RU2813626C1 - Modified endolysin and antibacterial compositions based thereon for treating infections caused by acinetobacter baumannii, pseudomonas aeruginosa, klebsiella pneumoniae, escherichia coli bacteria - Google Patents
Modified endolysin and antibacterial compositions based thereon for treating infections caused by acinetobacter baumannii, pseudomonas aeruginosa, klebsiella pneumoniae, escherichia coli bacteria Download PDFInfo
- Publication number
- RU2813626C1 RU2813626C1 RU2023125227A RU2023125227A RU2813626C1 RU 2813626 C1 RU2813626 C1 RU 2813626C1 RU 2023125227 A RU2023125227 A RU 2023125227A RU 2023125227 A RU2023125227 A RU 2023125227A RU 2813626 C1 RU2813626 C1 RU 2813626C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- escherichia coli
- pseudomonas aeruginosa
- antibacterial composition
- klebsiella pneumoniae
- acinetobacter baumannii
- Prior art date
Links
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 title claims abstract description 52
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N lysine Chemical class NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 title claims abstract description 40
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims abstract description 37
- 241000588626 Acinetobacter baumannii Species 0.000 title claims abstract description 29
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 title claims abstract description 17
- 241000589517 Pseudomonas aeruginosa Species 0.000 title claims abstract description 14
- 241000588747 Klebsiella pneumoniae Species 0.000 title claims abstract description 13
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 title description 16
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 49
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 49
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 46
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 10
- 230000000845 anti-microbial effect Effects 0.000 claims abstract description 4
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims abstract description 3
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims abstract description 3
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims abstract description 3
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 claims description 26
- 239000000243 solution Substances 0.000 claims description 24
- 108010062010 N-Acetylmuramoyl-L-alanine Amidase Proteins 0.000 claims description 21
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 claims description 16
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 claims description 11
- 239000004599 antimicrobial Substances 0.000 claims description 10
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 claims description 9
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 claims description 8
- 235000018977 lysine Nutrition 0.000 claims description 8
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 108700042778 Antimicrobial Peptides Proteins 0.000 claims description 6
- 102000044503 Antimicrobial Peptides Human genes 0.000 claims description 6
- 108010040201 Polymyxins Proteins 0.000 claims description 6
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 claims description 5
- 150000002669 lysines Chemical class 0.000 claims description 5
- 150000002960 penicillins Chemical class 0.000 claims description 5
- 229940041153 polymyxins Drugs 0.000 claims description 5
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 5
- 101100454361 Arabidopsis thaliana LCB1 gene Proteins 0.000 claims description 3
- 102100038608 Cathelicidin antimicrobial peptide Human genes 0.000 claims description 3
- 108050004290 Cecropin Proteins 0.000 claims description 3
- 229930186147 Cephalosporin Natural products 0.000 claims description 3
- 108010073254 Colicins Proteins 0.000 claims description 3
- 108010026389 Gramicidin Proteins 0.000 claims description 3
- 101000741320 Homo sapiens Cathelicidin antimicrobial peptide Proteins 0.000 claims description 3
- 108090000988 Lysostaphin Proteins 0.000 claims description 3
- 108060003100 Magainin Proteins 0.000 claims description 3
- 102000016943 Muramidase Human genes 0.000 claims description 3
- 108010014251 Muramidase Proteins 0.000 claims description 3
- 101100171146 Oryza sativa subsp. japonica DREB2C gene Proteins 0.000 claims description 3
- 229940124587 cephalosporin Drugs 0.000 claims description 3
- 150000001780 cephalosporins Chemical class 0.000 claims description 3
- 238000002648 combination therapy Methods 0.000 claims description 3
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 3
- 229960004905 gramicidin Drugs 0.000 claims description 3
- ZWCXYZRRTRDGQE-SORVKSEFSA-N gramicidina Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3C4=CC=CC=C4NC=3)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3C4=CC=CC=C4NC=3)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CC=3C4=CC=CC=C4NC=3)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](C(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](NC=O)C(C)C)CC(C)C)C(=O)NCCO)=CNC2=C1 ZWCXYZRRTRDGQE-SORVKSEFSA-N 0.000 claims description 3
- 229960000274 lysozyme Drugs 0.000 claims description 3
- 239000004325 lysozyme Substances 0.000 claims description 3
- 235000010335 lysozyme Nutrition 0.000 claims description 3
- 239000003910 polypeptide antibiotic agent Substances 0.000 claims description 3
- -1 protegrin Proteins 0.000 claims description 3
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 229940126601 medicinal product Drugs 0.000 claims description 2
- WTJDAUWOECZENF-OZWITMHCSA-N smap-29 Chemical compound NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CNC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC=1NC=NC=1)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N)[C@@H](C)CC)C(C)C)CC1=CC=C(O)C=C1 WTJDAUWOECZENF-OZWITMHCSA-N 0.000 claims description 2
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 claims 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 abstract description 29
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 21
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 abstract description 15
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 14
- 229940079593 drug Drugs 0.000 abstract description 14
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 6
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 abstract description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 18
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 16
- 206010052428 Wound Diseases 0.000 description 15
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 15
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 15
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 11
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 10
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 9
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 9
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 9
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 8
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 7
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 7
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 7
- 241000894007 species Species 0.000 description 7
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 6
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 230000009471 action Effects 0.000 description 6
- 230000000996 additive effect Effects 0.000 description 6
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 6
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 6
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 6
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 6
- 241000192125 Firmicutes Species 0.000 description 5
- 108010093965 Polymyxin B Proteins 0.000 description 5
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 5
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 5
- 229920000024 polymyxin B Polymers 0.000 description 5
- 229960005266 polymyxin b Drugs 0.000 description 5
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 4
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 4
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 4
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 4
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 4
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 4
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 4
- 230000002101 lytic effect Effects 0.000 description 4
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 4
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 4
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 4
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 4
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 4
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 4
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 4
- YRMCBQLZVBXOSJ-PCFSSPOYSA-N (e)-3-[(6r,6as)-4-hydroxy-6-methoxy-3-methyl-11-oxo-5,6,6a,7-tetrahydropyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepin-8-yl]prop-2-enamide Chemical compound CO[C@H]1NC2=C(O)C(C)=CC=C2C(=O)N2C=C(\C=C\C(N)=O)C[C@@H]12 YRMCBQLZVBXOSJ-PCFSSPOYSA-N 0.000 description 3
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 description 3
- 239000004354 Hydroxyethyl cellulose Substances 0.000 description 3
- 229920000663 Hydroxyethyl cellulose Polymers 0.000 description 3
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 3
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 3
- 229940124350 antibacterial drug Drugs 0.000 description 3
- 208000022362 bacterial infectious disease Diseases 0.000 description 3
- 229960004261 cefotaxime Drugs 0.000 description 3
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 3
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 3
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 3
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 3
- 244000000058 gram-negative pathogen Species 0.000 description 3
- 235000019447 hydroxyethyl cellulose Nutrition 0.000 description 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 3
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 3
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 3
- 239000000902 placebo Substances 0.000 description 3
- 229940068196 placebo Drugs 0.000 description 3
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 3
- 238000009097 single-agent therapy Methods 0.000 description 3
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 3
- 230000029663 wound healing Effects 0.000 description 3
- 238000011725 BALB/c mouse Methods 0.000 description 2
- 241000193738 Bacillus anthracis Species 0.000 description 2
- 208000001860 Eye Infections Diseases 0.000 description 2
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 2
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 2
- 238000012404 In vitro experiment Methods 0.000 description 2
- MSFSPUZXLOGKHJ-UHFFFAOYSA-N Muraminsaeure Natural products OC(=O)C(C)OC1C(N)C(O)OC(CO)C1O MSFSPUZXLOGKHJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010013639 Peptidoglycan Proteins 0.000 description 2
- 206010040047 Sepsis Diseases 0.000 description 2
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 description 2
- 206010048038 Wound infection Diseases 0.000 description 2
- DPXJVFZANSGRMM-UHFFFAOYSA-N acetic acid;2,3,4,5,6-pentahydroxyhexanal;sodium Chemical compound [Na].CC(O)=O.OCC(O)C(O)C(O)C(O)C=O DPXJVFZANSGRMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 2
- 230000003698 anagen phase Effects 0.000 description 2
- 230000008485 antagonism Effects 0.000 description 2
- 230000003214 anti-biofilm Effects 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 2
- 239000001768 carboxy methyl cellulose Substances 0.000 description 2
- AZZMGZXNTDTSME-JUZDKLSSSA-M cefotaxime sodium Chemical compound [Na+].N([C@@H]1C(N2C(=C(COC(C)=O)CS[C@@H]21)C([O-])=O)=O)C(=O)\C(=N/OC)C1=CSC(N)=N1 AZZMGZXNTDTSME-JUZDKLSSSA-M 0.000 description 2
- 210000002421 cell wall Anatomy 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 2
- 230000034994 death Effects 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 2
- 231100000673 dose–response relationship Toxicity 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 2
- 208000011323 eye infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 2
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 2
- 230000036541 health Effects 0.000 description 2
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 230000036457 multidrug resistance Effects 0.000 description 2
- 238000010899 nucleation Methods 0.000 description 2
- 239000002674 ointment Substances 0.000 description 2
- 230000035699 permeability Effects 0.000 description 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 2
- 238000012910 preclinical development Methods 0.000 description 2
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 2
- 235000010413 sodium alginate Nutrition 0.000 description 2
- 235000019812 sodium carboxymethyl cellulose Nutrition 0.000 description 2
- 229920001027 sodium carboxymethylcellulose Polymers 0.000 description 2
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 238000007492 two-way ANOVA Methods 0.000 description 2
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 2
- CETWSOHVEGTIBR-FORAGAHYSA-N (2s)-2,6-diamino-n-[(2s)-1-phenylpropan-2-yl]hexanamide;methanesulfonic acid Chemical compound CS(O)(=O)=O.CS(O)(=O)=O.NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)CC1=CC=CC=C1 CETWSOHVEGTIBR-FORAGAHYSA-N 0.000 description 1
- IXPNQXFRVYWDDI-UHFFFAOYSA-N 1-methyl-2,4-dioxo-1,3-diazinane-5-carboximidamide Chemical compound CN1CC(C(N)=N)C(=O)NC1=O IXPNQXFRVYWDDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FHVDTGUDJYJELY-UHFFFAOYSA-N 6-{[2-carboxy-4,5-dihydroxy-6-(phosphanyloxy)oxan-3-yl]oxy}-4,5-dihydroxy-3-phosphanyloxane-2-carboxylic acid Chemical compound O1C(C(O)=O)C(P)C(O)C(O)C1OC1C(C(O)=O)OC(OP)C(O)C1O FHVDTGUDJYJELY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- 206010002091 Anaesthesia Diseases 0.000 description 1
- 239000002028 Biomass Substances 0.000 description 1
- 206010051548 Burn infection Diseases 0.000 description 1
- 208000019300 CLIPPERS Diseases 0.000 description 1
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 1
- 241001360526 Escherichia coli ATCC 25922 Species 0.000 description 1
- 241001198387 Escherichia coli BL21(DE3) Species 0.000 description 1
- 238000012313 Kruskal-Wallis test Methods 0.000 description 1
- RJQXTJLFIWVMTO-TYNCELHUSA-N Methicillin Chemical compound COC1=CC=CC(OC)=C1C(=O)N[C@@H]1C(=O)N2[C@@H](C(O)=O)C(C)(C)S[C@@H]21 RJQXTJLFIWVMTO-TYNCELHUSA-N 0.000 description 1
- 206010048723 Multiple-drug resistance Diseases 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- 206010034133 Pathogen resistance Diseases 0.000 description 1
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 1
- 208000037581 Persistent Infection Diseases 0.000 description 1
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 1
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 1
- 241000293871 Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi Species 0.000 description 1
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 1
- 206010051017 Staphylococcal bacteraemia Diseases 0.000 description 1
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 description 1
- 241000191984 Staphylococcus haemolyticus Species 0.000 description 1
- 241000239110 Staphylococcus virus K Species 0.000 description 1
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 1
- 239000012505 Superdex™ Substances 0.000 description 1
- 239000000443 aerosol Substances 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 229940072056 alginate Drugs 0.000 description 1
- 235000010443 alginic acid Nutrition 0.000 description 1
- 229920000615 alginic acid Polymers 0.000 description 1
- 230000037005 anaesthesia Effects 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- 230000000721 bacterilogical effect Effects 0.000 description 1
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 238000005277 cation exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- MYPYJXKWCTUITO-KIIOPKALSA-N chembl3301825 Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=C2C=C3C=C1OC1=CC=C(C=C1Cl)[C@@H](O)[C@H](C(N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H]3C(=O)N[C@H]1C(=O)N[C@H](C(N[C@H](C3=CC(O)=CC(O)=C3C=3C(O)=CC=C1C=3)C(O)=O)=O)[C@H](O)C1=CC=C(C(=C1)Cl)O2)=O)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC)[C@H]1C[C@](C)(N)C(O)[C@H](C)O1 MYPYJXKWCTUITO-KIIOPKALSA-N 0.000 description 1
- 238000011097 chromatography purification Methods 0.000 description 1
- 208000021930 chronic lymphocytic inflammation with pontine perivascular enhancement responsive to steroids Diseases 0.000 description 1
- 238000005352 clarification Methods 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 230000002301 combined effect Effects 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 239000012531 culture fluid Substances 0.000 description 1
- 230000002354 daily effect Effects 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 230000000249 desinfective effect Effects 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 1
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 1
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 1
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 1
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 description 1
- 230000008029 eradication Effects 0.000 description 1
- 230000003203 everyday effect Effects 0.000 description 1
- 238000002270 exclusion chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 238000000556 factor analysis Methods 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 244000000059 gram-positive pathogen Species 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 239000007943 implant Substances 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 1
- 239000006166 lysate Substances 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 229960003085 meticillin Drugs 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 238000001000 micrograph Methods 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000149 penetrating effect Effects 0.000 description 1
- 230000035515 penetration Effects 0.000 description 1
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 1
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 238000007480 sanger sequencing Methods 0.000 description 1
- 238000004626 scanning electron microscopy Methods 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 239000000661 sodium alginate Substances 0.000 description 1
- 229940005550 sodium alginate Drugs 0.000 description 1
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 1
- 239000007921 spray Substances 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 229940037649 staphylococcus haemolyticus Drugs 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 238000011285 therapeutic regimen Methods 0.000 description 1
- 229950002526 tonabacase Drugs 0.000 description 1
- 230000000699 topical effect Effects 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960001600 xylazine Drugs 0.000 description 1
Abstract
Description
Область техникиField of technology
Группа изобретений относится к биотехнологии, биохимии, молекулярной биологии, микробиологи и может быть использована при создании антибактериальных препаратов для профилактики и лечения инфекций, вызванных, бактериями Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli. The group of inventions relates to biotechnology, biochemistry, molecular biology, microbiology and can be used in the creation of antibacterial drugs for the prevention and treatment of infections caused by bacteria Acinetobacter baumannii , Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli.
Уровень техникиState of the art
Востребованность новых подходов к лечению и профилактике бактериальных инфекций возрастает с распространением проблемы приобретенной устойчивости к антибиотикам среди микроорганизмов по всему миру. Особенно это актуально при борьбе с инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи, поскольку в их случае, наблюдается значительное давление отбора замкнутой системы госпитальных организаций и предрасположенности к передаче факторов резистентности среди патогенов. В свете распространения проблемы антибиотикоустойчивости, поиск и разработка новых классов антибиотиков с новыми мишенями и механизмами действия, не обладающими перекрестной устойчивостью к существующим классам антибиотиков, имеет первостепенное значение [1,2]. Среди них, активно изучаемым классом являются антибактериальные препараты на основе ферментов (энзибиотики), представляющие собой литические ферменты из различных источников, способные разрушать компоненты клеточных стенок бактериальных клеток и приводить к их лизису. К таким ферментам относят эндолизины бактериофагов, разрушающие бактерии за счет гидролиза пептдогликанового слоя и последующего осмотического лизиса клеток патогенов, которые активно исследуются в свете перспектив борьбы с инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи, склонными к распространению и приобретению множественной лекарственной устойчивости [3,4]. Так, например, показана высокая активность эндолизинов против грамотрицательных и грамположительных бактерий, независимо от их статуса устойчивости к антибиотическим препаратам [5]. Кроме того, они обладают значительной противобиопленочной активностью [6-8] и, по всей видимости, не провоцируют бактерии к быстрому развитию устойчивости, поскольку действуют на высококонсервативные участки клеточной стенки [9,10].The demand for new approaches to the treatment and prevention of bacterial infections is increasing with the spread of the problem of acquired antibiotic resistance among microorganisms around the world. This is especially true in the fight against infections associated with the provision of health care, since in their case, there is a significant selection pressure of a closed system of hospital organizations and a predisposition to the transmission of resistance factors among pathogens. In light of the growing problem of antibiotic resistance, the search and development of new classes of antibiotics with new targets and mechanisms of action that do not exhibit cross-resistance to existing classes of antibiotics is of paramount importance [1,2]. Among them, an actively studied class are enzyme-based antibacterial drugs (enzybiotics), which are lytic enzymes from various sources that can destroy components of the cell walls of bacterial cells and lead to their lysis. Such enzymes include endolysins of bacteriophages, which destroy bacteria due to hydrolysis of the peptdoglycan layer and subsequent osmotic lysis of pathogen cells, which are actively being studied in the light of the prospects for combating infections associated with the provision of medical care, prone to spread and acquisition of multidrug resistance [3,4]. . For example, endolysins have been shown to have high activity against gram-negative and gram-positive bacteria, regardless of their resistance status to antibiotic drugs [5]. In addition, they have significant antibiofilm activity [6-8] and, apparently, do not provoke bacteria to rapidly develop resistance, since they act on highly conserved areas of the cell wall [9,10].
В литературе описаны примеры использования эндолизинов в качестве противомикробных средств. Кроме того, проводятся клинические исследования эндолизинов CF-301 и N-Rephasin® SAL200 у пациентов с бактериемией, вызванной золотистым стафилококком (ClinicalTrials.gov Identifiers: NCT03089697; NCT03163446).The literature describes examples of the use of endolysins as antimicrobial agents. In addition, clinical studies of endolysins CF-301 and N-Rephasin® SAL200 are ongoing in patients with Staphylococcus aureus bacteremia (ClinicalTrials.gov Identifiers: NCT03089697; NCT03163446).
Из уровня техники известны несколько примеров решений на основе эндолизинов.Several examples of solutions based on endolysins are known from the prior art.
Известна заявка на изобретение (RU 202128276 A, опубликовано: 20.03.2022), в котором разработаны модифицированные варианты эндолизина PlySs2 ингибирующие рост, уменьшающие популяцию или приводящие к уничтожению по меньшей мере одного вида грамположительных бактерий, а также соответствующий вектор экспрессии, антибактериальная композиция и способ предотвращения или лечения бактериальной инфекции, вызванной по меньшей мере одним видом грамположительных бактерий, в том числе, в комбинации с антибиотиками.There is a known application for an invention (RU 202128276 A, published: 03/20/2022), in which modified variants of endolysin PlySs2 have been developed that inhibit growth, reduce the population or lead to the destruction of at least one type of gram-positive bacteria, as well as a corresponding expression vector, antibacterial composition and method preventing or treating a bacterial infection caused by at least one type of gram-positive bacteria, including in combination with antibiotics.
Известен патент на изобретение (RU 2715694 C1, опубликовано: 02.03.2020), в котором представлена фармацевтическая композиция для лечения глазных инфекций, вызванных метициллин-устойчивыми штаммами Staphylococcus aureus, включающей в качестве активного начала N-концевой СНАР-домен эндолизина бактериофага K Staphylococcus aureus. Заявляемая фармацевтическая композиция не токсична и более эффективна, чем антибиотик ванкомицин.There is a known patent for an invention (RU 2715694 C1, published: 03/02/2020), which presents a pharmaceutical composition for the treatment of eye infections caused by methicillin-resistant strains of Staphylococcus aureus , including as the active principle the N-terminal CHAP domain of endolysin of bacteriophage K Staphylococcus aureus . The claimed pharmaceutical composition is non-toxic and more effective than the antibiotic vancomycin.
Известен патент на группу изобретений (RU 2735103 C2, опубликовано: 28.10.2020), относящийся к способам предотвращения образования, а также разрушения или эрадикации биопленок грамположительных бактерий. Предложены способ предотвращения, разрушения или эрадикации биопленки, включающей одну или более из бактерий Staphylococcus и Streptococcus, и способ профилактики или лечения инфекции, ассоциированной с биопленкой.There is a known patent for a group of inventions (RU 2735103 C2, published: 10.28.2020), relating to methods for preventing the formation, as well as destruction or eradication of biofilms of gram-positive bacteria. A method is proposed for preventing, destroying or eradicating a biofilm comprising one or more of the bacteria Staphylococcus and Streptococcus , and a method for preventing or treating an infection associated with a biofilm.
Предполагается, что данные изобретения позволяют устранять зрелые стрептококковые или стафилококковые биопленки, и предотвращать образование биопленок de novo на поверхности устройств, имплантатов, разделительных мембран.It is believed that these inventions can eliminate mature streptococcal or staphylococcal biofilms, and prevent the formation of de novo biofilms on the surface of devices, implants, and separation membranes.
Все вышеуказанные решения предназначены для лечения инфекций, вызванных грамположительными видами патогенов, а результаты клинических исследований неоднозначны. Так, для производного эндолизина LSVT-1701 (tonabacase), были досрочно завершены КИ 2 фазы, без оглашения результатов, по причине спонсорского решения об отзыве, не связанного с какими-либо проблемами безопасности препарата. При этом, из литературы известно, что лизины, активные в отношении грамположительных бактерий часто не обладают широким спектром действия, и способны эффективно действовать только на бактерии в пределах рода, а иногда даже вида или определенных штаммов.All of the above solutions are intended to treat infections caused by gram-positive pathogens, and the results of clinical studies are mixed. Thus, for the endolysin derivative LSVT-1701 (tonabacase), phase 2 CTs were completed ahead of schedule, without announcing the results, due to a sponsor’s decision to withdraw, not related to any safety problems of the drug. At the same time, it is known from the literature that lysines active against gram-positive bacteria often do not have a wide spectrum of action, and can only effectively act on bacteria within the genus, and sometimes even species or certain strains.
В то же время, для лизинов, выделенных из бактериофагов, действующих против грамотрицательных видов бактерий, показан широкий спектр активности [11]. Однако, в случае грамотрицательных патогенов взаимодействие лизина с его субстратом пептидогликаном может быть затруднено из-за наличия внешней мембраны и часто требует дополнительных пермеабилизующих соединений в составе лекарственной формы.At the same time, a wide spectrum of activity has been shown for lysines isolated from bacteriophages acting against gram-negative bacterial species [11]. However, in the case of Gram-negative pathogens, the interaction of lysine with its substrate peptidoglycan can be complicated by the presence of an outer membrane and often requires additional permeabilizing compounds in the dosage form.
Эту проблему позволяют решать модификации нативных полипептидов эндолизинов путем введения в последовательность рекомбинантного белка пермеабилизующих пептидов.This problem can be solved by modifications of native endolysin polypeptides by introducing permeabilizing peptides into the sequence of the recombinant protein.
Для грамотрицательных бактерий известен патент на изобретение (RU 2725809 C2, опубликовано 06.07.2020), в котором полипептид F307 и его производные, в том числе, конъюгированные с антимикробными пептидами используют в качестве противомикробной композиция для лечения бактериальной инфекции, вызванной A. baumannii и других видов грамотрицательных бактерий (A. baumannii, E. coli, P. aeruginosa, S. aureus, B. anthracis и K. pneumoniae). Раскрыты способы лечения субъекта, дезинфекции предмета, ингибирования образования или разрушения бактериальной биопленки. Однако, в испытаниях in vitro для бактерий видов A. baumannii и B. anthracis снижение в высевах после применения данных полипептидов составляло не более 4 порядков, а в случае E. coli, P. aeruginosa и S. aureus полипептиды были практически неэффективны (снижение КОЕ менее 1,5 порядков). Испытания in vivo были проведены только для инфекционных моделей с использованием A. baumannii, поэтому, определить реальную эффективность в отношении широкого спектра грамотрицательных патогенов невозможно.For gram-negative bacteria, a patent for an invention is known (RU 2725809 C2, published 07/06/2020), in which the F307 polypeptide and its derivatives, including those conjugated with antimicrobial peptides, are used as an antimicrobial composition for the treatment of bacterial infections caused by A. baumannii and others species of gram-negative bacteria ( A. baumannii , E. coli , P. aeruginosa , S. aureus , B. anthracis and K. pneumoniae ). Methods for treating a subject, disinfecting an object, and inhibiting the formation or destruction of bacterial biofilm are disclosed. However, in in vitro tests for bacteria of the species A. baumannii and B. anthracis, the reduction in inoculations after the use of these polypeptides was no more than 4 orders of magnitude, and in the case of E. coli, P. aeruginosa and S. aureus, the polypeptides were practically ineffective (decrease in CFU less than 1.5 orders of magnitude). In vivo testing has only been conducted in infection models using A. baumannii, and therefore, true efficacy against a broad range of Gram-negative pathogens cannot be determined.
Известен патент на изобретение (RU 2703043 C1, опубликовано 15.10.2019), относящееся к модификации нативного эндолизина антисинегнойного бактериофага КРР10 модифицированным фрагментом миелоидного антимикробного пептида овцы SMAP-29 [K2,7,13]-SMAP-29(1-17), с целью использования в качестве антибактериальной композиции, проявляющей активность в отношении грамотрицательных бактерий Pseudomonas aeruginosa. Его активность в отношении широкого спектра бактерий так же не установлена.There is a known patent for an invention (RU 2703043 C1, published 10/15/2019) relating to the modification of native endolysin of the antipseudomonas bacteriophage KPP10 with a modified fragment of the sheep myeloid antimicrobial peptide SMAP-29 [K2,7,13]-SMAP-29(1-17), with for the purpose of use as an antibacterial composition exhibiting activity against gram-negative bacteria Pseudomonas aeruginosa . Its activity against a wide range of bacteria has also not been established.
Известна заявка на изобретение (RU 2020118691 A, дата публикации 13.01.2022), где описано применение для элиминации P. aeruginosa фармацевтической композиции по п. 1 или 2, которая представляет собой раствор, суспензию, эмульсию, ингалируемый порошок, аэрозоль или спрей. Его применение ограничено действием в отношении P. aeruginosa.There is a known application for an invention (RU 2020118691 A, publication date 01/13/2022), which describes the use of a pharmaceutical composition according to claim 1 or 2 for the elimination of P. aeruginosa , which is a solution, suspension, emulsion, inhalable powder, aerosol or spray. Its use is limited to action against P. aeruginosa .
В заявке на изобретение (RU 2015122812 A, дата публикации 10.01.2017) описан рекомбинантный эндолизин rEPA в качестве антибактериального средства против инфекционных заболеваний, вызываемых P. aeruginosa и фармацевтическая композиция на его основе для лечения инфекции глаз, вызванных этой бактерией. Его применение ограничено действием в отношении инфекций, вызванных P. aeruginosa.The application for invention (RU 2015122812 A, publication date 01/10/2017) describes recombinant endolysin rEPA as an antibacterial agent against infectious diseases caused by P. aeruginosa and a pharmaceutical composition based on it for the treatment of eye infections caused by this bacterium. Its use is limited to infections caused by P. aeruginosa .
Известна заявка на изобретение (RU 2020129467 A, дата публикации 04.05.2022), в которой приведены последовательности 34 различных эндолизинов, в том числе модифицированных различными пептидами. Для данных белков были определены минимальные ингибирующие концентрации на одном штамме P. aeruginosa. Шесть из них были оценены в комбинациях с широко применяемыми в терапии антибиотиками в эксперименте in vitro. Однако, не показано получение данных эндолизинов, их эффективность не была оценена на моделях экспериментальных инфекций, а также не приведены составы фармацевтических композиций с данными белками.There is a known application for an invention (RU 2020129467 A, publication date 05/04/2022), which shows the sequences of 34 different endolysins, including those modified with various peptides. Minimum inhibitory concentrations were determined for these proteins on one strain of P. aeruginosa . Six of them were evaluated in combination with commonly used therapeutic antibiotics in an in vitro experiment. However, the production of these endolysins is not shown, their effectiveness has not been assessed in models of experimental infections, and the compositions of pharmaceutical compositions with these proteins are not given.
Известен патент на изобретение (RU 2730613 C1, опубликовано 24.08.2020), в котором разработано антибактериальное средство на основе эндолизина LysAm24. Предложено использование белка рекомбинантного эндолизина бактериофага, в том числе в комбинации с фармацевтически приемлемыми носителями и/или веществами, увеличивающими проницаемость мембран, в качестве антимикробного средства, направленного против бактерий Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Salmonella typhi и Staphylococcus haemolyticus. На основе указанного белка, в том числе слитого с 8-гистидиновой меткой, получены антибактериальные композиции. Изобретение обеспечивает эффективное проникновение эндолизина без добавления различных пермеабилизаторов или ковалентно связанных пенетрирующих пептидов через наружную мембрану указанных бактерий и расщепление пептидогликана, что в конечном итоге приводит к гибели бактерий. Тем не менее, данный белок значительно теряет активность в отношении бактерий в стационарной фазе роста, а также в сложных смесях, в присутствии высоких концентраций солей, а, значит, может быть менее эффективен при системном введении препаратов на его основе.There is a known patent for an invention (RU 2730613 C1, published on August 24, 2020), in which an antibacterial agent based on endolysin LysAm24 was developed. It is proposed to use the recombinant bacteriophage endolysin protein, including in combination with pharmaceutically acceptable carriers and/or substances that increase membrane permeability, as an antimicrobial agent directed against the bacteria Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, Salmonella typhi and Staphylococcus haemolyticus . Antibacterial compositions were obtained based on this protein, including one fused with an 8-histidine tag. The invention ensures effective penetration of endolysin without the addition of various permeabilizers or covalently bound penetrating peptides through the outer membrane of these bacteria and cleavage of peptidoglycan, which ultimately leads to the death of the bacteria. However, this protein significantly loses activity against bacteria in the stationary growth phase, as well as in complex mixtures, in the presence of high concentrations of salts, and, therefore, may be less effective when administered systemically with drugs based on it.
В настоящее время отсутствуют препараты на основе эндолизинов бактериофагов, разрешенные к применению для лечения инфекционных заболеваний. Заявленное техническое решение более эффективно, чем исходный немодифицированный белок, так как сохраняет свои антибактериальные свойства в присутствии физиологических концентраций соли, что позволяет повысить эффективность антибактериальной терапии в отношении бактерий A. baumannii, P. aeruginosa, K. pneumoniae, E. coli, в том числе для применения в качестве инъекционной формы препарата.Currently, there are no drugs based on bacteriophage endolysins approved for use in the treatment of infectious diseases. The claimed technical solution is more effective than the original unmodified protein, since it retains its antibacterial properties in the presence of physiological salt concentrations, which makes it possible to increase the effectiveness of antibacterial therapy against bacteria A. baumannii , P. aeruginosa , K. pneumoniae , E. coli , including including for use as an injection form of the drug.
Известен патент на изобретение (RU 2781050 C1, опубликовано 04.10.2022), в котором разработана бактерицидная композиция определенного состава в форме геля для местного применения на основе модифицированного эндолизина LysECD7-SMAP, гидроксиэтилцеллюлозы и полиэтиленгликоля, обладающая активностью в отношении грамотрицательных бактерий при местном применении. Данная композиция предназначена для применения в качестве антимикробного средства при раневых и ожоговых инфекциях. Однако, для действующего вещества данной композиции не показано действие на бактериальные пленки, что является важной составляющей терапии раневых инфекций, а также не установлен антибактериальный эффект в комбинации с антибиотиками.There is a known patent for an invention (RU 2781050 C1, published 10/04/2022), in which a bactericidal composition of a certain composition in the form of a gel for topical use was developed based on modified endolysin LysECD7-SMAP, hydroxyethylcellulose and polyethylene glycol, which has activity against gram-negative bacteria when applied topically. This composition is intended for use as an antimicrobial agent for wound and burn infections. However, the active substance of this composition does not have an effect on bacterial films, which is an important component of the treatment of wound infections, and the antibacterial effect in combination with antibiotics has not been established.
Раскрытие сущности изобретенияDisclosure of the invention
Технической задачей заявленного изобретения является расширение арсенала противомикробных средств литического действия в отношении грамотрицательных бактерий, в том числе, с множественной лекарственной устойчивостью к используемым в терапии антибактериальным средствам.The technical objective of the claimed invention is to expand the arsenal of antimicrobial agents with lytic action against gram-negative bacteria, including those with multiple drug resistance to antibacterial agents used in therapy.
Технический результат заключается в создании эффективного противомикробного средства, обладающего бактерицидным действием в отношении грамотрицательных бактерий видов K. pneumoniae, P. aeruginosa, A. baumannii и E. coli, в том числе обладающих множественной устойчивостью к антибиотикам. Данное средство может быть использовано в виде антибактериальной композиции, применяемой индивидуально или в комбинации с другими лекарственными средствами, где комбинации с другими лекарственными препаратами обладают синергетическим или аддитивным эффектом. Кроме того, данное средство может быть использовано для профилактики и лечения инфекционных заболеваний, вызванных грамотрицательными бактериями, а также для элиминации и предотвращения образования бактериальных биопленок.The technical result consists in creating an effective antimicrobial agent that has a bactericidal effect against gram-negative bacteria of the species K. pneumoniae, P. aeruginosa, A. baumannii and E. coli, including those with multiple resistance to antibiotics. This agent can be used as an antibacterial composition, used alone or in combination with other drugs, where combinations with other drugs have a synergistic or additive effect. In addition, this product can be used to prevent and treat infectious diseases caused by gram-negative bacteria, as well as to eliminate and prevent the formation of bacterial biofilms.
Указанный технический результат достигается тем, что получен рекомбинантный полипептид модифицированного эндолизина (GRC-ML07), содержащий полипептид эндолизина LysAm24 дикого типа и антимикробный пептид RKLRRLKRKIAHKVKKY, при этом полипептид модифицированного эндолизина имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1.This technical result is achieved by obtaining a recombinant modified endolysin polypeptide (GRC-ML07) containing a wild-type LysAm24 endolysin polypeptide and an antimicrobial peptide RKLRRLKRKIAHKVKKY, wherein the modified endolysin polypeptide has the amino acid sequence SEQ ID NO:1.
Кроме того, были получены антибактериальные композиции, содержащие указанный полипептид в различных концентрациях (от 0,001 мг/мл до 10 мг/мл). Также антибактериальные композиции помимо полипептида могут содержать различные фармацевтически приемлемые вспомогательные вещества, пермеабилизаторы (трис(гидроксиметил)аминометан, этилендиаминтетрауксусная кислота (ЭДТА) и/или ее соли), противомикробными препаратами (антибиотики и синтетические антибактериальные средства - полимиксины, пенициллины, хлорамфеникол и другие; антимикробные пептиды - SMAP-29 (и его варианты), LL37, грамицидин, магаинин, протегрин, колицин, цекропин и другие) и другими литическими ферментами (нативные или модифицированные лизины бактериофагов AM24, AP22, ECD7, SI3 или других бактериофагов, лизостафин, лизоцим) для улучшения терапевтических свойств.In addition, antibacterial compositions were obtained containing the specified polypeptide in various concentrations (from 0.001 mg/ml to 10 mg/ml). Also, antibacterial compositions, in addition to the polypeptide, may contain various pharmaceutically acceptable excipients, permeabilizers (tris(hydroxymethyl)aminomethane, ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) and/or its salts), antimicrobials (antibiotics and synthetic antibacterial agents - polymyxins, penicillins, chloramphenicol and others; antimicrobial peptides - SMAP-29 (and its variants), LL37, gramicidin, magainin, protegrin, colicin, cecropin and others) and other lytic enzymes (native or modified lysines of bacteriophages AM24, AP22, ECD7, SI3 or other bacteriophages, lysostaphin, lysozyme ) to improve therapeutic properties.
Также разработано лекарственное средство в виде раствора, лиофилизата или геля, содержащее указанную антибактериальную композицию.A medicinal product has also been developed in the form of a solution, lyophilisate or gel containing the specified antibacterial composition.
Кроме того, раскрыто применение модифицированного полипептида лизина в качестве антимикробного средства, направленного против бактерий Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli. In addition, the use of a modified lysine polypeptide as an antimicrobial agent directed against the bacteria Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli is disclosed.
Также разработан способ лечения заболеваний, вызванных бактериями Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, заключающийся в введении субъекту, нуждающемуся в этом, эффективного количества индивидуальной антибактериальной композиции, содержащей полипептид модифицированного эндолизина, или эффективного количества антибактериальной композиции в составе комбинированной терапии с антибиотиками классов полимиксинов, пенициллинов, цефалоспоринов или хлорамфениколом.A method has also been developed for the treatment of diseases caused by bacteria Acinetobacter baumannii , Pseudomonas aeruginosa, Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli, which consists of administering to a subject in need of it an effective amount of an individual antibacterial composition containing a modified endolysin polypeptide, or an effective amount of an antibacterial composition as part of a combination therapy with antibiotics of the classes of polymyxins, penicillins, cephalosporins or chloramphenicol.
Краткое описание чертежейBrief description of drawings
На фиг.1 представлен график, отображающий бактерицидную активность различных концентраций 1 мкг/мл, 10 мкг/мл и 100 мкг/мл полипептида GRC-ML07 против штаммов A. baumannii Ts 50-16, P. aeruginosa Ts 38-16 и E. coli ATCC 25922. Антибактериальная активность (%) исследуемого полипептида рассчитана по отношению к количеству бактерий в контроле, инкубированном с буфером вместо белка. Для всех экспериментов показаны средние значения по стандартным отклонением после трех независимых экспериментов.Figure 1 is a graph showing the bactericidal activity of various concentrations of 1 μg/ml, 10 μg/ml and 100 μg/ml of the GRC-ML07 polypeptide against strains A. baumannii Ts 50-16, P. aeruginosa Ts 38-16 and E. coli ATCC 25922. Antibacterial activity (%) of the polypeptide under study was calculated relative to the number of bacteria in the control incubated with buffer instead of protein. For all experiments, the average standard deviation values from three independent experiments are shown.
На фиг.2 представлен график, отображающий бактерицидную активность полипептида GRC-ML07 в концентрации 100 мкг/мл против различных штаммов грамотрицательных бактерий. Приведена антибактериальная активность (%) по сравнению с контролем. Результаты представлены диаграммами размаха: линии - медианы; ящики - интерквартильный диапазон; усы - мин-макс.Figure 2 is a graph showing the bactericidal activity of the GRC-ML07 polypeptide at a concentration of 100 μg/ml against various strains of Gram-negative bacteria. Antibacterial activity (%) compared to control is given. The results are presented in range diagrams: lines - medians; boxes - interquartile range; mustache - min-max.
На фиг. 3 приведены микрофотографии суспензии бактерий A. baumannii Ts 50-16 после инкубации с полипептидом GRC-ML07 в концентрации 100 мкг/мл или с контрольным буфером PBS в течении 30 минут. Общее увеличение 16000.In fig. Figure 3 shows micrographs of a suspension of bacteria A. baumannii Ts 50-16 after incubation with the GRC-ML07 polypeptide at a concentration of 100 μg/ml or with a PBS control buffer for 30 minutes. Total increase 16,000.
На фиг.4 представлен график активности GRC-ML07 в различных концентрациях (0,1 и 1 мг/мл) в отношении сформированных 24-часовых биопленок K. pneumoniae Ts 104-14 после инкубации с полипептидом или контрольным буфером в течение 2 часов. Активность выражена в снижении оптической плотности (OD600) биопленок, окрашенных кристаллическим фиолетовым красителем. Для всех экспериментов показаны средние значения с SD после трех независимых экспериментов. * - значимый бактерицидный эффект относительно контроля (p<0,05), критерий Краскела-Уоллиса.Figure 4 shows a graph of the activity of GRC-ML07 at various concentrations (0.1 and 1 mg/ml) against the formed 24-hour biofilms of K. pneumoniae Ts 104-14 after incubation with the polypeptide or control buffer for 2 hours. The activity is expressed in a decrease in the optical density (OD600) of biofilms stained with crystal violet dye. For all experiments, mean values with SD from three independent experiments are shown. * - significant bactericidal effect relative to control (p<0.05), Kruskal-Wallis test.
На фиг.5 представлены результаты экспериментального изучения антибактериального эффекта GRC-ML07 на модели инфекции (инфицированная рана). А. Динамика ранозаживления, представленная в виде изменения площади раны, выраженной в процентах от значения на 1 сутки до начала лечения. Для всех экспериментов показаны средние значения с SEM. Значимый эффект относительно контроля наблюдается на 3 сутки в группе гель GRC-ML07 (p=0,033), двухфакторный дисперсионный анализ. Б. Бактериальная нагрузка смывов с раневой поверхности. Для всех экспериментов показаны средние значения с SD. **** - значимый бактерицидный эффект относительно контроля (p<0,0001), двухфакторный дисперсионный анализ.Figure 5 presents the results of an experimental study of the antibacterial effect of GRC-ML07 in an infection model (infected wound). A. Dynamics of wound healing, presented as a change in wound area, expressed as a percentage of the value on 1 day before the start of treatment. For all experiments, mean values with SEM are shown. A significant effect relative to the control was observed on day 3 in the GRC-ML07 gel group (p=0.033), two-way analysis of variance. B. Bacterial load of washings from the wound surface. Mean values with SD are shown for all experiments. **** - significant bactericidal effect relative to control (p<0.0001), two-way analysis of variance.
На фиг.6 представлены результаты экспериментального изучения антибактериального эффекта GRC-ML07 на модели инфекции (сепсис) при монотерапии и в комбинации с антибиотиком. А. Выживаемость мышей в ходе эксперимента (в каждой группе n=4). Б. Высевы из крови и селезенок животных в ходе эксперимента. Для всех экспериментов показаны средние значения с SEM. **** - значимый эффект относительно контроля (p<0,0001), двухфакторный дисперсионный анализ.Figure 6 presents the results of an experimental study of the antibacterial effect of GRC-ML07 on an infection model (sepsis) in monotherapy and in combination with an antibiotic. A. Survival of mice during the experiment (in each group n=4). B. Cultures from the blood and spleens of animals during the experiment. For all experiments, mean values with SEM are shown. **** - significant effect relative to control (p<0.0001), two-factor analysis of variance.
Осуществление изобретенияCarrying out the invention
Средство представляет собой полипептид модифицированного эндолизина GRC-ML07, рекомбинантный фермент, полученный биотехнологическим путем. Получение полипептида состоит из нескольких этапов. Исходная кодирующая последовательность GRC-ML07 была искусственно синтезирована в векторе pALTA-GRC-ML07 и интегрирована в экспрессионный вектор pET-42b (+), в результате чего была получена плазмида pET42b-GRC-ML07. Корректность сборки векторной конструкций проверяли методом секвенирования по Сэнгеру.The product is a modified endolysin polypeptide GRC-ML07, a recombinant enzyme obtained biotechnologically. Obtaining a polypeptide consists of several stages. The original coding sequence of GRC-ML07 was artificially synthesized in the vector pALTA-GRC-ML07 and integrated into the expression vector pET-42b(+), resulting in plasmid pET42b-GRC-ML07. The correctness of the assembly of vector constructs was verified by Sanger sequencing.
Субстанцию белка получали по следующей технологии: трансформация клеток штамма продуцента плазмидой методом heat-shock, культивирование полученных клеток-продуцентов E. coli Bl21(DE3)pLysS в колбах Эрленмейера с индукцией экспрессии белка с помощью изопропил-β-D-1-тиогалактопиранозида, осветление культуральной жидкости центрифугированием, получение растворимых фракций лизатов биомассы клеток продуцента, их двухстадийная хроматографическая очистка (катионообменная хроматография на носителе SP-sepharose, с последующей гель-эксклюзионной хроматографией на носителе Superdex 75).The protein substance was obtained using the following technology: transformation of cells of the producer strain with a plasmid using the heat-shock method, cultivation of the resulting producer cells E. coli Bl21(DE3)pLysS in Erlenmeyer flasks with induction of protein expression using isopropyl-β-D-1-thiogalactopyranoside, clarification culture fluid by centrifugation, obtaining soluble fractions of producer cell biomass lysates, their two-stage chromatographic purification (cation exchange chromatography on an SP-sepharose carrier, followed by gel exclusion chromatography on a Superdex 75 carrier).
Таким образом была получена фармакологически активная субстанция полипептида GRC-ML07 в виде раствора в стерильном фосфатно-солевом буфере, pH 7,4 в диапазоне концентраций от 1 до 30 мг/мл. Чистоту и подлинность полученного рекомбинантного полипептида подтверждали методом вертикального электрофореза в полиакриламидном геле в денатурирующих условиях, а концентрацию измеряли спектрофотометрически с учетом теоретического коэффициента экстинкции.Thus, the pharmacologically active substance of the GRC-ML07 polypeptide was obtained in the form of a solution in sterile phosphate-buffered saline, pH 7.4, in a concentration range from 1 to 30 mg/ml. The purity and identity of the resulting recombinant polypeptide was confirmed by vertical polyacrylamide gel electrophoresis under denaturing conditions, and the concentration was measured spectrophotometrically taking into account the theoretical extinction coefficient.
Авторами изобретения были получены антибактериальные композиции на основе указанной выше субстанции, содержащие указанный полипептид в различных концентрациях (от 0,001 мг/мл до 10 мг/мл).The authors of the invention obtained antibacterial compositions based on the above substance, containing the specified polypeptide in various concentrations (from 0.001 mg/ml to 10 mg/ml).
Были разработаны образцы композиций, дополненные различными фармацевтически приемлемыми носителями (например, вода, физиологический раствор, фосфатно-солевой буфер, трис(гидроксиметил)аминометан гидрохлорид). Данные композиции были включены в образцы лекарственных средств в виде раствора, в виде лиофилизата, а также в виде геля (гидроксиэтилцеллюлоза, натрий-карбоксиметилцеллюлоза, альгинаты натрия). Было показано, что они оказывают выраженный антибактериальный эффект в отношении различных видов бактерий.Sample formulations supplemented with various pharmaceutically acceptable carriers (eg, water, saline, phosphate-buffered saline, tris(hydroxymethyl)aminomethane hydrochloride) have been developed. These compositions were included in drug samples in the form of a solution, in the form of a lyophilisate, and also in the form of a gel (hydroxyethylcellulose, sodium carboxymethylcellulose, sodium alginates). They have been shown to have a strong antibacterial effect against various types of bacteria.
Данные композиции могут быть дополнены пермеабилизаторами (трис(гидроксиметил)аминометан, этилендиаминтетрауксусная кислота и/или ее соли), противомикробными препаратами (антибиотики и синтетические антибактериальные средства - полимиксины, пенициллины, хлорамфеникол и другие; антимикробные пептиды - SMAP-29 (и его варианты), LL37, грамицидин, магаинин, протегрин, колицин, цекропин и другие) и другими литическими ферментами (нативные или модифицированные лизины бактериофагов AM24, AP22, ECD7, SI3 или других бактериофагов, лизостафин, лизоцим) для улучшения терапевтических свойств.These compositions can be supplemented with permeabilizers (tris(hydroxymethyl)aminomethane, ethylenediaminetetraacetic acid and/or its salts), antimicrobials (antibiotics and synthetic antibacterial agents - polymyxins, penicillins, chloramphenicol and others; antimicrobial peptides - SMAP-29 (and its variants) , LL37, gramicidin, magainin, protegrin, colicin, cecropin and others) and other lytic enzymes (native or modified lysines of bacteriophages AM24, AP22, ECD7, SI3 or other bacteriophages, lysostaphin, lysozyme) to improve therapeutic properties.
Осуществление изобретения подтверждается следующими примерами.The implementation of the invention is confirmed by the following examples.
Пример 1. Изучение антибактериальной активности GRC-ML07 Example 1. Study of antibacterial activity of GRC-ML07
Оценка спектра действия и степени антибактериальной активности GRC-ML07 проводилась в экспериментах in vitro в отношении различных представителей грамотрицательных бактерий с различной степенью устойчивости к антибиотикам. Для этого суспензию бактерий в экспоненциальной фазе роста в PBS, pH 7,4 смешивали с эндолизином и инкубировали в течение 30 минут при 37°С с дальнейшим высевом на чашки Петри с агаризованной питательной средой и подсчетом колоний после инкубации в термостате. Полипептид проявлял дозозависимый антибактериальный эффект на штаммах P. aeruginosa, A. baumannii и E. coli (фиг. 1), значительно снижая количество бактерий в концентрации от 1 мкг/мл до 10 мг/мл. В концентрации 100 мкг/мл эндолизин проявлял значимую бактерицидную активность (более 30%) в отношении представителей грамотрицательных бактерий видов K. pneumoniae (n=4), P. aeruginosa (n=4), A. baumannii (n=4) и E. coli (n=2) (фиг. 2). Таким образом, в спектр антибактериальной активности модифицированного эндолизина входят практически все представители социально значимой группы патогенных бактерий ESKAPE, а также другие важные возбудители инфекционных заболеваний различной этиологии.The spectrum of action and the degree of antibacterial activity of GRC-ML07 was assessed in experimentsin vitro against various representatives of gram-negative bacteria with varying degrees of antibiotic resistance. To do this, a suspension of bacteria in the exponential growth phase in PBS, pH 7.4, was mixed with endolysin and incubated for 30 minutes at 37°C, followed by seeding on Petri dishes with an agar nutrient medium and counting colonies after incubation in a thermostat. The polypeptide exhibited a dose-dependent antibacterial effect on strainsP. aeruginosa, A. baumanniiAndE. coli(Fig. 1), significantly reducing the number of bacteria at concentrations from 1 μg/ml to 10 mg/ml. At a concentration of 100 μg/ml, endolysin exhibited significant bactericidal activity (more than 30%) against representatives of gram-negative bacteria speciesK. pneumoniae(n=4), P. aeruginosa(n=4), A. baumannii(n=4) AndE. coli(n=2) (Fig. 2). Thus, the spectrum of antibacterial activity of the modified endolysin includes almost all representatives of the socially significant group of pathogenic bacteria ESKAPE, as well as other important pathogens of infectious diseases of various etiologies.
Пример 2. Бактерицидное действие фермента Example 2. Bactericidal effect of the enzyme
Антибактериальная активность полипептида заключается в бактерицидном типе действия на бактериальные клетки, что было показано с помощью сканирующей электронной микроскопии.The antibacterial activity of the polypeptide consists of a bactericidal type of action on bacterial cells, which was shown using scanning electron microscopy.
После инкубации полипептида в концентрации 100 мкг/мл с суспензией бактерий модельного штамма A. baumannii в течение 30 минут и приготовления микропрепаратов, был показан лизис бактерий под действием GRC-ML07, в отличии от бактерий, инкубированных с PBS буфером (фиг.3).After incubating the polypeptide at a concentration of 100 μg/ml with a suspension of bacteria of the model strain A. baumannii for 30 minutes and preparing microslides, lysis of bacteria under the influence of GRC-ML07 was shown, in contrast to bacteria incubated with PBS buffer (Fig. 3).
Пример 3. Преимущества полипептида GRC-ML07 в сравнении с немодифицированным эндолизином Example 3. Advantages of the GRC-ML07 polypeptide compared to unmodified endolysin
Показано, что полипептид GRC-ML07 в концентрации 10 мкг/мл оказывает 100% антибактериальную активность на клетки бактерий модельного штамма A. baumannii в буфере с концентрацией натрия хлорида 150 мМ (фосфатно-солевой буфер, рН 7,4), в отличие от немодифицированного эндолизина, чья активность полностью ингибируется добавлением NaCl в концентрации от 50 мМ. Данное преимущество полипептида GRC-ML07 позволяет использовать его для создания фармацевтических композиций для парентерального применения.It was shown that the GRC-ML07 polypeptide at a concentration of 10 μg/ml has 100% antibacterial activity on bacterial cells of the model strain A. baumannii in a buffer with a sodium chloride concentration of 150 mM (phosphate-buffered saline, pH 7.4), in contrast to the unmodified endolysin, whose activity is completely inhibited by the addition of NaCl at a concentration of 50 mM. This advantage of the GRC-ML07 polypeptide allows it to be used to create pharmaceutical compositions for parenteral use.
Пример 4. Действие GRC-ML07 в отношении сформированных бактериальных биопленок. Example 4. Effect of GRC-ML07 on formed bacterial biofilms.
Противобиопленочную активность эндолизина оценивали на 24-часовых биопленках различных видов бактерий (K. pneumoniae, P. aeruginosa, A. baumannii). Для этого биопленки были выращены в лунках 96-луночного планшета, отмыты от планктонных клеток и подвержены воздействию раствора эндолизина в концентрациях 100 и 1000 мкг/мл в течение 2 часов. Дальнейшая окраска с помощью раствора кристаллического фиолетового показала, что эндолизин GRC-ML07 значительно снижал плотность биопленок относительно контроля в дозозависимой манере, разрушая до 100% биопленки. Пример действия полипептида на сформированные 24-часовые биопленки K. pneumoniae представлен на фиг. 4.The antibiofilm activity of endolysin was assessed on 24-hour biofilms of various bacterial species ( K. pneumoniae, P. aeruginosa, A. baumannii ). For this purpose, biofilms were grown in the wells of a 96-well plate, washed from planktonic cells and exposed to an endolysin solution at concentrations of 100 and 1000 μg/ml for 2 hours. Further staining with crystal violet solution showed that endolysin GRC-ML07 significantly reduced biofilm density relative to control in a dose-dependent manner, destroying up to 100% of biofilm. An example of the effect of the polypeptide on formed 24-hour biofilms of K. pneumoniae is presented in Fig. 4.
Пример 5. Синергизм действия полипептида GRC-ML07 и антибактериальных препаратов. Example 5. Synergism of the action of the GRC-ML07 polypeptide and antibacterial drugs.
В ходе работы был оценен in vitro потенциал применения подхода комбинированной терапии на основе классических антибиотиков и модифицированного эндолизина бактериофага GRC-ML07, в отношении грамотрицательных патогенов.During the work, the potential of using a combination therapy approach based on classical antibiotics and modified endolysin of the bacteriophage GRC-ML07 against gram-negative pathogens was assessed in vitro .
Синергизм действия различных концентраций GRC-ML07 и антибиотиков полимиксина В, хлорамфеникола, ампициллина и цефотаксима был показан методом шахматной доски на различных представителях грамотрицательных бактерий (по два штамма видов K. pneumoniae, P. aeruginosa, A. baumannii), в том числе, обладающих множественной лекарственной устойчивостью.The synergistic effect of various concentrations of GRC-ML07 and the antibiotics polymyxin B, chloramphenicol, ampicillin and cefotaxime was shown using the checkerboard method on various representatives of gram-negative bacteria (two strains each of the species K. pneumoniae, P. aeruginosa, A. baumannii ), including those with multidrug resistance.
Для этого двукратные разведения раствора эндолизина были инкубированы в лунках 96-луночного планшета с двукратными разведениями антибиотика в течение 16-20 часов и были оценены ингибирующие бактериальный рост комбинации. Для каждой комбинации рассчитывали ∑ФИК (индекс фракционной ингибирующей концентрации).To do this, two-fold dilutions of endolysin solution were incubated in the wells of a 96-well plate with two-fold dilutions of the antibiotic for 16-20 hours and bacterial growth inhibitory combinations were evaluated. For each combination, ∑FIC (fractional inhibitory concentration index) was calculated.
∑ФИК = МИКАБ / МИКА + МИКБА / МИКБ,∑FIC = MIC AB / MIC A + MIC BA / MIC B ,
где МИКА - МИК антибиотика А;where MIC A is the MIC of antibiotic A;
МИКБ - МИК антибиотика Б;MIC B - MIC of antibiotic B;
МИКАБ - МИК антибиотика A в присутствии антибиотика Б;MIC AB - MIC of antibiotic A in the presence of antibiotic B;
МИКБА - МИК антибиотика Б в присутствии антибиотика А.MIC BA - MIC of antibiotic B in the presence of antibiotic A.
Полученные результаты интерпретировали следующим образом:The results obtained were interpreted as follows:
В диапазоне доз GRC-ML07 от 512 мкг/мл до 64 мкг/мл и антибиотиков от 16 мкг/мл до 0,015 мкг/мл наблюдался выраженный синергетический или аддитивный эффект на всех трех видах бактерий (Таблица 1). Более того, ни для одной комбинации не было показано случаев антагонизма.In the dose range of GRC-ML07 from 512 μg/ml to 64 μg/ml and antibiotics from 16 μg/ml to 0.015 μg/ml, a strong synergistic or additive effect was observed on all three bacterial species (Table 1). Moreover, no cases of antagonism were shown for either combination.
Мы показали, что комбинации могут не только обладать синергетическим действием (в случае комбинации лизина и полимиксина), но и возвращать чувствительность микроорганизма к антибиотику. Например, для трех штаммов удалось показать аддитивный эффект в комбинации лизина с ампициллином, к которому все штаммы были исходно устойчивы. Аналогичные результаты были показаны для хлорамфеникола, причем следует отметить, что A. baumannii и P. aeruginosa обладают природной к нему устойчивостью, в то время как мы показали выраженный синергизм или аддитивный эффект. При этом, механизм противомикробного действия эндолизинов предполагает отсутствие развития устойчивости к нему бактерий, а значит такая терапевтическая схема безопасна при курсовом применении. Эти исследования могут послужить основой для разработки новых схем лечения с тяжелыми и хроническими инфекциями, вызванными антибиотико-устойчивыми возбудителями.We have shown that combinations can not only have a synergistic effect (in the case of a combination of lysine and polymyxin), but also restore the sensitivity of the microorganism to the antibiotic. For example, for three strains it was possible to show an additive effect in the combination of lysine with ampicillin, to which all strains were initially resistant. Similar results were shown for chloramphenicol, and it should be noted that A. baumannii and P. aeruginosa are naturally resistant to it, while we showed a strong synergism or additive effect. At the same time, the mechanism of the antimicrobial action of endolysins assumes that bacteria do not develop resistance to it, which means this therapeutic regimen is safe when used in a course. These studies may provide the basis for the development of new treatment regimens for severe and chronic infections caused by antibiotic-resistant pathogens.
Пример 6. Получение образцов антибактериальных композиций на основе GRC-ML07 Example 6. Preparation of samples of antibacterial compositions based on GRC-ML07
Были получены образцы композиций со следующим составом:Samples of compositions with the following composition were obtained:
1. Растворы были получены путем разведения концентрата (субстанции) полипептида в соответствующем буфере до необходимой концентрации.1. Solutions were obtained by diluting the polypeptide concentrate (substance) in an appropriate buffer to the required concentration.
Растворы полипептида с концентрацией 0,001 мг/мл, 0,01 мг/мл, 0,1 мг/мл, 1 мг/мл, 10 мг/мл в фосфатно-солевом буфере с рН 5,0, 6,0, 7,0, 7,5, 8,0, 9,0.Polypeptide solutions with concentrations of 0.001 mg/ml, 0.01 mg/ml, 0.1 mg/ml, 1 mg/ml, 10 mg/ml in phosphate-buffered saline with pH 5.0, 6.0, 7.0 , 7.5, 8.0, 9.0.
Растворы полипептида с концентрацией 0,001 мг/мл, 0,01 мг/мл, 0,1 мг/мл, 1 мг/мл, 10 мг/мл 20 мМ растворе трис гидрохлорида с рН 5,0, 6,0, 7,5, 8,0, 9,0.Polypeptide solutions with concentrations of 0.001 mg/ml, 0.01 mg/ml, 0.1 mg/ml, 1 mg/ml, 10 mg/ml 20 mM Tris hydrochloride solution with pH 5.0, 6.0, 7.5 , 8.0, 9.0.
Растворы полипептида с концентрацией 0,001 мг/мл, 0,01 мг/мл, 0,1 мг/мл, 1 мг/мл, 10 мг/мл в физиологическом растворе.Polypeptide solutions with concentrations of 0.001 mg/ml, 0.01 mg/ml, 0.1 mg/ml, 1 mg/ml, 10 mg/ml in physiological solution.
Растворы были дополнены веществами, улучшающими проницаемость бактериальных мембран (пермеабилизаторами) - трис(гидроксиметил)аминометаном в концентрации 40-100 мМ, этилендиаминтетрауксусной кислотой (ЭДТА) или ее натриевой солью в концентрации 1-100 мМ.The solutions were supplemented with substances that improve the permeability of bacterial membranes (permeabilizers) - tris(hydroxymethyl)aminomethane at a concentration of 40-100 mM, ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) or its sodium salt at a concentration of 1-100 mM.
2. Лиофилизаты с полипептидом были получены из вышеуказанных растворов путем сублимационного высушивания.2. Lyophilisates with the polypeptide were obtained from the above solutions by freeze drying.
3. Гели с полипептидом были получены путем введения вышеуказанных растворов полипептида в предварительно подготовленный 0,5% - 1% раствор альгината натрия, 1 - 3% раствор гидроксиэтилцеллюлозы и 1 - 3% раствор натрий-карбоксиметилцеллюлозы.3. Polypeptide gels were prepared by introducing the above polypeptide solutions into a previously prepared 0.5% - 1% sodium alginate solution, 1 - 3% hydroxyethylcellulose solution and 1 - 3% sodium carboxymethylcellulose solution.
Антибактериальная активность образцов оценивалась в экспериментах in vitro на модельном штамме A. baumannii. Например, растворы полипептида в PBS, Трис-HCl в диапазоне рН 5,0 - 9,0, а также физрастворе в концентрации 1 мкг/мл обладают активностью 80 - 100%. Добавление пермеабилизаторов приводит к увеличению активности до 100% во всех случаях. Заявленные композиции могут быть получены специалистами на практике и их использование обеспечивает реализацию заявленного назначения.The antibacterial activity of the samples was assessed in in vitro experiments using a model strain of A. baumannii. For example, solutions of the polypeptide in PBS, Tris-HCl in the pH range 5.0 - 9.0, as well as saline at a concentration of 1 μg/ml have an activity of 80 - 100%. The addition of permeabilizers leads to an increase in activity up to 100% in all cases. The claimed compositions can be obtained by specialists in practice and their use ensures the implementation of the stated purpose.
Пример 7. Экспериментальное изучение антибактериального эффекта GRC-ML07 на модели инфекции (инфицированная рана). Example 7. Experimental study of the antibacterial effect of GRC-ML07 on an infection model (infected wound).
Для эксперимента готовили гель на основе водорослевого альгината (1%), содержащего 1 мг/мл эндолизина GRC-ML07. Мышам BALB/c (самки, 18-20 г) за сутки до начала эксперимента удаляли шерстный покров машинкой для стрижки. Раневой дефект наносили на спинах животных под наркозом (золетил-ксилазин) специальным инструментом для биопсии (d=8 мм, Medax, Italy). Через 5 минут на поверхность раны наносили суспензию полирезистентного штамма P. aeruginosa Ts 38-16 в концентрации 5×108 КОЕ/рану. Спустя 24 ч начинали лечение накожным нанесением препарата (n = 6), плацебо (гель без полипептида, n = 6) или стандартным препаратом (гентамициновая мазь, n = 6) в соответствии с планом эксперимента. Для этого, препараты в объеме 100 мкл наносили на раневую поверхность ежедневно два раза в сутки в течение 5 дней. На 1, 3 и 7 сутки изучали патоморфологические изменения раневой поверхности и измеряли ее площадь (планиметрия), а также оценивали микробную нагрузку путем смывов с поверхности раны. Полученные смывы в PBS высевали разведения на плотную питательную среду с дальнейшим культивированием в течение 18 ч при температуре 37°С для оценки их обсемененности.For the experiment, a gel was prepared based on algal alginate (1%) containing 1 mg/ml endolysin GRC-ML07. BALB/c mice (females, 18-20 g) had their hair removed with a clipper one day before the experiment. The wound defect was made on the backs of animals under anesthesia (zoletyl-xylazine) with a special biopsy instrument (d=8 mm, Medax, Italy). After 5 minutes, a suspension of the multiresistant strain P. aeruginosa Ts 38-16 was applied to the surface of the wound at a concentration of 5×10 8 CFU/wound. After 24 hours, treatment was started with cutaneous application of the drug (n = 6), placebo (gel without polypeptide, n = 6) or standard drug (gentamicin ointment, n = 6) in accordance with the experimental plan. To do this, drugs in a volume of 100 μl were applied to the wound surface twice a day every day for 5 days. On days 1, 3 and 7, pathomorphological changes in the wound surface were studied and its area was measured (planimetry), and the microbial load was also assessed by washings from the surface of the wound. The resulting swabs were sown in PBS and diluted on a solid nutrient medium with further cultivation for 18 hours at 37°C to assess their contamination.
При оценке результатов исследования, с учетом динамики изменения площади ран и бактериальной нагрузки смывов, был выявлен непосредственный эффект исследуемой антибактериальной композиции на ранозаживление при образовании инфицированных ран. Показано изменение в обсемененности раны и достоверное снижение бактериальной нагрузки под действием геля с GRC-ML07. При лечении гелем GRC-ML07 было показано достоверное снижение площади ран по сравнению с контролем. Более того, после окончания лечения терапевтический эффект в группе GRC-ML07 сохранялся гораздо лучше, чем в группе плацебо. Лечение гентамициновой мазью значительно ухудшало течение инфекции, ранозаживление и обсемененность раневых поверхностей. Результаты эксперимента представлены на фиг. 5.When assessing the results of the study, taking into account the dynamics of changes in the area of wounds and the bacterial load of washings, a direct effect of the studied antibacterial composition on wound healing in the formation of infected wounds was revealed. A change in the contamination of the wound and a significant decrease in the bacterial load under the influence of the gel with GRC-ML07 were shown. Treatment with GRC-ML07 gel showed a significant reduction in wound area compared to the control. Moreover, after the end of treatment, the therapeutic effect in the GRC-ML07 group was maintained much better than in the placebo group. Treatment with gentamicin ointment significantly worsened the course of infection, wound healing and contamination of wound surfaces. The results of the experiment are presented in Fig. 5.
Пример 8. Экспериментальное изучение антибактериального эффекта GRC-ML07 на модели инфекции (сепсис) при монотерапии и в комбинации с антибиотиком. Example 8. Experimental study of the antibacterial effect of GRC-ML07 on an infection model (sepsis) in monotherapy and in combination with an antibiotic.
Самкам мышей линии BALB/c (18-20 г) внутрибрюшинно вводили взвесь клеток штамма K. pneumoniae М9 в дозе 1×105 КОЕ/животное. Спустя 2 часа после заражения внутривенно вводили исследуемый препарат GRC-ML07 в PBS рН=7,5 (12,5 мг/кг, n = 4), комбинацию GRC-ML07 и полимиксина В (0,05 мг/кг, n = 4) или плацебо (PBS, n = 4) в объеме 100 мкл. Лечение проводили ежедневно, 5 дней, 2 раза в сутки. В течение 3 суток за животными проводили наблюдение, учитывали их гибель, строили кривые выживаемости.Female BALB/c mice (18-20 g) were intraperitoneally injected with a suspension of cells of the K. pneumoniae M9 strain at a dose of 1×10 5 CFU/animal. 2 hours after infection, the study drug GRC-ML07 in PBS pH=7.5 (12.5 mg/kg, n = 4), a combination of GRC-ML07 and polymyxin B (0.05 mg/kg, n = 4) was administered intravenously ) or placebo (PBS, n = 4) in a volume of 100 μl. Treatment was carried out daily, 5 days, 2 times a day. The animals were observed for 3 days, their death was taken into account, and survival curves were constructed.
У павших животных отбирали образцы крови и извлекали селезенку, выживших животных подвергали эвтаназии методом цервикальной дислокации и отбирали те же образцы в последний день эксперимента. Проводили оценку обсемененности крови и гомогенатов селезенки методом бактериологического посева различных разведений на плотную питательную среду с дальнейшим культивированием в течение 18 ч при температуре 37°С, проводя подсчет выросших бактериальных колоний.Blood samples were taken from dead animals and the spleen was removed; surviving animals were euthanized by cervical dislocation and the same samples were collected on the last day of the experiment. The contamination of blood and spleen homogenates was assessed by bacteriological inoculation of various dilutions on a solid nutrient medium with further cultivation for 18 hours at a temperature of 37°C, counting the grown bacterial colonies.
При оценке результатов исследования, был выявлен значительный антибактериальный эффект исследуемого препарата GRC-ML07 как при монотерапии, так и в комбинации с антибиотиком в дозировке, составляющей 0,5 МИК. Выживаемость в контрольной группе составила 0% (все пали на вторые сутки эксперимента), при этом в группе GRC-ML07 выживаемость на 3 сутки составила 75%, а в группе с добавлением субтерапевтической дозы полимиксина В достигала 100%. Также показано достоверное снижение бактериальной нагрузки в крови под действием GRC-ML07. В селезёнке не было показано достоверных различий, тем не менее тенденция снижения высевов выражена. Результаты эксперимента представлены на фиг. 6.When assessing the results of the study, a significant antibacterial effect of the study drug GRC-ML07 was revealed both in monotherapy and in combination with an antibiotic at a dosage of 0.5 MIC. Survival in the control group was 0% (all died on the second day of the experiment), while in the GRC-ML07 group survival on day 3 was 75%, and in the group with the addition of a subtherapeutic dose of polymyxin B it reached 100%. A significant reduction in the bacterial load in the blood under the influence of GRC-ML07 was also shown. No significant differences were shown in the spleen, however, the trend towards a decrease in seedings was pronounced. The results of the experiment are presented in Fig. 6.
Список литературыBibliography
1. 2021 antibacterial agents in clinical and preclinical development: an overview and analysis [Internet]. [cited 2022 Jun 26]. Available from: https://www.who.int/publications/i/item/9789240047655;1. 2021 antibacterial agents in clinical and preclinical development: an overview and analysis [Internet]. [cited 2022 Jun 26]. Available from: https://www.who.int/publications/i/item/9789240047655;
2. Antibacterial agents in preclinical development: an open access database [Internet]. [cited 2022 Jun 26]. Available from: https://apps.who.int/iris/handle/10665/330290).2. Antibacterial agents in preclinical development: an open access database [Internet]. [cited 2022 Jun 26]. Available from: https://apps.who.int/iris/handle/10665/330290).
3. D, Briers Y. Lysins breaking down the walls of Gram-negative bacteria, no longer a no-go. Current Opinion in Biotechnology. 2021 Apr 1;68:15-22.3. D, Briers Y. Lysins breaking down the walls of Gram-negative bacteria, no longer a no-go. Current Opinion in Biotechnology. 2021 Apr 1;68:15-22.
4. Choi YJ, Kim S, Bae S, Kim Y, Chang HH, Kim J. Antibacterial Effects of Recombinant Endolysins in Disinfecting Medical Equipment: A Pilot Study. Frontiers in Microbiology. 2022 Mar 2;12:4380.4. Choi YJ, Kim S, Bae S, Kim Y, Chang HH, Kim J. Antibacterial Effects of Recombinant Endolysins in Disinfecting Medical Equipment: A Pilot Study. Frontiers in Microbiology. 2022 Mar 2;12:4380.
5. Schmelcher M, Loessner MJ. Bacteriophage endolysins - extending their application to tissues and the bloodstream. Current Opinion in Biotechnology. 2021 Apr 1;68:51-9.5. Schmelcher M, Loessner MJ. Bacteriophage endolysins - extending their application to tissues and the bloodstream. Current Opinion in Biotechnology. 2021 Apr 1;68:51-9.
6. Fursov M v., Abdrakhmanova RO, Antonova NP, Vasina D v., Kolchanova AD, Bashkina OA, et al. Antibiofilm activity of a broad-range recombinant endolysin LysECD7: In vitro and in vivo study. Viruses. 2020 May 1;12(5).6. Fursov M v., Abdrakhmanova RO, Antonova NP, Vasina D v., Kolchanova AD, Bashkina OA, et al. Antibiofilm activity of a broad-range recombinant endolysin LysECD7: In vitro and in vivo study. Viruses. 2020 May 1;12(5).
7. Vasina D v., Antonova NP, Grigoriev I v., Yakimakha VS, Lendel AM, Nikiforova MA, et al. Discovering the Potentials of Four Phage Endolysins to Combat Gram-Negative Infections. Frontiers in Microbiology. 2021 Oct 13;12:3033.7. Vasina D v., Antonova NP, Grigoriev I v., Yakimakha VS, Lendel AM, Nikiforova MA, et al. Discovering the Potentials of Four Phage Endolysins to Combat Gram-Negative Infections. Frontiers in Microbiology. 2021 Oct 13;12:3033.
8. Kim S, Jin JS, Lee DW, Kim J. Antibacterial activities of and biofilm removal by Ablysin, an endogenous lysozyme-like protein originated from Acinetobacter baumannii 1656-2. Journal of Global Antimicrobial Resistance. 2020 Dec 1;23:297-302.8. Kim S, Jin JS, Lee DW, Kim J. Antibacterial activities of and biofilm removal by Ablysin, an endogenous lysozyme-like protein originated from Acinetobacter baumannii 1656-2. Journal of Global Antimicrobial Resistance. 2020 Dec 1;23:297-302.
9. Love MJ, Abeysekera GS, Muscroft-Taylor AC, Billington C, Dobson RCJ. On the catalytic mechanism of bacteriophage endolysins: Opportunities for engineering. Biochim Biophys Acta Proteins Proteom [Internet]. 2020 Jan 1 [cited 2022 Jun 26];1868(1). Available from: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31678195/9. Love MJ, Abeysekera GS, Muscroft-Taylor AC, Billington C, Dobson RCJ. On the catalytic mechanism of bacteriophage endolysins: Opportunities for engineering. Biochim Biophys Acta Proteins Proteom [Internet]. 2020 Jan 1 [cited 2022 Jun 26];1868(1). Available from: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31678195/
10. Grishin A v., Karyagina AS, Vasina D v., Vasina I v., Gushchin VA, Lunin VG. Resistance to peptidoglycan-degrading enzymes. Critical Reviews in Microbiology. 2020 Nov 1;46(6):703-26.10. Grishin A v., Karyagina AS, Vasina D v., Vasina I v., Gushchin VA, Lunin VG. Resistance to peptidoglycan-degrading enzymes. Critical Reviews in Microbiology. 2020 Nov 1;46(6):703-26.
11. Gontijo MTP, Jorge GP, Brocchi M. Current Status of Endolysin-Based Treatments against Gram-Negative Bacteria. Antibiotics (Basel). 2021 Sep 22;10(10):1143.11. Gontijo MTP, Jorge GP, Brocchi M. Current Status of Endolysin-Based Treatments against Gram-Negative Bacteria. Antibiotics (Basel). 2021 Sep 22;10(10):1143.
--->--->
Перечень последовательностейList of sequences
<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?><?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE ST26SequenceListing PUBLIC "-//WIPO//DTD Sequence Listing <!DOCTYPE ST26SequenceListing PUBLIC "-//WIPO//DTD Sequence Listing
1.3//EN" "ST26SequenceListing_V1_3.dtd">1.3//EN" "ST26SequenceListing_V1_3.dtd">
<ST26SequenceListing originalFreeTextLanguageCode="ru" <ST26SequenceListing originalFreeTextLanguageCode="en"
dtdVersion="V1_3" fileName="Эндолизин GRC-ML07.xml" dtdVersion="V1_3" fileName="Endolysin GRC-ML07.xml"
softwareName="WIPO Sequence" softwareVersion="2.2.0" softwareName="WIPO Sequence" softwareVersion="2.2.0"
productionDate="2023-04-06">productionDate="2023-04-06">
<ApplicantFileReference>1</ApplicantFileReference> <ApplicantFileReference>1</ApplicantFileReference>
<ApplicantName languageCode="ru">федеральное государственное <ApplicantName languageCode="ru">federal state
бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр budgetary institution "National Research Center
эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Epidemiology and Microbiology named after honorary academician N.F. Gamaleya"
Министерства здравоохранения Российской Федерации</ApplicantName>Ministry of Health of the Russian Federation</ApplicantName>
<ApplicantNameLatin>federalnoe gosudarstvennoe biudzhetnoe <ApplicantNameLatin>federalnoe gosudarstvennoe biudzhetnoe
uchrezhdenie Natsionalnyi issledovatelskii tsentr epidemiologii i uchrezhdenie Natsionalnyi issledovatelskii tsentr epidemiologii i
mikrobiologii imeni pochetnogo akademika N F Gamalei Ministerstva mikrobiologii imeni pochetnogo akademika N F Gamalei Ministerstva
zdravookhraneniia Rossiiskoi Federatsii</ApplicantNameLatin>zdravookhraneniia Rossiiskoi Federatsii</ApplicantNameLatin>
<InventionTitle languageCode="ru">Модифицированный эндолизин и <InventionTitle languageCode="en">Modified endolysin and
антибактериальные композиции на его основе для лечения инфекций, antibacterial compositions based on it for the treatment of infections,
вызванных бактериями Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa, caused by bacteria Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa,
Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli</InventionTitle>Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli</InventionTitle>
<SequenceTotalQuantity>1</SequenceTotalQuantity> <SequenceTotalQuantity>1</SequenceTotalQuantity>
<SequenceData sequenceIDNumber="1"> <SequenceData sequenceIDNumber="1">
<INSDSeq> <INSDSeq>
<INSDSeq_length>243</INSDSeq_length> <INSDSeq_length>243</INSDSeq_length>
<INSDSeq_moltype>AA</INSDSeq_moltype> <INSDSeq_moltype>AA</INSDSeq_moltype>
<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division> <INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>
<INSDSeq_feature-table> <INSDSeq_feature-table>
<INSDFeature> <INSDFeature>
<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key> <INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>
<INSDFeature_location>1..243</INSDFeature_location> <INSDFeature_location>1..243</INSDFeature_location>
<INSDFeature_quals> <INSDFeature_quals>
<INSDQualifier> <INSDQualifier>
<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name> <INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>protein</INSDQualifier_value> <INSDQualifier_value>protein</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier> </INSDQualifier>
<INSDQualifier id="q2"> <INSDQualifier id="q2">
<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name> <INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>
<INSDQualifier_value>synthetic construct</INSDQualifier_value> <INSDQualifier_value>synthetic construct</INSDQualifier_value>
</INSDQualifier> </INSDQualifier>
</INSDFeature_quals> </INSDFeature_quals>
</INSDFeature> </INSDFeature>
</INSDSeq_feature-table> </INSDSeq_feature-table>
<INSDSeq_sequence>MDILKFNSRGDLVVHLQKKLASLGYKLNPDGIFGKATQEAVIHFQRQNG <INSDSeq_sequence>MDILKFNSRGDLVVHLQKKLASLGYKLNPDGIFGKATQEAVIHFQRQNG
LTSDGIVGKLTWSMLDSKTSSIGKTRTISQNGINFIKSFEGLRLRAYDDGVGVITIGYGTTRYPNGHKVQLTSDGIVGKLTWSMLDSKTSSIGKTRTISQNGINFIKSFEGLRLRAYDDGVGVITIGYGTTRYPNGHKVQ
LGDTCTEKQAEQYLSNDLVKFEKAVNELVKVPVNQNQYDALVSFTYNVGVGALSTSKALKLLNAGDYTGCLGDTCTEKQAEQYLSNDLVKFEKAVNELVKVPVNQNQYDALVSFTYNVGVGALSTSKALKLLNAGDYTGC
AKAMLSWNKGRVGGKLVEIGGLTRRRNAEKDLFLKLERKLRRLKRKIAHKVKKY</INSDSeq_sequenAKAMLSWNKGRVGGKLVEIGGLTRRRNAEKDLFLKLERKLRRLKRKIAHKVKKY</INSDSeq_sequen
ce>ce>
</INSDSeq> </INSDSeq>
</SequenceData> </SequenceData>
</ST26SequenceListing></ST26SequenceListing>
<---<---
Claims (11)
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2813626C1 true RU2813626C1 (en) | 2024-02-14 |
Family
ID=
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2703043C1 (en) * | 2018-09-20 | 2019-10-15 | Наталия Петровна Антонова | Bacteriophage lytic enzyme and antibacterial composition based thereon |
RU2730613C1 (en) * | 2019-05-08 | 2020-08-24 | федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации | Antibacterial composition (embodiments) and use of protein as antimicrobial agent directed against bacteria pseudomonas aeruginosa, klebsiella pneumoniae, escherichia coli, salmonella typhi and staphylococcus haemolyticus (embodiments) |
RU2781050C1 (en) * | 2021-09-28 | 2022-10-04 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью" Федерального медико-биологического агентства | Bactericidal pharmaceutical composition for topical application in the form of an endolysin-containing bactericidal gel |
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2703043C1 (en) * | 2018-09-20 | 2019-10-15 | Наталия Петровна Антонова | Bacteriophage lytic enzyme and antibacterial composition based thereon |
RU2730613C1 (en) * | 2019-05-08 | 2020-08-24 | федеральное государственное бюджетное учреждение «Национальный исследовательский центр эпидемиологии и микробиологии имени почетного академика Н.Ф. Гамалеи» Министерства здравоохранения Российской Федерации | Antibacterial composition (embodiments) and use of protein as antimicrobial agent directed against bacteria pseudomonas aeruginosa, klebsiella pneumoniae, escherichia coli, salmonella typhi and staphylococcus haemolyticus (embodiments) |
RU2781050C1 (en) * | 2021-09-28 | 2022-10-04 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью" Федерального медико-биологического агентства | Bactericidal pharmaceutical composition for topical application in the form of an endolysin-containing bactericidal gel |
RU2790481C1 (en) * | 2021-09-28 | 2023-02-21 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Центр стратегического планирования и управления медико-биологическими рисками здоровью" Федерального медико-биологического агентства | Antibacterial composition based on endolysins and drugs in form of gel or spray, using it |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
БД "GenBank" последовательность под номером APD20282.1, размещена 05.12.2022, endolysin [Acinetobacter phage AM24]. CARRATALA J. V. et al. Design strategies for positively charged endolysins: Insights into Artilysin development. Biotechnology Advances. 6 September 2023, v.69, 108250, p.1-14. ANTONOVA N.P. et al. Modulation of Endolysin LysECD7 Bactericidal Activity by Different Peptide Tag Fusion. Biomolecules. 2020, v.10, no.3, 440, p.1-17. doi: 10.3390/biom10030440. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2724545C2 (en) | Lysine polypeptides active against gram-negative bacteria | |
US11180744B2 (en) | Acinetobacter lysins | |
JP2024010053A (en) | Identification of lysins and derivatives thereof with bacterial activity against pseudomonas aeruginosa | |
KR102499670B1 (en) | Romo1-derived antimicrobial peptides containing lysine substitution and variants thereof | |
IL97344A (en) | Synergistic compositions containing béta-lactam antibiotics and cationic oligopeptides for treating infections | |
US20210330738A1 (en) | Antimicrobial, bacteriophage-derived polypeptides and their use against gram-negative bacteria | |
Ouyang et al. | Improving the antimicrobial performance of amphiphilic cationic antimicrobial peptides using glutamic acid full-scan and positive charge compensation strategies | |
RU2813626C1 (en) | Modified endolysin and antibacterial compositions based thereon for treating infections caused by acinetobacter baumannii, pseudomonas aeruginosa, klebsiella pneumoniae, escherichia coli bacteria | |
US20150072922A1 (en) | Rnase 7 antimicrobial peptides | |
JP2022525914A (en) | How to treat infective endocarditis | |
KR20210151188A (en) | Methods for treating and preventing bone and joint infections | |
RU2807688C9 (en) | Identification of lysines and their derivatives with antibacterial activity against pseudomonas aeruginosa | |
RU2807688C2 (en) | Identification of lysines and their derivatives with antibacterial activity against pseudomonas aeruginosa | |
RU2730613C1 (en) | Antibacterial composition (embodiments) and use of protein as antimicrobial agent directed against bacteria pseudomonas aeruginosa, klebsiella pneumoniae, escherichia coli, salmonella typhi and staphylococcus haemolyticus (embodiments) | |
CA3136126A1 (en) | Lysins and derivatives thereof with bactericidal activity against pseudomonas aeruginosa, in the presence of human serum | |
EP3873917A1 (en) | Compositions and methods comprising lysocins as bioengineered antimicrobials for use in targeting gram-negative bacteria | |
KR20230162045A (en) | Amurin, lysine, and lysine-antimicrobial peptide (AMP) constructs active against Gram-negative bacteria |