SU730691A1 - Method of preparing dinucleotides - Google Patents
Method of preparing dinucleotides Download PDFInfo
- Publication number
- SU730691A1 SU730691A1 SU772509187A SU2509187A SU730691A1 SU 730691 A1 SU730691 A1 SU 730691A1 SU 772509187 A SU772509187 A SU 772509187A SU 2509187 A SU2509187 A SU 2509187A SU 730691 A1 SU730691 A1 SU 730691A1
- Authority
- SU
- USSR - Soviet Union
- Prior art keywords
- reaction mixture
- mol
- fractions
- mixture
- nucleotide
- Prior art date
Links
Description
Изобретение относитс к усовершенствованному методу получени динуклеотидов , которые используютс дл синтеза фрагментов нуклеиновых кислот, необходимых дл исследований в молекул рной биологии, биохимии, и генной инженерии. Известен способ получени динуклеотидов , включающий цианэтил1фование (получение моноцианэтильного производного ) нуклеотида избытком (18-60 крат ным) цианэтанола и присутствии конденсирующего агента - дициклогексилкарбо- диимида (ДЦК); цианэтильное производное выдел ют из реакционной смеси экстракцией ДЦК циклогексаном и осаждением производного из раствора серным эфиром при -10 С, с последующей конден сацией полученного цианэтильного производного нуклеотида с нуклеотидным компонентом в присутствии конденсирующего агента трииаопропилбензолсульфонилхлорида (ТПС), Выход целевого продул, 41% l. Недостатком известного способа вл етс применение на стадии образовани циаиэтильных производных конденсирующего агента ДЦК, обладающего рко выраженными аллергенными свойствами (Ъсобенно опасны его пары и эфирные растворы), и повыщенна взрыво- и пожаро-опасность процесса вследствие применени болыдих количеств огнеопасных растворителей (серный эфир и цшшогексан дл удалени ДЦК). Цель изобретени - упрощение процесПоставленна цель достигаетс тем, что в способе получени динуклеотидов примен ют 2-3 кратный избыток цианэтанола , а в качестве конденсирующего агента стадии цианэтнлировани -триизопропил- бензолсульфонилхлорида, что позвол ет избежать применени ДДК, обладающего аллергенными свойствами и уменьщить пожароопасность процесса при выделении цианэтильного производного в результате замены экстракции циклогексаном (ДЦК) и осаждени в серном эфире обычной хроматографией, например на силикагеле в. системе хлороформ-метанол.This invention relates to an improved method for the production of dinucleotides that are used to synthesize nucleic acid fragments necessary for research in molecular biology, biochemistry, and genetic engineering. A known method for the preparation of dinucleotides, including cyanoethyl (preparation of a monocyanethyl derivative) nucleotide with an excess (18-60 times) of cyanoethanol and the presence of a condensing agent, dicyclohexylcarbodiimide (DCC); The cyanoethyl derivative was isolated from the reaction mixture by extracting DCC with cyclohexane and precipitating the derivative from the solution with sulfuric ether at -10 ° C, followed by condensing the obtained cyanoethyl derivative of the nucleotide with the nucleotide component in the presence of a condensing agent, triiopropylbenzenesulfonyl chloride (TPN). A disadvantage of the known method is the use of the condensating agent DCC, which has pronounced allergenic properties (its pairs and ether solutions are especially dangerous), and the explosion and fire hazard of the process due to the use of large amounts of flammable solvents (sulfur ether and cshsehexane). to remove DCC). The purpose of the invention is to simplify the process. The aim of the invention is achieved by using a 2-3 fold excess of cyano ethanol in the method for producing dinucleotides, and triisopropylbenzenesulfonyl chloride is avoided as a condensing agent of the cyanoethnlyation stage, which avoids the use of the process. isolating the cyanoethyl derivative as a result of replacing the extraction with cyclohexane (DCC) and precipitating the ether with conventional chromatography, for example on silica gel c. chloroform-methanol system.
Кроме того, в качестве фенил (низший ) алкилпроизводных примен ют триизопропилбенаолсульфонилхлорид или мезитилбнсульфонилтриазолид (МСТ).In addition, triisopropylbenenesulfonyl chloride or mesitylbonsulfonyl triazolide (MCT) are used as phenyl (lower) alkyl derivatives.
Выход целевого продукта 32-4О%,The yield of the target product 32-4O%
Пример. 1. Синтез 5 -фосфорилдезокситимидилил-{3 -5 ) дезокситими- дина 61 (рТ-Т) с использованием дициаи- этилового эфира (дСЕ рТ), полученного с помощью ТПС.Example. 1. Synthesis of 5-phosphoryl deoxythymidilyl- {3 -5) deoxythymidine 61 (pT-T) using dithium ethyl ester (dCE pT) obtained using TPS.
а) Цианэтилированиес рТ.a) Cyanethylation of pT.
Смесь 1,37 г (4 ммоль) дезокситимидин-5 фосфата (5рТ), 0,68 мл цианэтинола (СЕОН) высушивают упариванием с абсолют1й|1М пиридином.A mixture of 1.37 g (4 mmol) of deoxythymidine-5 phosphate (5pT), 0.68 ml of cyanethinol (CEON) is dried by evaporation with absolute | 1M pyridine.
Остаток после упаривани раствор ют в 16 мл пиридина, добавл ют в раствор 3,64 г (12 ммоль) ТПС и встр хивают реакционную смесь 2О ч при комнатной температуре в услови х, исключающих попадание влаги. При охлаждении до О С к смеси прибавл ют 16 млпредварнтель но охлажденной воды, вьодерживают 3 ч при . Реакционную смесь концентрируют в вакууме до минимального объема и упаривают трижды с ЗО мл воды. Добавл ют 45 мл воды и отфильтровывают осадок. Фильтрат упаривают досуха, высушивают упариванием с бензолом. Остаток после упаривани раствор т в 40 м смеси хлороформ-метанол (9:lV/v) и нанос т на колонку с 2ОО мл силикагел (о,140-0,315 мм). Хроматографируют сначала в линейном градиенте метанола в хлороформе (4ОО мл СНС& -4ООмл смеси CHCfc - , 8:2 V/v), затем 400 мл смеси (СНСед - , l:lV/v собира фракции по 8 мл/10 мин. Фракции 70-90 (32000 O.Egg-) упаривают, получают маслообразный остаток, содержщий 2,7 ммол СЦгрТ (67,5% в расчет найрТ).The residue after evaporation is dissolved in 16 ml of pyridine, 3.64 g (12 mmol) of TPS is added to the solution and the reaction mixture is shaken for 2 hours at room temperature under conditions that exclude the ingress of moisture. While cooling to 0 ° C, 16 ml of preferred but cooled water was added to the mixture, and kept for 3 hours at. The reaction mixture is concentrated in vacuo to a minimum volume and evaporated three times with 30 ml of water. 45 ml of water are added and the precipitate is filtered off. The filtrate is evaporated to dryness, dried by evaporation with benzene. The residue after evaporation is dissolved in 40 m chloroform-methanol mixture (9: 1V / v) and applied to the column with 2OO ml of silica gel (o, 140-0.315 mm). Chromatograph first in a linear gradient of methanol in chloroform (4OO ml CHC & 4OOm CHCfc -, 8: 2 V / v), then 400 ml of the mixture (CHSED -, l: lV / v collecting fractions of 8 ml / 10 min. Fractions 70-90 (32,000 O.Egg-) are evaporated to give an oily residue containing 2.7 mmol of SCrT (67.5% in the calculation of tar).
б) Конденсаци нуклеозидного компонента (QCEgpT) с нуклеотидным компонентом (9рТ -ОАс).b) Condensation of the nucleoside component (QCEgpT) with the nucleotide component (9pT-OAc).
1,9 г (4,2 моль) 3-О-ацетилтимидин-5-фосфата (ЙрТ-ОАс) высушивают упариванием с абсолютным пиридином. Остаток раствор ют в 10 мл пиридина, добавл ют в раствор 4 г (13,2 моль) ТПС и выдерживают реакционную смесь1.9 g (4.2 mol) of 3-O-acetylthymidine-5-phosphate (YRT-OAc) are dried by evaporation with absolute pyridine. The residue is dissolved in 10 ml of pyridine, 4 g (13.2 mol) TPS is added to the solution and the reaction mixture is maintained.
1-3 ч при комнатной температуре в услови х , исключающих попадание влаги. К полученному активному производному нуклеотидного компонента приливают раствор 2,7 мольЗСЕ рТ в 6 мл пир1щина и вьздерживают смесь 6 ч при комнатной температуре При охлаждении до к реакционной смеси прибавл ют предварительно охлажденные 20 мл воды и в ыдерживают 12 ч при . Охлаждают реакционную смесь до , приливают 48 мл охлажденного до О°С раствора 2 н. N&OH и выдерживают 45 мин при . Нейтрализуют реакционную смесь ЗОО мл1-3 hours at room temperature under conditions that prevent ingress of moisture. To the obtained active derivative of the nucleotide component, a solution of 2.7 molceCE RT in 6 ml of Pyrina is added and the mixture is held at room temperature for 6 hours. While cooled, 20 ml of water are added to the reaction mixture and kept at room temperature for 12 hours. Cool the reaction mixture until 48 ml of 2N solution cooled to O ° C are added. N & OH and incubated for 45 min at. Neutralize the reaction mixture ZOO ml
смолы КРС-2П (f Н)до рН 8, перенос т массу в колонку со 100 мл смолы КРС - 2П (Р,. ) и промывают колонку 1,5 л 30%-ного раствора пиридина в воде. Элюат упаривают досуха, раствор ютKRS-2P (fN) resin to pH 8, transfer the mass to the column with 100 ml of KRS-2P resin (P ,.) and wash the column with 1.5 l of a 30% pyridine solution in water. The eluate is evaporated to dryness, dissolved
в 5ОО мл раствора триэтйламмонийбикарбоната (ТЭАБ) и нанос т на колонку с 2ОО мл ионообменной смолы ДЭАЭмолселект А-25 (НСО 2,6:34 см). Хроматографируют в линейном градиентеin 5OO ml of a solution of triethylammonium bicarbonate (TEAB) and applied to a column with 2OO ml of ion-exchange resin DEAEmolselect A-25 (HCO 2.6: 34 cm). Chromatograph in a linear gradient
ТЭАБ (3 л 0,05 М - 3 л 0,35 М), собира фракции по 2О мл/2О мин. Из фракций 276-350 выдел ют 26OOOO.E.g динуклеотида 9(рТ-Т). Выход 32% (в расчете надрТ). Р{ (рТ-Т) относительноTEAB (3 l 0.05 M - 3 l 0.35 M), collecting fractions of 2O ml / 2O min. 26OOOO.E.g of dinucleotide 9 (pT-T) was isolated from fractions 276-350. Yield 32% (calculated TdT). Р {(рТ-Т) relatively
дрТ в системе EtOH (3:7) 0,9; В250/ 250 0,66; ,,72; E2gQ/E. ,26. Содержание нуклеотидного материала в полученном продукте 94,3%, содержание динуклеотида по данным микроколоночной ионообменной хроматографии 97%.drT in the EtOH system (3: 7) 0.9; B250 / 250 0.66; ,, 72; E2gQ / E. 26. The content of nucleotide material in the resulting product is 94.3%, the content of dinucleotide according to microcolumn ion exchange chromatography is 97%.
П р и м а р 2. Синтез 5 -фосфорил- N -анизоилдезоксицитидилил-(3 -5 )-Н-изобутирилдезоксигуанозин 5 (рС G )| с использованием моноцианэтилового эфира (ЗСЕрС ), полученного с помощью ТПС.Example 2. Synthesis of 5-phosphoryl-N-anisoyldeoxycytidilyl- (3 -5) -H-isobutyryl-deoxyguanosine 5 (pC G) | using monocyanethyl ether (SSRC) obtained by TPN.
а) Цианэтилирование 9рС .a) Cyanethyl 9pc.
Claims (1)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
SU772509187A SU730691A1 (en) | 1977-07-13 | 1977-07-13 | Method of preparing dinucleotides |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
SU772509187A SU730691A1 (en) | 1977-07-13 | 1977-07-13 | Method of preparing dinucleotides |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
SU730691A1 true SU730691A1 (en) | 1980-04-30 |
Family
ID=20718657
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SU772509187A SU730691A1 (en) | 1977-07-13 | 1977-07-13 | Method of preparing dinucleotides |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
SU (1) | SU730691A1 (en) |
-
1977
- 1977-07-13 SU SU772509187A patent/SU730691A1/en active
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Wagner et al. | Preparation and synthetic utility of some organotin derivatives of nucleosides | |
Narang et al. | [61] Chemical synthesis of deoxyoligonucleotides by the modified triester method | |
Ralph et al. | Studies on Polynucleotides. XI. 1 Chemical Polymerization of Mononucleotides. The Synthesis and Characterization of Deoxyadenosine Polynucleotides2 | |
CA1314876C (en) | Azithromycin dihydrate | |
De Garilhe et al. | Studies of the phosphodiesterase from rattlesnake venom | |
Van Boom et al. | The application of levulinic acid as protective group to the synthesis of tetradecaribonucleotide U‐A‐U‐A‐U‐A‐U‐A‐U‐A‐U‐A‐U‐A via the modified phosphotriester method | |
EP2599784A1 (en) | Nucleotide and/or oligonucleotide and preparation process thereof | |
Holý et al. | Synthesis of isomeric and enantiomeric O-phosphonylmethyl derivatives of 9-(2, 3-dihydroxypropyl) adenine | |
Posternak et al. | [54] The preparation of acylated derivatives of cyclic nucleotides | |
JP2801564B2 (en) | Phosphoramidites for polynucleotide synthesis | |
Maryanoff et al. | Stereoselective synthesis and biological activity of. beta.-and. alpha.-D-arabinose 1, 5-diphosphate: analogs of a potent metabolic regulator | |
NO783721L (en) | PROCEDURES FOR SYNTHESIS OF OLIGONUCLEOTIDS | |
Itakura et al. | Synthesis of lactose-operator gene fragments by the improved triester method | |
CS202570B2 (en) | Process for preparing aminoglycsidic antibiotics | |
Moffatt | The Synthesis of Orotidine-5 ″Phosphate | |
Ozaki et al. | Synthesis of 2-Substituted myo-Inositol 1, 3, 4, 5-Tetrakis (phosphate) and 1, 3, 4, 5, 6-Pentakis (phosphate) Analogs. | |
SU730691A1 (en) | Method of preparing dinucleotides | |
NZ528575A (en) | Process for the preparation of 2'-halo-beta-L-arabinofuranosyl nucleosides | |
GB2100721A (en) | Neplanocin a derivatives with antitumor activity | |
Honcharenko et al. | Synthesis and evaluation of stability of m3G-CAP analogues in serum-supplemented medium and cytosolic extract | |
Eto et al. | Syntheses of Ribonucleoside 5′-S-Methyl Phosphorothiolates and Ribonucleoside 3′: 5′-Cyclic Phosphates from Nucleosides Applying a New Phosphorylating Agent, MTBO | |
US3338882A (en) | 2'-and 3'-phosphates of 1-beta-d-arabinofuranosylcytosine | |
WO2005070946A1 (en) | Ribonucleic acid compound and method of liquid-phase synthesis of oligonucleic acid compound | |
Ohtsuka et al. | A new condensing reagent, 1-(2, 4, 6-triisopropylbenzenesulfonyl)-5-(pyridin-2-yl) tetrazolide and its use in the synthesis of λ cro binding heptadecanucleotide on a polymer support | |
SU659573A1 (en) | Spin-labelled derivatives of oligoribonucleotides as spin probes for investigating mechanism of effect of ferments and method of obtaining same |