD,該AAV載體經設計以表現ChR多肽、ChR2多肽、ArchT多肽、NpHR多肽、及/或ChrimsonR多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病視網膜病變,該AAV載體經設計以表現ChR多肽、ChR2多肽、ArchT多肽、NpHR多肽、及/或ChrimsonR多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病黃斑部水腫,該AAV載體經設計以表現ChR多肽、ChR2多肽、ArchT多肽、NpHR多肽、及/或ChrimsonR多肽。
在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療視網膜病況,該AAV載體經設計以表現具有抑制細胞凋亡能力之一或多個多肽。可如本文所述使用之具有抑制細胞凋亡能力之多肽的實例包括但不限於XIAP多肽、cIAP1多肽、C-IAP2多肽、Livin多肽、及存活素(Survivin)多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療濕性AMD,該AAV載體經設計以表現XIAP多肽、cIAP1多肽、C-IAP2多肽、Livin多肽、及/或存活素多肽(Survivin polypeptide)。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病視網膜病變,該AAV載體經設計以表現XIAP多肽、cIAP1多肽、C-IAP2多肽、Livin多肽、及/或存活素多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病黃斑部水腫,該AAV載體經設計以表現XIAP多肽、cIAP1多肽、C-IAP2多肽、Livin多肽、及/或存活素多肽。
在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療視網膜病況,該AAV載體經設計以表現具有抑制補體能力之一或多個多肽。可如本文所述使用之具有抑制補體能力之多肽的實例包括但不限於補體因子I多肽(Complement Factor I polypeptides)、補體因子H多肽(Complement factor H polypeptides)、及sCD59多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療濕性AMD,該AAV載體經設計以表現補體因子I多肽、補體因子H多肽、及/或sCD59多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療乾性AMD,該AAV載體經設計以表現補體因子I多肽、補體因子H多肽、及/或sCD59多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病視網膜病變,該AAV載體經設計以表現補體因子I多肽、補體因子H多肽、及/或sCD59多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病黃斑部水腫,該AAV載體經設計以表現補體因子I多肽、補體因子H多肽、及/或sCD59多肽。
在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療視網膜病況,該AAV載體經設計以表現具有誘導存活因子之能力的一或多個多肽。具有誘導可如本文所述使用之存活因子之能力的多肽的實例包括但不限於RdCVF多肽、RdCVFL多肽、HIF-1多肽、IAP家族多肽、及BCL-2家族多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療濕性AMD,該AAV載體經設計以表現RdCVF多肽、RdCVFL多肽、HIF-1多肽、IAP家族多肽、及/或BCL-2家族多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療乾性AMD,該AAV載體經設計以表現RdCVF多肽、RdCVFL多肽、HIF-1多肽、IAP家族多肽、及/或BCL-2家族多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病視網膜病變,該AAV載體經設計以表現RdCVF多肽、RdCVFL多肽、HIF-1多肽、IAP家族多肽、及/或BCL-2家族多肽。在一些情況下,可使用本文所提供之AAV載體來治療糖尿病黃斑部水腫,該AAV載體經設計以表現RdCVF多肽、RdCVFL多肽、HIF-1多肽、IAP家族多肽、及/或BCL-2家族多肽。
可使用任何適當方法將本文所提供之AAV載體或本文所提供之組成物(例如醫藥組成物)投予至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)。舉例而言,本文所提供之組成物(例如,含有一或多個本文所提供之AAV載體之醫藥組成物)可以下列方式投予至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物):玻璃體內、靜脈內(例如,經由靜脈注射或輸注)、皮下(例如,經由皮下注射)、腹膜內(例如,經由腹膜注射)、經口、經由吸入、肌內(例如,經由肌內注射)、視網膜下、玻璃體內、全身性、或脈絡膜上腔(suprachoroidally)。在一些情況下,組成物(例如,本文所提供之醫藥組成物)之投予途徑及/或模式可針對經治療之哺乳動物進行調整。
在一些情況下,用於治療視網膜病況之含有本文所提供之AAV載體的組成物(例如,本文所提供之醫藥組成物)的有效量可係降低視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度及/或減緩視網膜病況之進展而不會對哺乳動物產生顯著毒性的量。舉例而言,本文所提供之AAV載體的有效量可係約1x10
7個病毒基因體至約1x10
14個病毒基因體(例如,約1x10
7個病毒基因體至約1x10
13個病毒基因體、約1x10
7個病毒基因體至約1x10
12個病毒基因體、約1x10
7個病毒基因體至約1x10
11個病毒基因體、約1x10
7個病毒基因體至約1x10
10個病毒基因體、約1x10
8個病毒基因體至約1x10
14個病毒基因體、約1x10
9個病毒基因體至約1x10
14個病毒基因體、約1x10
10個病毒基因體至約1x10
14個病毒基因體、約1x10
8個病毒基因體至約1x10
12個病毒基因體、或約1x10
9個病毒基因體至約1x10
11個病毒基因體)。在一些情況下,本文所提供之AAV載體的有效量可係約1x10
10個病毒基因體/kg體重至約1x10
14個病毒基因體/kg體重(例如,約1x10
10個病毒基因體/kg體重至約1x10
13個病毒基因體/kg體重、約1x10
10個病毒基因體/kg體重至約1x10
12個病毒基因體/kg體重、約1x10
10個病毒基因體/kg體重至約1x10
11個病毒基因體/kg體重)。有效量可保持恆定或可根據哺乳動物對治療之反應而調整為滑動比例或可變劑量。各種因素會影響用於特定應用之實際有效量。舉例而言,根據視網膜病況之嚴重程度、投予途徑、哺乳動物之年齡及一般健康狀況、賦形劑之使用、與其他治療劑或預防性治療(諸如使用其他視網膜藥物)共同使用之可能性、及治療醫師之判斷,可能需要增加或減少本文所提供之組成物(例如,含有本文所提供之AAV載體之醫藥組成物)的實際有效投予量。
在一些情況下,投予含有本文所提供之AAV載體的組成物(例如,本文所提供之醫藥組成物)的有效頻率可係降低視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度及/或減緩視網膜病況之進展而不會對哺乳動物產生顯著毒性的頻率。各種因素會影響用於特定應用之實際有效頻率。舉例而言,根據視網膜病況之嚴重程度、投予途徑、哺乳動物之年齡及一般健康狀況、賦形劑之使用、與其他治療劑或預防性治療(諸如使用其他視網膜藥物)共同使用之可能性、及治療醫師之判斷,可能需要增加或減少本文所提供之組成物(例如,含有本文所提供之AAV載體之醫藥組成物)的實際有效投予頻率。
在一些情況下,投予含有本文所提供之AAV載體的組成物(例如,本文所提供之醫藥組成物)的有效持續時間可係降低視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度及/或減緩視網膜病況之進展而不會對哺乳動物產生顯著毒性的持續時間。舉例而言,投予本文所提供之醫藥組成物之有效持續時間可自單一時間點投予至數週至數個月(例如,4至12週)。在一些情況下,持續時間可持續到哺乳動物仍存活。多種因素會影響用於特定應用之實際有效持續時間。舉例而言,根據視網膜病況之嚴重程度、投予途徑、哺乳動物之年齡及一般健康狀況、賦形劑之使用、與其他治療劑或預防性治療(諸如使用其他視網膜藥物)共同使用之可能性、及治療醫師之判斷,可能需要增加或減少本文所提供之組成物(例如,含有本文所提供之AAV載體之醫藥組成物)的實際有效投予持續時間。
在一些情況下,可將治療視網膜病況之有效量的含有本文所提供之AAV載體的組成物(例如,本文所提供之醫藥組成物)投予至哺乳動物(例如人類或非人類靈長類動物)一次或兩次,以治療該哺乳動物。
本發明將進一步描述於以下實例中,但不限制申請專利範圍中所描述之本發明之範疇。
實例
實例1:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜眼窩視錐之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝(repack)」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集(enriched)」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:A1之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物介導在眼窩細胞中之表現(表1A)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據眼窩細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後介導眼窩視錐中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1A中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例2:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1A中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:A2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10
7至約1x10
14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例3:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝(repack)」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集(enriched)」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物介導在視網膜細胞中之表現(表1B)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後介導視網膜細胞中之轉基因表現(例如,高表現)的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1B中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例4:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1B中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:B2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10
7至約1x10
14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例5:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物介導跨二或多個視網膜區域之視網膜細胞中的表現。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據跨視網膜區域中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有向至少兩個不同視網膜區域之視網膜細胞遞送核酸並在其中表現核酸的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1C中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例6:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1C中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:C2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10
7至約1x10
14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例7:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染眼睛窩側區域之視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物介導在窩側區域之視網膜細胞中的表現(表1D)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜窩側區域中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後介導窩側區域之視網膜細胞中的轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1D中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例8:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1D中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:D2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10
7至約1x10
14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例11:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物介導以下表現:將核酸遞送至眼睛內多種不同類型的視網膜細胞並在其中表現核酸的能力,從而提供一種有效方式來將核酸遞送至許多不同的視網膜細胞類型(表1E)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據跨細胞類型中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後介導眼睛內之多種不同視網膜細胞類型中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1E中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例10:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1E中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:E2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10
7至約1x10
14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例11:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列,介導視網膜色素上皮細胞中之表現(表1F)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜色素上皮細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後介導視網膜色素上皮細胞中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1F中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例12:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1F中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:F2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10
7至約1x10
14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例13:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物優先介導在感光細胞中之表現(表1G)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後優先介導感光細胞中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1G中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例14:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1G中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:G2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10
7至約1x10
14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例15:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物優先介導在視網膜神經節細胞中之表現(表1H)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後優先介導視網膜神經節細胞中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1H中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例16:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1H中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:H2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10
7至約1x10
14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例17:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物優先介導在雙極細胞中之表現(表1I)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後優先介導雙極細胞中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1I中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例18:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1I中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:I2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10
7至約1x10
14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例19:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:J62至J64中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物優先介導在ON視網膜神經節細胞中之表現(表1J)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後優先介導ON視網膜神經節細胞中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1J中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例20:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1J中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:J2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10
7至約1x10
14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例21:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。在另一庫版本中,將AAV載體注入靈長類動物之視網膜中,接著自眼窩細胞之細胞核中擴增編碼AAV殼體多肽之核酸,從而產生「富集」庫。將AAV庫(例如,原始庫、重新封裝庫、及富集庫)之各次迭代玻璃體內注射至靈長動物的眼睛中。
在注射之後,AAV載體在體內彼此競爭。成功之AAV載體之感染引起DNA條碼的表現。自經分離之視網膜組織中產生單細胞懸浮液,並使用單細胞微流體技術(10X Genomics)來產生個別細胞之cDNA庫。根據細胞特異性、表現水平、及/或其他所欲特性,基於自多個細胞類型之數千個不同細胞之轉錄組中DNA條碼的存在及數量,執行運算分析以識別最佳載體。AAV殼體多肽之性能係基於mRNA轉錄水平而非DNA之存在來評估的,反映了AAV載體驅動AAV載體核酸表現之能力,而不是僅具有進入細胞之能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物優先介導在OFF視網膜神經節細胞中之表現(表1K)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。此等係依據視網膜細胞中之基因表現的總水平來判定。當使用野生型AAV2載體時,在偵測極限內未偵測到表現。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後優先介導OFF視網膜神經節細胞中之轉基因表現的能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1K中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例22:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1K中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:K2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10
7至約1x10
14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例23:構築含有突變殼體多肽之AAV載體
使用高通量方法來產生具有突變殼體多肽之AAV載體,並篩選彼等所產生之AAV載體,以得到具有展現高效率及/或特異性感染視網膜細胞之能力的特定AAV載體。參見例如Öztürk et al., bioRxiv, 2020.10.01.323196 (2020)及Öztürk et al., eLife, 10:e64175 (2021)。簡言之,建立了高度複雜之AAV突變體庫並將其注入靈長類動物(食蟹獼猴或恆河猴)之眼睛中。此等庫之建立使得庫中之每一AAV載體皆含有獨特的DNA條碼,其允許追蹤突變之AAV殼體多肽。在一個庫版本中,成功封裝之AAV載體經過聚合酶連鎖反應(PCR)擴增及重新封裝,從而產生「重新封裝」庫。
AAV殼體多肽之封裝性能係在原始庫及「重新封裝」庫中成功封裝之基礎上進行評估,反映了AAV載體之封裝能力。
具有殼體多肽之AAV載體包括位於SEQ ID NO:1之胺基酸殘基587及588之間的SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列,或SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列作為SEQ ID NO:1之胺基酸殘基585至590之替代物介導之有效封裝(表1L)。AAV載體基於總體分級進行排序,其中+++指示在測試之載體中前1/3之彼等者,++指示在測試之載體中之中間1/3之彼等者,且+指示在測試之載體中最後1/3之彼等者。
綜上所述,此等結果表明,包括AAV殼體多肽之AAV載體可具有在玻璃體內注射之後介導有效封裝之能力,該AAV殼體多肽(例如AAV2殼體多肽)具有表1L中所闡述之胺基酸序列或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體。
實例24:使用AAV載體治療視網膜病況
構築AAV載體以包括AAV2殼體多肽,其具有表1L中所闡述之胺基酸序列(例如,SEQ ID NO:L2)或基於此類所闡述之序列的根據式A的胺基酸序列AAV載體及編碼治療性多肽之外源核酸序列。將經構築之AAV載體以約1x10
7至約1x10
14個AAV載體之量玻璃體內投予至識別為具有視網膜病況的人類。在投予之後,視網膜病況之一或多種症狀之嚴重程度降低及/或視網膜病況之進展延緩。
實例25:額外實施例
實施例1A:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列。
實施例2A:如實施例1A之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3A:如實施例1A之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4A:如實施例1A之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5A:如實施例1A之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換。
實施例6A:如實施例1A至5A中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7A:如實施例1A至6A中任一者之載體,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於50%之眼窩視錐。
實施例8A:如實施例1A至7A中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9A:如實施例8A之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10A:如實施例9A之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11A:如實施例8A之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12A:如實施例11A之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13A:如實施例1A至12A中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在眼窩視錐中表現更多的核酸。
實施例14A:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列。
實施例15A:如實施例14A之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16A:如實施例14A之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17A:如實施例14A之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18A:如實施例14A之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換。
實施例19A:如實施例14A至18A中任一者之多肽,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染大於50%之眼窩視錐。
實施例20A:如實施例14A至19A中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在眼窩視錐中表現更多的核酸。
實施例21A:一種核酸分子,其編碼如實施例1A至13A中任一者之載體或實施例14A至20A中任一者之多肽。
實施例22A:如實施例21A之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23A:一種宿主細胞,其包含如實施例21A至22A中任一者之核酸分子。
實施例24A:如實施例23A之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25A:如實施例23A之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26A:一種宿主細胞,其包含如實施例1A至13A中任一者之載體或實施例14A至20A中任一者之多肽。
實施例27A:如實施例23A至26A中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28A:一種組成物,其包含如實施例1A至13A中任一者之載體。
實施例29A:如實施例28A之組成物,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例30A:如實施例28A至29A中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31A:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之眼窩視錐的方法,其中所述方法包含使所述眼窩視錐與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述眼窩視錐,從而將所述外源核酸序列遞送至所述眼窩視錐。
實施例32A:如實施例31A之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33A:如實施例31A之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34A:如實施例A31之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35A:如實施例31A之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換。
實施例36A:如實施例31A至35A中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37A:如實施例31A至36A中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38A:如實施例31A至37A中任一者之方法,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於50%之眼窩視錐。
實施例39A:如實施例31A至38A中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40A:如實施例39A之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41A:如實施例40A之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42A:如實施例39A之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43A:如實施例42A之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44A:如實施例31A至43A中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在眼窩視錐的表現水平相比,所述載體在所述眼窩視錐中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45A:如實施例31A至44A中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述眼窩視錐與所述載體接觸。
實施例46A:如實施例45A之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例47A:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的眼窩視錐與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述眼窩視錐並驅動所述外源核酸序列在所述眼窩視錐內之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48A:如實施例47A之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49A:如實施例47A至48A中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50A:如實施例47A至49A中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51A:如實施例47A至49A中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:A2至A18中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52A:如實施例47A至49A中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A2至A19中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53A:如實施例47A至49A中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:A19之胺基酸序列置換。
實施例54A:如實施例47A至53A中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55A:如實施例47A至54A中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於50%之眼窩視錐。
實施例56A:如實施例47A至55A中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57A:如實施例56A之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58A:如實施例47A至55A中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59A:如實施例58A之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。
實施例60A:如實施例47A至59A中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在眼窩視錐的表現水平相比,所述載體在所述眼窩視錐中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61A:如實施例47A至60A中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述眼窩視錐與所述載體接觸。
實施例62A:如實施例61A之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例1B:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。
實施例2B:如實施例1B之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3B:如實施例1B之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4B:如實施例1B之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5B:如實施例1B之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6B:如實施例1B至5B中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7B:如實施例1B至6B中任一者之載體,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2.5%之視網膜細胞。
實施例8B:如實施例1B至7B中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9B:如實施例8B之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10B:如實施例9B之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11B:如實施例8B之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12B:如實施例11B之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13B:如實施例1B至12B中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在視網膜細胞中表現更多的核酸。
實施例14B:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列。
實施例15B:如實施例14B之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16B:如實施例14B之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17B:如實施例14B之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18B:如實施例14B之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19B:如實施例14B至18B中任一者之多肽,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染大於2.5%之視網膜細胞。
實施例20B:如實施例14B至19B中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在視網膜細胞中表現更多的核酸。
實施例21B:一種核酸分子,其編碼如實施例1B至13B中任一者之載體或實施例14B至20B中任一者之多肽。
實施例22B:如實施例21B之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23B:一種宿主細胞,其包含如實施例21B至22B中任一者之核酸分子。
實施例24B:如實施例23B之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25B:如實施例23B之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26B:一種宿主細胞,其包含如實施例1B至13B中任一者之載體或實施例14B至20B中任一者之多肽。
實施例27B:如實施例23B至26B中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28B:一種組成物,其包含如實施例1B至13B中任一者之載體。
實施例29B:如實施例28B之組成物,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例30B:如實施例28B至29B中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31B:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜細胞的方法,其中所述方法包含使所述視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述視網膜細胞。
實施例32B:如實施例31B之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33B:如實施例31B之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34B:如實施例31B之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35B:如實施例31B之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36B:如實施例31B至35B中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37B:如實施例31B至35B中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38B:如實施例31B至37B中任一者之方法,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2.5%之視網膜細胞。
實施例39B:如實施例31B至38B中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40B:如實施例39B之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41B:如實施例40B之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42B:如實施例39B之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43B:如實施例42B之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44B:如實施例31B至43B中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45B:如實施例31B至44B中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例46B:如實施例45B之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例47B:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞並驅動所述外源核酸序列在所述視網膜細胞內之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48B:如實施例47B之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49B:如實施例47B至48B中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由LCA、OCA1、視網膜色素變性、視桿/視錐失養症、視錐失養症、斯特格氏病、尤塞氏症候群、XLRP、及XLRS所組成之群組。
實施例50B:如實施例47B至49B中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51B:如實施例47B至49B中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:B2至B298中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52B:如實施例47B至49B中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B2至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53B:如實施例47B至49B中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:B299至B317中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54B:如實施例47B至53B中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55B:如實施例47B至54B中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2.5%之視網膜細胞。
實施例56B:如實施例47B至55B中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57B:如實施例56B之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58B:如實施例47B至55B中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59B:如實施例58B之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。
實施例60B:如實施例47B至59B中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61B:如實施例47B至60B中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例62B:如實施例61B之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例1C:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。
實施例2C:如實施例1C之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3C:如實施例1C之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4C:如實施例1C之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5C:如實施例1C之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6C:如實施例1C至5C中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7C:如實施例1C至6C中任一者之載體,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。
實施例8C:如實施例1C至7C中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9C:如實施例8C之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10C:如實施例9C之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11C:如實施例8C之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12C:如實施例11C之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13C:如實施例1C至12C中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體可在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中所述至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
實施例14C:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列。
實施例15C:如實施例14C之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16C:如實施例14C之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17C:如實施例14C之多肽,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18C:如實施例14C之多肽,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19C:如實施例14C至18C中任一者之多肽,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染二或更多個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。
實施例20C:如實施例14C至19C中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中表現更多的核酸,其中所述至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
實施例21C:一種核酸分子,其編碼如實施例1C至13C中任一者之載體或實施例14C至20C中任一者之多肽。
實施例22C:如實施例21C之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23C:一種宿主細胞,其包含如實施例21C至22C中任一者之核酸分子。
實施例24C:如實施例23C之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25C:如實施例23C之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26C:一種宿主細胞,其包含如實施例1C至13C中任一者之載體或實施例14C至20C中任一者之多肽。
實施例27C:如實施例23C至26C中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28C:一種組成物,其包含如實施例1C至13C中任一者之載體。
實施例29C:如實施例28C之組成物,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例30C:如實施例28C至29C中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31C:一種用於向哺乳動物眼睛之至少兩個不同視網膜區域內之視網膜細胞遞送外源核酸序列的方法,其中所述方法包含使所述視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述至少兩個不同視網膜區域內之視網膜細胞,從而向所述視網膜細胞遞送所述外源核酸序列,其中所述至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
實施例32C:如實施例31C之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33C:如實施例31C之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34C:如實施例31C之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35C:如實施例31C之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36C:如實施例31C至35C中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37C:如實施例31C至36C中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38C:如實施例31C至37C中任一者之方法,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述至少兩個視網膜區域內大於2%之視網膜細胞。
實施例39C:如實施例31C至38C中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40C:如實施例39C之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41C:如實施例40C之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42C:如實施例39C之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43C:如實施例42C之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44C:如實施例31C至43C中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜細胞的表現水平相比,所述載體在所述至少兩個視網膜區域之所述視網膜細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45C:如實施例31C至44C中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例46C:如實施例45C之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例47C:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物眼睛的至少兩個視網膜區域的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述至少兩個視網膜區域之所述視網膜細胞並驅動所述外源核酸序列在所述至少兩個視網膜區域之所述視網膜細胞內之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48C:如實施例47C之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49C:如實施例47C至48C中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由LCA、OCA1、視網膜色素變性、視桿/視錐失養症、視錐失養症、斯特格氏病、尤塞氏症候群、XLRP、及XLRS所組成之群組。
實施例50C:如實施例47C至49C中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51C:如實施例47C至49C中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:C2至C43中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52C:如實施例47C至49C中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C2至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53C:如實施例47C至49C中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:C44至C45中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54C:如實施例47C至53C中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55C:如實施例47C至54C中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述至少兩個視網膜區域中大於2%之視網膜細胞。
實施例56C:如實施例47C至55C中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57C:如實施例56C之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58C:如實施例47C至55C中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59C:如實施例58C之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。
實施例60C:如實施例47C至59C中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在所述至少兩個視網膜區域之視網膜細胞中的表現水平相比,所述載體在所述至少兩個視網膜區域之所述視網膜細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61C:如實施例47C至60C中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述至少兩個視網膜區域的所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例62C:如實施例61C之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例63C:如實施例C47至C62中任一者之方法,其中所述至少兩個視網膜區域係選自由中央窩區域、窩側區域、弓形血管區域、及周邊區域所組成之群組。
實施例1D:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。
實施例2D:如實施例1D之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3D:如實施例1D之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4D:如實施例1D之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5D:如實施例1D之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6D:如實施例1D至5D中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7D:如實施例1D至6D中任一者之載體,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之眼睛窩側區域的視網膜細胞。
實施例8D:如實施例1D至7D中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9D:如實施例8D之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10D:如實施例9D之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11D:如實施例8D之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12D:如實施例11D之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13D:如實施例1D至12D中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在眼睛窩側區域之視網膜細胞中表現更多的核酸。
實施例14D:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列。
實施例15D:如實施例14D之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16D:如實施例14D之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17D:如實施例14D之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18D:如實施例14D之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19D:如實施例14D至18D中任一者之多肽,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染大於2%之眼睛窩側區域的視網膜細胞。
實施例20D:如實施例14D至19D中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在眼睛窩側區域的視網膜細胞中表現更多的核酸。
實施例21D:一種核酸分子,其編碼如實施例1D至13D中任一者之載體或實施例14D至20D中任一者之多肽。
實施例22D:如實施例21D之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23D:一種宿主細胞,其包含如實施例21D至22D中任一者之核酸分子。
實施例24D:如實施例23D之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25D:如實施例23D之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26D:一種宿主細胞,其包含如實施例1D至13D中任一者之載體或實施例14D至20D中任一者之多肽。
實施例27D:如實施例23D至26D中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28D:一種組成物,其包含如實施例1D至13D中任一者之載體。
實施例29D:如實施例28D之組成物,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例30D:如實施例28D至29D中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31D:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物眼睛窩側區域之視網膜細胞的方法,其中所述方法包含使所述視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述視網膜細胞。
實施例32D:如實施例31D之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33D:如實施例31D之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34D:如實施例31D之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35D:如實施例31D之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36D:如實施例31D至35D中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37D:如實施例31D至36D中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38D:如實施例31D至37D中任一者之方法,其中當玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之所述窩側區域的大於2%的視網膜細胞。
實施例39D:如實施例31D至38D中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40D:如實施例39D之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41D:如實施例40D之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42D:如實施例39D之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43D:如實施例42D之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44D:如實施例31D至43D中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在眼睛窩側區域的視網膜細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45D:如實施例31D至44D中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述窩側區域的所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例46D:如實施例45D之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例47D:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物眼睛窩側區域的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞並驅動所述外源核酸序列在所述視網膜細胞內之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48D:如實施例47D之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49D:如實施例47D至48D中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50D:如實施例47D至49D中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51D:如實施例47D至49D中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:D2至D76中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52D:如實施例47D至49D中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D2至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53D:如實施例47D至49D中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:D77至D78中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54D:如實施例47D至53D中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55D:如實施例47D至54D中任一者之方法,其中當玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之所述窩側區域的視網膜細胞。
實施例56D:如實施例47D至55D中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57D:如實施例56D之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58D:如實施例47D至55D中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59D:如實施例58D之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。
實施例60D:如實施例47D至59D中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在窩側區域的視網膜細胞中的表現水平相比,所述載體在所述窩側區域之所述視網膜細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61D:如實施例47D至60D中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述窩側區域的所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例62D:如實施例61D之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例1E:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。
實施例2E:如實施例1E之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3E:如實施例1E之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4E:如實施例1E之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5E:如實施例1E之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6E:如實施例1E至5E中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7E:如實施例1E至6E中任一者之載體,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中所述至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
實施例8E:如實施例1E至7E中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9E:如實施例8E之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10E:如實施例9E之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11E:如實施例8E之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12E:如實施例11E之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13E:如實施例1E至12E中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中所述至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
實施例14E:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列。
實施例15E:如實施例14E之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16E:如實施例14E之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17E:如實施例14E之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18E:如實施例14E之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19E:如實施例14E至18E中任一者之多肽,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染至少三種不同視網膜細胞類型,其中所述至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
實施例20E:如實施例14E至19E中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的核酸,其中所述至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
實施例21E:一種核酸分子,其編碼如實施例1E至13E中任一者之載體或實施例14E至20E中任一者之多肽。
實施例22E:如實施例21E之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23E:一種宿主細胞,其包含如實施例21E至22E中任一者之核酸分子。
實施例24E:如實施例23E之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25E:如實施例23E之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26E:一種宿主細胞,其包含如實施例1E至13E中任一者之載體或實施例14E至20E中任一者之多肽。
實施例27E:如實施例23E至26E中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28E:一種組成物,其包含如實施例1E至13E中任一者之載體。
實施例29E:如實施例28E之組成物,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例30E:如實施例28E至29E中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic E68。
實施例31E:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物眼睛之至少三種不同視網膜細胞類型的方法,其中所述方法包含使所述至少三種不同視網膜細胞類型與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述至少三種不同視網膜細胞類型,從而向所述至少三種不同視網膜細胞類型遞送所述外源核酸序列,其中所述至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
實施例32E:如實施例31E之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33E:如實施例31E之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34E:如實施例31E之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35E:如實施例31E之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36E:如實施例31E至35E中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37E:如實施例31E至36E中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38E:如實施例31E至37E中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛內大於2%的所述至少三種不同視網膜細胞類型。
實施例39E:如實施例31E至38E中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40E:如實施例39E之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41E:如實施例40E之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42E:如實施例39E之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43E:如實施例42E之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44E:如實施例31E至43E中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在所述至少三種不同視網膜細胞類型中的表現水平相比,所述載體在所述至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45E:如實施例31E至44E中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述至少三種不同視網膜細胞類型與所述載體接觸。
實施例46E:如實施例45E之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例47E:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物眼睛的至少三種不同視網膜細胞類型與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述至少三種不同視網膜細胞類型並驅動所述至少三種不同視網膜細胞類型內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48E:如實施例47E之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49E:如實施例47E至48E中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50E:如實施例47E至49E中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51E:如實施例47E至49E中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:E2至E75中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52E:如實施例47E至49E中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E2至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53E:如實施例47E至49E中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:E76至E83中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54E:如實施例47E至53E中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55E:如實施例47E至53E中任一者之方法,其中當玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛內大於2%的所述至少三種不同視網膜細胞類型。
實施例56E:如實施例47E至55E中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57E:如實施例56E之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58E:如實施例47E至55E中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59E:如實施例42E之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60E:如實施例47E至59E中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在所述至少三種不同視網膜細胞類型中的表現水平相比,所述載體在所述至少三種不同視網膜細胞類型中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61E:如實施例47E至60E中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述至少三種不同視網膜細胞類型與所述載體接觸。
實施例62E:如實施例61E之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例63E:如實施例44E至62E中任一者之方法,其中所述至少三種不同視網膜細胞類型選自由視網膜神經節細胞、無長突細胞、水平細胞、雙極細胞、穆勒神經膠質細胞、感光細胞、及視網膜色素上皮細胞所組成之群組。
實施例1F:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。
實施例2F:如實施例1F之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3F:如實施例1F之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4F:如實施例1F之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例5F:如實施例1F之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6F:如實施例1F至5F中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7F:如實施例1F至6F中任一者之載體,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。
實施例8F:如實施例1F至7F中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9F:如實施例8F之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10F:如實施例9F之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11F:如實施例8F之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12F:如實施例11F之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13F:如實施例1F至12F中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。
實施例14F:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列。
實施例15F:如實施例14F之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16F:如實施例14F之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17F:如實施例14F之多肽,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例18F:如實施例14F之多肽,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19F:如實施例14F至18F中任一者之多肽,其中當向人類(或非人類靈長類動物)之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。
實施例20F:如實施例14F至19F中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在視網膜色素上皮細胞中表現更多的核酸。
實施例21F:一種核酸分子,其編碼如實施例1F至13F中任一者之載體或實施例14F至20F中任一者之多肽。
實施例22F:如實施例21F之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23F:一種宿主細胞,其包含如實施例21F至22F中任一者之核酸分子。
實施例24F:如實施例23F之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25F:如實施例23F之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26F:一種宿主細胞,其包含如實施例1F至13F中任一者之載體或實施例14F至20F中任一者之多肽。
實施例27F:如實施例23F至26F中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28F:一種組成物,其包含如實施例1F至13F中任一者之載體。
實施例29F:如實施例28F之組成物,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例30F:如實施例28F至29F中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31F:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物眼睛之視網膜色素上皮細胞的方法,其中所述方法包含使所述視網膜色素上皮細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染視網膜色素上皮細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述視網膜色素上皮細胞。
實施例32F:如實施例31F之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33F:如實施例31F之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34F:如實施例31F之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例35F:如實施例31F之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36F:如實施例31F至35F中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37F:如實施例31F至36F中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38F:如實施例31F至37F中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%之視網膜色素上皮細胞。
實施例39F:如實施例31F至38F中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40F:如實施例39F之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41F:如實施例40F之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42F:如實施例39F之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43F:如實施例42F之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44F:如實施例31F至43F中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜色素上皮細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜色素上皮細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45F:如實施例31F至44F中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜色素上皮細胞與所述載體接觸。
實施例46F:如實施例45F之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例47F:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物眼睛的視網膜色素上皮細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜色素上皮細胞並驅動所述視網膜色素上皮細胞內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48F:如實施例47F之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49F:如實施例47F至48F中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50F:如實施例47F至49F中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51F:如實施例47F至49F中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F2至F5中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52F:如實施例47F至49F中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:F6至F10中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例53F:如實施例47F至49F中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:F2至F10中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54F:如實施例47F至53F中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55F:如實施例47F至54F中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之視網膜色素上皮細胞。
實施例56F:如實施例47F至55F中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57F:如實施例56F之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58F:如實施例47F至55F中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59F:如實施例58F之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60F:如實施例47F至59F中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜色素上皮細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜色素上皮細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61F:如實施例47F至60F中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜色素上皮細胞與所述載體接觸。
實施例62F:如實施例61F之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例1G:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。
實施例2G:如實施例1G之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3G:如實施例1G之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4G:如實施例1G之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5G:如實施例1G之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6G:如實施例1G至5G中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7G:如實施例1G至6G中任一者之載體,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的感光細胞。
實施例8G:如實施例1G至7G中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9G:如實施例8G之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10G:如實施例9G之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11G:如實施例8G之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12G:如實施例11G之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13G:如實施例1G至12G中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在感光細胞中表現更多的核酸。
實施例14G:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列。
實施例15G:如實施例14G之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16G:如實施例14G之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17G:如實施例14G之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18G:如實施例14G之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19G:如實施例14G至18G中任一者之多肽,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染所述眼睛之大於2%的感光細胞。
實施例20G:如實施例14G至19G中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在感光細胞中表現更多的核酸。
實施例21G:一種核酸分子,其編碼如實施例1G至13G中任一者之載體或實施例14G至20G中任一者之多肽。
實施例22G:如實施例21G之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23G:一種宿主細胞,其包含如實施例21G至22G中任一者之核酸分子。
實施例24G:如實施例23G之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25G:如實施例23G之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26G:一種宿主細胞,其包含如實施例1G至13G中任一者之載體或實施例14G至20G中任一者之多肽。
實施例27G:如實施例23G至26G中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28G:一種組成物,其包含如實施例1G至13G中任一者之載體。
實施例29G:如實施例28G之組成物,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例30G:如實施例28G至29G中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31G:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之感光細胞的方法,其中所述方法包含使所述感光細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述感光細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述感光細胞。
實施例32G:如實施例31G之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33G:如實施例31G之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34G:如實施例31G之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35G:如實施例31G之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36G:如實施例31G至35G中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37G:如實施例31G至36G中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38G:如實施例31G至37G中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的感光細胞。
實施例39G:如實施例31G至38G中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40G:如實施例39G之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41G:如實施例40G之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42G:如實施例39G之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43G:如實施例42G之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44G:如實施例31G至43G中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在感光細胞的表現水平相比,所述載體在所述感光細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45G:如實施例31G至44G中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述感光細胞與所述載體接觸。
實施例46G:如實施例45G之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例47G:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的感光細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述感光細胞並驅動所述感光細胞內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48G:如實施例47G之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49G:如實施例47G至48G中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50G:如實施例47G至49G中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51G:如實施例47G至49G中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:G2至G70中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52G:如實施例47G至49G中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G2至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53G:如實施例47G至49G中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:G71至G77中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54G:如實施例47G至53GF中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55G:如實施例47G至54G中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之感光細胞。
實施例56G:如實施例47G至55G中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57G:如實施例56G之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58G:如實施例47G至55G中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59G:如實施例58G之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60G:如實施例47G至59G中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在感光細胞中的表現水平相比,所述載體在所述感光細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61G:如實施例47G至60G中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述感光細胞與所述載體接觸。
實施例62G:如實施例61G之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例1H:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。
實施例2H:如實施例1H之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3H:如實施例1H之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4H:如實施例1H之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5H:如實施例1H之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6H:如實施例1H至5H中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7H:如實施例1H至6H中任一者之載體,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的視網膜神經節細胞。
實施例8H:如實施例1H至7H中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9H:如實施例8H之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10H:如實施例9H之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11H:如實施例8H之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12H:如實施例11H之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13H:如實施例1H至12H中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
實施例14H:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列。
實施例15H:如實施例14H之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16H:如實施例14H之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17H:如實施例14H之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18H:如實施例14H之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19H:如實施例14H至18H中任一者之多肽,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染所述眼睛之大於2%的視網膜神經節細胞。
實施例20H:如實施例14H至19H中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
實施例21H:一種核酸分子,其編碼如實施例1H至13H中任一者之載體或實施例14H至20H中任一者之多肽。
實施例22H:如實施例21H之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23H:一種宿主細胞,其包含如實施例21H至22H中任一者之核酸分子。
實施例24H:如實施例23H之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25H:如實施例23H之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26H:一種宿主細胞,其包含如實施例1H至13H中任一者之載體或實施例14H至20H中任一者之多肽。
實施例27H:如實施例23H至26H中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28H:一種組成物,其包含如實施例1H至13H中任一者之載體。
實施例29H:如實施例28H之組成物,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例30H:如實施例28H至29H中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31H:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜神經節細胞的方法,其中所述方法包含使所述視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述感光細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述感光細胞。
實施例32H:如實施例31H之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33H:如實施例31H之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34H:如實施例31H之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35H:如實施例31H之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36H:如實施例31H至35H中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37H:如實施例31H至36H中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38H:如實施例31H至37H中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的視網膜神經節細胞。
實施例39H:如實施例31H至38H中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40H:如實施例39H之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41H:如實施例40H之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42H:如實施例39H之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43H:如實施例42H之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44H:如實施例31H至43H中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜神經節細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜神經節細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45H:如實施例31H至44H中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜神經節細胞與所述載體接觸。
實施例46H:如實施例45H之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例47H:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜神經節細胞並驅動所述視網膜神經節細胞內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48H:如實施例47H之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49H:如實施例47H至48H中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50H:如實施例47H至49H中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51H:如實施例47H至49H中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:H2至H243中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52H:如實施例47H至49H中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H2至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53H:如實施例47H至49H中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:H244至H258中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54H:如實施例47H至53H中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55H:如實施例47H至54H中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之視網膜神經節細胞。
實施例56H:如實施例47H至55H中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57H:如實施例56H之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58H:如實施例47H至55H中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59H:如實施例58H之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60H:如實施例47H至59H中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜神經節細胞的表現水平相比,所述載體在所述視網膜神經節細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61H:如實施例47H至60H中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜神經節細胞與所述載體接觸。
實施例62H:如實施例61H之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例1I:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。
實施例2I:如實施例1I之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3I:如實施例1I之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4I:如實施例1I之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5I:如實施例1I之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6I:如實施例1I至5I中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7I:如實施例1I至6I中任一者之載體,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之視網膜之大於2%的雙極細胞。
實施例8I:如實施例1I至7I中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9I:如實施例8I之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10I:如實施例9I之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11I:如實施例8I之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12I:如實施例11I之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13I:如實施例1I至12I中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在視網膜之雙極細胞中表現更多的核酸。
實施例14I:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列。
實施例15I:如實施例14I之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16I:如實施例14I之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17I:如實施例14I之多肽,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18I:如實施例14I之多肽,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19I:如實施例14I至18I中任一者之多肽,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染所述眼睛之視網膜之大於2%的雙極細胞。
實施例20I:如實施例14I至19I中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在視網膜的雙極細胞中表現更多的核酸。
實施例21I:一種核酸分子,其編碼如實施例1I至13I中任一者之載體或實施例14I至20I中任一者之多肽。
實施例22I:如實施例21I之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23I:一種宿主細胞,其包含如實施例21I至22I中任一者之核酸分子。
實施例24I:如實施例23I之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25I:如實施例23I之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26I:一種宿主細胞,其包含如實施例1I至13I中任一者之載體或實施例14I至20I中任一者之多肽。
實施例27I:如實施例23I至26I中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28I:一種組成物,其包含如實施例1I至13I中任一者之載體。
實施例29I:如實施例28I之組成物,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例30I:如實施例28I至29I中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31I:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內視網膜之雙極細胞的方法,其中所述方法包含使所述雙極細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述雙極細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述雙極細胞。
實施例32I:如實施例31I之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33I:如實施例31I之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34I:如實施例31I之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35I:如實施例31I之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36I:如實施例31I至35I中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37I:如實施例31I至36I中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38I:如實施例31I至37I中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之視網膜之大於2%的雙極細胞。
實施例39I:如實施例31I至38I中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40I:如實施例39I之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41I:如實施例40I之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42I:如實施例39I之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43I:如實施例42I之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44I:如實施例31I至43I中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜的雙極細胞中的表現水平相比,所述載體在所述雙極細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45I:如實施例31I至44I中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述雙極細胞與所述載體接觸。
實施例46I:如實施例45I之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例47I:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物視網膜的雙極細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述雙極細胞並驅動所述雙極細胞內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48I:如實施例47I之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49I:如實施例47I至48I中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50I:如實施例47I至49I中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51I:如實施例47I至49I中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:I2至I67中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52I:如實施例47I至49I中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I2至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53I:如實施例47I至49I中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:I68至I74中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54I:如實施例47I至53I中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55I:如實施例47I至54I中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之視網膜的雙極細胞。
實施例56I:如實施例47I至55I中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57I:如實施例56I之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58I:如實施例47I至55I中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59I:如實施例58I之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60I:如實施例47I至59I中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在視網膜的雙極細胞中的表現水平相比,所述載體在所述雙極細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61I:如實施例47I至60I中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述雙極細胞與所述載體接觸。
實施例62I:如實施例61I之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例1J:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。
實施例2J:如實施例1J之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3J:如實施例1J之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4J:如實施例1J之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5J:如實施例1J之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J62至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6J:如實施例1J至5J中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7J:如實施例1J至6J中任一者之載體,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的ON視網膜神經節細胞。
實施例8J:如實施例1J至7J中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9J:如實施例8J之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10J:如實施例9J之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11J:如實施例8J之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12J:如實施例11J之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13J:如實施例1J至12J中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
實施例14J:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列。
實施例15J:如實施例14J之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16J:如實施例14J之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17J:如實施例14J之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18J:如實施例14J之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J62至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19J:如實施例14J至18J中任一者之多肽,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染所述眼睛之大於2%的ON視網膜神經節細胞。
實施例20J:如實施例14J至19J中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在ON視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
實施例21J:一種核酸分子,其編碼如實施例1J至13J中任一者之載體或實施例14J至20J中任一者之多肽。
實施例22J:如實施例21J之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23J:一種宿主細胞,其包含如實施例21J至22J中任一者之核酸分子。
實施例24J:如實施例23J之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25J:如實施例23J之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26J:一種宿主細胞,其包含如實施例1J至13J中任一者之載體或實施例14J至20J中任一者之多肽。
實施例27J:如實施例23J至26J中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28J:一種組成物,其包含如實施例1J至13J中任一者之載體。
實施例29J:如實施例28J之組成物,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例30J:如實施例28J至29J中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31J:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之ON視網膜神經節細胞的方法,其中所述方法包含使所述ON視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:2J至64J中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述ON視網膜神經節細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述ON視網膜神經節細胞。
實施例32J:如實施例31J之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33J:如實施例31J之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34J:如實施例31J之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35J:如實施例J31之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J62至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36J:如實施例31J至35J中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37J:如實施例31J至36J中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38J:如實施例31J至37J中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的ON視網膜神經節細胞。
實施例39J:如實施例31J至38J中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40J:如實施例39J之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41J:如實施例40J之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42J:如實施例39J之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43J:如實施例42J之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44J:如實施例31J至43J中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在ON視網膜神經節細胞的表現水平相比,所述載體在所述ON視網膜神經節細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45J:如實施例31J至44J中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述ON視網膜神經節細胞與所述載體接觸。
實施例46J:如實施例45J之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例47J:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的ON視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述ON視網膜神經節細胞並驅動所述ON視網膜神經節細胞內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48J:如實施例47J之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49J:如實施例47J至48J中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50J:如實施例47J至49J中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51J:如實施例47J至49J中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:J2至J61中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52J:如實施例47J至49J中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J2至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53J:如實施例47J至49J中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:J62至J64中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54J:如實施例47J至53J中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55J:如實施例47J至54J中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之ON視網膜神經節細胞。
實施例56J:如實施例47J至55J中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57J:如實施例56J之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58J:如實施例47J至55J中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59J:如實施例58J之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60J:如實施例47J至59J中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在ON視網膜神經節細胞的表現水平相比,所述載體在所述ON視網膜神經節細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61J:如實施例47J至60J中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述ON視網膜神經節細胞與所述載體接觸。
實施例62J:如實施例61J之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例1K:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。
實施例2K:如實施例1K之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3K:如實施例1K之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4K:如實施例1K之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5K:如實施例1K之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6K:如實施例1K至5K中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7K:如實施例1K至6K中任一者之載體,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的OFF視網膜神經節細胞。
實施例8K:如實施例1K至7K中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9K:如實施例8K之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10K:如實施例9K之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11K:如實施例8K之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12K:如實施例11K之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13K:如實施例1K至12K中任一者之載體,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,所述載體在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
實施例14K:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列。
實施例15K:如實施例14K之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16K:如實施例14K之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17K:如實施例14K之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18K:如實施例14K之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19K:如實施例14K至18K中任一者之多肽,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,包含所述多肽之AAV載體感染所述眼睛之大於2%的OFF視網膜神經節細胞。
實施例20K:如實施例14K至19K中任一者之多肽,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的表現水平相比,包含所述多肽之AAV載體在OFF視網膜神經節細胞中表現更多的核酸。
實施例21K:一種核酸分子,其編碼如實施例1K至13K中任一者之載體或實施例14K至20K中任一者之多肽。
實施例22K:如實施例21K之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23K:一種宿主細胞,其包含如實施例21K至22K中任一者之核酸分子。
實施例24K:如實施例23K之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25K:如實施例23K之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26K:一種宿主細胞,其包含如實施例1K至13K中任一者之載體或實施例14K至20K中任一者之多肽。
實施例27K:如實施例23K至26K中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28K:一種組成物,其包含如實施例1K至13K中任一者之載體。
實施例29K:如實施例28K之組成物,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例30K:如實施例28K至29K中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31K:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之OFF視網膜神經節細胞的方法,其中所述方法包含使所述OFF視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述OFF視網膜神經節細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述OFF視網膜神經節細胞。
實施例32K:如實施例31K之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33K:如實施例31K之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34K:如實施例31K之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35K:如實施例31K之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36K:如實施例31K至35K中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37K:如實施例31K至36K中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38K:如實施例31K至37K中任一者之方法,其中當向眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染所述眼睛之大於2%的OFF視網膜神經節細胞。
實施例39K:如實施例31K至38K中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40K:如實施例39K之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41K:如實施例40K之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42K:如實施例39K之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43K:如實施例42K之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44K:如實施例31K至43K中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在OFF視網膜神經節細胞中的表現水平相比,所述載體在所述OFF視網膜神經節細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例45K:如實施例31K至44K中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述OFF視網膜神經節細胞與所述載體接觸。
實施例46K:如實施例45K之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例47K:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的OFF視網膜神經節細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述OFF視網膜神經節細胞並驅動所述OFF視網膜神經節細胞內所述外源核酸序列之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48K:如實施例47K之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49K:如實施例47K至48K中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50K:如實施例47K至49K中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51K:如實施例47K至49K中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:K2至K60中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52K:如實施例47K至49K中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K2至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53K:如實施例47K至49K中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:K61至K63中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54K:如實施例47K至53K中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55K:如實施例47K至54K中任一者之方法,其中當向所述哺乳動物之眼睛玻璃體內投予至少1x10
7個所述載體之效價時,所述載體感染大於2%之OFF視網膜神經節細胞。
實施例56K:如實施例47K至55K中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57K:如實施例56K之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58K:如實施例47K至55K中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59K:如實施例58K之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60K:如實施例47K至59K中任一者之方法,其中與包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體在OFF視網膜神經節細胞中的表現水平相比,所述載體在所述OFF視網膜神經節細胞中表現更多的所述外源核酸序列。
實施例61K:如實施例47K至60K中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述OFF視網膜神經節細胞與所述載體接觸。
實施例62K:如實施例61K之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例1L:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。
實施例2L:如實施例1L之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例3L:如實施例1L之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例4L:如實施例1L之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例5L:如實施例1L之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例6L:如實施例1L至5L中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7L:如實施例1L至6L中任一者之載體,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。
實施例8L:如實施例1L至7L中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例9L:如實施例8L之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例10L:如實施例9L之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例11L:如實施例8L之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例12L:如實施例11L之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例13L:如實施例1L至12L中任一者之載體,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。
實施例14L:一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列。
實施例15L:如實施例14L之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例16L:如實施例14L之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例17L:如實施例14L之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例18L:如實施例14L之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例19L:如實施例14L至18L中任一者之多肽,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。
實施例20L:如實施例14L至19L中任一者之多肽,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。
實施例21L:一種核酸分子,其編碼如實施例1L至13L中任一者之載體或實施例14L至20L中任一者之多肽。
實施例22L:如實施例21L之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例23L:一種宿主細胞,其包含如實施例21L至22L中任一者之核酸分子。
實施例24L:如實施例23L之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例25L:如實施例23L之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例26L:一種宿主細胞,其包含如實施例1L至13L中任一者之載體或實施例14L至20L中任一者之多肽。
實施例27L:如實施例23L至26L中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例28L:一種組成物,其包含如實施例1L至13L中任一者之載體。
實施例29L:如實施例28L之組成物,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例30L:如實施例28L至29L中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例31L:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之細胞的方法,其中所述方法包含使所述細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述細胞。
實施例32L:如實施例31L之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例33L:如實施例31L之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例34L:如實施例31L之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例35L:如實施例31L之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L20至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例36L:如實施例31L至35L中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例37L:如實施例31L至36L中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例38L:如實施例31L至37L中任一者之方法,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。
實施例39L:如實施例31L至38L中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例40L:如實施例39L之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例41L:如實施例40L之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例42L:如實施例39L之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例43L:如實施例42L之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例44L:如實施例31L至43L中任一者之方法,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。
實施例45L:如實施例31L至44L中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述細胞與所述載體接觸。
實施例46L:如實施例45L之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例47L:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞並驅動所述外源核酸序列在所述視網膜細胞內之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例48L:如實施例47L之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例49L:如實施例47L至48L中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例50L:如實施例47L至49L中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例51L:如實施例47L至49L中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了所述SEQ ID NO:L2至L19中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
實施例52L:如實施例47L至49L中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L2至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例53L:如實施例47L至49L中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用所述SEQ ID NO:L19至L27中任一者之胺基酸序列置換。
實施例54L:如實施例47L至53L中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例55L:如實施例47L至54L中任一者之方法,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率。
實施例56L:如實施例47L至55L中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例57L:如實施例56L之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例58L:如實施例47L至55L中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例59L:如實施例58L之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例60L:如實施例47L至59L中任一者之方法,其中所述載體之封裝效率大於包含由SEQ ID NO:1闡述之胺基酸序列所組成之殼體多肽的比較性AAV載體的封裝效率至少10%。
實施例61L:如實施例47L至60L中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例62L:如實施例61L之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例1M:一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中所述殼體多肽包含下列中任一者之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例2M:如實施例1M之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例3M:如實施例1M之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A18、SEQ ID NO:B2至B298、SEQ ID NO:C2至C43、SEQ ID NO:D2至D76、SEQ ID NO:E2至E75、SEQ ID NO:F2至F11、SEQ ID NO:G2至G70、SEQ ID NO:H2至H243、SEQ ID NO:I2至I67、SEQ ID NO:J2至J61、SEQ ID NO:K2至K60、及SEQ ID NO:L2至L19。
實施例4M:如實施例1M之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例5M:如實施例1M之載體,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者所闡述之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A19、SEQ ID NO:B299至B317、SEQ ID NO:C44至C45、SEQ ID NO:D77至D78、SEQ ID NO:E76至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G71至G77、SEQ ID NO:H244至H258、SEQ ID NO:I68至I75、SEQ ID NO:J62至J64、SEQ ID NO:K61至K63、及SEQ ID NO:L20至L27。
實施例6M:如實施例1M至5M中任一者之載體,其中所述載體係AAV2載體。
實施例7M:如實施例1M至6M中任一者之載體,其中所述載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
實施例8N:如實施例7N之載體,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例9M:如實施例8M之載體,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例10M:如實施例7M之載體,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例11M:如實施例10M之載體,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例12M:一種AAV殼體多肽,其包含下列中任一者所闡述之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例13M:如實施例12M之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例14M:如實施例12M之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A18、SEQ ID NO:B2至B298、SEQ ID NO:C2至C43、SEQ ID NO:D2至D76、SEQ ID NO:E2至E75、SEQ ID NO:F2至F11、SEQ ID NO:G2至G70、SEQ ID NO:H2至H243、SEQ ID NO:I2至I67、SEQ ID NO:J2至J61、SEQ ID NO:K2至K60、及SEQ ID NO:L2至L19。
實施例15M:如實施例12M之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例16M:如實施例12M之多肽,其中所述多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者所闡述之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A19、SEQ ID NO:B299至B317、SEQ ID NO:C44至C45、SEQ ID NO:D77至D78、SEQ ID NO:E76至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G71至G77、SEQ ID NO:H244至H258、SEQ ID NO:I68至I75、SEQ ID NO:J62至J64、SEQ ID NO:K61至K63、及SEQ ID NO:L20至L27。
實施例17M:一種核酸分子,其編碼如實施例1M至11M中任一者之載體或實施例12M至16M中任一者之多肽。
實施例18M:如實施例17M之核酸分子,其中所述核酸分子係DNA。
實施例19M:一種宿主細胞,其包含如實施例17M至18M中任一者之核酸分子。
實施例20M:如實施例19M之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述載體。
實施例21M:如實施例20M之宿主細胞,其中所述宿主細胞表現所述多肽。
實施例22M:一種宿主細胞,其包含如實施例1M至11M中任一者之載體或實施例12M至16M中任一者之多肽。
實施例23M:如實施例19M至22M中任一者之宿主細胞,其中所述宿主細胞係視網膜細胞。
實施例24M:一種組成物,其包含如實施例1M至11M中任一者之載體。
實施例25M:如實施例24M之組成物,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例26M:如實施例24M至25M中任一者之組成物,其中所述組成物包含磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液、或Pluronic F68。
實施例27M:一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜細胞的方法,其中所述方法包含使所述視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及所述外源核酸序列之AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含下列中任一者之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞,從而將所述外源核酸序列遞送至所述視網膜細胞。
實施例28M:如實施例27M之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之所述胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例29M:如實施例27M之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之所述胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A18、SEQ ID NO:B2至B298、SEQ ID NO:C2至C43、SEQ ID NO:D2至D76、SEQ ID NO:E2至E75、SEQ ID NO:F2至F11、SEQ ID NO:G2至G70、SEQ ID NO:H2至H243、SEQ ID NO:I2至I67、SEQ ID NO:J2至J61、SEQ ID NO:K2至K60、及SEQ ID NO:L2至L19。
實施例30M:如實施例27M之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例31M:如實施例27M之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者所闡述之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A19、SEQ ID NO:B299至B317、SEQ ID NO:C44至C45、SEQ ID NO:D77至D78、SEQ ID NO:E76至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G71至G77、SEQ ID NO:H244至H258、SEQ ID NO:I68至I75、SEQ ID NO:J62至J64、SEQ ID NO:K61至K63、及SEQ ID NO:L20至L27。
實施例32M:如實施例27M至31M中任一者之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例33M:如實施例27M至32M中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例34M:如實施例27M至33M中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA或多肽。
實施例35M:如實施例34M之方法,其中所述外源核酸編碼RNA。
實施例36M:如實施例35M之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例37M:如實施例34M之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例38M:如實施例37M之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
實施例39M:如實施例27M至38M中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例40M:如實施例39M之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
實施例41M:一種用於治療視網膜病況之方法,其中所述方法包含使患有所述視網膜病況之哺乳動物的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中所述殼體多肽包含下列中任一者之胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27,其中所述AAV載體感染所述視網膜細胞並驅動所述外源核酸序列在所述視網膜細胞內之表現,從而治療所述視網膜病況。
實施例42M:如實施例41M之方法,其中所述哺乳動物係人類。
實施例43M:如實施例41M至42M中任一者之方法,其中所述視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
實施例44M:如實施例41M至43M中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之所述胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例45M:如實施例41M至43M中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了下列中任一者之所述胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間:SEQ ID NO:A2至A18、SEQ ID NO:B2至B298、SEQ ID NO:C2至C43、SEQ ID NO:D2至D76、SEQ ID NO:E2至E75、SEQ ID NO:F2至F11、SEQ ID NO:G2至G70、SEQ ID NO:H2至H243、SEQ ID NO:I2至I67、SEQ ID NO:J2至J61、SEQ ID NO:K2至K60、及SEQ ID NO:L2至L19。
實施例46M:如實施例41M至43M中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A2至A19、SEQ ID NO:B2至B317、SEQ ID NO:C2至C45、SEQ ID NO:D2至D78、SEQ ID NO:E2至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G2至G77、SEQ ID NO:H2至H258、SEQ ID NO:I2至I74、SEQ ID NO:J2至J64、SEQ ID NO:K2至K63、及SEQ ID NO:L2至L27。
實施例47M:如實施例41M至43M中任一者之方法,其中所述殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590經置換成下列中任一者所闡述之所述胺基酸序列:SEQ ID NO:A19、SEQ ID NO:B299至B317、SEQ ID NO:C44至C45、SEQ ID NO:D77至D78、SEQ ID NO:E76至E83、SEQ ID NO:F2至F10、SEQ ID NO:G71至G77、SEQ ID NO:H244至H258、SEQ ID NO:I68至I75、SEQ ID NO:J62至J64、SEQ ID NO:K61至K63、及SEQ ID NO:L20至L27。
實施例48M:如實施例41M至47M中任一者之方法,其中所述載體係AAV2載體。
實施例49M:如實施例41M至48M中任一者之方法,其中所述外源核酸序列編碼RNA。
實施例50M:如實施例49M之方法,其中所述RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
實施例51M:如實施例41M至50M中任一者之方法,其中所述外源核酸編碼多肽。
實施例52M:如實施例51M之方法,其中所述多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。
實施例53M:如實施例41M至52M中任一者之方法,其中所述方法包含向所述哺乳動物玻璃體內投予包含所述載體之組成物,從而使所述視網膜細胞與所述載體接觸。
實施例54M:如實施例53M之方法,其中所述組成物包含約1x10
7至約1x10
14個所述載體。
其他實施例
應理解,雖然本發明已結合其詳細描述來描述,但前述描述意欲說明而不限制本發明之範疇,本發明之範疇由隨附申請專利範圍之範疇定義。其他態樣、優點及修改在以下申請專利範圍之範疇內。
TW202400797A_112112174_SEQL.xml
Claims (90)
- 一種包含AAV殼體多肽之腺相關病毒(AAV)載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列。
- 如請求項1所述之載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
- 如請求項1所述之載體,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列置換。
- 如請求項1至3中任一項所述之載體,其中該載體係AAV2載體。
- 如請求項1至4中任一項所述之載體,其中該載體包含編碼RNA或多肽之外源核酸。
- 如請求項5所述之載體,其中該外源核酸編碼RNA。
- 如請求項6所述之載體,其中該RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
- 如請求項5所述之載體,其中該外源核酸編碼多肽。
- 如請求項8所述之載體,其中該多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
- 一種AAV殼體多肽,其包含SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列。
- 如請求項10所述之多肽,其中該多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
- 如請求項10所述之多肽,其中該多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列置換。
- 一種核酸分子,其編碼如請求項1至9中任一項之載體或如請求項10至12中任一項之多肽。
- 如請求項13所述之核酸分子,其中該核酸分子係DNA。
- 一種宿主細胞,其包含如請求項13至14中任一項之核酸分子。
- 如請求項15所述之宿主細胞,其中該宿主細胞表現該載體。
- 如請求項15所述之宿主細胞,其中該宿主細胞表現該多肽。
- 一種宿主細胞,其包含如請求項1至9中任一項之載體或如請求項10至12中任一項之多肽。
- 如請求項15至18中任一項所述之宿主細胞,其中該宿主細胞係視網膜細胞。
- 一種組成物,其包含如請求項1至9中任一項所述之載體及醫藥上可接受之賦形劑。
- 如請求項20所述之組成物,其中該組成物包含約1x10 7至約1x10 14個該載體。
- 如請求項20至21中任一項所述之組成物,其中該醫藥上可接受之賦形劑包含以下中之一或多者:磷酸鹽緩衝鹽水、漢克氏平衡鹽溶液(Hank’s Balanced Salt Solution)、及Pluronic F68。
- 一種用於遞送外源核酸序列至哺乳動物內之視網膜細胞的方法,其中該方法包含使該視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及該外源核酸序列之AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列,其中該AAV載體感染該視網膜細胞,從而將該外源核酸序列遞送至該視網膜細胞。
- 如請求項23所述之方法,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
- 如請求項23所述之方法,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列置換。
- 如請求項23至25中任一項所述之方法,其中該哺乳動物係人類。
- 如請求項23至26中任一項所述之方法,其中該載體係AAV2載體。
- 如請求項23至27中任一項所述之方法,其中該外源核酸序列編碼RNA或多肽。
- 如請求項28所述之方法,其中該外源核酸編碼RNA。
- 如請求項29所述之方法,其中該RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
- 如請求項28所述之方法,其中該外源核酸編碼多肽。
- 如請求項31所述之方法,其中該多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、或NR2E3多肽。
- 如請求項23至32中任一項所述之方法,其中該方法包含向該哺乳動物玻璃體內投予包含該載體之組成物,從而使該視網膜細胞與該載體接觸。
- 如請求項33所述之方法,其中該組成物包含約1x10 7至約1x10 14個該載體。
- 一種用於治療有需要之哺乳動物的視網膜病況之方法,其中該方法包含使患有該視網膜病況之哺乳動物的視網膜細胞與包含AAV殼體多肽及外源核酸序列的AAV載體接觸,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列,其中該等AAV載體感染該等視網膜細胞並驅動該外源核酸序列在該等視網膜細胞內之表現,從而治療該視網膜病況。
- 如請求項35所述之方法,其中該哺乳動物係人類。
- 如請求項35至36中任一項所述之方法,其中該視網膜病況係選自由下列所組成之群組:視錐失養症、視錐/視桿失養症、視網膜色素變性、黃斑部病變、全色盲、藍色視錐單色症、及色盲。
- 如請求項35至37中任一項所述之方法,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間。
- 如請求項35至37中任一項所述之方法,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,除了將SEQ ID NO:1之胺基酸位置585至590用該SEQ ID NO:2至1103中任一者之胺基酸序列置換。
- 如請求項35至39中任一項所述之方法,其中該等載體係AAV2載體。
- 如請求項35至40中任一項所述之方法,其中該外源核酸序列編碼RNA。
- 如請求項41所述之方法,其中該RNA係小分子干擾核糖核酸(siRNA)或微核糖核酸(microRNA)。
- 如請求項35至40中任一項所述之方法,其中該外源核酸編碼多肽。
- 如請求項43所述之方法,其中該多肽係ABCA4多肽、CRB1多肽、NPHP5多肽、及NR2E3多肽。
- 如請求項35至44中任一項所述之方法,其中該方法包含向該哺乳動物玻璃體內投予包含該等載體之組成物,從而使該等視網膜細胞與該等載體接觸。
- 如請求項45所述之方法,其中該組成物包含約1x10 7至約1x10 14個該等載體。
- 一種非天然存在之AAV殼體多肽,其中該殼體多肽包含SEQ ID NO:1之胺基酸序列,其包含位於SEQ ID NO:1之胺基酸位置587及588之間的式A的胺基酸序列插入物,其中該式A係: -L1-插入物-L2- (式A); 其中,該L1及該L2各獨立地係可選的具有一、二、或三個胺基酸之胺基酸連接子,且其中插入物表示表1A至1L之任何序列識別符之胺基酸序列,其不具有起始之LA及結束之A。
- 如請求項47所述之殼體多肽,其中該L1係一個胺基酸X1。
- 如請求項48所述之殼體多肽,其中該X1係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
- 如請求項48所述之殼體多肽,其中該X1係A。
- 如請求項47所述之殼體多肽,其中該L1係兩個胺基酸X2-X1。
- 如請求項51所述之殼體多肽,其中該X1係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
- 如請求項51所述之殼體多肽,其中該X1係A。
- 如請求項51至53中任一項所述之殼體多肽,其中該X2係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
- 如請求項54所述之殼體多肽,其中該X2係L。
- 如請求項51所述之殼體多肽,其中該X2-X1係LA。
- 如請求項47所述之殼體多肽,其中該L1係三個胺基酸X3-X2-X1。
- 如請求項57所述之殼體多肽,其中該X1係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
- 如請求項58所述之殼體多肽,其中該X1係A。
- 如請求項57至59中任一項所述之殼體多肽,其中該X2係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
- 如請求項60所述之殼體多肽,其中該X2係L。
- 如請求項57所述之殼體多肽,其中該X2-X1係LA。
- 如請求項57至62中任一項所述之殼體多肽,其中該X3係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
- 如請求項47所述之殼體多肽,其中該L1不存在。
- 如請求項47至64中任一項所述之殼體多肽,其中該L2係一個胺基酸Z1。
- 如請求項65所述之殼體多肽,其中該Z1係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
- 如請求項66所述之殼體多肽,其中該Z1係A。
- 如請求項47至64中任一項所述之殼體多肽,其中該L2係兩個胺基酸Z1-Z2。
- 如請求項68所述之殼體多肽,其中該Z1係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
- 如請求項69所述之殼體多肽,其中該Z1係A。
- 如請求項68至70中任一項所述之殼體多肽,其中該Z2係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
- 如請求項71所述之殼體多肽,其中該Z2係L。
- 如請求項68所述之殼體多肽,其中該Z1-Z2係AL。
- 如請求項47至64中任一項所述之殼體多肽,其中該L2係三個胺基酸Z1-Z2-Z3。
- 如請求項74所述之殼體多肽,其中該Z1係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
- 如請求項75所述之殼體多肽,其中該Z1係A。
- 如請求項74至76中任一項所述之殼體多肽,其中該Z2係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
- 如請求項77所述之殼體多肽,其中該Z2係L。
- 如請求項74所述之殼體多肽,其中該Z1-Z2係AL。
- 如請求項74至79中任一項所述之殼體多肽,其中該Z3係選自由A、V、I、及L所組成之胺基酸殘基的群組。
- 如請求項47至64中任一項所述之殼體多肽,其中該L2不存在。
- 如請求項47所述之殼體多肽,其中該胺基酸序列插入物包含表1A至1L之序列識別符之胺基酸序列中任一者,以LA起始並以A結束。
- 一種非天然存在之腺相關病毒(AAV)載體,其包含如請求項47至82中任一項所述之AAV殼體多肽。
- 一種病毒顆粒,其包含如請求項47至82中任一項所述之殼體多肽。
- 一種用於投予外源核酸序列至有需要之哺乳動物的方法,其中該方法包含向該哺乳動物投予有效量的如請求項83所述之載體,其中該載體包含該外源核酸序列。
- 如請求項85所述之方法,其中該哺乳動物係人類。
- 如請求項85至86中任一項所述之方法,其中該投予包含向該哺乳動物之眼睛投予該有效量。
- 如請求項85至87中任一項所述之方法,其中該投予足以允許在該哺乳動物之細胞中表現該外源核酸序列。
- 如請求項85至88中任一項所述之方法,其中該外源核酸序列編碼治療性多肽。
- 一種治療有需要之患者之視網膜病症的方法,其包含向該患者之眼睛投予有效量的AAV載體,其中該AAV載體包含AAV殼體多肽及外源核酸序列,其中該AAV殼體多肽由式A表示。
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