RU2807599C2 - Genetically modified sterile birds and method for their reproduction - Google Patents
Genetically modified sterile birds and method for their reproduction Download PDFInfo
- Publication number
- RU2807599C2 RU2807599C2 RU2021113247A RU2021113247A RU2807599C2 RU 2807599 C2 RU2807599 C2 RU 2807599C2 RU 2021113247 A RU2021113247 A RU 2021113247A RU 2021113247 A RU2021113247 A RU 2021113247A RU 2807599 C2 RU2807599 C2 RU 2807599C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- germ cells
- cells
- bird
- germ
- dazl
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 29
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 claims abstract description 164
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims abstract description 65
- 241000271566 Aves Species 0.000 claims abstract description 48
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 claims abstract description 47
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims abstract description 44
- 102100033672 Deleted in azoospermia-like Human genes 0.000 claims abstract description 43
- 101000871280 Homo sapiens Deleted in azoospermia-like Proteins 0.000 claims abstract description 42
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 41
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract description 25
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract description 25
- 108010076667 Caspases Proteins 0.000 claims abstract description 18
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 claims abstract description 16
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims abstract description 15
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims abstract description 15
- 102000011727 Caspases Human genes 0.000 claims abstract description 14
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract description 14
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 54
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 claims description 43
- 238000006471 dimerization reaction Methods 0.000 claims description 35
- 230000008685 targeting Effects 0.000 claims description 33
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 25
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 23
- 108090000566 Caspase-9 Proteins 0.000 claims description 21
- 102000004039 Caspase-9 Human genes 0.000 claims description 18
- 229940079593 drug Drugs 0.000 claims description 13
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 13
- 210000001161 mammalian embryo Anatomy 0.000 claims description 11
- 230000030833 cell death Effects 0.000 claims description 9
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims description 8
- 230000012447 hatching Effects 0.000 claims description 7
- 108020005004 Guide RNA Proteins 0.000 claims description 5
- 230000034994 death Effects 0.000 claims description 5
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims description 4
- 230000013011 mating Effects 0.000 claims description 3
- 238000010453 CRISPR/Cas method Methods 0.000 claims description 2
- 230000006801 homologous recombination Effects 0.000 claims 1
- 238000002744 homologous recombination Methods 0.000 claims 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 3
- 230000006378 damage Effects 0.000 abstract description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 abstract description 2
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 53
- 235000013330 chicken meat Nutrition 0.000 description 53
- 101000830411 Homo sapiens Probable ATP-dependent RNA helicase DDX4 Proteins 0.000 description 38
- 102100024770 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX4 Human genes 0.000 description 38
- 210000002257 embryonic structure Anatomy 0.000 description 31
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 28
- 238000002679 ablation Methods 0.000 description 27
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 26
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 21
- 235000013601 eggs Nutrition 0.000 description 15
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 15
- 239000000411 inducer Substances 0.000 description 15
- 108091033409 CRISPR Proteins 0.000 description 14
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 13
- 108020001162 nitroreductase Proteins 0.000 description 13
- 229940002612 prodrug Drugs 0.000 description 13
- 239000000651 prodrug Substances 0.000 description 13
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 13
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 12
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 11
- 210000002149 gonad Anatomy 0.000 description 11
- 241000894007 species Species 0.000 description 11
- 101150090523 DAZL gene Proteins 0.000 description 10
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 10
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 10
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 10
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 9
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 9
- 238000010354 CRISPR gene editing Methods 0.000 description 8
- 102100027913 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase FKBP1A Human genes 0.000 description 8
- 108010006877 Tacrolimus Binding Protein 1A Proteins 0.000 description 8
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 8
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 8
- 238000011161 development Methods 0.000 description 8
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 8
- 101150099380 Ddx4 gene Proteins 0.000 description 7
- 102000004459 Nitroreductase Human genes 0.000 description 7
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 7
- 241000272525 Anas platyrhynchos Species 0.000 description 6
- 241000272814 Anser sp. Species 0.000 description 6
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 6
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 6
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 6
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 5
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 4
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 4
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 4
- 210000003837 chick embryo Anatomy 0.000 description 4
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 4
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 4
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 4
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 4
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 4
- 230000013020 embryo development Effects 0.000 description 4
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 4
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 4
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 4
- RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N puromycin Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C[C@H](N)C(=O)N[C@H]1[C@@H](O)[C@H](N2C3=NC=NC(=C3N=C2)N(C)C)O[C@@H]1CO RXWNCPJZOCPEPQ-NVWDDTSBSA-N 0.000 description 4
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 4
- 210000003705 ribosome Anatomy 0.000 description 4
- 102220336801 rs1160846305 Human genes 0.000 description 4
- 102200015453 rs121912293 Human genes 0.000 description 4
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 4
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 3
- 102100036450 ATP-dependent RNA helicase TDRD9 Human genes 0.000 description 3
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 3
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 3
- 241000272184 Falconiformes Species 0.000 description 3
- 101000713950 Homo sapiens ATP-dependent RNA helicase TDRD9 Proteins 0.000 description 3
- 101000712009 Homo sapiens RING finger protein 17 Proteins 0.000 description 3
- 101000838456 Homo sapiens Tubulin alpha-1B chain Proteins 0.000 description 3
- 108020004684 Internal Ribosome Entry Sites Proteins 0.000 description 3
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 3
- 241000286209 Phasianidae Species 0.000 description 3
- 102100034188 RING finger protein 17 Human genes 0.000 description 3
- 108091081024 Start codon Proteins 0.000 description 3
- 102100028969 Tubulin alpha-1B chain Human genes 0.000 description 3
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 3
- PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N gold Chemical compound [Au] PCHJSUWPFVWCPO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 3
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 description 3
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 3
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 3
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 3
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 3
- 230000001568 sexual effect Effects 0.000 description 3
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 3
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 3
- 102100020724 Ankyrin repeat, SAM and basic leucine zipper domain-containing protein 1 Human genes 0.000 description 2
- 102000010565 Apoptosis Regulatory Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010063104 Apoptosis Regulatory Proteins Proteins 0.000 description 2
- 241000272201 Columbiformes Species 0.000 description 2
- 238000007702 DNA assembly Methods 0.000 description 2
- 102100037493 Gametocyte-specific factor 1 Human genes 0.000 description 2
- 101000785414 Homo sapiens Ankyrin repeat, SAM and basic leucine zipper domain-containing protein 1 Proteins 0.000 description 2
- 101001026441 Homo sapiens Gametocyte-specific factor 1 Proteins 0.000 description 2
- 101000701391 Homo sapiens Serine/threonine-protein kinase 31 Proteins 0.000 description 2
- 101000878981 Homo sapiens Squalene synthase Proteins 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 2
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 2
- 229930182555 Penicillin Natural products 0.000 description 2
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 2
- 102100030618 Serine/threonine-protein kinase 31 Human genes 0.000 description 2
- 102100037997 Squalene synthase Human genes 0.000 description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 2
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 2
- 239000002771 cell marker Substances 0.000 description 2
- 230000005754 cellular signaling Effects 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 2
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 2
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 2
- 238000010363 gene targeting Methods 0.000 description 2
- 238000010362 genome editing Methods 0.000 description 2
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 2
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 2
- 238000010166 immunofluorescence Methods 0.000 description 2
- 238000012744 immunostaining Methods 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 230000036512 infertility Effects 0.000 description 2
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 2
- 229940049954 penicillin Drugs 0.000 description 2
- COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N phenylalanine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 244000144977 poultry Species 0.000 description 2
- 235000013594 poultry meat Nutrition 0.000 description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 2
- 230000004952 protein activity Effects 0.000 description 2
- 229950010131 puromycin Drugs 0.000 description 2
- 230000001850 reproductive effect Effects 0.000 description 2
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N streptomycin Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- 230000002123 temporal effect Effects 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 210000001550 testis Anatomy 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 2
- 230000008359 toxicosis Effects 0.000 description 2
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 2
- 108010064245 urinary gonadotropin fragment Proteins 0.000 description 2
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- COVZYZSDYWQREU-UHFFFAOYSA-N Busulfan Chemical compound CS(=O)(=O)OCCCCOS(C)(=O)=O COVZYZSDYWQREU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000014914 Carrier Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000397 Caspase 3 Proteins 0.000 description 1
- 102000004018 Caspase 6 Human genes 0.000 description 1
- 108090000425 Caspase 6 Proteins 0.000 description 1
- 108090000567 Caspase 7 Proteins 0.000 description 1
- 102000004068 Caspase-10 Human genes 0.000 description 1
- 108090000572 Caspase-10 Proteins 0.000 description 1
- 102000004046 Caspase-2 Human genes 0.000 description 1
- 108090000552 Caspase-2 Proteins 0.000 description 1
- 102100029855 Caspase-3 Human genes 0.000 description 1
- 102100025597 Caspase-4 Human genes 0.000 description 1
- 101710090338 Caspase-4 Proteins 0.000 description 1
- 102100038902 Caspase-7 Human genes 0.000 description 1
- 102100026548 Caspase-8 Human genes 0.000 description 1
- 108090000538 Caspase-8 Proteins 0.000 description 1
- 241000272161 Charadriiformes Species 0.000 description 1
- 241000272194 Ciconiiformes Species 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 241000252212 Danio rerio Species 0.000 description 1
- 102100030068 Doublesex- and mab-3-related transcription factor 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100033575 Doublesex- and mab-3-related transcription factor B1 Human genes 0.000 description 1
- 241000271571 Dromaius novaehollandiae Species 0.000 description 1
- -1 FKB6 Proteins 0.000 description 1
- 241000287227 Fringillidae Species 0.000 description 1
- 241000272496 Galliformes Species 0.000 description 1
- 101100386498 Gallus gallus DAZL gene Proteins 0.000 description 1
- 108091023971 Gallus gallus miR-6611 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 241000288140 Gruiformes Species 0.000 description 1
- 102100033322 Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-10 Human genes 0.000 description 1
- HVLSXIKZNLPZJJ-TXZCQADKSA-N HA peptide Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)NC(=O)[C@H]1N(CCC1)C(=O)[C@@H](N)CC=1C=CC(O)=CC=1)C1=CC=C(O)C=C1 HVLSXIKZNLPZJJ-TXZCQADKSA-N 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000864807 Homo sapiens Doublesex- and mab-3-related transcription factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 101000871973 Homo sapiens Doublesex- and mab-3-related transcription factor B1 Proteins 0.000 description 1
- 101000926798 Homo sapiens Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(O) subunit gamma-10 Proteins 0.000 description 1
- 101000687974 Homo sapiens Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1 Proteins 0.000 description 1
- 101001077420 Homo sapiens Potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 Proteins 0.000 description 1
- 101000874141 Homo sapiens Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43 Proteins 0.000 description 1
- 101000956729 Homo sapiens RNA helicase Mov10l1 Proteins 0.000 description 1
- 101000652337 Homo sapiens Transcription factor SOX-21 Proteins 0.000 description 1
- 101000838350 Homo sapiens Tubulin alpha-1C chain Proteins 0.000 description 1
- 101000889747 Homo sapiens Tudor domain-containing protein 15 Proteins 0.000 description 1
- 101000835782 Homo sapiens Tudor domain-containing protein 5 Proteins 0.000 description 1
- 108010016648 Immunophilins Proteins 0.000 description 1
- 102000000521 Immunophilins Human genes 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 1
- 102000048850 Neoplasm Genes Human genes 0.000 description 1
- 108700019961 Neoplasm Genes Proteins 0.000 description 1
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 1
- 241000272458 Numididae Species 0.000 description 1
- 241000287127 Passeridae Species 0.000 description 1
- 241000288108 Passeriformes Species 0.000 description 1
- 102100024268 Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1 Human genes 0.000 description 1
- 102100025133 Potassium voltage-gated channel subfamily H member 7 Human genes 0.000 description 1
- 102100035724 Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43 Human genes 0.000 description 1
- 241000287531 Psittacidae Species 0.000 description 1
- 241000287530 Psittaciformes Species 0.000 description 1
- 108090000944 RNA Helicases Proteins 0.000 description 1
- 102000004409 RNA Helicases Human genes 0.000 description 1
- 102100038488 RNA helicase Mov10l1 Human genes 0.000 description 1
- 241000271574 Rheiformes Species 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000287485 Sphenisciformes Species 0.000 description 1
- 241001415849 Strigiformes Species 0.000 description 1
- 241000272534 Struthio camelus Species 0.000 description 1
- 241000271567 Struthioniformes Species 0.000 description 1
- 108010027179 Tacrolimus Binding Proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000018679 Tacrolimus Binding Proteins Human genes 0.000 description 1
- 102100030247 Transcription factor SOX-21 Human genes 0.000 description 1
- 102100028985 Tubulin alpha-1C chain Human genes 0.000 description 1
- 102100040194 Tudor domain-containing protein 15 Human genes 0.000 description 1
- 102100026393 Tudor domain-containing protein 5 Human genes 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- 241000269368 Xenopus laevis Species 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 1
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 210000000709 aorta Anatomy 0.000 description 1
- 230000001640 apoptogenic effect Effects 0.000 description 1
- 238000003782 apoptosis assay Methods 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 229960002118 asunaprevir Drugs 0.000 description 1
- XRWSZZJLZRKHHD-WVWIJVSJSA-N asunaprevir Chemical compound O=C([C@@H]1C[C@H](CN1C(=O)[C@@H](NC(=O)OC(C)(C)C)C(C)(C)C)OC1=NC=C(C2=CC=C(Cl)C=C21)OC)N[C@]1(C(=O)NS(=O)(=O)C2CC2)C[C@H]1C=C XRWSZZJLZRKHHD-WVWIJVSJSA-N 0.000 description 1
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 108091008324 binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 229960002092 busulfan Drugs 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 238000012993 chemical processing Methods 0.000 description 1
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 108091007930 cytoplasmic receptors Proteins 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 210000001671 embryonic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000002889 endothelial cell Anatomy 0.000 description 1
- 244000144992 flock Species 0.000 description 1
- 238000001943 fluorescence-activated cell sorting Methods 0.000 description 1
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 description 1
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000001173 gonocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 1
- 235000015220 hamburgers Nutrition 0.000 description 1
- 239000003018 immunosuppressive agent Substances 0.000 description 1
- 229940124589 immunosuppressive drug Drugs 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 229960000282 metronidazole Drugs 0.000 description 1
- VAOCPAMSLUNLGC-UHFFFAOYSA-N metronidazole Chemical compound CC1=NC=C([N+]([O-])=O)N1CCO VAOCPAMSLUNLGC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091048468 miR-383 stem-loop Proteins 0.000 description 1
- 238000001000 micrograph Methods 0.000 description 1
- 125000000449 nitro group Chemical group [O-][N+](*)=O 0.000 description 1
- 238000006384 oligomerization reaction Methods 0.000 description 1
- 230000017448 oviposition Effects 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 1
- 230000005522 programmed cell death Effects 0.000 description 1
- 230000004853 protein function Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 1
- 238000001959 radiotherapy Methods 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 210000004994 reproductive system Anatomy 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 238000007423 screening assay Methods 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 1
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 229960005322 streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 229960002935 telaprevir Drugs 0.000 description 1
- 108010017101 telaprevir Proteins 0.000 description 1
- BBAWEDCPNXPBQM-GDEBMMAJSA-N telaprevir Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@H](C(=O)N1C[C@@H]2CCC[C@@H]2[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC)C(=O)C(=O)NC1CC1)C(C)(C)C)C1CCCCC1)C(=O)C1=CN=CC=N1 BBAWEDCPNXPBQM-GDEBMMAJSA-N 0.000 description 1
- 101150069263 tra gene Proteins 0.000 description 1
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 1
- 230000001052 transient effect Effects 0.000 description 1
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 1
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 125000002987 valine group Chemical group [H]N([H])C([H])(C(*)=O)C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 101150089602 vasa gene Proteins 0.000 description 1
Abstract
Description
Область техникиField of technology
Настоящее изобретение относится к способам получения генетически модифицированных птиц и/или птиц дикого типа, например, кур, из половых клеток, и к птицам, полученным с применением таких способов.The present invention relates to methods for producing genetically modified birds and/or wild-type birds, such as chickens, from germ cells, and to birds produced using such methods.
Уровень техники State of the art
Получение пород птиц из выделенных половых клеток в настоящее время является в значительной степени неэффективным и сложным процессом. Особой проблемой, связанной с получением генетически модифицированных птиц, является стабильная передача половых клеток, содержащих генетическую модификацию, потомству птиц и последующим поколениям таких птиц. В частности, при использовании обычных способов передача зародышевых клеток является особенно неэффективной из-за конкуренции в формировании функциональных гамет между донорскими зародышевыми клетками, которые могут быть или не быть генетически модифицированными, и эндогенными зародышевыми клетками.Obtaining bird breeds from isolated germ cells is currently a largely inefficient and difficult process. A particular problem associated with the production of genetically modified birds is the stable transmission of germ cells containing the genetic modification to the offspring of birds and subsequent generations of such birds. In particular, when using conventional methods, germ cell transfer is particularly inefficient due to competition in the formation of functional gametes between the donor germ cells, which may or may not be genetically modified, and the endogenous germ cells.
Хотя диплоидные зародышевые клетки могут быть трансплантированы от одной птицы птице-хозяину, доля потомства, полученного из образовавшихся впоследствии гамет, варьирует, при этом все потомство или его часть образуется из гамет, полученных из эндогенных (принадлежащих птице-хозяину) зародышевых клеток (Nakamura et al (2010) Reprod Fert Dev 22(8): 1237-1246; Song et al (2014) Biol Reprod 90(1): 15). Эндогенные (хозяйские) зародышевые клетки могут быть уничтожены с использованием облучения или химиотерапевтических реагентов, таких как бусульфан, но эти токсичные реагенты также могут убить животное вместе с эндогенными зародышевыми клетками. Tagami использовал химическую обработку для получения стерильных суррогатных кур-хозяев (Nakamura et al (2010) Biol Reprod 83(1):130-7). Авторы изобретения и Nakamura использовали гамма-облучение для уничтожения эндогенных зародышевых клеток (MacDonald et al (2010) Plos One 5(11): e15518; Nakamura et al, (2012) J Reprod Dev 58(4): 432-437). Однако, хотя количество потомства, полученного из донорских зародышевых клеток, увеличилось после обработки, не все потомство было получено из донорских зародышевых клеток, и обработка убила многих кур-хозяев.Although diploid germ cells can be transplanted from one bird to a host bird, the proportion of progeny derived from the resulting gametes varies, with all or part of the progeny produced from gametes derived from endogenous (host bird) germ cells (Nakamura et al. al (2010) Reprod Fert Dev 22(8): 1237–1246; Song et al (2014) Biol Reprod 90(1): 15). Endogenous (host) germ cells can be killed using radiation or chemotherapy reagents such as busulfan, but these toxic reagents can also kill the animal along with the endogenous germ cells. Tagami used chemical processing to produce sterile surrogate chicken hosts (Nakamura et al (2010) Biol Reprod 83(1):130-7). We and Nakamura used gamma irradiation to kill endogenous germ cells (MacDonald et al (2010) Plos One 5(11): e15518; Nakamura et al, (2012) J Reprod Dev 58(4): 432-437). However, although the number of progeny produced from donor germ cells increased after the treatment, not all progeny were produced from donor germ cells, and the treatment killed many host hens.
Созданы трансгенные линии стерильных млекопитающих и рыб, которые экспрессируют продукт гена (нитроредуктазу, Ntr) в зародышевых клетках, который будет уничтожать зародышевые клетки в присутствии пролекарства. Ген iC9 (индуцибельная каспаза 9) использовали для уничтожения стволовых клеток у людей и мышей и для уничтожения эндотелиальных клеток у трансгенных мышей. Нельзя ожидать, что такие методы можно будет напрямую перенести на птиц, учитывая разные результаты, полученные с использованием методов модификации зародышевых клеток при применении у млекопитающих и птиц. Например, в предыдущей работе авторов изобретения была получена курица-самка без зародышевых клеток в результате генетической мутации в гене DDX4 с помощью технологии редактирования генома. (Taylor et al., Development 2017). Авторы изобретения не ожидали, что курица-самка будет стерильной, поскольку, в то время как самцы млекопитающих с мутантным геном Ddx4 являются стерильными, самки млекопитающих с мутантным Ddx4 имеют нормальную репродуктивную способность. Таким образом, методы модификации зародышевых клеток могут оказывать совершенно разные эффекты у млекопитающих и птиц. Стерильность также зависит от того, на какой стадии развития погибают эндогенные половые клетки. У птиц стерильные самки DDX4 содержат половые клетки до вылупления, которые могут конкурировать с донорскими зародышевыми клетками, инъецированными в генетически модифицированный хозяйский эмбрион. Transgenic lines of sterile mammals and fish have been created that express a gene product (nitroreductase, Ntr) in germ cells that will kill germ cells in the presence of a prodrug. The iC9 (inducible caspase 9) gene has been used to kill stem cells in humans and mice and to kill endothelial cells in transgenic mice. Such techniques cannot be expected to be directly transferable to birds, given the different results obtained using germ cell modification techniques when applied to mammals and birds. For example, the inventors' previous work produced a female germ cell-free chicken from a genetic mutation in the DDX4 gene using genome editing technology. (Taylor et al., Development 2017). The inventors did not expect the female hen to be sterile because, while male Ddx4 mutant mammals are sterile, female Ddx4 mutant mammals have normal reproductive capacity. Thus, germ cell modification techniques may have very different effects in mammals and birds. Sterility also depends on the stage of development at which endogenous germ cells die. In birds, sterile DDX4 females contain pre-hatching germ cells that can compete with donor germ cells injected into a genetically modified host embryo.
Краткое описание изобретенияBrief description of the invention
Настоящее изобретение решает многие проблемы предшествующего уровня техники. Авторы изобретения неожиданно показали, что при применении генной инженерии для экспрессии рекомбинантного белка в зародышевых клетках, который будет селективно уничтожать хозяйские зародышевые клетки по требованию, например, при воздействии определенного пролекарства или индуктора, не уничтожая другие клетки курицы-хозяина, может быть достигнута высокоэффективная интеграция донорских половых клеток. Этой птице-хозяину можно переносить зародышевую плазму (половые клетки) от разных видов птиц, и генетика потомства будет формироваться из перенесенного материала (фиг. 1).The present invention solves many of the problems of the prior art. The inventors have unexpectedly shown that by using genetic engineering to express a recombinant protein in germ cells that will selectively kill host germ cells on demand, such as upon exposure to a specific prodrug or inducer, without killing other cells of the host chicken, highly efficient integration can be achieved donor germ cells. Germplasm (sex cells) from different bird species can be transferred to this host bird, and the genetics of the offspring will be formed from the transferred material (Fig. 1).
Хотя были созданы трансгенные линии стерильных млекопитающих и рыб, экспрессирующие этот продукт гена, различия в активности и функции белка у представителей птиц и млекопитающих и различия в функции и активности генов между представителями птиц и млекопитающих означают, что нельзя ожидать, что методы, используемые у млекопитающих и рыб, могут быть перенесены на птиц, и, таким образом, методы модификации клеток могут оказывать совершенно разные эффекты у птиц и млекопитающих. Стерильность также зависит от того, когда эндогенные половые клетки погибают во время развития (временный характер активности гена или белка). Необходимо проанализировать много различных локусов у птиц, чтобы определить, будут ли они экспрессировать трансген на подходящей стадии развития, то есть, могут ли зародышевые клетки быть удалены на 100% во время эмбрионального развития. Although transgenic lines of sterile mammals and fish have been generated expressing this gene product, differences in protein activity and function between avian and mammalian species and differences in gene function and activity between avian and mammalian species mean that methods used in mammals cannot be expected to and fish may be transferable to birds, and thus cell modification techniques may have very different effects in birds and mammals. Sterility also depends on when endogenous germ cells die during development (the temporary nature of gene or protein activity). Many different loci in birds need to be analyzed to determine whether they will express the transgene at the appropriate stage of development, that is, whether the germ cells can be 100% removed during embryonic development.
Соответственно, первый аспект настоящего изобретения относится к трансгенной птице, содержащей трансген в зародышевых клетках указанной птицы, где активность белка, кодируемого указанным трансгеном, индуцируется посредством экзогенного индуцирующего агента, и при индукции активность указанного белка вызывает гибель указанных зародышевых клеток.Accordingly, the first aspect of the present invention relates to a transgenic bird containing a transgene in the germ cells of said bird, wherein the activity of a protein encoded by said transgene is induced by an exogenous inducing agent, and upon induction, the activity of said protein causes the death of said germ cells.
Второй аспект изобретения относится к трансгенной конструкции, содержащей (i) первую нуклеотидную последовательность, где активность белка, кодируемого указанной первой нуклеотидной последовательностью, вызывает гибель зародышевых клеток в присутствии экзогенного индуцирующего агента, и (ii) вторую нуклеотидную последовательность, которая нацеливает указанную конструкцию на птичьи зародышевые клетки.A second aspect of the invention relates to a transgenic construct comprising (i) a first nucleotide sequence, wherein the activity of a protein encoded by said first nucleotide sequence causes germ cell death in the presence of an exogenous inducing agent, and (ii) a second nucleotide sequence that targets said construct to avian germ cells.
Третий аспект относится к способу модификации зародышевой плазмы птицы, включающему введение трансгенной конструкции в оплодотворенное яйцо указанной птицы и инкубацию указанного яйца, где указанная трансгенная конструкция представляет собой трансгенную конструкцию согласно второму аспекту изобретения, и где указанная трансгенная конструкция встроена в зародышевые клетки указанного эмбриона.The third aspect relates to a method of modifying avian germplasm, comprising introducing a transgenic construct into a fertilized egg of said bird and incubating said egg, wherein said transgenic construct is a transgenic construct according to the second aspect of the invention, and wherein said transgenic construct is inserted into the germ cells of said embryo.
Четвертый аспект изобретения относится к трансгенной птице, содержащей трансгенную конструкцию согласно второму аспекту изобретения или полученной способом согласно третьему аспекту изобретения.The fourth aspect of the invention relates to a transgenic bird containing a transgenic construct according to the second aspect of the invention or obtained by a method according to the third aspect of the invention.
Согласно изобретению птица может представлять собой любую подходящую птицу. Например, птица может принадлежать к порядку galliformes (курообразные), aseriformes (гусеобразные), passeriformes (воробьинообразные), gruiformes (журавлеобразные), Struthioniformes (страусообразные), rheiformes (нандуобразные), casuariformes (казуарообразные), apyerygiformes (кивиобразные), otidiformes (дрофообразные), columbiformes (голубеобразные), sphenisciformes (пингвинообразные), cathartiformes (катартиды), accipitriformes (ястребообразные), strigiformes (совообразные), psittaciformes (попугаеобразные), charadriiformes (ржанкообразные) или falconiformes (соколообразные). В подходящем варианте птица представляет собой курицу, индейку, утку, гуся, перепела, фазана, тетерева, цесарку, голубя, страуса, эму, певчую птицу, попугая, зяблика, воробья, пингвина или сокола. В одном из вариантов осуществления птица представляет собой курицу.According to the invention, the bird can be any suitable bird. For example, a bird may belong to the order galliformes, aseriformes, passeriformes, gruiformes, struthioniformes, rheiformes, casuariformes, apyerygiformes, otidiformes ), columbiformes (pigeon-like), sphenisciformes (penguin-like), cathartiformes (cathartiformes), accipitriformes (hawk-like), strigiformes (owl-like), psittaciformes (parrot-like), charadriiformes (charadriformes) or falconiformes (falconiformes). Suitably, the bird is a chicken, turkey, duck, goose, quail, pheasant, grouse, guinea fowl, pigeon, ostrich, emu, songbird, parrot, finch, sparrow, penguin or falcon. In one embodiment, the bird is a chicken.
В изобретении трансгенная конструкция согласно изобретению и для применения в нем нацелена на зародышевые клетки. В одном из вариантов осуществления зародышевые клетки представляют собой примордиальные зародышевые клетки. В еще одном варианте осуществления зародышевые клетки представляют собой зародышевые клетки взрослого. Предпочтительно указанная конструкция нацелена на локус птичьего генома, который избирательно экспрессируется в примордиальных зародышевых клетках или зародышевых клетках в гонаде эмбриона, или в семенниках и яичниках взрослой птицы. Предпочтительно локус экспрессируется только в примордиальных зародышевых клетках или зародышевых клетках в гонаде эмбриона или взрослой птицы. В одном из вариантов осуществления трансгенная конструкция нацелена на один из следующих локусов, которые у птицы экспрессируются только в половых клетках: DAZL, DDX4, DMRT1, MIR383, TDRD15, TDRD5, FKB6, GASZ, DMRTB1, TDRD9, GTSF1, MOV10L1, STK31, RNF17, FDFT1, GNG10, DDX43, KCNH7, SOX21 TUBA1B или PNLDC1. В еще одном варианте осуществления указанная конструкция нацелена на один или более из следующих генов, кодирующих РНК: MSTRG.9846 (2:40789480-40848190), MSTRG.10457(2:71880785-71991485), MSTRG.17017 (3: 85453009-85462029). В подходящем варианте трансгенная конструкция нацелена на один из следующих локусов: DAZL, RNF17, TUBA1B, TUBA1C, STK31, FDFT1, gga-mir-6611. Предпочтительно трансген нацелен на локусы, которые на наиболее высоком уровне экспрессируются в куриных ПЗК. Предпочтительно трансген нацелен на локусы, которые на наиболее высоком уровне экспрессируются в ПЗК определенных птиц, например, гуся, утки и т. п.In the invention, the transgenic construct according to the invention and for use therein is targeted to germ cells. In one embodiment, the germ cells are primordial germ cells. In yet another embodiment, the germ cells are adult germ cells. Preferably, said construct targets a locus of the avian genome that is selectively expressed in primordial germ cells or germ cells in the gonad of an embryo, or in the testes and ovaries of an adult bird. Preferably, the locus is expressed only in primordial germ cells or germ cells in the gonad of an embryo or adult bird. In one embodiment, the transgenic construct targets one of the following loci, which in poultry are expressed only in germ cells: DAZL, DDX4, DMRT1, MIR383, TDRD15, TDRD5, FKB6, GASZ, DMRTB1, TDRD9, GTSF1, MOV10L1, STK31, RNF17 , FDFT1, GNG10, DDX43, KCNH7, SOX21 TUBA1B or PNLDC1. In yet another embodiment, the construct targets one or more of the following RNA encoding genes: MSTRG.9846 (2:40789480-40848190), MSTRG.10457(2:71880785-71991485), MSTRG.17017 (3:85453009-85462029 ). Suitably, the transgenic construct targets one of the following loci: DAZL, RNF17, TUBA1B, TUBA1C, STK31, FDFT1, gga-mir-6611. Preferably, the transgene targets loci that are expressed at the highest levels in chicken PGCs. Preferably, the transgene targets loci that are expressed at the highest levels in the PGC of certain birds, for example, goose, duck, etc.
Сравнение транскриптома РНК примордиальных зародышевых клеток различных видов птиц позволило определить гены, которые экспрессируются на высоких уровнях в зародышевых клетках большинства видов птиц. Этот анализ показал, что DAZL имеет самый высокий уровень у большинства видов птиц, GTSF1 - второй по величине для гусиных зародышевых клеток, а TDRD9 - второй по величине для утиных зародышевых клеток. Таким образом, разные участки генома могут лучше функционировать у отдельных видов птиц. На фиг. 21 показаны уровни экспрессии у курицы, утки и гуся, соответственно. Comparison of the RNA transcriptome of primordial germ cells of different avian species has identified genes that are expressed at high levels in the germ cells of most avian species. This analysis showed that DAZL has the highest level in most bird species, GTSF1 is the second highest in goose germ cells, and TDRD9 is the second highest in duck germ cells. Thus, different regions of the genome may function better in individual bird species. In fig. 21 shows the expression levels in chicken, duck and goose, respectively.
В подходящем варианте трансген нацелен на локусы, которые экспрессируются в правильное время в процессе роста и репродуктивном цикле птиц, чтобы обеспечить развитие птицы и репродуктивной системы птицы, но минимизировать конкуренцию донорских и хозяйских половых клеток. Например, в вариантах осуществления изобретения авторы изобретения определили, что из-за временного характера обеспечиваемой экспрессии стерильные самки DDX4 содержали половые клетки до вылупления, которые могут конкурировать с донорскими зародышевыми клетками. Зародышевые клетки погибали только после вылупления. Понятно, что возможность обеспечения возможности экспрессии до тех пор, пока не будет применен экзогенный агент, модулирования экспрессии посредством предоставления экзогенного агента и возможность учитывать временной характер экспрессии может обеспечить более выгодную систему, чем простой нокаут полового гена в организме хозяина.Suitably, the transgene targets loci that are expressed at the correct times during the avian growth and reproductive cycle to promote development of the bird and the avian reproductive system, but minimize competition between donor and host germ cells. For example, in embodiments of the invention, the inventors determined that due to the transient nature of the expression provided, sterile DDX4 females contained pre-hatching germ cells that could compete with the donor germ cells. The germ cells died only after hatching. It is understood that the ability to allow expression until an exogenous agent is applied, modulation of expression by providing an exogenous agent, and the ability to account for the temporal nature of expression may provide a more advantageous system than simply knocking out a sex gene in the host.
В подходящем варианте абляционный ген гибели клеток и локус, на который он нацелен, могут быть выбраны для абляции зародышевых клеток во время эмбрионального развития в зависимости от требований. Suitably, the ablative cell death gene and the locus it targets can be selected for ablation of germ cells during embryonic development depending on the requirements.
Абляционный трансген гибели клеток должен быть достаточно активным, чтобы обеспечивать абляцию большей части зародышевых клеток во время эмбрионального развития. DDX4 может быть выбран в качестве второй по предпочтительности альтернативы dazl в качестве локуса у кур. Понятно, что обеспечение трансгена, вызывающего абляцию клеток, обладающего повышенной апоптотической активностью могло бы преодолеть недостаточность абляции, о которой сообщалось при использовании нитроредуктазы. Например, повышенная активность iCaspase9 позволила бы использовать локус DDX4. Как будет понятно специалистам в данной области техники, для идентификации изменений аминокислот в белках, которые обеспечивают абляцию или потенциальную абляцию (Caspase9 или нитроредуктаза, или любой другой ген, индуцирующий гибель клеток), может быть использован скрининговый анализ, и чтобы сделать такие белки достаточно активными или более активными для обеспечения абляции зародышевых клеток на функционально полезных уровнях/с повышенной эффективностью может быть использован скрининг. Затем такие белки могут быть введены в любой из перечисленных локусов, специфичных для зародышевых клеток. An ablative cell death transgene must be active enough to ablate most germ cells during embryonic development. DDX4 may be selected as a second-preferred alternative to dazl as a locus in chickens. It is clear that providing a cell ablation transgene with enhanced apoptotic activity could overcome the ablation failure reported with nitroreductase. For example, increased iCaspase9 activity would allow use of the DDX4 locus. As will be appreciated by those skilled in the art, a screening assay can be used to identify amino acid changes in proteins that mediate ablation or potential ablation (Caspase9 or nitroreductase, or any other cell death inducing gene) and to make such proteins sufficiently active or more active to provide germ cell ablation at functionally useful levels/with increased efficiency, screening may be used. Such proteins can then be introduced into any of the listed germ cell-specific loci.
В вариантах осуществления изобретения было обнаружено, что ген каспазы 9 (версия аминокислот млекопитающего или модифицированной последовательностями курицы («куринизированная») версия (aviCaspase9), т.е. версия, приближенная по последовательности аминокислот к куриному белку) является особенно подходящим для обеспечения абляции хозяйских клеток. Как отмечено в примерах, было определено, что aviCaspase9 не вызывает абляцию всех зародышевых клеток, когда он присутствует в культуре клеток при введении в локус DDX4 куриной клетки.In embodiments of the invention, the caspase 9 gene (a mammalian amino acid version or a chicken sequence-modified version (aviCaspase9), i.e. a version similar in amino acid sequence to chicken protein) has been found to be particularly suitable for providing ablation of host proteins. cells. As noted in the Examples, aviCaspase9 was determined to not cause ablation of all germ cells when present in cell culture when introduced into the DDX4 locus of a chicken cell.
В подходящем варианте трансген каспазы 9 с аминокислотами млекопитающего может быть предложен для абляции зародышевых клеток при нацеливании на локус DAZL. В подходящем варианте абляция обеспечивает получение по существу чистого донорского потомства, например, более 75%, более 80%, более 85%, более 90%, более 95%, более 97%, более 99%, 100%. В подходящем варианте iCaspase9 может быть использован у кур для стерилизующей абляции. Было установлено, что ген iCaspase9 обеспечивает полную стерилизующую абляцию у кур (фиг. 23).Suitably, a mammalian amino acid caspase 9 transgene may be proposed for germ cell ablation by targeting the DAZL locus. Suitably, the ablation produces substantially pure donor progeny, eg, greater than 75%, greater than 80%, greater than 85%, greater than 90%, greater than 95%, greater than 97%, greater than 99%, 100%. Suitably, iCaspase9 can be used in chickens for sterilizing ablation. The iCaspase9 gene was found to provide complete sterilizing ablation in chickens (Fig. 23).
В частном варианте осуществления трансген может представлять собой кДНК, нацеленную на птичий локус DAZL, в частности, на с-концевую область птичьего локуса DAZL. Авторы изобретения определили, что DAZL не только экспрессируется на высоких уровнях в примордиальных зародышевых клетках и, таким образом, обеспечивает селективную абляцию клеток, но также обеспечивает достаточную экспрессию токсичного белка для обеспечения абляции. Более того, авторы изобретения определили, что помимо уровня экспрессии, обеспечиваемого локусами, важно время осуществления экспрессии (временной характер экспрессии). DAZL экспрессируется на ранней стадии в примордиальных зародышевых клетках птичьего эмбриона. Следовательно, временная экспрессия DAZL также выгодна для его использования при экспрессии токсичных белков или белков, индуцирующих апоптоз. В подходящем варианте iCaspase9 под управлением DAZL является особенно предпочтительным. Например, авторы изобретения определили, что трансген iCaspase9 хорошо функционирует в локусе DAZL курицы. In a particular embodiment, the transgene may be a cDNA targeting the avian DAZL locus, in particular the C-terminal region of the avian DAZL locus. The inventors determined that DAZL is not only expressed at high levels in primordial germ cells and thus mediates selective cell ablation, but also provides sufficient expression of the toxic protein to mediate ablation. Moreover, the inventors have determined that in addition to the level of expression provided by the loci, the timing of expression (temporal pattern of expression) is important. DAZL is expressed early in the primordial germ cells of the avian embryo. Therefore, transient expression of DAZL is also beneficial for its use in the expression of toxic or apoptosis-inducing proteins. Suitably, iCaspase9 under the control of DAZL is particularly preferred. For example, we determined that the iCaspase9 transgene functions well at the chicken DAZL locus.
Уровень экспрессии, обеспечиваемый конструкцией, и время осуществления экспрессии считаются важными факторами в контексте экспрессии токсичных белков или белков, индуцирующих апоптоз (например, каспазы), в отличие от использования нокаутов, когда может быть достаточным разрушение локуса. Степень абляции, производимой трансгеном, может регулироваться генетическим расположением трансгена, например, когда он встроен на 5'-конце гена или встроен на 3'-конце гена, или как независимый трансген, экспрессия которого управляется регуляторными областями генов, экспрессируемых только в половых клетках птиц.The level of expression provided by the construct and the timing of expression are considered important factors in the context of the expression of toxic or apoptosis-inducing proteins (eg caspases), as opposed to the use of knockouts where disruption of the locus may be sufficient. The extent of ablation produced by a transgene can be controlled by the genetic location of the transgene, for example when it is inserted at the 5' end of a gene, or inserted at the 3' end of a gene, or as an independent transgene whose expression is controlled by regulatory regions of genes expressed only in avian germ cells .
Как описано в настоящем документе, трансгенная конструкция согласно изобретению и для применения в нем содержит первую нуклеотидную последовательность, экспрессируемый с которой белок вызывает гибель зародышевых клеток в присутствии экзогенного индуцирующего агента. В некоторых вариантах осуществления трансген кодирует белок, активность или экспрессия которого индуцируются посредством экзогенного индуцирующего агента, где экспрессированный белок вызывает гибель указанных зародышевых клеток в присутствии экзогенного индуцирующего агента.As described herein, the transgenic construct of the invention and for use therein comprises a first nucleotide sequence, when expressed, a protein causes germ cell death in the presence of an exogenous inducing agent. In some embodiments, the transgene encodes a protein whose activity or expression is induced by an exogenous inducing agent, wherein the expressed protein causes the death of said germ cells in the presence of the exogenous inducing agent.
В подходящем варианте трансген может содержать часть, которая кодирует индуцируемый домен димеризации и домен, индуцирующий апоптоз. В подходящем варианте индуцируемый домен димеризации может представлять собой химически индуцируемый домен димеризации. В присутствии агента, индуцирующего димеризацию, например, химического соединения, индуцирующего димеризацию, экспрессированный белок димеризуется, вызывая апоптоз эндогенных зародышевых клеток.Suitably, the transgene may comprise a portion that encodes an inducible dimerization domain and an apoptosis-inducing domain. Suitably, the inducible dimerization domain may be a chemically inducible dimerization domain. In the presence of a dimerization-inducing agent, such as a dimerization-inducing chemical, the expressed protein dimerizes, causing apoptosis of the endogenous germ cells.
В изобретении может быть использован любой подходящий домен, индуцирующий апоптоз. В одном из вариантов осуществления домен, индуцирующий апоптоз, содержит ген каспазы, кодирующий белок каспазы, или состоит из него. Такими белками каспазы являются каспаза 2, 3, 4, 6, 7, 8, 9 или 10. Такой белок каспазы может содержать аминокислотные последовательности млекопитающих или птиц, или других позвоночных. В одном из вариантов осуществления каспаза представляет собой каспазу 9.Any suitable apoptosis-inducing domain may be used in the invention. In one embodiment, the apoptosis-inducing domain comprises or consists of a caspase gene encoding a caspase protein. Such caspase proteins are caspase 2, 3, 4, 6, 7, 8, 9 or 10. Such a caspase protein may contain amino acid sequences from mammals or birds or other vertebrates. In one embodiment, the caspase is caspase 9.
Соответственно, в подходящем варианте ген индуцибельная каспаза 9 (iC9) может экспрессироваться в зародышевых клетках птицы, например, курицы. При воздействии препарата для химически индуцированной димеризации (CID) каспаза 9 будет димеризоваться и активироваться, а затем вызовет апоптоз зародышевых клеток, содержащих димеризованную каспазу 9.Accordingly, in a suitable embodiment, the inducible caspase 9 (iC9) gene may be expressed in germ cells of an avian, such as chicken. When exposed to a chemically induced dimerization (CID) drug, caspase 9 will dimerize and become activated and then cause apoptosis of germ cells containing the dimerized caspase 9.
В подходящем варианте экспрессия указанного гена каспазы может быть индуцирована применением агента-индуктора димеризации посредством домена димеризации, индуцирующего димеризацию. Подходящие агенты-индукторы димеризации, которые могут быть использованы в изобретении, включают лиганд AP20187 (молекула B/B, Takara) или химические варианты этого продукта FK1012, AP1501, AP1903. Suitably, expression of said caspase gene can be induced by the use of a dimerization inducing agent via a dimerization inducing domain. Suitable dimerization inducing agents that can be used in the invention include ligand AP20187 (molecule B/B, Takara) or its chemical variants FK1012, AP1501, AP1903.
В одном таком варианте осуществления трансген представляет собой кДНК, кодирующую домен димеризации FKBP12 и ген каспазы 9, нацеленный на генетический локус, выбранный из DAZL или DDX4, в частности, DAZL или DDX4 у курицы. In one such embodiment, the transgene is a cDNA encoding an FKBP12 dimerization domain and a caspase 9 gene targeting a genetic locus selected from DAZL or DDX4, particularly DAZL or DDX4 in chicken.
В еще одном варианте осуществления указанный трансген может кодировать домен димеризации, слитый с доменом, индуцирующим апоптоз, например, геном каспазы, который может приводить к димеризации кодируемого белка после доставки препарата-индуктора стабильной димеризации. Например, трансген может кодировать стабилизируемый полипептидный линкер (SPL), присоединенный к молекуле каспазы. Добавление соединения, такого как асунапревир и телапревир, может стабилизировать домен димеризации молекул каспазы, что приведет к активации молекулы каспазы и активации гибели клеток (Jacobs et al (2018) Nature Methods 15: 523-526). In yet another embodiment, the transgene may encode a dimerization domain fused to an apoptosis-inducing domain, such as a caspase gene, which may result in dimerization of the encoded protein upon delivery of a stable dimerization inducer drug. For example, the transgene may encode a stabilized polypeptide linker (SPL) attached to a caspase molecule. The addition of a compound such as asunaprevir and telaprevir can stabilize the dimerization domain of caspase molecules, leading to activation of the caspase molecule and activation of cell death (Jacobs et al (2018) Nature Methods 15: 523-526).
В альтернативном варианте осуществления трансген может кодировать фермент, который превращает пролекарства в цитотоксические метаболиты. В таком примере в эндогенные зародышевые клетки может быть введено пролекарство (которое действует как экзогенный индуцирующий агент), и экспрессия трансгена, например кДНК, кодирующей ген бактериальной нитроредуктазы, может обеспечить фермент, который превращает пролекарство в цитотоксический метаболит.In an alternative embodiment, the transgene may encode an enzyme that converts prodrugs into cytotoxic metabolites. In such an example, a prodrug (which acts as an exogenous inducing agent) may be introduced into endogenous germ cells, and expression of a transgene, such as a cDNA encoding a bacterial nitroreductase gene, may provide an enzyme that converts the prodrug to a cytotoxic metabolite.
В такой системе могут быть использованы любой подходящий фермент и пролекарство, активируемое указанным ферментом. Например, когда фермент представляет собой нитроредуктазу, пролекарство может представлять собой CB1954 или метронидазол. Any suitable enzyme and prodrug activated by said enzyme may be used in such a system. For example, when the enzyme is a nitroreductase, the prodrug may be CB1954 or metronidazole.
В одном таком варианте осуществления трансген представляет собой кДНК, кодирующую ген нитроредуктазы, нацеленный на генетический локус, выбранный из DAZL или DDX4, в частности, DAZL или DDX4 у курицы.In one such embodiment, the transgene is a cDNA encoding a nitroreductase gene targeting a genetic locus selected from DAZL or DDX4, in particular DAZL or DDX4 in chicken.
В одном из вариантов осуществления трансгенная конструкция согласно изобретению и для применения в нем содержит кДНК и последовательность 2A или IRES (участок внутренней посадки рибосомы), так что рекомбинантный белок экспрессируется на одинаковых уровнях с эндогенным геном. Например, пептидная последовательность 2А может быть связана с кДНК, так что рекомбинантный белок экспрессируется на одинаковых уровнях с эндогенным геном. In one embodiment, the transgenic construct of the invention and for use therein comprises cDNA and a 2A or IRES (internal ribosome entry site) sequence such that the recombinant protein is expressed at similar levels to the endogenous gene. For example, the 2A peptide sequence can be linked to cDNA such that the recombinant protein is expressed at similar levels to the endogenous gene.
В одном из вариантов осуществления нуклеотидная последовательность из локуса, который у птицы экспрессируется только в зародышевых клетках или половых клетках (примеры таких локусов, включая DAZL и DDX4, приведены выше), где указанная нуклеотидная последовательность содержит регуляторные области и первый экзон до первого кодирующего метионина, связана с кДНК. Эта область ДНК может быть введена в организм птицы любым подходящим способом, который будет обеспечивать специфическую экспрессию рекомбинантного белка в зародышевых клетках, например, в транспозоне. In one embodiment, a nucleotide sequence from a locus that in birds is expressed only in germ cells or germ cells (examples of such loci, including DAZL and DDX4, are given above), wherein the nucleotide sequence comprises regulatory regions and the first exon up to the first methionine coding, linked to cDNA. This region of DNA can be introduced into the bird by any suitable method that will ensure specific expression of the recombinant protein in the germ cells, for example, in a transposon.
Примеры матриц репарации DAZL и DDX4 для применения в изобретении показаны на фиг. 15, 16, 17 и 18. Такие матрицы репарации составляют дополнительные независимые аспекты изобретения.Examples of DAZL and DDX4 repair templates for use in the invention are shown in FIG. 15, 16, 17 and 18. Such repair matrices constitute additional independent aspects of the invention.
В способах согласно изобретению для нацеливания трансгенной конструкции на зародышевые клетки могут быть использованы любые подходящие средства. В подходящем варианте для нацеливания трансгена на зародышевые клетки может быть использована система на основе CRISPR, такая как система на основе CRISPR/cas или CRISPR/cfp. В такой системе гидовая РНК может нацеливать конструкцию на зародышевые клетки.In the methods of the invention, any suitable means may be used to target the transgenic construct to germ cells. Suitably, a CRISPR-based system, such as a CRISPR/cas or CRISPR/cfp-based system, can be used to target the transgene to germ cells. In such a system, guide RNA can target the construct to germ cells.
В соответствии с дополнительным аспектом настоящего изобретения предложен набор, содержащий трансгенную конструкцию согласно второму аспекту изобретения и сайт-специфическую нуклеазу, такую как Cas9, для нацеливания указанной конструкции на генетический локус, специфически транскрибируемый в зародышевых клетках. In accordance with a further aspect of the present invention, there is provided a kit comprising a transgenic construct according to the second aspect of the invention and a site-specific nuclease, such as Cas9, for targeting the construct to a genetic locus specifically transcribed in germ cells.
В альтернативном варианте осуществления системы на основе CRISPR для нацеливания трансгенной конструкции на зародышевые клетки может быть использована система на основе транспозона для нацеливания трансгенной конструкции на зародышевые клетки. В такой системе нацеливание может быть достигнуто путем включения в транспозон (i) регуляторных областей из гена, избирательно экспрессируемого, предпочтительно исключительно экспрессируемого, в зародышевых клетках, вместе с (ii) указанной первой нуклеотидной последовательностью. Например, такой транспозон может содержать регуляторные области из DDX4 или DAZL, ген каспазы 9 и домен димеризации (в подходящем варианте - DAZL и icaspase9). Ожидается, что первая нуклеотидная последовательность будет экспрессироваться только в зародышевых клетках. Таким образом, при применении экзогенного индуцирующего агента можно ожидать гибели только зародышевых клеток. In an alternative embodiment of a CRISPR-based system for targeting a transgene construct to germ cells, a transposon-based system may be used to target the transgene construct to germ cells. In such a system, targeting can be achieved by incorporating into the transposon (i) regulatory regions from a gene selectively expressed, preferably exclusively expressed, in germ cells, together with (ii) said first nucleotide sequence. For example, such a transposon may contain regulatory regions from DDX4 or DAZL, a caspase 9 gene, and a dimerization domain (suitably DAZL and icaspase9). The first nucleotide sequence is expected to be expressed only in germ cells. Thus, when using an exogenous inducing agent, only germ cell death can be expected.
Трансгенная конструкция согласно второму аспекту изобретения может быть использована для модификации зародышевой плазмы птицы. Путем нацеливания трансгенной конструкции на зародышевые клетки и введения индуцирующего агента трансген активируется таким образом, что он может селективно уничтожать эндогенные зародышевые клетки. В подходящем варианте активация трансгена зародышевых клеток вызывает снижение количества зародышевых клеток по меньшей мере на 10%, по меньшей мере на 20%, по меньшей мере на 30%, по меньшей мере на 50%, по меньшей мере на 70%, по меньшей мере на 90%, до 100% от нормальных значений. В подходящем варианте процесс обеспечивает птицу, у которой отсутствуют эндогенные половые клетки. The transgenic construct according to the second aspect of the invention can be used to modify poultry germplasm. By targeting the transgene construct to germ cells and introducing an inducing agent, the transgene is activated such that it can selectively kill endogenous germ cells. Suitably, activation of the germ cell transgene causes a reduction in the number of germ cells by at least 10%, at least 20%, at least 30%, at least 50%, at least 70%, at least by 90%, up to 100% of normal values. Suitably, the process provides a bird that lacks endogenous germ cells.
В подходящем варианте при индукции трансген может экспрессироваться в присутствии экзогенного индуцирующего агента на уровне, достаточном для того, чтобы вызвать гибель зародышевых клеток при культивировании in vitro.Suitably, upon induction, the transgene may be expressed in the presence of an exogenous inducing agent at a level sufficient to cause germ cell death when cultured in vitro.
После или во время уничтожения эндогенных зародышевых клеток посредством, например, активации белка, кодируемого доменом, индуцирующим апоптоз, или превращения пролекарства в цитотоксический метаболит ферментом, кодируемым трансгеном, птице, лишенной зародышевых клеток (птице-хозяину), могут быть введены клетки (трансплантированные клетки), например, зародышевые клетки от другой птицы того же или другого вида птиц, так что птица-хозяин производит потомство с генетикой трансплантированных клеток. В подходящем варианте способ может включать этап трансплантации зародышевых клеток от птицы-донора суррогатной птице. After or during the destruction of endogenous germ cells by, for example, activation of a protein encoded by an apoptosis-inducing domain or conversion of a prodrug to a cytotoxic metabolite by an enzyme encoded by a transgene, the cells (transplanted cells) may be administered to the germ cell-deprived bird (host bird). ), for example, germ cells from another bird of the same or a different bird species, so that the host bird produces offspring with the genetics of the transplanted cells. Suitably, the method may include the step of transplanting germ cells from a donor bird to a surrogate bird.
В подходящем варианте индукция активности белка, кодируемого трансгеном, может быть остановлена до трансплантации донорских клеток.Suitably, induction of the activity of the protein encoded by the transgene can be stopped prior to transplantation of the donor cells.
В подходящем варианте трансплантированные клетки от птицы-донора могут быть получены из замороженных клеток. Suitably, the transplanted cells from the donor bird may be obtained from frozen cells.
Понятно, что зародышевые клетки, трансплантированные суррогатному хозяину от птицы-донора, будут иметь повышенный шанс конкурировать с эндогенными зародышевыми клетками, которые присутствовали в организме суррогатного хозяина, из-за действия трансгена.It is understood that germ cells transplanted into a surrogate host from a donor bird will have an increased chance of competing with endogenous germ cells that were present in the surrogate host due to the action of the transgene.
В подходящем варианте трансплантированные клетки могут представлять собой половые клетки с отредактированным геномом. В подходящем варианте половые клетки с отредактированным геномом могут происходить от того же или другого вида птиц, что и птица-хозяин.Suitably, the transplanted cells may be genome-edited germ cells. Suitably, the genome-edited germ cells may be derived from the same or a different avian species as the host bird.
В подходящем варианте способ может включать этап обеспечения птицы с геномом трансплантированных клеток. В подходящем варианте суррогатная птица-хозяин может применяться для получения множества, например, стаи, птиц с отредактированным геномом из половых клеток с отредактированным геномом этого же вида птиц или другого вида птиц.Suitably, the method may include the step of providing the bird with the genome of the transplanted cells. Suitably, a surrogate bird host may be used to produce a plurality, for example a flock, of genome-edited birds from genome-edited germ cells of the same bird species or a different bird species.
В одном из аспектов изобретения предложен способ получения суррогатной птицы-хозяина, включающий встраивание трансгенной конструкции в оплодотворенные яйца птицы и инкубацию указанных яиц до вылупления, где указанную трансгенную конструкцию встраивают в зародышевые клетки указанного эмбриона и белок, экспрессируемый с этой трансгенной конструкции, вызывает гибель указанных зародышевых клеток в присутствии экзогенного индуцирующего агента. Указанный способ позволяет встраивать указанную трансгенную конструкцию не только в зародышевые клетки указанного эмбриона, но также и в зародышевые клетки всего потомства, полученного впоследствии от птицы, полученной из указанного эмбриона. In one aspect of the invention, a method is provided for producing a surrogate avian host, comprising inserting a transgenic construct into fertilized avian eggs and incubating said eggs until hatching, wherein said transgenic construct is inserted into the germ cells of said embryo and the protein expressed from the transgenic construct causes the death of said germ cells in the presence of an exogenous inducing agent. This method allows for the insertion of said transgenic construct not only into the germ cells of said embryo, but also into the germ cells of all offspring subsequently obtained from a bird derived from said embryo.
В подходящем варианте способ может дополнительно включать обработку полученного суррогатного хозяина экзогенным индуцирующим агентом, чтобы вызвать гибель указанных эндогенных зародышевых клеток. В подходящем варианте способ дополнительно включает трансплантацию экзогенных половых клеток указанному суррогатному хозяину.Suitably, the method may further comprise treating the resulting surrogate host with an exogenous inducing agent to cause the death of said endogenous germ cells. Suitably, the method further comprises transplanting exogenous germ cells into said surrogate host.
В подходящем варианте способ дополнительно включает скрещивание самцов и самок-потомков от одной или более указанных суррогатных птиц-хозяев с получением птиц-потомков с зародышевыми клетками, имеющими генетические характеристики трансплантированных зародышевых клеток. Обнаружение потомства от трансплантированных зародышевых клеток может быть осуществлено стандартными методами геномного секвенирования. Suitably, the method further comprises mating male and female offspring from one or more of said surrogate host birds to produce offspring birds with germ cells having the genetic characteristics of the transplanted germ cells. Detection of progeny from transplanted germ cells can be accomplished by standard genomic sequencing methods.
Суррогатная птица-хозяин может быть использована для трансплантации клеток, в частности, зародышевых клеток, от других видов птиц. Зародышевые клетки могут представлять собой примордиальные зародышевые клетки, эмбриональные зародышевые клетки, гоноциты. Зародышевые клетки могут быть трансплантированы путем трансплантации семенников или яичников взрослой особи. Суррогатная птица-хозяин производит потомство с генетикой трансплантированных клеток.A surrogate avian host can be used to transplant cells, particularly germ cells, from other avian species. The germ cells may be primordial germ cells, embryonic germ cells, gonocytes. Germ cells can be transplanted by transplanting the testes or ovaries of an adult. The surrogate host bird produces offspring with the genetics of the transplanted cells.
Суррогатная птица-хозяин может быть использована для воссоздания видов птиц из замороженного генетического материала, хранящегося в форме половых клеток. Воссозданные виды птиц будут иметь геном замороженных половых клеток. A surrogate bird host can be used to recreate bird species from frozen genetic material stored in the form of germ cells. The recreated bird species will have a genome of frozen germ cells.
Варианты осуществления настоящего изобретения далее будут описаны только в качестве примера со ссылкой на прилагаемые графические материалы, где:Embodiments of the present invention will now be described by way of example only with reference to the accompanying drawings, in which:
Фиг. 1. Схема трансплантации зародышевых клеток стерильному хозяину.Fig. 1. Scheme of transplantation of germ cells into a sterile host.
Фиг. 2. Схема, показывающая нацеливание NTR и iCaspase9 (iC9) на локус DDX4. Матрица репарации NTR, нацеленная на локус DDX4, и матрица репарации ic9, нацеленная на локус DDX4.Fig. 2. Schematic showing NTR and iCaspase9 (iC9) targeting to the DDX4 locus. NTR repair template targeting the DDX4 locus and ic9 repair template targeting the DDX4 locus.
Фиг. 3. Схема, показывающая нацеливание NTR и iCaspase9 (iC9) на локус DAZL. Матрица репарации NTR, нацеленная на локус DAZL, и матрица репарации ic9, нацеленная на локус DAZL.Fig. 3. Schematic showing the targeting of NTR and iCaspase9 (iC9) to the DAZL locus. NTR repair template targeting the DAZL locus and ic9 repair template targeting the DAZL locus.
Фиг. 4. ПЗК, нацеленные на локус DAZL, экспрессируют примерно в 4 раза больше GFP, чем клетки, нацеленные на локус DDX4. ПЗК, содержащие GFP, нацеленные на локус Dazl, экспрессируют в 3,8 раза большую флуоресценцию GFP, чем ПЗК, содержащие GFP, нацеленные на локус Ddx4. A. Анализ флуоресценции GFP методом проточной цитометрии B. Микрофотография нацеленных ПЗК.Fig. 4. PGCs targeting the DAZL locus express approximately 4 times more GFP than cells targeting the DDX4 locus. GFP-containing PGCs targeting the Dazl locus express 3.8-fold more GFP fluorescence than GFP-containing PGCs targeting the Ddx4 locus. A. Flow cytometry analysis of GFP fluorescence B. Micrograph of targeted PGCs.
Фиг. 5. 500 ПЗК (контроль, CAG-NTR или Dazl-NTR) культивировали в присутствии или в отсутствие пролекарства нитроредуктазы CB1954 (n=2 для каждой концентрации пролекарства). Через 10 дней подсчитывали общее количество клеток в каждой лунке. N=6 для каждого значения из трех независимых экспериментов.Fig. 5. 500 PGCs (control, CAG-NTR or Dazl-NTR) were cultured in the presence or absence of the nitroreductase prodrug CB1954 (n=2 for each prodrug concentration). After 10 days, the total number of cells in each well was counted. N=6 for each value from three independent experiments.
Фиг. 6. 500 ПЗК (dazl-GFP, dazl-каспаза-человека или dazl-каспаза-курицы) культивировали в присутствии или в отсутствие молекулы-индуктора димеризации B/B. Через 10 дней подсчитывали общее количество клеток в каждой лунке. N=6 для каждого значения из трех независимых экспериментов.Fig. 6. 500 PGCs (dazl-GFP, dazl-caspase-human or dazl-caspase-chicken) were cultured in the presence or absence of the B/B dimerization inducer molecule. After 10 days, the total number of cells in each well was counted. N=6 for each value from three independent experiments.
Фиг. 7. Обработка B/B вызывает абляцию инъецированных ПЗК, нацеленных посредством DAZL-iCasp9. Эмбрионам на стадии 16 HH инъецировали 3500 ПЗК, трансфицированных реагентами CRISPR для вставки гена индуцибельной каспазы и GFP в локус dazl, и 3500 ПЗК, трансфицированных транспозоном для случайной вставки кассеты для экспрессии TdTomato в геном. После инъекции эмбрионам вводили 50 мкл 1x пенициллина/стрептомицина с или без 25 нМ препарата-индуктора димеризации B/B. На 8 день развития гонады иссекали и просматривали при флуоресценции. Изображения представляют собой три независимых инъекции для каждого варианта обработки.Fig. 7. B/B treatment causes ablation of injected PGCs targeted by DAZL-iCasp9. Stage 16 HH embryos were injected with 3500 PGCs transfected with CRISPR reagents to insert the inducible caspase gene and GFP into the dazl locus, and 3500 PGCs transfected with a transposon to randomly insert a TdTomato expression cassette into the genome. After injection, embryos were injected with 50 μl of 1x penicillin/streptomycin with or without 25 nM B/B dimerization inducer drug. On day 8 of development, the gonads were dissected and observed under fluorescence. Images are representative of three independent injections for each treatment.
Фиг. 8. Семь вариантов потомков G1, нацеленных посредством iCaspase9 и aviCaspase9 Fig. 8. Seven G1 progeny variants targeted by iCaspase9 and aviCaspase9
DAZL icaspase9, Dazl aviCaspase9 (курицы) инъецировали в оплодотворенные яйца от гетерозиготных по DDX4 самцов кур, скрещенных с самками дикого типа. 3000 ПЗК инъецировали в эмбрионы стадии 16 HH через сделанные в яйцах отверстия, яйца запечатывали и инкубировали до вылупления. Разведение этих кур-основателей дало семь трансгенных потомков G1, содержащих нацеленный трансген. Показанные на фигуре положительные потомки имеют номера 42, 4, 18. A. ПЦР с праймерами, специфическими к Caspase9; MW, маркеры молекулярной массы, A, Нацеленные ПЗК, содержащие aviCaspase9, B, Нацеленные ПЗК, содержащие iCaspase9. B. ПЦР с праймерами, специфическими к GFP.DAZL icaspase9, Dazl aviCaspase9 (chicken) were injected into fertilized eggs from DDX4 heterozygous male hens crossed with wild-type females. 3000 PGCs were injected into stage 16 HH embryos through holes made in the eggs, the eggs were sealed and incubated until hatching. Breeding of these founder hens produced seven G1 transgenic offspring containing the targeted transgene. The positive progeny numbers shown in the figure are 42, 4, 18. A. PCR with Caspase9-specific primers; MW, molecular weight markers, A, Targeted PGCs containing aviCaspase9, B, Targeted PGCs containing iCaspase9. B. PCR with GFP-specific primers.
Фиг. 9. Экспрессия GFP на 6 и 10 день эмбрионов G2 iCaspas9 и aviCaspase9. Fig. 9. GFP expression on days 6 and 10 of G2 iCaspase9 and aviCaspase9 embryos.
Эмбрионы G2, положительные по ПЦР на гены iCaspase9 и aviCaspase9, визуализировали на предмет флуоресценции GFP.G2 embryos positive by PCR for the iCaspase9 and aviCaspase9 genes were imaged for GFP fluorescence.
Фиг. 10. Экспрессия GFP является специфичной для зародышевых клеток у эмбрионов G2 iCaspas9 и aviCaspase9 на 10 день. Левые панели; Флуоресценция GFP в эмбрионах iCaspase9 и aviCaspase9, которым инъецировали B/B. Правые панели: иммунофлуоресценция на белок DDX4 (красный). Fig. 10. GFP expression is germ cell specific in G2 iCaspase9 and aviCaspase9 day 10 embryos. Left panels; GFP fluorescence in B/B-injected iCaspase9 and aviCaspase9 embryos. Right panels: immunofluorescence for DDX4 protein (red).
Фиг. 11. Эмбрионы iCaspase9 и aviCaspase9 G2, получившие B/B, не имеют зародышевых клеток. Fig. 11. B/B-fed iCaspase9 and aviCaspase9 G2 embryos have no germ cells.
B/B инъецировали в спинную аорту куриных эмбрионов на стадии 16 (день 2,5). Эмбрионы инкубировали и исследовали на 10 день на предмет флуоресценции GFP и экспрессии DDX4. Левые панели; Флуоресценция GFP в эмбрионах iCaspase9 и aviCaspase9, которым инъецировали B/B. Правые панели: иммунофлуоресценция для белка DDX4 (красный).B/B was injected into the dorsal aorta of stage 16 (day 2.5) chick embryos. Embryos were incubated and examined at day 10 for GFP fluorescence and DDX4 expression. Left panels; GFP fluorescence in B/B-injected iCaspase9 and aviCaspase9 embryos. Right panels: immunofluorescence for DDX4 protein (red).
Фиг. 12. Обработка трансгенных эмбрионов aviCaspase9 препаратом B/B вызывает абляцию хозяйских зародышевых клеток и позволяет трансплантированным донорским клеткам заселять гонады хозяина. Эмбрионам на стадии 16 HH, содержащим трансген aviCaspase9, нацеленный на локус DAZL, инъецировали 200 донорских ПЗК, трансфицированных транспозоном для случайной вставки кассеты для экспрессии TdTomato в геном. Инъецированные клетки находились в 1 мкл раствора, содержащего 0,5 мМ (конечная концентрация) препарата-индуктора димеризации B/B. После инъецирования в яйца добавляли вводили 50 мкл 1x пенициллина/стретпомицина, содержащего 15 мкМ (конечная концентрация) препарата-индуктора димеризации B/B, и инкубировали в течение 8 дней. На 10 день развития гонады иссекали и просматривали при флуоресценции. Все зародышевые клетки в эмбрионе aviCaspase9, получившем препарат-индуктор димеризации, были из донорских клеток с TdTomato, эндогенные (хозяйские) зародышевые клетки не были обнаружены.Fig. 12. Treatment of aviCaspase9 transgenic embryos with B/B causes ablation of host germ cells and allows transplanted donor cells to populate the host gonads. Stage 16 HH embryos containing the aviCaspase9 transgene targeting the DAZL locus were injected with 200 donor PGCs transfected with a transposon to randomly insert a TdTomato expression cassette into the genome. The injected cells were in 1 μl of a solution containing 0.5 mM (final concentration) of the B/B dimerization inducer drug. After injection, 50 μl of 1x penicillin/strethpomycin containing 15 μM (final concentration) B/B dimerization inducer drug was added to the eggs and incubated for 8 days. On day 10 of development, the gonads were dissected and observed under fluorescence. All germ cells in the aviCaspase9 embryo treated with the dimerization inducer drug were from donor cells with TdTomato; no endogenous (host) germ cells were detected.
Фиг. 13. ДНК, синтезированная для трансгена iCaspase9 человека.Fig. 13. DNA synthesized for the human iCaspase9 transgene.
Фиг. 14. ДНК, синтезированная для трансгена iCaspase9 курицы.Fig. 14. DNA synthesized for the chicken iCaspase9 transgene.
Фиг. 15. Последовательность ДНК для матрицы репарации DDX, содержащей оптимизированный для кур ген нитроредуктазы.Fig. 15. DNA sequence for the DDX repair template containing the nitroreductase gene optimized for chickens.
Фиг. 16. Последовательность ДНК для матрицы репарации DAZL, содержащей aviCaspase9 курицы.Fig. 16. DNA sequence for the DAZL repair template containing chicken aviCaspase9.
Фиг. 17. Последовательность ДНК для матрицы репарации DAZL, содержащей iCaspase9 человека.Fig. 17. DNA sequence for the DAZL repair template containing human iCaspase9.
Фиг. 18. Последовательность ДНК для матрицы репарации DDX4, содержащей iCaspase9 человека.Fig. 18. DNA sequence for the DDX4 repair template containing human iCaspase9.
Фиг. 19. ДНК для оптимизированного для кур гена нитроредуктазы. В верхней строке этой таблицы указан однобуквенный аминокислотный код для каждой аминокислоты, присутствующей в последовательности Ntr E.coli и оптимизированных по кодонам последовательностях Ntr. Во второй строке указана последовательность оснований в последовательности Ntr E.coli, а в третьей строке таблицы выделены изменения, которые были выполнены при оптимизации гена Ntr для курицы. Выделенные столбцы показывают, где были выполнены три мутации для создания конструкции 3AAS Ntr: треонин в 41 кодоне был мутирован в глутамин (CAG); аспарагин в положении 71 кодона был мутирован в серин (AGC), а фенилаланин в положении 124 кодона был мутирован в треонин (ACC). Fig. 19. DNA for chicken-optimized nitroreductase gene. The top row of this table provides a single-letter amino acid code for each amino acid present in the E. coli Ntr sequence and codon-optimized Ntr sequences. The second row gives the sequence of bases in the E. coli Ntr sequence, and the third row of the table highlights the changes that were made when optimizing the Ntr gene for chicken. The highlighted bars show where three mutations were made to create the 3AAS Ntr construct: threonine at codon 41 was mutated to glutamine (CAG); asparagine at codon position 71 was mutated to serine (AGC), and phenylalanine at codon position 124 was mutated to threonine (ACC).
На фиг. 20 представлена таблица транскриптома РНК куриных примордиальных зародышевых клеток по сравнению с другими тканями куриного эмбриона и плюрипотентными клетками для идентификации генов, которые на этих эмбриональных стадиях экспрессируются только в зародышевых клетках и на высоких уровнях. ESC - куриные эмбриональные стволовые клетки, EGKX - клетки куриных эмбрионов на стадии отложенного яйца, Не плюри - совокупность 66 неплюрипотентных тканей и клеточных линий взрослых кур.In fig. 20 provides a table of the RNA transcriptome of chick primordial germ cells compared to other chick embryonic tissues and pluripotent cells to identify genes that are expressed only in germ cells and at high levels at these embryonic stages. ESC - chicken embryonic stem cells, EGKX - cells of chicken embryos at the egg-laying stage, Nepluri - a set of 66 non-pluripotent tissues and cell lines of adult chickens.
Фиг. 21. Экспрессия генов, специфичных для зародышевых клеток, в птичьих ПЗК. На графике показана относительная экспрессия генов, специфичных для зародышевых клеток, в куриных, гусиных и утиных ПЗК. Среднее значение нормированных значений экспрессии получено из пакета DESeq2. Эти значения экспрессии нормированы к общему количеству операций чтения для всех образцов. Зарегистрированная экспрессия TDRD9 и TUBA1B является более высокой в утиных ПЗК, GASZ и RNF17 экспрессируются на высоком уровне в гусиных ПЗК, а остальные гены экспрессируются на более высоком уровне в куриных ПЗК.Fig. 21. Expression of germ cell-specific genes in avian PGCs. The graph shows the relative expression of germ cell-specific genes in chick, goose, and duck PGCs. The mean of normalized expression values was obtained from the DESeq2 package. These expression values are normalized to the total number of reads for all samples. The reported expression of TDRD9 and TUBA1B is higher in duck PGCs, GASZ and RNF17 are expressed at high levels in goose PGCs, and the remaining genes are expressed at higher levels in chicken PGCs.
Фиг. 22. 500 ПЗК (dazl-GFP, dazl-iCaspase, dazl-aviCaspase, ddx4-iCaspase9) культивировали в присутствии или в отсутствие молекулы-индуктора димеризации B/B. Через 10 дней подсчитывали общее количество клеток в каждой лунке. N=2 для каждого значения.Fig. 22. 500 PGCs (dazl-GFP, dazl-iCaspase, dazl-aviCaspase, ddx4-iCaspase9) were cultured in the presence or absence of the B/B dimerization inducer molecule. After 10 days, the total number of cells in each well was counted. N=2 for each value.
На фиг. 23 проиллюстрировано применение абляции клеток хозяина посредством caspase9 с использованием донорских ПЗК от китайских шелковых кур с черной кожей, инъецированных в суррогатные хозяйские эмбрионы iCaspase9, которые вылупляются и подвергаются разведению для получения чистого потомства. A) Потомство (эмбрионы) от суррогата Dazl-iCaspase9 не содержало трансгена GFP, что указывает на то, что большая часть хозяйских зародышевых клеток не дала потомства (50% потомства от эндогенных зародышевых клеток должны быть GFP+, если они не были подвергнуты абляции). Два потомка от суррогата Dazl-aviCaspase9 содержали трансген GFP, что указывает на то, что некоторые из потомков произошли от эндогенных зародышевых клеток. (A-C) Потомство (эмбрионы и куры) имеет черную кожу, что указывает на то, что они произошли от донорских зародышевых клеток. In fig. 23 illustrates the use of caspase9 host cell ablation using donor PGCs from Chinese black silkies injected into iCaspase9 surrogate host embryos that hatch and are bred to produce pure offspring. A) The progeny (embryos) from the Dazl-iCaspase9 surrogate did not contain the GFP transgene, indicating that the majority of the host germ cells did not produce progeny (50% of the progeny from endogenous germ cells should be GFP+ if they were not ablated). Two progeny from the Dazl-aviCaspase9 surrogate contained a GFP transgene, indicating that some of the progeny were derived from endogenous germ cells. (A-C) The offspring (embryos and chicks) have black skin, indicating that they are descended from donor germ cells.
Подробное описание изобретенияDetailed Description of the Invention
FK-связывающий белок (FKBP) FKBP12 принадлежит к рецепторному семейству иммунофилинов, и его аминокислотные последовательности являются высоко консервативными у млекопитающих и кур (Yazawa et al (2003) Comparative Biochem. Physiol: Mol. Integ. Physiol 136(2):391-399). Он представляет собой цитозольный рецептор иммуносупрессивного препарата FK506 и является мишенью для селективного контроля клеточной сигнализации посредством димеризации белка.FK binding protein (FKBP) FKBP12 belongs to the immunophilin receptor family, and its amino acid sequences are highly conserved between mammals and chickens (Yazawa et al (2003) Comparative Biochem. Physiol: Mol. Integ. Physiol 136(2):391-399 ). It is a cytosolic receptor for the immunosuppressive drug FK506 and is a target for selective control of cell signaling through protein dimerization.
Димерные варианты FKBP12, FK1012, были синтезированы Spencer и коллегами для опосредования контроля клеточной сигнализации посредством димеризации или олигомеризации внутриклеточных белков (Spencer et al (1993) Science 262:1019-1024). Позже был создан специфический связывающий карман в FKBP12 путем замены объемного фенилаланина меньшим остатком валина (FKBP12F36V). Модернизированные лиганды FK1012, в том числе AP1903 и близкородственный AP20187, были разработаны с высокой аффинностью и селективностью по отношению к FKBP12F36V и минимальным взаимодействием с эндогенными FKBP (Clackson et al (1998) PNAS 95(18):10437-10442; Nör et al (2002) Gene Ther 9(7):444-51). Dimeric variants of FKBP12, FK1012, were synthesized by Spencer and colleagues to mediate control of cellular signaling through dimerization or oligomerization of intracellular proteins (Spencer et al (1993) Science 262:1019-1024). Later, a specific binding pocket was created in FKBP12 by replacing the bulky phenylalanine with a smaller valine residue (FKBP12 F36V ). Redesigned FK1012 ligands, including AP1903 and the closely related AP20187, have been designed with high affinity and selectivity for FKBP12 F36V and minimal interaction with endogenous FKBPs (Clackson et al (1998) PNAS 95(18):10437-10442; Nör et al (2002) Gene Ther 9(7):444–51).
Белки каспазы, 2, 3, 4, 7, 8, 9 или 10, представляют собой встречающиеся в природе белки, которые, как известно, индуцируют программируемую гибель клеток. Каспаза 9 (Casp9) активируется при димеризации и приводит к апоптозу клеток. Casp9 может быть усечена для удаления ее домена димеризации (CARD). Путем слияния домена димеризации FKBP12F36V с Casp9 может быть селективно индуцирована абляция клеток при введении лиганда. Эта система называется системой индуцибельной каспазы 9 (iCas9 (iC9)). AP20187 представлен на рынке как препарат-индуктор гомодимеризации B/B. Он использовался для создания системы, индуцирующей абляцию клеток. Слитый белок использовался для устранения клеток in vitro (Carlotti et al (2005) Cancer Gene Ther 12(7):627-39). Он также использовался для устранения клеток in vivo у мышей, шпорцевых лягушек и данио-рерио (Mallet et al (2002) Nat Biotechnol 20(12):1234-1239; Pajvani et al (2005) Nat Med 11(7):797-803; Hamm et al (2009) Invest Ophthalmol Vis Sci 50(2):885-92; Weber et al (2016) Development 143(22):4279-4287; Shimokawa (2017) Nature 11; 545(7653):187-192).Caspase proteins, 2, 3, 4, 7, 8, 9 or 10, are naturally occurring proteins that are known to induce programmed cell death. Caspase 9 (Casp9) is activated upon dimerization and leads to cell apoptosis. Casp9 can be truncated to remove its dimerization domain (CARD). By fusing the FKBP12 F36V dimerization domain to Casp9, cell ablation can be selectively induced upon ligand administration. This system is called the inducible caspase 9 (iCas9 (iC9)) system. AP20187 is marketed as a B/B homodimerization inducer drug. It was used to create a system that induces cell ablation. The fusion protein was used to eliminate cells in vitro (Carlotti et al (2005) Cancer Gene Ther 12(7):627-39). It has also been used to eliminate cells in vivo in mice, clawed frogs and zebrafish (Mallet et al (2002) Nat Biotechnol 20(12):1234-1239; Pajvani et al (2005) Nat Med 11(7):797- 803; Hamm et al (2009) Invest Ophthalmol Vis Sci 50(2):885–92; Weber et al (2016) Development 143(22):4279–4287; Shimokawa (2017) Nature 11; 545(7653):187 -192).
Пример 1Example 1
Селективная абляция куриных примордиальных зародышевых клеток (ПЗК) посредством модификации куриного генома трансгеном индуцибельная каспаза 9 (iC9).Selective ablation of chick primordial germ cells (PGCs) through modification of the chicken genome with the inducible caspase 9 (iC9) transgene.
Получение конструкций ДНК, использованных для получения ПЗК, трансфицированных iCasp9Preparation of DNA constructs used to obtain iCasp9-transfected PGCs
Для специфической экспрессии индуцибельной Casp9 в ПЗК было использовано редактирование генома с помощью технологии CRISPR/Cas9 для опосредования вставки последовательности в следующие локусы, которые специфически экспрессируются в ПЗК:To specifically express inducible Casp9 in PGCs, genome editing using CRISPR/Cas9 technology was used to mediate sequence insertion at the following loci that are specifically expressed in PGCs:
DDX4: Куриный гомолог vasa гена, РНК-хеликаза, специфически экспрессируется в зародышевых клетках из локуса DDX4. Направленная вставка экзогенных генов в стартовый кодон DDX4 (ATG) была предпринята для достижения специфичной для зародышевых клеток экспрессии соответствующих белков.DDX4: The chicken homologue of the vasa gene, an RNA helicase, is specifically expressed in germ cells from the DDX4 locus. Targeted insertion of exogenous genes into the DDX4 start codon (ATG) was undertaken to achieve germ cell-specific expression of the corresponding proteins.
DAZL: Локус DAZL управляет экспрессией РНК-связывающего белка DAZL. Экспрессия DAZL также является специфичной для зародышевых клеток и согласно измерениям является по меньшей мере в 10 раз более высокой, чем экспрессия DDX4 (Jean et al. 2014). Направленная вставка экзогенных кДНК в стоп-кодон (TGA) локуса DAZL была использована для достижения специфической для зародышевых клеток экспрессии соответствующих белков.DAZL: The DAZL locus controls the expression of the RNA-binding protein DAZL. DAZL expression is also germ cell specific and has been measured to be at least 10-fold higher than DDX4 expression (Jean et al. 2014). Targeted insertion of exogenous cDNAs at the stop codon (TGA) of the DAZL locus was used to achieve germ cell-specific expression of the corresponding proteins.
Схема стратегии нацеливания представлена на фиг. 2 и фиг. 3.A diagram of the targeting strategy is shown in FIG. 2 and fig. 3.
Индуцибельная каспаза 9Inducible caspase 9
Плазмида pMSCV-F-del Casp9.IRES.GFP (https://www.addgene.org/15567/), депонированная в Spencer lab (Straathof et al (2005) Blood 105(11):4247-54), содержит последовательность кДНК для FKBP12F36V, слитую с усеченной Casp9 человека (усеченной таким образом, что ее домен димеризации был удален для снижения базальной активности), с HA-меткой, слитой с C-концом Casp9. Эта последовательность ДНК называется в настоящем документе iCasp9. Plasmid pMSCV-F-del Casp9.IRES.GFP (https://www.addgene.org/15567/), deposited in Spencer lab (Straathof et al (2005) Blood 105(11):4247-54), contains the sequence The cDNA for FKBP12 F36V fused to truncated human Casp9 (truncated such that its dimerization domain was removed to reduce basal activity), with an HA tag fused to the C terminus of Casp9. This DNA sequence is referred to herein as iCasp9.
Последовательность iCasp9 была химически синтезирована с предшествующей последовательностью P2A, с фланкирующими сайтами рестрикции BamH1 и с удаленным путем замены кодонов сайтом BamH1 внутри последовательности. Последовательность iCasp9, фланкированная сайтом BamH1 (iCasp9_человека), была синтезирована в векторе pMA.The iCasp9 sequence was chemically synthesized with the preceding P2A sequence, flanking BamH1 restriction sites, and with the BamH1 site removed by codon substitution within the sequence. The iCasp9 sequence flanked by the BamH1 site (human iCasp9) was synthesized in the pMA vector.
Кроме того, домен Casp9 iCasp9 человека (аминокислоты 135-417 в NP_001220.2) был заменен на гомологичную аминокислотную область последовательности белка Casp9 курицы (аминокислоты 169-450 в XP_424580.6) с получением последовательности iCasp9_курицы. Последовательность iCasp9 курицы была химически синтезирована с предшествующей последовательностью P2A, с фланкирующими сайтами рестрикции BamH1 и с удаленным путем замены кодонов сайтом BamH1 внутри последовательности. Последовательность iCasp9, фланкированная сайтом BamH1 (iCasp9_курицы), была синтезирована в векторе pMA. Эта последовательность ДНК называется в настоящем документе aviCasp9.In addition, the Casp9 domain of human iCasp9 (amino acids 135-417 in NP_001220.2) was replaced with the homologous amino acid region of the chicken Casp9 protein sequence (amino acids 169-450 in XP_424580.6) to obtain the chicken iCasp9 sequence. The chicken iCasp9 sequence was chemically synthesized with a preceding P2A sequence, flanking BamH1 restriction sites, and with the BamH1 site removed by codon substitution within the sequence. The iCasp9 sequence flanked by the BamH1 site (chicken iCasp9) was synthesized in the pMA vector. This DNA sequence is referred to herein as aviCasp9.
Трансген нитроредуктазыNitroreductase transgene
Ген нитроредуктазы присутствует у некоторых видов бактерий и восстанавливает нитрогруппу определенных химических соединений до цитотоксических метаболитов. Ген нитроредуктазы из E. coli был оптимизирован по кодонам для экспрессии у кур. Были произведены три аминокислотные замены, которые, как было показано, обеспечивают более высокую удельную активность (см. фиг. 19) в присутствии пролекарства-субстрата CB1954.The nitroreductase gene is present in some species of bacteria and reduces the nitro group of certain chemical compounds to cytotoxic metabolites. The nitroreductase gene from E. coli has been codon optimized for expression in chickens. Three amino acid substitutions were made which were shown to provide higher specific activity (see FIG. 19) in the presence of the prodrug substrate CB1954.
Матрица репарации DDX4-GFPDDX4-GFP repair template
Матрица репарации DDX4 изначально была сконструирована с использованием клонирования Гибсона, которое позволяет лигировать несколько перекрывающихся двухцепочечных фрагментов ДНК. Фрагменты для этой плазмиды получали с помощью ПЦР (праймеры Invitrogen) или рестрикционного гидролиза (ферменты NEB). Между генами были включены последовательности 2A с рибосомным проскоком, чтобы избежать трансляции слитых белков. Эти пептиды 2A были сконструированы с линкерами GSG на их аминоконцах, последовательность которых включает сайт вырезания рестриктазой BamH1, позволяющий встраивать дополнительные 2A-связанные гены.The DDX4 repair template was originally constructed using Gibson cloning, which allows for the ligation of multiple overlapping double-stranded DNA fragments. Fragments for this plasmid were obtained by PCR (Invitrogen primers) or restriction digestion (NEB enzymes). Ribosomal slip 2A sequences were inserted between genes to avoid translation of the fusion proteins. These 2A peptides were designed with GSG linkers at their amino termini, the sequence of which includes a BamH1 restriction enzyme excision site allowing the insertion of additional 2A-linked genes.
Основной фрагмент был получен с использованием последовательности из вектора pGEM-T (Promega), который содержит кассеты устойчивости к ампициллину и сайтов множественного клонирования (MCS). Последовательность pGEM-Т размером 3 тыс. п. н., наряду с 3 тыс. п. н. гомологии до стартового кодона DDX4 (левое нацеливающее плечо), была получена из ранее сконструированного вектора, нацеливающего на DDX4 (HOMOL pGEM-T левое плечо и правое плечо ddx4+GFPpuropolyA), с использованием Xcm1 и Nco1 для вырезания фрагмента размером 6 тыс. п. н., который был очищен с помощью очистки из геля.The core fragment was generated using sequence from the pGEM-T vector (Promega), which contains ampicillin resistance cassettes and multiple cloning sites (MCS). The pGEM-T sequence is 3 kb, along with 3 kb. homology to the DDX4 start codon (left targeting arm), was derived from a previously constructed DDX4 targeting vector ( HOMOL pGEM-T left arm and ddx4+GFPpuropolyA right arm ), using Xcm1 and Nco1 to excise the 6 kb fragment. n., which was purified using gel purification.
Правое нацеливающее плечо, состоящее из 1,5 тыс. п. н. гомологии от стартового кодона DDX4, было синтезировано с помощью ПЦР с использованием геномной ДНК, полученной из куриных ПЗК (клетки Y2, полученные из яиц, полученных от NARF (National Avian Research Facility, Национальный центр исследования птиц)). Прямой праймер для этой реакции (CGGTGACGTCGAGGAGAATCCTGGACCTATGGAGGAGGATTGGGATACCGAACTCGAGCAGGAGGCGGCAGCGGC, 75 п. н.), SEQ ID NO: 7, содержал частичную последовательность для T2A с рибосомным проскоком и замены кодонов в сайте нацеливания CRISPR/Cas9, чтобы матрица репарации не могла быть разрезана белком Cas9. Обратный праймер для этой реакции (GAAATCCAGCTTCCAGTTCCCACCTGGCCAGACAAGGGGCTGCTTGG, 47 п. н.), SEQ ID NO: 8, содержал выступ размером 20 п. н. от последовательности вектора pGEM-T вместе с нуклеотидами, которые повторно вставляли сайт разрезания для Xcm1 после выступа. Right targeting arm, consisting of 1.5 kb. homology from the DDX4 start codon was synthesized by PCR using genomic DNA obtained from chicken PGCs (Y2 cells obtained from eggs obtained from NARF (National Avian Research Facility, National Avian Research Center)). The forward primer for this reaction (CGGTGACGTCGAGGAGAATCCTGGACCTATGGAGGAGGATTGGGATACCGAACTCGAGCAGGAGGCGGCAGCGGC, 75 bp), SEQ ID NO: 7, contained a partial sequence for T2A with ribosomal skipping and codon replacement at the CRISPR/Cas9 targeting site so that the repair template could not be cut by the Cas9 protein. The reverse primer for this reaction (GAAATCCAGCTTCCAGTTCCCACCTGGCCAGACAAGGGGCTGCTTGG, 47 bp), SEQ ID NO: 8, contained a 20 bp overhang. from the pGEM-T vector sequence along with nucleotides that reinserted the cutting site for Xcm1 after the overhang.
Последний фрагмент (800 п. н.) для матрицы репарации DDX4 содержал последовательность для eGFP, которая была снова синтезирована с помощью ПЦР из ранее сконструированного вектора, нацеливающего на DDX4, HOMOL pGEM-T левое плечо и правое плечо ddx4+GFPpuropolyA. Прямой праймер (GGTGGGCTGCTGGCATTCGCCATGGTGAGCAAGGGCGAGGA, 41 п. н.), SEQ ID NO: 9, для этой реакции содержал выступ размером 20 п. н. от левого нацеливающего плеча вместе с нуклеотидами, которые повторно вставляли сайт разрезания для Nco1 после выступа. Обратный праймер для этой реакции (GATTCTCCTCGACGTCACCGCATGTTAGCAGACTTCCTCTGCCCTCTCCGGATCCCTTGTACAGCTCGTCCATGCC, 76 п. н.), SEQ ID NO: 10, содержал оставшуюся последовательность T2A плюс 20 п. н. выступа для частичной последовательности T2A во фрагменте правого плеча.The final fragment (800 bp) for the DDX4 repair template contained the sequence for eGFP, which was again synthesized by PCR from a previously constructed DDX4 targeting vector, HOMOL pGEM-T left arm and ddx4+GFPpuropolyA right arm . The forward primer (GGTGGGCTGCTGGCATTCGCCATGGTGAGCAAGGGCGAGGA, 41 bp), SEQ ID NO: 9, contained a 20 bp overhang for this reaction. from the left targeting arm along with nucleotides that reinserted the cutting site for Nco1 after the overhang. The reverse primer for this reaction (GATTCTCCTCGACGTCACCGCATGTTAGCAGACTTCCTCTGCCCTCTCCGGATCCCTTGTACAGCTCGTCCATGCC, 76 bp), SEQ ID NO: 10, contained the remaining T2A sequence plus 20 bp. ledge for partial T2A sequence in the right shoulder fragment.
Для лигирования фрагментов смесь 100 нг основного фрагмента вместе с эквимолярными количествами других фрагментов инкубировали с ферментом Gibson HiFi DNA Assembly Master Mix enzyme (NEB) в течение 1 часа при 50 °C. Компетентные клетки XL-10 Gold трансформировали 2 мкл лигированной плазмиды. Мини-препараты, полученные из трансформированных клеток, проверяли рестрикционным гидролизом, и получали макси-препараты.For fragment ligation, a mixture of 100 ng of the main fragment along with equimolar amounts of other fragments was incubated with Gibson HiFi DNA Assembly Master Mix enzyme (NEB) for 1 hour at 50°C. XL-10 Gold competent cells were transformed with 2 μl of the ligated plasmid. Mini-preparations obtained from transformed cells were tested by restriction hydrolysis, and maxi-preparations were obtained.
Матрица репарации DAZL была первоначально сконструирована с использованием клонирования Гибсона с фрагментами плазмиды, полученными с помощью ПЦР (праймеры IDT) или рестрикционного гидролиза (ферменты NEB). IDT позволяет синтезировать праймеры длиной > 100 п. н., которые были необходимы для этой работы. Также была сконструирована матрица репарации, включающая оптимизированный для кур ген NTR, продукт которого может быть использован для селективной абляции клеток при введении пролекарства. The DAZL repair template was initially constructed using Gibson cloning with plasmid fragments generated by PCR (IDT primers) or restriction digestion (NEB enzymes). IDT allows the synthesis of primers >100 bp in length, which were necessary for this work. A repair matrix was also constructed that included the NTR gene optimized for chickens, the product of which can be used for selective cell ablation when a prodrug is administered.
Основным фрагментом для нацеливающей матрицы была последовательность pGEM-T размером 3 тыс. п. н., которая была получена из описанной выше матрицы репарации DDX4-GFP с использованием Xcm1 и Not1 для вырезания ДНК. The core fragment for the targeting template was the 3-kb pGEM-T sequence, which was derived from the DDX4-GFP repair template described above using Xcm1 and Not1 to excise the DNA.
Левое нацеливающее плечо, состоящее из 1,5 тыс. п. н. гомологии до стоп-кодона DAZL (но не включая его), было синтезировано с помощью ПЦР с использованием геномной ДНК, полученной из куриных ПЗК (клетки Y2). Прямой праймер для этой реакцииLeft targeting arm, consisting of 1.5 kb. homology up to (but not including) the DAZL stop codon was synthesized by PCR using genomic DNA obtained from chicken PGCs (Y2 cells). Direct primer for this reaction
(TCTCCCATATGGTCGACCTGCAGGCGGCCGCGAATTCACTAGTGATTCTTCGTGGTT, 67 п. н.), SEQ ID NO: 11, содержал выступ размером 25 п. н. от последовательности вектора pGEM-T вместе с нуклеотидами, которые повторно вставляли сайт разрезания для Not1 после выступа. Обратный праймер для этой реакции (AGGCTGAAGTTAGTAGCTCCGGATCCAACACTTTTGAGCACTGCTCTT, 48 п. н.), SEQ ID NO: 12, содержал выступ размером 25 п. н. от последовательности P2A с рибосомным проскоком.(TCTCCCATATGGTCGACCTGCAGGCGGCCGCGAATTCACTAGTGATTCTTCGTGGTT, 67 bp), SEQ ID NO: 11, contained a 25 bp overhang. from the pGEM-T vector sequence along with nucleotides that reinserted the cutting site for Not1 after the overhang. The reverse primer for this reaction (AGGCTGAAGTTAGTAGCTCCGGATCCAACACTTTTGAGCACTGCTCTT, 48 bp), SEQ ID NO: 12, contained a 25 bp overhang. from the P2A sequence with ribosomal slip.
Третий фрагмент (600 п. н.) содержал последовательность P2A, за которой следовал NTR, который был вырезан с использованием BamH1 из матрицы репарации DDX4-GFP-NTR, которая, в свою очередь, была сконструирована с использованием матрицы репарации DDX4-GFP (линеаризованной с помощью BamH1 и лигированной со вставкой, содержащей последовательность P2A-NTR).The third fragment (600 bp) contained the P2A sequence followed by an NTR that was excised using BamH1 from the DDX4-GFP-NTR repair template, which in turn was constructed using the DDX4-GFP repair template (linearized using BamH1 and ligated to an insert containing the P2A-NTR sequence).
Четвертый фрагмент (800 п. н.) содержал последовательность для eGFP, которая была синтезирована с помощью ПЦР из матрицы репарации DDX4-GFP. Прямой праймер The fourth fragment (800 bp) contained the sequence for eGFP, which was synthesized by PCR from the DDX4-GFP repair template. Direct primer
(CAGAACATCACCCTGACCGAGGTGGGATCCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTGCTAACATGCGGTGACGTCGAGGAGAATCCTGGACCTATGGTGAGCAAGGGCGAGGA, 107 п. н.), SEQ ID NO: 13, для этой реакции содержал выступ размером 25 п. н. от гена NTR и последовательность для T2A с рибосомным проскоком. Обратный праймер для этой реакции (CTTGTACAGCTCGTCCATGCCG, 22 п. н.), SEQ ID NO: 14, не содержал выступов.(CAGAACATCACCCTGACCGAGGTGGGATCCGGAGAGGGCAGAGGAAGTCTGCTAACATGCGGTGACGTCGAGGAAATCCTGGACCTATGGTGAGCAAGGGCGAGGA, 107 bp), SEQ ID NO: 13, contained a 25 bp overhang for this reaction. from the NTR gene and the sequence for T2A with ribosomal slip. The reverse primer for this reaction (CTTGTACAGCTCGTCCATGCCG, 22 bp), SEQ ID NO: 14, did not contain overhangs.
Пятый и последний фрагмент для нацеливающей матрицы DAZL-GFP представлял собой правое нацеливающее плечо, состоящее из 1,5 тыс. п. н. гомологии от стоп-кодона DAZL (включительно), синтезированное с помощью ПЦР с использованием геномной ДНК, полученной из куриных ПЗК (клетки Y2). Прямой праймер для этой реакции (TCTCGGCATGGACGAGCTGTACAAGTGATGAACAAAGACTTTGAAGTACATAAATGTATTACTTTGATGTTAATACAGTTCAGTTTAGTAAGAT, 94 п. н.), SEQ ID NO: 15, содержал выступ размером 25 п. н. в ген eGFP и мутации в сайте PAM для соответствующей плазмиды CRISPR/Cas9. Обратный праймер для этой реакции (CTCTTCGAAATCCAGCTTCCAGTTCCCACCTGGCAATACTATTAAAGCAATAGGT, 55 п. н.), SEQ ID NO: 16, содержал выступ размером 25 п. н. в последовательности вектора pGEM-T вместе с нуклеотидами, которые повторно вставляли сайт разрезания для Xcm1 после выступа.The fifth and final fragment for the DAZL-GFP targeting template was the right targeting arm, consisting of 1.5 kb. homologies from the DAZL stop codon (inclusive), synthesized by PCR using genomic DNA obtained from chicken PGCs (Y2 cells). The forward primer for this reaction (TCTCGGCATGGACGAGCTGTACAAGTGATGAACAAAGACTTTGAAGTACATAAATGTATTACTTTGATGTTAATACAGTTCAGTTTAGTAAGAT, 94 bp), SEQ ID NO: 15, contained a 25 bp overhang. into the eGFP gene and mutations at the PAM site for the corresponding CRISPR/Cas9 plasmid. The reverse primer for this reaction (CTCTTCGAAATCCAGCTTCCAGTTCCCACCTGGCAATACTATTAAAGCAATAGGT, 55 bp), SEQ ID NO: 16, contained a 25 bp overhang. in the pGEM-T vector sequence along with nucleotides that reinserted the cutting site for Xcm1 after the overhang.
Для лигирования фрагментов смесь 100 нг основного фрагмента вместе с эквимолярными количествами других фрагментов инкубировали с ферментом Gibson HiFi DNA Assembly Master Mix enzyme (NEB) в течение 2 часов при 50 °C. Компетентные клетки XL-10 Gold трансформировали 2 мкл лигированной плазмиды. Мини-препараты, полученные из трансформированных клеток, проверяли рестрикционным гидролизом, и получали макси-препараты.For fragment ligation, a mixture of 100 ng of the main fragment along with equimolar amounts of other fragments was incubated with Gibson HiFi DNA Assembly Master Mix enzyme (NEB) for 2 hours at 50°C. XL-10 Gold competent cells were transformed with 2 μl of the ligated plasmid. Mini-preparations obtained from transformed cells were tested by restriction hydrolysis, and maxi-preparations were obtained.
BamH1 использовали для вырезания оптимизированной для кур последовательности NTR из матрицы репарации DAZL-GFP. Последовательности 2A-iCasp9 человека и курицы (iCasp9 и aviCasp9) вырезали с использованием BamH1 из соответствующих векторов pMA и вставляли в открытую матрицу репарации DAZL-GFP путем лигирования Т7. Компетентные клетки XL-10 Gold трансформировали 2 мкл лигированной плазмиды. Мини-препараты, полученные из трансформированных клеток, проверяли рестрикционным гидролизом, и получали макси-препараты для матрицы репарации DAZL-aviCasp9-GFP (курицы) и матрицы репарации DAZL- iCasp9-GFP (человека).BamH1 was used to excise the chicken-optimized NTR sequence from the DAZL-GFP repair template. Human and chicken 2A-iCasp9 sequences (iCasp9 and aviCasp9) were excised using BamH1 from their respective pMA vectors and inserted into the open DAZL-GFP repair template by T7 ligation. XL-10 Gold competent cells were transformed with 2 μl of the ligated plasmid. Mini-preparations obtained from transformed cells were tested by restriction digestion, and maxi-preparations were obtained for the DAZL-aviCasp9-GFP repair template (chicken) and the DAZL-iCasp9-GFP repair template (human).
Последовательности гидовой РНК (гРНК) в пределах 150 п. н. от стоп-кодона локуса DAZL были запрошены с использованием инструмента для конструирования CRISPR, доступного на сайте crispr.mit.edu. Прямые и обратные олигонуклеотиды (IDT) для 5 лучших гидовых РНК (с заменой двух первых оснований гидовой последовательности на GG) были синтезированы с липкими концами Bbs1. Олигонуклеотиды отжигали с помощью ПЦР и лигировали в pSpCas9(BB)-2A-Puro (PX459) V2.0 (https://www.addgene.org/62988/), используя смесь для гидролиза/лигирования в ПЦР. Компетентные клетки трансформировали 2 мкл лигированной плазмиды и получали макси-препараты из трансформированных колоний. Макси-препараты плазмид DAZL-PX459 (№ 1-5) были проверены с помощью ПЦР с использованием прямого олигонуклеотида и обратного праймера, комплементарного плазмиде PX459 на расстоянии 400 п. н. по ходу транскрипции от сайта разрезания для гидовой вставки (Bpi1).Guide RNA (gRNA) sequences within 150 bp. from the stop codon of the DAZL locus were queried using the CRISPR design tool available at crispr.mit.edu. Forward and reverse oligonucleotides (IDT) for the top 5 guide RNAs (with the first two bases of the guide sequence replaced by GG) were synthesized with Bbs1 cohesive ends. Oligonucleotides were annealed by PCR and ligated into pSpCas9(BB)-2A-Puro (PX459) V2.0 (https://www.addgene.org/62988/) using PCR digestion/ligation mixture. Competent cells were transformed with 2 μl of the ligated plasmid, and maxi-preparations were obtained from transformed colonies. Maxi-preparations of DAZL-PX459 plasmids (nos. 1–5) were verified by PCR using a forward oligonucleotide and a reverse primer complementary to the PX459 plasmid at a distance of 400 bp. downstream of the cut site for guide insertion (Bpi1).
Все последовательности ДНК показаны на фиг. 13-19.All DNA sequences are shown in Fig. 13-19.
Процесс трансфекцииTransfection process
Приблизительно 150 000 ПЗК трансфицировали 1 мкг матрицы репарации DAZL-iCasp9-GFP (курицы или человека) и 1 мкг DAZL-PX459 -4 или -5 с использованием Lipofectamine 3000. Через 5 часов в растворе Lipofectamine ПЗК осаждали и ресуспендировали в полной (FAOT) среде. Через 24 часа ПЗК получали свежую среду и в каждую лунку добавляли 2 мкл 0,1 мг/мл раствора пуромицина (конечная концентрация 0,04 мкг/мл). ПЗК инкубировали с пуромицином в течение 48 часов, один раз промывали и ресуспендировали в свежей среде. Клетки культивировали 1-2 недели для достижения популяции 200 000-400 000 клеток, а затем сортировали с использованием FACS для сбора успешно модифицированных (GFP-положительных) клеток. GFP-положительные клетки получали из ПЗК, трансфицированных DAZL-PX459 -4 или DAZL-PX459 -5, хотя только ПЗК, трансфицированные DAZL-PX459 -5, использовали для получения кур.Approximately 150,000 PGCs were transfected with 1 μg of DAZL-iCasp9-GFP repair template (chicken or human) and 1 μg of DAZL-PX459 -4 or -5 using Lipofectamine 3000. After 5 hours in Lipofectamine solution, PGCs were pelleted and resuspended in complete (FAOT) environment. After 24 hours, fresh medium was obtained for the PGCs and 2 μl of 0.1 mg/ml puromycin solution (final concentration 0.04 μg/ml) was added to each well. PGCs were incubated with puromycin for 48 hours, washed once, and resuspended in fresh medium. Cells were cultured for 1–2 weeks to achieve a population of 200,000–400,000 cells and then sorted using FACS to collect successfully modified (GFP-positive) cells. GFP-positive cells were obtained from PGCs transfected with DAZL-PX459 -4 or DAZL-PX459 -5, although only DAZL-PX459 -5 transfected PGCs were used to produce chickens.
DAZL-PX459 -4 содержит следующую гидовую последовательность: GGTCCTATTCCAGGAGAGGA SEQ ID NO: 17. Сайт PAM для этой гидовой последовательности находится на прямой цепи генома, на расстоянии 44 п. н. против хода транскрипции от стоп-кодона локуса DAZL.DAZL-PX459 -4 contains the following guide sequence: GGTCCTATTCCAGGAGAGGA SEQ ID NO: 17. The PAM site for this guide sequence is located on the forward strand of the genome, at a distance of 44 bp. upstream of the stop codon of the DAZL locus.
DAZL-PX459 -5 содержит в качестве своей гидовой последовательности: GGCTTACTAAACTGAACTGT SEQ ID NO: 18. Сайт PAM для этой гидовой последовательности находится на обратной цепи генома, на расстоянии 46 п. н. по ходу транскрипции от стоп-кодона локуса DAZL. В то время как последовательность сайта PAM для гидовой последовательности в DAZL-PX459 -5 была мутирована в плече гомологии конечной матрицы репарации DAZL-iCasp9-GFP, следует отметить, что последовательность сайта PAM для гидовой последовательности в DAZL-PX459 -4 не была мутирована. DAZL-PX459 -5 contains as its guide sequence: GGCTTACTAAACTGAACTGT SEQ ID NO: 18. The PAM site for this guide sequence is located on the reverse strand of the genome, at a distance of 46 bp. downstream of the stop codon of the DAZL locus. While the PAM site sequence for the guide sequence in DAZL-PX459 -5 was mutated in the homology arm of the final repair template DAZL-iCasp9-GFP, it is noteworthy that the PAM site sequence for the guide sequence in DAZL-PX459 -4 was not mutated.
ПЗК культивировали в течение трех недель для отбора клеток, которые были стабильно нацелены конструкциями, экспрессирующими GFP. Женские ПЗК, нацеленные посредством ddx4_GFP и dazl_GFP, очищали методом проточной цитометрии с использованием FACS-ARIA с гейтированием по флуоресценции GFP. Очищенные клетки наращивали в культуре и анализировали методом проточной цитометрии для количественной оценки уровня флуоресценции GFP. Клетки с GFP, нацеленные на локус DAZL, были в 3,75 раза более флуоресцентными, чем клетки с GFP, нацеленные на локус DDX4 (фиг. 4).PGCs were cultured for three weeks to select cells that were stably targeted by GFP-expressing constructs. Female PGCs targeted by ddx4_GFP and dazl_GFP were purified by flow cytometry using FACS-ARIA gated for GFP fluorescence. Purified cells were expanded in culture and analyzed by flow cytometry to quantify the level of GFP fluorescence. GFP cells targeting the DAZL locus were 3.75 times more fluorescent than GFP cells targeting the DDX4 locus (Fig. 4).
Женские ПЗК, нацеленные посредством DDX-Ntr, DDX-icaspase9, DAZL-Ntr, DAZL-icaspase9 (человека), Dazl-icaspase9 (курицы), очищали аналогичным образом.Female PGCs targeted by DDX-Ntr, DDX-icaspase9, DAZL-Ntr, DAZL-icaspase9 (human), Dazl-icaspase9 (chicken) were purified in a similar manner.
ПЗК, содержащие нацеленный ген нитроредуктазы, обрабатывали пролекарством CB1954. Под воздействием препарата ПЗК погибали. Клетки, содержащие NTR, нацеленные на локус dazl, демонстрировали уменьшение количества клеток по сравнению с контрольными клетками (фиг. 5).PGCs containing the targeted nitroreductase gene were treated with the prodrug CB1954. Under the influence of the drug, PZK died. Cells containing NTRs targeting the dazl locus showed a decrease in cell number compared to control cells (Fig. 5).
ПЗК, содержащие нацеленный ген icaspase9, обрабатывали соединением-индуктором димеризации B/B. Контрольные ненацеленные ПЗК не демонстрировали уменьшение количеств ПЗК при обработке препаратом. Клетки, содержащие гены caspase9 человека и курицы, нацеленные на локус dazl, демонстрировали значительно уменьшенные количества ПЗК (фиг. 6). Клетки, содержащие iCaspase 9, нацеленный на локус ddx4, демонстрировали немного меньшее количество ПЗК. Эти клетки смешивали с контрольными ПЗК с красной флуоресценцией и инъецировали куриным эмбрионам. Куриные эмбрионы обрабатывали соединением-индуктором димеризации B/B. У эмбрионов были визуально обнаружимы только красные ПЗК и контрольные ПЗК GFP. ПЗК с Dazl icaspase9 были уничтожены (фиг. 7).PGCs containing the targeted icaspase9 gene were treated with a B/B dimerization inducer compound. Control non-targeted PGCs did not show a decrease in PGC numbers when treated with the drug. Cells containing human and chicken caspase9 genes targeted to the dazl locus showed significantly reduced numbers of PGCs (Fig. 6). Cells containing iCaspase 9, which targets the ddx4 locus, showed slightly fewer PTCs. These cells were mixed with control PGCs with red fluorescence and injected into chick embryos. Chick embryos were treated with a B/B dimerization inducer compound. In embryos, only red PGCs and control GFP PGCs were visually detectable. PGCs with Dazl icaspase9 were destroyed (Fig. 7).
Получение курицы, нацеленной посредством Dazl icaspase9 Producing chicken targeted by Dazl icaspase9
Dazl iCaspase9 (человека) или Dazl aviCaspase9 (курицы), или обе из них в смеси инъецировали в оплодотворенные яйца от гетерозиготных по DDX4 (Z-Z) самцов кур, скрещенных с самками дикого типа. 3000 ПЗК инъецировали в эмбрионы стадии 16 HH через сделанные в яйцах отверстия, яйца запечатывали и инкубировали до вылупления. Разведение вылупившихся самок кур-основательниц (Z-W) дало трансгенное потомство, содержащее нацеленный трансген (фиг. 8).Dazl iCaspase9 (human) or Dazl aviCaspase9 (chicken), or both in a mixture, were injected into fertilized eggs from DDX4 heterozygous (Z - Z) male chickens crossed with wild-type females. 3000 PGCs were injected into stage 16 HH embryos through holes made in the eggs, the eggs were sealed and incubated until hatching. Breeding hatched female founder hens (Z - W) produced transgenic offspring containing the targeted transgene (Fig. 8).
Анализ абляции нацеленных посредством Dazl-iCaspase9 и Dazl-aviCaspase9 куриных и зародышевых клеток с использованием реагента-индуктора димеризации B/BAblation assay of Dazl-iCaspase9 and Dazl-aviCaspase9-targeted chick and germ cells using B/B dimerization inducer reagent
Кур G1 Dazl-icaspase9 и Dazl-aviCaspase9 выращивали до половой зрелости и спаривали с курами дикого типа. Оплодотворенные яйца от спариваний (эмбрионы G2) инкубировали и исследовали на предмет экспрессии GFP в гонадах. Зародышевые клетки в гонадах эмбрионов G2 как Dazl-icaspase9, так и Dazl-avicaspase9 содержали GFP+ клетки в гонаде (фиг. 9). Криосрезы и иммуноокрашивание антителом к маркеру зародышевых клеток DDX4 показали, что клетки, экспрессирующие GFP, являются зародышевыми клетками (фиг. 10). Эмбрионы G2 были протестированы на предмет абляции зародышевых клеток. 1,0 мкл 0,1 мМ реагента-индуктора димеризации B/B (Takara Bio, Inc) инъецировали в кровоток куриных эмбрионов на 2,5 день (стадия 16 по Гамбургеру и Гамильтону (HH)). Эмбрионы инкубировали в течение 8 дней, подвергали скринингу с помощью ПЦР для идентификации эмбрионов iCaspase9 и исследовали на предмет экспрессии GFP в гонадах. Обработанные препаратом эмбрионы G2 Dazl-iCaspase9 и Dazl-aviCaspase9 не имеют видимой экспрессии GFP (фиг. 11). Криосрезы и иммуноокрашивание антителом к маркеру зародышевых клеток DDX4 демонстрируют, что в гонадах эмбрионов Dazl-icaspase9 и Dazl-aviCaspase9 почти нет идентифицируемых DDX4-положительных или GFP+ клеток (фиг. 11). Чтобы показать, что экзогенные (донорские) ПЗК могут колонизировать стерилизованные хозяйские эмбрионы G2 Dazl-aviCaspase9, в эмбрионы инъецировали донорские красные флуоресцентные зародышевые клетки и препарат B/B. Эмбрионы инкубировали в течение 8 дней и исследовали на предмет флуоресценции и зародышевых клеток. В гонаде эмбриона G2 aviCaspase9 присутствовали только донорские зародышевые клетки, эндогенные (хозяйские) зародышевые клетки не были обнаружены. (фиг. 12).G1 Dazl-icaspase9 and Dazl-aviCaspase9 chickens were raised to sexual maturity and mated with wild-type chickens. Fertilized eggs from matings (G2 embryos) were incubated and examined for GFP expression in the gonads. Germ cells in the gonads of both Dazl-icaspase9 and Dazl-avicaspase9 G2 embryos contained GFP+ cells in the gonad (Fig. 9). Cryosections and immunostaining with an antibody to the germ cell marker DDX4 showed that the cells expressing GFP were germ cells (Fig. 10). G2 embryos were tested for germ cell ablation. 1.0 μl of 0.1 mM B/B dimerization inducer reagent (Takara Bio, Inc) was injected into the bloodstream of day 2.5 chick embryos (Hamburger and Hamilton (HH) stage 16). Embryos were incubated for 8 days, screened by PCR to identify iCaspase9 embryos, and examined for GFP expression in the gonads. Drug-treated G2 Dazl-iCaspase9 and Dazl-aviCaspase9 embryos had no visible GFP expression (Fig. 11). Cryosections and immunostaining with an antibody to the germ cell marker DDX4 demonstrate that there are almost no identifiable DDX4-positive or GFP+ cells in the gonads of Dazl-icaspase9 and Dazl-aviCaspase9 embryos (Fig. 11). To show that exogenous (donor) PGCs can colonize sterilized host G2 Dazl-aviCaspase9 embryos, donor red fluorescent germ cells and a B/B preparation were injected into the embryos. Embryos were incubated for 8 days and examined for fluorescence and germ cells. In the gonad of the G2 aviCaspase9 embryo, only donor germ cells were present; no endogenous (host) germ cells were detected. (Fig. 12).
Абляция зародышевых клеток у трансгенных курGerm cell ablation in transgenic chickens
Трасген iCaspase9 был нацелен на локус DDX4 или DAZL в ПЗК, а затем клетки подвергались действию препарата-индуктора димеризации. Было определено, что клетки, содержащие трансген, вставленный в локус DAZL, были ингибированы/уничтожены. Не ограничиваясь какой-либо конкретной теорией, авторы изобретения полагают, что уровни экспрессии на стадиях эмбрионального развития являются важными для абляции зародышевых клеток.The iCaspase9 tragene was targeted to the DDX4 or DAZL locus in the PGC, and the cells were then exposed to a dimerization inducer drug. It was determined that cells containing a transgene inserted into the DAZL locus were inhibited/killed. Without being limited to any particular theory, the inventors believe that expression levels at stages of embryonic development are important for germ cell ablation.
Это проиллюстрировано на фиг. 22.This is illustrated in FIG. 22.
Используя экспрессию каспазы 9, нацеленную на локус DAZL в ПЗК, тестировали абляцию хозяйских зародышевых клеток и получение потомства от донорской породы кур с использованием донорских куриных ПЗК от породы китайских шелковых кур с черной кожей. Были протестированы донорские ПЗК, инъецированные в хозяйские эмбрионы с каспазой, которые затем выращивали до половой зрелости и подвергали разведению. Как показано на фиг. 23, у потомства от хозяев Dazl-Caspase9, которым инъецировали ПЗК китайских шелковых кур и вводили препарат B/B, была обнаружена черная кожа, что указывает на то, что они произошли от донорских зародышевых клеток.Using caspase 9 expression targeting the DAZL locus in PGCs, host germ cell ablation and progeny generation from a donor chicken breed were tested using donor chicken PGCs from a black-skinned Chinese silky breed. Donor PGCs were tested by injecting caspase-containing host embryos, which were then grown to sexual maturity and bred. As shown in FIG. 23, offspring from Dazl-Caspase9 hosts injected with PGCs from Chinese silkies and treated with B/B were found to have black skin, indicating that they were derived from donor germ cells.
Более подробно, в этом варианте осуществления ПЗК китайских шелковых кур с черной кожей смешивали с препаратом-индуктором димеризации B/B и инъецировали хозяйским эмбрионам Dazl-Caspase, когда они находились в яйце. Яйца запечатывали, и эмбрионы вылуплялись, а затем были скрещены друг с другом по достижении половой зрелости. In more detail, in this embodiment, PGCs of black-skinned Chinese silkies were mixed with a B/B dimerization inducer drug and injected into Dazl-Caspase host embryos while they were in the egg. The eggs were sealed and the embryos hatched and then bred with each other once they reached sexual maturity.
50% потомства должны быть GFP-положительными, если они получены из эндогенных хозяйских GFP+ ПЗК с caspase9. Некоторые представители потомства от хозяина Dazl-aviCaspase9 были GFP+, и ни один из представителей потомства Dazl-iCaspase9 не был GFP+ (показано в таблице на фиг. 23 A).50% of the progeny should be GFP positive if they are derived from endogenous host GFP+ PGCs with caspase9. Some Dazl-aviCaspase9 host progeny were GFP+, and none of the Dazl-iCaspase9 progeny were GFP+ (shown in the table in Fig. 23 A).
Кроме того, эмбриональное потомство от хозяина Dazl-Caspase демонстрировало фенотип черной кожи донорских ПЗК китайских шелковых кур (показано на фиг. 23 B). Более того, вылупившееся потомство от хозяина Dazl-Caspase демонстрировало фенотип черной кожи донорских ПЗК китайских шелковых кур (показано на фиг. 23 C).In addition, embryonic progeny from the Dazl-Caspase host exhibited the black skin phenotype of Chinese silken chicken donor PGCs (shown in Fig. 23 B). Moreover, the hatched progeny from the Dazl-Caspase host exhibited the black skin phenotype of donor PGCs of Chinese silkies (shown in Fig. 23 C).
Хотя изобретение было конкретно проиллюстрировано и описано со ссылкой на конкретные примеры, специалистам в данной области техники будет ясно, что в него могут быть внесены различные изменения в отношении формы и деталей, не выходящие за пределы объема настоящего изобретения.Although the invention has been specifically illustrated and described with reference to specific examples, those skilled in the art will appreciate that various changes in form and detail may be made thereto without departing from the scope of the present invention.
--->--->
СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНСТЕЙLIST OF SEQUENCES
<110> The University Court of the University of Edinburgh<110> The University Court of the University of Edinburgh
<120> ГЕНЕТИЧЕСКИ МОДИФИЦИРОВАННЫЕ СТЕРИЛЬНЫЕ ПТИЦЫ И СПОСОБ ИХ <120> GENETICALLY MODIFIED STERILE BIRDS AND THEIR METHOD
ВОСПРОИЗВОДСТВАREPRODUCTION
<130> P191530.WO.01<130> P191530.WO.01
<150> GB1816633.0<150>GB1816633.0
<151> 2018-10-12<151> 2018-10-12
<160> 18<160> 18
<170> PatentIn version 3.5<170> Patent In version 3.5
<210> 1<210> 1
<211> 1317<211> 1317
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> мутантный сайт 2a-iCaspase9-Bam H1<223> mutant site 2a-iCaspase9-Bam H1
<400> 1<400> 1
ggatccggag ctactaactt cagcctgctg aagcaggctg gagacgtgga ggagaaccct ggatccggag ctactaactt cagcctgctg aagcaggctg gagacgtgga ggagaaccct
60 60
ggacctatgc tcgagggagt gcaggtggag actatctccc caggagacgg gcgcaccttc ggacctatgc tcgagggagt gcaggtggag actatctccc caggagacgg gcgcaccttc
120 120
cccaagcgcg gccagacctg cgtggtgcac tacaccggga tgcttgaaga tggaaagaaa cccaagcgcg gccagacctg cgtggtgcac tacaccggga tgcttgaaga tggaaagaaa
180 180
gttgattcct cccgggacag aaacaagccc tttaagttta tgctaggcaa gcaggaggtg gttgattcct cccgggacag aaacaagccc tttaagttta tgctaggcaa gcaggaggtg
240 240
atccgaggct gggaagaagg ggttgcccag atgagtgtgg gtcagagagc caaactgact atccgaggct gggaagaagg ggttgcccag atgagtgtgg gtcagagagc caaactgact
300 300
atatctccag attatgccta tggtgccact gggcacccag gcatcatccc accacatgcc atatctccag attatgccta tggtgccact gggcaccag gcatcatccc accacatgcc
360 360
actctcgtct tcgatgtgga gcttctaaaa ctggaatctg gcggtggttc cggagtcgac actctcgtct tcgatgtgga gcttctaaaa ctggaatctg gcggtggttc cggagtcgac
420 420
ggatttggtg atgtcggtgc tcttgagagt ttgaggggaa atgcagattt ggcttacatc ggatttggtg atgtcggtgc tcttgagagt ttgaggggaa atgcagattt ggcttacatc
480 480
ctgagcatgg agccctgtgg ccactgcctc attatcaaca atgtgaactt ctgccgtgag ctgagcatgg agccctgtgg ccactgcctc attatcaaca atgtgaactt ctgccgtgag
540 540
tccgggctcc gcacccgcac tggctccaac atcgactgtg agaagttgcg gcgtcgcttc tccgggctcc gcacccgcac tggctccaac atcgactgtg agaagttgcg gcgtcgcttc
600 600
tcctcgctgc atttcatggt ggaggtgaag ggcgacctga ctgccaagaa aatggtgctg tcctcgctgc atttcatggt ggaggtgaag ggcgacctga ctgccaagaa aatggtgctg
660 660
gctttgctgg agctggcgcg gcaggaccac ggtgctctgg actgctgcgt ggtggtcatt gctttgctgg agctggcgcg gcaggaccac ggtgctctgg actgctgcgt ggtggtcatt
720 720
ctctctcacg gctgtcaggc cagccacctg cagttcccag gggctgtcta cggcacagat ctctctcacg gctgtcaggc cagccacctg cagttcccag gggctgtcta cggcacagat
780 780
ggatgccctg tgtcggtcga gaagattgtg aacatcttca atgggaccag ctgccccagc ggatgccctg tgtcggtcga gaagattgtg aacatcttca atgggaccag ctgccccagc
840 840
ctgggaggga agcccaagct ctttttcatc caggcctgtg gtggggagca gaaagaccat ctgggaggga agcccaagct ctttttcatc caggcctgtg gtggggagca gaaagaccat
900 900
gggtttgagg tggcctccac ttcccctgaa gacgagtccc ctggcagtaa ccccgagcca gggtttgagg tggcctccac ttcccctgaa gacgagtccc ctggcagtaa ccccgagcca
960 960
gatgccaccc cgttccagga aggtttgagg accttcgacc agctggacgc catatctagt gatgccaccc cgttccagga aggtttgagg accttcgacc agctggacgc catatctagt
10201020
ttgcccacac ccagtgacat ctttgtgtcc tactctactt tcccaggttt tgtttcctgg ttgcccacac ccagtgacat ctttgtgtcc tactctactt tcccaggttt tgtttcctgg
10801080
agggacccca agagtggctc ctggtacgtt gagaccctgg acgacatctt tgagcagtgg agggacccca agagtggctc ctggtacgtt gagaccctgg acgacatctt tgagcagtgg
11401140
gctcactctg aagacctgca gtccctcctg cttagggtcg ctaatgctgt ttcggtgaaa gctcactctg aagacctgca gtccctcctg cttagggtcg ctaatgctgt ttcggtgaaa
12001200
gggatttata aacagatgcc tggttgcttt aatttcctcc ggaaaaaact tttctttaaa gggatttata aacagatgcc tggttgcttt aatttcctcc ggaaaaaact tttctttaaa
12601260
acatcagtcg actatccgta cgacgtacca gactacgcac tcgacctcga cggatcc acatcagtcg actatccgta cgacgtacca gactacgcac tcgacctcga cggatcc
13171317
<210> 2<210> 2
<211> 1315<211> 1315
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> 2a-aviCaspase9<223> 2a-aviCaspase9
<400> 2<400> 2
agggatccgg agctactaac ttcagcctgc tgaagcaggc tggagacgtg gaggagaacc agggatccgg agctactaac ttcagcctgc tgaagcaggc tggagacgtg gaggagaacc
60 60
ctggacctat gctcgaggga gtgcaggtgg agactatctc cccaggagac gggcgcacct ctggacctat gctcgaggga gtgcaggtgg agactatctc cccaggagac gggcgcacct
120 120
tccccaagcg cggccagacc tgcgtggtgc actacaccgg gatgcttgaa gatggaaaga tccccaagcg cggccagacc tgcgtggtgc actacaccgg gatgcttgaa gatggaaaga
180 180
aagttgattc ctcccgggac agaaacaagc cctttaagtt tatgcttggc aagcaggagg aagttgattc ctcccgggac agaaacaagc cctttaagtt tatgcttggc aagcaggagg
240 240
tgatccgagg ctgggaagaa ggggttgccc agatgagtgt gggtcagaga gccaaactga tgatccgagg ctgggaagaa ggggttgccc agatgagtgt gggtcagaga gccaaactga
300 300
ctatatctcc agattatgcc tatggtgcca ctgggcaccc aggcatcatc ccaccacatg ctatatctcc agattatgcc tatggtgcca ctgggcaccc aggcatcatc ccaccacatg
360 360
ccactctcgt cttcgatgtg gagcttctaa aactggaatc tggcggtggt tccggagtcg ccactctcgt cttcgatgtg gagcttctaa aactggaatc tggcggtggt tccggagtcg
420 420
acggtgtctc tgtgaattgc agaccagcta ggatgcatgc tagtgcatgc caggtgtacc acggtgtctc tgtgaattgc agaccagcta ggatgcatgc tagtgcatgc caggtgtacc
480 480
agctgcgagc agacccttgt gggcactgcc tgatcttcaa caatgtcagc ttcagcagag agctgcgagc agacccttgt gggcactgcc tgatcttcaa caatgtcagc ttcagcagag
540 540
actctgatct gtcgactcga gctggctctg acatagactg tgagaagctg gagaagcgtt actctgatct gtcgactcga gctggctctg acatagactg tgagaagctg gagaagcgtt
600 600
tcaggtccct gtgcttccac gtccggaccc tgcggaacct caaagctcag gaaattgatg tcaggtccct gtgcttccac gtccggaccc tgcggaacct caaagctcag gaaattgatg
660 660
tggagctgcg gaagctggcg cggctcgacc acagtgccct ggactgctgc ctcgtggtca tggagctgcg gaagctggcg cggctcgacc acagtgccct ggactgctgc ctcgtggtca
720 720
tcctctccca tggttgccag acaagccata ttcagtttcc cggagggatt tatggaacag tcctctccca tggttgccag acaagccata ttcagtttcc cggagggatt tatggaacag
780 780
atggcaaaat cattccaatc gaaaggattg tgaactattt caatgggtcc cagtgcccga atggcaaaat cattccaatc gaaaggattg tgaactattt caatgggtcc cagtgcccga
840 840
gtttgagagg aaaacccaaa ctcttcttca tccaggcctg tggaggagaa caaaaggacc gtttgagagg aaaacccaaa ctcttcttca tccaggcctg tggaggagaa caaaaggacc
900 900
aaggatttga ggtggattgt gaatcacccc aagatgaaac ttgccgacgt tccatagagt aaggatttga ggtggattgt gaatcacccc aagatgaaac ttgccgacgt tccatagagt
960 960
cggatgcgat tcctttccag gctccatcag ggaatgagga cgagccagac gccgtcgcca cggatgcgat tcctttccag gctccatcag ggaatgagga cgagccagac gccgtcgcca
10201020
gtttgcccac tcctggtgac atcttggtgt cctattcaac ttttccaggt tttgtgtcct gtttgcccac tcctggtgac atcttggtgt cctattcaac ttttccaggt tttgtgtcct
10801080
ggagggacaa ggtgagtggc tcgtggtacg tggaaacctt ggacagcgta ctggaacatt ggagggacaa ggtgagtggc tcgtggtacg tggaaacctt ggacagcgta ctggaacatt
11401140
acgcccgttc tgaagacctg cttaccatgc tacttcgggt gtcagacatc gtatccacca acgcccgttc tgaagacctg cttaccatgc tacttcgggt gtcagacatc gtatccacca
12001200
aggggaggta caagcagatc ccgggctgtt tcaacttcct tcgtaaaaaa ttcttcttcc aggggaggta caagcagatc ccgggctgtt tcaacttcct tcgtaaaaaa ttcttcttcc
12601260
tgtgcaaggt cgactatccg tacgacgtac cagactacgc actcgacgga tccaa tgtgcaaggt cgactatccg tacgacgtac cagactacgc actcgacgga tccaa
13151315
<210> 3<210> 3
<211> 5985<211> 5985
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Leftarm-GFP-2a-Nitroreductase-T2a-Right arm<223> Leftarm-GFP-2a-Nitroreductase-T2a-Right arm
<400> 3<400> 3
tttttttctt tgagatgagt atcttattgc agctctgtgc ataccccttg aaaatccgta tttttttctt tgagatgagt atcttattgc agctctgtgc ataccccttg aaaatccgta
60 60
ggtgatgtat ttatgttgac tgaaaatgga gtcattcaaa aattgatgac ttcttccttt ggtgatgtat ttatgttgac tgaaaatgga gtcattcaaa aattgatgac ttcttccttt
120 120
tctcttttta atctcgaaac ctgttctcag attcctttat cagaacaaaa agcacggctg tctcttttta atctcgaaac ctgttctcag attcctttat cagaacaaaa agcacggctg
180 180
catgtttttc accgttcaca cgactgtgtt tagccagcgt atctaaatgc ataacatgat catgtttttc accgttcaca cgactgtgtt tagccagcgt atctaaatgc ataacatgat
240 240
ttgccataac ttgagcctgc cataatcaga gcctcatttt gaaagctgtc atggtctgaa ttgccataac ttgagcctgc cataatcaga gcctcatttt gaaagctgtc atggtctgaa
300 300
acatagcatg ggtaagatga ttttcacctt gatgatgcat gtttaactca tttcaacgag acatagcatg ggtaagatga ttttcacctt gatgatgcat gtttaactca tttcaacgag
360 360
aggtcaaatc catccaaaaa tgctaaatct atcaaccagt tttcatgttc aagttctggc aggtcaaatc catccaaaaa tgctaaatct atcaaccagt tttcatgttc aagttctggc
420 420
acaaattttc gttctgactc catacgtgat tagatttcat tttgcaaatc atgaaaacta acaaattttc gttctgactc catacgtgat tagatttcat tttgcaaatc atgaaaacta
480 480
ttgccaaaac atacaatttt aagtcagcag ttttactgcc caaatttgca caagcacatg ttgccaaaac atacaatttt aagtcagcag ttttactgcc caaatttgca caagcacatg
540 540
taacgtgaca gacaaaaacc cactggacag agacaaaata ctgggtttgg ccagtatggt taacgtgaca gacaaaaacc cactggacag agacaaaata ctgggtttgg ccagtatggt
600 600
ttggctaagc cacgtttttc agggcaagaa ttgcctcacc tttttttata ttggaatcaa ttggctaagc cacgtttttc agggcaagaa ttgcctcacc ttttttttata ttggaatcaa
660 660
attctcaagt gtaacagcct ggcgccatct cagctgccat taagtagcat gtgctgcaac attctcaagt gtaacagcct ggcgccatct cagctgccat taagtagcat gtgctgcaac
720 720
aagatgtcta ccacacactc tgctctgggt ggtgggggca caccagtgtg gacggcaacc aagatgtcta ccacacactc tgctctgggt ggtggggggca caccagtgtg gacggcaacc
780 780
atgacacaag catagagtct tggcagaggt ccattgggtg catttatagt ggttcacact atgacacaag catagagtct tggcagaggt ccattgggtg catttatagt ggttcacact
840 840
ggggggttat cacagaatca tggaggttgg aaggtacctc cgggggtcat caaatccaac ggggggttat cacagaatca tggaggttgg aaggtacctc cggggggtcat caaatccaac
900 900
cacttgacaa agcaggttcc ctaaagtaga ttgctcaaga acagtcacag cactgctgct cacttgacaa agcaggttcc ctaaagtaga ttgctcaaga acagtcacag cactgctgct
960 960
cacagaaaat ctctagttgg taaggttacc tttttttttg ttgtcgctcc cagttaaacc cacagaaaat ctctagttgg taaggttacc tttttttttg ttgtcgctcc cagttaaacc
10201020
aaggtgggaa cacatccttt tcatagttgt attgtaggga tgtttatagc tattgctagg aaggtgggaa cacatccttt tcatagttgt attgtaggga tgtttatagc tattgctagg
10801080
gaaaactgaa cagcgtgcaa ggaagtcagc actgacacag ctttcccacg tgagagagct gaaaactgaa cagcgtgcaa ggaagtcagc actgacacag ctttcccacg tgagagagct
11401140
atttcaaagc aagatcagca catatcccaa tctgtacttc ctcaaacaca gcccaaaacc atttcaaagc aagatcagca catatcccaa tctgtacttc ctcaaacaca gcccaaaacc
12001200
gatagcaagg ccaagcagca gcactgctcc ttcaaggaaa ctgctgcata atctgaattt gatagcaagg ccaagcagca gcactgctcc ttcaaggaaa ctgctgcata atctgaattt
12601260
cagacggcag gaggaaacaa ggcagcagac tgatgaccta ccaccctgag tctcagctac cagacggcag gaggaaacaa ggcagcagac tgatgaccta ccaccctgag tctcagctac
13201320
atgcgatccg agccactcca actctgcttc ctgcagccct tccttcacgc tcatcttttg atgcgatccg agccactcca actctgcttc ctgcagccct tccttcacgc tcatcttttg
13801380
caccttaggc actcttataa ttcaagtact ttgtggcttt gggatatttg aagagcttgg caccttaggc actcttataa ttcaagtact ttgtggcttt gggatatttg aagagcttgg
14401440
tcagttagtc acaagtctgg ccacgtgcta tcatattagt ttgaaaagca atggagacac tcagttagtc acaagtctgg ccacgtgcta tcatattagt ttgaaaagca atggagacac
15001500
catctgctga tgctcaaagt ggttacaacc aaaacacaaa aaagcagagc tgtgggaaga catctgctga tgctcaaagt ggttacaacc aaaacacaaa aaagcagagc tgtgggaaga
15601560
attcaacatt ttgattatgc aagaagctag tcccagcctt gaaatccacc atctgcatca attcaacatt ttgattatgc aagaagctag tcccagcctt gaaatccacc atctgcatca
16201620
tgaaagacct aagtagttaa agccacagca gacatacagc ttctatttcc ttaccttctt tgaaagacct aagtagttaa agccacagca gacatacagc ttctatttcc ttaccttctt
16801680
catcattaac tacaggtctt ggaagatttt tgctgggaaa aagcttttat tgcaagaact catcattaac tacaggtctt ggaagatttt tgctgggaaa aagcttttat tgcaagaact
17401740
gtaatttatt aacagggaaa catgaaataa atgtgtaaat tctcctgcac tcccactgtc gtaatttatt aacagggaaa catgaaataa atgtgtaaat tctcctgcac tcccactgtc
18001800
attaaaaacg gctttaagaa agagtattca gtaactgcct gcattgtgtt gtgactttct attaaaaacg gctttaagaa agagtattca gtaactgcct gcattgtgtt gtgactttct
18601860
actctgtgac acacagcctt ctgggcaaag cacatattct gccatgcatg tgggtcgtgc actctgtgac acacagcctt ctgggcaaag cacatattct gccatgcatg tgggtcgtgc
19201920
cttggaaaat gggaacccac attcactgag ggcctcttga tgagctttcc ccttgagaac cttggaaaat gggaacccac attcactgag ggcctcttga tgagctttcc ccttgagaac
19801980
agcgaggtct catggatatc ttctcttctc caagccaaat aagcccagat ccctcagctt agcgaggtct catggatatc ttctcttctc caagccaaat aagcccagat ccctcagctt
20402040
tccttcatgg agaggctcca gccctctgat catgcctgca gcccttctct ggacctgctc tccttcatgg agaggctcca gccctctgat catgcctgca gcccttctct ggacctgctc
21002100
cagcagcccc acacgctcct catgctggga ccccagatct gcacatggta ttgcacatgg cagcagcccc acacgctcct catgctggga ccccagatct gcacatggta ttgcacatgg
21602160
ggcctcacaa cggcagagct gagagggaca attccctccc tcagccttta attctgcacg ggcctcacaa cggcagagct gagagggaca attccctccc tcagccttta attctgcacg
22202220
tacttaattt tgtctgtatt ttttttgcaa tagaatagcc tgcatgctag ttgctgtgtc tacttaattt tgtctgtatt ttttttgcaa tagaatagcc tgcatgctag ttgctgtgtc
22802280
gcacagctga attcactagg ttcctgtgaa acaaagggca atcccacagc cactgtagca gcacagctga attcactagg ttcctgtgaa acaaagggca atcccacagc cactgtagca
23402340
cgtgaggagc cacacaggtg ctctaattcc tacaggacag gcctagggac agagcggccc cgtgaggagc cacacaggtg ctctaattcc tacaggacag gcctagggac agagcggccc
24002400
taggactgcc ctcccgcacc tcctagcttc accttttgcc cgcgatcttt aagtaccctg taggactgcc ctcccgcacc tcctagcttc accttttgcc cgcgatcttt aagtaccctg
24602460
aagcataaac agggaaagcg ccgcccgcag cctcaccctg cttcccgccc aacgcggcac aagcataaac agggaaagcg ccgcccgcag cctcaccctg cttcccgccc aacgcggcac
25202520
cgcccaggcc gcagccgccc actaagagca ctagcgccac cttctcaccc cacccccacc cgcccaggcc gcagccgccc actaagagca ctagcgccac cttctcaccc cacccccacc
25802580
acgcgttcct agcggccctg agagctgctg cgcatgcgcc gcctgacgat tcgccctccc acgcgttcct agcggccctg agagctgctg cgcatgcgcc gcctgacgat tcgccctccc
26402640
attggctggc ggtcgaagca cggcgggggc acgcggtggc ggctatataa ggcgtctcgg attggctggc ggtcgaagca cggcggggggc acgcggtggc ggctatataa ggcgtctcgg
27002700
aagacggcgc catgctattt ggagcggaga gtgaaagtta cagttcctgg tgctggtagg aagacggcgc catgctattt ggagcggaga gtgaaagtta cagttcctgg tgctggtagg
27602760
gagtgtggcg cggagcggag cgctgcggct catcggaacc acaatggagc catagcagag gagtgtggcg cggagcggag cgctgcggct catcggaacc acaatggagc catagcagag
28202820
ccgggcgtgg gggcaagggc agtgcgtgct ggggagggct ccgtcgcgtg gccacgtcgc ccgggcgtgg gggcaagggc agtgcgtgct ggggagggct ccgtcgcgtg gccacgtcgc
28802880
gagagccgtc gggatggtgg cgtcagggcg gggggtgctg ctaacgtgct cctggtcctg gagagccgtc gggatggtgg cgtcagggcg gggggtgctg ctaacgtgct cctggtcctg
29402940
caggtgggct gctggcattc gccatggtga gcaagggcga ggagctgttc accggggtgg caggtgggct gctggcattc gccatggtga gcaagggcga ggagctgttc accggggtgg
30003000
tgcccatcct ggtcgagctg gacggcgacg taaacggcca caagttcagc gtgtccggcg tgcccatcct ggtcgagctg gacggcgacg taaacggcca caagttcagc gtgtccggcg
30603060
agggcgaggg cgatgccacc tacggcaagc tgaccctgaa gttcatctgc accaccggca agggcgaggg cgatgccacc tacggcaagc tgaccctgaa gttcatctgc accaccggca
31203120
agctgcccgt gccctggccc accctcgtga ccaccctgac ctacggcgtg cagtgcttca agctgcccgt gccctggccc accctcgtga ccaccctgac ctacggcgtg cagtgcttca
31803180
gccgctaccc cgaccacatg aagcagcacg acttcttcaa gtccgccatg cccgaaggct gccgctaccc cgaccacatg aagcagcacg acttcttcaa gtccgccatg cccgaaggct
32403240
acgtccagga gcgcaccatc ttcttcaagg acgacggcaa ctacaagacc cgcgccgagg acgtccagga gcgcaccatc ttcttcaagg acgacggcaa ctacaagacc cgcgccgagg
33003300
tgaagttcga gggcgacacc ctggtgaacc gcatcgagct gaagggcatc gacttcaagg tgaagttcga gggcgacacc ctggtgaacc gcatcgagct gaagggcatc gacttcaagg
33603360
aggacggcaa catcctgggg cacaagctgg agtacaacta caacagccac aacgtctata aggacggcaa catcctgggg cacaagctgg agtacaacta caacagccac aacgtctata
34203420
tcatggccga caagcagaag aacggcatca aggtgaactt caagatccgc cacaacatcg tcatggccga caagcagaag aacggcatca aggtgaactt caagatccgc cacaacatcg
34803480
aggacggcag cgtgcagctc gccgaccact accagcagaa cacccccatc ggcgacggcc aggacggcag cgtgcagctc gccgaccact accagcagaa cacccccatc ggcgacggcc
35403540
ccgtgctgct gcccgacaac cactacctga gcacccagtc cgccctgagc aaagacccca ccgtgctgct gcccgacaac cactacctga gcacccagtc cgccctgagc aaagacccca
36003600
acgagaagcg cgatcacatg gtcctgctgg agttcgtgac cgccgccggg atcactctcg acgagaagcg cgatcacatg gtcctgctgg agttcgtgac cgccgccggg atcactctcg
36603660
gcatggacga gctgtacaag ggatccggag ctactaactt cagcctgctg aagcaggctg gcatggacga gctgtacaag ggatccggag ctactaactt cagcctgctg aagcaggctg
37203720
gagacgtgga ggagaaccct ggacctatgg atatcatcag cgtggccctg aagagacaca gagacgtgga ggagaaccct ggacctatgg atatcatcag cgtggccctg aagagacaca
37803780
gcaccaaggc cttcgatgcc agcaagaagc tgacccccga gcaggccgag cagatcaaga gcaccaaggc cttcgatgcc agcaagaagc tgacccccga gcaggccgag cagatcaaga
38403840
ccctgctgca gtacagcccc agcagccaga acagccagcc ctggcacttc atcgtggcca ccctgctgca gtacagcccc agcagccaga acagccagcc ctggcacttc atcgtggcca
39003900
gcaccgagga aggcaaggcc agagtggcca agagcgccgc cggcaactac gtgttcagcg gcaccgagga aggcaaggcc agagtggcca agagcgccgc cggcaactac gtgttcagcg
39603960
agagaaagat gctggatgcc agccacgtgg tggtgttctg cgccaagacc gctatggatg agagaaagat gctggatgcc agccacgtgg tggtgttctg cgccaagacc gctatggatg
40204020
atgtgtggct gaagctggtg gtggatcagg aggatgccga tggcagattc gccacccccg atgtgtggct gaagctggtg gtggatcagg aggatgccga tggcagattc gccacccccg
40804080
aggccaaggc cgccaacgat aagggcagaa agttcaccgc cgatatgcac agaaaggatc aggccaaggc cgccaacgat aagggcagaa agttcaccgc cgatatgcac agaaaggatc
41404140
tgcacgatga tgccgagtgg atggccaagc aggtgtacct gaacgtgggc aacttcctgc tgcacgatga tgccgagtgg atggccaagc aggtgtacct gaacgtgggc aacttcctgc
42004200
tcggcgtggc cgccctgggc ctggatgccg tgcccatcga gggcttcgat gccgccatcc tcggcgtggc cgccctgggc ctggatgccg tgcccatcga gggcttcgat gccgccatcc
42604260
tggatgccga gttcggcctg aaggagaagg gctacaccag cctggtggtg gtgcccgtgg tggatgccga gttcggcctg aaggagaagg gctacaccag cctggtggtg gtgcccgtgg
43204320
gccaccacag cgtggaggat ttcaacgcca ccctccccaa gagcagactg ccccagaaca gccaccacag cgtggaggat ttcaacgcca ccctccccaa gagcagactg ccccagaaca
43804380
tcaccctgac cgaggtggga tccggagagg gcagaggaag tctgctaaca tgcggtgacg tcaccctgac cgaggtggga tccggagagg gcagaggaag tctgctaaca tgcggtgacg
44404440
tcgaggagaa tcctggacct atggaggagg attgggatac cgaactcgag caggaggcgg tcgaggagaa tcctggacct atggaggagg attgggatac cgaactcgag caggaggcgg
45004500
cagcggcttc ccaggggcgt tctgaggagc aggcgtggat ggtgagctgt gtccagggga cagcggcttc ccaggggcgt tctgaggagc aggcgtggat ggtgagctgt gtccagggga
45604560
gggcggtgcg gcagggagcg gggcactggg atggcccggt ctgggaaggg gaggccgaga gggcggtgcg gcagggagcg gggcactggg atggcccggt ctgggaaggg gaggccgaga
46204620
ggccttcgca gtgcttcctg cagctccccg agcagtgcga agaaggaggt gccgggctct ggccttcgca gtgcttcctg cagctccccg agcagtgcga agaaggaggt gccgggctct
46804680
gctgtgggag ccgaaggcac ggagctgcct ggggagggaa tggctgtgtg cctgaggtgc gctgtgggag ccgaaggcac ggagctgcct ggggagggaa tggctgtgtg cctgaggtgc
47404740
cagagaccgg caagggctgt acagagaggc aacggttttg tgtacaaatc atttgtatgg cagagaccgg caagggctgt acagagaggc aacggttttg tgtacaaatc atttgtatgg
48004800
gaaaccacaa aatcttgaag ctttattaca tggcagcgaa atactttggt gtgaagtaaa gaaaccacaa aatcttgaag ctttattaca tggcagcgaa atactttggt gtgaagtaaa
48604860
ggataagata gaggagtgta atgagagaca gctaaataat attttactac ttgtgggatg ggataagata gaggagtgta atgagagaca gctaaataat attttactac ttgtgggatg
49204920
agtgaatatc aggaggaact gctgtaaatt tcaggaggac ctgttgtgaa tcttcagtag agtgaatatc aggaggaact gctgtaaatt tcaggaggac ctgttgtgaa tcttcagtag
49804980
ttggcgccgc tcttacacat cttacagatg ccccttgagc aaagggggat aaggagagat ttggcgccgc tcttacacat cttacagatg ccccttgagc aaagggggat aaggagagat
50405040
gaacgggtta tccaaacagg tgatgagcta aaagtacagt tgcctaaaga agtagtagca gaacgggtta tccaaacagg tgatgagcta aaagtacagt tgcctaaaga agtagtagca
51005100
tgtgctatca gaatgataat tttgttagtt tggggttagt ttcctgtagt ggtagatagc tgtgctatca gaatgataat tttgttagtt tggggttagt ttcctgtagt ggtagatagc
51605160
cacaacaaga aaaccgctta agtttttgta aaacaaaaaa agcacgatcc agaagtaaaa cacaacaaga aaaccgctta agtttttgta aaacaaaaaa agcacgatcc agaagtaaaa
52205220
aatatgggta gttttttttg atgttcctct ctcacctggt gctttggcat actaatatgt aatatgggta gttttttttg atgttcctct ctcacctggt gctttggcat actaatatgt
52805280
gtctaattgt attaaacagg agaaatttaa acctaggctt tgctggaaat aaaatgttac gtctaattgt attaaacagg agaaatttaa acctaggctt tgctggaaat aaaatgttac
53405340
aatgctacaa tgtgaaaagt aggtgctatt ctgaactgtt ttgggtggag tatctgaatc aatgctacaa tgtgaaaagt aggtgctatt ctgaactgtt ttgggtggag tatctgaatc
54005400
tttgaataat ttaagaggga ctgacatatt taaaatactt aaggataatc tgtagccatg tttgaataat ttaagaggga ctgacatatt taaaatactt aaggataatc tgtagccatg
54605460
ctgtaaaaga acaacagaaa tgcagttggg aaggtgatgg aaatagtttt attcatgtta ctgtaaaaga acaacagaaa tgcagttggg aaggtgatgg aaatagtttt attcatgtta
55205520
ctggtggtct gaaacctttc taagcttaaa ctgtagaaaa aaattgcttc aaaagattgc ctggtggtct gaaacctttc taagcttaaa ctgtagaaaa aaattgcttc aaaagattgc
55805580
actattactt tgggcgacaa atgtttttaa ttggttttaa gtgtttgtta gcaaagtgaa actattactt tgggcgacaa atgtttttaa ttggttttaa gtgtttgtta gcaaagtgaa
56405640
gttgatgcca ccataagtct gacaggaggc aagataaact tgtcttcata ctgcttgtgt gttgatgcca ccataagtct gacaggaggc aagataaact tgtcttcata ctgcttgtgt
57005700
ataacttggt tttgatgaca tttgtgtgtg aacattatgc acttcagtgt agcgaagttt ataacttggt tttgatgaca tttgtgtgtg aacattatgc acttcagtgt agcgaagttt
57605760
aagaaacttt gaacagaata acttgaaaga gtgtgcacat gggtgcagaa gtcactttat aagaaacttt gaacagaata acttgaaaga gtgtgcacat gggtgcagaa gtcactttat
58205820
ttcagttggg agacttagca cctaaatgca ctgttagttc acatacactt tgcttggcct ttcagttggg agacttagca cctaaatgca ctgttagttc acatacactt tgcttggcct
58805880
gaaggtaaca ttgtgatgtc gctttttttc cctgtaggct aactctggca gaccaaacag gaaggtaaca ttgtgatgtc gctttttttc cctgtaggct aactctggca gaccaaacag
59405940
cccatccctc cgcttctcca gcagaccaag cagccccttg tctgg cccatccctc cgcttctcca gcagaccaag cagccccttg tctgg
59855985
<210> 4<210> 4
<211> 5155<211> 5155
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Left arm-2a-aviCaspase9-T2a-GFP-Right arm<223> Left arm-2a-aviCaspase9-T2a-GFP-Right arm
<400> 4<400> 4
cttcgtggct tggtgaagag atcttctgac ctcttcatca ccccctagaa ttaaggctgt cttcgtggct tggtgaagag atcttctgac ctcttcatca ccccctagaa ttaaggctgt
60 60
aatcatcatt tcagccattg cttaatccac tataatttct gcatgatttc agaaggctat aatcatcatt tcagccatg cttaatccac tataatttct gcatgatttc agaaggctat
120 120
cttgcttcct tgaaactaat aatacctagt ttgtagtgtt tagggatgtg taaaatgtgt cttgcttcct tgaaactaat aatacctagt ttgtagtgtt tagggatgtg taaaatgtgt
180 180
ttatgtcaag attttagtta gtctgataag aattgtggaa gaattgcagc tactaaaaag ttatgtcaag attttagtta gtctgataag aattgtggaa gaattgcagc tactaaaaag
240 240
gcagactggg tagcacttcc caccttactc agatttagga gtctcaagac atgtagatgg gcagactggg tagcacttcc caccttactc agatttagga gtctcaagac atgtagatgg
300 300
gtgaaattta ttattctttt ctctgcttgc ttttctggaa agctacctct atttggccag gtgaaattta ttattctttt ctctgcttgc ttttctggaa agctacctct atttggccag
360 360
cagttggctc tgaattcctt tctttaaagg agacctgact gctctcctgt ctgcctctta cagttggctc tgaattcctt tctttaaagg agacctgact gctctcctgt ctgcctctta
420 420
cacagctgta ctggtgtgtc actgatagaa acgtttacct tgaaagtgac aagtgggggc cacagctgta ctggtgtgtc actgatagaa acgtttacct tgaaagtgac aagtgggggc
480 480
gttgataccc attaacaaca ttaaagggaa aatttcagga aacaagaaaa ctgagaggag gttgataccc attaacaaca ttaaagggaa aatttcagga aacaagaaaa ctgagaggag
540 540
ttcagaatga aatgtaagcc ctgtgacaga ctcacactga tggtagtagg gtaactgatg ttcagaatga aatgtaagcc ctgtgacaga ctcacactga tggtagtagg gtaactgatg
600 600
gagatgcatc tataacaatt ctaactttta tttcagaagt ctgtggacag gagcatacaa gagatgcatc tataacaatt ctaactttta tttcagaagt ctgtggacag gagcatacaa
660 660
acagtagtat cttgtctgtt taaccctgaa aaccgtctga ggaacacctt tgtatcacaa acagtagtat cttgtctgtt taaccctgaa aaccgtctga ggaacacctt tgtatcacaa
720 720
gaagactact tcagggtatg tagtgaaagc aaaactaaat ctctaaaacc agctgatctt gaagactact tcagggtatg tagtgaaagc aaaactaaat ctctaaaacc agctgatctt
780 780
aactttgttc atatacagga tgccatgaag acaaaggttt atctgtactt gcttgagatt aactttgttc atatacagga tgccatgaag acaaaggttt atctgtactt gcttgagatt
840 840
ttactttttg tatgtgcatt gagatgaatg actggttagc tctcagttgg ttaatactca ttactttttg tatgtgcatt gagatgaatg actggttagc tctcagttgg ttaatactca
900 900
atgaaaattg cagaaattga gttcagtgga tttaagtgca ttgatacaag gctgcataag atgaaaattg cagaaattga gttcagtgga tttaagtgca ttgatacaag gctgcataag
960 960
aactgctgag cagtcagcta ttggatattt agagctaatc atccctcagg agcaatctgc aactgctgag cagtcagcta ttggatattt agagctaatc atccctcagg agcaatctgc
10201020
tgaaaggtaa gcagattgca tcttgtaaac gagagagcag agttaaacgt ttgtggtctt tgaaaggtaa gcagattgca tcttgtaaac gagagagcag agttaaacgt ttgtggtctt
10801080
tgctccactt aagtacccac agtggatgtc tatctgtact tttggttaaa aaatagataa tgctccactt aagtacccac agtggatgtc tatctgtact tttggttaaa aaatagataa
11401140
tttctacaac agactgtagt taggtcagta cctggtcatc aggtattaat ggaaagcttt tttctacaac agactgtagt taggtcagta cctggtcatc aggtattaat ggaaagcttt
12001200
ttgctgtgca ttcaatcttc atagaggtct gctttccaat tacattctct ttgttttaag ttgctgtgca ttcaatcttc atagaggtct gctttccaat tacattctct ttgttttaag
12601260
tataactttg aaactcaaat ataaaagcct gctacttttt tttgttctaa aaagacagat tataactttg aaactcaaat ataaaagcct gctacttttt tttgttctaa aaagacagat
13201320
gtggactagg cacctgtact gtgaaaccag aatagagaag ctgttgggca gatttgaaga gtggactagg cacctgtact gtgaaaccag aatagagaag ctgttgggca gatttgaaga
13801380
ggattgagta atatagagaa tgtcttgaga tatttgtgaa gcttttattg ctttgttgca ggattgagta atatagagaa tgtcttgaga tatttgtgaa gcttttattg ctttgttgca
14401440
attgttgtct agaaacatgg gctttttctg ttttttctcc tattccagga gaggagggcg attgttgtct agaaacatgg gctttttctg ttttttctcc tattccagga gaggagggcg
15001500
catcacttca gaaaaggaag agcagtgctc aaaagtgttg gatccggagc tactaacttc catcacttca gaaaaggaag agcagtgctc aaaagtgttg gatccggagc tactaacttc
15601560
agcctgctga agcaggctgg agacgtggag gagaaccctg gacctatgct cgagggagtg agcctgctga agcaggctgg agacgtggag gagaaccctg gacctatgct cgagggagtg
16201620
caggtggaga ctatctcccc aggagacggg cgcaccttcc ccaagcgcgg ccagacctgc caggtggaga ctatctcccc aggagacggg cgcaccttcc ccaagcgcgg ccagacctgc
16801680
gtggtgcact acaccgggat gcttgaagat ggaaagaaag ttgattcctc ccgggacaga gtggtgcact acaccgggat gcttgaagat ggaaagaaag ttgattcctc ccgggacaga
17401740
aacaagccct ttaagtttat gcttggcaag caggaggtga tccgaggctg ggaagaaggg aacaagccct ttaagtttat gcttggcaag caggaggtga tccgaggctg ggaagaaggg
18001800
gttgcccaga tgagtgtggg tcagagagcc aaactgacta tatctccaga ttatgcctat gttgcccaga tgagtgtggg tcagagagcc aaactgacta tatctccaga ttatgcctat
18601860
ggtgccactg ggcacccagg catcatccca ccacatgcca ctctcgtctt cgatgtggag ggtgccactg ggcacccagg catcatccca ccacatgcca ctctcgtctt cgatgtggag
19201920
cttctaaaac tggaatctgg cggtggttcc ggagtcgacg gtgtctctgt gaattgcaga cttctaaaac tggaatctgg cggtggttcc ggagtcgacg gtgtctctgt gaattgcaga
19801980
ccagctagga tgcatgctag tgcatgccag gtgtaccagc tgcgagcaga cccttgtggg ccagctagga tgcatgctag tgcatgccag gtgtaccagc tgcgagcaga cccttgtggg
20402040
cactgcctga tcttcaacaa tgtcagcttc agcagagact ctgatctgtc gactcgagct cactgcctga tcttcaacaa tgtcagcttc agcagagact ctgatctgtc gactcgagct
21002100
ggctctgaca tagactgtga gaagctggag aagcgtttca ggtccctgtg cttccacgtc ggctctgaca tagactgtga gaagctggag aagcgtttca ggtccctgtg cttccacgtc
21602160
cggaccctgc ggaacctcaa agctcaggaa attgatgtgg agctgcggaa gctggcgcgg cggaccctgc ggaacctcaa agctcaggaa attgatgtgg agctgcggaa gctggcgcgg
22202220
ctcgaccaca gtgccctgga ctgctgcctc gtggtcatcc tctcccatgg ttgccagaca ctcgaccaca gtgccctgga ctgctgcctc gtggtcatcc tctcccatgg ttgccagaca
22802280
agccatattc agtttcccgg agggatttat ggaacagatg gcaaaatcat tccaatcgaa agccatattc agtttcccgg agggatttat ggaacagatg gcaaaatcat tccaatcgaa
23402340
aggattgtga actatttcaa tgggtcccag tgcccgagtt tgagaggaaa acccaaactc aggattgtga actatttcaa tgggtcccag tgcccgagtt tgagaggaaa acccaaactc
24002400
ttcttcatcc aggcctgtgg aggagaacaa aaggaccaag gatttgaggt ggattgtgaa ttcttcatcc aggcctgtgg aggagaacaa aaggaccaag gatttgaggt ggattgtgaa
24602460
tcaccccaag atgaaacttg ccgacgttcc atagagtcgg atgcgattcc tttccaggct tcaccccaag atgaaacttg ccgacgttcc atagagtcgg atgcgattcc tttccaggct
25202520
ccatcaggga atgaggacga gccagacgcc gtcgccagtt tgcccactcc tggtgacatc ccatcaggga atgaggacga gccagacgcc gtcgccagtt tgcccactcc tggtgacatc
25802580
ttggtgtcct attcaacttt tccaggtttt gtgtcctgga gggacaaggt gagtggctcg ttggtgtcct attcaacttt tccaggtttt gtgtcctgga gggacaaggt gagtggctcg
26402640
tggtacgtgg aaaccttgga cagcgtactg gaacattacg cccgttctga agacctgctt tggtacgtgg aaaccttgga cagcgtactg gaacattacg cccgttctga agacctgctt
27002700
accatgctac ttcgggtgtc agacatcgta tccaccaagg ggaggtacaa gcagatcccg accatgctac ttcgggtgtc agacatcgta tccaccaagg ggaggtacaa gcagatcccg
27602760
ggctgtttca acttccttcg taaaaaattc ttcttcctgt gcaaggtcga ctatccgtac ggctgtttca acttccttcg taaaaaattc ttcttcctgt gcaaggtcga ctatccgtac
28202820
gacgtaccag actacgcact cgacggatcc ggagagggca gaggaagtct gctaacatgc gacgtaccag actacgcact cgacggatcc ggagagggca gaggaagtct gctaacatgc
28802880
ggtgacgtcg aggagaatcc tggacctatg gtgagcaagg gcgaggagct gttcaccggg ggtgacgtcg aggagaatcc tggacctatg gtgagcaagg gcgaggagct gttcaccggg
29402940
gtggtgccca tcctggtcga gctggacggc gacgtaaacg gccacaagtt cagcgtgtcc gtggtgccca tcctggtcga gctggacggc gacgtaaacg gccacaagtt cagcgtgtcc
30003000
ggcgagggcg agggcgatgc cacctacggc aagctgaccc tgaagttcat ctgcaccacc ggcgagggcg agggcgatgc cacctacggc aagctgaccc tgaagttcat ctgcaccacc
30603060
ggcaagctgc ccgtgccctg gcccaccctc gtgaccaccc tgacctacgg cgtgcagtgc ggcaagctgc ccgtgccctg gcccaccctc gtgaccaccc tgacctacgg cgtgcagtgc
31203120
ttcagccgct accccgacca catgaagcag cacgacttct tcaagtccgc catgcccgaa ttcagccgct accccgacca catgaagcag cacgacttct tcaagtccgc catgcccgaa
31803180
ggctacgtcc aggagcgcac catcttcttc aaggacgacg gcaactacaa gacccgcgcc ggctacgtcc aggagcgcac catcttcttc aaggacgacg gcaactacaa gacccgcgcc
32403240
gaggtgaagt tcgagggcga caccctggtg aaccgcatcg agctgaaggg catcgacttc gaggtgaagt tcgagggcga caccctggtg aaccgcatcg agctgaaggg catcgacttc
33003300
aaggaggacg gcaacatcct ggggcacaag ctggagtaca actacaacag ccacaacgtc aaggaggacg gcaacatcct ggggcacaag ctggagtaca actacaacag ccacaacgtc
33603360
tatatcatgg ccgacaagca gaagaacggc atcaaggtga acttcaagat ccgccacaac tatatcatgg ccgacaagca gaagaacggc atcaaggtga acttcaagat ccgccacaac
34203420
atcgaggacg gcagcgtgca gctcgccgac cactaccagc agaacacccc catcggcgac atcgaggacg gcagcgtgca gctcgccgac cactaccagc agaacacccc catcggcgac
34803480
ggccccgtgc tgctgcccga caaccactac ctgagcaccc agtccgccct gagcaaagac ggccccgtgc tgctgcccga caaccactac ctgagcaccc agtccgccct gagcaaagac
35403540
cccaacgaga agcgcgatca catggtcctg ctggagttcg tgaccgccgc cgggatcact cccaacgaga agcgcgatca catggtcctg ctggagttcg tgaccgccgc cgggatcact
36003600
ctcggcatgg acgagctgta caagtgatga acaaagactt tgaagtacat aaatgtatta ctcggcatgg acgagctgta caagtgatga acaaagactt tgaagtacat aaatgtatta
36603660
ctttgatgtt aatacagttc agtttagtaa gatgtgtagt aaaaagtgta accttgttca ctttgatgtt aatacagttc agtttagtaa gatgtgtagt aaaaagtgta accttgttca
37203720
aaaagttgct tcaagttgat gtttgtgttc tgttttacct gttccagaat agctattttt aaaagttgct tcaagttgat gtttgtgttc tgttttacct gttccagaat agctattttt
37803780
gcttgagaag tttgaagttg taagagttga aatatttcca ggttttatta ctagcttgca gcttgagaag tttgaagttg taagagttga aatatttcca ggttttatta ctagcttgca
38403840
tgcttttcct gctaactaac tgaaatgcta atcttaagga atttatatgg ggaaggggaa tgcttttcct gctaactaac tgaaatgcta atcttaagga atttatatgg ggaaggggaa
39003900
aaaagaaaaa cactttgttt ggtacgtgtg gattttcttc tgagctttaa ggtacagttt aaaagaaaaa cactttgttt ggtacgtgtg gattttcttc tgagctttaa ggtacagttt
39603960
gttgcatgtt aaaatttagt tcttattaaa ccacaacttt aagttactaa cgtcaaccag gttgcatgtt aaaatttagt tcttattaaa ccacaacttt aagttactaa cgtcaaccag
40204020
ttacctcttg cagttcaaaa gttgaagcag ttccttgtcc aagatggagt attttaaaac ttacctcttg cagttcaaaa gttgaagcag ttccttgtcc aagatggagt attttaaaac
40804080
tgagctctta atcagtggaa cagaagacgt cacggtgtaa ctcaactgaa gccctttaag tgagctctta atcagtggaa cagaagacgt cacggtgtaa ctcaactgaa gccctttaag
41404140
tcccggttct ctttagacta cctaatcaat gtctttgttt gctaacgaca gtttatctat tcccggttct ctttagacta cctaatcaat gtctttgttt gctaacgaca gtttatctat
42004200
gtgaatccta aaattcctat atgtaactta agatgcaaga atgtaattag ttacattggc gtgaatccta aaattcctat atgtaactta agatgcaaga atgtaattag ttacattggc
42604260
tgctcagtgg agtatgactt ttttttttac tggattaatt ttagcaatac ctgtatctta tgctcagtgg agtatgactt ttttttttac tggattaatt ttagcaatac ctgtatctta
43204320
aaattgtgag aaaatactgc atttaaaata tgcctaactt tgtgatgcaa tatgttaatc aaattgtgag aaaatactgc atttaaaata tgcctaactt tgtgatgcaa tatgttaatc
43804380
aaagaataca tgtaagcata ttttaataat aattatgtag attttagtca tgtattttga aaagaataca tgtaagcata ttttaataat aattatgtag attttagtca tgtattttga
44404440
aacaattaaa atttttaatt ttgacttacc ttcccagtgt gagtgacatc ctaatataat aacaattaaa atttttaatt ttgacttacc ttcccagtgt gagtgacatc ctaatataat
45004500
acttctaaat cttaagctgc tttgagaaag gcatgcagcg tatttattga aggaattgaa acttctaaat cttaagctgc tttgagaaag gcatgcagcg tatttattga aggaattgaa
45604560
gatttcttac cctacataag aattccagtt aggacaagtt tatagcaaca aactttcaca gatttcttac cctacataag aattccagtt aggacaagtt tatagcaaca aactttcaca
46204620
tttgctgtta gttctacctg cgattttgaa ggagtacaac tgagaacagc actcagtctt tttgctgtta gttctacctg cgattttgaa ggagtacaac tgagaacagc actcagtctt
46804680
gtatgtgtgt tgggtcctag tctgattcat ttttcttatt actaccctta tacctcagtc gtatgtgtgt tgggtcctag tctgattcat ttttcttatt actaccctta tacctcagtc
47404740
tccaagtaaa aaaggaaata actcctcctt tgtagacgtg tatatgtgaa tgaatagaat tccaagtaaa aaaggaaata actcctcctt tgtagacgtg tatatgtgaa tgaatagaat
48004800
ggcatgtccc acttcaaatg tctagaagta gatgttggtg aaacatgcaa taagagctga ggcatgtccc acttcaaatg tctagaagta gatgttggtg aaacatgcaa taagagctga
48604860
gttgctctgt acctggatag tgggctgtaa gatgcagcac aggagtgtcc caggactgtt gttgctctgt acctggatag tgggctgtaa gatgcagcac aggagtgtcc caggactgtt
49204920
gttcaggagt aggagtcagg ggagggaggc agggcttggg ggatagcaat aatagttggt gttcaggagt aggagtcagg ggagggaggc agggcttggg ggatagcaat aatagttggt
49804980
gccgttctcc ataaaattac tcagaagcaa tgttctggca gcataaatcg acctaaagtt gccgttctcc ataaaattac tcagaagcaa tgttctggca gcataaatcg acctaaagtt
50405040
gttaactttt tctctgctca gaccgttccc tagcactaaa gatgctgtgt ccttaagtgt gttaactttt tctctgctca gaccgttccc tagcactaaa gatgctgtgt ccttaagtgt
51005100
gtttccatac tatccatcac catgtttttc ccaacctatt gctttaatag tattg gtttccatac tatccatcac catgtttttc ccaacctatt gctttaatag tattg
51555155
<210> 5<210> 5
<211> 5161<211> 5161
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Left arm-2a-iCaspase9-T2a-GFP-Right arm<223> Left arm-2a-iCaspase9-T2a-GFP-Right arm
<400> 5<400> 5
cttcgtggct tggtgaagag atcttctgac ctcttcatca ccccctagaa ttaaggctgt cttcgtggct tggtgaagag atcttctgac ctcttcatca ccccctagaa ttaaggctgt
60 60
aatcatcatt tcagccattg cttaatccac tataatttct gcatgatttc agaaggctat aatcatcatt tcagccatg cttaatccac tataatttct gcatgatttc agaaggctat
120 120
cttgcttcct tgaaactaat aatacctagt ttgtagtgtt tagggatgtg taaaatgtgt cttgcttcct tgaaactaat aatacctagt ttgtagtgtt tagggatgtg taaaatgtgt
180 180
ttatgtcaag attttagtta gtctgataag aattgtggaa gaattgcagc tactaaaaag ttatgtcaag attttagtta gtctgataag aattgtggaa gaattgcagc tactaaaaag
240 240
gcagactggg tagcacttcc caccttactc agatttagga gtctcaagac atgtagatgg gcagactggg tagcacttcc caccttactc agatttagga gtctcaagac atgtagatgg
300 300
gtgaaattta ttattctttt ctctgcttgc ttttctggaa agctacctct atttggccag gtgaaattta ttattctttt ctctgcttgc ttttctggaa agctacctct atttggccag
360 360
cagttggctc tgaattcctt tctttaaagg agacctgact gctctcctgt ctgcctctta cagttggctc tgaattcctt tctttaaagg agacctgact gctctcctgt ctgcctctta
420 420
cacagctgta ctggtgtgtc actgatagaa acgtttacct tgaaagtgac aagtgggggc cacagctgta ctggtgtgtc actgatagaa acgtttacct tgaaagtgac aagtgggggc
480 480
gttgataccc attaacaaca ttaaagggaa aatttcagga aacaagaaaa ctgagaggag gttgataccc attaacaaca ttaaagggaa aatttcagga aacaagaaaa ctgagaggag
540 540
ttcagaatga aatgtaagcc ctgtgacaga ctcacactga tggtagtagg gtaactgatg ttcagaatga aatgtaagcc ctgtgacaga ctcacactga tggtagtagg gtaactgatg
600 600
gagatgcatc tataacaatt ctaactttta tttcagaagt ctgtggacag gagcatacaa gagatgcatc tataacaatt ctaactttta tttcagaagt ctgtggacag gagcatacaa
660 660
acagtagtat cttgtctgtt taaccctgaa aaccgtctga ggaacacctt tgtatcacaa acagtagtat cttgtctgtt taaccctgaa aaccgtctga ggaacacctt tgtatcacaa
720 720
gaagactact tcagggtatg tagtgaaagc aaaactaaat ctctaaaacc agctgatctt gaagactact tcagggtatg tagtgaaagc aaaactaaat ctctaaaacc agctgatctt
780 780
aactttgttc atatacagga tgccatgaag acaaaggttt atctgtactt gcttgagatt aactttgttc atatacagga tgccatgaag acaaaggttt atctgtactt gcttgagatt
840 840
ttactttttg tatgtgcatt gagatgaatg actggttagc tctcagttgg ttaatactca ttactttttg tatgtgcatt gagatgaatg actggttagc tctcagttgg ttaatactca
900 900
atgaaaattg cagaaattga gttcagtgga tttaagtgca ttgatacaag gctgcataag atgaaaattg cagaaattga gttcagtgga tttaagtgca ttgatacaag gctgcataag
960 960
aactgctgag cagtcagcta ttggatattt agagctaatc atccctcagg agcaatctgc aactgctgag cagtcagcta ttggatattt agagctaatc atccctcagg agcaatctgc
10201020
tgaaaggtaa gcagattgca tcttgtaaac gagagagcag agttaaacgt ttgtggtctt tgaaaggtaa gcagattgca tcttgtaaac gagagagcag agttaaacgt ttgtggtctt
10801080
tgctccactt aagtacccac agtggatgtc tatctgtact tttggttaaa aaatagataa tgctccactt aagtacccac agtggatgtc tatctgtact tttggttaaa aaatagataa
11401140
tttctacaac agactgtagt taggtcagta cctggtcatc aggtattaat ggaaagcttt tttctacaac agactgtagt taggtcagta cctggtcatc aggtattaat ggaaagcttt
12001200
ttgctgtgca ttcaatcttc atagaggtct gctttccaat tacattctct ttgttttaag ttgctgtgca ttcaatcttc atagaggtct gctttccaat tacattctct ttgttttaag
12601260
tataactttg aaactcaaat ataaaagcct gctacttttt tttgttctaa aaagacagat tataactttg aaactcaaat ataaaagcct gctacttttt tttgttctaa aaagacagat
13201320
gtggactagg cacctgtact gtgaaaccag aatagagaag ctgttgggca gatttgaaga gtggactagg cacctgtact gtgaaaccag aatagagaag ctgttgggca gatttgaaga
13801380
ggattgagta atatagagaa tgtcttgaga tatttgtgaa gcttttattg ctttgttgca ggattgagta atatagagaa tgtcttgaga tatttgtgaa gcttttattg ctttgttgca
14401440
attgttgtct agaaacatgg gctttttctg ttttttctcc tattccagga gaggagggcg attgttgtct agaaacatgg gctttttctg ttttttctcc tattccagga gaggagggcg
15001500
catcacttca gaaaaggaag agcagtgctc aaaagtgttg gatccggagc tactaacttc catcacttca gaaaaggaag agcagtgctc aaaagtgttg gatccggagc tactaacttc
15601560
agcctgctga agcaggctgg agacgtggag gagaaccctg gacctatgct cgagggagtg agcctgctga agcaggctgg agacgtggag gagaaccctg gacctatgct cgagggagtg
16201620
caggtggaga ctatctcccc aggagacggg cgcaccttcc ccaagcgcgg ccagacctgc caggtggaga ctatctcccc aggagacggg cgcaccttcc ccaagcgcgg ccagacctgc
16801680
gtggtgcact acaccgggat gcttgaagat ggaaagaaag ttgattcctc ccgggacaga gtggtgcact acaccgggat gcttgaagat ggaaagaaag ttgattcctc ccgggacaga
17401740
aacaagccct ttaagtttat gctaggcaag caggaggtga tccgaggctg ggaagaaggg aacaagccct ttaagtttat gctaggcaag caggaggtga tccgaggctg ggaagaaggg
18001800
gttgcccaga tgagtgtggg tcagagagcc aaactgacta tatctccaga ttatgcctat gttgcccaga tgagtgtggg tcagagagcc aaactgacta tatctccaga ttatgcctat
18601860
ggtgccactg ggcacccagg catcatccca ccacatgcca ctctcgtctt cgatgtggag ggtgccactg ggcacccagg catcatccca ccacatgcca ctctcgtctt cgatgtggag
19201920
cttctaaaac tggaatctgg cggtggttcc ggagtcgacg gatttggtga tgtcggtgct cttctaaaac tggaatctgg cggtggttcc ggagtcgacg gatttggtga tgtcggtgct
19801980
cttgagagtt tgaggggaaa tgcagatttg gcttacatcc tgagcatgga gccctgtggc cttgagagtt tgaggggaaa tgcagatttg gcttacatcc tgagcatgga gccctgtggc
20402040
cactgcctca ttatcaacaa tgtgaacttc tgccgtgagt ccgggctccg cacccgcact cactgcctca ttatcaacaa tgtgaacttc tgccgtgagt ccgggctccg cacccgcact
21002100
ggctccaaca tcgactgtga gaagttgcgg cgtcgcttct cctcgctgca tttcatggtg ggctccaaca tcgactgtga gaagttgcgg cgtcgcttct cctcgctgca tttcatggtg
21602160
gaggtgaagg gcgacctgac tgccaagaaa atggtgctgg ctttgctgga gctggcgcgg gaggtgaagg gcgacctgac tgccaagaaa atggtgctgg ctttgctgga gctggcgcgg
22202220
caggaccacg gtgctctgga ctgctgcgtg gtggtcattc tctctcacgg ctgtcaggcc caggaccacg gtgctctgga ctgctgcgtg gtggtcattc tctctcacgg ctgtcaggcc
22802280
agccacctgc agttcccagg ggctgtctac ggcacagatg gatgccctgt gtcggtcgag agccacctgc agttcccagg ggctgtctac ggcacagatg gatgccctgt gtcggtcgag
23402340
aagattgtga acatcttcaa tgggaccagc tgccccagcc tgggagggaa gcccaagctc aagattgtga acatcttcaa tgggaccagc tgccccagcc tgggagggaa gcccaagctc
24002400
tttttcatcc aggcctgtgg tggggagcag aaagaccatg ggtttgaggt ggcctccact tttttcatcc aggcctgtgg tggggagcag aaagaccatg ggtttgaggt ggcctccact
24602460
tcccctgaag acgagtcccc tggcagtaac cccgagccag atgccacccc gttccaggaa tcccctgaag acgagtcccc tggcagtaac cccgagccag atgccacccc gttccaggaa
25202520
ggtttgagga ccttcgacca gctggacgcc atatctagtt tgcccacacc cagtgacatc ggtttgagga ccttcgacca gctggacgcc atatctagtt tgcccacacc cagtgacatc
25802580
tttgtgtcct actctacttt cccaggtttt gtttcctgga gggaccccaa gagtggctcc tttgtgtcct actctacttt cccaggtttt gtttcctgga gggaccccaa gagtggctcc
26402640
tggtacgttg agaccctgga cgacatcttt gagcagtggg ctcactctga agacctgcag tggtacgttg agaccctgga cgacatcttt gagcagtggg ctcactctga agacctgcag
27002700
tccctcctgc ttagggtcgc taatgctgtt tcggtgaaag ggatttataa acagatgcct tccctcctgc ttagggtcgc taatgctgtt tcggtgaaag ggatttataa acagatgcct
27602760
ggttgcttta atttcctccg gaaaaaactt ttctttaaaa catcagtcga ctatccgtac ggttgcttta atttcctccg gaaaaaactt ttctttaaaa catcagtcga ctatccgtac
28202820
gacgtaccag actacgcact cgacctcgac ggatccggag agggcagagg aagtctgcta gacgtaccag actacgcact cgacctcgac ggatccggag agggcagagg aagtctgcta
28802880
acatgcggtg acgtcgagga gaatcctgga cctatggtga gcaagggcga ggagctgttc acatgcggtg acgtcgagga gaatcctgga cctatggtga gcaagggcga ggagctgttc
29402940
accggggtgg tgcccatcct ggtcgagctg gacggcgacg taaacggcca caagttcagc accggggtgg tgcccatcct ggtcgagctg gacggcgacg taaacggcca caagttcagc
30003000
gtgtccggcg agggcgaggg cgatgccacc tacggcaagc tgaccctgaa gttcatctgc gtgtccggcg agggcgaggg cgatgccacc tacggcaagc tgaccctgaa gttcatctgc
30603060
accaccggca agctgcccgt gccctggccc accctcgtga ccaccctgac ctacggcgtg accaccggca agctgcccgt gccctggccc accctcgtga ccaccctgac ctacggcgtg
31203120
cagtgcttca gccgctaccc cgaccacatg aagcagcacg acttcttcaa gtccgccatg cagtgcttca gccgctaccc cgaccacatg aagcagcacg acttcttcaa gtccgccatg
31803180
cccgaaggct acgtccagga gcgcaccatc ttcttcaagg acgacggcaa ctacaagacc cccgaaggct acgtccagga gcgcaccatc ttcttcaagg acgacggcaa ctacaagacc
32403240
cgcgccgagg tgaagttcga gggcgacacc ctggtgaacc gcatcgagct gaagggcatc cgcgccgagg tgaagttcga gggcgacacc ctggtgaacc gcatcgagct gaagggcatc
33003300
gacttcaagg aggacggcaa catcctgggg cacaagctgg agtacaacta caacagccac gacttcaagg aggacggcaa catcctgggg cacaagctgg agtacaacta caacagccac
33603360
aacgtctata tcatggccga caagcagaag aacggcatca aggtgaactt caagatccgc aacgtctata tcatggccga caagcagaag aacggcatca aggtgaactt caagatccgc
34203420
cacaacatcg aggacggcag cgtgcagctc gccgaccact accagcagaa cacccccatc cacaacatcg aggacggcag cgtgcagctc gccgaccact accagcagaa cacccccatc
34803480
ggcgacggcc ccgtgctgct gcccgacaac cactacctga gcacccagtc cgccctgagc ggcgacggcc ccgtgctgct gcccgacaac cactacctga gcacccagtc cgccctgagc
35403540
aaagacccca acgagaagcg cgatcacatg gtcctgctgg agttcgtgac cgccgccggg aaagacccca acgagaagcg cgatcacatg gtcctgctgg agttcgtgac cgccgccggg
36003600
atcactctcg gcatggacga gctgtacaag tgatgaacaa agactttgaa gtacataaat atcactctcg gcatggacga gctgtacaag tgatgaacaa agactttgaa gtacataaat
36603660
gtattacttt gatgttaata cagttcagtt tagtaagatg tgtagtaaaa agtgtaacct gtattacttt gatgttaata cagttcagtt tagtaagatg tgtagtaaaa agtgtaacct
37203720
tgttcaaaaa gttgcttcaa gttgatgttt gtgttctgtt ttacctgttc cagaatagct tgttcaaaaa gttgcttcaa gttgatgttt gtgttctgtt ttacctgttc cagaatagct
37803780
atttttgctt gagaagtttg aagttgtaag agttgaaata tttccaggtt ttattactag atttttgctt gagaagtttg aagttgtaag agttgaaata tttccaggtt ttattactag
38403840
cttgcatgct tttcctgcta actaactgaa atgctaatct taaggaattt atatggggaa cttgcatgct tttcctgcta actaactgaa atgctaatct taaggaattt atatggggaa
39003900
ggggaaaaaa gaaaaacact ttgtttggta cgtgtggatt ttcttctgag ctttaaggta ggggaaaaaa gaaaaacact ttgtttggta cgtgtggatt ttcttctgag ctttaaggta
39603960
cagtttgttg catgttaaaa tttagttctt attaaaccac aactttaagt tactaacgtc cagtttgttg catgttaaaa tttagttctt attaaaccac aactttaagt tactaacgtc
40204020
aaccagttac ctcttgcagt tcaaaagttg aagcagttcc ttgtccaaga tggagtattt aaccagttac ctcttgcagt tcaaaagttg aagcagttcc ttgtccaaga tggagtattt
40804080
taaaactgag ctcttaatca gtggaacaga agacgtcacg gtgtaactca actgaagccc taaaactgag ctcttaatca gtggaacaga agacgtcacg gtgtaactca actgaagccc
41404140
tttaagtccc ggttctcttt agactaccta atcaatgtct ttgtttgcta acgacagttt tttaagtccc ggttctcttt agactaccta atcaatgtct ttgtttgcta acgacagttt
42004200
atctatgtga atcctaaaat tcctatatgt aacttaagat gcaagaatgt aattagttac atctatgtga atcctaaaat tcctatatgt aacttaagat gcaagaatgt aattagttac
42604260
attggctgct cagtggagta tgactttttt ttttactgga ttaattttag caatacctgt attggctgct cagtggagta tgactttttt ttttactgga ttaattttag caatacctgt
43204320
atcttaaaat tgtgagaaaa tactgcattt aaaatatgcc taactttgtg atgcaatatg atcttaaaat tgtgagaaaa tactgcattt aaaatatgcc taactttgtg atgcaatatg
43804380
ttaatcaaag aatacatgta agcatatttt aataataatt atgtagattt tagtcatgta ttaatcaaag aatacatgta agcatatttt aataataatt atgtagattt tagtcatgta
44404440
ttttgaaaca attaaaattt ttaattttga cttaccttcc cagtgtgagt gacatcctaa ttttgaaaca attaaaattt ttaattttga cttaccttcc cagtgtgagt gacatcctaa
45004500
tataatactt ctaaatctta agctgctttg agaaaggcat gcagcgtatt tattgaagga tataatactt ctaaatctta agctgctttg agaaaggcat gcagcgtatt tattgaagga
45604560
attgaagatt tcttacccta cataagaatt ccagttagga caagtttata gcaacaaact attgaagatt tcttacccta cataagaatt ccagttagga caagtttata gcaacaaact
46204620
ttcacatttg ctgttagttc tacctgcgat tttgaaggag tacaactgag aacagcactc ttcacatttg ctgttagttc tacctgcgat tttgaaggag tacaactgag aacagcactc
46804680
agtcttgtat gtgtgttggg tcctagtctg attcattttt cttattacta cccttatacc agtcttgtat gtgtgttggg tcctagtctg attcattttt cttattacta cccttatacc
47404740
tcagtctcca agtaaaaaag gaaataactc ctcctttgta gacgtgtata tgtgaatgaa tcagtctcca agtaaaaaag gaaataactc ctcctttgta gacgtgtata tgtgaatgaa
48004800
tagaatggca tgtcccactt caaatgtcta gaagtagatg ttggtgaaac atgcaataag tagaatggca tgtcccactt caaatgtcta gaagtagatg ttggtgaaac atgcaataag
48604860
agctgagttg ctctgtacct ggatagtggg ctgtaagatg cagcacagga gtgtcccagg agctgagttg ctctgtacct ggatagtggg ctgtaagatg cagcacagga gtgtcccagg
49204920
actgttgttc aggagtagga gtcaggggag ggaggcaggg cttgggggat agcaataata actgttgttc aggagtagga gtcaggggag ggaggcaggg cttgggggat agcaataata
49804980
gttggtgccg ttctccataa aattactcag aagcaatgtt ctggcagcat aaatcgacct gttggtgccg ttctccataa aattactcag aagcaatgtt ctggcagcat aaatcgacct
50405040
aaagttgtta actttttctc tgctcagacc gttccctagc actaaagatg ctgtgtcctt aaagttgtta actttttctc tgctcagacc gttccctagc actaaagatg ctgtgtcctt
51005100
aagtgtgttt ccatactatc catcaccatg tttttcccaa cctattgctt taatagtatt aagtgtgttt ccatactatc catcaccatg tttttcccaa cctattgctt taatagtatt
51605160
g g
51615161
<210> 6<210> 6
<211> 6579<211> 6579
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Left arm-GFP-2a-iCaspase9-T2a-Right arm<223> Left arm-GFP-2a-iCaspase9-T2a-Right arm
<400> 6<400> 6
tttttttctt tgagatgagt atcttattgc agctctgtgc ataccccttg aaaatccgta tttttttctt tgagatgagt atcttattgc agctctgtgc ataccccttg aaaatccgta
60 60
ggtgatgtat ttatgttgac tgaaaatgga gtcattcaaa aattgatgac ttcttccttt ggtgatgtat ttatgttgac tgaaaatgga gtcattcaaa aattgatgac ttcttccttt
120 120
tctcttttta atctcgaaac ctgttctcag attcctttat cagaacaaaa agcacggctg tctcttttta atctcgaaac ctgttctcag attcctttat cagaacaaaa agcacggctg
180 180
catgtttttc accgttcaca cgactgtgtt tagccagcgt atctaaatgc ataacatgat catgtttttc accgttcaca cgactgtgtt tagccagcgt atctaaatgc ataacatgat
240 240
ttgccataac ttgagcctgc cataatcaga gcctcatttt gaaagctgtc atggtctgaa ttgccataac ttgagcctgc cataatcaga gcctcatttt gaaagctgtc atggtctgaa
300 300
acatagcatg ggtaagatga ttttcacctt gatgatgcat gtttaactca tttcaacgag acatagcatg ggtaagatga ttttcacctt gatgatgcat gtttaactca tttcaacgag
360 360
aggtcaaatc catccaaaaa tgctaaatct atcaaccagt tttcatgttc aagttctggc aggtcaaatc catccaaaaa tgctaaatct atcaaccagt tttcatgttc aagttctggc
420 420
acaaattttc gttctgactc catacgtgat tagatttcat tttgcaaatc atgaaaacta acaaattttc gttctgactc catacgtgat tagatttcat tttgcaaatc atgaaaacta
480 480
ttgccaaaac atacaatttt aagtcagcag ttttactgcc caaatttgca caagcacatg ttgccaaaac atacaatttt aagtcagcag ttttactgcc caaatttgca caagcacatg
540 540
taacgtgaca gacaaaaacc cactggacag agacaaaata ctgggtttgg ccagtatggt taacgtgaca gacaaaaacc cactggacag agacaaaata ctgggtttgg ccagtatggt
600 600
ttggctaagc cacgtttttc agggcaagaa ttgcctcacc tttttttata ttggaatcaa ttggctaagc cacgtttttc agggcaagaa ttgcctcacc ttttttttata ttggaatcaa
660 660
attctcaagt gtaacagcct ggcgccatct cagctgccat taagtagcat gtgctgcaac attctcaagt gtaacagcct ggcgccatct cagctgccat taagtagcat gtgctgcaac
720 720
aagatgtcta ccacacactc tgctctgggt ggtgggggca caccagtgtg gacggcaacc aagatgtcta ccacacactc tgctctgggt ggtggggggca caccagtgtg gacggcaacc
780 780
atgacacaag catagagtct tggcagaggt ccattgggtg catttatagt ggttcacact atgacacaag catagagtct tggcagaggt ccattgggtg catttatagt ggttcacact
840 840
ggggggttat cacagaatca tggaggttgg aaggtacctc cgggggtcat caaatccaac ggggggttat cacagaatca tggaggttgg aaggtacctc cggggggtcat caaatccaac
900 900
cacttgacaa agcaggttcc ctaaagtaga ttgctcaaga acagtcacag cactgctgct cacttgacaa agcaggttcc ctaaagtaga ttgctcaaga acagtcacag cactgctgct
960 960
cacagaaaat ctctagttgg taaggttacc tttttttttg ttgtcgctcc cagttaaacc cacagaaaat ctctagttgg taaggttacc tttttttttg ttgtcgctcc cagttaaacc
10201020
aaggtgggaa cacatccttt tcatagttgt attgtaggga tgtttatagc tattgctagg aaggtgggaa cacatccttt tcatagttgt attgtaggga tgtttatagc tattgctagg
10801080
gaaaactgaa cagcgtgcaa ggaagtcagc actgacacag ctttcccacg tgagagagct gaaaactgaa cagcgtgcaa ggaagtcagc actgacacag ctttcccacg tgagagagct
11401140
atttcaaagc aagatcagca catatcccaa tctgtacttc ctcaaacaca gcccaaaacc atttcaaagc aagatcagca catatcccaa tctgtacttc ctcaaacaca gcccaaaacc
12001200
gatagcaagg ccaagcagca gcactgctcc ttcaaggaaa ctgctgcata atctgaattt gatagcaagg ccaagcagca gcactgctcc ttcaaggaaa ctgctgcata atctgaattt
12601260
cagacggcag gaggaaacaa ggcagcagac tgatgaccta ccaccctgag tctcagctac cagacggcag gaggaaacaa ggcagcagac tgatgaccta ccaccctgag tctcagctac
13201320
atgcgatccg agccactcca actctgcttc ctgcagccct tccttcacgc tcatcttttg atgcgatccg agccactcca actctgcttc ctgcagccct tccttcacgc tcatcttttg
13801380
caccttaggc actcttataa ttcaagtact ttgtggcttt gggatatttg aagagcttgg caccttaggc actcttataa ttcaagtact ttgtggcttt gggatatttg aagagcttgg
14401440
tcagttagtc acaagtctgg ccacgtgcta tcatattagt ttgaaaagca atggagacac tcagttagtc acaagtctgg ccacgtgcta tcatattagt ttgaaaagca atggagacac
15001500
catctgctga tgctcaaagt ggttacaacc aaaacacaaa aaagcagagc tgtgggaaga catctgctga tgctcaaagt ggttacaacc aaaacacaaa aaagcagagc tgtgggaaga
15601560
attcaacatt ttgattatgc aagaagctag tcccagcctt gaaatccacc atctgcatca attcaacatt ttgattatgc aagaagctag tcccagcctt gaaatccacc atctgcatca
16201620
tgaaagacct aagtagttaa agccacagca gacatacagc ttctatttcc ttaccttctt tgaaagacct aagtagttaa agccacagca gacatacagc ttctatttcc ttaccttctt
16801680
catcattaac tacaggtctt ggaagatttt tgctgggaaa aagcttttat tgcaagaact catcattaac tacaggtctt ggaagatttt tgctgggaaa aagcttttat tgcaagaact
17401740
gtaatttatt aacagggaaa catgaaataa atgtgtaaat tctcctgcac tcccactgtc gtaatttatt aacagggaaa catgaaataa atgtgtaaat tctcctgcac tcccactgtc
18001800
attaaaaacg gctttaagaa agagtattca gtaactgcct gcattgtgtt gtgactttct attaaaaacg gctttaagaa agagtattca gtaactgcct gcattgtgtt gtgactttct
18601860
actctgtgac acacagcctt ctgggcaaag cacatattct gccatgcatg tgggtcgtgc actctgtgac acacagcctt ctgggcaaag cacatattct gccatgcatg tgggtcgtgc
19201920
cttggaaaat gggaacccac attcactgag ggcctcttga tgagctttcc ccttgagaac cttggaaaat gggaacccac attcactgag ggcctcttga tgagctttcc ccttgagaac
19801980
agcgaggtct catggatatc ttctcttctc caagccaaat aagcccagat ccctcagctt agcgaggtct catggatatc ttctcttctc caagccaaat aagcccagat ccctcagctt
20402040
tccttcatgg agaggctcca gccctctgat catgcctgca gcccttctct ggacctgctc tccttcatgg agaggctcca gccctctgat catgcctgca gcccttctct ggacctgctc
21002100
cagcagcccc acacgctcct catgctggga ccccagatct gcacatggta ttgcacatgg cagcagcccc acacgctcct catgctggga ccccagatct gcacatggta ttgcacatgg
21602160
ggcctcacaa cggcagagct gagagggaca attccctccc tcagccttta attctgcacg ggcctcacaa cggcagagct gagagggaca attccctccc tcagccttta attctgcacg
22202220
tacttaattt tgtctgtatt ttttttgcaa tagaatagcc tgcatgctag ttgctgtgtc tacttaattt tgtctgtatt ttttttgcaa tagaatagcc tgcatgctag ttgctgtgtc
22802280
gcacagctga attcactagg ttcctgtgaa acaaagggca atcccacagc cactgtagca gcacagctga attcactagg ttcctgtgaa acaaagggca atcccacagc cactgtagca
23402340
cgtgaggagc cacacaggtg ctctaattcc tacaggacag gcctagggac agagcggccc cgtgaggagc cacacaggtg ctctaattcc tacaggacag gcctagggac agagcggccc
24002400
taggactgcc ctcccgcacc tcctagcttc accttttgcc cgcgatcttt aagtaccctg taggactgcc ctcccgcacc tcctagcttc accttttgcc cgcgatcttt aagtaccctg
24602460
aagcataaac agggaaagcg ccgcccgcag cctcaccctg cttcccgccc aacgcggcac aagcataaac agggaaagcg ccgcccgcag cctcaccctg cttcccgccc aacgcggcac
25202520
cgcccaggcc gcagccgccc actaagagca ctagcgccac cttctcaccc cacccccacc cgcccaggcc gcagccgccc actaagagca ctagcgccac cttctcaccc cacccccacc
25802580
acgcgttcct agcggccctg agagctgctg cgcatgcgcc gcctgacgat tcgccctccc acgcgttcct agcggccctg agagctgctg cgcatgcgcc gcctgacgat tcgccctccc
26402640
attggctggc ggtcgaagca cggcgggggc acgcggtggc ggctatataa ggcgtctcgg attggctggc ggtcgaagca cggcggggggc acgcggtggc ggctatataa ggcgtctcgg
27002700
aagacggcgc catgctattt ggagcggaga gtgaaagtta cagttcctgg tgctggtagg aagacggcgc catgctattt ggagcggaga gtgaaagtta cagttcctgg tgctggtagg
27602760
gagtgtggcg cggagcggag cgctgcggct catcggaacc acaatggagc catagcagag gagtgtggcg cggagcggag cgctgcggct catcggaacc acaatggagc catagcagag
28202820
ccgggcgtgg gggcaagggc agtgcgtgct ggggagggct ccgtcgcgtg gccacgtcgc ccgggcgtgg gggcaagggc agtgcgtgct ggggagggct ccgtcgcgtg gccacgtcgc
28802880
gagagccgtc gggatggtgg cgtcagggcg gggggtgctg ctaacgtgct cctggtcctg gagagccgtc gggatggtgg cgtcagggcg gggggtgctg ctaacgtgct cctggtcctg
29402940
caggtgggct gctggcattc gccatggtga gcaagggcga ggagctgttc accggggtgg caggtgggct gctggcattc gccatggtga gcaagggcga ggagctgttc accggggtgg
30003000
tgcccatcct ggtcgagctg gacggcgacg taaacggcca caagttcagc gtgtccggcg tgcccatcct ggtcgagctg gacggcgacg taaacggcca caagttcagc gtgtccggcg
30603060
agggcgaggg cgatgccacc tacggcaagc tgaccctgaa gttcatctgc accaccggca agggcgaggg cgatgccacc tacggcaagc tgaccctgaa gttcatctgc accaccggca
31203120
agctgcccgt gccctggccc accctcgtga ccaccctgac ctacggcgtg cagtgcttca agctgcccgt gccctggccc accctcgtga ccaccctgac ctacggcgtg cagtgcttca
31803180
gccgctaccc cgaccacatg aagcagcacg acttcttcaa gtccgccatg cccgaaggct gccgctaccc cgaccacatg aagcagcacg acttcttcaa gtccgccatg cccgaaggct
32403240
acgtccagga gcgcaccatc ttcttcaagg acgacggcaa ctacaagacc cgcgccgagg acgtccagga gcgcaccatc ttcttcaagg acgacggcaa ctacaagacc cgcgccgagg
33003300
tgaagttcga gggcgacacc ctggtgaacc gcatcgagct gaagggcatc gacttcaagg tgaagttcga gggcgacacc ctggtgaacc gcatcgagct gaagggcatc gacttcaagg
33603360
aggacggcaa catcctgggg cacaagctgg agtacaacta caacagccac aacgtctata aggacggcaa catcctgggg cacaagctgg agtacaacta caacagccac aacgtctata
34203420
tcatggccga caagcagaag aacggcatca aggtgaactt caagatccgc cacaacatcg tcatggccga caagcagaag aacggcatca aggtgaactt caagatccgc cacaacatcg
34803480
aggacggcag cgtgcagctc gccgaccact accagcagaa cacccccatc ggcgacggcc aggacggcag cgtgcagctc gccgaccact accagcagaa cacccccatc ggcgacggcc
35403540
ccgtgctgct gcccgacaac cactacctga gcacccagtc cgccctgagc aaagacccca ccgtgctgct gcccgacaac cactacctga gcacccagtc cgccctgagc aaagacccca
36003600
acgagaagcg cgatcacatg gtcctgctgg agttcgtgac cgccgccggg atcactctcg acgagaagcg cgatcacatg gtcctgctgg agttcgtgac cgccgccggg atcactctcg
36603660
gcatggacga gctgtacaag ggatccggag ctactaactt cagcctgctg aagcaggctg gcatggacga gctgtacaag ggatccggag ctactaactt cagcctgctg aagcaggctg
37203720
gagacgtgga ggagaaccct ggacctatgc tcgagggagt gcaggtggag actatctccc gagacgtgga ggagaaccct ggacctatgc tcgagggagt gcaggtggag actatctccc
37803780
caggagacgg gcgcaccttc cccaagcgcg gccagacctg cgtggtgcac tacaccggga caggagacgg gcgcaccttc cccaagcgcg gccagacctg cgtggtgcac tacaccggga
38403840
tgcttgaaga tggaaagaaa gttgattcct cccgggacag aaacaagccc tttaagttta tgcttgaaga tggaaagaaa gttgattcct cccgggacag aaacaagccc tttaagttta
39003900
tgctaggcaa gcaggaggtg atccgaggct gggaagaagg ggttgcccag atgagtgtgg tgctaggcaa gcaggaggtg atccgaggct gggaagaagg ggttgcccag atgagtgtgg
39603960
gtcagagagc caaactgact atatctccag attatgccta tggtgccact gggcacccag gtcagagagc caaactgact atatctccag attatgccta tggtgccact gggcacccag
40204020
gcatcatccc accacatgcc actctcgtct tcgatgtgga gcttctaaaa ctggaatctg gcatcatccc accacatgcc actctcgtct tcgatgtgga gcttctaaaa ctggaatctg
40804080
gcggtggatc cggagtcgac ggatttggtg atgtcggtgc tcttgagagt ttgaggggaa gcggtggatc cggagtcgac ggatttggtg atgtcggtgc tcttgagagt ttgaggggaa
41404140
atgcagattt ggcttacatc ctgagcatgg agccctgtgg ccactgcctc attatcaaca atgcagattt ggcttacatc ctgagcatgg agccctgtgg ccactgcctc attatcaaca
42004200
atgtgaactt ctgccgtgag tccgggctcc gcacccgcac tggctccaac atcgactgtg atgtgaactt ctgccgtgag tccgggctcc gcacccgcac tggctccaac atcgactgtg
42604260
agaagttgcg gcgtcgcttc tcctcgctgc atttcatggt ggaggtgaag ggcgacctga agaagttgcg gcgtcgcttc tcctcgctgc atttcatggt ggaggtgaag ggcgacctga
43204320
ctgccaagaa aatggtgctg gctttgctgg agctggcgcg gcaggaccac ggtgctctgg ctgccaagaa aatggtgctg gctttgctgg agctggcgcg gcaggaccac ggtgctctgg
43804380
actgctgcgt ggtggtcatt ctctctcacg gctgtcaggc cagccacctg cagttcccag actgctgcgt ggtggtcatt ctctctcacg gctgtcaggc cagccacctg cagttcccag
44404440
gggctgtcta cggcacagat ggatgccctg tgtcggtcga gaagattgtg aacatcttca gggctgtcta cggcacagat ggatgccctg tgtcggtcga gaagattgtg aacatcttca
45004500
atgggaccag ctgccccagc ctgggaggga agcccaagct ctttttcatc caggcctgtg atgggaccag ctgccccagc ctgggaggga agcccaagct ctttttcatc caggcctgtg
45604560
gtggggagca gaaagaccat gggtttgagg tggcctccac ttcccctgaa gacgagtccc gtggggagca gaaagaccat gggtttgagg tggcctccac ttcccctgaa gacgagtccc
46204620
ctggcagtaa ccccgagcca gatgccaccc cgttccagga aggtttgagg accttcgacc ctggcagtaa ccccgagcca gatgccaccc cgttccagga aggtttgagg accttcgacc
46804680
agctggacgc catatctagt ttgcccacac ccagtgacat ctttgtgtcc tactctactt agctggacgc catatctagt ttgcccacac ccagtgacat ctttgtgtcc tactctactt
47404740
tcccaggttt tgtttcctgg agggacccca agagtggctc ctggtacgtt gagaccctgg tcccaggttt tgtttcctgg agggacccca agagtggctc ctggtacgtt gagaccctgg
48004800
acgacatctt tgagcagtgg gctcactctg aagacctgca gtccctcctg cttagggtcg acgacatctt tgagcagtgg gctcactctg aagacctgca gtccctcctg cttagggtcg
48604860
ctaatgctgt ttcggtgaaa gggatttata aacagatgcc tggttgcttt aatttcctcc ctaatgctgt ttcggtgaaa gggatttata aacagatgcc tggttgcttt aatttcctcc
49204920
ggaaaaaact tttctttaaa acatcagtcg actatccgta cgacgtacca gactacgcac ggaaaaaact tttctttaaa acatcagtcg actatccgta cgacgtacca gactacgcac
49804980
tcgacctcga cggatccgga gagggcagag gaagtctgct aacatgcggt gacgtcgagg tcgacctcga cggatccgga gagggcagag gaagtctgct aacatgcggt gacgtcgagg
50405040
agaatcctgg acctatggag gaggattggg ataccgaact cgagcaggag gcggcagcgg agaatcctgg acctatggag gaggattggg ataccgaact cgagcaggag gcggcagcgg
51005100
cttcccaggg gcgttctgag gagcaggcgt ggatggtgag ctgtgtccag gggagggcgg cttcccaggg gcgttctgag gagcaggcgt ggatggtgag ctgtgtccag gggagggcgg
51605160
tgcggcaggg agcggggcac tgggatggcc cggtctggga aggggaggcc gagaggcctt tgcggcaggg agcggggcac tgggatggcc cggtctggga aggggaggcc gagaggcctt
52205220
cgcagtgctt cctgcagctc cccgagcagt gcgaagaagg aggtgccggg ctctgctgtg cgcagtgctt cctgcagctc cccgagcagt gcgaagaagg aggtgccggg ctctgctgtg
52805280
ggagccgaag gcacggagct gcctggggag ggaatggctg tgtgcctgag gtgccagaga ggagccgaag gcacggagct gcctggggag ggaatggctg tgtgcctgag gtgccagaga
53405340
ccggcaaggg ctgtacagag aggcaacggt tttgtgtaca aatcatttgt atgggaaacc ccggcaaggg ctgtacagag aggcaacggt tttgtgtaca aatcatttgt atgggaaacc
54005400
acaaaatctt gaagctttat tacatggcag cgaaatactt tggtgtgaag taaaggataa acaaaatctt gaagctttat tacatggcag cgaaatactt tggtgtgaag taaaggataa
54605460
gatagaggag tgtaatgaga gacagctaaa taatatttta ctacttgtgg gatgagtgaa gatagaggag tgtaatgaga gacagctaaa taatatttta ctacttgtgg gatgagtgaa
55205520
tatcaggagg aactgctgta aatttcagga ggacctgttg tgaatcttca gtagttggcg tatcaggagg aactgctgta aatttcagga ggacctgttg tgaatcttca gtagttggcg
55805580
ccgctcttac acatcttaca gatgcccctt gagcaaaggg ggataaggag agatgaacgg ccgctcttac acatcttaca gatgcccctt gagcaaaggg ggataaggag agatgaacgg
56405640
gttatccaaa caggtgatga gctaaaagta cagttgccta aagaagtagt agcatgtgct gttatccaaa caggtgatga gctaaaagta cagttgccta aagaagtagt agcatgtgct
57005700
atcagaatga taattttgtt agtttggggt tagtttcctg tagtggtaga tagccacaac atcagaatga taattttgtt agtttggggt tagtttcctg tagtggtaga tagccacaac
57605760
aagaaaaccg cttaagtttt tgtaaaacaa aaaaagcacg atccagaagt aaaaaatatg aagaaaaccg cttaagtttt tgtaaaacaa aaaaagcacg atccagaagt aaaaaatatg
58205820
ggtagttttt tttgatgttc ctctctcacc tggtgctttg gcatactaat atgtgtctaa ggtagttttt tttgatgttc ctctctcacc tggtgctttg gcatactaat atgtgtctaa
58805880
ttgtattaaa caggagaaat ttaaacctag gctttgctgg aaataaaatg ttacaatgct ttgtattaaa caggagaaat ttaaacctag gctttgctgg aaataaaatg ttacaatgct
59405940
acaatgtgaa aagtaggtgc tattctgaac tgttttgggt ggagtatctg aatctttgaa acaatgtgaa aagtaggtgc tattctgaac tgttttgggt ggagtatctg aatctttgaa
60006000
taatttaaga gggactgaca tatttaaaat acttaaggat aatctgtagc catgctgtaa taatttaaga gggactgaca tatttaaaat acttaaggat aatctgtagc catgctgtaa
60606060
aagaacaaca gaaatgcagt tgggaaggtg atggaaatag ttttattcat gttactggtg aagaacaaca gaaatgcagt tgggaaggtg atggaaatag ttttattcat gttactggtg
61206120
gtctgaaacc tttctaagct taaactgtag aaaaaaattg cttcaaaaga ttgcactatt gtctgaaacc tttctaagct taaactgtag aaaaaaattg cttcaaaaga ttgcactatt
61806180
actttgggcg acaaatgttt ttaattggtt ttaagtgttt gttagcaaag tgaagttgat actttgggcg acaaatgttt ttaattggtt ttaagtgttt gttagcaaag tgaagttgat
62406240
gccaccataa gtctgacagg aggcaagata aacttgtctt catactgctt gtgtataact gccaccataa gtctgacagg aggcaagata aacttgtctt catactgctt gtgtataact
63006300
tggttttgat gacatttgtg tgtgaacatt atgcacttca gtgtagcgaa gtttaagaaa tggttttgat gacatttgtg tgtgaacatt atgcacttca gtgtagcgaa gtttaagaaa
63606360
ctttgaacag aataacttga aagagtgtgc acatgggtgc agaagtcact ttatttcagt ctttgaacag aataacttga aagagtgtgc acatgggtgc agaagtcact ttatttcagt
64206420
tgggagactt agcacctaaa tgcactgtta gttcacatac actttgcttg gcctgaaggt tgggagactt agcacctaaa tgcactgtta gttcacatac actttgcttg gcctgaaggt
64806480
aacattgtga tgtcgctttt tttccctgta ggctaactct ggcagaccaa acagcccatc aacattgtga tgtcgctttt tttccctgta ggctaactct ggcagaccaa acagcccatc
65406540
cctccgcttc tccagcagac caagcagccc cttgtctgg cctccgcttc tccagcagac caagcagccc cttgtctgg
65796579
<210> 7<210> 7
<211> 75<211> 75
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> прямой праймер<223> forward primer
<400> 7<400> 7
cggtgacgtc gaggagaatc ctggacctat ggaggaggat tgggataccg aactcgagca cggtgacgtc gaggagaatc ctggacctat ggaggaggat tgggataccg aactcgagca
60 60
ggaggcggca gcggc ggaggcggca gcggc
75 75
<210> 8<210> 8
<211> 47<211> 47
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> обратный праймер<223> reverse primer
<400> 8<400> 8
gaaatccagc ttccagttcc cacctggcca gacaaggggc tgcttgg gaaatccagc ttccagttcc cacctggcca gacaaggggc tgcttgg
47 47
<210> 9<210> 9
<211> 41<211> 41
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> прямой праймер<223> forward primer
<400> 9<400> 9
ggtgggctgc tggcattcgc catggtgagc aagggcgagg a ggtgggctgc tggcattcgc catggtgagc aagggcgagg a
41 41
<210> 10<210> 10
<211> 76<211> 76
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> обратный праймер<223> reverse primer
<400> 10<400> 10
gattctcctc gacgtcaccg catgttagca gacttcctct gccctctccg gatcccttgt gattctcctc gacgtcaccg catgttagca gacttcctct gccctctccg gatcccttgt
60 60
acagctcgtc catgcc acagctcgtc catgcc
76 76
<210> 11<210> 11
<211> 57<211> 57
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> прямой праймер<223> forward primer
<400> 11<400> 11
tctcccatat ggtcgacctg caggcggccg cgaattcact agtgattctt cgtggtt tctcccatat ggtcgacctg caggcggccg cgaattcact agtgattctt cgtggtt
57 57
<210> 12<210> 12
<211> 48<211> 48
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> обратный праймер<223> reverse primer
<400> 12<400> 12
aggctgaagt tagtagctcc ggatccaaca cttttgagca ctgctctt aggctgaagt tagtagctcc ggatccaaca cttttgagca ctgctctt
48 48
<210> 13<210> 13
<211> 107<211> 107
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> прямой праймер<223> forward primer
<400> 13<400> 13
cagaacatca ccctgaccga ggtgggatcc ggagagggca gaggaagtct gctaacatgc cagaacatca ccctgaccga ggtgggatcc ggagagggca gaggaagtct gctaacatgc
60 60
ggtgacgtcg aggagaatcc tggacctatg gtgagcaagg gcgagga ggtgacgtcg aggagaatcc tggacctatg gtgagcaagg gcgagga
107 107
<210> 14<210> 14
<211> 22<211> 22
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> обратный праймер<223> reverse primer
<400> 14<400> 14
cttgtacagc tcgtccatgc cg cttgtacagc tcgtccatgc cg
22 22
<210> 15<210> 15
<211> 94<211> 94
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> прямой праймер<223> forward primer
<400> 15<400> 15
tctcggcatg gacgagctgt acaagtgatg aacaaagact ttgaagtaca taaatgtatt tctcggcatg gacgagctgt acaagtgatg aacaaagact ttgaagtaca taaatgtatt
60 60
actttgatgt taatacagtt cagtttagta agat actttgatgt taatacagtt cagtttagta agat
94 94
<210> 16<210> 16
<211> 55<211> 55
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> обратный праймер<223> reverse primer
<400> 16<400> 16
ctcttcgaaa tccagcttcc agttcccacc tggcaatact attaaagcaa taggt ctcttcgaaa tccagcttcc agttcccacc tggcaatact attaaagcaa taggt
55 55
<210> 17<210> 17
<211> 20<211> 20
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> направляющая последовательность<223> guide sequence
<400> 17<400> 17
ggtcctattc caggagagga ggtcctattc caggagagga
20 20
<210> 18<210> 18
<211> 20<211> 20
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> направляющая последовательность<223> guide sequence
<400> 18<400> 18
ggcttactaa actgaactgt ggcttactaa actgaactgt
20 20
<---<---
Claims (18)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GB1816633.0 | 2018-10-12 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2021113247A RU2021113247A (en) | 2022-11-14 |
RU2807599C2 true RU2807599C2 (en) | 2023-11-17 |
Family
ID=
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2473688C2 (en) * | 2006-08-09 | 2013-01-27 | Вивалис | Method for producing transgenic birds using embryo stem cells |
WO2017175745A1 (en) * | 2016-04-04 | 2017-10-12 | 国立大学法人 東京大学 | Method for producing genetically modified animal employing reproductive cell-deficient animal |
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2473688C2 (en) * | 2006-08-09 | 2013-01-27 | Вивалис | Method for producing transgenic birds using embryo stem cells |
WO2017175745A1 (en) * | 2016-04-04 | 2017-10-12 | 国立大学法人 東京大学 | Method for producing genetically modified animal employing reproductive cell-deficient animal |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
TAYLOR L. ET AL. Efficient TALEN-mediated gene targeting of chicken primordial germ cells. Development 1 March 2017; 144 (5): 928-934. doi: https://doi.org/10.1242/dev.145367 Найдено онлайн: https://journals.biologists.com/dev/article/144/5/928/48332/Efficient-TALEN-mediated-gene-targeting-of-chicken Дата обращения 14.12.2021. LI ZHOU ET AL. Generation of all-male-like sterile zebrafish by eliminating primordial. Scientific reports, vol. 8, no. 1, 30 January 2018 (2018-01 -30), pages 1834-1845, XP055593094, DOI: 10.1038/S41598-018-20039-3 Найдено онлайн: https://www.nature.com/articles/s41598-018-20039-3 Дата обращения 14.12.2021. WOODCOCK M.E. ET AL. Gene editing in birds takes flight. Mamm Genome 28, 315-323 (2017). Найдено онлайн: https://link.springer.com/article/10.1007/s00335-017-9701-z#citeas Дата обращения 15.12.2021. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP4436130B2 (en) | Random incorporation of polynucleotides by in vitro linearization | |
KR101797784B1 (en) | Maternally induced sterility in animals | |
MX2007014139A (en) | Piggybac as a tool for genetic manipulation and analysis in vertebrates. | |
JP6004290B2 (en) | Transgenic chickens with inactivated endogenous loci | |
KR20070102517A (en) | In-vitro method for producing oocytes or eggs having targeted genomic modification | |
Chen et al. | Transgenic technology in marine organisms | |
CN113226021B (en) | Genetically modified birds and methods of reconstitution thereof | |
CA2300972A1 (en) | Use of mariner transposan in the production of transgenic animals | |
JP7426120B2 (en) | Method for producing knock-in cells | |
CA2395439A1 (en) | Controlling offspring's sex ratio by targeting transgenes onto the sex chromosomes | |
RU2807599C2 (en) | Genetically modified sterile birds and method for their reproduction | |
Chen et al. | Transgenic fish technology: Principle and application | |
SARMAŞIK | Application of gene transfer technology for genetic improvement of fish | |
JP2004511226A (en) | Genetic control of sex ratio in animal populations | |
KR102594009B1 (en) | Preparing method of transgenic germ cell and transgenic animal using the same | |
US20240130338A1 (en) | Birds for producing female hatchling and methods of producing same | |
Chiou et al. | 22 Application of Transgenic Fish Technology in Sea Food Production | |
Hull | Restriction Enzyme Mediated Integration and Lentiviral Transgenesis of the Species Eublepharis macularius, Litoria caerulea, and Xenopus laevis. | |
Houdebine | Transgenic animals | |
JP2019103471A (en) | Gene-transfer vector for mammalian cells | |
AU2332201A (en) | Repressible sterility of animals |