TH14170C3 - Vector with a gene transporting protein outside the cell, Lactobacillus casei. - Google Patents

Vector with a gene transporting protein outside the cell, Lactobacillus casei.

Info

Publication number
TH14170C3
TH14170C3 TH1703000699U TH1703000699U TH14170C3 TH 14170 C3 TH14170 C3 TH 14170C3 TH 1703000699 U TH1703000699 U TH 1703000699U TH 1703000699 U TH1703000699 U TH 1703000699U TH 14170 C3 TH14170 C3 TH 14170C3
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
gene
vector
specific
nucleotide
enzyme
Prior art date
Application number
TH1703000699U
Other languages
Thai (th)
Other versions
TH14170Y (en
TH14170U (en
TH14170A3 (en
Inventor
เทียมสกุล นางสาวศิรินทรา
ปัญญา นายมารุตพงศ์
นามวาท นายวิเศษ
ลุลิตานนท์ รองศาสตราจารย์วีระพงศ์
Original Assignee
นางสาวจิราภรณ์ เหลืองไพรินทร์
Filing date
Publication date
Application filed by นางสาวจิราภรณ์ เหลืองไพรินทร์ filed Critical นางสาวจิราภรณ์ เหลืองไพรินทร์
Publication of TH14170C3 publication Critical patent/TH14170C3/en
Publication of TH14170Y publication Critical patent/TH14170Y/en
Publication of TH14170U publication Critical patent/TH14170U/en
Publication of TH14170A3 publication Critical patent/TH14170A3/en

Links

Abstract

เวกเตอร์ที่มียีนนำส่งโปรตีนออกนอกเซลล์ของเชื้อแลคโตบาซิลลัส คาเซอิ (Lactobacillus casei) มีลักษณะเป็นวงแหวนดีเอ็นเอขนาด 6,224 คู่เบส ซึ่งมีส่วนประกอบคือ ยีนในการสร้างโปรตีนออก นอกเซลล์ ได้แก่ ยีนโปรโมเตอร์ (promoter), ยีนเปปไทน์ส่งสัญญาณ (signal peptide) และยีนกรีนฟลูออเรส เซนต์ (green fluorescent protein ,GFPuv), ยีนต้านยาแอมพลิซิลิน (Ampicillin, APR) และยีนต้านยาอิริโทมัย ซิน (Erythromycin, EryR), ยีนของโปรตีนเรพลิเคชั่นเอวัน(replication A1, RepA1), จุดเริ่มต้นของการเพิ่ม จำนวน(origin of replication, Ori) และตำแหน่งมัลติเปิลโคลนนิ่งไซท์ (Multiple cloning site) ที่จำเพาะต่อ เอ็นไซม์ 14 ชนิด ได้แก่ AatII, NotI, SacII, EcoRI, HindIII, KptiI, AgeI, NdeI, XhoI, BamHI, SaII, SpeI, PstI และXbaI ซึ่งเวกเตอร์ดังกล่าวสามารถสร้างโปรตีนเป้าหมายที่ต้องการศึกษาให้หลั่งออกมาภายนอกเซลล์ ของเชื้อแลคโตบาซิลลัสคาเซอิ (Lactobacillus casei)The vector containing the gene for delivering an extracellular protein from the bacterium Lactobacillus casei is a 6,224 base pair DNA ring, composed of the following components: Genes involved in extracellular protein synthesis include promoter genes, signal peptide genes, and green fluorescent protein (GFPuv) genes, ampicillin (APR) and erythromycin (EryR) resistance genes, the replication A1 (RepA1) protein gene, the origin of replication (Ori), and 14 enzyme-specific multiple cloning sites: AatII, NotI, SacII, EcoRI, HindIII, KptiI, AgeI, NdeI, XhoI, BamHI, SaII, SpeI, PstI, and XbaI. These vectors can synthesize the target proteins for extracellular secretion in Lactobacillus casei.

Claims (3)

ข้อถือสิทธฺ์ (ทั้งหมด) ซึ่งจะไม่ปรากฏบนหน้าประกาศโฆษณา :All claims which will not appear on the advertisement page: 1. เวกเตอร์ที่มียีนนำส่งโปรตีนออกนอกเซลล์ของเชื้อแลคโตบาซิลลัส คาเซอิ (Lactobacillus casei) มีลักษณะเป็นวงแหวนดีเอ็นเอ ซึ่งมีส่วนประกอบดังนี้ ก. ยีนในการสร้างโปรตีนออกนอกเซลล์ ประกอบด้วย โปรโมเตอร์ (promotor) เป็นยีนแลคเตดดีไฮโดรจีเนส (Lactate dehydrogenase promoter, LdhProl) ของเชื้อแลกโตบาซิลลัส คาเซอิ (Lactobacillus casei) โดยอยู่ในตำแหน่งของลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ 4858 - 5102 ของเวกเตอร์ ซึ่งเป็นตำแหน่งให้เอนไซม์อาร์เอนเอโพลีเมอเรส (RNS polymerase) จับ และเคลื่อนที่ ไปยังยีนโครงสร้างเพื่อสังเคราะห์อาร์เอนเอ (RNA) ยีนเปปไทน์ส่งสัญญาณ (signal peptide) เป็นยีนเซลล์วอลแอสโซชิเอเทดไฮโดรเลส (Cell wall- associated hydrolase, Cwh) ที่ทำหน้าที่ในการนำส่งโปรตีนเป้าหมายข้ามเยื่อหุ้มเซลล์และนำออกภายนอก เซลล์เชื้อแลกโตบาซิลลัส คาเซอิ (Lactobacillus casei) โดยอยู่ในตำแหน่งของลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ 5103 - 5238 ของเวกเตอร์ ยีนกรีนฟลูออเรสเซนต์ (green fluorescent protein,GFPuv ) เป็นยีนที่ใช้สร้างโปรตีนกรีนฟลูออ เรสเซนต์ซึ่งเป็นโปรตีนติดตามโปรตีนเป้าหมาย (โปรตีนที่ต้องการศึกษา) โดยอยู่ในตำแหน่งของลำดับนิ วคลีโอไทด์ที่ 5239 -5946 ของเวกเตอร์ ข. ยีนต้านยาอิริโทมัยซิน (Erythromycin, EryR), อยู่ในตำแหน่งของลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ 97- 828 ของเวกเตอร์ สำหรับใช้ในการคัดเลือกในเชื้อแลคโตบาซิลลัส คาเซอิ (Lactobacillus casei) ค. ยีนเรพพริเคชั่นเอวัน (replication A1, RepA1) มีตำแหน่งนิวคลีโอไทด์อยู่ที่ 1377-2225 ของ เวกเตอร์ ซึ่งเป็นส่วนยีนสร้างโปรตีนเรพพริเคชั่นเอวัน (replication A1) ที่ช่วยในการเพิ่มจำนวน ของเวกเตอร์ในเชื้อแลคโตบาซิลลัส คาเซอิ (Lactobacillus casei) ง. ส่วนจุดเริ่มต้นการเพิ่มจำนวนในเชื้อแลคโตบาซิลลัส คาเซอิ (ori) มีตำแหน่งนิวคลีโอไทด์อยู่ที่ 2365-2468 ของเวกเตอร์ ซึ่งเป็นตำแหน่งที่ทำให้เวกเตอร์สามารถเพิ่มจำนวนได้ในเชื้อแลคโต บาซิลลัส คาเซอิ (Lactobacillus casei) จ. ส่วนจุดเริ่มต้นการเพิ่มจำนวนในเชื้อ เอสเชอริเชีย โคไล (E.coli ori) มีจุดเริ่มต้นที่ตำแหน่งนิวคลี โอไทด์ที่ 3972 ซึ่งเป็นตำแหน่งที่ทำให้เวกเตอร์สามารถเพิ่มจำนวนได้ในเชื้อเอสเชอริเชีย โคไล ฉ. ยีนต้านยาแอมพิซิลิน (Ampicillin, APR) อยู่ในตำแหน่งของลำดับนิวคลีโอไทด์ที่ 4691-3834 ของเวกเตอร์ สำหรับใช้ในการคัดเลือกในเชื้อเอสเชอริเชีย โคไล (Escherichia coli) ช. ตำแหน่งมัลติเปิลโคลนนิ่งไซท์ (multiple cloning site) เป็นตำแหน่งที่มีลำดับยีนบนเวกเตอร์ ที่ สามารถตัดด้วยเอนไซม์ตัดจำเพาะ (restriction enzyme site) เพื่อใช้เป็นบริเวณสำหรับแทรกยีนที่ สนใจเข้าตรงตำแหน่งตัดจำเพาะ โดยที่เวกตอร์นี้มีตำแหน่งมัลติเปิลโคลนนิ่งไซท์ (multiple cloning site) ที่จำเพาะต่อเอนไซม์ 14 ชนิด ดังนี้ - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ AatII มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทด์ลำดับที่ 4822 - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ NotI มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทดลำดับที่ 4848 และ5991 - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ SacII มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทด์ลำตับที่ 4852 - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ EcoRI มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทด์ลำดับที่ 4858, 5973, 6224 และ2185 - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ HindIII มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทด์ลำดับที่5104, 1030 และ 2652 - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ KpnI มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทด์ลำดับที่ 5239,12 - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ AgeI มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทด์ลำดับที่ 5242 - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ NdeI มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทค์ลำดับที่ 5483 และ 6011 - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ XhoI มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทด์ลำดับที่ 5675 - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ BamHI มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทด์ลำดับที่ 5774, 1000 - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ SalI มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทด์ลำดับที่ 5857, 6005,24, 987 และ1012 - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ SpeI มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทด์ลำดับที่ 5979 - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ PstI มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทด์ลำดับที่ 5999 และ 1018 - ตำแหน่งจำเพาะต่อเอนไซม์ XbaI มีตำแหน่งอยู่ที่นิวคลีโอไทด์ลำดับที่ 10061. The vector containing genes for extracellular protein delivery from Lactobacillus casei is a DNA ring with the following components: a. Genes for extracellular protein synthesis, consisting of: a promoter, which is the lactate dehydrogenase promoter (LdhProl) gene of Lactobacillus casei, located at nucleotide sequence 4858-5102 of the vector. This site is where the RNA polymerase enzyme binds and moves to the structural gene to synthesize RNA. a signal peptide gene, which is a cell wall-associated hydrolase (Cwh) gene responsible for delivering target proteins across the cell membrane and out of the cell. The vector contains the following genes: a. The green fluorescent protein (GFPuv) gene, located at nucleotide sequences 5103-5238 of the vector, which synthesizes the green fluorescent protein (GFPuv) used to track the target protein (protein of interest). b. The erythromycin resistance gene (EryR), located at nucleotide sequences 97-828 of the vector, is used for selection in Lactobacillus casei. c. The replication A1 gene (RepA1), located at nucleotide sequences 1377-2225 of the vector, is a gene segment that synthesizes the replication A1 protein, which aids in protein replication. D. The starting point for replication in Lactobacillus casei (ORI) is at nucleotide position 2365-2468 of the vector, which is the position that allows the vector to replication in Lactobacillus casei. E. The starting point for replication in E. coli (ORI) is at nucleotide position 3972, which is the position that allows the vector to replication in E. coli. F. The ampicillin (APR) resistance gene is located at nucleotide position 4691-3834 of the vector, which is used for selection in Escherichia coli. G. A multiple cloning site is a location on the vector where a gene sequence can be cut by a restriction enzyme (restriction enzyme site). This area is used for inserting the gene of interest at a specific cut site. This vector has multiple cloning sites specific to 14 enzymes as follows: - Specific site for AatII enzyme is at nucleotide position 4822. - Specific sites for NotI enzyme are at nucleotide positions 4848 and 5991. - Specific site for SacII enzyme is at nucleotide position 4852. - Specific sites for EcoRI enzyme are at nucleotide positions 4858, 5973, 6224, and 2185. - Specific sites for HindIII enzyme are at nucleotide positions 5104, 1030, and 2652. - Specific sites for KpnI enzyme are at nucleotide positions 5239,12. - Specific site for AgeI enzyme is at nucleotide position 5242. - Specific site for NdeI enzyme is at nucleotide position... 5483 and 6011 - XhoI-specific loci are located at nucleotide position 5675. BamHI-specific loci are located at nucleotide position 5774, 1000. SalI-specific loci are located at nucleotide positions 5857, 6005, 24, 987, and 1012. SpeI-specific loci are located at nucleotide position 5979. PstI-specific loci are located at nucleotide positions 5999 and 1018. XbaI-specific loci are located at nucleotide position 1006. 2. เวกเตอร์ที่มียีนนำส่งโปรตีนออกนอกเซลล์ของเชื้อแลคโตบาซิลลัส คาเซอิ (Lactobacillus casei) ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่งมีขนาด 6,224 คู่เบส2. A vector containing a gene for the extracellular protein delivery of Lactobacillus casei, as per claim 1, with a size of 6,224 base pairs. 3. เวกเตอร์ที่มียีนนำส่งโปรตีนออกนอกเซลล์ ของเชื้อแลคโตบาซิลลัส คาเซอิ (Lactobacillus casei) ตามข้อถือสิทธิที่ 1 หรือ 2 ที่ซึ่งสามารถแทรกยีนหรือชิ้นดีเอ็นเอ (DNA) ช่วงขนาดตั้งแต่ 100 ถึง 1888 คู่เบส3. A vector containing a gene for the delivery of an extracellular protein of Lactobacillus casei, as per claim 1 or 2, which can accommodate a gene or DNA fragment ranging in size from 100 to 1888 base pairs.
TH1703000699U 2016-08-04 Vector with a gene transporting protein outside the cell, Lactobacillus casei. TH14170A3 (en)

Publications (4)

Publication Number Publication Date
TH14170C3 true TH14170C3 (en) 2018-07-17
TH14170Y TH14170Y (en) 2018-07-17
TH14170U TH14170U (en) 2018-07-17
TH14170A3 TH14170A3 (en) 2018-07-17

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US12168765B2 (en) S. pyogenes CAS9 mutant genes and polypeptides encoded by same
US11913014B2 (en) S. pyogenes Cas9 mutant genes and polypeptides encoded by same
Liu et al. Expression of recombinant protein using Corynebacterium glutamicum: progress, challenges and applications
Huang et al. Highly efficient single base editing in Aspergillus niger with CRISPR/Cas9 cytidine deaminase fusion
Baharoglu et al. Connecting environment and genome plasticity in the characterization of transformation-induced SOS regulation and carbon catabolite control of the Vibrio cholerae integron integrase
Barnard et al. High level recombinant protein expression in Ralstonia eutropha using T7 RNA polymerase based amplification
Zheng et al. Functional analysis of the sporulation-specific diadenylate cyclase CdaS in Bacillus thuringiensis
KR20170087522A (en) Fungal genome modification systems and methods of use
CN107142272A (en) A kind of method for controlling plasmid replication in Escherichia coli
US20200123496A1 (en) Methods for generating a bacterial hemoglobin library and uses thereof
KR102345898B1 (en) Methods for generating glucose permeabilization enzyme libraries and uses thereof
Wong et al. Genetic tools for streamlined and accelerated pathway engineering in Yarrowia lipolytica
Gao et al. Over‐expression, secretion, biochemical characterisation, and structure analysis of Bacillus subtilis aminopeptidase
JP2022514603A (en) Induced expression of genes in algae
Shimada et al. Novel regulator P gr R for switch control of peptidoglycan recycling in E scherichia coli
Pozsgai et al. Modified mariner transposons for random inducible-expression insertions and transcriptional reporter fusion insertions in Bacillus subtilis
Kilstrup et al. Activation control of pur gene expression in Lactococcus lactis: proposal for a consensus activator binding sequence based on deletion analysis and site-directed mutagenesis of purC and purD promoter regions
Jagtap et al. Bacillus subtilis Hfq: a role in chemotaxis and motility
KR101659732B1 (en) Protein Expression System Induced by Heavy Metals And Biosensor for Detecting Heavy Metals
US20230119263A1 (en) Pseudomonas mutant strains with enhanced xylose and galactose utilization
JP5297656B2 (en) Novel Bacillus subtilis mutant and protein production method
TH14170A3 (en) Vector with a gene transporting protein outside the cell, Lactobacillus casei.
EP3054004B1 (en) Aspergillus mutant strain and transformant thereof
Jørgensen et al. CTP limitation increases expression of CTP synthase in Lactococcus lactis
Hockett et al. Involvement of rppH in thermoregulation in Pseudomonas syringae