RU2824194C2 - Methods for gene modification of hematopoietic cells - Google Patents

Methods for gene modification of hematopoietic cells Download PDF

Info

Publication number
RU2824194C2
RU2824194C2 RU2021101135A RU2021101135A RU2824194C2 RU 2824194 C2 RU2824194 C2 RU 2824194C2 RU 2021101135 A RU2021101135 A RU 2021101135A RU 2021101135 A RU2021101135 A RU 2021101135A RU 2824194 C2 RU2824194 C2 RU 2824194C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
cells
leu
poloxamer
pge2
ala
Prior art date
Application number
RU2021101135A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2021101135A (en
Inventor
Брайан БИАРД
Гурав Д. ШАХ
Хуан Антонио БЮРЕН РОНСЕРО
Хосе Карлос СЕГОВИЯ САНС
Паула РИО ГАЛЬДО
Сюзана НАВАРРО ОРДОНЕС
Елена АЛЬМАРСА НОВОА
Оскар КИНТАНА БУСТАМАНТЕ
Кристина МЕСА НУНЬЕС
Кеннет ЛОУ
Киннари ПАТЕЛ
Original Assignee
Сентро Де Инвестигасьонес Энерхетикас, Медиоамбьенталес И Текнолохикас, О.А., М.П.
Фундасьон Институто Де Инвестигасьон Санитариа Фундасьон Хименес Диас
Спейскрафт Севен, Ллк
Консорсио Сентро Де Инвестигасьон Биомедика Эн Ред, М.П.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Сентро Де Инвестигасьонес Энерхетикас, Медиоамбьенталес И Текнолохикас, О.А., М.П., Фундасьон Институто Де Инвестигасьон Санитариа Фундасьон Хименес Диас, Спейскрафт Севен, Ллк, Консорсио Сентро Де Инвестигасьон Биомедика Эн Ред, М.П. filed Critical Сентро Де Инвестигасьонес Энерхетикас, Медиоамбьенталес И Текнолохикас, О.А., М.П.
Publication of RU2021101135A publication Critical patent/RU2021101135A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2824194C2 publication Critical patent/RU2824194C2/en

Links

Abstract

FIELD: biotechnology.
SUBSTANCE: present invention relates to biotechnology and genetic engineering, particularly to methods for genetic modification of hematopoietic cells. Presented is the use of prostaglandin E2 (PGE2), poloxamer and protamine sulphate for enhancing transduction by a recombinant retroviral vector.
EFFECT: compositions and methods according to the present invention can be used in gene therapy, including treatment of monogenic genetic diseases and disorders.
54 cl, 18 dwg, 2 tbl, 5 ex

Description

РОДСТВЕННЫЕ ЗАЯВКИRELATED APPLICATIONS

Данная заявка испрашивает приоритет на основании предварительной заявки на патент США № 62/712,146, поданной 30 июля 2018 г., содержание которой полностью включено в настоящий документ.This application claims priority to U.S. Provisional Patent Application No. 62/712,146, filed July 30, 2018, the contents of which are incorporated herein in their entirety.

ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙSEQUENCE LIST

Данная заявка подается в электронном виде через EFS-Web и включает в себя перечень последовательностей, представленный в электронном виде в формате .txt. Файл .txt содержит перечень последовательностей под названием «ROPA_01001WO_SeqList_ST25.txt», созданный 30 июля 2019 г. и имеющий размер 57 килобайт. Перечень последовательностей, содержащийся в этом .txt-файле, является частью описания и полностью включен в настоящий документ посредством ссылки.This application is submitted electronically via EFS-Web and includes a sequence listing provided electronically in .txt format. The .txt file contains a sequence listing titled "ROPA_01001WO_SeqList_ST25.txt" generated on July 30, 2019, and is 57 kilobytes in size. The sequence listing contained in this .txt file is part of the disclosure and is incorporated herein by reference in its entirety.

ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИAREA OF TECHNOLOGY

[0001] Настоящее изобретение в целом относится к способам генетической модификации гемопоэтических клеток. В частности, изобретение относится к применению комбинаций двух или более усилителей трансдукции, выбранных из простагландина E2 (PGE2), фрагмента рекомбинантного фибронектина, полоксамера и протаминсульфата, для усиления трансдукции рекомбинантным ретровирусным вектором.[0001] The present invention relates generally to methods for genetically modifying hematopoietic cells. In particular, the invention relates to the use of combinations of two or more transduction enhancers selected from prostaglandin E2 (PGE2), a fragment of recombinant fibronectin, poloxamer, and protamine sulfate, to enhance transduction by a recombinant retroviral vector.

УРОВЕНЬ ТЕХНИКИLEVEL OF TECHNOLOGY

[0002] Опосредованный перенос генов ex vivo в клетки-мишени является применяемым в клинической практике методом клеточной и генной терапии. Рекомбинантные ретровирусные векторы (например, рекомбинантные лентивирусные векторы) могут быть использованы для доставки полинуклеотидов в клетки (например, гемопоэтические клетки). Приведение целевых гемопоэтических клеток в контакт с рекомбинантным ретровирусным (например, лентивирусным) вектором приводит к доставке гена(ов) в указанные гемопоэтические клетки, этот процесс известен как трансдукция. Затем указанные гемопоэтические клетки могут быть введены субъекту с тем, чтобы гемопоэтические клетки прижились в костном мозге указанного субъекта.[0002] Indirect gene transfer ex vivo into target cells is a clinically used method of cell and gene therapy. Recombinant retroviral vectors (e.g., recombinant lentiviral vectors) can be used to deliver polynucleotides into cells (e.g., hematopoietic cells). Contacting the target hematopoietic cells with a recombinant retroviral (e.g., lentiviral) vector results in delivery of the gene(s) into said hematopoietic cells, a process known as transduction. Said hematopoietic cells can then be administered to a subject so that the hematopoietic cells engraft in the bone marrow of said subject.

[0003] Эффективность трансдукции ретровирусным (например, лентивирусным) вектором часто невысока, и она часто является основным препятствием для успешной генной терапии. Соответственно, остается неудовлетворенная потребность в композициях и способах, подходящих для применения в отношении гемопоэтических клеток в клиническом контексте. В настоящем изобретении предложены такие композиции, способы и другие объекты.[0003] Transduction efficiency of a retroviral (e.g., lentiviral) vector is often low and is often a major barrier to successful gene therapy. Accordingly, there remains an unmet need for compositions and methods suitable for use with hematopoietic cells in a clinical context. The present invention provides such compositions, methods, and other objects.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯBRIEF DESCRIPTION OF THE INVENTION

[0004] Настоящее изобретение в целом относится к способам генетической модификации гемопоэтических клеток. В частности, изобретение относится к применению комбинации двух или более усилителей трансдукции, где по меньшей мере два усилителя трансдукции из указанной комбинации выбраны из простагландина E2 (PGE2), полоксамера, фрагмента рекомбинантного фибронектина и/или протаминсульфата, для усиления трансдукции рекомбинантным ретровирусным вектором. В отдельных вариантах осуществления указанная комбинация включает три или более реагентов для трансдукции, включая простагландин E2 (PGE2), полоксамер и протаминсульфат. В отдельных вариантах осуществления указанная комбинация включает четыре или более реагентов для трансдукции, включая простагландин E2 (PGE2), полоксамер, фрагмент рекомбинантного фибронектина и протаминсульфат. Композиции и способы согласно настоящему изобретению особенно подходят для применения в генной терапии, включая лечение моногенных генетических заболеваний и расстройств. Способы согласно изобретению обладают тем преимуществом, что они приводят к снижению токсичности (большей выживаемости) трансдуцированной популяции клеток по сравнению с трансдукцией без усилителей трансдукции.[0004] The present invention relates generally to methods for genetically modifying hematopoietic cells. In particular, the invention relates to the use of a combination of two or more transduction enhancers, wherein at least two of the transduction enhancers of said combination are selected from prostaglandin E2 (PGE2), poloxamer, recombinant fibronectin fragment, and/or protamine sulfate, to enhance transduction by a recombinant retroviral vector. In certain embodiments, said combination comprises three or more transduction reagents, including prostaglandin E2 (PGE2), poloxamer, and protamine sulfate. In certain embodiments, said combination comprises four or more transduction reagents, including prostaglandin E2 (PGE2), poloxamer, recombinant fibronectin fragment, and protamine sulfate. The compositions and methods of the present invention are particularly suitable for use in gene therapy, including the treatment of monogenic genetic diseases and disorders. The methods of the invention have the advantage that they result in reduced toxicity (greater survival) of the transduced cell population compared to transduction without transduction enhancers.

[0005] В одном из аспектов изобретения предложен способ генетической модификации гемопоэтических клеток, включающий: приведение гемопоэтических клеток в контакт с полоксамером; приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с простагландином E2 (PGE2) или его производным; и приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с рекомбинантным ретровирусным вектором.[0005] In one aspect of the invention, a method for genetically modifying hematopoietic cells is provided, comprising: contacting hematopoietic cells with poloxamer; contacting said hematopoietic cells with prostaglandin E2 (PGE2) or a derivative thereof; and contacting said hematopoietic cells with a recombinant retroviral vector.

[0006] В одном из аспектов изобретения предложен способ генетической модификации гемопоэтических клеток, включающий: обеспечение гемопоэтических клеток; приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с полоксамером; приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с простагландином E2 (PGE2) или его производным; и приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с рекомбинантным ретровирусным вектором.[0006] In one aspect of the invention, a method for genetically modifying hematopoietic cells is provided, comprising: providing hematopoietic cells; contacting said hematopoietic cells with poloxamer; contacting said hematopoietic cells with prostaglandin E2 (PGE2) or a derivative thereof; and contacting said hematopoietic cells with a recombinant retroviral vector.

[0007] В одном из вариантов осуществления рекомбинантный ретровирусный вектор представляет собой рекомбинантный лентивирусный вектор.[0007] In one embodiment, the recombinant retroviral vector is a recombinant lentiviral vector.

[0008] В одном из вариантов осуществления гемопоэтические клетки были подвергнуты манипуляциям.[0008] In one embodiment, the hematopoietic cells have been manipulated.

[0009] В одном из вариантов осуществления стадия обеспечения включает обогащение CD34+ клетками.[0009] In one embodiment, the providing step comprises enriching with CD34+ cells.

[0010] В одном из вариантов осуществления гемопоэтические клетки были культивированы в сосудах, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина.[0010] In one embodiment, hematopoietic cells were cultured in vessels coated with a fragment of recombinant fibronectin.

[0011] В одном из вариантов осуществления полоксамер выбран из группы, состоящей из полоксамера 288, полоксамера 335, полоксамера 338 и полоксамера 407.[0011] In one embodiment, the poloxamer is selected from the group consisting of poloxamer 288, poloxamer 335, poloxamer 338, and poloxamer 407.

[0012] В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST).[0012] In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST).

[0013] В одном из вариантов осуществления PGE2 или его производное модифицированы.[0013] In one embodiment, PGE2 or a derivative thereof is modified.

[0014] В одном из вариантов осуществления PGE2 или его производное представляет собой 16,16-диметил-PGE2 (dmPGE2).[0014] In one embodiment, PGE2 or a derivative thereof is 16,16-dimethyl-PGE2 (dmPGE2).

[0015] В одном из вариантов осуществления PGE2 или его производное не модифицированы.[0015] In one embodiment, PGE2 or a derivative thereof is not modified.

[0016] В одном из вариантов осуществления способ дополнительно включает приведение гемопоэтических клеток в контакт с протаминсульфатом и/или фрагментом рекомбинантного фибронектина. В отдельных вариантах осуществления фрагмент рекомбинантного фибронектина может присутствовать в культуре в жидкой среде или может быть нанесен на чашку для культивирования. В отдельных вариантах осуществления клетки могут быть подвергнуты предварительной обработке путем культивирования на чашке, содержащей рекомбинантный фибронектин, и/или фрагмент рекомбинантного фибронектина может присутствовать в жидкой культуральной среде во время трансдукции.[0016] In one embodiment, the method further comprises contacting the hematopoietic cells with protamine sulfate and/or a recombinant fibronectin fragment. In some embodiments, the recombinant fibronectin fragment may be present in the culture in liquid medium or may be coated on a culture dish. In some embodiments, the cells may be pretreated by culturing on a dish containing recombinant fibronectin and/or the recombinant fibronectin fragment may be present in the liquid culture medium during transduction.

[0017] В одном из вариантов осуществления стадии приведения в контакт проводят одновременно, или время их проведения частично совпадает.[0017] In one embodiment, the contacting steps are carried out simultaneously, or the timing of their implementation partially coincides.

[0018] В одном из вариантов осуществления концентрация PGE2 или его производного составляет 5-30 мкг/мл.[0018] In one embodiment, the concentration of PGE2 or a derivative thereof is 5-30 μg/mL.

[0019] В одном из вариантов осуществления концентрация PGE2 или его производного составляет приблизительно 10 мкг/мл.[0019] In one embodiment, the concentration of PGE2 or a derivative thereof is about 10 μg/mL.

[0020] В одном из вариантов осуществления концентрация полоксамера составляет 200-1200 мкг/мл.[0020] In one embodiment, the concentration of poloxamer is 200-1200 mcg/mL.

[0021] В одном из вариантов осуществления концентрация полоксамера составляет приблизительно 1000 мкг/мл.[0021] In one embodiment, the concentration of poloxamer is approximately 1000 mcg/mL.

[0022] В одном из вариантов осуществления концентрация протаминсульфата составляет 4-10 мкг/мл.[0022] In one embodiment, the concentration of protamine sulfate is 4-10 mcg/mL.

[0023] В одном из вариантов осуществления концентрация протаминсульфата составляет приблизительно 4 мкг/мл.[0023] In one embodiment, the concentration of protamine sulfate is about 4 mcg/mL.

[0024] В одном из вариантов осуществления концентрация фрагмента рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin, составляет от приблизительно 5 до приблизительно 50 мкг/мл при использовании в культуре в жидкой среде.[0024] In one embodiment, the concentration of a recombinant fibronectin fragment, such as RetroNectin, is from about 5 to about 50 μg/mL when used in liquid culture.

[0025] В одном из вариантов осуществления концентрация фрагмента рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin, составляет приблизительно 20 мкг/мл при использовании в культуре в жидкой среде.[0025] In one embodiment, the concentration of a recombinant fibronectin fragment, such as RetroNectin, is approximately 20 μg/mL when used in liquid culture.

[0026] Во втором аспекте изобретения предложен способ усиления опосредованной рекомбинантным ретровирусным вектором генетической модификации гемопоэтических клеток, включающий обработку указанных гемопоэтических клеток или приведение их в контакт ex vivo с эффективным количеством PGE2 или его производного и с эффективным количеством полоксамера; и подвергание указанных гемопоэтических клеток воздействию или приведение их в контакт с рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, содержащий представляющий интерес ген, где эффективность вирусной трансдукции указанного рекомбинантного ретровирусного вектора повышена по сравнению с трансдукцией гемопоэтических клеток указанным рекомбинантным ретровирусным вектором в отсутствие PGE2 и полоксамера.[0026] In a second aspect of the invention, there is provided a method for enhancing recombinant retroviral vector-mediated genetic modification of hematopoietic cells, comprising treating said hematopoietic cells or contacting them ex vivo with an effective amount of PGE2 or a derivative thereof and with an effective amount of a poloxamer; and exposing said hematopoietic cells to or contacting them with a recombinant retroviral vector comprising a polynucleotide comprising a gene of interest, wherein the efficiency of viral transduction of said recombinant retroviral vector is increased compared to transduction of hematopoietic cells by said recombinant retroviral vector in the absence of PGE2 and poloxamer.

[0027] В одном из вариантов осуществления способ дополнительно включает обработку гемопоэтических клеток или приведение их в контакт ex vivo с эффективным количеством протаминсульфата и/или фрагмента рекомбинантного фибронектина.[0027] In one embodiment, the method further comprises treating the hematopoietic cells or contacting them ex vivo with an effective amount of protamine sulfate and/or a fragment of recombinant fibronectin.

[0028] В одном из вариантов осуществления представляющий интерес ген восполняет дефект в гене, связанный с моногенным генетическим заболеванием или расстройством.[0028] In one embodiment, the gene of interest complements a defect in a gene associated with a monogenic genetic disease or disorder.

[0029] В одном из вариантов осуществления представляющий интерес ген выбран из группы, состоящей из RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A и OSTM1. В частных вариантах осуществления представляющий интерес ген кодирует белок, кодируемый любым из этих генов, или кодирует функциональный фрагмент или вариант любого из этих генов. В частных вариантах осуществления ген или белок представляет собой ген или белок человека.[0029] In one embodiment, the gene of interest is selected from the group consisting of RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A, and OSTM1. In particular embodiments, the gene of interest encodes a protein encoded by any of these genes, or encodes a functional fragment or variant of any of these genes. In particular embodiments, the gene or protein is a human gene or protein.

[0030] В одном из вариантов осуществления способ противодействует клиническим осложнениям или облегчает моногенное генетическое заболевание или расстройство.[0030] In one embodiment, the method counteracts clinical complications or alleviates a monogenic genetic disease or disorder.

[0031] В одном из вариантов осуществления моногенетическое заболевание или расстройство выбрано из группы, состоящей из анемии Фанкони (включая любую из групп комплементации), дефицита адгезии лейкоцитов I типа, дефицита пируваткиназы и инфантильного злокачественного остеопороза.[0031] In one embodiment, the monogenetic disease or disorder is selected from the group consisting of Fanconi anemia (including any of the complementation groups), leukocyte adhesion deficiency type I, pyruvate kinase deficiency, and infantile malignant osteoporosis.

[0032] В одном из вариантов осуществления гемопоэтические клетки представляют собой CD34-обогащенные клетки, необязательно гемопоэтические клетки, клетки, полученные из костного мозга (BM), клетки, полученные из пуповинной крови (CB) или мобилизованные клетки периферической крови (mPB). В отдельных вариантах осуществления гемопоэтические клетки были получены от субъекта, подлежащего лечению рекомбинантно модифицированными гемопоэтическими клетками.[0032] In one embodiment, the hematopoietic cells are CD34-enriched cells, optionally hematopoietic cells, bone marrow (BM)-derived cells, cord blood (CB)-derived cells, or mobilized peripheral blood (mPB) cells. In certain embodiments, the hematopoietic cells were obtained from a subject to be treated with recombinantly modified hematopoietic cells.

[0033] В третьем аспекте изобретения предложен способ опосредованной рекомбинантным ретровирусным вектором генетической модификации гемопоэтических клеток, включающий получение CD34-обогащенных клеток из биологического образца (необязательно, периферической крови), полученного от субъекта, получавшего Г-КСФ (гранулоцитарный колониестимулирующий фактор) или его аналог (необязательно, филграстим, сарграмостим или пегфилграстим) и/или плериксафор; и генетическую модификацию указанных CD34-обогащенных клеток рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, кодирующий ген группы комплементации анемии Фанкони (FANC), ITGB2, пируваткиназу типа R, OSTM1, TCIRG1, CLCN7, OSTM1, или ген, кодирующий их функциональный вариант или фрагмент, и функционально связанную с ним последовательность активного в эукариотических клетках промотора; где стадия генетической модификации включает приведение указанных CD34-обогащенных клеток в контакт с указанным рекомбинантным ретровирусным вектором, PGE2 и полоксамером и, необязательно, с протаминсульфатом и/или фрагментом рекомбинантного фибронектина.[0033] In a third aspect of the invention, there is provided a method for recombinant retroviral vector-mediated genetic modification of hematopoietic cells, comprising obtaining CD34-enriched cells from a biological sample (optionally peripheral blood) obtained from a subject treated with G-CSF (granulocyte colony-stimulating factor) or an analogue thereof (optionally filgrastim, sargramostim or pegfilgrastim) and/or plerixafor; and genetically modifying said CD34-enriched cells with a recombinant retroviral vector comprising a polynucleotide encoding a Fanconi anemia complementation group (FANC) gene, ITGB2, pyruvate kinase type R, OSTM1, TCIRG1, CLCN7, OSTM1, or a gene encoding a functional variant or fragment thereof, and a promoter sequence operably linked thereto that is active in eukaryotic cells; wherein the genetic modification step comprises contacting said CD34-enriched cells with said recombinant retroviral vector, PGE2 and poloxamer and, optionally, protamine sulfate and/or a recombinant fibronectin fragment.

[0034] В изобретении предложен способ генетической модификации гемопоэтических клеток in vitro, опосредованной рекомбинантным ретровирусным вектором, включающий получение CD34-обогащенных клеток из биологического образца (необязательно, периферической крови), полученного от субъекта, получавшего Г-КСФ или его аналог (необязательно, филграстим, сарграмостим или пегфилграстим) и/или плериксафор; и генетическую модификацию указанных CD34-обогащенных клеток рекомбинантным ретровирусным вектором для заболевания или расстройства, выбранного из анемии Фанкони, дефицита адгезии лейкоцитов I типа, дефицита пируваткиназы или инфантильного злокачественного остеопороза; где указанный рекомбинантный ретровирусный вектор содержит полинуклеотид, кодирующий ген группы комплементации анемии Фанкони (FANC), ITGB2, пируваткиназу типа R, CLCN7, OSTM1, TCIRG1, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A, или ген, кодирующий их функциональный вариант или фрагмент, и функционально связанную с ним последовательность активного в эукариотических клетках промотора; где стадия генетической модификации включает приведение указанных CD34-обогащенных клеток в контакт с PGE2 и полоксамером и, необязательно, с протаминсульфатом.[0034] The invention provides a method for genetically modifying hematopoietic cells in vitro mediated by a recombinant retroviral vector, comprising obtaining CD34-enriched cells from a biological sample (optionally peripheral blood) obtained from a subject treated with G-CSF or an analogue thereof (optionally filgrastim, sargramostim or pegfilgrastim) and/or plerixafor; and genetically modifying said CD34-enriched cells with a recombinant retroviral vector for a disease or disorder selected from Fanconi anemia, leukocyte adhesion deficiency type I, pyruvate kinase deficiency or infantile malignant osteoporosis; wherein said recombinant retroviral vector comprises a polynucleotide encoding a gene of the Fanconi anemia complementation group (FANC), ITGB2, pyruvate kinase type R, CLCN7, OSTM1, TCIRG1, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A, or a gene encoding a functional variant or fragment thereof, and a sequence of a promoter functionally linked thereto that is active in eukaryotic cells; wherein the step of genetic modification comprises contacting said CD34-enriched cells with PGE2 and poloxamer and, optionally, with protamine sulfate.

[0035] В изобретении предложен способ лечения моногенного генетического заболевания или расстройства у нуждающегося в этом субъекта, включающий предоставление указанному субъекту генетически модифицированных гемопоэтических клеток, экспрессирующих полипептид, отсутствующий или мутировавший вследствие указанного моногенного генетического заболевания или расстройства. В частных вариантах осуществления CD34-обогащенные клетки, полученные из биологического образца (необязательно, периферической крови), полученного от субъекта после проведения у указанного субъекта терапии Г-КСФ или его аналогом (необязательно, филграстимом, сарграмостимом или пегфилграстимом) и/или плериксафором, генетически модифицируют путем приведения их в контакт с рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим кассету экспрессии, содержащую полинуклеотидную последовательность, кодирующую указанный полипептид, в присутствии по меньшей мере двух усилителей трансдукции, выбранных из простагландина E2 (PGE2), полоксамера, фрагмента рекомбинантного фибронектина и/или протаминсульфата, и полученные генетически модифицированные клетки предоставляют указанному субъекту. В отдельных вариантах осуществления заболевание или расстройство выбрано из анемии Фанкони, дефицита адгезии лейкоцитов I типа, дефицита пируваткиназы или инфантильного злокачественного остеопороза; и рекомбинантный ретровирусный вектор содержит полинуклеотид, содержащий ген группы комплементации анемии Фанкони (FANC), ITGB2, пируваткиназу типа R, CLCN7, OSTM1, TCIRG1, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A, или ген, кодирующий их функциональный вариант или фрагмент, и функционально связанную с ним последовательность активного в эукариотических клетках промотора.[0035] The invention provides a method for treating a monogenic genetic disease or disorder in a subject in need thereof, comprising providing said subject with genetically modified hematopoietic cells expressing a polypeptide that is missing or mutated as a result of said monogenic genetic disease or disorder. In particular embodiments, CD34-enriched cells obtained from a biological sample (optionally peripheral blood) obtained from a subject following therapy with G-CSF or an analogue thereof (optionally filgrastim, sargramostim or pegfilgrastim) and/or plerixafor in said subject are genetically modified by contacting them with a recombinant retroviral vector comprising an expression cassette comprising a polynucleotide sequence encoding said polypeptide in the presence of at least two transduction enhancers selected from prostaglandin E2 (PGE2), poloxamer, recombinant fibronectin fragment and/or protamine sulfate, and the resulting genetically modified cells are provided to said subject. In particular embodiments, the disease or disorder is selected from Fanconi anemia, leukocyte adhesion deficiency type I, pyruvate kinase deficiency or infantile malignant osteoporosis; and the recombinant retroviral vector contains a polynucleotide containing the Fanconi anemia complementation group gene (FANC), ITGB2, pyruvate kinase type R, CLCN7, OSTM1, TCIRG1, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A, or a gene encoding a functional variant or fragment thereof, and a sequence of a promoter active in eukaryotic cells functionally linked thereto.

[0036] В отдельных вариантах осуществления изобретения предложен способ лечения анемии Фанкони у нуждающегося в этом субъекта, включающий введение гемопоэтических клеток, полученных путем генетической модификации гемопоэтических клеток рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, кодирующий ген группы комплементации анемии Фанкони (FANC) или ген, кодирующий его функциональный вариант или фрагмент, в соответствии со способами, раскрытыми в настоящем документе.[0036] In certain embodiments, the invention provides a method of treating Fanconi anemia in a subject in need thereof, comprising administering hematopoietic cells obtained by genetically modifying hematopoietic cells with a recombinant retroviral vector comprising a polynucleotide encoding a Fanconi anemia complementation group (FANC) gene or a gene encoding a functional variant or fragment thereof, in accordance with the methods disclosed herein.

[0037] В отдельных вариантах осуществления изобретения предложен способ лечения дефицита адгезии лейкоцитов I типа у нуждающегося в этом субъекта, включающий введение гемопоэтических клеток, полученных путем генетической модификации гемопоэтических клеток рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, кодирующий ген ITGB2 или ген, кодирующий его функциональный вариант или фрагмент, в соответствии со способами, раскрытыми в настоящем документе.[0037] In certain embodiments, the invention provides a method of treating leukocyte adhesion deficiency type I in a subject in need thereof, comprising administering hematopoietic cells obtained by genetically modifying hematopoietic cells with a recombinant retroviral vector comprising a polynucleotide encoding the ITGB2 gene or a gene encoding a functional variant or fragment thereof, in accordance with the methods disclosed herein.

[0038] В отдельных вариантах осуществления изобретения предложен способ лечения дефицита пируваткиназы у нуждающегося в этом субъекта, включающий введение гемопоэтических клеток, полученных путем генетической модификации гемопоэтических клеток рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, кодирующий ген пируваткиназы типа R или ген, кодирующий его функциональный вариант или фрагмент, в соответствии со способами, раскрытыми в настоящем документе.[0038] In certain embodiments, the invention provides a method of treating pyruvate kinase deficiency in a subject in need thereof, comprising administering hematopoietic cells obtained by genetically modifying hematopoietic cells with a recombinant retroviral vector comprising a polynucleotide encoding a pyruvate kinase R gene or a gene encoding a functional variant or fragment thereof, in accordance with the methods disclosed herein.

[0039] В отдельных вариантах осуществления изобретения предложен способ лечения инфантильного злокачественного остеопороза у нуждающегося в этом субъекта, включающий введение гемопоэтических клеток, полученных путем генетической модификации гемопоэтических клеток рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, кодирующий ген CLCN7, OSTM1, TCIRG1, TNFSF11, PLEKHM1 или TNFRSF11A, или ген, кодирующий их функциональный вариант или фрагмент, в соответствии со способами, раскрытыми в настоящем документе.[0039] In certain embodiments, the invention provides a method of treating infantile malignant osteoporosis in a subject in need thereof, comprising administering hematopoietic cells obtained by genetically modifying hematopoietic cells with a recombinant retroviral vector comprising a polynucleotide encoding a CLCN7, OSTM1, TCIRG1, TNFSF11, PLEKHM1, or TNFRSF11A gene, or a gene encoding a functional variant or fragment thereof, in accordance with the methods disclosed herein.

[0040] В дополнительном связанном аспекте изобретения предложен способ получения популяции гемопоэтических клеток, содержащей по меньшей мере 80% или по меньшей мере 90% генетически модифицированных гемопоэтических клеток, включающий: приведение гемопоэтических клеток в контакт ex vivo с рекомбинантным ретровирусным вектором (необязательно, лентивирусным вектором), содержащим полинуклеотид, содержащий представляющий интерес ген или кодирующий представляющий интерес полипептид, где приведение в контакт происходит в присутствии PGE2 или его производного, необязательно PGE2 человека или 16,16-диметил-PGE2 (dmPGE2), и полоксамера, необязательно полоксамера 338 (LentiBOOST™). Клетки могут быть приведены в контакт с ретровирусным вектором в условиях и в течение времени, достаточных для обеспечения трансдукции клеток ретровирусным вектором, например, в подходящей культуральной среде в течение по меньшей мере одного часа, по меньшей мере двух часов, по меньшей мере четырех часов, по меньшей мере восьми часов, по меньшей мере двенадцати часов, по меньшей мере 16 часов или по меньшей мере 24 часов. В некоторых вариантах осуществления клетки трансдуцируют один раз или два раза подряд, например, после предварительной стимуляции, причем каждый цикл трансдукции составляет от 12 до 24 часов или от 16 до 18 часов. В некоторых вариантах осуществления клетки приводят в контакт с ретровирусным вектором и усилителями трансдукции в одно и то же время или в течение частично совпадающего периода времени. После трансдукции клетки могут быть включены в среду для заморозки (например, CryoStor CS5, BioLife Solutions, Ботелл, Вашингтон, США) и подвергнуты криоконсервации для последующего использования. В отдельных вариантах осуществления этого и других аспектов полоксамер выбран из группы, состоящей из полоксамера 288, полоксамера 335, полоксамера 338 и полоксамера 407. В частных вариантах осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). В отдельных вариантах осуществления PGE2 или его производное не модифицировано или модифицировано, например, 16,16-диметил-PGE2 (dmPGE2). В частных вариантах осуществления способ дополнительно включает приведение гемопоэтических клеток в контакт с протаминсульфатом и/или фрагментом рекомбинантного фибронектина. В некоторых вариантах осуществления концентрация PGE2 или его производного составляет 5-30 мкг/мл или приблизительно 10 мкг/мл. В некоторых вариантах осуществления концентрация полоксамера составляет 200-1200 мкг/мл или приблизительно 1000 мкг/мл. В некоторых вариантах осуществления концентрация протаминсульфата составляет 4-10 мкг/мл или приблизительно 4 мкг/мл. В отдельных вариантах осуществления полинуклеотид восполняет дефект в гене, связанный с моногенным генетическим заболеванием или расстройством. В отдельных вариантах осуществления представляющий интерес полипептид выбран из группы, состоящей из RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A и OSTM1. В некоторых вариантах осуществления заболевание или расстройство представляет собой моногенное генетическое заболевание или расстройство, например, выбранное из группы, состоящей из анемии Фанкони, дефицита адгезии лейкоцитов I типа, дефицита пируваткиназы и инфантильного злокачественного остеопороза. В частных вариантах осуществления гемопоэтические клетки представляют собой CD34-обогащенные клетки или CD34+ гемопоэтические клетки, необязательно клетки, полученные из костного мозга (BM), клетки, полученные из пуповинной крови (CB) или мобилизованные клетки периферической крови (mPB). В некоторых вариантах осуществления популяция гемопоэтических клеток имеет VCN/клетку, равное по меньшей мере 1,0, по меньшей мере 1,5, по меньшей мере 2,0 или по меньшей мере 2,5.[0040] In a further related aspect of the invention, there is provided a method of producing a population of hematopoietic cells comprising at least 80% or at least 90% genetically modified hematopoietic cells, comprising: contacting the hematopoietic cells ex vivo with a recombinant retroviral vector (optionally a lentiviral vector) comprising a polynucleotide comprising a gene of interest or encoding a polypeptide of interest, wherein the contacting occurs in the presence of PGE2 or a derivative thereof, optionally human PGE2 or 16,16-dimethyl-PGE2 (dmPGE2), and a poloxamer, optionally poloxamer 338 (LentiBOOST™). The cells can be contacted with the retroviral vector under conditions and for a time sufficient to allow transduction of the cells with the retroviral vector, such as in a suitable culture medium for at least one hour, at least two hours, at least four hours, at least eight hours, at least twelve hours, at least 16 hours, or at least 24 hours. In some embodiments, the cells are transduced once or twice in succession, such as after prestimulation, with each transduction cycle lasting from 12 to 24 hours or from 16 to 18 hours. In some embodiments, the cells are contacted with the retroviral vector and transduction enhancers at the same time or for an overlapping period of time. Following transduction, the cells can be included in a freezing medium (e.g., CryoStor CS5, BioLife Solutions, Bothell, WA, USA) and cryopreserved for later use. In certain embodiments of this and other aspects, the poloxamer is selected from the group consisting of poloxamer 288, poloxamer 335, poloxamer 338, and poloxamer 407. In particular embodiments, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). In particular embodiments, the PGE2 or derivative thereof is unmodified or modified, such as 16,16-dimethyl-PGE2 (dmPGE2). In particular embodiments, the method further comprises contacting the hematopoietic cells with protamine sulfate and/or a fragment of recombinant fibronectin. In some embodiments, the concentration of PGE2 or derivative thereof is 5-30 μg/mL, or about 10 μg/mL. In some embodiments, the concentration of the poloxamer is 200-1200 μg/mL, or about 1000 μg/mL. In some embodiments, the concentration of protamine sulfate is 4-10 μg/mL, or about 4 μg/mL. In some embodiments, the polynucleotide complements a defect in a gene associated with a monogenic genetic disease or disorder. In some embodiments, the polypeptide of interest is selected from the group consisting of RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A, and OSTM1. In some embodiments, the disease or disorder is a monogenic genetic disease or disorder, such as selected from the group consisting of Fanconi anemia, leukocyte adhesion deficiency type I, pyruvate kinase deficiency, and infantile malignant osteoporosis. In particular embodiments, the hematopoietic cells are CD34-enriched cells or CD34+ hematopoietic cells, optionally bone marrow (BM)-derived cells, cord blood (CB)-derived cells, or mobilized peripheral blood (mPB) cells. In some embodiments, the hematopoietic cell population has a VCN/cell of at least 1.0, at least 1.5, at least 2.0, or at least 2.5.

[0041] В связанном аспекте изобретения предложена популяция гемопоэтических клеток, содержащая по меньшей мере 80% или по меньшей мере 90% генетически модифицированных гемопоэтических клеток, где указанная популяция клеток была получена раскрытым способом.[0041] In a related aspect, the invention provides a population of hematopoietic cells comprising at least 80% or at least 90% genetically modified hematopoietic cells, wherein said population of cells was obtained by the disclosed method.

[0042] В еще одном связанном аспекте изобретения предложен способ лечения генетического заболевания или расстройства у нуждающегося в этом субъекта, включающий предоставление указанному субъекту популяции гемопоэтических клеток, содержащей по меньшей мере 80% или по меньшей мере 90% генетически модифицированных гемопоэтических клеток, где указанная популяция клеток была получена раскрытым способом, где указанные гемопоэтические клетки были получены от указанного субъекта до приведения их в контакт ex vivo с ретровирусным вектором, и где представляющий интерес ген кодирует функциональный полипептид, мутировавший или отсутствующий у указанного субъекта вследствие указанного генетического заболевания или расстройства. В некоторых вариантах осуществления представляющий интерес полипептид выбран из группы, состоящей из RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A и OSTM1. В некоторых вариантах осуществления заболевание или расстройство представляет собой моногенное генетическое заболевание или расстройство, например, выбранное из группы, состоящей из анемии Фанкони, дефицита адгезии лейкоцитов I типа, дефицита пируваткиназы и инфантильного злокачественного остеопороза. В частных вариантах осуществления гемопоэтические клетки представляют собой CD34-обогащенные клетки, необязательно клетки, полученные из костного мозга (BM), клетки, полученные из пуповинной крови (CB) или мобилизованные клетки периферической крови (mPB).[0042] In another related aspect, the invention provides a method of treating a genetic disease or disorder in a subject in need thereof, comprising providing to said subject a population of hematopoietic cells comprising at least 80% or at least 90% genetically modified hematopoietic cells, wherein said population of cells was obtained by the disclosed method, wherein said hematopoietic cells were obtained from said subject prior to contacting them ex vivo with a retroviral vector, and wherein the gene of interest encodes a functional polypeptide that is mutated or missing in said subject due to said genetic disease or disorder. In some embodiments, the polypeptide of interest is selected from the group consisting of RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A, and OSTM1. In some embodiments, the disease or disorder is a monogenic genetic disease or disorder, such as one selected from the group consisting of Fanconi anemia, leukocyte adhesion deficiency type I, pyruvate kinase deficiency, and infantile malignant osteoporosis. In particular embodiments, the hematopoietic cells are CD34-enriched cells, optionally bone marrow (BM)-derived cells, cord blood (CB)-derived cells, or mobilized peripheral blood (mPB) cells.

[0043] В различных вариантах осуществления любого из аспектов и вариантов осуществления, раскрытых в настоящем документе, клетки трансдуцируют на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin™. В различных вариантах осуществления любого из аспектов и вариантов осуществления, раскрытых в настоящем документе, клетки подвергают предварительной обработке путем культивирования на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin™, до и/или во время трансдукции. В некоторых вариантах осуществления клетки трансдуцируют в жидкой среде, содержащей Retro-Nectin. В некоторых вариантах осуществления клетки подвергают предварительной обработке путем культивирования на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, а также трансдуцируют в культуре в жидкой среде в присутствии фрагмента рекомбинантного фибронектина и других УТ. Таким образом, в некоторых вариантах осуществления клетки подвергают воздействию рекомбинантного фибронектина до воздействия других УТ во время трансдукции, а в некоторых вариантах осуществления клетки подвергают воздействию рекомбинантного фибронектина в одно время с воздействием других УТ или в течение частично совпадающего с ним периода времени.[0043] In various embodiments of any of the aspects and embodiments disclosed herein, the cells are transduced on plates coated with a fragment of recombinant fibronectin, such as RetroNectin™. In various embodiments of any of the aspects and embodiments disclosed herein, the cells are pretreated by culturing on plates coated with a fragment of recombinant fibronectin, such as RetroNectin™, prior to and/or during transduction. In some embodiments, the cells are transduced in liquid medium containing Retro-Nectin. In some embodiments, the cells are pretreated by culturing on plates coated with a fragment of recombinant fibronectin and are transduced in liquid culture in the presence of a fragment of recombinant fibronectin and other UTs. Thus, in some embodiments, the cells are exposed to recombinant fibronectin prior to exposure to other UTs during transduction, and in some embodiments, the cells are exposed to recombinant fibronectin at the same time as exposure to other UTs or for a period of time that overlaps therewith.

[0044] В различных вариантах осуществления любого из аспектов и вариантов осуществления, раскрытых в настоящем документе, клетки трансдуцируют в присутствии простагландина E2 (PGE2), полоксамера (например, LentiBoost™), фрагмента рекомбинантного фибронектина (например, RetroNectin™) и протаминсульфата.[0044] In various embodiments of any of the aspects and embodiments disclosed herein, the cells are transduced in the presence of prostaglandin E2 (PGE2), a poloxamer (e.g., LentiBoost™), a fragment of recombinant fibronectin (e.g., RetroNectin™), and protamine sulfate.

[0045] Другие особенности и преимущества изобретения будут очевидны из следующего подробного описания и формулы изобретения и охватываются ими.[0045] Other features and advantages of the invention will be apparent from and encompassed by the following detailed description and claims.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВBRIEF DESCRIPTION OF GRAPHIC MATERIALS

[0046] На ФИГ. 1 показан иллюстративный протокол трансдукции. Количества или комбинации УТ могут варьироваться. Криоконсервация является необязательной. Клетки могут быть использованы в свежем виде или после хранения в замороженном состоянии.[0046] FIG. 1 shows an exemplary transduction protocol. The amounts or combinations of UTs may vary. Cryopreservation is optional. The cells may be used fresh or after frozen storage.

[0047] На ФИГ. 2A и 2B показаны результаты определения VCN для клеток в культуре в жидкой среде, трансдуцированных в присутствии PGE2. Для ФИГ. 2A при каждой показанной концентрации левый столбец относится к результатам для клеток, трансдуцированных 2,5х107 TU/мл, а правый столбец относится к результатам для клеток, трансдуцированных 5х107 TU/мл лентивирусного вектора.[0047] FIGS. 2A and 2B show the results of VCN determination for cells in liquid culture transduced in the presence of PGE2. For FIG. 2A, at each concentration shown, the left column refers to the results for cells transduced with 2.5 x 10 7 TU/mL and the right column refers to the results for cells transduced with 5 x 10 7 TU/mL of lentiviral vector.

[0048] На ФИГ. 3A-3C показаны результаты анализа КОК (ФИГ. 3A), определения VCN (ФИГ. 3B) и процента (%) трансдукции (ФИГ. 3C) в анализе КОК для клеток, трансдуцированных в присутствии PGE2.[0048] FIGS. 3A-3C show the results of the COC assay (FIG. 3A), VCN determination (FIG. 3B), and percent (%) transduction (FIG. 3C) in the COC assay for cells transduced in the presence of PGE2.

[0049] На ФИГ. 4 показаны результаты определения VCN для клеток в культуре в жидкой среде, трансдуцированных в присутствии LentiBOOST. [0049] FIG. 4 shows the results of VCN determination for cells in liquid culture transduced in the presence of LentiBOOST.

[0050] На ФИГ. 5A-5C показаны результаты определения VCN и процента (%) трансдукции в анализе КОК для клеток, трансдуцированных с использованием LentiBOOST.[0050] FIGS. 5A-5C show the results of VCN determination and percent (%) transduction in the COC assay for cells transduced using LentiBOOST.

[0051] На ФИГ. 6 показаны результаты определения VCN для клеток в культуре в жидкой среде, трансдуцированных с использованием одного или более из LentiBOOST (LB), PGE2 и протаминсульфата (PS).[0051] FIG. 6 shows the results of VCN determination for cells in liquid culture transduced with one or more of LentiBOOST (LB), PGE2, and protamine sulfate (PS).

[0052] На ФИГ. 7A-7E показаны результаты анализа КОК для клеток, трансдуцированных с использованием одного или более из LentiBOOST (LB), PGE2 и протаминсульфата (PS) (ФИГ. 7A), определения VCN (ФИГ. 7B) и процента (%) трансдукции в анализе КОК для клеток, трансдуцированных в присутствии только PS, или LB, PGE2 и PS (ФИГ. 7C). На ФИГ. 7D и 7E показано влияние LB, PGE2 и PS на процент трансдукции (ФИГ. 7D) и VCN (ФИГ. 7E) КОК, полученных из различных источников CD34+, включая пуповинную кровь (CB-CD34+) и мобилизованную периферическую кровь (mPB-CD34+).[0052] FIGS. 7A-7E show the results of the COC assay for cells transduced with one or more of LentiBOOST (LB), PGE2, and protamine sulfate (PS) (FIG. 7A), the determination of VCN (FIG. 7B), and the percent (%) transduction in the COC assay for cells transduced in the presence of PS alone or LB, PGE2, and PS (FIG. 7C). FIGS. 7D and 7E show the effect of LB, PGE2, and PS on the percent transduction (FIG. 7D) and VCN (FIG. 7E) of COCs obtained from various CD34+ sources, including cord blood (CB-CD34+) and mobilized peripheral blood (mPB-CD34+).

[0053] На ФИГ. 8 показаны результаты масштабирования трансдукции только с PS («без УТ») или с PS и усилителями трансдукции LB и PGE2 («с УТ»). Анализ VCN показан для клеток спустя 14 дней культивирования в жидкой среде.[0053] FIG. 8 shows the results of scaling up transduction with PS alone (“without UT”) or with PS and the transduction enhancers LB and PGE2 (“with UT”). VCN analysis is shown for cells after 14 days of culture in liquid medium.

[0054] На ФИГ. 9A-9C показаны результаты масштабирования трансдукции только с PS или PS с усилителями трансдукции LB и PGE2. На ФИГ. 9A показаны результаты анализа КОК. На ФИГ. 9B показаны результаты по VCN в КОЕ. Результаты показаны для бурстобразующих единиц эритроидного ряда (BFU-E), гранулоцитарно-макрофагальных предшественников (CFU-GM) и миелоидных предшественников (CFU-GM). На ФИГ. 9C показана эффективность трансдукции в КОК.[0054] FIGS. 9A-9C show the results of scaling up transduction with PS alone or PS with LB and PGE2 transduction enhancers. FIG. 9A shows the results of the COC assay. FIG. 9B shows the results for VCN in CFU. The results are shown for burst-forming units of the erythroid lineage (BFU-E), granulocyte-macrophage progenitors (CFU-GM), and myeloid progenitors (CFU-GM). FIG. 9C shows the transduction efficiency in COC.

[0055] На ФИГ. 10A и 10B показаны результаты in vivo для трансдуцированных CD34+ клеток только с PS или PS с усилителями трансдукции LB и PGE2, трансплантированных иммунодефицитным мышам NSG. Показан процент (%)CD45-положительных (hCD45+) клеток человека (ФИГ. 10A) и VCN/клетку (ФИГ. 10B). Результат показан через один (1), два (2) или три (3) месяца после трансплантации (мпт).[0055] FIGS. 10A and 10B show in vivo results for transduced CD34+ cells with PS alone or PS with LB and PGE2 transduction enhancers transplanted into NSG immunodeficient mice. The percentage (%) of human CD45-positive (hCD45 + ) cells (FIG. 10A) and VCN/cell (FIG. 10B) are shown. The result is shown at one (1), two (2), or three (3) months post transplantation (mpt).

[0056] На ФИГ. 11 показано VCN в культуре в жидкой среде для партии LV GMP с (+УТ) усилителями трансдукции LB и PGE2 при MOI, равной 20 или 50, или без них (-УТ).[0056] FIG. 11 shows VCN in liquid culture for a GMP LV batch with (+UT) or without (-UT) LB and PGE2 transduction enhancers at an MOI of 20 or 50.

[0057] На ФИГ. 12A-12D показаны колониеобразующие единицы (КОЕ) для всех клеток (ФИГ. 12A), BFU (ФИГ. 12B), GM (ФИГ. 12C) и смешанных миелоидных предшественников (ФИГ. 12D) для партии LV GMP с (+УТ) усилителями трансдукции LB и PGE2 или без них (-УТ).[0057] FIGS. 12A-12D show colony forming units (CFU) for total cells (FIG. 12A), BFU (FIG. 12B), GM (FIG. 12C), and mixed myeloid progenitors (FIG. 12D) for the LV GMP batch with (+UT) or without (-UT) LB and PGE2 transduction enhancers.

[0058] На ФИГ. 13A и 13B показано VCN в КОЕ для партии LV GMP с (+УТ) усилителями трансдукции LB и PGE2 или без них (-УТ) для бурстобразующих единиц эритроидного ряда (BFU-E), гранулоцитарно-макрофагальных предшественников (CFU-GM) и миелоидных предшественников (CFU-GM) при MOI 20 (ФИГ. 13A) и MOI 50 (ФИГ. 13B).[0058] FIGS. 13A and 13B show VCN in CFU for the LV GMP batch with (+UT) or without (-UT) LB and PGE2 transduction enhancers for burst-forming units of the erythroid lineage (BFU-E), granulocyte-macrophage progenitors (CFU-GM), and myeloid progenitors (CFU-GM) at MOI 20 (FIG. 13A) and MOI 50 (FIG. 13B).

[0059] На ФИГ. 14A и 14B показано VCN и эффективность трансдукции в КОЕ с (+УТ) усилителями трансдукции LB и PGE2 при MOI 20 (ФИГ. 14A) и MOI 50 (ФИГ. 14B), или без них (-УТ).[0059] FIGS. 14A and 14B show VCN and transduction efficiency in CFU with (+UT) the transduction enhancers LB and PGE2 at MOI 20 (FIG. 14A) and MOI 50 (FIG. 14B), or without (-UT).

[0060] ФИГ. 15 представляет собой схематическую карту вектора для переноса pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO.[0060] FIG. 15 is a schematic map of the pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO transfer vector.

[0061] ФИГ. 16 представляет собой схематическую карту вектора для переноса pCCL-ChimhCD18W-82-RO.[0061] FIG. 16 is a schematic map of the pCCL-ChimhCD18W-82-RO transfer vector.

[0062] ФИГ. 17 представляет собой схематическую карту вектора для переноса pCCL-PGK-coRPKW-82-RO.[0062] FIG. 17 is a schematic map of the pCCL-PGK-coRPKW-82-RO transfer vector.

[0063] ФИГ. 18 представляет собой схематическую карту вектора для переноса pRRL.PPT.EFS.tcirg1h.wpre.[0063] FIG. 18 is a schematic map of the pRRL.PPT.EFS.tcirg1h.wpre transfer vector.

ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

[0064] Настоящее изобретение относится к композициям и способам генетической модификации гемопоэтических клеток. В частности, изобретение относится к применению комбинации двух или более из простагландина E2 (PGE2), полоксамера, фрагмента рекомбинантного фибронектина и/или протаминсульфата для усиления трансдукции рекомбинантным ретровирусным вектором. Композиции и способы согласно настоящему изобретению особенно подходят для применения в генной терапии, включая лечение моногенных заболеваний и расстройств. Сложности, ограничивавшие успех генной терапии, включая низкую эффективность трансдукции, решаются с помощью предложенных в настоящем документе композиций и способов.[0064] The present invention relates to compositions and methods for genetically modifying hematopoietic cells. In particular, the invention relates to the use of a combination of two or more of prostaglandin E2 (PGE2), poloxamer, recombinant fibronectin fragment, and/or protamine sulfate to enhance transduction by a recombinant retroviral vector. The compositions and methods of the present invention are particularly suitable for use in gene therapy, including the treatment of monogenic diseases and disorders. The difficulties that have limited the success of gene therapy, including low transduction efficiency, are addressed by the compositions and methods provided herein.

A. ОпределенияA. Definitions

[0065] Если не указано иное, все технические и научные термины, используемые в настоящем документе, имеют то же значение, которое обычно понимается специалистом в области, к которой относится данное изобретение. Хотя при практическом осуществлении настоящего изобретения могут быть использованы методы и материалы, аналогичные или эквивалентные описанным в настоящем документе, подходящие методы и материалы описаны ниже. Все публикации, патентные заявки, патенты и другие источники, упомянутые в настоящем документе, полностью включены посредством ссылки. В случае противоречий преимущественную силу имеет настоящее описание, включая определения. Кроме того, материалы, методы и примеры, описанные в настоящем документе, являются лишь иллюстративными и не подразумевают ограничительного характера.[0065] Unless defined otherwise, all technical and scientific terms used herein have the same meaning as commonly understood by one of ordinary skill in the art to which this invention pertains. Although methods and materials similar or equivalent to those described herein can be used in the practice of the present invention, suitable methods and materials are described below. All publications, patent applications, patents, and other references mentioned herein are incorporated by reference in their entirety. In case of conflict, the present description, including definitions, controls. Furthermore, the materials, methods, and examples described herein are illustrative only and are not intended to be limiting.

[0066] В различных вариантах осуществления, предусмотренных в настоящем документе, будут использоваться, если специально не указано иное, обычные методы из области химии, биохимии, органической химии, молекулярной биологии, микробиологии, технологии рекомбинантных ДНК, генетики, иммунологии и клеточной биологии, которые находятся в пределах компетенции специалистов в данной области техники, и многие из таких методов описаны ниже с целью иллюстрации. Такие методы полностью описаны в литературе. См., например, Sambrook, et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (3rd Edition, 2001); Sambrook, et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2nd Edition, 1989); Maniatis et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (1982); Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology (John Wiley and Sons, updated July 2008); Short Protocols in Molecular Biology: A Compendium of Methods from Current Protocols in Molecular Biology, Greene Pub. Associates and Wiley-Interscience; Glover, DNA Cloning: A Practical Approach, vol. I & II (IRL Press, Oxford, 1985); Anand, Techniques for the Analysis of Complex Genomes, (Academic Press, New York, 1992); Transcription and Translation (B. Hames & S. Higgins, Eds., 1984); Perbal, A Practical Guide to Molecular Cloning (1984); Harlow and Lane, Antibodies, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1998) Current Protocols in Immunology Q. E. Coligan, A. M. Kruisbeek, D. H. Margulies, E. M. Shevach and W. Strober, eds., 1991); Annual Review of Immunology; а также монографии в таких журналах, как Advances in Immunology, каждый из которых прямо включен в настоящий документ посредством ссылки.[0066] The various embodiments provided herein will employ, unless otherwise specifically indicated, conventional techniques in the fields of chemistry, biochemistry, organic chemistry, molecular biology, microbiology, recombinant DNA technology, genetics, immunology, and cell biology, which are within the skill of the art, and many of such techniques are described below for illustrative purposes. Such techniques are fully described in the literature. See, for example, Sambrook, et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (3rd Edition, 2001); Sambrook, et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2nd Edition, 1989); Maniatis et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual (1982); Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology (John Wiley and Sons, updated July 2008); Short Protocols in Molecular Biology: A Compendium of Methods from Current Protocols in Molecular Biology, Greene Pub. Associates and Wiley-Interscience; Glover, DNA Cloning: A Practical Approach, vol. I & II (IRL Press, Oxford, 1985); Anand, Techniques for the Analysis of Complex Genomes, (Academic Press, New York, 1992); Transcription and Translation (B. Hames & S. Higgins, Eds., 1984); Perbal, A Practical Guide to Molecular Cloning (1984); Harlow and Lane, Antibodies, (Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y., 1998) Current Protocols in Immunology Q. E. Coligan, A. M. Kruisbeek, D. H. Margulies, E. M. Shevach and W. Strober, eds., 1991); Annual Review of Immunology; and monographs in journals such as Advances in Immunology, each of which is expressly incorporated herein by reference.

[0067] В контексте настоящего документа термин «приблизительно» или «около» относится к количеству, уровню, значению, числу, частоте, проценту, измерению, размеру, величине, массе или длине, которые варьируются на вплоть до 30, 25, 20, 25, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2 или 1% от референсного количества, уровня, значения, числа, частоты, процента, измерения, размера, величины, массы или длины. В частных вариантах осуществления термины «приблизительно» или «около», предшествующие численному значению, означают указанное значение плюс или минус диапазон, равный 15%, 10%, 5% или 1%.[0067] As used herein, the term "approximately" or "about" refers to an amount, level, value, number, frequency, percentage, measurement, size, magnitude, mass, or length that varies by up to 30, 25, 20, 25, 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, or 1% of a reference amount, level, value, number, frequency, percentage, measurement, size, magnitude, mass, or length. In particular embodiments, the terms "approximately" or "about" preceding a numerical value mean the stated value plus or minus a range of 15%, 10%, 5%, or 1%.

[0068] «Трансфекция» относится к процессу введения голой ДНК в клетки невирусными методами.[0068] "Transfection" refers to the process of introducing naked DNA into cells by non-viral methods.

[0069] «Инфицирование» относится к процессу введения чужеродной ДНК в клетки с использованием вирусного вектора.[0069] "Infection" refers to the process of introducing foreign DNA into cells using a viral vector.

[0070] «Трансдукция» относится к введению чужеродной ДНК в геном клетки с использованием вирусного вектора.[0070] "Transduction" refers to the introduction of foreign DNA into the genome of a cell using a viral vector.

[0071] «Число копий вектора» или «VCN» относится к числу копий вектора в образце, деленному на число клеток. Обычно число копий вектора определяют с помощью количественной полимеразной цепной реакции (кПЦР) с использованием зонда к последовательности Psi встроенного провируса, а число клеток определяют с помощью кПЦР с использованием зонда к гену домашнего хозяйства человека, для которого будет присутствовать две копии на клетку (по одной на хромосому).[0071] "Vector copy number" or "VCN" refers to the number of vector copies in a sample divided by the number of cells. Typically, vector copy number is determined by quantitative polymerase chain reaction (qPCR) using a probe to the Psi sequence of the inserted provirus, and cell number is determined by qPCR using a probe to a human housekeeping gene, for which there will be two copies per cell (one per chromosome).

[0072] «Эффективность трансдукции» относится к проценту клеток, трансдуцированных по меньшей мере одной копией провируса. Например, если 1 x 106 клеток подвергаются воздействию вируса, и определено, что 0,5 x 106 клеток имеют хотя бы одну копию вируса в своем геноме, то эффективность трансдукции составляет 50%. Примером способа определения эффективности трансдукции является проточная цитометрия.[0072] "Transduction efficiency" refers to the percentage of cells that are transduced with at least one copy of the provirus. For example, if 1 x 10 6 cells are exposed to a virus, and 0.5 x 10 6 cells are determined to have at least one copy of the virus in their genome, then the transduction efficiency is 50%. An example of a method for determining transduction efficiency is flow cytometry.

[0073] В контексте настоящего документа термин «ретровирус» или «ретровирусный» относится к РНК-вирусу, который осуществляет обратную транскрипцию своей геномной РНК в линейную двухцепочечную копию ДНК, и затем ковалентно встраивает свою геномную ДНК в геном хозяина. Ретровирусные векторы являются общепринятым инструментом для доставки генов (Miller, 2000, Nature. 357: 455-460). После того, как вирус встраивается в геном хозяина, его называют «провирусом». Провирус служит матрицей для РНК-полимеразы II и управляет экспрессией молекул РНК, кодируемых вирусом.[0073] As used herein, the term "retrovirus" or "retroviral" refers to an RNA virus that reverse transcribes its genomic RNA into a linear double-stranded copy of DNA and then covalently inserts its genomic DNA into the host genome. Retroviral vectors are a common tool for gene delivery (Miller, 2000, Nature. 357: 455-460). Once the virus has integrated into the host genome, it is called a "provirus." The provirus serves as a template for RNA polymerase II and directs the expression of RNA molecules encoded by the virus.

[0074] Иллюстративные ретровирусы (семейство Retroviridae) включают, не ограничиваясь перечисленным: (1) род гаммаретровирусов, например, вирус мышиного лейкоза Молони (M-MuLV), вирус мышиной саркомы Молони (MoMSV), вирус рака молочной железы мышей (MuMTV), вирус лейкоза гиббонов (GaLV) и вирус лейкоза кошачьих (FLV), (2) род спумавирусов, например, обезьяний пенистый вирус, (3) род лентивирусов, например, вирус иммунодефицита человека-1 и вирус иммунодефицита обезьян.[0074] Illustrative retroviruses (family Retroviridae) include, but are not limited to: (1) the gammaretrovirus genus, such as Moloney murine leukemia virus (M-MuLV), Moloney murine sarcoma virus (MoMSV), murine mammary cancer virus (MuMTV), gibbon leukemia virus (GaLV), and feline leukemia virus (FLV), (2) the spumavirus genus, such as simian foamy virus, (3) the lentivirus genus, such as human immunodeficiency virus-1 and simian immunodeficiency virus.

[0075] В контексте настоящего документа термин «лентивирусный» или «лентивирус» относится к группе (или роду) сложных ретровирусов. Иллюстративные лентивирусы включают, не ограничиваясь перечисленным: ВИЧ (вирус иммунодефицита человека); включая ВИЧ 1 типа и ВИЧ 2 типа; вирус висна-маеди (VMV); вирус артрита-энцефалита коз и овец (CAEV); вирус инфекционной анемии лошадей (EIAV); вирус иммунодефицита кошачьих (FIV); вирус иммунодефицита крупного рогатого скота (BIV); и вирус иммунодефицита обезьян (SIV). В одном из вариантов осуществления предпочтительными являются векторные остовы на основе ВИЧ (т. е. цис-действующие элементы последовательности ВИЧ).[0075] As used herein, the term "lentiviral" or "lentivirus" refers to a group (or genus) of complex retroviruses. Exemplary lentiviruses include, but are not limited to: HIV (human immunodeficiency virus); including HIV type 1 and HIV type 2; visna-maedi virus (VMV); caprine and ovine arthritis encephalitis virus (CAEV); equine infectious anemia virus (EIAV); feline immunodeficiency virus (FIV); bovine immunodeficiency virus (BIV); and simian immunodeficiency virus (SIV). In one embodiment, HIV-based vector backbones (i.e., cis-acting elements of the HIV sequence) are preferred.

[0076] Ретровирусные векторы и, в частности, лентивирусные векторы, могут быть использованы при практическом осуществлении настоящего изобретения. Соответственно, подразумевается, что термин «ретровирусный вектор» в контексте настоящего документа включает «лентивирусный вектор»; и термин «ретровирус» в контексте настоящего документа включает «лентивирус».[0076] Retroviral vectors, and in particular lentiviral vectors, may be used in the practice of the present invention. Accordingly, the term "retroviral vector" as used herein is intended to include "lentiviral vector"; and the term "retrovirus" as used herein is intended to include "lentivirus".

[0077] Термин «вектор» в контексте настоящего документа обозначает молекулу нуклеиновой кислоты, способную переносить или транспортировать другую молекулу нуклеиновой кислоты. Переносимая нуклеиновая кислота обычно связана с молекулой нуклеиновой кислоты вектора, например, встроена в нее. Вектор может включать последовательности, управляющие автономной репликацией или обратной транскрипцией в клетке, или может включать последовательности, достаточные для встраивания в ДНК клетки-хозяина. Подходящие векторы включают вирусные векторы. Подходящие вирусные векторы включают, например, дефектные по репликации ретровирусы и лентивирусы.[0077] The term "vector" as used herein refers to a nucleic acid molecule capable of transferring or transporting another nucleic acid molecule. The transferred nucleic acid is typically linked to, for example, integrated into, the nucleic acid molecule of the vector. The vector may include sequences that direct autonomous replication or reverse transcription in the cell, or may include sequences sufficient for integration into the DNA of the host cell. Suitable vectors include viral vectors. Suitable viral vectors include, for example, replication-defective retroviruses and lentiviruses.

[0078] Термин «вирусный вектор» может относиться либо к вектору, либо к векторной частице, способной переносить нуклеиновую кислоту в клетку, или к самой переносимой нуклеиновой кислоте. Вирусные векторы содержат структурные и/или функциональные генетические элементы, которые в основном происходят из вируса. Термин «ретровирусный вектор» относится к вирусному вектору, содержащему структурные и функциональные генетические элементы или их части, которые в основном происходят из ретровируса. Термин «лентивирусный вектор» относится к вирусному вектору, содержащему структурные и функциональные генетические элементы или их части, включая LTR, которые в основном происходят из лентивируса. Термин «гибрид» относится к вектору, LTR или другой нуклеиновой кислоте, содержащим как ретровирусные, например, лентивирусные, последовательности, так и нелентивирусные вирусные последовательности. В одном из вариантов осуществления гибридный вектор относится к вектору или плазмиде для переноса, содержащим ретровирусные, например, лентивирусные, последовательности для обратной транскрипции, репликации, встраивания и/или упаковки.[0078] The term "viral vector" may refer to either a vector, a vector particle capable of transferring a nucleic acid into a cell, or the nucleic acid being transferred itself. Viral vectors contain structural and/or functional genetic elements that are primarily derived from a virus. The term "retroviral vector" refers to a viral vector containing structural and functional genetic elements or portions thereof that are primarily derived from a retrovirus. The term "lentiviral vector" refers to a viral vector containing structural and functional genetic elements or portions thereof, including LTRs, that are primarily derived from a lentivirus. The term "hybrid" refers to a vector, LTR, or other nucleic acid containing both retroviral, such as lentiviral, sequences, and non-lentiviral viral sequences. In one embodiment, a hybrid vector refers to a vector or transfer plasmid containing retroviral, such as lentiviral, sequences for reverse transcription, replication, insertion and/or packaging.

[0079] В частных вариантах осуществления термины «лентивирусный вектор» и «лентивирусный вектор экспрессии» могут использоваться для обозначения лентивирусных плазмид для переноса и/или инфекционных лентивирусных частиц. Если в настоящем документе делается ссылка на такие элементы, как сайты клонирования, промоторы, регуляторные элементы, гетерологичные нуклеиновые кислоты и т. д., следует иметь в виду, что последовательности этих элементов присутствуют в форме РНК в лентивирусных частицах согласно изобретению и присутствуют в форме ДНК в ДНК-плазмидах согласно изобретению.[0079] In particular embodiments, the terms "lentiviral vector" and "lentiviral expression vector" may be used to refer to lentiviral transfer plasmids and/or infectious lentiviral particles. When reference is made herein to elements such as cloning sites, promoters, regulatory elements, heterologous nucleic acids, etc., it is understood that the sequences of these elements are present in the form of RNA in the lentiviral particles of the invention and are present in the form of DNA in the DNA plasmids of the invention.

[0080] Согласно некоторым частным вариантам осуществления большая часть или все последовательности остова вирусного вектора происходят из лентивируса, например, ВИЧ-1. Однако следует иметь в виду, что может быть использовано множество различных источников лентивирусных последовательностей, и в некоторых из лентивирусных последовательностей может быть сделано множество замен и изменений, не оказывающих отрицательного влияния на способность вектора для переноса выполнять описанные в настоящем документе функции. Более того, в данной области техники известно множество лентивирусных векторов, см. Naldini et al., (1996a, 1996b и 1998); Zufferey et al., (1997); Dull et al., 1998, патенты США № 6,013,516 и 5,994,136, многие из которых могут быть адаптированы для получения вирусного вектора или плазмиды для переноса согласно настоящему изобретению.[0080] In some particular embodiments, most or all of the backbone sequences of the viral vector are derived from a lentivirus, such as HIV-1. However, it will be appreciated that many different sources of lentiviral sequences may be used, and many substitutions and changes may be made in some of the lentiviral sequences without adversely affecting the ability of the transfer vector to perform the functions described herein. Moreover, many lentiviral vectors are known in the art, see Naldini et al., (1996a, 1996b, and 1998); Zufferey et al., (1997); Dull et al., 1998, U.S. Patent Nos. 6,013,516 and 5,994,136, many of which may be adapted to produce the viral vector or transfer plasmid of the present invention.

[0081] В контексте настоящего документа термины «полинуклеотид» или «нуклеиновая кислота» в общем смысле относятся к биополимеру, содержащему нуклеотидные мономеры, ковалентно связанные в цепь, такую как ДНК и РНК. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид относится к геномной ДНК (гДНК), комплементарной ДНК (кДНК) или ДНК. Полинуклеотиды включают одно- и двухцепочечные полинуклеотиды, рекомбинантные, синтетические или выделенные. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид относится к матричной РНК (мРНК), РНК, геномной РНК (гРНК), плюс-цепи РНК (РНК (+)), минус-цепи РНК (РНК (-)). В контексте настоящего документа термины «полирибонуклеотид» или «рибонуклеиновая кислота» также относятся к матричной РНК (мРНК), РНК, геномной РНК (гРНК), плюс-цепи РНК (РНК (+)), минус-цепи РНК (РНК (-)). Предпочтительно полинуклеотиды согласно изобретению включают полинуклеотиды или варианты, обладающие по меньшей мере приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью последовательности любой из референсных последовательностей, описанных в настоящем документе (см., например, Перечень последовательностей), как правило, где вариант сохраняет по крайней мере одну биологическую активность референсной последовательности. В различных иллюстративных вариантах осуществления предусмотрены полинуклеотидные последовательности вирусных векторов и плазмид для переноса, и содержащие их композиции. В частных вариантах осуществления предусмотрены полинуклеотиды, кодирующие один или более терапевтических полипептидов и/или другие представляющие интерес гены. В частных вариантах осуществления полинуклеотиды, кодирующие терапевтический полипептид, включают, не ограничиваясь перечисленным, гены RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A и OSTM1. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотиды представляют собой кодон-оптимизированные варианты любого из этих генов. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотиды кодируют полипептид человека или его функциональный фрагмент или вариант, такой как, например, полипептид, кодируемый любым из раскрытых генов.[0081] As used herein, the terms "polynucleotide" or "nucleic acid" generally refer to a biopolymer comprising nucleotide monomers covalently linked into a chain, such as DNA and RNA. In some embodiments, a polynucleotide refers to genomic DNA (gDNA), complementary DNA (cDNA), or DNA. Polynucleotides include single- and double-stranded polynucleotides, recombinant, synthetic, or isolated. In some embodiments, a polynucleotide refers to messenger RNA (mRNA), RNA, genomic RNA (gRNA), plus-strand RNA (RNA(+)), minus-strand RNA (RNA(-)). As used herein, the terms "polyribonucleotide" or "ribonucleic acid" also refer to messenger RNA (mRNA), RNA, genomic RNA (gRNA), plus-strand RNA (RNA(+)), minus-strand RNA (RNA(-)). Preferably, the polynucleotides of the invention include polynucleotides or variants having at least about 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% sequence identity to any of the reference sequences described herein (see, e.g., the Sequence Listing), typically wherein the variant retains at least one biological activity of the reference sequence. In various exemplary embodiments, polynucleotide sequences of viral vectors and transfer plasmids, and compositions comprising them, are provided. In particular embodiments, polynucleotides encoding one or more therapeutic polypeptides and/or other genes of interest are provided. In particular embodiments, polynucleotides encoding a therapeutic polypeptide include, but are not limited to, the RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A, and OSTM1 genes. In some embodiments, the polynucleotides are codon-optimized versions of any of these genes. In some embodiments, the polynucleotides encode a human polypeptide or a functional fragment or variant thereof, such as, for example, a polypeptide encoded by any of the disclosed genes.

[0082] В контексте настоящего документа «псевдотипированный» вектор относится к вектору, имеющему рекомбинантный белок капсида или оболочки, который отличается от белка капсида или оболочки нативного вектора. Например, псевдотипированный VSVG лентивирусный вектор представляет собой вектор, созданный путем совместной экспрессии в пакующей клеточной линии белка оболочки вируса VSVG с РНК-геномом вируса таким образом, чтобы обеспечить включение белка оболочки VSVG в вирусные частицы, содержащие РНК-геном. Псевдотипированные векторы могут иметь измененный тропизм и/или пониженную иммуногенность, что делает их желательными для применения в генной терапии. Создание псевдотипированного вектора, а также изменение псевдотипирования вектора путем создания вирусных частиц в другой пакующей клеточной линии или путем совместной экспрессии белка оболочки (или белка капсида) из плазмиды или другой ДНК, кодирующей другой белок оболочки (или белок капсида), находится в компетенции специалистов в данной области техники. Примеры способов представлены в Cronin et al. Curr. Gene Ther. 5:387-398 (2005). В некоторых вариантах осуществления способы согласно изобретению включают использование псевдотипированных рекомбинантных ретровирусных векторов (например, лентивирусных векторов). В некоторых вариантах осуществления псевдотипированные рекомбинантные ретровирусные векторы псевдотипированы VSVG.[0082] As used herein, a "pseudotyped" vector refers to a vector that has a recombinant capsid or coat protein that differs from the capsid or coat protein of the native vector. For example, a pseudotyped VSVG lentiviral vector is a vector that is created by coexpressing the VSVG viral coat protein with the RNA genome of the virus in a packaging cell line in a manner that ensures that the VSVG coat protein is included in viral particles containing the RNA genome. Pseudotyped vectors may have altered tropism and/or reduced immunogenicity, making them desirable for use in gene therapy. The creation of a pseudotyped vector, as well as altering the pseudotyping of a vector by creating viral particles in a different packaging cell line or by coexpressing the coat protein (or capsid protein) from a plasmid or other DNA encoding a different coat protein (or capsid protein), is within the skill of the art. Examples of methods are provided in Cronin et al. Curr. Gene Ther. 5:387-398 (2005). In some embodiments, the methods of the invention involve the use of pseudotyped recombinant retroviral vectors (e.g., lentiviral vectors). In some embodiments, the pseudotyped recombinant retroviral vectors are pseudotyped with VSVG.

[0083] Под «усиливать», или «способствовать», или «увеличивать», или «расширять» обычно понимается способность композиций и/или способов, рассматриваемых в настоящем документе, вызывать, быть причиной или продуцировать большее количество трансдуцированных клеток по сравнению с количеством клеток, трансдуцированных либо носителем, либо контрольной молекулой/композицией, либо вызвать, быть причиной или продуцировать более высокое VCN в популяции трансдуцированных клеток. В одном из вариантов осуществления гемопоэтическая стволовая клетка или клетка-предшественник, трансдуцированная композициями и способами, рассматриваемыми в настоящем документе, характеризуется увеличением количества трансдуцированных клеток по сравнению с существующими композициями и способами для трансдукции, или характеризуется увеличением VCN в популяции трансдуцированных клеток. Увеличение трансдукции клеток может быть установлено с использованием способов, известных в данной области техники, таких как, среди прочего, репортерные анализы, ПЦР в реальном времени и экспрессия белков клеточной поверхности. «Увеличенная» или «усиленная» величина трансдукции обычно является «статистически значимой» величиной и может включать увеличение в 1,1, 1,2, 1,5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 30 или более раз (например, в 500, 1000 раз) (включая все целые числа и десятичные значения между ними и выше 1, например, 1,5, 1,6, 1,7, 1,8 и т. д.) по сравнению с количеством клеток, трансдуцированных носителем, контрольной композицией или другим методом трансдукции.[0083] By "enhance" or "promote" or "increase" or "expand" is generally meant the ability of the compositions and/or methods provided herein to induce, cause, or produce a greater number of transduced cells than the number of cells transduced with either a carrier or a control molecule/composition, or to induce, cause, or produce a higher VCN in a population of transduced cells. In one embodiment, a hematopoietic stem or progenitor cell transduced with the compositions and methods provided herein has an increase in the number of transduced cells than existing compositions and methods for transduction, or has an increase in VCN in a population of transduced cells. An increase in cell transduction can be determined using methods known in the art, such as, among others, reporter assays, real-time PCR, and cell surface protein expression. An "increased" or "enhanced" amount of transduction is typically a "statistically significant" amount and may include an increase of 1.1, 1.2, 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 30 or more times (e.g., 500, 1000 times) (including all integers and decimal values between and above 1, e.g., 1.5, 1.6, 1.7, 1.8, etc.) compared to the number of cells transduced by a vehicle, control composition, or other transduction method.

[0084] Под «уменьшать» или «понижать», или «убавлять», или «снижать», или «ослаблять» обычно понимаются композиции или способы, обеспечивающие сравнительно меньшее количество трансдуцированных клеток по сравнению с клетками, трансдуцированными с помощью композиций и/или способов согласно настоящему изобретению. «Уменьшенная» или «сниженная» величина трансдукции обычно является «статистически значимой» величиной и может включать уменьшение в 1,1, 1,2, 1,5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 30 или более раз (например, в 500, 1000 раз) (включая все целые числа и десятичные значения между ними и выше 1, например, 1,5, 1,6, 1,7, 1,8 и т. д.) по сравнению с количеством трансдуцированных клеток (референсный ответ), полученных с помощью композиций и/или способов согласно настоящему изобретению.[0084] By “reduce” or “lower” or “reduce” or “reduce” or “attenuate” is generally meant compositions or methods that provide a comparatively smaller number of transduced cells compared to cells transduced using the compositions and/or methods of the present invention. A “reduced” or “decreased” transduction amount is typically a “statistically significant” amount and may include a decrease of 1.1, 1.2, 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 30 or more times (e.g., 500, 1000 times) (including all integers and decimal values between and above 1, e.g., 1.5, 1.6, 1.7, 1.8, etc.) compared to the number of transduced cells (reference response) obtained using the compositions and/or methods of the present invention.

[0085] Под «поддерживать», или «сохранять», или «поддержание», или «отсутствие изменений», или «без существенных изменений», или «без существенного уменьшения» обычно понимают физиологический ответ, сопоставимый с ответом, вызванным носителем, контрольной молекулой/композицией, или ответом в определенной клетке. Сопоставимый ответ представляет собой ответ, по существу не отличающийся или не отличающийся в поддающейся измерению степени от референсного ответа.[0085] By "maintain" or "preserve" or "maintain" or "no change" or "no significant change" or "no significant decrease" is generally meant a physiological response that is comparable to the response elicited by a carrier, a control molecule/composition, or a response in a particular cell. A comparable response is a response that is not substantially different or not different to a measurable extent from a reference response.

[0086] В нижеследующем описании изложены определенные частные подробности, чтобы обеспечить полное понимание различных иллюстративных вариантов осуществления изобретения, предусмотренных в настоящем документе. Однако специалисту в данной области техники будет понятно, что частные иллюстративные варианты осуществления могут быть реализованы на практике без этих подробностей. Кроме того, следует иметь в виду, что отдельные векторы или группы векторов, полученные из различных комбинаций описанных в настоящем документе структур и заместителей, раскрыты в настоящей заявке в той же степени, как если бы каждый вектор или группа векторов были указаны по отдельности. Таким образом, выбор конкретных структур векторов или конкретных заместителей находится в пределах объема настоящего изобретения.[0086] In the following description, certain specific details are set forth in order to provide a thorough understanding of the various illustrative embodiments of the invention provided herein. However, one skilled in the art will appreciate that certain illustrative embodiments may be practiced without these details. Furthermore, it should be understood that individual vectors or groups of vectors derived from various combinations of the structures and substituents described herein are disclosed herein to the same extent as if each vector or group of vectors were individually recited. Thus, the selection of particular vector structures or particular substituents is within the scope of the present invention.

[0087] В контексте настоящего документа «X-VIVO 20» или «X-VIVO» относятся к бессывороточной среде с химически определенным составом для гемопоэтических клеток X-VIVO™ 20, доступной от Lonza®. Могут быть использованы среды, отличные от X-VIVO 20, и специалисты в данной области техники способны выбрать подходящие среды для выращивания и трансдукции клеток.[0087] As used herein, "X-VIVO 20" or "X-VIVO" refers to the chemically defined serum-free hematopoietic cell medium X-VIVO™ 20, available from Lonza®. Media other than X-VIVO 20 may be used, and those skilled in the art are able to select appropriate media for cell growth and transduction.

[0088] В контексте настоящего документа «rhSCF» относится к рекомбинантному фактору стволовых клеток человека.[0088] As used herein, "rhSCF" refers to recombinant human stem cell factor.

[0089] В контексте настоящего документа «rhTPO» относится к рекомбинантному тромбопоэтину человека.[0089] As used herein, "rhTPO" refers to recombinant human thrombopoietin.

[0090] В контексте настоящего документа «rh-FLT3-L» относится к рекомбинантному лиганду fms-подобной тирозинкиназы 3 человека.[0090] As used herein, "rh-FLT3-L" refers to a recombinant human fms-like tyrosine kinase 3 ligand.

[0091] В контексте настоящего документа «IL-3» или «rhIL-3» относится к рекомбинантному интерлейкину-3 человека.[0091] As used herein, "IL-3" or "rhIL-3" refers to recombinant human interleukin-3.

[0092] В контексте настоящего документа «PGE2» относится к простагландину E2 (PGE2), также известному как динопростон.[0092] As used herein, “PGE2” refers to prostaglandin E2 (PGE2), also known as dinoprostone.

[0093] В контексте настоящего документа «полоксамер» относится к неионогенным триблок-сополимерам, состоящим из центральной гидрофобной цепи полиоксипропилена (поли(пропиленоксида)) с двумя гидрофильными цепями полиоксиэтилена (поли(этиленоксида)) по бокам.[0093] As used herein, "poloxamer" refers to nonionic triblock copolymers consisting of a central hydrophobic chain of polyoxypropylene (poly(propylene oxide)) flanked by two hydrophilic chains of polyoxyethylene (poly(ethylene oxide)) on either side.

[0094] В контексте настоящего документа «фрагмент рекомбинантного фибронектина» относится к любому фрагменту белка фибронектина, который способствует повышению эффективности трансдукции. Не ограничиваясь какой-либо конкретной теорией, полагают, что фрагмент рекомбинантного фибронектина способствует колокализации лентивируса или ретровируса с клетками-мишенями. Примером фрагмента рекомбинантного фибронектина является фрагмент CH296 фибронектина человека, имеющий торговое наименование RetroNectin™.[0094] As used herein, a "recombinant fibronectin fragment" refers to any fragment of the fibronectin protein that enhances transduction efficiency. Without wishing to be bound by any particular theory, it is believed that a recombinant fibronectin fragment promotes colocalization of a lentivirus or retrovirus with target cells. An example of a recombinant fibronectin fragment is the CH296 fragment of human fibronectin, which has the trade name RetroNectin™.

[0095] Концентрации PGE2 или его производного, полоксамера или протаминсульфата, приведенные в описании и формуле изобретения, относятся к концентрации каждого агента в среде, в которой культивируются клетки.[0095] The concentrations of PGE2 or its derivative, poloxamer or protamine sulfate given in the description and claims refer to the concentration of each agent in the medium in which the cells are cultured.

[0096] В контексте настоящего документа «LB» или «LentiBoost» относится к усилителю трансдукции LentiBOOST™, доступному от Sirion Biotech®. Синонимы включают полоксамер 338, F108 и Kolliphor® P338.[0096] As used herein, "LB" or "LentiBoost" refers to the LentiBOOST™ transduction enhancer available from Sirion Biotech®. Synonyms include poloxamer 338, F108, and Kolliphor® P338.

[0097] В контексте настоящего документа «HSA» относится к сывороточному альбумину человека.[0097] As used herein, "HSA" refers to human serum albumin.

[0098] В контексте настоящего документа «ДМСО» относится к диметилсульфоксиду.[0098] As used herein, "DMSO" refers to dimethyl sulfoxide.

[0099] В контексте настоящего документа «КОК» относится к колониеобразующим клеткам. Анализ колониеобразующих клеток (КОК) используется для изучения характера пролиферации и дифференцировки гемопоэтических предшественников по их способности образовывать колонии в полутвердой среде. Количество и морфология колоний, образованных фиксированным количеством исходных клеток, дают предварительную информацию о способности предшественников к дифференцировке и пролиферации. Примеры анализов представлены в Sarma et al. Colony forming cell (CFC) assay for human hematopoietic cells. J Vis Exp. 2010 Dec 18;(46).[0099] As used herein, "CFC" refers to colony-forming cells. The colony-forming cell (CFC) assay is used to study the proliferation and differentiation patterns of hematopoietic progenitors by their ability to form colonies in a semi-solid medium. The number and morphology of colonies formed by a fixed number of initial cells provide preliminary information on the differentiation and proliferation capacity of the progenitors. Examples of assays are provided in Sarma et al. Colony forming cell (CFC) assay for human hematopoietic cells. J Vis Exp. 2010 Dec 18;(46).

[00100] В контексте настоящего документа «LC» относится к «культуре в жидкой среде».[00100] In the context of this document, "LC" refers to "liquid culture".

[00101] В контексте настоящего документа «КОЕ» относится к колониеобразующим единицам. КОЕ считается синонимом КОК, но иногда используется в отношении типов КОЕ, растущих в полутвердых средах.[00101] As used herein, "CFU" refers to colony forming units. CFU is considered synonymous with COC, but is sometimes used to refer to CFU types that grow in semi-solid media.

[00102] В контексте настоящего документа «TU» относится к трансдуцирующим единицам. TU/мл представляет собой общепринятую меру функционального титра ретровирусного (лентивирусного) препарата.[00102] As used herein, "TU" refers to transducing units. TU/mL is a commonly accepted measure of the functional titer of a retroviral (lentiviral) product.

[00103] В контексте настоящего документа «PS» относится к протаминсульфату.[00103] As used herein, "PS" refers to protamine sulfate.

[00104] В контексте настоящего документа «УТ» относится к одному или более усилителям трансдукции.[00104] As used herein, "UT" refers to one or more transduction enhancers.

[00105] В контексте настоящего документа «свежие клетки CB» относится к свежим клеткам пуповинной крови.[00105] As used herein, "fresh CB cells" refers to fresh cord blood cells.

[00106] В контексте настоящего документа «MOI» относится к множественности заражения.[00106] In the context of this document, "MOI" refers to multiplicity of infection.

[00107] В контексте настоящего документа «BFU-E» относится к бурстобразующим единицам эритроидного ряда (BFU-E), самым ранним эритроидным предшественникам.[00107] As used herein, "BFU-E" refers to burst-forming units of the erythroid lineage (BFU-E), the earliest erythroid precursors.

[00108] В контексте настоящего документа «CFU-GM» относится к колониеобразующим единицам гранулоцитарно-макрофагальных предшественников.[00108] As used herein, "CFU-GM" refers to colony-forming units of granulocyte-macrophage progenitors.

[00109] В контексте настоящего документа «CFU-GEMM» относится к колониеобразующим единицам миелоидных стволовых клеток (гранулоцитов, эритроцитов, моноцитов, мегакариоцитов).[00109] As used herein, "CFU-GEMM" refers to colony forming units of myeloid stem cells (granulocytes, erythrocytes, monocytes, megakaryocytes).

[00110] В контексте настоящего документа «mPB» относится к мобилизованным клеткам периферической крови.[00110] As used herein, "mPB" refers to mobilized peripheral blood cells.

[00111] В контексте настоящего документа «SCGM» относится к бессывороточной среде SCGM (питательная среда для стволовых клеток) от CellGenix®.[00111] As used herein, "SCGM" refers to the serum-free SCGM (stem cell growth medium) from CellGenix®.

[00112] Термины «введение» или «предоставление» в контексте настоящего документа относятся к доставке популяции гемопоэтических клеток субъекту, например, путем инфузии указанной популяции клеток субъекту внутриартериально или внутривенно. Популяция гемопоэтических клеток может быть введена в различных растворах, таких как физиологический раствор. В некоторых вариантах осуществления используемый раствор будет изотоничным крови субъекта и иметь забуференный pH.[00112] The terms "administering" or "providing" as used herein refer to delivering a population of hematopoietic cells to a subject, such as by infusing said population of cells into the subject intra-arterially or intravenously. The population of hematopoietic cells may be administered in various solutions, such as saline. In some embodiments, the solution used will be isotonic with the blood of the subject and have a buffered pH.

[00113] Обычно клетка называется «трансдуцированной» после введения вирусным вектором или векторной частицей гетерологичной ДНК (например, вектора или его кассеты экспрессии) в геном указанной клетки.[00113] A cell is typically said to be "transduced" after a viral vector or vector particle has introduced heterologous DNA (e.g., a vector or its expression cassette) into the genome of said cell.

[00114] Термин «клетка-хозяин» в контексте настоящего документа относится к клетке, трансдуцированной вирусным вектором или векторной частицей. Следует иметь в виду, что термин «клетка-хозяин» относится к исходной трансдуцированной клетке и ее потомству.[00114] The term "host cell" as used herein refers to a cell transduced with a viral vector or vector particle. It should be understood that the term "host cell" refers to the original transduced cell and its progeny.

[00115] Термины «лечение», «лечить» и тому подобные в настоящем документе в общем смысле означают достижение желаемого фармакологического и/или физиологического эффекта. Эффект может быть профилактическим с точки зрения полного или частичного предотвращения заболевания или его симптома, например, снижения вероятности того, что заболевание или его симптом возникнет у субъекта, и/или может быть терапевтическим с точки зрения частичного или полного излечения заболевания и/или нежелательного явления, связанного с заболеванием. «Лечение» в контексте настоящего документа охватывает любое лечение заболевания у млекопитающего и включает: (a) предотвращение возникновения заболевания у субъекта, который может быть предрасположен к его развитию, но у которого оно еще не было диагностировано; (b) подавление заболевания, т. е. остановку его развития; или (c) облегчение заболевания, т. е. способствование регрессии заболевания. Терапевтический агент может быть введен до, во время или после начала заболевания или травмы. Особый интерес представляет лечение текущего заболевания, при котором лечение стабилизирует или уменьшает нежелательные клинические симптомы у пациента. Такое лечение желательно проводить до полной утраты функции в пораженных тканях. Желательно, чтобы рассматриваемая терапия проводилась во время симптоматической стадии заболевания, а в некоторых случаях - после симптоматической стадии заболевания.[00115] The terms "treatment," "treat," and the like, as used herein, generally mean achieving a desired pharmacological and/or physiological effect. The effect may be prophylactic in terms of completely or partially preventing a disease or symptom thereof, such as reducing the likelihood that the disease or symptom thereof will occur in a subject, and/or may be therapeutic in terms of partially or completely curing the disease and/or an adverse event associated with the disease. "Treatment" as used herein encompasses any treatment of a disease in a mammal and includes: (a) preventing the onset of a disease in a subject that may be predisposed to developing it but has not yet been diagnosed with it; (b) suppressing the disease, i.e., stopping its progression; or (c) alleviating the disease, i.e., promoting regression of the disease. The therapeutic agent may be administered before, during, or after the onset of a disease or injury. Of particular interest is the treatment of the ongoing disease, in which the treatment stabilizes or reduces undesirable clinical symptoms in the patient. Such treatment is preferably carried out until complete loss of function in the affected tissues. It is desirable that the therapy in question be carried out during the symptomatic stage of the disease, and in some cases - after the symptomatic stage of the disease.

[00116] Термины «индивидуум», «хозяин», «субъект» и «пациент» используются в настоящем документе взаимозаменяемо и относятся к млекопитающему, включая, не ограничиваясь перечисленным, человека и нечеловекообразных приматов, включая обезьян и людей; животных для спорта из числа млекопитающих (например, лошадей); сельскохозяйственных животных из числа млекопитающих (например, овец, коз и т. д.); домашних животных из числа млекопитающих (собак, кошек и т. д.); и грызунов (например, мышей, крыс и т. д.).[00116] The terms "individual," "host," "subject," and "patient" are used interchangeably herein and refer to a mammal, including, but not limited to, humans and non-human primates, including monkeys and humans; mammalian sport animals (e.g., horses); mammalian farm animals (e.g., sheep, goats, etc.); mammalian domestic animals (dogs, cats, etc.); and rodents (e.g., mice, rats, etc.).

B. Варианты осуществления и вариацииB. Implementation Options and Variations

[00117] Ниже описаны различные композиции и способы. Хотя в настоящем документе приведены примеры частных вариантов композиций и способов, понятно, что любая из ряда альтернативных композиций и способов применима и подходит для применения при практическом осуществлении раскрытых в настоящем документе композиций и способов. Также ясно, что оценку конструкций экспрессии и способов, раскрытых в настоящем документе, можно проводить с использованием процедур, являющихся стандартными в данной области техники.[00117] Various compositions and methods are described below. Although particular embodiments of compositions and methods are exemplified herein, it is understood that any of a number of alternative compositions and methods are applicable and suitable for use in practicing the compositions and methods disclosed herein. It is also understood that evaluation of the expression constructs and methods disclosed herein can be performed using procedures that are standard in the art.

1. Трансдукция с использованием комбинаций усилителей трансдукции1. Transduction using combinations of transduction enhancers

[00118] В настоящем изобретении предложены обеспечивающие преимущества способы трансдукции гемопоэтических клеток лентивирусными векторами с получением популяции гемопоэтических клеток, имеющих высокий процент клеток, трансдуцированных лентивирусным вектором. Эти способы особенно предпочтительны для трансдукции гемопоэтических клеток с помощью лентивирусных векторов для генной терапии для исправления генетического дефекта, поскольку они позволяют получить большое количество клеток, экспрессирующих функциональный продукт скорректированного гена, введенного лентивирусным вектором для генной терапии.[00118] The present invention provides advantageous methods for transducing hematopoietic cells with lentiviral vectors to produce a population of hematopoietic cells having a high percentage of cells transduced with the lentiviral vector. These methods are particularly advantageous for transducing hematopoietic cells with lentiviral gene therapy vectors to correct a genetic defect because they produce a large number of cells expressing a functional product of a corrected gene introduced by the lentiviral gene therapy vector.

[00119] В данной области техники известны различные усилители трансдукции, включая полибрен, протаминсульфат, ретронектин (фрагмент рекомбинантного фибронектина) и ДЭАЭ-декстран. В некоторых случаях в качестве усилителей трансдукции использовали поликатионные агенты, такие как полибрен. Denning et al. Mol Biotechnol. 2013 Mar; 53(3): 308-314. Кроме того, в качестве усилителей трансдукции используются рапамицин и циклоспорин А. Однако в настоящем изобретении обнаружены определенные комбинации усилителей трансдукции, которые обеспечивают значительно более высокие уровни лентивирусной трансдукции гемопоэтических клеток по сравнению с использованием каждого из таких усилителей трансдукции по отдельности.[00119] Various transduction enhancers are known in the art, including polybrene, protamine sulfate, retronectin (a fragment of recombinant fibronectin), and DEAE-dextran. In some cases, polycationic agents such as polybrene have been used as transduction enhancers. Denning et al. Mol Biotechnol. 2013 Mar; 53(3): 308-314. In addition, rapamycin and cyclosporin A have been used as transduction enhancers. However, the present invention has discovered certain combinations of transduction enhancers that provide significantly higher levels of lentiviral transduction of hematopoietic cells compared to using each of such transduction enhancers alone.

[00120] В одном из аспектов изобретения предложен способ генетической модификации гемопоэтических клеток, включающий: приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с по меньшей мере двумя усилителями трансдукции, выбранными из простагландина E2 (PGE2) или его производного, полоксамера, протаминсульфата и фрагмента рекомбинантного фибронектина; и приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с рекомбинантным ретровирусным вектором. Клетки могут быть приведены в контакт с ретровирусным вектором в условиях и в течение времени, достаточных для обеспечения трансдукции клеток ретровирусным вектором, например, в подходящей культуральной среде в течение по меньшей мере одного часа, по меньшей мере двух часов, по меньшей мере четырех часов, по меньшей мере восьми часов, по меньшей мере двенадцати часов или по меньшей мере 16 часов. В некоторых вариантах осуществления клетки трансдуцируют один раз или два раза подряд, например, после предварительной стимуляции, причем каждый цикл трансдукции составляет от 12 до 24 часов или от 16 до 18 часов. В некоторых вариантах осуществления клетки приводят в контакт с ретровирусным вектором и усилителями трансдукции в одно и то же время или в течение частично совпадающего периода времени. В некоторых вариантах осуществления клетки приводят в контакт с усилителями трансдукции и рекомбинантным ретровирусным вектором в одно и то же время или в течение частично совпадающего периода времени. В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат полоксамер. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат полоксамер и PGE2 или его производное, или состоят из них. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат полоксамер и протаминсульфат, или состоят из них. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат полоксамер, PGE2 и протаминсульфат, или состоят из них. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат простагландин E2 (PGE2) или его производное, полоксамер, протаминсульфат и фрагмент рекомбинантного фибронектина, или состоят из них. В различных вариантах осуществления любого из аспектов и вариантов осуществления, раскрытых в настоящем документе, клетки трансдуцируют на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin™. В различных вариантах осуществления клетки подвергают предварительной обработке путем культивирования на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin™, до и/или во время трансдукции. В отдельных вариантах осуществления способ включает предварительную стимуляцию путем культивирования клеток на планшетах, покрытых приблизительно 2 мкг/см2 RetroNectin™ (RN). В некоторых вариантах осуществления клетки трансдуцируют в жидкой среде, содержащей Retro-Nectin™. В некоторых вариантах осуществления клетки подвергают предварительной обработке путем культивирования на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, а также трансдуцируют в культуре в жидкой среде в присутствии фрагмента рекомбинантного фибронектина и других УТ. [00120] In one aspect of the invention, there is provided a method for genetically modifying hematopoietic cells, comprising: contacting said hematopoietic cells with at least two transduction enhancers selected from prostaglandin E2 (PGE2) or a derivative thereof, poloxamer, protamine sulfate, and a fragment of recombinant fibronectin; and contacting said hematopoietic cells with a recombinant retroviral vector. The cells can be contacted with the retroviral vector under conditions and for a time sufficient to ensure transduction of the cells by the retroviral vector, such as in a suitable culture medium for at least one hour, at least two hours, at least four hours, at least eight hours, at least twelve hours, or at least 16 hours. In some embodiments, the cells are transduced once or twice consecutively, such as after prestimulation, with each transduction cycle being between 12 and 24 hours or between 16 and 18 hours. In some embodiments, the cells are contacted with the retroviral vector and the transduction enhancers at the same time or for an overlapping period of time. In some embodiments, the cells are contacted with the transduction enhancers and the recombinant retroviral vector at the same time or for an overlapping period of time. In certain embodiments, the two or more transduction enhancers comprise a poloxamer. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). In certain embodiments, the two or more transduction enhancers comprise or consist of a poloxamer and PGE2 or a derivative thereof. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). In certain embodiments, the two or more transduction enhancers comprise or consist of a poloxamer and a protamine sulfate. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). In certain embodiments, the two or more transduction enhancers comprise or consist of a poloxamer, PGE2, and protamine sulfate. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). In certain embodiments, the two or more transduction enhancers comprise or consist of a prostaglandin E2 (PGE2) or derivative thereof, a poloxamer, protamine sulfate, and a fragment of recombinant fibronectin. In various embodiments of any of the aspects and embodiments disclosed herein, the cells are transduced on plates coated with a fragment of recombinant fibronectin, such as RetroNectin™. In various embodiments, the cells are pretreated by culturing on plates coated with a recombinant fibronectin fragment, such as RetroNectin™, prior to and/or during transduction. In some embodiments, the method comprises prestimulating by culturing the cells on plates coated with about 2 μg/ cm2 RetroNectin™ (RN). In some embodiments, the cells are transduced in liquid medium containing Retro-Nectin™. In some embodiments, the cells are pretreated by culturing on plates coated with a recombinant fibronectin fragment and are transduced in liquid culture in the presence of the recombinant fibronectin fragment and other UTs.

[00121] В одном из аспектов изобретения предложен способ генетической модификации гемопоэтических клеток, включающий: обеспечение гемопоэтических клеток; приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с по меньшей мере двумя усилителями трансдукции, выбранными из простагландина E2 (PGE2) или его производного, полоксамера (например, полоксамера 338 (LentiBOOST™)), протаминсульфата и фрагмента рекомбинантного фибронектина; и приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с рекомбинантным ретровирусным вектором. В частных вариантах осуществления клетки приводят в контакт с усилителями трансдукции и рекомбинантным ретровирусным вектором в одно и то же время или в течение частично совпадающего периода времени. В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат полоксамер. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат полоксамер и PGE2 или его производное. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат полоксамер и протаминсульфат, или состоят из них. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат полоксамер, PGE2 и протаминсульфат, или состоят из них. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат простагландин E2 (PGE2) или его производное, полоксамер, протаминсульфат и фрагмент рекомбинантного фибронектина, или состоят из них. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат простагландин E2 (PGE2) или его производное, полоксамер, протаминсульфат и фрагмент рекомбинантного фибронектина, или состоят из них. В различных вариантах осуществления любого из аспектов и вариантов осуществления, раскрытых в настоящем документе, клетки трансдуцируют на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin™. В различных вариантах осуществления клетки подвергают предварительной обработке путем культивирования на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin™, до и/или во время трансдукции. В отдельных вариантах осуществления способ включает предварительную стимуляцию путем культивирования клеток на планшетах, покрытых приблизительно 2 мкг/см2 RetroNectin™ (RN). В некоторых вариантах осуществления клетки трансдуцируют в жидкой среде, содержащей Retro-Nectin™. В некоторых вариантах осуществления клетки подвергают предварительной обработке путем культивирования на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, а также трансдуцируют в культуре в жидкой среде в присутствии фрагмента рекомбинантного фибронектина и других УТ.[00121] In one aspect, the invention provides a method of genetically modifying hematopoietic cells, comprising: providing hematopoietic cells; contacting the hematopoietic cells with at least two transduction enhancers selected from prostaglandin E2 (PGE2) or a derivative thereof, a poloxamer (e.g., poloxamer 338 (LentiBOOST™)), protamine sulfate, and a fragment of recombinant fibronectin; and contacting the hematopoietic cells with a recombinant retroviral vector. In particular embodiments, the cells are contacted with the transduction enhancers and the recombinant retroviral vector at the same time or for an overlapping period of time. In particular embodiments, the two or more transduction enhancers comprise a poloxamer. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). In certain embodiments, the two or more transduction enhancers comprise a poloxamer and PGE2 or a derivative thereof. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). In certain embodiments, the two or more transduction enhancers comprise or consist of a poloxamer and protamine sulfate. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). In certain embodiments, the two or more transduction enhancers comprise or consist of a poloxamer, PGE2, and protamine sulfate. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). In certain embodiments, the two or more transduction enhancers comprise or consist of a prostaglandin E2 (PGE2) or a derivative thereof, a poloxamer, protamine sulfate, and a fragment of recombinant fibronectin. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). In particular embodiments, the two or more transduction enhancers comprise or consist of prostaglandin E2 (PGE2) or a derivative thereof, a poloxamer, protamine sulfate, and a recombinant fibronectin fragment. In various embodiments of any of the aspects and embodiments disclosed herein, cells are transduced on plates coated with a recombinant fibronectin fragment, e.g., RetroNectin™. In various embodiments, cells are pretreated by culturing on plates coated with a recombinant fibronectin fragment, e.g., RetroNectin™, prior to and/or during transduction. In particular embodiments, the method comprises prestimulating by culturing cells on plates coated with about 2 μg/ cm2 RetroNectin™ (RN). In some embodiments, the cells are transduced in a liquid medium containing Retro-Nectin™. In some embodiments, the cells are pretreated by culturing on plates coated with a recombinant fibronectin fragment and are transduced in liquid culture in the presence of a recombinant fibronectin fragment and other UTs.

[00122] В различных вариантах осуществления способов, раскрытых в настоящем документе, популяцию клеток культивируют в присутствии ретровирусного вектора, одного или более агентов, стимулирующих сигнальный путь рецептора простагландина EP, и полоксамера, имеющего среднюю молекулярную массу приблизительно 10000 дальтон. В некоторых вариантах осуществления клетки приводят в контакт с усилителями трансдукции и рекомбинантным ретровирусным вектором в одно и то же время или в течение частично совпадающего периода времени.[00122] In various embodiments of the methods disclosed herein, a population of cells is cultured in the presence of a retroviral vector, one or more agents that stimulate the prostaglandin EP receptor signaling pathway, and a poloxamer having an average molecular weight of about 10,000 daltons. In some embodiments, the cells are contacted with the transduction enhancers and the recombinant retroviral vector at the same time or for an overlapping period of time.

[00123] В различных вариантах осуществления способов, раскрытых в настоящем документе, популяцию клеток культивируют в присутствии ретровирусного вектора, одного или более агентов, стимулирующих сигнальный путь рецептора простагландина EP, и полоксамера, имеющего среднюю молекулярную массу полипропиленовых субъединиц более приблизительно 2250 дальтон и содержащего более приблизительно 40% полиэтиленоксида. В некоторых вариантах осуществления клетки приводят в контакт с усилителями трансдукции и рекомбинантным ретровирусным вектором в одно и то же время или в течение частично совпадающего периода времени.[00123] In various embodiments of the methods disclosed herein, a population of cells is cultured in the presence of a retroviral vector, one or more agents that stimulate the prostaglandin EP receptor signaling pathway, and a poloxamer having an average molecular weight of polypropylene subunits greater than about 2250 daltons and comprising greater than about 40% polyethylene oxide. In some embodiments, the cells are contacted with the transduction enhancers and the recombinant retroviral vector at the same time or for an overlapping period of time.

[00124] В частных вариантах осуществления способов, раскрытых в настоящем документе, клетки трансдуцируют в среде, содержащей комбинацию трех усилителей трансдукции: полоксамера 338 (LentiBOOST), PGE2 и протаминсульфата, например, в жидкой среде. Клетки могут быть прикреплены к чашке для культивирования, или клетки могут не быть прикреплены к чашке для культивирования. В частных вариантах осуществления клетки приводят в контакт с усилителями трансдукции и рекомбинантным ретровирусным вектором в одно и то же время или в течение частично совпадающего периода времени. В отдельных вариантах осуществления способ включает предварительную стимуляцию путем культивирования клеток на планшетах, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin™ (RN). В отдельных вариантах осуществления клетки трансдуцируют на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin™. В различных вариантах осуществления клетки подвергают предварительной обработке путем культивирования на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin™, до и/или во время трансдукции. В отдельных вариантах осуществления способ включает предварительную стимуляцию путем культивирования клеток на планшетах, покрытых приблизительно 2 мкг/см2 RetroNectin™ (RN). В некоторых вариантах осуществления клетки трансдуцируют в жидкой среде, содержащей Retro-Nectin™. В некоторых вариантах осуществления клетки подвергают предварительной обработке путем культивирования на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, а также трансдуцируют в культуре в жидкой среде в присутствии фрагмента рекомбинантного фибронектина и других УТ.[00124] In particular embodiments of the methods disclosed herein, the cells are transduced in a medium comprising a combination of three transduction enhancers: poloxamer 338 (LentiBOOST), PGE2, and protamine sulfate, such as in a liquid medium. The cells may be attached to a culture dish, or the cells may not be attached to a culture dish. In particular embodiments, the cells are contacted with the transduction enhancers and the recombinant retroviral vector at the same time or for an overlapping period of time. In particular embodiments, the method comprises prestimulating by culturing the cells on plates coated with a fragment of recombinant fibronectin, such as RetroNectin™ (RN). In particular embodiments, the cells are transduced on plates coated with a fragment of recombinant fibronectin, such as RetroNectin™. In various embodiments, the cells are pretreated by culturing on plates coated with a recombinant fibronectin fragment, such as RetroNectin™, prior to and/or during transduction. In some embodiments, the method comprises prestimulating by culturing the cells on plates coated with about 2 μg/ cm2 RetroNectin™ (RN). In some embodiments, the cells are transduced in liquid medium containing Retro-Nectin™. In some embodiments, the cells are pretreated by culturing on plates coated with a recombinant fibronectin fragment and are transduced in liquid culture in the presence of the recombinant fibronectin fragment and other UTs.

[00125] В связанном аспекте изобретения предложен способ усиления опосредованной рекомбинантным ретровирусным вектором генетической модификации гемопоэтических клеток, включающий обработку гемопоэтических клеток или приведение их в контакт ex vivo с эффективным количеством комбинации двух или более усилителей трансдукции, где по меньшей мере два из указанных усилителей трансдукции выбраны из PGE2 или его производного, полоксамера, протаминсульфата и фрагмента рекомбинантного фибронектина. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). В некоторых вариантах осуществления клетки приводят в контакт с PGE2 или его производным и эффективным количеством полоксамера; и приводят в контакт с рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, содержащий представляющий интерес ген, где эффективность вирусной трансдукции указанного ретровирусного вектора повышена по сравнению с трансдукцией гемопоэтических клеток указанным рекомбинантным ретровирусным вектором в отсутствие указанной комбинации усилителей трансдукции, например, PGE2 и полоксамера. В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат полоксамер и PGE2 или его производное. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат полоксамер и протаминсульфат, или состоят из них. В одном из вариантов осуществления способ дополнительно включает обработку гемопоэтических клеток или приведение их в контакт ex vivo с эффективным количеством протаминсульфата. В отдельных вариантах осуществления два или более усилителей трансдукции содержат простагландин E2 (PGE2) или его производное, полоксамер, протаминсульфат и фрагмент рекомбинантного фибронектина, или состоят из них. В различных вариантах осуществления любого из аспектов и вариантов осуществления, раскрытых в настоящем документе, клетки трансдуцируют на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin™. В различных вариантах осуществления клетки подвергают предварительной обработке путем культивирования на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin™, до и/или во время трансдукции. В отдельных вариантах осуществления способ включает предварительную стимуляцию путем культивирования клеток на планшетах, покрытых приблизительно 2 мкг/см2 RetroNectin™ (RN). В некоторых вариантах осуществления клетки трансдуцируют в жидкой среде, содержащей Retro-Nectin™. В некоторых вариантах осуществления клетки подвергают предварительной обработке путем культивирования на чашках, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, а также трансдуцируют в культуре в жидкой среде в присутствии фрагмента рекомбинантного фибронектина и других УТ.[00125] In a related aspect, the invention provides a method of enhancing recombinant retroviral vector-mediated genetic modification of hematopoietic cells, comprising treating hematopoietic cells or contacting them ex vivo with an effective amount of a combination of two or more transduction enhancers, wherein at least two of said transduction enhancers are selected from PGE2 or a derivative thereof, a poloxamer, protamine sulfate, and a recombinant fibronectin fragment. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). In some embodiments, the cells are contacted with PGE2 or a derivative thereof and an effective amount of the poloxamer; and contacted with a recombinant retroviral vector comprising a polynucleotide comprising a gene of interest, wherein the efficiency of viral transduction of said retroviral vector is enhanced compared to transduction of hematopoietic cells by said recombinant retroviral vector in the absence of said combination of transduction enhancers, e.g., PGE2 and a poloxamer. In certain embodiments, the two or more transduction enhancers comprise a poloxamer and PGE2 or a derivative thereof. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). In certain embodiments, the two or more transduction enhancers comprise or consist of a poloxamer and protamine sulfate. In one embodiment, the method further comprises treating or contacting the hematopoietic cells ex vivo with an effective amount of protamine sulfate. In some embodiments, the two or more transduction enhancers comprise or consist of prostaglandin E2 (PGE2) or a derivative thereof, poloxamer, protamine sulfate, and a fragment of recombinant fibronectin. In various embodiments of any of the aspects and embodiments disclosed herein, the cells are transduced on plates coated with a fragment of recombinant fibronectin, such as RetroNectin™. In various embodiments, the cells are pretreated by culturing on plates coated with a fragment of recombinant fibronectin, such as RetroNectin™, prior to and/or during transduction. In some embodiments, the method comprises prestimulating by culturing the cells on plates coated with about 2 μg/ cm2 of RetroNectin™ (RN). In some embodiments, the cells are transduced in liquid medium containing Retro-Nectin™. In some embodiments, the cells are pretreated by culturing on plates coated with a recombinant fibronectin fragment and are transduced in liquid culture in the presence of the recombinant fibronectin fragment and other UTs.

[00126] В отдельных вариантах осуществления любого из раскрытых в настоящем документе способов клетки приводят в контакт с раствором или культуральной средой, содержащими два или более усилителей трансдукции. Раствор или культуральная среда могут дополнительно содержать рекомбинантный ретровирусный вектор, или рекомбинантный ретровирусный вектор может быть добавлен после приведения клеток в контакт с раствором или культуральной средой, содержащей усилители трансдукции. В частных вариантах осуществления клетки присутствуют в чашке для культивирования, содержащей раствор или культуральную среду. В частных вариантах осуществления чашка для культивирования покрыта фрагментом рекомбинантного фибронектина. Клетки могут быть приведены в контакт с ретровирусным вектором в условиях и в течение времени, достаточных для обеспечения трансдукции клеток ретровирусным вектором, например, в подходящей культуральной среде в течение по меньшей мере одного часа, по меньшей мере двух часов, по меньшей мере четырех часов, по меньшей мере восьми часов, по меньшей мере двенадцати часов или по меньшей мере 16 часов. В некоторых вариантах осуществления клетки трансдуцируют один раз или два раза подряд, например, после предварительной стимуляции, причем каждый цикл трансдукции составляет от 12 до 24 часов или от 16 до 18 часов. В некоторых вариантах осуществления клетки приводят в контакт с ретровирусным вектором и усилителями трансдукции в одно и то же время или в течение частично совпадающего периода времени.[00126] In particular embodiments of any of the methods disclosed herein, the cells are contacted with a solution or culture medium comprising two or more transduction enhancers. The solution or culture medium may further comprise a recombinant retroviral vector, or the recombinant retroviral vector may be added after the cells are contacted with the solution or culture medium comprising the transduction enhancers. In particular embodiments, the cells are present in a culture dish comprising the solution or culture medium. In particular embodiments, the culture dish is coated with a recombinant fibronectin fragment. The cells may be contacted with the retroviral vector under conditions and for a time sufficient to allow transduction of the cells by the retroviral vector, such as in a suitable culture medium for at least one hour, at least two hours, at least four hours, at least eight hours, at least twelve hours, or at least 16 hours. In some embodiments, the cells are transduced once or twice in succession, such as after pre-stimulation, with each transduction cycle lasting from 12 to 24 hours or from 16 to 18 hours. In some embodiments, the cells are contacted with the retroviral vector and transduction enhancers at the same time or for an overlapping period of time.

[00127] В отдельных вариантах осуществления любого из раскрытых в настоящем документе способов клетки приводят в контакт с полоксамером. В одном из вариантов осуществления полоксамер выбран из группы, состоящей из полоксамера 288, полоксамера 335, полоксамера 338 и полоксамера 407. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). LentiBOOST™может быть использован в конечной концентрации от приблизительно 50 мкг/мл до приблизительно 1500 мкг/мл, от приблизительно 500 мкг/мл до приблизительно 1500 мкг/мл, от приблизительно 750 мкг/мл до приблизительно 1250 мкг/мл, приблизительно 900 мкг/мл, приблизительно 900 мкг/мл, приблизительно 950 мкг/мл, приблизительно 1000 мкг/мл, приблизительно 1050 мкг/мл, приблизительно 1100 мкг/мл или приблизительно 1150 мкг/мл.[00127] In certain embodiments of any of the methods disclosed herein, the cells are contacted with a poloxamer. In one embodiment, the poloxamer is selected from the group consisting of poloxamer 288, poloxamer 335, poloxamer 338, and poloxamer 407. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). LentiBOOST™ can be used at a final concentration of from about 50 mcg/mL to about 1500 mcg/mL, from about 500 mcg/mL to about 1500 mcg/mL, from about 750 mcg/mL to about 1250 mcg/mL, about 900 mcg/mL, about 900 mcg/mL, about 950 mcg/mL, about 1000 mcg/mL, about 1050 mcg/mL, about 1100 mcg/mL, or about 1150 mcg/mL.

[00128] В некоторых вариантах осуществления любого из раскрытых в настоящем документе способов клетки приводят в контакт с PGE2 или его производным. В одном из вариантов осуществления PGE2 или его производное модифицированы. В одном из вариантов осуществления PGE2 или его производное представляет собой диметилированный PGE2. В одном из вариантов осуществления диметилированный PGE2 представляет собой 16,16-диметилпростагландин E2. 16,16-диметилпростагландин E2 имеет следующую структуру (представленную как «скелетная структура», которую также называют «линейно-угловой (line-angle) формулой» или «упрощенной формулой»):[00128] In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the cells are contacted with PGE2 or a derivative thereof. In one embodiment, the PGE2 or derivative thereof is modified. In one embodiment, the PGE2 or derivative thereof is dimethylated PGE2. In one embodiment, the dimethylated PGE2 is 16,16-dimethylprostaglandin E2. 16,16-dimethylprostaglandin E2 has the following structure (represented as the "skeletal structure", which is also referred to as the "line-angle formula" or "simplified formula"):

Молекулярная формула: C22H36O5 Molecular formula: C 22 H 36 O 5

[00129] В некоторых вариантах осуществления PGE2 или его производное не модифицированы.[00129] In some embodiments, PGE2 or a derivative thereof is not modified.

[00130] В некоторых вариантах осуществления PGE2 или его производное могут быть использованы в конечной концентрации от приблизительно 1 мкМ до приблизительно 200 мкМ, от приблизительно 10 мкМ до приблизительно 20 мкМ, от приблизительно 20 мкМ до приблизительно 40 мкМ, от приблизительно 40 мкМ до приблизительно 60 мкМ, от приблизительно 60 мкМ до приблизительно 80 мкМ, приблизительно 5 мкМ, приблизительно 10 мкМ, приблизительно 15 мкМ, приблизительно 20 мкМ, приблизительно 25 мкМ, приблизительно 30 мкМ, приблизительно 35 мкМ или приблизительно 40 мкМ. PGE2 или его производное могут быть использованы в конечной концентрации от приблизительно 0,3 мкМ до приблизительно 70 мкг/мл, от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, от приблизительно 7 мкг/мл до приблизительно 13 мкг/мл, от приблизительно 13 мкг/мл до приблизительно 20 мкг/мл, от приблизительно 20 мкг/мл до приблизительно 26 мкг/мл, приблизительно 2 мкг/мл, приблизительно 3 мкг/мл, приблизительно 4 мкг/мл, приблизительно 5 мкг/мл, приблизительно 6 мкг/мл, приблизительно 7 мкг/мл, приблизительно 8 мкг/мл, приблизительно 9 мкг/мл, приблизительно 10 мкг/мл, приблизительно 11 мкг/мл, приблизительно 12 мкг/мл, приблизительно 13 мкг/мл, приблизительно 14 мкг/мл или приблизительно 15 мкг/мл.[00130] In some embodiments, PGE2 or a derivative thereof may be used at a final concentration of from about 1 μM to about 200 μM, from about 10 μM to about 20 μM, from about 20 μM to about 40 μM, from about 40 μM to about 60 μM, from about 60 μM to about 80 μM, about 5 μM, about 10 μM, about 15 μM, about 20 μM, about 25 μM, about 30 μM, about 35 μM, or about 40 μM. PGE2 or a derivative thereof can be used at a final concentration of from about 0.3 μM to about 70 μg/mL, from about 3 μg/mL to about 7 μg/mL, from about 7 μg/mL to about 13 μg/mL, from about 13 μg/mL to about 20 μg/mL, from about 20 μg/mL to about 26 μg/mL, about 2 μg/mL, about 3 μg/mL, about 4 μg/mL, about 5 μg/mL, about 6 μg/mL, about 7 μg/mL, about 8 μg/mL, about 9 μg/mL, about 10 μg/mL, about 11 μg/mL, about 12 μg/mL, about 13 mcg/ml, approximately 14 mcg/ml, or approximately 15 mcg/ml.

[00131] В некоторых вариантах осуществления любого из раскрытых в настоящем документе способов способ включает приведение гемопоэтических клеток в контакт с протаминсульфатом. Протаминсульфат может быть использован в конечной концентрации от приблизительно 4 мкг/мл до приблизительно 15 мкг/мл, от приблизительно 5 мкг/мл до приблизительно 10 мкг/мл, или приблизительно 5 мкг/мл, приблизительно 6 мкг/мл, приблизительно 7 мкг/мл, приблизительно 8 мкг/мл, приблизительно 9 мкг/мл, приблизительно 10 мкг/мл, приблизительно 11 мкг/мл, приблизительно 12 мкг/мл, приблизительно 13 мкг/мл, приблизительно 14 мкг/мл или приблизительно 15 мкг/мл, или более. В отдельных вариантах осуществления протаминсульфат может быть использован в конечной концентрации от приблизительно 1 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 1 мкг/мл, приблизительно 2 мкг/мл, приблизительно 3 мкг/мл, приблизительно 4 мкг/мл или приблизительно 5 мкг/мл.[00131] In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the method comprises contacting the hematopoietic cells with protamine sulfate. Protamine sulfate can be used at a final concentration of from about 4 μg/mL to about 15 μg/mL, from about 5 μg/mL to about 10 μg/mL, or about 5 μg/mL, about 6 μg/mL, about 7 μg/mL, about 8 μg/mL, about 9 μg/mL, about 10 μg/mL, about 11 μg/mL, about 12 μg/mL, about 13 μg/mL, about 14 μg/mL, or about 15 μg/mL, or more. In certain embodiments, protamine sulfate may be used at a final concentration of from about 1 μg/mL to about 5 μg/mL, from about 3 μg/mL to about 5 μg/mL, or about 1 μg/mL, about 2 μg/mL, about 3 μg/mL, about 4 μg/mL, or about 5 μg/mL.

[00132] В некоторых вариантах осуществления любого из раскрытых в настоящем документе способов клетки приводят в контакт с полоксамером 338 и PGE2 или его производным. В одном из вариантов осуществления полоксамер 338 и PGE2 или его производное используют в конечных концентрациях приблизительно 900 мкг/мл и от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 2 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 4 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 5 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 6 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 8 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 9 мкг/мл, соответственно. В любом из вышеуказанных вариантов осуществления протаминсульфат может необязательно быть использован в конечной концентрации от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, от приблизительно 1 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 1 мкг/мл, приблизительно 2 мкг/мл, приблизительно 3 мкг/мл, приблизительно 4 мкг/мл, приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 6 мкг/мл.[00132] In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the cells are contacted with poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof. In one embodiment, poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof are used at final concentrations of about 900 μg/mL and about 3 μg/mL to about 7 μg/mL, respectively, or about 900 μg/mL and about 2 μg/mL, respectively, or about 900 μg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 900 μg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 900 μg/mL and about 4 μg/mL, respectively, or about 900 μg/mL and about 5 μg/mL, respectively, or about 900 μg/mL and about 6 μg/mL, respectively, or about 900 μg/mL and about 7 μg/mL, respectively, or about 900 mcg/mL and about 8 mcg/mL, respectively, or about 900 mcg/mL and about 9 mcg/mL, respectively. In any of the above embodiments, protamine sulfate may optionally be used at a final concentration of from about 3 mcg/mL to about 7 mcg/mL, from about 1 mcg/mL to about 5 mcg/mL, from about 3 mcg/mL to about 5 mcg/mL, or about 1 mcg/mL, about 2 mcg/mL, about 3 mcg/mL, about 4 mcg/mL, about 5 mcg/mL, or about 6 mcg/mL.

[00133] В некоторых вариантах осуществления полоксамер 338 и PGE2 или его производное используют в конечных концентрациях приблизительно 950 мкг/мл и от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 2 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 950 мкг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 950 мкг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 950 мкг/мл и приблизительно 4 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 950 мкг/мл и приблизительно 5 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 950 мкг/мл и приблизительно 6 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 950 мкг/мл и приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 950 мкг/мл и приблизительно 8 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 950 мкг/мл и приблизительно 9 мкг/мл, соответственно. В любом из вышеуказанных вариантов осуществления протаминсульфат может необязательно быть использован в конечной концентрации от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, от приблизительно 1 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 1 мкг/мл, приблизительно 2 мкг/мл, приблизительно 3 мкг/мл, приблизительно 4 мкг/мл, приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 6 мкг/мл.[00133] In some embodiments, poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof are used at final concentrations of about 950 μg/mL and about 3 μg/mL to about 7 μg/mL, respectively, or about 900 μg/mL and about 2 μg/mL, respectively, or about 950 μg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 950 μg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 950 μg/mL and about 4 μg/mL, respectively, or about 950 μg/mL and about 5 μg/mL, respectively, or about 950 μg/mL and about 6 μg/mL, respectively, or about 950 μg/mL and about 7 μg/mL, respectively, or about 950 μg/mL and about 8 μg/mL, respectively, or about 950 μg/mL and about 9 μg/mL, respectively. In any of the above embodiments, protamine sulfate may optionally be used at a final concentration of about 3 μg/mL to about 7 μg/mL, about 1 μg/mL to about 5 μg/mL, about 3 μg/mL to about 5 μg/mL, or about 1 μg/mL, about 2 μg/mL, about 3 μg/mL, about 4 μg/mL, about 5 μg/mL, or about 6 μg/mL.

[00134] В некоторых вариантах осуществления полоксамер 338 и PGE2 или его производное используют в конечных концентрациях приблизительно 1000 мкг/мл и от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1000 мкг/мл и приблизительно 2 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1000 мкг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1000 мкг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1000 мкг/мл и приблизительно 4 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1000 мкг/мл и приблизительно 5 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1000 мкг/мл и приблизительно 6 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1000 мкг/мл и приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1000 мкг/мл и приблизительно 8 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1000 мкг/мл и приблизительно 9 мкг/мл, соответственно. В любом из вышеуказанных вариантов осуществления протаминсульфат может необязательно быть использован в конечной концентрации от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, от приблизительно 1 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 1 мкг/мл, приблизительно 2 мкг/мл, приблизительно 3 мкг/мл, приблизительно 4 мкг/мл, приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 6 мкг/мл.[00134] In some embodiments, poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof are used at final concentrations of about 1000 μg/mL and about 3 μg/mL to about 7 μg/mL, respectively, or about 1000 μg/mL and about 2 μg/mL, respectively, or about 1000 μg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 1000 μg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 1000 μg/mL and about 4 μg/mL, respectively, or about 1000 μg/mL and about 5 μg/mL, respectively, or about 1000 μg/mL and about 6 μg/mL, respectively, or about 1000 μg/mL and about 7 mcg/mL, respectively, or about 1000 mcg/mL and about 8 mcg/mL, respectively, or about 1000 mcg/mL and about 9 mcg/mL, respectively. In any of the above embodiments, protamine sulfate may optionally be used at a final concentration of from about 3 mcg/mL to about 7 mcg/mL, from about 1 mcg/mL to about 5 mcg/mL, from about 3 mcg/mL to about 5 mcg/mL, or about 1 mcg/mL, about 2 mcg/mL, about 3 mcg/mL, about 4 mcg/mL, about 5 mcg/mL, or about 6 mcg/mL.

[00135] В некоторых вариантах осуществления полоксамер 338 и PGE2 или его производное используют в конечных концентрациях приблизительно 1050 мкг/мл и от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1050 мкг/мл и приблизительно 2 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1050 мкг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1050 мкг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1050 мкг/мл и приблизительно 4 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1050 мкг/мл и приблизительно 5 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1050 мкг/мл и приблизительно 6 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1050 мкг/мл и приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1050 мкг/мл и приблизительно 8 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1050 мкг/мл и приблизительно 9 мкг/мл, соответственно. В любом из вышеуказанных вариантов осуществления протаминсульфат может необязательно быть использован в конечной концентрации от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, от приблизительно 1 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 1 мкг/мл, приблизительно 2 мкг/мл, приблизительно 3 мкг/мл, приблизительно 4 мкг/мл, приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 6 мкг/мл.[00135] In some embodiments, poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof are used at final concentrations of about 1050 μg/mL and about 3 μg/mL to about 7 μg/mL, respectively, or about 1050 μg/mL and about 2 μg/mL, respectively, or about 1050 μg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 1050 μg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 1050 μg/mL and about 4 μg/mL, respectively, or about 1050 μg/mL and about 5 μg/mL, respectively, or about 1050 μg/mL and about 6 μg/mL, respectively, or about 1050 μg/mL and about 7 mcg/mL, respectively, or about 1050 mcg/mL and about 8 mcg/mL, respectively, or about 1050 mcg/mL and about 9 mcg/mL, respectively. In any of the above embodiments, protamine sulfate may optionally be used at a final concentration of from about 3 mcg/mL to about 7 mcg/mL, from about 1 mcg/mL to about 5 mcg/mL, from about 3 mcg/mL to about 5 mcg/mL, or about 1 mcg/mL, about 2 mcg/mL, about 3 mcg/mL, about 4 mcg/mL, about 5 mcg/mL, or about 6 mcg/mL.

[00136] В некоторых вариантах осуществления любого из раскрытых в настоящем документе способов клетки приводят в контакт с полоксамером 338 и PGE2 или его производным. В одном из вариантов осуществления полоксамер 338 и PGE2 или его производное используют в конечных концентрациях приблизительно 0,5 мг/мл и от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 0,5 мг/мл и приблизительно 2 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 0,5 мг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 0,5 мг/мл и приблизительно 4 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 0,5 мг/мл и приблизительно 5 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 0,5 мг/мл и приблизительно 6 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 0,5 мг/мл и приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 0,5 мг/мл и приблизительно 8 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 0,5 мг/мл и приблизительно 9 мкг/мл, соответственно. В любом из вышеуказанных вариантов осуществления протаминсульфат может необязательно быть использован в конечной концентрации от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, от приблизительно 1 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 1 мкг/мл, приблизительно 2 мкг/мл, приблизительно 3 мкг/мл, приблизительно 4 мкг/мл, приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 6 мкг/мл.[00136] In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the cells are contacted with poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof. In one embodiment, poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof are used at final concentrations of about 0.5 mg/mL and about 3 μg/mL to about 7 μg/mL, respectively, or about 0.5 mg/mL and about 2 μg/mL, respectively, or about 0.5 mg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 900 μg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 0.5 mg/mL and about 4 μg/mL, respectively, or about 0.5 mg/mL and about 5 μg/mL, respectively, or about 0.5 mg/mL and about 6 μg/mL, respectively, or about 0.5 mg/mL and about 7 μg/mL, respectively, or about 0.5 mg/mL and about 8 μg/mL, respectively, or about 0.5 mg/mL and about 9 μg/mL, respectively. In any of the above embodiments, protamine sulfate may optionally be used at a final concentration of about 3 μg/mL to about 7 μg/mL, about 1 μg/mL to about 5 μg/mL, about 3 μg/mL to about 5 μg/mL, or about 1 μg/mL, about 2 μg/mL, about 3 μg/mL, about 4 μg/mL, about 5 μg/mL, or about 6 μg/mL.

[00137] В некоторых вариантах осуществления любого из раскрытых в настоящем документе способов клетки приводят в контакт с полоксамером 338 и PGE2 или его производным. В одном из вариантов осуществления полоксамер 338 и PGE2 или его производное используют в конечных концентрациях приблизительно 1 мг/мл и от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1 мг/мл и приблизительно 2 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1 мг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1 мг/мл и приблизительно 4 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1 мг/мл и приблизительно 5 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1 мг/мл и приблизительно 6 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1 мг/мл и приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1 мг/мл и приблизительно 8 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 1 мг/мл и приблизительно 9 мкг/мл, соответственно. В любом из вышеуказанных вариантов осуществления протаминсульфат может необязательно быть использован в конечной концентрации от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, от приблизительно 1 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 1 мкг/мл, приблизительно 2 мкг/мл, приблизительно 3 мкг/мл, приблизительно 4 мкг/мл, приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 6 мкг/мл.[00137] In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the cells are contacted with poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof. In one embodiment, poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof are used at final concentrations of about 1 mg/mL and about 3 μg/mL to about 7 μg/mL, respectively, or about 1 mg/mL and about 2 μg/mL, respectively, or about 1 mg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 900 μg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 1 mg/mL and about 4 μg/mL, respectively, or about 1 mg/mL and about 5 μg/mL, respectively, or about 1 mg/mL and about 6 μg/mL, respectively, or about 1 mg/mL and about 7 μg/mL, respectively, or about 1 mg/mL and about 8 μg/mL, respectively, or about 1 mg/mL and about 9 mcg/mL, respectively. In any of the above embodiments, protamine sulfate may optionally be used at a final concentration of from about 3 mcg/mL to about 7 mcg/mL, from about 1 mcg/mL to about 5 mcg/mL, from about 3 mcg/mL to about 5 mcg/mL, or about 1 mcg/mL, about 2 mcg/mL, about 3 mcg/mL, about 4 mcg/mL, about 5 mcg/mL, or about 6 mcg/mL.

[00138] В некоторых вариантах осуществления любого из раскрытых в настоящем документе способов клетки приводят в контакт с полоксамером 338 и PGE2 или его производным. В одном из вариантов осуществления полоксамер 338 и PGE2 или его производное используют в конечных концентрациях приблизительно 2 мг/мл и от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 2 мг/мл и приблизительно 2 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 2 мг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 2 мг/мл и приблизительно 4 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 2 мг/мл и приблизительно 5 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 2 мг/мл и приблизительно 6 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 2 мг/мл и приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 2 мг/мл и приблизительно 8 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 2 мг/мл и приблизительно 9 мкг/мл, соответственно. В любом из вышеуказанных вариантов осуществления протаминсульфат может необязательно быть использован в конечной концентрации от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, от приблизительно 1 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 1 мкг/мл, приблизительно 2 мкг/мл, приблизительно 3 мкг/мл, приблизительно 4 мкг/мл, приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 6 мкг/мл.[00138] In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the cells are contacted with poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof. In one embodiment, poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof are used at final concentrations of about 2 mg/mL and about 3 μg/mL to about 7 μg/mL, respectively, or about 2 mg/mL and about 2 μg/mL, respectively, or about 2 mg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 900 μg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 2 mg/mL and about 4 μg/mL, respectively, or about 2 mg/mL and about 5 μg/mL, respectively, or about 2 mg/mL and about 6 μg/mL, respectively, or about 2 mg/mL and about 7 μg/mL, respectively, or about 2 mg/mL and about 8 μg/mL, respectively, or about 2 mg/mL and about 9 mcg/mL, respectively. In any of the above embodiments, protamine sulfate may optionally be used at a final concentration of from about 3 mcg/mL to about 7 mcg/mL, from about 1 mcg/mL to about 5 mcg/mL, from about 3 mcg/mL to about 5 mcg/mL, or about 1 mcg/mL, about 2 mcg/mL, about 3 mcg/mL, about 4 mcg/mL, about 5 mcg/mL, or about 6 mcg/mL.

[00139] В некоторых вариантах осуществления любого из раскрытых в настоящем документе способов клетки приводят в контакт с полоксамером 338 и PGE2 или его производным. В одном из вариантов осуществления полоксамер 338 и PGE2 или его производное используют в конечных концентрациях приблизительно 4 мг/мл и от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 2 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 4 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 5 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 6 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 8 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 9 мкг/мл, соответственно. В любом из вышеуказанных вариантов осуществления протаминсульфат может необязательно быть использован в конечной концентрации от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, от приблизительно 1 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 1 мкг/мл, приблизительно 2 мкг/мл, приблизительно 3 мкг/мл, приблизительно 4 мкг/мл, приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 6 мкг/мл.[00139] In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the cells are contacted with poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof. In one embodiment, poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof are used at final concentrations of about 4 mg/mL and about 3 μg/mL to about 7 μg/mL, respectively, or about 4 mg/mL and about 2 μg/mL, respectively, or about 4 mg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 900 μg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 4 mg/mL and about 4 μg/mL, respectively, or about 4 mg/mL and about 5 μg/mL, respectively, or about 4 mg/mL and about 6 μg/mL, respectively, or about 4 mg/mL and about 7 μg/mL, respectively, or about 4 mg/mL and about 8 μg/mL, respectively, or about 4 mg/mL and about 9 mcg/mL, respectively. In any of the above embodiments, protamine sulfate may optionally be used at a final concentration of from about 3 mcg/mL to about 7 mcg/mL, from about 1 mcg/mL to about 5 mcg/mL, from about 3 mcg/mL to about 5 mcg/mL, or about 1 mcg/mL, about 2 mcg/mL, about 3 mcg/mL, about 4 mcg/mL, about 5 mcg/mL, or about 6 mcg/mL.

[00140] В некоторых вариантах осуществления любого из раскрытых в настоящем документе способов клетки приводят в контакт с полоксамером 338 и PGE2 или его производным. В одном из вариантов осуществления полоксамер 338 и PGE2 или его производное используют в конечных концентрациях от приблизительно 0,5 мг/мл до приблизительно 4 мг/мл и от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или от приблизительно 0,5 мг/мл до приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 2 мкг/мл, соответственно, или от приблизительно 0,5 мг/мл до приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или приблизительно 900 мкг/мл и приблизительно 3 мкг/мл, соответственно, или от приблизительно 0,5 мг/мл до приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 4 мкг/мл, соответственно, или от приблизительно 0,5 мг/мл до приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 5 мкг/мл, соответственно, или от приблизительно 0,5 мг/мл до приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 6 мкг/мл, соответственно, или от приблизительно 0,5 мг/мл до приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 7 мкг/мл, соответственно, или от приблизительно 0,5 мг/мл до приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 8 мкг/мл, соответственно, или от приблизительно 0,5 мг/мл до приблизительно 4 мг/мл и приблизительно 9 мкг/мл, соответственно. В любом из вышеуказанных вариантов осуществления протаминсульфат может необязательно быть использован в конечной концентрации от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 7 мкг/мл, от приблизительно 1 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, от приблизительно 3 мкг/мл до приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 1 мкг/мл, приблизительно 2 мкг/мл, приблизительно 3 мкг/мл, приблизительно 4 мкг/мл, приблизительно 5 мкг/мл, или приблизительно 6 мкг/мл.[00140] In some embodiments of any of the methods disclosed herein, the cells are contacted with poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof. In one embodiment, poloxamer 338 and PGE2 or a derivative thereof are used at final concentrations of from about 0.5 mg/mL to about 4 mg/mL and from about 3 μg/mL to about 7 μg/mL, respectively, or from about 0.5 mg/mL to about 4 mg/mL and about 2 μg/mL, respectively, or from about 0.5 mg/mL to about 4 mg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or about 900 μg/mL and about 3 μg/mL, respectively, or from about 0.5 mg/mL to about 4 mg/mL and about 4 μg/mL, respectively, or from about 0.5 mg/mL to about 4 mg/mL and about 5 μg/mL, respectively, or from about 0.5 mg/mL to about 4 mg/mL and about 6 mcg/ml, respectively, or from about 0.5 mg/ml to about 4 mg/ml and about 7 mcg/ml, respectively, or from about 0.5 mg/ml to about 4 mg/ml and about 8 mcg/ml, respectively, or from about 0.5 mg/ml to about 4 mg/ml and about 9 mcg/ml, respectively. In any of the above embodiments, protamine sulfate may optionally be used at a final concentration of from about 3 μg/mL to about 7 μg/mL, from about 1 μg/mL to about 5 μg/mL, from about 3 μg/mL to about 5 μg/mL, or about 1 μg/mL, about 2 μg/mL, about 3 μg/mL, about 4 μg/mL, about 5 μg/mL, or about 6 μg/mL.

[00141] В предпочтительных вариантах осуществления клетки трансдуцируют лентивирусным вектором в среде, содержащей полоксамер 338 в концентрации от приблизительно 0,5 мг/мл до приблизительно 4 мг/мл; PGE2 в концентрации от приблизительно 10 мкг/мл до приблизительно 50 мкг/мл; и протаминсульфат в концентрации от приблизительно 1 мкг/мл до приблизительно 10 мкг/мл. В варианте с прикреплением подложку в некоторых случаях покрывают фрагментом CH296 фибронектина человека, имеющим торговое наименование RetroNectin™, с использованием раствора RetroNectin™ в концентрации от приблизительно 20 мкг/мл до приблизительно 100 мкг/мл.[00141] In preferred embodiments, the cells are transduced with a lentiviral vector in a medium comprising poloxamer 338 at a concentration of about 0.5 mg/mL to about 4 mg/mL; PGE2 at a concentration of about 10 μg/mL to about 50 μg/mL; and protamine sulfate at a concentration of about 1 μg/mL to about 10 μg/mL. In an attached embodiment, the substrate is optionally coated with a CH296 fragment of human fibronectin, tradenamed RetroNectin™, using a RetroNectin™ solution at a concentration of about 20 μg/mL to about 100 μg/mL.

[00142] В предпочтительных вариантах осуществления клетки приводят в контакт с полоксамером 338 в концентрации от приблизительно 0,5 мг/мл до приблизительно 4 мг/мл; PGE2 в концентрации от приблизительно 10 мкг/мл до приблизительно 50 мкг/мл; и протаминсульфатом в концентрации от приблизительно 1 мкг/мл до приблизительно 10 мкг/мл.[00142] In preferred embodiments, the cells are contacted with poloxamer 338 at a concentration of about 0.5 mg/mL to about 4 mg/mL; PGE2 at a concentration of about 10 μg/mL to about 50 μg/mL; and protamine sulfate at a concentration of about 1 μg/mL to about 10 μg/mL.

[00143] В предпочтительных вариантах осуществления клетки трансдуцируют лентивирусным вектором в среде, содержащей полоксамер 338 в концентрации приблизительно 1 мг/мл; PGE2 в концентрации приблизительно 10 мкМ; и протаминсульфат в концентрации приблизительно 4 мкг/мл. В варианте с прикреплением подложку в некоторых случаях покрывают фрагментом CH296 фибронектина человека, имеющим торговое наименование RetroNectin™, с использованием раствора RetroNectin™ в концентрации приблизительно 20 мкг/мл. В отдельных вариантах осуществления чашки для культивирования покрывают 2 мкг/см2 RetroNectin™. В отдельных вариантах осуществления способ включает предварительную стимуляцию путем культивирования клеток на планшетах, покрытых фрагментом рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin™ (RN).[00143] In preferred embodiments, the cells are transduced with a lentiviral vector in a medium comprising poloxamer 338 at a concentration of about 1 mg/mL; PGE2 at a concentration of about 10 μM; and protamine sulfate at a concentration of about 4 μg/mL. In an attached embodiment, the substrate is optionally coated with a fragment of human fibronectin CH296, trade name RetroNectin™, using a RetroNectin™ solution at a concentration of about 20 μg/mL. In certain embodiments, the culture dishes are coated with 2 μg/ cm2 RetroNectin™. In certain embodiments, the method comprises pre-stimulating by culturing the cells on plates coated with a fragment of recombinant fibronectin, such as RetroNectin™ (RN).

[00144] В предпочтительных вариантах осуществления клетки приводят в контакт с полоксамером 338 в концентрации приблизительно 1 мг/мл; PGE2 в концентрации приблизительно 10 мкМ; и протаминсульфатом в концентрации приблизительно 4.[00144] In preferred embodiments, the cells are contacted with poloxamer 338 at a concentration of about 1 mg/mL; PGE2 at a concentration of about 10 μM; and protamine sulfate at a concentration of about 4.

[00145] Дополнительные иллюстративные варианты осуществления представлены в таблице 1 и таблице 2. Любая из указанных комбинаций и концентраций усилителей трансдукции может быть использована в соответствии с раскрытыми способами, а также с другими типами клеток. Кроме того, любая из указанных комбинаций может быть использована дополнительно в комбинации с рекомбинантным фибронектином, таким как RetroNectin™, например, когда чашки для культивирования, используемые для трансдукции, покрыты RetroNectin™.[00145] Additional exemplary embodiments are provided in Table 1 and Table 2. Any of the disclosed combinations and concentrations of transduction enhancers can be used in accordance with the disclosed methods as well as with other cell types. In addition, any of the disclosed combinations can be further used in combination with recombinant fibronectin, such as RetroNectin™, for example, when the culture dishes used for transduction are coated with RetroNectin™.

[00146] В некоторых вариантах осуществления стадии приведения в контакт проводят одновременно, или время их проведения частично совпадает.[00146] In some embodiments, the contacting steps are carried out simultaneously or at times that overlap.

[00147] В некоторых вариантах осуществления концентрация PGE2 или его производного составляет 5-30 мкг/мл. [00147] In some embodiments, the concentration of PGE2 or a derivative thereof is 5-30 μg/mL.

[00148] В некоторых вариантах осуществления концентрация PGE2 или его производного составляет приблизительно 10 мкг/мл. [00148] In some embodiments, the concentration of PGE2 or a derivative thereof is about 10 μg/mL.

[00149] В некоторых вариантах осуществления концентрация полоксамера составляет 200-1200 мкг/мл. [00149] In some embodiments, the concentration of poloxamer is 200-1200 mcg/mL.

[00150] В некоторых вариантах осуществления концентрация полоксамера составляет приблизительно 1000 мкг/мл. [00150] In some embodiments, the concentration of poloxamer is about 1000 mcg/mL.

[00151] В некоторых вариантах осуществления концентрация протаминсульфата составляет 4-10 мкг/мл. [00151] In some embodiments, the concentration of protamine sulfate is 4-10 μg/mL.

[00152] В некоторых вариантах осуществления концентрация протаминсульфата составляет приблизительно 4 мкг/мл. [00152] In some embodiments, the concentration of protamine sulfate is about 4 μg/mL.

[00153] В некоторых вариантах осуществления гемопоэтические клетки были культивированы или культивируются в сосудах, покрытых рекомбинантным фибронектином или его фрагментом, который повышает эффективность трансдукции. Фрагмент рекомбинантного фибронектина (например, фрагмент CH296 фибронектина человека, имеющий торговое наименование RetroNectin™) способствует колокализации лентивируса или ретровируса с клетками-мишенями и повышает эффективность трансдукции. [00153] In some embodiments, the hematopoietic cells have been or are cultured in vessels coated with recombinant fibronectin or a fragment thereof that enhances transduction efficiency. The recombinant fibronectin fragment (e.g., the CH296 fragment of human fibronectin, which has the trade name RetroNectin™) promotes colocalization of the lentivirus or retrovirus with target cells and enhances transduction efficiency.

[00154] В некоторых вариантах осуществления способ включает приведение гемопоэтических клеток в контакт с фрагментом рекомбинантного фибронектина, полоксамером и PGE2.[00154] In some embodiments, the method comprises contacting hematopoietic cells with a recombinant fibronectin fragment, poloxamer, and PGE2.

[00155] В некоторых вариантах осуществления способ включает приведение гемопоэтических клеток в контакт с фрагментом рекомбинантного фибронектина, полоксамером и протаминсульфатом. В некоторых вариантах осуществления способ включает приведение гемопоэтических клеток в контакт с фрагментом рекомбинантного фибронектина, полоксамером, PGE2 и протаминсульфатом.[00155] In some embodiments, the method comprises contacting the hematopoietic cells with a fragment of recombinant fibronectin, poloxamer, and protamine sulfate. In some embodiments, the method comprises contacting the hematopoietic cells with a fragment of recombinant fibronectin, poloxamer, PGE2, and protamine sulfate.

[00156] В некоторых вариантах осуществления способ включает приведение гемопоэтических клеток в контакт с фрагментом рекомбинантного фибронектина, PGE2 и протаминсульфатом.[00156] In some embodiments, the method comprises contacting hematopoietic cells with a fragment of recombinant fibronectin, PGE2, and protamine sulfate.

[00157] В отдельных вариантах осуществления любого из раскрытых в настоящем документе способов клетки приводят в контакт с усилителями трансдукции в одно и то же время или в течение частично совпадающего периода времени. В отдельных вариантах осуществления клетки также приводят в контакт с рекомбинантным ретровирусным вектором, например, в одно и то же время или в течение частично совпадающего периода времени, как в случае приведения клеток в контакт с усилителями трансдукции. В отдельных вариантах осуществления клетки присутствуют в сосудах, содержащих раствор или культуральную среду, где в указанных сосудах и/или культуральных средах присутствуют усилители трансдукции.[00157] In particular embodiments of any of the methods disclosed herein, the cells are contacted with transduction enhancers at the same time or for an overlapping period of time. In particular embodiments, the cells are also contacted with a recombinant retroviral vector, such as at the same time or for an overlapping period of time as contacting the cells with transduction enhancers. In particular embodiments, the cells are present in vessels containing a solution or culture medium, wherein the vessels and/or culture media contain transduction enhancers.

ПростагландиныProstaglandins

[00158] Простагландины в целом относятся к гормоноподобным молекулам, которые являются производными жирных кислот, содержащими 20 атомов углерода, включая 5-углеродное кольцо, как описано в настоящем документе и известно в данной области техники. Простагландин E2 (PGE2), также известный как динопростон, представляет собой природный простагландин, применяемый в качестве лекарственного средства. PGE2 имеет следующую структуру (представленную как «скелетная структура», которую также называют «линейно-угловой (line-angle) формулой» или «упрощенной формулой»):[00158] Prostaglandins generally refer to hormone-like molecules that are derivatives of fatty acids containing 20 carbon atoms, including a 5-carbon ring, as described herein and known in the art. Prostaglandin E2 (PGE2), also known as dinoprostone, is a natural prostaglandin used as a drug. PGE2 has the following structure (represented as a "skeletal structure", which is also called the "line-angle formula" or "simplified formula"):

Молекулярная формула PGE2: C22H36O5 Molecular formula of PGE2: C 22 H 36 O 5

[00159] Было показано, что простагландин E2 (PGE2) увеличивает уровень лентивирусной доставки трансгенов в культуре CD34+ клеток ex vivo. Heffner et al. Mol Ther. 2018 Jan 3;26(1):320-328.[00159] Prostaglandin E2 (PGE2) has been shown to enhance lentiviral delivery of transgenes in ex vivo cultured CD34+ cells. Heffner et al. Mol Ther. 2018 Jan 3;26(1):320-328.

[00160] Иллюстративные примеры «аналогов» или «производных» PGE2 включают, не ограничиваясь перечисленным, 16,16-диметил-PGE2 (dmPGE2), пара-(пара-ацетамидобензамидо)фениловый эфир 16-16-диметил-PGE2, 11-дезокси-16,16-диметил-PGE2, 9-дезокси-9-метилен-16,16-диметил-PGE2, 9-дезокси-9-метилен-PGE2, 9-кетофлупростенол, 5-транс-PGE2, 17-фенил-омега-тринор-PGE2, PGE2-сериноламид, сложный метиловый эфир PGE2, 16-фенилтетранор-PGE2, 15(S)-15-метил-PGE2, 15(R)-15-метил-PGE2, 8-изо-15-кето-PGE2, изопропиловый сложный эфир 8-изо-PGE2, 20-гидрокси-PGE2, ноклопрост, сульпростон, бутапрост, 15-кето-PGE2 и 19(R)-гидрокси-PGE2.[00160] Illustrative examples of "analogs" or "derivatives" of PGE2 include, but are not limited to, 16,16-dimethyl- PGE2 ( dmPGE2 ), para-(para-acetamidobenzamido)phenyl ether of 16-16-dimethyl- PGE2 , 11-deoxy-16,16-dimethyl- PGE2 , 9-deoxy-9-methylene-16,16-dimethyl- PGE2 , 9-deoxy-9-methylene- PGE2 , 9-ketofluprostenol, 5-trans- PGE2 , 17-phenyl-omega-trinor- PGE2 , PGE2 -serinolamide, PGE2 methyl ester, 16-phenyltetranor- PGE2 , 15(S)-15-methyl-PGE 2 , 15(R)-15-methyl-PGE 2 , 8-iso-15-keto-PGE 2 , isopropyl ester of 8-iso-PGE 2 , 20-hydroxy-PGE 2 , nocloprost, sulprostone, butaprost, 15-keto-PGE 2 and 19(R)-hydroxy-PGE 2 .

[00161] В настоящем документе также рассматриваются аналоги или производные простагландина, имеющие аналогичную PGE2 структуру, замещенные галогеном в положении 9 (см., например, заявку WO 2001/12596, полностью включенную в настоящий документ посредством ссылки), а также 2-декарбокси-2-фосфиновые производные простагландина, такие как описанные в публикации заявки на патент США № 2006/0247214, полностью включенной в настоящий документ посредством ссылки. [00161] Also contemplated herein are prostaglandin analogs or derivatives having a similar structure to PGE2, substituted with a halogen at the 9-position (see, for example, WO 2001/12596, incorporated herein by reference in its entirety), as well as 2-decarboxy-2-phosphine derivatives of prostaglandin, such as those described in U.S. Patent Application Publication No. 2006/0247214, incorporated herein by reference in its entirety.

ПолоксамерыPoloxamers

[00162] Полоксамеры представляют собой неионогенные триблок-сополимеры, состоящие из центральной гидрофобной цепи полиоксипропилена (поли(пропиленоксида)) с двумя гидрофильными цепями полиоксиэтилена (поли(этиленоксида)) по бокам. Полоксамеры также известны под торговыми наименованиями Synperonics, ® Pluronics® и Kolliphor®. Поскольку длину полимерных блоков можно регулировать, существует множество различных полоксамеров. Полоксамеры обычно обозначают буквой P (от слова полоксамер), за которой следуют три цифры: первые две цифры, умноженные на 100, дают приблизительную молекулярную массу полиоксипропиленового ядра, а последняя цифра, умноженная на 10, дает процентное содержание полиоксиэтилена (например, P407 = полоксамер с молекулярной массой полиоксипропилена 4000 г/моль и содержанием полиоксиэтилена 70%).[00162] Poloxamers are nonionic triblock copolymers consisting of a central hydrophobic chain of polyoxypropylene (poly(propylene oxide)) flanked by two hydrophilic chains of polyoxyethylene (poly(ethylene oxide)) . Poloxamers are also known under the trade names Synperonics, ® Pluronics® and Kolliphor®. Because the length of the polymer blocks can be adjusted, many different poloxamers exist. Poloxamers are typically designated by the letter P (for poloxamer) followed by three digits: the first two digits, multiplied by 100, give the approximate molecular weight of the polyoxypropylene core, and the last digit, multiplied by 10, gives the percentage of polyoxyethylene (e.g. P407 = a poloxamer with a polyoxypropylene molecular weight of 4000 g/mol and a polyoxyethylene content of 70%).

[00163] В частных вариантах осуществления полоксамер имеет среднюю молекулярную массу полипропиленовых субъединиц, равную по меньшей мере приблизительно 2750 дальтон. В частных вариантах осуществления полоксамер имеет среднюю молекулярную массу полипропиленовых субъединиц, равную по меньшей мере приблизительно 3250 дальтон. В частных вариантах осуществления полоксамер имеет среднюю молекулярную массу полипропиленовых субъединиц, равную по меньшей мере приблизительно 4000 дальтон или по меньшей мере приблизительно 10000 дальтон.[00163] In particular embodiments, the poloxamer has an average molecular weight of the polypropylene subunits of at least about 2750 daltons. In particular embodiments, the poloxamer has an average molecular weight of the polypropylene subunits of at least about 3250 daltons. In particular embodiments, the poloxamer has an average molecular weight of the polypropylene subunits of at least about 4000 daltons or at least about 10000 daltons.

[00164] В частных вариантах осуществления полоксамер содержит по меньшей мере приблизительно 50% полиэтиленоксида. В частных вариантах осуществления полоксамер содержит по меньшей мере приблизительно 60% полиэтиленоксида. В частных вариантах осуществления полоксамер содержит по меньшей мере приблизительно 70% полиэтиленоксида. В частных вариантах осуществления полоксамер содержит по меньшей мере приблизительно 80% полиэтиленоксида.[00164] In particular embodiments, the poloxamer comprises at least about 50% polyethylene oxide. In particular embodiments, the poloxamer comprises at least about 60% polyethylene oxide. In particular embodiments, the poloxamer comprises at least about 70% polyethylene oxide. In particular embodiments, the poloxamer comprises at least about 80% polyethylene oxide.

[00165] В частных вариантах осуществления полоксамер имеет среднюю молекулярную массу полипропиленовых субъединиц, равную по меньшей мере приблизительно 2750 дальтон, и полоксамер содержит по меньшей мере приблизительно 40% полиэтиленоксида. В частных вариантах осуществления полоксамер имеет среднюю молекулярную массу полипропиленовых субъединиц, равную по меньшей мере приблизительно 2750 дальтон, и полоксамер содержит по меньшей мере приблизительно 50% полиэтиленоксида. В частных вариантах осуществления полоксамер имеет среднюю молекулярную массу полипропиленовых субъединиц, равную по меньшей мере приблизительно 3250 дальтон, и полоксамер содержит по меньшей мере приблизительно 50% полиэтиленоксида.[00165] In particular embodiments, the poloxamer has an average molecular weight of the polypropylene subunits of at least about 2750 daltons, and the poloxamer comprises at least about 40% polyethylene oxide. In particular embodiments, the poloxamer has an average molecular weight of the polypropylene subunits of at least about 2750 daltons, and the poloxamer comprises at least about 50% polyethylene oxide. In particular embodiments, the poloxamer has an average molecular weight of the polypropylene subunits of at least about 3250 daltons, and the poloxamer comprises at least about 50% polyethylene oxide.

[00166] В отдельных вариантах осуществления полоксамер выбран из группы, состоящей из полоксамера 288, полоксамера 335, полоксамера 338 и полоксамера 407. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 288. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 335. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 407. В одном из вариантов осуществления рекомбинантный ретровирусный вектор представляет собой рекомбинантный лентивирусный вектор.[00166] In certain embodiments, the poloxamer is selected from the group consisting of poloxamer 288, poloxamer 335, poloxamer 338, and poloxamer 407. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 288. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 335. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 407. In one embodiment, the recombinant retroviral vector is a recombinant lentiviral vector.

[00167] Недавно было показано, что полоксамер F108 улучшает трансдукцию гемопоэтических клеток. Hoefig et al. J Gene Med. 2012 Aug;14(8):549-60; патент США № 9,771,599. Включение полоксамера в стандартный протокол трансдукции гемопоэтических стволовых клеток (HSC) дает высокие эффективности трансдукции, обеспечивая при этом сохранение способности трансдуцированных HSC к дифференцировке в различные гемопоэтические линии. Hauber at al. Hum Gene Ther Methods. 2018 Apr;29(2):104-113.[00167] Poloxamer F108 has recently been shown to improve hematopoietic cell transduction. Hoefig et al. J Gene Med. 2012 Aug;14(8):549-60; US Patent No. 9,771,599. Incorporation of poloxamer into a standard hematopoietic stem cell (HSC) transduction protocol results in high transduction efficiencies while maintaining the ability of transduced HSCs to differentiate into various hematopoietic lineages. Hauber at al. Hum Gene Ther Methods. 2018 Apr;29(2):104-113.

Фрагмент рекомбинантного фибронектинаRecombinant fibronectin fragment

[00168] Фрагмент рекомбинантного фибронектина может представлять собой любой фрагмент белка фибронектина, например, фибронектина человека, который способствует повышению эффективности трансдукции. Не ограничиваясь какой-либо конкретной теорией, полагают, что фрагмент рекомбинантного фибронектина способствует колокализации лентивируса или ретровируса с клетками-мишенями. Примером фрагмента рекомбинантного фибронектина является фрагмент CH296 фибронектина человека, имеющий торговое наименование RetroNectin™.[00168] The recombinant fibronectin fragment may be any fragment of the fibronectin protein, such as human fibronectin, that enhances transduction efficiency. Without being bound by any particular theory, it is believed that the recombinant fibronectin fragment promotes colocalization of the lentivirus or retrovirus with target cells. An example of a recombinant fibronectin fragment is the CH296 fragment of human fibronectin, which has the trade name RetroNectin™.

Гемопоэтические клеткиHematopoietic cells

[00169] Гемопоэтические клетки, которые могут быть трансдуцированы в соответствии со способами, раскрытыми в настоящем документе, включают любые гемопоэтические клетки или их популяцию. В отдельных вариантах осуществления гемопоэтические клетки являются гемопоэтическими клетками млекопитающего, например, человека, полученными от млекопитающего. В отдельных вариантах осуществления гемопоэтические клетки получены от человека, подлежащего лечению гемопоэтическими клетками после их трансдукции в соответствии со способом, раскрытым в настоящем документе. В одном из вариантов осуществления гемопоэтические клетки были обогащены CD34+ клетками. В отдельных вариантах осуществления гемопоэтические клетки представляют собой CD34-обогащенные популяции клеток, полученные из биологического образца, полученного от субъекта. В одном из вариантов осуществления биологический образец представляет собой образец костного мозга. В еще одном варианте осуществления биологический образец представляет собой периферическую кровь. В еще одном варианте осуществления биологический образец представляет собой пуповинную кровь.[00169] Hematopoietic cells that can be transduced according to the methods disclosed herein include any hematopoietic cells or population thereof. In certain embodiments, the hematopoietic cells are mammalian, e.g., human, hematopoietic cells obtained from a mammal. In certain embodiments, the hematopoietic cells are obtained from a human to be treated with the hematopoietic cells after transduction according to the method disclosed herein. In one embodiment, the hematopoietic cells have been enriched in CD34+ cells. In certain embodiments, the hematopoietic cells are CD34-enriched cell populations obtained from a biological sample obtained from a subject. In one embodiment, the biological sample is a bone marrow sample. In another embodiment, the biological sample is peripheral blood. In another embodiment, the biological sample is cord blood.

[00170] В частных вариантах осуществления биологический образец, например, периферическую кровь, получают от субъекта после мобилизации гемопоэтических стволовых клеток (HSC). В одном из вариантов осуществления HSC и/или клетки-предшественники мобилизуют путем проведения у субъекта терапии Г-КСФ или его аналогом. HSC и клетки-предшественники (HSPC) в периферической крови могут быть мобилизованы до взятия биологического образца. HSC и HSPC периферической крови могут быть мобилизованы любым способом, известным в данной области техники. HSC и HSPC периферической крови могут быть мобилизованы путем проведения у субъекта терапии любым агентом(ами), описанным в настоящем документе или известным в данной области техники, который увеличивает количество HSPC, циркулирующих в периферической крови субъекта. Например, в частных вариантах осуществления периферическую кровь мобилизуют путем проведения у субъекта терапии одним или более цитокинами или факторами роста (например, Г-КСФ, kit-лигандом (KL), IL-I, IL-7, IL-8, IL-11, лигандом Flt3, SCF, тромбопоэтином или ГМ-КСФ (гранулоцитарно-макрофагальным колониестимулирующим фактором) (таким как сарграмостим)). Различные типы Г-КСФ, которые могут быть использованы в способах мобилизации периферической крови, включают филграстим и Г-КСФ пролонгированного действия пэгфилграстим. В частных вариантах осуществления периферическую кровь мобилизуют путем проведения у субъекта терапии одним или более хемокинами (например, макрофагальным белком воспаления-1a (MIP1a/CCL3)), лигандами хемокиновых рецепторов (например, лигандами хемокинового рецептора-2 GROl3 и GR013M), аналогами хемокиновых рецепторов (например, аналогами белка фактора стромальных клеток-1a (SDF-1a), такими как CTCE-0021, CTCE-0214, или SDF-1a, таким как Met-SDF-113), или антагонистами хемокиновых рецепторов (например, антагонистами хемокинового (мотив C-X-C) рецептора 4 (CXCR4), такими как AMD3100). В частных вариантах осуществления периферическую кровь мобилизуют путем проведения у субъекта терапии одним или более агентами против интегриновой сигнализации (например, блокирующим антителом к очень позднему антигену 4 (VLA-4) или антителом к молекуле адгезии сосудистого эндотелия 1 типа (VCAM-1)). В частных вариантах осуществления периферическую кровь мобилизуют путем проведения у субъекта терапии одним или более цитотоксическими лекарственными средствами, такими как циклофосфамид, этопозид или паклитаксел. В частных вариантах осуществления периферическая кровь может быть мобилизована путем введения субъекту одного или более агентов, перечисленных выше, в течение определенного периода времени. Например, у субъекта может быть проведена терапия одним или более агентами (например, Г-КСФ) посредством инъекции (например, подкожной, внутривенной или внутрибрюшинной) раз в сутки или два раза в сутки за 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13 или 14 дней до сбора HSPC. В частных вариантах осуществления HSPC собирают в пределах 1, 2, 3, 4, 5, 6,7, 8, 12, 14, 16, 18, 20 или 24 часов после последней дозы агента, используемого для мобилизации HSPC в периферическую кровь. В частных вариантах осуществления HSC и HSPC мобилизуют путем проведения у субъекта терапии двумя или более разными типами агентов, описанных выше или известных в данной области техники, например, фактором роста (например, Г-КСФ) и антагонистом хемокинового рецептора (например, антагонистом рецептора CXCR4, таким как AMD3100), или фактором роста (например, Г-КСФ или KL) и анти-интегриновым агентом (например, блокирующим антителом к VLA-4). В одном из вариантов осуществления HSC и/или клетки-предшественники мобилизуют путем проведения у субъекта терапии Г-КСФ или его аналогом. В одном из вариантов осуществления Г-КСФ представляет собой филграстим. В одном из вариантов осуществления HSC и/или клетки-предшественники мобилизуют путем проведения у субъекта терапии плериксафором. В отдельном варианте осуществления HSC и/или клетки-предшественники мобилизуют с помощью комбинации филграстима и плериксафора, филграстимом в отдельности или плериксафором в отдельности. В частных вариантах осуществления различные типы мобилизующих агентов вводят одновременно или последовательно. Для получения дополнительной информации относительно способов мобилизации периферической крови см., например, Craddock et al., 1997, Blood 90(12):4779-4788; Jin et al., 2008, Journal of Translational Medicine 6:39; Pelus, 2008, Curr. Opin. Hematol. 15(4):285-292; Papayannopoulou et al., 1998, Blood 91(7):2231-2239; Tricot et al., 2008, Haematologica 93(11):1739-1742; и Weaver et al., 2001, Bone Marrow Transplantation 27(2):S23-S29).[00170] In particular embodiments, a biological sample, such as peripheral blood, is obtained from a subject after mobilization of hematopoietic stem cells (HSCs). In one embodiment, the HSCs and/or progenitor cells are mobilized by administering G-CSF or an analog thereof to the subject. The HSCs and progenitor cells (HSPCs) in the peripheral blood may be mobilized prior to collection of the biological sample. The peripheral blood HSCs and HSPCs may be mobilized by any method known in the art. The peripheral blood HSCs and HSPCs may be mobilized by administering to the subject therapy with any agent(s) described herein or known in the art that increases the number of HSPCs circulating in the subject's peripheral blood. For example, in particular embodiments, peripheral blood is mobilized by administering one or more cytokines or growth factors (e.g., G-CSF, kit ligand (KL), IL-I, IL-7, IL-8, IL-11, Flt3 ligand, SCF, thrombopoietin, or GM-CSF (granulocyte macrophage colony stimulating factor) (such as sargramostim)) to a subject. Various types of G-CSF that can be used in methods of mobilizing peripheral blood include filgrastim and extended-release G-CSF pegfilgrastim. In particular embodiments, peripheral blood is mobilized by administering to the subject one or more chemokines (e.g., macrophage inflammatory protein-1a (MIP1a/CCL3)), chemokine receptor ligands (e.g., chemokine receptor-2 ligands GRO13 and GR013M), chemokine receptor analogs (e.g., stromal cell derived factor-1a (SDF-1a) protein analogs such as CTCE-0021, CTCE-0214, or SDF-1a such as Met-SDF-113), or chemokine receptor antagonists (e.g., chemokine (C-X-C motif) receptor 4 (CXCR4) antagonists such as AMD3100). In particular embodiments, peripheral blood is mobilized by administering to the subject one or more agents against integrin signaling (e.g., a blocking antibody to very late antigen 4 (VLA-4) or an antibody to vascular endothelial cell adhesion molecule type 1 (VCAM-1)). In particular embodiments, peripheral blood is mobilized by administering to the subject one or more cytotoxic drugs, such as cyclophosphamide, etoposide, or paclitaxel. In particular embodiments, peripheral blood can be mobilized by administering to the subject one or more agents listed above over a period of time. For example, the subject may be treated with one or more agents (e.g., G-CSF) by injection (e.g., subcutaneous, intravenous, or intraperitoneal) once daily or twice daily 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, or 14 days prior to HSPC collection. In particular embodiments, HSPC are collected within 1, 2, 3, 4, 5, 6.7, 8, 12, 14, 16, 18, 20, or 24 hours after the last dose of the agent used to mobilize HSPC into the peripheral blood. In particular embodiments, HSCs and HSPCs are mobilized by administering to the subject therapy with two or more different types of agents described above or known in the art, such as a growth factor (e.g., G-CSF) and a chemokine receptor antagonist (e.g., a CXCR4 receptor antagonist such as AMD3100), or a growth factor (e.g., G-CSF or KL) and an anti-integrin agent (e.g., a VLA-4 blocking antibody). In one embodiment, HSCs and/or progenitor cells are mobilized by administering to the subject therapy with G-CSF or an analog thereof. In one embodiment, the G-CSF is filgrastim. In one embodiment, HSCs and/or progenitor cells are mobilized by administering to the subject therapy with plerixafor. In a particular embodiment, HSCs and/or progenitor cells are mobilized with a combination of filgrastim and plerixafor, filgrastim alone, or plerixafor alone. In particular embodiments, different types of mobilizing agents are administered simultaneously or sequentially. For further information regarding methods of mobilizing peripheral blood, see, e.g., Craddock et al., 1997, Blood 90(12):4779-4788; Jin et al., 2008, Journal of Translational Medicine 6:39; Pelus, 2008, Curr. Opin. Hematol. 15(4):285-292; Papayannopoulou et al., 1998, Blood 91(7):2231-2239; Tricot et al., 2008, Haematologica 93(11):1739-1742; and Weaver et al., 2001, Bone Marrow Transplantation 27(2):S23-S29).

[00171] В отдельных вариантах осуществления периферическую кровь получают через шприц или катетер, вводимый в вену субъекта. Например, периферическая кровь может быть собрана с помощью аппарата для афереза. Кровь течет из вены через катетер в аппарат для афереза, который отделяет лейкоциты, включая HSPC, от остальной крови, а затем возвращает оставшуюся кровь в организм пациента. Аферез можно проводить в течение нескольких часов несколько дней подряд (например, от 1 до 5 дней), пока не будет собрано достаточное количество HSPC.[00171] In some embodiments, peripheral blood is obtained through a syringe or catheter inserted into a vein of the subject. For example, peripheral blood can be collected using an apheresis machine. Blood flows from a vein through a catheter into an apheresis machine, which separates white blood cells, including HSPC, from the rest of the blood, and then returns the remaining blood to the patient. Apheresis can be performed over several hours over several consecutive days (e.g., 1 to 5 days) until a sufficient number of HSPC are collected.

[00172] В отдельных вариантах осуществления костный мозг получают из заднего гребня подвздошной кости субъекта путем пункционной аспирации (см., например, Koda et al., 1984, J. Clin Invest. 73:1377-1384).[00172] In certain embodiments, bone marrow is obtained from the posterior iliac crest of a subject by needle aspiration (see, e.g., Koda et al., 1984, J. Clin Invest. 73:1377-1384).

[00173] В отдельных вариантах осуществления может быть определен уровень гематокрита биологического образца. Уровень гематокрита может быть определен путем центрифугирования образца в камере для обработки для образования слоя эритроцитов образца, чтобы можно было определить объем осажденных эритроцитов. Следует учесть, что образец может быть объединен с антикоагулянтом для облегчения определения уровня гематокрита, и что такой антикоагулянт может быть добавлен в камеру для обработки до или во время центрифугирования. В качестве альтернативы, уровень гематокрита может быть определен путем измерения оптических свойств образца. Например, для анализа образца можно использовать спектрометр. Следует учесть, что можно использовать любой тип известных спектроскопических методов определения уровня гематокрита, таких как, например, рамановская спектроскопия и/или методы светорассеяния.[00173] In some embodiments, the hematocrit level of a biological sample can be determined. The hematocrit level can be determined by centrifuging the sample in a processing chamber to form a layer of red blood cells of the sample so that the volume of sedimented red blood cells can be determined. It should be appreciated that the sample can be combined with an anticoagulant to facilitate the determination of the hematocrit level, and that such an anticoagulant can be added to the processing chamber before or during centrifugation. Alternatively, the hematocrit level can be determined by measuring the optical properties of the sample. For example, a spectrometer can be used to analyze the sample. It should be appreciated that any type of known spectroscopic methods for determining the hematocrit level can be used, such as, for example, Raman spectroscopy and/or light scattering methods.

[00174] В отдельных вариантах осуществления биологический образец обеднен эритроцитами, например, перед получением одной или более популяций клеток, обогащенных CD34+ клетками, из биологического образца. В некоторых вариантах осуществления клетки, оставшиеся после проведения процедур обеднения, промывают. В еще одном варианте к промытым клеткам добавляют неспецифический IgG. В некоторых вариантах осуществления неспецифический IgG представляет собой флебогамму.[00174] In some embodiments, the biological sample is depleted of red blood cells, such as before obtaining one or more cell populations enriched in CD34+ cells from the biological sample. In some embodiments, the cells remaining after the depletion procedures are washed. In another embodiment, non-specific IgG is added to the washed cells. In some embodiments, the non-specific IgG is phlebogamma.

[00175] В некоторых случаях два или более биологических образцов смешивают перед селекцией CD34+, включая, например, образцы костного мозга, собранные в разное время, например, с интервалом в 1, 2, 3, 4 или более дней, или с интервалом в 1, 2 или 3 недели, или с интервалом в 1, 2 или 3 месяца, или с интервалом в несколько лет, включая другие промежутки времени.[00175] In some cases, two or more biological samples are mixed prior to CD34+ selection, including, for example, bone marrow samples collected at different times, such as 1, 2, 3, 4 or more days apart, or 1, 2 or 3 weeks apart, or 1, 2 or 3 months apart, or several years apart, including other time periods.

Обогащение гемопоэтических клеток CD34+ клетками Enrichment of hematopoietic cells with CD34+ cells

[00176] В некоторых вариантах осуществления гемопоэтические клетки представляют собой CD34-положительные гемопоэтические клетки. Обычно клетки CD34+ получают обогащением по CD34 при высокой строгости селекции. В качестве альтернативы или дополнительно к обогащению при высокой строгости селекции может быть проведено обогащение по CD34 при низкой строгости селекции.[00176] In some embodiments, the hematopoietic cells are CD34-positive hematopoietic cells. Typically, CD34+ cells are obtained by enriching for CD34 under high stringency selection. Alternatively, or in addition to enriching under high stringency selection, enriching for CD34 under low stringency selection may be performed.

[00177] В контексте настоящего документа «высокая строгость селекции» или «условия высокой строгости» относятся к способу обогащения популяцией клеток, предназначенному для достижения значительного обогащения клеток клетками, экспрессирующими определенный биологический маркер, например, CD34. Например, обогащение CD34 «при высокой строгости селекции» при использовании в клинических условиях дает средний выход CD34+ клеток 61,6% и медианный выход 65,7%, и среднюю относительную чистоту 88,5% и медианную относительную чистоту 95,9% (N=166) (Clin Lab. 2016 Jul 1;62(7):1243-1248 (PMID: 28164638)). «Высокая строгость селекции» относится к процессу, направленному на существенное обогащение относительно редким типом клеток, CD34+, который обычно составляет 0,2-2% клеточного продукта лейкофереза с мобилизацией или образца костного мозга. Обогащение по CD34+ клеткам при высокой строгости селекции из продукта лейкофереза с мобилизацией или образца костного мозга направлено на получение конечных процентных содержаний CD34+, увеличенных с 0,2-2% до > 80%. Для этого после первоначального нанесения биологического образца на матрицу захвата проводят повторные замены буфера, называемые в настоящем документе «промывками», с целью удаления клеток, слабо или неспецифически связанных с матрицей захвата. Как правило, клетки удаляют из матрицы захвата и наносят повторно для каждого цикла промывки. Удаление и повторное нанесение может выполняться вручную путем отбирания раствора из пробирок с помощью пипетки или автоматически с использованием системы насоса и трубок. Например, при использовании MagCloudz® от Quad Technologies в сочетании с системой магнитной сепарации клеток Dynabeads® комплексы клетка-магнитная частица отделяются в пробирках на магнитном штативе, а промывку выполняют вручную. При использовании системы CliniMACS® от Miltenyi Biotec предварительно настроенная автоматизированная программа загружает комплексы клетка-магнитная частица в магнитную колонку посредством набора трубок, и промывки/повторные загрузки выполняются с помощью системы клапанного насоса. В отдельных вариантах осуществления селекция в условиях высокой строгости может быть проведена на различных приборах, включая, не ограничиваясь перечисленным, MACSQuant Tyto® от Miltenyi Biotec, MagCloudz® от Quad Technologies, систему разделения клеток Sepax® от GE, систему разделения клеток Elutra® от Terumo, клеточный сепаратор COBE Spectra®, системы SynGen LAB® или WASH®, Lovo® от Fresenius-Kabi, систему CliniMACS® от Miltenyi Biotec или систему CliniMACS Prodigy®. Селекцию можно проводить в лаборатории или в месте оказания медицинской помощи. Подробные методы подготовки и обогащения клеток и популяций клеток, включая иллюстративные методы селекции CD34+ клеток в условиях высокой строгости, описаны, например, в публикации международной заявки WO 2016/118780. Иллюстративный метод селекции, подходящий для селекции высокой строгости, предоставлен в патенте США № 8,727,132. Дополнительные иллюстративные методы селекции приведены в международной патентной заявке PCT/US2019/027083, в частности, в примере 1.[00177] As used herein, "high stringency selection" or "high stringency conditions" refers to a method of enriching a cell population designed to achieve significant enrichment of cells expressing a particular biological marker, such as CD34. For example, enrichment of CD34 "under high stringency selection" when used in a clinical setting yields an average yield of 61.6% and a median yield of 65.7% of CD34 + cells, and an average relative purity of 88.5% and a median relative purity of 95.9% (N=166) (Clin Lab. 2016 Jul 1;62(7):1243-1248 (PMID: 28164638)). “High stringency gating” refers to a process designed to substantially enrich for a relatively rare cell type, CD34+, which typically constitutes 0.2-2% of a leukapheresis product with mobilization or a bone marrow sample. Enrichment of CD34+ cells with high stringency gating from a leukapheresis product with mobilization or a bone marrow sample is designed to achieve final percentages of CD34+ that are increased from 0.2-2% to >80%. This is accomplished by performing repeated buffer exchanges, referred to herein as “washes,” after the initial application of the biological sample to the capture matrix to remove cells that are weakly or non-specifically bound to the capture matrix. Typically, cells are removed from the capture matrix and re-applied for each wash cycle. Removal and re-application can be accomplished manually by aspirating solution from tubes using a pipette or automatically using a pump and tubing system. For example, when using MagCloudz® from Quad Technologies in combination with the Dynabeads® Magnetic Cell Separation System, cell-magnetic particle complexes are separated in tubes on a magnetic stand and washing is performed manually. When using the CliniMACS® system from Miltenyi Biotec, a pre-configured automated program loads cell-magnetic particle complexes onto a magnetic column via a set of tubes and washes/reloads are performed using a valve pump system. In some embodiments, high-stringency selection can be performed on a variety of instruments, including, but not limited to, the MACSQuant Tyto® from Miltenyi Biotec, the MagCloudz® from Quad Technologies, the Sepax® Cell Separation System from GE, the Elutra® Cell Separation System from Terumo, the COBE Spectra® Cell Separator, the SynGen LAB® or WASH® Systems, the Lovo® from Fresenius-Kabi, the CliniMACS® System from Miltenyi Biotec, or the CliniMACS Prodigy® System. Selection can be performed in the laboratory or at the point of care. Detailed methods for preparing and enriching cells and cell populations, including exemplary methods for selecting CD34+ cells under high stringency conditions, are described, for example, in International Publication No. WO 2016/118780. An illustrative selection method suitable for high stringency selection is provided in U.S. Patent No. 8,727,132. Additional illustrative selection methods are provided in international patent application PCT/US2019/027083, particularly in Example 1.

[00178] В протоколе обогащения при высокой строгости селекции биологический образец, содержащий CD34+ клетки, помечают реагентом для мечения CD34, например, напрямую конъюгированными иммуномагнитными микросферами. Биологический образец может быть суспендирован в любой подходящей жидкости, такой как, не ограничиваясь перечисленным, натрий-фосфатный буфер (PBS) с, необязательно, этилендиаминтетрауксусной кислотой (ЭДТА) при рН буфера и изотоничности, совместимых с жизнеспособностью клеток. В некоторых случаях используемая жидкость также содержит сывороточный альбумин человека в подходящей концентрации, например, приблизительно 2,5%. При помощи технологии магнитно-активированной сортировки клеток (MACS) биологический образец после мечения загружают в колонку, содержащую магниточувствительный или ферромагнитный материал. С помощью системы MACS магниточувствительный или ферромагнитный материал колонки удерживает целевые клетки, не влияя на способность нецелевых клеток проходить через колонку и выходить из нее. Такие магниточувствительные или ферромагнитные материалы включают железо, сталь, кобальт, никель и другие ферромагнитные редкоземельные металлы или их сплавы. Специалистам в данной области техники будет понятно, что такие материалы можно легко намагничивать и размагничивать. В некоторых вариантах осуществления биологический образец повторно пропускают через магниточувствительный или ферромагнитный материал один или несколько раз. После загрузки колонки связанные клетки промывают, элюируют и/или повторно загружают в колонку при медленной скорости для повышения чистоты обогащенной фракции. Подходящие промывочные буферы включают PBS с (необязательно) ЭДТА и (необязательно) сывороточным альбумином человека. Любой компонент меченого биологического образца, который удаляется во время этапов промывки, собирают в пакет для отходов или «нецелевой» пакет. После подходящих стадий промывки обогащенные при высокой строгости селекции клетки элюируют в пакет для целевых клеток.[00178] In a high stringency enrichment protocol, a biological sample containing CD34+ cells is labeled with a CD34 labeling reagent, such as directly conjugated immunomagnetic beads. The biological sample may be suspended in any suitable liquid, such as, but not limited to, phosphate buffered saline (PBS) with optionally ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) at a buffer pH and isotonicity compatible with cell viability. In some cases, the liquid used also contains human serum albumin at a suitable concentration, such as approximately 2.5%. Using magnetically activated cell sorting (MACS) technology, the biological sample, after labeling, is loaded onto a column containing a magnetically sensitive or ferromagnetic material. With the MACS system, a magnetically sensitive or ferromagnetic column material retains target cells without interfering with the ability of non-target cells to pass through and out of the column. Such magnetically sensitive or ferromagnetic materials include iron, steel, cobalt, nickel, and other ferromagnetic rare earth metals or alloys thereof. Those skilled in the art will appreciate that such materials can be readily magnetized and demagnetized. In some embodiments, the biological sample is repeatedly passed through the magnetically sensitive or ferromagnetic material one or more times. After loading the column, the bound cells are washed, eluted, and/or reloaded onto the column at a slow speed to improve the purity of the enriched fraction. Suitable wash buffers include PBS with (optional) EDTA and (optional) human serum albumin. Any component of the labeled biological sample that is removed during the wash steps is collected in a waste bag or "non-target" bag. After suitable washing steps, the enriched cells under high selection stringency are eluted into a target cell bag.

[00179] В протоколе обогащения при низкой строгости селекции биологический образец, содержащий CD34+ клетки, помечают реагентом для мечения CD34, например, напрямую конъюгированными иммуномагнитными микросферами. При помощи технологии магнитно-активированной сортировки клеток (MACS) биологический образец после мечения загружают в колонку, содержащую магниточувствительный или ферромагнитный материал, при более низкой скорости потока, чем при обогащении при высокой строгости селекции. Как и в случае обогащения при высокой строгости селекции, магниточувствительный или ферромагнитный материал колонки удерживает целевые клетки, не влияя на способность нецелевых клеток проходить через колонку и выходить из нее. В некоторых вариантах осуществления биологический образец повторно пропускают через магниточувствительный или ферромагнитный материал один или несколько раз. После загрузки колонки для обогащения при низкой строгости селекции связанные клетки промывают при более низкой степени строгости селекции. Затем связанные клетки элюируют в пакет для сбора.[00179] In a low stringency enrichment protocol, a biological sample containing CD34+ cells is labeled with a CD34 labeling reagent, such as directly conjugated immunomagnetic beads. Using magnetically activated cell sorting (MACS) technology, the labeled biological sample is loaded onto a column containing a magnetically sensitive or ferromagnetic material at a lower flow rate than for high stringency enrichment. As with high stringency enrichment, the magnetically sensitive or ferromagnetic column material retains target cells without interfering with the ability of non-target cells to pass through and out of the column. In some embodiments, the biological sample is recycled through the magnetically sensitive or ferromagnetic material one or more times. After loading the low stringency enrichment column, bound cells are washed at a lower stringency. Bound cells are then eluted into a collection bag.

[00180] В иллюстративном варианте осуществления обогащение при низкой строгости селекции проводят путем модификации стандартной рабочей процедуры системы MACS так, чтобы системная программа «режима обеднения», предназначенная для достижения обеднения при высокой строгости селекции (т. е. удаления целевых клеток), вместо этого приводила к обогащению при низкой строгости селекции. Работа системы MACS в режиме обеднения вызывает связывание целевых клеток в биологическом образце с магниточувствительным или ферромагнитным материалом в колонке с использованием медленной загрузки колонки и этапов промывки при более низкой строгости селекции, чем при работе в режиме обогащения. Нецелевые клетки вымываются системой MACS в промывочный или так называемый «целевой» пакет. Затем программа режима обеднения переключает выпускной клапан, чтобы направить жидкость в так называемый «нецелевой» пакет, а затем размагничивает колонку. Продолжающаяся загрузка жидкости в размагниченную колонку приводит к элюированию обогащенной CD34+ популяции клеток, которая была обогащена в условиях низкой строгости, в так называемый «нецелевой» пакет, в котором с помощью этого метода собирают целевые клетки.[00180] In an exemplary embodiment, enrichment at low selection stringency is accomplished by modifying a standard operating procedure of the MACS system such that the system's "depletion mode" program, designed to achieve depletion at high selection stringency (i.e., removal of target cells), instead results in enrichment at low selection stringency. Operation of the MACS system in depletion mode causes binding of target cells in a biological sample to a magnetically sensitive or ferromagnetic material in a column using slow column loading and wash steps at a lower selection stringency than operation in enrichment mode. Non-target cells are washed out by the MACS system into a wash or so-called "target" pack. The depletion mode program then switches the outlet valve to direct fluid into the so-called "non-target" pack and then demagnetizes the column. Continued loading of liquid into the demagnetized column results in the elution of the enriched CD34+ cell population, which was enriched under low stringency conditions, into the so-called “non-target” bag, where the target cells are collected using this method.

[00181] Специалисты в данной области техники поймут, что метод обогащения при низкой строгости селекции может быть проведен на различных приборах, включая, не ограничиваясь перечисленным, MACSQuant Tyto® от Miltenyi Biotec, MagCloudz® от Quad Technologies, систему разделения клеток Sepax® от GE, систему разделения клеток Elutra® от Terumo, клеточный сепаратор COBE Spectra®, системы SynGen LAB® или WASH®, Lovo® от Fresenius-Kabi, систему CliniMACS® от Miltenyi Biotec или систему CliniMACS Prodigy®. Специалисты в данной области техники смогут без проведения излишних экспериментов перепрограммировать программное обеспечение такой системы MACS таким образом, чтобы выходной клапан направлял поток начальной стадии связывания в пакет для отходов или «нецелевой» пакет (а не в целевой пакет), и направлял элюированную CD34-обогащенную при низкой строгости селекции популяцию в «целевой» пакет. В результате обогащение при низкой строгости селекции затем проводится в режиме разделения без обычных стадий промывки общепринятых программ MACS.[00181] Those skilled in the art will appreciate that the low stringency enrichment method can be performed on a variety of instruments, including, but not limited to, the MACSQuant Tyto® from Miltenyi Biotec, the MagCloudz® from Quad Technologies, the Sepax® Cell Separation System from GE, the Elutra® Cell Separation System from Terumo, the COBE Spectra® Cell Separator, the SynGen LAB® or WASH® Systems, the Lovo® from Fresenius-Kabi, the CliniMACS® System from Miltenyi Biotec, or the CliniMACS Prodigy® System. Without undue experimentation, one skilled in the art will be able to reprogram the software of such a MACS system such that the outlet valve directs the initial binding step flow to the waste or "off-target" bag (rather than the target bag) and directs the eluted low-stringency CD34-enriched population to the "target" bag. As a result, low-stringency enrichment is then carried out in a separation mode without the usual wash steps of conventional MACS programs.

[00182] В контексте настоящего документа «низкая строгость селекции» или «условия низкой строгости» относятся к способу обогащения популяции клеток, предназначенному для достижения обогащения клеток клетками, экспрессирующими определенный биологический маркер, например, CD34, таким образом, что сохраняется более высокий выход обогащенной популяции клеток, чем достигаемый при селекции высокой строгости, за счет обогащения клетками, экспрессирующими биологический маркер, по сравнению с другими клетками в биологическим образце, т. е., пониженное обогащение. По определению кратность обогащения в условиях высокой строгости больше, чем кратность обогащения в условиях низкой строгости. Кратность обогащения клетками, например, CD34+ клетками, в (CD34 или другой маркер)-обогащенной при высокой строгости селекции популяции клеток в некоторых случаях составляет в 2, 2,25, 2,5, 2,75, 3, 3,25, 3,5, 3,75 или в 4 раза больше, чем кратность обогащения CD34+ клетками в (CD34 или другой маркер)-обогащенной при низкой строгости селекции популяции клеток. В одном из вариантов осуществления кратность обогащения клетками, например, CD34+ клетками, в (CD34 или другой маркер)-обогащенной при высокой строгости селекции популяции клеток составляет в 2-4 раза больше, чем кратность обогащения CD34+ клетками в (CD34 или другой маркер)-обогащенной при низкой строгости селекции популяции клеток. В отдельных вариантах осуществления селекция в условиях низкий строгости может быть проведена на различных приборах, включая, не ограничиваясь перечисленным, MACSQuant Tyto® от Miltenyi Biotec, MagCloudz® от Quad Technologies, систему разделения клеток Sepax® от GE, систему разделения клеток Elutra® от Terumo, клеточный сепаратор COBE Spectra®, системы SynGen LAB® или WASH®, Lovo® от Fresenius-Kabi, систему CliniMACS® от Miltenyi Biotec или систему CliniMACS Prodigy®. Селекцию можно проводить в лаборатории или в месте оказания медицинской помощи. Иллюстративные методы обогащения клетками в условиях низкой строгости приведены в международной патентной заявке PCT/US2019/027083, полностью включенной в настоящий документ посредством ссылки.[00182] As used herein, "low stringency selection" or "low stringency conditions" refers to a method of enriching a population of cells that is designed to achieve enrichment of cells expressing a particular biological marker, such as CD34, in a manner that maintains a higher yield of the enriched population of cells than that achieved with high stringency selection due to enrichment of cells expressing the biological marker relative to other cells in the biological sample, i.e., reduced enrichment. By definition, the fold enrichment under high stringency conditions is greater than the fold enrichment under low stringency conditions. The fold enrichment of cells, such as CD34+ cells, in the (CD34 or other marker)-enriched cell population under high selection stringency is, in some cases, 2-fold, 2.25-fold, 2.5-fold, 2.75-fold, 3-fold, 3.25-fold, 3.5-fold, 3.75-fold, or 4-fold greater than the fold enrichment of CD34+ cells in the (CD34 or other marker)-enriched cell population under low selection stringency. In one embodiment, the fold enrichment of cells, such as CD34+ cells, in the (CD34 or other marker)-enriched cell population under high selection stringency is 2-fold to 4-fold greater than the fold enrichment of CD34+ cells in the (CD34 or other marker)-enriched cell population under low selection stringency. In some embodiments, low-stringency selection can be performed on a variety of instruments, including, but not limited to, the MACSQuant Tyto® from Miltenyi Biotec, MagCloudz® from Quad Technologies, Sepax® Cell Separation System from GE, Elutra® Cell Separation System from Terumo, COBE Spectra® Cell Separator, SynGen LAB® or WASH® Systems, Lovo® from Fresenius-Kabi, CliniMACS® System from Miltenyi Biotec, or CliniMACS Prodigy® System. Selection can be performed in the laboratory or at the point of care. Exemplary methods for low-stringency cell enrichment are provided in International Patent Application PCT/US2019/027083, which is incorporated herein by reference in its entirety.

[00183] Популяции клеток, обогащенные CD34+ клетками, могут быть получены путем селекции CD34+ клеток в условиях высокой строгости и/или в условиях низкой строгости с получением тем самым CD34-обогащенной при высокой строгости селекции популяции клеток и/или CD34-обогащенной при низкой строгости селекции популяции клеток. Методы селекции CD34+ клеток могут представлять собой позитивную селекцию, негативную селекцию или их комбинацию. В отдельных вариантах осуществления биологический образец, полученный от субъекта, делят на два образца, один из которых используют для получения CD34-обогащенной при высокой строгости селекции популяции клеток, а другой - для получения CD34-обогащенной при низкой строгости селекции популяции клеток. В других вариантах осуществления биологический образец, полученный от субъекта, сначала подвергают селекции CD34+ при низкой строгости для получения CD34-обогащенной при низкой строгости селекции популяции клеток, а затем часть указанной CD34-обогащенной при низкой строгости селекции популяции клеток подвергают селекции CD34+ при высокой строгости для получения CD34-обогащенной при высокой строгости селекции популяции клеток. Селекцию можно применять последовательно, например, селекция CD34-обогащенных клеток в условиях низкой строгости может быть применена первой, с последующей селекцией из полученной популяции дополнительно CD34-обогащенных клеток в условиях высокой строгости. В других случаях селекция CD34-обогащенных клеток в условиях высокой строгости может быть применена первой, с последующей селекцией из остаточной популяции CD34-обогащенных клеток в условиях низкой строгости. В некоторых случаях популяции клеток могут быть разделены таким образом, что селекция низкой строгости или высокой строгости применяется к части клеток, ранее подвергнутой селекции высокой строгости или низкой строгости. В некоторых случаях один биологический образец делят на два или более образцов перед селекцией CD34-обогащенных клеток в условиях низкой или высокой строгости.[00183] Populations of cells enriched in CD34+ cells can be obtained by selecting CD34+ cells under high stringency conditions and/or under low stringency conditions, thereby obtaining a CD34-enriched cell population under high stringency selection and/or a CD34-enriched cell population under low stringency selection. Methods for selecting CD34+ cells can be positive selection, negative selection, or a combination thereof. In certain embodiments, a biological sample obtained from a subject is divided into two samples, one of which is used to obtain a CD34-enriched cell population under high stringency selection and the other of which is used to obtain a CD34-enriched cell population under low stringency selection. In other embodiments, a biological sample obtained from a subject is first subjected to CD34+ selection at low stringency to obtain a CD34-enriched cell population at low stringency, and then a portion of said CD34-enriched cell population is subjected to CD34+ selection at high stringency to obtain a CD34-enriched cell population at high stringency. The selection may be applied sequentially, such that selection of CD34-enriched cells at low stringency may be applied first, followed by selection from the resulting population of additional CD34-enriched cells at high stringency. In other cases, selection of CD34-enriched cells at high stringency may be applied first, followed by selection from the residual population of CD34-enriched cells at low stringency. In some cases, cell populations may be divided such that low or high stringency selection is applied to a subset of cells previously subjected to high or low stringency selection. In some cases, a single biological sample is divided into two or more samples before selection of CD34-enriched cells under low or high stringency conditions.

[00184] В каждом случае предполагается селекция высокой строгости или низкой строгости до или после смешивания или разделения биологических образцов или обогащенных популяций клеток во всех возможных сочетаниях. В отдельных вариантах осуществления способ включает получение CD34-обогащенной при высокой строгости селекции популяции клеток из первого биологического образца, полученного от субъекта, путем селекции CD34+ клеток в условиях высокой строгости; и получение CD34-обогащенной при низкой строгости селекции популяции клеток из второго биологического образца, полученного от субъекта, путем селекции CD34+ клеток в условиях низкой строгости.[00184] In each case, high stringency or low stringency selection is contemplated before or after mixing or separating the biological samples or enriched cell populations in all possible combinations. In certain embodiments, the method comprises obtaining a CD34-enriched cell population at high stringency selection from a first biological sample obtained from a subject by selecting CD34 + cells under high stringency conditions; and obtaining a CD34-enriched cell population at low stringency selection from a second biological sample obtained from a subject by selecting CD34 + cells under low stringency conditions.

Трансдуцированные гемопоэтические клеткиTransduced hematopoietic cells

[00185] Как более подробно описано в разделе примеров, популяции гемопоэтических клеток, трансдуцированных в присутствии комбинации раскрытых в настоящем документе усилителей трансдукции, например, протаминсульфата, PGE2 или его производного и полоксамера (например, LentiBOOST), проявляют превосходные свойства по сравнению с гемопоэтическими клетками, трансдуцированными без указанной комбинации усилителей трансдукции. В отдельных вариантах осуществления клетки также были трансдуцированы в присутствии фрагмента рекомбинантного фибронектина, например, RetroNectin™. В частных вариантах осуществления трансдуцированные гемопоэтические клетки или их популяция обладают одним или более из следующего: увеличенное VCN, увеличенное VCN/клетку, увеличенный процент генно-модифицированных КОЕ и увеличенный процент генно-модифицированных КОК. В некоторых вариантах осуществления усиливается восстановление представляющего интерес гена. В частных вариантах осуществления для пациентов с LAD-1 процент (%) CD18+ клеток увеличивается после трансдукции лентивирусным вектором, содержащим ген CD18, по сравнению с трансдукцией без PGE2 или полоксамера, или по сравнению с трансдукцией без какого-либо усилителя трансдукции или только с одним усилителем трансдукции.[00185] As described in more detail in the examples section, populations of hematopoietic cells transduced in the presence of a combination of transduction enhancers disclosed herein, e.g., protamine sulfate, PGE2 or a derivative thereof, and a poloxamer (e.g., LentiBOOST), exhibit superior properties compared to hematopoietic cells transduced without the combination of transduction enhancers. In certain embodiments, the cells were also transduced in the presence of a recombinant fibronectin fragment, e.g., RetroNectin™. In particular embodiments, the transduced hematopoietic cells or population thereof have one or more of the following: an increased VCN, an increased VCN/cell, an increased percentage of gene-modified CFU, and an increased percentage of gene-modified COCs. In some embodiments, restoration of a gene of interest is enhanced. In particular embodiments, for patients with LAD-1, the percentage (%) of CD18 + cells is increased following transduction with a lentiviral vector containing the CD18 gene, compared to transduction without PGE2 or poloxamer, or compared to transduction without any transduction enhancer or with only one transduction enhancer.

[00186] В некоторых вариантах осуществления раскрытых способов процент гемопоэтических клеток, генетически модифицированных данным способом, увеличен по меньшей мере в 1,5 раза, по меньшей мере в 2 раза, по меньшей мере в 2,5 раза, по меньшей мере в 3 раза, по меньшей мере в 3,5 раза, по меньшей мере в 4 раза, по меньшей мере в 5 раз, по меньшей мере в 6 раз, по меньшей мере в 7 раз или по меньшей мере в 8 раз по сравнению с процентом гемопоэтических клеток, генетически модифицированных тем же вирусным вектором без обработки клеток PGE2 или полоксамером, или по сравнению с процентом гемопоэтических клеток, генетически модифицированных тем же вирусным вектором при обработке клеток только одним усилителем трансдукции.[00186] In some embodiments of the disclosed methods, the percentage of hematopoietic cells genetically modified by the method is increased by at least 1.5-fold, at least 2-fold, at least 2.5-fold, at least 3-fold, at least 3.5-fold, at least 4-fold, at least 5-fold, at least 6-fold, at least 7-fold, or at least 8-fold compared to the percentage of hematopoietic cells genetically modified with the same viral vector without treating the cells with PGE2 or poloxamer, or compared to the percentage of hematopoietic cells genetically modified with the same viral vector when the cells are treated with only one transduction enhancer.

[00187] В некоторых вариантах осуществления способ трансдукции гемопоэтических клеток ретровирусным (например, лентивирусным) вектором обеспечивает популяцию гемопоэтических клеток, имеющую VCN/клетку, равное по меньшей мере 1,0, по меньшей мере 1,5, по меньшей мере 2,0 или по меньшей мере 2,5. В некоторых вариантах осуществления способ лечения субъекта включает предоставление указанному субъекту популяции трансдуцированных гемопоэтических клеток, имеющей VCN/клетку, равное по меньшей мере 1,0, по меньшей мере 1,5, по меньшей мере 2,0 или по меньшей мере 2,5.[00187] In some embodiments, a method of transducing hematopoietic cells with a retroviral (e.g., lentiviral) vector provides a population of hematopoietic cells having a VCN/cell of at least 1.0, at least 1.5, at least 2.0, or at least 2.5. In some embodiments, a method of treating a subject comprises providing said subject with a population of transduced hematopoietic cells having a VCN/cell of at least 1.0, at least 1.5, at least 2.0, or at least 2.5.

[00188] В некоторых вариантах осуществления способ трансдукции гемопоэтических клеток ретровирусным вектором обеспечивает популяцию гемопоэтических клеток, характеризующуюся эффективностью трансдукции, равной по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 90% или по меньшей мере 100%. В некоторых вариантах осуществления способ лечения субъекта включает предоставление указанному субъекту популяции трансдуцированных гемопоэтических клеток, характеризующейся эффективностью трансдукции, равной по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 90% или по меньшей мере 100%. [00188] In some embodiments, a method of transducing hematopoietic cells with a retroviral vector provides a population of hematopoietic cells having a transduction efficiency of at least 50%, at least 60%, at least 70%, at least 80%, at least 90%, or at least 100%. In some embodiments, a method of treating a subject comprises providing said subject with a population of transduced hematopoietic cells having a transduction efficiency of at least 50%, at least 60%, at least 70%, at least 80%, at least 90%, or at least 100%.

[00189] В некоторых вариантах осуществления способ трансдукции гемопоэтических клеток ретровирусным вектором обеспечивает популяцию гемопоэтических клеток, имеющую процент трансдуцированных колониеобразующих клеток, равный по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 90% или по меньшей мере 100%. В некоторых вариантах осуществления способ лечения субъекта включает предоставление указанному субъекту популяции трансдуцированных гемопоэтических клеток, имеющей процент трансдуцированных колониеобразующих клеток, равный по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 90% или по меньшей мере 100%. [00189] In some embodiments, a method of transducing hematopoietic cells with a retroviral vector provides a population of hematopoietic cells having a percentage of transduced colony forming cells of at least 50%, at least 60%, at least 70%, at least 80%, at least 90%, or at least 100%. In some embodiments, a method of treating a subject comprises providing said subject with a population of transduced hematopoietic cells having a percentage of transduced colony forming cells of at least 50%, at least 60%, at least 70%, at least 80%, at least 90%, or at least 100%.

[00190] В некоторых вариантах осуществления изобретения предложена популяция гемопоэтических клеток, трансдуцированных рекомбинантным ретровирусным вектором (например, лентивирусным вектором), имеющая VCN/клетку, равное по меньшей мере 1,0, по меньшей мере 1,5, по меньшей мере 2,0 или по меньшей мере 2,5. В некоторых вариантах осуществления изобретения предложена популяция гемопоэтических клеток, трансдуцированных рекомбинантным ретровирусным вектором (например, лентивирусным вектором), характеризующаяся эффективностью трансдукции, равной по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 90% или по меньшей мере 100%. [00190] In some embodiments, the invention provides a population of hematopoietic cells transduced with a recombinant retroviral vector (e.g., a lentiviral vector) having a VCN/cell of at least 1.0, at least 1.5, at least 2.0, or at least 2.5. In some embodiments, the invention provides a population of hematopoietic cells transduced with a recombinant retroviral vector (e.g., a lentiviral vector) having a transduction efficiency of at least 50%, at least 60%, at least 70%, at least 80%, at least 90%, or at least 100%.

[00191] В некоторых вариантах осуществления изобретения предложен способ получения популяции гемопоэтических клеток, содержащей по меньшей мере 70%, по меньшей мере 71%, по меньшей мере 72%, по меньшей мере 73%, по меньшей мере 74%, по меньшей мере 75%, по меньшей мере 76%, по меньшей мере 77%, по меньшей мере 78%, по меньшей мере 79%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 81%, по меньшей мере 82%, по меньшей мере 83%, по меньшей мере 84%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 86%, по меньшей мере 87%, по меньшей мере 88%, по меньшей мере 89%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 91%, по меньшей мере 92%, по меньшей мере 93%, по меньшей мере 94% или по меньшей мере 95% генетически модифицированных гемопоэтических клеток, включающий: приведение гемопоэтических клеток в контакт ex vivo с рекомбинантным ретровирусным вектором (необязательно, лентивирусным вектором), содержащим полинуклеотид, содержащий представляющий интерес ген или кодирующий представляющий интерес полипептид, где приведение в контакт происходит в присутствии PGE2 или его производного, необязательно PGE2 человека или 16,16-диметил-PGE2 (dmPGE2), и полоксамера, необязательно полоксамера 338 (LentiBOOST™). Клетки могут быть приведены в контакт с ретровирусным вектором в условиях и в течение времени, достаточных для обеспечения трансдукции клеток ретровирусным вектором, например, в подходящей культуральной среде в течение по меньшей мере одного часа, по меньшей мере двух часов, по меньшей мере четырех часов, по меньшей мере восьми часов или по меньшей мере двенадцати часов. В некоторых вариантах осуществления клетки приводят в контакт с ретровирусным вектором и усилителями трансдукции в одно и то же время или в течение частично совпадающего периода времени.[00191] In some embodiments, the invention provides a method for producing a population of hematopoietic cells comprising at least 70%, at least 71%, at least 72%, at least 73%, at least 74%, at least 75%, at least 76%, at least 77%, at least 78%, at least 79%, at least 80%, at least 81%, at least 82%, at least 83%, at least 84%, at least 85%, at least 86%, at least 87%, at least 88%, at least 89%, at least 90%, at least 91%, at least 92%, at least 93%, at least 94%, or at least 95% genetically modified hematopoietic cells, comprising: contacting hematopoietic cells ex vivo with a recombinant retroviral vector (optionally a lentiviral vector) comprising a polynucleotide comprising a gene of interest or encoding a polypeptide of interest, wherein the contacting occurs in the presence of PGE2 or a derivative thereof, optionally human PGE2 or 16,16-dimethyl-PGE2 (dmPGE2), and a poloxamer, optionally poloxamer 338 (LentiBOOST™). The cells may be contacted with the retroviral vector under conditions and for a time sufficient to allow transduction of the cells by the retroviral vector, such as in a suitable culture medium for at least one hour, at least two hours, at least four hours, at least eight hours, or at least twelve hours. In some embodiments, the cells are contacted with the retroviral vector and the transduction enhancers at the same time or for an overlapping period of time.

[00192] Способы согласно изобретению обладают тем преимуществом, что они приводят к снижению токсичности (большей выживаемости) трансдуцированной популяции клеток по сравнению с трансдукцией без усилителей трансдукции. В некоторых вариантах осуществления изобретения предложен способ получения популяции гемопоэтических клеток, в котором токсичность по сравнению с трансдукцией без усилителя трансдукции снижена по меньшей мере на 10%, по меньшей мере на 11%, по меньшей мере на 12%, по меньшей мере на 13%, по меньшей мере на 14%, по меньшей мере на 15%, по меньшей мере на 16%, по меньшей мере на 17%, по меньшей мере на 18%, по меньшей мере на 19%, по меньшей мере на 20%, по меньшей мере на 21%, по меньшей мере на 22%, по меньшей мере на 23%, по меньшей мере на 24%, по меньшей мере на 25%, по меньшей мере на 26%, по меньшей мере на 27%, по меньшей мере на 28%, по меньшей мере на 29%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 31%, по меньшей мере на 32%, по меньшей мере на 33%, по меньшей мере на 34% или по меньшей мере на 35%. [00192] The methods of the invention have the advantage that they result in reduced toxicity (greater survival) of the transduced cell population compared to transduction without transduction enhancers. In some embodiments, the invention provides a method for producing a hematopoietic cell population wherein toxicity, compared to transduction without a transduction enhancer, is reduced by at least 10%, at least 11%, at least 12%, at least 13%, at least 14%, at least 15%, at least 16%, at least 17%, at least 18%, at least 19%, at least 20%, at least 21%, at least 22%, at least 23%, at least 24%, at least 25%, at least 26%, at least 27%, at least 28%, at least 29%, at least 30%, at least 31%, at least 32%, at least at least 33%, at least 34%, or at least 35%.

Векторы и кассеты экспрессииVectors and expression cassettes

[00193] Любой подходящий рекомбинантный ретровирусный вектор, который находит применение для доставки полинуклеотидных последовательностей в клетки млекопитающих, охватывается рекомбинантными ретровирусными векторами согласно настоящему изобретению. Например, вектор может содержать одноцепочечную или двухцепочечную нуклеиновую кислоту, например, одноцепочечную или двухцепочечную ДНК. Например, рекомбинантный ретровирусный вектор может представлять собой ДНК. Вектор может содержать одноцепочечную или двухцепочечную РНК, включая модифицированные формы РНК. В еще одном примере рекомбинантный ретровирусный вектор может представлять собой РНК, например, мРНК или модифицированную мРНК.[00193] Any suitable recombinant retroviral vector that finds use in delivering polynucleotide sequences into mammalian cells is encompassed by the recombinant retroviral vectors of the present invention. For example, a vector may comprise a single-stranded or double-stranded nucleic acid, such as single-stranded or double-stranded DNA. For example, a recombinant retroviral vector may be DNA. The vector may comprise single-stranded or double-stranded RNA, including modified forms of RNA. In another example, a recombinant retroviral vector may be RNA, such as mRNA or modified mRNA.

[00194] В частных вариантах осуществления рекомбинантный ретровирусный вектор может представлять собой вирусный вектор, полученный из вируса, например, аденовируса, аденоассоциированного вируса, лентивируса (LV), вируса герпеса, альфавируса или ретровируса, например, вируса мышиного лейкоза Молони (M-MuLV), вируса мышиной саркомы Молони (MoMSV), вируса саркомы мышей Харви (HaMuSV), вируса рака молочной железы мышей (MuMTV), вируса лейкоза гиббонов (GaLV), вируса лейкоза кошачьих (FLV), спумавируса, вируса лейкоза мышей Френд, вируса стволовых клеток мышей (MSCV) или вируса саркомы Рауса (RSV). Хотя ниже более подробно описаны варианты осуществления, охватывающие применение LV, ожидается, что специалист в данной области техники поймет, что аналогичные знания и навыки в данной области могут быть применены и к рекомбинантным ретровирусным векторам, не относящимся к LV. В некоторых вариантах осуществления рекомбинантный ретровирусный вектор представляет собой самоограниченный LV.[00194] In particular embodiments, the recombinant retroviral vector can be a viral vector derived from a virus, such as an adenovirus, an adeno-associated virus, a lentivirus (LV), a herpes virus, an alphavirus, or a retrovirus, such as Moloney murine leukemia virus (M-MuLV), Moloney murine sarcoma virus (MoMSV), Harvey murine sarcoma virus (HaMuSV), murine mammary cancer virus (MuMTV), gibbon leukemia virus (GaLV), feline leukemia virus (FLV), spumavirus, Friend murine leukemia virus, murine stem cell virus (MSCV), or Rous sarcoma virus (RSV). Although embodiments involving the use of LV are described in more detail below, it is expected that one skilled in the art will appreciate that similar knowledge and skill in the art can be applied to recombinant retroviral vectors other than LV. In some embodiments, the recombinant retroviral vector is a self-limited LV.

[00195] В частных вариантах осуществления вирусный вектор представляет собой лентивирусный вектор. В некоторых вариантах осуществления он представляет собой псевдотипированный лентивирусный вектор, например, псевдотипированный VSVG лентивирусный вектор. [00195] In particular embodiments, the viral vector is a lentiviral vector. In some embodiments, it is a pseudotyped lentiviral vector, such as a VSVG pseudotyped lentiviral vector.

[00196] В частности, отдельные способы, раскрытые в настоящем документе, относятся к трансдукции двух популяций стволовых клеток или клеток-предшественников, например, гемопоэтических стволовых клеток (HSC) или гемопоэтических клеток-предшественников (также называемых в настоящем документе «гемопоэтическими предшественниками»), рекомбинантным ретровирусным вектором, кодирующим и/или экспрессирующим терапевтический полипептид, например, FANCA, где одну популяцию получают селекцией в условиях высокой строгости, а другую популяцию получают селекцией в условиях низкой строгости. В одном из вариантов осуществления популяции клеток обогащены CD34+ клетками. В одном из вариантов осуществления HSC или гемопоэтические предшественники получены от субъекта с пониженной или отсутствующей активностью белка из одного или более белков, кодируемых FANCA. В одном из вариантов осуществления субъект имеет FA-A. В одном из вариантов осуществления эндогенный ген FANCA в HSC подвергнут делеции и/или мутирован.[00196] In particular, certain methods disclosed herein relate to transducing two populations of stem cells or progenitor cells, e.g., hematopoietic stem cells (HSCs) or hematopoietic progenitor cells (also referred to herein as "hematopoietic progenitors"), with a recombinant retroviral vector encoding and/or expressing a therapeutic polypeptide, e.g., FANCA, wherein one population is obtained by selection under high stringency conditions and the other population is obtained by selection under low stringency conditions. In one embodiment, the cell populations are enriched for CD34+ cells. In one embodiment, the HSCs or hematopoietic progenitors are obtained from a subject with reduced or absent protein activity from one or more proteins encoded by FANCA. In one embodiment, the subject has FA-A. In one embodiment, the endogenous FANCA gene in the HSCs is deleted and/or mutated.

[00197] В одном из вариантов осуществления трансдукция клетки рекомбинантным ретровирусным вектором приводит к встраиванию в клеточный геном кассеты экспрессии, содержащей промотор, функционально связанный с полинуклеотидной последовательностью, кодирующей терапевтический агент в указанном рекомбинантном ретровирусном векторе. В некоторых вариантах осуществления трансдукция клетки рекомбинантным ретровирусным вектором приводит к экспрессии терапевтического агента, например, биологически активного белка FANCA.[00197] In one embodiment, transducing a cell with a recombinant retroviral vector results in the integration into the cellular genome of an expression cassette comprising a promoter operably linked to a polynucleotide sequence encoding a therapeutic agent in said recombinant retroviral vector. In some embodiments, transducing a cell with a recombinant retroviral vector results in expression of a therapeutic agent, such as a biologically active FANCA protein.

[00198] Например, биологически активный белок FANCA является частью корового комплекса FA. В некоторых вариантах осуществления ген FANCA доставляют с помощью вирусного вектора. В одном из вариантов осуществления ген FANCA доставляют с помощью лентивирусного вектора. В отдельных вариантах осуществления лентивирусный вектор представляет собой PGK-FANCA.WPRE*LV. Предполагается, что после трансдукции клеток костного мозга (BM), или стволовых клеток, или клеток-предшественников от пациентов с FA-A лентивирусным вектором (LV) с FANCA терапевтический вектор встраивается в геном клеток. После встраивания терапевтический белок (например, белок FANCA человека) экспрессируется клетками. Трансдуцированные клетки FA подвергаются генетической коррекции и, таким образом, способны активировать путь FA путем моноубиквитинирования FANCD2 и FANCI. Затем эти белки смогут мигрировать в области повреждения ДНК и совместно с другими ДНК-репарирующими белками будут способствовать репарации ДНК в этих клетках, как это происходит в здоровых клетках.[00198] For example, a biologically active FANCA protein is part of an FA core complex. In some embodiments, the FANCA gene is delivered using a viral vector. In one embodiment, the FANCA gene is delivered using a lentiviral vector. In certain embodiments, the lentiviral vector is PGK-FANCA.WPRE*LV. It is contemplated that upon transduction of bone marrow (BM) cells or stem cells or progenitor cells from FA-A patients with a FANCA lentiviral vector (LV), the therapeutic vector is integrated into the genome of the cells. Once integrated, the therapeutic protein (e.g., human FANCA protein) is expressed by the cells. The transduced FA cells are genetically corrected and are thus capable of activating the FA pathway by monoubiquitinating FANCD2 and FANCI. These proteins will then be able to migrate to areas of DNA damage and, together with other DNA repair proteins, will promote DNA repair in these cells, as occurs in healthy cells.

[00199] Как обсуждается в настоящем документе, рассматриваемые способы и композиции находят применение для экспрессии трансгена, например, FANCA, в клетках животного. Например, рассматриваемые композиции могут применяться в исследованиях, например, для определения влияния гена на жизнеспособность и/или функцию клеток. В качестве еще одного примера, рассматриваемые композиции могут применяться в медицине, например, для лечения расстройства, такого как FA.[00199] As discussed herein, the subject methods and compositions find use in expressing a transgene, such as FANCA, in animal cells. For example, the subject compositions can be used in research, such as to determine the effect of a gene on cell viability and/or function. As another example, the subject compositions can be used in medicine, such as to treat a disorder such as FA.

[00200] В некоторых вариантах осуществления рассматриваемые способы обеспечивают терапевтический эффект, например, предотвращают развитие расстройства, останавливают прогрессирование расстройства, обращают вспять прогрессирование расстройства и т. д. Например, в одном из вариантов осуществления расстройство представляет собой анемию Фанкони (FA). В еще одном варианте осуществления заболевание или расстройство представляет собой недостаточность костного мозга (BMF). В одном из вариантов осуществления расстройство представляет собой тромбоцитопению. В еще одном варианте осуществления расстройство представляет собой лейкопению. В одном из вариантов осуществления расстройство представляет собой панцитопению. В одном из вариантов осуществления расстройство представляет собой нейтропению. В еще одном варианте осуществления расстройство представляет собой анемию. В некоторых вариантах осуществления рассматриваемый способ включает стадию обнаружения достижения терапевтического эффекта. Специалист в данной области техники поймет, что такие меры терапевтической эффективности будут применимы к конкретному изменяемому заболеванию, и определит соответствующие методы обнаружения, которые следует использовать для измерения терапевтической эффективности.[00200] In some embodiments, the subject methods provide a therapeutic effect, such as preventing the development of a disorder, stopping the progression of a disorder, reversing the progression of a disorder, etc. For example, in one embodiment, the disorder is Fanconi anemia (FA). In another embodiment, the disease or disorder is bone marrow failure (BMF). In one embodiment, the disorder is thrombocytopenia. In another embodiment, the disorder is leukopenia. In one embodiment, the disorder is pancytopenia. In one embodiment, the disorder is neutropenia. In another embodiment, the disorder is anemia. In some embodiments, the subject method includes the step of detecting the achievement of a therapeutic effect. One of skill in the art will recognize that such measures of therapeutic efficacy will be applicable to the particular disease being modifiable and will determine appropriate detection methods to be used to measure therapeutic efficacy.

[00201] Соответственно, настоящее изобретение относится к способам лечения FA или одного или более гематологических проявлений FA. В одном из вариантов осуществления гематологическое проявление FA выбрано из одного или более из недостаточности костного мозга (BMF), тромбоцитопении, лейкопении, панцитопении, нейтропении и анемии. В частном варианте осуществления гематологическое проявление представляет собой BMF, который у большинства пациентов с FA проявляется в детском возрасте. В одном из вариантов осуществления гематологическое проявление представляет собой тромбоцитопению. В еще одном варианте осуществления гематологическое проявление представляет собой лейкопению. В одном из вариантов осуществления гематологическое проявление представляет собой панцитопению. В одном из вариантов осуществления гематологическое проявление представляет собой нейтропению. В еще одном варианте осуществления гематологическое проявление представляет собой анемию. В одном из вариантов осуществления гематологическое проявление представляет собой комбинацию двух или более из BMF, тромбоцитопении, лейкопении, панцитопении, нейтропении и анемии.[00201] Accordingly, the present invention provides methods for treating FA or one or more hematological manifestations of FA. In one embodiment, the hematological manifestation of FA is selected from one or more of bone marrow failure (BMF), thrombocytopenia, leukopenia, pancytopenia, neutropenia, and anemia. In a particular embodiment, the hematological manifestation is BMF, which most patients with FA experience in childhood. In one embodiment, the hematological manifestation is thrombocytopenia. In another embodiment, the hematological manifestation is leukopenia. In one embodiment, the hematological manifestation is pancytopenia. In one embodiment, the hematological manifestation is neutropenia. In another embodiment, the hematological manifestation is anemia. In one embodiment, the hematological manifestation is a combination of two or more of BMF, thrombocytopenia, leukopenia, pancytopenia, neutropenia, and anemia.

[00202] Дополнительные LV векторы, которые могут быть использованы в соответствии со способами, раскрытыми в настоящем документе, включают, не ограничиваясь перечисленным, векторы, полученные с использованием векторов для переноса, раскрытых ниже.[00202] Additional LV vectors that can be used in accordance with the methods disclosed herein include, but are not limited to, vectors produced using the transfer vectors disclosed below.

2. Применение трансдуцированных гемопоэтических клеток2. Application of transduced hematopoietic cells

[00203] В некоторых вариантах осуществления гемопоэтические клетки, трансдуцированные в соответствии со способом, раскрытым в настоящем документе, применяют в генной терапии. В частных вариантах осуществления гемопоэтические клетки трансдуцируют вектором, содержащим представляющий интерес ген. Трансдуцированные клетки могут быть предоставлены нуждающемуся в этом субъекту, например, для лечения у указанного субъекта генетического заболевания или расстройства. В частных вариантах осуществления представляющий интерес ген восполняет дефект в гене, связанный с моногенным генетическим заболеванием или расстройством. В некоторых вариантах осуществления у субъекта содержится мутация в представляющем интерес эндогенном гене. В некоторых вариантах осуществления представляющий интерес ген, предоставляемый субъекту, кодон-оптимизирован, например, для усиления экспрессии в клетках млекопитающих.[00203] In some embodiments, hematopoietic cells transduced according to the method disclosed herein are used in gene therapy. In particular embodiments, the hematopoietic cells are transduced with a vector comprising a gene of interest. The transduced cells can be provided to a subject in need thereof, for example, to treat a genetic disease or disorder in the subject. In particular embodiments, the gene of interest complements a defect in a gene associated with a monogenic genetic disease or disorder. In some embodiments, the subject has a mutation in an endogenous gene of interest. In some embodiments, the gene of interest provided to the subject is codon optimized, for example, to enhance expression in mammalian cells.

[00204] В одном из вариантов осуществления представляющий интерес ген выбран из группы, состоящей из группы комплементации A (FANCA), группы комплементации C (FANCC) и группы комплементации G (FANCG) анемии Фанкони. В одном из вариантов осуществления представляющий интерес ген представляет собой эритроцитарную пируваткиназу (RPK). В одном из вариантов осуществления представляющий интерес ген представляет собой интегрин бета-2 (ITGB2), и/или представляющий интерес ген кодирует белок, кодируемый любым из генов, раскрытых в настоящем документе, или его функциональный фрагмент или вариант.[00204] In one embodiment, the gene of interest is selected from the group consisting of Fanconi anemia complementation group A (FANCA), complementation group C (FANCC), and complementation group G (FANCG). In one embodiment, the gene of interest is erythrocyte pyruvate kinase (RPK). In one embodiment, the gene of interest is integrin beta-2 (ITGB2), and/or the gene of interest encodes a protein encoded by any of the genes disclosed herein, or a functional fragment or variant thereof.

[00205] В одном из вариантов осуществления способ предотвращает или облегчает моногенное генетическое заболевание или расстройство.[00205] In one embodiment, the method prevents or alleviates a monogenic genetic disease or disorder.

[00206] В одном из вариантов осуществления моногенетическое заболевание или расстройство выбрано из группы, состоящей из анемии Фанкони, дефицита адгезии лейкоцитов I типа, дефицита пируваткиназы и инфантильного злокачественного остеопороза.[00206] In one embodiment, the monogenetic disease or disorder is selected from the group consisting of Fanconi anemia, leukocyte adhesion deficiency type I, pyruvate kinase deficiency, and infantile malignant osteoporosis.

[00207] Таким образом, в изобретении предложены способы лечения моногенных генетических заболеваний или расстройств, включая, не ограничиваясь перечисленным, анемию Фанкони, дефицит адгезии лейкоцитов I типа, дефицит пируваткиназы и инфантильный злокачественный остеопороз. В частных вариантах осуществления способ включает предоставление нуждающемуся в этом субъекту гемопоэтических клеток, трансдуцированных ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, содержащий последовательность, кодирующую терапевтический белок, функционально связанный с последовательностью промотора, где клетки были трансдуцированы в соответствии со способом, раскрытым в настоящем документе, например, в присутствии двух или более усилителей трансдукции, раскрытых в настоящем документе.[00207] Thus, the invention provides methods for treating monogenic genetic diseases or disorders, including, but not limited to, Fanconi anemia, leukocyte adhesion deficiency type I, pyruvate kinase deficiency, and infantile malignant osteoporosis. In particular embodiments, the method comprises providing to a subject in need thereof hematopoietic cells transduced with a retroviral vector comprising a polynucleotide comprising a sequence encoding a therapeutic protein operably linked to a promoter sequence, wherein the cells have been transduced according to the method disclosed herein, such as in the presence of two or more transduction enhancers disclosed herein.

[00208] В отдельных вариантах осуществления настоящее изобретение включает клетку, содержащую кассету экспрессии гена, кассету для переноса гена или рекомбинантный ретровирусный вектор, например, любой из раскрытых в настоящем документе. В связанных вариантах осуществления клетка была трансдуцирована рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим кассету экспрессии, или кассета экспрессии встроена в геном указанной клетки, где трансдукция была проведена в соответствии со способом, раскрытым в настоящем документе. В отдельных вариантах осуществления клетка представляет собой клетку, используемую для получения рекомбинантного ретровирусного вектора, например, пакующую клетку. [00208] In certain embodiments, the present invention includes a cell comprising a gene expression cassette, a gene transfer cassette, or a recombinant retroviral vector, such as any of those disclosed herein. In related embodiments, the cell has been transduced with a recombinant retroviral vector comprising the expression cassette, or the expression cassette has been inserted into the genome of the cell, wherein the transduction has been carried out in accordance with the method disclosed herein. In certain embodiments, the cell is a cell used to produce a recombinant retroviral vector, such as a packaging cell.

[00209] В отдельных вариантах осуществления клетка представляет собой клетку, которая должна быть доставлена субъекту, чтобы предоставить субъекту продукт гена, кодируемый кассетой экспрессии. Таким образом, в отдельных вариантах осуществления клетка является аутологичной для субъекта, подлежащего лечению, или была получена от субъекта, подлежащего лечению. В других вариантах осуществления клетка является аллогенной для субъекта, подлежащего лечению, или была получена от донора, отличного от субъекта, подлежащего лечению. В частных вариантах осуществления клетка представляет собой клетку млекопитающего, например, клетку человека. В отдельных вариантах осуществления клетка представляет собой клетку крови, эритроцит, гемопоэтическую клетку-предшественника, клетку костного мозга, например, не несущую линейных маркеров клетку костного мозга, гемопоэтическую стволовую клетку (например, CD34+) или коммитированную гемопоэтическую эритроидную клетку-предшественника. В частных вариантах осуществления клетка представляет собой CD34+ клетку, полученную от субъекта, подлежащего лечению указанной клеткой после ее трансдукции рекомбинантным ретровирусным вектором, раскрытым в настоящем документе. В частном варианте осуществления клетка представляет собой CD34+ клетку FA, полученную от субъекта, у которого диагностирована FA. Настоящее изобретение дополнительно включает популяции гемопоэтических клеток (необязательно CD34-обогащенных клеток), трансдуцированных в соответствии со способом, раскрытым в настоящем документе.[00209] In certain embodiments, the cell is a cell that is to be delivered to a subject to provide the subject with a gene product encoded by the expression cassette. Thus, in certain embodiments, the cell is autologous to the subject to be treated or was obtained from the subject to be treated. In other embodiments, the cell is allogeneic to the subject to be treated or was obtained from a donor other than the subject to be treated. In particular embodiments, the cell is a mammalian cell, such as a human cell. In certain embodiments, the cell is a blood cell, a red blood cell, a hematopoietic progenitor cell, a bone marrow cell, such as a lineage-naïve bone marrow cell, a hematopoietic stem cell (e.g., CD34+), or a committed hematopoietic erythroid progenitor cell. In particular embodiments, the cell is a CD34+ cell obtained from a subject to be treated with said cell after its transduction with a recombinant retroviral vector disclosed herein. In a particular embodiment, the cell is a CD34+ FA cell obtained from a subject diagnosed with FA. The present invention further includes populations of hematopoietic cells (optionally CD34-enriched cells) transduced according to the method disclosed herein.

[00210] В некоторых вариантах осуществления раскрытые в настоящем документе способы обеспечивают терапевтический эффект, например, предотвращают развитие расстройства, останавливают прогрессирование расстройства, обращают вспять прогрессирование расстройства и т. д. Например, в одном из вариантов осуществления расстройство представляет собой BMF. В одном из вариантов осуществления расстройство представляет собой тромбоцитопению. В еще одном варианте осуществления расстройство представляет собой лейкопению. В одном из вариантов осуществления расстройство представляет собой панцитопению. В одном из вариантов осуществления расстройство представляет собой нейтропению. В еще одном варианте осуществления расстройство представляет собой анемию. В некоторых вариантах осуществления рассматриваемый способ включает стадию обнаружения достижения терапевтического эффекта. Специалист в данной области техники поймет, что такие меры терапевтической эффективности будут применимы к конкретному изменяемому заболеванию, и определит соответствующие методы обнаружения, которые следует использовать для измерения терапевтической эффективности.[00210] In some embodiments, the methods disclosed herein provide a therapeutic effect, such as preventing the development of a disorder, stopping the progression of a disorder, reversing the progression of a disorder, etc. For example, in one embodiment, the disorder is BMF. In one embodiment, the disorder is thrombocytopenia. In another embodiment, the disorder is leukopenia. In one embodiment, the disorder is pancytopenia. In one embodiment, the disorder is neutropenia. In another embodiment, the disorder is anemia. In some embodiments, the subject method includes the step of detecting the achievement of a therapeutic effect. One of skill in the art will recognize that such measures of therapeutic efficacy will be applicable to the particular disease being modifiable and will determine appropriate detection methods to be used to measure therapeutic efficacy.

[00211] Ожидается, что экспрессия трансгена при использовании рассматриваемого трансгена будет устойчивой. Соответственно, в некоторых случаях экспрессия трансгена, например, как определено путем измерения уровней продукта гена, путем измерения терапевтической эффективности и т. д., может наблюдаться два месяца или менее после введения, например, 4, 3 или 2 недели или менее после введения, например, 1 неделю после введения рассматриваемой композиции. Также ожидается, что экспрессия трансгена будет сохраняться с течением времени. Соответственно, в некоторых случаях экспрессия трансгена, например, как определено путем измерения уровней продукта гена, путем измерения терапевтической эффективности и т. д., может наблюдаться 2 месяца или более после введения рассматриваемой композиции, например, 4, 6, 8 или 10 месяцев или более, в некоторых случаях - 1 год или более, например, 2, 3, 4 или 5 лет, в некоторых случаях - более чем 5 лет.[00211] It is expected that the expression of the transgene using the subject transgene will be stable. Accordingly, in some cases, the expression of the transgene, for example, as determined by measuring the levels of the gene product, by measuring the therapeutic efficacy, etc., may be observed for two months or less after administration, for example, 4, 3, or 2 weeks or less after administration, for example, 1 week after administration of the subject composition. It is also expected that the expression of the transgene will be maintained over time. Accordingly, in some cases, the expression of the transgene, for example, as determined by measuring the levels of the gene product, by measuring the therapeutic efficacy, etc., may be observed for 2 months or more after administration of the subject composition, for example, 4, 6, 8, or 10 months or more, in some cases 1 year or more, for example, 2, 3, 4, or 5 years, in some cases more than 5 years.

[00212]В отдельных вариантах осуществления способ включает стадию обнаружения экспрессии трансгена в клетках или в организме субъекта, где экспрессия усилена по сравнению с экспрессией из полинуклеотидной кассеты, не содержащей один или более улучшенных элементов согласно настоящему изобретению. Как правило, экспрессия будет увеличена в 2 раза или более по сравнению с экспрессией из референсной, т. е. контрольной полинуклеотидной кассеты, например, как известно в данной области техники, например, в 3 раза, 4 раза или 5 раз, или более, в некоторых случаях в 10 раз, 20 раз или 50 раз, или более, например, в 100 раз, о чем свидетельствует, например, более раннее обнаружение, более высокий уровень продукта гена, более сильное функциональное воздействие на клетки и т. д.[00212] In some embodiments, the method comprises the step of detecting expression of the transgene in cells or in the subject, wherein the expression is enhanced compared to expression from a polynucleotide cassette that does not contain one or more enhanced elements according to the present invention. Typically, the expression will be increased by 2-fold or more compared to expression from a reference, i.e., control polynucleotide cassette, for example, as known in the art, such as by 3-fold, 4-fold or 5-fold or more, in some cases by 10-fold, 20-fold or 50-fold or more, such as by 100-fold, as evidenced by, for example, earlier detection, higher levels of gene product, greater functional impact on cells, etc.

[00213] В некоторых вариантах осуществления доза клеток, которую пациенты получают путем инфузии, будет такой же, как и доза, полученная в результате процесса трансдукции. В различных предпочтительных вариантах осуществления пациенту вводят путем инфузии по меньшей мере приблизительно 1x101, 1x102, 1x103, 1x104, 1x105, 1x106, 1x107, 1x108 или более CD34-обогащенных при высокой строгости селекции клеток/кг массы тела пациента. В различных предпочтительных вариантах осуществления пациенту вводят путем инфузии по меньшей мере приблизительно 1x101, 1x102, 1x103, 1x104, 1x105, 1x106, 1x107, 1x108 или более CD34-обогащенных при низкой строгости селекции клеток/кг массы тела пациента. В некоторых вариантах осуществления пациенту вводят путем инфузии от 1x106 до 4x106 CD34-обогащенных при высокой строгости селекции клеток/кг массы тела пациента. В других вариантах осуществления пациенту вводят путем инфузии 3x105 и 4x106 CD34-обогащенных при высокой строгости селекции клеток/кг массы тела пациента. В некоторых вариантах осуществления пациенту вводят путем инфузии от 1x106 до 4x106 CD34-обогащенных при высокой строгости селекции клеток/кг массы тела пациента. В других вариантах осуществления пациенту вводят путем инфузии 3x105 и 4x106 CD34-обогащенных при высокой строгости селекции клеток/кг массы тела пациента. В некоторых вариантах осуществления инфузию клеток пациенту осуществляют в виде однократной дозы. В других вариантах осуществления инфузию клеток пациенту осуществляют в нескольких дозах (например, CD34-обогащенные при высокой и низкой строгости селекции популяции клеток вводят последовательно один или несколько раз). Инфузию трансдуцированных клеток можно проводить сразу после завершения процесса трансдукции. В частных вариантах осуществления трансдуцированные клетки хранят или замораживают перед использованием, тогда как в отдельных вариантах осуществления их предоставляют субъекту сразу же или вскоре после их трансдукции, например, в течение одного часа, двух часов, четырех часов или восьми часов.[00213] In some embodiments, the dose of cells that the patient receives by infusion will be the same as the dose obtained from the transduction process. In various preferred embodiments, at least about 1x10 1 , 1x10 2 , 1x10 3 , 1x10 4 , 1x10 5 , 1x10 6 , 1x10 7 , 1x10 8 or more CD34-enriched cells/kg of patient body weight are infused to the patient under high stringency selection. In various preferred embodiments, the patient is infused with at least about 1x10 1 , 1x10 2 , 1x10 3 , 1x10 4 , 1x10 5 , 1x10 6 , 1x10 7 , 1x10 8 or more low stringency CD34-enriched cells/kg patient body weight. In some embodiments, the patient is infused with 1x10 6 to 4x10 6 high stringency CD34-enriched cells/kg patient body weight. In other embodiments, the patient is infused with 3x10 5 and 4x10 6 high stringency CD34-enriched cells/kg patient body weight. In some embodiments, the patient is infused with 1x10 6 to 4x10 6 high stringency CD34-enriched cells/kg patient body weight. In other embodiments, the patient is infused with 3x10 5 and 4x10 6 high stringency CD34-enriched cells/kg patient body weight. In some embodiments, the cells are infused into the patient in a single dose. In other embodiments, the cells are infused into the patient in multiple doses (e.g., high and low stringency CD34-enriched cell populations are administered sequentially one or more times). The transduced cells can be infused immediately after the transduction process is complete. In particular embodiments, the transduced cells are stored or frozen prior to use, while in other embodiments, they are provided to the subject immediately or shortly after their transduction, such as within one hour, two hours, four hours, or eight hours.

[00214] После встраивания терапевтический белок (например, белок FANCA человека) экспрессируется клетками. Трансдуцированные клетки FA подвергаются генетической коррекции и, таким образом, способны активировать путь FA путем моноубиквитинирования FANCD2 и FANCI. Эти белки мигрируют в области повреждения ДНК и совместно с другими ДНК-репарирующими белками способствуют репарации ДНК в этих клетках, как это происходит в здоровых клетках.[00214] Once incorporated, the therapeutic protein (e.g., human FANCA protein) is expressed by the cells. Transduced FA cells are genetically corrected and are thus able to activate the FA pathway by monoubiquitinating FANCD2 and FANCI. These proteins migrate to areas of DNA damage and, together with other DNA repair proteins, promote DNA repair in these cells as occurs in healthy cells.

[00215] Как более подробно описано в разделе примеров, данные доклинических исследований in vitro с образцами костного мозга от людей с FA уже показали эффективность LV FANCA в отношении коррекции фенотипа этих клеток.[00215] As described in more detail in the examples section, preclinical in vitro data with bone marrow samples from people with FA have already demonstrated the effectiveness of LV FANCA in correcting the phenotype of these cells.

[00216] В одном из вариантов осуществления вводят по меньшей мере от 1 x 105 до 4 x 105 CD34+ скорректированных клеток (например, HSC, трансдуцированных FANCA) на килограмм массы тела пациента для восстановления гемопоэза у пациента с FA без проведения кондиционирования. В некоторых вариантах осуществления инфузию или введение трансдуцированных клеток пациенту проводят сразу же после трансдукции. В других вариантах осуществления трансдуцированные клетки замораживают перед проведением инфузии или введения пациенту с кондиционированием или без него.[00216] In one embodiment, at least 1 x 10 5 to 4 x 10 5 CD34 + corrected cells (e.g., FANCA-transduced HSCs) per kilogram of patient body weight are administered to restore hematopoiesis in a patient with FA without conditioning. In some embodiments, the transduced cells are infused or administered to the patient immediately after transduction. In other embodiments, the transduced cells are frozen prior to infusion or administration to the patient, with or without conditioning.

[00217] Генетическая коррекция HSC от пациентов с FA с последующей аутологичной трансплантацией этих клеток (гемопоэтическая генная терапия) является хорошей альтернативой для пациентов с FA, особенно тех, у кого нет HLA-идентичного родственника для аллогенной трансплантации. В одном из вариантов осуществления гемопоэтическая генная терапия является предпочтительной схемой лечения для пациента, у которого нет HLA-идентичного родственника. В еще одном варианте осуществления гемопоэтическая генная терапия является предпочтительной схемой лечения для пациента, у которого есть HLA-идентичный родственник.[00217] Genetic correction of HSCs from patients with FA followed by autologous transplantation of these cells (hematopoietic gene therapy) is a good alternative for patients with FA, especially those who do not have an HLA-identical relative for allogeneic transplantation. In one embodiment, hematopoietic gene therapy is the preferred treatment regimen for a patient who does not have an HLA-identical relative. In another embodiment, hematopoietic gene therapy is the preferred treatment regimen for a patient who has an HLA-identical relative.

[00218] Анемия Фанкони (FA) является заболеванием с аутосомно-рецессивным типом наследования (за исключением группы комплементации FA-B, которая наследуется как сцепленная с Х-хромосомой), и медианная выживаемость пациентов составляет около 24 лет (Butturini A, et al. (1994) Blood 84:1650-1655; Kutler DI, et al. (2003) Blood 101:1249-1256). При рождении анализ крови у этих пациентов обычно находится в пределах нормы. Макроцитоз часто является первым гематологическим отклонением, обнаруживаемым у таких пациентов. Обычно он развивается в тромбоцитопению, анемию и панцитопению. Недостаточность костного мозга (BMF) обычно наблюдается у этих пациентов через 5-10 лет, при этом средний возраст начала гематологического заболевания составляет 7 лет. Приблизительно у 80% пациентов с FA в течение первого десятилетия жизни развиваются признаки BMF. На основании эпидемиологических исследований, проведенных на сегодняшний день, если злокачественные эпизоды не появляются до развития аплазии, практически у всех пациентов с FA к 40 годам разовьется BMF, что является основной причиной смертности этих пациентов. Из-за сложных клинических проявлений FA ведение этих пациентов в основном направлено на улучшение следующих клинических проявлений: недостаточность костного мозга (BMF), миелоидный лейкоз и солидные опухоли.[00218] Fanconi anemia (FA) is a disorder with an autosomal recessive pattern of inheritance (except for the FA-B complementation group, which is inherited as an X-linked disorder) and the median survival of patients is about 24 years (Butturini A, et al. (1994) Blood 84:1650-1655; Kutler DI, et al. (2003) Blood 101:1249-1256). At birth, the blood count in these patients is usually normal. Macrocytosis is often the first hematological abnormality detected in these patients. It usually progresses to thrombocytopenia, anemia, and pancytopenia. Bone marrow failure (BMF) is usually observed in these patients after 5-10 years, with the average age of onset of the hematological disorder being 7 years. Approximately 80% of patients with FA develop features of BMF during the first decade of life. Based on epidemiologic studies to date, unless malignant episodes occur before aplasia develops, virtually all patients with FA will develop BMF by age 40, which is the leading cause of mortality in these patients. Due to the complex clinical manifestations of FA, management of these patients is mainly aimed at improving the following clinical manifestations: bone marrow failure (BMF), myeloid leukemia, and solid tumors.

[00219] В отдельных вариантах осуществления изобретения предложен способ лечения анемии Фанкони (FA) у нуждающегося в этом субъекта, включающий введение гемопоэтических клеток, трансдуцированных рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, кодирующий ген группы комплементации анемии Фанкони (FANC) или ген, кодирующий его функциональный вариант или фрагмент, в соответствии со способами, раскрытыми в настоящем документе. В некоторых вариантах осуществления ген кодирует FANCA.[00219] In certain embodiments, the invention provides a method of treating Fanconi anemia (FA) in a subject in need thereof, comprising administering hematopoietic cells transduced with a recombinant retroviral vector comprising a polynucleotide encoding a Fanconi anemia complementation group (FANC) gene or a gene encoding a functional variant or fragment thereof, in accordance with the methods disclosed herein. In some embodiments, the gene encodes FANCA.

[00220] В некоторых вариантах осуществления способы, раскрытые в настоящем документе, применяют для трансдукции гемопоэтических клеток лентивирусным вектором, полученным с использованием вектора для переноса pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO, например, для создания популяции клеток для лечения FA. pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO представляет собой лентивирусный вектор на основе плазмиды для переноса pCCL, используемой в системах лентивирусных векторов третьего поколения. Плазмида для переноса pCCL представляет собой лентивирусный вектор, содержащий химерные 5'-LTR CMV-ВИЧ и остовы вектора, в которые включены последовательности полиаденилирования и (без энхансера) точки начала репликации вируса обезьян 40 по ходу транскрипции от 3'-LTR ВИЧ, заменяя большую часть последовательности человека, оставшейся от сайта встраивания ВИЧ. В pCCL энхансер и промотор (нуклеотиды с -673 по -1 относительно сайта инициации транскрипции; регистрационный № GenBank K03104) CMV были присоединены к R-области ВИЧ-1. В векторе используется промотор PGK, связанный с кодон-оптимизированным геном FANCA с элементами RRE и cPPT/CTS, расположенными против хода транскрипции, и с элементом wPRE, расположенным по ходу транскрипции (ФИГ. 15).[00220] In some embodiments, the methods disclosed herein are used to transduce hematopoietic cells with a lentiviral vector produced using the pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO transfer vector, such as to generate a population of cells for the treatment of FA. pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO is a lentiviral vector based on the pCCL transfer plasmid used in third generation lentiviral vector systems. The pCCL transfer plasmid is a lentiviral vector comprising a chimeric CMV-HIV 5' LTR and a vector backbone that includes polyadenylation sequences and (minus the enhancer) simian virus 40 origin of replication downstream of the HIV 3' LTR, replacing most of the human sequence remaining from the HIV insertion site. In pCCL, the CMV enhancer and promoter (nucleotides -673 to -1 relative to the transcription start site; GenBank accession no. K03104) were fused to the HIV-1 R region. The vector utilizes the PGK promoter linked to a codon-optimized FANCA gene with RRE and cPPT/CTS elements located upstream and a wPRE element located downstream (FIG. 15).

[00221] Полученный лентивирусный вектор используют для трансдукции аутологичных CD34+ гемопоэтических стволовых клеток («HSC»), восполняя таким образом генетический дефект. Вкратце, HSC мобилизуют путем проведения у пациента терапии Г-КСФ, плериксафором или комбинацией Г-КСФ и плериксафора. Затем HSC собирают из периферической крови пациента с помощью афереза. Проводят обогащение CD34+ клетками с помощью магнитной сепарации (например, в системе CliniMACs от Miltenyi Biotec) и трансдуцируют CD34+ обогащенные клетки ex vivo в соответствии с раскрытыми в настоящем документе способами лентивирусными частицами, ранее полученными путем временной трансфекции системы лентивирусного вектора третьего поколения, которая включает плазмиду для переноса pCCL-PGK-FANCAW-82-RO. В отдельных вариантах осуществления клетки трансдуцируют в присутствии PGE2 и полоксамера. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). Затем трансдуцированные HSC трансплантируют пациенту путем инфузии и восстанавливают популяцию ниши HSC экспрессирующими FANCA клетками.[00221] The resulting lentiviral vector is used to transduce autologous CD34+ hematopoietic stem cells ("HSCs"), thereby compensating for the genetic defect. Briefly, HSCs are mobilized by administering G-CSF, plerixafor, or a combination of G-CSF and plerixafor to the patient. The HSCs are then collected from the patient's peripheral blood by apheresis. CD34+ cells are enriched using magnetic separation (e.g., the CliniMACs system from Miltenyi Biotec) and the CD34+ enriched cells are transduced ex vivo in accordance with the methods disclosed herein with lentiviral particles previously produced by transient transfection of a third-generation lentiviral vector system that includes the pCCL-PGK-FANCAW-82-RO transfer plasmid. In certain embodiments, the cells are transduced in the presence of PGE2 and a poloxamer. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). The transduced HSCs are then transplanted into the patient by infusion and the HSC niche population is repopulated with FANCA-expressing cells.

[00222] Последовательность кассеты экспрессии FANCA в pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO (5'-3') представляет собой следующую. Кодирующая последовательность FANCA обозначена выделенными полужирным шрифтом заглавными буквами. Последовательность WPRE подчеркнута.[00222] The sequence of the FANCA expression cassette in pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO (5'-3') is as follows. The FANCA coding sequence is indicated by bold capital letters. The WPRE sequence is underlined.

ggggttggggttgcgccttttccaaggcagccctgggtttgcgcagggacgcggctgctctgggcgtggttccgggaaacgcagcggcgccgaccctgggtctcgcacattcttcacgtccgttcgcagcgtcacccggatcttcgccgctacccttgtgggccccccggcgacgcttcctgctccgcccctaagtcgggaaggttccttgcggttcgcggcgtgccggacgtgacaaacggaagccgcacgtctcactagtaccctcgcagacggacagcgccagggagcaatggcagcgcgccgaccgcgatgggctgtggccaatagcggctgctcagcagggcgcgccgagagcagcggccgggaaggggcggtgcgggaggcggggtgtggggcggtagtgtgggccctgttcctgcccgcgcggtgttccgcattctgcaagcctccggagcgcacgtcggcagtcggctccctcgttgaccgaatcaccgacctctctccccagggggatcccccgggctgcaggaattcATGTCCGACTCGTGGGTCCCGAACTCCGCCTCGGGCCAGGACCCAGGGGGCCGCCGGAGGGCCTGGGCCGAGCTGCTGGCGGGAAGGGTCAAGAGGGAAAAATATAATCCTGAAAGGGCACAGAAATTAAAGGAATCAGCTGTGCGCCTCCTGCGAAGCCATCAGGACCTGAATGCCCTTTTGCTTGAGGTAGAAGGTCCACTGTGTAAAAAATTGTCTCTCAGCAAAGTGATTGACTGTGACAGTTCTGAGGCCTATGCTAATCATTCTAGTTCATTTATAGGCTCTGCTTTGCAGGATCAAGCCTCAAGGCTGGGGGTTCCCGTGGGTATTCTCTCAGCCGGGATGGTTGCCTCTAGCGTGGGACAGATCTGCACGGCTCCAGCGGAGACCAGTCACCCTGTGCTGCTGACTGTGGAGCAGAGAAAGAAGCTGTCTTCCCTGTTAGAGTTTGCTCAGTATTTATTGGCACACAGTATGTTCTCCCGTCTTTCCTTCTGTCAAGAATTATGGAAAATACAGAGTTCTTTGTTGCTTGAAGCGGTGTGGCATCTTCACGTACAAGGCATTGTGAGCCTGCAAGAGCTGCTGGAAAGCCATCCCGACATGCATGCTGTGGGATCGTGGCTCTTCAGGAATCTGTGCTGCCTTTGTGAACAGATGGAAGCATCCTGCCAGCATGCTGACGTCGCCAGGGCCATGCTTTCTGATTTTGTTCAAATGTTTGTTTTGAGGGGATTTCAGAAAAACTCAGATCTGAGAAGAACTGTGGAGCCTGAAAAAATGCCGCAGGTCACGGTTGATGTACTGCAGAGAATGCTGATTTTTGCACTTGACGCTTTGGCTGCTGGAGTACAGGAGGAGTCCTCCACTCACAAGATCGTGAGGTGCTGGTTCGGAGTGTTCAGTGGACACACGCTTGGCAGTGTAATTTCCACAGATCCTCTGAAGAGGTTCTTCAGTCATACCCTGACTCAGATACTCACTCACAGCCCTGTGCTGAAAGCATCTGATGCTGTTCAGATGCAGAGAGAGTGGAGCTTTGCGCGGACACACCCTCTGCTCACCTCACTGTACCGCAGGCTCTTTGTGATGCTGAGTGCAGAGGAGTTGGTTGGCCATTTGCAAGAAGTTCTGGAAACGCAGGAGGTTCACTGGCAGAGAGTGCTCTCCTTTGTGTCTGCCCTGGTTGTCTGCTTTCCAGAAGCGCAGCAGCTGCTTGAAGACTGGGTGGCGCGTTTGATGGCCCAGGCATTCGAGAGCTGCCAGCTGGACAGCATGGTCACTGCGTTCCTGGTTGTGCGCCAGGCAGCACTGGAGGGCCCCTCTGCGTTCCTGTCATATGCAGACTGGTTCAAGGCCTCCTTTGGGAGCACACGAGGCTACCATGGCTGCAGCAAGAAGGCCCTGGTCTTCCTGTTTACGTTCTTGTCAGAACTCGTGCCTTTTGAGTCTCCCCGGTACCTGCAGGTGCACATTCTCCACCCACCCCTGGTTCCCAGCAAGTACCGCTCCCTCCTCACAGACTACATCTCATTGGCCAAGACACGGCTGGCCGACCTCAAGGTTTCTATAGAAAACATGGGACTCTACGAGGATTTGTCATCAGCTGGGGACATTACTGAGCCCCACAGCCAAGCTCTTCAGGATGTTGAAAAGGCCATCATGGTGTTTGAGCATACGGGGAACATCCCAGTCACCGTCATGGAGGCCAGCATATTCAGGAGGCCTTACTACGTGTCCCACTTCCTCCCCGCCCTGCTCACACCTCGAGTGCTCCCCAAAGTCCCTGACTCCCGTGTGGCGTTTATAGAGTCTCTGAAGAGAGCAGATAAAATCCCCCCATCTCTGTACTCCACCTACTGCCAGGCCTGCTCTGCTGCTGAAGAGAAGCCAGAAGATGCAGCCCTGGGAGTGAGGGCAGAACCCAACTCTGCTGAGGAGCCCCTGGGACAGCTCACAGCTGCACTGGGAGAGCTGAGAGCCTCCATGACAGACCCCAGCCAGCGTGATGTTATATCGGCACAGGTGGCAGTGATTTCTGAAAGACTGAGGGCTGTCCTGGGCCACAATGAGGATGACAGCAGCGTTGAGATATCAAAGATTCAGCTCAGCATCAACACGCCGAGACTGGAGCCACGGGAACACATTGCTGTGGACCTCCTGCTGACGTCTTTCTGTCAGAACCTGATGGCTGCCTCCAGTGTCGCTCCCCCGGAGAGGCAGGGTCCCTGGGCTGCCCTCTTCGTGAGGACCATGTGTGGACGTGTGCTCCCTGCAGTGCTCACCCGGCTCTGCCAGCTGCTCCGTCACCAGGGCCCGAGCCTGAGTGCCCCACATGTGCTGGGGTTGGCTGCCCTGGCCGTGCACCTGGGTGAGTCCAGGTCTGCGCTCCCAGAGGTGGATGTGGGTCCTCCTGCACCTGGTGCTGGCCTTCCTGTCCCTGCGCTCTTTGACAGCCTCCTGACCTGTAGGACGAGGGATTCCTTGTTCTTCTGCCTGAAATTTTGTACAGCAGCAATTTCTTACTCTCTCTGCAAGTTTTCTTCCCAGTCACGAGATACTTTGTGCAGCTGCTTATCTCCAGGCCTTATTAAAAAGTTTCAGTTCCTCATGTTCAGATTGTTCTCAGAGGCCCGACAGCCTCTTTCTGAGGAGGACGTAGCCAGCCTTTCCTGGAGACCCTTGCACCTTCCTTCTGCAGACTGGCAGAGAGCTGCCCTCTCTCTCTGGACACACAGAACCTTCCGAGAGGTGTTGXAAAGAGGAAGATGTTCACTTAACTTACCAAGACTGGTTACACCTGGAGCTGGAAATTCAACCTGAAGCTGATGCTCTTTCAGATACTGAACGGCAGGACTTCCACCAGTGGGCGATCCATGAGCACTTTCTCCCTGAGTCCTCGGCTTCAGGGGGCTGTGACGGAGACCTGCAGGCTGCGTGTACCATTCTTGTCAACGCACTGATGGATTTCCACCAAAGCTCAAGGAGTTATGACCACTCAGAAAATTCTGATTTGGTCTTTGGTGGCCGCACAGGAAATGAGGATATTATTTCCAGATTGCAGGAGATGGTAGCTGACCTGGAGCTGCAGCAAGACCTCATAGTGCCTCTCGGCCACACCCCTTCCCAGGAGCACTTCCTCTTTGAGATTTTCCGCAGACGGCTCCAGGCTCTGACAAGCGGGTGGAGCGTGGCTGCCAGCCTTCAGAGACAGAGGGAGCTGCTAATGTACAAACGGATCCTCCTCCGCCTGCCTTCGTCTGTCCTCTGCGGCAGCAGCTTCCAGGCAGAACAGCCCATCACTGCCAGATGCGAGCAGTTCTTCCACTTGGTCAACTCTGAGATGAGAAACTTCTGCTCCCACGGAGGTGCCCTGACACAGGACATCACTGCCCACTTCTTCAGGGGCCTCCTGAACGCCTGTCTGCGGAGCAGAGACCCCTCCCTGATGGTCGACTTCATACTGGCCAAGTGCCAGACGAAATGCCCCTTAATTTTGACCTCTGCTCTGGTGTGGTGGCCGAGCCTGGAGCCTGTGCTGCTCTGCCGGTGGAGGAGACACTGCCAGAGCCCGCTGCCCCGGGAACTGCAGAAGCTACAAGAAGGCCGGCAGTTTGCCAGCGATTTCCTCTCCCCTGAGGCTGCCTCCCCAGCACCCAACCCGGACTGGCTCTCAGCTGCTGCACTGCACTTTGCGATTCAACAAGTCAGGGAAGAAAACATCAGGAAGCAGCTAAAGAAGCTGGACTGCGAGAGAGAGGAGCTATTGGTTTTCCTTTTCTTCTTCTCCTTGATGGGCCTGCTGTCGTCACATCTGACCTCAAATAGCACCACAGACCTGCCAAAGGCTTTCCACGTTTGTGCAGCAATCCTCGAGTGTTTAGAGAAGAGGAAGATATCCTGGCTGGCACTCTTTCAGTTGACAGAGAGTGACCTCAGGCTGGGGCGGCTCCTCCTCCGTGTGGCCCCGGATCAGCACACCAGGCTGCTGCCTTTCGCTTTTTACAGTCTTCTCTCCTACTTCCATGAAGACGCGGCCATCAGGGAAGAGGCCTTCCTGCATGTTGCTGTGGACATGTACTTGAAGCTGGTCCAGCTCTTCGTGGCTGGGGATACAAGCACAGTTTCACCTCCAGCTGGCAGGAGCCTGGAGCTCAAGGGTCAGGGCAACCCCGTGGAACTGATAACAAAAGCTCGTCTTTTTCTGCTGCAGTTAATACCTCGGTGCCCGAAAAAGAGCTTCTCACACGTGGCAGAGCTGCTGGCTGATCGTGGGGACTGCGACCCAGAGGTGAGCGCCGCCCTCCAGAGCAGACAGCAGGCTGCCCCTGACGCTGACCTGTCCCAGGAGCCTCATCTCTTCTGATGAgaattcgatatcaagcttatcgataccgtcgaatcccccgggctgcaggaattcgagcatcttaccgccatttattcccatatttgttctgtttttcttgatttgggtatacatttaaatgttaataaaacaaaatggtggggcaatcatttacatttttagggatatgtaattactagttcaggtgtattgccacaagacaaacatgttaagaaactttcccgttatttacgctctgttcctgttaatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactgatattcttaactatgttgctccttttacgctgtgtggatatgctgctttaatgcctctgtatcatgctattgcttcccgtacggctttcgttttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtccgtcaacgtggcgtggtgtgctctgtgtttgctgacgcaacccccactggctggggcattgccaccacctgtcaactcctttctgggactttcgctttccccctcccgatcgccacggcagaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctaggttgctgggcactgataattccgtggtgttgtcggggaagggcc (SEQ ID NO: 1). attcgagcatcttaccgccatttattcccatatttgttctgtttttcttgatttgggtatacatttaaatgttaataaaacaaaatggtggggcaatcatttacatttttagggatatgtaattactagttcaggtgtattgccacaagacaaacatgttaagaaactttcccgttatttacgctctgttcctgttaatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactgatattcttaactatgttgctccttttacgctgtgtggatatgctgctttaatgcctctgtatcatgctattgcttcccgtacggctttcgttttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtccgtcaacgtggcgtggtgtgctctgtgtttgctgacgcaacccccactggctggggcattgccaccacctgtcaactcctttctgggactttcgctttccccctcccgatcgccacggcagaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctaggttgctgggcactgataattccgtggtgttgtcggggaagggcc (SEQ ID NO: 1).

[00223] Последовательность белка FANCA, кодируемая этим полипептидом, представлена как SEQ ID NO: 2. Векторы для экспрессии FANCA, применимые в настоящем изобретении, включают, не ограничиваясь перечисленным, векторы, раскрытые в публикации международной патентной заявки WO 2018/049273, содержание которой полностью включено в настоящий документ.[00223] The FANCA protein sequence encoded by this polypeptide is set forth as SEQ ID NO: 2. FANCA expression vectors useful in the present invention include, but are not limited to, those disclosed in International Patent Application Publication No. WO 2018/049273, the contents of which are incorporated herein in their entirety.

[00224] Дефицит адгезии лейкоцитов-1 (LAD-1) - это редкое заболевание с аутосомно-рецессивным типом наследования, вызываемое мутациями в гене ITGB2, кодирующем CD18 - белок, присутствующий в нескольких рецепторных комплексах на клеточной поверхности, обнаруженных на лейкоцитах, включая лимфоцитарный функционально-ассоциированный антиген-1 (LFA-1), рецептор комплемента 3 (CR-3) и рецептор комплемента 4 (CR-4). Дефицит LFA-1 приводит к тому, что нейтрофилы не могут прикрепляться к кровеносным сосудам и мигрировать из них, поэтому их количество может быть высоким. Он также нарушает взаимодействие иммунных клеток, иммунологическое распознавание и функции лимфоцитов, связанные с уничтожением клеток.[00224] Leukocyte adhesion deficiency-1 (LAD-1) is a rare autosomal recessive disorder caused by mutations in the ITGB2 gene, which encodes CD18, a protein present in several cell surface receptor complexes found on leukocytes, including lymphocyte function-associated antigen-1 (LFA-1), complement receptor 3 (CR-3), and complement receptor 4 (CR-4). LFA-1 deficiency results in neutrophils failing to adhere to and migrate from blood vessels, so their numbers may be high. It also impairs immune cell communication, immune recognition, and lymphocyte cell-killing functions.

[00225] В отдельных вариантах осуществления изобретения предложен способ лечения дефицита адгезии лейкоцитов I типа (LAD-1) у нуждающегося в этом субъекта, включающий введение гемопоэтических клеток, трансдуцированных рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, кодирующий ген ITGB2 или ген, кодирующий его функциональный вариант или фрагмент, в соответствии со способами, раскрытыми в настоящем документе.[00225] In certain embodiments, the invention provides a method of treating leukocyte adhesion deficiency type I (LAD-1) in a subject in need thereof, comprising administering hematopoietic cells transduced with a recombinant retroviral vector comprising a polynucleotide encoding the ITGB2 gene or a gene encoding a functional variant or fragment thereof, in accordance with the methods disclosed herein.

[00226] В некоторых вариантах осуществления способы, раскрытые в настоящем документе, применяют для трансдукции гемопоэтических клеток лентивирусным вектором, полученным с использованием вектора для переноса pCCL-ChimhCD18W-82-RO, например, для создания популяции клеток для лечения LAD-1. pCCL-ChimhCD18W-82-RO представляет собой лентивирусный вектор для переноса на основе плазмиды для переноса pCCL, используемой в системах лентивирусных векторов третьего поколения. Плазмида для переноса pCCL представляет собой лентивирусный вектор, содержащий химерные 5'-LTR CMV-ВИЧ и остовы вектора, в которые включены последовательности полиаденилирования и (без энхансера) точки начала репликации вируса обезьян 40 по ходу транскрипции от 3'-LTR ВИЧ, заменяя большую часть последовательности человека, оставшейся от сайта встраивания ВИЧ. В pCCL энхансер и промотор (нуклеотиды с -673 по -1 относительно сайта инициации транскрипции; регистрационный № GenBank K03104) CMV были присоединены к R-области ВИЧ-1. В векторе используется промотор Chim, связанный с кодон-оптимизированным геном ITGB2 с элементами RRE и cPPT/CTS, расположенными против хода транскрипции, и с элементом wPRE, расположенным по ходу транскрипции (ФИГ. 16). Промотор Chim представляет собой слияние промотора c-Fes и минимальных 5'-фланкирующих областей CTSG (где ТАТА-бокс промотора CTSG мутирован для ограничения инициации транскрипции только минимальным промотором c-Fes).[00226] In some embodiments, the methods disclosed herein are used to transduce hematopoietic cells with a lentiviral vector produced using the pCCL-ChimhCD18W-82-RO transfer vector, such as to generate a population of cells for the treatment of LAD-1. pCCL-ChimhCD18W-82-RO is a lentiviral transfer vector based on the pCCL transfer plasmid used in third generation lentiviral vector systems. The pCCL transfer plasmid is a lentiviral vector comprising a chimeric CMV-HIV 5' LTR and a vector backbone that includes polyadenylation sequences and (minus the enhancer) simian virus 40 origin of replication downstream of the HIV 3' LTR, replacing most of the human sequence remaining from the HIV insertion site. In pCCL, the CMV enhancer and promoter (nucleotides -673 to -1 relative to the transcription start site; GenBank accession no. K03104) were fused to the HIV-1 R region. The vector utilizes the Chim promoter linked to a codon-optimized ITGB2 gene with RRE and cPPT/CTS elements upstream and a wPRE element downstream (FIG. 16). The Chim promoter is a fusion of the c-Fes promoter and the minimal 5' flanking regions of CTSG (where the TATA box of the CTSG promoter is mutated to restrict transcription initiation to the minimal c-Fes promoter).

[00227] Лентивирусные частицы получают путем временной трансфекции системы лентивирусного вектора третьего поколения, которая включает плазмиду для переноса LAD-1. Лентивирусные частицы используют для трансдукции аутологичных CD34+ гемопоэтических стволовых клеток (HSC), восполняя таким образом генетический дефект. Вкратце, HSC мобилизуют путем проведения у пациента терапии Г-КСФ, плериксафором или комбинацией Г-КСФ и плериксафора. Затем HSC собирают из периферической крови пациента с помощью афереза. Проводят обогащение CD34+ клетками с помощью магнитной сепарации (например, в системе CliniMACs от Miltenyi Biotec) и трансдуцируют CD34+ обогащенные клетки ex vivo лентивирусными частицами. Процесс трансдукции включает использование усилителей трансдукции, в частности, полиоксамеров (компания Rocket получила лицензию на LentiBOOST от Sirion Biotech GmbH как для клинического, так и для коммерческого использования) и PGE2 (коммерчески доступен от LGM Pharma). Затем трансдуцированные HSC трансплантируют пациенту путем инфузии, и они восстанавливают популяцию ниши HSC экспрессирующими LAD-1 клетками.[00227] Lentiviral particles are produced by transient transfection of a third-generation lentiviral vector system that includes a LAD-1 transfer plasmid. The lentiviral particles are used to transduce autologous CD34+ hematopoietic stem cells (HSCs), thereby replenishing the genetic defect. Briefly, HSCs are mobilized by treating the patient with G-CSF, plerixafor, or a combination of G-CSF and plerixafor. The HSCs are then collected from the patient's peripheral blood by apheresis. CD34+ cells are enriched for using magnetic separation (e.g., Miltenyi Biotec's CliniMACs system), and the CD34+ enriched cells are transduced ex vivo with the lentiviral particles. The transduction process involves the use of transduction enhancers, specifically polyoxamers (Rocket has licensed LentiBOOST from Sirion Biotech GmbH for both clinical and commercial use) and PGE2 (commercially available from LGM Pharma). The transduced HSCs are then transplanted into the patient by infusion, and they repopulate the HSC niche with LAD-1-expressing cells.

[00228] Полученный лентивирусный вектор используют для трансдукции аутологичных CD34+ гемопоэтических стволовых клеток («HSC»), восполняя генетический дефект. Вкратце, HSC мобилизуют путем проведения у пациента терапии Г-КСФ, плериксафором или комбинацией Г-КСФ и плериксафора. Затем HSC собирают из периферической крови пациента с помощью афереза. Обогащение CD34+ клетками может быть проведено с помощью магнитной сепарации (например, в системе CliniMACs от Miltenyi Biotec), и CD34+ обогащенные клетки трансдуцируют ex vivo в соответствии с раскрытыми в настоящем документе способами лентивирусными частицами, ранее полученными путем временной трансфекции системы лентивирусного вектора третьего поколения, которая включает плазмиду для переноса pCCL-ChimhCD18W-82-RO. В отдельных вариантах осуществления клетки трансдуцируют в присутствии PGE2 и полоксамера. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). Затем трансдуцированные HSC трансплантируют пациенту путем инфузии и восстанавливают популяцию ниши HSC экспрессирующими ITGB2 клетками.[00228] The resulting lentiviral vector is used to transduce autologous CD34+ hematopoietic stem cells ("HSCs"), compensating for the genetic defect. Briefly, HSCs are mobilized by administering G-CSF, plerixafor, or a combination of G-CSF and plerixafor to the patient. The HSCs are then collected from the patient's peripheral blood by apheresis. CD34+ cells can be enriched by magnetic separation (e.g., the CliniMACs system from Miltenyi Biotec), and the CD34+ enriched cells are transduced ex vivo in accordance with the methods disclosed herein with lentiviral particles previously produced by transient transfection of a third-generation lentiviral vector system that includes the pCCL-ChimhCD18W-82-RO transfer plasmid. In certain embodiments, the cells are transduced in the presence of PGE2 and poloxamer. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). The transduced HSCs are then transplanted into the patient by infusion and the HSC niche population is repopulated with ITGB2-expressing cells.

[00229] Последовательность кассеты экспрессии ITGB2 в pCCL-ChimhCD18W-82-RO (5'-3') представляет собой следующую. Кодирующая последовательность ITGB, также известного как CD18, обозначена выделенными полужирным шрифтом заглавными буквами. Последовательность WPRE подчеркнута.[00229] The sequence of the ITGB2 expression cassette in pCCL-ChimhCD18W-82-RO (5'-3') is as follows. The coding sequence of ITGB, also known as CD18, is indicated in bold capital letters. The WPRE sequence is underlined.

cgcgtctgccagctttcttgctttgctggagtattctggaatttgatgggttgagggttctggacacaatgccccaagccccttccttgttgtgctgggttcctatttctgctctcggcactgacttagcagctgctcaagagctcaccatgttggcttggattacacggtctcacccacatctccggcagtttgtgggcaaacttcctgagcagccttgggtgatgaaacctttcatggtagcaggagaatgggactgtgaattctcaatcccctgtccccaccccttccttcctctctcagggccttgctgtctaggaggagggagcacagcagcaactgactgggcagcctttcaggaaaggctagcccgggctcgatcgagaagcttgataattccgtgaggtggggagggctgggaccagggttccctctttctcttctgcggtggccctggcctggtgctaggactgcgcgcctcccctcagtacccgcggacaccctgggcttccctgggcccagcatctgcctggggcctcgccctgggctccccctcctgacccccaccttgcgccccttcccggtgttcccggggcgctgccgggccctggggcctgcggggcgcgggcggctcttggctgggccattctttcccggccccctcctcccttccgtttccgtggccgtgcggccggctagaggctgcggcccagcgcggagcaggggggctggcaggcgtcggggcggtcgggccggtcccgcccgccccttcccctccacaggcccgccccggggcctgggccaactgaaaccgcgggaggaggaagcgcggaatcaggaactggccggggtccgcaccgggcctgagtcggtccgaggccgtcccaggagcagctgcccgaagggcgaattgggggatcccccgggctaatgccaactttgtacaaaaaagcaggctccaccATGCTGGGCCTGCGCCCCCCACTTCTCGCCCTGGTGGGGCTGCTCTCCCTCGGGTGCGTCCTCTCTCAGGAGTGCACGAAGTTCAAGGTCAGCAGCTGCCGGGAATGCATCGAGTCGGGGCCCGGCTGCACCTGGTGCCAGAAGCTGAACTTCACAGGGCCGGGGGATCCTGACTCCATTCGCTGCGACACCCGGCCACAGCTGCTCATGAGGGGCTGTGCGGCTGACGACATCATGGACCCCACAAGCCTCGCTGAAACCCAGGAAGACCACAATGGGGGCCAGAAGCAGCTGTCCCCACAAAAAGTGACGCTTTACCTGCGACCAGGCCAGGCAGCAGCGTTCAACGTGACCTTCCGGCGGGCCAAGGGCTACCCCATCGACCTGTACTATCTGATGGACCTCTCCTACTCCATGCTTGATGACCTCAGGAATGTCAAGAAGCTAGGTGGCGACCTGCTCCGGGCCCTCAACGAGATCACCGAGTCCGGCCGCATTGGCTTCGGGTCCTTCGTGGACAAGACCGTGCTGCCGTTCGTGAACACGCACCCTGATAAGCTGCGAAACCCATGCCCCAACAAGGAGAAAGAGTGCCAGCCCCCGTTTGCCTTCAGGCACGTGCTGAAGCTGACCAACAACTCCAACCAGTTTCAGACCGAGGTCGGGAAGCAGCTGATTTCCGGAAACCTGGATGCACCCGAGGGTGGGCTGGACGCCATGATGCAGGTCGCCGCCTGCCCGGAGGAAATCGGCTGGCGCAACGTCACGCGGCTGCTGGTGTTTGCCACTGATGACGGCTTCCATTTCGCGGGCGACGGGAAGCTGGGCGCCATCCTGACCCCCAACGACGGCCGCTGTCACCTGGAGGACAACTTGTACAAGAGGAGCAACGAATTCGACTACCCATCGGTGGGCCAGCTGGCGCACAAGCTGGCTGAAAACAACATCCAGCCCATCTTCGCGGTGACCAGTAGGATGGTGAAGACCTACGAGAAACTCACCGAGATCATCCCCAAGTCAGCCGTGGGGGAGCTGTCTGAGGACTCCAGCAATGTGGTCCATCTCATTAAGAATGCTTACAATAAACTCTCCTCCAGGGTATTCCTGGATCACAACGCCCTCCCCGACACCCTGAAAGTCACCTACGACTCCTTCTGCAGCAATGGAGTGACGCACAGGAACCAGCCCAGAGGTGACTGTGATGGCGTGCAGATCAATGTCCCGATCACCTTCCAGGTGAAGGTCACGGCCACAGAGTGCATCCAGGAGCAGTCGTTTGTCATCCGGGCGCTGGGCTTCACGGACATAGTGACCGTGCAGGTCCTTCCCCAGTGTGAGTGCCGGTGCCGGGACCAGAGCAGAGACCGCAGCCTCTGCCATGGCAAGGGCTTCTTGGAGTGCGGCATCTGCAGGTGTGACACTGGCTACATTGGGAAAAACTGTGAGTGCCAGACACAGGGCCGGAGCAGCCAGGAGCTGGAAGGAAGCTGCCGGAAGGACAACAACTCCATCATCTGCTCAGGGCTGGGGGACTGTGTCTGCGGGCAGTGCCTGTGCCACACCAGCGACGTCCCCGGCAAGCTGATATACGGGCAGTACTGCGAGTGTGACACCATCAACTGTGAGCGCTACAACGGCCAGGTCTGCGGCGGCCCGGGGAGGGGGCTCTGCTTCTGCGGGAAGTGCCGCTGCCACCCGGGCTTTGAGGGCTCAGCGTGCCAGTGCGAGAGGACCACTGAGGGCTGCCTGAACCCGCGGCGTGTTGAGTGTAGTGGTCGTGGCCGGTGCCGCTGCAACGTATGCGAGTGCCATTCAGGCTACCAGCTGCCTCTGTGCCAGGAGTGCCCCGGCTGCCCCTCACCCTGTGGCAAGTACATCTCCTGCGCCGAGTGCCTGAAGTTCGAAAAGGGCCCCTTTGGGAAGAACTGCAGCGCGGCGTGTCCGGGCCTGCAGCTGTCGAACAACCCCGTGAAGGGCAGGACCTGCAAGGAGAGGGACTCAGAGGGCTGCTGGGTGGCCTACACGCTGGAGCAGCAGGACGGGATGGACCGCTACCTCATCTATGTGGATGAGAGCCGAGAGTGTGTGGCAGGCCCCAACATCGCCGCCATCGTCGGGGGCACCGTGGCAGGCATCGTGCTGATCGGCATTCTCCTGCTGGTCATCTGGAAGGCTCTGATCCACCTGAGCGACCTCCGGGAGTACAGGCGCTTTGAGAAGGAGAAGCTCAAGTCCCAGTGGAACAATGATAATCCCCTTTTCAAGAGCGCCACCACGACGGTCATGAACCCCAAGTTTGCTGAGAGTTAGgacccagctttcttgtacaaagttggcattaggaattcgagcatcttaccgccatttattcccatatttgttctgtttttcttgatttgggtatacatttaaatgttaataaaacaaaatggtggggcaatcatttacatttttagggatatgtaattactagttcaggtgtattgccacaagacaaacatgttaagaaactttcccgttatttacgctctgttcctgttaatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactgatattcttaactatgttgctccttttacgctgtgtggatatgctgctttaatgcctctgtatcatgctattgcttcccgtacggctttcgttttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtccgtcaacgtggcgtggtgtgctctgtgtttgctgacgcaacccccactggctggggcattgccaccacctgtcaactcctttctgggactttcgctttccccctcccgatcgccacggcagaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctaggttgctgggcactgataattccgtggtgttgtcggggaagggcc (SEQ ID NO: 3). attcgagcatcttaccgccatttattcccatatttgttctgtttttcttgatttgggtatacatttaaatgttaataaaacaaaatggtggggcaatcatttacatttttagggatatgtaattactagttcaggtgtattgccacaagacaaacatgttaagaaactttcccgttatttacgctctgttcctgttaatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactgatattcttaactatgttgctccttttacgctgtgtggatatgctgctttaatgcctctgtatcatgctattgcttcccgtacggctttcgttttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtccgtcaacgtggcgtggtgtgctctgtgtttgctgacgcaacccccactggctggggcattgccaccacctgtcaactcctttctgggactttcgctttccccctcccgatcgccacggcagaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctaggttgctgggcactgataattccgtggtgttgtcggggaagggcc (SEQ ID NO: 3).

[00230] Последовательность белка ITGB2 человека представлена как SEQ ID NO: 4.[00230] The human ITGB2 protein sequence is provided as SEQ ID NO: 4.

[00231] Дефицит пируваткиназы (PKD) - это моногенное метаболическое заболевание, вызываемое мутациями в гене PKLR, которые нарушают энергетический баланс эритроцитов, вызывая тем самым гемолитическую анемию, которая может очень сильно различаться по степени и может привести к летальному исходу в неонатальном периоде. [00231] Pyruvate kinase deficiency (PKD) is a monogenic metabolic disorder caused by mutations in the PKLR gene that disrupt the energy balance of red blood cells, thereby causing hemolytic anemia that can vary greatly in severity and can be fatal in the neonatal period.

[00232] В отдельных вариантах осуществления изобретения предложен способ лечения дефицита пируваткиназы у нуждающегося в этом субъекта, включающий введение гемопоэтических клеток, трансдуцированных рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, кодирующий ген пируваткиназы типа R или ген, кодирующий его функциональный вариант или фрагмент, в соответствии со способами, раскрытыми в настоящем документе.[00232] In certain embodiments, the invention provides a method of treating pyruvate kinase deficiency in a subject in need thereof, comprising administering hematopoietic cells transduced with a recombinant retroviral vector comprising a polynucleotide encoding a pyruvate kinase R gene or a gene encoding a functional variant or fragment thereof, in accordance with the methods disclosed herein.

[00233] В некоторых вариантах осуществления способы, раскрытые в настоящем документе, применяют для трансдукции гемопоэтических клеток лентивирусным вектором, полученным с использованием вектора для переноса pCCL-PGK-coRPKW-82-RO, например, для создания популяции клеток для лечения IMO. pCCL-PGK-coRPKW-82-RO ((плазмида PKD) основана на плазмиде для переноса pCCL, используемой в системах лентивирусных векторов третьего поколения. Плазмида для переноса pCCL представляет собой лентивирусный вектор, содержащий химерные 5'-LTR CMV-ВИЧ и остовы вектора, в которые включены последовательности полиаденилирования и (без энхансера) точки начала репликации вируса обезьян 40 по ходу транскрипции от 3'-LTR ВИЧ, заменяя большую часть последовательности человека, оставшейся от сайта встраивания ВИЧ. В pCCL энхансер и промотор (нуклеотиды с -673 по -1 относительно сайта инициации транскрипции; регистрационный № GenBank K03104) CMV были присоединены к R-области ВИЧ-1. Плазмида PKD включает промотор PGK, связанный с кодон-оптимизированным геном PKLR с элементами RRE и cPPT/CTS, расположенными против хода транскрипции, и с элементом wPRE, расположенным по ходу транскрипции (ФИГ. 1). Лентивирусные векторные частицы получают путем временной трансфекции системы лентивирусного вектора третьего поколения, которая включает плазмиду PKD (ФИГ. 17).[00233] In some embodiments, the methods disclosed herein are used to transduce hematopoietic cells with a lentiviral vector produced using the pCCL-PGK-coRPKW-82-RO transfer vector, such as to generate a population of cells for the treatment of IMO. pCCL-PGK-coRPKW-82-RO (PKD plasmid) is based on the pCCL transfer plasmid used in third-generation lentiviral vector systems. pCCL transfer plasmid is a lentiviral vector containing a chimeric CMV-HIV 5' LTR and a vector backbone that incorporates polyadenylation sequences and (minus the enhancer) simian virus 40 origin of replication downstream of the HIV 3' LTR, replacing most of the human sequence remaining from the HIV insertion site. In pCCL, the CMV enhancer and promoter (nucleotides -673 to -1 relative to the transcription start site; GenBank accession no. K03104) have been fused to the HIV-1 R region. PKD plasmid contains the PGK promoter linked to a codon-optimized PKLR gene with RRE and cPPT/CTS elements located upstream of transcription and with wPRE element located downstream of transcription (FIG. 1). Lentiviral vector particles are produced by transient transfection of a third generation lentiviral vector system that includes PKD plasmid (FIG. 17).

[00234] Лентивирусные векторные частицы затем могут быть использованы для трансдукции аутологичных CD34+ гемопоэтических стволовых клеток («HSC»), восполняя таким образом генетический дефект. Вкратце, HSC мобилизуют путем проведения у пациента терапии Г-КСФ, плериксафором или комбинацией Г-КСФ и плериксафора. Затем HSC собирают из периферической крови пациента с помощью афереза. Обогащение CD34+ клетками может быть проведено с помощью магнитной сепарации (например, в системе CliniMACs от Miltenyi Biotec), и CD34+ обогащенные клетки трансдуцируют ex vivo лентивирусными векторными частицами в соответствии со способами, раскрытыми в настоящем документе. В отдельных вариантах осуществления клетки трансдуцируют в присутствии PGE2 и полоксамера. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). Затем трансдуцированные HSC трансплантируют пациенту путем инфузии и восстанавливают популяцию ниши HSC экспрессирующими PKLR клетками.[00234] The lentiviral vector particles can then be used to transduce autologous CD34+ hematopoietic stem cells ("HSCs"), thereby replenishing the genetic defect. Briefly, HSCs are mobilized by administering G-CSF, plerixafor, or a combination of G-CSF and plerixafor to the patient. The HSCs are then collected from the patient's peripheral blood by apheresis. CD34+ cells can be enriched using magnetic separation (e.g., the CliniMACs system from Miltenyi Biotec), and the CD34+ enriched cells are transduced ex vivo with the lentiviral vector particles in accordance with the methods disclosed herein. In certain embodiments, the cells are transduced in the presence of PGE2 and a poloxamer. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). The transduced HSCs are then transplanted into the patient by infusion and the HSC niche population is repopulated with PKLR-expressing cells.

[00235] Последовательность кассеты экспрессии PKLR в pCCL-PGK-coRPKW-82-RO (5'-3') представляет собой следующую. Кодирующая последовательность PKLR обозначена выделенными полужирным шрифтом заглавными буквами. Промотор PGK выделен курсивом, а последовательность WPRE подчеркнута. [00235] The sequence of the PKLR expression cassette in pCCL-PGK-coRPKW-82-RO (5'-3') is as follows. The PKLR coding sequence is indicated by bold capital letters. The PGK promoter is indicated by italics and the WPRE sequence is underlined.

ggggttggggttgcgccttttccaaggcagccctgggtttgcgcagggacgcggctgctctgggcgtggttccgggaaacgcagcggcgccgaccctgggtctcgcacattcttcacgtccgttcgcagcgtcacccggatcttcgccgctacccttgtgggccccccggcgacgcttcctgctccgcccctaagtcgggaaggttccttgcggttcgcggcgtgccggacgtgacaaacggaagccgcacgtctcactagtaccctcgcagacggacagcgccagggagcaatggcagcgcgccgaccgcgatgggctgtggccaatagcggctgctcagcagggcgcgccgagagcagcggccgggaaggggcggtgcgggaggcggggtgtggggcggtagtgtgggccctgttcctgcccgcgcggtgttccgcattctgcaagcctccggagcgcacgtcggcagtcggctccctcgttgaccgaatcaccgacctctctccccagggggatccgtcgacaccggtgccaccATGAGCATCCAGGAAAATATCAGCTCTCTGCAGCTGCGGTCCTGGGTGTCCAAGAGCCAGAGAGACCTGGCCAAGAGCATCCTGATCGGAGCCCCTGGCGGACCAGCCGGATACCTGAGAAGGGCTAGCGTGGCCCAGCTGACCCAGGAACTGGGCACCGCCTTTTTCCAGCAGCAGCAGCTGCCAGCCGCCATGGCCGACACCTTTCTGGAACACCTGTGCCTGCTGGACATCGACTCTGAGCCCGTGGCCGCCAGAAGCACCAGCATCATTGCCACCATCGGCCCTGCCAGCAGAAGCGTGGAGCGGCTGAAAGAGATGATCAAGGCCGGCATGAATATCGCCCGGCTGAACTTCTCCCACGGCAGCCACGAGTACCACGCAGAGAGCATTGCCAACGTCCGGGAGGCCGTGGAGAGCTTTGCCGGCAGCCCCCTGAGCTACAGACCCGTGGCCATTGCCCTGGACACCAAGGGCCCCGAGATCAGAACAGGAATTCTGCAGGGAGGGCCTGAGAGCGAGGTGGAGCTGGTGAAGGGCAGCCAAGTGCTGGTGACCGTGGACCCCGCCTTCAGAACCAGAGGCAACGCCAACACAGTGTGGGTGGACTACCCCAACATCGTGCGGGTGGTGCCTGTGGGCGGCAGAATCTACATCGACGACGGCCTGATCAGCCTGGTGGTGCAGAAGATCGGACCTGAGGGCCTGGTGACCCAGGTCGAGAATGGCGGCGTGCTGGGCAGCAGAAAGGGCGTGAATCTGCCAGGCGCCCAGGTGGACCTGCCTGGCCTGTCTGAGCAGGACGTGAGAGACCTGAGATTTGGCGTGGAGCACGGCGTGGACATCGTGTTCGCCAGCTTCGTGCGGAAGGCCTCTGATGTGGCCGCCGTGAGAGCCGCTCTGGGCCCTGAAGGCCACGGCATCAAGATCATCAGCAAGATCGAGAACCACGAGGGCGTGAAGCGGTTCGACGAGATCCTGGAAGTGTCCGACGGCATCATGGTGGCCAGAGGCGACCTGGGCATCGAGATCCCCGCCGAGAAGGTGTTCCTGGCCCAGAAAATGATGATCGGACGGTGCAACCTGGCCGGCAAACCTGTGGTGTGCGCCACCCAGATGCTGGAAAGCATGATCACCAAGCCCAGACCCACCAGAGCCGAGACAAGCGACGTGGCCAACGCCGTGCTGGATGGCGCTGACTGCATCATGCTGTCCGGCGAGACAGCCAAGGGCAACTTCCCCGTGGAGGCCGTGAAGATGCAGCACGCCATTGCCAGAGAAGCCGAGGCCGCCGTGTACCACCGGCAGCTGTTCGAGGAACTGCGGAGAGCCGCCCCTCTGAGCAGAGATCCCACCGAAGTGACCGCCATCGGAGCCGTGGAAGCCGCCTTCAAGTGCTGCGCCGCTGCAATCATCGTGCTGACCACCACAGGCAGAAGCGCCCAGCTGCTGTCCAGATACAGACCCAGAGCCGCCGTGATCGCCGTGACAAGATCCGCCCAGGCCGCTAGACAGGTCCACCTGTGCAGAGGCGTGTTCCCCCTGCTGTACCGGGAGCCTCCCGAGGCCATCTGGGCCGACGACGTGGACAGACGGGTGCAGTTCGGCATCGAGAGCGGCAAGCTGCGGGGCTTCCTGAGAGTGGGCGACCTGGTGATCGTGGTGACAGGCTGGCGGCCTGGCAGCGGCTACACCAACATCATGAGGGTGCTGTCCATCAGCTGAccgcggtctagaggatcccccgggctgcaggaattcgagcatcttaccgccatttattcccatatttgttctgtttttcttgatttgggtatacatttaaatgttaataaaacaaaatggtggggcaatcatttacatttttagggatatgtaattactagttcaggtgtattgccacaagacaaacatgttaagaaactttcccgttatttacgctctgttcctgttaatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactgatattcttaactatgttgctccttttacgctgtgtggatatgctgctttaatgcctctgtatcatgctattgcttcccgtacggctttcgttttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtccgtcaacgtggcgtggtgtgctctgtgtttgctgacgcaacccccactggctggggcattgccaccacctgtcaactcctttctgggactttcgctttccccctcccgatcgccacggcagaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctaggttgctgggcactgataattccgtggtgttgtcggggaagggcc (SEQ ID NO: 5). attcgagcatcttaccgccatttattcccatatttgttctgtttttcttgatttgggtatacatttaaatgttaataaaacaaaatggtggggcaatcatttacatttttagggatatgtaattactagttcaggtgtattgccacaagacaaacatgttaagaaactttcccgttatttacgctctgttcctgttaatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactgatattcttaactatgttgctccttttacgctgtgtggatatgctgctttaatgcctctgtatcatgctattgcttcccgtacggctttcgttttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtccgtcaacgtggcgtggtgtgctctgtgtttgctgacgcaacccccactggctggggcattgccaccacctgtcaactcctttctgggactttcgctttccccctcccgatcgccacggcagaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctaggttgctgggcactgataattccgtggtgttgtcggggaagggcc (SEQ ID NO: 5).

[00236] Последовательность белка PKLR, кодируемая этим полипептидом, представлена как SEQ ID NO: 6. Дополнительные полинуклеотидные последовательности PKLR, применимые в настоящем изобретении, включают SEQ ID NO: 7-9. Векторы для экспрессии PKLR, применимые в настоящем изобретении, включают, не ограничиваясь перечисленным, векторы, раскрытые в международной патентной заявке PCT/US2019/041465, содержание которой полностью включено в настоящий документ.[00236] The PKLR protein sequence encoded by this polypeptide is set forth as SEQ ID NO: 6. Additional PKLR polynucleotide sequences useful in the present invention include SEQ ID NOs: 7-9. PKLR expression vectors useful in the present invention include, but are not limited to, those disclosed in International Patent Application PCT/US2019/041465, the contents of which are incorporated herein in their entirety.

[00237] Инфантильный злокачественный остеопороз (IMO) - это редкое расстройство с рецессивным типом наследования, характеризующееся увеличением костной массы, вызванным нарушением функции остеокластов. Это заболевание чаще всего вызвано мутациями в гене TCIRG1, кодирующем субъединицу V-АТФазы, участвующую в способности остеокластов резорбировать кость. Richter et al. показали, что функция остеокластов может быть восстановлена путем опосредованной лентивирусным вектором экспрессии TCIRG1, но точный порог восстановления резорбции, а также клеточный ответ на опосредованную вектором экспрессию TCIRG1 неизвестны.[00237] Infantile malignant osteoporosis (IMO) is a rare disorder with a recessive mode of inheritance characterized by increased bone mass caused by impaired osteoclast function. The disease is most often caused by mutations in the TCIRG1 gene, which encodes a subunit of the V-ATPase involved in the bone resorbing ability of osteoclasts. Richter et al. showed that osteoclast function can be restored by lentiviral vector-mediated expression of TCIRG1, but the exact threshold for restoration of resorption as well as the cellular response to vector-mediated TCIRG1 expression are unknown.

[00238] В отдельных вариантах осуществления изобретения предложен способ лечения инфантильного злокачественного остеопороза у нуждающегося в этом субъекта, включающий введение гемопоэтических клеток, трансдуцированных рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, кодирующий ген CLCN7, OSTM1, Т-клеточного иммунного регулятора 1, a3-субъединицы V0-домена Н+-транспортирующей АТФазы (TCIRG1), TNFSF11, PLEKHM1 или TNFRSF11A, или ген, кодирующий их функциональный вариант или фрагмент, в соответствии со способами, раскрытыми в настоящем документе.[00238] In certain embodiments, the invention provides a method of treating infantile malignant osteoporosis in a subject in need thereof, comprising administering hematopoietic cells transduced with a recombinant retroviral vector comprising a polynucleotide encoding a gene for CLCN7, OSTM1, T cell immune regulator 1, V0 domain of H+-transporting ATPase a3 subunit (TCIRG1), TNFSF11, PLEKHM1, or TNFRSF11A, or a gene encoding a functional variant or fragment thereof, in accordance with the methods disclosed herein.

[00239] В некоторых вариантах осуществления способы, раскрытые в настоящем документе, применяют для трансдукции гемопоэтических клеток лентивирусным вектором, полученным с использованием вектора для переноса pCCL.PPT.EFS.tcirg1h.wpre, например, для создания популяции клеток для лечения IMO. pCCL.PPT.EFS.tcirg1h.wpre представляет собой лентивирусный вектор для переноса на основе плазмиды для переноса pCCL, используемой в системах лентивирусных векторов третьего поколения. Плазмида для переноса pCCL представляет собой лентивирусный вектор, содержащий химерные 5'-LTR CMV-ВИЧ и остовы вектора, в которые включены последовательности полиаденилирования и (без энхансера) точки начала репликации вируса обезьян 40 по ходу транскрипции от 3'-LTR ВИЧ, заменяя большую часть последовательности человека, оставшейся от сайта встраивания ВИЧ. В pCCL энхансер и промотор (нуклеотиды с -673 по -1 относительно сайта инициации транскрипции; регистрационный № GenBank K03104) CMV были присоединены к R-области ВИЧ-1. В векторе используется промотор EFS (короткая, безинтронная форма промотора EF1-альфа), связанный с кодон-оптимизированным геном TCIRG1 с элементами RRE и cPPT/CTS, расположенными против хода транскрипции, и с элементом wPRE, расположенным по ходу транскрипции (ФИГ. 18).[00239] In some embodiments, the methods disclosed herein are used to transduce hematopoietic cells with a lentiviral vector produced using the pCCL.PPT.EFS.tcirg1h.wpre transfer vector, such as to generate a population of cells for the treatment of IMO. pCCL.PPT.EFS.tcirg1h.wpre is a lentiviral transfer vector based on the pCCL transfer plasmid used in third generation lentiviral vector systems. The pCCL transfer plasmid is a lentiviral vector comprising a chimeric CMV-HIV 5' LTR and a vector backbone that includes polyadenylation sequences and (minus the enhancer) simian virus 40 origins of replication downstream of the HIV 3' LTR, replacing most of the human sequence remaining from the HIV insertion site. In pCCL, the CMV enhancer and promoter (nucleotides -673 to -1 relative to the transcription start site; GenBank accession no. K03104) were fused to the HIV-1 R region. The vector utilizes the EFS promoter (a short, intronless form of the EF1-alpha promoter) linked to a codon-optimized TCIRG1 gene with RRE and cPPT/CTS elements located upstream and a wPRE element located downstream (FIG. 18).

[00240] Полученный лентивирусный вектор используют для трансдукции аутологичных CD34+ гемопоэтических стволовых клеток («HSC»), восполняя таким образом генетический дефект. В некоторых вариантах осуществления HSC мобилизуют путем проведения у пациента терапии Г-КСФ, плериксафором или комбинацией Г-КСФ и плериксафора. Затем HSC собирают из периферической крови пациента с помощью афереза. Обогащение CD34+ клетками может быть проведено с помощью магнитной сепарации (например, в системе CliniMACs от Miltenyi Biotec), и CD34+ обогащенные клетки могут быть трансдуцированы ex vivo в соответствии с раскрытыми в настоящем документе способами лентивирусными частицами, ранее полученными путем временной трансфекции системы лентивирусного вектора, которая включает плазмиду для переноса pCCLL.PPT.EFS.tcirg1h.wpre. В отдельных вариантах осуществления клетки трансдуцируют в присутствии PGE2 и полоксамера. В одном из вариантов осуществления полоксамер представляет собой полоксамер 338 (LentiBOOST™). Затем трансдуцированные HSC трансплантируют пациенту путем инфузии и генерируют остеокласты, экспрессирующие TCIRG1.[00240] The resulting lentiviral vector is used to transduce autologous CD34+ hematopoietic stem cells ("HSC"), thereby compensating for the genetic defect. In some embodiments, the HSC are mobilized by administering G-CSF, plerixafor, or a combination of G-CSF and plerixafor to the patient. The HSC are then collected from the patient's peripheral blood by apheresis. Enrichment of CD34+ cells can be accomplished by magnetic separation (e.g., the CliniMACs system from Miltenyi Biotec), and the CD34+ enriched cells can be transduced ex vivo in accordance with the methods disclosed herein with lentiviral particles previously produced by transient transfection of a lentiviral vector system that includes the pCCLL.PPT.EFS.tcirg1h.wpre transfer plasmid. In some embodiments, the cells are transduced in the presence of PGE2 and poloxamer. In one embodiment, the poloxamer is poloxamer 338 (LentiBOOST™). The transduced HSCs are then transplanted into the patient by infusion and generate osteoclasts expressing TCIRG1.

[00241] Последовательность кассеты экспрессии TCIRG1 в pCCL.PPT.EFS.tcirg1h.wpre (5'-3') представляет собой следующую. Кодирующая последовательность TCIRG1, также известного как CD18, обозначена выделенными полужирным шрифтом заглавными буквами. Последовательность WPRE подчеркнута. [00241] The sequence of the TCIRG1 expression cassette in pCCL.PPT.EFS.tcirg1h.wpre (5'-3') is as follows. The coding sequence of TCIRG1, also known as CD18, is indicated in bold capital letters. The WPRE sequence is underlined.

ggctccggtgcccgtcagtgggcagagcgcacatcgcccacagtccccgagaagttggggggaggggtcggcaattgaaccggtgcctagagaaggtggcgcggggtaaactgggaaagtgatgtcgtgtactggctccgcctttttcccgagggtgggggagaaccgtatataagtgcagtagtcgccgtgaacgttctttttcgcaacgggtttgccgccagaacacaggtgtcgtgacgcgggatccgccaccATGGGCTCCATGTTTCGGAGCGAGGAGGTGGCCCTGGTCCAGCTCTTTCTGCCCACAGCGGCTGCCTACACCTGCGTGAGTCGGCTGGGCGAGCTGGGCCTCGTGGAGTTCAGAGACCTCAACGCCTCGGTGAGCGCCTTCCAGAGACGCTTTGTGGTTGATGTTCGGCGCTGTGAGGAGCTGGAGAAGACCTTCACCTTCCTGCAGGAGGAGGTGCGGCGGGCTGGGCTGGTCCTGCCCCCGCCAAAGGGGAGGCTGCCGGCACCCCCACCCCGGGACCTGCTGCGCATCCAGGAGGAGACGGAGCGCCTGGCCCAGGAGCTGCGGGATGTGCGGGGCAACCAGCAGGCCCTGCGGGCCCAGCTGCACCAGCTGCAGCTCCACGCCGCCGTGCTACGCCAGGGCCATGAACCTCAGCTGGCAGCCGCCCACACAGATGGGGCCTCAGAGAGGACGCCCCTGCTCCAGGCCCCCGGGGGGCCGCACCAGGACCTGAGGGTCAACTTTGTGGCAGGTGCCGTGGAGCCCCACAAGGCCCCTGCCCTAGAGCGCCTGCTCTGGAGGGCCTGCAGAGGCTTCCTCATTGCCAGCTTCAGGGAGCTGGAGCAGCCGCTGGAGCACCCCGTGACGGGCGAGCCAGCCACGTGGATGACCTTCCTCATCTCCTACTGGGGTGAGCAGATCGGACAGAAGATCCGCAAGATCACGGACTGCTTCCACTGCCACGTCTTCCCGTTTCTGCAGCAGGAGGAGGCCCGCCTCGGGGCCCTGCAGCAGCTGCAACAGCAGAGCCAGGAGCTGCAGGAGGTCCTCGGGGAGACAGAGCGGTTCCTGAGCCAGGTGCTAGGCCGGGTGCTGCAGCTGCTGCCGCCAGGGCAGGTGCAGGTCCACAAGATGAAGGCCGTGTACCTGGCCCTGAACCAGTGCAGCGTGAGCACCACGCACAAGTGCCTCATTGCCGAGGCCTGGTGCTCTGTGCGAGACCTGCCCGCCCTGCAGGAGGCCCTGCGGGACAGCTCGATGGAGGAGGGAGTGAGTGCCGTGGCTCACCGCATCCCCTGCCGGGACATGCCCCCCACACTCATCCGCACCAACCGCTTCACGGCCAGCTTCCAGGGCATCGTGGATGCCTACGGCGTGGGCCGCTACCAGGAGGTCAACCCCGCTCCCTACACCATCATCACCTTCCCCTTCCTGTTTGCTGTGATGTTCGGGGATGTGGGCCACGGGCTGCTCATGTTCCTCTTCGCCCTGGCCATGGTCCTTGCGGAGAACCGACCGGCTGTGAAGGCCGCGCAGAACGAGATCTGGCAGACTTTCTTCAGGGGCCGCTACCTGCTCCTGCTTATGGGCCTGTTCTCCATCTACACCGGCTTCATCTACAACGAGTGCTTCAGTCGCGCCACCAGCATCTTCCCCTCGGGCTGGAGTGTGGCCGCCATGGCCAACCAGTCTGGCTGGAGTGATGCATTCCTGGCCCAGCACACGATGCTTACCCTGGACCCCAACGTCACCGGTGTCTTCCTGGGACCCTACCCCTTTGGCATCGATCCTATTTGGAGCCTGGCTGCCAACCACTTGAGCTTCCTCAACTCCTTCAAGATGAAGATGTCCGTCATCCTGGGCGTCGTGCACATGGCCTTTGGGGTGGTCCTCGGAGTCTTCAACCACGTGCACTTTGGCCAGAGGCACCGGCTGCTGCTGGAGACGCTGCCGGAGCTCACCTTCCTGCTGGGACTCTTCGGTTACCTCGTGTTCCTAGTCATCTACAAGTGGCTGTGTGTCTGGGCTGCCAGGGCCGCCTCGGCCCCCAGCATCCTCATCCACTTCATCAACATGTTCCTCTTCTCCCACAGCCCCAGCAACAGGCTGCTCTACCCCCGGCAGGAGGTGGTCCAGGCCACGCTGGTGGTCCTGGCCTTGGCCATGGTGCCCATCCTGCTGCTTGGCACACCCCTGCACCTGCTGCACCGCCACCGCCGCCGCCTGCGGAGGAGGCCCGCTGACCGACAGGAGGAAAACAAGGCCGGGTTGCTGGACCTGCCTGACGCATCTGTGAATGGCTGGAGCTCCGATGAGGAAAAGGCAGGGGGCCTGGATGATGAAGAGGAGGCCGAGCTCGTCCCCTCCGAGGTGCTCATGCACCAGGCCATCCACACCATCGAGTTCTGCCTGGGCTGCGTCTCCAACACCGCCTCCTACCTGCGCCTGTGGGCCCTGAGCCTGGCCCACGCCCAGCTGTCCGAGGTTCTGTGGGCCATGGTGATGCGCATAGGCCTGGGCCTGGGCCGGGAGGTGGGCGTGGCGGCTGTGGTGCTGGTCCCCATCTTTGCCGCCTTTGCCGTGATGACCGTGGCTATCCTGCTGGTGATGGAGGGACTCTCAGCCTTCCTGCACGCCCTGCGGCTGCACTGGGTGGAATTCCAGAACAAGTTCTACTCAGGCACGGGCTACAAGCTGAGTCCCTTCACCTTCGCTGCCACAGATGACTAGtaagtcgacggatcccccgggctgcaggaattcgagcatcttaccgccatttatacccatatttgttctgtttttcttgatttgggtatacatttaaatgttaataaaacaaaatggtggggcaatcatttacatttttagggatatgtaattactagttcaggtgtattgccacaagacaaacatgttaagaaactttcccgttatttacgctctgttcctgttaatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactgatattcttaactatgttgctccttttacgctgtgtggatatgctgctttaatgcctctgtatcatgctattgcttcccgtacggctttcgttttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtccgtcaacgtggcgtggtgtgctctgtgtttgctgacgcaacccccactggctggggcattgccaccacctgtcaactcctttctgggactttcgctttccccctcccgatcgccacggcagaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctaggttgctgggcactgataattccgtggtgttgtcggggaagctgacgtcctttcg (SEQ ID NO: 10). attcgagcatcttaccgccatttatacccatatttgttctgtttttcttgatttgggtatacatttaaatgttaataaaacaaaatggtggggcaatcatttacatttttagggatatgtaattactagttcaggtgtattgccacaagacaaacatgttaagaaactttcccgttatttacgctctgttcctgttaatcaacctctggattacaaaatttgtgaaagattgactgatattcttaactatgttgctccttttacgctgtgtggatatgctgctttaatgcctctgtatcatgctattgcttcccgtacggctttcgttttctcctccttgtataaatcctggttgctgtctctttatgaggagttgtggcccgttgtccgtcaacgtggcgtggtgtgctctgtgtttgctgacgcaacccccactggctggggcattgccaccacctgtcaactcctttctgggactttcgctttccccctcccgatcgccacggcagaactcatcgccgcctgccttgcccgctgctggacaggggctaggttgctgggcactgataattccgtggtgttgtcggggaagctgacgtcctttcg (SEQ ID NO: 10).

[00242] Последовательность белка TCIRG1, кодируемая этим полипептидом, представлена как SEQ ID NO: 11. [00242] The TCIRG1 protein sequence encoded by this polypeptide is presented as SEQ ID NO: 11.

[00243] В некоторых случаях рекомбинантный ретровирусный вектор обеспечивает трансген для гена, отличного от гена, связанного с заболеванием или расстройством, или восстанавливает такой ген. Например, не ограничиваясь перечисленным, рекомбинантный ретровирусный вектор может повышающе или понижающе регулировать гены иммунных эффекторов, может изменять маркеры клеточной поверхности, может обеспечивать альтернативные молекулы MHC или может кодировать гены иммуноглобулинов. В частности, предполагается, что в некоторых случаях рекомбинантный ретровирусный вектор или векторы обеспечивают возможность использования трансплантата от аллогенного или несовместимого донора, например, путем изменения иммунных маркеров (например, генов HLA или MHC) или индукции экспрессии генов иммунных эффекторов.[00243] In some cases, the recombinant retroviral vector provides a transgene for a gene other than a gene associated with a disease or disorder, or restores such a gene. For example, but not limited to, the recombinant retroviral vector may up- or down-regulate immune effector genes, may alter cell surface markers, may provide alternative MHC molecules, or may encode immunoglobulin genes. In particular, it is contemplated that in some cases, the recombinant retroviral vector or vectors may enable the use of a transplant from an allogeneic or incompatible donor, such as by altering immune markers (e.g., HLA or MHC genes) or inducing the expression of immune effector genes.

[00244] Кодирующая последовательность, которую необходимо экспрессировать в клетках, может представлять собой любую полинуклеотидную последовательность, например, ген или кДНК, которые кодируют продукт гена, например, терапевтический препарат на основе полипептида или РНК (миРНК, антисмысловой, рибозима, кшРНК и т. д.). Кодирующая последовательность может быть гетерологичной по отношению к промоторной последовательности, с которой она функционально связана, т. е. не быть функционально связанной с ней в природе. В качестве альтернативы, кодирующая последовательность может быть эндогенной по отношению к промоторной последовательности, с которой она функционально связана, т. е. быть свяанной с этим промотором в природе. Продукт гена может действовать внутри клетки млекопитающего или может действовать извне, например, он может секретироваться. Например, когда трансген является терапевтическим геном, кодирующая последовательность может представлять собой любой ген, кодирующий желаемый продукт гена или его функциональный фрагмент или вариант, который может применяться в качестве терапевтического средства для лечения заболевания или расстройства. В различных вариантах осуществления трансген кодирует FANCA человека.[00244] The coding sequence to be expressed in the cells may be any polynucleotide sequence, such as a gene or cDNA, that encodes a gene product, such as a polypeptide or RNA therapeutic (siRNA, antisense, ribozyme, shRNA, etc.). The coding sequence may be heterologous to the promoter sequence to which it is operably linked, i.e., not operably linked to it in nature. Alternatively, the coding sequence may be endogenous to the promoter sequence to which it is operably linked, i.e., linked to the promoter in nature. The gene product may act within the mammalian cell or may act externally, such as by being secreted. For example, where the transgene is a therapeutic gene, the coding sequence may be any gene encoding the desired gene product or a functional fragment or variant thereof that can be used as a therapeutic agent for the treatment of a disease or disorder. In various embodiments, the transgene encodes human FANCA.

[00245] В некоторых вариантах осуществления кодирующая последовательность трансгена модифицирована или «кодон-оптимизирована» для усиления экспрессии путем замены редко представленных кодонов более часто представленными кодонами. Кодирующая последовательность представляет собой часть последовательности мРНК, которая кодирует аминокислоты для трансляции. Во время трансляции каждый из 61 тринуклеотидного кодона транслируется в одну из 20 аминокислот, что приводит к вырождению или избыточности генетического кода. Однако разные типы клеток и разные виды животных используют тРНК (каждая из которых несет антикодон), кодирующие одни и те же аминокислоты с разной частотой. Когда последовательность гена содержит кодоны, которые редко представлены соответствующей тРНК, трансляционный аппарат рибосом может замедляться, препятствуя эффективной трансляции. Экспрессия может быть улучшена с помощью «оптимизации кодонов» для определенных видов, при которой кодирующую последовательность изменяют так, чтобы она кодировала ту же белковую последовательность, но с использованием кодонов, которые широко представлены и/или используются высокоэкспрессируемыми белками человека (Cid-Arregui et al., 2003; J. Virol. 77: 4928). В одном из аспектов настоящего изобретения кодирующая последовательность трансгена модифицирована для замены кодонов, редко экспрессируемых у млекопитающих или приматов, на кодоны, часто экспрессируемые у приматов. Например, в некоторых вариантах осуществления кодирующая последовательность, кодируемая трансгеном, кодирует полипептид, обладающий по меньшей мере 85% идентичностью последовательности полипептиду, кодируемому последовательностью, раскрытой выше или в настоящем документе, например, по меньшей мере 90% идентичностью последовательности, например, по меньшей мере 95% идентичностью последовательности, по меньшей мере 98% идентичностью последовательности, по меньшей мере 99% идентичностью последовательности, где по меньшей мере один кодон кодирующей последовательности имеет более высокую частоту встречаемости тРНК у людей, чем соответствующий кодон в последовательности, раскрытой выше или в настоящем документе.[00245] In some embodiments, the coding sequence of the transgene is modified or "codon optimized" to enhance expression by replacing underrepresented codons with more frequently represented codons. The coding sequence is the portion of the mRNA sequence that codes for amino acids for translation. During translation, each of the 61 trinucleotide codons is translated into one of 20 amino acids, resulting in degeneracy or redundancy of the genetic code. However, different cell types and different animal species use tRNAs (each carrying an anticodon) that code for the same amino acids at different frequencies. When a gene sequence contains codons that are underrepresented by the corresponding tRNA, the ribosome translation machinery can slow down, preventing efficient translation. Expression can be improved by species-specific "codon optimization," in which the coding sequence is altered to encode the same protein sequence but using codons that are widely represented and/or used by highly expressed human proteins (Cid-Arregui et al., 2003; J. Virol. 77: 4928). In one aspect of the present invention, the coding sequence of the transgene is modified to replace codons that are rarely expressed in mammals or primates with codons that are frequently expressed in primates. For example, in some embodiments, the coding sequence encoded by the transgene encodes a polypeptide that has at least 85% sequence identity to a polypeptide encoded by a sequence disclosed above or herein, such as at least 90% sequence identity, such as at least 95% sequence identity, at least 98% sequence identity, at least 99% sequence identity, wherein at least one codon of the coding sequence has a higher tRNA frequency in humans than the corresponding codon in the sequence disclosed above or herein.

[00246] В дополнительных вариантах осуществления кодирующая последовательность трансгена модифицирована для усиления экспрессии путем терминации или удаления открытых рамок считывания (ORF), которые не кодируют желаемый трансген. Открытая рамка считывания (ORF) представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты, которая следует за стартовым кодоном и не содержит стоп-кодона. ORF могут находиться в прямой или обратной ориентации и могут быть «в рамке считывания» или «вне рамки считывания» по сравнению с представляющим интерес геном. Такие открытые рамки считывания потенциально могут быть экспрессированы в кассете экспрессии вместе с представляющим интерес геном и могут привести к нежелательным побочным действиям. В одном из аспектов настоящего изобретения кодирующая последовательность трансгена была модифицирована для удаления открытых рамок считывания путем дополнительного изменения использования кодонов. Это может быть сделано путем удаления стартовых кодонов (ATG) и введения стоп-кодонов (TAG, TAA или TGA) в ORF, находящиеся в обратной ориентации или вне рамки считывания, при сохранении аминокислотной последовательности и поддержании широко используемых кодонов в представляющем интерес гене (т. е. избегая кодонов с частотой <20%). В настоящем изобретении кодирующая последовательность трансгена может быть оптимизирована либо путем оптимизации кодонов и удаления не относящихся к трансгену ORF, либо с помощью обоих методов. Как будет очевидно специалисту в данной области техники, после оптимизации кодонов предпочтительно удалить или минимизировать не относящиеся к трансгену ORF, чтобы удалить ORF, введенные во время оптимизации кодонов.[00246] In additional embodiments, the transgene coding sequence is modified to enhance expression by terminating or removing open reading frames (ORFs) that do not encode the desired transgene. An open reading frame (ORF) is a nucleic acid sequence that follows a start codon and does not contain a stop codon. ORFs can be in a forward or reverse orientation and can be "in frame" or "out of frame" relative to the gene of interest. Such open reading frames can potentially be expressed in an expression cassette along with the gene of interest and can lead to undesirable side effects. In one aspect of the present invention, the transgene coding sequence has been modified to remove open reading frames by further altering codon usage. This can be done by removing start codons (ATG) and introducing stop codons (TAG, TAA or TGA) into ORFs that are in the reverse orientation or out of frame, while maintaining the amino acid sequence and maintaining commonly used codons in the gene of interest (i.e., avoiding codons with a frequency of <20%). In the present invention, the coding sequence of the transgene can be optimized either by codon optimization and removing non-transgene ORFs, or by both methods. As will be apparent to those skilled in the art, after codon optimization, it is preferable to remove or minimize non-transgene ORFs in order to remove ORFs introduced during codon optimization.

[00247] Кроме того, как будет понятно специалисту в данной области техники, кассеты экспрессии и рекомбинантные ретровирусные векторы могут необязательно содержать другие элементы, включая, не ограничиваясь перечисленным, сайты рестрикции для облегчения клонирования и регуляторные элементы для конкретного рекомбинантного ретровирусного вектора.[00247] Additionally, as will be appreciated by one of skill in the art, expression cassettes and recombinant retroviral vectors may optionally contain other elements, including, but not limited to, restriction sites to facilitate cloning and regulatory elements for the particular recombinant retroviral vector.

[00248] В некоторых аспектах настоящего изобретения рассматриваемые полинуклеотидные кассеты применяют для доставки гена в клетки, например, для определения влияния этого гена на жизнеспособность и/или функцию клеток, для лечения заболевания клеток и т. д. В различных вариантах осуществления доставка вирусного вектора в клетки путем трансдукции может происходить in vivo, ex vivo или in vitro. Соответственно, в некоторых аспектах изобретения композиция, которая обеспечивает экспрессию трансгена в клетках млекопитающих, представляет собой рекомбинантный ретровирусный вектор, содержащий полинуклеотидную кассету, например, кассету для переноса гена, согласно настоящему изобретению.[00248] In some aspects of the present invention, the subject polynucleotide cassettes are used to deliver a gene to cells, such as to determine the effect of the gene on cell viability and/or function, to treat a cellular disease, etc. In various embodiments, delivery of a viral vector to cells by transduction may occur in vivo, ex vivo, or in vitro. Accordingly, in some aspects of the invention, a composition that provides for expression of a transgene in mammalian cells is a recombinant retroviral vector comprising a polynucleotide cassette, such as a gene transfer cassette, according to the present invention.

[00249] Рекомбинантные ретровирусные векторы, заключающие в себе полинуклеотидные кассеты согласно настоящему изобретению, могут быть получены с использованием стандартной методики. [00249] Recombinant retroviral vectors comprising the polynucleotide cassettes of the present invention can be prepared using standard techniques.

[00250] Например, в случае LV вирионов LV вектор экспрессии согласно изобретению может быть введен в клетку-продуцента с последующим введением хелперной конструкции для LV, где указанная хелперная конструкция включает кодирующие области LV, способные экспрессироваться в клетке-продуценте и восполняющие хелперные функции LV, отсутствующие в LV векторе. После этого осуществляют введение хелперного вируса и/или дополнительных векторов в клетку-продуцента, где хелперный вирус и/или дополнительные векторы обеспечивают вспомогательные функции, способные поддерживать эффективную продукцию LV. Затем клетки-продуценты культивируют с получением LV. Эти этапы выполняют по стандартной методике. В частных вариантах осуществления для получения рекомбинантных ретровирусных векторов используют плазмиды, изображенные на ФИГ. 38-41.[00250] For example, in the case of LV virions, an LV expression vector of the invention can be introduced into a producer cell, followed by the introduction of an LV helper construct, wherein the helper construct comprises LV coding regions capable of expression in the producer cell and which supplement the LV helper functions missing from the LV vector. The helper virus and/or additional vectors are then introduced into the producer cell, wherein the helper virus and/or additional vectors provide auxiliary functions capable of supporting efficient LV production. The producer cells are then cultured to produce LV. These steps are performed using standard techniques. In particular embodiments, the plasmids depicted in FIGS. 38-41 are used to produce recombinant retroviral vectors.

Способы получения вирусных векторовMethods for obtaining viral vectors

[00251] Рекомбинантные ретровирусные векторы, заключающие в себе полинуклеотидные кассеты согласно настоящему изобретению, могут быть получены с использованием стандартной методики. [00251] Recombinant retroviral vectors comprising the polynucleotide cassettes of the present invention can be prepared using standard techniques.

[00252] Например, в случае LV вирионов LV вектор экспрессии согласно изобретению может быть введен в клетку-продуцента с последующим введением хелперной конструкции для LV, где указанная хелперная конструкция включает кодирующие области LV, способные экспрессироваться в клетке-продуценте и восполняющие хелперные функции LV, отсутствующие в LV векторе. После этого осуществляют введение хелперного вируса и/или дополнительных векторов в клетку-продуцента, где хелперный вирус и/или дополнительные векторы обеспечивают вспомогательные функции, способные поддерживать эффективную продукцию LV. Затем клетки-продуценты культивируют с получением LV. Эти этапы выполняют по стандартной методике. В частных вариантах осуществления для получения рекомбинантных ретровирусных векторов используют плазмиды, изображенные на ФИГ. 38-41.[00252] For example, in the case of LV virions, an LV expression vector of the invention can be introduced into a producer cell, followed by the introduction of an LV helper construct, wherein the helper construct comprises LV coding regions capable of expression in the producer cell and which supplement the LV helper functions missing from the LV vector. The helper virus and/or additional vectors are then introduced into the producer cell, wherein the helper virus and/or additional vectors provide auxiliary functions capable of supporting efficient LV production. The producer cells are then cultured to produce LV. These steps are performed using standard techniques. In particular embodiments, the plasmids depicted in FIGS. 38-41 are used to produce recombinant retroviral vectors.

[00253] Может быть использован любой подходящий способ получения вирусных векторов для доставки рассматриваемых полинуклеотидных кассет, включая, не ограничиваясь перечисленным, способы, описанные в следующих ниже примерах. Для приведения в контакт с клетками млекопитающих in vitro или in vivo может быть приготовлена любая концентрация инфекционного вирусного вектора, подходящая для эффективной трансдукции клеток млекопитающих. Например, вирусные частицы могут быть приготовлены с концентрацией 108 инфекционных единиц на мл или более, например, 1x108 инфекционных единиц на мл; 5x108 инфекционных единиц на мл; 109 инфекционных единиц на мл; 5 x 109 инфекционных единиц на мл, 1010 инфекционных единиц на мл, 5x1010 инфекционных единиц на мл; 1011 инфекционных единиц на мл; 5 x1011 инфекционных единиц на мл; 1012 инфекционных единиц на мл; 5x1012 инфекционных единиц на мл; 1013 инфекционных единиц на мл; 1,5 x1013 инфекционных единиц на мл; 3x1013 инфекционных единиц на мл; 5x1013 инфекционных единиц на мл; 7,5x1013 инфекционных единиц на мл; 9x1013 инфекционных единиц на мл; 1 x 1014 инфекционных единиц на мл, 5 x 1014 инфекционных единиц на мл или более, но обычно не более 1 x 1015 инфекционных единиц на мл. [00253] Any suitable method for producing viral vectors for delivery of the subject polynucleotide cassettes may be used, including, but not limited to, the methods described in the following examples. Any concentration of infectious viral vector suitable for efficient transduction of mammalian cells may be prepared for contact with mammalian cells in vitro or in vivo. For example, viral particles may be prepared at a concentration of 10 8 infectious units per ml or more, such as 1 x 10 8 infectious units per ml; 5 x 10 8 infectious units per ml; 10 9 infectious units per ml; 5 x 10 9 infectious units per ml, 10 10 infectious units per ml, 5 x 10 10 infectious units per ml; 10 11 infectious units per ml; 5 x 10 11 infectious units per ml; 10 12 infectious units per ml; 5x1012 infectious units per ml; 1013 infectious units per ml; 1.5x1013 infectious units per ml; 3x1013 infectious units per ml; 5x1013 infectious units per ml; 7.5x1013 infectious units per ml; 9x1013 infectious units per ml; 1x1014 infectious units per ml, 5x1014 infectious units per ml or more, but usually not more than 1x1015 infectious units per ml.

[00254] При получении рассматриваемых рекомбинантных LV ретровирусных векторов могут быть использованы любые клетки-хозяева для продуцирования LV вирионов, включая, например, клетки млекопитающих (например, клетки HEK 293T). Клетки-хозяева также могут быть пакующими клетками, в которых гены LV gag/pol и Rev стабильно поддерживаются в клетке-хозяине, или клетками-продуцентами, в которых стабильно поддерживается и упаковывается геном LV вектора. LV векторы очищают и вводят в состав препарата с использованием стандартных методик, известных в данной области техники. [00254] In producing the subject recombinant LV retroviral vectors, any host cells for producing LV virions can be used, including, for example, mammalian cells (e.g., HEK 293T cells). The host cells can also be packaging cells in which the LV gag/pol and Rev genes are stably maintained in the host cell, or producer cells in which the LV vector genome is stably maintained and packaged. The LV vectors are purified and formulated using standard techniques known in the art.

Фармацевтические композиции и препаратыPharmaceutical compositions and preparations

[00255] Настоящее изобретение включает фармацевтические композиции и препараты, содержащие популяции клеток, как описано в настоящем документе, и фармацевтически приемлемый носитель, разбавитель или вспомогательное вещество. Рассматриваемые популяции клеток можно комбинировать с фармацевтически приемлемыми носителями, разбавителями и реагентами, пригодными для приготовления препарата, который является в целом безопасным, нетоксичным и подходящим, и включает вспомогательные вещества, приемлемые для применения у приматов. Примеры таких вспомогательных веществ, носителей или разбавителей включают, не ограничиваясь перечисленным, воду, физиологический раствор, растворы Рингера, раствор декстрозы и 5% сывороточный альбумин человека. В состав препаратов также могут быть включены дополнительные активные соединения. Растворы или суспензии, используемые в препаратах, могут включать стерильный разбавитель, такой как вода для инъекций, физиологический раствор, диметилсульфоксид (ДМСО), жирные масла, полиэтиленгликоли, глицерин, пропиленгликоль или другие синтетические растворители; антибактериальные соединения, такие как бензиловый спирт или метилпарабены; антиоксиданты, такие как аскорбиновая кислота или бисульфит натрия; хелатирующие соединения, такие как этилендиаминтетрауксусная кислота (ЭДТА); буферы, такие как ацетаты, цитраты или фосфаты; детергенты, такие как Tween 20, для предотвращения агрегации; и соединения для регулирования тоничности, такие как хлорид натрия или декстроза. pH можно регулировать с помощью кислот или оснований, таких как соляная кислота или гидроксид натрия. В частных вариантах осуществления препараты являются стерильными.[00255] The present invention includes pharmaceutical compositions and preparations comprising cell populations as described herein and a pharmaceutically acceptable carrier, diluent, or excipient. The subject cell populations can be combined with pharmaceutically acceptable carriers, diluents, and reagents suitable for preparing a preparation that is generally safe, non-toxic, and suitable, and includes excipients acceptable for use in primates. Examples of such excipients, carriers, or diluents include, but are not limited to, water, saline, Ringer's solutions, dextrose solution, and 5% human serum albumin. Additional active compounds can also be included in the preparations. Solutions or suspensions used in the preparations can include a sterile diluent such as water for injection, saline, dimethyl sulfoxide (DMSO), fixed oils, polyethylene glycols, glycerin, propylene glycol, or other synthetic solvents; antibacterial compounds such as benzyl alcohol or methylparabens; antioxidants such as ascorbic acid or sodium bisulfite; chelating agents such as ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA); buffers such as acetates, citrates or phosphates; detergents such as Tween 20 to prevent aggregation; and compounds for adjusting tonicity such as sodium chloride or dextrose. The pH can be adjusted with acids or bases such as hydrochloric acid or sodium hydroxide. In particular embodiments, the preparations are sterile.

[00256] В некоторых вариантах осуществления популяции клеток производят в соответствии с действующими Правилами надлежащей производственной практики. Производство в соответствии с действующими Правилами надлежащей производственной практики означает, что препарат, приготовленный для введения, достаточно безопасен, чтобы его можно было вводить человеку в соответствии с регулирующими нормативными положениями и государственными разрешениями. Как правило, регулирующие нормативные положения и разрешения диктуют, что препарат должен соответствовать заранее утвержденным критериям приемлемости в отношении принадлежности, силы действия, качества и чистоты. Критерии приемлемости включают количественные пределы, диапазоны или другие подходящие меры результатов испытаний, используемые для определения того, соответствует ли препарат действующим Правилам надлежащей производственной практики. Нормативная документация устанавливает аналитические процедуры, которые используются для проверки соответствия критериям приемлемости. Препараты могут оцениваться партиями. Партия представляет собой определенное количество препарата, испытанное на соответствие критериям приемлемости.[00256] In some embodiments, the cell populations are manufactured in accordance with current Good Manufacturing Practices. Manufactured in accordance with current Good Manufacturing Practices means that the drug prepared for administration is safe enough to be administered to a human subject in accordance with regulatory provisions and governmental approvals. Typically, regulatory provisions and approvals dictate that the drug must meet pre-established acceptance criteria for identity, potency, quality, and purity. Acceptance criteria include quantitative limits, ranges, or other suitable test result measures used to determine whether the drug complies with current Good Manufacturing Practices. The regulations establish analytical procedures that are used to verify compliance with the acceptance criteria. Drugs may be evaluated in batches. A batch is a specified amount of drug tested for compliance with the acceptance criteria.

[00257] Препараты могут быть включены в контейнер, упаковку или дозатор, например, шприц, например, предварительно заполненный шприц, вместе с инструкциями по введению.[00257] The preparations may be included in a container, package, or dispenser, such as a syringe, such as a pre-filled syringe, along with instructions for administration.

[00258] Если это необходимо или целесообразно, препараты могут включать местный анестетик, такой как лидокаин, для облегчения боли в месте инъекции.[00258] If necessary or appropriate, the preparations may include a local anesthetic such as lidocaine to relieve pain at the injection site.

[00259] Терапевтически эффективные количества клеток в препаратах могут составлять более 102 клеток, более 103 клеток, более 104 клеток, более 105 клеток, более 106 клеток, более 107 клеток, более 108 клеток, более 109 клеток, более 1010 клеток или более 1011. Терапевтически эффективные количества клеток в препаратах могут составлять менее 103 клеток, менее 104 клеток, менее 105 клеток, менее 106 клеток, менее 107 клеток, менее 108 клеток, менее 109 клеток, менее 1010 клеток, менее 1011 клеток или менее 1012. Терапевтически эффективные количества клеток в препаратах могут составлять от 103 клеток до 1012 клеток, от 104 клеток до 1011 клеток, от 105 клеток до 1010 клеток, от 108 клеток до 1012 клеток, от 109 клеток до 1012 клеток, от 108 клеток до 1010 клеток или от 109 клеток до 1011 клеток.[00259] Therapeutically effective amounts of cells in the preparations can be greater than 102 cells, greater than 103 cells, greater than 104 cells, greater than 105 cells, greater than 106 cells, greater than 107 cells, greater than 108 cells, greater than 109 cells, greater than 1010 cells, or greater than 1011 . Therapeutically effective amounts of cells in the preparations can be less than 103 cells, less than 104 cells, less than 105 cells, less than 106 cells, less than 107 cells, less than 108 cells, less than 109 cells, less than 1010 cells, less than 1011 cells, or less than 1012 . Therapeutically effective amounts of cells in the preparations may range from 103 cells to 1012 cells, from 104 cells to 1011 cells, from 105 cells to 1010 cells, from 108 cells to 1012 cells, from 109 cells to 1012 cells, from 108 cells to 1010 cells, or from 109 cells to 1011 cells.

[00260] В препаратах, раскрытых в настоящем документе, клетки обычно содержатся в объеме литр или менее, 500 мл или менее, 250 мл или менее или 100 мл или менее. Следовательно, плотность вводимых клеток обычно составляет более 104 клеток/мл, 107 клеток/мл или 108 клеток/мл.[00260] In the preparations disclosed herein, the cells are typically contained in a volume of a liter or less, 500 ml or less, 250 ml or less, or 100 ml or less. Therefore, the density of the cells administered is typically greater than 104 cells/ml, 107 cells/ml, or 108 cells/ml.

[00261] Описанные в настоящем документе препараты могут быть приготовлены для введения, например, путем инъекции, инфузии, перфузии или лаважа. Терапевтически эффективные количества для введения могут включать более 102 клеток, более 103 клеток, более 104 клеток, более 105 клеток, более 106 клеток, более 107 клеток, более 108 клеток, более 109 клеток, более 1010 клеток или более 1011. В частных вариантах осуществления минимальная доза составляет 2 x 106 клеток/кг массы тела субъекта. Терапевтически эффективные количества для введения могут включать менее 103 клеток, менее 104 клеток, менее 105 клеток, менее 106 клеток, менее 107 клеток, менее 108 клеток, менее 109 клеток, менее 1010 клеток, менее 1011 клеток или менее 1012. В частных вариантах осуществления максимальная доза составляет 2 x 1012 клеток/кг массы тела субъекта. Терапевтически эффективные количества для введения могут составлять от 103 клеток до 1012 клеток, от 104 клеток до 1011 клеток, от 105 клеток до 1010 клеток, от 108 клеток до 1012 клеток, от 109 клеток до 1012 клеток, от 108 клеток до 1010 клеток или от 109 клеток до 1011 клеток.[00261] The formulations described herein can be prepared for administration, for example, by injection, infusion, perfusion, or lavage. Therapeutically effective amounts for administration can include greater than 10 2 cells, greater than 10 3 cells, greater than 10 4 cells, greater than 10 5 cells, greater than 10 6 cells, greater than 10 7 cells, greater than 10 8 cells, greater than 10 9 cells, greater than 10 10 cells, or greater than 10 11 . In particular embodiments, the minimum dose is 2 x 10 6 cells/kg of subject body weight. Therapeutically effective amounts for administration can include less than 10 3 cells, less than 10 4 cells, less than 10 5 cells, less than 10 6 cells, less than 10 7 cells, less than 10 8 cells, less than 10 9 cells, less than 10 10 cells, less than 10 11 cells, or less than 10 12 . In particular embodiments, the maximum dose is 2 x 10 12 cells/kg of subject body weight. Therapeutically effective amounts for administration can be from 10 3 cells to 10 12 cells, from 10 4 cells to 10 11 cells, from 10 5 cells to 10 10 cells, from 10 8 cells to 10 12 cells, from 10 9 cells to 10 12 cells, from 10 8 cells to 10 10 cells, or from 10 9 cells to 10 11 cells.

[00262] В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция, предложенная в настоящем документе, содержит терапевтически эффективное количество популяции клеток, как раскрыто в настоящем документе, в смеси с фармацевтически приемлемым носителем и/или вспомогательным веществом, например, физиологическим раствором, натрий-фосфатным буфером, фосфатом и аминокислотами, полимерами, многоатомными спиртами, сахаром, буферами, консервантами и другими белками. Примеры аминокислот, полимеров, сахаров и тому подобного представляют собой соединения октилфеноксиполиэтоксиэтанола, соединения полиэтиленгликольмоностеарата, сложные эфиры полиоксиэтиленсорбита и жирных кислот, сахарозу, фруктозу, декстрозу, мальтозу, глюкозу, маннит, декстран, сорбит, инозит, галактит, ксилит, лактозу, трегалозу, бычий сывороточный альбумин или сывороточный альбумин человека, цитрат, ацетат, растворы Рингера и Хенка, цистеин, аргинин, карнитин, аланин, глицин, лизин, валин, лейцин, поливинилпирролидон, полиэтилен и гликоль. Предпочтительно, чтобы указанный препарат был стабильным в течение по меньшей мере шести месяцев при 4°C. В одном из вариантов осуществления популяция клеток свежеприготовлена из источника in vivo. В одном из вариантов осуществления популяцию клеток замораживают для хранения до включения в состав или после включения в состав фармацевтической композиции.[00262] In some embodiments, the pharmaceutical composition provided herein comprises a therapeutically effective amount of a cell population as disclosed herein in admixture with a pharmaceutically acceptable carrier and/or excipient, such as saline, sodium phosphate buffer, phosphate and amino acids, polymers, polyhydric alcohols, sugar, buffers, preservatives, and other proteins. Examples of amino acids, polymers, sugars and the like are octylphenoxypolyethoxyethanol compounds, polyethyleneglycol monostearate compounds, polyoxyethylene sorbitan fatty acid esters, sucrose, fructose, dextrose, maltose, glucose, mannitol, dextran, sorbitol, inositol, galactitol, xylitol, lactose, trehalose, bovine serum albumin or human serum albumin, citrate, acetate, Ringer's and Hank's solutions, cysteine, arginine, carnitine, alanine, glycine, lysine, valine, leucine, polyvinylpyrrolidone, polyethylene and glycol. Preferably, said preparation is stable for at least six months at 4°C. In one embodiment, the cell population is freshly prepared from an in vivo source. In one embodiment, the cell population is frozen for storage prior to or after incorporation into a pharmaceutical composition.

[00263] В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция, предложенная в настоящем документе, содержит буфер, такой как натрий-фосфатный буфер (PBS) или фосфат натрия/сульфат натрия, трис-буфер, глициновый буфер, стерильную воду и другие буферы, известные специалисту в данной области техники, такие как описанные в Good et al. (1966) Biochemistry 5:467. pH буфера, в котором содержится фармацевтическая композиция, содержащая ген-супрессор опухоли, содержащийся в системе для доставки на основе аденовирусного вектора, может находиться в диапазоне от 6,5 до 7,75, предпочтительно от 7 до 7,5 и наиболее предпочтительно от 7,2 до 7,4.[00263] In some embodiments, the pharmaceutical composition provided herein comprises a buffer, such as sodium phosphate buffer (PBS) or sodium phosphate/sodium sulfate, Tris buffer, glycine buffer, sterile water, and other buffers known to those skilled in the art, such as those described in Good et al. (1966) Biochemistry 5:467. The pH of the buffer in which the pharmaceutical composition comprising a tumor suppressor gene contained in an adenoviral vector delivery system is contained can range from 6.5 to 7.75, preferably from 7 to 7.5, and most preferably from 7.2 to 7.4.

[00264] Все публикации, упомянутые в настоящем документе, включены в него посредством ссылки для раскрытия и описания методов и/или материалов, в связи с которыми цитируются публикации. Подразумевается, что настоящее раскрытие превалирует над любым раскрытием включенной публикации в той степени, в которой имеет место противоречие. [00264] All publications mentioned in this document are herein incorporated by reference for the disclosure and description of the methods and/or materials in connection with which the publications are cited. The present disclosure is intended to supersede any disclosure of an incorporated publication to the extent of a conflict.

[00265] Кроме того, следует отметить, что формула изобретения может быть составлена с исключением любого необязательного элемента. В этой связи данное утверждение предназначено для использования в качестве оснований для использования такой исключительной терминологии, как «исключительно», «только» и т. п. в связи с перечислением элементов формулы изобретения, или использования «негативного» признака.[00265] It should also be noted that the claims may be drafted to exclude any optional element. In this regard, this statement is intended to serve as a basis for the use of such exclusive terminology as "solely", "only", etc. in connection with the listing of elements of the claims, or the use of a "negative" feature.

[00266] Обсуждаемые в настоящем документе публикации приведены исключительно в отношении содержащейся в них информации, опубликованной до даты подачи настоящей заявки. Кроме того, указанные даты публикации могут отличаться от фактических дат публикации, которые могут потребовать отдельного подтверждения.[00266] The publications discussed herein are cited solely with respect to the information contained therein that was published prior to the filing date of this application. In addition, the publication dates stated may differ from the actual publication dates, which may require separate confirmation.

[00267] Изобретение дополнительно описано в следующих примерах, которые не ограничивают объем изобретения, описанного в формуле изобретения.[00267] The invention is further described in the following examples, which do not limit the scope of the invention described in the claims.

ПримерыExamples

Пример 1Example 1

Трансдукция гемопоэтических клеток с помощью протаминсульфата и PGE2Transduction of hematopoietic cells using protamine sulfate and PGE2

[00268] Трансдукция гемопоэтических клеток ретровирусными векторами для клинического применения остается сложной задачей. В частности, из литературы неясно, какие усилители трансдукции или их комбинации вероятнее всего будут наиболее эффективными, или величина эффекта, который может быть достигнут. В этом примере установлено, что комбинация протаминсульфата и PGE2 увеличивает эффективность трансдукции.[00268] Transduction of hematopoietic cells with retroviral vectors for clinical use remains challenging. In particular, it is unclear from the literature which transduction enhancers or combinations of them are likely to be most effective, or the magnitude of the effect that can be achieved. In this example, a combination of protamine sulfate and PGE2 was found to increase transduction efficiency.

[00269] Иллюстративный протокол трансдукции гемопоэтических клеток лентивирусными векторами, как ее проводили в следующих примерах, представлен на ФИГ. 1, однако в различных экспериментах, описанных в примерах, среда для трансдукции не включала УТ, включала один УТ или различные комбинации УТ. Предварительная стимуляция включала культивирование клеток на планшетах, покрытых 2 мкг/см2 RetroNectin™ (RN). Среда для трансдукции включала содержимое среды для предварительной стимуляции (среда X-VIVO™ 20 плюс 100 нг/мл rhSCF, 100 нг/мл rhTPO, 100 нг/мл rh-FLT3-L и 20 нг/мл IL-3) и 4 мкг/мл протаминсульфата.[00269] An exemplary protocol for transducing hematopoietic cells with lentiviral vectors, as performed in the following examples, is shown in FIG. 1, however, in various experiments described in the examples, the transduction medium did not include UT, included a single UT, or included various combinations of UTs. Pre-stimulation involved culturing the cells on plates coated with 2 μg/ cm2 RetroNectin™ (RN). The transduction medium included the contents of the pre-stimulation medium (X-VIVO™ 20 medium plus 100 ng/ml rhSCF, 100 ng/ml rhTPO, 100 ng/ml rh-FLT3-L, and 20 ng/ml IL-3) and 4 μg/ml protamine sulfate.

[00270 ] В одном эксперименте гемопоэтические клетки трансдуцировали с помощью псевдотипированного VSVG LV, экспрессирующего репортер трансгена GFP (зеленый флуоресцентный белок). Клетки трансдуцировали 2,5x107 TU/мл или 5x107 TU/мл лентивирусного вектора в культуре в жидкой среде в присутствии PGE2 в различных концентрациях и анализировали для определения VCN спустя 14 дней культивирования в жидкой среде (ФИГ. 2A). Результаты показывают, что возрастающие концентрации PGE2 (10 мкг/мл, 30 мкг/мл или 50 мкг/мл) увеличивают эффективность трансдукции, измеряемую числом копий вектора на клетку.[00270] In one experiment, hematopoietic cells were transduced with pseudotyped VSVG LV expressing a GFP (green fluorescent protein) transgene reporter. Cells were transduced with 2.5x10 7 TU/ml or 5x10 7 TU/ml lentiviral vector in liquid culture in the presence of PGE2 at various concentrations and assayed for VCN after 14 days of liquid culture (FIG. 2A). The results show that increasing concentrations of PGE2 (10 μg/ml, 30 μg/ml, or 50 μg/ml) increased transduction efficiency as measured by the number of vector copies per cell.

[00273] В другом эксперименте клетки трансдуцировали 1x107 TU/мл или 1x108 TU/мл лентивирусного вектора в культуре в жидкой среде в присутствии PGE2, и анализировали для определения VCN спустя 14 дней культивирования в жидкой среде (ФИГ. 2B). При обеих концентрациях вектора PGE2 увеличивал эффективность трансдукции согласно результатам определения VCN/клетку. Анализ колониеобразующих единиц (КОЕ) проводили на трансдуцированных клетках (ФИГ. 3A, КОК = колониеобразующие клетки), а VCN и процент (%) трансдукции анализировали на отдельных колониях (ФИГ. 3B и 3C). При самой высокой протестированной концентрации PGE2 было трансдуцировано вплоть до приблизительно 75% клеток (ФИГ. 3C).[00273] In another experiment, cells were transduced with 1x10 7 TU/mL or 1x10 8 TU/mL lentiviral vector in liquid culture in the presence of PGE2 and assayed for VCN after 14 days of liquid culture (FIG. 2B). At both vector concentrations, PGE2 increased transduction efficiency as measured by VCN/cell. Colony forming unit (CFU) assays were performed on transduced cells (FIG. 3A, CFCs) and VCN and percent (%) transduction were assayed on individual colonies (FIGS. 3B and 3C). At the highest PGE2 concentration tested, up to approximately 75% of the cells were transduced (FIG. 3C).

Пример 2Example 2

Трансдукция гемопоэтических клеток с помощью протаминсульфата и полоксамера F108Transduction of hematopoietic cells using protamine sulfate and poloxamer F108

[00272] В этом примере установлено, что протаминсульфат и полоксамер F108 (также известный как полоксамер 338) увеличивают эффективность трансдукции. Тестирование согласно общему протоколу, показанному на ФИГ. 1, проводили в культуре в жидкой среде с использованием полоксамера F108 (LentiBOOST™). Результаты показаны на ФИГ. 4 для VCN в культуре в жидкой среде и ФИГ. 5A-5C для анализа результатов анализа КОЕ (ФИГ. 5A), а также VCN в изолированных одиночных КОЕ (ФИГ. 5B и 5C). При концентрациях 0,5 мг/мл, 1 мг/мл, 2 мг/мл и 4 мг/мл LentiBOOST™ увеличивал эффективность трансдукции псевдотипированного VSVG LV, экспрессирующего репортер трансгена GFP. Как и в случае с PGE2, при самой высокой протестированной концентрации PGE2 было возможным трансдуцировать вплоть до приблизительно 75% клеток (ФИГ. 5C).[00272] In this example, protamine sulfate and poloxamer F108 (also known as poloxamer 338) were found to increase transduction efficiency. Testing was performed in liquid culture using poloxamer F108 (LentiBOOST™), according to the general protocol shown in FIG. 1. The results are shown in FIG. 4 for VCN in liquid culture and FIGS. 5A-5C for the CFU assay results (FIG. 5A) and VCN in isolated single CFU (FIGS. 5B and 5C). At concentrations of 0.5 mg/mL, 1 mg/mL, 2 mg/mL, and 4 mg/mL, LentiBOOST™ increased the transduction efficiency of pseudotyped VSVG LV expressing a GFP transgene reporter. As with PGE2, at the highest concentration of PGE2 tested it was possible to transduce up to approximately 75% of the cells (FIG. 5C).

Пример 3Example 3

Трансдукция гемопоэтических клеток с помощью протаминсульфата, Pge2 и полоксамера F108Transduction of hematopoietic cells using protamine sulfate, Pge2 and poloxamer F108

[00273] В этом примере было установлено, что комбинация протаминсульфата, PGE2 и LentiBOOST™ неожиданным образом увеличивала эффективность трансдукции свыше результатов, наблюдавшихся с PGE2 либо LentiBOOST™ по отдельности. Проводили тестирование согласно протоколу, показанному на ФИГ. 1, и использовали его для сравнения протаминсульфата (PS), LentiBOOST™ (LB), LB плюс PGE2, PS плюс LB, или PS плюс LB плюс PGE2. LB использовали в концентрации 1 мг/мл, PGE2 использовали в концентрации 10 мкг/мл, а PS использовали в концентрации 4 мкг/мл. Результаты, полученные для VCN в трансдуцированных клетках спустя 14 дней культивирования в жидкой среде, показаны на ФИГ. 6. На ФИГ. 7A показан анализ КОЕ на трансдуцированных клетках, полученных из CB и mPB. Также показано VCN в изолированных колониях в присутствии LB плюс PGE2 плюс PS (ФИГ. 7B, ФИГ. 7E) и показана эффективность трансдукции (ФИГ. 7C, ФИГ. 7D). Как показано на ФИГ. 7C, более 80% клеток было трансдуцировано вектором в этих условиях. [00273] In this example, it was found that the combination of protamine sulfate, PGE2, and LentiBOOST™ unexpectedly increased transduction efficiency beyond the results observed with PGE2 or LentiBOOST™ alone. The protocol shown in FIG. 1 was tested and used to compare protamine sulfate (PS), LentiBOOST™ (LB), LB plus PGE2, PS plus LB, or PS plus LB plus PGE2. LB was used at a concentration of 1 mg/mL, PGE2 was used at a concentration of 10 μg/mL, and PS was used at a concentration of 4 μg/mL. The results obtained for VCN in transduced cells after 14 days of culture in liquid medium are shown in FIG. 6. FIG. 7A shows the CFU analysis of CB- and mPB-derived transduced cells. Also shown is VCN in isolated colonies in the presence of LB plus PGE2 plus PS (FIG. 7B, FIG. 7E) and transduction efficiency is shown (FIG. 7C, FIG. 7D). As shown in FIG. 7C, more than 80% of the cells were transduced with the vector under these conditions.

Пример 4Example 4

Масштабирование и тестирование способов усиления трансдукции in vivoScaling and testing methods to enhance transduction in vivo

[00274] Данный пример демонстрирует, что протоколы, установленные в примерах 1-3, могут быть перенесены в терапевтический вектор и масштабированы для получения достаточного количества вектора для клинических исследований, с использованием пуповинной крови в качестве исходного материала. Масштабирование процедуры трансдукции проводили с использованием CD34-обогащенных клеток пуповинной крови (CB) и LV, полученного из pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO без усилителей трансдукции (кроме PS, который использовали во всех экспериментах) или с усилителями трансдукции (+УТ), в частности, LB, PGE2 и PS. LB использовали в концентрации 1 мг/мл, PGE2 использовали в концентрации 10 мкг/мл, а PS использовали в концентрации 4 мкг/мл. VCN спустя 14 дней культивирования в жидкой среде показано на ФИГ. 8. Результаты анализа КОЕ (ФИГ. 9A), VCN в изолированных отдельных КОЕ (ФИГ. 9B), а также эффективность трансдукции в КОЕ (ФИГ. 9C) показаны в трансдуцированных клетках in vitro до трансплантации на ФИГ. 9A-9C. Результаты показаны для бурстобразующих единиц эритроидного ряда (BFU-E), гранулоцитарно-макрофагальных предшественников (CFU-GM) и миелоидных предшественников (CFU-GM) на ФИГ. 9B. На ФИГ. 10A и 10B показаны результаты in vivo. CD34+ клетки пуповинной крови трансдуцировали в присутствии или в отсутствие усилителей трансдукции (УТ: LB плюс PGE2 плюс PS) терапевтическим LV в течение ночи при множественности заражения (MOI), равной 50. LB использовали в концентрации 1 мг/мл, PGE2 использовали в концентрации 10 мкг/мл, а PS использовали в концентрации 4 мкг/мл. Затем собранные трансдуцированные клетки промывали и суспендировали при плотности 1-2,5×106 клеток/мл. Диапазон 1,3-1,6×105 трансдуцированных клеток внутривенно трансплантировали иммунодефицитным мышам NSG, облученным 1,5 Гр, в качестве ксеногенной модели гемопоэза человека. Процент (%)CD45-положительных (hCD45+) клеток чеовека (ФИГ. 10A) и VCN/клетку (ФИГ. 10B) оценивали через один (1), два (2) или три (3) месяца после трансплантации (мпт) в клетках костного мозга, взятых у перенесших трансплантацию животных.[00274] This example demonstrates that the protocols established in Examples 1-3 can be transferred to a therapeutic vector and scaled up to produce sufficient vector for clinical trials using cord blood as a starting material. Scale-up of the transduction procedure was performed using CD34-enriched cord blood (CB) cells and LV derived from pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO without transduction enhancers (except PS, which was used in all experiments) or with transduction enhancers (+UT), specifically LB, PGE2, and PS. LB was used at a concentration of 1 mg/mL, PGE2 was used at a concentration of 10 μg/mL, and PS was used at a concentration of 4 μg/mL. VCN after 14 days of culture in liquid medium is shown in FIG. 8. The results of the CFU assay (FIG. 9A), VCN in isolated single CFU (FIG. 9B), and transduction efficiency in CFU (FIG. 9C) are shown in the transduced cells in vitro before transplantation in FIGS. 9A-9C. The results are shown for burst-forming units of the erythroid lineage (BFU-E), granulocyte-macrophage progenitors (CFU-GM), and myeloid progenitors (CFU-GM) in FIG. 9B. FIGS. 10A and 10B show the in vivo results. Cord blood CD34 + cells were transduced in the presence or absence of transduction enhancers (TE: LB plus PGE2 plus PS) with therapeutic LV overnight at a multiplicity of infection (MOI) of 50. LB was used at a concentration of 1 mg/mL, PGE2 was used at a concentration of 10 μg/mL, and PS was used at a concentration of 4 μg/mL. The collected transduced cells were then washed and suspended at a density of 1-2.5× 106 cells/mL. A range of 1.3-1.6× 105 transduced cells were intravenously transplanted into 1.5 Gy irradiated immunodeficient NSG mice as a xenogeneic model of human hematopoiesis. The percentage (%) of human CD45-positive (hCD45 + ) cells (FIG. 10A) and VCN/cell (FIG. 10B) were assessed at one (1), two (2), or three (3) months post transplantation (mpt) in bone marrow cells collected from transplanted animals.

Пример 5Example 5

Продукция LV в условиях, соответствующих Правилам надлежащей производственной практики (GMP), и трансдукция mPBLV production under GMP conditions and mPB transduction

[00275] Данный пример демонстрирует, что протоколы, установленные в примерах 1-4, могут быть перенесены в терапевтический вектор и масштабированы для получения достаточного количества вектора для клинических исследований, с использованием мобилизованной периферической крови в качестве исходного материала. Осуществляли продукцию LV согласно GMP и использовали в следующей серии экспериментов, проведенных с использованием CD34+ гемопоэтических стволовых клеток, очищенных из мобилизованной периферической крови (mPB) от здорового донора. LV вектор представлял собой псевдотипированный VSVG LV, экспрессирующий трансген FANCA, который был получен с использованием вектора для переноса pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO. На ФИГ. 11 показано VCN/клетку в трансдуцированных клетках спустя 14 дней культивирования в жидкой среде с (+УТ) усилителями трансдукции PS, LB и PGE2 и при двух разных MOI, или без них (-УТ). LB использовали в концентрации 1 мг/мл, PGE2 использовали в концентрации 10 мкг/мл, а PS использовали в концентрации 4 мкг/мл. На ФИГ. 12A-12D показаны результаты анализов колониеобразующих единиц (КОЕ) для всех клеток, BFU, GM и смешанных миелоидных предшественников для GMP003 с (+УТ) усилителями трансдукции PS, LB и PGE2 при двух разных MOI, или без них (-УТ). На ФИГ. 13A и 13B показаны VCN в изолированных одиночных КОЕ для GMP003 с (+УТ) усилителями трансдукции PS, LB и PGE2 при 20 или 50 MOI, или без них (-УТ). Результаты показаны для бурстобразующих единиц эритроидного ряда (BFU-E), гранулоцитарно-макрофагальных предшественников (CFU-GM) и миелоидных предшественников (CFU-GM). На ФИГ. 14A и 14B показана эффективность трансдукции и VCN в КОЕ с (+УТ) усилителями трансдукции PS, LB и PGE2 или без них (-УТ) для бурстобразующих единиц эритроидного ряда (BFU-E), гранулоцитарно-макрофагальных предшественников (GM) и миелоидных предшественников (смешанных).[00275] This example demonstrates that the protocols established in Examples 1-4 can be transferred to a therapeutic vector and scaled up to produce sufficient vector for clinical trials using mobilized peripheral blood as a starting material. LV production was performed under GMP and used in the following series of experiments conducted using CD34+ hematopoietic stem cells purified from mobilized peripheral blood (mPB) from a healthy donor. The LV vector was a VSVG pseudotyped LV expressing the FANCA transgene that was generated using the pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO transfer vector. FIG. 11 shows the VCN/cell in transduced cells after 14 days of culture in liquid medium with (+UT) the transduction enhancers PS, LB, and PGE2 and at two different MOIs, or without (-UT). LB was used at a concentration of 1 mg/mL, PGE2 was used at a concentration of 10 μg/mL, and PS was used at a concentration of 4 μg/mL. FIGS. 12A-12D show the results of colony forming unit (CFU) assays for total cells, BFU, GM, and mixed myeloid progenitors for GMP003 with (+UT) the transduction enhancers PS, LB, and PGE2 at two different MOIs, or without (-UT). FIGS. 13A and 13B show VCN in isolated single CFUs for GMP003 with (+UT) the transduction enhancers PS, LB, and PGE2 at 20 or 50 MOIs, or without (-UT). The results are shown for burst forming units of the erythroid lineage (BFU-E), granulocyte-macrophage progenitors (CFU-GM), and myeloid progenitors (CFU-GM). FIG. 14A and 14B show transduction efficiency and VCN in CFU with (+UT) or without (-UT) the transduction enhancers PS, LB and PGE2 for burst-forming units of the erythroid lineage (BFU-E), granulocyte-macrophage progenitors (GM) and myeloid progenitors (mixed).

--->--->

Перечень последовательностейList of sequences

<110> CENTRO DE INVESTIGACIONES ENERGETICAS, MEDIOAMBIENTALES Y <110> CENTRO DE INVESTIGACIONES ENERGETICAS, MEDIOAMBIENTALES Y

TECNOLOGICAS, O.A., M.P. TECNOLOGICAS, O.A., M.P.

CONSORCIO CENTRO DE INVESTIGACION BIOMEDICA EN RED, M.P. CONSORCIO CENTRO DE INVESTIGACION BIOMEDICA EN RED, M.P.

FUNDACION INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA FUNDACION FUNDACION INSTITUTO DE INVESTIGACION SANITARIA FUNDACION

JIMENEZ DIAZJIMENEZ DIAZ

ROCKET PHARMACEUTICALS, LTD. ROCKET PHARMACEUTICALS, LTD.

<120> METHODS FOR GENE MODIFICATION OF HEMATOPOIETIC CELLS<120> METHODS FOR GENE MODIFICATION OF HEMATOPOIETIC CELLS

<130> ROPA-010/01WO 329592-2074<130> ROPA-010/01WO 329592-2074

<150> US 62/712,146<150> US 62/712,146

<151> 2018-07-30<151> 2018-07-30

<160> 11 <160> 11

<170> PatentIn version 3.5<170> PatentIn version 3.5

<210> 1<210> 1

<211> 5554<211> 5554

<212> DNA<212> DNA

<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence

<220><220>

<223> pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO vector sequence<223> pCCL-PGK-FANCAW-82-PRO vector sequence

<400> 1<400> 1

ggggttgggg ttgcgccttt tccaaggcag ccctgggttt gcgcagggac gcggctgctc 60ggggttgggg ttgcgccttt tccaaggcag ccctgggttt gcgcagggac gcggctgctc 60

tgggcgtggt tccgggaaac gcagcggcgc cgaccctggg tctcgcacat tcttcacgtc 120tgggcgtggt tccgggaaac gcagcggcgc cgaccctggg tctcgcacat tcttcacgtc 120

cgttcgcagc gtcacccgga tcttcgccgc tacccttgtg ggccccccgg cgacgcttcc 180cgttcgcagc gtcacccgga tcttcgccgc tacccttgtg ggccccccgg cgacgcttcc 180

tgctccgccc ctaagtcggg aaggttcctt gcggttcgcg gcgtgccgga cgtgacaaac 240tgctccgccc ctaagtcggg aaggttcctt gcggttcgcg gcgtgccgga cgtgacaaac 240

ggaagccgca cgtctcacta gtaccctcgc agacggacag cgccagggag caatggcagc 300ggaagccgca cgtctcacta gtaccctcgc agacggacag cgccagggag caatggcagc 300

gcgccgaccg cgatgggctg tggccaatag cggctgctca gcagggcgcg ccgagagcag 360gcgccgaccg cgatgggctg tggccaatag cggctgctca gcagggcgcg ccgagagcag 360

cggccgggaa ggggcggtgc gggaggcggg gtgtggggcg gtagtgtggg ccctgttcct 420cggccgggaa ggggcggtgc gggaggcggg gtgtggggcg gtagtgtggg ccctgttcct 420

gcccgcgcgg tgttccgcat tctgcaagcc tccggagcgc acgtcggcag tcggctccct 480gcccgcgcgg tgttccgcat tctgcaagcc tccggagcgc acgtcggcag tcggctccct 480

cgttgaccga atcaccgacc tctctcccca gggggatccc ccgggctgca ggaattcatg 540cgttgaccga atcaccgacc tctctcccca gggggatccc ccgggctgca ggaattcatg 540

tccgactcgt gggtcccgaa ctccgcctcg ggccaggacc cagggggccg ccggagggcc 600tccgactcgt gggtcccgaa ctccgcctcg ggccaggacc caggggggccg ccggagggcc 600

tgggccgagc tgctggcggg aagggtcaag agggaaaaat ataatcctga aagggcacag 660tgggccgagc tgctggcggg aagggtcaag agggaaaaat ataatcctga aagggcacag 660

aaattaaagg aatcagctgt gcgcctcctg cgaagccatc aggacctgaa tgcccttttg 720aaattaaagg aatcagctgt gcgcctcctg cgaagccatc aggacctgaa tgcccttttg 720

cttgaggtag aaggtccact gtgtaaaaaa ttgtctctca gcaaagtgat tgactgtgac 780cttgaggtag aaggtccact gtgtaaaaaa ttgtctctca gcaaagtgat tgactgtgac 780

agttctgagg cctatgctaa tcattctagt tcatttatag gctctgcttt gcaggatcaa 840agttctgagg cctatgctaa tcattctagt tcatttatag gctctgcttt gcaggatcaa 840

gcctcaaggc tgggggttcc cgtgggtatt ctctcagccg ggatggttgc ctctagcgtg 900gcctcaaggc tgggggttcc cgtgggtatt ctctcagccg ggatggttgc ctctagcgtg 900

ggacagatct gcacggctcc agcggagacc agtcaccctg tgctgctgac tgtggagcag 960ggacagatct gcacggctcc agcggagacc agtcaccctg tgctgctgac tgtggagcag 960

agaaagaagc tgtcttccct gttagagttt gctcagtatt tattggcaca cagtatgttc 1020agaaagaagc tgtcttccct gttagagttt gctcagtatt tattggcaca cagtatgttc 1020

tcccgtcttt ccttctgtca agaattatgg aaaatacaga gttctttgtt gcttgaagcg 1080tcccgtcttt ccttctgtca agaattatgg aaaatacaga gttctttgtt gcttgaagcg 1080

gtgtggcatc ttcacgtaca aggcattgtg agcctgcaag agctgctgga aagccatccc 1140gtgtggcatc ttcacgtaca aggcattgtg agcctgcaag agctgctgga aagccatccc 1140

gacatgcatg ctgtgggatc gtggctcttc aggaatctgt gctgcctttg tgaacagatg 1200gacatgcatg ctgtgggatc gtggctcttc aggaatctgt gctgcctttg tgaacagatg 1200

gaagcatcct gccagcatgc tgacgtcgcc agggccatgc tttctgattt tgttcaaatg 1260gaagcatcct gccagcatgc tgacgtcgcc agggccatgc tttctgattt tgttcaaatg 1260

tttgttttga ggggatttca gaaaaactca gatctgagaa gaactgtgga gcctgaaaaa 1320tttgttttga ggggatttca gaaaaactca gatctgagaa gaactgtgga gcctgaaaaa 1320

atgccgcagg tcacggttga tgtactgcag agaatgctga tttttgcact tgacgctttg 1380atgccgcagg tcacggttga tgtactgcag agaatgctga tttttgcact tgacgctttg 1380

gctgctggag tacaggagga gtcctccact cacaagatcg tgaggtgctg gttcggagtg 1440gctgctggag tacaggagga gtcctccact cacaagatcg tgaggtgctg gttcggagtg 1440

ttcagtggac acacgcttgg cagtgtaatt tccacagatc ctctgaagag gttcttcagt 1500ttcagtggac acacgcttgg cagtgtaatt tccacagatc ctctgaagag gttcttcagt 1500

cataccctga ctcagatact cactcacagc cctgtgctga aagcatctga tgctgttcag 1560cataccctga ctcagatact cactcacagc cctgtgctga aagcatctga tgctgttcag 1560

atgcagagag agtggagctt tgcgcggaca caccctctgc tcacctcact gtaccgcagg 1620atgcagagag agtggagctt tgcgcggaca caccctctgc tcacctcact gtaccgcagg 1620

ctctttgtga tgctgagtgc agaggagttg gttggccatt tgcaagaagt tctggaaacg 1680ctctttgtga tgctgagtgc agaggagttg gttggccatt tgcaagaagt tctggaaacg 1680

caggaggttc actggcagag agtgctctcc tttgtgtctg ccctggttgt ctgctttcca 1740caggaggttc actggcagag agtgctctcc tttgtgtctg ccctggttgt ctgctttcca 1740

gaagcgcagc agctgcttga agactgggtg gcgcgtttga tggcccaggc attcgagagc 1800gaagcgcagc agctgcttga agactgggtg gcgcgtttga tggcccaggc attcgagagc 1800

tgccagctgg acagcatggt cactgcgttc ctggttgtgc gccaggcagc actggagggc 1860tgccagctgg acagcatggt cactgcgttc ctggttgtgc gccaggcagc actggagggc 1860

ccctctgcgt tcctgtcata tgcagactgg ttcaaggcct cctttgggag cacacgaggc 1920ccctctgcgt tcctgtcata tgcagactgg ttcaaggcct cctttgggag cacacgaggc 1920

taccatggct gcagcaagaa ggccctggtc ttcctgttta cgttcttgtc agaactcgtg 1980taccatggct gcagcaagaa ggccctggtc ttcctgttta cgttcttgtc agaactcgtg 1980

ccttttgagt ctccccggta cctgcaggtg cacattctcc acccacccct ggttcccagc 2040ccttttgagt ctccccggta cctgcaggtg cacattctcc acccacccct ggttcccagc 2040

aagtaccgct ccctcctcac agactacatc tcattggcca agacacggct ggccgacctc 2100aagtaccgct ccctcctcac agactacatc tcattggcca agacacggct ggccgacctc 2100

aaggtttcta tagaaaacat gggactctac gaggatttgt catcagctgg ggacattact 2160aaggtttcta tagaaaacat gggactctac gaggatttgt catcagctgg ggacattact 2160

gagccccaca gccaagctct tcaggatgtt gaaaaggcca tcatggtgtt tgagcatacg 2220gagccccaca gccaagctct tcaggatgtt gaaaaggcca tcatggtgtt tgagcatacg 2220

gggaacatcc cagtcaccgt catggaggcc agcatattca ggaggcctta ctacgtgtcc 2280gggaacatcc cagtcaccgt catggaggcc agcatattca ggaggcctta ctacgtgtcc 2280

cacttcctcc ccgccctgct cacacctcga gtgctcccca aagtccctga ctcccgtgtg 2340cacttcctcc ccgccctgct cacacctcga gtgctcccca aagtccctga ctcccgtgtg 2340

gcgtttatag agtctctgaa gagagcagat aaaatccccc catctctgta ctccacctac 2400gcgtttatag agtctctgaa gagagcagat aaaatccccc catctctgta ctccacctac 2400

tgccaggcct gctctgctgc tgaagagaag ccagaagatg cagccctggg agtgagggca 2460tgccaggcct gctctgctgc tgaagagaag ccagaagatg cagccctggg agtgagggca 2460

gaacccaact ctgctgagga gcccctggga cagctcacag ctgcactggg agagctgaga 2520gaacccaact ctgctgagga gcccctggga cagctcacag ctgcactggg agagctgaga 2520

gcctccatga cagaccccag ccagcgtgat gttatatcgg cacaggtggc agtgatttct 2580gcctccatga cagaccccag ccagcgtgat gttatatcgg cacaggtggc agtgatttct 2580

gaaagactga gggctgtcct gggccacaat gaggatgaca gcagcgttga gatatcaaag 2640gaaagactga gggctgtcct gggccacaat gaggatgaca gcagcgttga gatatcaaag 2640

attcagctca gcatcaacac gccgagactg gagccacggg aacacattgc tgtggacctc 2700attcagctca gcatcaacac gccgagactg gagccacggg aacacattgc tgtggacctc 2700

ctgctgacgt ctttctgtca gaacctgatg gctgcctcca gtgtcgctcc cccggagagg 2760ctgctgacgt ctttctgtca gaacctgatg gctgcctcca gtgtcgctcc cccggagagg 2760

cagggtccct gggctgccct cttcgtgagg accatgtgtg gacgtgtgct ccctgcagtg 2820cagggtccct gggctgccct cttcgtgagg accatgtgtg gacgtgtgct ccctgcagtg 2820

ctcacccggc tctgccagct gctccgtcac cagggcccga gcctgagtgc cccacatgtg 2880ctcacccggc tctgccagct gctccgtcac cagggcccga gcctgagtgc cccacatgtg 2880

ctggggttgg ctgccctggc cgtgcacctg ggtgagtcca ggtctgcgct cccagaggtg 2940ctggggttgg ctgccctggc cgtgcacctg ggtgagtcca ggtctgcgct cccagaggtg 2940

gatgtgggtc ctcctgcacc tggtgctggc cttcctgtcc ctgcgctctt tgacagcctc 3000gatgtgggtc ctcctgcacc tggtgctggc cttcctgtcc ctgcgctctt tgacagcctc 3000

ctgacctgta ggacgaggga ttccttgttc ttctgcctga aattttgtac agcagcaatt 3060ctgacctgta ggacgaggga ttccttgttc ttctgcctga aattttgtac agcagcaatt 3060

tcttactctc tctgcaagtt ttcttcccag tcacgagata ctttgtgcag ctgcttatct 3120tcttactctc tctgcaagtt ttcttcccag tcacgagata ctttgtgcag ctgcttatct 3120

ccaggcctta ttaaaaagtt tcagttcctc atgttcagat tgttctcaga ggcccgacag 3180ccaggcctta ttaaaaagtt tcagttcctc atgttcagat tgttctcaga ggcccgacag 3180

cctctttctg aggaggacgt agccagcctt tcctggagac ccttgcacct tccttctgca 3240cctctttctg aggaggacgt agccagcctt tcctggagac ccttgcacct tccttctgca 3240

gactggcaga gagctgccct ctctctctgg acacacagaa ccttccgaga ggtgttgaaa 3300gactggcaga gagctgccct ctctctctgg acacacagaa ccttccgaga ggtgttgaaa 3300

gaggaagatg ttcacttaac ttaccaagac tggttacacc tggagctgga aattcaacct 3360gaggaagatg ttcacttaac ttaccaagac tggttacacc tggagctgga aattcaacct 3360

gaagctgatg ctctttcaga tactgaacgg caggacttcc accagtgggc gatccatgag 3420gaagctgatg ctctttcaga tactgaacgg caggacttcc accagtgggc gatccatgag 3420

cactttctcc ctgagtcctc ggcttcaggg ggctgtgacg gagacctgca ggctgcgtgt 3480cactttctcc ctgagtcctc ggcttcaggg ggctgtgacg gagacctgca ggctgcgtgt 3480

accattcttg tcaacgcact gatggatttc caccaaagct caaggagtta tgaccactca 3540accattcttg tcaacgcact gatggatttc caccaaagct caaggagtta tgaccactca 3540

gaaaattctg atttggtctt tggtggccgc acaggaaatg aggatattat ttccagattg 3600gaaaattctg atttggtctt tggtggccgc acaggaaatg aggatattat ttccagattg 3600

caggagatgg tagctgacct ggagctgcag caagacctca tagtgcctct cggccacacc 3660caggagatgg tagctgacct ggagctgcag caagacctca tagtgcctct cggccacacc 3660

ccttcccagg agcacttcct ctttgagatt ttccgcagac ggctccaggc tctgacaagc 3720ccttcccagg agcacttcct ctttgagatt ttccgcagac ggctccaggc tctgacaagc 3720

gggtggagcg tggctgccag ccttcagaga cagagggagc tgctaatgta caaacggatc 3780gggtggagcg tggctgccag ccttcagaga cagagggagc tgctaatgta caaacggatc 3780

ctcctccgcc tgccttcgtc tgtcctctgc ggcagcagct tccaggcaga acagcccatc 3840ctcctccgcc tgccttcgtc tgtcctctgc ggcagcagct tccaggcaga acagcccatc 3840

actgccagat gcgagcagtt cttccacttg gtcaactctg agatgagaaa cttctgctcc 3900actgccagat gcgagcagtt cttccacttg gtcaactctg agatgagaaa cttctgctcc 3900

cacggaggtg ccctgacaca ggacatcact gcccacttct tcaggggcct cctgaacgcc 3960cacggaggtg ccctgacaca ggacatcact gcccacttct tcaggggcct cctgaacgcc 3960

tgtctgcgga gcagagaccc ctccctgatg gtcgacttca tactggccaa gtgccagacg 4020tgtctgcgga gcagagaccc ctccctgatg gtcgacttca tactggccaa gtgccagacg 4020

aaatgcccct taattttgac ctctgctctg gtgtggtggc cgagcctgga gcctgtgctg 4080aaatgcccct taattttgac ctctgctctg gtgtggtggc cgagcctgga gcctgtgctg 4080

ctctgccggt ggaggagaca ctgccagagc ccgctgcccc gggaactgca gaagctacaa 4140ctctgccggt ggaggagaca ctgccagagc ccgctgcccc gggaactgca gaagctacaa 4140

gaaggccggc agtttgccag cgatttcctc tcccctgagg ctgcctcccc agcacccaac 4200gaaggccggc agtttgccag cgatttcctc tcccctgagg ctgcctcccc agcacccaac 4200

ccggactggc tctcagctgc tgcactgcac tttgcgattc aacaagtcag ggaagaaaac 4260ccggactggc tctcagctgc tgcactgcac tttgcgattc aacaagtcag ggaagaaaac 4260

atcaggaagc agctaaagaa gctggactgc gagagagagg agctattggt tttccttttc 4320atcaggaagc agctaaagaa gctggactgc gagagagagg agctattggt tttccttttc 4320

ttcttctcct tgatgggcct gctgtcgtca catctgacct caaatagcac cacagacctg 4380ttcttctcct tgatgggcct gctgtcgtca catctgacct caaatagcac cacagacctg 4380

ccaaaggctt tccacgtttg tgcagcaatc ctcgagtgtt tagagaagag gaagatatcc 4440ccaaaggctt tccacgtttg tgcagcaatc ctcgagtgtt tagagaagag gaagatatcc 4440

tggctggcac tctttcagtt gacagagagt gacctcaggc tggggcggct cctcctccgt 4500tggctggcac tctttcagtt gacagagagt gacctcaggc tggggcggct cctcctccgt 4500

gtggccccgg atcagcacac caggctgctg cctttcgctt tttacagtct tctctcctac 4560gtggccccgg atcagcacac caggctgctg cctttcgctt tttacagtct tctctcctac 4560

ttccatgaag acgcggccat cagggaagag gccttcctgc atgttgctgt ggacatgtac 4620ttccatgaag acgcggccat cagggaagag gccttcctgc atgttgctgt ggacatgtac 4620

ttgaagctgg tccagctctt cgtggctggg gatacaagca cagtttcacc tccagctggc 4680ttgaagctgg tccagctctt cgtggctggg gatacaagca cagtttcacc tccagctggc 4680

aggagcctgg agctcaaggg tcagggcaac cccgtggaac tgataacaaa agctcgtctt 4740aggagcctgg agctcaaggg tcagggcaac cccgtggaac tgataacaaa agctcgtctt 4740

tttctgctgc agttaatacc tcggtgcccg aaaaagagct tctcacacgt ggcagagctg 4800tttctgctgc agttaatacc tcggtgcccg aaaaagagct tctcacacgt ggcagagctg 4800

ctggctgatc gtggggactg cgacccagag gtgagcgccg ccctccagag cagacagcag 4860ctggctgatc gtggggactg cgacccagag gtgagcgccg ccctccagag cagacagcag 4860

gctgcccctg acgctgacct gtcccaggag cctcatctct tctgatgaga attcgatatc 4920gctgcccctg acgctgacct gtcccaggag cctcatctct tctgatgaga attcgatatc 4920

aagcttatcg ataccgtcga atcccccggg ctgcaggaat tcgagcatct taccgccatt 4980aagcttatcg ataccgtcga atcccccggg ctgcaggaat tcgagcatct taccgccatt 4980

tattcccata tttgttctgt ttttcttgat ttgggtatac atttaaatgt taataaaaca 5040tattcccata tttgttctgt ttttcttgat ttgggtatac atttaaatgt taataaaaca 5040

aaatggtggg gcaatcattt acatttttag ggatatgtaa ttactagttc aggtgtattg 5100aaatggtggg gcaatcattt acatttttag ggatatgtaa ttactagttc aggtgtattg 5100

ccacaagaca aacatgttaa gaaactttcc cgttatttac gctctgttcc tgttaatcaa 5160ccacaagaca aacatgttaa gaaactttcc cgttatttac gctctgttcc tgttaatcaa 5160

cctctggatt acaaaatttg tgaaagattg actgatattc ttaactatgt tgctcctttt 5220cctctggatt acaaaatttg tgaaagattg actgatattc ttaactatgt tgctcctttt 5220

acgctgtgtg gatatgctgc tttaatgcct ctgtatcatg ctattgcttc ccgtacggct 5280acgctgtgtg gatatgctgc tttaatgcct ctgtatcatg ctattgcttc ccgtacggct 5280

ttcgttttct cctccttgta taaatcctgg ttgctgtctc tttatgagga gttgtggccc 5340ttcgttttct cctccttgta taaatcctgg ttgctgtctc tttatgagga gttgtggccc 5340

gttgtccgtc aacgtggcgt ggtgtgctct gtgtttgctg acgcaacccc cactggctgg 5400gttgtccgtc aacgtggcgt ggtgtgctct gtgtttgctg acgcaacccc cactggctgg 5400

ggcattgcca ccacctgtca actcctttct gggactttcg ctttccccct cccgatcgcc 5460ggcattgcca ccacctgtca actcctttct gggactttcg ctttccccct cccgatcgcc 5460

acggcagaac tcatcgccgc ctgccttgcc cgctgctgga caggggctag gttgctgggc 5520acggcagaac tcatcgccgc ctgccttgcc cgctgctgga caggggctag gttgctgggc 5520

actgataatt ccgtggtgtt gtcggggaag ggcc 5554actgataatt ccgtggtgtt gtcggggaag ggcc 5554

<210> 2<210> 2

<211> 1455<211> 1455

<212> PRT<212> PRT

<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens

<400> 2<400> 2

Met Ser Asp Ser Trp Val Pro Asn Ser Ala Ser Gly Gln Asp Pro Gly Met Ser Asp Ser Trp Val Pro Asn Ser Ala Ser Gly Gln Asp Pro Gly

1 5 10 15 1 5 10 15

Gly Arg Arg Arg Ala Trp Ala Glu Leu Leu Ala Gly Arg Val Lys Arg Gly Arg Arg Arg Ala Trp Ala Glu Leu Leu Ala Gly Arg Val Lys Arg

20 25 30 20 25 30

Glu Lys Tyr Asn Pro Glu Arg Ala Gln Lys Leu Lys Glu Ser Ala Val Glu Lys Tyr Asn Pro Glu Arg Ala Gln Lys Leu Lys Glu Ser Ala Val

35 40 45 35 40 45

Arg Leu Leu Arg Ser His Gln Asp Leu Asn Ala Leu Leu Leu Glu Val Arg Leu Leu Arg Ser His Gln Asp Leu Asn Ala Leu Leu Leu Glu Val

50 55 60 50 55 60

Glu Gly Pro Leu Cys Lys Lys Leu Ser Leu Ser Lys Val Ile Asp Cys Glu Gly Pro Leu Cys Lys Lys Leu Ser Leu Ser Lys Val Ile Asp Cys

65 70 75 80 65 70 75 80

Asp Ser Ser Glu Ala Tyr Ala Asn His Ser Ser Ser Phe Ile Gly Ser Asp Ser Ser Glu Ala Tyr Ala Asn His Ser Ser Ser Phe Ile Gly Ser

85 90 95 85 90 95

Ala Leu Gln Asp Gln Ala Ser Arg Leu Gly Val Pro Val Gly Ile Leu Ala Leu Gln Asp Gln Ala Ser Arg Leu Gly Val Pro Val Gly Ile Leu

100 105 110 100 105 110

Ser Ala Gly Met Val Ala Ser Ser Val Gly Gln Ile Cys Thr Ala Pro Ser Ala Gly Met Val Ala Ser Ser Val Gly Gln Ile Cys Thr Ala Pro

115 120 125 115 120 125

Ala Glu Thr Ser His Pro Val Leu Leu Thr Val Glu Gln Arg Lys Lys Ala Glu Thr Ser His Pro Val Leu Leu Thr Val Glu Gln Arg Lys Lys

130 135 140 130 135 140

Leu Ser Ser Leu Leu Glu Phe Ala Gln Tyr Leu Leu Ala His Ser Met Leu Ser Ser Leu Leu Glu Phe Ala Gln Tyr Leu Leu Ala His Ser Met

145 150 155 160 145 150 155 160

Phe Ser Arg Leu Ser Phe Cys Gln Glu Leu Trp Lys Ile Gln Ser Ser Phe Ser Arg Leu Ser Phe Cys Gln Glu Leu Trp Lys Ile Gln Ser Ser

165 170 175 165 170 175

Leu Leu Leu Glu Ala Val Trp His Leu His Val Gln Gly Ile Val Ser Leu Leu Leu Glu Ala Val Trp His Leu His Val Gln Gly Ile Val Ser

180 185 190 180 185 190

Leu Gln Glu Leu Leu Glu Ser His Pro Asp Met His Ala Val Gly Ser Leu Gln Glu Leu Leu Glu Ser His Pro Asp Met His Ala Val Gly Ser

195 200 205 195 200 205

Trp Leu Phe Arg Asn Leu Cys Cys Leu Cys Glu Gln Met Glu Ala Ser Trp Leu Phe Arg Asn Leu Cys Cys Leu Cys Glu Gln Met Glu Ala Ser

210 215 220 210 215 220

Cys Gln His Ala Asp Val Ala Arg Ala Met Leu Ser Asp Phe Val Gln Cys Gln His Ala Asp Val Ala Arg Ala Met Leu Ser Asp Phe Val Gln

225 230 235 240 225 230 235 240

Met Phe Val Leu Arg Gly Phe Gln Lys Asn Ser Asp Leu Arg Arg Thr Met Phe Val Leu Arg Gly Phe Gln Lys Asn Ser Asp Leu Arg Arg Thr

245 250 255 245 250 255

Val Glu Pro Glu Lys Met Pro Gln Val Thr Val Asp Val Leu Gln Arg Val Glu Pro Glu Lys Met Pro Gln Val Thr Val Asp Val Leu Gln Arg

260 265 270 260 265 270

Met Leu Ile Phe Ala Leu Asp Ala Leu Ala Ala Gly Val Gln Glu Glu Met Leu Ile Phe Ala Leu Asp Ala Leu Ala Ala Gly Val Gln Glu Glu

275 280 285 275 280 285

Ser Ser Thr His Lys Ile Val Arg Cys Trp Phe Gly Val Phe Ser Gly Ser Ser Thr His Lys Ile Val Arg Cys Trp Phe Gly Val Phe Ser Gly

290 295 300 290 295 300

His Thr Leu Gly Ser Val Ile Ser Thr Asp Pro Leu Lys Arg Phe Phe His Thr Leu Gly Ser Val Ile Ser Thr Asp Pro Leu Lys Arg Phe Phe

305 310 315 320 305 310 315 320

Ser His Thr Leu Thr Gln Ile Leu Thr His Ser Pro Val Leu Lys Ala Ser His Thr Leu Thr Gln Ile Leu Thr His Ser Pro Val Leu Lys Ala

325 330 335 325 330 335

Ser Asp Ala Val Gln Met Gln Arg Glu Trp Ser Phe Ala Arg Thr His Ser Asp Ala Val Gln Met Gln Arg Glu Trp Ser Phe Ala Arg Thr His

340 345 350 340 345 350

Pro Leu Leu Thr Ser Leu Tyr Arg Arg Leu Phe Val Met Leu Ser Ala Pro Leu Leu Thr Ser Leu Tyr Arg Arg Leu Phe Val Met Leu Ser Ala

355 360 365 355 360 365

Glu Glu Leu Val Gly His Leu Gln Glu Val Leu Glu Thr Gln Glu Val Glu Glu Leu Val Gly His Leu Gln Glu Val Leu Glu Thr Gln Glu Val

370 375 380 370 375 380

His Trp Gln Arg Val Leu Ser Phe Val Ser Ala Leu Val Val Cys Phe His Trp Gln Arg Val Leu Ser Phe Val Ser Ala Leu Val Val Cys Phe

385 390 395 400 385 390 395 400

Pro Glu Ala Gln Gln Leu Leu Glu Asp Trp Val Ala Arg Leu Met Ala Pro Glu Ala Gln Gln Leu Leu Glu Asp Trp Val Ala Arg Leu Met Ala

405 410 415 405 410 415

Gln Ala Phe Glu Ser Cys Gln Leu Asp Ser Met Val Thr Ala Phe Leu Gln Ala Phe Glu Ser Cys Gln Leu Asp Ser Met Val Thr Ala Phe Leu

420 425 430 420 425 430

Val Val Arg Gln Ala Ala Leu Glu Gly Pro Ser Ala Phe Leu Ser Tyr Val Val Arg Gln Ala Ala Leu Glu Gly Pro Ser Ala Phe Leu Ser Tyr

435 440 445 435 440 445

Ala Asp Trp Phe Lys Ala Ser Phe Gly Ser Thr Arg Gly Tyr His Gly Ala Asp Trp Phe Lys Ala Ser Phe Gly Ser Thr Arg Gly Tyr His Gly

450 455 460 450 455 460

Cys Ser Lys Lys Ala Leu Val Phe Leu Phe Thr Phe Leu Ser Glu Leu Cys Ser Lys Lys Ala Leu Val Phe Leu Phe Thr Phe Leu Ser Glu Leu

465 470 475 480 465 470 475 480

Val Pro Phe Glu Ser Pro Arg Tyr Leu Gln Val His Ile Leu His Pro Val Pro Phe Glu Ser Pro Arg Tyr Leu Gln Val His Ile Leu His Pro

485 490 495 485 490 495

Pro Leu Val Pro Ser Lys Tyr Arg Ser Leu Leu Thr Asp Tyr Ile Ser Pro Leu Val Pro Ser Lys Tyr Arg Ser Leu Leu Thr Asp Tyr Ile Ser

500 505 510 500 505 510

Leu Ala Lys Thr Arg Leu Ala Asp Leu Lys Val Ser Ile Glu Asn Met Leu Ala Lys Thr Arg Leu Ala Asp Leu Lys Val Ser Ile Glu Asn Met

515 520 525 515 520 525

Gly Leu Tyr Glu Asp Leu Ser Ser Ala Gly Asp Ile Thr Glu Pro His Gly Leu Tyr Glu Asp Leu Ser Ser Ala Gly Asp Ile Thr Glu Pro His

530 535 540 530 535 540

Ser Gln Ala Leu Gln Asp Val Glu Lys Ala Ile Met Val Phe Glu His Ser Gln Ala Leu Gln Asp Val Glu Lys Ala Ile Met Val Phe Glu His

545 550 555 560 545 550 555 560

Thr Gly Asn Ile Pro Val Thr Val Met Glu Ala Ser Ile Phe Arg Arg Thr Gly Asn Ile Pro Val Thr Val Met Glu Ala Ser Ile Phe Arg Arg

565 570 575 565 570 575

Pro Tyr Tyr Val Ser His Phe Leu Pro Ala Leu Leu Thr Pro Arg Val Pro Tyr Tyr Val Ser His Phe Leu Pro Ala Leu Leu Thr Pro Arg Val

580 585 590 580 585 590

Leu Pro Lys Val Pro Asp Ser Arg Val Ala Phe Ile Glu Ser Leu Lys Leu Pro Lys Val Pro Asp Ser Arg Val Ala Phe Ile Glu Ser Leu Lys

595 600 605 595 600 605

Arg Ala Asp Lys Ile Pro Pro Ser Leu Tyr Ser Thr Tyr Cys Gln Ala Arg Ala Asp Lys Ile Pro Pro Ser Leu Tyr Ser Thr Tyr Cys Gln Ala

610 615 620 610 615 620

Cys Ser Ala Ala Glu Glu Lys Pro Glu Asp Ala Ala Leu Gly Val Arg Cys Ser Ala Ala Glu Glu Lys Pro Glu Asp Ala Ala Leu Gly Val Arg

625 630 635 640 625 630 635 640

Ala Glu Pro Asn Ser Ala Glu Glu Pro Leu Gly Gln Leu Thr Ala Ala Ala Glu Pro Asn Ser Ala Glu Glu Pro Leu Gly Gln Leu Thr Ala Ala

645 650 655 645 650 655

Leu Gly Glu Leu Arg Ala Ser Met Thr Asp Pro Ser Gln Arg Asp Val Leu Gly Glu Leu Arg Ala Ser Met Thr Asp Pro Ser Gln Arg Asp Val

660 665 670 660 665 670

Ile Ser Ala Gln Val Ala Val Ile Ser Glu Arg Leu Arg Ala Val Leu Ile Ser Ala Gln Val Ala Val Ile Ser Glu Arg Leu Arg Ala Val Leu

675 680 685 675 680 685

Gly His Asn Glu Asp Asp Ser Ser Val Glu Ile Ser Lys Ile Gln Leu Gly His Asn Glu Asp Asp Ser Ser Val Glu Ile Ser Lys Ile Gln Leu

690 695 700 690 695 700

Ser Ile Asn Thr Pro Arg Leu Glu Pro Arg Glu His Ile Ala Val Asp Ser Ile Asn Thr Pro Arg Leu Glu Pro Arg Glu His Ile Ala Val Asp

705 710 715 720 705 710 715 720

Leu Leu Leu Thr Ser Phe Cys Gln Asn Leu Met Ala Ala Ser Ser Val Leu Leu Leu Thr Ser Phe Cys Gln Asn Leu Met Ala Ala Ser Ser Val

725 730 735 725 730 735

Ala Pro Pro Glu Arg Gln Gly Pro Trp Ala Ala Leu Phe Val Arg Thr Ala Pro Pro Glu Arg Gln Gly Pro Trp Ala Ala Leu Phe Val Arg Thr

740 745 750 740 745 750

Met Cys Gly Arg Val Leu Pro Ala Val Leu Thr Arg Leu Cys Gln Leu Met Cys Gly Arg Val Leu Pro Ala Val Leu Thr Arg Leu Cys Gln Leu

755 760 765 755 760 765

Leu Arg His Gln Gly Pro Ser Leu Ser Ala Pro His Val Leu Gly Leu Leu Arg His Gln Gly Pro Ser Leu Ser Ala Pro His Val Leu Gly Leu

770 775 780 770 775 780

Ala Ala Leu Ala Val His Leu Gly Glu Ser Arg Ser Ala Leu Pro Glu Ala Ala Leu Ala Val His Leu Gly Glu Ser Arg Ser Ala Leu Pro Glu

785 790 795 800 785 790 795 800

Val Asp Val Gly Pro Pro Ala Pro Gly Ala Gly Leu Pro Val Pro Ala Val Asp Val Gly Pro Pro Ala Pro Gly Ala Gly Leu Pro Val Pro Ala

805 810 815 805 810 815

Leu Phe Asp Ser Leu Leu Thr Cys Arg Thr Arg Asp Ser Leu Phe Phe Leu Phe Asp Ser Leu Leu Thr Cys Arg Thr Arg Asp Ser Leu Phe Phe

820 825 830 820 825 830

Cys Leu Lys Phe Cys Thr Ala Ala Ile Ser Tyr Ser Leu Cys Lys Phe Cys Leu Lys Phe Cys Thr Ala Ala Ile Ser Tyr Ser Leu Cys Lys Phe

835 840 845 835 840 845

Ser Ser Gln Ser Arg Asp Thr Leu Cys Ser Cys Leu Ser Pro Gly Leu Ser Ser Gln Ser Arg Asp Thr Leu Cys Ser Cys Leu Ser Pro Gly Leu

850 855 860 850 855 860

Ile Lys Lys Phe Gln Phe Leu Met Phe Arg Leu Phe Ser Glu Ala Arg Ile Lys Lys Phe Gln Phe Leu Met Phe Arg Leu Phe Ser Glu Ala Arg

865 870 875 880 865 870 875 880

Gln Pro Leu Ser Glu Glu Asp Val Ala Ser Leu Ser Trp Arg Pro Leu Gln Pro Leu Ser Glu Glu Asp Val Ala Ser Leu Ser Trp Arg Pro Leu

885 890 895 885 890 895

His Leu Pro Ser Ala Asp Trp Gln Arg Ala Ala Leu Ser Leu Trp Thr His Leu Pro Ser Ala Asp Trp Gln Arg Ala Ala Leu Ser Leu Trp Thr

900 905 910 900 905 910

His Arg Thr Phe Arg Glu Val Leu Lys Glu Glu Asp Val His Leu Thr His Arg Thr Phe Arg Glu Val Leu Lys Glu Glu Asp Val His Leu Thr

915 920 925 915 920 925

Tyr Gln Asp Trp Leu His Leu Glu Leu Glu Ile Gln Pro Glu Ala Asp Tyr Gln Asp Trp Leu His Leu Glu Leu Glu Ile Gln Pro Glu Ala Asp

930 935 940 930 935 940

Ala Leu Ser Asp Thr Glu Arg Gln Asp Phe His Gln Trp Ala Ile His Ala Leu Ser Asp Thr Glu Arg Gln Asp Phe His Gln Trp Ala Ile His

945 950 955 960 945 950 955 960

Glu His Phe Leu Pro Glu Ser Ser Ala Ser Gly Gly Cys Asp Gly Asp Glu His Phe Leu Pro Glu Ser Ser Ala Ser Gly Gly Cys Asp Gly Asp

965 970 975 965 970 975

Leu Gln Ala Ala Cys Thr Ile Leu Val Asn Ala Leu Met Asp Phe His Leu Gln Ala Ala Cys Thr Ile Leu Val Asn Ala Leu Met Asp Phe His

980 985 990 980 985 990

Gln Ser Ser Arg Ser Tyr Asp His Ser Glu Asn Ser Asp Leu Val Phe Gln Ser Ser Arg Ser Tyr Asp His Ser Glu Asn Ser Asp Leu Val Phe

995 1000 1005 995 1000 1005

Gly Gly Arg Thr Gly Asn Glu Asp Ile Ile Ser Arg Leu Gln Glu Gly Gly Arg Thr Gly Asn Glu Asp Ile Ile Ser Arg Leu Gln Glu

1010 1015 1020 1010 1015 1020

Met Val Ala Asp Leu Glu Leu Gln Gln Asp Leu Ile Val Pro Leu Met Val Ala Asp Leu Glu Leu Gln Gln Asp Leu Ile Val Pro Leu

1025 1030 1035 1025 1030 1035

Gly His Thr Pro Ser Gln Glu His Phe Leu Phe Glu Ile Phe Arg Gly His Thr Pro Ser Gln Glu His Phe Leu Phe Glu Ile Phe Arg

1040 1045 1050 1040 1045 1050

Arg Arg Leu Gln Ala Leu Thr Ser Gly Trp Ser Val Ala Ala Ser Arg Arg Leu Gln Ala Leu Thr Ser Gly Trp Ser Val Ala Ala Ser

1055 1060 1065 1055 1060 1065

Leu Gln Arg Gln Arg Glu Leu Leu Met Tyr Lys Arg Ile Leu Leu Leu Gln Arg Gln Arg Glu Leu Leu Met Tyr Lys Arg Ile Leu Leu

1070 1075 1080 1070 1075 1080

Arg Leu Pro Ser Ser Val Leu Cys Gly Ser Ser Phe Gln Ala Glu Arg Leu Pro Ser Ser Val Leu Cys Gly Ser Ser Phe Gln Ala Glu

1085 1090 1095 1085 1090 1095

Gln Pro Ile Thr Ala Arg Cys Glu Gln Phe Phe His Leu Val Asn Gln Pro Ile Thr Ala Arg Cys Glu Gln Phe Phe His Leu Val Asn

1100 1105 1110 1100 1105 1110

Ser Glu Met Arg Asn Phe Cys Ser His Gly Gly Ala Leu Thr Gln Ser Glu Met Arg Asn Phe Cys Ser His Gly Gly Ala Leu Thr Gln

1115 1120 1125 1115 1120 1125

Asp Ile Thr Ala His Phe Phe Arg Gly Leu Leu Asn Ala Cys Leu Asp Ile Thr Ala His Phe Phe Arg Gly Leu Leu Asn Ala Cys Leu

1130 1135 1140 1130 1135 1140

Arg Ser Arg Asp Pro Ser Leu Met Val Asp Phe Ile Leu Ala Lys Arg Ser Arg Asp Pro Ser Leu Met Val Asp Phe Ile Leu Ala Lys

1145 1150 1155 1145 1150 1155

Cys Gln Thr Lys Cys Pro Leu Ile Leu Thr Ser Ala Leu Val Trp Cys Gln Thr Lys Cys Pro Leu Ile Leu Thr Ser Ala Leu Val Trp

1160 1165 1170 1160 1165 1170

Trp Pro Ser Leu Glu Pro Val Leu Leu Cys Arg Trp Arg Arg His Trp Pro Ser Leu Glu Pro Val Leu Leu Cys Arg Trp Arg Arg His

1175 1180 1185 1175 1180 1185

Cys Gln Ser Pro Leu Pro Arg Glu Leu Gln Lys Leu Gln Glu Gly Cys Gln Ser Pro Leu Pro Arg Glu Leu Gln Lys Leu Gln Glu Gly

1190 1195 1200 1190 1195 1200

Arg Gln Phe Ala Ser Asp Phe Leu Ser Pro Glu Ala Ala Ser Pro Arg Gln Phe Ala Ser Asp Phe Leu Ser Pro Glu Ala Ala Ser Pro

1205 1210 1215 1205 1210 1215

Ala Pro Asn Pro Asp Trp Leu Ser Ala Ala Ala Leu His Phe Ala Ala Pro Asn Pro Asp Trp Leu Ser Ala Ala Ala Leu His Phe Ala

1220 1225 1230 1220 1225 1230

Ile Gln Gln Val Arg Glu Glu Asn Ile Arg Lys Gln Leu Lys Lys Ile Gln Gln Val Arg Glu Glu Asn Ile Arg Lys Gln Leu Lys Lys

1235 1240 1245 1235 1240 1245

Leu Asp Cys Glu Arg Glu Glu Leu Leu Val Phe Leu Phe Phe Phe Leu Asp Cys Glu Arg Glu Glu Leu Leu Val Phe Leu Phe Phe Phe

1250 1255 1260 1250 1255 1260

Ser Leu Met Gly Leu Leu Ser Ser His Leu Thr Ser Asn Ser Thr Ser Leu Met Gly Leu Leu Ser Ser His Leu Thr Ser Asn Ser Thr

1265 1270 1275 1265 1270 1275

Thr Asp Leu Pro Lys Ala Phe His Val Cys Ala Ala Ile Leu Glu Thr Asp Leu Pro Lys Ala Phe His Val Cys Ala Ala Ile Leu Glu

1280 1285 1290 1280 1285 1290

Cys Leu Glu Lys Arg Lys Ile Ser Trp Leu Ala Leu Phe Gln Leu Cys Leu Glu Lys Arg Lys Ile Ser Trp Leu Ala Leu Phe Gln Leu

1295 1300 1305 1295 1300 1305

Thr Glu Ser Asp Leu Arg Leu Gly Arg Leu Leu Leu Arg Val Ala Thr Glu Ser Asp Leu Arg Leu Gly Arg Leu Leu Leu Arg Val Ala

1310 1315 1320 1310 1315 1320

Pro Asp Gln His Thr Arg Leu Leu Pro Phe Ala Phe Tyr Ser Leu Pro Asp Gln His Thr Arg Leu Leu Pro Phe Ala Phe Tyr Ser Leu

1325 1330 1335 1325 1330 1335

Leu Ser Tyr Phe His Glu Asp Ala Ala Ile Arg Glu Glu Ala Phe Leu Ser Tyr Phe His Glu Asp Ala Ala Ile Arg Glu Glu Ala Phe

1340 1345 1350 1340 1345 1350

Leu His Val Ala Val Asp Met Tyr Leu Lys Leu Val Gln Leu Phe Leu His Val Ala Val Asp Met Tyr Leu Lys Leu Val Gln Leu Phe

1355 1360 1365 1355 1360 1365

Val Ala Gly Asp Thr Ser Thr Val Ser Pro Pro Ala Gly Arg Ser Val Ala Gly Asp Thr Ser Thr Val Ser Pro Pro Ala Gly Arg Ser

1370 1375 1380 1370 1375 1380

Leu Glu Leu Lys Gly Gln Gly Asn Pro Val Glu Leu Ile Thr Lys Leu Glu Leu Lys Gly Gln Gly Asn Pro Val Glu Leu Ile Thr Lys

1385 1390 1395 1385 1390 1395

Ala Arg Leu Phe Leu Leu Gln Leu Ile Pro Arg Cys Pro Lys Lys Ala Arg Leu Phe Leu Leu Gln Leu Ile Pro Arg Cys Pro Lys Lys

1400 1405 1410 1400 1405 1410

Ser Phe Ser His Val Ala Glu Leu Leu Ala Asp Arg Gly Asp Cys Ser Phe Ser His Val Ala Glu Leu Leu Ala Asp Arg Gly Asp Cys

1415 1420 1425 1415 1420 1425

Asp Pro Glu Val Ser Ala Ala Leu Gln Ser Arg Gln Gln Ala Ala Asp Pro Glu Val Ser Ala Ala Leu Gln Ser Arg Gln Gln Ala Ala

1430 1435 1440 1430 1435 1440

Pro Asp Ala Asp Leu Ser Gln Glu Pro His Leu Phe Pro Asp Ala Asp Leu Ser Gln Glu Pro His Leu Phe

1445 1450 1455 1445 1450 1455

<210> 3<210> 3

<211> 3903<211> 3903

<212> DNA<212> DNA

<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence

<220><220>

<223> pCCL-ChimhCD18W-82-RO vector sequence<223> pCCL-ChimhCD18W-82-RO vector sequence

<400> 3<400> 3

cgcgtctgcc agctttcttg ctttgctgga gtattctgga atttgatggg ttgagggttc 60cgcgtctgcc agctttcttg ctttgctgga gtattctgga atttgatggg ttgagggttc 60

tggacacaat gccccaagcc ccttccttgt tgtgctgggt tcctatttct gctctcggca 120tggacacaat gccccaagcc ccttccttgt tgtgctgggt tcctatttct gctctcggca 120

ctgacttagc agctgctcaa gagctcacca tgttggcttg gattacacgg tctcacccac 180ctgacttagc agctgctcaa gagctcacca tgttggcttg gattacacgg tctcacccac 180

atctccggca gtttgtgggc aaacttcctg agcagccttg ggtgatgaaa cctttcatgg 240atctccggca gtttgtgggc aaacttcctg agcagccttg ggtgatgaaa cctttcatgg 240

tagcaggaga atgggactgt gaattctcaa tcccctgtcc ccaccccttc cttcctctct 300tagcaggaga atgggactgt gaattctcaa tcccctgtcc ccaccccttc cttcctctct 300

cagggccttg ctgtctagga ggagggagca cagcagcaac tgactgggca gcctttcagg 360cagggccttg ctgtctagga ggagggagca cagcagcaac tgactgggca gcctttcagg 360

aaaggctagc ccgggctcga tcgagaagct tgataattcc gtgaggtggg gagggctggg 420aaaggctagc ccgggctcga tcgagaagct tgataattcc gtgaggtggg gagggctggg 420

accagggttc cctctttctc ttctgcggtg gccctggcct ggtgctagga ctgcgcgcct 480accagggttc cctctttctc ttctgcggtg gccctggcct ggtgctagga ctgcgcgcct 480

cccctcagta cccgcggaca ccctgggctt ccctgggccc agcatctgcc tggggcctcg 540cccctcagta cccgcggaca ccctgggctt ccctgggccc agcatctgcc tggggcctcg 540

ccctgggctc cccctcctga cccccacctt gcgccccttc ccggtgttcc cggggcgctg 600ccctgggctc cccctcctga cccccacctt gcgccccttc ccggtgttcc cggggcgctg 600

ccgggccctg gggcctgcgg ggcgcgggcg gctcttggct gggccattct ttcccggccc 660ccgggccctg gggcctgcgg ggcgcgggcg gctcttggct gggccattct ttcccggccc 660

cctcctccct tccgtttccg tggccgtgcg gccggctaga ggctgcggcc cagcgcggag 720cctcctccct tccgtttccg tggccgtgcg gccggctaga ggctgcggcc cagcgcggag 720

caggggggct ggcaggcgtc ggggcggtcg ggccggtccc gcccgcccct tcccctccac 780caggggggct ggcaggcgtc ggggcggtcg ggccggtccc gcccgcccct tcccctccac 780

aggcccgccc cggggcctgg gccaactgaa accgcgggag gaggaagcgc ggaatcagga 840aggcccgccc cggggcctgg gccaactgaa accgcgggag gaggaagcgc ggaatcagga 840

actggccggg gtccgcaccg ggcctgagtc ggtccgaggc cgtcccagga gcagctgccc 900actggccggg gtccgcaccg ggcctgagtc ggtccgaggc cgtcccagga gcagctgccc 900

gaagggcgaa ttgggggatc ccccgggcta atgccaactt tgtacaaaaa agcaggctcc 960gaagggcgaa ttgggggatc ccccggggcta atgccaactt tgtacaaaaa agcaggctcc 960

accatgctgg gcctgcgccc cccacttctc gccctggtgg ggctgctctc cctcgggtgc 1020accatgctgg gcctgcgccc cccacttctc gccctggtgg ggctgctctc cctcgggtgc 1020

gtcctctctc aggagtgcac gaagttcaag gtcagcagct gccgggaatg catcgagtcg 1080gtcctctctc aggagtgcac gaagttcaag gtcagcagct gccgggaatg catcgagtcg 1080

gggcccggct gcacctggtg ccagaagctg aacttcacag ggccggggga tcctgactcc 1140gggcccggct gcacctggtg ccagaagctg aacttcacag ggccggggga tcctgactcc 1140

attcgctgcg acacccggcc acagctgctc atgaggggct gtgcggctga cgacatcatg 1200attcgctgcg acacccggcc acagctgctc atgaggggct gtgcggctga cgacatcatg 1200

gaccccacaa gcctcgctga aacccaggaa gaccacaatg ggggccagaa gcagctgtcc 1260gaccccacaa gcctcgctga aacccaggaa gaccacaatg ggggccagaa gcagctgtcc 1260

ccacaaaaag tgacgcttta cctgcgacca ggccaggcag cagcgttcaa cgtgaccttc 1320ccacaaaaag tgacgcttta cctgcgacca ggccaggcag cagcgttcaa cgtgaccttc 1320

cggcgggcca agggctaccc catcgacctg tactatctga tggacctctc ctactccatg 1380cggcgggcca agggctaccc catcgacctg tactatctga tggacctctc ctactccatg 1380

cttgatgacc tcaggaatgt caagaagcta ggtggcgacc tgctccgggc cctcaacgag 1440cttgatgacc tcaggaatgt caagaagcta ggtggcgacc tgctccgggc cctcaacgag 1440

atcaccgagt ccggccgcat tggcttcggg tccttcgtgg acaagaccgt gctgccgttc 1500atcaccgagt ccggccgcat tggcttcggg tccttcgtgg acaagaccgt gctgccgttc 1500

gtgaacacgc accctgataa gctgcgaaac ccatgcccca acaaggagaa agagtgccag 1560gtgaacacgc accctgataa gctgcgaaac ccatgcccca acaaggagaa agagtgccag 1560

cccccgtttg ccttcaggca cgtgctgaag ctgaccaaca actccaacca gtttcagacc 1620cccccgtttg ccttcaggca cgtgctgaag ctgaccaaca actccaacca gtttcagacc 1620

gaggtcggga agcagctgat ttccggaaac ctggatgcac ccgagggtgg gctggacgcc 1680gaggtcggga agcagctgat ttccggaaac ctggatgcac ccgaggtgg gctggacgcc 1680

atgatgcagg tcgccgcctg cccggaggaa atcggctggc gcaacgtcac gcggctgctg 1740atgatgcagg tcgccgcctg cccggaggaa atcggctggc gcaacgtcac gcggctgctg 1740

gtgtttgcca ctgatgacgg cttccatttc gcgggcgacg ggaagctggg cgccatcctg 1800gtgtttgcca ctgatgacgg cttccatttc gcgggcgacg ggaagctggg cgccatcctg 1800

acccccaacg acggccgctg tcacctggag gacaacttgt acaagaggag caacgaattc 1860acccccaacg acggccgctg tcacctggag gacaacttgt acaagaggag caacgaattc 1860

gactacccat cggtgggcca gctggcgcac aagctggctg aaaacaacat ccagcccatc 1920gactacccat cggtgggcca gctggcgcac aagctggctg aaaacaacat ccagcccatc 1920

ttcgcggtga ccagtaggat ggtgaagacc tacgagaaac tcaccgagat catccccaag 1980ttcgcggtga ccagtaggat ggtgaagacc tacgagaaac tcaccgagat catccccaag 1980

tcagccgtgg gggagctgtc tgaggactcc agcaatgtgg tccatctcat taagaatgct 2040tcagccgtgg gggagctgtc tgaggactcc agcaatgtgg tccatctcat taagaatgct 2040

tacaataaac tctcctccag ggtattcctg gatcacaacg ccctccccga caccctgaaa 2100tacaataaac tctcctccag ggtattcctg gatcacaacg ccctccccga caccctgaaa 2100

gtcacctacg actccttctg cagcaatgga gtgacgcaca ggaaccagcc cagaggtgac 2160gtcacctacg actccttctg cagcaatgga gtgacgcaca ggaaccagcc cagaggtgac 2160

tgtgatggcg tgcagatcaa tgtcccgatc accttccagg tgaaggtcac ggccacagag 2220tgtgatggcg tgcagatcaa tgtcccgatc accttccagg tgaaggtcac ggccacagag 2220

tgcatccagg agcagtcgtt tgtcatccgg gcgctgggct tcacggacat agtgaccgtg 2280tgcatccagg agcagtcgtt tgtcatccgg gcgctgggct tcacggacat agtgaccgtg 2280

caggtccttc cccagtgtga gtgccggtgc cgggaccaga gcagagaccg cagcctctgc 2340caggtccttc cccagtgtga gtgccggtgc cgggaccaga gcagagaccg cagcctctgc 2340

catggcaagg gcttcttgga gtgcggcatc tgcaggtgtg acactggcta cattgggaaa 2400catggcaagg gcttcttgga gtgcggcatc tgcaggtgtg acactggcta cattgggaaa 2400

aactgtgagt gccagacaca gggccggagc agccaggagc tggaaggaag ctgccggaag 2460aactgtgagt gccagacaca gggccggagc agccaggagc tggaaggaag ctgccggaag 2460

gacaacaact ccatcatctg ctcagggctg ggggactgtg tctgcgggca gtgcctgtgc 2520gacaacaact ccatcatctg ctcagggctg ggggactgtg tctgcgggca gtgcctgtgc 2520

cacaccagcg acgtccccgg caagctgata tacgggcagt actgcgagtg tgacaccatc 2580cacaccagcg acgtccccgg caagctgata tacgggcagt actgcgagtg tgacaccatc 2580

aactgtgagc gctacaacgg ccaggtctgc ggcggcccgg ggagggggct ctgcttctgc 2640aactgtgagc gctacaacgg ccaggtctgc ggcggcccgg ggagggggct ctgcttctgc 2640

gggaagtgcc gctgccaccc gggctttgag ggctcagcgt gccagtgcga gaggaccact 2700gggaagtgcc gctgccaccc gggctttgag ggctcagcgt gccagtgcga gaggaccact 2700

gagggctgcc tgaacccgcg gcgtgttgag tgtagtggtc gtggccggtg ccgctgcaac 2760gagggctgcc tgaacccgcg gcgtgttgag tgtagtggtc gtggccggtg ccgctgcaac 2760

gtatgcgagt gccattcagg ctaccagctg cctctgtgcc aggagtgccc cggctgcccc 2820gtatgcgagt gccattcagg ctaccagctg cctctgtgcc aggagtgccc cggctgcccc 2820

tcaccctgtg gcaagtacat ctcctgcgcc gagtgcctga agttcgaaaa gggccccttt 2880tcaccctgtg gcaagtacat ctcctgcgcc gagtgcctga agttcgaaaa gggccccttt 2880

gggaagaact gcagcgcggc gtgtccgggc ctgcagctgt cgaacaaccc cgtgaagggc 2940gggaagaact gcagcgcggc gtgtccgggc ctgcagctgt cgaacaaccc cgtgaagggc 2940

aggacctgca aggagaggga ctcagagggc tgctgggtgg cctacacgct ggagcagcag 3000aggacctgca aggagaggga ctcagagggc tgctgggtgg cctacacgct ggagcagcag 3000

gacgggatgg accgctacct catctatgtg gatgagagcc gagagtgtgt ggcaggcccc 3060gacgggatgg accgctacct catctatgtg gatgagagcc gagagtgtgt ggcaggcccc 3060

aacatcgccg ccatcgtcgg gggcaccgtg gcaggcatcg tgctgatcgg cattctcctg 3120aacatcgccg ccatcgtcgg gggcaccgtg gcaggcatcg tgctgatcgg cattctcctg 3120

ctggtcatct ggaaggctct gatccacctg agcgacctcc gggagtacag gcgctttgag 3180ctggtcatct ggaaggctct gatccacctg agcgacctcc gggagtacag gcgctttgag 3180

aaggagaagc tcaagtccca gtggaacaat gataatcccc ttttcaagag cgccaccacg 3240aaggagaagc tcaagtccca gtggaacaat gataatcccc ttttcaagag cgccaccacg 3240

acggtcatga accccaagtt tgctgagagt taggacccag ctttcttgta caaagttggc 3300acggtcatga accccaagtt tgctgagagt taggacccag ctttcttgta caaagttggc 3300

attaggaatt cgagcatctt accgccattt attcccatat ttgttctgtt tttcttgatt 3360attaggaatt cgagcatctt accgccattt attcccatat ttgttctgtt tttcttgatt 3360

tgggtataca tttaaatgtt aataaaacaa aatggtgggg caatcattta catttttagg 3420tgggtataca tttaaatgtt aataaaacaa aatggtgggg caatcattta catttttagg 3420

gatatgtaat tactagttca ggtgtattgc cacaagacaa acatgttaag aaactttccc 3480gatatgtaat tactagttca ggtgtattgc cacaagacaa acatgttaag aaactttccc 3480

gttatttacg ctctgttcct gttaatcaac ctctggatta caaaatttgt gaaagattga 3540gttatttacg ctctgttcct gttaatcaac ctctggatta caaaatttgt gaaagattga 3540

ctgatattct taactatgtt gctcctttta cgctgtgtgg atatgctgct ttaatgcctc 3600ctgatattct taactatgtt gctcctttta cgctgtgtgg atatgctgct ttaatgcctc 3600

tgtatcatgc tattgcttcc cgtacggctt tcgttttctc ctccttgtat aaatcctggt 3660tgtatcatgc tattgcttcc cgtacggctt tcgttttctc ctccttgtat aaatcctggt 3660

tgctgtctct ttatgaggag ttgtggcccg ttgtccgtca acgtggcgtg gtgtgctctg 3720tgctgtctct ttatgaggag ttgtggcccg ttgtccgtca acgtggcgtg gtgtgctctg 3720

tgtttgctga cgcaaccccc actggctggg gcattgccac cacctgtcaa ctcctttctg 3780tgtttgctga cgcaaccccc actggctggg gcattgccac cacctgtcaa ctcctttctg 3780

ggactttcgc tttccccctc ccgatcgcca cggcagaact catcgccgcc tgccttgccc 3840ggactttcgc tttccccctc ccgatcgcca cggcagaact catcgccgcc tgccttgccc 3840

gctgctggac aggggctagg ttgctgggca ctgataattc cgtggtgttg tcggggaagg 3900gctgctggac aggggctagg ttgctgggca ctgataattc cgtggtgttg tcggggaagg 3900

gcc 3903gcc 3903

<210> 4<210> 4

<211> 769<211> 769

<212> PRT<212> PRT

<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens

<400> 4<400> 4

Met Leu Gly Leu Arg Pro Pro Leu Leu Ala Leu Val Gly Leu Leu Ser Met Leu Gly Leu Arg Pro Pro Leu Leu Ala Leu Val Gly Leu Leu Ser

1 5 10 15 1 5 10 15

Leu Gly Cys Val Leu Ser Gln Glu Cys Thr Lys Phe Lys Val Ser Ser Leu Gly Cys Val Leu Ser Gln Glu Cys Thr Lys Phe Lys Val Ser Ser

20 25 30 20 25 30

Cys Arg Glu Cys Ile Glu Ser Gly Pro Gly Cys Thr Trp Cys Gln Lys Cys Arg Glu Cys Ile Glu Ser Gly Pro Gly Cys Thr Trp Cys Gln Lys

35 40 45 35 40 45

Leu Asn Phe Thr Gly Pro Gly Asp Pro Asp Ser Ile Arg Cys Asp Thr Leu Asn Phe Thr Gly Pro Gly Asp Pro Asp Ser Ile Arg Cys Asp Thr

50 55 60 50 55 60

Arg Pro Gln Leu Leu Met Arg Gly Cys Ala Ala Asp Asp Ile Met Asp Arg Pro Gln Leu Leu Met Arg Gly Cys Ala Ala Asp Asp Ile Met Asp

65 70 75 80 65 70 75 80

Pro Thr Ser Leu Ala Glu Thr Gln Glu Asp His Asn Gly Gly Gln Lys Pro Thr Ser Leu Ala Glu Thr Gln Glu Asp His Asn Gly Gly Gln Lys

85 90 95 85 90 95

Gln Leu Ser Pro Gln Lys Val Thr Leu Tyr Leu Arg Pro Gly Gln Ala Gln Leu Ser Pro Gln Lys Val Thr Leu Tyr Leu Arg Pro Gly Gln Ala

100 105 110 100 105 110

Ala Ala Phe Asn Val Thr Phe Arg Arg Ala Lys Gly Tyr Pro Ile Asp Ala Ala Phe Asn Val Thr Phe Arg Arg Ala Lys Gly Tyr Pro Ile Asp

115 120 125 115 120 125

Leu Tyr Tyr Leu Met Asp Leu Ser Tyr Ser Met Leu Asp Asp Leu Arg Leu Tyr Tyr Leu Met Asp Leu Ser Tyr Ser Met Leu Asp Asp Leu Arg

130 135 140 130 135 140

Asn Val Lys Lys Leu Gly Gly Asp Leu Leu Arg Ala Leu Asn Glu Ile Asn Val Lys Lys Leu Gly Gly Asp Leu Leu Arg Ala Leu Asn Glu Ile

145 150 155 160 145 150 155 160

Thr Glu Ser Gly Arg Ile Gly Phe Gly Ser Phe Val Asp Lys Thr Val Thr Glu Ser Gly Arg Ile Gly Phe Gly Ser Phe Val Asp Lys Thr Val

165 170 175 165 170 175

Leu Pro Phe Val Asn Thr His Pro Asp Lys Leu Arg Asn Pro Cys Pro Leu Pro Phe Val Asn Thr His Pro Asp Lys Leu Arg Asn Pro Cys Pro

180 185 190 180 185 190

Asn Lys Glu Lys Glu Cys Gln Pro Pro Phe Ala Phe Arg His Val Leu Asn Lys Glu Lys Glu Cys Gln Pro Pro Phe Ala Phe Arg His Val Leu

195 200 205 195 200 205

Lys Leu Thr Asn Asn Ser Asn Gln Phe Gln Thr Glu Val Gly Lys Gln Lys Leu Thr Asn Asn Ser Asn Gln Phe Gln Thr Glu Val Gly Lys Gln

210 215 220 210 215 220

Leu Ile Ser Gly Asn Leu Asp Ala Pro Glu Gly Gly Leu Asp Ala Met Leu Ile Ser Gly Asn Leu Asp Ala Pro Glu Gly Gly Leu Asp Ala Met

225 230 235 240 225 230 235 240

Met Gln Val Ala Ala Cys Pro Glu Glu Ile Gly Trp Arg Asn Val Thr Met Gln Val Ala Ala Cys Pro Glu Glu Ile Gly Trp Arg Asn Val Thr

245 250 255 245 250 255

Arg Leu Leu Val Phe Ala Thr Asp Asp Gly Phe His Phe Ala Gly Asp Arg Leu Leu Val Phe Ala Thr Asp Asp Gly Phe His Phe Ala Gly Asp

260 265 270 260 265 270

Gly Lys Leu Gly Ala Ile Leu Thr Pro Asn Asp Gly Arg Cys His Leu Gly Lys Leu Gly Ala Ile Leu Thr Pro Asn Asp Gly Arg Cys His Leu

275 280 285 275 280 285

Glu Asp Asn Leu Tyr Lys Arg Ser Asn Glu Phe Asp Tyr Pro Ser Val Glu Asp Asn Leu Tyr Lys Arg Ser Asn Glu Phe Asp Tyr Pro Ser Val

290 295 300 290 295 300

Gly Gln Leu Ala His Lys Leu Ala Glu Asn Asn Ile Gln Pro Ile Phe Gly Gln Leu Ala His Lys Leu Ala Glu Asn Asn Ile Gln Pro Ile Phe

305 310 315 320 305 310 315 320

Ala Val Thr Ser Arg Met Val Lys Thr Tyr Glu Lys Leu Thr Glu Ile Ala Val Thr Ser Arg Met Val Lys Thr Tyr Glu Lys Leu Thr Glu Ile

325 330 335 325 330 335

Ile Pro Lys Ser Ala Val Gly Glu Leu Ser Glu Asp Ser Ser Asn Val Ile Pro Lys Ser Ala Val Gly Glu Leu Ser Glu Asp Ser Ser Asn Val

340 345 350 340 345 350

Val His Leu Ile Lys Asn Ala Tyr Asn Lys Leu Ser Ser Arg Val Phe Val His Leu Ile Lys Asn Ala Tyr Asn Lys Leu Ser Ser Arg Val Phe

355 360 365 355 360 365

Leu Asp His Asn Ala Leu Pro Asp Thr Leu Lys Val Thr Tyr Asp Ser Leu Asp His Asn Ala Leu Pro Asp Thr Leu Lys Val Thr Tyr Asp Ser

370 375 380 370 375 380

Phe Cys Ser Asn Gly Val Thr His Arg Asn Gln Pro Arg Gly Asp Cys Phe Cys Ser Asn Gly Val Thr His Arg Asn Gln Pro Arg Gly Asp Cys

385 390 395 400 385 390 395 400

Asp Gly Val Gln Ile Asn Val Pro Ile Thr Phe Gln Val Lys Val Thr Asp Gly Val Gln Ile Asn Val Pro Ile Thr Phe Gln Val Lys Val Thr

405 410 415 405 410 415

Ala Thr Glu Cys Ile Gln Glu Gln Ser Phe Val Ile Arg Ala Leu Gly Ala Thr Glu Cys Ile Gln Glu Gln Ser Phe Val Ile Arg Ala Leu Gly

420 425 430 420 425 430

Phe Thr Asp Ile Val Thr Val Gln Val Leu Pro Gln Cys Glu Cys Arg Phe Thr Asp Ile Val Thr Val Gln Val Leu Pro Gln Cys Glu Cys Arg

435 440 445 435 440 445

Cys Arg Asp Gln Ser Arg Asp Arg Ser Leu Cys His Gly Lys Gly Phe Cys Arg Asp Gln Ser Arg Asp Arg Ser Leu Cys His Gly Lys Gly Phe

450 455 460 450 455 460

Leu Glu Cys Gly Ile Cys Arg Cys Asp Thr Gly Tyr Ile Gly Lys Asn Leu Glu Cys Gly Ile Cys Arg Cys Asp Thr Gly Tyr Ile Gly Lys Asn

465 470 475 480 465 470 475 480

Cys Glu Cys Gln Thr Gln Gly Arg Ser Ser Gln Glu Leu Glu Gly Ser Cys Glu Cys Gln Thr Gln Gly Arg Ser Ser Gln Glu Leu Glu Gly Ser

485 490 495 485 490 495

Cys Arg Lys Asp Asn Asn Ser Ile Ile Cys Ser Gly Leu Gly Asp Cys Cys Arg Lys Asp Asn Asn Ser Ile Ile Cys Ser Gly Leu Gly Asp Cys

500 505 510 500 505 510

Val Cys Gly Gln Cys Leu Cys His Thr Ser Asp Val Pro Gly Lys Leu Val Cys Gly Gln Cys Leu Cys His Thr Ser Asp Val Pro Gly Lys Leu

515 520 525 515 520 525

Ile Tyr Gly Gln Tyr Cys Glu Cys Asp Thr Ile Asn Cys Glu Arg Tyr Ile Tyr Gly Gln Tyr Cys Glu Cys Asp Thr Ile Asn Cys Glu Arg Tyr

530 535 540 530 535 540

Asn Gly Gln Val Cys Gly Gly Pro Gly Arg Gly Leu Cys Phe Cys Gly Asn Gly Gln Val Cys Gly Gly Pro Gly Arg Gly Leu Cys Phe Cys Gly

545 550 555 560 545 550 555 560

Lys Cys Arg Cys His Pro Gly Phe Glu Gly Ser Ala Cys Gln Cys Glu Lys Cys Arg Cys His Pro Gly Phe Glu Gly Ser Ala Cys Gln Cys Glu

565 570 575 565 570 575

Arg Thr Thr Glu Gly Cys Leu Asn Pro Arg Arg Val Glu Cys Ser Gly Arg Thr Thr Glu Gly Cys Leu Asn Pro Arg Arg Val Glu Cys Ser Gly

580 585 590 580 585 590

Arg Gly Arg Cys Arg Cys Asn Val Cys Glu Cys His Ser Gly Tyr Gln Arg Gly Arg Cys Arg Cys Asn Val Cys Glu Cys His Ser Gly Tyr Gln

595 600 605 595 600 605

Leu Pro Leu Cys Gln Glu Cys Pro Gly Cys Pro Ser Pro Cys Gly Lys Leu Pro Leu Cys Gln Glu Cys Pro Gly Cys Pro Ser Pro Cys Gly Lys

610 615 620 610 615 620

Tyr Ile Ser Cys Ala Glu Cys Leu Lys Phe Glu Lys Gly Pro Phe Gly Tyr Ile Ser Cys Ala Glu Cys Leu Lys Phe Glu Lys Gly Pro Phe Gly

625 630 635 640 625 630 635 640

Lys Asn Cys Ser Ala Ala Cys Pro Gly Leu Gln Leu Ser Asn Asn Pro Lys Asn Cys Ser Ala Ala Cys Pro Gly Leu Gln Leu Ser Asn Asn Pro

645 650 655 645 650 655

Val Lys Gly Arg Thr Cys Lys Glu Arg Asp Ser Glu Gly Cys Trp Val Val Lys Gly Arg Thr Cys Lys Glu Arg Asp Ser Glu Gly Cys Trp Val

660 665 670 660 665 670

Ala Tyr Thr Leu Glu Gln Gln Asp Gly Met Asp Arg Tyr Leu Ile Tyr Ala Tyr Thr Leu Glu Gln Gln Asp Gly Met Asp Arg Tyr Leu Ile Tyr

675 680 685 675 680 685

Val Asp Glu Ser Arg Glu Cys Val Ala Gly Pro Asn Ile Ala Ala Ile Val Asp Glu Ser Arg Glu Cys Val Ala Gly Pro Asn Ile Ala Ala Ile

690 695 700 690 695 700

Val Gly Gly Thr Val Ala Gly Ile Val Leu Ile Gly Ile Leu Leu Leu Val Gly Gly Thr Val Ala Gly Ile Val Leu Ile Gly Ile Leu Leu Leu

705 710 715 720 705 710 715 720

Val Ile Trp Lys Ala Leu Ile His Leu Ser Asp Leu Arg Glu Tyr Arg Val Ile Trp Lys Ala Leu Ile His Leu Ser Asp Leu Arg Glu Tyr Arg

725 730 735 725 730 735

Arg Phe Glu Lys Glu Lys Leu Lys Ser Gln Trp Asn Asn Asp Asn Pro Arg Phe Glu Lys Glu Lys Leu Lys Ser Gln Trp Asn Asn Asp Asn Pro

740 745 750 740 745 750

Leu Phe Lys Ser Ala Thr Thr Thr Val Met Asn Pro Lys Phe Ala Glu Leu Phe Lys Ser Ala Thr Thr Thr Val Met Asn Pro Lys Phe Ala Glu

755 760 765 755 760 765

Ser Ser

<210> 5<210> 5

<211> 2890<211> 2890

<212> DNA<212> DNA

<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence

<220><220>

<223> pCCL-PGK-coRPKW-82-RO vector sequence<223> pCCL-PGK-coRPKW-82-RO vector sequence

<400> 5<400> 5

ggggttgggg ttgcgccttt tccaaggcag ccctgggttt gcgcagggac gcggctgctc 60ggggttgggg ttgcgccttt tccaaggcag ccctgggttt gcgcagggac gcggctgctc 60

tgggcgtggt tccgggaaac gcagcggcgc cgaccctggg tctcgcacat tcttcacgtc 120tgggcgtggt tccgggaaac gcagcggcgc cgaccctggg tctcgcacat tcttcacgtc 120

cgttcgcagc gtcacccgga tcttcgccgc tacccttgtg ggccccccgg cgacgcttcc 180cgttcgcagc gtcacccgga tcttcgccgc tacccttgtg ggccccccgg cgacgcttcc 180

tgctccgccc ctaagtcggg aaggttcctt gcggttcgcg gcgtgccgga cgtgacaaac 240tgctccgccc ctaagtcggg aaggttcctt gcggttcgcg gcgtgccgga cgtgacaaac 240

ggaagccgca cgtctcacta gtaccctcgc agacggacag cgccagggag caatggcagc 300ggaagccgca cgtctcacta gtaccctcgc agacggacag cgccagggag caatggcagc 300

gcgccgaccg cgatgggctg tggccaatag cggctgctca gcagggcgcg ccgagagcag 360gcgccgaccg cgatgggctg tggccaatag cggctgctca gcagggcgcg ccgagagcag 360

cggccgggaa ggggcggtgc gggaggcggg gtgtggggcg gtagtgtggg ccctgttcct 420cggccgggaa ggggcggtgc gggaggcggg gtgtggggcg gtagtgtggg ccctgttcct 420

gcccgcgcgg tgttccgcat tctgcaagcc tccggagcgc acgtcggcag tcggctccct 480gcccgcgcgg tgttccgcat tctgcaagcc tccggagcgc acgtcggcag tcggctccct 480

cgttgaccga atcaccgacc tctctcccca gggggatccg tcgacaccgg tgccaccatg 540cgttgaccga atcaccgacc tctctcccca gggggatccg tcgacaccgg tgccaccatg 540

agcatccagg aaaatatcag ctctctgcag ctgcggtcct gggtgtccaa gagccagaga 600agcatccagg aaaatatcag ctctctgcag ctgcggtcct gggtgtccaa gagccagaga 600

gacctggcca agagcatcct gatcggagcc cctggcggac cagccggata cctgagaagg 660gacctggcca agagcatcct gatcggagcc cctggcggac cagccggata cctgagaagg 660

gctagcgtgg cccagctgac ccaggaactg ggcaccgcct ttttccagca gcagcagctg 720gctagcgtgg cccagctgac ccadgaactg ggcaccgcct ttttccagca gcagcagctg 720

ccagccgcca tggccgacac ctttctggaa cacctgtgcc tgctggacat cgactctgag 780ccagccgcca tggccgacac ctttctggaa cacctgtgcc tgctggacat cgactctgag 780

cccgtggccg ccagaagcac cagcatcatt gccaccatcg gccctgccag cagaagcgtg 840cccgtggccg ccagaagcac cagcatcatt gccaccatcg gccctgccag cagaagcgtg 840

gagcggctga aagagatgat caaggccggc atgaatatcg cccggctgaa cttctcccac 900gagcggctga aagagatgat caaggccggc atgaatatcg cccggctgaa cttctcccac 900

ggcagccacg agtaccacgc agagagcatt gccaacgtcc gggaggccgt ggagagcttt 960ggcagccacg agtaccacgc agagagcatt gccaacgtcc gggaggccgt ggagagcttt 960

gccggcagcc ccctgagcta cagacccgtg gccattgccc tggacaccaa gggccccgag 1020gccggcagcc ccctgagcta cagacccgtg gccattgccc tggacaccaa gggccccgag 1020

atcagaacag gaattctgca gggagggcct gagagcgagg tggagctggt gaagggcagc 1080atcagaacag gaattctgca gggagggcct gagagcgagg tggagctggt gaagggcagc 1080

caagtgctgg tgaccgtgga ccccgccttc agaaccagag gcaacgccaa cacagtgtgg 1140caagtgctgg tgaccgtgga ccccgccttc agaaccagag gcaacgccaa cacagtgtgg 1140

gtggactacc ccaacatcgt gcgggtggtg cctgtgggcg gcagaatcta catcgacgac 1200gtggactacc ccaacatcgt gcgggtggtg cctgtgggcg gcagaatcta catcgacgac 1200

ggcctgatca gcctggtggt gcagaagatc ggacctgagg gcctggtgac ccaggtcgag 1260ggcctgatca gcctggtggt gcagaagatc ggacctgagg gcctggtgac ccaggtcgag 1260

aatggcggcg tgctgggcag cagaaagggc gtgaatctgc caggcgccca ggtggacctg 1320aatggcggcg tgctgggcag cagaaagggc gtgaatctgc caggcgccca ggtggacctg 1320

cctggcctgt ctgagcagga cgtgagagac ctgagatttg gcgtggagca cggcgtggac 1380cctggcctgt ctgagcagga cgtgagagac ctgagatttg gcgtggagca cggcgtggac 1380

atcgtgttcg ccagcttcgt gcggaaggcc tctgatgtgg ccgccgtgag agccgctctg 1440atcgtgttcg ccagcttcgt gcggaaggcc tctgatgtgg ccgccgtgag agccgctctg 1440

ggccctgaag gccacggcat caagatcatc agcaagatcg agaaccacga gggcgtgaag 1500ggccctgaag gccacggcat caagatcatc agcaagatcg agaaccacga gggcgtgaag 1500

cggttcgacg agatcctgga agtgtccgac ggcatcatgg tggccagagg cgacctgggc 1560cggttcgacg agatcctgga agtgtccgac ggcatcatgg tggccagagg cgacctgggc 1560

atcgagatcc ccgccgagaa ggtgttcctg gcccagaaaa tgatgatcgg acggtgcaac 1620atcgagatcc ccgccgagaa ggtgttcctg gcccagaaaa tgatgatcgg acggtgcaac 1620

ctggccggca aacctgtggt gtgcgccacc cagatgctgg aaagcatgat caccaagccc 1680ctggccggca aacctgtggt gtgcgccacc cagatgctgg aaagcatgat caccaagccc 1680

agacccacca gagccgagac aagcgacgtg gccaacgccg tgctggatgg cgctgactgc 1740agacccacca gagccgagac aagcgacgtg gccaacgccg tgctggatgg cgctgactgc 1740

atcatgctgt ccggcgagac agccaagggc aacttccccg tggaggccgt gaagatgcag 1800atcatgctgt ccggcgagac agccaagggc aacttccccg tggaggccgt gaagatgcag 1800

cacgccattg ccagagaagc cgaggccgcc gtgtaccacc ggcagctgtt cgaggaactg 1860cacgccattg ccagagaagc cgaggccgcc gtgtaccacc ggcagctgtt cgaggaactg 1860

cggagagccg cccctctgag cagagatccc accgaagtga ccgccatcgg agccgtggaa 1920cggagagccg cccctctgag cagagatccc accgaagtga ccgccatcgg agccgtggaa 1920

gccgccttca agtgctgcgc cgctgcaatc atcgtgctga ccaccacagg cagaagcgcc 1980gccgccttca agtgctgcgc cgctgcaatc atcgtgctga ccaccacagg cagaagcgcc 1980

cagctgctgt ccagatacag acccagagcc gccgtgatcg ccgtgacaag atccgcccag 2040cagctgctgt ccagatacag acccagagcc gccgtgatcg ccgtgacaag atccgcccag 2040

gccgctagac aggtccacct gtgcagaggc gtgttccccc tgctgtaccg ggagcctccc 2100gccgctagac aggtccacct gtgcagaggc gtgttccccc tgctgtaccg ggagcctccc 2100

gaggccatct gggccgacga cgtggacaga cgggtgcagt tcggcatcga gagcggcaag 2160gaggccatct gggccgacga cgtggacaga cgggtgcagt tcggcatcga gagcggcaag 2160

ctgcggggct tcctgagagt gggcgacctg gtgatcgtgg tgacaggctg gcggcctggc 2220ctgcggggct tcctgagagt gggcgacctg gtgatcgtgg tgacaggctg gcggcctggc 2220

agcggctaca ccaacatcat gagggtgctg tccatcagct gaccgcggtc tagaggatcc 2280agcggctaca ccaacatcat gagggtgctg tccatcagct gaccgcggtc tagaggatcc 2280

cccgggctgc aggaattcga gcatcttacc gccatttatt cccatatttg ttctgttttt 2340cccggggctgc aggaattcga gcatcttacc gccatttatt cccatatttg ttctgttttt 2340

cttgatttgg gtatacattt aaatgttaat aaaacaaaat ggtggggcaa tcatttacat 2400cttgatttgg gtatacattt aaatgttaat aaaacaaaat ggtggggcaa tcatttacat 2400

ttttagggat atgtaattac tagttcaggt gtattgccac aagacaaaca tgttaagaaa 2460ttttagggat atgtaattac tagttcaggt gtattgccac aagacaaaca tgttaagaaa 2460

ctttcccgtt atttacgctc tgttcctgtt aatcaacctc tggattacaa aatttgtgaa 2520ctttcccgtt atttacgctc tgttcctgtt aatcaacctc tggattacaa aatttgtgaa 2520

agattgactg atattcttaa ctatgttgct ccttttacgc tgtgtggata tgctgcttta 2580agattgactg atattcttaa ctatgttgct ccttttacgc tgtgtggata tgctgcttta 2580

atgcctctgt atcatgctat tgcttcccgt acggctttcg ttttctcctc cttgtataaa 2640atgcctctgt atcatgctat tgcttcccgt acggctttcg ttttctcctc cttgtataaa 2640

tcctggttgc tgtctcttta tgaggagttg tggcccgttg tccgtcaacg tggcgtggtg 2700tcctggttgc tgtctcttta tgaggagttg tggcccgttg tccgtcaacg tggcgtggtg 2700

tgctctgtgt ttgctgacgc aacccccact ggctggggca ttgccaccac ctgtcaactc 2760tgctctgtgt ttgctgacgc aacccccact ggctggggca ttgccaccac ctgtcaactc 2760

ctttctggga ctttcgcttt ccccctcccg atcgccacgg cagaactcat cgccgcctgc 2820ctttctggga ctttcgcttt ccccctcccg atcgccacgg cagaactcat cgccgcctgc 2820

cttgcccgct gctggacagg ggctaggttg ctgggcactg ataattccgt ggtgttgtcg 2880cttgcccgct gctggacagg ggctaggttg ctgggcactg ataattccgt ggtgttgtcg 2880

gggaagggcc 2890gggaagggcc 2890

<210> 6<210> 6

<211> 574<211> 574

<212> PRT<212> PRT

<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens

<400> 6<400> 6

Met Ser Ile Gln Glu Asn Ile Ser Ser Leu Gln Leu Arg Ser Trp Val Met Ser Ile Gln Glu Asn Ile Ser Ser Leu Gln Leu Arg Ser Trp Val

1 5 10 15 1 5 10 15

Ser Lys Ser Gln Arg Asp Leu Ala Lys Ser Ile Leu Ile Gly Ala Pro Ser Lys Ser Gln Arg Asp Leu Ala Lys Ser Ile Leu Ile Gly Ala Pro

20 25 30 20 25 30

Gly Gly Pro Ala Gly Tyr Leu Arg Arg Ala Ser Val Ala Gln Leu Thr Gly Gly Pro Ala Gly Tyr Leu Arg Arg Ala Ser Val Ala Gln Leu Thr

35 40 45 35 40 45

Gln Glu Leu Gly Thr Ala Phe Phe Gln Gln Gln Gln Leu Pro Ala Ala Gln Glu Leu Gly Thr Ala Phe Phe Gln Gln Gln Gln Leu Pro Ala Ala

50 55 60 50 55 60

Met Ala Asp Thr Phe Leu Glu His Leu Cys Leu Leu Asp Ile Asp Ser Met Ala Asp Thr Phe Leu Glu His Leu Cys Leu Leu Asp Ile Asp Ser

65 70 75 80 65 70 75 80

Glu Pro Val Ala Ala Arg Ser Thr Ser Ile Ile Ala Thr Ile Gly Pro Glu Pro Val Ala Ala Arg Ser Thr Ser Ile Ile Ala Thr Ile Gly Pro

85 90 95 85 90 95

Ala Ser Arg Ser Val Glu Arg Leu Lys Glu Met Ile Lys Ala Gly Met Ala Ser Arg Ser Val Glu Arg Leu Lys Glu Met Ile Lys Ala Gly Met

100 105 110 100 105 110

Asn Ile Ala Arg Leu Asn Phe Ser His Gly Ser His Glu Tyr His Ala Asn Ile Ala Arg Leu Asn Phe Ser His Gly Ser His Glu Tyr His Ala

115 120 125 115 120 125

Glu Ser Ile Ala Asn Val Arg Glu Ala Val Glu Ser Phe Ala Gly Ser Glu Ser Ile Ala Asn Val Arg Glu Ala Val Glu Ser Phe Ala Gly Ser

130 135 140 130 135 140

Pro Leu Ser Tyr Arg Pro Val Ala Ile Ala Leu Asp Thr Lys Gly Pro Pro Leu Ser Tyr Arg Pro Val Ala Ile Ala Leu Asp Thr Lys Gly Pro

145 150 155 160 145 150 155 160

Glu Ile Arg Thr Gly Ile Leu Gln Gly Gly Pro Glu Ser Glu Val Glu Glu Ile Arg Thr Gly Ile Leu Gln Gly Gly Pro Glu Ser Glu Val Glu

165 170 175 165 170 175

Leu Val Lys Gly Ser Gln Val Leu Val Thr Val Asp Pro Ala Phe Arg Leu Val Lys Gly Ser Gln Val Leu Val Thr Val Asp Pro Ala Phe Arg

180 185 190 180 185 190

Thr Arg Gly Asn Ala Asn Thr Val Trp Val Asp Tyr Pro Asn Ile Val Thr Arg Gly Asn Ala Asn Thr Val Trp Val Asp Tyr Pro Asn Ile Val

195 200 205 195 200 205

Arg Val Val Pro Val Gly Gly Arg Ile Tyr Ile Asp Asp Gly Leu Ile Arg Val Val Pro Val Gly Gly Arg Ile Tyr Ile Asp Asp Gly Leu Ile

210 215 220 210 215 220

Ser Leu Val Val Gln Lys Ile Gly Pro Glu Gly Leu Val Thr Gln Val Ser Leu Val Val Gln Lys Ile Gly Pro Glu Gly Leu Val Thr Gln Val

225 230 235 240 225 230 235 240

Glu Asn Gly Gly Val Leu Gly Ser Arg Lys Gly Val Asn Leu Pro Gly Glu Asn Gly Gly Val Leu Gly Ser Arg Lys Gly Val Asn Leu Pro Gly

245 250 255 245 250 255

Ala Gln Val Asp Leu Pro Gly Leu Ser Glu Gln Asp Val Arg Asp Leu Ala Gln Val Asp Leu Pro Gly Leu Ser Glu Gln Asp Val Arg Asp Leu

260 265 270 260 265 270

Arg Phe Gly Val Glu His Gly Val Asp Ile Val Phe Ala Ser Phe Val Arg Phe Gly Val Glu His Gly Val Asp Ile Val Phe Ala Ser Phe Val

275 280 285 275 280 285

Arg Lys Ala Ser Asp Val Ala Ala Val Arg Ala Ala Leu Gly Pro Glu Arg Lys Ala Ser Asp Val Ala Ala Val Arg Ala Ala Leu Gly Pro Glu

290 295 300 290 295 300

Gly His Gly Ile Lys Ile Ile Ser Lys Ile Glu Asn His Glu Gly Val Gly His Gly Ile Lys Ile Ile Ser Lys Ile Glu Asn His Glu Gly Val

305 310 315 320 305 310 315 320

Lys Arg Phe Asp Glu Ile Leu Glu Val Ser Asp Gly Ile Met Val Ala Lys Arg Phe Asp Glu Ile Leu Glu Val Ser Asp Gly Ile Met Val Ala

325 330 335 325 330 335

Arg Gly Asp Leu Gly Ile Glu Ile Pro Ala Glu Lys Val Phe Leu Ala Arg Gly Asp Leu Gly Ile Glu Ile Pro Ala Glu Lys Val Phe Leu Ala

340 345 350 340 345 350

Gln Lys Met Met Ile Gly Arg Cys Asn Leu Ala Gly Lys Pro Val Val Gln Lys Met Met Ile Gly Arg Cys Asn Leu Ala Gly Lys Pro Val Val

355 360 365 355 360 365

Cys Ala Thr Gln Met Leu Glu Ser Met Ile Thr Lys Pro Arg Pro Thr Cys Ala Thr Gln Met Leu Glu Ser Met Ile Thr Lys Pro Arg Pro Thr

370 375 380 370 375 380

Arg Ala Glu Thr Ser Asp Val Ala Asn Ala Val Leu Asp Gly Ala Asp Arg Ala Glu Thr Ser Asp Val Ala Asn Ala Val Leu Asp Gly Ala Asp

385 390 395 400 385 390 395 400

Cys Ile Met Leu Ser Gly Glu Thr Ala Lys Gly Asn Phe Pro Val Glu Cys Ile Met Leu Ser Gly Glu Thr Ala Lys Gly Asn Phe Pro Val Glu

405 410 415 405 410 415

Ala Val Lys Met Gln His Ala Ile Ala Arg Glu Ala Glu Ala Ala Val Ala Val Lys Met Gln His Ala Ile Ala Arg Glu Ala Glu Ala Ala Val

420 425 430 420 425 430

Tyr His Arg Gln Leu Phe Glu Glu Leu Arg Arg Ala Ala Pro Leu Ser Tyr His Arg Gln Leu Phe Glu Glu Leu Arg Arg Ala Ala Pro Leu Ser

435 440 445 435 440 445

Arg Asp Pro Thr Glu Val Thr Ala Ile Gly Ala Val Glu Ala Ala Phe Arg Asp Pro Thr Glu Val Thr Ala Ile Gly Ala Val Glu Ala Ala Phe

450 455 460 450 455 460

Lys Cys Cys Ala Ala Ala Ile Ile Val Leu Thr Thr Thr Gly Arg Ser Lys Cys Cys Ala Ala Ala Ile Ile Val Leu Thr Thr Thr Gly Arg Ser

465 470 475 480 465 470 475 480

Ala Gln Leu Leu Ser Arg Tyr Arg Pro Arg Ala Ala Val Ile Ala Val Ala Gln Leu Leu Ser Arg Tyr Arg Pro Arg Ala Ala Val Ile Ala Val

485 490 495 485 490 495

Thr Arg Ser Ala Gln Ala Ala Arg Gln Val His Leu Cys Arg Gly Val Thr Arg Ser Ala Gln Ala Ala Arg Gln Val His Leu Cys Arg Gly Val

500 505 510 500 505 510

Phe Pro Leu Leu Tyr Arg Glu Pro Pro Glu Ala Ile Trp Ala Asp Asp Phe Pro Leu Leu Tyr Arg Glu Pro Pro Glu Ala Ile Trp Ala Asp Asp

515 520 525 515 520 525

Val Asp Arg Arg Val Gln Phe Gly Ile Glu Ser Gly Lys Leu Arg Gly Val Asp Arg Arg Val Gln Phe Gly Ile Glu Ser Gly Lys Leu Arg Gly

530 535 540 530 535 540

Phe Leu Arg Val Gly Asp Leu Val Ile Val Val Thr Gly Trp Arg Pro Phe Leu Arg Val Gly Asp Leu Val Ile Val Val Thr Gly Trp Arg Pro

545 550 555 560 545 550 555 560

Gly Ser Gly Tyr Thr Asn Ile Met Arg Val Leu Ser Ile Ser Gly Ser Gly Tyr Thr Asn Ile Met Arg Val Leu Ser Ile Ser

565 570 565 570

<210> 7<210> 7

<211> 1233<211> 1233

<212> DNA<212> DNA

<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence

<220><220>

<223> PKLR polynucloetide seqeunce<223> PKLR polynucloetide seqeunce

<400> 7<400> 7

atggtctgct tcagactgtt ccctgtccct ggatctggtc tggtgcttgt gtgcttggtg 60atggtctgct tcagactgtt ccctgtccct ggatctggtc tggtgcttgt gtgcttggtg 60

ctgggtgctg tgagatccta tgcccttgag ctgaacctga ctgactcaga aaatgccact 120ctgggtgctg tgagatccta tgcccttgag ctgaacctga ctgactcaga aaatgccact 120

tgcctgtatg ccaagtggca gatgaacttc actgtgagat atgagactac caacaagacc 180tgcctgtatg ccaagtggca gatgaacttc actgtgagat atgagactac caacaagacc 180

tacaagactg tgaccatctc agaccatggc actgtcacct acaatggatc aatctgtggt 240tacaagactg tgaccatctc agaccatggc actngtcacct acaatggatc aatctgtggt 240

gatgatcaga atggcccaaa gatagcagtg cagtttgggc ccggtttttc ctggattgct 300gatgatcaga atggcccaaa gatagcagtg cagtttgggc ccggtttttc ctggattgct 300

aacttcacca aggcagcctc cacctacagc attgactcag tcagcttcag ctacaacact 360aacttcacca aggcagcctc cacctacagc attgactcag tcagcttcag ctacaacact 360

ggggataaca ccaccttccc tgacgcagag gacaagggaa tccttactgt ggacgaactc 420ggggataaca ccaccttccc tgacgcagag gacaagggaa tccttactgt ggacgaactc 420

ctggcaatca gaatccccct taacgacctg ttcagatgca actccctttc aacccttgaa 480ctggcaatca gaatccccct taacgacctg ttcagatgca actccctttc aacccttgaa 480

aagaatgatg tggtgcaaca ctattgggac gtcctggtgc aagcctttgt gcagaatggg 540aagaatgatg tggtgcaaca ctattgggac gtcctggtgc aagcctttgt gcagaatggg 540

acagtgagta ccaacgagtt cctctgtgac aaggacaaga ccagcactgt ggcccccact 600acagtgagta ccaacgagtt cctctgtgac aaggacaaga ccagcactgt ggcccccact 600

atccacacca ctgtgcccag ccctaccact acccccaccc ctaaagagaa gccagaagct 660atccacacca ctgtgcccag ccctaccact acccccaccc ctaaagagaa gccagaagct 660

ggaacctact cagtcaacaa tggaaatgac acatgcctcc ttgccaccat gggactgcag 720ggaacctact cagtcaacaa tggaaatgac acatgcctcc ttgccaccat gggactgcag 720

ctgaacatca ctcaggacaa ggtggcctca gtgattaaca tcaaccctaa caccactcat 780ctgaacatca ctcaggacaa ggtggcctca gtgattaaca tcaaccctaa caccactcat 780

agcactggga gctgcagatc acatacagct ctgctgaggc tcaactcctc caccatcaag 840agcactggga gctgcagatc acatacagct ctgctgaggc tcaactcctc caccatcaag 840

tacctggact ttgtgtttgc tgtgaagaat gagaacaggt tctacctcaa ggaagtgaac 900tacctggact ttgtgtttgc tgtgaagaat gagaacaggt tctacctcaa ggaagtgaac 900

atttccatgt acctggtcaa tggttcagtg ttctctattg ccaacaacaa tctgagctac 960atttccatgt acctggtcaa tggttcagtg ttctctattg ccaacaacaa tctgagctac 960

tgggatgcac ccctgggatc ctcctacatg tgcaacaagg agcagactgt gagtgtgtca 1020tgggatgcac ccctgggatc ctcctacatg tgcaacaagg agcagactgt gagtgtgtca 1020

ggtgcttttc agatcaacac ttttgacctg agggtgcagc ccttcaatgt gactcaggga 1080ggtgcttttc agatcaacac ttttgacctg agggtgcagc ccttcaatgt gactcaggga 1080

aagtactcca ctgcacaaga gtgttccttg gatgatgaca ctatcctcat ccccattatt 1140aagtactcca ctgcacaaga gtgttccttg gatgatgaca ctatcctcat ccccattatt 1140

gtgggagctg gactgtcagg attgattata gtgattgtga ttgcttatgt gattggaagg 1200gtgggagctg gactgtcagg attgattata gtgattgtga ttgcttatgt gattggaagg 1200

agaaagagct atgctggcta ccagaccctg taa 1233agaaagagct atgctggcta ccagaccctg taa 1233

<210> 8<210> 8

<211> 1233<211> 1233

<212> DNA<212> DNA

<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence

<220><220>

<223> PKLR polynucloetide seqeunce<223> PKLR polynucloetide seqeunce

<400> 8<400> 8

atggtgtgct ttagactgtt tcctgtgcct ggttcagggc tggtcctggt ctgtctggtg 60atggtgtgct ttagactgtt tcctgtgcct ggttcagggc tggtcctggt ctgtctggtg 60

ctgggggctg tcagaagcta tgccttggag ctgaacctca ctgatagtga aaatgccact 120ctggggggctg tcagaagcta tgccttggag ctgaacctca ctgatagtga aaatgccact 120

tgtctgtatg ctaagtggca gatgaacttc actgtgagat atgaaaccac caacaagact 180tgtctgtatg ctaagtggca gatgaacttc actngtgagat atgaaaccac caacaagact 180

tacaaaacag tgaccatctc agatcatgga actgtgacct acaacggcag catttgtgga 240tacaaaacag tgaccatctc agatcatgga actgtgacct acaacggcag catttgtgga 240

gacgaccaga acggaccaaa aatcgctgtc caatttgggc ctggattctc ctggattgcc 300gacgaccaga acggaccaaa aatcgctgtc caatttgggc ctggattctc ctggattgcc 300

aatttcacta aagctgcctc cacatattca attgactcag tgtccttctc ctacaacact 360aatttcacta aagctgcctc cacatattca attgactcag tgtccttctc ctacaacact 360

ggggacaaca ctactttccc tgatgctgaa gataagggaa tcttgacagt ggatgagctg 420ggggacaaca ctactttccc tgatgctgaa gataagggaa tcttgacagt ggatgagctg 420

ctggctatca ggatcccttt gaatgacctg tttaggtgta attcactgag cactctggag 480ctggctatca ggatcccttt gaatgacctg tttaggtgta attcactgag cactctggag 480

aagaacgacg tggtgcagca ctactgggac gtgctggtgc aggcctttgt gcagaacggc 540aagaacgacg tggtgcagca ctactgggac gtgctggtgc aggcctttgt gcagaacggc 540

actgtgtcca ccaacgaatt cctgtgtgat aaggacaaaa cttccactgt ggcacctaca 600actgtgtcca ccaacgaatt cctgtgtgat aaggacaaaa cttccactgt ggcacctaca 600

attcacacta ctgtgccttc acctaccacc actccaactc caaaggaaaa gcctgaagca 660attcacacta ctgtgccttc acctaccacc actccaactc caaaggaaaa gcctgaagca 660

ggaacctact ctgtgaacaa tggcaatgat acctgtctgt tggccaccat gggcctccaa 720ggaacctact ctgtgaacaa tggcaatgat acctgtctgt tggccaccat gggcctccaa 720

ctgaacatta ctcaggacaa ggtggcctca gtgattaaca ttaaccccaa cactacccac 780ctgaacatta ctcaggacaa ggtggcctca gtgattaaca ttaaccccaa cactacccac 780

tccactggca gctgtagatc acacacagcc ttgctcagac tgaatagcag caccatcaag 840tccactggca gctgtagatc acacacagcc ttgctcagac tgaatagcag caccatcaag 840

tatttggatt ttgtgtttgc agtgaagaat gaaaacaggt tctacctgaa ggaagtcaac 900tatttggatt ttgtgtttgc agtgaagaat gaaaacaggt tctacctgaa ggaagtcaac 900

atctcaatgt acctggtgaa cggctcagtg ttcagcattg ccaacaacaa cctctcctat 960atctcaatgt acctggtgaa cggctcagtg ttcagcattg ccaacaacaa cctctcctat 960

tgggacgctc cactggggag cagctacatg tgtaacaagg aacagactgt gtcagtgtca 1020tgggacgctc cactggggag cagctacatg tgtaacaagg aacagactgt gtcagtgtca 1020

ggagccttcc agattaacac ctttgatctg agggtccaac cctttaatgt cactcaagga 1080ggagccttcc agattaacac ctttgatctg agggtccaac cctttaatgt cactcaagga 1080

aagtatagca ctgcccagga gtgctccctg gatgatgaca ccattctgat tccaatcatt 1140aagtatagca ctgcccagga gtgctccctg gatgatgaca ccattctgat tccaatcatt 1140

gtgggtgcag gactttctgg gcttattatt gtgattgtga ttgcctatgt gattggcaga 1200gtgggtgcag gactttctgg gcttattatt gtgattgtga ttgcctatgt gattggcaga 1200

aggaaatcct atgcagggta ccaaactctg taa 1233aggaaatcct atgcagggta ccaaactctg taa 1233

<210> 9<210> 9

<211> 1233<211> 1233

<212> DNA<212> DNA

<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence

<220><220>

<223> PKLR polynucloetide seqeunce<223> PKLR polynucloetide seqeunce

<400> 9<400> 9

atggtctgtt ttaggctgtt ccctgtccct ggttcaggac tggtcttagt gtgtctggtg 60atggtctgtt ttaggctgtt ccctgtccct ggttcaggac tggtcttagt gtgtctggtg 60

cttggagctg tcagaagcta tgccctggag ctgaacctga ctgactcaga aaatgccact 120cttggagctg tcagaagcta tgccctggag ctgaacctga ctgactcaga aaatgccact 120

tgcctgtatg ccaagtggca gatgaacttc actgtcagat atgaaaccac caacaagacc 180tgcctgtatg ccaagtggca gatgaacttc actgtcagat atgaaaccac caacaagacc 180

tataagactg tgaccatctc agaccatggc actgtgactt acaatgggtc aatttgtgga 240tataagactg tgaccatctc agaccatggc actgtgactt acaatgggtc aatttgtgga 240

gatgaccaga atggccctaa gatagctgtc cagtttggtc caggattcag ctggattgcc 300gatgaccaga atggccctaa gatagctgtc cagtttggtc caggattcag ctggattgcc 300

aacttcacca aggcagccag cacctacagc attgactctg tgtccttctc ctacaacaca 360aacttcacca aggcagccag cacctacagc attgactctg tgtccttctc ctacaacaca 360

ggagacaaca ccactttccc tgatgcagag gacaaaggta tcctgactgt ggatgagttg 420ggagacaaca ccactttccc tgatgcagag gacaaaggta tcctgactgt ggatgagttg 420

ctggcaatca ggatcccact gaacgatctg ttcaggtgca actcactgtc cactctggaa 480ctggcaatca ggatcccact gaacgatctg ttcaggtgca actcactgtc cactctggaa 480

aagaatgatg tggtgcagca ctattgggat gtgctagtcc aggcctttgt ccagaatggg 540aagaatgatg tggtgcagca ctattgggat gtgctagtcc aggcctttgt ccagaatggg 540

actgtgtcaa ctaatgagtt cctgtgtgac aaggacaaga caagcactgt agcccccact 600actgtgtcaa ctaatgagtt cctgtgtgac aaggacaaga caagcactgt agcccccact 600

atccatacca cagtacctag ccccaccact actccaaccc ccaaggagaa gcctgaggct 660atccatacca cagtacctag ccccaccact actccaaccc ccaaggagaa gcctgaggct 660

ggcacctact cagtgaacaa tgggaatgac acctgtttgc tggccactat gggactccaa 720ggcacctact cagtgaacaa tgggaatgac acctgtttgc tggccactat gggactccaa 720

ctgaacatca cccaggacaa agtggcctct gtgatcaata tcaatcccaa caccacccac 780ctgaacatca cccaggacaa agtggcctct gtgatcaata tcaatcccaa caccacccac 780

agcactgggt cctgcagaag ccacactgcc ctcctgaggc tcaactcatc aactatcaag 840agcactgggt cctgcagaag cccacactgcc ctcctgaggc tcaactcatc aactatcaag 840

tacttggatt ttgtgtttgc agtgaagaat gagaacagat tctacctcaa agaggtcaac 900tacttggatt ttgtgtttgc agtgaagaat gagaacagat tctacctcaa agaggtcaac 900

atttcaatgt acctggtgaa tgggagtgtg ttctccattg ctaacaacaa cctgagctac 960atttcaatgt acctggtgaa tgggagtgtg ttctccatg ctaacaacaa cctgagctac 960

tgggatgccc ctctgggctc ctcatacatg tgcaacaagg aacagactgt gagtgtgtca 1020tgggatgccc ctctgggctc ctcatacatg tgcaacaagg aacagactgt gagtgtgtca 1020

ggggccttcc agatcaacac ttttgacctg agagtgcagc cctttaatgt gacacaggga 1080ggggccttcc agatcaacac ttttgacctg agagtgcagc cctttaatgt gacacaggga 1080

aagtacagca ctgctcagga gtgcagcctg gatgatgaca ctatcctgat ccctatcatt 1140aagtacagca ctgctcagga gtgcagcctg gatgatgaca ctatcctgat ccctatcatt 1140

gtgggggcag gcctgtctgg actcattatt gtgattgtga ttgcctatgt gatagggaga 1200gtggggggcag gcctgtctgg actcattatt gtgattgtga ttgcctatgt gatagggaga 1200

aggaagtctt atgctggata ccagaccctg taa 1233aggaagtctt atgctggata ccagaccctg taa 1233

<210> 10<210> 10

<211> 3384<211> 3384

<212> DNA<212> DNA

<213> Artificial Sequence<213> Artificial Sequence

<220><220>

<223> pRRL.PPT.EFS.tcirg1h.wpre vector sequence<223> pRRL.PPT.EFS.tcirg1h.wpre vector sequence

<400> 10<400> 10

ggctccggtg cccgtcagtg ggcagagcgc acatcgccca cagtccccga gaagttgggg 60ggctccggtg cccgtcagtg ggcagagcgc acatcgccca cagtccccga gaagttgggg 60

ggaggggtcg gcaattgaac cggtgcctag agaaggtggc gcggggtaaa ctgggaaagt 120ggaggggtcg gcaattgaac cggtgcctag agaaggtggc gcggggtaaa ctgggaaagt 120

gatgtcgtgt actggctccg cctttttccc gagggtgggg gagaaccgta tataagtgca 180gatgtcgtgt actggctccg cctttttccc gagggtgggg gagaaccgta tataagtgca 180

gtagtcgccg tgaacgttct ttttcgcaac gggtttgccg ccagaacaca ggtgtcgtga 240gtagtcgccg tgaacgttct ttttcgcaac gggtttgccg ccagaacaca ggtgtcgtga 240

cgcgggatcc gccaccatgg gctccatgtt tcggagcgag gaggtggccc tggtccagct 300cgcgggatcc gccaccatgg gctccatgtt tcggagcgag gaggtggccc tggtccagct 300

ctttctgccc acagcggctg cctacacctg cgtgagtcgg ctgggcgagc tgggcctcgt 360ctttctgccc acagcggctg cctacacctg cgtgagtcgg ctgggcgagc tgggcctcgt 360

ggagttcaga gacctcaacg cctcggtgag cgccttccag agacgctttg tggttgatgt 420ggagttcaga gacctcaacg cctcggtgag cgccttccag agacgctttg tggttgatgt 420

tcggcgctgt gaggagctgg agaagacctt caccttcctg caggaggagg tgcggcgggc 480tcggcgctgt gaggagctgg agaagacctt caccttcctg caggaggagg tgcggcgggc 480

tgggctggtc ctgcccccgc caaaggggag gctgccggca cccccacccc gggacctgct 540tgggctggtc ctgcccccgc caaaggggag gctgccggca cccccacccc gggacctgct 540

gcgcatccag gaggagacgg agcgcctggc ccaggagctg cgggatgtgc ggggcaacca 600gcgcatccag gaggacgg agcgcctggc ccaggagctg cgggatgtgc ggggcaacca 600

gcaggccctg cgggcccagc tgcaccagct gcagctccac gccgccgtgc tacgccaggg 660gcaggccctg cgggcccagc tgcaccagct gcagctccac gccgccgtgc tacgccaggg 660

ccatgaacct cagctggcag ccgcccacac agatggggcc tcagagagga cgcccctgct 720ccatgaacct cagctggcag ccgcccacac agatggggcc tcagagagga cgcccctgct 720

ccaggccccc ggggggccgc accaggacct gagggtcaac tttgtggcag gtgccgtgga 780ccaggccccc ggggggccgc accaggacct gagggtcaac tttgtggcag gtgccgtgga 780

gccccacaag gcccctgccc tagagcgcct gctctggagg gcctgcagag gcttcctcat 840gccccacaag gcccctgccc tagagcgcct gctctggagg gcctgcagag gcttcctcat 840

tgccagcttc agggagctgg agcagccgct ggagcacccc gtgacgggcg agccagccac 900tgccagcttc agggagctgg agcagccgct ggagcacccc gtgacgggcg agccagccac 900

gtggatgacc ttcctcatct cctactgggg tgagcagatc ggacagaaga tccgcaagat 960gtggatgacc ttcctcatct cctactgggg tgagcagatc ggacagaaga tccgcaagat 960

cacggactgc ttccactgcc acgtcttccc gtttctgcag caggaggagg cccgcctcgg 1020cacggactgc ttccactgcc acgtcttccc gtttctgcag caggaggagg cccgcctcgg 1020

ggccctgcag cagctgcaac agcagagcca ggagctgcag gaggtcctcg gggagacaga 1080ggccctgcag cagctgcaac agcagagcca ggagctgcag gaggtcctcg ggggacaga 1080

gcggttcctg agccaggtgc taggccgggt gctgcagctg ctgccgccag ggcaggtgca 1140gcggttcctg agccaggtgc taggccgggt gctgcagctg ctgccgccag ggcaggtgca 1140

ggtccacaag atgaaggccg tgtacctggc cctgaaccag tgcagcgtga gcaccacgca 1200ggtccacaag atgaaggccg tgtacctggc cctgaaccag tgcagcgtga gcaccacgca 1200

caagtgcctc attgccgagg cctggtgctc tgtgcgagac ctgcccgccc tgcaggaggc 1260caagtgcctc attgccgagg cctggtgctc tgtgcgagac ctgcccgccc tgcaggaggc 1260

cctgcgggac agctcgatgg aggagggagt gagtgccgtg gctcaccgca tcccctgccg 1320cctgcgggac agctcgatgg aggagggagt gagtgccgtg gctcaccgca tcccctgccg 1320

ggacatgccc cccacactca tccgcaccaa ccgcttcacg gccagcttcc agggcatcgt 1380ggacatgccc cccacactca tccgcaccaa ccgcttcacg gccagcttcc agggcatcgt 1380

ggatgcctac ggcgtgggcc gctaccagga ggtcaacccc gctccctaca ccatcatcac 1440ggatgcctac ggcgtgggcc gctaccagga ggtcaacccc gctccctaca ccatcatcac 1440

cttccccttc ctgtttgctg tgatgttcgg ggatgtgggc cacgggctgc tcatgttcct 1500cttccccttc ctgtttgctg tgatgttcgg ggatgtgggc cacgggctgc tcatgttcct 1500

cttcgccctg gccatggtcc ttgcggagaa ccgaccggct gtgaaggccg cgcagaacga 1560cttcgccctg gccatggtcc ttgcggagaa ccgaccggct gtgaaggccg cgcagaacga 1560

gatctggcag actttcttca ggggccgcta cctgctcctg cttatgggcc tgttctccat 1620gatctggcag actttcttca ggggccgcta cctgctcctg cttatgggcc tgttctccat 1620

ctacaccggc ttcatctaca acgagtgctt cagtcgcgcc accagcatct tcccctcggg 1680ctacaccggc ttcatctaca acgagtgctt cagtcgcgcc accagcatct tcccctcggg 1680

ctggagtgtg gccgccatgg ccaaccagtc tggctggagt gatgcattcc tggcccagca 1740ctggagtgtg gccgccatgg ccaaccagtc tggctggagt gatgcattcc tggcccagca 1740

cacgatgctt accctggacc ccaacgtcac cggtgtcttc ctgggaccct acccctttgg 1800cacgatgctt accctggacc ccaacgtcac cggtgtcttc ctgggaccct acccctttgg 1800

catcgatcct atttggagcc tggctgccaa ccacttgagc ttcctcaact ccttcaagat 1860catcgatcct atttggagcc tggctgccaa ccacttgagc ttcctcaact ccttcaagat 1860

gaagatgtcc gtcatcctgg gcgtcgtgca catggccttt ggggtggtcc tcggagtctt 1920gaagatgtcc gtcatcctgg gcgtcgtgca catggccttt ggggtggtcc tcggagtctt 1920

caaccacgtg cactttggcc agaggcaccg gctgctgctg gagacgctgc cggagctcac 1980caaccacgtg cactttggcc agaggcaccg gctgctgctg gagacgctgc cggagctcac 1980

cttcctgctg ggactcttcg gttacctcgt gttcctagtc atctacaagt ggctgtgtgt 2040cttcctgctg ggactcttcg gttacctcgt gttcctagtc atctacaagt ggctgtgtgt 2040

ctgggctgcc agggccgcct cggcccccag catcctcatc cacttcatca acatgttcct 2100ctgggctgcc agggccgcct cggcccccag catcctcatc cacttcatca acatgttcct 2100

cttctcccac agccccagca acaggctgct ctacccccgg caggaggtgg tccaggccac 2160cttctcccac agccccagca acaggctgct ctacccccgg caggaggtgg tccaggccac 2160

gctggtggtc ctggccttgg ccatggtgcc catcctgctg cttggcacac ccctgcacct 2220gctggtggtc ctggccttgg ccatggtgcc catcctgctg cttggcacac ccctgcacct 2220

gctgcaccgc caccgccgcc gcctgcggag gaggcccgct gaccgacagg aggaaaacaa 2280gctgcaccgc caccgccgcc gcctgcggag gaggcccgct gaccgacagg aggaaaacaa 2280

ggccgggttg ctggacctgc ctgacgcatc tgtgaatggc tggagctccg atgaggaaaa 2340ggccgggttg ctggacctgc ctgacgcatc tgtgaatggc tggagctccg atgaggaaaa 2340

ggcagggggc ctggatgatg aagaggaggc cgagctcgtc ccctccgagg tgctcatgca 2400ggcaggggggc ctggatgatg aagaggaggc cgagctcgtc ccctccgagg tgctcatgca 2400

ccaggccatc cacaccatcg agttctgcct gggctgcgtc tccaacaccg cctcctacct 2460ccaggccatc cacaccatcg agttctgcct gggctgcgtc tccaacaccg cctcctacct 2460

gcgcctgtgg gccctgagcc tggcccacgc ccagctgtcc gaggttctgt gggccatggt 2520gcgcctgtgg gccctgagcc tggcccacgc ccagctgtcc gaggttctgt gggccatggt 2520

gatgcgcata ggcctgggcc tgggccggga ggtgggcgtg gcggctgtgg tgctggtccc 2580gatgcgcata ggcctgggcc tgggccggga ggtgggcgtg gcggctgtgg tgctggtccc 2580

catctttgcc gcctttgccg tgatgaccgt ggctatcctg ctggtgatgg agggactctc 2640catctttgcc gcctttgccg tgatgaccgt ggctatcctg ctggtgatgg agggactctc 2640

agccttcctg cacgccctgc ggctgcactg ggtggaattc cagaacaagt tctactcagg 2700agccttcctg cacgccctgc ggctgcactg ggtggaattc cagaacaagt tctactcagg 2700

cacgggctac aagctgagtc ccttcacctt cgctgccaca gatgactagt aagtcgacgg 2760cacgggctac aagctgagtc ccttcacctt cgctgccaca gatgactagt aagtcgacgg 2760

atcccccggg ctgcaggaat tcgagcatct taccgccatt tatacccata tttgttctgt 2820atcccccggg ctgcaggaat tcgagcatct taccgccatt tatacccata tttgttctgt 2820

ttttcttgat ttgggtatac atttaaatgt taataaaaca aaatggtggg gcaatcattt 2880ttttcttgat ttgggtatac atttaaatgt taataaaaca aaatggtggg gcaatcattt 2880

acatttttag ggatatgtaa ttactagttc aggtgtattg ccacaagaca aacatgttaa 2940acatttttag ggatatgtaa ttactagttc aggtgtattg ccacaagaca aacatgttaa 2940

gaaactttcc cgttatttac gctctgttcc tgttaatcaa cctctggatt acaaaatttg 3000gaaactttcc cgttatttac gctctgttcc tgttaatcaa cctctggatt acaaaatttg 3000

tgaaagattg actgatattc ttaactatgt tgctcctttt acgctgtgtg gatatgctgc 3060tgaaagattg actgatattc ttaactatgt tgctcctttt acgctgtgtg gatatgctgc 3060

tttaatgcct ctgtatcatg ctattgcttc ccgtacggct ttcgttttct cctccttgta 3120tttaatgcct ctgtatcatg ctattgcttc ccgtacggct ttcgttttct cctccttgta 3120

taaatcctgg ttgctgtctc tttatgagga gttgtggccc gttgtccgtc aacgtggcgt 3180taaatcctgg ttgctgtctc tttatgagga gttgtggccc gttgtccgtc aacgtggcgt 3180

ggtgtgctct gtgtttgctg acgcaacccc cactggctgg ggcattgcca ccacctgtca 3240ggtgtgctct gtgtttgctg acgcaacccc cactggctgg ggcattgcca ccacctgtca 3240

actcctttct gggactttcg ctttccccct cccgatcgcc acggcagaac tcatcgccgc 3300actcctttct gggactttcg ctttccccct cccgatcgcc acggcagaac tcatcgccgc 3300

ctgccttgcc cgctgctgga caggggctag gttgctgggc actgataatt ccgtggtgtt 3360ctgccttgcc cgctgctgga caggggctag gttgctgggc actgataatt ccgtggtgtt 3360

gtcggggaag ctgacgtcct ttcg 3384gtcggggaag ctgacgtcct ttcg 3384

<210> 11<210> 11

<211> 830<211> 830

<212> PRT<212> PRT

<213> Homo sapiens<213> Homo sapiens

<400> 11<400> 11

Met Gly Ser Met Phe Arg Ser Glu Glu Val Ala Leu Val Gln Leu Phe Met Gly Ser Met Phe Arg Ser Glu Glu Val Ala Leu Val Gln Leu Phe

1 5 10 15 1 5 10 15

Leu Pro Thr Ala Ala Ala Tyr Thr Cys Val Ser Arg Leu Gly Glu Leu Leu Pro Thr Ala Ala Ala Tyr Thr Cys Val Ser Arg Leu Gly Glu Leu

20 25 30 20 25 30

Gly Leu Val Glu Phe Arg Asp Leu Asn Ala Ser Val Ser Ala Phe Gln Gly Leu Val Glu Phe Arg Asp Leu Asn Ala Ser Val Ser Ala Phe Gln

35 40 45 35 40 45

Arg Arg Phe Val Val Asp Val Arg Arg Cys Glu Glu Leu Glu Lys Thr Arg Arg Phe Val Val Asp Val Arg Arg Cys Glu Glu Leu Glu Lys Thr

50 55 60 50 55 60

Phe Thr Phe Leu Gln Glu Glu Val Arg Arg Ala Gly Leu Val Leu Pro Phe Thr Phe Leu Gln Glu Glu Val Arg Arg Ala Gly Leu Val Leu Pro

65 70 75 80 65 70 75 80

Pro Pro Lys Gly Arg Leu Pro Ala Pro Pro Pro Arg Asp Leu Leu Arg Pro Pro Lys Gly Arg Leu Pro Ala Pro Pro Pro Arg Asp Leu Leu Arg

85 90 95 85 90 95

Ile Gln Glu Glu Thr Glu Arg Leu Ala Gln Glu Leu Arg Asp Val Arg Ile Gln Glu Glu Thr Glu Arg Leu Ala Gln Glu Leu Arg Asp Val Arg

100 105 110 100 105 110

Gly Asn Gln Gln Ala Leu Arg Ala Gln Leu His Gln Leu Gln Leu His Gly Asn Gln Gln Ala Leu Arg Ala Gln Leu His Gln Leu Gln Leu His

115 120 125 115 120 125

Ala Ala Val Leu Arg Gln Gly His Glu Pro Gln Leu Ala Ala Ala His Ala Ala Val Leu Arg Gln Gly His Glu Pro Gln Leu Ala Ala Ala His

130 135 140 130 135 140

Thr Asp Gly Ala Ser Glu Arg Thr Pro Leu Leu Gln Ala Pro Gly Gly Thr Asp Gly Ala Ser Glu Arg Thr Pro Leu Leu Gln Ala Pro Gly Gly

145 150 155 160 145 150 155 160

Pro His Gln Asp Leu Arg Val Asn Phe Val Ala Gly Ala Val Glu Pro Pro His Gln Asp Leu Arg Val Asn Phe Val Ala Gly Ala Val Glu Pro

165 170 175 165 170 175

His Lys Ala Pro Ala Leu Glu Arg Leu Leu Trp Arg Ala Cys Arg Gly His Lys Ala Pro Ala Leu Glu Arg Leu Leu Trp Arg Ala Cys Arg Gly

180 185 190 180 185 190

Phe Leu Ile Ala Ser Phe Arg Glu Leu Glu Gln Pro Leu Glu His Pro Phe Leu Ile Ala Ser Phe Arg Glu Leu Glu Gln Pro Leu Glu His Pro

195 200 205 195 200 205

Val Thr Gly Glu Pro Ala Thr Trp Met Thr Phe Leu Ile Ser Tyr Trp Val Thr Gly Glu Pro Ala Thr Trp Met Thr Phe Leu Ile Ser Tyr Trp

210 215 220 210 215 220

Gly Glu Gln Ile Gly Gln Lys Ile Arg Lys Ile Thr Asp Cys Phe His Gly Glu Gln Ile Gly Gln Lys Ile Arg Lys Ile Thr Asp Cys Phe His

225 230 235 240 225 230 235 240

Cys His Val Phe Pro Phe Leu Gln Gln Glu Glu Ala Arg Leu Gly Ala Cys His Val Phe Pro Phe Leu Gln Gln Glu Glu Ala Arg Leu Gly Ala

245 250 255 245 250 255

Leu Gln Gln Leu Gln Gln Gln Ser Gln Glu Leu Gln Glu Val Leu Gly Leu Gln Gln Leu Gln Gln Gln Ser Gln Glu Leu Gln Glu Val Leu Gly

260 265 270 260 265 270

Glu Thr Glu Arg Phe Leu Ser Gln Val Leu Gly Arg Val Leu Gln Leu Glu Thr Glu Arg Phe Leu Ser Gln Val Leu Gly Arg Val Leu Gln Leu

275 280 285 275 280 285

Leu Pro Pro Gly Gln Val Gln Val His Lys Met Lys Ala Val Tyr Leu Leu Pro Pro Gly Gln Val Gln Val His Lys Met Lys Ala Val Tyr Leu

290 295 300 290 295 300

Ala Leu Asn Gln Cys Ser Val Ser Thr Thr His Lys Cys Leu Ile Ala Ala Leu Asn Gln Cys Ser Val Ser Thr Thr His Lys Cys Leu Ile Ala

305 310 315 320 305 310 315 320

Glu Ala Trp Cys Ser Val Arg Asp Leu Pro Ala Leu Gln Glu Ala Leu Glu Ala Trp Cys Ser Val Arg Asp Leu Pro Ala Leu Gln Glu Ala Leu

325 330 335 325 330 335

Arg Asp Ser Ser Met Glu Glu Gly Val Ser Ala Val Ala His Arg Ile Arg Asp Ser Ser Met Glu Glu Gly Val Ser Ala Val Ala His Arg Ile

340 345 350 340 345 350

Pro Cys Arg Asp Met Pro Pro Thr Leu Ile Arg Thr Asn Arg Phe Thr Pro Cys Arg Asp Met Pro Pro Thr Leu Ile Arg Thr Asn Arg Phe Thr

355 360 365 355 360 365

Ala Ser Phe Gln Gly Ile Val Asp Ala Tyr Gly Val Gly Arg Tyr Gln Ala Ser Phe Gln Gly Ile Val Asp Ala Tyr Gly Val Gly Arg Tyr Gln

370 375 380 370 375 380

Glu Val Asn Pro Ala Pro Tyr Thr Ile Ile Thr Phe Pro Phe Leu Phe Glu Val Asn Pro Ala Pro Tyr Thr Ile Ile Thr Phe Pro Phe Leu Phe

385 390 395 400 385 390 395 400

Ala Val Met Phe Gly Asp Val Gly His Gly Leu Leu Met Phe Leu Phe Ala Val Met Phe Gly Asp Val Gly His Gly Leu Leu Met Phe Leu Phe

405 410 415 405 410 415

Ala Leu Ala Met Val Leu Ala Glu Asn Arg Pro Ala Val Lys Ala Ala Ala Leu Ala Met Val Leu Ala Glu Asn Arg Pro Ala Val Lys Ala Ala

420 425 430 420 425 430

Gln Asn Glu Ile Trp Gln Thr Phe Phe Arg Gly Arg Tyr Leu Leu Leu Gln Asn Glu Ile Trp Gln Thr Phe Phe Arg Gly Arg Tyr Leu Leu Leu

435 440 445 435 440 445

Leu Met Gly Leu Phe Ser Ile Tyr Thr Gly Phe Ile Tyr Asn Glu Cys Leu Met Gly Leu Phe Ser Ile Tyr Thr Gly Phe Ile Tyr Asn Glu Cys

450 455 460 450 455 460

Phe Ser Arg Ala Thr Ser Ile Phe Pro Ser Gly Trp Ser Val Ala Ala Phe Ser Arg Ala Thr Ser Ile Phe Pro Ser Gly Trp Ser Val Ala Ala

465 470 475 480 465 470 475 480

Met Ala Asn Gln Ser Gly Trp Ser Asp Ala Phe Leu Ala Gln His Thr Met Ala Asn Gln Ser Gly Trp Ser Asp Ala Phe Leu Ala Gln His Thr

485 490 495 485 490 495

Met Leu Thr Leu Asp Pro Asn Val Thr Gly Val Phe Leu Gly Pro Tyr Met Leu Thr Leu Asp Pro Asn Val Thr Gly Val Phe Leu Gly Pro Tyr

500 505 510 500 505 510

Pro Phe Gly Ile Asp Pro Ile Trp Ser Leu Ala Ala Asn His Leu Ser Pro Phe Gly Ile Asp Pro Ile Trp Ser Leu Ala Ala Asn His Leu Ser

515 520 525 515 520 525

Phe Leu Asn Ser Phe Lys Met Lys Met Ser Val Ile Leu Gly Val Val Phe Leu Asn Ser Phe Lys Met Lys Met Ser Val Ile Leu Gly Val Val

530 535 540 530 535 540

His Met Ala Phe Gly Val Val Leu Gly Val Phe Asn His Val His Phe His Met Ala Phe Gly Val Val Leu Gly Val Phe Asn His Val His Phe

545 550 555 560 545 550 555 560

Gly Gln Arg His Arg Leu Leu Leu Glu Thr Leu Pro Glu Leu Thr Phe Gly Gln Arg His Arg Leu Leu Leu Glu Thr Leu Pro Glu Leu Thr Phe

565 570 575 565 570 575

Leu Leu Gly Leu Phe Gly Tyr Leu Val Phe Leu Val Ile Tyr Lys Trp Leu Leu Gly Leu Phe Gly Tyr Leu Val Phe Leu Val Ile Tyr Lys Trp

580 585 590 580 585 590

Leu Cys Val Trp Ala Ala Arg Ala Ala Ser Ala Pro Ser Ile Leu Ile Leu Cys Val Trp Ala Ala Arg Ala Ala Ser Ala Pro Ser Ile Leu Ile

595 600 605 595 600 605

His Phe Ile Asn Met Phe Leu Phe Ser His Ser Pro Ser Asn Arg Leu His Phe Ile Asn Met Phe Leu Phe Ser His Ser Pro Ser Asn Arg Leu

610 615 620 610 615 620

Leu Tyr Pro Arg Gln Glu Val Val Gln Ala Thr Leu Val Val Leu Ala Leu Tyr Pro Arg Gln Glu Val Val Gln Ala Thr Leu Val Val Leu Ala

625 630 635 640 625 630 635 640

Leu Ala Met Val Pro Ile Leu Leu Leu Gly Thr Pro Leu His Leu Leu Leu Ala Met Val Pro Ile Leu Leu Leu Gly Thr Pro Leu His Leu Leu

645 650 655 645 650 655

His Arg His Arg Arg Arg Leu Arg Arg Arg Pro Ala Asp Arg Gln Glu His Arg His Arg Arg Arg Leu Arg Arg Arg Pro Ala Asp Arg Gln Glu

660 665 670 660 665 670

Glu Asn Lys Ala Gly Leu Leu Asp Leu Pro Asp Ala Ser Val Asn Gly Glu Asn Lys Ala Gly Leu Leu Asp Leu Pro Asp Ala Ser Val Asn Gly

675 680 685 675 680 685

Trp Ser Ser Asp Glu Glu Lys Ala Gly Gly Leu Asp Asp Glu Glu Glu Trp Ser Ser Asp Glu Glu Lys Ala Gly Gly Leu Asp Asp Glu Glu Glu

690 695 700 690 695 700

Ala Glu Leu Val Pro Ser Glu Val Leu Met His Gln Ala Ile His Thr Ala Glu Leu Val Pro Ser Glu Val Leu Met His Gln Ala Ile His Thr

705 710 715 720 705 710 715 720

Ile Glu Phe Cys Leu Gly Cys Val Ser Asn Thr Ala Ser Tyr Leu Arg Ile Glu Phe Cys Leu Gly Cys Val Ser Asn Thr Ala Ser Tyr Leu Arg

725 730 735 725 730 735

Leu Trp Ala Leu Ser Leu Ala His Ala Gln Leu Ser Glu Val Leu Trp Leu Trp Ala Leu Ser Leu Ala His Ala Gln Leu Ser Glu Val Leu Trp

740 745 750 740 745 750

Ala Met Val Met Arg Ile Gly Leu Gly Leu Gly Arg Glu Val Gly Val Ala Met Val Met Arg Ile Gly Leu Gly Leu Gly Arg Glu Val Gly Val

755 760 765 755 760 765

Ala Ala Val Val Leu Val Pro Ile Phe Ala Ala Phe Ala Val Met Thr Ala Ala Val Val Leu Val Pro Ile Phe Ala Ala Phe Ala Val Met Thr

770 775 780 770 775 780

Val Ala Ile Leu Leu Val Met Glu Gly Leu Ser Ala Phe Leu His Ala Val Ala Ile Leu Leu Val Met Glu Gly Leu Ser Ala Phe Leu His Ala

785 790 795 800 785 790 795 800

Leu Arg Leu His Trp Val Glu Phe Gln Asn Lys Phe Tyr Ser Gly Thr Leu Arg Leu His Trp Val Glu Phe Gln Asn Lys Phe Tyr Ser Gly Thr

805 810 815 805 810 815

Gly Tyr Lys Leu Ser Pro Phe Thr Phe Ala Ala Thr Asp Asp Gly Tyr Lys Leu Ser Pro Phe Thr Phe Ala Ala Thr Asp Asp

820 825 830 820 825 830

<---<---

Claims (69)

1. Способ генетической модификации гемопоэтических клеток, включающий:1. A method for genetic modification of hematopoietic cells, including: (a) обеспечение гемопоэтических клеток;(a) provision of hematopoietic cells; (b) приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с полоксамером;(b) contacting said hematopoietic cells with poloxamer; (c) приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с простагландином E2 (PGE2) или его производным;(c) contacting said hematopoietic cells with prostaglandin E2 (PGE2) or a derivative thereof; (d) приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с фрагментом рекомбинантного фибронектина; и(d) contacting said hematopoietic cells with a fragment of recombinant fibronectin; and (e) приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с рекомбинантным ретровирусным вектором.(e) contacting said hematopoietic cells with a recombinant retroviral vector. 2. Способ по п. 1, где рекомбинантный ретровирусный вектор представляет собой рекомбинантный лентивирусный вектор.2. The method according to claim 1, wherein the recombinant retroviral vector is a recombinant lentiviral vector. 3. Способ по п. 1, где гемопоэтические клетки были подвергнуты манипуляциям.3. The method according to claim 1, wherein the hematopoietic cells have been manipulated. 4. Способ по п. 3, где гемопоэтические клетки представляют собой CD34- обогащенные клетки.4. The method according to claim 3, wherein the hematopoietic cells are CD34-enriched cells. 5. Способ по п. 1, где полоксамер выбран из группы, состоящей из полоксамера 288, полоксамера 335, полоксамера 338 и полоксамера 407.5. The method according to claim 1, wherein the poloxamer is selected from the group consisting of poloxamer 288, poloxamer 335, poloxamer 338 and poloxamer 407. 6. Способ по п. 5, где полоксамер представляет собой полоксамер 338.6. The method of claim 5, wherein the poloxamer is poloxamer 338. 7. Способ по п. 1, где PGE2 или его производное является модифицированным.7. The method according to claim 1, wherein PGE2 or its derivative is modified. 8. Способ по п. 7, где PGE2 или его производное представляет собой 16,16- диметил-PGE2 (dmPGE2).8. The method of claim 7, wherein PGE2 or a derivative thereof is 16,16-dimethyl-PGE2 (dmPGE2). 9. Способ по п. 1, где PGE2 или его производное не является модифицированным.9. The method according to claim 1, wherein PGE2 or its derivative is not modified. 10. Способ по любому из предшествующих пунктов, где фрагмент рекомбинантного фибронектина представляет собой RetroNectin™.10. The method of any one of the preceding claims, wherein the recombinant fibronectin fragment is RetroNectin™. 11. Способ по п. 1, где стадии приведения в контакт проводят в одно и то же время, или время их проведения частично совпадает.11. The method according to claim 1, wherein the stages of bringing into contact are carried out at the same time, or the time of their implementation partially coincides. 12. Способ по любому из пп. 1-11, где концентрация PGE2 или его производного составляет 5-30 мкг/мл.12. The method according to any one of claims 1-11, wherein the concentration of PGE2 or its derivative is 5-30 μg/ml. 13. Способ по п. 12, где концентрация PGE2 или его производного составляет приблизительно 10 мкг/мл.13. The method of claim 12, wherein the concentration of PGE2 or its derivative is approximately 10 μg/ml. 14. Способ по любому из пп. 1-13, где концентрация полоксамера составляет 200-1200 мкг/мл.14. The method according to any one of claims 1-13, wherein the concentration of poloxamer is 200-1200 μg/ml. 15. Способ по п. 14, где концентрация полоксамера составляет приблизительно 1000 мкг/мл.15. The method of claim 14, wherein the concentration of poloxamer is approximately 1000 μg/mL. 16. Способ по любому из пп. 10-15, где концентрация протаминсульфата составляет 4-10 мкг/мл.16. The method according to any one of claims 10-15, wherein the concentration of protamine sulfate is 4-10 μg/ml. 17. Способ по п. 16, где концентрация протаминсульфата составляет приблизительно 4 мкг/мл.17. The method of claim 16, wherein the concentration of protamine sulfate is approximately 4 μg/mL. 18. Способ усиления опосредованной рекомбинантным ретровирусным вектором генетической модификации гемопоэтических клеток, включающий:18. A method for enhancing recombinant retroviral vector-mediated genetic modification of hematopoietic cells, comprising: (a) приведение гемопоэтических клеток в контакт ex vivo с эффективным количеством PGE2 или его производного, с эффективным количеством полоксамера и эффективным количеством фрагмента рекомбинантного фибронектина; и(a) contacting hematopoietic cells ex vivo with an effective amount of PGE2 or a derivative thereof, an effective amount of poloxamer, and an effective amount of a recombinant fibronectin fragment; and (b) приведение указанных гемопоэтических клеток в контакт с рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, содержащий представляющий интерес ген или кодирующий представляющий интерес полипептид,(b) contacting said hematopoietic cells with a recombinant retroviral vector containing a polynucleotide containing a gene of interest or encoding a polypeptide of interest, где эффективность вирусной трансдукции указанного рекомбинантного ретровирусного вектора повышена по сравнению с трансдукцией гемопоэтических клеток указанным рекомбинантным ретровирусным вектором в отсутствие указанного PGE2 или его производного, указанного полоксамера и фрагмента рекомбинантного фибронектина.wherein the efficiency of viral transduction of said recombinant retroviral vector is increased compared to transduction of hematopoietic cells by said recombinant retroviral vector in the absence of said PGE2 or its derivative, said poloxamer and a fragment of recombinant fibronectin. 19. Способ по п. 18, дополнительно включающий приведение гемопоэтических клеток в контакт ex vivo с эффективным количеством протаминсульфата.19. The method of claim 18, further comprising contacting the hematopoietic cells ex vivo with an effective amount of protamine sulfate. 20. Способ по п. 18, где представляющий интерес ген восполняет дефект в гене, связанный с моногенным генетическим заболеванием или расстройством.20. The method of claim 18, wherein the gene of interest compensates for a defect in a gene associated with a monogenic genetic disease or disorder. 21. Способ по п. 19, где представляющий интерес ген или представляющий интерес полипептид выбран из группы, состоящей из RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A и OSTM1.21. The method according to claim 19, wherein the gene of interest or polypeptide of interest is selected from the group consisting of RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A and OSTM1. 22. Способ по п. 18, где способ предотвращает или облегчает моногенное генетическое заболевание или расстройство.22. The method of claim 18, wherein the method prevents or alleviates a monogenic genetic disease or disorder. 23. Способ по п. 22, где моногенетическое заболевание или расстройство выбрано из группы, состоящей из анемии Фанкони, дефицита адгезии лейкоцитов I типа, дефицита пируваткиназы и инфантильного злокачественного остеопороза.23. The method of claim 22, wherein the monogenetic disease or disorder is selected from the group consisting of Fanconi anemia, leukocyte adhesion deficiency type I, pyruvate kinase deficiency, and infantile malignant osteoporosis. 24. Способ по п. 18, где гемопоэтические клетки представляют собой CD34- обогащенные клетки, необязательно гемопоэтические клетки, клетки, полученные из костного мозга (BM), клетки, полученные из пуповинной крови (CB) или мобилизованные клетки периферической крови (mPB).24. The method of claim 18, wherein the hematopoietic cells are CD34-enriched cells, optionally hematopoietic cells, bone marrow (BM)-derived cells, cord blood (CB)-derived cells, or mobilized peripheral blood (mPB) cells. 25. Способ опосредованной рекомбинантным ретровирусным вектором генетической модификации гемопоэтических клеток, включающий:25. A method for recombinant retroviral vector-mediated genetic modification of hematopoietic cells, comprising: (a) получение CD34-обогащенных клеток из биологического образца, полученного от субъекта, получавшего Г-КСФ (гранулоцитарный колониестимулирующий фактор) или его аналог и/или плериксафор; и(a) obtaining CD34-enriched cells from a biological sample obtained from a subject treated with G-CSF (granulocyte colony-stimulating factor) or its analogue and/or plerixafor; and (b) генетическую модификацию указанных CD34-обогащенных клеток рекомбинантным ретровирусным вектором, содержащим полинуклеотид, кодирующий ген группы комплементации анемии Фанкони (FANC), ITGB2, пируваткиназу типа R, OSTM1, TCIRG1, или ген, кодирующий их функциональный вариант или фрагмент, и функционально связанную с ним последовательность активного в эукариотических клетках промотора;(b) genetic modification of said CD34-enriched cells with a recombinant retroviral vector containing a polynucleotide encoding the Fanconi anemia complementation group (FANC) gene, ITGB2, pyruvate kinase type R, OSTM1, TCIRG1, or a gene encoding a functional variant or fragment thereof, and a sequence of a promoter active in eukaryotic cells functionally linked thereto; где стадия генетической модификации включает приведение указанных CD34- обогащенных клеток в контакт с указанным рекомбинантным ретровирусным вектором, PGE2, полоксамером и полипептидом рекомбинантного фибронектина или его вариантом.wherein the genetic modification step comprises contacting said CD34-enriched cells with said recombinant retroviral vector, PGE2, poloxamer, and recombinant fibronectin polypeptide or variant thereof. 26. Способ по п. 25, где биологический образец представляет собой периферическую кровь.26. The method according to claim 25, wherein the biological sample is peripheral blood. 27. Способ по п. 25 или 26, где аналог Г-КСФ представляет собой филграстим, сарграмостим или пегфилграстим.27. The method according to claim 25 or 26, wherein the G-CSF analogue is filgrastim, sargramostim or pegfilgrastim. 28. Способ по любому из пп. 25-27, где CD34-обогащенные клетки выбраны из группы, состоящей из гемопоэтических клеток, клеток, полученных из костного мозга (BM), клеток, полученных из пуповинной крови (CB) или мобилизованных клеток периферической крови (mPB).28. The method according to any one of claims 25-27, wherein the CD34-enriched cells are selected from the group consisting of hematopoietic cells, bone marrow (BM)-derived cells, cord blood (CB)-derived cells or mobilized peripheral blood (mPB) cells. 29. Способ трансдукции гемопоэтической клетки лентивирусным вектором, включающий культивирование указанной клетки в жидкой среде, содержащей лентивирусный вектор, где указанная жидкая среда содержит полоксамер, простагландин E2 (PGE2) или его производное и фрагмент рекомбинантного фибронектина.29. A method for transducing a hematopoietic cell with a lentiviral vector, comprising culturing said cell in a liquid medium containing the lentiviral vector, wherein said liquid medium contains a poloxamer, prostaglandin E2 (PGE2) or a derivative thereof, and a fragment of recombinant fibronectin. 30. Способ по п. 29, где жидкая среда содержит протаминсульфат.30. The method according to claim 29, wherein the liquid medium contains protamine sulfate. 31. Способ трансдукции гемопоэтической клетки лентивирусным вектором, включающий:31. A method for transducing a hematopoietic cell with a lentiviral vector, comprising: (a) обеспечение лентивирусного вектора в растворе, содержащем полоксамер, простагландин E2 (PGE2) или его производное и фрагмент рекомбинантного фибронектина;(a) providing a lentiviral vector in a solution containing a poloxamer, prostaglandin E2 (PGE2) or a derivative thereof, and a fragment of recombinant fibronectin; (b) обеспечение гемопоэтических клеток в жидкой культуральной среде; и(b) providing hematopoietic cells in a liquid culture medium; and (c) добавление указанного раствора к указанной жидкой культуральной среде.(c) adding said solution to said liquid culture medium. 32. Способ по п. 31, где жидкая среда содержит протаминсульфат.32. The method according to claim 31, wherein the liquid medium contains protamine sulfate. 33. Способ по любому из пп. 25-32, где лентивирусный вектор представляет собой рекомбинантный лентивирусный вектор.33. The method according to any one of claims 25-32, wherein the lentiviral vector is a recombinant lentiviral vector. 34. Способ по любому из пп. 25-33, где гемопоэтические клетки были подвергнуты манипуляциям.34. The method according to any one of claims 25-33, wherein the hematopoietic cells have been manipulated. 35. Способ по любому из пп. 25-34, где гемопоэтические клетки представляют собой CD34-обогащенные клетки.35. The method according to any one of claims 25-34, wherein the hematopoietic cells are CD34-enriched cells. 36. Способ по любому из пп. 25-35, где полоксамер выбран из группы, состоящей из полоксамера 288, полоксамера 335, полоксамера 338 и полоксамера 407.36. The method according to any one of claims 25-35, wherein the poloxamer is selected from the group consisting of poloxamer 288, poloxamer 335, poloxamer 338 and poloxamer 407. 37. Способ по любому из пп. 25-35, где полоксамер представляет собой полоксамер 338.37. The method according to any one of claims 25-35, wherein the poloxamer is poloxamer 338. 38. Способ по любому из пп. 25-37, где PGE2 или его производное является модифицированным.38. The method according to any one of claims 25-37, wherein PGE2 or its derivative is modified. 39. Способ по любому из пп. 25-38, где PGE2 или его производное представляет собой 16,16-диметил-PGE2 (dmPGE2).39. The method according to any one of claims 25-38, wherein PGE2 or a derivative thereof is 16,16-dimethyl-PGE2 (dmPGE2). 40. Способ по любому из пп. 25-39, где PGE2 или его производное не является модифицированным.40. The method according to any one of claims 25-39, wherein PGE2 or its derivative is not modified. 41. Способ по любому из пп. 25-40, где концентрация PGE2 или его производного составляет 5-30 мкг/мл.41. The method according to any one of claims 25-40, wherein the concentration of PGE2 or its derivative is 5-30 μg/ml. 42. Способ по любому из пп. 25-41, где концентрация PGE2 или его производного составляет приблизительно 10 мкг/мл.42. The method according to any one of claims 25-41, wherein the concentration of PGE2 or a derivative thereof is approximately 10 μg/ml. 43. Способ по любому из пп. 25-42, где концентрация полоксамера составляет 200-1200 мкг/мл.43. The method according to any one of claims 25-42, wherein the concentration of poloxamer is 200-1200 μg/ml. 44. Способ по любому из пп. 25-43, где концентрация полоксамера составляет приблизительно 1000 мкг/мл.44. The method according to any one of claims 25-43, wherein the concentration of poloxamer is approximately 1000 mcg/mL. 45. Способ по любому из пп. 25-44, где концентрация протаминсульфата составляет 4-10 мкг/мл.45. The method according to any one of claims 25-44, wherein the concentration of protamine sulfate is 4-10 μg/ml. 46. Способ по любому из пп. 25-45, где концентрация протаминсульфата составляет приблизительно 4 мкг/мл.46. The method according to any one of claims 25-45, wherein the concentration of protamine sulfate is approximately 4 μg/mL. 47. Способ по любому из пп. 25-46, где лентивирусный вектор содержит последовательность, кодирующую представляющий интерес полипептид, выбранный из группы, состоящей из RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A и OSTM1.47. The method according to any one of claims 25-46, wherein the lentiviral vector comprises a sequence encoding a polypeptide of interest selected from the group consisting of RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A and OSTM1. 48. Способ по любому из пп. 25-47, где гемопоэтические клетки представляют собой гемопоэтические клетки, клетки, полученные из костного мозга (BM), клетки, полученные из пуповинной крови (CB) или мобилизованные клетки периферической крови (mPB).48. The method according to any one of claims 25-47, wherein the hematopoietic cells are hematopoietic cells, cells derived from bone marrow (BM), cells derived from cord blood (CB) or mobilized peripheral blood (mPB) cells. 49. Популяция CD34-обогащенныx гемопоэтических клеток для использования в лечении моногенного генетического заболевания или расстройства, выбранного из группы, состоящей из анемии Фанкони, дефицита адгезии лейкоцитов I типа, дефицита пируваткиназы и инфантильного злокачественного остеопороза, содержащая по меньшей мере 80% генетически модифицированных гемопоэтических клеток, где указанная популяция клеток была получена способом по любому из пп. 29-32 и где генетически модифицированные клетки содержат последовательность, кодирующую RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A или OSTM1, где49. A population of CD34-enriched hematopoietic cells for use in the treatment of a monogenic genetic disease or disorder selected from the group consisting of Fanconi anemia, leukocyte adhesion deficiency type I, pyruvate kinase deficiency and infantile malignant osteoporosis, comprising at least 80% genetically modified hematopoietic cells, wherein said population of cells was obtained by the method of any one of claims 29 to 32 and wherein the genetically modified cells comprise a sequence encoding RPK, ITGB2, FANCA, FANCC, FANCG, TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A or OSTM1, wherein последовательность восполняет дефект в гене, связанный с моногенным генетическим заболеванием или расстройством.the sequence fills a defect in a gene associated with a single-gene genetic disease or disorder. 50. Популяция CD34-обогащенныx гемопоэтических клеток по п. 49, где гемопоэтические клетки содержат клетки, полученные из костного мозга (BM), клетки, полученные из пуповинной крови (CB) или мобилизованные клетки периферической крови (mPB).50. The CD34-enriched hematopoietic cell population of claim 49, wherein the hematopoietic cells comprise bone marrow (BM)-derived cells, cord blood (CB)-derived cells, or mobilized peripheral blood (mPB) cells. 51. Популяция CD34-обогащенныx гемопоэтических клеток по п. 49 или 50 для использования в лечении дефицита пируваткиназы, где генетически модифицированные гемопоэтические клетки содержат последовательность, кодирующую RPK.51. A population of CD34-enriched hematopoietic cells according to claim 49 or 50 for use in the treatment of pyruvate kinase deficiency, wherein the genetically modified hematopoietic cells comprise a sequence encoding RPK. 52. Популяция CD34-обогащенныx гемопоэтических клеток по п. 49 или 50 для использования в лечении дефицита адгезии лейкоцитов I типа, где генетически модифицированные гемопоэтические клетки содержат последовательность, кодирующую ITGB2.52. A population of CD34-enriched hematopoietic cells according to claim 49 or 50 for use in the treatment of leukocyte adhesion deficiency type I, wherein the genetically modified hematopoietic cells comprise a sequence encoding ITGB2. 53. Популяция CD34-обогащенныx гемопоэтических клеток по п. 49 или 50 для использования в лечении анемии Фанкони, где генетически модифицированные гемопоэтические клетки содержат последовательность, кодирующую FANCA, FANCC или FANCG.53. A population of CD34-enriched hematopoietic cells according to claim 49 or 50 for use in the treatment of Fanconi anemia, wherein the genetically modified hematopoietic cells comprise a sequence encoding FANCA, FANCC or FANCG. 54. Популяция CD34-обогащенныx гемопоэтических клеток по п. 49 или 50 для использования в лечении инфантильного злокачественного остеопороза, где генетически модифицированные гемопоэтические клетки содержат последовательность, кодирующую TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A или OSTM1.54. A population of CD34-enriched hematopoietic cells according to claim 49 or 50 for use in the treatment of infantile malignant osteoporosis, wherein the genetically modified hematopoietic cells comprise a sequence encoding TCIRG1, CLCN7, TNFSF11, PLEKHM1, TNFRSF11A or OSTM1.
RU2021101135A 2018-07-30 2019-07-30 Methods for gene modification of hematopoietic cells RU2824194C2 (en)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US62/712,146 2018-07-30

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2024118597A Division RU2024118597A (en) 2018-07-30 2019-07-30 METHODS OF GENOUS MODIFICATION OF HEMAPOIETIC CELLS

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2021101135A RU2021101135A (en) 2022-07-20
RU2824194C2 true RU2824194C2 (en) 2024-08-06

Family

ID=

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
DIPERSIO J.F. et al., Phase III prospective randomized double-blind placebo-controlled trial of plerixafor plus granulocyte colony-stimulating factor compared with placebo plus granulocyte colony-stimulating factor for autologous stem-cell mobilization and transplantation for patients with non-Hodgkin's lymphoma, J Clin Oncol, 2009, vol. 27, N. 28, pp. 4767-4773. CAVAZZANA M. et al., Gene Therapy for β-Hemoglobinopathies, Mol Ther, 2017, vol. 25, N. 5, pp. 1142-1154. СОЛОВЬЕВА В.В. и др., Влияние рекомбинантного гистона Н1.3 на эффективность лентивирусной трансдукции клеток человека in vitro, Клеточная трансплантология и тканевая инженерия, 2012, т. 7, N. 3, cc. 151-154. *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP6840189B2 (en) Dual vector for inhibition of human immunodeficiency virus
Mosca et al. Mesenchymal stem cells as vehicles for gene delivery.
KR101015913B1 (en) Methods for genetic modification of hematopoietic progenitor cells and uses of the modified cells
AU2011377617B2 (en) Improved gene therapy methods
AU2002316640A1 (en) Methods for genetic modification of hematopoietic progenitor cells and uses of the modified cells
US20130344040A1 (en) Process for the preparation of a composition of genetically modified hematopoietic progenitor cells
JP2019533434A (en) Gene therapy for Fanconi anemia patients
CN112888777A (en) Methods for genetic modification of hematopoietic cells
US20210154237A1 (en) Compositions and methods for stem cell transplant
CN114746546B (en) Engineered erythrocytes for the treatment of gout and hyperuricemia
KR20220049568A (en) UBE3A for the treatment of Angelman&#39;s syndrome
RU2824194C2 (en) Methods for gene modification of hematopoietic cells
JP2009201518A (en) Cell for gene therapy of lcat deficiency, and replication-deficient retrovirus vector and plasmid for use in production of the cell
JP2022532802A (en) Gene therapy vector for infantile malignant osteopetrosis
AU2004252010A1 (en) Method for transplanting lymphohematopoietic cells into mammal
JP7576754B2 (en) Compositions and methods for stem cell transplantation
Budak-Alpdogan et al. Functional assessment of the engraftment potential of gammaretrovirus-modified CD34+ cells, using a short serum-free transduction protocol
Newbound et al. Analysis of gene transfer efficiency of retrovirus producer cell transplantation for in situ gene transfer to hematopoietic cells
CN117441023A (en) Lentiviral vector and use thereof