RU2804941C1 - Variant of inner membrane protein and method for obtaining target product using it - Google Patents
Variant of inner membrane protein and method for obtaining target product using it Download PDFInfo
- Publication number
- RU2804941C1 RU2804941C1 RU2022114374A RU2022114374A RU2804941C1 RU 2804941 C1 RU2804941 C1 RU 2804941C1 RU 2022114374 A RU2022114374 A RU 2022114374A RU 2022114374 A RU2022114374 A RU 2022114374A RU 2804941 C1 RU2804941 C1 RU 2804941C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- amino acid
- protein
- acetylhomoserine
- seq
- homoserine
- Prior art date
Links
Abstract
Description
Область техники, к которой относится изобретениеField of technology to which the invention relates
Настоящее изобретение относится к варианту белка YjeH, который представляет собой белок внутренней мембраны, и к способу получения целевого продукта с его использованием.The present invention relates to a variant of the YjeH protein, which is an inner membrane protein, and to a method for obtaining the desired product using it.
Предшествующий уровень техникиPrior Art
О-Ацетилгомосерин действует как предшественник метионина, который является одной из незаменимых аминокислот в организме человека. Известно, что гомосерин, который является предшественником и метионина, и треонина, преобразуется в треонин через фосфогомосерин и преобразуется в метионин через ацетилгомосерин.O-Acetylhomoserine acts as a precursor to methionine, which is one of the essential amino acids in the human body. Homoserine, which is a precursor to both methionine and threonine, is known to be converted to threonine via phosphohomoserine and converted to methionine via acetylhomoserine.
Метионин используют не только как кормовую и пищевую добавку, но также в качестве сырьевого ингредиента для приготовления растворов для инфузии и фармацевтических препаратов и получают путем химического и биологического синтеза. Был опубликован способ получения L-метионина в две стадии из предшественника L-метионина, полученного путем ферментации, посредством ферментативного превращения (Международная публикация WO 2008/013432).Methionine is used not only as a feed and food additive, but also as a raw ingredient for the preparation of infusion solutions and pharmaceuticals and is obtained through chemical and biological synthesis. A method for producing L-methionine in two steps from a fermentation-derived L-methionine precursor by enzymatic conversion has been published (International Publication WO 2008/013432).
В этом процессе, осуществляемом в две стадии, О-сукцинилгомосерин и О-ацетилгомосерин используют в качестве предшественников метионина, и очень важно получить О-ацетилгомосерин с высоким выходом в целях экономичного массового производства.In this two-step process, O-succinylhomoserine and O-acetylhomoserine are used as methionine precursors, and it is very important to obtain O-acetylhomoserine in high yield for economical mass production.
Раскрытие изобретенияDisclosure of the Invention
Техническая задачаTechnical problem
В результате интенсивных усилий по повышению продукции О-ацетилгомосерина или гомосерина авторы настоящего изобретения обнаружили вариант белка внутренней мембраны, обладающий усиленной активностью экспорта О-ацетилгомосерина или гомосерина, в результате чего было осуществлено настоящее изобретение.As a result of intensive efforts to enhance the production of O-acetylhomoserine or homoserine, the present inventors discovered a variant of the inner membrane protein having enhanced O-acetylhomoserine or homoserine export activity, whereby the present invention was carried out.
Техническое решениеTechnical solution
В настоящем изобретении предложен вариант белка YjeH, который представляет собой белок внутренней мембраны, включающий i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или iii) замену в обоих положениях i) и ii), в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и обладающий гомологией 95% или более, но менее 100% с SEQ ID NO: 1.The present invention provides a variant of the YjeH protein, which is an inner membrane protein, comprising i) replacement of the amino acid corresponding to position 92 with asparagine, ii) replacement of the amino acid corresponding to position 351 with leucine, or iii) replacement at both positions i ) and ii), in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and having 95% or more but less than 100% homology with SEQ ID NO: 1.
В настоящем изобретении предложен полинуклеотид, кодирующий этот вариант.The present invention provides a polynucleotide encoding this variant.
В настоящем изобретении предложен вектор, включающий этот полинуклеотид.The present invention provides a vector comprising this polynucleotide.
В настоящем изобретении предложен микроорганизм, включающий по меньшей мере одно из: варианта белка внутренней мембраны YjeH, включающего i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или iii) замену в обоих положениях i) и ii), в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и обладающего гомологией 95% или более, но менее 100% с SEQ ID NO: 1; полинуклеотида, кодирующего этот вариант; и вектора, кодирующего этот полинуклеотид.The present invention provides a microorganism comprising at least one of: a variant of the inner membrane protein YjeH comprising i) replacing the amino acid corresponding to position 92 with asparagine, ii) replacing the amino acid corresponding to position 351 with leucine, or iii) replacing at both positions i) and ii), in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and having 95% or more but less than 100% homology with SEQ ID NO: 1; a polynucleotide encoding this variant; and a vector encoding this polynucleotide.
В настоящем изобретении предложен способ получения целевого продукта, включающий культивирование микроорганизма в культуральной среде, где микроорганизм включает по меньшей мере одно из: варианта белка внутренней мембраны YjeH, включающего i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или iii) замену в обоих положениях i) и ii), в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и обладающего гомологией 95% или более, но менее 100% с SEQ ID NO: 1; полинуклеотида, кодирующего этот вариант; и вектора, кодирующего этот полинуклеотид.The present invention provides a method for obtaining the target product, comprising cultivating a microorganism in a culture medium, where the microorganism includes at least one of: a variant of the inner membrane protein YjeH, including i) replacement of the amino acid corresponding to the 92nd position with asparagine, ii) replacement of the amino acid, corresponding to position 351, leucine, or iii) a substitution at both positions i) and ii) in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and having 95% or more but less than 100% homology with SEQ ID NO: 1; a polynucleotide encoding this variant; and a vector encoding this polynucleotide.
В настоящем изобретении предложен способ получения метионина, включающий получение О-ацетилгомосерина путем культивирования микроорганизма в культуральной среде и превращения О-ацетилгомосерина в метионин путем взаимодействия О-ацетилгомосерина с сульфидом, где микроорганизм включает по меньшей мере одно из: варианта белка внутренней мембраны YjeH, включающего i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или iii) замену в обоих положениях i) и ii), в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и обладающего гомологией 95% или более, но менее 100% с SEQ ID NO: 1; полинуклеотида, кодирующего этот вариант; и вектора, кодирующего этот полинуклеотид.The present invention provides a method for producing methionine, comprising producing O-acetylhomoserine by cultivating a microorganism in a culture medium and converting O-acetylhomoserine to methionine by reacting O-acetylhomoserine with a sulfide, wherein the microorganism comprises at least one of: a variant of the inner membrane protein YjeH, comprising i) replacing the amino acid corresponding to position 92 with asparagine, ii) replacing the amino acid corresponding to position 351 with leucine, or iii) replacing at both positions i) and ii), in the amino acid sequence SEQ ID NO: 1, and having homology of 95% or more but less than 100% with SEQ ID NO: 1; a polynucleotide encoding this variant; and a vector encoding this polynucleotide.
В настоящем изобретении предложен способ получения глюфосината, включающий получение О-ацетилгомосерина или гомосерина путем культивирования микроорганизма в культуральной среде и превращения О-ацетилгомосерина или гомосерина в глюфосинат, где микроорганизм включает по меньшей мере одно из: варианта белка внутренней мембраны YjeH, включающего i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или iii) замену в обоих положениях i) и ii), в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и обладающего гомологией 95% или более, но менее 100% с SEQ ID NO: 1; полинуклеотида, кодирующего этот вариант; и вектора, кодирующего этот полинуклеотид.The present invention provides a method for producing glufosinate, comprising producing O-acetylhomoserine or homoserine by cultivating a microorganism in a culture medium and converting O-acetylhomoserine or homoserine to glufosinate, wherein the microorganism comprises at least one of: a variant of the inner membrane protein YjeH, comprising i) a substitution the amino acid corresponding to position 92 with asparagine, ii) substitution of the amino acid corresponding to position 351 with leucine, or iii) substitution at both positions i) and ii), in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and having 95% homology or more but less than 100% with SEQ ID NO: 1; a polynucleotide encoding this variant; and a vector encoding this polynucleotide.
В настоящем изобретении предложена композиция для получения гомосерина, включающая микроорганизм или культуру микроорганизма.The present invention provides a composition for producing homoserine, comprising a microorganism or a culture of a microorganism.
В настоящем изобретении предложена композиция для получения О-ацетилгомосерина, включающая микроорганизм или культуру микроорганизма.The present invention provides a composition for the production of O-acetylhomoserine, comprising a microorganism or a culture of a microorganism.
В настоящем изобретении предложено применение варианта белка YjeH внутренней мембраны для получения О-ацетилцистеина или гомосерина.The present invention provides the use of a variant of the inner membrane protein YjeH to produce O-acetylcysteine or homoserine.
В настоящем изобретении предложено применение микроорганизма для продукции О-ацетилцистеина или гомосерина.The present invention provides the use of a microorganism for the production of O-acetylcysteine or homoserine.
Полезные эффекты изобретенияBeneficial effects of the invention
О-Ацетилгомосерин или гомосерин можно получать с высокими выходами путем культивирования микроорганизма, обладающего способностью продуцировать О-ацетилгомосерин или гомосерин, модифицированного с использованием варианта YjeH, представляющего собой белок внутренней мембраны, в соответствии с описанием настоящего изобретения по сравнению с немодифицированными белками.O-Acetylhomoserine or homoserine can be produced in high yields by cultivating a microorganism having the ability to produce O-acetylhomoserine or homoserine modified with an inner membrane protein variant of YjeH as described herein compared to unmodified proteins.
Краткое описание графических материаловBrief description of graphic materials
ФИГ. 1 представляет собой схематическое изображение плазмиды pDCM2.FIG. 1 is a schematic representation of plasmid pDCM2.
Лучший способ осуществления изобретенияThe best way to carry out the invention
Настоящее изобретение будет раскрыто подробно. В то же время каждое описание и воплощение изобретения, раскрытое в описании настоящего изобретения, можно применять к различным представленным в нем описаниям и воплощениям. Иными словами, в объем описания настоящего изобретения включены все комбинации различных компонентов, раскрытых в описании настоящего изобретения. Кроме того, объем описания настоящего изобретения не должен ограничиваться приведенными ниже описаниями.The present invention will be described in detail. However, each description and embodiment of the invention disclosed in the description of the present invention can be applied to the various descriptions and embodiments presented herein. In other words, all combinations of the various components disclosed in the specification of the present invention are included within the scope of the present invention. Moreover, the scope of the description of the present invention should not be limited to the following descriptions.
В одном аспекте описания настоящего изобретения для достижения вышеописанных целей предложен вариант белка YjeH внутренней мембраны, включающий i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или iii) замену в обоих положениях i) и ii), в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и обладающий гомологией 95% или более, но менее 100% с SEQ ID NO: 1.In one aspect of the present invention, to achieve the above-described objects, a variant of the inner membrane protein YjeH is provided, comprising i) replacing the amino acid corresponding to position 92 with asparagine, ii) replacing the amino acid corresponding to position 351 with leucine, or iii) replacing both positions i) and ii), in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and having 95% or more but less than 100% homology with SEQ ID NO: 1.
Вариант белка YjeH внутренней мембраны может обладать способностью к экспорту О-ацетилгомосерина или гомосерина, т.е. активностью экспорта О-ацетилгомосерина или гомосерина.A variant of the inner membrane protein YjeH may have the ability to export O-acetylhomoserine or homoserine, i.e. O-acetylhomoserine or homoserine export activity.
Используемый в настоящем документе термин «гомосерин» представляет собой α-аминокислоту, имеющую гидроксильную группу в боковой цепи. Известно, что гомосерин как промежуточное соединение биосинтеза треонина и метионина в микроорганизмах и растениях образуется из аспарагиновой кислоты 4-полуальдегида и имеет химическую формулу C4H9NO3. Гомосерин может быть преобразован в О-ацетилцистеин гомосеринацетилтрансферазой в присутствии ацетилкоэнзима А (ацетил-КоА).As used herein, the term “homoserine” is an α-amino acid having a hydroxyl group on the side chain. It is known that homoserine, as an intermediate in the biosynthesis of threonine and methionine in microorganisms and plants, is formed from aspartic acid 4-semialdehyde and has the chemical formula C 4 H 9 NO 3 . Homoserine can be converted to O-acetylcysteine by homoserine acetyltransferase in the presence of acetyl coenzyme A (acetyl-CoA).
Используемый в настоящем документе термин «О-ацетилгомосерин» относится к ацетильному производному L-гомосерина, который является специфичным промежуточным материалом в пути биосинтеза метионина в микроорганизмах. Известно, что О-ацетилгомосерин образуется путем взаимодействия между гомосерином и ацетил-КоА, катализируемого гомосеринацетилтрансферазой. Он имеет химическую формулу С6Н11NO4. О-Ацетилгомосерин может также называться О-ацетил-L-гомосерином.As used herein, the term “O-acetylhomoserine” refers to the acetyl derivative of L-homoserine, which is a specific intermediate in the methionine biosynthesis pathway in microorganisms. It is known that O-acetylhomoserine is formed by the interaction between homoserine and acetyl-CoA, catalyzed by homoserine acetyltransferase. It has the chemical formula C6H11NO4 . O-Acetylhomoserine may also be called O-acetyl-L-homoserine.
В частности, в варианте белка в соответствии с описанием настоящего изобретения i) аминокислота, соответствующая 92-му положению, может быть заменена другой аминокислотой, ii) аминокислота, соответствующая 351-му положению, может быть заменена другой аминокислотой, или iii) обе аминокислоты, соответствующие 92-му положению и 351-му положению, могут быть заменены другими аминокислотами в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, но без ограничений. Замена аминокислот может представлять собой i) замену аминокислоты, соответствующую 92-му положению, аспарагином, или ii) замену аминокислоты, соответствующую 351-му положению, лейцином, и более конкретно вариант белка может представлять собой вариант белка YjeH внутренней мембраны, в котором i) аминокислота, соответствующая 92-му положению, заменена аспарагином, ii) аминокислота, соответствующая 351-му положению, заменена лейцином, или iii) аминокислота, соответствующая 92-му положению, заменена аспарагином, а аминокислота, соответствующая 351-му положению, заменена лейцином, в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, но без ограничений.Specifically, in a protein variant as described herein, i) the amino acid corresponding to position 92 may be replaced by another amino acid, ii) the amino acid corresponding to position 351 may be replaced by another amino acid, or iii) both amino acids, corresponding to position 92 and position 351 may be replaced by other amino acids in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, but without limitation. The amino acid substitution may be i) a substitution of the amino acid corresponding to position 92 with asparagine, or ii) a substitution of the amino acid corresponding to position 351 with leucine, and more specifically, the protein variant may be a variant of the inner membrane protein YjeH, in which i) the amino acid corresponding to position 92 is replaced by asparagine, ii) the amino acid corresponding to position 351 is replaced by leucine, or iii) the amino acid corresponding to position 92 is replaced by asparagine and the amino acid corresponding to position 351 is replaced by leucine, in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, but without limitation.
Используемый в настоящем документе термин «белок внутренней мембраны» относится к белку, который является членом семейства белков эффлюкса аминокислот (Amino Acid Efflux, ААЕ), входящего в суперсемейство белков-переносчиков аминокислот-полиаминов-органокатионов (АРС), являющихся посредниками экспорта О-ацетилгомосерина и/или гомосерина. Предположительно этот белок содержит 12 транс мембранных α-спиралей, 10 из которых образуют складку инвертированных повторов, которая характерна для суперсемейства АРС. Белок внутренней мембраны может представлять собой, например, белок, включающий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1. Белок, включающий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, может использоваться взаимозаменяемо с белком, имеющим аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, или белок, состоящий из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1. В описании настоящего изобретения белок внутренней мембраны может использоваться взаимозаменяемо с О-ацетилгомосерин- или гомосерин-экспортирующим белком, белком, обладающим способностью к экспорту О-ацетилгомосерина или гомосерина, белком, обладающим О-ацетилгомосерин- или гомосерин-экспортирующей активностью, белком YjeH или YjeH.As used herein, the term “inner membrane protein” refers to a protein that is a member of the Amino Acid Efflux (AAE) family of proteins, a member of the superfamily of amino acid polyamine organocation (APC) transport proteins that mediate O-acetylhomoserine export. and/or homoserine. This protein is predicted to contain 12 transmembrane α-helices, 10 of which form the inverted repeat fold that is characteristic of the APC superfamily. The inner membrane protein may be, for example, a protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1. A protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 may be used interchangeably with a protein having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, or a protein consisting from the amino acid sequence SEQ ID NO: 1. In the specification of the present invention, inner membrane protein may be used interchangeably with O-acetylhomoserine or homoserine exporting protein, protein having the ability to export O-acetylhomoserine or homoserine, protein having O-acetylhomoserine or homoserine-exporting activity, YjeH or YjeH protein.
В описании настоящего изобретения SEQ ID NO: 1 может относиться к аминокислотной последовательности белка YjeH, который представляет собой белок внутренней мембраны. В частности, SEQ ID NO: 1 может представлять собой аминокислотную последовательность белка внутренней мембраны, кодируемого геном yjeH и обладающего О-ацетилгомосерин- или гомосерин-экспортирующей активностью. Аминокислотная последовательность SEQ ID NO: 1 может быть получена из известной базы данных GenBank Национального центра биотехнологической информации (NCBI). Например, аминокислотная последовательность может иметь происхождение из Escherichia coli (Е. coli), но без ограничений, и любая последовательность, обладающая активностью, идентичной активности этой аминокислотной последовательности, включена без ограничений. В дополнение к этому, хотя белок внутренней мембраны в описании настоящего изобретения может быть определен как белок, включающий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, этот белок внутренней мембраны не исключает мутацию, которая может произойти естественным путем или путем добавления незначащей последовательности выше или ниже аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, или ее молчащую мутацию. Если белок обладает активностью, идентичной или эквивалентной активности белка, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, он явным образом принадлежит к белку внутренней мембраны по описанию настоящего изобретения. Например, белок внутренней мембраны по описанию настоящего изобретения может представлять собой белок, состоящий из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1 или из аминокислотной последовательности, обладающей по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5% или 99,7% гомологией или идентичностью с ней. Также будет очевидно, что любой белок, имеющий аминокислотную последовательность, включающую делецию, модификацию, замену или добавление в части аминокислотной последовательности, входит в объем описания настоящего изобретения, если аминокислотная последовательность сохраняет вышеописанную гомологию или идентичность и эффекты, эквивалентные эффектам этого белка.As used herein, SEQ ID NO: 1 may refer to the amino acid sequence of YjeH protein, which is an inner membrane protein. In particular, SEQ ID NO: 1 may be the amino acid sequence of an inner membrane protein encoded by the yjeH gene and having O-acetylhomoserine or homoserine exporting activity. The amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 can be obtained from the known GenBank database of the National Center for Biotechnology Information (NCBI). For example, the amino acid sequence may be derived from Escherichia coli (E. coli), but is not limited to, and any sequence having activity identical to that of the amino acid sequence is included without limitation. In addition, although an inner membrane protein in the specification of the present invention may be defined as a protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, this inner membrane protein does not exclude mutation, which may occur naturally or by adding a minor sequence upstream or downstream of the amino acid sequence SEQ ID NO: 1, or a silent mutation thereof. If a protein has an activity identical or equivalent to that of a protein containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, it clearly belongs to the inner membrane protein described in the present invention. For example, the inner membrane protein of the present invention may be a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5% or 99.7% homology or identity with it. It will also be apparent that any protein having an amino acid sequence including deletion, modification, substitution or addition of portions of the amino acid sequence is within the scope of the present invention if the amino acid sequence retains the above-described homology or identity and effects equivalent to those of the protein.
Таким образом, хотя в описании настоящего изобретения используются выражения «белок или полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, представленную заданной последовательностью SEQ ID NO» и «белок или полипептид, включающий аминокислотную последовательность, представленную заданной последовательностью SEQ ID NO», очевидно, что любой белок, имеющий аминокислотную последовательность, включающую делецию, модификацию, замену или добавление в части аминокислотной последовательности, может также использоваться в описании настоящего изобретения, если этот белок обладает активностью, идентичной или эквивалентной активности полипептида, состоящей из заданной аминокислотной последовательности. Например, очевидно, что «белок, включающий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1» или «полипептид, включающий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1», относится к «белку, состоящему из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1», или «полипептиду, состоящему из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1», если первый обладает такой же или эквивалентной активностью, как последний.Thus, although the description of the present invention uses the expressions “a protein or polypeptide having the amino acid sequence represented by the specified sequence of SEQ ID NO” and “a protein or polypeptide comprising the amino acid sequence represented by the specified sequence of SEQ ID NO”, it is obvious that any protein having an amino acid sequence including deletion, modification, substitution or addition of portions of the amino acid sequence may also be used in the description of the present invention if the protein has an activity identical or equivalent to that of a polypeptide consisting of a given amino acid sequence. For example, it is apparent that “a protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1” or “a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1” refers to “a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1” or “a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1" if the former has the same or equivalent activity as the latter.
Используемый в настоящем документе термин «вариант» относится к белку, полученному путем консервативной замены и/или модификации по меньшей мере одной аминокислоты, отличающейся от аминокислоты указанной последовательности при сохранении ее функций или свойств. Вариант может иметь аминокислотную последовательность, отличающуюся от идентифицированной последовательности вследствие замены, делеции или добавления нескольких аминокислот. Такие варианты, как правило, могут быть идентифицированы путем модификации по меньшей мере одной аминокислоты вышеуказанной аминокислотной последовательности белка и оценки свойств модифицированного белка. Таким образом, активность варианта может быть усилена, может быть не изменена или снижена относительно нативного белка. В дополнение к этому некоторые варианты могут включать варианты, из которых удален по меньшей мере один участок, такой как N-концевая лидерная последовательность или трансмембранный домен. Другие варианты могут включать варианты, в которых участок удален с N- и/или С-конца зрелого белка. Термин «вариант» может быть также использован взаимозаменяемо с другими терминами, такими как модификация, модифицированный белок, модифицированный полипептид, мутант, мутеин и дивергент, а также любыми терминами, используемыми для указания вариации, которые могут быть также использованы без ограничений. В свете целей описания настоящего изобретения способность варианта может быть усилена относительно нативного или немодифицированного белка, но без ограничений.As used herein, the term “variant” refers to a protein produced by conservative substitution and/or modification of at least one amino acid different from an amino acid of the specified sequence while maintaining its functions or properties. A variant may have an amino acid sequence that differs from the identified sequence due to substitution, deletion, or addition of multiple amino acids. Such variants can typically be identified by modifying at least one amino acid of the above protein amino acid sequence and evaluating the properties of the modified protein. Thus, the activity of the variant may be enhanced, unchanged, or reduced relative to the native protein. In addition, some variants may include variants from which at least one region, such as an N-terminal leader sequence or transmembrane domain, is deleted. Other variants may include variants in which a region is removed from the N- and/or C-terminus of the mature protein. The term “variant” may also be used interchangeably with other terms such as modification, modified protein, modified polypeptide, mutant, mutein and divergent, as well as any terms used to indicate variation, which may also be used without limitation. In light of the purposes of the description of the present invention, the ability of the variant may be enhanced relative to the native or unmodified protein, but without limitation.
Используемый в настоящем документе термин «консервативная замена» относится к замене одной аминокислоты другой аминокислотой, обладающей подобным структурным и/или химическим свойством. Например, вариант может включать по меньшей мере одну консервативную замену при сохранении по меньшей мере одной биологической активности. Такая замена аминокислоты может, как правило, происходить на основе сходства полярности, заряда, растворимости, гидрофобности, гидрофильности и/или амфипатического характера остатка. Например, аминокислоты с электрическим зарядом и с боковыми цепями включают положительно заряженные (основные) аминокислоты, такие как аргинин, лизин и гистидин, и отрицательно заряженные (кислые) аминокислоты, такие как глутаминовая кислота и аспарагиновая кислота; а незаряженные аминокислоты с боковыми цепями включают неполярные аминокислоты, такие как глицин, аланин, валин, лейцин, изолейцин, метионин, фенилаланин, триптофан и пролин, и полярные, или гидрофильные аминокислоты, такие как серии, треонин, цистеин, тирозин, аспарагин и глутамин. Среди неполярных аминокислот ароматические аминокислоты включают фенилаланин и триптофан.As used herein, the term “conservative substitution” refers to the replacement of one amino acid with another amino acid having a similar structural and/or chemical property. For example, a variant may include at least one conservative substitution while maintaining at least one biological activity. Such amino acid substitution may generally occur on the basis of similarity in polarity, charge, solubility, hydrophobicity, hydrophilicity and/or amphipathic nature of the residue. For example, amino acids with an electrical charge and side chains include positively charged (basic) amino acids such as arginine, lysine and histidine, and negatively charged (acidic) amino acids such as glutamic acid and aspartic acid; and uncharged amino acids with side chains include non-polar amino acids such as glycine, alanine, valine, leucine, isoleucine, methionine, phenylalanine, tryptophan and proline, and polar or hydrophilic amino acids such as serine, threonine, cysteine, tyrosine, asparagine and glutamine . Among the nonpolar amino acids, aromatic amino acids include phenylalanine and tryptophan.
Варианты могут также включать делецию или добавление аминокислот, которые оказывают минимальное влияние на свойства и вторичную структуру полипептида. Например, полипептид может быть конъюгирован с сигнальной (или лидерной) последовательностью на N-конце белка, которая котрансляционно или посттрансляционно направляет перенос белка. Полипептид может быть также конъюгирован с другой последовательностью или линкером для идентификации, очистки или синтеза полипептида.Variations may also include deletion or addition of amino acids that have minimal effect on the properties and secondary structure of the polypeptide. For example, the polypeptide may be conjugated to a signal (or leader) sequence at the N-terminus of the protein that co-translationally or post-translationally directs protein transfer. The polypeptide may also be conjugated to another sequence or linker to identify, purify, or synthesize the polypeptide.
В описании настоящего изобретения «заменена другой аминокислотой» конкретно не ограничено, если аминокислота после замены отличается от аминокислоты до замены.In the description of the present invention, “replaced with another amino acid” is not particularly limited as long as the amino acid after the replacement is different from the amino acid before the replacement.
В описании настоящего изобретения «заменена другой аминокислотой» конкретно не ограничено, если аминокислота после замены отличается от аминокислоты до замены. В частности, аминокислота может быть замещена любой из лизина, гистидина, глутаминовой кислоты, аспарагиновой кислоты, глицина, аланина, валина, лейцина, изолейцина, метионина, фенилаланина, триптофана, пролина, серина, треонина, цистеина, тирозина, аспарагина и глутамина, в отличие от предыдущей аминокислотной последовательности.In the description of the present invention, “replaced with another amino acid” is not particularly limited as long as the amino acid after the replacement is different from the amino acid before the replacement. In particular, the amino acid may be replaced by any of lysine, histidine, glutamic acid, aspartic acid, glycine, alanine, valine, leucine, isoleucine, methionine, phenylalanine, tryptophan, proline, serine, threonine, cysteine, tyrosine, asparagine and glutamine, in difference from the previous amino acid sequence.
В частности, в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1 фенилаланин, который представляет собой аминокислоту, соответствующую 92-му положению, может быть заменен аспарагином, либо фенилаланин, который представляет собой аминокислоту, соответствующую 351-му положению, может быть заменен лейцином. В то же время в описании настоящего изобретения очевидно, что, если не используется выражение «заменен другой аминокислотой», выражение «заменен определенной аминокислотой» означает, что аминокислота после замены отличается от аминокислоты до замены.Specifically, in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, phenylalanine, which is the amino acid corresponding to position 92, may be replaced by asparagine, or phenylalanine, which is the amino acid corresponding to position 351, may be replaced by leucine. At the same time, in the description of the present invention, it is obvious that unless the expression “replaced by another amino acid” is used, the expression “replaced by a certain amino acid” means that the amino acid after the replacement is different from the amino acid before the replacement.
Замещенный аминокислотный остаток может включать не только природную аминокислоту, но также и неприродную аминокислоту. Неприродная аминокислота может представлять собой, например, D-аминокислоту, (гомо)-аминокислоту, (бета-гомо)-аминокислоту, N-метил-аминокислоту, α-метил-аминокислоту и редкую аминокислоту (например, цитруллин или нафтилаланин), но без ограничений. В то же время в описании настоящего изобретения очевидно, что, если не используется выражение «заменена другой аминокислотой», выражение «заменена определенной аминокислотой» означает, что аминокислота после замены отличается от аминокислоты до замены.The substituted amino acid residue may include not only a naturally occurring amino acid, but also a non-naturally occurring amino acid. The unnatural amino acid may be, for example, a D-amino acid, a (homo)-amino acid, a (beta-homo)-amino acid, an N-methyl amino acid, an α-methyl amino acid, and a rare amino acid (for example, citrulline or naphthylalanine), but without restrictions. At the same time, in the description of the present invention, it is obvious that unless the expression “replaced by another amino acid” is used, the expression “replaced by a certain amino acid” means that the amino acid after the replacement is different from the amino acid before the replacement.
Вариант может представлять собой такой, в котором по меньшей мере одна из аминокислот, соответствующая 92-му положению и 351-му положению, заменена аминокислотой, отличающейся от аминокислоты до замены в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, либо заменена незаряженной кислотой с боковой цепью, отличающейся от той, которая была до замены, но без ограничений.The variant may be one in which at least one of the amino acids corresponding to position 92 and position 351 is replaced by an amino acid different from the amino acid before the substitution in the amino acid sequence SEQ ID NO: 1, or is replaced by an uncharged side chain acid , different from the one that was before the replacement, but without restrictions.
В частности, вариант может представлять собой вариант белка, в котором i) аминокислота, соответствующая 92-му положению, может быть заменена другой аминокислотой, ii) аминокислота, соответствующая 351-му положению, может быть заменена другой аминокислотой, или iii) обе аминокислоты, соответствующие 92-му положению и 351-му положению, могут быть заменены другими аминокислотами в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, но без ограничений. Замена аминокислот может представлять собой i) замену 92-й аминокислоты аспарагином, или ii) замену 351-й аминокислоты лейцином. Более конкретно вариант может представлять собой вариант белка YjeH внутренней мембраны, в котором i) 92-я аминокислота заменена аспарагином, ii) 351-я аминокислота заменена лейцином, или iii) 92-я аминокислота заменена аспарагином, и 351-я аминокислота заменена лейцином в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, но без ограничений.In particular, the variant may be a protein variant in which i) the amino acid corresponding to position 92 may be replaced by another amino acid, ii) the amino acid corresponding to position 351 may be replaced by another amino acid, or iii) both amino acids, corresponding to position 92 and position 351 may be replaced by other amino acids in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, but without limitation. The amino acid substitution may be i) substitution of the 92nd amino acid with asparagine, or ii) substitution of the 351st amino acid with leucine. More specifically, the variant may be a variant of the inner membrane protein YjeH in which i) the 92nd amino acid is replaced by asparagine, ii) the 351st amino acid is replaced by leucine, or iii) the 92nd amino acid is replaced by asparagine, and the 351st amino acid is replaced by leucine in amino acid sequence SEQ ID NO: 1, but without limitation.
Используемый в настоящем документе термин «соответствует (чему-то)» относится к аминокислотному остатку в указанном положении в белке или полипептиде или к аминокислотному остатку, подобному, идентичному или гомологичному остатку, указанному в белке или полипептиде. Используемый в настоящем документе термин «соответствующая область» в целом относится к области, подобной ей в родственном белке или в белке сравнения.As used herein, the term “corresponds to (something)” refers to an amino acid residue at a specified position in a protein or polypeptide, or an amino acid residue that is similar, identical or homologous to a residue specified in a protein or polypeptide. As used herein, the term “corresponding region” generally refers to a region similar to it in a related or reference protein.
В описании настоящего изобретения для положения аминокислотного остатка белка, используемого в описании настоящего изобретения, может использоваться конкретная нумерация. Например, положение, соответствующее аминокислотному остатку белка по описанию настоящего изобретения, может быть перенумеровано в результате приведения аминокислотной последовательности сравниваемого белка в соответствие с аминокислотной последовательностью белка по описанию настоящего изобретения.In the description of the present invention, a specific numbering may be used for the position of the amino acid residue of the protein used in the description of the present invention. For example, a position corresponding to an amino acid residue of a protein of the present invention may be renumbered by aligning the amino acid sequence of the protein being compared to the amino acid sequence of the protein of the present invention.
Вариант белка YjeH внутренней мембраны, предложенный в описании настоящего изобретения, может относиться к варианту, обладающему усиленной способностью к экспорту О-ацетилгомосерина или гомосерина по сравнению с немодифицированным белком в результате замены аминокислоты в определенном положении в вышеописанном белке внутренней мембраны, обладающем способностью к экспорту О-ацетилгомосерина или гомосерина.The YjeH inner membrane protein variant proposed herein may refer to a variant having enhanced O-acetylhomoserine or homoserine export ability compared to the unmodified protein as a result of an amino acid substitution at a specific position in the above described inner membrane protein having O export ability. -acetylhomoserine or homoserine.
Вариант белка YjeH внутренней мембраны, включающий i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или замену в обоих положениях i) и ii) в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1 может включать любую из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 35 и 36, в частности состоящих из любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 35 и 36, более конкретно состоящих из любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 35 и 36, но без ограничений.A variant of the inner membrane protein YjeH comprising i) a substitution of the amino acid corresponding to position 92 with asparagine, ii) a substitution of the amino acid corresponding to position 351 with leucine, or a substitution at both positions i) and ii) in the amino acid sequence SEQ ID NO: 1 may include any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 35 and 36, in particular consisting of any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 35 and 36, more particularly consisting of any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 35 and 36, but without limitation .
В дополнение к этому вариант может включать аминокислотные последовательности SEQ ID NO: 35 и 36 или аминокислотную последовательность, в которой по меньшей мере любая одна аминокислота из 92-й и 351-й аминокислот фиксирована в аминокислотных последовательностях SEQ ID NO: 35 и 36, и имеющие по меньшей мере 80% гомологию с любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 35 и 36, но без ограничений. В частности, вариант по описанию настоящего изобретения может включать полипептид, имеющий 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% гомологию или идентичность с любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 35 и 36. Также очевидно, что любой белок, имеющий аминокислотную последовательность, включающую делецию, модификацию, замену или добавление в другой части аминокислотной последовательности, кроме 92-го положения и 351-го положения, входит в объем описания настоящего изобретения, если аминокислотная последовательность сохраняет вышеописанную гомологию или идентичность и эффекты, эквивалентные эффектам этого белка.In addition, the variant may include the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 35 and 36, or an amino acid sequence wherein at least any one of the 92nd and 351st amino acids is fixed in the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 35 and 36, and having at least 80% homology to, but not limited to, any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 35 and 36. In particular, a variant as described herein may include a polypeptide having 80%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% homology or identity with any of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 35 and 36. Also It is apparent that any protein having an amino acid sequence involving deletion, modification, substitution or addition in a portion of the amino acid sequence other than the 92nd position and the 351st position is within the scope of the present invention if the amino acid sequence retains the above-described homology or identity and effects equivalent to those of that protein.
Используемый в настоящем документе термин «гомология» или «идентичность» относится к степени соответствия между двумя данными аминокислотными последовательностями, или последовательностями оснований, и может быть выражен в процентах. Эти термины «гомология» и «идентичность» часто могут использоваться взаимозаменяемо.As used herein, the term “homology” or “identity” refers to the degree of correspondence between two given amino acid or base sequences and may be expressed as a percentage. The terms homology and identity can often be used interchangeably.
Гомологию или идентичность консервативных полинуклеотидов или полипептидов можно определить с помощью стандартного алгоритма приведения последовательностей в соответствие, вместе с которым можно использовать штрафы за гэпы по умолчанию, установленные программой. По существу гомологичные или идентичные последовательности могут гибридизоваться друг с другом на по меньшей мере около 50%, 60%, 70%, 80% или 90% полноразмерной последовательности или по всей полноразмерной последовательности в в условиях умеренной или высокой жесткости. В гибрид изо ванных полинуклеотидах можно также рассматривать полинуклеотиды, включающие вырожденный кодон вместо кодона.The homology or identity of conserved polynucleotides or polypeptides can be determined using a standard sequence matching algorithm, together with which can be used the default gap penalties set by the program. Substantially homologous or identical sequences may hybridize to each other over at least about 50%, 60%, 70%, 80%, or 90% of the full-length sequence, or throughout the entire full-length sequence under moderate to high stringency conditions. Hybrid polynucleotides may also include polynucleotides that include a degenerate codon in place of a codon.
Гомологию, подобие или идентичность последовательности между двумя определенными полипептидами или полинуклеотидами можно определить, используя любой известный компьютерный алгоритм, такой как программа FASTA, используя параметры по умолчанию, которые введены, например, Pearson et al. (1988) Рrос. Natl. Acad. Sci. USA 85: 2444. Альтернативно можно использовать алгоритм Нидлмана-Вунша (1970, J. Mol. Biol. 48: 443 453), выполняемый в программе Needleman из пакета программ The European Molecular Biology Open Software Suite (EMBOSS) (Rice et al., 2000, Trends Genet. 16: 276-277) (версия 5.0.0 или более новая) для этого определения (включая пакет программ GCG (Devereux, J. et al., Nucleic Acids Research 12: 387 (1984)), BLASTP, BLASTN, FASTA (Atschul, S.F. et al., J MOLEC BIOL 215: 403 (1990); Guide to Huge Computers, Martin J. Bishop, ed., Academic Press, San Diego, 1994, и CARILLO et al. (1988) SIAM J Applied Math 48: 1073). Например, гомологию, подобие или идентичность можно определить, используя программу BLAST из базы данных Национального центра биотехнологической информации, или ClustalW.Homology, similarity or sequence identity between two specific polypeptides or polynucleotides can be determined using any known computer algorithm, such as the FASTA program, using default parameters as introduced, for example, by Pearson et al. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 2444. Alternatively, one can use the Needleman-Wunsch algorithm (1970, J. Mol. Biol. 48: 443-453) run in the Needleman program from The European Molecular Biology Open Software Suite (EMBOSS) (Rice et al., 2000, Trends Genet. 16: 276-277) (version 5.0.0 or later) for this definition (including the GCG software package (Devereux, J. et al., Nucleic Acids Research 12: 387 (1984)), BLASTP, BLASTN, FASTA (Atschul, S.F. et al., J MOLEC BIOL 215: 403 (1990); Guide to Huge Computers, Martin J. Bishop, ed., Academic Press, San Diego, 1994, and CARILLO et al. (1988) SIAM J Applied Math 48: 1073) For example, homology, similarity, or identity can be determined using the BLAST program from the National Center for Biotechnology Information database, or ClustalW.
Гомологию, подобие или идентичность между полинуклеотидами или полипептида можно определить, например, путем сравнения информации о последовательности, используя компьютерную программу GAP, например программу, введенную Needleman et al. (1970), J Mol Biol. 48: 443, например, как описано в Smith and Waterman, Adv. Appl. Math (1981) 2: 482. Кратко, программа GAP определяет подобие как число приведенных в соответствие символов (т.е. нуклеотидов или аминокислот), которые являются подобными, деленное на общее число символов в более короткой из двух последовательностей. Параметры по умолчанию для программы GAP могут включать: (1) матрица двоичных сравнений (содержащая значения 1 для идентичности и 0 для неидентичности), матрица взвешенных сравнений Gribskov et al. (1986) Nucl. Acids Res. 14: 6745, описанная в Schwartz and Dayhoff, eds., Atlas Of Protein Sequence And Structure, National Biomedical Research Foundation, pp. 353-358 (1979) (или матрица замен EDNAFULL (версия EMBOSS NCBI NUC 4.4)); (2) штраф 3.0 за каждый гэп и дополнительный штраф 0.10 за каждый символ в каждом гэпе (или штраф за открытие гэпа 10 и штраф за удлинение гэпа 0,5); и (3) отсутствие штрафа за концевые гэпы.Homology, similarity or identity between polynucleotides or a polypeptide can be determined, for example, by comparing sequence information using a GAP computer program, such as the program introduced by Needleman et al. (1970), J Mol Biol. 48: 443, for example, as described in Smith and Waterman, Adv. Appl. Math (1981) 2: 482. Briefly, the GAP program defines similarity as the number of matched characters (ie, nucleotides or amino acids) that are similar divided by the total number of characters in the shorter of the two sequences. Default parameters for the GAP program may include: (1) a binary comparison matrix (containing the values 1 for identity and 0 for non-identity), a weighted comparison matrix Gribskov et al. (1986) Nucl. Acids Res. 14: 6745, described in Schwartz and Dayhoff, eds., Atlas Of Protein Sequence And Structure, National Biomedical Research Foundation, pp. 353-358 (1979) (or EDNAFULL substitution matrix (EMBOSS NCBI NUC version 4.4)); (2) a 3.0 penalty for each gap and an additional 0.10 penalty for each symbol in each gap (or a 10 penalty for opening a gap and a 0.5 penalty for extending a gap); and (3) no penalty for end gaps.
Гомологию, подобие или идентичность между двумя определенными полинуклеотидами или полипептидами также можно идентифицировать путем сравнения их последовательностей методом Саузерн-гибридизации в заданных условиях жесткости, и эти заданные условия жесткости входят в объем технологии и могут быть заданы методом, хорошо известным обычному специалисту в данной области техники (например, J. Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Laboratory press, Cold Spring Harbor, New York, 1989; F.M. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., New York).Homology, similarity or identity between two specific polynucleotides or polypeptides can also be identified by comparing their sequences by Southern hybridization under specified stringency conditions, and these specified stringency conditions are within the scope of the art and can be determined by a method well known to one of ordinary skill in the art. (e.g. J. Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Laboratory press, Cold Spring Harbor, New York, 1989; F. M. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., New York).
Используемый в настоящем документе термин «вариант белка внутренней мембраны» или «вариант белка YjeH внутренней мембраны» может обладать способностью к экспорту О-ацетилгомосерина или гомосерина и может использоваться взаимозаменяемо с модифицированным полипептидом, обладающим способностью к продукции О-ацетилгомосерина или гомосерина, О-ацетилгомосерин- или гомосерин-продуцирующим модифицированным полипептидом, модифицированным полипептидом, обладающим О-ацетилгомосерин- или гомосерин-продуцирующей способностью, модифицированным полипептидом, обладающим активностью экспорта О-ацетилгомосерина или гомосерина, вариантом с активностью экспорта О-ацетилгомосерина или гомосерина, О-ацетилгомосерин- или гомосерин-экспортирующим вариантом, модифицированным гомосерин-экспортирующим белком, модифицированным О-ацетилгомосерин-экспортирующим белком, модифицированным YjeH, вариантом YjeH, YjeH-вариантом, YjeH-мутантом и т.п.As used herein, the term "inner membrane protein variant" or "inner membrane protein variant YjeH" may have the ability to export O-acetylhomoserine or homoserine and may be used interchangeably with a modified polypeptide having the ability to produce O-acetylhomoserine or homoserine, O-acetylhomoserine - or a homoserine-producing modified polypeptide, a modified polypeptide having O-acetylhomoserine or homoserine-producing ability, a modified polypeptide having O-acetylhomoserine or homoserine export activity, a variant with O-acetylhomoserine or homoserine export activity, O-acetylhomoserine or homoserine -exporting variant, modified homoserine exporting protein, modified O-acetylhomoserine exporting protein, modified YjeH, YjeH variant, YjeH variant, YjeH mutant, etc.
В дополнение к этому белок может иметь происхождение из штаммов, относящихся к роду Escherichia, роду Erwinia, роду Serratia, роду Providencia, роду Corynebacterium, роду Pseudomonas, роду Leptospira, роду Salmonella, роду Brevibacterium, роду Hypomononas, роду Chromobacterium и роду Norcardia, или из дрожжей и грибов, в частности, иметь происхождение из штаммов, относящихся к роду Escherichia, роду Corynebacterium и роду Leptospira, и из дрожжей, и более конкретно иметь происхождение из штаммов, относящихся к роду Escherichia, например Escherichia coli (Е. coli), но без ограничений.In addition, the protein may be derived from strains belonging to the genus Escherichia, genus Erwinia, genus Serratia, genus Providencia, genus Corynebacterium, genus Pseudomonas, genus Leptospira, genus Salmonella, genus Brevibacterium, genus Hypomononas, genus Chromobacterium and genus Norcardia, or from yeasts and fungi, in particular having origin from strains belonging to the genus Escherichia, the genus Corynebacterium and the genus Leptospira, and from yeasts, and more particularly having origin from strains belonging to the genus Escherichia, for example Escherichia coli (E. coli), but without restrictions.
Вариант белка YjeH внутренней мембраны может включать мутацию в 92-м положении и/или 351-м положении в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и любой вариант, включающий добавление аминокислоты в аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 или делецию из нее может входить в объем описания настоящего изобретения, если аминокислота, соответствующая 92-му положению и/или 351-му положению от N-конца SEQ ID NO: 1 заменена. Вариант белка YjeH внутренней мембраны может включать аминокислотную последовательность, включающую замену 92-й аминокислоты и/или 351-й аминокислоты другой аминокислотой в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1 и может обладать усиленной активностью по сравнению с белком внутренней мембраны, включающим аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 или не включающую мутацию. Вариант белка YjeH внутренней мембраны может иметь гомологию или идентичность на 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5%, 99,7%или более и менее чем 100% с SEQ ID NO: 1.The inner membrane YjeH protein variant may include a mutation at position 92 and/or position 351 in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and any variant involving the addition of an amino acid to or deletion from the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 may include within the scope of the description of the present invention, if the amino acid corresponding to the 92nd position and/or the 351st position from the N-terminus of SEQ ID NO: 1 is replaced. The YjeH inner membrane protein variant may include an amino acid sequence comprising the substitution of the 92nd amino acid and/or the 351st amino acid with a different amino acid in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and may have enhanced activity compared to the inner membrane protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or not including mutation. The YjeH inner membrane protein variant may have homology or identity of 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99.5%, 99.7%, or more and less than 100 % with SEQ ID NO: 1.
Мутация 92-й или 351-й аминокислоты может представлять собой замену 92-й аминокислоты аспарагином или замену 351-й аминокислоты лейцином.A mutation at amino acid 92 or amino acid 351 may be a substitution of the 92nd amino acid with asparagine or a substitution of the 351st amino acid with leucine.
В частности, вариант белка YjeH внутренней мембраны может включать i) замену 92-й аминокислоты аспарагином, ii) замену 351-й аминокислоты лейцином, или замену обеих аминокислот i) и ii) в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1 и может обладать усиленной активностью по сравнению с белком, включающим аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 или с белком внутренней мембраны, имеющим происхождение из микроорганизма дикого типа без модификации.In particular, the YjeH inner membrane protein variant may include i) a substitution of the 92nd amino acid with asparagine, ii) a substitution of the 351st amino acid with leucine, or a substitution of both amino acids i) and ii) in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 and may have enhanced activity compared to a protein comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or an inner membrane protein derived from a wild-type microorganism without modification.
В другом аспекте описания настоящего изобретения предложен полинуклеотид, кодирующий вариант белка YjeH внутренней мембраны.In another aspect of the present invention, there is provided a polynucleotide encoding a variant of the inner membrane protein YjeH.
Белок YjeH внутренней мембраны и его вариант являются такими, как описано выше.The inner membrane protein YjeH and its variant are as described above.
Используемый в настоящем документе термин «полинуклеотид» относится к нити ДНК или РНК, имеющий определенную минимальную или большую длину, в виде полимера нуклеотидов, в котором нуклеотидные мономеры связаны друг с другом ковалентными связями, образуя длинную цепь; более конкретно полинуклеотид может представлять собой полинуклеотидный фрагмент, кодирующий вариант.As used herein, the term "polynucleotide" refers to a strand of DNA or RNA having a specified minimum or greater length, in the form of a polymer of nucleotides in which the nucleotide monomers are linked together by covalent bonds to form a long chain; more specifically, the polynucleotide may be a polynucleotide fragment encoding a variant.
Полинуклеотид может включать любую нуклеотидную последовательность, кодирующую вариант белка YjeH внутренней мембраны по описанию настоящего изобретения, без ограничений. В описании настоящего изобретения ген, кодирующий аминокислотную последовательность белка YjeH внутренней мембраны, представляет собой ген yjeH, который может иметь происхождение из Escherichia coli (Е. coli) без ограничений.The polynucleotide may include any nucleotide sequence encoding a variant of the inner membrane protein YjeH as described herein, without limitation. In the present invention, the gene encoding the amino acid sequence of the inner membrane protein YjeH is the yjeH gene, which may be derived from Escherichia coli (E. coli) without limitation.
В частности, полинуклеотид по описанию настоящего изобретения может включать различные модификации, выполненные в кодирующей области, при условии, что аминокислотная последовательность, экспрессирующаяся с кодирующей области в результате вырожденности кодонов или с учетом кодонов, предпочтительных в живом организме, в котором экспрессируется белок, не изменяется. В частности, может быть включена любая полинуклеотидная последовательность, кодирующая вариант белка YjeH внутренней мембраны, в котором 92я или 351я аминокислота заменена другой аминокислотой в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, без ограничений.In particular, the polynucleotide described in the present invention may include various modifications made to the coding region, provided that the amino acid sequence expressed from the coding region as a result of codon degeneracy or taking into account codon preferences in the living organism in which the protein is expressed is not changed . In particular, any polynucleotide sequence encoding a variant of the inner membrane protein YjeH in which the 92nd or 351st amino acid is replaced by another amino acid in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 may be included, without limitation.
В дополнение к этому может быть включена любая последовательность, кодирующая белок внутренней мембраны, в котором 92-я или 351-я аминокислота аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1 заменена другой аминокислотой путем гибридизации с зондом, который может быть получен из последовательностей известных генов, например последовательностей, комплементарных полноразмерной нуклеотидной последовательности или ее части, в жестких условиях, без ограничений. Термин «жесткие условия» относится к условиям, обеспечивающим возможность специфичной гибридизации между полинуклеотидами. Такие условия раскрыты подробно в известных документах (например, J. Sambrook et al.). Например, эти условия могут включать условия выполнения гибридизации между генами, обладающими высокой гомологией или идентичностью, например, гомологией или идентичностью 40% или более, в частности 90% или более, более конкретно 95% или более, еще более конкретно 97% или более и наиболее конкретно 99% или более, без выполнения гибридизации между генами, обладающие более низкой гомологией, чем упомянутые выше значения гомологии или идентичности, или с выполнением гибридизации один раз, в частности два или три раза, в общепринятых условиях отмывки для Саузерн-гибридизации при концентрации соли и температуре 60°С, 1×раствор цитрата и хлорида натрия (SSC) и 0,1% додецилсульфат натрия (ДСН), в частности 60°С, 0,1×SSC, 0,1% ДСН, и более конкретно 68°С, 0,1×SSC и 0,1% ДСН.In addition, any sequence encoding an inner membrane protein may be included in which the 92nd or 351st amino acid of amino acid sequence SEQ ID NO: 1 is replaced by another amino acid by hybridization with a probe that can be derived from known gene sequences, e.g. sequences complementary to the full-length nucleotide sequence or part thereof, under strict conditions, without restrictions. The term "stringent conditions" refers to conditions that allow specific hybridization between polynucleotides. Such conditions are disclosed in detail in known documents (eg, J. Sambrook et al.). For example, these conditions may include conditions for performing hybridization between genes having high homology or identity, for example, homology or identity of 40% or more, particularly 90% or more, more particularly 95% or more, even more particularly 97% or more, and most specifically 99% or more, without performing hybridization between genes having lower homology than the homology or identity values mentioned above, or performing hybridization once, in particular two or three times, under conventional washing conditions for Southern hybridization at concentration salt and a temperature of 60°C, 1×sodium citrate and chloride (SSC) solution and 0.1% sodium dodecyl sulfate (SDS), in particular 60°C, 0.1×SSC, 0.1% SDS, and more specifically 68 °C, 0.1×SSC and 0.1% SDS.
Для гибридизации требуется, чтобы два полинуклеотид а имели комплементарные последовательности, хотя основания могут не совпадать, в зависимости от степени жесткости гибридизации. Термин «комплементарный» используется для описания соотношения между основаниями нуклеотидов, способных гибридизоваться друг с другом. Например, что касается ДНК, аденин комплементарен тимину, а цитозин комплементарен гуанину. Таким образом, в описание настоящего изобретения может быть включена не только по существу подобная нуклеиновая кислота, но также изолированный фрагмент нуклеиновой кислоты, но комплементарный полноразмерной последовательности.Hybridization requires that the two polynucleotides have complementary sequences, although the bases may not be the same, depending on the stringency of the hybridization. The term "complementary" is used to describe the relationship between nucleotide bases that are capable of hybridizing with each other. For example, as far as DNA is concerned, adenine is complementary to thymine, and cytosine is complementary to guanine. Thus, not only a substantially similar nucleic acid, but also an isolated nucleic acid fragment, but complementary to the full-length sequence, may be included in the description of the present invention.
В частности, полинуклеотиды, обладающие гомологией или идентичностью, могут быть выявлены с использованием вышеописанных условий гибридизации и с использованием процесса гибридизации при значении Тm 55°С. Значение Тm может также составлять, но без ограничений, 60°С, 63°С или 65°С, и может быть соответствующим образом скорректировано специалистами в данной области техники в соответствии с предусмотренными целями.In particular, polynucleotides having homology or identity can be detected using the above-described hybridization conditions and using a hybridization process at a Tm value of 55°C. The Tm value may also be, but is not limited to, 60°C, 63°C, or 65°C, and may be adjusted accordingly by those skilled in the art according to intended purposes.
Соответствующая степень жесткости для гибридизации полинуклеотидов может зависеть от длин и степени комплементарности полинуклеотидов, а также от показателей, хорошо известных специалистам в данной области техники (Sambrook et al., см. выше, 9.50-9.51, 11.7-11.8).The appropriate degree of stringency for polynucleotide hybridization may depend on the lengths and degree of complementarity of the polynucleotides, as well as factors well known to those skilled in the art (Sambrook et al., supra, 9.50-9.51, 11.7-11.8).
В другом аспекте описания настоящего изобретения предложен вектор, включающий полинуклеотид, кодирующий вариант белка YjeH внутренней мембраны.In another aspect of the present invention, there is provided a vector comprising a polynucleotide encoding a variant of the inner membrane protein YjeH.
Белок YjeH внутренней мембраны, его вариант и полинуклеотид являются такими, как описано выше.The inner membrane protein YjeH, its variant and polynucleotide are as described above.
Вектор по описанию настоящего изобретения может представлять собой конструкцию ДНК, содержащую полинуклеотид, кодирующий целевой полипептид и функционально связанный с подходящей регуляторной областью экспрессии (регуляторной последовательностью экспрессии) таким образом, чтобы создать возможность экспрессии целевого полипептида в подходящей клетке-хозяине. Регуляторная последовательность экспрессии может включать промотор, способный инициировать транскрипцию, любую последовательность оператора для регуляции транскрипции, последовательность, кодирующую подходящий сайт связывания рибосомы на мРНК, и последовательность для регуляции терминации транскрипции и трансляции. При трансформации подходящей клетки-хозяина вектором этот вектор может реплицироваться или функционировать независимо от генома клетки-хозяина или может интегрировать в геном человека.A vector as described herein may be a DNA construct containing a polynucleotide encoding a target polypeptide and operably linked to a suitable expression regulatory region (expression regulatory sequence) so as to enable expression of the target polypeptide in a suitable host cell. The expression control sequence may include a promoter capable of initiating transcription, any operator sequence for regulating transcription, a sequence encoding a suitable ribosome binding site on the mRNA, and a sequence for regulating termination of transcription and translation. When a suitable host cell is transformed with a vector, the vector can replicate or function independently of the host cell genome or can integrate into the human genome.
При использовании в настоящем документе термин «экспрессия» включает любой процесс, связанный с продукцией полипептида, такой как транскрипция, посттранскрипционная модификация, трансляция, посттрансляционная модификация и секреция и т.д., без ограничений.As used herein, the term “expression” includes any process associated with the production of a polypeptide, such as transcription, post-transcriptional modification, translation, post-translational modification and secretion, etc., without limitation.
При использовании в настоящем документе термин «экспрессионный вектор» относится к линейной или кольцевой молекуле нуклеиновой кислоты, включающей кодирующую последовательность и функционально связанную регуляторную последовательность для ее экспрессии.As used herein, the term “expression vector” refers to a linear or circular nucleic acid molecule comprising a coding sequence and an operably linked regulatory sequence for its expression.
При использовании в настоящем документе термин «функционально связанный» относится к расположению регуляторной последовательности в соответствующем положении для регуляции экспрессии кодирующей последовательности. Таким образом, «функционально связанный» включает связывание между регуляторной областью функционального домена, обладающей известной или требуемой активностью, такой как промотор, стоп-кодон, сигнальная последовательность, либо энхансер и целевая последовательность (ген или полипептид) регуляции экспрессии, секреции или функционирования целевой последовательности в соответствии с известной или требуемой активностью.As used herein, the term "operably linked" refers to the arrangement of a regulatory sequence at an appropriate position to regulate the expression of a coding sequence. Thus, “operably linked” includes the binding between a regulatory region of a functional domain having a known or desired activity, such as a promoter, stop codon, signal sequence, or enhancer, and a target sequence (gene or polypeptide) regulating the expression, secretion, or function of the target sequence according to known or required activity.
Вектор, используемый в описании настоящего изобретения, конкретно не ограничен, и можно использовать любой известный вектор. Примеры известных векторов могут включать природные или рекомбинантные плазмиды, космиды, вирусы и бактериофаги. Например, в качестве фагового или космидного вектора можно использовать pWE15, М13, MBL3, MBL4, IXII, ASHII, АРII, t10, t11, Charon4A и Charon21A и т.д., а в качестве плазмидного вектора можно использовать векторы на основе pBR, на основе pUC, на основе pBluescriptII, на основе pGEM, на основе pTZ, на основе pCL и на основе рЕТ. В частности, можно использовать векторы pDCM2, pACYC177, pACYC184, pCL, pECCG117, pUC19, pBR322, pMW118 и pCC1BAC. Более конкретно вектор, используемый в описании настоящего изобретения, может представлять собой pDCM2 (ФИГ. 1, SEQ ID NO: 37), сконструированный для вставки и замены гена на хромосоме Corynebacterium, но без ограничений, и можно использовать любой экспрессионный вектор.The vector used in describing the present invention is not particularly limited, and any known vector can be used. Examples of known vectors may include natural or recombinant plasmids, cosmids, viruses and bacteriophages. For example, pWE15, M13, MBL3, MBL4, IXII, ASHII, APII, t10, t11, Charon4A and Charon21A, etc. can be used as a phage or cosmid vector, and vectors based on pBR, on pUC-based, pBluescriptII-based, pGEM-based, pTZ-based, pCL-based and pET-based. In particular, the vectors pDCM2, pACYC177, pACYC184, pCL, pECCG117, pUC19, pBR322, pMW118 and pCC1BAC can be used. More specifically, the vector used in the description of the present invention may be pDCM2 (FIG. 1, SEQ ID NO: 37), designed to insert and replace a gene on the Corynebacterium chromosome, but is not limited to, and any expression vector may be used.
Например, полинуклеотид, кодирующий целевой полипептид, может быть вставлен в хромосому с использованием вектора для вставки в хромосому клетки. Вставка полинуклеотида в хромосому может быть выполнена любым известным в данной области техники способом, например гомологичной рекомбинацией, без ограничений. Полинуклеотид может дополнительно включать селективный маркер для подтверждения вставки в хромосому. Селективный маркер используют для отбора клеток, трансформированных вектором, то есть для подтверждения вставки требуемой молекулы нуклеиновой кислоты, и примеры селективного маркера могут включать маркеры, обеспечивающие селективные фенотипы, такие как лекарственная устойчивость, потребность в питательном веществе, резистентность к цитотоксическим агентам или экспрессия поверхностного полипептида. В окружающей среде, обработанной селективным агентом, только клетки, экспрессирующие селективный маркер, способны выживать или проявлять различные фенотипы, и, таким образом, можно отобрать трансформированные клетки.For example, a polynucleotide encoding a target polypeptide can be inserted into a chromosome using a cell chromosome insertion vector. The insertion of a polynucleotide into a chromosome can be accomplished by any method known in the art, such as homologous recombination, without limitation. The polynucleotide may further include a selectable marker to confirm insertion into the chromosome. A selectable marker is used to select cells transformed with a vector, that is, to confirm insertion of a desired nucleic acid molecule, and examples of a selectable marker may include markers conferring selective phenotypes such as drug resistance, nutrient requirement, resistance to cytotoxic agents, or surface polypeptide expression . In an environment treated with a selection agent, only cells expressing the selectable marker are able to survive or exhibit different phenotypes, and thus transformed cells can be selected.
В другом аспекте описания настоящего изобретения предложен микроорганизм, включающий по меньшей мере одно из: варианта белка внутренней мембраны YjeH, включающего i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или iii) замену в обоих положениях i) и ii), в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и обладающего гомологией 95% или более, но менее 100% с SEQ ID NO: 1; полинуклеотида, кодирующего этот вариант; и вектора, кодирующего этот полинуклеотид.In another aspect of the present invention, there is provided a microorganism comprising at least one of: a variant of the inner membrane protein YjeH, comprising i) replacing the amino acid corresponding to position 92 with asparagine, ii) replacing the amino acid corresponding to position 351 with leucine, or iii) a substitution at both positions i) and ii) in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and having 95% or more but less than 100% homology with SEQ ID NO: 1; a polynucleotide encoding this variant; and a vector encoding this polynucleotide.
SEQ ID NO: 1, белок YjeH внутренней мембраны, его вариант, полинуклеотид, кодирующий этот вариант, и вектор, включающий этот полинуклеотид, являются такими, как описано выше.SEQ ID NO: 1, inner membrane protein YjeH, a variant thereof, a polynucleotide encoding the variant, and a vector including the polynucleotide are as described above.
Используемый в настоящем документе термин «микроорганизм, включающий вариант белка YjeH внутренней мембраны» относится к микроорганизму с усиленной способностью экспортировать О-ацетилгомосерин или гомосерин, полученному путем введения варианта белка YjeH внутренней мембраны в микроорганизм, обладающий слабой способностью экспортировать О-ацетилгомосерин или гомосерин. В частности, микроорганизм представляет собой микроорганизм, экспрессирующий вариант белка YjeH внутренней мембраны, включающий модификацию по меньшей мере одной аминокислоты в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и модификация аминокислоты может включать замену 92й или 351й аминокислоты с N-конца другой аминокислотой.As used herein, the term “microorganism comprising a variant of the inner membrane protein YjeH” refers to a microorganism with an enhanced ability to export O-acetylhomoserine or homoserine obtained by introducing a variant of the inner membrane protein YjeH into a microorganism having a weak ability to export O-acetylhomoserine or homoserine. Specifically, the microorganism is a microorganism expressing a variant of the inner membrane protein YjeH comprising a modification of at least one amino acid in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and the amino acid modification may include replacing the 92nd or 351st amino acid from the N-terminus with another amino acid.
В свете целей описания настоящего изобретения внеклеточный экспорт О-ацетилгомосерина или гомосерина микроорганизма, включающего по меньшей мере любое одно из варианта белка YjeH внутренней мембраны; полинуклеотида, кодирующего этот вариант; и вектора, включающего полинуклеотид, увеличивается, и, таким образом, этот микроорганизм отличается тем, что его способность продуцировать О-ацетилгомосерин или гомосерин усиливается. Хотя микроорганизмы дикого типа или немодифицированные микроорганизмы не могут экспортировать или могут продуцировать следовые количества О-ацетилгомосерина или гомосерина, способность продуцировать О-ацетилгомосерин или гомосерин может быть усилена в соответствии с описанием настоящего изобретения за счет увеличения экспортируемых количеств О-ацетилгомосерина или гомосерина путем введения по меньшей мере любого одного из варианта белка YjeH внутренней мембраны; полинуклеотида, кодирующего этот вариант; и вектора, включающего этот полинуклеотид.In light of the purposes of describing the present invention, the extracellular export of O-acetylhomoserine or homoserine of a microorganism comprising at least any one of the inner membrane protein variant YjeH; a polynucleotide encoding this variant; and the vector including the polynucleotide is increased, and thus the microorganism is characterized in that its ability to produce O-acetylhomoserine or homoserine is enhanced. Although wild-type or unmodified microorganisms cannot export or can produce trace amounts of O-acetylhomoserine or homoserine, the ability to produce O-acetylhomoserine or homoserine can be enhanced as described herein by increasing the exportable amounts of O-acetylhomoserine or homoserine by administering at least any one of the inner membrane protein YjeH variants; a polynucleotide encoding this variant; and a vector including this polynucleotide.
Используемый в настоящем изобретении термин «немодифицированный микроорганизм» не исключает штаммы, включающие мутацию, которая может возникать в микроорганизмах естественных путем, и относится к штамму или микроорганизму дикого типа, не включающему вариант белка YjeH внутренней мембраны. «Немодифицированный микроорганизм» может использоваться взаимозаменяемо со «штаммом до модификации», «микроорганизмом до модификации», «немутированным штаммом», «немутированным микроорганизмом», «немодифицированный штаммом» или «микроорганизмом сравнения».As used herein, the term “unmodified microorganism” does not exclude strains that include a mutation that may occur naturally in microorganisms, and refers to a wild-type strain or microorganism that does not include a variant of the inner membrane protein YjeH. "Unmodified microorganism" may be used interchangeably with "strain before modification", "microorganism before modification", "unmutated strain", "unmutated microorganism", "unmodified strain" or "comparative microorganism".
Используемый в настоящем документе термин «белок, который должен экспрессироваться/экспрессируется» означает состояние, в котором целевой белок введен в микроорганизм или модифицирован для экспрессии в микроорганизме. В том случае, если целевой белок присутствует в микроорганизме, активность этого белка можно усилить по сравнению с активностью эндогенного белка или белка до модификации. В свете объектов описания настоящего изобретения «целевой белок» может представлять собой вышеописанный вариант белка YjeH внутренней мембраны.As used herein, the term “protein to be expressed/is expressed” means a state in which the target protein is introduced into a microorganism or modified for expression in a microorganism. If the target protein is present in the microorganism, the activity of this protein can be enhanced compared to the activity of the endogenous protein or the protein before modification. In light of the subject matter of the present invention, the “target protein” may be a variant of the inner membrane protein YjeH described above.
В частности, термин «введение белка» относится к обеспечению активности конкретного белка в микроорганизме, который не имеет этого белка, или к усилению активности белка по сравнению с собственной активностью белка или с его активностью до модификации. Например, введение белка может относиться к введению в хромосому полинуклеотида, кодирующего конкретный белок, или к введению в микроорганизм вектора, включающего полинуклеотид, кодирующий этот конкретный белок, в результате чего экспрессируется активность этого белка. В дополнение к этому «усиление активности» может означать, что активность конкретного белка микроорганизма усиливается по сравнению с собственной активностью или активностью до модификации. Термин «собственная активность» может относиться к активности конкретного белка, которой обладает родительский штамм до трансформации, когда микроорганизм трансформируют естественным или искусственным природным вариантом.In particular, the term "introducing a protein" refers to providing the activity of a particular protein in a microorganism that does not have that protein, or enhancing the activity of the protein compared to the protein's own activity or its activity before modification. For example, protein introduction may refer to the introduction into a chromosome of a polynucleotide encoding a particular protein, or to the introduction into a microorganism of a vector comprising a polynucleotide encoding that particular protein, thereby expressing the activity of that protein. In addition, “enhanced activity” may mean that the activity of a particular microorganism protein is enhanced relative to its own activity or activity before modification. The term "intrinsic activity" may refer to the activity of a particular protein possessed by the parent strain prior to transformation when the microorganism is transformed with a natural or artificial natural variant.
В частности, усиление активности по описанию настоящего изобретения может быть достигнуто по меньшей мере одним способом, выбранным из группы, состоящей из: способа увеличения числа копий гена, кодирующего вариант белка; способа введения мутации в регуляторную последовательность экспрессии гена, кодирующего вариант белка; способа замещения регуляторной последовательности экспрессии гена последовательностью, кодирующей вариант белка и обладающей более сильной активностью; способа замещения гена, кодирующего белок внутренней мембраны дикого типа на хромосоме, геном, кодирующим вариант белка; способа дополнительного введения мутации в ген, кодирующий вариант белка, для усиления активности варианта белка; и способа введения варианта белка, без ограничений.In particular, the enhancement of activity as described in the present invention can be achieved by at least one method selected from the group consisting of: a method of increasing the copy number of a gene encoding a protein variant; a method for introducing a mutation into the expression regulatory sequence of a gene encoding a protein variant; a method of replacing a gene expression regulatory sequence with a sequence encoding a protein variant and having stronger activity; a method of replacing a gene encoding a wild-type inner membrane protein on a chromosome with a gene encoding a variant protein; a method for additionally introducing a mutation into a gene encoding a protein variant to enhance the activity of the protein variant; and a method of administering the protein variant, without limitation.
В приведенном выше описании увеличение числа копий гена, хотя конкретных ограничений нет, можно выполнять в состоянии функциональной связи с вектором или в состоянии, встроенном в хромосому клетки-хозяина. В частности, увеличение числа копий гена можно выполнять путем введения вектора, с которым функционально связан полинуклеотид, кодирующий вариант белка по описанию настоящего изобретения, и который может реплицироваться и функционировать в клетке-хозяине независимо от клетки-хозяина. Альтернативно в клетку вводят вектор, с которым функционально связан полинуклеотид, способен встраивать полинуклеотид в хромосому клетки-хозяина. Встраивание полинуклеотида в хромосому может быть выполнено любым известным в данной области техники способом, например гомологичной рекомбинации.In the above description, the increase in the number of copies of a gene, although there is no specific limitation, can be performed in a state of functional association with the vector or in a state integrated into the chromosome of the host cell. In particular, increasing the copy number of a gene can be accomplished by introducing a vector to which a polynucleotide encoding a protein variant as described herein is operably linked and which can replicate and function in a host cell independently of the host cell. Alternatively, a vector is introduced into the cell to which the polynucleotide is operably linked and is capable of inserting the polynucleotide into the chromosome of the host cell. The insertion of a polynucleotide into a chromosome can be accomplished by any method known in the art, such as homologous recombination.
Модификация экспрессионной регуляторной последовательности для повышения уровня экспрессии полинуклеотида может быть выполнена посредством, но без конкретных ограничений, индукции мутации на последовательности путем делеции, инсерции, неконсервативной замены, консервативной замены или любой их комбинации, чтобы дополнительно усилить активность регуляторной последовательности экспрессии или замены последовательностью, обладающей более сильной активностью. Регуляторная последовательность экспрессии может включать промотор, последовательность оператора, последовательность, кодирующую подходящий сайт связывания рибосомы, и последовательность для регуляции терминации транскрипции и трансляции.Modification of an expression control sequence to increase the expression level of a polynucleotide can be accomplished by, but without particular limitation, inducing a mutation on the sequence by deletion, insertion, non-conservative substitution, conservative substitution, or any combination thereof to further enhance the activity of the expression control sequence or substitution with a sequence having stronger activity. The expression control sequence may include a promoter, an operator sequence, a sequence encoding a suitable ribosome binding site, and a sequence for regulating transcription and translation termination.
Более сильный промотор, чем собственный промотор, может быть связан выше экспрессионной единицы полинуклеотида без ограничений. Примеры более сильного промотора, известные в данной области техники, могут включать промоторы CJ1-CJ7 (US 7662943 В2), промотор lac, промотор trp, промотор trc, промотор tac, промотор PR фага лямбда, промотор PL, промотор tet, промотор gapA, промотор SPL7, промотор SPL13 (sm3) (US 10584338 В2), промотор O2 (US 10273491 В2), промотор tkt и промотор уссА, без ограничений.A promoter stronger than its own promoter may be linked upstream of a polynucleotide expression unit without limitation. Examples of a stronger promoter known in the art may include the CJ1-CJ7 promoters (US Pat. No. 7,662,943 B2), lac promoter, trp promoter, trc promoter, tac promoter, lambda phage PR promoter, PL promoter, tet promoter, gapA promoter, SPL7, SPL13 promoter (sm3) (US 10584338 B2), O2 promoter (US 10273491 B2), tkt promoter and uscA promoter, without limitation.
В дополнение к этому модификация полинуклеотидной последовательности на хромосоме может быть выполнена путем индукции мутации в регуляторной последовательности экспрессии путем делеции, инсерции, неконсервативной замены, консервативной замены или любой их комбинации, чтобы дополнительно усилить активность полинуклеотидной последовательности, или путем замещения нуклеотидной последовательности модифицированной нуклеотидной последовательностью, обладающей более сильной активностью, но без ограничений.In addition, modification of a polynucleotide sequence on a chromosome can be accomplished by inducing a mutation in an expression regulatory sequence by deletion, insertion, non-conservative substitution, conservative substitution, or any combination thereof to further enhance the activity of the polynucleotide sequence, or by replacing the nucleotide sequence with a modified nucleotide sequence, having stronger activity, but without restrictions.
Введение белка и усиление активности может повысить активность или концентрацию белка по сравнению с активностью или концентрацией штамма дикого типа или немодифицированного штамма микроорганизма, без ограничений.The introduction of protein and enhancement of activity may increase the activity or concentration of the protein compared to the activity or concentration of a wild-type strain or an unmodified strain of the microorganism, without limitation.
В описании настоящего изобретения микроорганизм, включающий вариант белка YjeH внутренней мембраны, может представлять собой рекомбинантный микроорганизм, полученный путем трансформации с использованием вектора, включающего полинуклеотид, кодирующий вариант YjeH белка внутренней мембраны, но без ограничений.In the present invention, the microorganism comprising the YjeH variant of the inner membrane protein may be a recombinant microorganism obtained by transformation using a vector comprising a polynucleotide encoding the YjeH variant of the inner membrane protein, but is not limited to.
Используемый в настоящем документе термин «трансформация» относится к процессу введения в клетку-хозяина вектора, включающего полинуклеотид, кодирующий целевой белок, таким образом, чтобы кодируемый этим полинуклеотидом белок экспрессировался в клетке-хозяине. Трансформированный полинуклеотид может находиться либо в форме, встроенной в хромосому клетки-хозяина, либо в форме, локализованной вне хромосомы, и в любом случае белок экспрессируется в клетке-хозяине. В дополнение к этому полинуклеотид включает ДНК и/или РНК, кодирующую целевой белок. Полинуклеотид может быть введен в клетку-хозяина при условии, что полинуклеотид введен в клетку-хозяина и белок экспрессируется в ней. Например, полинуклеотид может быть введен в клетку-хозяина в форме экспрессионной кассеты, которая представляет собой генную конструкцию, включающую все незаменимые элементы, требующиеся для самостоятельной экспрессии. Экспрессионная кассета может, как правило, включать промотор, сигнал терминации транскрипции, сайт связывания рибосомы и сигнал терминации трансляции, которые функционально связаны с полинуклеотидом. Экспрессионная кассета может находиться в форме самостоятельно реплицирующегося экспрессионного вектора. Полинуклеотид может быть также введен в клетку-хозяина в его первоначальной форме и функционально связан с последовательностью, требующейся для экспрессии в клетке-хозяине, без ограничений.As used herein, the term “transformation” refers to the process of introducing into a host cell a vector comprising a polynucleotide encoding a target protein such that the protein encoded by the polynucleotide is expressed in the host cell. The transformed polynucleotide can be either in a form integrated into the chromosome of the host cell or in a form located outside the chromosome, and in either case the protein is expressed in the host cell. In addition, the polynucleotide includes DNA and/or RNA encoding the target protein. The polynucleotide can be introduced into a host cell provided that the polynucleotide is introduced into the host cell and the protein is expressed therein. For example, a polynucleotide can be introduced into a host cell in the form of an expression cassette, which is a gene construct that includes all the essential elements required for self-expression. The expression cassette may typically include a promoter, a transcription termination signal, a ribosome binding site, and a translation termination signal that are operably linked to the polynucleotide. The expression cassette may be in the form of a self-replicating expression vector. The polynucleotide may also be introduced into a host cell in its original form and operably linked to a sequence required for expression in the host cell, without limitation.
Типы микроорганизма, обладающего способностью к продукции гомосерина, конкретно не ограничены, если этот микроорганизм способен продуцировать О-ацетилгомосерин или гомосерин, и в частности микроорганизм может представлять собой любой микроорганизм, относящийся к роду Corynebacterium, роду Escherichia, роду Enterobacter, роду Erwinia, роду Serratia, роду Providencia и роду Brevibacterium, более конкретно микроорганизм, относящийся к роду Corynebacterium.The types of microorganism having the ability to produce homoserine are not particularly limited as long as the microorganism is capable of producing O-acetylhomoserine or homoserine, and in particular the microorganism can be any microorganism belonging to the Corynebacterium genus, Escherichia genus, Enterobacter genus, Erwinia genus, Serratia genus , the genus Providencia and the genus Brevibacterium, more specifically a microorganism belonging to the genus Corynebacterium.
Более конкретно микроорганизм, относящийся к роду Corynebacterium, может представлять собой Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium crudilactis, Corynebacterium deserti, Corynebacterium efficiens, Corynebacterium callunae, Corynebacterium stationis, Corynebacterium singulare, Corynebacterium halotolerans, Corynebacterium striatum, Corynebacterium pollutisoli, Corynebacterium imitans, Corynebacterium testudinoris или Corynebacterium flavescens, a также можно использовать без ограничений любые микроорганизмы, относящиеся к роду Corynebacterium.More specifically, the microorganism belonging to the genus Corynebacterium may be Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium crudilactis, Corynebacterium deserti, Corynebacterium efficiens, Corynebacterium callunae, Corynebacterium stationis, Corynebacterium singulare, Corynebacterium halotolerans, Corynebacterium striatum, Corynebacterium pollutisoli, Corynebacterium imitans, Corynebacterium testudinoris or Corynebacterium flavescens, and any microorganisms belonging to the genus Corynebacterium can also be used without limitation.
В описании настоящего изобретения родительский штамм микроорганизма может представлять собой микроорганизм, в котором ген, ослабляющий путь биосинтеза О-ацетилгомосерина или гомосерина, дополнительно инактивирован, или путь биосинтеза О-ацетилгомосерина или гомосерина усилен, чтобы повысить продукцию О-ацетилгомосерина или гомосерина, без ограничений.In the present invention, the parent strain of the microorganism may be a microorganism in which a gene weakening the O-acetylhomoserine or homoserine biosynthesis pathway is further inactivated, or the O-acetylhomoserine or homoserine biosynthesis pathway is enhanced to enhance the production of O-acetylhomoserine or homoserine, without limitation.
В частности, чтобы инактивировать ген, ослабляющий путь биосинтеза О-ацетилгомосерина или гомосерина, может быть, например, ослаблена или инактивирована экспрессия гена metB (SEQ ID NO: 17), кодирующего цистатионин-гшилш-синтазу, вовлеченную в путь деградации О-ацетилгомосерина, или гена metY (SEQ ID NO: 22), кодирующего О-ацетилгомосерин(тиол)-лиазу, вовлеченную в путь деградации О-ацетилгомосерина.In particular, in order to inactivate a gene that weakens the O-acetylhomoserine or homoserine biosynthetic pathway, the expression of the metB gene (SEQ ID NO: 17), encoding cystathionine hexyl synthase involved in the O-acetylhomoserine degradation pathway, can be attenuated or inactivated, for example. or the metY gene (SEQ ID NO: 22), encoding O-acetylhomoserine (thiol)-lyase involved in the O-acetylhomoserine degradation pathway.
Чтобы усилить путь биосинтеза О-ацетилгомосерина или гомосерина, например, можно ввести генетическую мутацию в ген lysC (SEQ ID NO: 27), кодирующий аспартокиназу, либо можно амплифицировать экспрессию гена metX (SEQ ID NO: 32), кодирующего О-ацетилгомосеринтрансферазу.To enhance the O-acetylhomoserine or homoserine biosynthetic pathway, for example, a genetic mutation can be introduced into the lysC gene (SEQ ID NO: 27), encoding aspartokinase, or the expression of the metX gene (SEQ ID NO: 32), encoding O-acetylhomoserine transferase, can be amplified.
Тем не менее данное воплощение не ограничено этим, и способность к продукции О-ацетилгомосерина или гомосерина можно усилить любыми известными способами регуляции экспрессии гена.However, this embodiment is not limited to this, and the ability to produce O-acetylhomoserine or homoserine can be enhanced by any known methods for regulating gene expression.
Используемый в настоящем документе термин «усиление/повышение» представляет собой понятие, включающее повышение активности по сравнению с собственной активностью.As used herein, the term "enhancement" is a concept that includes an increase in activity relative to one's own activity.
Усиление или повышение активности гена может быть достигнуто путем применения различных способов, хорошо известных в данной области техники. Примеры этих способов могут включать по меньшей мере один, выбранный из группы, состоящей из: способа увеличения числа копий гена; способа введения мутации в регуляторную последовательность экспрессии гена; способа замещения регуляторной последовательности экспрессии гена последовательностью, обладающей более сильной активностью; способа дополнительного введения мутации в ген с целью усиления активности гена; способа введения в микроорганизм чужеродного гена; и любой их комбинации, без ограничений.Enhancement or enhancement of gene activity can be achieved by using various methods well known in the art. Examples of these methods may include at least one selected from the group consisting of: a method for increasing the copy number of a gene; a method for introducing a mutation into a gene expression regulatory sequence; a method of replacing a gene expression regulatory sequence with a sequence having stronger activity; a method for additionally introducing a mutation into a gene in order to enhance the activity of the gene; a method of introducing a foreign gene into a microorganism; and any combination thereof, without restrictions.
Используемый в настоящем документе термин «инактивация» белка означает, что активность белка ослаблена по сравнению с собственной активностью, либо что белок не обладает активностью.As used herein, the term “inactivation” of a protein means that the activity of the protein is reduced relative to its own activity, or that the protein has no activity.
Инактивация белка может быть достигнута путем применения различных способов, хорошо известных в данной области техники. Примеры способов могут включать: способ делетирования части или полноразмерного гена, кодирующего белок на хромосоме, включающий удаление активности белка; способ замещения гена, кодирующего белок на хромосоме, мутантным геном для снижения ферментативной активности; способ индукции мутации в регуляторной последовательности экспрессии гена, кодирующего белок на хромосоме; способ замещения регуляторной последовательности экспрессии гена, кодирующего белок, последовательностью, обладающей более слабой активностью или не обладающей активностью (например, способ замещения промотора гена более слабым промотором, чем эндогенный промотор); способ делетирования части или полноразмерного гена, кодирующего белок на хромосоме; способ введения антисмыслового нуклеотида (например, антисенс-РНК), который ингибирует трансляцию с мРНК в белок посредством комплементарного связывания с транскриптом гена на хромосоме; способ создания невозможности присоединения рибосомы за счет формирования вторичной структуры путем искусственного присоединения комплементарной последовательности к последовательности Шайна - Дальгарно (ШД) выше ШД последовательности гена, кодирующего белок; и способ конструирования путем обратной транскрипции (RTE), который присоединяет промотор обратной транскрипции к 3' концу открытой рамки считывания (ОРС) соответствующей последовательности, и их комбинацию, но без конкретных ограничений.Protein inactivation can be achieved by using various methods well known in the art. Examples of methods may include: a method of deleting part or all of a gene encoding a protein on a chromosome, comprising removing the activity of the protein; a method of replacing a gene encoding a protein on a chromosome with a mutant gene to reduce enzymatic activity; a method for inducing a mutation in the expression regulatory sequence of a gene encoding a protein on a chromosome; a method of replacing an expression regulatory sequence of a gene encoding a protein with a sequence having weaker or no activity (for example, a method of replacing a gene promoter with a promoter weaker than an endogenous promoter); a method of deleting a part or full-length gene encoding a protein on a chromosome; a method of introducing an antisense nucleotide (eg, antisense RNA) that inhibits translation from mRNA to protein by complementary binding to a gene transcript on the chromosome; a method for making it impossible to attach a ribosome due to the formation of a secondary structure by artificially attaching a complementary sequence to the Shine-Dalgarno sequence (SD) above the SD sequence of the gene encoding the protein; and a reverse transcription engineering (RTE) method that attaches a reverse transcription promoter to the 3' end of an open reading frame (ORF) of a corresponding sequence, and a combination thereof, but without particular limitation.
В другом аспекте описания настоящего изобретения предложен способ получения целевого продукта, включающий культивирование микроорганизма в культуральной среде, где микроорганизм включает по меньшей мере одно из: варианта белка внутренней мембраны YjeH, включающего i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или iii) замену в обоих положениях i) и ii), в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и обладающего гомологией 95% или более, но менее 100% с SEQ ID NO: 1; полинуклеотида, кодирующего этот вариант; и вектора, кодирующего этот полинуклеотид.In another aspect of the description of the present invention, a method of obtaining the target product is provided, comprising cultivating a microorganism in a culture medium, where the microorganism includes at least one of: a variant of the inner membrane protein YjeH, comprising i) replacing the amino acid corresponding to the 92nd position with asparagine, ii) substitution of the amino acid corresponding to position 351 with leucine, or iii) substitution at both positions i) and ii) in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and having 95% or more but less than 100% homology with SEQ ID NO: 1; a polynucleotide encoding this variant; and a vector encoding this polynucleotide.
SEQ ID NO: 1, белок YjeH внутренней мембраны, его вариант, полинуклеотид, кодирующий этот вариант, вектор, включающий этот полинуклеотид, и включающий их микроорганизм являются такими, как описано выше.SEQ ID NO: 1, inner membrane protein YjeH, a variant thereof, a polynucleotide encoding the variant, a vector including the polynucleotide, and a microorganism including them are as described above.
Целевой продукт может представлять собой О-ацетилгомосерин или гомосерин, но без ограничений.The desired product may be O-acetylhomoserine or homoserine, but is not limited to.
Используемый в настоящем документе термин «культивирование» относится к выращиванию микроорганизма в отрегулированной соответствующим образом окружающей среде. Процесс культивирования по описанию настоящего изобретения можно выполнять в соответствии с подходящей средой и условиями культивирования, известными в данной области техники. Процесс культивирования может быть легко отрегулирован для использования специалистом в данной области техники в соответствии с отбираемым штаммом. Культивирование микроорганизма может быть выполнено в периодическом процессе, непрерывном процессе, периодическом процессе с подпиткой и т.д. без ограничений.As used herein, the term "cultivation" refers to growing a microorganism in an appropriately regulated environment. The culture process described in the present invention can be performed in accordance with suitable media and culture conditions known in the art. The cultivation process can be easily adjusted for use by one skilled in the art according to the strain being selected. The cultivation of the microorganism can be performed in a batch process, a continuous process, a fed-batch process, etc. no limits.
Используемый в настоящем документе термин «культуральная среда» относится к субстанции, в которой смешаны питательные компоненты, требующиеся для культивирования микроорганизма, в качестве основных ингредиентов и дополнены питательными компонентами и факторами роста, а также водой, которые необходимы для выживания и роста. В частности, хотя культуральная среда и другие условия культивирования для выращивания микроорганизма по настоящему изобретению конкретно не ограничены, если культуральная среда широко используется при культивировании микроорганизмов; микроорганизм по описанию настоящего изобретения можно культивировать в обычной среде, содержащей подходящие источники углерода, источники азота, источники фосфора, неорганические соединения, аминокислоты и/или витамины, в аэробных условиях при регуляции температуры, рН и т.д.As used herein, the term “culture medium” refers to a substance in which the nutritional components required for the cultivation of a microorganism are mixed as the main ingredients and supplemented with nutritional components and growth factors, as well as water, which are necessary for survival and growth. In particular, although the culture medium and other cultivation conditions for cultivating the microorganism of the present invention are not particularly limited, if the culture medium is widely used in cultivating microorganisms; the microorganism of the present invention can be cultivated in a conventional medium containing suitable carbon sources, nitrogen sources, phosphorus sources, inorganic compounds, amino acids and/or vitamins, under aerobic conditions under control of temperature, pH, etc.
В описании настоящего изобретения в качестве источников углерода можно использовать углеводы, такие как глюкоза, фруктоза, сахароза и мальтоза; сахарные спирты, такие как маннит и сорбит, органические кислоты, такие как пировиноградная кислота, молочная кислота и лимонная кислота; и аминокислоты, такие как глутаминовая кислота, метионин и лизин. В дополнение к этому можно использовать натуральные органические питательные компоненты, такие как гидролизаты крахмала, мелассы, сырые мелассы, рисовые отруби, маниок съедобный, тростниково-сахарная багасса и кукурузный сироп, и в частности углеводы, такие как глюкоза и предварительно стерильно обработанные мелассы (т.е. мелассы, преобразованные для снижения содержания сахаров), а также можно использовать подходящие количества любых других источников углерода без ограничений. Эти источники углерода можно использовать по отдельности или в виде комбинации по меньшей мере двух из них.In the present invention, carbohydrates such as glucose, fructose, sucrose and maltose can be used as carbon sources; sugar alcohols such as mannitol and sorbitol; organic acids such as pyruvic acid, lactic acid and citric acid; and amino acids such as glutamic acid, methionine and lysine. In addition, natural organic nutritional components such as starch hydrolysates, molasses, raw molasses, rice bran, cassava, cane bagasse and corn syrup can be used, and in particular carbohydrates such as glucose and pre-sterile processed molasses (t i.e. molasses converted to reduce sugar content), and suitable amounts of any other carbon sources may be used without restriction. These carbon sources can be used individually or as a combination of at least two of them.
В качестве источников азота можно использовать неорганические источники азота, такие как аммиак, сульфат аммония, хлорид аммония, ацетат аммония, фосфат аммония, карбонат аммония и нитрат аммония; и органические источники азота, такие как аминокислоты, например глутаминовая кислота, метионин и глутамин, пептон, NZ-амин, мясной экстракт, дрожжевой экстракт, солодовый экстракт, кукурузный сироп, гидролизат казеина, рыба или продукты ее деградации, а также обезжиренный соевый жмых или продукты его деградации. Эти источники азота можно использовать по отдельности или в виде комбинации по меньшей мере двух из них.As nitrogen sources, inorganic nitrogen sources such as ammonia, ammonium sulfate, ammonium chloride, ammonium acetate, ammonium phosphate, ammonium carbonate and ammonium nitrate can be used; and organic nitrogen sources such as amino acids such as glutamic acid, methionine and glutamine, peptone, NZ-amine, meat extract, yeast extract, malt extract, corn syrup, casein hydrolysate, fish or its degradation products, and defatted soybean meal or products of its degradation. These nitrogen sources can be used individually or as a combination of at least two of them.
В качестве источников фосфора можно использовать однозамещенный фосфат калия, двузамещенный фосфат калия или соответствующие им натрийсодержащие соли. В качестве неорганических соединений можно использовать хлорид натрия, хлорид кальция, хлорид железа, сульфат магния, сульфат железа, сульфат марганца, карбонат кальция и т.п. Дополнительно можно также включать аминокислоты, витамины и/или подходящий предшественник. Питательную среду и предшественники можно добавлять в культуральную среду в периодическом или непрерывном процессе без ограничений.As sources of phosphorus, you can use monopotassium phosphate, dipotassium phosphate or their corresponding sodium salts. As inorganic compounds, sodium chloride, calcium chloride, ferric chloride, magnesium sulfate, ferrous sulfate, manganese sulfate, calcium carbonate and the like can be used. Additionally, amino acids, vitamins and/or a suitable precursor may also be included. The nutrient medium and precursors can be added to the culture medium in a batch or continuous process without limitation.
В описании настоящего изобретения в процессе культивирования микроорганизма к культуре можно добавлять соединения, такие как гидроксид аммония, гидроксид калия, аммиак, фосфорная кислота и серная кислота, для доведения рН питательной среды. В процессе культивирования для подавления образования пены можно также добавлять пеногаситель, такой как полигликоле вый эфир жирной кислоты. В дополнение к этому в культуральную среду можно вводить кислород или кислородсодержащий газ для поддержания культуральной среды в аэробном состоянии, а в культуры можно вводить газы азот, водород или диоксид углерода для поддержания анаэробных и микроаэробных условий без введения каких-либо других газов, но воплощение не ограничено этим.In the present invention, during the process of cultivating a microorganism, compounds such as ammonium hydroxide, potassium hydroxide, ammonia, phosphoric acid and sulfuric acid can be added to the culture to adjust the pH of the culture medium. During the culture process, an antifoam agent such as a polyglycol fatty acid ester may also be added to suppress foam formation. In addition, oxygen or an oxygen-containing gas may be introduced into the culture medium to maintain the culture medium in an aerobic state, and nitrogen, hydrogen, or carbon dioxide gases may be introduced into the cultures to maintain anaerobic and microaerobic conditions without introducing any other gases, but the embodiment is not limited to this.
Температуру культуральной среды можно поддерживать при 25°С - 50°С, более конкретно при 30°С - 37°С без ограничений. Культивирование можно продолжать до получения требуемого количества продукта, в частности в течение от 10 часов до 100 часов, без ограничений.The temperature of the culture medium can be maintained at 25°C - 50°C, more particularly at 30°C - 37°C without limitation. Cultivation can be continued until the required amount of product is obtained, in particular for 10 hours to 100 hours, without limitation.
Целевой продукт, полученный в результате культивирования, может экспортироваться в культуральную среду или оставаться в клетках.The target product obtained as a result of cultivation can be exported to the culture medium or remain in the cells.
Способ может дополнительно включать выделение целевого продукта из культуральной среды или микроорганизма.The method may further include isolating the target product from the culture medium or microorganism.
Выделение целевого продукта, полученного на стадии культивирования описания настоящего изобретения, может быть выполнено путем сбора целевого продукта из культуры с использованием любого известного способа, выбранного в соответствии со способом культивирования. Например, можно использовать центрифугирование, фильтрование, анионообменную хроматографию, кристаллизацию и высокоэффективную жидкостную хроматографию (ВЭЖХ), и целевая аминокислота может быть выделена из питательной среды или микроорганизма с использованием любого подходящего способа в данной области техники без ограничений. Культура может также называться культуральной жидкостью.Isolation of the target product obtained in the cultivation step of the present invention can be accomplished by collecting the target product from the culture using any known method selected in accordance with the cultivation method. For example, centrifugation, filtration, anion exchange chromatography, crystallization and high performance liquid chromatography (HPLC) can be used, and the target amino acid can be isolated from the culture medium or microorganism using any suitable method in the art without limitation. The culture may also be called culture fluid.
Стадия выделения может также включать процесс очистки, который может быть выполнен с использованием подходящего способа, хорошо известного в данной области техники. Таким образом, выделенный целевой продукт может быть очищен из ферментационного бульона микроорганизма, включающего целевой продукт (Introduction to Biotechnology and Genetic Engineering, A.J. Nair., 2008).The isolation step may also include a purification process, which can be performed using a suitable method well known in the art. Thus, the isolated target product can be purified from the fermentation broth of the microorganism containing the target product (Introduction to Biotechnology and Genetic Engineering, A.J. Nair., 2008).
В другом аспекте описания настоящего изобретения предложен способ получения метионина, включающий: получение О-ацетилгомосерина путем культивирования микроорганизма в культуральной среде; и превращения О-ацетилгомосерина в метионин путем взаимодействия О-ацетилгомосерина с сульфидом, где микроорганизм включает по меньшей мере одно из: варианта белка внутренней мембраны YjeH, включающего i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или iii) замену в обоих положениях i) и ii), в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и обладающего гомологией 95% или более, но менее 100% с SEQ ID NO: 1; полинуклеотида, кодирующего этот вариант; и вектора, кодирующего этот полинуклеотид.In another aspect of the present invention, there is provided a method for producing methionine, comprising: producing O-acetylhomoserine by cultivating a microorganism in a culture medium; and converting O-acetylhomoserine to methionine by reacting O-acetylhomoserine with a sulfide, wherein the microorganism comprises at least one of: a variant of the inner membrane protein YjeH, comprising i) replacing the amino acid corresponding to position 92 with asparagine, ii) replacing the amino acid corresponding to the 351st position, leucine, or iii) a substitution at both positions i) and ii) in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and having 95% or more but less than 100% homology with SEQ ID NO: 1; a polynucleotide encoding this variant; and a vector encoding this polynucleotide.
SEQ ID NO: 1, белок YjeH внутренней мембраны, его вариант, полинуклеотид, кодирующий этот вариант, вектор, включающий этот полинуклеотид, включающий их микроорганизм и О-ацетилгомосерин являются такими, как описано выше.SEQ ID NO: 1, inner membrane protein YjeH, a variant thereof, a polynucleotide encoding the variant, a vector including the polynucleotide, a microorganism including them, and O-acetylhomoserine are as described above.
В описании настоящего изобретения О-ацетилгомосерин в качестве предшественника метионина может быть превращен в метионин посредством взаимодействия с сульфидом.In the present invention, O-acetyl homoserine as a methionine precursor can be converted to methionine by reaction with sulfide.
Взаимодействие с сульфидом относится к процессу образования L-метионина из О-сукцинилгомосерина с использованием любого известного способа. Например, L-метионин может быть получен путем взаимодействия метил меркаптана в качестве сульфида с О-ацетилгомосерином. В дополнение к этому можно добавлять катализатор или фермент или проводить реакцию в микроорганизме, включающем фермент, для повышения скорости реакции и повышения выхода.Sulfide reaction refers to the process of forming L-methionine from O-succinylhomoserine using any known method. For example, L-methionine can be prepared by reacting methyl mercaptan as a sulfide with O-acetylhomoserine. In addition, a catalyst or enzyme can be added or the reaction carried out in a microorganism containing the enzyme to increase the reaction rate and yield.
«Сульфид» может представлять собой, например, метилмеркаптан, и метилмеркаптан может представлять собой любые производные метилмеркаптана, способные обеспечивать атомы серы, такие как диметилсульфид (ДМС), раскрытые в международной публикации WO 2010/098629), а также натрия метилмеркаптан (CH3S-Na) в жидкой фазе и метилмеркаптан (CH3SH) в газообразном или жидком состоянии."Sulfide" may be, for example, methyl mercaptan, and methyl mercaptan may be any methyl mercaptan derivatives capable of providing sulfur atoms, such as dimethyl sulfide (DMS), disclosed in international publication WO 2010/098629), as well as sodium methyl mercaptan (CH 3 S -Na) in the liquid phase and methyl mercaptan (CH 3 SH) in the gaseous or liquid state.
В качестве фермента, используемого в реакции превращения метионина, можно использовать цистатионин-γ-синтазу, О-ацетилгомосерин-сульфгидрилазу или О-сукцинилгомосерин-сульфгидрилазу, которые известны в данной области техники.As the enzyme used in the methionine conversion reaction, cystathionine-γ-synthase, O-acetylhomoserine sulfhydrylase or O-succinylhomoserine sulfhydrylase, which are known in the art, can be used.
Процесс реакции превращения метионина может быть выражен следующей схемой реакции:The methionine conversion reaction process can be expressed by the following reaction scheme:
О-ацетил-L-гомосерин+CH3SH↔L-метионин+ацетатO-acetyl-L-homoserine+CH 3 SH↔L-methionine+acetate
В этой реакции остаток CH3S метилмеркаптана замещается остатком ацетата О-ацетилгомосерина с получением L-метионина.In this reaction, the CH 3 S residue of methyl mercaptan is replaced by an O-acetylhomoserine acetate residue to produce L-methionine.
Эту реакцию можно проводить при температуре от 20°С до 45°С, при этом поддерживая рН реакционной смеси в диапазоне от 6 до 7, и можно добавлять пиридоксаль-5'-фосфат в качестве кофермента.This reaction can be carried out at a temperature of from 20°C to 45°C, while maintaining the pH of the reaction mixture in the range of 6 to 7, and pyridoxal 5'-phosphate can be added as a coenzyme.
Превращение предшественника L-метионина в L-метионин в присутствии метилмеркаптана является ферментативной реакцией и раскрыто в международной публикации № WO 2008/013432. В международной публикации № WO 2008/013432 представлено подробное описание свойств и получения метионинпревращающих ферментов, обладающих соответствующей активностью для превращения предшественника L-метионина в L-метионин в присутствии метилмеркаптана. Такой подходящий метионинпревращающий фермент можно получить биотехнологическими методами, используя экспрессию гена.The conversion of the L-methionine precursor to L-methionine in the presence of methyl mercaptan is an enzymatic reaction and is disclosed in International Publication No. WO 2008/013432. International Publication No. WO 2008/013432 provides a detailed description of the properties and preparation of methionine converting enzymes having the appropriate activity to convert the L-methionine precursor to L-methionine in the presence of methyl mercaptan. Such a suitable methionine converting enzyme can be produced biotechnologically using gene expression.
Последовательность гена, кодирующего фермент, обладающий метионинпревращающей активностью, может быть получен, но без ограничений, из базы данных NCBI (США) и банка данных ДНК (KEGG, Япония). Для биологического превращения ген можно клонировать из полученной последовательности гена, а затем вводить в экспрессионный вектор. В частности, ген может экспрессироваться в активной форме с вектора pCL-CJI (CJ, Корея), который представляет собой экспрессионный вектор Е. coli в рекомбинантных штаммах, а экспрессированный белок может быть получен из раствора фермента, в котором лизируют клетки, обработанные ультразвуком. И штамм, экспрессирующий метионинпревращающий фермент, и экспрессированный метионинпревращающий фермент можно непосредственно использовать в реакции превращения метионина.The sequence of the gene encoding the enzyme having methionine-converting activity can be obtained, but without limitation, from the NCBI database (USA) and the DNA data bank (KEGG, Japan). For biological conversion, the gene can be cloned from the resulting gene sequence and then introduced into an expression vector. In particular, the gene can be expressed in active form from the vector pCL-CJI (CJ, Korea), which is an expression vector for E. coli in recombinant strains, and the expressed protein can be obtained from an enzyme solution in which sonicated cells are lysed. Both the strain expressing the methionine converting enzyme and the expressed methionine converting enzyme can be directly used in the methionine conversion reaction.
Для инициации реакции метионинпревращающий фермент, экспрессируемый с гена или из экспрессирующего его штамма микроорганизма, можно непосредственно, частично или полностью смешивать с супернатантом ферментации или с ферментационным бульоном, в котором накапливается L-метионин. Таким образом, реакцию можно инициировать путем добавления метионинпревращающего фермента или экспрессирующего его штамма микроорганизма в ферментационный раствор, в котором накапливается О-ацетилгомосерин, и добавления к нему метилмеркаптана.To initiate the reaction, the methionine-converting enzyme expressed from the gene or from the strain of microorganism expressing it can be mixed directly, partially or completely, with the fermentation supernatant or with the fermentation broth in which L-methionine accumulates. Thus, the reaction can be initiated by adding a methionine-converting enzyme or a strain of microorganism expressing it to the fermentation solution in which O-acetylhomoserine accumulates and adding methyl mercaptan thereto.
В частности, О-ацетилгомосерин, который накапливается в ферментационном растворе, может превращаться в L-метионин под действием цистатионин-γ-синтазы, О-ацетилгомосеринсульфгидрилазы или О-сукцинилгомосеринсульфгидрилазы.In particular, O-acetylhomoserine, which accumulates in the fermentation solution, can be converted to L-methionine by cystathionine-γ-synthase, O-acetylhomoserine sulfhydrylase or O-succinylhomoserine sulfhydrylase.
Реакция превращения в метионин может быть подтверждена с использованием DTNB (5,5-дитиобис(2-нитробензойная кислота), Sigma, США), и продукт реакции можно анализировать методом ВЭЖХ. В процессе реакции превращения в метионин можно дополнительно получить побочные продукты, такие как уксусная кислота, без отдельного процесса производства, посредством взаимодействия между метилмеркаптаном и О-ацетилгомосерином.The conversion reaction to methionine can be confirmed using DTNB (5,5-dithiobis(2-nitrobenzoic acid), Sigma, USA) and the reaction product can be analyzed by HPLC. The conversion reaction to methionine can further produce by-products such as acetic acid without a separate production process, through the reaction between methyl mercaptan and O-acetylhomoserine.
Ферментативная реакция между предшественником L-метионина и метилмеркаптаном может быть представлена следующей схемой реакции:The enzymatic reaction between the L-methionine precursor and methyl mercaptan can be represented by the following reaction scheme:
Способ получения метионина может легко определить обычный специалист в данной области техники при условии известных оптимальных условий культивирования и условий активации фермента. Конкретные условия и среды для культивирования являются такими, как определено выше.The method for producing methionine can be easily determined by one of ordinary skill in the art, provided the optimal culture conditions and enzyme activation conditions are known. The specific conditions and media for cultivation are as defined above.
В другом аспекте описания настоящего изобретения предложен способ получения глюфосината, включающий получение О-ацетилгомосерина или гомосерина путем культивирования микроорганизма в культуральной среде и превращения О-ацетилгомосерина или гомосерина в глюфосинат, где микроорганизм включает по меньшей мере одно из: варианта белка внутренней мембраны YjeH, включающего i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или iii) замену в обоих положениях i) и ii), в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и обладающего гомологией 95% или более, но менее 100% с SEQ ID NO: 1; полинуклеотида, кодирующего этот вариант; и вектора, кодирующего этот полинуклеотид.In another aspect of the present invention, there is provided a method for producing glufosinate, comprising producing O-acetylhomoserine or homoserine by cultivating a microorganism in a culture medium and converting O-acetylhomoserine or homoserine to glufosinate, wherein the microorganism comprises at least one of: a variant of the inner membrane protein YjeH, comprising i) replacing the amino acid corresponding to position 92 with asparagine, ii) replacing the amino acid corresponding to position 351 with leucine, or iii) replacing at both positions i) and ii), in the amino acid sequence SEQ ID NO: 1, and having homology of 95% or more but less than 100% with SEQ ID NO: 1; a polynucleotide encoding this variant; and a vector encoding this polynucleotide.
SEQ ID NO: 1, белок YjeH внутренней мембраны, его вариант, полинуклеотид, кодирующий этот вариант, вектор, включающий этот полинуклеотид, включающий их микроорганизм и гомосерин являются такими, как описано выше.SEQ ID NO: 1, inner membrane protein YjeH, a variant thereof, a polynucleotide encoding the variant, a vector including the polynucleotide, the microorganism including them, and homoserine are as described above.
Используемый в настоящем документе термин «глюфосинат» относится к широкому ряду натуральных гербицидов, продуцируемых несколькими видами почвенных бактерий Streptomyces, и также известен под названием «фосфинотрицин».As used herein, the term “glufosinate” refers to a wide range of natural herbicides produced by several species of soil bacteria Streptomyces and is also known as “phosphinothricin”.
В описании настоящего изобретения О-ацетилгомосерин или гомосерин можно превращать в глюфосинат посредством множества стадий, включая галогенирование.In the present invention, O-acetylhomoserine or homoserine can be converted to glufosinate through a variety of steps, including halogenation.
Реакция превращения в глюфосинат раскрыта, например, в CN 108516991 А. В частности, реакция превращения в глюкосинат может включать: (1) стадию выполнения азеотропной дегидратации гомосерина (формула II) с использованием органического растворителя в присутствии кислотного катализатора; и стадию добавления галогенирующего агента к азеотропно дегидратированному гомосерину и выполнения галогенирования с получением L-3,6-бис(2-галогенэтил)-2,5-дионпиперазина (формула III); (2) стадию добавления диэфира или метилфосфитного диэфира метилфосфиновой кислоты к L-3,6-бис(2-галогеноэтил)-2,5-дионпиперазину и выполнения реакции Аббова (Abbov) с использованием растворителя с высокой температурой кипения в присутствии катализатора с получением соединения формулы IV; и (3) стадию выполнения реакции гидролиза путем растворения соединения формулы IV в кислоте и нагревания раствора, удаления растворителя после завершения реакции, добавления к нему спирта и выполнения реакции превращения путем добавления к ней алкиленоксида с получением глюфосината (формула I).The conversion reaction to glufosinate is disclosed, for example, in CN 108516991 A. In particular, the conversion reaction to glucosinate may include: (1) the step of performing azeotropic dehydration of homoserine (Formula II) using an organic solvent in the presence of an acid catalyst; and the step of adding a halogenating agent to the azeotropically dehydrated homoserine and performing halogenation to obtain L-3,6-bis(2-haloethyl)-2,5-dionepiperazine (Formula III); (2) the step of adding diester or methyl phosphite diester of methyl phosphinic acid to L-3,6-bis(2-haloethyl)-2,5-dionepiperazine and performing an Abbov reaction using a high boiling point solvent in the presence of a catalyst to obtain a compound formula IV; and (3) the step of performing a hydrolysis reaction by dissolving a compound of formula IV in an acid and heating the solution, removing the solvent after completion of the reaction, adding an alcohol thereto, and performing a conversion reaction by adding an alkylene oxide thereto to produce glufosinate (formula I).
Реакция превращения в глюфосинат с использованием гомосерина в качестве предшественника может быть представлена с помощью следующей схемы:The conversion reaction to glufosinate using homoserine as a precursor can be represented using the following scheme:
Способ получения глюфосината может быть выполнен с использованием гомосерина, полученного путем биологической ферментации, в качестве предшественника согласно описанию настоящего изобретения. Глюфосинат может быть получен посредством получения L-3,6-бис(2-галогенэтил)-2,5-дионпиперазина взаимодействием с метилфосфонием путем азеотропной дегидратации и галогенирования, выполнения реакции Аббова, а затем выполнения реакции гидролиза, как описано выше.The method for producing glufosinate can be carried out using homoserine obtained by biological fermentation as a precursor as described in the present invention. Glufosinate can be prepared by preparing L-3,6-bis(2-haloethyl)-2,5-dionepiperazine by reacting with methylphosphonium by azeotropic dehydration and halogenation, performing the Abbow reaction, and then performing the hydrolysis reaction as described above.
В другом аспекте описания настоящего изобретения предложена композиция для получения гомосерина, включающая микроорганизм или культуру микроорганизма в культуральной среде, где микроорганизм включает по меньшей мере одно из: варианта белка внутренней мембраны YjeH, включающего i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или iii) замену в обоих положениях i) и ii), в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и обладающего гомологией 95% или более, но менее 100% с SEQ ID NO: 1; полинуклеотида, кодирующего этот вариант; и вектора, кодирующего этот полинуклеотид.In another aspect of the present invention, a composition for producing homoserine is provided, comprising a microorganism or a culture of a microorganism in a culture medium, wherein the microorganism comprises at least one of: a variant of the inner membrane protein YjeH, comprising i) replacing the amino acid corresponding to position 92 with asparagine, ii) substitution of the amino acid corresponding to position 351 with leucine, or iii) substitution at both positions i) and ii), in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and having 95% or more but less than 100% homology with SEQ ID NO: 1; a polynucleotide encoding this variant; and a vector encoding this polynucleotide.
В другом аспекте описания настоящего изобретения предложена композиция для получения О-ацетилгомосерина, включающая микроорганизм или культуру микроорганизма в культуральной среде, где микроорганизм включает по меньшей мере одно из: варианта белка внутренней мембраны YjeH, включающего i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или iii) замену в обоих положениях i) и ii), в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и обладающий гомологией 95% или более, но менее 100% с SEQ ID NO: 1; полинуклеотида, кодирующего этот вариант; и вектора, кодирующего этот полинуклеотид.In another aspect of the present invention, a composition for producing O-acetylhomoserine is provided, comprising a microorganism or a culture of a microorganism in a culture medium, wherein the microorganism comprises at least one of: a variant of the inner membrane protein YjeH, comprising i) an amino acid substitution corresponding to the 92nd position, asparagine, ii) substitution of the amino acid corresponding to position 351 with leucine, or iii) substitution at both positions i) and ii), in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and having 95% or more but less than 100% homology with SEQ ID NO: 1; a polynucleotide encoding this variant; and a vector encoding this polynucleotide.
SEQ ID NO: 1, белок YjeH внутренней мембраны, его вариант, полинуклеотид, кодирующий этот вариант, вектор, включающий этот полинуклеотид, включающий их микроорганизм, гомосерин и О-ацетилгомосерин являются такими, как описано выше.SEQ ID NO: 1, inner membrane protein YjeH, a variant thereof, a polynucleotide encoding the variant, a vector including the polynucleotide including the microorganism thereof, homoserine and O-acetylhomoserine are as described above.
Композиция для получения О-ацетилгомосерина или гомосерина может относиться к композиции, используемой для продукции О-ацетилгомосерина или гомосерина вариантом белка YjeH внутренней мембраны по описанию настоящего изобретения. Эта композиция может включать вариант белка YjeH внутренней мембраны или компонент, способный выполнять функцию белка YjeH внутренней мембраны без ограничений. Вариант белка YjeH внутренней мембраны может находиться в форме вставки в вектор, способный к экспрессии функционально связанного с ним гена в клетке-хозяине.The composition for producing O-acetylhomoserine or homoserine may refer to the composition used for producing O-acetylhomoserine or homoserine by the inner membrane protein YjeH variant described in the present invention. This composition may include a variant of the inner membrane protein YjeH or a component capable of performing the function of the inner membrane protein YjeH without limitation. The inner membrane protein YjeH variant may be in the form of an insert into a vector capable of expressing a functionally related gene in a host cell.
Композиция может дополнительно включать криопротектор или эксципиент. Криопротектор или эксципиент может представлять собой природное или не встречающееся в природе вещество, но без ограничений. В другом примере криопротектор или эксципиент может представлять собой вещество, с которым микроорганизм не вступает в контакт в природе и которое в природе не включено в этот микроорганизм, но без ограничений.The composition may further include a cryoprotectant or excipient. The cryoprotectant or excipient may be a natural or non-naturally occurring substance, but is not limited to. In another example, the cryoprotectant or excipient may be a substance that the microorganism does not naturally come into contact with and that is not naturally included in the microorganism, but is not limited to.
В другом аспекте описания настоящего изобретения предложено применение варианта белка YjeH внутренней мембраны для продукции О-ацетилгомосерина или гомосерина.Another aspect of the present invention provides the use of a variant of the inner membrane protein YjeH to produce O-acetylhomoserine or homoserine.
В другом аспекте описания настоящего изобретения предложено применение микроорганизма для получения О-ацетилгомосерина или гомосерина, где микроорганизм включает по меньшей мере одно из: варианта белка внутренней мембраны YjeH, включающего i) замену аминокислоты, соответствующей 92-му положению, аспарагином, ii) замену аминокислоты, соответствующей 351-му положению, лейцином, или iii) замену в обоих положениях i) и ii), в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и обладающего гомологией 95% или более, но менее 100% с SEQ ID NO: 1; полинуклеотида, кодирующего этот вариант; и вектора, кодирующего этот полинуклеотид.Another aspect of the present invention provides the use of a microorganism to produce O-acetylhomoserine or homoserine, wherein the microorganism comprises at least one of: a variant of the inner membrane protein YjeH, comprising i) replacing the amino acid corresponding to position 92 with asparagine, ii) replacing the amino acid corresponding to position 351, leucine, or iii) a substitution at both positions i) and ii) in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and having 95% or more but less than 100% homology with SEQ ID NO: 1; a polynucleotide encoding this variant; and a vector encoding this polynucleotide.
Гомосерин, О-ацетилгомосерин, белок YjeH внутренней мембраны, его вариант, полинуклеотид, кодирующий этот вариант, вектор, включающий этот полинуклеотид, и включающий их микроорганизм являются такими, как описано выше.Homoserine, O-acetylhomoserine, inner membrane protein YjeH, a variant thereof, a polynucleotide encoding the variant, a vector including the polynucleotide, and a microorganism including them are as described above.
Способ осуществления изобретенияMethod for carrying out the invention
Далее описание настоящего изобретения будет приведено более подробно со ссылкой на следующие примеры. Тем не менее следующие примеры представлены исключительно для иллюстрации описания настоящего изобретения, и объем описания настоящего изобретения не ограничен ими.The present invention will now be described in more detail with reference to the following examples. However, the following examples are presented solely to illustrate the description of the present invention, and the scope of the description of the present invention is not limited to them.
Пример 1: Конструирование плазмидыExample 1: Plasmid Construction
Плазмида (pDCM2, ФИГ. 1, SEQ ID NO: 37) была разработана для встраивания в хромосому Corynebacterium и замещения гена на ней и синтезирована при использовании службы синтеза генов компании Bionics Co., Ltd. Плазмида была разработана таким образом, что содержала фермент рестрикции, эффективный для клонирования, со ссылкой на статью, относящуюся к системе sacB, общеизвестной в данной области техники (Gene, 145 (1994) 69-73). Синтезированная плазмида pDCM2 обладает следующими характеристиками.The plasmid (pDCM2, FIG. 1, SEQ ID NO: 37) was designed to insert into and replace a gene on the Corynebacterium chromosome and was synthesized using the gene synthesis service of Bionics Co., Ltd. The plasmid was designed to contain a restriction enzyme efficient for cloning, with reference to an article relating to the sacB system, well known in the art (Gene, 145 (1994) 69-73). The synthesized plasmid pDCM2 has the following characteristics.
1) В связи с тем, что точка начала репликации активна только в Е. coli, плазмида самостоятельно реплицируется только в Е. coli и не может самостоятельно реплицироваться в Corynebacterium.1) Due to the fact that the origin of replication is active only in E. coli, the plasmid independently replicates only in E. coli and cannot independently replicate in Corynebacterium.
2) Плазмида содержит ген устойчивости к канамицину в качестве селективного маркера.2) The plasmid contains the kanamycin resistance gene as a selective marker.
3) Плазмида содержит ген левансукразы (sacB) в качестве вторичного положительного селективного маркера.3) The plasmid contains the levansucrase gene (sacB) as a secondary positive selection marker.
4) В окончательно полученном штамме не сохраняется генетической информации, имеющей происхождение из плазмиды pDCM2.4) The final strain obtained does not retain genetic information originating from the pDCM2 plasmid.
Пример 2: Конструирование штаммов с введенным вариантом экзогенного мембранного белка (YjeH) и оценка способности к продукции О-ацетилгомосерина и гомосеринаExample 2: Construction of strains with an introduced variant of an exogenous membrane protein (YjeH) and assessment of the ability to produce O-acetylhomoserine and homoserine
2-1. Конструирование штаммов с введенным экзогенным мембранным белком (YjeH) и вариантом YjeH2-1. Construction of strains with introduced exogenous membrane protein (YjeH) and YjeH variant
В целях оценки эффективности YjeH, который введен в Corynebacterium glutamicum АТСС13032 в качестве экзогенного мембранного белка и О-ацетилгомосерин-экспортирующего белка был получен вектор для встраивания в хромосому, включающий ген yjeH (SEQ ID NO: 2) кодирующий YjeH, имеющий происхождение из E. coli.In order to evaluate the effectiveness of YjeH, which was introduced into Corynebacterium glutamicum ATCC13032 as an exogenous membrane protein and an O-acetylhomoserine exporting protein, a chromosomal insertion vector was obtained that included the yjeH gene (SEQ ID NO: 2) encoding YjeH originating from E. coli
В частности, в целях конструирования вектора с делецией транспозазы были разработаны пара праймеров (SEQ ID NO: 4 и 5) для амплификации 5' вышележащей области и пара праймеров (SEQ ID NO: 6 и 7) для амплификации 3' нижележащей области по отношению к гену, кодирующему транспозазу (SEQ ID NO: 3, № гена NCg12335). Праймеры SEQ ID NO: 5 и 6 были разработаны так, что они пересекались друг с другом. В этой области была локализована последовательность фермента рестрикции SmaI. Последовательности праймеров представлены в таблице 1 ниже.Specifically, in order to construct a transposase deletion vector, a pair of primers (SEQ ID NO: 4 and 5) were designed to amplify the 5' upstream region and a pair of primers (SEQ ID NO: 6 and 7) to amplify the 3' downstream region of the gene encoding the transposase (SEQ ID NO: 3, Gene No. NCg12335). Primers SEQ ID NO: 5 and 6 were designed to overlap each other. The restriction enzyme sequence SmaI was localized in this region. The primer sequences are presented in Table 1 below.
ПЦР выполняли с использованием хромосомы дикого типа (WT) АТСС13032 в качестве матрицы и праймеров SEQ ID NO: 4 и 5 и SEQ ID NO: 6 и 7. ПЦР выполняли в следующих условиях. После денатурации при 95°С в течение 5 минут повторяли 30 циклов денатурации при 95°С в течение 30 секунд, отжига при 55°С в течение 30 секунд и полимеризации при 72°С в течение 30 секунд, а затем выполняли полимеризацию при 72°С в течение 7 минут. В результате получили фрагменты ДНК: 851 п. о. 5' вышележащей области и 847 п. о. 3' нижележащей области по отношению к области делеции гена NCg12335.PCR was performed using wild type (WT) chromosome ATCC13032 as template and primers SEQ ID NO: 4 and 5 and SEQ ID NO: 6 and 7. PCR was performed under the following conditions. After denaturation at 95°C for 5 minutes, 30 cycles of denaturation at 95°C for 30 seconds, annealing at 55°C for 30 seconds, and polymerization at 72°C for 30 seconds were repeated, followed by polymerization at 72°C. C for 7 minutes. As a result, DNA fragments were obtained: 851 bp. 5' of the overlying region and 847 bp. 3' downstream of the deletion region of the NCg12335 gene.
ПЦР выполняли с использованием двух амплифицированных фрагментов ДНК в качестве матриц и праймеров SEQ ID NO: 4 и 7. ПЦР выполняли в следующих условиях. После денатурации при 95°С в течение 5 минут повторяли 30 циклов денатурации при 95°С в течение 30 секунд, отжига при 55°С в течение 30 секунд и полимеризации при 72°С в течение 90 секунд, а затем выполняли полимеризацию при 72°С в течение 7 минут. В результате были амплифицированы фрагмент ДНК 1648 п. о., включающий область, способную делетировать ген, кодирующий транспозазу (SEQ ID NO: 3, № ген NCg12335).PCR was performed using two amplified DNA fragments as templates and primers SEQ ID NO: 4 and 7. PCR was performed under the following conditions. After denaturation at 95°C for 5 minutes, 30 cycles of denaturation at 95°C for 30 seconds, annealing at 55°C for 30 seconds, and polymerization at 72°C for 90 seconds were repeated, followed by polymerization at 72°C. C for 7 minutes. As a result, a DNA fragment of 1648 bp was amplified, including a region capable of deleting the gene encoding transposase (SEQ ID NO: 3, gene no. NCg12335).
Полученные продукты ПЦР клонировали путем слияния, используя вектор pDCM2, обработанный ферментом рестрикции SmaI, и набор реактивов для клонирования In-Fusion® HD Cloning Kit (Clontech). E. coli DH5α трансформировали клонированным вектором, и трансформированные Е. coli высевали методом мазка на твердую среду Лурия-Бертани (LB), содержащую канамицин (25 мг/л). Колонии, трансформированные плазмидой со вставкой целевого гена, отбирали с помощью ПЦР и получили плазмиду с использованием метода экстракции плазмиды. Наконец, был сконструирован рекомбинантный вектор pDCM2-ΔNCg12335, включающий клонированную кассету делеции NCg12335.The resulting PCR products were cloned by fusion using the SmaI restriction enzyme-treated pDCM2 vector and the In-Fusion® HD Cloning Kit (Clontech). E. coli DH5α was transformed with the cloned vector, and the transformed E. coli were smeared onto solid Luria-Bertani (LB) medium containing kanamycin (25 mg/L). Colonies transformed with the plasmid with the insertion of the target gene were selected by PCR and the plasmid was obtained using the plasmid extraction method. Finally, the recombinant vector pDCM2-ΔNCg12335 was constructed, including the cloned NCg12335 deletion cassette.
В целях оценки эффективности О-ацетилхолин-экспортирующего белка был разработан вектор для вставки в хромосому, включающий ген (SEQ ID NO: 2), кодирующий YjeH, имеющий происхождение из Е. coli. С этой целью был сконструирован вектор, экспрессирующий ген yjeH, с использованием промотора CJ7 (SEQ ID NO: 8, US 7662943 В2). Были разработаны пара праймеров (SEQ ID NO: 9 и 10) для амплификации промоторной области CJ7 и пара праймеров (SEQ ID NO: 11 и 12) для амплицикации области yjeH Е. coli. Последовательности праймеров представлены в таблице 2 ниже.In order to evaluate the effectiveness of the O-acetylcholine export protein, a chromosomal insertion vector containing the gene (SEQ ID NO: 2) encoding YjeH, which is derived from E. coli, was developed. For this purpose, a vector expressing the yjeH gene was constructed using the CJ7 promoter (SEQ ID NO: 8, US 7662943 B2). A pair of primers (SEQ ID NOs: 9 and 10) to amplify the CJ7 promoter region and a pair of primers (SEQ ID NOs: 11 and 12) to amplify the yjeH region of E. coli were designed. The primer sequences are presented in Table 2 below.
ПЦР выполняли с использованием pECCG117-PCJ7-gfp (US 7662943 В2) в качестве матрицы и праймеров SEQ ID NO: 9 и 10, а также выполняли ПЦР с использованием хромосомы дикого типа Е. coli в качестве матрицы и праймеров SEQ ID NO: 11 и 12 соответственно. ПЦР выполняли в следующих условиях. После денатурации при 95°С в течение 5 минут повторяли 30 циклов денатурации при 95°С в течение 30 секунд, отжига при 55°С в течение 30 секунд и полимеризации при 72°С в течение 90 секунд, а затем выполняли полимеризации при 72°С в течение 7 минут. В результате получили фрагмент ДНК 360 п. о. промоторной области CJ7 и фрагмент ДНК 1297 п. о. гена yjeН E. coli.PCR was performed using pECCG117-PCJ7-gfp (US 7662943 B2) as a template and primers SEQ ID NO: 9 and 10, and PCR was also performed using the E. coli wild type chromosome as a template and primers SEQ ID NO: 11 and 12 respectively. PCR was performed under the following conditions. After denaturation at 95°C for 5 minutes, 30 cycles of denaturation at 95°C for 30 seconds, annealing at 55°C for 30 seconds, and polymerization at 72°C for 90 seconds were repeated, followed by polymerizations at 72°C. C for 7 minutes. As a result, a DNA fragment of 360 bp was obtained. promoter region of CJ7 and a DNA fragment of 1297 bp. yjeH gene of E. coli.
ПЦР выполняли с использованием двух амплифицированных фрагментов ДНК в качестве матриц и праймеров SEQ ID NO: 9 и 12. ПЦР выполняли в следующих условиях. После денатурации при 95°С в течение 5 минут повторяли 30 циклов денатурации при 95°С в течение 30 секунд, отжига при 55°С в течение 30 секунд и полимеризации при 72°С в течение 90 секунд, а затем выполняли полимеризацию при 72°С в течение 7 минут. В результате были амплицифированы фрагмент ДНК 1614 п.о., включающий область, в которой находились вставки промотора CJ7 и гена. yjeH.PCR was performed using two amplified DNA fragments as templates and primers SEQ ID NO: 9 and 12. PCR was performed under the following conditions. After denaturation at 95°C for 5 minutes, 30 cycles of denaturation at 95°C for 30 seconds, annealing at 55°C for 30 seconds, and polymerization at 72°C for 90 seconds were repeated, followed by polymerization at 72°C. C for 7 minutes. As a result, a 1614 bp DNA fragment was amplified, including the region in which the CJ7 promoter and gene inserts were located. yjeH.
Фрагмент ДНК с делецией гена, полученный с помощью ПЦР, клонировали в векторе pDCM2-ΔNCg12335, обработанном ферментом рестрикции SmaI, с использованием набора реактивов In-Fusion® HD Cloning Kit (Clontech). Был окончательно сконструирован рекомбинантный вектор pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT).The gene deletion DNA fragment obtained by PCR was cloned into the pDCM2-ΔNCg12335 vector treated with the restriction enzyme SmaI using the In-Fusion® HD Cloning Kit (Clontech). The recombinant vector pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT) was finally constructed.
В частности, фенилаланин (Phe), который представляет собой 92-ю аминокислоту аминокислотной последовательности YjeH, был заменен аспарагином (Asn) (F92N), используя плазмиду pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT) в качестве матрицы и праймеры SEQ ID NO: 13 и 14. Сконструированная плазмида, включающая ген, кодирующий вариант YjeH (F92N), была названа pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N).Specifically, phenylalanine (Phe), which is the 92nd amino acid of the amino acid sequence of YjeH, was replaced by asparagine (Asn) (F92N) using plasmid pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT) as template and primers SEQ ID NOs: 13 and 14. The constructed plasmid including the gene encoding the YjeH variant (F92N) was named pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N).
Фенилаланин (Phe), который представляет собой 351-ю аминокислоту аминокислотной последовательности YjeH, был заменен лейцином (F351L) с использованием плазмиды pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT) в качестве матрицы и праймеров SEQ ID NO: 15 и 16. Сконструированная плазмида, включающая ген, кодирующий вариант YjeH (F351L), была названа pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L). Последовательности праймеров представлены в таблице 3 ниже.Phenylalanine (Phe), which is the 351st amino acid of the YjeH amino acid sequence, was replaced with leucine (F351L) using plasmid pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT) as template and primers SEQ ID NO: 15 and 16 The constructed plasmid including the gene encoding the YjeH variant (F351L) was named pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L). The primer sequences are presented in Table 3 below.
Штамм АТСС13032 трансформировали каждой из конструкций pDCM2-ΔNCg12335, pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) и pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L) с использованием электроимпульсного метода и подвергали процессу вторичного кроссинговера с получением АТСС13032 ΔNCg12335, АТСС13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), ATCC13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) и ATCC13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L), в которых ген NCg12335 был делетирован из хромосомы. Вставку инактивированного гена NCg12335 и вновь введенного гена Е. coli yjeH идентифицировали путем выполнения ПЦР с использованием праймеров SEQ ID NO: 4 и 7 и сравнения результатов с результатами для АТСС13032, в котором ген NCg12335 не был инактивирован.Strain ATCC13032 was transformed with each of the constructs pDCM2-ΔNCg12335, pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) and pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L ) using the electric pulse method and subjected to a secondary crossing over process to obtain ATCC13032 ΔNCg12335, ATCC13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), ATCC13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) and ATCC13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco , F351L), in which the NCg12335 gene was deleted from the chromosome. The insertion of the inactivated NCg12335 gene and the newly introduced E. coli yjeH gene was identified by performing PCR using primers SEQ ID NOs: 4 and 7 and comparing the results with those for ATCC13032, in which the NCg12335 gene was not inactivated.
2-2. Оценка способности к продукции О-ацетилгомосерина2-2. Assessment of the ability to produce O-acetylhomoserine
В целях сравнения О-ацетилгомосерин (О-АН)-продуцирующей способности АТСС13032 ΔNCg12335, АТСС13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), ATCC13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) и ATCC13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L), которые были сконструированы в примере 2-1, и штамма дикого типа АТСС13032 анализировали О-ацетилгомосерин, содержащийся в культурах, следующим методом.To compare the O-acetylhomoserine (O-AH)-producing capacity of ATCC13032ΔNCg12335, ATCC13032ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), ATCC13032ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) and ATCC13032Δ NCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L), which were constructed in Example 2-1, and the wild-type strain ATCC13032, O-acetylhomoserine contained in the cultures was analyzed by the following method.
Одну микробиологическую петлю для инокуляции каждого из штаммов инокулировали в колбу с угловыми перегородками вместимостью 250 мл, содержащую 25 мл описанной ниже среды, а затем культивировали при встряхивании при 33°С в течение 20 часов при 200 об/мин. Концентрации О-ацетилгомосерина анализировали с использованием ВЭЖХ, и анализируемые концентрации показаны в таблице 4.One microbiological inoculation loop for each strain was inoculated into a 250 ml corner flask containing 25 ml of the medium described below and then cultured with shaking at 33°C for 20 hours at 200 rpm. O-acetylhomoserine concentrations were analyzed using HPLC, and the analyzed concentrations are shown in Table 4.
Среда для продукции О-ацетилгомосерина (рН 7.2)Medium for the production of O-acetylhomoserine (pH 7.2)
30 г глюкозы, 2 г KН2РО4, 3 г мочевины, 40 г (NH4)2SO4, 2,5 г пептона, 5 г (10 мл) кукурузного сиропа (CSL, Sigma), 0,5 г MgSO4⋅7H2O и 20 г СаСО3 (в пересчете на 1 л дистиллированной воды)30 g glucose, 2 g KH 2 PO 4 , 3 g urea, 40 g (NH 4 ) 2 SO 4 , 2.5 g peptone, 5 g (10 ml) corn syrup (CSL, Sigma), 0.5 g MgSO 4 ⋅7H 2 O and 20 g CaCO 3 (calculated per 1 liter of distilled water)
В результате было подтверждено, что при культивировании АТСС13032 в качестве контроля О-ацетил-L-гомосерин накапливался в концентрации 0,3 г/л, и, как показано в таблице 4, делеция гена NCg12335 (транспозаза) не влияла на продукцию О-ацетил-L-гомосерина. В частности, было подтверждено, что при экспрессии гена yjeH дикого типа О-ацетил-L-гомосерин накапливался в концентрации 0,7 г/л, а при экспрессии вариантов гена yjeH О-ацетил-L-гомосерин накапливался в концентрациях 1,2 г/ли 1,0 г/л.As a result, it was confirmed that when ATCC13032 was cultured as a control, O-acetyl-L-homoserine accumulated at a concentration of 0.3 g/L, and, as shown in Table 4, deletion of the NCg12335 gene (transposase) did not affect the production of O-acetyl -L-homoserine. In particular, it was confirmed that when the wild type yjeH gene was expressed, O-acetyl-L-homoserine accumulated at a concentration of 0.7 g/l, and when yjeH gene variants were expressed, O-acetyl-L-homoserine accumulated at concentrations of 1.2 g /li 1.0 g/l.
Таким образом, на основании представленных выше результатов было подтверждено, что гены дикого типа и вариант yjeH по описанию настоящего изобретения приводят к значимому повышению продукции представляющей интерес аминокислоты в результате экспорта О-ацетилгомосерина из АТСС13032.Thus, based on the results presented above, it was confirmed that the wild type and yjeH variant genes as described in the present invention lead to a significant increase in the production of the amino acid of interest as a result of the export of O-acetylhomoserine from ATCC13032.
Штаммы АТСС13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) и АТСС13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L) были названы Corynebacterium glutamicum СМ04-0651 и Corynebacterium glutamicum CM04-0652 соответственно и депонированы в Корейском центре культур микроорганизмов согласно Будапештскому договору 4 декабря 2019 г. под номерами доступа KССМ12633Р и KССМ12634Р соответственно.Strains ATCC13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) and ATCC13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L) were named Corynebacterium glutamicum CM04-0651 and Corynebacterium glutamicum CM04-0652, respectively, and deposited in Cor. Yeisk Center for Microbial Cultures in accordance with the Budapest Treaty December 4, 2019 under accession numbers KССМ12633Р and KССМ12634Р respectively.
2-3. Оценка способности к продукции гомосерина2-3. Assessment of the ability to produce homoserine
В целях сравнения гомосерин-продуцирующей способности АТСС13032 ΔNCg12335, АТСС13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), АТСС13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) и ATCC13032 ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L), которые были сконструированы в примере 2-1, и штамма дикого типа АТСС13032 анализировали гомосерин, содержащийся в культурах, следующим методом.To compare the homoserine-producing capacity of ATCC13032ΔNCg12335, ATCC13032ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), ATCC13032ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) and ATCC13032ΔNCg12335::PC J7-yjeH (eco, F351L), which were constructed in Example 2-1, and the wild-type strain ATCC13032 was analyzed for homoserine contained in the cultures by the following method.
Одну микробиологическую петлю для инокуляции каждого из штаммов инокулировали в колбу с угловыми перегородками вместимостью 250 мл, содержащую 25 мл описанной ниже среды, а затем культивировали при встряхивании при 33°С в течение 20 часов при 200 об/мин. Концентрации гомосерина анализировали с использованием ВЭЖХ, и анализируемые концентрации показаны в таблице 5.One microbiological inoculation loop for each strain was inoculated into a 250 ml corner flask containing 25 ml of the medium described below and then cultured with shaking at 33°C for 20 hours at 200 rpm. Homoserine concentrations were analyzed using HPLC, and the analyzed concentrations are shown in Table 5.
Среда для продукции гомосерина (рН 7.2)Medium for homoserine production (pH 7.2)
30 г глюкозы, 2 г KН2РО4, 3 г мочевины, 40 г (NH4)2SO4, 2,5 г пептона, 5 г (10 мл) кукурузного сиропа (CSL, Sigma), 0,5 г MgSO4⋅7H2O и 20 г СаСО3 (в пересчете на 1 л дистиллированной воды)30 g glucose, 2 g KH 2 PO 4 , 3 g urea, 40 g (NH 4 ) 2 SO 4 , 2.5 g peptone, 5 g (10 ml) corn syrup (CSL, Sigma), 0.5 g MgSO 4 ⋅7H 2 O and 20 g CaCO 3 (calculated per 1 liter of distilled water)
В результате было подтверждено, что при культивировании АТСС13032 в качестве контроля гомосерин не накапливался (концентрация 0,0 г/л), и, как показано в таблице 5, делеция гена NCg12335 (транспозаза) не влияла на продукцию гомосерина. В частности, было подтверждено, что при экспрессии гена yjеН дикого типа гомосерин не накапливался (концентрация 0,0 г/л), а при экспрессии вариантов гена yjeH гомосерин накапливался в концентрациях 0,2 г/л и 0,2 г/л.As a result, it was confirmed that when ATCC13032 was cultured as a control, homoserine did not accumulate (concentration 0.0 g/L), and, as shown in Table 5, deletion of the NCg12335 (transposase) gene did not affect homoserine production. In particular, it was confirmed that when the wild-type yjeH gene was expressed, homoserine did not accumulate (concentration of 0.0 g/L), and when the yjeH gene variants were expressed, homoserine accumulated at concentrations of 0.2 g/L and 0.2 g/L.
Таким образом, на основании представленных выше результатов было подтверждено, что вариант тепа. yjeH по описанию настоящего изобретения приводит к значимому повышению продукции представляющей интерес аминокислоты в результате экспорта гомосерина из АТСС13032.Thus, based on the results presented above, it was confirmed that the tepa option. yjeH as described in the present invention leads to a significant increase in the production of the amino acid of interest as a result of the export of homoserine from ATCC13032.
Пример 3: Конструирование штамма с усиленной способностью к продукции О-ацетилгомосерина и оценка способности к продукции О-ацетилгомосерина и гомосеринаExample 3: Construction of a strain with enhanced ability to produce O-acetylhomoserine and evaluation of the ability to produce O-acetylhomoserine and homoserine
3-1. Инактивация цистатионин-гамма (γ)-синтазы (MetB)3-1. Inactivation of cystathionine gamma (γ) synthase (MetB)
С помощью ПЦР с использованием хромосомной ДНК Corynebacterium glutamicum АТСС13032 в качестве матрицы был получен ген metB, кодирующий цистатионин-γ-синтазу, вовлеченную в путь деградации О-ацетилгомосерина. Информация о нуклеотидной последовательности гена metB (NCBI № Ncg12360, SEQ ID NO: 17) была получена из GenBank Национальных институтов здравоохранения (США), и на ее основе были синтезированы праймеры (SEQ ID NO: 18 и 19), включающие N-конец гена metB и линкер, и праймеры (SEQ ID NO: 20 и 21), включающие его С-конец и линкер. Последовательности праймеров представлены в таблице 6 ниже.Using PCR using the chromosomal DNA of Corynebacterium glutamicum ATCC13032 as a template, the metB gene encoding cystathionine-γ-synthase involved in the O-acetylhomoserine degradation pathway was obtained. Information on the nucleotide sequence of the metB gene (NCBI No. Ncg12360, SEQ ID NO: 17) was obtained from GenBank of the National Institutes of Health (USA), and on its basis primers (SEQ ID NO: 18 and 19) including the N-terminus of the gene were synthesized metB and linker, and primers (SEQ ID NOs: 20 and 21) including its C-terminus and linker. The primer sequences are presented in Table 6 below.
ПЦР выполняли с использованием хромосомной ДНК АТСС13032 в качестве матрицы и праймеров SEQ ID NO: 18 и 19 и SEQ ID NO: 20 и 21. В качестве полимеразы использовали ДНК полимеразу высокой надежности PfuUltra™ (Stratagene) и выполняли ПЦР путем повторения 30 циклов денатурации при 96°С в течение 30 секунд, отжига при 53°С в течение 30 секунд и полимеризации при 72°С в течение 1 минуты. В результате получили: амплифицированный ген 558 п. о., содержащий N-конец гена metB и линкер, и амплифицированный ген 527 п. о., содержащий С-конец гена metB и линкер, соответственно.PCR was performed using ATCC13032 chromosomal DNA as a template and primers SEQ ID NOs: 18 and 19 and SEQ ID NOs: 20 and 21. PfuUltra™ High Confidence DNA Polymerase (Stratagene) was used as the polymerase and PCR was performed by repeating 30 cycles of denaturation at 96°C for 30 seconds, annealing at 53°C for 30 seconds and curing at 72°C for 1 minute. As a result, we obtained: a 558 bp amplified gene containing the N-terminus of the metB gene and a linker, and a 527 bp amplified gene containing the C-terminus of the metB gene and a linker, respectively.
ПЦР выполняли с использованием двух амплифицированных генов, полученных, как описано выше, в качестве матриц путем повторения 10 циклов денатурации при 96°С в течение 60 секунд, отжига при 50°С в течение 60 секунд и полимеризации при 72°С в течение 1 минуты, а затем добавления праймеров SEQ ID NO: 18 и 21 с последующей полимеризацией 20 раз. В результате была получена кассета инактивации 1064 п. о., включающая N-конец-линкер-С-конец гена metB. Полученные продукты ПЦР обрабатывали ферментами рестрикции XbaI и SalI и лигировали с вектором pDCM2, обработанным ферментами рестрикции XbaI и SaiI, для клонирования с получением конечной конструкции рекомбинантного вектора pDCM2-ΔmetB с клонированной кассетой инактивации metB.PCR was performed using the two amplified genes obtained as described above as templates by repeating 10 cycles of denaturation at 96°C for 60 seconds, annealing at 50°C for 60 seconds and polymerization at 72°C for 1 minute , and then adding primers SEQ ID NO: 18 and 21, followed by polymerization 20 times. As a result, an inactivation cassette of 1064 bp was obtained, including the N-terminus-linker-C-terminus of the metB gene. The resulting PCR products were treated with the restriction enzymes XbaI and SalI and ligated with the pDCM2 vector treated with the restriction enzymes XbaI and SaiI for cloning to obtain the final construct of the recombinant vector pDCM2-ΔmetB with the cloned metB inactivation cassette.
АТСС13032 трансформировали сконструированным вектором pDCM2-ΔmetB с использованием электроимпульсного метода и подвергали процессу вторичного кроссинговера с получением АТСС13032 ΔmetB, в котором ген metB был инактивирован в хромосоме. Инактивированный ген metB был, в конечном счете, подтвержден путем сравнения с АТСС13032, в котором ген metB не был инактивирован, после выполнения ПЦР с использованием праймеров SEQ ID NO: 18 и 21.ATCC13032 was transformed with the constructed vector pDCM2-ΔmetB using the electropulse method and subjected to a secondary crossover process to obtain ATCC13032ΔmetB, in which the metB gene was inactivated in the chromosome. The inactivated metB gene was ultimately confirmed by comparison with ATCC13032, in which the metB gene was not inactivated, after performing PCR using primers SEQ ID NO: 18 and 21.
3-2. Инактивация O-ацетилгомосерин(тнол)-лиазы (MetY)3-2. Inactivation of O-acetylhomoserine(tnol)-lyase (MetY)
С помощью ПЦР с использованием хромосомной ДНК Corynebacterium glutamicum АТСС13032 в качестве матрицы был получен ген metY, кодирующий О-ацетилгомосерин(тиол)-лиазу, вовлеченную в путь деградации О-ацетилгомосерина. Информация о нуклеотидной последовательности гена metY (NCBI № Ncg10625, SEQ ID NO: 22) была получена из GenBank Национальных институтов здравоохранения (США), и на ее основе были синтезированы праймеры (SEQ ID NO: 23 и 24), включающие N-конец гена metY и линкер, и праймеры (SEQ ID NO: 25 и 26), включающие его С-конец и линкер. Последовательности праймеров представлены в таблице 7 ниже.Using PCR using the chromosomal DNA of Corynebacterium glutamicum ATCC13032 as a template, the metY gene encoding O-acetylhomoserine(thiol)-lyase involved in the O-acetylhomoserine degradation pathway was obtained. Information on the nucleotide sequence of the metY gene (NCBI No. Ncg10625, SEQ ID NO: 22) was obtained from GenBank of the National Institutes of Health (USA), and on its basis primers (SEQ ID NO: 23 and 24) were synthesized, including the N-terminus of the gene metY and linker, and primers (SEQ ID NOs: 25 and 26) including its C-terminus and linker. The primer sequences are presented in Table 7 below.
ПЦР выполняли с использованием хромосомной ДНК АТСС13032 в качестве матрицы и праймеров SEQ ID NO: 23 и 24 и SEQ ID NO: 25 и 26. В качестве полимеразы использовали ДНК полимеразу высокой надежности PfuUltra™ (Stratagene) и выполняли ПЦР путем повторения 30 циклов денатурации при 96°С в течение 30 секунд, отжига при 53°С в течение 30 секунд и полимеризации при 72°С в течение 1 минуты. В результате получили: амплифицированный ген 548 п.о., содержащий N-конец гена metY и линкер, и амплифицированный ген 550 п.о., содержащий С-конец гена metY и линкер, соответственно. ПЦР выполняли с использованием двух амплифицированных генов, полученных, как описано выше, в качестве матриц путем повторения 10 циклов денатурации при 96°С в течение 60 секунд, отжига при 50°С в течение 60 секунд и полимеризации при 72°С в течение 1 минуты, а затем добавления праймеров SEQ ID NO: 23 и 26 с последующей полимеризацией 20 раз. В результате была получена кассета инактивации 1077 п.о., включающая N-конец линкер С-конец гена metY. Полученные продукты ПЦР обрабатывали ферментами рестрикции XbaI и SalI и лигировали с вектором pDCM2, обработанным ферментами рестрикции XbaI и SalI, для клонирования с получением конечной конструкции рекомбинантного вектора pDCM2-ΔmetY с клонированной кассетой инактивации metY.PCR was performed using ATCC13032 chromosomal DNA as a template and primers SEQ ID NOs: 23 and 24 and SEQ ID NOs: 25 and 26. PfuUltra™ High Confidence DNA Polymerase (Stratagene) was used as the polymerase and PCR was performed by repeating 30 cycles of denaturation at 96°C for 30 seconds, annealing at 53°C for 30 seconds and curing at 72°C for 1 minute. As a result, we obtained: a 548 bp amplified gene containing the N-terminus of the metY gene and a linker, and a 550 bp amplified gene containing the C-terminus of the metY gene and a linker, respectively. PCR was performed using the two amplified genes obtained as described above as templates by repeating 10 cycles of denaturation at 96°C for 60 seconds, annealing at 50°C for 60 seconds and polymerization at 72°C for 1 minute , and then adding primers SEQ ID NO: 23 and 26, followed by polymerization 20 times. As a result, an inactivation cassette of 1077 bp was obtained, including the N-terminal linker and the C-terminal end of the metY gene. The resulting PCR products were treated with the restriction enzymes XbaI and SalI and ligated with the pDCM2 vector treated with the restriction enzymes XbaI and SalI for cloning to obtain the final construct of the recombinant vector pDCM2-ΔmetY with the cloned metY inactivation cassette.
Штамм АТСС13032 ΔmetB трансформировали сконструированным вектором pDCM2-ΔmetY с использованием электроимпульсного метода и подвергали процессу вторичного кроссинговера с получением АТСС13032 ΔmetB ΔmetY, в котором ген metY инактивирован в хромосоме. Инактивированный ген metY был, в конечном счете, подтвержден путем сравнения с АТСС13032, в котором ген metY не был инактивирован, после выполнения ПЦР с использованием праймеров SEQ ID NO: 23 и 26.Strain ATCC13032ΔmetB was transformed with the constructed vector pDCM2-ΔmetY using the electropulse method and subjected to a secondary crossover process to obtain ATCC13032ΔmetBΔmetY, in which the metY gene is inactivated in the chromosome. The inactivated metY gene was ultimately confirmed by comparison with ATCC13032, in which the metY gene was not inactivated, after performing PCR using primers SEQ ID NOs: 23 and 26.
3-3. Введение варианта аспартокиназы (LysC)3-3. Introduction of aspartokinase variant (LysC)
В целях максимального повышения продукции О-ацетилгомосерина в полученный из Corynebacterium glutamicum АТСС13032 ген lysC (SEQ ID NO: 27), кодирующий аспартокиназу, вводили мутацию (L377K) для усиления экспрессии гена lysC и ослабления ингибирования L-лизином и L-треонином по механизму обратной связи (US 10662450 В2). В целях получения вектора, включающего вариант гена lysC, была разработана пара праймеров (SEQ ID NO: 28 и 29) для амплификации 5' вышележащей области и пара праймеров (SEQ ID NO: 30 и 31) для амплификации 3' нижележащей области по отношению к положению мутации. Вставку областей ферментов рестрикции XbaI и SalI вводили с обоих концов праймеров SEQ ID NO: 28 и 31, а праймеры SEQ ID NO: 29 и 30 были разработаны так, что они пересекались друг с другом, и нуклеотидная замена была локализована в этой области. Последовательности праймеров являются такими, как представлено в таблице 8 ниже.In order to maximize the production of O-acetylhomoserine, a mutation (L377K) was introduced into the lysC gene (SEQ ID NO: 27) obtained from Corynebacterium glutamicum ATCC13032, encoding aspartokinase, to enhance the expression of the lysC gene and weaken the inhibition by L-lysine and L-threonine by the reverse mechanism communications (US 10662450 B2). In order to obtain a vector including the lysC gene variant, a pair of primers (SEQ ID NO: 28 and 29) was designed to amplify the 5' upstream region and a pair of primers (SEQ ID NO: 30 and 31) to amplify the 3' downstream region of position of the mutation. The insertion of XbaI and SalI restriction enzyme regions was introduced at both ends of primers SEQ ID NOs: 28 and 31, and primers SEQ ID NOs: 29 and 30 were designed to overlap each other and the nucleotide change was localized to this region. The primer sequences are as shown in Table 8 below.
ПЦР выполняли с использованием Corynebacterium glutamicum АТСС13032 в качестве матрицы и праймеров SEQ ID NO: 28 и 29 и SEQ ID NO: 30 и 31. ПЦР выполняли в следующих условиях. После денатурации при 95°С в течение 5 минут повторяли 30 циклов денатурации при 95°С в течение 30 секунд, отжига при 55°С в течение 30 секунд и полимеризации при 72°С в течение 30 секунд, а затем выполняли полимеризацию при 72°С в течение 7 минут. В результате получили фрагмент ДНК 512 п.о. 5' вышележащей области и фрагмент ДНК 522 п.о. 3' нижележащей области по отношению к мутации гена lysC.PCR was performed using Corynebacterium glutamicum ATCC13032 as template and primers SEQ ID NO: 28 and 29 and SEQ ID NO: 30 and 31. PCR was performed under the following conditions. After denaturation at 95°C for 5 minutes, 30 cycles of denaturation at 95°C for 30 seconds, annealing at 55°C for 30 seconds, and polymerization at 72°C for 30 seconds were repeated, followed by polymerization at 72°C. C for 7 minutes. As a result, a DNA fragment of 512 bp was obtained. 5' upstream region and 522 bp DNA fragment. 3' downstream of the lysC gene mutation.
ПЦР выполняли с использованием двух амплифицированных фрагментов ДНК в качестве матриц и праймеров SEQ ID NO: 28 и 31. ПЦР выполняли в следующих условиях. После денатурации при 95°С в течение 5 минут повторяли 30 циклов денатурации при 95°С в течение 30 секунд, отжига при 55°С в течение 30 секунд и полимеризации при 72°С в течение 60 секунд, а затем выполняли полимеризацию при 72°С в течение 7 минут. В результате амплифицировали фрагмент ДНК 1011 п.о., включающий вариант гена lysC (L377K), кодирующий вариант аспартокиназы, в котором лейцин в 377-м положении был заменен лизином.PCR was performed using two amplified DNA fragments as templates and primers SEQ ID NO: 28 and 31. PCR was performed under the following conditions. After denaturation at 95°C for 5 minutes, 30 cycles of denaturation at 95°C for 30 seconds, annealing at 55°C for 30 seconds, and polymerization at 72°C for 60 seconds were repeated, followed by polymerization at 72°C. C for 7 minutes. As a result, a 1011 bp DNA fragment was amplified, including a variant of the lysC gene (L377K), encoding a variant of aspartokinase, in which leucine at position 377 was replaced by lysine.
Фрагмент lysC (L377K), полученный с помощью ПЦР, обрабатывали ферментами рестрикции XbaI и SalI на обоих концах и лигировали с вектором pDCM2, обработанным ферментами рестрикции XbaI и SalI, после чего его клонировали и окончательно получили рекомбинантный вектор pDCM2-lysC (L377K) с клонированной кассетой замены lysC (L377K).The lysC fragment (L377K), obtained by PCR, was treated with restriction enzymes XbaI and SalI at both ends and ligated with the vector pDCM2, treated with restriction enzymes XbaI and SalI, after which it was cloned and finally obtained the recombinant vector pDCM2-lysC (L377K) with cloned lysC replacement cassette (L377K).
Штамм АТСС13032 ΔmetB ΔmetY трансформировали полученным вектором pDCM2-lysC (L377K) электроимпульсным методом и подвергали процессу вторичного кроссинговера с получением Corynebacterium glutamicum АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) с введенным вариантом гена lysC на хромосоме. Вариант гена был окончательно идентифицирован с помощью ПЦР, выполненной с использованием праймеров SEQ ID NO: 28 и 31, а затем сравнивали последовательность с последовательностью гена lysC дикого типа методом секвенирования.Strain ATCC13032 ΔmetB ΔmetY was transformed with the resulting vector pDCM2-lysC (L377K) by the electric pulse method and subjected to the process of secondary crossing over to obtain Corynebacterium glutamicum ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) with an introduced variant of the lysC gene on the chromosome. The gene variant was conclusively identified by PCR performed using primers SEQ ID NOs: 28 and 31, and the sequence was then compared to the wild-type lysC gene sequence by sequencing.
3-4. Конструирование плазмиды с введением О-ацетилгомосеринтрансферазы (MetX)3-4. Construction of a plasmid with the introduction of O-acetylhomoserine transferase (MetX)
В целях амплификации гена, кодирующего О-ацетилгомосеринтрансферазу (MetX), была получена информация о нуклеотидной последовательности гена metX (NCBI № NCg10624, SEQ ID NO: 32) из GenBank Национальных институтов здравоохранения (США), фермент рестрикции BamHI был вставлен в оба конца каждого из праймеров (SEQ ID NO: 33 и 34)), основанных на этой последовательности, для амплификации области от промотора (локализованного примерно на 300 п.о. выше стартового кодона) до терминатора (локализованного примерно на 100 п.о. ниже стоп-кодона. ПЦР выполняли в следующих условиях. После денатурации при 95°С в течение 5 минут повторяли 30 циклов денатурации при 95°С в течение 30 секунд, отжига при 55°С в течение 30 секунд и полимеризации при 72°С в течение 90 секунд, а затем выполняли полимеризацию при 72°С в течение 7 минут. В результате получили фрагмент ДНК 1546 п. о. кодирующей области гена metX. Вектор pECCG117 (KR 10-0057684 В1) и фрагмент ДНК metX обрабатывали ферментом рестрикции BamHI, лигировали с помощью ДНК лигазы и клонировали с получением плазмиды, названной pECCG117-metX WT. Последовательности праймеров являются такими, как представлено в таблице 9 ниже.In order to amplify the gene encoding O-acetylhomoserine transferase (MetX), the nucleotide sequence information of the metX gene (NCBI No. NCg10624, SEQ ID NO: 32) was obtained from the GenBank of the National Institutes of Health (USA), the restriction enzyme BamHI was inserted into both ends of each of primers (SEQ ID NOs: 33 and 34) based on this sequence to amplify the region from the promoter (localized approximately 300 bp upstream of the start codon) to the terminator (localized approximately 100 bp downstream of the stop codon). codon PCR was performed under the following conditions: After denaturation at 95°C for 5 minutes, 30 cycles of denaturation at 95°C for 30 seconds, annealing at 55°C for 30 seconds, and polymerization at 72°C for 90 seconds were repeated. , and then polymerization was performed at 72°C for 7 minutes. As a result, a DNA fragment of 1546 bp of the coding region of the metX gene was obtained. The vector pECCG117 (KR 10-0057684 B1) and the metX DNA fragment were treated with the restriction enzyme BamHI, ligated using DNA ligase and cloned to obtain a plasmid named pECCG117-metX WT. The primer sequences are as shown in Table 9 below.
3-5. Конструирование штамма-продуцента О-ацетилгомосерина и оценка способности к продукции О-ацетилгомосерина3-5. Construction of an O-acetylhomoserine-producing strain and assessment of the ability to produce O-acetylhomoserine
После получения вектора pECCG117-metX WT в примере 3-4 его вводили в Corynebacterium glutamicum АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K), используя электроимпульсный метод, штамм высевали методом мазка на селективной среде, содержащей канамицин (25 мг/л), и культивировали до получения трансформантов.After obtaining the pECCG117-metX WT vector in example 3-4, it was introduced into Corynebacterium glutamicum ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) using the electric pulse method, the strain was sown by the smear method on a selective medium containing kanamycin (25 mg/l), and cultivated until transformants.
Для сравнения О-ацетилгомосерин-продуцирующей способности между штаммами, эти штаммы культивировали описанным ниже способом и анализировали О-ацетилгомосерин, содержащийся в культурах.To compare the O-acetylhomoserine-producing ability between strains, the strains were cultured as described below and the O-acetylhomoserine contained in the cultures was analyzed.
Одну микробиологическую петлю для инокуляции каждого из штаммов инокулировали в колбу с угловыми перегородками вместимостью 250 мл, содержащую 25 мл описанной ниже среды, а затем культивировали при встряхивании при 37°С в течение 20 часов при 200 об/мин. Концентрации О-ацетилгомосерина анализировали с использованием ВЭЖХ, и анализируемые концентрации показаны в таблице 10.One microbiological inoculation loop for each strain was inoculated into a 250 ml corner flask containing 25 ml of the medium described below, and then cultured with shaking at 37°C for 20 hours at 200 rpm. O-acetylhomoserine concentrations were analyzed using HPLC, and the analyzed concentrations are shown in Table 10.
Среда для продукции О-ацетилгомосерина (рН 7.2)Medium for the production of O-acetylhomoserine (pH 7.2)
30 г глюкозы, 2 г KН2РО4, 3 г мочевины, 40 г (NH4)2SO4, 2,5 г пептона, 5 г (10 мл) кукурузного сиропа (CSL, Sigma), 0,5 г MgSO4⋅7H2O, 400 мг метионина и 20 г СаСО3 (в пересчете на 1 л дистиллированной воды)30 g glucose, 2 g KH 2 PO 4 , 3 g urea, 40 g (NH 4 ) 2 SO 4 , 2.5 g peptone, 5 g (10 ml) corn syrup (CSL, Sigma), 0.5 g MgSO 4 ⋅7H 2 O, 400 mg of methionine and 20 g of CaCO 3 (calculated per 1 liter of distilled water)
В результате было подтверждено, что при культивировании АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) в качестве контроля О-ацетил-L-гомосерин накапливался в концентрации 0,7 г/л, а при культивировании штамма АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K)/pECCG117-metX WT О-ацетил-L-гомосерин накапливался в концентрации 1,3 г/л, как показано в таблице 10.As a result, it was confirmed that when ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) was cultivated as a control, O-acetyl-L-homoserine accumulated at a concentration of 0.7 g/l, and when the strain ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K)/pECCG117-metX was cultivated WT O-acetyl-L-homoserine accumulated at a concentration of 1.3 g/L, as shown in Table 10.
Таким образом, повышение продукции О-ацетил-L-гомосерина в штамме АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K)/pECCG117-metX WT было подтверждено на основании представленных выше результатов.Thus, the increased production of O-acetyl-L-homoserine in ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K)/pECCG117-metX WT strain was confirmed based on the results presented above.
3-6. Оценка способности к продукции гомосерина3-6. Assessment of the ability to produce homoserine
В Corynebacterium glutamicum АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K), сконструированный в примере 3-3, вводили вектор pECCG117-metX WT, сконструированный в примере 3-4, используя электроимпульсный метод, высевали методом мазка на селективную среду, содержащую (25 мг/л) канамицина и культивировали до получения трансформантов.In Corynebacterium glutamicum ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K), constructed in example 3-3, the pECCG117-metX WT vector, constructed in example 3-4, was introduced using the electric pulse method, sown using the smear method on a selective medium containing (25 mg/l) kanamycin and cultured until transformants were obtained.
Для сравнения гомосерин-продуцирующей способности между штаммами эти штаммы культивировали описанным ниже способом и анализировали гомосерин, содержащийся в культурах.To compare the homoserine-producing ability between strains, the strains were cultured as described below and the homoserine contained in the cultures was analyzed.
Одну микробиологическую петлю для инокуляции каждого из штаммов инокулировали в колбу с угловыми перегородками вместимостью 250 мл, содержащую 25 мл описанной ниже среды, а затем культивировали при встряхивании при 37°С в течение 20 часов при 200 об/мин. Концентрации гомосерина анализировали с использованием ВЭЖХ, и анализируемые концентрации показаны в таблице 11.One microbiological inoculation loop for each strain was inoculated into a 250 ml corner flask containing 25 ml of the medium described below, and then cultured with shaking at 37°C for 20 hours at 200 rpm. Homoserine concentrations were analyzed using HPLC, and the analyzed concentrations are shown in Table 11.
Среда для продукции гомосерина (рН 7.2)Medium for homoserine production (pH 7.2)
30 г глюкозы, 2 г KН2РО4, 3 г мочевины, 40 г (NH4)2SO4, 2,5 г пептона, 5 г (10 мл) кукурузного сиропа (CSL, Sigma), 0,5 г MgSO4⋅7H2O, 400 мг метионина и 20 г СаСО3 (в пересчете на 1 л дистиллированной воды)30 g glucose, 2 g KH 2 PO 4 , 3 g urea, 40 g (NH 4 ) 2 SO 4 , 2.5 g peptone, 5 g (10 ml) corn syrup (CSL, Sigma), 0.5 g MgSO 4 ⋅7H 2 O, 400 mg of methionine and 20 g of CaCO 3 (calculated per 1 liter of distilled water)
В результате было подтверждено, что при культивировании АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) в качестве контроля гомосерин накапливался в концентрации 0,2 г/л, а при культивировании штамма АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K)/pECCG117-metX WT гомосерин накапливался в концентрации 0,2 г/л, как показано в таблице 11.As a result, it was confirmed that when cultivating ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) as a control, homoserine accumulated at a concentration of 0.2 g/l, and when cultivating the ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K)/pECCG117-metX WT strain, homoserine accumulated at a concentration of 0 .2 g/l, as shown in Table 11.
Таким образом, на основании этих результатов было подтверждено, что штамм АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K)/pECCG117-metX WT характеризовался таким же уровнем продукции гомосерина.Thus, based on these results, it was confirmed that the ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K)/pECCG117-metX WT strain had the same level of homoserine production.
Пример 4: Конструирование штаммов с введенным вариантом экзогенного мембранного белка (YjeH), обладающего усиленной способностью к продукции О-ацетилгомосерина, и оценка способности к продукции О-ацетилгомосеринаExample 4: Construction of strains with an introduced variant of an exogenous membrane protein (YjeH) having an enhanced ability to produce O-acetylhomoserine, and evaluation of the ability to produce O-acetylhomoserine
4-1. Введение варианта экзогенного белка (YjeH)4-1. Introduction of an exogenous protein variant (YjeH)
Штамм Corynebacterium glutamicum АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K), сконструированный в примере 3-3, трансформировали векторами pDCM2-ΔNCg12335, pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) и pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L), ранее сконструированными в примере 2-1, и подвергали процессу вторичного кроссинговера с получением АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335, ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) и АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L), из хромосомы которых был удален ген NCg12335 (транспозаза). Встраивание инактивированного гена NCg12335 и вновь введенного гена yjeH Е. coli идентифицировали путем выполнения ПЦР с использованием праймеров SEQ ID NO: 4 и 7 и сравнения результатов с результатами для АТСС13032, в котором ген NCg12335 не был инактивирован.The Corynebacterium glutamicum strain ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K), constructed in example 3-3, was transformed with the vectors pDCM2-ΔNCg12335, pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7 -yjeH (eco, F92N ) and pDCM2-ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L), previously constructed in Example 2-1, and subjected to a secondary crossover process to obtain ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335, ATCC13032 ΔmetB Δmet Y lysC (L377K) ΔNCg12335:: PCJ7-yjeH (eco, WT), ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) and ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco , F351L), from whose chromosomes the NCg12335 (transposase) gene was deleted. The integration of the inactivated NCg12335 gene and the newly introduced E. coli yjeH gene was identified by performing PCR using primers SEQ ID NOs: 4 and 7 and comparing the results with those for ATCC13032, in which the NCg12335 gene was not inactivated.
4-2. Конструирование штамма-продуцента О-ацетилгомосерина и оценка способности к продукции О-ацетилгомосерина4-2. Construction of an O-acetylhomoserine-producing strain and assessment of the ability to produce O-acetylhomoserine
После получения вектора pECCG117-metX WT в примере 3-4 его вводили в АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335, ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) и АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L), полученные в примере 4-1, используя электроимпульсный метод, штаммы высевали методом мазка на селективную среду, содержащую (25 мг/л) канамицина и культивировали до получения трансформантов.After obtaining the pECCG117-metX WT vector in example 3-4, it was introduced into ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335, ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), ATCC 13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) and ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L), obtained in example 4-1, using the electric pulse method, the strains were smeared onto a selective medium, containing (25 mg/l) kanamycin and cultivated until transformants were obtained.
Для сравнения продуцирующей способности О-ацетилгомосерина между штаммами эти штаммы культивировали описанным ниже способом и анализировали О-ацетилгомосерин, содержащийся в культурах.To compare the O-acetylhomoserine production ability between strains, the strains were cultured as described below and the O-acetylhomoserine contained in the cultures was analyzed.
Одну микробиологическую петлю для инокуляции каждого из штаммов инокулировали в колбу с угловыми перегородками вместимостью 250 мл, содержащую 25 мл среды для продуцирования О-ацетилгомосерина (рН 7,2) примера 3-5, а затем культивировали при встряхивании при 33°С в течение 20 часов при 200 об/мин. Концентрации О-ацетилгомосерина анализировали с использованием ВЭЖХ, и анализируемые концентрации показаны в таблице 12.One microbiological loop for inoculation of each strain was inoculated into a flask with corner partitions with a capacity of 250 ml containing 25 ml of medium for the production of O-acetylhomoserine (pH 7.2) of example 3-5, and then cultured with shaking at 33°C for 20 hours at 200 rpm. O-acetylhomoserine concentrations were analyzed using HPLC, and the analyzed concentrations are shown in Table 12.
В результате было подтверждено, что при культивировании Corynebacterium glutamicum АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) в качестве контроля О-ацетил-L-гомосерин накапливался в концентрации 1,3 г/л, и, как показано в таблице 12, делеция гена NCg12335 (транспозаза) не влияла на продукцию О-ацетил-L-гомосерина. В частности, было подтверждено, что при экспрессии гена yjeH дикого типа О-ацетил-L-гомосерин накапливался в концентрации 2,1 г/л, а при экспрессии вариантов тепа. yjeH О-ацетил-L-гомосерин накапливался в концентрациях 2,7 г/л и 2,3 г/л.As a result, it was confirmed that when Corynebacterium glutamicum ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) was cultivated as a control, O-acetyl-L-homoserine accumulated at a concentration of 1.3 g/L, and, as shown in Table 12, deletion of the NCg12335 (transposase) gene ) did not affect the production of O-acetyl-L-homoserine. In particular, it was confirmed that when the wild-type yjeH gene was expressed, O-acetyl-L-homoserine accumulated at a concentration of 2.1 g/L, and when the tepa variants were expressed. yjeH O-acetyl-L-homoserine accumulated at concentrations of 2.7 g/L and 2.3 g/L.
Таким образом, на основании представленных выше результатов было подтверждено, что гены дикого типа и вариант yjeH по описанию настоящего изобретения приводят к значимому повышению продукции представляющей интерес аминокислоты в результате экспорта О-ацетил-L-гомосерина из Corynebacterium glutamicum АТСС13032.Thus, based on the results presented above, it was confirmed that the wild type and yjeH variant genes as described in the present invention lead to a significant increase in the production of the amino acid of interest as a result of the export of O-acetyl-L-homoserine from Corynebacterium glutamicum ATCC13032.
4-3. Оценка способности к продукции гомосерина4-3. Assessment of the ability to produce homoserine
После получения вектора pECCG117-metX WT в примере 3-4 его вводили в АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335, ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) и АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L), полученные в примере 4-1, используя электроимпульсный метод, штаммы высевали методом мазка на селективную среду, содержащую (25 мг/л) канамицина и культивировали до получения трансформантов.After obtaining the pECCG117-metX WT vector in example 3-4, it was introduced into ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335, ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), ATCC 13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) and ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L), obtained in example 4-1, using the electric pulse method, the strains were smeared onto a selective medium, containing (25 mg/l) kanamycin and cultivated until transformants were obtained.
Для сравнения гомосерин-продуцирующей способности между штаммами эти штаммы культивировали описанным ниже способом и анализировали гомосерин, содержащийся в культурах.To compare the homoserine-producing ability between strains, the strains were cultured as described below and the homoserine contained in the cultures was analyzed.
Одну микробиологическую петлю для инокуляции каждого из штаммов инокулировали в колбу с угловыми перегородками вместимостью 250 мл, содержащую 25 мл описанной ниже среды, а затем культивировали при встряхивании при 33°С в течение 20 часов при 200 об/мин. Концентрации гомосерина анализировали с использованием ВЭЖХ, и анализируемые концентрации показаны в таблице 13.One microbiological inoculation loop for each strain was inoculated into a 250 ml corner flask containing 25 ml of the medium described below and then cultured with shaking at 33°C for 20 hours at 200 rpm. Homoserine concentrations were analyzed using HPLC, and the analyzed concentrations are shown in Table 13.
Среда для продукции гомосерина (рН 7.2)Medium for homoserine production (pH 7.2)
30 г глюкозы, 2 г KН2РО4, 3 г мочевины, 40 г (NH4)2SO4, 2,5 г пептона, 5 г (10 мл) кукурузного сиропа (CSL, Sigma), 0,5 г MgSO4⋅7H2O, 400 мг метионина и 20 г СаСО3 (в пересчете на 1 л дистиллированной воды)30 g glucose, 2 g KH 2 PO 4 , 3 g urea, 40 g (NH 4 ) 2 SO 4 , 2.5 g peptone, 5 g (10 ml) corn syrup (CSL, Sigma), 0.5 g MgSO 4 ⋅7H 2 O, 400 mg of methionine and 20 g of CaCO 3 (calculated per 1 liter of distilled water)
В результате было подтверждено, что при культивировании Corynebacterium glutamicum АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) в качестве контроля гомосерин накапливался в концентрации 0,2 г/л, и, как показано в таблице 13, делеция гена NCg12335 (транспозаза) не влияла на продукцию гомосерина. В частности, было подтверждено, что при экспрессии гена yjeH дикого типа гомосерин накапливался в концентрации 0,2 г/л, а при экспрессии вариантов гена уjеН гомосерин накапливался в концентрациях 1,2 г/л и 0,7 г/л.As a result, it was confirmed that when Corynebacterium glutamicum ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) was cultivated as a control, homoserine accumulated at a concentration of 0.2 g/L, and, as shown in Table 13, deletion of the NCg12335 (transposase) gene did not affect the production of homoserine . In particular, it was confirmed that upon expression of the wild-type yjeH gene, homoserine accumulated at a concentration of 0.2 g/L, and upon expression of variants of the yjeH gene, homoserine accumulated at concentrations of 1.2 g/L and 0.7 g/L.
Таким образом, на основании представленных выше результатов было подтверждено, что гены дикого типа и вариант yjeH по описанию настоящего изобретения приводят к значимому повышению продукции представляющей интерес аминокислоты в результате экспорта гомосерина из Corynebacterium glutamicum АТСС13032.Thus, based on the results presented above, it was confirmed that the wild type and yjeH variant genes as described in the present invention lead to a significant increase in the production of the amino acid of interest as a result of homoserine export from Corynebacterium glutamicum ATCC13032.
Пример 5: Получение метионина (МЕТ) с использованием реакции превращения О-ацетилгомосерина, продуцируемого штаммомExample 5: Production of methionine (MET) using the conversion reaction of O-acetylhomoserine produced by the strain
После получения вектора pECCG117-metX WT в примере 3-4 его вводили в АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335, ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) и АТСС13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L), полученные в примере 4-1, используя электроимпульсный метод, штаммы высевали методом мазка на селективную среду, содержащую (25 мг/л) канамицина и культивировали до получения транс фор мантов.After obtaining the pECCG117-metX WT vector in example 3-4, it was introduced into ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335, ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, WT), ATCC 13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F92N) and ATCC13032 ΔmetB ΔmetY lysC (L377K) ΔNCg12335::PCJ7-yjeH (eco, F351L), obtained in example 4-1, using the electric pulse method, the strains were smeared onto a selective medium, containing (25 mg/l) kanamycin and cultivated until transformants were obtained.
В соответствии со способом, раскрытом в поданном ранее патентном документе (WO 2008/013432), был также клонирован ген metZ, кодирующий О-сукцинилгомосеринсульфгидрилазу, имеющий происхождение из Pseudomonas aeruginosa и Pseudomonas putida, который должен использоваться для превращения О-ацетилгомосерина в метионин. ПЦР выполняли с использованием хромосомы каждого штамма в качестве матрицы и праймеров для получения гена metZ из Pseudomonas aeruginosa и Pseudomonas putida, как описано ниже: 30 циклов денатурации при 94°С в течение 30 секунд, отжига при 55°С в течение 30 секунд, удлинения при 72°С в течение 2 минут с получением фрагментов ДНК. Полученные фрагменты ДНК расщепляли NdeI/PacI и клонировали в векторе pCL-CJ1 (CJ, Корея), расщепленном теми же ферментами. Клетки Е. coli W3110 трансформировали клонированным вектором и культивировали на чашке Петри со средой LB, содержащей 50 мкг/л спектиномицина, а затем отбирали колонии. Отобранными колониями инокулировали 3 мл среды LB, содержащей 50 мкг/л спектиномицина, и культивировали в течение ночи при 37°С. Клетки выделяли из культуры, промывали 0,1 М буферным раствором фосфата калия (рН 7,5), суспендировали в 200 мкл буферного раствора фосфата калия и лизировали путем обработки ультразвуком 5 раз через 30-секундные интервалы. Клеточный лизат центрифугировали при 12 000 об/мин в течение 10 мин, и в полученном супернатанте определяли количественно общий уровень белка с использованием раствора Bio-Rad для количественного определения белков (Bio-Rad, США). Экспрессию белка идентифицировали методом электрофореза в полиакриламидном геле с додецилсульфатом натрия (ДСН-ПААГ). Супернатант, полученный из клеточного экстракта, использовали для реакции ферментативного превращения.In accordance with the method disclosed in a previously filed patent document (WO 2008/013432), the metZ gene encoding O-succinylhomoserine sulfhydrylase, originating from Pseudomonas aeruginosa and Pseudomonas putida, which is to be used to convert O-acetylhomoserine to methionine, was also cloned. PCR was performed using the chromosome of each strain as a template and primers to obtain the metZ gene from Pseudomonas aeruginosa and Pseudomonas putida as described below: 30 cycles of denaturation at 94°C for 30 seconds, annealing at 55°C for 30 seconds, extension at 72°C for 2 minutes to obtain DNA fragments. The resulting DNA fragments were digested with NdeI/PacI and cloned into the pCL-CJ1 vector (CJ, Korea), digested with the same enzymes. E. coli W3110 cells were transformed with the cloned vector and cultured in a Petri dish with LB medium containing 50 μg/L spectinomycin, and then colonies were selected. Selected colonies were inoculated with 3 ml of LB medium containing 50 μg/L spectinomycin and cultured overnight at 37°C. Cells were isolated from culture, washed with 0.1 M potassium phosphate buffer (pH 7.5), suspended in 200 μl potassium phosphate buffer, and lysed by sonication 5 times at 30-second intervals. The cell lysate was centrifuged at 12,000 rpm for 10 min, and the resulting supernatant was quantified for total protein levels using Bio-Rad Protein Quantification Solution (Bio-Rad, USA). Protein expression was identified by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). The supernatant obtained from the cell extract was used for the enzymatic conversion reaction.
Также был клонирован ген metZ, кодирующий О-сукцинилгомосеринсульфгидрилазу, имеющий происхождение от Hyphomonas neptunium. ПЦР выполняли, используя хромосому Hyphomonas neptunium в качестве матрицы и праймер таким же образом, как описано выше для получения фрагментов ДНК. Полученные фрагменты ДНК расщепляли NdeI/AvrII и клонировали в векторе pCL-CJ1 (СJ, Корея), расщепленном теми же ферментами. Супернатант, полученный с использованием клонированного вектора, использовали таким же образом, как описано выше, и использовали в реакции ферментативного превращения.The metZ gene, encoding O-succinylhomoserine sulfhydrylase, originating from Hyphomonas neptunium, was also cloned. PCR was performed using the Hyphomonas neptunium chromosome as template and primer in the same manner as described above to obtain DNA fragments. The resulting DNA fragments were digested with NdeI/AvrII and cloned into the pCL-CJ1 vector (CJ, Korea), digested with the same enzymes. The supernatant obtained using the cloned vector was used in the same manner as described above and used in the enzymatic conversion reaction.
Каждым из штаммов W3110, трансформированных экспрессионным вектором metZ, имеющего происхождение из Pseudomonas, и трансформированных экспрессионным вектором metZ, имеющего происхождение из Hyphomonas, инокулировали чашку с питательной средой LB, содержащей спектиномицин в качестве антибиотика, и культивировали в течение ночи при температуре от 30°С до 40°С. Затем отдельной колонией инокулировали 40 мл среды LB, содержащей спектиномицин, и культивировали в течение 5 часов при температуре от 30°С до 40°С. Штаммы, экспрессирующие metZ происхождения из Pseudomonas и metZ происхождения из Hypomononas, культивировали в емкости для ферментации вместимостью 1 л при 600-900 об/мин и температуре от 30°С до 40°С в течение 15-30 часов с получением ферментационных бульонов. Питательная среда, используемая при культивировании, описана ниже. Клетки полученного ферментационного бульона лизировали путем обработки ультразвуком для получения растворов ферментов.Each of the strains W3110 transformed with the Pseudomonas-derived metZ expression vector and transformed with the Hyphomonas-derived metZ expression vector was inoculated into a plate of LB culture medium containing spectinomycin as an antibiotic and cultured overnight at 30°C. up to 40°C. A single colony was then inoculated with 40 ml of LB medium containing spectinomycin and cultured for 5 hours at 30°C to 40°C. Strains expressing metZ of Pseudomonas origin and metZ of Hypomononas origin were cultured in a 1 L fermentation vessel at 600-900 rpm and a temperature of 30°C to 40°C for 15-30 hours to obtain fermentation broths. The nutrient medium used for cultivation is described below. The cells of the resulting fermentation broth were lysed by sonication to obtain enzyme solutions.
Среда 2XYTWednesday 2XYT
10 г дрожжевого экстракта, 16 г триптофана, 40 г глюкозы и 50 г спектиномицина (в пересчете на 1 л дистиллированной воды)10 g yeast extract, 16 g tryptophan, 40 g glucose and 50 g spectinomycin (based on 1 liter of distilled water)
Реакцию превращения в метионин выполняли путем добавления раствора фермента О-сукцинилгомосеринсульфгидрилазы происхождения из Pseudomonas и Hyphomonas к культуре трансформанта, продуцирующего О-ацетилгомосерин. После добавления 0,1 л раствора фермента к 2,0 л культуры О-ацетилгомосерина, из которой не были удалены клетки, добавляли 0,3 л 15% раствора натрия метилмеркаптана для инициации реакции. Через 2 часа ферментационный бульон извлекали, удаляли из него клетки и идентифицировали концентрации полученного метионина методом ВЭЖХ. Анализируемые концентрации представлены в таблице 14 ниже.The conversion reaction to methionine was performed by adding a solution of the enzyme O-succinylhomoserine sulfhydrylase derived from Pseudomonas and Hyphomonas to the culture of the transformant producing O-acetylhomoserine. After adding 0.1 L of enzyme solution to 2.0 L of O-acetylhomoserine culture from which cells were not removed, 0.3 L of 15% sodium methyl mercaptan solution was added to initiate the reaction. After 2 hours, the fermentation broth was removed, the cells were removed from it, and the concentrations of the resulting methionine were identified by HPLC. The analyzed concentrations are presented in Table 14 below.
Приведенное выше описание настоящего изобретения представлено с целью иллюстрации, и специалистам в данной области техники должно быть понятно, что могут быть выполнены различные изменения и модификации без изменения технической концепции и существенных признаков настоящего изобретения. Таким образом, ясно, что описанные выше воплощения являются иллюстративными во всех аспектах и не ограничивают настоящее изобретение. Таким образом, объем данного описания определяется не подробным описанием, а формулой изобретения и его эквивалентами, а также всеми вариантами в рамках объема формулы изобретения, и его эквиваленты следует трактовать как включенные в объем описания.The above description of the present invention is presented for purposes of illustration, and it will be understood by those skilled in the art that various changes and modifications can be made without changing the technical concept and essential features of the present invention. Thus, it is clear that the embodiments described above are illustrative in all aspects and are not limiting of the present invention. Thus, the scope of this specification is determined not by the detailed description, but by the claims and their equivalents, as well as all variations within the scope of the claims, and their equivalents should be construed as included within the scope of the specification.
--->--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙLIST OF SEQUENCES
<110> CJ CheilJedang Corporation<110>CJ CheilJedang Corporation
<120> Модифицированный белок внутренней мембраны и способы получения<120> Modified inner membrane protein and methods of production
целевого продукта с его использованием target product with its use
<130> OPA20205<130> OPA20205
<150> KR 10-2019-0172055<150> KR 10-2019-0172055
<151> 2019-12-20<151> 2019-12-20
<160> 37<160> 37
<170> KoPatentIn 3.0<170> KoPatentIn 3.0
<210> 1<210> 1
<211> 418<211> 418
<212> PRT<212>PRT
<213> Неизвестно<213> Unknown
<220><220>
<223> Escherichia coli YjeH<223> Escherichia coli YjeH
<400> 1<400> 1
Met Ser Gly Leu Lys Gln Glu Leu Gly Leu Ala Gln Gly Ile Gly LeuMet Ser Gly Leu Lys Gln Glu Leu Gly Leu Ala Gln Gly Ile Gly Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Ser Thr Ser Leu Leu Gly Thr Gly Val Phe Ala Val Pro Ala LeuLeu Ser Thr Ser Leu Leu Gly Thr Gly Val Phe Ala Val Pro Ala Leu
20 25 30 20 25 30
Ala Ala Leu Val Ala Gly Asn Asn Ser Leu Trp Ala Trp Pro Val LeuAla Ala Leu Val Ala Gly Asn Asn Ser Leu Trp Ala Trp Pro Val Leu
35 40 45 35 40 45
Ile Ile Leu Val Phe Pro Ile Ala Ile Val Phe Ala Ile Leu Gly ArgIle Ile Leu Val Phe Pro Ile Ala Ile Val Phe Ala Ile Leu Gly Arg
50 55 60 50 55 60
His Tyr Pro Ser Ala Gly Gly Val Ala His Phe Val Gly Met Ala PheHis Tyr Pro Ser Ala Gly Gly Val Ala His Phe Val Gly Met Ala Phe
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Ser Arg Leu Glu Arg Val Thr Gly Trp Leu Phe Leu Ser Val IleGly Ser Arg Leu Glu Arg Val Thr Gly Trp Leu Phe Leu Ser Val Ile
85 90 95 85 90 95
Pro Val Gly Leu Pro Ala Ala Leu Gln Ile Ala Ala Gly Phe Gly GlnPro Val Gly Leu Pro Ala Ala Leu Gln Ile Ala Ala Gly Phe Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Ala Met Phe Gly Trp His Ser Trp Gln Leu Leu Leu Ala Glu Leu GlyAla Met Phe Gly Trp His Ser Trp Gln Leu Leu Leu Ala Glu Leu Gly
115 120 125 115 120 125
Thr Leu Ala Leu Val Trp Tyr Ile Gly Thr Arg Gly Ala Ser Ser SerThr Leu Ala Leu Val Trp Tyr Ile Gly Thr Arg Gly Ala Ser Ser Ser
130 135 140 130 135 140
Ala Asn Leu Gln Thr Val Ile Ala Gly Leu Ile Val Ala Leu Ile ValAla Asn Leu Gln Thr Val Ile Ala Gly Leu Ile Val Ala Leu Ile Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Ala Ile Trp Trp Ala Gly Asp Ile Lys Pro Ala Asn Ile Pro Phe ProAla Ile Trp Trp Ala Gly Asp Ile Lys Pro Ala Asn Ile Pro Phe Pro
165 170 175 165 170 175
Ala Pro Gly Asn Ile Glu Leu Thr Gly Leu Phe Ala Ala Leu Ser ValAla Pro Gly Asn Ile Glu Leu Thr Gly Leu Phe Ala Ala Leu Ser Val
180 185 190 180 185 190
Met Phe Trp Cys Phe Val Gly Leu Glu Ala Phe Ala His Leu Ala SerMet Phe Trp Cys Phe Val Gly Leu Glu Ala Phe Ala His Leu Ala Ser
195 200 205 195 200 205
Glu Phe Lys Asn Pro Glu Arg Asp Phe Pro Arg Ala Leu Met Ile GlyGlu Phe Lys Asn Pro Glu Arg Asp Phe Pro Arg Ala Leu Met Ile Gly
210 215 220 210 215 220
Leu Leu Leu Ala Gly Leu Val Tyr Trp Gly Cys Thr Val Val Val LeuLeu Leu Leu Ala Gly Leu Val Tyr Trp Gly Cys Thr Val Val Val Leu
225 230 235 240 225 230 235 240
His Phe Asp Ala Tyr Gly Glu Lys Met Ala Ala Ala Ala Ser Leu ProHis Phe Asp Ala Tyr Gly Glu Lys Met Ala Ala Ala Ala Ser Leu Pro
245 250 255 245 250 255
Lys Ile Val Val Gln Leu Phe Gly Val Gly Ala Leu Trp Ile Ala CysLys Ile Val Val Gln Leu Phe Gly Val Gly Ala Leu Trp Ile Ala Cys
260 265 270 260 265 270
Val Ile Gly Tyr Leu Ala Cys Phe Ala Ser Leu Asn Ile Tyr Ile GlnVal Ile Gly Tyr Leu Ala Cys Phe Ala Ser Leu Asn Ile Tyr Ile Gln
275 280 285 275 280 285
Ser Phe Ala Arg Leu Val Trp Ser Gln Ala Gln His Asn Pro Asp HisSer Phe Ala Arg Leu Val Trp Ser Gln Ala Gln His Asn Pro Asp His
290 295 300 290 295 300
Tyr Leu Ala Arg Leu Ser Ser Arg His Ile Pro Asn Asn Ala Leu AsnTyr Leu Ala Arg Leu Ser Ser Arg His Ile Pro Asn Asn Ala Leu Asn
305 310 315 320 305 310 315 320
Ala Val Leu Gly Cys Cys Val Val Ser Thr Leu Val Ile His Ala LeuAla Val Leu Gly Cys Cys Val Val Ser Thr Leu Val Ile His Ala Leu
325 330 335 325 330 335
Glu Ile Asn Leu Asp Ala Leu Ile Ile Tyr Ala Asn Gly Ile Phe IleGlu Ile Asn Leu Asp Ala Leu Ile Ile Tyr Ala Asn Gly Ile Phe Ile
340 345 350 340 345 350
Met Ile Tyr Leu Leu Cys Met Leu Ala Gly Cys Lys Leu Leu Gln GlyMet Ile Tyr Leu Leu Cys Met Leu Ala Gly Cys Lys Leu Leu Gln Gly
355 360 365 355 360 365
Arg Tyr Arg Leu Leu Ala Val Val Gly Gly Leu Leu Cys Val Leu LeuArg Tyr Arg Leu Leu Ala Val Val Gly Gly Leu Leu Cys Val Leu Leu
370 375 380 370 375 380
Leu Ala Met Val Gly Trp Lys Ser Leu Tyr Ala Leu Ile Met Leu AlaLeu Ala Met Val Gly Trp Lys Ser Leu Tyr Ala Leu Ile Met Leu Ala
385 390 395 400 385 390 395 400
Gly Leu Trp Leu Leu Leu Pro Lys Arg Lys Thr Pro Glu Asn Gly IleGly Leu Trp Leu Leu Leu Pro Lys Arg Lys Thr Pro Glu Asn Gly Ile
405 410 415 405 410 415
Thr ThrThr Thr
<210> 2<210> 2
<211> 1257<211> 1257
<212> ДНК<212> DNA
<213> Неизвестно<213> Unknown
<220><220>
<223> Escherichia coli yjeH<223> Escherichia coli yjeH
<400> 2<400> 2
atgagtggac tcaaacaaga actggggctg gcccagggca ttggcctgct atcgacgtca 60atgagtggac tcaaacaaga actggggctg gccccagggca ttggcctgct atcgacgtca 60
ttattaggca ctggcgtgtt tgccgttcct gcgttagctg cgctggtagc gggcaataac 120ttattaggca ctggcgtgtt tgccgttcct gcgttagctg cgctggtagc gggcaataac 120
agcctgtggg cgtggcccgt tttgattatc ttagtgttcc cgattgcgat tgtgtttgcg 180agcctgtggg cgtggcccgt tttgattatc ttagtgttcc cgattgcgat tgtgtttgcg 180
attctgggtc gccactatcc cagcgcaggc ggcgtcgcgc acttcgtcgg tatggcgttt 240attctgggtc gccactatcc cagcgcaggc ggcgtcgcgc acttcgtcgg tatggcgttt 240
ggttcgcggc ttgagcgagt caccggctgg ctgtttttat cggtcattcc cgtgggtttg 300ggttcgcggc ttgagcgagt caccggctgg ctgtttttat cggtcattcc cgtgggtttg 300
cctgccgcac tacaaattgc cgccgggttc ggccaggcga tgtttggctg gcatagctgg 360cctgccgcac tacaaattgc cgccgggttc ggccaggcga tgtttggctg gcatagctgg 360
caactgttgt tggcagaact cggtacgctg gcgctggtgt ggtatatcgg tactcgcggt 420caactgttgt tggcagaact cggtacgctg gcgctggtgt ggtatatcgg tactcgcggt 420
gccagttcca gtgctaatct acaaaccgtt attgccggac ttatcgtcgc gctgattgtc 480gccagttcca gtgctaatct acaaaccgtt attgccggac ttatcgtcgc gctgattgtc 480
gctatctggt gggcgggcga tatcaaacct gcgaatatcc cctttccggc acctggtaat 540gctatctggt gggcgggcga tatcaaacct gcgaatatcc cctttccggc acctggtaat 540
atcgaactta ccgggttatt tgctgcgtta tcagtgatgt tctggtgttt tgtcggtctg 600atcgaactta ccgggttatt tgctgcgtta tcagtgatgt tctggtgttt tgtcggtctg 600
gaggcatttg cccatctcgc ctcggaattt aaaaatccag agcgtgattt tcctcgtgct 660gaggcatttg cccatctcgc ctcggaattt aaaaatccag agcgtgattt tcctcgtgct 660
ttgatgattg gtctgctgct ggcaggatta gtctactggg gctgtacggt agtcgtctta 720ttgatgattg gtctgctgct ggcaggatta gtctactggg gctgtacggt agtcgtctta 720
cacttcgacg cctatggtga aaaaatggcg gcggcagcat cgcttccaaa aattgtagtg 780cacttcgacg cctatggtga aaaaatggcg gcggcagcat cgcttccaaa aattgtagtg 780
cagttgttcg gtgtaggagc gttatggatt gcctgcgtga ttggctatct ggcctgcttt 840cagttgttcg gtgtaggagc gttatggatt gcctgcgtga ttggctatct ggcctgcttt 840
gccagtctca acatttatat acagagcttc gcccgcctgg tctggtcgca ggcgcaacat 900gccagtctca acatttatat acagagcttc gcccgcctgg tctggtcgca ggcgcaacat 900
aatcctgacc actacctggc acgcctctct tctcgccata tcccgaataa tgccctcaat 960aatcctgacc actacctggc acgcctctct tctcgccata tcccgaataa tgccctcaat 960
gcggtgctcg gctgctgtgt ggtgagcact ttggtgattc atgctttaga gatcaatctg 1020gcggtgctcg gctgctgtgt ggtgagcact ttggtgattc atgctttaga gatcaatctg 1020
gacgctctta ttatttatgc caatggcatc tttattatga tttatctgtt atgcatgctg 1080gacgctctta ttatttatgc caatggcatc tttattatga tttatctgtt atgcatgctg 1080
gcaggctgta aattattgca aggacgttat cgactactgg cggtggttgg cgggctgtta 1140gcaggctgta aattattgca aggacgttat cgactactgg cggtggttgg cgggctgtta 1140
tgcgttctgt tactggcaat ggtcggctgg aaaagtctct atgcgctgat catgctggcg 1200tgcgttctgt tactggcaat ggtcggctgg aaaagtctct atgcgctgat catgctggcg 1200
gggttatggc tgttgctgcc aaaacgaaaa acgccggaaa atggcataac cacataa 1257gggttatggc tgttgctgcc aaaacgaaaa acgccggaaa atggcataac cacataa 1257
<210> 3<210> 3
<211> 267<211> 267
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Tn2335<223> Tn2335
<400> 3<400> 3
gtggcctaca ccttcgacca cgtcgtcgcc tggcgctggt gcaccaaaga agacgcctac 60gtggcctaca ccttcgacca cgtcgtcgcc tggcgctggt gcaccaaaga agacgcctac 60
aactacaccc acctcttcga tcaactccaa ccacccttaa tcgtgaccac cgacggacaa 120aactacaccc acctcttcga tcaactccaa ccacccttaa tcgtgaccac cgacggacaa 120
aaaaggcgca ctcaaagcca tcaccacgac ctggccgaca acgaaaatcc aacgctgcct 180aaaaggcgca ctcaaagcca tcaccacgac ctggccgaca acgaaaatcc aacgctgcct 180
cgtccacgtc aaacgcaacg tccaaaaaca cgtcacccta agacccgtgc tgagctcgcc 240cgtccacgtc aaacgcaacg tccaaaaaca cgtcacccta agacccgtgc tgagctcgcc 240
gaaaagcact ccggggtctc tccttga 267gaaaagcact ccggggtctc tccttga 267
<210> 4<210> 4
<211> 39<211> 39
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Tn_5 F<223> Tn_5 F
<400> 4<400> 4
tgaattcgag ctcggtaccc caccgacgcg catctgcct 39tgaattcgag ctcggtaccc caccgacgcg catctgcct 39
<210> 5<210> 5
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Tn_5 R<223> Tn_5 R
<400> 5<400> 5
ggtgtggtga ctttcagcag ttcccggggg ggaggaggca tgtggtgttg 50ggtgtggtga ctttcagcag ttcccggggg gggaggaggca tgtggtgttg 50
<210> 6<210> 6
<211> 50<211> 50
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Tn_3 F<223> Tn_3 F
<400> 6<400> 6
caacaccaca tgcctcctcc cccccgggaa ctgctgaaag tcaccacacc 50caacaccaca tgcctcctcc cccccgggaa ctgctgaaag tcaccacacc 50
<210> 7<210> 7
<211> 42<211> 42
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Tn_3 R<223> Tn_3 R
<400> 7<400> 7
gtcgactcta gaggatcccc ctcccaaacc attgaggaat gg 42gtcgactcta gaggatcccc ctcccaaacc attgaggaat gg 42
<210> 8<210> 8
<211> 318<211> 318
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> CJ7<223>CJ7
<400> 8<400> 8
agaaacatcc cagcgctact aatagggagc gttgaccttc cttccacgga ccggtaatcg 60agaaacatcc cagcgctact aatagggagc gttgaccttc cttccacgga ccggtaatcg 60
gagtgcctaa aaccgcatgc ggcttaggct ccaagatagg ttctgcgcgg ccgggtaatg 120gagtgcctaa aaccgcatgc ggcttaggct ccaagatagg ttctgcgcgg ccgggtaatg 120
catcttcttt agcaacaagt tgaggggtag gtgcaaataa gaacgacata gaaatcgtct 180catcttcttt agcaacaagt tgaggggtag gtgcaaataa gaacgacata gaaatcgtct 180
cctttctgtt tttaatcaac atacaccacc acctaaaaat tccccgacca gcaagttcac 240cctttctgtt tttaatcaac atacaccacc acctaaaaat tccccgacca gcaagttcac 240
agtattcggg cacaatatcg ttgccaaaat attgtttcgg aatatcatgg gatacgtacc 300agtattcggg cacaatatcg ttgccaaaat attgtttcgg aatatcatgg gatacgtacc 300
caacgaaagg aaacactc 318caacgaaagg aaacactc 318
<210> 9<210> 9
<211> 39<211> 39
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> CJ7_yjeH F<223> CJ7_yjeH F
<400> 9<400> 9
acaccacatg cctcctcccc agaaacatcc cagcgctac 39acaccacatg cctcctcccc agaaacatcc cagcgctac 39
<210> 10<210> 10
<211> 43<211> 43
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> CJ7_yjeH R<223> CJ7_yjeH R
<400> 10<400> 10
agttcttgtt tgagtccact catagtgttt cctttcgttg ggt 43agttcttgtt tgagtccact catagtgttt cctttcgttg ggt 43
<210> 11<210> 11
<211> 44<211> 44
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> yjeH F<223> yjeH F
<400> 11<400> 11
acccaacgaa aggaaacact atgagtggac tcaaacaaga actg 44acccaacgaa aggaaacact atgagtggac tcaaacaaga actg 44
<210> 12<210> 12
<211> 44<211> 44
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> yjeH R<223> yjeH R
<400> 12<400> 12
gactttcagc agttcccggg ttatgtggtt atgccatttt ccgg 44gactttcagc agttcccggg ttatgtggtt atgccatttt ccgg 44
<210> 13<210> 13
<211> 23<211> 23
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> F92N F<223>F92N F
<400> 13<400> 13
cggctggctg aatttatcgg tca 23cggctggctg aatttatcgg tca 23
<210> 14<210> 14
<211> 23<211> 23
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> F92N R<223>F92N R
<400> 14<400> 14
tgaccgataa attcagccag ccg 23tgaccgataa attcagccag ccg 23
<210> 15<210> 15
<211> 23<211> 23
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> F351L F<223>F351L F
<400> 15<400> 15
caatggcatc cttattatga ttt 23caatggcatc cttattatga ttt 23
<210> 16<210> 16
<211> 23<211> 23
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> F351L R<223>F351L R
<400> 16<400> 16
aaatcataat aaggatgcca ttg 23aaatcataat aaggatgcca ttg 23
<210> 17<210> 17
<211> 1161<211> 1161
<212> ДНК<212> DNA
<213> Неизвестно<213> Unknown
<220><220>
<223> Corynebacterium glutamicum metB<223> Corynebacterium glutamicum metB
<400> 17<400> 17
ttgtcttttg acccaaacac ccagggtttc tccactgcat cgattcacgc tgggtatgag 60ttgtcttttg acccaaacac cccaggtttc tccactgcat cgattcacgc tgggtatgag 60
ccagacgact actacggttc gattaacacc ccaatctatg cctccaccac cttcgcgcag 120cgacgact actacggttc gattaacacc ccaatctatg cctccaccac cttcgcgcag 120
aacgctccaa acgaactgcg caaaggctac gagtacaccc gtgtgggcaa ccccaccatc 180aacgctccaa acgaactgcg caaaggctac gagtacaccc gtgtgggcaa ccccaccatc 180
gtggcattag agcagaccgt cgcagcactc gaaggcgcaa agtatggccg cgcattctcc 240gtggcattag agcagaccgt cgcagcactc gaaggcgcaa agtatggccg cgcattctcc 240
tccggcatgg ctgcaaccga catcctgttc cgcatcatcc tcaagccggg cgatcacatc 300tccggcatgg ctgcaaccga catcctgttc cgcatcatcc tcaagccggg cgatcacatc 300
gtcctcggca acgatgctta cggcggaacc taccgcctga tcgacaccgt attcaccgca 360gtcctcggca acgatgctta cggcggaacc taccgcctga tcgacaccgt attcaccgca 360
tggggcgtcg aatacaccgt tgttgatacc tccgtcgtgg aagaggtcaa ggcagcgatc 420tggggcgtcg aatacaccgt tgttgatacc tccgtcgtgg aagaggtcaa ggcagcgatc 420
aaggacaaca ccaagctgat ctgggtggaa accccaacca acccagcact tggcatcacc 480aaggacaaca ccaagctgat ctgggtggaa accccaacca acccagcact tggcatcacc 480
gacatcgaag cagtagcaaa gctcaccgaa ggcaccaacg ccaagctggt tgttgacaac 540gacatcgaag cagtagcaaa gctcaccgaa ggcaccaacg ccaagctggt tgttgacaac 540
accttcgcat ccccatacct gcagcagcca ctaaaactcg gcgcacacgc agtcctgcac 600accttcgcat ccccatacct gcagcagcca ctaaaactcg gcgcacacgc agtcctgcac 600
tccaccacca agtacatcgg aggacactcc gacgttgttg gcggccttgt ggttaccaac 660tccaccacca agtacatcgg aggacactcc gacgttgttg gcggccttgt ggttaccaac 660
gaccaggaaa tggacgaaga actgctgttc atgcagggcg gcatcggacc gatcccatca 720gaccaggaaa tggacgaaga actgctgttc atgcagggcg gcatcggacc gatcccatca 720
gttttcgatg catacctgac cgcccgtggc ctcaagaccc ttgcagtgcg catggatcgc 780gttttcgatg catacctgac cgcccgtggc ctcaagaccc ttgcagtgcg catggatcgc 780
cactgcgaca acgcagaaaa gatcgcggaa ttcctggact cccgcccaga ggtctccacc 840cactgcgaca acgcagaaaa gatcgcggaa ttcctggact cccgcccaga ggtctccacc 840
gtgctctacc caggtctgaa gaaccaccca ggccacgaag tcgcagcgaa gcagatgaag 900gtgctctacc caggtctgaa gaaccaccca ggccacgaag tcgcagcgaa gcagatgaag 900
cgcttcggcg gcatgatctc cgtccgtttc gcaggcggcg aagaagcagc taagaagttc 960cgcttcggcg gcatgatctc cgtccgtttc gcaggcggcg aagaagcagc taagaagttc 960
tgtacctcca ccaaactgat ctgtctggcc gagtccctcg gtggcgtgga atccctcctg 1020tgtacctcca ccaaactgat ctgtctggcc gagtccctcg gtggcgtgga atccctcctg 1020
gagcacccag caaccatgac ccaccagtca gctgccggct ctcagctcga ggttccccgc 1080gagcacccag caaccatgac ccaccagtca gctgccggct ctcagctcga ggttccccgc 1080
gacctcgtgc gcatctccat tggtattgaa gacattgaag acctgctcgc agatgtcgag 1140gacctcgtgc gcatctccat tggtattgaa gacattgaag acctgctcgc agatgtcgag 1140
caggccctca ataaccttta g 1161caggccctca ataaccttta g 1161
<210> 18<210> 18
<211> 24<211> 24
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> metB_N_del F<223> metB_N_del F
<400> 18<400> 18
tctagacgcc cgcatactgg cttc 24tctagacgcc cgcatactgg cttc 24
<210> 19<210> 19
<211> 37<211> 37
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> metB_N_del R<223> metB_N_del R
<400> 19<400> 19
cccatccact aaacttaaac agatgtgatc gcccggc 37cccatccact aaacttaaac agatgtgatc gcccggc 37
<210> 20<210> 20
<211> 38<211> 38
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> metB_C_del F<223> metB_C_del F
<400> 20<400> 20
tgtttaagtt tagtggatgg ggaagaacca cccaggcc 38tgtttaagtt tagtggatgg ggaagaacca cccaggcc 38
<210> 21<210> 21
<211> 23<211> 23
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> metB_C_del R<223> metB_C_del R
<400> 21<400> 21
gtcgaccaat cgtccagagg gcg 23gtcgaccaat cgtccagagg gcg 23
<210> 22<210> 22
<211> 1314<211> 1314
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Corynebacterium glutamicum metY<223> Corynebacterium glutamicum metY
<400> 22<400> 22
atgccaaagt acgacaattc caatgctgac cagtggggct ttgaaacccg ctccattcac 60atgccaaagt acgacaattc caatgctgac cagtggggct ttgaaacccg ctccattcac 60
gcaggccagt cagtagacgc acagaccagc gcacgaaacc ttccgatcta ccaatccacc 120gcaggccagt cagtagacgc acagaccagc gcacgaaacc ttccgatcta ccaatccacc 120
gctttcgtgt tcgactccgc tgagcacgcc aagcagcgtt tcgcacttga ggatctaggc 180gctttcgtgt tcgactccgc tgagcacgcc aagcagcgtt tcgcacttga ggatctaggc 180
cctgtttact cccgcctcac caacccaacc gttgaggctt tggaaaaccg catcgcttcc 240cctgtttact cccgcctcac caacccaacc gttgaggctt tggaaaaccg catcgcttcc 240
ctcgaaggtg gcgtccacgc tgtagcgttc tcctccggac aggccgcaac caccaacgcc 300ctcgaaggtg gcgtccacgc tgtagcgttc tcctccggac aggccgcaac caccaacgcc 300
attttgaacc tggcaggagc gggcgaccac atcgtcacct ccccacgcct ctacggtggc 360attttgaacc tggcaggagc gggcgaccac atcgtcacct ccccacgcct ctacggtggc 360
accgagactc tattccttat cactcttaac cgcctgggta tcgatgtttc cttcgtggaa 420accgagactc tattccttat cactcttaac cgcctgggta tcgatgtttc cttcgtggaa 420
aaccccgacg accctgagtc ctggcaggca gccgttcagc caaacaccaa agcattcttc 480aaccccgacg accctgagtc ctggcaggca gccgttcagc caaacaccaa agcattcttc 480
ggcgagactt tcgccaaccc acaggcagac gtcctggata ttcctgcggt ggctgaagtt 540ggcgagactt tcgccaaccc acaggcagac gtcctggata ttcctgcggt ggctgaagtt 540
gcgcaccgca acagcgttcc actgatcatc gacaacacca tcgctaccgc agcgctcgtg 600gcgcaccgca acagcgttcc actgatcatc gacaacacca tcgctaccgc agcgctcgtg 600
cgcccgctcg agctcggcgc agacgttgtc gtcgcttccc tcaccaagtt ctacaccggc 660cgcccgctcg agctcggcgc agacgttgtc gtcgcttccc tcaccaagtt ctacaccggc 660
aacggctccg gactgggcgg cgtgcttatc gacggcggaa agttcgattg gactgtcgaa 720aacggctccg gactgggcgg cgtgcttatc gacggcggaa agttcgattg gactgtcgaa 720
aaggatggaa agccagtatt cccctacttc gtcactccag atgctgctta ccacggattg 780aaggatggaa agccagtatt cccctacttc gtcactccag atgctgctta ccacggattg 780
aagtacgcag accttggtgc accagccttc ggcctcaagg ttcgcgttgg ccttctacgc 840aagtacgcag accttggtgc accagccttc ggcctcaagg ttcgcgttgg ccttctacgc 840
gacaccggct ccaccctctc cgcattcaac gcatgggctg cagtccaggg catcgacacc 900gacaccggct ccaccctctc cgcattcaac gcatgggctg cagtccaggg catcgacacc 900
ctttccctgc gcctggagcg ccacaacgaa aacgccatca aggttgcaga attcctcaac 960ctttccctgc gcctggagcg ccacaacgaa aacgccatca aggttgcaga attcctcaac 960
aaccacgaga aggtggaaaa ggttaacttc gcaggcctga aggattcccc ttggtacgca 1020aaccacgaga aggtggaaaa ggttaacttc gcaggcctga aggattcccc ttggtacgca 1020
accaaggaaa agcttggcct gaagtacacc ggctccgttc tcaccttcga gatcaagggc 1080accaaggaaa agcttggcct gaagtacacc ggctccgttc tcaccttcga gatcaagggc 1080
ggcaaggatg aggcttgggc atttatcgac gccctgaagc tacactccaa ccttgcaaac 1140ggcaaggatg aggcttgggc atttatcgac gccctgaagc tacactccaa ccttgcaaac 1140
atcggcgatg ttcgctccct cgttgttcac ccagcaacca ccacccattc acagtccgac 1200atcggcgatg ttcgctccct cgttgttcac ccagcaacca ccacccattc acagtccgac 1200
gaagctggcc tggcacgcgc gggcgttacc cagtccaccg tccgcctgtc cgttggcatc 1260gaagctggcc tggcacgcgc gggcgttacc cagtccaccg tccgcctgtc cgttggcatc 1260
gagaccattg atgatatcat cgctgacctc gaaggcggct ttgctgcaat ctag 1314gagaaccattg atgatatcat cgctgacctc gaaggcggct ttgctgcaat ctag 1314
<210> 23<210> 23
<211> 24<211> 24
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> metY_N_del F<223> metY_N_del F
<400> 23<400> 23
tctagaccat cctgcaccat ttag 24tctagaccat cctgcaccat ttag 24
<210> 24<210> 24
<211> 37<211> 37
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> metY_N_del R<223> metY_N_del R
<400> 24<400> 24
cccatccact aaacttaaac acgctcctgc caggttc 37cccatccact aaacttaaac acgctcctgc caggttc 37
<210> 25<210> 25
<211> 39<211> 39
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> metY_C_del F<223> metY_C_del F
<400> 25<400> 25
tgtttaagtt tagtggatgg gcttggtacg caaccaagg 39tgtttaagtt tagtggatgg gcttggtacg caaccaagg 39
<210> 26<210> 26
<211> 23<211> 23
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> metY_C_del R<223> metY_C_del R
<400> 26<400> 26
gtcgacgatt gctccggctt cgg 23gtcgacgatt gctccggctt cgg 23
<210> 27<210> 27
<211> 1266<211> 1266
<212> ДНК<212> DNA
<213> Неизвестно<213> Unknown
<220><220>
<223> Corynebacterium glutamicum lysC<223> Corynebacterium glutamicum lysC
<400> 27<400> 27
gtggccctgg tcgtacagaa atatggcggt tcctcgcttg agagtgcgga acgcattaga 60gtggccctgg tcgtacagaa atatggcggt tcctcgcttg agagtgcgga acgcattaga 60
aacgtcgctg aacggatcgt tgccaccaag aaggctggaa atgatgtcgt ggttgtctgc 120aacgtcgctg aacggatcgt tgccaccaag aaggctggaa atgatgtcgt ggttgtctgc 120
tccgcaatgg gagacaccac ggatgaactt ctagaacttg cagcggcagt gaatcccgtt 180tccgcaatgg gagacaccac ggatgaactt ctagaacttg cagcggcagt gaatcccgtt 180
ccgccagctc gtgaaatgga tatgctcctg actgctggtg agcgtatttc taacgctctc 240ccgccagctc gtgaaatgga tatgctcctg actgctggtg agcgtatttc taacgctctc 240
gtcgccatgg ctattgagtc ccttggcgca gaagcccaat ctttcacggg ctctcaggct 300gtcgccatgg ctattgagtc ccttggcgca gaagcccaat ctttcacggg ctctcaggct 300
ggtgtgctca ccaccgagcg ccacggaaac gcacgcattg ttgatgtcac tccaggtcgt 360ggtgtgctca ccaccgagcg ccacggaaac gcacgcattg ttgatgtcac tccaggtcgt 360
gtgcgtgaag cactcgatga gggcaagatc tgcattgttg ctggtttcca gggtgttaat 420gtgcgtgaag cactcgatga gggcaagatc tgcattgttg ctggtttcca gggtgttaat 420
aaagaaaccc gcgatgtcac cacgttgggt cgtggtggtt ctgacaccac tgcagttgcg 480aaagaaaccc gcgatgtcac cacgttgggt cgtggtggtt ctgacaccac tgcagttgcg 480
ttggcagctg ctttgaacgc tgatgtgtgt gagatttact cggacgttga cggtgtgtat 540ttggcagctg ctttgaacgc tgatgtgtgt gagatttact cggacgttga cggtgtgtat 540
accgctgacc cgcgcatcgt tcctaatgca cagaagctgg aaaagctcag cttcgaagaa 600accgctgacc cgcgcatcgt tcctaatgca cagaagctgg aaaagctcag cttcgaagaa 600
atgctggaac ttgctgctgt tggctccaag attttggtgc tgcgcagtgt tgaatacgct 660atgctggaac ttgctgctgt tggctccaag attttggtgc tgcgcagtgt tgaatacgct 660
cgtgcattca atgtgccact tcgcgtacgc tcgtcttata gtaatgatcc cggcactttg 720cgtgcattca atgtgccact tcgcgtacgc tcgtcttata gtaatgatcc cggcactttg 720
attgccggct ctatggagga tattcctgtg gaagaagcag tccttaccgg tgtcgcaacc 780attgccggct ctatggagga tattcctgtg gaagaagcag tccttaccgg tgtcgcaacc 780
gacaagtccg aagccaaagt aaccgttctg ggtatttccg ataagccagg cgaggctgcg 840gacaagtccg aagccaaagt aaccgttctg ggtatttccg ataagccagg cgaggctgcg 840
aaggttttcc gtgcgttggc tgatgcagaa atcaacattg acatggttct gcagaacgtc 900aaggttttcc gtgcgttggc tgatgcagaa atcaacattg acatggttct gcagaacgtc 900
tcttctgtag aagacggcac caccgacatc accttcacct gccctcgttc cgacggccgc 960tcttctgtag aagacggcac caccgacatc accttcacct gccctcgttc cgacggccgc 960
cgcgcgatgg agatcttgaa gaagcttcag gttcagggca actggaccaa tgtgctttac 1020cgcgcgatgg agatcttgaa gaagcttcag gttcagggca actggaccaa tgtgctttac 1020
gacgaccagg tcggcaaagt ctccctcgtg ggtgctggca tgaagtctca cccaggtgtt 1080gacgaccagg tcggcaaagt ctccctcgtg ggtgctggca tgaagtctca cccaggtgtt 1080
accgcagagt tcatggaagc tctgcgcgat gtcaacgtga acatcgaatt gatttccacc 1140accgcagagt tcatggaagc tctgcgcgat gtcaacgtga acatcgaatt gatttccacc 1140
tctgagattc gtatttccgt gctgatccgt gaagatgatc tggatgctgc tgcacgtgca 1200tctgagattc gtatttccgt gctgatccgt gaagatgatc tggatgctgc tgcacgtgca 1200
ttgcatgagc agttccagct gggcggcgaa gacgaagccg tcgtttatgc aggcaccgga 1260ttgcatgagc agttccagct gggcggcgaa gacgaagccg tcgtttatgc aggcaccgga 1260
cgctaa 1266cgctaa 1266
<210> 28<210> 28
<211> 29<211> 29
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> lysC_L377K_5 F<223> lysC_L377K_5 F
<400> 28<400> 28
tcctctagag ctgcgcagtg ttgaatacg 29tcctctagag ctgcgcagtg ttgaatacg 29
<210> 29<210> 29
<211> 23<211> 23
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> lysC_L377K_5 R<223> lysC_L377K_5 R
<400> 29<400> 29
aggtggaaat cttttcgatg ttc 23aggtggaaat cttttcgatg ttc 23
<210> 30<210> 30
<211> 23<211> 23
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> lysC_L377K_3 F<223> lysC_L377K_3 F
<400> 30<400> 30
gaacatcgaa aagatttcca cct 23gaacatcgaa aagatttcca cct 23
<210> 31<210> 31
<211> 29<211> 29
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> lysC_L377K_3 R<223> lysC_L377K_3 R
<400> 31<400> 31
gactctagag ttcacctcag agacgatta 29gactctagag ttcacctcag agacgatta 29
<210> 32<210> 32
<211> 1134<211> 1134
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Corynebacterium glutamicum metX<223> Corynebacterium glutamicum metX
<400> 32<400> 32
atgcccaccc tcgcgccttc aggtcaactt gaaatccaag cgatcggtga tgtctccacc 60atgcccaccc tcgcgccttc aggtcaactt gaaatccaag cgatcggtga tgtctccacc 60
gaagccggag caatcattac aaacgctgaa atcgcctatc accgctgggg tgaataccgc 120gaagccggag caatcattac aaacgctgaa atcgcctatc accgctgggg tgaataccgc 120
gtagataaag aaggacgcag caatgtcgtt ctcatcgaac acgccctcac tggagattcc 180gtagataaag aaggacgcag caatgtcgtt ctcatcgaac acgccctcac tggagattcc 180
aacgcagccg attggtgggc tgacttgctc ggtcccggca aagccatcaa cactgatatt 240aacgcagccg attggtgggc tgacttgctc ggtcccggca aagccatcaa cactgatatt 240
tactgcgtga tctgtaccaa cgtcatcggt ggttgcaacg gttccaccgg acctggctcc 300tactgcgtga tctgtaccaa cgtcatcggt ggttgcaacg gttccaccgg acctggctcc 300
atgcatccag atggaaattt ctggggtaat cgcttccccg ccacgtccat tcgtgatcag 360atgcatccag atggaaattt ctggggtaat cgcttccccg ccacgtccat tcgtgatcag 360
gtaaacgccg aaaaacaatt cctcgacgca ctcggcatca ccacggtcgc cgcagtactt 420gtaaacgccg aaaaacaatt cctcgacgca ctcggcatca ccacggtcgc cgcagtactt 420
ggtggttcca tgggtggtgc ccgcacccta gagtgggccg caatgtaccc agaaactgtt 480ggtggttcca tgggtggtgc ccgcacccta gagtgggccg caatgtaccc agaaactgtt 480
ggcgcagctg ctgttcttgc agtttctgca cgcgccagcg cctggcaaat cggcattcaa 540ggcgcagctg ctgttcttgc agtttctgca cgcgccagcg cctggcaaat cggcattcaa 540
tccgcccaaa ttaaggcgat tgaaaacgac caccactggc acgaaggcaa ctactacgaa 600tccgcccaaa ttaaggcgat tgaaaacgac caccactggc acgaaggcaa ctactacgaa 600
tccggctgca acccagccac cggactcggc gccgcccgac gcatcgccca cctcacctac 660tccggctgca acccagccac cggactcggc gccgcccgac gcatcgccca cctcacctac 660
cgtggcgaac tagaaatcga cgaacgcttc ggcaccaaag cccaaaagaa cgaaaaccca 720cgtggcgaac tagaaatcga cgaacgcttc ggcaccaaag cccaaaagaa cgaaaaccca 720
ctcggtccct accgcaagcc cgaccagcgc ttcgccgtgg aatcctactt ggactaccaa 780ctcggtccct accgcaagcc cgaccagcgc ttcgccgtgg aatcctactt ggactaccaa 780
gcagacaagc tagtacagcg tttcgacgcc ggctcctacg tcttgctcac cgacgccctc 840gcagacaagc tagtacagcg tttcgacgcc ggctcctacg tcttgctcac cgacgccctc 840
aaccgccacg acattggtcg cgaccgcgga ggcctcaaca aggcactcga atccatcaaa 900aaccgccacg acattggtcg cgaccgcgga ggcctcaaca aggcactcga atccatcaaa 900
gttccagtcc ttgtcgcagg cgtagatacc gatattttgt acccctacca ccagcaagaa 960gttccagtcc ttgtcgcagg cgtagatacc gatattttgt acccctacca ccagcaagaa 960
cacctctcca gaaacctggg aaatctactg gcaatggcaa aaatcgtatc ccctgtcggc 1020cacctctcca gaaacctggg aaatctactg gcaatggcaa aaatcgtatc ccctgtcggc 1020
cacgatgctt tcctcaccga aagccgccaa atggatcgca tcgtgaggaa cttcttcagc 1080cacgatgctt tcctcaccga aagccgccaa atggatcgca tcgtgaggaa cttcttcagc 1080
ctcatctccc cagacgaaga caacccttcg acctacatcg agttctacat ctaa 1134ctcatctccc cagacgaaga caacccttcg acctacatcg agttctacat ctaa 1134
<210> 33<210> 33
<211> 28<211> 28
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> metX F<223> metX F
<400> 33<400> 33
ggatcccctc gttgttcacc cagcaacc 28ggatcccctc gttgttcacc cagcaacc 28
<210> 34<210> 34
<211> 30<211> 30
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> metX R<223> metX R
<400> 34<400> 34
ggatcccaaa gtcacaacta cttatgttag 30ggatcccaaa gtcacaacta cttatgttag 30
<210> 35<210> 35
<211> 418<211> 418
<212> PRT<212>PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> YjeH F92N<223> YjeH F92N
<400> 35<400> 35
Met Ser Gly Leu Lys Gln Glu Leu Gly Leu Ala Gln Gly Ile Gly LeuMet Ser Gly Leu Lys Gln Glu Leu Gly Leu Ala Gln Gly Ile Gly Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Ser Thr Ser Leu Leu Gly Thr Gly Val Phe Ala Val Pro Ala LeuLeu Ser Thr Ser Leu Leu Gly Thr Gly Val Phe Ala Val Pro Ala Leu
20 25 30 20 25 30
Ala Ala Leu Val Ala Gly Asn Asn Ser Leu Trp Ala Trp Pro Val LeuAla Ala Leu Val Ala Gly Asn Asn Ser Leu Trp Ala Trp Pro Val Leu
35 40 45 35 40 45
Ile Ile Leu Val Phe Pro Ile Ala Ile Val Phe Ala Ile Leu Gly ArgIle Ile Leu Val Phe Pro Ile Ala Ile Val Phe Ala Ile Leu Gly Arg
50 55 60 50 55 60
His Tyr Pro Ser Ala Gly Gly Val Ala His Phe Val Gly Met Ala PheHis Tyr Pro Ser Ala Gly Gly Val Ala His Phe Val Gly Met Ala Phe
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Ser Arg Leu Glu Arg Val Thr Gly Trp Leu Asn Leu Ser Val IleGly Ser Arg Leu Glu Arg Val Thr Gly Trp Leu Asn Leu Ser Val Ile
85 90 95 85 90 95
Pro Val Gly Leu Pro Ala Ala Leu Gln Ile Ala Ala Gly Phe Gly GlnPro Val Gly Leu Pro Ala Ala Leu Gln Ile Ala Ala Gly Phe Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Ala Met Phe Gly Trp His Ser Trp Gln Leu Leu Leu Ala Glu Leu GlyAla Met Phe Gly Trp His Ser Trp Gln Leu Leu Leu Ala Glu Leu Gly
115 120 125 115 120 125
Thr Leu Ala Leu Val Trp Tyr Ile Gly Thr Arg Gly Ala Ser Ser SerThr Leu Ala Leu Val Trp Tyr Ile Gly Thr Arg Gly Ala Ser Ser Ser
130 135 140 130 135 140
Ala Asn Leu Gln Thr Val Ile Ala Gly Leu Ile Val Ala Leu Ile ValAla Asn Leu Gln Thr Val Ile Ala Gly Leu Ile Val Ala Leu Ile Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Ala Ile Trp Trp Ala Gly Asp Ile Lys Pro Ala Asn Ile Pro Phe ProAla Ile Trp Trp Ala Gly Asp Ile Lys Pro Ala Asn Ile Pro Phe Pro
165 170 175 165 170 175
Ala Pro Gly Asn Ile Glu Leu Thr Gly Leu Phe Ala Ala Leu Ser ValAla Pro Gly Asn Ile Glu Leu Thr Gly Leu Phe Ala Ala Leu Ser Val
180 185 190 180 185 190
Met Phe Trp Cys Phe Val Gly Leu Glu Ala Phe Ala His Leu Ala SerMet Phe Trp Cys Phe Val Gly Leu Glu Ala Phe Ala His Leu Ala Ser
195 200 205 195 200 205
Glu Phe Lys Asn Pro Glu Arg Asp Phe Pro Arg Ala Leu Met Ile GlyGlu Phe Lys Asn Pro Glu Arg Asp Phe Pro Arg Ala Leu Met Ile Gly
210 215 220 210 215 220
Leu Leu Leu Ala Gly Leu Val Tyr Trp Gly Cys Thr Val Val Val LeuLeu Leu Leu Ala Gly Leu Val Tyr Trp Gly Cys Thr Val Val Val Leu
225 230 235 240 225 230 235 240
His Phe Asp Ala Tyr Gly Glu Lys Met Ala Ala Ala Ala Ser Leu ProHis Phe Asp Ala Tyr Gly Glu Lys Met Ala Ala Ala Ala Ser Leu Pro
245 250 255 245 250 255
Lys Ile Val Val Gln Leu Phe Gly Val Gly Ala Leu Trp Ile Ala CysLys Ile Val Val Gln Leu Phe Gly Val Gly Ala Leu Trp Ile Ala Cys
260 265 270 260 265 270
Val Ile Gly Tyr Leu Ala Cys Phe Ala Ser Leu Asn Ile Tyr Ile GlnVal Ile Gly Tyr Leu Ala Cys Phe Ala Ser Leu Asn Ile Tyr Ile Gln
275 280 285 275 280 285
Ser Phe Ala Arg Leu Val Trp Ser Gln Ala Gln His Asn Pro Asp HisSer Phe Ala Arg Leu Val Trp Ser Gln Ala Gln His Asn Pro Asp His
290 295 300 290 295 300
Tyr Leu Ala Arg Leu Ser Ser Arg His Ile Pro Asn Asn Ala Leu AsnTyr Leu Ala Arg Leu Ser Ser Arg His Ile Pro Asn Asn Ala Leu Asn
305 310 315 320 305 310 315 320
Ala Val Leu Gly Cys Cys Val Val Ser Thr Leu Val Ile His Ala LeuAla Val Leu Gly Cys Cys Val Val Ser Thr Leu Val Ile His Ala Leu
325 330 335 325 330 335
Glu Ile Asn Leu Asp Ala Leu Ile Ile Tyr Ala Asn Gly Ile Phe IleGlu Ile Asn Leu Asp Ala Leu Ile Ile Tyr Ala Asn Gly Ile Phe Ile
340 345 350 340 345 350
Met Ile Tyr Leu Leu Cys Met Leu Ala Gly Cys Lys Leu Leu Gln GlyMet Ile Tyr Leu Leu Cys Met Leu Ala Gly Cys Lys Leu Leu Gln Gly
355 360 365 355 360 365
Arg Tyr Arg Leu Leu Ala Val Val Gly Gly Leu Leu Cys Val Leu LeuArg Tyr Arg Leu Leu Ala Val Val Gly Gly Leu Leu Cys Val Leu Leu
370 375 380 370 375 380
Leu Ala Met Val Gly Trp Lys Ser Leu Tyr Ala Leu Ile Met Leu AlaLeu Ala Met Val Gly Trp Lys Ser Leu Tyr Ala Leu Ile Met Leu Ala
385 390 395 400 385 390 395 400
Gly Leu Trp Leu Leu Leu Pro Lys Arg Lys Thr Pro Glu Asn Gly IleGly Leu Trp Leu Leu Leu Pro Lys Arg Lys Thr Pro Glu Asn Gly Ile
405 410 415 405 410 415
Thr ThrThr Thr
<210> 36<210> 36
<211> 418<211> 418
<212> PRT<212>PRT
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> YjeH F351L<223> YjeH F351L
<400> 36<400> 36
Met Ser Gly Leu Lys Gln Glu Leu Gly Leu Ala Gln Gly Ile Gly LeuMet Ser Gly Leu Lys Gln Glu Leu Gly Leu Ala Gln Gly Ile Gly Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Ser Thr Ser Leu Leu Gly Thr Gly Val Phe Ala Val Pro Ala LeuLeu Ser Thr Ser Leu Leu Gly Thr Gly Val Phe Ala Val Pro Ala Leu
20 25 30 20 25 30
Ala Ala Leu Val Ala Gly Asn Asn Ser Leu Trp Ala Trp Pro Val LeuAla Ala Leu Val Ala Gly Asn Asn Ser Leu Trp Ala Trp Pro Val Leu
35 40 45 35 40 45
Ile Ile Leu Val Phe Pro Ile Ala Ile Val Phe Ala Ile Leu Gly ArgIle Ile Leu Val Phe Pro Ile Ala Ile Val Phe Ala Ile Leu Gly Arg
50 55 60 50 55 60
His Tyr Pro Ser Ala Gly Gly Val Ala His Phe Val Gly Met Ala PheHis Tyr Pro Ser Ala Gly Gly Val Ala His Phe Val Gly Met Ala Phe
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Ser Arg Leu Glu Arg Val Thr Gly Trp Leu Phe Leu Ser Val IleGly Ser Arg Leu Glu Arg Val Thr Gly Trp Leu Phe Leu Ser Val Ile
85 90 95 85 90 95
Pro Val Gly Leu Pro Ala Ala Leu Gln Ile Ala Ala Gly Phe Gly GlnPro Val Gly Leu Pro Ala Ala Leu Gln Ile Ala Ala Gly Phe Gly Gln
100 105 110 100 105 110
Ala Met Phe Gly Trp His Ser Trp Gln Leu Leu Leu Ala Glu Leu GlyAla Met Phe Gly Trp His Ser Trp Gln Leu Leu Leu Ala Glu Leu Gly
115 120 125 115 120 125
Thr Leu Ala Leu Val Trp Tyr Ile Gly Thr Arg Gly Ala Ser Ser SerThr Leu Ala Leu Val Trp Tyr Ile Gly Thr Arg Gly Ala Ser Ser Ser
130 135 140 130 135 140
Ala Asn Leu Gln Thr Val Ile Ala Gly Leu Ile Val Ala Leu Ile ValAla Asn Leu Gln Thr Val Ile Ala Gly Leu Ile Val Ala Leu Ile Val
145 150 155 160 145 150 155 160
Ala Ile Trp Trp Ala Gly Asp Ile Lys Pro Ala Asn Ile Pro Phe ProAla Ile Trp Trp Ala Gly Asp Ile Lys Pro Ala Asn Ile Pro Phe Pro
165 170 175 165 170 175
Ala Pro Gly Asn Ile Glu Leu Thr Gly Leu Phe Ala Ala Leu Ser ValAla Pro Gly Asn Ile Glu Leu Thr Gly Leu Phe Ala Ala Leu Ser Val
180 185 190 180 185 190
Met Phe Trp Cys Phe Val Gly Leu Glu Ala Phe Ala His Leu Ala SerMet Phe Trp Cys Phe Val Gly Leu Glu Ala Phe Ala His Leu Ala Ser
195 200 205 195 200 205
Glu Phe Lys Asn Pro Glu Arg Asp Phe Pro Arg Ala Leu Met Ile GlyGlu Phe Lys Asn Pro Glu Arg Asp Phe Pro Arg Ala Leu Met Ile Gly
210 215 220 210 215 220
Leu Leu Leu Ala Gly Leu Val Tyr Trp Gly Cys Thr Val Val Val LeuLeu Leu Leu Ala Gly Leu Val Tyr Trp Gly Cys Thr Val Val Val Leu
225 230 235 240 225 230 235 240
His Phe Asp Ala Tyr Gly Glu Lys Met Ala Ala Ala Ala Ser Leu ProHis Phe Asp Ala Tyr Gly Glu Lys Met Ala Ala Ala Ala Ser Leu Pro
245 250 255 245 250 255
Lys Ile Val Val Gln Leu Phe Gly Val Gly Ala Leu Trp Ile Ala CysLys Ile Val Val Gln Leu Phe Gly Val Gly Ala Leu Trp Ile Ala Cys
260 265 270 260 265 270
Val Ile Gly Tyr Leu Ala Cys Phe Ala Ser Leu Asn Ile Tyr Ile GlnVal Ile Gly Tyr Leu Ala Cys Phe Ala Ser Leu Asn Ile Tyr Ile Gln
275 280 285 275 280 285
Ser Phe Ala Arg Leu Val Trp Ser Gln Ala Gln His Asn Pro Asp HisSer Phe Ala Arg Leu Val Trp Ser Gln Ala Gln His Asn Pro Asp His
290 295 300 290 295 300
Tyr Leu Ala Arg Leu Ser Ser Arg His Ile Pro Asn Asn Ala Leu AsnTyr Leu Ala Arg Leu Ser Ser Arg His Ile Pro Asn Asn Ala Leu Asn
305 310 315 320 305 310 315 320
Ala Val Leu Gly Cys Cys Val Val Ser Thr Leu Val Ile His Ala LeuAla Val Leu Gly Cys Cys Val Val Ser Thr Leu Val Ile His Ala Leu
325 330 335 325 330 335
Glu Ile Asn Leu Asp Ala Leu Ile Ile Tyr Ala Asn Gly Ile Leu IleGlu Ile Asn Leu Asp Ala Leu Ile Ile Tyr Ala Asn Gly Ile Leu Ile
340 345 350 340 345 350
Met Ile Tyr Leu Leu Cys Met Leu Ala Gly Cys Lys Leu Leu Gln GlyMet Ile Tyr Leu Leu Cys Met Leu Ala Gly Cys Lys Leu Leu Gln Gly
355 360 365 355 360 365
Arg Tyr Arg Leu Leu Ala Val Val Gly Gly Leu Leu Cys Val Leu LeuArg Tyr Arg Leu Leu Ala Val Val Gly Gly Leu Leu Cys Val Leu Leu
370 375 380 370 375 380
Leu Ala Met Val Gly Trp Lys Ser Leu Tyr Ala Leu Ile Met Leu AlaLeu Ala Met Val Gly Trp Lys Ser Leu Tyr Ala Leu Ile Met Leu Ala
385 390 395 400 385 390 395 400
Gly Leu Trp Leu Leu Leu Pro Lys Arg Lys Thr Pro Glu Asn Gly IleGly Leu Trp Leu Leu Leu Pro Lys Arg Lys Thr Pro Glu Asn Gly Ile
405 410 415 405 410 415
Thr ThrThr Thr
<210> 37<210> 37
<211> 5803<211> 5803
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> pDCM2<223> pDCM2
<400> 37<400> 37
gttcgcttgc tgtccataaa accgcccagt ctagctatcg ccatgtaagc ccactgcaag 60gttcgcttgc tgtccataaa accgcccagt ctagctatcg ccatgtaagc ccactgcaag 60
ctacctgctt tctctttgcg cttgcgtttt cccttgtcca gatagcccag tagctgacat 120ctacctgctt tctctttgcg cttgcgtttt cccttgtcca gatagcccag tagctgacat 120
tcatccgggg tcagcaccgt ttctgcggac tggctttcta cgtgttccgc ttcctttagc 180tcatccgggg tcagcaccgt ttctgcggac tggctttcta cgtgttccgc ttcctttagc 180
agcccttgcg ccctgagtgc ttgcggcagc gtgaagctag cttttatcgc cattcgccat 240agcccttgcg ccctgagtgc ttgcggcagc gtgaagctag cttttatcgc cattcgccat 240
tcaggctgcg caactgttgg gaagggcgat cggtgcgggc ctcttcgcta ttacgccagc 300tcaggctgcg caactgttgg gaagggcgat cggtgcgggc ctcttcgcta ttacgccagc 300
tggcgaaagg gggatgtgct gcaaggcgat taagttgggt aacgccaggg ttttcccagt 360tggcgaaagg gggatgtgct gcaaggcgat taagttgggt aacgccaggg ttttcccagt 360
cacgacgttg taaaacgacg gccagtgaat tcgagctcgg tacccgggga tcctctagag 420cacgacgttg taaaacgacg gccagtgaat tcgagctcgg tacccgggga tcctctagag 420
tcgacctgca ggcatgcaag cttggcgtaa tcatggtcat agctgtttcc tgtgtgaaat 480tcgacctgca ggcatgcaag cttggcgtaa tcatggtcat agctgtttcc tgtgtgaaat 480
tgttatccgc tcacaattcc acacaacata cgagccggaa gcataaagtg taaagcctgg 540tgttatccgc tcacaattcc acacaacata cgagccggaa gcataaagtg taaagcctgg 540
ggtgcctaat gagtgagcta actcacatta attgcgttgc gctcactgcc cgctttccag 600ggtgcctaat gagtgagcta actcacatta attgcgttgc gctcactgcc cgctttccag 600
tcgggaaacc tgtcgtgcca gctgcattaa tgaatcggcc aacgcgcggg gagaggcggt 660tcgggaaacc tgtcgtgcca gctgcattaa tgaatcggcc aacgcgcggg gagaggcggt 660
ttgcgtattg ggcgctcttc cgcttcctcg ctcactgact cgctgcgctc ggtcgttcgg 720ttgcgtattg ggcgctcttc cgcttcctcg ctcactgact cgctgcgctc ggtcgttcgg 720
ctgcggcgag cggtatcagc tcactcaaag gcggtaatac ggttatccac agaatcaggg 780ctgcggcgag cggtatcagc tcactcaaag gcggtaatac ggttatccac agaatcaggg 780
gataacgcag gaaagaacat gtgagcaaaa ggccagcaaa aggccaggaa ccgtaaaaag 840gataacgcag gaaagaacat gtgagcaaaa ggccagcaaa aggccaggaa ccgtaaaaag 840
gccgcgttgc tggcgttttt ccataggctc cgcccccctg acgagcatca caaaaatcga 900gccgcgttgc tggcgttttt ccataggctc cgcccccctg acgagcatca caaaaatcga 900
cgctcaagtc agaggtggcg aaacccgaca ggactataaa gataccaggc gtttccccct 960cgctcaagtc agaggtggcg aaacccgaca ggactataaa gataccaggc gtttccccct 960
ggaagctccc tcgtgcgctc tcctgttccg accctgccgc ttaccggata cctgtccgcc 1020ggaagctccc tcgtgcgctc tcctgttccg accctgccgc ttaccggata cctgtccgcc 1020
tttctccctt cgggaagcgt ggcgctttct caatgctcac gctgtaggta tctcagttcg 1080tttctccctt cgggaagcgt ggcgctttct caatgctcac gctgtaggta tctcagttcg 1080
gtgtaggtcg ttcgctccaa gctgggctgt gtgcacgaac cccccgttca gcccgaccgc 1140gtgtaggtcg ttcgctccaa gctgggctgt gtgcacgaac cccccgttca gcccgaccgc 1140
tgcgccttat ccggtaacta tcgtcttgag tccaacccgg taagacacga cttatcgcca 1200tgcgccttat ccggtaacta tcgtcttgag tccaacccgg taagacacga cttatcgcca 1200
ctggcagcag ccactggtaa caggattagc agagcgaggt atgtaggcgg tgctacagag 1260ctggcagcag ccactggtaa caggattagc agagcgaggt atgtaggcgg tgctacagag 1260
ttcttgaagt ggtggcctaa ctacggctac actagaagga cagtatttgg tatctgcgct 1320ttcttgaagt ggtggcctaa ctacggctac actagaagga cagtatttgg tatctgcgct 1320
ctgctgaagc cagttacctt cggaaaaaga gttggtagct cttgatccgg caaacaaacc 1380ctgctgaagc cagttacctt cggaaaaaga gttggtagct cttgatccgg caaacaaacc 1380
accgctggta gcggtggttt ttttgtttgc aagcagcaga ttacgcgcag aaaaaaagga 1440accgctggta gcggtggttt ttttgtttgc aagcagcaga ttacgcgcag aaaaaaagga 1440
tctcaagaag atcctttgat cttttctacg gggtctgacg ctcagtggaa cgaaaactca 1500tctcaagaag atcctttgat cttttctacg gggtctgacg ctcagtggaa cgaaaactca 1500
cgttaaggga ttttggtcat gagattatca aaaaggatct tcacctagat ccttttgggg 1560cgttaaggga ttttggtcat gagattatca aaaaggatct tcacctagat ccttttgggg 1560
tgggcgaaga actccagcat gagatccccg cgctggagga tcatccagcc ctgatagaaa 1620tgggcgaaga actccagcat gagatccccg cgctggagga tcatccagcc ctgatagaaa 1620
cagaagccac tggagcacct caaaaacacc atcatacact aaatcagtaa gttggcagca 1680cagaagccac tggagcacct caaaaacacc atcatacact aaatcagtaa gttggcagca 1680
tcacccgacg cactttgcgc cgaataaata cctgtgacgg aagatcactt cgcagaataa 1740tcacccgacg cactttgcgc cgaataaata cctgtgacgg aagatcactt cgcagaataa 1740
ataaatcctg gtgtccctgt tgataccggg aagccctggg ccaacttttg gcgaaaatga 1800ataaatcctg gtgtccctgt tgataccggg aagccctggg ccaacttttg gcgaaaatga 1800
gacgttgatc ggcacgtaag aggttccaac tttcaccata atgaaataag atcactaccg 1860gacgttgatc ggcacgtaag aggttccaac tttcaccata atgaaataag atcactaccg 1860
ggcgtatttt ttgagttatc gagattttca ggagctgata gaaacagaag ccactggagc 1920ggcgtatttt ttgagttatc gagatttca ggagctgata gaaacagaag ccactggagc 1920
acctcaaaaa caccatcata cactaaatca gtaagttggc agcatcaccc gacgcacttt 1980acctcaaaaa caccatcata cactaaatca gtaagttggc agcatcaccc gacgcacttt 1980
gcgccgaata aatacctgtg acggaagatc acttcgcaga ataaataaat cctggtgtcc 2040gcgccgaata aatacctgtg acggaagatc acttcgcaga ataaataaat cctggtgtcc 2040
ctgttgatac cgggaagccc tgggccaact tttggcgaaa atgagacgtt gatcggcacg 2100ctgttgatac cgggaagccc tgggccaact tttggcgaaa atgagacgtt gatcggcacg 2100
taagaggttc caactttcac cataatgaaa taagatcact accgggcgta ttttttgagt 2160taagaggttc caactttcac cataatgaaa taagatcact accgggcgta ttttttgagt 2160
tatcgagatt ttcaggagct ctttggcatc gtctctcgcc tgtcccctca gttcagtaat 2220tatcgagatt ttcaggagct ctttggcatc gtctctcgcc tgtcccctca gttcagtaat 2220
ttcctgcatt tgcctgtttc cagtcggtag atattccaca aaacagcagg gaagcagcgc 2280ttcctgcatt tgcctgtttc cagtcggtag atattccaca aaacagcagg gaagcagcgc 2280
ttttccgctg cataaccctg cttcggggtc attatagcga ttttttcggt atatccatcc 2340ttttccgctg cataaccctg cttcggggtc attatagcga ttttttcggt atatccatcc 2340
tttttcgcac gatatacagg attttgccaa agggttcgtg tagactttcc ttggtgtatc 2400tttttcgcac gatatacagg attttgccaa agggttcgtg tagactttcc ttggtgtatc 2400
caacggcgtc agccgggcag gataggtgaa gtaggcccac ccgcgagcgg gtgttccttc 2460caacggcgtc agccgggcag gataggtgaa gtaggcccac ccgcgagcgg gtgttccttc 2460
ttcactgtcc cttattcgca cctggcggtg ctcaacggga atcctgctct gcgaggctgg 2520ttcactgtcc cttattcgca cctggcggtg ctcaacggga atcctgctct gcgaggctgg 2520
ccggctaccg ccggcgtaac agatgagggc aagcggatgg ctgatgaaac caagccaacc 2580ccggctaccg ccggcgtaac agatgagggc aagcggatgg ctgatgaaac caagccaacc 2580
aggaagggca gcccacctat caaggtgtac tgccttccag acgaacgaag agcgattgag 2640aggaagggca gcccacctat caaggtgtac tgccttccag acgaacgaag agcgattgag 2640
gaaaaggcgg cggcggccgg catgagcctg tcggcctacc tgctggccgt cggccagggc 2700gaaaaggcgg cggcggccgg catgagcctg tcggcctacc tgctggccgt cggccagggc 2700
tacaaaatca cgggcgtcgt ggactatgag cacgtccgcg agggcgtccc ggaaaacgat 2760tacaaaatca cgggcgtcgt ggactatgag cacgtccgcg agggcgtccc ggaaaacgat 2760
tccgaagccc aacctttcat agaaggcggc ggtggaatcg aaatctcgtg atggcaggtt 2820tccgaagccc aacctttcat agaaggcggc ggtggaatcg aaatctcgtg atggcaggtt 2820
gggcgtcgct tggtcggtca tttcgaaaaa ggttaggaat acggttagcc atttgcctgc 2880gggcgtcgct tggtcggtca tttcgaaaaa ggttaggaat acggttagcc atttgcctgc 2880
ttttatatag ttcantatgg gattcacctt tatgttgata agaaataaaa gaaaatgcca 2940ttttatatag ttcantatgg gattcacctt tatgttgata agaaataaaa gaaaatgcca 2940
ataggatatc ggcattttct tttgcgtttt tatttgttaa ctgttaattg tccttgttca 3000ataggatatc ggcattttct tttgcgtttt tatttgttaa ctgttaattg tccttgttca 3000
aggatgctgt ctttgacaac agatgttttc ttgcctttga tgttcagcag gaagctcggc 3060aggatgctgt ctttgacaac agatgttttc ttgcctttga tgttcagcag gaagctcggc 3060
gcaaacgttg attgtttgtc tgcgtagaat cctctgtttg tcatatagct tgtaatcacg 3120gcaaacgttg attgtttgtc tgcgtagaat cctctgtttg tcatatagct tgtaatcacg 3120
acattgtttc ctttcgcttg aggtacagcg aagtgtgagt aagtaaaggt tacatcgtta 3180acattgtttc ctttcgcttg aggtacagcg aagtgtgagt aagtaaaggt tacatcgtta 3180
ggcggatcaa gatccatttt taacacaagg ccagttttgt tcagcggctt gtatgggcca 3240ggcggatcaa gatccatttt taacacaagg ccagttttgt tcagcggctt gtatgggcca 3240
gttaaagaat tagaaacata accaagcatg taaatatcgt tagacgtaat gccgtcaatc 3300gttaaagaat tagaaacata accaagcatg taaatatcgt tagacgtaat gccgtcaatc 3300
gtcatttttg atccgcggga gtcagtgaac aggtaccatt tgccgttcat tttaaagacg 3360gtcatttttg atccgcggga gtcagtgaac aggtaccatt tgccgttcat tttaaagacg 3360
ttcgcgcgtt caatttcatc tgttactgtg ttagatgcaa tcagcggttt catcactttt 3420ttcgcgcgtt caatttcatc tgttactgtg ttagatgcaa tcagcggttt catcactttt 3420
ttcagtgtgt aatcatcgtt tagctcaatc ataccgagag cgccgtttgc taactcagcc 3480ttcagtgtgt aatcatcgtt tagctcaatc ataccgagag cgccgtttgc taactcagcc 3480
gtgcgttttt tatcgctttg cagaagtttt tgactttctt gacggaagaa tgatgtgctt 3540gtgcgttttt tatcgctttg cagaagtttt tgactttctt gacggaagaa tgatgtgctt 3540
ttgccatagt atgctttgtt aaataaagat tcttcgcctt ggtagccatc ttcagttcca 3600ttgccatagt atgctttgtt aaataaagat tcttcgcctt ggtagccatc ttcagttcca 3600
gtgtttgctt caaatactaa gtatttgtgg cctttatctt ctacgtagtg aggatctctc 3660gtgtttgctt caaatactaa gtatttgtgg cctttatctt ctacgtagtg aggatctctc 3660
agcgtatggt tgtcgcctga gctgtagttg ccttcatcga tgaactgctg tacattttga 3720agcgtatggt tgtcgcctga gctgtagttg ccttcatcga tgaactgctg tacattttga 3720
tacgtttttc cgtcaccgtc aaagattgat ttataatcct ctacaccgtt gatgttcaaa 3780tacgtttttc cgtcaccgtc aaagattgat ttataatcct ctacaccgtt gatgttcaaa 3780
gagctgtctg atgctgatac gttaacttgt gcagttgtca gtgtttgttt gccgtaatgt 3840gagctgtctg atgctgatac gttaacttgt gcagttgtca gtgtttgttt gccgtaatgt 3840
ttaccggaga aatcagtgta gaataaacgg atttttccgt cagatgtaaa tgtggctgaa 3900ttaccggaga aatcagtgta gaataaacgg atttttccgt cagatgtaaa tgtggctgaa 3900
cctgaccatt cttgtgtttg gtcttttagg atagaatcat ttgcatcgaa tttgtcgctg 3960cctgaccatt cttgtgtttg gtcttttagg atagaatcat ttgcatcgaa tttgtcgctg 3960
tctttaaaga cgcggccagc gtttttccag ctgtcaatag aagtttcgcc gactttttga 4020tctttaaaga cgcggccagc gtttttccag ctgtcaatag aagtttcgcc gactttttga 4020
tagaacatgt aaatcgatgt gtcatccgca tttttaggat ctccggctaa tgcaaagacg 4080tagaacatgt aaatcgatgt gtcatccgca tttttaggat ctccggctaa tgcaaagacg 4080
atgtggtagc cgtgatagtt tgcgacagtg ccgtcagcgt tttgtaatgg ccagctgtcc 4140atgtggtagc cgtgatagtt tgcgacagtg ccgtcagcgt tttgtaatgg ccagctgtcc 4140
caaacgtcca ggccttttgc agaagagata tttttaattg tggacgaatc aaattcagaa 4200caaacgtcca ggccttttgc agaagata tttttaattg tggacgaatc aaattcagaa 4200
acttgatatt tttcattttt ttgctgttca gggatttgca gcatatcatg gcgtgtaata 4260acttgatatt tttcattttt ttgctgttca gggatttgca gcatatcatg gcgtgtaata 4260
tgggaaatgc cgtatgtttc cttatatggc ttttggttcg tttctttcgc aaacgcttga 4320tgggaaatgc cgtatgtttc cttatatggc ttttggttcg tttctttcgc aaacgcttga 4320
gttgcgcctc ctgccagcag tgcggtagta aaggttaata ctgttgcttg ttttgcaaac 4380gttgcgcctc ctgccagcag tgcggtagta aaggttaata ctgttgcttg ttttgcaaac 4380
tttttgatgt tcatcgttca tgtctccttt tttatgtact gtgttagcgg tctgcttctt 4440tttttgatgt tcatcgttca tgtctccttt tttatgtact gtgttagcgg tctgcttctt 4440
ccagccctcc tgtttgaaga tggcaagtta gttacgcaca ataaaaaaag acctaaaata 4500ccagccctcc tgtttgaaga tggcaagtta gttacgcaca ataaaaaaag acctaaaata 4500
tgtaaggggt gacgccaaag tatacacttt gccctttaca cattttaggt cttgcctgct 4560tgtaaggggt gacgccaaag tatacacttt gccctttaca cattttaggt cttgcctgct 4560
ttatcagtaa caaacccgcg cgatttactt ttcgacctca ttctattaga ctctcgtttg 4620ttatcagtaa caaacccgcg cgatttactt ttcgacctca ttctattaga ctctcgtttg 4620
gattgcaact ggtctatttt cctcttttgt ttgatagaaa atcataaaag gatttgcaga 4680gattgcaact ggtctatttt cctcttttgt ttgatagaaa atcataaaag gatttgcaga 4680
ctacgggcct aaagaactaa aaaatctatc tgtttctttt cattctctgt attttttata 4740ctacgggcct aaagaactaa aaaatctatc tgtttctttt cattctctgt attttttata 4740
gtttctgttg catgggcata aagttgcctt tttaatcaca attcagaaaa tatcataata 4800gtttctgttg catgggcata aagttgcctt tttaatcaca attcagaaaa tatcataata 4800
tctcatttca ctaaataata gtgaacggca ggtatatgtg atgggttaaa aaggatcacc 4860tctcatttca ctaaataata gtgaacggca ggtatatgtg atgggttaaa aaggatcacc 4860
ccagagtccc gctcagaaga actcgtcaag aaggcgatag aaggcgatgc gctgcgaatc 4920cccagtccc gctcagaaga actcgtcaag aaggcgatag aaggcgatgc gctgcgaatc 4920
gggagcggcg ataccgtaaa gcacgaggaa gcggtcagcc cattcgccgc caagctcttc 4980gggagcggcg ataccgtaaa gcacgaggaa gcggtcagcc cattcgccgc caagctcttc 4980
agcaatatca cgggtagcca acgctatgtc ctgatagcgg tccgccacac ccagccggcc 5040agcaatatca cgggtagcca acgctatgtc ctgatagcgg tccgccacac ccagccggcc 5040
acagtcgatg aatccagaaa agcggccatt ttccaccatg atattcggca agcaggcatc 5100acagtcgatg aatccagaaa agcggccatt ttccaccatg atattcggca agcaggcatc 5100
gccatgggtc acgacgagat cctcgccgtc gggcatccgc gccttgagcc tggcgaacag 5160gccatgggtc acgacgagat cctcgccgtc gggcatccgc gccttgagcc tggcgaacag 5160
ttcggctggc gcgagcccct gatgctcttc gtccagatca tcctgatcga caagaccggc 5220ttcggctggc gcgagcccct gatgctcttc gtccagatca tcctgatcga caagaccggc 5220
ttccatccga gtacgtgctc gctcgatgcg atgtttcgct tggtggtcga atgggcaggt 5280ttccatccga gtacgtgctc gctcgatgcg atgtttcgct tggtggtcga atgggcaggt 5280
agccggatca agcgtatgca gccgccgcat tgcatcagcc atgatggata ctttctcggc 5340agccggatca agcgtatgca gccgccgcat tgcatcagcc atgatggata ctttctcggc 5340
aggagcaagg tgagatgaca ggagatcctg ccccggcact tcgcccaata gcagccagtc 5400aggagcaagg tgagatgaca ggagatcctg ccccggcact tcgcccaata gcagccagtc 5400
ccttcccgct tcagtgacaa cgtcgagaca gctgcgcaag gaacgcccgt cgtggccagc 5460ccttcccgct tcagtgacaa cgtcgagaca gctgcgcaag gaacgcccgt cgtggccagc 5460
cacgatagcc gcgctgcctc gtcttggagt tcattcaggg caccggacag gtcggtcttg 5520cacgatagcc gcgctgcctc gtcttggagt tcattcaggg caccggacag gtcggtcttg 5520
acaaaaagaa ccgggcgccc ctgcgctgac agccggaaca cggcggcatc agagcagccg 5580acaaaaagaa ccgggcgccc ctgcgctgac agccggaaca cggcggcatc agagcagccg 5580
attgtctgtt gtgcccagtc atagccgaat agcctctcca cccaagcggc cggagaacct 5640attgtctgtt gtgcccagtc atagccgaat agcctctcca cccaagcggc cggagaacct 5640
gcgtgcaatc catcttgttc aatcatgcga aacgatcctc atcctgtctc ttgatcagat 5700gcgtgcaatc catcttgttc aatcatgcga aacgatcctc atcctgtctc ttgatcagat 5700
cttgatcccc tgcgccatca gatccttggc ggcaagaaag ccatccagtt tactttgcag 5760cttgatcccc tgcgccatca gatccttggc ggcaagaaag ccatccagtt tactttgcag 5760
ggcttcccaa ccttaccaga gggcgcccca gctggcaatt ccg 5803ggcttcccaa ccttaccaga gggcgcccca gctggcaatt ccg 5803
<---<---
Claims (17)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR10-2019-0172055 | 2019-12-20 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2804941C1 true RU2804941C1 (en) | 2023-10-09 |
Family
ID=
Citations (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2012087039A2 (en) * | 2010-12-21 | 2012-06-28 | 씨제이제일제당 (주) | Variant polypeptide having homoserine acetyltransferase activity and microorganism expressing same |
US20130236934A1 (en) * | 2012-03-08 | 2013-09-12 | Novus International Inc. | Recombinant bacterium for l-homoserine production |
RU2614253C1 (en) * | 2014-06-23 | 2017-03-24 | СиДжей ЧеилДжеданг Корпорейшн | Microorganisms producing o-acetyl homoserine and method for o-acetyl homoserine production using this microorganism |
RU2694041C1 (en) * | 2015-10-13 | 2019-07-08 | СиДжей ЧеилДжеданг Корпорейшн | Embodiment of o-acetyl-homoserine-sulfhydrylase and method of producing l-methionine using this embodiment |
RU2706535C2 (en) * | 2015-06-04 | 2019-11-19 | СиДжей ЧеилДжеданг Корпорейшн | O-acetyl-homoserine-producing microorganism, and method of producing o-acetyl-homoserine using said microorganism |
CA3091741A1 (en) * | 2018-05-28 | 2019-12-05 | Cj Cheiljedang Corporation | Modified homoserine dehydrogenase and method for producing homoserine or l-amino acid derived from homoserine using the same |
Patent Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2012087039A2 (en) * | 2010-12-21 | 2012-06-28 | 씨제이제일제당 (주) | Variant polypeptide having homoserine acetyltransferase activity and microorganism expressing same |
US20130236934A1 (en) * | 2012-03-08 | 2013-09-12 | Novus International Inc. | Recombinant bacterium for l-homoserine production |
RU2614253C1 (en) * | 2014-06-23 | 2017-03-24 | СиДжей ЧеилДжеданг Корпорейшн | Microorganisms producing o-acetyl homoserine and method for o-acetyl homoserine production using this microorganism |
AU2015264911B2 (en) * | 2014-06-23 | 2017-11-23 | Cj Cheiljedang Corporation | Microorganism producing O-Acetyl homoserine and the method of producing O-Acetyl homoserine using the same |
RU2706535C2 (en) * | 2015-06-04 | 2019-11-19 | СиДжей ЧеилДжеданг Корпорейшн | O-acetyl-homoserine-producing microorganism, and method of producing o-acetyl-homoserine using said microorganism |
RU2694041C1 (en) * | 2015-10-13 | 2019-07-08 | СиДжей ЧеилДжеданг Корпорейшн | Embodiment of o-acetyl-homoserine-sulfhydrylase and method of producing l-methionine using this embodiment |
CA3091741A1 (en) * | 2018-05-28 | 2019-12-05 | Cj Cheiljedang Corporation | Modified homoserine dehydrogenase and method for producing homoserine or l-amino acid derived from homoserine using the same |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN115038714A (en) | Mutant of inner membrane protein and method for producing target product by using the same | |
KR102266233B1 (en) | Novel ABC transporter ATP-binding protein variant and a method for producing L-glutamic acid using the same | |
CN114729379A (en) | L-methionine-producing microorganism introduced with exogenous metZ gene-encoding protein and method for producing L-methionine using the same | |
CN115087734B (en) | Novel phosphonoacetate hydrolase variants and methods of using same for producing XMP or GMP | |
RU2804941C1 (en) | Variant of inner membrane protein and method for obtaining target product using it | |
CN115135759A (en) | Novel glucosamine-6-phosphate deaminase variant and method for producing L-glutamic acid using same | |
RU2827731C1 (en) | MICROORGANISM PRODUCING L-METHIONINE, INTO WHICH PROTEIN ENCODED BY FOREIGN metZ GENE IS INTRODUCED, AND METHOD OF PRODUCING L-METHIONINE USING SAID MICROORGANISM | |
RU2793468C1 (en) | New variant of tetrahydrodipicolinate-n-succinyltransferase and a method for obtaining l-valine with its use | |
RU2795616C1 (en) | New variant of malate dehydrogenase and a method for obtaining l-lysine using it | |
RU2817194C1 (en) | Recombinant microorganism for producing l-glutamic acid and method of producing l-glutamic acid using same | |
KR102525072B1 (en) | Novel citrate synthase variant and a method for producing L-amino acid using the same | |
RU2793443C1 (en) | New variant of 5.10-methylenetetrahydrofolate reductase and a method for obtaining l-valine with its use | |
RU2793442C1 (en) | New option of asparagine synthase and a method for obtaining l-valine using it | |
RU2793399C1 (en) | New variant of atp-phosphoribosyl transferase and method for obtaining l-valine with its use | |
RU2795067C1 (en) | New variant of proline dehydrogenase and a method for obtaining l-valine using it | |
RU2795789C1 (en) | New variant of the auxiliary urease protein and a method for obtaining l-valine with its use | |
RU2793440C1 (en) | New protein variant and method for obtaining l-valine with its use | |
RU2795615C1 (en) | New variant of the abc-transport atp-binding protein and a method for obtaining l-lysine using it | |
RU2793447C1 (en) | New protein variant and method for obtaining l-valine with its use | |
RU2792650C1 (en) | New variant of cysteine sulfinate desulfinase and method for obtaining l-valine with its use | |
RU2793431C1 (en) | New option of spermidine synthase and a method for obtaining l-valine with its use | |
KR102525074B1 (en) | Novel citrate synthase variant and a method for producing O-Acetyl-L-Homoserine or L-Methionine using the same | |
RU2794485C1 (en) | New protein option and method for obtaining l-valine with its use | |
KR102277403B1 (en) | Novel ribonuclease P variant and a method for producing L-glutamic acid using the same | |
KR20230139598A (en) | A microorganism producing O-acetyl homoserine and a method for producing O-acetyl homoserine or L-methionine using the same |