TH19231U - Primers and solutions for loop-mediated lsothermal amplification (LAMP) techniques for the detection of various fungal species. - Google Patents

Primers and solutions for loop-mediated lsothermal amplification (LAMP) techniques for the detection of various fungal species.

Info

Publication number
TH19231U
TH19231U TH2003001055U TH2003001055U TH19231U TH 19231 U TH19231 U TH 19231U TH 2003001055 U TH2003001055 U TH 2003001055U TH 2003001055 U TH2003001055 U TH 2003001055U TH 19231 U TH19231 U TH 19231U
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
primers
volume
concentration
lamp
loop
Prior art date
Application number
TH2003001055U
Other languages
Thai (th)
Other versions
TH19231A3 (en
TH19231Y (en
Inventor
ฉัตรสุวรรณ ดรธนิษฐา
จำเริญศักดิ์ชัย นางสาวธมลวรรณ
ดรป๋วย อุ่นใจ ผู้ช่วยศาสตราจารย์
ดรสุรางค์ ชาญกำแพงเดชา ผู้ช่วยศาสตราจารย์
ดรเทวัญ จันทร์วิไลศรี รองศาสตราจารย์
กาญจนบุษย์ ศาสตราจารย์เถลิงศักดิ์
Original Assignee
จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
Filing date
Publication date
Application filed by จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย filed Critical จุฬาลงกรณ์มหาวิทยาลัย
Publication of TH19231A3 publication Critical patent/TH19231A3/en
Publication of TH19231U publication Critical patent/TH19231U/en
Publication of TH19231Y publication Critical patent/TH19231Y/en

Links

Abstract

หน้า 1 ของจำนวน 1 หน้า บทสรุปการประดิษฐ์ การประดิษฐ์นี้เกี่ยวกับ ไพรเมอร์และสารละลายสำหรับกรรมวิธีการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอใน หลอดทดลองภายใต้สภาวะที่มีอุณหภูมิคงที่ (Loop-mediated Isothermal Amplification; LAMP) สำหรับการตรวจเชื้อราหลายชนิด ทุกสายพันธุ์ ได้อย่างรวดเร็วและไม่จำเป็นต้องใช้เครื่องมือจำเพาะ เนื่องจากเทคนิค การเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอในหลอดทดลองภายใต้สภาวะที่มีอุณหภูมิคงที่ (LAMP) สามารถเกิดปฏิกิริยาได้ที่อุณหภูมิเดียว โดยใช้ไพร์เมอร์ (LAMP) ซึ่งประกอบด้วยไพร์เมอร์ จำนวน 4 เส้น ได้แก่ ไพร์เมอร์ F3 ไพร์เมอร์ B3 ไพร์เมอร์ FIP และไพร์เมอร์ BIP จับจำเพาะบนตำแหน่ง 18s ไร โบโซมอลอาร์เอ็นเอยีนของเชื้อราได้หลายชนิด ซึ่งประกอบด้วย เอาท์เทอร์ไพรเมอร์ (18s-F3 และ 18s-B3) ความเข้มข้น 10 ไมโครโมลาร์ อย่างละ 0.5 ไมโครลิตร อินเนอร์ไพรเมอร์ (18s-FIP และ 18s- BIP) ความเข้มข้น 100 ไมโครโมลาร์ อย่างละ 0.4 ไมโครลิตร และสารอื่นๆที่ใช้ในการเกิดปฏิกิริยาPage 1 of 1. Summary of Invention. This invention concerns primers and solutions for loop-mediated isothermal amplification (LAMP) of DNA for rapid and instrument-free detection of various fungal species and strains. The LAMP amplification technique can be performed at a single temperature using a primer set consisting of four primers: F3, B3, FIP, and BIP. These primers specifically bind to the 18s ribosomal RNA gene of various fungal species. The invention includes 0.5 µL each of 10 µm² outer primers (18s-F3 and 18s-B3), 0.4 µL each of 100 µm² inner primers (18s-FIP and 18s-BIP), and other substances used in the reaction.

Claims (1)

หน้า 1 ของจำนวน 1 หน้า ข้อถือสิทธิ 1. ไพรเมอร์และสารละลายสำหรับกรรมวิธีการเพิ่มปริมาณดีเอ็นเอในหลอดทดลองภายใต้ สภาวะที่มีอุณหภูมิคงที่ (Loop-mediated Isothermal Amplification; LAMP) สำหรับการตรวจเชื้อ ราหลายชนิด ซึ่งประกอบด้วย ไพร์เมอร์ และสารที่ใช้ในการเกิดปฏิกิริยา ดังนี้ - เอาท์เทอร์ไพรเมอร์ (18s-F3 และ 18s-B3) ความเข้มข้น 10 ไมโครโมลาร์ อย่างละ 0.5 ไมโครลิตร ที่มีลำดับเบส ดังนี้ เอาท์เทอร์ไพรเมอร์ 18s-F3: 5’ GGCCAAGTCGATGGAAGTT 3’ เอาท์เทอร์ไพรเมอร์ 18s-B3: 5’ CAGGGACGTAATCAACGCA 3’ - อินเนอร์ไพรเมอร์ (18s-FIP และ 18s-BIP) ความเข้มข้น 100 ไมโครโมลาร์ อย่างละ 0.4 ไมโครลิตร ที่มีลำดับเบส ดังนี้ อินเนอร์ไพรเมอร์ 18s-FIP : 5’CGCTGGCTCCGTCAGTGTAGTTTTCAGGTCTGTGATGCCCTTAG 3’ อินเนอร์ไพรเมอร์ 18s-BIP : 5’AACTCCGTCGTGCTGGGGATTTTTAGCTGATGACTTGCGCTTAC 3’ - รีแอ๊คชั่นบัฟเฟอร์ ที่ความเข้มข้น 1 เท่า ปริมาตร 2.5 ไมโครลิตร - สารละลายเบสผสม (dNTPs) ประกอบด้วย สารดีออกซีอะดีโนซีน ไตรฟอสเฟส (dATP) สารดี ออกซีไทมิดีน ไตรฟอสเฟส (dTTP) สารดีออกซีกัวโนซีน ไตรฟอสเฟส (dGTP) และสารดีออกซีไซทิดีน ไตรฟอสเฟส (dCTP) อย่างละ 25 เปอร์เซ็นต์โดยปริมาตร ความเข้มข้น 1.6 มิลลิโมลาร์ ปริมาตร 1.5 ไมโครลิตร - สารละลายแมกนีเซียมซัลเฟต (MgSO4) ความเข้มข้น 3 มิลลิโมลาร์ ปริมาตร 0.75 ไมโครลิตร - สารละลายเบทาอีน ความเข้มข้น 5 โมลาร์ ปริมาตร 3 ไมโครลิตร - เอนไซม์บีเอสที ดีเอ็นเอพอลิเมอเรส (Bst DNA polymerase 8 unit) ปริมาตร 1 ไมโครลิตร และ - น้ำนาโนบริสุทธิ์ เพื่อปรับปริมาตรให้ได้ 12.45 ไมโครลิตรPage 1 of 1. Claims 1. Primers and solutions for in vitro DNA amplification under constant temperature conditions. Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) for the detection of various fungi, consisting of primers and reagents as follows: - Outer primers (18s-F3 and 18s-B3) at a concentration of 10 micromolar, 0.5 microliters each, with the following base sequences: Outer primer 18s-F3: 5’ GGCCAAGTCGATGGAAGTT 3’ Outer primer 18s-B3: 5’ CAGGGACGTAATCAACGCA 3’ - Inner primers (18s-FIP and 18s-BIP) at a concentration of 100 micromolar, 0.4 microliters each, with the following base sequences: Inner primer 18s-FIP: 5’CGCTGGCTCCGTCAGTGTAGTTTTCAGGTCTGTGATGCCCTTAG 3’ Inner primer 18s-BIP: 5’AACTCCGTCGTGCTGGGGATTTTTAGCTGATGACTTGCGCTTAC 3’ - Reaction buffer at concentration 1x, volume 2.5 µL - Mixed base solution (dNTPs) consisting of 25% by volume each of deoxyadenosine triphosphate (dATP), deoxythymidine triphosphate (dTTP), deoxyguanosine triphosphate (dGTP), and deoxycytidine triphosphate (dCTP), concentration 1.6 mmol, volume 1.5 µL - Magnesium sulfate solution (MgSO4), concentration 3 mmol, volume 0.75 µL - Betaine solution, concentration 5 molar, volume 3 µL - BST DNA polymerase enzyme (8 units), volume 1 µL and - Pure nanowater. To adjust the volume to 12.45 microliters.
TH2003001055U 2020-05-20 Primers and solutions for loop-mediated lsothermal amplification (LAMP) techniques for the detection of various fungal species. TH19231Y (en)

Publications (3)

Publication Number Publication Date
TH19231A3 TH19231A3 (en) 2022-02-04
TH19231U true TH19231U (en) 2022-02-04
TH19231Y TH19231Y (en) 2022-02-04

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Shirshikov et al. Loop-mediated isothermal amplification: from theory to practice
US9631231B2 (en) Compositions and methods for amplifying a nucleic acid sequence comprising a primer oligonucleotide with a 3′-terminal region comprising a 2′-modified nucleotide
US10544452B2 (en) Method and use of nucleic acid isothermal amplification via a polymerase spiral reaction
JP5680078B2 (en) Nucleic acid normalized quantification method based on ligation
JP5680080B2 (en) Nucleic acid normalized quantification method using anchor oligonucleotide and adapter oligonucleotide
WO2005089508A3 (en) Dna sequence detection by limited primer extension
WO2013177429A4 (en) Extreme pcr
WO2014004852A3 (en) Kit for isothermal dna amplification starting from an rna template
MX2009007280A (en) Stable reagents and kits useful in loop-mediated isothermal amplification (lamp).
RU2007118546A (en) REAGENT AND METHOD OF PREVENTING AT LEAST ONE ERROR START IN AMPLIFICATION OF POLYMERASE CHAIN REACTION, REAGENT KITS AND OLIGONUCLEOTIDES FOR CARRYING OUT AMPLIFICATION BY MEANS THROUGH
JP2014502496A5 (en)
WO2015148218A3 (en) Isothermal amplification under low salt condition
RU2018144299A (en) RING DNA AMPLIFICATION METHOD
WO2003027258A3 (en) RECOMBINANT DNA PROCESSES USING A dNTP MIXTURE CONTAINING MODIFIED NUCLEOTIDES
JP5200302B2 (en) Identification of RNA targets using helicases
EP2058406A3 (en) RNA detection method
TH19231Y (en) Primers and solutions for loop-mediated lsothermal amplification (LAMP) techniques for the detection of various fungal species.
CA2495051A1 (en) Improved compositions for in vitro amplification of nucleic acids
US20220169622A1 (en) Amplification of nucleic acids
WO2005073409A3 (en) Methods, compositions, and kits for amplifying and sequencing polynucleotides
US20140329702A1 (en) Method of amplifying a nucleic acid
PL446241A1 (en) Method of detecting changes in the nucleotide sequence using the isothermal nucleic acid amplification technique, a set of primers and the composition of the reaction mixture for detecting selected genetic variants
EP4053293A1 (en) Protected isothermal nucleic acid amplification (pina) methods for point-of-need diagnosis of emerging infectious diseases
TH19231A3 (en) Primers and solutions for the Loop-mediatedlsothermal Amplification (LAMP) technique for in vitro DNA enrichment techniques for assays on a variety of fungi.
TH14895U (en) Primers for detecting the fungus Malassezia slooffiae.