RU2797537C2 - Methods and compositions for improving plant characteristics - Google Patents
Methods and compositions for improving plant characteristics Download PDFInfo
- Publication number
- RU2797537C2 RU2797537C2 RU2019125282A RU2019125282A RU2797537C2 RU 2797537 C2 RU2797537 C2 RU 2797537C2 RU 2019125282 A RU2019125282 A RU 2019125282A RU 2019125282 A RU2019125282 A RU 2019125282A RU 2797537 C2 RU2797537 C2 RU 2797537C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- plant
- nitrogen
- microorganisms
- microorganism
- strain
- Prior art date
Links
Images
Abstract
Description
ПЕРЕКРЕСТНЫЕ ССЫЛКИCROSS REFERENCES
[0001] По настоящей заявке испрашивается приоритет предварительной патентной заявки США № 62/445570, зарегистрированной 12 января 2017 года; предварительной патентной заявки США № 62/445557, зарегистрированной 12 января 2017 года; предварительной патентной заявки США № 62/447889, зарегистрированной 18 января 2017 года; предварительной патентной заявки США № 62/467032, зарегистрированной 3 марта 2017 года; предварительной патентной заявки США № 62/566199, зарегистрированной 29 сентября 2017 года и предварительной патентной заявки США № 62/577147, зарегистрированной 25 октября 2017 года, которые включены в настоящий документ в качестве ссылки.[0001] This application claims the priority of US Provisional Application No. 62/445570 filed January 12, 2017; U.S. Provisional Application No. 62/445557, filed January 12, 2017; U.S. Provisional Application No. 62/447889, filed January 18, 2017; U.S. Provisional Application No. 62/467032, filed March 3, 2017; U.S. Provisional Application No. 62/566199, filed September 29, 2017, and U.S. Provisional Application No. 62/577147, filed October 25, 2017, which are incorporated herein by reference.
ИНФОРМАЦИЯ ОТНОСИТЕЛЬНО СПИСКА ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙINFORMATION REGARDING THE SEQUENCE LIST
[0002] Настоящая заявка содержит список последовательностей, который подан в электронном виде в формате ASCII и, таким образом, полностью включен в качестве ссылки. Указанная копия ASCII, созданная 3 января 2018 года, названа 47736-707_601_SL.txt, и ее размер составляет ≈599 кбайт.[0002] This application contains a sequence listing that is filed electronically in ASCII format and is therefore incorporated by reference in its entirety. The specified ASCII copy, created on January 3, 2018, is named 47736-707_601_SL.txt and is ≈599 KB in size.
ЗАЯВЛЕНИЕ О ФИНАНСИРУЕМОМ ИЗ ФЕДЕРАЛЬНОГО БЮДЖЕТА ИССЛЕДОВАНИИFEDERALLY FUNDED STUDY STATEMENT
[0003] Настоящее изобретение осуществлено с поддержкой правительства Соединенных Штатов Америки в виде грана SBIR 1520545, выделенного национальным научным фондом (National Science Foundation). Правительство США обладает определенными правами на описываемый объект изобретения.[0003] The present invention was made with the support of the Government of the United States of America in the form of grant SBIR 1520545 allocated by the National Science Foundation. The US government has certain rights in the subject matter described.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ, ПРЕДШЕСТВУЮЩИЙ ИЗОБРЕТЕНИЮBACKGROUND OF THE INVENTION
[0004] Растения связаны с микробиомом общим метаболомом. Многомерная зависимость между конкретным признаком сельскохозяйственной культуры и лежащим в его основе метаболоме характеризуется рельефом с множеством локальных максимумов. Оптимизация от меньшего локального максимума к другому, представляющему улучшенный признак, посредством изменения влияния микробиома на метаболом может являться желательным по целому ряду причин, например, для оптимизации сельскохозяйственных культур. Для удовлетворения потребностей растущего мирового населения необходимы экономически, экологически и социально устойчивые подходы к сельскому хозяйству и производству пищевых продуктов. Продовольственная и сельскохозяйственная организация ООН прогнозирует, что для удовлетворения потребностей растущего населения к 2050 году общее производство пищевых продуктов должно увеличиться на 70%, задача, которая осложняется многочисленными факторами, включая уменьшение ресурсов пресной воды, увеличивающуюся конкуренцию за пахотные земли, растущие цены на энергоносители, растущие затраты на производство и подобные требования для адаптации культур к давлению более засушливого, жаркого и более экстремального глобального климата.[0004] Plants are associated with the microbiome by a common metabolome. The multidimensional relationship between a particular trait of an agricultural crop and its underlying metabolome is characterized by a relief with many local maxima. Optimizing from a smaller local maximum to another representing an improved trait by changing the influence of the microbiome on the metabolome may be desirable for a variety of reasons, such as crop optimization. Economically, environmentally and socially sustainable approaches to agriculture and food production are needed to meet the needs of a growing global population. The Food and Agriculture Organization of the United Nations predicts that to meet the needs of a growing population by 2050, total food production must increase by 70%, a task that is complicated by numerous factors, including declining fresh water resources, increasing competition for arable land, rising energy prices, rising production costs and similar demands to adapt crops to the pressures of a drier, hotter and more extreme global climate.
[0005] Одной из представляющих интерес областей является улучшение фиксации азота. Газообразный азот (N2) является основным компонентом атмосферы Земли. Кроме того, элементарный азот (N) является важным компонентом множества химических соединений, составляющих живые организмы. Однако многие организмы не могут непосредственно использовать N2 для синтеза химических соединений, используемых в физиологических процессах, таких как рост и воспроизводство. Для использования N2 необходимо, чтобы N2 был комбинирован с водородом. Комбинирование водорода с N2 обозначают как фиксация азота. Фиксация азота, проводимая химически или биологически, требует затрат большого количества энергии. В биологических системах реакцию, которая приводит к фиксации азота, катализирует фермент, известный как нитрогеназа. Важной целью исследований фиксации азота является расширение этого фенотипа на небобовые растения, конкретно на важные агротехнические травы, такие как пшеница, рис и кукуруза. Несмотря на большой прогресс в понимании развития азотфиксирующего симбиоза между клубеньковыми бактериями и бобовыми, путь для использования этого знания для индукции азотфиксирующих клубеньков у небобовых культур все еще не ясен. Между тем, проблема обеспечения достаточных дополнительных источников азота, такого как в удобрениях, будет продолжать расти вместе с растущей необходимостью в увеличении производства пищевых продуктов.[0005] One area of interest is improving nitrogen fixation. Gaseous nitrogen (N 2 ) is the main component of the Earth's atmosphere. In addition, elemental nitrogen (N) is an essential component of many of the chemical compounds that make up living organisms. However, many organisms cannot directly use N2 to synthesize chemical compounds used in physiological processes such as growth and reproduction. To use N 2 it is necessary that N 2 be combined with hydrogen. The combination of hydrogen with N 2 is referred to as nitrogen fixation. Nitrogen fixation, either chemically or biologically, requires a large amount of energy. In biological systems, the reaction that leads to nitrogen fixation is catalyzed by an enzyme known as nitrogenase. An important goal of nitrogen fixation research is to extend this phenotype to non-legumes, specifically to important agricultural grasses such as wheat, rice, and corn. Despite great progress in understanding the development of nitrogen-fixing symbiosis between nodule bacteria and legumes, the way to use this knowledge to induce nitrogen-fixing nodules in non-legumes is still unclear. Meanwhile, the challenge of providing sufficient additional sources of nitrogen, such as in fertilizers, will continue to grow along with the growing need to increase food production.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯSUMMARY OF THE INVENTION
[0006] По одному из аспектов изобретения предоставлена бактериальная композиция, содержащая по меньшей мере один генно-инженерный бактериальный штамм, который фиксирует атмосферный азот в сельскохозяйственной системе, в которую в качестве удобрения внесено более 9,1 кг азота на акр.[0006] In one aspect of the invention, there is provided a bacterial composition comprising at least one genetically engineered bacterial strain that fixes atmospheric nitrogen in an agricultural system fertilized with more than 9.1 kg of nitrogen per acre.
[0007] По другому аспекту изобретения предоставлена бактериальная композиция, которая содержит по меньшей мере один бактериальный штамм, выведенный для фиксации атмосферного азота в сельскохозяйственной системе, в которую в качестве удобрения внесено более 9,1 кг азота на акр.[0007] According to another aspect of the invention, a bacterial composition is provided that contains at least one bacterial strain bred to fix atmospheric nitrogen in an agricultural system that has been fertilized with more than 9.1 kg of nitrogen per acre.
[0008] По дополнительному аспекту изобретения предоставлена бактериальная композиция, которая содержит по меньшей мере один генно-инженерный бактериальный штамм, который фиксирует атмосферный азот, где этот по меньшей мере один генно-инженерный бактериальный штамм содержит экзогенно добавленную ДНК, где указанная экзогенно добавленная ДНК по меньшей мере на 80% идентична с соответствующим нативным бактериальным штаммом.[0008] According to a further aspect of the invention, a bacterial composition is provided that comprises at least one genetically engineered bacterial strain that fixes atmospheric nitrogen, wherein the at least one genetically engineered bacterial strain comprises exogenously added DNA, wherein said exogenously added DNA at least 80% identical with the corresponding native bacterial strain.
[0009] По дополнительному аспекту изобретения предоставлен семенной состав, содержащий семена растения, инокулированного бактериальной композицией.[0009] According to a further aspect of the invention, a seed composition is provided comprising the seeds of a plant inoculated with the bacterial composition.
[0010] Другой аспекту изобретения предоставлен способ выращивания сельскохозяйственной культуры с использованием множества семян с семенным составом, инокулированным бактериальной композицией.[0010] Another aspect of the invention provides a method for growing a crop using a plurality of seeds with a seed composition inoculated with a bacterial composition.
[0011] По дополнительному аспекту изобретения предоставлен способ нанесения бактериальной композиции на поле.[0011] In a further aspect of the invention, a method for applying a bacterial composition to a field is provided.
[0012] По дополнительному аспекту изобретения предоставлена композиция удобрения, содержащая бактериальную композицию.[0012] According to a further aspect of the invention, a fertilizer composition comprising a bacterial composition is provided.
[0013] По другому аспекту изобретения предоставлен способ поддержания уровней азота в почве. Способ включает высаживание в почву поля сельскохозяйственной культуры, инокулированной генно-инженерными бактериями, которые фиксируют атмосферный азот. Способ также включает сбор урожая указанной сельскохозяйственной культуры, где между посадкой и сбором урожая в указанную почву указанного поля вносят не более 90% дозы азота, необходимой для получения указанной сельскохозяйственной культуры.[0013] According to another aspect of the invention, a method is provided for maintaining soil nitrogen levels. The method includes planting an agricultural crop inoculated with genetically engineered bacteria that fix atmospheric nitrogen into the soil of a field. The method also includes harvesting said crop, where between planting and harvesting, no more than 90% of the dose of nitrogen required to obtain said crop is applied to said soil of said field.
[0014] По дополнительному аспекту изобретения предоставлен способ доставки пробиотической добавки в сельскохозяйственную культуру. Способ включает покрытие семян сельскохозяйственной культуры покрытием для семян, пропиткой для семян или протравкой для семян. Указанные покрытие для семян, протравка для семян или пропитка для семян содержат живых представителей указанного пробиотика. Кроме того, способ включает внесение в почву поля указанных семян сельскохозяйственной культуры.[0014] In a further aspect of the invention, a method for delivering a probiotic supplement to a crop is provided. The method includes coating the seeds of an agricultural crop with a seed coating, a seed treatment, or a seed dressing. Said seed coating, seed dressing, or seed dressing contains live representatives of said probiotic. In addition, the method includes introducing said crop seeds into the soil of the field.
[0015] В дополнительном аспекте изобретения генно-инженерный бактериальный штамм представляет собой генно-инженерный штамм грамположительной бактерии. В определенных случаях генно-инженерный штамм грамположительной бактерии обладает измененным уровнем экспрессии регулятора кластера Nif. В определенных случаях генно-инженерный штамм грамположительной бактерии экспрессирует сниженное количество отрицательного регулятора кластера Nif. В определенных случаях генно-инженерный бактериальный штамм экспрессирует сниженное количество GlnR. В определенных случаях в геноме генно-инженерного бактериального штамма закодирован полипептид по меньшей мере на 75% идентичный с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Дж. Зера (Zehr lab). В определенных случаях в геноме генно-инженерного бактериального штамма закодирован полипептид по меньшей мере на 85% идентичный с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Дж. Зера. В определенных случаях в геноме генно-инженерного бактериального штамма закодирован полипептид по меньшей мере на 75% идентичный с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Д. Бакли (Buckley lab). В определенных случаях в геноме генно-инженерного бактериального штамма закодирован полипептид по меньшей мере на 85% идентичный с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Д. Бакли.[0015] In a further aspect of the invention, the engineered bacterial strain is a genetically engineered strain of a Gram-positive bacterium. In certain cases, a genetically engineered strain of gram-positive bacteria has an altered expression level of the Nif cluster regulator. In certain cases, a genetically engineered strain of Gram-positive bacteria expresses a reduced amount of the negative Nif cassette regulator. In certain cases, a genetically engineered bacterial strain expresses a reduced amount of GlnR . In certain cases, the genome of a genetically engineered bacterial strain encodes a polypeptide that is at least 75% identical to the sequence from the NifH database of the laboratory of J. Zehr (Zehr lab). In certain cases, the genome of a genetically engineered bacterial strain encodes a polypeptide that is at least 85% identical to the sequence from the NifH database of the laboratory of J. Zehr. In certain cases, the genome of a genetically engineered bacterial strain encodes a polypeptide that is at least 75% identical to the sequence from the NifH database of the laboratory of D. Buckley (Buckley lab). In certain cases, the genome of a genetically engineered bacterial strain encodes a polypeptide that is at least 85% identical to the sequence from the NifH database of D. Buckley's laboratory.
[0016] По другому аспекту изобретения предоставлен способ увеличения фиксации азота у небобового растения. Способ включает нанесение на растение множества не являющихся межродовыми бактерий, где указанное множество включает не являющихся межродовыми бактерий, которые (i) обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и (ii) продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час. Кроме того, множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 1% или более фиксированного азота. Кроме того, каждый представитель множества не являющихся межродовыми бактерий несет по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота так, что не являющиеся межродовыми бактерии становятся способны к фиксации атмосферного азота в присутствии экзогенного азота.[0016] According to another aspect of the invention, a method is provided for increasing nitrogen fixation in a non-legume plant. The method includes applying to a plant a plurality of non-intergeneric bacteria, wherein said plurality includes non-intergeneric bacteria that (i) have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of tissue the root of the plant and (ii) produce a fixed N of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour. In addition, many non-intergeneric bacteria, in planta , produce 1% or more of fixed nitrogen in the plant. In addition, each member of the plurality of non-intergeneric bacteria carries at least one genetic variation introduced into at least one gene or non-coding polynucleotide of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network such that the non-intergeneric bacteria become capable of fixing atmospheric nitrogen in the presence of exogenous nitrogen.
[0017] По дополнительному аспекту изобретения предоставлен способ увеличения фиксации азота у небобового растения. Способ включает нанесение на растение множества не являющихся межродовыми бактерий, где указанное множество включает не являющихся межродовыми бактерий, которые (i) обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и/или (ii) продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час. Кроме того, множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 1% или более фиксированного азота. Кроме того, каждый представитель множества не являющихся межродовыми бактерий несет по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота так, что не являющиеся межродовыми бактерии становятся способны к фиксации атмосферного азота в присутствии экзогенного азота.[0017] In a further aspect of the invention, a method is provided for increasing nitrogen fixation in a non-legume plant. The method includes applying to a plant a plurality of non-intergeneric bacteria, wherein said plurality includes non-intergeneric bacteria that (i) have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of tissue the plant root and/or (ii) produce a fixed N of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour. In addition, many non-intergeneric bacteria, in planta , produce 1% or more of fixed nitrogen in the plant. In addition, each member of the plurality of non-intergeneric bacteria carries at least one genetic variation introduced into at least one gene or non-coding polynucleotide of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network such that the non-intergeneric bacteria become capable of fixing atmospheric nitrogen in the presence of exogenous nitrogen.
[0018] По дополнительному аспекту изобретения предоставлен способ выведения штаммов микроорганизмов для улучшения конкретных признаков агротехнического значения. Способ включает предоставление множества штаммов микроорганизмов, обладающих способностью к колонизации требуемой сельскохозяйственной культуры. Способ также включает улучшение регуляторных сетей, влияющих на признак, посредством внутригеномной перестановки. Кроме того, способ включает оценку штаммов микроорганизмов во множестве штаммов микроорганизмов для определения меры признака. Кроме того, способ включает отбор из множества штаммов микроорганизмов одного или нескольких штаммов микроорганизмов, которые обеспечивают улучшение признака в случае требуемой сельскохозяйственной культуры.[0018] According to a further aspect of the invention, a method is provided for breeding strains of microorganisms to improve specific traits of agronomic importance. The method includes providing a plurality of strains of microorganisms having the ability to colonize the desired crop. The method also includes improving the regulatory networks affecting the trait through intragenomic rearrangement. In addition, the method includes evaluating microbial strains in a plurality of microbial strains to determine a measure of the trait. In addition, the method includes selecting from a plurality of microorganism strains one or more microorganism strains that provide an improvement in the trait in the case of the desired crop.
[0019] По другому аспекту изобретения предоставлен способ выведения штаммов микроорганизмов с улучшением конкретных признаков агротехнического значения. Способ включает предоставление множества штаммов микроорганизмов, обладающих способностью к колонизации требуемой сельскохозяйственной культуры. Способ также включает внесение генетического разнообразия во множество штаммов микроорганизмов. Кроме того, способ включает оценку штаммов микроорганизмов во множестве штаммов микроорганизмов для определения меры признака. Кроме того, способ включает отбор из множества штаммов микроорганизмов одного или нескольких штаммов микроорганизмов, которые обеспечивают улучшение признака в случае требуемой сельскохозяйственной культуры.[0019] According to another aspect of the invention, a method is provided for breeding strains of microorganisms with the improvement of specific signs of agronomic importance. The method includes providing a plurality of strains of microorganisms having the ability to colonize the desired crop. The method also includes the introduction of genetic diversity in a variety of strains of microorganisms. In addition, the method includes evaluating microbial strains in a plurality of microbial strains to determine a measure of the trait. In addition, the method includes selecting from a plurality of microorganism strains one or more microorganism strains that provide an improvement in the trait in the case of the desired crop.
[0020] По другому аспекту изобретения предоставлен способ увеличения у небобового растения количества получаемого из атмосферы азота. Способ включает воздействие на указанное небобовое растение подвергнутыми генетической инженерии не являющимися межродовыми микроорганизмами, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, или по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.[0020] According to another aspect of the invention, a method is provided for increasing the amount of nitrogen available from the atmosphere in a non-legume plant. The method includes exposing said non-legume plant to genetically engineered non-intergeneric microorganisms, wherein said genetically engineered non-intergeneric microorganisms carry at least one genetic variation introduced into a nitrogen fixation genetic regulatory network, or at least one genetic variation introduced into genetic regulatory network for nitrogen assimilation.
[0021] По дополнительному аспекту изобретения предоставлен способ увеличения у растения кукурузы количества получаемого из атмосферы азота. Способ включает воздействие на указанное растение кукурузы подвергнутыми генетической инженерии не являющимися межродовыми микроорганизмами, несущими генно-инженерные генетические вариации по меньшей мере в двух генах, выбранных из группы, состоящей из nifL, glnB, glnE и amtB.[0021] According to a further aspect of the invention, a method is provided for increasing the amount of atmospheric nitrogen available to a corn plant. The method includes exposing said corn plant to genetically engineered non-intergeneric microorganisms carrying genetically engineered genetic variations in at least two genes selected from the group consisting of nifL , glnB , glnE and amtB .
[0022] По другому аспекту изобретения предоставлен способ увеличения у растения кукурузы количества получаемого из атмосферы азота. Способ включает воздействие на указанное растение кукурузы подвергнутыми генетической инженерии не являющимися межродовыми микроорганизмами, несущими по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы, in planta, продуцируют у указанного растения кукурузы по меньшей мере 5% фиксированного азота, как измеряют посредством разведения 15N в сельскохозяйственных культурах, выращиваемых в полях, обрабатываемых удобрением, содержащим 1,2% 15N.[0022] According to another aspect of the invention, a method is provided for increasing the amount of atmospheric nitrogen available to a corn plant. The method includes exposing said corn plant to genetically engineered non-intergeneric microorganisms carrying at least one genetic variation introduced into a nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into a nitrogen assimilation genetic regulatory network, where said genetically engineered non-intergeneric microorganisms, in planta , produce in said corn plant at least 5% fixed nitrogen, as measured by 15 N dilution in crops grown in fields treated with a fertilizer containing 1.2% 15 N.
[0023] По дополнительному аспекту изобретения предоставлен способ увеличения фиксации азота у небобового растения. Способ включает нанесение на растение множества не являющихся межродовыми бактерий, где указанное множество включает не являющихся межродовыми бактерий, которые (i) обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и (ii) продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час. Кроме того, произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,5 × 10-8 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час. Кроме того, множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 1% или более фиксированного азота. Кроме того, каждый представитель множества не являющихся межродовыми бактерий несет по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота так, что не являющиеся межродовыми бактерии становятся способны к фиксации атмосферного азота в присутствии экзогенного азота.[0023] According to a further aspect of the invention, a method is provided for increasing nitrogen fixation in a non-legume plant. The method includes applying to a plant a plurality of non-intergeneric bacteria, wherein said plurality includes non-intergeneric bacteria that (i) have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of tissue the root of the plant and (ii) produce a fixed N of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour. In addition, the product of (i) the average colonizing capacity per unit of plant root tissue and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.5 x 10 -8 mmol N per gram wet weight of plant root tissue per hour. . In addition, many non-intergeneric bacteria, in planta , produce 1% or more of fixed nitrogen in the plant. In addition, each member of the plurality of non-intergeneric bacteria carries at least one genetic variation introduced into at least one gene or non-coding polynucleotide of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network such that the non-intergeneric bacteria become capable of fixing atmospheric nitrogen in the presence of exogenous nitrogen.
[0024] По другому аспекту изобретения предоставлен способ увеличения фиксации азота у небобового растения. Способ включает нанесение на растение множества бактерий, где указанное множество включает бактерии, которые (i) обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и/или (ii) продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час. Кроме того, множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 1% или более фиксированного азота.[0024] According to another aspect of the invention, a method is provided for increasing nitrogen fixation in a non-legume plant. The method includes applying a plurality of bacteria to a plant, wherein said plurality includes bacteria that (i) have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 × 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue and/or ( ii) produce a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour. In addition, many bacteria, in planta , produce 1% or more of fixed nitrogen in the plant.
[0025] По дополнительному аспекту изобретения предоставлен не являющаяся межродовой популяция бактерий, способная к увеличению фиксации азота у небобового растения, содержащая множество не являющихся межродовыми бактерий, которые (i) обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и/или (ii) продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час. Кроме того, множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении, выращиваемого в присутствии множества не являющихся межродовыми бактерий, 1% или более фиксированного азота. Кроме того, каждый представитель множества не являющихся межродовыми бактерий несет по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота так, что не являющиеся межродовыми бактерии становятся способны к фиксации атмосферного азота в присутствии экзогенного азота.[0025] In a further aspect of the invention, there is provided a non-intergeneric bacterial population capable of increasing nitrogen fixation in a non-legume plant, comprising a plurality of non-intergeneric bacteria that (i) have an average colonizing capacity per unit plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue and/or (ii) produce a fixed N of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour. In addition, a plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produce in a plant grown in the presence of a plurality of non-intergeneric bacteria, 1% or more of fixed nitrogen. In addition, each member of the plurality of non-intergeneric bacteria carries at least one genetic variation introduced into at least one gene or non-coding polynucleotide of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network such that the non-intergeneric bacteria become capable of fixing atmospheric nitrogen in the presence of exogenous nitrogen.
[0026] По дополнительному аспекту изобретения предоставлена популяция бактерий, способная к увеличению фиксации азота у небобового растения, где популяция бактерий содержит множество бактерий, которые (i) обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения; и/или (ii) продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час. Кроме того, множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 1% или более фиксированного азота.[0026] According to a further aspect of the invention, there is provided a bacterial population capable of increasing nitrogen fixation in a non-legume plant, wherein the bacterial population comprises a plurality of bacteria that (i) have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue; and/or (ii) produce a fixed N of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour. In addition, many bacteria, in planta , produce 1% or more of fixed nitrogen in the plant.
[0027] В другом аспекте изобретения предоставлены бактерии, которые (i) обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и/или (ii) продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.[0027] In another aspect of the invention, bacteria are provided that (i) have an average colonizing capacity per unit plant root tissue of at least about 1.0 × 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue and/or (ii) produce a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour.
[0028] В дополнительном аспекте изобретения предоставлены не являющиеся межродовыми бактерии, которые несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота так, что не являющиеся межродовыми бактерии способны к фиксации атмосферного азота в присутствии экзогенного азота, и где указанные бактерии (i) обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и/или (ii) продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.[0028] In a further aspect of the invention, non-intergeneric bacteria are provided that carry at least one genetic variation introduced into at least one gene or non-coding polynucleotide of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network such that the non-intergeneric bacteria are capable of atmospheric fixation. nitrogen in the presence of exogenous nitrogen, and wherein said bacteria (i) have an average colonizing capacity per unit plant root tissue of at least about 1.0 × 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue and/or (ii) produce a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour.
[0029] В дополнительном аспекте изобретения предоставлен способ увеличения фиксации азота в растении, включающий введение в растение эффективного количества композиции, которая содержит очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты 16S, которая по меньшей мере приблизительно на 97% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269, 277-283; очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 90% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276, 284-295; и/или очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 90% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 177-260, 296-303; и где растение, которому вводят эффективное количество композиции, демонстрирует увеличение фиксации азота по сравнению с растением без введения композиции.[0029] In a further aspect of the invention, a method of increasing nitrogen fixation in a plant is provided, comprising administering to the plant an effective amount of a composition that contains a purified population of bacteria that contains bacteria with a 16S nucleic acid sequence that is at least about 97% identical to the nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269, 277-283; a purified bacterial population that contains bacteria with a nucleic acid sequence that is at least about 90% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148 , 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276, 284-295; and/or a purified bacterial population that contains bacteria with a nucleic acid sequence that is at least about 90% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 177-260, 296-303; and wherein a plant administered with an effective amount of the composition exhibits an increase in nitrogen fixation compared to a plant without administration of the composition.
[0030] По дополнительному аспекту изобретения предоставлены выделенные бактерии, содержащие последовательность нуклеиновой кислоты 16S, которая по меньшей мере приблизительно на 97% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269, 277-283; последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 90% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276, 284-295; и/или последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 90% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 177-260, 296-303.[0030] In a further aspect of the invention, isolated bacteria are provided comprising a 16S nucleic acid sequence that is at least about 97% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269, 277-283; a nucleic acid sequence that is at least about 90% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166 , 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276, 284-295; and/or a nucleic acid sequence that is at least about 90% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 177-260, 296-303.
[0031] По другому аспекту изобретения предоставлен способ детекции последовательности с неприродным соединением, включающий: амплификацию нуклеотидной последовательности, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична последовательности с SEQ ID NO: 372-405.[0031] According to another aspect of the invention, a method for detecting a sequence with a non-natural compound is provided, comprising: amplifying a nucleotide sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77% , 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94 %, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the sequence with SEQ ID NO: 372-405.
[0032] По дополнительному аспекту изобретения предоставлен способ детекции последовательности с неприродным соединением, включающий: амплификацию нуклеотидной последовательности, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична последовательности фрагмента по меньшей мере с 10 последовательными парами оснований, содержащегося в SEQ ID NO: 372-405, где указанный фрагмент с последовательными парами оснований состоит из нуклеотидов на пересечении: расположенной выше последовательности, содержащей SEQ ID NO: 304-337, и расположенной ниже последовательности, содержащей SEQ ID NO: 338-371.[0032] According to a further aspect of the invention, a method for detecting a sequence with a non-natural compound is provided, comprising: amplifying a nucleotide sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77% , 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94 %, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the sequence of a fragment with at least 10 consecutive base pairs contained in SEQ ID NO: 372-405, where the specified fragment with consecutive base pairs consists of nucleotides at the intersection: located above the sequence containing SEQ ID NO: 304-337, and located below the sequence containing SEQ ID NO: 338-371.
[0033] По дополнительному аспекту изобретения предоставлена последовательность с неприродным соединением, содержащая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична последовательности с SEQ ID NO: 372-405.[0033] In a further aspect of the invention, there is provided a sequence with a non-natural compound comprising a nucleotide sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95% , 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the sequence with SEQ ID NO: 372-405.
[0034] По дополнительному аспекту изобретения предоставлена последовательность с неприродным соединением, содержащая нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична последовательности фрагмента по меньшей мере с 10 последовательными парами оснований, содержащегося в SEQ ID NO: 372-405, где указанный фрагмент с последовательными парами оснований состоит из нуклеотидов на пересечении: расположенной выше последовательности, содержащей SEQ ID NO: 304-337, и расположенной ниже последовательности, содержащей SEQ ID NO: 338-371.[0034] According to a further aspect of the invention, a sequence with a non-natural compound is provided, comprising a nucleotide sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95% , 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical to the sequence of a fragment with at least 10 consecutive base pairs contained in SEQ ID NO: 372-405, where the specified fragment with consecutive base pairs consists of nucleotides at the intersection: the sequence above containing SEQ ID NOs: 304-337 and below the sequence containing SEQ ID NOs: 338-371.
[0035] По дополнительному аспекту изобретения предоставлена бактериальная композиция, содержащая по меньшей мере один реконструированный штамм бактерий который фиксирует атмосферный азот, по меньшей мере один реконструированный штамм бактерий, содержащий экзогенно добавленную ДНК, где указанная экзогенно добавленная ДНК, по меньшей мере на 80% идентична с соответствующим нативным штаммом бактерий.[0035] In a further aspect of the invention, there is provided a bacterial composition comprising at least one reshaped bacterial strain that fixes atmospheric nitrogen, at least one remodeled bacterial strain containing exogenously added DNA, wherein said exogenously added DNA is at least 80% identical with the corresponding native bacterial strain.
[0036] По дополнительному аспекту изобретения предоставлен способ поддержания уровней азота в почве. Способ включает высаживание в почву поля сельскохозяйственной культуры, инокулированной реконструированными бактериями, которые фиксируют атмосферный азот. Способ также включает сбор урожая указанной сельскохозяйственной культуры, где между посадкой и сбором урожая в указанную почву указанного поля вносят не более 90% дозы азота, необходимой для получения указанной сельскохозяйственной культуры.[0036] According to a further aspect of the invention, a method is provided for maintaining soil nitrogen levels. The method includes planting a crop inoculated with reconstructed bacteria that fix atmospheric nitrogen into the soil of a field. The method also includes harvesting said crop, where between planting and harvesting, no more than 90% of the dose of nitrogen required to obtain said crop is applied to said soil of said field.
[0037] По другому аспекту изобретения предоставлен способ доставки пробиотической добавки в сельскохозяйственную культуру. Способ включает покрытие семян сельскохозяйственной культуры покрытием для семян, пропиткой для семян или протравкой для семян, где указанные покрытие для семян, протравка для семян или пропитка для семян содержат живых представителей указанного пробиотика. Способ также включает внесение указанных семян сельскохозяйственной культуры в почву поля.[0037] According to another aspect of the invention, a method for delivering a probiotic supplement to a crop is provided. The method includes coating seeds of a crop with a seed coating, seed treatment, or seed dressing, wherein said seed coating, seed dressing, or seed treatment contains live representatives of said probiotic. The method also includes applying said crop seeds to the field soil.
[0038] По дополнительному аспекту изобретения предоставлен способ увеличения у небобового растения количества получаемого из атмосферы азота. Способ включает воздействие на указанное небобовое растение реконструированными не являющимися межродовыми микроорганизмами, где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, или по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.[0038] According to a further aspect of the invention, a method is provided for increasing the amount of nitrogen available from the atmosphere in a non-legume plant. The method includes exposing said non-legume plant to reshaped non-intergeneric microorganisms, wherein said remodeled non-intergeneric microorganisms carry at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network, or at least one genetic variation introduced into the assimilation genetic regulatory network. nitrogen.
[0039] По дополнительному аспекту изобретения предоставлен способ увеличения у растения кукурузы количества получаемого из атмосферы азота. Способ включает воздействие на указанное растение кукурузы реконструированными не являющимися межродовыми микроорганизмами, несущими реконструированные генетические вариации по меньшей мере в двух генах, выбранных из группы, состоящей из nifL, glnB, glnE и amtB.[0039] According to a further aspect of the invention, a method is provided for increasing the amount of atmospheric nitrogen available to a corn plant. The method includes exposing said corn plant to reshaped non-intergeneric microorganisms carrying remodeled genetic variations in at least two genes selected from the group consisting of nifL , glnB , glnE and amtB .
[0040] По другому аспекту изобретения предоставлен способ увеличения у растения кукурузы количества получаемого из атмосферы азота. Способ включает воздействие на указанное растение кукурузы реконструированными не являющимися межродовыми микроорганизмами, несущими по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота, где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы, in planta, продуцируют у указанного растения кукурузы по меньшей мере 5% фиксированного азота, как измеряют посредством разведения 15N в сельскохозяйственных культурах, выращиваем в полях, обрабатываемых удобрением, содержащим 1,2% 15N.[0040] According to another aspect of the invention, a method is provided for increasing the amount of atmospheric nitrogen available to a corn plant. The method includes exposing said corn plant to reconstituted non-intergeneric microorganisms carrying at least one genetic variation introduced into a nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into a nitrogen assimilation genetic regulatory network, wherein said reconstituted non- intergeneric microorganisms, in planta , produce at least 5% fixed nitrogen in said corn plant, as measured by 15 N dilution in crops grown in fields treated with a fertilizer containing 1.2% 15 N.
[0041] Дополнительные аспекты изобретения относятся к роду микроорганизмов, который подвергали эволюции и оптимизировали для фиксации азота у небобовых сельскохозяйственных культур in planta. В частности, описаны способы увеличения фиксации азота у небобового растения. Способы могут включать воздействие на растение множеством бактерий. Каждый представитель множества несет одну или несколько генетических вариаций, вносимых в один или несколько генов или некодирующих полинуклеотидов генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота бактерий так, что бактерии становятся способны к фиксации атмосферного азота в присутствии экзогенного азота. Бактерии не являются межродовыми микроорганизмами. Кроме того, бактерии, in planta, продуцируют в растении 1% или более фиксированного азота.[0041] Additional aspects of the invention relate to a genus of microorganisms that has been evolved and optimized for nitrogen fixation in non-legume crops in planta . In particular, methods for increasing nitrogen fixation in a non-legume plant are described. The methods may include exposing the plant to a plurality of bacteria. Each member of the set carries one or more genetic variations introduced into one or more genes or non-coding polynucleotides of the bacterial nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network such that the bacteria become capable of atmospheric nitrogen fixation in the presence of exogenous nitrogen. Bacteria are not intergeneric microorganisms. In addition, bacteria, in planta , produce 1% or more of fixed nitrogen in the plant.
[0042] Дополнительные аспекты изобретения относятся к полезным выделенным микроорганизмам и композициям микроорганизмов. В частности, предоставлены выделенные и биологически чистые микроорганизмы, которые, в числе прочего, применимы при увеличении фиксации азота в сельскохозяйственной культуре. Описанные микроорганизмы можно использовать в их выделенном и биологически чистом состояниях, а также формулировать в композиции. Кроме того, в описании предоставлены композиции микроорганизмов, содержащие по меньшей мере два представителя описанных микроорганизмов, а также способы использования указанных композиций микроорганизмов.[0042] Additional aspects of the invention relate to useful isolated microorganisms and compositions of microorganisms. In particular, isolated and biologically pure microorganisms are provided that are useful in increasing nitrogen fixation in crops, among other things. The described microorganisms can be used in their isolated and biologically pure states, as well as formulated in the composition. In addition, the description provides compositions of microorganisms containing at least two representatives of the described microorganisms, as well as methods of using these compositions of microorganisms.
ВКЛЮЧЕНИЕ В КАЧЕСТВЕ ССЫЛКИINCLUDED AS A LINK
[0043] Все публикации, патенты и патентные заявки, указываемые в настоящем описании, включены в настоящий документ в качестве ссылки в той же степени, как если бы каждые конкретные публикация, патент или патентная заявка были конкретно и отдельно указаны для включения в качестве ссылки.[0043] All publications, patents, and patent applications referenced herein are incorporated herein by reference to the same extent as if each particular publication, patent, or patent application were specifically and separately indicated for inclusion by reference.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙBRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS
[0044] Новые признаки изобретения подробно описаны в прилагаемой формуле изобретения. Лучшее понимание признаков и преимуществ настоящего изобретения можно получить при обращении к приводимому ниже подробному описанию, в котором приведены иллюстративные варианты осуществления, в которых использованы основы изобретения, и к сопровождающим фигурам, в которых:[0044] New features of the invention are described in detail in the attached claims. A better understanding of the features and advantages of the present invention may be obtained by referring to the following detailed description, which provides illustrative embodiments in which the basis of the invention is used, and to the accompanying figures, in which:
[0045] На фигурах 1A-B представлено обогащение и выделение азотфиксирующих бактерий. (A) Для выделения единичных колоний азотфиксирующих бактерий использовали планшеты с агаром Nfb. (B) Полутвердый агар Nfb залитый в пробирку Balch. Стрелка указывает на пелликулу обогащенных азотфиксирующих бактерий.[0045] Figures 1A-B show the enrichment and isolation of nitrogen fixing bacteria. (A) Nfb agar plates were used to isolate single colonies of nitrogen fixing bacteria. (B) Semi-solid Nfb agar poured into a Balch tube. The arrow points to the pellicle of enriched nitrogen-fixing bacteria.
[0046] На фигуре 2 представлен иллюстративный скрининг nifH посредством ПЦР. В этом скрининге положительные полосы наблюдали при ≈350 п.н. для двух колоний. Более низко расположенные полосы представляют собой димеры праймеров.[0046] Figure 2 shows an exemplary screening of nifH by PCR. In this screen, positive bands were observed at ≈350 bp. for two colonies. The lower bands are primer dimers.
[0047] На фигуре 3 приведен пример скрининга посредством ПЦР колоний после мутагенеза с отбором CRISPR-Cas. Колонии CI006 подвергали скринингу с праймерами, специфичными для локуса nifL. Ожидаемый продукт ПЦР дикого типа составляет ≈2,2 т.п.н., тогда как ожидаемый мутант составляет ≈1,1 т.п.н. Семь из десяти подвергнутых скринингу колоний однозначно продемонстрировали требуемую делецию.[0047] The figure 3 shows an example of screening by PCR of colonies after mutagenesis with the selection of CRISPR-Cas. CI006 colonies were screened with primers specific for the nifL locus. The expected wild-type PCR product is ≈2.2 kb, while the expected mutant is ≈1.1 kb. Seven out of ten screened colonies clearly showed the required deletion.
[0048] На фигурах 4A-D приведены фенотипы различных штаммов in vitro. Анализ восстановления ацетилена (ARA) активность мутантов штамма CI010 (фигура 4A) и мутантов штамма CI006 (фигура 4B), выращиваемых в среде для фиксации азота, дополненной глутамином в концентрации от 0 до 10 мМ. Активность дополнительных штаммов в ARA приведена на фигуре 4C, а профиль выделения двумя штаммами аммония с течением времени представлен на фигуре 4D.[0048] Figures 4A-D show the in vitro phenotypes of various strains. Acetylene recovery assay (ARA) activity of CI010 strain mutants ( Figure 4A ) and CI006 strain mutants ( Figure 4B ) grown in nitrogen fixation medium supplemented with 0 to 10 mM glutamine. The activity of the additional strains in ARA is shown in Figure 4C and the release profile of the two strains of ammonium over time is shown in Figure 4D .
[0049] На фигуре 5 приведен профиль экспрессии в культуре 9 различных генов у штаммов CI006, вовлеченных в диазатрофную фиксацию азота. Цифры представляют количества каждого транскрипта. Приведены различные условия (0, 1, 10 мМ глутамин и 0%, 10%, 20% атмосферный воздух в N2).[0049] Figure 5 shows the culture expression profile of 9 different genes in CI006 strains involved in diazotrophic nitrogen fixation. The numbers represent the amounts of each transcript. Various conditions are shown (0, 1, 10 mM glutamine and 0%, 10%, 20% atmospheric air in N 2 ).
[0050] На фигуре 6 приведена колонизация CI006 корней кукурузы. Всходы кукурузы инокулировали CI006, несущими экспрессирующую RFP плазмиду. После двух недель роста и сохранения плазмиды при поливе соответствующим антибиотиком, корни собирали и проводили визуализацию посредством флуоресцентной микроскопии. Можно наблюдать колонизацию межклеточного пространства корней.[0050] Figure 6 shows CI006 colonization of corn roots. Corn seedlings were inoculated with CI006 carrying the RFP expression plasmid. After two weeks of growth and maintenance of the plasmid by irrigating with the appropriate antibiotic, the roots were harvested and visualized by fluorescence microscopy. Colonization of the intercellular space of the roots can be observed.
[0051] На фигуре 7 приведен азот, получаемый на уровне микроорганизмов у штамма дикого типа (CI050) и оптимизированного штамма (CM002).[0051] Figure 7 shows nitrogen obtained at the microbial level for the wild-type strain (CI050) and the optimized strain (CM002).
[0052] На фигурах 8 представлена экспериментальная установка для анализа массы плодов Micro-Tom.[0052] Figures 8 show the Micro-Tom fruit weight test setup.
[0053] На фигуре 9 представлен скрининг 10 штаммов на увеличение массы плода растения в Micro-Tom. Представлены результаты шести повторений. Для столбца 3, p=0,07. Для столбца 7, p=0,05.[0053] Figure 9 shows the Micro-Tom screening of 10 strains for plant fetal weight gain. The results of six repetitions are presented. For
[0054] На фигурах 10A-C приведены дополнительные результаты для активности микроорганизмов-кандидатов и других мутантов-кандидатов, выращиваемых в средах для фиксации азота, дополненной глутамином в концентрации от 0 до 10 мМ, в ARA.[0054] Figures 10A-C show additional results for the activity of candidate microorganisms and other candidate mutants grown in nitrogen fixation media supplemented with 0 to 10 mM glutamine in ARA.
[0055] На фигуре 11 приведен двойной мутант, который демонстрирует более высокое выделение аммиака, чем одиночный мутант, из которого он получен.[0055] Figure 11 shows a double mutant that exhibits higher ammonia excretion than the single mutant from which it is derived.
[0056] На фигуре 12 приведен NDFA, получаемый в эксперименте по захвату газообразного 15N (с обратной экстраполяцией с использованием суток воздействия) для определения NDFA в растениях кукурузы в условиях добавления удобрения.[0056] Figure 12 shows the NDFA obtained from the 15 N gas capture experiment (reverse extrapolated using day of exposure) to determine NDFA in corn plants under fertilization conditions.
[0057] На фигуре 13 приведено значение NDFA, получаемое в эксперименте по захвату газообразного 15N (с обратной экстраполяцией с использованием суток воздействия) для определения NDFA в растениях Setaria в условиях добавления удобрения.[0057] Figure 13 shows the NDFA value obtained from the 15 N gas capture experiment (back extrapolated using day of exposure) to determine NDFA in Setaria plants under fertilization conditions.
[0058] На фигуре 14A приведена степень включения газообразного 15N. Растения, инокулированные эволюционировавшим штаммом, по сравнению с неинокулированными растениями демонстрировали увеличение включения газообразного 15N.[0058] Figure 14A shows the degree of 15 N gas incorporation. Plants inoculated with the evolved strain showed an increase in 15 N gas incorporation compared to non-inoculated plants.
[0059] На фигуре 14B приведены 4 недели после посадки, до 7% азота в растениях, инокулированных эволюционировавшим штаммом, происходит из фиксированного микроорганизмами азота.[0059] Figure 14B shows 4 weeks after planting, up to 7% of the nitrogen in plants inoculated with the evolved strain comes from microbially fixed nitrogen.
[0060] На фигуре 14C показано увеличение площади листа (и других измерений биомассы, данные не показаны) у растений, инокулированных эволюционировавшим штаммом по сравнению с неинокулированными растениями или инокулированными растениями дикого типа.[0060] Figure 14C shows the increase in leaf area (and other biomass measurements, data not shown) in plants inoculated with the evolved strain compared to uninoculated plants or inoculated wild type plants.
[0061] На фигуре 15A приведены эволюционировавшие штаммы, которые демонстрируют значимо более высокую продукцию nifH в ткани корня, как определяют посредством транскриптомного исследования in planta.[0061] Figure 15A depicts evolved strains that show significantly higher production of nifH in root tissue as determined by in planta transcriptome testing.
[0062] На фигуре 15B показано, что уровень фиксированного азота, выявляемый в ткани растения, коррелирует с уровнем колонизации данного конкретного растения оптимизированным по HoME штаммом.[0062] Figure 15B shows that the level of fixed nitrogen detected in plant tissue correlates with the level of colonization of that particular plant by the HoME-optimized strain.
[0063] На фигуре 16A приведена карта структур почв различных полевых почв, тестируемых для колонизации. Почвы, которые исходно являлись источником незначительного количества микроорганизмов, указаны звездами.[0063] Figure 16A is a map of soil structures of various field soils tested for colonization. Soils, which initially were the source of a small number of microorganisms, are indicated by stars.
[0064] На фигуре 16B приведен уровень колонизации штамма 1 и штамма 5, которые тестируют в четырех различных типах почв (окружности). Оба штамма продемонстрировали относительно устойчивый профиль колонизации в различных типах почв.[0064] Figure 16B shows the colonization rate of
[0065] На фигуре 16C приведена колонизация штамма 1, протестированная в полевых испытаниях в течение вегетационного периода. Штамм 1 сохранялся в ткани кукурузы до 12 недели после посадки и начинал демонстрировать снижение колонизации после этого времени.[0065] Figure 16C shows the colonization of
[0040] На фигуре 17A приведена схема выведения микроорганизмов по вариантам осуществления.[0040] Figure 17A is a diagram of microorganism breeding in embodiments.
[0041] На фигуре 17B приведен расширенный вид определения состава микробиома, как приведено на фигуре 17A.[0041] Figure 17B is an expanded view of the microbiome composition as shown in Figure 17A .
[0042] На фигуре 17C приведено получение образцов корней, используемых в примере 7.[0042] Figure 17C shows the preparation of the root samples used in Example 7.
[0043] На фигуре 18 приведена линия модифицированных штаммов, полученных из штамма CI006.[0043] The figure 18 shows a line of modified strains derived from strain CI006.
[0044] На фигуре 19 приведена линия модифицированных штаммов, полученных из штамма CI019.[0044] The figure 19 shows a line of modified strains derived from strain CI019.
[0045] На фигуре 20 приведена тепловая карта количества фунтов азота, доставляемых на акре/сезон микроорганизмами по настоящему изобретению, зарегистрированная как функция микроорганизмов на грамм сырой массы на ммоль азота/микроорганизм/час. Ниже тонкой линии, пересекающей более крупное изображение, находятся микроорганизмы, доставляющие менее одного фунта азота на акре/сезон, а выше линии находятся микроорганизмы, доставляющие более одного фунта азота на акре/сезон. В таблице ниже тепловой карты приведены точные значения ммоль N, продуцируемые микроорганизмом в час (ммоль N/микроорганизм/час) вместе с точными значениями КОЕ на грамм сырой массы (КОЕ/г св.масс.) для каждого микроорганизма, приведенного на тепловой карте. Микроорганизмы, используемые для тепловой карты, анализировали на продукцию N в кукурузе. Для штаммов дикого типа CI006 и CI019, данные по колонизации корня кукурузы получали с одного полевого участка. Для оставшихся штаммов, колонизацию полагали такой же, как уровень в поле у дикого типа. Активность фиксации N определяли с использованием анализа ARA in vitro с 5 мМ глутамином.[0045] Figure 20 is a heat map of pounds of nitrogen delivered per acre/season by the microorganisms of the present invention, recorded as a function of microorganisms per gram wet weight per mmol nitrogen/microorganism/hour. Below the thin line across the larger image are microorganisms delivering less than one pound of nitrogen per acre/season, and above the line are microorganisms delivering more than one pound of nitrogen per acre/season. The table below the heatmap shows the exact mmol N produced by a microorganism per hour (mmol N/microorganism/hour) along with the exact CFU per gram wet weight (CFU/g wt) for each microorganism shown on the heatmap. The microorganisms used for the heat map were analyzed for N production in corn. For wild-type strains CI006 and CI019, maize root colonization data were obtained from one field plot. For the remaining strains, colonization was assumed to be the same as the wild type field level. N fixation activity was determined using an in vitro ARA assay with 5 mM glutamine.
[0046] На фигуре 21 приведена урожайность растений под воздействием штамма CI006. Область кругов соответствует относительной урожайности, тогда как затенение соответствует конкретному показателю MRTN. Ось x представляет собой значение p, а ось y представляет собой вероятность выигрыша.[0046] The figure 21 shows the yield of plants under the influence of strain CI006. The area of the circles corresponds to the relative yield, while the shading corresponds to the specific MRTN. The x-axis represents the p value and the y-axis represents the probability of winning.
[0047] На фигуре 22 приведена урожайность растений под воздействием штамма CM029. Область кругов соответствует относительной урожайности, тогда как затенение соответствует конкретному показателю MRTN. Ось x представляет собой значение p, а ось y представляет собой вероятность выигрыша.[0047] The figure 22 shows the yield of plants under the influence of strain CM029. The area of the circles corresponds to the relative yield, while the shading corresponds to the specific MRTN. The x-axis represents the p value and the y-axis represents the probability of winning.
[0048] На фигуре 23 приведена урожайность растений под воздействием штамма CM038. Область кругов соответствует относительной урожайности, тогда как затенение соответствует конкретному показателю MRTN. Ось x представляет собой значение p, а ось y представляет собой вероятность выигрыша.[0048] The figure 23 shows the yield of plants under the influence of strain CM038. The area of the circles corresponds to the relative yield, while the shading corresponds to the specific MRTN. The x-axis represents the p value and the y-axis represents the probability of winning.
[0049] На фигуре 24 приведена урожайность растений под воздействием штамма CI019. Область кругов соответствует относительной урожайности, тогда как затенение соответствует конкретному показателю MRTN. Ось x представляет собой значение p, а ось y представляет собой вероятность выигрыша.[0049] The figure 24 shows the yield of plants under the influence of strain CI019. The area of the circles corresponds to the relative yield, while the shading corresponds to the specific MRTN. The x-axis represents the p value and the y-axis represents the probability of winning.
[0050] На фигуре 25 приведена урожайность растений под воздействием штамма CM081. Область кругов соответствует относительной урожайности, тогда как затенение соответствует конкретному показателю MRTN. Ось x представляет собой значение p, а ось y представляет собой вероятность выигрыша.[0050] The figure 25 shows the yield of plants under the influence of strain CM081. The area of the circles corresponds to the relative yield, while the shading corresponds to the specific MRTN. The x-axis represents the p value and the y-axis represents the probability of winning.
[0051] На фигуре 26 приведена урожайность растений под воздействием штаммов CM029 и CM081. Область кругов соответствует относительной урожайности, тогда как затенение соответствует конкретному показателю MRTN. Ось x представляет собой значение p, а ось y представляет собой вероятность выигрыша.[0051] The figure 26 shows the yield of plants under the influence of strains CM029 and CM081. The area of the circles corresponds to the relative yield, while the shading corresponds to the specific MRTN. The x-axis represents the p value and the y-axis represents the probability of winning.
[0052] На фигуре 27 приведена урожайность растений в виде совокупных прироста/потери в бушелях. Область кругов соответствует относительной урожайности, тогда как затенение соответствует конкретному показателю MRTN. Ось x представляет собой значение p, а ось y представляет собой вероятность выигрыша.[0052] Figure 27 shows plant yields as cumulative gain/loss in bushels. The area of the circles corresponds to the relative yield, while the shading corresponds to the specific MRTN. The x-axis represents the p value and the y-axis represents the probability of winning.
[0053] На фигурах 28A-28E проиллюстрированы производные микроорганизмы, которые фиксируют и выделяют азот in vitro в условиях, сходных с высоконитратными сельскохозяйственными почвами. На фигуре 28A проиллюстрирована регуляторная сеть, контролирующая фиксацию и ассимиляцию азота у PBC6.1, включающая ключевые узлы NifL, NifA, GS, GlnE, изображенные в виде двухдоменого АТазного-AR фермента и AmtB. На фигуре 28B проиллюстрирован геном изолята PBC6.1 Kosakonia sacchari. Три траектории, описывающие геном, соответствуют данным транскрипции PBC6.1, PBC6.38 и дифференциальной экспрессии у штаммов, соответственно. На фигуре 28C проиллюстрирован кластер генов фиксации азота и данные по транскрипции увеличены для демонстрации более мелких подробностей. На фигуре 28D проиллюстрирована нитрогеназная активность при варьирующих концентрациях экзогенного азота, определенная анализом восстановления ацетилена. Штамм дикого типа демонстрирует подавление нитрогеназной активности по мере увеличения концентраций глутамина, тогда как производные штаммы демонстрируют различные степени устойчивости. Величины ошибок представляют собой стандартную ошибку среднего по меньшей мере трех биологических повторений. На фигуре 28E проиллюстрирован временное выделение аммиака производными штаммами, наблюдаемое при мМ концентрациях. По наблюдениям, штаммы дикого типа не выделяют фиксированный азот, и в средах накапливается незначительное количество аммиака. Величины ошибок представляют собой стандартную ошибку среднего.[0053] Figures 28A-28E illustrate derived microorganisms that fix and release nitrogen in vitro under conditions similar to high nitrate agricultural soils. Figure 28A illustrates the regulatory network controlling nitrogen fixation and assimilation in PBC6.1, including the key nodes NifL, NifA, GS, GlnE depicted as a dual domain ATase-AR enzyme and AmtB. Figure 28B illustrates the genome of the PBC6.1 isolate Kosakonia sacchari . The three trajectories describing the genome correspond to PBC6.1, PBC6.38 transcription and strain differential expression data, respectively. Figure 28C illustrates the nitrogen fixation gene cluster and transcription data is enlarged to show finer details. Figure 28D illustrates nitrogenase activity at varying concentrations of exogenous nitrogen as determined by an acetylene reduction assay. The wild-type strain shows suppression of nitrogenase activity as glutamine concentrations increase, while derived strains show varying degrees of resistance. The error bars are the standard error of the mean of at least three biological replicates. Figure 28E illustrates the transient release of ammonia from derivative strains observed at mM concentrations. According to observations, wild-type strains do not release fixed nitrogen, and a small amount of ammonia accumulates in the media. The error bars are the standard error of the mean.
[0054] На фигурах 29A-29C проиллюстрированы эксперименты в теплице, демонстрирующие фиксация азота микроорганизмами в кукурузе. На фигуре 29A проиллюстрирована колонизация микроорганизмами через шесть недель после инокуляция растений кукурузы штаммами, производными PBC6.1. Величины ошибок представляют собой стандартную ошибку среднего по меньшей мере восьми биологических повторений. На фигуре 29B проиллюстрирована транскрипция nifH in planta, определяемая посредством выделения тотальной РНК из корней и последующего анализа Nanostring. Только производные штаммы демонстрируют транскрипцию nifH в условиях корней. Величины ошибок представляют собой стандартную ошибку среднего по меньшей мере 3 биологических повторений. На фигуре 29C проиллюстрирована фиксация азота микроорганизмами, определяемая посредством разведения изотопного индикатора в тканях растений. Производные микроорганизмы демонстрируют значительный перенос фиксированного азота в растение. Величины ошибок представляют собой стандартную ошибку среднего по меньшей мере десяти биологических повторений.[0054] Figures 29A-29C illustrate greenhouse experiments demonstrating nitrogen fixation by microorganisms in corn. Figure 29A illustrates microorganism colonization six weeks after inoculation of corn plants with PBC6.1-derived strains. Error bars are the standard error of the mean of at least eight biological replicates. Figure 29B illustrates in planta transcription of nifH determined by isolation of total RNA from roots and subsequent Nanostring analysis. Only derived strains show nifH transcription under root conditions. Error bars are the standard error of the mean of at least 3 biological replicates. Figure 29C illustrates nitrogen fixation by microorganisms as determined by isotope tracer dilution in plant tissues. Derived microorganisms show a significant transfer of fixed nitrogen into the plant. The error bars are the standard error of the mean of at least ten biological replicates.
[0055] На фигуре 30 проиллюстрирована колонизация PBC6.1 почти до 21% количества ассоциированной с корнями микробиоты в корнях кукурузы. Количественные данные основанные на секвенирование ампликонов 16S ризосферы и эндосферы растений кукурузы, инокулированных PBC6.1 и выращиваемых в тепличных условиях.[0055] Figure 30 illustrates PBC6.1 colonization to nearly 21% of the root-associated microbiota in maize roots. Quantitative data based on sequencing of 16S amplicons from the rhizosphere and endosphere of maize plants inoculated with PBC6.1 and grown under greenhouse conditions.
[0056] На фигуре 31 проиллюстрированы транскрипционные уровни nifA в штаммах, производных PBC6.1, коррелируемые с уровнями восстановления ацетилена. Анализ ARA проводили, как описано в разделе способов, после чего отбирали образец культуры и подвергали анализу кПЦР с определением уровней транскрипта nifA. Величины ошибок в каждом измерении представляют собой стандартную ошибку среднего по меньшей мере трех биологических повторений.[0056] Figure 31 illustrates transcriptional levels of nifA in PBC6.1-derived strains correlated with acetylene reduction levels. ARA analysis was performed as described in the methods section, after which a culture sample was taken and subjected to qPCR analysis to determine the levels of the nifA transcript. The error rates in each measurement are the standard error of the mean of at least three biological replicates.
[0057] На фигуре 32 проиллюстрированы результаты тестового полевого эксперимента лета 2017 года. Полученные результаты урожайности демонстрируют, что микроорганизмы по изобретению могут служить в качестве потенциального заменителя удобрений. Например, использование микроорганизма по изобретению (т.е., 6-403) приводило к более высокому урожаю, чем у штамма дикого типа (WT) и к более высокому урожаю, чем у необработанного контроля (UTC). При обработке "-25 фунтов N" используют на 25 фунтов N на акр меньше, чем при стандартной сельскохозяйственной практике в этом регионе. Обработка UTC "100% N" предназначена для обозначения стандартной сельскохозяйственной практики в этом регионе, при которой 100% стандартного использования N применяет сельхозпроизводитель. Микроорганизм "6-403" депонирован под идентификатором NCMA 201708004, и его можно найти в таблице A. Он представляет собой мутанта Kosakonia sacchari (также называемого CM037) и представляет собой мутантный штамм-потомок CI006 дикого типа.[0057] Figure 32 illustrates the results of the summer 2017 field test. The yield results obtained demonstrate that the microorganisms of the invention can serve as a potential fertilizer substitute. For example, the use of the microorganism of the invention (ie, 6-403) resulted in higher yield than the wild type (WT) strain and higher yield than the untreated control (UTC). The "-25 lb N" treatment uses 25 lb N per acre less than standard farming practice in the region. The UTC treatment "100% N" is intended to refer to the standard agricultural practice in this region, where 100% of the standard N use is applied by the farmer. The microorganism "6-403" was deposited under NCMA ID 201708004 and can be found in Table A. It is a mutant of Kosakonia sacchari (also referred to as CM037) and is a wild-type mutant progeny strain of CI006.
[0058] На фигуре 33 проиллюстрированы результаты тестового полевого эксперимента лета 2017 года. Полученные результаты урожайности демонстрируют, что микроорганизмы по изобретению в различных регионах действуют единообразно. Кроме того, результаты урожайности демонстрируют, что микроорганизмы по изобретению хорошо функционируют как в среде с недостаточным содержанием азота, так и в среде с достаточным содержанием азота. Микроорганизм "6-881" (также известный как CM094, PBC6.94) и являющийся мутантным потомком штамма Kosakonia sacchari CI006 дикого типа, депонирован под идентификатором NCMA 201708002, и его можно найти в таблице A. Микроорганизм "137-1034", который является мутантным потомком штамма Klebsiella variicola CI137 дикого типа, депонирован под идентификатором NCMA 201712001, и его можно найти в таблице A. Микроорганизм "137-1036", который является мутантным потомком штамма Klebsiella variicola CI137 дикого типа, депонирован под идентификатором NCMA 201712002, и его можно найти в таблице A. Микроорганизм "6-404" (также известный как CM38, PBC6.38), и который является мутантным потомком штамма Kosakonia sacchari CI006 дикого типа, депонирован под идентификатором NCMA 201708003, и его можно найти в таблице A. Условия "недостатка питания" соответствует условиям с 0% азота. Условия с "достаточным содержанием удобрения" соответствует условиям со 100% азота.[0058] Figure 33 illustrates the results of the summer 2017 test field experiment. The yield results obtained demonstrate that the microorganisms according to the invention act uniformly in different regions. In addition, the yield results demonstrate that the microorganisms of the invention perform well in both nitrogen deficient and nitrogen rich environments. The microorganism "6-881" (also known as CM094, PBC6.94) and being a mutant descendant of the wild-type strain Kosakonia sacchari CI006, is deposited under NCMA ID 201708002 and can be found in Table A. The microorganism "137-1034", which is a mutant descendant of the wild-type strain Klebsiella variicola CI137, has been deposited under NCMA ID 201712001 and can be found in Table A. The microorganism "137-1036", which is a mutant descendant of the wild-type strain Klebsiella variicola CI137, has been deposited under NCMA ID 201712002 and can be found in Table A. The microorganism "6-404" (also known as CM38, PBC6.38), and which is a mutant progeny of the wild-type strain Kosakonia sacchari CI006, is deposited under NCMA ID 201708003 and can be found in Table A. The "lack of nutrition" condition corresponds to conditions with 0% nitrogen. Conditions with "sufficient fertilizer content" corresponds to conditions with 100% nitrogen.
[0059] На фигуре 34 приведена линия модифицированных штаммов, полученных из штамма CI006 (также обозначаемого "6", дикий тип Kosakonia sacchari).[0059] Figure 34 shows a line of modified strains derived from strain CI006 (also referred to as "6", wild type Kosakonia sacchari ).
[0060] На фигуре 35 приведена линия модифицированных штаммов, полученных из штамма CI019 (также обозначаемого "19", дикий тип Rahnella aquatilis).[0060] Figure 35 shows a line of modified strains derived from strain CI019 (also referred to as "19", wild type Rahnella aquatilis ).
[0061] На фигуре 36 приведена линия модифицированных штаммов, полученных из штамма CI137 (также обозначаемого "137", дикий тип Klebsiella variicola).[0061] Figure 36 shows a line of modified strains derived from strain CI137 (also referred to as "137", wild type Klebsiella variicola ).
[0062] На фигуре 37 приведена линия модифицированных штаммов, полученных из штамма 1021 (дикий тип Kosakonia pseudosacchari).[0062] Figure 37 shows a line of modified strains derived from strain 1021 (wild type Kosakonia pseudosacchari ).
[0063] На фигуре 38 приведена линия модифицированных штаммов, полученных из штамма 910 (дикий тип Kluyvera intermedia).[0063] Figure 38 shows a line of modified strains derived from strain 910 (wild type Kluyvera intermedia ).
[0064] На фигуре 39 приведена линия модифицированных штаммов, полученных из штамма 63 (дикий тип Rahnella aquatilis).[0064] Figure 39 shows a line of modified strains derived from strain 63 (wild type Rahnella aquatilis ).
[0065] На фигуре 40 приведена тепловая карта количества фунтов азота, доставляемых на акре/сезон микроорганизмами по настоящему изобретению, зарегистрированная как функция микроорганизмов на грамм сырой массы на ммоль азота/микроорганизм/час. Ниже тонкой линии, пересекающей более крупное изображение, находятся микроорганизмы, доставляющие менее одного фунта азота на акре/сезон, а выше линии находятся микроорганизмы, доставляющие более одного фунта азота на акре/сезон. В таблица C в примере 12 приведены точные значения ммоль N, продуцируемых микроорганизмом в час (ммоль N/микроорганизм/час) вместе с точными значениями КОЕ на грамм сырой массы (КОЕ/г св.масс.) для каждого микроорганизма, приведенного на тепловой карте. Данные на фигуре 40 получают для штаммов микроорганизмов, оцениваемых на продукцию N в кукурузе в полевых условиях. Каждая точка представляет собой количество фунтов N/акр, продуцируемых микроорганизмом, с использованием данных по колонизации корня кукурузы с одного полевого участка. Активность фиксации N определяли с использованием анализа ARA in vitro с 5 мМ N в форме глутамина или фосфата аммония.[0065] Figure 40 is a heat map of pounds of nitrogen delivered per acre/season by the microorganisms of the present invention, recorded as a function of microorganisms per gram wet weight per mmol nitrogen/microorganism/hour. Below the thin line across the larger image are microorganisms delivering less than one pound of nitrogen per acre/season, and above the line are microorganisms delivering more than one pound of nitrogen per acre/season. Table C in Example 12 lists the exact mmol N produced by a microorganism per hour (mmol N/microorganism/hr) along with the exact CFU per gram wet weight (CFU/g wt) for each microorganism shown on the heat map. . The data in Figure 40 is for microbial strains assessed for N production in corn in the field. Each point represents pounds N/acre produced by the microorganism using corn root colonization data from one field plot. N fixation activity was determined using an in vitro ARA assay with 5 mM N in the form of glutamine or ammonium phosphate.
[0066] На фигуре 41 приведена тепловая карта количества фунтов азота, доставляемых на акре/сезон микроорганизмами по настоящему изобретению, зарегистрированная как функция микроорганизмов на грамм сырой массы на ммоль азота/микроорганизм/час. Ниже тонкой линии, пересекающей более крупное изображение, находятся микроорганизмы, доставляющие менее одного фунта азота на акре/сезон, а выше линии находятся микроорганизмы, доставляющие более одного фунта азота на акре/сезон. В таблица D в примере 12 приведены точные значения ммоль N, продуцируемых микроорганизмом в час (ммоль N/микроорганизм/час) вместе с точными значениями КОЕ на грамм сырой массы (КОЕ/г св.масс.) для каждого микроорганизма, приведенного на тепловой карте. Данные на фигуре 41 получают для штаммов микроорганизмов, оцениваемых на продукцию N в кукурузе в лабораторных и тепличных условиях. Каждая точка представляет собой количество фунтов N/акр, продуцируемое одним штаммом. Белые точки представляют штаммы, для которых данные по колонизации корня кукурузы получали в тепличных условиях. Черные точки представляют мутантные штаммы, для которых уровни колонизации корней кукурузы получают на основании средних полевых уровней колонизации корней кукурузы родительского штамма дикого типа. Заштрихованные точки представляют родительские штаммы дикого типа с их средними полевыми уровнями колонизации корней кукурузы. Во всех случаях активность фиксации N определяли посредством анализа ARA in vitro с 5 мМ N в форме глутамина или фосфата аммония.[0066] Figure 41 is a heat map of pounds of nitrogen delivered per acre/season by the microorganisms of the present invention, recorded as a function of microorganisms per gram wet weight per mmol nitrogen/microorganism/hour. Below the thin line across the larger image are microorganisms delivering less than one pound of nitrogen per acre/season, and above the line are microorganisms delivering more than one pound of nitrogen per acre/season. Table D in Example 12 lists the exact mmol N produced by a microorganism per hour (mmol N/microorganism/hr) along with the exact CFU per gram wet weight (CFU/g wt) for each microorganism shown on the heat map. . The data in Figure 41 is obtained for strains of microorganisms evaluated for N production in corn under laboratory and greenhouse conditions. Each dot represents pounds N/acre produced by one strain. White dots represent strains for which corn root colonization data were obtained under greenhouse conditions. Black dots represent mutant strains for which corn root colonization levels are derived from average field corn root colonization levels of the wild-type parental strain. The shaded dots represent wild-type parental strains with their mean field levels of corn root colonization. In all cases, N fixation activity was determined by in vitro ARA assay with 5 mM N in the form of glutamine or ammonium phosphate.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
[0067] Хотя в настоящем документе представлены и описаны различные варианты осуществления изобретения, специалистам в данной области очевидно, что такие варианты осуществления предоставлены только в качестве примера. Специалисты в данной области могут проводить многочисленные вариации, изменения и замены без отклонения от изобретения. Следует понимать, что вместо вариантов осуществления изобретения, описываемых в настоящем документе, можно использовать различные альтернативы.[0067] While various embodiments of the invention are presented and described herein, those skilled in the art will appreciate that such embodiments are provided by way of example only. Numerous variations, changes and substitutions can be made by those skilled in the art without departing from the invention. It should be understood that instead of the embodiments of the invention described in this document, you can use various alternatives.
[0068] Повышенное использование удобрений сопряжено с экологическими проблемами и, вероятно, не представляется возможным для многих экономически напряженных регионов земного шара. Кроме того, многие промышленные предприятия в области микроорганизмов сфокусированы на создании межродовых микроорганизмов. Однако на подвергнутые инженерии микроорганизмы, которые характеризуют/классифицируют как межродовые, накладывается тяжелое регуляторное обременение. Эти межродовые микроорганизмы сталкиваются не только с более высоким регуляторным обременением, что затрудняет широкое распространение и внедрение, но также с большим вниманием общественности.[0068] The increased use of fertilizers is associated with environmental problems and is probably not possible for many economically stressed regions of the globe. In addition, many microbial industries focus on creating intergeneric micro-organisms. However, engineered microorganisms that are characterized/classified as intergeneric carry a heavy regulatory burden. These intergeneric microorganisms face not only a higher regulatory burden, making it difficult to spread and implement widely, but also more public scrutiny.
[0069] В настоящее время на рынке отсутствуют подвергнутые инженерии микроорганизмы, не являющиеся межродовыми и способные усиливать фиксацию азота у небобовых культур. Это отсутствие такого микроорганизма представляет собой недостающий элемент, помогающий создать действительно экологически чистую и более устойчивую сельскохозяйственную систему XXI века.[0069] There are currently no engineered non-intergeneric microorganisms on the market that can enhance nitrogen fixation in non-legumes. This absence of such a microorganism represents the missing element in helping to create a truly environmentally friendly and more sustainable agricultural system in the 21st century.
[0070] Настоящее изобретение решает указанные выше проблемы и предоставляет не являющийся межродовым микроорганизм, который был сконструирован для легкой фиксации азота в сельскохозяйственных культурах. Эти микроорганизмы не характеризуют/классифицируют как межродовые микроорганизмы и, следовательно, они не будут сталкиваться с их серьезным регулирующим обременением. Кроме того, исследованные не являющиеся межродовыми микроорганизмы могут поспособствовать сельхозпроизводителям XXI века стать менее зависимыми от использования постоянно растущего количества экзогенных азотных удобрений.[0070] The present invention solves the above problems and provides a non-intergeneric microorganism that has been engineered to readily fix nitrogen in crops. These micro-organisms are not characterized/classified as intergeneric micro-organisms and therefore will not face significant regulatory encumbrances. In addition, researched non-intergeneric microorganisms may help 21st century farmers become less dependent on the use of an ever-increasing amount of exogenous nitrogen fertilizers.
ОпределенияDefinitions
[0071] Термины "полинуклеотид", "нуклеотид", "нуклеотидная последовательность", "нуклеиновая кислота" и "олигонуклеотид" используют взаимозаменяемо. Они относятся к полимерной форме нуклеотидов любой длины, представляющих собой дезоксирибонуклеотиды, или рибонуклеотиды, или их аналоги. Полинуклеотиды могут обладать любой трехмерной структурой и могут выполнять любую функцию, известную или неизвестную. Неограничивающими примерами полинуклеотидов является следующее: кодирующие или некодирующие области гена или фрагмента гена, локусы (локус), определяемые на основе анализа сцепления, экзоны, интроны, информационная РНК (иРНК), транспортная РНК (тРНК), рибосомальная РНК (рРНК), малая интерферирующая РНК (миРНК), короткошпилечная РНК (кшРНК), микро-РНК (мкРНК), рибозимы, кДНК, рекомбинантные полинуклеотиды, разветвленные полинуклеотиды, плазмиды, векторы, выделенная ДНК любой последовательности, выделенная РНК любой последовательности, зонды и праймеры нуклеиновой кислоты. Полинуклеотид может содержать один или несколько модифицированных нуклеотидов, таких как метилированные нуклеотиды и аналоги нуклеотидов. Если они присутствуют, модификации структуры нуклеотида можно обеспечивать до или после сборки полимера. Последовательности нуклеотидов могут прерываться ненуклеотидными компонентами. Полинуклеотид можно дополнительно модифицировать после полимеризации, например, посредством конъюгации с меченым компонентом.[0071] The terms "polynucleotide", "nucleotide", "nucleotide sequence", "nucleic acid", and "oligonucleotide" are used interchangeably. They refer to the polymeric form of nucleotides of any length, which are deoxyribonucleotides or ribonucleotides or their analogues. Polynucleotides can have any three-dimensional structure and can perform any function, known or unknown. Non-limiting examples of polynucleotides are: coding or non-coding regions of a gene or gene fragment, loci (locus) determined by linkage analysis, exons, introns, messenger RNA (mRNA), transfer RNA (tRNA), ribosomal RNA (rRNA), small interfering RNA (siRNA), short hairpin RNA (shRNA), microRNA (miRNA), ribozymes, cDNA, recombinant polynucleotides, branched polynucleotides, plasmids, vectors, isolated DNA of any sequence, isolated RNA of any sequence, nucleic acid probes and primers. The polynucleotide may contain one or more modified nucleotides such as methylated nucleotides and nucleotide analogs. If present, modifications to the nucleotide structure may be provided before or after polymer assembly. Nucleotide sequences may be interrupted by non-nucleotide components. The polynucleotide can be further modified after polymerization, for example by conjugation with a labeled moiety.
[0072] "Гибридизация" относится к реакции, в которой реагируют один или несколько полинуклеотидов с формированием комплекса, который стабилизирован вследствие образования водородных связей между основаниями нуклеотидных остатков. Образование водородных связей может происходить при спаривании оснований по Уотсону-Крику, связывании по Хугстину или любым другим специфичным для последовательностей способом. Комплекс может содержать две цепи, формирующие дуплексную структуру, три или более цепи, формирующие мультицепочечный комплекс, одну самогибридизующуюся цепь или любую комбинацию из них. Реакция гибридизации может представлять собой этап в более сложном процессе, таком как инициация ПЦР или ферментативное расщепление полинуклеотида эндонуклеазой. Вторая последовательность, которая комплементарна первой последовательности обозначают как последовательность, "комплементарную" первой последовательности. Термин "гибридизующийся" в применении к полинуклеотиду относится к способности полинуклеотида к формированию комплекса, который стабилизирован вследствие образования водородных связей между основаниями нуклеотидных остатков в реакции гибридизации.[0072] "Hybridization" refers to a reaction in which one or more polynucleotides react to form a complex that is stabilized by hydrogen bonding between bases of nucleotide residues. Hydrogen bonding can occur by Watson-Crick base pairing, Hoogsteen bonding, or any other sequence-specific manner. The complex may contain two strands forming a duplex structure, three or more strands forming a multistrand complex, one self-hybridizing strand, or any combination of these. The hybridization reaction may be a step in a more complex process such as PCR initiation or enzymatic cleavage of a polynucleotide with an endonuclease. A second sequence that is complementary to the first sequence is referred to as a sequence "complementary" to the first sequence. The term "hybridizable" when applied to a polynucleotide refers to the ability of a polynucleotide to form a complex that is stabilized due to the formation of hydrogen bonds between bases of nucleotide residues in a hybridization reaction.
[0073] "Комплементарность" относится к способности нуклеиновой кислоты к формированию водородной связи(-ей) с другой последовательностью нуклеиновой кислоты посредством традиционного спаривания по Уотсону-Крику или других нетрадиционных типов спаривания. Процент комплементарности означает процент остатков в молекуле нуклеиновой кислоты, которые могут формировать водородные связи (например, посредством спаривания оснований по Уотсону-Крику) со второй последовательностью нуклеиновой кислоты (например, 5, 6, 7, 8, 9, 10 из 10 представляют собой комплементарность 50%, 60%, 70%, 80%, 90% и 100%, соответственно). "Идеальная комплементарность" означает, что се последовательные остатки последовательности нуклеиновой кислоты формируют водородные связи с таким же количеством последовательных остатков во второй последовательности нуклеиновой кислоты. Как используют в настоящем документе, "в значительной степени комплементарные" относится к степени комплементарности, которая составляет по меньшей мере 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98%, 99% или 100% на области 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 30, 35, 40, 45, 50 или более нуклеотидов, или относится к двум нуклеиновым кислотам, которые гибридизуются в жестких условиях. Идентичность последовательностей, например, для целей оценки процента комплементарности, можно определять любым подходящим алгоритмом выравнивания, включая в качестве неограничивающих примеров алгоритм Нидлмана-Вунша (см. например, средство выравнивания EMBOSS Needle, доступное на www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_needle/nucleotide.html, необязательно с установками по умолчанию), алгоритм BLAST (см. например, средство выравнивания BLAST, доступное на blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi, необязательно с настройками по умолчанию) или алгоритм Смита-Уотермана (см. например, средство выравнивания EMBOSS Water, доступное на www.ebi.ac.uk/Tools/psa/emboss_water/nucleotide.html, необязательно с настройками по умолчанию). Оптимальное выравнивание можно оценивать с использованием любых подходящих параметров выбранного алгоритма, включая параметры по умолчанию.[0073] "Complementarity" refers to the ability of a nucleic acid to form hydrogen bond(s) with another nucleic acid sequence via conventional Watson-Crick or other non-traditional mating types. Complementarity percent refers to the percentage of residues in a nucleic acid molecule that can form hydrogen bonds (e.g., via Watson-Crick base pairing) with a second nucleic acid sequence (e.g., 5, 6, 7, 8, 9, 10 out of 10 are complementarity 50%, 60%, 70%, 80%, 90% and 100%, respectively). "Perfect complementarity" means that all consecutive residues of a nucleic acid sequence form hydrogen bonds with the same number of consecutive residues in a second nucleic acid sequence. As used herein, "substantially complementary" refers to a degree of complementarity that is at least 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 97%, 98 %, 99% or 100% on
[0074] Как правило, "жесткие условия" гибридизации относятся к условиям, в которых нуклеиновая кислота, комплементарная последовательности-мишени, преимущественно гибридизуется с последовательностью-мишенью, и по существу не гибридизуется с не являющимися мишенями последовательностями. Как правило, жесткие условия зависят от последовательности и варьируют в зависимости от ряда факторов. Как правило, чем длиннее является последовательность, тем выше является температура при которой последовательность специфически гибридизуется с ее последовательностью-мишенью. Неограничивающие примеры жестких условий подробно описаны в Tijssen (1993), Laboratory Techniques In Biochemistry And Molecular Biology-Hybridization With Nucleic Acid Probes Part I, Second Chapter "Overview of principles of hybridization and the strategy of nucleic acid probe assay", Elsevier, N.Y.[0074] Generally, "stringent hybridization conditions" refer to conditions under which a nucleic acid that is complementary to a target sequence preferentially hybridizes to the target sequence and does not substantially hybridize to non-target sequences. As a rule, stringent conditions are sequence dependent and vary depending on a number of factors. Generally, the longer a sequence is, the higher is the temperature at which the sequence specifically hybridizes to its target sequence. Non-limiting examples of stringent conditions are detailed in Tijssen (1993), Laboratory Techniques In Biochemistry And Molecular Biology-Hybridization With Nucleic Acid Probes Part I, Second Chapter "Overview of principles of hybridization and the strategy of nucleic acid probe assay", Elsevier, N.Y.
[0075] Как используют в настоящем документе, "экспрессия" относится к процессу, посредством которого полинуклеотид транскрибируется с матрицы ДНК (например в иРНК или другой транскрипт РНК), и/или к процессу, посредством которого затем происходит трансляция транскрибируемой иРНК в пептиды, полипептиды или белки. Транскрипты и кодируемые полипептиды в совокупности можно обозначить как "продукт гена". Если полинуклеотид получен с геномной ДНК, экспрессия может включать сплайсинг иРНК в эукариотической клетке.[0075] As used herein, "expression" refers to the process by which a polynucleotide is transcribed from a DNA template (e.g. into an mRNA or other RNA transcript) and/or the process by which the transcribed mRNA is then translated into peptides, polypeptides or squirrels. The transcripts and encoded polypeptides can be collectively referred to as a "gene product". If the polynucleotide is derived from genomic DNA, expression may involve mRNA splicing in a eukaryotic cell.
[0076] Термины "полипептид", "пептид" и "белок" в настоящем документе используют взаимозаменяемо для обозначения полимеров аминокислот любой длины. Полимер может быть линейным или разветвленным, он может содержать модифицированные аминокислоты, и он может прерываться не являющимися аминокислотами участками. Термины также включает модифицированный полимер из аминокислот; например, посредством формирования дисульфидной связи, гликозилирования, липидизации, ацетилирования, фосфорилирования или любой другой манипуляции, такой как конъюгация с меченым компонентом. Как используют в настоящем документе термин "аминокислота" включает природные и/или неприродные или синтетические аминокислоты, включая глицин и D или L оптические изомеры, и аналоги аминокислот и пептидомиметики.[0076] The terms "polypeptide", "peptide", and "protein" are used interchangeably herein to refer to polymers of amino acids of any length. The polymer may be linear or branched, it may contain modified amino acids, and it may be interrupted by non-amino acid regions. The terms also include a modified polymer of amino acids; for example, by disulfide bond formation, glycosylation, lipidation, acetylation, phosphorylation, or any other manipulation such as conjugation with a labeled moiety. As used herein, the term "amino acid" includes natural and/or non-natural or synthetic amino acids, including glycine and D or L optical isomers, and amino acid analogs and peptidomimetics.
[0077] Как используют в настоящем документе, термин "приблизительно" используют как синоним термина "примерно". Для иллюстрации, использование термина "приблизительно" в отношении количества означает, что значения немного выходят за указанные значения, например, плюс или минус от 0,1% до 10%.[0077] As used herein, the term "about" is used as a synonym for the term "about". For illustration, the use of the term "about" in relation to the amount means that the values are slightly outside the specified values, for example, plus or minus from 0.1% to 10%.
[0078] Термин "биологически чистая культура" или "по существу чистая культура" относится к культуре вида бактерий, описываемого в настоящем документе, не содержащей других видов бактерий в количествах, достаточных для препятствия репликации культуры, или детектируемых стандартными бактериологическими методами.[0078] The term "biologically pure culture" or "substantially pure culture" refers to a culture of the bacterial species described herein that does not contain other bacterial species in quantities sufficient to interfere with the replication of the culture or detectable by standard bacteriological methods.
[0079] "Продуктивность растений" в основном относится к любому показателю роста или развития растения, который является причиной, по которой это растение выращивают. Для продовольственных культур, таких как зерновые или овощи, "продуктивность растений" может относиться к урожаю зерновых или плодов, собираемых у конкретной сельскохозяйственной культуры. Как используют в настоящем документе, улучшенная продуктивность растений в широком смысле относится к улучшению урожая зерна, плодов, цветов или других частей растений, собираемых с различными целями, улучшению роста частей растений, включая стебли, листья и корни, к стимуляции роста растений, подержанию высокого содержания хлорофилла в листьях, увеличению количества плодов или семян, увеличению массы единичного плода или семени, уменьшению выброса NO2 вследствие сниженного использования азотных удобрений и подобным улучшениям роста и развития растений.[0079] "Plant productivity" generally refers to any measure of plant growth or development that is the reason the plant is grown. For food crops such as cereals or vegetables, "plant productivity" may refer to the yield of cereals or fruits harvested from a particular crop. As used herein, improved plant productivity refers broadly to improving the yield of grains, fruits, flowers or other plant parts harvested for various purposes, improving the growth of plant parts including stems, leaves and roots, promoting plant growth, maintaining a high chlorophyll content in leaves, increase in the number of fruits or seeds, increase in the weight of a single fruit or seed, decrease in NO 2 emissions due to reduced use of nitrogen fertilizers, and similar improvements in plant growth and development.
[0080] Микроорганизмы в продовольственных культурах и около них могут влиять на признаки этих культур. Признаки растений, на которые могут влиять микроорганизмы включают: урожайность (например, продукция зерна, производство биомассы, развитие плодов, строение цветов); питание (например, потребление азота, фосфора, калия, железа, питательных микроэлементов); способность к контролю абиотического стресса (например, засухоустойчивость, солеустойчивость, жароустойчивость) и способность к контролю биотического стресса (например, сельскохозяйственных вредителей, сорняков, насекомых, грибов и бактерий). Стратегии изменения признаков сельскохозяйственных культур включают: увеличение концентраций ключевых метаболитов; изменение временной динамики воздействия микроорганизмов на ключевые метаболиты; связывание продукции/разрушения метаболитов микроорганизмами с новыми параметрами окружающей среды; сокращение нежелательных метаболитов и улучшение баланса метаболитов или обуславливающих белков.[0080] Microorganisms in and around food crops can affect the traits of those crops. Plant traits that can be affected by microorganisms include: yield (eg, grain production, biomass production, fruit development, flower structure); nutrition (eg intake of nitrogen, phosphorus, potassium, iron, micronutrients); the ability to control abiotic stress (eg drought tolerance, salt tolerance, heat tolerance) and the ability to control biotic stress (eg pests, weeds, insects, fungi and bacteria). Strategies for modifying crop traits include: increasing concentrations of key metabolites; change in the temporal dynamics of the impact of microorganisms on key metabolites; linking the production/destruction of metabolites by microorganisms with new environmental parameters; reducing unwanted metabolites and improving the balance of metabolites or conditioning proteins.
[0081] Как используют в настоящем документе, "регуляторная последовательность" относится к оператору, промотору, сайленсеру или терминатору.[0081] As used herein, "regulatory sequence" refers to an operator, promoter, silencer, or terminator.
[0082] Как используют в настоящем документе, "in planta" означает в растении, где растение дополнительно включает части, ткани, листья, корни, стебли, семена, семязачатки, пыльцу, цветы, плоды растения и т.д.[0082] As used herein, " in planta " means in a plant, where the plant further includes parts, tissues, leaves, roots, stems, seeds, ovules, pollen, flowers, fruits of the plant, etc.
[0083] В определенных вариантах осуществления природные или эндогенные регуляторные последовательности генов по настоящему изобретению заменяют одной или несколькими внутриродовыми регуляторными последовательностями.[0083] In certain embodiments, natural or endogenous regulatory sequences of the genes of the present invention are replaced with one or more intrageneric regulatory sequences.
[0084] Как используют в настоящем документе, "вводимый" относится к введению посредством современной биотехнологии, а не к природному введению.[0084] As used herein, "administered" refers to administration through modern biotechnology, and not natural administration.
[0085] В определенных вариантах осуществления бактерии по настоящему изобретению модифицированы так, что они не являются природными бактериями.[0085] In certain embodiments, the implementation of the bacteria of the present invention is modified so that they are not natural bacteria.
[0086] В определенных вариантах осуществления бактерии по настоящему изобретению присутствуют в растении в количестве по меньшей мере 103 КОЕ, 104 КОЕ, 105 КОЕ, 106 КОЕ, 107 КОЕ, 108 КОЕ, 109 КОЕ, 1010 КОЕ, 1011 КОЕ или 1012 КОЕ на грамм сырой или сухой массы растения. В определенных вариантах осуществления бактерии по настоящему изобретению присутствуют в растении в количестве по меньшей мере приблизительно 103 КОЕ, приблизительно 104 КОЕ, приблизительно 105 КОЕ, приблизительно 106 КОЕ, приблизительно 107 КОЕ, приблизительно 108 КОЕ, приблизительно 109 КОЕ, приблизительно 1010 КОЕ, приблизительно 1011 КОЕ или приблизительно 1012 КОЕ на грамм сырой или сухой массы растения. В определенных вариантах осуществления бактерии по настоящему изобретению присутствуют в растении в количестве по меньшей мере от 103 до 109, от 103 до 107, от 103 до 105, от 105 до 109, от 105 до 107, от 106 до 1010, от 106 до 107 КОЕ на грамм сырой или сухой массы растения.[0086] In certain embodiments, the bacteria of the present invention are present in the plant in an amount of at least 10 3 CFU, 10 4 CFU, 10 5 CFU, 10 6 CFU, 10 7 CFU, 10 8 CFU, 10 9 CFU, 10 10 CFU , 10 11 CFU or 10 12 CFU per gram wet or dry weight of the plant. In certain embodiments, the bacteria of the present invention are present in the plant in an amount of at least about 10 3 CFU, about 10 4 CFU, about 10 5 CFU, about 10 6 CFU, about 10 7 CFU, about 10 8 CFU, about 10 9 CFU , approximately 10 10 CFU, approximately 10 11 CFU or approximately 10 12 CFU per gram of wet or dry weight of the plant. In certain embodiments, the bacteria of the present invention are present in the plant in an amount of at least 10 3 to 10 9 , 10 3 to 10 7 , 10 3 to 10 5 , 10 5 to 10 9 , 10 5 to 10 7 , from 10 6 to 10 10 , from 10 6 to 10 7 CFU per gram of wet or dry weight of the plant.
[0087] Удобрения и экзогенный азот по настоящему изобретению могут включать следующие азотсодержащие молекулы: аммоний, нитрат, нитрит, аммиак, глутамин и т.д. Источники азота по настоящему изобретению могут включать безводный аммиак, сульфат аммония, мочевину, фосфат диаммония, формальдегидмочевину, фосфат моноаммония, нитрат аммония, жидкие азотные удобрения, нитрат кальция, нитрат калия, нитрат натрия и т.д.[0087] Fertilizers and exogenous nitrogen of the present invention may include the following nitrogen-containing molecules: ammonium, nitrate, nitrite, ammonia, glutamine, etc. The nitrogen sources of the present invention may include anhydrous ammonia, ammonium sulfate, urea, diammonium phosphate, formaldehyde urea, monoammonium phosphate, ammonium nitrate, liquid nitrogen fertilizers, calcium nitrate, potassium nitrate, sodium nitrate, and the like.
[0088] Как используют в настоящем документе, "экзогенный азот" относится к неатмосферному азоту, легкодоступному в почве, поле или среде для выращивания, который присутствует в условиях без ограничения азота, включая аммиак, аммоний, нитрат, нитрит, мочевина, мочевая кислота, аммонийные кислоты и т.д.[0088] As used herein, "exogenous nitrogen" refers to non-atmospheric nitrogen readily available in the soil, field, or growing medium that is present under conditions without nitrogen restriction, including ammonia, ammonium, nitrate, nitrite, urea, uric acid, ammonic acids, etc.
[0089] Как используют в настоящем документе, "условия без ограничения азота" относится к неатмосферному азоту, доступному в почве, поле, средах в концентрациях, больших чем приблизительно 4 мМ азот, как описано в Kant et al. (2010. J. Exp. Biol. 62(4):1499-1509), включенной в настоящий документ в качестве ссылки.[0089] As used herein, "non-limiting nitrogen conditions" refers to non-atmospheric nitrogen available in soil, field, environments at concentrations greater than about 4 mM nitrogen as described in Kant et al. (2010. J. Exp. Biol. 62(4):1499-1509), incorporated herein by reference.
[0090] Как используют в настоящем документе, "межродовой микроорганизм" представляет собой микроорганизм, который сформирован посредством преднамеренной комбинации генетического материала, исходно выделенного из организмов различных таксономических родов. Взаимозаменяемо с "межродовым микроорганизмом" можно использовать "межродовой мутант". Иллюстративный "межродовой микроорганизм" включает микроорганизм, содержащий мобильный генетический элемент, который впервые идентифицирован в микроорганизме, принадлежащем роду, отличного от микроорганизма-реципиента. Дополнительное объяснение в числе прочего можно найти в 40 C.F.R. 725.3.[0090] As used herein, an "intergeneric microorganism" is a microorganism that is formed by an intentional combination of genetic material originally isolated from organisms of different taxonomic genera. Interchangeably with "intergeneric microorganism" you can use "intergeneric mutant". An exemplary "intergeneric microorganism" includes a microorganism containing a mobile genetic element that is first identified in a microorganism belonging to a genus other than the recipient microorganism. Additional explanation can be found at 40 C.F.R., among other things. 725.3.
[0091] В различных аспектах микроорганизмы, исследованные в настоящем документе, представляют собой "не являющиеся межродовыми", что означает, что организмы микроорганизмы не являются межродовыми.[0091] In various aspects, the microorganisms explored herein are "non-intergeneric", which means that the microorganism organisms are not intergeneric.
[0092] Как используют в настоящем документе, "внутриродовой микроорганизм" представляет собой микроорганизм, который сформирован посредством преднамеренной комбинации генетического материала, исходно выделенного из организмов одного и того же таксономического рода. Взаимозаменяемо с "внутриродовым микроорганизмом" можно использовать "внутриродовой мутант".[0092] As used herein, an "intrageneric microorganism" is a microorganism that is formed by an intentional combination of genetic material originally isolated from organisms of the same taxonomic genus. Interchangeably with "intrageneric microorganism" you can use "intrageneric mutant".
[0093] Как используют в настоящем документе, "вводимый генетический материал" означает генетический материал, который добавляют в геном реципиента и который остается в геноме реципиента в качестве компонента.[0093] As used herein, "introduced genetic material" means genetic material that is added to the genome of the recipient and that remains in the genome of the recipient as a component.
[0094] В определенных вариантах осуществления генетическая регуляторная сеть фиксации и ассимиляции азота содержит полинуклеотиды, кодирующие гены, и некодирующие последовательности, которые направляют, модулируют и/или регулируют фиксацию и/или ассимиляцию азота микроорганизмами и может содержать полинуклеотидные последовательности кластера nif (например, nifA, nifB, nifC,…nifZ), полинуклеотиды, кодирующие регулирующий метаболизм азота белок C, полинуклеотиды, кодирующие регулирующий метаболизм азота белок B, полинуклеотидные последовательности кластера gln (например, glnA и glnD), draT и переносчики/пермеазы аммония. В определенных случаях кластер Nif может содержать NifB, NifH, NifD, NifK, NifE, NifN, NifX, hesa и NifV. В определенных случаях кластер Nif может содержать подмножество NifB, NifH, NifD, NifK, NifE, NifN, NifX, hesa и NifV.[0094] In certain embodiments, the genetic regulatory network for nitrogen fixation and assimilation comprises polynucleotides encoding genes and non-coding sequences that direct, modulate, and/or regulate nitrogen fixation and/or assimilation by microorganisms, and may comprise nif cluster polynucleotide sequences (e.g., nif A, nif B, nif C, ... nifZ ), polynucleotides encoding nitrogen metabolism regulating protein C, polynucleotides encoding nitrogen metabolism regulating protein B, gln cluster polynucleotide sequences (e.g. gln A and glnD ), dra T and ammonium transporters/permeases . In certain cases, a Nif cluster may contain NifB , NifH , NifD , NifK , NifE , NifN , NifX , hesa , and NifV . In certain cases, a Nif cluster may contain a subset of NifB , NifH , NifD , NifK , NifE , NifN , NifX , hesa and NifV .
[0095] В определенных вариантах осуществления удобрение по настоящему изобретению содержит по меньшей мере 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16%, 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33%, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66%, 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% азота по массе.[0095] In certain embodiments, the fertilizer of the present invention contains at least 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 11%, 12%, 13%, 14%, 15%, 16% , 17%, 18%, 19%, 20%, 21%, 22%, 23%, 24%, 25%, 26%, 27%, 28%, 29%, 30%, 31%, 32%, 33 %, 34%, 35%, 36%, 37%, 38%, 39%, 40%, 41%, 42%, 43%, 44%, 45%, 46%, 47%, 48%, 49%, 50%, 51%, 52%, 53%, 54%, 55%, 56%, 57%, 58%, 59%, 60%, 61%, 62%, 63%, 64%, 65%, 66% , 67%, 68%, 69%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83 %, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% nitrogen by weight.
[0096] В определенных вариантах осуществления удобрение по настоящему изобретению содержит по меньшей мере приблизительно 5%, приблизительно 6%, приблизительно 7%, приблизительно 8%, приблизительно 9%, приблизительно 10%, приблизительно 11%, приблизительно 12%, приблизительно 13%, приблизительно 14%, приблизительно 15%, приблизительно 16%, приблизительно 17%, приблизительно 18%, приблизительно 19%, приблизительно 20%, приблизительно 21%, приблизительно 22%, приблизительно 23%, приблизительно 24%, приблизительно 25%, приблизительно 26%, приблизительно 27%, приблизительно 28%, приблизительно 29%, приблизительно 30%, приблизительно 31%, приблизительно 32%, приблизительно 33%, приблизительно 34%, приблизительно 35%, приблизительно 36%, приблизительно 37%, приблизительно 38%, приблизительно 39%, приблизительно 40%, приблизительно 41%, приблизительно 42%, приблизительно 43%, приблизительно 44%, приблизительно 45%, приблизительно 46%, приблизительно 47%, приблизительно 48%, приблизительно 49%, приблизительно 50%, приблизительно 51%, приблизительно 52%, приблизительно 53%, приблизительно 54%, приблизительно 55%, приблизительно 56%, приблизительно 57%, приблизительно 58%, приблизительно 59%, приблизительно 60%, приблизительно 61%, приблизительно 62%, приблизительно 63%, приблизительно 64%, приблизительно 65%, приблизительно 66%, приблизительно 67%, приблизительно 68%, приблизительно 69%, приблизительно 70%, приблизительно 71%, приблизительно 72%, приблизительно 73%, приблизительно 74%, приблизительно 75%, приблизительно 76%, приблизительно 77%, приблизительно 78%, приблизительно 79%, приблизительно 80%, приблизительно 81%, приблизительно 82%, приблизительно 83%, приблизительно 84%, приблизительно 85%, приблизительно 86%, приблизительно 87%, приблизительно 88%, приблизительно 89%, приблизительно 90%, приблизительно 91%, приблизительно 92%, приблизительно 93%, приблизительно 94%, приблизительно 95%, приблизительно 96%, приблизительно 97%, приблизительно 98% или приблизительно 99% азота по массе.[0096] In certain embodiments, the fertilizer of the present invention contains at least about 5%, about 6%, about 7%, about 8%, about 9%, about 10%, about 11%, about 12%, about 13% , approximately 14%, approximately 15%, approximately 16%, approximately 17%, approximately 18%, approximately 19%, approximately 20%, approximately 21%, approximately 22%, approximately 23%, approximately 24%, approximately 25%, approximately 26%, approximately 27%, approximately 28%, approximately 29%, approximately 30%, approximately 31%, approximately 32%, approximately 33%, approximately 34%, approximately 35%, approximately 36%, approximately 37%, approximately 38% , approximately 39%, approximately 40%, approximately 41%, approximately 42%, approximately 43%, approximately 44%, approximately 45%, approximately 46%, approximately 47%, approximately 48%, approximately 49%, approximately 50%, approximately 51%, approximately 52%, approximately 53%, approximately 54%, approximately 55%, approximately 56%, approximately 57%, approximately 58%, approximately 59%, approximately 60%, approximately 61%, approximately 62%, approximately 63% , approximately 64%, approximately 65%, approximately 66%, approximately 67%, approximately 68%, approximately 69%, approximately 70%, approximately 71%, approximately 72%, approximately 73%, approximately 74%, approximately 75%, approximately 76%, approximately 77%, approximately 78%, approximately 79%, approximately 80%, approximately 81%, approximately 82%, approximately 83%, approximately 84%, approximately 85%, approximately 86%, approximately 87%, approximately 88% , about 89%, about 90%, about 91%, about 92%, about 93%, about 94%, about 95%, about 96%, about 97%, about 98%, or about 99% nitrogen by weight.
[0097] В определенных вариантах осуществления удобрение по настоящему изобретению содержит приблизительно от 5% до 50%, приблизительно от 5% до 75%, приблизительно от 10% до 50%, приблизительно от 10% до 75%, приблизительно от 15% до 50%, приблизительно от 15% до 75%, приблизительно от 20% до 50%, приблизительно от 20% до 75%, приблизительно от 25% до 50%, приблизительно от 25% до 75%, приблизительно от 30% до 50%, приблизительно от 30% до 75%, приблизительно от 35% до 50%, приблизительно от 35% до 75%, приблизительно от 40% до 50%, приблизительно от 40% до 75%, приблизительно от 45% до 50%, приблизительно от 45% до 75% или приблизительно от 50% до 75% азота по массе.[0097] In certain embodiments, the fertilizer of the present invention contains about 5% to 50%, about 5% to 75%, about 10% to 50%, about 10% to 75%, about 15% to 50% %, approximately 15% to 75%, approximately 20% to 50%, approximately 20% to 75%, approximately 25% to 50%, approximately 25% to 75%, approximately 30% to 50%, about 30% to 75%, about 35% to 50%, about 35% to 75%, about 40% to 50%, about 40% to 75%, about 45% to 50%, about 45% to 75% or about 50% to 75% nitrogen by weight.
[0098] В определенных вариантах осуществления увеличение фиксации азота и/или продукцию 1% или более азота в растении определяют относительно контрольных растений, которые не подвергали действию бактерий по настоящему изобретению. Все увеличения или уменьшения количеств бактерий определяют относительно контрольных растений. Все увеличения или уменьшения в растениях измеряют относительно контрольных растений.[0098] In certain embodiments, the increase in nitrogen fixation and/or the production of 1% or more nitrogen in a plant is determined relative to control plants that have not been exposed to the bacteria of the present invention. All increases or decreases in bacteria are determined relative to control plants. All increases or decreases in plants are measured relative to control plants.
[0099] Как используют в настоящем документе, "конститутивный промотор" представляет собой промотор, который является активным в большинстве условий и/или в течение большинства стадий развития. Существует несколько преимуществ использования в экспрессирующих векторах, используемых в биотехнологии, конститутивных промоторов, например: высокий уровень продукции белков, используемых для отбора трансгенных клеток или организмов; высокий уровень экспрессии репортерных белков или селективных маркеров, обеспечивая простые детекцию и количественный анализ; высокий уровень продукции фактора транскрипции, который является частью системы регуляции транскрипции; продукция соединений, у которых необходима повсеместная активность в организме; и продукция соединений, которые необходимы на всех стадиях развития. Неограничивающие иллюстративные конститутивные промоторы включают промотор 35S CaMV, промоторы опинов, промотор убиквитина, промотор алкогольдегидрогеназы и т.д.[0099] As used herein, a "constitutive promoter" is a promoter that is active under most conditions and/or during most stages of development. There are several advantages to using constitutive promoters in expression vectors used in biotechnology, for example: high production of proteins used to select transgenic cells or organisms; high expression of reporter proteins or selectable markers, allowing easy detection and quantification; a high level of transcription factor production, which is part of the transcription regulation system; production of compounds that require ubiquitous activity in the body; and the production of compounds that are essential at all stages of development. Non-limiting exemplary constitutive promoters include the CaMV 35S promoter, opine promoters, ubiquitin promoter, alcohol dehydrogenase promoter, and the like.
[0100] Как используют в настоящем документе, "неконститутивный промотор" представляет собой промотор, который активен в определенных условиях, в определенных типах клеток и/или в течение определенных стадиях развития. Например, тканеспецифичные, тканепредпочтительные, специфичные для типов клеток, предпочтительные для типов клеток, индуцибельные промоторы и промоторы под контролем развития являются неконститутивными промоторы. Примеры промоторов под контролем развития включают промоторы, которые предпочтительно инициируют транскрипцию в определенных тканях.[0100] As used herein, a "non-constitutive promoter" is a promoter that is active under certain conditions, in certain cell types, and/or during certain stages of development. For example, tissue-specific, tissue-preferred, cell-type-specific, cell-type-preferred, inducible, and developmentally controlled promoters are non-constitutive promoters. Examples of developmentally controlled promoters include promoters that preferentially initiate transcription in certain tissues.
[0101] Как используют в настоящем документе, "индуцибельный" или "реперссируемый" промотор представляет собой промотор, который находится под контролем химических веществ или факторов окружающей среды. Примеры условий окружающей среды, который могут влиять на транскрипцию под действием индуцибельных промоторов, включают анаэробные условия, определенные химические вещества, наличие света, кислые или основные условия и т.д.[0101] As used herein, an "inducible" or "repressible" promoter is a promoter that is under the control of chemicals or environmental factors. Examples of environmental conditions that can affect transcription by inducible promoters include anaerobic conditions, certain chemicals, presence of light, acidic or basic conditions, and so on.
[0102] Как используют в настоящем документе, "тканеспецифический" промотор представляет собой промотор, который инициирует транскрипцию только в определенных тканях. В отличие от конститутивной экспрессии генов, тканеспецифическая экспрессия является результатом нескольких взаимодействующих уровне регуляции генов. Таким образом, в данной области для достижения эффективной и надежной экспрессии трансгенов в конкретных тканях иногда предпочтительно использовать промоторы гомологичных или близкородственных видов. Это является одной из основных причин находимого как в научной, так и в патентной литературе большого количества тканеспецифичных промоторов, выделенных из конкретных тканей.[0102] As used herein, a "tissue-specific" promoter is one that initiates transcription only in certain tissues. Unlike constitutive gene expression, tissue-specific expression is the result of several interacting levels of gene regulation. Thus, in the art, it is sometimes preferable to use promoters from homologous or closely related species to achieve efficient and reliable expression of transgenes in specific tissues. This is one of the main reasons for the large number of tissue-specific promoters isolated from specific tissues found both in the scientific and patent literature.
[0103] Как используют в настоящем документе, термин "функционально связанные" относится к ассоциации последовательностей нуклеиновых кислот в одном фрагменте нуклеиновой кислоты так, что функцию одной регулирует другая. Например, промотор функционально связан с кодирующей последовательностью, когда он может регулировать экспрессию этой кодирующей последовательности (т.е., эта кодирующая последовательность находится под транскрипционным контролем промотора). Кодирующие последовательности могут быть функционально связаны с регуляторными последовательностями в смысловой или антисмысловой ориентации. В другом примере комплементарные области РНК по изобретению могут быть функционально связаны, непосредственно или опосредовано, со стороны 5'-конца от иРНК-мишени, или со стороны 3'-конца от иРНК-мишени, или с иРНК-мишенью, или первая комплементарная область находится со стороны 5'-конца, а ее комплементарная область находится со стороны 3'-конца от иРНК-мишени.[0103] As used herein, the term "operably linked" refers to the association of nucleic acid sequences in one nucleic acid fragment such that the function of one is controlled by the other. For example, a promoter is operably linked to a coding sequence when it can regulate the expression of that coding sequence (ie, that coding sequence is under the transcriptional control of the promoter). Coding sequences may be operably linked to regulatory sequences in either sense or antisense orientation. In another example, complementary RNA regions of the invention may be operably linked, directly or indirectly, 5' to the target mRNA, or 3' to the target mRNA, or to the target mRNA, or the first complementary region. is on the 5' end, and its complementary region is on the 3' end of the target mRNA.
[0104] В определенных аспектах "нанесение на растение множества не являющихся межродовыми бактерий" включает любые средства, которыми растение (включая части растения, такие как семена, корень, стебель, ткань и т.д.) приводят в контакт (т.е., производят воздействие) с указанными бактериями на любом этапе жизненного цикла растения. Таким образом, "нанесение на растение множества не являющихся межродовыми бактерий" включает любые из приводимых ниже средств воздействия на растение (включая части растения, такие как семена, корень, стебель, ткань и т.д.) указанными бактериями: распыление на растение, капание на растение, нанесение в виде покрытия семян, внесение в поле, на которое затем высаживают семена, внесение в поле, на которое уже высажены семена, внесение в поле со взрослыми растениями и т.д.[0104] In certain aspects, "applying a plurality of non-intergeneric bacteria to a plant" includes any means by which a plant (including parts of a plant such as a seed, root, stem, tissue, etc.) is brought into contact (i.e. , produce an effect) with these bacteria at any stage of the plant's life cycle. Thus, "applying a variety of non-intergeneric bacteria to a plant" includes any of the following means of exposing the plant (including plant parts such as seeds, root, stem, tissue, etc.) to said bacteria: spraying on the plant, dripping to a plant, application as a seed coat, application to a field that is then seeded, application to a field that has already been seeded, application to a field with mature plants, etc.
[0105] Как используют в настоящем документе "MRTN" представляет собой сокращение для максимального возврата азота, и его используют в качестве экспериментального показателя в примерах. MRTN разработан в государственном университете штата Айова, а информацию можно найти на странице: http://cnrc.agron.iastate.edu/ MRTN представляет собой уровень азота, при котором чистая экономическая отдача при применении азота является максимальной. Подход к расчету MRTN является региональным подходом к разработке рекомендаций по уровням азота в кукурузе в конкретных штатах. Данные исследований уровня азота оценивали для Иллинойса, Айовы, Мичигана, Миннесоты, Огайо и Висконсина, где было доступно достаточное количество исследований для посадок кукурузы после сои и посадок кукурузы после кукурузы. Исследования проводили с использованием весеннего междурядного или разделенного предпосевного/междурядного внесения азота, и участки не подвергали ирригации за исключением участков, которые указаны для ирригируемых песков в Висконсине. MRTN разработан в государственном университете штата Айова ввиду явных различий способов определения предполагаемых уровней азота, необходимых для производства кукурузы, неправильных предположений относительно рекомендаций по уровню азота и опасений об уровнях внесения. Рассчитывая MRTN, практикующие специалисты могут определить следующее: (1) уровень азота, при котором чистая экономическая отдача при применении азота является максимальной, (2) экономически оптимальный уровень азота, который является точкой, где последнее увеличение уровня азота обеспечивает увеличение урожайности, достаточное для оплаты дополнительного азота, (3) значение увеличения зерен кукурузы, связанное с применением азота, и максимальный урожай, который является урожаем, при котором внесение большего количества азота не приводит к увеличению урожая кукурузы. Таким образом, расчеты MRTN предоставляют практикующим специалистам средства для максимизации посевов кукурузы в разных регионах при максимальной финансовой выгоде от применения азота.[0105] As used herein, "MRTN" is an abbreviation for maximum nitrogen return, and is used as an experimental indicator in the examples. The MRTN was developed at Iowa State University and information can be found at: http://cnrc.agron.iastate.edu/ The MRTN is the level of nitrogen at which the net economic return from nitrogen application is highest. The MRTN approach is a regional approach to developing state-specific recommendations for corn nitrogen levels. Nitrogen survey data was evaluated for Illinois, Iowa, Michigan, Minnesota, Ohio, and Wisconsin, where sufficient surveys were available for planting corn after soybeans and planting corn after corn. Studies were conducted using spring inter-row or split pre-plant/inter-row nitrogen application, and the plots were not irrigated except for the plots that are indicated for the irrigated sands in Wisconsin. The MRTN was developed at Iowa State University due to distinct differences in the way in which estimated nitrogen levels are required for corn production, incorrect assumptions about nitrogen recommendations, and concerns about application levels. By calculating the MRTN, practitioners can determine the following: (1) the nitrogen level at which the net economic return from applying nitrogen is maximum, (2) the economically optimal nitrogen level, which is the point where the last increase in nitrogen levels provides an increase in yield sufficient to pay additional nitrogen, (3) the value of corn kernel growth associated with the application of nitrogen, and the maximum yield, which is the yield at which the application of more nitrogen does not increase the yield of corn. Thus, MRTN calculations provide practitioners with the means to maximize corn plantings across regions while maximizing the financial benefit of nitrogen application.
[0106] Термин ммоль представляет собой сокращение для миллимоля, который представляет собой тысячную часть (10-3) моля, сокращенного в настоящем документе как моль.[0106] The term mmol is an abbreviation for millimol, which is a thousandth (10 -3 ) of a mole, abbreviated as mole herein.
[0107] Как используют в настоящем документе термины "микроорганизм" или "микроб" следует понимать широко. Эти термины, используемые взаимозаменяемо, в качестве неограничивающих примеров включают два домена прокариот, бактерии и археи. Термин также может включать эукариотические грибы и простейших.[0107] As used herein, the terms "microorganism" or "microbe" should be understood broadly. These terms, used interchangeably, include, by way of non-limiting examples, the two prokaryotic domains, bacteria and archaea. The term may also include eukaryotic fungi and protists.
[0108] Термин "консорциумы микроорганизмов" или "консорциум микроорганизмов" относится к подмножеству сообщества микроорганизмов конкретных видов микроорганизмов или штаммам видов, которое можно описать, как выполняющее общую функцию, или можно описать, как участвующее, или приводящее, или коррелирующее с требуемым параметром, таким как представляющий интерес фенотипический признак.[0108] The term "consortia of microorganisms" or "consortium of microorganisms" refers to a subset of the microbial community of specific microbial species or strains of species that can be described as having a common function, or can be described as participating in, or leading to, or correlated with a desired parameter, such as the phenotypic trait of interest.
[0109] Термин "сообщество микроорганизмов" означает группу микроорганизмов, содержащую два или более видов или штаммов. В отличие от консорциумов микроорганизмов, сообщество микроорганизмов не должно выполнять общую функцию, или не должно участвовать, или приводить, или коррелировать с требуемым параметром, таким как представляющий интерес фенотипический признак.[0109] The term "community of microorganisms" means a group of microorganisms containing two or more species or strains. Unlike consortia of microorganisms, a microbial community does not have to share a common function, or does not have to participate in, or lead to, or correlate with a desired parameter, such as a phenotypic trait of interest.
[0110] Как используют в настоящем документе, "изолят", "выделенный", "выделенный микроорганизм" и подобные термины предназначены для обозначения того, что один или несколько микроорганизмов отделены по меньшей мере от одного из веществ, с которыми они ассоциированы в конкретной среде (например, почве, воде, ткани растения и т.д.). Таким образом, "выделенный микроорганизм" не находится в его природном окружении; точнее, что различными описанным в настоящем документе способами, микроорганизм удален из своего природного состояния и помещен в не встречающееся в природе состояние существования. Таким образом, выделенный штамм или выделенный микроорганизм может находиться, например, в виде биологически чистой культуры или в виде спор (или других форм штамма). В определенных аспектах выделенный микроорганизм может находиться в ассоциации с приемлемым носителем, который может являться приемлемым в сельском хозяйстве носителем.[0110] As used herein, "isolate", "isolated", "isolated microorganism" and similar terms are intended to mean that one or more microorganisms are separated from at least one of the substances with which they are associated in a particular environment. (eg soil, water, plant tissue, etc.). Thus, an "isolated microorganism" is not in its natural environment; rather, that by various methods described herein, the microorganism is removed from its natural state and placed in a non-naturally occurring state of existence. Thus, the isolated strain or isolated microorganism may be, for example, in the form of a biologically pure culture or in the form of spores (or other forms of the strain). In certain aspects, the isolated microorganism may be in association with an acceptable carrier, which may be an agriculturally acceptable carrier.
[0111] В определенных аспектах изобретения выделенные микроорганизмы существуют в виде "выделенных и биологически чистых культур". Специалисту в данной области следует понимать, что выделенная и биологически чистая культура конкретного микроорганизма означает, что указанная культура по существу очищена от других живых организмов и содержит только конкретный рассматриваемый микроорганизм. Культура может содержать варьирующие концентрации указанного микроорганизма. В настоящем описании отмечено, что выделенные и биологически чистые микроорганизмы часто "необязательно отличаются от менее чистых или загрязненных материалов". См., например, In re Bergstrom, 427 F.2d 1394, (CCPA 1970) (где описаны очищенные простагландины), также см., In re Bergy, 596 F.2d 952 (CCPA 1979) (где описаны очищенные микроорганизмы), также см., Parke-Davis & Co. v. H.K. Mulford & Co., 189 F. 95 (S.D.N.Y. 1911) (Learned Hand, описывающий очищенный адреналин), частично подтверждено, частично рассмотрено, 196 F. 496 (2d Cir. 1912), каждый из которых включен в настоящий документ в качестве ссылки. Кроме того, в определенных аспектах, в описании предусмотрены определенные количественные меры для ограничений концентрации или чистоты, которые необходимо выявить в выделенной и биологически чистой культуре микроорганизмов. Наличие этих значений чистоты в определенных вариантах осуществления является дополнительным признаком, который отличает предоставляемые по настоящему описанию микроорганизмы от тех микроорганизмов, которые существуют в природном состоянии. См., например, Merck & Co. v. Olin Mathieson Chemical Corp., 253 F.2d 156 (4th Cir. 1958) (где описаны ограничения чистоты для витамина B12, продуцируемого микроорганизмами), включенную в настоящий документ в качестве ссылки.[0111] In certain aspects of the invention, isolated microorganisms exist as "isolated and biologically pure cultures". One skilled in the art should understand that an isolated and biologically pure culture of a particular microorganism means that said culture is substantially free of other living organisms and contains only the particular microorganism in question. The culture may contain varying concentrations of said microorganism. As noted herein, isolated and biologically pure microorganisms are often "not necessarily different from less pure or contaminated materials." See, e.g., In re Bergstrom, 427 F.2d 1394, (CCPA 1970) (for purified prostaglandins), see also In re Bergy, 596 F.2d 952 (CCPA 1979) (for purified microorganisms), see also, Parke-Davis & Co. v. H.K. Mulford & Co., 189 F. 95 (SDNY 1911) (Learned Hand describing purified adrenaline), partly affirmed, partly reviewed, 196 F. 496 (2d Cir. 1912), each of which is incorporated herein by reference . In addition, in certain aspects, the description provides for certain quantitative measures to limit the concentration or purity that must be detected in an isolated and biologically pure culture of microorganisms. The presence of these purity values in certain embodiments is an additional feature that distinguishes the microorganisms provided herein from those microorganisms that exist in a natural state. See, for example, Merck & Co. v. Olin Mathieson Chemical Corp., 253 F.2d 156 ( 4th Cir. 1958) (which describes the purity limits for vitamin B12 produced by microorganisms), incorporated herein by reference.
[0112] Как используют в настоящем документе, "отдельные изоляты" следует понимать, как означающие композицию или культуру, содержащую преобладающие количества одного рода, вида или штамма микроорганизма после отделения от одного или нескольких других микроорганизмов.[0112] As used herein, "individual isolates" should be understood as meaning a composition or culture containing predominant amounts of one genus, species or strain of microorganism after separation from one or more other microorganisms.
[0113] Микроорганизмы по настоящему изобретению могут включать споры и/или вегетативные клетки. В определенных вариантах осуществления микроорганизмы по настоящему изобретению включают микроорганизмы в жизнеспособном, но не культивируемом (VBNC) состоянии. Как используют в настоящем документе, "спора" или "споры" относятся к структурам, продуцируемым бактериями и грибами, которые адаптированы для выживания и рассеивания. Как правило, споры характеризуют как покоящиеся структуры; однако споры способны к дифференцировке в процессе прорастания. Прорастание представляет собой дифференцировку спор в вегетативные клетки, которые способны к метаболической активности, росу и репродукции. Прорастание одной споры приводит к образованию одной грибковой или бактериальной вегетативной клетки. Споры грибов представляют собой единицы бесполой репродукция и в определенных случаях представляют собой необходимые структуры в жизненных циклах грибов. Бактериальные споры представляют собой структуры для условий выживания, которые, как правило, могут не способствовать выживанию или росту вегетативных клеток.[0113] The microorganisms of the present invention may include spores and/or vegetative cells. In certain embodiments, the implementation of the microorganisms of the present invention include microorganisms in a viable but not cultivated (VBNC) state. As used herein, "spore" or "spores" refers to structures produced by bacteria and fungi that are adapted to survive and disperse. As a rule, spores are characterized as resting structures; however, spores are capable of differentiation during germination. Germination is the differentiation of spores into vegetative cells that are capable of metabolic activity, dew and reproduction. The germination of one spore leads to the formation of one fungal or bacterial vegetative cell. Fungal spores are units of asexual reproduction and, in certain cases, represent essential structures in the life cycles of fungi. Bacterial spores are structures for survival conditions that generally may not be conducive to the survival or growth of vegetative cells.
[0114] Как используют в настоящем документе, "композиция микроорганизмов" относится к композиции, содержащий один или несколько микроорганизмы по настоящему изобретению. В определенных вариантах осуществления композицию микроорганизмов вводят в растения (включая различные части растения) и/или на сельскохозяйственные поля.[0114] As used herein, "composition of microorganisms" refers to a composition containing one or more microorganisms of the present invention. In certain embodiments, the microbial composition is administered to plants (including various plant parts) and/or agricultural fields.
[0115] Как используют в настоящем документе, "носитель", "приемлемый носитель" или "приемлемый в сельском хозяйстве носитель" относится к разбавителю, адъюванту, эксципиенту или носителю с которым микроорганизм можно вводить, который не оказывает вредного воздействия намикроорганизм.[0115] As used herein, "carrier", "acceptable carrier" or "agriculturally acceptable carrier" refers to a diluent, adjuvant, excipient or carrier with which a microorganism can be administered that does not adversely affect the microorganism.
Регуляция фиксации азотаRegulation of nitrogen fixation
[0116] В определенных случаях путь фиксации азота может действовать в качестве мишени генетической инженерии и оптимизации. Одним из признаков, которые могут являться мишенью для регуляции способами, описываемыми в настоящем документе, является фиксация азота. Азотные удобрения являются наибольшими эксплуатационными расходами на фермах и основным движущим фактором более высоких урожаев пропашных культур, таких как кукуруза и пшеница. В настоящем документе описаны продукты жизнедеятельности микроорганизмов, которые могут доставлять возобновляемые формы азота в небобовые сельскохозяйственные культуры. Хотя у некоторых эндофитов присутствуют генетические факторы, необходимые для фиксации азота в чистой культуре, основной технической проблемой является то, что эндофиты злаков и трав дикого типа прекращают фиксацию азота на удобряемых полях. Применение химических удобрений и остаточные уровни азота в полевых почвах подают микроорганизму сигнал выключения биохимического пути фиксации азота.[0116] In certain cases, the nitrogen fixation pathway can act as a target for genetic engineering and optimization. One of the traits that can be targeted by the methods described herein is nitrogen fixation. Nitrogen fertilizers are the biggest operating cost on farms and a major driver of higher yields in row crops such as corn and wheat. This document describes microbial waste products that can deliver renewable forms of nitrogen to non-legume crops. Although some endophytes have the genetic factors necessary for nitrogen fixation in pure crop, the main technical problem is that endophytes of wild-type cereals and grasses stop fixing nitrogen in fertilized fields. The use of chemical fertilizers and residual nitrogen levels in field soils signal the microorganism to turn off the biochemical pathway of nitrogen fixation.
[0117] Для разработки микроорганизма, способного к фиксации и переноса азота в кукурузу в присутствии удобрения выгодными могут являться изменения на транскрипционном и посттрансляционном уровнях компонентов регуляторной сети фиксации азота. С этой целью в настоящем документе описана технология эволюции хозяина-микроорганизма (HoME), позволяющая обеспечить направленную эволюцию регуляторных сетей и получать новые фенотипы. Также в настоящем документе описаны уникальные, проприетарные библиотеки азотфиксирующих эндофитов, выделенных из кукурузы, совместно с обширными "омиксными" данными о взаимодействии микроорганизмов и растения-хозяина в различных условиях окружающей среды, таких как недостаток и избыток азота. В определенных вариантах осуществления эта технология обеспечивает направленную эволюцию генетической регуляторной сети эндофитов в направлении получения микроорганизмов, которые активно фиксируют азот даже в присутствии удобрения в полевых условиях. Также в настоящем документе описана оценка промышленного потенциала получаемых микроорганизмов, которые колонизирует ткани корня кукурузы и продуцируют азот у удобряемых растений, и оценка совместимости эндофитов со стандартными технологиями составления и различными почвами для определения возможности интеграции микроорганизмов в современные стратегии контроля азота[0117] For the development of a microorganism capable of fixing and transferring nitrogen to corn in the presence of a fertilizer, changes at the transcriptional and post-translational levels of components of the nitrogen fixation regulatory network may be beneficial. To this end, this document describes the microorganism host evolution (HoME) technology, which allows for the directed evolution of regulatory networks and obtaining new phenotypes. Also described herein are unique, proprietary libraries of nitrogen-fixing endophytes isolated from maize, together with extensive "omics" data on microbial-host interactions under various environmental conditions such as nitrogen deficiency and nitrogen excess. In certain embodiments, this technology enables the directed evolution of the endophyte genetic regulatory network towards producing microorganisms that actively fix nitrogen even in the presence of fertilizer in the field. Also described in this paper is an assessment of the industrial potential of derived microorganisms that colonize corn root tissues and produce nitrogen in fertilized plants, and an assessment of the compatibility of endophytes with standard formulation technologies and various soils to determine the possibility of integrating microorganisms into modern nitrogen control strategies.
[0118] Для использования элементарного азота (N) для химического синтеза живые формы комбинируют газообразный азот (N2), доступный в атмосфере, с водородом в процессе, известном как фиксация азота. Вследствие энергоемкого характера биологической фиксации азота диазотрофы (бактерии и археи, которые фиксируют атмосферный газообразный азот) в процессе эволюции сформировали развитую и жесткую регуляцию кластера генов nif в ответ на кислород окружающей среды и доступный азот. Гены Nif кодируют ферменты, вовлеченные в фиксацию азота (такие как нитрогеназный комплекс), и белки, которые регулируют фиксацию азота. В Shamseldin (2013. Global J. Biotechnol. Biochem. 8(4):84-94) приведено подробное описание генов nif и их продуктов, и она включена в настоящий документ в качестве ссылки. В настоящем документе описаны способы получения растения с улучшенным признаком, включающие выделение бактерий из первого растения, внесение генетической вариации в ген выделенных бактерий для увеличения фиксации азота, воздействие вариантов бактерий на второе растение, выделение бактерий из второго растения с улучшенным признаком относительно первого растения и повторение этапов с бактериями, выделенными из второго растения.[0118] To use elemental nitrogen (N) for chemical synthesis, living forms combine gaseous nitrogen (N 2 ) available in the atmosphere with hydrogen in a process known as nitrogen fixation. Due to the energy-intensive nature of biological nitrogen fixation, diazotrophs (bacteria and archaea that fix atmospheric gaseous nitrogen) in the course of evolution have developed a developed and tight regulation of the nif gene cluster in response to environmental oxygen and available nitrogen. The Nif genes encode enzymes involved in nitrogen fixation (such as the nitrogenase complex) and proteins that regulate nitrogen fixation. Shamseldin (2013. Global J. Biotechnol. Biochem. 8(4):84-94) provides a detailed description of the nif genes and their products and is incorporated herein by reference. Methods for producing a trait-improved plant are described herein, including isolating bacteria from a first plant, introducing a genetic variation in the gene of the isolated bacteria to increase nitrogen fixation, exposing bacterial variants to a second plant, isolating bacteria from a second plant with an improved trait relative to the first plant, and repeating stages with bacteria isolated from the second plant.
[0119] У Proteobacteria регуляция фиксации азота сконцентрирована вокруг зависимого от фактора σ54 связывающего энхансеры белка NifA, положительного регулятора транскрипции кластера nif. Внутриклеточные уровни активного NifA контролируют два ключевых фактора: транскрипция оперона nifLA и ингибирование активности NifA белок-белковым взаимодействием с NifL. Оба эти процесса реагируют на внутриклеточные уровни глутамина посредством сигнального каскада белков PII. Этот каскад опосредован GlnD, который непосредственно определяет уровень глутамина и катализирует уридилирование или деуридилирование двух регуляторных белков PII, GlnB и GlnK, в ответ на отсутствие или наличие связанного глутамина, соответственно. В условиях избытка азота немодифицированный GlnB передает сигнал к деактивации промотора nifLA. Однако в условиях ограничения азота происходит посттрансляционная модификация GlnB, что ингибирует его активность и приводит к транскрипции оперона nifLA. Таким образом, существует жесткий контроль транскрипции nifLA в ответ на азот окружающей среды посредством сигнального каскада белков PII. На посттрансляционном уровне регуляции NifA GlnK ингибирует взаимодействие NifL/NifA в зависимости от общего уровня свободного GlnK в клетке.[0119] In Proteobacteria, the regulation of nitrogen fixation is centered around the factor σ 54 dependent enhancer-binding protein NifA, a positive transcriptional regulator of the nif cassette. Intracellular levels of active NifA control two key factors: transcription of the nifLA operon and inhibition of NifA activity by protein–protein interaction with NifL. Both of these processes respond to intracellular glutamine levels through a signaling cascade of PII proteins. This cascade is mediated by GlnD, which directly determines glutamine levels and catalyzes the uridylation or deuridylation of two PII regulatory proteins, GlnB and GlnK, in response to the absence or presence of bound glutamine, respectively. Under conditions of excess nitrogen, unmodified GlnB signals the deactivation of the nifLA promoter. However, under conditions of nitrogen restriction, post-translational modification of GlnB occurs, which inhibits its activity and leads to transcription of the nifLA operon. Thus, there is a tight control of nifLA transcription in response to environmental nitrogen through the signaling cascade of PII proteins. At the post-translational level of NifA regulation, GlnK inhibits the NifL/NifA interaction depending on the total level of free GlnK in the cell.
[0120] Транскрипция NifA происходит с оперона nifLA, промотор которого активирует фосфорилированный NtrC, другой зависимый от фактора σ54 регулятор. Состояние фосфорилирования NtrC опосредовано гистидинкиназой NtrB, которая взаимодействует с деуридилированным GlnB, но не с уридилированным GlnB. В условиях избытка азота высокий внутриклеточный уровень глутамина приводит к деуридилированию GlnB, который затем взаимодействует с NtrB с деактивацией ее фосфорилазной активности и активацией ее фосфатазной активности, что приводит к дефосфорилированию NtrC и деактивации промотора nifLA. Однако в условиях ограничения азота низкий уровень внутриклеточного глутамина приводит к уридилированию GlnB, что ингибирует его взаимодействие с NtrB и обеспечивает фосфорилирование NtrC и транскрипцию оперона nifLA. Таким образом, существует жесткий контроль экспрессии nifLA в ответ на азот окружающей среды посредством сигнального каскада белков PII. Все из nifA, ntrB, ntrC и glnB представляют собой гены, которые можно подвергать мутированию в способах, описываемых в настоящем документе. Эти процессы также могут реагировать на внутриклеточные или внеклеточные уровни аммиака, мочевины или нитратов.[0120] Transcription of NifA occurs from the operonnifLA, whose promoter activates phosphorylated NtrC, another σ-dependent54 regulator. The NtrC phosphorylation state is mediated by NtrB histidine kinase, which interacts with deuridylated GlnB but not with uridylated GlnB. Under conditions of excess nitrogen, a high intracellular level of glutamine leads to deuridylation of GlnB, which then interacts with NtrB to deactivate its phosphorylase activity and activate its phosphatase activity, which leads to dephosphorylation of NtrC and deactivation of the promoter.nifLA. However, under conditions of nitrogen restriction, a low level of intracellular glutamine leads to uridylation of GlnB, which inhibits its interaction with NtrB and ensures NtrC phosphorylation and operon transcription.nifLA. Thus, there is a tight control of expressionnifLA in response to environmental nitrogen through signaling cascade of PII proteins. All ofnifA, ntrB, ntrC AndglnB are genes that can be mutated in the ways described herein. These processes can also respond to intracellular or extracellular levels of ammonia, urea, or nitrate.
[0121] Также существует посттрансляционная регуляция активности NifA в ответ на азот окружающей среды, как правило, посредством опосредованного NifL ингибирования активности NifA. Как правило, взаимодействие на взаимодействие NifL и NifA влияет сигнальный каскад белков PII посредством GlnK, хотя характер взаимодействий между GlnK и NifL/NifA у диазотрофов значительно варьирует. У Klebsiella pneumoniae обе формы GlnK ингибируют взаимодействие NifL/NifA, и взаимодействие между GlnK и NifL/NifA определяют по общему уровню свободного GlnK в клетке. В условиях избытка азота деуридилированный GlnK взаимодействует с переносчиком аммиака AmtB, который служит для блокировки захвата аммиака посредством AmtB и изоляции GlnK на мембране, обеспечивая ингибирование NifA посредством NifL. С другой стороны, у Azotobacter vinelandii, для взаимодействия NifL/NifA и ингибирования NifA необходимо взаимодействие с деуридилированным GlnK, тогда как уридилирование GlnK ингибирует это взаимодействие с NifL. У диазотрофов с отсутствием гена nifL существуют данные о том, что ингибирование активности NifA происходит непосредственно при взаимодействии с деуридилированными формами GlnK и GlnB в условиях избытка азота. У некоторых бактерий кластер nif может находиться под регуляторным воздействием glnR, и дополнительно в определенных случаях это может включать отрицательную регуляцию. Независимо от механизма посттрансляционное ингибирование NifA является важным регулятором кластера nif у большинства известных диазотрофов. Дополнительно, гены, которые можно подвергать мутированию в способах, описываемых в настоящем документе, представляют собой nifL, amtB, glnK и glnR.[0121] There is also post-translational regulation of NifA activity in response to environmental nitrogen, typically through NifL-mediated inhibition of NifA activity. As a rule, the interaction between NifL and NifA is influenced by the signaling cascade of PII proteins through GlnK, although the nature of interactions between GlnK and NifL/NifA in diazotrophs varies considerably. In Klebsiella pneumoniae, both forms of GlnK inhibit the NifL/NifA interaction, and the interaction between GlnK and NifL/NifA is measured by the total level of free GlnK in the cell. Under conditions of excess nitrogen, deuridylated GlnK interacts with the ammonia transporter AmtB, which serves to block ammonia uptake by AmtB and sequester GlnK on the membrane, allowing NifA to be inhibited by NifL. On the other hand, in Azotobacter vinelandii , NifL/NifA interaction and NifA inhibition require interaction with deuridylated GlnK, while uridylation of GlnK inhibits this interaction with NifL. In diazotrophs lacking the nifL gene, there is evidence that inhibition of NifA activity occurs directly upon interaction with deuridylated forms of GlnK and GlnB under conditions of excess nitrogen. In some bacteria, the nif cluster may be under the regulatory influence of glnR, and additionally, in certain cases, this may include downregulation. Regardless of the mechanism, post-translational inhibition of NifA is an important regulator of the nif cluster in most known diazotrophs. Additionally, genes that can be mutated in the methods described herein are nifL, amtB , glnK , and glnR .
[0122] В дополнение к регуляции транскрипции кластера генов nif многие диазотрофы в процессе эволюции сформировали механизм прямой посттрансляционной модификации и ингибирования самого фермента нитрогеназы, известный как выключение нитрогеназы. Он опосредован АДФ-рибозилированием белка Fe (NifH) в условиях избытка азота, что нарушает его взаимодействие с белковым комплексом MoFe (NifDK) и устраняет нитрогеназную активность. DraT катализирует АДФ-рибозилирование белка Fe и выключение нитрогеназы, тогда как DraG катализирует удаление АДФ-рибозы и реактивацию нитрогеназы. Как и в случае транскрипции nifLA и ингибирования NifA, выключение нитрогеназы также регулирует сигнальный каскад белков PII. В условиях избытка азота деуридилированный GlnB взаимодействует с DraT и активирует его, тогда как деуридилированный GlnK взаимодействует с DraG и AmtB с формированием комплекса, изолируя DraG на мембране. В условиях ограничения азота уридилированные формы GlnB и GlnK не взаимодействуют с DraT и DraG, соответственно, что приводит к инактивации DraT и диффузии DraG к белку Fe, где он удаляет АДФ-рибозу и активирует нитрогеназу. В способах, описываемых в настоящем документе, также предусмотрено внесение генетических вариаций в гены nifH, nifD, nifK и draT.[0122] In addition to regulating the transcription of the nif gene cluster, many diazotrophs have evolved a mechanism for direct post-translational modification and inhibition of the nitrogenase enzyme itself, known as nitrogenase shutdown. It is mediated by ADP-ribosylation of the Fe protein (NifH) under conditions of excess nitrogen, which disrupts its interaction with the MoFe (NifDK) protein complex and eliminates nitrogenase activity. DraT catalyzes the ADP-ribosylation of the Fe protein and the shutdown of nitrogenase, while DraG catalyzes the removal of ADP-ribose and the reactivation of nitrogenase. As in the case of nifLA transcription and NifA inhibition, nitrogenase shutdown also regulates the signaling cascade of PII proteins. Under conditions of excess nitrogen, deuridylated GlnB interacts with DraT and activates it, while deuridylated GlnK interacts with DraG and AmtB to form a complex, sequestering DraG on the membrane. Under conditions of nitrogen restriction, the uridylated forms of GlnB and GlnK do not interact with DraT and DraG, respectively, leading to DraT inactivation and DraG diffusion to the Fe protein, where it removes ADP-ribose and activates nitrogenase. The methods described herein also provide for the introduction of genetic variations in the nifH, nifD, nifK and draT genes.
[0123] Хотя некоторые эндофиты обладают способностью к фиксации азота in vitro, часто эти генетические факторы в полевых условиях подавлены высокими уровнями экзогенных химических удобрений. Для облегчения фиксации азота в полевых условиях можно разделить определение уровня экзогенного азота и экспрессию фермента нитрогеназы. Улучшение суммарной нитрогеназной активности по времени дополнительно способствует увеличению продукции азота для использования сельскохозяйственной культурой. Конкретные мишени генетической вариации для облегчения фиксации азота в полевых условиях способами, описываемыми в настоящем документе, включают один или несколько генов, выбранных из группы, состоящей из nifA, nifL, ntrB, ntrC, glnA, glnB, glnK, draT, amtB, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB и nifQ.[0123] Although some endophytes have the ability to fix nitrogen in vitro , often these genetic factors are suppressed in the field by high levels of exogenous chemical fertilizers. To facilitate nitrogen fixation in the field, the determination of exogenous nitrogen levels and the expression of the nitrogenase enzyme can be separated. Improving the total nitrogenase activity over time further contributes to an increase in nitrogen production for crop use. Specific targets of genetic variation to facilitate field nitrogen fixation by the methods described herein include one or more genes selected from the group consisting of nifA, nifL, ntrB, ntrC, glnA, glnB, glnK, draT, amtB, gln D , glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, and nifQ .
[0124] Дополнительной мишенью генетической вариации для облегчения фиксации азота в полевых условиях способами, описываемыми в настоящем документе, является белок NifA. Как правило, белок NifA является активатором экспрессии генов фиксации азота. Увеличение продукции NifA (конститутивно или в условиях высокого содержания аммиака) преодолевает природный путь определения уровня аммиака. Кроме того, снижение продукции белков NifL, известного ингибитора NifA, также приводит к увеличению уровня свободного активного NifA. Кроме того, к повышению общего уровня белков NifA также приводит увеличение уровня транскрипции оперона nifAL (конститутивно или в условиях высокого содержания аммиака). Повышенного уровня экспрессии nifAL достигают, изменяя сам промотор или снижая экспрессию NtrB (часть сигнального каскада ntrB и ntrC, который исходно может приводить к выключению оперона nifAL в условиях высокого содержания азота). Высокий уровень NifA, достигаемый этими или любыми другими способами, описываемыми в настоящем документе, увеличивает активность фиксации азота эндофитами.[0124] An additional target of genetic variation to facilitate nitrogen fixation in the field by the methods described herein is the NifA protein. As a rule, the NifA protein is an activator of the expression of nitrogen fixation genes. Increasing NifA production (either constitutively or under high ammonia conditions) overrides nature's way of determining ammonia levels. In addition, a decrease in the production of NifL proteins, a known NifA inhibitor, also leads to an increase in the level of free active NifA. In addition, an increase in the level of transcription of the nifAL operon (constitutively or under conditions of high ammonia content) also leads to an increase in the total level of NifA proteins. An increased level of nifAL expression is achieved by changing the promoter itself or by reducing the expression of NtrB (part of the ntrB and ntrC signaling cascade, which can initially lead to the shutdown of the nifAL operon under conditions of high nitrogen content). The high level of NifA achieved by these or any other methods described herein increases the activity of nitrogen fixation by endophytes.
[0125] Другой мишенью генетической вариации для облегчения фиксации азота в полевых условиях способами, описываемыми в настоящем документе, является сигнальный каскад PII GlnD/GlnB/GlnK. Внутриклеточный уровень глутамина определяет сигнальный каскад PII GlnD/GlnB/GlnK. Мутации активного центра GlnD, устраняющие активность удаления уридилата GlnD, разрывают каскад определения уровня азота. Кроме того, уменьшение концентрации GlnB замыкает каскад определения уровня глутамина. Эти мутации "обманом" приводят клетки к определению условий ограничения азота, таким образом, увеличивая уровень активности фиксации азота. Эти процессы также могут реагировать на внутриклеточные или внеклеточные уровни аммиака, мочевины или нитратов.[0125] Another target of genetic variation to facilitate nitrogen fixation in the field by the methods described herein is the GlnD/GlnB/GlnK PII signaling cascade. The intracellular level of glutamine determines the PII GlnD/GlnB/GlnK signaling cascade. GlnD active site mutations that abolish GlnD uridylate scavenging activity disrupt the nitrogen detection cascade. In addition, a decrease in the concentration of GlnB closes the cascade of determining the level of glutamine. These mutations "trick" the cells into detecting conditions of nitrogen restriction, thus increasing the level of nitrogen fixation activity. These processes can also respond to intracellular or extracellular levels of ammonia, urea, or nitrate.
[0126] Также мишенью генетической вариации для облегчения фиксации азота в полевых условиях способами, описываемыми в настоящем документе, является белок amtB. Захват аммиака из окружающей среды можно уменьшать, снижая уровень экспрессии белка amtB. Без внутриклеточного аммиака эндофит неспособен к определению высокого уровня аммиака, что предотвращает отрицательную регуляцию генов фиксации азота. Любой аммиак, попадающий во внутриклеточный компартмент, преобразуется в глутамин. Внутриклеточный уровень глутамина является основным средством определения уровня азота. Снижение внутриклеточного уровня глутамина предотвращает определение клетками высоких уровней аммиака в окружающей среде. Это можно осуществлять, увеличивая уровень экспрессии глутаминазы, фермента, который преобразует глутамин в глутаминат. Кроме того, уровень внутриклеточного глутамина также можно уменьшать, снижая уровень глутаминсинтетазы (фермента, преобразующего аммиак в глутамин). Диазотрофы быстро ассимилируют фиксированный аммиак в глутамин и глутаминат для использования в клеточных процессах. Нарушение ассимиляции аммиака может обеспечить выведение фиксированного азота на экспорт из клетки в виде аммиака. Фиксированный аммиак преимущественно ассимилируется в глутамин глутаминсинтетазой (GS), кодируемой glnA, а затем в глутаминат глутаминоксоглутаратаминотрансферазой (GOGAT). В определенных примерах, glnS кодирует глутаминсинтетазу. GS посттрансляционно регулирует аденилилтрансфераза GS (GlnE), бифункциональный фермент, кодируемый glnE, который катализирует аденилирование и деаденилирование GS вследствие активности его аденилилтрансферазного (AT) и аденилилудаляющего (AR) доменов, соответственно. В условиях ограничения азота экспрессирован glnA и AR домен GlnE деаденилирует GS, обеспечивая ее активность. В условиях избытка азота экспрессия glnA выключена и глутамин аллостерически активирует AT домен GlnE, что вызывает аденилирование и деактивацию GS.[0126] Also targeted by genetic variation to facilitate nitrogen fixation in the field by the methods described herein is the amtB protein. The uptake of ammonia from the environment can be reduced by reducing the expression level of the amtB protein. Without intracellular ammonia, the endophyte is unable to detect high levels of ammonia, which prevents the downregulation of nitrogen fixation genes. Any ammonia entering the intracellular compartment is converted to glutamine. Intracellular glutamine levels are the primary means of determining nitrogen levels. A decrease in intracellular glutamine levels prevents cells from detecting high levels of ammonia in the environment. This can be done by increasing the expression level of glutaminase, the enzyme that converts glutamine to glutamate. In addition, the level of intracellular glutamine can also be reduced by reducing the level of glutamine synthetase (an enzyme that converts ammonia to glutamine). Diazotrophs rapidly assimilate fixed ammonia into glutamine and glutamate for use in cellular processes. Violation of ammonia assimilation can ensure the removal of fixed nitrogen for export from the cell in the form of ammonia. Fixed ammonia is predominantly assimilated to glutamine by glutamine synthetase (GS) encoded by glnA and then to glutamate by glutaminoxoglutarate aminotransferase (GOGAT). In certain examples, glnS encodes for glutamine synthetase. GS is post-translationally regulated by GS adenylyl transferase (GlnE), a bifunctional enzyme encoded by glnE that catalyzes adenylation and deadenylation of GS due to the activity of its adenylyl transferase (AT) and adenylyl retracting (AR) domains, respectively. Under conditions of nitrogen restriction, glnA is expressed and the AR domain of GlnE deadenylates GS, providing its activity. Under conditions of excess nitrogen, glnA expression is turned off and glutamine allosterically activates the AT domain of GlnE, which causes adenylation and deactivation of GS.
[0127] Кроме того, мишенью генетической вариации для облегчения фиксации азота в полевых условиях способами, описываемыми в настоящем документе, также может являться ген draT. После продукции клеткой ферментов фиксации азота другим уровнем, на котором клетка отрицательно регулирует активность фиксации в условиях высокого содержания азота, является выключение нитрогеназы. Это выключение можно устранить снижая уровень экспрессии DraT.[0127] In addition, the draT gene can also be targeted by genetic variation to facilitate nitrogen fixation in the field by the methods described herein. After the cell produces nitrogen fixation enzymes, another level at which the cell negatively regulates fixation activity under high nitrogen conditions is nitrogenase shutdown. This switch-off can be eliminated by reducing the level of DraT expression.
[0128] Способы придания микроорганизмам новых фенотипов можно проводить на транскрипционном, трансляционном и посттрансляционном уровнях. Транскрипционный уровень включает изменения в промоторе (такие как изменение аффинности к фактору сигма или участков связывания факторов транскрипции, включая делецию всего или части промотора) или изменение терминаторов и аттенюаторов транскрипции. Трансляционный уровень включает изменение в участках связывания рибосом и изменение сигналов деградации иРНК. Посттрансляционный уровень включает мутации активных центров ферментов и изменения белок-белковых взаимодействий. Эти изменения можно осуществлять множеством способов. Снижение уровня экспрессии (или полное устранение) можно осуществлять посредством замены природного участка связывания рибосомы (RBS) или промотора другими с меньшей силой/эффективностью. Участки старта ATG можно заменять на старт-кодоны GTG, TTG или CTG, что приводит к снижению трансляционной активности кодирующей области. Полного устранения экспрессии можно добиваться посредством нокаута (делеции) кодирующей области гена. Сдвиг открытой рамки считывания (ORF) с большой вероятностью приводит к преждевременному стоп-кодону в ORF, таким образом, приводя к получению нефункционального укороченного продукта. Подобным образом, вставка в рамку стоп-кодонов также приводит к получению нефункционального укороченного продукта. Для снижения эффективной концентрации конкретного гена также можно проводить добавление метки разрушения на N- или C-конец.[0128] Methods for imparting new phenotypes to microorganisms can be carried out at the transcriptional, translational, and post-translational levels. The transcriptional level includes changes in the promoter (such as a change in affinity for the sigma factor or transcription factor binding sites, including the deletion of all or part of the promoter) or a change in transcription terminators and attenuators. The translational level includes changes in ribosome binding sites and changes in mRNA degradation signals. The post-translational level includes mutations in the active sites of enzymes and changes in protein-protein interactions. These changes can be made in a variety of ways. Reducing the level of expression (or completely eliminating) can be done by replacing the natural ribosome binding site (RBS) or promoter with others with less strength/efficiency. The ATG start sites can be replaced with GTG, TTG or CTG start codons, resulting in a decrease in the translational activity of the coding region. Complete elimination of expression can be achieved by knockout (deletion) of the coding region of the gene. An open reading frame (ORF) shift is highly likely to result in a premature stop codon in the ORF, thus resulting in a non-functional truncated product. Similarly, in-frame insertion of stop codons also results in a non-functional truncated product. To reduce the effective concentration of a particular gene, the addition of a disruption tag to the N- or C-terminus can also be carried out.
[0129] И наоборот, определенного уровня экспрессии генов, описываемых в настоящем документе, можно достигать с использованием более сильных промоторов. Для обеспечения высокой активности промотора в условиях высокого уровня азота (или в любых других условиях) можно получать профиль транскрипции всего генома в условиях высокого уровня азота, и из этого массива данных можно выбирать активные промоторы с желаемым уровнем транскрипции для замены слабого промотора. Для улучшения эффективности инициации трансляции слабые старт-кодоны можно заменять старт-кодоном ATG. Также можно заменять слабые участки связывания рибосом (RBS) другими RBS с улучшенной эффективностью инициации трансляции. Кроме того, для изменения активности фермента также можно проводить сайт-специфический мутагенез.[0129] Conversely, a certain level of expression of the genes described herein can be achieved using stronger promoters. To ensure high promoter activity under high nitrogen conditions (or any other conditions), a whole genome transcription profile under high nitrogen conditions can be obtained, and active promoters with the desired transcription level can be selected from this data set to replace the weak promoter. To improve translation initiation efficiency, weak start codons can be replaced with an ATG start codon. It is also possible to replace weak ribosome binding sites (RBS) with other RBSs with improved translation initiation efficiency. In addition, site-directed mutagenesis can also be performed to change the activity of the enzyme.
[0130] Увеличение уровня фиксации азота, которое происходит в растении, может приводить к уменьшению количества необходимых химических удобрений для получения сельскохозяйственных культур и уменьшению эмиссии парниковых газов (например, оксида одновалентного азота).[0130] An increase in the level of nitrogen fixation that occurs in a plant can lead to a decrease in the amount of chemical fertilizers needed to produce crops and a decrease in greenhouse gas emissions (eg, monovalent nitric oxide).
Получение популяций бактерийObtaining populations of bacteria
Выделение бактерийIsolation of bacteria
[0131] Микроорганизмы, пригодные в способах и композициях, описываемых в настоящем документе, можно получать посредством выделения микроорганизмов с поверхностей или из тканей природных растений. Микроорганизмы можно получать посредством размалывания семян с выделением микроорганизмов. Микроорганизмы можно получать посредством посадки семян в различные образцы почв и выделения микроорганизмов из тканей. Кроме того, микроорганизмы можно получать посредством инокуляции растений экзогенными микроорганизмами и определения того, какие микроорганизмы остаются в тканях растений. Неограничивающие примеры тканей растений могут включать семена, всходы, листья, срезы, растение, луковицы или клубни.[0131] Microorganisms useful in the methods and compositions described herein can be obtained by isolating microorganisms from the surfaces or tissues of natural plants. Microorganisms can be obtained by grinding the seeds to isolate the microorganisms. Microorganisms can be obtained by planting seeds in various soil samples and isolating microorganisms from tissues. In addition, microorganisms can be obtained by inoculating plants with exogenous microorganisms and determining which microorganisms remain in plant tissues. Non-limiting examples of plant tissues may include seeds, shoots, leaves, sections, plant, bulbs, or tubers.
[0132] Способ получения микроорганизмов может представлять собой способ выделения бактерий из почв. Бактерии можно собирать из почв различного типа. В определенном примере почву можно характеризовать такими свойствами, как высокая или низкая плодородность, уровни влажности, уровни минералов и различные практические способы выращивания растений. Например, почва может быть включена в ротацию сельскохозяйственных культур, когда в одну и ту же почву в последовательные сезоны посадки высаживают различные сельскохозяйственные культуры. Последовательное выращивание различных сельскохозяйственных культур на одной и той же почве может предотвратить непропорциональное истощение определенных минералов. Бактерии можно выделять из растений, растущих в выбранных почвах. Проростки растений можно собирать на 2-6 неделях роста. Например, на один цикл сбора можно собрать по меньшей мере 400 изолятов. Типы почв и растений выявляют фенотипы растений, а также условия, которые обеспечивают последующее обогащение определенных фенотипов.[0132] The method for obtaining microorganisms may be a method for isolating bacteria from soils. Bacteria can be collected from soils of various types. In a specific example, the soil can be characterized by such properties as high or low fertility, moisture levels, mineral levels, and various practical ways of growing plants. For example, the soil may be included in a crop rotation where different crops are planted in the same soil in successive planting seasons. Consistently growing different crops on the same soil can prevent disproportionate depletion of certain minerals. Bacteria can be isolated from plants growing in selected soils. Plant seedlings can be harvested at 2-6 weeks of growth. For example, at least 400 isolates can be collected per collection cycle. Soil and plant types reveal plant phenotypes, as well as the conditions that ensure the subsequent enrichment of certain phenotypes.
[0133] Микроорганизмы можно выделять из тканей растений для оценки признаков микроорганизмов. Для выделения различных типов ассоциативных микроорганизмов, таких как ризосферные бактерии, эпифиты или эндофиты, параметры обработки образцов тканей можно варьировать. Для обогащения бактериями, осуществляющими фиксацию азота, изоляты можно культивировать в не содержащих азота средах. Альтернативно, микроорганизмы можно получать из всемирных банков штаммов.[0133] Microorganisms can be isolated from plant tissues to assess the characteristics of microorganisms. To isolate different types of associative microorganisms, such as rhizospheric bacteria, epiphytes or endophytes, the processing parameters of tissue samples can be varied. For enrichment with nitrogen-fixing bacteria, isolates can be cultured in nitrogen-free media. Alternatively, microorganisms can be obtained from worldwide strain banks.
[0134] для оценки признаков микроорганизмов анализы проводят в полевых условиях. В определенных вариантах осуществления ткань растения можно обрабатывать для скрининга посредством высокопроизводительной обработки ДНК и РНК. Кроме того, для оценки таких характеристик растений, как колонизация можно использовать неинвазивные измерения. Измерения на микроорганизмах дикого типа можно проводить поочередно от растения к растению. Измерения на микроорганизмах дикого типа также можно проводить в полевых условиях с использованием способов средней производительности. Измерения можно проводить последовательно в течение времени. Можно использовать модельную растительную систему, включая в качестве неограничивающих примеров Setaria.[0134] to assess the characteristics of microorganisms, analyzes are carried out in the field. In certain embodiments, plant tissue can be processed for screening through high throughput processing of DNA and RNA. In addition, non-invasive measurements can be used to assess plant characteristics such as colonization. Measurements on wild-type microorganisms can be carried out in turn from plant to plant. Measurements on wild-type microorganisms can also be carried out in the field using medium throughput methods. Measurements can be taken sequentially over time. A model plant system can be used, including but not limited to Setaria .
[0135] Микроорганизмы в растительной системе можно скринировать посредством транскрипционного профилирования микроорганизма в растительной системе. Примерами скрининга посредством транскрипционного профилирования являются использование способов количественной полимеразной цепной реакции (кПЦР), молекулярных штрих-кодов для детекции транскрипов, секвенирования нового поколения и мечения микроорганизмов флуоресцентными метками. Для оценки колонизации в теплице можно измерять факторы воздействия, включая в качестве неограничивающих примеров микробиом, абиотические факторы, почвенные условия, кислород, влажность, температуру, условия инокуляции и локализацию корней. Фиксацию азота у бактерий можно оценивать, определяя газообразный 15N/15N в удобрении (разведение) с использованием IRMS или NanoSIMS, как описано в настоящем документе. NanoSIMS представляет собой масс-спектрометрию вторичных ионов с высоким разрешением. Способ NanoSIMS представляет собой путь для исследования химической активности биологических образцов. Катализ восстановления реакций окисления, которые управляют метаболизмом микроорганизмов, может быть исследован на клеточном, субклеточном, молекулярном и элементном уровнях. NanoSIMS может обеспечивать высокое пространственное разрешение более 0,1 мкм. Посредством NanoSIMS можно детектировать использование изотопных индикаторов, таких как 13C, 15N и 18O. Таким образом, NanoSIMS можно использовать для определения химической активности азот в клетке.[0135] Microorganisms in a plant system can be screened by transcriptional profiling of a microorganism in a plant system. Examples of screening by transcriptional profiling are the use of quantitative polymerase chain reaction (qPCR) methods, molecular barcodes for transcript detection, next generation sequencing, and labeling of microorganisms with fluorescent labels. Influencing factors can be measured to assess colonization in a greenhouse, including, but not limited to, microbiome, abiotic factors, soil conditions, oxygen, moisture, temperature, inoculation conditions, and root localization. Nitrogen fixation in bacteria can be assessed by determining gaseous 15 N/ 15 N in fertilizer (dilution) using IRMS or NanoSIMS as described herein. NanoSIMS is a high resolution secondary ion mass spectrometry. The NanoSIMS method is a way to study the chemical activity of biological samples. The reduction catalysis of the oxidation reactions that govern the metabolism of microorganisms can be investigated at the cellular, subcellular, molecular and elemental levels. NanoSIMS can provide high spatial resolution in excess of 0.1 µm. NanoSIMS can detect the use of tracers such as 13 C, 15 N and 18 O. Thus, NanoSIMS can be used to determine the reactivity of nitrogen in a cell.
[0136] Для анализа растений можно использовать автоматизированные теплицы. Параметры растений в ответ на воздействие микроорганизмов в качестве неограничивающих примеров включают определение биомассы, анализ хлоропластов, CCD-камеру, измерения волюметрической томографии.[0136] Automated greenhouses can be used for plant analysis. Plant parameters in response to microbial attack include, but are not limited to, biomass determination, chloroplast analysis, CCD camera, volumetric tomography measurements.
[0137] Одним из способов обогащения популяции микроорганизмов является соответствие генотипу. Например, анализ полимеразной цепной реакцией (ПЦР) с направленным праймером или специфическим праймером. Для идентификации диазотрофов можно использовать праймеры, сконструированные для гена nifH, так как диазотрофы в процессе фиксации азота экспрессируют ген nifH. Популяцию микроорганизмов также можно обогащать посредством одноклеточных независимых от культивирования подходов и подходов к выделению на основе хемотаксиса. Альтернативно, направленное выделение микроорганизмов можно проводить посредством культивирования микроорганизмов на селективных средах. Для заранее спланированных подходов к обогащению популяций микроорганизмов требуемыми признаками можно руководствоваться биоинформатическими данными, и они описаны в настоящем документе.[0137] One way to enrich a population of microorganisms is to match the genotype. For example, polymerase chain reaction (PCR) analysis with a directed primer or a specific primer. Primers designed for the nifH gene can be used to identify diazotrophs, since diazotrophs express the nifH gene during nitrogen fixation. Microbial populations can also be enriched through single-cell culture-independent and chemotaxis-based isolation approaches. Alternatively, targeted isolation of microorganisms can be carried out by culturing the microorganisms on selective media. For pre-planned approaches to enrich populations of microorganisms for desired traits, bioinformatics data can be guided and are described in this document.
Обогащение микроорганизмами со способностями к фиксации азота с использованием биоинформатикиEnrichment with microorganisms with the ability to fix nitrogen using bioinformatics
[0138] Для идентификации и выделения способствующих росту растений ризобактерий (PGPR), которые выбирают на основе их способности к осуществлению фиксации азота можно использовать биоинформатические способы. Микроорганизмы с высокой способностью к фиксации азота могут способствовать благоприятным признакам в растениях. Биоинформатические способы анализа для идентификации PGPR в качестве неограничивающих примеров включают геномику, метагеномику, направленное выделение, секвенирование генов, секвенирование транскриптома и моделирование.[0138] Bioinformatic methods can be used to identify and isolate plant growth promoting rhizobacteria (PGPR) that are selected based on their ability to effect nitrogen fixation. Microorganisms with a high capacity for nitrogen fixation can contribute to favorable traits in plants. Bioinformatics assays for identifying PGPR include, but are not limited to, genomics, metagenomics, targeted isolation, gene sequencing, transcriptome sequencing, and modeling.
[0139] Геномный анализ можно использовать для идентификации PGPR и подтверждения присутствия мутаций способами секвенирования нового поколения, как описано в настоящем документе, и контроля версий микроорганизмов.[0139] Genomic analysis can be used to identify PGPR and confirm the presence of mutations by next generation sequencing methods, as described herein, and version control of microorganisms.
[0140] Метагеномику можно использовать для идентификации и выделения PGPR с использованием алгоритма прогнозирования для колонизации. Метаданные также можно использовать для идентификации присутствия подвергнутого генетической инженерии штамма в образцах из окружающей среды и теплицы.[0140] Metagenomics can be used to identify and isolate PGPR using a prediction algorithm for colonization. The metadata can also be used to identify the presence of the genetically engineered strain in environmental and greenhouse samples.
[0141] Секвенирование транскриптома можно использовать для прогнозирования генотипов, приводящих к фенотипам PGPR. Кроме того, транскриптомные данные используют для идентификации промоторов для изменения экспрессии генов. Транскриптомные данные можно анализировать в сочетании с полногеномной последовательностью (WGS) с получением моделей метаболизма и генных регуляторных сетей.[0141] Transcriptome sequencing can be used to predict genotypes leading to PGPR phenotypes. In addition, transcriptome data is used to identify promoters for altering gene expression. Transcriptome data can be analyzed in combination with whole genome sequencing (WGS) to generate metabolic models and gene regulatory networks.
Окультуривание микроорганизмовCulture of microorganisms
[0142] Микроорганизмы, выделенные в природе, можно подвергать процессу окультуривания, где микроорганизмы преобразуют в форму, которая является генетически отслеживаемой и идентифицируемой. Одним из способов окультуривания микроорганизма является конструирование в нем свойства устойчивости к антибиотикам. Процесс конструирования устойчивости к антибиотикам может начинаться с определения устойчивости штамма микроорганизмов дикого типа к антибиотикам. Если бактерии чувствительны к антибиотику, то антибиотик может являться хорошим кандидатом для конструирования устойчивости к антибиотикам. Затем в геном микроорганизма рекомбинантными способами можно вводить ген устойчивости к антибиотику или противоселективный суицидный вектор. Противоселективный суицидный вектор может состоять из делеции представляющего интерес ген, селективного маркера и противоселективного маркера sacB. Противоселекцию можно использовать для замены нативных последовательностей ДНК микроорганизмов генами устойчивости к антибиотикам. Для одновременной оценки нескольких микроорганизмов, позволяя параллельное окультуривание, можно использовать способ средней производительности. Альтернативные способы окультуривания включают использования направленных нуклеаз для предотвращения выпетливания последовательностей суицидного вектора или получения промежуточных последовательностей векторов.[0142] Microorganisms isolated from nature can be subjected to a culture process where the microorganisms are converted into a form that is genetically traceable and identifiable. One way to cultivate a microorganism is to construct antibiotic resistance properties in it. The process of constructing antibiotic resistance can begin with the determination of the antibiotic resistance of a strain of wild-type microorganisms. If the bacteria are sensitive to an antibiotic, then the antibiotic may be a good candidate for constructing antibiotic resistance. An antibiotic resistance gene or an antiselective suicide vector can then be introduced into the genome of the microorganism by recombinant methods. The anti-selective suicide vector may consist of a deletion of the gene of interest, a selectable marker, and the anti-selective marker sacBα . Counterselection can be used to replace the native DNA sequences of microorganisms with antibiotic resistance genes. For the simultaneous evaluation of several microorganisms, allowing parallel culture, the medium throughput method can be used. Alternative culture methods include the use of targeted nucleases to prevent looping of suicide vector sequences or to generate intermediate vector sequences.
[0143] ДНК-содержащие векторы можно вводить в бактерии различными способами, включая электропорацию и химическую трансформацию. Для трансформации можно использовать стандартную библиотеку векторов. Примером способа редактирования генов является CRISPR с предшествующим тестированием Cas9 для гарантии активности Cas9 в микроорганизмах.[0143] DNA-containing vectors can be introduced into bacteria in various ways, including electroporation and chemical transformation. For transformation, you can use the standard vector library. An example of a gene editing method is CRISPR with prior testing of Cas9 to ensure Cas9 activity in microorganisms.
Нетрансгенная инженерия микроорганизмовNon-transgenic engineering of microorganisms
[0144] Популяцию микроорганизмов с благоприятными свойствами можно получать посредством направленной эволюции. Направленная эволюция представляет собой подход, где имитируют процесс природного отбора для эволюции белков или нуклеиновых кислот в направлении определенной пользователем цели. Примером направленной эволюции является способ, когда в популяцию микроорганизмов вносят случайные мутации, выбирают микроорганизмы с наиболее благоприятными свойствами и продолжают выращивание отобранных микроорганизмов. Наиболее благоприятные свойства у способствующих росту ризобактерий (PGPRs) могут присутствовать в фиксации азота. Способ направленной эволюции может являться повторяющимся и адаптивным на основе процесса отбора после каждого повторения.[0144] A population of microorganisms with favorable properties can be obtained through directed evolution. Directed evolution is an approach where the process of natural selection is mimicked to evolve proteins or nucleic acids towards a user-defined goal. An example of directed evolution is when random mutations are introduced into a population of microorganisms, the microorganisms with the most favorable properties are selected, and the selected microorganisms are continued to grow. The most favorable properties in growth-promoting rhizobacteria (PGPRs) may be present in nitrogen fixation. The directed evolution method may be iterative and adaptive based on a selection process after each iteration.
[0145] Можно получать способствующие росту растений ризобактерии (PGPR) с высокой способностью к фиксации азота. Эволюцию PGPR можно проводить посредством внесения генетической вариации. Генетическую вариацию можно вносить посредством мутагенеза с использованием полимеразной цепной реакции, сайт-специфического мутагенеза, насыщающего мутагенеза, мутагенеза с перестановкой фрагментов, гомологичной рекомбинации, систем CRISPR/Cas9, химического мутагенеза и их сочетаний. Посредством этих подходов можно вносить случайные мутации в популяцию микроорганизмов. Например, мутантов можно получать с использованием синтетической ДНК или РНК посредством сайт-специфического мутагенеза. Мутантов можно получать с использованием средств, содержащихся в плазмидах, которые позже исправляют. Представляющие интерес гены можно идентифицировать с использованием библиотек других видов с улучшенными свойствами, включая в качестве неограничивающих примеров улучшенные свойства PGPR, улучшенную колонизацию злаковых, увеличенную чувствительность к кислороду, увеличенную фиксацию азота и увеличенное выведение аммиака. Внутриродовые гены можно конструировать на основе этих библиотек с использованием программного обеспечения, такого как программное обеспечение Geneious или Platypus design. Мутации можно конструировать с помощью машинного обучения. Мутации можно конструировать с помощью модели метаболизма. Автоматизированное конструирование мутаций можно проводить с использованием средств, подобных Platypus, и они будут формировать РНК для Cas-направленного мутагенеза.[0145] Plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR) with high nitrogen fixation capacity can be obtained. The evolution of PGPR can be carried out by introducing genetic variation. Genetic variation can be introduced by polymerase chain reaction mutagenesis, site-directed mutagenesis, saturation mutagenesis, fragment shuffling mutagenesis, homologous recombination, CRISPR/Cas9 systems, chemical mutagenesis, and combinations thereof. Through these approaches, random mutations can be introduced into a population of microorganisms. For example, mutants can be generated using synthetic DNA or RNA through site-directed mutagenesis. Mutants can be obtained using the means contained in the plasmids, which are later corrected. Genes of interest can be identified using other species libraries with improved properties, including but not limited to improved PGPR properties, improved cereal colonization, increased oxygen sensitivity, increased nitrogen fixation, and increased ammonia excretion. Intrageneric genes can be designed from these libraries using software such as Geneious or Platypus design software. Mutations can be engineered using machine learning. Mutations can be constructed using a metabolic model. Automated construction of mutations can be done using Platypus-like tools and will generate RNA for Cas-directed mutagenesis.
[0146] Внутриродовые гены можно переносить в микроорганизм-хозяин. Кроме того, в микроорганизм также можно переносить репортерные системы. Репортерные системы характеризуют промоторы, определяют успешность трансформации, обеспечивают скрининг мутантов и действуют в качестве средств отрицательного отбора.[0146] Intrageneric genes can be transferred to a host microorganism. In addition, reporter systems can also be transferred to the microorganism. Reporter systems characterize promoters, determine transformation success, screen for mutants, and act as negative selection agents.
[0147] Микроорганизмы, несущие мутацию, можно культивировать посредством серийных пересевов. Колония микроорганизмов содержит один вариант микроорганизма. Колонии микроорганизмов подвергают скринингу с помощью автоматизированного сборщик колоний и жидкостного манипулятора. Мутанты с дупликацией гена и увеличенным количеством копий экспрессируют более высокий генотип требуемого признака.[0147] Microorganisms carrying the mutation can be cultivated through serial passages. The colony of microorganisms contains one variant of the microorganism. Microbial colonies are screened using an automated colony picker and fluid handler. Mutants with a gene duplication and increased copy number express a higher genotype of the desired trait.
Отбор способствующих росту растений микроорганизмов на основе фиксации азотаSelection of plant growth-promoting microorganisms based on nitrogen fixation
[0148] Колонии микроорганизмов можно скринировать с использованием различных анализов оценки фиксация азота. Одним из способов определения фиксации азота является анализ с применением одного фермента, в котором определяют выведение азота. Альтернативный способ представляют собой анализ восстановления ацетилена (ARA) с непрерывным получением образцов в течение времени. ARA можно проводить в высокопроизводительных планшетах из массивов микропробирок. ARA можно проводить для живых растений и тканей растений. Составы сред и концентрацию кислорода в средах при анализах ARA можно варьировать. Другим способом скрининга вариантов микроорганизмов является использование биосенсоров. Для исследования активности микроорганизмов можно использовать NanoSIMS и микроспектроскопию Raman. В определенных случаях бактерии также можно культивировать и наращивать способами ферментации в биореакторах. Биореакторы конструируют для увеличения устойчивости роста бактерий и снижения чувствительности бактерий к кислороду. Для оценки чувствительности к кислороду, потребности в питательных веществах, фиксации азота и выведения азота используют среду для микроферментеров на основе высокопроизводительных планшетов. Бактерии также можно совместно культивировать с конкурирующими или благоприятными микроорганизмами для определения скрытых путей. Проточную цитометрию можно использовать для скрининга бактерий, которые продуцируют высокие уровни азота с использованием химических, колориметрических или флуоресцентных индикаторов. Бактерии можно культивировать в присутствии или отсутствии источника азота. Например, бактерии можно культивировать с глутамином, аммиаком, мочевиной или нитратами.[0148] Microbial colonies can be screened using various nitrogen fixation assays. One way to determine nitrogen fixation is a single enzyme assay that measures nitrogen excretion. An alternative method is the acetylene recovery assay (ARA) with continuous sampling over time. ARA can be run in high-throughput microtube arrays. ARA can be performed on living plants and plant tissues. Media compositions and oxygen concentrations in media can be varied in ARA assays. Another method for screening variants of microorganisms is the use of biosensors. NanoSIMS and Raman microspectroscopy can be used to study the activity of microorganisms. In certain cases, bacteria can also be cultured and grown by fermentation methods in bioreactors. Bioreactors are designed to increase the resistance of bacterial growth and reduce the sensitivity of bacteria to oxygen. Microfermenter media based on high performance plates are used to assess oxygen sensitivity, nutrient requirements, nitrogen fixation and nitrogen excretion. Bacteria can also be co-cultured with competing or favorable microorganisms to determine hidden pathways. Flow cytometry can be used to screen for bacteria that produce high levels of nitrogen using chemical, colorimetric, or fluorescent indicators. Bacteria can be cultured in the presence or absence of a nitrogen source. For example, bacteria can be cultured with glutamine, ammonia, urea, or nitrates.
Выведение микроорганизмовRemoval of microorganisms
[0149] Выведение микроорганизмов представляет собой способ систематической идентификации и улучшения роли видов в микробиоме сельскохозяйственной культуры. Способ включает три этапа: 1) отбор видов-кандидатов посредством картирования взаимодействий растение-микроорганизм и прогноза регуляторной сети, сцепленной с конкретным фенотипом, 2) практическое и прогнозируемое улучшение фенотипов микроорганизмов посредством внутривидового скрещивания регуляторных сетей и кластеров генов и 3) скрининг и отбор новых генотипов микроорганизмов, которые обеспечивают требуемые фенотипы сельскохозяйственных культур. Для систематического анализа улучшения штаммов получена модель, в которой сцеплена динамика колонизации сообщества микроорганизмов с генетической активностью ключевых видов. Модель используют для прогноза выведения генетических мишеней и увеличения частоты отбора улучшений кодируемых микробиомом свойств агротехнического значения. Для графического представления варианта осуществления процесса см., фигуру 17A. Конкретно, на фигуре 17A приведена схема выведения микроорганизмов по вариантам осуществления. Как проиллюстрировано на фигуре 17A, рациональное улучшение микробиома сельскохозяйственной культуры можно использовать для увеличения биоразнообразия почв, настройки воздействия ключевых видов и/или изменения сроков и экспрессии важных метаболических путей. С этой целью авторы изобретения разработали конвейер выведения микроорганизмов для идентификации и улучшения роли штаммов в микробиоме сельскохозяйственной культуры. Способ включает три этапы: 1) отбор видов-кандидатов посредством картирования взаимодействий растение-микроорганизм и прогноза регуляторной сети, сцепленной с конкретным фенотипом, 2) практическое и прогнозируемое улучшение фенотипов микроорганизмов посредством внутривидового скрещивания регуляторных сетей и кластеров генов и 3) скрининг и отбор новых генотипов микроорганизмов, которые обеспечивают требуемые фенотипы сельскохозяйственных культур. Для систематического анализа улучшения штаммов авторы изобретения используют модель, в которой сцеплена динамика колонизации сообщества микроорганизмов с генетической активностью ключевых видов. Этот процесс представляет собой методологию для выведения и отбора улучшений кодируемых микробиомом свойств агротехнического значения.[0149] Breeding microorganisms is a way to systematically identify and improve the role of species in the crop microbiome. The method includes three steps: 1) selection of candidate species by mapping plant-microorganism interactions and predicting a regulatory network linked to a particular phenotype, 2) practical and predictable improvement in microorganism phenotypes by intraspecific crossing of regulatory networks and gene clusters, and 3) screening and selection of new genotypes of microorganisms that provide the required phenotypes of crops. For a systematic analysis of the improvement of strains, a model was obtained in which the dynamics of colonization of a community of microorganisms is linked to the genetic activity of key species. The model is used to predict the breeding of genetic targets and to increase the frequency of selection for improvements in microbiome-encoded properties of agricultural value. For a graphical representation of an embodiment of the process, see Figure 17A . Specifically, Figure 17A is a diagram of microorganism breeding according to embodiments. As illustrated in Figure 17A , rational crop microbiome improvement can be used to increase soil biodiversity, tune key species exposure, and/or alter the timing and expression of important metabolic pathways. To this end, the inventors have developed a microbial breeding pipeline to identify and improve the role of strains in the crop microbiome. The method includes three steps: 1) selection of candidate species by mapping plant-microorganism interactions and predicting a regulatory network linked to a particular phenotype, 2) practical and predictable improvement in microorganism phenotypes by intraspecific crossing of regulatory networks and gene clusters, and 3) screening and selection of new genotypes of microorganisms that provide the required phenotypes of crops. To systematically analyze the improvement of strains, the inventors use a model in which the dynamics of microbial community colonization are linked to the genetic activity of key species. This process provides a methodology for inferring and selecting improvements in microbiome-encoded properties of agronomic value.
[0150] Получения бактерий для улучшения признаков растений (например, фиксации азота) можно достигать посредством серийного пересева. Получение этих бактерий в дополнение к идентификации бактерий и/или композиций, способных к обеспечению одного или нескольких улучшенных признаков в одном или нескольких растениях, можно проводить посредством отбора растений с конкретным улучшенным признаком, на который влияет микробная флора. Один из способов получения бактерий для улучшения признака растения включает этапы: (a) выделения бактерий из ткани или почвы первого растения; (b) внесение генетической вариации в одну или несколько бактерий с получением одного или нескольких вариантов бактерий; (c) воздействие вариантами бактерий на множество растений; (d) выделение бактерий из ткани или почвы одного из множества растений, где растение, из которого выделяют бактерии, обладает улучшенным признаком относительно других растений в множестве растений; и (e) повторение этапов (b)-(d) с бактериями, выделяемыми из растения с улучшенным признаком (этап (d)). Этапы (b)-(d) можно повторять любое количество раз (например, однократно, дважды, три раза, четыре раза, пять раз, десять раз или более) до достижения улучшенным признаком растения желаемого уровня. Кроме того, множество растений может представлять собой более двух растений, например, от 10 до 20 растений или 20 или более, 50 или более, 100 или более, 300 или более, 500 или более или 1000 или более растений.[0150] Obtaining bacteria to improve plant traits (eg, nitrogen fixation) can be achieved through serial reseeding. The production of these bacteria, in addition to identifying bacteria and/or compositions capable of providing one or more improved traits in one or more plants, can be accomplished by selecting plants with a particular improved trait that is affected by the microbial flora. One way to obtain bacteria to improve a trait of a plant includes the steps of: (a) isolating the bacteria from the tissue or soil of the first plant; (b) introducing a genetic variation into one or more bacteria to produce one or more bacterial variants; (c) exposure of bacterial variants to a plurality of plants; (d) isolating the bacteria from the tissue or soil of one of the plurality of plants, wherein the plant from which the bacteria is isolated has an improved trait relative to other plants in the plurality of plants; and (e) repeating steps (b)-(d) with bacteria isolated from the trait-improved plant (step (d)). Steps (b)-(d) can be repeated any number of times (eg, once, twice, three times, four times, five times, ten times or more) until the improved plant trait reaches the desired level. Further, the plurality of plants may be more than two plants, such as 10 to 20 plants, or 20 or more, 50 or more, 100 or more, 300 or more, 500 or more, or 1000 or more plants.
[0151] В дополнение к получению растения с улучшенным признаком, получают популяцию бактерий, содержащую бактерии, несущие одну или несколько генетических вариаций, вносимых в один или несколько генов (например, генов, регулирующих фиксацию азота). Повторяя описанные выше этапы, можно получать популяцию бактерий, которая содержит наиболее подходящих представителей популяции, которая коррелирует с представляющим интерес признаком растения. Бактерии в этой популяции можно идентифицировать и определить их благоприятные свойства, например, посредством генетического и/или фенотипического анализа. Генетический анализ можно проводить у выделенных на этапе (a) бактерий. Фенотипическую и/или генотипическую информацию можно получать с использованием способов, включающих: высокопроизводительный скрининг химических компонентов растительного происхождения, способы секвенирования, включающие высокопроизводительное секвенирование генетического материала, способы дифференциального дисплея (включая ДДОТ-ПЦР и ДД-ПЦР), способы с микропанелями нуклеиновых кислот, РНК-сек (секвенирование методом дробовика всего генома) и кПЦР-РВ (количественную ПЦР с детекцией в реальном времени). Полученную информацию можно использовать для получения профилирующей популяцию информации об идентификационных характеристиках и активности присутствующих бактерий, например, филогенетического анализа или основанного на микропанелях скрининга нуклеиновых кислот, кодирующих компоненты оперонов рРНК или других таксономически информативных локусов. Примеры таксономически информативных локусов включают ген 16S рРНК, ген 23S рРНК, ген 5S рРНК, ген 5.8S рРНК, ген 12S рРНК, ген 18S рРНК, ген 28S рРНК, ген gyrB, ген rpoB, ген fusA, ген recA, ген coxl, ген nifD. Примеры способов таксономического профилирования для определения таксонов, присутствующих в популяции описаны в US 20140155283. Идентификация бактерий может включать характеризующую активность одного или нескольких генов или оного или нескольких путей передачи сигнала, например, генов, ассоциированных с путем фиксации азота. также в бактериальных популяциях могут присутствовать синергические взаимодействия (когда два компонента при их комбинации увеличивают требуемое действие более чем аддитивно) между различными видами бактерий.[0151] In addition to obtaining a plant with an improved trait, a population of bacteria is obtained containing bacteria carrying one or more genetic variations introduced in one or more genes (for example, genes that regulate nitrogen fixation). By repeating the above steps, a bacterial population can be obtained that contains the most appropriate members of the population that correlates with the plant trait of interest. Bacteria in this population can be identified and their beneficial properties determined, for example, through genetic and/or phenotypic analysis. Genetic analysis can be performed on bacteria isolated in step (a). Phenotypic and/or genotypic information can be obtained using methods including: high-throughput screening of plant-derived chemical components, sequencing methods including high-throughput sequencing of genetic material, differential display methods (including DDOT-PCR and DD-PCR), nucleic acid microarray methods, RNA-sec (shotgun sequencing of the whole genome) and qPCR-RT (quantitative PCR with real-time detection). The information obtained can be used to obtain population profiling information about the identification characteristics and activity of the bacteria present, for example, phylogenetic analysis or microarray-based screening of nucleic acids encoding components of rRNA operons or other taxonomically informative loci. Examples of taxonomically informative loci include 16S rRNA gene, 23S rRNA gene, 5S rRNA gene, 5.8S rRNA gene, 12S rRNA gene, 18S rRNA gene, 28S rRNA gene, gyrB gene, rpoB gene, fusA gene, recA gene, coxl gene, nifD. Examples of taxonomic profiling methods for determining taxa present in a population are described in US 20140155283. Identification of bacteria may include characterizing the activity of one or more genes or one or more signal transduction pathways, for example genes associated with the nitrogen fixation pathway. also in bacterial populations there may be synergistic interactions (when two components, when combined, increase the desired effect more than additively) between different bacterial species.
Генетическая вариация - локализация и источники альтераций геномаGenetic variation - localization and sources of genome alterations
[0152] Генетическая вариация может представлять собой ген, выбранный из группы, состоящей из: nifA, nifL, ntrB, ntrC, glnA, glnB, glnK, draT, amtB, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB и nifQ. Генетическая вариация может представлять собой вариацию в гене, кодирующем белок с функциональностью, выбранной из группы, состоящей из: глутаминсинтетазы, глутаминазы, аденилаттрансферазы глутаминсинтетазы, активатора транскрипции, антиактиватора транскрипции, пируват:флаводоксин-оксидоредуктазы, флаводоксина или АДФ-D-рибозилтрансферазы НАД+:динитрогеназоредуктазы. Генетическая вариация может представлять собой мутацию, которая приводит к одному или нескольким из: повышенной экспрессии или активности NifA или глутаминазы; сниженной экспрессии или активности NifL, NtrB, глутаминсинтетазы, GlnB, GlnK, DraT, AmtB; сниженной активности удаления аденилата GlnE или сниженной активности удаления уридилата GlnD. Внесение генетической вариации может включать вставку и/или делецию одного или нескольких нуклеотидов в намеченном участке, например, 1, 2, 3, 4, 5, 10, 25, 50, 100, 250, 500 или более нуклеотидов. Генетическая вариация, вносимая в одну или несколько бактерий способами, описываемыми в настоящем документе, может представлять собой нокаут-мутацию (например, делецию промотора, вставку или делецию с получением преждевременного стоп-кодона, делецию всего гена), или она может представлять собой удаление или устранение активности белкового домена (например, точечную мутацию влияющую на активный центр, или делецию части гена, кодирующей значимую часть белкового продукта), или она может представлять собой изменение или удаление регуляторной последовательности гена-мишени. Также можно вставлять одну или несколько регуляторных последовательностей, включая гетерологичные регуляторные последовательности и регуляторные последовательности, выявленные в геноме вида или рода бактерий, соответствующих бактериям, у которых проводят генетическую вариацию. Кроме того, регуляторные последовательности можно выбирать на основе уровня экспрессии гена в культуре бактерий или в ткани растения. Генетическая вариация может представлять собой предопределенную генетическую вариацию, которую конкретно вводят в намеченный участок. Генетическая вариация может представлять собой случайную мутацию в намеченном участке. Генетическая вариация может представлять собой вставку или делецию одного или нескольких нуклеотидов. В некоторых случаях в одну или несколько выделенных бактерий перед воздействием бактерий на растения для оценки улучшения признака вносят множество различных генетических вариаций (например, 2, 3, 4, 5, 10 или более). Множество генетических вариаций может являться любым из описанных выше типов, одним и тем же или различными типами и любой их комбинацией. В некоторых случаях последовательно проводят множество различных генетических вариаций, проводя первую генетическую вариацию после первого этапа выделения, вторую генетическую вариацию после второго этапа выделения, и т.д. так, чтобы накопить множество генетических вариаций в бактериях постепенно обеспечивая улучшенные признаки у ассоциированных растений.[0152] The genetic variation may be a gene selected from the group consisting of: nifA, nifL, ntrB, ntrC, glnA, glnB, glnK, draT, amtB, gln D, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, and nifQ . The genetic variation may be a variation in a gene encoding a protein with a functionality selected from the group consisting of: glutamine synthetase, glutaminase, glutamine synthetase adenylate transferase, transcription activator, transcription antiactivator, pyruvate:flavodoxin oxidoreductase, flavodoxin, or ADP-D-ribosyltransferase NAD + : dinitrogenase reductase. The genetic variation may be a mutation that results in one or more of: increased expression or activity of NifA or glutaminase; reduced expression or activity of NifL, NtrB, glutamine synthetase, GlnB, GlnK, DraT, AmtB; reduced GlnE adenylate scavenging activity; or reduced GlnD uridylate scavenging activity. The introduction of genetic variation may include the insertion and/or deletion of one or more nucleotides at the target site, for example, 1, 2, 3, 4, 5, 10, 25, 50, 100, 250, 500 or more nucleotides. A genetic variation introduced into one or more bacteria by the methods described herein may be a knockout mutation (e.g., promoter deletion, premature stop codon insertion or deletion, entire gene deletion), or it may be a deletion or elimination of protein domain activity (for example, a point mutation affecting the active site, or deletion of a portion of a gene encoding a significant portion of a protein product), or it may be a change or deletion of the regulatory sequence of the target gene. It is also possible to insert one or more regulatory sequences, including heterologous regulatory sequences and regulatory sequences found in the genome of the bacterial species or genus corresponding to the bacteria in which the genetic variation is being carried out. In addition, regulatory sequences can be selected based on the level of gene expression in a bacterial culture or plant tissue. The genetic variation may be a predetermined genetic variation that is specifically introduced into the target site. The genetic variation may be a random mutation in the target area. A genetic variation may be an insertion or deletion of one or more nucleotides. In some cases, many different genetic variations (eg, 2, 3, 4, 5, 10 or more) are introduced into one or more of the isolated bacteria before the bacteria are exposed to the plants to evaluate the improvement of a trait. The plurality of genetic variations may be any of the types described above, the same or different types, and any combination thereof. In some cases, a plurality of different genetic variations are performed sequentially, conducting the first genetic variation after the first isolation step, the second genetic variation after the second isolation step, and so on. so as to accumulate many genetic variations in bacteria gradually providing improved traits in associated plants.
Генетическая вариация - способы внесения альтераций геномаGenetic variation - ways to introduce alterations in the genome
[0153] В основном термин "генетическая вариация" относится к любому изменению, вносимому в полинуклеотидную последовательность относительно эталонного полинуклеотида, такого как эталонный геном или его часть, или эталонный ген или его часть. Генетическую вариацию можно обозначать как "мутацию", а последовательность или организм, содержащие генетическую вариацию можно обозначать как "генетический вариант" или "мутант". Генетические вариации могут обладать рядом эффектов, таким как повышение или снижение определенного вида биологической активности, включение экспрессии гена, метаболизма и клеточной сигнализации. Генетические вариации можно конкретно вносить в намеченный участок или вносить случайным образом. Для внесения генетических вариаций доступен ряд средств и способов молекулярной биологии. Например, генетическую вариацию можно вносить посредством мутагенеза при полимеразной цепной реакции, сайт-специфического мутагенеза, насыщающего мутагенеза, мутагенеза с перестановкой фрагментов, гомологичной рекомбинации, рекомбинационной инженерии, опосредованной лямбда красным рекомбинация, систем CRISPR/Cas9, химического мутагенеза и их сочетаний. Химические способы внесения генетических вариаций включают воздействие на ДНК химическим мутагеном, например, этилметансульфонатом (EMS), метилметансульфонатом (MMS), N-нитрозомочевиной (EN U), N-метил-N-нитро-N'-нитрозогуанидином, 4-нитрохинолин-N-оксидом, диэтилсульфатом, бензопиреном, циклофосфамидом, блеомицином, триэтилмеламином, мономерным акриламидом, азотистым ипритом, винкристином, диэпоксиалканами (например, диэпоксибутаном), ICR-170, формальдегидом, гидрохлоридом прокарбазина, этиленоксидом, диметилнитрозамином, 7,12 диметилбенз(a)антраценом, хлорамбуцилом, гексаметилфосфамидом, бисульфаном и т.п. Индуцирующие мутации посредством облучения средства включают ультрафиолетовое облучение, γ-облучение, рентгеновские лучи и бомбардировку быстрыми нейтронами. Также генетические вариации можно вносить в нуклеиновые кислоты, например, с использованием триметилпсоралена с ультрафиолетовым облучением. Другим подходящим способом получения генетической вариации является случайная или направленная вставка мобильного элемента ДНК, например, транспозона. Генетические вариации можно вносить в нуклеиновую кислоту при амплификации в бесклеточной системе in vitro, например, с использованием способа полимеразной цепной реакции (ПЦР), такого как ПЦР со сниженной точностью. Генетические вариации можно вносить в нуклеиновые кислоты in vitro с использованием способы перестановки ДНК (например, перестановки экзонов, обмены доменов и т.п.). Генетические вариации также можно вносить в нуклеиновые кислоты как результат недостаточности в клетке ферментов репарации ДНК, например, полагают, что присутствие в клетке мутантного гена, кодирующего мутантный фермент репарации ДНК, приведет к получению высокой частоты мутаций (т.е., приблизительно от 1 мутации/100 генов до 1 мутации/10000 генов) в геноме клетки. Примеры генов, кодирующих ферменты репарации ДНК в качестве неограничивающих примеров включают Mut H, Mut S, Mut L, и Mut U и их гомологи у других видов (например, от MSH1 до MSH6, от PMS1 до PMS2, MLH1, GTBP, ERCC-1 и т.п.). Примеры описаний различных способов внесения генетических вариации приведены, например, в Stemple (2004) Nature 5:1-7; Chiang et al. (1993) PCR Methods Appl 2(3): 210-217; Stemmer (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:10747-10751 и в патентах США №№ 6033861 и 6773900.[0153] In general, the term "genetic variation" refers to any change introduced into a polynucleotide sequence relative to a reference polynucleotide, such as a reference genome or portion thereof, or a reference gene or portion thereof. A genetic variation may be referred to as a "mutation" and a sequence or organism containing the genetic variation may be referred to as a "genetic variant" or "mutant". Genetic variations can have a number of effects, such as an increase or decrease in a particular type of biological activity, the inclusion of gene expression, metabolism and cell signaling. Genetic variations can be specifically introduced into the target area or introduced randomly. A number of molecular biology tools and techniques are available for introducing genetic variation. For example, genetic variation can be introduced by polymerase chain reaction mutagenesis, site-directed mutagenesis, saturation mutagenesis, fragment shuffling mutagenesis, homologous recombination, recombination engineering, lambda red-mediated recombination, CRISPR/Cas9 systems, chemical mutagenesis, and combinations thereof. Chemical methods for introducing genetic variation include exposing DNA to a chemical mutagen, such as ethyl methanesulfonate (EMS), methyl methanesulfonate (MMS), N-nitrosourea (EN U), N-methyl-N-nitro-N'-nitrosoguanidine, -oxide, diethyl sulfate, benzopyrene, cyclophosphamide, bleomycin, triethylmelamine, monomeric acrylamide, nitrogen mustard, vincristine, diepoxyalkanes (e.g. diepoxybutane), ICR-170, formaldehyde, procarbazine hydrochloride, ethylene oxide, dimethylnitrosamine, 7,12 dimethylbenz(a)anthracene, chlorambucil, hexamethylphosphamide, bisulfan, and the like. Mutation-inducing agents by irradiation include ultraviolet irradiation, γ-irradiation, x-rays, and fast neutron bombardment. Also, genetic variations can be introduced into nucleic acids, for example, using trimethylpsoralen with ultraviolet irradiation. Another suitable method for generating genetic variation is the random or targeted insertion of a transposable DNA element, such as a transposon. Genetic variations can be introduced into the nucleic acid by amplification in an in vitro cell-free system, for example, using a polymerase chain reaction (PCR) method, such as reduced fidelity PCR. Genetic variations can be introduced into nucleic acids in vitro using DNA shuffling techniques (eg, exon shuffling, domain swaps, and the like). Genetic variations can also be introduced into nucleic acids as a result of a lack of DNA repair enzymes in the cell, for example, it is believed that the presence in the cell of a mutant gene encoding a mutant DNA repair enzyme will result in a high mutation rate (i.e., from about 1 mutation /100 genes to 1 mutation/10,000 genes) in the cell genome. Non-limiting examples of genes encoding DNA repair enzymes include Mut H, Mut S, Mut L, and Mut U and their homologues in other species (e.g., MSH1 to MSH6, PMS1 to PMS2, MLH1, GTBP, ERCC-1 and so on.). Examples of descriptions of various methods for introducing genetic variation are given, for example, in Stemple (2004) Nature 5:1-7; Chiang et al. (1993) PCR Methods Appl 2(3): 210-217; Stemmer (1994) Proc. Natl. Acad. sci. USA 91:10747-10751 and US Pat. Nos. 6,033,861 and 6,773,900.
[0154] Генетические вариации, вносимые в микроорганизмы, можно классифицировать как трансгенные, цисгенные, внутригеномные, внутриродовые, межродовые, синтетические, эволюционировавшие, полученные посредством перестановки или SNP.[0154] Genetic variations introduced into microorganisms can be classified as transgenic, cisgenic, intragenomic, intrageneric, intergeneric, synthetic, evolved, permuted, or SNP.
[0155] Для обеспечения улучшений описанных выше свойств генетическую вариацию можно вносить во множество метаболических путей в микроорганизмах. Характерные пути включают пути захвата серы, биосинтез гликогена, путь регуляции глутамина, путь захвата молибдена, путь фиксации азота, ассимиляцию аммиака, экскрецию или секрецию аммиака, захват азота, биосинтез глутамина, анаэробное окисление аммония, растворение фосфата, транспорт органических кислот, продукцию органических кислот, продукцию агглютитинов, гены захвата свободных реакционноспособных радикалов кислорода, биосинтез индолуксусной кислоты, биосинтез трегалозы, ферменты или пути разрушения клеточной стенки растений, гены крепления корней, секрецию экзополисахаридов, путь синтеза глутаминатсинтазы, пути захвата железа, пути сидерофора, хитиназный путь, ACC-дезаминазу, биосинтез глутатиона, гены передачи сигнала посредством фосфатов, путь гашения, пути цитохромов, путь гемоглобина, путь бактериального гемоглобин-подобного белка, малых-РНК rsmZ, биосинтез ризобиотоксина, белок адгезии lapA, путь чувства кворума AHL, биосинтез феназина, биосинтез циклического липопептида и продукцию антибиотиков.[0155] To provide improvements to the properties described above, genetic variation can be introduced into a variety of metabolic pathways in microorganisms. Typical pathways include sulfur uptake pathways, glycogen biosynthesis, glutamine regulation pathway, molybdenum uptake pathway, nitrogen fixation pathway, ammonia assimilation, ammonia excretion or secretion, nitrogen uptake, glutamine biosynthesis, anaerobic ammonium oxidation, phosphate dissolution, organic acid transport, organic acid production , agglutitin production, free reactive oxygen radical scavenging genes, indoleacetic acid biosynthesis, trehalose biosynthesis, enzymes or plant cell wall disruption pathways, root attachment genes, exopolysaccharide secretion, glutamate synthase synthesis pathway, iron uptake pathways, siderophore pathways, chitinase pathway, ACC deaminase , glutathione biosynthesis, phosphate signaling genes, quenching pathway, cytochrome pathways, hemoglobin pathway, bacterial hemoglobin-like protein pathway, rsmZ small RNAs, rhizobiotoxin biosynthesis, lapA adhesion protein, AHL quorum sensing pathway, phenazine biosynthesis, cyclic lipopeptide biosynthesis and antibiotic production.
[0156] Для внесения требуемых мутаций можно использовать системы CRISPR/Cas9 (короткие палиндромные повторы, регулярно расположенные группами)/ассоциированные с CRISPR (Cas). CRISPR/Cas9 обеспечивают бактериям и археям приобретенный иммунитет против вирусов и плазмид посредством использования CRISPR РНК (кпРНК), направляя сайленсинг внедряющихся нуклеиновых кислот. Белок Cas9 (или его функциональный эквивалент и/или вариант, т.е., подобный Cas9 белок) в природных условиях обладает ДНК-эндонуклеазной активностью, которая зависит от ассоциации белка с двумя природными или синтетическими молекулами РНК, называемыми кпРНК и транскпРНК (также называемыми направляющими РНК). В некоторых случаях, две молекулы ковалентно связаны с формированием одной молекулы (также называемой одиночной направляющей РНК ("онРНК"). Таким образом, белок Cas9 или подобный Cas9 белок ассоциируют с направленной к ДНК РНК (где этот термин включает конфигурацию с двумя направляющими молекулами РНК и конфигурацию с одиночной направляющей молекулой РНК), которая активирует Cas9 или подобный Cas9 белок и направляет белок к последовательности нуклеиновой кислоты-мишени. Если Cas9 или подобный Cas9 белок сохраняют свою ферментативную функцию, они расщепляют ДНК-мишень с образованием двухцепочечного разрыва, что может приводить к изменению генома (т.е., редактированию: делеции, вставке (когда присутствует полинуклеотид-донор), замене и т.д.), таким образом, изменяя экспрессию генов. Определенные варианты Cas9 (которые включены в термин подобные Cas9) изменяют так, чтобы они обладали сниженной активностью расщепления ДНК (в некоторых случаях они расщепляют одну цепь вместо обеих цепей ДНК-мишени, тогда как в других случаях их активность сильно снижают до отсутствия активности расщепления ДНК). Дополнительные иллюстративные описания систем CRISPR для внесения генетических вариаций можно найти, например, в US 8795965.[0156] CRISPR/Cas9 (regularly spaced short palindromic repeats)/CRISPR-associated (Cas) systems can be used to introduce the desired mutations. CRISPR/Cas9 provides bacteria and archaea with acquired immunity against viruses and plasmids through the use of CRISPR RNA (csRNA) to direct the silencing of invading nucleic acids. The Cas9 protein (or its functional equivalent and/or variant, i.e., a Cas9-like protein) naturally has DNA endonuclease activity that depends on the association of the protein with two natural or synthetic RNA molecules, called cpRNA and transcpRNA (also called guide RNA). In some cases, two molecules are covalently linked to form a single molecule (also called a single guide RNA ("sRNA"). Thus, a Cas9 protein or a Cas9-like protein associates with a DNA-directed RNA (where this term includes a two-guide RNA configuration). and single guide RNA configuration) that activates a Cas9 or Cas9-like protein and directs the protein to a target nucleic acid sequence. If Cas9 or a Cas9-like protein retains its enzymatic function, it cleaves the target DNA to form a double-strand break, which can to modify the genome (i.e., editing: deletions, insertions (when a donor polynucleotide is present), substitution, etc.), thereby altering gene expression. Certain variants of Cas9 (which are included in the term Cas9-like) alter so so that they have reduced DNA cleavage activity (in some cases they cleave one strand instead of both strands of the target DNA, while in other cases their activity is severely reduced to no DNA cleavage activity). Additional illustrative descriptions of CRISPR systems for introducing genetic variation can be found, for example, in US 8795965.
[0157] В качестве способа циклической амплификации в мутагенезе при полимеразной цепной реакции (ПЦР) для внесения желаемых мутаций используют мутагенные праймеры. ПЦР проводят в виде циклов денатурации, отжига и достройки. После амплификации посредством ПЦР отбор мутантной ДНК и удаление исходной плазмидной ДНК можно проводить посредством: 1) замены dCTP в течение ПЦР гидроксиметилированным dCTP, с последующим расщепление рестрикционными ферментами с удалением только негидроксиметилированной исходной ДНК; 2) одновременного мутагенеза гена устойчивости к антибиотикам и исследуемого гена, изменяя у плазмиды устойчивость к антибиотикам на устойчивость к другим антибиотикам, где устойчивость к новым антибиотикам затем облегчает отбор требуемой мутации; 3) расщепление исходной метилированной матричной ДНК после внесения требуемой мутации рестрикционным ферментом DpnI, который расщепляет только метилированную ДНК, посредством чего происходит выделение мутантных неметилированных цепей; или 4) получения кольцевых молекул мутантных продуктов ПЦР в дополнительной реакции лигирования с увеличением эффективности трансформации мутантной ДНК. Дополнительное описание иллюстративных способов можно найти, например, в US 7132265, US 6713285, US 6673610, US 6391548, US 5789166, US 5780270, US 5354670, US 5071743 и US 20100267147.[0157] As a method of cyclic amplification in polymerase chain reaction (PCR) mutagenesis, mutagenic primers are used to introduce desired mutations. PCR is carried out in the form of cycles of denaturation, annealing and completion. After amplification by PCR, selection of mutant DNA and removal of the original plasmid DNA can be carried out by: 1) replacing dCTP during PCR with hydroxymethylated dCTP, followed by restriction enzyme digestion to remove only the non-hydroxymethylated original DNA; 2) simultaneous mutagenesis of the antibiotic resistance gene and the gene under study, changing the antibiotic resistance of the plasmid to resistance to other antibiotics, where resistance to new antibiotics then facilitates the selection of the desired mutation; 3) cleavage of the original methylated template DNA after introducing the desired mutation with the restriction enzyme DpnI, which cleaves only methylated DNA, whereby the mutant unmethylated strands are isolated; or 4) obtaining circular molecules of mutant PCR products in an additional ligation reaction with an increase in the efficiency of transformation of the mutant DNA. Further description of illustrative methods can be found, for example, in US 7132265, US 6713285, US 6673610, US 6391548, US 5789166, US 5780270, US 5354670, US 5071743 and US 20100267147.
[0158] В олигонуклеотид-специфическом мутагенезе, также называемом сайт-специфическим мутагенезом, как правило, используют синтетический праймер ДНК. Этот синтетический праймер содержит требуемую мутацию и комплементарен матричной ДНК вокруг участка мутации так, что он может гибридизоваться с ДНК в представляющем интерес гене. Мутация может представлять собой однонуклеотидную замену (точечную мутацию), замену нескольких нуклеотидов, делецию или вставку или их комбинацию. Затем одноцепочечный праймер достраивают с использованием ДНК-полимеразы, которая копирует остальную часть гена. Копированный таким образом ген содержит мутантный участок, и его затем можно вносить в клетку-хозяина в виде вектора и клонировать. В заключение мутантов можно отбирать посредством секвенирования ДНК для проверки того, что они содержат требуемую мутацию.[0158] Oligonucleotide-specific mutagenesis, also referred to as site-specific mutagenesis, typically uses a synthetic DNA primer. This synthetic primer contains the desired mutation and is complementary to the template DNA around the site of the mutation so that it can hybridize to the DNA in the gene of interest. The mutation may be a single nucleotide substitution (point mutation), a multi-nucleotide substitution, a deletion or insertion, or a combination thereof. The single strand primer is then completed using a DNA polymerase that copies the rest of the gene. The gene copied in this manner contains a mutated region and can then be introduced into a host cell as a vector and cloned. Finally, mutants can be selected by DNA sequencing to verify that they contain the desired mutation.
[0159] Генетические вариации можно вносить с использованием ПЦР со сниженной точностью. В этом способе представляющий интерес ген амплифицируют с использованием ДНК-полимеразы в условиях недостаточности точности репликации последовательности. Результатом является то, что продукты амплификации содержат по меньшей мере одну ошибку в последовательности. Когда ген амплифицируют и полученный продукт(ы) реакции содержит одно или несколько изменений последовательности по сравнению с матричной молекулой, полученные продукты являются мутантными по сравнению с матрицей. Другим способом внесения случайных мутаций является воздействие на клетки химическим мутагеном, таким как нитрозогуанидин или этилметансульфонат (Nestmann, Mutat Res 1975 June; 28(3):323-30), а затем у хозяина выделяют вектор, содержащий ген.[0159] Genetic variations can be introduced using PCR with reduced accuracy. In this method, a gene of interest is amplified using a DNA polymerase under conditions of insufficient sequence replication fidelity. The result is that the amplification products contain at least one sequence error. When a gene is amplified and the resulting reaction product(s) contains one or more sequence changes from the template molecule, the resulting products are mutated from the template. Another way to introduce random mutations is to expose the cells to a chemical mutagen such as nitrosoguanidine or ethylmethanesulfonate (Nestmann, Mutat Res 1975 June; 28(3):323-30) and then isolate the vector containing the gene from the host.
[0160] Другим способом случайного мутагенеза является насыщающий мутагенез, в котором стараются получить все или почти все возможные мутации в конкретном участке или небольшой области гена. В широком смысле насыщающий мутагенез состоит из мутагенеза полного набора мутагенных кассет (где длина каждой кассеты составляет, например, 1-500 оснований) в определенной полинуклеотидной последовательности для мутагенеза (где длина последовательности для мутагенеза составляет, например, от 15 до 100000 оснований). Таким образом, в каждую подвергаемую мутагенезу кассету вносят группу мутаций (например, в диапазоне от 1 до 100 мутаций). Группа мутаций, вносимых в одну кассету, может отличаться от второй группы мутаций, вносимых во вторую кассету в течение одного раунда насыщающего мутагенеза, или являться такой же. Примерами таких групп являются делеции, добавления, группы конкретных кодонов и группы конкретных нуклеотидных кассет.[0160] Another method of random mutagenesis is saturation mutagenesis, which tries to get all or almost all possible mutations in a particular region or small region of a gene. In a broad sense, saturation mutagenesis consists of mutagenesis of a complete set of mutagenic cassettes (where each cassette is, for example, 1-500 bases long) in a specific mutagenesis polynucleotide sequence (where the mutagenesis sequence is, for example, 15 to 100,000 bases long). Thus, a group of mutations (eg, ranging from 1 to 100 mutations) is introduced into each cassette to be mutated. The group of mutations introduced into one cassette may be different or the same as the second group of mutations introduced into the second cassette during one round of saturation mutagenesis. Examples of such groups are deletions, additions, specific codon groups, and specific nucleotide cassette groups.
[0161] Мутагенез с перестановкой фрагментов, также называемый перестановкой ДНК, является способом быстрой репродукции благоприятных мутаций. В примере способ перестановки, используют ДНКазу для фрагментации набора исходных генов на части длиной, например, приблизительно 50-100 п.н. После этого проводят полимеразную цепную реакцию (ПЦР) без праймеры - фрагменты ДНК с достаточным перекрыванием гомологичных последовательностей отжигаются друг с другом и затем их достраивает ДНК-полимераза. После достижения некоторыми молекулами ДНК размера исходных генов, проводят несколько циклов этой достройки посредством ПЦР. Затем эти гены можно амплифицировать посредством другой ПЦР, в этот раз с добавлением праймеров, которые сконструированы так, чтобы они были комплементарны концам цепей. Праймеры могут содержать дополнительные последовательности, добавляемые на их 5'-концы, такие как последовательности участков распознавания рестрикционных ферментов, необходимые для лигирования в клонирующий вектор. Дополнительные примеры способов перестановок приведены в US 20050266541.[0161] Fragment shuffling mutagenesis, also referred to as DNA shuffling, is a way to rapidly reproduce favorable mutations. In an exemplary shuffling method, DNase is used to fragment a set of original genes into pieces of length, eg, approximately 50-100 bp. After that, a polymerase chain reaction (PCR) is carried out without primers - DNA fragments with sufficient overlap of homologous sequences are annealed to each other and then they are completed by DNA polymerase. After some DNA molecules reach the size of the original genes, several cycles of this completion are carried out by PCR. These genes can then be amplified by another PCR, this time with the addition of primers designed to be complementary to the ends of the chains. The primers may have additional sequences added to their 5' ends, such as restriction enzyme recognition sequences required for ligation into a cloning vector. Additional examples of permutation methods are given in US 20050266541.
[0162] Мутагенез посредством гомологичной рекомбинации включает рекомбинацию экзогенного фрагмента ДНК и полинуклеотидной последовательности-мишени. После образования двухцепочечных разрывов происходит удаление участков ДНК на 5'-концах разрывов в процессе, называемом резекцией. На последующем этапе внедрения цепи выступающий 3'-конец разорванной молекулы ДНК затем "внедряется" в сходную или идентичную молекулу ДНК, которая не подвергалась разрыву. Способ можно использовать для удаления генов, удаления экзонов, добавления генов и внесения точечных мутаций. Мутагенез посредством гомологичной рекомбинации может являться постоянным или условным. Как правило, также предоставляют матрицу рекомбинации. Матрица рекомбинации может представлять собой компонент другого вектора, содержащийся в отдельном векторе, или ее предоставляют в виде отдельного полинуклеотида. В определенных вариантах осуществления матрицу рекомбинации конструируют так, чтобы она служила в качестве матрицы в гомологичной рекомбинации, например, в пределах или рядом с последовательностью-мишенью, разрезаемой или расщепляемой сайт-специфической нуклеазой. Длина матричного полинуклеотида может являться любой подходящей длиной, например, длина может составлять приблизительно или более чем приблизительно 10, 15, 20, 25, 50, 75, 100, 150, 200, 500, 1000 или более нуклеотидов. В определенных вариантах осуществления матричный полинуклеотид комплементарен части полинуклеотида, содержащего последовательность-мишень. При оптимальном выравнивании матричныый полинуклеотид может перекрываться с одним или несколькими нуклеотидами последовательности-мишени (например, приблизительно или более чем приблизительно с 1, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90, 100 или более нуклеотидами). В определенных вариантах осуществления, когда матричная последовательность и полинуклеотид, содержащий последовательность-мишень, оптимально выровнены, ближайший нуклеотид матричного полинуклеотида находится в пределах приблизительно 1, 5, 10, 15, 20, 25, 50, 75, 100, 200, 300, 400, 500, 1000, 5000, 10000 или более нуклеотидов от последовательности-мишени. Неограничивающие примеры сайт-специфических нуклеаз, пригодных в способах гомологичной рекомбинации, включают нуклеазы с цинковыми пальцами, нуклеазы CRISPR, нуклеазы TALE и мегануклеазу. Для дополнительного описания использования таких нуклеаз, см. например, US 8795965 и US 20140301990.[0162] Mutagenesis by homologous recombination involves the recombination of an exogenous DNA fragment and a target polynucleotide sequence. After the formation of double-strand breaks, the sections of DNA at the 5' ends of the breaks are removed in a process called resection. In a subsequent strand insertion step, the 3' protruding end of the broken DNA molecule is then "introduced" into a similar or identical DNA molecule that has not been broken. The method can be used to remove genes, remove exons, add genes, and introduce point mutations. Mutagenesis by homologous recombination may be permanent or conditional. Typically, a recombination matrix is also provided. The recombination template may be a component of another vector contained in a separate vector or provided as a separate polynucleotide. In certain embodiments, the recombination template is designed to serve as a template in homologous recombination, for example, within or adjacent to the target sequence being cut or cleaved by the site-specific nuclease. The length of the template polynucleotide may be any suitable length, for example, the length may be about or more than about 10, 15, 20, 25, 50, 75, 100, 150, 200, 500, 1000 or more nucleotides. In certain embodiments, the template polynucleotide is complementary to the portion of the polynucleotide containing the target sequence. When optimally aligned, the template polynucleotide may overlap with one or more nucleotides of the target sequence (e.g., about or more than about 1, 5, 10, 15, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 60, 70, 80, 90, 100 or more nucleotides). In certain embodiments, when the template sequence and the polynucleotide containing the target sequence are optimally aligned, the closest nucleotide of the template polynucleotide is within about 1, 5, 10, 15, 20, 25, 50, 75, 100, 200, 300, 400 , 500, 1000, 5000, 10000 or more nucleotides from the target sequence. Non-limiting examples of site-specific nucleases useful in homologous recombination methods include zinc finger nucleases, CRISPR nucleases, TALE nucleases, and meganuclease. For further description of the use of such nucleases, see, for example, US 8795965 and US 20140301990.
[0163] Для получения генетических вариаций можно использовать мутагены, посредством которых преимущественно получают точечные мутации и короткие делеции, вставки, трансверсии и/или транзиции, включая химические мутагены или облучение. В качестве неограничивающих примеров мутагены включают этилметансульфонат, метилметансульфонат, N-этил-N-нитрозомочевину, триэтилмеламин, N-метил-N-нитрозомочевину, прокарбазин, хлорамбуцил, циклофосфамид, диэтилсульфат, мономерный акриламид, мелфалан, азотистый иприт, винкристин, диметилнитрозамин, N-метил-N'-нитронитрозогуанидин, нитрозогуанидин, 2-аминопурин, 7,12-диметилбенз(a)антрацен, этиленоксид, гексаметилфосфамид, бисульфан, диэпоксиалканы (диэпоксиоктан, диэпоксибутан и т.п.), дигидрохлорид 2-метокси-6-хлор-9[3-(этил-2-хлорэтил)аминопропиламино]акридина и формальдегид.[0163] To obtain genetic variations, mutagens can be used, by which point mutations and short deletions, insertions, transversions and/or transitions are predominantly obtained, including chemical mutagens or irradiation. As non-limiting examples, mutagens include ethyl methanesulfonate, methyl methanesulfonate, N-ethyl-N-nitrosourea, triethylmelamine, N-methyl-N-nitrosourea, procarbazine, chlorambucil, cyclophosphamide, diethyl sulfate, monomeric acrylamide, melphalan, nitrogen mustard, vincristine, dimethylnitrosamine, N- methyl-N'-nitronitrosoguanidine, nitrosoguanidine, 2-aminopurine, 7,12-dimethylbenz(a)anthracene, ethylene oxide, hexamethylphosphamide, bisulfan, diepoxyalkanes (diepoxyoctane, diepoxybutane, etc.), 2-methoxy-6-chloro-dihydrochloride 9[3-(ethyl-2-chloroethyl)aminopropylamino]acridine and formaldehyde.
[0164] Внесение генетической вариации может представлять собой незавершенный процесс так, что определенные бактерии в обрабатываемой популяции бактерий несут требуемую мутацию, тогда как другие нет. В определенных случаях для обогащения бактериями, несущими требуемую генетическую вариацию необходимо применять селекционное давление. Как правило, отбор успешных генетических вариантов включает отбор по или против определенной функциональности, придаваемой или устраняемой генетической вариацией, так как в случае вставки гена устойчивости к антибиотикам или устранения метаболической активности, обеспечивающей возможность преобразования нелетального соединения в летальный метаболит. Также селекционное давление можно применять на основе самой полинуклеотидной последовательности так, что необходимо внести только требуемую генетическую вариацию (например, также без необходимости селективного маркера). В этом случае, селекционное давление может включать расщепление геномов без генетической вариации, вносимой в участок-мишень так, что отбор эффективно направлен против эталонной последовательности в которую необходимо внести генетическую вариацию. Как правило, расщепление происходит в пределах 100 нуклеотидов от участка-мишени (например, в пределах 75, 50, 25, 10 или менее нуклеотидов от участка-мишени, включая расщепление в участке-мишени или в его пределах). Расщепление может направлять сайт-специфическая нуклеаза, выбранная из группы, состоящей из нуклеазы с цинковыми пальцами, нуклеазы CRISPR, нуклеазы TALE (TALEN) или мегануклеазы. Такой процесс аналогичен процессам увеличения гомологичной рекомбинации в участке-мишени, за исключением того, что не предоставлена матрица для гомологичной рекомбинации. В результате в бактериях без требуемой генетической вариации с большей вероятностью проходит расщепление, которое в отсутствии восстановления приводит к гибели клеток. Затем бактерии, выжившие в отборе, можно выделять для применения в воздействии на растения для оценки придаваемого улучшенного признака.[0164] The introduction of genetic variation may be a work in progress such that certain bacteria in the treated bacterial population carry the desired mutation while others do not. In certain cases, selection pressure must be applied to enrich for bacteria carrying the desired genetic variation. Generally, the selection of successful genetic variants involves selection for or against a particular functionality conferred or eliminated by the genetic variation, such as insertion of an antibiotic resistance gene or removal of a metabolic activity allowing the conversion of a non-lethal compound to a lethal metabolite. Also, selection pressure can be applied on the basis of the polynucleotide sequence itself, such that only the desired genetic variation needs to be introduced (eg also without the need for a selectable marker). In this case, the selection pressure may include segregation of genomes with no genetic variation introduced into the target region, such that selection is effectively directed against the reference sequence into which the genetic variation is to be introduced. Typically, cleavage occurs within 100 nucleotides of the target site (eg, within 75, 50, 25, 10 or less nucleotides of the target site, including cleavage at or within the target site). Cleavage can be directed by a site-specific nuclease selected from the group consisting of zinc finger nuclease, CRISPR nuclease, TALE nuclease (TALEN), or meganuclease. Such a process is similar to the processes for increasing homologous recombination at the target site, except that no template for homologous recombination is provided. As a result, bacteria without the required genetic variation are more likely to undergo cleavage, which in the absence of repair leads to cell death. The bacteria surviving the selection can then be isolated for use in plant treatment to evaluate the improved trait imparted.
[0165] Для направления расщепления в участке-мишени можно использовать нуклеазу CRISPR. Используя Cas9 для уничтожения немутантных клеток, можно обеспечивать улучшенный отбор мутантных микроорганизмов. Затем растениям инокулируют мутантные микроорганизмы для подтверждения симбиоза и обеспечения эволюционного давления с отбором эффективных симбионтов. Затем микроорганизмы можно повторно выделять из тканей растений. В системах с нуклеазами CRISPR, применяемых для отбора относительно отсутствия вариантов, можно использовать элементы, сходные с описанными выше в отношении внесения генетических вариаций элементами, за исключением того, что не предоставляют матрицу для гомологичной рекомбинации. Таким образом, расщепление, направленное на участок-мишень увеличивает гибель подвергшихся ему клеток.[0165] CRISPR nuclease can be used to direct the cleavage at the target site. By using Cas9 to kill wild-type cells, improved selection of mutant microorganisms can be achieved. The plants are then inoculated with mutant microorganisms to confirm the symbiosis and provide evolutionary pressure to select effective symbionts. The microorganisms can then be re-isolated from plant tissues. In systems with CRISPR nucleases used to select for the absence of variants, elements similar to those described above regarding the introduction of genetic variation elements can be used, except that they do not provide a template for homologous recombination. Thus, cleavage directed to the target site increases the death of exposed cells.
[0166] Доступны другие варианты специфически индуцируемого расщепления в участке-мишени, такие как нуклеазы с цинковыми пальцами, системы нуклеазы TALE (TALEN) и мегануклеаза. Нуклеазы с цинковыми пальцами (ZFN) представляют собой искусственные эндонуклеазы ДНК, получаемые посредством слияния связывающего ДНК домена цинковых пальцев с доменом расщепления ДНК. ZFN можно конструировать для расщепления требуемых последовательностей ДНК и это позволяет нуклеазам с цинковыми пальцами расщеплять уникальные последовательности-мишени. При введении в клетку ZFN можно использовать для редактирования ДНК-мишени в клетке (например, генома клетки) посредством индукции двухцепочечных разрывов. Подобные активаторам транскрипции эффекторные нуклеазы (TALEN) представляют собой искусственные эндонуклеазы ДНК, получаемые посредством слияния эффекторного ДНК-связывающего домена TAL (подобного активаторам транскрипции) с доменом расщепления ДНК. TALEN можно быстро конструировать для связывания практически любой требуемой последовательности ДНК и при введении в клетку, TALEN можно использовать для редактирования ДНК-мишени в клетке (например, генома клетки) посредством внесения двухцепочечных разрывов. Мегануклеазы (хоминг-эндонуклеаза) представляют собой эндодезоксирибонуклеазы, характеризууемые большим участком распознавания (двухцепочечных последовательностей ДНК длиной от 12 до 40 пар оснований). Мегануклеазы можно использовать для замещения, удаления или модификации последовательностей узконаправленным способом. Модифицируя узнаваемые ими последовательности посредством белковой инженерии, можно изменять последовательность-мишень. Мегануклеазы можно использовать для модификации всех типов геномов, бактерий, растений или животных и, как правило, их группируют в четыре семейства: семейство LAGLIDADG (SEQ ID NO:1), семейство GIY-YIG, семейство His-Cyst box и семейство HNH. Иллюстративные хоминг-эндонуклеазы включают I-SceI, I-CeuI, PI-PspI, PI-Sce, I-SceIV, I-CsmI, I-PanI, I-SceII, I-PpoI, I-SceIII, I-CreI, I-TevI, I-TevII и I-TevIII.[0166] Other variants of specifically induced cleavage at the target site are available, such as zinc finger nucleases, TALE nuclease (TALEN) systems, and meganuclease. Zinc finger nucleases (ZFNs) are artificial DNA endonucleases obtained by fusing the DNA-binding domain of zinc fingers with a DNA cleavage domain. ZFNs can be designed to cleave desired DNA sequences and this allows zinc finger nucleases to cleave unique target sequences. When introduced into a cell, ZFN can be used to edit a target DNA in the cell (eg, the cell's genome) by inducing double-strand breaks. Transcription activator-like effector nucleases (TALEN) are artificial DNA endonucleases obtained by fusion of the TAL effector DNA-binding domain (like transcription activators) with a DNA cleavage domain. TALEN can be quickly designed to bind virtually any desired DNA sequence, and when introduced into a cell, TALEN can be used to edit a target DNA in a cell (eg, the cell's genome) by introducing double-strand breaks. Meganucleases (homing endonuclease) are endodeoxyribonucleases characterized by a large recognition site (double-stranded DNA sequences from 12 to 40 base pairs in length). Meganucleases can be used to replace, delete or modify sequences in a narrow manner. By modifying the sequences they recognize through protein engineering, the target sequence can be changed. Meganucleases can be used to modify all types of genomes, bacteria, plants or animals, and are generally grouped into four families: the LAGLIDADG family (SEQ ID NO:1) , the GIY-YIG family, the His-Cyst box family, and the HNH family. Exemplary homing endonucleases include I-SceI, I-CeuI, PI-PspI, PI-Sce, I-SceIV, I-CsmI, I-PanI, I-SceII, I-PpoI, I-SceIII, I-CreI, I -TevI, I-TevII and I-TevIII.
Генетическая вариация - Способы идентификацииGenetic Variation - Methods of Identification
[0167] Микроорганизмы по настоящему изобретению можно идентифицировать по одной или нескольким генетическим модификациям или альтерациям, которые внесены в указанный микроорганизм. Одним из способов, которым можно идентифицировать указанные генетические модификацию или альтерацию, является сравнение с SEQ ID NO, которая содержит часть геномной последовательности микроорганизма, достаточную для идентификации генетической модификации или альтерации.[0167] The microorganisms of the present invention can be identified by one or more genetic modifications or alterations that are made in the specified microorganism. One way in which said genetic modification or alteration can be identified is by comparison with SEQ ID NO, which contains a portion of the microorganism's genomic sequence sufficient to identify the genetic modification or alteration.
[0168] Кроме того, в случае микроорганизмов, которые не должны нести генетических модификаций или альтераций (например, дикого типа), вносимых в их геномы, по описанию можно использовать последовательности нуклеиновых кислот 16S для идентификации указанных микроорганизмов. Последовательность нуклеиновой кислоты 16S представляет собой пример "молекулярного маркера" или "генетического маркера", который обозначает индикатор, который используют в способах визуализации различий характеристик последовательностей нуклеиновых кислот. Примерами других таких индикаторов являются метки полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ), метки полиморфизма длин амплифицированных фрагментов (AFLP), однонуклеотидные полиморфизмы (SNP), мутации вставок, микросателлитные метки (SSR), характеризуемые последовательностями амплифицированные области (SCAR), метки рестрикционных полиморфизмов амплифицированных последовательностей (CAPS) или метки изоферментов или комбинации меток, описываемых в настоящем разделе, что определяет конкретное генетическое и хромосомное положение. Метки дополнительно включают полинуклеотидные последовательности, кодирующие 16S или 18S рРНК, и внутренние транскрибируемые спейсерные (ITS) последовательности, которые представляют собой последовательности, находящиеся между генами малой субъединицы и большой субъединицы рРНК, которые оказались особенно пригодными при определении сходства или различий при сравнении друг с другом. Кроме того, для идентификации микроорганизмов, описываемых в настоящем документе, по описанию использованы уникальные последовательности, выявленные в представляющих интерес генах (например, nif H,D,K,L,A, glnE, amtB и т.д.).[0168] In addition, in the case of microorganisms that should not carry genetic modifications or alterations (eg, wild type) introduced into their genomes, 16S nucleic acid sequences can be used as described to identify these microorganisms. The 16S nucleic acid sequence is an example of a "molecular marker" or "genetic marker" which is an indicator that is used in methods for visualizing differences in characteristics of nucleic acid sequences. Examples of other such indicators are restriction fragment length polymorphism (RFLP) marks, amplified fragment length polymorphism (AFLP) marks, single nucleotide polymorphisms (SNPs), insertion mutations, microsatellite marks (SSR), sequence-characterized amplified regions (SCAR), amplified restriction polymorphism marks sequences (CAPS) or isoenzyme labels or combinations of labels described in this section that define a particular genetic and chromosomal position. The tags further include polynucleotide sequences encoding 16S or 18S rRNA and internal transcribed spacer (ITS) sequences, which are sequences between the small subunit and large subunit rRNA genes, which have proven to be particularly useful in determining similarities or differences when compared to each other. . In addition, unique sequences found in genes of interest (eg, nif H,D,K,L,A, glnE, amtB, etc.) are used as described to identify the microorganisms described herein.
[0169] Первичная структура большой субъединицы рРНК 16S содержит конкретную комбинацию консервативных, вариабельных и гипервариабельных областей, которые эволюционируют с разными скоростями и позволяют различать как очень древние линии, такие как домены, так и более современные линии, такие как роды. Вторичная структура субъединицы 16S содержит приблизительно 50 спиралей, что приводит к спариванию оснований приблизительно 67% остатков. Эти высококонсервативные вторичные структурные признаки имеют большую функциональную важность, и их можно использовать для обеспечения позиционной гомологии при множественном выравнивании последовательностей и филогенетическом анализе. За последние несколько десятилетий ген 16S рРНК стал наиболее секвенированным таксономическим маркером, и он является краеугольным камнем современной систематической классификации бактерий и архей. (Yarza et al. 2014. Nature Rev. Micro. 12:635-45).[0169] The primary structure of the 16S rRNA large subunit contains a specific combination of conserved, variable, and hypervariable regions that evolve at different rates and allow discrimination between very ancient lineages, such as domains, and more recent lineages, such as genera. The secondary structure of the 16S subunit contains approximately 50 helices, resulting in base pairing of approximately 67% of the residues. These highly conserved secondary structural features are of great functional importance and can be used to provide positional homology in multiple sequence alignments and phylogenetic analyses. Over the past few decades, the 16S rRNA gene has become the most sequenced taxonomic marker, and it is the cornerstone of the modern systematic classification of bacteria and archaea. (Yarza et al. 2014. Nature Rev. Micro. 12:635-45).
[0170] Таким образом, В определенных аспектах по описанию предусмотрена последовательность, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична по последовательности с любой последовательностью в таблицах E, F, G или H.[0170] Thus, In certain aspects, the description provides a sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96% , 97%, 98%, 99%, or 100% identical in sequence to any sequence in tables E , F , G , or H.
[0171] Таким образом, В определенных аспектах по описанию предусмотрен микроорганизм, который содержит последовательность, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична по последовательности с SEQ ID NO: 62-303. Эти последовательности и ассоциированные с ними описания можно найти в таблицах F, G и H.[0171] Thus, In certain aspects, the description provides a microorganism that contains a sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78% , 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% sequence identical to SEQ ID NO: 62-303. These sequences and their associated descriptions can be found in Tables F , G , and H.
[0172] В определенных аспектах по описанию предусмотрен микроорганизм, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты 16S, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична по последовательности с SEQ ID NO: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269, 277-283. Эти последовательности и ассоциированные с ними описания можно найти в таблицах G и H.[0172] In certain aspects, the description provides a microorganism that contains a 16S nucleic acid sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78% , 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical in sequence to SEQ ID NOs: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269, 277-283. These sequences and their associated descriptions can be found in Tables G and H.
[0173] В определенных аспектах по описанию предусмотрен микроорганизм, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична по последовательности с SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276, 284-295. Эти последовательности и ассоциированные с ними описания можно найти в таблицах G и H.[0173] In certain aspects, the description provides a microorganism that contains a nucleic acid sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95% , 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identical in sequence to SEQ ID NOs: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166 , 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276, 284-295. These sequences and their associated descriptions can be found in Tables G and H.
[0174] В определенных аспектах по описанию предусмотрен микроорганизм, который содержит последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична по последовательности с SEQ ID NO: 177-260, 296-303. Эти последовательности и ассоциированные с ними описания можно найти в таблицах G и H.[0174] In certain aspects, the description provides a microorganism that contains a nucleic acid sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95% , 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% sequence identical to SEQ ID NOs: 177-260, 296-303. These sequences and their associated descriptions can be found in Tables G and H.
[0175] В определенных аспектах по описанию предусмотрен микроорганизм, или праймер, или зонд, или последовательность с неприродным соединением, которые содержат, последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична по последовательности с SEQ ID NO: 304-424. Эти последовательности и ассоциированные с ними описания можно найти в таблице E.[0175] In certain aspects, the description provides a microorganism, or a primer, or a probe, or a sequence with a non-natural compound that contains, a nucleic acid sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74% , 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91 %, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% sequence identical to SEQ ID NO: 304-424. These sequences and their associated descriptions can be found in Table E.
[0176] В определенных аспектах по описанию предусмотрен микроорганизм, который содержит последовательность с неприродным соединением, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична последовательности с SEQ ID NO: 372-405. Эти последовательности и ассоциированные с ними описания можно найти в таблице E.[0176] In certain aspects, the description provides a microorganism that contains a sequence with a non-natural compound that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78% , 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the sequence with SEQ ID NO: 372-405. These sequences and their associated descriptions can be found in Table E.
[0177] В определенных аспектах по описанию предусмотрен микроорганизм, который содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична по последовательности с SEQ ID NO: 77, 78, 81, 82 или 83. Эти последовательности и ассоциированные с ними описания можно найти в таблицах F и H.[0177] In certain aspects, the description provides a microorganism that contains an amino acid sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79 %, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% sequence identical to SEQ ID NO: 77, 78, 81, 82, or 83. These sequences and their associated descriptions can be found in Tables F and H.
Генетическая вариация - Способы детекции: праймеры, зонды и анализыGenetic variation - Detection methods: primers, probes and assays
[0178] В настоящем описании указаны праймеры, зонды и анализы, которые пригодны для детекции микроорганизмов, исследуемых в настоящем документе. В определенных аспектах по описанию предусмотрены способы детекции родительских штаммов дикого типа. В других аспектах по описанию предусмотрены способы детекции не являющихся межродовыми подвергнутых генетической инженерии микроорганизмов, полученных из штаммов дикого типа. В определенных аспектах настоящее изобретение относится к способам идентификации не являющихся межродовыми генетических альтераций в микроорганизме.[0178] In the present description, primers, probes and assays are indicated that are suitable for the detection of microorganisms investigated in this document. In certain aspects, the disclosure provides methods for detecting parental wild-type strains. In other aspects, the disclosure provides methods for detecting non-intergeneric genetically engineered microorganisms derived from wild-type strains. In certain aspects, the present invention relates to methods for identifying non-intergeneric genetic alterations in a microorganism.
[0179] В определенных аспектах геноинженерные способы по настоящему изобретению приводят к получению в не являющихся межродовыми микроорганизмах последовательностей с неприродным "соединением" нуклеотидов. Эти неприродные соединения нуклеотидов можно использовать в качестве разновидности диагностики, что является показателем присутствия в микроорганизме, исследуемом в настоящем документе, конкретной генетической альтерации.[0179] In certain aspects, the genetic engineering methods of the present invention result in sequences with non-natural "connection" of nucleotides in non-intergeneric microorganisms. These non-natural nucleotide compounds can be used as a form of diagnosis that is indicative of the presence of a specific genetic alteration in the microorganism investigated herein.
[0180] Способами по настоящему изобретению можно детектировать эти неприродные соединения нуклеотидов посредством использования специализированных способов количественной ПЦР, включая уникальным образом сконструированные праймеры и зонды. В определенных аспектах зонды по изобретению связываются с последовательностями с неприродным соединением нуклеотидов. В определенных аспектах используют традиционную ПЦР. В других аспектах используют ПЦР с детекцией в реальном времени. В определенных аспектах используют количественную ПЦР (кПЦР).[0180] The methods of the present invention can detect these non-natural nucleotide compounds using specialized quantitative PCR methods, including uniquely designed primers and probes. In certain aspects, the probes of the invention bind to non-naturally coupled sequences. In certain aspects, conventional PCR is used. In other aspects, real-time detection PCR is used. In certain aspects, quantitative PCR (qPCR) is used.
[0181] Таким образом, описание может включать использование двух общих способов детекции продуктов ПЦР с детекцией в реальном времени: (1) неспецифические флуоресцентные красители, которые интеркалируют любую двухцепочечную ДНК, и (2) специфичные для последовательности зонды ДНК, состоящие из олигонуклеотидов, меченных флуоресцентным репортером, который обеспечивает детекцию только после гибридизации зонда с его комплементарной последовательностью. В определенных аспектах посредством указанных праймеров можно амплифицировать и, таким образом, можно детектировать посредством неспецифического красителя или посредством использования специфического зонда для гибридизации, только неприродное соединение нуклеотидов. В других аспектах праймеры по изобретению выбирают так, что праймеры фланкируют любую из сторон последовательности с соединением так, что если реакция амплификации происходит, то присутствует указанная последовательность с соединением.[0181] Thus, the description may include the use of two general methods for detecting real-time PCR products: (1) non-specific fluorescent dyes that intercalate any double-stranded DNA, and (2) sequence-specific DNA probes consisting of oligonucleotides labeled a fluorescent reporter that provides detection only after hybridization of the probe with its complementary sequence. In certain aspects, only a non-natural nucleotide compound can be amplified by said primers, and thus can be detected by a non-specific dye or by using a specific hybridization probe. In other aspects, the primers of the invention are chosen such that the primers flank either side of the sequence with the compound so that if an amplification reaction occurs, then the specified sequence is present with the compound.
[0182] Аспекты по изобретению включают сами молекулы с последовательностями с неприродным соединением нуклеотидов, вместе с другими нуклеотидными молекулами, которые способны к связыванию с указанными последовательностями с неприродным соединением нуклеотидов в условиях гибридизации от умеренных до строгих. В определенных аспектах молекулы нуклеотидов, которые способны к связыванию с указанными последовательностями с неприродным соединением нуклеотидов в условиях от умеренных до строгих, обозначают как "нуклеотидные зонды".[0182] Aspects of the invention include non-natural nucleotide pairing sequence molecules themselves, together with other nucleotide molecules that are capable of binding to said non-natural nucleotide pairing sequences under moderate to stringent hybridization conditions. In certain aspects, nucleotide molecules that are capable of binding to said sequences with unnatural nucleotide bonding under moderate to stringent conditions are referred to as "nucleotide probes".
[0183] В определенных аспектах геномную ДНК можно выделять из образцов и использовать для количественного определения присутствия микроорганизмов по изобретению с использованием кПЦР. Праймеры, используемые в реакции кПЦР, могут представлять собой праймеры, сконструированные посредством Primer Blast (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/) для амплификации уникальных областей генома дикого типа или уникальных областей подвергнутых генетической инженерии не являющихся межродовыми мутантных штаммов. Реакцию кПЦР можно проводить с использованием набора SYBR GreenER qPCR SuperMix Universal (Thermo Fisher P/N 11762100) с использованием только прямого и обратного праймеров для амплификации; альтернативно, можно использовать Kapa Probe Force kit (Kapa Biosystems P/N KK4301) с праймерами для амплификации и зондом TaqMan, содержащим метку красителя FAM на 5'-конце, внутренний гаситель ZEN, и связывающим малую бороздку средством и флуоресцентным гасителем на 3'-конец (Integrated DNA Technologies).[0183] In certain aspects, genomic DNA can be isolated from samples and used to quantify the presence of microorganisms of the invention using qPCR. The primers used in the qPCR reaction can be primers designed with Primer Blast (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/) to amplify unique regions of the wild-type genome or unique regions that have been genetically modified. engineering of non-intergeneric mutant strains. The qPCR reaction can be performed using the SYBR GreenER qPCR SuperMix Universal kit (Thermo Fisher P/N 11762100) using only forward and reverse amplification primers; alternatively, the Kapa Probe Force kit (Kapa Biosystems P/N KK4301) can be used with amplification primers and a TaqMan probe containing a FAM dye tag at the 5' end, an internal ZEN quencher, and a minor groove binder and a fluorescent quencher at the 3' end. end (Integrated DNA Technologies).
[0184] Определенные последовательности праймеров, зондов и последовательности с неприродными соединениями приведены в таблице E. Эффективность реакции кПЦР можно определять с использованием стандартной кривой, получаемой на основе известного количества гДНК из генома-мишени. Данные можно нормализовать на количество копий генома на г сырой массы с использованием массы ткани и объема выделения.[0184] Certain sequences of primers, probes, and sequences with non-natural compounds are shown in Table E. The efficiency of the qPCR reaction can be determined using a standard curve derived from a known amount of gDNA from the target genome. The data can be normalized to the number of copies of the genome per g wet weight using tissue weight and isolation volume.
[0185] Количественная полимеразная цепная реакция (кПЦР) представляет собой способ количественной, с детекцией в реальном времени, амплификации одной или нескольких последовательностей нуклеиновых кислот. Количественное определение в реальном времени в анализе ПЦР обеспечивает определение количества нуклеиновых кислот, получаемых на этапах амплификации ПЦР, сравнивая амплификацию представляющих интерес нуклеиновых кислот и соответствующей контрольной последовательности нуклеиновой кислоты, которая может действовать в качестве калибровочного стандарта.[0185] Quantitative polymerase chain reaction (qPCR) is a method for quantitative, with real-time detection, amplification of one or more nucleic acid sequences. Real-time quantification in the PCR assay provides quantification of nucleic acids produced by the PCR amplification steps by comparing the amplification of the nucleic acids of interest and a corresponding control nucleic acid sequence that can act as a calibration standard.
[0186] Часто в анализах кПЦР используют зонды TaqMan, которые для количественного определения последовательностей-мишеней нуклеиновых кислот требуют увеличенной специфичности. Зонды TaqMan содержат олигонуклеотидный зонд с флуорофором, связанным с 5'-концом и гасителем связанным с 3'-концом зонда. Когда зонды TaqMan остаются как есть, с 5' и 3'-концами зонда в тесном контакте друг с другом, гаситель предотвращает передачу флуоресцентного сигнала с флуорофора. Зонды TaqMan сконструированы для отжига в области нуклеиновой кислоты, амплифицируемой посредством конкретного набора праймеров. Так как полимераза Taq продлевает праймер и синтезирует формируемую цепь, 5'-3' экзонуклеазная активность Taq полимеразы разрушает зонд, который отжегся с матрицей. Это разрушение зонда высвобождает флуорофор, таким образом, нарушая тесный контакт с гасителем и обеспечивая флуоресценцию флуорофора. Флуоресценция, детектируемая при анализе кПЦР, прямо пропорциональна высвобождаемому флуорофору и количеству матрицы ДНК присутствующей в реакции.[0186] TaqMan probes are often used in qPCR assays, which require increased specificity to quantify target nucleic acid sequences. TaqMan probes contain an oligonucleotide probe with a fluorophore attached to the 5' end and a quencher attached to the 3' end of the probe. When the TaqMan probes are left as is, with the 5' and 3' ends of the probe in close contact with each other, the quencher prevents transmission of the fluorescent signal from the fluorophore. TaqMan probes are designed to anneal to the region of the nucleic acid amplified with a specific set of primers. Since Taq polymerase extends the primer and synthesizes the nascent chain, the 5'-3' exonuclease activity of Taq polymerase destroys the probe that has annealed to the template. This destruction of the probe releases the fluorophore, thus breaking close contact with the quencher and allowing the fluorophore to fluoresce. The fluorescence detected in the qPCR assay is directly proportional to the fluorophore released and the amount of DNA template present in the reaction.
[0187] Свойства кПЦР позволяют практику исключать трудоемкий этап постамплификации препарата гель-электрофореза, который, как правило, необходим для наблюдения за амплифицированными продуктами традиционных анализов ПЦР. Преимущества кПЦР по сравнению с обычной ПЦР являются значительными и включают увеличенную скорость, простоту использования, воспроизводимость и количественные характеристики.[0187] The properties of qPCR allow the practitioner to eliminate the laborious step of post-amplification of the gel electrophoresis preparation, which is usually necessary to monitor the amplified products of traditional PCR assays. The advantages of qPCR over conventional PCR are significant and include increased speed, ease of use, reproducibility, and quantitation.
Улучшение свойствProperty Improvement
[0188] Способы по настоящему изобретению можно использовать для придания или улучшения одного или нескольких из ряда требуемых признаков. Примеры признаков, которые можно придавать или улучшать, включают: биомассу корня, длину корня, рост, высоту побега, количество листьев, эффективность использования воды, общую биомассу, урожайность, размер плодов, размер семян, уровень фотосинтеза, засухостойкость, жароустойчивость, солеустойчивость, устойчивость к стрессу, вызванному нематодами, устойчивость к грибковому патогену, устойчивость к бактериальному патогену, устойчивость к вирусному патогену, уровень метаболита и экспрессия протеома. Требуемые признаки, включая рост, общую биомассу, биомассу корня и/или побега, пророст семян, жизнеспособность всходов, эффективность фотосинтеза, интенсивность транскрипции, количество или массу семян/плодов, урожай семян или плодов растения, содержание хлорофилла в листьях, скорость фотосинтеза, длина корня или любое их сочетание, можно использовать для определения роста и сравнения со скоростью роста эталонных сельскохозяйственных растений (например, растения без улучшенных признаков), выращиваемых в идентичных условиях.[0188] The methods of the present invention can be used to impart or improve one or more of a number of desired features. Examples of traits that can be given or improved include: root biomass, root length, growth, shoot height, number of leaves, water use efficiency, total biomass, yield, fruit size, seed size, photosynthesis rate, drought tolerance, heat tolerance, salt tolerance, tolerance nematode stress, fungal pathogen resistance, bacterial pathogen resistance, viral pathogen resistance, metabolite level and proteome expression. Required traits including growth, total biomass, root and/or shoot biomass, seed germination, seedling viability, photosynthetic efficiency, transcription rate, seed/fruit number or weight, plant seed or fruit yield, leaf chlorophyll content, photosynthesis rate, length roots, or any combination thereof, can be used to determine growth and compare with the growth rate of reference crop plants (eg, plants without improved traits) grown under identical conditions.
[0189] Предпочтительный придаваемый или улучшаемый признак, как описано в настоящем документе, представляет собой фиксацию азота. В некоторых случаях, растения, получаемые способами, описываемыми в настоящем документе, демонстрируют отличия по признаку, которые представляют собой превышение по меньшей мере приблизительно на 5%, например, по меньшей мере приблизительно на 5%, по меньшей мере приблизительно на 8%, по меньшей мере приблизительно на 10%, по меньшей мере приблизительно на 15%, по меньшей мере приблизительно на 20%, по меньшей мере приблизительно на 25%, по меньшей мере приблизительно на 30%, по меньшей мере приблизительно на 40%, по меньшей мере приблизительно на 50%, по меньшей мере приблизительно на 60%, по меньшей мере приблизительно на 75%, по меньшей мере приблизительно на 80%, по меньшей мере приблизительно на 80%, по меньшей мере приблизительно на 90%, или по меньшей мере на 100%, по меньшей мере приблизительно на 200%, по меньшей мере приблизительно на 300%, по меньшей мере приблизительно на 400% или более по сравнению с эталонным сельскохозяйственным растением, выращиваемым в почве в тех же условиях. В дополнительных примерах растение, получаемое в способах, описываемых в настоящем документе, демонстрирует различия по признаку, которые по меньшей мере приблизительно на 5% больше, например, по меньшей мере приблизительно 5%, по меньшей мере приблизительно 8%, по меньшей мере приблизительно 10%, по меньшей мере приблизительно 15%, по меньшей мере приблизительно 20%, по меньшей мере приблизительно 25%, по меньшей мере приблизительно 30%, по меньшей мере приблизительно 40%, по меньшей мере приблизительно 50%, по меньшей мере приблизительно 60%, по меньшей мере приблизительно 75%, по меньшей мере приблизительно 80%, по меньшей мере приблизительно 80%, по меньшей мере приблизительно 90%, или по меньшей мере 100%, по меньшей мере приблизительно 200%, по меньшей мере приблизительно 300%, по меньшей мере приблизительно 400% или более чем у эталонного сельскохозяйственного растения, выращиваемого в сходных условиях в почве.[0189] The preferred attribute to be imparted or improved, as described herein, is nitrogen fixation. In some instances, plants produced by the methods described herein exhibit trait differences that are at least about 5%, such as at least about 5%, at least about 8%, over at least about 10%, at least about 15%, at least about 20%, at least about 25%, at least about 30%, at least about 40%, at least about 50%, at least about 60%, at least about 75%, at least about 80%, at least about 80%, at least about 90%, or at least 100%, at least about 200%, at least about 300%, at least about 400% or more compared to a reference crop grown in soil under the same conditions. In additional examples, a plant produced by the methods described herein exhibits trait differences that are at least about 5% greater, such as at least about 5%, at least about 8%, at least about 10 %, at least about 15%, at least about 20%, at least about 25%, at least about 30%, at least about 40%, at least about 50%, at least about 60% , at least about 75%, at least about 80%, at least about 80%, at least about 90%, or at least 100%, at least about 200%, at least about 300%, at least about 400% or more than a reference crop grown under similar soil conditions.
[0190] Улучшаемый признак можно оценивать в условиях, включающих воздействие одного или нескольких биотических или абиотических стрессовых факторов. Примеры стрессовых факторов включают абиотические стрессовые воздействия (такие как тепловой стресс, солевой стресс, вызываемый засухой стресс, холодовой стресс и стресс, вызванный недостаточностью питательных веществ) и биотические стрессовые воздействия (такие как стресс, вызываемый нематодами, стресс, вызываемый растительноядными насекомыми, стресс, вызываемый грибковыми патогенами, стресс, вызываемый бактериальными патогенами и стресс, вызываемый вирусными патогенами).[0190] An improved trait can be evaluated under conditions involving exposure to one or more biotic or abiotic stressors. Examples of stressors include abiotic stressors (such as heat stress, salt stress, drought stress, cold stress, and nutrient deficiency stress) and biotic stressors (such as nematode stress, herbivorous insect stress, stress, stress caused by fungal pathogens, stress caused by bacterial pathogens and stress caused by viral pathogens).
[0191] Признак, улучшаемый способами и композициями по настоящему изобретению, может представлять собой фиксацию азота, в том числе и в растении, ранее не способном к фиксации азота. В некоторых случаях бактерии, выделяемые способом, описываемым в настоящем документе, продуцируют 1% или более (например, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 15%, 20% или более) азота растения, что может представлять собой увеличение способности к фиксации азота по меньшей мере в 2 раза (например, в 3 раза, в 4 раза, в 5 раз, в 6 раз, в 7 раз, в 8 раз, в 9 раз, в 10 раз, в 20 раз, в 50 раз, в 100 раз, в 1000 раз или более) по сравнению с бактериями, выделяемыми из первого растения до внесения какой-либо генетической вариации. В некоторых случаях бактерии продуцируют 5% или более азота растения. Желаемого уровня фиксации азота можно достигать после однократного или многократного повторения этапов внесения генетических вариаций, воздействия на множество растений и выделение бактерий из растений с улучшенным признаком (например, 1, 2, 3, 4, 5, 10, 15, 25 или более раз). В некоторых случаях, увеличенных уровней фиксации азота достигают в присутствии удобрения, дополненного глутамином, аммиаком или другим химическим источником азота. Известны способы оценки степени фиксации азота, примеры которых описаны в настоящем документе.[0191] The trait improved by the methods and compositions of the present invention may be nitrogen fixation, including in a plant previously incapable of nitrogen fixation. In some cases, bacteria isolated by the method described herein produce 1% or more (for example, 2%, 3%, 4%, 5%, 6%, 7%, 8%, 9%, 10%, 15% , 20% or more) of plant nitrogen, which may represent an increase in nitrogen fixation capacity of at least 2-fold (e.g., 3-fold, 4-fold, 5-fold, 6-fold, 7-fold, 8-fold , 9-fold, 10-fold, 20-fold, 50-fold, 100-fold, 1000-fold or more) compared to bacteria isolated from the first plant before any genetic variation was introduced. In some cases, the bacteria produce 5% or more of the plant's nitrogen. The desired level of nitrogen fixation can be achieved by repeating the steps of introducing genetic variation, exposing multiple plants, and isolating bacteria from trait-improved plants (e.g., 1, 2, 3, 4, 5, 10, 15, 25 or more times) once or multiple times. . In some cases, increased levels of nitrogen fixation are achieved in the presence of a fertilizer supplemented with glutamine, ammonia, or other chemical nitrogen source. Known methods for assessing the degree of nitrogen fixation, examples of which are described in this document.
[0192] Выведение микроорганизмов представляет собой способ для систематической идентификации и улучшения роли видов в микробиоме сельскохозяйственной культуры. Способ включает три этапа: 1) отбор видов-кандидатов посредством картирования взаимодействий растение-микроорганизм и прогноза регуляторной сети, сцепленной с конкретным фенотипом, 2) практическое и прогнозируемое улучшение фенотипов микроорганизмов посредством внутривидового скрещивания регуляторных сетей и кластеров генов и 3) скрининг и отбор новых генотипов микроорганизмов, которые обеспечивают требуемые фенотипы сельскохозяйственных культур. Для систематического анализа улучшения штаммов получена модель, в которой сцеплена динамика колонизации сообщества микроорганизмов с генетической активностью ключевых видов. Модель используют для прогноза выведения генетических мишеней и увеличения частоты отбора улучшений кодируемых микробиомом свойств агротехнического значения.[0192] Breeding microorganisms is a method for systematically identifying and improving the role of species in the crop microbiome. The method includes three steps: 1) selection of candidate species by mapping plant-microorganism interactions and predicting a regulatory network linked to a particular phenotype, 2) practical and predictable improvement of microorganism phenotypes by intraspecific crossing of regulatory networks and gene clusters, and 3) screening and selection of new genotypes of microorganisms that provide the required phenotypes of crops. For a systematic analysis of the improvement of strains, a model was obtained in which the dynamics of colonization of a community of microorganisms is linked to the genetic activity of key species. The model is used to predict the breeding of genetic targets and to increase the frequency of selection for improvements in microbiome-encoded properties of agricultural value.
Определение азота, доставляемого в значимых с сельскохозяйственной точки зрения полевых условияхDetermination of nitrogen delivered in agriculturally significant field conditions
[0193] В полевых условиях доставляемое количество азота можно определять, как функцию колонизации умноженной на активность.[0193] In the field, the amount of nitrogen delivered can be determined as a function of colonization times activity.
[0194] Приведенное выше уравнение требует (1) средней колонизации на единицу ткани растения и (2) активность в виде количества фиксированного азота или количества аммиака, экскретируемого каждой клеткой микроорганизма. Для преобразования в фунты азота на акр отслеживают физиологию роста кукурузы во времени, например, размер растения и ассоциированной корневой системы на всех стадиях созревания.[0194] The above equation requires (1) average colonization per unit of plant tissue and (2) activity in terms of the amount of fixed nitrogen or the amount of ammonia excreted by each cell of the microorganism. To convert to pounds of nitrogen per acre, the physiology of corn growth over time is tracked, such as plant size and associated root system, at all stages of maturity.
[0195] Фунты азота, доставляемые в сельскохозяйственную культуру на акр/сезон можно рассчитать по следующему уравнению:[0195] The pounds of nitrogen delivered to the crop per acre/season can be calculated using the following equation:
[0196] Ткань растения(t) представляет собой сырую массу ткани растения кукурузы в течение времени роста (t). Значения для обоснованного проведения расчета подробно описаны в публикации под названием Roots, Growth and Nutrient Uptake (Mengel. Dept. of Agronomy Pub.# AGRY-95-08 (Rev. May-95. p. 1-8).[0196] Plant tissue (t) is the wet mass of corn plant tissue during growth time (t). Values for making a reasonable calculation are detailed in Roots, Growth and Nutrient Uptake (Mengel. Dept. of Agronomy Pub. # AGRY-95-08 (Rev. May-95. p. 1-8).
[0197] Колонизация (t) представляет собой количество представляющих интерес микроорганизмов, выявленное в ткани растения на грамм сырой массы ткани растения, в любое конкретное время, t, в течение сезона роста. В случае, когда доступна только одна временная точка, эту одну временную точку нормализуют как пиковый уровень колонизации за сезон, а уровень колонизации в оставшихся временных точках, таким образом, корректируют.[0197] Colonization (t) is the number of microorganisms of interest found in plant tissue per gram wet weight of plant tissue, at any particular time, t, during a growth season. In the case where only one time point is available, that one time point is normalized as the peak colonization rate per season, and the colonization rate at the remaining time points is thus adjusted.
[0198] Активность(t) представляет собой скорость, с которой представляющие интерес микроорганизмы фиксируют N в единицу времени, в любое конкретное время, t, в течение сезона роста. В вариантах осуществления, описываемых в настоящем документе, этот уровень активности аппроксимируют посредством анализа восстановления ацетилена in vitro (ARA) в средах ARA в присутствии 5 мМ глутамина или анализа экскреции аммония в средах ARA media в присутствии 5 мМ ионов аммония.[0198] Activity(t) is the rate at which microorganisms of interest fix N per unit time, at any particular time, t, during a growth season. In the embodiments described herein, this level of activity is approximated by an in vitro acetylene reduction (ARA) assay in ARA media in the presence of 5 mM glutamine or an ammonium excretion assay in ARA media in the presence of 5 mM ammonium ions.
[0199] Затем доставляемое количество азота рассчитывают посредством численного интегрирования указанной выше функции. В случаях, когда значения переменных, описанных выше, дискретно определяют в указанных временных точках, значения между этими временными точками аппроксимируют, проводя линейную интерполяцию.[0199] The delivered amount of nitrogen is then calculated by numerically integrating the above function. In cases where the values of the variables described above are discretely determined at specified time points, the values between these time points are approximated by linear interpolation.
Фиксация азотаNitrogen fixation
[0200] В настоящем документе описаны способы увеличения фиксации азота в растении, включающие воздействие на растение бактериями, несущими одну или несколько генетических вариаций, вводимых в один или несколько генов, регулирующих фиксацию азота, где бактерии продуцируют в растении 1% или более азота (например, 2%, 5%, 10% или более), что может представлять собой по меньшей мере в 2 раза большую способность к фиксации азота по сравнению с растением в отсутствие бактерий. Бактерии могут продуцировать азот в присутствии удобрения, дополненного глутамином, мочевиной, нитратами или аммиаком. Генетические вариации могут представлять собой любые генетические вариации, описываемые в настоящем документе, включая примеры, приводимые выше, в любом количестве и в любой комбинации. Генетическую вариацию можно вносить в ген, выбранный из группы, состоящей из nifA, nifL, ntrB, ntrC, глутаминсинтетазы, glnA, glnB, glnK, draT, amtB, глутаминазу, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB и nifQ. Генетическая вариация может представлять собой мутацию, которая приводит к одному или нескольким из: повышенной экспрессии или активности NifA или глутаминазы; сниженной экспрессии или активности NifL, NtrB, глутаминсинтетазы, GlnB, GlnK, DraT, AmtB; сниженной активности удаления аденилата GlnE или сниженной активности удаления уридилата GlnD. Генетическая вариация, вносимая в одну или несколько бактерий способами, описываемыми в настоящем документе, может представлять собой нокаут-мутацию, или она может удалять регуляторную последовательность гена-мишени, или она может включать вставку гетерологичной регуляторной последовательности, например, вставку регуляторной последовательности, выявленной в геноме бактерий того же вида или рода. Регуляторную последовательность можно выбирать на основе уровня экспрессии гена в культуре бактерий или в ткани растения. Генетическую вариацию можно получать посредством химического мутагенеза. Растения, выращиваемые на этапе (c), можно подвергать воздействию биотических или абиотических стрессовых факторов.[0200] Described herein are methods of increasing nitrogen fixation in a plant, comprising exposing the plant to bacteria carrying one or more genetic variations introduced into one or more genes regulating nitrogen fixation, wherein the bacteria produce 1% or more nitrogen in the plant (e.g. , 2%, 5%, 10% or more), which may represent at least 2 times the nitrogen fixation capacity compared to the plant in the absence of bacteria. Bacteria can produce nitrogen in the presence of a fertilizer supplemented with glutamine, urea, nitrates, or ammonia. Genetic variations can be any of the genetic variations described herein, including the examples above, in any amount and in any combination. Genetic variation can be introduced into a gene selected from the group consisting of nifA, nifL, ntrB, ntrC, glutamine synthetase, glnA, glnB, glnK, draT, amtB, glutaminase, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE , nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, and nifQ. The genetic variation may be a mutation that results in one or more of: increased expression or activity of NifA or glutaminase; reduced expression or activity of NifL, NtrB, glutamine synthetase, GlnB, GlnK, DraT, AmtB; reduced GlnE adenylate scavenging activity; or reduced GlnD uridylate scavenging activity. A genetic variation introduced into one or more bacteria by the methods described herein may be a knockout mutation, or it may remove the regulatory sequence of the target gene, or it may include the insertion of a heterologous regulatory sequence, for example, the insertion of a regulatory sequence identified in bacterial genome of the same species or genus. The regulatory sequence can be selected based on the level of gene expression in the bacterial culture or plant tissue. Genetic variation can be obtained by chemical mutagenesis. Plants grown in step (c) may be subjected to biotic or abiotic stress factors.
[0201] Количественно фиксацию азота, происходящую в растениях, описываемых в настоящем документе, можно измерять различными способами, например, посредством анализа восстановления ацетилена (AR). Анализ восстановления ацетилена можно проводить in vitro или in vivo. Доказательство того, что конкретная бактерия предоставляет растению фиксированный азот, может включать: 1) общий N растения после инокуляции значимо увеличивается, предпочтительно с сопутствующим возрастанием концентрации N в растении; 2) симптомы недостаточности азота в условиях ограничения в N после инокуляции ослабляются (что должно включать возрастание сухой массы); 3) документацию фиксации N2 с использованием подхода с 15N (который может представлять собой эксперименты с разведением изотопа, анализы восстановления 15N2 или анализы распространенности 15N в природе); 4) встраивание фиксированного N в растение белок или метаболит и 5) отсутствие всех этих эффектов у растений без проведенной инокуляции или у растений, инокулированных мутантом инокулируемого штамма.[0201] Nitrogen fixation occurring in the plants described herein can be quantified in various ways, for example, by analyzing acetylene reduction (AR). The acetylene reduction assay can be performed in vitro or in vivo . Evidence that a particular bacterium provides fixed nitrogen to the plant may include: 1) the total N of the plant significantly increases after inoculation, preferably with a concomitant increase in N concentration in the plant; 2) symptoms of nitrogen deficiency under N-limiting conditions improve after inoculation (which should include an increase in dry weight); 3) documentation of N 2 fixation using the 15 N approach (which may be isotope dilution experiments, 15 N 2 recovery assays, or natural 15 N abundance assays); 4) the incorporation of fixed N into the plant protein or metabolite; and 5) the absence of all these effects in plants without inoculation or in plants inoculated with a mutant of the inoculated strain.
[0202] Регуляторный каскад фиксации азота дикого типа можно представить как цифровую логическую схему, где входящие O2 и NH4 + проходят через логический вентиль ИЛИ-НЕ, выход которого в дополнение к АТФ поступает в логический вентиль И. В определенных вариантах осуществления способы, описываемые в настоящем документе, нарушают действие NH4 + на эту схему в нескольких точках регуляторного каскада так, что микроорганизмы могут продуцировать азота даже на удобряемых полях. Однако способы, описываемые в настоящем документе, также предусматривают изменение влияния АТФ или O2 на схему или изменение схемы с использованием других регуляторных каскадов в клетке или изменение генетических схем, отличных от фиксации азота. Можно перестраивать генные кластеры с получением функциональных продуктов под контролем гетерологичной системы регуляции. Удаляя природные регуляторные элементы вне и в кодирующих последовательностях кластеров генов и заменяя их альтернативными системами регуляции, функциональные продукты сложных генетических оперонов и других кластеров генов можно контролировать и/или помещать в гетерологичные клетки, включая клетки других видов, отличных от видов, из которых получены природные гены. После перестройки синтетические кластеры генов можно контролировать посредством генетических схем или других индуцибельных систем регуляции, таким образом, контролируя экспрессию продуктов необходимым образом. Экспрессирующие кассеты можно конструировать так, чтобы они действовали в качестве логических вентилей, генераторов импульсов, осцилляторов, переключателей или устройств памяти. Контролирующую экспрессирующую кассету можно лигировать с промотором так, чтобы экспрессирующая кассета функционировала в качестве датчика состояний окружающей среды, такого как датчик кислорода, температуры, прикосновения, осмотического стресса, поверхностного напряжения или окислительно-восстановительного потенциала.[0202] The wild-type nitrogen fixation regulatory cascade can be thought of as a digital logic circuit where incoming O 2 and NH 4 + are passed through a NOR logic gate whose output, in addition to ATP, goes to an AND logic gate. In certain embodiments, the methods, described here disrupt the action of NH 4 + on this circuit at several points in the regulatory cascade so that microorganisms can produce nitrogen even in fertilized fields. However, the methods described herein also involve altering the effect of ATP or O 2 on the schema, or altering the schema using other regulatory cascades in the cell, or altering genetic circuits other than nitrogen fixation. It is possible to rearrange gene clusters to obtain functional products under the control of a heterologous regulatory system. By removing natural regulatory elements outside and in the coding sequences of gene clusters and replacing them with alternative regulatory systems, the functional products of complex genetic operons and other gene clusters can be controlled and/or placed in heterologous cells, including cells of other species than those from which the natural genes. Once rearranged, the synthetic gene clusters can be controlled by genetic circuits or other inducible regulatory systems, thus controlling the expression of the products as desired. Expression cassettes can be designed to act as logic gates, pulse generators, oscillators, switches, or memory devices. The expression control cassette can be ligated to the promoter such that the expression cassette functions as an environmental sensor such as oxygen, temperature, touch, osmotic stress, surface tension, or redox.
[0203] В качестве примера из кластера генов nif можно удалять гены nifL, nifA, nifT и nifX. Синтетические гены можно конструировать посредством рандомизации кодонов ДНК, кодирующей каждую аминокислотную последовательность. Отбор кодонов проводят, устанавливая, чтобы частота использования кодонов как можно больше отличалась от частоты использования кодонов в природном гене. Предлагаемые последовательности сканируют на наличие любых нежелательных свойств, таких как участки распознавания рестрикционных ферментов, участки распознавания транспозонов, повторяющиеся последовательности, промоторы сигма 54 и сигма 70, скрытые участки связывания рибосом и ро-независимые терминаторы. Синтетические участки связывания рибосом выбирают так, чтобы они соответствовали силе каждого соответствующего природного участка связывания рибосомы, например, конструируя плазмиду с флуоресцентным репортером, в которой 150 п.н., окружающих старт-кодон гена (от -60 до +90) слиты с геном флуоресцентного маркера. Этот химерный ген можно экспрессировать под контролем промотора Ptac, а флуоресценцию измерять посредством проточной цитометрии. Для получения синтетических участков связывания рибосом получают библиотеку репортерных плазмид с использованием 150 п.н. (от -60 до +90) синтетической экспрессирующей кассеты. В кратком изложении синтетическая экспрессирующая кассета может состоять из случайного ДНК-спейсера, вырожденной последовательности, кодирующей библиотеку RBS и кодирующей последовательности каждого синтетического гена. Подвергают скринингу множество клонов для идентификации синтетического участка связывания рибосомы, который наилучшим образом соответствует природному участку связывания рибосомы. Таким образом, конструируют синтетические опероны, которые состоят из таких же генов, что природные опероны, и тестируют на функциональную комплементацию. Дополнительное иллюстративное описание синтетических оперонов приведено в US20140329326.[0203] As an example, the nifL, nifA, nifT, and nifX genes can be deleted from the nif gene cluster. Synthetic genes can be constructed by randomizing the codons of the DNA encoding each amino acid sequence. The selection of codons is carried out by establishing that the frequency of use of codons is as different as possible from the frequency of use of codons in the natural gene. The proposed sequences are scanned for any undesirable features such as restriction enzyme recognition sites, transposon recognition sites, repeat sequences, sigma 54 and
Виды бактерийTypes of bacteria
[0204] Микроорганизмы пригодные в способах и композициях, описываемых в настоящем документе, можно получать из любого источника. В определенных случаях микроорганизмы могут представлять собой бактерии, археи, простейшие или грибы. Микроорганизмы по настоящему описанию могут представлять собой фиксирующие азот микроорганизмы, например, фиксирующие азот бактерии, фиксирующие азот археи, фиксирующие азот грибы, фиксирующие азот дрожжи или фиксирующие азот простейшие. Микроорганизмы, пригодные в способах и композициях, описываемых в настоящем документе, могут представлять формирующие споры микроорганизмы, например, формирующие споры бактерии. В определенных случаях бактерии, пригодные в способах и композициях, описываемых в настоящем документе, могут являться грамположительными бактериями или грамотрицательными бактериями. В определенных случаях бактерии могут представлять собой формирующие эндоспору бактерии Firmicute phylum. В определенных случаях бактерии могут представлять собой диазатроф. В определенных случаях бактерии могут не являться диазатрофом.[0204] Microorganisms useful in the methods and compositions described herein can be obtained from any source. In certain instances, the microorganisms may be bacteria, archaea, protozoa, or fungi. The microorganisms of the present disclosure may be nitrogen-fixing microorganisms, for example, nitrogen-fixing bacteria, nitrogen-fixing archaea, nitrogen-fixing fungi, nitrogen-fixing yeasts, or nitrogen-fixing protozoa. Microorganisms useful in the methods and compositions described herein may be spore-forming microorganisms, eg spore-forming bacteria. In certain instances, bacteria useful in the methods and compositions described herein may be gram positive bacteria or gram negative bacteria. In certain instances, the bacteria may be the endospore-forming bacteria Firmicute phylum . In certain cases, the bacteria may be a diazatroph. In certain cases, bacteria may not be diazotrophic.
[0205] Способы и композиции по настоящему описанию можно использовать с использованием архей, таких как, например, Methanothermobacter thermoautotrophicus.[0205] The methods and compositions of the present disclosure can be used using archaea such as, for example, Methanothermobacter thermoautotrophicus .
[0206] В определенных случаях бактерии, которые могут являться пригодными, в качестве неограничивающих примеров включают Agrobacterium radiobacter, Bacillus acidocaldarius, Bacillus acidoterrestris, Bacillus agri, Bacillus aizawai, Bacillus albolactis, Bacillus alcalophilus, Bacillus alvei, Bacillus aminoglucosidicus, Bacillus aminovorans, Bacillus amylolyticus (также известную как Paenibacillus amylolyticus) Bacillus amyloliquefaciens, Bacillus aneurinolyticus, Bacillus atrophaeus, Bacillus azotoformans, Bacillus badius, Bacillus cereus (synonyms: Bacillus endorhythmos, Bacillus medusa), Bacillus chitinosporus, Bacillus circulans, Bacillus coagulans, Bacillus endoparasiticus Bacillus fastidiosus, Bacillus firmus, Bacillus kurstaki, Bacillus lacticola, Bacillus lactimorbus, Bacillus lactis, Bacillus laterosporus (также известную как Brevibacillus laterosporus), Bacillus lautus, Bacillus lentimorbus, Bacillus lentus, Bacillus licheniformis, Bacillus maroccanus, Bacillus megaterium, Bacillus metiens, Bacillus mycoides, Bacillus natto, Bacillus nematocida, Bacillus nigrificans, Bacillus nigrum, Bacillus pantothenticus, Bacillus popillae, Bacillus psychrosaccharolyticus, Bacillus pumilus, Bacillus siamensis, Bacillus smithii, Bacillus sphaericus, Bacillus subtilis, Bacillus thuringiensis, Bacillus uniflagellatus, Bradyrhizobium japonicum, Brevibacillus brevis Brevibacillus laterosporus (ранее Bacillus laterosporus), Chromobacterium subtsugae, Delftia acidovorans, Lactobacillus acidophilus, Lysobacter antibioticus, Lysobacter enzymogenes, Paenibacillus alvei, Paenibacillus polymyxa, Paenibacillus popilliae (ранее Bacillus popilliae), Pantoea agglomerans, Pasteuria penetrans (ранее Bacillus penetrans), Pasteuria usgae, Pectobacterium carotovorum (ранее Erwinia carotovora), Pseudomonas aeruginosa, Pseudomonas aureofaciens, Pseudomonas cepacia (ранее known as Burkholderia cepacia), Pseudomonas chlororaphis, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas proradix, Pseudomonas putida, Pseudomonas syringae, Serratia entomophila, Serratia marcescens, Streptomyces colombiensis, Streptomyces galbus, Streptomyces goshikiensis, Streptomyces griseoviridis, Streptomyces lavendulae, Streptomyces prasinus, Streptomyces saraceticus, Streptomyces venezuelae, Xanthomonas campestris, Xenorhabdus luminescens, Xenorhabdus nematophila, Rhodococcus globerulus AQ719 (№ доступа NRRL B-21663), вид Bacillus AQ175 (№ доступа ATCC 55608), вид Bacillus AQ 177 (№ доступа ATCC 55609), вид Bacillus (№ доступа ATCC 53522) и штамм вида Streptomyces № доступа NRRL B-30145. В определенных случаях бактерия также может представлять собой Azotobacter chroococcum, Methanosarcina barkeri, Klesiella pneumoniae, Azotobacter vinelandii, Rhodobacter spharoides, Rhodobacter capsulatus, Rhodobcter palustris, Rhodosporillum rubrum, Rhizobium leguminosarum или Rhizobium etli.[0206] In certain instances, bacteria that may be useful include, but are not limited to , Agrobacterium radiobacter , Bacillus acidocaldarius , Bacillus acidoterrestris , Bacillus agri , Bacillus aizawai , Bacillus albolactis , Bacillus alcalophilus , Bacillus alvei , Bacillus aminoglucosidicus , Bacillus a minovorans , Bacillus amylolyticus (also known as Paenibacillus amylolyticus ) Bacillus amyloliquefaciens , Bacillus aneurinolyticus , Bacillus atrophaeus , Bacillus azotoformans , Bacillus badius , Bacillus cereus (synonyms: Bacillus endorhythmos , Bacillus medusa ), Bacillus chitinosporus , Bacillus circulans , Bac illus coagulans , Bacillus endoparasiticus Bacillus fastidiosus , Bacillus firmus Bacillus kurstaki Bacillus lacticola Bacillus lactimorbus acillus mycoides , Bacillus natto , _ _ _ Bacillus nematocida Bacillus nigrificans Bacillus nigrum Bacillus pantothenticus Bacillus popillae Bacillus psychrosaccharolyticus Bacillus pumilus Bacillus siamensis Bacillus smithii Bacillus sphaericus Bacillus subtilis Bacillus thuringiensis Bacillus uniflag ellatus , Bradyrhizobium japonicum , Brevibacillus brevis Brevibacillus laterosporus (formerly Bacillus laterosporus ), Chromobacterium subtsugae , Delftia acidovorans , Lactobacillus acidophilus , Lysobacter antibioticus , Lysobacter enzymogenes , Paenibacillus alvei , Paenibacillus polymyxa , Paenibacillus popilliae (formerly Bacillus popilliae ), Pantoea agglomerans , Pasteuria penetrans (formerly Bacillus penetrans ), Pasteuria usgae , Pectobacterium carotovorum (formerly Erwinia carotovora ) Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas aureofaciens Pseudomonas cepacia a , Serratia marcescens , Streptomyces colombiensis , Streptomyces galbus , Streptomyces goshikiensis , Streptomyces griseoviridis , Streptomyces lavendulae , Streptomyces prasinus , Streptomyces saraceticus , Streptomyces venezuelae , Xanthomonas campestris , Xenorhabdus luminescens , Xenorhabdus nematophila , Rhodococcus globerulus AQ719 (NRRL accession no. B-21663), species B acillus AQ175 (ATCC Accession No. 55608), species Bacillus AQ 177 ( Accession No. ATCC 55609), Bacillus species (Accession No. ATCC 53522) and Streptomyces species strain Accession No. NRRL B-30145. In certain instances, the bacterium may also be Azotobacter chroococcum , Methanosarcina barkeri , Klesiella pneumoniae , Azotobacter vinelandii , Rhodobacter spharoides , Rhodobacter capsulatus , Rhodobcter palustris , Rhodosporillum rubrum , Rhizobium leguminosarum , or Rhizobium etli .
[0207] В определенных случаях бактерия может представлять собой бактерию вида Clostridium, например, Clostridium pasteurianum, Clostridium beijerinckii, Clostridium perfringens, Clostridium tetani, Clostridium acetobutylicum.[0207] In certain instances, the bacterium may be a Clostridium spp., for example, Clostridium pasteurianum , Clostridium beijerinckii , Clostridium perfringens , Clostridium tetani , Clostridium acetobutylicum .
[0208] В определенных случаях бактерии, используемые в способах и композициях по настоящему изобретению, могут представлять собой цианобактерии. Примеры родов цианобактерий включают Anabaena (например, вид Anagaena PCC7120), Nostoc (например, Nostoc punctiforme) или Synechocystis (например, вид Synechocystis PCC6803).[0208] In certain cases, the bacteria used in the methods and compositions of the present invention may be cyanobacteria. Examples of cyanobacteria genera include Anabaena (eg Anagaena species PCC7120), Nostoc (eg Nostoc punctiforme ) or Synechocystis (eg Synechocystis species PCC6803).
[0209] В определенных случаях бактерии, используемые в способах и композициях по настоящему изобретению, могут принадлежать к таксономической группе Chlorobi, например, Chlorobium tepidum.[0209] In certain cases, the bacteria used in the methods and compositions of the present invention may belong to the Chlorobi taxonomic group, for example, Chlorobium tepidum .
[0210] В определенных случаях микроорганизмы, используемые в способах и композициях по настоящему изобретению, могут содержать ген, гомологичный известному гену NifH. Последовательности известных генов NifH можно найти, например, в базе данных лаборатории Дж. Зера NifH, (https://wwwzehr.pmc.ucsc.edu/nifH_Database_Public/, 4 апреля 2014 года), или базе данных лаборатории Д. Бакли NifH (http://www.css.cornell.edu/faculty/buckley/nifh.htm, и Gaby, John Christian, и Daniel H. Buckley. "A comprehensive aligned nifH gene database: a multipurpose tool for studies of nitrogen-fixing bacteria". Database 2014 (2014): bau001.). В определенных случаях микроорганизмы, используемые в способах и композициях по настоящему изобретению, могут содержать последовательность, которая кодирует полипептид по меньшей мере на 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 96%, 98%, 99% или более 99% идентичный по последовательности с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Дж. Зера, (https://wwwzehr.pmc.ucsc.edu/nifH_Database_Public/, 4 апреля 2014 года). В определенных случаях микроорганизмы, используемые в способах и композициях по настоящему изобретению, могут содержать последовательность, которая кодирует полипептид по меньшей мере на 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 96%, 98%, 99% или более 99% идентичный по последовательности с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Д. Бакли, (Gaby, John Christian, и Daniel H. Buckley. "A comprehensive aligned nifH gene database: a multipurpose tool for studies of nitrogen-fixing bacteria". Database 2014 (2014): bau001.).[0210] In certain cases, the microorganisms used in the methods and compositions of the present invention may contain a gene homologous to a known NifH gene. Sequences of known NifH genes can be found, for example, in the database of J. Zehr's laboratory NifH, (https://wwwzehr.pmc.ucsc.edu/nifH_Database_Public/, April 4, 2014), or the database of D. Buckley's laboratory NifH (http ://www.css.cornell.edu/faculty/buckley/nifh.htm, and Gaby, John Christian, and Daniel H. Buckley "A comprehensive aligned nifH gene database: a multipurpose tool for studies of nitrogen-fixing bacteria" .Database 2014 (2014): bau001.). In certain cases, the microorganisms used in the methods and compositions of the present invention may contain a sequence that encodes a polypeptide for at least 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 96%, 98 %, 99% or more than 99% sequence identical with the sequence from the NifH database of the laboratory of J. Zehr, (https://wwwzehr.pmc.ucsc.edu/nifH_Database_Public/, April 4, 2014). In certain cases, the microorganisms used in the methods and compositions of the present invention may contain a sequence that encodes a polypeptide for at least 60%, 70%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 96%, 98 %, 99% or more 99% sequence identical with the sequence from the NifH database of the laboratory of D. Buckley, (Gaby, John Christian, and Daniel H. Buckley. "A comprehensive aligned nifH gene database: a multipurpose tool for studies of nitrogen- fixing bacteria". Database 2014 (2014): bau001.).
[0211] Микроорганизмы, пригодные в способах и композициях, описываемых в настоящем документе, можно получать посредством выделения микроорганизмов с поверхностей или из тканей природных растений; измельчения семян с выделением микроорганизмов; высаживания семян в различные образцы почв и выделения микроорганизмов из тканей; или инокуляции растений экзогенными микроорганизмами и определения того, какие микроорганизмы обнаруживаются в тканях растений. Неограничивающие примеры тканей растений включают семена, всходы, листья, срезы, растения, луковицы или клубни. В некоторых случаях бактерии выделяют из семян. Параметры обработки образцов могут варьировать для выделения различных типов ассоциированных микроорганизмов, таких как ризосферные микроорганизмы, эпифиты или эндофиты. Вместо начального выделения из первого растения бактерии также можно получать из хранилищ, таких как коллекции природных штаммов. Микроорганизмы можно генотипировать и фенотипировать посредством секвенирование геномов выделенных микроорганизмов; профилирования составов сообществ in planta; характеристики функциональности транскриптомов сообществ или выделенных микроорганизмов; или скрининга свойств микроорганизмов с использованием селективных или фенотипических сред (например, фенотипы с фиксацией азота или растворением фосфатов). Выбранные штаммы или популяции кандидатов можно получать из данных секвенирования; данных фенотипирования; данных о растении (например, данных о геноме, фенотипе и/или урожае); данных о почве (например, pH, содержание N/P/K и/или биотическое сообщество основной почвы) или любой комбинации из них.[0211] Microorganisms useful in the methods and compositions described herein can be obtained by isolating microorganisms from the surfaces or tissues of natural plants; crushing seeds with the release of microorganisms; planting seeds in various soil samples and isolating microorganisms from tissues; or inoculating plants with exogenous microorganisms and determining which microorganisms are found in plant tissues. Non-limiting examples of plant tissues include seeds, shoots, leaves, sections, plants, bulbs, or tubers. In some cases, bacteria are isolated from seeds. Sample processing parameters can be varied to isolate different types of associated microorganisms such as rhizospheric microorganisms, epiphytes or endophytes. Instead of initial isolation from the first plant, the bacteria can also be obtained from repositories such as collections of natural strains. Microorganisms can be genotyped and phenotyped by sequencing the genomes of isolated microorganisms; profiling the composition of communities in planta ; characteristics of the functionality of transcriptomes of communities or isolated microorganisms; or screening for microbial properties using selective or phenotypic media (eg, nitrogen-fixing or phosphate-dissolving phenotypes). Selected strains or candidate populations can be derived from sequencing data; phenotyping data; plant data (eg genome, phenotype and/or yield data); soil data (eg, pH, N/P/K content, and/or biotic community of the base soil), or any combination of these.
[0212] Бактерии и способы получения бактерий, описываемые в настоящем документе, можно применять для бактерий, способных к эффективному самостоятельному размножению на поверхностях листьев, поверхностях корней или внутри тканей растений, не вызывая разрушительной защитной реакции растений, или для бактерий, которые устойчивы к защитным реакциям растений. Бактерии, описываемые в настоящем документе, можно выделять посредством культивирования экстракта ткани растения или смыва поверхности листа в среде без добавления азота. Однако бактерии могут являться некультивируемыми, т.е. об их культивируемости может быть неизвестно, или их может быть трудно культивировать известными в данной области стандартными способами. Бактерии, описываемые в настоящем документе, могут являться эндофитными или эпифитными или бактериями, обитающими в ризосфере растения (ризосферные бактерии). Бактерии, получаемые после однократного или многократного повторения этапов внесения генетической вариации, воздействия на множество растений и выделения бактерий из растений с улучшенным признаком (например, 1, 2, 3, 4, 5, 10, 15, 25 или более раз) могут являться эндофитными, эпифитными или ризосферными. Эндофиты представляют собой организмы, которые проникают внутрь растений, не вызывая симптомов заболеваний или не вызывая формирования симбиотических структур, и представляют собой агротехнический интерес, так как они могут усиливать рост растений и улучшать питание растений (например, посредством фиксации азота). Бактерии могут представлять собой передающиеся с семенами эндофиты. Передающиеся с семенами эндофиты включают бактерии, ассоциированные с семенами трав или других растений или получаемые из них, такие как передающиеся с семенами бактериальные эндофиты, выявляемые в созревших, сухих, неповрежденных (например, без трещин, без видимой грибковой инфекции или без преждевременного пророста) семян. Передающиеся с семенами бактериальные эндофиты могут быть ассоциированы или их можно получать с поверхности семян; альтернативно или кроме того, они могут быть ассоциированы или их можно получать из внутреннего компартмента семян (например, семян со стерилизованной поверхностью). В определенных случаях передающиеся с семенами бактериальные эндофиты способны к репликации в тканях растений, например, внутри семян. В определенных случаях передающиеся с семенами бактериальные эндофиты также способны переживать обезвоживание.[0212] The bacteria and methods for producing bacteria described herein can be used for bacteria that are capable of efficient self-propagation on leaf surfaces, root surfaces, or within plant tissues without inducing a destructive plant defense response, or for bacteria that are resistant to defense plant reactions. The bacteria described herein can be isolated by culturing a plant tissue extract or by washing the leaf surface in a medium without the addition of nitrogen. However, the bacteria may be non-culturable, ie. their culturability may not be known, or they may be difficult to cultivate by standard methods known in the art. The bacteria described herein may be endophytic or epiphytic, or bacteria living in the rhizosphere of a plant (rhizosphere bacteria). Bacteria obtained after repeating the steps of introducing genetic variation, exposing multiple plants, and isolating bacteria from plants with an improved trait (e.g., 1, 2, 3, 4, 5, 10, 15, 25, or more times) may be endophytic , epiphytic or rhizospheric. Endophytes are organisms that enter the interior of plants without causing disease symptoms or causing the formation of symbiotic structures, and are of agronomic interest because they can enhance plant growth and improve plant nutrition (eg, through nitrogen fixation). The bacteria may be seed-borne endophytes. Seed-borne endophytes include bacteria associated with or derived from seeds of grasses or other plants, such as seed-borne bacterial endophytes found in mature, dry, undamaged (e.g., no cracks, no visible fungal infection, or no premature germination) seeds . Seed-borne bacterial endophytes may be associated or obtained from the surface of seeds; alternatively, or in addition, they may be associated or may be obtained from the internal compartment of the seed (eg surface-sterilized seeds). In certain cases, seed-borne bacterial endophytes are able to replicate in plant tissues, for example, within seeds. In certain cases, seed-borne bacterial endophytes are also able to survive dehydration.
[0213] Бактерии, выделяемые способами по изобретению или используемые в способах или композициях по изобретению, могут включать множество бактерий различных таксонов в комбинации. В качестве примера бактерии могут включать Proteobacteria (такие как Pseudomonas, Enterobacter, Stenotrophomonas, Burkholderia, Rhizobium, Herbaspirillum, Pantoea, Serratia, Rahnella, Azospirillum, Azorhizobium, Azotobacter, Duganella, Delftia, Bradyrhizobiun, Sinorhizobium и Halomonas), Firmicutes (такие как Bacillus, Paenibacillus, Lactobacillus, Mycoplasma и Acetabacterium) и Actinobacteria (такие как Streptomyces, Rhodacoccus, Microbacterium и Curtobacterium). Бактерии, используемые в способах и композиции по настоящему описанию, могут включать фиксирующие азот бактериальные консорциумы из двух или более видов. В определенных случаях один или несколько видов бактерий бактериальных консорциумов могут быть способными к фиксации азота. В определенных случаях один или несколько видов бактериальных консорциумов могут облегчать или увеличивать способность других бактерии фиксировать азот. Бактерии, которые фиксируют азот, и бактерии, которые увеличивают способность других бактерий фиксировать азот, могут являться одними и теми же или различными. В определенных примерах штамм бактерий может быть способным фиксировать азот при нахождении в комбинации с другим штаммом бактерий или в определенных бактериальных консорциумах, но могут являться неспособными к фиксации азота в монокультуре. Примеры родов бактерий, которые можно найти в фиксирующих азот бактериальных консорциумам в качестве неограничивающих примеров включают Herbaspirillum, Azospirillum, Enterobacter и Bacillus.[0213] Bacteria isolated by the methods of the invention or used in the methods or compositions of the invention may include a variety of bacteria of different taxa in combination. By way of example, bacteria may include Proteobacteria (such as Pseudomonas, Enterobacter, Stenotrophomonas, Burkholderia, Rhizobium, Herbaspirillum, Pantoea, Serratia, Rahnella, Azospirillum, Azorhizobium, Azotobacter, Duganella, Delftia, Bradyrhizobiun, Sinorhizobium and Halomonas), Firmicutes ( such as bacillus , Paenibacillus, Lactobacillus, Mycoplasma and Acetabacterium) and Actinobacteria (such as Streptomyces, Rhodacoccus, Microbacterium and Curtobacterium) . The bacteria used in the methods and compositions of the present disclosure may include nitrogen-fixing bacterial consortia of two or more species. In certain cases, one or more species of bacteria of bacterial consortia may be capable of nitrogen fixation. In certain cases, one or more types of bacterial consortia can facilitate or increase the ability of other bacteria to fix nitrogen. Bacteria that fix nitrogen and bacteria that increase the ability of other bacteria to fix nitrogen may be the same or different. In certain instances, a bacterial strain may be capable of nitrogen fixation when in combination with another bacterial strain or in certain bacterial consortia, but may be incapable of nitrogen fixation in a monoculture. Examples of bacterial genera that can be found in nitrogen-fixing bacterial consortia include, but are not limited to, Herbaspirillum , Azospirillum , Enterobacter , and Bacillus .
[0214] Бактерии, которые можно получать способами, описываемыми в настоящем документе, включают вид Azotobacter, вид Bradyrhizobium, вид Klebsiella и вид Sinorhizobium. В определенных случаях бактерии можно выбирать из группы, состоящей из: Azotobacter vinelandii, Bradyrhizobium japonicum, Klebsiella pneumoniae и Sinorhizobium meliloti. В определенных случаях бактерии могут представлять собой бактерии рода Enterobacter или Rahnella. В определенных случаях бактерии могут представлять собой бактерии рода Frankia или Clostridium. Примеры бактерий рода Clostridium в качестве неограничивающих примеров включают Clostridium acetobutilicum, Clostridium pasteurianum, Clostridium beijerinckii, Clostridium perfringens и Clostridium tetani. В определенных случаях бактерии могут представлять собой бактерии рода Paenibacillus, например, Paenibacillus azotofixans, Paenibacillus borealis, Paenibacillus durus, Paenibacillus macerans, Paenibacillus polymyxa, Paenibacillus alvei, Paenibacillus amylolyticus, Paenibacillus campinasensis, Paenibacillus chibensis, Paenibacillus glucanolyticus, Paenibacillus illinoisensis, Paenibacillus larvae subsp. Larvae, Paenibacillus larvae subsp. Pulvifaciens, Paenibacillus lautus, Paenibacillus macerans, Paenibacillus macquariensis, Paenibacillus macquariensis, Paenibacillus pabuli, Paenibacillus peoriae или Paenibacillus polymyxa.[0214] Bacteria that can be obtained by the methods described herein include Azotobacter spp ., Bradyrhizobium spp. , Klebsiella spp., and Sinorhizobium spp . In certain cases, the bacteria can be selected from the group consisting of: Azotobacter vinelandii, Bradyrhizobium japonicum, Klebsiella pneumoniae and Sinorhizobium meliloti . In certain instances, the bacteria may be of the genus Enterobacter or Rahnella . In certain instances, the bacteria may be of the genus Frankia or Clostridium . Examples of bacteria of the genus Clostridium include, but are not limited to, Clostridium acetobutilicum , Clostridium pasteurianum , Clostridium beijerinckii , Clostridium perfringens , and Clostridium tetani . In certain cases, the bacteria may be of the genus Paenibacillus , e.g., Paenibacillus azotofixans , Paenibacillus borealis , Paenibacillus durus , Paenibacillus macerans , Paenibacillus polymyxa , Paenibacillus alvei , Paenibacillus amylolyticus , Paenibacillus campinasensis , Paenibacillus chibensis , Pa enibacillus glucanolyticus , Paenibacillus illinoisensis , Paenibacillus larvae subsp. Larvae , Paenibacillus larvae subsp. Pulvifaciens , Paenibacillus lautus , Paenibacillus macerans , Paenibacillus macquariensis , Paenibacillus macquariensis , Paenibacillus pabuli , Paenibacillus peoriae , or Paenibacillus polymyxa .
[0215] В определенных примерах бактерии, выделенные способами по изобретению, могут являться представителями одного или нескольких из следующих таксонов: Achromobacter, Acidithiobacillus, Acidovorax, Acidovoraz, Acinetobacter, Actinoplanes, Adlercreutzia, Aerococcus, Aeromonas, Afipia, Agromyces, Ancylobacter, Arthrobacter, Atopostipes, Azospirillum, Bacillus, Bdellovibrio, Beijerinckia, Bosea, Bradyrhizobium, Brevibacillus, Brevundimonas, Burkholderia, Candidatus Haloredivivus, Caulobacter, Cellulomonas, Cellvibrio, Chryseobacterium, Citrobacter, Clostridium, Coraliomargarita, Corynebacterium, Cupriavidus, Curtobacterium, Curvibacter, Deinococcus, Delftia, Desemzia, Devosia, Dokdonella, Dyella, Enhydrobacter, Enterobacter, Enterococcus, Erwinia, Escherichia, Escherichia/Shigella, Exiguobacterium, Ferroglobus, Filimonas, Finegoldia, Flavisolibacter, Flavobacterium, Frigoribacterium, Gluconacetobacter, Hafnia, Halobaculum, Halomonas, Halosimplex, Herbaspirillum, Hymenobacter, Klebsiella, Kocuria, Kosakonia, Lactobacillus, Leclercia, Lentzea, Luteibacter, Luteimonas, Massilia, Mesorhizobium, Methylobacterium, Microbacterium, Micrococcus, Microvirga, Mycobacterium, Neisseria, Nocardia, Oceanibaculum, Ochrobactrum, Okibacterium, Oligotropha, Oryzihumus, Oxalophagus, Paenibacillus, Panteoa, Pantoea, Pelomonas, Perlucidibaca, Plantibacter, Polynucleobacter, Propionibacterium, Propioniciclava, Pseudoclavibacter, Pseudomonas, Pseudonocardia, Pseudoxanthomonas, Psychrobacter, Rahnella, Ralstonia, Rheinheimera, Rhizobium, Rhodococcus, Rhodopseudomonas, Roseateles, Ruminococcus, Sebaldella, Sediminibacillus, Sediminibacterium, Serratia, Shigella, Shinella, Sinorhizobium, Sinosporangium, Sphingobacterium, Sphingomonas, Sphingopyxis, Sphingosinicella, Staphylococcus, 25 Stenotrophomonas, Strenotrophomonas, Streptococcus, Streptomyces, Stygiolobus, Sulfurisphaera, Tatumella, Tepidimonas, Thermomonas, Thiobacillus, Variovorax, родов WPS-2 неопределенного положения, Xanthomonas и Zimmermannella.[0215] In certain examples, bacteria isolated by the methods of the invention may be members of one or more of the following taxa: Achromobacter , Acidithiobacillus , Acidovorax , Acidovoraz , Acinetobacter , Actinoplanes , Adlercreutzia , Aerococcus , Aeromonas , Afipia , Agromyces , Ancylobacter , Arthrobacter , Atopost ipes , Azospirillum , Bacillus , Bdellovibrio , Beijerinckia , Bosea , Bradyrhizobium , Brevibacillus , Brevundimonas , Burkholderia , Candidatus Haloredivivus , Caulobacter , Cellulomonas , Cellvibrio , Chryseobacterium , Citrobacter , Clostridium , Coraliomargarita , Corynebacterium , Cupriavidus , Curtobacterium , Curvibacter , Deinococcus , Delftia , Desemzia , Devosia , Dokdonella , Dyella , Enhydrobacter , Enterobacter , Enterococcus , Erwinia , Escherichia , Escherichia/Shigella , Exiguobacterium , Ferroglobus , Filimonas , Finegoldia , Flavisolibacter , Flavobacterium , Frigoribacterium , Gluconacetobacter , Hafnia , Halobaculum , Halomonas , Halosimplex , Herbaspirillum , Hymenobacter , Klebsiella , Kocuria , Kosakonia , Lactobacillus , Leclercia , Lentzea , Luteibacter , Luteimonas , Massilia , Mesorhizobium , Methylobacterium , Microbacterium , Micrococcus , Microvirga , Mycobacterium , Neisseria , Nocardia , Oceanibaculum , Ochrobactrum , Okibacterium , Oligotropha , Oryzihumus , Oxalophagus , Paenibacillus , Panteoa , Pantoea , Pelomonas , Perlucidibaca , Plantibacter , Polynucleobacter , Propionibacterium , Propioniciclava , Pseudoclavibacter , Pseudomonas , Pseudonocardia , Pseudoxanthomonas , Psychrobacter , Rahnella , Ralstonia , Rheinheimera , Rhizobium , Rhodococcus , Rhodops eudomonas , Roseateles , Ruminococcus , Sebaldella , Sediminibacillus , Sediminibacterium , Serratia , Shigella , Shinella , Sinorhizobium , Sinosporangium , Sphingobacterium , Sphingomonas , Sphingopyxis , Sphingosinicella , Staphylococcus , 25 Stenotrophomonas , Strenotrophomonas , Streptococcus , Streptomyces , Stygiolobus , Sulfurisphaera , Tatumella , Tepidimonas , Thermomonas , T hiobacillus , Variovorax , genera WPS-2 indeterminate, Xanthomonas and Zimmermannella .
[0216] В определенных случаях используют виды бактерий, выбранные по меньшей мере из одного из следующих родов: Enterobacter, Klebsiella, Kosakonia и Rahnella. В определенных случаях используют комбинацию видов бактерий следующих родов: Enterobacter, Klebsiella, Kosakonia и Rahnella. В определенных случаях используемые виды могут представлять собой один или несколько из: Enterobacter sacchari, Klebsiella variicola, Kosakonia sacchari и Rahnella aquatilis.[0216] In certain instances, bacterial species selected from at least one of the following genera are used: Enterobacter , Klebsiella , Kosakonia , and Rahnella . In certain cases, a combination of bacterial species of the following genera is used: Enterobacter, Klebsiella, Kosakonia and Rahnella . In certain cases, the species used may be one or more of: Enterobacter sacchari , Klebsiella variicola , Kosakonia sacchari and Rahnella aquatilis .
[0217] В определенных случаях грамположительный микроорганизм может содержать нитрогеназную систему с молибденом-железом, содержащую: nifH, nifD, nifK, nifB, nifE, nifN, nifX, hesA, nifV, nifW, nifU, nifS, nifI1 и nifI 2 . В определенных случаях грамположительный микроорганизм может содержать нитрогеназную систему с ванадием, содержащую: vnfDG, vnfK, vnfE, vnfN, vupC, vupB, vupA, vnfV, vnfR1, vnfH, vnfR2, vnfA (регулятор транскрипции). В определенных случаях грамположительный микроорганизм may have an iron-only нитрогеназа система comprising: anfK, anfG, anfD, anfH, anfA (регулятор транскрипции). В определенных случаях грамположительный микроорганизм может содержать нитрогеназную систему, содержащую glnB и glnK (белки, передающие сигнал от азота). Определенные примеры ферментов, вовлеченных в метаболизм азота в грамположительных микроорганизмах включают glnA (глутаминсинтетазу), gdh (глутаминатдегидрогеназу), bdh (3-гидроксибутиратдегидрогеназу), глутаминазу, gltAB/gltB/gltS (глутаминатсинтазу), asnA/asnB (аспартатаммиаклигазу/аспарагинсинтетазу) и ansA/ansZ (аспарагиназу). Определенные примеры белков, вовлеченных в транспорт азота у грамположительных микроорганизмов, включают amtB (транспортер аммония), glnK (регулятор транспорта аммония), glnPHQ/glnQHMP (АТФ-зависимые транспортеры глутамина/глутамината), glnT/alsT/yrbD/yflA (глутаминоподобные протонные совместные переносчики) и gltP/gltT/yhcl/nqt (глутаминоподобные протонные совместные переносчики).[0217] In certain cases, a gram-positive microorganism may contain a molybdenum-iron nitrogenase system containing: nifH , nifD , nifK , nifB , nifE , nifN , nifX , hesA , nifV , nifW , nifU , nifS , nifI1 and nifI 2 . In certain cases, a gram-positive microorganism may contain a vanadium nitrogenase system containing: vnfDG , vnfK , vnfE , vnfN , vupC , vupB , vupA , vnfV , vnfR1 , vnfH , vnfR2 , vnfA (transcriptional regulator). In certain cases, a gram-positive microorganism may have an iron-only nitrogenase system comprising: anfK , anfG , anfD , anfH , anfA (transcriptional regulator). In certain cases, a gram-positive microorganism may contain a nitrogenase system containing glnB and glnK (proteins that transmit a signal from nitrogen). Specific examples of enzymes involved in nitrogen metabolism in Gram-positive microorganisms include glnA (glutamine synthetase), gdh (glutamate dehydrogenase), bdh (3-hydroxybutyrate dehydrogenase), glutaminase, gltAB/gltB/gltS (glutamate synthase), asnA/asnB (aspartate ammine ligase/asparagine synthetase) and ansA /ansZ (asparaginase). Specific examples of proteins involved in nitrogen transport in Gram-positive microorganisms include amtB (ammonium transporter), glnK (ammonium transport regulator), glnPHQ/glnQHMP (ATP-dependent glutamine/glutamate transporters), glnT/alsT/yrbD/yflA (glutamine-like proton transporters) and gltP/gltT/yhcl/nqt (glutamine-like proton co-transporters).
[0218] Примеры грамположительных микроорганизмов, которые могут представлять особый интерес, включают Paenibacillus polymixa, Paenibacillus riograndensis, вид Paenibacillus, вид Frankia, вид Heliobacterium, Heliobacterium chlorum, вид Heliobacillus, вид Heliophilum, вид Heliorestis, Clostridium acetobutylicum, вид Clostridium, Mycobacterium flaum, вид Mycobacterium, вид Arthrobacter, вид Agromyces, Corynebacterium autitrophicum, вид Corynebacterium, вид Micromonspora, вид Propionibacteria, вид Streptomyces и вид Microbacterium.[0218] Examples of Gram-positive microorganisms that may be of particular interest include Paenibacillus polymixa , Paenibacillus riograndensis , Paenibacillus spp., Frankia spp., Heliobacterium spp ., Heliobacterium chlorum , Heliobacillus spp., Heliophilum spp ., Heliorestis spp ., Clostridium acetobutylicum , Clostridium spp ., Mycobact erium flaum , Mycobacterium spp ., Arthrobacter spp ., Agromyces spp. , Corynebacterium autitrophicum , Corynebacterium spp. , Micromonspora spp. , Propionibacteria spp ., Streptomyces spp . and Microbacterium spp .
[0219] Определенные примеры генетических альтераций, которые можно проводить в грамположительных микроорганизмах, включают: делецию glnR с удалением отрицательной регуляции BNF в присутствии азота окружающей среды, вставку различных промоторов непосредственно выше кластера nif с устранением регуляции посредством GlnR в ответ на азот окружающей среды, мутацию glnA со снижением уровня ассимиляции аммония по пути GS-GOGAT, делецию amtB с уменьшением потребления аммоний из среды, мутацию glnA так, что он конститутивно находится в состоянии ингибирования по типу обратной связи (FBI-GS), с уменьшением ассимиляции аммония по пути GS-GOGAT.[0219] Certain examples of genetic alterations that can be carried out in Gram-positive microorganisms include: glnR deletion to deregulate BNF in the presence of environmental nitrogen, insertion of different promoters just upstream of the nif cassette to deregulate GlnR in response to environmental nitrogen, mutation glnA with a decrease in the level of ammonium assimilation along the GS-GOGAT pathway, deletion of amtB with a decrease in ammonium consumption from the environment, mutation of glnA so that it is constitutively in a state of feedback inhibition (FBI-GS), with a decrease in ammonium assimilation along the GS- GOGAT.
[0220] В определенных случаях основным регулятором метаболизма и фиксации N в видах Paenibacillus является glnR. В определенных случаях геном видов Paenibacillus может не содержать ген для продукции glnR. В определенных случаях геном вида Paenibacillus может не содержать ген для продукции glnE или glnD. В определенных случаях геном видов Paenibacillus может содержать ген для продукции glnB или glnK. Например, вид Paenibacillus WLY78 не содержит гена для glnB или его гомолога, выявленного у архебактерии Methanococcus maripaludis, nifI1 и nifI2. В определенных случаях геномы видов Paenibacillus могут варьировать. Например, у Paenibacillus polymixa E681 отсутствуют glnK и gdh, присутствует несколько переносчиков соединений азота, но по-видимому, только amtB находится под контролем GlnR. В другом примере вид Paenibacillus JDR2 содержит glnK, gdh и большинство других центральных генов метаболизма азота, содержит множество менее крупных переносчиков соединений азота, но не содержит glnPHQ под контролем GlnR. Paenibacillus riograndensis SBR5 содержит стандартный оперон glnRA, ген fdx, основной оперон nif, вторичный оперон nif и оперон anf (кодирующий содержащую только железо нитрогеназу). Выше каждого из этих оперонов выявлены предполагаемые участки glnR/tnrA. GlnR может регулировать все указанные выше опероны, за исключением оперона anf. GlnR может связываться с каждой из этих регуляторных последовательностей в виде димера.[0220] In certain cases, glnR is the main regulator of N metabolism and fixation in Paenibacillus species. In certain cases, the genome of Paenibacillus species may not contain a gene for the production of glnR. In certain cases, the genome of the Paenibacillus species may not contain a gene for the production of glnE or glnD. In certain cases, the genome of Paenibacillus species may contain a gene for the production of glnB or glnK . For example, the species Paenibacillus WLY78 does not contain the gene for glnB or its homolog found in the archaebacterium Methanococcus maripaludis , nifI1 and nifI 2 . In certain cases, the genomes of Paenibacillus species may vary. For example, Paenibacillus polymixa E681 lacks glnK and gdh , and has several nitrogen compound transporters, but apparently only amtB is under the control of GlnR. In another example, the species Paenibacillus JDR2 contains glnK , gdh and most of the other central nitrogen metabolism genes, contains many smaller nitrogen compound transporters, but does not contain glnPHQ under the control of GlnR. Paenibacillus riograndensis SBR5 contains the glnRA standard operon, the fdx gene, the nif primary operon, the nif secondary operon, and the anf operon (coding for iron-only nitrogenase). Upstream of each of these operons, putative glnR/tnrA regions have been identified. GlnR can regulate all of the above operons except for the anf operon. GlnR can bind to each of these regulatory sequences as a dimer.
[0221] Фиксирующие N штаммы Paenibacillus могут попадать в две подгруппы: подгруппу I, которая содержит только минимальный кластер генов nif, и подгруппу II, содержащую минимальный кластер и неохарактеризованный ген между nifX и hesA, и часто в других кластерах происходит дупликация определенных генов nif, таких как nifH, nifHDK, nifBEN, или кластеры, кодирующие гены нитрогеназы с ванадием (vnf) или содержащей только железо нитрогеназы).[0221] N-fixing strains of Paenibacillus can fall into two subgroups: subgroup I, which contains only a minimal cluster of nif genes, and subgroup II, which contains a minimal cluster and an uncharacterized gene between nifX and hesA , and duplication of certain nif genes often occurs in other clusters. such as nifH , nifHDK , nifBEN, or clusters encoding vanadium ( vnf ) or iron-only nitrogenase nitrogenase genes).
[0222] В определенных случаях геном видов Paenibacillus может не содержать гена для продукции glnB или glnK. В определенных случаях геном видов Paenibacillus может содержать минимальный кластер nif с 9 генами, транскрибируемыми с промотора sigma-70. В определенных случаях кластер nif Paenibacillus могут отрицательно регулировать азот или кислород. В определенных случаях геном видов Paenibacillus может не содержать гена для продукции sigma-54. Например, вид Paenibacillus WLY78 не содержит гена sigma-54. В определенных случаях кластер nif могут регулировать glnR и/или TnrA. В определенных случаях активность кластера nif можно определять изменяя активность glnR и/или TnrA.[0222] In certain cases, the genome of Paenibacillus species may not contain a gene for the production of glnB or glnK . In certain cases, the genome of Paenibacillus species may contain a minimal nif cluster with 9 genes transcribed from the sigma-70 promoter. In certain cases, a cluster of nif Paenibacillus can negatively regulate nitrogen or oxygen. In certain cases, the genome of Paenibacillus species may not contain the gene for the production of sigma-54 . For example, the species Paenibacillus WLY78 does not contain the sigma-54 gene. In certain cases, the nif cluster may regulate glnR and/or TnrA. In certain cases, the activity of the nif cluster can be determined by changing the activity of glnR and/or TnrA.
[0223] У Bacilli глутаминсинтетаза (GS) ингибирована по типу обратной связи высокими концентрациями внутриклеточного глутамина, вызывая сдвиг в подтверждении (обозначаемый как FBI-GS). Кластеры Nif содержат выраженные участки связывания для регуляторов GlnR и TnrA у различных видов Bacilli. GlnR связывает и подавляет экспрессию гена в присутствии избытка внутриклеточного глутамина и АМФ. Ролью GlnR может являться предотвращения притока и внутриклеточной продукции глутамина и аммония в условиях высокой доступности азота. TnrA может связывать и/или активировать (или подавлять) экспрессию генов в присутствии лимитирующего внутриклеточного глутамина и/или в присутствии FBI-GS. В определенных случаях активность кластера nif Bacilli можно изменять, изменяя активность GlnR.[0223] In Bacilli, glutamine synthetase (GS) is feedback inhibited by high concentrations of intracellular glutamine, causing a shift in confirmation (referred to as FBI-GS). The Nif clusters contain prominent binding sites for the GlnR and TnrA regulators in various Bacilli species. GlnR binds and represses gene expression in the presence of excess intracellular glutamine and AMP. The role of GlnR may be to prevent the influx and intracellular production of glutamine and ammonium under conditions of high nitrogen availability. TnrA can bind and/or activate (or repress) gene expression in the presence of limiting intracellular glutamine and/or in the presence of FBI-GS. In certain cases, the activity of the nif Bacilli cluster can be changed by changing the activity of GlnR.
[0224] Ингибированная по типу обратной связи глутаминсинтетаза (FBI-GS) может связывать GlnR и стабилизировать связывание GlnR с распознаваемыми последовательностями. Несколько видов бактерий содержат участок связывания GlnR/TnrA выше кластера nif. Изменение связывания FBI-GS и GlnR могут изменять активность пути nif.[0224] Feedback-inhibited glutamine synthetase (FBI-GS) can bind GlnR and stabilize GlnR binding to recognized sequences. Several bacterial species contain a GlnR/TnrA binding site upstream of the nif cluster. Altering FBI-GS and GlnR binding can alter the activity of the nif pathway.
Источники микроорганизмовSources of microorganisms
[0225] Бактерии (или любой микроорганизм по описанию) можно получать из любой обычной наземной окружающей среды, включая ее почвы, растения, грибы, животные (включая беспозвоночных) и другую биоту, включая осадки, воду и биоту озер и рек; из морской окружающей среды, ее биоты и осадков (например, морской воды, морского ила, морских растений, морских беспозвоночных (например, губок), морских позвоночных (например, рыб)); земной и морской геосферы (рыхлые поверхностные отложения и камни, например, раздробленные подпочвенные камни, песок и глины); криосферы и ее талых вод; атмосферы (например, отфильтрованной взвешенной пыли, облачных и дождевых капель); городской, промышленной и других техногенных окружающих сред (например, накопленные органический и минеральный материал на бетоне, желобах обочин, поверхностях крыш и дорожных покрытиях).[0225] Bacteria (or any microorganism as described) can be obtained from any common terrestrial environment, including its soils, plants, fungi, animals (including invertebrates) and other biota, including sediment, water, and biota of lakes and rivers; from the marine environment, its biota and sediments (eg sea water, sea silt, marine plants, marine invertebrates (eg sponges), marine vertebrates (eg fish)); terrestrial and marine geosphere (loose surface sediments and stones, for example, crushed subsoil stones, sand and clays); the cryosphere and its melt waters; atmosphere (for example, filtered suspended dust, cloud and rain drops); urban, industrial, and other man-made environments (eg, accumulated organic and mineral material on concrete, curbs, roof surfaces, and road surfaces).
[0226] Растения, из которых получают бактерии (или любой микроорганизм по описанию), могут представлять собой растение с одним или несколькими требуемыми признаками, например, растения, которые в природе растут в конкретной окружающей среде или в определенных представляющих интерес условиях. В качестве примера, определенное растение может в природе расти в песчаном грунте или песке с высокой минерализацией, или при экстремальных температурах, или с малым количеством воды, или оно может быть устойчивым к определенным вредителям или заболеваниям, присутствующим в окружающей среда, и желательным может являться выращивание коммерческой сельскохозяйственной культуры в таких условиях, в частности, например, если они представляют собой единственные доступные в конкретном географическом положении условия. В качестве дополнительного примера бактерии можно выделять из коммерческой сельскохозяйственной культуры, выращиваемой в таких средах или более конкретно, из конкретной сельскохозяйственной культуры, в которой среди сельскохозяйственных культур, выращиваемых в любой конкретной окружающей среде, наилучшим образом представлен представляющий интерес признак: например, наиболее быстрорастущие растения среди сельскохозяйственных культур, выращиваемых в почвах с ограниченным уровнем солей, или наименее повреждаемые растения среди сельскохозяйственных культур, подвергшихся сильному повреждению насекомыми или эпидемическим заболеванием, или растения с требуемыми количествами определенных метаболитов и других соединений, включая содержание волокон, содержание масел и т.п., или растения, демонстрирующие требуемые цвета, вкус или запах. Бактерии можно выделять из представляющего интерес растения или любого материала, находящегося в исследуемой окружающей среде, включая грибы и другую животную и растительную биоту, почву, воду, осадки и друг составляющие окружающей среды, как указано ранее.[0226] The plants from which the bacteria (or any microorganism as described) are derived can be a plant with one or more of the desired traits, such as plants that naturally grow in a particular environment or under certain conditions of interest. As an example, a particular plant may naturally grow in sandy soil or sand with a high mineral content, or at extreme temperatures, or with little water, or it may be resistant to certain pests or diseases present in the environment, and it may be desirable growing a commercial crop under such conditions, in particular, for example, if they are the only conditions available in a particular geographical location. As a further example, the bacteria can be isolated from a commercial crop grown in such media, or more specifically, from a particular crop in which, among crops grown in any particular environment, the trait of interest is best represented: e.g., fastest growing plants among crops grown in soils with limited salt levels, or the least damaged plants among crops that have been severely damaged by insects or epidemic disease, or plants with the required amounts of certain metabolites and other compounds, including fiber content, oil content, etc. , or plants that exhibit the required colors, tastes or smells. Bacteria can be isolated from the plant of interest or any material found in the environment of interest, including fungi and other animal and plant biota, soil, water, sediments, and other environmental components, as previously discussed.
[0227] Бактерии (или любой микроорганизм по описанию) можно выделять из ткани растения. Это выделение можно проводить из любой подходящий ткани растения, включая например, корень, стебель и листья и репродуктивные ткани растения. В качестве примера, общепринятые способы выделения из растений, как правило, включают вырезание в стерильных условиях материала исследуемого растения (например, участки корня или стебля, листья), стерилизация поверхности подходящим раствором (например, 2% гипохлоритом натрия) с последующим помещением материала растения на питательную среду для роста микроорганизмов. Альтернативно, материал растения со стерилизованной поверхностью можно измельчать в стерильную жидкость (как правило, воду) и жидкую суспензию, содержащую небольшие части измельченного материала растения наносить на поверхность подходящей твердой агарозной среды или сред, которые могут являться селективными или нет (например, содержать только фитиновую кислоту в качестве источника фосфора). Этот подход особенно пригоден для бактерий, которые формируют изолированные колонии и которые можно индивидуально перенести на отдельные планшеты с питательной средой, и дополнительно очищать до одного вида хорошо известными способами. Альтернативно, образцы корней или листьев растение можно не подвергать поверхностной стерилизации, а только аккуратно промыть, таким образом, включая в процесс выделения обитающие на поверхности эпифитные микроорганизмы, или эпифитные микроорганизмы можно выделять отдельно, прикладывая и убирая части корней, стеблей или листьев растений на поверхности агарозной среда, а затем выделяя отдельные колонии, как описано выше. Этот подход особенно пригоден, например, для бактерий. Альтернативно, корни можно обрабатывать без отмывания небольших количеств почвы, налипших на корни, таким образом, включая микроорганизмы, которые колонизирует ризосферу растения. В других случаях можно отбирать почву, налипшую на корни, разбавлять и наносить на агар с подходящими селективными и неселективными средами с получением отдельных колоний ризосферных бактерий.[0227] Bacteria (or any microorganism as described) can be isolated from plant tissue. This isolation can be carried out from any suitable tissue of the plant, including, for example, the root, stem and leaves, and reproductive tissues of the plant. By way of example, conventional plant isolation methods typically involve sterile cutting of test plant material (e.g., root or stem sections, leaves), sterilizing the surface with a suitable solution (e.g., 2% sodium hypochlorite), and then placing the plant material on nutrient medium for the growth of microorganisms. Alternatively, the surface-sterilized plant material can be ground into a sterile liquid (typically water) and a liquid suspension containing small portions of the ground plant material applied to the surface of a suitable solid agarose medium or media, which may or may not be selective (e.g., contain only phytic acid). acid as a source of phosphorus). This approach is particularly useful for bacteria that form isolated colonies and that can be individually transferred to individual culture media plates and further purified to a single species by well-known methods. Alternatively, samples of the roots or leaves of the plant may not be surface-sterilized but only gently washed, thus including surface-dwelling epiphytic microorganisms in the isolation process, or epiphytic microorganisms may be isolated separately by applying and removing parts of the roots, stems or leaves of plants on the surface. agarose medium and then isolating individual colonies as described above. This approach is particularly suitable, for example, for bacteria. Alternatively, the roots can be treated without washing off the small amounts of soil adhering to the roots, thus including the microorganisms that colonize the plant's rhizosphere. In other cases, the soil adhering to the roots can be taken, diluted and applied to agar with suitable selective and non-selective media to obtain individual colonies of rhizospheric bacteria.
БУДАПЕШТСКИЙ ДОГОВОР О МЕЖДУНАРОДНОМ ПРИЗНАНИИ ДЕПОНИРОВАНИЯ МИКРООРГАНИЗМОВ ДЛЯ ЦЕЛЕЙ ПАТЕНТНОЙ ПРОЦЕДУРЫBUDAPEST TREATY ON THE INTERNATIONAL RECOGNITION OF THE DEPOSIT OF MICROORGANISMS FOR THE PURPOSE OF PATENT PROCEDURE
[0228] Депозиты микроорганизмов по настоящему изобретению сделаны в соответствии с положениями будапештского договора о международном признании депонирования микроорганизмов для целей патентной процедуры (будапештского договора).[0228] Deposits of microorganisms of the present invention are made in accordance with the provisions of the Budapest Treaty on the International Recognition of the Deposit of Microorganisms for the Purposes of Patent Procedure (the Budapest Treaty).
[0229] Авторы утверждают, что в соответствии с 37 C.F.R. 1.808(a) (2) "все ограничения, наложенные вкладчиком на доступность публике депонированного материала, будут безвозвратно сняты при выдаче патента". Это утверждение подпадает под действие пункта (b) данного раздела (т.е. 37 C.F.R. 1.808 (b)).[0229] The authors contend that pursuant to 37 C.F.R. 1.808(a) (2) "All restrictions placed by the contributor on the availability to the public of the deposited material shall be irrevocably lifted upon the grant of the patent." This statement is subject to paragraph (b) of this section (i.e., 37 C.F.R. 1.808(b)).
[0230] Биологически чистые культуры Rahnella aquatilis и Enterobacter sacchari депонированы 14 июля 2015 года в американскую коллекцию типовых культур (ATCC; International Depositary Authority), 10801 University Blvd., Manassas, VA 20110, USA, и им присвоены номера ATTC Patent Deposit Designation PTA-122293 и PTA-122294, соответственно. Соответствующая информация о депозите приведена ниже в таблице A.[0230] Biologically pure cultures of Rahnella aquatilis and Enterobacter sacchari were deposited on July 14, 2015 with the American Type Culture Collection (ATCC; International Depositary Authority), 10801 University Blvd., Manassas, VA 20110, USA, and assigned ATTC Patent Deposit Designation PTA numbers -122293 and PTA-122294, respectively. Relevant deposit information is provided in Table A below.
[0231] Enterobacter sacchari в настоящее время переклассифицирована как Kosakonia sacchari, это название для этого организма можно использовать взаимозаменяемо на всем протяжении описания.[0231] Enterobacter sacchari is currently reclassified as Kosakonia sacchari , this name for this organism can be used interchangeably throughout the description.
[0232] Многие микроорганизмы по настоящему изобретению получены из двух штаммов дикого типа, как представлено на фигуре 18 и фигуре 19. Штамм CI006 представляет собой вид бактерий, ранее классифицированный в роде Enterobacter (см. указанную выше переклассификацию в Kosakonia), и на фигуре 19 приведена линия мутантов, которые получены из CI006. Штамм CI019 представляет собой вид бактерий, классифицированный в роде Rahnella, и на фигуре 19 приведена линия мутантов, которые получены из CI019. В отношении фигуры 18 и фигуры 19, следует отметить, что штаммы, содержащие CM в названии, представляют собой мутанты штаммов, изображенные непосредственно слева от указанного штамма CM. Информация из депозита для CI006 Kosakonia дикого типа (WT) и CI019 Rahnella WT приведена ниже в таблице A.[0232] Many of the microorganisms of the present invention are derived from two wild-type strains as shown in Figure 18 and Figure 19. Strain CI006 is a bacterial species previously classified in the genus Enterobacter (see above reclassification in Kosakonia ) and in Figure 19 shows a line of mutants that are derived from CI006. Strain CI019 is a species of bacteria classified in the genus Rahnella and Figure 19 shows the line of mutants that are derived from CI019. With respect to figures 18 and figures 19 , it should be noted that the strains containing CM in the name, are mutants of the strains depicted directly to the left of the specified strain of CM. Deposit information for CI006 Kosakonia wild type (WT) and CI019 Rahnella WT is shown in Table A below.
[0233] Некоторые микроорганизмы, описанные в настоящей заявке, депонированы 06 января 2017 года или 11 августа 2017 года в Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota (NCMA), находящегося по адресу 60 Bigelow Drive, East Boothbay, Maine 04544, USA. Как указано выше, все депозиты сделаны в соответствии с условиями будапештского договора о международном признании депонирования микроорганизмов для целей патентной процедуры. Номера доступа Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota и даты депозита для указанных выше депозитов по будапештскому договору приведены в таблице A. [0233] Some of the microorganisms described in this application were deposited on January 06, 2017 or August 11, 2017 at the Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota (NCMA), located at 60 Bigelow Drive, East Boothbay, Maine 04544, USA. As stated above, all deposits are made in accordance with the terms of the Budapest Treaty on the International Recognition of the Deposit of Microorganisms for the Purposes of Patent Procedure. Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota access numbers and deposit dates for the above Budapest Treaty deposits are shown in Table A.
[0234] Биологически чистые культуры Kosakonia sacchari (WT), Rahnella aquatilis (WT) и варианта штамма Kosakonia sacchari депонированы 06 января 2017 года в Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota (NCMA), находящийся по адресу 60 Bigelow Drive, East Boothbay, Maine 04544, USA, и им присвоены номера NCMA Patent Deposit Designation 201701001, 201701003 и 201701002, соответственно. Соответствующая информация о депозите приведена ниже в таблице A.[0234] Biologically pure cultures of Kosakonia sacchari (WT), Rahnella aquatilis (WT), and a variant strain of Kosakonia sacchari were deposited on January 06, 2017 at the Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota (NCMA), located at 60 Bigelow Drive, East Boothbay, Maine 04544, USA, and have been assigned NCMA Patent Deposit Designation numbers 201701001, 201701003, and 201701002, respectively. Relevant deposit information is provided in Table A below.
[0235] Биологически чистые культуры вариантов штаммов Kosakonia sacchari депонированы 11 августа 2017 года в Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota (NCMA), находящийся по адресу 60 Bigelow Drive, East Boothbay, Maine 04544, USA, и им присвоены номера NCMA Patent Deposit Designation 201708004, 201708003 и 201708002, соответственно. Соответствующая информация о депозите приведена ниже в таблице A.[0235] Biologically pure cultures of variant strains of Kosakonia sacchari were deposited on August 11, 2017 at the Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota (NCMA), located at 60 Bigelow Drive, East Boothbay, Maine 04544, USA, and assigned NCMA Patent Deposit numbers Designation 201708004, 201708003 and 201708002, respectively. Relevant deposit information is provided in Table A below.
[0236] Биологически чистая культура Klebsiella variicola (WT) депонирована 11 августа 2017 года в Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota (NCMA), находящийся по адресу 60 Bigelow Drive, East Boothbay, Maine 04544, USA, и ей присвоен номер NCMA Patent Deposit Designation 201708001. Биологически чистые культуры двух вариантов Klebsiella variicola депонированы 20 декабря 2017 года в Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota (NCMA), находящийся по адресу 60 Bigelow Drive, East Boothbay, Maine 04544, USA, и им присвоены номера NCMA Patent Deposit Designation 201712001 и 201712002, соответственно. Соответствующая информация о депозите приведена ниже в таблице A.[0236] A biologically pure culture of Klebsiella variicola (WT) was deposited on August 11, 2017 at the Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota (NCMA), located at 60 Bigelow Drive, East Boothbay, Maine 04544, USA, and has been assigned an NCMA Patent number Deposit Designation 201708001 Biologically pure cultures of two variants of Klebsiella variicola were deposited on December 20, 2017 at the Bigelow National Center for Marine Algae and Microbiota (NCMA) located at 60 Bigelow Drive, East Boothbay, Maine 04544, USA and assigned NCMA Patent numbers Deposit Designation 201712001 and 201712002, respectively. Relevant deposit information is provided in Table A below.
Таблица A: Микроорганизмы, депонированные в соответствии с будапештским договоромTable A: Microorganisms deposited under the Budapest Treaty
Выделенные и биологически чистые микроорганизмыIsolated and biologically pure microorganisms
[0237] Настоящее изобретение в определенных вариантах осуществления относится к выделенным и биологически чистым микроорганизмам, которые в числе прочего имеют применения в сельском хозяйстве. Микроорганизмы по изобретению можно использовать в их выделенном и биологически чистом состояниях, а также сформулированными в композиции (для описания иллюстративных композиций см. раздел ниже). Кроме того, по изобретению предоставлены композиции микроорганизмов, содержащие по меньшей мере два представителя описанных выделенных и биологически чистых микроорганизмов, а также способы использования указанных композиций микроорганизмов. Кроме того, по изобретению предусмотрены способы модуляции фиксации азота в растениях посредством использование описанных выделенных и биологически чистых микроорганизмов.[0237] The present invention in certain embodiments relates to isolated and biologically pure microorganisms, which, among other things, have applications in agriculture. The microorganisms of the invention can be used in their isolated and biologically pure states, as well as formulated in a composition (for a description of illustrative compositions, see the section below). In addition, the invention provides compositions of microorganisms containing at least two representatives of the described isolated and biologically pure microorganisms, as well as methods for using these compositions of microorganisms. In addition, the invention provides methods for modulating nitrogen fixation in plants through the use of the described isolated and biologically pure microorganisms.
[0238] В определенных аспектах выделенные и биологически чистые микроорганизмы по изобретению представляют собой микроорганизмы из таблицы A. В других аспектах выделенные и биологически чистые микроорганизмы по изобретению получают из микроорганизмов из таблицы A. Например, по настоящему документу предоставлены штамм, потомок, мутант или производное микроорганизма из таблицы A. По изобретению предусмотрены все возможные комбинации микроорганизмов, перечисленных в таблице A, где указанные комбинации иногда формируют консорциумы микроорганизмов. Микроорганизмы из таблицы A, индивидуально или в любой комбинации, можно комбинировать с любым растением, активным веществом (синтетическим, органическим и т.д.), адъювантом, носителем, добавков или биологическим компонентом, указанных в описании.[0238] In certain aspects, the isolated and biologically pure microorganisms of the invention are those of Table A. In other aspects, isolated and biologically pure microorganisms according to the invention are obtained from microorganisms from table A. For example, provided herein is a strain, progeny, mutant, or derivative of a microorganism from Table A. The invention contemplates all possible combinations of microorganisms listed in Table A , where said combinations sometimes form consortia of microorganisms. Microorganisms from table A , individually or in any combination, can be combined with any plant, active substance (synthetic, organic, etc.), adjuvant, carrier, additives or biological component specified in the description.
КомпозицииCompositions
[0239] Композиции, содержащие бактерии или популяции бактерий, полученных способами, описываемыми в настоящем документе, и/или обладающих характеристиками, как описано в настоящем документе, могут находиться в форме жидкости, пены или сухого продукта. Композиции, содержащие бактерии или популяции бактерий, полученных способами, описываемыми в настоящем документе, и/или обладающих характеристиками, как описано в настоящем документе, также можно использовать для улучшения свойств растений. В определенных примерах композиция, содержащая популяции бактерий, может находиться в форме a сухого порошка, взвеси порошка и воды или жидкой пропитки для семян. Композиции, содержащие популяции бактерий можно наносить на поверхность семян, и она может находиться в жидкой форме.[0239] Compositions containing bacteria or populations of bacteria obtained by the methods described herein and/or having the characteristics as described herein may be in the form of a liquid, foam or dry product. Compositions containing bacteria or populations of bacteria obtained by the methods described herein and/or having the characteristics as described herein can also be used to improve the properties of plants. In certain examples, the composition containing populations of bacteria may be in the form of a dry powder, a slurry of powder and water, or a liquid seed treatment. Compositions containing populations of bacteria can be applied to the surface of the seeds, and it can be in liquid form.
[0240] Композиция можно производить в биореакторах, таких как реакторы с непрерывно перемешиваемым резервуаром, реакторы периодического действия и на ферме. В определенных примерах композиции можно хранить в контейнере, таком как канистра или в миниобъеме. В определенных примерах композиции можно хранить в любом объекте, выбранном из группы, состоящей из бутылки, фляги, ампулы, упаковки, сосуда, мешка, коробки, ящика, обертки, картонной коробки, контейнера, накопитель, контейнер для перевозок, кузов грузового автомобиля и/или корпус.[0240] The composition can be produced in bioreactors such as continuously stirred tank reactors, batch reactors, and on a farm. In certain examples, the compositions may be stored in a container such as a canister or mini-volume. In certain examples, the compositions may be stored in any item selected from the group consisting of a bottle, flask, ampoule, package, vessel, bag, box, crate, wrapper, carton, container, accumulator, shipping container, truck bed, and/ or body.
[0241] Композиции также можно использовать для улучшения свойств растений. В определенных примерах одну или несколько композиций можно наносить на семена. В определенных примерах одну или несколько композиций можно наносить на проросток. В определенных примерах одну или несколько композиций можно наносить на поверхность семян. В определенных примерах одну или несколько композиций можно наносить в виде слоя на поверхности семян. В определенных примерах композиция, которую наносят на семена может находиться в жидкой форме, в форме сухого продукта, в форме пены, в форме взвеси порошка и воды, или в жидкой пропитки для семян. В определенных примерах одну или несколько композиций можно наносить на семена и/или проростки посредством распыления, погружения, покрытия, инкапсуляции и/или опыления семян и/или проростков одной или несколькими композициями. В определенных примерах на семена и/или проростки растений можно наносить несколько бактерий или популяции бактерий. В определенных примерах можно выбирать по меньшей мере два, по меньшей мере три, по меньшей мере четыре, по меньшей мере пять, по меньшей мере шесть, по меньшей мере семь, по меньшей мере восемь, по меньшей мере девять, по меньшей мере десять, или более чем десять бактерии комбинации бактерий из одного из следующих родов: Acidovorax, Agrobacterium, Bacillus, Burkholderia, Chryseobacterium, Curtobacterium, Enterobacter, Escherichia, Methylobacterium, Paenibacillus, Pantoea, Pseudomonas, Ralstonia, Saccharibacillus, Sphingomonas и Stenotrophomonas.[0241] the Compositions can also be used to improve the properties of plants. In certain examples, one or more compositions can be applied to seeds. In certain examples, one or more compositions can be applied to the seedling. In certain examples, one or more compositions can be applied to the surface of the seeds. In certain examples, one or more compositions can be applied as a layer on the surface of the seeds. In certain examples, the composition that is applied to the seed may be in liquid form, in dry product form, in foam form, in the form of a slurry of powder and water, or in liquid seed treatment. In certain examples, one or more compositions can be applied to seeds and/or seedlings by spraying, dipping, coating, encapsulating and/or pollinating the seeds and/or seedlings with one or more compositions. In certain examples, several bacteria or populations of bacteria can be applied to seeds and/or seedlings of plants. In certain examples, at least two, at least three, at least four, at least five, at least six, at least seven, at least eight, at least nine, at least ten, or more than ten bacteria combinations of bacteria from one of the following genera: Acidovorax , Agrobacterium , Bacillus , Burkholderia , Chryseobacterium , Curtobacterium , Enterobacter , Escherichia , Methylobacterium , Paenibacillus , Pantoea , Pseudomonas , Ralstonia , Saccharibacillus , Sphingomonas , and Stenotrophomo nas .
[0242] В определенных примерах по меньшей мере два, по меньшей мере три, по меньшей мере четыре, по меньшей мере пять, по меньшей мере шесть, по меньшей мере семь, по меньшей мере восемь, по меньшей мере девять, по меньшей мере десять или более чем десять бактерий и популяций бактерий эндофитной комбинации выбраны из одного из следующих семейств: Bacillaceae, Burkholderiaceae, Comamonadaceae, Enterobacteriaceae, Flavobacteriaceae, Methylobacteriaceae, Microbacteriaceae, Paenibacillileae, Pseudomonnaceae, Rhizobiaceae, Sphingomonadaceae, Xanthomonadaceae, Cladosporiaceae, Gnomoniaceae, Incertae sedis, Lasiosphaeriaceae, Netriaceae и Pleosporaceae.[0242] In certain examples, at least two, at least three, at least four, at least five, at least six, at least seven, at least eight, at least nine, at least ten or more than ten bacteria and bacterial populations of an endophytic combination are selected from one of the following families: Bacillaceae , Burkholderiaceae , Comamonadaceae , Enterobacteriaceae , Flavobacteriaceae , Methylobacteriaceae , Microbacteriaceae , Paenibacillileae , Pseudomonnaceae , Rhizobiaceae , Sphingomonadaceae , Xanthomonadaceae , Cladosporiaceae , Gnom oniaceae , Incertae sedis , Lasiosphaeriaceae , Netriaceae and Pleosporaceae .
[0243] В определенных примерах по меньшей мере два, по меньшей мере три, по меньшей мере четыре, по меньшей мере пять, по меньшей мере шесть, по меньшей мере семь, по меньшей мере восемь, по меньшей мере девять, по меньшей мере десять или более десяти бактерий и популяций бактерий эндофитной комбинации выбраны из одного из следующих семейств: Bacillaceae, Burkholderiaceae, Comamonadaceae, Enterobacteriaceae, Flavobacteriaceae, Methylobacteriaceae, Microbacteriaceae, Paenibacillileae, Pseudomonnaceae, Rhizobiaceae, Sphingomonadaceae, Xanthomonadaceae, Cladosporiaceae, Gnomoniaceae, Incertae sedis, Lasiosphaeriaceae, Netriaceae, Pleosporaceae.[0243] In certain examples, at least two, at least three, at least four, at least five, at least six, at least seven, at least eight, at least nine, at least ten or more than ten bacteria and bacterial populations of an endophytic combination are selected from one of the following families: Bacillaceae , Burkholderiaceae , Comamonadaceae , Enterobacteriaceae , Flavobacteriaceae , Methylobacteriaceae , Microbacteriaceae , Paenibacillileae , Pseudomonnaceae , Rhizobiaceae , Sphingomonadaceae , Xanthomonadaceae , Cladosporiaceae , Gononi aceae , Incertae sedis , Lasiosphaeriaceae , Netriaceae , Pleosporaceae .
[0244] Примеры композиций могут включать покрытия семян для коммерчески важных сельскохозяйственных культур, например, сорго, канолы, томата, клубники, ячменя, риса, кукурузы и пшеницы. Примеры композиций также могут включать покрытия семян кукурузы, сои, канолы, сорго, картофеля, риса, овощей, злаковых и семена масличных культур. Семена, как предоставлено по настоящему документу, могут представлять собой генетически модифицированные организмы (GMO), не GMO, органические формы или общепринятые формы. В определенных примерах композиции можно распылять на надземные части растений или наносить на корни, внося их в борозды, в которые сажают семена растений, поливая почву или опуская корни в суспензию композиции. В определенных примерах композиции можно обезвоживать подходящим способом, который сохраняет жизнеспособность клеток и способность к искусственному заселению и колонизации растений-хозяев. Виды бактерий могут присутствовать в композициях в концентрации от 108 до 1010 КОЕ/мл. В определенных примерах композиции можно дополнять ионами металлов-микроэлементов, такими как ионы молибдена, ионы железа, ионы марганца или комбинации этих ионов. Концентрации ионов в примерах композиций, описываемых в настоящем документе, могут составлять приблизительно от 0,1 мМ до приблизительно 50 мМ. Определенные примеры композиций также можно формулировать c носителем, таким как бета-глюкан, карбоксилметилцеллюлоза (CMC), бактериальное внеклеточное полимерное вещество (EPS), сахар, молоко животного или другие подходящие носители. В определенных примерах в качестве носителя можно использовать торф или посадочные материалы или биополимеры, в которых композицию помещают в биополимер. Композиции, содержащие бактериальные популяции, описываемые в настоящем документе, могут улучшать признаки растений, например, стимулировать рост растений, поддерживать высокое содержание хлорофилла в листьях, увеличивать количества плодов или семян и увеличивать массу единичного плода или семени.[0244] Examples of compositions may include seed coatings for commercially important crops, such as sorghum, canola, tomato, strawberry, barley, rice, corn, and wheat. Examples of compositions may also include seed coatings for corn, soybeans, canola, sorghum, potatoes, rice, vegetables, cereals and oilseeds. Seeds, as provided herein, may be genetically modified organisms (GMO), non-GMO, organic forms, or conventional forms. In certain examples, the compositions can be sprayed onto the aerial parts of the plants or applied to the roots by placing them in the furrows in which the plant seeds are planted, watering the soil, or dipping the roots into a suspension of the composition. In certain examples, the compositions can be dehydrated in a suitable manner that retains cell viability and the ability to artificially populate and colonize host plants. The bacterial species may be present in the compositions at a concentration of from 10 8 to 10 10 cfu/ml. In certain examples, the compositions can be supplemented with trace metal ions such as molybdenum ions, iron ions, manganese ions, or combinations of these ions. Ion concentrations in the exemplary compositions described herein can be from about 0.1 mM to about 50 mM. Certain exemplary compositions may also be formulated with a carrier such as beta-glucan, carboxymethylcellulose (CMC), bacterial extracellular polymeric substance (EPS), sugar, animal milk, or other suitable carriers. In certain examples, peat or planting materials or biopolymers can be used as a carrier, in which the composition is placed in a biopolymer. Compositions containing the bacterial populations described herein can improve plant traits, such as promoting plant growth, maintaining high leaf chlorophyll content, increasing fruit or seed numbers, and increasing single fruit or seed weight.
[0245] Композиции, содержащие бактериальные популяции, описываемые в настоящем документе, можно наносить на поверхность семян. Таким образом, предусмотрены композиции, содержащие семена, покрытые одним или несколькими видами бактерий, описанных в настоящем документе. Покрытие семян можно формулировать, смешивая популяцию бактерий с пористым, химически инертным гранулярным носителем. Альтернативно, композиции можно вносить непосредственно в борозды, в которые высаживают семена или распылять на листья растений или наносить посредством погружения корней в суспензию композиции. Можно использовать эффективное количество композиции для заполнения области грунта рядом с корнями растения с ростом жизнеспособных бактерий или заселения листьев растения с ростом жизнеспособных бактерий. Как правило, эффективное количество представляет собой количество, достаточное для получения растений с улучшенными признаками (например, с желаемым уровнем фиксации азота).[0245] Compositions containing the bacterial populations described herein can be applied to the surface of seeds. Thus, compositions are contemplated containing seeds coated with one or more of the bacterial species described herein. The seed coat can be formulated by mixing a population of bacteria with a porous, chemically inert granular carrier. Alternatively, the compositions can be applied directly to the furrows in which the seeds are planted, or sprayed onto the leaves of the plants, or applied by dipping the roots into a suspension of the composition. An effective amount of the composition can be used to fill an area of soil near the roots of a plant with growth of viable bacteria, or to colonize the leaves of a plant with growth of viable bacteria. Generally, an effective amount is an amount sufficient to produce plants with improved traits (eg, the desired level of nitrogen fixation).
[0246] Бактериальные композиции, описываемые в настоящем документе, можно формулировать с использованием приемлемого в сельском хозяйстве носителя. Состав, пригодный для этих вариантов осуществления, может содержать по меньшей мере одного представителя, выбранного из группы, состоящей из придающего клейкость средства, стабилизатора микроорганизмов, фунгицида, антибактериального средства, консерванта, стабилизатора, поверхностно-активного вещества, противокомплексного средства, гербицида, нематоцида, инсектицида, регулятора роста растения, удобрения, родентицида, поглотителя влаги бактерицида, питательного вещества или любой их комбинации. В определенных примерах композиции могут быть пригодными для длительного хранения. Например, любая из композиций, описываемых в настоящем документе, может содержать приемлемый в сельском хозяйстве носитель (например, один или несколько из удобрений, таких как неприродное удобрение, обеспечивающих прилипание средств, таких как неприродное обеспечивающее прилипание средство, и пестицидов, таких как неприродный пестицид). Неприродное обеспечивающее прилипание средство может представлять собой, например, полимер, сополимер или синтетический воск. Например, любой из покрытых семян, всходов или растений, описываемых в настоящем документе, может содержать в покрытии семян такой приемлемый в сельском хозяйстве носитель. В любых из композиций или способов, описываемых в настоящем документе, приемлемый в сельском хозяйстве носитель может представлять собой или может содержать неприродное соединение (например, неприродное удобрение, неприродное обеспечивающее прилипание средство, такое как полимер, сополимер или синтетический воск, или неприродный пестицид). Неограничивающие примеры приемлемых в сельском хозяйстве носителей описаны ниже. В данной области известны дополнительные примеры приемлемых в сельском хозяйстве носителей.[0246] The bacterial compositions described herein can be formulated using an agriculturally acceptable carrier. A formulation suitable for these embodiments may comprise at least one member selected from the group consisting of tackifying agent, microorganism stabilizer, fungicide, antibacterial agent, preservative, stabilizer, surfactant, anti-complex agent, herbicide, nematicide, an insecticide, a plant growth regulator, a fertilizer, a rodenticide, a humectant, a bactericide, a nutrient, or any combination thereof. In certain examples, the compositions may be suitable for long-term storage. For example, any of the compositions described herein may contain an agriculturally acceptable carrier (e.g., one or more of fertilizers, such as a non-natural fertilizer, tackifiers, such as a non-natural tackifier, and pesticides, such as a non-natural pesticide ). The non-natural tackifier may be, for example, a polymer, copolymer or synthetic wax. For example, any of the coated seeds, seedlings or plants described herein may contain such an agriculturally acceptable carrier in the seed coating. In any of the compositions or methods described herein, the agriculturally acceptable carrier may be or may contain a non-natural compound (eg, a non-natural fertilizer, a non-natural tackifier such as a polymer, copolymer, or synthetic wax, or a non-natural pesticide). Non-limiting examples of agriculturally acceptable carriers are described below. Additional examples of agriculturally acceptable carriers are known in the art.
[0247] В определенных случаях бактерии смешивают с приемлемым в сельском хозяйстве носителем. Носитель может представлять собой твердый носитель или жидкий носитель, и находиться в различных формах, включая микросферы, порошки, эмульсии и т.п. Носитель может представлять собой любой один или несколько из ряда носителей, которые обеспечивают ряд таких свойств, как увеличенная стабильность, смачиваемость или диспергируемость. В композиции можно включать средства для смачивания, такие как природные или синтетические поверхностно-активные вещества, которые могут быть неионными или ионными поверхностно-активными вещества, или их сочетание. Также для формулирования композиций, которые содержат выделенные бактерии, можно использовать эмульсии вода-в-масле (см., например, патент США № 7485451). Подходящие составы, которые можно получать, включают смачиваемые порошки, гранулы, гели, агарозные пластинки или шарики, загустители и т.п., микроинкапсулированные частицы и т.п., жидкости, такие как водные жидкости, водные суспензии, эмульсии вода-в-масле и т.д. Состав может содержать зерновые или бобовые продукты, например, молотые зерна или бобы, бульон или муку тонкого помола, получаемые из зерен или бобов, крахмал, сахар или масло.[0247] In certain cases, the bacteria are mixed with an agriculturally acceptable carrier. The carrier may be a solid carrier or a liquid carrier, and may be in various forms, including microspheres, powders, emulsions, and the like. The carrier may be any one or more of a number of carriers that provide a number of properties such as increased stability, wettability, or dispersibility. Wetting agents such as natural or synthetic surfactants, which may be non-ionic or ionic surfactants, or a combination thereof, may be included in the compositions. Also, water-in-oil emulsions can be used to formulate compositions that contain isolated bacteria (see, for example, US Pat. No. 7,485,451). Suitable formulations that can be prepared include wettable powders, granules, gels, agarose plates or beads, thickeners and the like, microencapsulated particles and the like, liquids such as aqueous liquids, aqueous suspensions, water-in-emulsions oil, etc. The composition may contain grains or legumes, for example, ground grains or beans, broth or fine flour obtained from grains or beans, starch, sugar or oil.
[0248] В определенных вариантах осуществления сельскохозяйственный носитель может представлять собой почву или среду для выращивания растений. Другие сельскохозяйственные носители, которые можно использовать, включают воду, удобрения, растительные масла, увлажнители или их сочетания. Альтернативно, сельскохозяйственный носитель может быть твердым, таким как диатомовая земля, глина, диоксид кремния, альгинат, глинистый грунт, бентонит, вермикулит, семенные коробочки, другое растительные и животные продукты или их комбинации, включая гранулы, осадки или суспензии. В качестве носителей также предусмотрены смеси любых указанных выше ингредиентов, в качестве неограничивающих примеров такие как песта (мука тонкого помола и каолиновая глина), шарики на основе агара или муки тонкого помола в глине, песке или глинистый грунт и т.д. Составы могут содержать источники пищи для бактерий, такие как ячмень, рис или другие биологические материалы, такие как семена, части растений, выжимки сахарного тростника, шелуха или плодоножки после обработки зерна, измельченный растительный материал или древесину из отходов строительных участков, опилки или мелкие волокна после переработки бумаги, ткани или дерева.[0248] In certain embodiments, the implementation of the agricultural carrier may be a soil or environment for growing plants. Other agricultural vehicles that can be used include water, fertilizers, vegetable oils, humectants, or combinations thereof. Alternatively, the agricultural carrier may be a solid such as diatomaceous earth, clay, silica, alginate, clay soil, bentonite, vermiculite, seed pods, other plant and animal products, or combinations thereof, including granules, sediments, or suspensions. Mixtures of any of the above ingredients are also contemplated as non-limiting examples, such as pestle (fine flour and kaolin clay), agar balls or fine flour in clay, sand or clay soil, etc. The formulations may contain food sources for bacteria such as barley, rice or other biological materials such as seeds, plant parts, sugar cane pomace, grain husks or stalks, shredded plant material or wood from construction site waste, sawdust or fine fibers. after processing paper, fabric or wood.
[0249] Для помощи в стимуляции роста или обеспечения питательных веществ для семян, всходов или растений можно использовать, например, удобрение. Неограничивающие примеры удобрений включают азот, фосфор, калий, кальций, серу, магний, бор, хлорид, марганец, железо, цинк, медь, молибден и селен (или их соли). Дополнительные примеры удобрений, включают одну или несколько аминокислот, соли, углеводы, витамины, глюкозу, NaCl, дрожжевой экстракт, NH4H2PO4, (NH4)2SO4, глицерин, валин, L-лейцин, молочную кислоту, пропионовую кислоту, янтарную кислоту, яблочную кислоту, лимонную кислоту, тартрат KH, ксилозу, ликсозу и лецитин. В одном из вариантов осуществления состав может содержать придающее клейкость средство или клеящее средство (обозначаемое как адгезивное средство), помогающее связывать другие активные средства с веществом (например, с поверхностью семян). Такие средства пригодны для комбинации бактерий с носителями, которые могут содержать другие соединения (например, контрольные средства, которые являются небиологическими), с получением покрывающей композиции. Такие композиции помогают получать покрытия вокруг растения или семян с поддержанием контакта микроорганизмов и других средств с растением или частью растения. В одном из вариантов осуществления адгезивы выбраны из группы, состоящей из: альгината, камедей, различных видов крахмала, лецитинов, формононетина, поливинилового спирта, щелочного формононетината, гесперетина, поливинилацетата, цефалинов, гуммиарабика, ксантановой камеди, минерального масла, полиэтиленгликоля (ПЭГ), поливинилпирролидона (ПВП), арабино-галактана, метилцеллюлозы, ПЭГ 400, хитозана, полиакриламида, полиакрилата, аолиакрилонитрила, глицерина, триэтиленгликоля, винилацетата, геллановой камеди, полистирола, поливинила, карбоксиметилцеллюлозы, камеди гхатти и полиоксиэтилен-полиоксибутиленовых блок-сополимеров.[0249] For example, a fertilizer can be used to help promote growth or provide nutrients to seeds, seedlings, or plants. Non-limiting examples of fertilizers include nitrogen, phosphorus, potassium, calcium, sulfur, magnesium, boron, chloride, manganese, iron, zinc, copper, molybdenum, and selenium (or salts thereof). Additional examples of fertilizers include one or more amino acids, salts, carbohydrates, vitamins, glucose, NaCl, yeast extract, NH 4 H 2 PO 4 , (NH 4 ) 2 SO 4 , glycerol, valine, L-leucine, lactic acid, propionic acid, succinic acid, malic acid, citric acid, KH tartrate, xylose, lyxose and lecithin. In one embodiment, the formulation may contain a tackifier or adhesive (referred to as an adhesive) to help bind other active agents to the substance (eg, the surface of the seeds). Such agents are suitable for combination of bacteria with carriers which may contain other compounds (eg control agents which are non-biological) to form a coating composition. Such compositions help to provide coatings around a plant or seed while maintaining contact of microorganisms and other agents with the plant or plant part. In one embodiment, the adhesives are selected from the group consisting of: alginate, gums, various starches, lecithins, formononetin, polyvinyl alcohol, alkaline formononetinate, hesperetin, polyvinyl acetate, cephalins, gum arabic, xanthan gum, mineral oil, polyethylene glycol (PEG), polyvinylpyrrolidone (PVP), arabino-galaktana, methyl cellulose,
[0250] В определенных вариантах осуществления адгезивы могут представлять собой, например, воск, такой как карнаубский воск, пчелиный воск, китайский воск, шеллачный воск, спермацетовый воск, канделильский воск, гидрированное касторовое масло, орикурийский воск и воск рисовых отрубей, полисахарид (например, крахмал, декстрины, мальтодекстрины, альгинат и хитозаны), жир, масло, белок (например, желатин и зеины), гуммиарабик и шеллаки. Адгезивные средства могут представлять собой неприродные соединения, например, полимеры, сополимеры и воска. Например, неограничивающие примеры полимеров, которые можно использовать в качестве адгезивного средства, включают: поливинилацетаты, сополимеры поливинилацетатов, сополимеры этилена и винилацетата (EVA), поливиниловые спирты, сополимеры поливиниловых спиртов, соединения целлюлозы (например, различные виды этилцеллюлозы, метилцеллюлозы, гидроксиметилцеллюлозы, гидроксипропилцеллюлозы и карбоксиметилцеллюлозы), поливинилпирролидоны, винилхлорид, сополимеры винилиденхлорида, лигносульфонаты кальция, акриловые сополимеры, поливинилакрилаты, полиэтиленоксид, ациламидные полимеры и сополимеры, полигидроксиэтилакрилат, мономерные метилакриламиды и полихлоропрен.[0250] In certain embodiments, the adhesives may be, for example, a wax such as carnauba wax, beeswax, Chinese wax, shellac wax, spermaceti wax, candelilla wax, hydrogenated castor oil, oricuria wax, and rice bran wax, a polysaccharide (e.g. , starch, dextrins, maltodextrins, alginate and chitosans), fat, oil, protein (eg gelatin and zeins), gum arabic and shellacs. Adhesives may be non-natural compounds such as polymers, copolymers and waxes. For example, non-limiting examples of polymers that can be used as an adhesive include: polyvinyl acetates, polyvinyl acetate copolymers, ethylene-vinyl acetate (EVA) copolymers, polyvinyl alcohols, polyvinyl alcohol copolymers, cellulose compounds (e.g. various types of ethylcellulose, methylcellulose, hydroxymethylcellulose, hydroxypropylcellulose and carboxymethylcelluloses), polyvinylpyrrolidones, vinyl chloride, vinylidene chloride copolymers, calcium lignosulfonates, acrylic copolymers, polyvinyl acrylates, polyethylene oxide, acylamide polymers and copolymers, polyhydroxyethyl acrylate, monomeric methylacrylamides and polychloroprene.
[0251] В определенных примерах одно или несколько из адгезивных средств, противогрибковых средств, средств регуляции роста и пестицидов (например, инсектицидов) представляют собой неприродные соединения (например, в любой комбинации). Дополнительные примеры приемлемых в сельском хозяйстве носителей включают дисперсанты (например, поливинилпирролидон/винилацетат PVPIVA S-630), поверхностно-активные вещества, связывающие средства и наполнители.[0251] In certain examples, one or more of the adhesives, antifungals, growth regulators, and pesticides (eg, insecticides) are non-natural compounds (eg, in any combination). Additional examples of agriculturally acceptable carriers include dispersants (eg, polyvinylpyrrolidone/vinyl acetate PVPIVA S-630), surfactants, binders, and fillers.
[0252] Состав также может содержать поверхностно-активное вещество. Неограничивающие примеры поверхностно-активных веществ включают смеси азотных удобрений и поверхностно-активных веществ, такие как Prefer 28 (Cenex), Surf-N (US), Inhance (Brandt), P-28 (Wilfarm) и Patrol (Helena); этерифицированные масла семян включают Sun-It II (AmCy), MSO (UAP), Scoil (Agsco), Hasten (Wilfarm) и Mes-100 (Drexel); и органо-силиконовые поверхностно-активные вещества включают Silwet L77 (UAP), Silikin (Terra), Dyne-Amic (Helena), Kinetic (Helena), Sylgard 309 (Wilbur-Ellis) и Century (Precision). В одном из вариантов осуществления поверхностно-активное вещество присутствует в концентрации от 0,01% об./об. до 10% об./об. В другом варианте осуществления поверхностно-активное вещество присутствует в концентрации от 0,1% об./об. до 1% об./об.[0252] The composition may also contain a surfactant. Non-limiting examples of surfactants include mixtures of nitrogen fertilizers and surfactants such as Prefer 28 (Cenex), Surf-N (US), Inhance (Brandt), P-28 (Wilfarm) and Patrol (Helena); esterified seed oils include Sun-It II (AmCy), MSO (UAP), Scoil (Agsco), Hasten (Wilfarm) and Mes-100 (Drexel); and organo-silicone surfactants include Silwet L77 (UAP), Silikin (Terra), Dyne-Amic (Helena), Kinetic (Helena), Sylgard 309 (Wilbur-Ellis) and Century (Precision). In one embodiment, the surfactant is present at a concentration of 0.01% v/v. up to 10% v/v In another embodiment, the surfactant is present at a concentration of 0.1% v/v. up to 1% v/v
[0253] В определенных случаях состав содержит стабилизатор микроорганизмов. Такое средство может включать поглотитель влаги, который может включать любое соединение или смесь соединений, которые можно классифицировать как поглотитель влаги вне зависимости от того используют ли соединение или соединения в таких концентрациях, что они фактически проявляют высушивающее действие на жидкое инокулируемое средство. Такие поглотители влаги в идеале совместимы с используемыми популяциями бактерий и должны поддерживать способность популяции микроорганизмов переживать нанесение на семена и переживать обезвоживание. Примеры подходящих поглотителей влаги включают одно или несколько из трегалозы, сахарозы, глицерина и метиленгликоля. Другие подходящие поглотители влаги в качестве неограничивающих примеров включают невосстанавливающие сахара и сахарные спирты (например, маннит или сорбит). Количество поглотителя влаги, вводимое в состав, может находиться в диапазоне приблизительно от 5% до приблизительно 50% по массе/объему, например, приблизительно от 10% до приблизительно 40%, приблизительно от 15% до приблизительно 35% или приблизительно от 20% до приблизительно 30%. В определенных случаях предпочтительно, чтобы состав содержал такие средства, как фунгицид, антибактериальное средство, гербицид, нематоцид, инсектицид, регулятор роста растения, родентицид, бактерицидное средство или питательное вещество. В определенных примерах средства могут включать защитные средства, которые обеспечивают защиту против патогенных микроорганизмов на поверхности семян. В определенных примерах защитные средства могут обеспечивать определенный уровень контроля почвенных патогенных микроорганизмов. В определенных примерах защитные средства могут быть эффективными преимущественно на поверхности семян.[0253] In certain cases, the composition contains a microorganism stabilizer. Such agent may include a desiccant, which may include any compound or mixture of compounds that can be classified as a desiccant, whether or not the compound or compounds are used at such concentrations that they actually exhibit a drying effect on the liquid inoculating agent. Such desiccants are ideally compatible with the bacterial populations used and should maintain the ability of the microbial population to survive seed application and survive dehydration. Examples of suitable moisture scavengers include one or more of trehalose, sucrose, glycerol and methylene glycol. Other suitable moisture scavengers include non-limiting examples of non-reducing sugars and sugar alcohols (eg mannitol or sorbitol). The amount of desiccant incorporated into the formulation may range from about 5% to about 50% by weight/volume, for example, from about 10% to about 40%, from about 15% to about 35%, or from about 20% to approximately 30%. In certain instances, it is preferred that the composition contains agents such as a fungicide, antibacterial agent, herbicide, nematocide, insecticide, plant growth regulator, rodenticide, bactericide or nutrient. In certain examples, the agents may include protective agents that provide protection against pathogens on the surface of the seeds. In certain instances, protective agents may provide some level of control of soil pathogens. In certain instances, the protectants may be effective predominantly on the surface of the seed.
[0254] В определенных примерах фунгицид может включать соединение или химическое или биологическое средство, которое может ингибировать рост гриба или уничтожать гриб. В определенных примерах фунгицид может включать соединения, которые могут являться фунгистатическими или фунгицидными. В определенных примерах фунгицид может представлять собой защитное средство или средства, которые эффективны преимущественно на поверхности семян, обеспечивая защиту против патогенных микроорганизмов на поверхности семян и обеспечивая определенный уровень контроля почвенных патогенных микроорганизмов. Неограничивающие примеры защитных фунгицидов включают каптан, манеб, тирам или флудиоксонил.[0254] In certain examples, the fungicide may include a compound or a chemical or biological agent that can inhibit or kill the fungus. In certain examples, the fungicide may include compounds that may be fungistatic or fungicidal. In certain instances, the fungicide may be a preservative or agents that are effective primarily on the surface of the seed, providing protection against pathogens on the surface of the seed and providing some level of control of soil pathogens. Non-limiting examples of protective fungicides include captan, maneb, thiram, or fludioxonil.
[0255] В определенных примерах фунгицид может представлять собой системный фунгицид, который может всасываться в растущий проросток и ингибировать или уничтожать гриб внутри тканей растений-хозяев. Системные фунгициды, используемые для пропитки семян в качестве неограничивающих примеров включают следующее: азоксистробин, карбоксин, мефеноксам, металаксил, тиабендазол, трифлоксистробин и различные триазоловые фунгициды, включающие дифеноконазол, ипконазол, тебуконазол и тритиконазол. Мефеноксам и металаксил преимущественно используют для воздействия на грибы водяной плесени Pythium и Phytophthora. Определенные фунгициды являются более предпочтительными, чем другие в зависимости от вида растения вследствие незначительных различий в чувствительности патогенных видов грибов или вследствие различий распределения фунгицидов или чувствительности растений. В определенных примерах фунгицид может представлять собой биологическое средство контроля, такое как бактерия или гриб. Такие организмы могут являться паразитами патогенных грибов или секретировать токсины или другие вещества, которые могут уничтожать или иным образом предотвращать рост грибов. В составе для семян в качестве контрольного средства можно использовать любой тип фунгицида, особенно фунгициды, которые широко используются у растений.[0255] In certain examples, the fungicide may be a systemic fungicide that can be absorbed into the growing seedling and inhibit or kill the fungus within host plant tissues. Systemic fungicides used for seed treatment include, but are not limited to, the following: azoxystrobin, carboxin, mefenoxam, metalaxyl, thiabendazole, trifloxystrobin, and various triazole fungicides including difenoconazole, ipconazole, tebuconazole, and triticonazole. Mefenoxam and metalaxyl are predominantly used to attack Pythium and Phytophthora water molds. Certain fungicides are preferred over others depending on the plant species due to minor differences in susceptibility of pathogenic fungal species or due to differences in fungicide distribution or plant susceptibility. In certain instances, the fungicide may be a biological control such as a bacterium or fungus. Such organisms may be parasites of pathogenic fungi or secrete toxins or other substances that can destroy or otherwise prevent the growth of fungi. Any type of fungicide can be used as a control agent in a seed formulation, especially fungicides that are widely used in plants.
[0256] В определенных примерах композиция покрытия для семян содержит средство для контроля, которое обладает антибактериальными свойствами. В одном из вариантов осуществления средство для контроля с антибактериальными свойствами выбрано из соединений, описываемых в других разделах настоящего документа. В другом варианте осуществления соединение представляет собой стрептомицин, окситетрациклин, оксолиновая кислота или гентамицин. Другие примеры антибактериальных соединений, которые можно использовать в качестве части композиции покрытия для семян включают соединения на основе дихлорофена и гемиформаля бензилового спирта (Proxel®, производимый ICI, или Acticide® RS, производимый Thor Chemie, и Kathon® MK 25, производимый Rohm & Haas) и производные изотиазолинона, такие как алкилизотиазолиноны и бензизотиазолиноны (Acticide® MBS, производимые Thor Chemie).[0256] In certain examples, the seed coating composition contains a control agent that has antibacterial properties. In one embodiment, the antibacterial control agent is selected from the compounds described elsewhere herein. In another embodiment, the compound is streptomycin, oxytetracycline, oxolinic acid, or gentamicin. Other examples of antibacterial compounds that can be used as part of a seed coating composition include compounds based on dichlorophene and benzyl alcohol hemiformal (Proxel® available from ICI or Acticide® RS available from Thor Chemie and
[0257] В определенных примерах регулятор роста выбран из группы, состоящей из: абсцизовой кислотаы, амидохлора, анцимидола, 6-бензиламинопурина, брассинолида, бутралина, хлормеквата (хлорида хлормекват), холинхлорида, цикланилида, даминозида, дикегулака, диметипина, 2,6-диметилпуридина, этефона, флуметралина, флурпримидола, флутиацета, форхлорфенурона, гибберелловой кислоты, инабенфида, индол-3-уксусной кислоты, малеиновог гидразида, мефлуидида, мепиквата (хлорида мепиквата), нафталинуксусной кислоты, N-6-бензиладенина, паклобутразола, фосфотритиоата прогексадиона, 2,3,5-три-йодобензойной кислоты, тринексапакэтила и униконазола. Дополнительные неограничивающие примеры регуляторов роста включают брассиностероиды, цитокинины (например, кинетин и зеатин), ауксины (например, индолилуксусную кислоту и индолилацетиласпартат), флавоноиды и изофлавоноиды (например, формононетин и диосметин), фитоауксины (например, глицеоллин) и индуцируемые фитоалексинами олигосахариды (например, пектин, хитин, хитозан, полигалактуроновая кислота и олигогалактуроновая кислота) и гибеллерины. Такие средства в идеале совместимы с сельскохозяйственными семенами или всходами, на которые наносят состав (например, он не должен быть вреден для роста или здоровья растений). Кроме того, в идеале средство представляет собой средство, которое не представляет угрозу безопасности применения для человека, животного или промышленного (например, отсутствие угроз безопасности или соединение является в достаточной степени нестабильным так, что потребляемый растительный продукт, получаемый из растения, содержит незначительные количества этого соединения).[0257] In certain examples, the growth regulator is selected from the group consisting of: abscisic acid, amidochlor, ancymidol, 6-benzylaminopurine, brassinolide, butralin, chlormequat (chlormequat chloride), choline chloride, cyclanilide, daminoside, dikegulac, dimethypine, 2,6- dimethylpuridine, ethephon, flumetralin, flurprimidol, fluthiacet, forchlorfenuron, gibberellic acid, inabenfide, indole-3-acetic acid, maleic hydrazide, mefluidide, mepiquat (mepiquat chloride), naphthaleneacetic acid, N-6-benzyladenine, paclobutrazole, phosphotriti prohexadione oate, 2 ,3,5-tri-iodobenzoic acid, trinexapacethyl and uniconazole. Additional non-limiting examples of growth regulators include brassinosteroids, cytokinins (eg, kinetin and zeatin), auxins (eg, indoleacetic acid and indole acetylaspartate), flavonoids and isoflavonoids (eg, formononetin and diosmetin), phytoauxins (eg, glyceollin), and phytoalexin-inducible oligosaccharides (eg. , pectin, chitin, chitosan, polygalacturonic acid and oligogalacturonic acid) and gibellerins. Such agents are ideally compatible with the agricultural seed or seedling to which the composition is applied (eg, it must not be harmful to plant growth or health). In addition, ideally, the agent is an agent that does not pose a safety hazard to human, animal, or industrial use (e.g., no safety hazards, or the compound is sufficiently unstable such that a consumable herbal product derived from the plant contains negligible amounts of it). connections).
[0258] Определенные примеры антагонистичных нематодам средств биоконтроля, включают ARF18; 30 видов Arthrobotrys; виды Chaetomium; виды Cylindrocarpon; виды Exophilia; виды Fusarium; виды Gliocladium; виды Hirsutella; виды Lecanicillium; виды Monacrosporium; виды Myrothecium; виды Neocosmospora; виды Paecilomyces; виды Pochonia; виды Stagonospora; везикулярно-арбускулярные микоризные грибы, виды Burkholderia; виды Pasteuria, виды Brevibacillus; виды Pseudomonas и Rhizobacteria. Особенно предпочтительные антагонистичные нематодам средства биоконтроля включают ARF18, Arthrobotrys oligospora, Arthrobotrys dactyloides, Chaetomium globosum, Cylindrocarpon heteronema, Exophilia jeanselmei, Exophilia pisciphila, Fusarium aspergilus, Fusarium solani, Gliocladium catenulatum, Gliocladium roseum, Gliocladium vixens, Hirsutella rhossiliensis, Hirsutella minnesotensis, Lecanicillium lecanii, Monacrosporium drechsleri, Monacrosporium gephyropagum, Myrotehcium verrucaria, Neocosmospora vasinfecta, Paecilomyces lilacinus, Pochonia chlamydosporia, Stagonospora heteroderae, Stagonospora phaseoli, везикулярно-арбускулярные микоризные грибы, Burkholderia cepacia, Pasteuria penetrans, Pasteuria thornei, Pasteuria nishizawae, Pasteuria ramosa, Pastrueia usage, штамм G4 Brevibacillus laterosporus, Pseudomonas fluorescens и Rhizobacteria.[0258] Certain examples of antagonistic nematode biocontrol agents include ARF18; 30 species of Arthrobotrys ; Chaetomium species; species of Cylindrocarpon ; Exophilia species; Fusarium species; species of Gliocladium ; Hirsutella species; Lecanicillium species; species of Monacrosporium ; Myrothecium species; Neocosmospora species; Paecilomyces species; species of Pochonia ; species of Stagonospora ; vesicular-arbuscular mycorrhizal fungi , Burkholderia species; Pasteuria spp., Brevibacillus spp.; Pseudomonas and Rhizobacteria species. Particularly preferred nematode antagonist biocontrol agents include ARF18, Arthrobotrys oligospora , Arthrobotrys dactyloides , Chaetomium globosum , Cylindrocarpon heteronema , Exophilia jeanselmei , Exophilia pisciphila , Fusarium aspergilus , Fusarium solani , Gclaliodium catenulatum , Gliocladium roseum , Gliocladium vixens , Hirsutella rhossiliensis , Hirsutella minnesotensis , Lecanicillium lecanii , Monacrosporium drechsleri , Monacrosporium gephyropagum , Myrotehcium verrucaria , Neocosmospora vasinfecta , Paecilomyces lilacinus , Pochonia chlamydosporia , Stagonospora heteroderae , Stagonospora phaseoli , vesicular-arbuscular mycorrhizal fungi , Burkholderia ce pacia , Pasteuria penetrans , Pasteuria thornei , Pasteuria nishizawae , Pasteuria ramosa , Pastrueia usage , strain G4 Brevibacillus laterosporus , Pseudomonas fluorescens and Rhizobacteria .
[0259] Определенные примеры питательных вещества можно выбрать из группы, состоящей из азотных удобрений, включающих в качестве неограничивающих примеров мочевину, нитрат аммония, сульфат аммония, безнапорные азотные растворы, водный аммиак, безводный аммиак, тиосульфат аммония, покрытую серой мочевину, мочевины-формальдегидов, IBDU, покрытую полимерами мочевину, нитрат кальция, уреаформ и метиленмочевину, фосфорные удобрения, такие как дифосфат аммония, монофосфат аммония, полифосфат аммония, концентрированный суперфосфат и тройной суперфосфат, и калийные удобрения, такие как хлорид калия, сульфат калия, сульфат калия-магния, нитрат калия. Такие композиции в композиции для покрытия семян могут находиться в виде свободных солей или ионов. Альтернативно, питательные вещества/удобрения можно формировать в виде комплексных или хелатированных соединений с обеспечением длительного высвобождения в течение продолжительного периода.[0259] Specific examples of nutrients can be selected from the group consisting of nitrogen fertilizers, including, but not limited to, urea, ammonium nitrate, ammonium sulfate, non-pressure nitrogen solutions, aqueous ammonia, anhydrous ammonia, ammonium thiosulfate, sulfur-coated urea, urea-formaldehydes , IBDU, polymer-coated urea, calcium nitrate, ureaform and methylene urea, phosphate fertilizers such as ammonium diphosphate, ammonium monophosphate, ammonium polyphosphate, concentrated superphosphate and triple superphosphate, and potash fertilizers such as potassium chloride, potassium sulfate, potassium magnesium sulfate , potassium nitrate. Such compositions in the seed coating composition may be in the form of free salts or ions. Alternatively, the nutrients/fertilizers can be complexed or chelated to provide sustained release over an extended period.
[0260] Определенные примеры родентицидов можно выбирать из группы веществ, состоящей из 2-изовалерилиндан-1,3-диона, 4-(хиноксалин-2-иламино)бензолсульфонамида, альфа-хлоргидрина, фосфида алюминия, альфа-нафтилтиомочевины, оксида мышьяка, карбоната бария, бистиосеми, бродифакума, бромадиолона, брометалина, цианида кальций, хлоралозы, хлорофацинона, холекальциферола, кумахлора, кумафурила, куматетралила, кримидина, дифенакума, дифетиалона, дифацинона, эргокальциферола, флокумафена, фторацетамида, флупропадина, гидрохлорида флупропадина, цианида водорода, йодометана, линдана, фосфида магния, метилбромида, норбормида, фосацетима, фосфина, фосфора, пиндона, арсенита калия, пиринурона, скиллирозида, арсенита натрия, цианида натрий, фторацетата натрия, стрихнина, сульфата талия, варфарина и фосфида цинка.[0260] Specific examples of rodenticides can be selected from the group consisting of 2-isovalerylindan-1,3-dione, 4-(quinoxalin-2-ylamino)benzenesulfonamide, alpha-chlorohydrin, aluminum phosphide, alpha-naphthylthiourea, arsenic oxide, carbonate barium, bistiosemi, brodifacoum, bromadiolone, bromethalin, calcium cyanide, chloralose, chlorophacinone, cholecalciferol, cumachlor, coumafuril, coumatetralyl, crimidine, difenacum, difetialon, difacinone, ergocalciferol, flocumafen, fluoroacetamide, flupropadine, hydrochloride f lupropadine, hydrogen cyanide, iodomethane, lindane , magnesium phosphide, methyl bromide, norbormide, fosacetim, phosphine, phosphorus, pindone, potassium arsenite, pyrinuron, skylyroside, sodium arsenite, sodium cyanide, sodium fluoroacetate, strychnine, thallium sulfate, warfarin, and zinc phosphide.
[0261] В жидкой форме, например, в растворе или суспензии, бактериальные популяции можно смешивать или суспендировать в воде или в водных растворах. Подходящие жидкие разбавители или носители включают воду, водные растворы, нефтяные дистилляты или другие жидкие носители.[0261] In liquid form, for example, in solution or suspension, bacterial populations can be mixed or suspended in water or in aqueous solutions. Suitable liquid diluents or carriers include water, aqueous solutions, petroleum distillates, or other liquid carriers.
[0262] Твердые композиции можно получать посредство диспергирования бактериальных популяций в соответствующим образом измельченном твердом носителе и на нем, таком как торф, пшеница, отруби, вермикулит, глина, тальк, бентонит, диатомовая земля, фуллерова глина, пастеризованная почва и т.п. Когда такие составы используют в качестве смачиваемых порошков, можно использовать биологически совместимые диспергирующие средства, такие как неионные, анионные, амфотерные или катионные диспергирующие средства и эмульгаторы.[0262] Solid compositions can be prepared by dispersing bacterial populations in and on a suitably pulverized solid carrier such as peat, wheat, bran, vermiculite, clay, talc, bentonite, diatomaceous earth, fuller's clay, pasteurized soil, and the like. When such formulations are used as wettable powders, biocompatible dispersants such as non-ionic, anionic, amphoteric or cationic dispersants and emulsifiers can be used.
[0263] Твердые носители, используемые в составе включают, например, минеральные носители, такие как каолиновая глина, пирофиллит, бентонит, монтмориллонит, диатомовая земля, кислая белая земля, вермикулит и перлит, и неорганические соли, такие как сульфат аммония, фосфат аммония, нитрат аммония, мочевина, хлорид аммония и карбонат кальция. Также можно использовать органические тонкодисперсные порошки, такие как пшеничная мука, пшеничные отруби и рисов отруби. Жидкие носители включают растительные масла, такие как соевое масло и хлопковое масло, глицерин, этиленгликоль, полиэтиленгликоль, пропиленгликоль, полипропиленгликоль и т.д.[0263] Solid carriers used in the formulation include, for example, mineral carriers such as kaolin clay, pyrophyllite, bentonite, montmorillonite, diatomaceous earth, acid white earth, vermiculite, and perlite, and inorganic salts such as ammonium sulfate, ammonium phosphate, ammonium nitrate, urea, ammonium chloride and calcium carbonate. Organic fine powders such as wheat flour, wheat bran and rice bran can also be used. Liquid carriers include vegetable oils such as soybean oil and cottonseed oil, glycerin, ethylene glycol, polyethylene glycol, propylene glycol, polypropylene glycol, and the like.
Применение популяций бактерий для сельскохозяйственных культурApplication of bacterial populations for crops
[0264] Композицию бактерий или популяцию бактерий, описываемые в настоящем документе, можно наносить в борозду, в форме талька или в виде пропитки для семян. Композицию можно наносить на упаковку семян в целом, миниобъеме, в мешке или в тальке.[0264] The bacterial composition or population of bacteria described herein can be applied to the furrow, in the form of talc, or as a seed coat. The composition can be applied to the package of seeds in general, mini-volume, in a bag or in talc.
[0265] Сельхозпроизводитель может высаживать обработанные семена и выращивать сельскохозяйственную культуру общепринятыми способами, двумя рядами или способами, не требующими обработки почвы. Семена можно распределять с использованием контрольного бункера или отдельного бункера. Семена также можно распределять с помощью сжатого воздуха или вручную. Посев семян можно проводить с использованием технологий с переменной скоростью. Кроме того, с использованием технологий с переменной скоростью может проводить нанесение бактерий или популяций бактерий, описываемых в настоящем документе. В определенных примерах бактерии можно наносить на семена кукурузы, сои, канолы, сорго, картофеля, риса, овощей, злаков, псевдозерновых и семена масличных культур. Примеры злаков могут включать ячмень, фонио, овес, траву пальмера, рожь, жемчужное просо, сорго, полбу, тэфф, тритикале и пшеницу. Примеры псевдозерновых могут включать грецкий орех, гречиху, полевой хвощ, чиа, лен, зерновой амарант, ганзу, киноа и кунжут. В определенных примерах семена могут являться генетически модифицированными организмами (GMO), не GMO, органическими или общепринятыми.[0265] The farmer can plant the treated seeds and grow the crop in conventional, two-row, or no-till methods. Seed can be distributed using the control hopper or a separate hopper. Seeds can also be distributed using compressed air or manually. Seeding of seeds can be carried out using technologies with variable speed. In addition, using technologies with variable speed can carry out the application of bacteria or populations of bacteria described in this document. In certain examples, the bacteria can be applied to corn, soybean, canola, sorghum, potato, rice, vegetable, cereal, pseudocereal and oilseed seeds. Examples of cereals may include barley, fonio, oats, palmer grass, rye, pearl millet, sorghum, spelt, teff, triticale and wheat. Examples of pseudocereals may include walnut, buckwheat, horsetail, chia, flax, grain amaranth, ganza, quinoa, and sesame. In certain instances, the seeds may be genetically modified organisms (GMO), non-GMO, organic, or conventional.
[0266] Кроме обработки сельскохозяйственных культур можно использовать добавки, такие как микроудобрение, PGR, гербицид, инсектицид и фунгицид. Примеры добавок включают защитные средства для сельскохозяйственных культур, такие как инсектициды, нематоциды, фунгициды, укрепляющие средства, такие как красители, полимеры, пеллетирование, примирование, и дезинфицирующие средства и другие средства, такие как инокулятор, PGR, смягчитель и питательные микроэлементы. PGR могут представлять собой природные или синтетические гормоны растений, которые влияют на рост корня, цветение или удлинение стебля. PGR могут включать ауксины, гиббереллины, цитокины, этилен и абсцизовую кислоту (ABA).[0266] In addition to crop treatment, additives such as microfertilizer, PGR, herbicide, insecticide, and fungicide can be used. Examples of additives include crop protectants such as insecticides, nematocides, fungicides, strengthening agents such as dyes, polymers, pelletizing, priming, and disinfectants, and other agents such as an inoculant, PGR, softener, and micronutrients. PGRs can be natural or synthetic plant hormones that affect root growth, flowering, or stem elongation. PGRs may include auxins, gibberellins, cytokines, ethylene, and abscisic acid (ABA).
[0267] Композицию можно наносить в борозду в комбинации с жидким удобрением. В определенных примерах жидкое удобрение можно содержать в резервуарах. Удобрения NPK содержат макробиогенные вещества с натрием, фосфором и калием.[0267] The composition can be applied to the furrow in combination with a liquid fertilizer. In certain instances, the liquid fertilizer may be contained in tanks. NPK fertilizers contain macronutrients with sodium, phosphorus and potassium.
[0268] Композиция может улучшать свойства растений, например, способствуя росту растений, поддерживая высокое содержание хлорофилла в листьях, увеличивая количества плодов или семян и увеличивая массу единичных плодов или семян. Способы по настоящему изобретению можно использовать для добавления или улучшения одного или нескольких из ряда требуемых свойств. Примеры свойств которые можно добавлять или улучшать включают: биомассу корня, длина корня, высоту, высоту побега, количество листьев, эффективность использования воды, общую биомассу, урожайность, размер плода, размер зерен, интенсивность фотосинтеза, засухоустойчивость, жароустойчивость, солеустойчивость, устойчивость к стрессу с низким содержанием азота, эффективность использования азота, устойчивость к воздействию нематод, устойчивость к грибковым патогенным микроорганизмам, устойчивость к бактериальным патогенным микроорганизмам, устойчивость к вирусным патогенным микроорганизмам, уровень метаболитов, модуляцию уровня метаболитов, экспрессию протеома. Требуемые свойства, включая высоту, общую биомассу, биомассу корня и/или побега, прорастание семян, жизнеспособность проростков, эффективность фотосинтеза, интенсивность транспирации, количество или масса семян/плодов, урожайность зерна или плодов у растения, содержание хлорофилла в листьях, интенсивность фотосинтеза, длина корня или любое их сочетание можно использовать для определения роста и сравнивать со скоростью роста эталонных сельскохозяйственных растений (например, растений без добавления и/или улучшения свойств), выращиваемых в идентичных условиях. В определенных примерах требуемые свойства, включая высоту, общую биомассу, биомассу корней и/или побегов, прорастание семян, жизнеспособность проростков, эффективность фотосинтеза, интенсивность транспирации, количество или масса семян/плодов, урожайность зерна или плодов у растения, содержание хлорофилла в листьях, интенсивность фотосинтеза, длину корня или любое их сочетание можно использовать для определения роста и сравнения с скоростью роста эталонного сельскохозяйственного растения (например, растения без добавления и/или улучшения свойств), выращиваемых в сходных условиях.[0268] The composition can improve the properties of plants, for example, promoting plant growth, maintaining a high chlorophyll content in leaves, increasing the number of fruits or seeds, and increasing the weight of single fruits or seeds. The methods of the present invention can be used to add or improve one or more of a number of desired properties. Examples of properties that can be added or improved include: root biomass, root length, height, shoot height, number of leaves, water use efficiency, total biomass, yield, fruit size, grain size, photosynthesis rate, drought tolerance, heat tolerance, salt tolerance, stress tolerance low nitrogen, nitrogen utilization efficiency, nematode resistance, fungal pathogen resistance, bacterial pathogen resistance, viral pathogen resistance, metabolite level, metabolite level modulation, proteome expression. Required properties, including height, total biomass, root and/or shoot biomass, seed germination, seedling viability, photosynthesis efficiency, transpiration rate, number or weight of seeds/fruits, grain or fruit yield per plant, leaf chlorophyll content, photosynthesis rate, root length, or any combination thereof, can be used to determine growth and compared with the growth rate of reference crop plants (eg, plants without addition and/or enhancement) grown under identical conditions. In certain examples, desired properties, including height, total biomass, root and/or shoot biomass, seed germination, seedling viability, photosynthesis efficiency, transpiration rate, number or weight of seeds/fruits, grain or fruit yield per plant, chlorophyll content in leaves, photosynthesis rate, root length, or any combination thereof can be used to determine growth and compare with the growth rate of a reference crop plant (eg, a plant without addition and/or enhancement) grown under similar conditions.
[0269] Агротехнические признаки растения-хозяина в качестве неограничивающих примеров могут включать следующие: измененное содержание масла, измененное содержание белка, измененный состав углеводов семян, измененный состав масла семян и измененный состав белка семян, химическую устойчивость, устойчивость к холоду, замедленное старение, устойчивость к болезням, устойчивость к засухе, массу початка, улучшение роста, улучшение жизнеспособности, теплоустойчивость, устойчивость к гербицидам, устойчивость к травоядным животным, улучшенную фиксацию азота, улучшенное использование азота, улучшенную архитектуру корней, улучшенную эффективность использования воды, увеличенную биомассу, увеличенную длину корней, увеличенную массу семян, увеличенный рост побегов, увеличенную урожайность, увеличенный урожай при условиях с ограничением количества воды, массу зерен, содержание влаги в зернах, толерантность к металлам, количество початков, количество зерен в початке, количество стручков, улучшение питания, устойчивость к патогенным микроорганизмам, устойчивость к вредителям, улучшение способности к фотосинтезу, устойчивость к засолению, сохранение зеленого цвета, улучшение мощности, увеличенную сухую массу зрелых семян, увеличенную сырую массу зрелых семян, увеличенное количество зрелых семян на растение, увеличенное содержание хлорофилла, увеличенное количество стручков на растение, увеличенную длину стручков на растении, уменьшенное количество увядших листьев на растении, уменьшенное количество сильно увядших листьев на растении и увеличенное количество не увядших листьев на растение, детектируемаое изменение уровня метаболита, детектируемое изменение уровня транскрипта и детектируемое изменение протеома по сравнению с растением изолинии, выращенным из семян без указанного состава препарата для обработки семян.[0269] Agronomic traits of the host plant may include, but are not limited to, the following: altered oil content, altered protein content, altered seed carbohydrate composition, altered seed oil composition and altered seed protein composition, chemical resistance, cold tolerance, delayed aging, resistance disease resistance, drought tolerance, ear weight, improved growth, improved viability, heat tolerance, herbicide tolerance, herbivore tolerance, improved nitrogen fixation, improved nitrogen utilization, improved root architecture, improved water use efficiency, increased biomass, increased root length , increased seed weight, increased shoot growth, increased yield, increased yield under water limited conditions, grain weight, grain moisture content, metal tolerance, number of cobs, number of kernels per cob, number of pods, improved nutrition, resistance to pathogenic resistance to pests, improved photosynthetic capacity, salinity tolerance, green color retention, improved vigor, increased dry weight of mature seeds, increased wet weight of mature seeds, increased number of mature seeds per plant, increased chlorophyll content, increased number of pods per plant , increased pod length per plant, reduced wilted leaves per plant, reduced severe wilted leaves per plant, and increased non-withered leaves per plant, detectable change in metabolite level, detectable change in transcript level, and detectable change in proteome compared to isoline plant grown from seeds without the specified composition of the preparation for seed treatment.
[0270] В определенных случаях растения инокулируют бактериями или популяциями бактерий, которые выделены у того же вида растения в виде составляющей инокулируемого растения. Например, бактерия или популяция бактерий, которую в норме выявляют у одного сорта Zea mays (кукурузы), ассоциирована с составляющим растения другого сорта Zea mays, у которого в его природном состоянии существует недостаток указанных бактерий и популяций бактерий. В одном варианте осуществления бактерии и популяции бактерий получают у растения родственного вида в качестве составляющей инокулированного растения. Например, бактерии и популяции бактерий, которые обычно выявляют у Zea diploperennis, Iltis et al., (Diploperennial teosinte), используют для Zea mays (кукурузы) или наоборот. В определенных случаях растения инокулируют бактериями и популяциями бактерий, которые гетерологичны по отношению к элементу растения инокулируемого растения. В одном варианте осуществления бактерии и популяции бактерий получают у растения другого вида. Например, бактерии и популяции бактерий, которые обычно выявляют у двудольных растений, применяют для однодольных растений (например, инокулируют кукурузу бактериями и популяциями бактерий, полученными из бобов сои) или наоборот. В других случаях бактерии и популяции бактерий, которые для инокуляции в растение, получают у родственных видов растения, подвергаемого инокуляции. В одном варианте осуществления бактерии и популяции бактерий получают у родственного таксона, например, у родственных видов. Растение другого вида может являться сельскохозяйственным растением. В другом варианте осуществления бактерии и популяции бактерий являются частью разработанной композиции, инокулируемой в любой элемент растения-хозяина.[0270] In certain instances, plants are inoculated with bacteria or populations of bacteria that are isolated from the same plant species as a constituent of the inoculated plant. For example, a bacterium or population of bacteria that is normally found in one cultivar of Zea mays (maize) is associated with a plant constituent of another cultivar of Zea mays that is deficient in said bacteria and bacterial populations in its natural state. In one embodiment, the bacteria and bacterial populations are obtained from a plant of a related species as a constituent of the inoculated plant. For example, bacteria and bacterial populations that are commonly found in Zea diploperennis , Iltis et al., (Diploperennial teosinte) are used for Zea mays (maize) or vice versa. In certain instances, plants are inoculated with bacteria and bacterial populations that are heterologous with respect to the plant element of the inoculated plant. In one embodiment, the bacteria and bacterial populations are obtained from a plant of another species. For example, bacteria and bacterial populations that are commonly found in dicotyledonous plants are applied to monocotyledonous plants (eg, corn is inoculated with bacteria and bacterial populations derived from soybeans) or vice versa. In other cases, the bacteria and bacterial populations to be inoculated into the plant are obtained from related species of the plant being inoculated. In one embodiment, the bacteria and bacterial populations are obtained from a related taxon, such as a related species. The plant of another species may be an agricultural plant. In another embodiment, the bacteria and bacterial populations are part of the designed composition, inoculated into any element of the host plant.
[0271] В определенных примерах бактерии или популяция бактерий являются экзогенными, где бактерии и популяция бактерий выделяют у растения, отличного от инокулируемого растения. Например, в одном из вариантов осуществления бактерии или популяция бактерий можно выделять из другого растения того же вида, что и инокулируемое растение. В определенных случаях бактерии или популяция бактерий можно выделять у видов, родственных инокулируемому растению.[0271] In certain examples, the bacteria or bacterial population is exogenous, where the bacteria and bacterial population are isolated from a plant other than the plant being inoculated. For example, in one embodiment, the bacteria or population of bacteria can be isolated from another plant of the same species as the plant being inoculated. In certain cases, the bacteria or population of bacteria can be isolated from species related to the inoculated plant.
[0272] В определенных примерах бактерии и популяции бактерий, описанные здесь, способны перемещаться от одного типа ткани к другому. Например, выявление и выделение бактерий и популяций бактерий по настоящему изобретению в зрелых тканях растений после нанесения покрытия на внешнюю поверхность семян демонстрирует их способность перемещаться из снаружи семян в вегетативные ткани созревающего растения. Таким ообразом, в одном из вариантов осуществления популяция бактерий и популяций бактерий способна перемещаться снаружи семян в вегетативные ткани растения. В одном из вариантов осуществления бактерии и популяции бактерий, которые наносят на семена растения, при прорастании семени в вегетативное состояние способны к локализации в других тканях растения. Например, бактерии и популяции бактерий могут быть способными к локализации в любой из тканей растения, в том числе: корне, добавочном корне, зародышевом корне, корневом волоске, побеге, листе, цветке, почке, метелке, меристеме, пыльце, пестике, завязи, тычинке, плоде, подземном побеге, корневом побеге, клубеньке, клубне, трихоме, защитных клетках, гидатоде, лепестке, чашелистике, оболочке зерна, оси колоса, сосудистом камбии, флоэме и ксилеме. В одном из вариантов осуществления бактерии и популяции бактерий способны к локализации в корне и/или корневых волосках растения. В другом варианте осуществления бактерии и популяции бактерий способны к локализации в фотосинтезирующих тканях, например листьях и побегах растения. В других случаях бактерии и популяции бактерий локализованы в сосудистых тканях растения, например, в ксилеме и флоэме. В еще одном из вариантов осуществления бактерии и популяции бактерий способны к локализации в репродуктивных тканях (цветке, пыльце, пестике, завязи, тычинке, плоде) растения. В другом варианте осуществления бактерии и популяции бактерий способны к локализации в корне, побегах, листьях и репродуктивных тканях растения. В еще одном из вариантов осуществления бактерии и популяции бактерий колонизируют плод или семенную ткань растения. В еще одном из вариантов осуществления бактерии и популяции бактерий способны колонизировать растение таким образом, что они находятся на поверхности растения (то есть их присутствие детектируют на внешней стороне растения или в эписфере растения). В других вариантах осуществления бактерии и популяции бактерий способны к локализации по существу во всем растении или во всех тканях растения. В определенных вариантах осуществления бактерии и популяции бактерий не локализованы в корне растения. В других случаях бактерии и популяции бактерий не локализованы в фотосинтезирующих тканях растения.[0272] In certain examples, the bacteria and bacterial populations described herein are capable of moving from one type of tissue to another. For example, detection and isolation of the bacteria and bacterial populations of the present invention in mature plant tissues after coating the outer surface of the seed demonstrates their ability to migrate from the outside of the seed into the vegetative tissues of the mature plant. Thus, in one embodiment, the bacterial population and bacterial populations are capable of moving from outside the seed into the vegetative tissues of the plant. In one embodiment, the bacteria and bacterial populations that are applied to the seeds of a plant are capable of localizing to other tissues of the plant when the seed germinates into a vegetative state. For example, bacteria and populations of bacteria may be capable of localization in any of the tissues of a plant, including: root, accessory root, germinal root, root hair, shoot, leaf, flower, bud, panicle, meristem, pollen, pistil, ovary, stamen, fruit, underground shoot, root shoot, nodule, tuber, trichome, guard cells, hydathode, petal, sepal, grain coat, spike axis, vascular cambium, phloem and xylem. In one embodiment, the bacteria and bacterial populations are capable of localizing to the root and/or root hairs of a plant. In another embodiment, the bacteria and populations of bacteria are capable of localization in photosynthetic tissues, such as leaves and shoots of a plant. In other cases, bacteria and bacterial populations are localized in plant vascular tissues, such as xylem and phloem. In yet another embodiment, the bacteria and bacterial populations are capable of localization in the reproductive tissues (flower, pollen, pistil, ovary, stamen, fruit) of the plant. In another embodiment, the bacteria and bacterial populations are capable of localization in the root, shoots, leaves and reproductive tissues of a plant. In yet another embodiment, the bacteria and bacterial populations colonize the fruit or seed tissue of the plant. In yet another embodiment, the bacteria and bacterial populations are capable of colonizing the plant such that they reside on the surface of the plant (ie, their presence is detected on the outside of the plant or in the plant's episphere). In other embodiments, the bacteria and bacterial populations are capable of localizing to substantially the entire plant or all tissues of the plant. In certain embodiments, the bacteria and bacterial populations are not located in the root of the plant. In other cases, bacteria and bacterial populations are not localized in the photosynthetic tissues of the plant.
[0273] Эффективность композиций также можно оценивать определяя относительную зрелость сельскохозяйственной культуры или тепловые единицы сельскохозяйственной культуры (CHU). Например, популяцию бактерий можно наносить на кукурузу, и рост кукурузы можно оценивать в соответствии с относительной зрелость зерна кукурузы или по времени за которое зерно кукурузы достигает максимальной массы. Также для прогноза созревания кукурузы можно использовать тепловые единицы сельскохозяйственных культур (CHU). CHU определяют количество накопленной теплоты посредством определения суточного максимума температур при росте сельскохозяйственной культуры.[0273] The effectiveness of the compositions can also be assessed by determining the relative maturity of the crop or crop heat units (CHU). For example, a population of bacteria can be applied to corn, and corn growth can be judged according to the relative maturity of the corn grain or the time it takes for the corn kernel to reach its maximum weight. Crop heat units (CHU) can also be used to predict maize maturation. CHU determine the amount of stored heat by determining the daily maximum temperatures during crop growth.
[0274] В примерах бактерии могут локализоваться в любой из тканей растения, в том числе: корне, добавочном корне, зародышевом корне, корневом волоске, побеге, листе, цветке, почке, метелке, меристеме, пыльце, пестике, завязи, тычинке, плоде, подземном побеге, корневом побеге, клубеньке, клубне, трихоме, защитных клетках, гидатоде, лепестке, чашелистике, оболочке зерна, оси колоса, сосудистом камбии, флоэме и ксилеме. В другом варианте осуществления бактерия или популяция бактерий способны к локализации в фотосинтезирующих тканях, например листьях и побегах растения. В других случаях бактерии и популяции бактерий локализуются в сосудистых тканях растения, например, в ксилеме и флоэме. В другом варианте осуществления бактерия или популяция бактерий способны к локализации в репродуктивных тканях (цветке, пыльце, пестике, завязи, тычинке или плоде) растения. В другом варианте осуществления бактерии и популяции бактерий способны к локализации в корне, побегах, листьях и репродуктивных тканях растения. В другом варианте осуществления бактерии или популяция бактерий колонизируют плод или семенную ткань растения. В еще одном варианте осуществления бактерии или популяция бактерий способны колонизировать растение так, что они находятся на поверхности растения. В другом варианте осуществления бактерии или популяция бактерий способны к локализации по существу во всем растении или во всех тканях растения. В определенных вариантах осуществления бактерии или популяция бактерий не локализованы в корне растения. В других случаях бактерии и популяции бактерий не локализованы в фотосинтезирующих тканях растения.[0274] In examples, bacteria can be localized in any of the plant tissues, including: root, accessory root, germinal root, root hair, shoot, leaf, flower, bud, panicle, meristem, pollen, pistil, ovary, stamen, fruit , underground shoot, root shoot, nodule, tuber, trichome, guard cells, hydathode, petal, sepal, grain coat, spike axis, vascular cambium, phloem and xylem. In another embodiment, the bacterium or population of bacteria is capable of localization in photosynthetic tissues, such as leaves and shoots of a plant. In other cases, bacteria and bacterial populations are localized in the vascular tissues of the plant, such as the xylem and phloem. In another embodiment, the bacterium or population of bacteria is capable of localization in the reproductive tissues (flower, pollen, pistil, ovary, stamen, or fruit) of the plant. In another embodiment, the bacteria and bacterial populations are capable of localization in the root, shoots, leaves and reproductive tissues of a plant. In another embodiment, the bacteria or population of bacteria colonize the fruit or seed tissue of the plant. In yet another embodiment, the bacteria or population of bacteria are capable of colonizing the plant such that they reside on the surface of the plant. In another embodiment, the bacteria, or population of bacteria, is capable of localizing to substantially the entire plant or all tissues of the plant. In certain embodiments, the bacteria or population of bacteria is not located in the root of the plant. In other cases, bacteria and bacterial populations are not localized in the photosynthetic tissues of the plant.
[0275] Эффективность бактериальных композиций, наносимых на сельскохозяйственные культуры можно оценивать, определяя различные свойства роста сельскохозяйственной культуры, включая в качестве неограничивающих примеров норму высева, мощность посева, силу корня, засухоустойчивость, высоту растения, сухую и тестовую массу.[0275] The effectiveness of bacterial compositions applied to crops can be assessed by determining various crop growth properties, including, but not limited to, seeding rate, planting power, root strength, drought tolerance, plant height, dry weight, and test weight.
Виды растенийplant species
[0276] Способы и бактерии, описываемые в настоящем документе, подходят для любого из множества растений, таких как растения родов Hordeum, Oryza, Zea и Triticeae. Другие неограничивающие примеры подходящих растений включают мхи, лишайники и водоросли. В некоторых случаях растения имеют экономическое, социальное и/или природоохранное значение, являясь продовольственными культурами, волокнистыми сельскохозяйственными культурами, масличными культурами, растениями, используемыми в лесной или целлюлозно-бумажной промышленности, сырьем для получения биотоплива и/или декоративными растениями. В определенных примерах растения можно использовать для продукции экономически значимых продуктов, таких как зерно, мука тонкого помола, крахмал, сироп, мука грубого помола, масло, пленка, упаковка, биологические добавки, волокнистая масса, корм для животных, корм для рыб, материал основы для промышленных химикатов, хлебопродукты, обработанный пищевой продукт для человека, сахар, спирт и/или белок. Неограничивающие примеры сельскохозяйственных культур включают кукурузу, рис, пшеницу, ячмень, сорго, просо, овес, рожь тритикале, гречиху, сахарную кукурузу, сахарный тростник, репчатый лук, томаты, клубнику и спаржу.[0276] The methods and bacteria described herein are suitable for any of a variety of plants, such as plants of the genera Hordeum, Oryza, Zea, and Triticeae . Other non-limiting examples of suitable plants include mosses, lichens and algae. In some cases, plants are of economic, social and/or environmental importance as food crops, fiber crops, oilseeds, plants used in the forestry or pulp and paper industry, biofuel feedstock and/or ornamental plants. In certain examples, plants can be used to produce economically valuable products such as grains, fine flour, starch, syrup, wholemeal, oil, film, packaging, biological additives, pulp, animal feed, fish food, base material. for industrial chemicals, baked goods, processed human food, sugar, alcohol and/or protein. Non-limiting examples of crops include corn, rice, wheat, barley, sorghum, millet, oats, triticale rye, buckwheat, sweet corn, sugarcane, onions, tomatoes, strawberries, and asparagus.
[0277] В определенных примерах растения, которые можно получать или улучшать способами и композициями, описываемыми в настоящем документе, может включать растения, которые являются важными или представляют интерес для сельского хозяйства, садоводства, биомассы для получения молекул биотоплива и других химических веществ, и/или для лесоводства. Определенные примеры этих растений могут включать ананас, банан, кокос, лилии, травяной горох и травы; и двудольные растения, такие как, например, горох, люцерна, физалис, дыня, нут, цикорий, клевер, кочанную капусту, чечевицу, сою, табак, картофель, батат, редис, огородную капусту, рапс, яблоневые деревья, виноград, хлопок, подсолнечник, арабидопсис, канолу, цитрусовые (включая апельсин, мандарин, кумкват, лимон, лайм, грейпфрут, тангерин, танжело, цитрон и помело), перец, фасоль и латук, Panicum virgatum (кисть), Sorghum bicolor (сорго, Судан), Miscanthus giganteus (мискантус), вид Saccharum (сахарный тростник), Populus balsamifera (тополь), Zea mays (кукуруза), Glycine max (соя), Brassica napus (канола), Triticum aestivum (пшеница), Gossypium hirsutum (хлопок), Oryza sativa (рис), Helianthus annuus (подсолнечник), Medicago sativa (люцерна), Beta vulgaris (сахарная свекла), Pennisetum glaucum (просо американское), виды Panicum виды Sorghum, виды Miscanthus, виды Saccharum, виды Erianthus, виды Populus, Secale cereale (рожь), виды Salix (верба), виды Eucalyptus (эвкалипт), виды Triticosecale (пшеница - 25 пшеница X рожь), Bamboo, Carthamus tinctorius (сафлор), Jatropha curcas (ятрофа), Ricinus communis (клещевина), Elaeis guineensis (масличная пальма), Phoenix dactylifera (финиковая пальма), Archontophoenix cunninghamiana (королевская пальма), Syagrus romanzoffiana (арекаструм), Linum usitatissimum (лен), Brassica juncea, Manihot esculenta (маниок), Lycopersicon esculentum (томат), Lactuca saliva (латук), Musa paradisiaca (банан), Solanum tuberosum (картофель), Brassica oleracea (брокколи, цветная капуста, брюссельская капуста), Camellia sinensis (чай), Fragaria ananassa (клубника), Theobroma cacao (какао), Coffea arabica (кофе), Vitis vinifera (виноград), Ananas comosus (ананас), Capsicum annum (острый и сладкий перец), Allium cepa (лук), Cucumis melo (дыня), Cucumis sativus (огурец), Cucurbita maxima (тыква), Cucurbita moschata (тыква), Spinacea oleracea (шпинат), Citrullus lanatus (арбуз), Abelmoschus esculentus (окра), Solanum melongena (баклажан), Papaver somniferum (опиумный мак), Papaver orientale, Taxus baccata, Taxus brevifolia, Artemisia annua, Cannabis saliva, Camptotheca acuminate, Catharanthus roseus, Vinca rosea, Cinchona officinalis, Coichicum autumnale, Veratrum californica, Digitalis lanata, Digitalis purpurea, виды Dioscorea 5, Andrographis paniculata, Atropa belladonna, Datura stomonium, виды Berberis, виды Cephalotaxus, Ephedra sinica, виды Ephedra, Erythroxylum coca, Galanthus wornorii, виды Scopolia, Lycopodium serratum (Huperzia serrata), виды Lycopodium, Rauwolfia serpentina, виды Rauwolfia, Sanguinaria canadensis, виды Hyoscyamus, Calendula officinalis, Chrysanthemum parthenium, Coleus forskohlii, Tanacetum parthenium, Parthenium argentatum (гваюла), виды Hevea (каучук), Mentha spicata (мята), Mentha piperita (мята), Bixa orellana, виды Alstroemeria, виды Rosa (роза), Dianthus caryophyllus (гвоздика), виды Petunia (петуния), Poinsettia pulcherrima (пуанзеция), Nicotiana tabacum (табак), Lupinus albus (люпин), Uniola paniculata (овес), Hordeum vulgare (ячмень) и виды Lolium (рожь).[0277] In certain examples, plants that can be obtained or improved by the methods and compositions described herein may include plants that are important or of interest to agriculture, horticulture, biomass for the production of biofuel molecules and other chemicals, and/ or for forestry. Certain examples of these plants may include pineapple, banana, coconut, lilies, grass peas, and herbs; and dicotyledonous plants such as, for example, peas, alfalfa, physalis, melon, chickpeas, chicory, clover, cabbage, lentils, soybeans, tobacco, potatoes, sweet potatoes, radishes, kale, rapeseed, apple trees, grapes, cotton, sunflower, arabidopsis, canola, citrus fruits (including orange, tangerine, kumquat, lemon, lime, grapefruit, tangerine, tangelo, citron and pomelo), pepper, beans and lettuce, Panicum virgatum (brush), Sorghum bicolor (sorghum, Sudan), Miscanthus giganteus (miscanthus), Saccharum species (sugarcane), Populus balsamifera (poplar), Zea mays (maize), Glycine max (soybean), Brassica napus (canola), Triticum aestivum (wheat), Gossypium hirsutum (cotton), Oryza sativa (rice), Helianthus annuus (sunflower), Medicago sativa (alfalfa), Beta vulgaris (sugar beet), Pennisetum glaucum (American millet), Panicum spp. Sorghum spp ., Miscanthus spp ., Saccharum spp ., Erianthus spp ., Populus spp ., Secale cereale (rye), Salix spp. (willow), Eucalyptus spp . (eucalyptus), Triticosecale spp . (wheat - 25 wheat X rye), Bamboo , Carthamus tinctorius (safflower), Jatropha curcas (jatropha), Ricinus communis (castor bean), Elaeis guineensis ( oil palm), Phoenix dactylifera (date palm), Archontophoenix cunninghamiana (royal palm), Syagrus romanzoffiana (arecastrum), Linum usitatissimum (flax), Brassica juncea , Manihot esculenta (cassava), Lycopersicon esculentum (tomato), Lactuca saliva (lettuce) , Musa paradisiaca (banana), Solanum tuberosum (potato), Brassica oleracea (broccoli, cauliflower, Brussels sprouts), Camellia sinensis (tea), Fragaria ananassa (strawberry), Theobroma cacao (cocoa), Coffea arabica (coffee), Vitis vinifera (grape), Ananas comosus (pineapple), Capsicum annum (hot and sweet pepper), Allium cepa (onion), Cucumis melo (melon), Cucumis sativus (cucumber), Cucurbita maxima (pumpkin), Cucurbita moschata (pumpkin), Spinacea oleracea (spinach), Citrullus lanatus (watermelon), Abelmoschus esculentus (okra), Solanum melongena (eggplant), Papaver somniferum (opium poppy), Papaver orientale , Taxus baccata , Taxus brevifolia , Artemisia annua , Cannabis saliva , Camptotheca acuminate , Catharanthus roseus , Vinca rosea , Cinchona officinalis , Coichicum autumnale , Veratrum californica , Digitalis lanata , Digitalis purpurea , Dioscorea 5 spp., Andrographis paniculata , Atropa belladonna , Datura stomonium , Berberis spp., Cephalotaxus spp., Ephedra sinica , Ephedra spp., Erythroxy lum coca , Galanthus wornorii , Scopolia species , Lycopodium serratum ( Huperzia serrata ), Lycopodium species, Rauwolfia serpentina , Rauwolfia species, Sanguinaria canadensis , Hyoscyamus species, Calendula officinalis , Chrysanthemum parthenium , Coleus forskohlii , Tanacetum parthenium , Parthenium argentatum (guayule), species Hevea (rubber), Mentha spicata (mint), Mentha piperita (mint), Bixa orellana , Alstroemeria spp., Rosa spp. (rose), Dianthus caryophyllus (carnation), Petunia spp . (petunia), Poinsettia pulcherrima (poinsettia), Nicotiana tabacum (tobacco), Lupinus albus (lupine), Uniola paniculata (oats), Hordeum vulgare (barley) and Lolium species (rye).
[0278] В определенных примерах можно использовать однодольное растение. Однодольные растения принадлежат к порядкам Alismatales, Arales, Arecales, Bromeliales, Commelinales, Cyclanthales, Cyperales, Eriocaulales, Hydrocharitales, Juncales, Lilliales, Najadales, Orchidales, Pandanales, Poales, Restionales, Triuridales, Typhales, и Zingiberales. Растения, принадлежащие к классу Gymnospermae, представляют собой Cycadales, Ginkgoales, Gnetales и Pinales. В определенных примерах однодольное растение можно выбирать из группы, состоящей из кукурузы, риса, пшеницы, ячменя и сахарного тростника.[0278] In certain examples, a monocot plant can be used. Monocots belong to the orders Alismatales , Arales , Arecales , Bromeliales , Commelinales , Cyclanthales , Cyperales , Eriocaulales , Hydrocharitales , Juncales , Lilliales , Najadales , Orchidales , Pandanales , Poales , Restionales , Triuridales , Typhales , and Zingiberales . Plants belonging to the class Gymnospermae are Cycadales , Ginkgoales , Gnetales and Pinales . In certain examples, the monocot plant may be selected from the group consisting of corn, rice, wheat, barley, and sugarcane.
[0279] В определенных примерах можно использовать двудольное растение, включая растения, принадлежащие порядкам Aristochiales, Asterales, Batales, Campanulales, Capparales, Caryophyllales, Casuarinales, Celastrales, Cornales, Diapensales, Dilleniales, Dipsacales, Ebenales, Ericales, Eucomiales, Euphorbiales, Fabales, Fagales, Gentianales, Geraniales, Haloragales, Hamamelidales, Middles, Juglandales, Lamiales, Laurales, Lecythidales, Leitneriales, Magniolales, Malvales, Myricales, Myrtales, Nymphaeales, Papeverales, Piperales, Plantaginales, Plumb aginales, Podostemales, Polemoniales, Polygalales, Polygonales, Primulales, Proteales, Rafflesiales, Ranunculales, Rhamnales, Rosales, Rubiales, Salicales, Santales, Sapindales, Sarraceniaceae, Scrophulariales, Theales, Trochodendrales, Umbellales, Urticales и Violates. В определенных примерах двудольное растение можно выбирать из группы, состоящей из хлопка, сои, перца и томата.[0279] In certain examples, a dicot plant can be used, including plants belonging to the orders Aristochiales , Asterales , Batales , Campanulales , Capparales , Caryophyllales , Casuarinales , Celastrales , Cornales , Diapensales , Dilleniales , Dipsacales , Ebenales , Ericales , Eucomiales , Euphorbiales , Fabal es , Fagales , Gentianales , Geraniales , Haloragales , Hamamelidales , Middles , Juglandales , Lamiales , Laurales , Lecythidales , Leitneriales , Magniolales , Malvales , Myricales , Myrtales , Nymphaeales , Papeverales , Piperales , Plantaginales , Plumb aginales , Podostemales , Polemoniales , Polygalales , Polygonales , Primulales , Proteales , Rafflesiales , Ranunculales , Rhamnales , Rosales , Rubiales , Salicales , Santales , Sapindales , Sarraceniaceae , Scrophulariales , Theales , Trochodendrales , Umbellales , Urticales and Violates . In certain instances, the dicot may be selected from the group consisting of cotton, soy, pepper, and tomato.
[0280] В некоторых случаях улучшаемое растение трудно поддается экспериментальным условиям. Например, может пройти слишком много времени для достаточного роста сельскохозяйственной культуры, чтобы практически последовательно оценить улучшенный признак в нескольких повторениях. Таким образом, первое растение, из которого исходно выделяют бактерии, и/или множество растений, для которых применяют генетически модифицированные бактерии, могут представлять собой модельные растения, такие как растение, более поддающиеся анализу в требуемых условиях. Неограничивающие примеры модельных растений включают Setaria, Brachypodium и Arabidopsis. Способность бактерий, выделяемых способом по настоящему изобретению с использованием модельного растения, затем для подтверждения приобретения улучшенного признака можно применять для растений другого типа (например, сельскохозяйственной культуры).[0280] In some cases, the improved plant is difficult to experimental conditions. For example, it may take too long for a crop to grow sufficiently to evaluate an improved trait almost consistently across multiple iterations. Thus, the first plant from which the bacteria are initially isolated and/or the plurality of plants to which the genetically modified bacteria are used may be model plants, such as a plant more amenable to analysis under the required conditions. Non-limiting examples of model plants include Setaria , Brachypodium and Arabidopsis . The ability of bacteria isolated by the method of the present invention using a model plant can then be applied to another type of plant (eg crop) to confirm the acquisition of an improved trait.
[0281] Признаки, которые можно улучшать способами, описываемыми в настоящем документе, включают любые наблюдаемые характеристики растения, включая, например, скорость роста, рост, массу, цвет, вкус, запах, изменения продукции растением одного или нескольких соединений (включая например, метаболиты, белки, лекарственные средства, углеводы, масла и любые другие соединения). Также предусмотрен отбор растений на основе генотипической информации (например, включая профиль экспрессии генов растения в ответ на бактерии или идентификацию присутствия генетических маркеров, таких как генетические маркеры, ассоциированные с увеличенной фиксацией азота). Растения в противоположность присутствию определенного свойства или признака (таких как требуемые свойство или признак) также можно выбирать на основе отсутствия, подавления или ингибирования определенного свойства или признака (таких как нежелательные свойство или признак).[0281] Traits that can be improved by the methods described herein include any observable characteristics of a plant, including, for example, growth rate, growth, weight, color, taste, smell, changes in the plant's production of one or more compounds (including, for example, metabolites , proteins, drugs, carbohydrates, oils and any other compounds). Also contemplated is selection of plants based on genotypic information (eg, including a plant's gene expression profile in response to bacteria or identification of the presence of genetic markers, such as genetic markers associated with increased nitrogen fixation). Plants, as opposed to the presence of a particular property or trait (such as a desired property or trait), can also be selected based on the absence, suppression, or inhibition of a particular property or trait (such as an undesirable property or trait).
Концентрации и уровни применения сельскохозяйственных композицийConcentrations and application levels of agricultural compositions
[0282] Как указано выше, сельскохозяйственные композиции по настоящему изобретению, которые содержат указанные микроорганизмы, можно наносить на растения множеством способов. В двух конкретных аспектах по изобретению предусмотрена обработка в бороздах или пропитка для семян.[0282] As indicated above, the agricultural compositions of the present invention, which contain these microorganisms, can be applied to plants in a variety of ways. In two specific aspects of the invention, a furrow treatment or seed treatment is provided.
[0283] Для варианты осуществления с пропиткой для семян микроорганизмы по изобретению могут находиться на семенах во множестве концентраций. Например, микроорганизмы в пропитке для семян могут присутствовать с концентрацией КОЕ на семя: 1×101, 1×102, 1×103, 1×104, 1×105, 1×106, 1×107, 1×108, 1×109, 1×1010 или более. В конкретных аспектах пропитка для семян композиции содержат приблизительно от 1×104 до приблизительно 1×108 КОЕ на семя. В других конкретных аспектах композиция пропитки для семян содержит приблизительно от 1×105 до приблизительно 1×107 КОЕ на семя. В других аспектах композиция пропитки для семян содержат приблизительно 1×106 КОЕ на семя.[0283] For seed treatment embodiments, the microorganisms of the invention can be found on seeds at a variety of concentrations. For example, microorganisms in seed treatment may be present at a CFU concentration per seed: 1×10 1 , 1×10 2 , 1×10 3 , 1×10 4 , 1×10 5 , 1×10 6 , 1×10 7 . 1×10 8 , 1×10 9 , 1×10 10 or more. In specific aspects, the seed treatment compositions contain from about 1×10 4 to about 1×10 8 CFU per seed. In other specific aspects, the seed treatment composition contains from about 1×10 5 to about 1×10 7 CFU per seed. In other aspects, the seed impregnation composition contains approximately 1×10 6 cfu per seed.
[0284] В Соединенных Штатах Америки приблизительно 10% площади посева кукурузы засажено при плотности семян более чем приблизительно 36000 семян на акр; 1/3 площади посева кукурузы засажено при плотности семян приблизительно от 33000 до 36000 семян на акр; 1/3 площади посева кукурузы засажено при плотности семян приблизительно от 30000 до 33000 семян на акр, и оставшаяся часть площади является переменной. См., "Corn Seeding Rate Considerations", написанную Steve Butzen, доступную на https://www.pioneer.com/home/site/us/agronomy/library/corn-seeding-rate-considerations/[0284] In the United States, approximately 10% of the corn area is planted at a seed density greater than approximately 36,000 seeds per acre; 1/3 of the corn area planted at a seed density of approximately 33,000 to 36,000 seeds per acre; 1/3 of the area under corn is planted at a seed density of approximately 30,000 to 33,000 seeds per acre, and the remainder of the area is variable. See, "Corn Seeding Rate Considerations" by Steve Butzen, available at https://www.pioneer.com/home/site/us/agronomy/library/corn-seeding-rate-considerations/
[0285] В таблице B ниже использованы различные концентрации КОЕ на семя в предусмотренном варианте осуществления пропитки для семян (поперечные ряды) и различные плотности посадки посевных площадей (1 колонка: 15K-41K) с расчетом общего количества КОЕ на акр, которое можно использовать в различных сельскохозяйственных условиях (т.е. концентрация пропитки для семян на семя × плотность посадки семян на акр). Таким образом, если использовать пропитка для семян с 1×106 КОЕ на семя и высаживать 30000 семян на акр, то общее содержание КОЕ на акр будет составлять 3×1010 (т.е. 30K × 1×106).[0285] Table B below uses various CFU concentrations per seed in the envisaged seed treatment embodiment (cross rows) and various acreage planting densities (1 column: 15K-41K) to calculate the total CFU per acre that can be used in different agricultural conditions (i.e. seed treatment concentration per seed × seed planting density per acre). Thus, if a seed treatment with 1×10 6 CFU per seed is used and 30,000 seeds per acre are planted, the total CFU per acre will be 3×10 10 (ie 30K×1×10 6 ).
Таблица B: Расчет общего количества КОЕ на акр для вариантов осуществления пропитки для семян Table B : Calculation of total CFU per acre for seed treatment options
[0286] Для вариантов осуществления обработки в борозде микроорганизмы по изобретению можно наносить с концентрацией КОЕ на акр: 1×106, 3,20×1010, 1,60×1011, 3,20×1011, 8,0×1011, 1,6×1012, 3,20×1012 или более. Таким образом, в определенных аспектах жидкие композиции для обработки в борозде можно наносить с концентрацией приблизительно от 1×106 до приблизительно 3×1012 КОЕ на акр.[0286] For furrow treatment embodiments, the microorganisms of the invention can be applied at a concentration of CFU per acre: 1×10 6 , 3.20×10 10 , 1.60×10 11 , 3.20×10 11 , 8.0× 10 11 , 1.6×10 12 , 3.20×10 12 or more. Thus, in certain aspects, the liquid furrow treatment compositions can be applied at a concentration of from about 1×10 6 to about 3×10 12 CFU per acre.
[0287] В определенных аспектах композиции для обработки в борозде содержатся в жидком составе. В вариантах осуществления для обработке жидкостью в борозде микроорганизмы могут находиться в концентрации КОЕ в миллилитре: 1×101, 1×102, 1×103, 1×104, 1×105, 1×106, 1×107, 1×108, 1×109, 1×1010, 1×1011, 1×1012, 1×1013 или более. В определенных аспектах жидкие композиции для обработке в борозде содержат микроорганизмы в концентрации приблизительно от 1×106 до приблизительно 1×1011 КОЕ в миллилитре. В других аспектах жидкие композиции для обработке в борозде содержат микроорганизмы в концентрации приблизительно от 1×107 до приблизительно 1×1010 КОЕ в миллилитре. В других аспектах жидкие композиции для обработке в борозде содержат микроорганизмы в концентрации приблизительно от 1×108 до приблизительно 1×109 КОЕ в миллилитре. В других аспектах жидкие композиции для обработке в борозде содержат микроорганизмы в концентрации приблизительно до 1×1013 КОЕ в миллилитре.[0287] In certain aspects, the furrow treatment compositions are contained in a liquid formulation. In embodiments for fluid treatment in the furrow, the microorganisms may be in a concentration of CFU per milliliter: 1×10 1 , 1×10 2 , 1×10 3 , 1×10 4 , 1×10 5 , 1×10 6 , 1×10 7 , 1×10 8 , 1×10 9 , 1×10 10 , 1×10 11 , 1×10 12 , 1×10 13 or more. In certain aspects, the liquid furrow treatment compositions contain microorganisms at a concentration of from about 1×10 6 to about 1×10 11 cfu per milliliter. In other aspects, the liquid furrow treatment compositions contain microorganisms at a concentration of from about 1×10 7 to about 1×10 10 CFU per milliliter. In other aspects, the liquid furrow treatment compositions contain microorganisms at a concentration of from about 1×10 8 to about 1×10 9 cfu per milliliter. In other aspects, the liquid furrow treatment compositions contain microorganisms at a concentration of up to about 1×10 13 cfu per milliliter.
ПРИМЕРЫEXAMPLES
[0288] В примерах, предоставляемых в настоящем документе, описаны способы выделения бактерий, анализа бактерий и растений и улучшения признаков растений. Примеры приведены исключительно с иллюстративными целями, и их не следует рассматривать, как каким-либо образом ограничивающие.[0288] The examples provided herein describe methods for isolating bacteria, analyzing bacteria and plants, and improving plant traits. The examples are provided for illustrative purposes only and should not be construed as limiting in any way.
Пример 1: Выделение микроорганизмов из ткани растенияExample 1 Isolation of Microorganisms from Plant Tissue
[0289] В различных сельскохозяйственных районах центральной Калифорнии получали верхние слои почвы. Получали двадцать почв с различными структурными характеристиками, включая плотную глину, торфяной суглинок, илистую глину и суглинок. Семена различных полевых кукурузы, сахарной кукурузы, старой негибридной кукурузу и томата высаживали в каждую почву, как представлено в таблице 1.[0289] Topsoil was obtained in various agricultural areas of central California. Received twenty soils with different structural characteristics, including dense clay, peat loam, silty clay and loam. Seeds of various field corn, sweet corn, old non-hybrid corn and tomato were planted in each soil as shown in Table 1 .
Таблица 1: Типы и сорта сельскохозяйственных культур, высаживаемых в почвы с различными характеристикамиTable 1: Types and varieties of crops planted in soils with different characteristics
[0290] Растения выкорчевывали через 2-4 недели роста и избыток почвы на поверхностях корней удаляли деионизированной водой. После удаления почвы у растений стерилизовали поверхность побелкой и интенсивно промывали в стерильной воде. Из растения вырезали 1 см участка очищенного корня и помещали в фосфатно-солевой буфер, содержащий 3 мм стальные гранулы. Посредством интенсивного перемешивания раствора на Qiagen TissueLyser II получали взвесь.[0290] Plants were uprooted after 2-4 weeks of growth and excess soil on root surfaces was removed with deionized water. After removing the soil from the plants, the surface was sterilized with whitewash and intensively washed in sterile water. A 1 cm section of the cleaned root was excised from the plant and placed in phosphate-buffered saline containing 3 mm steel pellets. By vigorously stirring the solution on a Qiagen TissueLyser II, a slurry was obtained.
[0291] Взвесь корня и солевого раствора разбавляли и инокулировали на различные типы сред для выращивания для выделения ризосферных, эндофитных, эпифитных и других ассоциированных с растениями микроорганизмов. Для получения единичных колоний использовали агарозные среды R2A и Nfb, а для получения популяций фиксирующих азот бактерий использовали полутвердые скошенные среды Nfb. Через 2-4 недели инкубации в полутвердых скошенных средах Nfb популяции микроорганизмов собирали и штрихами наносили на агар R2A для получения единичных колоний, как показано на фигуре 1A-B. Единичные колонии ресуспендировали в смеси R2A и глицерина, подвергали анализу ПЦР и замораживали при -80°C для дальнейшего анализа. Получали приблизительно 1000 единичных колоний и обозначали как "выделенные микроорганизмы".[0291] A suspension of root and saline was diluted and inoculated onto various types of growth media to isolate rhizospheric, endophytic, epiphytic, and other plant-associated microorganisms. R2A and Nfb agarose media were used to obtain single colonies, and Nfb semi-solid slant media were used to obtain populations of nitrogen-fixing bacteria. After 2-4 weeks of incubation in semi-solid Nfb slants, microorganism populations were collected and streaked onto R2A agar to obtain single colonies as shown in Figure 1A-B . Single colonies were resuspended in a mixture of R2A and glycerol, subjected to PCR analysis and frozen at -80°C for further analysis. Approximately 1000 single colonies were obtained and referred to as "isolated microorganisms".
[0292] Затем изоляты подвергали скринингу колоний посредством ПЦР с детекцией присутствия генов nifH для идентификации диазотрофов. Для анализа присутствия кластера nif в каждом изоляте использовали ранее описанный набор праймеров Ueda 19F/388R, для которого показано, что посредством него при скринингах детектируют более 90% диазотрофов (Ueda et al. 1995; J. Bacteriol. 177: 1414-1417). Накалывали единичные колонии выделенных изолятов, ресуспендировали в PBS и использовали в качестве матрицы для ПЦР колоний, как представлено на фигуре 2. Колонии изолятов, для которых получали положительные полосы при ПЦР повторно высевали штрихом, и дважды повторяли ПЦР колоний и повторное высевание штрихом для предотвращения ложно-положительной идентификации диазотрофов. Затем выделенные изоляты обозначали как "микроорганизмы-кандидаты".[0292] The isolates were then colony screened by PCR to detect the presence of nifH genes to identify diazotrophs. To analyze the presence of the nif cluster in each isolate, the previously described Ueda 19F/388R primer set was used, which has been shown to detect more than 90% of diazotrophs in screenings (Ueda et al. 1995; J. Bacteriol. 177: 1414-1417). Single colonies of isolated isolates were punctured, resuspended in PBS and used as template for colony PCR as shown in Figure 2 . Colonies of isolates for which positive PCR bands were obtained were streaked again, and colony PCR and streaked were repeated twice to prevent false positive identification of diazotrophs. The isolated isolates were then designated as "candidate microorganisms".
Пример 2: Характеристика выделенных микроорганизмовExample 2 Characterization of Isolated Microorganisms
Секвенирование, анализ и филогенетическая характеристикаSequencing, analysis and phylogenetic characterization
[0293] Для получения предварительных филогенетических идентификационных характеристик выделенных микроорганизмов и микроорганизмов-кандидатов использовали секвенирование 16S рДНК с набором праймеров 515f-806r (см. например, Vernon et al.; BMC Microbiol. 2002 Dec 23;2:39.). Микроорганизмы содержали различные рода, включая: Enterobacter, Burkholderia, Klebsiella, Bradyrhizobium, Rahnella, Xanthomonas, Raoultella, Pantoea, Pseudomonas, Brevundimonas, Agrobacterium и Paenibacillus, как представлено в таблице 2.[0293] 16S rDNA sequencing with primer set 515f-806r was used to obtain preliminary phylogenetic identification characteristics of isolated microorganisms and candidate microorganisms (see, for example, Vernon et al.; BMC Microbiol. 2002 Dec 23;2:39.). Microorganisms contained various genera including: Enterobacter , Burkholderia , Klebsiella , Bradyrhizobium , Rahnella , Xanthomonas , Raoultella , Pantoea , Pseudomonas , Brevundimonas , Agrobacterium , and Paenibacillus , as shown in Table 2 .
Таблица 2: Разнообразие микроорганизмов, выделяемых из растений томата, как определено посредством глубокого секвенирования 16S рДНК.Table 2: Diversity of microorganisms isolated from tomato plants as determined by 16S rDNA deep sequencing.
[0294] Затем геномы 39 микроорганизмов-кандидатов секвенировали с использованием платформы Illumina Miseq. Геномную ДНК из чистых культур выделяли с использованием мини-набора для ДНК QIAmp (QIAGEN), а библиотеки тотальной ДНК для секвенирования получали у независимого поставщика (SeqMatic, Hayward). Затем проводили сборку генома посредством конвейера A5 (Tritt et al., 2012; PLoS One 7(9):e42304). Проводили идентификацию и аннотацию генов, и гены, связанные с регуляцией и проявлением фиксации азота отмечали в качестве мишеней мутагенеза.[0294] The genomes of 39 candidate microorganisms were then sequenced using the Illumina Miseq platform. Genomic DNA from pure cultures was isolated using a QIAmp DNA mini kit (QIAGEN) and total DNA libraries for sequencing were obtained from an independent supplier (SeqMatic, Hayward). The genome was then assembled using the A5 pipeline (Tritt et al., 2012; PLoS One 7(9):e42304). Genes were identified and annotated, and genes associated with the regulation and expression of nitrogen fixation were marked as targets of mutagenesis.
Транскриптомное профилирование микроорганизмов-кандидатовTranscriptome profiling of candidate microorganisms
[0295] Для идентификации промоторов, которые активны в присутствии азота окружающей среды, проводили транскриптомное профилирование штамма CI010. Штамм CI010 культивировали в определенной среде без азота, дополненной 10 мМ глутамином. Из этих культур выделяли тотальную РНК (набор QIAGEN RNeasy) и подвергали секвенированию RNAseq посредством HiSeq Illumina (SeqMatic, Fremont CA). Прочтения секвенирования картировали на данные генома CI010 с использованием Geneious и идентифицировали высокоэкспрессированные гены под контролем проксимальных промоторов транскрипции.[0295] To identify promoters that are active in the presence of environmental nitrogen, transcriptomic profiling of strain CI010 was performed. The CI010 strain was cultured in a defined nitrogen-free medium supplemented with 10 mM glutamine. Total RNA was isolated from these cultures (QIAGEN RNeasy kit) and subjected to RNAseq sequencing by HiSeq Illumina (SeqMatic, Fremont CA). Sequencing reads were mapped to CI010 genome data using Geneious and identified highly expressed genes under the control of proximal transcription promoters.
[0296] В таблицах 3A-C перечислены гены и их относительные уровни экспрессии, определяемые посредством секвенирования RNAseq тотальной РНК. Последовательности проксимальных промоторов регистрировали для применения в мутагенезе метаболических путей nif, метаболических путей, связанных с утилизацией азота, или других генов с требуемым уровнем экспрессии.[0296] Tables 3A-C list genes and their relative expression levels as determined by total RNA RNAseq sequencing. Proximal promoter sequences were registered for use in mutagenesis of nif metabolic pathways, nitrogen utilization metabolic pathways, or other genes at the desired level of expression.
Таблица 3ATable 3A
Таблица 3BTable 3B
Таблица 3СTable 3C
Таблица штаммовStrain table
Таблица последовательностей штаммовStrain Sequence Table
Оценка удобства манипуляций с генамиAssessing the convenience of gene manipulation
[0297] Микроорганизмы-кандидаты характеризовали на основе способности к трансформации и удобства манипуляций с генами. Во-первых, определяли оптимальное использование источника углерода посредством выращивания на небольшой панели соответствующей среды, а также кривую роста в средах без азота и в богатых средах. Во-вторых, определяли природную устойчивость к антибиотикам каждого штамма посредством метода реплик и выращивания в жидкой культуре, содержащей панель антибиотиков, используемых в качестве селективных маркеров мутагенеза. В-третьих, каждый штамм тестировали на его способность к трансформации посредством электропорации коллекции плазмид. Коллекция плазмид содержит комбинаторное расширение семи участки начала репликации, т.е. p15a, pSC101, CloDF, colA, RK2, pBBR1 и pRO1600 и четыре маркера устойчивости к антибиотикам, т.е. CmR, KmR, SpecR и TetR. Эту системную оценку совместимости участков начала репликации и маркеров устойчивости использовали для идентификации векторов для основанного на плазмидах мутагенеза микроорганизмов-кандидатов.[0297] Microorganisms-candidates were characterized on the basis of the ability to transform and ease of manipulation of genes. First, the optimal utilization of the carbon source was determined by growing on a small panel of the appropriate medium, as well as the growth curve in nitrogen-free and rich media. Secondly, the natural antibiotic resistance of each strain was determined by the method of replication and growth in liquid culture containing a panel of antibiotics used as selective markers of mutagenesis. Third, each strain was tested for its ability to transform by electroporation of a collection of plasmids. The collection of plasmids contains a combinatorial extension of the seven origins of replication, i.e. p15a, pSC101, CloDF, colA, RK2, pBBR1 and pRO1600 and four antibiotic resistance markers, i.e. CmR, KmR, SpecR and TetR. This systemic compatibility assessment of origins of replication and resistance markers was used to identify vectors for plasmid-based mutagenesis of candidate microorganisms.
Пример 3: Мутагенез микроорганизмов-кандидатовExample 3 Mutagenesis of Candidate Microorganisms
Опосредованный Red лямбда нокаутMediated Red lambda knockout
[0298] Получали несколько мутантных микроорганизмов-кандидатов с использованием плазмиды pKD46 или ее производное, содержащие маркер устойчивости к канамицину (Datsenko et al. 2000; PNAS 97(12): 6640-6645). Нокаут-кассеты конструировали с гомологией 250 п.н., фланкирующей ген-мишень, и получали посредством ПЦР с достройкой перекрывающихся участков. Микроорганизмы-кандидаты трансформировали pKD46, культивировали в присутствии арабинозы для индукции механизм экспрессии Red лямбда, подготавливали для электропорация и трансформировали нокаут-кассетами с получением мутантных штаммов-кандидатов. Для получения тринадцати кандидатов, мутантных по регуляторным генам фиксации азота nifL, glnB и amtB, использовали четыре микроорганизма-кандидата и один лабораторный штамм, Klebsiella oxytoca M5A1, как представлено в таблице 4.[0298] Several candidate mutants were generated using the plasmid pKD46 or a derivative thereof containing a kanamycin resistance marker (Datsenko et al. 2000; PNAS 97(12): 6640-6645). Knockout cassettes were constructed with 250 bp homology flanking the target gene and generated by PCR with overlap completion. Candidate microorganisms were transformed with pKD46, cultured in the presence of arabinose to induce the Lambda Red expression mechanism, prepared for electroporation, and transformed with knockout cassettes to obtain candidate mutant strains. Four candidate microorganisms and one laboratory strain, Klebsiella oxytoca M5A1, were used to generate thirteen candidates mutated in the nitrogen fixation regulatory genes nifL , glnB , and amtB , as shown in Table 4 .
Таблица 4: Список одиночных нокаут-мутантов, полученных с использованием опосредованного Red лямбда мутагенезаTable 4: List of single knockout mutants generated using Red-mediated lambda mutagenesis
Олигонуклеотид-специфический мутагенез с отбором Cas9Oligonucleotide-specific mutagenesis with Cas9 selection
[0299] Для локализации изменений генома в гене rpoB DH10B E. coli использовали олигонуклеотид-специфический мутагенез, а мутантов отбирали с использованием системы CRISPR-Cas. Проведено конструирование мутагенного олигонуклеотида (ss1283: "G*T*T*G*ATCAGACCGATGTTCGGACCTTCcaagGTTTCGATCGGACATACGCGACCGTAGTGGGTCGGGTGTACGTCTCGAACTTCAAAGCC" (SEQ ID NO:2), где * означает тиофосфатную связь) для придания устойчивости к рифампицину посредством мутации 4 п.н. в гене rpoB. В клетках, содержащих плазмиду, кодирующую Cas9, проводили индукцию экспрессии Cas9, подготавливали их для электропорации, а затем проводили электропорацию мутагенным олигонуклеотидом и плазмидой, кодирующей конститутивную экспрессию направляющей РНК (нРНК), которая направляет расщепление Cas9 последовательности rpoB WT. Подвергнутые электропорации клетки восстанавливали в неселективных средах в течение ночи для обеспечения достаточной сегрегации полученных мутантных хромосом. После высевания на селекционную среду для отбора кодирующей нРНК плазмиды, показано, что две из десяти подвергаемых скринингу колоний содержат требуемую мутацию, тогда как остальные, как показано, являются "ускользнувшими" мутантами, полученными вследствие протоспейсерной мутации в плазмиде с нРНК или потери плазмиды с Cas9.[0299] Oligonucleotide-specific mutagenesis was used to localize genome changes in the E. coli DH10B rpoB gene, and mutants were selected using the CRISPR-Cas system. A mutagenic oligonucleotide (ss1283: "G*T*T*G*ATCAGACCGATGTTCGGACCTTCcaagGTTTCGATCGGACATACGCGACCGTAGTGGGTCGGGTGTACGTCTCGAACTTCAAAGCC" (SEQ ID NO:2) , where * denotes a thiophosphate bond) was constructed to confer resistance to rifampicin via a 4 bp mutation. in the rpoB gene. Cells containing a plasmid encoding Cas9 were induced to express Cas9, prepared for electroporation, and then electroporated with a mutagenic oligonucleotide and a plasmid encoding constitutive expression of a guide RNA (nRNA) that directs Cas9 cleavage of the WT rpoB sequence. The electroporated cells were reconstituted in non-selective media overnight to ensure sufficient segregation of the resulting mutant chromosomes. After seeding on selection medium to select the coding nRNA plasmid, two of the ten colonies screened were shown to contain the desired mutation, while the rest were shown to be escape mutants resulting from a protospacer mutation in the nRNA plasmid or loss of the Cas9 plasmid. .
Опосредованный Red лямбда мутагенез с отбором посредством Cas9Red-mediated lambda mutagenesis with selection through Cas9
[0300] Получали мутанты микроорганизмов-кандидатов CI006 и CI010 с использованием опосредованного Red лямбда мутагенеза с отбором посредством CRISPR-Cas. Нокаут-кассеты содержали эндогенный промотор, идентифицированный посредством транскриптомного профилирования (как описано в примере 2 и приведено в таблицах 3A-C) и области гомологии ≈250 п.н., фланкирующие мишень делеции. CI006 и CI010 трансформировали плазмидами, кодирующими систему рекомбинации Red лямбда (гены exo, beta, gam) под контролем промотора, индуцируемого арабинозой, и Cas9 под контролем промотора, индуцируемого IPTG. У полученных трансформантов индуцировали системы рекомбинации Red и Cas9 и получали штаммы для электропорации. Затем в компетентные клетки трансформировали нокаут-кассеты и плазмиду с кодируемой селектирующей нРНК. После высевания на селективные среды с антибиотиками для плазмиды Cas9 и плазмиды с нРНК, 7 из 10 подвергнутых скринингу колоний продемонстрировали требуемую нокаут-мутация, как представлено на фигуре 3.[0300] Received mutants of microorganism candidates CI006 and CI010 using Red-mediated lambda mutagenesis with selection by CRISPR-Cas. The knockout cassettes contained an endogenous promoter identified by transcriptome profiling (as described in Example 2 and shown in Tables 3A-C ) and ≈250 bp regions of homology flanking the deletion target. CI006 and CI010 were transformed with plasmids encoding the Red lambda recombination system (exo, beta, gam genes) under the control of an arabinose inducible promoter and Cas9 under the control of an IPTG inducible promoter. In the resulting transformants, the Red and Cas9 recombination systems were induced and strains for electroporation were obtained. Then knockout cassettes and a plasmid with encoded selection nRNA were transformed into competent cells. After seeding on selective media with antibiotics for Cas9 plasmid and nRNA plasmid, 7 out of 10 screened colonies showed the desired knockout mutation, as shown in Figure 3 .
Пример 4: Фенотипирование молекул-кандидатов Example 4: Phenotyping of Candidate Molecules in vitroin vitro
[0301] У различных мутантов определяли влияние экзогенного азота на биосинтез и активность нитрогеназы. Для определения нитрогеназной активности в условиях чистой культуры использовали анализ восстановления ацетилена (ARA) (Temme et. al. 2012; 109(18): 7085-7090). Штаммы выращивали в герметически закрытых тестовых пробирках и восстановление ацетилена в этилен количественно определяли с использованием газового хроматографа Agilent 6890. Активность микроорганизмов-кандидатов и других мутантов-кандидатов, выращиваемых в средах для фиксации азота, дополненных глутамином в концентрации от 0 до 10 мМ, в ARA представлена на фигурах 4A-B и фигурах 10A-C.[0301] In various mutants, the effect of exogenous nitrogen on the biosynthesis and activity of nitrogenase was determined. Acetylene reduction assay (ARA) was used to determine nitrogenase activity under pure culture conditions (Temme et. al. 2012; 109(18): 7085-7090). The strains were grown in sealed test tubes and the reduction of acetylene to ethylene was quantified using an Agilent 6890 gas chromatograph. The activity of candidate microorganisms and other candidate mutants grown in nitrogen fixation media supplemented with 0 to 10 mM glutamine in ARA shown in figures 4A-B and figures 10A-C .
[0302] В анаэробных условиях культивирования определяли диапазон концентраций глутамина и аммиака с количественным определением влияния на активность фиксации азота. В клетках дикого типа по мере роста концентрации глутамина активность быстро снижалась. Однако в ряду исходных нокаут-мутаций был подтвержден класс мутаций, обеспечивающих экспрессию генов фиксации азота в условиях концентрации глутамина, которые в ином случае подавляют эту активность у дикого типа. Как видно на фигуре 4C, этот профиль получали у четырех разных видов диазотрофов. Кроме того, перенастраивая регуляторную сеть с использованием идентифицированных генетических компонентов, уровень активности фиксации азота регулировали предсказуемым образом. Это можно наблюдать на фигуре 4B, на который проиллюстрированы штаммы CM023, CM021, CM015 и CI006. Штамм CM023 представляет собой слабо эволюционировавший штамм; штамм CM021 представляет собой сильно эволюционировавший штамм; штамм CM015 представляет собой средне эволюционировавший штамм; штамм CI006 представляет собой штамм дикого типа (штамм 2). Аммиак, выделяемый в супернатанты культур, тестировали с использованием ферментативного анализа (MEGAZYME). В анализе определяли количество расходуемого NADPH при оптической плотности 340 нм. Анализ проводили в бактериальных культурах, выращиваемых в не содержащей азот, анаэробной среде с исходной плотностью 109 КОЕ/мл. Как видно на фигуре 4D, в панели из шести эволюционировавших штаммов, один из штаммов выделял до 100 мкМ аммиака в течение периода 48 часов. Кроме того, как видно на фигуре 11 двойной мутант демонстрировал большее выделение аммиака, чем одиночный мутант, из которого он получен. Это демонстрирует способность микроорганизмов продуцировать аммиак в количествах, превышающих их физиологические потребности.[0302] Under anaerobic culture conditions, a range of glutamine and ammonia concentrations was determined, and the effect on nitrogen fixation activity was quantified. In wild-type cells, as the concentration of glutamine increased, the activity rapidly decreased. However, a class of mutations has been confirmed in a series of parental knockout mutations that mediate the expression of nitrogen fixation genes under conditions of glutamine concentration, which would otherwise suppress this activity in the wild type. As seen in Figure 4C , this profile was obtained from four different diazotrophic species. In addition, by reconfiguring the regulatory network using the identified genetic components, the level of nitrogen fixation activity was regulated in a predictable manner. This can be observed in Figure 4B , which illustrates strains CM023, CM021, CM015 and CI006. Strain CM023 is a weakly evolved strain; strain CM021 is a highly evolved strain; strain CM015 is a medium evolved strain; strain CI006 is a wild-type strain (strain 2). Ammonia released into culture supernatants was tested using an enzymatic assay (MEGAZYME). The amount of consumed NADPH was determined in the assay at an optical density of 340 nm. The assay was performed in bacterial cultures grown in a nitrogen-free, anaerobic environment with an initial density of 10 9 cfu/ml. As seen in Figure 4D , in a panel of six evolved strains, one of the strains released up to 100 μM ammonia over a 48 hour period. In addition, as seen in Figure 11 , the double mutant exhibited greater ammonia release than the single mutant from which it was derived. This demonstrates the ability of microorganisms to produce ammonia in quantities in excess of their physiological requirements.
Транскриптомное профилирование чистых культурTranscriptome profiling of pure cultures
[0303] Транскрипционная активность CI006 определяли с использованием платформы Nanostring Elements. Клетки выращивали в не содержащей азот среде и через 4 часа инкубации собирали 108 клеток. Выделяли тотальную РНК с использованием набора Qiagen RNeasy. Очищенную РНК отправляли в Core Diagnostics в Palo Alto, CA, для гибридизации с зондами и анализа Digital Analyzer, как представлено на фигуре 5.[0303] Transcriptional activity of CI006 was determined using the Nanostring Elements platform. Cells were grown in a nitrogen-free medium and 10 8 cells were harvested after 4 hours of incubation. Total RNA was isolated using the Qiagen RNeasy kit. The purified RNA was sent to Core Diagnostics in Palo Alto, CA for probe hybridization and Digital Analyzer analysis as shown in Figure 5 .
Пример 5: Фенотипирование микроорганизмов-кандидатов Example 5: Phenotyping of Candidate Microorganisms in plantain planta
Колонизация растений микроорганизмами-кандидатамиColonization of plants by microorganism candidates
[0304] Колонизацию желательных растения-хозяев микроорганизмами-кандидатами количественно определяли посредством экспериментов с кратковременным ростом растений. Растения кукурузы инокулировали штаммами, экспрессирующими RFP с плазмиды или с интегрированной посредством Tn5 экспрессирующей RFP кассеты. Растения выращивали в стерилизованном песке и нестерильной торфяной среде, а инокуляцию проводили посредством нанесения 1 мл культуры клеток пипеткой непосредственно на появившийся колеоптиль растения через трое суток после пророста. Плазмиды сохраняли посредством полива растений раствором, содержащим соответствующий антибиотик. Через три недели, собирали корни растений, три раза промывали в стерильной воде для удаления видимой почвы и разделяли на два образца. Один образец корней анализировали посредством флуоресцентной микроскопии для определения профилей локализации микроорганизмов-кандидатов. Микроскопию проводили на 10 мм частях лучших интактных корней растений, как представлено на фигуре 6.[0304] Colonization of desired host plants by candidate microorganisms was quantified through short term plant growth experiments. Maize plants were inoculated with strains expressing RFP from a plasmid or with a Tn5-integrated RFP expression cassette. Plants were grown in sterilized sand and non-sterile peat medium, and inoculation was carried out by applying 1 ml of cell culture with a pipette directly to the emerging plant coleoptile three days after germination. Plasmids were maintained by watering the plants with a solution containing the appropriate antibiotic. Three weeks later, plant roots were collected, washed three times in sterile water to remove visible soil, and divided into two samples. One root sample was analyzed by fluorescence microscopy to determine localization profiles of candidate microorganisms. Microscopy was performed on 10 mm parts of the best intact plant roots, as shown in figure 6 .
[0305] Разработан второй количественный способ оценки колонизации. Проводили количественной анализ ПЦР на препаратах тотальной ДНК из корней растений, инокулированных эндофитами. Семена кукурузы (Dekalb DKC-66-40) проращивали в предварительно автоклавированном песке в горшке 6,35 см на 6,35 см на 25,4 см. Через сутки после посадки проводили пропитку 1 мл ночной культуры эндофитов (среда SOB) непосредственно в участке расположения семян. 1 мл этой ночной культуры приблизительно эквивалентен приблизительно 109 КОЕ, с разбросом в пределах 3 раз друг от друга в зависимости от используемого штамма. Каждый проросток удобряли 3 раза в неделю 50 мл модифицированного раствора Хогланда, дополненного 2,5 мМ или 0,25 мМ нитратом аммония. Через четыре недели после посадки собирали образцы корней для выделения ДНК. Остатки почвы смывали с использованием распыления воды под давлением. Затем эти образцы ткани гомогенизировали с использованием QIAGEN Tissuelyzer, и затем выделяли ДНК с использованием мини-набор для выделения ДНК QIAmp (QIAGEN) по рекомендованному протоколу. С этими выделенными образцами ДНК проводили анализ кПЦР с использованием устройства для ОТ-ПЦР Stratagene Mx3005P с использованием праймеров, которые сконструированы (с использованием Primer BLAST NCBI) специфичными к локусам, в каждом геноме эндофитов. Количественно определяли присутствие копий геномов эндофитов. Для дальнейшего подтверждения идентификации эндофитов проводили секвенирование продуктов амплификации ПЦР и подтверждали наличие правильной последовательности. Обобщенная информация о профилях колонизации штаммов CI006 и CI008 из числа микроорганизмов-кандидатов представлена в таблице 5. У штамма CI008 продемонстрирован уровень колонизации до 107× КОЕ/г сырой массы корня.[0305] A second quantitative method for assessing colonization has been developed. A quantitative PCR analysis was carried out on preparations of total DNA from plant roots inoculated with endophytes. Corn seeds (Dekalb DKC-66-40) were germinated in pre-autoclaved sand in a 6.35 cm by 6.35 cm by 25.4 cm pot. location of seeds. 1 ml of this overnight culture is approximately equivalent to approximately 10 9 cfu, with a variation within 3 times each other depending on the strain used. Each seedling was fertilized 3 times a week with 50 ml of modified Hoagland's solution supplemented with 2.5 mM or 0.25 mM ammonium nitrate. Four weeks after planting, root samples were collected for DNA extraction. Soil residues were washed off using a pressurized water spray. These tissue samples were then homogenized using the QIAGEN Tissuelyzer and then DNA was isolated using the QIAmp Mini DNA Isolation Kit (QIAGEN) following the recommended protocol. These isolated DNA samples were subjected to qPCR analysis using a Stratagene Mx3005P RT-PCR device using primers that are designed (using Primer BLAST NCBI) to be specific to the loci within each endophyte genome. The presence of copies of endophyte genomes was quantified. To further confirm the identification of endophytes, the sequencing of the PCR amplification products was performed and the presence of the correct sequence was confirmed. A summary of the colonization profiles of candidate microorganism strains CI006 and CI008 is presented in Table 5 . Strain CI008 demonstrated a colonization rate of up to 10 7 × CFU/g ww of the root.
Таблица 5: Колонизация кукурузы, определяемая посредством кПЦРTable 5: Maize colonization determined by qPCR
Профилирование РНК RNA profiling in plantain planta
[0306] Биосинтез компонентов пути nif in planta оценивали, определяя транскрипцию генов nif. Тотальную РНК получали из тканей корней растений, инокулированных CI006 (способы посадки описаны ранее). Выделение РНК проводили с использованием мини-набора RNEasy по рекомендуемому протоколу (QIAGEN). Затем тотальную РНК этих тканей растений анализировали с использованием наборов Nanostring Elements (NanoString Technologies, Inc.) с использованием зондов, специфичных к генам nif в геноме штамма CI006. Данные по экспрессии генов nif in planta обобщены в таблице 6. Экспрессию генов nifH детектировали в инокулированных штаммом CM013 растениях, в то время как у инокулированных CI006 растений экспрессию nifH не детектировали. Штамм CM013 представляет собой производное штамма CI006, у которого ген nifL подвергнут нокауту.[0306] Biosynthesis of nif pathway components in planta was assessed by determining the transcription of nif genes. Total RNA was obtained from root tissues of plants inoculated with CI006 (planting methods described previously). RNA isolation was performed using the RNEasy mini kit according to the recommended protocol (QIAGEN). The total RNA of these plant tissues was then analyzed using Nanostring Elements kits (NanoString Technologies, Inc.) using probes specific for the nif genes in the CI006 strain genome. Data on nif gene expression in planta are summarized in Table 6 . Expression of nifH genes was detected in plants inoculated with strain CM013, while nifH expression was not detected in plants inoculated with CI006. Strain CM013 is a derivative of strain CI006 in which the nifL gene has been knocked out.
[0307] Высокоэкспрессированные гены CM011, ранжированные по транскриптам в т.н. на миллион (TPM), определяли in planta в условиях добавления удобрений. Промоторы, контролирующие экспрессию некоторых из этих высокоэкспрессированных генов, использовали в качестве матриц для гомологичной рекомбинации в являющихся мишенями локусах фиксации и ассимиляции азота. Проводили выделение образцов РНК выращиваемых в теплице инокулированных CM011 растений, удаляли рРНК с использованием набора Ribo-Zero, секвенировали с использованием платформы Truseq Illumina и обратно картировали на геном CM011. Высокоэкспрессированные гены CM011 приведены в таблице 7.[0307] Highly expressed CM011 genes, ranked by transcripts in the so-called. per million (TPM), determined in planta under conditions of addition of fertilizers. Promoters controlling the expression of some of these highly expressed genes have been used as templates for homologous recombination at the target nitrogen fixation and assimilation loci. RNA samples from greenhouse-grown CM011 inoculated plants were isolated, rRNA removed using the Ribo-Zero kit, sequenced using the Truseq Illumina platform, and mapped back to the CM011 genome. Highly expressed CM011 genes are shown in Table 7 .
Таблица 6: Экспрессия nifH Table 6: Expression of nifH in plantain planta
Таблица 7Table 7
Анализ Analysis 1515 NN
[0308] В основном способе демонстрации фиксации используют изотоп азота 15N, который находится в атмосфере с установленным уровнем относительно 14N. Добавляя в каждое удобрение или атмосферу повышенные уровни 15N, можно наблюдать фиксацию или непосредственно в увеличенных количествах 15N, фиксируемого из атмосферы, дополненной газообразным 15N2 (Yoshida 1980), или опосредовано посредством разведения обогащенного удобрения атмосферным газообразным N2 в тканях растений (Iniguez 2004). Способ разведения позволяет наблюдать накопление фиксированного азота в течение роста растения, тогда как способ с газообразным 15N2 ограничен определением фиксации, которая происходит в течение короткого интервала, в течение которого растение можно выращивать в ограниченной атмосфере (измерения скорости). Таким образом, способ с использованием газа лучше подходит для определения специфичности (так как любые повышенные уровни 15N2 в растении, превышающие атмосферный уровень, можно однозначно соотнести с фиксацией), но им нельзя демонстрировать суммарную активность.[0308] The main method for demonstrating fixation uses the nitrogen isotope 15 N, which is in the atmosphere at a set level relative to 14 N. By adding increased levels of 15 N to each fertilizer or atmosphere, fixation can be observed or directly in increased amounts of 15 N fixed from the atmosphere supplemented with 15 N 2 gas (Yoshida 1980), or indirectly through dilution of enriched fertilizer with atmospheric N 2 gas in plant tissues (Iniguez 2004). The dilution method allows observation of fixed nitrogen accumulation during plant growth, while the 15 N 2 gas method is limited to determining fixation, which occurs over a short interval during which the plant can be grown in a confined atmosphere (velocity measurements). Thus, the gas method is better suited for determining specificity (since any elevated levels of 15 N 2 in the plant above atmospheric levels can be unambiguously correlated with fixation), but they cannot show cumulative activity.
[0309] Для определения активности фиксация улучшенных штаммов относительно штаммов дикого типа и не подвергаемых инокуляции растений кукурузы проводили оба типа анализа, и у нескольких из улучшенных штаммов in planta наблюдали увеличенные уровни фиксация (фигура 12, фигура 14A и фигура 14B). Эти анализы являются важными для демонстрации того, что активность исследуемых штаммов in vitro соответствует результатам in vivo. Кроме того, эти анализы позволяют определять влияние удобрения на активность штамма, позволяя предполагать соответствующую функциональность в сельскохозяйственных условиях. Подобные результаты наблюдали, когда штаммами дикого типа и улучшенными штаммами инокулировали растения Setaria (фигура 13). Активность фиксации in planta, приведенная на фигурах 14A-14C, дополнительно подтверждена транскриптомными данными. Эволюционировавшие штаммы демонстрируют увеличенный уровень транскриптов nifH относительно вариантов дикого типа. Кроме того, обеспечиваемый микроорганизмами уровень азота in planta также коррелировал с уровнем колонизации растения в расчете на растение. Эти результаты (фигура 12, фигура 13, фигуры 14A-14C, фигура 15A и фигура 15B) поддерживают гипотезу о том, что вероятной причиной увеличения получаемого из атмосферы азота, наблюдаемого в тканях растений, является микроорганизм, вследствие улучшенной регуляции кластера генов nif. В дополнение к прямому определению фиксация определяли эффект инокуляции растений улучшенными штаммами в анализе биомассы растений в условиях недостатка азота. Хотя биомасса растения может быть связана со множеством возможных взаимодействий микроорганизмов с растением, можно ожидать, что добавление фиксированного азота может влиять на фенотип растения в условиях недостатка азота. Инокулированные растения выращивали в условиях полного отсутствия азота, наблюдали и значимое увеличение площади листьев, сырой и сухой массы побегов и сырой и сухой массы корней у инокулированных растений относительно необработанных контрольных растений (фигура 14C). Хотя эти различия нельзя приписать исключительно фиксации азота, они поддерживают вывод, что улучшенные штаммы активно предоставляют азот растениям. Выращивали растения кукурузы и Setaria и инокулировали как описано выше. Растениям посредством полива регулярно добавляли удобрение, содержавшее 1,2% 15N. Фиксацию азота микроорганизмами количественно определяли, определяя уровень 15N в ткани растения. На 4 неделе после посадки получали ткань четвертого листа и высушивали. Высушенные образцы листьев гомогенизировали с использованием гранул (QIAGEN Tissuelyzer) и разделяли на аликвоты в жестяные капсулы для IRMS (MBL Stable Isotope Laboratory at The Ecosystems Center, Woods Hole, MA). Рассчитывали азот, получаемый из атмосферы (NDFA), и продукция азота CI050 и CM002 приведена на фигуре 7.[0309] To determine the fixation activity of improved strains relative to wild-type and non-inoculated maize plants, both assays were performed and increased fixation levels were observed in several of the improved strains in planta ( Figure 12 , Figure 14A and Figure 14B ). These assays are important in demonstrating that the in vitro activity of test strains is consistent with in vivo results. In addition, these assays make it possible to determine the effect of a fertilizer on the activity of a strain, suggesting appropriate functionality under agricultural conditions. Similar results were observed when wild-type and improved strains were inoculated with Setaria plants ( Figure 13 ). In planta fixation activity shown in Figures 14A-14C was further confirmed by transcriptomic data. Evolved strains show an increased level of nifH transcripts relative to wild-type variants. In addition, the level of nitrogen provided by microorganisms in planta also correlated with the level of plant colonization per plant. These results ( Figure 12, Figure 13, Figures 14A-14C, Figure 15A and Figure 15B ) support the hypothesis that a microorganism is the likely cause of the increase in atmospheric nitrogen observed in plant tissues due to improved regulation of the nif gene cluster. In addition to direct determination of fixation, the effect of plant inoculation with improved strains was determined in a plant biomass analysis under nitrogen deficient conditions. Although plant biomass can be associated with a variety of possible microorganism-plant interactions, it would be expected that the addition of fixed nitrogen could influence plant phenotype under nitrogen-deficient conditions. The inoculated plants were grown under complete nitrogen-free conditions and a significant increase in leaf area, green and dry weight of shoots and wet and dry weight of roots was observed in the inoculated plants relative to untreated control plants ( Figure 14C ). Although these differences cannot be attributed solely to nitrogen fixation, they support the conclusion that improved strains actively provide nitrogen to plants. Corn and Setaria plants were grown and inoculated as described above. Fertilizer containing 1.2% 15 N was regularly added to plants by watering. Nitrogen fixation by microorganisms was quantified by determining the level of 15 N in plant tissue. Fourth leaf tissue was obtained at 4 weeks after planting and dried. Dried leaf samples were homogenized using pellets (QIAGEN Tissuelyzer) and aliquoted into IRMS tin capsules (MBL Stable Isotope Laboratory at The Ecosystems Center, Woods Hole, MA). Atmospheric nitrogen (NDFA) was calculated and nitrogen production of CI050 and CM002 is shown in Figure 7 .
Анализ продукции фитогормоновAnalysis of phytohormone production
[0310] Ранее для исследования влияния индол-3-уксусной кислоты на созревание плодов посредством анализа in vitro использовали сорт карликовых томатов (Solanum lycopersicum) "Micro-Tom" (Cohen 1996; J Am Soc Hortic Sci 121: 520-524). Для оценки продукции и секреции фитогормонов микроорганизмами-кандидатами разработан анализ планшетного скрининга с использованием незрелых плодов Micro-Tom. Получали двенадцатилуночные тестовые планшеты для тканевых культур, заполняя лунки агарозной средой, позволяя ей отвердевать и нанося на поверхность агара 10 мкл ночной культуры микроорганизмов, как представлено на фигуре 8. Лунки с агаром содержат увеличенные количества гибберелловой кислоты (GA), но в качестве положительного контроля и стандартнов не использовали ни одной культуры бактерий. В агар в участок нанесения бактериальной культуры стеблем вперед помещали цветы, срезанные с растущих растений Micro-Tom через сутки после начала цветения. За этими цветами наблюдали в течение 2-3 недель, после чего собирали и взвешивали плоды. Увеличение массы плода растения в нескольких повторениях свидетельствовал о продукции гормонов растений инокулируемыми микроорганизмами, как представлено на фигуре 9.[0310] Previously, the dwarf tomato ( Solanum lycopersicum ) cultivar "Micro-Tom" (Cohen 1996; J Am Soc Hortic Sci 121:520-524) was used to investigate the effect of indole-3-acetic acid on fruit ripening by in vitro assay. To assess the production and secretion of phytohormones by candidate microorganisms, a plate screening assay using immature Micro-Tom fruits was developed. Twelve-well tissue culture test plates were prepared by filling the wells with agarose medium, allowing it to solidify, and topping the agar surface with 10 µl of an overnight microorganism culture as shown in Figure 8 . Agar wells contain increased amounts of gibberellic acid (GA), but no bacterial cultures were used as positive controls and standards. Flowers cut from growing Micro-Tom plants one day after the start of flowering were placed in the agar in the area where the bacterial culture was applied stem first. These flowers were observed for 2-3 weeks, after which the fruits were collected and weighed. An increase in the mass of the plant fruit in several repetitions indicated the production of plant hormones by the inoculated microorganisms, as shown in figure 9 .
Пример 6: Циклическaя эволюция хозяин-микроорганизмExample 6: Host-Microorganism Cyclic Evolution
[0311] Растения кукурузы инокулировали CM013 и выращивали 4 недели приблизительно до стадии роста V5. Растения, демонстрирующие улучшенное накопление азота из микробных источников по результатам анализа 15N, выкорчевывали, и корни отмывали с использованием воды под давлением для удаления основной почвы. Производили срез корня массой 0,25 г и промывали в растворе PBS для удаления мелких частичек почвы и неприкрепившихся микроорганизмов. Образцы ткани гомогенизировали с использованием 3 мм стальных гранул в QIAGEN TissueLyser II. Гомогенат разбавляли и наносили в планшеты на агарозные среды SOB. Единичные колонии ресуспендировали в жидких средах и подвергали анализу ПЦР 16s рДНК и мутаций, уникальных для инокулируемого штамма. Процесс выделения микроорганизма, мутагенеза, инокуляции и повторного выделения можно повторять несколько раз с улучшением признаков микроорганизма, признаков растений и способности микроорганизмов к колонизации.[0311] Corn plants were inoculated with CM013 and grown for 4 weeks to approximately the V5 growth stage. Plants showing improved nitrogen uptake from microbial sources as measured by 15 N analysis were uprooted and the roots were washed using pressurized water to remove the underlying soil. A root cut was made weighing 0.25 g and washed in a PBS solution to remove small soil particles and unattached microorganisms. Tissue samples were homogenized using 3 mm steel beads in a QIAGEN TissueLyser II. The homogenate was diluted and plated on SOB agarose media. Single colonies were resuspended in liquid media and subjected to PCR analysis of 16s rDNA and mutations unique to the inoculated strain. The process of isolation of the microorganism, mutagenesis, inoculation and re-isolation can be repeated several times with the improvement of the characteristics of the microorganism, the characteristics of plants and the ability of microorganisms to colonize.
Пример 7: Совместимость в различных географических условияхExample 7: Compatibility in different geographical conditions
[0312] Способность улучшенных микроорганизмов к колонизации инокулированного растения является критичной для успешного существования растения в полевых условиях. Хотя описанные способы выделения разработаны для выбора из почвенных микроорганизмов, которые могут иметь тесную связь с сельскохозяйственными культурами, такими как кукуруза, многие штаммы не могут эффективно колонизировать в целому ряду генотипов растений, типов окружающей среды, типов почв или условий инокуляции. Так как колонизация представляет собой сложный процесс, требующий целого ряда взаимодействий между штаммом микроорганизмов и растением-хозяином, основным способом для выбора приоритетных штаммов для дальнейшей разработки стал скрининг на способность к колонизации. В ранних попытках оценки колонизации использовали флуоресцентно меченые штаммы, которая являлась эффективной, но отнимала много времени и не являлась масштабируемой относительно штаммов. Так как активность колонизации не поддается непосредственному улучшению, крайне важно отбирать потенциальных продуцирующих кандидатов из штаммов, которые являются природными колонизаторами.[0312] The ability of the improved microorganisms to colonize the inoculated plant is critical to the success of the plant in the field. Although the isolation methods described are designed to select from soil microorganisms that may be closely related to crops such as corn, many strains cannot effectively colonize across a range of plant genotypes, environmental types, soil types, or inoculation conditions. Since colonization is a complex process that requires a number of interactions between a strain of microorganisms and a host plant, screening for the ability to colonize has become the main way to select priority strains for further development. Early attempts at assessing colonization used fluorescently labeled strains, which were effective but time consuming and did not scale across strains. Since colonization activity cannot be directly improved, it is critical to select potential production candidates from strains that are natural colonizers.
[0313] Разработан анализ для тестирования на стабильную колонизацию штаммами дикого типа любого данного растения-хозяина с использованием кПЦР и праймеров, сконструированных так, чтобы они являлись специфичными для штамма в образце сообщества. Этот анализ предназначен для быстрого определения скорости колонизации микроорганизмов из образцов ткани кукурузы. Исходные тесты с использованием штаммов, оцениваемых как вероятные колонизаторы, с использованием флуоресцентной микроскопии и планшетных способов, продемонстрировали, что подход кПЦР может являться количественным и масштабируемым.[0313] An assay was developed to test for stable colonization by wild-type strains of any given host plant using qPCR and primers designed to be specific for the strain in a community sample. This assay is designed to rapidly determine the rate of colonization of microorganisms from maize tissue samples. Initial tests using strains assessed as likely colonizers using fluorescence microscopy and plate methods demonstrated that the qPCR approach can be quantitative and scalable.
[0314] Типичный анализ проводят следующим образом: растения, в основном сорта кукурузы и пшеницы, выращивают в торфяной горшковой смеси в теплице в шести повторениях на штамм. Через четыре или пять суток после посадки 1 мл пропитки культур бактерий в ранней стационарной фазе, разбавленной до OD590 0,6-1,0 (приблизительно 5×108 КОЕ/мл), пипетируют на восходящий колеоптиль. Растения поливают только водопроводной водой и оставляют рати в течение четырех недели с последующим забором образцов, во время которого растения выкорчевывают и корни тщательно промывают с удалением большинства остатков торфа. Вырезают образцы чистых корней и гомогенизируют с получением взвеси клеток дебриса растения и ассоциированных бактериальных клеток. Авторы разработали протокол высокопроизводительного выделения ДНК, который позволяет эффективно получать смесь ДНК растения и бактерий для использования в качестве матрицы для кПЦР. На основе экспериментом во резкому возрастанию количества бактериальных клеток, этим способом выделения ДНК получают количественный образец бактериальной ДНК относительно сырой массы корней. Каждый штамм оценивают с использованием штаммоспецифичных праймеров, сконструированных с использованием Primer BLAST (Ye 2012) и сравнивают с фоновой амплификацией у не подвергаемых инокуляции растений. Так как у некоторых праймеров у не подвергаемых инокуляции растений выявлена побочная амплификация, колонизацию определяют по наличию амплификации или повышенной амплификации соответствующего продукта по сравнению с фоновым уровнем.[0314] A typical analysis is carried out as follows: plants, mainly varieties of corn and wheat, are grown in peat potting mix in a greenhouse in six repetitions per strain. Four or five days after planting, 1 ml of the impregnation of cultures of bacteria in the early stationary phase, diluted to an OD 590 of 0.6-1.0 (approximately 5×10 8 CFU/ml), is pipetted onto an ascending coleoptile. The plants are irrigated with tap water only and left to rati for four weeks, followed by sampling, during which the plants are uprooted and the roots thoroughly washed to remove most of the peat residue. Samples of clean roots are cut out and homogenized to obtain a suspension of plant debris cells and associated bacterial cells. The authors have developed a protocol for high-throughput DNA isolation, which allows one to efficiently obtain a mixture of plant and bacterial DNA for use as a template for qPCR. Based on an experiment in a sharp increase in the number of bacterial cells, this method of DNA extraction obtains a quantitative sample of bacterial DNA relative to the wet weight of the roots. Each strain is evaluated using strain-specific primers designed using Primer BLAST (Ye 2012) and compared to background amplification in non-inoculated plants. Since some primers in non-inoculated plants showed side amplification, colonization is determined by the presence of amplification or increased amplification of the corresponding product compared to the background level.
[0315] Этот анализ использовали для определения совместимости продукта микроорганизмов в различных почвенных географических условиях. Качества полевых почв и полевые условия могут оказывать очень большое влияние на действие продукта микроорганизмов. pH почвы, способность к удержанию воды и конкурирующие микроорганизмы являются только малым количеством примеров факторов почвы, которые могут влиять на жизнеспособность инокулята и его способность к колонизации. Анализ колонизации проводили с использованием трех различных типов почв, образцы которых в качестве среды для выращивания растений получены с сельскохозяйственных полей в Калифорнии (фигура 16A). Для аппроксимации реальных сельскохозяйственных условий использовали промежуточную плотность инокуляции. В течение 3 недель штамм 5 колонизировал все растения на уровне от 106 до 107 КОЕ/г сырой массы. Через 7 недель роста растений, эволюционировавшая версия штамма 1 демонстрировала высокие уровни колонизации (106 КОЕ/г сырой массы) во всех типах почв. (фигура 16B).[0315] This analysis was used to determine the compatibility of the product of microorganisms in different soil geographic conditions. Field soil qualities and field conditions can have a very large influence on the action of the microbial product. Soil pH, water retention capacity, and competing microorganisms are just a few examples of soil factors that can affect inoculum viability and colonization ability. Colonization analysis was performed using three different soil types sampled as plant growth media from agricultural fields in California ( Figure 16A ). An intermediate inoculation density was used to approximate real agricultural conditions. Within 3 weeks,
[0316] Кроме того, для оценки колонизации в сложных полевых условиях на поле площадью 1 акр в Сан-Луис-Обиспо в июне 2015 года начато испытание с оценкой влияния и колонизации семи штаммов дикого типа на два сорта полевой кукурузы. Агротехническое проектирование и проведение испытания выполняла по контракту полевая исследовательская организация, Pacific Ag Research. Для инокуляции, использовали тот же способ покрытия семян торфяной культуры, который был испытан в экспериментах по способам инокуляции. В течение вегетационного периода собирали образцы растений для оценки колонизации корня и внутренности стебля. Образцы собирали из трех повторных участков после каждой обработки через четыре и восемь недель после посадки, и из всех шести повторений после каждой обработки незадолго перед сбором через 16 недель. Дополнительные образцы собирали из всех шести повторных участков после обработок путем инокуляции штамма 1 и штамма 2, а также необработанных контролей, через 12 недель. Число клеток на грамм сырой масса отмытых корней оценивали также, как и в других анализах колонизации с использованием кПЦР и штаммоспецифичных праймеров. Два штамма, штамм 1 и штамм 2, продемонстрировали стабильную и повсеместную колонизацию корней, которая достигала максимума через 12 недель, а затем резко снижалась (фигура 16C). Хотя штамм 2, по видимому, присутствовал в количествах, на порядок меньших, чем штамм 1, выявлено, что он его количества от растению к растению являются более постоянными. По видимому, ни один из штаммов внутренность стебля эффективно не колонизирует. В поддержку данных кПЦР о колонизации, оба штамма успешно повторно выделяли из образцов корней с использованием планшетов и секвенирование 16S для идентификации изолятов соответствующей последовательности.[0316] In addition, to evaluate colonization in challenging field conditions in a 1-acre field in San Luis Obispo, a trial was initiated in June 2015 to evaluate the impact and colonization of seven wild-type strains on two varieties of field corn. Agrotechnical design and testing was contracted out to a field research organization, Pacific Ag Research. For inoculation, the same peat seed coating method was used that was tested in the inoculation method experiments. During the growing season, plant samples were collected to assess the colonization of the root and the interior of the stem. Samples were collected from three replicate plots after each treatment at four and eight weeks post planting, and from all six replicate sites after each treatment shortly before collection at 16 weeks. Additional samples were collected from all six replicate sites after
Пример 8: Выведение микроорганизмовExample 8: Removal of microorganisms
[0317] Примеры выведения микроорганизмов можно обобщить на схеме фигуры 17A. На фигуре 17A приведено выведение микроорганизмов, где сначала можно определить состав микробиома и идентифицировать представляющий интерес вид. Метаболизм микробиома можно картировать и связать с генетикой. Затем можно провести направленную генетическую вариацию способами, включающими в качестве неограничивающих примеров конъюгацию и рекомбинацию, химический мутагенез, адаптивную эволюцию и редактирование генов. Производные микроорганизмы используют для инокуляции сельскохозяйственных культур. В определенных примерах выбраны сельскохозяйственные культуры с наилучшими фенотипами.[0317] Examples of breeding microorganisms can be summarized in the scheme of figure 17A . Figure 17A depicts microbial breeding, where the composition of the microbiome can first be determined and the species of interest identified. Microbiome metabolism can be mapped and linked to genetics. Directional genetic variation can then be carried out by methods including, but not limited to, conjugation and recombination, chemical mutagenesis, adaptive evolution, and gene editing. Derived microorganisms are used to inoculate crops. In certain examples, crops with the best phenotypes are selected.
[0318] Как предоставлено на фигуре 17A сначала можно определить состав микробиома и идентифицировать представляющий интерес вид. На фигуре 17B приведен расширенный вид этапа определения микробиома. Метаболизм микробиома можно картировать и связать с генетикой. Метаболизм азота может включать вход аммиака (NH4 +) из ризосферы в цитозоль бактерий посредством транспортера AmtB. Глутаминсинтетаза и АТФ осуществляют катализ преобразования аммиака и L-глутамината (L-Glu) в глутамин. Глутамин может приводить к формированию биомассы (росту растений), а также он может ингибировать экспрессию оперона nif. Затем, можно провести направленную генетическую вариацию способами, включающими в качестве неограничивающих примеров конъюгацию и рекомбинацию, химический мутагенез, адаптивную эволюцию и редактирование генов. Производные микроорганизмы используют для инокуляции сельскохозяйственных культур. Выбраны сельскохозяйственные культуры с наилучшими фенотипами.[0318] As shown in Figure 17A, the composition of the microbiome can first be determined and the species of interest identified. Figure 17B is an expanded view of the microbiome determination step. Microbiome metabolism can be mapped and linked to genetics. Nitrogen metabolism may include the entry of ammonia (NH 4 + ) from the rhizosphere into the bacterial cytosol via the AmtB transporter. Glutamine synthetase and ATP catalyze the conversion of ammonia and L-glutamate (L-Glu) to glutamine. Glutamine can lead to biomass formation (plant growth), and it can also inhibit the expression of the nif operon. Then, directed genetic variation can be carried out by methods including, but not limited to, conjugation and recombination, chemical mutagenesis, adaptive evolution, and gene editing. Derived microorganisms are used to inoculate crops. Selected crops with the best phenotypes.
Пример 9: Полевые испытания с микроорганизмами по изобретению - лето 2016 годаExample 9: Field trials with microorganisms according to the invention - summer 2016
[0319] Для оценки воздействия штаммов по настоящему изобретению на рост и продуктивность кукурузы при различных режимах азота проводили полевые испытания.[0319] Field trials were conducted to evaluate the effect of the strains of the present invention on corn growth and productivity under various nitrogen regimes.
[0320] Испытания проводили с (1) обработкой семи участков шестью штаммами и контролем - у четырех основных участков устанавливали 0, 15, 85 и 100% максимального возврата азота (MRTN) с региональным подтверждением. Контроль (только UTC) проводили при 10 100% MRTN плюс 5, 10 или 15 фунтов. Обработки проводили в четырех повторениях.[0320] The tests were performed with (1) treatment of seven sites with six strains and control - four main sites were set to 0, 15, 85 and 100% maximum nitrogen return (MRTN) with regional confirmation. Control (UTC only) was run at 10 100% MRTN plus 5, 10, or 15 lbs. Treatments were performed in four repetitions.
[0321] Участки кукурузы (минимум) составляли 4 ряда по 9,144 метра длиной с 124 участки на регион. Все наблюдения проводили в центральных двух рядах участков, а все получения образца с разрушением проводили во внешних рядах. Образцы семян перед использованием охлаждали до 1,5-2 часов.[0321] Plots of corn (minimum) were 4 rows of 9.144 meters long with 124 plots per region. All observations were made in the central two rows of plots, and all sample preparations with destruction were made in the outer rows. Seed samples were cooled to 1.5-2 hours before use.
[0322] Региональная сельскохозяйственная практика: Семена представляли собой коммерческую кукурузу без общепринятой обработки фунгицидами и инсектицидами. Все пропитки семян проводили одним специалистом по пропитке семян для обеспечения однородности. Дату посадки, норму высева, контроль сорняков/насекомых и т.д. оставляли как при региональной сельскохозяйственной практике. За исключением применения фунгицидов, использовали стандартные способы регуляции.[0322] Regional agricultural practice: Seeds were commercial corn without conventional fungicide and insecticide treatments. All seed treatments were performed by a single seed treatment specialist to ensure uniformity. Planting date, seeding rate, weed/insect control, etc. left as in regional agricultural practice. With the exception of the use of fungicides, standard methods of regulation were used.
[0323] Характеристики почв: Оценивали текстуру почв и плодородность почв. Образцы почв для каждого повторения засеивали предварительно для гарантии остаточных уровней нитратов ниже 22,7 кг/акр. Получали образцы грунта от 0 см до 30 см. Почву дополнительно характеризовали по pH, CEC, общим K и P.[0323] Soil characteristics: Soil texture and soil fertility were assessed. Soil samples for each iteration were pre-seeded to ensure residual nitrate levels below 22.7 kg/acre. Soil samples were obtained from 0 cm to 30 cm. The soil was further characterized by pH, CEC, total K and P.
[0324] Оценки: Начальную популяцию растений оценивали через 14 суток после посадки (DAP)/акр и дополнительно оценивали на: (1) мощность (по шкале от 1 до 10, w/10=отлично) 14 DAP & V10; (2) ведение протокола рейтингов заболеваний в любой момент, когда на участках проявляются симптомы; (3) запись любых различий при полегании, если на участке происходит полегание; (4) урожайность (Bu/акр), скорректированная на стандартный процент влажности; (5) массу теста и (6) процент влажности зерен.[0324] Assessments: Initial plant population was assessed 14 days after planting (DAP)/acre and further assessed for: (1) power (on a scale of 1 to 10, w/10=excellent) 14 DAP &V10; (2) keeping a record of disease ratings at any time the sites show symptoms; (3) record any differences in lodging if lodging occurs at the site; (4) yield (Bu/acre) corrected for standard percentage moisture; (5) the weight of the dough; and (6) the moisture percentage of the grains.
[0325] Требования к получению образцов: Образец почва получали в трех временных точках (до начала испытания, V10-VT, 1 неделя после сбора урожая). Во всех шести регионах и на всех участках отбирали образец с 10 граммами на образец (124 участка × 3 временные точки × 6 регионов).[0325] Requirements for obtaining samples: A soil sample was obtained at three time points (before the test, V10-VT, 1 week after harvest). All six regions and all regions were sampled at 10 grams per sample (124 regions x 3 time points x 6 regions).
[0326] Получение образца колонизации: Образцы колонизация собирали в двух временных точках (V10 и VT) для пяти регионов и шести временных точках (V4, V8, V10, VT, R5 и после сбора урожая). Образцы собирали следующим образом: (1) от 0% и 100% MRTN, 60 участков на регион; (2) 4 растения на участок, случайно выбранных из внешних рядов; (3) 5 граммов корня, 20,3 см стебля и вернхие три листа, каждый раздельно упакованный в мешок и с присвоенным ID - 12/мешков на участок; (4) пять регионов (60 участков × 2 временные точки × 12 мешков/участок); и один регион (60 участков × 6 временных точек × 12 мешков/участок. См., фигуру 17C, иллюстрирующую получение образцов колонизации.[0326] Colonization sample preparation : Colonization samples were collected at two time points (V10 and VT) for five regions and six time points (V4, V8, V10, VT, R5 and post-harvest). Samples were collected as follows: (1) from 0% and 100% MRTN, 60 plots per region; (2) 4 plants per plot randomly selected from the outer rows; (3) 5 grams of root, 20.3 cm stem and top three leaves, each individually bagged and assigned an ID of 12/bags per lot; (4) five regions (60 plots × 2 time points × 12 bags/plot); and one region (60 plots x 6 time points x 12 bags/plot. See Figure 17C illustrating the preparation of colonization samples.
[0327] Определение нормализованного разностного вегетационного индекса (NDVI) проводили с использованием инструмента Greenseeker в двух временных точках (V4 - V6 и VT). Анализировали каждый участок во всех шести регионах (124 участка × 2 временных точки × 6 регионов).[0327] The determination of the normalized difference vegetation index (NDVI) was performed using the Greenseeker tool at two time points (V4 - V6 and VT). Each site was analyzed in all six regions (124 sites x 2 time points x 6 regions).
[0328] Анализ корней проводили с использованием Win Rhizo из оного региона, который лучше всего иллюстрировал различия обработки. Случайным образом проводили отбор десяти растений на участок (по 5 рядом с каждым внешним рядом; предпочтительно отбирали растения на этапе V3-V4) и осторожно промывали для удаления как можно большего количества загрязнений. Десять корни помещали в пластиковый пакет и помечали. Анализ корней проводили с использованием анализа корней WinRhizo.[0328] Root analysis was performed using Win Rhizo from the region that best illustrated processing differences. Ten plants per plot were randomly selected (5 near each outer row; plants were preferably selected at V3-V4) and washed gently to remove as much contaminants as possible. Ten roots were placed in a plastic bag and labelled. Root analysis was performed using WinRhizo root assay.
[0329] Характеристики стеблей проводили для всех шести регионов между R2 и R5. Регистрировали диаметр стебля десяти растений на участок при высоте 15 см, а также длину первого междоузлия выше отметки 15 см. Проводили мониторинг десяти растений; пять последовательных растений от центра двух внутренних рядов. Проводили оценку в шести регионах (124 участка × 2 измерения × 6 регионов).[0329] Stem characteristics were performed for all six regions between R2 and R5. The stem diameter of ten plants per plot at a height of 15 cm was recorded, as was the length of the first internode above the 15 cm mark. Ten plants were monitored; five consecutive plants from the center of the two inner rows. Six regions were evaluated (124 sites × 2 measurements × 6 regions).
[0330] Нитраты тканей анализировали на всех участках и во всех регионах. Участок стебля длиной 20,3 см начинающийся от 15 см выше почва когда кукуруза находилась между первой и третей неделями после формирования черной точки; влагалища листьев удаляли. Оценивали все регионы и участки (6 регионов × 124 участка).[0330] Tissue nitrates were analyzed at all sites and in all regions. Stem section 20.3 cm long starting 15 cm above the soil when corn was between the first and third weeks after blackpoint formation; leaf sheaths were removed. All regions and sites were evaluated (6 regions × 124 sites).
[0331] Для всех регионов от начала посадки до сбора урожая регистрировали следующие погодные данные: суточные максимальные и минимальные температуры, температура почвы при посеве, суточные осадки плюс полив (если применимо) и любые необычные погодные явления, такие как сильный дождь, ветер, холод или жара.[0331] For all regions from planting to harvest, the following weather data was recorded: daily maximum and minimum temperatures, soil temperature at planting, daily precipitation plus watering (if applicable), and any unusual weather events such as heavy rain, wind, cold or fever.
[0332] В таблице 8 приведены данные по урожайности во всех шести регионах. Уровень азота значимо влиял на урожайность, но штаммы по уровням азота влияния не оказывали. Однако при наименьшем уровне азота штаммы CI006, CM029 и CI019 численно превзошли UTC на 4-6 bu/акр. Урожайность также численно увеличилась на 2-4 bu/акр под действием штаммов CM029, CI019 и CM081 при 15% MRTN.[0332] Table 8 shows yield data for all six regions. The level of nitrogen significantly affected the yield, but the strains had no effect on nitrogen levels. However, strains CI006, CM029 and CI019 outnumbered UTC by 4-6 bu/acre at the lowest nitrogen levels. Yields also increased numerically by 2-4 bu/acre with strains CM029, CI019 and CM081 at 15% MRTN.
Таблица 8: Данные по урожайности для всех шести регионовTable 8: Yield data for all six regions
[0333] В таблице 9 представлен другой подход к анализу. В таблице представлены четыре региона, где реакция на азот была наибольшей, что позволяет предполагать, что доступный остаточный азот был наименьшим. Этот подход не меняет оценку того, что уровень азота значимо влияет на урожайность, чего не делали штаммы при усреднении по всем уровням азота. Однако числовое преимущество урожайности при наименьшем уровне N является более выраженным для всех штаммов, особенно для CI006, CM029 и CM029/CM081, где урожайность вырастала от 8 до 10 bu/акр. При 15% MRTN штамм CM081 превосходил UTC на 5 bu.[0333] Table 9 presents a different approach to the analysis. The table shows the four regions where the response to nitrogen was greatest, suggesting that available residual nitrogen was the lowest. This approach does not change the assessment that nitrogen levels significantly affect yield, which strains did not do when averaged over all nitrogen levels. However, the numerical yield advantage at the lowest N level is more pronounced for all strains, especially for CI006, CM029 and CM029/CM081 where yields increased from 8 to 10 bu/acre. At 15% MRTN, strain CM081 outperformed UTC by 5 bu.
Таблица 9: Данные по урожайности в четырех регионахTable 9: Yield data for four regions
[0334] Результаты полевых испытаний также проиллюстрированы на фигурах 21-27. Результаты свидетельствуют, что микроорганизмы по изобретению способны увеличивать урожайность растений, что указывает на способность исследуемых микроорганизмов увеличивать фиксацию азота у важной сельскохозяйственной культуры, т.е. кукурузы.[0334] The results of field trials are also illustrated in Figures 21-27 . The results indicate that the microorganisms according to the invention are able to increase the yield of plants, which indicates the ability of the studied microorganisms to increase nitrogen fixation in an important agricultural crop, i. corn.
[0335] Полевые результаты дополнительно подтверждают описанные способы не являющейся межродовой модификации генома отобранных штаммов микроорганизмов для получения сельскохозяйственно значимых результатов в полевых условиях при применении указанных инженерных штаммов к сельскохозяйственной культуре.[0335] Field results further support the described methods for non-intergeneric modification of the genome of selected strains of microorganisms to obtain agriculturally significant results in the field when these engineered strains are applied to a crop.
[0336] На фигуре 18 приведена линия модифицированных штаммов, полученных из штамма CI006 (дикий тип Kosakonia sacchari). Полевые данные демонстрируют, что подвергнутое генетической инженерии производное штаммов CI006 дикого типа, т.е. CM029, может приводить к численно релевантным результатам в полевых условиях. Например, таблица 8 демонстрирует, что при 0% MRTN CM029 приводил к урожайности 147,0 bu/акр по сравнению с необработанным контролем при 141,2 bu/акр (увеличение на 5,8 bu/акр). Таблица 8 также демонстрирует, что при 15% MRTN CM029 приводил к урожайности 167,3 bu/акр по сравнению с необработанным контролем при 165,1 bu/акр (увеличение на 2,2 bu/акр). Таблица 9 поддерживает эти заключения и демонстрирует, что при 0% MRTN CM029 приводил к урожайности 140,7 bu/акр по сравнению с необработанным контролем при 131,9 bu/акр (увеличение на 8,8 bu/акр). Таблица 9 также демонстрирует, что при 15% MRTN CM029 приводил к урожайности 164,1 bu/акр по сравнению с необработанным контролем при 161,3 bu/акр (увеличение на 2,8 bu/акр).[0336] Figure 18 shows a line of modified strains derived from strain CI006 (wild type Kosakonia sacchari ). Field data demonstrate that a genetically engineered derivative of wild-type CI006 strains, i. CM029, can lead to numerically relevant results in the field. For example, Table 8 shows that at 0% MRTN, CM029 resulted in a yield of 147.0 bu/acre compared to the untreated control at 141.2 bu/acre (an increase of 5.8 bu/acre). Table 8 also shows that at 15% MRTN CM029 resulted in a yield of 167.3 bu/acre compared to the untreated control at 165.1 bu/acre (an increase of 2.2 bu/acre). Table 9 supports these conclusions and demonstrates that at 0% MRTN CM029 resulted in a yield of 140.7 bu/acre compared to the untreated control at 131.9 bu/acre (an increase of 8.8 bu/acre). Table 9 also shows that at 15% MRTN CM029 resulted in a yield of 164.1 bu/acre compared to the untreated control at 161.3 bu/acre (an increase of 2.8 bu/acre).
[0337] На фигуре 19 приведена линия модифицированных штаммов, полученных из штамма CI019 (дикий тип Rahnella aquatilis). Полевые данные демонстрируют, что подвергнутое генетической инженерии производное штаммов CI019 дикого типа, т.е. CM081, может приводить к численно релевантным результатам в полевых условиях. Например, таблица 8 демонстрирует, что при 15% MRTN CM081 приводил к урожайности 169,3 bu/акр по сравнению с необработанным контролем при 165,1 bu/акр (увеличение на 4,2 bu/акр). Таблица 9 поддерживает эти заключения и демонстрирует, что при 0% MRTN CM081 приводил к урожайности 136,3 bu/акр по сравнению с необработанным контролем при 131,9 bu/акр (увеличение на 4,4 bu/акр). Таблица 9 также демонстрирует, что при 15% MRTN CM081 приводил к урожайности 166,8 bu/акр по сравнению с необработанным контролем при 161,3 bu/акр (увеличение на 5,5 bu/акр).[0337] Figure 19 shows a line of modified strains derived from strain CI019 (wild type Rahnella aquatilis ). Field data demonstrate that a genetically engineered derivative of wild-type strains of CI019, i. CM081, can lead to numerically relevant results in the field. For example, Table 8 shows that at 15% MRTN CM081 resulted in a yield of 169.3 bu/acre compared to the untreated control at 165.1 bu/acre (an increase of 4.2 bu/acre). Table 9 supports these conclusions and demonstrates that at 0% MRTN CM081 resulted in a yield of 136.3 bu/acre compared to the untreated control at 131.9 bu/acre (an increase of 4.4 bu/acre). Table 9 also shows that at 15% MRTN CM081 resulted in a yield of 166.8 bu/acre compared to the untreated control at 161.3 bu/acre (an increase of 5.5 bu/acre).
[0338] Кроме того, в таблице 9 можно наблюдать, что комбинация CM029/см081 при 0% MRTN приводила к урожайности 141,4 bu/акр по сравнению с необработанным контролем при 131,9 bu/акр (увеличение на 9,5 bu/акр).[0338] In addition, it can be observed in Table 9 that the combination of CM029/CM081 at 0% MRTN resulted in a yield of 141.4 bu/acre compared to the untreated control at 131.9 bu/acre (an increase of 9.5 bu/acre). acre ).
Пример 10: Полевые испытания с микроорганизмами по изобретениюExample 10: Field trials with microorganisms according to the invention
[0339] В природе, включая сельскохозяйственные почвы, можно найти большое разнообразие фиксирующих азот бактерий можно. Однако потенциал микроорганизма для предоставления достаточного количество азота сельскохозяйственным культурам, чтобы обеспечить снижение использования удобрений, может быть лимитирован подавлением нитрогеназных генов в удобряемых почвах, а также низким количеством в тесной ассоциации с корнями сельскохозяйственных культур. Идентификация, выделение и выведение микроорганизмов, которые тесно ассоциированы с ключевыми коммерческими сельскохозяйственными культурами, может разрушить и улучшить регуляторные сети, связывающие чувствительность к азоту и фиксацию азота, и разблокировать значительный вклад ассоциированных с сельскохозяйственными культурами микроорганизмов в уровень азота. С этой целью идентифицированы фиксирующие азот микроорганизмы, ассоциированные и колонизирующие корневую систему кукурузы.[0339] In nature, including agricultural soils, a wide variety of nitrogen-fixing bacteria can be found. However, the microorganism's potential to provide sufficient nitrogen to crops to ensure reduced fertilizer use may be limited by suppression of nitrogenase genes in fertilized soils, as well as a low amount in close association with crop roots. Identification, isolation and breeding of microorganisms that are closely associated with key commercial crops can disrupt and improve the regulatory networks linking nitrogen sensitivity and nitrogen fixation and unlock the significant contribution of crop associated microorganisms to nitrogen levels. For this purpose, nitrogen-fixing microorganisms associated with and colonizing the root system of maize have been identified.
[0340] Собирали образцы корней растений кукурузы, выращиваемых в агротехнически значимых почвах, и из ризосферы и эндосферы выделяли популяции микроорганизмов. Выделяли геномную ДНК этих образцов с последующим секвенированием ампликонов 16S для профилирования состава сообщества. Выделен микроорганизм Kosakonia sacchari (штамм PBC6.1) и классифицирован посредством 16S рРНК и полногеномного секвенирования. Он представляет собой особенно интересный фиксатор азота, способный к колонизации почти 21% численности ассоциированной с корнями микробиоты (фигура 30). Для оценки чувствительности штамма к экзогенному азоту определяли уровни фиксации азота в чистой культуре с использованием классического анализа восстановления ацетилена (ARA) и различных уровней добавления глутамина. Вид демонстрировал высокий уровень активности фиксации азота в не содержащих азота средах, но экзогенный фиксированный азот подавлял экспрессию гена nif и нитрогеназную активность (штамм PBC6.1, фигура 28C и 28D). Кроме того, когда определяли аммиак, выделенный в супернатант PBC6.1, выращиваемого в азотфиксирующих условиях, можно было выявить очень небольшое выделение фиксированного азота (фигура 28E).[0340] Root samples of corn plants grown in agronomically significant soils were collected, and populations of microorganisms were isolated from the rhizosphere and endosphere. The genomic DNA of these samples was isolated followed by sequencing of the 16S amplicons to profile the composition of the community. The microorganism Kosakonia sacchari (strain PBC6.1) was isolated and classified by 16S rRNA and whole genome sequencing. It is a particularly interesting nitrogen fixer, capable of colonizing nearly 21% of the root-associated microbiota (FIG. 30). To assess strain sensitivity to exogenous nitrogen, levels of nitrogen fixation in pure culture were determined using the classical acetylene reduction assay (ARA) and various levels of glutamine supplementation. The species showed a high level of nitrogen fixation activity in nitrogen-free environments, but exogenous fixed nitrogen suppressed nif gene expression and nitrogenase activity (strain PBC6.1, figures 28C and 28D). In addition, when the ammonia released in the supernatant of PBC6.1 grown under nitrogen fixing conditions was determined, very little release of fixed nitrogen could be detected (FIG. 28E).
[0341] Авторы выдвинули гипотезу, что PBC6.1 мог бы стать значительным источником фиксированного азота на удобряемых полях, если бы регуляторные сети, контролирующие метаболизм азот были переконструированы с обеспечением оптимальной экспрессии нитрогеназы и выделения аммиака в присутствии фиксированного азота. Для обеспечения широкой фенотипической реконструкции без вставок трансгенов или синтетических регуляторных элементов в геноме PBC6.1 должно существовать достаточное генетическое разнообразие. Геном выделенного штамма составляет по меньшей мере 5,4 т.п.н. и содержит канонический кластер генов фиксации азота. Связанные пути метаболизма азота в PBC6.1 являются сходными с путями метаболизма азота модельного организма для фиксации азота, Klebsiella oxytoca m5al.[0341] The authors hypothesized that PBC6.1 could become a significant source of fixed nitrogen in fertilized fields if the regulatory networks controlling nitrogen metabolism were redesigned to ensure optimal nitrogenase expression and ammonia release in the presence of fixed nitrogen. Sufficient genetic diversity must exist in the PBC6.1 genome to allow for a broad phenotypic reconstruction without insertions of transgenes or synthetic regulatory elements. The genome of the isolated strain is at least 5.4 kb. and contains the canonical cluster of nitrogen fixation genes. The associated nitrogen metabolism pathways in PBC6.1 are similar to those of the nitrogen fixation model organism, Klebsiella oxytoca m5al .
[0342] Идентифицировано несколько узлов генной регуляторной сети, которые могут усиливать фиксацию азота и последующую его передачу растению-хозяину, особенно в условиях высоких экзогенных концентраций фиксированного азота (рис. 28А). Оперон nifLA напрямую регулирует остальную часть кластера nif посредством активации транскрипции с помощью NifA и азот- и кислород-зависимой репрессии NifA посредством NifL. Разрушение nifL может устранить ингибирование NifA и улучшить экспрессию nif в присутствии кислорода и экзогенного фиксированного азота. Кроме того, экспрессия nifA под контролем азот-независимого промотора может отделить биосинтез нитрогеназы от регуляции азотчувствительным комплексом NtrB/NtrC. Ассимиляцию фиксированного азота микроорганизмом в глютамин посредством глутаминсинтетазы (GS) обратимо регулирует двухдоменный фермент аденилаттрансфераза (АТаза) GlnE посредством аденилирования и деаденилирования GS с ослаблением и восстановлением активности, соответственно. Укорочение белка GlnE с удалением его удаляющего аденилат (AR) домена может приводить к конститутивно аденилированной глутаминсинтетазе, ограничивающей ассимиляцию аммиака микроорганизмом и увеличивающей содержание внутри- и внеклеточного аммиака. Наконец, снижение экспрессии AmtB, переносчика, ответственного за захват аммиака, может приводить к увеличению содержания внеклеточного аммиака. Для получения рационально сконструированных фенотипов микроорганизмов без использования трансгенов использовали два подхода: получение безмаркерных делеций геномных последовательностей, кодирующих домены белка или целые гены, и перестройка регуляторных сетей посредством внутригеномной перегруппировки промоторов. Посредством повторяющегося процесса мутагенеза получено несколько нетрансгенных производных штаммов PBC6.1 (таблица 10).[0342] Several nodes of the gene regulatory network have been identified that can enhance nitrogen fixation and its subsequent transfer to the host plant, especially under conditions of high exogenous concentrations of fixed nitrogen (Fig. 28A). The nifLA operon directly regulates the rest of the nif cluster through transcriptional activation by NifA and nitrogen- and oxygen-dependent repression of NifA by NifL. Destruction of nifL can abolish NifA inhibition and improve nif expression in the presence of oxygen and exogenous fixed nitrogen. In addition, the expression of nifA under the control of a nitrogen-independent promoter can separate nitrogenase biosynthesis from regulation by the nitrogen-sensitive NtrB/NtrC complex. The assimilation of fixed nitrogen by the microorganism into glutamine via glutamine synthetase (GS) is reversibly regulated by the two-domain enzyme adenylate transferase (ATase) GlnE through adenylation and deadenylation of GS with attenuation and restoration of activity, respectively. Shortening of the GlnE protein with the removal of its adenylate-removing (AR) domain can lead to a constitutively adenylated glutamine synthetase, which limits the assimilation of ammonia by the microorganism and increases the content of intra- and extracellular ammonia. Finally, a decrease in the expression of AmtB, the carrier responsible for ammonia uptake, can lead to an increase in extracellular ammonia. To obtain rationally constructed phenotypes of microorganisms without the use of transgenes, two approaches were used: obtaining marker-free deletions of genomic sequences encoding protein domains or entire genes, and rearranging regulatory networks through intragenomic rearrangement of promoters. Several non-transgenic derivatives of PBC6.1 strains were obtained through a repetitive mutagenesis process (Table 10).
Таблица 10. Список выделенных и производных штаммов K. sacchari используемых в настоящей работе. Prm, промоторная последовательность, полученная из генома PBC6.1; ΔglnEAR1 и ΔglnEAR2, различные укороченные варианты последовательности гена glnE, удаляющего удаляющий аденилат домен. Table 10. List of isolated and derived strains of K. sacchari used in this work. Prm, promoter sequence derived from the PBC6.1 genome;
[0343] Проведено несколько анализов in vitro для характеристики конкретных фенотипов производных штаммов. Для оценки чувствительности штамма к экзогенному азоту использовали ARA, в котором PBC6.1 демонстрировал подавление активности нитрогеназы при высоких концентрациях глютамина (фиг. 28D). В отличие от этого у большинства производных штаммов выявлен дерепрессированный фенотип с варьирующими уровнями восстановления ацетилена, наблюдаемыми при высоких концентрациях глютамина. Скорости транскрипции nifA в образцах, анализируемых посредством кПЦР, хорошо коррелировали со скоростями восстановления ацетилена (рис. 31), свидетельствуя в пользу гипотезы о том, что разрушение nifL и вставка азот-независимого промотора для контроля nifA может приводить к дерепрессии кластера nif. Штаммы с измененной активностью GlnE или AmtB продемонстрировали заметно повышенные уровни экскреции аммония по сравнению со штаммами дикого типа или производными без этих мутаций (фиг. 28E), иллюстрируя влияние этих генотипов на ассимиляцию и обратный захват аммиака.[0343] Several in vitro assays have been performed to characterize specific phenotypes of derived strains. To assess the sensitivity of the strain to exogenous nitrogen used ARA, in which PBC6.1 showed suppression of nitrogenase activity at high concentrations of glutamine (Fig. 28D). In contrast, most derived strains showed a derepressed phenotype with varying levels of acetylene reduction observed at high glutamine concentrations. The transcription rates of nifA in samples analyzed by qPCR correlated well with the rates of acetylene reduction (Fig. 31), supporting the hypothesis that disruption of nifL and insertion of a nitrogen-independent promoter to control nifA may lead to derepression of the nif cassette. Strains with altered GlnE or AmtB activity showed markedly increased levels of ammonium excretion compared to wild-type or derivative strains without these mutations (FIG. 28E), illustrating the effect of these genotypes on ammonia assimilation and reuptake.
[0344] Проведено два эксперимента для изучения взаимодействия производных PBC6.1 с растениями кукурузы и количественной оценки введения фиксированного азота в ткани растений. Во-первых, в исследовани в теплице количественно определяли уровни фиксации азота микроорганизмами с использованием изотопных индикаторов. В кратком изложении, растения выращивают с меченным 15N удобрением, а разбавленные концентрации 15N в тканях растений указывают на вклад фиксированного азота из микроорганизмов. Саженцы кукурузы инокулировали отобранными штаммами микроорганизмов, и растения выращивали до стадии роста V6. Затем растения разрушали для обеспечения возможности определения колонизации микроорганизмами и экспрессии генов, а также измерения соотношений 15N/14N в тканях растений посредством масс-спектрометрии с соотношением изотопов (IRMS). Анализ находящейся на воздухе ткани продемонстрировал небольшой незначимый вклад PBC6.38 и значимый вклад PBC6.94 (p=0,011) в уровень азота в растениях. Приблизительно 20% азота, выявленного в надземных листьях кукурузы, продуцировано PBC6.94, а остальное поступило из семян, почвенной смеси или "фоновой" фиксации другими почвенными микроорганизмами (рис. 29C). Это демонстрирует, что конвейер размножения микроорганизмов авторов изобретения может обеспечивать получение штаммов, способных вносить существенный вклад азота в растения в присутствии азотных удобрений. Определена транскрипция микроорганизмов в тканях растений, и экспрессию кластера генов nif наблюдали у производных штаммов, но не у штамма дикого типа (рис. 29B), что демонстрирует важность дерепрессии nif для вклада BNF в сельскохозяйственные культуры в условиях добавки удобрений. Колонизация корней, определяемая посредством кПЦР, демонстрировала, что для каждого из протестированных штаммов плотность колонизации различна (фигура 29А). У PBC6.38 и PBC6.94 наблюдали 50-кратное различие колонизации. Это различие может указывать на то, что PBC6.94 снизил приспособленность к ризосфере по сравнению с PBC6.38 в результате высокого уровня фиксации и выведения.[0344] Two experiments were conducted to study the interaction of PBC6.1 derivatives with corn plants and to quantify the introduction of fixed nitrogen into plant tissues. First, in a greenhouse study, levels of nitrogen fixation by microorganisms were quantified using isotope tracers. Briefly, plants are grown with 15 N labeled fertilizer, and dilute concentrations of 15 N in plant tissues indicate the contribution of fixed nitrogen from microorganisms. Corn seedlings were inoculated with the selected microbial strains and the plants were grown to the V6 growth stage. The plants were then destroyed to allow the determination of microorganism colonization and gene expression, as well as the measurement of 15 N/ 14 N ratios in plant tissues by isotope ratio mass spectrometry (IRMS). Exposed tissue analysis demonstrated a small non-significant contribution of PBC6.38 and a significant contribution of PBC6.94 (p=0.011) to nitrogen levels in plants. Approximately 20% of the nitrogen found in aboveground maize leaves is produced by PBC6.94, with the remainder coming from seed, soil mix, or “background” fixation by other soil microorganisms (Figure 29C). This demonstrates that the inventors' microbial propagation pipeline can produce strains capable of making a significant contribution of nitrogen to plants in the presence of nitrogen fertilizers. Transcription of microorganisms in plant tissues was determined, and expression of the nif gene cluster was observed in derived strains but not in the wild-type strain (Fig. 29B), demonstrating the importance of nif derepression for the contribution of BNF to crops under fertilization conditions. Root colonization determined by qPCR showed that each of the strains tested had a different colonization density (FIG. 29A). PBC6.38 and PBC6.94 showed a 50-fold difference in colonization. This difference may indicate that PBC6.94 has reduced rhizosphere fitness compared to PBC6.38 as a result of high levels of fixation and excretion.
СпособыWays
Средыenvironments
[0345] Минимальная среда содержит (на литр) 25 г Na2HPO4, 0,1 г CaCL2⋅2H2O, 3 г KH2PO4, 0,25 г MgSO4⋅7H2O, 1 г NaC1, 2,9 мг FeCl3, 0,25 мг Na2MoO4⋅2H2O и 20 г сахарозу. Среда для выращивания определена как минимальная среда, дополненная 50 мл 200 мМ глутамин на литр.[0345] The minimum medium contains (per liter) 25 g Na 2 HPO 4 , 0.1 g CaCL 2 ⋅2H 2 O, 3 g KH 2 PO 4 , 0.25 g MgSO 4 ⋅7H 2 O, 1 g NaC1, 2.9 mg FeCl 3 , 0.25 mg Na 2 MoO 4 ⋅2H 2 O and 20 g sucrose. Growth medium is defined as minimal medium supplemented with 50 ml of 200 mM glutamine per liter.
Выделение диазотрофовIsolation of diazotrophs
[0346] Саженцы кукурузы выращивали из семян (DKC 66-40, DeKalb, IL) в течение двух недель в условиях теплицы, с контролем от 22°C (ночью) до 26°C (днем), и обеспечивали 16-часовые световые циклы в почве, собранной в San Joaquin County, CA. Корни собирали и промывали стерильной деионизированной водой с удалением основной почвы. Ткани корня гомогенизировали с помощью 2-миллиметровых шариков из нержавеющей стали в лизаторе тканей (TissueLyser II, Qiagen P/N 85300) в течение трех минут при установке 30, и образцы центрифугировали в течение 1 минуты при 13000 об/мин для отделения ткани от бактерий, ассоциированных с корнем. Супернатанты разделяли на две фракции, и одну использовали для характеристики микробиома посредством секвенирования ампликона 16S рРНК, а оставшуюся фракцию разбавляли и высевали на среду, не содержащую азота (NfB), с добавлением 1,5% агара. Планшеты инкубировали при 30°С в течение 5-7 суток. Образовавшиеся колонии тестировали на присутствие гена nifH посредством ПЦР колоний с праймерами Ueda19f и Ueda406r. Геномную ДНК штаммов с положительной на nifH ПЦР колонии (QIAamp DNA Mini Kit, Cat No. 51306, QIAGEN, Germany) выделяли и секвенировали (Illumina MiSeq v3, SeqMatic, Fremont, CA). После сборки и аннотации последовательности изоляты, содержащие кластеры генов фиксации азота, использовали в последующих исследованиях.[0346] Corn seedlings were grown from seeds (DKC 66-40, DeKalb, IL) for two weeks in greenhouse conditions, controlled from 22°C (night) to 26°C (day), and provided with 16 hour light cycles in soil collected in San Joaquin County, CA. The roots were harvested and washed with sterile deionized water, removing the main soil. Root tissues were homogenized with 2 mm stainless steel balls in a tissue lyser (TissueLyser II, Qiagen P/N 85300) for three minutes at setting 30 and samples were centrifuged for 1 minute at 13,000 rpm to separate tissue from bacteria associated with the root. The supernatants were divided into two fractions and one was used for microbiome characterization by 16S rRNA amplicon sequencing, and the remaining fraction was diluted and plated on nitrogen free (NfB) medium supplemented with 1.5% agar. The plates were incubated at 30°C for 5-7 days. The resulting colonies were tested for the presence of the nifH gene by colony PCR with primers Ueda19f and Ueda406r. Genomic DNA of nifH positive colony PCR strains (QIAamp DNA Mini Kit, Cat No. 51306, QIAGEN, Germany) was isolated and sequenced (Illumina MiSeq v3, SeqMatic, Fremont, CA). After assembly and sequence annotation, isolates containing nitrogen fixation gene clusters were used in subsequent studies.
Профилирование микробиома из саженцев после выделенияProfiling the microbiome from seedlings after isolation
[0347] Из ассоциированных с корнями бактерий выделяли геномную ДНК с использованием набора ZR-96 Genomic DNA I (Zymo Research P/N D3011), и получали ампликоны 16S рРНК с использованием праймеров со штрихкодом Nextera, направленных к 799f и 1114r. Библиотеки ампликонов очищали и секвенировали с использованием платформы Illumina MiSeq v3 (SeqMatic, Fremont, CA). Считывания классифицировали по таксонам с использованием Kraken с использованием базы данных minikraken (фигура 30).[0347] Genomic DNA was isolated from root associated bacteria using the ZR-96 Genomic DNA I kit (Zymo Research P/N D3011) and 16S rRNA amplicons were generated using Nextera barcoded primers directed to 799f and 1114r. Amplicon libraries were purified and sequenced using the Illumina MiSeq v3 platform (SeqMatic, Fremont, CA). Readings were classified by taxa using Kraken using the minikraken database (Figure 30).
Анализ восстановления ацетилена (ARA)Acetylene Recovery Analysis (ARA)
[0348] Использовали модифицированную версию анализа восстановления ацетилена с определением нитрогеназной активности в условия культивирования чистых культур. Штаммы выращивали из одной колонии в SOB (RPI, P/N S25040-1000) при 30°C с перемешиванием при 200 об/мин в течение 24 часов, а затем субкультивировали 1:25 в среду для выращивания и аэробно выращивали в течение 24 часов (30°C, 200 об/мин). Затем 1 мл культуры из минимальной среды добавляли к 4 мл минимальной среды, дополненной от 0 до 10 мМ глутамином, в воздухонепроницаемых пробирках Hungate и выращивали анаэробно в течение 4 часов (30°C, 200 об/мин). Удаляли 10% свободного пространства, затем посредством инъекции проводили замещение равным объемом ацетилена, и инкубацию продолжали в течение 1 часа. Затем удаляли 2 мл свободного пространства посредством газонепроницаемого шприца для количественного определения продукции для количественного определения продукции этилена с использованием газового хроматографа Agilent 6850, оборудованного пламенно-ионизационного детектором (FID).[0348] A modified version of the acetylene reduction assay was used to determine nitrogenase activity under pure culture conditions. Strains were grown from a single colony in SOB (RPI, P/N S25040-1000) at 30°C with agitation at 200 rpm for 24 hours, and then subcultured 1:25 into growth medium and aerobically grown for 24 hours (30°C, 200 rpm). Then 1 ml culture from minimal medium was added to 4 ml minimal medium supplemented with 0 to 10 mM glutamine in airtight Hungate tubes and grown anaerobically for 4 hours (30° C., 200 rpm). Removed 10% headspace, then by injection carried out the replacement with an equal volume of acetylene, and the incubation was continued for 1 hour. 2 ml of head space was then removed with a gas-tight product quantification syringe to quantify ethylene production using an Agilent 6850 gas chromatograph equipped with a flame ionization detector (FID).
Анализ выделения аммонияAmmonium release analysis
[0349] Выведение фиксированного азота в форме аммиака определяли с использованием периодической ферментации в анаэробных биореакторах. Штаммы выращивали из одной колонии в 1 мл/лунку SOB в 96-луночных планшетах DeepWell. Планшеты инкубировали при 30°C с перемешиванием при 200 об/мин в течение 24 часов, а затем разбавляли 1:25 в свежем планшете, содержащем 1 мл/лунку среды для выращивания. Клетки инкубировали в течение 24 часов (30°C, 200 об/мин), а затем разбавляли 1:10 в свежем планшете, содержащем минимальную среду. Планшет переносили в анаэробную камеру с газовой смесью >98,5% азота, 1,2-1,5% водорода и < 30 м.д. кислорода и инкубировали с 1350 об/мин, комнатной температуре в течение 66-70 час. Биомассу исходной культуры сравнивали с конечной биомассой посредством определения оптической плотности при 590 нм. Затем клетки разделяли посредством центрифугирования, и супернатант из реакционного бульона анализировали на свободный аммиак с использованием набора для анализа аммиака Megazyme (P/N K-AMIAR) с нормализацией на биомассу в каждой временной точке.[0349] The excretion of fixed nitrogen in the form of ammonia was determined using batch fermentation in anaerobic bioreactors. Strains were grown from a single colony in 1 ml/well SOB in 96-well DeepWell plates. The plates were incubated at 30° C. with shaking at 200 rpm for 24 hours and then diluted 1:25 in a fresh plate containing 1 ml/well of growth medium. Cells were incubated for 24 hours (30°C, 200 rpm) and then diluted 1:10 in fresh plate containing minimal medium. The plate was transferred to an anaerobic chamber with a gas mixture of >98.5% nitrogen, 1.2-1.5% hydrogen and <30 ppm. oxygen and incubated at 1350 rpm, room temperature for 66-70 hours. The biomass of the original culture was compared with the final biomass by determining the optical density at 590 nm. The cells were then separated by centrifugation and the supernatant from the reaction broth was analyzed for free ammonia using the Megazyme Ammonia Assay Kit (P/N K-AMIAR) normalized to biomass at each time point.
Выделение ассоциированного с корнями микробиомаIsolation of the root-associated microbiome
[0350] Корни осторожно встряхивали для удаления осыпающихся частиц и корневые системы разделяли и вымачивали в стабилизирующем РНК растворе (Thermo Fisher P/N AM7021) в течение 30 минут. Затем корни недолго промывали стерильной деионизированной водой. Образцы гомогенизировали с использованием перемешивания с шариками с использованием шарикоподшипников из нержавеющей стали размером 1,27 см в тканевом лизаторе (TissueLyser II, Qiagen P/N 85300) в 2 мл буфера для лизиса (Qiagen P/N 79216). Выделение геномной ДНК проводили с использованием набора ZR-96 Quick-gDNA (Zymo Research P/N D3010), а выделение РНК проводили с использованием набор RNeasy (Qiagen P/N 74104).[0350] The roots were gently shaken to remove loose particles and the root systems were separated and soaked in RNA stabilizing solution (Thermo Fisher P/N AM7021) for 30 minutes. The roots were then washed briefly with sterile deionized water. Samples were homogenized using ball agitation using 1.27 cm stainless steel ball bearings in a tissue lyser (TissueLyser II, Qiagen P/N 85300) in 2 ml lysis buffer (Qiagen P/N 79216). Genomic DNA isolation was performed using the ZR-96 Quick-gDNA kit (Zymo Research P/N D3010) and RNA extraction was performed using the RNeasy kit (Qiagen P/N 74104).
Анализ колонизации корняRoot colonization assay
[0351] Через четверо суток после посадки на почву выше посаженных семян наносили 1 мл бактериальной ночной культуры (приблизительно 109 КОЕ). Саженцы удобряли три раза в неделю 25 мл модифицированного раствора Хогланда, дополненного 0,5 мМ нитратрм аммония. Через четыре недели после посадки собирали образцы корней и выделяли тотальную геномную ДНК (гДНК). Колонизацию корня количественно определяли с использованием кПЦР с праймерами, сконструированными для амплификации уникальных областей геномов дикого типа или производного штамма. Эффективность реакции кПЦР определяли с использованием стандартной кривой, получаемой на основе известных количеств гДНК из генома-мишени. Данные нормализовали на число копий генома на грамм сырой массы с использованием массы ткани и объема выделения. Для каждого эксперимента количество колонизаций сравнивали с саженцами необработанного контроля.[0351] Four days after planting, 1 ml of bacterial overnight culture (approximately 10 9 CFU) was applied to the soil above the planted seeds. The seedlings were fertilized three times a week with 25 ml of Hoagland's modified solution supplemented with 0.5 mM ammonium nitrate. Four weeks after planting, root samples were collected and total genomic DNA (gDNA) was isolated. Root colonization was quantified using qPCR with primers designed to amplify unique regions of the wild type or derived strain genomes. The efficiency of the qPCR reaction was determined using a standard curve derived from known amounts of gDNA from the target genome. The data were normalized to the number of genome copies per gram wet weight using tissue weight and isolation volume. For each experiment, the number of colonizations was compared to untreated control seedlings.
ТранскриптомикаTranscriptomics in planta in planta
[0352] Транскрипционное профилирование ассоциированных с корнями микроорганизмов проводили у саженцев, выращиваемы и обрабатываемых, как описано в разделе "Анализ колонизации корня". Очищенную РНК секвенировали с использованием платформы Illumina NextSeq (SeqMatic, Fremont, CA). Считывания картировали на геном инокулированного штамма с использованием bowtie2 с использованием параметров '-very-sensitive-local' и минимального показателя выравнивания 30. Покрытие генома рассчитывали с использованием samtools. Дифференциальное покрытие нормализовали на экспрессию генов домашнего хозяйства и визуализировали по геному с использованием Circos и по генному кластеру nif с использованием DNAplotlib. Кроме того, транскрипционный профиль in planta количественно определяли посредством направленного анализ Nanostring. Очищенные РНК обрабатывали на nCounter Sprint (Core Diagnostics, Hayward, CA).[0352] Transcriptional profiling of root-associated microorganisms was performed on seedlings grown and treated as described in the Root Colonization Assay section. Purified RNA was sequenced using the Illumina NextSeq platform (SeqMatic, Fremont, CA). Reads were mapped to the genome of the inoculated strain using bowtie2 using the '-very-sensitive-local' parameters and a minimum alignment score of 30. Genome coverage was calculated using samtools. Differential coverage was normalized for housekeeping gene expression and visualized across the genome using Circos and across the nif gene cluster using DNAplotlib. In addition, the in planta transcriptional profile was quantified by targeted Nanostring analysis. Purified RNAs were processed on nCounter Sprint (Core Diagnostics, Hayward, CA).
Тепличное исследование разведения 15N Greenhouse breeding research 15 N
[0353] Эксперимент по разведению удобрения с 15N проводили для оценки активности оптимизированного штамма in planta. Среду для посадки, содержащую минимальный фоновый N получали с использованием смеси вермикулита и промытого песка (5 промываний в DI H2O). Песчаную смесь автоклавировали в течение 1 часа при 122°C и отмеряли приблизительно 600 г в 656 мл горшки, которые пропитывали стерильной DI H2O и за 24 часа перед посадкой оставляли стекать. Поверхность семян кукурузы (DKC 66-40) стерилизовали в 0,625% гипохлорите натрия в течение 10 минут, затем пять раз промывали в стерильной дистиллированной воде и высаживали на глубину 1 см. Растения содержали под флуоресцентными лампами в течение четырех недель с 16 часовой длиной суток при комнатных температурах в среднем от 22°C (ночью) до 26°C (днем).[0353] A fertilizer dilution experiment with 15 N was performed to evaluate the in planta activity of the optimized strain. Planting media containing minimal background N was prepared using a mixture of vermiculite and washed sand (5 washes in DI H 2 O). The sand mixture was autoclaved for 1 hour at 122°C and measured approximately 600 g in 656 ml pots, which were soaked in sterile DI H 2 O and left to drain 24 hours before planting. The surface of corn seeds (DKC 66-40) was sterilized in 0.625% sodium hypochlorite for 10 minutes, then washed five times in sterile distilled water and planted at a depth of 1 cm. The plants were kept under fluorescent lamps for four weeks with a 16 hour day length at room temperatures average between 22°C (night) and 26°C (day).
[0354] Через пять суток после посадки саженцы инокулировали 1 мл суспензии клеток вымачивая непосредственно над растущим колеоптилем. Инокулят получали из 5 мл ночной культуры в SOB, которую дважды центрифугировали и ресуспендировали в 5 мл PBS для удаления остаточного SOB с последующим конечным разведением до OD 1,0 (приблизительно 109 КОЕ/мл). Контрольные растения обрабатывали стерильным PBS, и каждую обработку проводили для десяти повторов растений.[0354] Five days after planting, seedlings were inoculated with 1 ml of cell suspension by soaking directly over the growing coleoptile. The inoculum was prepared from a 5 ml overnight culture in SOB, which was centrifuged twice and resuspended in 5 ml PBS to remove residual SOB followed by a final dilution to OD 1.0 (approximately 10 9 CFU/ml). Control plants were treated with sterile PBS and each treatment was for ten plant replicates.
[0355] Растения удобряли 25 мл раствора удобрения, содержащего 2% обогащенного 15N 2 мМ KNO3, на 5, 9, 14 и 19 сутки после посадки, и тем же раствором без KNO3 на 7, 12, 16 и 18 сутки после посадки. Раствор удобрения содержал (на литр) 3 ммоль CaCl2, 0,5 ммоль KH2PO4, 2 ммоль MgSO4, 17,9 мкмоль FeSO4, 2,86 мг H3BO3, 1,81 мг MnCl2⋅4H2O, 0,22 мг ZnSO4⋅7H2O, 51 мкг CuSO4⋅5H2O, 0,12 мг Na2MoO4⋅2H2O и 0,14 нмоль NiCl2. Все горшки по мере необходимости смачивали стерильной DI H2O для поддержания соответствующей влажности почвы без стекания.[0355] Plants were fertilized with 25 ml of a fertilizer solution containing 2% enriched in 15
[0356] Через четыре недели растения собирали и разделяли на самом нижнем узле на образцы для выделения гДНК и РНК корня и находящиеся на воздухе ткани для IRMS. Находящиеся на воздухе ткани по мере необходимости протирали для удаления песка, целиком помещали в бумажные пакеты и высушивали по меньшей мере в течение 72 часов при 60°C. После полного высыхания тотальную находящуюся на воздухе ткань гомогенизировали посредством перемешивания с гранулами и 5-7 мг образцы анализировали посредством масс-спектрометрии с соотношением изотопов (IRMS) на δ15N в MBL Stable Isotope Laboratory (The Ecosystems Center, Woods Hole, MA). Процент NDFA рассчитывали с использованием следующей формулы: %NDFA=(δ15N среднего UTC - δ15N образца)/(δ15N среднего UTC) × 100.[0356] Four weeks later, plants were harvested and separated at the lowest node into samples for root gDNA and RNA isolation and exposed tissues for IRMS. The exposed fabrics were wiped to remove sand as needed, placed whole in paper bags and dried for at least 72 hours at 60°C. After complete drying, the total exposed tissue was homogenized by mixing with the beads and 5-7 mg samples were analyzed by isotope ratio mass spectrometry (IRMS) for δ15N at the MBL Stable Isotope Laboratory (The Ecosystems Center, Woods Hole, MA). The percentage of NDFA was calculated using the following formula: %NDFA=(δ15N mean UTC - δ15N sample)/(δ15N mean UTC) × 100.
Пример 11: Полевые испытания с микроорганизмами по изобретению - лето 2017 годаExample 11: Field trials with microorganisms according to the invention - summer 2017
[0357] Для оценки воздействия штаммов по настоящему изобретению рост и продуктивность кукурузы при различных режимах азота проводили полевые испытания. Приводимые ниже полевые данные демонстрируют, что не являющиеся межродовыми микроорганизмы по изобретению способны к фиксации атмосферного азота и доставке указанного азота в растение, что приводит к увеличенной урожайности в среде с ограниченным содержанием азота, а также в среде без ограничения азота.[0357] To evaluate the impact of the strains of the present invention, the growth and productivity of corn under various nitrogen regimes were conducted field trials. The following field data demonstrates that the non-intergeneric microorganisms of the invention are capable of fixing atmospheric nitrogen and delivering said nitrogen to the plant, resulting in increased yields in nitrogen-limited as well as non-nitrogen-limited environments.
[0358] Испытания проводили в семи регионы Соединенных Штатов в шести географически различных среднезападных регионах. Для обработки удобрениями использовали пять режимов азота: 100% от стандартной сельскохозяйственной практики участка/региона, 100% минус 25 фунтов, 100% минус 50 фунтов, 100% синус 75 фунтов и 0%; все данные приведены на акр. Фунты азота на акр для режима 100% зависели от стандартной сельскохозяйственной практики участка/региона. Указанные выше режимы азота находились в диапазоне приблизительно от 153 фунтов на акр до приблизительно 180 фунтов на акр со средним приблизительно 164 фунтов азота на акр.[0358] Tests were conducted in seven regions of the United States in six geographically distinct midwestern regions. Five nitrogen regimens were used for fertilization: 100% site/region standard agricultural practice, 100% minus 25 lbs, 100% minus 50 lbs, 100
[0359] Для каждого режима удобрения проводили 14 обработок. Для каждого режима проводили шесть повторений, и использовали схему с расщепленными делянками. 14 обработок включали: 12 различных микроорганизмов, 1 UTC c тем же уровнем удобрения как и основной участок и 1 UTC со 100% азота. В режиме со 100% азота 2-й UTC представлял собой 100 плюс 25 фунтов.[0359] For each fertilizer regimen, 14 treatments were performed. Six repetitions were performed for each regimen, and a split-plot scheme was used. The 14 treatments included: 12 different microorganisms, 1 UTC with the same level of fertilizer as the main plot, and 1 UTC with 100% nitrogen. In 100% nitrogen mode, 2nd UTC was 100 plus 25 pounds.
[0360] Участки кукурузы, минимально, состояли из 4 рядов по 9,144 м в длину (76,2 см между рядами) с 420 участками на регион. Если не указано иначе, все наблюдения проводили в центральных двух рядах участков, а все получения образца с разрушением проводили во внешних рядах. Образцы семян перед использованием охлаждали до 1,5-2 часов.[0360] Plots of corn, at a minimum, consisted of 4 rows of 9.144 m in length (76.2 cm between rows) with 420 plots per region. Unless otherwise indicated, all observations were made in the center two rows of plots, and all sample preparations with destruction were made in the outer rows. Seed samples were cooled to 1.5-2 hours before use.
[0361] Региональная сельскохозяйственная практика: Семена представляли собой коммерческую кукурузу, используемую с коммерческой пропиткой для семян без биологического совместного применения. Норма высева, дата посадки, контроль сорняков/насекомых, времена сбора урожая и другие стандартные практики ведения хозяйства соответствовали нормам местных сельскохозяйственных практик для регионов за исключением применения фунгицидов (если требовалось).[0361] Regional agricultural practice: Seeds were commercial corn used with commercial seed treatment without biological co-application. Seeding rate, planting date, weed/insect control, harvest times, and other standard farming practices were in line with local agricultural practices for the regions, with the exception of fungicide application (if required).
[0362] Нанесение микроорганизмов: Микроорганизмы наносили на семена в пропитке для семян на семена, которым уже проводили нормальную химическую обработку. Семена покрывали ферментационным бульоном, содержащим микроорганизмы.[0362] Application of Microorganisms: Microorganisms were applied to the seeds in a seed treatment for seeds that had already undergone normal chemical treatment. The seeds were covered with a fermentation broth containing microorganisms.
[0363] Характеристики почв: Оценивали текстуру почв и плодородность почв. Использовали стандартные способы получения образцов почв, которые включали образцы грунта на глубинах 0-30 см и 30-60 см. Стандарт получения образца почвы включал определение азота нитратов, азота аммония, общего азота, органических веществ и CEC. Стандарт получения образца почвы дополнительно включал определение pH, общего калия и общего фосфора. Для определения уровней азотных удобрений получали предпосадочные образцы почв из каждого региона для гарантии, что 0-12" и потенциально 12" до 24" почвенных регионов для азота нитратов.[0363] Soil characteristics: Soil texture and soil fertility were assessed. Standard soil sampling methods were used, which included soil samples at depths of 0-30 cm and 30-60 cm. The soil sampling standard included determination of nitrate nitrogen, ammonium nitrogen, total nitrogen, organic matter, and CEC. The standard for obtaining a soil sample additionally included the determination of pH, total potassium and total phosphorus. To determine nitrogen fertilizer levels, pre-plant soil samples were obtained from each region to ensure that 0-12" and potentially 12" to 24" soil regions for nitrate nitrogen.
[0364] Перед посадкой и внесением удобрений собирали по 2 мл образцов почв от 0 до 6-12" из UTC. Собирали по одному образцу на повтор на азотную область с использованием середины ряда. (5 режимов удобрения × 6 повторений=тридцать образцов почв).[0364] Before planting and fertilizing, 2 ml of soil samples were collected from 0 to 6-12" from UTC. Collected one sample per repetition per nitrogen area using the middle of the row. (5 fertilizer regimens × 6 repetitions = thirty soil samples) .
[0365] После посадки (V4-V6) собирали по 2 мл образцов почв от 0 до 6-12" из UTC. Собирали по одному образцу на повтор на каждую азотную область с использованием середины ряда. (5 режимов удобрения × 6 повторений=тридцать образцов почв).[0365] After planting (V4-V6), 2 ml of soil samples from 0 to 6-12" from UTC were collected. One sample was collected per repeat for each nitrogen area using the middle of the row. (5 fertilization regimens × 6 repetitions = thirty soil samples).
[0366] После сбора урожая (V4-V6) собирали по 2 мл образцы почв от 0 до 6-12" из UTC. Собирали по одному образцу на повтор на каждую азотную область с использованием середины ряда. Дополнительно после сбора урожая собирали образцы почвы на 0-12" из UTC и потенциально 12-24" из UTC (5 режимов удобрения × 6 повторений=тридцать образцов почв).[0366] After harvesting (V4-V6), 2 ml soil samples were collected from 0 to 6-12" from UTC. Collected one sample per repetition for each nitrogen area using the middle of the row. 0-12" from UTC and potentially 12-24" from UTC (5 fertilizer applications x 6 repetitions = thirty soil samples).
[0367] Образец почвы для V6-V10 для каждого режима удобрения (исключая обработку 100% и 100%+25 фунтов [в блоке 100%] для всех режимов удобрения при 0-12" и 12-24". (5 режимов удобрения × 2 глубины=10 образцов на регион).[0367] Soil sample for V6-V10 for each fertilizer setting (excluding 100% and 100%+25 lb treatment [in 100% block] for all fertilizer settings at 0-12" and 12-24" (5 fertilizer settings × 2 depths=10 samples per region).
[0368] После сбора урожая образец почва для каждого режима удобрения (исключая обработку 100% и 100%+25 фунтов [в блоке 100%] для всех режимов удобрения при 0-12" и 12-24". (5 режимов удобрения × 2 глубины=10 образцов на регион).[0368] After harvest, soil sample for each fertilization regimen (excluding 100% and 100%+25 lb treatment [in 100% block] for all fertilization regimens at 0-12" and 12-24". (5 fertilization regimens × 2 depth=10 samples per region).
[0369] Анализ: Исходную популяцию растений оценивали при ≈50% UTC, а конечную популяцию растений оценивали перед сбором. Анализ включал (1) потенциально температуру (датчик температуры); (2) мощность (по шкале 1-10 с 10=отлично) при V4 и V8-V10; (3) высота растения при V8-V10 и V14; (4) урожайность (бушелей/акр), скорректированная на стандартный процент влажности; (5) тестовая масса; (6) процент влажности зерен; (7) тесты нитратов стебля при черной точке (420 участков × 7 регионов); (8) колонизацию с 1 растением на участок в пакете с застежкой на молнии при 0% и 100% удобрения при V4-V6 (1 растение × 14 обработок × 6 повторений × 2 режима удобрения=168 растений); (9) транскриптомика с 1 растением на участок в пакете с застежкой на молнии при 0% и 100% удобрения при V4-V6 (1 растение × 14 обработок × 6 повторений × 2 режима удобрения=168 растения); (10) определение нормализованного разностного вегетационного индекса (NDVI) или нормализованной разности красного края (NDRE) с использованием инструмента Greenseeker в два момента времени (V4-V6 и VT) для оценки каждого участка во всех 7 регионах (420 участки × 2 момента времени × 7 регионов=5880 точек данных); (11) характеристики стебля, определяемые во всех 7 регионах между R2 и R5 посредством регистрации диаметра стебля 10 растений/участок при высоте 15 см, регистрация длины первого междоузлия выше отметки 15 см, проводили мониторинг 10 растений (5 последовательных растений от центра двух внутренних рядов) (420 участки × 10 растений × 7 регионов=29400 точек данных).[0369] Analysis: The initial plant population was evaluated at ≈50% UTC, and the final plant population was evaluated before harvest. The analysis included (1) potential temperature (temperature sensor); (2) power (on a scale of 1-10 with 10=excellent) at V4 and V8-V10; (3) plant height at V8-V10 and V14; (4) yield (bushels/acre) corrected for standard moisture percentage; (5) test mass; (6) grain moisture percentage; (7) black dot stem nitrate tests (420 plots × 7 regions); (8) colonization with 1 plant per plot in a ziplock bag at 0% and 100% fertilizer at V4-V6 (1 plant x 14 treatments x 6 reps x 2 fertilization regimens = 168 plants); (9) transcriptomic with 1 plant per plot in a zipper bag at 0% and 100% fertilization at V4-V6 (1 plant x 14 treatments x 6 reps x 2 fertilization regimens = 168 plants); (10) determination of Normalized Difference Vegetation Index (NDVI) or Normalized Red Edge Difference (NDRE) using the Greenseeker tool at two time points (V4-V6 and VT) to evaluate each plot in all 7 regions (420 plots × 2 time points × 7 regions=5880 data points); (11) stem characteristics determined in all 7 regions between R2 and R5 by recording stem diameter 10 plants/plot at 15 cm height, recording first internode length above 15 cm mark, monitoring 10 plants (5 consecutive plants from the center of the two inner rows ) (420 plots × 10 plants × 7 regions=29400 data points).
[0370] Схема мониторинга: Практические исполнители посещали все испытания на стадии V3-V4 для оценки ранней сезонной реакции на обработки и в течение стадии репродуктивного роста для мониторинга созревания. Местный сотрудник непрерывно производил исследовательские испытания.[0370] Monitoring Scheme: Practitioners attended all trials during the V3-V4 stage to assess early seasonal response to treatments and during the reproductive growth stage to monitor maturation. A local employee continuously made exploratory tests.
[0371] Информация о погоде: Собирали данные о погоде, охватывающие период от посадки до сбора урожая, и они состояли из суточных минимальных и максимальных температур, температуры почвы при посеве, суточных осадков и ирригации (если применяли) и необычных погодных явлений, таких как сильный ветер, дождь, холод, жара.[0371] Weather Information: Weather data was collected covering the period from planting to harvest, and consisted of daily minimum and maximum temperatures, soil temperature at planting, daily precipitation and irrigation (if applicable), and unusual weather events such as strong wind, rain, cold, heat.
[0372] Представление данных: Включая данные, указанные выше, в полевых испытаниях получили точки данных, включая текстуры почвы; расстояние между рядами; размеры участка; ирригацию; обработку почвы; предыдущий урожай; норму высева; популяцию растений; сезонные поступления удобрений, включая источник, норму, сроки и место размещения; размеры площади уборки, способ сбора урожая, например, ручным или машинным способом и используемые измерительные инструменты (весы, монитор урожайности и т. д.)[0372] Data presentation : Including the data above, data points were obtained in field trials, including soil textures; distance between rows; plot dimensions; irrigation; tillage; previous harvest; seeding rate; plant population; seasonal inputs of fertilizers, including source, rate, timing and location; the size of the harvested area, the method of harvesting, for example, by hand or machine, and the measuring instruments used (scales, yield monitor, etc.)
[0373] Результаты: Избранные результаты указанного выше полевого испытания приведены на фигуре 32 и фигуре 33.[0373] Results: Selected results from the above field trial are shown in Figure 32 and Figure 33 .
[0374] На фигуре 32, можно видеть, что использование микроорганизма по изобретению (т.е., 6-403) приводило к более высокому урожаю, чем у штамма дикого типа (дикий тип) и к более высокому урожаю, чем у необработанного контроля (UTC). При обработке "-25 lbs N" использовали на 25 фунтов N на акр менее, чем при стандартной сельскохозяйственной практике в регионе. Обработка UTC "100% N" предназначена для обозначения стандартной сельскохозяйственной практики региона, при которой 100% стандартного использования N применяет сельхозпроизводитель. Микроорганизм "6-403" депонирован под идентификатором NCMA 201708004, и его можно найти в таблице A. Он представляет собой мутант Kosakonia sacchari (также называемый CM037) и является мутантным потомком штамма CI006 дикого типа.[0374] In figure 32 , it can be seen that the use of the microorganism of the invention (i.e., 6-403) resulted in a higher yield than the wild type strain (wild type) and a higher yield than the untreated control (UTC). The "-25 lbs N" treatment used 25 lbs N per acre less than standard farming practice in the region. The UTC treatment "100% N" is intended to refer to a region's standard agricultural practice in which 100% of the standard N use is applied by the farmer. The microorganism "6-403" was deposited under NCMA ID 201708004 and can be found in Table A. It is a mutant of Kosakonia sacchari (also referred to as CM037) and is a mutant offspring of wild-type strain CI006.
[0375] На фигуре 33 полученные результаты урожайности демонстрируют, что микроорганизмы по настоящему изобретению действуют в различных регионах действуют единообразно. Кроме того, результаты урожайности демонстрируют, что микроорганизмы по настоящему изобретению хорошо функционируют как в среде с недостаточным содержанием азота (то есть в среде с ограничением азота), так и в среде, которая с достаточным содержанием азота (то есть среда без ограничения азота). Микроорганизм "6-881" (также известный как CM094, PBC6.94), и который является мутантным потомком штамма Kosakonia sacchari CI006 дикого типа, депонирован под идентификатором NCMA 201708002, и его можно найти в таблице A. Микроорганизм "137-1034", который является мутантным потомком штамма Klebsiella variicola CI137 дикого типа, депонирован под идентификатором NCMA 201712001, и его можно найти в таблице A. Микроорганизм "137-1036", который является мутантным потомком штамма Klebsiella variicola CI137 дикого типа, депонирован под идентификатором NCMA 201712002, и его можно найти в таблице A. Микроорганизм "6-404" (также известный как CM38, PBC6.38), и который является мутантным потомком штамма Kosakonia sacchari CI006 дикого типа, депонирован под идентификатором NCMA 201708003, и его можно найти в таблице A.[0375] In Figure 33, the yield results obtained demonstrate that the microorganisms of the present invention act in different regions in a uniform manner. In addition, the yield results demonstrate that the microorganisms of the present invention function well both in an environment with insufficient nitrogen content (i.e., an environment with nitrogen restriction) and in an environment that has sufficient nitrogen content (i.e., an environment without nitrogen restriction). The microorganism "6-881" (also known as CM094, PBC6.94), and which is a mutant progeny of wild-type strain Kosakonia sacchari CI006, is deposited under NCMA ID 201708002 and can be found in Table A. The microorganism "137-1034", which is a mutant descendant of the wild-type strain Klebsiella variicola CI137, has been deposited under NCMA ID 201712001 and can be found in Table A. The microorganism "137-1036", which is a mutant descendant of the wild-type strain Klebsiella variicola CI137, has been deposited under NCMA ID 201712002 and can be found in Table A. The microorganism "6-404" (also known as CM38, PBC6.38), and which is a mutant progeny of the wild-type strain Kosakonia sacchari CI006, is deposited under NCMA ID 201708003 and can be found in Table A.
Пример 12: Род не являющихся межродовыми микроорганизмов, эффективный для сельскохозяйственных системExample 12 Non-intergeneric Microorganism Genus Effective for Agricultural Systems
[0376] Микроорганизмы по настоящему изобретению оценивали и сравнивали друг с другом по продукции азота, происходящей на акре в течение сезона. См. фигуру 20, фигуру 40 и фигуру 41 [0376] The microorganisms of the present invention were evaluated and compared with each other in terms of nitrogen production occurring per acre during the season. See figure 20 , figure 40 and figure 41
[0377] Авторы изобретения выдвинули гипотезу, что для того, чтобы популяция подвергнутых генетической инженерии не являющихся межродовыми микроорганизмов была эффективна в современной сельскохозяйственной системе пропашных культур, популяция микроорганизмов должна продуцировать по меньшей мере один фунт или более азота на акр за сезон.[0377] The inventors hypothesized that for a population of genetically engineered non-intergeneric microorganisms to be effective in a modern row crop agricultural system, the microbial population must produce at least one pound or more of nitrogen per acre per season.
[0378] Исходя из этого, авторы изобретения неожиданно выявили функциональный род микроорганизмов, которые в числе прочего способны вносить вклад в: повышение урожайности у небобовых сельскохозяйственных культур; и/или снижение зависимости сельхозпроизводителя от применения экзогенного азота; и/или способность производить по меньшей мере один фунт азота на акр за сезон, даже в неограничивающих азот средах, где указанный род определен произведением колонизирующей способность × ммоль N, продуцируемых на микроорганизмом в час (т.е. линии, разделяющая фигуры 20, 40 и 41).[0378] Based on this, the inventors unexpectedly identified a functional genus of microorganisms that, among other things, are able to contribute to: increasing yields in non-legume crops; and/or reducing the farmer's dependence on the use of exogenous nitrogen; and/or the ability to produce at least one pound of nitrogen per acre per season, even in non-nitrogen-restricting environments, where the specified genus is defined by the product of colonizing capacity × mmol N produced per microorganism per hour (i.e., the line dividing figures 20 , 40 and 41 ).
[0379] В отношении фигур 20, 40 и 41, определенные данные использования микроорганизмов по изобретению объединены для изображения тепловой карты количества фунтов азота, доставляемых на акре/сезон микроорганизмами по изобретению, которая зарегистрирована как функция микроорганизмов на грамм сырой массы на ммоль азота/микроорганизм/час. Ниже тонкой линии, пересекающей более крупное изображение, находятся микроорганизмы, доставляющие менее одного фунта азота на акре/сезон, а выше линии находятся микроорганизмы, доставляющие более одного фунта азота на акре/сезон.[0379] Referring to Figures 20 , 40, and 41 , certain inventive microorganism usage data are combined to display a heat map of the number of pounds of nitrogen delivered per acre/season by inventive micro-organisms, which is recorded as a function of microorganisms per gram wet weight per mmol of nitrogen/microorganism /hour. Below the thin line across the larger image are microorganisms delivering less than one pound of nitrogen per acre/season, and above the line are microorganisms delivering more than one pound of nitrogen per acre/season.
[0380] Полевые данные и тепловая карта колонизация дикого типа: Микроорганизмы, используемые в тепловой карте фигуры 20, анализировали на продукцию N в кукурузе. Для штаммов дикого типа CI006 и CI019 данные по колонизации корня кукурузы получали с одного полевого участка. Для оставшихся штаммов колонизацию полагали такой же, как уровень в поле у дикого типа. Активность фиксации N определяли с использованием анализа ARA in vitro с 5 мМ глутамином. В таблице ниже тепловая карта на фигуре 20 дает точное значение ммоль N, продуцируемых микроорганизмом в час (ммоль N/микроорганизм/час), вместе с точными значениями КОЕ на грамм сырой массы (КОЕ/г св.масс.) для каждого микроорганизма, приведенного на тепловой карте.[0380] Field Data and Heatmap Wild Type Colonization: The microorganisms used in the heatmap of Figure 20 were analyzed for N production in corn. For wild-type strains CI006 and CI019, maize root colonization data were obtained from a single field plot. For the remaining strains, colonization was assumed to be the same as the wild-type level in the field. N fixation activity was determined using an in vitro ARA assay with 5 mM glutamine. In the table below, the heat map in Figure 20 gives the exact value of mmol N produced by a microorganism per hour (mmol N/microorganism/hour), together with the exact values of CFU per gram wet weight (CFU/g wt.) for each microorganism, given on the heat map.
[0381] Тепловая карта полевых данных: Данные, используемые в тепловой карте фигуры 40, получали у штаммов микроорганизмов, оцениваемых на продукцию N в кукурузе в полевых условиях. Каждая точка представляет собой фунты N/акр, продуцируемые микроорганизмом, с использованием данных по колонизации корня кукурузы с одного полевого участка. Активность фиксации N определяли с использованием анализа ARA in vitro с 5 мМ N в форме глутамина или фосфата аммония. В приводимой ниже таблице C даны точные значения ммоль N, продуцируемых микроорганизмом в час (ммоль N/микроорганизм/час) вместе с точными значениями КОЕ на грамм сырой массы (КОЕ/г св.масс.) для каждого микроорганизма, приведенного на тепловой карте фигуры 40.[0381] Heat map of field data: The data used in the heat map of figure 40 was obtained from strains of microorganisms evaluated for N production in corn in the field. Each point represents pounds N/acre produced by the microorganism using corn root colonization data from one field plot. N fixation activity was determined using an in vitro ARA assay with 5 mM N in the form of glutamine or ammonium phosphate. Table C below gives the exact mmol N produced by a microorganism per hour (mmol N/microorganism/hr) along with the exact CFU per gram wet weight (CFU/g wt) for each microorganism shown on the heat map of the figure . 40 .
[0382] Тепловая карта на основе тепличных и лабораторных данных: Данные, используемые в тепловой карте фигуры 41, получали у штаммов микроорганизмов, оцениваемых на продукцию N в кукурузе в лабораторных и тепличных условиях. Каждая точка представляет собой фунты N/акр, продуцируемые одним штаммом. Белые точки представляют штаммы, у которых данные по колонизации корня кукурузы собраны в тепличных условиях. Черные точки представляют мутантные штаммы, для которых уровни колонизации корней кукурузы получают на основе средних полевых уровней колонизации корней кукурузы родительского штамма дикого типа. Заштрихованные точки представляют родительские штаммы дикого типа с их средними полевыми уровнями колонизации корней кукурузы. Во всех случаях, активность фиксации N определяли посредством анализа ARA in vitro с 5 мМ N в форме глутамина или фосфата аммония. В приводимой ниже таблице D даны точные значения ммоль N, продуцируемых микроорганизмом в час (ммоль N/микроорганизм/час) вместе с точными значениями КОЕ на грамм сырой массы (КОЕ/г св.масс.) для каждого микроорганизма, приведенного на тепловой карте of фигура 41.[0382] Heatmap Based on Greenhouse and Laboratory Data: The data used in the heatmap of Figure 41 was obtained from strains of microorganisms assessed for N production in corn under laboratory and greenhouse conditions. Each dot represents pounds N/acre produced by one strain. White dots represent strains from which corn root colonization data were collected under greenhouse conditions. Black dots represent mutant strains for which corn root colonization levels are derived from average field corn root colonization levels of the wild-type parental strain. The shaded dots represent wild-type parental strains with their mean field levels of corn root colonization. In all cases, N fixation activity was determined by in vitro ARA assay with 5 mM N in the form of glutamine or ammonium phosphate. Table D below gives the exact mmol N produced by a microorganism per hour (mmol N/microorganism/hr) along with the exact CFU per gram wet weight (CFU/g wt) for each microorganism shown on the heat map of figure 41 .
Таблица C: фигура 40 - Тепловая карта для полевых данныхTable C: figure 40 - Heat map for field data
Таблица D: фигура 41 - Тепловая карта для тепличных и лабораторных данныхTable D: figure 41 - Heat map for greenhouse and laboratory data
[0383] Выводы: Данные на фигурах 20, 40, 41 и в таблицах C и D иллюстрируют большое количество представителей описанного рода (т.е. микроорганизмов справа от линии на фигурах). Кроме того, эти многочисленные представители происходят из разнообразного набора таксономических родов, которые можно найти в приводимых выше таблицах C и D. Кроме того, авторы изобретения выявили множество генетических свойств, которые отображают зависимость структура/функция, которая выявлено у многих микроорганизмов. Эту генетическую зависимость можно найти во множестве таблиц по изобретению, где приведены генетические модификации, проводимые авторами изобретения, которые включают внесение по меньшей мере одной генетической вариации по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.[0383] Conclusions: The data in figures 20 , 40 , 41 and in tables C and D illustrate a large number of representatives of the described genus (ie microorganisms to the right of the line in the figures). In addition, these numerous members come from a diverse array of taxonomic genera that can be found in Tables C and D above. In addition, the inventors have identified a variety of genetic properties that reflect the structure/function relationship found in many microorganisms. This genetic dependency can be found in a variety of tables of the invention, which list the genetic modifications carried out by the inventors, which include the introduction of at least one genetic variation in at least one gene or non-coding polynucleotide of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network.
[0384] Таким образом, недавно выявленный род подтверждается: (1) надежным набором данных, (2) большим количеством представителей, (3) представителями из разных таксономических родов и (4) классами генетических модификаций, которые определяют зависимость структура/функция в лежащей в основе генетической архитектуре представителей рода.[0384] Thus, the newly identified genus is supported by: (1) a robust dataset, (2) a large number of members, (3) members from different taxonomic genera, and (4) classes of genetic modifications that define a structure/function relationship in the underlying basis of the genetic architecture of representatives of the genus.
Пример 13: Способы и анализы для детекции не являющихся межродовыми подвергнутых генетической инженерии микроорганизмовExample 13 Methods and Assays for Detecting Non-Intergeneric Genetically Engineered Microorganisms
[0385] В настоящем описании указаны праймеры, зонды и анализы, которые пригодны для детекции микроорганизмов, используемых в различных указанных выше примерах. Посредством анализов можно детектировать последовательности с неприродным "соединением" нуклеотидов в полученных/мутантных не являющихся межродовыми микроорганизмах. Эти неприродные соединения нуклеотидов можно использовать в качестве типа диагностики, которая является показателем присутствия конкретной генетической альтерация в микроорганизме.[0385] In the present description, primers, probes and assays are indicated that are suitable for the detection of microorganisms used in the various examples above. The assays can detect sequences with non-natural "connection" of nucleotides in the resulting/mutant non-intergeneric microorganisms. These non-natural nucleotide compounds can be used as a type of diagnostic that is indicative of the presence of a particular genetic alteration in a microorganism.
[0386] Способами по настоящему изобретению можно детектировать эти неприродные соединения нуклеотидов с использованием специализированных способов количественной ПЦР, включая уникальным образом сконструированные праймеры и зонды. Зонды могут связываться с последовательностями с неприродным соединением нуклеотидов. Т.е. можно использовать специфичные для последовательностей ДНК-содержащие зонды, состоящие из олигонуклеотидов, которые мечены флуоресцентным репортером, обеспечивающем детекцию только после гибридизации зонда с комплементарной ему последовательностью. Количественные способы могут гарантировать, что амплификацию посредством указанных праймеров пройдет только неприродное соединение нуклеотидов, и, таким образом, его можно детектировать посредством неспецифического красителя или посредством использования специфического зонда для гибридизации. Другим аспектом способа является выбор праймеров так, чтобы праймеры фланкировали какой-либо конец последовательности с соединением так, что если происходит реакция амплификации, то указанная последовательность с соединением присутствует.[0386] The methods of the present invention can detect these non-natural nucleotide compounds using specialized quantitative PCR methods, including uniquely designed primers and probes. Probes can bind to sequences with non-natural connection of nucleotides. Those. you can use sequence-specific DNA-containing probes, consisting of oligonucleotides that are labeled with a fluorescent reporter, providing detection only after hybridization of the probe with its complementary sequence. Quantitative methods can ensure that only non-natural nucleotide bonding will be amplified by said primers, and thus can be detected by a non-specific dye or by using a specific hybridization probe. Another aspect of the method is the selection of primers such that the primers flank either end of the sequence with the compound so that if an amplification reaction occurs, said sequence with the compound is present.
[0387] Таким образом, из образцов можно выделять геномную ДНК и использовать для количественного определения присутствия микроорганизмов по изобретению с применением кПЦР. Праймеры, используемые в реакции кПЦР, могут представлять собой праймеры, сконструированные посредством Primer Blast (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/праймер-blast/) с амплификацией уникальных областей генома дикого типа или уникальных областей подвергнутых генетической инженерии не являющихся межродовыми мутантных штаммов. Реакцию кПЦР можно проводить с использованием набор SYBR GreenER qPCR SuperMix Universal (Thermo Fisher P/N 11762100), с использованием только прямого и обратного праймеров для амплификации; альтернативно, можно использовать набор Kapa Probe Force (Kapa Biosystems P/N KK4301) с праймерами для амплификации и зондом TaqMan, содержащем красящую метку FAM dye на 5'-конец, внутренний гаситель ZEN, и связывающее малую бороздку средство и флуоресцентный гаситель на 3'-конце (Integrated DNA Technologies).[0387] Thus, genomic DNA can be isolated from samples and used to quantify the presence of microorganisms of the invention using qPCR. The primers used in the qPCR reaction may be primers designed with Primer Blast (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/) to amplify unique regions of the wild type genome or unique regions subjected to genetic engineering of non-intergeneric mutant strains. The qPCR reaction can be performed using the SYBR GreenER qPCR SuperMix Universal kit (Thermo Fisher P/N 11762100), using only forward and reverse amplification primers; alternatively, the Kapa Probe Force kit (Kapa Biosystems P/N KK4301) with amplification primers and TaqMan probe containing FAM dye at the 5' end, internal ZEN quencher, and minor groove binder and fluorescent quencher at 3' can be used. -end (Integrated DNA Technologies).
[0388] Определенные последовательности праймеров, зондов и последовательности с неприродным соединением, которые можно использовать в способах кПЦР, перечислены в приводимой ниже таблице E. Конкретно, последовательности с неприродным соединением можно найти в SEQ ID NO: 372-405.[0388] Certain primer, probe, and non-naturally coupled sequences that can be used in qPCR methods are listed in Table E below. Specifically, sequences with non-natural connection can be found in SEQ ID NO: 372-405.
Таблица E: Детекция микроорганизмовTable E: Detection of microorganisms
GAACGTCGCCAG
GTGGCACAAATT
GTCAGAACTACG
ACACGACTAACC
GACCGCAGGAG
TGTGCGATGACC
CTGAATATGATG
ATGGA/TTCTTGG
TTCTCTGGAGCG
CTTTATCGGCAT
CCTGACTGAAGA
ATTTGCAGGCTT
CTTCCCAACCTG
GCTTGCACCCGT
GCAGGTAGTTGT
GATGAACAT-3'5'-TGGTGTCCGGGC
GAACGTCGCCAG
GTGGCACAAATT
GTCAGAACTACG
ACACGACTAACC
GACCGCAGGAG
TGTGCGATGACC
CTGAATATGATG
ATGGA/TTCTTGG
TTTCTCTGGAGCG
CTTTATCGGCAT
CCTGACTGAAGA
ATTTGCAGGCTT
CTTCCCAACCTG
GCTTGCACCCGT
GCAGGTAGTTGT
GATGAACAT-3'
CGGAAAACGAG
TTCAAACGGCGC
GTCCCAATCGTATTAATGGCGAGATTCGCGCCACGGAAGTTCGCTTAACAGGTCTGGAAGGCGAGCAGCTTGGTATT/GCGATAGAACTCACTTCACGCCCCGAAGGGGGAAGCTGCCTGACCCTACGATTCCCGCTATTTCATTCACTGACCGGAGGTTCAAAATGACCCAGCGAAC
-3'5'-
CGGAAAACGAG
TTCAAACGGCGC
GTCCCAATCGTATTAATGGCGAGATTTCGCGCCACGGAAGTTCGCTTAACAGGTCTGGAAGGCGAGCAGCTTGGTATT/GCGATAGAACTCACTTCACGCCCCGAAGGGGGAAGCTGCCTGACCCTACGATTCCCGCTATTTCATTCACTGACCGGAGGTTCAAAATGACCCAGCGAAC
-3'
GAAATCGAACAT
TTCCGTAATACC
GCCATTACCCAG
GAGCCGTTCTGG
TTGCACAGCGGA
AAACGTTAACGA
AAGGATATTTCG
CATG/TCCCTGTG
CGCCGCGTCGCC
GATGGTGGCCAG
CCAACTGGCGCG
CTACCCGATCCT
GCTCGATGAACT
GCTCGACCCGAA
CACGCTCTATCA
ACCGACGG-3'5'-CGCCAGAGAGTT
GAAATCGAACAT
TTCCGTAATACC
GCCATTACCAG
GAGCCGTTCTGG
TTGCACAGCGGA
AAACGTTAACGA
AAGGATATTTCG
CATG/TCCCTGTG
CGCCGCGTCGCC
GATGGTGGCCAG
CCAACTGGCGCG
CTACCCGATCCT
GCTCGATGAACT
GCTCGACCCGAA
CACGCTCTATCA
ACCGACGG-3'
GCCAGGTGGCAC
AAATTGTCAGAA
CTACGACACGAC
TAACCGACCGCA
GGAGTGTGCGAT
GACCCTGAATAT
GATGATGGATGC
CAGC/CGTTCTGT
AATAATAACCGG
ACAATTCGGACT
GATTAAAAAAG
CGCCCTCGCGGC
GCTTTTTTTATAT
TCTCGACTCCAT
TTAAAATAAAAA
ATCCAATC-3'5'-CGGGCGAACGTC
GCCAGGTGGCAC
AAATTGTCAGAA
CTACGACACGAC
TAACCGACCGCA
GGAGTGTGCGAT
GACCCTGAATAT
GATGATGGATGC
CAGC/CGTTCTGT
AATAATAACCGG
ACAATTCGGACT
GATTAAAAAAG
CGCCCTCGCGGC
GCTTTTTTTATAT
TCTCGACTCCAT
TTAAAATAAAAA
ATCCAATC-3'
AGTTTGTGTAAT
ACTTGTAACGCT
ACATGGAGATTA
ACTCAATCTAGA
GGGTATTAATAA
TGAATCGTACTA
AACTGGTACTGG
GCGC/AACTCAC
TTCACGCCCCGA
AGGGGGAAGCT
GCCTGACCCTAC
GATTCCCGCTAT
TTCATTCACTGA
CCGGAGGTTCAA
AATGACCCAGCG
AACCGAGTCG-3'5'-TCAACCTAAAAA
AGTTTGTGTAAT
ACTTGTAACGCT
ACATGGAGATTA
ACTCAATCTAGA
GGGTATTAATAA
TGAATCGTACTA
AACTGGTACTGG
GCGC/AACTCAC
TTCACGCCCCGA
AGGGGGAAGCT
GCCTGACCCTAC
GATTCCCGCTAT
TTCATTCACTGA
CCGGAGGTTCAA
AATGACCCAGCG
AACCGAGTCG-3'
GCCAGGTGGCAC
AAATTGTCAGAA
CTACGACACGAC
TAACCGACCGCA
GGAGTGTGCGAT
GACCCTGAATAT
GATGATGGATGC
CAGC/CGCGTCA
GGTTGAACGTAA
AAAAGTCGGTCT
GCGCAAAGCAC
GTCGTCGTCCGC
AGTTCTCCAAAC
GTTAATTGGTTT
CTGCTTCGGCAG
AACGATTGGC-3'5'-CGGGCGAACGTC
GCCAGGTGGCAC
AAATTGTCAGAA
CTACGACACGAC
TAACCGACCGCA
GGAGTGTGCGAT
GACCCTGAATAT
GATGATGGATGC
CAGC/CGCGTCA
GGTTGAACGTAA
AAAAGTCGGTCT
GCGCAAAGCAC
GTCGTCGTCGCGC
AGTTCTCCAAAC
GTTAATTGGTTT
CTGCTTCGGCAG
AACGATTGGC-3'
AAATGGCTGGG
ATTGTTCATTTTT
TGTTTGCCTTAC
AACGAGAGTGA
CAGTACGCGCGG
GTAGTTAACTCA
ACATCTGACCGG
TCGAT/AACTCA
CTTCACGCCCCG
AAGGGGGAAGC
TGCCTGACCCTA
CGATTCCCGCTA
TTTCATTCACTG
ACCGGAGGTTCA
AAATGACCCAGC
GAACCGAGTCG-
3'5'-AATTTTCTGCCC
AAATGGCTGGG
ATTGTTCATTTTT
TGTTTGCCTTAC
AACGAGAGTGA
CAGTACGCGCGG
GTAGTTAACTCA
ACATCTGACCGG
TCGAT/AACTCA
CTTCACGCCCCG
AAGGGGGAAGC
TGCCTGACCCTA
CGATTCCCGCTA
TTTCATTCACTG
ACCGGAGGTTCA
AAATGACCCAGC
GAACCGAGTCG-
3'
GGCCACCACGCC
AGACCACACGAT
AGTGATGGCAAC
ACTTTCCAGCTG
CACCAGCACCTG
ATGGCCCATGGT
CACACCTTCAGC
GAAA/CCGATCC
CCATCACTGTGT
GTCTTGTATTAC
AGTGCCGCTTCG
TCGGCTTCGCCG
GTACGAATACGA
ATGACGCGTTGC
AGCTCAGCAACG
AAAATTTTG-3'5'-GTAACCAATAAA
GGCCACCACCGCC
AGACCACACGAT
AGTGATGGCAAC
ACTTTCCAGCTG
CACCAGCACCTG
ATGGCCCATGGT
CACACCTTCAGC
GAAA/CCGATCC
CCATCACTGTGT
GTCTTGTATTAC
AGTGCCGCTTCG
TCGGCTTTCGCCG
GTACGAATACGA
ATGACGCGTTGC
AGCTCAGCAACG
AAAATTTTG-3'
TCTGAATGAAGC
TCTTGAAAAAGC
TGAGGAAGCGG
GCGTCGATTTAG
TAGAAATCAGTC
CGAATGCCGAGC
CGCCAGTTTGTC
GAATC/CCGTCTC
TGAAGCTCTCGG
TGAACATTGTTG
CGAGGCAGGAT
GCGAGCTGGTTG
TGTTTTGACATT
ACCGATAATGTG
CCGCGTGAACGG
GTGCGTTATG-3'5'-TGGTATTGTCAG
TCTGAATGAAGC
TCTTGAAAAAGC
TGAGGAAGCGG
GCGTCGATTTAG
TAGAAATCAGTC
CGAATGCCGAGC
CGCCAGTTTGTC
GAATC/CCGTCTC
TGAAGCTCTCGG
TGAACATTGTTG
CGAGGCAGGAT
GCGAGCTGGTTG
TGTTTTGACATT
ACCGATAATGTG
CCGCGTGAACGG
GTGCGTTATG-3'
GTTCGC
CTCACA
GGSEQ ID NO:406 CAAGAA
GTTCGC
CTCACA
GG
TCGC
AACA
ATGT
TCACSEQ ID NO:407 TGCC
TCGC
AACA
ATGT
TCAC
GCGCGCATTTGT
TATGCCAATCCG
GCATTCTGCCGC
CAGACGGGTTTT
GCACTTGAGACA
CTTTTGGGCGAG
AACCACCGTCTG
CTGG/TGAACAT
CACTGATGCACA
AGCTACCTATGT
CGAAGAATTAAC
TAAAAAACTGCA
AGATGCAGGCAT
TCGCGTTAAAGC
CGACTTGAGAAA
TGAGAAGAT-3'5'-ACCGATCCGCAG
GCGCGCATTTGT
TATGCCAATCCG
GCATTCTGCCGC
CAGACGGGTTTT
GCACTTGAGACA
CTTTTGGGCGAG
AACCACCGTCTG
CTGG/TGAACAT
CACTGATGCACA
AGCTACCTATGT
CGAAGAATTAAC
TAAAAAACTGCA
AGATGCAGGCAT
TCGCGTTAAAGC
CGACTTGAGAAA
TGAGAAGAT-3'
GTTATAATGCCG
CGCCCTCATATT
GTGGGGATTTCT
TAATGACCTATC
CTGGGTCCTAAA
GTTGTAGTTGAC
ATTAGCGGAGCA
CTAAC/CCGTCTC
TGAAGCTCTCGG
TGAACATTGTTG
CGAGGCAGGAT
GCGAGCTGGTTG
TGTTTTGACATT
ACCGATAATGTG
CCGCGTGAACGG
GTGCGTTATG-3'5'-CGGGAACCGGT
GTTATAATGCCG
CGCCCTCATATT
GTGGGGATTCTCT
TAATGACCTATC
CTGGGTCCTAA
GTTGTAGTTGAC
ATTAGCGGAGCA
CTAAC/CCGTCTC
TGAAGCTCTCGG
TGAACATTGTTG
CGAGGCAGGAT
GCGAGCTGGTTG
TGTTTTGACATT
ACCGATAATGTG
CCGCGTGAACGG
GTGCGTTATG-3'
CATATT
GTGGGG
ATSEQ ID NO:408 CGCCCT
CATTT
GTGGGG
AT
TAAC
GCAC
CCGT
TCASEQ ID NO:409 GGCA
TAAC
GCAC
CCGT
TCA
M/T
A
AC
C
CG
T
C/Z
EN/
T
CT
G
AAG
CTC
TC
G
GT/
3IA
BkF
Q/SEQ ID NO:410 /56-FA
M/T
A
AC
C
CG
T
C/Z
EN/
T
CT
G
AAG
CTC
TC
G
GT/
3IA
BkF
Q/
GCGCGCATTTGT
TATGCCAATCCG
GCATTCTGCCGC
CAGACGGGTTTT
GCACTTGAGACA
CTTTTGGGCGAG
AACCACCGTCTG
CTGG/TACAGTA
GCGCCTCTCAAA
AATAGATAAAC
GGCTCATGTACG
TGGGCCGTTTAT
TTTTTCTACCCA
TAATCGGGAACC
GGTGTTATAATG
CCGCGCCCTC-3'5'-ACCGATCCGCAG
GCGCGCATTTGT
TATGCCAATCCG
GCATTCTGCCGC
CAGACGGGTTTT
GCACTTGAGACA
CTTTTGGGCGAG
AACCACCGTCTG
CTGG/TACAGTA
GCGCCTCTCAAA
AATAGATAAAC
GGCTCATGTACG
TGGGCCGTTTAT
TTTTTCTACCCA
TAATCGGGAACC
GGTGTTATAATG
CCGCGCCCTC-3'
AGTTTGTGTAAT
ACTTGTAACGCT
ACATGGAGATTA
ACTCAATCTAGA
GGGTATTAATAA
TGAATCGTACTA
AACTGGTACTGG
GCGC/AACTCAC
TTCACACCCCGA
AGGGGGAAGTT
GCCTGACCCTAC
GATTCCCGCTAT
TTCATTCACTGA
CCGGAGGTTCAA
AATGACCCAGCG
AACCGAGTCG-3'5'-TCAACCTAAAAA
AGTTTGTGTAAT
ACTTGTAACGCT
ACATGGAGATTA
ACTCAATCTAGA
GGGTATTAATAA
TGAATCGTACTA
AACTGGTACTGG
GCGC/AACTCAC
TTCACACCCCGA
AGGGGGAAGTT
GCCTGACCCTAC
GATTCCCGCTAT
TTCATTCACTGA
CCGGAGGTTCAA
AATGACCCAGCG
AACCGAGTCG-3'
GGTACT
GGGCGC
AACTSEQ ID NO:411 TAAACT
GGTACT
GGGCGC
AACT
TCGA
AGCG
CCAG
ACGG
TATSEQ ID NO:412 CAAA
TCGA
AGCG
CCAG
ACGG
TAT
FA
M/A
AG
TTG
CCT
/ZE
N/G
AC
CCT
AC
GA
TTC
CC/
3IA
BkF
Q/SEQ ID NO:413 /56-
FA
M/A
AG
TTG
CCT
/ZE
N/G
AC
CCT
AC
GA
TTC
CC/
3IA
BkF
Q/
GGCCTGGTGGCA
CAAATTGTCAGA
ACTACGACACGA
CTAACTGACCGC
AGGAGTGTGCG
ATGACCCTGAAT
ATGATGATGGAT
GCCGGC/CGTCC
TGTAATAATAAC
CGGACAATTCGG
ACTGATTAAAAA
AGCGCCCTTGTG
GCGCTTTTTTTA
TATTCCCGCCTC
CATTTAAAATAA
AAAATCCAATC-
3'5'-GGGCGACAAAAC
GGCCTGGTGGCA
CAAATTGTCAGA
ACTACGACACGA
CTAACTGACCGC
AGGAGTGTGCG
ATGACCCTGAAT
ATGATGATGGAT
GCCGGC/CGTCC
TGTAATAATAAC
CGGACAATTCGG
ACTGATTAAAAA
AGCGCCCTTGTG
GCGCTTTTTTTA
TATTCCCGCCTC
CATTTAAAATAA
AAAATCCAATC-
3'
GGCCTGGTGGCA
CAAATTGTCAGA
ACTACGACACGA
CTAACTGACCGC
AGGAGTGTGCG
ATGACCCTGAAT
ATGATGATGGAT
GCCGGC/GGACA
TCATCGCGACAA
ACAATATTAATA
CCGGCAACCACA
CCGGCAATTTAC
GAGACTGCGCA
GGCATCCTTTCT
CCCGTCAATTTC
TGTCAAATAAAG
-3'5'-GGGCGACAAAAC
GGCCTGGTGGCA
CAAATTGTCAGA
ACTACGACACGA
CTAACTGACCGC
AGGAGTGTGCG
ATGACCCTGAAT
ATGATGATGGAT
GCCGGC/GGACA
TCATCGCGACAA
ACAATATTAATA
CCGGCAACCACA
CCGGCAATTTAC
GAGACTGCGCA
GGCATCCTTTCT
CCCGTCAATTTC
TGTCAAATAAAG
-3'
CTCTTT
GCATGG
TTSEQ ID NO:414 GGTGCA
CTCTTT
GCATGG
TT
AGTC
TCGT
AAAT
TGCCSEQ ID NO:415 GCGC
AGTC
TCGT
AAAT
TGCC
FA
M/C
A
GG
A
GT
G
T/Z
EN/G
CG
A
TG
A
CC
C
TG
A
AT/
3IA
BkF
QSEQ ID NO:416 /56-
FA
M/C
A
GG
A
GT
G
T/Z
EN/G
CG
A
TG
A
CC
C
TG
A
AT/
3IA
BkF
Q
GGATGAATGTGC
CATTAAATGCGC
AGCATAATGGTG
CGTTGTGCGGGA
AAACTGCTTTTT
TTTGAAAGGGTT
GGTCAGTAGCGG
AAAC/AACTCAC
TTCACACCCCGA
AGGGGGAAGTT
GCCTGACCCTAC
GATTCCCGCTAT
TTCATTCACTGA
CCGGAGGTTCAA
AATGACCCAGCG
AACCGAGTCG-3'5'-TAAGAATTATCT
GGATGAATGTGC
CATTAAATGCGC
AGCATAATGGTG
CGTTGTGCGGGA
AAACTGCTTTTTT
TTTGAAAGGGTT
GGTCAGTAGCGG
AAAC/AACTCAC
TTCACACCCCGA
AGGGGGAAGTT
GCCTGACCCTAC
GATTCCCGCTAT
TTCATTCACTGA
CCGGAGGTTCAA
AATGACCCAGCG
AACCGAGTCG-3'
GAAATCGAACAT
TTCCGTAATACC
GCGATTACCCAG
GAGCCGTTCTGG
TTGCACAGCGGA
AAACGTTAACGA
AAGGATATTTCG
CATG/TTTAACG
ATCTGATTGGCG
ATGATGAAACG
GATTCGCCGGAA
GATGCGCTTTCT
GAGAGCTGGCG
CGAATTGTGGCA
GGATGCGTTGCA
GGAGGAGGATT-
3'5'-CGCCAGAGAGTC
GAAATCGAACAT
TTCCGTAATACC
GCGATTACCCAG
GAGCCGTTCTGG
TTGCACAGCGGA
AAACGTTAACGA
AAGGATATTTCG
CATG/TTTAACG
ATCTGATTGGCG
ATGATGAAACG
GATTCGCCGGAA
GATGCGCTTTCT
GAGAGCTGGCG
CGAATTGTGGCA
GGATGCGTTGCA
GGAGGAGGATT-
3'
GAAATCGAACAT
TTCCGTAATACC
GCGATTACCCAG
GAGCCGTTCTGG
TTGCACAGCGGA
AAACGTTAACGA
AAGGATATTTCG
CATG/GCACTGA
AACACCTCATTT
CCCTGTGTGCCG
CGTCGCCGATGG
TTGCCAGTCAGC
TGGCGCGCTACC
CGATCCTGCTTG
ATGAATTGCTCG
ACCCGAATA-3'5'-CGCCAGAGAGTC
GAAATCGAACAT
TTCCGTAATACC
GCGATTACCCAG
GAGCCGTTCTGG
TTGCACAGCGGA
AAACGTTAACGA
AAGGATATTTCG
CATG/GCACTGA
AACACCTCATTT
CCCTGTGTGCCG
CGTCCGCCGATGG
TTGCCAGTCAGC
TGGCGCGCTACC
CGATCCTGCTTG
ATGAATTGCTCG
ACCCGAATA-3'
TTTCTGGTTAAA
CGGGCAACCTCG
TTAACTGACTGA
CTAGCCTGGGCA
AACTGCCCGGGC
TTTTTTTTGCAA
GGAATCTGATTT
CATG/GCGCTCA
AACAGTTAATCC
GTCTGTGTGCCG
CCTCGCCGATGG
TCGCGACACAAC
TTGCACGTCATC
CTTTATTGCTCG
ATGAACTGCTCG
ACCCGCGCA-3'5'-GATGATGGATGC
TTTCTGGTTAAA
CGGGCAACCTCG
TTAACTGACTGA
CTAGCCTGGGCA
AACTGCCCGGGC
TTTTTTTTGCAA
GGAATCTGATTTT
CATG/GCCGCTCA
AACAGTTAATCC
GCTTGTGTGCCG
CCTCGCCGATGG
TCGCGACACAAC
TTGCACGTCATC
CTTTATTGCTCG
ATGAACTGCTCG
ACCCCGCGCA-3'
GCGCGCATTTGT
TATGCCAATCCG
GCATTCTGCCGC
CAGACGGGTTTT
GCACTTGAGACA
CTTTTGGGCGAG
AACCACCGTCTG
CTGG/AGTCTGA
ACTCATCCTGCG
GCAGTCGGTGAG
ACGTATTTTTGA
CCAAAGAGTGAT
CTACATCACGGA
ATTTTGTGGTTG
TTGCTGCTTAAA
AGGGCAAAT-3'5'-ACCGATCCGCAG
GCGCGCATTTGT
TATGCCAATCCG
GCATTCTGCCGC
CAGACGGGTTTT
GCACTTGAGACA
CTTTTGGGCGAG
AACCACCGTCTG
CTGG/AGTCTGA
ACTCATCCTGCG
GCAGTCGGTGAG
ACGTATTTTGA
CCAAAGAGTGAT
CTACATCACGGA
ATTTTGTGGTTG
TTGCTGCTTAAA
AGGGCAAAT-3'
CCAGCTTACAAA
TTGCCTGATTGC
GGCCCCGATGGC
CGGTATCACTGA
CCGACCATTTCG
TGCCTTATGTCA
TGCGATGGGGGC
TGGG/CCGTCTCT
GAAGCTCTCGGT
GAACATTGTTGC
GAGGCAGGATG
CGAGCTGGTTGT
GTTTTGACATTA
CCGATAATGTGC
CGCGTGAACGG
GTGCGTTATG-3'5'-CATCGGACACCA
CCAGCTTACAAA
TTGCCTGATTGC
GGCCCCGATGGC
CGGTATCACTGA
CCGACCATTTCG
TGCCTTTATGTCA
TGCGATGGGGGC
TGGG/CCGTCTCT
GAAGCTCTCGGT
GAACATTGTTGC
GAGGCAGGATG
CGAGCTGGTTGT
GTTTGACATTA
CCGATAATGTGC
CGCGTGAACGG
GTGCGTTATG-3'
GGAGGAATAAG
GTATTAAAGGCG
GAAAACGAGTTC
AAACGGCACGTC
CGAATCGTATCA
ATGGCGAGATTC
GCGCCCTGGAAG
TTCGC/GCCATTG
AGCTGGCTTCCC
GACCGCAGGGC
GGCACCTGCCTG
ACCCTGCGTTTC
CCGCTGTTTAAC
ACCCTGACCGGA
GGTGAAGCATG
ATCCCTGAATC-
3'5'-TCTTCAACAACT
GGAGGAATAAG
GTATTAAAGGCG
GAAAACGATTTC
AAACGGCACGTC
CGAATCGTATCA
ATGGCGAGATTC
GCGCCCTGGAAG
TTCGC/GCCATTG
AGCTGGCTTCCC
GACCGCAGGGC
GGCACCTGCCTG
ACCCTGCGTTTC
CCGCTGTTTAAC
ACCCTGACCGGA
GGTGAAGCATG
ATCCCTGAATC-
3'
AGCATG
GACGTA
ASEQ ID NO:417 CTCGGC
AGCATG
GACGTA
A
GTGT
TAAA
CAGC
GGG
AAASEQ ID NO:418 AGG
GTGT
TAAA
CAGC
GGG
AAA
FA
M/A
A
CG
G
CA
C
G/Z
EN/
T
CC
G
AA
T
CG
T
AT
C
AA/
3IA
BkF
Q/SEQ ID NO:419 /56-
FA
M/A
A
CG
G
CA
C
G/Z
EN/
T
CC
G
AA
T
CG
T
AT
C
AA/
3IA
BkF
Q/
TTACCCCGCCGC
GTTTTGCGCACG
GTGTCGGACAAT
TTGTCATAACTG
CGACACAGGAG
TTTGCGATGACC
CTGAATATGATG
CTCGA/AGCGTC
AGGTACCGGTCA
TGATTCACCGTG
CGATTCTCGGTT
CCCTGGAGCGCT
TCATTGGCATCC
TGACCGAAGAGT
TCGCTGGCTTCT
TCCCAACCTG-3'5'-TCCGGGTTCGGC
TTACCCCGCCGC
GTTTTGCGCACG
GTGTCGGACAAT
TTGTCATAACTG
CGACACAGGAG
TTTGCGATGACC
CTGAATATGATG
CTCGA/AGCGTC
AGGTACCGGTCA
TGATTCACCGTG
CGATTCTCGGTT
CCTGGAGCGCT
TCATTGGCATCC
TGACCGAAGAGT
TCGCTGGCTTCT
TCCCAACCTG-3'
TTGAATATTTCC
GTCGCCAGGCGC
TGGCTGCCGAGC
CGTTCTGGCTGC
ATAGTGGAAAA
CGATAATTTCAG
GCCAGGGAGCC
CTTATG/GCGCTG
AAGCACCTGATC
ACGCTCTGCGCG
GCGTCGCCGATG
GTCGCCAGCCAG
CTGGCGCGCCAC
CCGCTGCTGCTG
GATGAGCTGCTG
GATCCCAACA-3'5'-ATCGCAGCGTCT
TTGAATATTTCC
GTCGCCAGGCGC
TGGCTGCCGAGC
CGTTCTGGCTGC
ATAGTGGAAAA
CGATAATTTCAG
GCCAGGGAGCC
CTTATG/GCGCTG
AAGCACCTGATC
ACGCTCTGCGCG
GCGTCGCCGATG
GTCGCCAGCCAG
CTGGCGCCGCCAC
CCGCTGCTGCTG
GATGAGCTGCTG
GATCCCAACA-3'
TTCTGG
CTGCAT
AGSEQ ID NO:420GAGCCG
TTCTGG
CTGCAT
AG
TCGG
CTGA
TAGA
GGSEQ ID NO:421 GCCG
TCGG
CTGA
TAGA
GG
FA
M/T
TAT
GG
CG
C/Z
EN/
TG
AA
GC
AC
CT
GA
TC
A/3I
ABk
FQ/SEQ ID NO:422 /56-
FA
M/T
TAT
GG
CG
C/Z
EN/
TG
AA
GC
AC
CT
GA
TC
A/3I
ABk
FQ/
TTACCCCGCCGC
GTTTTGCGCACG
GTGTCGGACAAT
TTGTCATAACTG
CGACACAGGAG
TTTGCGATGACC
CTGAATATGATG
CTCGA/GCCCGC
TGACCGACCAGA
ACTTCCACCTTG
GACTCGGCTATA
CCCTTGGCGTGA
CGGCGCGCGATA
ACTGGGACTACA
TCCCCATTCCGG
TGATCTTACC-3'5'-TCCGGGTTCGGC
TTACCCCGCCGC
GTTTTGCGCACG
GTGTCGGACAAT
TTGTCATAACTG
CGACACAGGAG
TTTGCGATGACC
CTGAATATGATG
CTCGA/GCCCGC
TGACCGACCAGA
ACTTCCACCTTG
GACTCGGCTATA
CCCTTGGCGTGA
CGGGCGCCGATA
ACTGGGACTACA
TCCCCATTCCGG
TGATCTTACC-3'
AAAGTTGCACTG
GACAAAAGGTA
CCACAATTGGTG
TACTGATACTCG
ACACAGCATTAG
TGTCGATTTTTC
ATATAAAGGTAA
TTTTG/GCCATTG
AGCTGGCTTCCC
GACCGCAGGGC
GGCACCTGCCTG
ACCCTGCGTTTC
CCGCTGTTTAAC
ACCCTGACCGGA
GGTGAAGCATG
ATCCCTGAATC-
3'5'-TCACTTTTTAGC
AAAGTTGCACTG
GACAAAAGGTA
CCACAATTGGTG
TACTGATACTCG
ACACAGCATTAG
TGTCGATTTTTC
ATATAAAGGTAA
TTTTG/GCCATTG
AGCTGGCTTCCC
GACCGCAGGGC
GGCACCTGCCTG
ACCCTGCGTTTC
CCGCTGTTTAAC
ACCCTGACCGGA
GGTGAAGCATG
ATCCCTGAATC-
3'
TTACCCCGCCGC
GTTTTGCGCACG
GTGTCGGACAAT
TTGTCATAACTG
CGACACAGGAG
TTTGCGATGACC
CTGAATATGATG
CTCGA/GCTAAA
GTTCTCGGCTAA
TCGCTGATAACA
TTTGACGCAATG
CGCAATAAAAG
GGCATCATTTGA
TGCCCTTTTTGC
ACGCTTTCATAC
CAGAACCTGGC-
3'5'-TCCGGGTTCGGC
TTACCCCGCCGC
GTTTTGCGCACG
GTGTCGGACAAT
TTGTCATAACTG
CGACACAGGAG
TTTGCGATGACC
CTGAATATGATG
CTCGA/GCTAAA
GTTCTCGGCTAAA
TCGCTGATAACA
TTTGACGCAATG
CGCAATAAAAG
GGCATCATTTGA
TGCCCTTTTTGC
ACGCTTTCATAC
CAGAACCTGGC-
3'
AATAGCAGGGA
AGAGGCGCCAG
AACCGCCAGCGT
TGAAGCAGTTTG
AACGCGTTCAGT
GTATAATCCGAA
ACTTAATTTCGG
TTTGGA/GCCATT
GAGCTGGCTTCC
CGACCGCAGGG
CGGCACCTGCCT
GACCCTGCGTTT
CCCGCTGTTTAA
CACCCTGACCGG
AGGTGAAGCAT
GATCCCTGAATC
-3'5'-GTTTCTCCTTTGC
AATAGCAGGGA
AGAGGCCGCCAG
AACCGCCAGCGT
TGAAGCAGTTTG
AACGCGTTCAGT
GTATAATCCGAA
ACTTAATTTCGG
TTTGGA/GCCATT
GAGCTGGCTTCC
CGACCGCAGGG
CGGCACCTGCCT
GACCCTGCGTTT
CCCGCTGTTTAA
CACCCTGACCGG
AGGTGAAGCAT
GATCCCTGAATC
-3'
TTACCCCGCCGC
GTTTTGCGCACG
GTGTCGGACAAT
TTGTCATAACTG
CGACACAGGAG
TTTGCGATGACC
CTGAATATGATG
CTCGA/CGCCGT
CCTCGCAGTACC
ATTGCAACCGAC
TTTACAGCAAGA
AGTGATTCTGGC
ACGCATGGAAC
AAATTCTTGCCA
GTCGGGCTTTAT
CCGATGACGAA-
3'5'-TCCGGGTTCGGC
TTACCCCGCCGC
GTTTTGCGCACG
GTGTCGGACAAT
TTGTCATAACTG
CGACACAGGAG
TTTGCGATGACC
CTGAATATGATG
CTCGA/CGCCGT
CCTCGCAGTACC
ATTGCAACCGAC
TTTACAGCAAGA
AGTGATTCTGGC
ACGCATGGAAC
AAATTCTTGCCA
GTCGGGCTTTTAT
CCGATGACGAA-
3'
GTATTCAATTAC
TTAGGCATTTAC
TTAACGCAGGCA
GGCAATTTTGAT
GCTGCCTATGAA
GCGTTTGATTCT
GTACTTGAGCTT
GATC/GCCATTG
AGCTGGCTTCCC
GACCGCAGGGC
GGCACCTGCCTG
ACCCTGCGTTTC
CCGCTGTTTAAC
ACCCTGACCGGA
GGTGAAGCATG
ATCCCTGAATC-
3'5'-GATATGCCTGAA
GTATTCAATTAC
TTAGGCATTTAC
TTAACGCAGGCA
GGCAATTTTGAT
GCTGCCTATGAA
GCGTTTTGATTCT
GTACTTGAGCT
GATC/GCCATTG
AGCTGGCTTCCC
GACCGCAGGGC
GGCACCTGCCTG
ACCCTGCGTTTC
CCGCTGTTTAAC
ACCCTGACCGGA
GGTGAAGCATG
ATCCCTGAATC-
3'
TCTGAATGAAGC
TCTTGAAAAAGC
TGAGGAAGCGG
GCGTCGATTTAG
TAGAAATCAGTC
CGAATGCCGAGC
CGCCAGTTTGTC
GAATC/TCTTTAG
ATCTCTCGGTCC
GCCCTGATGGCG
GCACCTTGCTGA
CGTTACGCCTGC
CGGTACAGCAG
GTTATCACCGGA
GGCTTAAAATGA
CCCAGTTACC-3'5'-TGGTATTGTCAG
TCTGAATGAAGC
TCTTGAAAAAGC
TGAGGAAGCGG
GCGTCGATTTAG
TAGAAATCAGTC
CGAATGCCGAGC
CGCCAGTTTGTC
GAATC/TCTTTAG
ATCTCTCGGTCC
GCCTGATGGCG
GCACCTTGCTGA
CGTTACGCCTGC
CGGTACAGCAG
GTTATCACCGGA
GGCTTAAAATGA
CCCAGTTAC-3'
CGAGTT
CAACCG
GCSEQ ID NO:423 GGAAAAA
CGAGTT
CAACCG
GC
GGAC
CGAG
AGAT
CTAASEQ ID NO:424 GGGC
GGAC
CGAG
AGAT
CTAA
GGTTATTCCGGG
TGAGTATATGTG
TGATTTGGGTTC
CGGCATTGCGCA
ATAAAGGGGAG
AAAGACATGAG
CATCACGGCGTT
ATCAGC/TGAAT
ATCACTGACTCA
CAAGCTACCTAT
GTCGAAGAATTA
ACTAAAAAACTG
CAAGATGCAGG
CATTCGCGTTAA
AGCCGACTTGAG
AAATGAGAAGAT-3'5'-TGCAAATTGCAC
GGTTATTCCGGG
TGAGTATATGTG
TGATTTGGGTTC
CGGCATTGCGCA
ATAAAGGGGAG
AAAGACATGAG
CATCACGGCGTT
ATCAGC/TGAAT
ATCACTGACTCA
CAAGCTACCTAT
GTCGAAGAATTA
ACTAAAAAACTG
CAAGATGCAGG
CATTCGCGTTAA
AGCCGACTTGAG
AAATGAGAAGAT-3'
ATGTCGGGCGTT
TCACAACACAAA
ATGTTGTAAATG
CGACACAGCCG
GGCCTGAAACCA
GGAGCGTGTGAT
GACCTTTAATAT
GATGC/CTGGGG
TCACTGGAGCGC
TTTATCGGCATC
CTGACCGAAGA
ATTTGCCGGTTT
CTTCCCGACCTG
GCTGGCCCCTGT
TCAGGTTGTGGT
GATGAATATCA-
3'5'-TCAGGGCTGCGG
ATGTCGGGCGTT
TCACAACACAAA
ATGTTGTAAATG
CGACACAGCCG
GGCCTGAAACCA
GGAGCGTGTGAT
GACCTTTAATAT
GATGC/CTGGGG
TCACTGGAGCGC
TTTATCGGCATC
CTGACCGAAGA
ATTTGCCGGTTT
CTTCCCGACCTG
GCTGGCCCCTGT
TCAGGTTGTGGT
GATGAATATCA-
3'
TTCAAACGGCAC
GTCCGAATCGTA
TCAATGGCGAGA
TTCGCGCCCAGG
AAGTTCGCTTAA
CTGGTCTGGAAG
GTGAGCAGCTGG
GTATT/GCAATA
GAACTAACTACC
CGCCCTGAAGGC
GGTACCTGCCTG
ACCCTGCGATTC
CCGTTATTTCAT
TCACTGACCGGA
GGCCCACGATGA
CCCAGCGACC-3'5'-CGGAAAACGAG
TTCAAACGGCAC
GTCCGAATCGTA
TCAATGGCGAGA
TTCGCGCCCAGG
AAGTTCGCTTAA
CTGGTCTGGAAG
GTGAGCAGCTGG
GTATT/GCAATA
GAACTAACTACC
CGCCCTGAAGGC
GGTACCTGCCTG
ACCCTGCGATTC
CCGTTATTTCAT
TCACTGACCGGA
GGCCCACGATGA
CCCAGCGACC-3'
Таблица F: Подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмыTable F: Genetically engineered non-intergeneric microorganisms
Таблица G: Подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмыTable G: Genetically engineered non-intergeneric microorganisms
Таблица HTable H
[0389] Использование терминов в единственном числе в рамках описания изобретения (особенно в рамках приводимой ниже формулы изобретения) следует рассматривать как относящиеся к единственному и множественному числу, если в настоящем документе не указано иначе или явно не продиктовано контекстом. Если не указано иначе, термины "содержащий", "обладающий", "включающий" и "вмещающий" следует рассматривать как открытые термины (т.е., означающие "включающие в качестве неограничивающих примеров"). Если в настоящем документе не указано иначе указание диапазонов значений в настоящем документе служит исключительно в качестве способа сокращения индивидуального указания каждого отдельного значения, находящегося в указанном диапазоне и каждое отдельное значение включено в описание также, как если бы оно было индивидуально указано в настоящем документе. Например, если указан диапазон 10-15, то также включены 11, 12, 13 и 14. Если в настоящем документе не указано иначе или иначе явно не продиктовано контекстом, все способы, описываемые в настоящем документе, можно проводить в любом подходящем порядке. Если не указано иначе, использование любого и всех примеров или иллюстративных формулировок (например, "такой как"), приводимое в настоящем документе, предназначено исключительно для лучшего описания изобретения и не предназначено для ограничения объема изобретения. Ни одну из формулировок в описании не следует рассматривать как указание того, что какой-либо незаявляемый элемент существенен для практического осуществления изобретения.[0389] The use of terms in the singular within the scope of the description of the invention (especially within the scope of the following claims) should be considered as referring to the singular and plural, unless otherwise indicated herein or clearly dictated by the context. Unless otherwise indicated, the terms "comprising", "having", "including", and "comprising" should be considered as open terms (ie, meaning "including as non-limiting examples"). Unless otherwise indicated herein, the indication of ranges of values in this document serves solely as a way of shortening the individual indication of each individual value that is in the specified range, and each individual value is included in the description as if it were individually indicated in this document. For example, if the range is 10-15, then 11, 12, 13, and 14 are also included. Unless otherwise indicated herein or otherwise explicitly dictated by the context, all methods described herein can be performed in any suitable order. Unless otherwise indicated, the use of any and all examples or illustrative language (eg, "such as") given herein is intended solely to better describe the invention and is not intended to limit the scope of the invention. None of the language in the description should be taken as an indication that any non-claimed element is essential to the practice of the invention.
[0390] Хотя в настоящем документы приведены и описаны предпочтительные варианты осуществления настоящего изобретения, специалистам в данной области очевидно, что такие варианты осуществления приведены исключительно в качестве примера. Специалисты в данной области могут проводить множество вариаций, изменений и изменений без отклонения от изобретения. Следует понимать, что в практическом осуществлении изобретения можно использовать различные альтернативы вариантам осуществления изобретения, описываемым в настоящем документе. Следует понимать, что объем изобретения определен приводимой ниже формулой изобретения и что таким образом охвачены способы и структуры в объеме этой формулы изобретения и их эквиваленты.[0390] While preferred embodiments of the present invention are provided and described herein, those skilled in the art will appreciate that such embodiments are provided by way of example only. Many variations, changes and modifications can be made by those skilled in the art without deviating from the invention. It should be understood that various alternatives to the embodiments of the invention described herein can be used in the practice of the invention. It is to be understood that the scope of the invention is defined by the following claims and that the methods and structures within the scope of those claims and their equivalents are thus encompassed.
ПУНКТЫITEMS
1. Способ увеличения фиксации азота у небобового растения, включающий:1. A method for increasing nitrogen fixation in a non-legume plant, comprising:
a. нанесение на растение множества не являющихся межродовыми бактерий, где указанное множество включает не являющихся межродовыми бактерий, которые:a. applying to a plant a plurality of non-intergeneric bacteria, wherein said plurality includes non-intergeneric bacteria that:
i. обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения; и/илиi. have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue; and/or
ii. продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час, иii. produce a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour, and
где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 1% или более фиксированного азота, иwhere a plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produce 1% or more of fixed nitrogen in the plant, and
где каждый представитель множества не являющихся межродовыми бактерий несет по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота так, что не являющиеся межродовыми бактерии становятся способны к фиксации атмосферного азота в присутствии экзогенного азота.wherein each member of a plurality of non-intergeneric bacteria carries at least one genetic variation introduced into at least one gene or non-coding polynucleotide of the genetic regulatory network for nitrogen fixation or assimilation such that the non-intergeneric bacteria become capable of fixing atmospheric nitrogen in the presence of exogenous nitrogen .
2. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит бактерии, которые: обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения.2. The method of
3. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит бактерии, которые: продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.3. The method of
4. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит бактерии, которые: обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.4. The method of
5. Способ по п. 1, где по меньшей мере одна генетическая вариация содержит введенную контрольную последовательность, функционально связанную по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.5. The method of
6. Способ по п. 1, где по меньшей мере одна генетическая вариация содержит промотор, функционально связанный по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.6. The method of
7. Способ по п. 1, где по меньшей мере одна генетическая вариация содержит индуцибельный промотор, функционально связанный по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.7. The method of
8. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий не содержит конститутивный промотор, функционально связанный с геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.8. The method of
9. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий не содержит конститутивный промотор, функционально связанный с геном в генном кластере nif.9. The method of
10. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.10. The method of
11. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий, наносимых на растение, не стимулирует увеличения захвата экзогенного неатмосферного азота.11. The method of
12. Способ по п. 1, где растение выращивают в почве поля, куда добавили по меньшей мере приблизительно 22,7 кг азот-содержащего удобрения на акр, и где азот-содержащее удобрение содержит по меньшей мере приблизительно 5% азота по массе.12. The method of
13. Способ по п. 1, где растение выращивают в почве поля, куда добавили по меньшей мере приблизительно 22,7 кг азот-содержащего удобрения на акр, и где азот-содержащее удобрение содержит по меньшей мере приблизительно 5% азота по массе, и где азот-содержащее удобрение содержит аммоний или содержащую аммоний молекулу.13. The method of
14. Способ по п. 1, где экзогенный азот выбран из удобрения, содержащего один или несколько из: глутамина, аммиака, аммония, мочевины, нитрата, нитрита, содержащих аммоний молекул, содержащих нитраты молекул и содержащих нитриты молекул.14. The method of
15. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 5% фиксированного азота или более.15. The method of
16. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 10% фиксированного азота или более.16. The method of
17. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, фиксирует атмосферный азот в нелимитирующих азот условиях.17. The method of
18. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.18. The method of
19. Способ по п. 1, где фиксированный азот, продуцируемый множеством не являющихся межродовыми бактерий, определяют посредством разведения обогащенного удобрения атмосферным газообразным N2 в ткани растения.19. The method of
20. Способ по п. 1, где по меньшей мере один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота выбран из группы, состоящей из: nifA, nifL, ntrB, ntrC, полинуклеотида, кодирующего глутаминсинтетазу, glnA, glnB, glnK, drat, amtB, полинуклеотида, кодирующего глутаминазу, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, nifQ и гена, ассоциированного с биосинтезом нитрогеназного фермента.20. The method of
21. Способ по п. 1, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутацию, которая приводит к одному или нескольким из: увеличенной экспрессии или активности NifA или глутаминазы; сниженной экспрессии или активности nifL, NtrB, глутаминсинтетазы, GlnB, GlnK, DraT, AmtB; сниженной аденилил-удаляющей активности GlnE или сниженной уридилат-удаляющей активности GlnD.21. The method according to p. 1, where at least one genetic variation is a mutation that leads to one or more of: increased expression or activity of NifA or glutaminase; reduced expression or activity of nifL, NtrB, glutamine synthetase, GlnB, GlnK, DraT, AmtB; reduced GlnE adenylyl scavenging activity; or reduced GlnD uridylate scavenging activity.
22. Способ по п. 1, где по меньшей мере одна генетическая вариация выбрана из: (A) нокаут-мутации; (B) удаления или устранения регуляторной последовательность гена-мишени; (C) наличия вставки гетерологичной регуляторной последовательности или (D) делеции домена.22. The method according to p. 1, where at least one genetic variation is selected from: (A) knockout mutations; (B) removing or eliminating the regulatory sequence of the target gene; (C) the presence of a heterologous regulatory sequence insertion or (D) a domain deletion.
23. Способ по п. 1, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL.23. The method of
24. Способ по п. 1, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена.24. The method of
25. Способ по п. 1, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB.25. The method of
26. Способ по п. 1, где по меньшей мере одна генетическая вариация выбрана из: мутантного гена nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL; мутантного гена glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена; мутантного гена amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB; и их сочетаний.26. The method according to p. 1, where at least one genetic variation is selected from: a mutant nifL gene that is modified to contain a heterologous promoter built into the specified nifL gene; a mutant glnE gene that results in a truncated glnE protein lacking an adenylyl-removal (AR) domain; a mutant amtB gene that results in no expression of said amtB gene; and their combinations.
27. Способ по п. 1, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL, и мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена.27. The method of
28. Способ по п. 1, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL, и мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена, и мутантный ген amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB.28. The method of
29. Способ по п. 1, где растение содержит семена, стебель, цветок, плод, листья или ризому.29. The method of claim. 1, where the plant contains seeds, stem, flower, fruit, leaves or rhizome.
30. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в композицию.30. The method of
31. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в композицию, содержащую приемлемый в сельском хозяйстве носитель.31. The method of
32. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий вносят в борозды, в которые высажены семена указанного растения.32. The method of
33. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в жидкую композицию для внесения в борозды, содержащую бактерии в концентрации приблизительно от 1 × 107 до приблизительно 1 × 1010 КОЕ в миллилитре.33. The method of
34. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий наносят на семена указанного растения.34. The method of
35. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в покрытие для семян и наносят на семена указанного растения.35. The method of
36. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в покрытие для семян и наносят на семена указанного растения в концентрации приблизительно от 1 × 105 до приблизительно 1 × 107 КОЕ на семя.36. The method of
37. Способ по п. 1, где растение представляет собой злаковую сельскохозяйственную культуру.37. The method of
38. Способ по п. 1, где растение выбрано из группы, состоящей из: кукурузы, риса, пшеницы, ячменя, сорго, просо, овса, ржи и тритикале.38. The method of claim. 1, where the plant is selected from the group consisting of: corn, rice, wheat, barley, sorghum, millet, oats, rye and triticale.
39. Способ по п. 1, где растение представляет собой кукурузу.39. The method of
40. Способ по п. 1, где растение представляет собой сельскохозяйственную культуру.40. The method of
41. Способ по п. 1, где растение представляет собой генетически модифицированный организм.41. The method of
42. Способ по п. 1, где растение не является генетически модифицированным организмом.42. The method of claim. 1, where the plant is not a genetically modified organism.
43. Способ по п. 1, где растение подвергали генной инженерии или выводили для эффективного использования азота43. The method of
44. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит по меньшей мере два различных вида бактерий.44. The method of
45. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит по меньшей мере два различных штамма одного и того же вида бактерий.45. The method of
46. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит бактерии, выбранные из: Rahnella aquatilis, Klebsiella variicola, Achromobacter spiritinus, Achromobacter marplatensis, Microbacterium murale, Kluyvera intermedia, Kosakonia pseudosacchari, вида Enterobacter, Azospirillum lipoferum, Kosakonia sacchari и их сочетаний.46. The method of
47. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий являются эндофитными, эпифитными или ризосферными.47. The method of
48. Способ по п. 1, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит бактерии, выбранные из: бактерий, депонированных как PTA-122293, бактерий, депонированных как PTA-122294, бактерий, депонированных как NCMA 201701002, бактерий, депонированных как NCMA 201708004, бактерий, депонированных как NCMA 201708003, бактерий, депонированных как NCMA 201708002, бактерий, депонированных как NCMA 201712001, бактерий, депонированных как NCMA 201712002, и их сочетаний.48. The method of
49. Бактериальная композиция, содержащая:49. Bacterial composition containing:
по меньшей мере один генно-инженерный бактериальный штамм который фиксирует атмосферный азот в сельскохозяйственной системе, в которую в качестве удобрения внесено более 9,1 кг азота на акр.at least one genetically engineered bacterial strain that fixes atmospheric nitrogen in an agricultural system fertilized with more than 9.1 kg of nitrogen per acre.
50. Бактериальная композиция, содержащая:50. Bacterial composition containing:
по меньшей мере один штамм бактерий, который выведен для фиксации атмосферного азота в сельскохозяйственной системе, в которую в качестве удобрения внесено более 9,1 кг азота на акр.at least one strain of bacteria that has been bred to fix atmospheric nitrogen in an agricultural system that has been fertilized with more than 9.1 kg of nitrogen per acre.
51. Бактериальн композиция по п. 49 или п. 50, где указанное удобрение представляет собой химическое удобрение, выбранное из группы, состоящей из безводного аммиака, сульфата аммония, мочевины, дифосфата аммония, уреаформа, UAN (мочевино-аммониевый нитрат), монофосфата аммония, нитрата аммония, растворов азота, нитрата кальция, нитрата калия и нитрата натрия.51. A bacterial composition according to claim 49 or
52. Бактериальная композиция, содержащая:52. Bacterial composition containing:
по меньшей мере один генно-инженерный бактериальный штамм который фиксирует атмосферный азот, по меньшей мере один генно-инженерный бактериальный штамм, содержащий экзогенно добавленную ДНК, где указанная экзогенно добавленная ДНК, по меньшей мере на 80% идентична с соответствующим нативным штаммом бактерий.at least one genetically engineered bacterial strain that fixes atmospheric nitrogen, at least one genetically engineered bacterial strain containing exogenously added DNA, where said exogenously added DNA is at least 80% identical with the corresponding native bacterial strain.
53. Бактериальная композиция по п. 52, где указанная экзогенно добавленная ДНК, по меньшей мере на 85% идентична с соответствующим нативным штаммом бактерий.53. The bacterial composition of claim 52, wherein said exogenously added DNA is at least 85% identical to the corresponding native bacterial strain.
54. Бактериальная композиция по п. 52, где указанная экзогенно добавленная ДНК, по меньшей мере на 90% идентична с соответствующим нативным штаммом бактерий.54. The bacterial composition of claim 52, wherein said exogenously added DNA is at least 90% identical to the corresponding native bacterial strain.
55. Бактериальная композиция по п. 52, где указанная экзогенно добавленная ДНК, по меньшей мере на 95% идентична с соответствующим нативным штаммом бактерий.55. The bacterial composition of claim 52, wherein said exogenously added DNA is at least 95% identical to the corresponding native bacterial strain.
56. Бактериальная композиция по п. 52, где указанная экзогенно добавленная ДНК, по меньшей мере на 99% идентична с соответствующим нативным штаммом бактерий.56. The bacterial composition of claim 52, wherein said exogenously added DNA is at least 99% identical to the corresponding native bacterial strain.
57. Бактериальная композиция по п. 52, где указанная экзогенно добавленная ДНК происходит из того же штамма бактерий, что и указанный соответствующий нативный штамм бактерий.57. The bacterial composition of claim 52, wherein said exogenously added DNA originates from the same bacterial strain as said corresponding native bacterial strain.
58. Бактериальная композиция по любому из предшествующих пп., где указанная бактериальная композиция представляет собой композицию удобрения.58. A bacterial composition according to any of the preceding claims, wherein said bacterial composition is a fertilizer composition.
59. Бактериальная композиция по любому из предшествующих пп., где указанный по меньшей мере один генно-инженерный бактериальный штамм содержит по меньшей мере одну вариацию в гене или межгенной области в пределах 10000 п.н. от гена, выбранного из группы, состоящей из: nifA, nifL, ntrB, ntrC, glnA, glnB, glnK, draT, amtB, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB и nifQ.59. A bacterial composition according to any one of the preceding claims, wherein said at least one genetically engineered bacterial strain contains at least one variation in a gene or intergenic region within 10,000 bp. from a gene selected from the group consisting of: nifA , nifL , ntrB , ntrC , glnA , glnB , glnK , draT , amtB , glnD , glnE , nifJ , nifH , nifD , nifK , nifY , nifE , nifN , nif U , nifS , nifV , nifW , nifZ , nifM , nifF , nifB , and nifQ .
60. Бактериальная композиция по любому из предшествующих пп., дополнительно содержащая по меньшей мере один дополнительный компонент, выбранный из группы, состоящей из придающего клейкость средства, стабилизатора микроорганизмов, фунгицида, антибактериального средства, консерванта, стабилизатора, поверхностно-активного вещества, антикомплексого средства, гербицида, нематоцида, инсектицида, регулятора роста растения, удобрения, родентицида, влагопоглотителя, бактерицидного средства и питательного вещества.60. A bacterial composition according to any one of the preceding claims, further comprising at least one additional component selected from the group consisting of a tackifying agent, a microorganism stabilizer, a fungicide, an antibacterial agent, a preservative, a stabilizer, a surfactant, an anti-complex agent, herbicide, nematocide, insecticide, plant growth regulator, fertilizer, rodenticide, desiccant, bactericide and nutrient.
61. Бактериальная композиция по любому из предшествующих пп., дополнительно содержащая по меньшей мере один дополнительный компонент, выбранный из группы, состоящей из красителя, праймера, гранулы, дезинфицирующего средства, регулятора роста растений, предохранителя и нематоцида.61. A bacterial composition according to any one of the preceding claims, further comprising at least one additional component selected from the group consisting of a dye, a primer, a granule, a disinfectant, a plant growth regulator, a preservative, and a nematocide.
62. Бактериальная композиция по любому из предшествующих пп., где указанную бактериальную композицию формулируют для внесения в поле.62. A bacterial composition according to any one of the preceding claims, wherein said bacterial composition is formulated for field application.
63. Бактериальная композиция по п. 62, где указанную бактериальную композицию формулируют для внесения в борозду.63. The bacterial composition of claim 62, wherein said bacterial composition is formulated to be applied to the furrow.
64. Бактериальная композиция по п. 62, где указанную бактериальную композицию формулируют для нанесения в качестве покрытия для семян, протравки для семян или пропитки для семян.64. The bacterial composition of claim 62, wherein said bacterial composition is formulated for application as a seed coat, seed dressing, or seed treatment.
65. Бактериальная композиция по п. 61 или п. 62, где указанную бактериальную композицию формулируют для нанесения во время, до или после посадки семян.65. The bacterial composition of claim 61 or claim 62, wherein said bacterial composition is formulated to be applied during, before, or after planting the seeds.
66. Семенной состав, содержащий семена растения, которые инокулированы бактериальной композицией по любому из предшествующих пп.66. Seed composition containing plant seeds that are inoculated with a bacterial composition according to any one of the preceding paragraphs.
67. Способ выращивания сельскохозяйственной культуры с использованием множества семян с семенным составом по п. 66.67. A method of growing an agricultural crop using a plurality of seeds with a seed composition according to claim 66.
68. Способ по п. 67, дополнительно включающий сбор урожая указанной сельскохозяйственной культуры.68. The method of claim 67, further comprising harvesting said crop.
69. Способ внесения бактериальной композиции по любому из предшествующих пп. в поле.69. The method of making a bacterial composition according to any one of the preceding paragraphs. in field.
70. Способ по п. 69, где указанную бактериальную композицию вносят в указанное поле в форме, выбранной из группы, состоящей из жидкой формы, сухой формы, гранул, порошка и осадка.70. The method of claim 69, wherein said bacterial composition is applied to said field in a form selected from the group consisting of liquid form, dry form, granules, powder, and pellet.
71. Способ по п. 69, где указанную бактериальную композицию вносят в указанное поле в виде покрытия для семян, протравки для семян или пропитки для семян.71. The method of claim 69, wherein said bacterial composition is applied to said field as a seed coat, seed dressing, or seed dressing.
72. Способ по п. 69, где указанную бактериальную композицию вносят в указанное поле в качестве обработки борозды.72. The method of claim 69, wherein said bacterial composition is applied to said field as a furrow treatment.
73. Способ по п. 69, где указанную бактериальную композицию вносят в указанное поле во время, до или после посадки семян.73. The method of claim 69, wherein said bacterial composition is applied to said field during, before, or after planting the seeds.
74. Композиция удобрения, содержащая бактериальную композицию по любому из предшествующих пп.74. A fertilizer composition containing a bacterial composition according to any one of the preceding paragraphs.
75. Композиция удобрения по п. 74, где указанная композиция удобрения представляет собой композиция покрытия для семян, протравки для семян или пропитки для семян.75. A fertilizer composition according to claim 74, wherein said fertilizer composition is a seed coat, seed dressing, or seed treatment composition.
76. Композиция удобрения по п. 74, где указанная композиция удобрения представляет собой композицию для внесения в борозду.76. A fertilizer composition according to claim 74, wherein said fertilizer composition is a furrow application composition.
77. Композиция удобрения по п. 74, где указанную композицию удобрения предоставляют для сельскохозяйственной культуры во время, до или после посадки.77. A fertilizer composition according to claim 74, wherein said fertilizer composition is provided to the crop during, before, or after planting.
78. Композиция удобрения по п. 74, дополнительно содержащая пористый носитель.78. A fertilizer composition according to claim 74, further comprising a porous carrier.
79. Композиция удобрения по п. 74, дополнительно содержащая дополнительный синергический компонент, который при комбинации с указанной бактериальной композицией увеличивает положительное удобряющее действие указанной композиции удобрения на сельскохозяйственную культуру, которое превышает суммарное положительное действие ее индивидуальных компонентов.79. A fertilizer composition according to claim 74, additionally containing an additional synergistic component, which, when combined with said bacterial composition, increases the positive fertilizing effect of said fertilizer composition on the crop, which exceeds the total positive effect of its individual components.
80. Способ поддержания уровней азота в почве, включающий:80. A method of maintaining nitrogen levels in the soil, including:
высаживание в почву поля сельскохозяйственной культуры, инокулированной генно-инженерными бактериями, которые фиксируют атмосферный азот; иplanting in the soil of a field of an agricultural crop inoculated with genetically engineered bacteria that fix atmospheric nitrogen; And
сбор урожая указанной сельскохозяйственной культуры, где между посадкой и сбором урожая в указанную почву указанного поля вносят не более 90% дозы азота, необходимой для получения указанной сельскохозяйственной культуры.harvesting said crop, wherein between planting and harvesting, no more than 90% of the dose of nitrogen required to produce said crop is applied to said soil of said field.
81. Способ по п. 80, где между посадкой и сбором урожая в указанную почву указанного поля вносят не более 80% дозы азота, необходимой для получения указанной сельскохозяйственной культуры.81. The method according to
82. Способ по п. 80, где между посадкой и сбором урожая в указанную почву указанного поля вносят не более 70% дозы азота, необходимой для получения указанной сельскохозяйственной культуры.82. The method according to
83. Способ по п. 80, где между посадкой и сбором урожая в указанную почву указанного поля вносят не более 60% дозы азота, необходимой для получения указанной сельскохозяйственной культуры.83. The method according to
84. Способ по п. 80, где между посадкой и сбором урожая в указанную почву указанного поля вносят не более 50% дозы азота, необходимой для получения указанной сельскохозяйственной культуры.84. The method according to
85. Способ по п. 80, где между посадкой и сбором урожая в указанную почву указанного поля вносят не более 40% дозы азота, необходимой для получения указанной сельскохозяйственной культуры.85. The method according to
86. Способ по п. 80, где указанная генно-инженерная бактерия содержит бактериальную композицию по любому из предшествующих пп.86. The method according to p. 80, where the specified genetically engineered bacterium contains a bacterial composition according to any one of the preceding paragraphs.
87. Способ по п. 80, где указанная генно-инженерная бактерия состоит из бактериальной композиции по любому из предшествующих пп.87. The method according to p. 80, where the specified genetically engineered bacterium consists of a bacterial composition according to any of the preceding paragraphs.
88. Способ доставки пробиотической добавки в сельскохозяйственную культуру, включающий:88. A method for delivering a probiotic supplement to an agricultural crop, including:
покрытие семян сельскохозяйственной культуры покрытием для семян, пропиткой для семян или протравкой для семян, где указанные покрытие для семян, протравка для семян или пропитка для семян содержат живых представителей указанного пробиотика; иcoating the seeds of the crop with a seed coating, seed dressing, or seed dressing, wherein said seed coat, seed dressing, or seed dressing contains live representatives of said probiotic; And
внесение в почву поля указанных семян сельскохозяйственной культуры.introduction into the soil of the field of the specified seeds of an agricultural crop.
89. Способ по п. 88, где указанные покрытие для семян, протравку для семян или пропитку для семян наносят на указанные семена сельскохозяйственной культуры одним слоем.89. The method of claim 88, wherein said seed coat, seed dressing, or seed treatment is applied to said crop seed in a single layer.
90. Способ по п. 88, где указанное покрытие для семян наносят на указанные семена сельскохозяйственной культуры несколькими слоями.90. The method of claim 88, wherein said seed coating is applied to said crop seeds in multiple layers.
91. Способ по п. 88, где указанное покрытие для семян наносят на указанные семена сельскохозяйственной культуры в смеси.91. The method of claim 88, wherein said seed coating is applied to said crop seeds in a mixture.
92. Способ по п. 88, где указанные семена сельскохозяйственной культуры являются неклубеньковыми.92. The method of claim 88, wherein said crop seeds are non-nodulating.
93. Способ по п. 88, где указанное покрытие для семян содержит бактериальную композицию по любому из предшествующих пп.93. The method according to p. 88, where the specified seed coating contains a bacterial composition according to any one of the preceding paragraphs.
94. Способ по любому из предшествующих пп., где генно-инженерный бактериальный штамм представляет собой генно-инженерный штамм грамположительной бактерии.94. The method according to any one of the preceding claims, where the genetically engineered bacterial strain is a genetically engineered strain of a Gram-positive bacterium.
95. Способ по п. 94, где генно-инженерный штамм грамположительной бактерии обладает измененным уровнем экспрессии регулятора кластера Nif.95. The method of claim 94, wherein the genetically engineered Gram-positive bacterium has an altered expression level of the Nif cluster regulator.
96. Способ по п. 94, где генно-инженерный штамм грамположительной бактерии экспрессирует сниженное количество отрицательного регулятора кластера Nif.96. The method of claim 94, wherein the genetically engineered Gram-positive bacterium expresses a reduced amount of a negative Nif cassette regulator.
97. Способ по п. 94, где генно-инженерный бактериальный штамм экспрессирует сниженное количество of GlnR.97. The method of claim 94, wherein the genetically engineered bacterial strain expresses a reduced amount of GlnR .
98. Способ по любому из предшествующих пп., где в геноме генно-инженерного бактериального штамма закодирован полипептид по меньшей мере на 75% идентичный с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Дж. Зера.98. The method according to any one of the preceding claims, wherein the genome of the genetically engineered bacterial strain encodes a polypeptide at least 75% identical to the sequence from the NifH database of the laboratory of J. Zehr.
99. Способ по любому из предшествующих пп., где в геноме генно-инженерного бактериального штамма закодирован полипептид по меньшей мере на 85% идентичный с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Дж. Зера.99. The method according to any one of the preceding claims, wherein the genome of the genetically engineered bacterial strain encodes a polypeptide that is at least 85% identical to the sequence from the NifH database of the laboratory of J. Zehr.
100. Способ по любому из предшествующих пп., где в геноме генно-инженерного бактериального штамма закодирован полипептид по меньшей мере на 75% идентичный с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Д. Бакли.100. The method according to any one of the preceding claims, wherein the genome of the genetically engineered bacterial strain encodes a polypeptide that is at least 75% identical to the sequence from the NifH database of D. Buckley's laboratory.
101. Способ по любому из предшествующих пп., где в геноме генно-инженерного бактериального штамма закодирован полипептид по меньшей мере на 85% идентичный с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Д. Бакли.101. The method according to any one of the preceding claims, wherein the genome of the genetically engineered bacterial strain encodes a polypeptide that is at least 85% identical to the sequence from the NifH database of D. Buckley's laboratory.
102. Способ выведения штаммов микроорганизмов для улучшения конкретных признаков агротехнического значения, включающий:102. A method for breeding strains of microorganisms to improve specific signs of agrotechnical significance, including:
предоставление множества штаммов микроорганизмов, обладающих способностью к колонизации требуемой сельскохозяйственной культуры;providing a plurality of strains of microorganisms having the ability to colonize the desired crop;
улучшение регуляторных сетей, влияющих на признак посредством внутригеномной перестановки;improvement of regulatory networks affecting the trait through intragenomic rearrangement;
оценку штаммов микроорганизмов во множестве штаммов микроорганизмов для определения меры признака; иevaluating strains of microorganisms in a plurality of strains of microorganisms to determine the measure of the sign; And
отбор из множества штаммов микроорганизмов одного или нескольких штаммов микроорганизмов, которые обеспечивают улучшение признака в случае требуемой сельскохозяйственной культуры.selection from a plurality of strains of microorganisms of one or more strains of microorganisms, which provide an improvement in the trait in the case of the desired crop.
103. Способ по п. 102, где конкретный признак, подвергаемый улучшению, представляет собой способность штамма микроорганизмов фиксировать азот.103. The method of claim 102, wherein the particular trait to be improved is the ability of the microorganism strain to fix nitrogen.
104. Способ по п. 103, где конкретный признак, подвергаемый улучшению, представляет собой способность штамма микроорганизмов фиксировать атмосферный азот в присутствии N-удобряем условия роста.104. The method of claim 103, wherein the particular trait to be improved is the ability of the microorganism strain to fix atmospheric nitrogen in the presence of N-fertilize growth conditions.
105. Способ выведения штаммов микроорганизмов для улучшения конкретных признаков агротехнического значения, включающий:105. A method for breeding strains of microorganisms to improve specific signs of agrotechnical significance, including:
предоставление множества штаммов микроорганизмов, обладающих способностью к колонизации требуемой сельскохозяйственной культуры;providing a plurality of strains of microorganisms having the ability to colonize the desired crop;
внесение генетического разнообразия во множество штаммов микроорганизмов;the introduction of genetic diversity in many strains of microorganisms;
оценку штаммов микроорганизмов во множестве штаммов микроорганизмов для определения меры признака; иevaluating strains of microorganisms in a plurality of strains of microorganisms to determine the measure of the sign; And
отбор из множества штаммов микроорганизмов одного или нескольких штаммов микроорганизмов, которые обеспечивают улучшение признака в случае требуемой сельскохозяйственной культуры.selection from a plurality of strains of microorganisms of one or more strains of microorganisms, which provide an improvement in the trait in the case of the desired crop.
106. Способ по п. 105, где конкретный признак, подвергаемый улучшению, представляет собой способность штамма микроорганизмов фиксировать азот.106. The method of claim 105, wherein the particular trait to be improved is the ability of the microorganism strain to fix nitrogen.
107. Способ по п. 106, где конкретный признак, подвергаемый улучшению, представляет собой способность штамма микроорганизмов фиксировать атмосферный азот в присутствии N-удобряем условия роста.107. The method of claim 106 wherein the particular trait to be improved is the ability of the microorganism strain to fix atmospheric nitrogen in the presence of N-fertilize growth conditions.
108. Способ увеличения у небобового растения количества получаемого из атмосферы азота, включающий:108. A method for increasing the amount of nitrogen obtained from the atmosphere in a non-legume plant, including:
воздействие на указанное небобовое растение подвергнутыми генетической инженерии не являющимися межродовыми микроорганизмами, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы несут по меньшей мере одна генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, или по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.exposing said non-legume plant to genetically engineered non-intergeneric microorganisms, wherein said genetically engineered non-intergeneric microorganisms carry at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network, or at least one genetic variation introduced into the genetic regulatory nitrogen assimilation network.
109. Способ по п. 108, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в указанную генетическую регуляторную сеть фиксации азота.109. The method of
110. Способ по п. 108, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в указанную генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.110. The method of
111. Способ по п. 108, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в указанную генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в указанную генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.111. The method of
112. Способ по п. 108, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы вносят в борозды, в которые высаживают семена указанного небобового растения.112. The method of
113. Способ по п. 108, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы наносят на семена указанного небобового растения.113. The method of
114. Способ по п. 108, где указанное небобовое растение представляет собой небобовую сельскохозяйственную культуру, выбранную из группы, состоящей из сорго, канолы, томата, клубники, ячменя, риса, кукурузы, пшеницы, картофеля, просо, злаковых, зерновых и кукурузы.114. The method of
115. Способ по п. 108, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы колонизируют по меньшей мере корень указанного небобового растения так, что указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы присутствуют в указанном небобовом растении в количестве по меньшей мере 105 колониеобразующих единиц на грамм сырой массы ткани.115. The method of
116. Способ по п. 108, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы способны к фиксации атмосферного азота в нелимитирующих азот условиях.116. The method of
117. Способ по п. 108, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.117. The method of
118. Способ по п. 108, где указанную по меньшей мере одну генетическую вариацию вносят в ген, выбранный из группы, состоящей из nifA, nifL, ntrB, ntrC, полинуклеотида, кодирующего глутаминсинтетазу, glnA, glnB, glnK, drat, amtB, полинуклеотида, кодирующего глутаминазу, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, nifQ и гена, ассоциированного с биосинтезом нитрогеназного фермента.118. The method of
119. Способ по п. 108, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы, in planta, продуцируют в указанном небобовом растении по меньшей мере 1% фиксированного азота.119. The method of
120. Способ по п. 119, где указанный фиксированный азот в указанном небобовом растении, продуцируемый указанными подвергнутыми генетической инженерии не являющимися межродовыми микроорганизмами, определяют посредством разведения 15N в сельскохозяйственных культурах, выращиваемых в полях, обрабатываемых удобрением, содержащим 1,2% 15N.120. The method of claim 119, wherein said fixed nitrogen in said non-legume plant produced by said genetically engineered non-intergeneric microorganisms is determined by diluting 15 N in crops grown in fields treated with a fertilizer containing 1.2% 15 N .
121. Способ по п. 119, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы, in planta, продуцируют в указанном небобовом растении 5% фиксированного азота или более.121. The method of claim 119, wherein said genetically engineered non-intergeneric microorganisms, in planta , produce 5% or more fixed nitrogen in said non-legume plant.
122. Способ по п. 108, где указанные не являющиеся межродовыми микроорганизмы подвергают генетической инженерии с использованием по меньшей мере инженерии одного типа, выбранной из группы, состоящей из направленного мутагенеза, случайного мутагенеза и направленной эволюции.122. The method of
123. Способ увеличения количества получаемого из атмосферы азота у растения кукурузы, включающий123. A method for increasing atmospheric nitrogen in a corn plant, comprising
воздействие на указанное растение кукурузы подвергнутыми генетической инженерии не являющимися межродовыми микроорганизмами, несущими генно-инженерные генетические вариации по меньшей мере в двух генах, выбранных из группы, состоящей из nifL, glnB, glnE и amtB.exposing said corn plant to genetically engineered non-intergeneric microorganisms carrying genetically engineered genetic variations in at least two genes selected from the group consisting of nifL , glnB , glnE and amtB .
124. Способ по п. 123, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.124. The method of
125. Способ по п. 123, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы вносят в борозды, в которые высажены семена указанного растения кукурузы.125. The method of
126. Способ по п. 123, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы наносят на семена указанного растения кукурузы.126. The method of
127. Способ увеличения количества получаемого из атмосферы азота у растения кукурузы, включающий:127. A method for increasing the amount of nitrogen obtained from the atmosphere in a corn plant, including:
воздействие на указанное растение кукурузы подвергнутыми генетической инженерии не являющимися межродовыми микроорганизмами, несущими по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота, где указанные подвергнутые генетической инженерии не являющиеся межродовыми микроорганизмы, in planta, продуцируют у указанного растения кукурузы по меньшей мере 5% фиксированного азота, как измеряют посредством разведения 15N в сельскохозяйственных культурах, выращиваемых в полях, обрабатываемых удобрением, содержащим 1,2% 15N.exposure of said corn plant to genetically engineered non-intergeneric microorganisms carrying at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into the nitrogen assimilation genetic regulatory network, where said genetically engineered non-intergeneric microorganisms, in planta , produce at least 5% fixed nitrogen in said corn plant, as measured by 15 N dilution in crops grown in fields treated with a fertilizer containing 1.2% 15 N.
128. Способ увеличения фиксации азота у небобового растения, включающий:128. A method for increasing nitrogen fixation in a non-legume plant, comprising:
a. нанесение на растение множества не являющихся межродовыми бактерий, где указанное множество включает не являющихся межродовыми бактерий, которые:a. applying to a plant a plurality of non-intergeneric bacteria, wherein said plurality includes non-intergeneric bacteria that:
i. обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения; иi. have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue; And
ii. продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час, иii. produce a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour, and
где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,5 × 10-8 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час, иwhere the product of (i) the average colonizing capacity per unit plant root tissue and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.5 x 10 -8 mmol N per gram wet weight of plant root tissue per hour, and
где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 1% фиксированного азота или более, иwhere a plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produce 1% or more of fixed nitrogen in the plant, and
где каждый представитель множества не являющихся межродовыми бактерий несет по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота так, что не являющиеся межродовыми бактерии становятся способны к фиксации атмосферного азота в присутствии экзогенного азота.wherein each member of a plurality of non-intergeneric bacteria carries at least one genetic variation introduced into at least one gene or non-coding polynucleotide of the genetic regulatory network for nitrogen fixation or assimilation such that the non-intergeneric bacteria become capable of fixing atmospheric nitrogen in the presence of exogenous nitrogen .
129. Способ по п. 128, где по меньшей мере одна генетическая вариация содержит введенную контрольную последовательность, функционально связанную по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.129. The method of claim 128, wherein at least one genetic variation comprises an introduced control sequence operably linked to at least one gene of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network.
130. Способ по п. 128, где по меньшей мере одна генетическая вариация содержит промотор, функционально связанный по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.130. The method of claim 128, wherein at least one genetic variation contains a promoter operably linked to at least one gene of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network.
131. Способ по п. 128, где по меньшей мере одна генетическая вариация содержит индуцибельный промотор, функционально связанный по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.131. The method of claim 128, wherein at least one genetic variation comprises an inducible promoter operably linked to at least one gene of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network.
132. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий не содержит конститутивный промотор, функционально связанный с геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.132. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria do not contain a constitutive promoter operably linked to a gene for a nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network.
133. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий не содержит конститутивный промотор, функционально связанный с геном в генном кластере nif.133. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria do not contain a constitutive promoter operably linked to a gene in the nif gene cluster.
134. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.134. The method of claim 128, wherein a plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , excrete nitrogen-containing nitrogen fixation products.
135. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий, наносимых на растение, не стимулирует увеличения захвата экзогенного неатмосферного азота.135. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria applied to the plant does not stimulate increased uptake of exogenous non-atmospheric nitrogen.
136. Способ по п. 128, где растение выращивают в почве поля, куда добавили по меньшей мере приблизительно 22,7 кг азот-содержащего удобрения на акр, и где азот-содержащее удобрение содержит по меньшей мере приблизительно 5% азота по массе.136. The method of claim 128, wherein the plant is grown in field soil to which at least about 22.7 kg of nitrogen-containing fertilizer per acre has been added, and wherein the nitrogen-containing fertilizer contains at least about 5% nitrogen by weight.
137. Способ по п. 128, где растение выращивают в почве поля, куда добавили по меньшей мере приблизительно 22,7 кг азот-содержащего удобрения на акр, и где азот-содержащее удобрение содержит по меньшей мере приблизительно 5% азота по массе, и где азот-содержащее удобрение содержит аммоний или содержащую аммоний молекулу.137. The method of claim 128, wherein the plant is grown in field soil to which at least about 22.7 kg of nitrogen-containing fertilizer per acre has been added, and where the nitrogen-containing fertilizer contains at least about 5% nitrogen by mass, and wherein the nitrogen-containing fertilizer contains ammonium or an ammonium-containing molecule.
138. Способ по п. 128, где экзогенный азот выбран из удобрения, содержащего один или несколько из: глутамина, аммиака, аммония, мочевины, нитрата, нитрита, содержащих аммоний молекул, содержащих нитраты молекул и содержащих нитриты молекул.138. The method of claim 128, wherein the exogenous nitrogen is selected from a fertilizer containing one or more of: glutamine, ammonia, ammonium, urea, nitrate, nitrite, ammonium-containing molecules, nitrate-containing molecules, and nitrite-containing molecules.
139. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 5% фиксированного азота или более.139. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produce 5% or more fixed nitrogen in the plant.
140. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 10% фиксированного азота или более.140. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produce 10% or more fixed nitrogen in the plant.
141. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, фиксирует атмосферный азот в нелимитирующих азот условиях.141. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , fixes atmospheric nitrogen under non-nitrogen-limiting conditions.
142. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.142. The method of claim 128, wherein a plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , excrete nitrogen-containing nitrogen fixation products.
143. Способ по п. 128, где фиксированный азот, продуцируемый множеством не являющихся межродовыми бактерий, определяют посредством разведения обогащенного удобрения атмосферным газообразным N2 в ткани растения.143. The method of claim 128, wherein the fixed nitrogen produced by a plurality of non-intergeneric bacteria is determined by diluting the enriched fertilizer with atmospheric N 2 gas in plant tissue.
144. Способ по п. 128, где по меньшей мере один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота выбраны из группы, состоящей из: nifA, nifL, ntrB, ntrC, полинуклеотида, кодирующего глутаминсинтетазу, glnA, glnB, glnK, drat, amtB, полинуклеотида, кодирующего глутаминазу, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, nifQ и гена, ассоциированного с биосинтезом нитрогеназного фермента.144. The method according to p. 128, where at least one gene or non-coding polynucleotide of the genetic regulatory network of nitrogen fixation or assimilation is selected from the group consisting of: nifA, nifL, ntrB, ntrC , polynucleotide encoding glutamine synthetase, glnA, glnB, glnK, Drat, AMTB , polynucleotide, encoding glutamine, GLND, GLNE, NIFJ, NIFH, NIFD, NIFK, NIFY, NIFE, NIFN, NIFU, NIFS, NIFV, NIFW, NIFZ, NIFM, NIFF, NIFB, NIFQ and Gene associated With biosynthesis nitrogenase enzyme.
145. Способ по п. 128, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутацию, которая приводит к одному или нескольким из: увеличенной экспрессии или активности NifA или глутаминазы; сниженной экспрессии или активности nifL, NtrB, глутаминсинтетазы, GlnB, GlnK, DraT, AmtB; сниженной аденилил-удаляющей активности GlnE или сниженной уридилат-удаляющей активности GlnD.145. The method according to p. 128, where at least one genetic variation is a mutation that leads to one or more of: increased expression or activity of NifA or glutaminase; reduced expression or activity of nifL, NtrB, glutamine synthetase, GlnB, GlnK, DraT, AmtB; reduced GlnE adenylyl scavenging activity; or reduced GlnD uridylate scavenging activity.
146. Способ по п. 128, где по меньшей мере одна генетическая вариация выбрана из: (A) нокаут-мутации; (B) удаления или устранения регуляторной последовательность гена-мишени; (C) наличия вставки гетерологичной регуляторной последовательности или (D) делеции домена.146. The method according to p. 128, where at least one genetic variation is selected from: (A) a knockout mutation; (B) removing or eliminating the regulatory sequence of the target gene; (C) the presence of a heterologous regulatory sequence insertion or (D) a domain deletion.
147. Способ по п. 128, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL.147. The method of claim 128, wherein at least one genetic variation is a mutant nifL gene that is altered to contain a heterologous promoter inserted into said nifL gene.
148. Способ по п. 128, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена.148. The method of claim 128, wherein at least one genetic variation is a mutant glnE gene that results in a truncated glnE protein lacking an adenylyl-removing (AR) domain.
149. Способ по п. 128, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB.149. The method of claim 128, wherein at least one genetic variation is a mutant amtB gene that results in a lack of expression of said amtB gene.
150. Способ по п. 128, где по меньшей мере одна генетическая вариация выбрана из: мутантного гена nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL; мутантного гена glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена; мутантного гена amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB; и их сочетаний.150. The method according to p. 128, where at least one genetic variation is selected from: a mutant nifL gene that is modified to contain a heterologous promoter built into the specified nifL gene; a mutant glnE gene that results in a truncated glnE protein lacking an adenylyl-removal (AR) domain; a mutant amtB gene that results in no expression of said amtB gene; and their combinations.
151. Способ по п. 128, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL, и мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена.151. The method according to p. 128, where at least one genetic variation is a mutant nifL gene, which is modified to contain a heterologous promoter inserted into the specified nifL gene, and a mutant glnE gene, which leads to the formation of a truncated glnE protein with no adenylyl-removing (AR) domain.
152. Способ по п. 128, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL, и мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена и мутантный ген amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB.152. The method according to p. 128, where at least one genetic variation is a mutant nifL gene, which is modified to contain a heterologous promoter inserted into the specified nifL gene, and a mutant glnE gene, which leads to the formation of a truncated glnE protein with no an adenylyl-removing (AR) domain and a mutant amtB gene that results in the absence of said amtB gene expression.
153. Способ по п. 128, где растение содержит семена, стебель, цветок, плод, листья или ризому.153. The method according to item 128, where the plant contains seeds, stem, flower, fruit, leaves or rhizome.
154. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в композицию.154. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria are formulated into a composition.
155. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в композицию, содержащую приемлемый в сельском хозяйстве носитель.155. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria are formulated into a composition containing an agriculturally acceptable carrier.
156. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий вносят в борозды, в которые высажены семена указанного растения.156. The method of claim 128, wherein a plurality of non-intergeneric bacteria are introduced into the furrows in which seeds of said plant are planted.
157. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в жидкую композицию для внесения в борозду, содержащую бактерии в концентрации приблизительно от 1 × 107 до приблизительно 1 × 1010 КОЕ в миллилитре.157. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria is formulated into a furrow liquid composition containing the bacteria at a concentration of about 1 x 10 7 to about 1 x 10 10 cfu per milliliter.
158. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий наносят на семена указанного растения.158. The method of claim 128, wherein a plurality of non-intergeneric bacteria is applied to the seeds of said plant.
159. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в покрытие для семян и наносят на семена указанного растения.159. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria are formulated into a seed coat and applied to the seeds of said plant.
160. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в покрытие для семян и наносят на семена указанного растения в концентрации приблизительно от 1 × 105 до приблизительно 1 × 107 КОЕ на семя.160. The method of claim 128, wherein a plurality of non-intergeneric bacteria are formulated into a seed coat and applied to the seeds of said plant at a concentration of about 1 x 10 5 to about 1 x 10 7 CFU per seed.
161. Способ по п. 128, где растение представляет собой злаковую сельскохозяйственную культуру.161. The method of claim 128, wherein the plant is a cereal crop.
162. Способ по п. 128, где растение выбрано из группы, состоящей из: кукурузы, риса, пшеницы, ячменя, сорго, просо, овса, ржи и тритикале.162. The method of claim 128, wherein the plant is selected from the group consisting of: corn, rice, wheat, barley, sorghum, millet, oats, rye, and triticale.
163. Способ по п. 128, где растение представляет собой кукурузу.163. The method of claim 128, wherein the plant is corn.
164. Способ по п. 128, где растение представляет собой сельскохозяйственную культуру.164. The method of claim 128, wherein the plant is a crop.
165. Способ по п. 128, где растение представляет собой генетически модифицированный организм.165. The method of claim 128, wherein the plant is a genetically modified organism.
166. Способ по п. 128, где растение не является генетически модифицированным организмом.166. The method of claim 128, wherein the plant is not a genetically modified organism.
167. Способ по п. 128, где растение подвергали генной инженерии или выводили для эффективного использования азота167. The method of claim 128 wherein the plant has been genetically engineered or bred to use nitrogen efficiently
168. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит по меньшей мере два различных вида бактерий.168. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria comprises at least two different species of bacteria.
169. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит по меньшей мере два различных штамма одного и того же вида бактерий.169. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria comprises at least two different strains of the same bacterial species.
170. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит бактерии, выбранные из: Rahnella aquatilis, Klebsiella variicola, Achromobacter spiritinus, Achromobacter marplatensis, Microbacterium murale, Kluyvera intermedia, Kosakonia pseudosacchari, вида Enterobacter, Azospirillum lipoferum, Kosakonia sacchari и их сочетаний.170. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria contains bacteria selected from: Rahnella aquatilis , Klebsiella variicola , Achromobacter spiritinus , Achromobacter marplatensis , Microbacterium murale , Kluyvera intermedia , Kosakonia pseudosacchari , Enterobacter species, Azospirillum lipoferum , Kosakonia sacchari and their combinations.
171. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий являются эндофитными, эпифитными или ризосферными.171. The method of claim 128, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria are endophytic, epiphytic, or rhizospheric.
172. Способ по п. 128, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит бактерии, выбранные из: бактерий, депонированных как PTA-122293, бактерий, депонированных как PTA-122294, бактерий, депонированных как NCMA 201701002, бактерий, депонированных как NCMA 201708004, бактерий, депонированных как NCMA 201708003, бактерий, депонированных как NCMA 201708002, бактерий, депонированных как NCMA 201712001, бактерий, депонированных как NCMA 201712002, и их сочетаний.172. The method according to p. 128, where the set of non-intergeneric bacteria contains bacteria selected from: bacteria deposited as PTA-122293, bacteria deposited as PTA-122294, bacteria deposited as NCMA 201701002, bacteria deposited as NCMA 201708004, bacteria deposited as NCMA 201708003, bacteria deposited as NCMA 201708002, bacteria deposited as NCMA 201712001, bacteria deposited as NCMA 201712002, and combinations thereof.
173. Способ увеличения фиксации азота у небобового растения, включающий:173. A method for increasing nitrogen fixation in a non-legume plant, including:
a. нанесение на растение множества бактерий, где указанное множество включает бактерии, которые:a. applying a plurality of bacteria to a plant, wherein said plurality includes bacteria that:
i. обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения; и/илиi. have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue; and/or
ii. продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час, иii. produce a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour, and
где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 1% фиксированного азота или более.where a plurality of bacteria, in planta , produce 1% or more fixed nitrogen in the plant.
174. Способ по п. 173, где множество бактерий содержит бактерии, которые: обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения.174. The method of claim 173, wherein the plurality of bacteria comprises bacteria that: have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue.
175. Способ по п. 173, где множество бактерий содержит бактерии, которые: продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 173 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.175. The method of claim 173, wherein the plurality of bacteria comprise bacteria that: produce a fixed N of at least about 173 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour.
176. Способ по п. 173, где множество бактерий содержит бактерии, которые: обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.176. The method of claim 173, wherein the plurality of bacteria comprises bacteria that: have an average colonizing capacity per unit plant root tissue of at least about 1.0 × 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue and produce a fixed N of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour.
177. Способ по п. 173, где множество бактерий содержит бактерии, которые: обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час, и где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,5 × 10-8 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.177. The method of claim 173, wherein the plurality of bacteria comprises bacteria that: have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue and produce a fixed N of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour, and where the product of (i) the average colonizing capacity per unit of plant root tissue and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2, 5 x 10 -8 mmol N per gram wet weight of plant root tissue per hour.
178. Способ по п. 173, где множество бактерий, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.178. The method of claim 173, wherein a plurality of bacteria, in planta , excrete nitrogen-containing nitrogen fixation products.
179. Способ по п. 173, где множество бактерий, наносимых на растение, не стимулирует увеличения захвата экзогенного неатмосферного азота.179. The method according to p. 173, where a lot of bacteria applied to the plant does not stimulate an increase in the uptake of exogenous non-atmospheric nitrogen.
180. Способ по п. 173, где растение содержит семена, стебель, цветок, плод, листья или ризому.180. The method according to item 173, where the plant contains seeds, stem, flower, fruit, leaves or rhizome.
181. Способ по п. 173, где множество бактерий формулируют в композицию.181. The method of claim 173, wherein the plurality of bacteria are formulated into a composition.
182. Способ по п. 173, где множество бактерий формулируют в композицию, содержащую приемлемый в сельском хозяйстве носитель.182. The method of claim 173, wherein the plurality of bacteria are formulated into a composition containing an agriculturally acceptable carrier.
183. Способ по п. 173, где множество бактерий вносят в борозды, в которые высажены семена указанного растения.183. The method according to p. 173, where a lot of bacteria are brought into the furrows in which the seeds of the specified plant are planted.
184. Способ по п. 173, где множество бактерий формулируют в жидкую композицию для внесения в борозду, содержащую бактерии в концентрации приблизительно от 1 × 107 до приблизительно 1 × 1010 КОЕ в миллилитре.184. The method of claim 173, wherein the plurality of bacteria are formulated into a liquid furrow application containing bacteria at a concentration of from about 1 x 10 7 to about 1 x 10 10 CFU per milliliter.
185. Способ по п. 173, где множество бактерий наносят на семена указанного растения.185. The method according to p. 173, where a lot of bacteria are applied to the seeds of the specified plant.
186. Способ по п. 173, где множество бактерий формулируют в покрытие для семян и наносят на семена указанного растения.186. The method of claim 173, wherein the plurality of bacteria are formulated into a seed coat and applied to the seeds of said plant.
187. Способ по п. 173, где множество бактерий формулируют в покрытие для семян и наносят на семена указанного растения в концентрации приблизительно от 1 × 105 до приблизительно 1 × 107 КОЕ на семя.187. The method of claim 173, wherein the plurality of bacteria are formulated into a seed coat and applied to the seeds of said plant at a concentration of about 1 x 10 5 to about 1 x 10 7 cfu per seed.
188. Способ по п. 173, где растение представляет собой злаковую сельскохозяйственную культуру.188. The method of claim 173, wherein the plant is a cereal crop.
189. Способ по п. 173, где растение выбрано из группы, состоящей из: кукурузы, риса, пшеницы, ячменя, сорго, просо, овса, ржи и тритикале.189. The method of claim 173, wherein the plant is selected from the group consisting of: corn, rice, wheat, barley, sorghum, millet, oats, rye, and triticale.
190. Способ по п. 173, где растение представляет собой кукурузу.190. The method of claim 173, wherein the plant is corn.
191. Способ по п. 173, где растение представляет собой сельскохозяйственную культуру.191. The method of claim 173, wherein the plant is a crop.
192. Способ по п. 173, где растение представляет собой генетически модифицированный организм.192. The method of claim 173, wherein the plant is a genetically modified organism.
193. Способ по п. 173, где растение не является генетически модифицированным организмом.193. The method of claim 173, wherein the plant is not a genetically modified organism.
194. Способ по п. 173, где растение подвергали генной инженерии или выводили для эффективного использования азота194. The method of claim 173 wherein the plant has been genetically engineered or bred to use nitrogen efficiently
195. Способ по п. 173, где множество бактерий содержит по меньшей мере два различных вида бактерий.195. The method according to p. 173, where the set of bacteria contains at least two different types of bacteria.
196. Способ по п. 173, где множество бактерий содержит по меньшей мере два различных штамма одного и того же вида бактерий.196. The method of claim 173, wherein the plurality of bacteria contains at least two different strains of the same bacterial species.
197. Способ по п. 173, где множество бактерий содержит бактерии, выбранные из: Rahnella aquatilis, Klebsiella variicola, Achromobacter spiritinus, Achromobacter marplatensis, Microbacterium murale, Kluyvera intermedia, Kosakonia pseudosacchari, вида Enterobacter, Azospirillum lipoferum, Kosakonia sacchari и их сочетаний.197. The method of claim 173, wherein the plurality of bacteria contains bacteria selected from: Rahnella aquatilis , Klebsiella variicola , Achromobacter spiritinus , Achromobacter marplatensis , Microbacterium murale , Kluyvera intermedia , Kosakonia pseudosacchari , Enterobacter species, Azospirillum lipoferum , Kosakonia s acchari and their combinations.
198. Способ по п. 173, где множество бактерий являются эндофитными, эпифитными или ризосферными.198. The method of claim 173, wherein the plurality of bacteria are endophytic, epiphytic, or rhizospheric.
199. Способ по п. 173, где множество бактерий выбраны из: бактерий, депонированных как NCMA 201701003, бактерий, депонированных как NCMA 201701001, и бактерий, депонированных как NCMA 201708001.199. The method of claim 173, wherein the plurality of bacteria are selected from: bacteria deposited as NCMA 201701003, bacteria deposited as NCMA 201701001, and bacteria deposited as NCMA 201708001.
200. Не являющаяся межродовой популяция бактерий, способная к увеличению фиксации азота у небобового растения, содержащая:200. A non-intergeneric bacterial population capable of increasing nitrogen fixation in a non-legume plant, comprising:
a. множество не являющихся межродовыми бактерий, которые:a. a variety of non-intergeneric bacteria that:
i. обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения; и/илиi. have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue; and/or
ii. продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час, иii. produce a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour, and
где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 1% фиксированного азота или более, выращиваем в присутствии множества не являющихся межродовыми бактерий, иwhere the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produce 1% or more fixed nitrogen in the plant, grown in the presence of the plurality of non-intergeneric bacteria, and
где каждый представитель множества не являющихся межродовыми бактерий несет по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота так, что не являющиеся межродовыми бактерии становятся способны к фиксации атмосферного азота в присутствии экзогенного азота.wherein each member of a plurality of non-intergeneric bacteria carries at least one genetic variation introduced into at least one gene or non-coding polynucleotide of the genetic regulatory network for nitrogen fixation or assimilation such that the non-intergeneric bacteria become capable of fixing atmospheric nitrogen in the presence of exogenous nitrogen .
201. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит бактерии, которые: обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения.201. The non-intergeneric bacterial population of
202. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит бактерии, которые: продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.202. The non-intergeneric bacterial population of
203. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит бактерии, которые: обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.203. The non-intergeneric bacterial population of
204. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где по меньшей мере одна генетическая вариация содержит введенную контрольную последовательность, функционально связанную по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.204. A non-intergeneric population of bacteria according to
205. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где по меньшей мере одна генетическая вариация содержит промотор, функционально связанный по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.205. A non-intergeneric population of bacteria according to
206. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где по меньшей мере одна генетическая вариация содержит индуцибельный промотор, функционально связанный по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.206. A non-intergeneric population of bacteria according to
207. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий не содержит конститутивный промотор, функционально связанный с геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.207. A non-intergeneric population of bacteria according to
208. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий не содержит конститутивный промотор, функционально связанный с геном в генном кластере nif.208. The non-intergeneric bacterial population of
209. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.209. The non-intergeneric bacterial population of
210. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий, наносимых на растение, не стимулирует увеличения захвата экзогенного неатмосферного азота.210. The non-intergeneric bacterial population of
211. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где растение выращивают в почве поля, куда добавили по меньшей мере приблизительно 22,7 кг азот-содержащего удобрения на акр, и где азот-содержащее удобрение содержит по меньшей мере приблизительно 5% азота по массе.211. The non-intergeneric bacterial population of
212. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где растение выращивают в почве поля, куда добавили по меньшей мере приблизительно 22,7 кг азот-содержащего удобрения на акр, и где азот-содержащее удобрение содержит по меньшей мере приблизительно 5% азота по массе, и где азот-содержащее удобрение содержит аммоний или содержащую аммоний молекулу.212. The non-intergeneric bacterial population of
213. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где экзогенный азот выбран из удобрения, содержащего один или несколько из: глутамина, аммиака, аммония, мочевины, нитрата, нитрита, содержащих аммоний молекул, содержащих нитраты молекул и содержащих нитриты молекул.213. The non-intergeneric bacterial population of
214. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 5% фиксированного азота или более.214. The non-intergeneric bacterial population of
215. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 10% фиксированного азота или более.215. The non-intergeneric bacterial population of
216. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, фиксирует атмосферный азот в нелимитирующих азот условиях.216. The non-intergeneric bacterial population of
217. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.217. The non-intergeneric bacterial population of
218. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где фиксированный азот, продуцируемый множеством не являющихся межродовыми бактерий, определяют посредством разведения обогащенного удобрения атмосферным газообразным N2 в ткани растения.218. The non-intergeneric bacterial population of
219. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где по меньшей мере один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота выбраны из группы, состоящей из: nifA, nifL, ntrB, ntrC, полинуклеотида, кодирующего глутаминсинтетазу, glnA, glnB, glnK, drat, amtB, полинуклеотида, кодирующего глутаминазу, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, nifQ и гена, ассоциированного с биосинтезом нитрогеназного фермента.219. A non-intergeneric population of bacteria according to
220. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутацию, которая приводит к одному или нескольким из: увеличенной экспрессии или активности NifA или глутаминазы; сниженной экспрессии или активности nifL, NtrB, глутаминсинтетазы, GlnB, GlnK, DraT, AmtB; сниженной аденилил-удаляющей активности GlnE или сниженной уридилат-удаляющей активности GlnD.220. Non-intergeneric population of bacteria according to
221. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где по меньшей мере одна генетическая вариация выбрана из: (A) нокаут-мутации; (B) удаления или устранения регуляторной последовательность гена-мишени; (C) наличия вставки гетерологичной регуляторной последовательности или (D) делеции домена.221. Non-intergeneric population of bacteria according to
222. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL.222. A non-intergeneric population of bacteria according to
223. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена.223. The non-intergeneric bacterial population of
224. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB.224. The non-intergeneric bacterial population of
225. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где по меньшей мере одна генетическая вариация выбрана из: мутантного гена nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL; мутантного гена glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена; мутантного гена amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB; и их сочетаний.225. A non-intergeneric population of bacteria according to
226. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL и мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена.226. A non-intergeneric population of bacteria according to
227. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL и мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена и мутантный ген amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB.227. A non-intergeneric population of bacteria according to
228. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где растение содержит семена, стебель, цветок, плод, листья или ризому.228. A non-intergeneric population of bacteria according to
229. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в композицию.229. The non-intergeneric bacterial population of
230. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в композицию, содержащую приемлемый в сельском хозяйстве носитель.230. The non-intergeneric bacterial population of
231. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в жидкую композицию для внесения в борозду, содержащую бактерии в концентрации приблизительно от 1 × 107 до приблизительно 1 × 1010 КОЕ в миллилитре.231. The non-intergeneric bacterial population of
232. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий формулируют в покрытие для семян.232. The non-intergeneric bacterial population of
233. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где растение представляет собой злаковую сельскохозяйственную культуру.233. The non-intergeneric bacterial population of
234. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где растение выбрано из группы, состоящей из: кукурузы, риса, пшеницы, ячменя, сорго, просо, овса, ржи и тритикале.234. A non-intergeneric population of bacteria according to
235. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где растение представляет собой кукурузу.235. The non-intergeneric bacterial population of
236. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где растение представляет собой сельскохозяйственную культуру.236. The non-intergeneric bacterial population of
237. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где растение представляет собой генетически модифицированный организм.237. A non-intergeneric population of bacteria according to
238. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где растение не является генетически модифицированным организмом.238. A non-intergeneric population of bacteria according to
239. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где растение подвергали генной инженерии или выводили для эффективного использования азота239. A non-intergeneric population of bacteria according to
240. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит по меньшей мере два различных вида бактерий.240. The non-intergeneric bacterial population of
241. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит по меньшей мере два различных штамма одного и того же вида бактерий.241. The non-intergeneric bacterial population of
242. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит бактерии, выбранные из: Rahnella aquatilis, Klebsiella variicola, Achromobacter spiritinus, Achromobacter marplatensis, Microbacterium murale, Kluyvera intermedia, Kosakonia pseudosacchari, вида Enterobacter, Azospirillum lipoferum, Kosakonia sacchari и их сочетаний.242. A non-intergeneric population of bacteria according to
243. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий являются эндофитными, эпифитными или ризосферными.243. The non-intergeneric bacterial population of
244. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по п. 200, где множество не являющихся межродовыми бактерий содержит бактерии, выбранные из: бактерий, депонированных как PTA-122293, бактерий, депонированных как PTA-122294, бактерий, депонированных как NCMA 201701002, бактерий, депонированных как NCMA 201708004, бактерий, депонированных как NCMA 201708003, бактерий, депонированных как NCMA 201708002, бактерий, депонированных как NCMA 201712001, бактерий, депонированных как NCMA 201712002, и их сочетаний.244. A non-intergeneric population of bacteria according to
245. Популяция бактерий, способная к увеличению фиксации азота у небобового растения, содержащая:245. A population of bacteria capable of increasing nitrogen fixation in a non-legume plant, containing:
a. множество бактерий, которые:a. many bacteria that
i. обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения; и/илиi. have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue; and/or
ii. продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час, иii. produce a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour, and
где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 1% фиксированного азота или более.where a plurality of bacteria, in planta , produce 1% or more fixed nitrogen in the plant.
246. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий содержит бактерии, которые: обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения.246. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria comprises bacteria that: have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 × 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue.
247. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий содержит бактерии, которые: продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 245 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.247. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria comprises bacteria that: produce a fixed N of at least about 245 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour.
248. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий содержит бактерии, которые: обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.248. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria comprises bacteria that: have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 × 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue and produce a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour.
249. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий содержит бактерии, которые: обладают средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и продуцируют фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час, и где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,5 × 10-8 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.249. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria comprises bacteria that: have an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 × 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue and produce a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour, and where the product of (i) the average colonizing capacity per unit of plant root tissue and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2 .5 × 10 -8 mmol N per gram wet weight of plant root tissue per hour.
250. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.250. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria, in planta , excrete nitrogen-containing nitrogen fixation products.
251. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий, наносимых на растение, не стимулирует увеличения захвата экзогенного неатмосферного азота.251. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria applied to the plant does not stimulate increased uptake of exogenous non-atmospheric nitrogen.
252. Популяция бактерий по п. 245, где растение содержит семена, стебель, цветок, плод, листья или ризому.252. The bacterial population of claim 245, wherein the plant contains seeds, stem, flower, fruit, leaves, or rhizome.
253. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий формулируют в композицию.253. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria are formulated into a composition.
254. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий формулируют в композицию, содержащую приемлемый в сельском хозяйстве носитель.254. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria are formulated into a composition containing an agriculturally acceptable carrier.
255. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий вносят в борозды, в которые высажены семена указанного растения.255. A population of bacteria according to claim 245, where a plurality of bacteria are introduced into the furrows in which the seeds of the specified plant are planted.
256. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий формулируют в жидкую композицию для внесения в борозду, содержащую бактерии в концентрации приблизительно от 1 × 107 до приблизительно 1 × 1010 КОЕ в миллилитре.256. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria is formulated into a liquid furrow application containing bacteria at a concentration of about 1 x 10 7 to about 1 x 10 10 cfu per milliliter.
257. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий наносят на семена указанного растения.257. A population of bacteria according to claim 245, wherein a plurality of bacteria is applied to the seeds of said plant.
258. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий формулируют в покрытие для семян и наносят на семена указанного растения.258. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria is formulated into a seed coating and applied to the seeds of said plant.
259. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий формулируют в покрытие для семян и наносят на семена указанного растения в концентрации приблизительно от 1 × 105 до приблизительно 1 × 107 КОЕ на семя.259. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria are formulated into a seed coat and applied to the seeds of said plant at a concentration of about 1 x 10 5 to about 1 x 10 7 CFU per seed.
260. Популяция бактерий по п. 245, где растение представляет собой злаковую сельскохозяйственную культуру.260. The bacterial population of claim 245, wherein the plant is a cereal crop.
261. Популяция бактерий по п. 245, где растение выбрано из группы, состоящей из: кукурузы, риса, пшеницы, ячменя, сорго, просо, овса, ржи и тритикале.261. The bacterial population of claim 245, wherein the plant is selected from the group consisting of: corn, rice, wheat, barley, sorghum, millet, oats, rye, and triticale.
262. Популяция бактерий по п. 245, где растение представляет собой кукурузу.262. The bacterial population of claim 245, wherein the plant is corn.
263. Популяция бактерий по п. 245, где растение представляет собой сельскохозяйственную культуру.263. The bacterial population of claim 245, wherein the plant is a crop.
264. Популяция бактерий по п. 245, где растение представляет собой генетически модифицированный организм.264. The bacterial population of claim 245, where the plant is a genetically modified organism.
265. Популяция бактерий по п. 245, где растение не является генетически модифицированным организмом.265. A population of bacteria according to clause 245, where the plant is not a genetically modified organism.
266. Популяция бактерий по п. 245, где растение подвергали генной инженерии или выводили для эффективного использования азота266. Population of bacteria according to clause 245, where the plant has been genetically engineered or bred to use nitrogen efficiently
267. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий содержит по меньшей мере два различных вида бактерий.267. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria contains at least two different bacterial species.
268. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий содержит по меньшей мере два различных штамма одного и того же вида бактерий.268. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria contains at least two different strains of the same bacterial species.
269. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий содержит бактерии, выбранные из: Rahnella aquatilis, Klebsiella variicola, Achromobacter spiritinus, Achromobacter marplatensis, Microbacterium murale, Kluyvera intermedia, Kosakonia pseudosacchari, вида Enterobacter, Azospirillum lipoferum, Kosakonia sacchari и их сочетаний.269. A population of bacteria according to claim 245, where a plurality of bacteria contains bacteria selected from: Rahnella aquatilis , Klebsiella variicola , Achromobacter spiritinus , Achromobacter marplatensis , Microbacterium murale , Kluyvera intermedia , Kosakonia pseudosacchari , Enterobacter species, Azospirillum lipoferum , Kosak onia sacchari and their combinations .
270. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий являются эндофитными, эпифитными или ризосферными.270. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria are endophytic, epiphytic, or rhizospheric.
271. Популяция бактерий по п. 245, где множество бактерий выбраны из: бактерий, депонированных как NCMA 201701003, бактерий, депонированных как NCMA 201701001, и бактерий, депонированных как NCMA 201708001.271. The bacterial population of claim 245, wherein the plurality of bacteria are selected from: bacteria deposited as NCMA 201701003, bacteria deposited as NCMA 201701001, and bacteria deposited as NCMA 201708001.
272. Бактерия, которая:272. A bacterium that:
i. обладает средней колонизирующей способность на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения; и/илиi. has an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue; and/or
ii. продуцирует фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.ii. produces a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour.
273. Не являющаяся межродовой бактерия, несущая: по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную по меньшей мере в один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота так, что не являющаяся межродовой бактерия способна к фиксации атмосферного азота в присутствии экзогенного азота, и где указанная бактерия:273. A non-intergeneric bacterium carrying: at least one genetic variation introduced into at least one gene or non-coding polynucleotide of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network so that the non-intergeneric bacterium is capable of fixing atmospheric nitrogen in the presence of exogenous nitrogen, and where is the indicated bacterium:
i. обладает средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения; и/илиi. has an average colonizing capacity per unit plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue; and/or
ii. продуцирует фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.ii. produces a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour.
274. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где бактерия обладает средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения.274. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein the bacterium has an average colonizing capacity per unit of plant root tissue of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue.
275. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где бактерия продуцирует фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.275. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein the bacterium produces a fixed N of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour.
276. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где бактерия обладает средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и продуцирует фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час.276. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein the bacterium has an average colonizing capacity per unit plant root tissue of at least about 1.0 × 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue and produces a fixed N of at least approximately 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour.
277. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где бактерия обладает средней колонизирующей способностью на единицу ткани корня растения по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения и продуцирует фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час, и где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,5 × 10-8 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.277. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein the bacterium has an average colonizing capacity per unit plant root tissue of at least about 1.0 × 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue and produces a fixed N of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour, and where the product of (i) the average colonizing capacity per unit of plant root tissue and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.5 x 10 -8 mmol N per gram wet weight of plant root tissue per hour.
278. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где по меньшей мере одна генетическая вариация содержит введенную контрольную последовательность, функционально связанную по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.278. A non-intergeneric bacterium according to claim 273, wherein at least one genetic variation contains an introduced control sequence operably linked to at least one gene of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network.
279. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где по меньшей мере одна генетическая вариация содержит промотор, функционально связанный по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.279. A non-intergeneric bacterium according to claim 273, wherein at least one genetic variation contains a promoter operably linked to at least one gene of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network.
280. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где по меньшей мере одна генетическая вариация содержит индуцибельный промотор, функционально связанный по меньшей мере с одним геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.280. A non-intergeneric bacterium according to claim 273, wherein at least one genetic variation contains an inducible promoter operably linked to at least one gene of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network.
281. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где бактерия не содержит конститутивный промотор, функционально связанный с геном генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота.281. A non-intergeneric bacterium according to claim 273, wherein the bacterium does not contain a constitutive promoter operably linked to the gene for the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network.
282. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где бактерия не содержит конститутивный промотор, функционально связанный с геном в генном кластере nif.282. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein the bacterium does not contain a constitutive promoter operably linked to a gene in the nif gene cluster.
283. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где бактерия, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.283. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein the bacterium, in planta , excretes nitrogen-containing nitrogen fixation products.
284. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где по меньшей мере один ген или некодирующий полинуклеотид генетической регуляторной сети фиксации или ассимиляции азота выбраны из группы, состоящей из: nifA, nifL, ntrB, ntrC, полинуклеотида, кодирующего глутаминсинтетазу, glnA, glnB, glnK, drat, amtB, полинуклеотида, кодирующего глутаминазу, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, nifQ и гена, ассоциированного с биосинтезом нитрогеназного фермента.284. A non-intergeneric bacterium according to claim 273, wherein at least one gene or non-coding polynucleotide of the nitrogen fixation or assimilation genetic regulatory network is selected from the group consisting of: nifA, nifL, ntrB, ntrC , a polynucleotide encoding glutamine synthetase, glnA, glnB , glnK, drat, amtB , полинуклеотида, кодирующего глутаминазу, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, nifQ и гена, associated with the biosynthesis of the nitrogenase enzyme.
285. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутацию, которая приводит к одному или нескольким из: увеличенной экспрессии или активности NifA или глутаминазы; сниженной экспрессии или активности nifL, NtrB, глутаминсинтетазы, GlnB, GlnK, DraT, AmtB; сниженной аденилил-удаляющей активности GlnE или сниженной уридилат-удаляющей активности GlnD.285. Non-intergeneric bacterium according to item 273, where at least one genetic variation is a mutation that leads to one or more of: increased expression or activity of NifA or glutaminase; reduced expression or activity of nifL, NtrB, glutamine synthetase, GlnB, GlnK, DraT, AmtB; reduced GlnE adenylyl scavenging activity; or reduced GlnD uridylate scavenging activity.
286. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где по меньшей мере одна генетическая вариация выбрана из: (A) нокаут-мутации; (B) удаления или устранения регуляторной последовательность гена-мишени; (C) наличия вставки гетерологичной регуляторной последовательности или (D) делеции домена.286. Non-intergeneric bacterium according to item 273, where at least one genetic variation is selected from: (A) a knockout mutation; (B) removing or eliminating the regulatory sequence of the target gene; (C) the presence of a heterologous regulatory sequence insertion or (D) a domain deletion.
287. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL.287. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein at least one genetic variation is a mutant nifL gene that is altered to contain a heterologous promoter inserted into said nifL gene.
288. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена.288. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein at least one genetic variation is a mutant glnE gene that results in a truncated glnE protein lacking an adenylyl-removing (AR) domain.
289. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB.289. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein at least one genetic variation is a mutant amtB gene that results in a lack of expression of said amtB gene.
290. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где по меньшей мере одна генетическая вариация выбрана из: мутантного гена nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL; мутантного гена glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена; мутантного гена amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB; и их сочетаний.290. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein at least one genetic variation is selected from: a mutant nifL gene that is modified to contain a heterologous promoter inserted into said nifL gene; a mutant glnE gene that results in a truncated glnE protein lacking an adenylyl-removal (AR) domain; a mutant amtB gene that results in no expression of said amtB gene; and their combinations.
291. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL и мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена.291. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein at least one genetic variation is a mutant nifL gene that is altered to contain a heterologous promoter inserted into said nifL gene and a mutant glnE gene that results in a truncated glnE protein with the absence of an adenylyl-removing (AR) domain.
292. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где по меньшей мере одна генетическая вариация представляет собой мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL и мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена и мутантный ген amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB.292. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein at least one genetic variation is a mutant nifL gene that is altered to contain a heterologous promoter inserted into said nifL gene and a mutant glnE gene that results in a truncated glnE protein with the absence of an adenylyl-removal (AR) domain and a mutant amtB gene that results in the absence of said amtB gene expression.
293. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, формулируемая в композицию.293. A non-intergeneric bacterium according to claim 273, formulated into a composition.
294. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, формулируемая в композицию, содержащую приемлемый в сельском хозяйстве носитель.294. The non-intergeneric bacterium of claim 273, formulated into a composition containing an agriculturally acceptable carrier.
295. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, формулируемая в жидкую композицию для внесения в борозду.295. The non-intergeneric bacterium of claim 273, formulated into a liquid composition for application to the furrow.
296. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, формулируемая в покрытие для семян.296. The non-intergeneric bacterium of claim 273 formulated into a seed coating.
297. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где указанная бактерия выбрана из: Rahnella aquatilis, Klebsiella variicola, Achromobacter spiritinus, Achromobacter marplatensis, Microbacterium murale, Kluyvera intermedia, Kosakonia pseudosacchari, вида Enterobacter, Azospirillum lipoferum, Kosakonia sacchari и их сочетаний.297. A non-intergeneric bacterium according to claim 273, where said bacterium is selected from: Rahnella aquatilis , Klebsiella variicola , Achromobacter spiritinus , Achromobacter marplatensis , Microbacterium murale , Kluyvera intermedia , Kosakonia pseudosacchari , Enterobacter species, Azospirillum lipoferum , Kosakonia sacchari and their combinations.
298. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где указанная бактерия является эндофитной, эпифитной или ризосферной.298. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein said bacterium is endophytic, epiphytic, or rhizospheric.
299. Не являющаяся межродовой бактерия по п. 273, где указанная бактерия выбрана из: бактерий, депонированных как PTA-122293, бактерий, депонированных как PTA-122294, бактерий, депонированных как NCMA 201701002, бактерий, депонированных как NCMA 201708004, бактерий, депонированных как NCMA 201708003, бактерий, депонированных как NCMA 201708002, бактерий, депонированных как NCMA 201712001, бактерий, депонированных как NCMA 201712002, и их сочетаний.299. The non-intergeneric bacterium of claim 273, wherein said bacterium is selected from: bacteria deposited as PTA-122293, bacteria deposited as PTA-122294, bacteria deposited as NCMA 201701002, bacteria deposited as NCMA 201708004, bacteria deposited as NCMA 201708003, bacteria deposited as NCMA 201708002, bacteria deposited as NCMA 201712001, bacteria deposited as NCMA 201712002, and combinations thereof.
300. Способ увеличения фиксации азота в растении, включающий введение в растение эффективного количество композиции, содержащей:300. A method for increasing nitrogen fixation in a plant, which includes introducing into the plant an effective amount of a composition containing:
i. очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты 16S, которая по меньшей мере приблизительно на 97% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269, 277-283;i. a purified bacterial population that contains bacteria with a 16S nucleic acid sequence that is at least about 97% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269, 277-283;
ii. очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 90% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276, 284-295; и/илиii. a purified bacterial population that contains bacteria with a nucleic acid sequence that is at least about 90% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148 , 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276, 284-295; and/or
iii. очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 90% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 177-260, 296-303; иiii. a purified bacterial population that contains bacteria with a nucleic acid sequence that is at least about 90% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 177-260, 296-303; And
где растение, которому вводят эффективное количество композиции, демонстрирует увеличение фиксации азота по сравнению с растением без введения композиции.wherein a plant administered with an effective amount of the composition exhibits an increase in nitrogen fixation compared to a plant without administration of the composition.
301. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты 16S, которая по меньшей мере приблизительно на 97% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269 и 277-283.301. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains bacteria with a 16S nucleic acid sequence that is at least about 97% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269 and 277-283.
302. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты 16S, которая по меньшей мере приблизительно на 99% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269 и 277-283.302. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains bacteria with a 16S nucleic acid sequence that is at least about 99% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269 and 277-283.
303. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты 16S, выбранной из SEQ ID NO: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269 и 277-283.303. The method according to p. 300, where the composition contains: a purified population of bacteria, which contains bacteria with a 16S nucleic acid sequence selected from SEQ ID NO: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157 , 167, 261, 262, 269 and 277-283.
304. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 90% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 и 284-295.304. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains bacteria with a nucleic acid sequence that is at least about 90% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 86-95, 97-110 , 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 and 284-295
305. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 95% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 и 284-295.305. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains bacteria with a nucleic acid sequence that is at least about 95% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 86-95, 97-110 , 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 and 284-295
306. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 99% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 и 284-295.306. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains bacteria with a nucleic acid sequence that is at least about 99% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 86-95, 97-110 , 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 and 284-295
307. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 и 284-295.307. The method according to p. 300, where the composition contains: a purified population of bacteria, which contains bacteria with a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 and 284-295.
308. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 90% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 177-260 и 296-303.308. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains bacteria with a nucleic acid sequence that is at least about 90% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 177-260 and 296-303 .
309. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 95% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 177-260 и 296-303.309. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains bacteria with a nucleic acid sequence that is at least about 95% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 177-260 and 296-303 .
310. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 99% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 177-260 и 296-303.310. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains bacteria with a nucleic acid sequence that is at least about 99% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 177-260 and 296-303 .
311. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с последовательностью нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 177-260 и 296-303.311. The method according to p. 300, where the composition contains: a purified population of bacteria, which contains bacteria with a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NO: 177-260 and 296-303.
312. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии по меньшей мере с одной генетической вариацией, внесенной в ген, выбранный из группы, состоящей из nifA, nifL, ntrB, ntrC, полинуклеотида, кодирующего глутаминсинтетазу, glnA, glnB, glnK, drat, amtB, полинуклеотида, кодирующего глутаминазу, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, nifQ и гена, ассоциированного с биосинтезом нитрогеназного фермента.312. The method according to p. 300, where the composition contains: a purified population of bacteria that contains bacteria with at least one genetic variation introduced into a gene selected from the group consisting of nifA , nifL , ntrB , ntrC , a polynucleotide encoding glutamine synthetase, glnA , glnB , glnK , drat, amtB , polynucleotide encoding glutaminase, glnD , glnE , nifJ , nifH , nifD , nifK , nifY , nifE , nifN , nifU , nifS , nifV , nifW , nifZ , nifM , nifF , nifB , nifQ and a gene associated with the biosynthesis of the nitrogenase enzyme.
313. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии по меньшей мере с одной генетической вариацией, внесенной в ген, выбранный из группы, состоящей из nifA, nifL, ntrB, ntrC, полинуклеотида, кодирующего глутаминсинтетазу, glnA, glnB, glnK, drat, amtB, полинуклеотида, кодирующего глутаминазу, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, nifQ и гена, ассоциированного с биосинтезом нитрогеназного фермента, где генетическая вариация (A) представляет собой нокаут-мутацию; (B) удаляет или устраняет регуляторную последовательность гена-мишени; (C) содержит вставку гетерологичной регуляторной последовательности или (D) является делецией домена.313. The method according to p. 300, where the composition contains: a purified population of bacteria that contains bacteria with at least one genetic variation introduced into a gene selected from the group consisting of nifA , nifL , ntrB , ntrC , a polynucleotide encoding glutamine synthetase, glnA , glnB , glnK , drat, amtB , polynucleotide encoding glutaminase, glnD , glnE , nifJ , nifH , nifD , nifK , nifY , nifE , nifN , nifU , nifS , nifV , nifW , nifZ , nifM , nifF , nifB , nifQ and a gene associated with the biosynthesis of nitrogenase enzyme, where the genetic variation (A) is a knockout mutation; (B) removes or eliminates the regulatory sequence of the target gene; (C) contains an insert of a heterologous regulatory sequence or (D) is a domain deletion.
314. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии по меньшей мере с одной мутацией, которая приводит к одному или нескольким из: увеличенной экспрессии или активности NifA или глутаминазы; сниженной экспрессии или активности nifL, NtrB, глутаминсинтетазы, GlnB, GlnK, DraT, или AmtB; сниженной аденилил-удаляющей активности GlnE или сниженной уридилат-удаляющей активности GlnD.314. The method according to p. 300, where the composition contains: a purified population of bacteria that contains bacteria with at least one mutation that leads to one or more of: increased expression or activity of NifA or glutaminase; decreased expression or activity of nifL, NtrB, glutamine synthetase, GlnB, GlnK, DraT, or AmtB; reduced GlnE adenylyl scavenging activity; or reduced GlnD uridylate scavenging activity.
315. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с мутантным геном nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL.315. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains bacteria with a mutated nifL gene that is altered to contain a heterologous promoter inserted into said nifL gene.
316. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с мутантным геном glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена.316. The method of claim 300 wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains bacteria with a mutant glnE gene that results in a truncated glnE protein lacking an adenylyl-removing (AR) domain.
317. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с мутантным геном amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB.317. The method according to p. 300, where the composition contains: a purified population of bacteria that contains bacteria with a mutant amtB gene, which leads to a lack of expression of the specified amtB gene.
318. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии по меньшей мере с одной из следующих генетических альтераций: мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL; мутантного гена glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена; мутантного гена amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB; и их сочетаний.318. The method according to p. 300, where the composition contains: a purified population of bacteria that contains bacteria with at least one of the following genetic alterations: a mutant nifL gene that is modified to contain a heterologous promoter inserted into the specified nifL gene; a mutant glnE gene that results in a truncated glnE protein lacking an adenylyl-removal (AR) domain; a mutant amtB gene that results in no expression of said amtB gene; and their combinations.
319. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с мутантным геном nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL и мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена.319. The method according to p. 300, where the composition contains: a purified population of bacteria that contains bacteria with a mutant nifL gene that is modified to contain a heterologous promoter built into the specified nifL gene and a mutant glnE gene that leads to the formation of a truncated glnE protein with the absence of an adenylyl-removing (AR) domain.
320. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с мутантным геном nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL и мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена и мутантный ген amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB.320. The method according to p. 300, where the composition contains: a purified population of bacteria that contains bacteria with a mutant nifL gene that is modified to contain a heterologous promoter built into the specified nifL gene and a mutant glnE gene that leads to the formation of a truncated glnE protein with the absence of an adenylyl-removal (AR) domain and a mutant amtB gene that results in the absence of said amtB gene expression.
321. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с модификацией nifL, которые экспрессируют белок NifL менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации nifL.321. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains nifL modified bacteria that express the NifL protein in less than about 50% of non- nifL modified bacteria.
322. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с модификацией nifL, которые экспрессируют белок NifL менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации nifL, где модификация представляет собой разрушение, нокаут или укорочение.322. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains nifL modified bacteria that express the NifL protein in less than about 50% of non- nifL modified bacteria, where the modification is disruption, knockout, or truncation.
323. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с модификацией nifL, которые экспрессируют белок NifL менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации nifL, и где бактерии дополнительно содержат промотор, функционально связанный с последовательностью nifA.323. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains nifL-modified bacteria that express the NifL protein in less than about 50% of non- nifL- modified bacteria, and wherein the bacteria further comprise a promoter operably linked to the nifA sequence .
324. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с модификацией nifL, которые экспрессируют белок NifL менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации nifL, и где у бактерий отсутствует гомолог nifL.324. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains nifL modified bacteria that express the NifL protein in less than about 50% of the non- nifL modified bacteria, and wherein the bacteria lacks the nifL homologue.
325. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с модификацией glnE, которые экспрессируют белок glnE менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации glnE.325. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains glnE modified bacteria that express glnE protein in less than about 50% of non- glnE modified bacteria.
326. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с модификацией glnE, которые экспрессируют белок glnE менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации glnE, где модификация представляет собой разрушение, нокаут или укорочение.326. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified population of bacteria that contains glnE modified bacteria that express the glnE protein of less than about 50% of non- glnE modified bacteria, where the modification is disruption, knockout, or shortening.
327. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с модификацией glnE, которые экспрессируют белок glnE менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации glnE, и где в последовательности белка glnE отсутствует аденилил-удаляющий (AR) домен.327. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains glnE modified bacteria that express the glnE protein in less than about 50% of the glnE modified bacteria, and where the glnE protein sequence lacks an adenylyl-deleting (AR ) domain.
328. Способ по п. 300, где композиция содержит: очищенную популяцию бактерий, которая содержит бактерии с модификацией glnE, которые экспрессируют белок glnE менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации glnE, и где в последовательности белка glnE отсутствует аденилил-удаляющая (AR) активность.328. The method of claim 300, wherein the composition comprises: a purified bacterial population that contains glnE modified bacteria that express the glnE protein in less than about 50% of non -glnE modified bacteria, and where the glnE protein sequence lacks an adenylyl-removing (AR ) activity.
329. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий, in planta, обеспечивает растению по меньшей мере 1% фиксированного азота.329. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population, in planta , provides the plant with at least 1% fixed nitrogen.
330. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий, in planta, обеспечивает растению по меньшей мере 5% фиксированного азота.330. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population, in planta , provides the plant with at least 5% fixed nitrogen.
331. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий, in planta, обеспечивает растению по меньшей мере 10% фиксированного азота.331. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population, in planta , provides the plant with at least 10% fixed nitrogen.
332. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий способна к фиксации атмосферного азота в нелимитирующих азот условиях.332. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population is capable of fixing atmospheric nitrogen under non-nitrogen-limiting conditions.
333. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.333. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population, in planta , excretes nitrogen-containing nitrogen fixation products.
334. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий, in planta, обеспечивает растению по меньшей мере 1% фиксированного азота, и где указанный фиксированный азот измеряют посредством разведения обогащенного удобрения атмосферным газообразным N2 в ткани растения.334. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population, in planta , provides the plant with at least 1% fixed nitrogen, and wherein said fixed nitrogen is measured by diluting the enriched fertilizer with atmospheric N 2 gas in plant tissue.
335. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий колонизирует корень указанного растения и присутствует в количестве по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения.335. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population colonizes the root of said plant and is present in an amount of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue.
336. Способ по п. 300, где растение содержит семена, стебель, цветок, плод, листья или ризому.336. The method according to item 300, where the plant contains seeds, stem, flower, fruit, leaves or rhizome.
337. Способ по п. 300, где композиция содержит: приемлемый в сельском хозяйстве носитель.337. The method of claim 300, wherein the composition contains: an agriculturally acceptable carrier.
338. Способ по п. 300, где композицию, содержащую очищенную популяцию бактерий, вносят в борозды, в которые высажены семена указанного растения.338. The method of claim 300, wherein the composition containing the purified population of bacteria is applied to the furrows in which seeds of said plant are planted.
339. Способ по п. 300, где композицию, содержащую очищенную популяцию бактерий, формулируют в виде жидкой композиции для внесения в борозду, содержащей бактерии в концентрации приблизительно от 1 × 107 до приблизительно 1 × 1010 КОЕ в миллилитре.339. The method of claim 300, wherein the composition containing the purified population of bacteria is formulated as a liquid furrow composition containing bacteria at a concentration of from about 1 x 10 7 to about 1 x 10 10 CFU per milliliter.
340. Способ по п. 300, где композицию, содержащую очищенную популяцию бактерий, наносят на семена указанного растения.340. The method according to p. 300, where the composition containing the purified population of bacteria is applied to the seeds of the specified plant.
341. Способ по п. 300, где композицию, содержащую очищенную популяцию бактерий, формулируют в виде покрытия для семян и наносят на семена указанного растения.341. The method of claim 300 wherein the composition comprising the purified bacterial population is formulated as a seed coat and applied to the seeds of said plant.
342. Способ по п. 300, где композицию, содержащую очищенную популяцию бактерий, формулируют в виде покрытия для семян и наносят на семена указанного растения в концентрации приблизительно от 1 × 105 до приблизительно 1 × 107 КОЕ на семя.342. The method of claim 300, wherein the composition comprising the purified bacterial population is formulated as a seed coat and applied to the seeds of said plant at a concentration of about 1 x 10 5 to about 1 x 10 7 CFU per seed.
343. Способ по п. 300, где растение является небобовым.343. The method of claim 300, wherein the plant is a non-legume.
344. Способ по п. 300, где растение представляет собой злаковую сельскохозяйственную культуру.344. The method of claim 300, wherein the plant is a cereal crop.
345. Способ по п. 300, где растение выбрано из группы, состоящей из: кукурузы, риса, пшеницы, ячменя, сорго, просо, овса, ржи и тритикале.345. The method of claim 300, wherein the plant is selected from the group consisting of: corn, rice, wheat, barley, sorghum, millet, oats, rye, and triticale.
346. Способ по п. 300, где растение представляет собой кукурузу.346. The method of claim 300 wherein the plant is corn.
347. Способ по п. 300, где растение представляет собой бобовое растение.347. The method of claim 300, wherein the plant is a legume.
348. Способ по п. 300, где растение представляет собой зерновую сельскохозяйственную культуру.348. The method of claim 300, wherein the plant is a cereal crop.
349. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии, выбранные из: Rahnella aquatilis, Klebsiella variicola, Achromobacter spiritinus, Achromobacter marplatensis, Microbacterium murale, Kluyvera intermedia, Kosakonia pseudosacchari, вида Enterobacter, Azospirillum lipoferum, Kosakonia sacchari и их сочетаний.349. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria selected from: Rahnella aquatilis , Klebsiella variicola , Achromobacter spiritinus , Achromobacter marplatensis , Microbacterium murale , Kluyvera intermedia , Kosakonia pseudosacchari , Enterobacter species, Azospirillum lipoferum , Kosak onia sacchari and their combinations .
350. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии рода Rahnella.350. The method of claim 300 wherein the purified bacterial population contains bacteria of the genus Rahnella .
351. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии вида Rahnella aquatilis.351. The method of claim 300 wherein the purified bacterial population contains bacteria of the species Rahnella aquatilis .
352. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии, депонированные как PTA-122293.352. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria deposited as PTA-122293.
353. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии, депонированные как NCMA 201701003.353. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria deposited as NCMA 201701003.
354. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии рода Kosakonia.354. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria of the genus Kosakonia .
355. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии вида Kosakonia sacchari.355. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria of the species Kosakonia sacchari .
356. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии, депонированные как PTA-122294.356. The method of claim 300 wherein the purified bacterial population contains bacteria deposited as PTA-122294.
357. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии, депонированные как NCMA 201701001.357. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria deposited as NCMA 201701001.
358. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии, депонированные как NCMA 201701002.358. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria deposited as NCMA 201701002.
359. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии, депонированные как NCMA 201708004.359. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria deposited as NCMA 201708004.
360. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии, депонированные как NCMA 201708003.360. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria deposited as NCMA 201708003.
361. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии, депонированные как NCMA 201708002.361. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria deposited as NCMA 201708002.
362. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии рода Klebsiella.362. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria of the genus Klebsiella .
363. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии вида Klebsiella variicola.363. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria of the species Klebsiella variicola .
364. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии, депонированные как NCMA 201708001.364. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria deposited as NCMA 201708001.
365. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии, депонированные как NCMA 201712001.365. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria deposited as NCMA 201712001.
366. Способ по п. 300, где очищенная популяция бактерий содержит бактерии, депонированные как NCMA 201712002.366. The method of claim 300, wherein the purified bacterial population contains bacteria deposited as NCMA 201712002.
367. Выделенные бактерии, содержащие:367. Isolated bacteria containing:
i. последовательность нуклеиновой кислоты 16S, которая по меньшей мере приблизительно на 97% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269, 277-283;i. a 16S nucleic acid sequence that is at least about 97% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269, 277-283;
ii. последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 90% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276, 284-295; и/илиii. a nucleic acid sequence that is at least about 90% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166 , 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276, 284-295; and/or
iii. последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 90% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 177-260, 296-303.iii. a nucleic acid sequence that is at least about 90% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 177-260, 296-303.
368. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: последовательность нуклеиновой кислоты 16S, которая по меньшей мере приблизительно на 97% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269 и 277-283.368. The isolated bacteria of claim 367, comprising: a 16S nucleic acid sequence that is at least about 97% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136 , 149, 157, 167, 261, 262, 269 and 277-283.
369. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: последовательность нуклеиновой кислоты 16S, которая по меньшей мере приблизительно на 99% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269 и 277-283.369. The isolated bacteria of claim 367, comprising: a 16S nucleic acid sequence that is at least about 99% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136 , 149, 157, 167, 261, 262, 269 and 277-283.
370. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: последовательность нуклеиновой кислоты 16S, выбранную из SEQ ID NO: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269 и 277-283.370. Isolated bacteria according to claim 367, containing: a 16S nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 85, 96, 111, 121, 122, 123, 124, 136, 149, 157, 167, 261, 262, 269 and 277-283.
371. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 90% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 и 284-295.371. The isolated bacteria of claim 367, comprising: a nucleic acid sequence that is at least about 90% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 and 284-295.
372. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 95% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 и 284-295.372. The isolated bacteria of claim 367, comprising: a nucleic acid sequence that is at least about 95% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 and 284-295.
373. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 99% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 и 284-295.373. The isolated bacteria of claim 367, comprising: a nucleic acid sequence that is at least about 99% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 and 284-295.
374. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из SEQ ID NO: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168-176, 263-268, 270-274, 275, 276 и 284-295.374. Isolated bacteria according to claim 367, containing: a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 86-95, 97-110, 112-120, 125-135, 137-148, 150-156, 158-166, 168 -176, 263-268, 270-274, 275, 276 and 284-295.
375. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 90% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 177-260 и 296-303.375. The isolated bacteria of claim 367, comprising: a nucleic acid sequence that is at least about 90% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 177-260 and 296-303.
376. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 95% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 177-260 и 296-303.376. The isolated bacteria of claim 367, comprising: a nucleic acid sequence that is at least about 95% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 177-260 and 296-303.
377. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: последовательность нуклеиновой кислоты, которая по меньшей мере приблизительно на 99% идентична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из SEQ ID NO: 177-260 и 296-303.377. The isolated bacteria of claim 367, comprising: a nucleic acid sequence that is at least about 99% identical to a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 177-260 and 296-303.
378. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: последовательность нуклеиновой кислоты, выбранную из SEQ ID NO: 177-260 и 296-303.378. Isolated bacteria according to claim 367, containing: a nucleic acid sequence selected from SEQ ID NOs: 177-260 and 296-303.
379. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в ген, выбранный из группы, состоящей из nifA, nifL, ntrB, ntrC, полинуклеотида, кодирующего глутаминсинтетазу, glnA, glnB, glnK, drat, amtB, полинуклеотида, кодирующего глутаминазу, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, nifQ и гена, ассоциированного с биосинтезом нитрогеназного фермента.379. Isolated bacteria according to claim 367, containing: at least one genetic variation introduced into a gene selected from the group consisting of nifA , nifL , ntrB , ntrC , a polynucleotide encoding glutamine synthetase, glnA , glnB , glnK , drat, amtB , a polynucleotide encoding glutaminase, glnD , glnE , nifJ , nifH , nifD , nifK , nifY , nifE , nifN , nifU , nifS , nifV , nifW , nifZ , nifM , nifF , nifB , nifQ and a gene associated with the biosynthesis of the nitrogenase enzyme.
380. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в ген, выбранный из группы, состоящей из nifA, nifL, ntrB, ntrC, полинуклеотида, кодирующего глутаминсинтетазу, glnA, glnB, glnK, drat, amtB, полинуклеотида, кодирующего глутаминазу, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, nifQ и гена, ассоциированного с биосинтезом нитрогеназного фермента, где генетическая вариация (A) представляет собой нокаут-мутацию; (B) удаляет или устраняет регуляторную последовательность гена-мишени; (C) содержит вставку гетерологичной регуляторной последовательности или (D) является делецией домена.380. Isolated bacteria according to claim 367, containing: at least one genetic variation introduced into a gene selected from the group consisting of nifA , nifL , ntrB , ntrC , a polynucleotide encoding glutamine synthetase, glnA , glnB , glnK , drat, amtB , a polynucleotide encoding glutaminase, glnD , glnE , nifJ , nifH , nifD , nifK , nifY , nifE , nifN , nifU , nifS , nifV , nifW , nifZ , nifM , nifF , nifB , nifQ and a gene associated with the biosynthesis of the nitrogenase enzyme, where the genetic variation (A) is a knockout mutation; (B) removes or eliminates the regulatory sequence of the target gene; (C) contains an insert of a heterologous regulatory sequence or (D) is a domain deletion.
381. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: по меньшей мере одну мутацию, которая приводит к одному или нескольким из: увеличенной экспрессии или активности NifA или глутаминазы; сниженной экспрессии или активности nifL, NtrB, глутаминсинтетазы, GlnB, GlnK, DraT, или AmtB; сниженной аденилил-удаляющей активности GlnE или сниженной уридилат-удаляющей активности GlnD.381. Selected bacteria according to item 367, containing: at least one mutation that leads to one or more of: increased expression or activity of NifA or glutaminase; decreased expression or activity of nifL, NtrB, glutamine synthetase, GlnB, GlnK, DraT, or AmtB; reduced GlnE adenylyl scavenging activity; or reduced GlnD uridylate scavenging activity.
382. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL.382. Isolated bacteria according to claim 367, containing: a mutant nifL gene that is modified to contain a heterologous promoter inserted into said nifL gene.
383. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена.383. Isolated bacteria according to item 367, containing: a mutant glnE gene, which leads to the formation of a truncated glnE protein with the absence of an adenylyl-removing (AR) domain.
384. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: мутантный ген amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB.384. Isolated bacteria according to item 367, containing: a mutant amtB gene, which leads to the absence of the expression of the specified amtB gene.
385. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: по меньшей мере одну из следующих генетических альтераций: мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL; мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена; мутантный ген amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB; и их сочетания.385. The isolated bacteria of claim 367, containing: at least one of the following genetic alterations: a mutant nifL gene that is modified to contain a heterologous promoter inserted into said nifL gene; a mutant glnE gene that results in a truncated glnE protein lacking an adenylyl-removal (AR) domain; a mutant amtB gene that results in no expression of said amtB gene; and their combinations.
386. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL и мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена.386. Isolated bacteria according to claim 367, containing: a mutant nifL gene, which is modified to contain a heterologous promoter inserted into the specified nifL gene and a mutant glnE gene, which leads to the formation of a truncated glnE protein with the absence of an adenylyl-removing (AR) domain .
387. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: мутантный ген nifL, который изменен так, чтобы содержать гетерологичный промотор, встроенный в указанный ген nifL и мутантный ген glnE, который приводит к образованию укороченного белка glnE с отсутствием аденилил-удаляющего (AR) домена и мутантный ген amtB, который приводит к отсутствию экспрессии указанного гена amtB.387. Isolated bacteria according to claim 367, containing: a mutant nifL gene that is modified to contain a heterologous promoter inserted into the specified nifL gene and a mutant glnE gene that leads to the formation of a truncated glnE protein with the absence of an adenylyl-removing (AR) domain and a mutant amtB gene that results in the lack of expression of said amtB gene.
388. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: модификацию nifL, которые экспрессируют белок NifL менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации nifL.388. The isolated bacteria of claim 367 containing: the nifL modification which express the NifL protein in less than about 50% of the bacteria with no nifL modification.
389. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: модификацию nifL, которые экспрессируют белок NifL менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации nifL, где модификация представляет собой разрушение, нокаут или укорочение.389. The isolated bacteria of claim 367, comprising: a nifL modification that expresses the NifL protein in less than about 50% of bacteria with no nifL modification, where the modification is disruption, knockout, or truncation.
390. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: модификацию nifL, которые экспрессируют белок NifL менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации nifL, и где бактерии дополнительно содержат промотор, функционально связанный с последовательностью nifA.390. The isolated bacteria of claim 367, comprising: a nifL modification that expresses the NifL protein in less than about 50% of the bacteria without the nifL modification, and wherein the bacteria additionally contain a promoter operably linked to the nifA sequence.
391. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: модификацию nifL, которые экспрессируют белок NifL менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации nifL, и где у бактерий отсутствует гомолог nifL.391. The isolated bacteria of claim 367 containing: a nifL modification that expresses the NifL protein in less than about 50% of the bacteria with no nifL modification, and where the bacteria lacks a nifL homologue.
392. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: модификацию glnE, которые экспрессируют белок glnE менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации glnE.392. The isolated bacteria of claim 367 containing: a glnE modification that express the glnE protein in less than about 50% of bacteria with no glnE modification.
393. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: модификацию glnE, которые экспрессируют белок glnE менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации glnE, где модификация представляет собой разрушение, нокаут или укорочение.393. The isolated bacteria of claim 367, comprising: a glnE modification that expresses the glnE protein in less than about 50% of bacteria with no glnE modification, where the modification is disruption, knockout, or truncation.
394. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: модификацию glnE, которые экспрессируют белок glnE менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации glnE, и где в последовательности белка glnE отсутствует аденилил-удаляющий (AR) домен.394. The isolated bacteria of claim 367 containing: a glnE modification that express the glnE protein in less than about 50% of bacteria without the glnE modification, and where the glnE protein sequence lacks an adenylyl-removal (AR) domain.
395. Выделенные бактерии по п. 367, содержащие: модификацию glnE, которые экспрессируют белок glnE менее чем приблизительно 50% бактерий с отсутствием модификации glnE, и где в последовательности белка glnE отсутствует аденилил-удаляющий (AR) активность.395. The isolated bacteria of claim 367 containing: a glnE modification that express the glnE protein in less than about 50% of the bacteria without the glnE modification, and where the glnE protein sequence lacks adenylyl-clearing (AR) activity.
396. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии, in planta, обеспечивают растению по меньшей мере 1% фиксированного азота, воздействующего на указанные бактерии.396. The isolated bacteria of claim 367, wherein the bacteria, in planta , provide the plant with at least 1% of the fixed nitrogen that affects said bacteria.
397. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии, in planta, обеспечивают растению по меньшей мере 5% фиксированного азота, воздействующего на указанные бактерии.397. The isolated bacteria of claim 367, wherein the bacteria, in planta , provide the plant with at least 5% of the fixed nitrogen that affects said bacteria.
398. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии, in planta, обеспечивают растению по меньшей мере 10% фиксированного азота, воздействующего на указанные бактерии.398. The isolated bacteria of claim 367, wherein the bacteria, in planta , provide the plant with at least 10% of the fixed nitrogen that affects said bacteria.
399. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии способны к фиксации атмосферного азота в нелимитирующих азот условиях.399. The isolated bacteria of claim 367, wherein the bacteria are capable of fixing atmospheric nitrogen under non-nitrogen-limiting conditions.
400. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.400. The isolated bacteria of claim 367, wherein the bacteria, in planta , excretes nitrogen-containing products of nitrogen fixation.
401. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии, in planta, обеспечивают растению по меньшей мере 1% фиксированного азота, воздействующего на указанные бактерии, и где указанный фиксированный азот измеряют посредством разведения обогащенного удобрения атмосферным газообразным N2 в ткани растения.401. The isolated bacteria of claim 367, wherein the bacteria, in planta , provide the plant with at least 1% of the fixed nitrogen affecting said bacteria, and wherein said fixed nitrogen is measured by diluting the enriched fertilizer with atmospheric N 2 gas in the plant tissue.
402. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии колонизируют корень растения, воздействующего на указанные бактерии в концентрации по меньшей мере приблизительно 1,0 × 104 бактериальных клеток на грамм сырой массы ткани корня растения.402. The isolated bacteria of claim 367, wherein the bacteria colonize the root of a plant that attacks said bacteria at a concentration of at least about 1.0 x 10 4 bacterial cells per gram wet weight of plant root tissue.
403. Выделенные бактерии по п. 367, формулируемые в сельскохозяйственную композицию.403. The isolated bacteria of claim 367 formulated into an agricultural composition.
404. Выделенные бактерии по п. 367, формулируемые во вносимую в борозду композицию.404. The isolated bacteria of claim 367 formulated into a furrow-applied composition.
405. Выделенные бактерии по п. 367, формулируемые в виде жидкой композиции для внесения в борозду, которая содержит бактерии в концентрации приблизительно от 1 × 107 до приблизительно 1 × 1010 КОЕ в миллилитре.405. The isolated bacteria of claim 367, formulated as a liquid furrow composition that contains bacteria at a concentration of about 1 x 10 7 to about 1 x 10 10 CFU per milliliter.
406. Выделенные бактерии по п. 367, формулируемые в виде пропитки для семян или покрытия для семян.406. The isolated bacteria of claim 367 formulated as a seed impregnation or seed coating.
407. Выделенные бактерии по п. 367, формулируемые в виде пропитки для семян или покрытия для семян, которые содержит бактерии в концентрации приблизительно от 1 × 105 до приблизительно 1 × 107 КОЕ на семя.407. The isolated bacteria of claim 367, formulated as a seed impregnation or seed coating, which contains the bacteria at a concentration of from about 1 x 10 5 to about 1 x 10 7 cfu per seed.
408. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии контактируют с растением и увеличивают фиксацию азота в растении.408. The isolated bacteria of claim 367, wherein the bacteria contact the plant and increase nitrogen fixation in the plant.
409. Выделенные бактерии по п. 367, наносимые на небобовое растение.409. The isolated bacteria of claim 367 applied to a non-legume plant.
410. Выделенные бактерии по п. 367, наносимые на злаковую сельскохозяйственную культуру.410. Isolated bacteria according to item 367 applied to a cereal crop.
411. Выделенные бактерии по п. 367, наносимые на растение, выбранное из группы, состоящей из: кукурузы, риса, пшеницы, ячменя, сорго, просо, овса, ржи и тритикале.411. The isolated bacteria of claim 367 applied to a plant selected from the group consisting of: corn, rice, wheat, barley, sorghum, millet, oats, rye and triticale.
412. Выделенные бактерии по п. 367, наносимые на кукурузу.412. Isolated bacteria according to item 367 applied to corn.
413. Выделенные бактерии по п. 367, наносимые на бобовое растение.413. Isolated bacteria according to item 367 applied to a leguminous plant.
414. Выделенные бактерии по п. 367, наносимые на зерновую сельскохозяйственную культуру.414. Isolated bacteria according to item 367 applied to a grain crop.
415. Выделенные бактерии по п. 367, выбранные из: Rahnella aquatilis, Klebsiella variicola, Achromobacter spiritinus, Achromobacter marplatensis, Microbacterium murale, Kluyvera intermedia, Kosakonia pseudosacchari, вида Enterobacter, Azospirillum lipoferum, Kosakonia sacchari и их сочетаний.415. Isolated bacteria according to item 367, selected from: Rahnella aquatilis , Klebsiella variicola , Achromobacter spiritinus , Achromobacter marplatensis , Microbacterium murale , Kluyvera intermedia , Kosakonia pseudosacchari , Enterobacter species, Azospirillum lipoferum , Kosakonia sacchari and their combinations.
416. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии принадлежат роду Rahnella.416. The isolated bacteria of claim 367, wherein the bacteria belong to the genus Rahnella .
417. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии принадлежат виду Rahnella aquatilis.417. Isolated bacteria according to item 367, where the bacteria belong to the species Rahnella aquatilis .
418. Выделенные бактерии по п. 367, депонированы как PTA-122293.418. Isolated bacteria according to item 367, deposited as PTA-122293.
419. Выделенные бактерии по п. 367, депонированы как NCMA 201701003.419. The isolated bacteria of claim 367, deposited as NCMA 201701003.
420. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии принадлежат роду Kosakonia.420. The isolated bacteria of claim 367, wherein the bacteria belong to the genus Kosakonia .
421. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии принадлежат виду Kosakonia sacchari.421. The isolated bacteria of claim 367, wherein the bacteria are of the species Kosakonia sacchari .
422. Выделенные бактерии по п. 367, депонированы как PTA-122294.422. Isolated bacteria according to item 367, deposited as PTA-122294.
423. Выделенные бактерии по п. 367, депонированы как NCMA 201701001.423. The isolated bacteria of item 367, deposited as NCMA 201701001.
424. Выделенные бактерии по п. 367, депонированы как NCMA 201701002.424. The isolated bacteria of claim 367, deposited as NCMA 201701002.
425. Выделенные бактерии по п. 367, депонированы как NCMA 201708004.425. The isolated bacteria of claim 367, deposited as NCMA 201708004.
426. Выделенные бактерии по п. 367, депонированы как NCMA 201708003.426. The isolated bacteria of claim 367, deposited as NCMA 201708003.
427. Выделенные бактерии по п. 367, депонированы как NCMA 201708002.427. The isolated bacteria of item 367, deposited as NCMA 201708002.
428. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии принадлежат роду Klebsiella.428. The isolated bacteria of claim 367, wherein the bacteria belong to the genus Klebsiella .
429. Выделенные бактерии по п. 367, где бактерии принадлежат виду Klebsiella variicola.429. The isolated bacteria of claim 367, wherein the bacteria belong to the species Klebsiella variicola .
430. Выделенные бактерии по п. 367, депонированы как NCMA 201708001.430. The isolated bacteria of item 367, deposited as NCMA 201708001.
431. Выделенные бактерии по п. 367, депонированы как NCMA 201712001.431. The isolated bacteria of item 367, deposited as NCMA 201712001.
432. Выделенные бактерии по п. 367, депонированы как NCMA 201712002.432. The isolated bacteria of item 367, deposited as NCMA 201712002.
433. Композиция, содержащая любую одну или несколько бактерий по пп. 415-432.433. Composition containing any one or more bacteria according to paragraphs. 415-432.
434. Способ детекции последовательности с неприродным соединением, включающий: амплификацию нуклеотидной последовательности, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична последовательности с SEQ ID NO: 372-405.434. A method for detecting a sequence with a non-natural compound, comprising: amplifying a nucleotide sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79% , 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96 %, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the sequence with SEQ ID NO: 372-405.
435. Способ по п. 434, где указанную амплификацию проводят посредством полимеразной цепной реакции.435. The method according to p. 434, where the specified amplification is carried out by polymerase chain reaction.
436. Способ по п. 434, где указанную амплификацию проводят посредством количественной полимеразной цепной реакции.436. The method according to p. 434, where the specified amplification is carried out by quantitative polymerase chain reaction.
437. Способ детекции последовательности с неприродным соединением, включающий: амплификацию нуклеотидной последовательности, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична последовательности фрагмента по меньшей мере с 10 последовательными парами оснований, содержащегося в SEQ ID NO: 372-405, где указанный фрагмент с последовательными парами оснований состоит из нуклеотидов на пересечении: расположенной выше последовательности, содержащей SEQ ID NO: 304-337, и расположенной ниже последовательности, содержащей SEQ ID NO: 338-371.437. A method for detecting a sequence with a non-natural compound, comprising: amplifying a nucleotide sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79% , 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96 %, 97%, 98%, 99% or 100% identical to the sequence of a fragment with at least 10 consecutive base pairs contained in SEQ ID NO: 372-405, where the specified fragment with consecutive base pairs consists of nucleotides at the intersection: located above sequence containing SEQ ID NO: 304-337, and below the sequence containing SEQ ID NO: 338-371.
438. Способ по п. 437, где указанную амплификацию проводят посредством полимеразной цепной реакции.438. The method according to p. 437, where the specified amplification is carried out by polymerase chain reaction.
439. Способ по п. 437, где указанную амплификацию проводят посредством количественной полимеразной цепной реакции.439. The method of claim 437, wherein said amplification is carried out by means of a quantitative polymerase chain reaction.
440. Последовательность с неприродным соединением, содержащая: нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична последовательности с SEQ ID NO: 372-405.440. A sequence with a non-natural compound containing: a nucleotide sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80% , 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97 %, 98%, 99% or 100% identical to the sequence with SEQ ID NO: 372-405.
441. Последовательность с неприродным соединением, содержащая: нуклеотидную последовательность, которая по меньшей мере приблизительно на 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентична последовательности фрагмента по меньшей мере с 10 последовательными парами оснований, содержащегося в SEQ ID NO: 372-405, где указанный фрагмент с последовательными парами оснований состоит из нуклеотидов на пересечении: расположенной выше последовательности, содержащей SEQ ID NO: 304-337, и расположенной ниже последовательности, содержащей SEQ ID NO: 338-371.441. A sequence with a non-natural compound containing: a nucleotide sequence that is at least about 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80% , 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97 %, 98%, 99%, or 100% identical to the sequence of a fragment with at least 10 consecutive base pairs contained in SEQ ID NO: 372-405, where the specified fragment with consecutive base pairs consists of nucleotides at the intersection: located above the sequence containing SEQ ID NO: 304-337, and the sequence below containing SEQ ID NO: 338-371.
442. Бактериальная композиция, содержащая:442. Bacterial composition containing:
по меньшей мере один реконструированный штамм бактерий который фиксирует атмосферный азот, по меньшей мере один реконструированный штамм бактерий, содержащий экзогенно добавленную ДНК, где указанная экзогенно добавленная ДНК, по меньшей мере на 80% идентична с соответствующим нативным штаммом бактерий.at least one reconstructed bacterial strain that fixes atmospheric nitrogen, at least one reconstructed bacterial strain containing exogenously added DNA, where said exogenously added DNA is at least 80% identical with the corresponding native bacterial strain.
443. Способ поддержания уровней азота в почве, включающий:443. A method of maintaining nitrogen levels in the soil, including:
высаживание в почву поля сельскохозяйственной культуры, инокулированной реконструированными бактериями, которые фиксируют атмосферный азот; иplanting in the soil of a crop field inoculated with reshaped bacteria that fix atmospheric nitrogen; And
сбор урожая указанной сельскохозяйственной культуры, где между посадкой и сбором урожая в указанную почву указанного поля вносят не более 90% дозы азота, необходимой для получения указанной сельскохозяйственной культуры.harvesting said crop, wherein between planting and harvesting, no more than 90% of the dose of nitrogen required to produce said crop is applied to said soil of said field.
444. Способ доставки пробиотической добавки в сельскохозяйственную культуру, включающий:444. A method for delivering a probiotic supplement to an agricultural crop, including:
покрытие семян сельскохозяйственной культуры покрытием для семян, пропиткой для семян или протравкой для семян, где указанные покрытие для семян, протравка для семян или пропитка для семян содержат живых представителей указанного пробиотика; иcoating the seeds of the crop with a seed coating, seed dressing, or seed dressing, wherein said seed coat, seed dressing, or seed dressing contains live representatives of said probiotic; And
внесение указанных семян сельскохозяйственной культуры в почву поля.the introduction of these seeds of agricultural crops into the soil of the field.
445. Способ увеличения у небобового растения количества получаемого из атмосферы азота, включающий:445. A method for increasing the amount of nitrogen obtained from the atmosphere in a non-legume plant, including:
воздействие на указанное небобовое растение реконструированными не являющимися межродовыми микроорганизмами, где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, или по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.exposing said non-legume plant to reshaped non-intergeneric microorganisms, wherein said reengineered non-intergeneric microorganisms carry at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network or at least one genetic variation introduced into the nitrogen assimilation genetic regulatory network.
446. Способ увеличения у растения кукурузы количества получаемого из атмосферы азота, включающий:446. A method for increasing the amount of nitrogen obtained from the atmosphere in a corn plant, including:
воздействие на указанное растение кукурузы реконструированными не являющимися межродовыми микроорганизмами, несущими реконструированные генетические вариации по меньшей мере в двух генах, выбранных из группы, состоящей из nifL, glnB, glnE и amtB.exposing said corn plant to reshaped non-intergeneric microorganisms carrying remodeled genetic variations in at least two genes selected from the group consisting of nifL , glnB , glnE and amtB .
447. Способ увеличения у растения кукурузы количества получаемого из атмосферы азота, включающий:447. A method for increasing the amount of nitrogen obtained from the atmosphere in a corn plant, including:
воздействие на указанное растение кукурузы реконструированными не являющимися межродовыми микроорганизмами, несущими по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота, где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы, in planta, продуцируют у указанного растения кукурузы по меньшей мере 5% фиксированного азота, как измеряют посредством разведения 15N в сельскохозяйственных культурах, выращиваемых в полях, обрабатываемых удобрением, содержащим 1,2% 15N.exposing said corn plant to reengineered non-intergeneric microorganisms carrying at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into the nitrogen assimilation genetic regulatory network, wherein said reengineered non-intergeneric microorganisms , in planta , produce at least 5% fixed nitrogen in said corn plant, as measured by 15 N dilution in crops grown in fields treated with a fertilizer containing 1.2% 15 N.
448. Способ по любому из предыдущих пп., где бактерия продуцирует фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час в присутствии экзогенного азота.448. The method of any one of the preceding claims, wherein the bacterium produces a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour in the presence of exogenous nitrogen.
449. Бактерия по любому из предыдущих пп., где бактерия продуцирует фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час в присутствии экзогенного азота.449. A bacterium according to any of the preceding claims, wherein the bacterium produces a fixed N in an amount of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour in the presence of exogenous nitrogen.
450. Популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где бактерия продуцирует фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час в присутствии экзогенного азота.450. A population of bacteria according to any one of the preceding claims, wherein the bacterium produces a fixed N of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour in the presence of exogenous nitrogen.
451. Выделенные бактерии по любому из предыдущих пп., где бактерия продуцирует фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час в присутствии экзогенного азота.451. The isolated bacteria of any one of the preceding claims, wherein the bacterium produces a fixed N of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour in the presence of exogenous nitrogen.
452. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где бактерия продуцирует фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час в присутствии экзогенного азота.452. A non-intergeneric population of bacteria according to any one of the preceding claims, wherein the bacterium produces a fixed N of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour in the presence of exogenous nitrogen.
453. Не являющаяся межродовой бактерия по любому из предыдущих пп., где бактерия продуцирует фиксированный N в количестве по меньшей мере приблизительно 1 × 10-17 ммоль N на бактериальную клетку в час в присутствии экзогенного азота.453. The non-intergeneric bacterium of any one of the preceding claims, wherein the bacterium produces a fixed N of at least about 1 x 10 -17 mmol N per bacterial cell per hour in the presence of exogenous nitrogen.
454. Способ по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 5% фиксированного азота или более.454. The method of any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 5% or more fixed nitrogen in the plant.
455. Способ по любому из предыдущих пп., где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 5% фиксированного азота или более.455. The method of any one of the preceding claims, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produces 5% or more of fixed nitrogen in the plant.
456. Бактерия по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 5% фиксированного азота или более.456. A bacterium according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 5% or more of fixed nitrogen in the plant.
457. Популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 5% фиксированного азота или более.457. A bacterial population according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produces 5% or more fixed nitrogen in the plant.
458. Выделенные бактерии по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 5% фиксированного азота или более.458. An isolated bacteria according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 5% or more of fixed nitrogen in the plant.
459. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 5% фиксированного азота или более.459. A non-intergeneric population of bacteria according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produces 5% or more fixed nitrogen in the plant.
460. Не являющаяся межродовой бактерия по любому из предыдущих пп., где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 5% фиксированного азота или более.460. The non-intergeneric bacterium of any one of the preceding claims, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produce 5% or more of fixed nitrogen in the plant.
461. Способ по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 10% фиксированного азота или более.461. The method of any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 10% or more fixed nitrogen in the plant.
462. Способ по любому из предыдущих пп., где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 10% фиксированного азота или более.462. The method of any one of the preceding claims, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produces 10% or more fixed nitrogen in the plant.
463. Бактерия по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 10% фиксированного азота или более.463. A bacterium according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 10% or more fixed nitrogen in the plant.
464. Популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 10% фиксированного азота или более.464. A population of bacteria according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 10% or more of fixed nitrogen in the plant.
465. Выделенные бактерии по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 10% фиксированного азота или более.465. Isolated bacteria according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 10% or more fixed nitrogen in the plant.
466. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 10% фиксированного азота или более.466. A non-intergeneric population of bacteria according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produces 10% or more fixed nitrogen in the plant.
467. Не являющаяся межродовой бактерия по любому из предыдущих пп., где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 10% фиксированного азота или более.467. The non-intergeneric bacterium of any one of the preceding claims, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produce 10% or more of fixed nitrogen in the plant.
468. Способ по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 15% фиксированного азота или более.468. The method of any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 15% or more fixed nitrogen in the plant.
469. Способ по любому из предыдущих пп., где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 15% фиксированного азота или более.469. The method of any one of the preceding claims, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produce 15% or more fixed nitrogen in the plant.
470. Бактерия по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 15% фиксированного азота или более.470. A bacterium according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 15% or more of fixed nitrogen in the plant.
471. Популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 15% фиксированного азота или более.471. A bacterial population according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 15% or more of fixed nitrogen in the plant.
472. Выделенные бактерии по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 15% фиксированного азота или более.472. An isolated bacteria according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 15% or more fixed nitrogen in the plant.
473. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 15% фиксированного азота или более.473. A non-intergeneric bacterial population according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produces 15% or more of fixed nitrogen in the plant.
474. Не являющаяся межродовой бактерия по любому из предыдущих пп., где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 15% фиксированного азота или более.474. The non-intergeneric bacterium of any one of the preceding claims, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produces 15% or more of fixed nitrogen in the plant.
475. Способ по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 20% фиксированного азота или более.475. The method of any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 20% or more of fixed nitrogen in the plant.
476. Способ по любому из предыдущих пп., где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 20% фиксированного азота или более.476. The method of any one of the preceding claims, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produces 20% or more fixed nitrogen in the plant.
477. Бактерия по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 20% фиксированного азота или более.477. A bacterium according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 20% or more fixed nitrogen in the plant.
478. Популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 20% фиксированного азота или более.478. A bacterial population according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produces 20% or more fixed nitrogen in the plant.
479. Выделенные бактерии по любому из предыдущих пп., где множество бактерий, in planta, продуцирует в растении 20% фиксированного азота или более.479. An isolated bacteria according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of bacteria, in planta , produce 20% or more of fixed nitrogen in the plant.
480. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 20% фиксированного азота или более.480. A non-intergeneric bacterial population according to any one of the preceding claims, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produces 20% or more of fixed nitrogen in the plant.
481. Не являющаяся межродовой бактерия по любому из предыдущих пп., где множество не являющихся межродовыми бактерий, in planta, продуцирует в растении 20% фиксированного азота или более.481. The non-intergeneric bacterium of any one of the preceding claims, wherein the plurality of non-intergeneric bacteria, in planta , produces 20% or more of fixed nitrogen in the plant.
482. Способ по любому из предыдущих пп., где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,0 × 10-7 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.482. The method according to any one of the preceding claims, wherein the product of (i) the average colonizing capacity per unit of plant root tissue and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.0 x 10 -7 mmol N per grams wet weight of plant root tissue per hour.
483. Бактерия по любому из предыдущих пп., где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,0 × 10-7 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.483. A bacterium according to any of the preceding claims, wherein the product of (i) the average colonizing capacity per unit of plant root tissue and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.0 x 10 -7 mmol N per grams wet weight of plant root tissue per hour.
484. Популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,0 × 10-7 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.484. A population of bacteria according to any one of the preceding claims, wherein the product of (i) the average colonizing capacity per unit root tissue of the plant and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.0 x 10 -7 mmol N per gram wet weight of plant root tissue per hour.
485. Выделенные бактерии по любому из предыдущих пп., где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,0 × 10-7 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.485. The isolated bacteria of any one of the preceding claims, wherein the product of (i) the average colonizing capacity per unit of plant root tissue and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.0 x 10 -7 mmol N per gram wet weight of plant root tissue per hour.
486. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,0 × 10-7 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.486. A non-intergeneric population of bacteria according to any of the preceding claims, wherein the product of (i) the average colonizing capacity per unit root tissue of the plant and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.0 × 10 - 7 mmol N per gram wet weight of plant root tissue per hour.
487. Не являющаяся межродовой бактерия по любому из предыдущих пп., где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,0 × 10-7 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.487. A non-intergeneric bacterium according to any one of the preceding claims, wherein the product of (i) the average colonizing capacity per unit root tissue of the plant and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.0 x 10 -7 mmol N per gram wet weight of plant root tissue per hour.
488. Способ по любому из предыдущих пп., где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,0 × 10-6 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.488. The method according to any one of the preceding claims, wherein the product of (i) the average colonizing capacity per unit of plant root tissue and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.0 x 10 -6 mmol N per grams wet weight of plant root tissue per hour.
489. Бактерия по любому из предыдущих пп., где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,0 × 10-6 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.489. A bacterium according to any of the preceding claims, wherein the product of (i) the average colonizing capacity per unit of plant root tissue and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.0 x 10 -6 mmol N per grams wet weight of plant root tissue per hour.
490. Популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,0 × 10-6 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.490. A population of bacteria according to any one of the preceding claims, wherein the product of (i) the average colonizing capacity per unit of plant root tissue and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.0 x 10 -6 mmol N per gram wet weight of plant root tissue per hour.
491. Выделенные бактерии по любому из предыдущих пп., где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,0 × 10-6 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.491. The isolated bacteria of any one of the preceding claims, wherein the product of (i) the average colonizing capacity per unit of plant root tissue and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.0 x 10 -6 mmol N per gram wet weight of plant root tissue per hour.
492. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,0 × 10-6 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.492. A non-intergeneric population of bacteria according to any one of the preceding claims, wherein the product of (i) the average colonizing capacity per unit of plant root tissue and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.0 × 10 - 6 mmol N per gram wet weight of plant root tissue per hour.
493. Не являющаяся межродовой бактерия по любому из предыдущих пп., где произведение (i) средней колонизирующей способности на единицу ткани корня растения и (ii) продуцируемого фиксированного N на бактериальную клетку в час составляет по меньшей мере приблизительно 2,0 × 10-6 ммоль N на грамм сырой массы ткани корня растения в час.493. A non-intergeneric bacterium according to any one of the preceding claims, wherein the product of (i) the average colonizing capacity per unit root tissue of the plant and (ii) the fixed N produced per bacterial cell per hour is at least about 2.0 × 10 -6 mmol N per gram wet weight of plant root tissue per hour.
494. Способ по любому из предыдущих пп., где растение реконструировано или выведено для эффективного использования азота.494. The method of any one of the preceding claims, wherein the plant is remodeled or bred to use nitrogen efficiently.
495. Бактериальная композиция по любому из предыдущих пп., где указанный по меньшей мере один реконструированный штамм бактерий содержит по меньшей мере одну вариацию в гене или межгенной области в пределах 10000 п.н. от гена, выбранного из группы, состоящей из: nifA, nifL, ntrB, ntrC, glnA, glnB, glnK, draT, amtB, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB и nifQ. 495. A bacterial composition according to any one of the preceding claims, wherein said at least one reconstructed bacterial strain contains at least one variation in a gene or intergenic region within 10,000 bp. from a gene selected from the group consisting of: nifA, nifL, ntrB, ntrC, glnA, glnB, glnK, draT, amtB, glnD, glnE, nifJ, nifH, nifD, nifK, nifY, nifE, nifN, nifU, nifS, nifV, nifW, nifZ, nifM, nifF, nifB, and nifQ.
496. Способ по любому из предыдущих пп., где указанная реконструированная бактерия содержит бактериальную композицию по любому из предшествующих пп.496. The method according to any of the previous paragraphs, where the specified reconstructed bacterium contains a bacterial composition according to any one of the preceding paragraphs.
497. Способ по любому из предыдущих пп., где указанная реконструированная бактерия состоит из бактериальной композиции по любому из предшествующих пп.497. The method according to any of the previous paragraphs, where the specified reconstructed bacterium consists of a bacterial composition according to any of the preceding paragraphs.
498. Способ по любому из предыдущих пп., где реконструированный штамм бактерий представляет собой реконструированный грамположительный штамм бактерий.498. The method of any one of the preceding claims, wherein the reshaped bacterial strain is a reshaped Gram-positive bacterial strain.
499. Способ по любому из предыдущих пп., где реконструированный грамположительный штамм бактерий обладает измененным уровнем экспрессии регулятора кластера Nif.499. The method according to any one of the preceding claims, wherein the reshaped Gram-positive bacterial strain has an altered expression level of the Nif cluster regulator.
500. Способ по любому из предыдущих пп., где реконструированный грамположительный штамм бактерий экспрессирует сниженное количество отрицательного регулятора кластера Nif.500. The method of any one of the preceding claims, wherein the reshaped Gram-positive bacterial strain expresses a reduced amount of a negative Nif cassette regulator.
501. Способ по любому из предыдущих пп., где реконструированный штамм бактерий экспрессирует сниженное количество GlnR.501. The method of any one of the preceding claims, wherein the reshaped bacterial strain expresses a reduced amount of GlnR .
502. Способ по любому из предыдущих пп., где геном реконструированного штамма бактерий кодирует полипептид по меньшей мере на 75% идентичный с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Дж. Зера.502. The method according to any of the preceding claims, wherein the genome of the reconstructed bacterial strain encodes a polypeptide that is at least 75% identical to the sequence from the NifH database of the laboratory of J. Zehr.
503. Способ по любому из предыдущих пп., где геном реконструированного штамма бактерий кодирует полипептид по меньшей мере на 85% идентичный с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Дж. Зера.503. The method according to any one of the preceding claims, wherein the genome of the reconstructed bacterial strain encodes a polypeptide that is at least 85% identical to the sequence from the NifH database of the laboratory of J. Zehr.
504. Способ по любому из предыдущих пп., где геном реконструированного штамма бактерий кодирует полипептид по меньшей мере на 75% идентичный с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Д. Бакли.504. The method according to any one of the preceding claims, wherein the genome of the reconstructed bacterial strain encodes a polypeptide that is at least 75% identical to a sequence from the NifH database of D. Buckley's laboratory.
505. Способ по любому из предыдущих пп., где геном реконструированного штамма бактерий кодирует полипептид по меньшей мере на 85% идентичный с последовательностью из базы данных NifH лаборатории Д. Бакли.505. The method according to any one of the preceding claims, wherein the genome of the reconstructed bacterial strain encodes a polypeptide that is at least 85% identical to the sequence from the NifH database of D. Buckley's laboratory.
506. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в указанную генетическую регуляторную сеть фиксации азота.506. The method of any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric microorganisms carry at least one genetic variation introduced into said nitrogen fixation genetic regulatory network.
507. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в указанную генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.507. The method of any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric microorganisms carry at least one genetic variation introduced into said nitrogen assimilation genetic regulatory network.
508. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в указанную генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в указанную генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.508. The method of any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric microorganisms carry at least one genetic variation introduced into said nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into said nitrogen assimilation genetic regulatory network .
509. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы вносят в борозды, в которые высаживают семена указанного небобового растения.509. The method of any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric microorganisms are applied to the furrows in which the seeds of said non-legume plant are planted.
510. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы наносят на семена указанного небобового растения.510. The method of any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric microorganisms are applied to the seeds of said non-legume plant.
511. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы колонизируют по меньшей мере корень указанного небобового растения так, что указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы присутствует в указанном небобовом растении в количестве по меньшей мере 105 колониеобразующих единиц на грамм сырой массы ткани.511. The method according to any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric microorganisms colonize at least the root of said non-legume plant such that said remodeled non-intergeneric micro-organisms are present in said non-legume plant in an amount of at least 10 5 colony forming units per gram wet mass of tissue.
512. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы способны к фиксации атмосферного азота в нелимитирующих азот условиях.512. The method of any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric microorganisms are capable of fixing atmospheric nitrogen under non-nitrogen-limiting conditions.
513. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.513. The method of any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric microorganisms, in planta , excrete nitrogen-containing nitrogen fixation products.
514. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы, in planta, продуцируют в указанном небобовом растении по меньшей мере 1% фиксированного азота.514. The method according to any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric microorganisms, in planta , produce at least 1% fixed nitrogen in said non-legume plant.
515. Способ по любому из предыдущих пп., где указанный фиксированный азот в указанном небобовом растении, продуцируемый указанными реконструированными не являющимися межродовыми микроорганизмы определяют посредством разведения 15N в сельскохозяйственных культурах, выращиваемых в полях, обрабатываемых удобрением, содержащим 1,2% 15N.515. The method according to any one of the preceding claims, wherein said fixed nitrogen in said non-legume plant produced by said reconstructed non-intergeneric microorganisms is determined by diluting 15 N in crops grown in fields treated with a fertilizer containing 1.2% 15 N.
516. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы, in planta, продуцируют в указанном небобовом растении 5% фиксированного азота или более.516. The method of any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric microorganisms, in planta , produce 5% or more of fixed nitrogen in said non-legume plant.
517. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные не являющиеся межродовыми микроорганизмы реконструированы с использованием по меньшей мере инженерии одного типа, выбранной из группы, состоящей из направленного мутагенеза, случайного мутагенеза и направленной эволюции.517. The method of any one of the preceding claims, wherein said non-intergeneric microorganisms are engineered using at least one type of engineering selected from the group consisting of site-directed mutagenesis, random mutagenesis, and site-directed evolution.
518. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы, in planta, экскретирует азот-содержащие продукты фиксации азота.518. The method of any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric microorganisms, in planta , excrete nitrogen-containing nitrogen fixation products.
519. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы вносят в борозды, в которые высажены семена указанного растения кукурузы.519. The method of any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric microorganisms are applied to furrows in which seeds of said corn plant are planted.
520. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы наносят на семена указанного растения кукурузы.520. The method of any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric microorganisms are applied to seeds of said corn plant.
521. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми микроорганизмы несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.521. The method according to any one of the preceding claims, wherein said reconstructed non-intergeneric microorganisms carry at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into the nitrogen assimilation genetic regulatory network.
522. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные не являющиеся межродовыми микроорганизмы несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.522. The method of any one of the preceding claims, wherein said non-intergeneric microorganisms carry at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into the nitrogen assimilation genetic regulatory network.
523. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные генно-инженерные не являющиеся межродовыми микроорганизмы несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.523. The method according to any one of the preceding claims, wherein said genetically engineered non-intergeneric microorganisms carry at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into the nitrogen assimilation genetic regulatory network .
524. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные реконструированные не являющиеся межродовыми бактерии несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.524. The method of any one of the preceding claims, wherein said reshaped non-intergeneric bacteria carry at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into the nitrogen assimilation genetic regulatory network.
525. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные не являющиеся межродовыми бактерии несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.525. The method of any one of the preceding claims, wherein said non-intergeneric bacteria carry at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into the nitrogen assimilation genetic regulatory network.
526. Способ по любому из предыдущих пп., где указанные генно-инженерные не являющиеся межродовыми бактерии несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.526. The method according to any one of the preceding claims, wherein said genetically engineered non-intergeneric bacteria carry at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into the nitrogen assimilation genetic regulatory network .
527. Бактерия по любому из предыдущих пп., где указанная бактерия несет по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.527. A bacterium according to any one of the preceding claims, wherein said bacterium carries at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into the nitrogen assimilation genetic regulatory network.
528. Популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где бактерии в указанной популяции бактерий несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.528. A bacterial population according to any one of the preceding claims, wherein the bacteria in said bacterial population carry at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into the nitrogen assimilation genetic regulatory network.
529. Выделенные бактерии по любому из предыдущих пп., где указанные выделенные бактерии несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.529. The isolated bacteria according to any one of the preceding claims, wherein said isolated bacteria carry at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into the nitrogen assimilation genetic regulatory network.
530. Не являющаяся межродовой популяция бактерий по любому из предыдущих пп., где не являющиеся межродовыми бактерии в указанной не являющейся межродовой популяции бактерий несут по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.530. A non-intergeneric bacterial population according to any of the preceding claims, wherein the non-intergeneric bacteria in said non-intergeneric bacterial population carry at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation, introduced into the genetic regulatory network of nitrogen assimilation.
531. Не являющаяся межродовой бактерия по любому из предыдущих пп., где указанная не являющаяся межродовой бактерия несет по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть фиксации азота, и по меньшей мере одну генетическую вариацию, внесенную в генетическую регуляторную сеть ассимиляции азота.531. A non-intergeneric bacterium according to any one of the preceding claims, wherein said non-intergeneric bacterium carries at least one genetic variation introduced into the nitrogen fixation genetic regulatory network and at least one genetic variation introduced into the nitrogen assimilation genetic regulatory network .
532. Композиция, содержащая любую одну или несколько бактерий по любому из предыдущих пп.532. Composition containing any one or more bacteria according to any of the previous paragraphs.
--->--->
СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙSEQUENCE LIST
<110> PIVOT BIO, INC.<110> PIVOT BIO, INC.
<120> СПОСОБЫ И КОМПОЗИЦИИ ДЛЯ УЛУЧШЕНИЯ ПРИЗНАКОВ РАСТЕНИЙ<120> METHODS AND COMPOSITIONS FOR IMPROVING PLANT CHARACTERISTICS
<130> 47736-707.601<130> 47736-707.601
<140><140>
<141><141>
<150> 62/577,147<150> 62/577.147
<151> 2017-10-25<151> 2017-10-25
<150> 62/566,199<150> 62/566.199
<151> 2017-09-29<151> 2017-09-29
<150> 62/467,032<150> 62/467.032
<151> 2017-03-03<151> 2017-03-03
<150> 62/447,889<150> 62/447.889
<151> 2017-01-18<151> 2017-01-18
<150> 62/445,557<150> 62/445.557
<151> 2017-01-12<151> 2017-01-12
<150> 62/445,570<150> 62/445.570
<151> 2017-01-12<151> 2017-01-12
<160> 424 <160> 424
<170> PatentIn version 3.5<170>PatentIn version 3.5
<210> 1<210> 1
<211> 9<211> 9
<212> Белок<212> Protein
<213> Неизвестно<213> Unknown
<220><220>
<223> Описание неизвестного: <223> Description of unknown:
последовательность пептидного мотива семейства "LAGLIDADG" sequence of the peptide motif of the "LAGLIDADG" family
<400> 1<400> 1
Leu Ala Gly Leu Ile Asp Ala Asp Gly Leu Ala Gly Leu Ile Asp Ala Asp Gly
1 5 15
<210> 2<210> 2
<211> 90<211> 90
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический олигонуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic oligonucleotide
<400> 2<400> 2
gttgatcaga ccgatgttcg gaccttccaa ggtttcgatc ggacatacgc gaccgtagtg 60gttgatcaga ccgatgttcg gaccttccaa ggtttcgatc ggacatacgc gaccgtagtg 60
ggtcgggtgt acgtctcgaa cttcaaagcc 90ggtcgggtgt acgtctcgaa cttcaaagcc 90
<210> 3<210> 3
<211> 257<211> 257
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 3<400> 3
gcctctcggg gcgctttttt ttattccggc actagccgct attaataaaa atgcaaatcg 60gcctctcggg gcgctttttt ttattccggc actagccgct attaataaaa atgcaaatcg 60
gaatttacta tttaacgcga gattatctaa gatgaatccg atggaagcgc gctgttttca 120gaatttacta tttaacgcga gattatctaa gatgaatccg atggaagcgc gctgttttca 120
ctcgcctttt taaagttacg tgatgatttc gatgcttctt tgagcgaacg atcaaaaata 180ctcgcctttt taaagttacg tgatgatttc gatgcttctt tgagcgaacg atcaaaaata 180
agcgtattca ggtaaaaaaa tattctcatc acaaaaaagt ttgtgtaata cttgtaacgc 240agcgtattca ggtaaaaaaa tattctcatc acaaaaaagt ttgtgtaata cttgtaacgc 240
tacatggaga ttaactc 257tacatggaga ttaactc 257
<210> 4<210> 4
<211> 260<211> 260
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 4<400> 4
ggttcacata aacataatta tcgccacggc gatagccgta cgctttttgc gtcacaacat 60ggttcacata aacataatta tcgccacggc gatagccgta cgctttttgc gtcacaacat 60
ccatggtgaa gccggctttt tcaagaacac gcgccacctc atcgggtctt aaatacatac 120ccatggtgaa gccggctttt tcaagaacac gcgccacctc atcgggtctt aaatacatac 120
tcattcctca ttatctttta ccgcacgtta accttacctt attcattaaa ggcaacgctt 180tcattcctca ttatctttta ccgcacgtta accttacctt attcattaaa ggcaacgctt 180
tcggaatatt ccataaaggg ctatttacag cataattcaa aatcttgtcc tacacttata 240tcggaatatt ccataaaggg ctatttacag cataattcaa aatcttgtcc tacacttata 240
gactcaatgg aattaaggga 260gactcaatgg aattaaggga 260
<210> 5<210> 5
<211> 260<211> 260
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 5<400> 5
gcgcggaaaa tcgacgcata gcgcattctc agaagccggc ctggtctcgg tggaaaagcg 60gcgcggaaaa tcgacgcata gcgcattctc agaagccggc ctggtctcgg tggaaaagcg 60
aatctttccc acgaccgccg ggcctttaac aaaagaatca atgacctgat taatgtcgct 120aatctttccc acgaccgccg ggcctttaac aaaagaatca atgacctgat taatgtcgct 120
atccattctc tctccgcgta atgcgatctt ttttcatcat acctaacaaa ctggcagagg 180atccattctc tctccgcgta atgcgatctt ttttcatcat acctaacaaa ctggcagagg 180
gaaaagccgc gcggtttttc tgcgaagtgt attgtaagat ttgtttgata tgttatatcg 240240
taacatatta ttgcaaacat 260taacatatta ttgcaaacat 260
<210> 6<210> 6
<211> 259<211> 259
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 6<400> 6
ctgacgaagc gagttacatc accggtgaaa ctctgcacgt caacggcgga atgtatatgg 60ctgacgaagc gagttacatc accggtgaaa ctctgcacgt caacggcgga atgtatatgg 60
tctgaccgag atttgcgcaa aacgctcagg aaccgcgcag tctgtgcggt tcactgtaat 120tctgaccgag atttgcgcaa aacgctcagg aaccgcgcag tctgtgcggt tcactgtaat 120
gttttgtaca aaatgatttg cgttatgagg gcaaacagcc gcaaaatagc gtaaaatcgt 180gttttgtaca aaatgatttg cgttatgagg gcaaacagcc gcaaaatagc gtaaaatcgt 180
ggtaagacct gccgggattt agttgcaaat ttttcaacat tttatacact acgaaaacca 240ggtaagacct gccgggattt agttgcaaat ttttcaacat tttatacact acgaaaacca 240
tcgcgaaagc gagttttga 259tcgcgaaagc gagttttga 259
<210> 7<210> 7
<211> 260<211> 260
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 7<400> 7
acgcctgggg cgccgaccag cgggaagagt gatttggcca acgaggcgcc gctctgaatg 60acgcctgggg cgccgaccag cgggaagagt gatttggcca acgaggcgcc gctctgaatg 60
gaaatcatgg cgattaaaat aaccagtatc ggcaaccatg ccggtacctt acgagacgag 120gaaatcatgg cgattaaaat aaccagtatc ggcaaccatg ccggtacctt acgagacgag 120
ccgggcatcc tttctcctgt caattttgtc aaatgcggta aaggttccag tgtaattgaa 180ccgggcatcc tttctcctgt caattttgtc aaatgcggta aaggttccag tgtaattgaa 180
ttaccccgcg ccggttgagc taatgttgaa aaaaagggtc ttaaaagcag tacaataggg 240ttaccccgcg ccggttgagc taatgttgaa aaaaagggtc ttaaaagcag tacaataggg 240
cgggtctgaa gataatttca 260cgggtctgaa gataatttca 260
<210> 8<210> 8
<211> 260<211> 260
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 8<400> 8
tctgattcct gatgaaaata aacgcgacct tgaagaaatt ccggataacg ttatcgccga 60tctgattcct gatgaaaata aacgcgacct tgaagaaatt ccggataacg ttatcgccga 60
tttagatatc catccggtga aacgaatcga ggaagttctg gcacttgcgc tacagaacga 120tttagatatc catccggtga aacgaatcga ggaagttctg gcacttgcgc tacagaacga 120
accgtttgga atggaagtcg tcacggcaaa atagtgattt cgcgcaaata gcgctaagaa 180accgtttgga atggaagtcg tcacggcaaa atagtgattt cgcgcaaata gcgctaagaa 180
aaatagggct ggtaagtaaa ttcgtacttg ccagcctttt tttgtgtagc taacttagat 240aaatagggct ggtaagtaaa ttcgtacttg ccagcctttt tttgtgtagc taacttagat 240
cgctggcagg ggggtcaatt 260cgctggcagg ggggtcaatt 260
<210> 9<210> 9
<211> 259<211> 259
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 9<400> 9
gtaagaaagt cggcctgcgt aaagcacgtc gtcgtcctca gttctccaaa cgttaattgt 60gtaagaaagt cggcctgcgt aaagcacgtc gtcgtcctca gttctccaaa cgttaattgt 60
tttctgctca cgcagaacaa tttgcgaaaa aacccgcttc ggcgggtttt tttatggata 120tttctgctca cgcagaacaa tttgcgaaaa aacccgcttc ggcgggtttt tttatggata 120
aatttgccat tttccctcta caaacgcccc attgttacca ctttttcagc atttccagaa 180aatttgccat ttttccctcta caaacgcccc attgttacca ctttttcagc atttccagaa 180
tcccctcacc acaacgtctt caaaatctgg taaactatca tccaattttc tgcccaaatg 240tcccctcacc acaacgtctt caaaatctgg taaactatca tccaattttc tgcccaaatg 240
caggtgattg ttcattttt 259caggtgattg ttcattttt 259
<210> 10<210> 10
<211> 260<211> 260
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 10<400> 10
gtcaaagccg tattatcgac cccttaggga caacgcttgc cggggcggga gagcggccgc 60gtcaaagccg tattatcgac cccttagggga caacgcttgc cggggcggga gagcggccgc 60
agttgatttt tgccgaactt tcagctgatt atattcagca ggtacgcgag cgcctgccgg 120agttgatttt tgccgaactt tcagctgatt atattcagca ggtacgcgag cgcctgccgg 120
tgttgcgcaa tcgccgcttt gcgccaccgc aattattatg acgttttttt aaacaaggct 180180
tgattcacct tgttacagat tgctattgtg tccgcgcgtc aaatagccgt taattgtatg 240tgattcacct tgttacagat tgctattgtg tccgcgcgtc aaatagccgt taattgtatg 240
cgtgtatgat ggcgtattcg 260cgtgtatgat ggcgtattcg 260
<210> 11<210> 11
<211> 260<211> 260
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 11<400> 11
gaggcggtgg ttgaccgtat cggtcccgag catcatgagc tttcggggcg agcgaaagat 60gaggcggtgg ttgaccgtat cggtcccgag catcatgagc tttcggggcg agcgaaagat 60
atgggatcgg cggcggtact gctggcgatt atcatcgcgc tgatcgcgtg gggaacgctg 120atgggatcgg cggcggtact gctggcgatt atcatcgcgc tgatcgcgtg gggaacgctg 120
ctgtgggcga actaccgcta agtcttgtcg tagctgctcg caaaacggaa agaaactcct 180ctgtgggcga actaccgcta agtcttgtcg tagctgctcg caaaacggaa agaaactcct 180
gatttttgtg tgaaatgtgg ttccaaaatc accgttagct gtatatactc acagcataac 240gatttttgtg tgaaatgtgg ttccaaaatc accgttagct gtatatactc acagcataac 240
tgtatataca cccagggggc 260tgtatataca ccggggggc 260
<210> 12<210> 12
<211> 260<211> 260
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 12<400> 12
taagaaaagc ggcctgtacg aagacggcgt acgtaaagac aggctggata acgacgatat 60taagaaaagc ggcctgtacg aagacggcgt acgtaaagac aggctggata acgacgatat 60
gatcgatcag ctggaagcgc gtattcgcgc taaagcatcg atgctggatg aggcgcgtcg 120gatcgatcag ctggaagcgc gtattcgcgc taaagcatcg atgctggatg aggcgcgtcg 120
tatcgatatc cagcaggttg aagcgaaata acgtgttggg aagcgatacg cttcccgtgt 180180
atgattgaac ctgcgggcgc gaggcgccgg ggttcatttt tgtatatata aagagaataa 240atgattgaac ctgcgggcgc gaggcgccgg ggttcatttt tgtatatata aagagaataa 240
acgtggcaaa gaacattcaa 260acgtggcaaa gaacattcaa 260
<210> 13<210> 13
<211> 237<211> 237
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 13<400> 13
atgaatcgta ctaaactggt actgggcgcg gtaatcctgg gttctactct gctggctggt 60atgaatcgta ctaaactggt actgggcgcg gtaatcctgg gttctactct gctggctggt 60
tgctccagca atgctaaaat cgatcagctg tcttctgacg ttcagactct gaacgctaaa 120tgctccagca atgctaaaat cgatcagctg tcttctgacg ttcagactct gaacgctaaa 120
gttgaccagc tgagcaacga cgtgaacgca atgcgttccg acgttcaggc tgctaaagat 180gttgaccagc tgagcaacga cgtgaacgca atgcgttccg acgttcaggc tgctaaagat 180
gacgcagctc gcgctaacca gcgtctggac aacgcagcta ctaaataccg taagtaa 237gacgcagctc gcgctaacca gcgtctggac aacgcagcta ctaaataccg taagtaa 237
<210> 14<210> 14
<211> 327<211> 327
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 14<400> 14
atggccaacc gagcaaaccg caacaacgta gaagagagcg ctgaagatat ccataacgat 60atggccaacc gagcaaaccg caacaacgta gaagagagcg ctgaagatat ccataacgat 60
gtcagccaat tagcggatac gctggaagag gtgctgaaat cgtggggcag cgacgccaaa 120gtcagccaat tagcggatac gctggaagag gtgctgaaat cgtggggcag cgacgccaaa 120
gacgaagcgg aggccgcgcg caaaaaagcg caggcgctgc tgaaagagac ccgcgcccgg 180180
cttaacggca acaaccgcgt ccagcaggcg gcgtgcgacg ccatgggctg cgctgacagc 240cttaacggca acaaccgcgt ccagcaggcg gcgtgcgacg ccatgggctg cgctgacagc 240
tacgtgcgcg acaaaccgtg gcaaagcgtc ggcgccgcag cagccgttgg ggtatttatt 300tacgtgcgcg acaaaccgtg gcaaagcgtc ggcgccgcag cagccgttgg ggtatttatt 300
ggcgtattac tgaatttacg tcgataa 327ggcgtattac tgaatttacg tcgataa 327
<210> 15<210> 15
<211> 648<211> 648
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 15<400> 15
atgaccaaaa agatttccgc cctagcgttt ggcattggca tggtaatggc gagcagccag 60atgaccaaaa agatttccgc cctagcgttt ggcattggca tggtaatggc gagcagccag 60
gcttttgccc acggtcacca tagtcatggc ccggcgctga ccgaagcgga acaaaaggcg 120gcttttgccc acggtcacca tagtcatggc ccggcgctga ccgaagcgga acaaaaggcg 120
agtgaaggca tttttgctga ccaggacgta aaggacaggg cgctgagcga ctgggagggg 180agtgaaggca tttttgctga ccaggacgta aaggacaggg cgctgagcga ctgggagggg 180
atctggcagt cggttaaccc ctatctgctg aacggggatt tagatccggt tctggagcag 240atctggcagt cggttaaccc ctatctgctg aacggggatt tagatccggt tctggagcag 240
aaggccaaaa aggccggtaa aagcgtggcg gaatatcggg aatattataa gaagggctac 300aaggccaaaa aggccggtaa aagcgtggcg gaatatcggg aatattataa gaagggctac 300
gctaccgatg tcgaccagat tggtatcgag gataacgtca tggagtttca cgtcgggaaa 360360
accgtcaacg cctgtaagta cagctattcc ggttacaaaa ttctgaccta cgcatccggt 420accgtcaacg cctgtaagta cagctattcc ggttacaaaa ttctgaccta cgcatccggt 420
aaaaaaggcg tgcgctacct gttcgaatgc cagcaggcgg attcaaaagc gccgaagttt 480aaaaaaggcg tgcgctacct gttcgaatgc cagcaggcgg attcaaaagc gccgaagttt 480
gttcagttta gcgatcacac catcgcgcca cgcaagtccc agcatttcca catctttatg 540gttcagttta gcgatcacac catcgcgcca cgcaagtccc agcatttcca catctttatg 540
ggcaatgagt cccaggaagc gctgctgaaa gagatggata actggccaac ctactatcct 600ggcaatgagt ccggaagc gctgctgaaa gagatggata actggccaac ctactatcct 600
tatgcgctgc ataaagagca gattgtcgac gaaatgctgc accactaa 648tatgcgctgc ataaagagca gattgtcgac gaaatgctgc accactaa 648
<210> 16<210> 16
<211> 237<211> 237
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 16<400> 16
atgagcacta tcgaagaacg cgttaagaaa attatcggcg aacagctggg cgttaagcag 60atgagcacta tcgaagaacg cgttaagaaa attatcggcg aacagctggg cgttaagcag 60
gaagaagtta ccaacaatgc ttccttcgtt gaagacctgg gcgctgattc tcttgacacc 120gaagaagtta ccaacaatgc ttccttcgtt gaagacctgg gcgctgattc tcttgacacc 120
gttgagctgg taatggctct ggaagaagag tttgatactg agattccgga cgaagaagct 180gttgagctgg taatggctct ggaagaagag tttgatactg agattccggga cgaagaagct 180
gagaaaatca ctactgttca ggctgccatt gattacatca acggccacca ggcgtaa 237gagaaaatca ctactgttca ggctgccatt gattacatca acggccacca ggcgtaa 237
<210> 17<210> 17
<211> 513<211> 513
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 17<400> 17
atgaataaaa ttgcacgttt ttcagcactg gccgttgttc tggctgcatc cgtaggtacc 60atgaataaaa ttgcacgttt ttcagcactg gccgttgttc tggctgcatc cgtaggtacc 60
actgctttcg ctgcgacttc taccgttacc ggtggctacg cgcagagcga catgcagggt 120actgctttcg ctgcgacttc taccgttacc ggtggctacg cgcagagcga catgcagggt 120
gaagcgaaca aagctggcgg tttcaacctg aagtaccgct acgagcaaga caacaacccg 180gaagcgaaca aagctggcgg tttcaacctg aagtaccgct acgagcaaga caacaacccg 180
ctgggtgtta tcggttcttt cacctacacc gaaaaagatc gttctgaatc tggcgtttac 240ctgggtgtta tcggttcttt cacctacacc gaaaaagatc gttctgaatc tggcgtttac 240
aaaaaaggcc agtactacgg catcaccgca ggtccggctt accgtctgaa cgactgggct 300aaaaaaggcc agtactacgg catcaccgca ggtccggctt accgtctgaa cgactgggct 300
agcatctacg gcgtagtggg tgttggttac ggtaaattcc aggacaacag ctacccgaac 360agcatctacg gcgtagtggg tgttggttac ggtaaattcc aggacaacag ctacccgaac 360
aaatctgata tgagcgacta cggtttctct tacggcgctg gtctgcagtt caacccgatc 420aaatctgata tgagcgacta cggtttctct tacggcgctg gtctgcagtt caacccgatc 420
gaaaacgttg ccctggactt ctcctacgag cagtctcgca ttcgtaacgt tgacgttggc 480gaaaacgttg ccctggactt ctcctacgag cagtctcgca ttcgtaacgt tgacgttggc 480
acctggattg ctggcgtagg ttaccgcttc taa 513acctggattg ctggcgtaggg ttaccgcttc taa 513
<210> 18<210> 18
<211> 273<211> 273
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 18<400> 18
gtgaataaat ctcaactgat tgacaaaatt gctgccggtg cggacatttc taaagccgca 60gtgaataaat ctcaactgat tgacaaaatt gctgccggtg cggacatttc taaagccgca 60
gctggacgtg cgttagatgc tttaatcgct tctgttactg aatctctgca ggctggagat 120gctggacgtg cgttagatgc tttaatcgct tctgttactg aatctctgca ggctggagat 120
gacgttgcgc tggtagggtt tggtactttt gctgttaaag agcgcgctgc ccgtactggt 180gacgttgcgc tggtagggtt tggtactttt gctgttaaag agcgcgctgc ccgtactggt 180
cgcaatccgc aaacaggcaa agaaatcacc attgctgctg ctaaagttcc gggtttccgc 240cgcaatccgc aaacaggcaa agaaatcacc attgctgctg ctaaagttcc gggtttccgc 240
gcaggtaaag cgctgaaaga cgcggtaaac tga 273gcaggtaaag cgctgaaaga cgcggtaaac tga 273
<210> 19<210> 19
<211> 639<211> 639
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 19<400> 19
atggctgtcg ctgccaacaa acgttcggta atgacgctgt tttctggtcc tactgacatc 60atggctgtcg ctgccaacaa acgttcggta atgacgctgt tttctggtcc tactgacatc 60
tatagccatc aggtccgcat cgtgctggcc gaaaaaggtg ttagttttga gatagagcac 120tatagccatc aggtccgcat cgtgctggcc gaaaaaggtg ttagttttga gatagagcac 120
gtggagaagg acaacccgcc tcaggatctg attgacctca acccgaatca aagcgtaccg 180gtggagaagg acaacccgcc tcaggatctg attgacctca acccgaatca aagcgtaccg 180
acgcttgtgg atcgtgagct cactctgtgg gaatctcgca tcattatgga atatctggat 240acgcttgtgg atcgtgagct cactctgtgg gaatctcgca tcattatgga atatctggat 240
gagcgtttcc cgcatccgcc gctcatgccg gtttacccgg tggcgcgtgg ggaaagccgt 300gagcgtttcc cgcatccgcc gctcatgccg gtttacccgg tggcgcgtgg ggaaagccgt 300
ctgtatatgc agcgtatcga aaaggactgg tattcgttga tgaataccat tcagaccggt 360ctgtatatgc agcgtatcga aaaggactgg tattcgttga tgaataccat tcagaccggt 360
accgctgcgc aggctgatac tgcgcgtaag cagctgcgtg aagaactaca ggcgattgcg 420accgctgcgc aggctgatac tgcgcgtaag cagctgcgtg aagaactaca ggcgattgcg 420
ccagttttca cccagaagcc ctacttcctg agcgatgagt tcagcctggt ggactgctac 480ccagttttca cccagaagcc ctacttcctg agcgatgagt tcagcctggt ggactgctac 480
ctggcaccac tgctgtggcg tctgccggtt ctcggcgtag agctggtcgg cgctggcgcg 540ctggcaccac tgctgtggcg tctgccggtt ctcggcgtag agctggtcgg cgctggcgcg 540
aaagagctta aaggctatat gactcgcgta tttgagcgcg actctttcct cgcttcttta 600aaagagctta aaggctatat gactcgcgta tttgagcgcg actctttcct cgcttcttta 600
actgaagccg aacgtgaaat gcgtctcggt cggggctaa 639actgaagccg aacgtgaaat gcgtctcggt cggggctaa 639
<210> 20<210> 20
<211> 204<211> 204
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 20<400> 20
atgggtgaga ttagtattac caaactgctg gtagtcgcag cgctgattat cctggtgttt 60atgggtgaga ttagtattac caaactgctg gtagtcgcag cgctgattat cctggtgttt 60
ggtaccaaaa agttacgcac gctgggtgga gacctgggct cggctatcaa aggctttaaa 120ggtaccaaaa agttacgcac gctgggtgga gacctgggct cggctatcaa aggctttaaa 120
aaagccatga gcgatgacga tgacagtgcg aagaagacca gtgctgaaga agcgccggca 180aaagccatga gcgatgacga tgacagtgcg aagaagacca gtgctgaaga agcgccggca 180
cagaagctct ctcataaaga gtaa 204cagaagctct ctcataaaga gtaa 204
<210> 21<210> 21
<211> 609<211> 609
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 21<400> 21
atgaaagcgt taacgaccag gcagcaagag gtgtttgatc tcattcggga tcatatcagc 60atgaaagcgt taacgaccag gcagcaagag gtgtttgatc tcattcggga tcatatcagc 60
cagacgggca tgccgccgac gcgtgcggag attgctcagc gcttggggtt tcgctcccca 120cagacgggca tgccgccgac gcgtgcggag attgctcagc gcttggggtt tcgctcccca 120
aacgcggcgg aagagcatct gaaagcgctg gcgcgtaaag gcgcaatcga gatcgtttcc 180aacgcggcgg aagagcatct gaaagcgctg gcgcgtaaag gcgcaatcga gatcgtttcc 180
ggcgcctccc gcggtattcg tctgctgacg gaagaagaaa ccggtctgcc gcttattggc 240ggcgcctccc gcggtattcg tctgctgacg gaagaagaaa ccggtctgcc gcttattggc 240
cgcgtcgcgg caggtgagcc gctgctagcg cagcagcaca ttgaaggcca ctaccaggtg 300cgcgtcgcgg caggtgagcc gctgctagcg cagcagcaca ttgaaggcca ctaccaggtg 300
gacccggcca tgtttaagcc gaacgccgat tttctgctgc gtgttagcgg tatgtcgatg 360gacccggcca tgtttaagcc gaacgccgat tttctgctgc gtgttagcgg tatgtcgatg 360
aaggatatcg gtattctcga tggcgacctg ctggctgtcc ataaaacgca ggatgtgcgc 420aaggatatcg gtattctcga tggcgacctg ctggctgtcc ataaaacgca ggatgtgcgc 420
aatggtcagg tggttgtggc gcgtatcgac gaagaagtga ccgtgaagcg tctgaaaaaa 480aatggtcagg tggttgtggc gcgtatcgac gaagaagtga ccgtgaagcg tctgaaaaaa 480
cagggtaacg tcgtggaatt gctgccggaa aacagcgaat tctcgccgat cgtggtcgac 540cagggtaacg tcgtggaatt gctgccggaa aacagcgaat tctcgccgat cgtggtcgac 540
cttcgcgaac aaagctttac tattgaaggc ctggccgtcg gcgttatccg caacggcaac 600cttcgcgaac aaagctttac tattgaaggc ctggccgtcg gcgttatccg caacggcaac 600
tggcaataa 609tggcaataa 609
<210> 22<210> 22
<211> 1245<211> 1245
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 22<400> 22
atgaacgatt atctgccggg cgaaaccgct ctctggcagc gcattgaagg ctcactgaag 60atgaacgatt atctgccggg cgaaaccgct ctctggcagc gcattgaagg ctcactgaag 60
caggtgcttg gtagctacgg ttacagcgaa atccgtttgc cgattgtaga gcagaccccg 120caggtgcttg gtagctacgg ttacagcgaa atccgtttgc cgattgtaga gcagaccccg 120
ttattcaaac gcgctatcgg cgaagtgacc gacgtggttg aaaaagagat gtacaccttt 180ttattcaaac gcgctatcgg cgaagtgacc gacgtggttg aaaaagagat gtacaccttt 180
gaggaccgta acggcgatag cctgactcta cgtccggaag gcacggctgg ctgcgtacgc 240gaggaccgta acggcgatag cctgactcta cgtccggaag gcacggctgg ctgcgtacgc 240
gccggtatcg aacatggtct cctgtacaat caagaacagc gcctgtggta cattgggccg 300gccggtatcg aacatggtct cctgtacaat caagaacagc gcctgtggta cattgggccg 300
atgttccgcc acgaacgtcc gcaaaaaggc cgctaccgtc agttccacca gattggcgcc 360atgttccgcc acgaacgtcc gcaaaaaggc cgctaccgtc agttccacca gattggcgcc 360
gaagcgtttg gcctgcaggg gccggatatc gatgccgagc tgattatgct gaccgcccgc 420gaagcgtttg gcctgcaggg gccggatatc gatgccgagc tgattatgct gaccgcccgc 420
tggtggcgcg agctgggcat ctccggccac gttgcgctgg agctgaactc tatcggttcg 480tggtggcgcg agctgggcat ctccggccac gttgcgctgg agctgaactc tatcggttcg 480
ctggaggctc gcgctaacta tcgcgacgcg ctggtggcct atcttgagca gtttaaagat 540ctggaggctc gcgctaacta tcgcgacgcg ctggtggcct atcttgagca gtttaaagat 540
aagctggacg aagactgcaa acgccgcatg tacaccaacc cgctgcgcgt gctggattct 600aagctggacg aagactgcaa acgccgcatg tacaccaacc cgctgcgcgt gctggattct 600
aaaaacccgg acgtccaggc gctgctgaac gacgccccga cgctgggcga ctatcttgat 660aaaaacccgg acgtccaggc gctgctgaac gacgccccga cgctgggcga ctatcttgat 660
gaagagtcca aaacgcattt tgccgggctg tgcgcgctgc tggatgatgc cggtattcgc 720gaagagtcca aaacgcattt tgccgggctg tgcgcgctgc tggatgatgc cggtattcgc 720
tataccgtga atcagcgtct ggtacgcggt ctcgactact acaaccgcac cgtgtttgag 780tataccgtga atcagcgtct ggtacgcggt ctcgactact acaaccgcac cgtgtttgag 780
tgggtcacca ccagcctcgg ttcccagggc accgtctgcg ccggaggccg ttacgatggt 840tgggtcacca ccagcctcgg ttcccagggc accgtctgcg ccgggaggccg ttacgatggt 840
ctggttgagc agcttggcgg tcgcgctacc cctggcgtcg gctttgcgat ggggctggaa 900ctggttgagc agcttggcgg tcgcgctacc cctggcgtcg gctttgcgat ggggctggaa 900
cgtcttgttt tactggttca ggcagtgaat ccggaattta aagccgatcc tgttgtcgat 960cgtcttgttt tactggttca ggcagtgaat cgggaattta aagccgatcc tgttgtcgat 960
atatacctgg tagcctccgg aactgacacc cagtccgcag caatgcgtct ggctgaacag 1020atatacctgg tagcctccgg aactgacacc cagtccgcag caatgcgtct ggctgaacag 1020
gtacgcgatg cgttacccgg cgttaagctg atgaccaacc atggcggcgg caactttaag 1080gtacgcgatg cgttacccgg cgttaagctg atgaccaacc atggcggcgg caactttaag 1080
aagcagtttg cgcgcgctga taaatggggc gctcgcgttg cgctggtgct gggcgaatca 1140aagcagtttg cgcgcgctga taaatggggc gctcgcgttg cgctggtgct gggcgaatca 1140
gaaatcgccg acggaaacgt ggtagtgaaa gatttacgct caggtgagca aactaccgta 1200gaaatcgccg acggaaacgt ggtagtgaaa gatttacgct caggtgagca aactaccgta 1200
acgcaggata gcgttgctgc gcatttgcgc acacttctgg gttaa 1245acgcaggata gcgttgctgc gcatttgcgc acacttctgg gttaa 1245
<210> 23<210> 23
<211> 1413<211> 1413
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 23<400> 23
atgaaaaaga ccaaaattgt ttgcaccatc ggtccgaaaa ccgaatccga agagatgttg 60atgaaaaaga ccaaaattgt ttgcaccatc ggtccgaaaa ccgaatccga agagatgttg 60
accaaaatgc tggacgcggg catgaacgtt atgcgtctga acttctctca cggtgactat 120accaaaatgc tggacgcggg catgaacgtt atgcgtctga acttctctca cggtgactat 120
gcggaacacg gtcagcgcat ccagaatctg cgcaatgtga tgagtaaaac cggtaagaaa 180gcggaacacg gtcagcgcat ccagaatctg cgcaatgtga tgagtaaaac cggtaagaaa 180
gcggcaatcc tgctggacac caaaggtccg gaaatccgta ccattaagct ggaaggcggc 240gcggcaatcc tgctggacac caaaggtccg gaaatccgta ccattaagct ggaaggcggc 240
aacgacgtct ccctgaaagc gggccagacc ttcaccttca ccaccgataa atccgttgtc 300aacgacgtct ccctgaaagc gggccagacc ttcaccttca ccaccgataa atccgttgtc 300
ggtaataacg aaatcgttgc ggtgacctat gaaggcttca ccagcgacct gagcgttggc 360ggtaataacg aaatcgttgc ggtgacctat gaaggcttca ccagcgacct gagcgttggc 360
aacacggtac tggttgacga tggtctgatc ggtatggaag tgaccgctat cgaaggcaac 420aacacggtac tggttgacga tggtctgatc ggtatggaag tgaccgctat cgaaggcaac 420
aaagttgttt gtaaagtgct gaacaacggc gacctcggcg agaacaaagg cgttaacctg 480aaagttgttt gtaaagtgct gaacaacggc gacctcggcg agaacaaagg cgttaacctg 480
ccgggcgtat ctatcgcgct gccggcgctg gctgaaaaag acaaacagga tctgatcttc 540ccgggcgtat ctatcgcgct gccggcgctg gctgaaaaag acaaacagga tctgatcttc 540
ggttgcgaac agggcgttga ctttgttgcg gcatccttta tccgtaagcg ttctgacgtt 600ggttgcgaac agggcgttga ctttgttgcg gcatccttta tccgtaagcg ttctgacgtt 600
gttgaaatcc gtgagcacct gaaagcccac ggcggcgaga agatccagat catctccaaa 660gttgaaatcc gtgagcacct gaaagcccac ggcggcgaga agatccagat catctccaaa 660
atcgaaaacc aggaaggcct gaacaacttc gacgaaatcc tcgaagcctc tgacggcatc 720atcgaaaacc aggaaggcct gaacaacttc gacgaaatcc tcgaagcctc tgacggcatc 720
atggtagccc gtggcgacct gggcgttgaa atcccggttg aagaagttat cttcgcgcag 780atggtagccc gtggcgacct gggcgttgaa atcccggttg aagaagttat cttcgcgcag 780
aagatgatga tcgagaaatg tatccgcgcg cgtaaagtcg ttatcaccgc gacccagatg 840840
ctggattcca tgatcaaaaa cccgcgtccg acccgtgcgg aagcaggcga cgtggccaac 900ctggattcca tgatcaaaaa cccgcgtccg acccgtgcgg aagcaggcga cgtggccaac 900
gccatcctcg acggcaccga cgcagttatg ctgtccggcg aatccgcgaa aggtaaatac 960gccatcctcg acggcaccga cgcagttatg ctgtccggcg aatccgcgaa aggtaaatac 960
ccgctggaag cggtcaccat catggcgacc atctgcgaac gtaccgaccg cgtcatgacc 1020ccgctggaag cggtcaccat catggcgacc atctgcgaac gtaccgaccg cgtcatgacc 1020
agccgtcttg agtacaacaa cgacaaccgt aagctgcgca tcaccgaagc ggtgtgccgc 1080agccgtcttg agtacaacaa cgacaaccgt aagctgcgca tcaccgaagc ggtgtgccgc 1080
ggtgcggtag aaacggctga aaaactggaa gcgccgctga tcgttgtggc aacccagggc 1140ggtgcggtag aaacggctga aaaactggaa gcgccgctga tcgttgtggc aacccagggc 1140
ggtaaatccg cgcgcgccgt acgtaaatac ttcccggatg ccactatcct ggcgctgacc 1200ggtaaatccg cgcgcgccgt acgtaaatac ttcccggatg ccactatcct ggcgctgacc 1200
accaacgaaa ccaccgcgcg tcagctggtg ctgagcaaag gcgttgtggc acagctggtt 1260accaacgaaa ccaccgcgcg tcagctggtg ctgagcaaag gcgttgtggc acagctggtt 1260
gaagatatct cctctaccga tgcgttctac atccagggta aagaactggc gctgcagagc 1320gaagatatct cctctaccga tgcgttctac atccagggta aagaactggc gctgcagagc 1320
ggtctggcgc gtaaaggcga cgtggttgtt atggtttccg gcgcgttagt cccgagcgga 1380ggtctggcgc gtaaaggcga cgtggttgtt atggtttccg gcgcgttagt cccgagcgga 1380
accaccaata ccgcttccgt gcacgtgctg taa 1413accaccaata ccgcttccgt gcacgtgctg taa 1413
<210> 24<210> 24
<211> 351<211> 351
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 24<400> 24
atgtatttaa gacccgatga ggtggcgcgt gttcttgaaa aagccggctt caccatggat 60atgtatttaa gacccgatga ggtggcgcgt gttcttgaaa aagccggctt caccatggat 60
gttgtgacgc aaaaagcgta cggctatcgc cgtggcgata attatgttta tgtgaaccgt 120gttgtgacgc aaaaagcgta cggctatcgc cgtggcgata attatgttta tgtgaaccgt 120
gaagctcgta tggggcgtac cgcgttaatt attcatccgg ctttaaaaga gcgcagcaca 180gaagctcgta tggggcgtac cgcgttaatt attcatccgg ctttaaaaga gcgcagcaca 180
acgcttgcgg agcccgcgtc ggatatcaaa acctgcgatc attatgagca gttcccgctc 240acgcttgcgg agcccgcgtc ggatatcaaa acctgcgatc attatgagca gttcccgctc 240
tatttagcgg gggatgctca acagcattat ggtattccac acgggttcag ttcgcgaatg 300tatttagcgg gggatgctca acagcattat ggtattccac acgggttcag ttcgcgaatg 300
gcgcttgagc gttttctgag tggcctgttt ggcgaaacgc agtatagctg a 351gcgcttgagc gttttctgag tggcctgttt ggcgaaacgc agtatagctg a 351
<210> 25<210> 25
<211> 864<211> 864
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 25<400> 25
atggatagcg acattaatca ggtcattgat tcttttgtta aaggcccggc ggtcgtggga 60atggatagcg acattaatca ggtcattgat tcttttgtta aaggcccggc ggtcgtggga 60
aagattcgct tttccaccga gaccaggccg gcttctgaga atgcgctatg cgtcgatttt 120aagattcgct tttccaccga gaccaggccg gcttctgaga atgcgctatg cgtcgatttt 120
ccgcgcctcg aaatcatgct tgcgggtcag cttcacgatc cggcgattaa agccgatcgc 180ccgcgcctcg aaatcatgct tgcgggtcag cttcacgatc cggcgattaa agccgatcgc 180
gcccagctca tgccgcacga tgtgctgtat attcccgctg gcggatggaa tgacccgcaa 240gcccagctca tgccgcacga tgtgctgtat attcccgctg gcggatggaa tgacccgcaa 240
tggctggcgc cctccactct gctcactatc ttatttggta aacagcagct ggaattcgtc 300tggctggcgc cctccactct gctcactatc ttatttggta aacagcagct ggaattcgtc 300
ctgcgccact gggacggcag cgcgcttaac gtgctggata aacagcaggt tccgcgccgc 360ctgcgccact gggacggcag cgcgcttaac gtgctggata aacagcaggt tccgcgccgc 360
ggtccccggg tcggctcttt tctgctgcag gcgctgaatg aaatgcagat gcagccgcgg 420ggtccccggg tcggctcttt tctgctgcag gcgctgaatg aaatgcagat gcagccgcgg 420
gagcagcaca cggcccgctt tattgtcacc agcctgctca gccactgtgc cgatctgctg 480gagcagcaca cggcccgctt tattgtcacc agcctgctca gccactgtgc cgatctgctg 480
ggcagccagg tacaaacctc atcgcgcagc caggcgcttt ttgaagcgat tcgtaagcat 540ggcagccagg tacaaacctc atcgcgcagc caggcgcttt ttgaagcgat tcgtaagcat 540
attgacgccc actttgccga cccgttaacc cgggagtcgg tggcgcaggc gttttacctc 600attgacgccc actttgccga cccgttaacc cgggagtcgg tggcgcaggc gttttacctc 600
tcgccaaact atctatccca cctgttccag aaatgcgggc caatgggctt taacgagtat 660660
ctgaatcaca tccgcctgga gcaggccaga atgctgttaa aaggccacga tatgaaagtg 720ctgaatcaca tccgcctgga gcaggccaga atgctgttaa aaggccacga tatgaaagtg 720
aaagatatcg cccacgcctg cggtttcgcc gacagcaact acttctgccg cctgtttcgc 780aaagatatcg cccacgcctg cggtttcgcc gacagcaact acttctgccg cctgtttcgc 780
aaaaacaccg aacgctcgcc gtcggagtat cgccgtcaat atcacagcca gctgacggaa 840aaaaacaccg aacgctcgcc gtcggagtat cgccgtcaat atcacagcca gctgacggaa 840
aaaacagccc cggcaaaaaa ctag 864aaaacagccc cggcaaaaaa ctag 864
<210> 26<210> 26
<211> 735<211> 735
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 26<400> 26
atgagttttg aaggaaaaat cgcgctggtt accggtgcaa gtcgcgggat tggccgcgca 60atgagttttg aaggaaaaat cgcgctggtt accggtgcaa gtcgcgggat tggccgcgca 60
atcgctgaaa cgctcgttgc ccgtggcgcg aaagttatcg ggactgcgac cagcgaaagc 120atcgctgaaa cgctcgttgc ccgtggcgcg aaagttatcg ggactgcgac cagcgaaagc 120
ggcgcgcagg cgatcagcga ttatttaggt gctaacggta aaggtctgct gctgaatgtg 180ggcgcgcagg cgatcagcga ttatttaggt gctaacggta aaggtctgct gctgaatgtg 180
accgatcctg catctattga atctgttctg ggaaatattc gcgcagaatt tggtgaagtt 240accgatcctg catctattga atctgttctg ggaaatattc gcgcagaatt tggtgaagtt 240
gatatcctgg tgaacaatgc cgggatcact cgtgataacc tgttaatgcg catgaaagat 300gatatcctgg tgaacaatgc cgggatcact cgtgataacc tgttaatgcg catgaaagat 300
gatgagtgga acgatattat cgaaaccaac ctgtcatctg ttttccgtct gtcaaaagcg 360gatgagtgga acgatattat cgaaaccaac ctgtcatctg ttttccgtct gtcaaaagcg 360
gtaatgcgcg ctatgatgaa aaagcgtcat ggacgtatta tcactatcgg ttctgtggtt 420gtaatgcgcg ctatgatgaa aaagcgtcat ggacgtatta tcactatcgg ttctgtggtt 420
ggtaccatgg gaaatgcggg tcaggccaac tacgctgcgg cgaaagcggg tctgattggc 480ggtaccatgg gaaatgcggg tcaggccaac tacgctgcgg cgaaagcggg tctgattggc 480
ttcagtaaat cactggctcg cgaagttgcg tcccgcggta ttactgtaaa cgttgttgct 540ttcagtaaat cactggctcg cgaagttgcg tcccgcggta ttactgtaaa cgttgttgct 540
ccgggcttta ttgaaacgga catgacgcgt gcgctgaccg atgagcagcg tgcgggtacg 600ccgggcttta ttgaaacgga catgacgcgt gcgctgaccg atgagcagcg tgcgggtacg 600
ctggcggcag ttcctgcggg gcgcctcggc tctccaaatg aaatcgccag tgcggtggca 660ctggcggcag ttcctgcggg gcgcctcggc tctccaaatg aaatcgccag tgcggtggca 660
tttttagcct ctgacgaagc gagttacatc accggtgaaa ctctgcacgt caacggcgga 720tttttagcct ctgacgaagc gagttacatc accggtgaaa ctctgcacgt caacggcgga 720
atgtatatgg tctga 735atgtatatgg tctga 735
<210> 27<210> 27
<211> 71<211> 71
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический олигонуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic oligonucleotide
<400> 27<400> 27
atgcccggct cgtctcgtaa ggtaccggca tggttgccga tactggttat tttaatcgcc 60atgcccggct cgtctcgtaa ggtaccggca tggttgccga tactggttat tttaatcgcc 60
atgatttcca t 71atgatttcca t 71
<210> 28<210> 28
<211> 2355<211> 2355
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 28<400> 28
atgaatcctg agcgttctga acgcattgaa atccccgtat tgccgttgcg cgatgtggtg 60atgaatcctg agcgttctga acgcattgaa atccccgtat tgccgttgcg cgatgtggtg 60
gtttatccgc acatggtcat acccctgttt gtagggcggg aaaaatctat ccgttgtctc 120gtttatccgc acatggtcat acccctgttt gtagggcggg aaaaatctat ccgttgtctc 120
gaagcagcca tggaccatga taaaaaaatc atgctggttg cgcagaaaga agcctcgacg 180gaagcagcca tggaccatga taaaaaaatc atgctggttg cgcagaaaga agcctcgacg 180
gatgagccgg gtgtaaacga tcttttcacc gtcgggaccg tggcgtctat tttgcaaatg 240gatgagccgg gtgtaaacga tcttttcacc gtcgggaccg tggcgtctat tttgcaaatg 240
ctgaagctac cggacggtac tgttaaagtg ctggtcgaag gtttgcagcg cgcgcgcatc 300ctgaagctac cggacggtac tgttaaagtg ctggtcgaag gtttgcagcg cgcgcgcatc 300
tctgcgctgt ctgataatgg cgaacatttt tcggcgaagg cggaatacct tgaatcgccg 360tctgcgctgt ctgataatgg cgaacatttt tcggcgaagg cggaatacct tgaatcgccg 360
gcgattgacg aacgcgagca ggaagtgctg gttcgtaccg ctatcagcca gtttgaaggc 420gcgattgacg aacgcgagca ggaagtgctg gttcgtaccg ctatcagcca gtttgaaggc 420
tacatcaagc tgaacaaaaa aatccctccg gaagtgctga cgtcgctgaa tagcatcgac 480tacatcaagc tgaacaaaaa aatccctccg gaagtgctga cgtcgctgaa tagcatcgac 480
gatccggcgc gtctggcgga taccatcgct gcgcatatgc cgctgaagct ggcggacaaa 540gatccggcgc gtctggcgga taccatcgct gcgcatatgc cgctgaagct ggcggacaaa 540
cagtccgtgc tggagatgtc cgacgttaac gagcgtctgg aatatctgat ggcgatgatg 600cagtccgtgc tggagatgtc cgacgttaac gagcgtctgg aatatctgat ggcgatgatg 600
gagtcggaaa tcgatctgct gcaggtggag aagcgtattc gcaaccgcgt gaaaaagcag 660gagtcggaaa tcgatctgct gcaggtggag aagcgtattc gcaaccgcgt gaaaaagcag 660
atggagaaat ctcagcgcga gtactatctg aatgagcaaa tgaaagccat tcaaaaagag 720atggagaaat ctcagcgcga gtactatctg aatgagcaaa tgaaagccat tcaaaaagag 720
ctcggcgaga tggacgacgc cccggacgag aacgaagcgc tgaagcgtaa gatcgacgcg 780ctcggcgaga tggacgacgc cccggacgag aacgaagcgc tgaagcgtaa gatcgacgcg 780
gcgaaaatgc cgaaagaggc aaaagagaaa accgaagcgg aactgcaaaa actgaaaatg 840gcgaaaatgc cgaaagaggc aaaagagaaa accgaagcgg aactgcaaaa actgaaaatg 840
atgtccccga tgtcggcgga agcgaccgtc gttcgcggct acatcgactg gatggtgcag 900atgtccccga tgtcggcgga agcgaccgtc gttcgcggct acatcgactg gatggtgcag 900
gtaccgtgga acgctcgcag caaggttaaa aaagacctgc gtcaggctca ggagatcctc 960gtaccgtgga acgctcgcag caaggttaaa aaagacctgc gtcaggctca ggagatcctc 960
gataccgatc actacggcct tgagcgcgtg aaggatcgca ttcttgagta cctcgcggtg 1020gataccgatc actacggcct tgagcgcgtg aaggatcgca ttcttgagta cctcgcggtg 1020
cagagccgtg ttaacaagct caaagggccg atcctgtgcc tggttgggcc tccgggggta 10801080
ggtaaaacct ctctcggcca atccatcgcc aaagcaactg gacgcaaata tgtgcgtatg 1140ggtaaaacct ctctcggcca atccatcgcc aaagcaactg gacgcaaata tgtgcgtatg 1140
gcgctgggcg gcgtgcgtga tgaagcggaa atccgcggtc accgccgtac ctatattggc 1200gcgctgggcg gcgtgcgtga tgaagcggaa atccgcggtc accgccgtac ctatattggc 1200
tcaatgccgg gcaaactgat ccagaaaatg gctaaagtgg gcgttaaaaa cccgctgttc 1260tcaatgccgg gcaaactgat ccagaaaatg gctaaagtgg gcgttaaaaa cccgctgttc 1260
ttgctggatg agatcgacaa gatgtcttct gacatgcgcg gcgatccggc ctcggcgctg 1320ttgctggatg agatcgacaa gatgtcttct gacatgcgcg gcgatccggc ctcggcgctg 1320
ctggaggtgt tggatccgga acagaacgtg gcctttaacg accactatct ggaagtggat 1380ctggaggtgt tggatccgga acagaacgtg gcctttaacg accactatct ggaagtggat 1380
tacgatctca gcgacgtgat gttcgttgcg acctctaact ccatgaacat cccggcgccg 1440tacgatctca gcgacgtgat gttcgttgcg acctctaact ccatgaacat cccggcgccg 1440
ctgctggatc gtatggaagt gatccgcctc tccggctata ccgaagatga gaagctaaac 1500ctgctggatc gtatggaagt gatccgcctc tccggctata ccgaagatga gaagctaaac 1500
atcgccaaac gccatctgct gtcaaaacag attgagcgta acgcgctcaa gaaaggcgag 1560atcgccaaac gccatctgct gtcaaaacag attgagcgta acgcgctcaa gaaaggcgag 1560
ctgacggtgg atgacagcgc gattatcggc atcattcgct actacacccg tgaagcaggc 1620ctgacggtgg atgacagcgc gattatcggc atcattcgct actacacccg tgaagcaggc 1620
gtgcgtggtc tggagcgtga aatctcgaaa ctgtgccgca aagcggtgaa acagctgctg 1680gtgcgtggtc tggagcgtga aatctcgaaa ctgtgccgca aagcggtgaa acagctgctg 1680
ctggataagt cgctgaaaca catcgagatt aacggcgaca acctgcacga tttccttggc 1740ctggataagt cgctgaaaca catcgagatt aacggcgaca acctgcacga tttccttggc 1740
gtgcagcgct acgactatgg tcgtgcggat agcgaaaacc gcgtaggtca ggtgaccgga 1800gtgcagcgct acgactatgg tcgtgcggat agcgaaaacc gcgtaggtca ggtgaccgga 1800
ctggcgtgga cggaagtggg cggcgatctg ctgaccattg aaaccgcctg cgttccgggt 18601860
aaaggcaaac tgacctacac cggttcactg ggtgaagtca tgcaggaatc catccaggcg 1920aaaggcaaac tgacctacac cggttcactg ggtgaagtca tgcaggaatc catccaggcg 1920
gcgctgacgg tggttcgttc acgtgcggat aagctgggta ttaactcaga cttttacgaa 1980gcgctgacgg tggttcgttc acgtgcggat aagctgggta ttaactcaga cttttacgaa 1980
aaacgtgata ttcacgttca cgtgccggaa ggcgcgacgc cgaaggatgg tccaagcgcc 20402040 aaacgtgata ttcacgttca cgtgccggaa
ggtatcgcga tgtgcaccgc gctggtttcc tgtctgacgg gtaatccggt acgcgccgac 2100ggtatcgcga tgtgcaccgc gctggtttcc tgtctgacgg gtaatccggt acgcgccgac 2100
gtggcgatga ccggtgagat taccctccgt ggccaggtat tgccgattgg tggtctgaag 2160gtggcgatga ccggtgagat taccctccgt ggccaggtat tgccgattgg tggtctgaag 2160
gaaaaactgt tggccgcgca tcgcggcggc attaagactg ttctgattcc tgatgaaaat 2220gaaaaactgt tggccgcgca tcgcggcggc attaagactg ttctgattcc tgatgaaaat 2220
aaacgcgacc ttgaagaaat tccggataac gttatcgccg atttagatat ccatccggtg 2280aaacgcgacc ttgaagaaat tccggataac gttatcgccg atttagatat ccatccggtg 2280
aaacgaatcg aggaagttct ggcacttgcg ctacagaacg aaccgtttgg aatggaagtc 2340aaacgaatcg aggaagttct ggcacttgcg ctacagaacg aaccgtttgg aatggaagtc 2340
gtcacggcaa aatag 2355gtcacggcaa aatag 2355
<210> 29<210> 29
<211> 393<211> 393
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 29<400> 29
atggctgaaa atcaatacta cggcaccggt cgccgcaaaa gttccgcagc tcgcgttttc 60atggctgaaa atcaatacta cggcaccggt cgccgcaaaa gttccgcagc tcgcgttttc 60
atcaaaccgg gcaacggtaa aatcgttatc aaccagcgtt ctctggaaca gtacttcggt 120atcaaaccgg gcaacggtaa aatcgttatc aaccagcgtt ctctggaaca gtacttcggt 120
cgtgaaactg cccgcatggt agttcgtcag ccgctggaac tggtcgacat ggttgagaaa 180cgtgaaactg cccgcatggt agttcgtcag ccgctggaac tggtcgacat ggttgagaaa 180
ttagatctgt acatcaccgt taaaggtggt ggtatctctg gtcaggctgg tgcgatccgt 240ttagatctgt acatcaccgt taaaggtggt ggtatctctg gtcaggctgg tgcgatccgt 240
cacggtatca cccgcgctct gatggagtac gacgagtccc tgcgtggcga actgcgtaaa 300cacggtatca cccgcgctct gatggagtac gacgagtccc tgcgtggcga actgcgtaaa 300
gctggtttcg ttactcgtga tgctcgtcag gttgaacgta agaaagtcgg cctgcgtaaa 360gctggtttcg ttactcgtga tgctcgtcag gttgaacgta agaaagtcgg cctgcgtaaa 360
gcacgtcgtc gtcctcagtt ctccaaacgt taa 393gcacgtcgtc gtcctcagtt ctccaaacgt taa 393
<210> 30<210> 30
<211> 789<211> 789
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 30<400> 30
atgtttgttg ctgccggaca atttgccgta acgccggact ggacgggaaa cgcgcagacc 60atgtttgttg ctgccggaca atttgccgta acgccggact ggacgggaaa cgcgcagacc 60
tgcgtcagca tgatgcgcca ggccgcggag cggggggcgt cgcttctggt tctgcctgag 120tgcgtcagca tgatgcgcca ggccgcggag cggggggcgt cgcttctggt tctgcctgag 120
gcgttgctgg cgcgagacga taacgatgcg gatttatcgg ttaaatccgc ccagcagctg 180180
gatggcggct tcttacagct cttgctggcg gagagcgaaa acagcgcttt gacgacggtg 240gatggcggct tcttacagct cttgctggcg gagagcgaaa acagcgcttt gacgacggtg 240
ctgaccctgc atatcccttc cggcgaaggt cgagcgacga atacgctggt ggccctgcgt 300ctgaccctgc atatcccttc cggcgaaggt cgagcgacga atacgctggt ggccctgcgt 300
caggggaaga ttgtggcgca atatcagaaa ctgcatctct atgatgcgtt caatatccag 360caggggaaga ttgtggcgca atatcagaaa ctgcatctct atgatgcgtt caatatccag 360
gaatccaggc tggtcgatgc cgggcggcaa attccgccgc tgatcgaagt cgacgggatg 420gaatccaggc tggtcgatgc cgggcggcaa attccgccgc tgatcgaagt cgacgggatg 420
cgcgtcgggc tgatgacctg ctacgattta cgtttccctg agctggcgct gtcgttagcg 480cgcgtcgggc tgatgacctg ctacgattta cgtttccctg agctggcgct gtcgttagcg 480
ctcagcggcg cgcagctcat agtgttgcct gccgcgtggg taaaagggcc gctgaaggaa 540ctcagcggcg cgcagctcat agtgttgcct gccgcgtggg taaaagggcc gctgaaggaa 540
catcactggg cgacgctgct ggcggcgcgg gcgctggata caacctgcta tattgtcgcc 600catcactggg cgacgctgct ggcggcgcgg gcgctggata caacctgcta tattgtcgcc 600
gcaggagagt gcgggacgcg taatatcggt caaagccgta ttatcgaccc cttagggaca 660660 gcaggagagt gcgggacgcg taatatcggt
acgcttgccg gggcgggaga gcggccgcag ttgatttttg ccgaactttc agctgattat 720acgcttgccg gggcgggaga gcggccgcag ttgatttttg ccgaactttc agctgattat 720
attcagcagg tacgcgagcg cctgccggtg ttgcgcaatc gccgctttgc gccaccgcaa 780attcagcagg tacgcgagcg cctgccggtg ttgcgcaatc gccgctttgc gccaccgcaa 780
ttattatga 789ttattatga 789
<210> 31<210> 31
<211> 369<211> 369
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 31<400> 31
atggccaata ataccactgg gttaacccga attattaaag cggccgggta ttcctggaaa 60atggccaata ataccactgg gttaacccga attattaaag cggccgggta ttcctggaaa 60
ggattccgtg cggcgtgggt caatgaggcc gcatttcgtc aggaaggcat cgcggccgtt 120ggattccgtg cggcgtgggt caatgaggcc gcatttcgtc aggaaggcat cgcggccgtt 120
attgccgtgg cgatcgcctg ctggttggac gtcgatgcca tcacgcgggt gctgctcatt 180attgccgtgg cgatcgcctg ctggttggac gtcgatgcca tcacgcgggt gctgctcatt 180
agctcggtcc tgttagtgat gatagttgaa attatcaata gcgcgattga ggcggtggtt 240agctcggtcc tgttagtgat gatagttgaa attatcaata gcgcgattga ggcggtggtt 240
gaccgtatcg gtcccgagca tcatgagctt tcggggcgag cgaaagatat gggatcggcg 300gaccgtatcg gtcccgagca tcatgagctt tcggggcgag cgaaagatat gggatcggcg 300
gcggtactgc tggcgattat catcgcgctg atcgcgtggg gaacgctgct gtgggcgaac 360gcggtactgc tggcgattat catcgcgctg atcgcgtggg gaacgctgct gtgggcgaac 360
taccgctaa 369taccgctaa 369
<210> 32<210> 32
<211> 1122<211> 1122
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 32<400> 32
atgcataacc aggctccgat tcaacgtaga aaatcaaaac gaatttacgt tgggaatgtg 60atgcataacc aggctccgat tcaacgtaga aaatcaaaac gaatttacgt tgggaatgtg 60
ccgattggcg atggcgcccc catcgccgta cagtcgatga caaacacgcg caccaccgat 120ccgattggcg atggcgcccc catcgccgta cagtcgatga caaacacgcg caccaccgat 120
gtggcggcga cggtaaatca aattaaagcc ctcgagcgcg ttggcgcgga tatcgtgcgc 180gtggcggcga cggtaaatca aattaaagcc ctcgagcgcg ttggcgcgga tatcgtgcgc 180
gtttcggtgc cgacgatgga tgcggcggaa gcgttcaaac ttatcaaaca gcaggttaac 240240
gtcccgctgg ttgccgatat ccacttcgat taccgcattg cgctgaaggt agcggaatac 300gtcccgctgg ttgccgatat ccacttcgat taccgcattg cgctgaaggt agcggaatac 300
ggcgttgatt gcctgcgtat taacccgggc aatatcggca acgaagagcg tatccgcatg 360ggcgttgatt gcctgcgtat taacccgggc aatatcggca acgaagagcg tatccgcatg 360
gtggtggact gcgctcgcga taaaaatatt cctatccgta tcggggtaaa cgccggttct 420gtggtggact gcgctcgcga taaaaatatt cctatccgta tcggggtaaa cgccggttct 420
ctggaaaaag atctccagga aaaatacggc gaaccgactc cgcaggcgct gctggaatcg 480ctggaaaaag atctccagga aaaatacggc gaaccgactc cgcaggcgct gctggaatcg 480
gcaatgcgcc atgttgatca tctcgatcgt ctcaacttcg atcagtttaa agtcagcgta 540gcaatgcgcc atgttgatca tctcgatcgt ctcaacttcg atcagtttaa agtcagcgta 540
aaagcctccg atgtgttcct cgcggttgaa tcctatcgcc tgttggcgaa acagatcgat 600aaagcctccg atgtgttcct cgcggttgaa tcctatcgcc tgttggcgaa acagatcgat 600
cagcctctgc acctcgggat caccgaagcg ggcggcgcgc gcagcggcgc ggtgaagtcc 660cagcctctgc acctcgggat caccgaagcg ggcggcgcgc gcagcggcgc ggtgaagtcc 660
gcgatcggcc tcggcctgct gctgtctgaa gggattggcg atacgctgcg cgtctctctg 720gcgatcggcc tcggcctgct gctgtctgaa gggattggcg atacgctgcg cgtctctctg 720
gcggcggatc ccgttgaaga gatcaaagtg ggcttcgata ttctcaagtc gctgcgtatt 780gcggcggatc ccgttgaaga gatcaaagtg ggcttcgata ttctcaagtc gctgcgtatt 780
cgctctcgcg ggatcaactt tattgcctgc ccgacctgtt cacgtcagga gtttgacgtt 840cgctctcgcg ggatcaactt tattgcctgc ccgacctgtt cacgtcagga gtttgacgtt 840
atcggtaccg ttaacgcgct ggagcagcgc ctggaagata tcattacgcc gatggatatt 900atcggtaccg ttaacgcgct ggagcagcgc ctggaagata tcattacgcc gatggatatt 900
tcgatcattg gctgcgtggt aaacggtccc ggcgaggcgc tggtttccac cctcggcgta 960tcgatcattg gctgcgtggt aaacggtccc ggcgaggcgc tggtttccac cctcggcgta 960
accggcggca ataagaaaag cggcctgtac gaagacggcg tacgtaaaga caggctggat 1020accggcggca ataagaaaag cggcctgtac gaagacggcg tacgtaaaga caggctggat 1020
aacgacgata tgatcgatca gctggaagcg cgtattcgcg ctaaagcatc gatgctggat 1080aacgacgata tgatcgatca gctggaagcg cgtattcgcg ctaaagcatc gatgctggat 1080
gaggcgcgtc gtatcgatat ccagcaggtt gaagcgaaat aa 1122gaggcgcgtc gtatcgatat ccagcaggtt gaagcgaaat aa 1122
<210> 33<210> 33
<211> 876<211> 876
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 33<400> 33
atgagccata ttcaacggga aacgtcttgc tccaggccgc gattaaattc caacatggat 60atgagccata ttcaacggga aacgtcttgc tccaggccgc gattaaattc caacatggat 60
gctgatttat atgggtataa atgggctcgc gataatgtcg ggcaatcagg tgcgacaatc 120gctgatttat atgggtataa atgggctcgc gataatgtcg ggcaatcagg tgcgacaatc 120
tatcgattgt atgggaagcc cgatgcgcca gagttgtttc tgaaacatgg caaaggtagc 180tatcgattgt atgggaagcc cgatgcgcca gagttgtttc tgaaacatgg caaaggtagc 180
gttgccaatg atgttacaga tgagatggtc agactaaact ggctgacgga atttatgcct 240gttgccaatg atgttacaga tgagatggtc agactaaact ggctgacgga atttatgcct 240
cttccgacca tcaagcattt tatccgtact cctgatgatg catggttact caccactgcg 300cttccgacca tcaagcattt tatccgtact cctgatgatg catggttact caccactgcg 300
atccccggga aaacagcatt ccaggtatta gaagaatatc ctgattcagg tgaaaatatt 360atccccggga aaacagcatt ccaggtatta gaagaatatc ctgattcagg tgaaaatatt 360
gttgatgcgc tggcagtgtt cctgcgccgg ttgcattcga ttcctgtttg taattgtcct 420gttgatgcgc tggcagtgtt cctgcgccgg ttgcattcga ttcctgtttg taattgtcct 420
tttaacagcg atcgcgtatt tcgtctcgct caggcgcaat cacgaatgaa taacggtttg 480tttaacagcg atcgcgtatt tcgtctcgct caggcgcaat cacgaatgaa taacggtttg 480
gttgatgcga gtgattttga tgacgagcgt aatggctggc ctgttgaaca agtctggaaa 540gttgatgcga gtgattttga tgacgagcgt aatggctggc ctgttgaaca agtctggaaa 540
gaaatgcata agcttttgcc attctcaccg gattcagtcg tcactcatgg tgatttctca 600gaaatgcata agcttttgcc attctcaccg gattcagtcg tcactcatgg tgatttctca 600
cttgataacc ttatttttga cgaggggaaa ttaataggtt gtattgatgt tggacgagtc 660cttgataacc ttatttttga cgaggggaaa ttaataggtt gtattgatgt tggacgagtc 660
ggaatcgcag accgatacca ggatcttgcc atcctatgga actgcctcgg tgagttttct 720ggaatcgcag accgatacca ggatcttgcc atcctatgga actgcctcgg tgagttttct 720
ccttcattac agaaacggct ttttcaaaaa tatggtattg ataatcctga tatgaataaa 780tatggtattg ataatcctga tatgaataaa 780
ttgcagtttc atttgatgct cgatgagttt ttctaataag cctgcctggt tctgcgtttc 840ttgcagtttc atttgatgct cgatgagttt ttctaataag cctgcctggt tctgcgtttc 840
ccgctcttta ataccctgac cggaggtgag caatga 876ccgctcttta ataccctgac cggaggtgag caatga 876
<210> 34<210> 34
<211> 1491<211> 1491
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 34<400> 34
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120
agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180
atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240
gactgttttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300gactgtttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300
gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360
aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420
gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480
ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540
accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600
gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660
gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720
aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780
ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840
gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900
tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960
tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020
cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080
gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140
ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200
ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260
actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320
ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380
ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440
ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491
<210> 35<210> 35
<211> 1021<211> 1021
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 35<400> 35
ctgatccttc aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa 60ctgatccttc aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa 60
tctctgatgt tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc 120tctctgatgt tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc 120
ttacataaac agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc 180ttacataaac agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc 180
caggccgcga ttaaattcca acatggatgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga 240caggccgcga ttaaattcca acatggatgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga 240
taatgtcggg caatcaggtg cgacaatcta tcgattgtat gggaagcccg atgcgccaga 300taatgtcggg caatcaggtg cgacaatcta tcgattgtat gggaagcccg atgcgccaga 300
gttgtttctg aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtcag 360gttgtttctg aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtcag 360
actaaactgg ctgacggaat ttatgcctct tccgaccatc aagcatttta tccgtactcc 420actaaactgg ctgacggaat ttatgcctct tccgaccatc aagcatttta tccgtactcc 420
tgatgatgca tggttactca ccactgcgat ccccgggaaa acagcattcc aggtattaga 480tgatgatgca tggttactca ccactgcgat ccccgggaaa acagcattcc aggtattaga 480
agaatatcct gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gcagtgttcc tgcgccggtt 540agaatatcct gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gcagtgttcc tgcgccggtt 540
gcattcgatt cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgcgtatttc gtctcgctca 600gcattcgatt cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgcgtatttc gtctcgctca 600
ggcgcaatca cgaatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa 660ggcgcaatca cgaatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa 660
tggctggcct gttgaacaag tctggaaaga aatgcataag cttttgccat tctcaccgga 720tggctggcct gttgaacaag tctggaaaga aatgcataag cttttgccat tctcaccgga 720
ttcagtcgtc actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt 780ttcagtcgtc actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt 780
aataggttgt attgatgttg gacgagtcgg aatcgcagac cgataccagg atcttgccat 840aataggttgt attgatgttg gacgagtcgg aatcgcagac cgataccagg atcttgccat 840
cctatggaac tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata 900cctatggaac tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata 900
tggtattgat aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt 960tggtattgat aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagtttt 960
ctaataagcc ttgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 1020ctaataagcc ttgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 1020
a 1021a 1021
<210> 36<210> 36
<211> 1071<211> 1071
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 36<400> 36
atgaagatag caacaatgaa aacaggtctg ggagcgttgg ctcttcttcc ctgatccttc 60atgaagatag caacaatgaa aacaggtctg ggagcgttgg ctcttcttcc ctgatccttc 60
aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa tctctgatgt 120aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa tctctgatgt 120
tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc ttacataaac 180tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc ttacataaac 180
agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc ccgtccgcgc 240agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc ccgtccgcgc 240
ttaaactcca acatggacgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga taatgtcggg 300ttaaactcca acatggacgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga taatgtcggg 300
caatcaggtg cgacaatcta tcgcttgtat gggaagcccg atgcgccaga gttgtttctg 360caatcaggtg cgacaatcta tcgcttgtat gggaagcccg atgcgccaga gttgtttctg 360
aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtccg tctcaactgg 420aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtccg tctcaactgg 420
ctgacggagt ttatgcctct cccgaccatc aagcatttta tccgtactcc tgatgatgcg 480ctgacggagt ttatgcctct cccgaccatc aagcatttta tccgtactcc tgatgatgcg 480
tggttactca ccaccgcgat tcctgggaaa acagccttcc aggtattaga agaatatcct 540tggttactca ccaccgcgat tcctgggaaa acagccttcc aggtattaga agaatatcct 540
gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gccgtgttcc tgcgccggtt acattcgatt 600gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gccgtgttcc tgcgccggtt acattcgatt 600
cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgtgtatttc gtcttgctca ggcgcaatca 660660
cgcatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa tggctggcct 720cgcatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa tggctggcct 720
gttgaacaag tctggaaaga aatgcacaag ctcttgccat tctcaccgga ttcagtcgtc 780gttgaacaag tctggaaaga aatgcacaag ctcttgccat tctcaccggga ttcagtcgtc 780
actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt aataggttgt 840actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg agggggaaatt aataggttgt 840
attgatgttg gacgggtcgg aatcgcagac cgttaccagg accttgccat tctttggaac 900attgatgttg gacgggtcgg aatcgcagac cgttaccagg accttgccat tctttggaac 900
tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata tggtattgat 960tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata tggtattgat 960
aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt ctaataagcc 1020aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagtttt ctaataagcc 1020
tgtgaagggc tggacgtaaa cagccacggc gaaaacgcct acaacgcctg a 1071tgtgaagggc tggacgtaaa cagccacggc gaaaacgcct acaacgcctg a 1071
<210> 37<210> 37
<211> 1071<211> 1071
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 37<400> 37
atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gtacccgagg cgattgccgg ctgatccttc 60atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gtacccgagg cgattgccgg ctgatccttc 60
aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa tctctgatgt 120aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa tctctgatgt 120
tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc ttacataaac 180tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc ttacataaac 180
agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc ccgtccgcgc 240agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc ccgtccgcgc 240
ttaaactcca acatggacgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga taatgtcggg 300ttaaactcca acatggacgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga taatgtcggg 300
caatcaggtg cgacaatcta tcgcttgtat gggaagcccg atgcgccaga gttgtttctg 360caatcaggtg cgacaatcta tcgcttgtat gggaagcccg atgcgccaga gttgtttctg 360
aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtccg tctcaactgg 420aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtccg tctcaactgg 420
ctgacggagt ttatgcctct cccgaccatc aagcatttta tccgtactcc tgatgatgcg 480ctgacggagt ttatgcctct cccgaccatc aagcatttta tccgtactcc tgatgatgcg 480
tggttactca ccaccgcgat tcctgggaaa acagccttcc aggtattaga agaatatcct 540tggttactca ccaccgcgat tcctgggaaa acagccttcc aggtattaga agaatatcct 540
gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gccgtgttcc tgcgccggtt acattcgatt 600gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gccgtgttcc tgcgccggtt acattcgatt 600
cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgtgtatttc gtcttgctca ggcgcaatca 660660
cgcatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa tggctggcct 720cgcatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa tggctggcct 720
gttgaacaag tctggaaaga aatgcacaag ctcttgccat tctcaccgga ttcagtcgtc 780gttgaacaag tctggaaaga aatgcacaag ctcttgccat tctcaccggga ttcagtcgtc 780
actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt aataggttgt 840actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg agggggaaatt aataggttgt 840
attgatgttg gacgggtcgg aatcgcagac cgttaccagg accttgccat tctttggaac 900attgatgttg gacgggtcgg aatcgcagac cgttaccagg accttgccat tctttggaac 900
tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata tggtattgat 960tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata tggtattgat 960
aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt ctaataagcc 1020aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagtttt ctaataagcc 1020
ttggttctgc gtttcccgct ctttaatacc ctgaccggag gtgagcaatg a 1071ttggttctgc gtttcccgct ctttaatacc ctgaccggag gtgagcaatg a 1071
<210> 38<210> 38
<211> 426<211> 426
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 38<400> 38
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60
cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120
tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180
aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240
aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300
ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360
gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420
aaatga 426aaatga 426
<210> 39<210> 39
<211> 446<211> 446
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 39<400> 39
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc tcaccacggc gataaccata ggttttcggc 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc tcaccacggc gataaccata ggttttcggc 60
gtggccacat ccatggtgaa tcccactttt tccagcacgc gcgccacttc atcgggtctt 120gtggccacat ccatggtgaa tcccactttt tccagcacgc gcgccacttc atcgggtctt 120
aaatacatag attttcctcg tcatctttcc aaagcctcgc caccttacat gactgagcat 180aaatacatag attttcctcg tcatctttcc aaagcctcgc caccttacat gactgagcat 180
ggaccgtgac tcagaaaatt ccacaaacga acctgaaagg cgtgattgcc gtctggcctt 240ggaccgtgac tcagaaaatt ccacaaacga acctgaaagg cgtgattgcc gtctggcctt 240
aaaaattatg gtctaaacta aaatttacat cgaaaacgag ggaggatcct atgtttaaca 300aaaaattatg gtctaaacta aaatttacat cgaaaacgag ggaggatcct atgtttaaca 300
aaccgaatcg ccgtgacgta gatgaaggtg ttgaggatat taaccacgat gttaaccagc 360aaccgaatcg ccgtgacgta gatgaaggtg ttgaggatat taaccacgat gttaaccagc 360
tcgaactcac ttcacacccc gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc 420tcgaactcac ttcacacccc gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc 420
attcactgac cggaggttca aaatga 446attcactgac cggaggttca aaatga 446
<210> 40<210> 40
<211> 452<211> 452
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 40<400> 40
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc tgacgaggca ggttacatca ctggtgaaac 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc tgacgaggca ggttacatca ctggtgaaac 60
cctgcacgtc aatggcggaa tgtatatggt ttaaccacga tgaaaattat ttgcgttatt 120120
agggcgaaag gcctcaaaat agcgtaaaat cgtggtaaga actgccggga tttagttgca 180agggcgaaag gcctcaaaat agcgtaaaat cgtggtaaga actgccggga tttagttgca 180
aatttttcaa cattttatac actacgaaaa ccatcgcgaa agcgagtttt gataggaaat 240aatttttcaa cattttatac actacgaaaa ccatcgcgaa agcgagtttt gataggaaat 240
ttaagagtat gagcactatc gaagaacgcg ttaagaaaat tatcggcgaa cagctgggcg 300ttaagagtat gagcactatc gaagaacgcg ttaagaaaat tatcggcgaa cagctgggcg 300
ttaagcagga agaagttacc aacaatgctt ccttcgttga agacctgggc gctgattctc 360ttaagcagga agaagttacc aacaatgctt ccttcgttga agacctgggc gctgattctc 360
ttgacaccga actcacttca caccccgaag ggggaagttg cctgacccta cgattcccgc 420ttgacaccga actcacttca caccccgaag ggggaagttg cctgacccta cgattcccgc 420
tatttcattc actgaccgga ggttcaaaat ga 452tattcattc actgaccgga ggttcaaaat ga 452
<210> 41<210> 41
<211> 461<211> 461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 41<400> 41
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60
ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120
aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180
tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240240
cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300
atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360
taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420
gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461
<210> 42<210> 42
<211> 463<211> 463
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 42<400> 42
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc atattgacac catgacgcgc gtaatgctga 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc atattgacac catgacgcgc gtaatgctga 60
ttggttctgt gacgctggta atgattgtcg aaattctgaa cagtgccatc gaagccgtag 120ttggttctgt gacgctggta atgattgtcg aaattctgaa cagtgccatc gaagccgtag 120
tagaccgtat tggtgcagaa ttccatgaac tttccgggcg ggcgaaggat atggggtcgg 180180
cggcggtgct gatgtccatc ctgctggcga tgtttacctg gatcgcatta ctctggtcac 240cggcggtgct gatgtccatc ctgctggcga tgtttacctg gatcgcatta ctctggtcac 240
attttcgata acgcttccag aattcgataa cgccctggtt ttttgcttaa atttggttcc 300attttcgata acgcttccag aattcgataa cgccctggtt ttttgcttaa atttggttcc 300
aaaatcgcct ttagctgtat atactcacag cataactgta tatacaccca gggggcggga 360aaaatcgcct ttagctgtat atactcacag cataactgta tatacaccca gggggcggga 360
tgaaagcatt aacggccagg aactcacttc acaccccgaa gggggaagtt gcctgaccct 420tgaaagcatt aacggccagg aactcacttc acaccccgaa gggggaagtt gcctgaccct 420
acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa tga 463acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa tga 463
<210> 43<210> 43
<211> 428<211> 428
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 43<400> 43
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc atcatattgc gctccctggt tatcatttgt 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc atcatattgc gctccctggt tatcatttgt 60
tactaaatga aatgttataa tataacaatt ataaatacca catcgctttc aattcaccag 120tactaaatga aatgttataa tataacaatt ataaatacca catcgctttc aattcaccag 120
ccaaatgaga ggagcgccgt ctgacatagc cagcgctata aaacatagca ttatctatat 180ccaaatgaga ggagcgccgt ctgacatagc cagcgctata aaacatagca ttatctatat 180
gtttatgatt aataactgat ttttgcgttt tggatttggc tgtggcatcc ttgccgctct 240gtttatgatt aataactgat ttttgcgttt tggatttggc tgtggcatcc ttgccgctct 240
tttcgcagcg tctgcgtttt tgccctccgg tcagggcatt taagggtcag caatgagttt 300tttcgcagcg tctgcgtttt tgccctccgg tcagggcatt taagggtcag caatgagttt 300
ttacgcaatt acgattcttg ccttcggcat gtcgatggat gctttaactc acttcacacc 360ttacgcaatt acgattcttg ccttcggcat gtcgatggat gctttaactc acttcacacc 360
ccgaaggggg aagttgcctg accctacgat tcccgctatt tcattcactg accggaggtt 420ccgaaggggg aagttgcctg accctacgat tcccgctatt tcattcactg accggaggtt 420
caaaatga 428caaaatga 428
<210> 44<210> 44
<211> 452<211> 452
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 44<400> 44
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgcgtcaggt tgaacgtaaa aaagtcggtc 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgcgtcaggt tgaacgtaaa aaagtcggtc 60
tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct ccaaacgtta attggtttct gcttcggcag 120tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct ccaaacgtta attggtttct gcttcggcag 120
aacgattggc gaaaaaaccc ggtgcgaacc gggttttttt atggataaag atcgtgttat 180aacgattggc gaaaaaaccc ggtgcgaacc gggttttttt atggataaag atcgtgttat 180
ccacagcaat ccattgatta tctcttcttt ttcagcattt ccagaatccc ctcaccacaa 240ccacagcaat ccattgatta tctcttcttt ttcagcattt ccagaatccc ctcaccacaa 240
agcccgcaaa atctggtaaa ctatcatcca attttctgcc caaatggctg ggattgttca 300agcccgcaaa atctggtaaa ctatcatcca attttctgcc caaatggctg ggattgttca 300
ttttttgttt gccttacaac gagagtgaca gtacgcgcgg gtagttaact caacatctga 360gccttacaac gagagtgaca gtacgcgcgg gtagttaact caacatctga 360
ccggtcgata actcacttca caccccgaag ggggaagttg cctgacccta cgattcccgc 420ccggtcgata actcacttca caccccgaag ggggaagttg cctgacccta cgattcccgc 420
tatttcattc actgaccgga ggttcaaaat ga 452tattcattc actgaccgga ggttcaaaat ga 452
<210> 45<210> 45
<211> 410<211> 410
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 45<400> 45
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cctgtatgaa gatggcgtgc gcaaagatcg 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cctgtatgaa gatggcgtgc gcaaagatcg 60
cctggataac agcgatatga ttagccagct tgaagcccgc attcgcgcga aagcgtcaat 120cctggataac agcgatatga ttagccagct tgaagcccgc attcgcgcga aagcgtcaat 120
gctggacgaa gcgcgtcgta tcgatgtgca acaggtagaa aaataaggtt gctgggaagc 180gctggacgaa gcgcgtcgta tcgatgtgca acaggtagaa aaataaggtt gctgggaagc 180
ggcaggcttc ccgtgtatga tgaacccgcc cggcgcgacc cgttgttcgt cgcggccccg 240ggcaggcttc ccgtgtatga tgaacccgcc cggcgcgacc cgttgttcgt cgcggccccg 240
agggttcatt ttttgtatta ataaagagaa taaacgtggc aaaaaatatt caagccattc 300agggttcatt ttttgtatta ataaagagaa taaacgtggc aaaaaatatt caagccattc 300
gcggcatgaa cgattatctg cctggcgaac tcacttcaca ccccgaaggg ggaagttgcc 360gcggcatgaa cgattatctg cctggcgaac tcacttcaca ccccgaaggg ggaagttgcc 360
tgaccctacg attcccgcta tttcattcac tgaccggagg ttcaaaatga 410tgaccctacg attcccgcta tttcattcac tgaccgggagg ttcaaaatga 410
<210> 46<210> 46
<211> 1071<211> 1071
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 46<400> 46
atgaaaaaga ttgatgcgat tattaaacct ttcaaactgg atgacgtgcg ctgatccttc 60atgaaaaaga ttgatgcgat tattaaacct ttcaaactgg atgacgtgcg ctgatccttc 60
aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa tctctgatgt 120aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa tctctgatgt 120
tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc ttacataaac 180tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc ttacataaac 180
agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc ccgtccgcgc 240agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc ccgtccgcgc 240
ttaaactcca acatggacgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga taatgtcggg 300ttaaactcca acatggacgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga taatgtcggg 300
caatcaggtg cgacaatcta tcgcttgtat gggaagcccg atgcgccaga gttgtttctg 360caatcaggtg cgacaatcta tcgcttgtat gggaagcccg atgcgccaga gttgtttctg 360
aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtccg tctcaactgg 420aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtccg tctcaactgg 420
ctgacggagt ttatgcctct cccgaccatc aagcatttta tccgtactcc tgatgatgcg 480ctgacggagt ttatgcctct cccgaccatc aagcatttta tccgtactcc tgatgatgcg 480
tggttactca ccaccgcgat tcctgggaaa acagccttcc aggtattaga agaatatcct 540tggttactca ccaccgcgat tcctgggaaa acagccttcc aggtattaga agaatatcct 540
gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gccgtgttcc tgcgccggtt acattcgatt 600gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gccgtgttcc tgcgccggtt acattcgatt 600
cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgtgtatttc gtcttgctca ggcgcaatca 660660
cgcatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa tggctggcct 720cgcatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa tggctggcct 720
gttgaacaag tctggaaaga aatgcacaag ctcttgccat tctcaccgga ttcagtcgtc 780gttgaacaag tctggaaaga aatgcacaag ctcttgccat tctcaccggga ttcagtcgtc 780
actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt aataggttgt 840actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg agggggaaatt aataggttgt 840
attgatgttg gacgggtcgg aatcgcagac cgttaccagg accttgccat tctttggaac 900attgatgttg gacgggtcgg aatcgcagac cgttaccagg accttgccat tctttggaac 900
tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata tggtattgat 960tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata tggtattgat 960
aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt ctaataagcc 1020aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagtttt ctaataagcc 1020
tcgcgcgtga ttcgtatccg caccggcgaa gaagacgacg cggcgattta a 1071tcgcgcgtga ttcgtatccg caccggcgaa gaagacgacg cggcgattta a 1071
<210> 47<210> 47
<211> 1295<211> 1295
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 47<400> 47
atgaccatga acctgatgac ggatgtcgtc tcagccaccg ggatcgccgg gttgctttca 60atgaccatga acctgatgac ggatgtcgtc tcagccaccg ggatcgccgg gttgctttca 60
cgacaacacc cgacgctgtt ttttacacta attgaacagg cccccgtggc gatcacgctg 120cgacaacacc cgacgctgtt ttttacacta attgaacagg cccccgtggc gatcacgctg 120
acggataccg ctgcccgcat tgtctatgcc aacccgggcg tgttgagtca tcctgactag 180acggataccg ctgcccgcat tgtctatgcc aacccgggcg tgttgagtca tcctgactag 180
ctgagatgag ggctcgcctg atccttcaac tcagcaaaag ttcgatttat tcaacaaagc 240ctgagatgag ggctcgcctg atccttcaac tcagcaaaag ttcgattat tcaacaaagc 240
cacgttgtgt ctcaaaatct ctgatgttac attgcacaag ataaaaatat atcatcatga 300cacgttgtgt ctcaaaatct ctgatgttac attgcacaag ataaaaatat atcatcatga 300
acaataaaac tgtctgctta cataaacagt aatacaaggg gtgttatgag ccatattcaa 360acaataaaac tgtctgctta cataaacagt aatacaaggg gtgttatgag ccatattcaa 360
cgggaaacgt cttgctccag gccgcgatta aattccaaca tggatgctga tttatatggg 420cgggaaacgt cttgctccag gccgcgatta aattccaaca tggatgctga tttatatggg 420
tataaatggg ctcgcgataa tgtcgggcaa tcaggtgcga caatctatcg attgtatggg 480tataaatggg ctcgcgataa tgtcgggcaa tcaggtgcga caatctatcg attgtatggg 480
aagcccgatg cgccagagtt gtttctgaaa catggcaaag gtagcgttgc caatgatgtt 540aagcccgatg cgccagagtt gtttctgaaa catggcaaag gtagcgttgc caatgatgtt 540
acagatgaga tggtcagact aaactggctg acggaattta tgcctcttcc gaccatcaag 600acagatgaga tggtcagact aaactggctg acggaattta tgcctcttcc gaccatcaag 600
cattttatcc gtactcctga tgatgcatgg ttactcacca ctgcgatccc cgggaaaaca 660cattttatcc gtactcctga tgatgcatgg ttactcacca ctgcgatccc cgggaaaaca 660
gcattccagg tattagaaga atatcctgat tcaggtgaaa atattgttga tgcgctggca 720gcattccagg tattagaaga atatcctgat tcaggtgaaa atattgttga tgcgctggca 720
gtgttcctgc gccggttgca ttcgattcct gtttgtaatt gtccttttaa cagcgatcgc 780gtgttcctgc gccggttgca ttcgattcct gtttgtaatt gtccttttaa cagcgatcgc 780
gtatttcgtc tcgctcaggc gcaatcacga atgaataacg gtttggttga tgcgagtgat 840gtatttcgtc tcgctcaggc gcaatcacga atgaataacg gtttggttga tgcgagtgat 840
tttgatgacg agcgtaatgg ctggcctgtt gaacaagtct ggaaagaaat gcataagctt 900tttgatgacg agcgtaatgg ctggcctgtt gaacaagtct ggaaagaaat gcataagctt 900
ttgccattct caccggattc agtcgtcact catggtgatt tctcacttga taaccttatt 960ttgccattct caccggattc agtcgtcact catggtgatt tctcacttga taaccttatt 960
tttgacgagg ggaaattaat aggttgtatt gatgttggac gagtcggaat cgcagaccga 1020tttgacgagg ggaaattaat aggttgtatt gatgttggac gagtcggaat cgcagaccga 1020
taccaggatc ttgccatcct atggaactgc ctcggtgagt tttctccttc attacagaaa 1080taccaggatc ttgccatcct atggaactgc ctcggtgagt tttctccttc attacagaaa 1080
cggctttttc aaaaatatgg tattgataat cctgatatga ataaattgca gtttcatttg 11401140
atgctcgatg agtttttcta ataagcctga ccggtggtga atttaatctc gctgacgtgt 1200atgctcgatg agtttttcta ataagcctga ccggtggtga atttaatctc gctgacgtgt 1200
agacattcat cgatctgcat ccacggtccg gcggcggtac ctgcctgacg ctacgtttac 12601260
cgctctttta tgaactgacc ggaggcccaa gatga 1295cgctctttta tgaactgacc ggaggcccaa gatga 1295
<210> 48<210> 48
<211> 1491<211> 1491
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 48<400> 48
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120
agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180
atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240
gactgttttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300gactgtttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300
gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360
aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420
gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480
ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540
accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600
gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660
gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720
aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780
ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840
gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900
tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960
tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020
cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080
gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140
ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200
ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260
actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320
ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380
ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440
ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491
<210> 49<210> 49
<211> 1021<211> 1021
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 49<400> 49
ctgatccttc aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa 60ctgatccttc aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa 60
tctctgatgt tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc 120tctctgatgt tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc 120
ttacataaac agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc 180ttacataaac agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc 180
caggccgcga ttaaattcca acatggatgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga 240caggccgcga ttaaattcca acatggatgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga 240
taatgtcggg caatcaggtg cgacaatcta tcgattgtat gggaagcccg atgcgccaga 300taatgtcggg caatcaggtg cgacaatcta tcgattgtat gggaagcccg atgcgccaga 300
gttgtttctg aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtcag 360gttgtttctg aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtcag 360
actaaactgg ctgacggaat ttatgcctct tccgaccatc aagcatttta tccgtactcc 420actaaactgg ctgacggaat ttatgcctct tccgaccatc aagcatttta tccgtactcc 420
tgatgatgca tggttactca ccactgcgat ccccgggaaa acagcattcc aggtattaga 480tgatgatgca tggttactca ccactgcgat ccccgggaaa acagcattcc aggtattaga 480
agaatatcct gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gcagtgttcc tgcgccggtt 540agaatatcct gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gcagtgttcc tgcgccggtt 540
gcattcgatt cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgcgtatttc gtctcgctca 600gcattcgatt cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgcgtatttc gtctcgctca 600
ggcgcaatca cgaatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa 660ggcgcaatca cgaatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa 660
tggctggcct gttgaacaag tctggaaaga aatgcataag cttttgccat tctcaccgga 720tggctggcct gttgaacaag tctggaaaga aatgcataag cttttgccat tctcaccgga 720
ttcagtcgtc actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt 780ttcagtcgtc actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt 780
aataggttgt attgatgttg gacgagtcgg aatcgcagac cgataccagg atcttgccat 840aataggttgt attgatgttg gacgagtcgg aatcgcagac cgataccagg atcttgccat 840
cctatggaac tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata 900cctatggaac tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata 900
tggtattgat aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt 960tggtattgat aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagtttt 960
ctaataagcc ttgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 1020ctaataagcc ttgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 1020
a 1021a 1021
<210> 50<210> 50
<211> 1071<211> 1071
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 50<400> 50
atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gtacccgagg cgattgccgg ctgatccttc 60atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gtacccgagg cgattgccgg ctgatccttc 60
aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa tctctgatgt 120aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa tctctgatgt 120
tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc ttacataaac 180tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc ttacataaac 180
agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc ccgtccgcgc 240agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc ccgtccgcgc 240
ttaaactcca acatggacgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga taatgtcggg 300ttaaactcca acatggacgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga taatgtcggg 300
caatcaggtg cgacaatcta tcgcttgtat gggaagcccg atgcgccaga gttgtttctg 360caatcaggtg cgacaatcta tcgcttgtat gggaagcccg atgcgccaga gttgtttctg 360
aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtccg tctcaactgg 420aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtccg tctcaactgg 420
ctgacggagt ttatgcctct cccgaccatc aagcatttta tccgtactcc tgatgatgcg 480ctgacggagt ttatgcctct cccgaccatc aagcatttta tccgtactcc tgatgatgcg 480
tggttactca ccaccgcgat tcctgggaaa acagccttcc aggtattaga agaatatcct 540tggttactca ccaccgcgat tcctgggaaa acagccttcc aggtattaga agaatatcct 540
gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gccgtgttcc tgcgccggtt acattcgatt 600gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gccgtgttcc tgcgccggtt acattcgatt 600
cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgtgtatttc gtcttgctca ggcgcaatca 660660
cgcatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa tggctggcct 720cgcatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa tggctggcct 720
gttgaacaag tctggaaaga aatgcacaag ctcttgccat tctcaccgga ttcagtcgtc 780gttgaacaag tctggaaaga aatgcacaag ctcttgccat tctcaccggga ttcagtcgtc 780
actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt aataggttgt 840actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg agggggaaatt aataggttgt 840
attgatgttg gacgggtcgg aatcgcagac cgttaccagg accttgccat tctttggaac 900attgatgttg gacgggtcgg aatcgcagac cgttaccagg accttgccat tctttggaac 900
tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata tggtattgat 960tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata tggtattgat 960
aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt ctaataagcc 1020aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagtttt ctaataagcc 1020
ttggttctgc gtttcccgct ctttaatacc ctgaccggag gtgagcaatg a 1071ttggttctgc gtttcccgct ctttaatacc ctgaccggag gtgagcaatg a 1071
<210> 51<210> 51
<211> 461<211> 461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 51<400> 51
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60
ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120
aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180
tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240240
cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300
atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360
taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420
gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461
<210> 52<210> 52
<211> 426<211> 426
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 52<400> 52
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60
cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120
tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180
aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240
aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300
ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360
gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420
aaatga 426aaatga 426
<210> 53<210> 53
<211> 452<211> 452
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 53<400> 53
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc tgacgaggca ggttacatca ctggtgaaac 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc tgacgaggca ggttacatca ctggtgaaac 60
cctgcacgtc aatggcggaa tgtatatggt ttaaccacga tgaaaattat ttgcgttatt 120120
agggcgaaag gcctcaaaat agcgtaaaat cgtggtaaga actgccggga tttagttgca 180agggcgaaag gcctcaaaat agcgtaaaat cgtggtaaga actgccggga tttagttgca 180
aatttttcaa cattttatac actacgaaaa ccatcgcgaa agcgagtttt gataggaaat 240aatttttcaa cattttatac actacgaaaa ccatcgcgaa agcgagtttt gataggaaat 240
ttaagagtat gagcactatc gaagaacgcg ttaagaaaat tatcggcgaa cagctgggcg 300ttaagagtat gagcactatc gaagaacgcg ttaagaaaat tatcggcgaa cagctgggcg 300
ttaagcagga agaagttacc aacaatgctt ccttcgttga agacctgggc gctgattctc 360ttaagcagga agaagttacc aacaatgctt ccttcgttga agacctgggc gctgattctc 360
ttgacaccga actcacttca caccccgaag ggggaagttg cctgacccta cgattcccgc 420ttgacaccga actcacttca caccccgaag ggggaagttg cctgacccta cgattcccgc 420
tatttcattc actgaccgga ggttcaaaat ga 452tattcattc actgaccgga ggttcaaaat ga 452
<210> 54<210> 54
<211> 426<211> 426
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 54<400> 54
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60
cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120
tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180
aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240
aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300
ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360
gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420
aaatga 426aaatga 426
<210> 55<210> 55
<211> 461<211> 461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 55<400> 55
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60
ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120
aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180
tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240240
cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300
atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360
taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420
gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461
<210> 56<210> 56
<211> 1491<211> 1491
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 56<400> 56
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120
agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180
atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240
gactgttttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300gactgtttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300
gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360
aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420
gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480
ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540
accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600
gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660
gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720
aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780
ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840
gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900
tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960
tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020
cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080
gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140
ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200
ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260
actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320
ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380
ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440
ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491
<210> 57<210> 57
<211> 1491<211> 1491
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 57<400> 57
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120
agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180
atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240
gactgttttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300gactgtttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300
gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360
aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420
gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480
ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540
accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600
gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660
gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720
aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780
ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840
gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900
tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960
tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020
cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080
gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140
ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200
ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260
actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320
ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380
ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440
ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491
<210> 58<210> 58
<211> 1021<211> 1021
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 58<400> 58
ctgatccttc aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa 60ctgatccttc aactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccacgttg tgtctcaaaa 60
tctctgatgt tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc 120tctctgatgt tacattgcac aagataaaaa tatatcatca tgaacaataa aactgtctgc 120
ttacataaac agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc 180ttacataaac agtaatacaa ggggtgttat gagccatatt caacgggaaa cgtcttgctc 180
caggccgcga ttaaattcca acatggatgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga 240caggccgcga ttaaattcca acatggatgc tgatttatat gggtataaat gggctcgcga 240
taatgtcggg caatcaggtg cgacaatcta tcgattgtat gggaagcccg atgcgccaga 300taatgtcggg caatcaggtg cgacaatcta tcgattgtat gggaagcccg atgcgccaga 300
gttgtttctg aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtcag 360gttgtttctg aaacatggca aaggtagcgt tgccaatgat gttacagatg agatggtcag 360
actaaactgg ctgacggaat ttatgcctct tccgaccatc aagcatttta tccgtactcc 420actaaactgg ctgacggaat ttatgcctct tccgaccatc aagcatttta tccgtactcc 420
tgatgatgca tggttactca ccactgcgat ccccgggaaa acagcattcc aggtattaga 480tgatgatgca tggttactca ccactgcgat ccccgggaaa acagcattcc aggtattaga 480
agaatatcct gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gcagtgttcc tgcgccggtt 540agaatatcct gattcaggtg aaaatattgt tgatgcgctg gcagtgttcc tgcgccggtt 540
gcattcgatt cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgcgtatttc gtctcgctca 600gcattcgatt cctgtttgta attgtccttt taacagcgat cgcgtatttc gtctcgctca 600
ggcgcaatca cgaatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa 660ggcgcaatca cgaatgaata acggtttggt tgatgcgagt gattttgatg acgagcgtaa 660
tggctggcct gttgaacaag tctggaaaga aatgcataag cttttgccat tctcaccgga 720tggctggcct gttgaacaag tctggaaaga aatgcataag cttttgccat tctcaccgga 720
ttcagtcgtc actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt 780ttcagtcgtc actcatggtg atttctcact tgataacctt atttttgacg aggggaaatt 780
aataggttgt attgatgttg gacgagtcgg aatcgcagac cgataccagg atcttgccat 840aataggttgt attgatgttg gacgagtcgg aatcgcagac cgataccagg atcttgccat 840
cctatggaac tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata 900cctatggaac tgcctcggtg agttttctcc ttcattacag aaacggcttt ttcaaaaata 900
tggtattgat aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagttttt 960tggtattgat aatcctgata tgaataaatt gcagtttcat ttgatgctcg atgagtttt 960
ctaataagcc ttgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 1020ctaataagcc ttgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 1020
a 1021a 1021
<210> 59<210> 59
<211> 1491<211> 1491
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 59<400> 59
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120
agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180
atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240
gactgttttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300gactgtttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300
gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360
aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420
gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480
ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540
accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600
gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660
gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720
aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780
ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840
gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900
tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960
tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020
cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080
gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140
ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200
ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260
actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320
ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380
ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440
ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491
<210> 60<210> 60
<211> 1491<211> 1491
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 60<400> 60
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gagcgtgttg 120
agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180agtcatcctg actagctgag atgagggctc gccccctcgt cccgacactt ccagatcgcc 180
atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240atagcgcaca gcgcctcgag cggtggtaac ggcgcagtgg cggttttcat ggcttgttat 240
gactgttttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300gactgtttt ttggggtaca gtctatgcct cgggcatcca agcagcaagc gcgttacgcc 300
gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360gtgggtcgat gtttgatgtt atggagcagc aacgatgtta cgcagcaggg cagtcgccct 360
aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420aaaacaaagt taaacatcat gagggaagcg gtgatcgccg aagtatcgac tcaactatca 420
gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480gaggtagttg gcgtcatcga gcgccatctc gaaccgacgt tgctggccgt acatttgtac 480
ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540ggctccgcag tggatggcgg cctgaagcca cacagtgata ttgatttgct ggttacggtg 540
accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600accgtaaggc ttgatgaaac aacgcggcga gctttgatca acgacctttt ggaaacttcg 600
gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660gcttcccctg gagagagcga gattctccgc gctgtagaag tcaccattgt tgtgcacgac 660
gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720gacatcattc cgtggcgtta tccagctaag cgcgaactgc aatttggaga atggcagcgc 720
aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780aatgacattc ttgcaggtat cttcgagcca gccacgatcg acattgatct ggctatcttg 780
ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840ctgacaaaag caagagaaca tagcgttgcc ttggtaggtc cagcggcgga ggaactcttt 840
gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900gatccggttc ctgaacagga tctatttgag gcgctaaatg aaaccttaac gctatggaac 900
tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960tcgccgcccg actgggctgg cgatgagcga aatgtagtgc ttacgttgtc ccgcatttgg 960
tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020tacagcgcag taaccggcaa aatcgcgccg aaggatgtcg ctgccgactg ggcaatggag 1020
cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080cgcctgccgg cccagtatca gcccgtcata cttgaagcta gacaggctta tcttggacaa 1080
gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140gaagaagatc gcttggcctc gcgcgcagat cagttggaag aatttgtcca ctacgtgaaa 1140
ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200ggcgagatca ccaaggtagt cggcaaataa tgtctaacaa ttcgttcaag ccgacgccgc 1200
ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260ttcgcggcgc ggcttaactc aagcgttaga tgcactaagc acataattgc tcacagccaa 1260
actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320actatcaggt caagtctgct tttattattt ttaagcgtgc ataataagcc ctacacaaat 1320
ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380ggtacccgac cggtggtgaa tttaatctcg ctgacgtgta gacattccct tatccagacg 1380
ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440ctgatcgccc atcatcgcgg ttctttagat ctctcggtcc gccctgatgg cggcaccttg 1440
ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491ctgacgttac gcctgccggt acagcaggtt atcaccggag gcttaaaatg a 1491
<210> 61<210> 61
<211> 1563<211> 1563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<400> 61<400> 61
atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60
agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120
catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180
ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240
ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300
ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360
gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420
cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480
atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc gcgtgccgga agatgatgaa 540atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc gcgtgccgga agatgatgaa 540
gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600
gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660
gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720
cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780
ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840
ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900
ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960
gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020
ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080
cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140
ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200
atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260
ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320
ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380
atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440
ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500
gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg tggaaccgtg cgccccggcg 15601560 gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac
taa 1563taa 1563
<210> 62<210> 62
<211> 1536<211> 1536
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> рДНК 16S - контиг 5, штамм CI006<223> rDNA 16S -
<400> 62<400> 62
ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60
gaacggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct 120gaacggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct 120
gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180
cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc agatgtgccc agatgggatt 240cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc agatgtgccc agatgggatt 240
agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300
accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360
attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420
ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggg agtaaggtta ataaccttat tcattgacgt 480ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggg agtaaggtta ataaccttat tcattgacgt 480
tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc 540tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc 540
aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggtctgtca agtcggatgt 600aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggtctgtca agtcggatgt 600
gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca tccgaaactg gcaggcttga gtctcgtaga 660gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca tccgaaactg gcaggcttga gtctcgtaga 660
gggaggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg 720gggaggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg 720
cgaaggcggc ctcctggacg aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag 780cgaaggcggc ctcctggacg aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag 780
gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcta tttggaggtt gtgcccttga 840gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcta tttggaggtt gtgcccttga 840
ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaaat agaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt 900ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaaat agaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt 900
aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat 960aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat 960
gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atccacagaa ctttccagag atggattggt 1020gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atccacagaa ctttccagag atggattggt 1020
gccttcggga actgtgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt 1080gccttcggga actgtgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt 1080
tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt tgccagcggt ccggccggga 11401140
actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat 1200actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat 1200
ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggcgc atacaaagag aagcgacctc 1260ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggcgc atacaaagag aagcgacctc 1260
gcgagagtaa gcggacctca taaagtgcgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac 1320gcgagagtaa gcggacctca taaagtgcgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac 1320
tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgtg gatcagaatg ccacggtgaa tacgttcccg 13801380
ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagctt 1440ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagctt 1440
aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg 1500aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg 1500
taaccgtagg ggaacctgcg gttggatcac ctcctt 1536taaccgtagg ggaacctgcg gttggatcac ctcctt 1536
<210> 63<210> 63
<211> 1537<211> 1537
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> рДНК 16S - контиг 8, штамм CI006<223> rDNA 16S -
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (450)..(450)<222> (450)..(450)
<223> a, c, g или t<223> a, c, g or t
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (452)..(452)<222> (452)..(452)
<223> a, c, g или t<223> a, c, g or t
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (455)..(455)<222> (455)..(455)
<223> a, c, g или t<223> a, c, g or t
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (473)..(473)<222> (473)..(473)
<223> a, c, g или t<223> a, c, g or t
<400> 63<400> 63
ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60
gaacggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct 120gaacggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct 120
gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180
cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc agatgtgccc agatgggatt 240cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc agatgtgccc agatgggatt 240
agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300
accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360
attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420
ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggn antanggtta ataacctgtg ttnattgacg 480ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggn antanggtta ataacctgtg ttnattgacg 480
ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540
caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600
tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc atccgaaact ggcaggcttg agtctcgtag 660tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc atccgaaact ggcaggcttg agtctcgtag 660
agggaggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720agggaggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720
gcgaaggcgg cctcctggac gaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780gcgaaggcgg ccctcctggac gaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780
ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtct atttggaggt tgtgcccttg 840ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtct atttggaggt tgtgcccttg 840
aggcgtggct tccggagcta acgcgttaaa tagaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900aggcgtggct tccggagcta acgcgttaaa tagaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900
taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960
tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacaga acttagcaga gatgctttgg 1020tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacaga acttagcaga gatgctttgg 1020
tgccttcggg aactgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080tgccttcggg aactgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080
ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg ttaggccggg 1140ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg ttaggccggg 1140
aactcaaagg agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca 1200aactcaaagg agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca 1200
tggcccttac gaccagggct acacacgtgc tacaatggcg catacaaaga gaagcgacct 1260tggcccttac gaccaggggct acacacgtgc tacaatggcg catacaaaga gaagcgacct 1260
cgcgagagta agcggacctc ataaagtgcg tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga 13201320 cgcgagagta agcggacctc ataaagtgcg tcgtagtccg
ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc 1380ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc 1380
gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa gtaggtagct 1440gggccttgta cacaccgcc gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa gtaggtagct 1440
taaccttcgg gagggcgctt accactttgt gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag 1500taaccttcgg gagggcgctt accactttgt gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag 1500
gtaaccgtag gggaacctgc ggttggatca cctcctt 1537gtaaccgtag gggaacctgc ggttggatca ccttcctt 1537
<210> 64<210> 64
<211> 1540<211> 1540
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Rahnella<213> view of Rahnella
<220><220>
<223> рДНК 16S, штамм CI019<223> rDNA 16S, strain CI019
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (70)..(70)<222> (70)..(70)
<223> a, c, g или t<223> a, c, g or t
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (267)..(267)<222> (267)..(267)
<223> a, c, g или t<223> a, c, g or t
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (455)..(455)<222> (455)..(455)
<223> a, c, g или t<223> a, c, g or t
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (458)..(458)<222> (458)..(458)
<223> a, c, g или t<223> a, c, g or t
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (473)..(473)<222> (473)..(473)
<223> a, c, g или t<223> a, c, g or t
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (1135)..(1135)<222> (1135)..(1135)
<223> a, c, g или t<223> a, c, g or t
<400> 64<400> 64
attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60
cgagcggcan cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120cgagcggcan cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120
tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180
cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240
attagctagt aggtgaggta atggctnacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300attagctagt aggtgaggta atggctnacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300
atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360
aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420
gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcancanac ttaatacgtg tgntgattga 480gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcancanac ttaatacgtg tgntgattga 480
cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540
tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600
tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660
agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720
tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780
caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840
tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900
gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960gttaaaactc aaatgaattg acggggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960
gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020
agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080
tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc acgtnatggt 11401140
gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200
tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260
actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320
cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt 1380cgactccatg tgaatacgtt 1380
cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440
gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500
aaggtaaccg taggggaacc tgcggttgga tcacctcctt 1540aaggtaaccg taggggaacc tgcggttggga tcacctcctt 1540
<210> 65<210> 65
<211> 882<211> 882
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> nifH, штамм CI006<223> nifH strain CI006
<400> 65<400> 65
atgaccatgc gtcaatgcgc catttacggc aaaggtggga tcggcaaatc gaccaccaca 60atgaccatgc gtcaatgcgc catttacggc aaaggtggga tcggcaaatc gaccaccaca 60
cagaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggtaaaaaag tcatgattgt cggctgtgac 120cagaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggtaaaaaag tcatgattgt cggctgtgac 120
ccgaaagccg attccacgcg tttgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180ccgaaagccg attccacgcg tttgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180
atggctgctg aagtcggctc cgtggaagac ctggagttag aagacgtgct gcaaatcggt 240atggctgctg aagtcggctc cgtggaagac ctggagttag aagacgtgct gcaaatcggt 240
tacggcggcg tgcgctgcgc agagtccggc ggcccggagc caggcgtggg ctgtgccggt 300tacggcggcg tgcgctgcgc agagtccggc ggcccggagc caggcgtggg ctgtgccggt 300
cgcggggtga tcaccgcgat taacttcctc gaagaagaag gcgcttacgt gccggatctc 360cgcggggtga tcaccgcgat taacttcctc gaagaagaag gcgcttacgt gccggatctc 360
gattttgttt tctacgacgt gctgggcgac gtggtatgcg gtggtttcgc catgccgatt 420gtggttgcg gtggtttcgc catgccgatt 420
cgtgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtttgctctg gcgaaatgat ggcgatgtac 480cgtgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtttgctctg gcgaaatgat ggcgatgtac 480
gccgccaaca acatctccaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggtaa agtgcgcctc 540gccgccaaca acatctccaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggtaa agtgcgcctc 540
ggcgggctga tttgtaactc gcgccagacc gaccgtgaag atgaactgat cattgcgctg 600ggcgggctga tttgtaactc gcgccagacc gaccgtgaag atgaactgat cattgcgctg 600
gcagaaaaac tcggcacgca gatgatccac tttgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgt 660gcagaaaaac tcggcacgca gatgatccac tttgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgt 660
gcggaaatcc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga cctgcaatca ggcgaacgaa 720gcggaaatcc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga cctgcaatca ggcgaacgaa 720
tatcgcagcc ttgccagcaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtgcc caccccctgc 780tatcgcagcc ttgccagcaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtgcc caccccctgc 780
accatggatg aactggaaga actgctgatg gagttcggca ttatggatgt ggaagacacc 840accatggatg aactggaaga actgctgatg gagttcggca ttatggatgt ggaagacacc 840
agcatcattg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgccgtct ga 882agcatcattg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgccgtct ga 882
<210> 66<210> 66
<211> 1449<211> 1449
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> NifD, штамм CI006<223> NifD strain CI006
<400> 66<400> 66
atgagcaatg caacaggcga acgcaacctg gagataatcg agcaggtgct cgaggttttc 60atgagcaatg caacaggcga acgcaacctg gagataatcg agcaggtgct cgaggttttc 60
ccggagaaga cgcgcaaaga acgcagaaaa cacatgatgg tgacggaccc ggagcaggaa 120ccggagaaga cgcgcaaaga acgcagaaaa cacatgatgg tgacggaccc ggagcaggaa 120
agcgtcggta agtgcatcat ctctaaccgc aaatcgcagc caggcgtgat gaccgtgcgc 180agcgtcggta agtgcatcat ctctaaccgc aaatcgcagc caggcgtgat gaccgtgcgc 180
ggctgctcgt atgccggttc gaaaggggtg gtatttgggc caatcaagga tatggcgcat 240ggctgctcgt atgccggttc gaaaggggtg gtatttgggc caatcaagga tatggcgcat 240
atctcgcatg gcccaatcgg ctgcggccaa tactcccgcg ccgggcggcg gaactactac 300atctcgcatg gcccaatcgg ctgcggccaa tactcccgcg ccgggcggcg gaactactac 300
accggcgtca gcggcgtgga cagcttcggc acgctcaact tcacctccga ttttcaggag 360accggcgtca gcggcgtgga cagcttcggc acgctcaact tcacctccga ttttcaggag 360
cgcgacatcg tgtttggcgg cgataaaaag ctcgccaaac tgattgaaga gctggaagag 420cgcgacatcg tgtttggcgg cgataaaaag ctcgccaaac tgattgaaga gctggaagag 420
ctgttcccgc tgaccaaagg catttcgatt cagtcggaat gcccggtcgg cctgattggc 480ctgttcccgc tgaccaaagg catttcgatt cagtcggaat gcccggtcgg cctgattggc 480
gatgacattg aggccgtcgc gaacgccagc cgcaaagcca tcaacaaacc ggttattccg 540gatgacattg aggccgtcgc gaacgccagc cgcaaagcca tcaacaaacc ggttattccg 540
gtgcgttgcg aaggctttcg cggcgtgtcg caatccctcg gtcaccatat tgccaacgat 600gtgcgttgcg aaggctttcg cggcgtgtcg caatccctcg gtcaccatat tgccaacgat 600
gtgatccgcg actgggtgct ggataaccgc gaaggcaaac cgttcgaatc caccccttac 660gtgatccgcg actgggtgct ggataaccgc gaaggcaaac cgttcgaatc caccccttac 660
gatgtggcga tcatcggcga ttacaacatc ggcggcgatg cctgggcttc gcgcattttg 720gatgtggcga tcatcggcga ttacaacatc ggcggcgatg cctgggcttc gcgcattttg 720
ctcgaagaga tgggcttgcg ggtggtggca cagtggtctg gcgacggtac gctggtggag 780ctcgaagaga tgggcttgcg ggtggtggca cagtggtctg gcgacggtac gctggtggag 780
atggaaaaca cgccgttcgt caaactgaac ctggtgcatt gttaccgctc aatgaactac 840atggaaaaca cgccgttcgt caaactgaac ctggtgcatt gttaccgctc aatgaactac 840
atctcgcgcc atatggagga gaagcacggt attccgtgga tggaatacaa cttctttggt 900atctcgcgcc atatggagga gaagcacggt attccgtgga tggaatacaa cttctttggt 900
ccgacgaaaa tcgcggaatc gctgcgcaaa atcgccgacc agtttgacga caccattcgc 960ccgacgaaaa tcgcggaatc gctgcgcaaa atcgccgacc agtttgacga caccattcgc 960
gccaacgccg aagcggtgat cgccagatac caggcgcaaa acgacgccat tatcgccaaa 1020gccaacgccg aagcggtgat cgccagatac caggcgcaaa acgacgccat tatcgccaaa 1020
tatcgcccgc gtctggaggg gcgcaaagtg ctgctttata tgggcgggct gcgtccgcgc 1080tatcgcccgc gtctggaggg gcgcaaagtg ctgctttata tgggcgggct gcgtccgcgc 1080
catgtgattg gcgcctatga agacctggga atggagatca tcgctgccgg ttatgagttc 1140catgtgattg gcgcctatga agacctggga atggagatca tcgctgccgg ttatgagttc 1140
ggtcataacg atgattacga ccgcaccttg ccggatctga aagagggcac gctgctgttt 1200ggtcataacg atgattacga ccgcaccttg ccggatctga aagagggcac gctgctgttt 1200
gatgatgcca gcagttatga gctggaggcg ttcgtcaacg cgctgaaacc ggatctcatc 1260gatgatgcca gcagttatga gctggaggcg ttcgtcaacg cgctgaaacc ggatctcatc 1260
ggttccggca tcaaagagaa gtacatcttt cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320ggttccggca tcaaagagaa gtacatcttt cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320
cactcctggg attactccgg cccgtaccac ggctatgacg gcttcgccat cttcgcccgc 1380cactcctggg attactccgg cccgtaccac ggctatgacg gcttcgccat cttcgcccgc 1380
gatatggata tgacgctcaa caaccccgcg tggggccagt tgaccgcgcc gtggctgaaa 1440gatatggata tgacgctcaa caaccccgcg tggggccagt tgaccgcgcc gtggctgaaa 1440
tccgcctga 1449tccgcctga 1449
<210> 67<210> 67
<211> 1563<211> 1563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> nifK, штамм CI006<223> nifK, strain CI006
<400> 67<400> 67
atgagccaga ctgctgagaa aatacagaat tgccatcccc tgtttgaaca ggatgcttac 60atgagccaga ctgctgagaa aatacagaat tgccatcccc tgtttgaaca ggatgcttac 60
cagacgctgt ttgccggtaa acgggcactc gaagaggcgc actcgccgga gcgggtgcag 120cagacgctgt ttgccggtaa acgggcactc gaagaggcgc actcgccgga gcgggtgcag 120
gaagtgtttc aatggaccac taccccggaa tatgaagcgc tgaactttaa acgcgaagcg 180180
ctgactatcg acccggcaaa agcctgccag ccgctgggcg cggtgctctg ttcgctgggg 240ctgactatcg acccggcaaa agcctgccag ccgctgggcg cggtgctctg ttcgctgggg 240
tttgccaata ccctaccgta tgtgcacggt tcacagggtt gcgtggccta tttccgcacg 300tttgccaata ccctaccgta tgtgcacggt tcacaggggtt gcgtggccta tttccgcacg 300
tactttaacc gccactttaa agaaccggtg gcctgcgtgt cggattcaat gacggaagac 360360
gcggcggtgt tcggcgggaa taacaacctc aacaccggct tacaaaacgc cagcgcgctg 420gcggcggtgt tcggcgggaa taacaacctc aacaccggct tacaaaacgc cagcgcgctg 420
tataaaccgg agattatcgc cgtctctacc acctgtatgg cggaagtgat cggtgatgat 480tataaaccgg agattatcgc cgtctctacc acctgtatgg cggaagtgat cggtgatgat 480
ttgcaggcct ttatcgccaa cgccaaaaaa gatggttttc tcgatgccgc catccccgtg 540ttgcaggcct ttatcgccaa cgccaaaaaa gatggttttc tcgatgccgc catccccgtg 540
ccctacgcgc acacccccag ttttatcggc agccatatca ccggctggga taacatgttt 600ccctacgcgc acacccccag ttttatcggc agccatatca ccggctggga taacatgttt 600
gaaggttttg cccggacctt tacggcagac catgaagctc agcccggcaa actttcacgc 660gaaggttttg cccggacctt tacggcagac catgaagctc agcccggcaa actttcacgc 660
atcaacctgg tgaccgggtt tgaaacctat ctcggcaatt tccgcgtgct gaaacgcatg 720atcaacctgg tgaccgggtt tgaaacctat ctcggcaatt tccgcgtgct gaaacgcatg 720
atggaacaaa tggaggtgcc ggcgagtgtg ctctccgatc cgtcggaagt gctggatact 780atggaacaaa tggaggtgcc ggcgagtgtg ctctccgatc cgtcggaagt gctggatact 780
cccgccaacg ggcattacca gatgtacgcg ggcgggacga cgcagcaaga gatgcgcgag 840cccgccaacg ggcattacca gatgtacgcg ggcgggacga cgcagcaaga gatgcgcgag 840
gcgccggatg ctatcgacac cctgttgctg cagccctggc aactggtgaa aagcaaaaaa 900gcgccggatg ctatcgacac cctgttgctg cagccctggc aactggtgaa aagcaaaaaa 900
gtggtgcagg agatgtggaa tcagcccgcc accgaggttt ctgttcccgt tgggctggca 960gtggtgcagg agatgtggaa tcagcccgcc accgaggttt ctgttcccgt tgggctggca 960
ggaacagacg aactgttgat ggcgattagc cagttaaccg gcaaggccat tcccgattca 1020ggaacagacg aactgttgat ggcgattagc cagttaaccg gcaaggccat tcccgattca 1020
ctggcgctgg agcgcgggcg gctggtcgat atgatgctcg attcccacac ctggttgcac 1080ctggcgctgg agcgcgggcg gctggtcgat atgatgctcg attcccacac ctggttgcac 1080
ggtaaaaaat tcggcctgtt tggcgatccg gattttgtca tgggattgac ccgtttcctg 1140ggtaaaaaat tcggcctgtt tggcgatccg gattttgtca tgggattgac ccgtttcctg 1140
ctggagctgg gctgcgaacc gaccgttatc ctctgccaca acggtaacaa acgctggcag 1200ctggagctgg gctgcgaacc gaccgttatc ctctgccaca acggtaacaa acgctggcag 1200
aaagcaatga agaaaatgct tgacgcctcg ccgtacggcc aggagagcga agtgtttatc 12601260
aactgcgatt tgtggcattt ccgctcgctg atgtttaccc gccagccgga ttttatgatt 1320aactgcgatt tgtggcattt ccgctcgctg atgtttaccc gccagccgga ttttatgatt 1320
ggcaactcgt acggcaagtt cattcagcgc gacaccttag ccaaaggcga gcagtttgaa 1380ggcaactcgt acggcaagtt cattcagcgc gacaccttag ccaaaggcga gcagtttgaa 1380
gttccgctga tccgcctcgg ttttcccctg ttcgaccgcc accatctgca ccgccagacc 1440gttccgctga tccgcctcgg ttttcccctg ttcgaccgcc accatctgca ccgccagacc 1440
acctggggct acgagggcgc catgagcatt ctcactaccc ttgtgaatgc ggtactggag 1500acctggggct acgagggcgc catgagcatt ctcactaccc ttgtgaatgc ggtactggag 1500
aaagtggaca aagagaccat caagctcggc aaaaccgact acagcttcga tcttatccgt 15601560
taa 1563taa 1563
<210> 68<210> 68
<211> 1488<211> 1488
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> nifL, штамм CI006<223> nifL strain CI006
<400> 68<400> 68
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc gcgcccgagg caatcgccgg tgcgctttcg 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc gcgcccgagg caatcgccgg tgcgctttcg 60
cgacaccatc ctgggctgtt ttttaccatc gttgaagaag cgcccgtcgc catttcgctg 120120
actgatgccg acgcacgcat tgtctatgcc aacccggctt tctgccgcca gaccggctat 180actgatgccg acgcacgcat tgtctatgcc aacccggctt tctgccgcca gaccggctat 180
gaactagaag cgttgttgca gcaaaatccc cgcctgcttg caagtcgcca aaccccacgg 240gaactagaag cgttgttgca gcaaaatccc cgcctgcttg caagtcgcca aacccccgg 240
gaaatctatc aggatatgtg gcacaccttg ttacaacgcc gaccgtggcg cgggcaattg 300gaaatctatc aggatatgtg gcacaccttg ttacaacgcc gaccgtggcg cgggcaattg 300
attaaccgcc accgcgacgg cagcctgtat ctggtcgaga tcgatatcac cccggtgatt 360attaaccgcc accgcgacgg cagcctgtat ctggtcgaga tcgatatcac cccggtgatt 360
aacccgtttg gcgaactgga acactacctg gcaatgcagc gcgatatcag cgccagttat 420aacccgtttg gcgaactgga acactacctg gcaatgcagc gcgatatcag cgccagttat 420
gcgctggagc agcggttgcg caatcacatg acgctgaccg aagcggtgct gaataacatt 480gcgctggagc agcggttgcg caatcacatg acgctgaccg aagcggtgct gaataacatt 480
ccggcggcgg tggttgtagt ggatgaacgc gatcatgtgg ttatggataa ccttgcctac 540ccggcggcgg tggttgtagt ggatgaacgc gatcatgtgg ttatggataa ccttgcctac 540
aaaacgttct gtgccgactg cggcggaaaa gagctcctga gcgaactcaa tttttcagcc 600aaaacgttct gtgccgactg cggcggaaaa gagctcctga gcgaactcaa tttttcagcc 600
cgaaaagcgg agctggcaaa cggccaggtc ttaccggtgg tgctgcgcgg tgaggtgcgc 660660
tggttgtcgg tgacctgctg ggcgctgccg ggcgtcagcg aagaagccag tcgctacttt 720tggttgtcgg tgacctgctg ggcgctgccg ggcgtcagcg aagaagccag tcgctacttt 720
attgataaca ggctgacgcg cacgctggtg gtgatcaccg acgacaccca acaacgccag 780attgataaca ggctgacgcg cacgctggtg gtgatcaccg acgacaccca acaacgccag 780
cagcaggaac agggccgact tgaccgcctt aaacagcaga tgaccaacgg caaactactg 840cagcaggaac agggccgact tgaccgcctt aaacagcaga tgaccaacgg caaactactg 840
gcagcgatcc gcgaagcgct tgacgccgcg ctgatccagc ttaactgccc catcaatatg 900gcagcgatcc gcgaagcgct tgacgccgcg ctgatccagc ttaactgccc catcaatatg 900
ctggcggcgg cgcgacgttt aaacggcagt gataacaaca atgtggcgct cgacgccgcg 960ctggcggcgg cgcgacgttt aaacggcagt gataacaaca atgtggcgct cgacgccgcg 960
tggcgcgaag gtgaagaggc gatggcgcgg ctgaaacgtt gccgcccgtc gctggaactg 1020tggcgcgaag gtgaagaggc gatggcgcgg ctgaaacgtt gccgcccgtc gctggaactg 1020
gaaagtgcgg ccgtctggcc gctgcaaccc ttttttgacg atctgcgcgc gctttatcac 1080gaaagtgcgg ccgtctggcc gctgcaaccc ttttttgacg atctgcgcgc gctttatcac 1080
acccgctacg agcaggggaa aaatttgcag gtcacgctgg attcccatca tctggtggga 1140acccgctacg agcaggggaa aaatttgcag gtcacgctgg attcccatca tctggtggga 1140
tttggtcagc gtacgcaact gttagcctgc ctgagtctgt ggctcgatcg cacgctggat 1200tttggtcagc gtacgcaact gttagcctgc ctgagtctgt ggctcgatcg cacgctggat 1200
attgccgccg ggctgggtga tttcaccgcg caaacgcaga tttacgcccg cgaagaagag 12601260
ggctggctct ctttgtatat cactgacaat gtgccgctga tcccgctgcg ccacacccac 1320ggctggctct ctttgtatat cactgacaat gtgccgctga tcccgctgcg cccacacccac 1320
tcgccggatg cgcttaacgc tccgggaaaa ggcatggagc tgcgcctgat ccagacgctg 13801380 tcgccggatg cgcttaacgc tccgggaaaa ggcatggagc
gtggcacacc accacggcgc aatagaactc acttcacacc ccgaaggggg aagttgcctg 1440gtggcacacc accacggcgc aatagaactc acttcacacc ccgaaggggg aagttgcctg 1440
accctacgat tcccgctatt tcattcactg accggaggtt caaaatga 1488accctacgat tcccgctatt tcattcactg accggaggtt caaaatga 1488
<210> 69<210> 69
<211> 1575<211> 1575
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> nifA, штамм CI006<223> nifA strain CI006
<400> 69<400> 69
atgacccagc gaaccgagtc gggtaatacc gtctggcgct tcgatttgtc ccagcagttc 60atgacccagc gaaccgagtc gggtaatacc gtctggcgct tcgatttgtc ccagcagttc 60
actgcgatgc agcgcataag cgtggtactc agccgggcga ccgaggtcga tcagacgctc 120actgcgatgc agcgcataag cgtggtactc agccgggcga ccgaggtcga tcagacgctc 120
cagcaagtgc tgtgcgtatt gcacaatgac gcctttttgc agcacggcat gatctgtctg 180cagcaagtgc tgtgcgtatt gcacaatgac gccttttttgc agcacggcat gatctgtctg 180
tacgacagcc agcaggcgat tttgaatatt gaagcgttgc aggaagccga tcagcagtta 240tacgacagcc agcaggcgat tttgaatatt gaagcgttgc aggaagccga tcagcagtta 240
atccccggca gctcgcaaat ccgctatcgt ccgggcgaag ggctggtcgg gacggtgctt 300atccccggca gctcgcaaat ccgctatcgt ccgggcgaag ggctggtcgg gacggtgctt 300
tcgcagggcc aatcattagt gctggcgcgc gttgctgacg atcagcgctt tcttgaccgg 360tcgcagggcc aatcattagt gctggcgcgc gttgctgacg atcagcgctt tcttgaccgg 360
ctcgggttgt atgattacaa cctgccgttt atcgccgtgc cgctgatagg gccagatgcg 420ctcgggttgt atgattacaa ccgccgttt atcgccgtgc cgctgatagg gccagatgcg 420
cagactttcg gtgtgctgac ggcacaaccc atggcgcgtt acgaagagcg attacccgcc 480cagactttcg gtgtgctgac ggcacaaccc atggcgcgtt acgaagagcg attacccgcc 480
tgcacccgct ttctggaaac ggtcgctaac ctggtcgcgc aaaccgtgcg tttgatggca 540tgcacccgct ttctggaaac ggtcgctaac ctggtcgcgc aaaccgtgcg tttgatggca 540
ccaccggcag tgcgcccttc cccgcgcgcc gccataacac aggccgccag cccgaaatcc 600ccaccggcag tgcgcccttc cccgcgcgcc gccataacac aggccgccag cccgaaatcc 600
tgcacggcct cacgcgcatt tggttttgaa aatatggtcg gtaacagtcc ggcgatgcgc 660tgcacggcct cacgcgcatt tggttttgaa aatatggtcg gtaacagtcc ggcgatgcgc 660
cagaccatgg agattatccg tcaggtttcg cgctgggaca ccaccgttct ggtacgcggc 720cagaccatgg agattatccg tcaggtttcg cgctgggaca ccaccgttct ggtacgcggc 720
gagagtggca ccggcaagga gctgattgcc aacgccatcc accaccattc gccgcgtgcc 780gagagtggca ccggcaagga gctgattgcc aacgccatcc accaccattc gccgcgtgcc 780
ggtgcgccat ttgtgaaatt caactgtgcg gcgctgccgg acacactgct ggaaagcgaa 840ggtgcgccat ttgtgaaatt caactgtgcg gcgctgccgg acacactgct ggaaagcgaa 840
ttgttcggtc acgagaaagg ggcatttacc ggcgcggtac gccagcgtaa aggccgtttt 900ttgttcggtc acgagaaagg ggcatttacc ggcgcggtac gccagcgtaa aggccgtttt 900
gagctggccg atggcggcac gctgtttctt gacgagatcg gcgagagtag cgcctcgttt 960gagctggccg atggcggcac gctgtttctt gacgagatcg gcgagagtag cgcctcgttt 960
caggctaagc tgctgcgcat tttgcaggaa ggcgaaatgg aacgcgtcgg cggcgacgag 1020caggctaagc tgctgcgcat tttgcaggaa ggcgaaatgg aacgcgtcgg cggcgacgag 1020
acattgcaag tgaatgtgcg cattattgcc gcgacgaacc gcaatcttga agatgaagtc 1080acattgcaag tgaatgtgcg cattattgcc gcgacgaacc gcaatcttga agatgaagtc 1080
cggctggggc actttcgcga agatctctat tatcgcctga atgtgatgcc catcgccctg 1140cggctggggc actttcgcga agatctctat tatcgcctga atgtgatgcc catcgccctg 1140
ccgccactac gcgaacgcca ggaggacatt gccgagctgg cgcactttct ggtgcgtaaa 1200ccgccactac gcgaacgcca ggaggacatt gccgagctgg cgcactttct ggtgcgtaaa 1200
atcgcccata accagagccg tacgctgcgc attagcgagg gcgctatccg cctgctgatg 1260atcgcccata accagagccg tacgctgcgc attagcgagg gcgctatccg cctgctgatg 1260
agctacaact ggcccggtaa tgtgcgcgaa ctggaaaact gccttgagcg ctcagcggtg 1320agctacaact ggcccggtaa tgtgcgcgaa ctggaaaact gccttgagcg ctcagcggtg 1320
atgtcggaga acggtctgat cgatcgggat gtgattttgt ttaatcatcg cgaccagcca 1380atgtcggaga acggtctgat cgatcgggat gtgattttgt ttaatcatcg cgaccagcca 1380
gccaaaccgc cagttatcag cgtctcgcat gatgataact ggctcgataa caaccttgac 1440gccaaaccgc cagttatcag cgtctcgcat gatgataact ggctcgataa caaccttgac 1440
gagcgccagc ggctgattgc ggcgctggaa aaagcgggat gggtacaagc caaagccgcg 1500gagcgccagc ggctgattgc ggcgctggaa aaagcgggat gggtacaagc caaagccgcg 1500
cgcttgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcctatcgta ttcagacgat ggatataacc 1560cgcttgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcctatcgta ttcagacgat ggatataacc 1560
ctgccaaggc tataa 1575ctgccaaggc tataa 1575
<210> 70<210> 70
<211> 876<211> 876
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Rahnella<213> view of Rahnella
<220><220>
<223> nifH, штамм CI019<223> nifH strain CI019
<400> 70<400> 70
atggcaatgc gtcaatgtgc aatctacggg aaagggggta ttggtaaatc caccactacc 60atggcaatgc gtcaatgtgc aatctacggg aaagggggta ttggtaaatc caccactacc 60
caaaaccttg tagcggctct ggccgaaatg aataagaagg tcatgatcgt cggctgtgac 120caaaaccttg tagcggctct ggccgaaatg aataagaagg tcatgatcgt cggctgtgac 120
cctaaggctg attcaacccg cctcattctg catgcgaaag cacagaacac catcatggaa 180cctaaggctg attcaacccg cctcattctg catgcgaaag cacagaacac catcatggaa 180
atggccgctg aagtgggctc cgtggaagat ctggagctgg aagatgtgat gcaaatcggc 240atggccgctg aagtgggctc cgtggaagat ctggagctgg aagatgtgat gcaaatcggc 240
tatggcggcg tgcgctgtgc ggaatcaggc ggccctgagc ctggtgtggg ttgtgccgga 300tatggcggcg tgcgctgtgc ggaatcaggc ggccctgagc ctggtgtggg ttgtgccgga 300
cgcggggtga tcaccgccat caacttcctc gaagaagaag gcgcgtatgt gccggatctg 360cgcggggtga tcaccgccat caacttcctc gaagaagaag gcgcgtatgt gccggatctg 360
gatttcgtgt tttacgacgt attgggcgat gtggtctgtg gcggtttcgc gatgccaatt 420gatttcgtgt tttacgacgt attgggcgat gtggtctgtg gcggtttcgc gatgccaatt 420
cgcgaaaaca aagcgcagga aatctacatc gtatgctccg gtgaaatgat ggcgatgtat 480cgcgaaaaca aagcgcagga aatctacatc gtatgctccg gtgaaatgat ggcgatgtat 480
gccgccaaca acatttccaa aggcatcgtg aaatacgcga aatcgggcaa agttcgcctg 540gccgccaaca acatttccaa aggcatcgtg aaatacgcga aatcgggcaa agttcgcctg 540
gccgggctga tctgtaactc ccgccagacg gatcgcgaag atgaactgat catcgcgctg 600gccgggctga tctgtaactc ccgccagacg gatcgcgaag atgaactgat catcgcgctg 600
gctgaaaaac ttggcacgca aatgatccac ttcgtgccgc gtgacaacat tgtgcaacgc 660gctgaaaaac ttggcacgca aatgatccac ttcgtgccgc gtgacaacat tgtgcaacgc 660
gctgaaatcc gccgcatgac ggtcatcgaa tacgacccga cttgtgcgca ggcagatcag 720gctgaaatcc gccgcatgac ggtcatcgaa tacgacccga cttgtgcgca ggcagatcag 720
tatcgtgcac tggcgaacaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtgcc gacaccggtc 780tatcgtgcac tggcgaacaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtgcc gacaccggtc 780
accatggatg agctggaagc cctgttaatg gaatttggca ttatggaaga agaagacctg 840840
accatcgtcg gtcgtaccgc cgccgaagag gcgtga 876accatcgtcg gtcgtaccgc cgccgaagag gcgtga 876
<210> 71<210> 71
<211> 1449<211> 1449
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Rahnella<213> view of Rahnella
<220><220>
<223> nifD, штамм CI019<223> nifD strain CI019
<400> 71<400> 71
atgaccagtg aaacacgcga acgtaacgag gcattgatcc aggaagtgct ggagatcttc 60atgaccagtg aaacacgcga acgtaacgag gcattgatcc aggaagtgct ggagatcttc 60
cccgagaagg cgcttaaaga tcgtaagaaa cacatgatga ccaccgaccc ggcgatggaa 120cccgagaagg cgcttaaaga tcgtaagaaa cacatgatga ccaccgaccc ggcgatggaa 120
tctgtcggca agtgtattgt ctcaaaccgc aaatcacagc cgggcgtgat gaccgtgcga 180tctgtcggca agtgtattgt ctcaaaccgc aaatcacagc cgggcgtgat gaccgtgcga 180
ggctgcgctt acgccggttc caaaggcgtg gtctttggcc cgatcaaaga catggcgcat 240ggctgcgctt acgccggttc caaaggcgtg gtctttggcc cgatcaaaga catggcgcat 240
atctcccacg gcccggttgg ttgcggccag tattctcgtg ccggacgccg taactattac 300atctccccg gcccggttgg ttgcggccag tattctcgtg ccggacgccg taactattac 300
accggctgga gcggcgtgaa cagctttggc accctcaact tcaccagtga ttttcaggaa 360accggctgga gcggcgtgaa cagctttggc accctcaact tcaccagtga ttttcaggaa 360
cgggacatcg tatttggcgg cgataaaaag ctcgacaaac tgatcgacga actggagatg 420cgggacatcg tatttggcgg cgataaaaag ctcgacaaac tgatcgacga actggagatg 420
ttgttcccgc tgaccaaagg catttcggta cagtcggaat gtccggtcgg tctgatcggc 480ttgttcccgc tgaccaaagg catttcggta cagtcggaat gtccggtcgg tctgatcggc 480
gatgacattt ctgccgtcgc caaagccagc agcgccaaaa tcggtaagcc ggtcgtgccg 540gatgacattt ctgccgtcgc caaagccagc agcgccaaaa tcggtaagcc ggtcgtgccg 540
gtacgctgcg aggggttccg cggtgtgtcg caatcgctcg gccatcacat tgctaacgat 600gtacgctgcg aggggttccg cggtgtgtcg caatcgctcg gccatcacat tgctaacgat 600
gtcatccgcg actgggtgct ggataaccgc gaaggcaatg aatttgaaac cacgccttac 660gtcatccgcg actgggtgct ggataaccgc gaaggcaatg aatttgaaac cacgccttac 660
gacgtggcga ttatcggcga ctacaacatc ggcggtgacg cctgggcctc acgtattctg 720gacgtggcga ttatcggcga ctacaacatc ggcggtgacg cctgggcctc acgtattctg 720
ctcgaagaaa tggggctgcg tgtggtggcg cagtggtccg gcgacggcac gctggtggag 780ctcgaagaaa tggggctgcg tgtggtggcg cagtggtccg gcgacggcac gctggtggag 780
atggaaaaca ccccgaaagt cgcactcaat ctggtgcact gctaccgctc gatgaactac 840atggaaaaca ccccgaaagt cgcactcaat ctggtgcact gctaccgctc gatgaactac 840
atctcccgtc atatggaaga aaaacacggc attccgtgga tggaatacaa cttctttggc 900atctcccgtc atatggaaga aaaacacggc attccgtgga tggaatacaa cttctttggc 900
ccgaccaaaa ttgcggaatc tctgcgcgaa atcgcggcgc gttttgacga taccatccgg 960ccgaccaaaa ttgcggaatc tctgcgcgaa atcgcggcgc gttttgacga taccatccgg 960
aaaaacgccg aagcggtgat tgaaaaatat caggcgcaaa cgcaggcggt gatcgacaaa 1020aaaaacgccg aagcggtgat tgaaaaatat caggcgcaaa cgcaggcggt gatcgacaaa 1020
taccgtccgc gtctggaagg caaaaaggtg ctgttgtatc tcggcggttt acgtccgcgc 1080taccgtccgc gtctggaagg caaaaaggtg ctgttgtatc tcggcggttt acgtccgcgc 1080
cacatcatcg gggcgtatga agatctggga atggaaatca tcggtaccgg ctatgaattc 1140cacatcatcg gggcgtatga agatctggga atggaaatca tcggtaccgg ctatgaattc 1140
ggtcataacg atgattacga ccgcacctta ccgatgctca aagaaggcac gttgctgttc 1200ggtcataacg atgattacga ccgcacctta ccgatgctca aagaaggcac gttgctgttc 1200
gatgacctga gcagttatga gctggaagcg ttcgttaaag cgctgaaacc ggatcttgtc 1260gatgacctga gcagttatga gctggaagcg ttcgttaaag cgctgaaacc ggatcttgtc 1260
gggtcaggca tcaaagaaaa atacattttc cagaaaatgg gcgtgccgtt ccgccagatg 1320gggtcaggca tcaaagaaaa atacattttc cagaaaatgg gcgtgccgtt ccgccagatg 1320
cactcctggg attattccgg cccttatcac ggctacgacg gtttcggcat ttttgcccgt 13801380
gacatggaca tgacgctgaa caatccgggc tggagtcagc tgaccgcccc ctggttgaaa 1440gacatggaca tgacgctgaa caatccgggc tggagtcagc tgaccgcccc ctggttgaaa 1440
tcggcctga 1449tcggcctga 1449
<210> 72<210> 72
<211> 1569<211> 1569
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Rahnella<213> view of Rahnella
<220><220>
<223> nifK, штамм CI019<223> nifK strain CI019
<400> 72<400> 72
atgagtcaag atcttggcac cccaaaatcc tgtttcccgc tgttcgagca ggatgaatac 60atgagtcaag atcttggcac cccaaaatcc tgtttcccgc tgttcgagca ggatgaatac 60
cagagtatgt ttacccacaa acgcgcgctg gaagaagcac acggcgaggc gaaagtgcgg 120cagagtatgt ttacccacaa acgcgcgctg gaagaagcac acggcgaggc gaaagtgcgg 120
gaagtgtttg aatggaccac cacgcaggaa tatcaggatc tgaacttctc gcgtgaagcg 180gaagtgtttg aatggaccac cacgcaggaa tatcaggatc tgaacttctc gcgtgaagcg 180
ctgaccgtcg acccggcgaa agcctgccag ccgttaggcg cggtactttg cgcgctgggt 240ctgaccgtcg acccggcgaa agcctgccag ccgttaggcg cggtactttg cgcgctgggt 240
tttgccaaca cgttgccgta tgtccacggt tcacaaggct gtgtggcgta tttccgtacc 300tttgccaaca cgttgccgta tgtccacggt tcacaaggct gtgtggcgta tttccgtacc 300
tattttaatc gtcatttcaa agagccggtg gcctgtgttt ccgactcaat gaccgaagat 360360
gccgccgttt ttggcggaaa taacaacatg aatgtcggtc tggaaaacgc cagcgcgctg 420gccgccgttt ttggcggaaa taacaacatg aatgtcggtc tggaaaacgc cagcgcgctg 420
tacaagccgg aaattattgc tgtctccacc acctgtatgg cggaagtgat cggtgatgac 480tacaagccgg aaattattgc tgtctccacc acctgtatgg cggaagtgat cggtgatgac 480
ctgcaggctt ttatcgccaa cgccaaaaaa gacggatttg tggatgccgg tatgccaatc 540ctgcaggctt ttatcgccaa cgccaaaaaa gacggatttg tggatgccgg tatgccaatc 540
ccgtatgccc atacaccgag ttttctgggc agtcatgtca ccggctggga caacatgttt 600ccgtatgccc atacaccgag ttttctgggc agtcatgtca ccggctggga caacatgttt 600
gaaggcttcg cccgtacctt taccaccgac gccacgcggg aatatcagcc gggcaaactt 660gaaggcttcg cccgtacctt taccaccgac gccacgcggg aatatcagcc gggcaaactt 660
gccaaactga acgtggtgac cggttttgaa acttatctcg gcaactaccg ggttattcac 720gccaaactga acgtggtgac cggttttgaa acttatctcg gcaactaccg ggttattcac 720
cgcatgatga gccagatggg ggtcgaatgc agcgtcttgt ccgatccgtc tgaagtgctc 780cgcatgatga gccagatggg ggtcgaatgc agcgtcttgt ccgatccgtc tgaagtgctc 780
gacaccccgg ctgacggcca ataccgcatg tatgccggcg gcaccacgca aaccgaaatg 840gacaccccgg ctgacggcca ataccgcatg tatgccggcg gcaccacgca aaccgaaatg 840
cgtgatgcac cggatgccat cgacaccttg ctgctgcaac cgtggcaatt gcagaaaacc 900cgtgatgcac cggatgccat cgacaccttg ctgctgcaac cgtggcaatt gcagaaaacc 900
aaaaaagtgg tgcagggcga ctggaatcag ccgggcaccg aagtcagtgt accgattggc 960aaaaaagtgg tgcagggcga ctggaatcag ccgggcaccg aagtcagtgt accgattggc 960
ctggcggcga ccgatgcctt gctgatgacg gtaagcgaac tgaccggcaa accgatagct 1020ctggcggcga ccgatgcctt gctgatgacg gtaagcgaac tgaccggcaa accgatagct 1020
gacacgctgg cgactgaacg tggccgtctg gtggacatga tgctcgattc ccacacctgg 1080gacacgctgg cgactgaacg tggccgtctg gtggacatga tgctcgattc ccacacctgg 1080
ctgcatggca agcgtttcgg tctctacggt gacccggatt ttgtgatggg catgaccgca 1140ctgcatggca agcgtttcgg tctctacggt gacccggatt ttgtgatgggg catgaccgca 1140
ttcctgctgg aactgggctg tgaaccgacc accattctca gccataacgg caacaaacgc 1200ttcctgctgg aactgggctg tgaaccgacc accattctca gccataacgg caacaaacgc 1200
tggcagaaag ccatgaagaa aatgctggct gattcgcctt acgggcagga cagcgaagtg 1260tggcagaaag ccatgaagaa aatgctggct gattcgcctt acgggcagga cagcgaagtg 1260
tatgtgaact gcgatctgtg gcatttccgc tcgctgatgt ttacccgtaa accggacttt 1320tatgtgaact gcgatctgtg gcatttccgc tcgctgatgt ttacccgtaa accggacttt 1320
atgatcggca actcttacgg aaaattcatt cagcgtgaca cgctggccaa aggcgaacag 1380atgatcggca actcttacgg aaaattcatt cagcgtgaca cgctggccaa aggcgaacag 1380
ttcgaagtgc cgctgatccg catcggtttt ccgatttttg accggcacca tttgcaccgt 1440ttcgaagtgc cgctgatccg catcggtttt ccgatttttg accggcacca tttgcaccgt 1440
cagaccacct ggggatacga aggggcgatg agcatactga cgcaactggt gaatgcggta 1500cagaccacct ggggatacga aggggcgatg agcatactga cgcaactggt gaatgcggta 1500
cttgaacaac tggatcgcga aaccatgaag ctcggcaaaa ccgactacaa cttcgacctg 1560cttgaacaac tggatcgcga aaccatgaag ctcggcaaaa ccgactacaa cttcgacctg 1560
atccgctaa 1569atccgctaa 1569
<210> 73<210> 73
<211> 1488<211> 1488
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Rahnella<213> view of Rahnella
<220><220>
<223> nifL, штамм CI019<223> nifL strain CI019
<400> 73<400> 73
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg ccagccagca gacgccgaaa 240240
catatctatg acgaaatgtg gcgcactttg ttgcagggca aatcctggaa cggccaactg 300catatctatg acgaaatgtg gcgcactttg ttgcaggggca aatcctggaa cggccaactg 300
atcaaccggc gtaataaccg ttcgctttat ctggcggatg tcactatcac gcctgtttta 360atcaaccggc gtaataaccg ttcgctttat ctggcggatg tcactatcac gcctgtttta 360
ggcgcggacg ggcaggtgga gcattacctc ggcatgcaca aagatatcag cgagaaatac 420ggcgcggacg ggcaggtgga gcattacctc ggcatgcaca aagatatcag cgagaaatac 420
gcgctggaac agcggttgcg caaccacatc accttgttca cggaggtgct gaacaatatt 480gcgctggaac agcggttgcg caaccacatc accttgttca cggaggtgct gaacaatatt 480
cccgccgccg tggtggtggt ggatgagcag gacaatgtgg tgatggacaa tctggcctac 540cccgccgccg tggtggtggt ggatgagcag gacaatgtgg tgatggacaa tctggcctac 540
aaaacccttt gcgcggactg cggcggcaaa gagctgctgg ctgaaatggg ctatccgcaa 600aaaacccttt gcgcggactg cggcggcaaa gagctgctgg ctgaaatgggg ctatccgcaa 600
ctcaaagaga tgctcaacag tggcgaaccg gtgccggttt ccatgcgcgg caacgtacgc 660ctcaaagaga tgctcaacag tggcgaaccg gtgccggttt ccatgcgcgg caacgtacgc 660
tggttttctt tcggtcaatg gttattgcag ggcgttaatg aagaggccag ccgctttttt 720tggttttctt tcggtcaatg gttattgcag ggcgttaatg aagaggccag ccgctttttt 720
accggcatta ccgcgccggg aaaactgatt gttctgaccg actgcaccga tcagcatcac 780accggcatta ccgcgccggg aaaactgatt gttctgaccg actgcaccga tcagcatcac 780
cggcagcagc agggttatct tgaccggctt aagcaaaaac tcaccaacgg caaattattg 840cggcagcagc agggttatct tgaccggctt aagcaaaaac tcaccaacgg caaattattg 840
gcggccatcc gtgagtcgct cgatgccgcg cttatccagc tcaacgggcc aatcaatatg 900gcggccatcc gtgagtcgct cgatgccgcg cttatccagc tcaacgggcc aatcaatatg 900
ctggcggctg cgcgtcgtct taacggcgaa gaaggcaaca acatggcgct ggaattcgcc 960ctggcggctg cgcgtcgtct taacggcgaa gaaggcaaca acatggcgct ggaattcgcc 960
tggcgcgaag gcgagcaggc ggtgagtcgc ttacaggcct gccgtccgtc gctggatttt 1020tggcgcgaag gcgagcaggc ggtgagtcgc ttacaggcct gccgtccgtc gctggatttt 1020
gagccgcagg cagaatggcc ggtcagtgaa ttctttgacg atctgagcgc gctgtacgac 1080gagccgcagg cagaatggcc ggtcagtgaa ttctttgacg atctgagcgc gctgtacgac 1080
agccattttc tcagtgacgg tgaattgcgt tacgtggtca tgccatctga tctgcacgct 1140agccattttc tcagtgacgg tgaattgcgt tacgtggtca tgccatctga tctgcacgct 1140
gtcgggcaac gaacgcaaat ccttaccgcg ctgagcttat ggattgatca cacgctgtca 1200gtcgggcaac gaacgcaaat ccttaccgcg ctgagcttat ggattgatca cacgctgtca 1200
caggcgcagg ccatgccgtc tctgaagctc tcggtgaaca ttgttgcgag gcaggatgcg 1260caggcgcagg ccatgccgtc tctgaagctc tcggtgaaca ttgttgcgag gcaggatgcg 1260
agctggttgt gttttgacat taccgataat gtgccgcgtg aacgggtgcg ttatgcccgc 1320agctggttgt gttttgacat taccgataat gtgccgcgtg aacgggtgcg ttatgcccgc 1320
ccggaagcgg cgttttcccg tccggggaat ggcatggagc tgcgccttat ccagacgctg 1380ccggaagcgg cgttttcccg tccggggaat ggcatggagc tgcgccttat cggacgctg 1380
atcgcccatc atcgcggttc tttagatctc tcggtccgcc ctgatggcgg caccttgctg 1440atcgcccatc atcgcggttc tttagatctc tcggtccgcc ctgatggcgg caccttgctg 1440
acgttacgcc tgccggtaca gcaggttatc accggaggct taaaatga 1488acgttacgcc tgccggtaca gcaggttatc accggaggct taaaatga 1488
<210> 74<210> 74
<211> 1557<211> 1557
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Rahnella<213> view of Rahnella
<220><220>
<223> nifA, штамм CI019<223> nifA strain CI019
<400> 74<400> 74
atgacccagt tacctaccgc gggcccggtt atccggcgct ttgatatgtc tgcccagttt 60atgacccagt tacctaccgc gggcccggtt atccggcgct ttgatatgtc tgcccagttt 60
acggcgcttt atcgcatcag cgtggcgctg agtcaggaaa gcaacaccgg gcgcgcactg 120acggcgcttt atcgcatcag cgtggcgctg agtcaggaaa gcaacaccgg gcgcgcactg 120
gcggcgatcc tcgaagtgct tcacgatcat gcatttatgc aatacggcat ggtgtgtctg 180gcggcgatcc tcgaagtgct tcacgatcat gcatttatgc aatacggcat ggtgtgtctg 180
tttgataaag aacgcaatgc actctttgtg gaatccctgc atggcatcga cggcgaaagg 240tttgataaag aacgcaatgc actctttgtg gaatccctgc atggcatcga cggcgaaagg 240
aaaaaagaga cccgccatgt ccgttaccgc atgggggaag gcgtgatcgg cgcggtgatg 300aaaaaagaga cccgccatgt ccgttaccgc atgggggaag gcgtgatcgg cgcggtgatg 300
agccagcgtc aggcgctggt gttaccgcgc atttcagacg atcagcgttt tctcgaccgc 360agccagcgtc aggcgctggt gttaccgcgc atttcagacg atcagcgttt tctcgaccgc 360
ctgaatattt acgattacag cctgccgttg attggcgtgc cgatccccgg tgcggataat 420ctgaatattt acgattacag cctgccgttg attggcgtgc cgatccccgg tgcggataat 420
cagccatcgg gcgtgctggt ggcacagccg atggcgttgc acgaagaccg gctgactgcc 480cagccatcgg gcgtgctggt ggcacagccg atggcgttgc acgaagaccg gctgactgcc 480
agtacgcggt ttttagaaat ggtcgccaat ctcatcagcc agccactgcg ttctgccacg 540agtacgcggt ttttagaaat ggtcgccaat ctcatcagcc agccactgcg ttctgccacg 540
cccccggaat cattgcctgc tcaaacgccg gtccggtgca gtgttccgcg ccagtttggt 600ccccgggaat cattgcctgc tcaaacgccg gtccggtgca gtgttccgcg ccagtttggt 600
ttcgagcaga tggtcgggaa aagtcaggcg atgcgccaga cgatggacat tttacggcag 660ttcgagcaga tggtcgggaa aagtcaggcg atgcgccaga cgatggacat tttacggcag 660
gtttccaaat gggataccac ggttctggtg cgtggtgaaa gcggcaccgg caaggaactt 720gtttccaaat gggataccac ggttctggtg cgtggtgaaa gcggcaccgg caaggaactt 720
atcgccaatg ccattcatta caactcaccc cgtgcggccg cgccatttgt gaaattcaac 780atcgccaatg ccattcatta caactcaccc cgtgcggccg cgccatttgt gaaattcaac 780
tgcgccgcgc tgccggataa cctgctggaa agcgaactgt tcggtcatga aaaaggggcc 840tgcgccgcgc tgccggataa cctgctggaa agcgaactgt tcggtcatga aaaaggggcc 840
ttcaccggcg ctatccgtac ccgtaaaggc cgctttgaac tggcggacgg gggcacgtta 900ttcaccggcg ctatccgtac ccgtaaaggc cgctttgaac tggcggacgg gggcacgtta 900
ttcctcgatg aaatcggcga atcgagcgcg tcgtttcagg ccaaattgct gcgcattttg 960ttcctcgatg aaatcggcga atcgagcgcg tcgtttcagg ccaaattgct gcgcattttg 960
caggaaggtg aaatggaacg ggtcggcggc gataccacgc tgaaagttga tgtgcgcatt 1020caggaaggtg aaatggaacg ggtcggcggc gataccacgc tgaaagttga tgtgcgcatt 1020
attgctgcca ccaaccgtaa tcttgaagag gaagtgcgtg ccgggaattt tcgcgaagac 10801080 attgctgcca ccaaccgtaa tcttgaagag gaagtgcgtg
ctgtattatc gcctgaacgt gatgccggtt tcgctgcctg cactgcgtga aaggctggat 1140ctgtattatc gcctgaacgt gatgccggtt tcgctgcctg cactgcgtga aaggctggat 1140
gatatcgccg atctggcgcc gtttctggtc aaaaagattg cgctgcgtca ggggcgggaa 1200gatatcgccg atctggcgcc gtttctggtc aaaaagattg cgctgcgtca ggggcgggaa 1200
ctgcgcatca gcgacggtgc ggtgcgtctg ctgatgacct acagctggcc aggcaacgtg 1260ctgcgcatca gcgacggtgc ggtgcgtctg ctgatgacct acagctggcc aggcaacgtg 1260
cgtgaactgg aaaactgtct cgaacgggcg tcggtaatga ccgatgaagg gctgatcgac 1320cgtgaactgg aaaactgtct cgaacgggcg tcggtaatga ccgatgaagg gctgatcgac 1320
cgcgacgtga tcctgttcaa tcaccatgaa tccccggcgc tgtccgtcaa acccggcctg 1380cgcgacgtga tcctgttcaa tcaccatgaa tccccggcgc tgtccgtcaa acccggcctg 1380
ccgctcgcga cagatgaaag ctggctggat caggaactcg acgaacgcca gcgggtgatt 1440ccgctcgcga cagatgaaag ctggctggat caggaactcg acgaacgcca gcgggtgatt 1440
gccgcactgg agaaaaccgg ctgggtgcag gccaaagcgg cccgactgct gggcatgaca 1500gccgcactgg agaaaaccgg ctgggtgcag gccaaagcgg cccgactgct gggcatgaca 1500
ccgcgccaga ttgcctaccg tatccagatt atggacatca acatgcaccg tatctga 1557ccgcgccaga ttgcctaccg tatccagatt atggacatca acatgcaccg tatctga 1557
<210> 75<210> 75
<211> 1314<211> 1314
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> Prm5 с фланкирующими областями длиной 500 п.н., штамм CI006<223> Prm5 with 500 bp flanking regions, strain CI006
<400> 75<400> 75
aaaactaccg ccgcaattaa tgaacccaac gctactgttg ccgggccatg ctcttccccg 60aaaactaccg ccgcaattaa tgaacccaac gctactgttg ccgggccatg ctcttccccg 60
gcgcgctgcc cggaaaggat atagattgcc cagcacgcgc cagcaccaag cgcgaacgcc 120gcgcgctgcc cggaaaggat atagattgcc cagcacgcgc cagcaccaag cgcgaacgcc 120
gcgccagtga gatcaacatg tgaaacattt tcgcccagcg gcagcagata caagaggcca 180gcgccagtga gatcaacatg tgaaacattt tcgcccagcg gcagcagata caagaggcca 180
agtaccgcca ggatcaccca gatgaaatcc accgggcggc gtgaggcaaa aagcgccacc 240agtaccgcca ggatcaccca gatgaaatcc accgggcggc gtgaggcaaa aagcgccacc 240
gccagcgggc cggtaaattc cagcgccacc gcaacgccga gcggtatcgt ctggatcgat 300gccagcgggc cggtaaattc cagcgccacc gcaacgccga gcggtatcgt ctggatcgat 300
aaatagaaca tatagttcat ggcgccgagc gacaggccat aaaacagcag tggcaggcgt 360aaatagaaca tatagttcat ggcgccgagc gacaggccat aaaacagcag tggcaggcgt 360
tgttcacggg taaaatgtaa acgccagggc ttgaacacta cgaccaaaat aagggtgcca 420tgttcacggg taaaatgtaa acgccagggc ttgaacacta cgaccaaaat aagggtgcca 420
agtgcgagac gcagcgcggt gacgccgggt gcgccaacaa tcggaaacag tgatttcgcc 480agtgcgagac gcagcgcggt gacgccgggt gcgccaacaa tcggaaacag tgatttcgcc 480
agcgacgcgc ctccctgaat ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac 540agcgacgcgc ctccctgaat ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac 540
accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag 600accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag 600
taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg aaaaaaagta 660taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg aaaaaaagta 660
actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc aattaagaat 720actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc aattaagaat 720
tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg ggaaaactgc 780tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg ggaaaactgc 780
ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aactttctgt tacatcaaat ggcgctttag 840ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aactttctgt tacatcaaat ggcgctttag 840
accccaattc ccgcaaagag tttcttaact aattttgata tatttaaacg cgtaggacgt 900accccaattc ccgcaaagag tttcttaact aattttgata tatttaaacg cgtaggacgt 900
aggatttact tgaagcacat ttgaggtgga ttatgaaaaa aattgcatgt ctttcagcac 960aggatttact tgaagcacat ttgaggtgga ttatgaaaaa aattgcatgt ctttcagcac 960
tggccgcact tctggcggtt tctgcaggtt ccgcagtagc agcaacttca accgtaactg 1020tggccgcact tctggcggtt tctgcaggtt ccgcagtagc agcaacttca accgtaactg 1020
gcggctacgc tcagagcgac gctcagggta ttgctaacaa aactaacggt ttcaacctga 1080gcggctacgc tcagagcgac gctcagggta ttgctaacaa aactaacggt ttcaacctga 1080
aatatcgcta cgagcaggac aacaacccgc tgggtgttat cggttccttt acttacactg 1140aatatcgcta cgagcaggac aacaacccgc tgggtgttat cggttccttt acttacactg 1140
aaaaagatcg caccgaaagc agcgtttata acaaagcgca gtactacggc atcaccgcag 1200aaaaagatcg caccgaaagc agcgtttata acaaagcgca gtactacggc atcaccgcag 1200
gcccggctta ccgcatcaac gactgggcga gcatctacgg tgttgtgggt gtaggttacg 12601260
gtaaattcca gcagactgta gacaccgcta aagtgtctga caccagcgac tacg 1314gtaaattcca gcagactgta gacaccgcta aagtgtctga caccagcgac tacg 1314
<210> 76<210> 76
<211> 3413<211> 3413
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> оперон nifLA - выше межгенной области и CDS nifL и nifA, штамм CI006<223> nifLA operon - upstream of the intergenic region and CDS nifL and nifA, strain CI006
<400> 76<400> 76
aacacacgct cctgttgaaa aagagatccc gccgggaaat gcggtgaacg tgtctgatat 60aacacacgct cctgttgaaa aagagatccc gccgggaaat gcggtgaacg tgtctgatat 60
tgcgaagagt gtgccagttt tggtcgcggg caaaacctgc accagtttgg ttattaatgc 120tgcgaagagt gtgccagttt tggtcgcggg caaaacctgc accagtttgg ttattaatgc 120
accagtctgg cgcttttttt cgccgagttt ctcctcgcta atgcccgcca ggcgcggctt 180accagtctgg cgcttttttt cgccgagttt ctcctcgcta atgcccgcca ggcgcggctt 180
tggcgctgat agcgcgctga ataccgatct ggatcaaggt tttgtcgggt tatcagccaa 240tggcgctgat agcgcgctga ataccgatct ggatcaaggt tttgtcgggt tatcagccaa 240
aaggtgcact ctttgcatgg ttatacgtgc ctgacatgtt gtccgggcga caaacggcct 300aaggtgcact ctttgcatgg ttatacgtgc ctgacatgtt gtccggggcga caaacggcct 300
ggtggcacaa attgtcagaa ctacgacacg actaactgac cgcaggagtg tgcgatgacc 360ggtggcacaa attgtcagaa ctacgacacg actaactgac cgcaggagtg tgcgatgacc 360
ctgaatatga tgatggatgc cggcgcgccc gaggcaatcg ccggtgcgct ttcgcgacac 420ctgaatatga tgatggatgc cggcgcgcc gaggcaatcg ccggtgcgct ttcgcgacac 420
catcctgggc tgttttttac catcgttgaa gaagcgcccg tcgccatttc gctgactgat 480catcctgggc tgttttttac catcgttgaa gaagcgcccg tcgccatttc gctgactgat 480
gccgacgcac gcattgtcta tgccaacccg gctttctgcc gccagaccgg ctatgaacta 540gccgacgcac gcattgtcta tgccaacccg gctttctgcc gccagaccgg ctatgaacta 540
gaagcgttgt tgcagcaaaa tccccgcctg cttgcaagtc gccaaacccc acgggaaatc 600gaagcgttgt tgcagcaaaa tccccgcctg cttgcaagtc gccaaacccc acgggaaatc 600
tatcaggata tgtggcacac cttgttacaa cgccgaccgt ggcgcgggca attgattaac 660tatcaggata tgtggcacac cttgttacaa cgccgaccgt ggcgcgggca attgattaac 660
cgccaccgcg acggcagcct gtatctggtc gagatcgata tcaccccggt gattaacccg 720cgccaccgcg acggcagcct gtatctggtc gagatcgata tcaccccggt gattaacccg 720
tttggcgaac tggaacacta cctggcaatg cagcgcgata tcagcgccag ttatgcgctg 780tttggcgaac tggaacacta cctggcaatg cagcgcgata tcagcgccag ttatgcgctg 780
gagcagcggt tgcgcaatca catgacgctg accgaagcgg tgctgaataa cattccggcg 840gagcagcggt tgcgcaatca catgacgctg accgaagcgg tgctgaataa cattccggcg 840
gcggtggttg tagtggatga acgcgatcat gtggttatgg ataaccttgc ctacaaaacg 900gcggtggttg tagtggatga acgcgatcat gtggttatgg ataaccttgc ctacaaaacg 900
ttctgtgccg actgcggcgg aaaagagctc ctgagcgaac tcaatttttc agcccgaaaa 960ttctgtgccg actgcggcgg aaaagagctc ctgagcgaac tcaatttttc agcccgaaaa 960
gcggagctgg caaacggcca ggtcttaccg gtggtgctgc gcggtgaggt gcgctggttg 1020gcggagctgg caaacggcca ggtcttaccg gtggtgctgc gcggtgaggt gcgctggttg 1020
tcggtgacct gctgggcgct gccgggcgtc agcgaagaag ccagtcgcta ctttattgat 10801080
aacaggctga cgcgcacgct ggtggtgatc accgacgaca cccaacaacg ccagcagcag 11401140
gaacagggcc gacttgaccg ccttaaacag cagatgacca acggcaaact actggcagcg 1200gaacagggcc gacttgaccg ccttaaacag cagatgacca acggcaaact actggcagcg 1200
atccgcgaag cgcttgacgc cgcgctgatc cagcttaact gccccatcaa tatgctggcg 1260atccgcgaag cgcttgacgc cgcgctgatc cagcttaact gccccatcaa tatgctggcg 1260
gcggcgcgac gtttaaacgg cagtgataac aacaatgtgg cgctcgacgc cgcgtggcgc 1320gcggcgcgac gtttaaacgg cagtgataac aacaatgtgg cgctcgacgc cgcgtggcgc 1320
gaaggtgaag aggcgatggc gcggctgaaa cgttgccgcc cgtcgctgga actggaaagt 1380gaaggtgaag aggcgatggc gcggctgaaa cgttgccgcc cgtcgctgga actggaaagt 1380
gcggccgtct ggccgctgca accctttttt gacgatctgc gcgcgcttta tcacacccgc 1440gcggccgtct ggccgctgca accctttttt gacgatctgc gcgcgcttta tcacacccgc 1440
tacgagcagg ggaaaaattt gcaggtcacg ctggattccc atcatctggt gggatttggt 1500tacgagcagg ggaaaaattt gcaggtcacg ctggattccc atcatctggt gggatttggt 1500
cagcgtacgc aactgttagc ctgcctgagt ctgtggctcg atcgcacgct ggatattgcc 1560cagcgtacgc aactgttagc ctgcctgagt ctgtggctcg atcgcacgct ggatattgcc 1560
gccgggctgg gtgatttcac cgcgcaaacg cagatttacg cccgcgaaga agagggctgg 16201620
ctctctttgt atatcactga caatgtgccg ctgatcccgc tgcgccacac ccactcgccg 1680ctctctttgt atatcactga caatgtgccg ctgatcccgc tgcgccacac ccactcgccg 1680
gatgcgctta acgctccggg aaaaggcatg gagctgcgcc tgatccagac gctggtggca 1740gatgcgctta acgctccggg aaaaggcatg gagctgcgcc tgatccagac gctggtggca 1740
caccaccacg gcgcaataga actcacttca caccccgaag ggggaagttg cctgacccta 1800caccaccacg gcgcaataga actcacttca caccccgaag ggggaagttg cctgacccta 1800
cgattcccgc tatttcattc actgaccgga ggttcaaaat gacccagcga accgagtcgg 1860cgattcccgc tattcattc actgaccgga ggttcaaaat gacccagcga accgagtcgg 1860
gtaataccgt ctggcgcttc gatttgtccc agcagttcac tgcgatgcag cgcataagcg 1920gtaataccgt ctggcgcttc gatttgtccc agcagttcac tgcgatgcag cgcataagcg 1920
tggtactcag ccgggcgacc gaggtcgatc agacgctcca gcaagtgctg tgcgtattgc 1980tggtactcag ccgggcgacc gaggtcgatc agacgctcca gcaagtgctg tgcgtattgc 1980
acaatgacgc ctttttgcag cacggcatga tctgtctgta cgacagccag caggcgattt 2040acaatgacgc ctttttgcag cacggcatga tctgtctgta cgacagccag caggcgattt 2040
tgaatattga agcgttgcag gaagccgatc agcagttaat ccccggcagc tcgcaaatcc 2100tgaatattga agcgttgcag gaagccgatc agcagttaat ccccggcagc tcgcaaatcc 2100
gctatcgtcc gggcgaaggg ctggtcggga cggtgctttc gcagggccaa tcattagtgc 2160gctatcgtcc gggcgaaggg ctggtcggga cggtgctttc gcagggccaa tcattagtgc 2160
tggcgcgcgt tgctgacgat cagcgctttc ttgaccggct cgggttgtat gattacaacc 2220tggcgcgcgt tgctgacgat cagcgctttc ttgaccggct cgggttgtat gattacaacc 2220
tgccgtttat cgccgtgccg ctgatagggc cagatgcgca gactttcggt gtgctgacgg 2280tgccgtttat cgccgtgccg ctgatagggc cagatgcgca gactttcggt gtgctgacgg 2280
cacaacccat ggcgcgttac gaagagcgat tacccgcctg cacccgcttt ctggaaacgg 2340cacaacccat ggcgcgttac gaagagcgat tacccgcctg cacccgcttt ctggaaacgg 2340
tcgctaacct ggtcgcgcaa accgtgcgtt tgatggcacc accggcagtg cgcccttccc 2400tcgctaacct ggtcgcgcaa accgtgcgtt tgatggcacc accggcagtg cgcccttccc 2400
cgcgcgccgc cataacacag gccgccagcc cgaaatcctg cacggcctca cgcgcatttg 2460cgcgcgccgc cataacacag gccgccagcc cgaaatcctg cacggcctca cgcgcatttg 2460
gttttgaaaa tatggtcggt aacagtccgg cgatgcgcca gaccatggag attatccgtc 2520gttttgaaaa tatggtcggt aacagtccgg cgatgcgcca gaccatggag attatccgtc 2520
aggtttcgcg ctgggacacc accgttctgg tacgcggcga gagtggcacc ggcaaggagc 2580aggtttcgcg ctgggacacc accgttctgg tacgcggcga gagtggcacc ggcaaggagc 2580
tgattgccaa cgccatccac caccattcgc cgcgtgccgg tgcgccattt gtgaaattca 2640tgattgccaa cgccatccac caccattcgc cgcgtgccgg tgcgccattt gtgaaattca 2640
actgtgcggc gctgccggac acactgctgg aaagcgaatt gttcggtcac gagaaagggg 2700actgtgcggc gctgccggac acactgctgg aaagcgaatt gttcggtcac gagaaagggg 2700
catttaccgg cgcggtacgc cagcgtaaag gccgttttga gctggccgat ggcggcacgc 2760catttaccgg cgcggtacgc cagcgtaaag gccgttttga gctggccgat ggcggcacgc 2760
tgtttcttga cgagatcggc gagagtagcg cctcgtttca ggctaagctg ctgcgcattt 2820tgtttcttga cgagatcggc gagagtagcg cctcgtttca ggctaagctg ctgcgcattt 2820
tgcaggaagg cgaaatggaa cgcgtcggcg gcgacgagac attgcaagtg aatgtgcgca 2880tgcaggaagg cgaaatggaa cgcgtcggcg gcgacgagac attgcaagtg aatgtgcgca 2880
ttattgccgc gacgaaccgc aatcttgaag atgaagtccg gctggggcac tttcgcgaag 2940ttattgccgc gacgaaccgc aatcttgaag atgaagtccg gctggggcac tttcgcgaag 2940
atctctatta tcgcctgaat gtgatgccca tcgccctgcc gccactacgc gaacgccagg 3000atctctatta tcgcctgaat gtgatgccca tcgccctgcc gccactacgc gaacgccagg 3000
aggacattgc cgagctggcg cactttctgg tgcgtaaaat cgcccataac cagagccgta 3060aggacattgc cgagctggcg cactttctgg tgcgtaaaat cgcccataac cagagccgta 3060
cgctgcgcat tagcgagggc gctatccgcc tgctgatgag ctacaactgg cccggtaatg 3120cgctgcgcat tagcgagggc gctatccgcc tgctgatgag ctacaactgg cccggtaatg 3120
tgcgcgaact ggaaaactgc cttgagcgct cagcggtgat gtcggagaac ggtctgatcg 3180tgcgcgaact ggaaaactgc cttgagcgct cagcggtgat gtcggagaac ggtctgatcg 3180
atcgggatgt gattttgttt aatcatcgcg accagccagc caaaccgcca gttatcagcg 3240atcgggatgt gattttgttt aatcatcgcg accagccagc caaaccgcca gttatcagcg 3240
tctcgcatga tgataactgg ctcgataaca accttgacga gcgccagcgg ctgattgcgg 3300tctcgcatga tgataactgg ctcgataaca accttgacga gcgccagcgg ctgattgcgg 3300
cgctggaaaa agcgggatgg gtacaagcca aagccgcgcg cttgctgggg atgacgccgc 3360cgctggaaaa agcgggatgg gtacaagcca aagccgcgcg cttgctgggg atgacgccgc 3360
gccaggtcgc ctatcgtatt cagacgatgg atataaccct gccaaggcta taa 3413gccaggtcgc ctatcgtatt cagacgatgg atataaccct gccaaggcta taa 3413
<210> 77<210> 77
<211> 495<211> 495
<212> Белок<212> Protein
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> NifL, штамм CI006<223> NifL strain CI006
<400> 77<400> 77
Met Thr Leu Asn Met Met Met Asp Ala Gly Ala Pro Glu Ala Ile Ala Met Thr Leu Asn Met Met Met Asp Ala Gly Ala Pro Glu Ala Ile Ala
1 5 10 15 1 5 10 15
Gly Ala Leu Ser Arg His His Pro Gly Leu Phe Phe Thr Ile Val Glu Gly Ala Leu Ser Arg His His Pro Gly Leu Phe Phe Thr Ile Val Glu
20 25 30 20 25 30
Glu Ala Pro Val Ala Ile Ser Leu Thr Asp Ala Asp Ala Arg Ile Val Glu Ala Pro Val Ala Ile Ser Leu Thr Asp Ala Asp Ala Arg Ile Val
35 40 45 35 40 45
Tyr Ala Asn Pro Ala Phe Cys Arg Gln Thr Gly Tyr Glu Leu Glu Ala Tyr Ala Asn Pro Ala Phe Cys Arg Gln Thr Gly Tyr Glu Leu Glu Ala
50 55 60 50 55 60
Leu Leu Gln Gln Asn Pro Arg Leu Leu Ala Ser Arg Gln Thr Pro Arg Leu Leu Gln Gln Asn Pro Arg Leu Leu Ala Ser Arg Gln Thr Pro Arg
65 70 75 80 65 70 75 80
Glu Ile Tyr Gln Asp Met Trp His Thr Leu Leu Gln Arg Arg Pro Trp Glu Ile Tyr Gln Asp Met Trp His Thr Leu Leu Gln Arg Arg Pro Trp
85 90 95 85 90 95
Arg Gly Gln Leu Ile Asn Arg His Arg Asp Gly Ser Leu Tyr Leu Val Arg Gly Gln Leu Ile Asn Arg His Arg Asp Gly Ser Leu Tyr Leu Val
100 105 110 100 105 110
Glu Ile Asp Ile Thr Pro Val Ile Asn Pro Phe Gly Glu Leu Glu His Glu Ile Asp Ile Thr Pro Val Ile Asn Pro Phe Gly Glu Leu Glu His
115 120 125 115 120 125
Tyr Leu Ala Met Gln Arg Asp Ile Ser Ala Ser Tyr Ala Leu Glu Gln Tyr Leu Ala Met Gln Arg Asp Ile Ser Ala Ser Tyr Ala Leu Glu Gln
130 135 140 130 135 140
Arg Leu Arg Asn His Met Thr Leu Thr Glu Ala Val Leu Asn Asn Ile Arg Leu Arg Asn His Met Thr Leu Thr Glu Ala Val Leu Asn Asn Ile
145 150 155 160 145 150 155 160
Pro Ala Ala Val Val Val Val Asp Glu Arg Asp His Val Val Met Asp Pro Ala Ala Val Val Val Val Asp Glu Arg Asp His Val Val Met Asp
165 170 175 165 170 175
Asn Leu Ala Tyr Lys Thr Phe Cys Ala Asp Cys Gly Gly Lys Glu Leu Asn Leu Ala Tyr Lys Thr Phe Cys Ala Asp Cys Gly Gly Lys Glu Leu
180 185 190 180 185 190
Leu Ser Glu Leu Asn Phe Ser Ala Arg Lys Ala Glu Leu Ala Asn Gly Leu Ser Glu Leu Asn Phe Ser Ala Arg Lys Ala Glu Leu Ala Asn Gly
195 200 205 195 200 205
Gln Val Leu Pro Val Val Leu Arg Gly Glu Val Arg Trp Leu Ser Val Gln Val Leu Pro Val Val Leu Arg Gly Glu Val Arg Trp Leu Ser Val
210 215 220 210 215 220
Thr Cys Trp Ala Leu Pro Gly Val Ser Glu Glu Ala Ser Arg Tyr Phe Thr Cys Trp Ala Leu Pro Gly Val Ser Glu Glu Ala Ser Arg Tyr Phe
225 230 235 240 225 230 235 240
Ile Asp Asn Arg Leu Thr Arg Thr Leu Val Val Ile Thr Asp Asp Thr Ile Asp Asn Arg Leu Thr Arg Thr Leu Val Val Ile Thr Asp Asp Thr
245 250 255 245 250 255
Gln Gln Arg Gln Gln Gln Glu Gln Gly Arg Leu Asp Arg Leu Lys Gln Gln Gln Arg Gln Gln Gln Glu Gln Gly Arg Leu Asp Arg Leu Lys Gln
260 265 270 260 265 270
Gln Met Thr Asn Gly Lys Leu Leu Ala Ala Ile Arg Glu Ala Leu Asp Gln Met Thr Asn Gly Lys Leu Leu Ala Ala Ile Arg Glu Ala Leu Asp
275 280 285 275 280 285
Ala Ala Leu Ile Gln Leu Asn Cys Pro Ile Asn Met Leu Ala Ala Ala Ala Ala Leu Ile Gln Leu Asn Cys Pro Ile Asn Met Leu Ala Ala Ala
290 295 300 290 295 300
Arg Arg Leu Asn Gly Ser Asp Asn Asn Asn Val Ala Leu Asp Ala Ala Arg Arg Leu Asn Gly Ser Asp Asn Asn Asn Val Ala Leu Asp Ala Ala
305 310 315 320 305 310 315 320
Trp Arg Glu Gly Glu Glu Ala Met Ala Arg Leu Lys Arg Cys Arg Pro Trp Arg Glu Gly Glu Glu Glu Ala Met Ala Arg Leu Lys Arg Cys Arg Pro
325 330 335 325 330 335
Ser Leu Glu Leu Glu Ser Ala Ala Val Trp Pro Leu Gln Pro Phe Phe Ser Leu Glu Leu Glu Ser Ala Ala Val Trp Pro Leu Gln Pro Phe Phe
340 345 350 340 345 350
Asp Asp Leu Arg Ala Leu Tyr His Thr Arg Tyr Glu Gln Gly Lys Asn Asp Asp Leu Arg Ala Leu Tyr His Thr Arg Tyr Glu Gln Gly Lys Asn
355 360 365 355 360 365
Leu Gln Val Thr Leu Asp Ser His His Leu Val Gly Phe Gly Gln Arg Leu Gln Val Thr Leu Asp Ser His His Leu Val Gly Phe Gly Gln Arg
370 375 380 370 375 380
Thr Gln Leu Leu Ala Cys Leu Ser Leu Trp Leu Asp Arg Thr Leu Asp Thr Gln Leu Leu Ala Cys Leu Ser Leu Trp Leu Asp Arg Thr Leu Asp
385 390 395 400 385 390 395 400
Ile Ala Ala Gly Leu Gly Asp Phe Thr Ala Gln Thr Gln Ile Tyr Ala Ile Ala Ala Gly Leu Gly Asp Phe Thr Ala Gln Thr Gln Ile Tyr Ala
405 410 415 405 410 415
Arg Glu Glu Glu Gly Trp Leu Ser Leu Tyr Ile Thr Asp Asn Val Pro Arg Glu Glu Glu Gly Trp Leu Ser Leu Tyr Ile Thr Asp Asn Val Pro
420 425 430 420 425 430
Leu Ile Pro Leu Arg His Thr His Ser Pro Asp Ala Leu Asn Ala Pro Leu Ile Pro Leu Arg His Thr His Ser Pro Asp Ala Leu Asn Ala Pro
435 440 445 435 440 445
Gly Lys Gly Met Glu Leu Arg Leu Ile Gln Thr Leu Val Ala His His Gly Lys Gly Met Glu Leu Arg Leu Ile Gln Thr Leu Val Ala His His
450 455 460 450 455 460
His Gly Ala Ile Glu Leu Thr Ser His Pro Glu Gly Gly Ser Cys Leu His Gly Ala Ile Glu Leu Thr Ser His Pro Glu Gly Gly Ser Cys Leu
465 470 475 480 465 470 475 480
Thr Leu Arg Phe Pro Leu Phe His Ser Leu Thr Gly Gly Ser Lys Thr Leu Arg Phe Pro Leu Phe His Ser Leu Thr Gly Gly Ser Lys
485 490 495 485 490 495
<210> 78<210> 78
<211> 524<211> 524
<212> Белок<212> Protein
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> NifA, штамм CI006<223> NifA strain CI006
<400> 78<400> 78
Met Thr Gln Arg Thr Glu Ser Gly Asn Thr Val Trp Arg Phe Asp Leu Met Thr Gln Arg Thr Glu Ser Gly Asn Thr Val Trp Arg Phe Asp Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Ser Gln Gln Phe Thr Ala Met Gln Arg Ile Ser Val Val Leu Ser Arg Ser Gln Gln Phe Thr Ala Met Gln Arg Ile Ser Val Val Leu Ser Arg
20 25 30 20 25 30
Ala Thr Glu Val Asp Gln Thr Leu Gln Gln Val Leu Cys Val Leu His Ala Thr Glu Val Asp Gln Thr Leu Gln Gln Val Leu Cys Val Leu His
35 40 45 35 40 45
Asn Asp Ala Phe Leu Gln His Gly Met Ile Cys Leu Tyr Asp Ser Gln Asn Asp Ala Phe Leu Gln His Gly Met Ile Cys Leu Tyr Asp Ser Gln
50 55 60 50 55 60
Gln Ala Ile Leu Asn Ile Glu Ala Leu Gln Glu Ala Asp Gln Gln Leu Gln Ala Ile Leu Asn Ile Glu Ala Leu Gln Glu Ala Asp Gln Gln Leu
65 70 75 80 65 70 75 80
Ile Pro Gly Ser Ser Gln Ile Arg Tyr Arg Pro Gly Glu Gly Leu Val Ile Pro Gly Ser Ser Gln Ile Arg Tyr Arg Pro Gly Glu Gly Leu Val
85 90 95 85 90 95
Gly Thr Val Leu Ser Gln Gly Gln Ser Leu Val Leu Ala Arg Val Ala Gly Thr Val Leu Ser Gln Gly Gln Ser Leu Val Leu Ala Arg Val Ala
100 105 110 100 105 110
Asp Asp Gln Arg Phe Leu Asp Arg Leu Gly Leu Tyr Asp Tyr Asn Leu Asp Asp Gln Arg Phe Leu Asp Arg Leu Gly Leu Tyr Asp Tyr Asn Leu
115 120 125 115 120 125
Pro Phe Ile Ala Val Pro Leu Ile Gly Pro Asp Ala Gln Thr Phe Gly Pro Phe Ile Ala Val Pro Leu Ile Gly Pro Asp Ala Gln Thr Phe Gly
130 135 140 130 135 140
Val Leu Thr Ala Gln Pro Met Ala Arg Tyr Glu Glu Arg Leu Pro Ala Val Leu Thr Ala Gln Pro Met Ala Arg Tyr Glu Glu Glu Arg Leu Pro Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Cys Thr Arg Phe Leu Glu Thr Val Ala Asn Leu Val Ala Gln Thr Val Cys Thr Arg Phe Leu Glu Thr Val Ala Asn Leu Val Ala Gln Thr Val
165 170 175 165 170 175
Arg Leu Met Ala Pro Pro Ala Val Arg Pro Ser Pro Arg Ala Ala Ile Arg Leu Met Ala Pro Pro Ala Val Arg Pro Ser Pro Arg Ala Ala Ile
180 185 190 180 185 190
Thr Gln Ala Ala Ser Pro Lys Ser Cys Thr Ala Ser Arg Ala Phe Gly Thr Gln Ala Ala Ser Pro Lys Ser Cys Thr Ala Ser Arg Ala Phe Gly
195 200 205 195 200 205
Phe Glu Asn Met Val Gly Asn Ser Pro Ala Met Arg Gln Thr Met Glu Phe Glu Asn Met Val Gly Asn Ser Pro Ala Met Arg Gln Thr Met Glu
210 215 220 210 215 220
Ile Ile Arg Gln Val Ser Arg Trp Asp Thr Thr Val Leu Val Arg Gly Ile Ile Arg Gln Val Ser Arg Trp Asp Thr Thr Val Leu Val Arg Gly
225 230 235 240 225 230 235 240
Glu Ser Gly Thr Gly Lys Glu Leu Ile Ala Asn Ala Ile His His His Glu Ser Gly Thr Gly Lys Glu Leu Ile Ala Asn Ala Ile His His His
245 250 255 245 250 255
Ser Pro Arg Ala Gly Ala Pro Phe Val Lys Phe Asn Cys Ala Ala Leu Ser Pro Arg Ala Gly Ala Pro Phe Val Lys Phe Asn Cys Ala Ala Leu
260 265 270 260 265 270
Pro Asp Thr Leu Leu Glu Ser Glu Leu Phe Gly His Glu Lys Gly Ala Pro Asp Thr Leu Leu Glu Ser Glu Leu Phe Gly His Glu Lys Gly Ala
275 280 285 275 280 285
Phe Thr Gly Ala Val Arg Gln Arg Lys Gly Arg Phe Glu Leu Ala Asp Phe Thr Gly Ala Val Arg Gln Arg Lys Gly Arg Phe Glu Leu Ala Asp
290 295 300 290 295 300
Gly Gly Thr Leu Phe Leu Asp Glu Ile Gly Glu Ser Ser Ala Ser Phe Gly Gly Thr Leu Phe Leu Asp Glu Ile Gly Glu Ser Ser Ala Ser Phe
305 310 315 320 305 310 315 320
Gln Ala Lys Leu Leu Arg Ile Leu Gln Glu Gly Glu Met Glu Arg Val Gln Ala Lys Leu Leu Arg Ile Leu Gln Glu Gly Glu Met Glu Arg Val
325 330 335 325 330 335
Gly Gly Asp Glu Thr Leu Gln Val Asn Val Arg Ile Ile Ala Ala Thr Gly Gly Asp Glu Thr Leu Gln Val Asn Val Arg Ile Ile Ala Ala Thr
340 345 350 340 345 350
Asn Arg Asn Leu Glu Asp Glu Val Arg Leu Gly His Phe Arg Glu Asp Asn Arg Asn Leu Glu Asp Glu Val Arg Leu Gly His Phe Arg Glu Asp
355 360 365 355 360 365
Leu Tyr Tyr Arg Leu Asn Val Met Pro Ile Ala Leu Pro Pro Leu Arg Leu Tyr Tyr Arg Leu Asn Val Met Pro Ile Ala Leu Pro Pro Leu Arg
370 375 380 370 375 380
Glu Arg Gln Glu Asp Ile Ala Glu Leu Ala His Phe Leu Val Arg Lys Glu Arg Gln Glu Asp Ile Ala Glu Leu Ala His Phe Leu Val Arg Lys
385 390 395 400 385 390 395 400
Ile Ala His Asn Gln Ser Arg Thr Leu Arg Ile Ser Glu Gly Ala Ile Ile Ala His Asn Gln Ser Arg Thr Leu Arg Ile Ser Glu Gly Ala Ile
405 410 415 405 410 415
Arg Leu Leu Met Ser Tyr Asn Trp Pro Gly Asn Val Arg Glu Leu Glu Arg Leu Leu Met Ser Tyr Asn Trp Pro Gly Asn Val Arg Glu Leu Glu
420 425 430 420 425 430
Asn Cys Leu Glu Arg Ser Ala Val Met Ser Glu Asn Gly Leu Ile Asp Asn Cys Leu Glu Arg Ser Ala Val Met Ser Glu Asn Gly Leu Ile Asp
435 440 445 435 440 445
Arg Asp Val Ile Leu Phe Asn His Arg Asp Gln Pro Ala Lys Pro Pro Arg Asp Val Ile Leu Phe Asn His Arg Asp Gln Pro Ala Lys Pro Pro
450 455 460 450 455 460
Val Ile Ser Val Ser His Asp Asp Asn Trp Leu Asp Asn Asn Leu Asp Val Ile Ser Val Ser His Asp Asp Asn Trp Leu Asp Asn Asn Leu Asp
465 470 475 480 465 470 475 480
Glu Arg Gln Arg Leu Ile Ala Ala Leu Glu Lys Ala Gly Trp Val Gln Glu Arg Gln Arg Leu Ile Ala Ala Leu Glu Lys Ala Gly Trp Val Gln
485 490 495 485 490 495
Ala Lys Ala Ala Arg Leu Leu Gly Met Thr Pro Arg Gln Val Ala Tyr Ala Lys Ala Ala Arg Leu Leu Gly Met Thr Pro Arg Gln Val Ala Tyr
500 505 510 500 505 510
Arg Ile Gln Thr Met Asp Ile Thr Leu Pro Arg Leu Arg Ile Gln Thr Met Asp Ile Thr Leu Pro Arg Leu
515 520 515 520
<210> 79<210> 79
<211> 2850<211> 2850
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> glnE, штамм CI006<223> glnE strain CI006
<400> 79<400> 79
atgccgcacc acgcaggatt gtcgcagcac tggcaaacgg tattttctcg tctgccggaa 60atgccgcacc acgcaggatt gtcgcagcac tggcaaacgg tattttctcg tctgccggaa 60
tcgctcaccg cgcagccatt gagcgcgcag gcgcagtcag tgctcacttt tagtgatttt 120tcgctcaccg cgcagccatt gagcgcgcag gcgcagtcag tgctcacttt tagtgatttt 120
gttcaggaca gcatcatcgc gcatcctgag tggctggcag agcttgaaag cgcgccgccg 180gttcaggaca gcatcatcgc gcatcctgag tggctggcag agcttgaaag cgcgccgccg 180
cctgcgaacg aatggcaaca ctatgcgcaa tggctgcaag cggcgctgga tggcgtcacc 240cctgcgaacg aatggcaaca ctatgcgcaa tggctgcaag cggcgctgga tggcgtcacc 240
gatgaagcct cgctgatgcg cgcgctgcgg ctgtttcgcc gtcgcatcat ggtgcgcatc 300gatgaagcct cgctgatgcg cgcgctgcgg ctgtttcgcc gtcgcatcat ggtgcgcatc 300
gcctggagcc aggcgttaca gttggtggcg gaagaagata tcctgcaaca gcttagcgtg 360gcctggagcc aggcgttaca gttggtggcg gaagaagata tcctgcaaca gcttagcgtg 360
ctggcggaaa ccctgatcgt cgccgcgcgc gactggcttt atgaggcctg ctgccgtgag 420ctggcggaaa ccctgatcgt cgccgcgcgc gactggcttt atgaggcctg ctgccgtgag 420
tggggaacgc cgagcaatcc acaaggcgtg gcgcagccga tgctggtact cggcatgggc 480tggggaacgc cgagcaatcc acaaggcgtg gcgcagccga tgctggtact cggcatggggc 480
aaactgggtg gcggcgaact caatttctca tccgatatcg atttgatttt cgcctggccg 540aaactgggtg gcggcgaact caatttctca tccgatatcg atttgatttt cgcctggccg 540
gaaaatggcg caacgcgcgg tggacgccgt gagctggata acgcgcaatt tttcactcgc 600gaaaatggcg caacgcgcgg tggacgccgt gagctggata acgcgcaatt tttcactcgc 600
cttggtcaac ggctgattaa agtcctcgac cagccaacgc aggatggctt tgtctaccgc 660cttggtcaac ggctgattaa agtcctcgac cagccaacgc aggatggctt tgtctaccgc 660
gtcgatatgc gcttgcgccc gtttggcgac agcggcccgc tggtgctgag ctttgccgcg 720gtcgatatgc gcttgcgccc gtttggcgac agcggcccgc tggtgctgag ctttgccgcg 720
ctggaagatt actaccagga gcaggggcgc gattgggaac gctacgcgat ggtgaaagcg 780ctggaagatt actaccagga gcaggggcgc gattgggaac gctacgcgat ggtgaaagcg 780
cgcattatgg gcgataacga cggcgaccat gcgcgggagt tgcgcgcaat gctgcgcccg 840cgcattatgg gcgataacga cggcgaccat gcgcgggagt tgcgcgcaat gctgcgcccg 840
tttgttttcc gccgttatat cgacttcagc gtgattcagt ccctgcgtaa catgaaaggc 900tttgttttcc gccgttatat cgacttcagc gtgattcagt ccctgcgtaa catgaaaggc 900
atgattgccc gcgaagtgcg tcgccgtggc ctgaaggaca acattaagct cggcgcgggc 960atgattgccc gcgaagtgcg tcgccgtggc ctgaaggaca acattaagct cggcgcgggc 960
gggatccgcg aaatagaatt tatcgtccag gttttccagc tgattcgcgg cggtcgcgag 1020gggatccgcg aaatagaatt tatcgtccag gttttccagc tgattcgcgg cggtcgcgag 1020
cctgcactgc aatcgcgttc actgttgccg acgcttgctg ccatagatca actgcatctg 1080cctgcactgc aatcgcgttc actgttgccg acgcttgctg ccatagatca actgcatctg 1080
ctgccggatg gcgacgcaac ccggctgcgc gaggcgtatt tgtggctgcg acggctggag 1140ctgccggatg gcgacgcaac ccggctgcgc gaggcgtatt tgtggctgcg acggctggag 1140
aacctgctgc aaagcatcaa tgacgaacag acacagacgc tgccgggcga tgaactgaat 1200aacctgctgc aaagcatcaa tgacgaacag aacacagacgc tgccgggcga tgaactgaat 1200
cgcgcgcgcc tcgcctgggg aatgggcaaa gatagctggg aagcgctctg cgaaacgctg 1260cgcgcgcgcc tcgcctgggg aatgggcaaa gatagctggg aagcgctctg cgaaacgctg 1260
gaagcgcata tgtcggcggt gcgtcagata tttaacgatc tgattggcga tgatgaaacg 13201320
gattcgccgg aagatgcgct ttctgagagc tggcgcgaat tgtggcagga tgcgttgcag 13801380
gaggaggatt ccacgcccgt gctggcgcat ctctcagagg acgatcgccg ccgcgtggtg 1440gaggaggatt ccacgcccgt gctggcgcat ctctcagagg acgatcgccg ccgcgtggtg 1440
gcgctgattg ccgattttcg caaagagttg gataaacgca ccattggccc gcgagggcgg 1500gcgctgattg ccgattttcg caaagagttg gataaacgca ccattggccc gcgagggcgg 1500
caggtactcg atcacttaat gccgcatctg ctcagcgatg tatgctcgcg cgacgatgcg 1560caggtactcg atcacttaat gccgcatctg ctcagcgatg tatgctcgcg cgacgatgcg 1560
ccagtaccgc tgtcacgcct gacgccgctg ctcaccggaa ttattacccg caccacttac 1620ccagtaccgc tgtcacgcct gacgccgctg ctcaccggaa ttattacccg caccacttac 1620
cttgagctgc taagtgaatt tcccggcgca ctgaaacacc tcatttccct gtgtgccgcg 1680cttgagctgc taagtgaatt tcccggcgca ctgaaacacc tcatttccct gtgtgccgcg 1680
tcgccgatgg ttgccagtca gctggcgcgc tacccgatcc tgcttgatga attgctcgac 1740tcgccgatgg ttgccagtca gctggcgcgc tacccgatcc tgcttgatga attgctcgac 1740
ccgaatacgc tctatcaacc gacggcgatg aatgcctatc gcgatgagct gcgccaatac 1800ccgaatacgc tctatcaacc gacggcgatg aatgcctatc gcgatgagct gcgccaatac 1800
ctgctgcgcg tgccggaaga tgatgaagag caacagcttg aggcgctgcg gcagtttaag 1860ctgctgcgcg tgccggaaga tgatgaagag caacagcttg aggcgctgcg gcagtttaag 1860
caggcgcagt tgctgcgcgt ggcggcggcg gatattgccg gtacgttgcc agtaatgaaa 1920caggcgcagt tgctgcgcgt ggcggcggcg gatattgccg gtacgttgcc agtaatgaaa 1920
gtgagcgatc acttaacctg gctggcggaa gcgattattg atgcggtggt gcagcaagcc 1980gtgagcgatc acttaacctg gctggcggaa gcgattattg atgcggtggt gcagcaagcc 1980
tgggggcaga tggtggcgcg ttatggccag ccaacgcatc tgcacgatcg cgaagggcgc 2040tgggggcaga tggtggcgcg ttatggccag ccaacgcatc tgcacgatcg cgaagggcgc 2040
ggttttgcgg tggtcggtta tggcaagctg ggcggctggg agctgggtta cagctccgat 2100ggttttgcgg tggtcggtta tggcaagctg ggcggctggg agctgggtta cagctccgat 2100
ctggatctgg tattcctgca cgactgcccg atggatgtga tgaccgatgg cgagcgtgaa 2160ctggatctgg tattcctgca cgactgcccg atggatgtga tgaccgatgg cgagcgtgaa 2160
atcgatggtc gccagttcta tttgcgtctc gcgcagcgcg tgatgcacct gtttagcacg 2220atcgatggtc gccagttcta tttgcgtctc gcgcagcgcg tgatgcacct gtttagcacg 2220
cgcacgtcgt ccggcatcct ttatgaagtt gatgcgcgtc tgcgtccatc tggcgctgcg 2280cgcacgtcgt ccggcatcct ttatgaagtt gatgcgcgtc tgcgtccatc tggcgctgcg 2280
gggatgctgg tcactactac ggaatcgttc gccgattacc agcaaaacga agcctggacg 2340gggatgctgg tcactactac ggaatcgttc gccgattacc agcaaaacga agcctggacg 2340
tgggaacatc aggcgctggc ccgtgcgcgc gtggtgtacg gcgatccgca actgaccgcc 2400tgggaacatc aggcgctggc ccgtgcgcgc gtggtgtacg gcgatccgca actgaccgcc 2400
gaatttgacg ccattcgccg cgatattctg atgacgcctc gcgacggcgc aacgctgcaa 2460gaatttgacg ccattcgccg cgatattctg atgacgcctc gcgacggcgc aacgctgcaa 2460
accgacgtgc gagaaatgcg cgagaaaatg cgtgcccatc ttggcaacaa gcataaagac 2520accgacgtgc gagaaatgcg cgagaaaatg cgtgcccatc ttggcaacaa gcataaagac 2520
cgcttcgatc tgaaagccga tgaaggcggt atcaccgaca tcgagtttat cgcccaatat 25802580 cgcttcgatc tgaaagccga tgaaggcggt
ctggtgctgc gctttgccca tgacaagccg aaactgacgc gctggtcgga taatgtgcgc 2640ctggtgctgc gctttgccca tgacaagccg aaactgacgc gctggtcgga taatgtgcgc 2640
attctcgaag ggctggcgca aaacggcatc atggaggagc aggaagcgca ggcattgacg 2700attctcgaag ggctggcgca aaacggcatc atggaggagc aggaagcgca ggcattgacg 2700
ctggcgtaca ccacattgcg tgatgagctg caccacctgg cgctgcaaga gttgccggga 2760ctggcgtaca ccacattgcg tgatgagctg caccacctgg cgctgcaaga gttgccggga 2760
catgtggcgc tctcctgttt tgtcgccgag cgtgcgctta ttaaaaccag ctgggacaag 2820catgtggcgc tctcctgttt tgtcgccgag cgtgcgctta ttaaaaccag ctgggacaag 2820
tggctggtgg aaccgtgcgc cccggcgtaa 2850tggctggtgg aaccgtgcgc cccggcgtaa 2850
<210> 80<210> 80
<211> 1563<211> 1563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> glnE_KO1, штамм CI006<223> glnE_KO1, strain CI006
<400> 80<400> 80
atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60
agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120
catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180
ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240
ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300
ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360
gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420
cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480
atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc gcgtgccgga agatgatgaa 540atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc gcgtgccgga agatgatgaa 540
gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600
gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660
gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720
cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780
ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840
ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900
ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960
gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020
ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080
cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140
ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200
atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260
ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320
ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380
atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440
ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500
gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg tggaaccgtg cgccccggcg 15601560 gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac
taa 1563taa 1563
<210> 81<210> 81
<211> 949<211> 949
<212> Белок<212> Protein
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> glnE, штамм CI006<223> glnE strain CI006
<400> 81<400> 81
Met Pro His His Ala Gly Leu Ser Gln His Trp Gln Thr Val Phe Ser Met Pro His His Ala Gly Leu Ser Gln His Trp Gln Thr Val Phe Ser
1 5 10 15 1 5 10 15
Arg Leu Pro Glu Ser Leu Thr Ala Gln Pro Leu Ser Ala Gln Ala Gln Arg Leu Pro Glu Ser Leu Thr Ala Gln Pro Leu Ser Ala Gln Ala Gln
20 25 30 20 25 30
Ser Val Leu Thr Phe Ser Asp Phe Val Gln Asp Ser Ile Ile Ala His Ser Val Leu Thr Phe Ser Asp Phe Val Gln Asp Ser Ile Ile Ala His
35 40 45 35 40 45
Pro Glu Trp Leu Ala Glu Leu Glu Ser Ala Pro Pro Pro Ala Asn Glu Pro Glu Trp Leu Ala Glu Leu Glu Ser Ala Pro Pro Pro Ala Asn Glu
50 55 60 50 55 60
Trp Gln His Tyr Ala Gln Trp Leu Gln Ala Ala Leu Asp Gly Val Thr Trp Gln His Tyr Ala Gln Trp Leu Gln Ala Ala Leu Asp Gly Val Thr
65 70 75 80 65 70 75 80
Asp Glu Ala Ser Leu Met Arg Ala Leu Arg Leu Phe Arg Arg Arg Ile Asp Glu Ala Ser Leu Met Arg Ala Leu Arg Leu Phe Arg Arg Arg Ile
85 90 95 85 90 95
Met Val Arg Ile Ala Trp Ser Gln Ala Leu Gln Leu Val Ala Glu Glu Met Val Arg Ile Ala Trp Ser Gln Ala Leu Gln Leu Val Ala Glu Glu
100 105 110 100 105 110
Asp Ile Leu Gln Gln Leu Ser Val Leu Ala Glu Thr Leu Ile Val Ala Asp Ile Leu Gln Gln Leu Ser Val Leu Ala Glu Thr Leu Ile Val Ala
115 120 125 115 120 125
Ala Arg Asp Trp Leu Tyr Glu Ala Cys Cys Arg Glu Trp Gly Thr Pro Ala Arg Asp Trp Leu Tyr Glu Ala Cys Cys Arg Glu Trp Gly Thr Pro
130 135 140 130 135 140
Ser Asn Pro Gln Gly Val Ala Gln Pro Met Leu Val Leu Gly Met Gly Ser Asn Pro Gln Gly Val Ala Gln Pro Met Leu Val Leu Gly Met Gly
145 150 155 160 145 150 155 160
Lys Leu Gly Gly Gly Glu Leu Asn Phe Ser Ser Asp Ile Asp Leu Ile Lys Leu Gly Gly Gly Glu Leu Asn Phe Ser Ser Asp Ile Asp Leu Ile
165 170 175 165 170 175
Phe Ala Trp Pro Glu Asn Gly Ala Thr Arg Gly Gly Arg Arg Glu Leu Phe Ala Trp Pro Glu Asn Gly Ala Thr Arg Gly Gly Arg Arg Glu Leu
180 185 190 180 185 190
Asp Asn Ala Gln Phe Phe Thr Arg Leu Gly Gln Arg Leu Ile Lys Val Asp Asn Ala Gln Phe Phe Thr Arg Leu Gly Gln Arg Leu Ile Lys Val
195 200 205 195 200 205
Leu Asp Gln Pro Thr Gln Asp Gly Phe Val Tyr Arg Val Asp Met Arg Leu Asp Gln Pro Thr Gln Asp Gly Phe Val Tyr Arg Val Asp Met Arg
210 215 220 210 215 220
Leu Arg Pro Phe Gly Asp Ser Gly Pro Leu Val Leu Ser Phe Ala Ala Leu Arg Pro Phe Gly Asp Ser Gly Pro Leu Val Leu Ser Phe Ala Ala
225 230 235 240 225 230 235 240
Leu Glu Asp Tyr Tyr Gln Glu Gln Gly Arg Asp Trp Glu Arg Tyr Ala Leu Glu Asp Tyr Tyr Gln Glu Gln Gly Arg Asp Trp Glu Arg Tyr Ala
245 250 255 245 250 255
Met Val Lys Ala Arg Ile Met Gly Asp Asn Asp Gly Asp His Ala Arg Met Val Lys Ala Arg Ile Met Gly Asp Asn Asp Gly Asp His Ala Arg
260 265 270 260 265 270
Glu Leu Arg Ala Met Leu Arg Pro Phe Val Phe Arg Arg Tyr Ile Asp Glu Leu Arg Ala Met Leu Arg Pro Phe Val Phe Arg Arg Tyr Ile Asp
275 280 285 275 280 285
Phe Ser Val Ile Gln Ser Leu Arg Asn Met Lys Gly Met Ile Ala Arg Phe Ser Val Ile Gln Ser Leu Arg Asn Met Lys Gly Met Ile Ala Arg
290 295 300 290 295 300
Glu Val Arg Arg Arg Gly Leu Lys Asp Asn Ile Lys Leu Gly Ala Gly Glu Val Arg Arg Arg Gly Leu Lys Asp Asn Ile Lys Leu Gly Ala Gly
305 310 315 320 305 310 315 320
Gly Ile Arg Glu Ile Glu Phe Ile Val Gln Val Phe Gln Leu Ile Arg Gly Ile Arg Glu Ile Glu Phe Ile Val Gln Val Phe Gln Leu Ile Arg
325 330 335 325 330 335
Gly Gly Arg Glu Pro Ala Leu Gln Ser Arg Ser Leu Leu Pro Thr Leu Gly Gly Arg Glu Pro Ala Leu Gln Ser Arg Ser Leu Leu Pro Thr Leu
340 345 350 340 345 350
Ala Ala Ile Asp Gln Leu His Leu Leu Pro Asp Gly Asp Ala Thr Arg Ala Ala Ile Asp Gln Leu His Leu Leu Pro Asp Gly Asp Ala Thr Arg
355 360 365 355 360 365
Leu Arg Glu Ala Tyr Leu Trp Leu Arg Arg Leu Glu Asn Leu Leu Gln Leu Arg Glu Ala Tyr Leu Trp Leu Arg Arg Leu Glu Asn Leu Leu Gln
370 375 380 370 375 380
Ser Ile Asn Asp Glu Gln Thr Gln Thr Leu Pro Gly Asp Glu Leu Asn Ser Ile Asn Asp Glu Gln Thr Gln Thr Leu Pro Gly Asp Glu Leu Asn
385 390 395 400 385 390 395 400
Arg Ala Arg Leu Ala Trp Gly Met Gly Lys Asp Ser Trp Glu Ala Leu Arg Ala Arg Leu Ala Trp Gly Met Gly Lys Asp Ser Trp Glu Ala Leu
405 410 415 405 410 415
Cys Glu Thr Leu Glu Ala His Met Ser Ala Val Arg Gln Ile Phe Asn Cys Glu Thr Leu Glu Ala His Met Ser Ala Val Arg Gln Ile Phe Asn
420 425 430 420 425 430
Asp Leu Ile Gly Asp Asp Glu Thr Asp Ser Pro Glu Asp Ala Leu Ser Asp Leu Ile Gly Asp Asp Glu Thr Asp Ser Pro Glu Asp Ala Leu Ser
435 440 445 435 440 445
Glu Ser Trp Arg Glu Leu Trp Gln Asp Ala Leu Gln Glu Glu Asp Ser Glu Ser Trp Arg Glu Leu Trp Gln Asp Ala Leu Gln Glu Glu Asp Ser
450 455 460 450 455 460
Thr Pro Val Leu Ala His Leu Ser Glu Asp Asp Arg Arg Arg Val Val Thr Pro Val Leu Ala His Leu Ser Glu Asp Asp Arg Arg Arg Val Val
465 470 475 480 465 470 475 480
Ala Leu Ile Ala Asp Phe Arg Lys Glu Leu Asp Lys Arg Thr Ile Gly Ala Leu Ile Ala Asp Phe Arg Lys Glu Leu Asp Lys Arg Thr Ile Gly
485 490 495 485 490 495
Pro Arg Gly Arg Gln Val Leu Asp His Leu Met Pro His Leu Leu Ser Pro Arg Gly Arg Gln Val Leu Asp His Leu Met Pro His Leu Leu Ser
500 505 510 500 505 510
Asp Val Cys Ser Arg Asp Asp Ala Pro Val Pro Leu Ser Arg Leu Thr Asp Val Cys Ser Arg Asp Asp Ala Pro Val Pro Leu Ser Arg Leu Thr
515 520 525 515 520 525
Pro Leu Leu Thr Gly Ile Ile Thr Arg Thr Thr Tyr Leu Glu Leu Leu Pro Leu Leu Thr Gly Ile Ile Thr Arg Thr Thr Tyr Leu Glu Leu Leu
530 535 540 530 535 540
Ser Glu Phe Pro Gly Ala Leu Lys His Leu Ile Ser Leu Cys Ala Ala Ser Glu Phe Pro Gly Ala Leu Lys His Leu Ile Ser Leu Cys Ala Ala
545 550 555 560 545 550 555 560
Ser Pro Met Val Ala Ser Gln Leu Ala Arg Tyr Pro Ile Leu Leu Asp Ser Pro Met Val Ala Ser Gln Leu Ala Arg Tyr Pro Ile Leu Leu Asp
565 570 575 565 570 575
Glu Leu Leu Asp Pro Asn Thr Leu Tyr Gln Pro Thr Ala Met Asn Ala Glu Leu Leu Asp Pro Asn Thr Leu Tyr Gln Pro Thr Ala Met Asn Ala
580 585 590 580 585 590
Tyr Arg Asp Glu Leu Arg Gln Tyr Leu Leu Arg Val Pro Glu Asp Asp Tyr Arg Asp Glu Leu Arg Gln Tyr Leu Leu Arg Val Pro Glu Asp Asp
595 600 605 595 600 605
Glu Glu Gln Gln Leu Glu Ala Leu Arg Gln Phe Lys Gln Ala Gln Leu Glu Glu Gln Gln Leu Glu Ala Leu Arg Gln Phe Lys Gln Ala Gln Leu
610 615 620 610 615 620
Leu Arg Val Ala Ala Ala Asp Ile Ala Gly Thr Leu Pro Val Met Lys Leu Arg Val Ala Ala Ala Asp Ile Ala Gly Thr Leu Pro Val Met Lys
625 630 635 640 625 630 635 640
Val Ser Asp His Leu Thr Trp Leu Ala Glu Ala Ile Ile Asp Ala Val Val Ser Asp His Leu Thr Trp Leu Ala Glu Ala Ile Ile Asp Ala Val
645 650 655 645 650 655
Val Gln Gln Ala Trp Gly Gln Met Val Ala Arg Tyr Gly Gln Pro Thr Val Gln Gln Ala Trp Gly Gln Met Val Ala Arg Tyr Gly Gln Pro Thr
660 665 670 660 665 670
His Leu His Asp Arg Glu Gly Arg Gly Phe Ala Val Val Gly Tyr Gly His Leu His Asp Arg Glu Gly Arg Gly Phe Ala Val Val Gly Tyr Gly
675 680 685 675 680 685
Lys Leu Gly Gly Trp Glu Leu Gly Tyr Ser Ser Asp Leu Asp Leu Val Lys Leu Gly Gly Trp Glu Leu Gly Tyr Ser Ser Asp Leu Asp Leu Val
690 695 700 690 695 700
Phe Leu His Asp Cys Pro Met Asp Val Met Thr Asp Gly Glu Arg Glu Phe Leu His Asp Cys Pro Met Asp Val Met Thr Asp Gly Glu Arg Glu
705 710 715 720 705 710 715 720
Ile Asp Gly Arg Gln Phe Tyr Leu Arg Leu Ala Gln Arg Val Met His Ile Asp Gly Arg Gln Phe Tyr Leu Arg Leu Ala Gln Arg Val Met His
725 730 735 725 730 735
Leu Phe Ser Thr Arg Thr Ser Ser Gly Ile Leu Tyr Glu Val Asp Ala Leu Phe Ser Thr Arg Thr Ser Ser Gly Ile Leu Tyr Glu Val Asp Ala
740 745 750 740 745 750
Arg Leu Arg Pro Ser Gly Ala Ala Gly Met Leu Val Thr Thr Thr Glu Arg Leu Arg Pro Ser Gly Ala Ala Gly Met Leu Val Thr Thr Thr Glu
755 760 765 755 760 765
Ser Phe Ala Asp Tyr Gln Gln Asn Glu Ala Trp Thr Trp Glu His Gln Ser Phe Ala Asp Tyr Gln Gln Asn Glu Ala Trp Thr Trp Glu His Gln
770 775 780 770 775 780
Ala Leu Ala Arg Ala Arg Val Val Tyr Gly Asp Pro Gln Leu Thr Ala Ala Leu Ala Arg Ala Arg Val Val Tyr Gly Asp Pro Gln Leu Thr Ala
785 790 795 800 785 790 795 800
Glu Phe Asp Ala Ile Arg Arg Asp Ile Leu Met Thr Pro Arg Asp Gly Glu Phe Asp Ala Ile Arg Arg Asp Ile Leu Met Thr Pro Arg Asp Gly
805 810 815 805 810 815
Ala Thr Leu Gln Thr Asp Val Arg Glu Met Arg Glu Lys Met Arg Ala Ala Thr Leu Gln Thr Asp Val Arg Glu Met Arg Glu Lys Met Arg Ala
820 825 830 820 825 830
His Leu Gly Asn Lys His Lys Asp Arg Phe Asp Leu Lys Ala Asp Glu His Leu Gly Asn Lys His Lys Asp Arg Phe Asp Leu Lys Ala Asp Glu
835 840 845 835 840 845
Gly Gly Ile Thr Asp Ile Glu Phe Ile Ala Gln Tyr Leu Val Leu Arg Gly Gly Ile Thr Asp Ile Glu Phe Ile Ala Gln Tyr Leu Val Leu Arg
850 855 860 850 855 860
Phe Ala His Asp Lys Pro Lys Leu Thr Arg Trp Ser Asp Asn Val Arg Phe Ala His Asp Lys Pro Lys Leu Thr Arg Trp Ser Asp Asn Val Arg
865 870 875 880 865 870 875 880
Ile Leu Glu Gly Leu Ala Gln Asn Gly Ile Met Glu Glu Gln Glu Ala Ile Leu Glu Gly Leu Ala Gln Asn Gly Ile Met Glu Glu Gln Glu Ala
885 890 895 885 890 895
Gln Ala Leu Thr Leu Ala Tyr Thr Thr Leu Arg Asp Glu Leu His His Gln Ala Leu Thr Leu Ala Tyr Thr Thr Leu Arg Asp Glu Leu His His
900 905 910 900 905 910
Leu Ala Leu Gln Glu Leu Pro Gly His Val Ala Leu Ser Cys Phe Val Leu Ala Leu Gln Glu Leu Pro Gly His Val Ala Leu Ser Cys Phe Val
915 920 925 915 920 925
Ala Glu Arg Ala Leu Ile Lys Thr Ser Trp Asp Lys Trp Leu Val Glu Ala Glu Arg Ala Leu Ile Lys Thr Ser Trp Asp Lys Trp Leu Val Glu
930 935 940 930 935 940
Pro Cys Ala Pro Ala Pro Cys Ala Pro Ala
945 945
<210> 82<210> 82
<211> 520<211> 520
<212> Белок<212> Protein
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> GlnE_KO1, штамм CI006<223> GlnE_KO1 strain CI006
<400> 82<400> 82
Met Phe Asn Asp Leu Ile Gly Asp Asp Glu Thr Asp Ser Pro Glu Asp Met Phe Asn Asp Leu Ile Gly Asp Asp Glu Thr Asp Ser Pro Glu Asp
1 5 10 15 1 5 10 15
Ala Leu Ser Glu Ser Trp Arg Glu Leu Trp Gln Asp Ala Leu Gln Glu Ala Leu Ser Glu Ser Trp Arg Glu Leu Trp Gln Asp Ala Leu Gln Glu
20 25 30 20 25 30
Glu Asp Ser Thr Pro Val Leu Ala His Leu Ser Glu Asp Asp Arg Arg Glu Asp Ser Thr Pro Val Leu Ala His Leu Ser Glu Asp Asp Arg Arg
35 40 45 35 40 45
Arg Val Val Ala Leu Ile Ala Asp Phe Arg Lys Glu Leu Asp Lys Arg Arg Val Val Ala Leu Ile Ala Asp Phe Arg Lys Glu Leu Asp Lys Arg
50 55 60 50 55 60
Thr Ile Gly Pro Arg Gly Arg Gln Val Leu Asp His Leu Met Pro His Thr Ile Gly Pro Arg Gly Arg Gln Val Leu Asp His Leu Met Pro His
65 70 75 80 65 70 75 80
Leu Leu Ser Asp Val Cys Ser Arg Asp Asp Ala Pro Val Pro Leu Ser Leu Leu Ser Asp Val Cys Ser Arg Asp Asp Ala Pro Val Pro Leu Ser
85 90 95 85 90 95
Arg Leu Thr Pro Leu Leu Thr Gly Ile Ile Thr Arg Thr Thr Tyr Leu Arg Leu Thr Pro Leu Leu Thr Gly Ile Ile Thr Arg Thr Thr Tyr Leu
100 105 110 100 105 110
Glu Leu Leu Ser Glu Phe Pro Gly Ala Leu Lys His Leu Ile Ser Leu Glu Leu Leu Ser Glu Phe Pro Gly Ala Leu Lys His Leu Ile Ser Leu
115 120 125 115 120 125
Cys Ala Ala Ser Pro Met Val Ala Ser Gln Leu Ala Arg Tyr Pro Ile Cys Ala Ala Ser Pro Met Val Ala Ser Gln Leu Ala Arg Tyr Pro Ile
130 135 140 130 135 140
Leu Leu Asp Glu Leu Leu Asp Pro Asn Thr Leu Tyr Gln Pro Thr Ala Leu Leu Asp Glu Leu Leu Asp Pro Asn Thr Leu Tyr Gln Pro Thr Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Met Asn Ala Tyr Arg Asp Glu Leu Arg Gln Tyr Leu Leu Arg Val Pro Met Asn Ala Tyr Arg Asp Glu Leu Arg Gln Tyr Leu Leu Arg Val Pro
165 170 175 165 170 175
Glu Asp Asp Glu Glu Gln Gln Leu Glu Ala Leu Arg Gln Phe Lys Gln Glu Asp Asp Glu Glu Gln Gln Leu Glu Ala Leu Arg Gln Phe Lys Gln
180 185 190 180 185 190
Ala Gln Leu Leu Arg Val Ala Ala Ala Asp Ile Ala Gly Thr Leu Pro Ala Gln Leu Leu Arg Val Ala Ala Ala Asp Ile Ala Gly Thr Leu Pro
195 200 205 195 200 205
Val Met Lys Val Ser Asp His Leu Thr Trp Leu Ala Glu Ala Ile Ile Val Met Lys Val Ser Asp His Leu Thr Trp Leu Ala Glu Ala Ile Ile
210 215 220 210 215 220
Asp Ala Val Val Gln Gln Ala Trp Gly Gln Met Val Ala Arg Tyr Gly Asp Ala Val Val Gln Gln Ala Trp Gly Gln Met Val Ala Arg Tyr Gly
225 230 235 240 225 230 235 240
Gln Pro Thr His Leu His Asp Arg Glu Gly Arg Gly Phe Ala Val Val Gln Pro Thr His Leu His Asp Arg Glu Gly Arg Gly Phe Ala Val Val
245 250 255 245 250 255
Gly Tyr Gly Lys Leu Gly Gly Trp Glu Leu Gly Tyr Ser Ser Asp Leu Gly Tyr Gly Lys Leu Gly Gly Trp Glu Leu Gly Tyr Ser Ser Asp Leu
260 265 270 260 265 270
Asp Leu Val Phe Leu His Asp Cys Pro Met Asp Val Met Thr Asp Gly Asp Leu Val Phe Leu His Asp Cys Pro Met Asp Val Met Thr Asp Gly
275 280 285 275 280 285
Glu Arg Glu Ile Asp Gly Arg Gln Phe Tyr Leu Arg Leu Ala Gln Arg Glu Arg Glu Ile Asp Gly Arg Gln Phe Tyr Leu Arg Leu Ala Gln Arg
290 295 300 290 295 300
Val Met His Leu Phe Ser Thr Arg Thr Ser Ser Gly Ile Leu Tyr Glu Val Met His Leu Phe Ser Thr Arg Thr Ser Ser Gly Ile Leu Tyr Glu
305 310 315 320 305 310 315 320
Val Asp Ala Arg Leu Arg Pro Ser Gly Ala Ala Gly Met Leu Val Thr Val Asp Ala Arg Leu Arg Pro Ser Gly Ala Ala Gly Met Leu Val Thr
325 330 335 325 330 335
Thr Thr Glu Ser Phe Ala Asp Tyr Gln Gln Asn Glu Ala Trp Thr Trp Thr Thr Glu Ser Phe Ala Asp Tyr Gln Gln Asn Glu Ala Trp Thr Trp
340 345 350 340 345 350
Glu His Gln Ala Leu Ala Arg Ala Arg Val Val Tyr Gly Asp Pro Gln Glu His Gln Ala Leu Ala Arg Ala Arg Val Val Tyr Gly Asp Pro Gln
355 360 365 355 360 365
Leu Thr Ala Glu Phe Asp Ala Ile Arg Arg Asp Ile Leu Met Thr Pro Leu Thr Ala Glu Phe Asp Ala Ile Arg Arg Asp Ile Leu Met Thr Pro
370 375 380 370 375 380
Arg Asp Gly Ala Thr Leu Gln Thr Asp Val Arg Glu Met Arg Glu Lys Arg Asp Gly Ala Thr Leu Gln Thr Asp Val Arg Glu Met Arg Glu Lys
385 390 395 400 385 390 395 400
Met Arg Ala His Leu Gly Asn Lys His Lys Asp Arg Phe Asp Leu Lys Met Arg Ala His Leu Gly Asn Lys His Lys Asp Arg Phe Asp Leu Lys
405 410 415 405 410 415
Ala Asp Glu Gly Gly Ile Thr Asp Ile Glu Phe Ile Ala Gln Tyr Leu Ala Asp Glu Gly Gly Ile Thr Asp Ile Glu Phe Ile Ala Gln Tyr Leu
420 425 430 420 425 430
Val Leu Arg Phe Ala His Asp Lys Pro Lys Leu Thr Arg Trp Ser Asp Val Leu Arg Phe Ala His Asp Lys Pro Lys Leu Thr Arg Trp Ser Asp
435 440 445 435 440 445
Asn Val Arg Ile Leu Glu Gly Leu Ala Gln Asn Gly Ile Met Glu Glu Asn Val Arg Ile Leu Glu Gly Leu Ala Gln Asn Gly Ile Met Glu Glu
450 455 460 450 455 460
Gln Glu Ala Gln Ala Leu Thr Leu Ala Tyr Thr Thr Leu Arg Asp Glu Gln Glu Ala Gln Ala Leu Thr Leu Ala Tyr Thr Thr Leu Arg Asp Glu
465 470 475 480 465 470 475 480
Leu His His Leu Ala Leu Gln Glu Leu Pro Gly His Val Ala Leu Ser Leu His His Leu Ala Leu Gln Glu Leu Pro Gly His Val Ala Leu Ser
485 490 495 485 490 495
Cys Phe Val Ala Glu Arg Ala Leu Ile Lys Thr Ser Trp Asp Lys Trp Cys Phe Val Ala Glu Arg Ala Leu Ile Lys Thr Ser Trp Asp Lys Trp
500 505 510 500 505 510
Leu Val Glu Pro Cys Ala Pro Ala Leu Val Glu Pro Cys Ala Pro Ala
515 520 515 520
<210> 83<210> 83
<211> 341<211> 341
<212> Белок<212> Protein
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> 3АТ-азный домен, штамм CI006<223> 3ATase domain, strain CI006
<400> 83<400> 83
Glu Glu Gln Gln Leu Glu Ala Leu Arg Gln Phe Lys Gln Ala Gln Leu Glu Glu Gln Gln Leu Glu Ala Leu Arg Gln Phe Lys Gln Ala Gln Leu
1 5 10 15 1 5 10 15
Leu Arg Val Ala Ala Ala Asp Ile Ala Gly Thr Leu Pro Val Met Lys Leu Arg Val Ala Ala Ala Asp Ile Ala Gly Thr Leu Pro Val Met Lys
20 25 30 20 25 30
Val Ser Asp His Leu Thr Trp Leu Ala Glu Ala Ile Ile Asp Ala Val Val Ser Asp His Leu Thr Trp Leu Ala Glu Ala Ile Ile Asp Ala Val
35 40 45 35 40 45
Val Gln Gln Ala Trp Gly Gln Met Val Ala Arg Tyr Gly Gln Pro Thr Val Gln Gln Ala Trp Gly Gln Met Val Ala Arg Tyr Gly Gln Pro Thr
50 55 60 50 55 60
His Leu His Asp Arg Glu Gly Arg Gly Phe Ala Val Val Gly Tyr Gly His Leu His Asp Arg Glu Gly Arg Gly Phe Ala Val Val Gly Tyr Gly
65 70 75 80 65 70 75 80
Lys Leu Gly Gly Trp Glu Leu Gly Tyr Ser Ser Asp Leu Asp Leu Val Lys Leu Gly Gly Trp Glu Leu Gly Tyr Ser Ser Asp Leu Asp Leu Val
85 90 95 85 90 95
Phe Leu His Asp Cys Pro Met Asp Val Met Thr Asp Gly Glu Arg Glu Phe Leu His Asp Cys Pro Met Asp Val Met Thr Asp Gly Glu Arg Glu
100 105 110 100 105 110
Ile Asp Gly Arg Gln Phe Tyr Leu Arg Leu Ala Gln Arg Val Met His Ile Asp Gly Arg Gln Phe Tyr Leu Arg Leu Ala Gln Arg Val Met His
115 120 125 115 120 125
Leu Phe Ser Thr Arg Thr Ser Ser Gly Ile Leu Tyr Glu Val Asp Ala Leu Phe Ser Thr Arg Thr Ser Ser Gly Ile Leu Tyr Glu Val Asp Ala
130 135 140 130 135 140
Arg Leu Arg Pro Ser Gly Ala Ala Gly Met Leu Val Thr Thr Thr Glu Arg Leu Arg Pro Ser Gly Ala Ala Gly Met Leu Val Thr Thr Thr Glu
145 150 155 160 145 150 155 160
Ser Phe Ala Asp Tyr Gln Gln Asn Glu Ala Trp Thr Trp Glu His Gln Ser Phe Ala Asp Tyr Gln Gln Asn Glu Ala Trp Thr Trp Glu His Gln
165 170 175 165 170 175
Ala Leu Ala Arg Ala Arg Val Val Tyr Gly Asp Pro Gln Leu Thr Ala Ala Leu Ala Arg Ala Arg Val Val Tyr Gly Asp Pro Gln Leu Thr Ala
180 185 190 180 185 190
Glu Phe Asp Ala Ile Arg Arg Asp Ile Leu Met Thr Pro Arg Asp Gly Glu Phe Asp Ala Ile Arg Arg Asp Ile Leu Met Thr Pro Arg Asp Gly
195 200 205 195 200 205
Ala Thr Leu Gln Thr Asp Val Arg Glu Met Arg Glu Lys Met Arg Ala Ala Thr Leu Gln Thr Asp Val Arg Glu Met Arg Glu Lys Met Arg Ala
210 215 220 210 215 220
His Leu Gly Asn Lys His Lys Asp Arg Phe Asp Leu Lys Ala Asp Glu His Leu Gly Asn Lys His Lys Asp Arg Phe Asp Leu Lys Ala Asp Glu
225 230 235 240 225 230 235 240
Gly Gly Ile Thr Asp Ile Glu Phe Ile Ala Gln Tyr Leu Val Leu Arg Gly Gly Ile Thr Asp Ile Glu Phe Ile Ala Gln Tyr Leu Val Leu Arg
245 250 255 245 250 255
Phe Ala His Asp Lys Pro Lys Leu Thr Arg Trp Ser Asp Asn Val Arg Phe Ala His Asp Lys Pro Lys Leu Thr Arg Trp Ser Asp Asn Val Arg
260 265 270 260 265 270
Ile Leu Glu Gly Leu Ala Gln Asn Gly Ile Met Glu Glu Gln Glu Ala Ile Leu Glu Gly Leu Ala Gln Asn Gly Ile Met Glu Glu Gln Glu Ala
275 280 285 275 280 285
Gln Ala Leu Thr Leu Ala Tyr Thr Thr Leu Arg Asp Glu Leu His His Gln Ala Leu Thr Leu Ala Tyr Thr Thr Leu Arg Asp Glu Leu His His
290 295 300 290 295 300
Leu Ala Leu Gln Glu Leu Pro Gly His Val Ala Leu Ser Cys Phe Val Leu Ala Leu Gln Glu Leu Pro Gly His Val Ala Leu Ser Cys Phe Val
305 310 315 320 305 310 315 320
Ala Glu Arg Ala Leu Ile Lys Thr Ser Trp Asp Lys Trp Leu Val Glu Ala Glu Arg Ala Leu Ile Lys Thr Ser Trp Asp Lys Trp Leu Val Glu
325 330 335 325 330 335
Pro Cys Ala Pro Ala Pro Cys Ala Pro Ala
340 340
<210> 84<210> 84
<211> 1342<211> 1342
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> Prm5 встроенный в область nifL, штамм CI006, в настоящее время штамм CM029<223> Prm5 embedded in the nifL region, strain CI006, currently strain CM029
<400> 84<400> 84
ccgagcgtcg gggtgcctaa tatcagcacc ggatacgaga gaaaagtgtc tacatcggtt 60cggagcgtcg gggtgcctaa tatcagcacc ggatacgaga gaaaagtgtc tacatcggtt 60
cggttgatat tgaccggcgc atccgccagc ccgcccagtt tctggtggat ctgtttggcg 120cggttgatat tgaccggcgc atccgccagc ccgcccagtt tctggtggat ctgtttggcg 120
attttgcggg tcttgccggt gtcggtgccg aaaaaaatac caatatttgc cataacacac 180attttgcggg tcttgccggt gtcggtgccg aaaaaaatac caatatttgc cataacacac 180
gctcctgttg aaaaagagat cccgccggga aatgcggtga acgtgtctga tattgcgaag 240gctcctgttg aaaaagagat cccgccggga aatgcggtga acgtgtctga tattgcgaag 240
agtgtgccag ttttggtcgc gggcaaaacc tgcaccagtt tggttattaa tgcaccagtc 300agtgtgccag ttttggtcgc gggcaaaacc tgcaccagtt tggttattaa tgcaccagtc 300
tggcgctttt tttcgccgag tttctcctcg ctaatgcccg ccaggcgcgg ctttggcgct 360360
gatagcgcgc tgaataccga tctggatcaa ggttttgtcg ggttatcagc caaaaggtgc 420gatagcgcgc tgaataccga tctggatcaa ggttttgtcg ggttatcagc caaaaggtgc 420
actctttgca tggttatacg tgcctgacat gttgtccggg cgacaaacgg cctggtggca 480actctttgca tggttatacg tgcctgacat gttgtccggg cgacaaacgg cctggtggca 480
caaattgtca gaactacgac acgactaact gaccgcagga gtgtgcgatg accctgaata 540caaattgtca gaactacgac acgactaact gaccgcagga gtgtgcgatg accctgaata 540
tgatgatgga tgccggcgga catcatcgcg acaaacaata ttaataccgg caaccacacc 600tgatgatgga tgccggcgga catcatcgcg acaaacaata ttaataccgg caaccacacc 600
ggcaatttac gagactgcgc aggcatcctt tctcccgtca atttctgtca aataaagtaa 660ggcaatttac gagactgcgc aggcatcctt tctcccgtca atttctgtca aataaagtaa 660
aagaggcagt ctacttgaat tacccccggc tggttgagcg tttgttgaaa aaaagtaact 720aagaggcagt ctacttgaat tacccccggc tggttgagcg tttgttgaaa aaaagtaact 720
gaaaaatccg tagaatagcg ccactctgat ggttaattaa cctattcaat taagaattat 780gaaaaatccg tagaatagcg ccactctgat ggttaattaa cctattcaat taagaattat 780
ctggatgaat gtgccattaa atgcgcagca taatggtgcg ttgtgcggga aaactgcttt 840ctggatgaat gtgccattaa atgcgcagca taatggtgcg ttgtgcggga aaactgcttt 840
tttttgaaag ggttggtcag tagcggaaac aactcacttc acaccccgaa gggggaagtt 900tttttgaaag ggttggtcag tagcggaaac aactcacttc acaccccgaa gggggaagtt 900
gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg 960gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg 960
aaccgagtcg ggtaataccg tctggcgctt cgatttgtcc cagcagttca ctgcgatgca 1020aaccgagtcg ggtaataccg tctggcgctt cgatttgtcc cagcagttca ctgcgatgca 1020
gcgcataagc gtggtactca gccgggcgac cgaggtcgat cagacgctcc agcaagtgct 1080gcgcataagc gtggtactca gccgggcgac cgaggtcgat cagacgctcc agcaagtgct 1080
gtgcgtattg cacaatgacg cctttttgca gcacggcatg atctgtctgt acgacagcca 1140gtgcgtattg cacaatgacg cctttttgca gcacggcatg atctgtctgt acgacagcca 1140
gcaggcgatt ttgaatattg aagcgttgca ggaagccgat cagcagttaa tccccggcag 1200gcaggcgatt ttgaatattg aagcgttgca ggaagccgat cagcagttaa tccccggcag 1200
ctcgcaaatc cgctatcgtc cgggcgaagg gctggtcggg acggtgcttt cgcagggcca 1260ctcgcaaatc cgctatcgtc cgggcgaagg gctggtcggg acggtgcttt cgcagggcca 1260
atcattagtg ctggcgcgcg ttgctgacga tcagcgcttt cttgaccggc tcgggttgta 1320atcattagtg ctggcgcgcg ttgctgacga tcagcgcttt cttgaccggc tcgggttgta 1320
tgattacaac ctgccgttta tc 1342tgattacaac ctgccgttta tc 1342
<210> 85<210> 85
<211> 1270<211> 1270
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> 16S<223> 16S
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (186)..(186)<222> (186)..(186)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (458)..(458)<222> (458)..(458)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (1041)..(1041)<222> (1041)..(1041)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (1131)..(1132)<222> (1131)..(1132)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (1135)..(1135)<222> (1135)..(1135)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (1139)..(1140)<222> (1139)..(1140)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 85<400> 85
attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60
cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120
tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180
cctcgnaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240cctcgnaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240
attagctagt aggtgaggta atggctcacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300attagctagt aggtgaggta atggctcacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300
atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360
aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420
gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcanac ttaatacgtg tggtgattga 480gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcanac ttaatacgtg tggtgattga 480
cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540
tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600
tgtgaaatcc ccgcgcttaa cgtgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660tgtgaaatcc ccgcgcttaa cgtgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660
agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720
tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780
caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840
tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900
gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960gttaaaactc aaatgaattg acggggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960
gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccacg gaattcgcca gagatggctt 1020gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccacg gaattcgcca gagatggctt 1020
agtgccttcg ggaaccgtga nacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080agtgccttcg ggaaccgtga nacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080
tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc nngtnatgnn 11401140
gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200
tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260
actcgcgagg 1270actcgcgagg 1270
<210> 86<210> 86
<211> 876<211> 876
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifH<223> nifH
<400> 86<400> 86
atggcaatgc gtcaatgcgc aatctacggg aaagggggta ttgggaaatc caccactacc 60atggcaatgc gtcaatgcgc aatctacggg aaagggggta ttgggaaatc caccactacc 60
caaaaccttg tagcggctct ggccgaaatg aataagaagg tcatgatcgt cggctgtgac 120caaaaccttg tagcggctct ggccgaaatg aataagaagg tcatgatcgt cggctgtgac 120
cctaaggctg attcaacccg cctcattctg catgcgaaag cacagaacac catcatggaa 180cctaaggctg attcaacccg cctcattctg catgcgaaag cacagaacac catcatggaa 180
atggccgctg aagtgggctc cgtggaagat ctggagctgg aagatgtgat gcaaatcggc 240atggccgctg aagtgggctc cgtggaagat ctggagctgg aagatgtgat gcaaatcggc 240
tatggcggcg tgcgctgtgc ggaatcaggc ggccctgagc ctggtgtggg ttgtgccgga 300tatggcggcg tgcgctgtgc ggaatcaggc ggccctgagc ctggtgtggg ttgtgccgga 300
cgcggggtga tcaccgccat caacttcctc gaagaagaag gcgcgtatgt gccggatctg 360cgcggggtga tcaccgccat caacttcctc gaagaagaag gcgcgtatgt gccggatctg 360
gattttgtgt tttacgacgt attgggcgat gtggtctgtg gcggtttcgc gatgccaatt 420gtggtctgtg gcggtttcgc gatgccaatt 420
cgcgaaaaca aagcgcagga aatctacatc gtgtgctccg gtgaaatgat ggcgatgtat 480cgcgaaaaca aagcgcagga aatctacatc gtgtgctccg gtgaaatgat ggcgatgtat 480
gccgccaaca acatttccaa aggcatcgtg aaatacgcga aatcgggcaa agttcgcctg 540gccgccaaca acatttccaa aggcatcgtg aaatacgcga aatcgggcaa agttcgcctg 540
gccgggctga tctgtaactc ccgccagacg gatcgcgaag atgaactgat catcgcgctg 600gccgggctga tctgtaactc ccgccagacg gatcgcgaag atgaactgat catcgcgctg 600
gctgaaaaac ttggcacgca aatgatccac ttcgtgccgc gtgacaacat tgtgcaacgc 660gctgaaaaac ttggcacgca aatgatccac ttcgtgccgc gtgacaacat tgtgcaacgc 660
gctgaaatcc gccgcatgac ggtcatcgaa tacgacccga cttgtgcgca ggcagatcag 720gctgaaatcc gccgcatgac ggtcatcgaa tacgacccga cttgtgcgca ggcagatcag 720
tatcgtgcac tggcgaacaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtgcc gacaccggtc 780tatcgtgcac tggcgaacaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtgcc gacaccggtc 780
accatggatg agctggaagc cctgttaatg gaatttggca ttatggaaga agaagacctg 840840
gccatcgtcg gtcgtaccgc cgccgaagag gcgtga 876gccatcgtcg gtcgtaccgc cgccgaagag gcgtga 876
<210> 87<210> 87
<211> 1374<211> 1374
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifD1<223> nifD1
<400> 87<400> 87
atgaaggcaa aagagattct ggcgctgatt gatgagccag cctgtgagca taaccacaag 60atgaaggcaa aagagattct ggcgctgatt gatgagccag cctgtgagca taaccacaag 60
cagaagtcgg gttgcagcct gccgaaaccg ggcgcgacgg caggcggttg tgcgtttgat 120cagaagtcgg gttgcagcct gccgaaaccg ggcgcgacgg caggcggttg tgcgtttgat 120
ggcgcgcaga ttgcgctgct gccggtcgcg gacgtcgcgc atctggtgca cggcccgatt 180ggcgcgcaga ttgcgctgct gccggtcgcg gacgtcgcgc atctggtgca cggcccgatt 180
ggctgtaccg gcagttcatg ggacaaccgt ggcagccgca gttccgggcc ttccatcaac 240ggctgtaccg gcagttcatg ggacaaccgt ggcagccgca gttccggggcc ttccatcaac 240
cgcatgggct tcaccaccga catgagcgag caggatgtga ttatggggcg cggcgagcga 300cgcatgggct tcaccaccga catgagcgag caggatgtga ttatggggcg cggcgagcga 300
cgcttatttc acgccgtgca gcacatcgtc agccattacc atccggtggc ggtctttatt 360360
tacaacacct gcgtacccgc gatggaaggg gatgacgttg aagccgtgtg tcgcgccgca 420tacaacacct gcgtacccgc gatggaaggg gatgacgttg aagccgtgtg tcgcgccgca 420
tcggccgctg ccggtgtgcc ggttatttca gtcgatgccg ccggtttcta cggcagcaaa 480tcggccgctg ccggtgtgcc ggttatttca gtcgatgccg ccggtttcta cggcagcaaa 480
aatctcggta accgcattgc cggggacgtg atggtcaaaa aggtgatcgg ccagcgcgaa 540aatctcggta accgcattgc cggggacgtg atggtcaaaa aggtgatcgg ccagcgcgaa 540
cccgcgccgt ggccggaaaa ctcaccgatc cccgccggac accgccacag catcagcctg 600cccgcgccgt ggccggaaaa ctcaccgatc cccgccggac accgccacag catcagcctg 600
attggcgaat tcaatattgc cggcgagttc tggcacgttc tgccgctgct cgatgagctc 660attggcgaat tcaatattgc cggcgagttc tggcacgttc tgccgctgct cgatgagctc 660
gggatccgcg tgctgtgcag cctttccggg gattcccgtt ttgctgaaat ccagactatg 720gggatccgcg tgctgtgcag cctttccgggg gattcccgtt ttgctgaaat ccagactatg 720
caccgtggcg aagccaacat gctggtgtgc tcgcgggcgc tgatcaacgt cgcccgaaaa 780caccgtggcg aagccaacat gctggtgtgc tcgcgggcgc tgatcaacgt cgcccgaaaa 780
atggaagagc gttaccagat cccatggttt gaaggcagtt tttatggcct gcgttccatg 840atggaagagc gttaccagat cccatggttt gaaggcagtt tttatggcct gcgttccatg 840
gctgattccc tgcgcacgat cgccgtgctg ctcaaagacc cggatttaca ggcgcgcaca 900gctgattccc tgcgcacgat cgccgtgctg ctcaaagacc cggatttaca ggcgcgcaca 900
gaacgtctga ttgagcgcga ggaggcggcg acacatcttg cgcttgcgcc ttaccgtgcg 960gaacgtctga ttgagcgcga ggaggcggcg acacatcttg cgcttgcgcc ttaccgtgcg 960
cggctcagcg ggcgcaaggc gctgctgtat accggtggcg tgaaatcctg gtcggtggtc 1020cggctcagcg ggcgcaaggc gctgctgtat accggtggcg tgaaatcctg gtcggtggtc 1020
tcggcgttac aggatttagg catcacggtg gtggcgaccg gcacccgaaa atcaaccgaa 1080tcggcgttac aggatttagg catcacggtg gtggcgaccg gcacccgaaa atcaaccgaa 1080
gaagacaagc agcgtattcg cgaactgatg ggtgaagacg tgctgatgct cgacgaaggc 1140gaagacaagc agcgtattcg cgaactgatg ggtgaagacg tgctgatgct cgacgaaggc 1140
aatgccagaa ccttgctcga caccctctat cgtttcggcg gcgacatcat gatcgccggg 1200aatgccagaa ccttgctcga caccctctat cgtttcggcg gcgacatcat gatcgccggg 1200
ggccgcaaca tgtataccgc gtacaaagcc cgcctgccgt tcctggatat caatcaggag 1260ggccgcaaca tgtataccgc gtacaaagcc cgcctgccgt tcctggatat caatcaggag 1260
cgcgagcatg cgtttgccgg atatcacggg ctggtaaatc tggccgaaca gttgtgtatc 1320cgcgagcatg cgtttgccgg atatcacggg ctggtaaatc tggccgaaca gttgtgtatc 1320
accctggaaa gcccggtctg ggcgcaggtc aaccgtctgg cgccgtggcg ctaa 1374accctggaaa gcccggtctg ggcgcaggtc aaccgtctgg cgccgtggcg ctaa 1374
<210> 88<210> 88
<211> 1449<211> 1449
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifD2<223> nifD2
<400> 88<400> 88
atgaccagtg aaacacgcga acgtaacgag gcattgatcc aggaagtgct ggagatcttc 60atgaccagtg aaacacgcga acgtaacgag gcattgatcc aggaagtgct ggagatcttc 60
cccgagaagg cgcttaaaga tcgtaagaaa cacatgatga ccaccgaccc ggcgatggaa 120cccgagaagg cgcttaaaga tcgtaagaaa cacatgatga ccaccgaccc ggcgatggaa 120
tctgtcggca agtgtattgt ctcaaaccgc aaatcacagc cgggcgtgat gaccgtgcga 180tctgtcggca agtgtattgt ctcaaaccgc aaatcacagc cgggcgtgat gaccgtgcga 180
ggctgcgctt acgccggttc caaaggcgtg gtctttggcc cgatcaaaga catggcgcat 240ggctgcgctt acgccggttc caaaggcgtg gtctttggcc cgatcaaaga catggcgcat 240
atctcccacg gcccggttgg ttgcggccag tattcccgtg ccggacgccg taactattac 300atctccccg gcccggttgg ttgcggccag tattcccgtg ccggacgccg taactattac 300
accggctgga gcggcgtgaa cagctttggc accctcaact tcaccagtga ttttcaggaa 360accggctgga gcggcgtgaa cagctttggc accctcaact tcaccagtga ttttcaggaa 360
cgggacatcg tatttggcgg cgataaaaag ctcgacaaat tgatcgatga actggagatg 420cgggacatcg tatttggcgg cgataaaaag ctcgacaaat tgatcgatga actggagatg 420
ttgttcccgc tgagcaaagg catttcggtg cagtcggaat gtccggtcgg tctgatcggc 480ttgttcccgc tgagcaaagg catttcggtg cagtcggaat gtccggtcgg tctgatcggc 480
gatgacattt ctgccgtcgc caaagccagc agcgccaaaa tcggtaagcc ggtcgtgccg 540gatgacattt ctgccgtcgc caaagccagc agcgccaaaa tcggtaagcc ggtcgtgccg 540
gtacgctgcg aggggttccg cggtgtgtcg caatcgctcg gccatcacat tgctaacgat 600gtacgctgcg aggggttccg cggtgtgtcg caatcgctcg gccatcacat tgctaacgat 600
gtcatccgcg actgggtgct ggataaccgc gaaggcaatg aatttgaaac cacgccttac 660gtcatccgcg actgggtgct ggataaccgc gaaggcaatg aatttgaaac cacgccttac 660
gacgtggcga ttatcggcga ctacaacatc ggcggtgacg cctgggcctc acgtattctg 720gacgtggcga ttatcggcga ctacaacatc ggcggtgacg cctgggcctc acgtattctg 720
ctcgaagaaa tggggctgcg cgtggtggcg cagtggtccg gcgacggcac gctggtggag 780ctcgaagaaa tggggctgcg cgtggtggcg cagtggtccg gcgacggcac gctggtggag 780
atggaaaaca ccccgaaagt cgcgctcaat ctggtgcact gctaccgctc gatgaactac 840atggaaaaca ccccgaaagt cgcgctcaat ctggtgcact gctaccgctc gatgaactac 840
atctcccgtc atatggaaga aaaacacggc attccgtgga tggaatacaa cttctttggc 900atctcccgtc atatggaaga aaaacacggc attccgtgga tggaatacaa cttctttggc 900
ccgaccaaaa ttgcggaatc tctgcgcgaa atcgcggcgc gttttgacga taccatccgg 960ccgaccaaaa ttgcggaatc tctgcgcgaa atcgcggcgc gttttgacga taccatccgg 960
aaaaacgccg aagcggtgat tgaaaaatat caggcgcaaa cgcaggcggt gatcgacaaa 1020aaaaacgccg aagcggtgat tgaaaaatat caggcgcaaa cgcaggcggt gatcgacaaa 1020
taccgtccgc gtctggaagg caaaaaggtg ctgttgtatc tcggcggttt acgtccgcgc 1080taccgtccgc gtctggaagg caaaaaggtg ctgttgtatc tcggcggttt acgtccgcgc 1080
cacatcatcg gggcgtatga agatctggga atggaaatca tcggtaccgg ctatgaattc 1140cacatcatcg gggcgtatga agatctggga atggaaatca tcggtaccgg ctatgaattc 1140
ggtcataacg atgattacga ccgcacctta ccgatgctca aagaaggcac gttgctgttc 1200ggtcataacg atgattacga ccgcacctta ccgatgctca aagaaggcac gttgctgttc 1200
gatgacctga gcagttatga gctggaagcg ttcgttaaag cgctgaaacc ggatcttgtc 1260gatgacctga gcagttatga gctggaagcg ttcgttaaag cgctgaaacc ggatcttgtc 1260
gggtcaggta tcaaagaaaa atacattttc cagaaaatgg gcgtgccgtt ccgccagatg 1320gggtcaggta tcaaagaaaa atacattttc cagaaaatgg gcgtgccgtt ccgccagatg 1320
cactcctggg attattccgg cccttatcac ggctacgacg gtttcggcat ttttgcccgt 13801380
gacatggaca tgacgctgaa caatccgggc tggagtcagc tgaccgcccc ctggttgaaa 1440gacatggaca tgacgctgaa caatccgggc tggagtcagc tgaccgcccc ctggttgaaa 1440
acggcctga 1449acggcctga 1449
<210> 89<210> 89
<211> 1386<211> 1386
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifK1<223> nifK1
<400> 89<400> 89
atggctcaaa ttctgcgtaa tgccaagccg cttgccacca cgcctgtcaa aagcgggcaa 60atggctcaaa ttctgcgtaa tgccaagccg cttgccacca cgcctgtcaa aagcgggcaa 60
ccgctcgggg cgatcctggc cagtcagggg ctggaaaatt gcatcccgct ggttcacggc 120ccgctcgggg cgatcctggc cagtcagggg ctggaaaatt gcatcccgct ggttcacggc 120
gcgcaaggtt gtagcgcgtt cgccaaagtt ttcttcatcc agcattttca cgatccgatc 180gcgcaaggtt gtagcgcgtt cgccaaagtt ttcttcatcc agcattttca cgatccgatc 180
ccgttgcagt ccacggcgat ggaatcgacc acgactatca tgggctcgga tggcaacgtc 240ccgttgcagt ccacggcgat ggaatcgacc acgactatca tgggctcgga tggcaacgtc 240
agtactgcgt tgaccacgtt gtgtcagcgc agtaatccaa aagccattgt gattttgagc 300agtactgcgt tgaccacgtt gtgtcagcgc agtaatccaa aagccattgt gattttgagc 300
accggactgt cagaagcgca gggcagtgat ttgtcgatgg cgctgcgtga gtttcgcgac 360accggactgt cagaagcgca gggcagtgat ttgtcgatgg cgctgcgtga gtttcgcgac 360
aaagaaccgc gctttaatgc catcgctatt ctgaccgtta acacgccgga tttttacggc 420aaagaaccgc gctttaatgc catcgctatt ctgaccgtta acacgccgga ttttacggc 420
tcgctggaaa acggctacag cgcgctgatg gaaagcgtga tcactcagtg ggtgccggaa 480tcgctggaaa acggctacag cgcgctgatg gaaagcgtga tcactcagtg ggtgccggaa 480
aagccgccga ccggcatgcg taacaagcgc gtgaacctgc tggtgagcca tctgctgacg 540aagccgccga ccggcatgcg taacaagcgc gtgaacctgc tggtgagcca tctgctgacg 540
ccgggggatc tggaattact gcgcagctat gtcgaagcct ttggcctgca accggtgatc 600ccgggggatc tggaattact gcgcagctat gtcgaagcct ttggcctgca accggtgatc 600
ctgccggatt tatcacagtc gctggacgga catctggcga atggcgattt caatccggtc 660ctgccggatt tatcacagtc gctggacggga catctggcga atggcgattt caatccggtc 660
acgcagggcg gcacgtcgca acgccagatt gaacaaatgg ggcagagcct gaccaccatt 720acgcagggcg gcacgtcgca acgccagatt gaacaaatgg ggcagagcct gaccaccatt 720
accattggca gttcgctcaa ctgcgccgcc agtctgatgg cgatgcgcag ccgtggcatg 780accattggca gttcgctcaa ctgcgccgcc agtctgatgg cgatgcgcag ccgtggcatg 780
gcgctgaacc tgccgcacct gatgacgctg gaaaacatgg acagtctgat ccgccatctg 840gcgctgaacc tgccgcacct gatgacgctg gaaaacatgg acagtctgat ccgccatctg 840
catcaggtgt caggccgcga ggtaccggca tggattgagc gccagcgcgg gcaactgctg 900catcaggtgt caggccgcga ggtaccggca tggattgagc gccagcgcgg gcaactgctg 900
gacgccatga tcgactgcca tacctggctg cagtcacagc gtattgcgct ggcggcagaa 960gacgccatga tcgactgcca tacctggctg cagtcacagc gtattgcgct ggcggcagaa 960
gcggatttgc tggtggcgtg gtgcgatttc gctcagagcc agggaatgcg cgtcgggccg 1020gcggatttgc tggtggcgtg gtgcgatttc gctcagagcc agggaatgcg cgtcgggccg 1020
gtgattgcgc cggttaatca gcagtcactg gccgggctgc cggtcgaaca ggtggtgatc 1080gtgattgcgc cggttaatca gcagtcactg gccgggctgc cggtcgaaca ggtggtgatc 1080
ggcgatctgg aagatttaca aacccggctc gacagctacc cggtttcact gctggtggcg 1140ggcgatctgg aagatttaca aacccggctc gacagctacc cggtttcact gctggtggcg 1140
aactcccacg ctgcaccact ggcggaaaaa aacggtatcg cgctggtacg tgccggtttc 1200aactccccg ctgcaccact ggcggaaaaa aacggtatcg cgctggtacg tgccggtttc 1200
ccgctttacg accgtctcgg ggaatttcgc cgcgtgcggc agggctatgc gggtattcgc 1260ccgctttacg accgtctcgg ggaatttcgc cgcgtgcggc agggctatgc gggtattcgc 1260
gacaccttgt tcgaactcgc gaacctgatg caggcgcgcc atcacatgct gacggcgtat 1320gacaccttgt tcgaactcgc gaacctgatg caggcgcgcc atcacatgct gacggcgtat 1320
cactcaccgc ttaggcaggt gttcggcctg agcccggtac cggaggccag tcatgaggcg 1380cactcaccgc ttaggcaggt gttcggcctg agcccggtac cggaggccag tcatgaggcg 1380
cgctaa 1386cgctaa 1386
<210> 90<210> 90
<211> 1569<211> 1569
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifK2<223> nifK2
<400> 90<400> 90
atgagtcaag atcttggcac cccaaaatcc tgtttcccgc tgttcgagca ggatgaatac 60atgagtcaag atcttggcac cccaaaatcc tgtttcccgc tgttcgagca ggatgaatac 60
cagaatatgt ttacccacaa acgcgcgctg gaagaagcac acggcgaggc gaaagtgcgg 120cagaatatgt ttacccacaa acgcgcgctg gaagaagcac acggcgaggc gaaagtgcgg 120
gaagtgtttg aatggaccac cacgcaggaa tatcaggatc tgaacttctc gcgtgaagcg 180gaagtgtttg aatggaccac cacgcaggaa tatcaggatc tgaacttctc gcgtgaagcg 180
ctgaccgtcg acccggcgaa agcctgccag ccgttaggcg cggtactttg cgcgctgggt 240ctgaccgtcg acccggcgaa agcctgccag ccgttaggcg cggtactttg cgcgctgggt 240
tttaccaaca cgttgccgta tgtccatggt tcacaaggct gtgtggcgta tttccgtacc 300tttaccaaca cgttgccgta tgtccatggt tcacaaggct gtgtggcgta tttccgtacc 300
tattttaatc gtcatttcaa agagccggtg gcctgtgttt ccgactcaat gaccgaagat 360360
gccgccgttt ttggcggaaa taacaacatg aatgtcggtc tggaaaacgc cagcgcgctg 420gccgccgttt ttggcggaaa taacaacatg aatgtcggtc tggaaaacgc cagcgcgctg 420
tacaagccgg aaattattgc ggtctccacc acctgtatgg cggaagtgat cggtgatgac 480tacaagccgg aaattattgc ggtctccacc acctgtatgg cggaagtgat cggtgatgac 480
ctgcaggctt ttatcgccaa cgccaaaaaa gacggatttg tggatgccgg tatgccaatc 540ctgcaggctt ttatcgccaa cgccaaaaaa gacggatttg tggatgccgg tatgccaatc 540
ccgtatgccc atacaccgag ttttctgggc agtcatgtca ccggctggga caacatgttt 600ccgtatgccc atacaccgag ttttctgggc agtcatgtca ccggctggga caacatgttt 600
gaaggcttcg cccgtacctt taccaccgac gccacgcggg aatatcagcc gggcaaactt 660gaaggcttcg cccgtacctt taccaccgac gccacgcggg aatatcagcc gggcaaactt 660
gccaaactga acgtggtgac cggttttgaa acttatctcg gcaactaccg ggttattcac 720gccaaactga acgtggtgac cggttttgaa acttatctcg gcaactaccg ggttattcac 720
cgcatgatga gccagatggg ggtcgaatgc agcgtcttgt ccgatccgtc tgaagtgctc 780cgcatgatga gccagatggg ggtcgaatgc agcgtcttgt ccgatccgtc tgaagtgctc 780
gacaccccgg ctgacggcca ataccgcatg tatgccggcg gcaccacgca aaccgaaatg 840gacaccccgg ctgacggcca ataccgcatg tatgccggcg gcaccacgca aaccgaaatg 840
cgtgatgcac cggatgccat cgacaccttg ctgctgcaac cgtggcaatt acagaaaacc 900cgtgatgcac cggatgccat cgacaccttg ctgctgcaac cgtggcaatt acagaaaacc 900
aaaaaggtgg tgcagggcga ctggaatcag ccgggcaccg aagtcagtgt accgattggc 960aaaaaggtgg tgcagggcga ctggaatcag ccgggcaccg aagtcagtgt accgattggc 960
ctggcggcga ccgatgcctt gctgatgacg gtaagcgaac tgaccggcaa accgatagct 1020ctggcggcga ccgatgcctt gctgatgacg gtaagcgaac tgaccggcaa accgatagct 1020
gacgcgctgg cgactgaacg tggccgtctg gtggacatga tgctcgattc tcacacctgg 10801080
ctgcacggca agcgtttcgg tctctacggt gacccggatt ttgtgatggg catgaccgca 1140ctgcacggca agcgtttcgg tctctacggt gacccggatt ttgtgatgggg catgaccgca 1140
ttcctgctgg aactgggctg tgaaccgacc accattctca gccataacgg caacaaacgc 1200ttcctgctgg aactgggctg tgaaccgacc accattctca gccataacgg caacaaacgc 1200
tggcagaaag ccatgaagaa aatgctggct gattcgcctt acggacagga cagcgaagtg 1260tggcagaaag ccatgaagaa aatgctggct gattcgcctt acggacagga cagcgaagtg 1260
tatgtgaact gcgatctgtg gcatttccgc tcgctgatgt ttacccgtaa accggacttt 1320tatgtgaact gcgatctgtg gcatttccgc tcgctgatgt ttacccgtaa accggacttt 1320
atgatcggca actcttacgg aaaattcatt cagcgtgaca cgctggccaa aggcgaacag 1380atgatcggca actcttacgg aaaattcatt cagcgtgaca cgctggccaa aggcgaacag 1380
ttcgaagtgc cgctgatccg tatcggattc ccgatttttg accggcacca tttgcaccgt 1440ttcgaagtgc cgctgatccg tatcggattc ccgatttttg accggcacca tttgcaccgt 1440
cagaccacct ggggatacga gggcgcgatg agcatcctga cgcaactggt gaatgcggtg 1500cagaccacct ggggatacga gggcgcgatg agcatcctga cgcaactggt gaatgcggtg 1500
ctcgaacagc tggatcgcga aaccatgaag ctcggcaaaa ccgactacaa cttcgatctg 15601560 ctcgaacagc tggatcgcga aaccatgaag ctcggcaaaa
atccgctaa 1569atccgctaa 1569
<210> 91<210> 91
<211> 1488<211> 1488
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifL<223> nifL
<400> 91<400> 91
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat catcggtggc gatttcgctg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat catcggtggc gatttcgctg 120
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg ccagccagca gacgccgaaa 240240
catatctatg acgaaatgtg gcgcactttg ttgcagggca aatcctggaa cggccaactg 300catatctatg acgaaatgtg gcgcactttg ttgcaggggca aatcctggaa cggccaactg 300
atcaaccggc gtaataaccg ttcgctttat ctggcggatg tcactatcac gcctgtttta 360atcaaccggc gtaataaccg ttcgctttat ctggcggatg tcactatcac gcctgtttta 360
ggcgcggacg ggcaggtgga gcattacctc ggcatgcaca aagatatcag cgagaaatac 420ggcgcggacg ggcaggtgga gcattacctc ggcatgcaca aagatatcag cgagaaatac 420
gcgctggagc agcggttgcg caaccacatc accttgttca cggaggtgct gaacaatatt 480gcgctggagc agcggttgcg caaccacatc accttgttca cggaggtgct gaacaatatt 480
cccgccgccg tggtggtggt ggatgagcag gacaatgtgg tgatggacaa tctggcctac 540cccgccgccg tggtggtggt ggatgagcag gacaatgtgg tgatggacaa tctggcctac 540
aaaaccctgt gcgctgactg cggcggaaaa gagctgttgg ccgaaatggg ctatccgcaa 600aaaaccctgt gcgctgactg cggcggaaaa gagctgttgg ccgaaatggg ctatccgcaa 600
ctcaaagaga tgctcaacag tggcgaaccg gtgccggttt ccatgcgcgg caacgtacgc 660ctcaaagaga tgctcaacag tggcgaaccg gtgccggttt ccatgcgcgg caacgtacgc 660
tggttttctt tcggtcagtg gtcattgcag ggcgttaatg aagaggccag ccgctttttt 720tggttttctt tcggtcagtg gtcattgcag ggcgttaatg aagaggccag ccgctttttt 720
accggcatta ccgcgccggg aaaactgatt gttctcaccg actgcaccga tcagcatcac 780accggcatta ccgcgccggg aaaactgatt gttctcaccg actgcaccga tcagcatcac 780
cggcagcagc agggttatct tgaccggctc aagcaaaaac ttaccaacgg caaattgctg 840cggcagcagc agggttatct tgaccggctc aagcaaaaac ttaccaacgg caaattgctg 840
gcagccatcc gcgagtcgct tgatgccgcg ctgattcagc tcaacgggcc aattaatatg 900gcagccatcc gcgagtcgct tgatgccgcg ctgattcagc tcaacgggcc aattaatatg 900
ctggcggctg cgcgtcgtct taacggcgaa gaaggcaaca acatggcgct ggaattcgcc 960ctggcggctg cgcgtcgtct taacggcgaa gaaggcaaca acatggcgct ggaattcgcc 960
tggcgcgaag gcgagcaggc ggtgagtcgc ttacaggcct gccgtccgtc gctggatttt 1020tggcgcgaag gcgagcaggc ggtgagtcgc ttacaggcct gccgtccgtc gctggatttt 1020
gagccgcagg cagaatggcc ggtcagtgaa ttcttcgacg atctgagcgc gctgtacgac 1080gagccgcagg cagaatggcc ggtcagtgaa ttcttcgacg atctgagcgc gctgtacgac 1080
agccattttc tcagtgacgg tgaattgcgt tacgtggtca tgccatctga tctgcacgct 1140agccattttc tcagtgacgg tgaattgcgt tacgtggtca tgccatctga tctgcacgct 1140
gtcgggcaac gaacgcaaat ccttaccgcg ctgagcttat ggattgatca cacgctgtca 1200gtcgggcaac gaacgcaaat ccttaccgcg ctgagcttat ggattgatca cacgctgtca 1200
caggcgcagg ccatgccgtc tctgaagctc tcggtgaaca ttgttgcgaa gcaggatgcg 1260caggcgcagg ccatgccgtc tctgaagctc tcggtgaaca ttgttgcgaa gcaggatgcg 1260
agctggttgt gttttgacat taccgataat gtgccgcgtg aacgggtgcg ttatgcccgc 1320agctggttgt gttttgacat taccgataat gtgccgcgtg aacgggtgcg ttatgcccgc 1320
ccggaagcgg cgttttcccg tccggggaat ggcatggagc tgcgccttat ccagacgctg 1380ccggaagcgg cgttttcccg tccggggaat ggcatggagc tgcgccttat cggacgctg 1380
atcgcccatc atcgcggttc tttagatctc tcggtccgcc ctgatggcgg caccttgctg 1440atcgcccatc atcgcggttc tttagatctc tcggtccgcc ctgatggcgg caccttgctg 1440
acgttacgcc tgccggtaca gcaggttatc accggaggct taaaatga 1488acgttacgcc tgccggtaca gcaggttatc accggaggct taaaatga 1488
<210> 92<210> 92
<211> 1557<211> 1557
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifA<223> nifA
<400> 92<400> 92
atgacccagt tacctaccgc gggcccggtt atccggcgct ttgatatgtc tgcccagttt 60atgacccagt tacctaccgc gggcccggtt atccggcgct ttgatatgtc tgcccagttt 60
acggcgcttt atcgcatcag cgtggcgctg agtcaggaaa gcaataccgc gcgcgcactg 120acggcgcttt atcgcatcag cgtggcgctg agtcaggaaa gcaataccgc gcgcgcactg 120
gcggcgatcc tcgaagtgct tcacgatcat gcatttatgc aatacggcat ggtgtgtctg 180gcggcgatcc tcgaagtgct tcacgatcat gcatttatgc aatacggcat ggtgtgtctg 180
ttcgataaag aacgcaatgc actgtttgtg gaatccctgc atggcatcga cggcgaaagg 240ttcgataaag aacgcaatgc actgtttgtg gaatccctgc atggcatcga cggcgaaagg 240
aaaaaagaga cccgccatgt ccgttaccgc atgggggaag gcgtgatcgg cgcggtgatg 300aaaaaagaga cccgccatgt ccgttaccgc atgggggaag gcgtgatcgg cgcggtgatg 300
agccagcgtc aggcgctggt gttaccgcgc atttcagacg atcagcgttt tctcgaccgc 360agccagcgtc aggcgctggt gttaccgcgc atttcagacg atcagcgttt tctcgaccgc 360
ctgaatattt acgattacag cctgccgctg attggtgtgc cgatccccgg tgcggataat 420ctgaatattt acgattacag cctgccgctg attggtgtgc cgatccccgg tgcggataat 420
cagcctgcgg gtgtgctggt ggcacagccg atggcgttgc acgaagaccg gctggctgcc 480cagcctgcgg gtgtgctggt ggcacagccg atggcgttgc acgaagaccg gctggctgcc 480
agtacgcggt ttttagaaat ggtcgccaat ctcatcagcc agccactgcg ttctgccacg 540agtacgcggt ttttagaaat ggtcgccaat ctcatcagcc agccactgcg ttctgccacg 540
cccccggaat cattgcctgc tcaaacgccg gtccggtgca gtgttccgcg ccagtttggt 600ccccgggaat cattgcctgc tcaaacgccg gtccggtgca gtgttccgcg ccagtttggt 600
tttgagcaga tggtcgggaa aagtcaggcg atgcgccaga cgatggacat tttacggcag 660tttgagcaga tggtcgggaa aagtcaggcg atgcgccaga cgatggacat tttacggcag 660
gtttccaaat gggataccac ggttctggtg cgtggtgaaa gcggcaccgg caaggaactt 720gtttccaaat gggataccac ggttctggtg cgtggtgaaa gcggcaccgg caaggaactt 720
atcgccaatg ccattcatta caactcaccc cgtgcggccg cgccatttgt gaaattcaac 780atcgccaatg ccattcatta caactcaccc cgtgcggccg cgccatttgt gaaattcaac 780
tgcgccgcgc tgccggataa cctgctggaa agcgaactgt tcggtcatga aaaaggggcc 840tgcgccgcgc tgccggataa cctgctggaa agcgaactgt tcggtcatga aaaaggggcc 840
ttcaccggcg ctatacgcac ccgaaaaggc cgctttgaac tggcggacgg gggcacgtta 900ttcaccggcg ctatacgcac ccgaaaaggc cgctttgaac tggcggacgg gggcacgtta 900
ttcctcgatg aaatcggcga atcgagcgcg tcgtttcagg ccaaattgct gcgcattttg 960ttcctcgatg aaatcggcga atcgagcgcg tcgtttcagg ccaaattgct gcgcattttg 960
caggaaggtg aaatggaacg ggtcggcggc gataccacgc tgaaagttga tgtgcgcatt 1020caggaaggtg aaatggaacg ggtcggcggc gataccacgc tgaaagttga tgtgcgcatt 1020
attgctgcca ccaaccgtaa tcttgaggag gaagtgcgtg ccgggaattt tcgcgaagac 10801080 attgctgcca ccaaccgtaa tcttgaggag gaagtgcgtg
ctgtattatc gcctgaacgt gatgccggtt tcgctgcctg cactgcgtga aaggctggat 1140ctgtattatc gcctgaacgt gatgccggtt tcgctgcctg cactgcgtga aaggctggat 1140
gatatcgccg atctggcgcc gtttctggtc aaaaagattg cgctgcgtca ggggcgggaa 1200gatatcgccg atctggcgcc gtttctggtc aaaaagattg cgctgcgtca ggggcgggaa 1200
ctgcgcatca gtgatggtgc ggtgcgtctg ctgatgacct acagctggcc aggcaacgtg 1260ctgcgcatca gtgatggtgc ggtgcgtctg ctgatgacct acagctggcc aggcaacgtg 1260
cgtgaactgg aaaactgcct cgaacgggcg tcggtaatga ccgatgaagg gctgatcgac 1320cgtgaactgg aaaactgcct cgaacgggcg tcggtaatga ccgatgaagg gctgatcgac 1320
cgcgacgtga tcctgttcaa tcaccatgag tccccggcgc tgtccgtcaa acccggtctg 1380cgcgacgtga tcctgttcaa tcaccatgag tccccggcgc tgtccgtcaa acccggtctg 1380
ccgctggcga cagatgaaag ctggctggat caggaactcg acgaacgcca gcgggtgatt 1440ccgctggcga cagatgaaag ctggctggat caggaactcg acgaacgcca gcgggtgatt 1440
gctgcactgg agaaaaccgg ctgggtgcag gccaaagcgg cccgactgct gggcatgaca 1500gctgcactgg agaaaaccgg ctgggtgcag gccaaagcgg cccgactgct gggcatgaca 1500
ccgcgccaga ttgcctaccg tatccagatt atggacatca acatgcaccg tatctga 1557ccgcgccaga ttgcctaccg tatccagatt atggacatca acatgcaccg tatctga 1557
<210> 93<210> 93
<211> 2838<211> 2838
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> glnE<223> glnE
<400> 93<400> 93
atgttgccac tttcttctgt tttgcaaagc cacgcgcaga gtttgcctga acgctggcat 60atgttgccac tttcttctgt tttgcaaagc cacgcgcaga gtttgcctga acgctggcat 60
gaacatcctg aaaacctgcc cctccccgat gatgaacagc tggctgtgct gagcagcagt 120gaacatcctg aaaacctgcc cctccccgat gatgaacagc tggctgtgct gagcagcagt 120
gaattcatga cggacagttt gctggctttt ccgcagtggt ggcatgaaat tgtccaaaat 180gaattcatga cggacagttt gctggctttt ccgcagtggt ggcatgaaat tgtccaaaat 180
ccccctcagg cgcaggagtg gcaactttac cgtcagtggc tggatgaatc gctgacgcag 240ccccctcagg cgcaggagtg gcaactttac cgtcagtggc tggatgaatc gctgacgcag 240
gtgactgacg aagccgggtt aatgaaagct ttgcgtctgt tccgccgccg tattctgacc 300gtgactgacg aagccgggtt aatgaaagct ttgcgtctgt tccgccgccg tattctgacc 300
cgcattgcgt ggtcacagtc cgcgcaaacc agcgaagcaa aagatacgct tcaccagctg 360cgcattgcgt ggtcacagtc cgcgcaaacc agcgaagcaa aagatacgct tcaccagctg 360
agtgaactgg cggaattatt gattgtcagc gcccgtgact ggctgtatgc cgcttgctgt 420agtgaactgg cggaattatt gattgtcagc gcccgtgact ggctgtatgc cgcttgctgt 420
cgcgagttcg gtacgccggt caatgccgca ggggaaccgc agagaatgct gatcctcggg 480cgcgagttcg gtacgccggt caatgccgca ggggaaccgc agagaatgct gatcctcggg 480
atgggcaaac tcggcggtgg cgagctgaat ttctcatcgg acatcgacct gatttttgct 540atgggcaaac tcggcggtgg cgagctgaat ttctcatcgg acatcgacct gatttttgct 540
tatccggaaa atggccagac acgcggcggt cggcgtgaac tggataacgc acaatttttc 600tatccggaaa atggccagac acgcggcggt cggcgtgaac tggataacgc acaatttttc 600
acccggctcg gccagcgtct gatcaaagcg ctggatcagc ccactatcga cggttttgtc 660acccggctcg gccagcgtct gatcaaagcg ctggatcagc ccactatcga cggttttgtc 660
tatcgcgtgg acatgcgttt gcgtccgttc ggcgacagtg gcccgctggt gatgagcttc 720tatcgcgtgg acatgcgttt gcgtccgttc ggcgacagtg gcccgctggt gatgagcttc 720
ccggcactgg aagattatta tcaggaacag gggcgcgact gggaacgcta cgcaatggtg 780ccggcactgg aagattatta tcaggaacag gggcgcgact gggaacgcta cgcaatggtg 780
aaagcgcgtc tgatgggcgg cgcggaggac atcagcagtc aggaattgcg taaaatgctg 840aaagcgcgtc tgatgggcgg cgcgggaggac atcagcagtc aggaattgcg taaaatgctg 840
atgccttttg tcttccgccg ttatatcgat ttcagtgtga tccagtccct gcgtaacatg 900atgccttttg tcttccgccg ttatatcgat ttcagtgtga tccagtccct gcgtaacatg 900
aaaggcatga tcgcccgcga agtacgccgc cgtggtctga aagacaacat caaactcggc 960aaaggcatga tcgcccgcga agtacgccgc cgtggtctga aagacaacat caaactcggc 960
gcaggcggta ttcgtgaaat tgaatttatc gtgcaggtat ttcagctgat ccgtggcggt 1020gcaggcggta ttcgtgaaat tgaatttatc gtgcaggtat ttcagctgat ccgtggcggt 1020
cgtgaaccgg cattgcagca gcgtgcgttg ttgccaacgc ttcaggcgct ggaaaatctg 1080cgtgaaccgg cattgcagca gcgtgcgttg ttgccaacgc ttcaggcgct ggaaaatctg 1080
gggctgctgc cggtagagca ggtgttgcag ttgcgtaaca gctatctgtt cctgcgacgt 1140gggctgctgc cggtagagca ggtgttgcag ttgcgtaaca gctatctgtt cctgcgacgt 1140
ctggaaaacc tgttgcaggc cattgctgac gagcaaacgc aaaccttacc gtccgatgag 1200ctggaaaacc tgttgcaggc cattgctgac gagcaaacgc aaaccttacc gtccgatgag 1200
ctgaatcagg cgcgtctggc gtgggggatg aattacgctg gctggccgca gcttctggat 1260ctgaatcagg cgcgtctggc gtgggggatg aattacgctg gctggccgca gcttctggat 1260
gcagtgaatg ctcacatgca ggccgtacgc gcggtattta acgatctgat tggcgatgac 1320gcagtgaatg ctcacatgca ggccgtacgc gcggtattta acgatctgat tggcgatgac 1320
acgccagatg ccgaagatga cgtgcaactc tcccggttca gcagtttatg gattgatacg 1380acgccagatg ccgaagatga cgtgcaactc tcccggttca gcagtttatg gattgatacg 1380
cttgagcctg acgagctggc tccgctggtg ccgcaacttg acgaaaatgc gcaacggcat 1440cttgagcctg acgagctggc tccgctggtg ccgcaacttg acgaaaatgc gcaacggcat 1440
gttttacatc agattgctga ttttcgccgt gacgtggata aacgcacgat agggccacgt 1500gttttacatc agattgctga ttttcgccgt gacgtggata aacgcacgat agggccacgt 1500
gggcgtgatc agttggattt gctgatgccg cgtttactgg cccaggtctg cacctataaa 1560gggcgtgatc agttggattt gctgatgccg cgtttactgg cccaggtctg cacctataaa 1560
aatgcggatg tgacgttaca gcgcctgatg cagttgctgc tcaatatcgt cacgcgcacg 1620aatgcggatg tgacgttaca gcgcctgatg cagttgctgc tcaatatcgt cacgcgcacg 1620
acgtatatcg agctgctggt ggaatatccc ggtgcgctca aacagttaat acgtctgtgc 1680acgtatatcg agctgctggt ggaatatccc ggtgcgctca aacagttaat acgtctgtgc 1680
gctgcctcgc cgatggtggc gacgcaactt gcgcgtcatc ctttattgct cgacgaactg 1740gctgcctcgc cgatggtggc gacgcaactt gcgcgtcatc ctttattgct cgacgaactg 1740
ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cgtaccgtga tgaactgcgg 1800ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cgtaccgtga tgaactgcgg 1800
caatatctga tgcgggtgcc aaccgaagac gaagaacaac agcttgaagc cgtgcgccag 1860caatatctga tgcgggtgcc aaccgaagac gaagaacaac agcttgaagc cgtgcgccag 1860
ttcaaacagg cacagcattt acgtattgcg gccggggata tttccggtgc gttgccggtg 1920ttcaaacagg cacagcattt acgtattgcg gccggggata tttccggtgc gttgccggtg 1920
atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt gcggaggcca ttctcgacgt tgtggtgcaa 1980atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt gcggaggcca ttctcgacgt tgtggtgcaa 1980
caggcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac ggtcagccaa cccatcttca gcaccgtaaa 2040caggcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac ggtcagccaa cccatcttca gcaccgtaaa 2040
gggcgcggtt ttgccgtggt gggttacgga aaactcggtg gctgggagct gggttacagc 2100gggcgcggtt ttgccgtggt gggttacgga aaactcggtg gctgggagct gggttacagc 2100
tcggatctgg atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aagtcatgac cgacggcgaa 2160tcggatctgg atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aagtcatgac cgacggcgaa 2160
cgcagcattg acgggcgtca gttttatctg cggctggcgc agcgcatcat gcatttattc 2220cgcagcattg acgggcgtca gttttatctg cggctggcgc agcgcatcat gcatttattc 2220
agcacccgta cgtcgtcagg cattctttat gaggttgacc cgcgtctgcg gccttccggt 2280agcacccgta cgtcgtcagg cattctttat gaggttgacc cgcgtctgcg gccttccggt 2280
gcttccggca tgctggtcag caccatcgaa gcttttgcgg attatcaggc caacgaagcc 2340gcttccggca tgctggtcag caccatcgaa gcttttgcgg attatcaggc caacgaagcc 2340
tggacatggg agcatcaggc gctggttcgc gcgcgtgtgg tttatggtga tccgcaactg 2400tggacatggg agcatcaggc gctggttcgc gcgcgtgtgg tttatggtga tccgcaactg 2400
acgcagcaat ttaatgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tgccgacggc 2460acgcagcaat ttaatgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tgccgacggc 2460
ttgcgtaagg aagtccgtga aatgcgcgag aaaatgtatg cccatctggg cagcaaaaga 2520ttgcgtaagg aagtccgtga aatgcgcgag aaaatgtatg cccatctggg cagcaaaaga 2520
gccgacgagt ttgatctgaa agccgatccg ggtggcataa cggatattga attcatcgca 2580gccgacgagt ttgatctgaa agccgatccg ggtggcataa cggatattga attcatcgca 2580
caatatctgg ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacccgctg gtctgataac 2640caatatctgg ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacccgctg gtctgataac 2640
gtgcggattt tcgaactgat ggcgcgacat gacatcatgc cggaagagga agcacgccat 2700gtgcggattt tcgaactgat ggcgcgacat gacatcatgc cggaagagga agcacgccat 2700
ctgacgcagg cttacgtgac attgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac 2760ctgacgcagg cttacgtgac attgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac 2760
agcgggaaag tggccgcaga cagctttgcc actgagcgcg cgcaaatccg cgccagctgg 2820agcgggaaag tggccgcaga cagctttgcc actgagcgcg cgcaaatccg cgccagctgg 2820
gcaaactggc ttggctga 2838gcaaactggc ttggctga 2838
<210> 94<210> 94
<211> 1290<211> 1290
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> amtB<223> amtB
<400> 94<400> 94
atgaaaaaac ttttatccat gatggggctt ggtgcagtgg ctttgctacc ttcgcttgcc 60atgaaaaaac ttttatccat gatggggctt ggtgcagtgg ctttgctacc ttcgcttgcc 60
atggcagcag caccagcagc ggcaaacggt gctgataacg cctttatgat gatttgtacc 120atggcagcag caccagcagc ggcaaacggt gctgataacg cctttatgat gatttgtacc 120
gcgctggtat tgttcatgac cgtacccggt gtggcgttgt tctacggcgg cttactgcgt 180gcgctggtat tgttcatgac cgtacccggt gtggcgttgt tctacggcgg cttactgcgt 180
tctaaaaacg ttttgtccat gctgactcag gttattgtta cctttgctct ggtctgcgtc 240tctaaaaacg ttttgtccat gctgactcag gttattgtta cctttgctct ggtctgcgtc 240
ctgtggatcc tctacggtta cagccttgcc ttcagtgaag gtaacgcgtt cttcggtggt 300ctgtggatcc tctacggtta cagccttgcc ttcagtgaag gtaacgcgtt cttcggtggt 300
ttcagcaacg taatgatgaa aggcattggc ctggattctg tgactggcac cttctcgcag 360ttcagcaacg taatgatgaa aggcattggc ctggattctg tgactggcac cttctcgcag 360
atgatccacg ttgcattcca gtgttcattt gcctgcatca ctgtagcgct gatcgtaggt 420atgatccacg ttgcattcca gtgttcattt gcctgcatca ctgtagcgct gatcgtaggt 420
ggtattgctg aacgtgtgcg tttctcagca gttctgattt tcactgtgat ctggctgact 480ggtattgctg aacgtgtgcg tttctcagca gttctgattt tcactgtgat ctggctgact 480
ttctcttata ttccgatggc tcacatggta tgggcaggcg gtttcctggc tgctgacggt 540ttctcttata ttccgatggc tcacatggta tgggcaggcg gtttcctggc tgctgacggt 540
gcgctggact ttgccggtgg taccgttgtt catatcaatg ccgcaattgc tggcctggta 600gcgctggact ttgccggtgg taccgttgtt catatcaatg ccgcaattgc tggcctggta 600
ggggcttatc tgctgggtaa acgcgccggt tttggcaaag aagctttcaa accacacaac 660ggggcttatc tgctgggtaa acgcgccggt tttggcaaag aagctttcaa accacacaac 660
ctgccaatgg tcttcactgg cgcctcaatc ctgtatgtgg gctggttcgg cttcaatgcg 720ctgccaatgg tcttcactgg cgcctcaatc ctgtatgtgg gctggttcgg cttcaatgcg 720
ggttcagcaa gtgccgcaag ctctgttgcc gcgctggctt tcctgaacac tgtcattgct 780ggttcagcaa gtgccgcaag ctctgttgcc gcgctggctt tcctgaacac tgtcattgct 780
actgctggcg caatcctgtc ctggacgctg gttgagtgga tggtgcgcgg taagccctca 840actgctggcg caatcctgtc ctggacgctg gttgagtgga tggtgcgcgg taagccctca 840
ctgctgggcg caagctccgg tgctatcgca ggtctggtgg ctatcacgcc tgcatgtggt 900ctgctgggcg caagctccgg tgctatcgca ggtctggtgg ctatcacgcc tgcatgtggt 900
acggtcggcg taggtggtgc tctgattatc ggtctggtag gcggtatcac tggtctgtgg 960acggtcggcg taggtggtgc tctgattatc ggtctggtag gcggtatcac tggtctgtgg 960
ggggttgtta ccctgaaaaa atggctgcgt gttgatgaca cctgtgatgt gttcggtgtt 1020ggggttgtta ccctgaaaaa atggctgcgt gttgatgaca cctgtgatgt gttcggtgtt 1020
catggcgtgt gcggtatcgt aggttgtctg ctgacgggtg tattcacgtc cagttcactt 1080catggcgtgt gcggtatcgt aggttgtctg ctgacgggtg tattcacgtc cagttcactt 1080
ggcggcgtgg gctacgcaga aggcgtgacc atgggccatc aggtttgggt gcagttcttc 1140ggcggcgtgg gctacgcaga aggcgtgacc atgggccatc aggtttgggt gcagttcttc 1140
agcgtgtgcg taacattggt ctggtcaggc gttgttgcct tcatcggtta caaagtggct 1200agcgtgtgcg taacattggt ctggtcaggc gttgttgcct tcatcggtta caaagtggct 1200
gacatgatcg taggtctgcg tgttcctgaa gaacaagaac gcgaaggtct ggacgttaac 1260gacatgatcg taggtctgcg tgttcctgaa gaacaagaac gcgaaggtct ggacgttaac 1260
agccacggcg aaaacgctta caaccaataa 1290agccacggcg aaaacgctta caaccaataa 1290
<210> 95<210> 95
<211> 500<211> 500
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> PinfC<223> PinfC
<400> 95<400> 95
tgaatatcac tgactcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 60tgaatatcac tgactcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 60
caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac 120caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac 120
acacgctacg ccgtgttcct tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca 180acacgctacg ccgtgttcct tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca 180
aagttgctgt tcgtactcgt cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg 240aagttgctgt tcgtactcgt cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg 240
ttgacaaact gctggcggaa atccgcagca gaagtcatca tcaactggag gaataaagta 300ttgacaaact gctggcggaa atccgcagca gaagtcatca tcaactggag gaataaagta 300
ttaaaggcgg aaaacgagtt caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg 360ttaaaggcgg aaaacgagtt caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg 360
cgcaagaagt tcgcctcacc ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg 420cgcaagaagt tcgcctcacc ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg 420
aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg 480aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg 480
agccgccagt ttgtcgaatc 500agccgccagt ttgtcgaatc 500
<210> 96<210> 96
<211> 1085<211> 1085
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> 16S<223> 16S
<400> 96<400> 96
attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60
cgagcggtag cacagagagc ttgctctcgg gtgacgagcg gcggacgggt gagtaatgtc 120cgagcggtag cacagagagc ttgctctcgg gtgacgagcg gcggacgggt gagtaatgtc 120
tgggaaactg cctgatggag ggggataact actggaaacg gtagctaata ccgcataacg 180tgggaaactg cctgatggag ggggataact actggaaacg gtagctaata ccgcataacg 180
tcgcaagacc aaagtggggg accttcgggc ctcatgccat cagatgtgcc cagatgggat 240tcgcaagacc aaagtggggg accttcgggc ctcatgccat cagatgtgcc cagatgggat 240
tagctagtag gtggggtaac ggctcaccta ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat 300tagctagtag gtggggtaac ggctcaccta ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat 300
gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360
tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttcgg 420420
gttgtaaagc actttcagcg gggaggaagg cggtgaggtt aataacctca ccgattgacg 480gttgtaaagc actttcagcg gggaggaagg cggtgaggtt aataacctca ccgattgacg 480
ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540
caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600
tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc attcgaaact ggcaggctag agtcttgtag 660tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc attcgaaact ggcaggctag agtcttgtag 660
aggggggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720aggggggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720
gcgaaggcgg ccccctggac aaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780gcgaaggcgg ccccctggac aaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780
ggattagata ccctggtagt ccacgctgta aacgatgtcg atttggaggt tgtgcccttg 840ggattagata ccctggtagt ccacgctgta aacgatgtcg atttggaggt tgtgcccttg 840
aggcgtggct tccggagcta acgcgttaaa tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900aggcgtggct tccggagcta acgcgttaaa tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900
taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960
tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacaga actttccaga gatggattgg 1020tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacaga actttccaga gatggattgg 1020
tgccttcggg aactgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080tgccttcggg aactgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080
ttggg 1085ttggg 1085
<210> 97<210> 97
<211> 882<211> 882
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifH1<223> nifH1
<400> 97<400> 97
atgaccatgc gtcaatgcgc tatctacggt aaaggcggta tcggtaaatc caccaccacc 60atgaccatgc gtcaatgcgc tatctacggt aaaggcggta tcggtaaatc caccaccacc 60
cagaatctcg tcgcggccct cgccgagatg ggtaagaaag tgatgatcgt cggctgcgat 120cagaatctcg tcgcggccct cgccgagatg ggtaagaaag tgatgatcgt cggctgcgat 120
ccgaaagcgg attccacccg tctgatcctc cacgctaaag cccagaacac catcatggag 180ccgaaagcgg attccacccg tctgatcctc cacgctaaag cccagaacac catcatggag 180
atggcggcgg aagtgggctc ggtcgaggat ctggagctcg aagacgttct gcaaatcggc 240atggcggcgg aagtgggctc ggtcgaggat ctggagctcg aagacgttct gcaaatcggc 240
tatggcgatg tccgttgcgc cgaatccggc ggcccggagc caggcgtcgg ctgcgccgga 300tatggcgatg tccgttgcgc cgaatccggc ggcccggagc caggcgtcgg ctgcgccgga 300
cgcggggtga tcaccgccat caacttcctc gaggaagaag gcgcctatga agaagatttg 360360
gatttcgtct tctatgacgt cctcggcgac gtggtctgcg gcggcttcgc tatgccgatc 420gatttcgtct tctatgacgt cctcggcgac gtggtctgcg gcggcttcgc tatgccgatc 420
cgcgaaaaca aagcccagga gatctacatc gtctgctccg gcgagatgat ggcgatgtat 480cgcgaaaaca aagccgga gatctacatc gtctgctccg gcgagatgat ggcgatgtat 480
gccgccaaca atatctccaa agggatcgtg aagtacgcca aatccggcaa ggtgcgcctc 540gccgccaaca atatctccaa agggatcgtg aagtacgcca aatccggcaa ggtgcgcctc 540
ggcggcctga tctgtaactc gcgcaaaacc gaccgggaag acgaactgat catcgccctg 600ggcggcctga tctgtaactc gcgcaaaacc gaccgggaag acgaactgat catcgccctg 600
gcggagaagc ttggcacgca gatgatccac ttcgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgc 660gcggagaagc ttggcacgca gatgatccac ttcgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgc 660
gcggagatcc gccggatgac ggtgatcgag tacgacccga cctgtcagca ggcgaatgaa 720gcggagatcc gccggatgac ggtgatcgag tacgacccga cctgtcagca ggcgaatgaa 720
tatcgtcaac tggcgcagaa gatcgtcaat aacaccaaaa aagtggtgcc gacgccgtgc 780tatcgtcaac tggcgcagaa gatcgtcaat aacaccaaaa aagtggtgcc gacgccgtgc 780
accatggacg agctggaatc gctgctgatg gagttcggca tcatggaaga agaagacacc 840accatggacg agctggaatc gctgctgatg gagttcggca tcatggaaga agaagacacc 840
agcatcattg gtaaaaccgc cgctgaagaa aacgcggcct ga 882agcatcattg gtaaaaccgc cgctgaagaa aacgcggcct ga 882
<210> 98<210> 98
<211> 1113<211> 1113
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifH2<223> nifH2
<400> 98<400> 98
atggttagga aaagtagaag taaaaataca aatatagaac taactgaaca tgaccattta 60atggttagga aaagtagaag taaaaataca aatatagaac taactgaaca tgaccattta 60
ttaataagtc aaataaaaaa gcttaaaaca caaaccactt gcttttttaa taataaagga 120ttaataagtc aaataaaaaa gcttaaaaca caaaccactt gcttttttaa taataaagga 120
ggggttggga agactacatt agtagcaaat ttaggagcag agctatcaat aaactttagt 180ggggttggga agactacatt agtagcaaat ttaggagcag agctatcaat aaactttagt 180
gcaaaagttc ttattgtgga tgccgaccct caatgtaatc tcacgcagta tgtattaagt 240gcaaaagttc ttattgtgga tgccgaccct caatgtaatc tcacgcagta tgtattaagt 240
gatgaagaaa ctcaggactt atatgggcaa gaaaatccag atagtattta tacagtaata 300gatgaagaaa ctcaggactt atatgggcaa gaaaatccag atagtattta tacagtaata 300
agaccactat cctttggtaa aggatatgaa agtgacctcc ctataaggca tgtagagaat 360agaccactat cctttggtaa aggatatgaa agtgacctcc ctataaggca tgtagagaat 360
ttcggttttg acataattgt cggtgaccct agacttgctt tacaggaaga ccttttagct 420ttcggttttg acataattgt cggtgaccct agacttgctt tacaggaaga ccttttagct 420
ggagactggc gagatgccaa aggcggtggg atgcgaggaa ttaggacaac ttttgtattt 480ggagactggc gagatgccaa aggcggtggg atgcgaggaa ttaggacaac ttttgtattt 480
gcagagttaa ttaagaaagc tcgtgagcta aattatgatt ttgttttctt tgacatggga 540gcagagttaa ttaagaaagc tcgtgagcta aattatgatt ttgttttctt tgacatggga 540
ccatcattag gcgcaatcaa cagggcagta ttactggcaa tggaattctt tgtcgtccca 600ccatcattag gcgcaatcaa cagggcagta ttactggcaa tggaattctt tgtcgtccca 600
atgtcaatcg atgtattttc actatgggct attaaaaata ttggctccac ggtttcaata 660atgtcaatcg atgtattttc actatgggct attaaaaata ttggctccac ggtttcaata 660
tggaaaaaag aattagacac agggattcgg ctctcagagg aacctagcga attatcacaa 720tggaaaaaag aattagacac agggattcgg ctctcagagg aacctagcga attatcacaa 720
ttatcacctc aaggaaaact aaagtttctc ggttacgtca cccaacaaca taaagaacgc 780ttatcacctc aaggaaaact aaagtttctc ggttacgtca cccaacaaca taaagaacgc 780
tctggatacg atacaattca gcttgagaat actgaggaag aaataaaatc gaaacgtcgg 840tctggatacg atacaattca gcttgagaat actgaggaag aaataaaatc gaaacgtcgg 840
gtaaaggcgt atgaagacat tggagaggtg tttccttcta aaattactga gcatctttct 900gtaaaggcgt atgaagacat tggagaggtg tttccttcta aaattactga gcatctttct 900
aaactttatg catcaaaaga tatgaaccca caccttggag atatacgtca tttaggtagt 960aaactttatg catcaaaaga tatgaaccca caccttggag atatacgtca tttaggtagt 960
ttagctccga aatcacaatc acaacacgtt ccgatgatat cagtgtctgg tacaggaaat 1020ttagctccga aatcacaatc acaacacgtt ccgatgatat cagtgtctgg tacaggaaat 1020
tacaccagac ttagaaaaag cgcgcgtgaa ctttatcgag atattgcaag aagatactta 1080tacaccagac ttagaaaaag cgcgcgtgaa ctttatcgag atattgcaag aagatactta 1080
gagaacattc agactgctaa tggcgagaaa tag 1113gagaacattc agactgctaa tggcgagaaa
<210> 99<210> 99
<211> 1374<211> 1374
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifD1<223> nifD1
<400> 99<400> 99
atgaagggaa aggaaattct ggcgctgctg gacgaacccg cctgcgagca caaccagaag 60atgaagggaa aggaaattct ggcgctgctg gacgaacccg cctgcgagca caaccagaag 60
caaaaatccg gctgcagcgc ccctaagccc ggcgctaccg ccggcggttg cgccttcgac 120caaaaatccg gctgcagcgc ccctaagccc ggcgctaccg ccggcggttg cgccttcgac 120
ggcgcgcaga taacgctcct gcccatcgcc gacgtcgcgc acctggtgca cggccccatc 180ggcgcgcaga taacgctcct gcccatcgcc gacgtcgcgc acctggtgca cggccccatc 180
ggctgcgcgg gcagctcgtg ggataaccgc ggcagcgtca gcgccggccc ggccctcaac 240ggctgcgcgg gcagctcgtg ggataaccgc ggcagcgtca gcgccggccc ggccctcaac 240
cggctcggct ttaccaccga tcttaacgaa caggatgtga ttatgggccg cggcgaacgc 300cggctcggct ttaccaccga tcttaacgaa caggatgtga ttatggggccg cggcgaacgc 300
cgcctgttcc acgccgtgcg tcacatcgtc gaccgctatc atccggcggc ggtctttatc 360cgcctgttcc acgccgtgcg tcacatcgtc gaccgctatc atccggcggc ggtctttatc 360
tacaacacct gcgtaccggc gatggagggc gatgacatcg aggcggtctg ccaggccgca 420tacaacacct gcgtaccggc gatggagggc gatgacatcg aggcggtctg ccaggccgca 420
cagaccgcca ccggcgtccc ggtcatcgct attgacgccg ccggtttcta cggcagtaaa 480cagaccgcca ccggcgtccc ggtcatcgct attgacgccg ccggtttcta cggcagtaaa 480
aatcttggca accgaatggc gggcgacgtg atgctcaggc aggtgattgg ccagcgcgaa 540aatcttggca accgaatggc gggcgacgtg atgctcaggc aggtgattgg ccagcgcgaa 540
ccggccccgt ggccagacaa cacgcccttt gccccggccc agcgccacga tatcggcctg 600ccggccccgt ggccagacaa cacgcccttt gccccggccc agcgccacga tatcggcctg 600
attggcgaat tcaatatcgc cggcgagttc tggcaggtcc agccgctgct cgacgagctg 660attggcgaat tcaatatcgc cggcgagttc tggcaggtcc agccgctgct cgacgagctg 660
gggatccgcg tcctcggcag cctctccggc gacggccgct ttgccgagat ccagaccctg 720gggatccgcg tcctcggcag cctctccggc gacggccgct ttgccgagat ccagaccctg 720
caccgggcgc aggccaatat gctggtgtgc tcgcgcgcgc tgatcaacgt cgcccggggg 780caccgggcgc aggccaatat gctggtgtgc tcgcgcgcgc tgatcaacgt cgcccggggg 780
ctggagctgc gctacggcac gccgtggttt gaaggcagct tctacgggat ccgcgccacc 840ctggagctgc gctacggcac gccgtggttt gaaggcagct tctacgggat ccgcgccacc 840
tccgacgcct tgcgccagct ggcgacgctg ctgggggatg acgacctgcg ccgccgcacc 900tccgacgcct tgcgccagct ggcgacgctg ctgggggatg acgacctgcg ccgccgcacc 900
gaggcgctga tcgcccgcga agagcaggcg gcggagcagg ctcttgcgcc gtggcgtgag 960gaggcgctga tcgcccgcga agagcaggcg gcggagcagg ctcttgcgcc gtggcgtgag 960
cagctccgcg ggcgcaaagt gctgctctat accggcggcg tgaaatcctg gtcggtggta 1020cagctccgcg ggcgcaaagt gctgctctat accggcggcg tgaaatcctg gtcggtggta 1020
tcggccctgc aggatctcgg catgaccgtg gtggccaccg gcacgcgcaa atccaccgag 1080tcggccctgc aggatctcgg catgaccgtg gtggccaccg gcacgcgcaa atccaccgag 1080
gaggacaaac agcggatccg tgagctgatg ggcgacgagg cggtgatgct tgaggagggc 1140gaggacaaac agcggatccg tgagctgatg ggcgacgagg cggtgatgct tgaggagggc 1140
aatgcccgca ccctgctcga cgtggtgtac cgctatcagg ccgacctgat gatcgccggc 1200aatgcccgca ccctgctcga cgtggtgtac cgctatcagg ccgacctgat gatcgccggc 1200
ggacgcaata tgtacaccgc ctggaaagcc cggctgccgt ttctcgatat caatcaggag 1260ggacgcaata tgtacaccgc ctggaaagcc cggctgccgt ttctcgatat caatcaggag 1260
cgcgagcacg cctacgccgg ctatcagggc atcatcaccc tcgcccgcca gctctgtctg 1320cgcgagcacg cctacgccgg ctatcagggc atcatcaccc tcgcccgcca gctctgtctg 1320
accctcgcca gccccgtctg gccgcaaacg catacccgcg ccccgtggcg ctag 1374accctcgcca gccccgtctg gccgcaaacg catacccgcg ccccgtggcg ctag 1374
<210> 100<210> 100
<211> 1449<211> 1449
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifD2<223> nifD2
<400> 100<400> 100
atgaccaacg caacaggcga acgtaacctt gcgctcatcc aggaagtcct ggaggtgttt 60atgaccaacg caacaggcga acgtaacctt gcgctcatcc aggaagtcct ggaggtgttt 60
cccgaaaccg cgcgcaaaga gcgcagaaag cacatgatga tcagcgatcc gcagatggag 120cccgaaaccg cgcgcaaaga gcgcagaaag cacatgatga tcagcgatcc gcagatggag 120
agcgtcggca agtgcattat ctcgaaccgt aaatcgcagc ccggggtgat gaccgtgcgc 180agcgtcggca agtgcattat ctcgaaccgt aaatcgcagc ccggggtgat gaccgtgcgc 180
ggctgcgcct atgcgggctc gaaaggggtg gtgtttgggc caatcaaaga catggcccat 240ggctgcgcct atgcgggctc gaaaaggggtg gtgtttgggc caatcaaaga catggcccat 240
atctcgcacg gccccatcgg ctgcggccag tattcccgcg ccggacggcg caactactat 300atctcgcacg gccccatcgg ctgcggccag tattcccgcg ccggacggcg caactactat 300
accggcgtca gcggtgtcga cagcttcggc accctgaact tcacctctga ttttcaggag 360accggcgtca gcggtgtcga cagcttcggc accctgaact tcacctctga ttttcaggag 360
cgcgatattg ttttcggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgatcgaaga gatggagctg 420cgcgatattg ttttcggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgatcgaaga gatggagctg 420
ctgttcccgc tgaccaaagg gatcaccatc cagtcggagt gcccggtggg cctgatcggc 480ctgttcccgc tgaccaaagg gatcaccatc cagtcggagt gcccggtggg cctgatcggc 480
gatgacatca gcgccgtagc caacgccagc agcaaggcgc tggataaacc ggtgatcccg 540gatgacatca gcgccgtagc caacgccagc agcaaggcgc tggataaacc ggtgatcccg 540
gtgcgctgcg aaggctttcg cggcgtatcg caatcgctgg gccaccatat cgccaacgac 600gtgcgctgcg aaggctttcg cggcgtatcg caatcgctgg gccaccatat cgccaacgac 600
gtggtgcgcg actgggtgct gaacaatcgc gaagggcagc cgtttgccag caccccgtac 660gtggtgcgcg actgggtgct gaacaatcgc gaagggcagc cgtttgccag caccccgtac 660
gatgttgcca tcattggcga ttacaacatc ggcggcgacg cctgggcctc gcgcattctg 720gatgttgcca tcattggcga ttacaacatc ggcggcgacg cctgggcctc gcgcattctg 720
ctggaagaga tggggctgcg cgtagtggcg cagtggtccg gcgacggcac cctggtggag 780ctggaagaga tggggctgcg cgtagtggcg cagtggtccg gcgacggcac cctggtggag 780
atggagaaca ccccattcgt taagcttaac ctcgtccact gctaccgttc gatgaactat 840atggagaaca ccccattcgt taagcttaac ctcgtccact gctaccgttc gatgaactat 840
atcgcccgcc atatggagga gaaacatcag atcccatgga tggaatataa cttcttcggc 900atcgcccgcc atatggagga gaaacatcag atcccatgga tggaatataa cttcttcggc 900
ccgaccaaaa tcgccgaatc gctgcgcaag atcgccgatc aatttgatga caccattcgc 960ccgaccaaaa tcgccgaatc gctgcgcaag atcgccgatc aatttgatga caccattcgc 960
gccaatgcgg aagcggtgat cgccaaatat gaggggcaga tggcggccat catcgccaaa 1020gccaatgcgg aagcggtgat cgccaaatat gaggggcaga tggcggccat catcgccaaa 1020
tatcgcccgc ggctggaggg gcgcaaagtg ctgctgtaca tgggggggct gcggccgcgc 1080tatcgcccgc ggctggaggg gcgcaaagtg ctgctgtaca tgggggggct gcggccgcgc 1080
cacgtcatcg gcgcctatga ggatctcggg atggagatca tcgccgccgg ctacgagttt 1140cacgtcatcg gcgcctatga ggatctcggg atggagatca tcgccgccgg ctacgagttt 1140
gcccataacg atgattacga ccgcaccctg ccggacctga aagagggcac cctgctgttt 1200gcccataacg atgattacga ccgcaccctg ccggacctga aagagggcac cctgctgttt 1200
gacgatgcca gcagctatga gctggaggcc ttcgtcaaag cgctgaaacc tgacctcatc 1260gacgatgcca gcagctatga gctggaggcc ttcgtcaaag cgctgaaacc tgacctcatc 1260
ggctccggga tcaaagagaa atatatcttc cagaaaatgg gggtgccgtt ccgccagatg 1320ggctccggga tcaaagagaa atatatcttc cagaaaatgg gggtgccgtt ccgccagatg 1320
cactcctggg actattccgg cccctatcac ggctatgacg gcttcgccat ctttgcccgc 1380cactcctggg actattccgg cccctatcac ggctatgacg gcttcgccat ctttgcccgc 1380
gatatggata tgaccctgaa caatccggcg tggaacgaac tgactgcccc gtggctgaag 1440gatatggata tgaccctgaa caatccggcg tggaacgaac tgactgcccc gtggctgaag 1440
tctgcgtga 1449tctgcgtga 1449
<210> 101<210> 101
<211> 1386<211> 1386
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifK1<223> nifK1
<400> 101<400> 101
atggcagata ttatccgcag tgaaaaaccg ctggcggtga gcccgattaa aaccgggcaa 60atggcagata ttatccgcag tgaaaaaccg ctggcggtga gcccgattaa aaccgggcaa 60
ccgctcgggg cgatcctcgc cagcctcggg ctggcccagg ccatcccgct ggtccacggc 120ccgctcgggg cgatcctcgc cagcctcggg ctggcccagg ccatcccgct ggtcccggc 120
gcccagggct gcagcgcctt cgccaaagtt ttctttattc agcatttcca tgacccggtg 180gcccagggct gcagcgcctt cgccaaagtt ttcttttattc agcatttcca tgacccggtg 180
ccgctgcagt cgacggccat ggatccgacc gccacgatca tgggggccga cggcaatatc 240ccgctgcagt cgacggccat ggatccgacc gccacgatca tgggggccga cggcaatatc 240
ttcaccgcgc tcgacaccct ctgccagcgc cacagcccgc aggccatcgt gctgctcagc 300ttcaccgcgc tcgacaccct ctgccagcgc cacagcccgc aggccatcgt gctgctcagc 300
accggtctgg cggaagcgca gggcagcgat atcgcccggg tggtgcgcca gtttcgcgag 360accggtctgg cggaagcgca gggcagcgat atcgcccggg tggtgcgcca gtttcgcgag 360
gcgcatccgc gccataacgg cgtggcgatc ctcaccgtca ataccccgga tttttttggc 420gcgcatccgc gccataacgg cgtggcgatc ctcaccgtca ataccccggga tttttttggc 420
tctatggaaa acggctacag cgcggtgatc gagagcgtga tcgagcagtg ggtcgcgccg 480tctatggaaa acggctacag cgcggtgatc gagagcgtga tcgagcagtg ggtcgcgccg 480
acgccgcgtc cggggcagcg gccccggcgg gtcaacctgc tggtcagcca cctctgttcg 540acgccgcgtc cggggcagcg gccccggcgg gtcaacctgc tggtcagcca cctctgttcg 540
ccaggggata tcgaatggct gggccgctgc gtggaggcct ttggcctgca gccggtgatc 600ccaggggata tcgaatggct gggccgctgc gtggaggcct ttggcctgca gccggtgatc 600
ctgccggacc tctcgcagtc aatggatggc cacctcggtg aaggggattt tacgcccctg 660ctgccggacc tctcgcagtc aatggatggc cacctcggtg aaggggattt tacgcccctg 660
acccagggcg gcgcctcgct gcgccagatt gcccagatgg gccagagtct gggcagcttc 720acccagggcg gcgcctcgct gcgccagatt gcccagatgg gccagagtct gggcagcttc 720
gccattggcg tgtcgctcca gcgggcggca tcgctcctga cccaacgcag ccgcggcgac 780gccattggcg tgtcgctcca gcgggcggca tcgctcctga cccaacgcag ccgcggcgac 780
gtgatcgccc tgccgcatct gatgaccctc gaccattgcg atacctttat ccatcagctg 840gtgatcgccc tgccgcatct gatgaccctc gaccattgcg atacctttat ccatcagctg 840
gcgaagatgt ccggacgccg cgtaccggcc tggattgagc gccagcgtgg ccagctgcag 900gcgaagatgt ccggacgccg cgtaccggcc tggattgagc gccagcgtgg ccagctgcag 900
gatgcgatga tcgactgcca tatgtggctt cagggccagc gcatggcgat ggcggcggag 960gatgcgatga tcgactgcca tatgtggctt cagggccagc gcatggcgat ggcggcggag 960
ggcgacctgc tggcggcgtg gtgtgatttc gcccgcagcc aggggatgca gcccggcccg 1020ggcgacctgc tggcggcgtg gtgtgatttc gcccgcagcc aggggatgca gcccggcccg 1020
ctggtcgccc ccaccagcca ccccagcctg cgccagctgc cggtcgagca agtcgtgccg 1080ctggtcgccc ccaccagcca ccccagcctg cgccagctgc cggtcgagca agtcgtgccg 1080
ggggatcttg aggatctgca gcagctgctg agccaccaac ccgccgatct gctggtggct 1140ggggatcttg aggatctgca gcagctgctg agccaccaac ccgccgatct gctggtggct 1140
aactctcacg cccgcgatct ggcggagcag tttgccctgc cgctgatccg cgtcggtttt 1200aactctcacg cccgcgatct ggcggagcag tttgccctgc cgctgatccg cgtcggtttt 1200
cccctcttcg accggctcgg tgagtttcgt cgcgtccgcc aggggtacgc cggtatgcga 1260cccctcttcg accggctcgg tgagtttcgt cgcgtccgcc aggggtacgc cggtatgcga 1260
gatacgctgt ttgaactggc caatctgctg cgcgaccgcc atcaccacac cgccctctac 1320gatacgctgt ttgaactggc caatctgctg cgcgaccgcc atcaccacac cgccctctac 1320
cgctcgccgc ttcgccaggg cgccgacccc cagccggctt caggagacgc ttatgccgcc 13801380
cattaa 1386cattaa 1386
<210> 102<210> 102
<211> 1563<211> 1563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifK2<223> nifK2
<400> 102<400> 102
atgagccaaa cgatcgataa aattcacagc tgttatccgc tgtttgaaca ggatgaatac 60atgagccaaa cgatcgataa aattcacagc tgttatccgc tgtttgaaca ggatgaatac 60
cagaccctgt tccagaataa aaagaccctt gaagaggcgc acgacgcgca gcgtgtgcag 120cagaccctgt tccagaataa aaagaccctt gaagaggcgc acgacgcgca gcgtgtgcag 120
gaggtttttg cctggaccac caccgccgag tatgaagcgc tgaacttcca gcgcgaggcg 180gaggtttttg cctggaccac caccgccgag tatgaagcgc tgaacttcca gcgcgaggcg 180
ctgaccgtcg acccggccaa agcctgccag ccgctcggcg ccgtactctg cgcgctgggg 240ctgaccgtcg acccggccaa agcctgccag ccgctcggcg ccgtactctg cgcgctgggg 240
ttcgccggca ccctgcccta cgtgcacggc tcccagggct gcgtcgccta ttttcgcacc 300ttcgccggca ccctgccta cgtgcacggc tcccagggct gcgtcgccta ttttcgcacc 300
tactttaacc gccattttaa agagccggtc gcctgcgtct ccgactccat gaccgaggac 360tactttaacc gccattttaa agagccggtc gcctgcgtct ccgactccat gaccgaggac 360
gcggcggtgt tcggcggcaa caacaacatg aatctgggcc tgcagaatgc cagcgcgctg 420gcggcggtgt tcggcggcaa caacaacatg aatctgggcc tgcagaatgc cagcgcgctg 420
tataaacccg agattatcgc cgtctccacc acctgtatgg ccgaggtgat cggcgacgat 480tataaacccg agattatcgc cgtctccacc acctgtatgg ccgaggtgat cggcgacgat 480
ctgcaggcgt ttatcgccaa cgccaaaaaa gagggatttg ttgacgaccg catcgccatt 540ctgcaggcgt ttatcgccaa cgccaaaaaa gagggatttg ttgacgaccg catcgccatt 540
ccttacgccc atacccccag ctttatcggc agccatgtca ccggctggga caatatgttc 600ccttacgccc atacccccag ctttatcggc agccatgtca ccggctggga caatatgttc 600
gaagggttcg cgaagacctt taccgctgac tacgccgggc agccgggcaa acagcaaaag 660660
ctcaatctgg tgaccggatt tgagacctat ctcggcaact tccgcgtgct gaagcggatg 720ctcaatctgg tgaccggatt tgagacctat ctcggcaact tccgcgtgct gaagcggatg 720
atggcgcaga tggatgtccc gtgcagcctg ctctccgacc catcagaggt gctcgacacc 780atggcgcaga tggatgtccc gtgcagcctg ctctccgacc catcagaggt gctcgacacc 780
cccgccgacg gccattaccg gatgtacgcc ggcggcacca gccagcagga gatcaaaacc 840cccgccgacg gccattaccg gatgtacgcc ggcggcacca gccagcagga gatcaaaacc 840
gcgccggacg ccattgacac cctgctgctg cagccgtggc agctggtgaa aagcaaaaag 900gcgccggacg ccattgacac cctgctgctg cagccgtggc agctggtgaa aagcaaaaag 900
gtggttcagg agatgtggaa ccagcccgcc accgaggtgg ccgttccgct gggcctggcc 960gtggttcagg agatgtggaa ccagcccgcc accgaggtgg ccgttccgct gggcctggcc 960
gccaccgacg cgctgctgat gaccgtcagt cagctgaccg gcaaaccgat cgccgacgct 1020gccaccgacg cgctgctgat gaccgtcagt cagctgaccg gcaaaccgat cgccgacgct 1020
ctgaccctgg agcgcggccg gctggtcgac atgatgctgg attcccacac ctggctgcat 1080ctgaccctgg agcgcggccg gctggtcgac atgatgctgg attcccacac ctggctgcat 1080
ggcaaaaaat tcggcctcta cggcgatccg gatttcgtga tggggctgac gcgcttcctg 1140ggcaaaaaat tcggcctcta cggcgatccg gatttcgtga tggggctgac gcgcttcctg 1140
ctggagctgg gctgcgagcc gacggtgatc ctcagtcata acgccaataa acgctggcaa 1200ctggagctgg gctgcgagcc gacggtgatc ctcagtcata acgccaataa acgctggcaa 1200
aaagcgatga agaaaatgct cgatgcctcg ccgtacggtc aggaaagcga agtgttcatc 1260aaagcgatga agaaaatgct cgatgcctcg ccgtacggtc aggaaagcga agtgttcatc 1260
aactgcgacc tgtggcactt ccggtcgctg atgttcaccc gtcagccgga ctttatgatc 1320aactgcgacc tgtggcactt ccggtcgctg atgttcaccc gtcagccgga ctttatgatc 1320
ggtaactcct acggcaagtt tatccagcgc gataccctgg caaagggcaa agccttcgaa 1380ggtaactcct acggcaagtt tatccagcgc gataccctgg caaagggcaa agccttcgaa 1380
gtgccgctga tccgtctggg ctttccgctg ttcgaccgcc atcatctgca ccgccagacc 1440gtgccgctga tccgtctggg ctttccgctg ttcgaccgcc atcatctgca ccgccagacc 1440
acctggggct atgaaggcgc aatgaacatc gtcacgacgc tggtgaacgc cgtgctggaa 1500acctggggct atgaaggcgc aatgaacatc gtcacgacgc tggtgaacgc cgtgctggaa 1500
aaactggacc acgacaccag ccagttgggc aaaaccgatt acagcttcga cctcgttcgt 15601560
taa 1563taa 1563
<210> 103<210> 103
<211> 1485<211> 1485
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifL<223> nifL
<400> 103<400> 103
atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gcgccggagg ccatcgccgg cgcgctgact 60atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gcgccgggagg ccatcgccgg cgcgctgact 60
caacaacatc cggggctgtt ttttaccatg gtggaacagg cctcggtggc catctccctc 120caacaacatc cggggctgtt ttttaccatg gtggaacagg cctcggtggc catctccctc 120
accgatgcca gcgccaggat catttacgcc aacccggcgt tttgccgcca gaccggctat 180accgatgcca gcgccaggat catttacgcc aacccggcgt tttgccgcca gaccggctat 180
tcgctggcgc aattgttaaa ccagaacccg cgcctgctgg ccagcagcca gacgccgcgc 240tcgctggcgc aattgttaaa ccagaacccg cgcctgctgg ccagcagcca gacgccgcgc 240
gagatctatc aggagatgtg gcataccctg ctccagcgtc agccctggcg cggtcagctg 300gagatctatc aggagatgtg gcataccctg ctccagcgtc agccctggcg cggtcagctg 300
attaatcagc gtcgggacgg cggcctgtac ctggtggaga ttgacatcac cccggtgctt 360attaatcagc gtcgggacgg cggcctgtac ctggtggaga ttgacatcac cccggtgctt 360
agcccgcaag gggaactgga gcattatctg gcgatgcagc gggatatcag cgtcagctac 420agcccgcaag gggaactgga gcattatctg gcgatgcagc gggatatcag cgtcagctac 420
accctcgaac agcggctgcg caaccatatg accctgatgg aggcggtgct gaataatatc 480accctcgaac agcggctgcg caaccatatg accctgatgg aggcggtgct gaataatatc 480
cccgccgccg tggtagtggt ggacgagcag gatcgggtgg tgatggacaa cctcgcctac 540cccgccgccg tggtagtggt ggacgagcag gatcgggtgg tgatggacaa cctcgcctac 540
aaaaccttct gcgctgactg cggcggccgg gagctgctca ccgagctgca ggtctcccct 600aaaaccttct gcgctgactg cggcggccgg gagctgctca ccgagctgca ggtctcccct 600
ggccggatga cgcccggcgt ggaggcgatc ctgccggtgg cgctgcgcgg ggccgcgcgc 660ggccggatga cgcccggcgt ggaggcgatc ctgccggtgg cgctgcgcgg ggccgcgcgc 660
tggctgtcgg taacctgctg gccgttgccc ggcgtcagtg aagaggccag ccgctacttt 720tggctgtcgg taacctgctg gccgttgccc ggcgtcagtg aagaggccag ccgctacttt 720
atcgacagcg cgctggcgcg gaccctggtg gtgatcgccg actgtaccca gcagcgtcag 780atcgacagcg cgctggcgcg gaccctggtg gtgatcgccg actgtaccca gcagcgtcag 780
cagcaggagc aagggcgcct tgaccggctg aagcagcaaa tgaccgccgg caagctgctg 840cagcaggagc aagggcgcct tgaccggctg aagcagcaaa tgaccgccgg caagctgctg 840
gcggcgatcc gcgagtcgct ggacgccgcg ctgatccagc tgaactgccc gattaatatg 900gcggcgatcc gcgagtcgct ggacgccgcg ctgatccagc tgaactgccc gattaatatg 900
ctggcggcag cccgtcggct gaacggcgag ggaagcggga atgtggcgct ggaggccgcc 960ctggcggcag cccgtcggct gaacggcgag ggaagcggga atgtggcgct ggaggccgcc 960
tggcgtgaag gggaagaggc gatggcgcgg ctccagcgct gtcgcccatc gctggaactc 1020tggcgtgaag gggaagaggc gatggcgcgg ctccagcgct gtcgcccatc gctggaactc 1020
gaaaaccccg ccgtctggcc gctgcagccc tttttcgacg atctgtgcgc cctctaccgt 10801080
acacgcttcg atcccgacgg gctgcaggtc gacatggcct caccgcatct gatcggcttt 1140acacgcttcg atcccgacgg gctgcaggtc gacatggcct caccgcatct gatcggcttt 1140
ggccagcgca ccccactgct ggcgtgctta agcctgtggc tcgatcgcac cctggccctc 1200ggccagcgca ccccactgct ggcgtgctta agcctgtggc tcgatcgcac cctggccctc 1200
gccgccgaac tcccctccgt gccgctggcg atgcagctct acgccgagga gaacgacggc 1260gccgccgaac tcccctccgt gccgctggcg atgcagctct acgccgagga gaacgacggc 1260
tggctgtcgc tgtatctgac tgacaacgta ccgctgctgc aggtgcgcta cgctcactcc 1320tggctgtcgc tgtatctgac tgacaacgta ccgctgctgc aggtgcgcta cgctcactcc 1320
cccgacgcgc tgaactcgcc gggcaaaggc atggagctgc ggctgatcca gaccctggtg 1380cccgacgcgc tgaactcgcc gggcaaaggc atggagctgc ggctgatcca gaccctggtg 1380
gcgcaccatc gcggggccat tgagctggct tcccgaccgc agggcggcac ctgcctgacc 1440gcgcaccatc gcggggccat tgagctggct tcccgaccgc agggcggcac ctgcctgacc 1440
ctgcgtttcc cgctgtttaa caccctgacc ggaggtgaag catga 1485ctgcgtttcc cgctgtttaa caccctgacc ggaggtgaag catga 1485
<210> 104<210> 104
<211> 1575<211> 1575
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifA<223> nifA
<400> 104<400> 104
atgatccctg aatccgaccc ggacaccacc gtcagacgct tcgacctctc tcagcagttc 60atgatccctg aatccgaccc ggacaccacc gtcagacgct tcgacctctc tcagcagttc 60
accgccatgc agcggataag cgtggtgctg agccgggcca ccgaggccag caaaacgctg 120accgccatgc agcggataag cgtggtgctg agccggggcca ccgaggccag caaaacgctg 120
caggaggtgc tcagcgtatt acacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgcctg 180caggaggtgc tcagcgtatt acacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgcctg 180
tacgacagcg agcaggagat cctcagtatc gaagcgctgc agcaaaccgg ccagcagccc 240tacgacagcg agcaggagat cctcagtatc gaagcgctgc agcaaaccgg ccagcagccc 240
ctccccggca gcacgcagat ccgctatcgc cccggcgagg gactggtggg gaccgtgctg 300ctccccggca gcacgcagat ccgctatcgc cccggcgagg gactggtggg gaccgtgctg 300
gcccaggggc agtcgctggt gctgccccgg gtcgccgacg atcagcgttt tctcgaccgc 360gcccaggggc agtcgctggg gctgccccgg gtcgccgacg atcagcgttt tctcgaccgc 360
ctgagcctct acgattacga tctgccgttt atcgccgtac cgttgatggg gcccaacgcc 420ctgagcctct acgattacga tctgccgttt atcgccgtac cgttgatggg gcccaacgcc 420
cggccaatag gggtgctggc ggcccagccg atggcgcgcc aggaagagcg gctgccggcc 480cggccaatag gggtgctggc ggcccagccg atggcgcgcc aggaagagcg gctgccggcc 480
tgcacccgtt ttctcgaaac cgtcgccaac ctcgtcgccc agaccatccg gctgatgatc 540tgcacccgtt ttctcgaaac cgtcgccaac ctcgtcgccc agaccatccg gctgatgatc 540
cttccggcct cacccgccct gtcgagccgc cagccgccga aggtggaacg gccgccggcc 600cttccggcct cacccgccct gtcgagccgc cagccgccga aggtggaacg gccgccggcc 600
tgctcgtcgt cgcgcggcgt gggccttgac aatatggtcg gcaagagccc ggcgatgcgc 660tgctcgtcgt cgcgcggcgt gggccttgac aatatggtcg gcaagagccc ggcgatgcgc 660
cagatcgtgg aggtgatccg tcaggtttcg cgctgggaca ccaccgtgct ggtacgcggc 720cagatcgtgg aggtgatccg tcaggtttcg cgctgggaca ccaccgtgct ggtacgcggc 720
gaaagcggca ccgggaaaga gctgatcgcc aacgccatcc atcaccattc gccacgggct 780gaaagcggca ccgggaaaga gctgatcgcc aacgccatcc atcaccattc gccacgggct 780
ggcgccgcct tcgtcaaatt taactgcgcg gcgctgccgg acaccctgct ggaaagcgaa 840ggcgccgcct tcgtcaaatt taactgcgcg gcgctgccgg acaccctgct ggaaagcgaa 840
ctgttcggcc atgagaaagg cgcctttacc ggggcggtgc gtcagcgtaa aggacgtttt 900ctgttcggcc atgagaaagg cgcctttacc ggggcggtgc gtcagcgtaa aggacgtttt 900
gagctggcgg atggcggcac cctgttcctc gatgagattg gtgaaagcag cgcctcgttc 960gagctggcgg atggcggcac cctgttcctc gatgagattg gtgaaagcag cgcctcgttc 960
caggccaagc tgctgcgtat cctccaggag ggggagatgg agcgggtcgg cggcgatgag 1020caggccaagc tgctgcgtat cctccaggag ggggagatgg agcggggtcgg cggcgatgag 1020
accctgcggg tgaatgtccg catcatcgcc gccaccaacc gtcacctgga ggaggaggtc 1080accctgcggg tgaatgtccg catcatcgcc gccaccaacc gtcacctgga ggaggaggtc 1080
cggctgggcc atttccgcga ggatctctac tatcgtctga acgtgatgcc catcgccctg 1140cggctgggcc atttccgcga ggatctctac tatcgtctga acgtgatgcc catcgccctg 1140
cccccgctgc gcgagcgtca ggaggacatc gccgagctgg cgcacttcct ggtgcgcaaa 1200cccccgctgc gcgagcgtca ggaggacatc gccgagctgg cgcacttcct ggtgcgcaaa 1200
atcggccagc atcaggggcg cacgctgcgg atcagcgagg gcgcgatccg cctgctgatg 1260atcggccagc atcaggggcg cacgctgcgg atcagcgagg gcgcgatccg cctgctgatg 1260
gagtacagct ggccgggtaa cgttcgcgaa ctggagaact gcctcgaacg atcggcggtg 1320gagtacagct ggccgggtaa cgttcgcgaa ctggagaact gcctcgaacg atcggcggtg 1320
atgtcggaga gtggcctgat cgatcgcgac gtgatcctct tcactcacca ggatcgtccc 1380atgtcggaga gtggcctgat cgatcgcgac gtgatcctct tcactcacca ggatcgtccc 1380
gccaaagccc tgcctgccag cgggccagcg gaagacagct ggctggacaa cagcctggac 1440gccaaagccc tgcctgccag cgggccagcg gaagacagct ggctggacaa cagcctggac 1440
gaacgtcagc gactgatcgc cgcgctggaa aaagccggct gggtgcaggc caaggcggca 1500gaacgtcagc gactgatcgc cgcgctggaa aaagccggct gggtgcaggc caaggcggca 1500
cggctgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcttatcgga tccagatcat ggatatcacc 1560cggctgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcttatcggga tccagatcat ggatatcacc 1560
ctgccgcgtc tgtag 1575ctgccgcgtc tgtag 1575
<210> 105<210> 105
<211> 2838<211> 2838
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> glnE<223> glnE
<400> 105<400> 105
atgatgccgc tttctccgca attacagcag cactggcaga cggtcgctga ccgtctgcca 60atgatgccgc tttctccgca attacagcag cactggcaga cggtcgctga ccgtctgcca 60
gcggattttc ccattgccga actgagccca caggccaggt cggtcatggc gttcagcgat 120gcggattttc ccattgccga actgagccca caggccaggt cggtcatggc gttcagcgat 120
tttgtcgaac agagtgtgat cgcccagccg ggctggctga atgagcttgc ggactcctcg 180tttgtcgaac agagtgtgat cgcccagccg ggctggctga atgagcttgc ggactcctcg 180
ccggaggcgg aagagtggcg gcattacgag gcctggctgc aggatcgcct gcaggccgtc 240ccggaggcgg aagagtggcg gcattacgag gcctggctgc aggatcgcct gcaggccgtc 240
actgacgaag cggggttgat gcgagagctg cgtctcttcc gccgccagat gatggtccgc 300actgacgaag cggggttgat gcgagagctg cgtctcttcc gccgccagat gatggtccgc 300
atcgcctggg cgcaggcgct gtcgctggtg agcgaagaag agactctgca gcagctgagc 360atcgcctggg cgcaggcgct gtcgctggtg agcgaagaag agactctgca gcagctgagc 360
gtcctggcgg agaccctgat tgtcgccgcc cgcgactggc tgtacgccgc ctgctgtaag 420gtcctggcgg agaccctgat tgtcgccgcc cgcgactggc tgtacgccgc ctgctgtaag 420
gagtggggaa cgccatgcaa tgccgagggc cagccgcagc cgctgctgat cctcgggatg 480gagtggggaa cgccatgcaa tgccgagggc cagccgcagc cgctgctgat cctcgggatg 480
ggaaagctgg gcggcggcga gctgaacttc tcttccgata tcgatctgat ctttgcctgg 540ggaaagctgg gcggcggcga gctgaacttc tcttccgata tcgatctgat ctttgcctgg 540
cctgagcatg gcgccacccg cggcggccgc cgcgagctgg ataacgccca gttctttacc 600cctgagcatg gcgccacccg cggcggccgc cgcgagctgg ataacgccca gttctttacc 600
cgtctggggc agcggctgat caaggccctt gaccagccga cgcaggacgg ctttgtctat 660cgtctggggc agcggctgat caaggccctt gaccagccga cgcaggacgg ctttgtctat 660
cgggttgaca tgcgcctgcg gccgtttggc gacagtgggc cgctggtact cagttttgcg 720cgggttgaca tgcgcctgcg gccgtttggc gacagtgggc cgctggtact cagttttgcg 720
gcgctggaag attattacca ggagcagggt cgggactggg aacgctatgc gatggtgaaa 780gcgctggaag attattacca ggagcagggt cgggactggg aacgctatgc gatggtgaaa 780
gcgcggatca tgggcgataa cgacggcgtg tacgccagcg agttgcgcgc gatgctccgt 840gcgcggatca tgggcgataa cgacggcgtg tacgccagcg agttgcgcgc gatgctccgt 840
cctttcgtct tccgccgtta tatcgacttc agcgtgatcc agtcgctgcg taacatgaaa 900cctttcgtct tccgccgtta tatcgacttc agcgtgatcc agtcgctgcg taacatgaaa 900
ggcatgatcg cccgcgaagt gcggcgtcgc gggctgaaag acaacatcaa gctcggcgcc 960ggcatgatcg cccgcgaagt gcggcgtcgc gggctgaaag acaacatcaa gctcggcgcc 960
ggcgggatcc gtgaaattga gtttatcgtt caggtctttc aactgatccg cggtggtcgc 1020ggcgggatcc gtgaaattga gtttatcgtt caggtctttc aactgatccg cggtggtcgc 1020
gaacctgcac tgcagcagcg cgccctgctg ccgacgctgg cggcgattga tgagctacat 1080gaacctgcac tgcagcagcg cgccctgctg ccgacgctgg cggcgattga tgagctacat 1080
ctgctgccgg aaggcgacgc ggcgctgctg cgcgaggcct atctgttcct gcgccggctg 1140ctgctgccgg aaggcgacgc ggcgctgctg cgcgaggcct atctgttcct gcgccggctg 1140
gaaaacctgc tgcaaagcat caacgatgag cagacccaga ccctgccgca ggatgaactt 1200gaaaacctgc tgcaaagcat caacgatgag cagacccaga ccctgccgca ggatgaactt 1200
aaccgcgcca ggctggcgtg ggggatgcat accgaagact gggagacgct gagcgcgcag 1260aaccgcgcca ggctggcgtg ggggatgcat accgaagact gggagacgct gagcgcgcag 1260
ctggcgagcc agatggccaa cgtgcggcga gtgtttaatg aactgatcgg cgatgatgag 1320ctggcgagcc agatggccaa cgtgcggcga gtgtttaatg aactgatcgg cgatgatgag 1320
gatcagtccc cggatgagca actggccgag tactggcgcg agctgtggca ggatgcgctg 1380gatcagtccc cggatgagca actggccgag tactggcgcg agctgtggca ggatgcgctg 1380
gaagaagatg acgccagccc ggcgctggcg catttaaacg ataccgaccg ccgtagcgtg 1440gaagaagatg acgccagccc ggcgctggcg catttaaacg ataccgaccg ccgtagcgtg 1440
ctggcgctga ttgccgattt tcgtaaagag ctggatcggc gcaccatcgg cccgcgcggc 1500ctggcgctga ttgccgattt tcgtaaagag ctggatcggc gcaccatcgg cccgcgcggc 1500
cgccaggtgc tggatcagct gatgccgcat ctgctgagcg aaatctgctc gcgcgccgat 1560cgccaggtgc tggatcagct gatgccgcat ctgctgagcg aaatctgctc gcgcgccgat 1560
gcgccgctgc ctctggcgcg gatcacgccg ctgttgaccg ggatcgtcac ccgtaccacc 1620gcgccgctgc ctctggcgcg gatcacgccg ctgttgaccg ggatcgtcac ccgtaccacc 1620
tatcttgagc tgctgagcga attccccggc gcgctgaagc acctgatcac gctctgcgcg 1680tatcttgagc tgctgagcga attccccggc gcgctgaagc acctgatcac gctctgcgcg 1680
gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg cgccacccgc tgctgctgga tgagctgctg 1740gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg cgccacccgc tgctgctgga tgagctgctg 1740
gatcccaaca ccctctatca gccgacggcg accgatgcct atcgcgacga gctgcgccag 1800gatcccaaca ccctctatca gccgacggcg accgatgcct atcgcgacga gctgcgccag 1800
tacctgctgc gcgtgccgga agaggatgaa gagcagcagc tggaggcgtt gcgccagttt 1860tacctgctgc gcgtgccgga agaggatgaa gagcagcagc tggaggcgtt gcgccagttt 1860
aagcaggcgc agcagctgca tatcgcggcg gcggatatcg ctggtaccct gccggtgatg 1920aagcaggcgc agcagctgca tatcgcggcg gcggatatcg ctggtaccct gccggtgatg 1920
aaggtcagcg atcacttaac ctggcttgcc gaagcgatcc tcgacgcggt ggtgcagcag 1980aaggtcagcg atcacttaac ctggcttgcc gaagcgatcc tcgacgcggt ggtgcagcag 1980
gcatgggggc agatggtcgc tcgctacggc cagccgaccc acctgcacga tcgccagggt 2040gcatgggggc agatggtcgc tcgctacggc cagccgaccc acctgcacga tcgccagggt 2040
cgcggcttcg ccgtcgtcgg ctacggtaag cttggcggct gggagctggg ctacagctcc 2100cgcggcttcg ccgtcgtcgg ctacggtaag cttggcggct gggagctggg ctacagctcc 2100
gatctcgatc tggtgttcct ccatgactgc ccggcggagg tgatgaccga cggcgagcgg 2160gatctcgatc tggtgttcct ccatgactgc ccggcggagg tgatgaccga cggcgagcgg 2160
gagattgacg gccgtcagtt ctacctgcgg ctggcccagc ggatcatgca cctgttcagc 2220gagattgacg gccgtcagtt ctacctgcgg ctggcccagc ggatcatgca cctgttcagc 2220
acccgcacct cgtccggtat tctctacgaa gtggacgccc ggctgcgtcc ttctggcgcg 2280acccgcacct cgtccggtat tctctacgaa gtggacgccc ggctgcgtcc ttctggcgcg 2280
gcggggatgc tggtcaccac cgccgacgcg tttgctgact atcagcagaa cgaagcctgg 2340gcggggatgc tggtcaccac cgccgacgcg tttgctgact atcagcagaa cgaagcctgg 2340
acgtgggaac atcaggcgct ggtgcgcgcc cgcgtggtct atggcgaccc ggcgctgcag 2400acgtgggaac atcaggcgct ggtgcgcgcc cgcgtggtct atggcgaccc ggcgctgcag 2400
gcgcgctttg acgccattcg tcgcgatatc ctgaccaccc cgcgggaggg gatgaccctg 2460gcgcgctttg acgccattcg tcgcgatatc ctgaccaccc cgcgggaggg gatgaccctg 2460
cagaccgagg ttcgcgagat gcgcgagaag atgcgcgccc accttggcaa caaacatccc 2520cagaccgagg ttcgcgagat gcgcgagaag atgcgcgccc accttggcaa caaacatccc 2520
gatcgttttg atatcaaagc cgatgccggc gggatcaccg atattgaatt tattactcag 2580gatcgttttg atatcaaagc cgatgccggc gggatcaccg atattgaatt tattactcag 2580
tatctggtcc tacgctatgc cagtgacaag ccgaagctga cccgctggtc tgacaacgtg 26402640
cgtattcttg agctgctggc gcagaacgac atcatggacg aggaggaggc gcgcgcctta 2700cgtattcttg agctgctggc gcagaacgac atcatggacg aggaggaggc gcgcgcctta 2700
acgcatgcgt acaccacctt gcgtgatgcg ctccatcacc tggccctgca ggagcagccg 2760acgcatgcgt acaccacctt gcgtgatgcg ctccatcacc tggccctgca ggagcagccg 2760
ggacacgtgg cgccagaggc cttcagccgg gagcgtcagc aggtcagcgc cagctggcag 2820ggacacgtgg cgccagaggc cttcagccgg gagcgtcagc aggtcagcgc cagctggcag 2820
aagtggctga tggcttaa 2838aagtggctga tggcttaa 2838
<210> 106<210> 106
<211> 500<211> 500
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> PinfC<223> PinfC
<400> 106<400> 106
agcgtcaggt accggtcatg attcaccgtg cgattctcgg ttccctggag cgcttcattg 60agcgtcaggt accggtcatg attcaccgtg cgattctcgg ttccctggag cgcttcattg 60
gcatcctgac cgaagagttc gctggcttct tcccaacctg gattgcacca gtgcaggtag 120gcatcctgac cgaagagttc gctggcttct tcccaacctg gattgcacca gtgcaggtag 120
tggtcatgaa tattaccgat tctcaggctg aatacgttaa cgaattgacg cgtaaactac 180tggtcatgaa tattaccgat tctcaggctg aatacgttaa cgaattgacg cgtaaactac 180
aaaatgcggg cattcgtgta aaagcagact tgagaaatga gaagattggc tttaaaatcc 240aaaatgcggg cattcgtgta aaagcagact tgagaaatga gaagattggc tttaaaatcc 240
gcgagcacac tttacgtcgt gtcccgtata tgttggtctg tggcgacaaa gaagtcgaag 300gcgagcacac tttacgtcgt gtcccgtata tgttggtctg tggcgacaaa gaagtcgaag 300
ccggcaaagt ggccgtgcgc acccgtcgcg ggaaagacct cggcagcatg gacgtaagtg 360ccggcaaagt ggccgtgcgc acccgtcgcg ggaaagacct cggcagcatg gacgtaagtg 360
aagtgattga gaagctgcaa caagagattc gcagccgcag tcttcaacaa ctggaggaat 420aagtgattga gaagctgcaa caagagattc gcagccgcag tcttcaacaa ctggaggaat 420
aaggtattaa aggcggaaaa cgagttcaaa cggcacgtcc gaatcgtatc aatggcgaga 480aaggtattaa aggcggaaaa cgagttcaaa cggcacgtcc gaatcgtatc aatggcgaga 480
ttcgcgccct ggaagttcgc 500ggaagttcgc 500
<210> 107<210> 107
<211> 1287<211> 1287
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> amtB<223> amtB
<400> 107<400> 107
atgaaaatgg caacaatgaa atcgggtctg ggggcattag cccttcttcc gggactggca 60atgaaaatgg caacaatgaa atcgggtctg ggggcattag cccttcttcc gggactggca 60
atggccgcgc ccgcagtggc ggacaaagcc gataacgcgt ttatgatgat ttgcaccgcg 120atggccgcgc ccgcagtggc ggacaaagcc gataacgcgt ttatgatgat ttgcaccgcg 120
ctggttctgt ttatgaccat cccggggatc gcgctgtttt acggcggcct gatccgcggc 180ctggttctgt ttatgaccat cccggggatc gcgctgtttt acggcggcct gatccgcggc 180
aaaaacgtcc tttccatgct gactcaggtg attgtgacct ttggcctggt ctgcgtactg 240aaaaacgtcc tttccatgct gactcaggtg attgtgacct ttggcctggt ctgcgtactg 240
tgggtgattt atggctatac cctggccttc ggcaccggcg gcagcttctt cggtagtttt 300tgggtgattt atggctatac cctggccttc ggcaccggcg gcagcttctt cggtagtttt 300
gactgggtga tgctgaaaaa tattgaactg aaagcgctga tgggcacctt ctatcagtac 360gactgggtga tgctgaaaaa tattgaactg aaagcgctga tgggcacctt ctatcagtac 360
atccacgtgg ccttccaggg ctcgttcgcc tgtatcaccg tcgggctgat cgtgggggcg 420atccacgtgg ccttccaggg ctcgttcgcc tgtatcaccg tcgggctgat cgtgggggcg 420
ctggctgagc gtattcgttt ctccgccgtg ctgatttttg tggtggtgtg gatgacgctc 480ctggctgagc gtattcgttt ctccgccgtg ctgatttttg tggtggtgtg gatgacgctc 480
tcttatgttc cgattgcgca catggtctgg ggcggcggtc tgctggcgac ccacggcgcg 540tcttatgttc cgattgcgca catggtctgg ggcggcggtc tgctggcgac ccacggcgcg 540
ctggacttcg cgggcggcac cgttgtacac atcaacgccg cggttgccgg gctggtgggt 600ctggacttcg cgggcggcac cgttgtacac atcaacgccg cggttgccgg gctggtgggt 600
gcgtacatga tgggcaaacg tgtgggcttc ggcaaagaag cgttcaaacc gcacaatctg 660gcgtacatga tgggcaaacg tgtgggcttc ggcaaagaag cgttcaaacc gcacaatctg 660
ccgatggtgt tcaccggaac cgccatcctc tacgtgggct ggttcggctt caacgccggc 720ccgatggtgt tcaccggaac cgccatcctc tacgtgggct ggttcggctt caacgccggc 720
tccgccagcg cagcgaacga aattgccgca ttggctttcg tcaacaccgt cgtcgccaca 780tccgccagcg cagcgaacga aattgccgca ttggctttcg tcaacaccgt cgtcgccaca 780
gcggctgcca tcctggcgtg gacctttggc gaatgggccc tgcgcggtaa accttcactg 840gcggctgcca tcctggcgtg gaccttttggc gaatgggccc tgcgcggtaa accttcactg 840
ctgggcgcct gctccggggc gattgccggt ctggttggcg tcacaccagc ctgtgggtat 900ctgggcgcct gctccggggc gattgccggt ctggttggcg tcacaccagc ctgtgggtat 900
atcggtgtcg gtggggcgtt gattgtgggt atcgcatctg gtctggcggg catctggggc 960atcggtgtcg gtggggcgtt gattgtgggt atcgcatctg gtctggcggg catctggggc 960
gtaacggcgc tgaaacgctg gctgcgggtt gatgaccctt gcgacgtctt cggcgtccac 1020gtaacggcgc tgaaacgctg gctgcgggtt gatgaccctt gcgacgtctt cggcgtccac 1020
ggcgtctgcg gcatcgtcgg ctgtatcctg accggtatct tcgcggccac ctctctgggc 1080ggcgtctgcg gcatcgtcgg ctgtatcctg accggtatct tcgcggccac ctctctgggc 1080
ggcgtgggtt atgcagaagg cgtcaccatg ggccatcagc tgctggtgca actcgagagt 1140ggcgtgggtt atgcagaagg cgtcaccatg ggccatcagc tgctggtgca actcgagagt 1140
atcgcgatta ccatcgtctg gtcgggcgtt gtcgctttca ttggctacaa agtggcggac 1200atcgcgatta ccatcgtctg gtcgggcgtt gtcgctttca ttggctacaa agtggcggac 1200
atgaccgtgg ggctgcgcgt accagaagag caggagcgcg aaggactgga cgtcaacagc 1260atgaccgtgg ggctgcgcgt accagaagag caggagcgcg aaggactgga cgtcaacagc 1260
catggcgaaa acgcctacaa cgcctga 1287catggcgaaa acgcctacaa cgcctga 1287
<210> 108<210> 108
<211> 299<211> 299
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> Prm8.2<223> Prm8.2
<400> 108<400> 108
cgccgtcctc gcagtaccat tgcaaccgac tttacagcaa gaagtgattc tggcacgcat 60cgccgtcctc gcagtaccat tgcaaccgac tttacagcaa gaagtgattc tggcacgcat 60
ggaacaaatt cttgccagtc gggctttatc cgatgacgaa cgcgcacagc ttttatatga 120ggaacaaatt cttgccagtc gggctttatc cgatgacgaa cgcgcacagc ttttatatga 120
gcgcggagtg ttgtatgata gtctcggtct gagggcatta gcgcgaaatg atttttcaca 180gcgcggagtg ttgtatgata gtctcggtct gagggcatta gcgcgaaatg atttttcaca 180
agcgctggca atccgacccg atatgcctga agtattcaat tacttaggca tttacttaac 240agcgctggca atccgacccg atatgcctga agtattcaat tacttaggca tttacttaac 240
gcaggcaggc aattttgatg ctgcctatga agcgtttgat tctgtacttg agcttgatc 299gcaggcaggc aattttgatg ctgcctatga agcgtttgat tctgtacttg agcttgatc 299
<210> 109<210> 109
<211> 300<211> 300
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> Prm6.2<223> Prm6.2
<400> 109<400> 109
gctaaagttc tcggctaatc gctgataaca tttgacgcaa tgcgcaataa aagggcatca 60gctaaagttc tcggctaatc gctgataaca tttgacgcaa tgcgcaataa aagggcatca 60
tttgatgccc tttttgcacg ctttcatacc agaacctggc tcatcagtga ttttttttgt 120tttgatgccc tttttgcacg ctttcatacc agaacctggc tcatcagtga ttttttttgt 120
cataatcatt gctgagacag gctctgaaga gggcgtttat acaccaaacc attcgagcgg 180cataatcatt gctgagacag gctctgaaga gggcgtttat acaccaaacc attcgagcgg 180
tagcgcgacg gcaagtcagc gttctccttt gcaatagcag ggaagaggcg ccagaaccgc 240tagcgcgacg gcaagtcagc gttctccttt gcaatagcag ggaagaggcg ccagaaccgc 240
cagcgttgaa gcagtttgaa cgcgttcagt gtataatccg aaacttaatt tcggtttgga 300cagcgttgaa gcagtttgaa cgcgttcagt gtataatccg aaacttaatt tcggtttgga 300
<210> 110<210> 110
<211> 400<211> 400
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> Prm1.2<223> Prm1.2
<400> 110<400> 110
gcccgctgac cgaccagaac ttccaccttg gactcggcta tacccttggc gtgacggcgc 60gcccgctgac cgaccagaac ttccaccttg gactcggcta tacccttggc gtgacggcgc 60
gcgataactg ggactacatc cccattccgg tgatcttacc attggcgtca ataggttacg 120gcgataactg ggactacatc cccattccgg tgatcttacc attggcgtca ataggttacg 120
gtccggcgac tttccagatg acctatattc ccggcaccta caataacggt aacgtttact 180gtccggcgac tttccagatg acctatattc ccggcaccta caataacggt aacgtttact 180
tcgcctgggc tcgtatacag ttttaattcg ctaagtctta gcaataaatg agataagcgg 240tcgcctgggc tcgtatacag ttttaattcg ctaagtctta gcaataaatg agataagcgg 240
tgtgtcttgt ggaaaaacaa ggactaaagc gttacccact aaaaaagata gcgactttta 300tgtgtcttgt ggaaaaacaa ggactaaagc gttacccact aaaaaagata gcgactttta 300
tcacttttta gcaaagttgc actggacaaa aggtaccaca attggtgtac tgatactcga 360tcacttttta gcaaagttgc actggacaaa aggtaccaca attggtgtac tgatactcga 360
cacagcatta gtgtcgattt ttcatataaa ggtaattttg 400cacagcatta gtgtcgattt ttcatataaa ggtaattttg 400
<210> 111<210> 111
<211> 1536<211> 1536
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> 16S<223> 16S
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (245)..(245)<222> (245)..(245)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (452)..(452)<222> (452)..(452)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (454)..(454)<222> (454)..(454)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (1131)..(1132)<222> (1131)..(1132)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 111<400> 111
ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60
gagcggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagcgg cggacgggtg agtaatgtct 120gagcggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagcgg cggacgggtg agtaatgtct 120
gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180
cgcaagacca aagtggggga ccttcgggcc tcatgccatc agatgtgccc agatgggatt 240cgcaagacca aagtggggga ccttcgggcc tcatgccatc agatgtgccc agatgggatt 240
agctngtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300agctngtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300
accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360
attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420
ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggc gntnaggtta ataaccttgt cgattgacgt 480ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggc gntnaggtta ataaccttgt cgattgacgt 480
tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc 540tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc 540
aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggtctgtca agtcggatgt 600aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggtctgtca agtcggatgt 600
gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca ttcgaaactg gcaggctaga gtcttgtaga 660gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca ttcgaaactg gcaggctaga gtcttgtaga 660
ggggggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg 720ggggggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg 720
cgaaggcggc cccctggaca aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag 780cgaaggcggc cccctggaca aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag 780
gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa acgatgtcga tttggaggtt gtgcccttga 840gattagatac cctggtagtc cacgctgtaa acgatgtcga tttggaggtt gtgcccttga 840
ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaaat cgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt 900ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaaat cgaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt 900
aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat 960aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat 960
gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atccacagaa ctttccagag atggattggt 1020gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atccacagaa ctttccagag atggattggt 1020
gccttcggga actgtgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt 1080gccttcggga actgtgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt 1080
tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt tgccagcggt nnggccggga 11401140
actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat 1200actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat 1200
ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggcat atacaaagag aagcgacctc 1260ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggcat atacaaagag aagcgacctc 1260
gcgagagcaa gcggacctca taaagtatgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac 1320gcgagagcaa gcggacctca taaagtatgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac 1320
tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgta gatcagaatg ctacggtgaa tacgttcccg 1380tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgta gatcagaatg ctacggtgaa tacgttcccg 1380
ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagctt 1440ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagctt 1440
aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg 1500aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg 1500
taaccgtagg ggaacctgcg gttggatcac ctcctt 1536taaccgtagg ggaacctgcg gttggatcac ctcctt 1536
<210> 112<210> 112
<211> 882<211> 882
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifH<223> nifH
<400> 112<400> 112
atgaccatgc gtcaatgcgc tatctacggt aaaggcggta tcggtaaatc caccaccacc 60atgaccatgc gtcaatgcgc tatctacggt aaaggcggta tcggtaaatc caccaccacc 60
cagaatctcg tcgcggccct cgccgagatg ggtaagaaag tgatgatcgt cggctgcgat 120cagaatctcg tcgcggccct cgccgagatg ggtaagaaag tgatgatcgt cggctgcgat 120
ccgaaagcgg actccacccg tctgatcctt cacgctaaag cccagaacac catcatggag 180ccgaaagcgg actccaccg tctgatcctt cacgctaaag cccagaacac catcatggag 180
atggcggcgg aagtgggctc ggtcgaggat ctggagctcg aagacgttct gcaaatcggc 240atggcggcgg aagtgggctc ggtcgaggat ctggagctcg aagacgttct gcaaatcggc 240
tatggcgatg tccgttgcgc cgaatccggc ggcccggagc caggcgtcgg ctgcgccgga 300tatggcgatg tccgttgcgc cgaatccggc ggcccggagc caggcgtcgg ctgcgccgga 300
cgcggggtga tcaccgccat caacttcctc gaggaagaag gcgcctatga ggaagatttg 360cgcggggtga tcaccgccat caacttcctc gaggaagaag gcgcctatga ggaagatttg 360
gatttcgtct tctatgacgt cctcggcgac gtagtctgcg gcggcttcgc catgccgatc 420gatttcgtct tctatgacgt cctcggcgac gtagtctgcg gcggcttcgc catgccgatc 420
cgcgaaaaca aagcccagga gatctacatc gtctgctccg gcgagatgat ggcgatgtat 480cgcgaaaaca aagccgga gatctacatc gtctgctccg gcgagatgat ggcgatgtat 480
gccgccaaca atatctccaa ggggatcgtg aagtacgcga aatctggcaa ggtgcgcctc 540gccgccaaca atatctccaa ggggatcgtg aagtacgcga aatctggcaa ggtgcgcctc 540
ggcggcctga tctgtaactc gcgcaaaacc gaccgggaag acgaactgat catcgccctg 600ggcggcctga tctgtaactc gcgcaaaacc gaccgggaag acgaactgat catcgccctg 600
gcggagaagc ttggcacgca gatgatccac ttcgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgc 660gcggagaagc ttggcacgca gatgatccac ttcgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgc 660
gcggagatcc gccggatgac ggtgatcgag tacgacccga cctgtcagca ggcgaatgaa 720gcggagatcc gccggatgac ggtgatcgag tacgacccga cctgtcagca ggcgaatgaa 720
tatcgtcaac tggcgcagaa gatcgtcaat aacaccaaaa aagtggtgcc aacgccgtgc 780tatcgtcaac tggcgcagaa gatcgtcaat aacaccaaaa aagtggtgcc aacgccgtgc 780
accatggacg agctggaatc gctgctgatg gagttcggca tcatggaaga agaagacacc 840accatggacg agctggaatc gctgctgatg gagttcggca tcatggaaga agaagacacc 840
agcatcattg gtaaaaccgc cgctgaagaa aacgcggcct ga 882agcatcattg gtaaaaccgc cgctgaagaa aacgcggcct ga 882
<210> 113<210> 113
<211> 1449<211> 1449
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifD1<223> nifD1
<400> 113<400> 113
atgaccaacg caacaggcga acgtaacctt gcgctcatcc aggaagtcct ggaggtgttt 60atgaccaacg caacaggcga acgtaacctt gcgctcatcc aggaagtcct ggaggtgttt 60
cccgaaaccg cgcgcaaaga gcgcagaaag cacatgatga tcagcgatcc gcagatggag 120cccgaaaccg cgcgcaaaga gcgcagaaag cacatgatga tcagcgatcc gcagatggag 120
agcgtcggca agtgcattat ctcgaaccgt aaatcgcagc ccggggtgat gaccgtgcgt 180agcgtcggca agtgcattat ctcgaaccgt aaatcgcagc ccggggtgat gaccgtgcgt 180
ggctgcgcct atgcgggctc gaaaggggtg gtgtttgggc caatcaaaga catggcccat 240ggctgcgcct atgcgggctc gaaaaggggtg gtgtttgggc caatcaaaga catggcccat 240
atctcgcacg gccccatcgg ctgcggccag tactcgcgcg ccggacggcg caactactat 300atctcgcacg gccccatcgg ctgcggccag tactcgcgcg ccggacggcg caactactat 300
accggcgtca gcggtgtcga cagcttcggc accctgaact tcacctctga ttttcaggag 360accggcgtca gcggtgtcga cagcttcggc accctgaact tcacctctga ttttcaggag 360
cgcgatattg ttttcggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgatcgaaga gatggagctg 420cgcgatattg ttttcggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgatcgaaga gatggagctg 420
ctgttcccgc tgaccaaagg gatcaccatc cagtcggagt gcccggtggg cctgatcggc 480ctgttcccgc tgaccaaagg gatcaccatc cagtcggagt gcccggtggg cctgatcggc 480
gatgacatca gcgccgtggc caacgccagc agcaaggcgc tggataaacc ggtgatcccg 540gatgacatca gcgccgtggc caacgccagc agcaaggcgc tggataaacc ggtgatcccg 540
gtgcgctgcg aaggctttcg cggcgtatcg caatcgctgg gccaccatat cgccaacgac 600gtgcgctgcg aaggctttcg cggcgtatcg caatcgctgg gccaccatat cgccaacgac 600
gtggtgcgcg actgggtgct gaacaatcgc gaagggcagc cgtttgccag caccccgtat 660gtggtgcgcg actgggtgct gaacaatcgc gaagggcagc cgtttgccag caccccgtat 660
gatgttgcca tcattggcga ttacaacatc ggcggcgacg cctgggcctc gcgcattctg 720gatgttgcca tcattggcga ttacaacatc ggcggcgacg cctgggcctc gcgcattctg 720
ctggaagaga tggggctgcg cgtagtggcg cagtggtccg gcgacggcac cctggtggag 780ctggaagaga tggggctgcg cgtagtggcg cagtggtccg gcgacggcac cctggtggag 780
atggagaaca ccccattcgt taagcttaac ctcgtccact gctaccgttc gatgaactat 840atggagaaca ccccattcgt taagcttaac ctcgtccact gctaccgttc gatgaactat 840
atcgcccgcc atatggagga gaaacatcag atcccgtgga tggaatataa cttcttcggc 900atcgcccgcc atatggagga gaaacatcag atcccgtgga tggaatataa cttcttcggc 900
ccgaccaaaa tcgccgaatc gctgcgcaag atcgccgatc aatttgatga caccattcgc 960ccgaccaaaa tcgccgaatc gctgcgcaag atcgccgatc aatttgatga caccattcgc 960
gccaatgcgg aagcggtgat cgccaaatat gaggggcaga tggcggccat catcgccaaa 1020gccaatgcgg aagcggtgat cgccaaatat gaggggcaga tggcggccat catcgccaaa 1020
tatcgcccgc ggctggaggg gcgcaaagtg ctgctgtaca tgggggggct gcggccgcgc 1080tatcgcccgc ggctggaggg gcgcaaagtg ctgctgtaca tgggggggct gcggccgcgc 1080
cacgtcatcg gcgcctatga ggatctcggg atggagatca tcgccgccgg ctacgagttt 1140cacgtcatcg gcgcctatga ggatctcggg atggagatca tcgccgccgg ctacgagttt 1140
gcccataacg atgattacga ccgcaccctg ccggacctga aagagggcac cctgctgttt 1200gcccataacg atgattacga ccgcaccctg ccggacctga aagagggcac cctgctgttt 1200
gacgatgcca gcagctatga gctggaggcc ttcgtcaaag cgctgaaacc tgacctcatc 1260gacgatgcca gcagctatga gctggaggcc ttcgtcaaag cgctgaaacc tgacctcatc 1260
ggctccggga tcaaagagaa atatatcttc cagaaaatgg gggtgccgtt ccgccagatg 1320ggctccggga tcaaagagaa atatatcttc cagaaaatgg gggtgccgtt ccgccagatg 1320
cactcctggg actattccgg cccctatcac ggctatgacg gcttcgccat ctttgcccgc 1380cactcctggg actattccgg cccctatcac ggctatgacg gcttcgccat ctttgcccgc 1380
gatatggata tgaccctgaa caatccggcg tggaacgaac tgactgcccc gtggctgaag 1440gatatggata tgaccctgaa caatccggcg tggaacgaac tgactgcccc gtggctgaag 1440
tctgcgtga 1449tctgcgtga 1449
<210> 114<210> 114
<211> 1374<211> 1374
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifD2<223> nifD2
<400> 114<400> 114
atgaagggaa aggaaattct ggcgctgctg gacgaacccg cctgcgagca caaccagaag 60atgaagggaa aggaaattct ggcgctgctg gacgaacccg cctgcgagca caaccagaag 60
caaaaatccg gctgcagcgc tcctaagccc ggcgcaaccg ccggcggctg cgccttcgac 120caaaaatccg gctgcagcgc tcctaagccc ggcgcaaccg ccggcggctg cgccttcgac 120
ggcgcgcaga taacgctcct gcccatcgcc gacgtcgcgc acctggtgca cggccccatc 180ggcgcgcaga taacgctcct gcccatcgcc gacgtcgcgc acctggtgca cggccccatc 180
ggctgcgcgg gcagctcgtg ggataaccgc ggcagcgtca gcgccggccc ggccctcaac 240ggctgcgcgg gcagctcgtg ggataaccgc ggcagcgtca gcgccggccc ggccctcaac 240
cggctcggct ttaccaccga tcttaacgaa caggatgtga ttatgggccg cggcgaacgc 300cggctcggct ttaccaccga tcttaacgaa caggatgtga ttatggggccg cggcgaacgc 300
cgcctgttcc acgccgtccg tcacatcgtc gaccgctatc atccggcggc ggtctttatc 360cgcctgttcc acgccgtccg tcacatcgtc gaccgctatc atccggcggc ggtctttatc 360
tacaacacct gcgtaccggc gatggagggg gatgacctgg aggccgtctg ccaggccgca 420tacaacacct gcgtaccggc gatggagggg gatgacctgg aggccgtctg ccaggccgca 420
cagaccgcca ccggcgtccc ggtcatcgcc attgacgccg ccggtttcta cggcagtaaa 480cagaccgcca ccggcgtccc ggtcatcgcc attgacgccg ccggtttcta cggcagtaaa 480
aatcttggca accgaatggc gggcgacgtg atgctcaggc aggtgattgg ccagcgcgaa 540aatcttggca accgaatggc gggcgacgtg atgctcaggc aggtgattgg ccagcgcgaa 540
ccggccccgt ggccagacaa cacgcccttt gccccggccc agcgccacga tatcggcctg 600ccggccccgt ggccagacaa cacgcccttt gccccggccc agcgccacga tatcggcctg 600
attggcgaat tcaatatcgc cggcgagttc tggcaggtcc agccgctgct cgacgagctg 660attggcgaat tcaatatcgc cggcgagttc tggcaggtcc agccgctgct cgacgagctg 660
gggatccgcg tcctcggcag cctctccggc gacggccgct ttgccgagat ccagaccctg 720gggatccgcg tcctcggcag cctctccggc gacggccgct ttgccgagat ccagaccctg 720
caccgggcgc aggccaatat gctggtgtgc tcgcgcgcgc tgatcaacgt cgcccggggg 780caccgggcgc aggccaatat gctggtgtgc tcgcgcgcgc tgatcaacgt cgcccggggg 780
ctggagctgc gctacggcac gccgtggttt gaaggcagct tctacgggat ccgcgccacc 840ctggagctgc gctacggcac gccgtggttt gaaggcagct tctacgggat ccgcgccacc 840
tccgacgcct tgcgccagct ggcggcgctg ctgggggatg acgacctgtg ccgccgcacc 900tccgacgcct tgcgccagct ggcggcgctg ctgggggatg acgacctgtg ccgccgcacc 900
gaggcgctga tcgcccgcga agagcaggcg gcggagcagg cgctggcgcc gtggcgcgag 960gaggcgctga tcgcccgcga agagcaggcg gcggagcagg cgctggcgcc gtggcgcgag 960
cagctccgtg ggcgcaaagt gttgctctac accggcggcg tgaaatcctg gtcggtggta 1020cagctccgtg ggcgcaaagt gttgctctac accggcggcg tgaaatcctg gtcggtggta 1020
tcagccctgc aggatctcgg catgaccgtg gtggccaccg gcacgcggaa atccaccgag 1080tcagccctgc aggatctcgg catgaccgtg gtggccaccg gcacgcggaa atccaccgag 1080
gaggacaaac agcggatccg tgagctgatg ggcgacgagg cggtgatgct tgaggagggc 1140gaggacaaac agcggatccg tgagctgatg ggcgacgagg cggtgatgct tgaggagggc 1140
aatgcccgca ccctgctcga cgtggtgtac cgctatcagg ccgacctgat gatcgccggc 1200aatgcccgca ccctgctcga cgtggtgtac cgctatcagg ccgacctgat gatcgccggc 1200
ggacgcaata tgtacaccgc ctggaaagcc cggctgccgt ttctcgatat caatcaggag 1260ggacgcaata tgtacaccgc ctggaaagcc cggctgccgt ttctcgatat caatcaggag 1260
cgcgagcacg cctacgccgg ctatcagggc atcatcaccc tcgcccgcca gctctgtctg 1320cgcgagcacg cctacgccgg ctatcagggc atcatcaccc tcgcccgcca gctctgtctg 1320
accctcgcca gtcccgtctg gccgcaaacg catacccgcg ccccgtggcg ctag 1374accctcgcca gtcccgtctg gccgcaaacg catacccgcg ccccgtggcg ctag 1374
<210> 115<210> 115
<211> 1386<211> 1386
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifK1<223> nifK1
<400> 115<400> 115
atggcagaca ttatccgcag tgaaaaaccg ctggcggtga gcccgattaa aaccgggcaa 60atggcagaca ttatccgcag tgaaaaaccg ctggcggtga gcccgattaa aaccgggcaa 60
ccgctcgggg cgatcctcgc cagcctcggg ctggcccagg ccatcccgct ggtccacggc 120ccgctcgggg cgatcctcgc cagcctcggg ctggcccagg ccatcccgct ggtcccggc 120
gcccagggct gcagcgcctt cgccaaagtt ttctttattc agcatttcca tgacccggtg 180gcccagggct gcagcgcctt cgccaaagtt ttcttttattc agcatttcca tgacccggtg 180
ccgctgcagt cgacggccat ggatccgacc gccacgatca tgggggccga cggcaatatc 240ccgctgcagt cgacggccat ggatccgacc gccacgatca tgggggccga cggcaatatc 240
ttcaccgcgc tcgacaccct ctgccagcgc cacagcccgc aggccatcgt gctgctcagc 300ttcaccgcgc tcgacaccct ctgccagcgc cacagcccgc aggccatcgt gctgctcagc 300
accggtctgg cggaagcgca gggcagcgat atcgcccggg tggtgcgcca gtttcgtgag 360accggtctgg cggaagcgca gggcagcgat atcgcccggg tggtgcgcca gtttcgtgag 360
gcgcatccgc gccataacgg cgtggcgatc ctcaccgtca ataccccgga tttttttggc 420gcgcatccgc gccataacgg cgtggcgatc ctcaccgtca ataccccggga tttttttggc 420
tcgatggaaa acggctacag cgcggtgatc gagagcgtga tcgagcagtg ggtcgcgccg 480tcgatggaaa acggctacag cgcggtgatc gagagcgtga tcgagcagtg ggtcgcgccg 480
acgccgcgtc cggggcagcg gccccggcgg gtcaacctgc tggtcagcca cctctgttcg 540acgccgcgtc cggggcagcg gccccggcgg gtcaacctgc tggtcagcca cctctgttcg 540
ccaggggata tcgaatggct gggccgctgc gtggaggcct ttggcctgca gccggtgatc 600ccaggggata tcgaatggct gggccgctgc gtggaggcct ttggcctgca gccggtgatc 600
ctgccggacc tctcgcagtc aatggatggc cacctcggtg aaggggattt tacgcccctg 660ctgccggacc tctcgcagtc aatggatggc cacctcggtg aaggggattt tacgcccctg 660
acccagggcg gcgcctcgct gcgccagatt gcccagatgg gccagagtct gggcagcttc 720acccagggcg gcgcctcgct gcgccagatt gcccagatgg gccagagtct gggcagcttc 720
gccattggcg tgtcgctcca gcgggcggca tcgctcctga cccaacgcag ccgcggcgac 780gccattggcg tgtcgctcca gcgggcggca tcgctcctga cccaacgcag ccgcggcgac 780
gtgatcgccc tgccgcatct gatgaccctc gaccattgcg atacctttat ccatcagctg 840gtgatcgccc tgccgcatct gatgaccctc gaccattgcg atacctttat ccatcagctg 840
gcgaagatgt ccggacgccg cgtaccggcc tggattgagc gccagcgcgg ccagctgcag 900gcgaagatgt ccggacgccg cgtaccggcc tggattgagc gccagcgcgg ccagctgcag 900
gatgcgatga tcgactgcca tatgtggctt cagggccagc gcatggcgat ggcggcggag 960gatgcgatga tcgactgcca tatgtggctt cagggccagc gcatggcgat ggcggcggag 960
ggcgacctgc tggcggcgtg gtgtgatttc gcccgcagcc aggggatgca gcccggcccg 1020ggcgacctgc tggcggcgtg gtgtgatttc gcccgcagcc aggggatgca gcccggcccg 1020
ctggtcgccc ccaccagcca ccccagcctg cgccagctgc cggtcgatca ggtcgtgccg 1080ctggtcgccc ccaccagcca ccccagcctg cgccagctgc cggtcgatca ggtcgtgccg 1080
ggggatcttg aggatctgca gcagctgctg agccaccaac ccgccgatct gctggtggct 1140ggggatcttg aggatctgca gcagctgctg agccaccaac ccgccgatct gctggtggct 1140
aactctcacg cccgcgatct ggcggagcag tttgccctgc cgctgatccg cgtcggtttt 1200aactctcacg cccgcgatct ggcggagcag tttgccctgc cgctgatccg cgtcggtttt 1200
cccctcttcg accggctcgg tgagtttcgt cgcgtccgcc aggggtacgc cggtatgcga 1260cccctcttcg accggctcgg tgagtttcgt cgcgtccgcc aggggtacgc cggtatgcga 1260
gatacgctgt ttgagctggc caatctgctg cgcgaccgcc atcaccacac cgccctctac 1320gatacgctgt ttgagctggc caatctgctg cgcgaccgcc atcaccacac cgccctctac 1320
cgctcgccgc ttcgccaggg cgccgacccc ctgccggctt caggagacgc ttatgccgcc 13801380
cattaa 1386cattaa 1386
<210> 116<210> 116
<211> 183<211> 183
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifK2<223> nifK2
<400> 116<400> 116
gtgccgctga tccgtctggg ctttccgctg ttcgaccgcc atcatctgca ccgccagacc 60gtgccgctga tccgtctggg ctttccgctg ttcgaccgcc atcatctgca ccgccagacc 60
acctggggct atgaaggcgc aatgaacatc gtcacgacgc tggtgaacgc cgtgctggaa 120acctggggct atgaaggcgc aatgaacatc gtcacgacgc tggtgaacgc cgtgctggaa 120
aaactggacc acgacaccag ccagttgggc aaaaccgatt acagcttcga cctcgttcgt 180180
taa 183taa 183
<210> 117<210> 117
<211> 1485<211> 1485
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifL<223> nifL
<400> 117<400> 117
atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gcaccggagg ccatcgccgg cgcgctgact 60atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gcaccgggagg ccatcgccgg cgcgctgact 60
caacaacatc cggggctgtt ttttaccatg gtggaacagg cctcggtggc catatccctc 120caacaacatc cggggctgtt ttttaccatg gtggaacagg cctcggtggc catatccctc 120
accgatgcca gcgccaggat catttacgcc aacccagcgt tttgccgcca gaccggctat 180accgatgcca gcgccaggat catttacgcc aacccagcgt tttgccgcca gaccggctat 180
tcgctggcgc aattgttaaa ccagaacccg cgcctgctgg ccagcagcca gacgccgcgc 240tcgctggcgc aattgttaaa ccagaacccg cgcctgctgg ccagcagcca gacgccgcgc 240
gcgatctatc aggagatgtg gcataccctg ctccagcgtc agccctggcg cggtcagctg 300gcgatctatc aggagatgtg gcataccctg ctccagcgtc agccctggcg cggtcagctg 300
attaatcagc gtcgggacgg cggcctgtgc ctggtggaga ttgacatcac cccggtgctt 360attaatcagc gtcgggacgg cggcctgtgc ctggtggaga ttgacatcac cccggtgctt 360
agcccgcaag gggaactgga gcattatctg gcgatgcagc gggatatcag cgtcagctac 420agcccgcaag gggaactgga gcattatctg gcgatgcagc gggatatcag cgtcagctac 420
accctcgaac aacggctgcg caaccatatg accctgatgg aggcggtgct gaataatatc 480accctcgaac aacggctgcg caaccatatg accctgatgg aggcggtgct gaataatatc 480
cccgccgccg tggtggtggt ggacgagcag gatcgggtgg tgatggacaa cctcgcctac 540cccgccgccg tggtggtggt ggacgagcag gatcgggtgg tgatggacaa cctcgcctac 540
aaaaccttct gcgctgactg cggcggccgg gagctgctca ccgagctgca ggtctcccct 600aaaaccttct gcgctgactg cggcggccgg gagctgctca ccgagctgca ggtctcccct 600
ggccggatga cgcccggcgt ggaggcgatc ctgccggtag cgctgcgcgg ggccgcgcgc 660ggccggatga cgcccggcgt ggaggcgatc ctgccggtag cgctgcgcgg ggccgcgcgc 660
tggctgtcgg taacctgctg gccgttgccc ggcgtcagtg aagaggccag ccgctacttt 720tggctgtcgg taacctgctg gccgttgccc ggcgtcagtg aagaggccag ccgctacttt 720
atcgacagcg cgctggcgcg gaccctggtg gtgatcgccg actgtaccca gcagcgtcag 780atcgacagcg cgctggcgcg gaccctggtg gtgatcgccg actgtaccca gcagcgtcag 780
cagcaggagc aaggacgcct tgaccggctg aagcagcaaa tgaccgccgg caagctgctg 840cagcaggagc aaggacgcct tgaccggctg aagcagcaaa tgaccgccgg caagctgctg 840
gcggcgatcc gcgagtcgct ggacgccgcg ctgatccagc tgaactgccc gattaatatg 900gcggcgatcc gcgagtcgct ggacgccgcg ctgatccagc tgaactgccc gattaatatg 900
ctggcggcag cccgtcggct gaacggcgag ggaagcggga atgtggcgct ggaggccgcc 960ctggcggcag cccgtcggct gaacggcgag ggaagcggga atgtggcgct ggaggccgcc 960
tggcgtgaag gggaagaggc gatggcgcgg ctccagcgct gtcgcccatc gctggaactc 1020tggcgtgaag gggaagaggc gatggcgcgg ctccagcgct gtcgcccatc gctggaactc 1020
gaaaaccccg ccgtctggcc gctgcagccc tttttcgacg atctgtgcgc cctctaccgt 10801080
acccgcttcg atcccgacgg gctgcaggtc gacatggcct caccgcatct gatcggcttt 1140acccgcttcg atcccgacgg gctgcaggtc gacatggcct caccgcatct gatcggcttt 1140
ggccagcgca ccccgctgct ggcgtgctta agcctgtggc tcgaccgcac cctggccctc 1200ggccagcgca ccccgctgct ggcgtgctta agcctgtggc tcgaccgcac cctggccctc 1200
gccgccgaat tgccctccgt gccgctggcg atgcagctct atgccgagga gaacgacggc 1260gccgccgaat tgccctccgt gccgctggcg atgcagctct atgccgagga gaacgacggc 1260
tggctgtcgc tgtacctgac tgataacgta ccgctgttgc aggtgcgcta cgcccactcc 1320tggctgtcgc tgtacctgac tgataacgta ccgctgttgc aggtgcgcta cgcccactcc 1320
cccgacgcgc tgaactcgcc gggtaaaggc atggagctgc ggctgatcca gaccctggtg 1380cccgacgcgc tgaactcgcc gggtaaaggc atggagctgc ggctgatcca gaccctggtg 1380
gcgcaccatc gcggggccat tgagctggct tcccgaccgc agggcggcac ctgcctgacc 1440gcgcaccatc gcggggccat tgagctggct tcccgaccgc agggcggcac ctgcctgacc 1440
ctgcgtttcc cgctgtttaa caccctgacc ggaggtgaag catga 1485ctgcgtttcc cgctgtttaa caccctgacc ggaggtgaag catga 1485
<210> 118<210> 118
<211> 1575<211> 1575
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> nifA<223> nifA
<400> 118<400> 118
atgatccctg aatccgaccc ggacaccacc gtcagacgct tcgacctctc tcagcagttc 60atgatccctg aatccgaccc ggacaccacc gtcagacgct tcgacctctc tcagcagttc 60
accgccatgc agcggataag cgtggtgctg agccgggcca ccgaggccag caaaacgctg 120accgccatgc agcggataag cgtggtgctg agccggggcca ccgaggccag caaaacgctg 120
caggaggtac tcactgtatt gcacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgcctg 180caggaggtac tcactgtatt gcacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgcctg 180
tacgacagcg agcaggagat cctcagtatc gaagcgctgc agcaaaccgg ccagcagccc 240tacgacagcg agcaggagat cctcagtatc gaagcgctgc agcaaaccgg ccagcagccc 240
ctccccggca gcacgcagat ccgctatcgc cccggcgagg gactggtggg gaccgtgctg 300ctccccggca gcacgcagat ccgctatcgc cccggcgagg gactggtggg gaccgtgctg 300
gcccaggggc agtcgctggt gctgccccgg gtcgccgacg atcagcgttt tctcgaccgc 360gcccaggggc agtcgctggg gctgccccgg gtcgccgacg atcagcgttt tctcgaccgc 360
ctgagcctct acgattacga tctgccgttt atcgccgtac cgttgatggg gcccaacgcc 420ctgagcctct acgattacga tctgccgttt atcgccgtac cgttgatggg gcccaacgcc 420
cggccaatag gggtgctggc ggcccagccg atggcgcgcc aggaagagcg gctgccggcc 480cggccaatag gggtgctggc ggcccagccg atggcgcgcc aggaagagcg gctgccggcc 480
tgcacccgtt ttctcgaaac cgtcgccaac ctcgtcgccc agaccatccg gctgatgatc 540tgcacccgtt ttctcgaaac cgtcgccaac ctcgtcgccc agaccatccg gctgatgatc 540
cttccggcct cacccgccct gtcgagccgc cagccgccga aggtggaacg gccgccggcc 600cttccggcct cacccgccct gtcgagccgc cagccgccga aggtggaacg gccgccggcc 600
tgctcgtcgt cgcgcggcgt gggccttgac aatatggtcg gcaagagccc ggcgatgcgc 660tgctcgtcgt cgcgcggcgt gggccttgac aatatggtcg gcaagagccc ggcgatgcgc 660
cagatcgtgg aggtgatccg tcaggtttcg cgctgggaca ccaccgtgct ggtgcgcggt 720cagatcgtgg aggtgatccg tcaggtttcg cgctgggaca ccaccgtgct ggtgcgcggt 720
gaaagcggca ccgggaaaga gctgatcgcc aacgccatcc atcaccattc gccacgggct 780gaaagcggca ccgggaaaga gctgatcgcc aacgccatcc atcaccattc gccacgggct 780
ggcgccgcct tcgtcaaatt taactgcgcg gcgctgccgg acaccctgct ggaaagcgaa 840ggcgccgcct tcgtcaaatt taactgcgcg gcgctgccgg acaccctgct ggaaagcgaa 840
ctgttcggcc atgagaaagg cgcctttacc ggggcggtgc gtcagcgtaa aggacgtttt 900ctgttcggcc atgagaaagg cgcctttacc ggggcggtgc gtcagcgtaa aggacgtttt 900
gagctggcgg atggcggcac cctgttcctc gatgagattg gtgaaagcag cgcctcgttc 960gagctggcgg atggcggcac cctgttcctc gatgagattg gtgaaagcag cgcctcgttc 960
caggccaagc tgctgcgtat cctccaggag ggggagatgg agcgggtcgg cggcgatgag 1020caggccaagc tgctgcgtat cctccaggag ggggagatgg agcggggtcgg cggcgatgag 1020
accctgcggg tgaatgtccg catcatcgcc gccaccaacc gtcacctgga ggaggaggtc 1080accctgcggg tgaatgtccg catcatcgcc gccaccaacc gtcacctgga ggaggaggtc 1080
cggctgggcc atttccgcga ggatctctat tatcgtctga acgtgatgcc catcgccctg 1140cggctgggcc atttccgcga ggatctctat tatcgtctga acgtgatgcc catcgccctg 1140
cccccgctgc gcgagcgtca ggaggacatc gccgagctgg cgcacttcct ggtgcgcaaa 1200cccccgctgc gcgagcgtca ggaggacatc gccgagctgg cgcacttcct ggtgcgcaaa 1200
atcggccagc atcaggggcg cacgctgcgg atcagcgagg gcgcgatccg cctgctgatg 1260atcggccagc atcaggggcg cacgctgcgg atcagcgagg gcgcgatccg cctgctgatg 1260
gagtacagct ggccgggtaa cgttcgcgaa ctggagaact gcctcgaacg atcggcggtg 1320gagtacagct ggccgggtaa cgttcgcgaa ctggagaact gcctcgaacg atcggcggtg 1320
atgtcggaga gtggcctgat cgatcgcgac gtgatcctct tcactcacca ggatcgtccc 1380atgtcggaga gtggcctgat cgatcgcgac gtgatcctct tcactcacca ggatcgtccc 1380
gccaaagccc tgcctgccag cgggccagcg gaagacagct ggctggacaa cagcctggac 1440gccaaagccc tgcctgccag cgggccagcg gaagacagct ggctggacaa cagcctggac 1440
gaacgtcagc gactgatcgc cgcgctggaa aaagccggct gggtgcaggc caaggcggca 1500gaacgtcagc gactgatcgc cgcgctggaa aaagccggct gggtgcaggc caaggcggca 1500
cggctgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcttaccgga tccagatcat ggatatcacc 1560cggctgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcttaccggga tccagatcat ggatatcacc 1560
ctgccgcgtc tgtag 1575ctgccgcgtc tgtag 1575
<210> 119<210> 119
<211> 2838<211> 2838
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> glnE<223> glnE
<400> 119<400> 119
atgatgccgc tttctccgca attacagcag cactggcaga cggtcgctga ccgtctgcca 60atgatgccgc tttctccgca attacagcag cactggcaga cggtcgctga ccgtctgcca 60
gcggattttc ccattgcaga actgagccca caggccaggt cggtcatggc gttcagcgat 120gcggattttc ccattgcaga actgagccca caggccaggt cggtcatggc gttcagcgat 120
tttgtcgaac agagtgtgat cgcccagccg ggctggctga atgagcttgc ggactcctcg 180tttgtcgaac agagtgtgat cgcccagccg ggctggctga atgagcttgc ggactcctcg 180
ccggaggcgg aagagtggcg gcattacgag gcctggctgc aggatcgcct gcaggccgtc 240ccggaggcgg aagagtggcg gcattacgag gcctggctgc aggatcgcct gcaggccgtc 240
actgacgaag cggggttgat gcgagagctg cgtctcttcc gccgccagat gatggtccgc 300actgacgaag cggggttgat gcgagagctg cgtctcttcc gccgccagat gatggtccgc 300
atcgcctggg cgcaggcgct gtcgctggtg agcgaagaag agaccctgca gcagctgagc 360atcgcctggg cgcaggcgct gtcgctggtg agcgaagaag agaccctgca gcagctgagc 360
gccctggcgg agaccctgat tgtcgccgcc cgcgactggc tctacgccgc ctgctgtaag 420gccctggcgg agaccctgat tgtcgccgcc cgcgactggc tctacgccgc ctgctgtaag 420
gagtggggaa cgccatgcaa tgccgagggc cagccgcagc cgctgctgat cctcgggatg 480gagtggggaa cgccatgcaa tgccgagggc cagccgcagc cgctgctgat cctcgggatg 480
ggaaagctgg gcggcggcga gctgaacttc tcttccgata tcgatctgat ctttgcctgg 540ggaaagctgg gcggcggcga gctgaacttc tcttccgata tcgatctgat ctttgcctgg 540
cctgagcatg gcgccacccg cggcggccgc cgcgagctgg ataacgccca gttctttacc 600cctgagcatg gcgccacccg cggcggccgc cgcgagctgg ataacgccca
cgtctggggc agcggctgat caaggccctt gaccagccga cgcaggacgg ctttgtctat 660cgtctggggc agcggctgat caaggccctt gaccagccga cgcaggacgg ctttgtctat 660
cgggttgaca tgcgcctgcg gccgtttggc gacagtgggc cgctggtact cagctttgcg 720cgggttgaca tgcgcctgcg gccgtttggc gacagtgggc cgctggtact cagctttgcg 720
gcactggaag attattacca ggagcagggt cgggactggg aacgctatgc gatggtgaaa 780gcactggaag attattacca ggagcagggt cgggactgggg aacgctatgc gatggtgaaa 780
gcgcggatca tgggcgataa cgacggcgtg tacgccagcg agttgcgcgc gatgctccgt 840gcgcggatca tgggcgataa cgacggcgtg tacgccagcg agttgcgcgc gatgctccgt 840
cctttcgtct tccgccgtta tatcgacttc agcgtgatcc agtcgctgcg taacatgaaa 900cctttcgtct tccgccgtta tatcgacttc agcgtgatcc agtcgctgcg taacatgaaa 900
ggcatgatcg cccgcgaagt gcggcgtcgc gggctgaaag acaacatcaa gctcggcgcc 960ggcatgatcg cccgcgaagt gcggcgtcgc gggctgaaag acaacatcaa gctcggcgcc 960
ggcgggatcc gtgaaattga gtttatcgtt caggtctttc agctgatccg cggtggtcgc 1020ggcgggatcc gtgaaattga gtttatcgtt caggtctttc agctgatccg cggtggtcgc 1020
gaacctgcac tgcagcagcg cgccctgctg ccgacgctgg cggcgattga tgagctacat 1080gaacctgcac tgcagcagcg cgccctgctg ccgacgctgg cggcgattga tgagctacat 1080
ctgctgccgg aaggcgacgc ggcgctgctg cgcgaggcct atctgttcct gcgccggctg 1140ctgctgccgg aaggcgacgc ggcgctgctg cgcgaggcct atctgttcct gcgccggctg 1140
gaaaacctgc tgcaaagcat caacgatgaa cagacccaga ccctgccgca ggatgaactt 1200gaaaacctgc tgcaaagcat caacgatgaa cagacccaga
aaccgcgcca ggctggcgtg ggggatgcat accgaagact gggagacgct gagcgcgcag 1260aaccgcgcca ggctggcgtg ggggatgcat accgaagact gggagacgct gagcgcgcag 1260
ctggcgagcc agatggccaa cgtgcggcga gtgtttaatg aactgatcgg cgatgatgag 1320ctggcgagcc agatggccaa cgtgcggcga gtgtttaatg aactgatcgg cgatgatgag 1320
gatcagtccc cggatgagca actggccgag tactggcgcg agctgtggca ggatgcgctg 1380gatcagtccc cggatgagca actggccgag tactggcgcg agctgtggca ggatgcgctg 1380
gaagaagatg acgccagccc ggcgctggcg catttaaacg ataccgaccg ccgtagcgtg 1440gaagaagatg acgccagccc ggcgctggcg catttaaacg ataccgaccg ccgtagcgtg 1440
ctggcgctga ttgccgattt tcgtaaagag ctggatcggc gcaccatcgg cccgcgcggc 1500ctggcgctga ttgccgattt tcgtaaagag ctggatcggc gcaccatcgg cccgcgcggc 1500
cgccaggtgc tggatcagct gatgccgcat ctgctgagcg aaatctgctc gcgtgccgat 1560cgccaggtgc tggatcagct gatgccgcat ctgctgagcg aaatctgctc gcgtgccgat 1560
gcgccgctgc ctctggcgcg gatcacgccg ctgttgaccg ggatcgtcac ccgtaccacc 1620gcgccgctgc ctctggcgcg gatcacgccg ctgttgaccg ggatcgtcac ccgtaccacc 1620
tatcttgagc tgctgagcga attccccggc gcgctgaagc acctgatcac gctctgcgcg 1680tatcttgagc tgctgagcga attccccggc gcgctgaagc acctgatcac gctctgcgcg 1680
gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg cgccacccgc tgctgctgga tgagctgctg 1740gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg cgccacccgc tgctgctgga tgagctgctg 1740
gatcccaaca ccctctatca gccgacggcg accgatgcct atcgcgacga gctgcgccag 1800gatcccaaca ccctctatca gccgacggcg accgatgcct atcgcgacga gctgcgccag 1800
tacctgctgc gcgtgccgga agaggatgaa gagcagcagc tggaggcgtt gcgccagttt 1860tacctgctgc gcgtgccgga agaggatgaa gagcagcagc tggaggcgtt gcgccagttt 1860
aagcaggcgc agcagctgca tatcgcggcg gcggatatcg ctggtaccct gccggtgatg 1920aagcaggcgc agcagctgca tatcgcggcg gcggatatcg ctggtaccct gccggtgatg 1920
aaggtcagcg atcacttaac ctggcttgcc gaagcgatcc tcgacgcggt ggtgcagcag 1980aaggtcagcg atcacttaac ctggcttgcc gaagcgatcc tcgacgcggt ggtgcagcag 1980
gcatgggggc agatggtcgc tcgctacggt cagccgaccc acctgcacga tcgccagggt 2040gcatgggggc agatggtcgc tcgctacggt cagccgaccc acctgcacga tcgccagggt 2040
cgcggcttcg ccgttgtcgg ctacggtaag ctcggcggct gggagctggg ctacagctcc 2100cgcggcttcg ccgttgtcgg ctacggtaag ctcggcggct gggagctggg ctacagctcc 2100
gatctcgatc tggtgttcct ccatgactgc ccggcggagg tgatgaccga cggcgagcgg 2160gatctcgatc tggtgttcct ccatgactgc ccggcggagg tgatgaccga cggcgagcgg 2160
gagattgacg gccgtcagtt ctacctgcgg ctggcccagc ggatcatgca cctgttcagc 2220gagattgacg gccgtcagtt ctacctgcgg ctggcccagc ggatcatgca cctgttcagc 2220
acccgcacct cgtccggtat tctctacgaa gtggacgccc ggctgcgtcc ttctggcgcg 2280acccgcacct cgtccggtat tctctacgaa gtggacgccc ggctgcgtcc ttctggcgcg 2280
gcggggatgc tggtcaccac cgccgacgcg tttgctgact atcagcagaa cgaagcctgg 2340gcggggatgc tggtcaccac cgccgacgcg tttgctgact atcagcagaa cgaagcctgg 2340
acgtgggaac atcaggcgct ggtgcgcgcc cgcgtggtct atggcgaccc ggcgctgcag 2400acgtgggaac atcaggcgct ggtgcgcgcc cgcgtggtct atggcgaccc ggcgctgcag 2400
gcgcgctttg acgccattcg tcgcgatatc ctgaccaccc cgcgggaggg gacgaccctg 24602460 gcgcgctttg acgccattcg tcgcgatatc ctgaccaccc
cagaccgagg ttcgcgagat gcgcgagaag atgcgcgccc accttggcaa caaacatccc 2520cagaccgagg ttcgcgagat gcgcgagaag atgcgcgccc accttggcaa caaacatccc 2520
gatcgttttg atatcaaagc cgatgccggc gggatcaccg atattgaatt tattactcag 2580gatcgttttg atatcaaagc cgatgccggc gggatcaccg atattgaatt tattactcag 2580
tatctggtcc tacgctatgc cagtgacaag ccgaagctga cccgctggtc tgacaacgtg 26402640
cgtattcttg agctgctggc gcagaacgac atcatggacg aggaggaggc gcgcgcctta 2700cgtattcttg agctgctggc gcagaacgac atcatggacg aggaggaggc gcgcgcctta 2700
acgcatgcat acaccacctt gcgtgatgcg ctccatcacc tggccctgca ggagcagccg 2760acgcatgcat acaccacctt gcgtgatgcg ctccatcacc tggccctgca ggagcagccg 2760
ggacacgtgg cgccagaggc cttcagccgg gagcgtcagc aggtcagcgc cagctggcag 2820ggacacgtgg cgccagaggc cttcagccgg gagcgtcagc aggtcagcgc cagctggcag 2820
aagtggctga tggcttaa 2838aagtggctga tggcttaa 2838
<210> 120<210> 120
<211> 1287<211> 1287
<212> ДНК<212> DNA
<213> Klebsiella variicola<213> Klebsiella variicola
<220><220>
<223> amtB<223> amtB
<400> 120<400> 120
atgaaaatgg caacaatgaa atcgggtctg ggggcattag cccttcttcc gggactggca 60atgaaaatgg caacaatgaa atcgggtctg ggggcattag cccttcttcc gggactggca 60
atggccgcgc ccgcagtggc ggacaaagcc gataacgcgt ttatgatgat ttgcaccgcg 120atggccgcgc ccgcagtggc ggacaaagcc gataacgcgt ttatgatgat ttgcaccgcg 120
ctggttctgt ttatgaccat cccggggatc gcgctgtttt acggcggcct gatccgcggc 180ctggttctgt ttatgaccat cccggggatc gcgctgtttt acggcggcct gatccgcggc 180
aaaaacgtcc tttccatgct gactcaggtg attgtgacct ttggcctggt ctgcgtactg 240aaaaacgtcc tttccatgct gactcaggtg attgtgacct ttggcctggt ctgcgtactg 240
tgggtgattt atggctatac cctggccttc ggcaccggcg gcagcttctt cggtagcttt 300tgggtgattt atggctatac cctggccttc ggcaccggcg gcagcttctt cggtagcttt 300
gactgggtga tgctgaaaaa tattgaactg aaagcgctga tgggcacctt ctatcagtac 360gactgggtga tgctgaaaaa tattgaactg aaagcgctga tgggcacctt ctatcagtac 360
atccacgtgg ccttccaggg ctcgttcgcc tgtatcaccg tcgggctgat cgtgggggcg 420atccacgtgg ccttccaggg ctcgttcgcc tgtatcaccg tcgggctgat cgtgggggcg 420
ctggctgagc gtattcgttt ctccgccgtg ctgattttcg tggtggtgtg gatgacgctc 480ctggctgagc gtattcgttt ctccgccgtg ctgattttcg tggtggtgtg gatgacgctc 480
tcttatgttc cgattgcgca catggtctgg ggcggcggtc tgctggcgac ccacggcgcg 540tcttatgttc cgattgcgca catggtctgg ggcggcggtc tgctggcgac ccacggcgcg 540
ctggacttcg cgggcggcac cgttgtacac atcaacgccg cggttgccgg gctggtgggt 600ctggacttcg cgggcggcac cgttgtacac atcaacgccg cggttgccgg gctggtgggt 600
gcgtatatga tgggcaaacg tgtgggcttc ggcaaagaag cgttcaaacc gcacaatctg 660gcgtatatga tgggcaaacg tgtgggcttc ggcaaagaag cgttcaaacc gcacaatctg 660
ccgatggtgt tcaccggaac cgccatcctc tacgtgggct ggttcggctt caacgccggc 720ccgatggtgt tcaccggaac cgccatcctc tacgtgggct ggttcggctt caacgccggc 720
tccgccagcg cagcgaacga aattgccgca ctggctttcg tcaacaccgt cgtcgccaca 780tccgccagcg cagcgaacga aattgccgca ctggctttcg tcaacaccgt cgtcgccaca 780
gcggcagcca tcctggcctg gacctttggc gaatgggctc tgcgcggcaa accttcactg 840gcggcagcca tcctggcctg gacctttggc gaatgggctc tgcgcggcaa accttcactg 840
ctgggcgcct gctccggggc gattgccggt ctggttggcg tcacaccagc ctgtgggtat 900ctgggcgcct gctccggggc gattgccggt ctggttggcg tcacaccagc ctgtgggtat 900
atcggtgtcg gtggggcgtt gattgtgggt atcgcatctg gtctggcggg catctggggc 960atcggtgtcg gtggggcgtt gattgtgggt atcgcatctg gtctggcggg catctggggc 960
gtaacggcgc tgaaacgctg gctgcgggtt gatgaccctt gcgacgtctt cggcgtccac 1020gtaacggcgc tgaaacgctg gctgcgggtt gatgaccctt gcgacgtctt cggcgtccac 1020
ggcgtctgcg gcatcgtcgg ctgtatcctg accggtatct tcgcggccac ctctctgggc 1080ggcgtctgcg gcatcgtcgg ctgtatcctg accggtatct tcgcggccac ctctctgggc 1080
ggcgtgggtt atgcagaagg cgtcaccatg ggccatcagc tgctggtgca actcgagagt 1140ggcgtgggtt atgcagaagg cgtcaccatg ggccatcagc tgctggtgca actcgagagt 1140
atcgcgatta ccatcgtctg gtcgggcgtt gtcgctttca ttggctacaa agtggcggac 1200atcgcgatta ccatcgtctg gtcgggcgtt gtcgctttca ttggctacaa agtggcggac 1200
atgaccgtgg ggctgcgcgt accagaagag caggagcgcg aaggactgga cgtcaacagc 1260atgaccgtgg ggctgcgcgt accagaagag caggagcgcg aaggactgga cgtcaacagc 1260
catggcgaaa acgcctacaa cgcctga 1287catggcgaaa acgcctacaa cgcctga 1287
<210> 121<210> 121
<211> 1435<211> 1435
<212> ДНК<212> DNA
<213> Achromobacter spiritinus<213> Achromobacter spiritinus
<220><220>
<223> 16S<223> 16S
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (255)..(255)<222> (255)..(255)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (454)..(454)<222> (454)..(454)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 121<400> 121
ctgaagagtt tgatcctggc tcagattgaa cgctagcggg atgccttaca catgcaagtc 60ctgaagagtt tgatcctggc tcagattgaa cgctagcggg atgccttaca catgcaagtc 60
gaacggcagc acggacttcg gtctggtggc gagtggcgaa cgggtgagta atgtatcgga 120gaacggcagc acggacttcg gtctggtggc gagtggcgaa cgggtgagta atgtatcgga 120
acgtgcctag tagcggggga taactacgcg aaagcgtagc taataccgca tacgccctac 180180
gggggaaagc aggggatcgc aagaccttgc actattagag cggccgatat cggattagct 240gggggaaagc aggggatcgc aagaccttgc actattagag cggccgatat cggattagct 240
agttggtggg gtaanggctc accaaggcga cgatccgtag ctggtttgag aggacgacca 300agttggtggg gtaanggctc accaaggcga cgatccgtag ctggtttgag aggacgacca 300
gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg 360gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg 360
gacaatgggg gaaaccctga tccagccatc ccgcgtgtgc gatgaaggcc ttcgggttgt 420gacaatgggg gaaaccctga tccagccatc ccgcgtgtgc gatgaaggcc ttcgggttgt 420
aaagcacttt tggcaggaaa gaaacgtcat gggntaatac cccgtgaaac tgacggtacc 480aaagcacttt tggcaggaaa gaaacgtcat gggntaatac cccgtgaaac tgacggtacc 480
tgcagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcaagc 540tgcagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcaagc 540
gttaatcgga attactgggc gtaaagcgtg cgcaggcggt tcggaaagaa agatgtgaaa 600gttaatcgga attactgggc gtaaagcgtg cgcaggcggt tcggaaagaa agatgtgaaa 600
tcccagagct taactttgga actgcatttt taactaccgg gctagagtgt gtcagaggga 660tcccagagct taactttgga actgcatttt taactaccgg gctagagtgt gtcagaggga 660
ggtggaattc cgcgtgtagc agtgaaatgc gtagatatgc ggaggaacac cgatggcgaa 720ggtggaattc cgcgtgtagc agtgaaatgc gtagatatgc ggaggaacac cgatggcgaa 720
ggcagcctcc tgggataaca ctgacgctca tgcacgaaag cgtggggagc aaacaggatt 780ggcagcctcc tgggataaca ctgacgctca tgcacgaaag cgtggggagc aaacaggatt 780
agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcaactag ctgttggggc cttcgggcct 840agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcaactag ctgttggggc cttcgggcct 840
tagtagcgca gctaacgcgt gaagttgacc gcctggggag tacggtcgca agattaaaac 900tagtagcgca gctaacgcgt gaagttgacc gcctggggag tacggtcgca agattaaaac 900
tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggatgat gtggattaat tcgatgcaac 960tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggatgat gtggattaat tcgatgcaac 960
gcgaaaaacc ttacctaccc ttgacatgtc tggaattctg aagagattcg gaagtgctcg 1020gcgaaaaacc ttacctaccc ttgacatgtc tggaattctg aagagattcg gaagtgctcg 1020
caagagaacc ggaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg 1080caagagaacc ggaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg 1080
gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cattagttgc tacgaaaggg cactctaatg 1140gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cattagttgc tacgaaaggg cactctaatg 1140
agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcctca tggcccttat 1200agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcctca tggcccttat 1200
gggtagggct tcacacgtca tacaatggtc gggacagagg gtcgccaacc cgcgaggggg 1260gggtagggct tcacacgtca tacaatggtc gggacagagg gtcgccaacc cgcgagggggg 1260
agccaatccc agaaacccga tcgtagtccg gatcgcagtc tgcaactcga ctgcgtgaag 1320agccaatccc agaaacccga tcgtagtccg gatcgcagtc tgcaactcga ctgcgtgaag 1320
tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta 1380tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta 1380
cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tttaccagaa gtagttagcc taacc 1435cacaccgcc gtcacaccat gggagtgggt tttaccagaa gtagttagcc taacc 1435
<210> 122<210> 122
<211> 1528<211> 1528
<212> ДНК<212> DNA
<213> Achromobacter marplatensis<213> Achromobacter marplatensis
<220><220>
<223> 16S<223> 16S
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (255)..(255)<222> (255)..(255)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (999)..(999)<222> (999)..(999)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (1009)..(1009)<222> (1009)..(1009)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (1437)..(1437)<222> (1437)..(1437)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 122<400> 122
ctgaagagtt tgatcctggc tcagattgaa cgctagcggg atgccttaca catgcaagtc 60ctgaagagtt tgatcctggc tcagattgaa cgctagcggg atgccttaca catgcaagtc 60
gaacggcagc acggacttcg gtctggtggc gagtggcgaa cgggtgagta atgtatcgga 120gaacggcagc acggacttcg gtctggtggc gagtggcgaa cgggtgagta atgtatcgga 120
acgtgcctag tagcggggga taactacgcg aaagcgtagc taataccgca tacgccctac 180180
gggggaaagc aggggatcgc aagaccttgc actattagag cggccgatat cggattagct 240gggggaaagc aggggatcgc aagaccttgc actattagag cggccgatat cggattagct 240
agttggtggg gtaanggctc accaaggcga cgatccgtag ctggtttgag aggacgacca 300agttggtggg gtaanggctc accaaggcga cgatccgtag ctggtttgag aggacgacca 300
gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg 360gccacactgg gactgagaca cggcccagac tcctacggga ggcagcagtg gggaattttg 360
gacaatgggg gaaaccctga tccagccatc ccgcgtgtgc gatgaaggcc ttcgggttgt 420gacaatgggg gaaaccctga tccagccatc ccgcgtgtgc gatgaaggcc ttcgggttgt 420
aaagcacttt tggcaggaaa gaaacgtcat gggttaatac cccgtgaaac tgacggtacc 480aaagcacttt tggcaggaaa gaaacgtcat gggttaatac cccgtgaaac tgacggtacc 480
tgcagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcaagc 540tgcagaataa gcaccggcta actacgtgcc agcagccgcg gtaatacgta gggtgcaagc 540
gttaatcgga attactgggc gtaaagcgtg cgcaggcggt tcggaaagaa agatgtgaaa 600gttaatcgga attactgggc gtaaagcgtg cgcaggcggt tcggaaagaa agatgtgaaa 600
tcccagagct taactttgga actgcatttt taactaccgg gctagagtgt gtcagaggga 660tcccagagct taactttgga actgcatttt taactaccgg gctagagtgt gtcagaggga 660
ggtggaattc cgcgtgtagc agtgaaatgc gtagatatgc ggaggaacac cgatggcgaa 720ggtggaattc cgcgtgtagc agtgaaatgc gtagatatgc ggaggaacac cgatggcgaa 720
ggcagcctcc tgggataaca ctgacgctca tgcacgaaag cgtggggagc aaacaggatt 780ggcagcctcc tgggataaca ctgacgctca tgcacgaaag cgtggggagc aaacaggatt 780
agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcaactag ctgttggggc cttcgggcct 840agataccctg gtagtccacg ccctaaacga tgtcaactag ctgttggggc cttcgggcct 840
tagtagcgca gctaacgcgt gaagttgacc gcctggggag tacggtcgca agattaaaac 900tagtagcgca gctaacgcgt gaagttgacc gcctggggag tacggtcgca agattaaaac 900
tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggatgat gtggattaat tcgatgcaac 960tcaaaggaat tgacggggac ccgcacaagc ggtggatgat gtggattaat tcgatgcaac 960
gcgaaaaacc ttacctaccc ttgacatgtc tggaattcng aagagattng gaagtgctcg 1020gcgaaaaacc ttacctaccc ttgacatgtc tggaattcng aagagattng gaagtgctcg 1020
caagagaacc ggaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg 1080caagagaacc ggaacacagg tgctgcatgg ctgtcgtcag ctcgtgtcgt gagatgttgg 1080
gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cattagttgc tacgaaaggg cactctaatg 1140gttaagtccc gcaacgagcg caacccttgt cattagttgc tacgaaaggg cactctaatg 1140
agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcctca tggcccttat 1200agactgccgg tgacaaaccg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcctca tggcccttat 1200
gggtagggct tcacacgtca tacaatggtc gggacagagg gtcgccaacc cgcgaggggg 1260gggtagggct tcacacgtca tacaatggtc gggacagagg gtcgccaacc cgcgagggggg 1260
agccaatccc agaaacccga tcgtagtccg gatcgcagtc tgcaactcga ctgcgtgaag 1320agccaatccc agaaacccga tcgtagtccg gatcgcagtc tgcaactcga ctgcgtgaag 1320
tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta 1380tcggaatcgc tagtaatcgc ggatcagcat gtcgcggtga atacgttccc gggtcttgta 1380
cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tttaccagaa gtagttagcc taaccgnaag 1440cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tttaccagaa gtagttagcc taaccgnaag 1440
gggggcgatt accacggtag gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat 1500gggggcgatt accacggtag gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag gtagccgtat 1500
cggaaggtgc ggctggatca cctccttt 1528cggaaggtgc ggctggatca cctccttt 1528
<210> 123<210> 123
<211> 1522<211> 1522
<212> ДНК<212> DNA
<213> Microbacterium murale<213> Microbacterium murale
<220><220>
<223> 16S<223> 16S
<400> 123<400> 123
tacggagagt ttgatcctgg ctcaggatga acgctggcgg cgtgcttaac acatgcaagt 60tacggagagt ttgatcctgg ctcaggatga acgctggcgg cgtgcttaac acatgcaagt 60
cgaacggtga acacggagct tgctctgtgg gatcagtggc gaacgggtga gtaacacgtg 120cgaacggtga acacggagct tgctctgtgg gatcagtggc gaacgggtga gtaacacgtg 120
agcaacctgc ccctgactct gggataagcg ctggaaacgg cgtctaatac tggatatgtg 180agcaacctgc ccctgactct gggataagcg ctggaaacgg cgtctaatac tggatatgtg 180
acgtggccgc atggtctgcg tctggaaaga atttcggttg gggatgggct cgcggcctat 240acgtggccgc atggtctgcg tctggaaaga atttcggttg gggatgggct cgcggcctat 240
cagcttgttg gtgaggtaat ggctcaccaa ggcgtcgacg ggtagccggc ctgagagggt 300cagcttgttg gtgaggtaat ggctcaccaa ggcgtcgacg ggtagccggc ctgagagggt 300
gaccggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360gaccggccac actgggactg agacacggcc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360
tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag caacgccgcg tgagggatga cggccttcgg 420tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag caacgccgcg tgagggatga cggccttcgg 420
gttgtaaacc tcttttagca gggaagaagc gaaagtgacg gtacctgcag aaaaagcgcc 480gttgtaaacc tcttttagca gggaagaagc gaaagtgacg gtacctgcag aaaaagcgcc 480
ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggcg caagcgttat ccggaattat 540ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat acgtagggcg caagcgttat ccggaattat 540
tgggcgtaaa gagctcgtag gcggtttgtc gcgtctgctg tgaaatccgg aggctcaacc 600tgggcgtaaa gagctcgtag gcggtttgtc gcgtctgctg tgaaatccgg aggctcaacc 600
tccggcctgc agtgggtacg ggcagactag agtgcggtag gggagattgg aattcctggt 660tccggcctgc agtgggtacg ggcagactag agtgcggtag gggagattgg aattcctggt 660
gtagcggtgg aatgcgcaga tatcaggagg aacaccgatg gcgaaggcag atctctgggc 720gtagcggtgg aatgcgcaga tatcaggagg aacaccgatg gcgaaggcag atctctgggc 720
cgtaactgac gctgaggagc gaaagggtgg ggagcaaaca ggcttagata ccctggtagt 780cgtaactgac gctgaggagc gaaagggtgg ggagcaaaca ggcttagata ccctggtagt 780
ccaccccgta aacgttggga actagttgtg gggtccattc cacggattcc gtgacgcagc 840ccaccccgta aacgttggga actagttgtg gggtccattc cacggattcc gtgacgcagc 840
taacgcatta agttccccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg 900taacgcatta agttccccgc ctggggagta cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg 900
acggggaccc gcacaagcgg cggagcatgc ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt 960acggggaccc gcacaagcgg cggagcatgc ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt 960
accaaggctt gacatatacg agaacgggcc agaaatggtc aactctttgg acactcgtaa 1020accaaggctt gacatatacg agaacgggcc agaaatggtc aactctttgg acactcgtaa 1020
acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac 1080acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac 1080
gagcgcaacc ctcgttctat gttgccagca cgtaatggtg ggaactcatg ggatactgcc 1140gagcgcaacc ctcgttctat gttgccagca cgtaatggtg ggaactcatg ggatactgcc 1140
ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgtcttggg 1200ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac gtcaaatcat catgcccctt atgtcttggg 1200
cttcacgcat gctacaatgg ccggtacaaa gggctgcaat accgcgaggt ggagcgaatc 1260cttcacgcat gctacaatgg ccggtacaaa gggctgcaat accgcgaggt ggagcgaatc 1260
ccaaaaagcc ggtcccagtt cggattgagg tctgcaactc gacctcatga agtcggagtc 1320ccaaaaagcc ggtcccagtt cggattgagg tctgcaactc gacctcatga agtcggagtc 1320
gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg 1380gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg 1380
cccgtcaagt catgaaagtc ggtaacacct gaagccggtg gcctaaccct tgtggaggga 1440cccgtcaagt catgaaagtc ggtaacacct gaagccggtg gcctaaccct tgtggaggga 1440
gccgtcgaag gtgggatcgg taattaggac taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag 1500gccgtcgaag gtgggatcgg taattaggac taagtcgtaa caaggtagcc gtaccggaag 1500
gtgcggctgg atcacctcct tt 1522gtgcggctgg atcacctcct tt 1522
<210> 124<210> 124
<211> 1537<211> 1537
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kluyvera intermedia<213> Kluyvera intermedia
<220><220>
<223> 16S<223> 16S
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (455)..(455)<222> (455)..(455)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (1004)..(1004)<222> (1004)..(1004)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 124<400> 124
attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60
cgaacggtag cacagagagc ttgctctcgg gtgacgagtg gcggacgggt gagtaatgtc 120cgaacggtag cacagagagc ttgctctcgg gtgacgagtg gcggacgggt gagtaatgtc 120
tgggaaactg cccgatggag ggggataact actggaaacg gtagctaata ccgcataatg 180tgggaaactg cccgatggag ggggataact actggaaacg gtagctaata ccgcataatg 180
tcgcaagacc aaagaggggg accttcgggc ctcttgccat cggatgtgcc cagatgggat 240tcgcaagacc aaagaggggg accttcgggc ctcttgccat cggatgtgcc cagatgggat 240
tagcttgttg gtgaggtaat ggctcaccaa ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat 300tagcttgttg gtgaggtaat ggctcaccaa ggcgacgatc cctagctggt ctgaggat 300
gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360
tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttcgg 420420
gttgtaaagc actttcagcg gggaggaagg cgatncggtt aataaccgtg ttgattgacg 480gttgtaaagc actttcagcg gggaggaagg cgatncggtt aataaccgtg ttgattgacg 480
ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540
caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600
tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc attcgaaact ggcaggcttg agtcttgtag 660tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc attcgaaact ggcaggcttg agtcttgtag 660
aggggggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720aggggggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720
gcgaaggcgg ccccctggac aaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780gcgaaggcgg ccccctggac aaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780
ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtcg acttggaggt tgtgcccttg 840ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtcg acttggaggt tgtgcccttg 840
aggcgtggct tccggagcta acgcgttaag tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900aggcgtggct tccggagcta acgcgttaag tcgaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900
taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960
tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacgga attnggcaga gatgccttag 1020tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacgga attnggcaga gatgccttag 1020
tgccttcggg aaccgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080tgccttcggg aaccgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080
ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg tccggccggg 1140ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg tccggccggg 1140
aactcaaagg agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca 1200aactcaaagg agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca 1200
tggcccttac gaccagggct acacacgtgc tacaatggca tatacaaaga gaagcgacct 1260tggcccttac gaccaggggct acacacgtgc tacaatggca tatacaaaga gaagcgacct 1260
cgcgagagca agcggacctc ataaagtatg tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga 13201320
ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc 1380ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc 1380
gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa gtaggtagct 1440gggccttgta cacaccgcc gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa gtaggtagct 1440
taaccttcgg gagggcgctt accactttgt gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag 1500taaccttcgg gagggcgctt accactttgt gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag 1500
gtaaccgtag gggaacctgc ggttggatca cctcctt 1537gtaaccgtag gggaacctgc ggttggatca ccttcctt 1537
<210> 125<210> 125
<211> 882<211> 882
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kluyvera intermedia<213> Kluyvera intermedia
<220><220>
<223> nifH<223> nifH
<400> 125<400> 125
atgaccatgc gtcaatgcgc catttatggc aaaggtggga tcggcaaatc caccaccacg 60atgaccatgc gtcaatgcgc catttatggc aaaggtggga tcggcaaatc caccaccacg 60
caaaacctcg tcgccgctct cgcggaaatg ggtaaaaaag tgatgatcgt cggctgcgac 120caaaacctcg tcgccgctct cgcggaaatg ggtaaaaaag tgatgatcgt cggctgcgac 120
ccgaaagcgg actccacccg tctgatcctg catgcgaaag cacagaacac cattatggag 180ccgaaagcgg actccaccg tctgatcctg catgcgaaag cacagaacac cattatggag 180
atggccgccg aagtgggttc agtggaagac cttgaactgg aagatgtgct gcaaatcggt 240atggccgccg aagtgggttc agtggaagac cttgaactgg aagatgtgct gcaaatcggt 240
tacggcggcg tgcgttgtgc agaatccggc ggcccggagc caggcgtggg ttgtgcaggc 300tacggcggcg tgcgttgtgc agaatccggc ggcccggagc caggcgtggg ttgtgcaggc 300
cgcggcgtta ttaccgccat taacttcctt gaagaagaag gcgcctatgt cagcgacctc 360cgcggcgtta ttaccgccat taacttcctt gaagaagaag gcgcctatgt cagcgacctc 360
gactttgtct tctatgacgt cctcggtgac gtggtctgcg gcgggttcgc catgccgatt 420gactttgtct tctatgacgt cctcggtgac gtggtctgcg gcgggttcgc catgccgatt 420
cgtgaaaaca aagcgcaaga gatctatatc gtctgctccg gggaaatgat ggcgatgtat 480cgtgaaaaca aagcgcaaga gatctatatc gtctgctccg gggaaatgat ggcgatgtat 480
gccgctaaca acatctccaa aggcatcgtg aaatacgcta aatccggcaa ggtgcgcctg 540gccgctaaca acatctccaa aggcatcgtg aaatacgcta aatccggcaa ggtgcgcctg 540
ggcgggctga tttgtaactc ccgtcagacc gaccgcgaag atgaactgat catcgcgctg 600ggcgggctga tttgtaactc ccgtcagacc gaccgcgaag atgaactgat catcgcgctg 600
gcagaaaaac tgggcaccca gatgattcac tttgtgccac gcgacaacat cgtccagcgc 660gcagaaaaac tgggcaccca gatgattcac tttgtgccac gcgacaacat cgtccagcgc 660
gcggaaattc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga aatgcaacca ggccgacgaa 720gcggaaattc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga aatgcaacca ggccgacgaa 720
taccgcgcgc tggcgaacaa gatcgtcaac aacaccctga tggtcgtccc gaccccttgc 780taccgcgcgc tggcgaacaa gatcgtcaac aacaccctga tggtcgtccc gaccccttgc 780
accatggatg aactggaaga gctgctgatg gaattcggca ttatggatgt ggaagacgcc 840accatggatg aactggaaga gctgctgatg gaattcggca ttatggatgt ggaagacgcc 840
agcatcatcg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgcggcct ga 882agcatcatcg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgcggcct ga 882
<210> 126<210> 126
<211> 660<211> 660
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kluyvera intermedia<213> Kluyvera intermedia
<220><220>
<223> CDS железо-молибденового кофактора динитрогеназы<223> CDS of iron-molybdenum dinitrogenase cofactor
<400> 126<400> 126
atgaacgata acgatgtcct tttctggcgc atgctggcgc tatttcagtg tctgccggaa 6060
ctgcaacccg cgcagatcct ggcctggctg acaggagaac gcgacgacgc cttaaccccg 120ctgcaacccg cgcagatcct ggcctggctg acaggagaac gcgacgacgc cttaaccccg 120
gcgtacctcg ataagcttaa cgtccgcgaa ctggaagcga ccttcccgtc tgaaacggcg 180gcgtacctcg ataagcttaa cgtccgcgaa ctggaagcga ccttcccgtc tgaaacggcg 180
atgatgtcgc ccgcacgctg gagccgcgtt aacgcgtgcc ttcacggtac gctgcccgca 240atgatgtcgc ccgcacgctg gagccgcgtt aacgcgtgcc ttcacggtac gctgcccgca 240
cacctgcagg taaaaagcac cactcgtcag gggcaattac gggtagcctt ttgttcacag 300cacctgcagg taaaaagcac cactcgtcag gggcaattac gggtagcctt ttgttcacag 300
gatggattgc tgatcaatgg tcattttggt caggggcggc tgttttttat ctacgccttt 360gatggattgc tgatcaatgg tcattttggt caggggcggc tgttttttat ctacgccttt 360
gatgaacagg gcggatggct acacgcgtta cgccgtcttc cctcggcccc gcaaacccag 420gatgaacagg gcggatggct acacgcgtta cgccgtcttc cctcggcccc gcaaacccag 420
gagccgaatg aagttcgcgc gcagctcctg agtgattgcc acctgctgtt ttgtgaagcc 480gagccgaatg aagttcgcgc gcagctcctg agtgattgcc acctgctgtt ttgtgaagcc 480
attggcggcc ctgcggcggc ccggctgatt cgtcacaata tccacccgat gaaagtgtcg 540attggcggcc ctgcggcggc ccggctgatt cgtcacaata tccacccgat gaaagtgtcg 540
ccagggatgt ccattgccgc ccagtgtgat gccattaccg cactgctgag cggacgtctg 600ccagggatgt ccattgccgc ccagtgtgat gccattaccg cactgctgag cggacgtctg 600
ccaccgtggc tggcaaaacg tcttgagaaa gccaacccgc tggaagagcg ggtgttttaa 660ccaccgtggc tggcaaaacg tcttgagaaa gccaacccgc tggaagagcg ggtgttttaa 660
<210> 127<210> 127
<211> 1374<211> 1374
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kluyvera intermedia<213> Kluyvera intermedia
<220><220>
<223> nifD1<223> nifD1
<400> 127<400> 127
atgaagggaa atgacattct cgcgctgctg gatgaacccg cctgcgaaca caatcacaaa 60atgaagggaa atgacattct cgcgctgctg gatgaacccg cctgcgaaca caatcacaaa 60
cagaaatccg gctgtagcgc ccctaaaccc ggtgccacgg cgggcggttg cgcgttcgac 120cagaaatccg gctgtagcgc ccctaaaccc ggtgccacgg cgggcggttg cgcgttcgac 120
ggcgcgcaaa tcaccctgtt gccgctgtcg gatgtggcgc acctggtcca cggaccgatt 180ggcgcgcaaa tcaccctgtt gccgctgtcg gatgtggcgc acctggtcca cggaccgatt 180
ggctgcacgg gaagctcctg ggataaccgg ggcagtatga gctccggccc cagtctcaac 240ggctgcacgg gaagctcctg ggataaccgg ggcagtatga gctccggccc cagtctcaac 240
cggctcggct ttaccaccga cctgaacgag caggatgtca ttatggggcg cggcgaacgg 300cggctcggct ttaccaccga cctgaacgag caggatgtca ttatggggcg cggcgaacgg 300
cggcttttcc acgcggtgcg tcatatcgtc aaccgttatc accctgccgc cgtgtttatc 360cggcttttcc acgcggtgcg tcatatcgtc aaccgttatc accctgccgc cgtgtttatc 360
tataacacct gcgttccggc gatggagggt gatgatattg acgccgtctg tcaggcggcg 420tataacacct gcgttccggc gatggagggt gatgatattg acgccgtctg tcaggcggcg 420
gaaaccgcca ccggcgtgcc agtgattgcc gttgatgccg ccgggttcta tggcagcaaa 480gaaaccgcca ccggcgtgcc agtgattgcc gttgatgccg ccgggttcta tggcagcaaa 480
aaccttggca accgtctcgc gggtgaagtg atggttaaca aggtcattgg acggcgcccg 540aaccttggca accgtctcgc gggtgaagtg atggttaaca aggtcattgg acggcgcccg 540
cccgccccct ggccggacga tacccccttc gcgccggaac accgccacga tatcggcctg 600cccgccccct ggccggacga tacccccttc gcgccggaac accgccacga tatcggcctg 600
attggcgaat ttaatatcgc cggggagttc tggcacgttc agccgctgct cgatgagctg 660attggcgaat ttaatatcgc cggggagttc tggcacgttc agccgctgct cgatgagctg 660
ggtattcgcg tgctgggcag cctttccggg gatggccgtt ttagtgaaat ccagaccctg 720ggtattcgcg tgctggggcag cctttccgggg gatggccgtt ttagtgaaat ccagaccctg 720
caccacgcgc aggtcaatat gctggtctgc tcaagagcgc tgatcaatgt tgcccgcacc 780caccacgcgc aggtcaatat gctggtctgc tcaagagcgc tgatcaatgt tgcccgcacc 780
ctggaacagc gctatggcac cccctggttt gagggcagtt tttacggcgt gcgcgctacc 840ctggaacagc gctatggcac cccctggttt gagggcagtt tttacggcgt gcgcgctacc 840
tccgatgccc tgcgtcaact ggcatccctg cttggcgaca gcgatctgat tgcccgcacc 900tccgatgccc tgcgtcaact ggcatccctg cttggcgaca gcgatctgat tgcccgcacc 900
gaagccgtta ttgcccgcga agaagccacg gcaaatcagg cgctcgcccc gtggcgcgaa 960gaagccgtta ttgcccgcga agaagccacg gcaaatcagg cgctcgcccc gtggcgcgaa 960
cggctacagg gtcgcaaagt gctgctctat accggtgggg tgaaatcctg gtcggtggtc 1020cggctacagg gtcgcaaagt gctgctctat accggtgggg tgaaatcctg gtcggtggtc 1020
tccgcattgc aggatttagg gatgaccgtc gtggcgactg gcacccgcaa atctaccgaa 1080tccgcattgc aggatttagg gatgaccgtc gtggcgactg gcacccgcaa atctaccgaa 1080
gaagataagc agcgtattcg cgaattaatg ggcgatgacg cgctaatgct ggaagaaggc 1140gaagataagc agcgtattcg cgaattaatg ggcgatgacg cgctaatgct ggaagaaggc 1140
aacgcccgca ccctgctgga tgtggtgtac cgctatcagg cggatttgat gatcgctggg 1200aacgcccgca ccctgctgga tgtggtgtac cgctatcagg cggatttgat gatcgctggg 1200
gggcgtaaca tgtataccgc gtacaaagcg cggctgccgt ttctggatat caaccaggag 1260gggcgtaaca tgtataccgc gtacaaagcg cggctgccgt ttctggatat caaccaggag 1260
cgtgaacacg cctttgcggg ttatcgcggc atcgtcaccc tcgcccaaca gctttgccag 1320cgtgaacacg cctttgcggg ttatcgcggc atcgtcaccc tcgcccaaca gctttgccag 1320
actattgaaa gccccgtctg gccgcaaaca cacgcccgcg cgccgtggca ataa 1374actattgaaa gccccgtctg gccgcaaaca cacgcccgcg cgccgtggca ataa 1374
<210> 128<210> 128
<211> 1449<211> 1449
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kluyvera intermedia<213> Kluyvera intermedia
<220><220>
<223> nifD2<223> nifD2
<400> 128<400> 128
atgagcaatg caacaggcga acgtaatctg gaaattatcc aggaagtgct ggagatcttt 60atgagcaatg caacaggcga acgtaatctg gaaattatcc aggaagtgct ggagatcttt 60
cccgaaaaaa cgcgcaaaga acgcagaaag cacatgatgg tgaccgaccc ggagatggaa 120cccgaaaaaa cgcgcaaaga acgcagaaag cacatgatgg tgaccgaccc ggagatggaa 120
agcgtcggga aatgcatcat ctctaaccgc aaatcgcagc cgggtgtgat gactgtccgc 180agcgtcggga aatgcatcat ctctaaccgc aaatcgcagc cgggtgtgat gactgtccgc 180
ggctgctcct acgccgggtc gaaaggcgtg gtttttgggc cgattaaaga tatggcccac 240ggctgctcct acgccgggtc gaaaggcgtg gtttttggggc cgattaaaga tatggcccac 240
atctcccacg gcccgatcgg ctgtgggcag tactcccgtg ccgggcggcg caactactac 300atctccccg gcccgatcgg ctgtgggcag tactcccgtg cggggcggcg caactactac 300
accggggtca gcggcgttga ttccttcggg acgctgaact ttacctctga ttttcaggag 360accggggtca gcggcgttga ttccttcggg acgctgaact ttacctctga ttttcaggag 360
cgcgatatcg tcttcggcgg cgataaaaag ctcaccaaac tgattgagga gatggaggaa 420cgcgatatcg tcttcggcgg cgataaaaag ctcaccaaac tgattgagga gatggaggaa 420
ctgttcccgc tgaccaaagg catctccatt cagtcggagt gcccggtagg tttaatcggt 480ctgttcccgc tgaccaaagg catctccatt cagtcggagt gcccggtagg tttaatcggt 480
gacgatatcg aagcggtggc gaatgccagt aaaaaagcgc tcaacaagcc ggtgatcccg 540gacgatatcg aagcggtggc gaatgccagt aaaaaagcgc tcaacaagcc ggtgatcccg 540
gtgcgttgcg aaggctttcg cggcgtgtcg cagtcgctcg gtcaccatat cgccaacgac 600gtgcgttgcg aaggctttcg cggcgtgtcg cagtcgctcg gtcaccatat cgccaacgac 600
gttatccgcg actgggtgct ggataaccgc gaagggaagc ccttcgaatc taccccctat 660gttatccgcg actgggtgct ggataaccgc gaagggaagc ccttcgaatc taccccctat 660
gacgtggcca tcatcggcga ttacaacatc gggggggatg cctgggcgtc gcgcattctg 720gacgtggcca tcatcggcga ttacaacatc gggggggatg cctgggcgtc gcgcattctg 720
cttgaagaga tggggttacg cgtggtggcg cagtggtccg gtgacggcac gctggtagag 780cttgaagaga tggggttacg cgtggtggcg cagtggtccg gtgacggcac gctggtagag 780
atggaaaaca ccccgttcgt caagctgaac ctggtgcact gctaccgctc tatgaactac 840atggaaaaca ccccgttcgt caagctgaac ctggtgcact gctaccgctc tatgaactac 840
atctctcgcc atatggaaga gaaacacggt atcccgtgga tggagtacaa cttcttcggc 900atctctcgcc atatggaaga gaaacacggt atcccgtgga tggagtacaa cttcttcggc 900
ccgaccaaaa tcgccgaatc gctgcgtaag atcgccgatc aatttgacga caccatccgc 960ccgaccaaaa tcgccgaatc gctgcgtaag atcgccgatc aatttgacga caccatccgc 960
gccaatgcgg aagcggtgat cgccaaatat caggcgcaaa acgatgcgat tatcgccaaa 1020gccaatgcgg aagcggtgat cgccaaatat caggcgcaaa acgatgcgat tatcgccaaa 1020
taccgcccgc gtctcgaagg ccgcaaggtg ctgctctata tgggtggcct gcgtcctcgc 1080taccgcccgc gtctcgaagg ccgcaaggtg ctgctctata tgggtggcct gcgtcctcgc 1080
cacgtgattg gcgcgtatga ggatttgggc atggagattg tcgccgccgg gtatgaattt 1140cacgtgattg gcgcgtatga ggatttgggc atggagattg tcgccgccgg gtatgaattt 1140
gcccataacg acgattacga ccgcaccctg ccggacctca aagagggcac gctgttgttc 1200gcccataacg acgattacga ccgcaccctg ccggacctca aaggggcac gctgttgttc 1200
gacgatgcca gcagttatga actggaagcc ttcgtgaagg cgattaagcc ggacctcatt 1260gacgatgcca gcagttatga actggaagcc ttcgtgaagg cgattaagcc ggacctcatt 1260
ggctcaggca tcaaggaaaa atacattttc cagaaaatgg gggtaccgtt tcgccagatg 1320ggctcaggca tcaaggaaaa atacattttc cagaaaatgg gggtaccgtt tcgccagatg 1320
cactcctggg attactccgg cccgtatcac ggctatgacg gctttgccat ctttgcccgc 1380cactcctggg attactccgg cccgtatcac ggctatgacg gctttgccat ctttgcccgc 1380
gatatggaca tgacgctcaa caatcccgcc tggggcgagt tgaccgcacc ctggctgaaa 1440gatatggaca tgacgctcaa caatcccgcc tggggcgagt tgaccgcacc ctggctgaaa 1440
tcagcctga 1449tcagcctga 1449
<210> 129<210> 129
<211> 1383<211> 1383
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kluyvera intermedia<213> Kluyvera intermedia
<220><220>
<223> nifK1<223> nifK1
<400> 129<400> 129
atggcagata tcatccgtaa tcagaaaccg ctggcggtaa gcccggtaaa aagcggccag 60atggcagata tcatccgtaa tcagaaaccg ctggcggtaa gcccggtaaa aagcggccag 60
ccgttaggcg ccattctggc gagcctcggc tttgagcaca gtattccact ggtgcacggt 120ccgttaggcg ccattctggc gagcctcggc tttgagcaca gtattccact ggtgcacggt 120
gcgcagggat gcagcgcgtt cgccaaagtg ttttttatcc aacattttca tgaccctatt 180gcgcagggat gcagcgcgtt cgccaaagtg ttttttatcc aacattttca tgaccctatt 180
ccgctgcaat ccacggcgat ggaccccacc tcaacggtca tgggggcgga cggcaatatc 240ccgctgcaat ccacggcgat ggaccccacc tcaacggtca tgggggcgga cggcaatatc 240
cttgccgcgc tcaatacgct gtgccagcgc aacaccccga aagctatcgt cctgttgagt 300cttgccgcgc tcaatacgct gtgccagcgc aacaccccga aagctatcgt cctgttgagt 300
accggcctgt ctgaggcgca gggcagcgat atcagccgcg tggtacgtca gtttcgtgag 360accggcctgt ctgaggcgca gggcagcgat atcagccgcg tggtacgtca gtttcgtgag 360
gattttcccc gccacaaaaa tatcgccctc ctgacggtca acaccccgga tttttacggc 420gattttcccc gccacaaaaa tatcgccctc ctgacggtca acaccccggga tttttacggc 420
acgctggaga acggctttag tgcggtggtg gaaagcgtca tcgaacagtg ggtgccggaa 480acgctggaga acggctttag tgcggtggtg gaaagcgtca tcgaacagtg ggtgccggaa 480
aagcctcagc atggcctgcg taaccggcgg gtcaacttgt tgttaagtca cctgctgacg 540aagcctcagc atggcctgcg taaccggcgg gtcaacttgt tgttaagtca cctgctgacg 540
cccggtgatg ttgagttgct gcgcagctac gtggaggctt ttggcctgca accggtgatc 600cccggtgatg ttgagttgct gcgcagctac gtggaggctt ttggcctgca accggtgatc 600
gtgccggatc tttcacagtc gctggatggt cacctggcaa gcggtgattt ttcgccggtc 660gtgccggatc tttcacagtc gctggatggt cacctggcaa gcggtgattt ttcgccggtc 660
actcaggggg gaacgcccct gcgcattatc gaacagatgg gacagagcct gtgcacgttt 720actcagggggg gaacgcccct gcgcattatc gaacagatgg gacagagcct gtgcacgttt 720
gctattggcg tgtcgctgtc ccgtgcggca tcgctgctgg cacagcgtag ccgtggcgag 780gctattggcg tgtcgctgtc ccgtgcggca tcgctgctgg cacagcgtag ccgtggcgag 780
gtgatcgtgc ttccccatct gatgaccatg gaacattgcg accgttttat tcatcaactg 840gtgatcgtgc ttccccatct gatgaccatg gaacattgcg accgttttat tcatcaactg 840
aagatcattt ccgggcgcga ggttcccgcc tggattgagc gccagcgcgg acaattgcag 900aagatcattt cggggcgcga ggttcccgcc tggattgagc gccagcgcgg acaattgcag 900
gatgcgatga tcgattgtca tatgtggttg caggataccc ggctcgcgct ggccgccgag 960gatgcgatga tcgattgtca tatgtggttg caggataccc ggctcgcgct ggccgccgag 960
ggcgatctgc tggcgggctg gtgtgatttc gcccgtagcc agggcatgct ccccggcccc 1020ggcgatctgc tggcgggctg gtgtgatttc gcccgtagcc agggcatgct ccccggcccc 1020
gttgtggcgc cggtcagcca gccgggcctg caacagcttc ccgtggagaa agtggtcatt 1080gttgtggcgc cggtcagcca gccgggcctg caacagcttc ccgtggagaa agtggtcatt 1080
ggcgatctgg aagatatgca ggatttactc tgcgctatgc ctgctgacct gctggtcgcc 1140ggcgatctgg aagatatgca ggatttactc tgcgctatgc ctgctgacct gctggtcgcc 1140
aactcccatg ccgcagacct ggccgaacaa ttctccatcc cgctgatccg cgccgggttc 1200aactcccatg ccgcagacct ggccgaacaa ttctccatcc cgctgatccg cgccggggttc 1200
cctatcttcg acaggcttgg cgaatttcgt cgcgtgcgtc agggataccc cggcattcgc 1260cctatcttcg acaggcttgg cgaatttcgt cgcgtgcgtc agggataccc cggcattcgc 1260
gacacgctgt ttgagctggc gaacctgatg cgcgaacgtc atcaccacct gcccgtctac 1320gacacgctgt ttgagctggc gaacctgatg cgcgaacgtc atcaccacct gcccgtctac 1320
cgctcccccc tgcgccagca atttgcccag gacgctgacg gaggccgcta tgcaacatgt 1380cgctcccccc tgcgccagca atttgcccag gacgctgacg gaggccgcta tgcaacatgt 1380
taa 1383taa 1383
<210> 130<210> 130
<211> 1563<211> 1563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kluyvera intermedia<213> Kluyvera intermedia
<220><220>
<223> nifK2<223> nifK2
<400> 130<400> 130
atgagccaaa ctgctgagaa aattgtcacc tgtcatccgc tgtttgaaca ggacgaatac 60atgagccaaa ctgctgagaa aattgtcacc tgtcatccgc tgtttgaaca ggacgaatac 60
cagacgctgt ttcgcaataa gcgcggtctg gaagaggcgc acgacccgca gcgcgtgcaa 120cagacgctgt ttcgcaataa gcgcggtctg gaagaggcgc acgacccgca gcgcgtgcaa 120
gaggtttttg aatggaccac cacggcggag tatgaagcgc tgaactttaa gcgtgaagcg 180gaggtttttg aatggaccac cacggcggag tatgaagcgc tgaactttaa gcgtgaagcg 180
ttaaccgtcg atccggcaaa ggcctgccag cctttaggat cggtactctg ctcgctgggt 240ttaaccgtcg atccggcaaa ggcctgccag cctttaggat cggtactctg ctcgctgggt 240
tttgccaata cgctgcctta tgtgcacggt tcccagggct gtgtggccta tttccgcacc 300tttgccaata cgctgcctta tgtgcacggt tcccagggct gtgtggccta tttccgcacc 300
tattttaacc gtcatttcaa agagccgatc gcttgcgttt ccgactctat gacagaggat 360tattttaacc gtcatttcaa agagccgatc gcttgcgttt ccgactctat gacagaggat 360
gcggcggtct tcggcggcaa caacaacctt aacaccgggt tgcaaaatgc cagcgccctg 420gcggcggtct tcggcggcaa caacaacctt aacaccgggt tgcaaaatgc cagcgccctg 420
tacaaaccgg aaattgtcgc tgtctccact acctgtatgg cggaggtcat cggcgatgac 480tacaaaccgg aaattgtcgc tgtctccact acctgtatgg cggaggtcat cggcgatgac 480
ctgcaggcct ttatcgccaa cgccaaaaag gacgggttta ttgatgccgc cattccggtg 540ctgcaggcct ttatcgccaa cgccaaaaag gacgggttta ttgatgccgc cattccggtg 540
ccctacgccc atacgccaag ttttatcggt agccacatca ccggctggga caacatgttt 600ccctacgccc atacgccaag ttttatcggt agccacatca ccggctggga caacatgttt 600
gaaggtttcg cccgggcatt taccgccgat cacgtggcgc aaccgggcaa actggcgaag 660gaaggtttcg ccggggcatt taccgccgat cacgtggcgc aaccggggcaa actggcgaag 660
ctaaacctgg tgaccggttt tgaaacctat cttggcaatt accgcgtgct caaacgcatg 720ctaaacctgg tgaccggttt tgaaacctat cttggcaatt accgcgtgct caaacgcatg 720
atggcccaga tggaggtgcc ctgtagcctg ctgtctgacc cgtctgaggt gttagatacg 780atggcccaga tggaggtgcc ctgtagcctg ctgtctgacc cgtctgaggt gttagatacg 780
ccagccgacg gccactatcg catgtatgcg ggcggcacaa cgcaacaaga gatgcgcgac 840ccagccgacg gccactatcg catgtatgcg ggcggcacaa cgcaacaaga gatgcgcgac 840
gcccccgatg ctatcgacac cctgctgctg caaccctggc atctggtgaa gagtaaaaaa 900gcccccgatg ctatcgacac cctgctgctg caaccctggc atctggtgaa gagtaaaaaa 900
gtggtgcagg agtcctgggg ccagcccgcc acagaagtgt ccatcccaat gggactgacc 960gtggtgcagg agtcctgggg ccagcccgcc acagaagtgt ccatcccaat gggactgacc 960
gggaccgacg aactgctgat ggcagtcagt cagttaaccg gcaaaccggt ggccgatgaa 1020gggaccgacg aactgctgat ggcagtcagt cagttaaccg gcaaaccggt ggccgatgaa 1020
ctgacgctgg agcgtgggcg cctggtggat atgattctcg attcacacac ctggctgcac 1080ctgacgctgg agcgtgggcg cctggtggat atgattctcg attcacacac ctggctgcac 1080
ggtaagaaat tcggtctcta cggcgatccg gattttgtga tggggctgac gcgtttcctg 1140ggtaagaaat tcggtctcta cggcgatccg gattttgtga tggggctgac gcgtttcctg 1140
ctggaactgg gctgcgagcc gacggttatc ctctgtcata acggtagcaa gcgctggcag 1200ctggaactgg gctgcgagcc gacggttatc ctctgtcata acggtagcaa gcgctggcag 1200
aaagcgatga agaaaatgct tgaggcatcg ccctacggtc aggagagcga agtgttcatc 1260aaagcgatga agaaaatgct tgaggcatcg ccctacggtc aggagagcga agtgttcatc 1260
aactgcgatc tgtggcattt ccgctcgctg atgtttaccc gcaaaccgga ctttatgatc 1320aactgcgatc tgtggcattt ccgctcgctg atgtttaccc gcaaaccggga ctttatgatc 1320
ggcaactcgt acgccaaatt catccagcgt gacacgctgg cgaaaggcga acagtttgaa 1380ggcaactcgt acgccaaatt catccagcgt gacacgctgg cgaaaggcga acagtttgaa 1380
gttccgctga tccgtcttgg cttcccgttg ttcgaccgcc accacctgca tcgccagacc 1440gttccgctga tccgtcttgg cttcccgttg ttcgaccgcc accacctgca tcgccagacc 1440
acatggggtt atgaaggggc gatgaatatc gtcaccaccc tggtcaacgc cgtgctggaa 1500acatggggtt atgaaggggc gatgaatatc gtcaccaccc tggtcaacgc cgtgctggaa 1500
aaagtcgacc gcgataccat caaactgggc aaaacggact acagcttcga ccttgtccgc 15601560
taa 1563taa 1563
<210> 131<210> 131
<211> 1488<211> 1488
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kluyvera intermedia<213> Kluyvera intermedia
<220><220>
<223> nifL<223> nifL
<400> 131<400> 131
atgaccttta atatgatgct ggagaccagc gcaccgcagc acattgcggg caacctctca 60atgaccttta atatgatgct ggagaccagc gcaccgcagc acattgcggg caacctctca 60
cttcaacatc ccggactgtt ttccacgatg gttgaacagg ctccgatcgc gatttcgctg 120cttcaacatc ccggactgtt ttccacgatg gttgaacagg ctccgatcgc gatttcgctg 120
accgacccgg acgcgaggat tctgtacgct aatccggcct tttgtcgcca gaccggttat 180accgacccgg acgcgaggat tctgtacgct aatccggcct tttgtcgcca gaccggttat 180
agcctggaag agctgctcaa ccagaaccat cgcatactgg caagccaaca gacgccgcgc 240agcctggaag agctgctcaa ccagaaccat cgcatactgg caagccaaca gacgccgcgc 240
agcatttatc aggaactgtg gcaaacgctg ctgcaacaga tgccctggcg cggtcagctc 300agcatttatc aggaactgtg gcaaacgctg ctgcaacaga tgccctggcg cggtcagctc 300
atcaatcgcc gtcgggatgg cagcctttat ctggctgagg tcgatatcac cccggtcgtc 360atcaatcgcc gtcgggatgg cagcctttat ctggctgagg tcgatatcac cccggtcgtc 360
aacaaacagg gcgaactgga acactacctc gccatgcaac gtgatatcag cgccagctat 420aacaaacagg gcgaactgga acactacctc gccatgcaac gtgatatcag cgccagctat 420
gcgctcgaac agcgattgcg caatcacacc accatgagcg aggcggtgct gaacaacatt 480gcgctcgaac agcgattgcg caatcacacc accatgagcg aggcggtgct gaacaacatt 480
cctgccgccg tggtggtggt caacgagcag gaccaggtag tcatggacaa cctcgcctac 540cctgccgccg tggtggtggt caacgagcag gaccaggtag tcatggacaa cctcgcctac 540
aaaaccttct gtgccgactg cggtggcaag gagctgctca ccgaactgga tttctcccgg 600aaaaccttct gtgccgactg cggtggcaag gagctgctca ccgaactgga tttctcccgg 600
cgcaaaagcg atctctatgc cgggcaaata ctgcctgtgg tgctgcgcgg cgccgtgcgc 660cgcaaaagcg atctctatgc cgggcaaata ctgcctgtgg tgctgcgcgg cgccgtgcgc 660
tggctctctg tcacctgctg gaccttgccg ggggtgagcg aagaagccag ccgctacttt 720tggctctctg tcacctgctg gaccttgccg ggggtgagcg aagaagccag ccgctacttt 720
attgataccg cgctgccccg caccctggtg gtgatcaccg actgcaccca gcaacaacaa 780attgataccg cgctgccccg caccctggtg gtgatcaccg actgcaccca gcaacaacaa 780
caggccgaac agggccgtct cgatcgtctc aaacaggaga tgaccaccgg gaagctgctg 840caggccgaac agggccgtct cgatcgtctc aaacaggaga tgaccaccgg gaagctgctg 840
gccgcgatcc gtgaatcgtt ggatgccgcg ctggttcagc taaactgccc catcaatatg 900gccgcgatcc gtgaatcgtt ggatgccgcg ctggttcagc taaactgccc catcaatatg 900
ctggcggcgg cgcgacgtct caacggtgaa gataaccata acgtggcgct ggatgccgcg 960ctggcggcgg cgcgacgtct caacggtgaa gataaccata acgtggcgct ggatgccgcg 960
tggcgcgagg gggaagaggc gctggcccgc ctgcaacgct gccgcccttc tctcgatctg 1020tggcgcgagg gggaagaggc gctggcccgc ctgcaacgct gccgcccttc tctcgatctg 1020
gaagagagcg cgctgtggcc tctgcaaccg ctgtttgacg acctgcgcgc cctttaccat 1080gaagagagcg cgctgtggcc tctgcaaccg ctgtttgacg acctgcgcgc cctttaccat 1080
acccgctata acaatggcga aaatctgcac gttgaaatgg cctctccgca tctggcgggg 1140acccgctata acaatggcga aaatctgcac gttgaaatgg cctctccgca tctggcgggg 1140
tttggtcagc gcacgcagat ccttgcctgt ctcagtttgt ggctcgaccg tacgctggcc 1200tttggtcagc gcacgcagat ccttgcctgt ctcagtttgt ggctcgaccg tacgctggcc 1200
ctcgccgccg cgctaccgga cagaacgctg catacccagc tttacgcccg tgaagaagat 1260ctcgccgccg cgctaccggga cagaacgctg catacccagc tttacgcccg tgaagaagat 1260
ggctggctgt ccatttggct gacagataat gtgccgctca tccatgtgcg atacgcccac 1320ggctggctgt ccatttggct gacagataat gtgccgctca tccatgtgcg atacgcccac 1320
tcccccgatg ccctgaacgc ccccggcaaa gggatggagc tgcgattgat tcaaaccctg 13801380
gttgcccatc atcgcggcgc aatagaacta actacccgcc ctgaaggcgg tacctgcctg 1440gttgcccatc atcgcggcgc aatagaacta actacccgcc ctgaaggcgg tacctgcctg 1440
accctgcgat tcccgttatt tcattcactg accggaggcc cacgatga 1488accctgcgat tcccgttatt tcattcactg accggaggcc cacgatga 1488
<210> 132<210> 132
<211> 1572<211> 1572
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kluyvera intermedia<213> Kluyvera intermedia
<220><220>
<223> nifA<223> nifA
<400> 132<400> 132
atgacccagc gacccgagtc gggcaccacc gtctggcgtt ttgatctctc acagcaattt 60atgacccagc gacccgagtc gggcaccacc gtctggcgtt ttgatctctc acagcaattt 60
accgccatgc agcgcatcag cgtggtgttg agtcgcgcaa ccgagataag ccagacgctg 120accgccatgc agcgcatcag cgtggtgttg agtcgcgcaa ccgagataag ccagacgctg 120
caggaggtgc tgtgtgttct gcataatgac gcatttatgc aacacggcat gctgtgtctg 180caggaggtgc tgtgtgttct gcataatgac gcatttatgc aacacggcat gctgtgtctg 180
tatgacaacc agcaggaaat tctgagtatt gaagccttgc aggaggcaga ccaacatctg 240tatgacaacc agcaggaaat tctgagtatt gaagccttgc aggaggcaga ccaacatctg 240
atccccggca gctcgcaaat tcgctatcgc cctggcgaag ggctggtagg agccgtactg 300atccccggca gctcgcaaat tcgctatcgc cctggcgaag ggctggtagg agccgtactg 300
tcccagggac aatctcttgt gctgccgcgt gtcgccgacg atcaacgctt tctcgacagg 360tcccagggac aatctcttgt gctgccgcgt gtcgccgacg atcaacgctt tctcgacagg 360
cttggcatct atgattacaa cctgccgttt atcgccgtcc ccttaatggg gccaggcgcg 420cttggcatct atgattacaa cctgccgttt atcgccgtcc ccttaatggg gccaggcgcg 420
cagacgattg gcgtgctcgc cgcgcagccg atggcgcgtc tggaggagcg gcttccttcc 480cagacgattg gcgtgctcgc cgcgcagccg atggcgcgtc tggaggagcg gcttccttcc 480
tgtacgcgct ttctggaaac cgtcgccaat ctggtcgcac agacagtccg gctgatgacc 540tgtacgcgct ttctggaaac cgtcgccaat ctggtcgcac agacagtccg gctgatgacc 540
ccgcctgccg ccgccacacc gcgcgccgcg attgcccaga ccgaacgcca gcgcaactgt 600ccgcctgccg ccgccacacc gcgcgccgcg attgcccaga ccgaacgcca gcgcaactgt 600
ggcactcctc gccccttcgg ctttgagaat atggtgggca aaagcccggc catgcagcag 660ggcactcctc gccccttcgg ctttgagaat atggtgggca aaagcccggc catgcagcag 660
acaatggaca ttatccgcca ggtttcgcgc tgggatacca cggtactggt gcgcggcgaa 720acaatggaca ttatccgcca ggtttcgcgc tgggatacca cggtactggt gcgcggcgaa 720
agcggcaccg gtaaagaact tatcgccaat gctattcatc acaactcccc tcgcgccgcc 780agcggcaccg gtaaagaact tatcgccaat gctattcatc acaactcccc tcgcgccgcc 780
gcgccctttg tgaaatttaa ctgcgcggcg ctaccggata cgctactgga gagcgaattg 840gcgccctttg tgaaatttaa ctgcgcggcg ctaccggata cgctactgga gagcgaattg 840
ttcggccatg aaaaaggggc gttcaccggc gcggttcgcc agcgtaaagg acgttttgaa 900ttcggccatg aaaaaggggc gttcaccggc gcggttcgcc agcgtaaagg acgttttgaa 900
ctggccgatg gcggcacact gtttcttgat gaaattggcg aaagcagcgc ctcgttccag 960ctggccgatg gcggcacact gtttcttgat gaaattggcg aaagcagcgc ctcgttccag 960
gccaaactgc tgcgtatttt gcaggagggt gaaatggagc gcgttggcgg cgacgaaacc 1020gccaaactgc tgcgtatttt gcaggagggt gaaatggagc gcgttggcgg cgacgaaacc 1020
ctgcgcgtca atgtgcgtat catcgccgcc accaaccgga atctggaaga agaggtgcgg 1080ctgcgcgtca atgtgcgtat catcgccgcc accaaccgga atctggaaga agaggtgcgg 1080
atgggcaatt tccgcgagga tctctattat cgcctcaacg taatgcccat ctccctgccc 1140atgggcaatt tccgcgagga tctctattat cgcctcaacg taatgcccat ctccctgccc 1140
ccgctgcgtg aacgtcagga ggacattgcc gagctggcgc actttctggt gcgcaaaatc 1200ccgctgcgtg aacgtcagga ggacattgcc gagctggcgc actttctggt gcgcaaaatc 1200
gcccataacc aggggcgtac gctgcgcatc agtgatggcg ccatccgtct gctgatgggt 1260gcccataacc aggggcgtac gctgcgcatc agtgatggcg ccatccgtct gctgatgggt 1260
tacaactggc ccggtaacgt gcgtgagctg gaaaattgcc tggaacgttc ggcagtgatg 1320tacaactggc ccggtaacgt gcgtgagctg gaaaattgcc tggaacgttc ggcagtgatg 1320
tcagaaaacg gcctgatcga ccgcgatgtg gtgctcttta accaccgtga gaacacgcca 1380tcagaaaacg gcctgatcga ccgcgatgtg gtgctcttta accaccgtga gaacacgcca 1380
aaactcgcta tcgccgccgc gccaaaagag gatagctggc ttgatcaaac gctggatgaa 1440aaactcgcta tcgccgccgc gccaaaagag gatagctggc ttgatcaaac gctggatgaa 1440
cgtcaacggc tgattgccgc gctggaaaaa gccgggtggg tgcaggccaa agcggcgcgt 15001500
ctgctgggta tgacgccccg tcaggtcgcc tatcggatac aaattatgga tatcagcatg 15601560
cccaggatgt ga 1572cccaggatgt ga 1572
<210> 133<210> 133
<211> 2853<211> 2853
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kluyvera intermedia<213> Kluyvera intermedia
<220><220>
<223> glnE<223> glnE
<400> 133<400> 133
atgatgccgc actctccaca gctacagcag cactggcaaa ctgtactggc ccgcttgcct 60atgatgccgc actctccaca gctacagcag cactggcaaa ctgtactggc ccgcttgcct 60
gagtcattca gtgaaacacc gcttagtgaa caagcgcagt tagtgcttac tttcagtgat 120gagtcattca gtgaaacacc gcttagtgaa caagcgcagt tagtgcttac tttcagtgat 120
tttgtgcagg atagccttgc cgcgcatcct gactggctgg ctgagctgga aagcgcaccg 180tttgtgcagg atagccttgc cgcgcatcct gactggctgg ctgagctgga aagcgcaccg 180
ccacaggcgg acgagtggaa gcagtatgcg caaacccttc gcgaatcgct ggaaggtgtg 240ccacaggcgg acgagtggaa gcagtatgcg caaacccttc gcgaatcgct ggaaggtgtg 240
ggagatgagg catcattaat gcgtgcgctg cgcctgttcc gtcgccatat gatggtgcgc 300ggagatgagg catcattaat gcgtgcgctg cgcctgttcc gtcgccatat gatggtgcgc 300
attgcctggg cgcagtcgct ggcgctggtg gcagaagatg agacgttgca gcagttgagc 360attgcctggg cgcagtcgct ggcgctggtg gcagaagatg agacgttgca gcagttgagc 360
gtactggcgg agaccctgat cgtcgctgca cgcgactggc tttacgatgc ctgctgtcgc 420gtactggcgg agaccctgat cgtcgctgca cgcgactggc tttacgatgc ctgctgtcgc 420
gagtggggaa cgccgtgcaa tcagcagggg gaaccgcagc cgttgctgat cctgggcatg 480gagtggggaa cgccgtgcaa tcagcagggg gaaccgcagc cgttgctgat cctgggcatg 480
ggcaagctgg gtggcgggga gcttaacttt tcgtccgata tcgatctgat ttttgcctgg 540ggcaagctgg gtggcggggga gcttaacttt tcgtccgata tcgatctgat ttttgcctgg 540
ccggaaaacg gttcaacgcg cggtgggcga cgcgaacttg ataacgccca gttttttact 600cgggaaaacg gttcaacgcg cggtgggcga cgcgaacttg ataacgccca gttttttact 600
cgcttgggac agcgcctgat caaagtgctc gaccagccga cgcaggatgg ctttgtctat 660660
cgcgtggata tgcggctgcg cccgtttggc gacagcggtc cgctggtgct gagttttgcc 720cgcgtggata tgcggctgcg cccgtttggc gacagcggtc cgctggtgct gagttttgcc 720
gcgctggaag attattatca ggagcagggg cgcgactggg aacgttatgc gatggtgaaa 780gcgctggaag attattatca ggagcagggg cgcgactggg aacgttatgc gatggtgaaa 780
gcccgcatta tgggcgataa ggacgatgtt tacgctggcg aattacgggc catgctgcgg 840gcccgcatta tgggcgataa ggacgatgtt tacgctggcg aattacgggc catgctgcgg 840
ccgttcgtct tccgtcgcta tatcgatttc agcgttattc agtctctgcg taacatgaaa 900ccgttcgtct tccgtcgcta tatcgatttc agcgttattc agtctctgcg taacatgaaa 900
gggatgattg cccgcgaagt gcgccgccgt ggtctgaaag ataacattaa gctgggcgcg 960gggatgattg cccgcgaagt gcgccgccgt ggtctgaaag ataacattaa gctgggcgcg 960
ggcggcatcc gtgagattga gtttatcgtt caggtgttcc agttgatacg cggtgggcgc 1020ggcggcatcc gtgagattga gtttatcgtt caggtgttcc agttgatacg cggtgggcgc 1020
gagccgtcgt tgcagtcccg ttcactgtta ccgacgctgg acgctatcga taagctgggt 10801080
ttgctgccgc ctggcgatgc accggcgtta cgccaggcct atttgtatct gcgccgtctg 1140ttgctgccgc ctggcgatgc accggcgtta cgccaggcct atttgtatct gcgccgtctg 1140
gaaaacctgc tgcaaagcat taacgacgaa caaacgcaga cgctgccgac agatgaactc 1200gaaaacctgc tgcaaagcat taacgacgaa caaacgcaga cgctgccgac agatgaactc 1200
aatcgcgcgc gtctggcctg ggggatgcgg gtcgcagact gggaaaccct gaccgctgag 1260aatcgcgcgc gtctggcctg ggggatgcgg gtcgcagact gggaaaccct gaccgctgag 1260
cttgaaaagc agatgtctgc cgtacgaggg atattcaaca ccctgattgg cgatgacgaa 1320cttgaaaagc agatgtctgc cgtacgaggg atattcaaca ccctgattgg cgatgacgaa 1320
gccgaagagc agggggatgc gctctgcggg caatggagtg agttgtggca ggatgcgttt 1380gccgaagagc agggggatgc gctctgcggg caatggagtg agttgtggca ggatgcgttt 1380
caggaagatg acagcacgcc tgtgctggcg cacctttctg acgatgatcg ccgccgcgtg 1440caggaagatg acagcacgcc tgtgctggcg cacctttctg acgatgatcg ccgccgcgtg 1440
gtcgcgatga ttgctgattt tcgcaaagag ctggataaac gcaccattgg cccacgcggc 1500gtcgcgatga ttgctgattt tcgcaaagag ctggataaac gcaccattgg cccacgcggc 1500
cgccaggtgc tcgaccatct gatgccgcat ctgttgagtg atgtctgctc ccgtgaggat 1560cgccaggtgc tcgaccatct gatgccgcat ctgttgagtg atgtctgctc ccgtgaggat 1560
gcccctgtac cgttgtctcg cgtgacgccg ctgttaacgg gaattgtcac gcgtacgacg 1620gcccctgtac cgttgtctcg cgtgacgccg ctgttaacgg gaattgtcac gcgtacgacg 1620
tatcttgagc tgctcagcga gtttcctggt gcgcgtaagc atctgatttc actctgtgcc 1680tatcttgagc tgctcagcga gtttcctggt gcgcgtaagc atctgatttc actctgtgcc 1680
gcctcgccga tggtggccag taagctggcg cgctatccgt tattgctgga tgagttgctc 1740gcctcgccga tggtggccag taagctggcg cgctatccgt tattgctgga tgagttgctc 1740
gatccgaata ccctttatca gcccacggcg atgaatgcct accgggatga gctacgtcag 1800gatccgaata ccctttatca gcccacggcg atgaatgcct accgggatga gctacgtcag 1800
tatctgctgc gtgtgccgga tgacgatgaa gagcagcaac tggaggcgtt acgccagttt 18601860
aaacaggctc aattgttgcg tgtggcggca gcagatctgg caggcacact ccccgtgatg 1920aaacaggctc aattgttgcg tgtggcggca gcagatctgg caggcacact ccccgtgatg 1920
aaagtgagcg atcacttaac atggcttgcc gaagccatca ttgaagccgt ggtacaacag 1980aaagtgagcg atcacttaac atggcttgcc gaagccatca ttgaagccgt ggtacaacag 1980
gcgtggagcc tgatggtatc gcgttatggg cagccgaaac acttacgcga ccgtgaaggc 2040gcgtggagcc tgatggtatc gcgttatggg cagccgaaac acttacgcga ccgtgaaggc 2040
cgtgggtttg cagtggtcgg ttacggcaaa ctgggcggtt gggagctggg ctatagttcc 2100cgtgggtttg cagtggtcgg ttacggcaaa ctgggcggtt gggagctggg ctatagttcc 2100
gatctggatt tgattttcct tcatgactgt ccggtggacg tgatgactga cggcgagcgg 2160gatctggatt tgattttcct tcatgactgt ccggtggacg tgatgactga cggcgagcgg 2160
gaaatcgatg gccgccaatt ttatctgcgc cttgcccagc gcgtgatgca cctgttcagt 2220gaaatcgatg gccgccaatt ttatctgcgc cttgcccagc gcgtgatgca cctgttcagt 2220
acgcgcacct catccgggat cctgtatgag gtagacgcgc gcttgcgccc gtccggtgcg 2280acgcgcacct catccgggat cctgtatgag gtagacgcgc gcttgcgccc gtccggtgcg 2280
gcgggaatgc tggtgacctc aaccgaatcc tttgccgact accagcgcac cgaagcctgg 2340gcgggaatgc tggtgacctc aaccgaatcc tttgccgact accagcgcac cgaagcctgg 2340
acctgggaac atcaggcgct ggttcgcgcc cgcgttgtct atggcgatcc acaattaaac 2400acctgggaac atcaggcgct ggttcgcgcc cgcgttgtct atggcgatcc acaattaaac 2400
gcgcaatttg atgccatccg ccgcgatatc accatgaccg tgcgtaatgg tgcaacgtta 2460gcgcaatttg atgccatccg ccgcgatatc accatgaccg tgcgtaatgg tgcaacgtta 2460
caaaccgagg tgcgcgagat gcgcgaaaaa atgcgcgccc acttgagcaa taagcacaag 25202520
gatcgctttg atattaaagc cgatgagggt ggaattaccg atatcgaatt tatcacccag 2580gatcgctttg atattaaagc cgatgagggt ggaattaccg atatcgaatt tatcacccag 2580
tatctggtgc tgcgttatgc ccatgccaaa ccgaaactga cgcgctggtc ggacaatgtc 2640tatctggtgc tgcgttatgc ccatgccaaa ccgaaactga cgcgctggtc ggacaatgtc 2640
cgcattctgg aagggctggc gcaaaacggc attatggaag agcaggaagc gcaggcactt 2700cgcattctgg aagggctggc gcaaaacggc attatggaag agcaggaagc gcaggcactt 2700
accaccgcct atacaacgtt gcgtgatgag ctgcatcacc tggcgctaca ggagctgcca 2760accaccgcct atacaacgtt gcgtgatgag ctgcatcacc tggcgctaca ggagctgcca 2760
ggacatgttc cggaggcatg ttttgtcgct gaacgcgcga tggtgcgagc ctgctggaac 2820ggacatgttc cggaggcatg ttttgtcgct gaacgcgcga tggtgcgagc ctgctggaac 2820
aagtggttgg tggagccgtg cgaggacgcg taa 2853aagtggttgg tggagccgtg cgaggacgcg taa 2853
<210> 134<210> 134
<211> 1290<211> 1290
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kluyvera intermedia<213> Kluyvera intermedia
<220><220>
<223> amtB<223> amtB
<400> 134<400> 134
atgaagaaag cactattaaa agcgggtctg gcctcgctgg cattactgcc gtgtctggct 60atgaagaaag cactattaaa agcgggtctg gcctcgctgg cattactgcc gtgtctggct 60
atggcagccg atccggttgt cgtcgataaa gccgacaatg cctttatgat gatttgcacc 120atggcagccg atccggttgt cgtcgataaa gccgacaatg cctttatgat gatttgcacc 120
gcgctggtgc tgtttatgtc aattccgggc atcgccctgt tctatggtgg tttaatccgc 180gcgctggtgc tgtttatgtc aattccgggc atcgccctgt tctatggtgg tttaatccgc 180
ggtaaaaacg tcctttctat gctgacacag gttgcggtta cgttcgcact ggtgtgcgtg 240ggtaaaaacg tcctttctat gctgacacag gttgcggtta cgttcgcact ggtgtgcgtg 240
ctgtgggtgg tttacggcta ctctctggcc tttggcactg gcggcagctt cttcggtagc 300ctgtgggtgg tttacggcta ctctctggcc tttggcactg gcggcagctt cttcggtagc 300
ttcgactggg tgatgctgaa aaatattgag ctgaaagcgc tgatgggcac catctatcag 360ttcgactggg tgatgctgaa aaatattgag ctgaaagcgc tgatgggcac catctatcag 360
tacattcacg ttgcgttcca gggctcgttt gcctgtatta ccgtcggcct gattgtcggt 420tacattcacg ttgcgttcca gggctcgttt gcctgtatta ccgtcggcct gattgtcggt 420
gcgctggcag aacgtatccg tttctccgca gtactgattt tcgtcgtggt atggctgacg 480gcgctggcag aacgtatccg tttctccgca gtactgattt tcgtcgtggt atggctgacg 480
ctgtcctacg tgccgatcgc acacatggtc tggggcggcg gtctgctggc aacccatggc 540ctgtcctacg tgccgatcgc acacatggtc tggggcggcg gtctgctggc aacccatggc 540
gccatggatt ttgcgggcgg tacagtcgtt cacatcaacg cagccgttgc aggcctggtg 600gccatggatt ttgcgggcgg tacagtcgtt cacatcaacg cagccgttgc aggcctggtg 600
ggtgcttacc tgattggcaa acgtgtcggt ttcggtaaag aagcgtttaa accgcacaac 660ggtgcttacc tgattggcaa acgtgtcggt ttcggtaaag aagcgtttaa accgcacaac 660
ctgccgatgg tgtttaccgg tacggcaatc ctctactttg gctggttcgg attcaacgcg 720ctgccgatgg tgtttaccgg tacggcaatc ctctactttg gctggttcgg attcaacgcg 720
ggttctgcaa gcgcggcgaa cgaaattgcg ggtctggctt ttgttaacac cgtcgtggca 780ggttctgcaa gcgcggcgaa cgaaattgcg ggtctggctt ttgttaacac cgtcgtggca 780
acagcgggtg caatcctctc ctgggtcttc ggtgagtggg cgctgcgcgg caaaccgtct 840acagcgggtg caatcctctc ctgggtcttc ggtgagtggg cgctgcgcgg caaaccgtct 840
ctgttgggtg cctgttctgg tgcgattgct ggcctcgtgg gtatcacccc ggcgtgtggt 900ctgttgggtg cctgttctgg tgcgattgct ggcctcgtgg gtatcacccc ggcgtgtggt 900
tacgttggtg tgggtggcgc gctgatcgtg ggcatcgttg caggcctggc gggtctgtgg 960tacgttggtg tgggtggcgc gctgatcgtg ggcatcgttg caggcctggc gggtctgtgg 960
ggcgttaccg cgctgaaacg ctggctgcgt gttgacgacc cgtgtgatgt cttcggtgtt 1020ggcgttaccg cgctgaaacg ctggctgcgt gttgacgacc cgtgtgatgt cttcggtgtt 1020
cacggcgtgt gcggtatcgt aggttgtatc atgacaggta tcttcgcagc cacttcactg 1080cacggcgtgt gcggtatcgt aggttgtatc atgacaggta tcttcgcagc cacttcactg 1080
ggcggcgtgg gttatgccga aggcgtgacc atgggccatc aggttctggt acaactggaa 1140ggcggcgtgg gttatgccga aggcgtgacc atgggccatc aggttctggt acaactggaa 1140
agtatcgcca ttactatcgt atggtctggt atcgtcgcct ttatcggtta caaactggct 1200agtatcgcca ttactatcgt atggtctggt atcgtcgcct ttatcggtta caaactggct 1200
gatatgacag tgggtctgcg tgttccggaa gatcaggaac gcgaagggct ggacgtcaac 1260gatatgacag tgggtctgcg tgttccggaa gatcaggaac gcgaagggct ggacgtcaac 1260
agccacggcg agaacgccta caacgcctga 1290agccacggcg agaacgccta caacgcctga 1290
<210> 135<210> 135
<211> 498<211> 498
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kluyvera intermedia<213> Kluyvera intermedia
<220><220>
<223> PinfC<223> PinfC
<400> 135<400> 135
ctggggtcac tggagcgctt tatcggcatc ctgaccgaag aatttgccgg tttcttcccg 60ctggggtcac tggagcgctt tatcggcatc ctgaccgaag aatttgccgg tttcttcccg 60
acctggctgg cccctgttca ggttgtggtg atgaatatca ctgattctca agctgaatat 120acctggctgg cccctgttca ggttgtggtg atgaatatca ctgattctca agctgaatat 120
gtcaacgaat tgacccgtaa attgcaaaat gcgggcattc gtgtaaaagc ggacttgaga 180gtcaacgaat tgacccgtaa attgcaaaat gcgggcattc gtgtaaaagc ggacttgaga 180
aacgagaaga ttggctttaa aatccgcgag cacactttac gtcgtgtccc ttatatgttg 240aacgagaaga ttggctttaa aatccgcgag cacactttac gtcgtgtccc ttatatgttg 240
gtctgtggtg ataaagaggt ggaagcaggc aaagtggccg ttcgcacccg ccgcggtaaa 300gtctgtggtg ataaagaggt ggaagcaggc aaagtggccg ttcgcacccg ccgcggtaaa 300
gacctgggca gcctggacgt aagtgaagtg attgagaagc tgcaacaaga gattcgcagc 360gacctgggca gcctggacgt aagtgaagtg attgagaagc tgcaacaaga gattcgcagc 360
cgcagtcttc aacaactgga ggaataaggt attaaaggcg gaaaacgagt tcaaacggca 420cgcagtcttc aacaactgga ggaataaggt attaaaggcg gaaaacgagt tcaaacggca 420
cgtccgaatc gtatcaatgg cgagattcgc gcccaggaag ttcgcttaac tggtctggaa 480cgtccgaatc gtatcaatgg cgagattcgc gccaggaag ttcgcttaac tggtctggaa 480
ggtgagcagc tgggtatt 498ggtgagcagc tgggtatt 498
<210> 136<210> 136
<211> 1537<211> 1537
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia pseudosacchari<213> Kosakonia pseudosacchari
<220><220>
<223> 16S<223> 16S
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (454)..(454)<222> (454)..(454)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 136<400> 136
attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60
cgaacggtag cacagagagc ttgctctcgg gtgacgagtg gcggacgggt gagtaatgtc 120cgaacggtag cacagagagc ttgctctcgg gtgacgagtg gcggacgggt gagtaatgtc 120
tgggaaactg cctgatggag ggggataact actggaaacg gtagctaata ccgcataacg 180tgggaaactg cctgatggag ggggataact actggaaacg gtagctaata ccgcataacg 180
tcgcaagacc aaagaggggg accttcgggc ctcttgccat cagatgtgcc cagatgggat 240tcgcaagacc aaagaggggg accttcgggc ctcttgccat cagatgtgcc cagatgggat 240
tagctagtag gtggggtaac ggctcaccta ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat 300tagctagtag gtggggtaac ggctcaccta ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat 300
gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360
tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag ccatgccgcg tgtatgaaga aggccttcgg 420tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag ccatgccgcg tgtatgaaga aggccttcgg 420
gttgtaaagt actttcagcg gggaggaagg cganacggtt aataaccgtg ttgattgacg 480gttgtaaagt actttcagcg gggaggaagg cganacggtt aataaccgtg ttgattgacg 480
ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540
caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600
tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc atccgaaact ggcaggcttg agtctcgtag 660tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc atccgaaact ggcaggcttg agtctcgtag 660
agggaggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720agggaggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720
gcgaaggcgg cctcctggac gaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780gcgaaggcgg ccctcctggac gaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780
ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtct atttggaggt tgtgcccttg 840ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtct atttggaggt tgtgcccttg 840
aggcgtggct tccggagcta acgcgttaaa tagaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900aggcgtggct tccggagcta acgcgttaaa tagaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900
taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960
tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacaga acttgccaga gatggcttgg 1020tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacaga acttgccaga gatggcttgg 1020
tgccttcggg aactgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080tgccttcggg aactgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080
ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg tccggccggg 1140ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg tccggccggg 1140
aactcaaagg agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca 1200aactcaaagg agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca 1200
tggcccttac gaccagggct acacacgtgc tacaatggcg catacaaaga gaagcgacct 1260tggcccttac gaccaggggct acacacgtgc tacaatggcg catacaaaga gaagcgacct 1260
cgcgagagca agcggacctc ataaagtgcg tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga 13201320 cgcgagagca agcggacctc ataaagtgcg tcgtagtccg
ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc 1380ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc 1380
gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa gtaggtagct 1440gggccttgta cacaccgcc gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa gtaggtagct 1440
taaccttcgg gagggcgctt accactttgt gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag 1500taaccttcgg gagggcgctt accactttgt gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag 1500
gtaaccgtag gggaacctgc ggttggatca cctcctt 1537gtaaccgtag gggaacctgc ggttggatca ccttcctt 1537
<210> 137<210> 137
<211> 882<211> 882
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia pseudosacchari<213> Kosakonia pseudosacchari
<220><220>
<223> nifH<223> nifH
<400> 137<400> 137
atgaccatgc gtcaatgcgc catttacggc aaaggtggga tcggtaaatc gaccaccaca 60atgaccatgc gtcaatgcgc catttacggc aaaggtggga tcggtaaatc gaccaccaca 60
cagaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggtaagaaag tcatgatcgt cggctgcgat 120cagaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggtaagaaag tcatgatcgt cggctgcgat 120
ccgaaagccg actccacgcg tttgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180ccgaaagccg actccacgcg tttgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180
atggccgccg aagtcggctc cgtcgaagac ctggaattag aagacgtgct gcaaatcggt 240atggccgccg aagtcggctc cgtcgaagac ctggaattag aagacgtgct gcaaatcggt 240
tacggcggcg tgcgctgcgc ggaatccggt ggcccggagc caggtgtggg ttgtgccggt 300tacggcggcg tgcgctgcgc ggaatccggt ggcccggagc caggtgtggg ttgtgccggt 300
cgtggcgtga tcaccgcgat taacttcctc gaagaagaag gcgcttacgt gccggatctg 360cgtggcgtga tcaccgcgat taacttcctc gaagaagaag gcgcttacgt gccggatctg 360
gattttgttt tctacgacgt gctgggcgac gtggtatgcg gtggtttcgc catgccgatt 420gtggttgcg gtggtttcgc catgccgatt 420
cgtgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtttgctctg gcgaaatgat ggcgatgtac 480cgtgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtttgctctg gcgaaatgat ggcgatgtac 480
gccgccaata acatctccaa aggcatcgtg aaatatgcca aatccggtaa agtgcgcctc 540gccgccaata acatctccaa aggcatcgtg aaatatgcca aatccggtaa agtgcgcctc 540
ggcgggctga tttgtaactc gcgccagacc gaccgcgaag atgaactcat cattgcgctg 600ggcgggctga tttgtaactc gcgccagacc gaccgcgaag atgaactcat cattgcgctg 600
gcggaaaaac tcggcacgca aatgatccac tttgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgt 660gcggaaaaac tcggcacgca aatgatccac tttgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgt 660
gcggaaatcc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga cctgcaatca ggccaacgaa 720gcggaaatcc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga cctgcaatca ggccaacgaa 720
tatcgcagcc ttgccagcaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtacc aaccccctgc 780tatcgcagcc ttgccagcaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtacc aaccccctgc 780
accatggatg aactggaaga actgctgatg gagttcggca ttatggatgt ggaagacgcc 840accatggatg aactggaaga actgctgatg gagttcggca ttatggatgt ggaagacgcc 840
agcatcattg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgccgtct ga 882agcatcattg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgccgtct ga 882
<210> 138<210> 138
<211> 1449<211> 1449
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia pseudosacchari<213> Kosakonia pseudosacchari
<220><220>
<223> nifD1<223> nifD1
<400> 138<400> 138
atgagcaatg caacaggcga acgtaacctg gaaatcatcg agcaggtgct ggaggttttc 60atgagcaatg caacaggcga acgtaacctg gaaatcatcg agcaggtgct ggaggttttc 60
ccggaaaaga cgcgcaaaga gcgcagaaaa cacatgatgg tgacggaccc ggagcaggag 120cgggaaaaga cgcgcaaaga gcgcagaaaa cacatgatgg tgacggaccc ggagcaggag 120
agcgtcggca agtgcatcat ctctaaccgc aaatcgcagc cgggcgtgat gaccgtgcgt 180agcgtcggca agtgcatcat ctctaaccgc aaatcgcagc cgggcgtgat gaccgtgcgt 180
ggctgctcgt atgccggatc aaaaggggtg gtatttgggc caatcaaaga tatggcgcat 240ggctgctcgt atgccggatc aaaaggggtg gtatttgggc caatcaaaga tatggcgcat 240
atctcccacg gcccgatcgg ctgcgggcag tactcccgcg ccgggcggcg taactactat 300atctccccg gcccgatcgg ctgcgggcag tactcccgcg ccgggcggcg taactactat 300
accggcgtca gcggcgtgga cagtttcggc acgctcaact tcacctccga tttccaggag 360accggcgtca gcggcgtgga cagtttcggc acgctcaact tcacctccga tttccaggag 360
cgcgacatcg tgtttggcgg cgacaaaaag ctcgccaaac tgattgaaga gctggaagaa 420cgcgacatcg tgtttggcgg cgacaaaaag ctcgccaaac tgattgaaga gctggaagaa 420
ctgtttccgc tgaccaaagg catttcgatt cagtcggaat gcccggtcgg cctgattggc 480ctgtttccgc tgaccaaagg catttcgatt cagtcggaat gcccggtcgg cctgattggc 480
gatgatattg aagccgtggc gaacgccagc cgcaaagcga tcaacaaacc ggttattccg 540gatgatattg aagccgtggc gaacgccagc cgcaaagcga tcaacaaacc ggttattccg 540
gtgcgttgcg aaggctttcg cggcgtgtcg caatccctcg gtcaccatat tgccaacgat 600gtgcgttgcg aaggctttcg cggcgtgtcg caatccctcg gtcaccatat tgccaacgat 600
gtgatccgcg actgggtact ggataaccgc gaaggcaaac cgtttgaatc caccccttac 660gtgatccgcg actgggtact ggataaccgc gaaggcaaac cgtttgaatc caccccttac 660
gatgtggcga tcatcggcga ttacaacatc ggtggcgacg cctgggcctc gcgcattttg 720gatgtggcga tcatcggcga ttacaacatc ggtggcgacg cctgggcctc gcgcattttg 720
ctcgaagaga tggggttgcg ggtggtcgcg cagtggtccg gcgacggtac gctggtggag 780ctcgaagaga tggggttgcg ggtggtcgcg cagtggtccg gcgacggtac gctggtggag 780
atggaaaaca cgccgttcgt caaactgaac ctggtgcact gctaccgctc gatgaactac 840atggaaaaca cgccgttcgt caaactgaac ctggtgcact gctaccgctc gatgaactac 840
atctcgcgcc atatggagga gaagcacggt attccgtgga tggaatacaa cttctttggc 900atctcgcgcc atatggagga gaagcacggt attccgtgga tggaatacaa cttctttggc 900
ccgacgaaaa tcgcggaatc gctgcgcaaa atcgccgacc tgttcgacga caccattcgc 960ccgacgaaaa tcgcggaatc gctgcgcaaa atcgccgacc tgttcgacga caccattcgc 960
gccaacgccg aagcggtgat cgcccgatac caggcgcaga acgacgccat tatcgccaaa 1020gccaacgccg aagcggtgat cgcccgatac caggcgcaga acgacgccat tatcgccaaa 1020
tatcgcccac gtctggaggg tcgcaaagtg ttgctctata tgggcgggct gcgtccgcgc 1080tatcgcccac gtctggaggg tcgcaaagtg ttgctctata tgggcgggct gcgtccgcgc 1080
catgtgattg gcgcctatga agatctggga atggagatca tcgccgccgg ttatgagttt 1140catgtgattg gcgcctatga agatctggga atggagatca tcgccgccgg ttatgagttt 1140
ggtcataacg acgattacga ccgcaccctg ccggatctga aagagggcac gctgctgttt 1200ggtcataacg acgattacga ccgcaccctg ccggatctga aagagggcac gctgctgttt 1200
gatgacgcca gcagctatga gctggaggcg tttgtcaacg cgctgaaacc ggatctcatc 1260gatgacgcca gcagctatga gctggaggcg tttgtcaacg cgctgaaacc ggatctcatc 1260
ggttccggca tcaaagagaa gtacatcttt cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320ggttccggca tcaaagagaa gtacatcttt cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320
cactcctggg attactccgg cccgtaccac ggctatgacg gcttcgccat cttcgcccgc 1380cactcctggg attactccgg cccgtaccac ggctatgacg gcttcgccat cttcgcccgc 1380
gatatggata tgacgctcaa caaccccgcc tggggtcagt tgaccgcgcc gtggcttaaa 1440gatatggata tgacgctcaa caaccccgcc tggggtcagt tgaccgcgcc gtggcttaaa 1440
tccgcctga 1449tccgcctga 1449
<210> 139<210> 139
<211> 1374<211> 1374
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia pseudosacchari<213> Kosakonia pseudosacchari
<220><220>
<223> nifD2<223> nifD2
<400> 139<400> 139
atgaagggga acgacatcct ggctctgctc gatgaaccag cctgcgagca taaccataaa 60atgaagggga acgacatcct ggctctgctc gatgaaccag cctgcgagca taaccataaa 60
cagaaaaccg gctgtagcgc gccaaaaccc ggcgccaccg ccggaggctg cgccttcgac 120cagaaaaccg gctgtagcgc gccaaaaccc ggcgccaccg cgggaggctg cgccttcgac 120
ggcgcacaga tcaccctgct gccactttcc gatgtggcgc atctggtaca tggcccgatt 180ggcgcacaga tcaccctgct gccactttcc gatgtggcgc atctggtaca tggcccgatt 180
ggctgcgccg gcagctcatg ggataaccgt ggcagcctga gttctggccc gctgattaac 240ggctgcgccg gcagctcatg ggataaccgt ggcagcctga gttctggccc gctgattaac 240
cgactcggat tcaccactga tttgaacgaa caggatgtca tcatggggcg cggcgagcgg 300cgactcggat tcaccactga tttgaacgaa caggatgtca tcatggggcg cggcgagcgg 300
cggttgtttc acgcggtgcg ccatattgtc gagcgctatc acccggcggc ggtatttatt 360cggttgtttc acgcggtgcg ccatattgtc gagcgctatc acccggcggc ggtatttatt 360
tacaacacct gcgttccggc tatggaaggc gatgacattg acgcggtctg ccaggccgcc 420tacaacacct gcgttccggc tatggaaggc gatgacattg acgcggtctg ccaggccgcc 420
gcgaccgcca ccggtgtgcc cgtgattgcc gtagatgtgg ccggttttta cggtagcaaa 480gcgaccgcca ccggtgtgcc cgtgattgcc gtagatgtgg ccggttttta cggtagcaaa 480
aacctgggta accgcctcgc gggcgaggtg atggtgaaaa aagttatcgg cgggcgcgaa 540aacctgggta accgcctcgc gggcgaggtg atggtgaaaa aagttatcgg cgggcgcgaa 540
cccgcgccgt ggccggacaa tacacctttt gccccggcgc accgccatga cataggcctg 600cccgcgccgt ggccggacaa tacacctttt gccccggcgc accgccatga cataggcctg 600
attggcgaat ttaacatcgc cggcgagttc tggcatatcc agccgctgct tgatgagctg 660attggcgaat ttaacatcgc cggcgagttc tggcatatcc agccgctgct tgatgagctg 660
ggtattcgcg tccttggctc cctttccggc gacgggcgct ttgccgagat ccagacgttg 720ggtattcgcg tccttggctc cctttccggc gacgggcgct ttgccgagat cggacgttg 720
caccgcgcgc aggtcaatat gctggtgtgc tccagggcgc tgattaatgt cgccagatcg 780caccgcgcgc aggtcaatat gctggtgtgc tccagggcgc tgattaatgt cgccagatcg 780
cttgaacaac gttatggcac accctggttt gaaggcagtt tttatggcgt tcgcgccacc 840cttgaacaac gttatggcac accctggttt gaaggcagtt tttatggcgt tcgcgccacc 840
tccgatgccc tgcgccagct ggcaacactc accggcgata gcgatttaat ggcgcgaacc 900tccgatgccc tgcgccagct ggcaacactc accggcgata gcgatttaat ggcgcgaacc 900
gaacggctga tcgcacgtga agagcaagcc acagaacagg cgctagcacc gctgcgtgaa 960gaacggctga tcgcacgtga agagcaagcc acagaacagg cgctagcacc gctgcgtgaa 960
cggttacacg gccggaaagt gctgctctat accggtggcg tgaaatcctg gtcggtggtt 1020cggttacacg gccggaaagt gctgctctat accggtggcg tgaaatcctg gtcggtggtt 1020
tcggcgctgc aggatctcgg catgacggtc gttgctaccg gaacgcgcaa atccaccgaa 1080tcggcgctgc aggatctcgg catgacggtc gttgctaccg gaacgcgcaa atccaccgaa 1080
gaggataaac aacgcatccg tgaactgatg ggcgatgacg ccatcatgct ggatgaaggc 1140gaggataaac aacgcatccg tgaactgatg ggcgatgacg ccatcatgct ggatgaaggc 1140
aatgcccgcg ccttgctgga tgtggtctat cgctacaaag ccgacatgat gatcgcgggc 1200aatgcccgcg ccttgctgga tgtggtctat cgctacaaag ccgacatgat gatcgcgggc 1200
gggcgcaaca tgtacaccgc ctataaagcg cgtctgccct ttctggatat caaccaggag 1260gggcgcaaca tgtacaccgc ctataaagcg cgtctgccct ttctggatat caaccaggag 1260
cgtgaacacg cgtttgccgg ttatcgcggc atcatcacgc ttgccgaaca actttgtcag 1320cgtgaacacg cgtttgccgg ttatcgcggc atcatcacgc ttgccgaaca actttgtcag 1320
acgctggaaa gcccggtctg gccgcaaaca catgcccgcg ccccgtggca ataa 1374acgctggaaa gcccggtctg gccgcaaaca catgcccgcg ccccgtggca ataa 1374
<210> 140<210> 140
<211> 1563<211> 1563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia pseudosacchari<213> Kosakonia pseudosacchari
<220><220>
<223> nifK1<223> nifK1
<400> 140<400> 140
atgagccaga ctgctgagaa aatacagaat tgccatcccc tgtttgaaca ggacgcctac 60atgagccaga ctgctgagaa aatacagaat tgccatcccc tgtttgaaca ggacgcctac 60
cagacactat ttgccggtaa acgggcactc gaagaggctc actcgccgga gcgggtgcag 120cagacactat ttgccggtaa acgggcactc gaagaggctc actcgccgga gcgggtgcag 120
gaagtgtttc aatggaccac caccccggaa tacgaagcgc tgaacttcaa acgcgaagcg 180gaagtgtttc aatggaccac caccccggaa tacgaagcgc tgaacttcaa acgcgaagcg 180
ctgactatcg acccggcaaa agcctgccag ccgctggggg cggtgctctg ttcgctgggg 240ctgactatcg acccggcaaa agcctgccag ccgctggggg cggtgctctg ttcgctgggg 240
tttgccaaca ccctgccgta tgtgcacggt tcacagggtt gtgtggccta tttccgtacg 300tttgccaaca ccctgccgta tgtgcacggt tcacaggggtt gtgtggccta tttccgtacg 300
tactttaacc gccacttcaa agaaccggtg gcctgcgtgt cggattcgat gacggaagac 360tactttaacc gccacttcaa agaaccggtg gcctgcgtgt cggattcgat gacggaagac 360
gcggccgtgt tcggcgggaa taacaacctc aacaccgggt tacaaaacgc cagcgcactg 420gcggccgtgt tcggcgggaa taacaacctc aacaccgggt tacaaaacgc cagcgcactg 420
tataaaccgg agattatcgc cgtctctacc acctgtatgg cggaagtgat cggtgatgat 480tataaaccgg agattatcgc cgtctctacc acctgtatgg cggaagtgat cggtgatgat 480
ttacaggcgt ttatcgccaa cgccaaaaaa gatggttttc tcgatgccgc catccccgtg 540ttacaggcgt ttatcgccaa cgccaaaaaa gatggttttc tcgatgccgc catccccgtg 540
ccctacgccc acacccccag ttttatcggt agccatatca ccggctggga caacatgttt 600ccctacgccc acacccccag ttttatcggt agccatatca ccggctggga caacatgttt 600
gaaggttttg cccgtacctt taccgcaaac catcagccac agcccggtaa actttcacgc 660gaaggttttg cccgtacctt taccgcaaac catcagccac agcccggtaa actttcacgc 660
ctgaacctgg tgaccgggtt tgaaacctat ctcggcaatt tccgcgtgct gaaacgcatg 720ctgaacctgg tgaccgggtt tgaaacctat ctcggcaatt tccgcgtgct gaaacgcatg 720
atggaacaaa tggaggtgca ggcgagtgtg ctctccgatc cgtcggaggt gctggacacc 780atggaacaaa tggaggtgca ggcgagtgtg ctctccgatc cgtcggaggt gctggacacc 780
cccgccaatg gccattacca gatgtacgcg ggcggtacga cgcagcaaga gatgcgcgag 840cccgccaatg gccattacca gatgtacgcg ggcggtacga cgcagcaaga gatgcgcgag 840
gcaccggatg ccatcgacac cctgctgctg caaccgtggc agctggtgaa aagcaaaaaa 900gcaccggatg ccatcgacac cctgctgctg caaccgtggc agctggtgaa aagcaaaaaa 900
gtggtgcagg agatgtggaa tcagcccgcc accgaggttg ccattcccgt cgggctggca 960gtggtgcagg agatgtggaa tcagcccgcc accgaggttg ccattcccgt cgggctggca 960
ggcacagacg aactgttgat ggcgattagc cagttaaccg gcaaagccat tcccgattcg 1020ggcacagacg aactgttgat ggcgattagc cagttaaccg gcaaagccat tcccgattcg 1020
ctggcgctgg agcgcgggcg gctggtcgat atgatgctcg actcccacac ctggttacac 1080ctggcgctgg agcgcgggcg gctggtcgat atgatgctcg actcccacac ctggttacac 1080
ggtaaaaaat tcggtctgtt tggcgatccg gattttgtca tgggattgac ccgcttcctg 1140ggtaaaaaat tcggtctgtt tggcgatccg gattttgtca tgggattgac ccgcttcctg 1140
ctggaactgg gctgtgaacc tgccgtcatc ctctgccata acggtaacaa acgctggcaa 1200ctggaactgg gctgtgaacc tgccgtcatc ctctgccata acggtaacaa acgctggcaa 1200
aaagcgatga agaaaatgct cgatgcttca ccgtacggcc aggagagcga agtgtttatc 12601260
aactgcgact tgtggcattt ccgctcgctg atgttcaccc gccagccgga ttttatgatt 1320aactgcgact tgtggcattt ccgctcgctg atgttcaccc gccagccgga ttttatgatt 1320
ggcaactcgt acgccaagtt tattcagcgc gacaccttag ccaagggcga acagtttgaa 1380ggcaactcgt acgccaagtt tattcagcgc gacaccttag ccaagggcga acagtttgaa 1380
gtcccgctga tccgcctcgg ttttccgctg ttcgaccgtc accatctgca ccgccagacc 1440gtcccgctga tccgcctcgg ttttccgctg ttcgaccgtc accatctgca ccgccagacc 1440
acctggggct acgagggcgc gatgagcatt ctcacgacgc tggtgaatgc ggtactggag 1500acctggggct acgagggcgc gatgagcatt ctcacgacgc tggtgaatgc ggtactggag 1500
aaagtggaca aagagaccat caagctcggc aaaaccgact acagcttcga tcttatccgt 15601560
taa 1563taa 1563
<210> 141<210> 141
<211> 1386<211> 1386
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia pseudosacchari<213> Kosakonia pseudosacchari
<220><220>
<223> nifK2<223> nifK2
<400> 141<400> 141
atggctgata ttgttcgtag taaaaaaccg ctggcggtga gcccgataaa aagcggccag 60atggctgata ttgttcgtag taaaaaaccg ctggcggtga gcccgataaa aagcggccag 60
ccgctggggg cgatcctggc aagcctgggt ttcgaacagt gcataccgct ggtacacggc 120ccgctggggg cgatcctggc aagcctgggt ttcgaacagt gcataccgct ggtacacggc 120
gctcaggggt gcagcgcgtt cgcgaaagtg ttctttattc aacattttca cgacccgatc 180gctcaggggt gcagcgcgtt cgcgaaagtg ttcttttattc aacattttca cgacccgatc 180
ccgctgcaat cgacggcgat ggacccgact tccaccatta tgggcgccga tgaaaacatt 240ccgctgcaat cgacggcgat ggacccgact tccaccatta tgggcgccga tgaaaacatt 240
tttaccgcgc tcaatgttct ctgccagcgc aacgccgcga aagccatcgt gctgctcagc 300tttaccgcgc tcaatgttct ctgccagcgc aacgccgcga aagccatcgt gctgctcagc 300
accgggctgt cagaagccca gggcagcgat atttcacgag tggtgcgcca gtttcgtgat 360accgggctgt cagaagccca gggcagcgat atttcacgag tggtgcgcca gtttcgtgat 360
gactttccgc ggcataaaaa cgtggcgctg ctcaccgtca acaccccgga tttctacggc 420gactttccgc ggcataaaaa cgtggcgctg ctcaccgtca acaccccggga tttctacggc 420
tcgctggaaa acggctacag cgccgtgctg gaaagcatga ttgaacagtg ggtgcccgcg 480tcgctggaaa acggctacag cgccgtgctg gaaagcatga ttgaacagtg ggtgcccgcg 480
cagcccgccg ccagcctgcg caaccgtcgc gtcaacctgc tggtcagcca tttactgacg 540cagcccgccg ccagcctgcg caaccgtcgc gtcaacctgc tggtcagcca tttactgacg 540
ccgggcgata tcgaactgtt acgcagttat gtggaagcat tcggtctgca accggtgatt 600ccgggcgata tcgaactgtt acgcagttat gtggaagcat tcggtctgca accggtgatt 600
gtgccggatc tatcgcagtc gctggacgga catctggcca acggtgattt ttcgcccgtc 660gtgccggatc tatcgcagtc gctggacgga catctggcca acggtgattt ttcgcccgtc 660
acccaggggg gaacaccgct gcgcatgatt gaacagatgg ggcaaaacct ggccactttt 720acccagggggg gaacaccgct gcgcatgatt gaacagatgg ggcaaaacct ggccactttt 720
gtgattggcc actcgctggg gcgggcggcg gcgttactgg cgcagcgcag ccgtggcgag 780gtgattggcc actcgctggg gcgggcggcg gcgttactgg cgcagcgcag ccgtggcgag 780
gtgatcgccc tgccgcatct gatgacgctt gatgcgtgcg acacctttat ccatcgcctg 840gtgatcgccc tgccgcatct gatgacgctt gatgcgtgcg acacctttat ccatcgcctg 840
aaaaccctct ccgggcgcga cgtgcccgcg tggattgagc gccagcgcgg gcaagtgcag 900aaaaccctct ccgggcgcga cgtgcccgcg tggattgagc gccagcgcgg gcaagtgcag 900
gatgcgatga tcgattgcca tatgtggttg cagggcgcgg ctatcgccat ggccgcagaa 960gatgcgatga tcgattgcca tatgtggttg cagggcgcgg ctatcgccat ggccgcagaa 960
ggcgatcacc tggcggcatg gtgcgatttc gcccgcagcc agggcatgat ccccggcccg 1020ggcgatcacc tggcggcatg gtgcgatttc gcccgcagcc agggcatgat ccccggcccg 1020
gttgtcgcgc cggtcagcca gccggggttg caaaatctgc cggttgaaat ggtggtcatc 1080gttgtcgcgc cggtcagcca gccggggttg caaaatctgc cggttgaaat ggtggtcatc 1080
ggcgatctgg aagatatgca ggatcggctt tgcgcgacgc ccgccgcgtt actggtggcc 1140ggcgatctgg aagatatgca ggatcggctt tgcgcgacgc ccgccgcgtt actggtggcc 1140
aattctcatg ccgccgatct cgccacgcag tttgatatgt cgcttatccg cgccgggttt 12001200
ccggtgtatg accggctggg ggaatttcgt cggctgcgcc aggggtatag cggcattcgt 1260ccggtgtatg accggctggg ggaatttcgt cggctgcgcc aggggtatag cggcattcgt 1260
gacacgctgt ttgagctggc gaatgtgatg cgcgaacgcc attgcccgct tgcaacctac 1320gacacgctgt ttgagctggc gaatgtgatg cgcgaacgcc attgcccgct tgcaacctac 1320
cgctcgccgc tgcgtcagcg cttcggcgac aacgttacgc caggagatcg gtatgccgca 1380cgctcgccgc tgcgtcagcg cttcggcgac aacgttacgc caggagatcg gtatgccgca 1380
tgttaa 1386tgttaa 1386
<210> 142<210> 142
<211> 1488<211> 1488
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia pseudosacchari<213> Kosakonia pseudosacchari
<220><220>
<223> nifL<223> nifL
<400> 142<400> 142
atgaccctga atatgatgat ggatgccagc gcgcccgagg ccatcgccgg tgcgctttcg 60atgaccctga atatgatgat ggatgccagc gcgcccgagg ccatcgccgg tgcgctttcg 60
caacaacatc ctgggctgtt ttttaccatc gttgaagaag cccccgtcgc tatttcacta 120caacaacatc ctgggctgtt ttttaccatc gttgaagaag cccccgtcgc tatttcacta 120
accgatgccg aggcacgtat tgtctatgcc aacccggcat tctgccgcca gaccggctat 180accgatgccg aggcacgtat tgtctatgcc aacccggcat tctgccgcca gaccggctat 180
gagcttgagg agttgttgca gcaaaatccc cgcctgcttg ccagtcagca gaccccacgg 240gagcttgagg agttgttgca gcaaaatccc cgcctgcttg ccagtcagca gaccccacgg 240
gaaatctacc aggatatgtg gcacaccctg ttacaacgtc gaccatggcg cgggcaattg 300gaaatctacc aggatatgtg gcacaccctg ttacaacgtc gaccatggcg cgggcaattg 300
atcaaccgcc accgtgacgg cagccttttt ctggttgaga tcgatatcac cccggtgatt 360atcaaccgcc accgtgacgg cagccttttt ctggttgaga tcgatatcac cccggtgatt 360
aacccgtttg gcgaactgga acactacctg gccatgcagc gcgatatcag cgccggttat 420aacccgtttg gcgaactgga acactacctg gccatgcagc gcgatatcag cgccggttat 420
gcgctggagc agcggttgcg taatcacatg gcgctgaccg aagcggtgct gaataacatt 480gcgctggagc agcggttgcg taatcacatg gcgctgaccg aagcggtgct gaataacatt 480
ccggcggcgg tggtcgtggt cgatgaacgc gatcgtgtgg ttatggataa cctcgcctat 540ccggcggcgg tggtcgtggt cgatgaacgc gatcgtgtgg ttatggataa cctcgcctat 540
aaaactttct gtgctgattg cggcggaaaa gagctactga gcgaactcca tttttcagcc 600aaaactttct gtgctgattg cggcggaaaa gagctactga gcgaactcca tttttcagcc 600
cgtaaagcgg agctggcaaa cggccaggtc ttaccggtgg tgctgcgcgg cgcggtgcgc 660660
tggttgtcgg tcacctgctg ggcgctgcca ggcgtcagcg aagaagccag tcgctacttt 720tggttgtcgg tcacctgctg ggcgctgcca ggcgtcagcg aagaagccag tcgctacttt 720
attgataata ccttgacgcg cacgctggtg gtcatcaccg acgacaccca gcagcgccag 780attgataata ccttgacgcg cacgctggtg gtcatcaccg acgacaccca gcagcgccag 780
cagcaagagc aaggacggct tgaccgcctt aaacagcaga tgaccagcgg caaactgctg 840cagcaagagc aaggacggct tgaccgcctt aaacagcaga tgaccagcgg caaactgctg 840
gcggcgatcc gcgaagcgct tgacgccgcg ctgatccagc ttaactgccc catcaatatg 900gcggcgatcc gcgaagcgct tgacgccgcg ctgatccagc ttaactgccc catcaatatg 900
ctggcggcgg cgcggcgttt aaacggcagt gataacagca acgtagcgct ggacgccgcg 960ctggcggcgg cgcggcgttt aaacggcagt gataacagca acgtagcgct ggacgccgcg 960
tggcgcgaag gtgaagaagc gatggcgcgg ctgaaacggt gccgcccgtc gctggagctg 1020tggcgcgaag gtgaagaagc gatggcgcgg ctgaaacggt gccgcccgtc gctggagctg 1020
gaaagtgccg ccgtctggcc gctgcaaccc ttttttgacg acttgcgcgc gctttatcac 1080gaaagtgccg ccgtctggcc gctgcaaccc ttttttgacg acttgcgcgc gctttatcac 1080
acccgctacg agcagggtaa aaatttgcag gtcacgctgg attcgacgca tctggtggga 1140acccgctacg agcagggtaa aaatttgcag gtcacgctgg attcgacgca tctggtggga 1140
tttggtcagc gaacccaact gctggcctgc ctgagtctgt ggctcgatcg cacgctggat 1200tttggtcagc gaacccaact gctggcctgc ctgagtctgt ggctcgatcg cacgctggat 1200
attgccgtcg ggctgcgtga tttcaccgcc caaacgcaga tttacgcccg ggaagaagcg 12601260
ggctggctct cgttgtatat cactgacaat gtgccgttga ttccgctgcg ccatacccat 1320ggctggctct cgttgtatat cactgacaat gtgccgttga ttccgctgcg ccatacccat 1320
tcgccggatg cgcttaacgc accgggaaaa ggtatggagt tgcggctgat ccagacgctg 13801380 tcgccggatg cgcttaacgc accgggaaaa ggtatggagt
gtagcgcatc acaacggcgc gatagaactc acttcacgcc ccgaaggggg aagctgcctg 1440gtagcgcatc acaacggcgc gatagaactc acttcacgcc ccgaaggggg aagctgcctg 1440
accctacgat tcccgctatt tcattcactg accggaggtt caaaatga 1488accctacgat tcccgctatt tcattcactg accggaggtt caaaatga 1488
<210> 143<210> 143
<211> 1575<211> 1575
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia pseudosacchari<213> Kosakonia pseudosacchari
<220><220>
<223> nifA<223> nifA
<400> 143<400> 143
atgacccagc gaaccgagtc gggtaatacc gtctggcgct tcgatttatc ccagcagttc 60atgacccagc gaaccgagtc gggtaatacc gtctggcgct tcgatttatc ccagcagttc 60
accgcgatgc agcggataag cgtggttctc agccgggcga ccgaggttga acagacactc 120accgcgatgc agcggataag cgtggttctc agccgggcga ccgaggttga acagacactc 120
cagcaggtgc tgtgcgtatt gcacaatgac gcctttttgc agcacggcat gatctgtctg 180cagcaggtgc tgtgcgtatt gcacaatgac gccttttttgc agcacggcat gatctgtctg 180
tacgacagcc agcaggcgat tttgactatt gaagcgttgc aggaagccga tcagcagttg 240tacgacagcc agcaggcgat tttgactatt gaagcgttgc aggaagccga tcagcagttg 240
atccccggca gctcgcaaat tcgctaccgt ccgggtgaag ggctggtcgg gacggtgctt 300atccccggca gctcgcaaat tcgctaccgt ccgggtgaag ggctggtcgg gacggtgctt 300
tcgcaggggc aatcgttagt gctggcgcgt gtggctgacg atcagcgctt tcttgaccgc 360tcgcaggggc aatcgttagt gctggcgcgt gtggctgacg atcagcgctt tcttgaccgc 360
ctgggactgt atgattacaa cctgccgttt atcgccgtgc cgctgatagg gccggatgcg 420ctgggactgt atgattacaa ccgccgttt atcgccgtgc cgctgatagg gccggatgcg 420
cagacttttg gcgtgctgac ggcgcaaccg atggcgcgtt acgaagagcg gttacccgcc 480cagacttttg gcgtgctgac ggcgcaaccg atggcgcgtt acgaagagcg gttacccgcc 480
tgcacccgct ttctggaaac ggtcgcgaat ctggtggcgc agaccgtgcg tttgatgacg 540tgcacccgct ttctggaaac ggtcgcgaat ctggtggcgc agaccgtgcg tttgatgacg 540
ccgccggctg cacgcccttc cccacgcgct gccatcacgc caaccgccag cccgaaatcg 600ccgccggctg cacgcccttc cccacgcgct gccatcacgc caaccgccag cccgaaatcg 600
tgcagtactt cacgcgcgtt cggcttcgaa aatatggtcg gcaacagccc ggcaatgcgc 660tgcagtactt cacgcgcgtt cggcttcgaa aatatggtcg gcaacagccc ggcaatgcgc 660
cagaccatgg agattatccg tcaggtttcg cgctgggata ccaccgttct ggtgcgcggc 720cagaccatgg agattatccg tcaggtttcg cgctgggata ccaccgttct ggtgcgcggc 720
gagagcggca ccggcaagga actgattgcc aacgccatcc atcacaattc gccgcgcgcc 780gagagcggca ccggcaagga actgattgcc aacgccatcc atcacaattc gccgcgcgcc 780
agtgcgccat ttgtgaaatt caactgtgcg gcgctgccgg acacattgct tgaaagcgaa 840agtgcgccat ttgtgaaatt caactgtgcg gcgctgccgg acacattgct tgaaagcgaa 840
ttatttggtc atgaaaaagg cgcctttacc ggcgcggtac gccagcgtaa aggccgtttt 900ttatttggtc atgaaaaagg cgcctttacc ggcgcggtac gccagcgtaa aggccgtttt 900
gagctggccg atggcggcac gctgtttctt gacgaaattg gggaaagcag cgcctcgttt 960gagctggccg atggcggcac gctgtttctt gacgaaattg gggaaagcag cgcctcgttt 960
caggctaagc tgctgcgtat tttgcaggag ggcgaaatgg aacgcgtcgg tggtgacgag 1020caggctaagc tgctgcgtat tttgcaggag ggcgaaatgg aacgcgtcgg tggtgacgag 1020
acattgcaag tgaatgtgcg catcattgcc gcgacgaacc gcaaccttga agatgaagta 1080acattgcaag tgaatgtgcg catcattgcc gcgacgaacc gcaaccttga agatgaagta 1080
cgcctgggac attttcgcga agatctctat taccgcctga atgtgatgcc catcgccctg 1140cgcctgggac attttcgcga agatctctat taccgcctga atgtgatgcc catcgccctg 1140
ccgccgctgc gcgaacgcca ggacgacatc gccgaactgg cacattttct ggtgcgtaaa 1200ccgccgctgc gcgaacgcca ggacgacatc gccgaactgg cacattttct ggtgcgtaaa 1200
atcgcccaca accagaaccg cacgctgcgc attagcgagg gcgctatccg cctgctgatg 1260atcgcccaca accagaaccg cacgctgcgc attagcgagg gcgctatccg cctgctgatg 1260
agctacagct ggcccggcaa tgtgcgcgaa ctggaaaact gccttgagcg ctctgcggtg 1320agctacagct ggcccggcaa tgtgcgcgaa ctggaaaact gccttgagcg ctctgcggtg 1320
atgtcggaaa acggtctgat cgatcgggac gtgattttat ttaatcatcg cgaccagcca 1380atgtcggaaa acggtctgat cgatcgggac gtgattttat ttaatcatcg cgaccagcca 1380
gccaaaccgc cggttatcag cgtcacgccc gacgataact ggctcgataa cacccttgac 1440gccaaaccgc cggttatcag cgtcacgccc gacgataact ggctcgataa cacccttgac 1440
gagcgccagc ggctgattgc cgcgctggaa aaagcgggat gggtacaagc caaagccgcc 1500gagcgccagc ggctgattgc cgcgctggaa aaagcgggat gggtacaagc caaagccgcc 1500
cgcttgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcttatcgta ttcagaccat ggatatcacc 1560cgcttgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcttatcgta ttcagaccat ggatatcacc 1560
ctgccaaggc tataa 1575ctgccaaggc tataa 1575
<210> 144<210> 144
<211> 2850<211> 2850
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia pseudosacchari<213> Kosakonia pseudosacchari
<220><220>
<223> glnE<223> glnE
<400> 144<400> 144
atgccgcacc acgcaggatt gtcgcagcac tggcaaacgg ttttttctcg tctgccggaa 60atgccgcacc acgcaggatt gtcgcagcac tggcaaacgg ttttttctcg tctgccggaa 60
gcgctcaccg cgcaaccatt gagcgcgcag gcgcagtcag tgctcacttt tagtgatttt 120gcgctcaccg cgcaaccatt gagcgcgcag gcgcagtcag tgctcacttt tagtgatttt 120
gttcaggaca gcatcatcgt gcatcctgag tggctggcag agcttgaaag cgcaccgccg 180gttcaggaca gcatcatcgt gcatcctgag tggctggcag agcttgaaag cgcaccgccg 180
ccagcgaacg agtggcaaca ctacgcgcaa tggctgcaag cggcgctgga gggcgtcacc 240ccagcgaacg agtggcaaca ctacgcgcaa tggctgcaag cggcgctgga gggcgtcacc 240
gatgaaacct cgctgatgcg cacgctgcgg ctgtttcgcc gtcgcattat ggtgcgcatc 300gatgaaacct cgctgatgcg cacgctgcgg ctgtttcgcc gtcgcattat ggtgcgcatc 300
gcctggagtc aggcgctaca gttggtggcg gaagaggata tcctgcaaca gctcagcgtg 360gcctggagtc aggcgctaca gttggtggcg gaagaggata tcctgcaaca gctcagcgtg 360
ctggcggaaa ctctgatcgt cgccgcgcgc gactggctct atgacgcctg ctgccgtgag 420ctggcggaaa ctctgatcgt cgccgcgcgc gactggctct atgacgcctg ctgccgtgag 420
tggggaacgc cgtgcaatcc gcaaggcgtc gcgcagccga tgctggtgct cggcatgggc 480tggggaacgc cgtgcaatcc gcaaggcgtc gcgcagccga tgctggtgct cggcatggggc 480
aaacttggcg gcggcgaact caatttctca tccgatatcg atttgatttt tgcctggccg 540aaacttggcg gcggcgaact caatttctca tccgatatcg atttgatttt tgcctggccg 540
gaaaatggca ccacgcgcgg cggacgccgt gaactggata acgcgcagtt ttttacccgc 600gaaaatggca ccacgcgcgg cggacgccgt gaactggata acgcgcagtt ttttacccgc 600
cttggtcaac ggctaattaa agtcctcgac cagcccacgc aggatggctt tgtctaccgc 660cttggtcaac ggctaattaa agtcctcgac cagccccgc aggatggctt tgtctaccgc 660
gtcgatatgc gcttgcgtcc ctttggcgac agcggcccgc tggtgctgag ttttgccgcg 720gtcgatatgc gcttgcgtcc ctttggcgac agcggcccgc tggtgctgag ttttgccgcg 720
ctggaagatt actaccagga gcaggggcgc gactgggaac gatacgcgat ggtgaaagcg 780ctggaagatt actaccagga gcaggggcgc gactgggaac gatacgcgat ggtgaaagcg 780
cgcattatgg gggacaacga cggcgaccat gcgcgagagt tgcgcgccat gctgcgcccg 840cgcattatgg gggacaacga cggcgaccat gcgcgagagt tgcgcgccat gctgcgcccg 840
ttcgttttcc gccgctatat cgacttcagc gtgatccagt ctctgcgcaa catgaaaggc 900ttcgttttcc gccgctatat cgacttcagc gtgatccagt ctctgcgcaa catgaaaggc 900
atgattgccc gcgaagtgcg gcgtcgcggc ctgaaggaca acataaaact cggcgcgggc 960atgattgccc gcgaagtgcg gcgtcgcggc ctgaaggaca acataaaact cggcgcgggc 960
ggtattcgcg aaatagagtt tatcgtgcag gttttccagt tgattcgcgg cggtcgcgag 1020ggtattcgcg aaatagagtt tatcgtgcag gttttccagt tgattcgcgg cggtcgcgag 1020
cctgcgctgc aatcgcgttc gctgttgccg acgcttgctg ccattgatca actacatctg 1080cctgcgctgc aatcgcgttc gctgttgccg acgcttgctg ccattgatca actacatctg 1080
ctgccggatg gtgatgcacc ccggctgcgc gaggcgtatt tgtggctgcg acggctggaa 1140ctgccggatg gtgatgcacc ccggctgcgc gaggcgtatt tgtggctgcg acggctggaa 1140
aacttgctgc aaagcattaa tgacgaacag acacagacgc tgccggccga tgatttgaat 1200aacttgctgc aaagcattaa tgacgaacag aacacagacgc tgccggccga tgatttgaat 1200
cgcgcgcgcc tcgcctgggg aatgggcaaa gagagctggg aagcgctctg cgaaacgctg 1260cgcgcgcgcc tcgcctgggg aatgggcaaa gagagctggg aagcgctctg cgaaacgctg 1260
gaagcgcata tgtcggcggt gcggcagatt ttcaacgatc tgattggcga tgatgaaacg 1320gaagcgcata tgtcggcggt gcggcagatt ttcaacgatc tgattggcga tgatgaaacg 1320
gattcgccgg aagatgcgct ttctgagggc tggcgcgaat tgtggcagga tgcgttgcag 13801380
gaagaggact ctacgcccgt gctggcgcat ctttccgagg acgatcgccg ccgcgtggtg 1440gaagaggact ctacgcccgt gctggcgcat ctttccgagg acgatcgccg ccgcgtggtg 1440
gcgctgattg ctgattttcg caaagagctg gataaacgca ccattggccc gcgcgggcga 1500gcgctgattg ctgattttcg caaagagctg gataaacgca ccattggccc gcgcgggcga 1500
caggtactcg atcacttaat gccgcatctg ctcagcgatg tatgctcgcg tgacgatgcg 1560caggtactcg atcacttaat gccgcatctg ctcagcgatg tatgctcgcg tgacgatgcg 1560
ccagtgccgc tgtcgcgtct gacgccgctg ctcaccggta ttattacgcg caccacttac 1620ccagtgccgc tgtcgcgtct gacgccgctg ctcaccggta ttattacgcg caccacttac 1620
cttgagctgc tgagtgaatt ccccggtgcg ctgaaacacc tcatttccct gtgcgccgcg 1680cttgagctgc tgagtgaatt ccccggtgcg ctgaaacacc tcatttccct gtgcgccgcg 1680
tcgccgatgg tggccagcca actggcgcgc tacccgatcc tgctcgatga actgctcgac 1740tcgccgatgg tggccagcca actggcgcgc tacccgatcc tgctcgatga actgctcgac 1740
ccgaacacgc tctatcaacc gacggcgatg aacgcctatc gcgatgaact gcgacaatac 1800ccgaacacgc tctatcaacc gacggcgatg aacgcctatc gcgatgaact gcgacaatac 1800
ctgttgcgcg tgccggaaga ggatgaagag cagcaactgg aggcgctacg gcagtttaag 1860ctgttgcgcg tgccggaaga ggatgaagag cagcaactgg aggcgctacg gcagtttaag 1860
caggcgcagt tgttgcgcgt agcggcggcg gatatcgccg gtacgttacc cgtcatgaaa 1920caggcgcagt tgttgcgcgt agcggcggcg gatatcgccg gtacgttacc cgtcatgaaa 1920
gtgagcgatc acttaacctg gctggcggaa gcgattatcg atgcggtggt gcagcaagcc 1980gtgagcgatc acttaacctg gctggcggaa gcgattatcg atgcggtggt gcagcaagcc 1980
tggaaccaga tggtggcgcg ttacggccag ccgacgcatc tgcacgatcg cgaagggcgc 2040tggaaccaga tggtggcgcg ttacggccag ccgacgcatc tgcacgatcg cgaagggcgc 2040
ggtttcgccg tggtcggtta cggcaaactt ggcggctggg aattaggtta cagctccgat 2100ggtttcgccg tggtcggtta cggcaaactt ggcggctggg aattaggtta cagctccgat 2100
ctggatctgg tgttcctgca cgactgcccc atggatgtga tgaccgatgg cgagcgtgaa 2160ctggatctgg tgttcctgca cgactgcccc atggatgtga tgaccgatgg cgagcgtgaa 2160
atcgatggcc gccagttcta tttgcgcctc gcgcagcgcg tgatgcacct gttcagcacg 2220atcgatggcc gccagttcta tttgcgcctc gcgcagcgcg tgatgcacct gttcagcacg 2220
cgcacgtcgt ccggcattct ttatgaagtc gatgcgcgtt tgcgcccgtc cggcgcggcc 2280cgcacgtcgt ccggcattct ttatgaagtc gatgcgcgtt tgcgcccgtc cggcgcggcc 2280
ggaatgctgg tgaccactgc ggaagcgttc gccgattatc aaaaaaatga agcctggaca 2340ggaatgctgg tgaccactgc ggaagcgttc gccgattatc aaaaaaatga agcctggaca 2340
tgggagcatc aggcgctggc gcgtgcgcgc gtggtgtacg gcgatccgca actgaccgcc 2400tgggagcatc aggcgctggc gcgtgcgcgc gtggtgtacg gcgatccgca actgaccgcc 2400
gaatttgacg ccattcgccg cgatatcctg atgacctccc gcgatgccgc taccctgcaa 2460gaatttgacg ccattcgccg cgatatcctg atgacctccc gcgatgccgc taccctgcaa 2460
accgaagtgc gggaaatgcg tgagaaaatg cgcgcccatc ttggtaacaa gcacaaagac 2520accgaagtgc gggaaatgcg tgagaaaatg cgcgcccatc ttggtaacaa gcacaaagac 2520
cgtttcgatc tgaaagccga tgaaggcggt atcaccgata ttgagtttat cgctcagtat 25802580
ctggtgctgc gctttgccca tgagaagccg aaactgacgc gctggtcgga taatgtgcgc 2640ctggtgctgc gctttgccca tgagaagccg aaactgacgc gctggtcgga taatgtgcgc 2640
atcctcgaag ggctggcgca aaacggcatc atggatgagc aggaagcgca ggcattgacg 2700atcctcgaag ggctggcgca aaacggcatc atggatgagc aggaagcgca ggcattgacg 2700
ctggcgtaca ccacgttgcg tgatgagctg caccacctgg cgctgcaaga gctgccagga 2760ctggcgtaca ccacgttgcg tgatgagctg caccacctgg cgctgcaaga gctgccagga 2760
catgtggcgc tctcctgttt tgtcgccgag cgtgcgctta tcaaaaccag ctgggacaag 2820catgtggcgc tctcctgttt tgtcgccgag cgtgcgctta tcaaaaccag ctgggacaag 2820
tggctggtgg aaccgtgcgc cccggcgtaa 2850tggctggtgg aaccgtgcgc cccggcgtaa 2850
<210> 145<210> 145
<211> 1287<211> 1287
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia pseudosacchari<213> Kosakonia pseudosacchari
<220><220>
<223> amtB<223> amtB
<400> 145<400> 145
atgaaaaaca caacattaaa aacggctctt gcttcgctgg cgttgctgcc aggcctggcg 60atgaaaaaca caacattaaa aacggctctt gcttcgctgg cgttgctgcc aggcctggcg 60
atggcggctc ccgctgtggc ggataaagcc gacaacggct ttatgatgat ttgcaccgcg 120atggcggctc ccgctgtggc ggataaagcc gacaacggct ttatgatgat ttgcaccgcg 120
ctggtgctgt ttatgaccat tccgggcatt gcgctgttct acggcggttt gatccgcggt 180ctggtgctgt ttatgaccat tccgggcatt gcgctgttct acggcggttt gatccgcggt 180
aaaaacgtgc tgtcgatgct gacgcaggtt gccgtcacct tcgctctggt gtgcatcctg 240aaaaacgtgc tgtcgatgct gacgcaggtt gccgtcacct tcgctctggt gtgcatcctg 240
tgggtggttt acggctactc tctggcattt ggcgagggca acagcttctt cggcagtttc 300tgggtggttt acggctactc tctggcattt ggcgagggca acagcttctt cggcagtttc 300
aactgggcga tgttgaaaaa catcgaattg aaagccgtga tgggcagcat ttatcagtac 360aactgggcga tgttgaaaaa catcgaattg aaagccgtga tgggcagcat ttatcagtac 360
atccacgtgg cgttccaggg ctcctttgct tgtatcaccg ttggcctgat tgtcggtgcg 420atccacgtgg cgttccaggg ctcctttgct tgtatcaccg ttggcctgat tgtcggtgcg 420
ctggctgagc gtattcgctt ctctgcggtg ctgatttttg tggtggtatg gctgacgctt 480ctggctgagc gtattcgctt ctctgcggtg ctgatttttg tggtggtatg gctgacgctt 480
tcttatgtgc cgattgcgca catggtctgg ggtggcggtc tgctggcaac ccacggcgcg 540tcttatgtgc cgattgcgca catggtctgg ggtggcggtc tgctggcaac ccacggcgcg 540
ctggatttcg cgggcggtac ggttgttcac atcaacgccg cgatcgcagg tctggtgggg 600ctggatttcg cgggcggtac ggttgttcac atcaacgccg cgatcgcagg tctggtgggg 600
gcttacctga ttggcaaacg cgtgggcttt ggcaaagaag cgttcaaacc gcataacctg 660gcttacctga ttggcaaacg cgtgggcttt ggcaaagaag cgttcaaacc gcataacctg 660
ccgatggtct tcaccggcac cgcgatcctc tatgttggct ggtttggctt caacgccggc 720ccgatggtct tcaccggcac cgcgatcctc tatgttggct ggtttggctt caacgccggc 720
tctgcaagct cggcgaacga aatcgctgcg ctggctttcg tgaacacggt tgttgccact 780tctgcaagct cggcgaacga aatcgctgcg ctggctttcg tgaacacggt tgttgccact 780
gcggccgcta ttctggcgtg ggtatttggc gagtgggcaa tgcgcggtaa gccgtctctg 840gcggccgcta ttctggcgtg ggtatttggc gagtgggcaa tgcgcggtaa gccgtctctg 840
ctcggtgcct gttctggtgc catcgcgggt ctggttggta tcaccccggc gtgcggttat 900ctcggtgcct gttctggtgc catcgcgggt ctggttggta tcaccccggc gtgcggttat 900
gtgggtgtcg gcggcgcgct gattgtgggt ctgattgccg gtctggcagg gctgtggggc 960gtgggtgtcg gcggcgcgct gattgtgggt ctgattgccg gtctggcagg gctgtggggc 960
gttactgcac tgaaacgtat gttgcgtgtt gatgacccat gcgatgtctt cggtgtgcac 1020gttactgcac tgaaacgtat gttgcgtgtt gatgacccat gcgatgtctt cggtgtgcac 1020
ggcgtgtgcg gcatcgtggg ttgtatcctg accggtatct tcgcgtctac gtcgctgggc 1080ggcgtgtgcg gcatcgtggg ttgtatcctg accggtatct tcgcgtctac gtcgctgggc 1080
ggtgtcggtt tcgctgaagg ggtgaccatg ggccatcagg tactggtaca gctggaaagc 1140ggtgtcggtt tcgctgaagg ggtgaccatg ggccatcagg tactggtaca gctggaaagc 1140
gttgccatca ctatcgtgtg gtctggcgtg gtggccttta tcggttacaa actggcggat 1200gttgccatca ctatcgtgtg gtctggcgtg gtggccttta tcggttacaa actggcggat 1200
atgacggtag gcctgcgcgt accggaagag caagagcgtg aagggctgga tgtgaacagc 1260atgacggtag gcctgcgcgt accggaagag caagagcgtg aagggctgga tgtgaacagc 1260
cacggcgaaa atgcgtataa cgcctga 1287cacggcgaaa atgcgtataa cgcctga 1287
<210> 146<210> 146
<211> 500<211> 500
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia pseudosacchari<213> Kosakonia pseudosacchari
<220><220>
<223> PinfC<223> PinfC
<400> 146<400> 146
ttcttggttc tctggagcgc tttatcggca tcctgactga agaatttgca ggcttcttcc 60ttcttggttc tctggagcgc tttatcggca tcctgactga agaatttgca ggcttcttcc 60
caacctggct tgcacccgtg caggtagttg tgatgaacat cactgattcg caggctgaat 120caacctggct tgcacccgtg caggtagttg tgatgaacat cactgattcg caggctgaat 120
acgttaacga attgacccgt aaactgcaaa atgcgggcat tcgtgtaaaa gcagacttga 180acgttaacga attgacccgt aaactgcaaa atgcgggcat tcgtgtaaaa gcagacttga 180
gaaacgagaa gattggcttt aaaatccgcg agcacacttt acgtcgtgtc ccttatatgc 240gaaacgagaa gattggcttt aaaatccgcg agcacacttt acgtcgtgtc ccttatatgc 240
tggtttgtgg tgacaaagag gtcgaagccg gcaaagttgc tgtgcgtacc cgtcgcggta 300tggtttgtgg tgacaaagag gtcgaagccg gcaaagttgc tgtgcgtacc cgtcgcggta 300
aagacctggg tagcctggac gtaaatgatg ttatcgagaa gctgcaacaa gagattcgca 360aagacctggg tagcctggac gtaaatgatg ttatcgagaa gctgcaacaa gagattcgca 360
gccgcagtct tcaacaactg gaggaataag gtattaaagg cggaaaacga gttcaaacgg 420gccgcagtct tcaacaactg gaggaataag gtattaaagg cggaaaacga gttcaaacgg 420
cgcgtcccaa tcgtattaat ggcgagattc gcgccacgga agttcgctta acaggtctgg 480cgcgtcccaa tcgtattaat ggcgagattc gcgccacggga agttcgctta acaggtctgg 480
aaggcgagca gcttggtatt 500aaggcgagca gcttggtatt 500
<210> 147<210> 147
<211> 348<211> 348
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia pseudosacchari<213> Kosakonia pseudosacchari
<220><220>
<223> Prm1<223> Prm1
<400> 147<400> 147
cgttctgtaa taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt 60cgttctgtaa taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt 60
ttttatattc tcgactccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg 120ttttatattc tcgactccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg 120
gccattatct aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt 180gccattatct aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt 180
ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa 240ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa 240
aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc 300aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc 300
aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgc 348aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgc 348
<210> 148<210> 148
<211> 339<211> 339
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia pseudosacchari<213> Kosakonia pseudosacchari
<220><220>
<223> Prm7<223> Prm7
<400> 148<400> 148
cgcgtcaggt tgaacgtaaa aaagtcggtc tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct 60cgcgtcaggt tgaacgtaaa aaagtcggtc tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct 60
ccaaacgtta attggtttct gcttcggcag aacgattggc gaaaaaaccc ggtgcgaacc 120ccaaacgtta attggtttct gcttcggcag aacgattggc gaaaaaaccc ggtgcgaacc 120
gggttttttt atggataaag atcgtgttat ccacagcaat ccattgatta tctcttcttt 180gggttttttt atggataaag atcgtgttat ccacagcaat ccattgatta tctcttcttt 180
ttcagcattt ccagaatccc ctcaccacaa agcccgcaaa atctggtaaa ctatcatcca 240ttcagcattt ccagaatccc ctcaccacaa agcccgcaaa atctggtaaa ctatcatcca 240
attttctgcc caaatggctg ggattgttca ttttttgttt gccttacaac gagagtgaca 300attttctgcc caaatggctg ggattgttca ttttttgttt gccttacaac gagagtgaca 300
gtacgcgcgg gtagttaact caacatctga ccggtcgat 339gtacgcgcgg gtagttaact caacatctga ccggtcgat 339
<210> 149<210> 149
<211> 1538<211> 1538
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> 16S<223> 16S
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (62)..(62)<222> (62)..(62)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (265)..(265)<222> (265)..(265)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (457)..(457)<222> (457)..(457)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (469)..(469)<222> (469)..(469)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (539)..(539)<222> (539)..(539)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (551)..(552)<222> (551)..(552)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (559)..(559)<222> (559)..(559)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (561)..(561)<222> (561)..(561)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (576)..(576)<222> (576)..(576)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (587)..(587)<222> (587)..(587)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (591)..(591)<222> (591)..(591)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (655)..(657)<222> (655)..(657)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (665)..(665)<222> (665)..(665)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (678)..(678)<222> (678)..(678)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (706)..(706)<222> (706)..(706)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (710)..(710)<222> (710)..(710)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (714)..(714)<222> (714)..(714)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (718)..(718)<222> (718)..(718)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (735)..(735)<222> (735)..(735)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (755)..(755)<222> (755)..(755)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (759)..(759)<222> (759)..(759)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (796)..(796)<222> (796)..(796)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (1006)..(1007)<222> (1006)..(1007)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (1016)..(1017)<222> (1016)..(1017)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (1133)..(1133)<222> (1133)..(1133)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 149<400> 149
ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60
gngcggaagc acaggagagc ttgctctctg ggtgacgagc ggcggacggg tgagtaatgt 120gngcggaagc acaggagagc ttgctctctg ggtgacgagc ggcggacggg tgagtaatgt 120
ctgggaaact gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataac 180ctgggaaact gcctgatgga gggggataac tactggaaac ggtagctaat accgcataac 180
gtcgcaagac caaagagggg gaccttcggg cctcttgcca tcagatgtgc ccagatggga 240gtcgcaagac caaagagggg gaccttcgggg cctcttgcca tcagatgtgc ccagatggga 240
ttagctagta ggtggggtaa cggcncacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga 300ttagctagta ggtggggtaa cggcncacct aggcgacgat ccctagctgg tctgagagga 300
tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga 360tgaccagcca cactggaact gagacacggt ccagactcct acgggaggca gcagtgggga 360
atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag aaggccttcg 420atattgcaca atgggcgcaa gcctgatgca gccatgccgc gtgtatgaag aaggccttcg 420
ggttgtaaag tactttcagc ggggaggaag gtgttgnggt taataaccnc agcaattgac 480ggttgtaaag tactttcagc ggggaggaag gtgttgnggt taataaccnc agcaattgac 480
gttacccgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggnt 540gttacccgca gaagaagcac cggctaactc cgtgccagca gccgcggtaa tacggaggnt 540
gcaagcgtta nncggaatna ntgggcgtaa agcgtncgca ggcggtntgt naagtcggat 600gcaagcgtta nncggaatna ntgggcgtaa agcgtncgca ggcggtntgt naagtcggat 600
gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggcta gagtnnngta 660gtgaaatccc cgggctcaac ctgggaactg cattcgaaac tggcaggcta gagtnnngta 660
gaggngggta gaattccngg tgtagcggtg aaatgcgtag agatcnggan gaanaccngt 720gaggngggta gaattccngg tgtagcggtg aaatgcgtag agatcnggan gaanaccngt 720
ggcgaaggcg gcccnctgga caaagactga cgctnaggng cgaaagcgtg gggagcaaac 780ggcgaaggcg gcccnctgga caaagactga cgctnaggng cgaaagcgtg gggagcaaac 780
aggattagat accctngtag tccacgccgt aaacgatgtc gacttggagg ttgtgccctt 840aggattagat accctngtag tccacgccgt aaacgatgtc gacttggagg ttgtgccctt 840
gaggcgtggc ttccggagct aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg 900gaggcgtggc ttccggagct aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg 900
ttaaaactca aatgaattga cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg 960ttaaaactca aatgaattga cggggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg 960
atgcaacgcg aagaacctta cctactcttg acatccagag aacttnncag agatgnnttg 1020atgcaacgcg aagaacctta cctactcttg acatccagag aacttnncag agatgnnttg 1020
gtgccttcgg gaactctgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat 1080gtgccttcgg gaactctgag acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat 1080
gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc cttatccttt gttgccagcg gtncggccgg 11401140
gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc 1200gaactcaaag gagactgcca gtgataaact ggaggaaggt ggggatgacg tcaagtcatc 1200
atggccctta cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc gcatacaaag agaagcgacc 1260atggccctta cgagtagggc tacacacgtg ctacaatggc gcatacaaag agaagcgacc 1260
tcgcgagagc aagcggacct cataaagtgc gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg 1320tcgcgagagc aagcggacct cataaagtgc gtcgtagtcc ggattggagt ctgcaactcg 1320
actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tagatcagaa tgctacggtg aatacgttcc 1380actccatgaa gtcggaatcg ctagtaatcg tagatcagaa tgctacggtg aatacgttcc 1380
cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagtggg ttgcaaaaga agtaggtagc 14401440
ttaaccttcg ggagggcgct taccactttg tgattcatga ctggggtgaa gtcgtaacaa 1500ttaaccttcg ggagggcgct taccactttg tgattcatga ctggggtgaa gtcgtaacaa 1500
ggtaaccgta ggggaacctg cggttggatc acctcctt 1538ggtaaccgta ggggaacctg cggttggatc acctcctt 1538
<210> 150<210> 150
<211> 882<211> 882
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> nifH<223> nifH
<400> 150<400> 150
atgaccatgc gtcaatgtgc catttacggc aaaggtggta tcggtaaatc cactaccacg 60atgaccatgc gtcaatgtgc catttacggc aaaggtggta tcggtaaatc cactaccacg 60
caaaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggcaagaaag taatgatcgt cggctgcgac 120caaaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggcaagaaag taatgatcgt cggctgcgac 120
ccgaaagcag actccactcg tctgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180ccgaaagcag actccactcg tctgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180
atggcggctg aagtcggctc cgtggaagac cttgaactgg aagatgtgct gcaaatcggt 240atggcggctg aagtcggctc cgtggaagac cttgaactgg aagatgtgct gcaaatcggt 240
tacggcgacg tacgctgcgc agaatccggc ggcccggaac caggcgttgg ctgtgctggt 300tacggcgacg tacgctgcgc agaatccggc ggcccggaac caggcgttgg ctgtgctggt 300
cgcggggtaa ttaccgccat caacttcctg gaagaagaag gcgcctatgt tcccgacctc 360cgcggggtaa ttaccgccat caacttcctg gaagaagaag gcgcctatgt tcccgacctc 360
gatttcgtct tttacgacgt gttgggcgac gtggtgtgcg gggggttcgc catgccgatt 420gatttcgtct gttacgacgt gttgggcgac gtggtgtgcg gggggttcgc catgccgatt 420
cgcgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtctgctccg gcgaaatgat ggcgatgtac 480cgcgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtctgctccg gcgaaatgat ggcgatgtac 480
gccgccaaca acatctctaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggcaa agtgcgcctt 540gccgccaaca acatctctaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggcaa agtgcgcctt 540
ggcgggctga tctgtaactc ccgtcagacc gaccgcgaag atgagctgat catagcgctg 600ggcgggctga tctgtaactc ccgtcagacc gaccgcgaag atgagctgat catagcgctg 600
gcggaaaaac tcggcaccca gatgatccac ttcgtgccgc gcgacaacat cgtgcaacgc 660gcggaaaaac tcggcaccca gatgatccac ttcgtgccgc gcgacaacat cgtgcaacgc 660
gctgaaatcc gccgtatgac ggtgattgag tacgatccga aatgcaacca ggccaatgaa 720gctgaaatcc gccgtatgac ggtgattgag tacgatccga aatgcaacca ggccaatgaa 720
taccgcacgc tggcgaacaa gatcgtcaac aacaccaaaa tggtcgtgcc aacgcccatc 780taccgcacgc tggcgaacaa gatcgtcaac aacaccaaaa tggtcgtgcc aacgcccatc 780
accatggacg aactggaaga gctgttgatg gaattcggca ttatggatgt ggaagacacc 840accatggacg aactggaaga gctgttgatg gaattcggca ttatggatgt ggaagacacc 840
agcattatcg gtaaaaccgc cgcagaagaa aacgcggttt ga 882agcattatcg gtaaaaccgc cgcagaagaa aacgcggttt ga 882
<210> 151<210> 151
<211> 1449<211> 1449
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> nifD1<223> nifD1
<400> 151<400> 151
atgagcaatg caacaggcga acgtaatctg gagatcatcc aggaagtgct ggagatcttt 60atgagcaatg caacaggcga acgtaatctg gagatcatcc aggaagtgct ggagatcttt 60
ccggaaaaaa cgcgcaaaga acgcagaaag cacatgatgg tgagcgaccc ggagatggaa 120ccggaaaaaa cgcgcaaaga acgcagaaag cacatgatgg tgagcgaccc ggagatggaa 120
agcgtcggga aatgcatcat ctccaaccgt aagtcgcagc ccggcgtaat gaccgtgcgc 180agcgtcggga aatgcatcat ctccaaccgt aagtcgcagc ccggcgtaat gaccgtgcgc 180
ggttgctctt acgccggttc taaaggggtg gtattcgggc cgatcaaaga tatggcccat 240ggttgctctt acgccggttc taaaggggtg gtattcgggc cgatcaaaga tatggcccat 240
atttcccacg gcccggtcgg ctgcggtcag tactcccgcg ccgggcggcg taactactac 300atttccccg gcccggtcgg ctgcggtcag tactcccgcg ccgggcggcg taactactac 300
accggcgtca gcggtgtgga tagcttcggt acgctcaact ttacctccga ttttcaggag 360accggcgtca gcggtgtgga tagcttcggt acgctcaact ttacctccga ttttcaggag 360
cgcgatatcg tgtttggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgattgaaga gatggagacg 420cgcgatatcg tgtttggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgattgaaga gatggagacg 420
ctgttcccgc tgaccaaagg gatctccatt cagtccgaat gcccggtcgg cctgattggc 480ctgttcccgc tgaccaaagg gatctccatt cagtccgaat gcccggtcgg cctgattggc 480
gacgacattg aagccgttgc caacgccagc cgcaaagcca tcaataaacc ggtcattccg 540gacgacattg aagccgttgc caacgccagc cgcaaagcca tcaataaacc ggtcattccg 540
gtgcgctgcg aaggttttcg cggcgtttcc cagtcactcg gtcaccacat tgccaacgac 600gtgcgctgcg aaggttttcg cggcgtttcc cagtcactcg gtcaccacat tgccaacgac 600
gtgatccgcg actgggtact ggataaccgc gaaggcaagc cgtttgaggc cggtccttat 660gtgatccgcg actgggtact ggataaccgc gaaggcaagc cgtttgaggc cggtccttat 660
gacgtggcga tcatcggcga ttacaacatc ggcggcgatg cctgggcgtc gcgcattttg 720720
ctcgaagaga tgggcctgcg cgtggtggcg cagtggtccg gcgacggcac gctggttgag 780ctcgaagaga tgggcctgcg cgtggtggcg cagtggtccg gcgacggcac gctggttgag 780
atggagaaca cgccgttcgt caaactcaac cttgtgcact gctaccgctc aatgaactat 840atggagaaca cgccgttcgt caaactcaac cttgtgcact gctaccgctc aatgaactat 840
atctcccgcc atatggagga gaaacacggt attccgtgga tggagtacaa cttcttcggt 900atctcccgcc atatggagga gaaacacggt attccgtgga tggagtacaa cttcttcggt 900
ccgaccaaag tcgccgaatc gttgcgcaaa atcgccgata tgtttgatga caccattcgc 960ccgaccaaag tcgccgaatc gttgcgcaaa atcgccgata tgtttgatga caccattcgc 960
gccaacgccg aagcggtgat cgccaaatat caggcgcaga acgacgccat catcgccaaa 1020gccaacgccg aagcggtgat cgccaaatat caggcgcaga acgacgccat catcgccaaa 1020
taccgtccgc gtctggaagg ccgcaaagtg ctgctgtata tgggcggttt acgtcctcgc 1080taccgtccgc gtctggaagg ccgcaaagtg ctgctgtata tgggcggttt acgtcctcgc 1080
catgtgattg gcgcttatga agatctgggg atggaaatta tcgctgcggg ttatgaattc 1140catgtgattg gcgcttatga agatctgggg atggaaatta tcgctgcggg ttatgaattc 1140
gcccacaacg atgactacga ccgcaccctg ccggatctga aagaaggcac cttgctgttc 1200gcccacaacg atgactacga ccgcaccctg ccggatctga aagaaggcac cttgctgttc 1200
gacgatgcca gcagttatga actggaagcc tttgtcaaag cgctgaagcc ggatctgatc 1260gacgatgcca gcagttatga actggaagcc tttgtcaaag cgctgaagcc ggatctgatc 1260
ggctccggca ttaaagagaa gtacatcttc cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320ggctccggca ttaaagagaa gtacatcttc cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320
cactcctggg attactccgg cccctatcac ggttatgacg gctttgccat cttcgcccgc 1380cactcctggg attactccgg cccctatcac ggttatgacg gctttgccat cttcgcccgc 1380
gatatggata tgacgatcaa caaccccgcg tggggccagt tgaccgcgcc gtggctgaaa 14401440
tccgcctga 1449tccgcctga 1449
<210> 152<210> 152
<211> 1092<211> 1092
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> nifD2<223> nifD2
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (709)..(709)<222> (709)..(709)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 152<400> 152
atgggacgcg gcgagcgccg cctgttccat gccgtgcgcc acatcgtcaa ccgctaccac 60atgggacgcg gcgagcgccg cctgttccat gccgtgcgcc acatcgtcaa ccgctaccac 60
ccggccgccg tctttatcta taacacctgc gttcccgcga tggagggcga cgatatcgaa 120ccggccgccg tctttatcta taacacctgc gttcccgcga tggagggcga cgatatcgaa 120
gccgtctgcc aggcggcaga aaccgccatc ggcgtaccgg tgattgccgt tgatgtcgcc 180gccgtctgcc aggcggcaga aaccgccatc ggcgtaccgg tgattgccgt tgatgtcgcc 180
gggttttacg gcagcaaaaa tctcggcaac cggttggccg gtgaagtgat ggtgaaaaag 240gggttttacg gcagcaaaaa tctcggcaac cggttggccg gtgaagtgat ggtgaaaaag 240
gtgattggcg ggcgtgaacc cgcgccgtgg ccggaagata ccccttttgc cccggcgcac 300gtgattggcg ggcgtgaacc cgcgccgtgg ccggaagata ccccttttgc cccggcgcac 300
cgccacgata tcgggctgat tggcgaattc aatattgccg gagagttctg gcatattcag 360cgccacgata tcgggctgat tggcgaattc aatattgccg gagagttctg gcatattcag 360
ccgctgctcg atgagctggg tattcgcgtg ctcggcagcc tctccggcga cgggcgcttc 420ccgctgctcg atgagctggg tattcgcgtg ctcggcagcc tctccggcga cgggcgcttc 420
agtgaaatcc agacgctgca ccgggcgcag gtcaatatgc tggtctgctc cagggcgctg 480agtgaaatcc agacgctgca ccgggcgcag gtcaatatgc tggtctgctc cagggcgctg 480
atcaacgtcg cccgctcgct ggagcagcgc tacggcacgc cgtggtttga aggcagtttt 540atcaacgtcg cccgctcgct ggagcagcgc tacggcacgc cgtggtttga aggcagtttt 540
tatggtgttc gcgccacctc tgacgccctg cgccaactgg cggcgctgac cggagaccgc 600tatggtgttc gcgccacctc tgacgccctg cgccaactgg cggcgctgac cggagaccgc 600
gatctgatgc agcgcaccga acagctcatt gcccgcgaag agcagcaaac agagcaggcg 660gatctgatgc agcgcaccga acagctcatt gcccgcgaag agcagcaaac agagcaggcg 660
ctggccccgc tgcgcgagcg cctgcgcggg cgcaaagcgc tgctctatnc cggcggcgtg 720ctggccccgc tgcgcgagcg cctgcgcggg cgcaaagcgc tgctctatnc cggcggcgtg 720
aaatcctggt cggtggtttc ggcgcttcag gatctgggca tggaagtggt ggcgaccggc 780aaatcctggt cggtggtttc ggcgcttcag gatctgggca tggaagtggt ggcgaccggc 780
acgcgcaaat ccaccgaaga ggataaacag cgcatccgcg aactgatggg cgccgacgcg 840acgcgcaaat ccaccgaaga ggataaacag cgcatccgcg aactgatggg cgccgacgcg 840
ctgatgcttg atgaaggtaa cgcccgctcg ctgctggacg tggtttaccg ctacaaggcg 900ctgatgcttg atgaaggtaa cgccgctcg ctgctggacg tggtttaccg ctacaaggcg 900
gacatgatga tcgccggggg acgcaatatg tacaccgcct acaaagcgcg gctgccgttc 960gacatgatga tcgccggggg acgcaatatg tacaccgcct acaaagcgcg gctgccgttc 960
ctcgatatca atcaggagcg cgagcacgcc tttgccggct accgcggcat tgtcaccctg 1020ctcgatatca atcaggagcg cgagcacgcc tttgccggct accgcggcat tgtcaccctg 1020
gccgaacagc tctgcctgac catggaaagc ccggtctggc cgcaaaccca ttcccgcgca 1080gccgaacagc tctgcctgac catggaaagc ccggtctggc cgcaaaccca ttcccgcgca 1080
ccgtggcaat aa 1092ccgtggcaat aa 1092
<210> 153<210> 153
<211> 846<211> 846
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> nifK<223> nifK
<400> 153<400> 153
atgatggagc aaatggacgt gccgtgcagc ctgctttccg atccctccga agtgctggat 60atgatggagc aaatggacgt gccgtgcagc ctgctttccg atccctccga agtgctggat 60
accccggctg acgggcatta ccacatgtat gcgggcggta cgacccagca ggagatgcgc 120accccggctg acgggcatta ccacatgtat gcgggcggta cgacccagca ggagatgcgc 120
gaagcgcctg acgctatcga caccctgctg ctgcaaccct ggcaactggt gaaaaccaaa 180gaagcgcctg acgctatcga caccctgctg ctgcaaccct ggcaactggt gaaaaccaaa 180
aaagtggtgc aggaaagctg gaaccagccc gctaccgagg tgcaaatccc aatggggctg 240aaagtggtgc aggaaagctg gaaccagccc gctaccgagg tgcaaatccc aatggggctg 240
gccggaaccg acgagctgct gatgacggta agccagttaa ccggcaaagc cattccggat 300gccggaaccg acgagctgct gatgacggta agccagttaa ccggcaaagc cattccggat 300
agcttagcgc tggaacgcgg tcggctggtg gatatgatgc tcgactccca cacctggctg 360agcttagcgc tggaacgcgg tcggctggtg gatatgatgc tcgactccca cacctggctg 360
cacggcaaga aattcggcct gttcggtgac ccggattttg tcatggggct gacccgcttc 420cacggcaaga aattcggcct gttcggtgac ccggattttg tcatggggct gacccgcttc 420
ctgctggaac tgggctgcga accgacggtg attctgtgcc ataacggcag caagcgctgg 480ctgctggaac tgggctgcga accgacggtg attctgtgcc ataacggcag caagcgctgg 480
cagaaagcga tgaagaaaat gcttgaagcc tcgccgtacg ggaaagagag cgaagtcttt 540cagaaagcga tgaagaaaat gcttgaagcc tcgccgtacg ggaaagagag cgaagtcttt 540
atcaactgcg atttgtggca tttccgctcg ctgatgttta cccgtcagcc ggactttatg 600atcaactgcg atttgtggca tttccgctcg ctgatgttta cccgtcagcc ggactttatg 600
atcggcaact cctacgccaa gtttatccag cgcgatacgc tggcgaaggg tgagcagttt 660atcggcaact cctacgccaa gtttatccag cgcgatacgc tggcgaaggg tgagcagttt 660
gaagtgccgc tgatccgcct ggggttcccg ctgttcgatc gccaccatct gcaccgccag 720gaagtgccgc tgatccgcct ggggttcccg ctgttcgatc gccaccatct gcaccgccag 720
accacctggg gttacgaagg ggccatgagt atcctcacca cgctggttaa tgcggtgctg 780accacctggg gttacgaagg ggccatgagt atcctcacca cgctggttaa tgcggtgctg 780
gagaaagtcg acagagagac catcaagctc ggcaaaaccg actacagctt cgatcttatc 840gagaaagtcg acagagagac catcaagctc ggcaaaaccg actacagctt cgatcttatc 840
cgttaa 846cgttaa 846
<210> 154<210> 154
<211> 1095<211> 1095
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> nifL<223> nifL
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (942)..(942)<222> (942)..(942)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 154<400> 154
atgcagcgcg acatcagcac cagctacgcg ctggaacaac ggctgcgcaa tcatatgacg 60atgcagcgcg acatcagcac cagctacgcg ctggaacaac ggctgcgcaa tcatatgacg 60
ctgaccgaag ccgtcttgaa taacattccg gcggcggttg tagtggtgga tgaacgcgat 120ctgaccgaag ccgtcttgaa taacattccg gcggcggttg tagtggtgga tgaacgcgat 120
cgggtggtga tggataacct cgcctacaaa accttttgcg ccgattgcgg cggtaaagaa 180180
ctactcaccg aaatcaactt ttccgcccat aaggcggagc tggcgcaggg cctggtactg 240ctactcaccg aaatcaactt ttccgcccat aaggcggagc tggcgcaggg cctggtactg 240
ccggtagtgc tgcgcggcac cgtgcgctgg ttgtccgtta cctgttgggc gctgccgggc 300ccggtagtgc tgcgcggcac cgtgcgctgg ttgtccgtta cctgttggggc gctgccggggc 300
gtcagcgaag aagcaggccg ctactttatt gatagcgccg tgccgcgcac gctggtggtg 360gtcagcgaag aagcaggccg ctactttatt gatagcgccg tgccgcgcac gctggtggtg 360
atcaccgata atactcagca gcagcaacaa caggagcagg ggcgtcttga tcgtctgaag 420atcaccgata atactcagca gcagcaacaa caggagcagg ggcgtcttga tcgtctgaag 420
cagcagataa ccagcggtaa attgctggcg gcgatccgcg aatcgctgga cgccgcgctg 480cagcagataa ccagcggtaa attgctggcg gcgatccgcg aatcgctgga cgccgcgctg 480
gtacaactca attgcccaat taatatgctg gccgccgcac gccgcttaaa tggcgacgag 540gtacaactca attgcccaat taatatgctg gccgccgcac gccgcttaaa tggcgacgag 540
catagcaatc tggcgctgga tgccgcatgg cgtgaaggcg aagaagcgat ggcgcggttg 600catagcaatc tggcgctgga tgccgcatgg cgtgaaggcg aagaagcgat ggcgcggttg 600
cagcgctgcc gcccgtcgct ggaactggaa agcccggcag tctggccgct ccagccgttc 660cagcgctgcc gcccgtcgct ggaactggaa agcccggcag tctggccgct cgccgttc 660
cttgacgatc tgcgtgccct gtatcacacc cgatataacc agggcgaaaa cctgcaaatt 720cttgacgatc tgcgtgccct gtatcacacc cgatataacc agggcgaaaa cctgcaaatt 720
gagctggaat cccccgacct ggtgggcttt ggccagcgaa cacaactgct tgcctgcctg 780gagctggaat cccccgacct ggtgggcttt ggccagcgaa cacaactgct tgcctgcctg 780
agcctgtggc tcgacagaac cctggatatt gccgcggagc tacgtgattt cacggtacag 840agcctgtggc tcgacagaac cctggatatt gccgcggagc tacgtgattt cacggtacag 840
actcaacttt acgcccgcga agagagcggc tggctgtcgt tctatttaaa cgacaatgtg 900actcaacttt acgcccgcga agagagcggc tggctgtcgt tctatttaaa cgacaatgtg 900
ccgctgattc aggtgcgcta cacccattca cccgatgcac tnaatgcgcc cggtaaaggc 960ccgctgattc aggtgcgcta cacccattca cccgatgcac tnaatgcgcc cggtaaaggc 960
atggagctgc ggctgatcca gacgctggtc gcccaccatc gaggcgcaat agaactgacc 1020atggagctgc ggctgatcca gacgctggtc gcccaccatc gaggcgcaat agaactgacc 1020
tcacgccctc agggaggcac ctgtctgatc ctgcgtttcc cattatttta ctcgctgaca 1080tcacgccctc agggaggcac ctgtctgatc ctgcgtttcc cattatttta ctcgctgaca 1080
ggaggctcac tatga 1095ggaggctcac tatga 1095
<210> 155<210> 155
<211> 219<211> 219
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> частичный ген nifA<223> partial nifA gene
<400> 155<400> 155
atgactcagc gaaccgagtc gggtacaacc gtctggcgct ttgacctctc ccaacagttt 60atgactcagc gaaccgagtc gggtacaacc gtctggcgct ttgacctctc ccaacagttt 60
acagccatgc agcgtatcag tgtggtgtta agccgcgcga cggagatcgg gcagacgcta 120acagccatgc agcgtatcag tgtggtgtta agccgcgcga cggagatcgg gcagacgcta 120
caggaagtgc tgtgcgtgct gcacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgtccg 180caggaagtgc tgtgcgtgct gcacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgtccg 180
tacgcgcggg tgcgcgtctt cgcgagcgta tggctttga 219tacgcgcggg tgcgcgtctt cgcgagcgta tggctttga 219
<210> 156<210> 156
<211> 1635<211> 1635
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> glnE<223> glnE
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (234)..(234)<222> (234)..(234)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (274)..(274)<222> (274)..(274)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (1535)..(1535)<222> (1535)..(1535)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 156<400> 156
atgcgcgtgg aagactggtc aacgctgacc gaacggctcg atgcccatat ggcaggcgtg 60atgcgcgtgg aagactggtc aacgctgacc gaacggctcg atgcccatat ggcaggcgtg 60
cgccgaatct ttaacgaact gatcggtgat gacgaaagtg agtcgcagga cgatgcgctc 120cgccgaatct ttaacgaact gatcggtgat gacgaaagtg agtcgcagga cgatgcgctc 120
tccgagcact ggcgcgagct gtggcaggac gcgcttcagg aagatgacac cacgccggtg 180tccgagcact ggcgcgagct gtggcaggac gcgcttcagg aagatgacac cacgccggtg 180
ctgacgcact taaccgacga cgcgcgccat cgcgtggtgg cgctgatcgc tganttccgt 240ctgacgcact taaccgacga cgcgcgccat cgcgtggtgg cgctgatcgc tganttccgt 240
cttgagctga acaaacgcgc catcggcccg cgtngtcgcc aggtgctgga tcacctgatg 300cttgagctga acaaacgcgc catcggcccg cgtngtcgcc aggtgctgga tcacctgatg 300
ccgcacctgc tgagcgaagt ctgctcgcgt gccgatgcgc cggtgccgct gtcgcggatg 360ccgcacctgc tgagcgaagt ctgctcgcgt gccgatgcgc cggtgccgct gtcgcggatg 360
atgcccctgc tgagcgggat tatcacccgt actacctacc ttgaactcct gagcgagttc 420atgcccctgc tgagcgggat tatcacccgt actacctacc ttgaactcct gagcgagttc 420
cctggcgcgc ttaagcacct gatttcactc tgcgccgcgt cgccgatggt ggccaacaag 480cctggcgcgc ttaagcacct gatttcactc tgcgccgcgt cgccgatggt ggccaacaag 480
ctggcgcgtt acccgctgct gctggatgag ctgctcgatc cgaataccct ttatcaaccg 540ctggcgcgtt acccgctgct gctggatgag ctgctcgatc cgaataccct ttatcaaccg 540
acggcgaccg acgcctaccg ggacgaactg cgtcagtatc tgctgcgcgt gccggaagaa 600acggcgaccg acgcctaccg ggacgaactg cgtcagtatc tgctgcgcgt gccggaagaa 600
gacgaagagc aacagctgga ggcgctgcgt cagtttaagc aggcccagat gctgcgcgtg 660gacgaagagc aacagctgga ggcgctgcgt cagtttaagc aggcccagat gctgcgcgtg 660
gcggccgcag atattgccgg aacgctgccg gtgatgaaag tgagcgatca cttaacctgg 720gcggccgcag atattgccgg aacgctgccg gtgatgaaag tgagcgatca cttaacctgg 720
cttgcggaag cgattatcga cgcggtggtg catcaggcct gggtgcagat ggtggcgcgc 780cttgcggaag cgattatcga cgcggtggtg catcaggcct gggtgcagat ggtggcgcgc 780
tatggccagc cgaaacatct ggctgaccgt gatggtcgcg gcttcgcggt ggtgggttac 840tatggccagc cgaaacatct ggctgaccgt gatggtcgcg gcttcgcggt ggtgggttac 840
ggtaagctcg gcggttggga gctgggctat agctccgatc tggatttaat cttcctccac 900ggtaagctcg gcggttggga gctgggctat agctccgatc tggatttaat cttcctccac 900
gactgcccgg ttgatgtgat gaccgacggc gagcgcgaga ttgacgggcg tcagttctac 960gactgcccgg ttgatgtgat gaccgacggc gagcgcgaga ttgacgggcg tcagttctac 960
ctgcgcctgg cgcagcgcat catgcacctg ttcagcaccc gcacctcgtc gggcattttg 1020ctgcgcctgg cgcagcgcat catgcacctg ttcagcaccc gcacctcgtc gggcattttg 1020
tatgaagtgg atgcccgtct gcgcccgtcc ggcgcggcgg gcatgctggt cacctcgacg 1080tatgaagtgg atgcccgtct gcgcccgtcc ggcgcggcgg gcatgctggt cacctcgacg 1080
gagtccttcg ctgattacca gaagaatgaa gcctggacgt gggagcatca ggcgctggtg 1140gagtccttcg ctgattacca gaagaatgaa gcctggacgt gggagcatca ggcgctggtg 1140
cgcgcccgtg tggtgtatgg cgatccgctg ctgaaaacgc agtttgacgt gattcgtaag 1200cgcgcccgtg tggtgtatgg cgatccgctg ctgaaaacgc agtttgacgt gattcgtaag 1200
gaagtcatga ccaccgtgcg cgatggcagc acgctgcaaa cggaagtgcg cgaaatgcgc 1260gaagtcatga ccaccgtgcg cgatggcagc acgctgcaaa cggaagtgcg cgaaatgcgc 1260
gagaaaatgc gcgcgcactt aggcaataaa catcgcgatc gctttgatat taaagccgat 1320gagaaaatgc gcgcgcactt aggcaataaa catcgcgatc gctttgatat taaagccgat 1320
gagggcggta ttaccgatat tgagtttatt acccagtatc tggtgttgct gcacgcgcat 1380gagggcggta ttaccgatat tgagtttatt acccagtatc tggtgttgct gcacgcgcat 1380
gacaagccga agctgacgcg ctggtcggat aacgtgcgca ttctggaact gctggcgcaa 1440gacaagccga agctgacgcg ctggtcggat aacgtgcgca ttctggaact gctggcgcaa 1440
aacgacatta tggacgagca ggaggcgcag gccttaaccc gtgcctatac aacgcttcgc 1500aacgacatta tggacgagca ggaggcgcag gccttaaccc gtgcctatac aacgcttcgc 1500
gatgagctcc atcatctggc gttgcaggag cagcngggac acgtggcgct ggactgtttc 1560gatgagctcc atcatctggc gttgcaggag cagcngggac acgtggcgct ggactgtttc 1560
accgctgaac gcgctcaggt aacggccagc tggcagaagt ggctggtgga accgtgcgta 1620accgctgaac gcgctcaggt aacggccagc tggcagaagt ggctggtgga accgtgcgta 1620
acaaatcaag tgtga 1635acaaatcaag tgtga 1635
<210> 157<210> 157
<211> 1316<211> 1316
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> 16S<223> 16S
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (43)..(43)<222> (43)..(43)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (247)..(247)<222> (247)..(247)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (784)..(785)<222> (784)..(785)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (794)..(795)<222> (794)..(795)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 157<400> 157
agatgtgccc agatgggatt agctagtagg tggggtaacg gcncacctag gcgacgatcc 60agatgtgccc agatgggatt agctagtagg tggggtaacg gcncacctag gcgacgatcc 60
ctagctggtc tgagaggatg accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac 120ctagctggtc tgagaggatg accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac 120
gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt 180gggaggcagc agtggggaat attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt 180
gtatgaagaa ggccttcggg ttgtaaagta ctttcagcgg ggaggaaggt gttgtggtta 240gtatgaagaa ggccttcggg ttgtaaagta ctttcagcgg ggaggaaggt gttgtggtta 240
ataaccncag caattgacgt tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc 300ataaccncag caattgacgt tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc 300
cgcggtaata cggagggtgc aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg 360cgcggtaata cggagggtgc aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg 360
cggtctgtca agtcggatgt gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca ttcgaaactg 420cggtctgtca agtcggatgt gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca ttcgaaactg 420
gcaggctaga gtcttgtaga ggggggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag 480gcaggctaga gtcttgtaga ggggggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag 480
atctggagga ataccggtgg cgaaggcggc cccctggaca aagactgacg ctcaggtgcg 540atctggagga ataccggtgg cgaaggcggc cccctggaca aagactgacg ctcaggtgcg 540
aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcga 600aaagcgtggg gagcaaacag gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcga 600
cttggaggtt gtgcccttga ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaagt cgaccgcctg 660cttggaggtt gtgcccttga ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaagt cgaccgcctg 660
gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg 720gggagtacgg ccgcaaggtt aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg 720
agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tactcttgac atccagagaa 780agcatgtggt ttaattcgat gcaacgcgaa gaaccttacc tactcttgac atccagagaa 780
cttnncagag atgnnttggt gccttcggga actctgagac aggtgctgca tggctgtcgt 840cttnncagag atgnnttggt gccttcggga actctgagac aggtgctgca tggctgtcgt 840
cagctcgtgt tgtgaaatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt 900cagctcgtgt tgtgaaatgt tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt 900
tgccagcggt ccggccggga actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg 960tgccagcggt ccggccggga actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg 960
ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttacg agtagggcta cacacgtgct acaatggcgc 1020ggatgacgtc aagtcatcat ggcccttacg agtagggcta cacacgtgct acaatggcgc 1020
atacaaagag aagcgacctc gcgagagcaa gcggacctca taaagtgcgt cgtagtccgg 1080atacaaagag aagcgacctc gcgagagcaa gcggacctca taaagtgcgt cgtagtccgg 1080
attggagtct gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgta gatcagaatg 1140attggagtct gcaactcgac tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgta gatcagaatg 1140
ctacggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt 1200ctacggtgaa tacgttcccg ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt 1200
gcaaaagaag taggtagctt aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact 1260gcaaaagaag taggtagctt aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact 1260
ggggtgaagt cgtaacaagg taaccgtagg ggaacctgcg gttggatcac ctcctt 1316ggggtgaagt cgtaacaagg taaccgtagg ggaacctgcg gttggatcac ctcctt 1316
<210> 158<210> 158
<211> 882<211> 882
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> nifH<223> nifH
<400> 158<400> 158
atgaccatgc gtcaatgtgc catttacggc aaaggtggta tcggtaaatc cactaccacg 60atgaccatgc gtcaatgtgc catttacggc aaaggtggta tcggtaaatc cactaccacg 60
caaaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggcaagaaag taatgatcgt cggctgcgac 120caaaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggcaagaaag taatgatcgt cggctgcgac 120
ccgaaagcag actccactcg tctgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180ccgaaagcag actccactcg tctgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180
atggcggctg aagtcggctc cgtggaagac cttgaactgg aagatgtgct gcaaatcggt 240atggcggctg aagtcggctc cgtggaagac cttgaactgg aagatgtgct gcaaatcggt 240
tacggcgacg tacgctgcgc agaatccggc ggcccggaac caggcgttgg ctgtgctggt 300tacggcgacg tacgctgcgc agaatccggc ggcccggaac caggcgttgg ctgtgctggt 300
cgcggggtaa ttaccgccat caacttcctg gaagaagaag gcgcctatgt tcccgacctc 360cgcggggtaa ttaccgccat caacttcctg gaagaagaag gcgcctatgt tcccgacctc 360
gatttcgtct tttacgacgt gttgggcgac gtggtgtgcg gggggttcgc catgccgatt 420gatttcgtct gttacgacgt gttgggcgac gtggtgtgcg gggggttcgc catgccgatt 420
cgcgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtctgctccg gcgaaatgat ggcgatgtac 480cgcgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtctgctccg gcgaaatgat ggcgatgtac 480
gccgccaaca acatctctaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggcaa agtgcgcctt 540gccgccaaca acatctctaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggcaa agtgcgcctt 540
ggcgggctga tctgtaactc ccgtcagacc gaccgcgaag atgagctgat catagcgctg 600ggcgggctga tctgtaactc ccgtcagacc gaccgcgaag atgagctgat catagcgctg 600
gcggaaaaac tcggcaccca gatgatccac ttcgtgccgc gcgacaacat cgtgcaacgc 660gcggaaaaac tcggcaccca gatgatccac ttcgtgccgc gcgacaacat cgtgcaacgc 660
gctgaaatcc gccgtatgac ggtgattgag tacgatccga aatgcaacca ggccaatgaa 720gctgaaatcc gccgtatgac ggtgattgag tacgatccga aatgcaacca ggccaatgaa 720
taccgcacgc tggcgaacaa gatcgtcaac aacaccaaaa tggtcgtgcc aacgcccatc 780taccgcacgc tggcgaacaa gatcgtcaac aacaccaaaa tggtcgtgcc aacgcccatc 780
accatggacg aactggaaga gctgttgatg gaattcggca ttatggatgt ggaagacacc 840accatggacg aactggaaga gctgttgatg gaattcggca ttatggatgt ggaagacacc 840
agcattatcg gtaaaaccgc cgcagaagaa aacgcggttt ga 882agcattatcg gtaaaaccgc cgcagaagaa aacgcggttt ga 882
<210> 159<210> 159
<211> 1449<211> 1449
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> nifD1<223> nifD1
<400> 159<400> 159
atgagcaatg caacaggcga acgtaatctg gagatcatcc aggaagtgct ggagatcttt 60atgagcaatg caacaggcga acgtaatctg gagatcatcc aggaagtgct ggagatcttt 60
ccggaaaaaa cgcgcaaaga acgcagaaag cacatgatgg tgagcgaccc ggagatggaa 120ccggaaaaaa cgcgcaaaga acgcagaaag cacatgatgg tgagcgaccc ggagatggaa 120
agcgtcggga aatgcatcat ctccaaccgt aagtcgcagc ccggcgtaat gaccgtgcgc 180agcgtcggga aatgcatcat ctccaaccgt aagtcgcagc ccggcgtaat gaccgtgcgc 180
ggttgctctt acgccggttc taaaggggtg gtattcgggc cgatcaaaga tatggcccat 240ggttgctctt acgccggttc taaaggggtg gtattcgggc cgatcaaaga tatggcccat 240
atttcccacg gcccggtcgg ctgcggtcag tactcccgcg ccgggcggcg taactactac 300atttccccg gcccggtcgg ctgcggtcag tactcccgcg ccgggcggcg taactactac 300
accggcgtca gcggtgtgga tagcttcggt acgctcaact ttacctccga ttttcaggag 360accggcgtca gcggtgtgga tagcttcggt acgctcaact ttacctccga ttttcaggag 360
cgcgatatcg tgtttggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgattgaaga gatggagacg 420cgcgatatcg tgtttggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgattgaaga gatggagacg 420
ctgttcccgc tgaccaaagg gatctccatt cagtccgaat gcccggtcgg cctgattggc 480ctgttcccgc tgaccaaagg gatctccatt cagtccgaat gcccggtcgg cctgattggc 480
gacgacattg aagccgttgc caacgccagc cgcaaagcca tcaataaacc ggtcattccg 540gacgacattg aagccgttgc caacgccagc cgcaaagcca tcaataaacc ggtcattccg 540
gtgcgctgcg aaggttttcg cggcgtttcc cagtcactcg gtcaccacat tgccaacgac 600gtgcgctgcg aaggttttcg cggcgtttcc cagtcactcg gtcaccacat tgccaacgac 600
gtgatccgcg actgggtact ggataaccgc gaaggcaagc cgtttgaggc cggtccttat 660gtgatccgcg actgggtact ggataaccgc gaaggcaagc cgtttgaggc cggtccttat 660
gacgtggcga tcatcggcga ttacaacatc ggcggcgatg cctgggcgtc gcgcattttg 720720
ctcgaagaga tgggcctgcg cgtggtggcg cagtggtccg gcgacggcac gctggttgag 780ctcgaagaga tgggcctgcg cgtggtggcg cagtggtccg gcgacggcac gctggttgag 780
atggagaaca cgccgttcgt caaactcaac cttgtgcact gctaccgctc aatgaactat 840atggagaaca cgccgttcgt caaactcaac cttgtgcact gctaccgctc aatgaactat 840
atctcccgcc atatggagga gaaacacggt attccgtgga tggagtacaa cttcttcggt 900atctcccgcc atatggagga gaaacacggt attccgtgga tggagtacaa cttcttcggt 900
ccgaccaaag tcgccgaatc gttgcgcaaa atcgccgata tgtttgatga caccattcgc 960ccgaccaaag tcgccgaatc gttgcgcaaa atcgccgata tgtttgatga caccattcgc 960
gccaacgccg aagcggtgat cgccaaatat caggcgcaga acgacgccat catcgccaaa 1020gccaacgccg aagcggtgat cgccaaatat caggcgcaga acgacgccat catcgccaaa 1020
taccgtccgc gtctggaagg ccgcaaagtg ctgctgtata tgggcggttt acgtcctcgc 1080taccgtccgc gtctggaagg ccgcaaagtg ctgctgtata tgggcggttt acgtcctcgc 1080
catgtgattg gcgcttatga agatctgggg atggaaatta tcgctgcggg ttatgaattc 1140catgtgattg gcgcttatga agatctgggg atggaaatta tcgctgcggg ttatgaattc 1140
gcccacaacg atgactacga ccgcaccctg ccggatctga aagaaggcac cttgctgttc 1200gcccacaacg atgactacga ccgcaccctg ccggatctga aagaaggcac cttgctgttc 1200
gacgatgcca gcagttatga actggaagcc tttgtcaaag cgctgaagcc ggatctgatc 1260gacgatgcca gcagttatga actggaagcc tttgtcaaag cgctgaagcc ggatctgatc 1260
ggctccggca ttaaagagaa gtacatcttc cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320ggctccggca ttaaagagaa gtacatcttc cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320
cactcctggg attactccgg cccctatcac ggttatgacg gctttgccat cttcgcccgc 1380cactcctggg attactccgg cccctatcac ggttatgacg gctttgccat cttcgcccgc 1380
gatatggata tgacgatcaa caaccccgcg tggggccagt tgaccgcgcc gtggctgaaa 14401440
tccgcctga 1449tccgcctga 1449
<210> 160<210> 160
<211> 1374<211> 1374
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> nifD2<223> nifD2
<400> 160<400> 160
atgaagggga acgagatcct ggctttgctc gatgaacctg cctgcgagca caaccataaa 60atgaagggga acgagatcct ggctttgctc gatgaacctg cctgcgagca caaccataaa 60
cagaaatccg gctgcagcgc gccgaaaccc ggcgcgacag cgggcggctg cgcctttgac 120cagaaatccg gctgcagcgc gccgaaaccc ggcgcgacag cgggcggctg cgcctttgac 120
ggtgcgcaga tcaccctgct gccactctcc gatgttgccc acctggtaca cggccccatt 180ggtgcgcaga tcaccctgct gccactctcc gatgttgccc acctggtaca cggccccatt 180
ggttgtaccg gtagctcatg ggataaccgt ggcagcttca gttccggccc gacgatcaac 240ggttgtaccg gtagctcatg ggataaccgt ggcagcttca gttccggccc gacgatcaac 240
cggctgggtt ttaccaccga tctgagcgaa caggatgtga tcatgggacg cggcgagcgc 300cggctgggtt ttaccaccga tctgagcgaa caggatgtga tcatgggacg cggcgagcgc 300
cgcctgttcc atgccgtgcg ccacatcgtc aaccgctacc acccggccgc cgtctttatc 360cgcctgttcc atgccgtgcg ccacatcgtc aaccgctacc acccggccgc cgtctttatc 360
tataacacct gcgttcccgc gatggagggc gacgatatcg aagccgtctg ccaggcggca 420tataacacct gcgttcccgc gatggagggc gacgatatcg aagccgtctg ccaggcggca 420
gaaaccgcca tcggcgtacc ggtgattgcc gttgatgtcg ccgggtttta cggcagcaaa 480gaaaccgcca tcggcgtacc ggtgattgcc gttgatgtcg cggggtttta cggcagcaaa 480
aatctcggca accggttggc cggtgaagtg atggtgaaaa aggtgattgg cgggcgtgaa 540aatctcggca accggttggc cggtgaagtg atggtgaaaa aggtgattgg cgggcgtgaa 540
cccgcgccgt ggccggaaga tacccctttt gccccggcgc accgccacga tatcgggctg 600600
attggcgaat tcaatattgc cggagagttc tggcatattc agccgctgct cgatgagctg 660attggcgaat tcaatattgc cggagagttc tggcatattc agccgctgct cgatgagctg 660
ggtattcgcg tgctcggcag cctctccggc gacgggcgct tcagtgaaat ccagacgctg 720ggtattcgcg tgctcggcag cctctccggc gacgggcgct tcagtgaaat ccagacgctg 720
caccgggcgc aggtcaatat gctggtctgc tccagggcgc tgatcaacgt cgcccgctcg 780caccgggcgc aggtcaatat gctggtctgc tccagggcgc tgatcaacgt cgcccgctcg 780
ctggagcagc gctacggcac gccgtggttt gaaggcagtt tttatggtgt tcgcgccacc 840ctggagcagc gctacggcac gccgtggttt gaaggcagtt tttatggtgt tcgcgccacc 840
tctgacgccc tgcgccaact ggcggcgctg accggagacc gcgatctgat gcagcgcacc 900tctgacgccc tgcgccaact ggcggcgctg accggagacc gcgatctgat gcagcgcacc 900
gaacagctca ttgcccgcga agagcagcaa acagagcagg cgctggcccc gctgcgcgag 960gaacagctca ttgcccgcga agagcagcaa acagagcagg cgctggcccc gctgcgcgag 960
cgcctgcgcg ggcgcaaagc gctgctctat accggcggcg tgaaatcctg gtcggtggtt 1020cgcctgcgcg ggcgcaaagc gctgctctat accggcggcg tgaaatcctg gtcggtggtt 1020
tcggcgcttc aggatctggg catggaagtg gtggcgaccg gcacgcgcaa atccaccgaa 1080tcggcgcttc aggatctggg catggaagtg gtggcgaccg gcacgcgcaa atccaccgaa 1080
gaggataaac agcgcatccg cgaactgatg ggcgccgacg cgctgatgct tgatgaaggt 1140gaggataaac agcgcatccg cgaactgatg ggcgccgacg cgctgatgct tgatgaaggt 1140
aacgcccgct cgctgctgga cgtggtttac cgctacaagg cggacatgat gatcgccggg 1200aacgcccgct cgctgctgga cgtggtttac cgctacaagg cggacatgat gatcgccggg 1200
ggacgcaata tgtacaccgc ctacaaagcg cggctgccgt tcctcgatat caatcaggag 1260ggacgcaata tgtacaccgc ctacaaagcg cggctgccgt tcctcgatat caatcaggag 1260
cgcgagcacg cctttgccgg ctaccgcggc attgtcaccc tggccgaaca gctctgcctg 1320cgcgagcacg cctttgccgg ctaccgcggc attgtcaccc tggccgaaca gctctgcctg 1320
accatggaaa gcccggtctg gccgcaaacc cattcccgcg caccgtggca ataa 1374accatggaaa gcccggtctg gccgcaaacc cattcccgcg caccgtggca ataa 1374
<210> 161<210> 161
<211> 1563<211> 1563
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> nifK1<223> nifK1
<400> 161<400> 161
atgagccaaa gtgctgagaa aattcaaaac tgtcatccgc tgtttgaaca ggatgcgtac 60atgagccaaa gtgctgagaa aattcaaaac tgtcatccgc tgtttgaaca ggatgcgtac 60
cagatgctgt ttaaagataa acggcaactg gaagaggccc acgatccggc gcgcgtgcag 120cagatgctgt ttaaagataa acggcaactg gaagaggccc acgatccggc gcgcgtgcag 120
gaggtctttc aatggaccac caccgccgag tatgaagcgc ttaactttca acgcgaagcg 180gaggtctttc aatggaccac caccgccgag tatgaagcgc ttaactttca acgcgaagcg 180
ctgactatcg atccggccaa agcctgccag ccgctgggtg cggtactgtg ctcgctgggc 240ctgactatcg atccggccaa agcctgccag ccgctgggtg cggtactgtg ctcgctgggc 240
tttgccaata ccctgcccta tgttcacggc tcccaggggt gcgtggccta tttccgcacc 300tttgccaata ccctgcccta tgttcacggc tcccaggggt gcgtggccta tttccgcacc 300
tattttaacc gtcactttaa agagccgatt gcctgtgttt ctgactcgat gacggaagat 360tattttaacc gtcactttaa agagccgatt gcctgtgttt ctgactcgat gacggaagat 360
gcggcagtat tcggcggcaa caacaacctg aacaccgggt tgcagaacgc cagcgccctc 420gcggcagtat tcggcggcaa caacaacctg aacaccgggt tgcagaacgc cagcgccctc 420
tacaagccgg aaatcattgc cgtctccacc acctgtatgg cggaggtcat cggcgacgac 480tacaagccgg aaatcattgc cgtctccacc acctgtatgg cggaggtcat cggcgacgac 480
ctgcaggcgt ttattgctaa cgccaaaaaa gacggcttta tcgacgcggc gatcccggtg 540ctgcaggcgt ttattgctaa cgccaaaaaa gacggcttta tcgacgcggc gatcccggtg 540
ccttacgcgc acacgccaag ctttatcggc agccatatca ccggctggga caatatgttt 600600
gagggcttcg cccgtacctt taccgccgat tacagcggac aaccgggcaa attaccgcgt 660gagggcttcg cccgtacctt taccgccgat tacagcggac aaccgggcaa attaccgcgt 660
atcaatctgg tcagcggatt tgaaacctat ctcggtaatt tccgcgtgct gaaacgcatg 720atcaatctgg tcagcggatt tgaaacctat ctcggtaatt tccgcgtgct gaaacgcatg 720
atggagcaaa tggacgtgcc gtgcagcctg ctttccgatc cctccgaagt gctggatacc 780atggagcaaa tggacgtgcc gtgcagcctg ctttccgatc cctccgaagt gctggatacc 780
ccggctgacg ggcattacca catgtatgcg ggcggtacga cccagcagga gatgcgcgaa 840ccggctgacg ggcattacca catgtatgcg ggcggtacga cccagcagga gatgcgcgaa 840
gcgcctgacg ctatcgacac cctgctgctg caaccctggc aactggtgaa aaccaaaaaa 900gcgcctgacg ctatcgacac cctgctgctg caaccctggc aactggtgaa aaccaaaaaa 900
gtggtgcagg aaagctggaa ccagcccgct accgaggtgc aaatcccaat ggggctggcc 960gtggtgcagg aaagctggaa ccagcccgct accgaggtgc aaatcccaat ggggctggcc 960
ggaaccgacg agctgctgat gacggtaagc cagttaaccg gcaaagccat tccggatagc 1020ggaaccgacg agctgctgat gacggtaagc cagttaaccg gcaaagccat tccggatagc 1020
ttagcgctgg aacgcggtcg gctggtggat atgatgctcg actcccacac ctggctgcac 1080ttagcgctgg aacgcggtcg gctggtggat atgatgctcg actcccacac ctggctgcac 1080
ggcaagaaat tcggcctgtt cggtgacccg gattttgtca tggggctgac ccgcttcctg 1140ggcaagaaat tcggcctgtt cggtgacccg gattttgtca tggggctgac ccgcttcctg 1140
ctggaactgg gctgcgaacc gacggtgatt ctgtgccata acggcagcaa gcgctggcag 1200ctggaactgg gctgcgaacc gacggtgatt ctgtgccata acggcagcaa gcgctggcag 1200
aaagcgatga agaaaatgct tgaagcctcg ccgtacggga aagagagcga agtctttatc 12601260
aactgcgatt tgtggcattt ccgctcgctg atgtttaccc gtcagccgga ctttatgatc 1320aactgcgatt tgtggcattt ccgctcgctg atgtttaccc gtcagccgga ctttatgatc 1320
ggcaactcct acgccaagtt tatccagcgc gatacgctgg cgaagggtga gcagtttgaa 1380ggcaactcct acgccaagtt tatccagcgc gatacgctgg cgaagggtga gcagtttgaa 1380
gtgccgctga tccgcctggg gttcccgctg ttcgatcgcc accatctgca ccgccagacc 1440gtgccgctga tccgcctggg gttcccgctg ttcgatcgcc accatctgca ccgccagacc 1440
acctggggtt acgaaggggc catgagtatc ctcaccacgc tggttaatgc ggtgctggag 1500acctggggtt acgaaggggc catgagtatc ctcaccacgc tggttaatgc ggtgctggag 1500
aaagtcgaca gagagaccat caagctcggc aaaaccgact acagcttcga tcttatccgt 15601560
taa 1563taa 1563
<210> 162<210> 162
<211> 1386<211> 1386
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> nifK2<223> nifK2
<400> 162<400> 162
atggcagaaa ttatccgtag taaaaagccg ctggccgtca gcccggtaaa aagtggccag 60atggcagaaa ttatccgtag taaaaagccg ctggccgtca gcccggtaaa aagtggccag 60
ccgctgggcg cgattctggc gagcatgggc tttgaacaga gcattccgct ggttcatggc 120ccgctgggcg cgattctggc gagcatggggc tttgaacaga gcattccgct ggttcatggc 120
gctcaggggt gcagcgcctt cgcgaaggtc ttttttatcc agcattttca cgatccgatc 180gctcaggggt gcagcgcctt cgcgaaggtc ttttttatcc agcattttca cgatccgatc 180
ccgctgcaat cgacggcaat ggacccgaca tcgaccatta tgggtgccga tgagaacatc 240ccgctgcaat cgacggcaat ggacccgaca tcgaccatta tgggtgccga tgagaacatc 240
tttaccgcgc tgaatgtgct gtgttcacgc aacaacccga aagcgattgt tctgctgagc 300tttaccgcgc tgaatgtgct gtgttcacgc aacaacccga aagcgattgt tctgctgagc 300
actggccttt ccgaggcgca gggcagcgat atttcgcgcg tggtgcgcca gttccgcgat 360actggccttt ccgaggcgca gggcagcgat atttcgcgcg tggtgcgcca gttccgcgat 360
gaatatccgc gccataaagg ggtggcgctg ctgaccgtca acacgccgga tttttacggc 420gaatatccgc gccataaagg ggtggcgctg ctgaccgtca acacgccggga ttttacggc 420
agcctggaaa acggctacag cgcggtgctg gagagcatgg ttgaacagtg ggtgccggaa 480agcctggaaa acggctacag cgcggtgctg gagagcatgg ttgaacagtg ggtgccggaa 480
aaaccgcagc cgggcgtgcg caatcgccgc gtgaacctgc tgctcagcca tttgcttacg 540aaaccgcagc cgggcgtgcg caatcgccgc gtgaacctgc tgctcagcca tttgcttacg 540
ccgggcgaca ttgagctgct gcgaagttat gtcgaggcat ttggcctgca gccggtgatg 600ccgggcgaca ttgagctgct gcgaagttat gtcgaggcat ttggcctgca gccggtgatg 600
gtgccggatc tttcccagtc gctggatggc catctcgcca gcggggattt ctcgccaatt 660gtgccggatc tttcccagtc gctggatggc catctcgcca gcggggattt ctcgccaatt 660
acccagggcg gcagcagcct gcggctgatt gaacagatgg gacagagtct tggcacgttc 720acccagggcg gcagcagcct gcggctgatt gaacagatgg gacagagtct tggcacgttc 720
gccattggcg tatccctctc ccgcgccgcg caattgctgg cgcagcgcag ccatgcggaa 780gccattggcg tatccctctc ccgcgccgcg caattgctgg cgcagcgcag ccatgcggaa 780
gtggtcaccc tgccgcatct gatgaccatg agccagtgcg atacgtttat tcatcaactg 840gtggtcaccc tgccgcatct gatgaccatg agccagtgcg atacgtttat tcatcaactg 840
aagcgcctct ccgggcgcga tgttccggcg tggatcgaac gccagcgcgg gcaactgcag 900aagcgcctct ccgggcgcga tgttccggcg tggatcgaac gccagcgcgg gcaactgcag 900
gatgcgatga tcgattgtca tatgtggttg cagggcgcgc ctgtcgcgct ggccgccgag 960gatgcgatga tcgattgtca tatgtggttg cagggcgcgc ctgtcgcgct ggccgccgag 960
ggcgatctgc tcgccgcctg gtgcgatttc gcctgcgata tgggcatggt gcccggcccg 1020ggcgatctgc tcgccgcctg gtgcgatttc gcctgcgata tgggcatggt gcccggcccg 1020
gtggtggcgc cggtgagcca gaaagggttg caggatctgc cggtcgaaaa agtcattatc 1080gtggtggcgc cggtgagcca gaaagggttg caggatctgc cggtcgaaaa agtcattatc 1080
ggcgatctgg aggatatgca ggatctgttg tgtgaaacgc ctgcatcgct gctcgtctct 1140ggcgatctgg aggatatgca ggatctgttg tgtgaaacgc ctgcatcgct gctcgtctct 1140
aattctcacg ccgctgattt ggccgggcag ttcgacattc cgctggtgcg cgccggtttc 1200aattctcacg ccgctgattt ggccgggcag ttcgacattc cgctggtgcg cgccggtttc 1200
cccctgttcg accgtctggg cgagtttcgc cgcgtgcgcc agggttacgc cgggatgcgc 1260cccctgttcg accgtctggg cgagtttcgc cgcgtgcgcc agggttacgc cgggatgcgc 1260
gacaccttgt ttgagctggc gaatgcgctg cgcgatcgcc atcatcatct tgccgcttat 1320gacaccttgt ttgagctggc gaatgcgctg cgcgatcgcc atcatcatct tgccgcttat 1320
cactcgccgc tgcgccagcg tttttacgaa cccgcatctt cgggaggtga ctatgcaaca 1380cactcgccgc tgcgccagcg tttttacgaa cccgcatctt cgggaggtga ctatgcaaca 1380
tgttaa 1386tgttaa 1386
<210> 163<210> 163
<211> 1488<211> 1488
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> nifL<223> nifL
<400> 163<400> 163
atgaccctga atatgatgat ggacgccacc gcgcccgccg agatcgccgg agcgctctca 60atgaccctga atatgatgat ggacgccacc gcgcccgccg agatcgccgg agcgctctca 60
caacagcatc ccgggttgtt tttcaccatg gttgaacagg cgcccgtcgc gatttcactg 120caacagcatc ccgggttgtt tttcaccatg gttgaacagg cgcccgtcgc gatttcactg 120
accgatgccg atgcccacat tctctacgcc aaccccgcgt tttgtcgcca gtcggggtat 180accgatgccg atgcccacat tctctacgcc aaccccgcgt tttgtcgcca gtcggggtat 180
gaactggaag agttgttgca gcaaaacccg cgcctgcttg ccagtaagca gacgccgcgt 240gaactggaag agttgttgca gcaaaacccg cgcctgcttg ccagtaagca gacgccgcgt 240
gaaatctacc aggaaatgtg gcacaccctg ctgcaacacc gtccgtggcg cggacaactg 300gaaatctacc aggaaatgtg gcacaccctg ctgcaacacc gtccgtggcg cggacaactg 300
atcaaccgtc gccgcgacgg cagcctgttt ctggtggaaa tcgacatcac cccactgttt 360atcaaccgtc gccgcgacgg cagcctgttt ctggtggaaa tcgacatcac cccactgttt 360
gatgcgttcg gcaaactcga acattacctg gccatgcagc gcgacatcag caccagctac 420gatgcgttcg gcaaactcga acattacctg gccatgcagc gcgacatcag caccagctac 420
gcgctggaac aacggctgcg caatcatatg acgctgaccg aagccgtctt gaataacatt 480gcgctggaac aacggctgcg caatcatatg acgctgaccg aagccgtctt gaataacatt 480
ccggcggcgg ttgtagtggt ggatgaacgc gatcgggtgg tgatggataa cctcgcctac 540ccggcggcgg ttgtagtggt ggatgaacgc gatcgggtgg tgatggataa cctcgcctac 540
aaaacctttt gcgccgattg cggcggtaaa gaactactca ccgaaatcaa cttttccgcc 600aaaacctttt gcgccgattg cggcggtaaa gaactactca ccgaaatcaa cttttccgcc 600
cataaggcgg agctggcgca gggcctggta ctgccggtag tgctgcgcgg caccgtgcgc 660cataaggcgg agctggcgca gggcctggta ctgccggtag tgctgcgcgg caccgtgcgc 660
tggttgtccg ttacctgttg ggcgctgccg ggcgtcagcg aagaagcagg ccgctacttt 720tggttgtccg ttacctgttg ggcgctgccg ggcgtcagcg aagaagcagg ccgctacttt 720
attgatagcg ccgtgccgcg cacgctggtg gtgatcaccg ataatactca gcagcagcaa 780attgatagcg ccgtgccgcg cacgctggtg gtgatcaccg ataatactca gcagcagcaa 780
caacaggagc aggggcgtct tgatcgtctg aagcagcaga taaccagcgg taaattgctg 840caacaggagc aggggcgtct tgatcgtctg aagcagcaga taaccagcgg taaattgctg 840
gcggcgatcc gcgaatcgct ggacgccgcg ctggtacaac tcaattgccc aattaatatg 900gcggcgatcc gcgaatcgct ggacgccgcg ctggtacaac tcaattgccc aattaatatg 900
ctggccgccg cacgccgctt aaatggcgac gagcatagca atctggcgct ggatgccgca 960ctggccgccg cacgccgctt aaatggcgac gagcatagca atctggcgct ggatgccgca 960
tggcgtgaag gcgaagaagc gatggcgcgg ttgcagcgct gccgcccgtc gctggaactg 1020tggcgtgaag gcgaagaagc gatggcgcgg ttgcagcgct gccgcccgtc gctggaactg 1020
gaaagcccgg cagtctggcc gctccagccg ttccttgacg atctgcgtgc cctgtatcac 1080gaaagcccgg cagtctggcc gctccagccg ttccttgacg atctgcgtgc cctgtatcac 1080
acccgatata accagggcga aaacctgcaa attgagctgg aatcccccga cctggtgggc 1140acccgatata accagggcga aaacctgcaa attgagctgg aatcccccga cctggtgggc 1140
tttggccagc gaacacaact gcttgcctgc ctgagcctgt ggctcgacag aaccctggat 1200tttggccagc gaacacaact gcttgcctgc ctgagcctgt ggctcgacag aaccctggat 1200
attgccgcgg agctacgtga tttcacggta cagactcaac tttacgcccg cgaagagagc 12601260
ggctggctgt cgttctattt aaacgacaat gtgccgctga ttcaggtgcg ctacacccat 1320ggctggctgt cgttctattt aaacgacaat gtgccgctga ttcaggtgcg ctacacccat 1320
tcacccgatg cactcaatgc gcccggtaaa ggcatggagc tgcggctgat ccagacgctg 1380tcacccgatg cactcaatgc gcccggtaaa
gtcgcccacc atcgaggcgc aatagaactg acctcacgcc ctcagggagg cacctgtctg 1440gtcgcccacc atcgaggcgc aatagaactg acctcacgcc ctcagggagg cacctgtctg 1440
atcctgcgtt tcccattatt ttactcgctg acaggaggct cactatga 1488atcctgcgtt tcccattatt ttactcgctg acagggaggct cactatga 1488
<210> 164<210> 164
<211> 1575<211> 1575
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> nifA<223> nifA
<400> 164<400> 164
atgactcagc gaaccgagtc gggtacaacc gtctggcgct ttgacctctc ccaacagttt 60atgactcagc gaaccgagtc gggtacaacc gtctggcgct ttgacctctc ccaacagttt 60
acagccatgc agcgtatcag tgtggtgtta agccgcgcga cggagatcgg gcagacgcta 120acagccatgc agcgtatcag tgtggtgtta agccgcgcga cggagatcgg gcagacgcta 120
caggaagtgc tgtgcgtgct gcacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgtctg 180caggaagtgc tgtgcgtgct gcacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgtctg 180
tacgacagta agcaagcgat cctttccatt gaagccttgc atgaggccga tcagcagtta 240tacgacagta agcaagcgat cctttccatt gaagccttgc atgaggccga tcagcagtta 240
attcccggca gttcacagat tcgctaccgt ccgggcgaag ggctggtagg cacggtgctt 300attcccggca gttcacagat tcgctaccgt ccgggcgaag ggctggtagg cacggtgctt 300
tcacagggac agtcgctggt actgccctgt gtctccgacg atcggcgttt tctcgatcgc 360tcacagggac agtcgctggt actgccctgt gtctccgacg atcggcgttt tctcgatcgc 360
ctgggattgt atgattacag cttgccgttt atcgccgtgc cgctgatggg gccaaactcg 420ctgggattgt atgattacag cttgccgttt atcgccgtgc cgctgatggg gccaaactcg 420
cagcctatcg gcgtgctggc cgcccagcct atggcgcgtt acgaggagcg gctgcccgcc 480cagcctatcg gcgtgctggc cgcccagcct atggcgcgtt acgaggagcg gctgcccgcc 480
tgcacgcgtt ttcttgaaac cgtcgccaat ctggtggcgc aaaccgttcg cctgatgaca 540tgcacgcgtt ttcttgaaac cgtcgccaat ctggtggcgc aaaccgttcg cctgatgaca 540
ccgcccagcg tcgcgtctcc accccgtgct gctgccgcgc agattgccag ccagcgcggg 600ccgcccagcg tcgcgtctcc accccgtgct gctgccgcgc agattgccag ccagcgcggg 600
tgcgcgtctt cgcgagcgta tggctttgaa aacatggtcg gtaaaagcgc ggctatgcgt 660tgcgcgtctt cgcgagcgta tggctttgaa aacatggtcg gtaaaagcgc ggctatgcgt 660
cagacgctgg aaattattcg ccaggtatca cgctgggaca ccaccgtgct ggtgcgtggc 720cagacgctgg aaattattcg ccaggtatca cgctgggaca ccaccgtgct ggtgcgtggc 720
gaaagcggaa ccggtaaaga gttgatagcc aacgctatcc accacaattc accgcgcgcc 780gaaagcggaa ccggtaaaga gttgatagcc aacgctatcc accacaattc accgcgcgcc 780
gccgcgccgt ttgtcaaatt caactgcgcg gcgctgcccg atacgctgct ggagagtgaa 840gccgcgccgt ttgtcaaatt caactgcgcg gcgctgcccg atacgctgct ggagagtgaa 840
ctcttcggtc atgaaaaagg cgcgtttacc ggcgcggtgc gccagcgcaa aggccgtttc 900ctcttcggtc atgaaaaagg cgcgtttacc ggcgcggtgc gccagcgcaa aggccgtttc 900
gaactggcgg atggcggtac gctgtttctt gatgagatcg gcgaaagtag cgcctcgttt 960gaactggcgg atggcggtac gctgtttctt gatgagatcg gcgaaagtag cgcctcgttt 960
caggcgaaat tgctgcgtat cttgcaggaa ggcgaaatgg aacgcgtcgg cggcgacgaa 1020caggcgaaat tgctgcgtat cttgcaggaa ggcgaaatgg aacgcgtcgg cggcgacgaa 1020
acgctgcggg tgaatgtacg gatcattgcc gccaccaacc gcaatctgga agaggaagtg 1080acgctgcggg tgaatgtacg gatcattgcc gccaccaacc gcaatctgga agaggaagtg 1080
cggctgggta attttcgcga agatctctac tatcgcctta atgtgatgcc gatctccctg 1140cggctgggta attttcgcga agatctctac tatcgcctta atgtgatgcc gatctccctg 1140
cccccgctcc gcgagcgtca ggaggacatc gtcgagctgg cgcattttct ggtgcgcaaa 1200cccccgctcc gcgagcgtca ggaggacatc gtcgagctgg cgcattttct ggtgcgcaaa 1200
atcgcgcaaa accagaaccg cacgctgcgc atcagcgatg gcgcgatccg tttgttgatg 1260atcgcgcaaa accagaaccg cacgctgcgc atcagcgatg gcgcgatccg tttgttgatg 1260
agctatagct ggcctggaaa cgtgcgtgag ctggaaaact gccttgagcg atcggcggtg 1320agctatagct ggcctggaaa cgtgcgtgag ctggaaaact gccttgagcg atcggcggtg 1320
atgtcggaaa acgggctgat cgatcgcgac gtgattttgt ttcaccacag ggaaaatctg 1380atgtcggaaa acgggctgat cgatcgcgac gtgattttgt ttcaccacag ggaaaatctg 1380
ccaaaaacgc cacagaccag tgcgccgcgc gaagagagct ggctcgatca gaacctcgat 1440ccaaaaacgc cacagaccag tgcgccgcgc gaagagagct ggctcgatca gaacctcgat 1440
gagcgacaaa gattgatcgc cgcgctggag aaagccggtt gggtacaggc aaaagccgcg 1500gagcgacaaa gattgatcgc cgcgctggag aaagccggtt gggtacaggc aaaagccgcg 1500
cgcctgctgg gaatgacccc gcgccaggtg gcctatcgta ttcagacgat ggacattgcc 1560cgcctgctgg gaatgacccc gcgccaggtg gcctatcgta ttcagacgat ggacattgcc 1560
atgccgagat tgtag 1575atgccgagat tgtag 1575
<210> 165<210> 165
<211> 2856<211> 2856
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> glnE<223> glnE
<400> 165<400> 165
atgccgcttt cttcgcagtt acagcagcag tggcagaccg tttgcgaacg tctgcctgag 60atgccgcttt cttcgcagtt acagcagcag tggcagaccg tttgcgaacg tctgcctgag 60
tcattaccgg cgtcatcgtt aagcgagcag gcaaagagcg tgctcgtctt cagtgatttt 120tcattaccgg cgtcatcgtt aagcgagcag gcaaagagcg tgctcgtctt cagtgatttt 120
gtgcaggaaa gtatcaccgc caacccgaac tggctggcgg aacttgagaa cgcaccaccg 180gtgcaggaaa gtatcaccgc caacccgaac tggctggcgg aacttgagaa cgcaccaccg 180
caggcagaag agtggcggca ctatgctggc tggctgcaaa ctgtactcga agacgttacg 240caggcagaag agtggcggca ctatgctggc tggctgcaaa ctgtactcga agacgttacg 240
gatgaggcca cgctgatgcg cgtcctgcgc cagttccgtc gtcgggtgat ggtgcgcatt 300gatgaggcca cgctgatgcg cgtcctgcgc cagttccgtc gtcgggtgat ggtgcgcatt 300
gcctgggctc aggcgctgga actggtgagc gaagagagta cgctgcagca gttaagcgag 360gcctgggctc aggcgctgga actggtgagc gaagagagta cgctgcagca gttaagcgag 360
ctggcgcaaa cgttgattgt cgccgcgcga gactggctct atgccgcctg ctgtaaagag 420ctggcgcaaa cgttgattgt cgccgcgcga gactggctct atgccgcctg ctgtaaagag 420
tggggcacgc cgtgcagcga ggaaggggtt cctcagccgc tgttgattct ggggatggga 480tggggcacgc cgtgcagcga ggaaggggtt cctcagccgc tgttgattct ggggatggga 480
aagctgggcg gctgcgagct gaacttctcc tctgatatcg acctgatttt tgcctggccg 540aagctgggcg gctgcgagct gaacttctcc tctgatatcg acctgatttt tgcctggccg 540
gagaacggct ccacgcgcgg aggccgccgc gagctggaca acgcgcagtt ctttacccgt 600gagaacggct ccacgcgcgg aggccgccgc gagctggaca acgcgcagtt ctttacccgt 600
ctcggccagc gcctgattaa agcgctggat cagcccacgc aggacggttt tgtttaccgc 660ctcggccagc gcctgattaa agcgctggat cagcccacgc aggacggttt tgtttaccgc 660
gtggacatgc gcctgcgtcc gtttggcgac agcgggccgc tggtgctgag ctttgcggcg 720gtggacatgc gcctgcgtcc gtttggcgac agcgggccgc tggtgctgag ctttgcggcg 720
ctggaagatt attaccagga gcaaggtcgc gactgggagc gttacgcgat ggtcaaagcg 780ctggaagatt attaccagga gcaaggtcgc gactgggagc gttacgcgat ggtcaaagcg 780
cggatcatgg gcgacagcga cgacgcttat gccaacgagc tgcgcgccat gctgcgtccg 840cggatcatgg gcgacagcga cgacgcttat gccaacgagc tgcgcgccat gctgcgtccg 840
ttcgtgttcc gtcgctatat cgacttcagc gtcatccagt ccctgcgaaa tatgaaaggg 900ttcgtgttcc gtcgctatat cgacttcagc gtcatccagt ccctgcgaaa tatgaaaggg 900
atgattgccc gcgaggtgcg ccgccgtggg ctgaaagaca atatcaagct cggtgcgggc 960atgattgccc gcgaggtgcg ccgccgtggg ctgaaagaca atatcaagct cggtgcgggc 960
ggcatccgcg aaatcgaatt tatcgtccag gtcttccagc ttattcgcgg cggacgcgag 1020ggcatccgcg aaatcgaatt tatcgtccag gtcttccagc ttattcgcgg cggacgcgag 1020
ccgtcgctgc agtcccgttc cttattaccg acgctgagcg ccattgcgca gctgcatctc 1080ccgtcgctgc agtcccgttc cttattaccg acgctgagcg ccattgcgca gctgcatctc 1080
ctgccggacg gcgacgcgca aaccctgcgc gaggcctatc ttttcctgcg tcgtctggaa 1140ctgccggacg gcgacgcgca aaccctgcgc gaggcctatc ttttcctgcg tcgtctggaa 1140
aacctgctgc aaagcattaa tgacgaacag acccaaaccc tgccgggcga cgaccttaac 1200aacctgctgc aaagcattaa tgacgaacag acccaaaccc tgccggggcga cgaccttaac 1200
cgggcgcgtc tggcctgggg aatgcgcgtg gaagactggt caacgctgac cgaacggctc 1260cgggcgcgtc tggcctgggg aatgcgcgtg gaagactggt caacgctgac cgaacggctc 1260
gatgcccata tggcaggcgt gcgccgaatc tttaacgaac tgatcggtga tgacgaaagt 13201320 gatgcccata tggcaggcgt gcgccgaatc tttaacgaac
gagtcgcagg acgatgcgct ctccgagcac tggcgcgagc tgtggcagga cgcgcttcag 1380gagtcgcagg acgatgcgct ctccgagcac tggcgcgagc tgtggcagga cgcgcttcag 1380
gaagatgaca ccacgccggt gctgacgcac ttaaccgacg acgcgcgcca tcgcgtggtg 14401440
gcgctgatcg ctgatttccg tcttgagctg aacaaacgcg ccatcggccc gcgtggtcgc 1500gcgctgatcg ctgatttccg tcttgagctg aacaaacgcg ccatcggccc gcgtggtcgc 1500
caggtgctgg atcacctgat gccgcacctg ctgagcgaag tctgctcgcg tgccgatgcg 1560caggtgctgg atcacctgat gccgcacctg ctgagcgaag tctgctcgcg tgccgatgcg 1560
ccggtgccgc tgtcgcggat gatgcccctg ctgagcggga ttatcacccg tactacctac 1620ccggtgccgc tgtcgcggat gatgcccctg ctgagcggga ttatcacccg tactacctac 1620
cttgaactcc tgagcgagtt ccctggcgcg cttaagcacc tgatttcact ctgcgccgcg 16801680 cttgaactcc tgagcgagtt ccctggcgcg
tcgccgatgg tggccaacaa gctggcgcgt tacccgctgc tgctggatga gctgctcgat 1740tcgccgatgg tggccaacaa gctggcgcgt tacccgctgc tgctggatga gctgctcgat 1740
ccgaataccc tttatcaacc gacggcgacc gacgcctacc gggacgaact gcgtcagtat 1800ccgaataccc tttatcaacc gacggcgacc gacgcctacc gggacgaact gcgtcagtat 1800
ctgctgcgcg tgccggaaga agacgaagag caacagctgg aggcgctgcg tcagtttaag 1860ctgctgcgcg tgccggaaga agacgaagag caacagctgg aggcgctgcg tcagtttaag 1860
caggcccaga tgctgcgcgt ggcggccgca gatattgccg gaacgctgcc ggtgatgaaa 1920caggcccaga tgctgcgcgt ggcggccgca gatattgccg gaacgctgcc ggtgatgaaa 1920
gtgagcgatc acttaacctg gcttgcggaa gcgattatcg acgcggtggt gcatcaggcc 1980gtgagcgatc acttaacctg gcttgcggaa gcgattatcg acgcggtggt gcatcaggcc 1980
tgggtgcaga tggtggcgcg ctatggccag ccgaaacatc tggctgaccg tgatggtcgc 2040tgggtgcaga tggtggcgcg ctatggccag ccgaaacatc tggctgaccg tgatggtcgc 2040
ggcttcgcgg tggtgggtta cggtaagctc ggcggttggg agctgggcta tagctccgat 2100ggcttcgcgg tggtgggtta cggtaagctc ggcggttggg agctgggcta tagctccgat 2100
ctggatttaa tcttcctcca cgactgcccg gttgatgtga tgaccgacgg cgagcgcgag 2160ctggatttaa tcttcctcca cgactgcccg gttgatgtga tgaccgacgg cgagcgcgag 2160
attgacgggc gtcagttcta cctgcgcctg gcgcagcgca tcatgcacct gttcagcacc 2220attgacgggc gtcagttcta cctgcgcctg gcgcagcgca tcatgcacct gttcagcacc 2220
cgcacctcgt cgggcatttt gtatgaagtg gatgcccgtc tgcgcccgtc cggcgcggcg 2280cgcacctcgt cgggcatttt gtatgaagtg gatgcccgtc tgcgcccgtc cggcgcggcg 2280
ggcatgctgg tcacctcgac ggagtccttc gctgattacc agaagaatga agcctggacg 2340ggcatgctgg tcacctcgac ggagtccttc gctgattacc agaagaatga agcctggacg 2340
tgggagcatc aggcgctggt gcgcgcccgt gtggtgtatg gcgatccgct gctgaaaacg 2400tgggagcatc aggcgctggt gcgcgcccgt gtggtgtatg gcgatccgct gctgaaaacg 2400
cagtttgacg tgattcgtaa ggaagtcatg accaccgtgc gcgatggcag cacgctgcaa 2460cagtttgacg tgattcgtaa ggaagtcatg accaccgtgc gcgatggcag cacgctgcaa 2460
acggaagtgc gcgaaatgcg cgagaaaatg cgcgcgcact taggcaataa acatcgcgat 2520acggaagtgc gcgaaatgcg cgagaaaatg cgcgcgcact taggcaataa acatcgcgat 2520
cgctttgata ttaaagccga tgagggcggt attaccgata ttgagtttat tacccagtat 25802580
ctggtgttgc tgcacgcgca tgacaagccg aagctgacgc gctggtcgga taacgtgcgc 2640ctggtgttgc tgcacgcgca tgacaagccg aagctgacgc gctggtcgga taacgtgcgc 2640
attctggaac tgctggcgca aaacgacatt atggacgagc aggaggcgca ggccttaacc 2700attctggaac tgctggcgca aaacgacatt atggacgagc aggaggcgca ggccttaacc 2700
cgtgcctata caacgcttcg cgatgagctc catcatctgg cgttgcagga gcagccggga 2760cgtgcctata caacgcttcg cgatgagctc catcatctgg cgttgcagga gcagccggga 2760
cacgtggcgc tggactgttt caccgctgaa cgcgctcagg taacggccag ctggcagaag 2820cacgtggcgc tggactgttt caccgctgaa cgcgctcagg taacggccag ctggcagaag 2820
tggctggtgg aaccgtgcgt aacaaatcaa gtgtga 2856tggctggtgg aaccgtgcgt aacaaatcaa gtgtga 2856
<210> 166<210> 166
<211> 1290<211> 1290
<212> ДНК<212> DNA
<213> вид Enterobacter<213> Enterobacter species
<220><220>
<223> amtB<223> amtB
<400> 166<400> 166
atgaagatag caacacttaa aacgggtctg ggttcgctgg cactgctgcc gggcctggcg 60atgaagatag caacacttaa aacgggtctg ggttcgctgg cactgctgcc gggcctggcg 60
ctggctgctg cacctgcggt ggcagacaaa gccgataacg cctttatgat gatcagcacc 120ctggctgctg cacctgcggt ggcagacaaa gccgataacg cctttatgat gatcagcacc 120
gcgctggtgc tgttcatgtc cattccgggc attgcgctgt tctatggcgg cctgatccgt 180gcgctggtgc tgttcatgtc cattccgggc attgcgctgt tctatggcgg cctgatccgt 180
ggcaaaaacg ttctctccat gctgacgcag gttgccgtaa cgttcgcgct ggtctgcgta 240ggcaaaaacg ttctctccat gctgacgcag gttgccgtaa cgttcgcgct ggtctgcgta 240
ctgtgggtgg tttacggtta ctcgctggct ttcggcacgg gcaacgcgtt ctttggtaac 300ctgtgggtgg tttacggtta ctcgctggct ttcggcacgg gcaacgcgtt ctttggtaac 300
ttcgactggg tgatgctgaa aaatattgaa ctgaccgcgc tgatgggcag tttctaccag 360360
tatattcacg ttgctttcca gggctcgttc gcctgcatta ccgtcgggct gattgtaggc 420tatattcacg ttgctttcca gggctcgttc gcctgcatta ccgtcgggct gattgtaggc 420
gcgcttgccg agcgtattcg tttctctgcg gtcctgatct tcgtggtggt ctggctgacg 480gcgcttgccg agcgtattcg tttctctgcg gtcctgatct tcgtggtggt ctggctgacg 480
ctctcctatg tgccgattgc gcacatggtc tggggtggcg gtctgctggc gacgcatggc 540ctctcctatg tgccgattgc gcacatggtc tggggtggcg gtctgctggc gacgcatggc 540
gcgctggact tcgcgggcgg taccgttgtg cacattaacg ccgcggtagc gggtctggtt 600gcgctggact tcgcgggcgg taccgttgtg cacattaacg ccgcggtagc gggtctggtt 600
ggcgcatacc tgattggcaa acgcgtgggc ttcggtaaag aagcgttcaa accgcacaac 660ggcgcatacc tgattggcaa acgcgtggggc ttcggtaaag aagcgttcaa accgcacaac 660
ctgccgatgg tcttcaccgg taccgcgatc ctctactttg gctggtttgg tttcaacgcc 720ctgccgatgg tcttcaccgg taccgcgatc ctctactttg gctggtttgg tttcaacgcc 720
ggctcagcaa gtgccgcgaa cgaaatcgcc gcgctggcct tcgtgaatac cgttgtggcc 780ggctcagcaa gtgccgcgaa cgaaatcgcc gcgctggcct tcgtgaatac cgttgtggcc 780
acggcaggtg caatcctctc ctgggtcttt ggcgagtggg ctgtgcgcgg taaaccttct 840acggcaggtg caatcctctc ctgggtcttt ggcgagtggg ctgtgcgcgg taaaccttct 840
ctgctgggtg cctgttcggg ggcgattgct ggtctggtcg gtatcacccc agcatgtggt 900ctgctgggtg cctgttcggg ggcgattgct ggtctggtcg gtatcacccc agcatgtggt 900
tatgtcggtg tgggtggcgc gctgctggtc ggcctggtgt caggtctggc gggtctgtgg 960tatgtcggtg tgggtggcgc gctgctggtc ggcctggtgt caggtctggc gggtctgtgg 960
ggcgtgacgg cgctgaaacg tattctgcgc gttgatgacc cttgcgatgt gtttggcgtg 1020ggcgtgacgg cgctgaaacg tattctgcgc gttgatgacc cttgcgatgt gtttggcgtg 1020
cacggcgtgt gcggcatcgt cggctgtatc atgaccggta tctttgcagc gaaatcgctg 1080cacggcgtgt gcggcatcgt cggctgtatc atgaccggta tctttgcagc gaaatcgctg 1080
ggtggcgtgg gctacgcaga aggcgtcacc atggcccatc aggtgctggt gcagctggaa 1140ggtggcgtgg gctacgcaga aggcgtcacc atggcccatc aggtgctggt gcagctggaa 1140
agtattgctg tcaccgtggt gtggtctgcc gttgtcgctt tcattggcta caaactggcg 1200agtattgctg tcaccgtggt gtggtctgcc gttgtcgctt tcattggcta caaactggcg 1200
gacatgacgg ttggtctgcg cgtgccggaa gagcaggaac gcgaaggtct ggacgtcaac 1260gacatgacgg ttggtctgcg cgtgccggaa gagcaggaac gcgaaggtct ggacgtcaac 1260
agccacggcg agaatgcgta taacgcatga 1290agccacggcg agaatgcgta taacgcatga 1290
<210> 167<210> 167
<211> 1299<211> 1299
<212> ДНК<212> DNA
<213> Azospirillum lipoferum<213> Azospirillum lipoferum
<220><220>
<223> 16S<223> 16S
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (294)..(294)<222> (294)..(294)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (299)..(299)<222> (299)..(299)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (302)..(302)<222> (302)..(302)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (309)..(310)<222> (309)..(310)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (332)..(332)<222> (332)..(332)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (346)..(346)<222> (346)..(346)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (351)..(351)<222> (351)..(351)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (438)..(438)<222> (438)..(438)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (445)..(445)<222> (445)..(445)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (454)..(454)<222> (454)..(454)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (469)..(469)<222> (469)..(469)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (477)..(477)<222> (477)..(477)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (492)..(492)<222> (492)..(492)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (504)..(504)<222> (504)..(504)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (555)..(555)<222> (555)..(555)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (775)..(775)<222> (775)..(775)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 167<400> 167
gccgagagag gggcccgcgt cggattaggt agttggtgag gtaatggctc accaagcctt 60gccgagagag gggcccgcgt cggattaggt agttggtgag gtaatggctc accaagcctt 60
cgatccgtag ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac 120cgatccgtag ctggtctgag aggatgatca gccacactgg gactgagaca cggcccagac 120
tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatgggc gcaagcctga tccagcaatg 180tcctacggga ggcagcagtg gggaatattg gacaatggggc gcaagcctga tccagcaatg 180
ccgcgtgagt gatgaaggcc ttagggttgt aaagctcttt cgcacgcgac gatgatgacg 240ccgcgtgagt gatgaaggcc ttagggttgt aaagctcttt cgcacgcgac gatgatgacg 240
gtagcgtgag aagaagcccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgnagggng 300gtagcgtgag aagaagcccc ggctaacttc gtgccagcag ccgcggtaat acgnagggng 300
cnagcgttnn tcggaattac tgggcgtaaa gngcgcgtag gcggcntgtt nagtcagaag 360cnagcgttnn tcggaattac tgggcgtaaa gngcgcgtag gcggcntgtt nagtcagaag 360
tgaaagcccc gggctcaacc tgggaatagc ttttgatact ggcaggcttg agttccggag 420tgaaagcccc gggctcaacc tgggaatagc ttttgatact ggcaggcttg agttccggag 420
aggatggtgg aattcccngt gtagnggtga aatncgtaga tattgggang aacaccngtg 480aggatggtgg aattcccngt gtagnggtga aatncgtaga tattgggang aacaccngtg 480
gcgaaggcgg cnatctggac gganactgac gctgaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 540gcgaaggcgg cnatctggac gganactgac gctgaggcgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 540
ggattagata ccctngtagt ccacgccgta aacgatgaat gctagacgtc ggggtgcatg 600ggattagata ccctngtagt ccacgccgta aacgatgaat gctagacgtc ggggtgcatg 600
cacttcggtg tcgccgctaa cgcattaagc attccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt 660cacttcggtg tcgccgctaa cgcattaagc attccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt 660
aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa 720aaaactcaaa ggaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgaa 720
gcaacgcgca gaaccttacc aacccttgac atgtccactt tgggctcgag agatngggtc 780gcaacgcgca gaaccttacc aacccttgac atgtccactt tgggctcgag agatngggtc 780
cttcagttcg gctgggtgga acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag 840cttcagttcg gctgggtgga acacaggtgc tgcatggctg tcgtcagctc gtgtcgtgag 840
atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctaccgt cagttgccat cattcagttg 900atgttgggtt aagtcccgca acgagcgcaa cccctaccgt cagttgccat cattcagttg 900
ggcactctgg tggaaccgcc ggtgacaagc cggaggaagg cggggatgac gtcaagtcct 960ggcactctgg tggaaccgcc ggtgacaagc cggaggaagg cggggatgac gtcaagtcct 960
catggccctt atgggttggg ctacacacgt gctacaatgg cggtgacagt gggaagcgaa 1020catggccctt atgggttggg ctacacacgt gctacaatgg cggtgacagt gggaagcgaa 1020
gtcgcgagat ggagcaaatc cccaaaagcc gtctcagttc ggatcgcact ctgcaactcg 1080gtcgcgagat ggagcaaatc cccaaaagcc gtctcagttc ggatcgcact ctgcaactcg 1080
agtgcgtgaa gttggaatcg ctagtaatcg cggatcagca cgccgcggtg aatacgttcc 1140agtgcgtgaa gttggaatcg ctagtaatcg cggatcagca cgccgcggtg aatacgttcc 1140
cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg ttttacccga aggtggtgcg 1200cgggccttgt acacaccgcc cgtcacacca tgggagttgg ttttacccga aggtggtgcg 1200
ctaaccgcaa ggaggcagcc aaccacggta aggtcagcga ctggggtgaa gtcgtaacaa 1260ctaaccgcaa ggaggcagcc aaccacggta aggtcagcga ctggggtgaa gtcgtaacaa 1260
ggtagccgta ggggaacctg cggctggatc acctccttt 1299ggtagccgta ggggaacctg cggctggatc acctccttt 1299
<210> 168<210> 168
<211> 897<211> 897
<212> ДНК<212> DNA
<213> Azospirillum lipoferum<213> Azospirillum lipoferum
<220><220>
<223> nifH<223> nifH
<400> 168<400> 168
atggccaaag cgcctctgcg tcagatcgcc ttttacggca agggcggtat cggcaagtcc 60atggccaaag cgcctctgcg tcagatcgcc ttttacggca agggcggtat cggcaagtcc 60
accacctctc agaacacgct ggccgcgctg gtcgagctgg atcagaggat cctgatcgtc 120accacctctc agaacacgct ggccgcgctg gtcgagctgg atcagaggat cctgatcgtc 120
ggctgcgacc cgaaggccga ctcgacccgc ctgatcctgc acgcaaaggc ccaggacacc 180ggctgcgacc cgaaggccga ctcgacccgc ctgatcctgc acgcaaaggc ccaggacacc 180
gtcctgcatc tggccgccga ggccggctcg gtcgaggatc tggagctcga ggacgttctc 240gtcctgcatc tggccgccga ggccggctcg gtcgaggatc tggagctcga ggacgttctc 240
aagatcggct acaagaacat caagtgcgtc gagtccggcg gtccggagcc gggggtcggc 300aagatcggct acaagaacat caagtgcgtc gagtccggcg gtccggagcc gggggtcggc 300
tgcgccggcc gcggcgtcat cacctcgatc aacttcctgg aagagaacgg cgcctacgac 360tgcgccggcc gcggcgtcat cacctcgatc aacttcctgg aagagaacgg cgcctacgac 360
gacgtggact atgtgtccta cgacgtgctg ggcgacgtgg tctgcggcgg cttcgccatg 420gacgtggact atgtgtccta cgacgtgctg ggcgacgtgg tctgcggcgg cttcgccatg 420
ccgatccgcg agaacaaggc ccaggaaatc tacatcgtca tgtccggcga gatgatggcg 480ccgatccgcg agaacaaggc cggaaatc tacatcgtca tgtccggcga gatgatggcg 480
ctgtacgccg ccaacaacat cgccaagggc atcctgaagt acgcgcacag cggcggcgtc 540ctgtacgccg ccaacaacat cgccaagggc atcctgaagt acgcgcacag cggcggcgtc 540
cgtctcggcg gcctgatctg caacgagcgc cagaccgaca aggaatggga tctggccgac 600cgtctcggcg gcctgatctg caacgagcgc cagaccgaca aggaatggga tctggccgac 600
gcgctggcca agcgcctggg ctccaagctg atccacttcg tgccgcgcga caacatcgtc 660gcgctggcca agcgcctgggg ctccaagctg atccacttcg tgccgcgcga caacatcgtc 660
cagcacgccg agctgcgccg catgacggtc atcgagtacg ccccggacag caagcaggcc 720cagcacgccg agctgcgccg catgacggtc atcgagtacg ccccggacag caagcaggcc 720
ggcgaatacc gcgcgctcgc caacaagatc catgcgaact ccggccaggg ttgcatcccg 780ggcgaatacc gcgcgctcgc caacaagatc catgcgaact ccggcgggg ttgcatcccg 780
accccgatca ccatggaaga gctggaagag atgctgatgg acttcggcat catgaagacc 840accccgatca ccatggaaga gctggaagag atgctgatgg acttcggcat catgaagacc 840
gaggagcagc agctcgccga gctcgccgcc aaggaagcgg cgaaggccgg cgcctga 897gaggagcagc agctcgccga gctcgccgcc aaggaagcgg cgaaggccgg cgcctga 897
<210> 169<210> 169
<211> 1440<211> 1440
<212> ДНК<212> DNA
<213> Azospirillum lipoferum<213> Azospirillum lipoferum
<220><220>
<223> nifD1<223> nifD1
<400> 169<400> 169
atgagcctgt ccgagaacac cacggtcgac gtcaagaacc tcgtcaacga agtcctcgaa 60atgagcctgt ccgagaacac cacggtcgac gtcaagaacc tcgtcaacga agtcctcgaa 60
gcctatcccg aaaaatcccg caagcgccgc gccaagcacc tgaacgtgct ggaggccgag 120gcctatcccg aaaaatcccg caagcgccgc gccaagcacc tgaacgtgct ggaggccgag 120
gccaaggact gcggcgtcaa gtcgaacgtc aagtccatcc ccggcgtcat gaccatccgc 180gccaaggact gcggcgtcaa gtcgaacgtc aagtccatcc ccggcgtcat gaccatccgc 180
ggctgcgcct atgccggctc caagggcgtg gtgtggggtc cgatcaagga catgatccac 240ggctgcgcct atgccggctc caagggcgtg gtgtggggtc cgatcaagga catgatccac 240
atctcccacg gtccggtcgg ctgcggctac tactcctggt ccggccgccg caactactac 300atctccccg gtccggtcgg ctgcggctac tactcctggt ccggccgccg caactactac 300
atcggcgaca ccggtgtgga cagctggggc acgatgcact tcacctccga cttccaggag 360atcggcgaca ccggtgtgga cagctggggc acgatgcact tcacctccga cttccaggag 360
aaggacatcg tcttcggcgg cgacaagaag ctgcacaagg tcatcgagga aatcaacgag 420aaggacatcg tcttcggcgg cgacaagaag ctgcacaagg tcatcgagga aatcaacgag 420
ctgttcccgc tggtgaacgg catctcgatc cagtcggaat gcccgatcgg cctgatcggc 480ctgttcccgc tggtgaacgg catctcgatc cagtcggaat gcccgatcgg cctgatcggc 480
gacgacatcg aggctgtcgc ccgcgccaag tcggcggaaa tcggcaagcc ggtcatcccc 540gacgacatcg aggctgtcgc ccgcgccaag tcggcggaaa tcggcaagcc ggtcatcccc 540
gtgcgctgcg aaggcttccg cggcgtgtcc cagtcgctgg gccaccacat cgccaacgac 600gtgcgctgcg aaggcttccg cggcgtgtcc cagtcgctgg gccaccacat cgccaacgac 600
gccatccgag actgggtgtt cgagaagacg gaacccaagg ccggcttcgt ctccaccccc 660gccatccgag actgggtgtt cgagaagacg gaacccaagg ccggcttcgt ctccaccccc 660
tatgacgtca ccatcatcgg cgactacaac atcggcggcg acgcctggtc gtcccgcatc 720tatgacgtca ccatcatcgg cgactacaac atcggcggcg acgcctggtc gtcccgcatc 720
ctgctggagg agatcggcct gcgcgtgatc gcccagtggt cgggcgacgg cacgctcgcc 780ctgctggagg agatcggcct gcgcgtgatc gcccagtggt cgggcgacgg cacgctcgcc 780
gaactggaga acacgccgaa ggccaaggtc aacctgatcc actgctaccg ctcgatgaac 840gaactggaga acacgccgaa ggccaaggtc aacctgatcc actgctaccg ctcgatgaac 840
tacatcgcgc gccacatgga agagaagttc aacattcctt ggatggaata caacttcttc 900tacatcgcgc gccacatgga agagaagttc aacattcctt ggatggaata caacttcttc 900
ggcccgagcc agatcgccga atccctgcgc aagatcgccg ctctcttcga cgacaagatc 960ggcccgagcc agatcgccga atccctgcgc aagatcgccg ctctcttcga cgacaagatc 960
aaggagaacg ccgagaaggt catcgcccgc taccagccga tggtcgatgc ggtcatcgcc 1020aaggagaacg ccgagaaggt catcgcccgc taccagccga tggtcgatgc ggtcatcgcc 1020
aagtacaagc cgcggctcga aggcaagaag gtcatgatct acgtcggcgg cctgcgtccc 1080aagtacaagc cgcggctcga aggcaagaag gtcatgatct acgtcggcgg cctgcgtccc 1080
cgccacgtcg tcgatgccta ccatgacctc ggcatggaga tcaccggcac cggctacgag 1140cgccacgtcg tcgatgccta ccatgacctc ggcatggaga tcaccggcac cggctacgag 1140
ttcgcccaca acgacgacta tcagcgcacg cagcactacg tgaaggaagg cacgctgatc 1200ttcgcccaca acgacgacta tcagcgcacg cagcactacg tgaaggaagg cacgctgatc 1200
tacgacgacg tcaccgcgtt cgaactggag aagttcgtcg aggcgatgcg tcccgacctc 12601260
gtcgcgtcgg gcatcaagga aaagtacgtg ttccagaaga tgggcctgcc gttccgccag 1320gtcgcgtcgg gcatcaagga aaagtacgtg ttccagaaga tgggcctgcc gttccgccag 1320
atgcacagct gggactactc cggcccgtac cacggctatg acggcttcgc gatcttcgcc 1380atgcacagct gggactactc cggcccgtac cacggctatg acggcttcgc gatcttcgcc 1380
cgcgacatgg acctggccat caacaacccc gtctggggcg tgatgaaggc cccgttctga 1440cgcgacatgg acctggccat caacaacccc gtctggggcg tgatgaaggc cccgttctga 1440
<210> 170<210> 170
<211> 1419<211> 1419
<212> ДНК<212> DNA
<213> Azospirillum lipoferum<213> Azospirillum lipoferum
<220><220>
<223> nifD2<223> nifD2
<400> 170<400> 170
atgctccagg acaagatcca ggatgtcttc aacgaaccgg gctgcgcgac caaccaagcc 60atgctccagg acaagatcca ggatgtcttc aacgaaccgg gctgcgcgac caaccaagcc 60
aaatcggcca aggagaagaa gaagggctgc accaagtcgc tgaaaccggg ggcggcagcc 120aaatcggcca aggagaagaa gaagggctgc accaagtcgc tgaaaccgggg ggcggcagcc 120
ggcggctgcg cctatgacgg ggcgatgatc gtgctccagc cgatcgccga cgccgcccat 180ggcggctgcg cctatgacgg ggcgatgatc gtgctccagc cgatcgccga cgccgcccat 180
ctggtccatg gccccatcgc ctgcctcgga aacagttggg acaaccgcgg ctccaaatcc 240ctggtccatg gccccatcgc ctgcctcgga aacagttggg acaaccgcgg ctccaaatcc 240
tccggctcgc agctctaccg caccggcttc accaccgatc tgtcggaact ggacgtcatc 300tccggctcgc agctctaccg caccggcttc accaccgatc tgtcggaact ggacgtcatc 300
ggcggcggcg agaagaagct ctaccgcgcc atcaaggaga tcgttcagca atacgacccg 360ggcggcggcg agaagaagct ctaccgcgcc atcaaggaga tcgttcagca atacgacccg 360
ccggccgtct tcgtctatca gacctgcgtg cccgccatga ccggcgacga catcgccgcg 420ccggccgtct tcgtctatca gacctgcgtg cccgccatga ccggcgacga catcgccgcg 420
gtctgcaagt tcgccacgca gaagctgggc aagccggtga tcccggtgga ctcgccgggc 480gtctgcaagt tcgccacgca gaagctgggc aagccggtga tcccggtgga ctcgccgggc 480
ttcgtcgggt cgaagaatct cggcaacaag ctggccggcg aagccctgct ggagcatgtc 540ttcgtcgggt cgaagaatct cggcaacaag ctggccggcg aagccctgct ggagcatgtc 540
atcggcacgg tcgaaccgga ctacaccacc ccgaccgacg tctgcatcat cggcgaatac 600atcggcacgg tcgaaccgga ctacaccacc ccgaccgacg tctgcatcat cggcgaatac 600
aaccttgccg gcgagctgtg gctggtcaag ccgctgctgg acgagatcgg catccgcctc 660aaccttgccg gcgagctgtg gctggtcaag ccgctgctgg acgagatcgg catccgcctc 660
ctgtcctgca tttccggcga cggccgctac cgggaggtgg cgcaggccca ccgcgcccgc 720ctgtcctgca tttccggcga cggccgctac cgggaggtgg cgcaggccca ccgcgcccgc 720
gtcaccatga tggtgtgcag ccaggcgctg gtgaatgtcg ggcgcaagat ggaggagcgc 780gtcaccatga tggtgtgcag ccaggcgctg gtgaatgtcg ggcgcaagat ggaggagcgc 780
tacggcatcc cctatttcga ggggtccttc tacggcgtgt ccgacatgtc ggacaccctg 840tacggcatcc cctatttcga ggggtccttc tacggcgtgt ccgacatgtc ggacaccctg 840
cgcaccatga cccgcatgct ggtggagcgc ggcgccgaca agggcctgat cgaccgggcg 900cgcaccatga cccgcatgct ggtggagcgc ggcgccgaca agggcctgat cgaccgggcg 900
gagggcgtga tcgcgcggga ggaaagccgg gtctggcgcc ggctggaacc ctacaagccg 960gagggcgtga tcgcgcggga ggaaagccgg gtctggcgcc ggctggaacc ctacaagccg 960
cgcttcgacg gcaagcgcgt ccttctcttc accggcggcg tcaagagctg gtcgatggtc 1020cgcttcgacg gcaagcgcgt ccttctcttc accggcggcg tcaagagctg gtcgatggtc 1020
agcgcgctgg agggtgcggg gctgaccatc ctcggcacct ccaccaagaa atcgaccagg 1080agcgcgctgg agggtgcggg gctgaccatc ctcggcacct ccaccaagaa atcgaccagg 1080
gaggacaagg agcgcatcaa gaagatgaag ggcgaagagt tccaccagtg ggacgatttg 1140gaggacaagg agcgcatcaa gaagatgaag ggcgaagagt tccaccagtg ggacgatttg 1140
aagccgcgcg acatctacag gatgctggcc gacgatcagg ccgacatcat gatgtccggc 1200aagccgcgcg acatctacag gatgctggcc gacgatcagg ccgacatcat gatgtccggc 1200
ggccgctcgc agttcatctc gctgaaggcc aaggttccct ggctcgacat caaccaggag 1260ggccgctcgc agttcatctc gctgaaggcc aaggttccct ggctcgacat caaccaggag 1260
cgccaccacg cctatgccgg ctatgacggc atcgtcaatc tctgcgagga gatcgacaaa 1320cgccaccacg cctatgccgg ctatgacggc atcgtcaatc tctgcgagga gatcgacaaa 1320
acgctgtcga atccgatctg gcgtcaggtg cgtcagccgg caccgtggga gtccggcgcg 1380acgctgtcga atccgatctg gcgtcaggtg cgtcagccgg caccgtggga gtccggcgcg 1380
tcctccaccc ttctggcttc ctcgatggcg gcggagtga 1419tcctccaccc ttctggcttc ctcgatggcg gcggagtga 1419
<210> 171<210> 171
<211> 1383<211> 1383
<212> ДНК<212> DNA
<213> Azospirillum lipoferum<213> Azospirillum lipoferum
<220><220>
<223> nifK<223> nifK
<400> 171<400> 171
atgtcccaca tccagcgctt cccctccgcc gccaaggccg cctccaccaa cccgctgaag 60atgtcccaca tccagcgctt cccctccgcc gccaaggccg cctccaccaa cccgctgaag 60
atgagccagc cgctgggtgc ggctctggcc tatctcggcg tcgaccgctg cctgccgctg 120atgagccagc cgctgggtgc ggctctggcc tatctcggcg tcgaccgctg cctgccgctg 120
ttccatggct cgcagggctg caccgccttc gggctggtcc tgctggtgcg ccatttccgc 180ttccatggct cgcagggctg caccgccttc gggctggtcc tgctggtgcg ccatttccgc 180
gaggcgatcc cgctccagac cacggcgatg gatcaggtcg ccaccatcct cggcggctac 240gaggcgatcc cgctccagac cacggcgatg gatcaggtcg ccaccatcct cggcggctac 240
gacaatctgg agcaggcgat ccgcaccatc gtcgagcgca accagcccgc catgatcggc 300gacaatctgg agcaggcgat ccgcaccatc gtcgagcgca accagcccgc catgatcggc 300
gtcgccacca ccggcgtcac cgagaccaag ggcgaggata tggccggaca gtacacgctg 360gtcgccacca ccggcgtcac cgagaccaag ggcgaggata tggccggaca gtacacgctg 360
ttccgccagc gcaaccccga cttggccgac acggccctgg tcttcgccaa cacccccgac 420ttccgccagc gcaaccccga cttggccgac acggccctgg tcttcgccaa cacccccgac 420
ttcgccggcg gcttcgagga cggcttcgcc gccgcggtca ccgcgatggt cgagcggttg 480ttcgccggcg gcttcgagga cggcttcgcc gccgcggtca ccgcgatggt cgagcggttg 480
gtcgaaccgt cgccggtgcg catcccgacc caggtcaacg tgctggccgg ctgccatctg 540gtcgaaccgt cgccggtgcg catcccgacc caggtcaacg tgctggccgg ctgccatctg 540
tcccccggcg acgtggagga actgcgcgac atcatcgaag gcttcggcct gtcgccgatc 600tcccccggcg acgtggagga actgcgcgac atcatcgaag gcttcggcct gtcgccgatc 600
ttcctgcccg acctgtcgct gtcgatggcg ggccgccagc cggccgactt caccgccacc 660ttcctgcccg acctgtcgct gtcgatggcg ggccgccagc cggccgactt caccgccacc 660
tcgctgggcg gcgtgaccgt cgatcagatc cgcgccatgg gcgcttcggc cctcaccatc 720tcgctgggcg gcgtgaccgt cgatcagatc cgcgccatgg gcgcttcggc cctcaccatc 720
gtggtcggtg agcatatgcg ggtggccggt aacgcgctgg agctgaagac cgacgtgccc 780gtggtcggtg agcatatgcg ggtggccggt aacgcgctgg agctgaagac cgacgtgccc 780
agccatttct tcaaccgcct gaccgggctg gaggcgacgg acaagctggt ccggctgctg 840agccatttct tcaaccgcct gaccgggctg gaggcgacgg acaagctggt ccggctgctg 840
atggagttgt cgggcaagcc ggcgcccgcc cggctgcggc gccagcgcga aagcctggtc 900atggagttgt cgggcaagcc ggcgcccgcc cggctgcggc gccagcgcga aagcctggtc 900
gatgccatgc tcgacgggca tttcttctac agccgcaagc gcatcgccgt cgcgctggag 960gatgccatgc tcgacgggca tttcttctac agccgcaagc gcatcgccgt cgcgctggag 960
cccgacctgc tctatgccgt caccggcttc ctcgccgaca tgggggccga ggtgatcgcc 1020cccgacctgc tctatgccgt caccggcttc ctcgccgaca tgggggccga ggtgatcgcc 1020
gcggtgtccc cgacgcagag cccggtgctg gagcggttga aggccgccac catcatggtc 1080gcggtgtccc cgacgcagag cccggtgctg gagcggttga aggccgccac catcatggtc 1080
ggcgatcatt ccgacgtgga gacgctggcc cgcgacgccg acctgatcgt ctccaactcg 1140ggcgatcatt ccgacgtgga gacgctggcc cgcgacgccg acctgatcgt ctccaactcg 1140
cacgggcggc agggagccgc gcggatcggc gtggctctgc accgcatggg cctgccgctg 1200cacgggcggc aggagccgc gcggatcggc gtggctctgc accgcatggg cctgccgctg 1200
ttcgaccggc tgggggccgg cctgcgcgtc caggtcggct accgcggcac gcgggaactg 1260ttcgaccggc tgggggccgg cctgcgcgtc caggtcggct accgcggcac gcgggaactg 1260
ctgtgcgaca tcggcaacct gttcctcgcc cgcgagatgg accacgagca cgggcacgag 1320ctgtgcgaca tcggcaacct gttcctcgcc cgcgagatgg accacgagca cgggcacgag 1320
agccacgacc acggggaatc ccacggctgc ggaggcggat catgcggatg caacgccgtc 1380agccacgacc acggggaatc ccacggctgc ggaggcggat catgcggatg caacgccgtc 1380
tga 1383tga 1383
<210> 172<210> 172
<211> 1560<211> 1560
<212> ДНК<212> DNA
<213> Azospirillum lipoferum<213> Azospirillum lipoferum
<220><220>
<223> nifK1<223> nifK1
<400> 172<400> 172
atgaccgaca agctttcgca gagcgccgac aaggtcctcg accactacac cctcttccgg 60atgaccgaca agctttcgca gagcgccgac aaggtcctcg accactacac cctcttccgg 60
cagcccgaat acgcggcgat gttcgagaag aagaagaccg agttcgagta cggccattcg 120cagcccgaat acgcggcgat gttcgagaag aagaagaccg agttcgagta cggccattcg 120
gacgaggaag tcgcccgcgt gtccgaatgg accaagtccg aggactacaa ggcgaagaac 180gacgaggaag tcgcccgcgt gtccgaatgg accaagtccg aggactacaa ggcgaagaac 180
ttcgcccgtg aagcggtcgt catcaacccg accaaggcct gccagccgat cggcgcaatg 240ttcgcccgtg aagcggtcgt catcaacccg accaaggcct gccagccgat cggcgcaatg 240
ttcgccgccc agggcttcga aggcaccctg cccttcgtcc acggctccca gggctgcgtc 300ttcgccgccc agggcttcga aggcaccctg cccttcgtcc acggctccca gggctgcgtc 300
gcctattacc gcacccacct gacccgtcac ttcaaggagc cgaacagcgc ggtctcctcg 360gcctattacc gcacccacct gacccgtcac ttcaaggagc cgaacagcgc ggtctcctcg 360
tcgatgacgg aggacgcggc ggtgttcggc ggcctgaaca acatgatcga cggcctggcg 420tcgatgacgg aggacgcggc ggtgttcggc ggcctgaaca acatgatcga cggcctggcg 420
aacgcctatg cgctctacaa gccgaagatg atcgcggtga tgaccacctg catggccgaa 480aacgcctatg cgctctacaa gccgaagatg atcgcggtga tgaccacctg catggccgaa 480
gtcatcggcg acgatttgca gggcttcatc gccaatgcga agaccaagga cagcgtcccg 540gtcatcggcg acgatttgca gggcttcatc gccaatgcga agaccaagga cagcgtcccg 540
gccgacttcc cggtccccta cgcccacacc ccggccttcg tcggcagcca catcgtcggc 600gccgacttcc cggtccccta cgcccacacc ccggccttcg tcggcagcca catcgtcggc 600
tacgacaaca tgatcaaggg gatcctgacc aacttctggg gtacgtcgga gaatttcgac 660tacgacaaca tgatcaaggg gatcctgacc aacttctggg gtacgtcgga gaatttcgac 660
acacccaaga ccgagcagat caacctgatc ccgggcttcg acggcttcgc cgtcggcaac 720acacccaaga ccgagcagat caacctgatc ccgggcttcg acggcttcgc cgtcggcaac 720
aaccgcgaac tgaagcgcat cgccggcgaa ttcggcgtga agctgcaaat cctgtccgac 780aaccgcgaac tgaagcgcat cgccggcgaa ttcggcgtga agctgcaaat cctgtccgac 780
gtgtccgaca atttcgacac gccgatggat ggcgagtacc gcatgtatga cggcggcacc 840gtgtccgaca atttcgacac gccgatggat ggcgagtacc gcatgtatga cggcggcacc 840
accatcgagg agaccaagga ggccctgcac gccaaggcca ccatctccat gcaggagtac 900accatcgagg agaccaagga ggccctgcac gccaaggcca ccatctccat gcaggagtac 900
aacacgaccc agaccctgca attctgcaag gagaagggtc aggaagtcgc caagttcaac 960aacacgaccc agaccctgca attctgcaag gagaagggtc aggaagtcgc caagttcaac 960
tacccgatgg gcgtcaccgg caccgacgag ctgctgctga agctcgccga actgtcgggc 1020tacccgatgg gcgtcaccgg caccgacgag ctgctgctga agctcgccga actgtcgggc 1020
aagccggtcc cggccagcct gaagctggag cgcggccgtc tggtcgacgc catcgccgac 1080aagccggtcc cggccagcct gaagctggag cgcggccgtc tggtcgacgc catcgccgac 1080
agccacaccc acatgcacgg caagcgcttc gccgtctatg gcgacccgga cttctgcctg 1140agccacaccc acatgcacgg caagcgcttc gccgtctatg gcgacccggga cttctgcctg 1140
ggcatgtcca agttcctgct ggagctgggt gcggagccgg tgcacatcct gtcgacgtcg 1200ggcatgtcca agttcctgct ggagctgggt gcggagccgg tgcacatcct gtcgacgtcg 1200
ggctccaaga agtgggagaa gcaggtccag aaggtgctgg acggctcgcc cttcggcgcc 1260ggctccaaga agtgggagaa gcaggtccag aaggtgctgg acggctcgcc cttcggcgcc 1260
tcgggcaagg cccatggcgg caaggatctg tggcacctgc gttcgctgat cttcaccgac 1320tcgggcaagg cccatggcgg caaggatctg tggcacctgc gttcgctgat cttcaccgac 1320
aaggtggact acatcatcgg caacagctac ggcaagtatc tggagcgcga caccaaggtt 1380aaggtggact acatcatcgg caacagctac ggcaagtatc tggagcgcga caccaaggtt 1380
ccgctgatcc gcctgaccta cccgatcttc gaccgccacc accaccaccg ctacccgacc 1440ccgctgatcc gcctgaccta cccgatcttc gaccgccacc accaccaccg ctacccgacc 1440
tggggctacc agggcgcgct gaacgtgctg gtacggatcc tggaccggat cttcgaggac 1500tggggctacc agggcgcgct gaacgtgctg gtacggatcc tggaccggat cttcgaggac 1500
atcgacgcca acaccaacat cgtcggccag accgactact cgttcgacct gatccgctga 1560atcgacgcca acaccaacat cgtcggccag accgactact cgttcgacct gatccgctga 1560
<210> 173<210> 173
<211> 1530<211> 1530
<212> ДНК<212> DNA
<213> Azospirillum lipoferum<213> Azospirillum lipoferum
<220><220>
<223> nifA<223> nifA
<400> 173<400> 173
atgttgacct ctgatattgt tggcaaattg cgctgcatcg cagcagaccc caaagcgggc 60atgttgacct ctgatattgt tggcaaattg cgctgcatcg cagcagaccc caaagcgggc 60
atcgcaaggg gcctcgacac cgggacgacg aagatcggtc ccgtttggga gggtgacgtg 120atcgcaaggg gcctcgacac cgggacgacg aagatcggtc ccgtttggga gggtgacgtg 120
ggcgacaccg tggatttcga agcgctgcgc cagcgggcgg tccactccct gttcgaacat 180ggcgacaccg tggatttcga agcgctgcgc cagcgggcgg tccactccct gttcgaacat 180
ctggaatcca tgtgcgtcgg cgccgtcgcc gtcgaccaca ccggccgcat cgcctggatg 240ctggaatcca tgtgcgtcgg cgccgtcgcc gtcgaccaca ccggccgcat cgcctggatg 240
gacgagaagt acaaggctct gctgggcgtt cccgacgacc cgcgcggccg gcaggtggag 300gacgagaagt acaaggctct gctgggcgtt cccgacgacc cgcgcggccg gcaggtggag 300
gacgtcatcc ccaacagcca gctgcgccgg gtgatcgaca gcggccagcc gcagccgctg 360gacgtcatcc ccaacagcca gctgcgccgg gtgatcgaca gcggccagcc gcagccgctg 360
gacatcatgg agttcgacga ccggtccttc gtggtgacgc ggatgccgct gttcggcacc 420gacatcatgg agttcgacga ccggtccttc gtggtgacgc ggatgccgct gttcggcacc 420
gacggttcga tcatcggcgc catcggcttc gtgctgttcg accgcgccga atatctccgc 480gacggttcga tcatcggcgc catcggcttc gtgctgttcg accgcgccga atatctccgc 480
ccgctggtcc gcaaatacga gaagatgcag gaggagctgg cccgcaccca gcaggagctg 540ccgctggtcc gcaaatacga gaagatgcag gaggagctgg cccgcaccca gcaggagctg 540
gcgcatgagc gccgcgccaa atactccttc tcgcagttcc tgggcgccag cgaatcgatc 600gcgcatgagc gccgcgccaa atactccttc tcgcagttcc tgggcgccag cgaatcgatc 600
cgcgagatca agcggctggg gcgccgcgcc gcccagatgg attcgaccgt cctgctgctg 660cgcgagatca agcggctggg gcgccgcgcc gcccagatgg attcgaccgt cctgctgctg 660
ggcgaaaccg ggaccggcaa ggagctgctg gcccaggcca tccattccgc cagcccgcgg 720ggcgaaaccg ggaccggcaa ggagctgctg gcccaggcca tccattccgc cagcccgcgg 720
gcgtccaagc ccttcgtcgg cgtcaatgtc gccgccattc cggaaaccct gctggaggcg 780gcgtccaagc ccttcgtcgg cgtcaatgtc gccgccattc cggaaaccct gctggaggcg 780
gagttcttcg gcgtcgcccc cggcgccttc accggcgccg accgccgcca ccgcgacggc 840gagttcttcg gcgtcgcccc cggcgccttc accggcgccg accgccgcca ccgcgacggc 840
aagttccagc tcgccaacgg cggcaccctg ttcctcgacg agatcggcga catgccgctg 900aagttccagc tcgccaacgg cggcaccctg ttcctcgacg agatcggcga catgccgctg 900
ccggtgcagg ccaagcttct gcgcgtgctg caggagcggg agatcgagcc gctcggctcc 960ccggtgcagg ccaagcttct gcgcgtgctg caggagcggg agatcgagcc gctcggctcc 960
aacaaggtgg tgcgggtcga tgtccgcatc atcgccgcca ccagccgtga cctgcacgcc 10201020
ctggtgcgtg agaagcagtt ccgcgccgac ctctattacc ggctgaatgt ggtgccgatc 1080ctggtgcgtg agaagcagtt ccgcgccgac ctctattacc ggctgaatgt ggtgccgatc 1080
accctgccgc cgctgcgcga ccggccggag gacatcgaga gcatcgccga ccgcatcctg 1140accctgccgc cgctgcgcga ccggccggag gacatcgaga gcatcgccga ccgcatcctg 1140
gaacagctgg cgatccagca gggcacgccg ccgcgcgagc tgctggaatc ggcggtgcag 1200gaacagctgg cgatccagca gggcacgccg ccgcgcgagc tgctggaatc ggcggtgcag 1200
gtgctgcgcg actatgactg gcccggcaat gtgcgcgagc tttacaacac gctggaacgg 1260gtgctgcgcg actatgactg gcccggcaat gtgcgcgagc tttacaacac gctggaacgg 1260
gtggtggcgc tgaccgatgc gccgatcctg accgcgccgc acatccgcag cgtgctgccc 1320gtggtggcgc tgaccgatgc gccgatcctg accgcgccgc acatccgcag cgtgctgccc 1320
ggccagcatc cggccggcgc gtcggccctg ccgctggcgg ccggcgcgcg gccgttgcag 1380ggccagcatc cggccggcgc gtcggccctg ccgctggcgg ccggcgcgcg gccgttgcag 1380
gaggtgctgc acgccgccga gcgccacgcc atcgccgcgg cgcttgagga ggcgaacggc 1440gaggtgctgc acgccgccga gcgccacgcc atcgccgcgg cgcttgagga ggcgaacggc 1440
gtcaaggcgc gggcggcgaa gctgctgggc atttcgcgcg cgtcgctgta cgaacgcatg 1500gtcaaggcgc gggcggcgaa gctgctgggc atttcgcgcg cgtcgctgta cgaacgcatg 1500
gtgacgctgg ggttgggggc gacgcagtag 1530gtgacgctgg ggttgggggc gacgcagtag 1530
<210> 174<210> 174
<211> 3030<211> 3030
<212> ДНК<212> DNA
<213> Azospirillum lipoferum<213> Azospirillum lipoferum
<220><220>
<223> glnE<223> glnE
<400> 174<400> 174
atgccgagtc ccatcgcgtt ctcaagcccc ttgccgaagc ctttcgacag cgcgcaggcg 60atgccgagtc ccatcgcgtt ctcaagcccc ttgccgaagc ctttcgacag cgcgcaggcg 60
gcgctgggga tggagcgctg gcgccagcag gccgccgcgg cggagccgga gacccgcgcc 120gcgctgggga tggagcgctg gcgccagcag gccgccgcgg cggagccgga gacccgcgcc 120
tgggcggaag ccttcgccga ttcggagacc ggccgggcgc tgatcggggc ggtgtgcggc 180tgggcggaag ccttcgccga ttcggagacc ggccgggcgc tgatcggggc ggtgtgcggc 180
aacagcccgt atctcggcca cagcctgacg cgggagttgc ccttcgtcgc ccgtacagtg 240aacagcccgt atctcggcca cagcctgacg cgggagttgc ccttcgtcgc ccgtacagtg 240
caggacggct tcgacgacac cttcgccgcg ctgatcgccg ctctccatgc cgagcatggc 300caggacggct tcgacgacac cttcgccgcg ctgatcgccg ctctccatgc cgagcatggc 300
gaggagaaat cgatggaccg gctgatggcc ggcctgcggg tggcgaagcg gcgggcggcg 360gaggagaaat cgatggaccg gctgatggcc ggcctgcggg tggcgaagcg gcgggcggcg 360
ctgctgatcg cgctggccga catcgccggc gcgtggccgc tgttccgcgt caccggcgcc 420ctgctgatcg cgctggccga catcgccggc gcgtggccgc tgttccgcgt caccggcgcc 420
ctgtcggagc tggcggagac gggggtgcag ctggccgcga atttcctgct gcgccgcgcc 480ctgtcggagc tggcggagac gggggtgcag ctggccgcga atttcctgct gcgccgcgcc 480
agggaggcgg ggacgctgac gctgccggat ccgcagcgac cgtgggtcgg ttcgggcctg 540agggaggcgg ggacgctgac gctgccggat ccgcagcgac cgtgggtcgg ttcgggcctg 540
atcgttttgg gcatgggtaa gcttggcggg cgcgaactca actattccag cgacatcgac 600atcgttttgg gcatgggtaa gcttggcggg cgcgaactca actattccag cgacatcgac 600
ctgatcgtcc tgtatgacga cgctgttgtg cagacgcccc agccggacaa cctcgcgcga 660ctgatcgtcc tgtatgacga cgctgttgtg cagacgcccc agccggacaa cctcgcgcga 660
accttcatca ggctcgcacg cgatcttgtc cgcattatgg atgaacggac caaggacggc 720accttcatca ggctcgcacg cgatcttgtc cgcattatgg atgaacggac caaggacggc 720
tacgtcttcc gcaccgacct tcggcttagg cccgatcccg gcgccacgcc gctggcggtt 780tacgtcttcc gcaccgacct tcggcttagg cccgatcccg gcgccacgcc gctggcggtt 780
tccgtctccg cagccgaaat ttattacggc agcgtcggtc agaactggga acgcgcggcg 840tccgtctccg cagccgaaat ttattacggc agcgtcggtc agaactggga acgcgcggcg 840
atgatcaagg cccgtcccat cgccggcgat ctggaggcgg gcgcctcctt tgtccgcttc 900atgatcaagg cccgtcccat cgccggcgat ctggaggcgg gcgcctcctt tgtccgcttc 900
ctggagccct tcgtctggcg ccgcaacctg gatttcgccg ccatccagga catccattcg 960ctggagccct tcgtctggcg ccgcaacctg gatttcgccg ccatccagga catccattcg 960
atcaaacgcc agatcaacgc ccacaagggc caccgcgagg tgacggtcaa cggccacgac 1020atcaaacgcc agatcaacgc ccacaagggc caccgcgagg tgacggtcaa cggccacgac 1020
atcaaggtcg gccgcggcgg catccgcgag atcgagttct tcgcccagac ccagcagctg 1080atcaaggtcg gccgcggcgg catccgcgag atcgagttct tcgcccagac ccagcagctg 1080
atcttcggcg ggcgcgaccc gcgcgtgcga atcgctccga ccctgatggc gaacgaggcg 1140atcttcggcg ggcgcgaccc gcgcgtgcga atcgctccga ccctgatggc gaacgaggcg 1140
ctgcgcgacg tcggccgcgt gccgccgcag acggtggaag agcttgccgg ggcctatcat 1200ctgcgcgacg tcggccgcgt gccgccgcag acggtggaag agcttgccgg ggcctatcat 1200
ttcctgcgcc gtgtcgaaca tcgcatccag atgatcgacg accagcagac ccatcgtatt 1260ttcctgcgcc gtgtcgaaca tcgcatccag atgatcgacg accagcagac ccatcgtatt 1260
cccgccgacg atgccggggt ggcgcatttg gccaccttcc tcggctatga cgaccccgcc 1320cccgccgacg atgccggggt ggcgcatttg gccaccttcc tcggctatga cgaccccgcc 1320
gccttccggg cggaactgct ggcgacgctg gggcaggtgg aggaccgcta tgccgagctg 13801380
ttcgaggagg cgccgtcgct ttccggcccc ggcaatctgg tcttcaccgg caccgacccc 1440ttcgaggagg cgccgtcgct ttccggcccc ggcaatctgg tcttcaccgg caccgacccc 1440
gatccgggca cgatggagac gctgaagggc atgggcttcg ccgatccggc ccgcgtcatc 1500gatccgggca cgatggagac gctgaagggc atgggcttcg ccgatccggc ccgcgtcatc 1500
agcgtggtgt cggcctggca tcgcggccgc taccgcgcca cccggtcggg ccgggcgcgg 1560agcgtggtgt cggcctggca tcgcggccgc taccgcgcca cccggtcggg cggggcgcgg 1560
gagctgctga cggagctgac gccggccctg ctgagtgcgc tgaccaagac cccggccccc 1620gagctgctga cggagctgac gccggccctg ctgagtgcgc tgaccaagac cccggccccc 1620
gattcggcgc tgatgaactt cgacgatttc ctcggcaagc tgccggccgg cgtcggtctg 16801680
ttctcgctgt tcgtcgccaa tccctggctc ctggagctgg tggcggagat catgggcatc 1740ttctcgctgt tcgtcgccaa tccctggctc ctggagctgg tggcggagat catgggcatc 1740
gcgccgcaga tggcgcagac gctgtcgcgc aacccgtcgc tgctcgacgc cgtgctgtcg 1800gcgccgcaga tggcgcagac gctgtcgcgc aacccgtcgc tgctcgacgc cgtgctgtcg 1800
ccggacttct tcgacccgct gccgggcaag gaggacgggc tggccgacga ccacgcccgc 1860ccggacttct tcgacccgct gccgggcaag gaggacgggc tggccgacga ccacgcccgc 1860
gtgatggcgc cggcccgcga tttcgaggat gcgctgaccc tgtcgcggcg ctggaccaac 1920gtgatggcgc cggcccgcga tttcgaggat gcgctgaccc tgtcgcggcg ctggaccaac 1920
gaccagcgct tccgcgccgg ggtgcatatc ctgcgcggca tcaccgatgg cgaccgctgc 1980gaccagcgct tccgcgccgg ggtgcatatc ctgcgcggca tcaccgatgg cgaccgctgc 1980
ggcgccttcc tggccgatct ggccgacatc gtcgtccccg accttgcccg ccgggtggag 2040ggcgccttcc tggccgatct ggccgacatc gtcgtccccg accttgcccg ccgggtggag 2040
gaggagttcg cccagcgcca cggccatatt cccggcggcg cctgggtggt ggtggcgatg 2100gaggagttcg cccagcgcca cggccatatt cccggcggcg cctgggtggt ggtggcgatg 2100
ggcaagctcg gcagccggca gctgaccatc acgtccgaca tcgacctgat cgtcatctac 2160ggcaagctcg gcagccggca gctgaccatc acgtccgaca tcgacctgat cgtcatctac 2160
gatgtggcgc cgggccaagg gggcgggggc ggtccccgct tgtcggatgg tgccaagccg 2220gatgtggcgc cgggccaagg gggcgggggc ggtccccgct tgtcggatgg tgccaagccg 2220
ctgtcgccca acgagtatta catcaagctg actcagcgtc tgaccaacgc cattaccgcg 2280ctgtcgccca acgagtatta catcaagctg actcagcgtc tgaccaacgc cattaccgcg 2280
ccgatgggcg acggccggct ctacgaggtc gacatgcggc tgcgcccgtc gggcaacgcc 2340ccgatgggcg acggccggct ctacgaggtc gacatgcggc tgcgcccgtc gggcaacgcc 2340
gggccgctcg ccacctcgct ggacgctttc ctgaaatatc aggcgaccga tgcctggacc 2400gggccgctcg ccacctcgct ggacgctttc ctgaaatatc aggcgaccga tgcctggacc 2400
tgggagcata tggccctgac ccgcgcccgg gtgatcggcg gtgatgcgga gctggccggg 2460tgggagcata tggccctgac ccgcgcccgg gtgatcggcg gtgatgcgga gctggccggg 2460
cgggtgtcgg cagcgatccg ctcggtgctg acggcgccgc gcgatgccga ccggctgctg 2520cgggtgtcgg cagcgatccg ctcggtgctg acggcgccgc gcgatgccga ccggctgctg 2520
tgggacgtgg ccgacatgcg gcggcggatc gagaaggagt tcgggacgac caatgtctgg 2580tgggacgtgg ccgacatgcg gcggcggatc gagaaggagt tcgggacgac caatgtctgg 2580
aacgtcaaat acgcccgcgg cggcctgatc gacatcgagt tcatcgccca gtacctgcaa 2640aacgtcaaat acgcccgcgg cggcctgatc gacatcgagt tcatcgccca gtacctgcaa 2640
ctgcgccatg gtcacgagcg gccggacatc ctgcacatcg gcaccgccaa ggcgctgggc 2700ctgcgccatg gtcacgagcg gccggacatc ctgcacatcg gcaccgccaa ggcgctggggc 2700
tgcgccgccc ggacgggcgc gctggcgccg gaggtggcgg aggatctgga gacgacgctg 2760tgcgccgccc ggacgggcgc gctggcgccg gaggtggcgg aggatctgga gacgacgctg 2760
cggctgtggc ggcgggtgca gggctttctg cggttgacca ccgccggggt gctcgatccc 2820cggctgtggc ggcgggtgca gggctttctg cggttgacca ccgccggggt gctcgatccc 2820
aatcaggtgt cgcccagcct gctggccggg ctggtccgcg ccgcctttcc tgctgacttt 2880aatcaggtgt cgcccagcct gctggccggg ctggtccgcg ccgcctttcc tgctgacttt 2880
cagggcgagc gtgagcctgg cactgttgac ttccccgaac tggaccacaa aatccgtgcc 2940cagggcgagc gtgagcctgg cactgttgac ttccccgaac tggaccacaa aatccgtgcc 2940
gtcgccgccc gcgcccatgg tcatttcaag accctggtcg aggaaccggc gggccgtctg 3000gtcgccgccc gcgcccatgg tcatttcaag accctggtcg aggaaccggc gggccgtctg 3000
gccccacccg ccaccacgcc tccagcctga 3030gccccacccg ccaccacgcc tccagcctga 3030
<210> 175<210> 175
<211> 1440<211> 1440
<212> ДНК<212> DNA
<213> Azospirillum lipoferum<213> Azospirillum lipoferum
<220><220>
<223> amtB1<223> amtB1
<400> 175<400> 175
atgaaccgtc tgttccttat ggccgcaccg atgatggcgg ttgctctggg cgcggtcggc 60atgaaccgtc tgttccttat ggccgcaccg atgatggcgg ttgctctgggg cgcggtcggc 60
atgccggccg cagcccttgc ccaggatccg gcggctgccg ccgctgccgc ggctgcggct 120atgccggccg cagcccttgc ccaggatccg gcggctgccg ccgctgccgc ggctgcggct 120
gcggctgccg ccgctgctgc cgcaccggcg gctccggcgc tgaatggcgg cgacaccgcc 180gcggctgccg ccgctgctgc cgcaccggcg gctccggcgc tgaatggcgg cgacaccgcc 180
tggatgctca tctccaccgc gctggtgctg atgatgacca tccccggcct ggcgctgttc 240tggatgctca tctccaccgc gctggtgctg atgatgacca tccccggcct ggcgctgttc 240
tacggcggca tggtccgcaa gatgaacgtg ctgtcgacgg tgatgcagag cttcgccatc 300tacggcggca tggtccgcaa gatgaacgtg ctgtcgacgg tgatgcagag cttcgccatc 300
acctgcctga tcagcgtcct gtggtacgtc atcggctaca gcctggcctt caccggcacc 360acctgcctga tcagcgtcct gtggtacgtc atcggctaca gcctggcctt caccggcacc 360
ggtgcctatg tcggcggtct cgaccggctg ttcctcaacg ggctcgactt cacgaaggcc 420ggtgcctatg tcggcggtct cgaccggctg ttcctcaacg ggctcgactt cacgaaggcc 420
ttcgtgctgg gcgaggcgac cgggtcgggc gtcccgacga ccatccccga gccggtcttc 480ttcgtgctgg gcgaggcgac cgggtcgggc gtcccgacga ccatccccga gccggtcttc 480
atgatgttcc agatgacctt tgcgatcatc accccggccc tgatcaccgg cgccttcgcc 540atgatgttcc agatgacctt tgcgatcatc accccggccc tgatcaccgg cgccttcgcc 540
gaccgcatga agttctcctc cctgctggtc ttcaccgcgc tgtggtcgat cgtggtctat 600gaccgcatga agttctcctc cctgctggtc ttcaccgcgc tgtggtcgat cgtggtctat 600
gcgccgatcg cccactgggt ctggtacccg tcgggcttcc tgttcggcct gggcgtgctg 660660
gacttcgccg gcggcacggt cgtgcacatc aacgccggcg tcgccggcct ggtcgccgcg 720gacttcgccg gcggcacggt cgtgcacatc aacgccggcg tcgccggcct ggtcgccgcg 720
ctggtgatcg gcaagcgcaa gggctacccg aaggaagcct tcatgccgca caacctggtg 780ctggtgatcg gcaagcgcaa gggctacccg aaggaagcct tcatgccgca caacctggtg 780
ctgtcgctga tcggcgcctc gctgctgtgg gtcggctggt tcggcttcaa cgccggttcg 840ctgtcgctga tcggcgcctc gctgctgtgg gtcggctggt tcggcttcaa cgccggttcg 840
gccctgaccg ccggtccgcg tgccggcatg gcgctggccg ccacgcacat cgccaccgcc 900gccctgaccg ccggtccgcg tgccggcatg gcgctggccg ccacgcacat cgccaccgcc 900
ggtgccgcca tgggctggct gttcgcggag tggatcgtca agggcaagcc gtcgatcctc 960ggtgccgcca tgggctggct gttcgcggag tggatcgtca agggcaagcc gtcgatcctc 960
ggcatcatct ccggcgccgt cgccggcctg gtcgcggtga ccccggccgc cggcttcgtc 1020ggcatcatct ccggcgccgt cgccggcctg gtcgcggtga ccccggccgc cggcttcgtc 1020
gacccgacgg gcgccatcgt catcggcatc gtcgccggcg tggtctgctt ctggtcggcc 1080gacccgacgg gcgccatcgt catcggcatc gtcgccggcg tggtctgctt ctggtcggcc 1080
accagcctca agcacatgct gggctatgac gacagcctgg acgccttcgg cgtgcacggc 1140accagcctca agcacatgct gggctatgac gacagcctgg acgccttcgg cgtgcacggc 1140
gtcggcggcc tgatcggcgc catcctgacc ggcgtcttcg ccaagatgtc ggtgtccaac 1200gtcggcggcc tgatcggcgc catcctgacc ggcgtcttcg ccaagatgtc ggtgtccaac 1200
agcgaaggcg gcttcgcctc cgtcctgcag gccgacccga aggccacgct gggcctgctg 1260agcgaaggcg gcttcgcctc cgtcctgcag gccgacccga aggccacgct gggcctgctg 1260
gaaggcaacg ccgccgccgt ctggatccag gtccagggcg tcctctacac catggtctgg 1320gaaggcaacg ccgccgccgt ctggatccag gtccagggcg tcctctacac catggtctgg 1320
tgcgccatcg ccaccttcgt cctgctgaag atcgtcgatg tggtcatggg cctgcgcgtc 1380tgcgccatcg ccaccttcgt cctgctgaag atcgtcgatg tggtcatggg cctgcgcgtc 1380
gaagaggatg tggagcgcga cggtctcgac ctcgccctgc atggcgagag catccactaa 1440gaagaggatg tggagcgcga cggtctcgac ctcgccctgc atggcgagag catccactaa 1440
<210> 176<210> 176
<211> 1227<211> 1227
<212> ДНК<212> DNA
<213> Azospirillum lipoferum<213> Azospirillum lipoferum
<220><220>
<223> amtB2<223> amtB2
<400> 176<400> 176
atggatgcgg caaagacggg tggcgacgtc cttttcgtgc tgatgggcgc ggtgatggtg 60atggatgcgg caaagacggg tggcgacgtc cttttcgtgc tgatgggcgc ggtgatggtg 60
ctggcgatgc attgcggctt cgccctgctg gaggtcggga cggtccggcg caagaatcag 120ctggcgatgc attgcggctt cgccctgctg gaggtcggga cggtccggcg caagaatcag 120
gtcaacgcgc tggtgaagat cctgtcggac ttcgccatgt cgaccatcgc ctattttttc 180gtcaacgcgc tggtgaagat cctgtcggac ttcgccatgt cgaccatcgc ctattttttc 180
gtcggttatg ccgtggccta cggcatcgac ttcttcgccg acgcccacac gctggtcggc 240gtcggttatg ccgtggccta cggcatcgac ttcttcgccg acgcccacac gctggtcggc 240
aagggaagcg gcgggttcgc ggcctatggc tacgatctgg tgaagttctt cttcctggcg 300aagggaagcg gcgggttcgc ggcctatggc tacgatctgg tgaagttctt cttcctggcg 300
accttcgccg ccgcggtgcc ggccatcgtc tcgggcggca tcgccgagcg tgctaggttc 360360
tggccgcagg ccgccgccac gctggcgctg atcgcgctgt tctatccatt gctggaaggc 420tggccgcagg ccgccgccac gctggcgctg atcgcgctgt tctatccatt gctggaaggc 420
acggtctggg gcacccgctt cggcctgcaa agctggatgg ccgcgacctt cggccagcct 480acggtctggg gcacccgctt cggcctgcaa agctggatgg ccgcgacctt cggccagcct 480
ttccacgact tcgccggatc tgtggtggtg catgccttcg gcggctgggt ggcgctgggt 540ttccacgact tcgccggatc tgtggtggtg catgccttcg gcggctgggt ggcgctgggt 540
gccgtgctga acctcggcaa ccgccgcggc cgctaccgtc cgaacggctc gctgatcgcc 600gccgtgctga acctcggcaa ccgccgcggc cgctaccgtc cgaacggctc gctgatcgcc 600
attccgccgt cgaacatccc cttcctggcg ctgggcgcct gggtgctgtg cgtggggtgg 660attccgccgt cgaacatccc cttcctggcg ctgggcgcct gggtgctgtg cgtggggtgg 660
ttcggcttca acgtgatgag cgcccaggtg ctggatggcg tgacgggtct ggtggcgctg 720ttcggcttca acgtgatgag cgcccaggtg ctggatggcg tgacgggtct ggtggcgctg 720
aactcgctga tggcgatggt cggcggcatc gtcacctcgc tggtgatcag ccgcaccgat 780aactcgctga tggcgatggt cggcggcatc gtcacctcgc tggtgatcag ccgcaccgat 780
cccggcttcg tccacaacgg cgcgctggcc ggtctggtgg cggtctgcgc cgggtccgac 840cccggcttcg tccacaacgg cgcgctggcc ggtctggtgg cggtctgcgc cgggtccgac 840
gtgatgcacc cgctgggcgc gctggtcacc ggcggcatcg ccgggctgct gttcgtctgg 900gtgatgcacc cgctgggcgc gctggtcacc ggcggcatcg ccgggctgct gttcgtctgg 900
gccttcaaca aatgccagat cgactggaag atcgacgacg tgctgggcgt ctggccgctg 960gccttcaaca aatgccagat cgactggaag atcgacgacg tgctgggcgt ctggccgctg 960
cacggtctgt gcggcctgac cggcggcctg ctggccggcg tcttcgggca ggaggcactg 1020cacggtctgt gcggcctgac cggcggcctg ctggccggcg tcttcgggca ggaggcactg 1020
ggcggccttg gcggcgtgtc gatcctcagc cagatcgtcg gcacggcaag cggcgccagc 1080ggcggccttg gcggcgtgtc gatcctcagc cagatcgtcg gcacggcaag cggcgccagc 1080
ttcggattcg tctcgggtct ggcggtctac ggcctgctgc gcgtcaccgt cggcatccgc 1140ttcggattcg tctcgggtct ggcggtctac ggcctgctgc gcgtcaccgt cggcatccgc 1140
ctcgatcccg agcaggagta caagggcgcc gacttgtcgt tgcaccatat caccgcgtac 1200ctcgatcccg agcaggagta caagggcgcc gacttgtcgt tgcaccatat caccgcgtac 1200
ccggaagagg acgcgccgac cctgtaa 1227ccggaagagg acgcgccgac cctgtaa 1227
<210> 177<210> 177
<211> 613<211> 613
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::PinfC<223> delta-nifL::PinfC
<400> 177<400> 177
atgaccctga atatgatgat ggattcttgg ttctctggag cgctttatcg gcatcctgac 60atgaccctga atatgatgat ggattcttgg ttctctggag cgctttatcg gcatcctgac 60
tgaagaattt gcaggcttct tcccaacctg gcttgcaccc gtgcaggtag ttgtgatgaa 120tgaagaattt gcaggcttct tcccaacctg gcttgcaccc gtgcaggtag ttgtgatgaa 120
catcactgat tcgcaggctg aatacgttaa cgaattgacc cgtaaactgc aaaatgcggg 180catcactgat tcgcaggctg aatacgttaa cgaattgacc cgtaaactgc aaaatgcggg 180
cattcgtgta aaagcagact tgagaaacga gaagattggc tttaaaatcc gcgagcacac 240cattcgtgta aaagcagact tgagaaacga gaagattggc tttaaaatcc gcgagcacac 240
tttacgtcgt gtcccttata tgctggtttg tggtgacaaa gaggtcgaag ccggcaaagt 300tttacgtcgt gtcccttata tgctggtttg tggtgacaaa gaggtcgaag ccggcaaagt 300
tgctgtgcgt acccgtcgcg gtaaagacct gggtagcctg gacgtaaatg atgttatcga 360tgctgtgcgt acccgtcgcg gtaaagacct gggtagcctg gacgtaaatg atgttatcga 360
gaagctgcaa caagagattc gcagccgcag tcttcaacaa ctggaggaat aaggtattaa 420gaagctgcaa caagagattc gcagccgcag tcttcaacaa ctggaggaat aaggtattaa 420
aggcggaaaa cgagttcaaa cggcgcgtcc caatcgtatt aatggcgaga ttcgcgccac 480aggcggaaaa cgagttcaaa cggcgcgtcc caatcgtatt aatggcgaga ttcgcgccac 480
ggaagttcgc ttaacaggtc tggaaggcga gcagcttggt attgcgatag aactcacttc 540ggaagttcgc ttaacaggtc tggaaggcga gcagcttggt attgcgatag aactcacttc 540
acgccccgaa gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg 600acgccccgaa gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg 600
aggttcaaaa tga 613aggttcaaaa tga 613
<210> 178<210> 178
<211> 1613<211> 1613
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::PinfC с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::PinfC with a 500 bp flanking region.
<400> 178<400> 178
accggataag agagaaaagt gtcgacgtcg gtccggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60accggataag agagaaaagt gtcgacgtcg gtccggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60
agctcgccca gtttttggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120agctcgccca gtttttggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120
ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgcgg 180ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgcgg 180
ggaaaatgcg gtgaacatgt cagctattgc gaagagtgtg ccagttttgc tcacgggcaa 240ggaaaatgcg gtgaacatgt cagctattgc gaagagtgtg ccagttttgc tcacgggcaa 240
aagctgcacc agaatgggta ttaatgcacc agcctggcgc tttttttcgc ggcacgtccc 300aagctgcacc agaatgggta ttaatgcacc agcctggcgc tttttttcgc ggcacgtccc 300
ctcgctaatg cccgtctggc gcggctttga cgctgataag gcgctgaata ccgatctgga 360ctcgctaatg cccgtctggc gcggctttga cgctgataag gcgctgaata ccgatctgga 360
tcaaggtttt gtcgggttat cgtccaaaag gtgcactctt tgcatggtta taagtgcctg 420tcaaggtttt gtcgggttat cgtccaaaag gtgcactctt tgcatggtta taagtgcctg 420
acatggtgtc cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480acatggtgtc cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480
accgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggattcttgg ttctctggag 540accgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggattcttgg ttctctggag 540
cgctttatcg gcatcctgac tgaagaattt gcaggcttct tcccaacctg gcttgcaccc 600cgctttatcg gcatcctgac tgaagaattt gcaggcttct tcccaacctg gcttgcaccc 600
gtgcaggtag ttgtgatgaa catcactgat tcgcaggctg aatacgttaa cgaattgacc 660gtgcaggtag ttgtgatgaa catcactgat tcgcaggctg aatacgttaa cgaattgacc 660
cgtaaactgc aaaatgcggg cattcgtgta aaagcagact tgagaaacga gaagattggc 720cgtaaactgc aaaatgcggg cattcgtgta aaagcagact tgagaaacga gaagattggc 720
tttaaaatcc gcgagcacac tttacgtcgt gtcccttata tgctggtttg tggtgacaaa 780tttaaaatcc gcgagcacac tttacgtcgt gtcccttata tgctggtttg tggtgacaaa 780
gaggtcgaag ccggcaaagt tgctgtgcgt acccgtcgcg gtaaagacct gggtagcctg 840gaggtcgaag ccggcaaagt tgctgtgcgt acccgtcgcg gtaaagacct gggtagcctg 840
gacgtaaatg atgttatcga gaagctgcaa caagagattc gcagccgcag tcttcaacaa 900gacgtaaatg atgttatcga gaagctgcaa caagagattc gcagccgcag tcttcaacaa 900
ctggaggaat aaggtattaa aggcggaaaa cgagttcaaa cggcgcgtcc caatcgtatt 960ctggaggaat aaggtattaa aggcggaaaa cgagttcaaa cggcgcgtcc caatcgtatt 960
aatggcgaga ttcgcgccac ggaagttcgc ttaacaggtc tggaaggcga gcagcttggt 1020aatggcgaga ttcgcgccac ggaagttcgc ttaacaggtc tggaaggcga gcagcttggt 1020
attgcgatag aactcacttc acgccccgaa gggggaagct gcctgaccct acgattcccg 1080attgcgatag aactcacttc acgccccgaa gggggaagct gcctgaccct acgattcccg 1080
ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg ggtaataccg 1140ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg ggtaataccg 1140
tctggcgctt cgatttatcc cagcagttca ccgcgatgca gcggataagc gtggttctca 1200tctggcgctt cgatttatcc cagcagttca ccgcgatgca gcggataagc gtggttctca 1200
gccgggcgac cgaggttgaa cagacactcc agcaggtgct gtgcgtattg cacaatgacg 1260gccgggcgac cgaggttgaa cagacactcc agcaggtgct gtgcgtattg cacaatgacg 1260
cctttttgca gcacggcatg atctgtctgt acgacagcca gcaggcgatt ttgactattg 1320cctttttgca gcacggcatg atctgtctgt acgacagcca gcaggcgatt ttgactattg 1320
aagcgttgca ggaagccgat cagcagttga tccccggcag ctcgcaaatt cgctaccgtc 1380aagcgttgca ggaagccgat cagcagttga tccccggcag ctcgcaaatt cgctaccgtc 1380
cgggtgaagg gctggtcggg acggtgcttt cgcaggggca atcgttagtg ctggcgcgtg 1440cgggtgaagg gctggtcggg acggtgcttt cgcaggggca atcgttagtg ctggcgcgtg 1440
tggctgacga tcagcgcttt cttgaccgcc tgggactgta tgattacaac ctgccgttta 1500tggctgacga tcagcgcttt cttgaccgcc tgggactgta tgattacaac ctgccgttta 1500
tcgccgtgcc gctgataggg ccggatgcgc agacttttgg cgtgctgacg gcgcaaccga 1560tcgccgtgcc gctgataggg ccggatgcgc agacttttgg cgtgctgacg gcgcaaccga 1560
tggcgcgtta cgaagagcgg ttacccgcct gcacccgctt tctggaaacg gtc 1613tggcgcgtta cgaagagcgg ttacccgcct gcacccgctt tctggaaacg gtc 1613
<210> 179<210> 179
<211> 1185<211> 1185
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2<223> glnE-delta-AR-2
<400> 179<400> 179
tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc 60tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc 60
gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg cgatgaacgc ctatcgcgat 120gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg cgatgaacgc ctatcgcgat 120
gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg aagagcagca actggaggcg 180gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg aagagcagca actggaggcg 180
ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg cggcggatat cgccggtacg 240ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg cggcggatat cgccggtacg 240
ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg cggaagcgat tatcgatgcg 300ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg cggaagcgat tatcgatgcg 300
gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg gccagccgac gcatctgcac 360gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg gccagccgac gcatctgcac 360
gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca aacttggcgg ctgggaatta 420gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca aacttggcgg ctgggaatta 420
ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact gccccatgga tgtgatgacc 480ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact gccccatgga tgtgatgacc 480
gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc gcctcgcgca gcgcgtgatg 540gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc gcctcgcgca gcgcgtgatg 540
cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg aagtcgatgc gcgtttgcgc 600cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg aagtcgatgc gcgtttgcgc 600
ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag cgttcgccga ttatcaaaaa 660660
aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg cgcgcgtggt gtacggcgat 720aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg cgcgcgtggt gtacggcgat 720
ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata tcctgatgac ctcccgcgat 780ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata tcctgatgac ctcccgcgat 780
gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga aaatgcgcgc ccatcttggt 840gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga aaatgcgcgc ccatcttggt 840
aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag gcggtatcac cgatattgag 900aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag gcggtatcac cgatattgag 900
tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga agccgaaact gacgcgctgg 960tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga agccgaaact gacgcgctgg 960
tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg gcatcatgga tgagcaggaa 1020tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg gcatcatgga tgagcaggaa 1020
gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg agctgcacca cctggcgctg 1080gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg agctgcacca cctggcgctg 1080
caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg ccgagcgtgc gcttatcaaa 11401140
accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg cgtaa 1185accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg cgtaa 1185
<210> 180<210> 180
<211> 2085<211> 2085
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-2 with a 500 bp flanking region.
<400> 180<400> 180
taaagcgagc gctcacttac gtgatctgtt gacgcagtcc gaagcgacca ttacttcagc 60taaagcgagc gctcacttac gtgatctgtt gacgcagtcc gaagcgacca ttacttcagc 60
cgtttcagca gatacggcgg tgtggagtgc gcaatcagcc ctggcgaaac tggtgctcac 120cgtttcagca gatacggcgg tgtggagtgc gcaatcagcc ctggcgaaac tggtgctcac 120
cgagtggtta gtgacgcagg gctggcgaac cttccttgat gaaaaagcgc aggctaagtt 180cgagtggtta gtgacgcagg gctggcgaac cttccttgat gaaaaagcgc aggctaagtt 180
tgccgactcc tttaaacgct ttgctgacgt tcatctgtca cgcagcgccg ccgagctgaa 240tgccgactcc tttaaacgct ttgctgacgt tcatctgtca cgcagcgccg ccgagctgaa 240
aaaagccttt gcccagccgc tgggcgacag ctatcgcgac cagttaccgc ggctggcgcg 300aaaagccttt gcccagccgc tgggcgacag ctatcgcgac cagttaccgc ggctggcgcg 300
tgatatcgac agcgcgttat tgctggccgg acattacgat cgcgcgcgcg ccgtggagtg 360tgatatcgac agcgcgttat tgctggccgg acattacgat cgcgcgcgcg ccgtggagtg 360
gctggaaaac tggcaggggc ttcagcacgc tattgaaacg cgccagagag ttgaaatcga 420gctggaaaac tggcaggggc ttcagcacgc tattgaaacg cgccagagag ttgaaatcga 420
acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg ttgcacagcg gaaaacgtta 480acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg ttgcacagcg gaaaacgtta 480
acgaaaggat atttcgcatg tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg 540acgaaaggat atttcgcatg tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg 540
cgcgctaccc gatcctgctc gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg 600cgcgctaccc gatcctgctc gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg 600
cgatgaacgc ctatcgcgat gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg 660cgatgaacgc ctatcgcgat gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg 660
aagagcagca actggaggcg ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg 720aagagcagca actggaggcg ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg 720
cggcggatat cgccggtacg ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg 780cggcggatat cgccggtacg ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg 780
cggaagcgat tatcgatgcg gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg 840840
gccagccgac gcatctgcac gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca 900gccagccgac gcatctgcac gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca 900
aacttggcgg ctgggaatta ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact 960aacttggcgg ctgggaatta ggttacagct ccgatctggga tctggtgttc ctgcacgact 960
gccccatgga tgtgatgacc gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc 1020gccccatgga tgtgatgacc gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc 1020
gcctcgcgca gcgcgtgatg cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg 1080gcctcgcgca gcgcgtgatg cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg 1080
aagtcgatgc gcgtttgcgc ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag 1140aagtcgatgc gcgtttgcgc ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag 1140
cgttcgccga ttatcaaaaa aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg 1200cgttcgccga ttatcaaaaa aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg 1200
cgcgcgtggt gtacggcgat ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata 1260cgcgcgtggt gtacggcgat ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata 1260
tcctgatgac ctcccgcgat gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga 1320tcctgatgac ctcccgcgat gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga 1320
aaatgcgcgc ccatcttggt aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag 1380aaatgcgcgc ccatcttggt aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag 1380
gcggtatcac cgatattgag tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga 1440gcggtatcac cgatattgag tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga 1440
agccgaaact gacgcgctgg tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg 1500agccgaaact gacgcgctgg tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg 1500
gcatcatgga tgagcaggaa gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg 1560gcatcatgga tgagcaggaa gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg 1560
agctgcacca cctggcgctg caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg 1620agctgcacca cctggcgctg caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg 1620
ccgagcgtgc gcttatcaaa accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg 1680ccgagcgtgc gcttatcaaa accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg 1680
cgtaagtgtg gtatcatcgc gcgcaaattt tgtatctctc aggagacagg aatgaaagtt 1740cgtaagtgtg gtatcatcgc gcgcaaattt tgtatctctc aggagacagg aatgaaagtt 1740
acgctgccag agttcaatca agccggtgtc atggtggtgg gtgatgtgat gctggatcgc 1800acgctgccag agttcaatca agccggtgtc atggtggtgg gtgatgtgat gctggatcgc 1800
tactggtacg gcccaaccag ccgcatttct ccggaagcgc cagttccggt tgttaaagtc 1860tactggtacg gcccaaccag ccgcatttct ccggaagcgc cagttccggt tgttaaagtc 1860
gatactattg aagagcgacc gggcggtgcg gcaaacgtgg cgatgaacat tgcctcgctg 1920gatactattg aagagcgacc gggcggtgcg gcaaacgtgg cgatgaacat tgcctcgctg 1920
ggcgcaacgg cgcgtctggt tggcctgact ggcattgatg atgcggcgcg cgcgctgagc 1980ggcgcaacgg cgcgtctggt tggcctgact ggcattgatg atgcggcgcg cgcgctgagc 1980
aaagcgctgg cggatgttaa tgttaaatgt gacttcgttt ctgttccgac tcaccccacc 2040aaagcgctgg cggatgttaa tgttaaatgt gacttcgttt ctgttccgac tcaccccacc 2040
atcactaagc tgcgcgtgct gtcgcgtaac cagcaactga ttcgc 2085atcactaagc tgcgcgtgct gtcgcgtaac cagcaactga ttcgc 2085
<210> 181<210> 181
<211> 461<211> 461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1<223> delta-nifL::Prm1
<400> 181<400> 181
atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa taataaccgg acaattcgga 60atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa taataaccgg acaattcgga 60
ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc tcgactccat ttaaaataaa 120ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc tcgactccat ttaaaataaa 120
aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180
tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240240
cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300
atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360
taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac gccccgaagg gggaagctgc ctgaccctac 420taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac gccccgaagg gggaagctgc ctgaccctac 420
gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461
<210> 182<210> 182
<211> 1461<211> 1461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm1 with a 500 bp flanking region.
<400> 182<400> 182
accggataag agagaaaagt gtcgacgtcg gtccggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60accggataag agagaaaagt gtcgacgtcg gtccggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60
agctcgccca gtttttggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120agctcgccca gtttttggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120
ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgcgg 180ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgcgg 180
ggaaaatgcg gtgaacatgt cagctattgc gaagagtgtg ccagttttgc tcacgggcaa 240ggaaaatgcg gtgaacatgt cagctattgc gaagagtgtg ccagttttgc tcacgggcaa 240
aagctgcacc agaatgggta ttaatgcacc agcctggcgc tttttttcgc ggcacgtccc 300aagctgcacc agaatgggta ttaatgcacc agcctggcgc tttttttcgc ggcacgtccc 300
ctcgctaatg cccgtctggc gcggctttga cgctgataag gcgctgaata ccgatctgga 360ctcgctaatg cccgtctggc gcggctttga cgctgataag gcgctgaata ccgatctgga 360
tcaaggtttt gtcgggttat cgtccaaaag gtgcactctt tgcatggtta taagtgcctg 420tcaaggtttt gtcgggttat cgtccaaaag gtgcactctt tgcatggtta taagtgcctg 420
acatggtgtc cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480acatggtgtc cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480
accgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa 540accgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa 540
taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc 600taataaccgg acaattcggga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc 600
tcgactccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660tcgactccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660
aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720
tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780
aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840
gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac gccccgaagg 900gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac gccccgaagg 900
gggaagctgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960gggaagctgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960
acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttatccca gcagttcacc 1020acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttatccca gcagttcacc 1020
gcgatgcagc ggataagcgt ggttctcagc cgggcgaccg aggttgaaca gacactccag 1080gcgatgcagc ggataagcgt ggttctcagc cgggcgaccg aggttgaaca gacactccag 1080
caggtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140caggtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140
gacagccagc aggcgatttt gactattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttgatc 1200gacagccagc aggcgatttt gactattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttgatc 1200
cccggcagct cgcaaattcg ctaccgtccg ggtgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260cccggcagct cgcaaattcg ctaccgtccg ggtgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260
caggggcaat cgttagtgct ggcgcgtgtg gctgacgatc agcgctttct tgaccgcctg 1320caggggcaat cgttagtgct ggcgcgtgtg gctgacgatc agcgctttct tgaccgcctg 1320
ggactgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc ggatgcgcag 1380ggactgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc ggatgcgcag 1380
acttttggcg tgctgacggc gcaaccgatg gcgcgttacg aagagcggtt acccgcctgc 1440acttttggcg tgctgacggc gcaaccgatg gcgcgttacg aagagcggtt acccgcctgc 1440
acccgctttc tggaaacggt c 1461acccgctttc tggaaacggt c 1461
<210> 183<210> 183
<211> 1185<211> 1185
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2<223> glnE-delta-AR-2
<400> 183<400> 183
tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc 60tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc 60
gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg cgatgaacgc ctatcgcgat 120gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg cgatgaacgc ctatcgcgat 120
gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg aagagcagca actggaggcg 180gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg aagagcagca actggaggcg 180
ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg cggcggatat cgccggtacg 240ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg cggcggatat cgccggtacg 240
ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg cggaagcgat tatcgatgcg 300ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg cggaagcgat tatcgatgcg 300
gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg gccagccgac gcatctgcac 360gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg gccagccgac gcatctgcac 360
gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca aacttggcgg ctgggaatta 420gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca aacttggcgg ctgggaatta 420
ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact gccccatgga tgtgatgacc 480ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact gccccatgga tgtgatgacc 480
gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc gcctcgcgca gcgcgtgatg 540gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc gcctcgcgca gcgcgtgatg 540
cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg aagtcgatgc gcgtttgcgc 600cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg aagtcgatgc gcgtttgcgc 600
ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag cgttcgccga ttatcaaaaa 660660
aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg cgcgcgtggt gtacggcgat 720aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg cgcgcgtggt gtacggcgat 720
ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata tcctgatgac ctcccgcgat 780ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata tcctgatgac ctcccgcgat 780
gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga aaatgcgcgc ccatcttggt 840gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga aaatgcgcgc ccatcttggt 840
aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag gcggtatcac cgatattgag 900aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag gcggtatcac cgatattgag 900
tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga agccgaaact gacgcgctgg 960tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga agccgaaact gacgcgctgg 960
tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg gcatcatgga tgagcaggaa 1020tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg gcatcatgga tgagcaggaa 1020
gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg agctgcacca cctggcgctg 1080gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg agctgcacca cctggcgctg 1080
caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg ccgagcgtgc gcttatcaaa 11401140
accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg cgtaa 1185accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg cgtaa 1185
<210> 184<210> 184
<211> 2085<211> 2085
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-2 with a 500 bp flanking region.
<400> 184<400> 184
taaagcgagc gctcacttac gtgatctgtt gacgcagtcc gaagcgacca ttacttcagc 60taaagcgagc gctcacttac gtgatctgtt gacgcagtcc gaagcgacca ttacttcagc 60
cgtttcagca gatacggcgg tgtggagtgc gcaatcagcc ctggcgaaac tggtgctcac 120cgtttcagca gatacggcgg tgtggagtgc gcaatcagcc ctggcgaaac tggtgctcac 120
cgagtggtta gtgacgcagg gctggcgaac cttccttgat gaaaaagcgc aggctaagtt 180cgagtggtta gtgacgcagg gctggcgaac cttccttgat gaaaaagcgc aggctaagtt 180
tgccgactcc tttaaacgct ttgctgacgt tcatctgtca cgcagcgccg ccgagctgaa 240tgccgactcc tttaaacgct ttgctgacgt tcatctgtca cgcagcgccg ccgagctgaa 240
aaaagccttt gcccagccgc tgggcgacag ctatcgcgac cagttaccgc ggctggcgcg 300aaaagccttt gcccagccgc tgggcgacag ctatcgcgac cagttaccgc ggctggcgcg 300
tgatatcgac agcgcgttat tgctggccgg acattacgat cgcgcgcgcg ccgtggagtg 360tgatatcgac agcgcgttat tgctggccgg acattacgat cgcgcgcgcg ccgtggagtg 360
gctggaaaac tggcaggggc ttcagcacgc tattgaaacg cgccagagag ttgaaatcga 420gctggaaaac tggcaggggc ttcagcacgc tattgaaacg cgccagagag ttgaaatcga 420
acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg ttgcacagcg gaaaacgtta 480acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg ttgcacagcg gaaaacgtta 480
acgaaaggat atttcgcatg tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg 540acgaaaggat atttcgcatg tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg 540
cgcgctaccc gatcctgctc gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg 600cgcgctaccc gatcctgctc gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg 600
cgatgaacgc ctatcgcgat gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg 660cgatgaacgc ctatcgcgat gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg 660
aagagcagca actggaggcg ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg 720aagagcagca actggaggcg ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg 720
cggcggatat cgccggtacg ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg 780cggcggatat cgccggtacg ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg 780
cggaagcgat tatcgatgcg gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg 840840
gccagccgac gcatctgcac gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca 900gccagccgac gcatctgcac gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca 900
aacttggcgg ctgggaatta ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact 960aacttggcgg ctgggaatta ggttacagct ccgatctggga tctggtgttc ctgcacgact 960
gccccatgga tgtgatgacc gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc 1020gccccatgga tgtgatgacc gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc 1020
gcctcgcgca gcgcgtgatg cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg 1080gcctcgcgca gcgcgtgatg cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg 1080
aagtcgatgc gcgtttgcgc ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag 1140aagtcgatgc gcgtttgcgc ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag 1140
cgttcgccga ttatcaaaaa aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg 1200cgttcgccga ttatcaaaaa aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg 1200
cgcgcgtggt gtacggcgat ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata 1260cgcgcgtggt gtacggcgat ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata 1260
tcctgatgac ctcccgcgat gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga 1320tcctgatgac ctcccgcgat gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga 1320
aaatgcgcgc ccatcttggt aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag 1380aaatgcgcgc ccatcttggt aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag 1380
gcggtatcac cgatattgag tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga 1440gcggtatcac cgatattgag tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga 1440
agccgaaact gacgcgctgg tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg 1500agccgaaact gacgcgctgg tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg 1500
gcatcatgga tgagcaggaa gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg 1560gcatcatgga tgagcaggaa gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg 1560
agctgcacca cctggcgctg caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg 1620agctgcacca cctggcgctg caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg 1620
ccgagcgtgc gcttatcaaa accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg 1680ccgagcgtgc gcttatcaaa accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg 1680
cgtaagtgtg gtatcatcgc gcgcaaattt tgtatctctc aggagacagg aatgaaagtt 1740cgtaagtgtg gtatcatcgc gcgcaaattt tgtatctctc aggagacagg aatgaaagtt 1740
acgctgccag agttcaatca agccggtgtc atggtggtgg gtgatgtgat gctggatcgc 1800acgctgccag agttcaatca agccggtgtc atggtggtgg gtgatgtgat gctggatcgc 1800
tactggtacg gcccaaccag ccgcatttct ccggaagcgc cagttccggt tgttaaagtc 1860tactggtacg gcccaaccag ccgcatttct ccggaagcgc cagttccggt tgttaaagtc 1860
gatactattg aagagcgacc gggcggtgcg gcaaacgtgg cgatgaacat tgcctcgctg 1920gatactattg aagagcgacc gggcggtgcg gcaaacgtgg cgatgaacat tgcctcgctg 1920
ggcgcaacgg cgcgtctggt tggcctgact ggcattgatg atgcggcgcg cgcgctgagc 1980ggcgcaacgg cgcgtctggt tggcctgact ggcattgatg atgcggcgcg cgcgctgagc 1980
aaagcgctgg cggatgttaa tgttaaatgt gacttcgttt ctgttccgac tcaccccacc 2040aaagcgctgg cggatgttaa tgttaaatgt gacttcgttt ctgttccgac tcaccccacc 2040
atcactaagc tgcgcgtgct gtcgcgtaac cagcaactga ttcgc 2085atcactaagc tgcgcgtgct gtcgcgtaac cagcaactga ttcgc 2085
<210> 185<210> 185
<211> 461<211> 461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1<223> delta-nifL::Prm1
<400> 185<400> 185
atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa taataaccgg acaattcgga 60atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa taataaccgg acaattcgga 60
ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc tcgactccat ttaaaataaa 120ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc tcgactccat ttaaaataaa 120
aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180
tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240240
cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300
atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360
taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac gccccgaagg gggaagctgc ctgaccctac 420taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac gccccgaagg gggaagctgc ctgaccctac 420
gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461
<210> 186<210> 186
<211> 1461<211> 1461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm1 with a 500 bp flanking region.
<400> 186<400> 186
accggataag agagaaaagt gtcgacgtcg gtccggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60accggataag agagaaaagt gtcgacgtcg gtccggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60
agctcgccca gtttttggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120agctcgccca gtttttggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120
ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgcgg 180ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgcgg 180
ggaaaatgcg gtgaacatgt cagctattgc gaagagtgtg ccagttttgc tcacgggcaa 240ggaaaatgcg gtgaacatgt cagctattgc gaagagtgtg ccagttttgc tcacgggcaa 240
aagctgcacc agaatgggta ttaatgcacc agcctggcgc tttttttcgc ggcacgtccc 300aagctgcacc agaatgggta ttaatgcacc agcctggcgc tttttttcgc ggcacgtccc 300
ctcgctaatg cccgtctggc gcggctttga cgctgataag gcgctgaata ccgatctgga 360ctcgctaatg cccgtctggc gcggctttga cgctgataag gcgctgaata ccgatctgga 360
tcaaggtttt gtcgggttat cgtccaaaag gtgcactctt tgcatggtta taagtgcctg 420tcaaggtttt gtcgggttat cgtccaaaag gtgcactctt tgcatggtta taagtgcctg 420
acatggtgtc cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480acatggtgtc cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480
accgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa 540accgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa 540
taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc 600taataaccgg acaattcggga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc 600
tcgactccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660tcgactccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660
aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720
tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780
aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840
gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac gccccgaagg 900gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac gccccgaagg 900
gggaagctgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960gggaagctgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960
acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttatccca gcagttcacc 1020acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttatccca gcagttcacc 1020
gcgatgcagc ggataagcgt ggttctcagc cgggcgaccg aggttgaaca gacactccag 1080gcgatgcagc ggataagcgt ggttctcagc cgggcgaccg aggttgaaca gacactccag 1080
caggtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140caggtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140
gacagccagc aggcgatttt gactattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttgatc 1200gacagccagc aggcgatttt gactattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttgatc 1200
cccggcagct cgcaaattcg ctaccgtccg ggtgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260cccggcagct cgcaaattcg ctaccgtccg ggtgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260
caggggcaat cgttagtgct ggcgcgtgtg gctgacgatc agcgctttct tgaccgcctg 1320caggggcaat cgttagtgct ggcgcgtgtg gctgacgatc agcgctttct tgaccgcctg 1320
ggactgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc ggatgcgcag 1380ggactgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc ggatgcgcag 1380
acttttggcg tgctgacggc gcaaccgatg gcgcgttacg aagagcggtt acccgcctgc 1440acttttggcg tgctgacggc gcaaccgatg gcgcgttacg aagagcggtt acccgcctgc 1440
acccgctttc tggaaacggt c 1461acccgctttc tggaaacggt c 1461
<210> 187<210> 187
<211> 1185<211> 1185
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2<223> glnE-delta-AR-2
<400> 187<400> 187
tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc 60tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc 60
gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg cgatgaacgc ctatcgcgat 120gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg cgatgaacgc ctatcgcgat 120
gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg aagagcagca actggaggcg 180gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg aagagcagca actggaggcg 180
ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg cggcggatat cgccggtacg 240ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg cggcggatat cgccggtacg 240
ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg cggaagcgat tatcgatgcg 300ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg cggaagcgat tatcgatgcg 300
gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg gccagccgac gcatctgcac 360gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg gccagccgac gcatctgcac 360
gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca aacttggcgg ctgggaatta 420gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca aacttggcgg ctgggaatta 420
ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact gccccatgga tgtgatgacc 480ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact gccccatgga tgtgatgacc 480
gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc gcctcgcgca gcgcgtgatg 540gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc gcctcgcgca gcgcgtgatg 540
cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg aagtcgatgc gcgtttgcgc 600cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg aagtcgatgc gcgtttgcgc 600
ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag cgttcgccga ttatcaaaaa 660660
aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg cgcgcgtggt gtacggcgat 720aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg cgcgcgtggt gtacggcgat 720
ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata tcctgatgac ctcccgcgat 780ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata tcctgatgac ctcccgcgat 780
gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga aaatgcgcgc ccatcttggt 840gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga aaatgcgcgc ccatcttggt 840
aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag gcggtatcac cgatattgag 900aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag gcggtatcac cgatattgag 900
tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga agccgaaact gacgcgctgg 960tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga agccgaaact gacgcgctgg 960
tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg gcatcatgga tgagcaggaa 1020tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg gcatcatgga tgagcaggaa 1020
gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg agctgcacca cctggcgctg 1080gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg agctgcacca cctggcgctg 1080
caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg ccgagcgtgc gcttatcaaa 11401140
accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg cgtaa 1185accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg cgtaa 1185
<210> 188<210> 188
<211> 2085<211> 2085
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-2 with a 500 bp flanking region.
<400> 188<400> 188
taaagcgagc gctcacttac gtgatctgtt gacgcagtcc gaagcgacca ttacttcagc 60taaagcgagc gctcacttac gtgatctgtt gacgcagtcc gaagcgacca ttacttcagc 60
cgtttcagca gatacggcgg tgtggagtgc gcaatcagcc ctggcgaaac tggtgctcac 120cgtttcagca gatacggcgg tgtggagtgc gcaatcagcc ctggcgaaac tggtgctcac 120
cgagtggtta gtgacgcagg gctggcgaac cttccttgat gaaaaagcgc aggctaagtt 180cgagtggtta gtgacgcagg gctggcgaac cttccttgat gaaaaagcgc aggctaagtt 180
tgccgactcc tttaaacgct ttgctgacgt tcatctgtca cgcagcgccg ccgagctgaa 240tgccgactcc tttaaacgct ttgctgacgt tcatctgtca cgcagcgccg ccgagctgaa 240
aaaagccttt gcccagccgc tgggcgacag ctatcgcgac cagttaccgc ggctggcgcg 300aaaagccttt gcccagccgc tgggcgacag ctatcgcgac cagttaccgc ggctggcgcg 300
tgatatcgac agcgcgttat tgctggccgg acattacgat cgcgcgcgcg ccgtggagtg 360tgatatcgac agcgcgttat tgctggccgg acattacgat cgcgcgcgcg ccgtggagtg 360
gctggaaaac tggcaggggc ttcagcacgc tattgaaacg cgccagagag ttgaaatcga 420gctggaaaac tggcaggggc ttcagcacgc tattgaaacg cgccagagag ttgaaatcga 420
acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg ttgcacagcg gaaaacgtta 480acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg ttgcacagcg gaaaacgtta 480
acgaaaggat atttcgcatg tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg 540acgaaaggat atttcgcatg tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg 540
cgcgctaccc gatcctgctc gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg 600cgcgctaccc gatcctgctc gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg 600
cgatgaacgc ctatcgcgat gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg 660cgatgaacgc ctatcgcgat gaactgcgac aatacctgtt gcgcgtgccg gaagaggatg 660
aagagcagca actggaggcg ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg 720aagagcagca actggaggcg ctacggcagt ttaagcaggc gcagttgttg cgcgtagcgg 720
cggcggatat cgccggtacg ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg 780cggcggatat cgccggtacg ttacccgtca tgaaagtgag cgatcactta acctggctgg 780
cggaagcgat tatcgatgcg gtggtgcagc aagcctggaa ccagatggtg gcgcgttacg 840840
gccagccgac gcatctgcac gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca 900gccagccgac gcatctgcac gatcgcgaag ggcgcggttt cgccgtggtc ggttacggca 900
aacttggcgg ctgggaatta ggttacagct ccgatctgga tctggtgttc ctgcacgact 960aacttggcgg ctgggaatta ggttacagct ccgatctggga tctggtgttc ctgcacgact 960
gccccatgga tgtgatgacc gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc 1020gccccatgga tgtgatgacc gatggcgagc gtgaaatcga tggccgccag ttctatttgc 1020
gcctcgcgca gcgcgtgatg cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg 1080gcctcgcgca gcgcgtgatg cacctgttca gcacgcgcac gtcgtccggc attctttatg 1080
aagtcgatgc gcgtttgcgc ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag 1140aagtcgatgc gcgtttgcgc ccgtccggcg cggccggaat gctggtgacc actgcggaag 1140
cgttcgccga ttatcaaaaa aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg 1200cgttcgccga ttatcaaaaa aatgaagcct ggacatggga gcatcaggcg ctggcgcgtg 1200
cgcgcgtggt gtacggcgat ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata 1260cgcgcgtggt gtacggcgat ccgcaactga ccgccgaatt tgacgccatt cgccgcgata 1260
tcctgatgac ctcccgcgat gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga 1320tcctgatgac ctcccgcgat gccgctaccc tgcaaaccga agtgcgggaa atgcgtgaga 1320
aaatgcgcgc ccatcttggt aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag 1380aaatgcgcgc ccatcttggt aacaagcaca aagaccgttt cgatctgaaa gccgatgaag 1380
gcggtatcac cgatattgag tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga 1440gcggtatcac cgatattgag tttatcgctc agtatctggt gctgcgcttt gcccatgaga 1440
agccgaaact gacgcgctgg tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg 1500agccgaaact gacgcgctgg tcggataatg tgcgcatcct cgaagggctg gcgcaaaacg 1500
gcatcatgga tgagcaggaa gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg 1560gcatcatgga tgagcaggaa gcgcaggcat tgacgctggc gtacaccacg ttgcgtgatg 1560
agctgcacca cctggcgctg caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg 1620agctgcacca cctggcgctg caagagctgc caggacatgt ggcgctctcc tgttttgtcg 1620
ccgagcgtgc gcttatcaaa accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg 1680ccgagcgtgc gcttatcaaa accagctggg acaagtggct ggtggaaccg tgcgccccgg 1680
cgtaagtgtg gtatcatcgc gcgcaaattt tgtatctctc aggagacagg aatgaaagtt 1740cgtaagtgtg gtatcatcgc gcgcaaattt tgtatctctc aggagacagg aatgaaagtt 1740
acgctgccag agttcaatca agccggtgtc atggtggtgg gtgatgtgat gctggatcgc 1800acgctgccag agttcaatca agccggtgtc atggtggtgg gtgatgtgat gctggatcgc 1800
tactggtacg gcccaaccag ccgcatttct ccggaagcgc cagttccggt tgttaaagtc 1860tactggtacg gcccaaccag ccgcatttct ccggaagcgc cagttccggt tgttaaagtc 1860
gatactattg aagagcgacc gggcggtgcg gcaaacgtgg cgatgaacat tgcctcgctg 1920gatactattg aagagcgacc gggcggtgcg gcaaacgtgg cgatgaacat tgcctcgctg 1920
ggcgcaacgg cgcgtctggt tggcctgact ggcattgatg atgcggcgcg cgcgctgagc 1980ggcgcaacgg cgcgtctggt tggcctgact ggcattgatg atgcggcgcg cgcgctgagc 1980
aaagcgctgg cggatgttaa tgttaaatgt gacttcgttt ctgttccgac tcaccccacc 2040aaagcgctgg cggatgttaa tgttaaatgt gacttcgttt ctgttccgac tcaccccacc 2040
atcactaagc tgcgcgtgct gtcgcgtaac cagcaactga ttcgc 2085atcactaagc tgcgcgtgct gtcgcgtaac cagcaactga ttcgc 2085
<210> 189<210> 189
<211> 452<211> 452
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm7<223> delta-nifL::Prm7
<400> 189<400> 189
atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgcgtcaggt tgaacgtaaa aaagtcggtc 60atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgcgtcaggt tgaacgtaaa aaagtcggtc 60
tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct ccaaacgtta attggtttct gcttcggcag 120tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct ccaaacgtta attggtttct gcttcggcag 120
aacgattggc gaaaaaaccc ggtgcgaacc gggttttttt atggataaag atcgtgttat 180aacgattggc gaaaaaaccc ggtgcgaacc gggttttttt atggataaag atcgtgttat 180
ccacagcaat ccattgatta tctcttcttt ttcagcattt ccagaatccc ctcaccacaa 240ccacagcaat ccattgatta tctcttcttt ttcagcattt ccagaatccc ctcaccacaa 240
agcccgcaaa atctggtaaa ctatcatcca attttctgcc caaatggctg ggattgttca 300agcccgcaaa atctggtaaa ctatcatcca attttctgcc caaatggctg ggattgttca 300
ttttttgttt gccttacaac gagagtgaca gtacgcgcgg gtagttaact caacatctga 360gccttacaac gagagtgaca gtacgcgcgg gtagttaact caacatctga 360
ccggtcgata actcacttca cgccccgaag ggggaagctg cctgacccta cgattcccgc 420ccggtcgata actcacttca cgccccgaag ggggaagctg cctgacccta cgattcccgc 420
tatttcattc actgaccgga ggttcaaaat ga 452tattcattc actgaccgga ggttcaaaat ga 452
<210> 190<210> 190
<211> 1451<211> 1451
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm7 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm7 with a 500 bp flanking region.
<400> 190<400> 190
accggataag agagaaaagt gtcgacgtcg gtccggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60accggataag agagaaaagt gtcgacgtcg gtccggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60
agctcgccca gtttttggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120agctcgccca gtttttggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120
ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgcgg 180ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgcgg 180
ggaaaatgcg gtgaacatgt cagctattgc gaagagtgtg ccagttttgc tcacgggcaa 240ggaaaatgcg gtgaacatgt cagctattgc gaagagtgtg ccagttttgc tcacgggcaa 240
aagctgcacc agaatgggta ttaatgcacc agcctggcgc tttttttcgc ggcacgtccc 300aagctgcacc agaatgggta ttaatgcacc agcctggcgc tttttttcgc ggcacgtccc 300
ctcgctaatg cccgtctggc gcggctttga cgctgataag gcgctgaata ccgatctgga 360ctcgctaatg cccgtctggc gcggctttga cgctgataag gcgctgaata ccgatctgga 360
tcaaggtttt gtcgggttat cgtccaaaag gtgcactctt tgcatggtta taagtgcctg 420tcaaggtttt gtcgggttat cgtccaaaag gtgcactctt tgcatggtta taagtgcctg 420
acatggtgtc cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480acatggtgtc cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480
accgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgcgtcaggt 540accgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgcgtcaggt 540
tgaacgtaaa aaagtcggtc tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct ccaaacgtta 600tgaacgtaaa aaagtcggtc tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct ccaaacgtta 600
attggtttct gcttcggcag aacgattggc gaaaaaaccc ggtgcgaacc gggttttttt 660attggtttct gcttcggcag aacgattggc gaaaaaaccc ggtgcgaacc gggttttttt 660
atggataaag atcgtgttat ccacagcaat ccattgatta tctcttcttt ttcagcattt 720atggataaag atcgtgttat ccacagcaat ccattgatta tctcttcttt ttcagcattt 720
ccagaatccc ctcaccacaa agcccgcaaa atctggtaaa ctatcatcca attttctgcc 780ccagaatccc ctcaccacaa agcccgcaaa atctggtaaa ctatcatcca attttctgcc 780
caaatggctg ggattgttca ttttttgttt gccttacaac gagagtgaca gtacgcgcgg 840caaatggctg ggattgttca ttttttgttt gccttacaac gagagtgaca gtacgcgcgg 840
gtagttaact caacatctga ccggtcgata actcacttca cgccccgaag ggggaagctg 900gtagttaact caacatctga ccggtcgata actcacttca cgccccgaag ggggaagctg 900
cctgacccta cgattcccgc tatttcattc actgaccgga ggttcaaaat gacccagcga 960cctgacccta cgattcccgc tatttcattc actgaccgga ggttcaaaat gacccagcga 960
accgagtcgg gtaataccgt ctggcgcttc gatttatccc agcagttcac cgcgatgcag 1020accgagtcgg gtaataccgt ctggcgcttc gatttatccc agcagttcac cgcgatgcag 1020
cggataagcg tggttctcag ccgggcgacc gaggttgaac agacactcca gcaggtgctg 1080cggataagcg tggttctcag ccgggcgacc gaggttgaac agacactcca gcaggtgctg 1080
tgcgtattgc acaatgacgc ctttttgcag cacggcatga tctgtctgta cgacagccag 1140tgcgtattgc acaatgacgc ctttttgcag cacggcatga tctgtctgta cgacagccag 1140
caggcgattt tgactattga agcgttgcag gaagccgatc agcagttgat ccccggcagc 1200caggcgattt tgactattga agcgttgcag gaagccgatc agcagttgat ccccggcagc 1200
tcgcaaattc gctaccgtcc gggtgaaggg ctggtcggga cggtgctttc gcaggggcaa 1260tcgcaaattc gctaccgtcc gggtgaaggg ctggtcggga cggtgctttc gcaggggcaa 1260
tcgttagtgc tggcgcgtgt ggctgacgat cagcgctttc ttgaccgcct gggactgtat 1320tcgttagtgc tggcgcgtgt ggctgacgat cagcgctttc ttgaccgcct gggactgtat 1320
gattacaacc tgccgtttat cgccgtgccg ctgatagggc cggatgcgca gacttttggc 1380gattacaacc tgccgtttat cgccgtgccg ctgatagggc cggatgcgca gacttttggc 1380
gtgctgacgg cgcaaccgat ggcgcgttac gaagagcggt tacccgcctg cacccgcttt 1440gtgctgacgg cgcaaccgat ggcgcgttac gaagagcggt tacccgcctg cacccgcttt 1440
ctggaaacgg t 1451ctggaaacgg t 1451
<210> 191<210> 191
<211> 1191<211> 1191
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2<223> glnE-delta-AR-2
<400> 191<400> 191
atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60
gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120
gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180
gaagagcagc agctggaggc gttgcgccag tttaagcagg cgcagcagct gcatatcgcg 240gaagagcagc agctggaggc gttgcgccag tttaagcagg cgcagcagct gcatatcgcg 240
gcggcggata tcgctggtac cctgccggtg atgaaggtca gcgatcactt aacctggctt 300gcggcggata tcgctggtac cctgccggtg atgaaggtca gcgatcactt aacctggctt 300
gccgaagcga tcctcgacgc ggtggtgcag caggcatggg ggcagatggt cgctcgctac 360gccgaagcga tcctcgacgc ggtggtgcag caggcatggg ggcagatggt cgctcgctac 360
ggccagccga cccacctgca cgatcgccag ggtcgcggct tcgccgtcgt cggctacggt 420ggccagccga cccacctgca cgatcgccag ggtcgcggct tcgccgtcgt cggctacggt 420
aagcttggcg gctgggagct gggctacagc tccgatctcg atctggtgtt cctccatgac 480aagcttggcg gctgggagct gggctacagc tccgatctcg atctggtgtt cctccatgac 480
tgcccggcgg aggtgatgac cgacggcgag cgggagattg acggccgtca gttctacctg 540tgcccggcgg aggtgatgac cgacggcgag cgggagattg acggccgtca gttctacctg 540
cggctggccc agcggatcat gcacctgttc agcacccgca cctcgtccgg tattctctac 600cggctggccc agcggatcat gcacctgttc agcacccgca cctcgtccgg tattctctac 600
gaagtggacg cccggctgcg tccttctggc gcggcgggga tgctggtcac caccgccgac 660gaagtggacg cccggctgcg tccttctggc gcggcgggga tgctggtcac caccgccgac 660
gcgtttgctg actatcagca gaacgaagcc tggacgtggg aacatcaggc gctggtgcgc 720gcgtttgctg actatcagca gaacgaagcc tggacgtggg aacatcaggc gctggtgcgc 720
gcccgcgtgg tctatggcga cccggcgctg caggcgcgct ttgacgccat tcgtcgcgat 780gcccgcgtgg tctatggcga cccggcgctg caggcgcgct ttgacgccat tcgtcgcgat 780
atcctgacca ccccgcggga ggggatgacc ctgcagaccg aggttcgcga gatgcgcgag 840atcctgacca ccccgcggga ggggatgacc ctgcagaccg aggttcgcga gatgcgcgag 840
aagatgcgcg cccaccttgg caacaaacat cccgatcgtt ttgatatcaa agccgatgcc 900aagatgcgcg cccaccttgg caacaaacat cccgatcgtt ttgatatcaa agccgatgcc 900
ggcgggatca ccgatattga atttattact cagtatctgg tcctacgcta tgccagtgac 960ggcgggatca ccgatattga atttattact cagtatctgg tcctacgcta tgccagtgac 960
aagccgaagc tgacccgctg gtctgacaac gtgcgtattc ttgagctgct ggcgcagaac 1020aagccgaagc tgacccgctg gtctgacaac gtgcgtattc ttgagctgct ggcgcagaac 1020
gacatcatgg acgaggagga ggcgcgcgcc ttaacgcatg cgtacaccac cttgcgtgat 1080gacatcatgg acgaggagga ggcgcgcgcc ttaacgcatg cgtacaccac cttgcgtgat 1080
gcgctccatc acctggccct gcaggagcag ccgggacacg tggcgccaga ggccttcagc 1140gcgctccatc acctggccct gcaggagcag ccgggacacg tggcgccaga ggccttcagc 1140
cgggagcgtc agcaggtcag cgccagctgg cagaagtggc tgatggctta a 1191cgggagcgtc agcaggtcag cgccagctgg cagaagtggc tgatggctta a 1191
<210> 192<210> 192
<211> 2191<211> 2191
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-2 with a 500 bp flanking region.
<400> 192<400> 192
cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60
gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120
actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180
atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240
cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300
cgcgacatcg acagcgtcca gctgctggcg ggcgcctatg gcgacgccgt cgcgccgtgg 360360
ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420
tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480
tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540
cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600
acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660
tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctggaggc gttgcgccag tttaagcagg 720tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctggaggc gttgcgccag tttaagcagg 720
cgcagcagct gcatatcgcg gcggcggata tcgctggtac cctgccggtg atgaaggtca 780cgcagcagct gcatatcgcg gcggcggata tcgctggtac cctgccggtg atgaaggtca 780
gcgatcactt aacctggctt gccgaagcga tcctcgacgc ggtggtgcag caggcatggg 840gcgatcactt aacctggctt gccgaagcga tcctcgacgc ggtggtgcag caggcatggg 840
ggcagatggt cgctcgctac ggccagccga cccacctgca cgatcgccag ggtcgcggct 900ggcagatggt cgctcgctac ggccagccga cccacctgca cgatcgccag ggtcgcggct 900
tcgccgtcgt cggctacggt aagcttggcg gctgggagct gggctacagc tccgatctcg 960tcgccgtcgt cggctacggt aagcttggcg gctgggagct gggctacagc tccgatctcg 960
atctggtgtt cctccatgac tgcccggcgg aggtgatgac cgacggcgag cgggagattg 1020atctggtgtt cctccatgac tgcccggcgg aggtgatgac cgacggcgag cgggagattg 1020
acggccgtca gttctacctg cggctggccc agcggatcat gcacctgttc agcacccgca 1080acggccgtca gttctacctg cggctggccc agcggatcat gcacctgttc agcacccgca 1080
cctcgtccgg tattctctac gaagtggacg cccggctgcg tccttctggc gcggcgggga 1140cctcgtccgg tattctctac gaagtggacg cccggctgcg tccttctggc gcggcgggga 1140
tgctggtcac caccgccgac gcgtttgctg actatcagca gaacgaagcc tggacgtggg 1200tgctggtcac caccgccgac gcgtttgctg actatcagca gaacgaagcc tggacgtggg 1200
aacatcaggc gctggtgcgc gcccgcgtgg tctatggcga cccggcgctg caggcgcgct 1260aacatcaggc gctggtgcgc gcccgcgtgg tctatggcga cccggcgctg caggcgcgct 1260
ttgacgccat tcgtcgcgat atcctgacca ccccgcggga ggggatgacc ctgcagaccg 1320ttgacgccat tcgtcgcgat atcctgacca ccccgcggga ggggatgacc ctgcagaccg 1320
aggttcgcga gatgcgcgag aagatgcgcg cccaccttgg caacaaacat cccgatcgtt 13801380
ttgatatcaa agccgatgcc ggcgggatca ccgatattga atttattact cagtatctgg 1440ttgatatcaa agccgatgcc ggcgggatca ccgatattga atttattact cagtatctgg 1440
tcctacgcta tgccagtgac aagccgaagc tgacccgctg gtctgacaac gtgcgtattc 1500tcctacgcta tgccagtgac aagccgaagc tgacccgctg gtctgacaac gtgcgtattc 1500
ttgagctgct ggcgcagaac gacatcatgg acgaggagga ggcgcgcgcc ttaacgcatg 1560ttgagctgct ggcgcagaac gacatcatgg acgaggagga ggcgcgcgcc ttaacgcatg 1560
cgtacaccac cttgcgtgat gcgctccatc acctggccct gcaggagcag ccgggacacg 1620cgtacaccac cttgcgtgat gcgctccatc acctggccct gcaggagcag ccgggacacg 1620
tggcgccaga ggccttcagc cgggagcgtc agcaggtcag cgccagctgg cagaagtggc 1680tggcgccaga ggccttcagc cgggagcgtc agcaggtcag cgccagctgg cagaagtggc 1680
tgatggctta actataaaat cgggtgtgct attatcgcgc gcaaagtttg cgtctcgcag 1740tgatggctta actataaaat cgggtgtgct attatcgcgc gcaaagtttg cgtctcgcag 1740
gagagagtca tgaaagtaac gctgccggag tttgaacgtg caggagtgtt ggtggtgggt 18001800
gatgtgatgc tggaccgcta ctggtacggc cccaccagtc gtatttcccc ggaagccccg 1860gatgtgatgc tggaccgcta ctggtacggc cccaccagtc gtatttcccc ggaagccccg 1860
gtgccggtgg tgaaggtgga aaatatcgaa gaacgtcctg gcggcgcggc aaacgtagcg 1920gtgccggtgg tgaaggtgga aaatatcgaa gaacgtcctg gcggcgcggc aaacgtagcg 1920
atgaacatcg cctccctggg ggcaacgtcg cgcctggtgg gattgaccgg gattgatgac 1980atgaacatcg cctccctggg ggcaacgtcg cgcctggtgg gattgaccgg gattgatgac 1980
gctgcccgcg cgctgagcca ggcgctggcc aatgtgaatg tgaagtgcga cttcgtctcc 2040gctgcccgcg cgctgagcca ggcgctggcc aatgtgaatg tgaagtgcga cttcgtctcc 2040
gtcccgactc acccgaccat caccaagctg cgggtgctgt cgcgcaatca gcagctgatc 2100gtcccgactc acccgaccat caccaagctg cgggtgctgt cgcgcaatca gcagctgatc 2100
cgcctcgact ttgaagaggg cttctccggc gtggatccgc agccgatgca tgagcgcatt 2160cgcctcgact ttgaagaggg cttctccggc gtggatccgc agccgatgca tgagcgcatt 2160
cagcaggcgc tgggagccat tggcgcactg g 2191cagcaggcgc tgggagccat tggcgcactg g 2191
<210> 193<210> 193
<211> 613<211> 613
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::PinfC<223> delta-nifL::PinfC
<400> 193<400> 193
atgaccctga atatgatgct agaagcgtca ggtaccggtc atgattcacc gtgcgattct 60atgaccctga atatgatgct agaagcgtca ggtaccggtc atgattcacc gtgcgattct 60
cggttccctg gagcgcttca ttggcatcct gaccgaagag ttcgctggct tcttcccaac 120cggttccctg gagcgcttca ttggcatcct gaccgaagag ttcgctggct tcttcccaac 120
ctggattgca ccagtgcagg tagtggtcat gaatattacc gattctcagg ctgaatacgt 180ctggattgca ccagtgcagg tagtggtcat gaatattacc gattctcagg ctgaatacgt 180
taacgaattg acgcgtaaac tacaaaatgc gggcattcgt gtaaaagcag acttgagaaa 240taacgaattg acgcgtaaac tacaaaatgc gggcattcgt gtaaaagcag acttgagaaa 240
tgagaagatt ggctttaaaa tccgcgagca cactttacgt cgtgtcccgt atatgttggt 300tgagaagatt ggctttaaaa tccgcgagca cactttacgt cgtgtcccgt atatgttggt 300
ctgtggcgac aaagaagtcg aagccggcaa agtggccgtg cgcacccgtc gcgggaaaga 360ctgtggcgac aaagaagtcg aagccggcaa agtggccgtg cgcacccgtc gcgggaaaga 360
cctcggcagc atggacgtaa gtgaagtgat tgagaagctg caacaagaga ttcgcagccg 420cctcggcagc atggacgtaa gtgaagtgat tgagaagctg caacaagaga ttcgcagccg 420
cagtcttcaa caactggagg aataaggtat taaaggcgga aaacgagttc aaacggcacg 480cagtcttcaa caactggagg aataaggtat taaaggcgga aaacgagttc aaacggcacg 480
tccgaatcgt atcaatggcg agattcgcgc cctggaagtt cgcgccattg agctggcttc 540tccgaatcgt atcaatggcg agattcgcgc cctggaagtt cgcgccattg agctggcttc 540
ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg 600ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg 600
aggtgaagca tga 613aggtgaagca tga 613
<210> 194<210> 194
<211> 1613<211> 1613
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::PinfC с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::PinfC with a 500 bp flanking region.
<400> 194<400> 194
ggccgtcgcc cagcgtcggc gtccccaaca gcagggccgg gtaggccagc aggtccgcca 60ggccgtcgcc cagcgtcggc gtccccaaca gcagggccgg gtaggccagc aggtccgcca 60
gcgtggcgcg gttaatattg accggggcgg cggcggcctc ccccagctgc ttgtggatca 120gcgtggcgcg gttaatattg accggggcgg cggcggcctc ccccagctgc ttgtggatca 120
ttttcgcgat cttgcgggtt ttaccggtat cggtaccaaa gaaaatgcca atgttcgcca 180ttttcgcgat cttgcggtt ttaccggtat cggtaccaaa gaaaatgcca atgttcgcca 180
tagtacgctc ctgtcggaat ggtgttgaaa aaaggaatga cgacagaggt attgcgaagg 240tagtacgctc ctgtcggaat ggtgttgaaa aaaggaatga cgacagaggt attgcgaagg 240
ctgtgccagg ttgccctgca ccgcgacggc ccatccctgc cccatcagga tcgcttcgca 300ctgtgccagg ttgccctgca ccgcgacggc ccatccctgc cccatcagga tcgcttcgca 300
tcacgatgcc gcgcgccaaa ggcgcacccg gcggggcgaa aggtaaaaat ccgtgaattt 360tcacgatgcc gcgcgccaaa ggcgcacccg gcggggcgaa aggtaaaaat ccgtgaattt 360
tccccctgtc ggatcaatgt ttcgcgtggt cgttccgata agggcgcaca ctttgcatgg 420tccccctgtc ggatcaatgt ttcgcgtggt cgttccgata agggcgcaca ctttgcatgg 420
ttatccgggt tcggcttacc ccgccgcgtt ttgcgcacgg tgtcggacaa tttgtcataa 480ttatccgggt tcggcttacc ccgccgcgtt ttgcgcacgg tgtcggacaa tttgtcataa 480
ctgcgacaca ggagtttgcg atgaccctga atatgatgct agaagcgtca ggtaccggtc 540ctgcgacaca ggagtttgcg atgaccctga atatgatgct agaagcgtca ggtaccggtc 540
atgattcacc gtgcgattct cggttccctg gagcgcttca ttggcatcct gaccgaagag 600atgattcacc gtgcgattct cggttccctg gagcgcttca ttggcatcct gaccgaagag 600
ttcgctggct tcttcccaac ctggattgca ccagtgcagg tagtggtcat gaatattacc 660ttcgctggct tcttcccaac ctggattgca ccagtgcagg tagtggtcat gaatattacc 660
gattctcagg ctgaatacgt taacgaattg acgcgtaaac tacaaaatgc gggcattcgt 720gattctcagg ctgaatacgt taacgaattg acgcgtaaac tacaaaatgc gggcattcgt 720
gtaaaagcag acttgagaaa tgagaagatt ggctttaaaa tccgcgagca cactttacgt 780gtaaaagcag acttgagaaa tgagaagatt ggctttaaaa tccgcgagca cactttacgt 780
cgtgtcccgt atatgttggt ctgtggcgac aaagaagtcg aagccggcaa agtggccgtg 840cgtgtcccgt atatgttggt ctgtggcgac aaagaagtcg aagccggcaa agtggccgtg 840
cgcacccgtc gcgggaaaga cctcggcagc atggacgtaa gtgaagtgat tgagaagctg 900cgcacccgtc gcgggaaaga cctcggcagc atggacgtaa gtgaagtgat tgagaagctg 900
caacaagaga ttcgcagccg cagtcttcaa caactggagg aataaggtat taaaggcgga 960caacaagaga ttcgcagccg cagtcttcaa caactggagg aataaggtat taaaggcgga 960
aaacgagttc aaacggcacg tccgaatcgt atcaatggcg agattcgcgc cctggaagtt 1020aaacgagttc aaacggcacg tccgaatcgt atcaatggcg agattcgcgc cctggaagtt 1020
cgcgccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg 10801080 cgcgccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct
ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tgatccctga atccgacccg gacaccaccg 1140ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tgatccctga atccgacccg gacaccaccg 1140
tcagacgctt cgacctctct cagcagttca ccgccatgca gcggataagc gtggtgctga 1200tcagacgctt cgacctctct cagcagttca ccgccatgca gcggataagc gtggtgctga 1200
gccgggccac cgaggccagc aaaacgctgc aggaggtgct cagcgtatta cacaacgatg 1260gccgggccac cgaggccagc aaaacgctgc aggaggtgct cagcgtatta cacaacgatg 1260
cctttatgca gcacgggatg atctgcctgt acgacagcga gcaggagatc ctcagtatcg 1320ccttttatgca gcacgggatg atctgcctgt acgacagcga gcaggagatc ctcagtatcg 1320
aagcgctgca gcaaaccggc cagcagcccc tccccggcag cacgcagatc cgctatcgcc 1380aagcgctgca gcaaaccggc cagcagcccc tccccggcag cacgcagatc cgctatcgcc 1380
ccggcgaggg actggtgggg accgtgctgg cccaggggca gtcgctggtg ctgccccggg 1440ccggcgaggg actggtgggg accgtgctgg cccaggggca gtcgctggtg ctgccccggg 1440
tcgccgacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgagcctcta cgattacgat ctgccgttta 1500tcgccgacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgagcctcta cgattacgat ctgccgttta 1500
tcgccgtacc gttgatgggg cccaacgccc ggccaatagg ggtgctggcg gcccagccga 1560tcgccgtacc gttgatgggg cccaacgccc ggccaatagg ggtgctggcg gcccagccga 1560
tggcgcgcca ggaagagcgg ctgccggcct gcacccgttt tctcgaaacc gtc 1613tggcgcgcca ggaagagcgg ctgccggcct gcacccgttt tctcgaaacc gtc 1613
<210> 195<210> 195
<211> 1155<211> 1155
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> делеция 36 п.н. glnE-delta-AR-2<223> 36 bp deletion glnE-delta-AR-2
<400> 195<400> 195
atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60
gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120
gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180
gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg gtaccctgcc ggtgatgaag 240gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg gtaccctgcc ggtgatgaag 240
gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg acgcggtggt gcagcaggca 300gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg acgcggtggt gcagcaggca 300
tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc tgcacgatcg ccagggtcgc 360tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc tgcacgatcg ccagggtcgc 360
ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg agctgggcta cagctccgat 420ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg agctgggcta cagctccgat 420
ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga tgaccgacgg cgagcgggag 480ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga tgaccgacgg cgagcgggag 480
attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga tcatgcacct gttcagcacc 540attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga tcatgcacct gttcagcacc 540
cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc tgcgtccttc tggcgcggcg 600600 cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg
gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc agcagaacga agcctggacg 660gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc agcagaacga agcctggacg 660
tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg gcgacccggc gctgcaggcg 720tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg gcgacccggc gctgcaggcg 720
cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc gggaggggat gaccctgcag 780cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc gggaggggat gaccctgcag 780
accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc ttggcaacaa acatcccgat 840accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc ttggcaacaa acatcccgat 840
cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata ttgaatttat tactcagtat 900cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata ttgaatttat tactcagtat 900
ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc gctggtctga caacgtgcgt 960ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc gctggtctga caacgtgcgt 960
attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg aggaggcgcg cgccttaacg 1020attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg aggaggcgcg cgccttaacg 1020
catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg ccctgcagga gcagccggga 1080catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg ccctgcagga gcagccggga 1080
cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg tcagcgccag ctggcagaag 1140cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg tcagcgccag ctggcagaag 1140
tggctgatgg cttaa 1155tggctgatgg cttaa 1155
<210> 196<210> 196
<211> 2155<211> 2155
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> делеция 36 п.н. glnE-delta-AR-2<223> 36 bp deletion glnE-delta-AR-2
<400> 196<400> 196
cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60
gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120
actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180
atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240
cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300
cgcgacatcg acagcgtcca gctgctggcg ggcgcctatg gcgacgccgt cgcgccgtgg 360360
ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420
tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480
tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540
cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600
acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660
tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg 720tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg 720
gtaccctgcc ggtgatgaag gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg 780gtaccctgcc ggtgatgaag gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg 780
acgcggtggt gcagcaggca tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc 840acgcggtggt gcagcaggca tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc 840
tgcacgatcg ccagggtcgc ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg 900tgcacgatcg ccagggtcgc ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg 900
agctgggcta cagctccgat ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga 960agctgggcta cagctccgat ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga 960
tgaccgacgg cgagcgggag attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga 1020tgaccgacgg cgagcgggag attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga 1020
tcatgcacct gttcagcacc cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc 1080tcatgcacct gttcagcacc cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc 1080
tgcgtccttc tggcgcggcg gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc 1140tgcgtccttc tggcgcggcg gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc 1140
agcagaacga agcctggacg tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg 1200agcagaacga agcctggacg tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg 1200
gcgacccggc gctgcaggcg cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc 1260gcgacccggc gctgcaggcg cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accacccccgc 1260
gggaggggat gaccctgcag accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc 1320gggaggggat gaccctgcag accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc 1320
ttggcaacaa acatcccgat cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata 13801380
ttgaatttat tactcagtat ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc 1440ttgaatttat tactcagtat ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc 1440
gctggtctga caacgtgcgt attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg 1500gctggtctga caacgtgcgt attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg 1500
aggaggcgcg cgccttaacg catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg 1560aggaggcgcg cgccttaacg catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg 1560
ccctgcagga gcagccggga cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg 1620ccctgcagga gcagccggga cacgtggcgc cagaggcctt cagccggggag cgtcagcagg 1620
tcagcgccag ctggcagaag tggctgatgg cttaactata aaatcgggtg tgctattatc 1680tcagcgccag ctggcagaag tggctgatgg cttaactata aaatcgggtg tgctattatc 1680
gcgcgcaaag tttgcgtctc gcaggagaga gtcatgaaag taacgctgcc ggagtttgaa 1740gcgcgcaaag tttgcgtctc gcaggagaga gtcatgaaag taacgctgcc ggagtttgaa 1740
cgtgcaggag tgttggtggt gggtgatgtg atgctggacc gctactggta cggccccacc 1800cgtgcaggag tgttggtggt gggtgatgtg atgctggacc gctactggta cggccccacc 1800
agtcgtattt ccccggaagc cccggtgccg gtggtgaagg tggaaaatat cgaagaacgt 18601860
cctggcggcg cggcaaacgt agcgatgaac atcgcctccc tgggggcaac gtcgcgcctg 1920cctggcggcg cggcaaacgt agcgatgaac atcgcctccc tgggggcaac gtcgcgcctg 1920
gtgggattga ccgggattga tgacgctgcc cgcgcgctga gccaggcgct ggccaatgtg 1980gtgggattga ccgggattga tgacgctgcc cgcgcgctga gccaggcgct ggccaatgtg 1980
aatgtgaagt gcgacttcgt ctccgtcccg actcacccga ccatcaccaa gctgcgggtg 2040aatgtgaagt gcgacttcgt ctccgtcccg actcacccga ccatcaccaa gctgcgggtg 2040
ctgtcgcgca atcagcagct gatccgcctc gactttgaag agggcttctc cggcgtggat 2100ctgtcgcgca atcagcagct gatccgcctc gactttgaag agggcttctc cggcgtggat 2100
ccgcagccga tgcatgagcg cattcagcag gcgctgggag ccattggcgc actgg 2155ccgcagccga tgcatgagcg cattcagcag gcgctgggag ccattggcgc actgg 2155
<210> 197<210> 197
<211> 412<211> 412
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm8.2<223> delta-nifL::Prm8.2
<400> 197<400> 197
atgaccctga atatgatgct cgacgccgtc ctcgcagtac cattgcaacc gactttacag 60atgaccctga atatgatgct cgacgccgtc ctcgcagtac cattgcaacc gactttacag 60
caagaagtga ttctggcacg catggaacaa attcttgcca gtcgggcttt atccgatgac 120caagaagtga ttctggcacg catggaacaa attcttgcca gtcgggcttt atccgatgac 120
gaacgcgcac agcttttata tgagcgcgga gtgttgtatg atagtctcgg tctgagggca 180gaacgcgcac agcttttata tgagcgcgga gtgttgtatg atagtctcgg tctgagggca 180
ttagcgcgaa atgatttttc acaagcgctg gcaatccgac ccgatatgcc tgaagtattc 240ttagcgcgaa atgatttttc acaagcgctg gcaatccgac ccgatatgcc tgaagtattc 240
aattacttag gcatttactt aacgcaggca ggcaattttg atgctgccta tgaagcgttt 300aattacttag gcatttactt aacgcaggca ggcaattttg atgctgccta tgaagcgttt 300
gattctgtac ttgagcttga tcgccattga gctggcttcc cgaccgcagg gcggcacctg 360gattctgtac ttgagcttga tcgccattga gctggcttcc cgaccgcagg gcggcacctg 360
cctgaccctg cgtttcccgc tgtttaacac cctgaccgga ggtgaagcat ga 412cctgaccctg cgtttcccgc tgtttaacac cctgaccggga ggtgaagcat
<210> 198<210> 198
<211> 1389<211> 1389
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm8.2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm8.2 with a 500 bp flanking region.
<400> 198<400> 198
cccaacagca gggccgggta ggccagcagg tccgccagcg tggcgcggtt aatattgacc 60cccaacagca gggccgggta ggccagcagg tccgccagcg tggcgcggtt aatattgacc 60
ggggcggcgg cggcctcccc cagctgcttg tggatcattt tcgcgatctt gcgggtttta 120ggggcggcgg cggcctcccc cagctgcttg tggatcattt tcgcgatctt gcgggtttta 120
ccggtatcgg taccaaagaa aatgccaatg ttcgccatag tacgctcctg tcggaatggt 180ccggtatcgg taccaaagaa aatgccaatg ttcgccatag tacgctcctg tcggaatggt 180
gttgaaaaaa ggaatgacga cagaggtatt gcgaaggctg tgccaggttg ccctgcaccg 240gttgaaaaaa ggaatgacga cagaggtatt gcgaaggctg tgccaggttg ccctgcaccg 240
cgacggccca tccctgcccc atcaggatcg cttcgcatca cgatgccgcg cgccaaaggc 300cgacggccca tccctgcccc atcaggatcg cttcgcatca cgatgccgcg cgccaaaggc 300
gcacccggcg gggcgaaagg taaaaatccg tgaattttcc ccctgtcgga tcaatgtttc 360360
gcgtggtcgt tccgataagg gcgcacactt tgcatggtta tccgggttcg gcttaccccg 420gcgtggtcgt tccgataagg gcgcacactt tgcatggtta tcggggttcg gcttaccccg 420
ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg cgacacagga gtttgcgatg 480ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg cgacacaggga gtttgcgatg 480
accctgaata tgatgctcga cgccgtcctc gcagtaccat tgcaaccgac tttacagcaa 540accctgaata tgatgctcga cgccgtcctc gcagtaccat tgcaaccgac tttacagcaa 540
gaagtgattc tggcacgcat ggaacaaatt cttgccagtc gggctttatc cgatgacgaa 600gaagtgattc tggcacgcat ggaacaaatt cttgccagtc gggctttatc cgatgacgaa 600
cgcgcacagc ttttatatga gcgcggagtg ttgtatgata gtctcggtct gagggcatta 660cgcgcacagc ttttatatga gcgcggagtg ttgtatgata gtctcggtct gagggcatta 660
gcgcgaaatg atttttcaca agcgctggca atccgacccg atatgcctga agtattcaat 720gcgcgaaatg atttttcaca agcgctggca atccgacccg atatgcctga agtattcaat 720
tacttaggca tttacttaac gcaggcaggc aattttgatg ctgcctatga agcgtttgat 780tacttaggca tttacttaac gcaggcaggc aattttgatg ctgcctatga agcgtttgat 780
tctgtacttg agcttgatcg ccattgagct ggcttcccga ccgcagggcg gcacctgcct 840tctgtacttg agcttgatcg ccattgagct ggcttcccga ccgcaggggcg gcacctgcct 840
gaccctgcgt ttcccgctgt ttaacaccct gaccggaggt gaagcatgat ccctgaatcc 900gaccctgcgt ttcccgctgt ttaacaccct gaccgggaggt gaagcatgat ccctgaatcc 900
gacccggaca ccaccgtcag acgcttcgac ctctctcagc agttcaccgc catgcagcgg 960gacccggaca ccaccgtcag acgcttcgac ctctctcagc agttcaccgc catgcagcgg 960
ataagcgtgg tgctgagccg ggccaccgag gccagcaaaa cgctgcagga ggtgctcagc 1020ataagcgtgg tgctgagccg ggccaccgag gccagcaaaa cgctgcagga ggtgctcagc 1020
gtattacaca acgatgcctt tatgcagcac gggatgatct gcctgtacga cagcgagcag 1080gtattacaca acgatgcctt tatgcagcac gggatgatct gcctgtacga cagcgagcag 1080
gagatcctca gtatcgaagc gctgcagcaa accggccagc agcccctccc cggcagcacg 1140gagatcctca gtatcgaagc gctgcagcaa accggccagc agcccctccc cggcagcacg 1140
cagatccgct atcgccccgg cgagggactg gtggggaccg tgctggccca ggggcagtcg 1200cagatccgct atcgccccgg cgagggactg gtggggaccg tgctggccca ggggcagtcg 1200
ctggtgctgc cccgggtcgc cgacgatcag cgttttctcg accgcctgag cctctacgat 1260ctggtgctgc cccgggtcgc cgacgatcag cgttttctcg accgcctgag cctctacgat 1260
tacgatctgc cgtttatcgc cgtaccgttg atggggccca acgcccggcc aataggggtg 1320tacgatctgc cgtttatcgc cgtaccgttg atggggccca acgcccggcc aataggggtg 1320
ctggcggccc agccgatggc gcgccaggaa gagcggctgc cggcctgcac ccgttttctc 1380ctggcggccc agccgatggc gcgccaggaa gagcggctgc cggcctgcac ccgttttctc 1380
gaaaccgtc 1389gaaaccgtc 1389
<210> 199<210> 199
<211> 1155<211> 1155
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> делеция 36 п.н. glnE-delta-AR-2<223> 36 bp deletion glnE-delta-AR-2
<400> 199<400> 199
atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60
gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120
gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180
gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg gtaccctgcc ggtgatgaag 240gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg gtaccctgcc ggtgatgaag 240
gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg acgcggtggt gcagcaggca 300gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg acgcggtggt gcagcaggca 300
tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc tgcacgatcg ccagggtcgc 360tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc tgcacgatcg ccagggtcgc 360
ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg agctgggcta cagctccgat 420ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg agctgggcta cagctccgat 420
ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga tgaccgacgg cgagcgggag 480ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga tgaccgacgg cgagcgggag 480
attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga tcatgcacct gttcagcacc 540attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga tcatgcacct gttcagcacc 540
cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc tgcgtccttc tggcgcggcg 600600 cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg
gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc agcagaacga agcctggacg 660gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc agcagaacga agcctggacg 660
tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg gcgacccggc gctgcaggcg 720tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg gcgacccggc gctgcaggcg 720
cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc gggaggggat gaccctgcag 780cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc gggaggggat gaccctgcag 780
accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc ttggcaacaa acatcccgat 840accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc ttggcaacaa acatcccgat 840
cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata ttgaatttat tactcagtat 900cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata ttgaatttat tactcagtat 900
ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc gctggtctga caacgtgcgt 960ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc gctggtctga caacgtgcgt 960
attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg aggaggcgcg cgccttaacg 1020attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg aggaggcgcg cgccttaacg 1020
catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg ccctgcagga gcagccggga 1080catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg ccctgcagga gcagccggga 1080
cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg tcagcgccag ctggcagaag 1140cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg tcagcgccag ctggcagaag 1140
tggctgatgg cttaa 1155tggctgatgg cttaa 1155
<210> 200<210> 200
<211> 2155<211> 2155
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> делеция 36 п.н. glnE-delta-AR-2<223> 36 bp deletion glnE-delta-AR-2
<400> 200<400> 200
cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60
gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120
actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180
atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240
cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300
cgcgacatcg acagcgtcca gctgctggcg ggcgcctatg gcgacgccgt cgcgccgtgg 360360
ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420
tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480
tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540
cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600
acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660
tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg 720tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg 720
gtaccctgcc ggtgatgaag gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg 780gtaccctgcc ggtgatgaag gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg 780
acgcggtggt gcagcaggca tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc 840acgcggtggt gcagcaggca tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc 840
tgcacgatcg ccagggtcgc ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg 900tgcacgatcg ccagggtcgc ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg 900
agctgggcta cagctccgat ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga 960agctgggcta cagctccgat ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga 960
tgaccgacgg cgagcgggag attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga 1020tgaccgacgg cgagcgggag attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga 1020
tcatgcacct gttcagcacc cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc 1080tcatgcacct gttcagcacc cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc 1080
tgcgtccttc tggcgcggcg gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc 1140tgcgtccttc tggcgcggcg gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc 1140
agcagaacga agcctggacg tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg 1200agcagaacga agcctggacg tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg 1200
gcgacccggc gctgcaggcg cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc 1260gcgacccggc gctgcaggcg cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accacccccgc 1260
gggaggggat gaccctgcag accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc 1320gggaggggat gaccctgcag accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc 1320
ttggcaacaa acatcccgat cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata 13801380
ttgaatttat tactcagtat ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc 1440ttgaatttat tactcagtat ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc 1440
gctggtctga caacgtgcgt attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg 1500gctggtctga caacgtgcgt attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg 1500
aggaggcgcg cgccttaacg catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg 1560aggaggcgcg cgccttaacg catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg 1560
ccctgcagga gcagccggga cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg 1620ccctgcagga gcagccggga cacgtggcgc cagaggcctt cagccggggag cgtcagcagg 1620
tcagcgccag ctggcagaag tggctgatgg cttaactata aaatcgggtg tgctattatc 1680tcagcgccag ctggcagaag tggctgatgg cttaactata aaatcgggtg tgctattatc 1680
gcgcgcaaag tttgcgtctc gcaggagaga gtcatgaaag taacgctgcc ggagtttgaa 1740gcgcgcaaag tttgcgtctc gcaggagaga gtcatgaaag taacgctgcc ggagtttgaa 1740
cgtgcaggag tgttggtggt gggtgatgtg atgctggacc gctactggta cggccccacc 1800cgtgcaggag tgttggtggt gggtgatgtg atgctggacc gctactggta cggccccacc 1800
agtcgtattt ccccggaagc cccggtgccg gtggtgaagg tggaaaatat cgaagaacgt 18601860
cctggcggcg cggcaaacgt agcgatgaac atcgcctccc tgggggcaac gtcgcgcctg 1920cctggcggcg cggcaaacgt agcgatgaac atcgcctccc tgggggcaac gtcgcgcctg 1920
gtgggattga ccgggattga tgacgctgcc cgcgcgctga gccaggcgct ggccaatgtg 1980gtgggattga ccgggattga tgacgctgcc cgcgcgctga gccaggcgct ggccaatgtg 1980
aatgtgaagt gcgacttcgt ctccgtcccg actcacccga ccatcaccaa gctgcgggtg 2040aatgtgaagt gcgacttcgt ctccgtcccg actcacccga ccatcaccaa gctgcgggtg 2040
ctgtcgcgca atcagcagct gatccgcctc gactttgaag agggcttctc cggcgtggat 2100ctgtcgcgca atcagcagct gatccgcctc gactttgaag agggcttctc cggcgtggat 2100
ccgcagccga tgcatgagcg cattcagcag gcgctgggag ccattggcgc actgg 2155ccgcagccga tgcatgagcg cattcagcag gcgctgggag ccattggcgc actgg 2155
<210> 201<210> 201
<211> 413<211> 413
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm6.2<223> delta-nifL::Prm6.2
<400> 201<400> 201
atgaccctga atatgatgct cgagctaaag ttctcggcta atcgctgata acatttgacg 60atgaccctga atatgatgct cgagctaaag ttctcggcta atcgctgata acatttgacg 60
caatgcgcaa taaaagggca tcatttgatg ccctttttgc acgctttcat accagaacct 120caatgcgcaa taaaagggca tcatttgatg ccctttttgc acgctttcat accagaacct 120
ggctcatcag tgattttttt tgtcataatc attgctgaga caggctctga agagggcgtt 180ggctcatcag tgattttttt tgtcataatc attgctgaga caggctctga agagggcgtt 180
tatacaccaa accattcgag cggtagcgcg acggcaagtc agcgttctcc tttgcaatag 240tatacaccaa accattcgag cggtagcgcg acggcaagtc agcgttctcc tttgcaatag 240
cagggaagag gcgccagaac cgccagcgtt gaagcagttt gaacgcgttc agtgtataat 300cagggaagag gcgccagaac cgccagcgtt gaagcagttt gaacgcgttc agtgtataat 300
ccgaaactta atttcggttt ggagccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct 360ccgaaactta atttcggttt ggagccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct 360
gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tga 413gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tga 413
<210> 202<210> 202
<211> 1413<211> 1413
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm6.2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm6.2 with a 500 bp flanking region.
<400> 202<400> 202
ggccgtcgcc cagcgtcggc gtccccaaca gcagggccgg gtaggccagc aggtccgcca 60ggccgtcgcc cagcgtcggc gtccccaaca gcagggccgg gtaggccagc aggtccgcca 60
gcgtggcgcg gttaatattg accggggcgg cggcggcctc ccccagctgc ttgtggatca 120gcgtggcgcg gttaatattg accggggcgg cggcggcctc ccccagctgc ttgtggatca 120
ttttcgcgat cttgcgggtt ttaccggtat cggtaccaaa gaaaatgcca atgttcgcca 180ttttcgcgat cttgcggtt ttaccggtat cggtaccaaa gaaaatgcca atgttcgcca 180
tagtacgctc ctgtcggaat ggtgttgaaa aaaggaatga cgacagaggt attgcgaagg 240tagtacgctc ctgtcggaat ggtgttgaaa aaaggaatga cgacagaggt attgcgaagg 240
ctgtgccagg ttgccctgca ccgcgacggc ccatccctgc cccatcagga tcgcttcgca 300ctgtgccagg ttgccctgca ccgcgacggc ccatccctgc cccatcagga tcgcttcgca 300
tcacgatgcc gcgcgccaaa ggcgcacccg gcggggcgaa aggtaaaaat ccgtgaattt 360tcacgatgcc gcgcgccaaa ggcgcacccg gcggggcgaa aggtaaaaat ccgtgaattt 360
tccccctgtc ggatcaatgt ttcgcgtggt cgttccgata agggcgcaca ctttgcatgg 420tccccctgtc ggatcaatgt ttcgcgtggt cgttccgata agggcgcaca ctttgcatgg 420
ttatccgggt tcggcttacc ccgccgcgtt ttgcgcacgg tgtcggacaa tttgtcataa 480ttatccgggt tcggcttacc ccgccgcgtt ttgcgcacgg tgtcggacaa tttgtcataa 480
ctgcgacaca ggagtttgcg atgaccctga atatgatgct cgagctaaag ttctcggcta 540ctgcgacaca ggagtttgcg atgaccctga atatgatgct cgagctaaag ttctcggcta 540
atcgctgata acatttgacg caatgcgcaa taaaagggca tcatttgatg ccctttttgc 600atcgctgata acatttgacg caatgcgcaa taaaagggca tcatttgatg ccctttttgc 600
acgctttcat accagaacct ggctcatcag tgattttttt tgtcataatc attgctgaga 660acgctttcat accagaacct ggctcatcag tgattttttt tgtcataatc attgctgaga 660
caggctctga agagggcgtt tatacaccaa accattcgag cggtagcgcg acggcaagtc 720caggctctga agagggcgtt tatacaccaa accattcgag cggtagcgcg acggcaagtc 720
agcgttctcc tttgcaatag cagggaagag gcgccagaac cgccagcgtt gaagcagttt 780agcgttctcc tttgcaatag cagggaagag gcgccagaac cgccagcgtt gaagcagttt 780
gaacgcgttc agtgtataat ccgaaactta atttcggttt ggagccattg agctggcttc 840gaacgcgttc agtgtataat ccgaaactta atttcggttt ggagccattg agctggcttc 840
ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg 900ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg 900
aggtgaagca tgatccctga atccgacccg gacaccaccg tcagacgctt cgacctctct 960aggtgaagca tgatccctga atccgacccg gacaccaccg tcagacgctt cgacctctct 960
cagcagttca ccgccatgca gcggataagc gtggtgctga gccgggccac cgaggccagc 1020cagcagttca ccgccatgca gcggataagc gtggtgctga gccgggccac cgaggccagc 1020
aaaacgctgc aggaggtgct cagcgtatta cacaacgatg cctttatgca gcacgggatg 1080aaaacgctgc aggaggtgct cagcgtatta cacaacgatg cctttatgca gcacgggatg 1080
atctgcctgt acgacagcga gcaggagatc ctcagtatcg aagcgctgca gcaaaccggc 1140atctgcctgt acgacagcga gcaggagatc ctcagtatcg aagcgctgca gcaaaccggc 1140
cagcagcccc tccccggcag cacgcagatc cgctatcgcc ccggcgaggg actggtgggg 1200cagcagcccc tccccggcag cacgcagatc cgctatcgcc ccggcgaggg actggtgggg 1200
accgtgctgg cccaggggca gtcgctggtg ctgccccggg tcgccgacga tcagcgtttt 1260accgtgctgg cccaggggca gtcgctggtg ctgccccggg tcgccgacga tcagcgtttt 1260
ctcgaccgcc tgagcctcta cgattacgat ctgccgttta tcgccgtacc gttgatgggg 1320ctcgaccgcc tgagcctcta cgattacgat ctgccgttta tcgccgtacc gttgatgggg 1320
cccaacgccc ggccaatagg ggtgctggcg gcccagccga tggcgcgcca ggaagagcgg 1380cccaacgccc ggccaatagg ggtgctggcg gcccagccga tggcgcgcca ggaagagcgg 1380
ctgccggcct gcacccgttt tctcgaaacc gtc 1413ctgccggcct gcacccgttt tctcgaaacc gtc 1413
<210> 203<210> 203
<211> 513<211> 513
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1.2<223> delta-nifL::Prm1.2
<400> 203<400> 203
atgaccctga atatgatgct cgagcccgct gaccgaccag aacttccacc ttggactcgg 60atgaccctga atatgatgct cgagcccgct gaccgaccag aacttccacc ttggactcgg 60
ctataccctt ggcgtgacgg cgcgcgataa ctgggactac atccccattc cggtgatctt 120ctataccctt ggcgtgacgg cgcgcgataa ctgggactac atccccattc cggtgatctt 120
accattggcg tcaataggtt acggtccggc gactttccag atgacctata ttcccggcac 180accattggcg tcaataggtt acggtccggc gactttccag atgacctata ttcccggcac 180
ctacaataac ggtaacgttt acttcgcctg ggctcgtata cagttttaat tcgctaagtc 240ctacaataac ggtaacgttt acttcgcctg ggctcgtata cagttttaat tcgctaagtc 240
ttagcaataa atgagataag cggtgtgtct tgtggaaaaa caaggactaa agcgttaccc 300ttagcaataa atgagataag cggtgtgtct tgtggaaaaa caaggactaa agcgttaccc 300
actaaaaaag atagcgactt ttatcacttt ttagcaaagt tgcactggac aaaaggtacc 360actaaaaaag atagcgactt ttatcacttt ttagcaaagt tgcactggac aaaaggtacc 360
acaattggtg tactgatact cgacacagca ttagtgtcga tttttcatat aaaggtaatt 420acaattggtg tactgatact cgacacagca ttagtgtcga tttttcatat aaaggtaatt 420
ttggccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg 480ttggccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg 480
ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tga 513ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tga 513
<210> 204<210> 204
<211> 1513<211> 1513
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1.2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm1.2 with a 500 bp flanking region.
<400> 204<400> 204
ggccgtcgcc cagcgtcggc gtccccaaca gcagggccgg gtaggccagc aggtccgcca 60ggccgtcgcc cagcgtcggc gtccccaaca gcagggccgg gtaggccagc aggtccgcca 60
gcgtggcgcg gttaatattg accggggcgg cggcggcctc ccccagctgc ttgtggatca 120gcgtggcgcg gttaatattg accggggcgg cggcggcctc ccccagctgc ttgtggatca 120
ttttcgcgat cttgcgggtt ttaccggtat cggtaccaaa gaaaatgcca atgttcgcca 180ttttcgcgat cttgcggtt ttaccggtat cggtaccaaa gaaaatgcca atgttcgcca 180
tagtacgctc ctgtcggaat ggtgttgaaa aaaggaatga cgacagaggt attgcgaagg 240tagtacgctc ctgtcggaat ggtgttgaaa aaaggaatga cgacagaggt attgcgaagg 240
ctgtgccagg ttgccctgca ccgcgacggc ccatccctgc cccatcagga tcgcttcgca 300ctgtgccagg ttgccctgca ccgcgacggc ccatccctgc cccatcagga tcgcttcgca 300
tcacgatgcc gcgcgccaaa ggcgcacccg gcggggcgaa aggtaaaaat ccgtgaattt 360tcacgatgcc gcgcgccaaa ggcgcacccg gcggggcgaa aggtaaaaat ccgtgaattt 360
tccccctgtc ggatcaatgt ttcgcgtggt cgttccgata agggcgcaca ctttgcatgg 420tccccctgtc ggatcaatgt ttcgcgtggt cgttccgata agggcgcaca ctttgcatgg 420
ttatccgggt tcggcttacc ccgccgcgtt ttgcgcacgg tgtcggacaa tttgtcataa 480ttatccgggt tcggcttacc ccgccgcgtt ttgcgcacgg tgtcggacaa tttgtcataa 480
ctgcgacaca ggagtttgcg atgaccctga atatgatgct cgagcccgct gaccgaccag 540ctgcgacaca ggagtttgcg atgaccctga atatgatgct cgagcccgct gaccgaccag 540
aacttccacc ttggactcgg ctataccctt ggcgtgacgg cgcgcgataa ctgggactac 600aacttccacc ttggactcgg ctataccctt ggcgtgacgg cgcgcgataa ctgggactac 600
atccccattc cggtgatctt accattggcg tcaataggtt acggtccggc gactttccag 660atccccattc cggtgatctt accattggcg tcaataggtt acggtccggc gactttccag 660
atgacctata ttcccggcac ctacaataac ggtaacgttt acttcgcctg ggctcgtata 720atgacctata ttcccggcac ctacaataac ggtaacgttt acttcgcctg ggctcgtata 720
cagttttaat tcgctaagtc ttagcaataa atgagataag cggtgtgtct tgtggaaaaa 780cagttttaat tcgctaagtc ttagcaataa atgagataag cggtgtgtct tgtggaaaaa 780
caaggactaa agcgttaccc actaaaaaag atagcgactt ttatcacttt ttagcaaagt 840caaggactaa agcgttaccc actaaaaaag atagcgactt ttatcacttt ttagcaaagt 840
tgcactggac aaaaggtacc acaattggtg tactgatact cgacacagca ttagtgtcga 900tgcactggac aaaaggtacc acaattggtg tactgatact cgacacagca ttagtgtcga 900
tttttcatat aaaggtaatt ttggccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct 960tttttcatat aaaggtaatt ttggccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct 960
gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tgatccctga 1020gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tgatccctga 1020
atccgacccg gacaccaccg tcagacgctt cgacctctct cagcagttca ccgccatgca 1080atccgacccg gacaccaccg tcagacgctt cgacctctct cagcagttca ccgccatgca 1080
gcggataagc gtggtgctga gccgggccac cgaggccagc aaaacgctgc aggaggtgct 1140gcggataagc gtggtgctga gccgggccac cgaggccagc aaaacgctgc aggaggtgct 1140
cagcgtatta cacaacgatg cctttatgca gcacgggatg atctgcctgt acgacagcga 1200cagcgtatta cacaacgatg cctttatgca gcacgggatg atctgcctgt acgacagcga 1200
gcaggagatc ctcagtatcg aagcgctgca gcaaaccggc cagcagcccc tccccggcag 1260gcaggagatc ctcagtatcg aagcgctgca gcaaaccggc cagcagcccc tccccggcag 1260
cacgcagatc cgctatcgcc ccggcgaggg actggtgggg accgtgctgg cccaggggca 1320cacgcagatc cgctatcgcc ccggcgaggg actggtgggg accgtgctgg cccaggggca 1320
gtcgctggtg ctgccccggg tcgccgacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgagcctcta 1380gtcgctggtg ctgccccggg tcgccgacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgagcctcta 1380
cgattacgat ctgccgttta tcgccgtacc gttgatgggg cccaacgccc ggccaatagg 1440cgattacgat ctgccgttta tcgccgtacc gttgatgggg cccaacgccc ggccaatagg 1440
ggtgctggcg gcccagccga tggcgcgcca ggaagagcgg ctgccggcct gcacccgttt 1500ggtgctggcg gcccagccga tggcgcgcca ggaagagcgg ctgccggcct gcacccgttt 1500
tctcgaaacc gtc 1513tctcgaaacc gtc 1513
<210> 205<210> 205
<211> 1155<211> 1155
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> делеция 36 п.н. glnE-delta-AR-2<223> 36 bp deletion glnE-delta-AR-2
<400> 205<400> 205
atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60
gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120
gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180
gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg gtaccctgcc ggtgatgaag 240gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg gtaccctgcc ggtgatgaag 240
gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg acgcggtggt gcagcaggca 300gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg acgcggtggt gcagcaggca 300
tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc tgcacgatcg ccagggtcgc 360tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc tgcacgatcg ccagggtcgc 360
ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg agctgggcta cagctccgat 420ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg agctgggcta cagctccgat 420
ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga tgaccgacgg cgagcgggag 480ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga tgaccgacgg cgagcgggag 480
attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga tcatgcacct gttcagcacc 540attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga tcatgcacct gttcagcacc 540
cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc tgcgtccttc tggcgcggcg 600600 cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg
gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc agcagaacga agcctggacg 660gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc agcagaacga agcctggacg 660
tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg gcgacccggc gctgcaggcg 720tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg gcgacccggc gctgcaggcg 720
cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc gggaggggat gaccctgcag 780cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc gggaggggat gaccctgcag 780
accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc ttggcaacaa acatcccgat 840accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc ttggcaacaa acatcccgat 840
cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata ttgaatttat tactcagtat 900cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata ttgaatttat tactcagtat 900
ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc gctggtctga caacgtgcgt 960ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc gctggtctga caacgtgcgt 960
attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg aggaggcgcg cgccttaacg 1020attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg aggaggcgcg cgccttaacg 1020
catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg ccctgcagga gcagccggga 1080catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg ccctgcagga gcagccggga 1080
cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg tcagcgccag ctggcagaag 1140cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg tcagcgccag ctggcagaag 1140
tggctgatgg cttaa 1155tggctgatgg cttaa 1155
<210> 206<210> 206
<211> 2155<211> 2155
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> делеция 36 п.н. glnE-delta-AR-2<223> 36 bp deletion glnE-delta-AR-2
<400> 206<400> 206
cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60
gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120
actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180
atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240
cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300
cgcgacatcg acagcgtcca gctgctggcg ggcgcctatg gcgacgccgt cgcgccgtgg 360360
ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420
tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480
tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540
cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600
acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660
tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg 720tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctgcatat cgcggcggcg gatatcgctg 720
gtaccctgcc ggtgatgaag gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg 780gtaccctgcc ggtgatgaag gtcagcgatc acttaacctg gcttgccgaa gcgatcctcg 780
acgcggtggt gcagcaggca tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc 840acgcggtggt gcagcaggca tgggggcaga tggtcgctcg ctacggccag ccgacccacc 840
tgcacgatcg ccagggtcgc ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg 900tgcacgatcg ccagggtcgc ggcttcgccg tcgtcggcta cggtaagctt ggcggctggg 900
agctgggcta cagctccgat ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga 960agctgggcta cagctccgat ctcgatctgg tgttcctcca tgactgcccg gcggaggtga 960
tgaccgacgg cgagcgggag attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga 1020tgaccgacgg cgagcgggag attgacggcc gtcagttcta cctgcggctg gcccagcgga 1020
tcatgcacct gttcagcacc cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc 1080tcatgcacct gttcagcacc cgcacctcgt ccggtattct ctacgaagtg gacgcccggc 1080
tgcgtccttc tggcgcggcg gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc 1140tgcgtccttc tggcgcggcg gggatgctgg tcaccaccgc cgacgcgttt gctgactatc 1140
agcagaacga agcctggacg tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg 1200agcagaacga agcctggacg tgggaacatc aggcgctggt gcgcgcccgc gtggtctatg 1200
gcgacccggc gctgcaggcg cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accaccccgc 1260gcgacccggc gctgcaggcg cgctttgacg ccattcgtcg cgatatcctg accacccccgc 1260
gggaggggat gaccctgcag accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc 1320gggaggggat gaccctgcag accgaggttc gcgagatgcg cgagaagatg cgcgcccacc 1320
ttggcaacaa acatcccgat cgttttgata tcaaagccga tgccggcggg atcaccgata 13801380
ttgaatttat tactcagtat ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc 1440ttgaatttat tactcagtat ctggtcctac gctatgccag tgacaagccg aagctgaccc 1440
gctggtctga caacgtgcgt attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg 1500gctggtctga caacgtgcgt attcttgagc tgctggcgca gaacgacatc atggacgagg 1500
aggaggcgcg cgccttaacg catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg 1560aggaggcgcg cgccttaacg catgcgtaca ccaccttgcg tgatgcgctc catcacctgg 1560
ccctgcagga gcagccggga cacgtggcgc cagaggcctt cagccgggag cgtcagcagg 1620ccctgcagga gcagccggga cacgtggcgc cagaggcctt cagccggggag cgtcagcagg 1620
tcagcgccag ctggcagaag tggctgatgg cttaactata aaatcgggtg tgctattatc 1680tcagcgccag ctggcagaag tggctgatgg cttaactata aaatcgggtg tgctattatc 1680
gcgcgcaaag tttgcgtctc gcaggagaga gtcatgaaag taacgctgcc ggagtttgaa 1740gcgcgcaaag tttgcgtctc gcaggagaga gtcatgaaag taacgctgcc ggagtttgaa 1740
cgtgcaggag tgttggtggt gggtgatgtg atgctggacc gctactggta cggccccacc 1800cgtgcaggag tgttggtggt gggtgatgtg atgctggacc gctactggta cggccccacc 1800
agtcgtattt ccccggaagc cccggtgccg gtggtgaagg tggaaaatat cgaagaacgt 18601860
cctggcggcg cggcaaacgt agcgatgaac atcgcctccc tgggggcaac gtcgcgcctg 1920cctggcggcg cggcaaacgt agcgatgaac atcgcctccc tgggggcaac gtcgcgcctg 1920
gtgggattga ccgggattga tgacgctgcc cgcgcgctga gccaggcgct ggccaatgtg 1980gtgggattga ccgggattga tgacgctgcc cgcgcgctga gccaggcgct ggccaatgtg 1980
aatgtgaagt gcgacttcgt ctccgtcccg actcacccga ccatcaccaa gctgcgggtg 2040aatgtgaagt gcgacttcgt ctccgtcccg actcacccga ccatcaccaa gctgcgggtg 2040
ctgtcgcgca atcagcagct gatccgcctc gactttgaag agggcttctc cggcgtggat 2100ctgtcgcgca atcagcagct gatccgcctc gactttgaag agggcttctc cggcgtggat 2100
ccgcagccga tgcatgagcg cattcagcag gcgctgggag ccattggcgc actgg 2155ccgcagccga tgcatgagcg cattcagcag gcgctgggag ccattggcgc actgg 2155
<210> 207<210> 207
<211> 613<211> 613
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::PinfC<223> delta-nifL::PinfC
<400> 207<400> 207
atgaccctga atatgatgct agaagcgtca ggtaccggtc atgattcacc gtgcgattct 60atgaccctga atatgatgct agaagcgtca ggtaccggtc atgattcacc gtgcgattct 60
cggttccctg gagcgcttca ttggcatcct gaccgaagag ttcgctggct tcttcccaac 120cggttccctg gagcgcttca ttggcatcct gaccgaagag ttcgctggct tcttcccaac 120
ctggattgca ccagtgcagg tagtggtcat gaatattacc gattctcagg ctgaatacgt 180ctggattgca ccagtgcagg tagtggtcat gaatattacc gattctcagg ctgaatacgt 180
taacgaattg acgcgtaaac tacaaaatgc gggcattcgt gtaaaagcag acttgagaaa 240taacgaattg acgcgtaaac tacaaaatgc gggcattcgt gtaaaagcag acttgagaaa 240
tgagaagatt ggctttaaaa tccgcgagca cactttacgt cgtgtcccgt atatgttggt 300tgagaagatt ggctttaaaa tccgcgagca cactttacgt cgtgtcccgt atatgttggt 300
ctgtggcgac aaagaagtcg aagccggcaa agtggccgtg cgcacccgtc gcgggaaaga 360ctgtggcgac aaagaagtcg aagccggcaa agtggccgtg cgcacccgtc gcgggaaaga 360
cctcggcagc atggacgtaa gtgaagtgat tgagaagctg caacaagaga ttcgcagccg 420cctcggcagc atggacgtaa gtgaagtgat tgagaagctg caacaagaga ttcgcagccg 420
cagtcttcaa caactggagg aataaggtat taaaggcgga aaacgagttc aaacggcacg 480cagtcttcaa caactggagg aataaggtat taaaggcgga aaacgagttc aaacggcacg 480
tccgaatcgt atcaatggcg agattcgcgc cctggaagtt cgcgccattg agctggcttc 540tccgaatcgt atcaatggcg agattcgcgc cctggaagtt cgcgccattg agctggcttc 540
ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg 600ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg ctgtttaaca ccctgaccgg 600
aggtgaagca tga 613aggtgaagca tga 613
<210> 208<210> 208
<211> 1613<211> 1613
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::PinfC с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::PinfC with a 500 bp flanking region.
<400> 208<400> 208
ggccgtcgcc cagcgtcggc gtccccaaca gcagggccgg gtaggccagc aggtccgcca 60ggccgtcgcc cagcgtcggc gtccccaaca gcagggccgg gtaggccagc aggtccgcca 60
gcgtggcgcg gttaatattg accggggcgg cggcggcctc ccccagctgc ttgtggatca 120gcgtggcgcg gttaatattg accggggcgg cggcggcctc ccccagctgc ttgtggatca 120
ttttcgcgat cttgcgggtt ttaccggtat cggtaccaaa gaaaatgcca atgttcgcca 180ttttcgcgat cttgcggtt ttaccggtat cggtaccaaa gaaaatgcca atgttcgcca 180
tagtacgctc ctgtcggaat ggtgttgaaa aaaggaatga cgacagaggt attgcgaagg 240tagtacgctc ctgtcggaat ggtgttgaaa aaaggaatga cgacagaggt attgcgaagg 240
ctgtgccagg ttgccctgca ccgcgacggc ccatccctgc cccatcagga tcgcttcgca 300ctgtgccagg ttgccctgca ccgcgacggc ccatccctgc cccatcagga tcgcttcgca 300
tcacgatgcc gcgcgccaaa ggcgcacccg gcggggcgaa aggtaaaaat ccgtgaattt 360tcacgatgcc gcgcgccaaa ggcgcacccg gcggggcgaa aggtaaaaat ccgtgaattt 360
tccccctgtc ggatcaatgt ttcgcgtggt cgttccgata agggcgcaca ctttgcatgg 420tccccctgtc ggatcaatgt ttcgcgtggt cgttccgata agggcgcaca ctttgcatgg 420
ttatccgggt tcggcttacc ccgccgcgtt ttgcgcacgg tgtcggacaa tttgtcataa 480ttatccgggt tcggcttacc ccgccgcgtt ttgcgcacgg tgtcggacaa tttgtcataa 480
ctgcgacaca ggagtttgcg atgaccctga atatgatgct agaagcgtca ggtaccggtc 540ctgcgacaca ggagtttgcg atgaccctga atatgatgct agaagcgtca ggtaccggtc 540
atgattcacc gtgcgattct cggttccctg gagcgcttca ttggcatcct gaccgaagag 600atgattcacc gtgcgattct cggttccctg gagcgcttca ttggcatcct gaccgaagag 600
ttcgctggct tcttcccaac ctggattgca ccagtgcagg tagtggtcat gaatattacc 660ttcgctggct tcttcccaac ctggattgca ccagtgcagg tagtggtcat gaatattacc 660
gattctcagg ctgaatacgt taacgaattg acgcgtaaac tacaaaatgc gggcattcgt 720gattctcagg ctgaatacgt taacgaattg acgcgtaaac tacaaaatgc gggcattcgt 720
gtaaaagcag acttgagaaa tgagaagatt ggctttaaaa tccgcgagca cactttacgt 780gtaaaagcag acttgagaaa tgagaagatt ggctttaaaa tccgcgagca cactttacgt 780
cgtgtcccgt atatgttggt ctgtggcgac aaagaagtcg aagccggcaa agtggccgtg 840cgtgtcccgt atatgttggt ctgtggcgac aaagaagtcg aagccggcaa agtggccgtg 840
cgcacccgtc gcgggaaaga cctcggcagc atggacgtaa gtgaagtgat tgagaagctg 900cgcacccgtc gcgggaaaga cctcggcagc atggacgtaa gtgaagtgat tgagaagctg 900
caacaagaga ttcgcagccg cagtcttcaa caactggagg aataaggtat taaaggcgga 960caacaagaga ttcgcagccg cagtcttcaa caactggagg aataaggtat taaaggcgga 960
aaacgagttc aaacggcacg tccgaatcgt atcaatggcg agattcgcgc cctggaagtt 1020aaacgagttc aaacggcacg tccgaatcgt atcaatggcg agattcgcgc cctggaagtt 1020
cgcgccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct gcctgaccct gcgtttcccg 10801080 cgcgccattg agctggcttc ccgaccgcag ggcggcacct
ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tgatccctga atccgacccg gacaccaccg 1140ctgtttaaca ccctgaccgg aggtgaagca tgatccctga atccgacccg gacaccaccg 1140
tcagacgctt cgacctctct cagcagttca ccgccatgca gcggataagc gtggtgctga 1200tcagacgctt cgacctctct cagcagttca ccgccatgca gcggataagc gtggtgctga 1200
gccgggccac cgaggccagc aaaacgctgc aggaggtgct cagcgtatta cacaacgatg 1260gccgggccac cgaggccagc aaaacgctgc aggaggtgct cagcgtatta cacaacgatg 1260
cctttatgca gcacgggatg atctgcctgt acgacagcga gcaggagatc ctcagtatcg 1320ccttttatgca gcacgggatg atctgcctgt acgacagcga gcaggagatc ctcagtatcg 1320
aagcgctgca gcaaaccggc cagcagcccc tccccggcag cacgcagatc cgctatcgcc 1380aagcgctgca gcaaaccggc cagcagcccc tccccggcag cacgcagatc cgctatcgcc 1380
ccggcgaggg actggtgggg accgtgctgg cccaggggca gtcgctggtg ctgccccggg 1440ccggcgaggg actggtgggg accgtgctgg cccaggggca gtcgctggtg ctgccccggg 1440
tcgccgacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgagcctcta cgattacgat ctgccgttta 1500tcgccgacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgagcctcta cgattacgat ctgccgttta 1500
tcgccgtacc gttgatgggg cccaacgccc ggccaatagg ggtgctggcg gcccagccga 1560tcgccgtacc gttgatgggg cccaacgccc ggccaatagg ggtgctggcg gcccagccga 1560
tggcgcgcca ggaagagcgg ctgccggcct gcacccgttt tctcgaaacc gtc 1613tggcgcgcca ggaagagcgg ctgccggcct gcacccgttt tctcgaaacc gtc 1613
<210> 209<210> 209
<211> 1191<211> 1191
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2<223> glnE-delta-AR-2
<400> 209<400> 209
atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc cgatggtcgc cagccagctg 60
gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca acaccctcta tcagccgacg 120
gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc tgcgcgtgcc ggaagaggat 180
gaagagcagc agctggaggc gttgcgccag tttaagcagg cgcagcagct gcatatcgcg 240gaagagcagc agctggaggc gttgcgccag tttaagcagg cgcagcagct gcatatcgcg 240
gcggcggata tcgctggtac cctgccggtg atgaaggtca gcgatcactt aacctggctt 300gcggcggata tcgctggtac cctgccggtg atgaaggtca gcgatcactt aacctggctt 300
gccgaagcga tcctcgacgc ggtggtgcag caggcatggg ggcagatggt cgctcgctac 360gccgaagcga tcctcgacgc ggtggtgcag caggcatggg ggcagatggt cgctcgctac 360
ggccagccga cccacctgca cgatcgccag ggtcgcggct tcgccgtcgt cggctacggt 420ggccagccga cccacctgca cgatcgccag ggtcgcggct tcgccgtcgt cggctacggt 420
aagcttggcg gctgggagct gggctacagc tccgatctcg atctggtgtt cctccatgac 480aagcttggcg gctgggagct gggctacagc tccgatctcg atctggtgtt cctccatgac 480
tgcccggcgg aggtgatgac cgacggcgag cgggagattg acggccgtca gttctacctg 540tgcccggcgg aggtgatgac cgacggcgag cgggagattg acggccgtca gttctacctg 540
cggctggccc agcggatcat gcacctgttc agcacccgca cctcgtccgg tattctctac 600cggctggccc agcggatcat gcacctgttc agcacccgca cctcgtccgg tattctctac 600
gaagtggacg cccggctgcg tccttctggc gcggcgggga tgctggtcac caccgccgac 660gaagtggacg cccggctgcg tccttctggc gcggcgggga tgctggtcac caccgccgac 660
gcgtttgctg actatcagca gaacgaagcc tggacgtggg aacatcaggc gctggtgcgc 720gcgtttgctg actatcagca gaacgaagcc tggacgtggg aacatcaggc gctggtgcgc 720
gcccgcgtgg tctatggcga cccggcgctg caggcgcgct ttgacgccat tcgtcgcgat 780gcccgcgtgg tctatggcga cccggcgctg caggcgcgct ttgacgccat tcgtcgcgat 780
atcctgacca ccccgcggga ggggatgacc ctgcagaccg aggttcgcga gatgcgcgag 840atcctgacca ccccgcggga ggggatgacc ctgcagaccg aggttcgcga gatgcgcgag 840
aagatgcgcg cccaccttgg caacaaacat cccgatcgtt ttgatatcaa agccgatgcc 900aagatgcgcg cccaccttgg caacaaacat cccgatcgtt ttgatatcaa agccgatgcc 900
ggcgggatca ccgatattga atttattact cagtatctgg tcctacgcta tgccagtgac 960ggcgggatca ccgatattga atttattact cagtatctgg tcctacgcta tgccagtgac 960
aagccgaagc tgacccgctg gtctgacaac gtgcgtattc ttgagctgct ggcgcagaac 1020aagccgaagc tgacccgctg gtctgacaac gtgcgtattc ttgagctgct ggcgcagaac 1020
gacatcatgg acgaggagga ggcgcgcgcc ttaacgcatg cgtacaccac cttgcgtgat 1080gacatcatgg acgaggagga ggcgcgcgcc ttaacgcatg cgtacaccac cttgcgtgat 1080
gcgctccatc acctggccct gcaggagcag ccgggacacg tggcgccaga ggccttcagc 1140gcgctccatc acctggccct gcaggagcag ccgggacacg tggcgccaga ggccttcagc 1140
cgggagcgtc agcaggtcag cgccagctgg cagaagtggc tgatggctta a 1191cgggagcgtc agcaggtcag cgccagctgg cagaagtggc tgatggctta a 1191
<210> 210<210> 210
<211> 2191<211> 2191
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-2 with a 500 bp flanking region.
<400> 210<400> 210
cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60cgtaaggcga ccacccagct ccgcgcgttg ctgaacgacg ctgaagccgt tctgctggcc 60
gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120gcggacaccg ccgacgaggc gttattccgc accgaggtcg tcggcgccaa actggccctg 120
actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180actgaatggc tggtccagcg cggctggcgt ccgttcctca acgaggcagg agagaaaaaa 180
atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240atagccggat cgttcaaacg gtttgccgat attaacctct cgcgggtggc ggccgagctg 240
cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300cgcagcgccg tgcagcatct ggcggttgaa gatgccgccg accagttgcc gaagctgtcc 300
cgcgacatcg acagcgtcca gctgctggcg ggcgcctatg gcgacgccgt cgcgccgtgg 360360
ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420ctggagaact ggcaggagct tcaccgtgca atagcacatg acgatcgcag cgtctttgaa 420
tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480tatttccgtc gccaggcgct ggctgccgag ccgttctggc tgcatagtgg aaaacgataa 480
tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540tttcaggcca gggagccctt atggcgctga agcacctgat cacgctctgc gcggcgtcgc 540
cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600cgatggtcgc cagccagctg gcgcgccacc cgctgctgct ggatgagctg ctggatccca 600
acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660acaccctcta tcagccgacg gcgaccgatg cctatcgcga cgagctgcgc cagtacctgc 660
tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctggaggc gttgcgccag tttaagcagg 720tgcgcgtgcc ggaagaggat gaagagcagc agctggaggc gttgcgccag tttaagcagg 720
cgcagcagct gcatatcgcg gcggcggata tcgctggtac cctgccggtg atgaaggtca 780cgcagcagct gcatatcgcg gcggcggata tcgctggtac cctgccggtg atgaaggtca 780
gcgatcactt aacctggctt gccgaagcga tcctcgacgc ggtggtgcag caggcatggg 840gcgatcactt aacctggctt gccgaagcga tcctcgacgc ggtggtgcag caggcatggg 840
ggcagatggt cgctcgctac ggccagccga cccacctgca cgatcgccag ggtcgcggct 900ggcagatggt cgctcgctac ggccagccga cccacctgca cgatcgccag ggtcgcggct 900
tcgccgtcgt cggctacggt aagcttggcg gctgggagct gggctacagc tccgatctcg 960tcgccgtcgt cggctacggt aagcttggcg gctgggagct gggctacagc tccgatctcg 960
atctggtgtt cctccatgac tgcccggcgg aggtgatgac cgacggcgag cgggagattg 1020atctggtgtt cctccatgac tgcccggcgg aggtgatgac cgacggcgag cgggagattg 1020
acggccgtca gttctacctg cggctggccc agcggatcat gcacctgttc agcacccgca 1080acggccgtca gttctacctg cggctggccc agcggatcat gcacctgttc agcacccgca 1080
cctcgtccgg tattctctac gaagtggacg cccggctgcg tccttctggc gcggcgggga 1140cctcgtccgg tattctctac gaagtggacg cccggctgcg tccttctggc gcggcgggga 1140
tgctggtcac caccgccgac gcgtttgctg actatcagca gaacgaagcc tggacgtggg 1200tgctggtcac caccgccgac gcgtttgctg actatcagca gaacgaagcc tggacgtggg 1200
aacatcaggc gctggtgcgc gcccgcgtgg tctatggcga cccggcgctg caggcgcgct 1260aacatcaggc gctggtgcgc gcccgcgtgg tctatggcga cccggcgctg caggcgcgct 1260
ttgacgccat tcgtcgcgat atcctgacca ccccgcggga ggggatgacc ctgcagaccg 1320ttgacgccat tcgtcgcgat atcctgacca ccccgcggga ggggatgacc ctgcagaccg 1320
aggttcgcga gatgcgcgag aagatgcgcg cccaccttgg caacaaacat cccgatcgtt 13801380
ttgatatcaa agccgatgcc ggcgggatca ccgatattga atttattact cagtatctgg 1440ttgatatcaa agccgatgcc ggcgggatca ccgatattga atttattact cagtatctgg 1440
tcctacgcta tgccagtgac aagccgaagc tgacccgctg gtctgacaac gtgcgtattc 1500tcctacgcta tgccagtgac aagccgaagc tgacccgctg gtctgacaac gtgcgtattc 1500
ttgagctgct ggcgcagaac gacatcatgg acgaggagga ggcgcgcgcc ttaacgcatg 1560ttgagctgct ggcgcagaac gacatcatgg acgaggagga ggcgcgcgcc ttaacgcatg 1560
cgtacaccac cttgcgtgat gcgctccatc acctggccct gcaggagcag ccgggacacg 1620cgtacaccac cttgcgtgat gcgctccatc acctggccct gcaggagcag ccgggacacg 1620
tggcgccaga ggccttcagc cgggagcgtc agcaggtcag cgccagctgg cagaagtggc 1680tggcgccaga ggccttcagc cgggagcgtc agcaggtcag cgccagctgg cagaagtggc 1680
tgatggctta actataaaat cgggtgtgct attatcgcgc gcaaagtttg cgtctcgcag 1740tgatggctta actataaaat cgggtgtgct attatcgcgc gcaaagtttg cgtctcgcag 1740
gagagagtca tgaaagtaac gctgccggag tttgaacgtg caggagtgtt ggtggtgggt 18001800
gatgtgatgc tggaccgcta ctggtacggc cccaccagtc gtatttcccc ggaagccccg 1860gatgtgatgc tggaccgcta ctggtacggc cccaccagtc gtatttcccc ggaagccccg 1860
gtgccggtgg tgaaggtgga aaatatcgaa gaacgtcctg gcggcgcggc aaacgtagcg 1920gtgccggtgg tgaaggtgga aaatatcgaa gaacgtcctg gcggcgcggc aaacgtagcg 1920
atgaacatcg cctccctggg ggcaacgtcg cgcctggtgg gattgaccgg gattgatgac 1980atgaacatcg cctccctggg ggcaacgtcg cgcctggtgg gattgaccgg gattgatgac 1980
gctgcccgcg cgctgagcca ggcgctggcc aatgtgaatg tgaagtgcga cttcgtctcc 2040gctgcccgcg cgctgagcca ggcgctggcc aatgtgaatg tgaagtgcga cttcgtctcc 2040
gtcccgactc acccgaccat caccaagctg cgggtgctgt cgcgcaatca gcagctgatc 2100gtcccgactc acccgaccat caccaagctg cgggtgctgt cgcgcaatca gcagctgatc 2100
cgcctcgact ttgaagaggg cttctccggc gtggatccgc agccgatgca tgagcgcatt 2160cgcctcgact ttgaagaggg cttctccggc gtggatccgc agccgatgca tgagcgcatt 2160
cagcaggcgc tgggagccat tggcgcactg g 2191cagcaggcgc tgggagccat tggcgcactg g 2191
<210> 211<210> 211
<211> 1188<211> 1188
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2<223> glnE-delta-AR-2
<400> 211<400> 211
atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc cgatggtcgc gacacaactt 60atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc cgatggtcgc gacacaactt 60
gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt 120gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt 120
gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga tgcgggtgcc aacagaagac 180gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga tgcgggtgcc aacagaagac 180
gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg cccagcattt gcgtatcgca 240gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg cccagcattt gcgtatcgca 240
gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt 300gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt 300
gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac 360gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac 360
gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt ttgccgtggt cggttacggg 420gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt ttgccgtggt cggttacggg 420
aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg atctggtctt cctgctcgat 480aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg atctggtctt cctgctcgat 480
tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg acggacgtca gttttatctt 540tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg acggacgtca gttttatctt 540
cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga catcgtcagg cattctttac 600cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcaccggga catcgtcagg cattctttac 600
gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca tgctggtcag taccattgaa 660gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca tgctggtcag taccattgaa 660
gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg agcatcaggc gctggttcgc 720gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg agcatcaggc gctggttcgc 720
gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat ttaacgccac gcgtcgcgac 780gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat ttaacgccac gcgtcgcgac 780
attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg aggtccgtga aatgcgcgag 840attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg aggtccgtga aatgcgcgag 840
aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt ttgatctgaa agccgatccg 900aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt ttgatctgaa agccgatccg 900
ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg ttctgcgttt cgcgcatgat 960ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg ttctgcgttt cgcgcatgat 960
gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt ttgaactgat ggcacgatat 1020gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt ttgaactgat ggcacgatat 1020
gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg cttatgtgac gctgcgcgat 1080gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg cttatgtgac gctgcgcgat 1080
gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag tggccgcgga cagctttgct 1140gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag tggccgcgga cagctttgct 1140
actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc tcggctga 1188actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc tcggctga 1188
<210> 212<210> 212
<211> 2188<211> 2188
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-2 with a 500 bp flanking region.
<400> 212<400> 212
cggtactgga acagaaatcg gcggatgcgc aggaaatttg ttatgacacg gcctgtctga 60cggtactgga acagaaatcg gcggatgcgc aggaaatttg ttatgacacg gcctgtctga 60
agtgcaagtt agtgcttact tcctggctgg caacctcagg ctggacgccg tttattgatg 120agtgcaagtt agtgcttact tcctggctgg caacctcagg ctggacgccg tttattgatg 120
ataaatctgc gaagaaactg gacgcttcct tcaaacgttt tgctgacatc atgctcggtc 180ataaatctgc gaagaaactg gacgcttcct tcaaacgttt tgctgacatc atgctcggtc 180
gtaccgcagc ggatctgaaa gaagcctttg cgcagccact gacggaagaa ggttatcgcg 240gtaccgcagc ggatctgaaa gaagcctttg cgcagccact gacggaagaa ggttatcgcg 240
atcagctggc gcgcctgaaa cgccagatca ttaccttcca tttgcttgcc ggtgcttacc 300atcagctggc gcgcctgaaa cgccagatca ttaccttcca tttgcttgcc ggtgcttacc 300
ctgaaaaaga cgtcgatgcg tatattgccg gctgggtgga cctgcaacag gccatcgttc 360ctgaaaaaga cgtcgatgcg tatattgccg gctgggtgga cctgcaacag gccatcgttc 360
agcagcaaca cgcctgggag gattcggccc gttctcacgc ggtgatgatg gatgctttct 420agcagcaaca cgcctgggag gattcggccc gttctcacgc ggtgatgatg gatgctttct 420
ggttaaacgg gcaacctcgt taactgactg actagcctgg gcaaactgcc cgggcttttt 480ggttaaacgg gcaacctcgt taactgactg actagcctgg gcaaactgcc cgggcttttt 480
tttgcaagga atctgatttc atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc 540tttgcaagga atctgatttc atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc 540
cgatggtcgc gacacaactt gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc 600cgatggtcgc gacacaactt gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc 600
gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga 660gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga 660
tgcgggtgcc aacagaagac gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg 720tgcgggtgcc aacagaagac gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg 720
cccagcattt gcgtatcgca gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca 780cccagcattt gcgtatcgca gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca 780
gtgaccattt aacctacctt gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg 840gtgaccattt aacctacctt gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg 840
aacaaatggt cgtaaaatac gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt 900aacaaatggt cgtaaaatac gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt 900
ttgccgtggt cggttacggg aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg 960ttgccgtggt cggttacggg aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg 960
atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg 1020atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg 1020
acggacgtca gttttatctt cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga 1080acggacgtca gttttatctt cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcaccggga 1080
catcgtcagg cattctttac gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca 1140catcgtcagg cattctttac gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca 1140
tgctggtcag taccattgaa gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg 1200tgctggtcag taccattgaa gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg 1200
agcatcaggc gctggttcgc gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat 1260agcatcaggc gctggttcgc gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat 1260
ttaacgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg 1320ttaacgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg 1320
aggtccgtga aatgcgcgag aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt 13801380
ttgatctgaa agccgatccg ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg 1440ttgatctgaa agccgatccg ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg 1440
ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt 1500ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt 1500
ttgaactgat ggcacgatat gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg 1560ttgaactgat ggcacgatat gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg 1560
cttatgtgac gctgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag 1620cttatgtgac gctgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag 1620
tggccgcgga cagctttgct actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc 1680tggccgcgga cagctttgct actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc 1680
tcggctgagg gtttttattc ggctaacagg cgcttgtgat attatccggc gcattgtatt 1740tcggctgagg gtttttattc ggctaacagg cgcttgtgat attatccggc gcattgtatt 1740
tacccgattt gatttatctg ttttggagtc ttgggatgaa agtgactttg cctgattttc 1800tacccgattt gatttatctg ttttggagtc ttgggatgaa agtgactttg cctgattttc 1800
accgcgcagg tgtgctggtt gtcggtgacg taatgttaga ccgttactgg tatggcccga 1860accgcgcagg tgtgctggtt gtcggtgacg taatgttaga ccgttactgg tatggcccga 1860
ccaatcgtat ttctccggaa gctccggtgc cggtggtgaa ggtcagtacc attgaagagc 1920ccaatcgtat ttctccggaa gctccggtgc cggtggtgaa ggtcagtacc attgaagagc 1920
ggcctggcgg tgcagctaac gtggcgatga acatttcatc tctgggcgcc tcttcctgtc 1980ggcctggcgg tgcagctaac gtggcgatga acatttcatc tctgggcgcc tcttcctgtc 1980
tgatcggcct gaccggcgta gacgacgctg cgcgtgccct cagtgagcgt ctggcagaag 2040tgatcggcct gaccggcgta gacgacgctg cgcgtgccct cagtgagcgt ctggcagaag 2040
tgaaagttaa ctgcgatttc gtcgcactat ccacacatcc taccatcacc aaactgcgaa 2100tgaaagttaa ctgcgatttc gtcgcactat ccacacatcc taccatcacc aaactgcgaa 2100
ttttgtcccg taaccagcaa ctgatccgcc tcgactttga ggaaggtttt gaaggcgttg 2160ttttgtcccg taaccagcaa ctgatccgcc tcgactttga ggaaggtttt gaaggcgttg 2160
atctcgagcc gatgctgacc aaaataga 2188atctcgagcc gatgctgacc aaaataga 2188
<210> 213<210> 213
<211> 635<211> 635
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm6.1<223> delta-nifL::Prm6.1
<400> 213<400> 213
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg aatttttttt cacaaagcgt 240240
agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt ggaagcgaat attggtgaaa 300agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt ggaagcgaat attggtgaaa 300
ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt acaaagttaa tatgcgcgcc 360ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt acaaagttaa tatgcgcgcc 360
ctccgtctct gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca ggatgcgagc tggttgtgtt 420ctccgtctct gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca ggatgcgagc tggttgtgtt 420
ttgacattac cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta tgcccgcccg gaagcggcgt 480ttgacattac cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta tgcccgcccg gaagcggcgt 480
tttcccgtcc ggggaatggc atggagctgc gccttatcca gacgctgatc gcccatcatc 540tttcccgtcc ggggaatggc atggagctgc gccttatcca gacgctgatc gcccatcatc 540
gcggttcttt agatctctcg gtccgccctg atggcggcac cttgctgacg ttacgcctgc 600gcggttcttt agatctctcg gtccgccctg atggcggcac cttgctgacg ttacgcctgc 600
cggtacagca ggttatcacc ggaggcttaa aatga 635cggtacagca ggttatcacc ggaggcttaa aatga 635
<210> 214<210> 214
<211> 1635<211> 1635
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm6.1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm6.1 with a 500 bp flanking region.
<400> 214<400> 214
tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60
tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120
gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180
aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240
ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300
cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360
catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420
gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480
gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540
atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600
cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660
tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720
aatttttttt cacaaagcgt agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt 780aatttttttt cacaaagcgt agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt 780
ggaagcgaat attggtgaaa ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt 840ggaagcgaat attggtgaaa ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt 840
acaaagttaa tatgcgcgcc ctccgtctct gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca 900acaaagttaa tatgcgcgcc ctccgtctct gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca 900
ggatgcgagc tggttgtgtt ttgacattac cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta 960ggatgcgagc tggttgtgtt ttgacattac cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta 960
tgcccgcccg gaagcggcgt tttcccgtcc ggggaatggc atggagctgc gccttatcca 1020tgcccgcccg gaagcggcgt tttcccgtcc ggggaatggc atggagctgc gccttatcca 1020
gacgctgatc gcccatcatc gcggttcttt agatctctcg gtccgccctg atggcggcac 1080gacgctgatc gcccatcatc gcggttcttt agatctctcg gtccgccctg atggcggcac 1080
cttgctgacg ttacgcctgc cggtacagca ggttatcacc ggaggcttaa aatgacccag 1140cttgctgacg ttacgcctgc cggtacagca ggttatcacc ggaggcttaa aatgacccag 1140
ttacctaccg cgggcccggt tatccggcgc tttgatatgt ctgcccagtt tacggcgctt 1200ttacctaccg cgggcccggt tatccggcgc tttgatatgt ctgcccagtt tacggcgctt 1200
tatcgcatca gcgtggcgct gagtcaggaa agcaacaccg ggcgcgcact ggcggcgatc 1260tatcgcatca gcgtggcgct gagtcaggaa agcaacaccg ggcgcgcact ggcggcgatc 1260
ctcgaagtgc ttcacgatca tgcatttatg caatacggca tggtgtgtct gtttgataaa 13201320
gaacgcaatg cactctttgt ggaatccctg catggcatcg acggcgaaag gaaaaaagag 1380gaacgcaatg cactctttgt ggaatccctg catggcatcg acggcgaaag gaaaaaagag 1380
acccgccatg tccgttaccg catgggggaa ggcgtgatcg gcgcggtgat gagccagcgt 1440acccgccatg tccgttaccg catgggggaa ggcgtgatcg gcgcggtgat gagccagcgt 1440
caggcgctgg tgttaccgcg catttcagac gatcagcgtt ttctcgaccg cctgaatatt 1500caggcgctgg tgttaccgcg catttcagac gatcagcgtt ttctcgaccg cctgaatatt 1500
tacgattaca gcctgccgtt gattggcgtg ccgatccccg gtgcggataa tcagccatcg 1560tacgattaca gcctgccgtt gattggcgtg ccgatccccg gtgcggataa tcagccatcg 1560
ggcgtgctgg tggcacagcc gatggcgttg cacgaagacc ggctgactgc cagtacgcgg 1620ggcgtgctgg tggcacagcc gatggcgttg cacgaagacc ggctgactgc cagtacgcgg 1620
tttttagaaa tggtc 1635tttttagaaa tggtc 1635
<210> 215<210> 215
<211> 635<211> 635
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm6.1<223> delta-nifL::Prm6.1
<400> 215<400> 215
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg aatttttttt cacaaagcgt 240240
agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt ggaagcgaat attggtgaaa 300agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt ggaagcgaat attggtgaaa 300
ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt acaaagttaa tatgcgcgcc 360ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt acaaagttaa tatgcgcgcc 360
ctccgtctct gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca ggatgcgagc tggttgtgtt 420ctccgtctct gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca ggatgcgagc tggttgtgtt 420
ttgacattac cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta tgcccgcccg gaagcggcgt 480ttgacattac cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta tgcccgcccg gaagcggcgt 480
tttcccgtcc ggggaatggc atggagctgc gccttatcca gacgctgatc gcccatcatc 540tttcccgtcc ggggaatggc atggagctgc gccttatcca gacgctgatc gcccatcatc 540
gcggttcttt agatctctcg gtccgccctg atggcggcac cttgctgacg ttacgcctgc 600gcggttcttt agatctctcg gtccgccctg atggcggcac cttgctgacg ttacgcctgc 600
cggtacagca ggttatcacc ggaggcttaa aatga 635cggtacagca ggttatcacc ggaggcttaa aatga 635
<210> 216<210> 216
<211> 1635<211> 1635
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm6.1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm6.1 with a 500 bp flanking region.
<400> 216<400> 216
tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60
tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120
gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180
aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240
ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300
cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360
catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420
gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480
gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540
atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600
cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660
tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720
aatttttttt cacaaagcgt agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt 780aatttttttt cacaaagcgt agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt 780
ggaagcgaat attggtgaaa ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt 840ggaagcgaat attggtgaaa ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt 840
acaaagttaa tatgcgcgcc ctccgtctct gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca 900acaaagttaa tatgcgcgcc ctccgtctct gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca 900
ggatgcgagc tggttgtgtt ttgacattac cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta 960ggatgcgagc tggttgtgtt ttgacattac cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta 960
tgcccgcccg gaagcggcgt tttcccgtcc ggggaatggc atggagctgc gccttatcca 1020tgcccgcccg gaagcggcgt tttcccgtcc ggggaatggc atggagctgc gccttatcca 1020
gacgctgatc gcccatcatc gcggttcttt agatctctcg gtccgccctg atggcggcac 1080gacgctgatc gcccatcatc gcggttcttt agatctctcg gtccgccctg atggcggcac 1080
cttgctgacg ttacgcctgc cggtacagca ggttatcacc ggaggcttaa aatgacccag 1140cttgctgacg ttacgcctgc cggtacagca ggttatcacc ggaggcttaa aatgacccag 1140
ttacctaccg cgggcccggt tatccggcgc tttgatatgt ctgcccagtt tacggcgctt 1200ttacctaccg cgggcccggt tatccggcgc tttgatatgt ctgcccagtt tacggcgctt 1200
tatcgcatca gcgtggcgct gagtcaggaa agcaacaccg ggcgcgcact ggcggcgatc 1260tatcgcatca gcgtggcgct gagtcaggaa agcaacaccg ggcgcgcact ggcggcgatc 1260
ctcgaagtgc ttcacgatca tgcatttatg caatacggca tggtgtgtct gtttgataaa 13201320
gaacgcaatg cactctttgt ggaatccctg catggcatcg acggcgaaag gaaaaaagag 1380gaacgcaatg cactctttgt ggaatccctg catggcatcg acggcgaaag gaaaaaagag 1380
acccgccatg tccgttaccg catgggggaa ggcgtgatcg gcgcggtgat gagccagcgt 1440acccgccatg tccgttaccg catgggggaa ggcgtgatcg gcgcggtgat gagccagcgt 1440
caggcgctgg tgttaccgcg catttcagac gatcagcgtt ttctcgaccg cctgaatatt 1500caggcgctgg tgttaccgcg catttcagac gatcagcgtt ttctcgaccg cctgaatatt 1500
tacgattaca gcctgccgtt gattggcgtg ccgatccccg gtgcggataa tcagccatcg 1560tacgattaca gcctgccgtt gattggcgtg ccgatccccg gtgcggataa tcagccatcg 1560
ggcgtgctgg tggcacagcc gatggcgttg cacgaagacc ggctgactgc cagtacgcgg 1620ggcgtgctgg tggcacagcc gatggcgttg cacgaagacc ggctgactgc cagtacgcgg 1620
tttttagaaa tggtc 1635tttttagaaa tggtc 1635
<210> 217<210> 217
<211> 786<211> 786
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm7.1<223> delta-nifL::Prm7.1
<400> 217<400> 217
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg ttaaaaacgt gaccacgagc 240gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg ttaaaaacgt gaccacgagc 240
attaataaac gccacgaaat gtggcgttta tttattcaaa aagtatcttc tttcataaaa 300attaataaac gccacgaaat gtggcgttta tttattcaaa aagtatcttc tttcataaaa 300
agtgctaaat gcagtagcag caaaattggg ataagtccca tggaatacgg ctgttttcgc 360agtgctaaat gcagtagcag caaaattgggg ataagtccca tggaatacgg ctgttttcgc 360
tgcaattttt aactttttcg taaaaaaaga tgtttctttg agcgaacgat caaaatatag 420tgcaattttt aactttttcg taaaaaaaga tgtttctttg agcgaacgat caaaatatag 420
cgttaaccgg caaaaaatta ttctcattag aaaatagttt gtgtaatact tgtaacgcta 480cgttaaccgg caaaaaatta ttctcattag aaaatagttt gtgtaatact tgtaacgcta 480
catggagatt aacttaatct agagggtttt ataccgtctc tgaagctctc ggtgaacatt 540catggagatt aacttaatct aggggtttt ataccgtctc tgaagctctc ggtgaacatt 540
gttgcgaggc aggatgcgag ctggttgtgt tttgacatta ccgataatgt gccgcgtgaa 600gttgcgaggc aggatgcgag ctggttgtgt tttgacatta ccgataatgt gccgcgtgaa 600
cgggtgcgtt atgcccgccc ggaagcggcg ttttcccgtc cggggaatgg catggagctg 660cgggtgcgtt atgcccgcc ggaagcggcg ttttcccgtc cggggaatgg catggagctg 660
cgccttatcc agacgctgat cgcccatcat cgcggttctt tagatctctc ggtccgccct 720cgccttatcc agacgctgat cgcccatcat cgcggttctt tagatctctc ggtccgccct 720
gatggcggca ccttgctgac gttacgcctg ccggtacagc aggttatcac cggaggctta 780gatggcggca ccttgctgac gttacgcctg ccggtacagc aggttatcac cggaggctta 780
aaatga 786aaatga 786
<210> 218<210> 218
<211> 1786<211> 1786
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm7.1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm7.1 with a 500 bp flanking region.
<400> 218<400> 218
gtttcgtctc gaggccgggc aactgagcgg ccccgttgaa accgacctgg gctggcatct 60gtttcgtctc gaggccgggc aactgagcgg ccccgttgaa accgacctgg gctggcatct 60
gttgttgtgc gaacaaattc gcctgccgca acccttgccg aaagccgaag ccttaacgcg 120gttgttgtgc gaacaaattc gcctgccgca acccttgccg aaagccgaag ccttaacgcg 120
ggtgcgtcag caactgattg cccggcaaca gaaacattat cagcgccagt ggctgcaaca 180ggtgcgtcag caactgattg cccggcaaca gaaacattat cagcgccagt ggctgcaaca 180
actgatcaac gcctgagcct gttctccttc ttgttgatgc agacgggtta atgcccgttt 240actgatcaac gcctgagcct gttctccttc ttgttgatgc agacgggtta atgcccgttt 240
tgcacgaaaa atgcacataa attgcctgcg ttgccttata acagcgcagg gaaatcctgc 300tgcacgaaaa atgcacataa attgcctgcg ttgccttata acagcgcagg gaaatcctgc 300
ctccggcctt gtgccacacc gcgctttgcc tggtttgtgg taaaaactgg cccgctttgc 360ctccggcctt gtgccacacc gcgctttgcc tggtttgtgg taaaaactgg cccgctttgc 360
atcctgatgc ttaaaacacc ccgttcagat caacctttgg gcagataagc ccgcgaaagg 420atcctgatgc ttaaaacacc ccgttcagat caacctttgg gcagataagc ccgcgaaagg 420
cctgcaaatt gcacggttat tccgggtgag tatatgtgtg atttgggttc cggcattgcg 480cctgcaaatt gcacggttat tccgggtgag tatatgtgtg atttgggttc cggcattgcg 480
caataaaggg gagaaagaca tgagcatcac ggcgttatca gcatcatttc ctgaggggaa 540caataaaggg gagaaagaca tgagcatcac ggcgttatca gcatcatttc ctgaggggaa 540
tatcgccagc cgcttgtcgc tgcaacatcc ttcactgttt tataccgtgg ttgaacaatc 600tatcgccagc cgcttgtcgc tgcaacatcc ttcactgttt tataccgtgg ttgaacaatc 600
ttcggtggcg atttcgctga ccgatccgca ggcgcgcatt tgttatgcca atccggcatt 660ttcggtggcg atttcgctga ccgatccgca ggcgcgcatt tgttatgcca atccggcatt 660
ctgccgccag acgggttttg cacttgagac acttttgggc gagaaccacc gtctgctggt 720ctgccgccag acgggttttg cacttgagac acttttgggc gagaaccacc gtctgctggt 720
taaaaacgtg accacgagca ttaataaacg ccacgaaatg tggcgtttat ttattcaaaa 780780
agtatcttct ttcataaaaa gtgctaaatg cagtagcagc aaaattggga taagtcccat 840agtatcttct ttcataaaaa gtgctaaatg cagtagcagc aaaattggga taagtcccat 840
ggaatacggc tgttttcgct gcaattttta actttttcgt aaaaaaagat gtttctttga 900ggaatacggc tgttttcgct gcaattttta actttttcgt aaaaaaagat gtttctttga 900
gcgaacgatc aaaatatagc gttaaccggc aaaaaattat tctcattaga aaatagtttg 960gcgaacgatc aaaatatagc gttaaccggc aaaaaattat tctcattaga aaatagtttg 960
tgtaatactt gtaacgctac atggagatta acttaatcta gagggtttta taccgtctct 1020tgtaatactt gtaacgctac atggagatta acttaatcta gagggtttta taccgtctct 1020
gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca ggatgcgagc tggttgtgtt ttgacattac 1080gaagctctcg gtgaacattg ttgcgaggca ggatgcgagc tggttgtgtt ttgacattac 1080
cgataatgtg ccgcgtgaac gggtgcgtta tgcccgcccg gaagcggcgt tttcccgtcc 11401140
ggggaatggc atggagctgc gccttatcca gacgctgatc gcccatcatc gcggttcttt 1200ggggaatggc atggagctgc gccttatcca gacgctgatc gcccatcatc gcggttcttt 1200
agatctctcg gtccgccctg atggcggcac cttgctgacg ttacgcctgc cggtacagca 1260agatctctcg gtccgccctg atggcggcac cttgctgacg ttacgcctgc cggtacagca 1260
ggttatcacc ggaggcttaa aatgacccag ttacctaccg cgggcccggt tatccggcgc 1320ggttatcacc ggaggcttaa aatgacccag ttacctaccg cgggcccggt tatccggcgc 1320
tttgatatgt ctgcccagtt tacggcgctt tatcgcatca gcgtggcgct gagtcaggaa 1380tttgatatgt ctgcccagtt tacggcgctt tatcgcatca gcgtggcgct gagtcaggaa 1380
agcaacaccg ggcgcgcact ggcggcgatc ctcgaagtgc ttcacgatca tgcatttatg 1440agcaacaccg ggcgcgcact ggcggcgatc ctcgaagtgc ttcacgatca tgcatttatg 1440
caatacggca tggtgtgtct gtttgataaa gaacgcaatg cactctttgt ggaatccctg 1500caatacggca tggtgtgtct gtttgataaa gaacgcaatg cactctttgt ggaatccctg 1500
catggcatcg acggcgaaag gaaaaaagag acccgccatg tccgttaccg catgggggaa 1560catggcatcg acggcgaaag gaaaaaagag acccgccatg tccgttaccg catgggggaa 1560
ggcgtgatcg gcgcggtgat gagccagcgt caggcgctgg tgttaccgcg catttcagac 1620ggcgtgatcg gcgcggtgat gagccagcgt caggcgctgg tgttaccgcg catttcagac 1620
gatcagcgtt ttctcgaccg cctgaatatt tacgattaca gcctgccgtt gattggcgtg 1680gatcagcgtt ttctcgaccg cctgaatatt tacgattaca gcctgccgtt gattggcgtg 1680
ccgatccccg gtgcggataa tcagccatcg ggcgtgctgg tggcacagcc gatggcgttg 1740ccgatccccg gtgcggataa tcagccatcg ggcgtgctgg tggcacagcc gatggcgttg 1740
cacgaagacc ggctgactgc cagtacgcgg tttttagaaa tggtcg 1786cacgaagacc ggctgactgc cagtacgcgg tttttagaaa tggtcg 1786
<210> 219<210> 219
<211> 993<211> 993
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1.2<223> delta-nifL::Prm1.2
<400> 219<400> 219
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg tgaacatcac tgatgcacaa 240240
gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg caggcattcg cgttaaagcc 300gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg caggcattcg cgttaaagcc 300
gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac acacgctacg ccgtgttcct 360360
tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca aagttgctgt tcgtacccgc 420tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca aagttgctgt tcgtacccgc 420
cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg ttgacaaact gctggcggaa 480cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg ttgacaaact gctggcggaa 480
atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta ttaaaggcgg aaaacgagtt 540atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta ttaaaggcgg aaaacgagtt 540
caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg cgcaagaagt tcgcctcaca 600caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg cgcaagaagt tcgcctcaca 600
ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag 660ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag 660
gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc 720gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc 720
ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 780ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 780
gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg cccgcccgga agcggcgttt 840gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg cccgcccggga agcggcgttt 840
tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc 900tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc 900
ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg 960ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg 960
gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tga 993gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tga 993
<210> 220<210> 220
<211> 1993<211> 1993
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1.2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm1.2 with a 500 bp flanking region.
<400> 220<400> 220
tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60
tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120
gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180
aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240
ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300
cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360
catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420
gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480
gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540
atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600
cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660
tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720
tgaacatcac tgatgcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 780tgaacatcac tgatgcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 780
caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac 840caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac 840
acacgctacg ccgtgttcct tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca 900acacgctacg ccgtgttcct tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca 900
aagttgctgt tcgtacccgc cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg 960aagttgctgt tcgtacccgc cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg 960
ttgacaaact gctggcggaa atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta 1020ttgacaaact gctggcggaa atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta 1020
ttaaaggcgg aaaacgagtt caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg 1080ttaaaggcgg aaaacgagtt caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg 1080
cgcaagaagt tcgcctcaca ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg 1140cgcaagaagt tcgcctcaca ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg 1140
aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg 1200aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg 1200
agccgccagt ttgtcgaatc ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg 1260agccgccagt ttgtcgaatc ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg 1260
atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 1320atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 1320
cccgcccgga agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga 1380cccgcccggga agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga 1380
cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct 1440cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct 1440
tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tgacccagtt 1500tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tgacccagtt 1500
acctaccgcg ggcccggtta tccggcgctt tgatatgtct gcccagttta cggcgcttta 1560acctaccgcg ggcccggtta tccggcgctt tgatatgtct gcccagttta cggcgcttta 1560
tcgcatcagc gtggcgctga gtcaggaaag caacaccggg cgcgcactgg cggcgatcct 1620tcgcatcagc gtggcgctga gtcaggaaag caacaccggg cgcgcactgg cggcgatcct 1620
cgaagtgctt cacgatcatg catttatgca atacggcatg gtgtgtctgt ttgataaaga 1680cgaagtgctt cacgatcatg catttatgca atacggcatg gtgtgtctgt ttgataaaga 1680
acgcaatgca ctctttgtgg aatccctgca tggcatcgac ggcgaaagga aaaaagagac 1740acgcaatgca ctctttgtgg aatccctgca tggcatcgac ggcgaaagga aaaaagagac 1740
ccgccatgtc cgttaccgca tgggggaagg cgtgatcggc gcggtgatga gccagcgtca 1800ccgccatgtc cgttaccgca tgggggaagg cgtgatcggc gcggtgatga gccagcgtca 1800
ggcgctggtg ttaccgcgca tttcagacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgaatattta 18601860
cgattacagc ctgccgttga ttggcgtgcc gatccccggt gcggataatc agccatcggg 1920cgattacagc ctgccgttga ttggcgtgcc gatccccggt gcggataatc agccatcggg 1920
cgtgctggtg gcacagccga tggcgttgca cgaagaccgg ctgactgcca gtacgcggtt 1980cgtgctggtg gcacagccga tggcgttgca cgaagaccgg ctgactgcca gtacgcggtt 1980
tttagaaatg gtc 1993tttagaaatg gtc 1993
<210> 221<210> 221
<211> 993<211> 993
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1.2<223> delta-nifL::Prm1.2
<400> 221<400> 221
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg tgaacatcac tgatgcacaa 240240
gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg caggcattcg cgttaaagcc 300gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg caggcattcg cgttaaagcc 300
gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac acacgctacg ccgtgttcct 360360
tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca aagttgctgt tcgtacccgc 420tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca aagttgctgt tcgtacccgc 420
cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg ttgacaaact gctggcggaa 480cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg ttgacaaact gctggcggaa 480
atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta ttaaaggcgg aaaacgagtt 540atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta ttaaaggcgg aaaacgagtt 540
caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg cgcaagaagt tcgcctcaca 600caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg cgcaagaagt tcgcctcaca 600
ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag 660ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag 660
gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc 720gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc 720
ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 780ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 780
gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg cccgcccgga agcggcgttt 840gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg cccgcccggga agcggcgttt 840
tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc 900tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc 900
ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg 960ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg 960
gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tga 993gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tga 993
<210> 222<210> 222
<211> 1993<211> 1993
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1.2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm1.2 with a 500 bp flanking region.
<400> 222<400> 222
tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60
tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120
gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180
aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240
ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300
cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360
catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420
gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480
gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540
atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600
cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660
tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720
tgaacatcac tgatgcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 780tgaacatcac tgatgcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 780
caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac 840caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac 840
acacgctacg ccgtgttcct tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca 900acacgctacg ccgtgttcct tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca 900
aagttgctgt tcgtacccgc cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg 960aagttgctgt tcgtacccgc cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg 960
ttgacaaact gctggcggaa atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta 1020ttgacaaact gctggcggaa atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta 1020
ttaaaggcgg aaaacgagtt caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg 1080ttaaaggcgg aaaacgagtt caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg 1080
cgcaagaagt tcgcctcaca ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg 1140cgcaagaagt tcgcctcaca ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg 1140
aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg 1200aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg 1200
agccgccagt ttgtcgaatc ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg 1260agccgccagt ttgtcgaatc ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg 1260
atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 1320atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 1320
cccgcccgga agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga 1380cccgcccggga agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga 1380
cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct 1440cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct 1440
tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tgacccagtt 1500tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tgacccagtt 1500
acctaccgcg ggcccggtta tccggcgctt tgatatgtct gcccagttta cggcgcttta 1560acctaccgcg ggcccggtta tccggcgctt tgatatgtct gcccagttta cggcgcttta 1560
tcgcatcagc gtggcgctga gtcaggaaag caacaccggg cgcgcactgg cggcgatcct 1620tcgcatcagc gtggcgctga gtcaggaaag caacaccggg cgcgcactgg cggcgatcct 1620
cgaagtgctt cacgatcatg catttatgca atacggcatg gtgtgtctgt ttgataaaga 1680cgaagtgctt cacgatcatg catttatgca atacggcatg gtgtgtctgt ttgataaaga 1680
acgcaatgca ctctttgtgg aatccctgca tggcatcgac ggcgaaagga aaaaagagac 1740acgcaatgca ctctttgtgg aatccctgca tggcatcgac ggcgaaagga aaaaagagac 1740
ccgccatgtc cgttaccgca tgggggaagg cgtgatcggc gcggtgatga gccagcgtca 1800ccgccatgtc cgttaccgca tgggggaagg cgtgatcggc gcggtgatga gccagcgtca 1800
ggcgctggtg ttaccgcgca tttcagacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgaatattta 18601860
cgattacagc ctgccgttga ttggcgtgcc gatccccggt gcggataatc agccatcggg 1920cgattacagc ctgccgttga ttggcgtgcc gatccccggt gcggataatc agccatcggg 1920
cgtgctggtg gcacagccga tggcgttgca cgaagaccgg ctgactgcca gtacgcggtt 1980cgtgctggtg gcacagccga tggcgttgca cgaagaccgg ctgactgcca gtacgcggtt 1980
tttagaaatg gtc 1993tttagaaatg gtc 1993
<210> 223<210> 223
<211> 1188<211> 1188
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2<223> glnE-delta-AR-2
<400> 223<400> 223
atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc cgatggtcgc gacacaactt 60atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc cgatggtcgc gacacaactt 60
gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt 120gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt 120
gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga tgcgggtgcc aacagaagac 180gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga tgcgggtgcc aacagaagac 180
gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg cccagcattt gcgtatcgca 240gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg cccagcattt gcgtatcgca 240
gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt 300gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt 300
gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac 360gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac 360
gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt ttgccgtggt cggttacggg 420gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt ttgccgtggt cggttacggg 420
aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg atctggtctt cctgctcgat 480aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg atctggtctt cctgctcgat 480
tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg acggacgtca gttttatctt 540tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg acggacgtca gttttatctt 540
cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga catcgtcagg cattctttac 600cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcaccggga catcgtcagg cattctttac 600
gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca tgctggtcag taccattgaa 660gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca tgctggtcag taccattgaa 660
gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg agcatcaggc gctggttcgc 720gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg agcatcaggc gctggttcgc 720
gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat ttaacgccac gcgtcgcgac 780gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat ttaacgccac gcgtcgcgac 780
attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg aggtccgtga aatgcgcgag 840attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg aggtccgtga aatgcgcgag 840
aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt ttgatctgaa agccgatccg 900aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt ttgatctgaa agccgatccg 900
ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg ttctgcgttt cgcgcatgat 960ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg ttctgcgttt cgcgcatgat 960
gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt ttgaactgat ggcacgatat 1020gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt ttgaactgat ggcacgatat 1020
gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg cttatgtgac gctgcgcgat 1080gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg cttatgtgac gctgcgcgat 1080
gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag tggccgcgga cagctttgct 1140gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag tggccgcgga cagctttgct 1140
actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc tcggctga 1188actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc tcggctga 1188
<210> 224<210> 224
<211> 2188<211> 2188
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-2 with a 500 bp flanking region.
<400> 224<400> 224
cggtactgga acagaaatcg gcggatgcgc aggaaatttg ttatgacacg gcctgtctga 60cggtactgga acagaaatcg gcggatgcgc aggaaatttg ttatgacacg gcctgtctga 60
agtgcaagtt agtgcttact tcctggctgg caacctcagg ctggacgccg tttattgatg 120agtgcaagtt agtgcttact tcctggctgg caacctcagg ctggacgccg tttattgatg 120
ataaatctgc gaagaaactg gacgcttcct tcaaacgttt tgctgacatc atgctcggtc 180ataaatctgc gaagaaactg gacgcttcct tcaaacgttt tgctgacatc atgctcggtc 180
gtaccgcagc ggatctgaaa gaagcctttg cgcagccact gacggaagaa ggttatcgcg 240gtaccgcagc ggatctgaaa gaagcctttg cgcagccact gacggaagaa ggttatcgcg 240
atcagctggc gcgcctgaaa cgccagatca ttaccttcca tttgcttgcc ggtgcttacc 300atcagctggc gcgcctgaaa cgccagatca ttaccttcca tttgcttgcc ggtgcttacc 300
ctgaaaaaga cgtcgatgcg tatattgccg gctgggtgga cctgcaacag gccatcgttc 360ctgaaaaaga cgtcgatgcg tatattgccg gctgggtgga cctgcaacag gccatcgttc 360
agcagcaaca cgcctgggag gattcggccc gttctcacgc ggtgatgatg gatgctttct 420agcagcaaca cgcctgggag gattcggccc gttctcacgc ggtgatgatg gatgctttct 420
ggttaaacgg gcaacctcgt taactgactg actagcctgg gcaaactgcc cgggcttttt 480ggttaaacgg gcaacctcgt taactgactg actagcctgg gcaaactgcc cgggcttttt 480
tttgcaagga atctgatttc atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc 540tttgcaagga atctgatttc atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc 540
cgatggtcgc gacacaactt gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc 600cgatggtcgc gacacaactt gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc 600
gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga 660gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga 660
tgcgggtgcc aacagaagac gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg 720tgcgggtgcc aacagaagac gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg 720
cccagcattt gcgtatcgca gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca 780cccagcattt gcgtatcgca gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca 780
gtgaccattt aacctacctt gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg 840gtgaccattt aacctacctt gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg 840
aacaaatggt cgtaaaatac gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt 900aacaaatggt cgtaaaatac gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt 900
ttgccgtggt cggttacggg aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg 960ttgccgtggt cggttacggg aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg 960
atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg 1020atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg 1020
acggacgtca gttttatctt cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga 1080acggacgtca gttttatctt cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcaccggga 1080
catcgtcagg cattctttac gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca 1140catcgtcagg cattctttac gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca 1140
tgctggtcag taccattgaa gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg 1200tgctggtcag taccattgaa gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg 1200
agcatcaggc gctggttcgc gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat 1260agcatcaggc gctggttcgc gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat 1260
ttaacgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg 1320ttaacgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg 1320
aggtccgtga aatgcgcgag aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt 13801380
ttgatctgaa agccgatccg ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg 1440ttgatctgaa agccgatccg ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg 1440
ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt 1500ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt 1500
ttgaactgat ggcacgatat gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg 1560ttgaactgat ggcacgatat gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg 1560
cttatgtgac gctgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag 1620cttatgtgac gctgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag 1620
tggccgcgga cagctttgct actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc 1680tggccgcgga cagctttgct actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc 1680
tcggctgagg gtttttattc ggctaacagg cgcttgtgat attatccggc gcattgtatt 1740tcggctgagg gtttttattc ggctaacagg cgcttgtgat attatccggc gcattgtatt 1740
tacccgattt gatttatctg ttttggagtc ttgggatgaa agtgactttg cctgattttc 1800tacccgattt gatttatctg ttttggagtc ttgggatgaa agtgactttg cctgattttc 1800
accgcgcagg tgtgctggtt gtcggtgacg taatgttaga ccgttactgg tatggcccga 1860accgcgcagg tgtgctggtt gtcggtgacg taatgttaga ccgttactgg tatggcccga 1860
ccaatcgtat ttctccggaa gctccggtgc cggtggtgaa ggtcagtacc attgaagagc 1920ccaatcgtat ttctccggaa gctccggtgc cggtggtgaa ggtcagtacc attgaagagc 1920
ggcctggcgg tgcagctaac gtggcgatga acatttcatc tctgggcgcc tcttcctgtc 1980ggcctggcgg tgcagctaac gtggcgatga acatttcatc tctgggcgcc tcttcctgtc 1980
tgatcggcct gaccggcgta gacgacgctg cgcgtgccct cagtgagcgt ctggcagaag 2040tgatcggcct gaccggcgta gacgacgctg cgcgtgccct cagtgagcgt ctggcagaag 2040
tgaaagttaa ctgcgatttc gtcgcactat ccacacatcc taccatcacc aaactgcgaa 2100tgaaagttaa ctgcgatttc gtcgcactat ccacacatcc taccatcacc aaactgcgaa 2100
ttttgtcccg taaccagcaa ctgatccgcc tcgactttga ggaaggtttt gaaggcgttg 2160ttttgtcccg taaccagcaa ctgatccgcc tcgactttga ggaaggtttt gaaggcgttg 2160
atctcgagcc gatgctgacc aaaataga 2188atctcgagcc gatgctgacc aaaataga 2188
<210> 225<210> 225
<211> 663<211> 663
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm3.1<223> delta-nifL::Prm3.1
<400> 225<400> 225
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg tacagtagcg cctctcaaaa 240gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg tacagtagcg cctctcaaaa 240
atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttattttttc tacccataat cgggaaccgg 300atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttatttttttc tacccataat cgggaaccgg 300
tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa tgacctatcc tgggtcctaa 360tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa tgacctatcc tgggtcctaa 360
agttgtagtt gacattagcg gagcactaac ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt 420agttgtagtt gacattagcg gagcactaac ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt 420
gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg 480gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg 480
gtgcgttatg cccgcccgga agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc 540gtgcgttatg cccgcccgga agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc 540
cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat 600cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat 600
ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa 660ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa 660
tga 663tga 663
<210> 226<210> 226
<211> 1663<211> 1663
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm3.1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm3.1 with a 500 bp flanking region.
<400> 226<400> 226
tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60
tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120
gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180
aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240
ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300
cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360
catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420
gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480
gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540
atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600
cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660
tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720
tacagtagcg cctctcaaaa atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttattttttc 780tacagtagcg cctctcaaaa atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttatttttttc 780
tacccataat cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa 840tacccataat cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa 840
tgacctatcc tgggtcctaa agttgtagtt gacattagcg gagcactaac ccgtctctga 900tgacctatcc tgggtcctaa agttgtagtt gacattagcg gagcactaac ccgtctctga 900
agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg 960agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg 960
ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg cccgcccgga agcggcgttt tcccgtccgg 1020ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg cccgcccggga agcggcgttt tcccgtccgg 1020
ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag 1080ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag 1080
atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg 1140atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg 1140
ttatcaccgg aggcttaaaa tgacccagtt acctaccgcg ggcccggtta tccggcgctt 1200ttatcaccgg aggcttaaaa tgacccagtt acctaccgcg ggcccggtta tccggcgctt 1200
tgatatgtct gcccagttta cggcgcttta tcgcatcagc gtggcgctga gtcaggaaag 1260tgatatgtct gcccagttta cggcgcttta tcgcatcagc gtggcgctga gtcaggaaag 1260
caacaccggg cgcgcactgg cggcgatcct cgaagtgctt cacgatcatg catttatgca 1320caacaccggg cgcgcactgg cggcgatcct cgaagtgctt cacgatcatg catttatgca 1320
atacggcatg gtgtgtctgt ttgataaaga acgcaatgca ctctttgtgg aatccctgca 1380atacggcatg gtgtgtctgt ttgataaaga acgcaatgca ctctttgtgg aatccctgca 1380
tggcatcgac ggcgaaagga aaaaagagac ccgccatgtc cgttaccgca tgggggaagg 1440tggcatcgac ggcgaaagga aaaaagagac ccgccatgtc cgttaccgca tgggggaagg 1440
cgtgatcggc gcggtgatga gccagcgtca ggcgctggtg ttaccgcgca tttcagacga 1500cgtgatcggc gcggtgatga gccagcgtca ggcgctggtg ttaccgcgca tttcagacga 1500
tcagcgtttt ctcgaccgcc tgaatattta cgattacagc ctgccgttga ttggcgtgcc 1560tcagcgtttt ctcgaccgcc tgaatattta cgattacagc ctgccgttga ttggcgtgcc 1560
gatccccggt gcggataatc agccatcggg cgtgctggtg gcacagccga tggcgttgca 1620gatccccggt gcggataatc agccatcggg cgtgctggtg gcacagccga tggcgttgca 1620
cgaagaccgg ctgactgcca gtacgcggtt tttagaaatg gtc 1663cgaagaccgg ctgactgcca gtacgcggtt tttagaaatg gtc 1663
<210> 227<210> 227
<211> 1188<211> 1188
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2<223> glnE-delta-AR-2
<400> 227<400> 227
atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc cgatggtcgc gacacaactt 60atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc cgatggtcgc gacacaactt 60
gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt 120gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt 120
gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga tgcgggtgcc aacagaagac 180gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga tgcgggtgcc aacagaagac 180
gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg cccagcattt gcgtatcgca 240gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg cccagcattt gcgtatcgca 240
gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt 300gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt 300
gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac 360gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac 360
gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt ttgccgtggt cggttacggg 420gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt ttgccgtggt cggttacggg 420
aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg atctggtctt cctgctcgat 480aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg atctggtctt cctgctcgat 480
tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg acggacgtca gttttatctt 540tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg acggacgtca gttttatctt 540
cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga catcgtcagg cattctttac 600cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcaccggga catcgtcagg cattctttac 600
gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca tgctggtcag taccattgaa 660gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca tgctggtcag taccattgaa 660
gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg agcatcaggc gctggttcgc 720gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg agcatcaggc gctggttcgc 720
gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat ttaacgccac gcgtcgcgac 780gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat ttaacgccac gcgtcgcgac 780
attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg aggtccgtga aatgcgcgag 840attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg aggtccgtga aatgcgcgag 840
aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt ttgatctgaa agccgatccg 900aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt ttgatctgaa agccgatccg 900
ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg ttctgcgttt cgcgcatgat 960ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg ttctgcgttt cgcgcatgat 960
gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt ttgaactgat ggcacgatat 1020gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt ttgaactgat ggcacgatat 1020
gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg cttatgtgac gctgcgcgat 1080gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg cttatgtgac gctgcgcgat 1080
gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag tggccgcgga cagctttgct 1140gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag tggccgcgga cagctttgct 1140
actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc tcggctga 1188actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc tcggctga 1188
<210> 228<210> 228
<211> 2188<211> 2188
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-2 with a 500 bp flanking region.
<400> 228<400> 228
cggtactgga acagaaatcg gcggatgcgc aggaaatttg ttatgacacg gcctgtctga 60cggtactgga acagaaatcg gcggatgcgc aggaaatttg ttatgacacg gcctgtctga 60
agtgcaagtt agtgcttact tcctggctgg caacctcagg ctggacgccg tttattgatg 120agtgcaagtt agtgcttact tcctggctgg caacctcagg ctggacgccg tttattgatg 120
ataaatctgc gaagaaactg gacgcttcct tcaaacgttt tgctgacatc atgctcggtc 180ataaatctgc gaagaaactg gacgcttcct tcaaacgttt tgctgacatc atgctcggtc 180
gtaccgcagc ggatctgaaa gaagcctttg cgcagccact gacggaagaa ggttatcgcg 240gtaccgcagc ggatctgaaa gaagcctttg cgcagccact gacggaagaa ggttatcgcg 240
atcagctggc gcgcctgaaa cgccagatca ttaccttcca tttgcttgcc ggtgcttacc 300atcagctggc gcgcctgaaa cgccagatca ttaccttcca tttgcttgcc ggtgcttacc 300
ctgaaaaaga cgtcgatgcg tatattgccg gctgggtgga cctgcaacag gccatcgttc 360ctgaaaaaga cgtcgatgcg tatattgccg gctgggtgga cctgcaacag gccatcgttc 360
agcagcaaca cgcctgggag gattcggccc gttctcacgc ggtgatgatg gatgctttct 420agcagcaaca cgcctgggag gattcggccc gttctcacgc ggtgatgatg gatgctttct 420
ggttaaacgg gcaacctcgt taactgactg actagcctgg gcaaactgcc cgggcttttt 480ggttaaacgg gcaacctcgt taactgactg actagcctgg gcaaactgcc cgggcttttt 480
tttgcaagga atctgatttc atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc 540tttgcaagga atctgatttc atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc 540
cgatggtcgc gacacaactt gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc 600cgatggtcgc gacacaactt gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc 600
gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga 660gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga 660
tgcgggtgcc aacagaagac gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg 720tgcgggtgcc aacagaagac gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg 720
cccagcattt gcgtatcgca gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca 780cccagcattt gcgtatcgca gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca 780
gtgaccattt aacctacctt gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg 840gtgaccattt aacctacctt gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg 840
aacaaatggt cgtaaaatac gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt 900aacaaatggt cgtaaaatac gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt 900
ttgccgtggt cggttacggg aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg 960ttgccgtggt cggttacggg aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg 960
atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg 1020atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg 1020
acggacgtca gttttatctt cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga 1080acggacgtca gttttatctt cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcaccggga 1080
catcgtcagg cattctttac gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca 1140catcgtcagg cattctttac gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca 1140
tgctggtcag taccattgaa gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg 1200tgctggtcag taccattgaa gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg 1200
agcatcaggc gctggttcgc gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat 1260agcatcaggc gctggttcgc gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat 1260
ttaacgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg 1320ttaacgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg 1320
aggtccgtga aatgcgcgag aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt 13801380
ttgatctgaa agccgatccg ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg 1440ttgatctgaa agccgatccg ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg 1440
ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt 1500ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt 1500
ttgaactgat ggcacgatat gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg 1560ttgaactgat ggcacgatat gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg 1560
cttatgtgac gctgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag 1620cttatgtgac gctgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag 1620
tggccgcgga cagctttgct actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc 1680tggccgcgga cagctttgct actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc 1680
tcggctgagg gtttttattc ggctaacagg cgcttgtgat attatccggc gcattgtatt 1740tcggctgagg gtttttattc ggctaacagg cgcttgtgat attatccggc gcattgtatt 1740
tacccgattt gatttatctg ttttggagtc ttgggatgaa agtgactttg cctgattttc 1800tacccgattt gatttatctg ttttggagtc ttgggatgaa agtgactttg cctgattttc 1800
accgcgcagg tgtgctggtt gtcggtgacg taatgttaga ccgttactgg tatggcccga 1860accgcgcagg tgtgctggtt gtcggtgacg taatgttaga ccgttactgg tatggcccga 1860
ccaatcgtat ttctccggaa gctccggtgc cggtggtgaa ggtcagtacc attgaagagc 1920ccaatcgtat ttctccggaa gctccggtgc cggtggtgaa ggtcagtacc attgaagagc 1920
ggcctggcgg tgcagctaac gtggcgatga acatttcatc tctgggcgcc tcttcctgtc 1980ggcctggcgg tgcagctaac gtggcgatga acatttcatc tctgggcgcc tcttcctgtc 1980
tgatcggcct gaccggcgta gacgacgctg cgcgtgccct cagtgagcgt ctggcagaag 2040tgatcggcct gaccggcgta gacgacgctg cgcgtgccct cagtgagcgt ctggcagaag 2040
tgaaagttaa ctgcgatttc gtcgcactat ccacacatcc taccatcacc aaactgcgaa 2100tgaaagttaa ctgcgatttc gtcgcactat ccacacatcc taccatcacc aaactgcgaa 2100
ttttgtcccg taaccagcaa ctgatccgcc tcgactttga ggaaggtttt gaaggcgttg 2160ttttgtcccg taaccagcaa ctgatccgcc tcgactttga ggaaggtttt gaaggcgttg 2160
atctcgagcc gatgctgacc aaaataga 2188atctcgagcc gatgctgacc aaaataga 2188
<210> 229<210> 229
<211> 613<211> 613
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::PinfC<223> delta-nifL::PinfC
<400> 229<400> 229
atgagcatca cggcgttatc agctgaatat cactgactca caagctacct atgtcgaaga 60atgagcatca cggcgttatc agctgaatat cactgactca caagctacct atgtcgaaga 60
attaactaaa aaactgcaag atgcaggcat tcgcgttaaa gccgacttga gaaatgagaa 120attaactaaa aaactgcaag atgcaggcat tcgcgttaaa gccgacttga gaaatgagaa 120
gattggcttt aaaattcgcg aacacacgct acgccgtgtt ccttatatgt tagtttgtgg 180180
cgataaagag gtcgaagcag gcaaagttgc tgttcgtact cgtcgcggca aagacttagg 240cgataaagag gtcgaagcag gcaaagttgc tgttcgtact cgtcgcggca aagacttagg 240
aagcatggat gttagcgaag tcgttgacaa actgctggcg gaaatccgca gcagaagtca 300aagcatggat gttagcgaag tcgttgacaa actgctggcg gaaatccgca gcagaagtca 300
tcatcaactg gaggaataaa gtattaaagg cggaaaacga gttcaaccgg cgcgtcctaa 360tcatcaactg gaggaataaa gtattaaagg cggaaaacga gttcaaccgg cgcgtcctaa 360
tcgcattaac aaagagattc gcgcgcaaga agttcgcctc accggcgtcg atggcgagca 420tcgcattaac aaagagattc gcgcgcaaga agttcgcctc accggcgtcg atggcgagca 420
gattggtatt gtcagtctga atgaagctct tgaaaaagct gaggaagcgg gcgtcgattt 480gattggtatt gtcagtctga atgaagctct tgaaaaagct gaggaagcgg gcgtcgattt 480
agtagaaatc agtccgaatg ccgagccgcc agtttgtcga atctctttag atctctcggt 540agtagaaatc agtccgaatg ccgagccgcc agtttgtcga atctctttag atctctcggt 540
ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg 600ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg 600
aggcttaaaa tga 613aggcttaaaa tga 613
<210> 230<210> 230
<211> 1613<211> 1613
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::PinfC с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::PinfC with a 500 bp flanking region.
<400> 230<400> 230
tgtttcgtct cgaagccggg caactgagca gccccgttga aaccgaactg ggctggcatc 60tgtttcgtct cgaagccggg caactgagca gccccgttga aaccgaactg ggctggcatc 60
tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgag gccttaacgc 120tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgag gccttaacgc 120
gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaatcatta tcagcgccag tggctgcaac 180gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaatcatta tcagcgccag tggctgcaac 180
aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttggtg cagacgggtt aatgcccgtt 240aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttggtg cagacgggtt aatgcccgtt 240
ttgcacgaaa aatgcacata aactgccttc gctgccttat aacagcgcat ggaaatcctg 300ttgcacgaaa aatgcacata aactgccttc gctgccttat aacagcgcat ggaaatcctg 300
cctcctgcct tgtgccacgc cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360360
catcctgatg tttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420catcctgatg tttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420
gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480
gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agctgaatat cactgactca 540gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agctgaatat cactgactca 540
caagctacct atgtcgaaga attaactaaa aaactgcaag atgcaggcat tcgcgttaaa 600caagctacct atgtcgaaga attaactaaa aaactgcaag atgcaggcat tcgcgttaaa 600
gccgacttga gaaatgagaa gattggcttt aaaattcgcg aacacacgct acgccgtgtt 660gccgacttga gaaatgagaa gattggcttt aaaattcgcg aacacacgct acgccgtgtt 660
ccttatatgt tagtttgtgg cgataaagag gtcgaagcag gcaaagttgc tgttcgtact 720ccttatatgt tagtttgtgg cgataaagag gtcgaagcag gcaaagttgc tgttcgtact 720
cgtcgcggca aagacttagg aagcatggat gttagcgaag tcgttgacaa actgctggcg 780cgtcgcggca aagacttagg aagcatggat gttagcgaag tcgttgacaa actgctggcg 780
gaaatccgca gcagaagtca tcatcaactg gaggaataaa gtattaaagg cggaaaacga 840gaaatccgca gcagaagtca tcatcaactg gaggaataaa gtattaaagg cggaaaacga 840
gttcaaccgg cgcgtcctaa tcgcattaac aaagagattc gcgcgcaaga agttcgcctc 900gttcaaccgg cgcgtcctaa tcgcattaac aaagagattc gcgcgcaaga agttcgcctc 900
accggcgtcg atggcgagca gattggtatt gtcagtctga atgaagctct tgaaaaagct 960accggcgtcg atggcgagca gattggtatt gtcagtctga atgaagctct tgaaaaagct 960
gaggaagcgg gcgtcgattt agtagaaatc agtccgaatg ccgagccgcc agtttgtcga 1020gaggaagcgg gcgtcgattt agtagaaatc agtccgaatg ccgagccgcc agtttgtcga 1020
atctctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg 1080atctctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg 1080
gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tgacccagtt acctaccgcg ggcccggtta 1140gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tgacccagtt acctaccgcg ggcccggtta 1140
tccggcgctt tgatatgtct gcccagttta cggcgcttta tcgcatcagc gtggcgctga 1200tccggcgctt tgatatgtct gcccagttta cggcgcttta tcgcatcagc gtggcgctga 1200
gtcaggaaag caataccgcg cgcgcactgg cggcgatcct cgaagtgctt cacgatcatg 1260gtcaggaaag caataccgcg cgcgcactgg cggcgatcct cgaagtgctt cacgatcatg 1260
catttatgca atacggcatg gtgtgtctgt tcgataaaga acgcaatgca ctgtttgtgg 1320catttatgca atacggcatg gtgtgtctgt tcgataaaga acgcaatgca ctgtttgtgg 1320
aatccctgca tggcatcgac ggcgaaagga aaaaagaaac ccgccatgtc cgttaccgca 1380aatccctgca tggcatcgac ggcgaaagga aaaaagaaac ccgccatgtc cgttaccgca 1380
tgggggaagg cgtgatcggc gcggtgatga gccagcgtca ggcgctggtg ttaccgcgca 1440tgggggaagg cgtgatcggc gcggtgatga gccagcgtca ggcgctggtg ttaccgcgca 1440
tttcagacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgaatattta cgattacagc ctgccgctga 1500tttcagacga tcagcgtttt ctcgaccgcc tgaatattta cgattacagc ctgccgctga 1500
ttggtgtgcc gatccccggt gcggataatc agcctgcggg tgtgctggtg gcacagccga 1560ttggtgtgcc gatccccggt gcggataatc agcctgcggg tgtgctggtg gcacagccga 1560
tggcgttgca cgaagaccgg ctggctgcca gtacgcggtt tttagaaatg gtc 1613tggcgttgca cgaagaccgg ctggctgcca gtacgcggtt tttagaaatg gtc 1613
<210> 231<210> 231
<211> 426<211> 426
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm5<223> delta-nifL::Prm5
<400> 231<400> 231
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60
cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120
tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180
aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240
aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300
ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360
gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420
aaatga 426aaatga 426
<210> 232<210> 232
<211> 1426<211> 1426
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm5 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm5 with a 500 bp flanking region.
<400> 232<400> 232
accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60
agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120
ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180
ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240
acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300
tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360
caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420
catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480
actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc 540actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc 540
gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc 600gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc 600
ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc 660ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc 660
ggctggttga gcgtttgttg aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct 720ggctggttga gcgtttgttg aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct 720
gatggttaat taacctattc aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca 780gatggttaat taacctattc aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca 780
gcataatggt gcgttgtgcg ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga 840gcataatggt gcgttgtgcg ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga 840
aacaactcac ttcacacccc gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc 900aacaactcac ttcacacccc gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc 900
attcactgac cggaggttca aaatgaccca gcgaaccgag tcgggtaata ccgtctggcg 960attcactgac cggaggttca aaatgaccca gcgaaccgag tcgggtaata ccgtctggcg 960
cttcgatttg tcccagcagt tcactgcgat gcagcgcata agcgtggtac tcagccgggc 1020cttcgatttg tcccagcagt tcactgcgat gcagcgcata agcgtggtac tcagccgggc 1020
gaccgaggtc gatcagacgc tccagcaagt gctgtgcgta ttgcacaatg acgccttttt 10801080
gcagcacggc atgatctgtc tgtacgacag ccagcaggcg attttgaata ttgaagcgtt 11401140 gcagcacggc atgatctgtc tgtacgacag
gcaggaagcc gatcagcagt taatccccgg cagctcgcaa atccgctatc gtccgggcga 1200gcaggaagcc gatcagcagt taatccccgg cagctcgcaa atccgctatc gtccgggcga 1200
agggctggtc gggacggtgc tttcgcaggg ccaatcatta gtgctggcgc gcgttgctga 1260agggctggtc gggacggtgc tttcgcaggg ccaatcatta gtgctggcgc gcgttgctga 1260
cgatcagcgc tttcttgacc ggctcgggtt gtatgattac aacctgccgt ttatcgccgt 13201320
gccgctgata gggccagatg cgcagacttt cggtgtgctg acggcacaac ccatggcgcg 1380gccgctgata gggccagatg cgcagacttt cggtgtgctg acggcacaac ccatggcgcg 1380
ttacgaagag cgattacccg cctgcacccg ctttctggaa acggtc 1426ttacgaagag cgattacccg cctgcacccg ctttctggaa acggtc 1426
<210> 233<210> 233
<211> 461<211> 461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1<223> delta-nifL::Prm1
<400> 233<400> 233
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60
ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120
aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180
tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240240
cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300
atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360
taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420
gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461
<210> 234<210> 234
<211> 1461<211> 1461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm1 with a 500 bp flanking region.
<400> 234<400> 234
accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60
agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120
ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180
ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240
acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300
tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360
caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420
catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480
actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540
taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600taataaccgg acaattcggga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600
ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660
aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720
tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780
aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840
gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900
gggaagttgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960gggaagttgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960
acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020
gcgatgcagc gcataagcgt ggtactcagc cgggcgaccg aggtcgatca gacgctccag 1080gcgatgcagc gcataagcgt ggtactcagc cgggcgaccg aggtcgatca gacgctccag 1080
caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc ttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140
gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200
cccggcagct cgcaaatccg ctatcgtccg ggcgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260cccggcagct cgcaaatccg ctatcgtccg ggcgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260
cagggccaat cattagtgct ggcgcgcgtt gctgacgatc agcgctttct tgaccggctc 1320cagggccaat cattagtgct ggcgcgcgtt gctgacgatc agcgctttct tgaccggctc 1320
gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380
actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440
acccgctttc tggaaacggt c 1461acccgctttc tggaaacggt c 1461
<210> 235<210> 235
<211> 461<211> 461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1<223> delta-nifL::Prm1
<400> 235<400> 235
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60
ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120
aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180
tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240240
cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300
atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360
taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420
gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461
<210> 236<210> 236
<211> 1461<211> 1461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm1 with a 500 bp flanking region.
<400> 236<400> 236
accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60
agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120
ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180
ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240
acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300
tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360
caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420
catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480
actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540
taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600taataaccgg acaattcggga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600
ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660
aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720
tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780
aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840
gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900
gggaagttgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960gggaagttgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960
acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020
gcgatgcagc gcataagcgt ggtactcagc cgggcgaccg aggtcgatca gacgctccag 1080gcgatgcagc gcataagcgt ggtactcagc cgggcgaccg aggtcgatca gacgctccag 1080
caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc ttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140
gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200
cccggcagct cgcaaatccg ctatcgtccg ggcgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260cccggcagct cgcaaatccg ctatcgtccg ggcgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260
cagggccaat cattagtgct ggcgcgcgtt gctgacgatc agcgctttct tgaccggctc 1320cagggccaat cattagtgct ggcgcgcgtt gctgacgatc agcgctttct tgaccggctc 1320
gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380
actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440
acccgctttc tggaaacggt c 1461acccgctttc tggaaacggt c 1461
<210> 237<210> 237
<211> 1188<211> 1188
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2<223> glnE-delta-AR-2
<400> 237<400> 237
atggcactga aacacctcat ttccctgtgt gccgcgtcgc cgatggttgc cagtcagctg 60atggcactga aacacctcat ttccctgtgt gccgcgtcgc cgatggttgc cagtcagctg 60
gcgcgctacc cgatcctgct tgatgaattg ctcgacccga atacgctcta tcaaccgacg 120gcgcgctacc cgatcctgct tgatgaattg ctcgacccga atacgctcta tcaaccgacg 120
gcgatgaatg cctatcgcga tgagctgcgc caatacctgc tgcgcgtgcc ggaagatgat 180gcgatgaatg cctatcgcga tgagctgcgc caatacctgc tgcgcgtgcc ggaagatgat 180
gaagagcaac agcttgaggc gctgcggcag tttaagcagg cgcagttgct gcgcgtggcg 240gaagagcaac agcttgaggc gctgcggcag tttaagcagg cgcagttgct gcgcgtggcg 240
gcggcggata ttgccggtac gttgccagta atgaaagtga gcgatcactt aacctggctg 300gcggcggata ttgccggtac gttgccagta atgaaagtga gcgatcactt aacctggctg 300
gcggaagcga ttattgatgc ggtggtgcag caagcctggg ggcagatggt ggcgcgttat 360360
ggccagccaa cgcatctgca cgatcgcgaa gggcgcggtt ttgcggtggt cggttatggc 420ggccagccaa cgcatctgca cgatcgcgaa gggcgcggtt ttgcggtggt cggttatggc 420
aagctgggcg gctgggagct gggttacagc tccgatctgg atctggtatt cctgcacgac 480aagctgggcg gctgggagct gggttacagc tccgatctgg atctggtatt cctgcacgac 480
tgcccgatgg atgtgatgac cgatggcgag cgtgaaatcg atggtcgcca gttctatttg 540tgcccgatgg atgtgatgac cgatggcgag cgtgaaatcg atggtcgcca gttctatttg 540
cgtctcgcgc agcgcgtgat gcacctgttt agcacgcgca cgtcgtccgg catcctttat 600cgtctcgcgc agcgcgtgat gcacctgttt agcacgcgca cgtcgtccgg catcctttat 600
gaagttgatg cgcgtctgcg tccatctggc gctgcgggga tgctggtcac tactacggaa 660gaagttgatg cgcgtctgcg tccatctggc gctgcgggga tgctggtcac tactacggaa 660
tcgttcgccg attaccagca aaacgaagcc tggacgtggg aacatcaggc gctggcccgt 720tcgttcgccg attaccagca aaacgaagcc tggacgtggg aacatcaggc gctggcccgt 720
gcgcgcgtgg tgtacggcga tccgcaactg accgccgaat ttgacgccat tcgccgcgat 780gcgcgcgtgg tgtacggcga tccgcaactg accgccgaat ttgacgccat tcgccgcgat 780
attctgatga cgcctcgcga cggcgcaacg ctgcaaaccg acgtgcgaga aatgcgcgag 840attctgatga cgcctcgcga cggcgcaacg ctgcaaaccg acgtgcgaga aatgcgcgag 840
aaaatgcgtg cccatcttgg caacaagcat aaagaccgct tcgatctgaa agccgatgaa 900aaaatgcgtg cccatcttgg caacaagcat aaagaccgct tcgatctgaa agccgatgaa 900
ggcggtatca ccgacatcga gtttatcgcc caatatctgg tgctgcgctt tgcccatgac 960ggcggtatca ccgacatcga gtttatcgcc caatatctgg tgctgcgctt tgcccatgac 960
aagccgaaac tgacgcgctg gtcggataat gtgcgcattc tcgaagggct ggcgcaaaac 1020aagccgaaac tgacgcgctg gtcggataat gtgcgcattc tcgaagggct ggcgcaaaac 1020
ggcatcatgg aggagcagga agcgcaggca ttgacgctgg cgtacaccac attgcgtgat 1080ggcatcatgg aggagcagga agcgcaggca ttgacgctgg cgtacaccac attgcgtgat 1080
gagctgcacc acctggcgct gcaagagttg ccgggacatg tggcgctctc ctgttttgtc 1140gagctgcacc acctggcgct gcaagagttg ccgggacatg tggcgctctc ctgttttgtc 1140
gccgagcgtg cgcttattaa aaccagctgg gacaagtggc tggtggaa 1188gccgagcgtg cgcttattaa aaccagctgg gacaagtggc tggtggaa 1188
<210> 238<210> 238
<211> 2206<211> 2206
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-2 with a 500 bp flanking region.
<400> 238<400> 238
gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60
tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120
caccgagtgg ctagtgacgc agggctggcg aaccttcctt gatgaaaaag cgcaggccaa 180caccgagtgg ctagtgacgc agggctggcg aaccttcctt gatgaaaaag cgcaggccaa 180
attcgccgac tcctttaaac gctttgctga catccatctg tcacgcagcg ccgccgagct 240attcgccgac tcctttaaac gctttgctga catccatctg tcacgcagcg ccgccgagct 240
gaaaaaagcc tttgcccaac cgctgggcga cagctatcgc gaccagttgc cgcgcctggc 300gaaaaaagcc tttgcccaac cgctgggcga cagctatcgc gaccagttgc cgcgcctggc 300
gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360
atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420
cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480
ttaacgaaag gatatttcgc atggcactga aacacctcat ttccctgtgt gccgcgtcgc 540ttaacgaaag gatatttcgc atggcactga aacacctcat ttccctgtgt gccgcgtcgc 540
cgatggttgc cagtcagctg gcgcgctacc cgatcctgct tgatgaattg ctcgacccga 600cgatggttgc cagtcagctg gcgcgctacc cgatcctgct tgatgaattg ctcgacccga 600
atacgctcta tcaaccgacg gcgatgaatg cctatcgcga tgagctgcgc caatacctgc 660atacgctcta tcaaccgacg gcgatgaatg cctatcgcga tgagctgcgc caatacctgc 660
tgcgcgtgcc ggaagatgat gaagagcaac agcttgaggc gctgcggcag tttaagcagg 720tgcgcgtgcc ggaagatgat gaagagcaac agcttgaggc gctgcggcag tttaagcagg 720
cgcagttgct gcgcgtggcg gcggcggata ttgccggtac gttgccagta atgaaagtga 780cgcagttgct gcgcgtggcg gcggcggata ttgccggtac gttgccagta atgaaagtga 780
gcgatcactt aacctggctg gcggaagcga ttattgatgc ggtggtgcag caagcctggg 840gcgatcactt aacctggctg gcggaagcga ttattgatgc ggtggtgcag caagcctggg 840
ggcagatggt ggcgcgttat ggccagccaa cgcatctgca cgatcgcgaa gggcgcggtt 900ggcagatggt ggcgcgttat ggccagccaa cgcatctgca cgatcgcgaa gggcgcggtt 900
ttgcggtggt cggttatggc aagctgggcg gctgggagct gggttacagc tccgatctgg 960ttgcggtggt cggttatggc aagctgggcg gctgggagct gggttacagc tccgatctgg 960
atctggtatt cctgcacgac tgcccgatgg atgtgatgac cgatggcgag cgtgaaatcg 1020atctggtatt cctgcacgac tgcccgatgg atgtgatgac cgatggcgag cgtgaaatcg 1020
atggtcgcca gttctatttg cgtctcgcgc agcgcgtgat gcacctgttt agcacgcgca 1080atggtcgcca gttctatttg cgtctcgcgc agcgcgtgat gcacctgttt agcacgcgca 1080
cgtcgtccgg catcctttat gaagttgatg cgcgtctgcg tccatctggc gctgcgggga 1140cgtcgtccgg catcctttat gaagttgatg cgcgtctgcg tccatctggc gctgcgggga 1140
tgctggtcac tactacggaa tcgttcgccg attaccagca aaacgaagcc tggacgtggg 1200tgctggtcac tactacggaa tcgttcgccg attaccagca aaacgaagcc tggacgtggg 1200
aacatcaggc gctggcccgt gcgcgcgtgg tgtacggcga tccgcaactg accgccgaat 1260aacatcaggc gctggcccgt gcgcgcgtgg tgtacggcga tccgcaactg accgccgaat 1260
ttgacgccat tcgccgcgat attctgatga cgcctcgcga cggcgcaacg ctgcaaaccg 1320ttgacgccat tcgccgcgat attctgatga cgcctcgcga cggcgcaacg ctgcaaaccg 1320
acgtgcgaga aatgcgcgag aaaatgcgtg cccatcttgg caacaagcat aaagaccgct 1380acgtgcgaga aatgcgcgag aaaatgcgtg cccatcttgg caacaagcat aaagaccgct 1380
tcgatctgaa agccgatgaa ggcggtatca ccgacatcga gtttatcgcc caatatctgg 1440tcgatctgaa agccgatgaa ggcggtatca ccgacatcga gtttatcgcc caatatctgg 1440
tgctgcgctt tgcccatgac aagccgaaac tgacgcgctg gtcggataat gtgcgcattc 1500tgctgcgctt tgcccatgac aagccgaaac tgacgcgctg gtcggataat gtgcgcattc 1500
tcgaagggct ggcgcaaaac ggcatcatgg aggagcagga agcgcaggca ttgacgctgg 1560tcgaagggct ggcgcaaaac ggcatcatgg aggagcagga agcgcaggca ttgacgctgg 1560
cgtacaccac attgcgtgat gagctgcacc acctggcgct gcaagagttg ccgggacatg 1620cgtacaccac attgcgtgat gagctgcacc acctggcgct gcaagagttg ccgggacatg 1620
tggcgctctc ctgttttgtc gccgagcgtg cgcttattaa aaccagctgg gacaagtggc 1680tggcgctctc ctgttttgtc gccgagcgtg cgcttattaa aaccagctgg gacaagtggc 1680
tggtggaacc gtgcgccccg gcgtaagtgt ggtatcatcg cgcgcaaatt ttgtatctct 1740tggtggaacc gtgcgccccg gcgtaagtgt ggtatcatcg cgcgcaaatt ttgtatctct 1740
caggagacag gaatgaaagt gacgctgcca gagtttaagc aagccggtgt aatggtggtg 1800caggagacag gaatgaaagt gacgctgcca gagtttaagc aagccggtgt aatggtggtg 1800
ggtgatgtga tgctggatcg ttactggtat ggcccaacca gccgtatctc tccggaagcg 1860ggtgatgtga tgctggatcg ttactggtat ggcccaacca gccgtatctc tcgggaagcg 1860
ccagtcccgg ttgttaaagt cgataccatt gaagagcgtc ctggcggcgc ggcaaacgtg 1920ccagtcccgg ttgttaaagt cgataccatt gaagagcgtc ctggcggcgc ggcaaacgtg 1920
gcgatgaata tcgcctcact gggcgccacg gcgcgtctgg ttggcctgac tggcattgac 1980gcgatgaata tcgcctcact gggcgccacg gcgcgtctgg ttggcctgac tggcattgac 1980
gatgcggcgc gcgcgctgag caaagcgctg gccgatgtta acgttaaatg tgacttcgtt 2040gatgcggcgc gcgcgctgag caaagcgctg gccgatgtta acgttaaatg tgacttcgtt 2040
tctgttccga cgcatcccac catcactaag ctgcgcgtgc tgtcgcgtaa ccagcagctg 2100tctgttccga cgcatcccac catcactaag ctgcgcgtgc tgtcgcgtaa ccagcagctg 2100
attcgcctgg actttgaaga gggttttgaa ggagtcgatc cgcaaccgat gcatgaacgc 2160attcgcctgg actttgaaga gggttttgaa ggagtcgatc cgcaaccgat gcatgaacgc 2160
atcagccagg cgcttggtaa tattggcgcg ctggtgctgt cggatt 2206atcagccagg cgcttggtaa tattggcgcg ctggtgctgt cggatt 2206
<210> 239<210> 239
<211> 1563<211> 1563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-1<223> glnE-delta-AR-1
<400> 239<400> 239
atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60
agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120
catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180
ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240
ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300
ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360
gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420
cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480
atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc gcgtgccgga agatgatgaa 540atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc gcgtgccgga agatgatgaa 540
gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600
gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660
gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720
cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780
ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840
ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900
ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960
gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020
ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080
cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140
ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200
atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260
ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320
ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380
atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440
ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500
gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg tggaaccgtg cgccccggcg 15601560 gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac
taa 1563taa 1563
<210> 240<210> 240
<211> 461<211> 461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1<223> delta-nifL::Prm1
<400> 240<400> 240
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60
ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120
aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180
tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240240
cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300
atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360
taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420
gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461
<210> 241<210> 241
<211> 1461<211> 1461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm1 with a 500 bp flanking region.
<400> 241<400> 241
accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60
agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120
ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180
ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240
acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300
tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360
caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420
catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480
actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540
taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600taataaccgg acaattcggga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600
ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660
aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720
tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780
aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840
gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900
gggaagttgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960gggaagttgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960
acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020
gcgatgcagc gcataagcgt ggtactcagc cgggcgaccg aggtcgatca gacgctccag 1080gcgatgcagc gcataagcgt ggtactcagc cgggcgaccg aggtcgatca gacgctccag 1080
caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc ttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140
gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200
cccggcagct cgcaaatccg ctatcgtccg ggcgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260cccggcagct cgcaaatccg ctatcgtccg ggcgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260
cagggccaat cattagtgct ggcgcgcgtt gctgacgatc agcgctttct tgaccggctc 1320cagggccaat cattagtgct ggcgcgcgtt gctgacgatc agcgctttct tgaccggctc 1320
gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380
actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440
acccgctttc tggaaacggt c 1461acccgctttc tggaaacggt c 1461
<210> 242<210> 242
<211> 2563<211> 2563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-1 with a 500 bp flanking region.
<400> 242<400> 242
gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60
tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120
caccgagtgg ctagtgacgc agggctggcg aaccttcctt gatgaaaaag cgcaggccaa 180caccgagtgg ctagtgacgc agggctggcg aaccttcctt gatgaaaaag cgcaggccaa 180
attcgccgac tcctttaaac gctttgctga catccatctg tcacgcagcg ccgccgagct 240attcgccgac tcctttaaac gctttgctga catccatctg tcacgcagcg ccgccgagct 240
gaaaaaagcc tttgcccaac cgctgggcga cagctatcgc gaccagttgc cgcgcctggc 300gaaaaaagcc tttgcccaac cgctgggcga cagctatcgc gaccagttgc cgcgcctggc 300
gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360
atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420
cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480
ttaacgaaag gatatttcgc atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc 540ttaacgaaag gatatttcgc atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc 540
cggaagatgc gctttctgag agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg 600cggaagatgc gctttctgag agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg 600
attccacgcc cgtgctggcg catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga 660attccacgcc cgtgctggcg catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga 660
ttgccgattt tcgcaaagag ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac 720ttgccgattt tcgcaaagag ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac 720
tcgatcactt aatgccgcat ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac 780tcgatcactt aatgccgcat ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac 780
cgctgtcacg cctgacgccg ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc 840cgctgtcacg cctgacgccg ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc 840
tgctaagtga atttcccggc gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga 900tgctaagtga atttcccggc gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga 900
tggttgccag tcagctggcg cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata 960tggttgccag tcagctggcg cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata 960
cgctctatca accgacggcg atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc 1020cgctctatca accgacggcg atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc 1020
gcgtgccgga agatgatgaa gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc 1080gcgtgccgga agatgatgaa gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc 1080
agttgctgcg cgtggcggcg gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg 1140agttgctgcg cgtggcggcg gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg 1140
atcacttaac ctggctggcg gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc 1200atcacttaac ctggctggcg gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc 1200
agatggtggc gcgttatggc cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg 1260agatggtggc gcgttatggc cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg 1260
cggtggtcgg ttatggcaag ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc 1320cggtggtcgg ttatggcaag ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc 1320
tggtattcct gcacgactgc ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg 1380tggtattcct gcacgactgc ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg 1380
gtcgccagtt ctatttgcgt ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt 1440gtcgccagtt ctatttgcgt ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt 1440
cgtccggcat cctttatgaa gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc 1500cgtccggcat cctttatgaa gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc 1500
tggtcactac tacggaatcg ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac 1560tggtcactac tacggaatcg ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac 1560
atcaggcgct ggcccgtgcg cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg 1620atcaggcgct ggcccgtgcg cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg 1620
acgccattcg ccgcgatatt ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg 1680acgccattcg ccgcgatatt ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg 1680
tgcgagaaat gcgcgagaaa atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg 1740tgcgagaaat gcgcgagaaa atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg 1740
atctgaaagc cgatgaaggc ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc 1800atctgaaagc cgatgaaggc ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc 1800
tgcgctttgc ccatgacaag ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg 1860tgcgctttgc ccatgacaag ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg 1860
aagggctggc gcaaaacggc atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt 1920aagggctggc gcaaaacggc atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt 1920
acaccacatt gcgtgatgag ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg 1980acaccacatt gcgtgatgag ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg 1980
cgctctcctg ttttgtcgcc gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg 2040cgctctcctg ttttgtcgcc gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg 2040
tggaaccgtg cgccccggcg taagtgtggt atcatcgcgc gcaaattttg tatctctcag 2100tggaaccgtg cgccccggcg taagtgtggt atcatcgcgc gcaaattttg tatctctcag 2100
gagacaggaa tgaaagtgac gctgccagag tttaagcaag ccggtgtaat ggtggtgggt 2160gagacaggaa tgaaagtgac gctgccagag tttaagcaag ccggtgtaat ggtggtgggt 2160
gatgtgatgc tggatcgtta ctggtatggc ccaaccagcc gtatctctcc ggaagcgcca 2220gatgtgatgc tggatcgtta ctggtatggc ccaaccagcc gtatctctcc ggaagcgcca 2220
gtcccggttg ttaaagtcga taccattgaa gagcgtcctg gcggcgcggc aaacgtggcg 2280gtcccggttg ttaaagtcga taccattgaa gagcgtcctg gcggcgcggc aaacgtggcg 2280
atgaatatcg cctcactggg cgccacggcg cgtctggttg gcctgactgg cattgacgat 2340atgaatatcg cctcactggg cgccacggcg cgtctggttg gcctgactgg cattgacgat 2340
gcggcgcgcg cgctgagcaa agcgctggcc gatgttaacg ttaaatgtga cttcgtttct 2400gcggcgcgcg cgctgagcaa agcgctggcc gatgttaacg ttaaatgtga cttcgtttct 2400
gttccgacgc atcccaccat cactaagctg cgcgtgctgt cgcgtaacca gcagctgatt 2460gttccgacgc atcccaccat cactaagctg cgcgtgctgt cgcgtaacca gcagctgatt 2460
cgcctggact ttgaagaggg ttttgaagga gtcgatccgc aaccgatgca tgaacgcatc 2520cgcctggact ttgaagaggg ttttgaagga gtcgatccgc aaccgatgca tgaacgcatc 2520
agccaggcgc ttggtaatat tggcgcgctg gtgctgtcgg att 2563agccaggcgc ttggtaatat tggcgcgctg gtgctgtcgg att 2563
<210> 243<210> 243
<211> 1563<211> 1563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-1<223> glnE-delta-AR-1
<400> 243<400> 243
atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60
agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120
catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180
ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240
ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300
ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360
gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420
cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480
atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc gcgtgccgga agatgatgaa 540atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc gcgtgccgga agatgatgaa 540
gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600
gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660
gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720
cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780
ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840
ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900
ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960
gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020
ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080
cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140
ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200
atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260
ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320
ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380
atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440
ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500
gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg tggaaccgtg cgccccggcg 15601560 gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac
taa 1563taa 1563
<210> 244<210> 244
<211> 2563<211> 2563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-1 with a 500 bp flanking region.
<400> 244<400> 244
gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60
tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120
caccgagtgg ctagtgacgc agggctggcg aaccttcctt gatgaaaaag cgcaggccaa 180caccgagtgg ctagtgacgc agggctggcg aaccttcctt gatgaaaaag cgcaggccaa 180
attcgccgac tcctttaaac gctttgctga catccatctg tcacgcagcg ccgccgagct 240attcgccgac tcctttaaac gctttgctga catccatctg tcacgcagcg ccgccgagct 240
gaaaaaagcc tttgcccaac cgctgggcga cagctatcgc gaccagttgc cgcgcctggc 300gaaaaaagcc tttgcccaac cgctgggcga cagctatcgc gaccagttgc cgcgcctggc 300
gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360
atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420
cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480
ttaacgaaag gatatttcgc atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc 540ttaacgaaag gatatttcgc atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc 540
cggaagatgc gctttctgag agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg 600cggaagatgc gctttctgag agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg 600
attccacgcc cgtgctggcg catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga 660attccacgcc cgtgctggcg catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga 660
ttgccgattt tcgcaaagag ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac 720ttgccgattt tcgcaaagag ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac 720
tcgatcactt aatgccgcat ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac 780tcgatcactt aatgccgcat ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac 780
cgctgtcacg cctgacgccg ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc 840cgctgtcacg cctgacgccg ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc 840
tgctaagtga atttcccggc gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga 900tgctaagtga atttcccggc gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga 900
tggttgccag tcagctggcg cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata 960tggttgccag tcagctggcg cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata 960
cgctctatca accgacggcg atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc 1020cgctctatca accgacggcg atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc 1020
gcgtgccgga agatgatgaa gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc 1080gcgtgccgga agatgatgaa gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc 1080
agttgctgcg cgtggcggcg gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg 1140agttgctgcg cgtggcggcg gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg 1140
atcacttaac ctggctggcg gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc 1200atcacttaac ctggctggcg gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc 1200
agatggtggc gcgttatggc cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg 1260agatggtggc gcgttatggc cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg 1260
cggtggtcgg ttatggcaag ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc 1320cggtggtcgg ttatggcaag ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc 1320
tggtattcct gcacgactgc ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg 1380tggtattcct gcacgactgc ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg 1380
gtcgccagtt ctatttgcgt ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt 1440gtcgccagtt ctatttgcgt ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt 1440
cgtccggcat cctttatgaa gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc 1500cgtccggcat cctttatgaa gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc 1500
tggtcactac tacggaatcg ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac 1560tggtcactac tacggaatcg ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac 1560
atcaggcgct ggcccgtgcg cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg 1620atcaggcgct ggcccgtgcg cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg 1620
acgccattcg ccgcgatatt ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg 1680acgccattcg ccgcgatatt ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg 1680
tgcgagaaat gcgcgagaaa atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg 1740tgcgagaaat gcgcgagaaa atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg 1740
atctgaaagc cgatgaaggc ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc 1800atctgaaagc cgatgaaggc ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc 1800
tgcgctttgc ccatgacaag ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg 1860tgcgctttgc ccatgacaag ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg 1860
aagggctggc gcaaaacggc atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt 1920aagggctggc gcaaaacggc atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt 1920
acaccacatt gcgtgatgag ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg 1980acaccacatt gcgtgatgag ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg 1980
cgctctcctg ttttgtcgcc gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg 2040cgctctcctg ttttgtcgcc gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg 2040
tggaaccgtg cgccccggcg taagtgtggt atcatcgcgc gcaaattttg tatctctcag 2100tggaaccgtg cgccccggcg taagtgtggt atcatcgcgc gcaaattttg tatctctcag 2100
gagacaggaa tgaaagtgac gctgccagag tttaagcaag ccggtgtaat ggtggtgggt 2160gagacaggaa tgaaagtgac gctgccagag tttaagcaag ccggtgtaat ggtggtgggt 2160
gatgtgatgc tggatcgtta ctggtatggc ccaaccagcc gtatctctcc ggaagcgcca 2220gatgtgatgc tggatcgtta ctggtatggc ccaaccagcc gtatctctcc ggaagcgcca 2220
gtcccggttg ttaaagtcga taccattgaa gagcgtcctg gcggcgcggc aaacgtggcg 2280gtcccggttg ttaaagtcga taccattgaa gagcgtcctg gcggcgcggc aaacgtggcg 2280
atgaatatcg cctcactggg cgccacggcg cgtctggttg gcctgactgg cattgacgat 2340atgaatatcg cctcactggg cgccacggcg cgtctggttg gcctgactgg cattgacgat 2340
gcggcgcgcg cgctgagcaa agcgctggcc gatgttaacg ttaaatgtga cttcgtttct 2400gcggcgcgcg cgctgagcaa agcgctggcc gatgttaacg ttaaatgtga cttcgtttct 2400
gttccgacgc atcccaccat cactaagctg cgcgtgctgt cgcgtaacca gcagctgatt 2460gttccgacgc atcccaccat cactaagctg cgcgtgctgt cgcgtaacca gcagctgatt 2460
cgcctggact ttgaagaggg ttttgaagga gtcgatccgc aaccgatgca tgaacgcatc 2520cgcctggact ttgaagaggg ttttgaagga gtcgatccgc aaccgatgca tgaacgcatc 2520
agccaggcgc ttggtaatat tggcgcgctg gtgctgtcgg att 2563agccaggcgc ttggtaatat tggcgcgctg gtgctgtcgg att 2563
<210> 245<210> 245
<211> 426<211> 426
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm5<223> delta-nifL::Prm5
<400> 245<400> 245
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac 60
cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg 120
tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg 180
aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct gatggttaat taacctattc 240
aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg 300
ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga aacaactcac ttcacacccc 360
gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc attcactgac cggaggttca 420
aaatga 426aaatga 426
<210> 246<210> 246
<211> 1426<211> 1426
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm5 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm5 with a 500 bp flanking region.
<400> 246<400> 246
accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60
agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120
ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180
ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240
acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300
tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360
caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420
catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480
actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc 540actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc 540
gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc 600gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc 600
ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc 660ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg aattaccccc 660
ggctggttga gcgtttgttg aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct 720ggctggttga gcgtttgttg aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata gcgccactct 720
gatggttaat taacctattc aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca 780gatggttaat taacctattc aattaagaat tatctggatg aatgtgccat taaatgcgca 780
gcataatggt gcgttgtgcg ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga 840gcataatggt gcgttgtgcg ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt cagtagcgga 840
aacaactcac ttcacacccc gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc 900aacaactcac ttcacacccc gaagggggaa gttgcctgac cctacgattc ccgctatttc 900
attcactgac cggaggttca aaatgaccca gcgaaccgag tcgggtaata ccgtctggcg 960attcactgac cggaggttca aaatgaccca gcgaaccgag tcgggtaata ccgtctggcg 960
cttcgatttg tcccagcagt tcactgcgat gcagcgcata agcgtggtac tcagccgggc 1020cttcgatttg tcccagcagt tcactgcgat gcagcgcata agcgtggtac tcagccgggc 1020
gaccgaggtc gatcagacgc tccagcaagt gctgtgcgta ttgcacaatg acgccttttt 10801080
gcagcacggc atgatctgtc tgtacgacag ccagcaggcg attttgaata ttgaagcgtt 11401140 gcagcacggc atgatctgtc tgtacgacag
gcaggaagcc gatcagcagt taatccccgg cagctcgcaa atccgctatc gtccgggcga 1200gcaggaagcc gatcagcagt taatccccgg cagctcgcaa atccgctatc gtccgggcga 1200
agggctggtc gggacggtgc tttcgcaggg ccaatcatta gtgctggcgc gcgttgctga 1260agggctggtc gggacggtgc tttcgcaggg ccaatcatta gtgctggcgc gcgttgctga 1260
cgatcagcgc tttcttgacc ggctcgggtt gtatgattac aacctgccgt ttatcgccgt 13201320
gccgctgata gggccagatg cgcagacttt cggtgtgctg acggcacaac ccatggcgcg 1380gccgctgata gggccagatg cgcagacttt cggtgtgctg acggcacaac ccatggcgcg 1380
ttacgaagag cgattacccg cctgcacccg ctttctggaa acggtc 1426ttacgaagag cgattacccg cctgcacccg ctttctggaa acggtc 1426
<210> 247<210> 247
<211> 461<211> 461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1<223> delta-nifL::Prm1
<400> 247<400> 247
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60
ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120
aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180
tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240240
cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300
atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360
taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420
gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461
<210> 248<210> 248
<211> 1461<211> 1461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm1 with a 500 bp flanking region.
<400> 248<400> 248
accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60
agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120
ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180
ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240
acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300
tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360
caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420
catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480
actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540
taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600taataaccgg acaattcggga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600
ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660
aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720
tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780
aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840
gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900
gggaagttgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960gggaagttgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960
acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020
gcgatgcagc gcataagcgt ggtactcagc cgggcgaccg aggtcgatca gacgctccag 1080gcgatgcagc gcataagcgt ggtactcagc cgggcgaccg aggtcgatca gacgctccag 1080
caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc ttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140
gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200
cccggcagct cgcaaatccg ctatcgtccg ggcgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260cccggcagct cgcaaatccg ctatcgtccg ggcgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260
cagggccaat cattagtgct ggcgcgcgtt gctgacgatc agcgctttct tgaccggctc 1320cagggccaat cattagtgct ggcgcgcgtt gctgacgatc agcgctttct tgaccggctc 1320
gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380
actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440
acccgctttc tggaaacggt c 1461acccgctttc tggaaacggt c 1461
<210> 249<210> 249
<211> 1188<211> 1188
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2<223> glnE-delta-AR-2
<400> 249<400> 249
atggcactga aacacctcat ttccctgtgt gccgcgtcgc cgatggttgc cagtcagctg 60atggcactga aacacctcat ttccctgtgt gccgcgtcgc cgatggttgc cagtcagctg 60
gcgcgctacc cgatcctgct tgatgaattg ctcgacccga atacgctcta tcaaccgacg 120gcgcgctacc cgatcctgct tgatgaattg ctcgacccga atacgctcta tcaaccgacg 120
gcgatgaatg cctatcgcga tgagctgcgc caatacctgc tgcgcgtgcc ggaagatgat 180gcgatgaatg cctatcgcga tgagctgcgc caatacctgc tgcgcgtgcc ggaagatgat 180
gaagagcaac agcttgaggc gctgcggcag tttaagcagg cgcagttgct gcgcgtggcg 240gaagagcaac agcttgaggc gctgcggcag tttaagcagg cgcagttgct gcgcgtggcg 240
gcggcggata ttgccggtac gttgccagta atgaaagtga gcgatcactt aacctggctg 300gcggcggata ttgccggtac gttgccagta atgaaagtga gcgatcactt aacctggctg 300
gcggaagcga ttattgatgc ggtggtgcag caagcctggg ggcagatggt ggcgcgttat 360360
ggccagccaa cgcatctgca cgatcgcgaa gggcgcggtt ttgcggtggt cggttatggc 420ggccagccaa cgcatctgca cgatcgcgaa gggcgcggtt ttgcggtggt cggttatggc 420
aagctgggcg gctgggagct gggttacagc tccgatctgg atctggtatt cctgcacgac 480aagctgggcg gctgggagct gggttacagc tccgatctgg atctggtatt cctgcacgac 480
tgcccgatgg atgtgatgac cgatggcgag cgtgaaatcg atggtcgcca gttctatttg 540tgcccgatgg atgtgatgac cgatggcgag cgtgaaatcg atggtcgcca gttctatttg 540
cgtctcgcgc agcgcgtgat gcacctgttt agcacgcgca cgtcgtccgg catcctttat 600cgtctcgcgc agcgcgtgat gcacctgttt agcacgcgca cgtcgtccgg catcctttat 600
gaagttgatg cgcgtctgcg tccatctggc gctgcgggga tgctggtcac tactacggaa 660gaagttgatg cgcgtctgcg tccatctggc gctgcgggga tgctggtcac tactacggaa 660
tcgttcgccg attaccagca aaacgaagcc tggacgtggg aacatcaggc gctggcccgt 720tcgttcgccg attaccagca aaacgaagcc tggacgtggg aacatcaggc gctggcccgt 720
gcgcgcgtgg tgtacggcga tccgcaactg accgccgaat ttgacgccat tcgccgcgat 780gcgcgcgtgg tgtacggcga tccgcaactg accgccgaat ttgacgccat tcgccgcgat 780
attctgatga cgcctcgcga cggcgcaacg ctgcaaaccg acgtgcgaga aatgcgcgag 840attctgatga cgcctcgcga cggcgcaacg ctgcaaaccg acgtgcgaga aatgcgcgag 840
aaaatgcgtg cccatcttgg caacaagcat aaagaccgct tcgatctgaa agccgatgaa 900aaaatgcgtg cccatcttgg caacaagcat aaagaccgct tcgatctgaa agccgatgaa 900
ggcggtatca ccgacatcga gtttatcgcc caatatctgg tgctgcgctt tgcccatgac 960ggcggtatca ccgacatcga gtttatcgcc caatatctgg tgctgcgctt tgcccatgac 960
aagccgaaac tgacgcgctg gtcggataat gtgcgcattc tcgaagggct ggcgcaaaac 1020aagccgaaac tgacgcgctg gtcggataat gtgcgcattc tcgaagggct ggcgcaaaac 1020
ggcatcatgg aggagcagga agcgcaggca ttgacgctgg cgtacaccac attgcgtgat 1080ggcatcatgg aggagcagga agcgcaggca ttgacgctgg cgtacaccac attgcgtgat 1080
gagctgcacc acctggcgct gcaagagttg ccgggacatg tggcgctctc ctgttttgtc 1140gagctgcacc acctggcgct gcaagagttg ccgggacatg tggcgctctc ctgttttgtc 1140
gccgagcgtg cgcttattaa aaccagctgg gacaagtggc tggtggaa 1188gccgagcgtg cgcttattaa aaccagctgg gacaagtggc tggtggaa 1188
<210> 250<210> 250
<211> 2206<211> 2206
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-2 with a 500 bp flanking region.
<400> 250<400> 250
gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60
tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120
caccgagtgg ctagtgacgc agggctggcg aaccttcctt gatgaaaaag cgcaggccaa 180caccgagtgg ctagtgacgc agggctggcg aaccttcctt gatgaaaaag cgcaggccaa 180
attcgccgac tcctttaaac gctttgctga catccatctg tcacgcagcg ccgccgagct 240attcgccgac tcctttaaac gctttgctga catccatctg tcacgcagcg ccgccgagct 240
gaaaaaagcc tttgcccaac cgctgggcga cagctatcgc gaccagttgc cgcgcctggc 300gaaaaaagcc tttgcccaac cgctgggcga cagctatcgc gaccagttgc cgcgcctggc 300
gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360
atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420
cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480
ttaacgaaag gatatttcgc atggcactga aacacctcat ttccctgtgt gccgcgtcgc 540ttaacgaaag gatatttcgc atggcactga aacacctcat ttccctgtgt gccgcgtcgc 540
cgatggttgc cagtcagctg gcgcgctacc cgatcctgct tgatgaattg ctcgacccga 600cgatggttgc cagtcagctg gcgcgctacc cgatcctgct tgatgaattg
atacgctcta tcaaccgacg gcgatgaatg cctatcgcga tgagctgcgc caatacctgc 660atacgctcta tcaaccgacg gcgatgaatg cctatcgcga tgagctgcgc caatacctgc 660
tgcgcgtgcc ggaagatgat gaagagcaac agcttgaggc gctgcggcag tttaagcagg 720tgcgcgtgcc ggaagatgat gaagagcaac agcttgaggc gctgcggcag tttaagcagg 720
cgcagttgct gcgcgtggcg gcggcggata ttgccggtac gttgccagta atgaaagtga 780cgcagttgct gcgcgtggcg gcggcggata ttgccggtac gttgccagta atgaaagtga 780
gcgatcactt aacctggctg gcggaagcga ttattgatgc ggtggtgcag caagcctggg 840gcgatcactt aacctggctg gcggaagcga ttattgatgc ggtggtgcag caagcctggg 840
ggcagatggt ggcgcgttat ggccagccaa cgcatctgca cgatcgcgaa gggcgcggtt 900ggcagatggt ggcgcgttat ggccagccaa cgcatctgca cgatcgcgaa gggcgcggtt 900
ttgcggtggt cggttatggc aagctgggcg gctgggagct gggttacagc tccgatctgg 960ttgcggtggt cggttatggc aagctgggcg gctgggagct gggttacagc tccgatctgg 960
atctggtatt cctgcacgac tgcccgatgg atgtgatgac cgatggcgag cgtgaaatcg 1020atctggtatt cctgcacgac tgcccgatgg atgtgatgac cgatggcgag cgtgaaatcg 1020
atggtcgcca gttctatttg cgtctcgcgc agcgcgtgat gcacctgttt agcacgcgca 1080atggtcgcca gttctatttg cgtctcgcgc agcgcgtgat gcacctgttt agcacgcgca 1080
cgtcgtccgg catcctttat gaagttgatg cgcgtctgcg tccatctggc gctgcgggga 1140cgtcgtccgg catcctttat gaagttgatg cgcgtctgcg tccatctggc gctgcgggga 1140
tgctggtcac tactacggaa tcgttcgccg attaccagca aaacgaagcc tggacgtggg 1200tgctggtcac tactacggaa tcgttcgccg attaccagca aaacgaagcc
aacatcaggc gctggcccgt gcgcgcgtgg tgtacggcga tccgcaactg accgccgaat 1260aacatcaggc gctggcccgt gcgcgcgtgg tgtacggcga tccgcaactg accgccgaat 1260
ttgacgccat tcgccgcgat attctgatga cgcctcgcga cggcgcaacg ctgcaaaccg 1320ttgacgccat tcgccgcgat attctgatga cgcctcgcga cggcgcaacg ctgcaaaccg 1320
acgtgcgaga aatgcgcgag aaaatgcgtg cccatcttgg caacaagcat aaagaccgct 1380acgtgcgaga aatgcgcgag aaaatgcgtg cccatcttgg caacaagcat aaagaccgct 1380
tcgatctgaa agccgatgaa ggcggtatca ccgacatcga gtttatcgcc caatatctgg 1440tcgatctgaa agccgatgaa ggcggtatca ccgacatcga gtttatcgcc caatatctgg 1440
tgctgcgctt tgcccatgac aagccgaaac tgacgcgctg gtcggataat gtgcgcattc 1500tgctgcgctt tgcccatgac aagccgaaac tgacgcgctg gtcggataat gtgcgcattc 1500
tcgaagggct ggcgcaaaac ggcatcatgg aggagcagga agcgcaggca ttgacgctgg 1560tcgaagggct ggcgcaaaac ggcatcatgg aggagcagga agcgcaggca ttgacgctgg 1560
cgtacaccac attgcgtgat gagctgcacc acctggcgct gcaagagttg ccgggacatg 1620cgtacaccac attgcgtgat gagctgcacc acctggcgct gcaagagttg ccgggacatg 1620
tggcgctctc ctgttttgtc gccgagcgtg cgcttattaa aaccagctgg gacaagtggc 1680tggcgctctc ctgttttgtc gccgagcgtg cgcttattaa aaccagctgg gacaagtggc 1680
tggtggaacc gtgcgccccg gcgtaagtgt ggtatcatcg cgcgcaaatt ttgtatctct 1740tggtggaacc gtgcgccccg gcgtaagtgt ggtatcatcg cgcgcaaatt ttgtatctct 1740
caggagacag gaatgaaagt gacgctgcca gagtttaagc aagccggtgt aatggtggtg 1800caggagacag gaatgaaagt gacgctgcca gagtttaagc aagccggtgt aatggtggtg 1800
ggtgatgtga tgctggatcg ttactggtat ggcccaacca gccgtatctc tccggaagcg 1860ggtgatgtga tgctggatcg ttactggtat ggcccaacca gccgtatctc tcgggaagcg 1860
ccagtcccgg ttgttaaagt cgataccatt gaagagcgtc ctggcggcgc ggcaaacgtg 1920ccagtcccgg ttgttaaagt cgataccatt gaagagcgtc ctggcggcgc ggcaaacgtg 1920
gcgatgaata tcgcctcact gggcgccacg gcgcgtctgg ttggcctgac tggcattgac 1980gcgatgaata tcgcctcact gggcgccacg gcgcgtctgg ttggcctgac tggcattgac 1980
gatgcggcgc gcgcgctgag caaagcgctg gccgatgtta acgttaaatg tgacttcgtt 2040gatgcggcgc gcgcgctgag caaagcgctg gccgatgtta acgttaaatg tgacttcgtt 2040
tctgttccga cgcatcccac catcactaag ctgcgcgtgc tgtcgcgtaa ccagcagctg 2100tctgttccga cgcatcccac catcactaag ctgcgcgtgc tgtcgcgtaa ccagcagctg 2100
attcgcctgg actttgaaga gggttttgaa ggagtcgatc cgcaaccgat gcatgaacgc 2160attcgcctgg actttgaaga gggttttgaa ggagtcgatc cgcaaccgat gcatgaacgc 2160
atcagccagg cgcttggtaa tattggcgcg ctggtgctgt cggatt 2206atcagccagg cgcttggtaa tattggcgcg ctggtgctgt cggatt 2206
<210> 251<210> 251
<211> 199<211> 199
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-amtB<223> delta-amtB
<400> 251<400> 251
tttcgctgaa ggtgtgacca tgggccatca ggtgctggtg cagctggaaa gtgttgccat 60tttcgctgaa ggtgtgacca tgggccatca ggtgctggtg cagctggaaa gtgttgccat 60
cactatcgtg tggtctggcg tggtggcctt tattggttac aaactggcgg acatgacggt 120cactatcgtg tggtctggcg tggtggcctt tattggttac aaactggcgg acatgacggt 120
aggcctgcgc gtaccggaag aacaagaacg tgaagggctg gatgtaaaca gccacggcga 180aggcctgcgc gtaccggaag aacaagaacg tgaagggctg
aaacgcctat aacgcctga 199aaacgcctat aacgcctga 199
<210> 252<210> 252
<211> 1199<211> 1199
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-amtB с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-amtB with a 500 bp flanking region.
<400> 252<400> 252
tttcctttct gactctgccc gtccgggcgc actaacggcc tgaaatactc cctcttttca 60tttcctttct gactctgcc gtccgggcgc actaacggcc tgaaatactc
ttcctggcac aacgattgca atgtctgttg cgtgttagct gcggccatta tcgaattcga 120ttcctggcac aacgattgca atgtctgttg cgtgttagct gcggccatta tcgaattcga 120
ctggaggggg atctatgaag ctggttaccg tggtgattaa gccattcaaa cttgaagacg 180ctggaggggg atctatgaag ctggttaccg tggtgattaa
tgcgtgaagc gctttcttct attggtattc aagggttgac cgtaactgaa gtgaaaggct 240tgcgtgaagc gctttcttct attggtattc aagggttgac cgtaactgaa gtgaaaggct 240
ttggccgtca gaagggtcac gctgagctgt accgcggtgc ggaatatagc gttaatttcc 300ttggccgtca gaagggtcac gctgagctgt accgcggtgc ggaatatagc gttaatttcc 300
tgccgaaagt gaaaattgat gtggcgatcg ctgacgatca actcgatgaa gtaatcgatg 360tgccgaaagt gaaaattgat gtggcgatcg ctgacgatca actcgatgaa gtaatcgatg 360
tgatcagcaa agcggcctac accggaaaaa ttggcgacgg caaaattttc gttgctgagc 420tgatcagcaa agcggcctac accggaaaaa ttggcgacgg caaaattttc gttgctgagc 420
tgcaacgcgt cattcgtatt cgtaccggcg aagccgacga agcggcactg taatacaaga 480tgcaacgcgt cattcgtatt cgtaccggcg aagccgacga agcggcactg taatacaaga 480
cacacagtga tggggatcgg tttcgctgaa ggtgtgacca tgggccatca ggtgctggtg 540cacacagtga tggggatcgg tttcgctgaa ggtgtgacca tgggccatca ggtgctggtg 540
cagctggaaa gtgttgccat cactatcgtg tggtctggcg tggtggcctt tattggttac 600cagctggaaa gtgttgccat cactatcgtg tggtctggcg tggtggcctt tattggttac 600
aaactggcgg acatgacggt aggcctgcgc gtaccggaag aacaagaacg tgaagggctg 660aaactggcgg acatgacggt aggcctgcgc gtaccggaag aacaagaacg tgaagggctg 660
gatgtaaaca gccacggcga aaacgcctat aacgcctgat tgcgttgagt tatctcctga 720gatgtaaaca gccacggcga aaacgcctat aacgcctgat tgcgttgagt tatctcctga 720
gcataaaaaa gcctccattc ggaggctttt ctttttttaa gtttaaagcg cggttagttg 780gcataaaaaa gcctccattc ggaggctttt cttttttttaa gtttaaagcg cggttagttg 780
cgattgcgca tgacgccttc ctgcacgctg gacgcgacca gcacaccctc ttgcgtatag 840cgattgcgca tgacgccttc ctgcacgctg gacgcgacca gcacaccctc ttgcgtatag 840
aactcgccgc gcacaaaacc gcgagcgctg gaggctgacg tgctttccac actgtagagc 900aactcgccgc gcacaaaacc gcgagcgctg gaggctgacg tgctttccac actgtagagc 900
agccattcgt tcatattaaa cgggcgatgg aaccacatgg agtggtcaat ggtggcaacc 960agccattcgt tcatattaaa cgggcgatgg aaccacatgg agtggtcaat ggtggcaacc 960
tgcataccgc gctcaaggaa gcccacgccg tgcggctgaa gtgcaaccgg caggaagtta 1020tgcataccgc gctcaaggaa gcccacgccg tgcggctgaa gtgcaaccgg caggaagtta 1020
aagtctgagg catatccaag cagatattga tgtacgcgaa aatcgtccgg caccgtgccg 1080aagtctgagg catatccaag cagatattga tgtacgcgaa aatcgtccgg caccgtgccg 1080
tttgcgcgga tccatacctg gcgggtggga tcggcaacgt ggcctttcag cgggttatga 11401140
aactcaaccg ggcggatctc cagtggttta tcactaagaa acttctcttt ggcctgcgg 1199aactcaaccg ggcggatctc cagtggttta tcactaagaa acttctcttt ggcctgcgg 1199
<210> 253<210> 253
<211> 1563<211> 1563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-1<223> glnE-delta-AR-1
<400> 253<400> 253
atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc cggaagatgc gctttctgag 60
agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg attccacgcc cgtgctggcg 120
catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga ttgccgattt tcgcaaagag 180
ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac tcgatcactt aatgccgcat 240
ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac cgctgtcacg cctgacgccg 300
ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc tgctaagtga atttcccggc 360
gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 420
cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata cgctctatca accgacggcg 480
atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc gcgtgccgga agatgatgaa 540atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc gcgtgccgga agatgatgaa 540
gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc agttgctgcg cgtggcggcg 600
gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg atcacttaac ctggctggcg 660
gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc agatggtggc gcgttatggc 720
cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg cggtggtcgg ttatggcaag 780
ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc tggtattcct gcacgactgc 840
ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg gtcgccagtt ctatttgcgt 900
ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt cgtccggcat cctttatgaa 960
gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc tggtcactac tacggaatcg 1020
ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac atcaggcgct ggcccgtgcg 1080
cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg acgccattcg ccgcgatatt 1140
ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg tgcgagaaat gcgcgagaaa 1200
atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg atctgaaagc cgatgaaggc 1260
ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc tgcgctttgc ccatgacaag 1320
ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg aagggctggc gcaaaacggc 1380
atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt acaccacatt gcgtgatgag 1440
ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg cgctctcctg ttttgtcgcc 1500
gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg tggaaccgtg cgccccggcg 15601560 gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac
taa 1563taa 1563
<210> 254<210> 254
<211> 2563<211> 2563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-1 with a 500 bp flanking region.
<400> 254<400> 254
gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60gcgcaaagcg agtgctcact tacgtgatct gttgacacaa tctgaagcga ccataacttc 60
tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120tgccgtttca gcgaatacgg cggtgtggag cgcacaatca gccctggcga agctggtgct 120
caccgagtgg ctagtgacgc agggctggcg aaccttcctt gatgaaaaag cgcaggccaa 180caccgagtgg ctagtgacgc agggctggcg aaccttcctt gatgaaaaag cgcaggccaa 180
attcgccgac tcctttaaac gctttgctga catccatctg tcacgcagcg ccgccgagct 240attcgccgac tcctttaaac gctttgctga catccatctg tcacgcagcg ccgccgagct 240
gaaaaaagcc tttgcccaac cgctgggcga cagctatcgc gaccagttgc cgcgcctggc 300gaaaaaagcc tttgcccaac cgctgggcga cagctatcgc gaccagttgc cgcgcctggc 300
gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360gcgtgatatc gactgcgcgt tactgctggc cgggcattac gatcgcgcgc gcgccgtgga 360
atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420atggctggaa aactggcagg ggcttcagca cgccattgaa acgcgccaga gagtcgaaat 420
cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480cgaacatttc cgtaataccg cgattaccca ggagccgttc tggttgcaca gcggaaaacg 480
ttaacgaaag gatatttcgc atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc 540ttaacgaaag gatatttcgc atgtttaacg atctgattgg cgatgatgaa acggattcgc 540
cggaagatgc gctttctgag agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg 600cggaagatgc gctttctgag agctggcgcg aattgtggca ggatgcgttg caggaggagg 600
attccacgcc cgtgctggcg catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga 660attccacgcc cgtgctggcg catctctcag aggacgatcg ccgccgcgtg gtggcgctga 660
ttgccgattt tcgcaaagag ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac 720ttgccgattt tcgcaaagag ttggataaac gcaccattgg cccgcgaggg cggcaggtac 720
tcgatcactt aatgccgcat ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac 780tcgatcactt aatgccgcat ctgctcagcg atgtatgctc gcgcgacgat gcgccagtac 780
cgctgtcacg cctgacgccg ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc 840cgctgtcacg cctgacgccg ctgctcaccg gaattattac ccgcaccact taccttgagc 840
tgctaagtga atttcccggc gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga 900tgctaagtga atttcccggc gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga 900
tggttgccag tcagctggcg cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata 960tggttgccag tcagctggcg cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata 960
cgctctatca accgacggcg atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc 1020cgctctatca accgacggcg atgaatgcct atcgcgatga gctgcgccaa tacctgctgc 1020
gcgtgccgga agatgatgaa gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc 1080gcgtgccgga agatgatgaa gagcaacagc ttgaggcgct gcggcagttt aagcaggcgc 1080
agttgctgcg cgtggcggcg gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg 1140agttgctgcg cgtggcggcg gcggatattg ccggtacgtt gccagtaatg aaagtgagcg 1140
atcacttaac ctggctggcg gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc 1200atcacttaac ctggctggcg gaagcgatta ttgatgcggt ggtgcagcaa gcctgggggc 1200
agatggtggc gcgttatggc cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg 1260agatggtggc gcgttatggc cagccaacgc atctgcacga tcgcgaaggg cgcggttttg 1260
cggtggtcgg ttatggcaag ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc 1320cggtggtcgg ttatggcaag ctgggcggct gggagctggg ttacagctcc gatctggatc 1320
tggtattcct gcacgactgc ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg 1380tggtattcct gcacgactgc ccgatggatg tgatgaccga tggcgagcgt gaaatcgatg 1380
gtcgccagtt ctatttgcgt ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt 1440gtcgccagtt ctatttgcgt ctcgcgcagc gcgtgatgca cctgtttagc acgcgcacgt 1440
cgtccggcat cctttatgaa gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc 1500cgtccggcat cctttatgaa gttgatgcgc gtctgcgtcc atctggcgct gcggggatgc 1500
tggtcactac tacggaatcg ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac 1560tggtcactac tacggaatcg ttcgccgatt accagcaaaa cgaagcctgg acgtgggaac 1560
atcaggcgct ggcccgtgcg cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg 1620atcaggcgct ggcccgtgcg cgcgtggtgt acggcgatcc gcaactgacc gccgaatttg 1620
acgccattcg ccgcgatatt ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg 1680acgccattcg ccgcgatatt ctgatgacgc ctcgcgacgg cgcaacgctg caaaccgacg 1680
tgcgagaaat gcgcgagaaa atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg 1740tgcgagaaat gcgcgagaaa atgcgtgccc atcttggcaa caagcataaa gaccgcttcg 1740
atctgaaagc cgatgaaggc ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc 1800atctgaaagc cgatgaaggc ggtatcaccg acatcgagtt tatcgcccaa tatctggtgc 1800
tgcgctttgc ccatgacaag ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg 1860tgcgctttgc ccatgacaag ccgaaactga cgcgctggtc ggataatgtg cgcattctcg 1860
aagggctggc gcaaaacggc atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt 1920aagggctggc gcaaaacggc atcatggagg agcaggaagc gcaggcattg acgctggcgt 1920
acaccacatt gcgtgatgag ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg 1980acaccacatt gcgtgatgag ctgcaccacc tggcgctgca agagttgccg ggacatgtgg 1980
cgctctcctg ttttgtcgcc gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg 2040cgctctcctg ttttgtcgcc gagcgtgcgc ttattaaaac cagctgggac aagtggctgg 2040
tggaaccgtg cgccccggcg taagtgtggt atcatcgcgc gcaaattttg tatctctcag 2100tggaaccgtg cgccccggcg taagtgtggt atcatcgcgc gcaaattttg tatctctcag 2100
gagacaggaa tgaaagtgac gctgccagag tttaagcaag ccggtgtaat ggtggtgggt 2160gagacaggaa tgaaagtgac gctgccagag tttaagcaag ccggtgtaat ggtggtgggt 2160
gatgtgatgc tggatcgtta ctggtatggc ccaaccagcc gtatctctcc ggaagcgcca 2220gatgtgatgc tggatcgtta ctggtatggc ccaaccagcc gtatctctcc ggaagcgcca 2220
gtcccggttg ttaaagtcga taccattgaa gagcgtcctg gcggcgcggc aaacgtggcg 2280gtcccggttg ttaaagtcga taccattgaa gagcgtcctg gcggcgcggc aaacgtggcg 2280
atgaatatcg cctcactggg cgccacggcg cgtctggttg gcctgactgg cattgacgat 2340atgaatatcg cctcactggg cgccacggcg cgtctggttg gcctgactgg cattgacgat 2340
gcggcgcgcg cgctgagcaa agcgctggcc gatgttaacg ttaaatgtga cttcgtttct 2400gcggcgcgcg cgctgagcaa agcgctggcc gatgttaacg ttaaatgtga cttcgtttct 2400
gttccgacgc atcccaccat cactaagctg cgcgtgctgt cgcgtaacca gcagctgatt 2460gttccgacgc atcccaccat cactaagctg cgcgtgctgt cgcgtaacca gcagctgatt 2460
cgcctggact ttgaagaggg ttttgaagga gtcgatccgc aaccgatgca tgaacgcatc 2520cgcctggact ttgaagaggg ttttgaagga gtcgatccgc aaccgatgca tgaacgcatc 2520
agccaggcgc ttggtaatat tggcgcgctg gtgctgtcgg att 2563agccaggcgc ttggtaatat tggcgcgctg gtgctgtcgg att 2563
<210> 255<210> 255
<211> 461<211> 461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1<223> delta-nifL::Prm1
<400> 255<400> 255
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga 60
ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa 120
aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct aagatgaatc cgatggaagc 180
tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa 240240
cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta 300
atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac 360
taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg gggaagttgc ctgaccctac 420
gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg a 461
<210> 256<210> 256
<211> 1461<211> 1461
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm1 with a 500 bp flanking region.
<400> 256<400> 256
accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60accggatacg agagaaaagt gtctacatcg gttcggttga tattgaccgg cgcatccgcc 60
agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120agcccgccca gtttctggtg gatctgtttg gcgattttgc gggtcttgcc ggtgtcggtg 120
ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180ccgaaaaaaa taccaatatt tgccataaca cacgctcctg ttgaaaaaga gatcccgccg 180
ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240ggaaatgcgg tgaacgtgtc tgatattgcg aagagtgtgc cagttttggt cgcgggcaaa 240
acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300acctgcacca gtttggttat taatgcacca gtctggcgct ttttttcgcc gagtttctcc 300
tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360tcgctaatgc ccgccaggcg cggctttggc gctgatagcg cgctgaatac cgatctggat 360
caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420caaggttttg tcgggttatc agccaaaagg tgcactcttt gcatggttat acgtgcctga 420
catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480catgttgtcc gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta 480
actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540actgaccgca ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa 540
taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600taataaccgg acaattcggga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc 600
ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg gccattatct 660
aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt ttattgaaag 720
tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa aaatattctc 780
aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc aatctagagg 840
gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgcaa ctcacttcac accccgaagg 900
gggaagttgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960gggaagttgc ctgaccctac gattcccgct atttcattca ctgaccggag gttcaaaatg 960
acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020acccagcgaa ccgagtcggg taataccgtc tggcgcttcg atttgtccca gcagttcact 1020
gcgatgcagc gcataagcgt ggtactcagc cgggcgaccg aggtcgatca gacgctccag 1080gcgatgcagc gcataagcgt ggtactcagc cgggcgaccg aggtcgatca gacgctccag 1080
caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc tttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140caagtgctgt gcgtattgca caatgacgcc ttttgcagc acggcatgat ctgtctgtac 1140
gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200gacagccagc aggcgatttt gaatattgaa gcgttgcagg aagccgatca gcagttaatc 1200
cccggcagct cgcaaatccg ctatcgtccg ggcgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260cccggcagct cgcaaatccg ctatcgtccg ggcgaagggc tggtcgggac ggtgctttcg 1260
cagggccaat cattagtgct ggcgcgcgtt gctgacgatc agcgctttct tgaccggctc 1320cagggccaat cattagtgct ggcgcgcgtt gctgacgatc agcgctttct tgaccggctc 1320
gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380gggttgtatg attacaacct gccgtttatc gccgtgccgc tgatagggcc agatgcgcag 1380
actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440actttcggtg tgctgacggc acaacccatg gcgcgttacg aagagcgatt acccgcctgc 1440
acccgctttc tggaaacggt c 1461acccgctttc tggaaacggt c 1461
<210> 257<210> 257
<211> 199<211> 199
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-amtB<223> delta-amtB
<400> 257<400> 257
tttcgctgaa ggtgtgacca tgggccatca ggtgctggtg cagctggaaa gtgttgccat 60tttcgctgaa ggtgtgacca tgggccatca ggtgctggtg cagctggaaa gtgttgccat 60
cactatcgtg tggtctggcg tggtggcctt tattggttac aaactggcgg acatgacggt 120cactatcgtg tggtctggcg tggtggcctt tattggttac aaactggcgg acatgacggt 120
aggcctgcgc gtaccggaag aacaagaacg tgaagggctg gatgtaaaca gccacggcga 180aggcctgcgc gtaccggaag aacaagaacg tgaagggctg gatgtaaaca gccacggcga 180
aaacgcctat aacgcctga 199aaacgcctat aacgcctga 199
<210> 258<210> 258
<211> 1199<211> 1199
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-amtB с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-amtB with a 500 bp flanking region.
<400> 258<400> 258
tttcctttct gactctgccc gtccgggcgc actaacggcc tgaaatactc cctcttttca 60tttcctttct gactctgcc gtccgggcgc actaacggcc tgaaatactc cctcttttca 60
ttcctggcac aacgattgca atgtctgttg cgtgttagct gcggccatta tcgaattcga 120ttcctggcac aacgattgca atgtctgttg cgtgttagct gcggccatta tcgaattcga 120
ctggaggggg atctatgaag ctggttaccg tggtgattaa gccattcaaa cttgaagacg 180ctggaggggg atctatgaag ctggttaccg tggtgattaa gccattcaaa cttgaagacg 180
tgcgtgaagc gctttcttct attggtattc aagggttgac cgtaactgaa gtgaaaggct 240tgcgtgaagc gctttcttct attggtattc aagggttgac cgtaactgaa gtgaaaggct 240
ttggccgtca gaagggtcac gctgagctgt accgcggtgc ggaatatagc gttaatttcc 300ttggccgtca gaagggtcac gctgagctgt accgcggtgc ggaatatagc gttaatttcc 300
tgccgaaagt gaaaattgat gtggcgatcg ctgacgatca actcgatgaa gtaatcgatg 360tgccgaaagt gaaaattgat gtggcgatcg ctgacgatca actcgatgaa gtaatcgatg 360
tgatcagcaa agcggcctac accggaaaaa ttggcgacgg caaaattttc gttgctgagc 420tgatcagcaa agcggcctac accggaaaaa ttggcgacgg caaaattttc gttgctgagc 420
tgcaacgcgt cattcgtatt cgtaccggcg aagccgacga agcggcactg taatacaaga 480tgcaacgcgt cattcgtatt cgtaccggcg aagccgacga agcggcactg taatacaaga 480
cacacagtga tggggatcgg tttcgctgaa ggtgtgacca tgggccatca ggtgctggtg 540cacacagtga tggggatcgg tttcgctgaa ggtgtgacca tgggccatca ggtgctggtg 540
cagctggaaa gtgttgccat cactatcgtg tggtctggcg tggtggcctt tattggttac 600cagctggaaa gtgttgccat cactatcgtg tggtctggcg tggtggcctt tattggttac 600
aaactggcgg acatgacggt aggcctgcgc gtaccggaag aacaagaacg tgaagggctg 660aaactggcgg acatgacggt aggcctgcgc gtaccggaag aacaagaacg tgaagggctg 660
gatgtaaaca gccacggcga aaacgcctat aacgcctgat tgcgttgagt tatctcctga 720gatgtaaaca gccacggcga aaacgcctat aacgcctgat tgcgttgagt tatctcctga 720
gcataaaaaa gcctccattc ggaggctttt ctttttttaa gtttaaagcg cggttagttg 780gcataaaaaa gcctccattc ggaggctttt cttttttttaa gtttaaagcg cggttagttg 780
cgattgcgca tgacgccttc ctgcacgctg gacgcgacca gcacaccctc ttgcgtatag 840cgattgcgca tgacgccttc ctgcacgctg gacgcgacca gcacaccctc ttgcgtatag 840
aactcgccgc gcacaaaacc gcgagcgctg gaggctgacg tgctttccac actgtagagc 900aactcgccgc gcacaaaacc gcgagcgctg gaggctgacg tgctttccac actgtagagc 900
agccattcgt tcatattaaa cgggcgatgg aaccacatgg agtggtcaat ggtggcaacc 960agccattcgt tcatattaaa cgggcgatgg aaccacatgg agtggtcaat ggtggcaacc 960
tgcataccgc gctcaaggaa gcccacgccg tgcggctgaa gtgcaaccgg caggaagtta 1020tgcataccgc gctcaaggaa gcccacgccg tgcggctgaa gtgcaaccgg caggaagtta 1020
aagtctgagg catatccaag cagatattga tgtacgcgaa aatcgtccgg caccgtgccg 1080aagtctgagg catatccaag cagatattga tgtacgcgaa aatcgtccgg caccgtgccg 1080
tttgcgcgga tccatacctg gcgggtggga tcggcaacgt ggcctttcag cgggttatga 11401140
aactcaaccg ggcggatctc cagtggttta tcactaagaa acttctcttt ggcctgcgg 1199aactcaaccg ggcggatctc cagtggttta tcactaagaa acttctcttt ggcctgcgg 1199
<210> 259<210> 259
<211> 607<211> 607
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::PinfC<223> delta-nifL::PinfC
<400> 259<400> 259
atgaccttta atatgatgcc tggggtcact ggagcgcttt atcggcatcc tgaccgaaga 60atgaccttta atatgatgcc tggggtcact ggagcgcttt atcggcatcc tgaccgaaga 60
atttgccggt ttcttcccga cctggctggc ccctgttcag gttgtggtga tgaatatcac 120atttgccggt ttcttcccga cctggctggc ccctgttcag gttgtggtga tgaatatcac 120
tgattctcaa gctgaatatg tcaacgaatt gacccgtaaa ttgcaaaatg cgggcattcg 180tgattctcaa gctgaatatg tcaacgaatt gacccgtaaa ttgcaaaatg cgggcattcg 180
tgtaaaagcg gacttgagaa acgagaagat tggctttaaa atccgcgagc acactttacg 240tgtaaaagcg gacttgagaa acgagaagat tggctttaaa atccgcgagc acactttacg 240
tcgtgtccct tatatgttgg tctgtggtga taaagaggtg gaagcaggca aagtggccgt 300tcgtgtccct tatatgttgg tctgtggtga taaagaggtg gaagcaggca aagtggccgt 300
tcgcacccgc cgcggtaaag acctgggcag cctggacgta agtgaagtga ttgagaagct 360tcgcacccgc cgcggtaaag acctgggcag cctggacgta agtgaagtga ttgagaagct 360
gcaacaagag attcgcagcc gcagtcttca acaactggag gaataaggta ttaaaggcgg 420gcaacaagag attcgcagcc gcagtcttca acaactggag gaataaggta ttaaaggcgg 420
aaaacgagtt caaacggcac gtccgaatcg tatcaatggc gagattcgcg cccaggaagt 480aaaacgagtt caaacggcac gtccgaatcg tatcaatggc gagattcgcg ccggaagt 480
tcgcttaact ggtctggaag gtgagcagct gggtattgca atagaactaa ctacccgccc 540tcgcttaact ggtctggaag gtgagcagct gggtattgca atagaactaa ctacccgccc 540
tgaaggcggt acctgcctga ccctgcgatt cccgttattt cattcactga ccggaggccc 600tgaaggcggt acctgcctga ccctgcgatt cccgttattt cattcactga ccggaggccc 600
acgatga 607acgatga 607
<210> 260<210> 260
<211> 1607<211> 1607
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::PinfC с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::PinfC with a 500 bp flanking region.
<400> 260<400> 260
ggtacgacaa aaacgtctcc agcgacgtgc ggttaatatt gactggcgca tccgccacat 60ggtacgacaa aaacgtctcc agcgacgtgc ggttaatatt gactggcgca tccgccacat 60
cccccagttt ttgctggatc agtttggcga ttttgcgggt ttttcccgtg tcactgccaa 120cccccagttt ttgctggatc agtttggcga ttttgcgggt ttttcccgtg tcactgccaa 120
aaaaaatacc aatgttagcc atgtcgcgct cctgttgaga aagaataagg ccgcctgcaa 180aaaaaatacc aatgttagcc atgtcgcgct cctgttgaga aagaataagg ccgcctgcaa 180
acggcggata tcccttctcc tgttgcgaag gctgtgccag gtttttttaa ggccttctgt 240acggcggata tcccttctcc tgttgcgaag gctgtgccag gtttttttaa ggccttctgt 240
gcactgaaat gggtgaaaaa atgactcttt tttgtgcagg caccgtcctc tctccgctat 300gcactgaaat gggtgaaaaa atgactcttt tttgtgcagg caccgtcctc tctccgctat 300
ccagacctgc tttgaaggcc tctgagggcc aaatcagggc caaaacacga atcaggatca 360ccagacctgc tttgaaggcc tctgaggggcc aaatcagggc caaaacacga atcaggatca 360
atgtttcggc gcgttacctg ttcgaaaggt gcactctttg catggttaat cacacccaat 420atgtttcggc gcgttacctg ttcgaaaggt gcactctttg catggttaat cacacccaat 420
cagggctgcg gatgtcgggc gtttcacaac acaaaatgtt gtaaatgcga cacagccggg 480cagggctgcg gatgtcgggc gtttcacaac acaaaatgtt gtaaatgcga cacagccggg 480
cctgaaacca ggagcgtgtg atgaccttta atatgatgcc tggggtcact ggagcgcttt 540cctgaaacca ggagcgtgtg atgaccttta atatgatgcc tggggtcact ggagcgcttt 540
atcggcatcc tgaccgaaga atttgccggt ttcttcccga cctggctggc ccctgttcag 600atcggcatcc tgaccgaaga atttgccggt ttcttcccga cctggctggc ccctgttcag 600
gttgtggtga tgaatatcac tgattctcaa gctgaatatg tcaacgaatt gacccgtaaa 660gttgtggtga tgaatatcac tgattctcaa gctgaatatg tcaacgaatt gacccgtaaa 660
ttgcaaaatg cgggcattcg tgtaaaagcg gacttgagaa acgagaagat tggctttaaa 720ttgcaaaatg cgggcattcg tgtaaaagcg gacttgagaa acgagaagat tggctttaaa 720
atccgcgagc acactttacg tcgtgtccct tatatgttgg tctgtggtga taaagaggtg 780atccgcgagc acactttacg tcgtgtccct tatatgttgg tctgtggtga taaagaggtg 780
gaagcaggca aagtggccgt tcgcacccgc cgcggtaaag acctgggcag cctggacgta 840gaagcaggca aagtggccgt tcgcacccgc cgcggtaaag acctgggcag cctggacgta 840
agtgaagtga ttgagaagct gcaacaagag attcgcagcc gcagtcttca acaactggag 900agtgaagtga ttgagaagct gcaacaagag attcgcagcc gcagtcttca acaactggag 900
gaataaggta ttaaaggcgg aaaacgagtt caaacggcac gtccgaatcg tatcaatggc 960gaataaggta ttaaaggcgg aaaacgagtt caaacggcac gtccgaatcg tatcaatggc 960
gagattcgcg cccaggaagt tcgcttaact ggtctggaag gtgagcagct gggtattgca 1020gagattcgcg cccaggaagt tcgcttaact ggtctggaag gtgagcagct gggtattgca 1020
atagaactaa ctacccgccc tgaaggcggt acctgcctga ccctgcgatt cccgttattt 1080atagaactaa ctacccgccc tgaaggcggt acctgcctga ccctgcgatt cccgttattt 1080
cattcactga ccggaggccc acgatgaccc agcgacccga gtcgggcacc accgtctggc 1140cattcactga cgggaggccc acgatgaccc agcgacccga gtcgggcacc accgtctggc 1140
gttttgatct ctcacagcaa tttaccgcca tgcagcgcat cagcgtggtg ttgagtcgcg 1200gttttgatct ctcacagcaa tttaccgcca tgcagcgcat cagcgtggtg ttgagtcgcg 1200
caaccgagat aagccagacg ctgcaggagg tgctgtgtgt tctgcataat gacgcattta 12601260
tgcaacacgg catgctgtgt ctgtatgaca accagcagga aattctgagt attgaagcct 1320tgcaacacgg catgctgtgt ctgtatgaca accagcagga aattctgagt attgaagcct 1320
tgcaggaggc agaccaacat ctgatccccg gcagctcgca aattcgctat cgccctggcg 1380tgcaggaggc agaccaacat ctgatccccg gcagctcgca aattcgctat cgccctggcg 1380
aagggctggt aggagccgta ctgtcccagg gacaatctct tgtgctgccg cgtgtcgccg 1440aagggctggt aggagccgta ctgtcccagg gacaatctct tgtgctgccg cgtgtcgccg 1440
acgatcaacg ctttctcgac aggcttggca tctatgatta caacctgccg tttatcgccg 1500acgatcaacg ctttctcgac aggcttggca tctatgatta caacctgccg tttatcgccg 1500
tccccttaat ggggccaggc gcgcagacga ttggcgtgct cgccgcgcag ccgatggcgc 1560tccccttaat ggggccaggc gcgcagacga ttggcgtgct cgccgcgcag ccgatggcgc 1560
gtctggagga gcggcttcct tcctgtacgc gctttctgga aaccgtc 1607gtctggagga gcggcttcct tcctgtacgc gctttctgga aaccgtc 1607
<210> 261<210> 261
<211> 1536<211> 1536
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> 16S-1<223> 16S-1
<400> 261<400> 261
ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60
gaacggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct 120gaacggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct 120
gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180
cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc agatgtgccc agatgggatt 240cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc agatgtgccc agatgggatt 240
agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300
accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360
attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420
ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggg agtaaggtta ataaccttat tcattgacgt 480ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggg agtaaggtta ataaccttat tcattgacgt 480
tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc 540tacccgcaga agaagcaccg gctaactccg tgccagcagc cgcggtaata cggagggtgc 540
aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggtctgtca agtcggatgt 600aagcgttaat cggaattact gggcgtaaag cgcacgcagg cggtctgtca agtcggatgt 600
gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca tccgaaactg gcaggcttga gtctcgtaga 660gaaatccccg ggctcaacct gggaactgca tccgaaactg gcaggcttga gtctcgtaga 660
gggaggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg 720gggaggtaga attccaggtg tagcggtgaa atgcgtagag atctggagga ataccggtgg 720
cgaaggcggc ctcctggacg aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag 780cgaaggcggc ctcctggacg aagactgacg ctcaggtgcg aaagcgtggg gagcaaacag 780
gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcta tttggaggtt gtgcccttga 840gattagatac cctggtagtc cacgccgtaa acgatgtcta tttggaggtt gtgcccttga 840
ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaaat agaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt 900ggcgtggctt ccggagctaa cgcgttaaat agaccgcctg gggagtacgg ccgcaaggtt 900
aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat 960aaaactcaaa tgaattgacg ggggcccgca caagcggtgg agcatgtggt ttaattcgat 960
gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atccacagaa ctttccagag atggattggt 1020gcaacgcgaa gaaccttacc tggtcttgac atccacagaa ctttccagag atggattggt 1020
gccttcggga actgtgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt 1080gccttcggga actgtgagac aggtgctgca tggctgtcgt cagctcgtgt tgtgaaatgt 1080
tgggttaagt cccgcaacga gcgcaaccct tatcctttgt tgccagcggt ccggccggga 11401140
actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat 1200actcaaagga gactgccagt gataaactgg aggaaggtgg ggatgacgtc aagtcatcat 1200
ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggcgc atacaaagag aagcgacctc 1260ggcccttacg accagggcta cacacgtgct acaatggcgc atacaaagag aagcgacctc 1260
gcgagagtaa gcggacctca taaagtgcgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac 1320gcgagagtaa gcggacctca taaagtgcgt cgtagtccgg attggagtct gcaactcgac 1320
tccatgaagt cggaatcgct agtaatcgtg gatcagaatg ccacggtgaa tacgttcccg 13801380
ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagctt 1440ggccttgtac acaccgcccg tcacaccatg ggagtgggtt gcaaaagaag taggtagctt 1440
aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg 1500aaccttcggg agggcgctta ccactttgtg attcatgact ggggtgaagt cgtaacaagg 1500
taaccgtagg ggaacctgcg gttggatcac ctcctt 1536taaccgtagg ggaacctgcg gttggatcac ctcctt 1536
<210> 262<210> 262
<211> 1537<211> 1537
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> 16S-2<223> 16S-2
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (450)..(450)<222> (450)..(450)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (452)..(452)<222> (452)..(452)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (455)..(455)<222> (455)..(455)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (473)..(473)<222> (473)..(473)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 262<400> 262
ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60ttgaagagtt tgatcatggc tcagattgaa cgctggcggc aggcctaaca catgcaagtc 60
gaacggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct 120gaacggtagc acagagagct tgctctcggg tgacgagtgg cggacgggtg agtaatgtct 120
gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180gggaaactgc ctgatggagg gggataacta ctggaaacgg tagctaatac cgcataacgt 180
cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc agatgtgccc agatgggatt 240cgcaagacca aagaggggga ccttcgggcc tcttgccatc agatgtgccc agatgggatt 240
agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300agctagtagg tggggtaacg gctcacctag gcgacgatcc ctagctggtc tgagaggatg 300
accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360accagccaca ctggaactga gacacggtcc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 360
attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420attgcacaat gggcgcaagc ctgatgcagc catgccgcgt gtgtgaagaa ggccttcggg 420
ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggn antanggtta ataacctgtg ttnattgacg 480ttgtaaagca ctttcagcgg ggaggaaggn antanggtta ataacctgtg ttnattgacg 480
ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540
caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600
tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc atccgaaact ggcaggcttg agtctcgtag 660tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc atccgaaact ggcaggcttg agtctcgtag 660
agggaggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720agggaggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720
gcgaaggcgg cctcctggac gaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780gcgaaggcgg ccctcctggac gaagactgac gctcaggtgc gaaagcgtgg ggagcaaaca 780
ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtct atttggaggt tgtgcccttg 840ggattagata ccctggtagt ccacgccgta aacgatgtct atttggaggt tgtgcccttg 840
aggcgtggct tccggagcta acgcgttaaa tagaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900aggcgtggct tccggagcta acgcgttaaa tagaccgcct ggggagtacg gccgcaaggt 900
taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960
tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacaga acttagcaga gatgctttgg 1020tgcaacgcga agaaccttac ctggtcttga catccacaga acttagcaga gatgctttgg 1020
tgccttcggg aactgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080tgccttcggg aactgtgaga caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg ttgtgaaatg 1080
ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg ttaggccggg 1140ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg ttgccagcgg ttaggccggg 1140
aactcaaagg agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca 1200aactcaaagg agactgccag tgataaactg gaggaaggtg gggatgacgt caagtcatca 1200
tggcccttac gaccagggct acacacgtgc tacaatggcg catacaaaga gaagcgacct 1260tggcccttac gaccaggggct acacacgtgc tacaatggcg catacaaaga gaagcgacct 1260
cgcgagagta agcggacctc ataaagtgcg tcgtagtccg gattggagtc tgcaactcga 13201320 cgcgagagta agcggacctc ataaagtgcg tcgtagtccg
ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc 1380ctccatgaag tcggaatcgc tagtaatcgt ggatcagaat gccacggtga atacgttccc 1380
gggccttgta cacaccgccc gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa gtaggtagct 1440gggccttgta cacaccgcc gtcacaccat gggagtgggt tgcaaaagaa gtaggtagct 1440
taaccttcgg gagggcgctt accactttgt gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag 1500taaccttcgg gagggcgctt accactttgt gattcatgac tggggtgaag tcgtaacaag 1500
gtaaccgtag gggaacctgc ggttggatca cctcctt 1537gtaaccgtag gggaacctgc ggttggatca ccttcctt 1537
<210> 263<210> 263
<211> 882<211> 882
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> nifH<223> nifH
<400> 263<400> 263
atgaccatgc gtcaatgcgc catttacggc aaaggtggga tcggcaaatc gaccaccaca 60atgaccatgc gtcaatgcgc catttacggc aaaggtggga tcggcaaatc gaccaccaca 60
cagaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggtaaaaaag tcatgattgt cggctgtgac 120cagaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggtaaaaaag tcatgattgt cggctgtgac 120
ccgaaagccg attccacgcg tttgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180ccgaaagccg attccacgcg tttgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180
atggctgctg aagtcggctc cgtggaagac ctggagttag aagacgtgct gcaaatcggt 240atggctgctg aagtcggctc cgtggaagac ctggagttag aagacgtgct gcaaatcggt 240
tacggcggcg tgcgctgcgc agagtccggc ggcccggagc caggcgtggg ctgtgccggt 300tacggcggcg tgcgctgcgc agagtccggc ggcccggagc caggcgtggg ctgtgccggt 300
cgcggggtga tcaccgcgat taacttcctc gaagaagaag gcgcttacgt gccggatctc 360cgcggggtga tcaccgcgat taacttcctc gaagaagaag gcgcttacgt gccggatctc 360
gattttgttt tctacgacgt gctgggcgac gtggtatgcg gtggtttcgc catgccgatt 420gtggttgcg gtggtttcgc catgccgatt 420
cgtgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtttgctctg gcgaaatgat ggcgatgtac 480cgtgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtttgctctg gcgaaatgat ggcgatgtac 480
gccgccaaca acatctccaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggtaa agtgcgcctc 540gccgccaaca acatctccaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggtaa agtgcgcctc 540
ggcgggctga tttgtaactc gcgccagacc gaccgtgaag atgaactgat cattgcgctg 600ggcgggctga tttgtaactc gcgccagacc gaccgtgaag atgaactgat cattgcgctg 600
gcagaaaaac tcggcacgca gatgatccac tttgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgt 660gcagaaaaac tcggcacgca gatgatccac tttgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgt 660
gcggaaatcc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga cctgcaatca ggcgaacgaa 720gcggaaatcc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga cctgcaatca ggcgaacgaa 720
tatcgcagcc ttgccagcaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtgcc caccccctgc 780tatcgcagcc ttgccagcaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtgcc caccccctgc 780
accatggatg aactggaaga actgctgatg gagttcggca ttatggatgt ggaagacacc 840accatggatg aactggaaga actgctgatg gagttcggca ttatggatgt ggaagacacc 840
agcatcattg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgccgtct ga 882agcatcattg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgccgtct ga 882
<210> 264<210> 264
<211> 1449<211> 1449
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> nifD2<223> nifD2
<400> 264<400> 264
atgagcaatg caacaggcga acgcaacctg gagataatcg agcaggtgct cgaggttttc 60atgagcaatg caacaggcga acgcaacctg gagataatcg agcaggtgct cgaggttttc 60
ccggagaaga cgcgcaaaga acgcagaaaa cacatgatgg tgacggaccc ggagcaggaa 120ccggagaaga cgcgcaaaga acgcagaaaa cacatgatgg tgacggaccc ggagcaggaa 120
agcgtcggta agtgcatcat ctctaaccgc aaatcgcagc caggcgtgat gaccgtgcgc 180agcgtcggta agtgcatcat ctctaaccgc aaatcgcagc caggcgtgat gaccgtgcgc 180
ggctgctcgt atgccggttc gaaaggggtg gtatttgggc caatcaagga tatggcgcat 240ggctgctcgt atgccggttc gaaaggggtg gtatttgggc caatcaagga tatggcgcat 240
atctcgcatg gcccaatcgg ctgcggccaa tactcccgcg ccgggcggcg gaactactac 300atctcgcatg gcccaatcgg ctgcggccaa tactcccgcg ccgggcggcg gaactactac 300
accggcgtca gcggcgtgga cagcttcggc acgctcaact tcacctccga ttttcaggag 360accggcgtca gcggcgtgga cagcttcggc acgctcaact tcacctccga ttttcaggag 360
cgcgacatcg tgtttggcgg cgataaaaag ctcgccaaac tgattgaaga gctggaagag 420cgcgacatcg tgtttggcgg cgataaaaag ctcgccaaac tgattgaaga gctggaagag 420
ctgttcccgc tgaccaaagg catttcgatt cagtcggaat gcccggtcgg cctgattggc 480ctgttcccgc tgaccaaagg catttcgatt cagtcggaat gcccggtcgg cctgattggc 480
gatgacattg aggccgtcgc gaacgccagc cgcaaagcca tcaacaaacc ggttattccg 540gatgacattg aggccgtcgc gaacgccagc cgcaaagcca tcaacaaacc ggttattccg 540
gtgcgttgcg aaggctttcg cggcgtgtcg caatccctcg gtcaccatat tgccaacgat 600gtgcgttgcg aaggctttcg cggcgtgtcg caatccctcg gtcaccatat tgccaacgat 600
gtgatccgcg actgggtgct ggataaccgc gaaggcaaac cgttcgaatc caccccttac 660gtgatccgcg actgggtgct ggataaccgc gaaggcaaac cgttcgaatc caccccttac 660
gatgtggcga tcatcggcga ttacaacatc ggcggcgatg cctgggcttc gcgcattttg 720gatgtggcga tcatcggcga ttacaacatc ggcggcgatg cctgggcttc gcgcattttg 720
ctcgaagaga tgggcttgcg ggtggtggca cagtggtctg gcgacggtac gctggtggag 780ctcgaagaga tgggcttgcg ggtggtggca cagtggtctg gcgacggtac gctggtggag 780
atggaaaaca cgccgttcgt caaactgaac ctggtgcatt gttaccgctc aatgaactac 840atggaaaaca cgccgttcgt caaactgaac ctggtgcatt gttaccgctc aatgaactac 840
atctcgcgcc atatggagga gaagcacggt attccgtgga tggaatacaa cttctttggt 900atctcgcgcc atatggagga gaagcacggt attccgtgga tggaatacaa cttctttggt 900
ccgacgaaaa tcgcggaatc gctgcgcaaa atcgccgacc agtttgacga caccattcgc 960ccgacgaaaa tcgcggaatc gctgcgcaaa atcgccgacc agtttgacga caccattcgc 960
gccaacgccg aagcggtgat cgccagatac caggcgcaaa acgacgccat tatcgccaaa 1020gccaacgccg aagcggtgat cgccagatac caggcgcaaa acgacgccat tatcgccaaa 1020
tatcgcccgc gtctggaggg gcgcaaagtg ctgctttata tgggcgggct gcgtccgcgc 1080tatcgcccgc gtctggaggg gcgcaaagtg ctgctttata tgggcgggct gcgtccgcgc 1080
catgtgattg gcgcctatga agacctggga atggagatca tcgctgccgg ttatgagttc 1140catgtgattg gcgcctatga agacctggga atggagatca tcgctgccgg ttatgagttc 1140
ggtcataacg atgattacga ccgcaccttg ccggatctga aagagggcac gctgctgttt 1200ggtcataacg atgattacga ccgcaccttg ccggatctga aagagggcac gctgctgttt 1200
gatgatgcca gcagttatga gctggaggcg ttcgtcaacg cgctgaaacc ggatctcatc 1260gatgatgcca gcagttatga gctggaggcg ttcgtcaacg cgctgaaacc ggatctcatc 1260
ggttccggca tcaaagagaa gtacatcttt cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320ggttccggca tcaaagagaa gtacatcttt cagaaaatgg gcgtgccgtt tcgccagatg 1320
cactcctggg attactccgg cccgtaccac ggctatgacg gcttcgccat cttcgcccgc 1380cactcctggg attactccgg cccgtaccac ggctatgacg gcttcgccat cttcgcccgc 1380
gatatggata tgacgctcaa caaccccgcg tggggccagt tgaccgcgcc gtggctgaaa 1440gatatggata tgacgctcaa caaccccgcg tggggccagt tgaccgcgcc gtggctgaaa 1440
tccgcctga 1449tccgcctga 1449
<210> 265<210> 265
<211> 1563<211> 1563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> nifK2<223> nifK2
<400> 265<400> 265
atgagccaga ctgctgagaa aatacagaat tgccatcccc tgtttgaaca ggatgcttac 60atgagccaga ctgctgagaa aatacagaat tgccatcccc tgtttgaaca ggatgcttac 60
cagacgctgt ttgccggtaa acgggcactc gaagaggcgc actcgccgga gcgggtgcag 120cagacgctgt ttgccggtaa acgggcactc gaagaggcgc actcgccgga gcgggtgcag 120
gaagtgtttc aatggaccac taccccggaa tatgaagcgc tgaactttaa acgcgaagcg 180180
ctgactatcg acccggcaaa agcctgccag ccgctgggcg cggtgctctg ttcgctgggg 240ctgactatcg acccggcaaa agcctgccag ccgctgggcg cggtgctctg ttcgctgggg 240
tttgccaata ccctaccgta tgtgcacggt tcacagggtt gcgtggccta tttccgcacg 300tttgccaata ccctaccgta tgtgcacggt tcacaggggtt gcgtggccta tttccgcacg 300
tactttaacc gccactttaa agaaccggtg gcctgcgtgt cggattcaat gacggaagac 360360
gcggcggtgt tcggcgggaa taacaacctc aacaccggct tacaaaacgc cagcgcgctg 420gcggcggtgt tcggcgggaa taacaacctc aacaccggct tacaaaacgc cagcgcgctg 420
tataaaccgg agattatcgc cgtctctacc acctgtatgg cggaagtgat cggtgatgat 480tataaaccgg agattatcgc cgtctctacc acctgtatgg cggaagtgat cggtgatgat 480
ttgcaggcct ttatcgccaa cgccaaaaaa gatggttttc tcgatgccgc catccccgtg 540ttgcaggcct ttatcgccaa cgccaaaaaa gatggttttc tcgatgccgc catccccgtg 540
ccctacgcgc acacccccag ttttatcggc agccatatca ccggctggga taacatgttt 600ccctacgcgc acacccccag ttttatcggc agccatatca ccggctggga taacatgttt 600
gaaggttttg cccggacctt tacggcagac catgaagctc agcccggcaa actttcacgc 660gaaggttttg cccggacctt tacggcagac catgaagctc agcccggcaa actttcacgc 660
atcaacctgg tgaccgggtt tgaaacctat ctcggcaatt tccgcgtgct gaaacgcatg 720atcaacctgg tgaccgggtt tgaaacctat ctcggcaatt tccgcgtgct gaaacgcatg 720
atggaacaaa tggaggtgcc ggcgagtgtg ctctccgatc cgtcggaagt gctggatact 780atggaacaaa tggaggtgcc ggcgagtgtg ctctccgatc cgtcggaagt gctggatact 780
cccgccaacg ggcattacca gatgtacgcg ggcgggacga cgcagcaaga gatgcgcgag 840cccgccaacg ggcattacca gatgtacgcg ggcgggacga cgcagcaaga gatgcgcgag 840
gcgccggatg ctatcgacac cctgttgctg cagccctggc aactggtgaa aagcaaaaaa 900gcgccggatg ctatcgacac cctgttgctg cagccctggc aactggtgaa aagcaaaaaa 900
gtggtgcagg agatgtggaa tcagcccgcc accgaggttt ctgttcccgt tgggctggca 960gtggtgcagg agatgtggaa tcagcccgcc accgaggttt ctgttcccgt tgggctggca 960
ggaacagacg aactgttgat ggcgattagc cagttaaccg gcaaggccat tcccgattca 1020ggaacagacg aactgttgat ggcgattagc cagttaaccg gcaaggccat tcccgattca 1020
ctggcgctgg agcgcgggcg gctggtcgat atgatgctcg attcccacac ctggttgcac 1080ctggcgctgg agcgcgggcg gctggtcgat atgatgctcg attcccacac ctggttgcac 1080
ggtaaaaaat tcggcctgtt tggcgatccg gattttgtca tgggattgac ccgtttcctg 1140ggtaaaaaat tcggcctgtt tggcgatccg gattttgtca tgggattgac ccgtttcctg 1140
ctggagctgg gctgcgaacc gaccgttatc ctctgccaca acggtaacaa acgctggcag 1200ctggagctgg gctgcgaacc gaccgttatc ctctgccaca acggtaacaa acgctggcag 1200
aaagcaatga agaaaatgct tgacgcctcg ccgtacggcc aggagagcga agtgtttatc 12601260
aactgcgatt tgtggcattt ccgctcgctg atgtttaccc gccagccgga ttttatgatt 1320aactgcgatt tgtggcattt ccgctcgctg atgtttaccc gccagccgga ttttatgatt 1320
ggcaactcgt acggcaagtt cattcagcgc gacaccttag ccaaaggcga gcagtttgaa 1380ggcaactcgt acggcaagtt cattcagcgc gacaccttag ccaaaggcga gcagtttgaa 1380
gttccgctga tccgcctcgg ttttcccctg ttcgaccgcc accatctgca ccgccagacc 1440gttccgctga tccgcctcgg ttttcccctg ttcgaccgcc accatctgca ccgccagacc 1440
acctggggct acgagggcgc catgagcatt ctcactaccc ttgtgaatgc ggtactggag 1500acctggggct acgagggcgc catgagcatt ctcactaccc ttgtgaatgc ggtactggag 1500
aaagtggaca aagagaccat caagctcggc aaaaccgact acagcttcga tcttatccgt 15601560
taa 1563taa 1563
<210> 266<210> 266
<211> 1488<211> 1488
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> nifL<223> nifL
<400> 266<400> 266
atgaccctga atatgatgat ggatgccggc gcgcccgagg caatcgccgg tgcgctttcg 60atgaccctga atatgatgat ggatgccggc gcgcccgagg caatcgccgg tgcgctttcg 60
cgacaccatc ctgggctgtt ttttaccatc gttgaagaag cgcccgtcgc catttcgctg 120120
actgatgccg acgcacgcat tgtctatgcc aacccggctt tctgccgcca gaccggctat 180actgatgccg acgcacgcat tgtctatgcc aacccggctt tctgccgcca gaccggctat 180
gaactagaag cgttgttgca gcaaaatccc cgcctgcttg caagtcgcca aaccccacgg 240gaactagaag cgttgttgca gcaaaatccc cgcctgcttg caagtcgcca aacccccgg 240
gaaatctatc aggatatgtg gcacaccttg ttacaacgcc gaccgtggcg cgggcaattg 300gaaatctatc aggatatgtg gcacaccttg ttacaacgcc gaccgtggcg cgggcaattg 300
attaaccgcc accgcgacgg cagcctgtat ctggtcgaga tcgatatcac cccggtgatt 360attaaccgcc accgcgacgg cagcctgtat ctggtcgaga tcgatatcac cccggtgatt 360
aacccgtttg gcgaactgga acactacctg gcaatgcagc gcgatatcag cgccagttat 420aacccgtttg gcgaactgga acactacctg gcaatgcagc gcgatatcag cgccagttat 420
gcgctggagc agcggttgcg caatcacatg acgctgaccg aagcggtgct gaataacatt 480gcgctggagc agcggttgcg caatcacatg acgctgaccg aagcggtgct gaataacatt 480
ccggcggcgg tggttgtagt ggatgaacgc gatcatgtgg ttatggataa ccttgcctac 540ccggcggcgg tggttgtagt ggatgaacgc gatcatgtgg ttatggataa ccttgcctac 540
aaaacgttct gtgccgactg cggcggaaaa gagctcctga gcgaactcaa tttttcagcc 600aaaacgttct gtgccgactg cggcggaaaa gagctcctga gcgaactcaa tttttcagcc 600
cgaaaagcgg agctggcaaa cggccaggtc ttaccggtgg tgctgcgcgg tgaggtgcgc 660660
tggttgtcgg tgacctgctg ggcgctgccg ggcgtcagcg aagaagccag tcgctacttt 720tggttgtcgg tgacctgctg ggcgctgccg ggcgtcagcg aagaagccag tcgctacttt 720
attgataaca ggctgacgcg cacgctggtg gtgatcaccg acgacaccca acaacgccag 780attgataaca ggctgacgcg cacgctggtg gtgatcaccg acgacaccca acaacgccag 780
cagcaggaac agggccgact tgaccgcctt aaacagcaga tgaccaacgg caaactactg 840cagcaggaac agggccgact tgaccgcctt aaacagcaga tgaccaacgg caaactactg 840
gcagcgatcc gcgaagcgct tgacgccgcg ctgatccagc ttaactgccc catcaatatg 900gcagcgatcc gcgaagcgct tgacgccgcg ctgatccagc ttaactgccc catcaatatg 900
ctggcggcgg cgcgacgttt aaacggcagt gataacaaca atgtggcgct cgacgccgcg 960ctggcggcgg cgcgacgttt aaacggcagt gataacaaca atgtggcgct cgacgccgcg 960
tggcgcgaag gtgaagaggc gatggcgcgg ctgaaacgtt gccgcccgtc gctggaactg 1020tggcgcgaag gtgaagaggc gatggcgcgg ctgaaacgtt gccgcccgtc gctggaactg 1020
gaaagtgcgg ccgtctggcc gctgcaaccc ttttttgacg atctgcgcgc gctttatcac 1080gaaagtgcgg ccgtctggcc gctgcaaccc ttttttgacg atctgcgcgc gctttatcac 1080
acccgctacg agcaggggaa aaatttgcag gtcacgctgg attcccatca tctggtggga 1140acccgctacg agcaggggaa aaatttgcag gtcacgctgg attcccatca tctggtggga 1140
tttggtcagc gtacgcaact gttagcctgc ctgagtctgt ggctcgatcg cacgctggat 1200tttggtcagc gtacgcaact gttagcctgc ctgagtctgt ggctcgatcg cacgctggat 1200
attgccgccg ggctgggtga tttcaccgcg caaacgcaga tttacgcccg cgaagaagag 12601260
ggctggctct ctttgtatat cactgacaat gtgccgctga tcccgctgcg ccacacccac 1320ggctggctct ctttgtatat cactgacaat gtgccgctga tcccgctgcg cccacacccac 1320
tcgccggatg cgcttaacgc tccgggaaaa ggcatggagc tgcgcctgat ccagacgctg 13801380 tcgccggatg cgcttaacgc tccgggaaaa ggcatggagc
gtggcacacc accacggcgc aatagaactc acttcacacc ccgaaggggg aagttgcctg 1440gtggcacacc accacggcgc aatagaactc acttcacacc ccgaaggggg aagttgcctg 1440
accctacgat tcccgctatt tcattcactg accggaggtt caaaatga 1488accctacgat tcccgctatt tcattcactg accggaggtt caaaatga 1488
<210> 267<210> 267
<211> 1575<211> 1575
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> nifA<223> nifA
<400> 267<400> 267
atgacccagc gaaccgagtc gggtaatacc gtctggcgct tcgatttgtc ccagcagttc 60atgacccagc gaaccgagtc gggtaatacc gtctggcgct tcgatttgtc ccagcagttc 60
actgcgatgc agcgcataag cgtggtactc agccgggcga ccgaggtcga tcagacgctc 120actgcgatgc agcgcataag cgtggtactc agccgggcga ccgaggtcga tcagacgctc 120
cagcaagtgc tgtgcgtatt gcacaatgac gcctttttgc agcacggcat gatctgtctg 180cagcaagtgc tgtgcgtatt gcacaatgac gccttttttgc agcacggcat gatctgtctg 180
tacgacagcc agcaggcgat tttgaatatt gaagcgttgc aggaagccga tcagcagtta 240tacgacagcc agcaggcgat tttgaatatt gaagcgttgc aggaagccga tcagcagtta 240
atccccggca gctcgcaaat ccgctatcgt ccgggcgaag ggctggtcgg gacggtgctt 300atccccggca gctcgcaaat ccgctatcgt ccgggcgaag ggctggtcgg gacggtgctt 300
tcgcagggcc aatcattagt gctggcgcgc gttgctgacg atcagcgctt tcttgaccgg 360tcgcagggcc aatcattagt gctggcgcgc gttgctgacg atcagcgctt tcttgaccgg 360
ctcgggttgt atgattacaa cctgccgttt atcgccgtgc cgctgatagg gccagatgcg 420ctcgggttgt atgattacaa ccgccgttt atcgccgtgc cgctgatagg gccagatgcg 420
cagactttcg gtgtgctgac ggcacaaccc atggcgcgtt acgaagagcg attacccgcc 480cagactttcg gtgtgctgac ggcacaaccc atggcgcgtt acgaagagcg attacccgcc 480
tgcacccgct ttctggaaac ggtcgctaac ctggtcgcgc aaaccgtgcg tttgatggca 540tgcacccgct ttctggaaac ggtcgctaac ctggtcgcgc aaaccgtgcg tttgatggca 540
ccaccggcag tgcgcccttc cccgcgcgcc gccataacac aggccgccag cccgaaatcc 600ccaccggcag tgcgcccttc cccgcgcgcc gccataacac aggccgccag cccgaaatcc 600
tgcacggcct cacgcgcatt tggttttgaa aatatggtcg gtaacagtcc ggcgatgcgc 660tgcacggcct cacgcgcatt tggttttgaa aatatggtcg gtaacagtcc ggcgatgcgc 660
cagaccatgg agattatccg tcaggtttcg cgctgggaca ccaccgttct ggtacgcggc 720cagaccatgg agattatccg tcaggtttcg cgctgggaca ccaccgttct ggtacgcggc 720
gagagtggca ccggcaagga gctgattgcc aacgccatcc accaccattc gccgcgtgcc 780gagagtggca ccggcaagga gctgattgcc aacgccatcc accaccattc gccgcgtgcc 780
ggtgcgccat ttgtgaaatt caactgtgcg gcgctgccgg acacactgct ggaaagcgaa 840ggtgcgccat ttgtgaaatt caactgtgcg gcgctgccgg acacactgct ggaaagcgaa 840
ttgttcggtc acgagaaagg ggcatttacc ggcgcggtac gccagcgtaa aggccgtttt 900ttgttcggtc acgagaaagg ggcatttacc ggcgcggtac gccagcgtaa aggccgtttt 900
gagctggccg atggcggcac gctgtttctt gacgagatcg gcgagagtag cgcctcgttt 960gagctggccg atggcggcac gctgtttctt gacgagatcg gcgagagtag cgcctcgttt 960
caggctaagc tgctgcgcat tttgcaggaa ggcgaaatgg aacgcgtcgg cggcgacgag 1020caggctaagc tgctgcgcat tttgcaggaa ggcgaaatgg aacgcgtcgg cggcgacgag 1020
acattgcaag tgaatgtgcg cattattgcc gcgacgaacc gcaatcttga agatgaagtc 1080acattgcaag tgaatgtgcg cattattgcc gcgacgaacc gcaatcttga agatgaagtc 1080
cggctggggc actttcgcga agatctctat tatcgcctga atgtgatgcc catcgccctg 1140cggctggggc actttcgcga agatctctat tatcgcctga atgtgatgcc catcgccctg 1140
ccgccactac gcgaacgcca ggaggacatt gccgagctgg cgcactttct ggtgcgtaaa 1200ccgccactac gcgaacgcca ggaggacatt gccgagctgg cgcactttct ggtgcgtaaa 1200
atcgcccata accagagccg tacgctgcgc attagcgagg gcgctatccg cctgctgatg 1260atcgcccata accagagccg tacgctgcgc attagcgagg gcgctatccg cctgctgatg 1260
agctacaact ggcccggtaa tgtgcgcgaa ctggaaaact gccttgagcg ctcagcggtg 1320agctacaact ggcccggtaa tgtgcgcgaa ctggaaaact gccttgagcg ctcagcggtg 1320
atgtcggaga acggtctgat cgatcgggat gtgattttgt ttaatcatcg cgaccagcca 1380atgtcggaga acggtctgat cgatcgggat gtgattttgt ttaatcatcg cgaccagcca 1380
gccaaaccgc cagttatcag cgtctcgcat gatgataact ggctcgataa caaccttgac 1440gccaaaccgc cagttatcag cgtctcgcat gatgataact ggctcgataa caaccttgac 1440
gagcgccagc ggctgattgc ggcgctggaa aaagcgggat gggtacaagc caaagccgcg 1500gagcgccagc ggctgattgc ggcgctggaa aaagcgggat gggtacaagc caaagccgcg 1500
cgcttgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcctatcgta ttcagacgat ggatataacc 1560cgcttgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcctatcgta ttcagacgat ggatataacc 1560
ctgccaaggc tataa 1575ctgccaaggc tataa 1575
<210> 268<210> 268
<211> 2850<211> 2850
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> glnE<223> glnE
<400> 268<400> 268
atgccgcacc acgcaggatt gtcgcagcac tggcaaacgg tattttctcg tctgccggaa 60atgccgcacc acgcaggatt gtcgcagcac tggcaaacgg tattttctcg tctgccggaa 60
tcgctcaccg cgcagccatt gagcgcgcag gcgcagtcag tgctcacttt tagtgatttt 120tcgctcaccg cgcagccatt gagcgcgcag gcgcagtcag tgctcacttt tagtgatttt 120
gttcaggaca gcatcatcgc gcatcctgag tggctggcag agcttgaaag cgcgccgccg 180gttcaggaca gcatcatcgc gcatcctgag tggctggcag agcttgaaag cgcgccgccg 180
cctgcgaacg aatggcaaca ctatgcgcaa tggctgcaag cggcgctgga tggcgtcacc 240cctgcgaacg aatggcaaca ctatgcgcaa tggctgcaag cggcgctgga tggcgtcacc 240
gatgaagcct cgctgatgcg cgcgctgcgg ctgtttcgcc gtcgcatcat ggtgcgcatc 300gatgaagcct cgctgatgcg cgcgctgcgg ctgtttcgcc gtcgcatcat ggtgcgcatc 300
gcctggagcc aggcgttaca gttggtggcg gaagaagata tcctgcaaca gcttagcgtg 360gcctggagcc aggcgttaca gttggtggcg gaagaagata tcctgcaaca gcttagcgtg 360
ctggcggaaa ccctgatcgt cgccgcgcgc gactggcttt atgaggcctg ctgccgtgag 420ctggcggaaa ccctgatcgt cgccgcgcgc gactggcttt atgaggcctg ctgccgtgag 420
tggggaacgc cgagcaatcc acaaggcgtg gcgcagccga tgctggtact cggcatgggc 480tggggaacgc cgagcaatcc acaaggcgtg gcgcagccga tgctggtact cggcatggggc 480
aaactgggtg gcggcgaact caatttctca tccgatatcg atttgatttt cgcctggccg 540aaactgggtg gcggcgaact caatttctca tccgatatcg atttgatttt cgcctggccg 540
gaaaatggcg caacgcgcgg tggacgccgt gagctggata acgcgcaatt tttcactcgc 600gaaaatggcg caacgcgcgg tggacgccgt gagctggata acgcgcaatt tttcactcgc 600
cttggtcaac ggctgattaa agtcctcgac cagccaacgc aggatggctt tgtctaccgc 660cttggtcaac ggctgattaa agtcctcgac cagccaacgc aggatggctt tgtctaccgc 660
gtcgatatgc gcttgcgccc gtttggcgac agcggcccgc tggtgctgag ctttgccgcg 720gtcgatatgc gcttgcgccc gtttggcgac agcggcccgc tggtgctgag ctttgccgcg 720
ctggaagatt actaccagga gcaggggcgc gattgggaac gctacgcgat ggtgaaagcg 780ctggaagatt actaccagga gcaggggcgc gattgggaac gctacgcgat ggtgaaagcg 780
cgcattatgg gcgataacga cggcgaccat gcgcgggagt tgcgcgcaat gctgcgcccg 840cgcattatgg gcgataacga cggcgaccat gcgcgggagt tgcgcgcaat gctgcgcccg 840
tttgttttcc gccgttatat cgacttcagc gtgattcagt ccctgcgtaa catgaaaggc 900tttgttttcc gccgttatat cgacttcagc gtgattcagt ccctgcgtaa catgaaaggc 900
atgattgccc gcgaagtgcg tcgccgtggc ctgaaggaca acattaagct cggcgcgggc 960atgattgccc gcgaagtgcg tcgccgtggc ctgaaggaca acattaagct cggcgcgggc 960
gggatccgcg aaatagaatt tatcgtccag gttttccagc tgattcgcgg cggtcgcgag 1020gggatccgcg aaatagaatt tatcgtccag gttttccagc tgattcgcgg cggtcgcgag 1020
cctgcactgc aatcgcgttc actgttgccg acgcttgctg ccatagatca actgcatctg 1080cctgcactgc aatcgcgttc actgttgccg acgcttgctg ccatagatca actgcatctg 1080
ctgccggatg gcgacgcaac ccggctgcgc gaggcgtatt tgtggctgcg acggctggag 1140ctgccggatg gcgacgcaac ccggctgcgc gaggcgtatt tgtggctgcg acggctggag 1140
aacctgctgc aaagcatcaa tgacgaacag acacagacgc tgccgggcga tgaactgaat 1200aacctgctgc aaagcatcaa tgacgaacag aacacagacgc tgccgggcga tgaactgaat 1200
cgcgcgcgcc tcgcctgggg aatgggcaaa gatagctggg aagcgctctg cgaaacgctg 1260cgcgcgcgcc tcgcctgggg aatgggcaaa gatagctggg aagcgctctg cgaaacgctg 1260
gaagcgcata tgtcggcggt gcgtcagata tttaacgatc tgattggcga tgatgaaacg 13201320
gattcgccgg aagatgcgct ttctgagagc tggcgcgaat tgtggcagga tgcgttgcag 13801380
gaggaggatt ccacgcccgt gctggcgcat ctctcagagg acgatcgccg ccgcgtggtg 1440gaggaggatt ccacgcccgt gctggcgcat ctctcagagg acgatcgccg ccgcgtggtg 1440
gcgctgattg ccgattttcg caaagagttg gataaacgca ccattggccc gcgagggcgg 1500gcgctgattg ccgattttcg caaagagttg gataaacgca ccattggccc gcgagggcgg 1500
caggtactcg atcacttaat gccgcatctg ctcagcgatg tatgctcgcg cgacgatgcg 1560caggtactcg atcacttaat gccgcatctg ctcagcgatg tatgctcgcg cgacgatgcg 1560
ccagtaccgc tgtcacgcct gacgccgctg ctcaccggaa ttattacccg caccacttac 1620ccagtaccgc tgtcacgcct gacgccgctg ctcaccggaa ttattacccg caccacttac 1620
cttgagctgc taagtgaatt tcccggcgca ctgaaacacc tcatttccct gtgtgccgcg 1680cttgagctgc taagtgaatt tcccggcgca ctgaaacacc tcatttccct gtgtgccgcg 1680
tcgccgatgg ttgccagtca gctggcgcgc tacccgatcc tgcttgatga attgctcgac 1740tcgccgatgg ttgccagtca gctggcgcgc tacccgatcc tgcttgatga attgctcgac 1740
ccgaatacgc tctatcaacc gacggcgatg aatgcctatc gcgatgagct gcgccaatac 1800ccgaatacgc tctatcaacc gacggcgatg aatgcctatc gcgatgagct gcgccaatac 1800
ctgctgcgcg tgccggaaga tgatgaagag caacagcttg aggcgctgcg gcagtttaag 1860ctgctgcgcg tgccggaaga tgatgaagag caacagcttg aggcgctgcg gcagtttaag 1860
caggcgcagt tgctgcgcgt ggcggcggcg gatattgccg gtacgttgcc agtaatgaaa 1920caggcgcagt tgctgcgcgt ggcggcggcg gatattgccg gtacgttgcc agtaatgaaa 1920
gtgagcgatc acttaacctg gctggcggaa gcgattattg atgcggtggt gcagcaagcc 1980gtgagcgatc acttaacctg gctggcggaa gcgattattg atgcggtggt gcagcaagcc 1980
tgggggcaga tggtggcgcg ttatggccag ccaacgcatc tgcacgatcg cgaagggcgc 2040tgggggcaga tggtggcgcg ttatggccag ccaacgcatc tgcacgatcg cgaagggcgc 2040
ggttttgcgg tggtcggtta tggcaagctg ggcggctggg agctgggtta cagctccgat 2100ggttttgcgg tggtcggtta tggcaagctg ggcggctggg agctgggtta cagctccgat 2100
ctggatctgg tattcctgca cgactgcccg atggatgtga tgaccgatgg cgagcgtgaa 2160ctggatctgg tattcctgca cgactgcccg atggatgtga tgaccgatgg cgagcgtgaa 2160
atcgatggtc gccagttcta tttgcgtctc gcgcagcgcg tgatgcacct gtttagcacg 2220atcgatggtc gccagttcta tttgcgtctc gcgcagcgcg tgatgcacct gtttagcacg 2220
cgcacgtcgt ccggcatcct ttatgaagtt gatgcgcgtc tgcgtccatc tggcgctgcg 2280cgcacgtcgt ccggcatcct ttatgaagtt gatgcgcgtc tgcgtccatc tggcgctgcg 2280
gggatgctgg tcactactac ggaatcgttc gccgattacc agcaaaacga agcctggacg 2340gggatgctgg tcactactac ggaatcgttc gccgattacc agcaaaacga agcctggacg 2340
tgggaacatc aggcgctggc ccgtgcgcgc gtggtgtacg gcgatccgca actgaccgcc 2400tgggaacatc aggcgctggc ccgtgcgcgc gtggtgtacg gcgatccgca actgaccgcc 2400
gaatttgacg ccattcgccg cgatattctg atgacgcctc gcgacggcgc aacgctgcaa 2460gaatttgacg ccattcgccg cgatattctg atgacgcctc gcgacggcgc aacgctgcaa 2460
accgacgtgc gagaaatgcg cgagaaaatg cgtgcccatc ttggcaacaa gcataaagac 2520accgacgtgc gagaaatgcg cgagaaaatg cgtgcccatc ttggcaacaa gcataaagac 2520
cgcttcgatc tgaaagccga tgaaggcggt atcaccgaca tcgagtttat cgcccaatat 25802580 cgcttcgatc tgaaagccga tgaaggcggt
ctggtgctgc gctttgccca tgacaagccg aaactgacgc gctggtcgga taatgtgcgc 2640ctggtgctgc gctttgccca tgacaagccg aaactgacgc gctggtcgga taatgtgcgc 2640
attctcgaag ggctggcgca aaacggcatc atggaggagc aggaagcgca ggcattgacg 2700attctcgaag ggctggcgca aaacggcatc atggaggagc aggaagcgca ggcattgacg 2700
ctggcgtaca ccacattgcg tgatgagctg caccacctgg cgctgcaaga gttgccggga 2760ctggcgtaca ccacattgcg tgatgagctg caccacctgg cgctgcaaga gttgccggga 2760
catgtggcgc tctcctgttt tgtcgccgag cgtgcgctta ttaaaaccag ctgggacaag 2820catgtggcgc tctcctgttt tgtcgccgag cgtgcgctta ttaaaaccag ctgggacaag 2820
tggctggtgg aaccgtgcgc cccggcgtaa 2850tggctggtgg aaccgtgcgc cccggcgtaa 2850
<210> 269<210> 269
<211> 1536<211> 1536
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> 16S-3<223> 16S-3
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (766)..(776)<222> (766)..(776)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (905)..(905)<222> (905)..(905)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 269<400> 269
attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60
cgaacggtag cacagagagc ttgctctcgg gtgacgagtg gcggacgggt gagtaatgtc 120cgaacggtag cacagagagc ttgctctcgg gtgacgagtg gcggacgggt gagtaatgtc 120
tgggaaactg cctgatggag ggggataact actggaaacg gtagctaata ccgcataacg 180tgggaaactg cctgatggag ggggataact actggaaacg gtagctaata ccgcataacg 180
tcgcaagacc aaagaggggg accttcgggc ctcttgccat cagatgtgcc cagatgggat 240tcgcaagacc aaagaggggg accttcgggc ctcttgccat cagatgtgcc cagatgggat 240
tagctagtag gtggggtaac ggctcaccta ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat 300tagctagtag gtggggtaac ggctcaccta ggcgacgatc cctagctggt ctgagaggat 300
gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta cgggaggcag cagtggggaa 360
tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag ccatgccgcg tgtgtgaaga aggccttcgg 420420
gttgtaaagc actttcagcg gggaggaagg gagtaaggtt aataaccttg ctcattgacg 480gttgtaaagc actttcagcg gggaggaagg gagtaaggtt aataaccttg ctcattgacg 480
ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540ttacccgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag ccgcggtaat acggagggtg 540
caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag gcggtctgtc aagtcggatg 600
tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc atccgaaact ggcaggcttg agtctcgtag 660tgaaatcccc gggctcaacc tgggaactgc atccgaaact ggcaggcttg agtctcgtag 660
agggaggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720agggaggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga gatctggagg aataccggtg 720
gcgaaggcgg cctcctggac gaagactgac gctcaggtgc gaaagnnnnn nnnnnnaaca 780780
ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacgatgtct actagccgtt ggggcctttg 840ggattagata ccctggtagt ccatgccgta aacgatgtct actagccgtt ggggcctttg 840
aggctttagt ggcgcagcta acgcgataag tagaccgcct ggggagtacg gtcgcaagac 900aggctttagt ggcgcagcta acgcgataag tagaccgcct ggggagtacg gtcgcaagac 900
taaanctcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960taaanctcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg gagcatgtgg tttaattcga 960
tgcaacgcga agaaccttac ctggccttga catagtaaga attttccaga gatggattgg 1020tgcaacgcga agaaccttac ctggccttga catagtaaga attttccaga gatggattgg 1020
tgccttcggg aacttacata caggtgctgc atggctgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg 10801080
ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtcattag ttgctacatt tagttgggca 1140ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttgtcattag ttgctacatt tagttgggca 1140
ctctaatgag actgccggtg acaaaccgga ggaaggtggg gatgacgtca agtcctcatg 1200ctctaatgag actgccggtg acaaaccggga ggaaggtggg gatgacgtca agtcctcatg 1200
gcccttatag gtggggctac acacgtcata caatggctgg tacaaagggt tgccaacccg 1260gcccttatag gtggggctac acacgtcata caatggctgg tacaaagggt tgccaacccg 1260
cgagggggag ctaatcccat aaaaccagtc gtagtccgga tcgcagtctg caactcgact 1320cgagggggag ctaatcccat aaaaccagtc gtagtccgga tcgcagtctg caactcgact 1320
gcgtgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtgg atcagaatgt cacggtgaat acgttcccgg 1380gcgtgaagtc ggaatcgcta gtaatcgtgg atcagaatgt cacggtgaat acgttcccgg 1380
gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagcgggttc tgccagaagt agttagctta 1440gtcttgtaca caccgcccgt cacaccatgg gagcgggttc tgccagaagt agttagctta 1440
accgcaagga gggcgattac cacggcaggg ttcgtgactg gggtgaagtc gtaacaaggt 1500accgcaagga gggcgattac cacggcaggg ttcgtgactg gggtgaagtc gtaacaaggt 1500
agccgtatcg gaaggtgcgg ctggatcacc tccttt 1536agccgtatcg gaaggtgcgg ctggatcacc tccttt 1536
<210> 270<210> 270
<211> 882<211> 882
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> nifD1<223> nifD1
<400> 270<400> 270
atgaccatgc gtcaatgcgc catttacggc aaaggtggga tcggcaaatc gaccaccaca 60atgaccatgc gtcaatgcgc catttacggc aaaggtggga tcggcaaatc gaccaccaca 60
cagaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggtaaaaaag tcatgattgt cggctgtgac 120cagaacctgg tcgccgcgct ggcggagatg ggtaaaaaag tcatgattgt cggctgtgac 120
ccgaaagccg attccacgcg tttgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180ccgaaagccg attccacgcg tttgatcctg catgcgaaag cgcagaacac cattatggag 180
atggctgctg aagtcggctc cgtggaagac ctggagttag aagacgtgct gcaaatcggt 240atggctgctg aagtcggctc cgtggaagac ctggagttag aagacgtgct gcaaatcggt 240
tacggcggcg tgcgctgcgc agagtccggc ggcccggagc caggcgtggg ctgtgccggt 300tacggcggcg tgcgctgcgc agagtccggc ggcccggagc caggcgtggg ctgtgccggt 300
cgcggggtga tcaccgcgat taacttcctc gaagaagaag gcgcttacgt gccggatctc 360cgcggggtga tcaccgcgat taacttcctc gaagaagaag gcgcttacgt gccggatctc 360
gattttgttt tctacgacgt gctgggcgac gtggtatgcg gtggtttcgc catgccgatt 420gtggttgcg gtggtttcgc catgccgatt 420
cgtgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtttgctctg gcgaaatgat ggcgatgtac 480cgtgaaaaca aagcgcagga gatctacatc gtttgctctg gcgaaatgat ggcgatgtac 480
gccgccaaca acatctccaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggtaa agtgcgcctc 540gccgccaaca acatctccaa aggcatcgtg aaatacgcca aatccggtaa agtgcgcctc 540
ggcgggctga tttgtaactc gcgccagacc gaccgtgaag atgaactgat cattgcgctg 600ggcgggctga tttgtaactc gcgccagacc gaccgtgaag atgaactgat cattgcgctg 600
gcagaaaaac tcggcacgca gatgatccac tttgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgt 660gcagaaaaac tcggcacgca gatgatccac tttgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgt 660
gcggaaatcc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga cctgcaatca ggcgaacgaa 720gcggaaatcc gccgtatgac ggttatcgaa tatgacccga cctgcaatca ggcgaacgaa 720
tatcgcagcc ttgccagcaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtgcc caccccctgc 780tatcgcagcc ttgccagcaa aatcgtcaac aacaccaaaa tggtggtgcc caccccctgc 780
accatggatg aactggaaga actgctgatg gagttcggca ttatggatgt ggaagacacc 840accatggatg aactggaaga actgctgatg gagttcggca ttatggatgt ggaagacacc 840
agcatcattg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgccgtct ga 882agcatcattg gtaaaaccgc cgccgaagaa aacgccgtct ga 882
<210> 271<210> 271
<211> 1386<211> 1386
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> nifK1<223> nifK1
<400> 271<400> 271
atggccgaaa ttctgcgcag taaaaaaccg ctggcggtca gcccgataaa aagcggccag 60atggccgaaa ttctgcgcag taaaaaaccg ctggcggtca gcccgataaa aagcggccag 60
ccgctggggg cgatcctcgc aagcctgggt gtcgaacagt gcataccgct ggtacacggc 120ccgctggggg cgatcctcgc aagcctgggt gtcgaacagt gcataccgct ggtacacggc 120
gcacagggat gtagcgcgtt cgcgaaggtg ttctttattc aacattttca cgatccgatc 180gcacagggat gtagcgcgtt cgcgaaggtg ttcttttattc aacattttca cgatccgatc 180
ccgctgcaat cgacggcgat ggatccgact tccaccatta tgggcgccga tgaaaacatt 240ccgctgcaat cgacggcgat ggatccgact tccaccatta tgggcgccga tgaaaacatt 240
tttaccgcgc tcaatgtgct ctgccagcgc aacgccgcga aagccattgt gctgctcagc 300tttaccgcgc tcaatgtgct ctgccagcgc aacgccgcga aagccattgt gctgctcagc 300
accgggcttt cagaagccca gggcagcgac atttcgcggg tggtgcgcca gtttcgtgat 360accgggcttt cagaagccca gggcagcgac atttcgcggg tggtgcgcca gtttcgtgat 360
gattttcccc ggcataaagg cgttgcgctg ctcaccgtca acacacccga tttctacggc 420gattttcccc ggcataaagg cgttgcgctg ctcaccgtca acacacccga tttctacggc 420
tcgctggaaa acggctacag cgccgtgctg gaaagcatga ttgaacagtg ggtacccgca 480tcgctggaaa acggctacag cgccgtgctg gaaagcatga ttgaacagtg ggtacccgca 480
cagcccgccg ccagcctgcg caaccgccgt gtcaacctgc tggtcagcca tttactgaca 540cagcccgccg ccagcctgcg caaccgccgt gtcaacctgc tggtcagcca tttactgaca 540
ccaggcgata tcgaactgtt gcgcagttat gttgaagcct tcggcctgca accggtgatt 600ccaggcgata tcgaactgtt gcgcagttat gttgaagcct tcggcctgca accggtgatt 600
gtgccggatc tgtcgctgtc gctggacggg catctggcag acggtgattt ttcgcctgtt 660gtgccggatc tgtcgctgtc gctggacggg catctggcag acggtgattt ttcgcctgtt 660
acccaagggg gaacatcgct gcgcatgatt gaacagatgg ggcaaaacct ggccaccttt 720acccaagggg gaacatcgct gcgcatgatt gaacagatgg ggcaaaacct ggccaccttt 720
gtgattggcg cctcgctggg ccgtgcggcg gcgttactgg cgcagcgcag ccgtggcgag 780gtgattggcg cctcgctggg ccgtgcggcg gcgttactgg cgcagcgcag ccgtggcgag
gtgatcgccc tgccgcatct gatgacgctt gcagcctgcg acacgtttat tcatcgactg 840gtgatcgccc tgccgcatct gatgacgctt gcagcctgcg acacgtttat tcatcgactg 840
aaaaccctct ccgggcgcga tgtccccgcg tggattgagc gccagcgcgg ccaagttcag 900aaaaccctct ccgggcgcga tgtccccgcg tggattgagc gccagcgcgg ccaagttcag 900
gatgcgatga tcgattgcca tatgtggctg cagggtgcgg ctatcgccat ggcagcagaa 960gatgcgatga tcgattgcca tatgtggctg cagggtgcgg ctatcgccat ggcagcagaa 960
ggcgatcacc tggcggcatg gtgcgatttc gcccgcagcc agggcatgat ccccggcccg 1020ggcgatcacc tggcggcatg gtgcgatttc gcccgcagcc agggcatgat ccccggcccg 1020
attgtcgcac cggtcagcca gccggggttg caaaatctgc cggttgaaac cgtggttatc 1080attgtcgcac cggtcagcca gccggggttg caaaatctgc cggttgaaac cgtggttatc 1080
ggcgatctgg aagatatgca ggatcggctt tgcgcgacgc ccgccgcgtt actggtggcc 1140ggcgatctgg aagatatgca ggatcggctt tgcgcgacgc ccgccgcgtt actggtggcc 1140
aattctcatg ccgccgatct cgccacgcag tttgatttgt cacttatccg cgccgggttc 12001200
ccggtgtatg accggctggg ggaatttcgt cgcctgcgcc aggggtacag cggcattcgt 1260ccggtgtatg accggctggg ggaatttcgt cgcctgcgcc aggggtacag cggcattcgt 1260
gacacgctgt ttgagctggc gaatgtgatg cgcgagcgcc atcacccgct tgcaacctac 1320gacacgctgt ttgagctggc gaatgtgatg cgcgagcgcc atcacccgct tgcaacctac 1320
cgctcgccgc tgcgccagca cgccgacgac aacgttacgc ctggagatct gtatgccgca 1380cgctcgccgc tgcgccagca cgccgacgac aacgttacgc ctggagatct gtatgccgca 1380
tgttaa 1386tgttaa 1386
<210> 272<210> 272
<211> 1287<211> 1287
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> amtB<223> amtB
<400> 272<400> 272
atgaaaaaca caacattaaa aacagcgctt gcttcgctgg cgttactgcc tggcctggcg 60atgaaaaaca caacattaaa aacagcgctt gcttcgctgg cgttactgcc tggcctggcg 60
atggcggctc ccgctgtggc ggataaagcc gacaacggct ttatgatgat ttgcaccgcg 120atggcggctc ccgctgtggc ggataaagcc gacaacggct ttatgatgat ttgcaccgcg 120
ctggtgctgt ttatgaccat tccgggcatt gcgctgttct acggcggttt gatccgcggt 180ctggtgctgt ttatgaccat tccgggcatt gcgctgttct acggcggttt gatccgcggt 180
aaaaacgtgc tgtcgatgct gacgcaggtt gccgtcacct tcgcactggt gtgcattctg 240aaaaacgtgc tgtcgatgct gacgcaggtt gccgtcacct tcgcactggt gtgcattctg 240
tgggtggtgt atggctactc gctggcattt ggcgagggca acagcttctt cgggagtttt 300tgggtggtgt atggctactc gctggcattt ggcgaggggca acagcttctt cgggagtttt 300
aactgggcga tgttgaaaaa catcgaactg aaagccgtga tgggcagcat ttatcagtat 360aactgggcga tgttgaaaaa catcgaactg aaagccgtga tgggcagcat ttatcagtat 360
atccacgtgg cgttccaggg ttccttcgcc tgtatcaccg ttggcctgat tgtcggtgca 420atccacgtgg cgttccaggg ttccttcgcc tgtatcaccg ttggcctgat tgtcggtgca 420
ctggctgagc gtattcgctt ctctgcggtg ctgatttttg tggtggtatg gctgacgctt 480ctggctgagc gtattcgctt ctctgcggtg ctgatttttg tggtggtatg gctgacgctt 480
tcttacgtgc cgattgcaca catggtgtgg ggcggcggtc tgctggcaac ccacggtgcg 540tcttacgtgc cgattgcaca catggtgtgg ggcggcggtc tgctggcaac ccacggtgcg 540
ctggatttcg caggcggtac ggttgttcac atcaacgctg cgattgcagg tctggtgggg 600ctggatttcg caggcggtac ggttgttcac atcaacgctg cgattgcagg tctggtgggg 600
gcttacctga ttggcaaacg cgtgggcttt ggcaaagaag cattcaaacc gcataacctg 660gcttacctga ttggcaaacg cgtgggcttt ggcaaagaag cattcaaacc gcataacctg 660
ccgatggtct tcactggcac cgctatcctg tatgttggct ggtttggttt caacgccggc 720ccgatggtct tcactggcac cgctatcctg tatgttggct ggtttggttt caacgccggc 720
tccgcaagct cggcgaacga aattgctgcg ctggccttcg tgaacactgt cgttgccact 780tccgcaagct cggcgaacga aattgctgcg ctggccttcg tgaacactgt cgttgccact 780
gctgccgcta ttctggcgtg ggtatttggc gaatgggcaa tgcgcggcaa gccgtctctg 840gctgccgcta ttctggcgtg ggtatttggc gaatgggcaa tgcgcggcaa gccgtctctg 840
ctcggtgcct gttctggtgc catcgcgggt ctggttggta tcacccccgc ctgtggttat 900ctcggtgcct gttctggtgc catcgcgggt ctggttggta tcacccccgc ctgtggttat 900
gtgggtgtcg gcggtgcgct gattgtgggt ctgattgccg gtctggctgg gctgtggggc 960gtgggtgtcg gcggtgcgct gattgtgggt ctgattgccg gtctggctgg gctgtggggc 960
gttactgcgc tgaaacgtat gttgcgtgtc gatgacccgt gtgacgtatt cggtgtgcac 1020gttactgcgc tgaaacgtat gttgcgtgtc gatgacccgt gtgacgtatt cggtgtgcac 1020
ggcgtgtgcg gcatcgtggg ctgtatcctg acgggtatct tcgcctctac gtcgctgggt 1080ggcgtgtgcg gcatcgtggg ctgtatcctg acgggtatct tcgcctctac gtcgctgggt 1080
ggtgtcggtt tcgctgaagg tgtgaccatg ggccatcagg tgctggtgca gctggaaagt 1140ggtgtcggtt tcgctgaagg tgtgaccatg ggccatcagg tgctggtgca gctggaaagt 1140
gttgccatca ctatcgtgtg gtctggcgtg gtggccttta ttggttacaa actggcggac 1200gttgccatca ctatcgtgtg gtctggcgtg gtggccttta ttggttacaa actggcggac 1200
atgacggtag gcctgcgcgt accggaagaa caagaacgtg aagggctgga tgtaaacagc 1260atgacggtag gcctgcgcgt accggaagaa caagaacgtg aagggctgga tgtaaacagc 1260
cacggcgaaa acgcctataa cgcctga 1287cacggcgaaa acgcctataa cgcctga 1287
<210> 273<210> 273
<211> 348<211> 348
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> Prm1<223> Prm1
<400> 273<400> 273
cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt 60cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt 60
ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg 120ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc ggatttcact atttaaactg 120
gccattatct aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt 180gccattatct aagatgaatc cgatggaagc tcgctgtttt aacacgcgtt ttttaacctt 180
ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa 240ttattgaaag tcggtgcttc tttgagcgaa cgatcaaatt taagtggatt cccatcaaaa 240
aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc 300aaatattctc aacctaaaaa agtttgtgta atacttgtaa cgctacatgg agattaactc 300
aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgc 348aatctagagg gtattaataa tgaatcgtac taaactggta ctgggcgc 348
<210> 274<210> 274
<211> 313<211> 313
<212> ДНК<212> DNA
<213> Kosakonia sacchari<213> Kosakonia sacchari
<220><220>
<223> Prm5<223> Prm5
<400> 274<400> 274
ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg 60ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg 60
cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg 120cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag taaaagaggc agtctacttg 120
aattaccccc ggctggttga gcgtttgttg aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata 180aattacccc ggctggttga gcgtttgttg aaaaaaagta actgaaaaat ccgtagaata 180
gcgccactct gatggttaat taacctattc aattaagaat tatctggatg aatgtgccat 240gcgccactct gatggttaat taacctattc aattaagaat tatctggatg aatgtgccat 240
taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt 300taaatgcgca gcataatggt gcgttgtgcg ggaaaactgc ttttttttga aagggttggt 300
cagtagcgga aac 313cagtagcgga aac 313
<210> 275<210> 275
<211> 1485<211> 1485
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifL<223> nifL
<400> 275<400> 275
atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gcgccggagg ccatcgccgg cgcgctgact 60atgaccctga atatgatgct cgataacgcc gcgccgggagg ccatcgccgg cgcgctgact 60
caacaacatc cggggctgtt ttttaccatg gtggaacagg cctcggtggc catctccctc 120caacaacatc cggggctgtt ttttaccatg gtggaacagg cctcggtggc catctccctc 120
accgatgcca gcgccaggat catttacgcc aacccggcgt tttgccgcca gaccggctat 180accgatgcca gcgccaggat catttacgcc aacccggcgt tttgccgcca gaccggctat 180
tcgctggcgc aattgttaaa ccagaacccg cgcctgctgg ccagcagcca gacgccgcgc 240tcgctggcgc aattgttaaa ccagaacccg cgcctgctgg ccagcagcca gacgccgcgc 240
gagatctatc aggagatgtg gcataccctg ctccagcgtc agccctggcg cggtcagctg 300gagatctatc aggagatgtg gcataccctg ctccagcgtc agccctggcg cggtcagctg 300
attaatcagc gtcgggacgg cggcctgtac ctggtggaga ttgacatcac cccggtgctt 360attaatcagc gtcgggacgg cggcctgtac ctggtggaga ttgacatcac cccggtgctt 360
agcccgcaag gggaactgga gcattatctg gcgatgcagc gggatatcag cgtcagctac 420agcccgcaag gggaactgga gcattatctg gcgatgcagc gggatatcag cgtcagctac 420
accctcgaac agcggctgcg caaccatatg accctgatgg aggcggtgct gaataatatc 480accctcgaac agcggctgcg caaccatatg accctgatgg aggcggtgct gaataatatc 480
cccgccgccg tggtagtggt ggacgagcag gatcgggtgg tgatggacaa cctcgcctac 540cccgccgccg tggtagtggt ggacgagcag gatcgggtgg tgatggacaa cctcgcctac 540
aaaaccttct gcgctgactg cggcggccgg gagctgctca ccgagctgca ggtctcccct 600aaaaccttct gcgctgactg cggcggccgg gagctgctca ccgagctgca ggtctcccct 600
ggccggatga cgcccggcgt ggaggcgatc ctgccggtgg cgctgcgcgg ggccgcgcgc 660ggccggatga cgcccggcgt ggaggcgatc ctgccggtgg cgctgcgcgg ggccgcgcgc 660
tggctgtcgg taacctgctg gccgttgccc ggcgtcagtg aagaggccag ccgctacttt 720tggctgtcgg taacctgctg gccgttgccc ggcgtcagtg aagaggccag ccgctacttt 720
atcgacagcg cgctggcgcg gaccctggtg gtgatcgccg actgtaccca gcagcgtcag 780atcgacagcg cgctggcgcg gaccctggtg gtgatcgccg actgtaccca gcagcgtcag 780
cagcaggagc aagggcgcct tgaccggctg aagcagcaaa tgaccgccgg caagctgctg 840cagcaggagc aagggcgcct tgaccggctg aagcagcaaa tgaccgccgg caagctgctg 840
gcggcgatcc gcgagtcgct ggacgccgcg ctgatccagc tgaactgccc gattaatatg 900gcggcgatcc gcgagtcgct ggacgccgcg ctgatccagc tgaactgccc gattaatatg 900
ctggcggcag cccgtcggct gaacggcgag ggaagcggga atgtggcgct ggaggccgcc 960ctggcggcag cccgtcggct gaacggcgag ggaagcggga atgtggcgct ggaggccgcc 960
tggcgtgaag gggaagaggc gatggcgcgg ctccagcgct gtcgcccatc gctggaactc 1020tggcgtgaag gggaagaggc gatggcgcgg ctccagcgct gtcgcccatc gctggaactc 1020
gaaaaccccg ccgtctggcc gctgcagccc tttttcgacg atctgtgcgc cctctaccgt 10801080
acacgcttcg atcccgacgg gctgcaggtc gacatggcct caccgcatct gatcggcttt 1140acacgcttcg atcccgacgg gctgcaggtc gacatggcct caccgcatct gatcggcttt 1140
ggccagcgca ccccactgct ggcgtgctta agcctgtggc tcgatcgcac cctggccctc 1200ggccagcgca ccccactgct ggcgtgctta agcctgtggc tcgatcgcac cctggccctc 1200
gccgccgaac tcccctccgt gccgctggcg atgcagctct acgccgagga gaacgacggc 1260gccgccgaac tcccctccgt gccgctggcg atgcagctct acgccgagga gaacgacggc 1260
tggctgtcgc tgtatctgac tgacaacgta ccgctgctgc aggtgcgcta cgctcactcc 1320tggctgtcgc tgtatctgac tgacaacgta ccgctgctgc aggtgcgcta cgctcactcc 1320
cccgacgcgc tgaactcgcc gggcaaaggc atggagctgc ggctgatcca gaccctggtg 1380cccgacgcgc tgaactcgcc gggcaaaggc atggagctgc ggctgatcca gaccctggtg 1380
gcgcaccatc gcggggccat tgagctggct tcccgaccgc agggcggcac ctgcctgacc 1440gcgcaccatc gcggggccat tgagctggct tcccgaccgc agggcggcac ctgcctgacc 1440
ctgcgtttcc cgctgtttaa caccctgacc ggaggtgaag catga 1485ctgcgtttcc cgctgtttaa caccctgacc ggaggtgaag catga 1485
<210> 276<210> 276
<211> 1575<211> 1575
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifA<223> nifA
<400> 276<400> 276
atgatccctg aatccgaccc ggacaccacc gtcagacgct tcgacctctc tcagcagttc 60atgatccctg aatccgaccc ggacaccacc gtcagacgct tcgacctctc tcagcagttc 60
accgccatgc agcggataag cgtggtgctg agccgggcca ccgaggccag caaaacgctg 120accgccatgc agcggataag cgtggtgctg agccggggcca ccgaggccag caaaacgctg 120
caggaggtgc tcagcgtatt acacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgcctg 180caggaggtgc tcagcgtatt acacaacgat gcctttatgc agcacgggat gatctgcctg 180
tacgacagcg agcaggagat cctcagtatc gaagcgctgc agcaaaccgg ccagcagccc 240tacgacagcg agcaggagat cctcagtatc gaagcgctgc agcaaaccgg ccagcagccc 240
ctccccggca gcacgcagat ccgctatcgc cccggcgagg gactggtggg gaccgtgctg 300ctccccggca gcacgcagat ccgctatcgc cccggcgagg gactggtggg gaccgtgctg 300
gcccaggggc agtcgctggt gctgccccgg gtcgccgacg atcagcgttt tctcgaccgc 360gcccaggggc agtcgctggg gctgccccgg gtcgccgacg atcagcgttt tctcgaccgc 360
ctgagcctct acgattacga tctgccgttt atcgccgtac cgttgatggg gcccaacgcc 420ctgagcctct acgattacga tctgccgttt atcgccgtac cgttgatggg gcccaacgcc 420
cggccaatag gggtgctggc ggcccagccg atggcgcgcc aggaagagcg gctgccggcc 480cggccaatag gggtgctggc ggcccagccg atggcgcgcc aggaagagcg gctgccggcc 480
tgcacccgtt ttctcgaaac cgtcgccaac ctcgtcgccc agaccatccg gctgatgatc 540tgcacccgtt ttctcgaaac cgtcgccaac ctcgtcgccc agaccatccg gctgatgatc 540
cttccggcct cacccgccct gtcgagccgc cagccgccga aggtggaacg gccgccggcc 600cttccggcct cacccgccct gtcgagccgc cagccgccga aggtggaacg gccgccggcc 600
tgctcgtcgt cgcgcggcgt gggccttgac aatatggtcg gcaagagccc ggcgatgcgc 660tgctcgtcgt cgcgcggcgt gggccttgac aatatggtcg gcaagagccc ggcgatgcgc 660
cagatcgtgg aggtgatccg tcaggtttcg cgctgggaca ccaccgtgct ggtacgcggc 720cagatcgtgg aggtgatccg tcaggtttcg cgctgggaca ccaccgtgct ggtacgcggc 720
gaaagcggca ccgggaaaga gctgatcgcc aacgccatcc atcaccattc gccacgggct 780gaaagcggca ccgggaaaga gctgatcgcc aacgccatcc atcaccattc gccacgggct 780
ggcgccgcct tcgtcaaatt taactgcgcg gcgctgccgg acaccctgct ggaaagcgaa 840ggcgccgcct tcgtcaaatt taactgcgcg gcgctgccgg acaccctgct ggaaagcgaa 840
ctgttcggcc atgagaaagg cgcctttacc ggggcggtgc gtcagcgtaa aggacgtttt 900ctgttcggcc atgagaaagg cgcctttacc ggggcggtgc gtcagcgtaa aggacgtttt 900
gagctggcgg atggcggcac cctgttcctc gatgagattg gtgaaagcag cgcctcgttc 960gagctggcgg atggcggcac cctgttcctc gatgagattg gtgaaagcag cgcctcgttc 960
caggccaagc tgctgcgtat cctccaggag ggggagatgg agcgggtcgg cggcgatgag 1020caggccaagc tgctgcgtat cctccaggag ggggagatgg agcggggtcgg cggcgatgag 1020
accctgcggg tgaatgtccg catcatcgcc gccaccaacc gtcacctgga ggaggaggtc 1080accctgcggg tgaatgtccg catcatcgcc gccaccaacc gtcacctgga ggaggaggtc 1080
cggctgggcc atttccgcga ggatctctac tatcgtctga acgtgatgcc catcgccctg 1140cggctgggcc atttccgcga ggatctctac tatcgtctga acgtgatgcc catcgccctg 1140
cccccgctgc gcgagcgtca ggaggacatc gccgagctgg cgcacttcct ggtgcgcaaa 1200cccccgctgc gcgagcgtca ggaggacatc gccgagctgg cgcacttcct ggtgcgcaaa 1200
atcggccagc atcaggggcg cacgctgcgg atcagcgagg gcgcgatccg cctgctgatg 1260atcggccagc atcaggggcg cacgctgcgg atcagcgagg gcgcgatccg cctgctgatg 1260
gagtacagct ggccgggtaa cgttcgcgaa ctggagaact gcctcgaacg atcggcggtg 1320gagtacagct ggccgggtaa cgttcgcgaa ctggagaact gcctcgaacg atcggcggtg 1320
atgtcggaga gtggcctgat cgatcgcgac gtgatcctct tcactcacca ggatcgtccc 1380atgtcggaga gtggcctgat cgatcgcgac gtgatcctct tcactcacca ggatcgtccc 1380
gccaaagccc tgcctgccag cgggccagcg gaagacagct ggctggacaa cagcctggac 1440gccaaagccc tgcctgccag cgggccagcg gaagacagct ggctggacaa cagcctggac 1440
gaacgtcagc gactgatcgc cgcgctggaa aaagccggct gggtgcaggc caaggcggca 1500gaacgtcagc gactgatcgc cgcgctggaa aaagccggct gggtgcaggc caaggcggca 1500
cggctgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcttatcgga tccagatcat ggatatcacc 1560cggctgctgg ggatgacgcc gcgccaggtc gcttatcggga tccagatcat ggatatcacc 1560
ctgccgcgtc tgtag 1575ctgccgcgtc tgtag 1575
<210> 277<210> 277
<211> 1540<211> 1540
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> 16S-1<223> 16S-1
<400> 277<400> 277
attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60
cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120
tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180
cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240
attagctagt aggtgaggta atggctcacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300attagctagt aggtgaggta atggctcacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300
atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360
aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420
gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcatac ttaatacgtg tggtgattga 480gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcatac ttaatacgtg tggtgattga 480
cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540
tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600
tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660
agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720
tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780
caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840
tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900
gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960gttaaaactc aaatgaattg acggggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960
gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020
agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080
tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc acgtaatggt 11401140
gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200
tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260
actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320
cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt 1380cgactccatg tgaatacgtt 1380
cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440
gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500
aaggtaaccg taggggaacc tgcggttgga tcacctcctt 1540aaggtaaccg taggggaacc tgcggttggga tcacctcctt 1540
<210> 278<210> 278
<211> 1540<211> 1540
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> 16S-2<223> 16S-2
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (267)..(267)<222> (267)..(267)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 278<400> 278
attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60
cgagcggcat cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120cgagcggcat cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120
tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180
cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240
attagctagt aggtgaggta atggctnacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300attagctagt aggtgaggta atggctnacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300
atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360
aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420
gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcatac ttaatacgtg tggtgattga 480gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcatac ttaatacgtg tggtgattga 480
cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540
tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600
tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660
agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720
tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780
caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840
tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900
gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960gttaaaactc aaatgaattg acggggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960
gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020
agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080
tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc acgtgatggt 11401140
gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200
tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260
actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320
cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt 1380cgactccatg tgaatacgtt 1380
cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440
gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500
aaggtaaccg taggggaacc tgcggttgga tcacctcctt 1540aaggtaaccg taggggaacc tgcggttggga tcacctcctt 1540
<210> 279<210> 279
<211> 1540<211> 1540
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> 16S-3<223> 16S-3
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (455)..(455)<222> (455)..(455)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 279<400> 279
attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60
cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120
tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180
cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240
attagctagt aggtgaggta atggctcacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300attagctagt aggtgaggta atggctcacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300
atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360
aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420
gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcancatac ttaatacgtg tggtgattga 480gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcancatac ttaatacgtg tggtgattga 480
cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540
tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600
tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660
agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720
tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780
caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840
tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900
gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960gttaaaactc aaatgaattg acggggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960
gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020
agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080
tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc acgtgatggt 11401140
gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200
tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260
actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320
cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt 1380cgactccatg tgaatacgtt 1380
cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440
gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500
aaggtaaccg taggggaacc tgcggttgga tcacctcctt 1540aaggtaaccg taggggaacc tgcggttggga tcacctcctt 1540
<210> 280<210> 280
<211> 1540<211> 1540
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> 16S-4<223> 16S-4
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (70)..(70)<222> (70)..(70)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 280<400> 280
attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60
cgagcggcan cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120cgagcggcan cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120
tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180
cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240
attagctagt aggtgaggta atggcttacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300attagctagt aggtgaggta atggcttacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300
atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360
aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420
gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcacac ttaatacgtg tggtgattga 480gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcacac ttaatacgtg tggtgattga 480
cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540
tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600
tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660
agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720
tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780
caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840
tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900
gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960gttaaaactc aaatgaattg acggggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960
gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020
agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080
tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc acgtgatggt 11401140
gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200
tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260
actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320
cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt 1380cgactccatg tgaatacgtt 1380
cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440
gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500
aaggtaaccg taggggaacc tgcggttgga tcacctcctt 1540aaggtaaccg taggggaacc tgcggttggga tcacctcctt 1540
<210> 281<210> 281
<211> 1540<211> 1540
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> 16S-5<223> 16S-5
<400> 281<400> 281
attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60
cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120
tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180tctgggaaac tgcctgatgg agggggataa ctactggaaa cggtagctaa taccgcatga 180
cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240cctcgaaaga gcaaagtggg ggatcttcgg acctcacgcc atcggatgtg cccagatggg 240
attagctagt aggtgaggta atggctcacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300attagctagt aggtgaggta atggctcacc taggcgacga tccctagctg gtctgagagg 300
atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360atgaccagcc acactggaac tgagacacgg tccagactcc tacgggaggc agcagtgggg 360
aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420aatattgcac aatgggcgca agcctgatgc agccatgccg cgtgtgtgaa gaaggcctta 420
gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcacac ttaatacgtg tgttgattga 480gggttgtaaa gcactttcag cgaggaggaa ggcatcacac ttaatacgtg tgttgattga 480
cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540cgttactcgc agaagaagca ccggctaact ccgtgccagc agccgcggta atacggaggg 540
tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600tgcaagcgtt aatcggaatt actgggcgta aagcgcacgc aggcggtttg ttaagtcaga 600
tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660tgtgaaatcc ccgagcttaa cttgggaact gcatttgaaa ctggcaagct agagtcttgt 660
agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720agaggggggt agaattccag gtgtagcggt gaaatgcgta gagatctgga ggaataccgg 720
tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780tggcgaaggc ggccccctgg acaaagactg acgctcaggt gcgaaagcgt ggggagcaaa 780
caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840caggattaga taccctggta gtccacgctg taaacgatgt cgacttggag gttgtgccct 840
tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900tgaggcgtgg cttccggagc taacgcgtta agtcgaccgc ctggggagta cggccgcaag 900
gttaaaactc aaatgaattg acgggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960gttaaaactc aaatgaattg acggggggccc gcacaagcgg tggagcatgt ggtttaattc 960
gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020gatgcaacgc gaagaacctt acctactctt gacatccaga gaatttgcca gagatggcga 1020
agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080agtgccttcg ggaactctga gacaggtgct gcatggctgt cgtcagctcg tgttgtgaaa 1080
tgttgggtta agtcccgcaa cgagcgcaac ccttatcctt tgttgccagc acgtgatggt 11401140
gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200gggaactcaa aggagactgc cggtgataaa ccggaggaag gtggggatga cgtcaagtca 1200
tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260tcatggccct tacgagtagg gctacacacg tgctacaatg gcatatacaa agagaagcga 1260
actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320actcgcgaga gcaagcggac ctcataaagt atgtcgtagt ccggattgga gtctgcaact 1320
cgactccatg aagtcggaat cgctagtaat cgtagatcag aatgctacgg tgaatacgtt 1380cgactccatg tgaatacgtt 1380
cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440cccgggcctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagtg ggttgcaaaa gaagtaggta 1440
gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500gcttaacctt cgggagggcg cttaccactt tgtgattcat gactggggtg aagtcgtaac 1500
aaggtaaccg taggggaacc tgcggttgga tcacctcctt 1540aaggtaaccg taggggaacc tgcggttggga tcacctcctt 1540
<210> 282<210> 282
<211> 1009<211> 1009
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> 16S-6<223> 16S-6
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (296)..(296)<222> (296)..(296)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (311)..(311)<222> (311)..(311)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<220><220>
<221> модифицированное основание<221> modified base
<222> (973)..(973)<222> (973)..(973)
<223> a, c, t, g, неизвестное или другое<223> a, c, t, g, unknown or other
<400> 282<400> 282
gtagctaata ccgcatgacc tcgaaagagc aaagtggggg atcttcggac ctcacgccat 60gtagctaata ccgcatgacc tcgaaagagc aaagtggggg atcttcggac ctcacgccat 60
cggatgtgcc cagatgggat tagctagtag gtgaggtaat ggctcaccta ggcgacgatc 120cggatgtgcc cagatgggat tagctagtag gtgaggtaat ggctcaccta ggcgacgatc 120
cctagctggt ctgagaggat gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta 180cctagctggt ctgagaggat gaccagccac actggaactg agacacggtc cagactccta 180
cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag ccatgccgcg 240cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag ccatgccgcg 240
tgtgtgaaga aggccttagg gttgtaaagc actttcagcg aggaggaagg catcanactt 300tgtgtgaaga aggccttagg gttgtaaagc actttcagcg aggaggaagg catcanactt 300
aatacgtgtg ntgattgacg ttactcgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag 360aatacgtgtg ntgattgacg ttactcgcag aagaagcacc ggctaactcc gtgccagcag 360
ccgcggtaat acggagggtg caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag 420ccgcggtaat acggagggtg caagcgttaa tcggaattac tgggcgtaaa gcgcacgcag 420
gcggtttgtt aagtcagatg tgaaatcccc gagcttaact tgggaactgc atttgaaact 480gcggtttgtt aagtcagatg tgaaatcccc gagcttaact tgggaactgc atttgaaact 480
ggcaagctag agtcttgtag aggggggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga 540ggcaagctag agtcttgtag aggggggtag aattccaggt gtagcggtga aatgcgtaga 540
gatctggagg aataccggtg gcgaaggcgg ccccctggac aaagactgac gctcaggtgc 600gatctggagg aataccggtg gcgaaggcgg ccccctggac aaagactgac gctcaggtgc 600
gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgctgta aacgatgtcg 660gaaagcgtgg ggagcaaaca ggattagata ccctggtagt ccacgctgta aacgatgtcg 660
acttggaggt tgtgcccttg aggcgtggct tccggagcta acgcgttaag tcgaccgcct 720acttggaggt tgtgcccttg aggcgtggct tccggagcta acgcgttaag tcgaccgcct 720
ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg 780ggggagtacg gccgcaaggt taaaactcaa atgaattgac gggggcccgc acaagcggtg 780
gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctactcttga catccagaga 840gagcatgtgg tttaattcga tgcaacgcga agaaccttac ctactcttga catccagaga 840
atttgccaga gatggcgaag tgccttcggg aactctgaga caggtgctgc atggctgtcg 900atttgccaga gatggcgaag tgccttcggg aactctgaga caggtgctgc atggctgtcg 900
tcagctcgtg ttgtgaaatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg 960tcagctcgtg ttgtgaaatg ttgggttaag tcccgcaacg agcgcaaccc ttatcctttg 960
ttgccagcac gtnatggtgg gaactcaaag gagactgccg gtgataaac 1009ttgccagcac gtnatggtgg gaactcaaag gagactgccg gtgataaac 1009
<210> 283<210> 283
<211> 1519<211> 1519
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> 16S-7<223> 16S-7
<400> 283<400> 283
attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60attgaagagt ttgatcatgg ctcagattga acgctggcgg caggcctaac acatgcaagt 60
cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120cgagcggcag cgggaagtag cttgctactt tgccggcgag cggcggacgg gtgagtaatg 120
tcctgatgga ggggataact actggaacgg tagctaatac cgcacctcga aagagcaaag 180tcctgatgga ggggataact actggaacgg tagctaatac cgcacctcga aagagcaaag 180
tgggggatct tcggacctca cgccatcgga tgtgcccaga tgggattagc tagtaggtga 240tgggggatct tcggacctca cgccatcgga tgtgcccaga tgggattagc tagtaggtga 240
ggtaatggct cacctaggcg acgatcccta gctggtctga gaggatgacc agccacactg 300ggtaatggct cacctaggcg acgatcccta gctggtctga gaggatgacc agccacactg 300
gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg 360gaactgagac acggtccaga ctcctacggg aggcagcagt ggggaatatt gcacaatggg 360
cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc cttagggttg taaagcactt 420cgcaagcctg atgcagccat gccgcgtgtg tgaagaaggc cttagggttg taaagcactt 420
tcagcgagga ggaaggcatc atacttaata cgtgtggtga ttgacgttac tcgcagaaga 480tcagcgagga ggaaggcatc atacttaata cgtgtggtga ttgacgttac tcgcagaaga 480
agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg agggtgcaag cttaatcgga 540agcaccggct aactccgtgc cagcagccgc ggtaatacgg agggtgcaag cttaatcgga 540
attactgggc gtaaagcgca cgcaggcggt tgttaagtca gatgtgaaat ccccgagctt 600attactgggc gtaaagcgca cgcaggcggt tgttaagtca gatgtgaaat ccccgagctt 600
aacttgggaa ctgcatttga aactggcaag ctagagtctt gtagaggggg gtagaattcc 660aacttgggaa ctgcatttga aactggcaag ctagagtctt gtagaggggg gtagaattcc 660
aggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatctg gaggaatacc ggtggcgaag gcggccccct 720aggtgtagcg gtgaaatgcg tagagatctg gaggaatacc ggtggcgaag gcggccccct 720
ggacaaagac tgacgctcag gtgcgaaagc gtggggagca aacaggatta ataccctggt 780ggacaaagac tgacgctcag gtgcgaaagc gtggggagca aacagatta ataccctggt 780
agtccacgct gtaacgatgt cgacttggag gttgtgccct gaggcgtggc ttccggagct 840agtccacgct gtaacgatgt cgacttggag gttgtgccct gaggcgtggc ttccggagct 840
aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga 900aacgcgttaa gtcgaccgcc tggggagtac ggccgcaagg ttaaaactca aatgaattga 900
cgggggcccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg atgcaacgcg aagaacctta 960cggggggccg cacaagcggt ggagcatgtg gtttaattcg atgcaacgcg aagaacctta 960
cctactcttg acatccagag aatttgccag agatggcgaa gtgccttcgg gaactctgag 1020cctactcttg acatccagag aatttgccag agatggcgaa gtgccttcgg gaactctgag 1020
acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat gttgggttaa gtcccgcaac 1080acaggtgctg catggctgtc gtcagctcgt gttgtgaaat gttgggttaa gtcccgcaac 1080
gagcgcaacc cttatccttt gttgccagca cgtaatggtg ggaactcaaa ggagactgcc 1140gagcgcaacc cttatccttt gttgccagca cgtaatggtg ggaactcaaa ggagactgcc 1140
ggtgataaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt acgagtaggg 1200ggtgataaac cggaggaagg tggggatgac gtcaagtcat catggccctt acgagtaggg 1200
ctacacacgt gctacaatgg catatacaaa gagaagcgaa ctcgcgagag caagcggacc 1260ctacacacgt gctacaatgg catatacaaa gagaagcgaa ctcgcgagag caagcggacc 1260
tcataaagta tgtcgtagtc cggattggag tctgcaactc gactccatga agtcggaatc 1320tcataaagta tgtcgtagtc cggattggag tctgcaactc gactccatga agtcggaatc 1320
gctagtaatc gtagatcaga atgctacggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc 1380gctagtaatc gtagatcaga atgctacggt gaatacgttc ccgggccttg tacacaccgc 1380
ccgtcacacc atgggagtgg gttgcaaaag aagtaggtag cttaaccttc gggagggcgc 1440ccgtcacacc atgggagtgg gttgcaaaag aagtaggtag cttaaccttc gggagggcgc 1440
ttaccacttt gtgattcatg actggggtga agtcgtaaca aggtaaccgt aggggaacct 1500ttaccacttt gtgattcatg actggggtga agtcgtaaca aggtaaccgt aggggaacct 1500
gcggttggat cacctcctt 1519gcggttggat cacctcctt 1519
<210> 284<210> 284
<211> 882<211> 882
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifH1<223> nifH1
<400> 284<400> 284
atgaccatgc gtcaatgcgc tatctacggt aaaggcggta tcggtaaatc caccaccacc 60atgaccatgc gtcaatgcgc tatctacggt aaaggcggta tcggtaaatc caccaccacc 60
cagaatctcg tcgcggccct cgccgagatg ggtaagaaag tgatgatcgt cggctgcgat 120cagaatctcg tcgcggccct cgccgagatg ggtaagaaag tgatgatcgt cggctgcgat 120
ccgaaagcgg attccacccg tctgatcctc cacgctaaag cccagaacac catcatggag 180ccgaaagcgg attccacccg tctgatcctc cacgctaaag cccagaacac catcatggag 180
atggcggcgg aagtgggctc ggtcgaggat ctggagctcg aagacgttct gcaaatcggc 240atggcggcgg aagtgggctc ggtcgaggat ctggagctcg aagacgttct gcaaatcggc 240
tatggcgatg tccgttgcgc cgaatccggc ggcccggagc caggcgtcgg ctgcgccgga 300tatggcgatg tccgttgcgc cgaatccggc ggcccggagc caggcgtcgg ctgcgccgga 300
cgcggggtga tcaccgccat caacttcctc gaggaagaag gcgcctatga agaagatttg 360360
gatttcgtct tctatgacgt cctcggcgac gtggtctgcg gcggcttcgc tatgccgatc 420gatttcgtct tctatgacgt cctcggcgac gtggtctgcg gcggcttcgc tatgccgatc 420
cgcgaaaaca aagcccagga gatctacatc gtctgctccg gcgagatgat ggcgatgtat 480cgcgaaaaca aagccgga gatctacatc gtctgctccg gcgagatgat ggcgatgtat 480
gccgccaaca atatctccaa agggatcgtg aagtacgcca aatccggcaa ggtgcgcctc 540gccgccaaca atatctccaa agggatcgtg aagtacgcca aatccggcaa ggtgcgcctc 540
ggcggcctga tctgtaactc gcgcaaaacc gaccgggaag acgaactgat catcgccctg 600ggcggcctga tctgtaactc gcgcaaaacc gaccgggaag acgaactgat catcgccctg 600
gcggagaagc ttggcacgca gatgatccac ttcgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgc 660gcggagaagc ttggcacgca gatgatccac ttcgttcccc gcgacaacat tgtgcagcgc 660
gcggagatcc gccggatgac ggtgatcgag tacgacccga cctgtcagca ggcgaatgaa 720gcggagatcc gccggatgac ggtgatcgag tacgacccga cctgtcagca ggcgaatgaa 720
tatcgtcaac tggcgcagaa gatcgtcaat aacaccaaaa aagtggtgcc gacgccgtgc 780tatcgtcaac tggcgcagaa gatcgtcaat aacaccaaaa aagtggtgcc gacgccgtgc 780
accatggacg agctggaatc gctgctgatg gagttcggca tcatggaaga agaagacacc 840accatggacg agctggaatc gctgctgatg gagttcggca tcatggaaga agaagacacc 840
agcatcattg gtaaaaccgc cgctgaagaa aacgcggcct ga 882agcatcattg gtaaaaccgc cgctgaagaa aacgcggcct ga 882
<210> 285<210> 285
<211> 1113<211> 1113
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifH2<223> nifH2
<400> 285<400> 285
atggttagga aaagtagaag taaaaataca aatatagaac taactgaaca tgaccattta 60atggttagga aaagtagaag taaaaataca aatatagaac taactgaaca tgaccattta 60
ttaataagtc aaataaaaaa gcttaaaaca caaaccactt gcttttttaa taataaagga 120ttaataagtc aaataaaaaa gcttaaaaca caaaccactt gcttttttaa taataaagga 120
ggggttggga agactacatt agtagcaaat ttaggagcag agctatcaat aaactttagt 180ggggttggga agactacatt agtagcaaat ttaggagcag agctatcaat aaactttagt 180
gcaaaagttc ttattgtgga tgccgaccct caatgtaatc tcacgcagta tgtattaagt 240gcaaaagttc ttattgtgga tgccgaccct caatgtaatc tcacgcagta tgtattaagt 240
gatgaagaaa ctcaggactt atatgggcaa gaaaatccag atagtattta tacagtaata 300gatgaagaaa ctcaggactt atatgggcaa gaaaatccag atagtattta tacagtaata 300
agaccactat cctttggtaa aggatatgaa agtgacctcc ctataaggca tgtagagaat 360agaccactat cctttggtaa aggatatgaa agtgacctcc ctataaggca tgtagagaat 360
ttcggttttg acataattgt cggtgaccct agacttgctt tacaggaaga ccttttagct 420ttcggttttg acataattgt cggtgaccct agacttgctt tacaggaaga ccttttagct 420
ggagactggc gagatgccaa aggcggtggg atgcgaggaa ttaggacaac ttttgtattt 480ggagactggc gagatgccaa aggcggtggg atgcgaggaa ttaggacaac ttttgtattt 480
gcagagttaa ttaagaaagc tcgtgagcta aattatgatt ttgttttctt tgacatggga 540gcagagttaa ttaagaaagc tcgtgagcta aattatgatt ttgttttctt tgacatggga 540
ccatcattag gcgcaatcaa cagggcagta ttactggcaa tggaattctt tgtcgtccca 600ccatcattag gcgcaatcaa cagggcagta ttactggcaa tggaattctt tgtcgtccca 600
atgtcaatcg atgtattttc actatgggct attaaaaata ttggctccac ggtttcaata 660atgtcaatcg atgtattttc actatgggct attaaaaata ttggctccac ggtttcaata 660
tggaaaaaag aattagacac agggattcgg ctctcagagg aacctagcga attatcacaa 720tggaaaaaag aattagacac agggattcgg ctctcagagg aacctagcga attatcacaa 720
ttatcacctc aaggaaaact aaagtttctc ggttacgtca cccaacaaca taaagaacgc 780ttatcacctc aaggaaaact aaagtttctc ggttacgtca cccaacaaca taaagaacgc 780
tctggatacg atacaattca gcttgagaat actgaggaag aaataaaatc gaaacgtcgg 840tctggatacg atacaattca gcttgagaat actgaggaag aaataaaatc gaaacgtcgg 840
gtaaaggcgt atgaagacat tggagaggtg tttccttcta aaattactga gcatctttct 900gtaaaggcgt atgaagacat tggagaggtg tttccttcta aaattactga gcatctttct 900
aaactttatg catcaaaaga tatgaaccca caccttggag atatacgtca tttaggtagt 960aaactttatg catcaaaaga tatgaaccca caccttggag atatacgtca tttaggtagt 960
ttagctccga aatcacaatc acaacacgtt ccgatgatat cagtgtctgg tacaggaaat 1020ttagctccga aatcacaatc acaacacgtt ccgatgatat cagtgtctgg tacaggaaat 1020
tacaccagac ttagaaaaag cgcgcgtgaa ctttatcgag atattgcaag aagatactta 1080tacaccagac ttagaaaaag cgcgcgtgaa ctttatcgag atattgcaag aagatactta 1080
gagaacattc agactgctaa tggcgagaaa tag 1113gagaacattc agactgctaa tggcgagaaa
<210> 286<210> 286
<211> 1374<211> 1374
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifD1<223> nifD1
<400> 286<400> 286
atgaagggaa aggaaattct ggcgctgctg gacgaacccg cctgcgagca caaccagaag 60atgaagggaa aggaaattct ggcgctgctg gacgaacccg cctgcgagca caaccagaag 60
caaaaatccg gctgcagcgc ccctaagccc ggcgctaccg ccggcggttg cgccttcgac 120caaaaatccg gctgcagcgc ccctaagccc ggcgctaccg ccggcggttg cgccttcgac 120
ggcgcgcaga taacgctcct gcccatcgcc gacgtcgcgc acctggtgca cggccccatc 180ggcgcgcaga taacgctcct gcccatcgcc gacgtcgcgc acctggtgca cggccccatc 180
ggctgcgcgg gcagctcgtg ggataaccgc ggcagcgtca gcgccggccc ggccctcaac 240ggctgcgcgg gcagctcgtg ggataaccgc ggcagcgtca gcgccggccc ggccctcaac 240
cggctcggct ttaccaccga tcttaacgaa caggatgtga ttatgggccg cggcgaacgc 300cggctcggct ttaccaccga tcttaacgaa caggatgtga ttatggggccg cggcgaacgc 300
cgcctgttcc acgccgtgcg tcacatcgtc gaccgctatc atccggcggc ggtctttatc 360cgcctgttcc acgccgtgcg tcacatcgtc gaccgctatc atccggcggc ggtctttatc 360
tacaacacct gcgtaccggc gatggagggc gatgacatcg aggcggtctg ccaggccgca 420tacaacacct gcgtaccggc gatggagggc gatgacatcg aggcggtctg ccaggccgca 420
cagaccgcca ccggcgtccc ggtcatcgct attgacgccg ccggtttcta cggcagtaaa 480cagaccgcca ccggcgtccc ggtcatcgct attgacgccg ccggtttcta cggcagtaaa 480
aatcttggca accgaatggc gggcgacgtg atgctcaggc aggtgattgg ccagcgcgaa 540aatcttggca accgaatggc gggcgacgtg atgctcaggc aggtgattgg ccagcgcgaa 540
ccggccccgt ggccagacaa cacgcccttt gccccggccc agcgccacga tatcggcctg 600ccggccccgt ggccagacaa cacgcccttt gccccggccc agcgccacga tatcggcctg 600
attggcgaat tcaatatcgc cggcgagttc tggcaggtcc agccgctgct cgacgagctg 660attggcgaat tcaatatcgc cggcgagttc tggcaggtcc agccgctgct cgacgagctg 660
gggatccgcg tcctcggcag cctctccggc gacggccgct ttgccgagat ccagaccctg 720gggatccgcg tcctcggcag cctctccggc gacggccgct ttgccgagat ccagaccctg 720
caccgggcgc aggccaatat gctggtgtgc tcgcgcgcgc tgatcaacgt cgcccggggg 780caccgggcgc aggccaatat gctggtgtgc tcgcgcgcgc tgatcaacgt cgcccggggg 780
ctggagctgc gctacggcac gccgtggttt gaaggcagct tctacgggat ccgcgccacc 840ctggagctgc gctacggcac gccgtggttt gaaggcagct tctacgggat ccgcgccacc 840
tccgacgcct tgcgccagct ggcgacgctg ctgggggatg acgacctgcg ccgccgcacc 900tccgacgcct tgcgccagct ggcgacgctg ctgggggatg acgacctgcg ccgccgcacc 900
gaggcgctga tcgcccgcga agagcaggcg gcggagcagg ctcttgcgcc gtggcgtgag 960gaggcgctga tcgcccgcga agagcaggcg gcggagcagg ctcttgcgcc gtggcgtgag 960
cagctccgcg ggcgcaaagt gctgctctat accggcggcg tgaaatcctg gtcggtggta 1020cagctccgcg ggcgcaaagt gctgctctat accggcggcg tgaaatcctg gtcggtggta 1020
tcggccctgc aggatctcgg catgaccgtg gtggccaccg gcacgcgcaa atccaccgag 1080tcggccctgc aggatctcgg catgaccgtg gtggccaccg gcacgcgcaa atccaccgag 1080
gaggacaaac agcggatccg tgagctgatg ggcgacgagg cggtgatgct tgaggagggc 1140gaggacaaac agcggatccg tgagctgatg ggcgacgagg cggtgatgct tgaggagggc 1140
aatgcccgca ccctgctcga cgtggtgtac cgctatcagg ccgacctgat gatcgccggc 1200aatgcccgca ccctgctcga cgtggtgtac cgctatcagg ccgacctgat gatcgccggc 1200
ggacgcaata tgtacaccgc ctggaaagcc cggctgccgt ttctcgatat caatcaggag 1260ggacgcaata tgtacaccgc ctggaaagcc cggctgccgt ttctcgatat caatcaggag 1260
cgcgagcacg cctacgccgg ctatcagggc atcatcaccc tcgcccgcca gctctgtctg 1320cgcgagcacg cctacgccgg ctatcagggc atcatcaccc tcgcccgcca gctctgtctg 1320
accctcgcca gccccgtctg gccgcaaacg catacccgcg ccccgtggcg ctag 1374accctcgcca gccccgtctg gccgcaaacg catacccgcg ccccgtggcg ctag 1374
<210> 287<210> 287
<211> 1449<211> 1449
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifD2<223> nifD2
<400> 287<400> 287
atgaccaacg caacaggcga acgtaacctt gcgctcatcc aggaagtcct ggaggtgttt 60atgaccaacg caacaggcga acgtaacctt gcgctcatcc aggaagtcct ggaggtgttt 60
cccgaaaccg cgcgcaaaga gcgcagaaag cacatgatga tcagcgatcc gcagatggag 120cccgaaaccg cgcgcaaaga gcgcagaaag cacatgatga tcagcgatcc gcagatggag 120
agcgtcggca agtgcattat ctcgaaccgt aaatcgcagc ccggggtgat gaccgtgcgc 180agcgtcggca agtgcattat ctcgaaccgt aaatcgcagc ccggggtgat gaccgtgcgc 180
ggctgcgcct atgcgggctc gaaaggggtg gtgtttgggc caatcaaaga catggcccat 240ggctgcgcct atgcgggctc gaaaaggggtg gtgtttgggc caatcaaaga catggcccat 240
atctcgcacg gccccatcgg ctgcggccag tattcccgcg ccggacggcg caactactat 300atctcgcacg gccccatcgg ctgcggccag tattcccgcg ccggacggcg caactactat 300
accggcgtca gcggtgtcga cagcttcggc accctgaact tcacctctga ttttcaggag 360accggcgtca gcggtgtcga cagcttcggc accctgaact tcacctctga ttttcaggag 360
cgcgatattg ttttcggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgatcgaaga gatggagctg 420cgcgatattg ttttcggcgg cgataaaaag ctgaccaaac tgatcgaaga gatggagctg 420
ctgttcccgc tgaccaaagg gatcaccatc cagtcggagt gcccggtggg cctgatcggc 480ctgttcccgc tgaccaaagg gatcaccatc cagtcggagt gcccggtggg cctgatcggc 480
gatgacatca gcgccgtagc caacgccagc agcaaggcgc tggataaacc ggtgatcccg 540gatgacatca gcgccgtagc caacgccagc agcaaggcgc tggataaacc ggtgatcccg 540
gtgcgctgcg aaggctttcg cggcgtatcg caatcgctgg gccaccatat cgccaacgac 600gtgcgctgcg aaggctttcg cggcgtatcg caatcgctgg gccaccatat cgccaacgac 600
gtggtgcgcg actgggtgct gaacaatcgc gaagggcagc cgtttgccag caccccgtac 660gtggtgcgcg actgggtgct gaacaatcgc gaagggcagc cgtttgccag caccccgtac 660
gatgttgcca tcattggcga ttacaacatc ggcggcgacg cctgggcctc gcgcattctg 720gatgttgcca tcattggcga ttacaacatc ggcggcgacg cctgggcctc gcgcattctg 720
ctggaagaga tggggctgcg cgtagtggcg cagtggtccg gcgacggcac cctggtggag 780ctggaagaga tggggctgcg cgtagtggcg cagtggtccg gcgacggcac cctggtggag 780
atggagaaca ccccattcgt taagcttaac ctcgtccact gctaccgttc gatgaactat 840atggagaaca ccccattcgt taagcttaac ctcgtccact gctaccgttc gatgaactat 840
atcgcccgcc atatggagga gaaacatcag atcccatgga tggaatataa cttcttcggc 900atcgcccgcc atatggagga gaaacatcag atcccatgga tggaatataa cttcttcggc 900
ccgaccaaaa tcgccgaatc gctgcgcaag atcgccgatc aatttgatga caccattcgc 960ccgaccaaaa tcgccgaatc gctgcgcaag atcgccgatc aatttgatga caccattcgc 960
gccaatgcgg aagcggtgat cgccaaatat gaggggcaga tggcggccat catcgccaaa 1020gccaatgcgg aagcggtgat cgccaaatat gaggggcaga tggcggccat catcgccaaa 1020
tatcgcccgc ggctggaggg gcgcaaagtg ctgctgtaca tgggggggct gcggccgcgc 1080tatcgcccgc ggctggaggg gcgcaaagtg ctgctgtaca tgggggggct gcggccgcgc 1080
cacgtcatcg gcgcctatga ggatctcggg atggagatca tcgccgccgg ctacgagttt 1140cacgtcatcg gcgcctatga ggatctcggg atggagatca tcgccgccgg ctacgagttt 1140
gcccataacg atgattacga ccgcaccctg ccggacctga aagagggcac cctgctgttt 1200gcccataacg atgattacga ccgcaccctg ccggacctga aagagggcac cctgctgttt 1200
gacgatgcca gcagctatga gctggaggcc ttcgtcaaag cgctgaaacc tgacctcatc 1260gacgatgcca gcagctatga gctggaggcc ttcgtcaaag cgctgaaacc tgacctcatc 1260
ggctccggga tcaaagagaa atatatcttc cagaaaatgg gggtgccgtt ccgccagatg 1320ggctccggga tcaaagagaa atatatcttc cagaaaatgg gggtgccgtt ccgccagatg 1320
cactcctggg actattccgg cccctatcac ggctatgacg gcttcgccat ctttgcccgc 1380cactcctggg actattccgg cccctatcac ggctatgacg gcttcgccat ctttgcccgc 1380
gatatggata tgaccctgaa caatccggcg tggaacgaac tgactgcccc gtggctgaag 1440gatatggata tgaccctgaa caatccggcg tggaacgaac tgactgcccc gtggctgaag 1440
tctgcgtga 1449tctgcgtga 1449
<210> 288<210> 288
<211> 1386<211> 1386
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifK1<223> nifK1
<400> 288<400> 288
atggcagata ttatccgcag tgaaaaaccg ctggcggtga gcccgattaa aaccgggcaa 60atggcagata ttatccgcag tgaaaaaccg ctggcggtga gcccgattaa aaccgggcaa 60
ccgctcgggg cgatcctcgc cagcctcggg ctggcccagg ccatcccgct ggtccacggc 120ccgctcgggg cgatcctcgc cagcctcggg ctggcccagg ccatcccgct ggtcccggc 120
gcccagggct gcagcgcctt cgccaaagtt ttctttattc agcatttcca tgacccggtg 180gcccagggct gcagcgcctt cgccaaagtt ttcttttattc agcatttcca tgacccggtg 180
ccgctgcagt cgacggccat ggatccgacc gccacgatca tgggggccga cggcaatatc 240ccgctgcagt cgacggccat ggatccgacc gccacgatca tgggggccga cggcaatatc 240
ttcaccgcgc tcgacaccct ctgccagcgc cacagcccgc aggccatcgt gctgctcagc 300ttcaccgcgc tcgacaccct ctgccagcgc cacagcccgc aggccatcgt gctgctcagc 300
accggtctgg cggaagcgca gggcagcgat atcgcccggg tggtgcgcca gtttcgcgag 360accggtctgg cggaagcgca gggcagcgat atcgcccggg tggtgcgcca gtttcgcgag 360
gcgcatccgc gccataacgg cgtggcgatc ctcaccgtca ataccccgga tttttttggc 420gcgcatccgc gccataacgg cgtggcgatc ctcaccgtca ataccccggga tttttttggc 420
tctatggaaa acggctacag cgcggtgatc gagagcgtga tcgagcagtg ggtcgcgccg 480tctatggaaa acggctacag cgcggtgatc gagagcgtga tcgagcagtg ggtcgcgccg 480
acgccgcgtc cggggcagcg gccccggcgg gtcaacctgc tggtcagcca cctctgttcg 540acgccgcgtc cggggcagcg gccccggcgg gtcaacctgc tggtcagcca cctctgttcg 540
ccaggggata tcgaatggct gggccgctgc gtggaggcct ttggcctgca gccggtgatc 600ccaggggata tcgaatggct gggccgctgc gtggaggcct ttggcctgca gccggtgatc 600
ctgccggacc tctcgcagtc aatggatggc cacctcggtg aaggggattt tacgcccctg 660ctgccggacc tctcgcagtc aatggatggc cacctcggtg aaggggattt tacgcccctg 660
acccagggcg gcgcctcgct gcgccagatt gcccagatgg gccagagtct gggcagcttc 720acccagggcg gcgcctcgct gcgccagatt gcccagatgg gccagagtct gggcagcttc 720
gccattggcg tgtcgctcca gcgggcggca tcgctcctga cccaacgcag ccgcggcgac 780gccattggcg tgtcgctcca gcgggcggca tcgctcctga cccaacgcag ccgcggcgac 780
gtgatcgccc tgccgcatct gatgaccctc gaccattgcg atacctttat ccatcagctg 840gtgatcgccc tgccgcatct gatgaccctc gaccattgcg atacctttat ccatcagctg 840
gcgaagatgt ccggacgccg cgtaccggcc tggattgagc gccagcgtgg ccagctgcag 900gcgaagatgt ccggacgccg cgtaccggcc tggattgagc gccagcgtgg ccagctgcag 900
gatgcgatga tcgactgcca tatgtggctt cagggccagc gcatggcgat ggcggcggag 960gatgcgatga tcgactgcca tatgtggctt cagggccagc gcatggcgat ggcggcggag 960
ggcgacctgc tggcggcgtg gtgtgatttc gcccgcagcc aggggatgca gcccggcccg 1020ggcgacctgc tggcggcgtg gtgtgatttc gcccgcagcc aggggatgca gcccggcccg 1020
ctggtcgccc ccaccagcca ccccagcctg cgccagctgc cggtcgagca agtcgtgccg 1080ctggtcgccc ccaccagcca ccccagcctg cgccagctgc cggtcgagca agtcgtgccg 1080
ggggatcttg aggatctgca gcagctgctg agccaccaac ccgccgatct gctggtggct 1140ggggatcttg aggatctgca gcagctgctg agccaccaac ccgccgatct gctggtggct 1140
aactctcacg cccgcgatct ggcggagcag tttgccctgc cgctgatccg cgtcggtttt 1200aactctcacg cccgcgatct ggcggagcag tttgccctgc cgctgatccg cgtcggtttt 1200
cccctcttcg accggctcgg tgagtttcgt cgcgtccgcc aggggtacgc cggtatgcga 1260cccctcttcg accggctcgg tgagtttcgt cgcgtccgcc aggggtacgc cggtatgcga 1260
gatacgctgt ttgaactggc caatctgctg cgcgaccgcc atcaccacac cgccctctac 1320gatacgctgt ttgaactggc caatctgctg cgcgaccgcc atcaccacac cgccctctac 1320
cgctcgccgc ttcgccaggg cgccgacccc cagccggctt caggagacgc ttatgccgcc 13801380
cattaa 1386cattaa 1386
<210> 289<210> 289
<211> 1563<211> 1563
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> nifK2<223> nifK2
<400> 289<400> 289
atgagccaaa cgatcgataa aattcacagc tgttatccgc tgtttgaaca ggatgaatac 60atgagccaaa cgatcgataa aattcacagc tgttatccgc tgtttgaaca ggatgaatac 60
cagaccctgt tccagaataa aaagaccctt gaagaggcgc acgacgcgca gcgtgtgcag 120cagaccctgt tccagaataa aaagaccctt gaagaggcgc acgacgcgca gcgtgtgcag 120
gaggtttttg cctggaccac caccgccgag tatgaagcgc tgaacttcca gcgcgaggcg 180gaggtttttg cctggaccac caccgccgag tatgaagcgc tgaacttcca gcgcgaggcg 180
ctgaccgtcg acccggccaa agcctgccag ccgctcggcg ccgtactctg cgcgctgggg 240ctgaccgtcg acccggccaa agcctgccag ccgctcggcg ccgtactctg cgcgctgggg 240
ttcgccggca ccctgcccta cgtgcacggc tcccagggct gcgtcgccta ttttcgcacc 300ttcgccggca ccctgccta cgtgcacggc tcccagggct gcgtcgccta ttttcgcacc 300
tactttaacc gccattttaa agagccggtc gcctgcgtct ccgactccat gaccgaggac 360tactttaacc gccattttaa agagccggtc gcctgcgtct ccgactccat gaccgaggac 360
gcggcggtgt tcggcggcaa caacaacatg aatctgggcc tgcagaatgc cagcgcgctg 420gcggcggtgt tcggcggcaa caacaacatg aatctgggcc tgcagaatgc cagcgcgctg 420
tataaacccg agattatcgc cgtctccacc acctgtatgg ccgaggtgat cggcgacgat 480tataaacccg agattatcgc cgtctccacc acctgtatgg ccgaggtgat cggcgacgat 480
ctgcaggcgt ttatcgccaa cgccaaaaaa gagggatttg ttgacgaccg catcgccatt 540ctgcaggcgt ttatcgccaa cgccaaaaaa gagggatttg ttgacgaccg catcgccatt 540
ccttacgccc atacccccag ctttatcggc agccatgtca ccggctggga caatatgttc 600ccttacgccc atacccccag ctttatcggc agccatgtca ccggctggga caatatgttc 600
gaagggttcg cgaagacctt taccgctgac tacgccgggc agccgggcaa acagcaaaag 660660
ctcaatctgg tgaccggatt tgagacctat ctcggcaact tccgcgtgct gaagcggatg 720ctcaatctgg tgaccggatt tgagacctat ctcggcaact tccgcgtgct gaagcggatg 720
atggcgcaga tggatgtccc gtgcagcctg ctctccgacc catcagaggt gctcgacacc 780atggcgcaga tggatgtccc gtgcagcctg ctctccgacc catcagaggt gctcgacacc 780
cccgccgacg gccattaccg gatgtacgcc ggcggcacca gccagcagga gatcaaaacc 840cccgccgacg gccattaccg gatgtacgcc ggcggcacca gccagcagga gatcaaaacc 840
gcgccggacg ccattgacac cctgctgctg cagccgtggc agctggtgaa aagcaaaaag 900gcgccggacg ccattgacac cctgctgctg cagccgtggc agctggtgaa aagcaaaaag 900
gtggttcagg agatgtggaa ccagcccgcc accgaggtgg ccgttccgct gggcctggcc 960gtggttcagg agatgtggaa ccagcccgcc accgaggtgg ccgttccgct gggcctggcc 960
gccaccgacg cgctgctgat gaccgtcagt cagctgaccg gcaaaccgat cgccgacgct 1020gccaccgacg cgctgctgat gaccgtcagt cagctgaccg gcaaaccgat cgccgacgct 1020
ctgaccctgg agcgcggccg gctggtcgac atgatgctgg attcccacac ctggctgcat 1080ctgaccctgg agcgcggccg gctggtcgac atgatgctgg attcccacac ctggctgcat 1080
ggcaaaaaat tcggcctcta cggcgatccg gatttcgtga tggggctgac gcgcttcctg 1140ggcaaaaaat tcggcctcta cggcgatccg gatttcgtga tggggctgac gcgcttcctg 1140
ctggagctgg gctgcgagcc gacggtgatc ctcagtcata acgccaataa acgctggcaa 1200ctggagctgg gctgcgagcc gacggtgatc ctcagtcata acgccaataa acgctggcaa 1200
aaagcgatga agaaaatgct cgatgcctcg ccgtacggtc aggaaagcga agtgttcatc 1260aaagcgatga agaaaatgct cgatgcctcg ccgtacggtc aggaaagcga agtgttcatc 1260
aactgcgacc tgtggcactt ccggtcgctg atgttcaccc gtcagccgga ctttatgatc 1320aactgcgacc tgtggcactt ccggtcgctg atgttcaccc gtcagccgga ctttatgatc 1320
ggtaactcct acggcaagtt tatccagcgc gataccctgg caaagggcaa agccttcgaa 1380ggtaactcct acggcaagtt tatccagcgc gataccctgg caaagggcaa agccttcgaa 1380
gtgccgctga tccgtctggg ctttccgctg ttcgaccgcc atcatctgca ccgccagacc 1440gtgccgctga tccgtctggg ctttccgctg ttcgaccgcc atcatctgca ccgccagacc 1440
acctggggct atgaaggcgc aatgaacatc gtcacgacgc tggtgaacgc cgtgctggaa 1500acctggggct atgaaggcgc aatgaacatc gtcacgacgc tggtgaacgc cgtgctggaa 1500
aaactggacc acgacaccag ccagttgggc aaaaccgatt acagcttcga cctcgttcgt 15601560
taa 1563taa 1563
<210> 290<210> 290
<211> 2838<211> 2838
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> glnE<223> glnE
<400> 290<400> 290
atgatgccgc tttctccgca attacagcag cactggcaga cggtcgctga ccgtctgcca 60atgatgccgc tttctccgca attacagcag cactggcaga cggtcgctga ccgtctgcca 60
gcggattttc ccattgccga actgagccca caggccaggt cggtcatggc gttcagcgat 120gcggattttc ccattgccga actgagccca caggccaggt cggtcatggc gttcagcgat 120
tttgtcgaac agagtgtgat cgcccagccg ggctggctga atgagcttgc ggactcctcg 180tttgtcgaac agagtgtgat cgcccagccg ggctggctga atgagcttgc ggactcctcg 180
ccggaggcgg aagagtggcg gcattacgag gcctggctgc aggatcgcct gcaggccgtc 240ccggaggcgg aagagtggcg gcattacgag gcctggctgc aggatcgcct gcaggccgtc 240
actgacgaag cggggttgat gcgagagctg cgtctcttcc gccgccagat gatggtccgc 300actgacgaag cggggttgat gcgagagctg cgtctcttcc gccgccagat gatggtccgc 300
atcgcctggg cgcaggcgct gtcgctggtg agcgaagaag agactctgca gcagctgagc 360atcgcctggg cgcaggcgct gtcgctggtg agcgaagaag agactctgca gcagctgagc 360
gtcctggcgg agaccctgat tgtcgccgcc cgcgactggc tgtacgccgc ctgctgtaag 420gtcctggcgg agaccctgat tgtcgccgcc cgcgactggc tgtacgccgc ctgctgtaag 420
gagtggggaa cgccatgcaa tgccgagggc cagccgcagc cgctgctgat cctcgggatg 480gagtggggaa cgccatgcaa tgccgagggc cagccgcagc cgctgctgat cctcgggatg 480
ggaaagctgg gcggcggcga gctgaacttc tcttccgata tcgatctgat ctttgcctgg 540ggaaagctgg gcggcggcga gctgaacttc tcttccgata tcgatctgat ctttgcctgg 540
cctgagcatg gcgccacccg cggcggccgc cgcgagctgg ataacgccca gttctttacc 600cctgagcatg gcgccacccg cggcggccgc cgcgagctgg ataacgccca gttctttacc 600
cgtctggggc agcggctgat caaggccctt gaccagccga cgcaggacgg ctttgtctat 660cgtctggggc agcggctgat caaggccctt gaccagccga cgcaggacgg ctttgtctat 660
cgggttgaca tgcgcctgcg gccgtttggc gacagtgggc cgctggtact cagttttgcg 720cgggttgaca tgcgcctgcg gccgtttggc gacagtgggc cgctggtact cagttttgcg 720
gcgctggaag attattacca ggagcagggt cgggactggg aacgctatgc gatggtgaaa 780gcgctggaag attattacca ggagcagggt cgggactggg aacgctatgc gatggtgaaa 780
gcgcggatca tgggcgataa cgacggcgtg tacgccagcg agttgcgcgc gatgctccgt 840gcgcggatca tgggcgataa cgacggcgtg tacgccagcg agttgcgcgc gatgctccgt 840
cctttcgtct tccgccgtta tatcgacttc agcgtgatcc agtcgctgcg taacatgaaa 900cctttcgtct tccgccgtta tatcgacttc agcgtgatcc agtcgctgcg taacatgaaa 900
ggcatgatcg cccgcgaagt gcggcgtcgc gggctgaaag acaacatcaa gctcggcgcc 960ggcatgatcg cccgcgaagt gcggcgtcgc gggctgaaag acaacatcaa gctcggcgcc 960
ggcgggatcc gtgaaattga gtttatcgtt caggtctttc aactgatccg cggtggtcgc 1020ggcgggatcc gtgaaattga gtttatcgtt caggtctttc aactgatccg cggtggtcgc 1020
gaacctgcac tgcagcagcg cgccctgctg ccgacgctgg cggcgattga tgagctacat 1080gaacctgcac tgcagcagcg cgccctgctg ccgacgctgg cggcgattga tgagctacat 1080
ctgctgccgg aaggcgacgc ggcgctgctg cgcgaggcct atctgttcct gcgccggctg 1140ctgctgccgg aaggcgacgc ggcgctgctg cgcgaggcct atctgttcct gcgccggctg 1140
gaaaacctgc tgcaaagcat caacgatgag cagacccaga ccctgccgca ggatgaactt 1200gaaaacctgc tgcaaagcat caacgatgag cagacccaga ccctgccgca ggatgaactt 1200
aaccgcgcca ggctggcgtg ggggatgcat accgaagact gggagacgct gagcgcgcag 1260aaccgcgcca ggctggcgtg ggggatgcat accgaagact gggagacgct gagcgcgcag 1260
ctggcgagcc agatggccaa cgtgcggcga gtgtttaatg aactgatcgg cgatgatgag 1320ctggcgagcc agatggccaa cgtgcggcga gtgtttaatg aactgatcgg cgatgatgag 1320
gatcagtccc cggatgagca actggccgag tactggcgcg agctgtggca ggatgcgctg 1380gatcagtccc cggatgagca actggccgag tactggcgcg agctgtggca ggatgcgctg 1380
gaagaagatg acgccagccc ggcgctggcg catttaaacg ataccgaccg ccgtagcgtg 1440gaagaagatg acgccagccc ggcgctggcg catttaaacg ataccgaccg ccgtagcgtg 1440
ctggcgctga ttgccgattt tcgtaaagag ctggatcggc gcaccatcgg cccgcgcggc 1500ctggcgctga ttgccgattt tcgtaaagag ctggatcggc gcaccatcgg cccgcgcggc 1500
cgccaggtgc tggatcagct gatgccgcat ctgctgagcg aaatctgctc gcgcgccgat 1560cgccaggtgc tggatcagct gatgccgcat ctgctgagcg aaatctgctc gcgcgccgat 1560
gcgccgctgc ctctggcgcg gatcacgccg ctgttgaccg ggatcgtcac ccgtaccacc 1620gcgccgctgc ctctggcgcg gatcacgccg ctgttgaccg ggatcgtcac ccgtaccacc 1620
tatcttgagc tgctgagcga attccccggc gcgctgaagc acctgatcac gctctgcgcg 1680tatcttgagc tgctgagcga attccccggc gcgctgaagc acctgatcac gctctgcgcg 1680
gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg cgccacccgc tgctgctgga tgagctgctg 1740gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg cgccacccgc tgctgctgga tgagctgctg 1740
gatcccaaca ccctctatca gccgacggcg accgatgcct atcgcgacga gctgcgccag 1800gatcccaaca ccctctatca gccgacggcg accgatgcct atcgcgacga gctgcgccag 1800
tacctgctgc gcgtgccgga agaggatgaa gagcagcagc tggaggcgtt gcgccagttt 1860tacctgctgc gcgtgccgga agaggatgaa gagcagcagc tggaggcgtt gcgccagttt 1860
aagcaggcgc agcagctgca tatcgcggcg gcggatatcg ctggtaccct gccggtgatg 1920aagcaggcgc agcagctgca tatcgcggcg gcggatatcg ctggtaccct gccggtgatg 1920
aaggtcagcg atcacttaac ctggcttgcc gaagcgatcc tcgacgcggt ggtgcagcag 1980aaggtcagcg atcacttaac ctggcttgcc gaagcgatcc tcgacgcggt ggtgcagcag 1980
gcatgggggc agatggtcgc tcgctacggc cagccgaccc acctgcacga tcgccagggt 2040gcatgggggc agatggtcgc tcgctacggc cagccgaccc acctgcacga tcgccagggt 2040
cgcggcttcg ccgtcgtcgg ctacggtaag cttggcggct gggagctggg ctacagctcc 2100cgcggcttcg ccgtcgtcgg ctacggtaag cttggcggct gggagctggg ctacagctcc 2100
gatctcgatc tggtgttcct ccatgactgc ccggcggagg tgatgaccga cggcgagcgg 2160gatctcgatc tggtgttcct ccatgactgc ccggcggagg tgatgaccga cggcgagcgg 2160
gagattgacg gccgtcagtt ctacctgcgg ctggcccagc ggatcatgca cctgttcagc 2220gagattgacg gccgtcagtt ctacctgcgg ctggcccagc ggatcatgca cctgttcagc 2220
acccgcacct cgtccggtat tctctacgaa gtggacgccc ggctgcgtcc ttctggcgcg 2280acccgcacct cgtccggtat tctctacgaa gtggacgccc ggctgcgtcc ttctggcgcg 2280
gcggggatgc tggtcaccac cgccgacgcg tttgctgact atcagcagaa cgaagcctgg 2340gcggggatgc tggtcaccac cgccgacgcg tttgctgact atcagcagaa cgaagcctgg 2340
acgtgggaac atcaggcgct ggtgcgcgcc cgcgtggtct atggcgaccc ggcgctgcag 2400acgtgggaac atcaggcgct ggtgcgcgcc cgcgtggtct atggcgaccc ggcgctgcag 2400
gcgcgctttg acgccattcg tcgcgatatc ctgaccaccc cgcgggaggg gatgaccctg 2460gcgcgctttg acgccattcg tcgcgatatc ctgaccaccc cgcgggaggg gatgaccctg 2460
cagaccgagg ttcgcgagat gcgcgagaag atgcgcgccc accttggcaa caaacatccc 2520cagaccgagg ttcgcgagat gcgcgagaag atgcgcgccc accttggcaa caaacatccc 2520
gatcgttttg atatcaaagc cgatgccggc gggatcaccg atattgaatt tattactcag 2580gatcgttttg atatcaaagc cgatgccggc gggatcaccg atattgaatt tattactcag 2580
tatctggtcc tacgctatgc cagtgacaag ccgaagctga cccgctggtc tgacaacgtg 26402640
cgtattcttg agctgctggc gcagaacgac atcatggacg aggaggaggc gcgcgcctta 2700cgtattcttg agctgctggc gcagaacgac atcatggacg aggaggaggc gcgcgcctta 2700
acgcatgcgt acaccacctt gcgtgatgcg ctccatcacc tggccctgca ggagcagccg 2760acgcatgcgt acaccacctt gcgtgatgcg ctccatcacc tggccctgca ggagcagccg 2760
ggacacgtgg cgccagaggc cttcagccgg gagcgtcagc aggtcagcgc cagctggcag 2820ggacacgtgg cgccagaggc cttcagccgg gagcgtcagc aggtcagcgc cagctggcag 2820
aagtggctga tggcttaa 2838aagtggctga tggcttaa 2838
<210> 291<210> 291
<211> 449<211> 449
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> Prm4<223> Prm4
<400> 291<400> 291
agtctgaact catcctgcgg cagtcggtga gacgtatttt tgaccaaaga gtgatctaca 60agtctgaact catcctgcgg cagtcggtga gacgtatttt tgaccaaaga gtgatctaca 60
tcacggaatt ttgtggttgt tgctgcttaa aagggcaaat ctacccttag aatcaactgt 120tcacggaatt ttgtggttgt tgctgcttaa aagggcaaat ctacccttag aatcaactgt 120
tatatcaggg ggattcagag agatattagg aatttgcaca agcgcacaat ttaaccacat 180tatatcaggg ggattcagag agatattagg aatttgcaca agcgcacaat ttaaccacat 180
catgataacg ccatgtaaaa caaagataaa aaaacaaaat gcagtgactt acatcgcaag 240catgataacg ccatgtaaaa caaagataaa aaaacaaaat gcagtgactt acatcgcaag 240
caaggcattt tcttatccaa ttgctcaaag tttggccttt catatcgcaa cgaaaatgcg 300caaggcattt tcttatccaa ttgctcaaag tttggccttt catatcgcaa cgaaaatgcg 300
taatatacgc gcccttgcgg acatcagtat ggtcattcct agttcatgcg catcggacac 360taatatacgc gcccttgcgg acatcagtat ggtcattcct agttcatgcg catcggacac 360
caccagctta caaattgcct gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga ccgaccattt 420caccagctta caaattgcct gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga ccgaccattt 420
cgtgccttat gtcatgcgat gggggctgg 449cgtgccttat gtcatgcgat gggggctgg 449
<210> 292<210> 292
<211> 500<211> 500
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> Prm1.2<223> Prm1.2
<400> 292<400> 292
tgaacatcac tgatgcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 60tgaacatcac tgatgcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 60
caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac 120caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat tggctttaaa attcgcgaac 120
acacgctacg ccgtgttcct tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca 180acacgctacg ccgtgttcct tatatgttag tttgtggcga taaagaggtc gaagcaggca 180
aagttgctgt tcgtacccgc cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg 240aagttgctgt tcgtacccgc cgcggcaaag acttaggaag catggatgtt agcgaagtcg 240
ttgacaaact gctggcggaa atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta 300ttgacaaact gctggcggaa atccgcagca gaagtcttca tcaactggag gaataaagta 300
ttaaaggcgg aaaacgagtt caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg 360ttaaaggcgg aaaacgagtt caaccggcgc gtcctaatcg cattaacaaa gagattcgcg 360
cgcaagaagt tcgcctcaca ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg 420cgcaagaagt tcgcctcaca ggcgtcgatg gcgagcagat tggtattgtc agtctgaatg 420
aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg 480aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt agaaatcagt ccgaatgccg 480
agccgccagt ttgtcgaatc 500agccgccagt ttgtcgaatc 500
<210> 293<210> 293
<211> 170<211> 170
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> Prm3.1<223> Prm3.1
<400> 293<400> 293
tacagtagcg cctctcaaaa atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttattttttc 60tacagtagcg cctctcaaaa atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttatttttttc 60
tacccataat cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa 120tacccataat cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa 120
tgacctatcc tgggtcctaa agttgtagtt gacattagcg gagcactaac 170tgacctatcc tgggtcctaa agttgtagtt gacattagcg gagcactaac 170
<210> 294<210> 294
<211> 142<211> 142
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> Prm6.1<223> Prm6.1
<400> 294<400> 294
aatttttttt cacaaagcgt agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt 60aatttttttt cacaaagcgt agcgttattg aatcgcacat tttaaactgt tggccgctgt
ggaagcgaat attggtgaaa ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt 120ggaagcgaat attggtgaaa ggtgcggttt taaggccttt ttctttgact ctctgtcgtt 120
acaaagttaa tatgcgcgcc ct 142acaaagttaa tatgcgcgcc ct 142
<210> 295<210> 295
<211> 293<211> 293
<212> ДНК<212> DNA
<213> Rahnella aquatilis<213> Rahnella aquatilis
<220><220>
<223> Prm7.1<223> Prm7.1
<400> 295<400> 295
ttaaaaacgt gaccacgagc attaataaac gccacgaaat gtggcgttta tttattcaaa 60ttaaaaacgt gaccgagc attaataaac gccacgaaat gtggcgttta tttattcaaa 60
aagtatcttc tttcataaaa agtgctaaat gcagtagcag caaaattggg ataagtccca 120aagtatcttc tttcataaaa agtgctaaat gcagtagcag caaaattggg ataagtccca 120
tggaatacgg ctgttttcgc tgcaattttt aactttttcg taaaaaaaga tgtttctttg 180tggaatacgg ctgttttcgc tgcaattttt aactttttcg taaaaaaaga tgtttctttg 180
agcgaacgat caaaatatag cgttaaccgg caaaaaatta ttctcattag aaaatagttt 240agcgaacgat caaaatatag cgttaaccgg caaaaaatta ttctcattag aaaatagttt 240
gtgtaatact tgtaacgcta catggagatt aacttaatct agagggtttt ata 293gtgtaatact tgtaacgcta catggagatt aacttaatct aggggtttt ata 293
<210> 296<210> 296
<211> 1188<211> 1188
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2<223> glnE-delta-AR-2
<400> 296<400> 296
atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc cgatggtcgc gacacaactt 60atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc cgatggtcgc gacacaactt 60
gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt 120gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc gcacgcttta ccagccgatt 120
gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga tgcgggtgcc aacagaagac 180gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga tgcgggtgcc aacagaagac 180
gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg cccagcattt gcgtatcgca 240gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg cccagcattt gcgtatcgca 240
gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt 300gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca gtgaccattt aacctacctt 300
gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac 360gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg aacaaatggt cgtaaaatac 360
gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt ttgccgtggt cggttacggg 420gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt ttgccgtggt cggttacggg 420
aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg atctggtctt cctgctcgat 480aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg atctggtctt cctgctcgat 480
tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg acggacgtca gttttatctt 540tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg acggacgtca gttttatctt 540
cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga catcgtcagg cattctttac 600cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcaccggga catcgtcagg cattctttac 600
gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca tgctggtcag taccattgaa 660gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca tgctggtcag taccattgaa 660
gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg agcatcaggc gctggttcgc 720gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg agcatcaggc gctggttcgc 720
gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat ttaacgccac gcgtcgcgac 780gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat ttaacgccac gcgtcgcgac 780
attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg aggtccgtga aatgcgcgag 840attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg aggtccgtga aatgcgcgag 840
aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt ttgatctgaa agccgatccg 900aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt ttgatctgaa agccgatccg 900
ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg ttctgcgttt cgcgcatgat 960ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg ttctgcgttt cgcgcatgat 960
gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt ttgaactgat ggcacgatat 1020gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt ttgaactgat ggcacgatat 1020
gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg cttatgtgac gctgcgcgat 1080gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg cttatgtgac gctgcgcgat 1080
gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag tggccgcgga cagctttgct 1140gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag tggccgcgga cagctttgct 1140
actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc tcggctga 1188actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc tcggctga 1188
<210> 297<210> 297
<211> 2188<211> 2188
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> glnE-delta-AR-2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> glnE-delta-AR-2 with a 500 bp flanking region.
<400> 297<400> 297
cggtactgga acagaaatcg gcggatgcgc aggaaatttg ttatgacacg gcctgtctga 60cggtactgga acagaaatcg gcggatgcgc aggaaatttg ttatgacacg gcctgtctga 60
agtgcaagtt agtgcttact tcctggctgg caacctcagg ctggacgccg tttattgatg 120agtgcaagtt agtgcttact tcctggctgg caacctcagg ctggacgccg tttattgatg 120
ataaatctgc gaagaaactg gacgcttcct tcaaacgttt tgctgacatc atgctcggtc 180ataaatctgc gaagaaactg gacgcttcct tcaaacgttt tgctgacatc atgctcggtc 180
gtaccgcagc ggatctgaaa gaagcctttg cgcagccact gacggaagaa ggttatcgcg 240gtaccgcagc ggatctgaaa gaagcctttg cgcagccact gacggaagaa ggttatcgcg 240
atcagctggc gcgcctgaaa cgccagatca ttaccttcca tttgcttgcc ggtgcttacc 300atcagctggc gcgcctgaaa cgccagatca ttaccttcca tttgcttgcc ggtgcttacc 300
ctgaaaaaga cgtcgatgcg tatattgccg gctgggtgga cctgcaacag gccatcgttc 360ctgaaaaaga cgtcgatgcg tatattgccg gctgggtgga cctgcaacag gccatcgttc 360
agcagcaaca cgcctgggag gattcggccc gttctcacgc ggtgatgatg gatgctttct 420agcagcaaca cgcctgggag gattcggccc gttctcacgc ggtgatgatg gatgctttct 420
ggttaaacgg gcaacctcgt taactgactg actagcctgg gcaaactgcc cgggcttttt 480ggttaaacgg gcaacctcgt taactgactg actagcctgg gcaaactgcc cgggcttttt 480
tttgcaagga atctgatttc atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc 540tttgcaagga atctgatttc atggcgctca aacagttaat ccgtctgtgt gccgcctcgc 540
cgatggtcgc gacacaactt gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc 600cgatggtcgc gacacaactt gcacgtcatc ctttattgct cgatgaactg ctcgacccgc 600
gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga 660gcacgcttta ccagccgatt gagccgggcg cttaccgcga cgaactgcgt cagtatctga 660
tgcgggtgcc aacagaagac gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg 720tgcgggtgcc aacagaagac gaagaacagc agcttgaagc cgtgcgccag ttcaaacagg 720
cccagcattt gcgtatcgca gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca 780cccagcattt gcgtatcgca gccggggata tttccggggc attgccggtg atgaaagtca 780
gtgaccattt aacctacctt gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg 840gtgaccattt aacctacctt gccgaggcca ttctcgatgt cgtggtgcag catgcgtggg 840
aacaaatggt cgtaaaatac gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt 900aacaaatggt cgtaaaatac gggcagcccg cgcatcttca gcaccgtgag gggcgcggtt 900
ttgccgtggt cggttacggg aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg 960ttgccgtggt cggttacggg aaactcggtg gctgggagct gggttatagc tcagatctgg 960
atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg 1020atctggtctt cctgctcgat tgcgcgccgg aggtgatgac ggacggcgaa cgcagcatcg 1020
acggacgtca gttttatctt cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcacccgga 1080acggacgtca gttttatctt cggctggcgc agcgcattat gcacttattc agcaccggga 1080
catcgtcagg cattctttac gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca 1140catcgtcagg cattctttac gaggttgatc cgcgtctgcg accttccggc gcatccggca 1140
tgctggtcag taccattgaa gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg 1200tgctggtcag taccattgaa gcgtttgcag attatcaggc caatgaagcc tggacgtggg 1200
agcatcaggc gctggttcgc gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat 1260agcatcaggc gctggttcgc gcgcgcgtgg tttacgggga tccgcaactg acacagcaat 1260
ttaacgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg 1320ttaacgccac gcgtcgcgac attctttgcc gccagcgcga tggcgacggc ctgcgtaagg 1320
aggtccgtga aatgcgcgag aaaatgtatg cccatctggg gagtaaaaaa gcccacgagt 13801380
ttgatctgaa agccgatccg ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg 1440ttgatctgaa agccgatccg ggtggcatca cggatattga attcattgca caatacctgg 1440
ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt 1500ttctgcgttt cgcgcatgat gagccgaagc tgacgcgctg gtctgataac gtgcggattt 1500
ttgaactgat ggcacgatat gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg 1560ttgaactgat ggcacgatat gacatcatgc cggaagagga agcgcgccat ctgacgcagg 1560
cttatgtgac gctgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag 1620cttatgtgac gctgcgcgat gaaattcatc atctggcgtt gcaggaacac agcgggaaag 1620
tggccgcgga cagctttgct actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc 1680tggccgcgga cagctttgct actgagcgcg cgcagatccg tgccagctgg gcaaagtggc 1680
tcggctgagg gtttttattc ggctaacagg cgcttgtgat attatccggc gcattgtatt 1740tcggctgagg gtttttattc ggctaacagg cgcttgtgat attatccggc gcattgtatt 1740
tacccgattt gatttatctg ttttggagtc ttgggatgaa agtgactttg cctgattttc 1800tacccgattt gatttatctg ttttggagtc ttgggatgaa agtgactttg cctgattttc 1800
accgcgcagg tgtgctggtt gtcggtgacg taatgttaga ccgttactgg tatggcccga 1860accgcgcagg tgtgctggtt gtcggtgacg taatgttaga ccgttactgg tatggcccga 1860
ccaatcgtat ttctccggaa gctccggtgc cggtggtgaa ggtcagtacc attgaagagc 1920ccaatcgtat ttctccggaa gctccggtgc cggtggtgaa ggtcagtacc attgaagagc 1920
ggcctggcgg tgcagctaac gtggcgatga acatttcatc tctgggcgcc tcttcctgtc 1980ggcctggcgg tgcagctaac gtggcgatga acatttcatc tctgggcgcc tcttcctgtc 1980
tgatcggcct gaccggcgta gacgacgctg cgcgtgccct cagtgagcgt ctggcagaag 2040tgatcggcct gaccggcgta gacgacgctg cgcgtgccct cagtgagcgt ctggcagaag 2040
tgaaagttaa ctgcgatttc gtcgcactat ccacacatcc taccatcacc aaactgcgaa 2100tgaaagttaa ctgcgatttc gtcgcactat ccacacatcc taccatcacc aaactgcgaa 2100
ttttgtcccg taaccagcaa ctgatccgcc tcgactttga ggaaggtttt gaaggcgttg 2160ttttgtcccg taaccagcaa ctgatccgcc tcgactttga ggaaggtttt gaaggcgttg 2160
atctcgagcc gatgctgacc aaaataga 2188atctcgagcc gatgctgacc aaaataga 2188
<210> 298<210> 298
<211> 524<211> 524
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::null-v1<223> delta-nifL::null-v1
<400> 298<400> 298
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg agtctgaact catcctgcga 240gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg agtctgaact catcctgcga 240
tgggggctgg gccgtctctg aagctctcgg tgaacattgt tgcgaggcag gatgcgagct 300tgggggctgg gccgtctctg aagctctcgg tgaacattgt tgcgaggcag gatgcgagct 300
ggttgtgttt tgacattacc gataatgtgc cgcgtgaacg ggtgcgttat gcccgcccgg 360360
aagcggcgtt ttcccgtccg gggaatggca tggagctgcg ccttatccag acgctgatcg 420aagcggcgtt ttcccgtccg gggaatggca tggagctgcg ccttatccag acgctgatcg 420
cccatcatcg cggttcttta gatctctcgg tccgccctga tggcggcacc ttgctgacgt 480cccatcatcg cggttcttta gatctctcgg tccgccctga tggcggcacc ttgctgacgt 480
tacgcctgcc ggtacagcag gttatcaccg gaggcttaaa atga 524tacgcctgcc ggtacagcag gttatcaccg gaggcttaaa atga 524
<210> 299<210> 299
<211> 1524<211> 1524
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::null-v1 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::null-v1 with a 500 bp flanking region.
<400> 299<400> 299
tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60
tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120
gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180
aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240
ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300
cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360
catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420
gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480
gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540
atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600
cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660
tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720
agtctgaact catcctgcga tgggggctgg gccgtctctg aagctctcgg tgaacattgt 780agtctgaact catcctgcga tgggggctgg gccgtctctg aagctctcgg tgaacattgt 780
tgcgaggcag gatgcgagct ggttgtgttt tgacattacc gataatgtgc cgcgtgaacg 840tgcgaggcag gatgcgagct ggttgtgttt tgacattacc gataatgtgc cgcgtgaacg 840
ggtgcgttat gcccgcccgg aagcggcgtt ttcccgtccg gggaatggca tggagctgcg 900ggtgcgttat gcccgccgg aagcggcgtt ttcccgtccg gggaatggca tggagctgcg 900
ccttatccag acgctgatcg cccatcatcg cggttcttta gatctctcgg tccgccctga 960ccttatccag acgctgatcg cccatcatcg cggttcttta gatctctcgg tccgccctga 960
tggcggcacc ttgctgacgt tacgcctgcc ggtacagcag gttatcaccg gaggcttaaa 1020tggcggcacc ttgctgacgt tacgcctgcc ggtacagcag gttatcaccg gaggcttaaa 1020
atgacccagt tacctaccgc gggcccggtt atccggcgct ttgatatgtc tgcccagttt 10801080
acggcgcttt atcgcatcag cgtggcgctg agtcaggaaa gcaacaccgg gcgcgcactg 1140acggcgcttt atcgcatcag cgtggcgctg agtcaggaaa gcaacaccgg gcgcgcactg 1140
gcggcgatcc tcgaagtgct tcacgatcat gcatttatgc aatacggcat ggtgtgtctg 1200gcggcgatcc tcgaagtgct tcacgatcat gcatttatgc aatacggcat ggtgtgtctg 1200
tttgataaag aacgcaatgc actctttgtg gaatccctgc atggcatcga cggcgaaagg 1260tttgataaag aacgcaatgc actctttgtg gaatccctgc atggcatcga cggcgaaagg 1260
aaaaaagaga cccgccatgt ccgttaccgc atgggggaag gcgtgatcgg cgcggtgatg 1320aaaaaagaga cccgccatgt ccgttaccgc atgggggaag gcgtgatcgg cgcggtgatg 1320
agccagcgtc aggcgctggt gttaccgcgc atttcagacg atcagcgttt tctcgaccgc 1380agccagcgtc aggcgctggt gttaccgcgc atttcagacg atcagcgttt tctcgaccgc 1380
ctgaatattt acgattacag cctgccgttg attggcgtgc cgatccccgg tgcggataat 1440ctgaatattt acgattacag cctgccgttg attggcgtgc cgatccccgg tgcggataat 1440
cagccatcgg gcgtgctggt ggcacagccg atggcgttgc acgaagaccg gctgactgcc 1500cagccatcgg gcgtgctggt ggcacagccg atggcgttgc acgaagaccg gctgactgcc 1500
agtacgcggt ttttagaaat ggtc 1524agtacgcggt ttttagaaat ggtc 1524
<210> 300<210> 300
<211> 266<211> 266
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::null-v2<223> delta-nifL::null-v2
<400> 300<400> 300
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg ttaaagcctg ccggtacagc 240gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg ttaaagcctg ccggtacagc 240
aggttatcac cggaggctta aaatga 266aggttatcac cggaggctta aaatga 266
<210> 301<210> 301
<211> 1266<211> 1266
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::null-v2 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::null-v2 with a 500 bp flanking region.
<400> 301<400> 301
tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60
tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120
gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180
aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240
ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300
cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360
catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420
gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480
gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540
atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600
cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660
tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720
ttaaagcctg ccggtacagc aggttatcac cggaggctta aaatgaccca gttacctacc 780ttaaagcctg ccggtacagc aggttatcac cggaggctta aaatgaccca gttacctacc 780
gcgggcccgg ttatccggcg ctttgatatg tctgcccagt ttacggcgct ttatcgcatc 840gcgggccgg ttatccggcg ctttgatatg tctgcccagt ttacggcgct ttatcgcatc 840
agcgtggcgc tgagtcagga aagcaacacc gggcgcgcac tggcggcgat cctcgaagtg 900agcgtggcgc tgagtcagga aagcaacacc gggcgcgcac tggcggcgat cctcgaagtg 900
cttcacgatc atgcatttat gcaatacggc atggtgtgtc tgtttgataa agaacgcaat 960cttcacgatc atgcatttat gcaatacggc atggtgtgtc tgtttgataa agaacgcaat 960
gcactctttg tggaatccct gcatggcatc gacggcgaaa ggaaaaaaga gacccgccat 1020gcactctttg tggaatccct gcatggcatc gacggcgaaa ggaaaaaaga gacccgccat 1020
gtccgttacc gcatggggga aggcgtgatc ggcgcggtga tgagccagcg tcaggcgctg 1080gtccgttacc gcatggggga aggcgtgatc ggcgcggtga tgagccagcg tcaggcgctg 1080
gtgttaccgc gcatttcaga cgatcagcgt tttctcgacc gcctgaatat ttacgattac 1140gtgttaccgc gcatttcaga cgatcagcgt tttctcgacc gcctgaatat ttacgattac 1140
agcctgccgt tgattggcgt gccgatcccc ggtgcggata atcagccatc gggcgtgctg 1200agcctgccgt tgattggcgt gccgatcccc ggtgcggata atcagccatc gggcgtgctg 1200
gtggcacagc cgatggcgtt gcacgaagac cggctgactg ccagtacgcg gtttttagaa 12601260
atggtc 1266atggtc 1266
<210> 302<210> 302
<211> 943<211> 943
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm4<223> delta-nifL::Prm4
<400> 302<400> 302
atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga atatcgccag ccgcttgtcg 60
ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat cttcggtggc gatttcgctg 120
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 180
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg agtctgaact catcctgcgg 240gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg agtctgaact catcctgcgg 240
cagtcggtga gacgtatttt tgaccaaaga gtgatctaca tcacggaatt ttgtggttgt 300300
tgctgcttaa aagggcaaat ctacccttag aatcaactgt tatatcaggg ggattcagag 360tgctgcttaa aagggcaaat ctacccttag aatcaactgt tatatcaggg ggattcagag 360
agatattagg aatttgcaca agcgcacaat ttaaccacat catgataacg ccatgtaaaa 420agatattagg aatttgcaca agcgcacaat ttaaccacat catgataacg ccatgtaaaa 420
caaagataaa aaaacaaaat gcagtgactt acatcgcaag caaggcattt tcttatccaa 480caaagataaa aaaacaaaat gcagtgactt acatcgcaag caaggcattt tcttatccaa 480
ttgctcaaag tttggccttt catatcgcaa cgaaaatgcg taatatacgc gcccttgcgg 540ttgctcaaag tttggccttt catatcgcaa cgaaaatgcg taatatacgc gcccttgcgg 540
acatcagtat ggtcattcct agttcatgcg catcggacac caccagctta caaattgcct 600acatcagtat ggtcattcct agttcatgcg catcggacac caccagctta caaattgcct 600
gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga ccgaccattt cgtgccttat gtcatgcgat 660gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga ccgaccattt cgtgccttat gtcatgcgat 660
gggggctggg ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg 720gggggctggg ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg 720
gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg cccgcccgga 780gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg cccgccggga 780
agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga cgctgatcgc 840agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc cttatccaga cgctgatcgc 840
ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt 900ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat ggcggcacct tgctgacgtt 900
acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tga 943acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa tga 943
<210> 303<210> 303
<211> 1943<211> 1943
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> delta-nifL::Prm4 с фланкирующей областью длиной 500 п.н.<223> delta-nifL::Prm4 with a 500 bp flanking region.
<400> 303<400> 303
tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60tgtttcgtct cgaggccggg caactgagcg gccccgttga aaccgacctg ggctggcatc 60
tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120tgttgttgtg cgaacaaatt cgcctgccgc aacccttgcc gaaagccgaa gccttaacgc 120
gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180gggtgcgtca gcaactgatt gcccggcaac agaaacatta tcagcgccag tggctgcaac 180
aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240aactgatcaa cgcctgagcc tgttctcctt cttgttgatg cagacgggtt aatgcccgtt 240
ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300ttgcacgaaa aatgcacata aattgcctgc gttgccttat aacagcgcag ggaaatcctg 300
cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360cctccggcct tgtgccacac cgcgctttgc ctggtttgtg gtaaaaactg gcccgctttg 360
catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420catcctgatg cttaaaacac cccgttcaga tcaacctttg ggcagataag cccgcgaaag 420
gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480gcctgcaaat tgcacggtta ttccgggtga gtatatgtgt gatttgggtt ccggcattgc 480
gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540gcaataaagg ggagaaagac atgagcatca cggcgttatc agcatcattt cctgagggga 540
atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600atatcgccag ccgcttgtcg ctgcaacatc cttcactgtt ttataccgtg gttgaacaat 600
cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660cttcggtggc gatttcgctg accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat 660
tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720tctgccgcca gacgggtttt gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 720
agtctgaact catcctgcgg cagtcggtga gacgtatttt tgaccaaaga gtgatctaca 780agtctgaact catcctgcgg cagtcggtga gacgtatttt tgaccaaaga gtgatctaca 780
tcacggaatt ttgtggttgt tgctgcttaa aagggcaaat ctacccttag aatcaactgt 840tcacggaatt ttgtggttgt tgctgcttaa aagggcaaat ctacccttag aatcaactgt 840
tatatcaggg ggattcagag agatattagg aatttgcaca agcgcacaat ttaaccacat 900tatatcaggg ggattcagag agatattagg aatttgcaca agcgcacaat ttaaccacat 900
catgataacg ccatgtaaaa caaagataaa aaaacaaaat gcagtgactt acatcgcaag 960catgataacg ccatgtaaaa caaagataaa aaaacaaaat gcagtgactt acatcgcaag 960
caaggcattt tcttatccaa ttgctcaaag tttggccttt catatcgcaa cgaaaatgcg 1020caaggcattt tcttatccaa ttgctcaaag tttggccttt catatcgcaa cgaaaatgcg 1020
taatatacgc gcccttgcgg acatcagtat ggtcattcct agttcatgcg catcggacac 1080taatatacgc gcccttgcgg acatcagtat ggtcattcct agttcatgcg catcggacac 1080
caccagctta caaattgcct gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga ccgaccattt 1140caccagctta caaattgcct gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga ccgaccattt 1140
cgtgccttat gtcatgcgat gggggctggg ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt 1200cgtgccttat gtcatgcgat gggggctggg ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt 1200
gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg 1260gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg 1260
gtgcgttatg cccgcccgga agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc 1320gtgcgttatg cccgcccgga agcggcgttt tcccgtccgg ggaatggcat ggagctgcgc 1320
cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat 1380cttatccaga cgctgatcgc ccatcatcgc ggttctttag atctctcggt ccgccctgat 1380
ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa 1440ggcggcacct tgctgacgtt acgcctgccg gtacagcagg ttatcaccgg aggcttaaaa 1440
tgacccagtt acctaccgcg ggcccggtta tccggcgctt tgatatgtct gcccagttta 1500tgacccagtt acctaccgcg ggcccggtta tccggcgctt tgatatgtct gcccagttta 1500
cggcgcttta tcgcatcagc gtggcgctga gtcaggaaag caacaccggg cgcgcactgg 15601560
cggcgatcct cgaagtgctt cacgatcatg catttatgca atacggcatg gtgtgtctgt 1620cggcgatcct cgaagtgctt cacgatcatg catttatgca atacggcatg gtgtgtctgt 1620
ttgataaaga acgcaatgca ctctttgtgg aatccctgca tggcatcgac ggcgaaagga 1680ttgataaaga acgcaatgca ctctttgtgg aatccctgca tggcatcgac ggcgaaagga 1680
aaaaagagac ccgccatgtc cgttaccgca tgggggaagg cgtgatcggc gcggtgatga 17401740
gccagcgtca ggcgctggtg ttaccgcgca tttcagacga tcagcgtttt ctcgaccgcc 1800gccagcgtca ggcgctggtg ttaccgcgca tttcagacga tcagcgtttt ctcgaccgcc 1800
tgaatattta cgattacagc ctgccgttga ttggcgtgcc gatccccggt gcggataatc 1860tgaatattta cgattacagc ctgccgttga ttggcgtgcc gatccccggt gcggataatc 1860
agccatcggg cgtgctggtg gcacagccga tggcgttgca cgaagaccgg ctgactgcca 1920agccatcggg cgtgctggtg gcacagccga tggcgttgca cgaagaccgg ctgactgcca 1920
gtacgcggtt tttagaaatg gtc 1943gtacgcggtttttagaaatg gtc 1943
<210> 304<210> 304
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 304<400> 304
tggtgtccgg gcgaacgtcg ccaggtggca caaattgtca gaactacgac acgactaacc 60tggtgtccgg gcgaacgtcg ccaggtggca caaattgtca gaactacgac acgactaacc 60
gaccgcagga gtgtgcgatg accctgaata tgatgatgga 100gaccgcagga gtgtgcgatg accctgaata tgatgatgga 100
<210> 305<210> 305
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 305<400> 305
cggaaaacga gttcaaacgg cgcgtcccaa tcgtattaat ggcgagattc gcgccacgga 60cggaaaacga gttcaaacgg cgcgtcccaa tcgtattaat ggcgagattc gcgccacggga 60
agttcgctta acaggtctgg aaggcgagca gcttggtatt 100agttcgctta acaggtctgg aaggcgagca gcttggtatt 100
<210> 306<210> 306
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 306<400> 306
cgccagagag ttgaaatcga acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg 60cgccagagag ttgaaatcga acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg 60
ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg 100ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg 100
<210> 307<210> 307
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 307<400> 307
cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta accgaccgca 60cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta accgaccgca 60
ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc 100ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc 100
<210> 308<210> 308
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 308<400> 308
tcaacctaaa aaagtttgtg taatacttgt aacgctacat ggagattaac tcaatctaga 60tcaacctaaa aaagtttgtg taatacttgt aacgctacat ggagattaac tcaatctaga 60
gggtattaat aatgaatcgt actaaactgg tactgggcgc 100gggtattaat aatgaatcgt actaaactgg tactgggcgc 100
<210> 309<210> 309
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 309<400> 309
cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta accgaccgca 60cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta accgaccgca 60
ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc 100ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc 100
<210> 310<210> 310
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 310<400> 310
aattttctgc ccaaatggct gggattgttc attttttgtt tgccttacaa cgagagtgac 60aatttttctgc ccaaatggct gggattgttc atttttttgtt tgccttacaa cgagagtgac 60
agtacgcgcg ggtagttaac tcaacatctg accggtcgat 100agtacgcgcg ggtagttaac tcaacatctg accggtcgat 100
<210> 311<210> 311
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 311<400> 311
gtaaccaata aaggccacca cgccagacca cacgatagtg atggcaacac tttccagctg 60gtaaccaata aaggccacca cgccagacca cacgatagtg atggcaacac tttccagctg 60
caccagcacc tgatggccca tggtcacacc ttcagcgaaa 100caccagcacc tgatggccca tggtcacacc ttcagcgaaa 100
<210> 312<210> 312
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 312<400> 312
tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt 60tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt 60
agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc 100agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc 100
<210> 313<210> 313
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 313<400> 313
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 100gcacttgaga cacttttgggg cgagaaccac cgtctgctgg 100
<210> 314<210> 314
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 314<400> 314
cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa tgacctatcc 60cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa tgacctatcc 60
tgggtcctaa agttgtagtt gacattagcg gagcactaac 100tgggtcctaa agttgtagtt gacattagcg gagcactaac 100
<210> 315<210> 315
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 315<400> 315
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 100gcacttgaga cacttttgggg cgagaaccac cgtctgctgg 100
<210> 316<210> 316
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 316<400> 316
tcaacctaaa aaagtttgtg taatacttgt aacgctacat ggagattaac tcaatctaga 60tcaacctaaa aaagtttgtg taatacttgt aacgctacat ggagattaac tcaatctaga 60
gggtattaat aatgaatcgt actaaactgg tactgggcgc 100gggtattaat aatgaatcgt actaaactgg tactgggcgc 100
<210> 317<210> 317
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 317<400> 317
gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta actgaccgca 60gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta actgaccgca 60
ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc 100ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc 100
<210> 318<210> 318
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 318<400> 318
gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta actgaccgca 60gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta actgaccgca 60
ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc 100ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc 100
<210> 319<210> 319
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 319<400> 319
taagaattat ctggatgaat gtgccattaa atgcgcagca taatggtgcg ttgtgcggga 60taagaattat ctggatgaat gtgccattaa atgcgcagca taatggtgcg ttgtgcggga 60
aaactgcttt tttttgaaag ggttggtcag tagcggaaac 100aaactgcttt tttttgaaag ggttggtcag tagcggaaac 100
<210> 320<210> 320
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 320<400> 320
cgccagagag tcgaaatcga acatttccgt aataccgcga ttacccagga gccgttctgg 60cgccagagag tcgaaatcga acatttccgt aataccgcga ttacccagga gccgttctgg 60
ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg 100ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg 100
<210> 321<210> 321
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 321<400> 321
cgccagagag tcgaaatcga acatttccgt aataccgcga ttacccagga gccgttctgg 60cgccagagag tcgaaatcga acatttccgt aataccgcga ttacccagga gccgttctgg 60
ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg 100ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg 100
<210> 322<210> 322
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 322<400> 322
gatgatggat gctttctggt taaacgggca acctcgttaa ctgactgact agcctgggca 60gatgatggat gctttctggt taaacgggca acctcgttaa ctgactgact agcctgggca 60
aactgcccgg gctttttttt gcaaggaatc tgatttcatg 100aactgcccgg gctttttttt gcaaggaatc tgatttcatg 100
<210> 323<210> 323
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 323<400> 323
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg 100gcacttgaga cacttttgggg cgagaaccac cgtctgctgg 100
<210> 324<210> 324
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 324<400> 324
catcggacac caccagctta caaattgcct gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga 60catcggacac caccagctta caaattgcct gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga 60
ccgaccattt cgtgccttat gtcatgcgat gggggctggg 100ccgaccattt cgtgccttat gtcatgcgat gggggctggg 100
<210> 325<210> 325
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 325<400> 325
tcttcaacaa ctggaggaat aaggtattaa aggcggaaaa cgagttcaaa cggcacgtcc 60tcttcaacaa ctggaggaat aaggtattaa aggcggaaaa cgagttcaaa cggcacgtcc 60
gaatcgtatc aatggcgaga ttcgcgccct ggaagttcgc 100gaatcgtatc aatggcgaga ttcgcgccct ggaagttcgc 100
<210> 326<210> 326
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 326<400> 326
tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60
cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga 100cgacacaggga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga 100
<210> 327<210> 327
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 327<400> 327
atcgcagcgt ctttgaatat ttccgtcgcc aggcgctggc tgccgagccg ttctggctgc 60atcgcagcgt ctttgaatat ttccgtcgcc aggcgctggc tgccgagccg ttctggctgc 60
atagtggaaa acgataattt caggccaggg agcccttatg 100atagtggaaa acgataattt caggccaggg agcccttatg 100
<210> 328<210> 328
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 328<400> 328
tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60
cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga 100cgacacaggga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga 100
<210> 329<210> 329
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 329<400> 329
tcacttttta gcaaagttgc actggacaaa aggtaccaca attggtgtac tgatactcga 60tcacttttta gcaaagttgc actggacaaa aggtaccaca attggtgtac tgatactcga 60
cacagcatta gtgtcgattt ttcatataaa ggtaattttg 100cacagcatta gtgtcgattt ttcatataaa ggtaattttg 100
<210> 330<210> 330
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 330<400> 330
tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60
cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga 100cgacacaggga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga 100
<210> 331<210> 331
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 331<400> 331
gttctccttt gcaatagcag ggaagaggcg ccagaaccgc cagcgttgaa gcagtttgaa 60gttctccttt gcaatagcag ggaagaggcg ccagaaccgc cagcgttgaa gcagtttgaa 60
cgcgttcagt gtataatccg aaacttaatt tcggtttgga 100cgcgttcagt gtataatccg aaacttaatt tcggtttgga 100
<210> 332<210> 332
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 332<400> 332
tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60
cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga 100cgacacaggga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga 100
<210> 333<210> 333
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 333<400> 333
gatatgcctg aagtattcaa ttacttaggc atttacttaa cgcaggcagg caattttgat 60gatatgcctg aagtattcaa ttacttaggc atttacttaa cgcaggcagg caattttgat 60
gctgcctatg aagcgtttga ttctgtactt gagcttgatc 100gctgcctatg aagcgtttga ttctgtactt gagcttgatc 100
<210> 334<210> 334
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 334<400> 334
tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt 60tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt 60
agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc 100agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc 100
<210> 335<210> 335
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 335<400> 335
tgcaaattgc acggttattc cgggtgagta tatgtgtgat ttgggttccg gcattgcgca 60tgcaaattgc acggttattc cgggtgagta tatgtgtgat ttgggttccg gcattgcgca 60
ataaagggga gaaagacatg agcatcacgg cgttatcagc 100ataaagggga gaaagacatg agcatcacgg cgttatcagc 100
<210> 336<210> 336
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 336<400> 336
tcagggctgc ggatgtcggg cgtttcacaa cacaaaatgt tgtaaatgcg acacagccgg 60tcagggctgc ggatgtcggg cgtttcacaa cacaaaatgt tgtaaatgcg acacagccgg 60
gcctgaaacc aggagcgtgt gatgaccttt aatatgatgc 100gcctgaaacc aggagcgtgt gatgaccttt aatatgatgc 100
<210> 337<210> 337
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. выше соединения<223> 100 b.p. above connection
<400> 337<400> 337
cggaaaacga gttcaaacgg cacgtccgaa tcgtatcaat ggcgagattc gcgcccagga 60cggaaaacga gttcaaacgg cacgtccgaa tcgtatcaat ggcgagattc gcgccgga 60
agttcgctta actggtctgg aaggtgagca gctgggtatt 100agttcgctta actggtctgg aaggtgagca gctgggtatt 100
<210> 338<210> 338
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 338<400> 338
ttcttggttc tctggagcgc tttatcggca tcctgactga agaatttgca ggcttcttcc 60ttcttggttc tctggagcgc tttatcggca tcctgactga agaatttgca ggcttcttcc 60
caacctggct tgcacccgtg caggtagttg tgatgaacat 100caacctggct tgcacccgtg caggtagttg tgatgaacat 100
<210> 339<210> 339
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 339<400> 339
gcgatagaac tcacttcacg ccccgaaggg ggaagctgcc tgaccctacg attcccgcta 60gcgatagaac tcacttcacg ccccgaaggg ggaagctgcc tgaccctacg attcccgcta 60
tttcattcac tgaccggagg ttcaaaatga cccagcgaac 100tttcattcac tgaccgggagg ttcaaaatga cccagcgaac 100
<210> 340<210> 340
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 340<400> 340
tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc 60tccctgtgcg ccgcgtcgcc gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc 60
gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg 100gatgaactgc tcgacccgaa cacgctctat caaccgacgg 100
<210> 341<210> 341
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 341<400> 341
cgttctgtaa taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt 60cgttctgtaa taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt 60
ttttatattc tcgactccat ttaaaataaa aaatccaatc 100ttttatattc tcgactccat ttaaaataaa aaatccaatc 100
<210> 342<210> 342
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 342<400> 342
aactcacttc acgccccgaa gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt 60aactcacttc acgccccgaa gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt 60
cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg 100cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg 100
<210> 343<210> 343
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 343<400> 343
cgcgtcaggt tgaacgtaaa aaagtcggtc tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct 60cgcgtcaggt tgaacgtaaa aaagtcggtc tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct 60
ccaaacgtta attggtttct gcttcggcag aacgattggc 100ccaaacgtta attggtttct gcttcggcag aacgattggc 100
<210> 344<210> 344
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 344<400> 344
aactcacttc acgccccgaa gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt 60aactcacttc acgccccgaa gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt 60
cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg 100cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg 100
<210> 345<210> 345
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 345<400> 345
ccgatcccca tcactgtgtg tcttgtatta cagtgccgct tcgtcggctt cgccggtacg 60ccgatcccca tcactgtgtg tcttgtatta cagtgccgct tcgtcggctt cgccggtacg 60
aatacgaatg acgcgttgca gctcagcaac gaaaattttg 100aatacgaatg acgcgttgca gctcagcaac gaaaattttg 100
<210> 346<210> 346
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 346<400> 346
ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 60ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 60
gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 100gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 100
<210> 347<210> 347
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 347<400> 347
tgaacatcac tgatgcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 60tgaacatcac tgatgcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 60
caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat 100caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat 100
<210> 348<210> 348
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 348<400> 348
ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 60ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 60
gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 100gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 100
<210> 349<210> 349
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 349<400> 349
tacagtagcg cctctcaaaa atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttattttttc 60tacagtagcg cctctcaaaa atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttatttttttc 60
tacccataat cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc 100tacccataat cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc 100
<210> 350<210> 350
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 350<400> 350
aactcacttc acaccccgaa gggggaagtt gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt 60aactcacttc acaccccgaa gggggaagtt gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt 60
cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg 100cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg 100
<210> 351<210> 351
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 351<400> 351
cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt 60cgtcctgtaa taataaccgg acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt 60
ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc 100ttttatattc ccgcctccat ttaaaataaa aaatccaatc 100
<210> 352<210> 352
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 352<400> 352
ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg 60ggacatcatc gcgacaaaca atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg 60
cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag 100cgcaggcatc ctttctcccg tcaatttctg tcaaataaag 100
<210> 353<210> 353
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 353<400> 353
aactcacttc acaccccgaa gggggaagtt gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt 60aactcacttc acaccccgaa gggggaagtt gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt 60
cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg 100cactgaccgg aggttcaaaa tgacccagcg aaccgagtcg 100
<210> 354<210> 354
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 354<400> 354
tttaacgatc tgattggcga tgatgaaacg gattcgccgg aagatgcgct ttctgagagc 60tttaacgatc tgattggcga tgatgaaacg gattcgccgg aagatgcgct ttctgagagc 60
tggcgcgaat tgtggcagga tgcgttgcag gaggaggatt 100tggcgcgaat tgtggcagga tgcgttgcag gaggaggatt 100
<210> 355<210> 355
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 355<400> 355
gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 60gcactgaaac acctcatttc cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg 60
cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata 100cgctacccga tcctgcttga tgaattgctc gacccgaata 100
<210> 356<210> 356
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 356<400> 356
gcgctcaaac agttaatccg tctgtgtgcc gcctcgccga tggtcgcgac acaacttgca 60gcgctcaaac agttaatccg tctgtgtgcc gcctcgccga tggtcgcgac acaacttgca 60
cgtcatcctt tattgctcga tgaactgctc gacccgcgca 100cgtcatcctt tattgctcga tgaactgctc gacccgcgca 100
<210> 357<210> 357
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 357<400> 357
agtctgaact catcctgcgg cagtcggtga gacgtatttt tgaccaaaga gtgatctaca 60agtctgaact catcctgcgg cagtcggtga gacgtatttt tgaccaaaga gtgatctaca 60
tcacggaatt ttgtggttgt tgctgcttaa aagggcaaat 100tcacggaatt ttgtggttgt tgctgcttaa aagggcaaat 100
<210> 358<210> 358
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 358<400> 358
ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 60ccgtctctga agctctcggt gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt 60
gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 100gacattaccg ataatgtgcc gcgtgaacgg gtgcgttatg 100
<210> 359<210> 359
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 359<400> 359
gccattgagc tggcttcccg accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg 6060
tttaacaccc tgaccggagg tgaagcatga tccctgaatc 100tttaacaccc tgaccgggagg tgaagcatga tccctgaatc 100
<210> 360<210> 360
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 360<400> 360
agcgtcaggt accggtcatg attcaccgtg cgattctcgg ttccctggag cgcttcattg 60agcgtcaggt accggtcatg attcaccgtg cgattctcgg ttccctggag cgcttcattg 60
gcatcctgac cgaagagttc gctggcttct tcccaacctg 100gcatcctgac cgaagagttc gctggcttct tcccaacctg 100
<210> 361<210> 361
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 361<400> 361
gcgctgaagc acctgatcac gctctgcgcg gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg 60gcgctgaagc acctgatcac gctctgcgcg gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg 60
cgccacccgc tgctgctgga tgagctgctg gatcccaaca 100cgccacccgc tgctgctgga tgagctgctg gatcccaaca 100
<210> 362<210> 362
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 362<400> 362
gcccgctgac cgaccagaac ttccaccttg gactcggcta tacccttggc gtgacggcgc 60gcccgctgac cgaccagaac ttccaccttg gactcggcta tacccttggc gtgacggcgc 60
gcgataactg ggactacatc cccattccgg tgatcttacc 100gcgataactg ggactacatc cccattccgg tgatcttacc 100
<210> 363<210> 363
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 363<400> 363
gccattgagc tggcttcccg accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg 6060
tttaacaccc tgaccggagg tgaagcatga tccctgaatc 100tttaacaccc tgaccgggagg tgaagcatga tccctgaatc 100
<210> 364<210> 364
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 364<400> 364
gctaaagttc tcggctaatc gctgataaca tttgacgcaa tgcgcaataa aagggcatca 60gctaaagttc tcggctaatc gctgataaca tttgacgcaa tgcgcaataa aagggcatca 60
tttgatgccc tttttgcacg ctttcatacc agaacctggc 100tttgatgccc ttttgcacg ctttcatacc agaacctggc 100
<210> 365<210> 365
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 365<400> 365
gccattgagc tggcttcccg accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg 6060
tttaacaccc tgaccggagg tgaagcatga tccctgaatc 100tttaacaccc tgaccgggagg tgaagcatga tccctgaatc 100
<210> 366<210> 366
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 366<400> 366
cgccgtcctc gcagtaccat tgcaaccgac tttacagcaa gaagtgattc tggcacgcat 60cgccgtcctc gcagtaccat tgcaaccgac tttacagcaa gaagtgattc tggcacgcat 60
ggaacaaatt cttgccagtc gggctttatc cgatgacgaa 100ggaacaaatt cttgccagtc gggctttatc cgatgacgaa 100
<210> 367<210> 367
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 367<400> 367
gccattgagc tggcttcccg accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg 6060
tttaacaccc tgaccggagg tgaagcatga tccctgaatc 100tttaacaccc tgaccgggagg tgaagcatga tccctgaatc 100
<210> 368<210> 368
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 368<400> 368
tctttagatc tctcggtccg ccctgatggc ggcaccttgc tgacgttacg cctgccggta 60tctttagatc tctcggtccg ccctgatggc ggcaccttgc tgacgttacg cctgccggta 60
cagcaggtta tcaccggagg cttaaaatga cccagttacc 100cagcaggtta tcaccgggagg cttaaaatga cccagttacc 100
<210> 369<210> 369
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 369<400> 369
tgaatatcac tgactcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 60tgaatatcac tgactcacaa gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg 60
caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat 100caggcattcg cgttaaagcc gacttgagaa atgagaagat 100
<210> 370<210> 370
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 370<400> 370
ctggggtcac tggagcgctt tatcggcatc ctgaccgaag aatttgccgg tttcttcccg 60ctggggtcac tggagcgctt tatcggcatc ctgaccgaag aatttgccgg tttcttcccg 60
acctggctgg cccctgttca ggttgtggtg atgaatatca 100acctggctgg cccctgttca ggttgtggtg atgaatatca 100
<210> 371<210> 371
<211> 100<211> 100
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 100 п.н. ниже соединения<223> 100 b.p. below connection
<400> 371<400> 371
gcaatagaac taactacccg ccctgaaggc ggtacctgcc tgaccctgcg attcccgtta 60gcaatagaac taactacccg ccctgaaggc ggtacctgcc tgaccctgcg attcccgtta 60
tttcattcac tgaccggagg cccacgatga cccagcgacc 100tttcattcac tgaccgggagg cccacgatga cccagcgacc 100
<210> 372<210> 372
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / PinfC<223> disrupted nifL / PinfC gene
<400> 372<400> 372
tggtgtccgg gcgaacgtcg ccaggtggca caaattgtca gaactacgac acgactaacc 60tggtgtccgg gcgaacgtcg ccaggtggca caaattgtca gaactacgac acgactaacc 60
gaccgcagga gtgtgcgatg accctgaata tgatgatgga ttcttggttc tctggagcgc 120gaccgcagga gtgtgcgatg accctgaata tgatgatgga ttcttggttc tctggagcgc 120
tttatcggca tcctgactga agaatttgca ggcttcttcc caacctggct tgcacccgtg 180tttatcggca tcctgactga agaatttgca ggcttcttcc caacctggct tgcacccgtg 180
caggtagttg tgatgaacat 200
<210> 373<210> 373
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> PinfC / разрушенный ген nifL<223> PinfC / disrupted nifL gene
<400> 373<400> 373
cggaaaacga gttcaaacgg cgcgtcccaa tcgtattaat ggcgagattc gcgccacgga 60cggaaaacga gttcaaacgg cgcgtcccaa tcgtattaat ggcgagattc gcgccacggga 60
agttcgctta acaggtctgg aaggcgagca gcttggtatt gcgatagaac tcacttcacg 120agttcgctta acaggtctgg aaggcgagca gcttggtatt gcgatagaac tcacttcacg 120
ccccgaaggg ggaagctgcc tgaccctacg attcccgcta tttcattcac tgaccggagg 180ccccgaaggg ggaagctgcc tgaccctacg attcccgcta tttcattcac tgaccgggagg 180
ttcaaaatga cccagcgaac 200
<210> 374<210> 374
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 5'-UTR и ATG / укороченный ген glnE<223> 5'-UTR and ATG / truncated glnE gene
<400> 374<400> 374
cgccagagag ttgaaatcga acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg 60cgccagagag ttgaaatcga acatttccgt aataccgcca ttacccagga gccgttctgg 60
ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg tccctgtgcg ccgcgtcgcc 120ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg tccctgtgcg ccgcgtcgcc 120
gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc gatgaactgc tcgacccgaa 180gatggtggcc agccaactgg cgcgctaccc gatcctgctc gatgaactgc tcgacccgaa 180
cacgctctat caaccgacgg 200
<210> 375<210> 375
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / Prm1<223> disrupted nifL / Prm1 gene
<400> 375<400> 375
cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta accgaccgca 60cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta accgaccgca 60
ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa taataaccgg 120ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgttctgtaa taataaccgg 120
acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc tcgactccat 180acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctc gcggcgcttt ttttatattc tcgactccat 180
ttaaaataaa aaatccaatc 200ttaaaataaa aaatccaatc 200
<210> 376<210> 376
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> Prm1 / разрушенный ген nifL<223> Prm1 / disrupted nifL gene
<400> 376<400> 376
tcaacctaaa aaagtttgtg taatacttgt aacgctacat ggagattaac tcaatctaga 60tcaacctaaa aaagtttgtg taatacttgt aacgctacat ggagattaac tcaatctaga 60
gggtattaat aatgaatcgt actaaactgg tactgggcgc aactcacttc acgccccgaa 120gggtattaat aatgaatcgt actaaactgg tactgggcgc aactcacttc acgccccgaa 120
gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa 180gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa 180
tgacccagcg aaccgagtcg 200
<210> 377<210> 377
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / Prm7<223> disrupted nifL / Prm7 gene
<400> 377<400> 377
cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta accgaccgca 60cgggcgaacg tcgccaggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta accgaccgca 60
ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgcgtcaggt tgaacgtaaa 120ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccagc cgcgtcaggt tgaacgtaaa 120
aaagtcggtc tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct ccaaacgtta attggtttct 180aaagtcggtc tgcgcaaagc acgtcgtcgt ccgcagttct ccaaacgtta attggtttct 180
gcttcggcag aacgattggc 200
<210> 378<210> 378
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> Prm4 / разрушенный ген nifL<223> Prm4 / disrupted nifL gene
<400> 378<400> 378
aattttctgc ccaaatggct gggattgttc attttttgtt tgccttacaa cgagagtgac 60aatttttctgc ccaaatggct gggattgttc atttttttgtt tgccttacaa cgagagtgac 60
agtacgcgcg ggtagttaac tcaacatctg accggtcgat aactcacttc acgccccgaa 120agtacgcgcg ggtagttaac tcaacatctg accggtcgat aactcacttc acgccccgaa 120
gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa 180gggggaagct gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa 180
tgacccagcg aaccgagtcg 200
<210> 379<210> 379
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> от 5'-UTR до ATG - 4 п.н. гена amtB / разрушенный ген amtB<223> from 5'-UTR to ATG - 4 b.p. amtB gene / disrupted amtB gene
<400> 379<400> 379
gtaaccaata aaggccacca cgccagacca cacgatagtg atggcaacac tttccagctg 60gtaaccaata aaggccacca cgccagacca cacgatagtg atggcaacac tttccagctg 60
caccagcacc tgatggccca tggtcacacc ttcagcgaaa ccgatcccca tcactgtgtg 120caccagcacc tgatggccca tggtcacacc ttcagcgaaa ccgatcccca tcactgtgtg 120
tcttgtatta cagtgccgct tcgtcggctt cgccggtacg aatacgaatg acgcgttgca 180tcttgtatta cagtgccgct tcgtcggctt cgccggtacg aatacgaatg acgcgttgca 180
gctcagcaac gaaaattttg 200
<210> 380<210> 380
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> Prm1.2 / разрушенный ген nifL<223> Prm1.2 / disrupted nifL gene
<400> 380<400> 380
tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt 60tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt 60
agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc ccgtctctga agctctcggt 120agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc ccgtctctga agctctcggt 120
gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc 180gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc 180
gcgtgaacgg gtgcgttatg 200
<210> 381<210> 381
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / Prm1.2<223> disrupted nifL / Prm1.2 gene
<400> 381<400> 381
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg tgaacatcac tgatgcacaa 120120
gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg caggcattcg cgttaaagcc 180gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg caggcattcg cgttaaagcc 180
gacttgagaa atgagaagat 200
<210> 382<210> 382
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> Prm3.1 / разрушенный ген nifL<223> Prm3.1 / disrupted nifL gene
<400> 382<400> 382
cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa tgacctatcc 60cgggaaccgg tgttataatg ccgcgccctc atattgtggg gatttcttaa tgacctatcc 60
tgggtcctaa agttgtagtt gacattagcg gagcactaac ccgtctctga agctctcggt 120tgggtcctaa agttgtagtt gacattagcg gagcactaac ccgtctctga agctctcggt 120
gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc 180gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc 180
gcgtgaacgg gtgcgttatg 200
<210> 383<210> 383
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / Prm3.1<223> disrupted nifL / Prm3.1 gene
<400> 383<400> 383
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg tacagtagcg cctctcaaaa 120gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg tacagtagcg cctctcaaaa 120
atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttattttttc tacccataat cgggaaccgg 180atagataaac ggctcatgta cgtgggccgt ttatttttttc tacccataat cgggaaccgg 180
tgttataatg ccgcgccctc 200tgttataatg ccgcgccctc 200
<210> 384<210> 384
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> Prm1 / разрушенный ген nifL<223> Prm1 / disrupted nifL gene
<400> 384<400> 384
tcaacctaaa aaagtttgtg taatacttgt aacgctacat ggagattaac tcaatctaga 60tcaacctaaa aaagtttgtg taatacttgt aacgctacat ggagattaac tcaatctaga 60
gggtattaat aatgaatcgt actaaactgg tactgggcgc aactcacttc acaccccgaa 120gggtattaat aatgaatcgt actaaactgg tactgggcgc aactcacttc acaccccgaa 120
gggggaagtt gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa 180gggggaagtt gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa 180
tgacccagcg aaccgagtcg 200
<210> 385<210> 385
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / Prm1<223> disrupted nifL / Prm1 gene
<400> 385<400> 385
gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta actgaccgca 60gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta actgaccgca 60
ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg 120ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc cgtcctgtaa taataaccgg 120
acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat 180acaattcgga ctgattaaaa aagcgccctt gtggcgcttt ttttatattc ccgcctccat 180
ttaaaataaa aaatccaatc 200ttaaaataaa aaatccaatc 200
<210> 386<210> 386
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / Prm5<223> disrupted nifL / Prm5 gene
<400> 386<400> 386
gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta actgaccgca 60gggcgacaaa cggcctggtg gcacaaattg tcagaactac gacacgacta actgaccgca 60
ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca 120ggagtgtgcg atgaccctga atatgatgat ggatgccggc ggacatcatc gcgacaaaca 120
atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg 180atattaatac cggcaaccac accggcaatt tacgagactg cgcaggcatc ctttctcccg 180
tcaatttctg tcaaataaag 200
<210> 387<210> 387
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> Prm5 / разрушенный ген nifL<223> Prm5 / disrupted nifL gene
<400> 387<400> 387
taagaattat ctggatgaat gtgccattaa atgcgcagca taatggtgcg ttgtgcggga 60taagaattat ctggatgaat gtgccattaa atgcgcagca taatggtgcg ttgtgcggga 60
aaactgcttt tttttgaaag ggttggtcag tagcggaaac aactcacttc acaccccgaa 120aaactgcttt tttttgaaag ggttggtcag tagcggaaac aactcacttc acaccccgaa 120
gggggaagtt gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa 180gggggaagtt gcctgaccct acgattcccg ctatttcatt cactgaccgg aggttcaaaa 180
tgacccagcg aaccgagtcg 200
<210> 388<210> 388
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 5'-UTR и ATG / укороченный ген glnE<223> 5'-UTR and ATG / truncated glnE gene
<400> 388<400> 388
cgccagagag tcgaaatcga acatttccgt aataccgcga ttacccagga gccgttctgg 60cgccagagag tcgaaatcga acatttccgt aataccgcga ttacccagga gccgttctgg 60
ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg tttaacgatc tgattggcga 120ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg tttaacgatc tgattggcga 120
tgatgaaacg gattcgccgg aagatgcgct ttctgagagc tggcgcgaat tgtggcagga 180tgatgaaacg gattcgccgg aagatgcgct ttctgagagc tggcgcgaat tgtggcagga
tgcgttgcag gaggaggatt 200
<210> 389<210> 389
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 5'-UTR и ATG / укороченный ген glnE<223> 5'-UTR and ATG / truncated glnE gene
<400> 389<400> 389
cgccagagag tcgaaatcga acatttccgt aataccgcga ttacccagga gccgttctgg 60cgccagagag tcgaaatcga acatttccgt aataccgcga ttacccagga gccgttctgg 60
ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg gcactgaaac acctcatttc 120ttgcacagcg gaaaacgtta acgaaaggat atttcgcatg gcactgaaac acctcatttc 120
cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg cgctacccga tcctgcttga 180cctgtgtgcc gcgtcgccga tggttgccag tcagctggcg cgctacccga tcctgcttga 180
tgaattgctc gacccgaata 200tgaattgctc gacccgaata 200
<210> 390<210> 390
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 5'-UTR и ATG / укороченный ген glnE<223> 5'-UTR and ATG / truncated glnE gene
<400> 390<400> 390
gatgatggat gctttctggt taaacgggca acctcgttaa ctgactgact agcctgggca 60gatgatggat gctttctggt taaacgggca acctcgttaa ctgactgact agcctgggca 60
aactgcccgg gctttttttt gcaaggaatc tgatttcatg gcgctcaaac agttaatccg 120aactgcccgg gctttttttt gcaaggaatc tgatttcatg gcgctcaaac agttaatccg 120
tctgtgtgcc gcctcgccga tggtcgcgac acaacttgca cgtcatcctt tattgctcga 180tctgtgtgcc gcctcgccga tggtcgcgac acaacttgca cgtcatcctt tattgctcga 180
tgaactgctc gacccgcgca 200tgaactgctc gacccgcgca 200
<210> 391<210> 391
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / Prm4<223> disrupted nifL / Prm4 gene
<400> 391<400> 391
accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60accgatccgc aggcgcgcat ttgttatgcc aatccggcat tctgccgcca gacgggtttt 60
gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg agtctgaact catcctgcgg 120gcacttgaga cacttttggg cgagaaccac cgtctgctgg agtctgaact catcctgcgg 120
cagtcggtga gacgtatttt tgaccaaaga gtgatctaca tcacggaatt ttgtggttgt 180180
tgctgcttaa aagggcaaat 200
<210> 392<210> 392
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> Prm4 / разрушенный ген nifL<223> Prm4 / disrupted nifL gene
<400> 392<400> 392
catcggacac caccagctta caaattgcct gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga 60catcggacac caccagctta caaattgcct gattgcggcc ccgatggccg gtatcactga 60
ccgaccattt cgtgccttat gtcatgcgat gggggctggg ccgtctctga agctctcggt 120ccgaccattt cgtgccttat gtcatgcgat gggggctggg ccgtctctga agctctcggt 120
gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc 180gaacattgtt gcgaggcagg atgcgagctg gttgtgtttt gacattaccg ataatgtgcc 180
gcgtgaacgg gtgcgttatg 200
<210> 393<210> 393
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> PinfC / разрушенный ген nifL<223> PinfC / disrupted nifL gene
<400> 393<400> 393
tcttcaacaa ctggaggaat aaggtattaa aggcggaaaa cgagttcaaa cggcacgtcc 60tcttcaacaa ctggaggaat aaggtattaa aggcggaaaa cgagttcaaa cggcacgtcc 60
gaatcgtatc aatggcgaga ttcgcgccct ggaagttcgc gccattgagc tggcttcccg 120gaatcgtatc aatggcgaga ttcgcgccct ggaagttcgc gccattgagc tggcttcccg 120
accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg tttaacaccc tgaccggagg 180accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg tttaacaccc tgaccgggagg 180
tgaagcatga tccctgaatc 200
<210> 394<210> 394
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / PinfC<223> disrupted nifL / PinfC gene
<400> 394<400> 394
tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60
cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga agcgtcaggt accggtcatg 120cgacacaggga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga agcgtcaggt accggtcatg 120
attcaccgtg cgattctcgg ttccctggag cgcttcattg gcatcctgac cgaagagttc 180attcaccgtg cgattctcgg ttccctggag cgcttcattg gcatcctgac cgaagagttc 180
gctggcttct tcccaacctg 200
<210> 395<210> 395
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> 5'-UTR и ATG / укороченный ген glnE<223> 5'-UTR and ATG / truncated glnE gene
<400> 395<400> 395
atcgcagcgt ctttgaatat ttccgtcgcc aggcgctggc tgccgagccg ttctggctgc 60atcgcagcgt ctttgaatat ttccgtcgcc aggcgctggc tgccgagccg ttctggctgc 60
atagtggaaa acgataattt caggccaggg agcccttatg gcgctgaagc acctgatcac 120atagtggaaa acgataattt caggccaggg agcccttatg gcgctgaagc acctgatcac 120
gctctgcgcg gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg cgccacccgc tgctgctgga 180gctctgcgcg gcgtcgccga tggtcgccag ccagctggcg cgccacccgc tgctgctgga 180
tgagctgctg gatcccaaca 200
<210> 396<210> 396
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / Prm1.2<223> disrupted nifL / Prm1.2 gene
<400> 396<400> 396
tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60
cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga gcccgctgac cgaccagaac 120cgacacaggga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga gcccgctgac cgaccagaac 120
ttccaccttg gactcggcta tacccttggc gtgacggcgc gcgataactg ggactacatc 180ttccaccttg gactcggcta tacccttggc gtgacggcgc gcgataactg ggactacatc 180
cccattccgg tgatcttacc 200
<210> 397<210> 397
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> Prm1.2 / разрушенный ген nifL<223> Prm1.2 / disrupted nifL gene
<400> 397<400> 397
tcacttttta gcaaagttgc actggacaaa aggtaccaca attggtgtac tgatactcga 60tcacttttta gcaaagttgc actggacaaa aggtaccaca attggtgtac tgatactcga 60
cacagcatta gtgtcgattt ttcatataaa ggtaattttg gccattgagc tggcttcccg 120cacagcatta gtgtcgattt ttcatataaa ggtaattttg gccattgagc tggcttcccg 120
accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg tttaacaccc tgaccggagg 180accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg tttaacaccc tgaccgggagg 180
tgaagcatga tccctgaatc 200
<210> 398<210> 398
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / Prm6.2<223> disrupted nifL / Prm6.2 gene
<400> 398<400> 398
tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60
cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga gctaaagttc tcggctaatc 120cgacacaggga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga gctaaagttc tcggctaatc 120
gctgataaca tttgacgcaa tgcgcaataa aagggcatca tttgatgccc tttttgcacg 180180
ctttcatacc agaacctggc 200
<210> 399<210> 399
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> Prm6.2 / разрушенный ген nifL<223> Prm6.2 / disrupted nifL gene
<400> 399<400> 399
gttctccttt gcaatagcag ggaagaggcg ccagaaccgc cagcgttgaa gcagtttgaa 60gttctccttt gcaatagcag ggaagaggcg ccagaaccgc cagcgttgaa gcagtttgaa 60
cgcgttcagt gtataatccg aaacttaatt tcggtttgga gccattgagc tggcttcccg 120cgcgttcagt gtataatccg aaacttaatt tcggtttgga gccattgagc tggcttcccg 120
accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg tttaacaccc tgaccggagg 180accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg tttaacaccc tgaccgggagg 180
tgaagcatga tccctgaatc 200
<210> 400<210> 400
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / Prm8.2<223> disrupted nifL / Prm8.2 gene
<400> 400<400> 400
tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60tccgggttcg gcttaccccg ccgcgttttg cgcacggtgt cggacaattt gtcataactg 60
cgacacagga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga cgccgtcctc gcagtaccat 120cgacacaggga gtttgcgatg accctgaata tgatgctcga cgccgtcctc gcagtaccat 120
tgcaaccgac tttacagcaa gaagtgattc tggcacgcat ggaacaaatt cttgccagtc 180tgcaaccgac tttacagcaa gaagtgattc tggcacgcat ggaacaaatt cttgccagtc 180
gggctttatc cgatgacgaa 200gggctttatc cgatgacgaa 200
<210> 401<210> 401
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> Prm8.2 / разрушенный ген nifL<223> Prm8.2 / disrupted nifL gene
<400> 401<400> 401
gatatgcctg aagtattcaa ttacttaggc atttacttaa cgcaggcagg caattttgat 60gatatgcctg aagtattcaa ttacttaggc atttacttaa cgcaggcagg caattttgat 60
gctgcctatg aagcgtttga ttctgtactt gagcttgatc gccattgagc tggcttcccg 120gctgcctatg aagcgtttga ttctgtactt gagcttgatc gccattgagc tggcttcccg 120
accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg tttaacaccc tgaccggagg 180accgcagggc ggcacctgcc tgaccctgcg tttcccgctg tttaacaccc tgaccgggagg 180
tgaagcatga tccctgaatc 200
<210> 402<210> 402
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> PinfC / разрушенный ген nifL<223> PinfC / disrupted nifL gene
<400> 402<400> 402
tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt 60tggtattgtc agtctgaatg aagctcttga aaaagctgag gaagcgggcg tcgatttagt 60
agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc tctttagatc tctcggtccg 120agaaatcagt ccgaatgccg agccgccagt ttgtcgaatc tctttagatc tctcggtccg 120
ccctgatggc ggcaccttgc tgacgttacg cctgccggta cagcaggtta tcaccggagg 180ccctgatggc ggcaccttgc tgacgttacg cctgccggta cagcaggtta tcaccgggagg 180
cttaaaatga cccagttacc 200
<210> 403<210> 403
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / PinfC<223> disrupted nifL / PinfC gene
<400> 403<400> 403
tgcaaattgc acggttattc cgggtgagta tatgtgtgat ttgggttccg gcattgcgca 60tgcaaattgc acggttattc cgggtgagta tatgtgtgat ttgggttccg gcattgcgca 60
ataaagggga gaaagacatg agcatcacgg cgttatcagc tgaatatcac tgactcacaa 120ataaagggga gaaagacatg agcatcacgg cgttatcagc tgaatatcac tgactcacaa 120
gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg caggcattcg cgttaaagcc 180gctacctatg tcgaagaatt aactaaaaaa ctgcaagatg caggcattcg cgttaaagcc 180
gacttgagaa atgagaagat 200
<210> 404<210> 404
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> разрушенный ген nifL / PinfC<223> disrupted nifL / PinfC gene
<400> 404<400> 404
tcagggctgc ggatgtcggg cgtttcacaa cacaaaatgt tgtaaatgcg acacagccgg 60tcagggctgc ggatgtcggg cgtttcacaa cacaaaatgt tgtaaatgcg acacagccgg 60
gcctgaaacc aggagcgtgt gatgaccttt aatatgatgc ctggggtcac tggagcgctt 120gcctgaaacc aggagcgtgt gatgaccttt aatatgatgc ctggggtcac tggagcgctt 120
tatcggcatc ctgaccgaag aatttgccgg tttcttcccg acctggctgg cccctgttca 180tatcggcatc ctgaccgaag aatttgccgg tttcttcccg acctggctgg cccctgttca 180
ggttgtggtg atgaatatca 200
<210> 405<210> 405
<211> 200<211> 200
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический полинуклеотид<223> Artificial sequence description: Synthetic polynucleotide
<220><220>
<223> PinfC / разрушенный ген nifL<223> PinfC / disrupted nifL gene
<400> 405<400> 405
cggaaaacga gttcaaacgg cacgtccgaa tcgtatcaat ggcgagattc gcgcccagga 60cggaaaacga gttcaaacgg cacgtccgaa tcgtatcaat ggcgagattc gcgccgga 60
agttcgctta actggtctgg aaggtgagca gctgggtatt gcaatagaac taactacccg 120agttcgctta actggtctgg aaggtgagca gctgggtatt gcaatagaac taactacccg 120
ccctgaaggc ggtacctgcc tgaccctgcg attcccgtta tttcattcac tgaccggagg 180ccctgaaggc ggtacctgcc tgaccctgcg attcccgtta tttcattcac tgaccgggagg 180
cccacgatga cccagcgacc 200
<210> 406<210> 406
<211> 20<211> 20
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 406<400> 406
caagaagttc gcctcacagg 20caagaagttc gcctcacagg 20
<210> 407<210> 407
<211> 20<211> 20
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 407<400> 407
tgcctcgcaa caatgttcac 20
<210> 408<210> 408
<211> 20<211> 20
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 408<400> 408
cgccctcata ttgtggggat 20cgccctcata ttgtggggat 20
<210> 409<210> 409
<211> 19<211> 19
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 409<400> 409
ggcataacgc acccgttca 19
<210> 410<210> 410
<211> 15<211> 15
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический зонд<223> Artificial sequence description: Synthetic probe
<400> 410<400> 410
tctgaagctc tcggt 15tctgaagctc tcggt 15
<210> 411<210> 411
<211> 22<211> 22
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 411<400> 411
taaactggta ctgggcgcaa ct 22taaactggta ctgggcgcaa ct 22
<210> 412<210> 412
<211> 23<211> 23
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 412<400> 412
caaatcgaag cgccagacgg tat 23caaatcgaag cgccagacgg tat 23
<210> 413<210> 413
<211> 15<211> 15
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический зонд<223> Artificial sequence description: Synthetic probe
<400> 413<400> 413
gaccctacga ttccc 15
<210> 414<210> 414
<211> 20<211> 20
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 414<400> 414
ggtgcactct ttgcatggtt 20
<210> 415<210> 415
<211> 20<211> 20
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 415<400> 415
gcgcagtctc gtaaattgcc 20gcgcagtctc gtaaattgcc 20
<210> 416<210> 416
<211> 15<211> 15
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический зонд<223> Artificial sequence description: Synthetic probe
<400> 416<400> 416
gcgatgaccc tgaat 15
<210> 417<210> 417
<211> 19<211> 19
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 417<400> 417
ctcggcagca tggacgtaa 19
<210> 418<210> 418
<211> 21<211> 21
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 418<400> 418
agggtgttaa acagcgggaa a 21agggtgttaa acagcgggaa a 21
<210> 419<210> 419
<211> 15<211> 15
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический зонд<223> Artificial sequence description: Synthetic probe
<400> 419<400> 419
tccgaatcgt atcaa 15
<210> 420<210> 420
<211> 20<211> 20
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 420<400> 420
gagccgttct ggctgcatag 20
<210> 421<210> 421
<211> 18<211> 18
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 421<400> 421
gccgtcggct gatagagg 18
<210> 422<210> 422
<211> 15<211> 15
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический зонд<223> Artificial sequence description: Synthetic probe
<400> 422<400> 422
tgaagcacct gatca 15
<210> 423<210> 423
<211> 20<211> 20
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 423<400> 423
ggaaaacgag ttcaaccggc 20
<210> 424<210> 424
<211> 20<211> 20
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> Описание искусственной последовательности: Синтетический праймер<223> Artificial sequence description: Synthetic primer
<400> 424<400> 424
gggcggaccg agagatctaa 20
<---<---
Claims (35)
Applications Claiming Priority (13)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201762445570P | 2017-01-12 | 2017-01-12 | |
US201762445557P | 2017-01-12 | 2017-01-12 | |
US62/445,557 | 2017-01-12 | ||
US62/445,570 | 2017-01-12 | ||
US201762447889P | 2017-01-18 | 2017-01-18 | |
US62/447,889 | 2017-01-18 | ||
US201762467032P | 2017-03-03 | 2017-03-03 | |
US62/467,032 | 2017-03-03 | ||
US201762566199P | 2017-09-29 | 2017-09-29 | |
US62/566,199 | 2017-09-29 | ||
US201762577147P | 2017-10-25 | 2017-10-25 | |
US62/577,147 | 2017-10-25 | ||
PCT/US2018/013671 WO2018132774A1 (en) | 2017-01-12 | 2018-01-12 | Methods and compositions for improving plant traits |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2023103521A Division RU2023103521A (en) | 2017-01-12 | 2018-01-12 | METHODS AND COMPOSITIONS FOR IMPROVING PLANT CHARACTERISTICS |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2019125282A RU2019125282A (en) | 2021-02-12 |
RU2019125282A3 RU2019125282A3 (en) | 2021-05-26 |
RU2797537C2 true RU2797537C2 (en) | 2023-06-07 |
Family
ID=
Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2013132518A1 (en) * | 2012-03-03 | 2013-09-12 | Department Of Biotechnology Ministry Of Science & Technology | Recombinant nitrogen fixing microorganism and uses thereof |
Patent Citations (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2013132518A1 (en) * | 2012-03-03 | 2013-09-12 | Department Of Biotechnology Ministry Of Science & Technology | Recombinant nitrogen fixing microorganism and uses thereof |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
Q. AN et al. Constitutive expression of the nifA gene activates associative nitrogen fixation of Enterobacter gergoviae 57-7, an opportunistic endophytic diazotroph. JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY, vol. 103, no. 3, September 2007 (2007-09), pages 613-620, DOI: 10.1111/j.1365-2672.2007.03289.x. MUS F. et al. Symbiotic Nitrogen Fixation and the Challenges to Its Extension to Nonlegumes. Appl Environ Microbiol. 2016;82(13):3698-3710. doi:10.1128/AEM.01055-16. ИВАНОВА Е.С. и др. Искусственная регуляция генов, кодирующих белки нитрогеназного комплекса ризобиальных бактерий. ВЕСТНИК ОГУ, N13(174)/декабрь 2014, с. 36-39. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN110799474B (en) | Methods and compositions for improving plant traits | |
US10919814B2 (en) | Methods and compositions for improving plant traits | |
US20200331820A1 (en) | Gene targets for nitrogen fixation targeting for improving plant traits | |
CN112739202A (en) | Dynamic nitrogen delivery by remodeling microorganisms for temporal and spatial targeting | |
KR20200044015A (en) | Methods and compositions for improving genetically engineered microorganisms | |
CN112584699A (en) | Platform for guiding microbial remodeling and reasonable improvement of agricultural microbial species | |
CN114929874A (en) | Plant colonization assay using native microbial barcodes | |
RU2797537C2 (en) | Methods and compositions for improving plant characteristics | |
RU2805085C2 (en) | Target genes for targeted impact on nitrogen fixation to improve plant quality | |
RU2775712C2 (en) | Methods and compositions for improving plant qualities |