RU2791256C2 - Immunogenic compositions - Google Patents
Immunogenic compositions Download PDFInfo
- Publication number
- RU2791256C2 RU2791256C2 RU2020102449A RU2020102449A RU2791256C2 RU 2791256 C2 RU2791256 C2 RU 2791256C2 RU 2020102449 A RU2020102449 A RU 2020102449A RU 2020102449 A RU2020102449 A RU 2020102449A RU 2791256 C2 RU2791256 C2 RU 2791256C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- polymer
- composition according
- polypeptide
- immunogenic composition
- immunogenic
- Prior art date
Links
Images
Abstract
Description
ПЕРЕКРЕСТНАЯ ССЫЛКА НА РОДСТВЕННЫЕ ЗАЯВКИCROSS-REFERENCE TO RELATED APPLICATIONS
По настоящей заявке испрашивается приоритет на основании временной заявки на патент США номер 62/524315, поданной 23 июня 2017 г., и временной заявки на патент США номер 62/633807, поданной 22 февраля, 2018 г., содержание которых включено в настоящее описание посредством ссылки в полном объеме.This application claims priority from U.S. Provisional Application No. 62/524,315, filed June 23, 2017, and U.S. Provisional Application No. 62/633,807, filed February 22, 2018, the contents of which are incorporated herein by links in full.
ПРЕДПОСЫЛКИ К СОЗДАНИЮ ИЗОБРЕТЕНИЯBACKGROUND TO THE INVENTION
Нозокомиальная инфекция, также называемая внутрибольничной инфекцией, является основной проблемой, с которой сталкиваются пациенты в настоящее время. Опросы, проведенные в США в 183 больницах (Magill et al., 2014), показали, что из 11282 пациентов, 452 имели одну или более инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи (4,0%; 95% доверительный интервал, 3,7-4,4). Из 504 таких инфекций, наиболее распространенными были пневмония (21,8%), инфекции операционного поля (21,8%) и желудочно-кишечные инфекции (17,1%). Clostridium difficile являлся наиболее часто упоминаемым патогеном (вызывающим 12,1% инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи). Инфекции, связанные с медицинскими устройствами (то есть, связанная с центральным катетером инфекция кровотока, связанная с катетером инфекция мочевыводящих путей и связанная с вентилирующим устройством пневмония), на которые традиционно были направлены программы по предотвращению инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, составляли 25,6% таких инфекций. По оценкам авторов изобретения, в больницах неотложной помощи в Соединенных Штатах Америки (США) в 2011 г. находились 648000 пациентов с 721800 инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи.Nosocomial infection, also called nosocomial infection, is the main problem that patients face today. Surveys conducted in the United States in 183 hospitals (Magill et al., 2014) showed that of 11,282 patients, 452 had one or more healthcare-associated infections (4.0%; 95% CI, 3.7 -4.4). Of the 504 such infections, the most common were pneumonia (21.8%), surgical site infections (21.8%), and gastrointestinal infections (17.1%). Clostridium difficile was the most commonly reported pathogen (causing 12.1% of healthcare-associated infections). Medical device-associated infections (i.e., central catheter-associated bloodstream infection, catheter-associated urinary tract infection, and ventilator-associated pneumonia) that have traditionally been targeted by healthcare-associated infection prevention programs accounted for 25, 6% of such infections. The inventors estimate that there were 648,000 patients in emergency hospitals in the United States of America (USA) in 2011 with 721,800 healthcare-associated infections.
С резким возрастанием числа бактерий с множественной лекарственной резистентностью (МЛР), стало сложно лечить внутрибольничные инфекции. Клиницистам приходится прибегать к применению более токсичных и менее эффективных антибиотиков. Тем не менее, по оценкам Центра контроля и профилактики заболеваний (ЦКПЗ), ежегодно происходят ~23000 смертей от инфекций, вызываемых МЛР бактериями.With the surge in multidrug-resistant bacteria (MLR), it has become difficult to treat nosocomial infections. Clinicians have to resort to more toxic and less effective antibiotics. However, the Centers for Disease Control and Prevention (CDC) estimates that ~23,000 deaths occur each year from infections caused by MDR bacteria.
Таким образом, сохраняется потребность в эффективных технологиях профилактики и/или лечения таких инфекций.Thus, there remains a need for effective technologies for the prevention and/or treatment of such infections.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯSUMMARY OF THE INVENTION
Настоящее изобретение направлено на решение проблемы отсутствия соответствующих технологий профилактики и/или лечения внутрибольничных инфекций. В числе прочего настоящее изобретение направлено на решение проблем получения вакцин с достаточной иммуногенностью для создания иммунитета и предотвращения колонизации.The present invention addresses the problem of the lack of appropriate technologies for the prevention and/or treatment of nosocomial infections. Among other things, the present invention addresses the problems of obtaining vaccines with sufficient immunogenicity to confer immunity and prevent colonization.
В частности, настоящее раскрытие относится к композициям и способам для профилактики и/или лечения внутрибольничных инфекций у пациентов.In particular, the present disclosure relates to compositions and methods for the prevention and/or treatment of nosocomial infections in patients.
В частности, настоящее изобретение относится к иммуногенным композициям, содержащим, например, (i) каркасный полимер, включающий полимер и один или более антигенных полисахаридов, конъюгированных с полимером; и (ii) один или более полипептидных антигенов в не ковалентном комплексе с полимером или антигенным полисахаридом.In particular, the present invention relates to immunogenic compositions containing, for example, (i) a backbone polymer comprising a polymer and one or more antigenic polysaccharides conjugated to the polymer; and (ii) one or more polypeptide antigens in a non-covalent complex with a polymer or antigenic polysaccharide.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенная композиция может содержать один или более антигенных полисахаридов, конъюгированных с полимером при помощи линкера. В некоторых вариантах осуществления иммуногенная композиция может содержать один или более антигенных полисахаридов, конъюгированных с полимером без линкера. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов получены из грамотрицательных бактерий и/или грамположительных бактерий. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов получены из антигенных полисахаридов Klebsiella, Pseudomonas и/или E. coli.In some embodiments, the implementation of the immunogenic composition may contain one or more antigenic polysaccharides conjugated to the polymer using a linker. In some embodiments, the immunogenic composition may comprise one or more antigenic polysaccharides conjugated to a polymer without a linker. In some embodiments, one or more antigenic polysaccharides are derived from Gram-negative bacteria and/or Gram-positive bacteria. In some embodiments, the one or more antigenic polysaccharides are derived from Klebsiella, Pseudomonas and/or E. coli antigenic polysaccharides.
В некоторых вариантах осуществления одно или более из потенциальной возможности опсонизации или иммуногенности одного или более антигенных полисахаридов увеличивается относительно ранее определенного уровня, при измерении методом ELISA и/или в функциональном анализе антител. В некоторых вариантах осуществления одно или более из потенциальной возможности опсонизации или иммуногенности одного или более антигенных полисахаридов увеличивается относительно контрольной композиции, при измерении методом ELISA и/или в функциональном анализе антител. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и/или антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полисахарид, присутствующий в вакцинной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в вакцинной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в вакцинной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в вакцинной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в вакцинной композиции, и/или антигенный полисахарид, присутствующий в вакцинной композиции, и не содержать полимер, присутствующий в вакцинной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полисахарид, присутствующий в фармацевтической композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в фармацевтической композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в фармацевтической композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в фармацевтической композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в фармацевтической композиции, и/или антигенный полисахарид, присутствующий в фармацевтической композиции, и не содержать полимер, присутствующий в фармацевтической композиции.In some embodiments, one or more of the potential for opsonization or immunogenicity of one or more antigenic polysaccharides is increased relative to a previously determined level, as measured by ELISA and/or in a functional antibody assay. In some embodiments, one or more of the potential for opsonization or immunogenicity of one or more antigenic polysaccharides is increased relative to a control composition, as measured by ELISA and/or in a functional antibody assay. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain an antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and/or an antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain a polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polysaccharide present in the vaccine composition and not contain the backbone polymer present in the vaccine composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polypeptide present in the vaccine composition and not contain the backbone polymer present in the vaccine composition. In some embodiments, the control composition may contain an antigenic polypeptide present in the vaccine composition and/or an antigenic polysaccharide present in the vaccine composition and not contain a polymer present in the vaccine composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polysaccharide present in the pharmaceutical composition and not contain the backbone polymer present in the pharmaceutical composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polypeptide present in the pharmaceutical composition and not contain the backbone polymer present in the pharmaceutical composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polypeptide present in the pharmaceutical composition and/or the antigenic polysaccharide present in the pharmaceutical composition and not contain the polymer present in the pharmaceutical composition.
В некоторых вариантах осуществления одно или более из потенциальной возможности опсонизации или иммуногенности одного или более антигенных полисахаридов увеличивается по меньшей мере в 1 раз, 2 раза, 3 раза, 4 раза или 5 раз относительно ранее определенного уровня, при измерении методом ELISA и/или в функциональном анализе антител. В некоторых вариантах осуществления ранее определенный уровень представляет собой преиммунный уровень. В некоторых вариантах осуществления эпитопная валентность одного или более антигенных полисахаридов по меньшей мере в 1 раз, 2 раза, 3 раза, 4 раза или 5 раз превышает таковую у нативного полисахарида.In some embodiments, one or more of the potential for opsonization or immunogenicity of one or more antigenic polysaccharides is increased by at least 1-fold, 2-fold, 3-fold, 4-fold, or 5-fold relative to a previously determined level, as measured by ELISA and/or functional analysis of antibodies. In some embodiments, the previously determined level is the pre-immune level. In some embodiments, the epitope valency of one or more antigenic polysaccharides is at least 1-fold, 2-fold, 3-fold, 4-fold, or 5-fold greater than that of the native polysaccharide.
В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидных антигенов могут представлять собой белки-носители для одного или более антигенных полисахаридов. В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту иммуногенная композиция вызывает продуцирование антител против одного или более патогенов у пациента на более высоком уровне, чем в случае композиции, содержащей антигенный полисахарид и не содержащей каркасный полимер, при измерении методом ELISA. В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту иммуногенная композиция вызывает продуцирование антител против одного или более патогенов у пациента на более высоком уровне, чем в случае композиции, содержащей полипептидный антиген и не содержащей каркасный полимер, при измерении методом ELISA. В некоторых вариантах осуществления один или более патогенов выбирают из Klebsiella, Pseudomonas и E. coli. В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту иммуногенная композиция вызывает иммунный ответ против одного или более из Klebsiella, Pseudomonas и E. coli.In some embodiments, one or more polypeptide antigens may be carrier proteins for one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, upon administration to a patient, the immunogenic composition causes the production of antibodies against one or more pathogens in the patient at a higher level than the composition containing the antigenic polysaccharide and not containing the backbone polymer, as measured by ELISA. In some embodiments, upon administration to a patient, the immunogenic composition causes the production of antibodies against one or more pathogens in the patient at a higher level than the composition containing the polypeptide antigen and not containing the backbone polymer, as measured by ELISA. In some embodiments, one or more pathogens are selected from Klebsiella, Pseudomonas , and E. coli . In some embodiments, upon administration to a patient, the immunogenic composition elicits an immune response against one or more of Klebsiella, Pseudomonas , and E. coli .
В некоторых вариантах осуществления полипептидный антиген представляет собой, или содержит, бактериальный полипептид, грибковый полипептид и/или вирусный полипептид, или их сочетания. В некоторых вариантах осуществления полипептидный антиген представляет собой, или содержит, полипептид, или его иммуногенный фрагмент, из Klebsiella, Pseudomonas и/или E. coli. В некоторых вариантах осуществления полипептидный антиген представляет собой, или содержит, полипептид, полученный из полипептида Klebsiella, Pseudomonas и/или E. coli.In some embodiments, the polypeptide antigen is, or contains, a bacterial polypeptide, a fungal polypeptide, and/or a viral polypeptide, or combinations thereof. In some embodiments, the polypeptide antigen is, or contains, a polypeptide, or an immunogenic fragment thereof, from Klebsiella, Pseudomonas, and/or E. coli . In some embodiments, the polypeptide antigen is, or contains, a polypeptide derived from a Klebsiella, Pseudomonas and/or E. coli polypeptide.
В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой, или содержит, полисахарид, полипептид или синтетический дендример. В некоторых вариантах осуществления полимер имеет размер от примерно 50 кДа до примерно 2000 кДа. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой, или содержит, капсульный полисахарид из грамотрицательных или грамположительных бактерий. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой, или содержит, капсульный полисахарид Klebsiella, экзополисахарид Pseudomonas и/или капсульный полисахарид Escherichia. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой, или содержит, капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой, или содержит, линейный поли-L-лизин или дендример L-лизина. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой, или содержит, дендример синтетического моносахарида или олигосахарида.In some embodiments, the polymer is, or contains, a polysaccharide, a polypeptide, or a synthetic dendrimer. In some embodiments, the implementation of the polymer has a size of from about 50 kDa to about 2000 kDa. In some embodiments, the implementation of the polymer is, or contains, capsular polysaccharide from gram-negative or gram-positive bacteria. In some embodiments, the capsular polysaccharide is, or contains, a capsular polysaccharideklebsiella, exopolysaccharidePseudomonasand/or capsular polysaccharideEscherichia. In some embodiments, the polymer is, or contains, a capsular polysaccharideKlebsiella spp. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer is, or contains, linear poly-L-lysine or L-lysine dendrimer. In some embodiments, the polymer is, or contains, a synthetic monosaccharide or oligosaccharide dendrimer.
В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидных антигенов находятся в не ковалентном комплексе с полимером и/или одним или более антигенными полисахаридами за счет образования по меньшей мере одной пары комплементарных аффинных молекул, включающей (i) первую аффинную молекулу, связанную с полимером или одним или более антигенными полисахаридами; и (ii) комплементарную аффинную молекулу, связанную с одним или более полипептидными антигенами. В некоторых вариантах осуществления пару комплементарных аффинных молекул выбирают из группы, состоящей из: биотина/биотин-связывающего белка, антитела/антигена, фермента/субстрата, рецептора/лиганда, металла/металл-связывающего белка, углевод/углевод-связывающего белка, липида/липид-связывающего белка и His-метки/His-метку-связывающей молекулы. В некоторых вариантах осуществления первая аффинная молекула представляет собой биотин или его производное. В некоторых вариантах осуществления комплементарная аффинная молекула представляет собой биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен. В некоторых вариантах осуществления биотин-связывающий белок представляет собой ризавидин, авидин, стрептавидин, брадавидин, тамавидин, лентиавидин, зебавидин, нейтравидин, каптавидин™, или их сочетание.In some embodiments, one or more polypeptide antigens are in a non-covalent complex with a polymer and/or one or more antigenic polysaccharides by forming at least one pair of complementary affinity molecules, comprising (i) a first affinity molecule associated with the polymer or one or more antigenic polysaccharides; and (ii) a complementary affinity molecule associated with one or more polypeptide antigens. In some embodiments, a pair of complementary affinity molecules is selected from the group consisting of: biotin/biotin-binding protein, antibody/antigen, enzyme/substrate, receptor/ligand, metal/metal-binding protein, carbohydrate/carbohydrate-binding protein, lipid/ a lipid-binding protein; and a His-tag/His-tag-binding molecule. In some embodiments, the first affinity molecule is biotin or a derivative thereof. In some embodiments, the complementary affinity molecule is a biotin binding protein or a biotin binding domain thereof. In some embodiments, the biotin binding protein is rizavidin, avidin, streptavidin, bradavidin, tamavidin, lentiavidin, zebavidin, neutravidin, captavidin™, or a combination thereof.
В некоторых вариантах осуществления первая аффинная молекула перекрестно сшита или ковалентно связана с полимером, или одним или более антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления первая аффинная молекула перекрестно сшита или ковалентно связана с полимером каркасного полимера. В некоторых вариантах осуществления первая аффинная молекула перекрестно сшита или ковалентно связана с одним или более антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления первая аффинная молекула перекрестно сшита или ковалентно связана с полимером каркасного полимера и с одним или более антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой, или содержит, поли-L-лизин. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов представляют собой, или содержат, полисахарид из одного или более из Klebsiella, Pseudomonas и E. coli. In some embodiments, the first affinity molecule is cross-linked or covalently linked to a polymer or one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, the first affinity molecule is cross-linked or covalently linked to the backbone polymer polymer. In some embodiments, the first affinity molecule is cross-linked or covalently linked to one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, the first affinity molecule is cross-linked or covalently linked to the backbone polymer polymer and to one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, the implementation of the polymer is, or contains, poly-L-lysine. In some embodiments, the one or more antigenic polysaccharides are, or contain, a polysaccharide from one or more of Klebsiella, Pseudomonas , and E. coli.
В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов представляют собой, или содержат, OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, или их сочетание. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов представляют собой или содержат OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11, O12 P. aeruginosa, или их сочетание. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один из антигенных полисахаридов представляет собой, или содержит, экзополисахарид PsL P. aeruginosa. В некоторых вариантах осуществления PsL представляет собой, или содержит, по меньшей мере один эпитоп, который связывает моноклональное антитело, содержащее аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 4, и/или аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 5.In some embodiments, the one or more antigenic polysaccharides are, or contain, K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, or a combination thereof. In some embodiments, the one or more antigenic polysaccharides are or comprise P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11, O12 OPS, or a combination thereof. In some embodiments, at least one of the antigenic polysaccharides is, or contains, a P. aeruginosa PsL exopolysaccharide. In some embodiments, PsL is, or contains, at least one epitope that binds a monoclonal antibody containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% , 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 4, and/or an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100 % identity with SEQ ID NO: 5.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один полипептидный антиген представляет собой, или содержит, аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 1 (фимбриальный белок I типа K. pneumoniae), или ее иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один полипептидный антиген представляет собой, или содержит, аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 2 (консервативный фимбриальный белок III типа MrkA K. pneumoniae), и/или аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 3, или ее иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один полипептидный антиген представляет собой, или содержит, флагеллин подтипа A FliC P. aeruginosa, флагеллин подтипа B FliC P. aeruginosa, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один полипептидный антиген представляет собой, или содержит, аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 6 (флагеллин подтипа A1 FliC P. aeruginosa), аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 9 (флагеллин подтипа A2 FliC P. aeruginosa), аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 7 (флагеллин подтипа B FliC P. aeruginosa), или ее иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один полипептидный антиген представляет собой, или содержит, аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, at least one polypeptide antigen is, or contains, an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity. with the sequence of SEQ ID NO: 1 ( K. pneumoniae type I fimbrial protein), or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, at least one polypeptide antigen is, or contains, an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity. with the sequence of SEQ ID NO: 2 (conservative fimbrial protein type III MrkA K. pneumoniae ), and/or an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 3, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, at least one polypeptide antigen is, or comprises, P. aeruginosa FliC subtype A flagellin, P. aeruginosa FliC subtype B flagellin, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, at least one polypeptide antigen is, or contains, an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity. with the sequence of SEQ ID NO: 6 ( P. aeruginosa FliC subtype A1 flagellin), an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 9 ( P. aeruginosa FliC subtype A2 flagellin), an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100 % identity with the sequence of SEQ ID NO: 7 ( P. aeruginosa FliC subtype B flagellin), or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, at least one polypeptide antigen is, or contains, an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity. with the sequence of SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa ), or its immunogenic fragment.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенная композиция по изобретению представляет собой, или содержит, (a) каркасный полимер, включающий (i) полимер, содержащий капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19; и (ii) один или более антигенных полисахаридов, содержащих полисахарид Klebsiella или Pseudomonas, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19; и (b) один или более полипептидных антигенов в не ковалентном комплексе с полимером за счет образования по меньшей мере одной пары комплементарных аффинных молекул, включающей (i) первую аффинную молекулу, связанную с полимером; и (ii) комплементарную аффинную молекулу, связанную с одним или более полипептидными антигенами. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов представляют собой, или содержат, OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, или их сочетание. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов представляют собой, или содержат, OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, или их сочетание. В некоторых вариантах осуществления первая аффинная молекула представляет собой биотин или его производное, и комплементарная аффинная молекула представляет собой, или содержит, биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен. В некоторых вариантах осуществления биотин-связывающий белок представляет собой, или содержит, ризавидин или его биотин-связывающий домен. В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидных антигенов представляют собой, или содержат, домен D2 флагеллина подтипа B FliC P. aeruginosa, лишенный TLR5-связывающего мотива, PcrV P. aeruginosa, MrkA K. pneumoniae, их антигенные фрагменты, или их сочетание.In some embodiments, the immunogenic composition of the invention is, or contains, (a) a backbone polymer comprising (i) a polymer containing a capsular polysaccharideKlebsiella spp. K19; and (ii) one or more antigenic polysaccharides comprising a polysaccharideKlebsiella orPseudomonas, conjugated with capsular polysaccharideKlebsiella spp. K19; and (b) one or more polypeptide antigens in a non-covalent complex with a polymer by forming at least one pair of complementary affinity molecules, including (i) a first affinity molecule associated with the polymer; and (ii) a complementary affinity molecule associated with one or more polypeptide antigens. In some embodiments, one or more antigenic polysaccharides are, or contain, OPS type O1, O2, O3, O5K. pneumoniae, or a combination of them. In some embodiments, one or more antigenic polysaccharides are, or contain, OPS type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11P. aeruginosa, or a combination of them. In some embodiments, the first affinity molecule is biotin or a derivative thereof, and the complementary affinity molecule is, or contains, a biotin binding protein or a biotin binding domain thereof. In some embodiments, the biotin binding protein is, or contains, rizavidin or its biotin binding domain. In some embodiments, one or more polypeptide antigens are, or contain, the D2 domain of FliC subtype B flagellinP. aeruginosa, lacking a TLR5-binding motif, PcrVP. aeruginosa, MrkAK. pneumoniae, their antigenic fragments, or their combination.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна пара комплементарных аффинных молекул включает слитый белок, содержащий (i) биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен, (ii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 10 (домен D2 флагеллина FlaB, лишенный TLR5-связывающего мотива), или ее иммуногенный фрагмент, и (iii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 2 или SEQ ID NO: 3 (MrkA K. pneumoniae), или ее иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок представляет собой, или содержит, полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 24 (Rhavi-FlaB-Домен2-MrkA-His).In some embodiments, at least one pair of complementary affinity molecules comprises a fusion protein containing (i) a biotin-binding protein or a biotin-binding domain thereof, (ii) a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 10 (FlaB flagellin D2 domain lacking a TLR5 binding motif), or an immunogenic fragment thereof, and (iii) a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 3 (MrkA K. pneumoniae ), or its immunogenic fragment. In some embodiments, the fusion protein is, or contains, a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 24 (Rhavi-FlaB-Domain2-MrkA-His).
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна пара комплементарных аффинных молекул включает слитый белок, содержащий (i) биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен, (ii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 10 (домен D2 флагеллина подтипа B FliC P. aeruginosa, лишенный TLR5-связывающего мотива), или ее иммуногенный фрагмент, и (iii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa), или ее иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок представляет собой, или содержит, полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 26 (Rhavi-FlaB-Домен2-PcrV-His).In some embodiments, at least one pair of complementary affinity molecules comprises a fusion protein containing (i) a biotin-binding protein or a biotin-binding domain thereof, (ii) a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 10 ( P. aeruginosa FliC subtype B flagellin D2 domain lacking a TLR5 binding motif), or an immunogenic fragment thereof , and (iii) a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 8 ( PcrV P. aeruginosa ), or its immunogenic fragment. In some embodiments, the fusion protein is, or contains, a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 26 (Rhavi-FlaB-Domain2-PcrV-His).
В частности, настоящее изобретение относится к вакцинным композициям. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция может содержать одну или более иммуногенных композиций. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция может содержать фармацевтически приемлемый носитель.In particular, the present invention relates to vaccine compositions. In some embodiments, the implementation of the vaccine composition may contain one or more immunogenic compositions. In some embodiments, the implementation of the vaccine composition may contain a pharmaceutically acceptable carrier.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция может содержать одно или более из (a) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (b) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (c) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; и (d) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером.In some embodiments, the implementation of the vaccine composition may contain one or more of (a) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (b) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (c) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; and (d) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция может содержать одно или более из (a) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (b) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (c) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; и (d) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером.In some embodiments, the implementation of the vaccine composition may contain one or more of (a) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (b) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (c) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; and (d) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция может содержать одно или более из (a) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (b) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (c) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (d) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (e) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (f) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (g) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; и (h) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером.In some embodiments, the implementation of the vaccine composition may contain one or more of (a) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (b) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (c) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (d) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (e) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (f) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, PA O6 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (g) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; and (h) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and a Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция может содержать одно или более из (a) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (b) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (c) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (d) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (e) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (f) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (g) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; и (h) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером.In some embodiments, the implementation of the vaccine composition may contain one or more of (a) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (b) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (c) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (d) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (e) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (f) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, PA O6 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (g) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; and (h) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and a Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция может содержать одно или более из: (a) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (b) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (c) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (d) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (e) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (f) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (g) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (h) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (i) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (j) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (k) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; и (l) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером.In some embodiments, the implementation of the vaccine composition may contain one or more of: (a) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (b) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (c) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (d) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (e) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (f) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, PA O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (g) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (h) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (i) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (j) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (k) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, PA O10 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; and (l) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and a Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция может содержать одно или более из (a) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (b) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (c) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (d) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (e) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (f) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (g) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (h) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (i) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (j) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (k) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; и (l) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером. В некоторых вариантах осуществления слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA представляет собой, или содержит, полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 24 (Rhavi-FlaB-Домен2-MrkA-His). В некоторых вариантах осуществления слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV представляет собой, или содержит, полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 26 (Rhavi-FlaB-Домен2-PcrV-His).In some embodiments, the implementation of the vaccine composition may contain one or more of (a) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (b) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (c) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (d) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (e) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (f) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, PA O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (g) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (h) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (i) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (j) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; (k) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, PA O10 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; and (l) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and a Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer. In some embodiments, the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein is, or contains, a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with SEQ ID NO: 24 (Rhavi-FlaB-Domain2-MrkA-His). In some embodiments, the Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein is, or contains, a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with SEQ ID NO: 26 (Rhavi-FlaB-Domain2-PcrV-His).
В некоторых вариантах осуществления OPS каждой иммуногенной композиции присутствует в массовом отношении примерно 1:1. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер каждой иммуногенной композиции присутствует в массовом отношении примерно 1:1. В некоторых вариантах осуществления совокупно OPS и CPS каждой иммуногенной композиции присутствуют в массовом отношении примерно 1:1. В некоторых вариантах осуществления OPS каждой иммуногенной композиции присутствует в количестве примерно 1 мкг. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер каждой иммуногенной композиции присутствует в количестве примерно 1 мкг. В некоторых вариантах осуществления совокупно OPS и CPS каждой иммуногенной композиции присутствуют в количестве примерно 1 мкг. В некоторых вариантах осуществления OPS каждой иммуногенной композиции присутствует в количестве примерно 5 мкг. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер каждой иммуногенной композиции присутствует в количестве примерно 5 мкг. В некоторых вариантах осуществления совокупно OPS и CPS каждой иммуногенной композиции присутствуют в количестве примерно 5 мкг. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер представляет собой, или содержит, каркас BP-1. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер представляет собой, или содержит, каркас BP-1.2. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер представляет собой, или содержит, каркас BP-2a. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер представляет собой, или содержит, каркас BP-2b. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер представляет собой, или содержит, каркас BP-3.In some embodiments, the OPS of each immunogenic composition is present in a weight ratio of about 1:1. In some embodiments, the backbone polymer of each immunogenic composition is present in a weight ratio of about 1:1. In some embodiments, the combined OPS and CPS of each immunogenic composition are present in a weight ratio of about 1:1. In some embodiments, the OPS of each immunogenic composition is present in an amount of about 1 μg. In some embodiments, the framework polymer of each immunogenic composition is present in an amount of about 1 μg. In some embodiments, the total OPS and CPS of each immunogenic composition are present in an amount of about 1 μg. In some embodiments, the OPS of each immunogenic composition is present in an amount of about 5 μg. In some embodiments, the backbone polymer of each immunogenic composition is present in an amount of about 5 μg. In some embodiments, the total OPS and CPS of each immunogenic composition are present in an amount of about 5 μg. In some embodiments, the backbone polymer is, or contains, a BP-1 backbone. In some embodiments, the backbone polymer is, or contains, a BP-1.2 backbone. In some embodiments, the backbone polymer is, or contains, a BP-2a backbone. In some embodiments, the backbone polymer is, or contains, a BP-2b backbone. In some embodiments, the backbone polymer is, or contains, a BP-3 backbone.
В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидных антигенов представляют собой, или содержат, один или более белков P. aeruginosa, или их вариантов, и при этом комплементарная аффинная молекула представляет собой, или содержит, биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один из полипептидных антигенов представляет собой, или содержит, аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 7 (флагеллин FlaB P. aeruginosa), или ее иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один из полипептидных антигенов представляет собой, или содержит, аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 6 (флагеллин FlaA1 P. aeruginosa), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, the one or more polypeptide antigens are, or contain, one or more P. aeruginosa proteins, or variants thereof, and wherein the complementary affinity molecule is, or contains, a biotin-binding protein or a biotin-binding domain thereof. In some embodiments, at least one of the polypeptide antigens is, or contains, an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 7 (flagellin FlaB P. aeruginosa ), or its immunogenic fragment. In some embodiments, at least one of the polypeptide antigens is, or contains, an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 6 ( P. aeruginosa flagellin FlaA1), or an immunogenic fragment thereof.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна пара комплементарных аффинных молекул представляют собой, или включают, слитый белок, содержащий биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 9 (флагеллин FlaA2), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, at least one complementary affinity molecule pair is, or includes, a fusion protein comprising a biotin binding protein or a biotin binding domain thereof and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90 %, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 9 (flagellin FlaA2), or an immunogenic fragment thereof.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна пара комплементарных аффинных молекул представляют собой, или включают, слитый белок, содержащий биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 10 (домен D2 флагеллина FlaB, лишенный TLR5-связывающего мотива), или ее иммуногенный фрагмент, или полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 11 (домен D2 флагеллина FlaA1, лишенный TLR5-связывающего мотива), или ее иммуногенный фрагмент, или полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 12 (домен D2 флагеллина FlaA2, лишенный TLR5-связывающего мотива), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, at least one complementary affinity molecule pair is, or includes, a fusion protein comprising a biotin binding protein or a biotin binding domain thereof and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90 %, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 10 (FlaB flagellin D2 domain lacking a TLR5-binding motif), or an immunogenic fragment thereof, or a polypeptide containing an amino acid a sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 11 (FlaA1 flagellin D2 domain lacking TLR5 binding motif), or an immunogenic fragment thereof, or a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the SEQ ID sequence NO: 12 (FlaA2 flagellin D2 domain lacking TLR5-binding motif), or its immunogenic fragment.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна пара комплементарных аффинных молекул представляют собой, или включают, слитый белок, содержащий биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 10 (домен D2 флагеллина FlaB, лишенный TLR5-связывающего мотива), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, at least one complementary affinity molecule pair is, or includes, a fusion protein comprising a biotin binding protein or a biotin binding domain thereof and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90 %, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 10 (FlaB flagellin D2 domain lacking a TLR5 binding motif), or an immunogenic fragment thereof.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна пара комплементарных аффинных молекул представляют собой, или включают, слитый белок, содержащий биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 11 (домен D2 флагеллина FlaA1, лишенный TLR5-связывающего мотива), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, at least one complementary affinity molecule pair is, or includes, a fusion protein comprising a biotin binding protein or a biotin binding domain thereof and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90 %, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 11 (FlaA1 flagellin D2 domain lacking a TLR5 binding motif), or an immunogenic fragment thereof.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна пара комплементарных аффинных молекул представляют собой, или включают, слитый белок, содержащий биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 12 (домен D2 флагеллина FlaA2, лишенный TLR5-связывающего мотива), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, at least one complementary affinity molecule pair is, or includes, a fusion protein comprising a biotin binding protein or a biotin binding domain thereof and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90 %, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 12 (FlaA2 flagellin D2 domain lacking a TLR5 binding motif), or an immunogenic fragment thereof.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна пара комплементарных аффинных молекул представляют собой, или включают, слитый белок, содержащий биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 8 (PcrV секреторной системы III типа (TTSS) P. aeruginosa), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, at least one complementary affinity molecule pair is, or includes, a fusion protein comprising a biotin binding protein or a biotin binding domain thereof and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90 %, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 8 (PcrV secretory system type III (TTSS) P. aeruginosa ), or its immunogenic fragment.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна пара комплементарных аффинных молекул представляют собой, или включают, слитый белок, содержащий (i) биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен, (ii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 7 (флагеллин подтипа B FliC P. aeruginosa), или ее иммуногенный фрагмент, и (iii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, at least one pair of complementary affinity molecules is, or includes, a fusion protein containing (i) a biotin-binding protein or a biotin-binding domain thereof, (ii) a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80 %, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 7 ( P. aeruginosa FliC subtype B flagellin), or an immunogenic fragment thereof, and ( iii) a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa ), or an immunogenic fragment thereof.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна пара комплементарных аффинных молекул представляют собой, или включают, слитый белок, содержащий (i) биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен, (ii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 10 (домен D2 флагеллина подтипа B FliC P. aeruginosa, лишенный TLR5-связывающего мотива), или ее иммуногенный фрагмент, и (iii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, at least one pair of complementary affinity molecules is, or includes, a fusion protein containing (i) a biotin-binding protein or a biotin-binding domain thereof, (ii) a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80 %, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 10 ( P. aeruginosa FliC subtype B flagellin D2 domain lacking TLR5 binding motif) , or an immunogenic fragment thereof, and (iii) a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the SEQ sequence ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa ), or an immunogenic fragment thereof.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна пара комплементарных аффинных молекул представляют собой, или включают, слитый белок, содержащий (i) биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен, (ii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 7 (флагеллин подтипа B FliC P. aeruginosa), или ее иммуногенный фрагмент, и (iii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 2 или SEQ ID NO: 3 (MrkA K. pneumoniae), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, at least one pair of complementary affinity molecules is, or includes, a fusion protein containing (i) a biotin-binding protein or a biotin-binding domain thereof, (ii) a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80 %, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 7 ( P. aeruginosa FliC subtype B flagellin), or an immunogenic fragment thereof, and ( iii) a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO : 3 (MrkA K. pneumoniae ), or its immunogenic fragment.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна пара комплементарных аффинных молекул представляют собой, или включают, слитый белок, содержащий (i) биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен, (ii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 10 (домен D2 флагеллина подтипа B FliC P. aeruginosa, лишенный TLR5-связывающего мотива), или ее иммуногенный фрагмент, и (iii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 2 или SEQ ID NO: 3 (MrkA K. pneumoniae), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, at least one complementary affinity molecule pair is, or includes, a fusion protein comprising (i) a biotin binding protein or a biotin binding domain thereof, (ii) a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80 %, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 10 ( P. aeruginosa FliC subtype B flagellin D2 domain lacking TLR5 binding motif) , or an immunogenic fragment thereof, and (iii) a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the SEQ sequence ID NO: 2 or SEQ ID NO: 3 (MrkA K. pneumoniae ), or an immunogenic fragment thereof.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере одна пара комплементарных аффинных молекул представляют собой, или включают, слитый белок, содержащий (i) биотин-связывающий белок или его биотин-связывающий домен, (ii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa), или ее иммуногенный фрагмент, и (iii) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 2 или SEQ ID NO: 3 (MrkA K. pneumoniae), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, at least one complementary affinity molecule pair is, or includes, a fusion protein comprising (i) a biotin binding protein or a biotin binding domain thereof, (ii) a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80 %, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa ), or an immunogenic fragment thereof, and (iii) a polypeptide , containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 2 or SEQ ID NO: 3 ( MrkA K. pneumoniae ), or its immunogenic fragment.
В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту иммуногенная композиция вызывает продуцирование антител, которые узнают нативный MrkA на K. pneumoniae, экспрессирующей MrkA. В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту вакцинная композиция вызывает продуцирование антител, которые узнают нативный MrkA на K. pneumoniae, экспрессирующей MrkA.In some embodiments, upon administration to a patient, the immunogenic composition causes the production of antibodies that recognize native MrkA against K. pneumoniae expressing MrkA. In some embodiments, upon administration to a patient, the vaccine composition causes the production of antibodies that recognize native MrkA against K. pneumoniae expressing MrkA.
В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция содержит одну или более иммуногенных композиций или вакцинных композиций, описанных в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция содержит фармацевтически приемлемый носитель. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция содержит один или более адъювантов. В некоторых вариантах осуществления адъювант выбирают из группы, состоящей из фосфата алюминия, гидроксида алюминия, фосфатированного гидроксида алюминия, агонистов TLR, таких как агонист TLR2 сапонин (QS21) или порины, агонистов TLR4, таких как, например, монофосфориллипид A (MPL), и агонистов TLR5, таких как флагеллины, и так далее.In some embodiments, the implementation of the pharmaceutical composition contains one or more immunogenic compositions or vaccine compositions described in the present invention. In some embodiments, the implementation of the pharmaceutical composition contains a pharmaceutically acceptable carrier. In some embodiments, the implementation of the pharmaceutical composition contains one or more adjuvants. In some embodiments, the adjuvant is selected from the group consisting of aluminum phosphate, aluminum hydroxide, phosphated aluminum hydroxide, TLR agonists such as TLR2 agonist saponin (QS21) or porins, TLR4 agonists such as, for example, monophosphoryl lipid A (MPL), and TLR5 agonists such as flagellins, and so on.
В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция составлена для внутримышечного, внутрибрюшинного, внутрикожного и/или подкожного введения. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция составлена для инъекции. В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту фармацевтическая композиция вызывает Th1 и/или Th17 клеточный ответ. В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту фармацевтическая композиция вызывает опсонический/бактерицидный ответ против одного или более из Klebsiella, Pseudomonas и E. coli. В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту фармацевтическая композиция приводит к уменьшению скорости передачи инфекции и/или колонизации слизистых поверхностей одним или более из Klebsiella, Pseudomonas и E. coli. В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту фармацевтическая композиция приводит к уменьшению скорости передачи инфекции и/или колонизации ЖК тракта одним или более из Klebsiella, Pseudomonas и E. coli.In some embodiments, the pharmaceutical composition is formulated for intramuscular, intraperitoneal, intradermal, and/or subcutaneous administration. In some embodiments, the pharmaceutical composition is formulated for injection. In some embodiments, upon administration to a patient, the pharmaceutical composition induces a Th1 and/or Th17 cellular response. In some embodiments, upon administration to a patient, the pharmaceutical composition elicits an opsonic/bactericidal response against one or more of Klebsiella , Pseudomonas , and E. coli . In some embodiments, upon administration to a patient, the pharmaceutical composition results in a reduction in the rate of transmission of infection and/or colonization of mucosal surfaces by one or more of Klebsiella, Pseudomonas , and E. coli. In some embodiments, upon administration to a patient, the pharmaceutical composition results in a reduction in the rate of transmission of infection and/or colonization of the GI tract by one or more of Klebsiella , Pseudomonas , and E. coli .
Некоторые варианты осуществления относятся к способам иммунизации пациента против инфекции Klebsiella, включающим введение пациенту эффективного количества иммуногенной композиции по изобретению. Некоторые варианты осуществления относятся к способам иммунизации пациента против инфекции Klebsiella, включающим введение пациенту эффективного количества вакцинной композиции по изобретению. Некоторые варианты осуществления относятся к способам иммунизации пациента против инфекции Klebsiella, включающим введение пациенту эффективного количества фармацевтической композиции по изобретению.Some embodiments relate to methods for immunizing a patient against an infection.Klebsiella, comprising administering to a patient an effective amount of an immunogenic composition of the invention. Some embodiments relate to methods for immunizing a patient against an infection.Klebsiella, comprising administering to a patient an effective amount of a vaccine composition of the invention. Some embodiments relate to methods for immunizing a patient against an infection.Klebsiellacomprising administering to a patient an effective amount of a pharmaceutical composition of the invention.
Некоторые варианты осуществления относятся к способам иммунизации пациента против инфекции P. aeruginosa, включающим введение пациенту эффективного количества иммуногенной композиции по изобретению. Некоторые варианты осуществления относятся к способам иммунизации пациента против инфекции P. aeruginosa, включающим введение пациенту эффективного количества вакцинной композиции по изобретению. Некоторые варианты осуществления относятся к способам иммунизации пациента против инфекции P. aeruginosa, включающим введение пациенту эффективного количества фармацевтической композиции по изобретению.Some embodiments relate to methods for immunizing a patient against P. aeruginosa infection, comprising administering to the patient an effective amount of an immunogenic composition of the invention. Some embodiments relate to methods for immunizing a patient against P. aeruginosa infection, comprising administering to the patient an effective amount of a vaccine composition of the invention. Some embodiments relate to methods for immunizing a patient against P. aeruginosa infection, comprising administering to the patient an effective amount of a pharmaceutical composition of the invention.
Некоторые варианты осуществления относятся к способам иммунизации пациента против инфекции E. coli, включающим введение пациенту эффективного количества иммуногенной композиции по изобретению. Некоторые варианты осуществления относятся к способам иммунизации пациента против инфекции E. coli, включающим введение пациенту эффективного количества вакцинной композиции по изобретению. Некоторые варианты осуществления относятся к способам иммунизации пациента против инфекции E. coli, включающим введение пациенту эффективного количества фармацевтической композиции по изобретению.Some embodiments relate to methods for immunizing a patient against an E. coli infection, comprising administering to the patient an effective amount of an immunogenic composition of the invention. Some embodiments relate to methods for immunizing a patient against an E. coli infection comprising administering to the patient an effective amount of a vaccine composition of the invention. Some embodiments relate to methods for immunizing a patient against an E. coli infection, comprising administering to the patient an effective amount of a pharmaceutical composition of the invention.
В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту иммуногенная композиция вызывает иммунный ответ против грамотрицательных и/или грамположительных бактерий. В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту вакцинная композиция вызывает иммунный ответ против грамотрицательных и/или грамположительных бактерий. В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту фармацевтическая композиция вызывает иммунный ответ против грамотрицательных и/или грамположительных бактерий. В некоторых вариантах осуществления грамотрицательные бактерии выбирают из Klebsiella, Pseudomonas, E. coli, а также их сочетания. В некоторых вариантах осуществления иммунный ответ представляет собой выработку антител или B-клеточный ответ. В некоторых вариантах осуществления иммунный ответ представляет собой CD4+ T-клеточный ответ, включая Th1, Th2, или Th17 ответ, или CD8+ T-клеточный ответ, или CD4+/CD8+ T-клеточный ответ. В некоторых вариантах осуществления иммунный ответ представляет собой выработку антител или B-клеточный ответ; и T-клеточный ответ.In some embodiments, upon administration to a patient, the immunogenic composition elicits an immune response against Gram-negative and/or Gram-positive bacteria. In some embodiments, upon administration to a patient, the vaccine composition elicits an immune response against Gram-negative and/or Gram-positive bacteria. In some embodiments, upon administration to a patient, the pharmaceutical composition induces an immune response against Gram-negative and/or Gram-positive bacteria. In some embodiments, the Gram-negative bacteria are selected from Klebsiella, Pseudomonas, E. coli , and combinations thereof. In some embodiments, the implementation of the immune response is the production of antibodies or B-cell response. In some embodiments, the immune response is a CD4+ T cell response, including a Th1, Th2, or Th17 response, or a CD8+ T cell response, or a CD4+/CD8+ T cell response. In some embodiments, the implementation of the immune response is the production of antibodies or B-cell response; and T cell response.
Некоторые варианты осуществления относятся к композициям антител, содержащим антитела, выработанные у млекопитающего, иммунизированного иммуногенной композицией по изобретению. Некоторые варианты осуществления относятся к композициям антител, содержащим антитела, выработанные у млекопитающего, иммунизированного вакцинной композицией по изобретению. Некоторые варианты осуществления относятся к композициям антител, содержащим антитела, выработанные у млекопитающего, иммунизированного фармацевтической композицией по изобретению. В некоторых вариантах осуществления композиция антител содержит по меньшей мере одно антитело, выбранное из группы, состоящей из моноклональных антител и антиидиотипических антител. В некоторых вариантах осуществления композиция антител содержит выделенную гамма-глобулиновую фракцию.Some embodiments relate to antibody compositions comprising antibodies raised in a mammal immunized with an immunogenic composition of the invention. Some embodiments relate to antibody compositions comprising antibodies raised in a mammal immunized with a vaccine composition of the invention. Some embodiments relate to antibody compositions comprising antibodies raised in a mammal immunized with a pharmaceutical composition of the invention. In some embodiments, the antibody composition comprises at least one antibody selected from the group consisting of monoclonal antibodies and anti-idiotypic antibodies. In some embodiments, the antibody composition contains an isolated gamma globulin fraction.
В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к способам очистки O-антигенного полисахарида от одного или более клеточных компонентов Klebsiella, при этом клеточные компоненты включают белок и/или нуклеиновую кислоту, включающим стадии: создания контакта одного или более клеточных компонентов с окисляющим реагентом, с получением смеси, при этом pH смеси составляет примерно 3-5; отделения O-антигенного полисахарида от клеточных компонентов; и извлечение OPS, при этом OPS является практически свободным от других клеточных компонентов и содержит свободный альдегид на его восстанавливающем конце. В некоторых вариантах осуществления окисляющий реагент представляет собой нитрит натрия, кислота представляет собой уксусную кислоту, и при этом восстанавливающий конец OPS представляет собой остаток 2,5-ангидроманнозы, содержащий свободный альдегид.In some embodiments, the invention relates to methods for purifying an O-antigenic polysaccharide from one or more Klebsiella cellular components, wherein the cellular components include a protein and/or nucleic acid, comprising the steps of: contacting one or more cellular components with an oxidizing agent, to obtain a mixture , while the pH of the mixture is about 3-5; separating the O-antigenic polysaccharide from cellular components; and extracting the OPS, wherein the OPS is substantially free of other cellular components and contains a free aldehyde at its reducing end. In some embodiments, the oxidizing agent is sodium nitrite, the acid is acetic acid, and the reducing end of the OPS is a free aldehyde containing 2,5-anhydromannose residue.
В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к способам очистки O-антигенного полисахарида от одного или более клеточных компонентов грамотрицательных бактерий, при этом клеточные компоненты включают белок и/или нуклеиновую кислоту, включающим: создание контакта одного или более клеточных компонентов с кислотным реагентом, с получением смеси, при этом pH смеси составляет примерно 3-5, нагревание смеси до температуры от примерно 80°C до примерно 100°C; отделение O-антигенного полисахарида от клеточных компонентов; и извлечение OPS, при этом OPS является практически свободным от других клеточных компонентов и содержит кетон на его восстанавливающем конце.In some embodiments, the invention relates to methods for purifying an O-antigenic polysaccharide from one or more cellular components of gram-negative bacteria, wherein the cellular components include a protein and/or nucleic acid, including: contacting one or more cellular components with an acidic reagent, obtaining a mixture , while the pH of the mixture is about 3-5, heating the mixture to a temperature of from about 80°C to about 100°C; separating the O-antigenic polysaccharide from cellular components; and extracting the OPS, wherein the OPS is substantially free of other cellular components and contains a ketone at its reducing end.
В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к способам получения каркасного полимера, включающего по меньшей мере один не биотинилированный O-антигенный полисахарид, при этом O-антигенный полисахарид содержит первичную аминогруппу, и по меньшей мере один биотинилированный полисахарид, включающим: химическое связывание первичной аминогруппы O-антигенного полисахарида путем смешивания O-антигенного полисахарида с частично окисленным полисахаридом, содержащим альдегидные группы и биотин, содержащий первичный амин, с получением смеси; и восстановительное аминирование смеси восстанавливающим реагентом, с получением полимерного каркаса BP-1, при этом полисахарид является биотинилированным, и химически связанный O-антигенный полисахарид является не биотинилированным. Некоторые варианты осуществления относятся к полимерному каркасу BP-1, полученному способами, раскрытыми в настоящем изобретении.In some embodiments, the invention relates to methods for producing a backbone polymer comprising at least one non-biotinylated O-antigenic polysaccharide, wherein the O-antigenic polysaccharide contains a primary amino group, and at least one biotinylated polysaccharide, comprising: chemical binding of the primary amino group O- an antigenic polysaccharide by mixing an O-antigenic polysaccharide with a partially oxidized polysaccharide containing aldehyde groups and biotin containing a primary amine to form a mixture; and reductively aminating the mixture with a reducing reagent to form a BP-1 polymer backbone, wherein the polysaccharide is biotinylated and the chemically bound O-antigenic polysaccharide is not biotinylated. Some embodiments relate to a BP-1 polymer backbone made by the methods disclosed in the present invention.
В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к способам получения каркасного полимера, включающего по меньшей мере один не биотинилированный O-антигенный полисахарид, при этом O-антигенный полисахарид содержит первичную аминогруппу, и по меньшей мере один биотинилированный полисахарид, включающим: химическое связывание первичной аминогруппы O-антигенного полисахарида путем смешивания O-антигенного полисахарида с полисахаридом, биотинилированным и окисленным, полученным сначала путем обработки карбоксилатных групп полисахарида 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимидом (EDC) и N-гидроксисукцинимидом (NHS), а также биотин гидразидом, с последующей обработкой полисахарида окисляющим реагентом; и восстановительное аминирование смеси восстанавливающим реагентом, с получением полимерного каркаса BP-1.2, при этом полисахарид является биотинилированным, и химически связанный O-антигенный полисахарид является не биотинилированным. В некоторых вариантах осуществления первичная группа на O-антигенном полисахариде представляет собой α-аминогруппу L-аланина внешнего ядра OPS из P. aeruginosa или аминогруппу, которая была введена в восстанавливающий конец O-антигенного полисахарида за счет химического связывания короткой спейсерной молекулы, содержащей первичную группу на каждом конце, путем восстановительного аминирования восстанавливающим реагентом. В некоторых вариантах осуществления окисляющий реагент для окисления полисахарида представляет собой периодат натрия, короткий спейсер, содержащий диамин, представляет собой дигидразид адипиновой кислоты, и восстанавливающий реагент для восстановительного аминирования представляет собой цианоборогидрид натрия. Некоторые варианты осуществления относятся к полимерному каркасу BP-1.2, полученному способами, раскрытыми в настоящем изобретении.In some embodiments, the invention relates to methods for producing a backbone polymer comprising at least one non-biotinylated O-antigenic polysaccharide, wherein the O-antigenic polysaccharide contains a primary amino group, and at least one biotinylated polysaccharide, comprising: chemical binding of the primary amino group O- antigenic polysaccharide by mixing an O-antigenic polysaccharide with a polysaccharide, biotinylated and oxidized, obtained first by treating the carboxylate groups of the polysaccharide with 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide (EDC) and N-hydroxysuccinimide (NHS), as well as biotin hydrazide, followed by treatment of the polysaccharide with an oxidizing agent; and reductively aminating the mixture with a reducing reagent to form a BP-1.2 polymer backbone, wherein the polysaccharide is biotinylated and the chemically bound O-antigenic polysaccharide is not biotinylated. In some embodiments, the primary group on the O-antigenic polysaccharide is the α-amino group of L-alanine of the outer core of the OPS from P. aeruginosa , or an amino group that has been introduced into the reducing end of the O-antigenic polysaccharide by chemically linking a short spacer molecule containing the primary group at each end, by reductive amination with a reducing agent. In some embodiments, the oxidizing reagent for oxidizing the polysaccharide is sodium periodate, the diamine-containing short spacer is adipic acid dihydrazide, and the reducing reagent for reductive amination is sodium cyanoborohydride. Some embodiments relate to a BP-1.2 polymer backbone made by the methods disclosed in the present invention.
В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к способам получения каркасного полимера, включающего по меньшей мере один не биотинилированный O-антигенный полисахарид, при этом O-антигенный полисахарид содержит первичную аминогруппу, и по меньшей мере один биотинилированный полисахарид, включающим: химическое связывание первичной аминогруппы O-антигенного полисахарида путем смешивания O-антигенного полисахарида с полисахаридом, биотинилированным и CDAP-активированным, полученным сначала путем обработки карбоксилатных групп полисахарида 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)-карбодиимидом (EDC) и N-гидроксисукцинимидом (NHS), а также биотин гидразидом, с последующей активацией биотинилированного полисахарида CDAP, с получением полимерного каркаса BP-1.3, при этом полисахарид является биотинилированным, и химически связанный O-антигенный полисахарид является не биотинилированным. В некоторых вариантах осуществления первичная группа на O-антигенном полисахариде представляет собой α-аминогруппу L-аланина внешнего ядра OPS P. aeruginosa или аминогруппу, которая была введена в восстанавливающий конец O-антигенного полисахарида за счет химического связывания короткой спейсерной молекулы, содержащей первичную группу на каждом конце, путем восстановительного аминирования восстанавливающим реагентом. В некоторых вариантах осуществления короткий спейсер, содержащий диамин, представляет собой дигидразид адипиновой кислоты, и восстанавливающий реагент для восстановительного аминирования представляет собой цианоборогидрид натрия. Некоторые варианты осуществления относятся к полимерному каркасу BP-1.3, полученному способами, раскрытыми в настоящем изобретении.In some embodiments, the invention relates to methods for producing a backbone polymer comprising at least one non-biotinylated O-antigenic polysaccharide, wherein the O-antigenic polysaccharide contains a primary amino group, and at least one biotinylated polysaccharide, comprising: chemical binding of the primary amino group O- antigenic polysaccharide by mixing an O-antigenic polysaccharide with a biotinylated and CDAP-activated polysaccharide obtained first by treating the carboxylate groups of the polysaccharide with 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)-carbodiimide (EDC) and N-hydroxysuccinimide (NHS), and biotin with hydrazide, followed by activation of the biotinylated CDAP polysaccharide to form a BP-1.3 polymer backbone, the polysaccharide being biotinylated and the chemically bound O-antigenic polysaccharide being non-biotinylated. In some embodiments, the primary group on the O antigenic polysaccharide is the P. aeruginosa OPS outer core L-alanine α-amino group or an amino group that has been introduced into the reducing end of the O antigenic polysaccharide by chemically linking a short spacer molecule containing the primary group on each end, by reductive amination with a reducing reagent. In some embodiments, the diamine-containing short spacer is adipic acid dihydrazide and the reductive amination reducing agent is sodium cyanoborohydride. Some embodiments relate to a BP-1.3 polymer backbone made by the methods disclosed in the present invention.
В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к способам получения каркасного полимера, включающего по меньшей мере один биотинилированный O-антигенный полисахарид и по меньшей мере один биотинилированный полисахарид, включающим: химическое связывание O-антигенного полисахарида, содержащего первичный амин в его ядре, полученного либо путем связывания короткого спейсера, содержащего первичный амин на каждом конце, с O-антигенным полисахаридом путем восстановительного аминирования, с получением молекулы O-антигенный полисахарид-спейсер, или с использованием не дериватизированного OPS, содержащего α-аминогруппу L-аланина, смешивания O-антигенного полисахарида, содержащего первичный амин, с частично окисленным полисахаридом, с получением смеси; восстановительное аминирование смеси, с получением каркаса OPS; и дериватизацию каркаса OPS при помощи CDAP и биотина, содержащего первичный амин, с получением, в результате, каркасного полимера, при этом полисахарид и химически связанный O-антигенный полисахарид являются биотинилированными. Некоторые варианты осуществления относятся к каркасному полимеру, полученному способами, раскрытыми в настоящем изобретении.In some embodiments, the invention relates to methods for producing a backbone polymer comprising at least one biotinylated O-antigenic polysaccharide and at least one biotinylated polysaccharide, including: a short spacer containing a primary amine at each end with an O-antigenic polysaccharide by reductive amination to form an O-antigenic polysaccharide spacer molecule, or using non-derivatized OPS containing the α-amino group of L-alanine, mixing the O-antigenic polysaccharide, containing a primary amine, with a partially oxidized polysaccharide, to obtain a mixture; reductive amination of the mixture to form an OPS backbone; and derivatizing the OPS backbone with CDAP and biotin containing a primary amine, resulting in a backbone polymer wherein the polysaccharide and chemically bound O-antigenic polysaccharide are biotinylated. Some embodiments relate to a backbone polymer obtained by the methods disclosed in the present invention.
В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к способам получения каркасного полимера, включающего по меньшей мере один биотинилированный O-антигенный полисахарид и по меньшей мере один не биотинилированный полисахарид, включающим: биотинилирование O-антигенного полисахарида, содержащего один или более коровых KDO и/или фрагментов гептозы, при помощи CDAP и биотина, содержащего первичный амин, с получением смеси биотинилированного OPS; частичное окисление смеси биотинилированного OPS периодатом натрия для введения альдегидов в коровые KDO и/или фрагменты гептозы; восстановительное аминирование биотинилированной смеси дигидразидом адипиновой кислоты; смешивание биотинилированного и аминированного OPS с частично окисленным полисахаридом, с получением смеси; и восстановительное аминирование смеси; с получением, в результате, каркасного полимера, при этом полисахарид является не биотинилированным, и химически связанный O-антигенный полисахарид является биотинилированным. Некоторые варианты осуществления относятся к каркасному полимеру, полученному способами, раскрытыми в настоящем изобретении.In some embodiments, the invention relates to methods for producing a backbone polymer comprising at least one biotinylated O-antigenic polysaccharide and at least one non-biotinylated polysaccharide, comprising: biotinylating an O-antigenic polysaccharide containing one or more core KDO and/or heptose fragments , using CDAP and biotin containing a primary amine, to obtain a mixture of biotinylated OPS; partial oxidation of the mixture of biotinylated OPS with sodium periodate to introduce aldehydes into core KDO and/or heptose moieties; reductive amination of the biotinylated mixture with adipic acid dihydrazide; mixing the biotinylated and aminated OPS with the partially oxidized polysaccharide to form a mixture; and reductive amination of the mixture; resulting in a backbone polymer wherein the polysaccharide is not biotinylated and the chemically bound O-antigenic polysaccharide is biotinylated. Some embodiments relate to a backbone polymer obtained by the methods disclosed in the present invention.
В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к способам получения каркасного полимера, включающего по меньшей мере один биотинилированный O-антигенный полисахарид и полимер PLL, включающим: восстановительное аминирование O-антигенного полисахарида, содержащего концевые альдегиды или альфа-KDO, ε-NH2 группами полимера PLL, с получением полимера OPS-PLL; дериватизацию OPS при помощи CDAP, с получением смеси производных; проведение реакции смеси производных с биотином, содержащим первичный амин; и обработку, или не обработку, смеси ацилирующим реагентом для блокирования непрореагировавших ε-NH2 групп полимера PLL; с получением, в результате, каркасного полимера, при этом блокированный каркас N-ацетилированный-PLL, или неблокированный PLL, является не биотинилированным, и химически связанный O-антигенный полисахарид является биотинилированным. В некоторых вариантах осуществления ацилирующий реагент представляет собой уксусный ангидрид или ацетилхлорид. В некоторых вариантах осуществления восстанавливающий реагент представляет собой цианоборогидрид натрия. Некоторые варианты осуществления относятся к каркасному полимеру, полученному способами, раскрытыми в настоящем изобретении.In some embodiments, the invention relates to methods for producing a backbone polymer comprising at least one biotinylated O-antigenic polysaccharide and a PLL polymer, including: reductive amination of an O-antigenic polysaccharide containing terminal aldehydes or alpha-KDO, ε-NH 2 groups of the PLL polymer , to obtain an OPS-PLL polymer; derivatization of OPS with CDAP to obtain a mixture of derivatives; carrying out the reaction of a mixture of derivatives with biotin containing a primary amine; and treating, or not treating, the mixture with an acylating agent to block unreacted ε-NH 2 groups of the PLL polymer; resulting in a backbone polymer wherein the N-acetylated-PLL blocked backbone, or unblocked PLL, is not biotinylated and the chemically bound O-antigenic polysaccharide is biotinylated. In some embodiments, the acylating agent is acetic anhydride or acetyl chloride. In some embodiments, the reducing agent is sodium cyanoborohydride. Some embodiments relate to a backbone polymer obtained by the methods disclosed in the present invention.
В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к способам получения каркасного полимера, включающего по меньшей мере один не биотинилированный O-антигенный полисахарид, при этом O-антигенный полисахарид содержит азидогруппу на его восстанавливающем конце, и по меньшей мере один биотинилированный полисахарид, содержащий алкиновые группы, включающим: связывание реакцией клик-химии в присутствии катализатора O-антигенного полисахарида, содержащего азидогруппу на его восстанавливающем конце, с биотинилированным полисахаридом, содержащим алкины, с получением в результате каркасного полимера OPS, при этом полисахарид является биотинилированным, а связанный реакцией клик-химии O-антигенный полисахарид является не биотинилированным. Некоторые варианты осуществления относятся к каркасному полимеру, полученному способами, раскрытыми в настоящем изобретении.In some embodiments, the invention relates to methods for producing a backbone polymer comprising at least one non-biotinylated O-antigenic polysaccharide, wherein the O-antigenic polysaccharide contains an azido group at its reducing end, and at least one biotinylated polysaccharide containing alkyne groups, comprising : Catalyzed linking of an O-antigenic polysaccharide containing an azido group at its reducing end with a biotinylated alkyne-containing polysaccharide to form an OPS backbone polymer, wherein the polysaccharide is biotinylated and the click chemistry linked O- the antigenic polysaccharide is not biotinylated. Some embodiments relate to a backbone polymer obtained by the methods disclosed in the present invention.
В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к способам получения каркасного полимера, включающего по меньшей мере один не биотинилированный O-антигенный полисахарид, при этом O-антигенный полисахарид содержит альдегидную или кетонную группу на его восстанавливающем конце, и по меньшей мере один биотинилированный полисахарид, содержащий первичные аминогруппы, полученный реакцией клик-химии в присутствии катализатора, при этом биотинилированный полисахарид содержит алкиновые группы с низкомолекулярным соединением, содержащим азидогруппу на одном конце и свободную аминогруппу на другом конце, включающим: химическое связывание O-антигенного полисахарида, содержащего альдегидные или кетонные группы, путем смешивания O-антигенного полисахарида с биотинилированным полисахаридом, содержащим первичные аминогруппы, и восстановительного аминирования смеси восстанавливающим реагентом, с получением в результате каркасного полимера, при этом полисахарид является биотинилированным, а химически связанный O-антигенный полисахарид является не биотинилированным. Некоторые варианты осуществления относятся к каркасному полимеру, полученному способами, раскрытыми в настоящем изобретении.In some embodiments, the invention relates to methods for producing a backbone polymer comprising at least one non-biotinylated O-antigenic polysaccharide, wherein the O-antigenic polysaccharide contains an aldehyde or ketone group at its reducing end, and at least one biotinylated polysaccharide containing primary amino group obtained by a click chemistry reaction in the presence of a catalyst, wherein the biotinylated polysaccharide contains alkyne groups with a low molecular weight compound containing an azido group at one end and a free amino group at the other end, including: chemical binding of an O-antigenic polysaccharide containing aldehyde or ketone groups by mixing an O-antigenic polysaccharide with a biotinylated polysaccharide containing primary amino groups, and reductively aminating the mixture with a reducing reagent, resulting in a backbone polymer, wherein the polysaccharide is biotinylated and the chi the micably linked O-antigenic polysaccharide is not biotinylated. Some embodiments relate to a backbone polymer obtained by the methods disclosed in the present invention.
В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к способам получения каркасного полимера, включающего по меньшей мере один биотинилированный O-антигенный полисахарид, при этом биотинилированный O-антигенный полисахарид содержит азидогруппу на его восстанавливающем конце, и по меньшей мере один не биотинилированный полисахарид, содержащий алкины, включающим: связывание реакцией клик-химии в присутствии катализатора биотинилированного O-антигенного полисахарида, содержащего азидогруппу на его восстанавливающем конце, с не биотинилированным полисахаридом, содержащим алкины, с получением в результате каркасного полимера, при этом полисахарид является не биотинилированным, и связанный реакцией клик-химии O-антигенный полисахарид является биотинилированным. В некоторых вариантах осуществления катализатор для связывания реакцией клик-химии O-антигенного полисахарида и полисахарида посредством алкин-азидного циклоприсоединения представляет собой сульфат меди. В некоторых вариантах осуществления алкиновую группу для дериватизации полисахарида выбирают из группы, состоящей из 1-амино-3-бутина, 1-амино-4-пентина, DBCO-амина и алкин-ПЭГ4-амина. В некоторых вариантах осуществления азидную группу для дериватизации полисахарида выбирают из группы, состоящей из азидо-ПЭГ3-амина, азидопропиламина и азидобутиламина. Некоторые варианты осуществления относятся к каркасному полимеру, полученному способами, раскрытыми в настоящем изобретении.In some embodiments, the invention relates to methods for producing a backbone polymer comprising at least one biotinylated O-antigenic polysaccharide, wherein the biotinylated O-antigenic polysaccharide contains an azido group at its reducing end, and at least one non-biotinylated alkyne-containing polysaccharide, comprising : linking by a click chemistry reaction in the presence of a catalyst a biotinylated O-antigenic polysaccharide containing an azido group at its reducing end to a non-biotinylated polysaccharide containing alkynes, resulting in a backbone polymer, the polysaccharide being non-biotinylated and bound by a click chemistry reaction The O-antigenic polysaccharide is biotinylated. In some embodiments, the catalyst for the click chemistry coupling of the O-antigenic polysaccharide and the polysaccharide via an alkyne azide cycloaddition is copper sulfate. In some embodiments, the alkyne group for derivatization of the polysaccharide is selected from the group consisting of 1-amino-3-butyne, 1-amino-4-pentine, DBCO-amine, and alkyne-PEG4-amine. In some embodiments, the azide group for derivatization of the polysaccharide is selected from the group consisting of azido-PEG3-amine, azidopropylamine, and azidobutylamine. Some embodiments relate to a backbone polymer obtained by the methods disclosed in the present invention.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок представляет собой, или содержит, биотин-связывающий домен и полипептид, который представляет собой, или содержит, аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с любой последовательностью из SEQ ID NO: 16-26. В некоторых вариантах осуществления слитый белок представляет собой, или содержит, биотин-связывающий домен и полипептид, который представляет собой, или содержит, аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с любой последовательностью из SEQ ID NO: 1-3 или 6-26.In some embodiments, the fusion protein is, or contains, a biotin binding domain and a polypeptide that is, or contains, an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97% , 98%, 99% or 100% identity with any sequence from SEQ ID NO: 16-26. In some embodiments, the fusion protein is, or contains, a biotin binding domain and a polypeptide that is, or contains, an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97% , 98%, 99%, or 100% identity with any of SEQ ID NOs: 1-3 or 6-26.
В некоторых вариантах осуществления способ получения варианта MAPS включает образование комплекса из по меньшей мере одного каркасного полимера, описанного в настоящем изобретении, с по меньшей мере одним слитым белком, описанным в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления вариант MAPS представляет собой BP-1 MAPS, BP-1.2 MAPS, BP-1.3 MAPS, BP-2a MAPS, BP-2b MAPS или BP-3 MAPS.In some embodiments, a method for making a MAPS variant comprises complexing at least one backbone polymer described herein with at least one fusion protein described herein. In some embodiments, the MAPS variant is MAPS BP-1, MAPS BP-1.2, MAPS BP-1.3, MAPS BP-2a, MAPS BP-2b, or MAPS BP-3.
В некоторых вариантах осуществления способ оценки иммуногенности иммуногенной композиции, описанной в настоящем изобретении, включает оценку, измерение и/или сравнение иммунного ответа с использованием одного или более in vitro биоанализов, в том числе, анализа B-клеточных и T-клеточных ответов, например, уровней антител методом ELISA, функциональных уровней антител методом FC, ОФУ, и в других функциональных тестах, таких как определение агглютинации, подвижности, цитотоксичности, Th1/Th17 клеток и уровней цитокинов, а также in vivo анализов в животных моделях внутрибольничного заболевания (пневмонии, сепсиса, инфекций ожоговых ран, ЖК тракта и операционного поля), таких как анализ бактериального клиренса, пассивной и активной защиты после заражения внутрибольничными патогенами, которые являются мишенью для иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления иммунный ответ сравнивают с ответом для контрольной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и/или антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать полимер, присутствующий в иммуногенной композиции.In some embodiments, a method for assessing the immunogenicity of an immunogenic composition of the present invention comprises assessing, measuring, and/or comparing an immune response using one or more in vitro bioassays, including analysis of B-cell and T-cell responses, for example, antibody levels by ELISA, functional antibody levels by FC, OFU, and other functional tests such as determination of agglutination, motility, cytotoxicity, Th1/Th17 cells and cytokine levels, as well as in vivo assays in animal models of nosocomial disease (pneumonia, sepsis , infections of burn wounds, gastrointestinal tract and surgical field), such as analysis of bacterial clearance, passive and active protection after infection with nosocomial pathogens that are the target of the immunogenic composition. In some embodiments, the implementation of the immune response is compared with the response to the control composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain an antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and/or an antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain a polymer present in the immunogenic composition.
В некоторых вариантах осуществления способ оценки эффективности иммуногенной композиции, описанной в настоящем изобретении, включает оценку, измерение и/или сравнение иммунного ответа с использованием одного или более in vitro биоанализов, в том числе, анализа B-клеточных и T-клеточных ответов, например, уровней антител методом ELISA, функциональных уровней антител методом FC, ОФУ, и в других функциональных тестах, таких как определение агглютинации, подвижности, цитотоксичности, Th1/Th17 клеток и цитокинов, а также in vivo анализов в животных моделях внутрибольничного заболевания (пневмонии, сепсиса, инфекций ожоговых ран, ЖК тракта и операционного поля), таких как анализ бактериального клиренса, пассивной и активной защиты после заражения внутрибольничными патогенами, которые являются мишенью для иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления иммунный ответ сравнивают с ответом для контрольной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и/или антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать полимер, присутствующий в иммуногенной композиции.In some embodiments, a method for evaluating the efficacy of an immunogenic composition of the present invention comprises evaluating, measuring, and/or comparing an immune response using one or more in vitro bioassays, including analysis of B-cell and T-cell responses, for example, antibody levels by ELISA, functional antibody levels by FC, OFU, and other functional tests such as determination of agglutination, motility, cytotoxicity, Th1/Th17 cells and cytokines, as well as in vivo assays in animal models of nosocomial disease (pneumonia, sepsis, infections of burn wounds, GI tract and surgical field), such as analysis of bacterial clearance, passive and active protection after infection with nosocomial pathogens that are the target of the immunogenic composition. In some embodiments, the implementation of the immune response is compared with the response to the control composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain an antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and/or an antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain a polymer present in the immunogenic composition.
В некоторых вариантах осуществления способ оценки иммуногенности вакцинной композиции, описанной в настоящем изобретении, включает оценку, измерение и/или сравнение иммунного ответа с использованием одного или более in vitro биоанализов, в том числе, анализа B-клеточных и T-клеточных ответов, например, уровней антител методом ELISA, функциональных уровней антител методом FC, ОФУ, и в других функциональных тестах, таких как определение агглютинации, подвижности, цитотоксичности, Th1/Th17 клеток и цитокинов, а также in vivo анализов в животных моделях внутрибольничного заболевания (пневмонии, сепсиса, инфекций ожоговых ран, ЖК тракта и операционного поля), таких как анализ бактериального клиренса, пассивной и активной защиты после заражения внутрибольничными патогенами, которые являются мишенью для иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления иммунный ответ сравнивают с ответом для контрольной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и/или антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать полимер, присутствующий в иммуногенной композиции.In some embodiments, a method for assessing the immunogenicity of a vaccine composition described in the present invention includes assessing, measuring and/or comparing an immune response using one or more in vitro bioassays, including analysis of B-cell and T-cell responses, for example, antibody levels by ELISA, functional antibody levels by FC, OFU, and other functional tests such as determination of agglutination, motility, cytotoxicity, Th1/Th17 cells and cytokines, as well as in vivo assays in animal models of nosocomial disease (pneumonia, sepsis, infections of burn wounds, GI tract and surgical field), such as analysis of bacterial clearance, passive and active protection after infection with nosocomial pathogens that are the target of the immunogenic composition. In some embodiments, the implementation of the immune response is compared with the response to the control composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain an antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and/or an antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain a polymer present in the immunogenic composition.
В некоторых вариантах осуществления способ оценки эффективности вакцинной композиции, описанной в настоящем изобретении, включает оценку, измерение и/или сравнение иммунного ответа с использованием одного или более in vitro биоанализов, в том числе, анализа B-клеточных и T-клеточных ответов, например, уровней антител методом ELISA, функциональных уровней антител методом FC, ОФУ, и в других функциональных тестах, таких как определение агглютинации, подвижности, цитотоксичности, Th1/Th17 клеток и цитокинов, а также in vivo анализов в животных моделях внутрибольничного заболевания (пневмонии, сепсиса, инфекций ожоговых ран, ЖК тракта и операционного поля), таких как анализ бактериального клиренса, пассивной и активной защиты после заражения внутрибольничными патогенами, которые являются мишенью для иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления иммунный ответ сравнивают с ответом для контрольной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и/или антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать полимер, присутствующий в иммуногенной композиции.In some embodiments, a method for evaluating the efficacy of a vaccine composition of the present invention includes evaluating, measuring, and/or comparing an immune response using one or more in vitro bioassays, including analysis of B-cell and T-cell responses, for example, antibody levels by ELISA, functional antibody levels by FC, OFU, and other functional tests such as determination of agglutination, motility, cytotoxicity, Th1/Th17 cells and cytokines, as well as in vivo assays in animal models of nosocomial disease (pneumonia, sepsis, infections of burn wounds, GI tract and surgical field), such as analysis of bacterial clearance, passive and active protection after infection with nosocomial pathogens that are the target of the immunogenic composition. In some embodiments, the implementation of the immune response is compared with the response to the control composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain an antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and/or an antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain a polymer present in the immunogenic composition.
В некоторых вариантах осуществления способ оценки иммуногенности фармацевтической композиции, описанной в настоящем изобретении, включает оценку, измерение и/или сравнение иммунного ответа с использованием одного или более in vitro биоанализов, в том числе, анализа B-клеточных и T-клеточных ответов, например, уровней антител методом ELISA, функциональных уровней антител методом FC, ОФУ, и в других функциональных тестах, таких как определение агглютинации, подвижности, цитотоксичности, Th1/Th17 клеток и цитокинов, а также in vivo анализов в животных моделях внутрибольничного заболевания (пневмонии, сепсиса, инфекций ожоговых ран, ЖК тракта и операционного поля), таких как анализ бактериального клиренса, пассивной и активной защиты после заражения внутрибольничными патогенами, которые являются мишенью для иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления иммунный ответ сравнивают с ответом для контрольной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и/или антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать полимер, присутствующий в иммуногенной композиции.In some embodiments, a method for assessing the immunogenicity of a pharmaceutical composition described in the present invention includes assessing, measuring and/or comparing an immune response using one or more in vitro bioassays, including analysis of B-cell and T-cell responses, for example, antibody levels by ELISA, functional antibody levels by FC, OFU, and other functional tests such as determination of agglutination, motility, cytotoxicity, Th1/Th17 cells and cytokines, as well as in vivo assays in animal models of nosocomial disease (pneumonia, sepsis, infections of burn wounds, GI tract and surgical field), such as analysis of bacterial clearance, passive and active protection after infection with nosocomial pathogens that are the target of the immunogenic composition. In some embodiments, the implementation of the immune response is compared with the response to the control composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain an antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and/or an antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain a polymer present in the immunogenic composition.
В некоторых вариантах осуществления способ оценки эффективности фармацевтической композиции, описанной в настоящем изобретении, включает оценку, измерение и/или сравнение иммунного ответа с использованием одного или более in vitro биоанализов, в том числе, анализа B-клеточных и T-клеточных ответов, например, уровней антител методом ELISA, функциональных уровней антител методом FC, ОФУ, и в других функциональных тестах, таких как определение агглютинации, подвижности, цитотоксичности, Th1/Th17 клеток и цитокинов, а также in vivo анализов в животных моделях внутрибольничного заболевания (пневмонии, сепсиса, инфекций ожоговых ран, ЖК тракта и операционного поля), таких как анализ бактериального клиренса, пассивной и активной защиты после заражения внутрибольничными патогенами, которые являются мишенью для иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления иммунный ответ сравнивают с ответом для контрольной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать каркасный полимер, присутствующий в иммуногенной композиции. В некоторых вариантах осуществления контрольная композиция может содержать антигенный полипептид, присутствующий в иммуногенной композиции, и/или антигенный полисахарид, присутствующий в иммуногенной композиции, и не содержать полимер, присутствующий в иммуногенной композиции.In some embodiments, a method for evaluating the effectiveness of a pharmaceutical composition described in the present invention includes assessing, measuring and/or comparing an immune response using one or more in vitro bioassays, including analysis of B-cell and T-cell responses, for example, antibody levels by ELISA, functional antibody levels by FC, OFU, and other functional tests such as determination of agglutination, motility, cytotoxicity, Th1/Th17 cells and cytokines, as well as in vivo assays in animal models of nosocomial disease (pneumonia, sepsis, infections of burn wounds, GI tract and surgical field), such as analysis of bacterial clearance, passive and active protection after infection with nosocomial pathogens that are the target of the immunogenic composition. In some embodiments, the implementation of the immune response is compared with the response to the control composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain the antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and not contain the backbone polymer present in the immunogenic composition. In some embodiments, the control composition may contain an antigenic polypeptide present in the immunogenic composition and/or an antigenic polysaccharide present in the immunogenic composition and not contain a polymer present in the immunogenic composition.
Список общепринятых сокращенийList of common abbreviations
ADH: дигидразид адипиновой кислоты; ПМР: резистентность к противомикробным средствам; УЕ: условная единица; BB: каркас; BP: каркасный полимер; CDAP: 1-циано-4-диметиламинопиридиния тетрафторборат; ЦКПЗ: Центр контроля и профилактики заболеваний; CDM: среда с определенным химическим составом; КФ: кистозный фиброз; CP: общая часть; CPS: капсульный полисахарид; КОЕ: колониеобразующие единицы; COPS: коровый O-полисахарид; ХТ: холерный токсин; ДНК: дезоксирибонуклеиновая кислота; ДТТ: дитиотреитол; EC: Escherichia coli; EDC: 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)-карбодиимид; ELISA: иммуноферментный анализ; ELISpot: клеточный иммуноферментный анализ; ETEC: энтеротоксичная E. coli; ПЦ: проточная цитометрия; ПФ: проточная фаза; ЖК: желудочно-кишечный; ГОБ: грамотрицательные бактерии; ГОП: грамотрицательные палочки; H-ЯМР: протонный ядерный магнитный резонанс; ГА: гемагглютинация; УН: убитые нагреванием; клетки HL-60: человеческие клетки промиелоцитарного лейкоза; ВЭЖХ: высокоэффективная жидкостная хроматография; IATS: Международная система серотипирования антигенов; ОИТ: отделение интенсивной терапии; ИОХ: ионообменная хроматография; IFN: интерферон; IL: интерлейкин; в/м: внутримышечно; и/н: интраназально; в/б: внутрибрюшинно; в/в: внутривенно; в/в IG: внутривенный иммуноглобулин; Ig: иммуноглобулин; KDO: группа кетокислоты; KP: Klebsiella pneumoniae; KO: Klebsiella oxytoca; LAL: лизат амебоцитов мечехвоста: LPS: липополисахарид; мАт: моноклональные антитело; MALLS: анализ многоуглового рассеяния лазерного излучения; MAPS: множественная система представления антигенов; МЛР: множественная лекарственная резистентность; MHC: главный комплекс гистосовместимости; ММ: молекулярная масса; NAPLL: N-ацетил-поли-L-лизин; NaBH3CN: цианоборогидрид натрия; NaIO4: метапериодат натрия; NHS: N-гидроксисукцинимид; НЧС: нормальная человеческая сыворотка; ЯМР: ядерный магнитный резонанс; OD: оптическая плотность; OMP: белок наружной мембраны; ОФА: анализ опсонофагоцитирующей активности; ОФУ: опсонофагоцитарное уничтожение; OPS: O-полисахарид; PA: Pseudomonas aeruginosa; ПЦР: полимеразная цепная реакция; PBS: фосфатно-солевой буфер; ПЭГ: полиэтиленгликоль; PMN: полиморфноядерные лейкоциты; PLL: поли-L-лизин; п/о: перорально; ППГ: полипропиленгликоль; PRO-CN: контрольный белок-носитель; КТ: коклюшный токсин; RCB: исследовательский банк клеток; КП: коэффициент преломления; РИА: радиоиммунный анализ; РНК: рибонуклеиновая кислота; об/мин: оборотов в минуту; СБТ: сывороточный бактерицидный тест; п/к: подкожно; SDS: додецилсульфат натрия; SDS-ПААГ: электрофорез в полиакриламидном геле с додецилсульфатом натрия: ЭХ: эксклюзионная хроматография; TFF: проточная фильтрация вдоль потока; TLR: toll-подобный рецептор; TNF: фактор некроза опухоли; TTSS: секреторная система третьего типа, УФ: ультрафильтрация; США: Соединенные Штаты Америки; WFI: вода для инъекций.ADH: adipic acid dihydrazide; PMR: resistance to antimicrobial agents; UE: conventional unit; BB: frame; BP: framework polymer; CDAP: 1-cyano-4-dimethylaminopyridinium tetrafluoroborate; CDC: Centers for Disease Control and Prevention; CDM: environment with a defined chemical composition; CF: cystic fibrosis; CP: general part; CPS: capsular polysaccharide; CFU: colony forming units; COPS: core O-polysaccharide; HT: cholera toxin; DNA: deoxyribonucleic acid; DTT: dithiothreitol; EC: Escherichia coli ; EDC: 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide; ELISA: enzyme immunoassay; ELISpot: cellular enzyme immunoassay; ETEC: enterotoxic E. coli ; PC: flow cytometry; PF: flow phase; GI: gastrointestinal; GOB: gram-negative bacteria; GOP: gram-negative rods; H-NMR: proton nuclear magnetic resonance; HA: hemagglutination; UN: killed by heat; HL-60 cells: human promyelocytic leukemia cells; HPLC: high performance liquid chromatography; IATS: International Antigen Serotyping System; ICU: intensive care unit; IOC: ion exchange chromatography; IFN: interferon; IL: interleukin; i / m: intramuscularly; i/n: intranasally; i/b: intraperitoneally; in / in: intravenously; IV IG: intravenous immunoglobulin; Ig: immunoglobulin; KDO: keto acid group; KP: Klebsiella pneumoniae ; KO: Klebsiella oxytoca ; LAL: horseshoe crab amebocyte lysate: LPS: lipopolysaccharide; mAb: monoclonal antibody; MALLS: analysis of multi-angle laser light scattering; MAPS: Multiple Antigen Presentation System; MDR: multiple drug resistance; MHC: major histocompatibility complex; MM: molecular weight; NAPLL: N-acetyl-poly-L-lysine; NaBH 3 CN: sodium cyanoborohydride; NaIO 4 : sodium metaperiodate; NHS: N-hydroxysuccinimide; SNP: normal human serum; NMR: nuclear magnetic resonance; OD: optical density; OMP: outer membrane protein; OFA: analysis of opsonophagocytic activity; OFU: opsonophagocytic killing; OPS: O-polysaccharide; PA: Pseudomonas aeruginosa ; PCR: polymerase chain reaction; PBS: phosphate-buffered saline; PEG: polyethylene glycol; PMN: polymorphonuclear leukocytes; PLL: poly-L-lysine; p/o: orally; PPG: polypropylene glycol; PRO-CN: control carrier protein; CT: pertussis toxin; RCB: research cell bank; KP: refractive index; RIA: radioimmunoassay; RNA: ribonucleic acid; rpm: revolutions per minute; PBT: serum bactericidal test; s / c: subcutaneously; SDS: sodium dodecyl sulfate; SDS-PAGE: polyacrylamide gel electrophoresis with sodium dodecyl sulfate: SEC: size exclusion chromatography; TFF: flow filtration along the flow; TLR: toll-like receptor; TNF: tumor necrosis factor; TTSS: secretory system of the third type, UV: ultrafiltration; USA: United States of America; WFI: water for injection.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙBRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS
Идеи настоящего изобретения, описанные в настоящем описании, будут более понятны при изучении следующего далее описания различных иллюстративных вариантов осуществления в сочетании с сопроводительными чертежами. Следует понимать, что описанные ниже чертежи предназначены исключительно для иллюстративных целей и никоим образом не должны ограничивать объем настоящего изобретения.The ideas of the present invention described in the present description will be better understood by studying the following description of various illustrative embodiments in conjunction with the accompanying drawings. It should be understood that the drawings described below are for illustrative purposes only and should in no way limit the scope of the present invention.
На Фигуре 1A схематически показана структура внутреннего ядра (верх) и наружного ядра (низ) липополисахарида из P. aeruginosa (PA), стрелка с надписью «расщепление» указывает на сайт расщепления, опосредованного уксусной кислотой, между «группами кетокислоты» (KDO) и молекулой липида A. На Фигуре 1B схематически показана структура повторяющихся O-полисахаридных (OPS) единиц нескольких из разных соответствующих международным стандартам типирования (IATS) коровых типов PA. На Фигуре 1C показана структура части корового полисахарида липополисахарида (LPS) K. pneumoniae с сайтом дезаминирующего расщепления между остатками глюкозамина и галактуроновой кислоты ядра при обработке LPS нитритом натрия и уксусной кислотой (азотистой кислотой), что приводит к образованию 2,5-ангидроманнозы с альдегидной группой на C-1 на восстанавливающем конце общей части (CP) OPS. На Фигуре 1D показана химическая структура повторяющихся единиц некоторых из OPS K. pneumoniae (KP) с 2,5-ангидроманнозой на восстанавливающем конце CP OPS. На Фигуре 1E показана химическая структура повторяющейся единицы капсульного полисахарида (CPS) K. oxytoca (KO) K19, который идентичен CPS K. pneumoniae K19 (Brisse et al., 2013), таким образом, их обоих взаимозаменяемо называют в настоящем изобретении KP K19 CPS. На Фигуре 1F представлен спектр H-ядерного магнитного резонанса (H-ЯМР) при 950 МГц очищенного KP K19 CPS.Figure 1A schematically shows the structure of the inner core (top) and outer core (bottom) of lipopolysaccharide fromP. aeruginosa(PA), an arrow labeled "cleavage" indicates the acetic acid-mediated cleavage site between "keto acid groups" (KDO) and the lipid A molecule. international typing standards (IATS) for PA core types. Figure 1C shows the structure of the lipopolysaccharide (LPS) core polysaccharide portionK. pneumoniaewith a deaminating cleavage site between core glucosamine and galacturonic acid residues upon treatment of LPS with sodium nitrite and acetic acid (nitrous acid), resulting in 2,5-anhydromannose with an aldehyde group at C-1 at the reducing end of the common portion (CP) of OPS. Figure 1D shows the chemical structure of the repeating units of some of the OPSK. pneumoniae (KP) with 2,5-anhydromannose at the reducing end of CP OPS. Figure 1E shows the chemical structure of the capsular polysaccharide repeating unit (CPS)K. oxytoca(KO) K19 which is identical to CPSK. pneumoniae K19et al., 2013), thus both are referred to interchangeably in the present invention as KP K19 CPS. Figure 1F shows the H-Nuclear Magnetic Resonance (H-NMR) spectrum at 950 MHz of purified KP K19 CPS.
На Фигуре 2A схематически представлен иллюстративный химический способ получения KP/PA OPS, меченого дигидразидом адипиновой кислоты (ADH) и связанного путем восстановительного аминирования с окисленным CPS, с избирательным биотинилированием на CPS (BP-1). На Фигуре 2B схематически представлен иллюстративный химический способ получения KP/PA CPS/OPS BP-1.2, где остатки биотина связаны на карбоксилатных группах CPS каркасного полимера в процессе реакции с 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)-карбодиимидом и N-гидроксисукцинимидом (EDC-NHS), и ADH-меченый OPS связан с биотинилированным CPS каркасного полимера путем восстановительного аминирования с окисленным периодатом и биотинилированным CPS. На Фигуре 2C схематически представлен иллюстративный химический способ получения KP/PA CPS/OPS BP-1.3, где остатки биотина связаны на карбоксилатных группах CPS каркасного полимера в процессе реакции с 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)-карбодиимидом и N-гидроксисукцинимидом (EDC-NHS), с последующим связыванием ADH-меченого OPS с биотинилированным и CDAP-активированным CPS каркасного полимера.Figure 2A is a schematic of an exemplary chemical process for preparing KP/PA OPS labeled with adipic acid dihydrazide (ADH) and coupled by reductive amination to oxidized CPS, with selective biotinylation on CPS (BP-1). Figure 2B is a schematic representation of an exemplary chemical process for the preparation of KP/PA CPS/OPS BP-1.2 where biotin residues are bonded to the carboxylate groups of the CPS backbone polymer during reaction with 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)-carbodiimide and N-hydroxysuccinimide (EDC-NHS), and the ADH-labeled OPS is linked to the biotinylated backbone polymer CPS by reductive amination with oxidized periodate and biotinylated CPS. Figure 2C is a schematic representation of an exemplary chemical process for the preparation of KP/PA CPS/OPS BP-1.3 where biotin residues are bonded to the CPS carboxylate groups of the backbone polymer during reaction with 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)-carbodiimide and N-hydroxysuccinimide (EDC-NHS), followed by binding of the ADH-labeled OPS to the biotinylated and CDAP-activated CPS backbone polymer.
На Фигуре 3 схематически представлен иллюстративный химический способ получения ADH-меченого OPS, связанного с окисленным CPS, с последующим добавлением остатков биотина на CPS и OPS (BP-2a).Figure 3 is a schematic representation of an exemplary chemical method for producing ADH-labeled OPS bound to oxidized CPS followed by the addition of biotin residues on CPS and OPS (BP-2a).
На Фигуре 4 схематически представлен иллюстративный химический способ получения OPS, связанного с окисленным CPS, в котором остатки биотина избирательно связывают с OPS (BP-2b).Figure 4 is a schematic representation of an illustrative chemical method for producing OPS associated with oxidized CPS, in which biotin residues are selectively associated with OPS (BP-2b).
На Фигуре 5A схематически представлен иллюстративный химический способ получения каркасного полимера OPS с полимером поли-L-лизином (PLL), в котором остатки биотина избирательно вводят в OPS, и непрореагировавшие свободные ε-аминогруппы PLL блокируют для получения каркасного полимера биотинилированного OPS и N-ацетилированного PLL (NAPLL) (BP-3). На Фигуре 5B представлены три схемы получения иллюстративных каркасных полимеров. На схеме 1 и схеме 2 показаны два варианта химического способа получения CPS/OPS каркаса 1 (BP-1) с использованием клик-химии; на схеме 3 показан химический способ с использованием клик-химии для получения CPS/OPS каркаса 2b (BP-2b).Figure 5A is a schematic of an exemplary OPS scaffold polymer chemistry with poly-L-lysine (PLL) polymer in which biotin residues are selectively introduced into OPS and unreacted free ε-amino groups of PLL are blocked to produce a biotinylated OPS and N-acetylated scaffold polymer. PLL (NAPLL) (BP-3). Figure 5B shows three schemes for the preparation of exemplary backbone polymers.
На Фигуре 6A показаны результаты иллюстративной эксклюзионной хроматографии (ЭХ), высокоэффективной жидкостной хроматографии (ВЭЖХ) (Waters BioAlliance с колонкой Phenomenex BioSep SEC-4000 и скоростью потока 1 мл/мин в PBS pH 7,4, содержащем азид натрия (0,02%); профили элюции окисленного CPS KP K19, OPS-ADH дериватизированного KPO1 (кривая 1), KPO5 (кривая 5), PAO6 (кривая 6), PAO10 (кривая 10). На Фигуре 6B показаны результаты ЭХ-ВЭЖХ (Waters BioAlliance с колонкой Phenomenex BioSep SEC-4000 и скоростью потока 1 мл/мин в PBS, pH 7,4, содержащем азид натрия (0,02%); профили элюции (слева): OPSADH; окисленный KP K19 CPSOX (указано на фигуре как K19OX); и K19 CPSOX: OPSADH каркасный полимер и (справа): K19 CPSOX: OPSADH каркасный полимер после определения размера молекул методом либо ЭХ, либо ультрафильтрации (УФ), при использовании мембраны с номинальным порогом отсечения по молекулярной массе (NMWCO) 100 кДа. На Фигуре 6C показаны результаты изучения антигенности методом иммуноферментного анализа (ELISA) с конструктами PA COPS или PA COPS: K19 BP-1, с использованием гипериммунной кроличьей сыворотки после иммунизации убитой нагреванием (УН) Pseudomonas aeruginosa (после четвертой иммунизации). COPS энтеротоксичной E. coli (ETEC) использовали в качестве отрицательного контроля в ELISA. Сильная реакционная способность PA COPS K19 BP-1 с иммунной сывороткой, специфичной для OPS Pseudomonas aeruginosa, указывает на то, что эпитопы OPS в каркасном полимере сохранены.Figure 6A shows the results of an exemplary size exclusion chromatography (SEC), high performance liquid chromatography (HPLC) (Waters BioAlliance with a Phenomenex BioSep SEC-4000 column and a flow rate of 1 ml/min in PBS pH 7.4 containing sodium azide (0.02% elution profiles of oxidized CPS KP K19, OPS-ADH derivatized KPO1 (curve 1), KPO5 (curve 5), PAO6 (curve 6), PAO10 (curve 10). Phenomenex BioSep SEC-4000 and a flow rate of 1 ml/min in PBS, pH 7.4 containing sodium azide (0.02%), elution profiles (left): OPSADH; oxidized KP K19 CPSOX (indicated on the figure as K19OX); and K19 CPSOX:OPSADH framework polymer and (right): K19 CPSOX:OPSADH framework polymer after molecular sizing by either SEC or ultrafiltration (UV) using a membrane with a nominal molecular weight cut-off (NMWCO) of 100 kDa. Figure 6C shows the results of an ELISA antigenicity study with PA COPS or PA COPS: K19 BP-1 constructs using hyperimmune rabbit serum after immunization. heat killed (HH)Pseudomonas aeruginosa (after the fourth immunization). COPS enterotoxicE. coli (ETEC) was used as a negative control in the ELISA. Strong reactivity of PA COPS K19 BP-1 with OPS-specific immune seraPseudomonas aeruginosa, indicates that the OPS epitopes in the backbone polymer are conserved.
На Фигуре 7A схематически представлен иллюстративный комплекс BP-1 MAPS со слитым белком ризавидина и OPS BP-1 или BP-1.2; На Фигуре 7B схематически представлен иллюстративный комплекс BP-2a MAPS со слитым белком ризавидина и OPS BP-2a; На Фигуре 7C схематически представлен иллюстративный комплекс BP-2b MAPS со слитым белком ризавидина и OPS BP-2b; на Фигуре 7D схематически представлен комплекс BP-3 MAPS со слитым белком ризавидина и OPS BP-3; на Фигуре 7E схематически представлен комплекс MAPS со слитым белком ризавидина и нативным OPS.Figure 7A is a schematic of an exemplary MAPS BP-1 complex with a rizavidin fusion protein and OPS BP-1 or BP-1.2; Figure 7B is a schematic representation of an exemplary MAPS BP-2a complex with a fusion protein of rizavidin and OPS BP-2a; Figure 7C is a schematic representation of an exemplary MAPS BP-2b complex with a fusion protein of rizavidin and OPS BP-2b; Figure 7D is a schematic representation of the MAPS BP-3 complex with rizavidin fusion protein and OPS BP-3; Figure 7E is a schematic representation of the MAPS complex with rizavidin fusion protein and native OPS.
На Фигуре 8A представлена иллюстративная схема последовательности операций последующего процесса очистки OPS из KP и OPS из PA. На Фигуре 8B показаны результаты иллюстративной ЭХ-ВЭЖХ (Waters BioAlliance с колонкой Phenomenex BioSep SEC-4000 использовали при скорости потока 1 мл/мин в PBS, pH 7,4, содержащем азид натрия (0,02%); профили очищенных KP OPS и K19 CPS наложены на кривые коэффициента преломления (КП), слева направо: K19 CPS, O1, O3, O2 и O5. На Фигуре 8C показаны результаты иллюстративной ЭХ-ВЭЖХ (Waters BioAlliance с колонкой Phenomenex BioSep SEC-4000 использовали при скорости потока 1 мл/мин в PBS, pH 7,4, содержащем азид натрия (0,02%); профили очищенных PA OPS наложены на кривые КП, слева направо: O2, O6, O3, O4, O5, O1, O10 и O11.Figure 8A is an exemplary flow diagram of a subsequent purification process for OPS from KP and OPS from PA. Figure 8B shows the results of an illustrative SEC-HPLC (Waters BioAlliance with a Phenomenex BioSep SEC-4000 column used at a flow rate of 1 ml/min in PBS, pH 7.4 containing sodium azide (0.02%); profiles of purified KP OPS and K19 CPS superimposed on refractive index (RI) curves, from left to right: K19 CPS, O1, O3, O2 and O5 Figure 8C shows the results of an illustrative SEC-HPLC (Waters BioAlliance with a Phenomenex BioSep SEC-4000 column used at a flow rate of 1 ml /min in PBS pH 7.4 containing sodium azide (0.02%) Purified PA OPS profiles superimposed on CP curves, from left to right: O2, O6, O3, O4, O5, O1, O10 and O11.
На Фигуре 9A представлена иллюстративная схема последовательности операций последующего процесса очистки KO CPS K19. На Фигуре 9B представлена конструкция гена для избыточно продуцирующего экзополисахарид PsL штамма Pseudomonas. На Фигуре 9C представлена схема последовательности операций последующего процесса очистки экзополисахарида PsL PA.Figure 9A is an exemplary flow diagram of a subsequent KO CPS K19 purification process. Figure 9B shows the gene construct for an exopolysaccharide overproducing PsL Pseudomonas strain. Figure 9C is a flow diagram of the subsequent purification process for PsL PA exopolysaccharide.
На Фигуре 10, верхней панели, представлен иллюстративный профиль элюции при ЭХ на колонке Superdex-200 комплексов BP-2a MAPS слитого белка Rhavi-FlaBD2-MrkA с K19: KPO2-ADH BP-2a. На Фигуре 10, нижней панели, показаны результаты скрининга путем проведения электрофореза в полиакриламидном геле с додецилсульфатом натрия (SDS-ПААГ) и окрашивания на общий белок фракций, элюированных с колонки при ЭХ, образцы были обработаны без нагревания в буфере с додецилсульфатом натрия (SDS) для образцов, содержащем 10 мМ дитиотреитол (ДТТ), перед проведением SDS-ПААГ, чтобы комплексы MAPS могли оставаться интактными.Figure 10, top panel, shows an exemplary SEC elution profile on a Superdex-200 column of BP-2a MAPS complexes of the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein with K19:KPO2-ADH BP-2a. Figure 10, bottom panel, shows the results of screening by sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) and staining for total protein of fractions eluted from the SEC column, samples were processed without heating in sodium dodecyl sulfate (SDS) buffer for samples containing 10 mM dithiothreitol (DTT) prior to SDS-PAGE so that the MAPS complexes can remain intact.
На Фигурах 11A-11C приведены примеры анализа методом SDS-ПААГ и окрашивания на общий белок иллюстративных вариантов комплексов MAPS с BP-1, полученных с использованием разных слитых белков. На Фигуре 11A показаны результаты иллюстративного SDS-ПААГ вариантов комплексов MAPS с BP-1, образованных из слитого белка ризавидина (PRO-CN) отдельно с PA O10 OPS BP-1 (дорожки 4 и 5), PA O1 OPS BP-1 (дорожки 6 и 7) и PA O2 OPS BP-1 (дорожки 8 и 9). На Фигуре 11B показаны результаты иллюстративного SDS-ПААГ вариантов комплексов MAPS с BP-1, образованных из белка ризавидин-FlaB-PcrV (Rhavi-FlaB-PcrV) отдельно с PA O10 OPS BP-1 (дорожки 4 и 5), PA O1 OPS BP-1 (дорожки 6 и 7) и PA O2 OPS BP-1 (дорожки 8 и 9). На Фигуре 11C показаны результаты иллюстративного SDS-ПААГ вариантов комплексов MAPS с BP-1, образованных из белка ризавидин-FlaB-D2-MrkA (Rhavi-FlaBD2-MrkA) с PA O10 OPS BP-1 (дорожки 4 и 5), PA O1 OPS (дорожки 6 и 7) и PA O2 OPS BP-1 (дорожки 8 и 9). На Фигурах 11A-11C отдельно слитый белок ризавидина использовали в качестве контроля (дорожки 1 и 2). Каждый из образцов обрабатывали с нагреванием (при кипячении) (дорожки 1, 4, 6 и 8) и без нагревания (дорожки 2, 5, 7 и 9). Варианты комплексов MAPS с BP-1 не разрушались без нагревания, и белок в вариантах комплексов MAPS с BP-1 оставался в самой верхней части геля. При кипячении варианты комплексов MAPS с BP-1 разрушались, белок высвобождался, и белковый димер также диссоциировал. В эксперимент также включали белковые маркеры молекулярной массы (дорожка 3), и молекулярная масса стандартов указана слева от геля в кДа.Figures 11A-11C show examples of SDS-PAGE analysis and total protein staining of exemplary variants of MAPS complexes with BP-1 made using different fusion proteins. Figure 11A shows the results of exemplary SDS-PAGE variants of MAPS complexes with BP-1 formed from the fusion protein of rizavidin (PRO-CN) alone with PA O10 OPS BP-1 (
На Фигуре 12A приведено схематическое изображение слитых белков ризавидин-антиген, которые получены из Pseudomonas (PcrV; FlaB; FlaA2; FlaA1; FlaB-PcrV; FlaBD2; FlaA2-D2) или Klebsiella (MrkA), или гибридных белков, полученных как из Klebsiella, так и из Pseudomonas (FlaB-D2-MrkA; PcrV-MrkA). На Фигуре 12B показана биологическая активность toll-подобного рецептора (TLR) 5 в отношении нативных флагеллинов Pseudomonas и слитых белков Rhavi, отдельно или в виде варианта комплекса MAPS с пневмококковыми полисахаридами (PnPS) 6B, в этом анализе клетки HEK293-NFkB:Luc отвечали на флагеллин, но не отдельно взятую среду. Эти результаты указывают на то, что конструкты ризавидина и флагеллина (FlaB, FlaA1, FlaA2), отдельно или в комплексе MAPS с PnPS 6B, стимулировали активность TLR5, следовательно, белок имел правильную укладку.Figure 12A is a schematic representation of rhizavidin-antigen fusion proteins that are derived from Pseudomonas (PcrV; FlaB; FlaA2; FlaA1; FlaB-PcrV; FlaBD2; FlaA2-D2) or Klebsiella (MrkA), or fusion proteins derived from both Klebsiella , and from Pseudomonas (FlaB-D2-MrkA; PcrV-MrkA). Figure 12B shows the biological activity of the toll-like receptor (TLR) 5 against native Pseudomonas flagellins and Rhavi fusion proteins, alone or as a variant of the MAPS complex with pneumococcal polysaccharides (PnPS) 6B, in this assay, HEK293-NFkB:Luc cells responded to flagellin, but not a single medium . These results indicate that the rhizavidin and flagellin constructs (FlaB, FlaA1, FlaA2), alone or in combination with MAPS and
На Фигурах 13A-13B приведено сравнение способности комплексов MAPS, полученных с разными слитыми белками ризавидин-антиген и пневмококковыми капсульными полисахаридами (PnCPS), вызывать ответ в виде продуцирования анти-CPS 19A антитела (Фигура 13A) или анти-CPS 6B антитела (Фигура 13B) у кроликов, при измерении методом ELISA. Оценивали образцы, полученные до иммунизации (P0), через две недели после первой иммунизации (P1) и через две недели после второй иммунизации (P2). Измеренный ответ в виде IgG выражали в условных единицах (УЕ) на основании стандартной кривой, считая УЕ на мл за 12500. Среднее геометрическое значение указано в виде горизонтальной черной линии с планками погрешностей для 95% доверительного интервала. Фигура 13A, верхняя панель: ответ в виде продуцирования иммуноглобулинов (IgG) на PnCPS 19A с PRO-CN; отдельно ризавидин (Rhavi); ризавидин-FlaB-D2 (FlaBD2); ризавидин-FlaA2-D2 (FlaA2D2); ризавидин-FlaB-PcrV (FlaB-PcrV); ризавидин-FlaB-D2-MrkA (FlaBD2-MrkA); ризавидин-PcrV-MrkA (PcrV-MrkA). Фигура 13A, нижняя панель: PRO-CN; ризавидин-PcrV (PcrV); ризавидин-FlaB (FlaB); ризавидин-FlaA1 (FlaA1); ризавидин-FlaA2 (FlaA2); ризавидин-MrkA (MrkA). Фигура 13B, верхняя панель: ответ в виде продуцирования IgG на PnCPS 6B с PRO-CN; отдельно ризавидин (Rhavi); ризавидин-FlaB-D2 (FlaBD2); ризавидин-FlaA2-D2 (FlaA2D2); ризавидин-FlaB-PcrV (FlaB-PcrV); ризавидин-FlaB-D2-MrkA (FlaBD2-MrkA); ризавидин-PcrV-MrkA (PcrV-MrkA). Фигура 13B, нижняя панель: PRO-CN; ризавидин-PcrV (PcrV); ризавидин-FlaB (FlaB); ризавидин-FlaA1 (FlaA1); ризавидин-FlaA2 (FlaA2); ризавидин-MrkA (MrkA).Figures 13A-13B compare the ability of MAPS complexes made with different rhizavidin-antigen fusion proteins and pneumococcal capsular polysaccharides (PnCPS) to elicit an
На Фигуре 14 показан иммунный ответ у кроликов, иммунизированных слитыми белками ризавидин-антиген (100 мкг белка в адъюванте Фрейнда). IgG против используемого для иммунизации антигена у кроликов при измерении методом ELISA в образцах сыворотки, полученных до иммунизации (P0) и через две недели после второй иммунизации (P2). Измеренный ответ в виде IgG выражали в условных единицах (УЕ) на основании стандартной кривой, считая УЕ на мл за 12500. Среднее геометрическое значение указано в виде горизонтальной черной линии. Титры представлены в УЕ для белков Rhavi-FlaB-D2 (FlaB-D2); Rhavi-FlaA2-D2 (FlaA2-D2); Rhavi-FlaB-PcrV (FlaB-PcrV); Rhavi-FlaB-D2-MrkA (FlaB-D2-MrkA) и Rhavi-PcrV-MrkA (PcrV-MrkA).Figure 14 shows the immune response in rabbits immunized with rizavidin-antigen fusion proteins (100 μg protein in Freund's adjuvant). IgG against immunization antigen in rabbits as measured by ELISA in serum samples obtained before immunization (P0) and two weeks after the second immunization (P2). The measured IgG response was expressed in arbitrary units (AU) based on the standard curve, counting AU per ml as 12500. The geometric mean is indicated as a horizontal black line. Titers are in AU for Rhavi-FlaB-D2 (FlaB-D2) proteins; Rhavi-FlaA2-D2 (FlaA2-D2); Rhavi-FlaB-PcrV (FlaB-PcrV); Rhavi-FlaB-D2-MrkA (FlaB-D2-MrkA) and Rhavi-PcrV-MrkA (PcrV-MrkA).
На Фигуре 15 приведено сравнение иммуногенности у кроликов двухвалентных препаратов PA O6 и O10 нативных OPS в комплексах MAPS со слитым белком ризавидина PRO-CN или ризавидином (Rhz). Титры IgG против O6 или O10 OPS представлены в виде единиц ELISA до (P0), после одной (P1) или двух инъекций (P2).Figure 15 compares immunogenicity in rabbits of native OPS divalent PA O6 and O10 preparations in MAPS complexes with rizavidin PRO-CN fusion protein or rizavidin (Rhz). IgG titers against O6 or O10 OPS are presented as ELISA units before (P0), after one (P1) or two injections (P2).
На Фигуре 16 приведено сравнение иммуногенности у кроликов препаратов 2-валентного KP O1 и KP O5 OPS BP-1; одновалентного KP O1 BP-2a, а также KP O1 BP-2b, все в вариантах комплексов MAPS со слитым белком ризавидина PRO-CN и с фосфатом алюминия. Титры IgG против KP O1 или KP O5 OPS представлены в виде единиц ELISA до (P0), после одной (P1) или двух инъекций (P2).Figure 16 compares the immunogenicity in rabbits of 2-valent KP O1 and KP O5 OPS BP-1 preparations; monovalent KP O1 BP-2a, as well as KP O1 BP-2b, all in variants of MAPS complexes with the PRO-CN rhizavidin fusion protein and with aluminum phosphate. IgG titers against KP O1 or KP O5 OPS are presented as ELISA units before (P0), after one (P1) or two injections (P2).
На Фигуре 17 приведено сравнение иммуногенности у кроликов препаратов: 2-валентного PA O6, O10 OPS BP-1 в комплексе с PRO-CN; PA O6, O10 OPS BP-1 в комплексе с PRO-CN (без квасцов); PA O6, O10-BP-1 (без белка, например, без PRO-CN); PA O6, O10 OPS BP-1 (без MAPS; например, без биотинилирования, но компоненты каркасного полимера и PRO-CN включены); и одновалентного PA-O6 OPS BP-1 в BP-1 комплексах MAPS со слитым белком ризавидина PRO-CN с фосфатом алюминия, если нет иных указаний. Титры IgG против PA O6 и против PA O10 OPS представлены в виде единиц ELISA до (P0), после одной (P1) или двух инъекций (P2).Figure 17 compares the immunogenicity in rabbits of preparations: 2-valent PA O6, O10 OPS BP-1 in complex with PRO-CN; PA O6, O10 OPS BP-1 in complex with PRO-CN (without alum); PA O6, O10-BP-1 (no protein, e.g. no PRO-CN); PA O6, O10 OPS BP-1 (no MAPS; e.g., no biotinylation, but backbone polymer and PRO-CN components included); and monovalent PA-O6 OPS BP-1 in MAPS BP-1 complexes with PRO-CN rhizavidin aluminum phosphate fusion protein, unless otherwise indicated. Anti-PA O6 and anti-PA O10 OPS IgG titers are presented as ELISA units before (P0), after one (P1) or two injections (P2).
На Фигуре 18A приведено сравнение результатов опсонофагоцитарного уничтожения (ОФУ), полученных с использованием человеческих клеток промиелоцитарного лейкоза (HL-60), клеток Klebsiella штамма 12-0581 (O1: K62), кроличьей иммунной сыворотки (от кроликов AFV651 и AFV667) к: KP O1 OPS BP-1 PRO-CN MAPS до и после второй иммунизации (слева); KP O1 OPS BP-2a/ризавидин PRO-CN MAPS до и после второй иммунизации (справа). Повышенное уничтожение наблюдали в случае сыворотки к BP-2a при сравнении иммунной сыворотки с преиммунной сывороткой от одного и того же кролика. На Фигуре 18B приведено сравнение результатов ОФУ, полученных с клетками HL-60, клетками Pseudomonas штамма PA IATSO6, кроличьей иммунной сывороткой к двухвалентному PA O6, O10-OPS BP-1 PRO-CN MAPS и одновалентному PA IATSO6-OPS BP-1 PRO-CN MAPS. Отдельные протестированные сыворотки кроликов приводили к ОФУ клеток PA IATSO6, кроличья сыворотка AFV643 приводила к эффекту прозоны, что свидетельствовало о высоком титра антител против OPS. На Фигуре 18C показано, что четыре отдельные иммунные сыворотки кроликов (P2), полученные с использованием 2-валентной вакцины PA O6, PA O10 OPS BP-1-PRO-CN-MAPS, индуцировали сильное ОФУ бактерий PA O10 клетками HL-60.Figure 18A compares opsonophagocytic killing (OPK) results obtained using human promyelocytic leukemia cells (HL-60), Klebsiella cells strain 12-0581 (O1:K62), rabbit immune sera (from AFV651 and AFV667 rabbits) to: KP O1 OPS BP-1 PRO-CN MAPS before and after the second immunization (left); KP O1 OPS BP-2a/rhizavidin PRO-CN MAPS before and after the second immunization (right). Increased killing was observed for anti-BP-2a sera when comparing immune sera with pre-immune sera from the same rabbit. Figure 18B compares the results of OFU obtained with HL-60 cells, Pseudomonas strain PA IATSO6 cells, rabbit immune serum to bivalent PA O6, O10-OPS BP-1 PRO-CN MAPS and monovalent PA IATSO6-OPS BP-1 PRO- CN MAPS. Separate tested rabbit sera resulted in OFU of PA IATSO6 cells, rabbit AFV643 serum resulted in a prozone effect, indicating a high titer of anti-OPS antibodies. Figure 18C shows that four separate rabbit immune sera (P2) prepared using a 2-valent PA O6 vaccine, PA O10 OPS BP-1-PRO-CN-MAPS, induced strong RFU of PA O10 bacteria on HL-60 cells.
На Фигуре 19A приведено сравнение полученных методом проточной цитометрии (ПЦ) результатов связывания целых клеток Klebsiella штамма B5055 (O1: K2) с отдельными кроличьими сыворотками к PRO-CN вариантов MAPS KPO1, O5 OPS BP-1 (слева) и KPO1 OPS BP-2a (справа). Эти полученные методом ПЦ результаты связывания с целыми бактериями имели аналогичную тенденцию с титрами ELISA к очищенному KPO1 OPS, то есть, низкий титр, низкое связывание методом ПЦ. Небольшое число дважды положительных событий указывало на слабое связывание антитела или ограниченное экспонирование OPS на поверхности клеток Klebsiella штамма B5055. На Фигуре 19B (верхняя панель) показана диаграмма разброса данных ПЦ для отдельной кроличьей сыворотки (AFV667) к PRO-CN BP-2a комплексу MAPS с KPO1 OPS BP-2a, где сравнивается слабое связывание с (B5055) и (K. pneumoniae, штамм Caroli, O1: K2) и сильное связывание с не инкапсулированными клетками штаммов Klebsiella (CVD 3001) O1. На Фигуре 19B (нижняя панель) показаны определенные методом ПЦ общие события связывания с теми же тремя штаммами Klebsiella O1 сыворотки от кролика, вакцинированного 2-валентным KP O1, O5 OPS BP-1 PRO-CN MAPS. Эти данные по связыванию указывают на то, что количество CPS, влияющее на экспонирование OPS, возможно, зависит от условий выращивания.On Figure 19A comparison of whole cell binding results obtained by flow cytometry (FC)Klebsiellastrain B5055 (O1:K2) with separate rabbit sera to PRO-CN variants MAPS KPO1, O5 OPS BP-1 (left) and KPO1 OPS BP-2a (right). These QC results for binding to whole bacteria showed a similar trend with ELISA titers towards purified KPO1 OPS, ie, low titer, low QC binding. A small number of double positive events indicated poor antibody binding or limited OPS exposure on the cell surface.Klebsiellastrain B5055. On Figure 19B (top panel) scatter plot shown PTs for a separate rabbit serum (AFV667) to PRO-CN BP-2a MAPS complex with KPO1 OPS BP-2a comparing weak binding to (B5055) and (K. pneumoniae,strain Caroli, O1:K2) and strong binding to non-encapsulated cells of strainsKlebsiella (CVD 3001) O1. Figure 19B (lower panel) shows the total binding events determined by the QC method with the same three strains.Klebsiella O1 serum from a rabbit vaccinated with 2-valent KP O1, O5 OPS BP-1 PRO-CN MAPS. These binding data indicate that the amount of CPS affecting OPS exposure may be dependent on growth conditions.
На Фигуре 20 приведено сравнение полученных методом ПЦ результатов связывания целых бактерий Pseudomonas штамма PAK (O6:FlaA1) с (слева) кроличьей сывороткой к 2-валентному PAO6-PAO10 с нативным OPS-PRO-CN (объединенная сыворотка от 3 кроликов, после второй иммунизации); (в центре) кроличьей сывороткой к 2-валентному PAO6-PAO10 OPS BP-1-PRO-CN MAPS (объединенная сыворотка от 3 кроликов, после второй иммунизации); (справа) кроличьей сывороткой к одновалентному PAO6-IATSO6 - OPS BP-1-PRO-CN MAPS (объединенная сыворотка от 3 кроликов, после второй иммунизации); более сильное связывание по результатам ПЦ наблюдали для PAO6 OPS BP-1 MAPS в сравнении с нативной формой OPS MAPS.Figure 20 compares the results of PAK (O6:FlaA1) whole bacteria Pseudomonas (O6:FlaA1) binding to (left) rabbit serum to 2-valent PAO6-PAO10 to native OPS-PRO-CN (pooled serum from 3 rabbits, after the second immunization) obtained by PC. ); (middle) rabbit serum to 2-valent PAO6-PAO10 OPS BP-1-PRO-CN MAPS (pooled sera from 3 rabbits, after second immunization); (right) rabbit serum to monovalent PAO6 - IATSO6 - OPS BP-1-PRO-CN MAPS (pooled sera from 3 rabbits, after second immunization); stronger binding by LC results was observed for PAO6 OPS BP-1 MAPS compared to the native form of OPS MAPS.
На Фигуре 21A показаны полученные методом ПЦ данные по связыванию анти-FlaB кролика с PA O1 штамма O5, экспрессирующего FlaB: на правой панели показана диаграмма разброса данных с высокой процентной долей меченой популяции PA O1 в сыворотке после третьей иммунизации (иммунизация P3; объединенная сыворотка от 10 кроликов) у кроликов, вакцинированных ризавидин-FlaB-D2 (без связывающей области TLR5) при сравнении с сывороткой до иммунизации (P0) (левая панель). На Фигуре 21B, верхняя панель, показаны результаты ПЦ для отдельной кроличьей сыворотки P3 против ризавидин-FlaB-D2; центральная панель, показаны результаты для отдельной кроличьей сыворотки P3 против ризавидин-FlaB-PcrV; нижняя панель, показаны результаты для отдельной кроличьей сыворотки P3 против ризавидин-FlaB-D2-MrkA.Figure 21A shows the QC data for rabbit anti-FlaB binding to PA O1 of the FlaB-expressing strain O5: the right panel shows the scatterplot of the data. with a high percentage of labeled PA O1 population in sera after the third immunization (P3 immunization; pooled sera from 10 rabbits) in rabbits vaccinated with rizavidin-FlaB-D2 (no TLR5 binding region) when compared to pre-immunization sera (P0) (left panel ). Figure 21B, top panel, shows the LC results for a single P3 rabbit serum against rizavidin-FlaB-D2; central panel showing results for a single P3 rabbit serum against rizavidin-FlaB-PcrV; bottom panel showing results for a single P3 rabbit serum against rizavidin-FlaB-D2-MrkA.
На Фигуре 22 показаны результаты ОФУ клетками HL-60 штамма-мишени Pseudomonas штамма PAO1 (O5: экспрессирующего FlaB) с объединенной кроличьей анти-Rhavi-FlaB-His иммунной сывороткой в сравнении с положительным контролем - анти-PA-FlaB антителом против PAO1 FlaB и поликлональным человеческим внутривенным иммуноглобулином (в/в IG) и отрицательным контролем (без антитела).Figure 22 shows the results of PFU with HL-60 cells of target strain Pseudomonas strain PAO1 (O5: expressing FlaB) with pooled rabbit anti-Rhavi-FlaB-His immune sera compared with positive control anti-PA-FlaB anti-PAO1 FlaB antibody and polyclonal human intravenous immunoglobulin (IV IG) and negative control (no antibody).
На Фигуре 23 показано блокирование адгезии KP O5 6997 (место происхождения Южная Африка) к клеткам A549 (карцинома легкого) при разных разбавлениях анти-FlaBD2-MrkA кроличьей сыворотки. Сыворотка против FlaBD2-MrkA (после третьей иммунизации, P3) ингибировала связывание Klebsiella штамма 6997 с клетками A549, в отличие от преиммунной сыворотки. Это указывает на то, что белковый компонент MrkA в СБ FlaBD2-MrkA имел правильную укладку и вызывал продуцирование функциональных антител.Figure 23 shows blocking of adhesion of KP O5 6997 (origin South Africa) to A549 cells (lung carcinoma) at different dilutions of anti-FlaBD2-MrkA rabbit serum. Serum against FlaBD2-MrkA (after the third immunization, P3) inhibited the binding of
На Фигуре 24A показана защита анти-PcrV антителами клеток A549 от цитотоксической интоксикации Pseudomonas штамма PAK (O6:FlaA1). Монослои клеток A549 инфицировали Pseudomonas штамма PAK (O6:FlaA1) в течение 4 часов в присутствии 10% сыворотки от кроликов (3 объединенные сыворотки), вакцинированных слитым белком Rhavi-FlaB-PcrV. Анти-Rhavi-FlaB-PcrV (P3, после третьей иммунизации) сыворотка защищала клетки от интоксикации Pseudomonas штамма PAK, в сравнении с преиммунной сывороткой, о чем свидетельствует меньшее количество округлившихся и отделившихся клеток. На Фигуре 24B, монослой клеток A549 инфицировали Pseudomonas штамма PAK в течение 4 часов в присутствии сыворотки от NCB006 Rhavi-FlaB-PcrV (3 объединенные сыворотки) при разных разведениях. Клетки промывали PBS и инкубировали в течение 1 часа с нейтральным красным. Клетки лизировали, и поглощение красителя в каждой лунке регистрировали. Анти-Rhavi-FlaB-PcrV (P3) сыворотка защищала клетки от цитотоксической интоксикации Pseudomonas штамма PAK, в сравнении с преиммунной сывороткой, до разведения 1 к 40.Figure 24A shows anti-PcrV antibody protection of A549 cells against cytotoxic intoxication by Pseudomonas strain PAK (O6:FlaA1). Monolayers of A549 cells were infected with Pseudomonas strain PAK (O6:FlaA1) for 4 hours in the presence of 10% serum from rabbits (3 pooled sera) vaccinated with the Rhavi-FlaB-PcrV fusion protein. Anti-Rhavi-FlaB-PcrV (P3, after third immunization) serum protected cells from Pseudomonas strain PAK intoxication compared to pre-immune serum, as evidenced by fewer rounded and detached cells. In Figure 24B, a monolayer of A549 cells was infected with Pseudomonas strain PAK for 4 hours in the presence of sera from NCB006 Rhavi-FlaB-PcrV (3 pooled sera) at various dilutions. Cells were washed with PBS and incubated for 1 hour with neutral red. Cells were lysed and dye uptake in each well was recorded. Anti-Rhavi-FlaB-PcrV (P3) serum protected cells from cytotoxic intoxication with Pseudomonas strain PAK, compared to pre-immune serum, up to a dilution of 1:40.
На Фигуре 25 показаны результаты анализа на цитотоксичность с использованием клеток A549 и анти-FlaB-PcrV кроличьей сыворотки (после третьей иммунизации; P3) с разными штаммами Pseudomonas: в случае высокотоксичной PA IATS O1 (замкнутые ромбы) сывороточная защита от цитотоксичности отсутствовала; в случае цитотоксической PA M2 O5 (замкнутые кружки) сывороточная защита отсутствовала; в случае цитотоксической PA 17002 O10 (замкнутые треугольники) четко наблюдалась сывороточная защита; в случае не цитотоксической PA IATS O6 (замкнутые треугольники) токсичность отсутствовала.Figure 25 shows the results of a cytotoxicity assay using A549 cells and anti-FlaB-PcrV rabbit serum (after the third immunization; P3) with different strains of Pseudomonas : in the case of highly toxic PA IATS O1 (closed diamonds), there was no serum protection against cytotoxicity; in the case of cytotoxic PA M2 O5 (closed circles), there was no serum protection; in the case of
На Фигуре 26 представлен график Каплана-Мейера выживаемости мышей, которым были нанесены ожоги, с последующим инфицированием 28 колониеобразующими единицами (КОЕ) экспрессирующих FlaB Pseudomonas штамма M-2 (O5), введенными в ожоговую рану. В данной модели мышам CD-1 пассивно вводили преиммунную кроличью сыворотку или анти-FlaB кроличью сыворотку и либо имитировали инфицирование фосфатно-солевым буфером (PBS), либо инфицировали Pseudomonas штамма M-2 в PBS. Мыши, которым вводили анти-FlaB иммунную сыворотку, были защищены (5/5, или выживаемость 100%) в течение 10 дней, или более, от заражения раны Pseudomonas штамма M-2, в то время как все мыши из других групп, кроме ложно инфицированных мышей, погибали от заражения раны.Figure 26 is a Kaplan-Meier plot of the survival of burnt mice followed by infection with 28 colony forming units (CFU) of FlaB-expressing Pseudomonas strain M-2 (O5) injected into a burn wound. In this model, CD-1 mice were passively injected with pre-immune rabbit serum or anti-FlaB rabbit serum and either mimicked phosphate buffered saline (PBS) infection or infected with Pseudomonas strain M-2 in PBS. Mice treated with anti-FlaB immune sera were protected (5/5, or 100% survival) for 10 days or more from wound infection with Pseudomonas strain M-2, while all mice from other groups except falsely infected mice died from infection of the wound.
На Фигуре 27 показан клиренс и нагрузка органа в мышиной модели инфекции KP. Мышам (CD1; группы из 3) пассивно вводили внутрибрюшинной (в/б) инъекцией кроличью сыворотку против KPO1 BP-2a OPS-PRO-CN MAPS, и затем инфицировали внутривенно (в/в) Klebsiella штамма KP B5055 O1: K2 (9×104 КОЕ). Количество жизнеспособных KP в селезенке измеряли через 14 ч после инфицирования. Имело место явное уменьшение количества жизнеспособных KP в селезенках мышей, получавших иммунную сыворотку (P2), в сравнении с селезенками мышей, которые получали преиммунную сыворотку (P0). Эти данные свидетельствуют о том, что анти-OPS O1 антитело, полученное к каркасному полимеру в вакцине варианта MAPS, было способно очищать ткани мышей от микроорганизмов и, таким образом, имело функциональную защитную активность in vivo.Figure 27 shows clearance and organ loading in a mouse model of KP infection. Mice (CD1; groups of 3) were passively injected intraperitoneally (ip) with rabbit anti-KPO1 BP-2a OPS-PRO-CN MAPS serum and then infected intravenously (iv) with Klebsiella strain KP B5055 O1:K2 (9× 10 4 CFU). The number of viable KP in the spleen was measured 14 hours after infection. There was a clear decrease in the number of viable KP in the spleens of mice treated with immune serum (P2) compared to the spleens of mice that received pre-immune serum (P0). These data suggest that the anti-OPS O1 antibody raised against the backbone polymer in the MAPS variant vaccine was able to clear microorganisms from mouse tissues and thus had functional protective activity in vivo .
На Фигуре 28 представлен график Каплана-Мейера выживаемости при пассивной защите мышей введенной кроличьей сывороткой против KPO1 BP-1 OPS-PRO-CN MAPS перед инфицированием их Klebsiella штамма B5055 (O1: K2), выращенными в салицилате для уменьшения экспрессии капсулы. Мышам CD1 (5/группу) вводили в/б 0,1 мл объединенной кроличьей иммунной (P2) или преиммунной (P0) сыворотки, с последующим в/б бактериальным заражением 2×104 КОЕ Klebsiella штамма B5055 (O1: K2). Показаны графики Каплана-Мейера выживаемости для мышей, получавших сыворотку P0 или P2 против KPO1 BP-1 OPS-PRO-CN MAPS. Сыворотка P2 защищала животных в модели, с выживанием мышей, получавших сыворотку против KPO1 BP-1 OPS-PRO-CN MAPS, в большем количестве и в течение более длительного времени, чем мышей, получавших сыворотку P0.Figure 28 is a Kaplan-Meier plot of survival when mice are passively protected with administered rabbit anti-KPO1 BP-1 OPS-PRO-CN MAPS serum prior to infection with Klebsiella strain B5055 (O1:K2) grown in salicylate to reduce capsule expression. CD1 mice (5/group) were injected ip with 0.1 ml pooled rabbit immune (P2) or pre-immune (P0) serum, followed by ip bacterial challenge with 2×10 4 cfu of Klebsiella strain B5055 (O1:K2). Shown are Kaplan-Meier plots of survival for mice treated with serum P0 or P2 against KPO1 BP-1 OPS-PRO-CN MAPS. Serum P2 protected animals in the model, with mice treated with serum against KPO1 BP-1 OPS-PRO-CN MAPS surviving in greater numbers and for a longer time than mice treated with serum P0.
На Фигуре 29 представлены результаты ELISA конечных титров IgG против KP OPS в объединенной сыворотке от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 (5 мкг PS от каждого типа BP в вакцине, экспериментальная группа 5), в сравнении с 4-валентной KP вакциной (5 мкг PS от каждого типа BP в вакцине, экспериментальная группа 4).Figure 29 shows ELISA results of end-point anti-KP OPS IgG titers in pooled sera from rabbits immunized with 12-valent KP/PA vaccine 1 (5 μg PS from each BP type in the vaccine, treatment group 5) compared to 4-valent KP vaccine (5 μg PS from each type of BP in the vaccine, experimental group 4).
На Фигуре 30 представлены результаты ELISA конечных титров IgG против PA OPS в объединенной сыворотке от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 (5 мкг PS от каждого типа BP в вакцине, экспериментальная группа 5), в сравнении с 8-валентной PA вакциной (5 мкг PS от каждого типа BP в вакцине, экспериментальная группа 4).Figure 30 shows ELISA results of end-point anti-PA OPS IgG titers in pooled sera from rabbits immunized with 12-valent KP/PA vaccine 1 (5 μg PS from each BP type in the vaccine, treatment group 5) compared to 8-valent PA vaccine (5 μg PS from each type of BP in the vaccine, experimental group 4).
На Фигуре 31 представлены результаты ELISA конечных титров IgG против PA OPS в объединенной сыворотке от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 (например, 60 мкг суммарных PS в вакцине; 5 мкг PS от каждого типа BP в вакцине), в сравнении с 12-валентной KP/PA вакциной 1 при (1 мкг PS от каждого типа BP в вакцине, экспериментальная группа 6).Figure 31 shows ELISA results of endpoint titers of anti-PA OPS IgG in pooled sera from rabbits immunized with 12-valent KP/PA vaccine 1 (e.g., 60 μg total PS in vaccine; 5 μg PS from each BP type in vaccine), compared with 12-valent KP/
На Фигуре 32 показаны индивидуальные титры IgG против каждого PS в 12-валентной KP/PA вакцине 1 в дозе 5 мкг (например, 60 мкг суммарных PS в вакцине; 5 мкг PS от каждого типа BP в вакцине).Figure 32 shows individual IgG titers against each PS in 12-valent KP/
На Фигуре 33 показаны индивидуальные титры IgG против каждого PS в 12-валентной KP/PA вакцине 1 в дозе 1 мкг (например, 12 мкг суммарных PS в вакцине; 1 мкг PS от каждого типа BP в вакцине).Figure 33 shows individual IgG titers against each PS in 1 μg 12-valent KP/PA vaccine 1 (eg, 12 μg total PS in vaccine; 1 μg PS from each BP type in vaccine).
На Фигуре 34 показано увеличение индукции индивидуальных анти-OPS IgG в случае 12-валентной KP/PA вакцины в дозе 5 мкг.Figure 34 shows the increase in the induction of individual anti-OPS IgG in the case of a 12-valent KP/PA vaccine at a dose of 5 μg.
На Фигуре 35 приведено сравнение увеличения индукции индивидуальных анти-OPS IgG в случае 12-валентной KP/PA вакцины в дозе 5 мкг PS на дозу BP и 1 мкг PS на дозу BP.Figure 35 compares the increase in the induction of individual anti-OPS IgG in the case of a 12-valent KP/PA vaccine at a dose of 5 μg PS per dose of BP and 1 μg PS per dose of BP.
На Фигуре 36 представлены результаты ELISA конечных титров IgG против PA и KP OPS в объединенной сыворотке от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 2 в дозе 60 мкг, 5 мкг PS от каждого типа BP в дозе вакцины (экспериментальная группа 1), в сравнении с 12-валентной KP/PA вакциной 2 в дозе 12 мкг, 1 мкг PS от каждого типа BP в вакцине (экспериментальная группа 2).Figure 36 shows ELISA results of end-point anti-PA and KP OPS IgG titers in pooled sera from rabbits immunized with 60 μg 12-valent KP/
На Фигуре 37 показаны индивидуальные титры IgG против каждого PS в 12-валентной KP/PA вакцине 2 в дозе 5 мкг.Figure 37 shows individual IgG titers against each PS in 12-valent KP/
На Фигуре 38 показано увеличение индукции индивидуальных анти-OPS IgG в случае 12-валентной KP/PA вакцины 2 в дозе 5 мкг.Figure 38 shows the increase in the induction of individual anti-OPS IgG in the case of 12-valent KP/
На Фигуре 39 показаны результаты анализа ELISA кроличьих IgG против FlaBD2, индуцированных введением 12-валентной KP/PA вакцины 1, 12-валентной KP/PA вакцины 2, 8-валентной PA вакцины и 4-валентной KP вакцины.Figure 39 shows the results of an ELISA assay of rabbit anti-FlaBD2 IgG induced by 12-valent KP/
На Фигуре 40 показаны результаты анализа ELISA кроличьих IgG против MrkA, индуцированных введением 12-валентной KP/PA вакцины 1, 12-валентной KP/PA вакцины 2, 8-валентной PA вакцины и 4-валентной KP вакцины.Figure 40 shows the results of an ELISA assay of rabbit anti-MrkA IgG induced by administration of 12-valent KP/
На Фигуре 41 показаны результаты анализа ELISA кроличьих IgG против PcrV, индуцированных введением 12-валентной KP/PA вакцины 1.Figure 41 shows the results of an ELISA assay of rabbit anti-PcrV IgG induced by 12-valent KP/
На Фигуре 42 показано увеличение индукции индивидуальных IgG против белка-носителя, индуцированных введением 12-валентной KP/PA вакцины 1, 12-валентной KP/PA вакцины 2, 8-валентной PA вакцины и 4-валентной KP вакцины.Figure 42 shows the increase in induction of individual anti-carrier protein IgGs induced by administration of 12-valent KP/
На Фигуре 43 показано увеличение индукции ответа на FlaB, вызванного введением различных вакцинных препаратов в трех исследованиях иммуногенности на кроликах: NCB007, NCB008 и NCB012.Figure 43 shows the increase in the induction of a response to FlaB caused by the administration of various vaccine preparations in three studies of immunogenicity in rabbits: NCB007, NCB008 and NCB012.
На Фигуре 44 показано увеличение индукции ответа на MrkA, вызванного введением различных вакцинных препаратов в трех исследованиях иммуногенности на кроликах: NCB007, NCB008 и NCB012.Figure 44 shows the increase in induction of a response to MrkA caused by the administration of various vaccine preparations in three rabbit immunogenicity studies: NCB007, NCB008 and NCB012.
На Фигуре 45 показано увеличение индукции ответа на PcrV, вызванного введением различных вакцинных препаратов в трех исследованиях иммуногенности на кроликах: NCB007, NCB008 и NCB012.Figure 45 shows the increase in PcrV response induction induced by the administration of various vaccine preparations in three rabbit immunogenicity studies: NCB007, NCB008 and NCB012.
На Фигуре 46 показано отсутствие биологической активности агониста TLR5 у белков-носителей, содержащих только домен 2 FlaB.Figure 46 shows the absence of TLR5 agonist biological activity in carrier proteins containing only
На Фигуре 47 показаны результаты анализа ОФУ человеческими нейтрофилами KP O2 K-штамма 7380.Figure 47 shows the results of analysis of PFU with human neutrophils KP O2 K-strain 7380.
На Фигуре 48A показаны результаты анализа поглощения и ОФУ с клеточной линией J774 макрофагов в присутствии гентамицина. На Фигуре 48B показаны результаты анализа поглощения и ОФУ с клеточной линией J774 макрофагов в отсутствие гентамицина.Figure 48A shows the results of an uptake and RFU assay with the J774 macrophage cell line in the presence of gentamicin. Figure 48B shows the results of the uptake and PFU analysis with the J774 macrophage cell line in the absence of gentamicin.
На Фигуре 49 показаны результаты анализа защиты от гентамицина для PA и KP, опсонизированных объединенной сывороткой от кроликов, иммунизированных 12-валентной вакциной 1. Иммунная сыворотка (P2) опосредует поглощение бактерий макрофаг-подобными клетками J774, в отличие от преиммунной сыворотки (P0).Figure 49 shows the results of the gentamicin protection assay for PA and KP opsonized with pooled sera from rabbits immunized with 12-
На Фигуре 50 показаны результаты микроскопического анализа поглощения бактерий макрофаг-подобными клетками J774 с использованием GFP-меченых PA. PA активно поглощаются после воздействия иммунной сыворотки.Figure 50 shows the results of microscopic analysis of bacterial uptake by macrophage-like J774 cells using GFP-labeled PA. PA are actively taken up after exposure to immune serum.
На Фигуре 51 показано, что объединенная сыворотка от кроликов, получавших дозу 5 мкг 12-валентной KP/PA вакцины 1 (всего 60 мкг PS), стимулирует поглощение бактерий фагоцитирующими клетками.Figure 51 shows that pooled sera from rabbits treated with a 5 μg dose of 12-valent KP/PA vaccine 1 (total 60 μg PS) stimulated bacterial uptake by phagocytic cells.
На Фигуре 52 показана выживаемость клеток, в процентах, в анализе HL60 ОФУ с KP O2 штамма 7380.Figure 52 shows the cell survival, in percent, in the HL60 PFU with KP O2 strain 7380 assay.
На Фигуре 53 представлены результаты анализов, демонстрирующие, что антитела к PcrV защищают клетки от цитотоксичности. При смешивании штамма PA (без FlaB) с 12-валентной иммунной сывороткой (пул 10, высокая доза вакцины 1) наблюдается сниженная цитотоксичность для клеток в сравнении с использованием преиммунной сыворотки от тех же кроликов.Figure 53 presents the results of analyzes demonstrating that antibodies to PcrV protect cells from cytotoxicity. When mixing the PA strain (without FlaB) with 12-valent immune sera (
На Фигуре 54 показано, что клетки, обработанные объединенной сывороткой от кроликов, иммунизированных дозой 5 мкг (например, всего 60 мкг PS в вакцине; 5 мкг PS от каждого типа BP в вакцине) 12-валентной KP/PA вакцины 1, демонстрируют сниженную подвижность штамма PA O5 FlaB через антитело к FlaB, в сравнении клетками, обработанными преиммунной сывороткой.Figure 54 shows that cells treated with pooled sera from rabbits immunized at 5 μg (e.g. total 60 μg PS in vaccine; 5 μg PS from each BP type in vaccine) of 12-valent KP/
На Фигуре 55 показано, что объединенная сыворотка от кроликов, иммунизированных 4-валентной KP вакциной (доза 5 мкг, экспериментальная группа 4), не содержащей PA OPS, приводит к увеличению агрегации FlaB-экспрессирующих PA, что свидетельствует о том, что антитело, полученное против FlaB-содержащего белка-носителя, является функциональным.Figure 55 shows that pooled sera from rabbits immunized with a 4-valent KP vaccine (5 μg dose, experimental group 4) without PA OPS resulted in increased aggregation of FlaB-expressing PA, indicating that the antibody generated against a FlaB-containing carrier protein is functional.
На Фигуре 56 показано, что объединенная сыворотка от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1, объединенная сыворотка от кроликов, иммунизированных 8-валентной PA вакциной (MrkA является единственным антигеном KP в 8-валентной PA вакцине), объединенная сыворотка от кроликов, иммунизированных 4-валентной KP вакциной, блокируют адгезию KP O5 штамма 6997 к клеткам A549. Данные свидетельствуют о том, что причиной является антитело к MrkA, индуцированное белком-носителем FlaBD2-MrkA.Figure 56 shows pooled sera from rabbits immunized with 12-valent KP/
На Фигуре 57 представлены результаты анализа клиренса крови для 3 мышей, зараженных KP O1 штамма B5055, через 1 час и 4 часа после заражения.The Figure 57 shows the results of the analysis of blood clearance for 3 mice infected with KP O1 strain B5055, 1 hour and 4 hours after infection.
На Фигуре 58 показана нагрузка органа в печени и селезенке мышей после заражения KP O1 штамма B5055.Figure 58 shows organ loading in the liver and spleen of mice after infection with KP O1 strain B5055.
На Фигуре 59 представлены результаты анализа клиренса крови для 3 мышей, зараженных KP O5 штамма 6997, через 1 час и 4 часа после заражения.The Figure 59 shows the results of the blood clearance analysis for 3 mice infected with
На Фигуре 60 показана нагрузка органа в селезенке мышей после заражения KP O5 (штамм 6997).Figure 60 shows organ loading in the spleen of mice after infection with KP O5 (strain 6997).
На Фигуре 61 представлены результаты анализа пассивной защиты от нагрузки органа в селезенке мышей, показывающие клиренс KP O2 (штамм KPN-12) из системы кровообращения мышей, получивших сыворотку от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1.Figure 61 shows the results of a passive organ loading defense assay in the spleen of mice showing the clearance of KP O2 (strain KPN-12) from the circulatory system of mice treated with sera from rabbits immunized with 12-valent KP/
На Фигуре 62 показаны различные иллюстративные оптимизированные протоколы и результаты экспериментов по пассивной защите мышей CD-1 при помощи преиммунной и иммунной сывороток против Klebsiella O2 K2 из исследования NCB012.Figure 62 shows various illustrative optimized protocols and results of passive protection experiments in CD-1 mice with preimmune and immune sera against Klebsiella O2 K2 from the NCB012 study.
На Фигура 63 показана индукция IL-17a в стимулированных клетках селезенки от мышей, иммунизированных вакциной KP O1 MAPS, с последующим бактериальным заражением KP O1:K2 штамма B5055.Figure 63 shows the induction of IL-17a in stimulated spleen cells from mice immunized with the MAPS KP O1 vaccine followed by bacterial infection with KP O1:K2 strain B5055.
На Фигуре 64 представлен экспериментальный протокол и результаты исследования с колонизацией PA O6 ЖК тракта крыс, иммунизированных двумя дозами вакцины PA O6 MAPS, с последующим бактериальным заражением.Figure 64 shows the experimental protocol and results of a PA O6 colonization study of the GI tract of rats immunized with two doses of MAPS PA O6 vaccine followed by bacterial challenge.
На Фигуре 65 представлено схематическое изображение структуры KP OPS Gal-I, Gal-II и Gal-III эпитопов.Figure 65 is a schematic representation of the structure of KP OPS Gal-I, Gal-II and Gal-III epitopes.
На Фигуре 66 показано связывание с клетками, экспрессирующими эпитопы KP D-Gal-III и KP D-Gal-I, определенное методом проточной цитометрии в сыворотке от животных, иммунизированных 4-валентной KP PRO-CN MAPS вакциной.Figure 66 shows binding to cells expressing KP D-Gal-III and KP D-Gal-I epitopes as determined by flow cytometry in sera from animals immunized with 4-valent KP PRO-CN MAPS vaccine.
На Фигуре 67 представлены результаты анализа методом проточной цитометрии, демонстрирующие, что антитела в объединенной сыворотке от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1, связываются с двумя из трех штаммов ST258 из бактериемических изолятов и также связываются с тремя из четырех штаммов серотипов, не присутствующих в вакцине с мутантными аллелями MrkA.Figure 67 shows the results of flow cytometry analysis demonstrating that antibodies in pooled sera from rabbits immunized with 12-valent KP/
На Фигуре 68 показаны индивидуальные титры анти-OPS IgG после иммунизации BP-1 (группа 1) и BP-1.2 (группа 2) KP/PA 4-валентной MAPS вакциной.Figure 68 shows individual anti-OPS IgG titers after immunization with BP-1 (group 1) and BP-1.2 (group 2) KP/PA 4-valent MAPS vaccine.
На Фигуре 69 показан ответ в виде IgG на белок-носитель, наблюдаемый при сравнении объединенных сывороток против BP-1 MAPS (группа 1) и BP-1.2 MAPS (группа 2).Figure 69 shows the IgG response to carrier protein observed when pooled sera against MAPS BP-1 (Group 1) and BP-1.2 MAPS (Group 2) are compared.
На Фигуре 70 показаны в отдельных сыворотках ответы в виде продуцирования антител к белку-носителю FlaBD2 для BP-1 и BP-1.2 (KP/PA, 4-валентная), соответственно.Figure 70 shows individual sera antibody responses to the FlaBD2 carrier protein for BP-1 and BP-1.2 (KP/PA, 4-valent), respectively.
На Фигуре 71 показаны в отдельных сыворотках ответы в виде продуцирования антител к белку-носителю MrkA для BP-1 и BP-1.2 (KP/PA, 4-валентная), соответственно.Figure 71 shows individual sera antibody responses to the MrkA carrier protein for BP-1 and BP-1.2 (KP/PA, 4-valent), respectively.
ОпределенияDefinitions
В настоящей заявке, если иное не следует из контекста, (i) термин в единственном числе можно считать означающим «по меньшей мере один»; (ii) «или» можно понимать как «и/или»; (iii) термины «содержащие» и «включающие» можно понимать как охватывающие указанные компоненты или стадии, представленные либо в отдельности, либо совместно с одним или более дополнительными компонентами или стадиями; (iv) термины «примерно» и «приблизительно» следует считать допускающими стандартное отклонение, как понятно специалистам в данной области; и (v) при указании диапазонов конечные точки включены.In this application, unless otherwise indicated by the context, (i) the term in the singular can be considered to mean "at least one"; (ii) "or" can be understood as "and/or"; (iii) the terms "comprising" and "comprising" can be understood as covering the specified components or steps, presented either alone or together with one or more additional components or steps; (iv) the terms "about" and "approximately" are to be considered as allowing for a standard deviation, as understood by those skilled in the art; and (v) when specifying ranges, endpoints are included.
Примерно: Термин «примерно», используемый в настоящем изобретении применительно к значению, относится к значению, которое является аналогичным, в контексте указанного значения. Как правило, специалисты в данной области, знакомые с контекстом, понимают относительную степень отличия, охваченную термином «примерно» в этом контексте. Например, в некоторых вариантах осуществления термин «примерно» может охватывать диапазон значений, который находится в пределах 25%, 20%, 19%, 18%, 17%, 16%, 15%, 14%, 13%, 12%, 11%, 10%, 9%, 8%, 7%, 6%, 5%, 4%, 3%, 2%, 1%, или менее, от указанного значения. Approximately: The term "about", as used in the present invention in relation to the value, refers to the value, which is similar, in the context of the specified value. Typically, those skilled in the art familiar with the context will understand the relative degree of difference encompassed by the term "about" in this context. For example, in some embodiments, the term "about" may cover a range of values that is within 25%, 20%, 19%, 18%, 17%, 16%, 15%, 14%, 13%, 12%, 11 %, 10%, 9%, 8%, 7%, 6%, 5%, 4%, 3%, 2%, 1%, or less of the indicated value.
Введение: Используемый в настоящем изобретении термин «введение», как правило, означает введение композиции пациенту, или в систему, для обеспечения доставки средства, которое представляет собой, или включено в, композицию. Специалистам в данной области знакомо множество способов, которые можно, в соответствующих обстоятельствах, использовать для введения пациенту, например, человеку. Например, в некоторых вариантах осуществления введение может быть внутриглазным, пероральным, парентеральным, топическим и так далее. В некоторых конкретных вариантах осуществления введение может быть бронхиальным (например, путем бронхиальной инстилляции), трансбуккальным, кожным (которое может представлять собой, или включать, например, одно или более из топического введения на кожу, внутрикожного, подкожного, чрескожного и так далее), энтеральным, внутриартериальным, внутрикожным, внутрижелудочным, интрамедуллярным, внутримышечным, интраназальным, внутрибрюшинным, интратекальным, внутривенным, интравентрикулярным, в конкретный орган (например, в печень), мукозальным, назальным, пероральным, ректальным, подкожным, подъязычным, топическим, трахеальным (например, путем интратрахеальной инстилляции), вагинальным, интравитреальным и так далее. В некоторых вариантах осуществления введение может включать введение одной дозы. В некоторых вариантах осуществления введение может включать введение фиксированного количества доз. В некоторых вариантах осуществления введение может включать прерывистое (например, несколько доз, разделенных во времени) и/или периодическое (например, отдельные дозы, разделенные одинаковыми временными интервалами) введение доз. В некоторых вариантах осуществления введение может включать непрерывное введение дозы (например, перфузию) в течение по меньшей мере выбранного периода времени. Introduction: As used herein, the term "administration" generally means administering a composition to a patient, or system, to effect delivery of the agent that is, or included in, the composition. Those skilled in the art are familiar with a variety of methods that can, under appropriate circumstances, be used to administer to a patient, eg, a human. For example, in some embodiments, administration may be intraocular, oral, parenteral, topical, and so on. In some specific embodiments, administration may be bronchial (eg, by bronchial instillation), buccal, dermal (which may be, or include, for example, one or more of topical administration to the skin, intradermal, subcutaneous, transdermal, and so on), enteral, intraarterial, intradermal, intragastric, intramedullary, intramuscular, intranasal, intraperitoneal, intrathecal, intravenous, intraventricular, specific organ (eg, liver), mucosal, nasal, oral, rectal, subcutaneous, sublingual, topical, tracheal (eg, by intratracheal instillation), vaginal, intravitreal and so on. In some embodiments, the implementation of the introduction may include the introduction of a single dose. In some embodiments, the implementation of the introduction may include the introduction of a fixed number of doses. In some embodiments, administration may include discontinuous (eg, multiple doses separated by time) and/or intermittent (eg, separate doses separated by equal time intervals) dosing. In some embodiments, administration may include continuous dosing (eg, perfusion) for at least a selected period of time.
Средство: В настоящем изобретении термин «средство», как правило, может быть использован для обозначения соединения или объекта любого химического класса, включая, например, полипептид, нуклеиновую кислоту, сахарид, липид, малую молекулу, металл, либо их сочетание или комплекс. При определенных обстоятельствах, как понятно из контекста специалистам в данной области, термин может быть использован для обозначения объекта, который представляет собой, или содержит, клетку или микроорганизм, или его фракцию, экстракт или компонент. Альтернативно или дополнительно, как будет понятно из контекста, термин может быть использован для обозначения естественного продукта, в том отношении, что он встречается, и/или может быть получен, в природе. В некоторых случаях, опять-таки, как будет понятно из контекста, термин может быть использован для обозначения одного или более объектов, которые являются искусственными в том отношении, что они спроектированы, сконструированы и/или созданы рукой человека, и/или не встречаются в природе. В некоторых вариантах осуществления средство может быть использовано в выделенной или чистой форме; в некоторых вариантах осуществления средство может быть использовано в необработанной форме. В некоторых вариантах осуществления потенциальные средства могут быть предоставлены в виде наборов или библиотек, например, которые могут быть подвергнуты скринингу для идентификации или определения характеристик активных средств в их составе. В некоторых случаях термин «средство» может относиться к соединению или объекту, представляющему собой, или содержащему, полимер; в некоторых случаях термин может относиться к соединению или объекту, содержащему один или более полимерных фрагментов. В некоторых вариантах осуществления термин «средство» может относиться к соединению или объекту, не являющемуся полимером и/или практически свободному от любого полимера и/или от одного или более конкретных полимерных фрагментов. В некоторых вариантах осуществления термин может относиться к соединению или объекту, лишенному или практически свободному от любого полимерного фрагмента. Means: In the present invention, the term "agent" can generally be used to refer to a compound or entity of any chemical class, including, for example, a polypeptide, nucleic acid, saccharide, lipid, small molecule, metal, or a combination or complex thereof. Under certain circumstances, as will be understood from the context by those skilled in the art, the term may be used to refer to an entity that is, or contains, a cell or microorganism, or a fraction, extract, or component thereof. Alternatively, or additionally, as will be clear from the context, the term may be used to refer to a natural product, in that it occurs and/or can be obtained in nature. In some cases, again, as will be clear from the context, the term can be used to refer to one or more objects that are artificial in that they are designed, constructed and/or created by human hand, and/or do not occur in nature. In some embodiments, the agent may be used in isolated or pure form; in some embodiments, the agent may be used in its raw form. In some embodiments, potential agents may be provided as kits or libraries, for example, which may be screened to identify or characterize the active agents within them. In some instances, the term "agent" may refer to a compound or entity that is, or contains, a polymer; in some cases, the term may refer to a compound or entity containing one or more polymeric fragments. In some embodiments, the term "agent" may refer to a non-polymer compound or entity and/or substantially free of any polymer and/or one or more specific polymer moieties. In some embodiments, the term may refer to a compound or entity devoid of or substantially free of any polymer moiety.
Аминокислота: В самом широком смысле используемый в настоящем изобретении термин «аминокислота» относится к любому соединению и/или веществу, которое может быть включено в полипептидную цепь, например, за счет образования одной или более пептидных связей. В некоторых вариантах осуществления аминокислота имеет общую структуру H2N-C(H)(R)-COOH. В некоторых вариантах осуществления аминокислота представляет собой природную аминокислоту. В некоторых вариантах осуществления аминокислота представляет собой неприродную аминокислоту; в некоторых вариантах осуществления аминокислота представляет собой D-аминокислоту; в некоторых вариантах осуществления аминокислота представляет собой Lаминокислоту. Термин «стандартная аминокислота» относится к любой из двадцати стандартных L-аминокислот, обычно встречающихся в природных пептидах. Термин «нестандартная аминокислота» относится к любой аминокислоте, отличающейся от стандартных аминокислот, независимо от того, получена ли она путем синтеза, или из природного источника. В некоторых вариантах осуществления аминокислота, включая карбокси- и/или амино-концевую аминокислоту в полипептиде, может иметь структурную модификацию в сравнении с общей структурой, приведенной выше. Например, в некоторых вариантах осуществления аминокислота может быть модифицирована путем метилирования, амидирования, ацетилирования, пегилирования, гликозилирования, фосфорилирования и/или замены (например, аминогруппы, карбоксильной группы, одного или более протонов и/или гидроксильной группы) в сравнении с общей структурой. В некоторых вариантах осуществления такая модификация может, например, изменять время полувыведения из системы кровообращения полипептида, содержащего модифицированную аминокислоту, в сравнении с полипептидом, содержащим в остальном идентичную, не модифицированную аминокислоту. В некоторых вариантах осуществления такая модификация существенно не изменяет соответствующую активность полипептида, содержащего модифицированную аминокислоту, в сравнении с полипептидом, содержащим в остальном идентичную, не модифицированную аминокислоту. Как будет понятно из контекста, в некоторых вариантах осуществления термин «аминокислота» может быть использован для обозначения свободной аминокислоты; в некоторых вариантах осуществления он может быть использован для обозначения аминокислотного остатка полипептида. Amino acid: In the broadest sense used in the present invention, the term "amino acid" refers to any compound and/or substance that can be included in the polypeptide chain, for example, through the formation of one or more peptide bonds. In some embodiments, the amino acid has the general structure H2N-C(H)(R)-COOH. In some embodiments, the amino acid is a naturally occurring amino acid. In some embodiments, the amino acid is a non-natural amino acid; in some embodiments, the amino acid is a D-amino acid; in some embodiments, the amino acid is a La-amino acid. The term "standard amino acid" refers to any of the twenty standard L-amino acids commonly found in natural peptides. The term "non-standard amino acid" refers to any amino acid that differs from the standard amino acids, whether obtained by synthesis or from a natural source. In some embodiments, an amino acid, including a carboxy- and/or amino-terminal amino acid in a polypeptide, may have a structural modification from the general structure above. For example, in some embodiments, an amino acid may be modified by methylation, amidation, acetylation, pegylation, glycosylation, phosphorylation, and/or substitution (e.g., an amino group, a carboxyl group, one or more protons, and/or a hydroxyl group) relative to the overall structure. In some embodiments, such a modification may, for example, alter the circulatory half-life of a polypeptide containing a modified amino acid as compared to a polypeptide containing an otherwise identical, unmodified amino acid. In some embodiments, the implementation of such a modification does not significantly change the corresponding activity of the polypeptide containing the modified amino acid, in comparison with the polypeptide containing an otherwise identical, unmodified amino acid. As will be clear from the context, in some embodiments, the implementation of the term "amino acid" can be used to refer to a free amino acid; in some embodiments, it can be used to refer to an amino acid residue of a polypeptide.
Антитело: Используемый в настоящем изобретении термин «антитело» относится к полипептиду, содержащему канонические элементы последовательности иммуноглобулина, достаточные для придания свойства специфического связывания конкретного антигена-мишени. Как известно в данной области, интактные антитела, продуцируемые в природе, представляют собой тетрамерные молекулы размером примерно 150 кДа, состоящие из двух идентичных полипептидов тяжелой цепи (каждая размером примерно 50 кДа) и двух идентичных полипептидов легкой цепи (каждая размером примерно 25 кДа), которые связаны друг с другом в структуру, обычно называемую «Y-образной» структурой. Каждая тяжелая цепь состоит из по меньшей мере четырех доменов (каждый длиной примерно 110 аминокислот) - амино-концевого вариабельного (VH) домена (расположенного на концах Y-образной структуры), за которым следуют три константных домена: CH1, CH2 и карбокси-концевой CH3 (расположенный у основания стебля «Y»). Короткая область, известная как «переход», соединяет вариабельную и константные области тяжелой цепи. «Шарнир» соединяет домены CH2 и CH3 с остальной частью антитела. Два дисульфидных моста в этой шарнирной области соединяют два полипептида тяжелой цепи друг с другом в интактном антителе. Каждая легкая цепь состоит из двух доменов - амино-концевого вариабельного (VL) домена, за которым следует карбокси-концевой константный (CL) домен, они отделены друг от друга еще одним «переходом». Тетрамеры интактного антитела состоят из двух димеров тяжелая цепь-легкая цепь, в которых тяжелая и легкая цепи связаны друг с другом одной дисульфидной связью; две другие дисульфидные связи соединяют шарнирные области тяжелых цепей друг с другом, так что димеры связаны друг с другом, образуя тетрамер. Продуцируемые в природе антитела также являются гликозилированными, как правило, на домене CH2. Каждый домен в природном антителе имеет структуру, называемую «укладкой цепи иммуноглобулинов», которая образована из двух бета-складчатых слоев (например, 3-, 4- или 5-цепочечных складчатых слоев), упакованных друг против друга в плотную антипараллельную бета-бочку. Каждый вариабельный домен содержит три гипервариабельные петли, известные как «определяющие комплементарность области» (CDR1, CDR2 и CDR3), и четыре в некоторой степени инвариантные «каркасные» области (FR1, FR2, FR3 и FR4). При сворачивании природных антител области FR образуют бета-складчатые структуры, которые создают структурный каркас для доменов, области петель CDR, как из легкой, так и из тяжелой, цепей сближаются в трехмерном пространстве, образуя один гипервариабельный антигенсвязывающий сайт, расположенный на конце «Y» структуры. Fc-область природных антител связывается с элементами системы комплемента, а также с рецепторами на эффекторных клетках, включая, например, эффекторные клетки, которые опосредуют цитотоксичность. Как известно в данной области, аффинность и/или другие характеристики связывания Fc-областей с Fc-рецепторами можно модулировать путем гликозилирования или другой модификации. В некоторых вариантах осуществления антитела, полученные и/или используемые в соответствии с настоящим изобретением, содержат гликозилированные Fc-домены, включая Fc-домены, модифицированные или сконструированные с использованием такого гликозилирования. Для целей настоящего изобретения, в конкретных вариантах осуществления любой полипептид или комплекс полипептидов, включающий достаточные последовательности доменов иммуноглобулина, которые имеются в природных антителах, можно называть и/или использовать в качестве «антитела», независимо от того, произведен ли полипептид естественным образом (например, выработан организмом в ответ на антиген), или произведен рекомбинантными методами, химическим синтезом или с использованием другой искусственной системы или методологии. В некоторых вариантах осуществления антитело является поликлональным; в некоторых вариантах осуществления антитело является моноклональным. В некоторых вариантах осуществления антитело имеет последовательности константной области, которые характерны для антител мыши, кролика, примата или человека. В некоторых вариантах осуществления элементы последовательности антитела являются гуманизированными, приматизированными, химерными, и так далее, как известно в данной области. Кроме того, используемый в настоящем изобретении термин «антитело» в соответствующих вариантах осуществления может означать (если нет иных указаний или не очевидно из контекста) любой из известных в данной области или разработанных конструктов или форматов для использования структурных и функциональных признаков антитела в альтернативной презентации. Например, в некоторых вариантах осуществления антитело, используемое по настоящему изобретению, имеет формат, выбранный из, но без ограничения, интактных IgA, IgG, IgE или IgM антител; би- или мультиспецифических антител (например, Zybodies® и так далее); фрагментов антител, таких как Fab-фрагменты, Fab’-фрагменты, F(ab’)2-фрагменты, Fd’-фрагменты, Fd-фрагменты, а также выделенные области CDR или их наборы; одноцепочечных Fv; продуктов слияния полипептид-Fc; однодоменных антител (например, однодоменных антител акулы, таких как IgNAR или их фрагменты); верблюжьих антител; маскированных антител (например, Probodies®); иммунофармацевтических средств на основе модульного белка малого размера (Small Modular ImmunoPharmaceuticals («SMIP™»); одноцепочечных или тандемных диател (TandAb®); VHH; антикалинов®; нанотел® минител; BiTE®; белков, содержащих анкириновые повторы, или дарпинов®; авимеров®; DART; TCR-подобных антител;, аднектинов®; аффилинов®; транстел®; аффител®; ТримерX®; микробелков; финомеров®, центиринов® и калбиторов®. В некоторых вариантах осуществления у антитела может отсутствовать ковалентная модификация (например, присоединение гликана), которую оно бы имело в случае естественного продуцирования. В некоторых вариантах осуществления антитело может иметь ковалентную модификацию (например, присоединение гликана, полезной нагрузки (например, детектируемого фрагмента, терапевтического фрагмента, каталитического фрагмента и так далее), или другую боковую группу (например, полиэтиленгликоль и так далее). Antibody: As used herein, the term "antibody" refers to a polypeptide containing canonical immunoglobulin sequence elements sufficient to confer the specific binding property of a particular target antigen. As is known in the art, intact antibodies naturally produced are about 150 kDa tetramer molecules composed of two identical heavy chain polypeptides (each about 50 kDa) and two identical light chain polypeptides (each about 25 kDa), which are connected to each other in a structure commonly referred to as a "Y-shaped" structure. Each heavy chain consists of at least four domains (each about 110 amino acids long) - an amino-terminal variable (VH) domain (located at the ends of a Y-shaped structure), followed by three constant domains: CH1, CH2 and a carboxy-terminal CH3 (located at the base of the "Y" stem). A short region, known as the "crossover", connects the variable and constant regions of the heavy chain. The "hinge" connects the CH2 and CH3 domains to the rest of the antibody. Two disulfide bridges in this hinge region connect two heavy chain polypeptides to each other in an intact antibody. Each light chain consists of two domains - an amino-terminal variable (VL) domain followed by a carboxy-terminal constant (CL) domain, they are separated from each other by another "junction". Intact antibody tetramers consist of two heavy chain-light chain dimers in which the heavy and light chains are linked to each other by a single disulfide bond; two other disulfide bonds connect the hinge regions of the heavy chains to each other so that the dimers are linked to each other to form a tetramer. Naturally produced antibodies are also glycosylated, typically on the CH2 domain. Each domain in a natural antibody has a structure called an "immunoglobulin chain fold" that is formed from two beta-pleated sheets (eg, 3-, 4-, or 5-stranded sheets) packed opposite each other in a tight, anti-parallel beta-barrel. Each variable domain contains three hypervariable loops known as "complementarity determining regions" (CDR1, CDR2 and CDR3) and four somewhat invariant "framework" regions (FR1, FR2, FR3 and FR4). When natural antibodies are folded, the FR regions form beta-sheet structures that create a structural framework for the domains, the CDR loop regions, both from the light and heavy chains, converge in three-dimensional space, forming one hypervariable antigen-binding site located at the “Y” end structures. The Fc region of natural antibodies binds to elements of the complement system as well as to receptors on effector cells, including, for example, effector cells that mediate cytotoxicity. As is known in the art, the affinity and/or other binding characteristics of Fc regions to Fc receptors can be modulated by glycosylation or other modification. In some embodiments, antibodies made and/or used in accordance with the present invention contain glycosylated Fc domains, including Fc domains modified or engineered using such glycosylation. For the purposes of the present invention, in specific embodiments, any polypeptide or complex of polypeptides comprising sufficient sequences of immunoglobulin domains that are found in naturally occurring antibodies may be referred to and/or used as an "antibody", whether or not the polypeptide is naturally produced (e.g. , produced by an organism in response to an antigen), or produced by recombinant methods, chemical synthesis, or using another artificial system or methodology. In some embodiments, the antibody is polyclonal; in some embodiments, the antibody is monoclonal. In some embodiments, the antibody has constant region sequences that are characteristic of mouse, rabbit, primate, or human antibodies. In some embodiments, the antibody sequence elements are humanized, primatized, chimeric, and so on, as is known in the art. In addition, as used herein, the term "antibody", in appropriate embodiments, may mean (unless otherwise indicated or evident from the context) any of the constructs or formats known in the art or developed for using the structural and functional features of an antibody in an alternative presentation. For example, in some embodiments, an antibody used according to the present invention has a format selected from, but not limited to, intact IgA, IgG, IgE, or IgM antibodies; bi- or multispecific antibodies (eg Zybodies® and so on); antibody fragments such as Fab fragments, Fab' fragments, F(ab')2-fragments, Fd'-fragments, Fd-fragments, as well as selected CDR areas or their sets; single chain Fv; polypeptide-Fc fusion products; single domain antibodies (eg single domain shark antibodies such as IgNAR or fragments thereof); camel antibodies; masked antibodies (for example, Probodies®); immunopharmaceuticals based on a small-sized modular protein (SmallModularImmunoPharmaceuticals ("SMIP™"); single-stranded or tandem diabodies (TandAb®); VHH; anticalin®; nanobody® minitel; BiTE®; proteins containing ankyrin repeats, or darpins®; avimers®; DART; TCR-like antibodies;, adnectins®; affiliates®; transtel®; affiliate®; TrimerX®; microproteins; finomers®, centirins® and calbitors®. In some embodiments, the antibody may lack the covalent modification (eg, addition of a glycan) that it would have if produced naturally. In some embodiments, the antibody may have a covalent modification (eg, attachment of a glycan, payload (eg, detectable moiety, therapeutic moiety, catalytic moiety, etc.), or other pendant group (eg, polyethylene glycol, etc.).
Антиген: Используемый в настоящем изобретении термин «антиген» означает (i) средство, вызывающее иммунный ответ; и/или (ii) средство, которое связывается с T-клеточным рецептором (например, при представлении молекулой MHC) или с антителом. В некоторых вариантах осуществления антиген вызывает гуморальный ответ (например, включающий продуцирование антиген-специфических антител); в некоторых вариантах осуществления антиген вызывает клеточный ответ (например, с вовлечением T-клеток, рецепторы которых специфически взаимодействуют с антигеном). В некоторых вариантах осуществления антиген вызывает гуморальный ответ и клеточный ответ. В некоторых вариантах осуществления антиген связывается с антителом, и может вызывать или не вызывать конкретный физиологический ответ в организме. Как правило, антиген может представлять собой, или содержать, любую химическую молекулу, такую как, например, малая молекула, нуклеиновая кислота, полипептид, углевод, липид, полимер (в некоторых вариантах осуществления отличный от биологического полимера (например, отличный от нуклеотидного или аминокислотного полимера)) и так далее. В некоторых вариантах осуществления антиген представляет собой, или содержит, полипептид. В некоторых вариантах осуществления антиген представляет собой, или содержит, полисахарид. Специалисты в данной области понимают, что, как правило, антиген может быть предоставлен в выделенной или чистой форме, или, альтернативно, может быть предоставлен в необработанной форме (например, вместе с другими материалами, например, в экстракте, таком как клеточный экстракт или другой относительно необработанный содержащий антиген источник). В некоторых вариантах осуществления антигены, используемые по настоящему изобретению, предоставлены в необработанной форме. В некоторых вариантах осуществления антиген представляет собой рекомбинантный антиген. Antigen: Used in the present invention, the term "antigen" means (i) an agent that causes an immune response; and/or (ii) an agent that binds to a T cell receptor (eg, when presented with an MHC molecule) or an antibody. In some embodiments, the antigen elicits a humoral response (eg, including the production of antigen-specific antibodies); in some embodiments, the antigen elicits a cellular response (eg, involving T cells whose receptors specifically interact with the antigen). In some embodiments, the antigen elicits a humoral response and a cellular response. In some embodiments, an antigen binds to an antibody, and may or may not elicit a specific physiological response in the body. Typically, an antigen may be, or comprise, any chemical molecule such as, for example, a small molecule, nucleic acid, polypeptide, carbohydrate, lipid, polymer (in some embodiments, other than a biological polymer (e.g., other than a nucleotide or amino acid polymer) and so on. In some embodiments, the antigen is, or contains, a polypeptide. In some embodiments, the implementation of the antigen is, or contains, a polysaccharide. Those skilled in the art will appreciate that, in general, the antigen may be provided in isolated or pure form, or alternatively may be provided in raw form (e.g., together with other materials, e.g., in an extract such as a cell extract or other relatively untreated antigen-containing source). In some embodiments, the antigens used in the present invention are provided in raw form. In some embodiments, the antigen is a recombinant antigen.
Связанные с: Два объекта являются «связанными» друг с другом, при использовании этого термина в настоящем изобретении, если присутствие, уровень и/или форма одного коррелирует с соответствующими характеристиками другого. В некоторых вариантах осуществления два или более объектов физически «связаны» между собой, если они взаимодействуют, прямо или опосредованно, так, что они находятся и/или остаются в физической близости друг с другом. В некоторых вариантах осуществления два или более объектов, которые физически связаны между собой, являются ковалентно связанными между собой; в некоторых вариантах осуществления два или более объектов, которые физически связаны между собой, не являются ковалентно связанными между собой, но являются связанными нековалентно, например, за счет аффинности взаимодействия, водородных связей, ван-дер-ваальсовых сил, гидрофобных взаимодействий, магнетизма, а также их сочетаний. Connected with: Two objects are "associated" with each other, as the term is used in the present invention, if the presence, level and/or form of one is correlated with the corresponding characteristics of the other. In some embodiments, two or more objects are physically "connected" if they interact, directly or indirectly, such that they are and/or remain in physical proximity to each other. In some embodiments, two or more entities that are physically linked are covalently linked; in some embodiments, two or more entities that are physically bonded to each other are not covalently bonded to each other, but are bonded non-covalently, for example, through interaction affinity, hydrogen bonds, van der Waals forces, hydrophobic interactions, magnetism, and as well as their combinations.
Каркасный полимер: Используемый в настоящем изобретении термин «каркасный полимер» означает полимер, с которым конъюгированы, или могут быть конъюгированы, один или более полисахаридов (например, антигенных полисахаридов). В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер представляет собой полимер и один или более полисахаридов (например, антигенных полисахаридов), конъюгированных с полимером. Framework polymer: As used herein, the term "framework polymer" means a polymer to which one or more polysaccharides (eg, antigenic polysaccharides) are conjugated, or may be conjugated. In some embodiments, the backbone polymer is a polymer and one or more polysaccharides (eg, antigenic polysaccharides) conjugated to the polymer.
Связывание: Следует понимать, что используемый в настоящем изобретении термин «связывание», как правило, означает нековалентную ассоциацию между, или среди, двумя, или более, объектами. «Прямое связывание» включает физический контакт между объектами или фрагментами; непрямое связывание включает физическое взаимодействие путем физического контакта с одним или более промежуточными объектами. Связывание между двумя или более объектами можно, как правило, оценивать в любом из различных контекстов - включая случаи, когда взаимодействующие объекты или фрагменты изучают в изоляции или в контексте более сложных систем (например, в ковалентной или иной ассоциации с носителем и/или в биологической системе или клетке). Binding: It should be understood that as used in the present invention, the term "binding", as a rule, means non-covalent association between, or among, two or more objects. "Direct linking" includes physical contact between objects or fragments; indirect bonding involves physical interaction through physical contact with one or more intermediate entities. Binding between two or more entities can generally be assessed in any of a variety of contexts - including cases where interacting entities or fragments are studied in isolation or in the context of more complex systems (e.g., in covalent or other association with a carrier and/or in biological system or cell).
Белок-носитель: Используемый в настоящем изобретении термин «белок-носитель» означает белок или пептид, который вызывает или усиливает иммунный ответ на связанный с ним, или находящийся в комплексе с ним, гаптен. В некоторых вариантах осуществления иммунный ответ, вызванный или усиленный белком-носителем, представляет собой ответ на гаптен. В некоторых вариантах осуществления не развивается какой-либо существенный ответ на сам белок-носитель; в некоторых вариантах осуществления ответ на белок-носитель может быть обнаружен. В некоторых вариантах осуществления белок-носитель находится в комплексе с одной или более другими молекулами. Carrier protein: Used in the present invention, the term "carrier protein" means a protein or peptide that causes or enhances the immune response associated with it, or complexed with it, hapten. In some embodiments, the immune response elicited or enhanced by the carrier protein is a response to a hapten. In some embodiments, no significant response develops to the carrier protein itself; in some embodiments, the response to the carrier protein can be detected. In some embodiments, the carrier protein is complexed with one or more other molecules.
Клик-химия: Используемый в настоящем изобретении термин «клик-химия» означает быструю и высокопроизводительную реакцию, например, описанную K. B. Sharpless в 2001 г. В некоторых вариантах осуществления в реакции клик-химии образуются побочные продукты, которые могут быть удалены без применения хроматографии. В некоторых вариантах осуществления в реакции клик-химии образуются только побочные продукты, которые могут быть удалены без применения хроматографии. В некоторых вариантах осуществления реакция клик-химии является стереоспецифической. В некоторых вариантах осуществления реакцию клик-химии можно проводить с использованием одного или более легко удаляемых растворителей. В некоторых вариантах осуществления реакцию клик-химии можно проводить с использованием одного или более слабых растворителей. В некоторых вариантах осуществления в реакции клик-химии используют катализируемую медью реакцию азид-алкинового циклоприсоединения для соединения одного или более молекулярных объектов. В некоторых вариантах осуществления один или более молекулярных объектов не ограничены молекулярными размерами. В некоторых вариантах осуществления реакция клик-химии может быть биоортогональной; например, ни реагенты, ни функциональные группы их продуктов не взаимодействуют с функционализированными биомолекулами, и/или реакция протекает легко в мягких нетоксичных условиях, например, при комнатной температуре и, предпочтительно, в воде. В некоторых вариантах осуществления реакция клик-химии может представлять собой катализируемое медью циклоприсоединение Хьюсгена, азид-алкиновое [3+2] биполярное циклоприсоединение, лигирование Штаудингера, или азид-фосфиновое лигирование. В некоторых вариантах осуществления клик-химию можно использовать для связывания между собой двух полимеров (например, двух нуклеиновых кислот или нуклеиновую кислоту и белок или пептид, или два гликополимера, и так далее). Click chemistry: As used herein, the term "click chemistry" refers to a fast and high throughput reaction such as that described by K. B. Sharpless in 2001. In some embodiments, the click chemistry reaction produces by-products that can be removed without the use of chromatography. In some embodiments, the click chemistry reaction produces only by-products that can be removed without the use of chromatography. In some embodiments, the click chemistry reaction is stereospecific. In some embodiments, the click chemistry reaction can be carried out using one or more easily removable solvents. In some embodiments, the click chemistry reaction can be carried out using one or more weak solvents. In some embodiments, the click chemistry reaction uses a copper-catalyzed azide-alkyne cycloaddition reaction to join one or more molecular entities. In some embodiments, the implementation of one or more molecular entities is not limited to molecular sizes. In some embodiments, the click chemistry reaction may be bioorthogonal; for example, neither the reactants nor the functional groups of their products interact with the functionalized biomolecules, and/or the reaction proceeds readily under mild, non-toxic conditions, eg, at room temperature and preferably in water. In some embodiments, the click chemistry reaction can be a copper-catalyzed Huisgen cycloaddition, an azide-alkyne [3+2] bipolar cycloaddition, a Staudinger ligation, or an azide-phosphine ligation. In some embodiments, click chemistry can be used to link two polymers (eg, two nucleic acids, or a nucleic acid and a protein or peptide, or two glycopolymers, etc.) to each other.
Колонизация (например, слизистой оболочки или ЖК тракта): Используемый в настоящем изобретении термин «колонизация» означает способность микроорганизма создавать нишу в анатомической зоне, например, слизистой оболочке, участке повреждения, органе и так далее. Colonization (eg, mucosal or GI tract): Used in the present invention, the term "colonization" means the ability of a microorganism to create a niche in the anatomical zone, for example, the mucous membrane, the site of injury, organ, and so on.
Комбинированная терапия: Используемый в настоящем изобретении термин «комбинированная терапия» относится к ситуациям, когда пациент одновременно подвергается воздействию двух или более терапевтических режимов (например, двух или более лекарственных средств). В некоторых вариантах осуществления два или более режимов могут быть применены одновременно; в некоторых вариантах осуществления такие режимы могут быть применены последовательно (например, все «дозы» первого режима вводят до введения какой-либо из доз второго режима); в некоторых вариантах осуществления такие средства вводят в перекрывающихся режимах дозирования. В некоторых вариантах осуществления «применение» комбинированной терапии может включать применение одного или более средств или методов лечения для пациента, получающего другое средство(а) или метод(ы) лечения, в сочетании. Для ясности, для комбинированной терапии не требуется, чтобы отдельные средства были введены совместно в одной композиции (или даже обязательно в одно и то же время), хотя в некоторых вариантах осуществления два или более средств, или их активных фрагментов, могут быть введены совместно в комбинированной композиции, или даже в комбинированном соединении (например, в виде части одного химического комплекса или ковалентно связанного объекта). Combination Therapy: Used in the present invention, the term "combination therapy" refers to situations where the patient is simultaneously exposed to two or more therapeutic regimens (for example, two or more drugs). In some embodiments, two or more modes may be applied simultaneously; in some embodiments, such regimens may be administered sequentially (eg, all "doses" of the first regimen are administered prior to the administration of any of the doses of the second regimen); in some embodiments, such agents are administered in overlapping dosing regimens. In some embodiments, "administering" a combination therapy may include administering one or more agents or treatments to a patient receiving another agent(s) or treatment(s) in combination. To be clear, combination therapy does not require that the individual agents be co-administered in the same composition (or even necessarily at the same time), although in some embodiments, two or more agents, or active fragments thereof, may be co-administered in a combined composition, or even in a combined compound (eg, as part of a single chemical complex or covalently bonded entity).
Композиция: Специалисты в данной области понимают, что используемый в настоящем изобретении термин «композиция» может быть использован для обозначения дискретного физического объекта, который содержит один или более определенных компонентов. Как правило, если не указано иначе, композиция может иметь любую форму - например, газ, гель, жидкость, твердое вещество и так далее. Composition: Those skilled in the art will appreciate that the term "composition" as used herein can be used to refer to a discrete physical object that contains one or more specific components. As a rule, unless otherwise indicated, the composition may be in any form - for example, gas, gel, liquid, solid, and so on.
Производное: Используемый в настоящем изобретении термин «производное» означает структурный аналог эталонного вещества. То есть, «производное» представляет собой вещество, которое имеет значительное структурное сходство с эталонным веществом, например, общую центральную или консенсусную структуру, но также и отличается некоторыми дискретными признаками. В некоторых вариантах осуществления производное представляет собой вещество, которое может быть получено из эталонного вещества путем химических манипуляций. В некоторых вариантах осуществления производное представляет собой вещество, которое может быть получено путем проведения процесса синтеза, в значительной степени аналогичного (например, имеющего множество общих этапов) тому, который приводит к получению эталонного вещества. Derivative: Used in the present invention, the term "derivative" means a structural analogue of the reference substance. That is, a "derivative" is a substance that has a significant structural similarity to the reference substance, such as a common core or consensus structure, but also differs in some discrete features. In some embodiments, a derivative is a substance that can be obtained from a reference substance by chemical manipulation. In some embodiments, a derivative is a substance that can be obtained by carrying out a synthetic process substantially similar (eg, having many common steps) to that which results in a reference substance.
Домен: Используемый в настоящем изобретении термин «домен» означает секцию или часть объекта. В некоторых вариантах осуществления «домен» связан с конкретным структурным и/или функциональным признаком объекта таким образом, что, когда домен физически отделен от остальной части исходного объекта, он в значительной степени, или полностью, сохраняет конкретный структурный и/или функциональный признак. Альтернативно или дополнительно, домен может представлять собой, или включать, часть объекта, которая при отделении от этого (исходного) объекта и связывании с другим объектом (реципиентом) в значительной степени сохраняет и/или передает объекту-реципиенту один или более структурных и/или функциональных признаков, которые характеризуют его в исходном объекте. В некоторых вариантах осуществления домен представляет собой секцию или часть молекулы (например, малой молекулы, углевода, липида, нуклеиновой кислоты или полипептида). В некоторых вариантах осуществления домен представляет собой секцию полипептида; в некоторых таких вариантах осуществления домен характеризуется конкретным структурным элементом (например, конкретной аминокислотной последовательностью или мотивом последовательности, α-спиральной структурой, β-складчатой структурой, биспиральной структурой, случайной спиральной структурой и так далее), и/или конкретным функциональным признаком (например, активностью связывания, ферментативной активностью, активностью сворачивания, активностью сигнализации и так далее). Domain: Used in the present invention, the term "domain" means a section or part of the object. In some embodiments, a "domain" is associated with a particular structural and/or functional feature of an entity such that when the domain is physically separated from the rest of the original entity, it retains the particular structural and/or functional feature to a significant extent or all of it. Alternatively, or additionally, a domain may be, or include, a portion of an entity that, when separated from that (original) entity and associated with another entity (the recipient), substantially retains and/or transfers to the recipient entity one or more structural and/or functional features that characterize it in the original object. In some embodiments, a domain is a section or part of a molecule (eg, a small molecule, carbohydrate, lipid, nucleic acid, or polypeptide). In some embodiments, the domain is a section of a polypeptide; in some such embodiments, the domain is characterized by a specific structural element (e.g., a specific amino acid sequence or sequence motif, α-helical structure, β-sheet structure, coiled structure, random helical structure, etc.), and/or a specific functional feature (e.g., binding activity, enzymatic activity, folding activity, signaling activity, and so on).
Лекарственная форма или стандартная лекарственная форма: Специалисты в данной области понимают, что термин «лекарственная форма» может быть использован для обозначения физически дискретной единицы активного средства (например, терапевтического или диагностического средства) для введения пациенту. Как правило, каждая такая единица содержит заранее определенное количество активного средства. В некоторых вариантах осуществления такое количество представляет собой количество стандартной дозы (или ее целой части), подходящее для введения в соответствии с режимом введения, который был выбран для достижения желаемого или полезного результата при введении соответствующей популяции (то есть, в соответствии с терапевтическим режимом дозирования). Специалисты в данной области понимают, что общее количество терапевтической композиции, или средства, введенное конкретному пациенту, определяет один или более практикующих врачей, и его можно вводить во множестве лекарственных форм. Dosage form or standard dosage form: Those skilled in the art will appreciate that the term "dosage form" may be used to refer to a physically discrete unit of an active agent (eg, therapeutic or diagnostic agent) for administration to a patient. Typically, each such unit contains a predetermined amount of the active agent. In some embodiments, such an amount is the amount of a unit dose (or whole portion thereof) suitable for administration in accordance with the administration regimen that has been selected to achieve the desired or beneficial result when administered to the relevant population (i.e., in accordance with the therapeutic dosing regimen ). Those skilled in the art will appreciate that the total amount of therapeutic composition or agent administered to a particular patient is determined by one or more practitioners and may be administered in a variety of dosage forms.
Режим дозирования: Специалисты в данной области понимают, что термин «режим дозирования» может быть использован для обозначения набора стандартных доз (как правило, более одной), индивидуально вводимых пациенту, как правило, с некоторыми интервалами времени. В некоторых вариантах осуществления конкретное лекарственное средство имеет рекомендованный режим дозирования, который может включать введение одной или более доз. В некоторых вариантах осуществления режим дозирования включает введение множества доз, при этом каждую из них вводят через некоторый промежуток времени. В некоторых вариантах осуществления временные интервалы между введениями отдельных доз являются одинаковыми; в некоторых вариантах осуществления режим дозирования включает введение множества доз, и имеют место по меньшей мере два разных временных интервала между введением отдельных доз. В некоторых вариантах осуществления все дозы в режиме дозирования являются одинаковыми в отношении вводимого количества. В некоторых вариантах осуществления разные дозы в режиме дозирования являются разными в отношении вводимого количества. В некоторых вариантах осуществления режим дозирования включает введение первой дозы в первом количестве дозы, с последующим введением одной или более дополнительных доз во втором количестве дозы, отличающемся от первого количества дозы. В некоторых вариантах осуществления режим дозирования включает введение первой дозы в первом количестве дозы, с последующим введением одной или более дополнительных доз во втором количестве дозы, таком же, как первое количество дозы. В некоторых вариантах осуществления режим дозирования приводит к достижению желаемого или полезного результата при введении соответствующей популяции (то есть, представляет собой терапевтический режим дозирования). Dosing regimen: Those skilled in the art will appreciate that the term "dosing regimen" may be used to refer to a set of unit doses (typically more than one) individually administered to a patient, typically at some time interval. In some embodiments, the implementation of a particular drug has a recommended dosing regimen, which may include the introduction of one or more doses. In some embodiments, the implementation of the dosing regimen includes the introduction of multiple doses, with each of them administered after a certain period of time. In some embodiments, the implementation of the time intervals between the introduction of individual doses are the same; in some embodiments, the implementation of the dosing regimen includes the introduction of multiple doses, and there are at least two different time intervals between the introduction of individual doses. In some embodiments, all doses in a dosing regimen are the same with respect to the amount administered. In some embodiments, different doses in a dosing regimen are different with respect to the amount administered. In some embodiments, the dosing regimen comprises administering a first dose in a first dose amount followed by one or more additional doses in a second dose amount different from the first dose amount. In some embodiments, the dosing regimen comprises administering a first dose in a first dose amount, followed by administering one or more additional doses in a second dose amount, the same as the first dose amount. In some embodiments, the implementation of the dosage regimen leads to the achievement of the desired or beneficial result when administered to the appropriate population (ie, is a therapeutic dosage regimen).
Эпитоп: Используемый в настоящем изобретении термин «эпитоп» охватывает любой фрагмент, который специфически узнается связывающим компонентом иммуноглобулина (например, антителом или рецептором). В некоторых вариантах осуществления эпитоп состоит из множества химических атомов или групп на антигене. В некоторых вариантах осуществления такие химические атомы или группы экспонируются на поверхности, когда антиген принимает соответствующую трехмерную конформацию. В некоторых вариантах осуществления такие химические атомы или группы физически расположены в пространстве в непосредственной близости друг от друга, когда антиген принимает такую конформацию. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере некоторые такие химические атомы или группы физически отдаляются друг от друга, когда антиген принимает альтернативную конформацию (например, линеаризуется). Epitope: As used herein, the term "epitope" encompasses any fragment that is specifically recognized by an immunoglobulin binding component (eg, antibody or receptor). In some embodiments, an epitope consists of a plurality of chemical atoms or groups on an antigen. In some embodiments, such chemical atoms or groups are exposed on the surface when the antigen assumes the appropriate three-dimensional conformation. In some embodiments, such chemical atoms or groups are physically located in space in close proximity to each other when the antigen assumes such a conformation. In some embodiments, at least some of these chemical atoms or groups physically move away from each other when the antigen assumes an alternative conformation (eg, linearizes).
Экзополисахарид: Используемый в настоящем изобретении термин «экзополисахарид» относится к природным высокомолекулярным полимерам, состоящим из остатков сахара и секретируемым микроорганизмами в окружающую их среду. Экзополисахариды могут быть названы взаимозаменяемо внеклеточными полисахаридами (ВПС). ВПС обеспечивают функциональную и структурную целостность биопленок и считаются фундаментальным компонентом, определяющим физико-химические свойства биопленки. ВПС составляют от 50% до 90% общего органического вещества биопленок. Exopolysaccharide: As used in the present invention, the term "exopolysaccharide" refers to natural high molecular weight polymers composed of sugar residues and secreted by microorganisms into their environment. Exopolysaccharides may be referred to interchangeably as extracellular polysaccharides (EPS). IPNs provide the functional and structural integrity of biofilms and are considered to be a fundamental component that determines the physicochemical properties of a biofilm. VPS make up from 50% to 90% of the total organic matter of biofilms.
Фрагмент: «Фрагмент» материала или объекта, описанного в настоящем изобретении, имеет структуру, которая включает дискретную часть целого, но лишена одного или более фрагментов, имеющихся в целом объекте. В некоторых вариантах осуществления фрагмент состоит из такой дискретной части. В некоторых вариантах осуществления фрагмент включает дискретную часть целого, при этом дискретная часть имеет одну или более функциональных характеристик, общих с целым объектом. В некоторых вариантах осуществления фрагмент состоит из такой дискретной части. В некоторых вариантах осуществления фрагмент состоит из, или содержит характерный структурный элемент или группу, имеющиеся в целом объекте. В некоторых вариантах осуществления фрагмент полимера содержит, или состоит из, по меньшей мере 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, или более, мономерных единиц (например, остатков), которые присутствуют в целом полимере. В некоторых вариантах осуществления фрагмент полимера содержит, или состоит из, по меньшей мере примерно 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 25%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или более, мономерных единиц (например, остатков), которые присутствуют в целом полимере. В некоторых вариантах осуществления целый материал или объект может быть назван «исходным» целым. Fragment: A "fragment" of a material or object described in the present invention has a structure that includes a discrete part of the whole, but lacks one or more fragments found in the whole object. In some embodiments, the implementation of the fragment consists of such a discrete part. In some embodiments, the implementation of the fragment includes a discrete part of the whole, while the discrete part has one or more functional characteristics in common with the whole object. In some embodiments, the implementation of the fragment consists of such a discrete part. In some embodiments, the implementation of the fragment consists of, or contains a characteristic structural element or group found in the whole object. In some embodiments, the polymer fragment contains, or consists of, at least 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 , 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190 , 200, 210, 220, 230, 240, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, or more, monomeric units (e.g., residues) that are present in the entire polymer. In some embodiments, the polymer fragment contains, or consists of, at least about 5%, 10%, 15%, 20%, 25%, 30%, 25%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60 %, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or more, monomeric units (e.g., residues) that are present as a whole polymer. In some embodiments, the implementation of the whole material or object may be called the "original" whole.
Гомология: Используемый в настоящем изобретении термин «гомология» относится к общему родству между полимерными молекулами, например, между молекулами нуклеиновой кислоты (например, молекулами ДНК и/или молекулами РНК) и/или между полипептидными молекулами. В некоторых вариантах осуществления полимерные молекулы считают «гомологичными» друг другу, если их последовательности имеют идентичность по меньшей мере 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99%. В некоторых вариантах осуществления полимерные молекулы считают «гомологичными» друг другу, если их последовательности имеют сходство по меньшей мере 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99%. Homology: Used in the present invention, the term "homology" refers to a common relationship between polymer molecules, for example, between nucleic acid molecules (eg, DNA molecules and/or RNA molecules) and/or between polypeptide molecules. In some embodiments, polymer molecules are considered "homologous" to each other if their sequences share at least 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70% identity. , 75%, 80%, 85%, 90%, 95% or 99%. In some embodiments, polymer molecules are considered "homologous" to each other if their sequences share at least 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70% similarity. , 75%, 80%, 85%, 90%, 95% or 99%.
Идентичность: Используемый в настоящем изобретении термин «идентичность» относится к общему родству между полимерными молекулами, например, между молекулами нуклеиновой кислоты (например, молекулами ДНК и/или молекулами РНК) и/или между полипептидными молекулами. В некоторых вариантах осуществления полимерные молекулы считают «в значительной степени идентичными» друг другу, если их последовательности имеют идентичность по меньшей мере 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99%. Рассчитывать процент идентичности двух нуклеотидных или полипептидных последовательностей, например, можно путем выравнивания двух последовательностей для целей оптимального сравнения (например, делеции могут быть внесены в одну или обе из первой и второй последовательностей для оптимального выравнивания, и неидентичные последовательности можно не учитывать для целей сравнения). В конкретных вариантах осуществления длина последовательности, выравниваемой для целей сравнения, составляет по меньшей мере 30%, по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95% или практически 100% от длины эталонной последовательности. Затем сравнивают нуклеотиды в соответствующих положениях. Если положение в первой последовательности занято тем же остатком (например, нуклеотидом или аминокислотой), что и соответствующее положение во второй последовательности, то молекулы идентичны в этом положении. Процент идентичности между двумя последовательностями зависит от числа идентичных положений в обеих последовательностях, с учетом числа делеций и длины каждой делеции, которые необходимо внести для оптимального выравнивания двух последовательностей. Сравнение последовательностей и определение процента идентичности между двумя последовательностями можно выполнять с использованием математического алгоритма. Например, процент идентичности между двумя нуклеотидными последовательностями можно определять с использованием алгоритма Майерса-Миллера (CABIOS, 1989, 4: 11-17), который включен в программу ALIGN (версия 2.0). В некоторых иллюстративных вариантах осуществления для сравнений нуклеотидных последовательностей, выполняемых при помощи программы ALIGN, используют таблицу весов замен остатков PAM120, штраф за удлинение делеции 12 и штраф за внесение делеции 4. Альтернативно, процент идентичности между двумя нуклеотидными последовательностями можно определять с использованием программы GAP в пакете программ GCG, используя матрицу NWSgapDNA.CMP. Identity: Used in the present invention, the term "identity" refers to a common relationship between polymeric molecules, for example, between nucleic acid molecules (eg, DNA molecules and/or RNA molecules) and/or between polypeptide molecules. In some embodiments, polymer molecules are considered "substantially identical" to each other if their sequences share at least 25%, 30%, 35%, 40%, 45%, 50%, 55%, 60%, 65% identity. , 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% or 99%. Percent identity between two nucleotide or polypeptide sequences can be calculated, for example, by aligning the two sequences for optimal comparison purposes (for example, deletions can be made in one or both of the first and second sequences for optimal alignment, and non-identical sequences can be ignored for comparison purposes) . In specific embodiments, the length of the sequence aligned for comparison purposes is at least 30%, at least 40%, at least 50%, at least 60%, at least 70%, at least 80%, at least 90%, at least 95%, or substantially 100% of the length of the reference sequence. The nucleotides are then compared at the corresponding positions. If a position in the first sequence is occupied by the same residue (eg, nucleotide or amino acid) as the corresponding position in the second sequence, then the molecules are identical at that position. The percent identity between two sequences depends on the number of identical positions in both sequences, considering the number of deletions and the length of each deletion that must be made to optimally align the two sequences. Comparing sequences and determining percent identity between two sequences can be performed using a mathematical algorithm. For example, the percent identity between two nucleotide sequences can be determined using the Myers-Miller algorithm (CABIOS, 1989, 4: 11-17), which is included in the ALIGN program (version 2.0). In some exemplary embodiments, nucleotide sequence comparisons performed using the ALIGN program use a PAM120 residue substitution weight table, a deletion extension penalty of 12, and a deletion insertion penalty of 4. Alternatively, percent identity between two nucleotide sequences can be determined using the GAP program in GCG software package using the NWSgapDNA.CMP matrix.
«Улучшение», «увеличение», «ингибирование» или «уменьшение» : Используемые в настоящем изобретении термины «улучшение», «увеличение», «ингибирование», «уменьшение», или их грамматические эквиваленты, указывают на изменение значений относительно исходного уровня или другого эталонного показателя. В некоторых вариантах осуществления соответствующий эталонный показатель может представлять собой, или включать, показатель в конкретной системе (например, у одного индивидуума) при сопоставимых во всем остальном условиях, за исключением присутствия (например, до и/или после) конкретного средства или воздействия, или в присутствии соответствующего сопоставимого эталонного средства. В некоторых вариантах осуществления соответствующий эталонный показатель может представлять собой, или включать, показатель в сопоставимой системе, который, как известно или как ожидается, будет отвечать определенным образом в присутствии соответствующего средства или воздействия. "Improvement", "increase", "inhibition" or"decrease" : Used in the present invention, the terms "improvement", "increase", "inhibition", "decrease", or their grammatical equivalents, indicate a change in values relative to the original level or other benchmark. In some embodiments, the relevant benchmark may be, or include, a score in a particular system (e.g., in one individual) under otherwise comparable conditions except for the presence (e.g., before and/or after) of a particular agent or treatment, or in the presence of an appropriate comparable reference agent. In some embodiments, the implementation of the corresponding benchmark may be, or include, the indicator in a comparable system, which is known or expected to respond in a certain way in the presence of the corresponding means or influence.
Выделенные: Используемый в настоящем изобретении термин означает вещество, и/или объект, которое было (1) отделено от по меньшей мере некоторых из компонентов, с которыми оно было связано, когда было исходно получено (или в природе и/или в экспериментальных условиях), и/или (2) сконструировано, продуцировано, получено и/или изготовлено рукой человека. Выделенные вещества, и/или объекты, могут быть отделены от приблизительно 10%, приблизительно 20%, приблизительно 30%, приблизительно 40%, приблизительно 50%, приблизительно 60%, приблизительно 70%, приблизительно 80%, приблизительно 90%, приблизительно 91%, приблизительно 92%, приблизительно 93%, приблизительно 94%, приблизительно 95%, приблизительно 96%, приблизительно 97%, приблизительно 98%, приблизительно 99% или более приблизительно 99% других компонентов, с которыми они были исходно связаны. В некоторых вариантах осуществления выделенные средства являются на приблизительно 80%, приблизительно 85%, приблизительно 90%, приблизительно 91%, приблизительно 92%, приблизительно 93%, приблизительно 94%, приблизительно 95%, приблизительно 96%, приблизительно 97%, приблизительно 98%, приблизительно 99% или более приблизительно 99% чистыми. В настоящем изобретении вещество называют «чистым», если оно в значительной степени свободно от других компонентов. В некоторых вариантах осуществления, как понятно специалистам в данной области, вещество все-еще может считаться «выделенным» или даже «чистым» после объединения с некоторыми другими компонентами, такими как, например, один или более носителей или эксципиентов (например, буфер, растворитель, вода и так далее); в таких вариантах осуществления степень, в процентах, изолированности или чистоты вещества рассчитывают без учета таких носителей или эксципиентов. В качестве одного примера, в некоторых вариантах осуществления биологический полимер, такой как полипептид или полинуклеотид, существующий в природе, считают «выделенным», если a) в силу своего происхождения, или источника происхождения, он не связан с некоторыми или всеми компонентами, которые сопровождают его в его естественном состоянии в природе; b) он является в значительной степени свободным от других полипептидов или нуклеиновых кислот того же вида от биологического вида, который продуцирует его в природе; c) он экспрессируется или иным образом связан с компонентами из клетки, или другой экспрессионной системы, не принадлежащей биологическому виду, который продуцирует его в природе. Таким образом, например, в некоторых вариантах осуществления полипептид, который химически синтезирован или синтезирован в клеточной системе, отличной от той, которая продуцирует его в природе, считают «выделенным» полипептидом. Альтернативно или дополнительно, в некоторых вариантах осуществления полипептид, к которому были применены один или более методов очистки, можно считать «выделенным» полипептидом в той степени, в которой он был отделен от других компонентов a) с которыми он связан в природе; и/или b) с которыми он был связан, когда исходно был продуцирован. Selected: The term used in the present invention means a substance and/or object that was (1) separated from at least some of the components with which it was associated when it was originally obtained (either in nature and/or under experimental conditions), and /or (2) designed, produced, obtained and/or made by human hand. The isolated substances and/or objects can be separated from about 10%, about 20%, about 30%, about 40%, about 50%, about 60%, about 70%, about 80%, about 90%, about 91 %, about 92%, about 93%, about 94%, about 95%, about 96%, about 97%, about 98%, about 99%, or more than about 99% of the other components with which they were originally associated. In some embodiments, committed funds are about 80%, about 85%, about 90%, about 91%, about 92%, about 93%, about 94%, about 95%, about 96%, about 97%, about 98% %, about 99% or more about 99% pure. In the present invention, a substance is referred to as "pure" if it is substantially free of other components. In some embodiments, as understood by those skilled in the art, the substance may still be considered "isolated" or even "pure" after being combined with certain other components, such as, for example, one or more carriers or excipients (e.g., buffer, diluent , water and so on); in such embodiments, the percentage isolation or purity of a substance is calculated without taking into account such carriers or excipients. As one example, in some embodiments, a biological polymer, such as a naturally occurring polypeptide or polynucleotide, is considered "isolated" if a) by virtue of its origin, or source of origin, it is not associated with some or all of the components that accompany him in his natural state in nature; b) it is substantially free of other polypeptides or nucleic acids of the same species from the species that naturally produces it; c) it is expressed or otherwise associated with components from a cell or other expression system not belonging to the species that naturally produces it. Thus, for example, in some embodiments, a polypeptide that is chemically synthesized or synthesized in a cellular system other than that which naturally produces it is considered an "isolated" polypeptide. Alternatively or additionally, in some embodiments, a polypeptide to which one or more purification methods have been applied can be considered an "isolated" polypeptide to the extent that it has been separated from other components a) with which it is naturally associated; and/or b) with which it was associated when it was originally produced.
Линкер: Используемый в настоящем изобретении термин «линкер» означает часть многокомпонентного средства, которая соединяет разные компоненты друг с другом. Например, специалисты в данной области понимают, что полипептид, структура которого включает два или более функциональных или организационных доменов, часто включает последовательность аминокислот между такими доменами, которая связывает их друг с другом. В некоторых вариантах осуществления полипептид, содержащий элемент линкера, в целом, имеет структуру общей формулы S1-L-S2, где S1 и S2 могут быть одинаковыми или разными, и представляют собой два домена, связанные друг с другом линкером. В некоторых вариантах осуществления полипептидный линкер имеет длину по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 или более аминокислот. В некоторых вариантах осуществления линкер характеризуется тем, что он не принимает жесткую трехмерную структуру, а, скорее, обеспечивает гибкость полипептиду. Множество различных элементов линкера, которые могут быть соответствующим образом использованы при конструировании полипептидов (например, слитых полипептидов), известны в данной области (Holliger et al., 1993; Poljak, 1994). Linker: Used in the present invention, the term "linker" means a part of a multi-component means, which connects different components to each other. For example, those skilled in the art will appreciate that a polypeptide whose structure includes two or more functional or organizational domains often includes an amino acid sequence between such domains that links them together. In some embodiments, the implementation of the polypeptide containing the element of the linker, in general, has the structure of the General formula S1-L-S2, where S1 and S2 may be the same or different, and represent two domains linked to each other by a linker. In some embodiments, the polypeptide linker is at least 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21 in length. , 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100 or more amino acids. In some embodiments, the implementation of the linker is characterized in that it does not take on a rigid three-dimensional structure, but rather provides flexibility to the polypeptide. A variety of different linker elements that can be appropriately used in constructing polypeptides (e.g., fusion polypeptides) are known in the art (Holligeret al., 1993; Poljak, 1994).
Фармацевтическая композиция: Используемый в настоящем изобретении термин «фармацевтическая композиция» означает композицию, в которой активное средство составлено совместно с одним или более фармацевтически приемлемыми носителями. В некоторых вариантах осуществления активное средство присутствует в стандартном количестве дозы, подходящем для введения в терапевтическом режиме, который имеет статистически значимую вероятность достижения заранее определенного терапевтического эффекта при введении соответствующей популяции. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция может быть специально составлена для введения в твердой или жидкой форме, включая формы, адаптированные для: перорального введения, например, жидкие лекарственные формы (водные или неводные растворы или суспензии), таблетки, например, предназначенные для трансбуккальной, подъязычной и системной абсорбции, болюсы, порошки, гранулы, пасты для нанесения на язык; парентерального введения, например, путем подкожной, внутримышечной, внутривенной или эпидуральной инъекции, в виде, например, стерильного раствора или суспензии, или препарата с замедленным высвобождением; топического нанесения, например, в виде крема, мази, пластыря с контролируемым высвобождением или спрея, наносимого на кожу, в легкие или ротовую полость; интравагинального или интраректального введения, например, в виде пессария, крема или пены; подъязычного; глазного; чрескожного введения; назального, легочного введения и введения на другие слизистые поверхности. Pharmaceutical composition: Used in the present invention, the term "pharmaceutical composition" means a composition in which the active agent is formulated together with one or more pharmaceutically acceptable carriers. In some embodiments, the active agent is present in a dosage unit suitable for administration in a therapeutic regimen that has a statistically significant probability of achieving a predetermined therapeutic effect when administered to an appropriate population. In some embodiments, the pharmaceutical composition may be specifically formulated for administration in solid or liquid form, including forms adapted for: oral administration, e.g., liquid dosage forms (aqueous or non-aqueous solutions or suspensions), tablets, e.g. and systemic absorption, boluses, powders, granules, pastes for application to the tongue; parenteral administration, for example, by subcutaneous, intramuscular, intravenous or epidural injection, in the form of, for example, a sterile solution or suspension, or a sustained release formulation; topical application, for example, in the form of a cream, ointment, controlled release patch or spray applied to the skin, lungs or mouth; intravaginal or intrarectal administration, for example, in the form of a pessary, cream or foam; sublingual; eye; transdermal administration; nasal, pulmonary administration and administration to other mucous surfaces.
Фармацевтически приемлемые: В настоящем изобретении термин «фармацевтически приемлемые», используемый применительно к носителю, разбавителю или эксципиенту, которые используют для формулирования композиции, раскрытой в настоящем изобретении, означает, что носитель, разбавитель или эксципиент должны быть совместимы с другими ингредиентами композиции и не наносить вред реципиенту. Pharmaceutically acceptable: In the present invention, the term "pharmaceutically acceptable" as used in relation to the carrier, diluent or excipient that is used to formulate the composition disclosed in the present invention means that the carrier, diluent or excipient must be compatible with the other ingredients of the composition and not harm the recipient.
Полисахарид: Используемый в настоящем изобретении термин «полисахарид» означает полимерную углеводную молекулу, состоящую из длинных цепей моносахаридных единиц, связанных между собой гликозидными связями, которая при гидролизе распадается на составляющие ее моносахариды или олигосахариды. Полисахариды имеют структуру в диапазоне от линейной до сильно разветвленной. Примеры включают запасающие полисахариды, такие как крахмал и гликоген, структурные полисахариды, такие как целлюлоза и хитин, а также микробные полисахариды и антигенные полисахариды, присутствующие в микроорганизмах, включая, но без ограничения, OPS, CPS, COPS и LPS. Polysaccharide: As used herein, the term "polysaccharide" means a polymeric carbohydrate molecule composed of long chains of monosaccharide units linked together by glycosidic bonds, which, upon hydrolysis, breaks down into its constituent monosaccharides or oligosaccharides. Polysaccharides have a structure ranging from linear to highly branched. Examples include storage polysaccharides such as starch and glycogen, structural polysaccharides such as cellulose and chitin, and microbial polysaccharides and antigenic polysaccharides found in microorganisms, including but not limited to OPS, CPS, COPS, and LPS.
Профилактика или предотвращение: В настоящем изобретении при использовании в связи с возникновением заболевания, нарушения и/или состояния термины «профилактика» или «предотвращение» означают уменьшение риска развития заболевания, нарушения и/или состояния, и/или отсрочку начала проявления одного или более признаков или симптомов заболевания, нарушения или состояния. Предотвращение можно считать полным, если начало развития заболевания, нарушения или состояния было отсрочено на заранее определенный период времени. Prevention or Prevention: In the present invention, when used in connection with the occurrence of a disease, disorder and/or condition, the terms "prevention" or "prevention" means reducing the risk of developing a disease, disorder and/or condition, and/or delaying the onset of one or more signs or symptoms of a disease, disorders or conditions. Prevention can be considered complete if the onset of the disease, disorder, or condition has been delayed by a predetermined period of time.
Белок: Используемый в настоящем изобретении термин «белок» означает полипептид (то есть, цепь из по меньшей мере двух аминокислот, связанных друг с другом пептидными связями). Белки могут включать фрагменты, отличные от аминокислот (например, могут представлять собой гликопротеины, протеогликаны и так далее), и/или могут быть иным образом обработаны или модифицированы. Специалисты в данной области понимают, что «белок» может представлять собой полную полипептидную цепь, которая продуцируется клеткой (с сигнальной последовательностью или без нее), или может представлять собой ее характерную часть. Специалисты в данной области понимают, что белок может иногда содержать более одной полипептидной цепи, например, связанные одной или более дисульфидными связями или связанные другим способом. Полипептиды могут содержать L-аминокислоты, D-аминокислоты, или и те, и другие, и могут иметь любые из множества аминокислотных модификаций или аналогов, известных в данной области. Полезные модификации включают, например, концевое ацетилирование, амидирование, метилирование и так далее. В некоторых вариантах осуществления белки могут содержать природные аминокислоты, неприродные аминокислоты, синтетические аминокислоты и их сочетания. Термин «пептид», как правило, используют для обозначения полипептида, имеющего длину менее приблизительно 100 аминокислот, менее приблизительно 50 аминокислот, менее 20 аминокислот или менее 10 аминокислот. В некоторых вариантах осуществления белки представляют собой антитела, фрагменты антител, их биологически активные части и/или их характерные части. Protein: As used in the present invention, the term "protein" means a polypeptide (ie, a chain of at least two amino acids linked together by peptide bonds). Proteins may include moieties other than amino acids (eg, may be glycoproteins, proteoglycans, etc.) and/or may be otherwise processed or modified. Those skilled in the art will appreciate that a "protein" may be a complete polypeptide chain that is produced by a cell (with or without a signal sequence) or may be a characteristic portion thereof. Those skilled in the art will appreciate that a protein may sometimes contain more than one polypeptide chain, such as linked by one or more disulfide bonds or otherwise linked. The polypeptides may contain L-amino acids, D-amino acids, or both, and may have any of a variety of amino acid modifications or analogues known in the art. Useful modifications include, for example, terminal acetylation, amidation, methylation, and so on. In some embodiments, proteins may contain natural amino acids, non-natural amino acids, synthetic amino acids, and combinations thereof. The term "peptide" is generally used to refer to a polypeptide having a length of less than about 100 amino acids, less than about 50 amino acids, less than 20 amino acids, or less than 10 amino acids. In some embodiments, the proteins are antibodies, antibody fragments, biologically active portions thereof, and/or characteristic portions thereof.
Полипептид: Используемый в настоящем изобретении термин «полипептид», как правило, является признанным в данной области обозначением полимера из по меньшей мере трех аминокислот. Специалисты в данной области понимают, что термин «полипептид» должен быть достаточно общим, чтобы охватывать не только полипептиды, имеющие полную последовательность, приведенную в настоящем изобретении, но также охватывать полипептиды, которые представляют собой функциональные фрагменты (то есть, фрагменты, сохраняющие по меньшей мере одну активность) таких полных полипептидов. Кроме того, специалисты в данной области понимают, что белковые последовательности, как правило, могут допускать некоторую степень изменения без нарушения активности. Таким образом, любой полипептид, который сохраняет активность и имеет, в целом, по меньшей мере приблизительно 30-40% идентичности последовательности, часто более приблизительно 50%, 60%, 70% или 80%, и также, как правило, включает по меньшей мере одну область с гораздо более высокой степенью идентичности, часто более 90% или даже 95%, 96%, 97%, 98% или 99% в одной или более высоко консервативных областях, как правило, включающих по меньшей мере 3-4 и часто до 20 или более аминокислот, с другим полипептидом того же класса, охвачен соответствующим используемым в настоящем изобретении термином «полипептид». Полипептиды могут содержать L-аминокислоты, D-аминокислоты, или и те, и другие, и могут иметь любые из множества аминокислотных модификаций или аналогов, известных в данной области. Полезные модификации включают, например, концевое ацетилирование, амидирование, метилирование и так далее. В некоторых вариантах осуществления белки могут содержать природные аминокислоты, неприродные аминокислоты, синтетические аминокислоты и их сочетания. Polypeptide: As used herein, the term "polypeptide" is generally the art-recognized designation for a polymer of at least three amino acids. Those skilled in the art will appreciate that the term "polypeptide" should be generic enough to include not only polypeptides having the entire sequence recited in the present invention, but also polypeptides that are functional fragments (i.e., fragments that retain at least at least one activity) of such complete polypeptides. In addition, those skilled in the art will appreciate that protein sequences generally can tolerate some degree of change without disrupting activity. Thus, any polypeptide that retains activity and has, in general, at least about 30-40% sequence identity, often more than about 50%, 60%, 70%, or 80%, and also typically includes at least at least one area with a much higher degree of identity, often more than 90% or even 95%, 96%, 97%, 98% or 99% in one or more highly conservative areas, usually including at least 3-4 and often up to 20 amino acids or more, with another polypeptide of the same class, is encompassed by the appropriate term "polypeptide" as used herein. The polypeptides may contain L-amino acids, D-amino acids, or both, and may have any of a variety of amino acid modifications or analogues known in the art. Useful modifications include, for example, terminal acetylation, amidation, methylation, and so on. In some embodiments, proteins may contain natural amino acids, non-natural amino acids, synthetic amino acids, and combinations thereof.
Предотвращение: Используемый в настоящем изобретении термин «предотвращение» означает отсрочку начала развития и/или уменьшение частоты и/или степени тяжести одного или более симптомов конкретного заболевания, нарушения или состояния. В некоторых вариантах осуществления предотвращение оценивают на базе популяции, таким образом, считают, что средство «предотвращает» конкретное заболевание, нарушение или состояние, если статистически значимое уменьшение развития, частоты и/или интенсивности одного или более симптомов заболевания, нарушения или состояния наблюдается в популяции, предрасположенной к заболеванию, нарушению или состоянию. Предотвращение можно считать полным, если начало развития заболевания, нарушения или состояния было отсрочено на заранее определенный период времени. Prevention: Used in the present invention, the term "prevention" means delaying the onset of development and/or reducing the frequency and/or severity of one or more symptoms of a particular disease, disorder or condition. In some embodiments, prevention is assessed on a population basis, such that an agent is considered to "prevent" a particular disease, disorder, or condition if a statistically significant reduction in the development, frequency, and/or intensity of one or more symptoms of the disease, disorder, or condition is observed in the population predisposed to a disease, disorder, or condition. Prevention can be considered complete if the onset of the disease, disorder, or condition has been delayed by a predetermined period of time.
Белок: Используемый в настоящем изобретении термин «белок» означает полипептид (то есть, цепь из по меньшей мере двух аминокислот, связанных друг с другом пептидными связями). Белки могут включать фрагменты, отличные от аминокислот (например, могут представлять собой гликопротеины, протеогликаны и так далее), и/или могут быть иным образом обработаны или модифицированы. Специалисты в данной области понимают, что «белок» может представлять собой полную полипептидную цепь, которая продуцируется клеткой (с сигнальной последовательностью или без нее), или может представлять собой ее характерную часть. Специалисты в данной области понимают, что белок может иногда содержать более одной полипептидной цепи, например, связанные одной или более дисульфидными связями или связанные другим способом. Полипептиды могут содержать L-аминокислоты, D-аминокислоты, или и те, и другие, и могут иметь любые из множества аминокислотных модификаций или аналогов, известных в данной области. Полезные модификации включают, например, концевое ацетилирование, амидирование, метилирование и так далее. В некоторых вариантах осуществления белки могут содержать природные аминокислоты, неприродные аминокислоты, синтетические аминокислоты и их сочетания. Термин «пептид», как правило, используют для обозначения полипептида, имеющего длину менее приблизительно 100 аминокислот, менее приблизительно 50 аминокислот, менее 20 аминокислот или менее 10 аминокислот. В некоторых вариантах осуществления белки представляют собой антитела, фрагменты антител, их биологически активные части и/или их характерные части. Protein: As used in the present invention, the term "protein" means a polypeptide (ie, a chain of at least two amino acids linked together by peptide bonds). Proteins may include moieties other than amino acids (eg, may be glycoproteins, proteoglycans, etc.) and/or may be otherwise processed or modified. Those skilled in the art will appreciate that a "protein" may be a complete polypeptide chain that is produced by a cell (with or without a signal sequence) or may be a characteristic portion thereof. Those skilled in the art will appreciate that a protein may sometimes contain more than one polypeptide chain, such as linked by one or more disulfide bonds or otherwise linked. The polypeptides may contain L-amino acids, D-amino acids, or both, and may have any of a variety of amino acid modifications or analogues known in the art. Useful modifications include, for example, terminal acetylation, amidation, methylation, and so on. In some embodiments, proteins may contain natural amino acids, non-natural amino acids, synthetic amino acids, and combinations thereof. The term "peptide" is generally used to refer to a polypeptide having a length of less than about 100 amino acids, less than about 50 amino acids, less than 20 amino acids, or less than 10 amino acids. In some embodiments, the proteins are antibodies, antibody fragments, biologically active portions thereof, and/or characteristic portions thereof.
Рекомбинантные: Используемый в настоящем изобретении термин «рекомбинантные» означает полипептиды, которые были спроектированы, сконструированы, получены, экспрессированы, созданы, изготовлены и/или выделены рекомбинантными методами, например, полипептиды, экспрессированные с использованием рекомбинантного экспрессионного вектора, трансфицированного в клетку-хозяина; полипептиды, выделенные из рекомбинантной комбинаторной библиотеки человеческих полипептидов; полипептиды, полученные от животного (например, мыши, кролика, овцы, рыбы и так далее), которое является трансгенным, или иным образом было изменено для экспрессии гена или генов, или генных компонентов, которые кодируют и/или управляют экспрессией полипептида или одного или более его компонентов, частей, элементов или доменов; и/или полипептиды, полученные, экспрессированные, созданные или выделенные любыми другими методами, включающими сплайсинг или лигирование выбранных элементов нуклеотидных последовательностей друг с другом, химический синтез выбранных элементов последовательности и/или получение иным образом нуклеиновой кислоты, которая кодирует и/или управляет экспрессией полипептида или одного или более его компонентов, частей, элементов или доменов. В некоторых вариантах осуществления один или более из таких выбранных элементов последовательности встречается в природе. В некоторых вариантах осуществления один или более из таких выбранных элементов последовательности сконструированы in silico. В некоторых вариантах осуществления один или более из таких выбранных элементов последовательности получены в результате мутагенеза (например, in vivo или in vitro) известного элемента последовательности, например, из природного или синтетического источника, такого как, например, имеющийся в зародышевой линии исходного интересующего организма (например, человека, мыши и так далее). Recombinant: As used herein, the term "recombinant" means polypeptides that have been designed, engineered, produced, expressed, created, manufactured and/or isolated by recombinant methods, for example, polypeptides expressed using a recombinant expression vector transfected into a host cell; polypeptides isolated from a recombinant combinatorial library of human polypeptides; polypeptides derived from an animal (e.g., mouse, rabbit, sheep, fish, etc.) that is transgenic or has been otherwise altered to express a gene or genes or gene components that encode and/or direct the expression of a polypeptide or one or more than its components, parts, elements or domains; and/or polypeptides obtained, expressed, created or isolated by any other methods, including splicing or ligation of selected elements of nucleotide sequences with each other, chemical synthesis of selected elements of the sequence and/or otherwise obtaining a nucleic acid that encodes and/or directs the expression of a polypeptide or one or more of its components, parts, elements or domains. In some embodiments, one or more of such selected sequence elements occur naturally. In some embodiments, one or more of such selected sequence elements are constructedin silico. In some embodiments, one or more of such selected sequence elements are obtained by mutagenesis (e.g.,in vivo orin vitro) a known sequence element, for example, from a natural or synthetic source, such as, for example, present in the germline of the original organism of interest (eg, human, mouse, etc.).
Эталон: Используемый в настоящем изобретении термин «эталон» описывает стандарт, или контроль, с которым проводят сравнение. Например, в некоторых вариантах осуществления представляющие интерес средство, животное, индивидуума, популяцию, образец, последовательность или значение сравнивают с эталонным, или контрольным, средством, животным, индивидуумом, популяцией, образцом, последовательностью или значением. В некоторых вариантах осуществления эталон, или контроль, тестируют и/или определяют практически одновременно с тестированием или определением представляющего интерес объекта. В некоторых вариантах осуществления эталон, или контроль, представляет собой исторический эталон, или контроль, необязательно, воплощенный в материальном носителе. Обычно, как понятно специалистам в данной области, эталон, или контроль, определяют или характеризуют в условиях или обстоятельствах, сопоставимых с теми, в которых проводят оценку. Специалисты в данной области понимают, когда имеет место достаточное сходство для оправдания опоры на, и/или сравнения с конкретным возможным эталоном или контролем. Reference: Used in the present invention, the term "reference" describes the standard, or control, which is compared. For example, in some embodiments, the agent, animal, individual, population, sample, sequence, or value of interest is compared to a reference or control agent, animal, individual, population, sample, sequence, or value. In some embodiments, a reference or control is tested and/or determined at substantially the same time that the object of interest is tested or determined. In some embodiments, the reference or control is a historical reference or control, optionally embodied in a tangible medium. Typically, as will be understood by those skilled in the art, a reference or control is defined or characterized under conditions or circumstances comparable to those under which the evaluation is performed. Those skilled in the art will recognize when there is sufficient similarity to justify reliance on, and/or comparison with, a particular candidate reference or control.
Ответ: Используемый в настоящем изобретении термин «ответ» на лечение может означать любое полезное изменение состояния пациента, которое вызвано, или коррелирует с, лечением. Такое изменение может включать стабилизацию состояния (например, предотвращение ухудшения, которое имело бы место в отсутствие лечения), уменьшение симптомов состояния и/или улучшение перспектив лечения состояния, и так далее. Он может означать ответ пациента или ответ опухоли. Ответ опухоли или пациента можно измерять в соответствии с самыми разными критериями, включая клинические критерии и объективные критерии. Методы оценки ответа включают, но без ограничения, клиническое обследование, позитронную эмиссионную томографию, рентгенографию грудной клетки, КТ-сканирование, МРТ, ультразвуковое, эндоскопическое, лапароскопическое исследование, определение присутствия и уровня опухолевых маркеров в образце, полученном от пациента, цитологический и/или гистологический анализ. Многие из этих методов направлены на определение размера опухоли или определение общей опухолевой нагрузки иным образом. Методы и руководства для оценки ответа на лечение описаны в Therasse et. al. (2000) «New guidelines to evaluate the response to treatment in solid tumors», Европейской организации по изучению и лечению рака, Национального института рака США, Национального института рака Канады. Точные критерии ответа могут быть выбраны любым соответствующим образом, при условии, что при сравнении групп опухолей и/или пациентов, сравниваемые группы оценивают на основании одинаковых или сопоставимых критериев для определения степени ответа. Специалист в данной области сможет выбирать соответствующие критерии. Answer: As used herein, the term "response" to treatment can mean any beneficial change in a patient's condition that is caused by, or correlates with, treatment. Such change may include stabilizing the condition (eg, preventing deterioration that would have occurred in the absence of treatment), reducing the symptoms of the condition and/or improving the prospects for treatment of the condition, and so on. It can mean the patient's response or the tumor's response. Tumor or patient response can be measured according to a variety of criteria, including clinical criteria and objective criteria. Response evaluation methods include, but are not limited to, clinical examination, positron emission tomography, chest x-ray, CT scan, MRI, ultrasound, endoscopic, laparoscopic, determination of the presence and level of tumor markers in a patient sample, cytology and/or histological analysis. Many of these methods are aimed at determining the size of the tumor or otherwise determine the total tumor burden. Methods and guidelines for assessing response to treatment are described in Therasse et. al. (2000) "New guidelines to evaluate the response to treatment in solid tumors", European Organization for Research and Treatment of Cancer, US National Cancer Institute, National Cancer Institute of Canada. The exact response criteria may be chosen in any appropriate manner, provided that when comparing groups of tumors and/or patients, compared groups are evaluated based on the same or comparable criteria to determine the degree of response. One skilled in the art will be able to select appropriate criteria.
Риск: Как будет понятно из контекста, «риск» развития заболевания, нарушения и/или состояния означает вероятность, что у конкретного индивидуума разовьется заболевание, нарушение, и/или состояние. В некоторых вариантах осуществления риск выражают в процентах. В некоторых вариантах осуществления риск составляет от 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 до 100%. В некоторых вариантах осуществления риск выражают как риск относительно риска, связанного с эталонным образцом или группой эталонных образцов. В некоторых вариантах осуществления эталонный образец, или группа эталонных образцов, связан с известным риском заболевания, нарушения, состояния и/или события. В некоторых вариантах осуществления эталонные образцы, или группа эталонных образцов, получены от индивидуумов, сопоставимых с конкретным индивидуумом. В некоторых вариантах осуществления относительный риск составляет 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 или более. Risk: As will be clear from the context, "risk" of developing a disease, disorder, and/or condition means the likelihood that a particular individual will develop a disease, disorder, and/or condition. In some embodiments, the risk is expressed as a percentage. In some embodiments, the risk is from 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 to 100%. In some embodiments, risk is expressed as a risk relative to the risk associated with a reference sample or group of reference samples. In some embodiments, a reference sample, or group of reference samples, is associated with a known risk of a disease, disorder, condition, and/or event. In some embodiments, reference samples, or a group of reference samples, are obtained from individuals comparable to a particular individual. In some embodiments, the relative risk is 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 or more.
Серотип: Используемый в настоящем изобретении термин «серотип», также называемый сероваром, относится к определенной вариации среди видов бактерий или вирусов, или среди иммунных клеток разных индивидуумов. Эти микроорганизмы, вирусы или клетки коллективно классифицируют на основании их клеточных поверхностных антигенов, что делает возможной эпидемиологическую классификацию микроорганизмов на подвидовом уровне. Группу сероваров с общими антигенами можно называть серогруппой или, иногда, серокомплексом. Serotype: Used in the present invention, the term "serotype", also called serovar, refers to a certain variation among species of bacteria or viruses, or among the immune cells of different individuals. These micro-organisms, viruses or cells are collectively classified based on their cell surface antigens, which makes it possible to classify the micro-organisms epidemiologically at the subspecies level. A group of serovars with common antigens may be called a serogroup or sometimes a serocomplex.
Короткий олигосахарид: Для целей настоящего изобретения олигосахарид, как правило, считают «коротким», если он имеет менее 4, или менее 3, остатков в любой линейной цепи. Short oligosaccharide: For the purposes of the present invention, an oligosaccharide is generally considered "short" if it has less than 4, or less than 3, residues in any linear chain.
Пациент: Используемый в настоящем изобретении термин «пациент» означает организм, как правило, млекопитающее (например, человека, в некоторых вариантах осуществления включая человека до рождения). В некоторых вариантах осуществления пациент страдает от соответствующего заболевания, нарушения или состояния. В некоторых вариантах осуществления пациент предрасположен к заболеванию, нарушению или состоянию. В некоторых вариантах осуществления пациент проявляет один или более симптомов или признаков заболевания, нарушения или состояния. В некоторых вариантах осуществления пациент не проявляет какие-либо симптомы или признаки заболевания, нарушения или состояния. В некоторых вариантах осуществления пациент является пациентом с одним или более признаками, характерными для наличия предрасположенности или риска развития заболевания, нарушения или состояния. В некоторых вариантах осуществления пациент является пациентом. В некоторых вариантах осуществления пациент является индивидуумом, которому поставлен диагноз, и/или применяется и/или была применена терапия. Patient: Used in the present invention, the term "patient" means an organism, usually a mammal (eg, human, in some embodiments, including a human before birth). In some embodiments, the implementation of the patient suffers from a corresponding disease, disorder or condition. In some embodiments, the patient is predisposed to a disease, disorder, or condition. In some embodiments, the patient exhibits one or more symptoms or signs of a disease, disorder, or condition. In some embodiments, the patient does not exhibit any symptoms or signs of the disease, disorder, or condition. In some embodiments, the patient is a patient with one or more features indicative of a predisposition to or risk of developing a disease, disorder, or condition. In some embodiments, the patient is a patient. In some embodiments, the patient is an individual who has been diagnosed and/or is being treated and/or has been treated.
Предрасположенность: Индивидуум, который «предрасположен» к заболеванию, нарушению или состоянию, имеет риск развития заболевания, нарушения или состояния. В некоторых вариантах осуществления индивидуум, который предрасположен к заболеванию, нарушению или состоянию, не проявляет какие-либо симптомы заболевания, нарушения или состояния. В некоторых вариантах осуществления у индивидуума, который предрасположен к заболеванию, нарушению или состоянию, не было диагностировано заболевание, нарушение и/или состояние. В некоторых вариантах осуществления индивидуум, который предрасположен к заболеванию, нарушению или состоянию, является индивидуумом, который был подвергнут условиям, связанным с развитием заболевания, нарушения или состояния. В некоторых вариантах осуществления риск развития заболевания, нарушения и/или состояния является риском, основанным на оценке популяции (например, членов семьи индивидуумов, страдающих от заболевания, нарушения или состояния). Predisposition: An individual who is "predisposed" to a disease, disorder, or condition is at risk of developing the disease, disorder, or condition. In some embodiments, the individual who is predisposed to the disease, disorder, or condition does not exhibit any symptoms of the disease, disorder, or condition. In some embodiments, the individual who is predisposed to the disease, disorder, or condition has not been diagnosed with the disease, disorder, and/or condition. In some embodiments, the individual who is predisposed to the disease, disorder, or condition is an individual who has been exposed to conditions associated with the development of the disease, disorder, or condition. In some embodiments, the risk of developing a disease, disorder, and/or condition is a risk based on an estimate of the population (eg, family members of individuals suffering from the disease, disorder, or condition).
Уменьшение симптомов: В соответствии с настоящим изобретением, имеет место «уменьшение симптомов», когда один или более симптомов конкретного заболевания, нарушения или состояния уменьшаются по величине (например, интенсивности, степени тяжести и так далее) и/или частоте. Для ясности, отсрочку начала проявления конкретного симптома считают одной из форм уменьшения частоты данного симптома. Reducing symptoms: In accordance with the present invention, there is a "reduction in symptoms" when one or more symptoms of a particular disease, disorder or condition are reduced in magnitude (eg, intensity, severity, etc.) and/or frequency. To be clear, delaying the onset of a particular symptom is considered one form of reducing the frequency of that symptom.
Терапевтически эффективное количество: Используемый в настоящем изобретении термин «терапевтически эффективное количество» означает количество, которое производит желаемый эффект, ради которого оно было введено. В некоторых вариантах осуществления термин означает количество, которое является достаточным при введении популяции, страдающей от, или предрасположенной к заболеванию, нарушению и/или состоянию, в соответствии с терапевтическим режимом дозирования для лечения заболевания, нарушения и/или состояния. В некоторых вариантах осуществления терапевтически эффективное количество представляет собой количество, которое приводит к уменьшению частоты и/или степени тяжести, и/или к отсрочке начала проявления одного или более симптомов заболевания, нарушения и/или состояния. Специалисты в данной области понимают, что термин «терапевтически эффективное количество» не обязательно означает, что было проведено успешное лечение конкретного индивидуума. Скорее, терапевтически эффективное количество может представлять собой такое количество, которое обеспечивает конкретный желаемый фармакологический ответ у значительного количества пациентов при введении пациентам, которые нуждаются в таком лечении. В некоторых вариантах осуществления ссылка на терапевтически эффективное количество может быть ссылкой на количество, измеренное в одной или более конкретных тканях (например, ткани, пораженной заболеванием, нарушением или состоянием) или жидкостях (например, крови, слюне, сыворотке, поте, слезах, моче и так далее). Специалисты в данной области понимают, что в некоторых вариантах осуществления терапевтически эффективное количество конкретного средства или терапевтического препарата может быть составлено и/или введено в одной дозе. В некоторых вариантах осуществления терапевтически эффективное количество средства может быть составлено и/или введено в нескольких дозах, например, в виде части режима дозирования. В некоторых вариантах осуществления терапевтически эффективное количество может означать количество иммуногенной композиции или вакцины, которое достаточно для вызывания иммунного ответа. Например, «терапевтически эффективное количество» означает нетоксическое, но достаточное количество, которое может быть использовано для лечения, ослабления или предотвращения инфекции и/или заболевания (например, бактериальной инфекции, пневмококковой инфекции и так далее) у какого-либо пациента. Therapeutically effective amount: Used in the present invention, the term "therapeutically effective amount" means an amount that produces the desired effect for which it was introduced. In some embodiments, the term means an amount that is sufficient when administered to a population suffering from or predisposed to a disease, disorder and/or condition, in accordance with a therapeutic dosage regimen for the treatment of the disease, disorder and/or condition. In some embodiments, a therapeutically effective amount is an amount that results in a reduction in the frequency and/or severity of, and/or a delay in the onset of, one or more symptoms of a disease, disorder, and/or condition. Those skilled in the art will appreciate that the term "therapeutically effective amount" does not necessarily mean that a particular individual has been successfully treated. Rather, a therapeutically effective amount may be that amount which provides a particular desired pharmacological response in a significant number of patients when administered to patients in need of such treatment. In some embodiments, a reference to a therapeutically effective amount may be a reference to an amount measured in one or more specific tissues (e.g., tissue affected by a disease, disorder, or condition) or fluids (e.g., blood, saliva, serum, sweat, tears, urine). and so on). Those skilled in the art will appreciate that, in some embodiments, a therapeutically effective amount of a particular agent or therapeutic agent may be formulated and/or administered in a single dose. In some embodiments, a therapeutically effective amount of an agent may be formulated and/or administered in multiple doses, eg, as part of a dosage regimen. In some embodiments, a therapeutically effective amount may mean an amount of an immunogenic composition or vaccine that is sufficient to elicit an immune response. For example, "therapeutically effective amount" means a non-toxic but sufficient amount that can be used to treat, reduce or prevent infection and/or disease (eg, bacterial infection, pneumococcal infection, and so on) in any patient.
Лечение: Используемый в настоящем изобретении термин «лечение» (а также «лечить» или «терапия») относится к любому применению терапии, которое приводит к частичному или полному ослаблению, облегчению, смягчению, ингибированию, отсрочке начала проявления, уменьшению степени тяжести и/или уменьшению частоты одного или более симптомов, признаков и/или причин конкретного заболевания, нарушения и/или состояния. В некоторых вариантах осуществления такое лечение может быть применено к пациенту, который не проявляет признаки соответствующего заболевания, нарушения и/или состояния, и/или к пациенту, который проявляет лишь ранние признаки заболевания, нарушения и/или состояния. Альтернативно или дополнительно, такое лечение может быть применено к пациенту, который проявляет один или более признанных признаков соответствующего заболевания, нарушения и/или состояния. В некоторых вариантах осуществления лечение может быть применено к пациенту, который был диагностирован, как страдающий от соответствующего заболевания, нарушения и/или состояния. В некоторых вариантах осуществления лечение может быть применено к пациенту, который, как известно, имеет один или более факторов предрасположенности, которые статистически коррелируют с повышенным риском развития соответствующего заболевания, нарушения и/или состояния. Treatment: As used herein, the term "treatment" (and also "treat" or "therapy") refers to any use of therapy that results in partial or complete reduction, alleviation, mitigation, inhibition, delay in onset, reduction in severity, and/or reduction the frequency of one or more symptoms, signs and/or causes of a particular disease, disorder and/or condition. In some embodiments, such treatment may be administered to a patient who is not showing signs of the relevant disease, disorder, and/or condition and/or to a patient who is showing only early signs of the disease, disorder, and/or condition. Alternatively, or additionally, such treatment may be administered to a patient who exhibits one or more of the recognized features of a relevant disease, disorder, and/or condition. In some embodiments, the treatment may be administered to a patient who has been diagnosed as suffering from a relevant disease, disorder, and/or condition. In some embodiments, the treatment may be applied to a patient who is known to have one or more predisposition factors that are statistically correlated with an increased risk of developing the corresponding disease, disorder and/or condition.
Вариант: Используемый в настоящем изобретении в контексте молекул, например, нуклеиновых кислот, белков или малых молекул, термин «вариант» означает молекулу, которая имеет значительную структурную идентичность с эталонной молекулой, но отличается структурно от этой эталонной молекулы, например, присутствием или отсутствием, или уровнем одной или более химических групп, в сравнении с эталонной молекулой. В некоторых вариантах осуществления вариант также отличается функционально от его эталонной молекулы. Как правило, решение о том, есть ли основания считать конкретную молекулу «вариантом» эталонной молекулы, основано на степени ее структурной идентичности с эталонной молекулой. Как понимают специалисты в данной области, любая биологическая или химическая эталонная молекула имеет определенные характерные структурные элементы. Вариант, по определению, является отдельной молекулой, которая имеет общие один или более таких характерных структурных элементов, но отличается по меньшей мере в одном аспекте от эталонной молекулы. В качестве нескольких примеров, полипептид может иметь характерный элемент последовательности, состоящий из множества аминокислот, имеющих определенные положения относительно друг друга в линейном или трехмерном пространстве и/или вносящих вклад в формирование конкретного структурного мотива и/или биологической функции; нуклеиновая кислота может иметь характерный элемент последовательности, состоящий из множества нуклеотидных остатков, имеющих определенные положения относительно друг друга в линейном или трехмерном пространстве. В некоторых вариантах осуществления вариантный полипептид, или нуклеиновая кислота, может отличаться от эталонного полипептида, или нуклеиновой кислоты, вследствие одного или более отличий аминокислотной или нуклеотидной последовательности и/или одного или более отличий в химических группах (например, углеводах, липидах, фосфатных группах), которые являются ковалентно связанными компонентами полипептида или нуклеиновой кислоты (например, которые присоединены к каркасу полипептида или нуклеиновой кислоты). В некоторых вариантах осуществления вариантный полипептид, или нуклеиновая кислота, имеет общую идентичность последовательности с эталонным полипептидом, или нуклеиновой кислотой, которая составляет по меньшей мере 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97% или 99%. В некоторых вариантах осуществления вариантный полипептид, или нуклеиновая кислота, отличается по меньшей мере одним характерным элементом последовательности от эталонного полипептида, или нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления эталонный полипептид, или нуклеиновая кислота, имеет один или более видов биологической активности. В некоторых вариантах осуществления вариантный полипептид, или нуклеиновая кислота, имеет общие один или более видов биологической активности с эталонным пептидом, или нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах осуществления вариантный полипептид, или нуклеиновая кислота, лишен(а) одного или более видов биологической активности эталонного пептида, или нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления вариантный полипептид, или нуклеиновая кислота, имеет сниженный уровень одного или более видов биологической активности, в сравнении с эталонным полипептидом, или нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах осуществления интересующий полипептид, или нуклеиновую кислоту, считают «вариантом» эталонного пептида, или нуклеиновой кислоты, если он(она) имеет аминокислотную, или нуклеотидную, последовательность, которая идентична последовательности эталона, но имеет небольшое количество изменений последовательности в конкретных положениях. Как правило, менее приблизительно 20%, приблизительно 15%, приблизительно 10%, приблизительно 9%, приблизительно 8%, приблизительно 7%, приблизительно 6%, приблизительно 5%, приблизительно 4%, приблизительно 3% или приблизительно 2% остатков в варианте замещены, вставлены или делетированы в сравнении с эталоном. В некоторых вариантах осуществления вариантный полипептид, или нуклеиновая кислота, имеет приблизительно 10, приблизительно 9, приблизительно 8, приблизительно 7, приблизительно 6, приблизительно 5, приблизительно 4, приблизительно 3, приблизительно 2, или приблизительно 1 замещенный остаток в сравнении с эталоном. Часто вариантный полипептид, или нуклеиновая кислота, имеет очень небольшое количество (например, менее приблизительно 5, приблизительно 4, приблизительно 3, приблизительно 2 или приблизительно 1) замещенных, вставленных или делетированных функциональных остатков (то есть, остатков, которые участвуют в конкретной биологической активности) в сравнении с эталоном. В некоторых вариантах осуществления вариантный полипептид, или нуклеиновая кислота, имеет не более приблизительно 5, приблизительно 4, приблизительно 3, приблизительно 2 или приблизительно 1 добавления или делеции, и, в некоторых вариантах осуществления, не имеет добавления или делеции, в сравнении с эталоном. В некоторых вариантах осуществления вариантный полипептид, или нуклеиновая кислота, имеет менее приблизительно 25, приблизительно 20, приблизительно 19, приблизительно 18, приблизительно 17, приблизительно 16, приблизительно 15, приблизительно 14, приблизительно 13, приблизительно 10, приблизительно 9, приблизительно 8, приблизительно 7, приблизительно 6 и, обычно, менее приблизительно 5, приблизительно 4, приблизительно 3 или приблизительно 2 добавлений или делеций в сравнении с эталоном. В некоторых вариантах осуществления эталонный полипептид, или нуклеиновая кислота, встречается в природе. В некоторых вариантах осуществления эталонный полипептид, или нуклеиновая кислота, представляет собой полипептид, или нуклеиновую кислоту, человека. Option: Used in the present invention in the context of molecules, such as nucleic acids, proteins or small molecules, the term "variant" means a molecule that has significant structural identity with the reference molecule, but differs structurally from this reference molecule, for example, the presence or absence, or level one or more chemical groups compared to a reference molecule. In some embodiments, the variant also differs functionally from its reference molecule. As a rule, the decision about whether there is reason to consider a particular molecule as a "variant" of the reference molecule is based on the degree of its structural identity with the reference molecule. As understood by those skilled in the art, any biological or chemical reference molecule has certain characteristic structural elements. A variant, by definition, is a single molecule that shares one or more of these characteristic structural elements, but differs in at least one aspect from the reference molecule. As a few examples, a polypeptide may have a characteristic element of the sequence, consisting of a plurality of amino acids having certain positions relative to each other in linear or three-dimensional space and/or contributing to the formation of a particular structural motif and/or biological function; a nucleic acid may have a characteristic element of the sequence, consisting of a plurality of nucleotide residues having certain positions relative to each other in linear or three-dimensional space. In some embodiments, the variant polypeptide or nucleic acid may differ from the reference polypeptide or nucleic acid due to one or more amino acid or nucleotide sequence differences and/or one or more chemical group differences (e.g., carbohydrates, lipids, phosphate groups) , which are covalently linked components of the polypeptide or nucleic acid (eg, which are attached to the backbone of the polypeptide or nucleic acid). In some embodiments, the variant polypeptide or nucleic acid has a common sequence identity with a reference polypeptide or nucleic acid that is at least 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92 %, 93%, 94%, 95%, 96%, 97% or 99%. In some embodiments, the variant polypeptide or nucleic acid differs in at least one characteristic sequence element from the reference polypeptide or nucleic acid. In some embodiments, the reference polypeptide or nucleic acid has one or more biological activities. In some embodiments, the variant polypeptide or nucleic acid shares one or more biological activities with the reference peptide or nucleic acid. In some embodiments, the variant polypeptide or nucleic acid lacks one or more of the biological activities of the reference peptide or nucleic acid. In some embodiments, the implementation of the variant polypeptide, or nucleic acid, has a reduced level of one or more types of biological activity, compared with the reference polypeptide, or nucleic acid. In some embodiments, a polypeptide or nucleic acid of interest is considered a "variant" of a reference peptide or nucleic acid if it has an amino acid or nucleotide sequence that is identical to that of the reference but has few sequence changes at specific positions. Typically less than about 20%, about 15%, about 10%, about 9%, about 8%, about 7%, about 6%, about 5%, about 4%, about 3%, or about 2% residues per option replaced, inserted or deleted in comparison with the reference. In some embodiments, the variant polypeptide or nucleic acid has about 10, about 9, about 8, about 7, about 6, about 5, about 4, about 3, about 2, or about 1 substituted residue relative to a reference. Often, a variant polypeptide or nucleic acid has a very small number (e.g., less than about 5, about 4, about 3, about 2, or about 1) substituted, inserted, or deleted functional residues (i.e., residues that are involved in a particular biological activity). ) in comparison with the standard. In some embodiments, the variant polypeptide or nucleic acid has no more than about 5, about 4, about 3, about 2, or about 1 additions or deletions, and, in some embodiments, no additions or deletions, compared to a reference. In some embodiments, the variant polypeptide or nucleic acid has less than about 25, about 20, about 19, about 18, about 17, about 16, about 15, about 14, about 13, about 10, about 9, about 8, about 7, about 6, and typically less than about 5, about 4, about 3, or about 2 additions or deletions compared to the reference. In some embodiments, the implementation of the reference polypeptide, or nucleic acid, occurs in nature. In some embodiments, the reference polypeptide or nucleic acid is a human polypeptide or nucleic acid.
Вакцинация: Используемый в настоящем изобретении термин «вакцинация» означает введение композиции, предназначенной для инициации иммунного ответа, например, на вызывающий заболевание агент. Для целей настоящего изобретения вакцинацию можно проводить до, в процессе и/или после воздействия вызывающего заболевание агента и, в конкретных вариантах осуществления, до, в процессе и/или вскоре после воздействия агента. В некоторых вариантах осуществления вакцинация включает несколько введений, надлежащим образом разнесенных во времени, вакцинной композиции. Vaccination: Used in the present invention, the term "vaccination" means the introduction of a composition designed to initiate an immune response, for example, to a disease-causing agent. For the purposes of the present invention, vaccination can be carried out before, during and/or after exposure to the disease-causing agent and, in specific embodiments, before, during and/or shortly after exposure to the agent. In some embodiments, the implementation of the vaccination includes several introductions, suitably spaced apart in time, the vaccine composition.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ КОНКРЕТНЫХ ВАРИАНТОВ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯDETAILED DESCRIPTION OF SPECIFIC IMPLEMENTATION OPTIONS
Настоящее изобретение относится, в целом, к композициям, системам и способам, которые включают находящиеся в комплексе белки и полисахариды, например, вакцины из находящихся в комплексе белков и полисахаридов. Такие комплексы могут быть использованы, например, для индукции и/или усиления иммунного защитного ответа у пациентов, имеющих риск внутрибольничной инфекции.The present invention relates generally to compositions, systems and methods that include complexed proteins and polysaccharides, eg protein-polysaccharide complexed vaccines. Such complexes can be used, for example, to induce and/or enhance an immune protective response in patients at risk of nosocomial infection.
Внутрибольничная инфекция представляет собой инфекцию, приобретаемую в больнице или другой организации здравоохранения в течение по меньшей мере приблизительно 48 часов после поступления. Чтобы подчеркнуть как больничные, так и не больничные условия, внутрибольничную инфекцию иногда называют инфекцией, связанной с оказанием медицинской помощи (ИСМП или ИСОМП). В некоторых вариантах осуществления внутрибольничная инфекция может быть приобретена в больнице, доме престарелых, реабилитационном центре, поликлинике или других клинических условиях. В некоторых вариантах осуществления внутрибольничная инфекция передается в клинических условиях предрасположенному к ней пациенту различными способами. В некоторых вариантах осуществления медицинский персонал может распространять внутрибольничную инфекцию, помимо передачи через зараженное оборудование, постельное белье или воздушно-капельным путем. В некоторых вариантах осуществления источником внутрибольничной инфекции может быть внешнее окружение, другой инфицированный пациент, персонал, который может быть инфицирован, или, в некоторых случаях, источник внутрибольничной инфекции может быть неизвестен. В некоторых случаях микроорганизм, вызывающий внутрибольничную инфекцию, происходит из собственной микробиоты кожи пациента, становясь оппортунистическим после операции или других процедур, которые нарушают защитный барьер кожи. Хотя источником заражения пациента может являться его собственная кожа, такая инфекция все еще считается внутрибольничной, поскольку она развивается в условиях оказания медицинской помощи.A nosocomial infection is an infection acquired from a hospital or other health care organization within at least about 48 hours of admission. To emphasize both hospital and non-hospital settings, hospital-acquired infection is sometimes referred to as healthcare-associated infection (HAI or HAI). In some embodiments, the nosocomial infection may be acquired in a hospital, nursing home, rehabilitation center, clinic, or other clinical setting. In some embodiments, the nosocomial infection is clinically transmitted to a predisposed patient in a variety of ways. In some embodiments, healthcare personnel may spread a nosocomial infection other than transmission through contaminated equipment, linens, or airborne droplets. In some embodiments, the source of the nosocomial infection may be the external environment, another infected patient, personnel who may be infected, or, in some cases, the source of the nosocomial infection may be unknown. In some cases, the organism causing nosocomial infection originates from the patient's own skin microbiota, becoming opportunistic after surgery or other procedures that compromise the skin's protective barrier. Although a patient's own skin may be the source of infection, such an infection is still considered nosocomial because it develops in a healthcare setting.
Резистентность к противомикробным средствамResistance to antimicrobial agents
Люди все больше понимают и ценят роль вакцин в решении проблемы резистентности к противомикробным средствам (ПМР). Вакцины могут уменьшать распространенность резистентности за счет уменьшения потребности в использовании противомикробных средств и могут уменьшить ее последствия за счет сокращения общего числа случаев. Путем уменьшения количества патогенов, которые могут быть ответственны за конкретный клинический синдром, вакцины могут позволять использовать антибиотики более узкого спектра для эмпирической терапии. Эти эффекты могут быть усилены за счет популяционного иммунитета, с распространением защиты на не вакцинированных людей в популяции. Поскольку большая часть селекции на резистентность происходит вследствие селекции на не вовлеченные в процесс представители нормальной микрофлоры, вакцинация может уменьшать давление селекции на резистентность даже для патогенов, не включенных в вакцину. Некоторые вакцины оказали непропорциональное влияние на лекарственно-устойчивые клоны видов-мишеней, полезный эффект, который мог бы быть более обдуманно использован при разработке вакцин (Lipsitch and Siber, 2016). Полезные эффекты вакцин в борьбе с ПМР по каждому из этих механизмов могут быть усилены за счет непрямой защиты, или популяционного иммунитета (Fine, 1993), который имеет место, когда вакцинированные индивидуумы не подвергаются инфицированию или колонизации и, таким образом, не передают патоген другим. В этом случае число инфекций, резистентных инфекций и применение противомикробных средств может быть уменьшено не только для вакцинированных индивидуумов, но также и для контактирующих с ними лиц. И наконец, для вакцин против микроорганизмов, которые бессимптомно колонизируют носоглотку, кожу, кишечник или другие участки тела, существует теоретическая возможность того, что уменьшение плотности микробных популяций за счет вакцинации приведет к уменьшению возможности генетического обмена элементами резистентности (Levin et al., 1979; Levin and Cornejo, 2009).People are increasingly understanding and appreciating the role of vaccines in tackling the problem of antimicrobial resistance (AMR). Vaccines can reduce the prevalence of resistance by reducing the need for antimicrobial use, and can reduce its consequences by reducing the overall number of cases. By reducing the number of pathogens that may be responsible for a particular clinical syndrome, vaccines may allow the use of narrower spectrum antibiotics for empiric therapy. These effects can be enhanced by herd immunity, extending protection to unvaccinated people in the population. Since much of the selection for resistance is due to selection for uninvolved normal microflora, vaccination can reduce the pressure of selection for resistance even for pathogens not included in the vaccine. Some vaccines have had a disproportionate effect on drug-resistant clones of the target species, a beneficial effect that could have been more thoughtfully exploited in vaccine development (Lipsitch and Siber, 2016). The beneficial effects of vaccines in controlling MTCT for each of these mechanisms can be enhanced by indirect protection, or herd immunity (Fine, 1993), which occurs when vaccinated individuals do not become infected or colonized and thus do not transmit the pathogen to others. . In this case, the number of infections, resistant infections and the use of antimicrobial agents can be reduced not only for vaccinated individuals, but also for their contacts. Finally, for vaccines against microorganisms that asymptomatically colonize the nasopharynx, skin, intestines, or other areas of the body, there is a theoretical possibility that the reduction in microbial population density due to vaccination would reduce the possibility of genetic exchange of resistance elements (Levin et al., 1979; Levin and Cornejo, 2009).
Вакцинами, представляющими особый интерес, являются вакцины, направленные на наиболее важные возбудители ИСМП, которые часто являются устойчивыми ко многим антибиотикам (ЦКПЗ, 2013; Chang et al., 2015). Наиболее распространенные возбудители ИСМП включают грамотрицательные бактерии с множественной резистентностью; в недавних публикациях сообщается об изолятах со всего мира, которые стали резистентными к средствам, являющимся последней надеждой, полимиксину B и колистину (Du et al., 2015: Liu et al., 2016). Резистентность к средствам первой и второй линии также является проблемой в случае грамположительных микроорганизмов. Вид Candida является важным возбудителем мукозальных и диссеминированных инфекций у пациентов с иммунной недостаточностью, а также после противомикробной терапии (ЦКПЗ, 2013). Грамотрицательные виды E. coli, Pseudomonas, Klebsiella и Acinetobacter также становятся все более резистентными ко многим антибиотикам (McGann et al., 2016; Collignon, 2009; Agodi et al., 2011, отчет ВОЗ, 2014). Чтобы устранить этот пробел в знаниях, ЦКПЗ начал трехэтапное исследование в 2009 году по разработке и проведению многоуровневого обследования распространенности ИСМП и использования противомикробных средств. Исследования распространенности были проведены в других странах для осознания масштабов и глубины проблемы, связанной с такой инфекцией. Кульминацией усилий ЦКПЗ в 2011 году стало проведение масштабного опроса, в котором была оценена распространенность ИСМП в больницах неотложной помощи, определена распространенность этих инфекций в зависимости от участка инфицирования и патогена, как показано в Таблице 1, и получены обновленные оценки национального бремени этих инфекций (Magill et al., 2014).Vaccines of particular interest are those that target the most important HCAI pathogens, which are often resistant to multiple antibiotics (CDC, 2013; Chang et al., 2015). The most common causative agents of HAIs include multidrug-resistant gram-negative bacteria; recent publications report isolates from around the world that have become resistant to the drugs of last resort, polymyxin B and colistin (Du et al., 2015: Liu et al., 2016). Resistance to first and second line agents is also a problem in Gram-positive organisms. Candida species is an important causative agent of mucosal and disseminated infections in immunocompromised patients, as well as after antimicrobial therapy (CDC, 2013). Gram-negative E. coli, Pseudomonas , Klebsiella and Acinetobacter species are also becoming increasingly resistant to many antibiotics (McGann et al., 2016; Collignon, 2009; Agodi et al., 2011, WHO report, 2014). To address this knowledge gap, CDC began a three-stage study in 2009 to design and conduct a multilevel survey on HAI prevalence and antimicrobial use. Prevalence studies have been carried out in other countries to understand the extent and depth of the problem associated with such an infection. CDC's efforts culminated in 2011 with a large-scale survey that estimated the prevalence of HCAI in acute care hospitals, determined the prevalence of these infections by site of infection and pathogen as shown in Table 1, and provided updated estimates of the national burden of these infections (Magill et al., 2014).
Опросы были проведены в США в 183 больницах (Magill et al., 2014). Из 11282 пациентов, 452 имели 1 или более ИСМП (4,0%; 95% доверительный интервал, 3,7-4,4). Из 504 таких инфекций, наиболее распространенными типами были пневмония (21,8%), инфекции операционного поля (21,8%) и желудочно-кишечные (ЖК) инфекции (17,1%). C. difficile являлся наиболее часто упоминаемым патогеном (вызывающим 12,1% инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи). Инфекции, связанные с медицинскими устройствами (то есть, связанная с центральным катетером инфекция кровотока, связанная с катетером инфекция мочевыводящих путей и связанная с вентилирующим устройством пневмония), на которые традиционно были направлены программы по предотвращению ИСМП, составляли 25,6% таких инфекций. По оценкам авторов изобретения, в больницах неотложной помощи в Соединенных Штатов Америки (США) в 2011 г. находились 648000 пациентов с 721800 инфекциями, связанными с оказанием медицинской помощи. Вакцинация против K. pneumoniae, P. aeruginosa, E. coli, или их сочетания, в больничных условиях значительно повлияла бы на частоту случаев наиболее распространенных ИСМП, таких как пневмония, инфекции операционного поля и мочевыводящих путей, а также привела бы к уменьшению распространенности резистентности к антибиотикам, как показано в Таблице 1.Surveys were conducted in the US in 183 hospitals (Magill et al., 2014). Of 11282 patients, 452 had 1 or more HCAIs (4.0%; 95% CI, 3.7-4.4). Of the 504 such infections, the most common types were pneumonia (21.8%), surgical field infections (21.8%), and gastrointestinal (GI) infections (17.1%). C. difficile was the most commonly reported pathogen (causing 12.1% of healthcare-associated infections). Medical device infections (i.e., central catheter-associated bloodstream infection, catheter-associated urinary tract infection, and ventilator-associated pneumonia), which have traditionally been targeted by HCAI prevention programs, accounted for 25.6% of these infections. The inventors estimate that there were 648,000 patients in emergency hospitals in the United States of America (USA) in 2011 with 721,800 healthcare-associated infections. Vaccination against K. pneumoniae , P. aeruginosa , E. coli , or a combination of these, in the hospital setting would significantly reduce the incidence of the most common HAIs, such as pneumonia, surgical site infections, and urinary tract infections, and reduce the prevalence of resistance to antibiotics, as shown in Table 1.
Таблица 1: Многоуровневая оценка распространенности ИСМП: в зависимости от типа инфекции (Magill Table 1: Multilevel estimation of HAI prevalence: by type of infection (Magill et al.,et al., 2014) 2014)
Иммуногенные комплексыImmunogenic complexes
Настоящее изобретение относится к иммуногенным комплексам, которые включают каркасные полимеры, полисахариды и полипептиды.The present invention relates to immunogenic complexes that include backbone polymers, polysaccharides and polypeptides.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенные комплексы представляют собой множественные системы представления антигенов (MAPS). Некоторые системы MAPS ранее были описаны в WO 2012/155007. Как правило, иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, представляет собой новый вариант комплексов MAPS-типа, которые включают (i) каркасный полимер, включающий полимер и один или более полисахаридов (например, антигенных полисахаридов), конъюгированных с полимером; и (ii) один или более полипептидов (например, антигенных полипептидов и/или полипептидов-носителей) в не ковалентном комплексе с полимером и/или антигенным полисахаридом. Некоторые иллюстративные каркасные полимеры показаны в иммуногенных комплексах, представленных на Фигурах 7A-7D. В некоторых вариантах осуществления вариантный комплекс MAPS представляет собой BP-1 MAPS. В некоторых вариантах осуществления вариантный комплекс MAPS представляет собой BP-1.2 MAPS. В некоторых вариантах осуществления вариантный комплекс MAPS представляет собой BP-2a MAPS. В некоторых вариантах осуществления вариантный комплекс MAPS представляет собой BP-2b MAPS. В некоторых вариантах осуществления вариантный комплекс MAPS представляет собой BP-3 MAPS.In some embodiments, the immunogenic complexes are multiple antigen presentation systems (MAPS). Some MAPS systems have previously been described in WO 2012/155007. Typically, the immunogenic complex described in the present invention is a novel variant of MAPS-type complexes that include (i) a backbone polymer comprising a polymer and one or more polysaccharides (eg, antigenic polysaccharides) conjugated to the polymer; and (ii) one or more polypeptides (eg, antigenic and/or carrier polypeptides) in a non-covalent complex with a polymer and/or antigenic polysaccharide. Some exemplary backbone polymers are shown in the immunogenic complexes shown in Figures 7A-7D. In some embodiments, the variant MAPS complex is BP-1 MAPS. In some embodiments, the variant MAPS complex is BP-1.2 MAPS. In some embodiments, the variant MAPS complex is MAPS BP-2a. In some embodiments, the variant MAPS complex is BP-2b MAPS. In some embodiments, the variant MAPS complex is BP-3 MAPS.
В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидных антигенов находятся в не ковалентном комплексе с каркасным полимером, и/или антигенным полисахаридом, конъюгированным с указанным полимером, за счет образования по меньшей мере одной пары аффинная молекула/комплементарная аффинная молекула, включающей (i) первую аффинную молекулу, связанную с полимером и/или антигенным полисахаридом; и (ii) комплементарную аффинную молекулу, связанную с одним или более полипептидными антигенами. В некоторых вариантах осуществления один или более полисахаридов химически связаны с полимером. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов получены из грамотрицательных бактерий и/или грамположительных бактерий. В некоторых вариантах осуществления один или более микробных антигенных полисахаридов получены из антигенных полисахаридов K. pneumoniae, P. aeruginosa и E. coli.In some embodiments, one or more polypeptide antigens are in a non-covalent complex with a backbone polymer and/or an antigenic polysaccharide conjugated to said polymer by forming at least one affinity molecule/complementary affinity molecule pair comprising (i) a first affinity a molecule associated with a polymer and/or antigenic polysaccharide; and (ii) a complementary affinity molecule associated with one or more polypeptide antigens. In some embodiments, one or more polysaccharides are chemically bonded to a polymer. In some embodiments, one or more antigenic polysaccharides are derived from Gram-negative bacteria and/or Gram-positive bacteria. In some embodiments, the one or more microbial antigenic polysaccharides are derived from K. pneumoniae, P. aeruginosa, and E. coli antigenic polysaccharides.
В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидов ковалентно связаны (например, слиты) с комплементарной аффинной молекулой, описанной в настоящем изобретении.In some embodiments, one or more polypeptides are covalently linked (eg, fused) to a complementary affinity molecule as described herein.
В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов конъюгированы с каркасным полимером. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов конъюгированы с каркасным полимером в соотношении от приблизительно 0,01 до приблизительно 10 по массе. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов конъюгированы с каркасным полимером в соотношении от приблизительно 0,01 до приблизительно 0,1 по массе. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов конъюгированы с каркасным полимером в соотношении от приблизительно 0,01 до приблизительно 1 по массе. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов конъюгированы с каркасным полимером в соотношении от приблизительно 0,1 до приблизительно 1 по массе. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов конъюгированы с каркасным полимером в соотношении от приблизительно 0,1 до приблизительно 10 по массе. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов конъюгированы с каркасным полимером в соотношении от приблизительно 1 до приблизительно 10 по массе.In some embodiments, one or more antigenic polysaccharides are conjugated to a backbone polymer. In some embodiments, one or more antigenic polysaccharides are conjugated to the backbone polymer in a ratio of about 0.01 to about 10 by weight. In some embodiments, one or more antigenic polysaccharides are conjugated to the backbone polymer in a ratio of about 0.01 to about 0.1 by weight. In some embodiments, one or more antigenic polysaccharides are conjugated to the backbone polymer in a ratio of about 0.01 to about 1 by weight. In some embodiments, one or more antigenic polysaccharides are conjugated to the backbone polymer in a ratio of about 0.1 to about 1 by weight. In some embodiments, one or more antigenic polysaccharides are conjugated to the backbone polymer in a ratio of about 0.1 to about 10 by weight. In some embodiments, one or more antigenic polysaccharides are conjugated to the backbone polymer in a ratio of about 1 to about 10 by weight.
В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов получены из одного или более патогенов. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов получены из 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24 или 25 серотипов или штаммов патогена.In some embodiments, one or more antigenic polysaccharides are derived from one or more pathogens. In some embodiments, one or more antigenic polysaccharides are derived from 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20 , 21, 22, 23, 24 or 25 serotypes or strains of the pathogen.
В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер содержит одну или более аффинных молекул, конъюгированных с каркасным полимером. В некоторых вариантах осуществления антигенные полисахариды содержат одну или более аффинных молекул, конъюгированных с антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер и антигенные полисахариды конъюгированы с одной или более аффинными молекулами. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер конъюгирован с одной или более аффинными молекулами, и антигенные полисахариды не конъюгированы с аффинной молекулой. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер не конъюгирован с аффинной молекулой, и антигенные полисахариды конъюгированы с одной или более аффинными молекулами. В некоторых вариантах осуществления аффинные молекулы включают биотин или производные биотина.In some embodiments, the framework polymer contains one or more affinity molecules conjugated to the framework polymer. In some embodiments, the antigenic polysaccharides comprise one or more affinity molecules conjugated to the antigenic polysaccharides. In some embodiments, the backbone polymer and the antigenic polysaccharides are conjugated to one or more affinity molecules. In some embodiments, the backbone polymer is conjugated to one or more affinity molecules and the antigenic polysaccharides are not conjugated to the affinity molecule. In some embodiments, the backbone polymer is not conjugated to an affinity molecule and the antigenic polysaccharides are conjugated to one or more affinity molecules. In some embodiments, the affinity molecules include biotin or biotin derivatives.
В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер содержит множество аффинных молекул, конъюгированных с каркасным полимером. В некоторых вариантах осуществления антигенные полисахариды содержат множество аффинных молекул, конъюгированных с антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер и антигенные полисахариды конъюгированы с множеством аффинных молекул. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер конъюгирован с множеством аффинных молекул, и антигенные полисахариды не конъюгированы с аффинной молекулой. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер не конъюгирован с аффинной молекулой, и антигенные полисахариды конъюгированы с множеством аффинных молекул. В некоторых вариантах осуществления аффинные молекулы включают биотин или производные биотина.In some embodiments, the framework polymer contains a plurality of affinity molecules conjugated to the framework polymer. In some embodiments, the antigenic polysaccharides comprise a plurality of affinity molecules conjugated to the antigenic polysaccharides. In some embodiments, the framework polymer and the antigenic polysaccharides are conjugated to a plurality of affinity molecules. In some embodiments, the backbone polymer is conjugated to a plurality of affinity molecules and the antigenic polysaccharides are not conjugated to the affinity molecule. In some embodiments, the backbone polymer is not conjugated to an affinity molecule and the antigenic polysaccharides are conjugated to a plurality of affinity molecules. In some embodiments, the affinity molecules include biotin or biotin derivatives.
В некоторых вариантах осуществления полисахариды и/или полипептиды, которые могут быть включены в иммуногенные комплексы, получены рекомбинантными методами или методами синтеза. В некоторых вариантах осуществления полисахариды и/или полипептиды, которые могут быть включены в иммуногенные комплексы, выделены и/или получены из природных источников. Иллюстративные полисахариды и/или полипептиды описаны ниже.In some embodiments, the implementation of the polysaccharides and/or polypeptides that can be included in the immunogenic complexes obtained by recombinant methods or methods of synthesis. In some embodiments, the polysaccharides and/or polypeptides that may be included in the immunogenic complexes are isolated and/or obtained from natural sources. Illustrative polysaccharides and/or polypeptides are described below.
KlebsiellaKlebsiella
Подавляющее большинство инфекций Klebsiella связаны с госпитализацией. Как оппортунистические патогены, Klebsiella spp. в основном атакуют индивидуумов с иммунной недостаточностью, которые госпитализированы и страдают от тяжелых основных заболеваний, таких как сахарный диабет или хроническая обструктивная болезнь легких. Возбудителем внутрибольничных инфекций Klebsiella является в основном K. pneumoniae, самый важный для медицины вид рода. По оценкам, Klebsiella spp. является возбудителем в 8% случаев всех внутрибольничных бактериальных инфекций в США и Европе (Podschun and Ullmann, 1998). Не было отмечено значительных географических различий в частоте встречаемости, за исключением гипервирулентных K1-инкапсулированных штаммов, которые встречаются преимущественно в Азии и редко встречаются в Европе и Западном полушарии. В США Klebsiella является возбудителем в 3-7% случаев всех внутрибольничных бактериальных инфекций, что ставит ее в число восьми наиболее важных инфекционных патогенов в больницах (Horan et al., 1988; Schaberg et al., 1991); и данные, полученные из Соединенного королевства (Bergogne-Berezin, 1995) и из Германии (Ullmann, 1986), на удивление аналогичны тем, о которых сообщает ЦКПЗ. Таким образом, в некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает один или более полисахаридов и/или полипептидов Klebsiella.The vast majority of Klebsiella infections are associated with hospitalization. As opportunistic pathogens, Klebsiella spp . mainly attack immunocompromised individuals who are hospitalized and suffer from severe underlying diseases such as diabetes mellitus or chronic obstructive pulmonary disease. The causative agent of nosocomial infections Klebsiella is mainly K. pneumoniae , the most important species of the genus for medicine. It is estimated that Klebsiella spp . is the causative agent in 8% of all nosocomial bacterial infections in the US and Europe (Podschun and Ullmann, 1998). There were no significant geographic differences in incidence, with the exception of hypervirulent K1-encapsulated strains, which occur predominantly in Asia and are rare in Europe and the Western Hemisphere. In the US, Klebsiella accounts for 3-7% of all hospital-acquired bacterial infections, making it one of the eight most important infectious pathogens in hospitals (Horan et al., 1988; Schaberg et al., 1991); and data from the United Kingdom (Bergogne-Berezin, 1995) and from Germany (Ullmann, 1986) are surprisingly similar to those reported by the CDC. Thus, in some embodiments, the immunogenic complex described herein comprises one or more Klebsiella.beta . polysaccharides and/or polypeptides.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает один или более полисахаридов из LPS, и/или CPS полисахаридов Klebsiella. В некоторых вариантах осуществления полисахариды из LPS представляют собой OPS. В некоторых вариантах осуществления полисахариды из LPS представляют собой COPS. Капсулы продуцируются почти всеми штаммами Klebsiella; они представляют собой самый наружный слой поверхностных структур, соприкасающийся с окружающей средой хозяина, и доказано, что они являются высоко иммуногенными и нетоксичными (Cryz et al., 1985). Недостатком вакцины против CPS Klebsiella pneumoniae (KP) является большое число капсульных (K) антигенов (более 80 разных антигенов). Однако в исследованиях частоты встречаемости капсульных типов среди бактериемических изолятов Klebsiella, было обнаружено, что лишь 25 серотипов составляют 70% всех бактериемических штаммов (Cryz et al., 1986a). С учетом этих серо-эпидемиологических данных была составлена 24-валентная KP CPS вакцина, которая, как было впоследствии доказано, является безопасной и иммуногенной (Edelman et al., 1994). Однако простые полисахариды сами по себе являются недостаточно иммуногенными для индукции и поддержания долгосрочного и эффективного ответа памяти, и часто должны быть конъюгированы с белками, чтобы быть эффективными. Разработка 24-валентной полисахаридной конъюгатной KP вакцины является сложной и проблематичной, поскольку для объединения 24 гликоконъюгатов в одной вакцине может потребоваться уравновешивание иммуногенности каждого компонента.In some embodiments, the immunogenic complex described herein comprises one or more polysaccharides from LPS and/or CPS polysaccharides.Klebsiella. In some embodiments, the polysaccharides from the LPS are OPS. In some embodiments, the polysaccharides from the LPS are COPS. Capsules are produced by almost all strainsKlebsiella; they are the outermost layer of surface structures in contact with the host environment and have been shown to be highly immunogenic and non-toxic (Cryzet al., 1985). The lack of a vaccine against CPSKlebsiella pneumoniae (KP) is a large number of capsular (K) antigens (more than 80 different antigens). However, in studies of the frequency of occurrence of capsular types among bacteremic isolatesKlebsiella, only 25 serotypes were found to account for 70% of all bacteremic strains (Cryzet al., 1986a). Based on these sero-epidemiological data, a 24-valent KP CPS vaccine was formulated, which was subsequently proven to be safe and immunogenic (Edelmanet al., 1994). However, simple polysaccharides alone are not immunogenic enough to induce and maintain a long-term and effective memory response, and often must be conjugated to proteins to be effective. The development of a 24-valent polysaccharide conjugate KP vaccine is complex and problematic because combining 24 glycoconjugates in one vaccine may require balancing the immunogenicity of each component.
Вследствие его эндотоксических свойств, LPS считают важным в патологии септицемии. До последнего времени, как правило, считалось, что O-антигены LPS Klebsiella маскированы CPS, и, следовательно, не экспонированы на бактериальной поверхности. Однако в нескольких исследованиях было продемонстрировано экспонирование на поверхности и доступность для антител O-антигенов в штаммах, экспрессирующих конкретные капсульные серотипы (Tomas et al., 1988). В отличие от K-антигенов, известно лишь восемь O-типов, при этом O1 является наиболее часто встречающимся O-типом в клинических изолятах. На четыре изолята KP (O1, O2, O3, O5) приходится большинство клинических изолятов (Hansen et al., 1999). Сообщалось, что введение моноклональных антител (мАт) к антигену O1 Klebsiella производило защитное действие в мышиной модели летальной эндотоксемии (Mandine et al., 1990).Owing to its endotoxic properties, LPS is considered important in the pathology of septicemia. Until recently, it was generally believed that O antigens LPSKlebsiella masked by CPS, and therefore not exposed to the bacterial surface. However, several studies have demonstrated surface exposure and antibody accessibility of O antigens in strains expressing specific capsular serotypes (Tomaset al., 1988). Unlike K antigens, only eight O types are known, with O1 being the most common O type in clinical isolates. The four KP isolates (O1, O2, O3, O5) account for the majority of clinical isolates (Hansenet al., 1999). It has been reported that administration of monoclonal antibodies (mAbs) to the O1 antigenKlebsiella produced a protective effect in a mouse model of lethal endotoxemia (Mandineet al., 1990).
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает белок или полипептид пилей 3 типа Klebsiella. В отличие от других фимбрий, пили 3 типа вызывают агглютинацию эритроцитов, обработанных танином. Несмотря на то, что его название, манноза-резистентный, Klebsiella-подобный гемагглютинин (MR/K-HA), подразумевает, что этот фимбриальный тип синтезируется только Klebsiella, более поздние исследования продемонстрировали, что пили 3 типа имеются у многих родов кишечных бактерий (Clegg and Gerlach, 1987). Кроме того, пили 3 типа, очевидно, не идентичны во всех родах энтеробактерий, поскольку серологические исследования показали значительное антигенное разнообразие (Old and Adegbola, 1985). Первоначально описанные как адгезионные органеллы Klebsiella, населяющих корни растений, эти пили, как позднее было обнаружено, способны связываться с различными клетками человека. Штаммы K. pneumoniae, экспрессирующие пили 3 типа, прикрепляются к эндотелиальным клеткам, эпителию дыхательных путей и уроэпителиальным клеткам (Hornick et al., 1992; Tarkkanen et al., 1997; Würker et al, 1990). В почках эти пили опосредуют бактериальную адгезию к базальным мембранам канальцев, капсулам Боумена и почечным кровеносным сосудам (Tarkkanen et al., 1990). MrkA является основным белком фимбриального комплекса III типа и участвует в адгезии к клетке-хозяину и образовании биопленок (Murphy and Clegg, 2012), стратегии, используемой бактериальными патогенами при инфицировании (Burmolle et al., 2008). MrkA, но не адгезин (MrkD), как показано ранее, способствует образованию биопленок (Langstraat et al., 2001). Антиген MrkA имеет высокую степень консервативности последовательности в разных изолятах KP и, в целом, является доступным в качестве внеклеточной мишени (Wang et al., 2016). MrkA из двух наиболее преобладающих патогенных изолятов, K. pneumoniae и Klebsiella oxytoca, имеют гомологию 95%. Кроме того, гомология MrkA у репрезентативных представителей семейства Enterobacteriaceae составляет >90% и, таким образом, эти данные о последовательности предоставляют потенциальную возможность разработки основанной на MrkA стратегии против K. pneumoniae и всех грамотрицательных бактерий.In some embodiments, the immunogenic complex described herein comprises a Klebsiella
Полисахариды Klebsiella pneumoniaePolysaccharides of Klebsiella pneumoniae
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает один или более полисахаридов K. pneumoniae. Помимо CPS (например, K-антигена), OPS является другим важным фактором вирулентности для K. pneumoniae. Существуют по меньшей мере 9 подтипов OPS K. pneumoniae, каждый из которых имеет разную химическую структуру полисахарида. В некоторых вариантах осуществления полисахариды OPS включены в иммунный комплекс, описанный в настоящем изобретении. Каждое используемое в настоящем изобретении обозначение серотипа указано в соответствии со Справочно-исследовательским центром изучения Escherichia и Klebsiella, сотрудничающим с Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ).In some embodiments, the implementation of the immunogenic complex described in the present invention includes one or more polysaccharidesK. pneumoniae. Apart from CPS (e.g. K-antigen), OPS is another important virulence factor forK. pneumoniae. There are at least 9 subtypes of OPSK. pneumoniae, each with a different polysaccharide chemical structure. In some embodiments, the OPS polysaccharides are included in the immune complex described in the present invention. Each serotype designation used in the present invention is indicated in accordance with the Reference and Research Center for the studyEscherichia AndKlebsiellacooperating with the World Health Organization (WHO).
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс включает один или более полисахаридов Klebsiella, которые представляют собой полисахариды, или их производные, из одного или более серотипов K. pneumoniae, выбранных из O1 (и d-Gal-III вариантов), O2 (и d-Gal-III вариантов), O2ac, O3, O4, O5, O7, O8 и O12. В некоторых вариантах осуществления иммунный комплекс включает полисахариды, или их производные, из одного или более из серотипов O1, O2, O3 и O5 Klebsiella, или их сочетания. В некоторых вариантах осуществления иммунный комплекс включает полисахариды, или их производные, из каждого из серотипов O1, O2, O3 и O5 Klebsiella.In some embodiments, the immunogenic complex comprises one or more polysaccharidesKlebsiella, which are polysaccharides, or derivatives thereof, from one or more serotypesK. pneumoniaeselected from O1 (and d-Gal-III variants), O2 (and d-Gal-III variants), O2ac, O3, O4, O5, O7, O8 and O12. In some embodiments, the immune complex comprises polysaccharides, or derivatives thereof, from one or more of the O1, O2, O3, and O5 serotypes.Klebsiella, or combinations thereof. In some embodiments, the immune complex comprises polysaccharides, or derivatives thereof, from each of the O1, O2, O3 and O5 serotypesKlebsiella.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс включает один или более полисахаридов Klebsiella, которые представляют собой, или получены из, OPS. В некоторых вариантах осуществления OPS представляет собой, или получен из серотипа O1, O2, O3, O5 Klebsiella, а также их вариантов и/или сочетания. В некоторых вариантах осуществления иммунный комплекс включает OPS Klebsiella, выбранный из, или полученный из, одного или более из серотипов O1, O2, O3 и O5, или их сочетания. В некоторых вариантах осуществления иммунный комплекс включает OPS Klebsiella из, или полученный из, каждого из серотипов O1, O2, O3 и O5.In some embodiments, the immunogenic complex comprises one or more polysaccharidesKlebsiella, which are, or derived from, OPS. In some embodiments, the OPS is, or is derived from, serotype O1, O2, O3, O5Klebsiella, as well as their variants and/or combinations. In some embodiments, the implementation of the immune complex includes OPSKlebsiella, selected from, or derived from, one or more of the O1, O2, O3 and O5 serotypes, or combinations thereof. In some embodiments, the implementation of the immune complex includes OPSKlebsiella from, or derived from, each of the O1, O2, O3 and O5 serotypes.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс включает один или более полисахаридов Klebsiella, которые представляют собой, или получены из, CPS. В некоторых вариантах осуществления CPS представляет собой, или получен из K1, K2, K10, K16 и K19 Klebsiella. В некоторых вариантах осуществления CPS представляет собой, или получен из K19 Klebsiella.In some embodiments, the immunogenic complex comprises one or more Klebsiella polysaccharides that are, or are derived from, CPS. In some embodiments, the implementation of the CPS is, or derived from K1, K2, K10, K16 and K19 Klebsiella . In some embodiments, the CPS is or is derived from K19 Klebsiella .
Полипептиды Klebsiella pneumoniaePolypeptides of Klebsiella pneumoniae
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает один или более полипептидов K. pneumoniae. В некоторых вариантах осуществления полипептид K. pneumoniae представляет собой полипептид, или производное, фимбриального белка I типа K. pneumoniae, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид K. pneumoniae представляет собой, или содержит, полипептид с SEQ ID NO: 1, опубликованной в Gerlach et al., 2012, J Bacteriology, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид K. pneumoniae представляет собой, или содержит, полипептид, имеющий по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 1, или его иммуногенный фрагмент.In some embodiments, the implementation of the immunogenic complex described in the present invention includes one or more polypeptidesK. pneumoniae. In some embodiments, the polypeptideK. pneumoniae is a polypeptide, or derivative, of type I fimbrial proteinK. pneumoniae, or its immunogenic fragment. In some embodiments, the polypeptideK. pneumoniae is, or contains, the polypeptide of SEQ ID NO: 1 published in Gerlachet al., 2012, J Bacteriology, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the polypeptideK. pneumoniae is, or contains, a polypeptide having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% identity with the sequence of SEQ ID NO: 1, or an immunogenic fragment thereof.
SEQ ID NO: 1 фимбриального белка I типа K. pneumoniae SEQ ID NO: 1 K. pneumoniae type I fimbrial protein
mkiktlamivvsalslsstaaladtttvnggtvhfkgevvnaacavdagsidqtvqlgqvrsaklatagstssavgfniqlddcdttvatkasvafagtaidssnttvlalqnsaagsatnvgvqildntgtplaldgatfsaattlndgpniipfqaryyatgaatagianadatfkvqyemkiktlamivvsalslsstaaladtttvnggtvhfkgevvnaacavdagsidqtvqlgqvrsaklatagstssavgfniqlddcdttvatkasvafagtaidssnttvlalqnsaagsatnvgvqildntgtplaldgatfsaattlndgpniipfqaryyatgaatagianadatfkvqye
В некоторых вариантах осуществления полипептид K. pneumoniae представляет собой полипептид, или производное, консервативного фимбриального белка III типа MrkA K. pneumoniae, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид K. pneumoniae представляет собой, или содержит, полипептид с SEQ ID NO: 2, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид K. pneumoniae представляет собой, или содержит, полипептид, имеющий по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 2, или его иммуногенный фрагмент.In some embodiments, the K. pneumoniae polypeptide is a polypeptide, or derivative, of the K. pneumoniae conserved type III fimbrial protein MrkA, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the K. pneumoniae polypeptide is, or contains, a polypeptide of SEQ ID NO: 2, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the K. pneumoniae polypeptide is, or contains, a polypeptide having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identity with the sequence of SEQ ID NO: 2, or an immunogenic fragment thereof.
SEQ ID NO: 2 консервативного фимбриального белка III типа MrkA K. pneumoniae SEQ ID NO: 2 Conserved fimbrial protein type III MrkA K. pneumoniae
MKKVLLSAAMATAFFGMTAAHAADTTVGGGQVNFFGKVTDVSCTVSVNGQGSDANVYLSPVTLTEVKAAAADTYLKPKSFTIDVSNCQAADGTKQDDVSKLGVNWTGGNLLAGATSKQQGYLANTEASGAQNIQLVLSTDNATALTNKIIPGDSTQPKAKGDASAVADGARFTYYVGYATSAPTTVTTGVVNSYATYEITYQMKKVLLSAAMATAFFGMTAAHAADTTVGGGQVNFFGKVTDVSCTVSVNGQGSDANVYLSPVTLTEVKAAAADTYLKPKSFTIDVSNCQAADGTKQDDVSKLGVNWTGGNLLAGATSKQQGYLANTEASGAQNIQLVLSTDNATALTNKIIPGDSTQPKAKGDASAVADGARFTYYVGYATSAPTTVTTGVVNSYATYQ
В некоторых вариантах осуществления полипептид K. pneumoniae представляет собой полипептид, или производное, фимбриального белка III типа MrkA K. pneumoniae, или его иммуногенный фрагмент, например, фрагмент с повторяющимися последовательностями для обеспечения стабилизирующих взаимодействий с мономерным белком MrkA. В некоторых вариантах осуществления полипептид K. pneumoniae представляет собой, или содержит, полипептид с SEQ ID NO: 3, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид K. pneumoniae представляет собой, или содержит, полипептид, имеющий по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 3, или его иммуногенный фрагмент.In some embodiments, the K. pneumoniae polypeptide is a polypeptide, or derivative, of the K. pneumoniae MrkA fimbrial protein type III, or an immunogenic fragment thereof, e.g., a repeat sequence fragment to provide stabilizing interactions with the monomeric MrkA protein. In some embodiments, the K. pneumoniae polypeptide is, or contains, a polypeptide of SEQ ID NO: 3, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the K. pneumoniae polypeptide is, or contains, a polypeptide having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identity with the sequence of SEQ ID NO: 3, or an immunogenic fragment thereof.
SEQ ID NO: 3 стабилизированного фимбриального белка III типа MrkA K. pneumoniae SEQ ID NO: 3 K. pneumoniae type III stabilized fimbrial protein MrkA
ADTTVGGGQVNFFGKVTDVSCTVSVNGQGSDANVYLSPVTLTEVKAAAADTYLKPKSFTIDVSNCQAADGTKQDDVSKLGVNWTGGNLLAGATSKQQGYLANTEASGAQNIQLVLSTDNATALTNKIIPGDSTQPKAKGDASAVADGARFTYYVGYATSAPTTVTTGVVNSYATYEITYQGGGGGGADTTVGGGQVNFFGKVTDVSADTTVGGGQVNFFGKVTDVSCTVSVNGQGSDANVYLSPVTLTEVKAAAADTYLKPKSFTIDVSNCQAADGTKQDDVSKLGVNWTGGNLLAGATSKQQGYLANTEASGAQNIQLVLSTDNATALTNKIIPGDSTQPKAKGDASAVADGARFTYYVGYATSAPTTVTTGVVNSYATYEITYVSQGGGGGADTTVGK
PseudomonasPseudomonas
Pseudomonas является основным возбудителем ИСМП, в частности, при иммунной недостаточности вследствие нейтропении и у пациентов с механической вентиляцией легких, и является главной причиной смерти пациентов с кистозным фиброзом. Инфекция Pseudomonas также имеет место в случае ожоговых ран, повреждений глаз (например, роговицы), травме и так далее. Таким образом, в некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает один или более полисахаридов и/или полипептидов Pseudomonas. Pseudomonas is the main causative agent of HCAI, particularly in immunocompromised patients due to neutropenia and in mechanically ventilated patients, and is the leading cause of death in patients with cystic fibrosis. Pseudomonas infection also occurs in burn wounds, eye injuries (eg, cornea), trauma, and so on. Thus, in some embodiments, the immunogenic complex described herein comprises one or more Pseudomonas polysaccharides and/or polypeptides.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает O-антиген Pseudomonas. Ранее, компания Wellcome Research направляла основные усилия на разработку вакцины на основе этого антигена, объединяя очищенные экстракты, содержащие O-антиген 16 из 20 серотипов, в вакцине PEV-1. Результаты в общей сложности пяти клинических исследований фаз 1-2 были опубликованы с 1976 по 1984 годы (Jones et al., 1976, 1978, 1979, 1980; Langford and Hiller, 1984). Данные по изучению безопасности вакцины указывают на то, что она была хорошо переносима. Сероконверсия оказалась относительно постоянной в вакцинированных группах здоровых добровольцев, а также пациентов с ожогами или кистозным фиброзом (КФ). Вакцинация оказывала переменное влияние на колонизацию ожоговой раны, от незначительного или нулевого до значительного. В одном исследовании посев крови показал снижение количества бактерий почти в 10 раз вследствие вакцинации. В каждом исследовании с участием пациентов с ожогами имело место снижение смертности, которое варьировало в пределах 70-100%, хотя количество смертей из-за P. aeruginosa не всегда точно поддается определению. В исследованиях КФ (Langford and Hiller, 1984), судя по всему, отсутствовала как клиническая польза, так и отличие в колонизации P. aeruginosa при вакцинации, и отсутствовала корреляция между титрами антител в ELISA и клиническими или бактериологическими показателями. В Swiss Serum Institute, Berna Biotech и Crucell была разработана восьмивалентная O-антиген-экзотоксин A конъюгатная вакцина (Aerugen), которая прошла через три клинических испытания фаз 1-2, результаты которых опубликованы (Schaad, et al., 1991; Lang, et al., 1995; Cryz et al., 1994). Их вводимая внутримышечно (в/м) вакцина, судя по всему, была хорошо переносимой, и сероконверсия для всех серотипов была признана значимой во всех исследованиях. Вакцинация приводила к значительному уменьшению колонизации в большинстве исследований, и сообщалось об отсутствии связанных с PA смертей в группах применения вакцины или плацебо. В исследовании Crucell фазы 3 с участием 476 пациентов с КФ результаты для вакцины не достигли желаемого конечного результата и не повторили результаты, полученные в предыдущих исследованиях.In some embodiments, the immunogenic complex described herein comprises Pseudomonas O antigen. Previously, Wellcome Research focused on developing a vaccine based on this antigen by combining purified extracts containing the O antigen from 16 out of 20 serotypes into a PEV-1 vaccine. Results from a total of five phase 1-2 clinical trials were published from 1976 to 1984 (Jones et al., 1976, 1978, 1979, 1980; Langford and Hiller, 1984). Safety data from the vaccine indicate that it was well tolerated. Seroconversion was relatively constant in vaccinated groups of healthy volunteers, as well as patients with burns or cystic fibrosis (CF). Vaccination had a variable effect on burn wound colonization, from negligible or none to significant. In one study, blood cultures showed an almost 10-fold reduction in bacteria due to vaccination. In every study involving patients with burns, there was a reduction in mortality that ranged from 70-100%, although the number of deaths due to P. aeruginosa is not always accurately determined. In CF studies (Langford and Hiller, 1984) there appeared to be no clinical benefit or difference in P. aeruginosa colonization upon vaccination, and no correlation between ELISA antibody titers and clinical or bacteriological parameters. An octavalent O-antigen-exotoxin A conjugate vaccine (Aerugen) was developed by the Swiss Serum Institute, Berna Biotech and Crucell and has gone through three Phase 1-2 clinical trials with published results (Schaad, et al., 1991; Lang, et al . al., 1995; Cryz et al., 1994). Their intramuscular (IM) vaccine appeared to be well tolerated, and seroconversion for all serotypes was found to be significant in all studies. Vaccination resulted in a significant reduction in colonization in most studies, and no PA-related deaths were reported in the vaccine or placebo groups. In the
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает жгутик Pseudomonas, или его антигенный фрагмент. В ранних исследованиях эффективности (Holder et al., 1982; Holder and Naglich, 1986; Montie, et al., 1987) установлено, что жгутик как a, так и b, типа мог обеспечивать специфическую для типа защиту от гибели в мышиных моделях ожогов, однако жгутик типа b, похоже, был несколько более эффективен в этом. В доклинических исследованиях компании IMMUNO AG (Crowe, et al., 1991) были использованы индивидуальные вакцины, состоящие из жгутика типа a0, a0a1a2, a0a2, a0a3, a0a3a4 и b, и определено, что антиген b, судя по всему, является лучшим иммуногеном, обеспечивая более высокую степень защиты в мышиной модели иммунной недостаточности, чем препараты с типом a. Результаты исследования фазы 1 в той же публикации показали, что все из этих иммуногенов вызывали продуцирование сывороточных антител с высокими титрами и продолжительным действием, как и одиночный иммуноген типа b в последующем исследовании фазы 2 (Döring, et al., 1995), где также наблюдали сероконверсию IgG, IgA и sIgA в бронхоальвеолярных смывах. Введение комбинированной вакцины с тип a (a0a1a2) + тип b жгутиками пациентам с КФ (фаза 3) приводило к продуцированию сывороточных IgG с высокими титрами и продолжительным действием. Однако, хотя имел место некоторый защитный эффект от легочной инфекции P. aeruginosa, присутствие серотипов, не связанных с вакциной, не позволило четко интерпретировать результат (Döring and Dorner, 1997; Döring, et al. 2007). В последующем обзоре Döring и Pier (2008) предположили, что двухвалентная флагеллярная вакцина может быть неоптимальной, и тем не менее, видимо, отсутствуют данные по одиночной вакцине, содержащей жгутик типа b и все из подтипов типа a.In some embodiments, the immunogenic complex described herein comprises a Pseudomonas flagellum, or an antigenic fragment thereof. Early efficacy studies (Holder et al., 1982; Holder and Naglich, 1986; Montie, et al., 1987) found that both type a and b flagellum could confer type-specific protection against death in murine burn models. , however, the type b flagellum seems to have been somewhat more efficient in this. Preclinical studies by IMMUNO AG (Crowe, et al., 1991) used individual vaccines consisting of a0, a0a1a2, a0a2, a0a3, a0a3a4 and b flagellum types and determined that the b antigen appears to be the best immunogen , providing a higher degree of protection in a mouse model of immune deficiency than type a preparations. The results of a
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает флагеллин Pseudomonas, или его антигенный фрагмент. Исследования субъединиц жгутика, флагеллина, не продвинулись дальше исследовательской фазы. В исследования были включены очищенный флагеллин (Campodonico, et al., 2010; Faezi, et al., 2013), ДНК вакцина с флагеллином (Saha, et al., 2007), а также конъюгат флагеллин/полиманнуроновая кислота (Campodonico, et al., 2011). Хотя все из них являются иммуногенными и защитными, они, судя по всему, не достигают уровней, которых достигают флагеллярные препараты. Также была изучена пассивная иммунизация с использованием сыворотки против типа b (Barnea, et al., 2006), мАт против типа a (Barnea, et al., 2009) и сыворотки против типа a (Faezi, et al., 2011). Все препараты приводили к уменьшению смертности в мышиной модели ожога.In some embodiments, the immunogenic complex described herein comprises Pseudomonas flagellin, or an antigenic fragment thereof. Research on the flagellar subunit, flagellin, has not advanced beyond the exploratory phase. The studies included purified flagellin (Campodonico, et al., 2010; Faezi, et al., 2013), flagellin DNA vaccine (Saha, et al., 2007), and a flagellin/polymannuronic acid conjugate (Campodonico , et al. ., 2011). While all of these are immunogenic and protective, they do not appear to reach the levels that flagellar drugs achieve. Passive immunization using anti-type b sera (Barnea, et al., 2006), anti-type a mAb (Barnea, et al., 2009), and anti-type a sera (Faezi, et al., 2011) has also been studied. All drugs resulted in reduced mortality in a mouse burn model.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает PcrV Pseudomonas (секреторной системы III типа), или его антигенный фрагмент. Ключевым фактором вирулентности, связанным с тяжестью заболевания, является секреторная система III типа (T3SS) P. aeruginosa, которая инъецирует бактериальные токсины непосредственно в цитоплазму клеток-хозяев. Белок PcrV, расположенный на конце инжектисомного комплекса T3SS, необходим для функционирования T3SS и является надежно подтвержденной мишенью в животных моделях для разработки иммунологических стратегий профилактики, направленных на P. aeruginosa. Основываясь на предыдущих результатах исследований PcrV, в которых активная и пассивная иммунизация (Sawa, et al., 1999; Holder, et al., 2001; Shime, et al., 2001; Frank, et al., 2002) демонстрировала защиту в различных животных моделях, в KaloBios были разработаны «Humaneered™, высокоаффинные пегилированные Fab'» (KB-001), которые были изучены в качестве пассивной терапии в доклинических (Baer, et al., 2009) и клинических испытаниях (Francois et al., 2012; Milla et al., 2014). Хотя как мышиные, так и гуманизированные («humaneered»), мАт и их Fab’-фрагменты продемонстрировали эффективность в исследованиях на животных, при клиническом испытании KB-001 не были обнаружены существенные отличия в количественных показателях колонизации P. aeruginosa, симптомах или спирометрии, и новый усовершенствованный вариант KB-001A для лечения инфекции P. aeruginosa у пациентов с кистозным фиброзом не соответствовал основным показателям эффективности в клиническом испытании фазы 2 с участием людей (ClinTrials.gov, 2014). Что касается использования в качестве активной вакцины, до настоящего изобретения было проведено мало исследований с белковым антигеном PcrV.In some embodiments, the implementation of the immunogenic complex described in the present invention includes PcrV Pseudomonas (type III secretory system), or antigenic fragment. A key virulence factor associated with disease severity is the type III secretory system (T3SS) of P. aeruginosa , which injects bacterial toxins directly into the cytoplasm of host cells. The PcrV protein, located at the end of the T3SS injectisomal complex, is essential for T3SS function and is a well-established target in animal models for the development of immunological prevention strategies targeting P. aeruginosa . Based on previous results from PcrV studies in which active and passive immunization (Sawa, et al., 1999; Holder, et al., 2001; Shime, et al., 2001; Frank, et al., 2002) demonstrated protection in various animal models, "Humaneered™, high affinity pegylated Fab'" (KB-001) has been developed in KaloBios and has been studied as a passive therapy in preclinical (Baer, et al., 2009) and clinical trials (Francois et al., 2012 ; Milla et al., 2014). Although both murine and humaneered mAbs and their Fab' fragments have been shown to be effective in animal studies, no significant differences in P. aeruginosa colonization scores, symptoms, or spirometry were found in the KB-001 clinical trial, and a new improved version of KB-001A for the treatment of P. aeruginosa infection in patients with cystic fibrosis did not meet key efficacy outcomes in a
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает экзополисахарид Pseudomonas. В некоторых вариантах осуществления иммунный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает PsL Pseudomonas. Этот экзополисахарид важен для адгезии P. aeruginosa к клеткам млекопитающих, а также для образования и поддержания биопленок, продуцируемых немукоидными и мукоидными изолятами P. aeruginosa. Полисахарид PsL удерживает вместе клетки биопленок, таким образом, в этом заключается важная роль PsL в адгезии (Ma et al., 2006). Функциональный скрининг выявил, что мАт к одному эпитопу PsL демонстрируют превосходную активность в ОФУ и анализах адгезии к клеткам, и обеспечивают значительную защиту во многих животных моделях.In some embodiments, the immunogenic complex described herein comprises Pseudomonas exopolysaccharide. In some embodiments, the implementation of the immune complex described in the present invention includes PsL Pseudomonas . This exopolysaccharide is important for the adhesion of P. aeruginosa to mammalian cells and for the formation and maintenance of biofilms produced by nonmucoid and mucoid isolates of P. aeruginosa . The PsL polysaccharide holds biofilm cells together, thus, this is the important role of PsL in adhesion (Ma et al., 2006). Functional screening revealed that mAbs against a single PsL epitope exhibit excellent activity in RFU and cell adhesion assays, and provide significant protection in many animal models.
Полисахарид PsL представляет собой доступный для антител независимый от серотипа поверхностный элемент, который распространен как среди немукоидных, так и мукоидных, клинических изолятов (DiGiandomenico et al., 2012). У животных анти-PsL антитела опосредуют ОФУ в присутствии эффекторных клеток и ингибируют связывание P. aeruginosa с эпителиальными клетками. Предположительно анти-PsL специфическое мАт Cam-003 пассивно защищало и уменьшало бактериальную нагрузку в органах мышей зависимым от дозы образом (DiGiandomenico et al., 2012). мАт Cam-003 также оказывало защитное действие против множества серотипов P. aeruginosa в модели мышиной пневмонии. Аналогичные результаты были получены в мышиных моделях скарификации роговицы или ожога, в обоих случаях Cam-003 было эффективно для уменьшения инфекции. MEDI 3902 представляет собой биспецифическое антитело, нацеленное на независимый от серотипа фактор вирулентности TTSS PcrV и экзополисахарид PsL фактора персистенции (DiGiandomenico et al., 2014). Завершено исследование фазы 1 по изучению безопасности MEDI 3902 для предотвращения пневмонии (связанной с вентилированием легких пневмонии), вызываемой Pseudomonas (https://clinicaltrials.gov/NCT02255760). Что касается использования в качестве активной вакцины, до настоящего изобретения было проведено мало исследований с антигенным экзополисахаридом PsL.The polysaccharide PsL is an antibody-accessible, serotype-independent surface element that is common in both nonmucoid and mucoid clinical isolates (DiGiandomenico et al., 2012). In animals, anti-PsL antibodies mediate OFU in the presence of effector cells and inhibit the binding of P. aeruginosa to epithelial cells. Presumably, the anti-PsL specific mAb Cam-003 passively protected and reduced the bacterial load in mouse organs in a dose-dependent manner (DiGiandomenico et al., 2012). The mAb Cam-003 was also protective against multiple P. aeruginosa serotypes in a murine pneumonia model. Similar results were obtained in mouse models of corneal scarification or burn, in both cases Cam-003 was effective in reducing infection. MEDI 3902 is a bispecific antibody targeting the serotype-independent virulence factor TTSS PcrV and the exopolysaccharide persistence factor PsL (DiGiandomenico et al., 2014). The
Полисахариды Pseudomonas aeruginosaPseudomonas aeruginosa polysaccharides
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает один или более полисахаридов P. aeruginosa. Известно приблизительно 20 серотипов O-антигена при определении методом IATS. O-антигенный полисахарид молекулы является нетоксической потенциальной мишенью для разработки вакцины. В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает один или более OPS, LPS и/или экзополисахаридов Pseudomonas. В некоторых вариантах осуществления полисахариды из LPS представляют собой OPS. В некоторых вариантах осуществления полисахариды из LPS представляют собой COPS.In some embodiments, the implementation of the immunogenic complex described in the present invention includes one or more polysaccharidesP. aeruginosa. Approximately 20 O antigen serotypes are known as determined by IATS. The O-antigenic polysaccharide molecule is a non-toxic potential target for vaccine development. In some embodiments, the immunogenic complex described herein comprises one or more OPS, LPS, and/or exopolysaccharides.Pseudomonas. In some embodiments, the polysaccharides from the LPS are OPS. In some embodiments, the polysaccharides from the LPS are COPS.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс включает один или более полисахаридов Pseudomonas, которые представляют собой полисахариды, или их производные, из одного или более серотипов P. aeruginosa, выбранных из O1, O2, O3, O4, O5, O6, O7, O8, O9, O10, O11, O12, O13, O14, O15, O16, O17, O18, O19 и O20 (IATS). В некоторых вариантах осуществления иммунный комплекс включает один или более полисахаридов Pseudomonas, которые представляют собой полисахариды, или их производные, из одного или более серотипов P. aeruginosa, выбранных из O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10 и O11, или их сочетание. В некоторых вариантах осуществления иммунный комплекс включает полисахариды Pseudomonas, которые представляют собой полисахариды, или их производные, из каждого из серотипов P. aeruginosa, выбранных из O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10 и O11.In some embodiments, the immunogenic complex comprises one or more polysaccharidesPseudomonas, which are polysaccharides, or derivatives thereof, from one or more serotypesP. aeruginosaselected from O1, O2, O3, O4, O5, O6, O7, O8, O9, O10, O11, O12, O13, O14, O15, O16, O17, O18, O19 and O20 (IATS). In some embodiments, the immune complex comprises one or more polysaccharidesPseudomonas, which are polysaccharides, or derivatives thereof, from one or more serotypesP. aeruginosaselected from O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10 and O11, or a combination thereof. In some embodiments, the immune complex comprises polysaccharidesPseudomonas, which are polysaccharides, or their derivatives, from each of the serotypesP. aeruginosaselected from O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10 and O11.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс включает один или более полисахаридов Pseudomonas, которые представляют собой, или получены из, OPS. В некоторых вариантах осуществления OPS представляет собой OPS, или его производное, из Pseudomonas типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O7, O8, O9, O1O, O11, O12, O13, O14, O15, O16, O17, O18, O19 и O2O, или их сочетания. В некоторых вариантах осуществления OPS представляет собой OPS, или его производное, из Pseudomonas типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O1O, или O11, или их сочетания. В некоторых вариантах осуществления OPS представляет собой OPS, или его производное, из каждой из Pseudomonas типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O1O или O11.In some embodiments, the immunogenic complex comprises one or more Pseudomonas polysaccharides that are, or are derived from, OPS. In some embodiments, OPS is OPS, or a derivative thereof, from Pseudomonas type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O7, O8, O9, O1O, O11, O12, O13, O14, O15, O16, O17, O18, O19 and O2O, or combinations thereof. In some embodiments, OPS is OPS, or a derivative thereof, from Pseudomonas type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O1O, or O11, or combinations thereof. In some embodiments, OPS is OPS, or a derivative thereof, from each of Pseudomonas type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O1O, or O11.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс включает один или более полисахаридов Pseudomonas, которые представляют собой, или являются производными капсульного или подобного капсульному внеклеточного полисахарида. В некоторых вариантах осуществления капсульный или подобный капсульному полисахарид представляет собой полисахарид, или его производное, из альгината, Psl или Pel Pseudomonas.In some embodiments, the immunogenic complex comprises one or more Pseudomonas polysaccharides that are, or are derived from, a capsular or capsular-like extracellular polysaccharide. In some embodiments, the capsular or capsular-like polysaccharide is a polysaccharide, or a derivative thereof, from Pseudomonas alginate, Psl or Pel.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс включает один или более полисахаридов Pseudomonas, которые представляют собой, или получены из экзополисахарида. В некоторых вариантах осуществления экзополисахарид представляет собой, или получен из, PsL. В некоторых вариантах осуществления PsL содержит по меньшей мере один эпитоп, который связывает моноклональное антитело, содержащее последовательность SEQ ID NO: 4 и/или SEQ ID NO: 5. В некоторых вариантах осуществления моноклональное антитело, которое связывает по меньшей мере один эпитоп PsL, представляет собой, или содержит, полипептид, имеющий по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 4, или его PsL-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления моноклональное антитело, которое связывает по меньшей мере один эпитоп PsL, представляет собой, или содержит, полипептид, имеющий по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 5, или его PsL-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления моноклональное антитело, которое связывает по меньшей мере один эпитоп PsL, представляет собой, или содержит, полипептид, имеющий по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 4, или его PsL-связывающий фрагмент, и полипептид, имеющий по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 5, или его PsL-связывающий фрагмент.In some embodiments, the immunogenic complex comprises one or more Pseudomonas polysaccharides that are, or are derived from, an exopolysaccharide. In some embodiments, the exopolysaccharide is, or is derived from, PsL. In some embodiments, PsL contains at least one epitope that binds a monoclonal antibody comprising the sequence of SEQ ID NO: 4 and/or SEQ ID NO: 5. In some embodiments, a monoclonal antibody that binds at least one PsL epitope is is, or contains, a polypeptide having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% identity with the sequence of SEQ ID NO: 4, or its PsL-binding fragment. In some embodiments, a monoclonal antibody that binds at least one PsL epitope is, or contains, a polypeptide having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99 % identity with the sequence of SEQ ID NO: 5, or its PsL-binding fragment. In some embodiments, a monoclonal antibody that binds at least one PsL epitope is, or contains, a polypeptide having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99 % identity with the sequence of SEQ ID NO: 4, or a PsL-binding fragment thereof, and a polypeptide having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identity with the sequence SEQ ID NO: 5, or a PsL-binding fragment thereof.
Последовательность SEQ ID NO: 4 в PsL-связывающем мАт Cam-003Sequence of SEQ ID NO: 4 in PsL-binding mAb Cam-003
QVRLQQSGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSTSPYFWSWLRQPPGKGLEWIGYIHSNGGTNYNPSLKSRLTISGDTSKNQFSLNLSFVTAADTALYYCARTDYDVYGPAFDIWGQGTMVTVQVRLQQSGPGLVKPSETLSLTCTVSGGSTSPYFWSWLRQPPGKGLEWIGYIHSNGGTNYNPSLKSRLTISGDTSKNQFSLNLSFVTAADTALYYCARTDYDVYGPAFDIWGQGTMVTV
Последовательность SEQ ID NO: 5 в PsL-связывающем мАт Cam-003Sequence of SEQ ID NO: 5 in PsL-binding mAb Cam-003
SSELTQDPAVSVALGQTVRITCQGDSLRSYYASWYQQKPGQAPVLVIYGKNNRPSGIPDRFSGSSSGNTASLTITGAQAEDEADYYCNSRDSSGNHVVFGGGTKLTVLSSELTQDPAVSVALGQTVRITCQGDSLRSYYASWYQQKPGQAPVLVIYGKNNRPSGIPDRFSGSSSGNTASLTITGAQAEDEADYYCNSRDSSGNHVVFGGGTKLTVL
Полипептиды Pseudomonas aeruginosaPseudomonas aeruginosa polypeptides
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает один или более полипептидов P. aeruginosa. В некоторых вариантах осуществления полипептид P. aeruginosa представляет собой полипептид, или его производное, флагеллина подтипа A1 FliC P. aeruginosa, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид P. aeruginosa представляет собой, или содержит, полипептид с SEQ ID NO: 6, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид P. aeruginosa представляет собой, или содержит, полипептид, имеющий по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 6, или его иммуногенный фрагмент.In some embodiments, the implementation of the immunogenic complex described in the present invention includes one or more polypeptidesP. aeruginosa. In some embodiments, the polypeptideP. aeruginosa is a polypeptide, or derivative thereof, of flagellin subtype A1 FliCP. aeruginosa, or its immunogenic fragment. In some embodiments, the polypeptideP. aeruginosa is, or contains, a polypeptide of SEQ ID NO: 6, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the polypeptideP. aeruginosa is, or contains, a polypeptide having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% or 99% identity with the sequence of SEQ ID NO: 6, or an immunogenic fragment thereof.
SEQ ID NO: 6 флагеллина подтипа A1 FliC P. aeruginosa SEQ ID NO: 6 P. aeruginosa subtype A1 flagellins
MALTVNTNIASLNTQRNLNNSSASLNTSLQRLSTGSRINSAKDDAAGLQIANRLTSQVNGLNVATKNANDGISLAQTAEGALQQSTNILQRMRDLSLQSANGSNSDSERTALNGEVKQLQKELDRISNTTTFGGRKLLDGSFGVASFQVGSAANEIISVGIDEMSAESLNGTYFKADGGGAVTAATASGTVDIAIGITGGSAVNVKVDMKGNETAEQAAAKIAAAVNDANVGIGAFSDGDTISYVSKAGKDGSGAITSAVSGVVIADTGSTGVGTAAGVTPSATAFAKTNDTVAKIDISTAKGAQSAVLVIDEAIKQIDAQRADLGAVQNRFDNTINNLKNIGENVSAARGRIEDTDFAAETANLTKNQVLQQAGTAILAQANQLPQSVLSLLRMALTVNTNIASLNTQRNLNNSSASLNTSLQRLSTGSRINSAKDDAAGLQIANRLTSQVNGLNVATKNANDGISLAQTAEGALQQSTNILQRMRDLSLQSANGSNSDSERTALNGEVKQLQKELDRISNTTTFGGRKLLDGSFGVASFQVGSAANEIISVGIDEMSAESLNGTYFKADGGGAVTAATASGTVDIAIGITGGSAVNVKVDMKGNETAEQAAAKIAAAVNDANVGIGAFSDGDTISYVSKAGKDGSGAITSAVSGVVIADTGSTGVGTAAGVTPSATAFAKTNDTVAKIDISTAKGAQSAVLVIDEAIKQIDAQRADLGAVQNRFDNTINNLKNIGENVSAARGRIEDTDFAAETANLTKNQVLQQAGTAILAQANQLPQSVLSLLR
В некоторых вариантах осуществления полипептид P. aeruginosa представляет собой полипептид, или его производное, флагеллина подтипа B FliC P. aeruginosa, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид P. aeruginosa представляет собой, или содержит, полипептид с SEQ ID NO: 7, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид P. aeruginosa представляет собой, или содержит, полипептид, имеющий по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 7, или его иммуногенный фрагмент.In some embodiments, the P. aeruginosa polypeptide is a P. aeruginosa FliC subtype B flagellin polypeptide, or derivative thereof, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the P. aeruginosa polypeptide is, or contains, a polypeptide of SEQ ID NO: 7, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the P. aeruginosa polypeptide is, or contains, a polypeptide having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identity with the sequence of SEQ ID NO: 7, or an immunogenic fragment thereof.
SEQ ID NO: 7 флагеллина подтипа B FliC P. aeruginosa SEQ ID NO: 7 Flagellin subtype B FliC P. aeruginosa
MALTVNTNIASLNTQRNLNASSNDLNTSLQRLTTGYRINSAKDDAAGLQISNRLSNQISGLNVATRNANDGISLAQTAEGALQQSTNILQRIRDLALQSANGSNSDADRAALQKEVAAQQAELTRISDTTTFGGRKLLDGSFGTTSFQVGSNAYETIDISLQNASASAIGSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSGTGTQASQVFGNASAAQKSSVASVDISTADGAQNAIAVVDNALAAIDAQRADLGAVQNRFKNTIDNLTNISENATNARSRIKDTDFAAETAALSKNQVLQQAGTAILAQANQLPQAVLSLLRMALTVNTNIASLNTQRNLNASSNDLNTSLQRLTTGYRINSAKDDAAGLQISNRLSNQISGLNVATRNANDGISLAQTAEGALQQSTNILQRIRDLALQSANGSNSDADRAALQKEVAAQQAELTRISDTTTFGGRKLLDGSFGTTSFQVGSNAYETIDISLQNASASAIGSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSGTGTQASQVFGNASAAQKSSVASVDISTADGAQNAIAVVDNALAAIDAQRADLGAVQNRFKNTIDNLTNISENATNARSRIKDTDFAAETAALSKNQVLQQAGTAILAQANQLPQAVLSLLR
В некоторых вариантах осуществления полипептид P. aeruginosa представляет собой полипептид, или его производное, домена D2 флагеллина подтипа B FliC P. aeruginosa, лишенного TLR5-связывающего мотива, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид P. aeruginosa представляет собой, или содержит, полипептид с SEQ ID NO: 10, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид P. aeruginosa представляет собой, или содержит, полипептид, имеющий по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 10, или его иммуногенный фрагмент.In some embodiments, the P. aeruginosa polypeptide is a P. aeruginosa FliC subtype B flagellin D2 domain polypeptide, or a derivative thereof, lacking a TLR5 binding motif, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the P. aeruginosa polypeptide is, or contains, the polypeptide of SEQ ID NO: 10, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the P. aeruginosa polypeptide is, or contains, a polypeptide having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identity with the sequence of SEQ ID NO: 10, or an immunogenic fragment thereof.
SEQ ID NO: 10 домена D2 флагеллина подтипа B FliC P. aeruginosa, лишенного TLR5-связывающего мотиваSEQ ID NO: 10 P. aeruginosa FliC subtype B flagellin D2 domain lacking TLR5 binding motif
GSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSGTGTQASQVFGNASAAQKSSGSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSTGTQAAK
В некоторых вариантах осуществления полипептид P. aeruginosa представляет собой полипептид, или его производное, фактора вирулентности PcrV секреторной системы третьего типа (TTSS) P. aeruginosa, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид P. aeruginosa представляет собой, или содержит, полипептид с SEQ ID NO: 8, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид P. aeruginosa представляет собой, или содержит, полипептид, имеющий по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 8, или его иммуногенный фрагмент.In some embodiments , the P. aeruginosa polypeptide is a P. aeruginosa secretory system type III PcrV virulence factor (TTSS) virulence factor polypeptide, or derivative thereof, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the P. aeruginosa polypeptide is, or contains, a polypeptide of SEQ ID NO: 8, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the P. aeruginosa polypeptide is, or contains, a polypeptide having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identity with the sequence of SEQ ID NO: 8, or an immunogenic fragment thereof.
SEQ ID NO: 8 фактора вирулентности PcrV секреторной системы третьего типа (TTSS) P. aeruginosa SEQ ID NO: 8 PcrV Type III Secretory System (TTSS) Virulence Factor P. aeruginosa
MEVRNLNAARELFLDELLAASAAPASAEQEELLALLRSERIVLAHAGQPLSEAQVLKALAWLLAANPSAPPGQGLEVLREVLQARRQPGAQWDLREFLVSAYFSLHGRLDEDVIGVYKDVLQTQDGKRKALLDELKALTAELKVYSVIQSQINAALSAKQGIRIDAGGIDLVDPTLYGYAVGDPRWKDSPEYALLSNLDTFSGKLSIKDFLSGSPKQSGELKGLSDEYPFEKDNNPVGNFATTVSDRSRPLNDKVNEKTTLLNDTSSRYNSAVEALNRFIQKYDSVLRDILSAIMEVRNLNAARELFLDELLAASAAPASAEQEELLALLRSERIVLAHAGQPLSEAQVLKALAWLLAANPSAPPGQGLEVLREVLQARRQPGAQWDLREFLVSAYFSLHGRLDEDVIGVYKDVLQTQDGKRKALLDELKALTAELKVYSVIQSQINAALSAKQGIRIDAGGIDLVDPTLYGYAVGDPRWKDSPEYALLSNLDTFSGKLSIKDFLSGSPKQSGELKGLSDEYPFEKDNNPVGNFATTVSDRSRPLNDKVNEKTTLLNDTSSRYNSAVEALNRFIQKYDSVLRDILSAI
Escherichia coliEscherichia coli
Смертность в результате сепсиса, вызванного E. coli, составляет 20%-40% даже при оптимальной противомикробной терапии и поддерживающей терапии (Grandsen et al., 1990; Kreger et al., 1980; Rayner and Willcox, 1988; Bryan et al., 1983; Cross et al., 1983). Безусловно, существует потребность в новых профилактических и терапевтических подходах, включая дополнительное лечение антителами к этим и другим грамотрицательным бактериям. Хотя O-антиген-специфичные антитела защищают от инфекции, вызываемой гомологичными бактериальными штаммами, исследователи считают, что иммунотерапия такими антителами имеет ограниченную ценность ввиду разнообразия серотипов грамотрицательных бактерий (Baumgartner, 1990). Однако эпидемиологические исследования бактериальных серотипов, связанных с внекишечной инвазивной инфекцией E. coli, выявили, что ограниченное количество O-серогрупп являются причиной приблизительно 60% случаев бактериемии (Grandsen et al., 1990; Cross et al., 1984; McCabe et al., 1978). Соответственно, сохраняется потребность в эффективных технологиях профилактики и/или лечения таких инфекций.Mortality due to E. coli sepsis is 20%-40% even with optimal antimicrobial therapy and supportive care (Grandsen et al., 1990; Kreger et al., 1980; Rayner and Willcox, 1988; Bryan et al., 1983; Cross et al., 1983). Clearly, there is a need for new preventive and therapeutic approaches, including adjunctive treatment with antibodies to these and other Gram-negative bacteria. Although O-antigen-specific antibodies protect against infection by homologous bacterial strains, researchers believe that immunotherapy with such antibodies is of limited value due to the diversity of Gram-negative bacteria serotypes (Baumgartner, 1990). However, epidemiological studies of bacterial serotypes associated with extraintestinal invasive E. coli infection have found that a limited number of O-serogroups are responsible for approximately 60% of bacteremia cases (Grandsen et al., 1990; Cross et al., 1984; McCabe et al., 1978). Accordingly, there remains a need for effective technologies for the prevention and/or treatment of such infections.
Способы очистки полисахаридовMethods for purification of polysaccharides
В некоторых вариантах осуществления изобретение относится к способам очистки одного или более полисахаридов, описанных в настоящем изобретении, от одного или более клеточных компонентов бактерий. В некоторых вариантах осуществления способы включают очистку O-антигенного полисахарида от одного или более клеточных компонентов бактерий. В некоторых вариантах осуществления способы включают очистку CPS от одного или более клеточных компонентов бактерий.In some embodiments, the invention relates to methods for purifying one or more of the polysaccharides described herein from one or more bacterial cellular components. In some embodiments, the methods include purifying the O antigenic polysaccharide from one or more bacterial cellular components. In some embodiments, the methods include purifying the CPS from one or more bacterial cellular components.
В некоторых вариантах осуществления бактерии являются грамотрицательными. В некоторых вариантах осуществления бактерии представляют собой K. pneumoniae, P. aeruginosa и E. coli. In some embodiments, the bacteria are gram negative. In some embodiments, the bacteria representK. pneumoniae,P. aeruginosa AndE. coli.
В некоторых вариантах осуществления клеточные компоненты включают белок. В некоторых вариантах осуществления клеточные компоненты включают нуклеиновую кислоту. В некоторых вариантах осуществления клеточные компоненты включают липиды. В некоторых вариантах осуществления клеточные компоненты включают полисахариды. В некоторых вариантах осуществления клеточные компоненты являются частью лизата.In some embodiments, the cellular components include a protein. In some embodiments, the cellular components comprise a nucleic acid. In some embodiments, the cellular components include lipids. In some embodiments, the cellular components include polysaccharides. In some embodiments, the cellular components are part of the lysate.
В некоторых вариантах осуществления способ очистки полисахарида от одного или более клеточных компонентов бактерий включает создание контакта клеточных компонентов с окисляющим реагентом и кислотой, с получением смеси. В некоторых вариантах осуществления окисляющий реагент представляет собой нитрит натрия. В некоторых вариантах осуществления кислота представляет собой уксусную кислоту. В некоторых вариантах осуществления значение pH смеси составляет от приблизительно 3 до приблизительно 5. В некоторых вариантах осуществления способ включает отделение O-антигенного полисахарида от одного или более клеточных компонентов в смеси. В некоторых вариантах осуществления отделенный OPS содержит свободный альдегид на его восстанавливающем конце. В некоторых вариантах осуществления отделенный OPS содержит остаток 2,5-ангидроманнозы, содержащий свободный альдегид, на его восстанавливающем конце. В некоторых вариантах осуществления способ включает извлечение OPS, при этом извлеченный OPS является практически свободным от одного или более других клеточных компонентов. В некоторых вариантах осуществления извлеченный OPS содержит свободный альдегид на его восстанавливающем конце. В некоторых вариантах осуществления извлеченный OPS содержит остаток 2,5-ангидроманнозы, содержащий свободный альдегид, на его восстанавливающем конце.In some embodiments, a method for purifying a polysaccharide from one or more bacterial cellular components includes contacting the cellular components with an oxidizing agent and an acid to form a mixture. In some embodiments, the oxidizing agent is sodium nitrite. In some embodiments, the acid is acetic acid. In some embodiments, the pH of the mixture is from about 3 to about 5. In some embodiments, the method includes separating the O-antigenic polysaccharide from one or more cellular components in the mixture. In some embodiments, the separated OPS contains a free aldehyde at its reducing end. In some embodiments, the separated OPS contains a free aldehyde containing 2,5-anhydromannose moiety at its reducing end. In some embodiments, the method includes recovering OPS, wherein the recovered OPS is substantially free of one or more other cellular components. In some embodiments, the recovered OPS contains a free aldehyde at its reducing end. In some embodiments, the recovered OPS contains a free aldehyde containing 2,5-anhydromannose residue at its reducing end.
В некоторых вариантах осуществления способ очистки полисахарида от одного или более клеточных компонентов грамотрицательных бактерий включает создание контакта клеточных компонентов с кислотным реагентом, с получением смеси. В некоторых вариантах осуществления значение pH смеси составляет от приблизительно 3 до приблизительно 5. В некоторых вариантах осуществления способ включает нагревание смеси до температуры от приблизительно 80°C до приблизительно 135°C. В некоторых вариантах осуществления способ включает отделение корового и O-антигенного полисахарида (COPS) от одного или более клеточных компонентов в смеси. В некоторых вариантах осуществления отделенный COPS содержит KDO на его восстанавливающем конце. В некоторых вариантах осуществления отделенный COPS содержит кетон в KDO на его восстанавливающем конце. В некоторых вариантах осуществления способ включает извлечение COPS, при этом извлеченный COPS является практически свободным от одного или более других клеточных компонентов. В некоторых вариантах осуществления извлеченный COPS содержит кетон на его восстанавливающем конце.In some embodiments, a method for purifying a polysaccharide from one or more Gram-negative bacterial cellular components comprises contacting the cellular components with an acidic reagent to form a mixture. In some embodiments, the pH of the mixture is from about 3 to about 5. In some embodiments, the method includes heating the mixture to a temperature of from about 80°C to about 135°C. In some embodiments, the method includes separating the core and O antigenic polysaccharide (COPS) from one or more cellular components in the mixture. In some embodiments, the implementation of the separated COPS contains KDO at its recovery end. In some embodiments, the separated COPS contains a ketone in the KDO at its reducing end. In some embodiments, the method includes recovering COPS, wherein the recovered COPS is substantially free of one or more other cellular components. In some embodiments, the recovered COPS contains a ketone at its reducing end.
Пары аффинных молекулPairs of affine molecules
Как описано в настоящем изобретении, в некоторых вариантах осуществления иммунные комплексы по изобретению включают один или более полипептидов в не ковалентном комплексе с одним или более полимерами и/или одним или более антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидов образуют комплекс за счет аффинного взаимодействия с одним или более полимерами и/или одним или более антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления иммунные комплексы по изобретению включают один или более полипептидов в не ковалентном комплексе с одним или более полимерами и/или одним или более антигенными полисахаридами, образованном за счет одной или более пар аффинная молекула/комплементарная аффинная молекула. В некоторых вариантах осуществления иммунный комплекс включает (i) первую аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении, конъюгированную с одним или более полимерами и/или конъюгированную с одним или более антигенными полисахаридами, и (ii) слитый белок, который представляет собой, или содержит, комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении, и полипептид. При связывании первой аффинной молекулы и комплементарной аффинной молекулы один или более полипептидов образуют не ковалентный комплекс с одним или более полимерами и/или одним или более антигенными полисахаридами.As described herein, in some embodiments, the immune complexes of the invention comprise one or more polypeptides in a non-covalent complex with one or more polymers and/or one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, one or more polypeptides form a complex through affinity interaction with one or more polymers and/or one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, the immune complexes of the invention comprise one or more polypeptides in a non-covalent complex with one or more polymers and/or one or more antigenic polysaccharides formed by one or more affinity molecule/complementary affinity molecule pairs. In some embodiments, the immune complex comprises (i) a first affinity molecule described herein conjugated to one or more polymers and/or conjugated to one or more antigenic polysaccharides, and (ii) a fusion protein that is, or contains, a complementary affinity molecule described in the present invention, and a polypeptide. Upon binding of the first affinity molecule and the complementary affinity molecule, one or more polypeptides form a non-covalent complex with one or more polymers and/or one or more antigenic polysaccharides.
В некоторых вариантах осуществления пару аффинная молекула/комплементарная аффинная молекула выбирают из одного или более из: биотина/биотин-связывающего белка, антитела/антигена, фермента/субстрата, рецептора/лиганда, металла/металл-связывающего белка, углевод/углевод-связывающего белка, липида/липид-связывающего белка и His-метки/His-метку-связывающей молекулы.In some embodiments, the affinity molecule/complementary affinity molecule pair is selected from one or more of: biotin/biotin binding protein, antibody/antigen, enzyme/substrate, receptor/ligand, metal/metal binding protein, carbohydrate/carbohydrate binding protein , a lipid/lipid-binding protein, and a His-tag/His-tag-binding molecule.
В некоторых вариантах осуществления первая аффинная молекула представляет собой биотин (или его производное, или фрагмент), и комплементарная аффинная молекула представляет собой биотин-связывающий белок, или его биотин-связывающий домен. В некоторых вариантах осуществления биотин-связывающий белок представляет собой ризавидин, авидин, стрептавидин, брадавидин, тамавидин, лентиавидин, зебавидин, нейтравидин, каптавидин™, или их биотин-связывающие фрагменты, или их сочетание. В некоторых вариантах осуществления биотин-связывающий белок представляет собой ризавидин, или его биотин-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления биотин-связывающий белок содержит полипептид с SEQ ID NO: 13, или его биотин-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления биотин-связывающий белок содержит полипептид с SEQ ID NO: 14, или его биотин-связывающий фрагмент.In some embodiments, the first affinity molecule is biotin (or a derivative or fragment thereof) and the complementary affinity molecule is a biotin-binding protein, or a biotin-binding domain thereof. In some embodiments, the biotin-binding protein is rizavidin, avidin, streptavidin, bradavidin, tamavidin, lentiavidin, zebavidin, neutravidin, captavidin™, or biotin-binding fragments thereof, or a combination thereof. In some embodiments, the biotin-binding protein is rizavidin, or a biotin-binding fragment thereof. In some embodiments, the biotin-binding protein comprises a polypeptide of SEQ ID NO: 13, or a biotin-binding fragment thereof. In some embodiments, the biotin-binding protein comprises a polypeptide of SEQ ID NO: 14, or a biotin-binding fragment thereof.
Слитые белкиFusion proteins
В некоторых вариантах осуществления иммунный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает слитый белок, который представляет собой, или содержит, комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении, и один или более полипептидов, описанных в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления такие слитые белки имеют свойства носителя и/или антигенные свойства. В некоторых вариантах осуществления слитый белок представляет собой, или содержит, биотин-связывающий белок, или его биотин-связывающий домен, и полипептид.In some embodiments, the implementation of the immune complex described in the present invention includes a fusion protein that is, or contains, a complementary affinity molecule described in the present invention, and one or more polypeptides described in the present invention. In some embodiments, such fusion proteins have carrier properties and/or antigenic properties. In some embodiments, the fusion protein is, or contains, a biotin-binding protein, or a biotin-binding domain thereof, and a polypeptide.
В некоторых вариантах осуществления биотин-связывающий белок содержит полипептид с SEQ ID NO: 13, или его биотин-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид представляет собой, или содержит, полипептид, имеющий по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 13, или его биотин-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления биотин-связывающий белок содержит полипептид с SEQ ID NO: 14, или его биотин-связывающий фрагмент. В некоторых вариантах осуществления полипептид представляет собой, или содержит, полипептид, имеющий по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 14, или его биотин-связывающий фрагмент.In some embodiments, the biotin-binding protein comprises a polypeptide of SEQ ID NO: 13, or a biotin-binding fragment thereof. In some embodiments, the polypeptide is, or contains, a polypeptide having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identity with the sequence of SEQ ID NO: 13, or its biotin-binding fragment. In some embodiments, the biotin-binding protein comprises a polypeptide of SEQ ID NO: 14, or a biotin-binding fragment thereof. In some embodiments, the polypeptide is, or contains, a polypeptide having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identity with the sequence of SEQ ID NO: 14, or its biotin-binding fragment.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин-связывающий белок, описанный в настоящем изобретении), и один или более полипептидов, полученные из одного или более из K. pneumoniae, P. aeruginosa и E. coli. In some embodiments, the fusion protein comprises a complementary affinity molecule as described herein (e.g., a biotin binding protein as described herein) and one or more polypeptides derived from one or more of K. pneumoniae, P. aeruginosa, and E coli.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит один или более линкеров и/или гистидиновую метку. В некоторых вариантах осуществления линкер содержит полипептид, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 15 (GGGGSSS). В некоторых вариантах осуществления линкер содержит полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% или 99% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 15.In some embodiments, the fusion protein contains one or more linkers and/or a histidine tag. In some embodiments, the implementation of the linker contains a polypeptide containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 15 (GGGGSSS). In some embodiments, the linker contains a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, or 99% identity with the sequence of SEQ ID NO: 15.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин-связывающий белок, описанный в настоящем изобретении), и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 7 (флагеллин FlaB P. aeruginosa), или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин-связывающий белок, описанный в настоящем изобретении), и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 6 (флагеллин FlaA1 P. aeruginosa), или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин-связывающий белок, описанный в настоящем изобретении), и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 9 (флагеллин FlaA2 P. aeruginosa), или его иммуногенный фрагмент.In some embodiments, the fusion protein comprises a complementary affinity molecule as described herein (e.g., a biotin binding protein as described herein) and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 7 ( P. aeruginosa flagellin FlaB), or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the fusion protein comprises a complementary affinity molecule as described herein (e.g., a biotin binding protein as described herein) and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 6 ( P. aeruginosa flagellin FlaA1), or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the fusion protein comprises a complementary affinity molecule as described herein (e.g., a biotin binding protein as described herein) and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 9 ( P. aeruginosa flagellin FlaA2), or an immunogenic fragment thereof.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин-связывающий белок, описанный в настоящем изобретении), и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 10 (домен D2 флагеллина FlaB P. aeruginosa, лишенный TLR5-связывающего мотива), или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин-связывающий белок, описанный в настоящем изобретении), и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 11 (домен D2 флагеллина FlaA1 P. aeruginosa, лишенный TLR5-связывающего мотива), или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин-связывающий белок, описанный в настоящем изобретении), и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 12 (домен D2 флагеллина FlaA2 P. aeruginosa, лишенный TLR5-связывающего мотива), или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин-связывающий белок, описанный в настоящем изобретении), и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 8 (PcrV секреторной системы III типа (TTSS) P. aeruginosa), или его иммуногенный фрагмент.In some embodiments, the fusion protein comprises a complementary affinity molecule as described herein (e.g., a biotin binding protein as described herein) and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 10 ( P. aeruginosa FlaB flagellin D2 domain lacking a TLR5-binding motif), or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the fusion protein comprises a complementary affinity molecule as described herein (e.g., a biotin binding protein as described herein) and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 11 ( P. aeruginosa FlaA1 flagellin D2 domain lacking the TLR5-binding motif), or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the fusion protein comprises a complementary affinity molecule as described herein (e.g., a biotin binding protein as described herein) and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 12 ( P. aeruginosa FlaA2 flagellin D2 domain lacking a TLR5-binding motif), or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, the fusion protein comprises a complementary affinity molecule as described herein (e.g., a biotin binding protein as described herein) and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 8 (PcrV secretory system type III (TTSS) P. aeruginosa ), or its immunogenic fragment.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин-связывающий белок, описанный в настоящем изобретении), и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 7 (флагеллин подтипа B FliC P. aeruginosa), или его иммуногенный фрагмент, и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa), или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 23. В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин-связывающий белок, описанный в настоящем изобретении), и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 10 (домен D2 флагеллина подтипа B FliC P. aeruginosa, лишенный TLR5-связывающего мотива), или его иммуногенный фрагмент, и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa), или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 26.In some embodiments, the fusion protein comprises a complementary affinity molecule as described herein (e.g., a biotin binding protein as described herein) and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 7 ( P. aeruginosa FliC subtype B flagellin), or an immunogenic fragment thereof, and a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa ), or its immunogenic fragment. In some embodiments, the fusion protein comprises a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 23. In some embodiments, the fusion protein contains a complementary affinity molecule described in the present invention (for example, a biotin-binding protein described in the present invention), and a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90% , 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 10 ( P. aeruginosa FliC subtype B flagellin D2 domain lacking a TLR5 binding motif), or an immunogenic fragment thereof, and a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa ) , or its immunogenic fragment. In some embodiments, the fusion protein comprises a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 26.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин-связывающий белок, описанный в настоящем изобретении), и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 7 (флагеллин подтипа B FliC P. aeruginosa), или его иммуногенный фрагмент, и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 2 (консервативный MrkA K. pneumoniae), или его иммуногенный фрагмент.In some embodiments, the fusion protein comprises a complementary affinity molecule as described herein (e.g., a biotin binding protein as described herein) and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 7 ( P. aeruginosa FliC subtype B flagellin), or an immunogenic fragment thereof, and a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 2 ( K. pneumoniae conserved MrkA), or an immunogenic fragment thereof.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин-связывающий белок, описанный в настоящем изобретении), и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 10 (домен D2 флагеллина подтипа B FliC P. aeruginosa, лишенный TLR5-связывающего мотива), или его иммуногенный фрагмент, и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 3 (стабилизированный MrkA K. pneumoniae), или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит полипептид с SEQ ID NO: 24.In some embodiments, the fusion protein comprises a complementary affinity molecule as described herein (e.g., a biotin binding protein as described herein) and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity to SEQ ID NO: 10 ( P. aeruginosa FliC subtype B flagellin D2 domain lacking a TLR5 binding motif), or an immunogenic fragment thereof, and a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 3 (stabilized MrkA K. pneumoniae ), or its immunogenic fragment. In some embodiments, the fusion protein comprises the polypeptide of SEQ ID NO: 24.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит комплементарную аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин-связывающий белок, описанный в настоящем изобретении), и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa), или его иммуногенный фрагмент, и полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 3 (стабилизированный MrkA K. pneumoniae), или его иммуногенный фрагмент.In some embodiments, the fusion protein comprises a complementary affinity molecule as described herein (e.g., a biotin binding protein as described herein) and a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95 %, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 8 (PcrV P. aeruginosa ), or an immunogenic fragment thereof, and a polypeptide containing an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with SEQ ID NO: 3 ( K. pneumoniae stabilized MrkA), or an immunogenic fragment thereof.
Каркасные полимерыFramework polymers
Как описано в настоящем изобретении, в некоторых вариантах осуществления иммунные комплексы по изобретению включают каркасный полимер, включающий полимер, конъюгированный с одним или более антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой, или содержит, полисахарид, полипептид или синтетический дендример. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой, или содержит, поли-L-лизин (PLL). В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой, или содержит, линейный поли-L-лизин или дендример L-лизина. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой CPS, полученный из грамотрицательных или грамположительных бактерий. В некоторых вариантах осуществления CPS представляет собой CPS K. pneumoniae, экзополисахарид P. aeruginosa и/или CPS E. coli. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой CPS KP K19. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой дендример синтетического моносахарида или олигосахарида. В некоторых вариантах осуществления полимер имеет размер от приблизительно 50 КДа до приблизительно 2000 КДа. В некоторых вариантах осуществления полимер имеет антигенные свойства. В некоторых вариантах осуществления полимер не является антигенным. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой, или содержит, один или более антигенных полисахаридов. В некоторых вариантах осуществления один или более антигенных полисахаридов могут представлять собой OPS K. pneumoniae, OPS P. aeruginosa, или их сочетание.As described herein, in some embodiments, the immune complexes of the invention comprise a backbone polymer comprising a polymer conjugated to one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, the polymer is, or contains, a polysaccharide, a polypeptide, or a synthetic dendrimer. In some embodiments, the implementation of the polymer is, or contains, poly-L-lysine (PLL). In some embodiments, the implementation of the polymer is, or contains, linear poly-L-lysine or L-lysine dendrimer. In some embodiments, the polymer is a CPS derived from Gram-negative or Gram-positive bacteria. In some embodiments, the CPS is K. pneumoniae CPS, P. aeruginosa exopolysaccharide, and/or E. coli CPS. In some embodiments, the polymer is CPS KP K19. In some embodiments, the polymer is a synthetic monosaccharide or oligosaccharide dendrimer. In some embodiments, the implementation of the polymer has a size of from about 50 KD to about 2000 KD. In some embodiments, the implementation of the polymer has antigenic properties. In some embodiments, the implementation of the polymer is not antigenic. In some embodiments, the implementation of the polymer is, or contains, one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, the one or more antigenic polysaccharides may be K. pneumoniae OPS, P. aeruginosa OPS, or a combination thereof.
Каркасный полимер 1 (BP-1)Framework polymer 1 (BP-1)
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает каркасный полимер, включающий полимер, конъюгированный с одним или более антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер включает первую аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин), конъюгированную (например, сшитую или ковалентно связанную) с полимером. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой полисахарид. В некоторых вариантах осуществления антигенный полисахарид представляет собой O-антигенный полисахарид, коровый O-антиген или коровый полисахарид. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер включает по меньшей мере один полимер (например, полисахарид), который является биотинилированным, и по меньшей мере один антигенный полисахарид (например, по меньшей мере один O-антигенный полисахарид), который является не биотинилированным.In some embodiments, the implementation of the immunogenic complex described in the present invention includes a backbone polymer, including a polymer conjugated to one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, the backbone polymer comprises a first affinity molecule described herein (eg, biotin) conjugated (eg, cross-linked or covalently linked) to the polymer. In some embodiments, the implementation of the polymer is a polysaccharide. In some embodiments, the antigenic polysaccharide is an O antigenic polysaccharide, a core O antigen, or a core polysaccharide. In some embodiments, the framework polymer includes at least one polymer (eg, a polysaccharide) that is biotinylated and at least one antigenic polysaccharide (eg, at least one O-antigenic polysaccharide) that is not biotinylated.
В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер, который включает по меньшей мере один биотинилированный полимер (например, биотинилированный полисахарид) и по меньшей мере один не биотинилированный O-антигенный полисахарид, получают путем объединения не биотинилированного O-антигенного полисахарида, который содержит первичную аминогруппу (естественным образом или с линкером), с частично окисленным полисахаридом, содержащим альдегидную группу и биотин, содержащий первичный амин, с получением смеси; и восстановительного аминирования смеси восстанавливающим реагентом, для химического связывания O-антигенного полисахарида (то есть, антигенного полисахарида) с полисахаридом (то есть, полимером), за счет чего образуется каркасный полимер, который включает биотинилированный полисахарид, химически связанный с не биотинилированным антигенным полисахаридом (то есть, не биотинилированным O-антигенным полисахаридом).In some embodiments, a backbone polymer that includes at least one biotinylated polymer (e.g., a biotinylated polysaccharide) and at least one non-biotinylated O-antigenic polysaccharide is prepared by combining a non-biotinylated O-antigenic polysaccharide that contains a primary amino group (naturally or with a linker), with a partially oxidized polysaccharide containing an aldehyde group and biotin containing a primary amine, to obtain a mixture; and reductively aminating the mixture with a reducing agent to chemically bond the O-antigenic polysaccharide (i.e., antigenic polysaccharide) to the polysaccharide (i.e., polymer), thereby forming a backbone polymer that includes a biotinylated polysaccharide chemically bonded to a non-biotinylated antigenic polysaccharide ( i.e., non-biotinylated O-antigenic polysaccharide).
В некоторых вариантах осуществления O-антигенный полисахарид химически связан с частично окисленным полимером (например, полисахаридом) при помощи спейсера. В некоторых вариантах осуществления спейсер представляет собой короткий спейсер. В некоторых вариантах осуществления короткий спейсер содержит первичный амин на каждом конце спейсера. В некоторых вариантах осуществления спейсер может представлять собой дигидразид адипиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления полимер (например, полисахарид) является биотинилированным, и химически связанный O-антигенный полисахарид является не биотинилированным.In some embodiments, the O-antigenic polysaccharide is chemically bonded to a partially oxidized polymer (eg, polysaccharide) using a spacer. In some embodiments, the spacer is a short spacer. In some embodiments, the short spacer contains a primary amine at each end of the spacer. In some embodiments, the spacer may be adipic acid dihydrazide. In some embodiments, the polymer (eg, polysaccharide) is biotinylated and the chemically linked O-antigenic polysaccharide is not biotinylated.
В некоторых вариантах осуществления O-антигенный полисахарид содержит первичную аминогруппу. В некоторых вариантах осуществления первичная аминогруппа представляет собой α-аминогруппу L-аланина внешнего ядра O-полисахарида P. aeruginosa или аминогруппу, которая была введена в восстанавливающий конец O-антигенного полисахарида за счет химического связывания спейсерной молекулы, содержащей первичную группу на каждом конце, путем восстановительного аминирования восстанавливающим реагентом. В некоторых вариантах осуществления O-антигенный полисахарид, содержащий первичную аминогруппу, химически связывают путем смешивания O-антигенного полисахарида, содержащего первичную аминогруппу, с частично окисленным полимером (например, полисахаридом), содержащим альдегидную группу и биотин, содержащий первичный амин, с получением смеси; и восстановительного аминирования смеси восстанавливающим реагентом, с получением каркасного полимера, при этом полимер (например, полисахарид) является биотинилированным, но химически связанный O-антигенный полисахарид является не биотинилированным.In some embodiments, the implementation of the O-antigenic polysaccharide contains a primary amino group. In some embodiments, the primary amino group is the L-alanine α-amino group of the outer core of the P. aeruginosa O-polysaccharide, or an amino group that has been introduced into the reducing end of the O-antigenic polysaccharide by chemically linking a spacer molecule containing a primary group at each end by reductive amination with a reducing reagent. In some embodiments, an O-antigenic polysaccharide containing a primary amino group is chemically bonded by mixing an O-antigenic polysaccharide containing a primary amino group with a partially oxidized polymer (e.g., a polysaccharide) containing an aldehyde group and biotin containing a primary amine to form a mixture; and reductively aminating the mixture with a reducing agent to form a backbone polymer, wherein the polymer (eg, polysaccharide) is biotinylated but the chemically bound O-antigenic polysaccharide is not biotinylated.
В некоторых вариантах осуществления полимер (например, полисахарид) является частично окисленным окисляющим реагентом. В некоторых вариантах осуществления окисляющий реагент представляет собой периодат натрия. В некоторых вариантах осуществления восстанавливающий реагент включает цианоборогидрид натрия или борогидрид натрия.In some embodiments, the polymer (eg, polysaccharide) is a partially oxidized oxidizing agent. In some embodiments, the oxidizing agent is sodium periodate. In some embodiments, the reducing agent comprises sodium cyanoborohydride or sodium borohydride.
Каркасный полимер 1.2 (BP-1.2)Framework polymer 1.2 (BP-1.2)
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает каркасный полимер, включающий полимер, конъюгированный с одним или более антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер включает первую аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин), конъюгированную (например, сшитую или ковалентно связанную) с полимером. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой полисахарид. В некоторых вариантах осуществления антигенный полисахарид представляет собой O-антигенный полисахарид, коровый O-антиген или коровый полисахарид. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер включает по меньшей мере один полимер (например, полисахарид), который является биотинилированным, и по меньшей мере один антигенный полисахарид (например, по меньшей мере один O-антигенный полисахарид), который является не биотинилированным.In some embodiments, the implementation of the immunogenic complex described in the present invention includes a backbone polymer, including a polymer conjugated to one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, the backbone polymer comprises a first affinity molecule described herein (eg, biotin) conjugated (eg, cross-linked or covalently linked) to the polymer. In some embodiments, the implementation of the polymer is a polysaccharide. In some embodiments, the antigenic polysaccharide is an O antigenic polysaccharide, a core O antigen, or a core polysaccharide. In some embodiments, the framework polymer includes at least one polymer (eg, a polysaccharide) that is biotinylated and at least one antigenic polysaccharide (eg, at least one O-antigenic polysaccharide) that is not biotinylated.
В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер, который включает по меньшей мере один биотинилированный полимер (например, биотинилированный полисахарид) и по меньшей мере один не биотинилированный O-антигенный полисахарид, получают путем объединения не биотинилированного O-антигенного полисахарида, который содержит первичную аминогруппу (естественным образом или с линкером), с частично окисленным полисахаридом, содержащим одну или более альдегидных групп и один или более остатков биотина, введенных в ортогональный сайт путем проведения реакции с карбодиимидом (EDC) и N-гидроксисукцинимидом (NHS), и с использованием карбоксилатов остатков уроновой кислоты полисахарида, и восстановительного аминирования смеси восстанавливающим реагентом для химического связывания O-антигенного полисахарида (то есть, антигенного полисахарида) с полисахаридом (то есть, полимером), за счет чего образуется каркасный полимер, который включает биотинилированный полисахарид, химически связанный с не биотинилированным антигенным полисахаридом (то есть, не биотинилированным O-антигенным полисахаридом). В некоторых вариантах осуществления O-антигенный полисахарид химически связан с частично окисленным полимером (например, полисахаридом) при помощи спейсера. В некоторых вариантах осуществления спейсер представляет собой короткий спейсер. В некоторых вариантах осуществления короткий спейсер содержит первичный амин на каждом конце спейсера. В некоторых вариантах осуществления спейсер может представлять собой дигидразид адипиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления полимер (например, полисахарид) является биотинилированным, и химически связанный O-антигенный полисахарид является не биотинилированным.In some embodiments, a backbone polymer that includes at least one biotinylated polymer (e.g., a biotinylated polysaccharide) and at least one non-biotinylated O-antigenic polysaccharide is prepared by combining a non-biotinylated O-antigenic polysaccharide that contains a primary amino group (naturally or with a linker), with a partially oxidized polysaccharide containing one or more aldehyde groups and one or more biotin residues introduced into the orthogonal site by reaction with carbodiimide (EDC) and N-hydroxysuccinimide (NHS), and using carboxylates of uronic acid residues polysaccharide, and reductively aminating the mixture with a reducing reagent to chemically link the O-antigenic polysaccharide (i.e., antigenic polysaccharide) with the polysaccharide (i.e., polymer), thereby forming a backbone polymer that includes a biotinylated polysaccharide chemically associated with non-bio tinylated antigenic polysaccharide (i.e., non-biotinylated O-antigenic polysaccharide). In some embodiments, the O-antigenic polysaccharide is chemically bonded to a partially oxidized polymer (eg, polysaccharide) using a spacer. In some embodiments, the spacer is a short spacer. In some embodiments, the short spacer contains a primary amine at each end of the spacer. In some embodiments, the spacer may be adipic acid dihydrazide. In some embodiments, the polymer (eg, polysaccharide) is biotinylated and the chemically linked O-antigenic polysaccharide is not biotinylated.
В некоторых вариантах осуществления O-антигенный полисахарид содержит первичную аминогруппу. В некоторых вариантах осуществления первичная аминогруппа представляет собой α-аминогруппу L-аланина внешнего ядра O-полисахарида P. aeruginosa или аминогруппу, которая была введена в восстанавливающий конец O-антигенного полисахарида за счет химического связывания спейсерной молекулы, содержащей первичную группу на каждом конце, путем восстановительного аминирования восстанавливающим реагентом. В некоторых вариантах осуществления O-антигенный полисахарид, содержащий первичную аминогруппу, химически связывают путем смешивания O-антигенного полисахарида, содержащего первичную аминогруппу, с частично окисленным полимером (например, полисахаридом), содержащим альдегидную группу и биотин, содержащий первичный амин, с получением смеси; и восстановительного аминирования смеси восстанавливающим реагентом, с получением каркасного полимера, при этом полимер (например, полисахарид) является биотинилированным, но химически связанный O-антигенный полисахарид является не биотинилированным.In some embodiments, the implementation of the O-antigenic polysaccharide contains a primary amino group. In some embodiments, the primary amino group is the L-alanine α-amino group of the outer core of the P. aeruginosa O-polysaccharide, or an amino group that has been introduced into the reducing end of the O-antigenic polysaccharide by chemically linking a spacer molecule containing a primary group at each end by reductive amination with a reducing reagent. In some embodiments, an O-antigenic polysaccharide containing a primary amino group is chemically bonded by mixing an O-antigenic polysaccharide containing a primary amino group with a partially oxidized polymer (e.g., a polysaccharide) containing an aldehyde group and biotin containing a primary amine to form a mixture; and reductively aminating the mixture with a reducing agent to form a backbone polymer, wherein the polymer (eg, polysaccharide) is biotinylated but the chemically bound O-antigenic polysaccharide is not biotinylated.
В некоторых вариантах осуществления полимер (например, полисахарид) является частично окисленным окисляющим реагентом. В некоторых вариантах осуществления окисляющий реагент включает периодат натрия. В некоторых вариантах осуществления восстанавливающий реагент включает цианоборогидрид натрия или борогидрид натрия.In some embodiments, the polymer (eg, polysaccharide) is a partially oxidized oxidizing agent. In some embodiments, the oxidizing agent comprises sodium periodate. In some embodiments, the reducing agent comprises sodium cyanoborohydride or sodium borohydride.
В некоторых вариантах осуществления OPS, содержащий альдегид или кетон, аминируют на его восстанавливающем конце, с использованием короткого спейсера, содержащего первичный амин на каждом конце (например, дигидразид адипиновой кислоты ADH), путем восстановительного аминирования цианоборогидридом натрия (NaBH3CN), с получением дериватизированного гидразидом OPS. В некоторых вариантах осуществления каркас CPS KP19 биотинилируют одним или более остатками биотина, введенными в ортогональный сайт путем проведения реакции карбоксилатов остатков уроновой кислоты полисахарида с карбодиимидом (EDC), N-гидроксисукцинимидом (NHS) и производным биотина, содержащим первичный амин (таким как, например, амин-ПЭГ3-биотин). В некоторых вариантах осуществления биотинилированный полимер CPS KP 19 затем частично окисляют периодатом, получая одну или более альдегидных групп, смешивают с дериватизированным гидразидом OPS и проводят восстановительное аминирование смеси восстанавливающим реагентом, таким как цианоборогидрид натрия (NaBH3CN), с получением каркасного полимера BP-1.2, содержащего один или более фрагментов биотина на остатках уроновой кислоты полимерного каркаса и без биотина на O-антигенном полисахариде.In some embodiments, an OPS containing an aldehyde or ketone is aminated at its reducing end, using a short spacer containing a primary amine at each end (e.g., adipic acid dihydrazide ADH), by reductive amination with sodium cyanoborohydride (NaBH3CN), to produce a hydrazide-derivatized OPS. In some embodiments, the KP19 CPS backbone is biotinylated with one or more biotin residues introduced into the orthogonal site by reacting carboxylates of polysaccharide uronic acid residues with carbodiimide (EDC), N-hydroxysuccinimide (NHS), and a biotin derivative containing a primary amine (such as, for example, , amine-PEG3-biotin). In some embodiments, the biotinylated CPS KP 19 polymer is then partially oxidized with periodate to give one or more aldehyde groups, mixed with derivatized OPS hydrazide, and reductively aminated with a reducing agent such as sodium cyanoborohydride (NaBH3CN) to form a BP-1.2 backbone polymer, containing one or more biotin fragments on the uronic acid residues of the polymer backbone and without biotin on the O-antigenic polysaccharide.
Каркасный полимер 1.3 (BP-1.3)Framework polymer 1.3 (BP-1.3)
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает каркасный полимер, включающий полимер, конъюгированный с одним или более антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер включает первую аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин), конъюгированную (например, сшитую или ковалентно связанную) с полимером. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой полисахарид. В некоторых вариантах осуществления антигенный полисахарид представляет собой O-антигенный полисахарид, коровый O-антиген или коровый полисахарид. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер включает по меньшей мере один полимер (например, полисахарид), который является биотинилированным, и по меньшей мере один антигенный полисахарид (например, по меньшей мере один O-антигенный полисахарид), который является не биотинилированным.In some embodiments, the implementation of the immunogenic complex described in the present invention includes a backbone polymer, including a polymer conjugated to one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, the backbone polymer comprises a first affinity molecule described herein (eg, biotin) conjugated (eg, cross-linked or covalently linked) to the polymer. In some embodiments, the implementation of the polymer is a polysaccharide. In some embodiments, the antigenic polysaccharide is an O antigenic polysaccharide, a core O antigen, or a core polysaccharide. In some embodiments, the framework polymer includes at least one polymer (eg, a polysaccharide) that is biotinylated and at least one antigenic polysaccharide (eg, at least one O-antigenic polysaccharide) that is not biotinylated.
В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер, который включает по меньшей мере один биотинилированный полимер (например, биотинилированный полисахарид) и по меньшей мере один не биотинилированный O-антигенный полисахарид, получают путем объединения не биотинилированного O-антигенного полисахарида, который содержит первичную аминогруппу (естественным образом или с линкером), с CDAP-активированным полисахаридом с одним или более остатками биотина, введенными в ортогональный сайт путем проведения реакции с карбодиимидом (EDC) и N-гидроксисукцинимидом (NHS), и с использованием карбоксилатов остатков уроновой кислоты полисахарида, с получением каркасного полимера, который включает биотинилированный полисахарид, химически связанный с не биотинилированным антигенным полисахаридом (то есть, не биотинилированным O-антигенным полисахаридом). В некоторых вариантах осуществления O-антигенный полисахарид химически связан с CDAP-активированным полимером (например, полисахаридом) при помощи спейсера. В некоторых вариантах осуществления спейсер представляет собой короткий спейсер. В некоторых вариантах осуществления короткий спейсер содержит первичный амин на каждом конце спейсера. В некоторых вариантах осуществления спейсер может представлять собой дигидразид адипиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления полимер (например, полисахарид) является биотинилированным, и химически связанный O-антигенный полисахарид является не биотинилированным.In some embodiments, a backbone polymer that includes at least one biotinylated polymer (e.g., a biotinylated polysaccharide) and at least one non-biotinylated O-antigenic polysaccharide is prepared by combining a non-biotinylated O-antigenic polysaccharide that contains a primary amino group (naturally or with a linker), with a CDAP-activated polysaccharide with one or more biotin residues introduced into the orthogonal site by reaction with carbodiimide (EDC) and N-hydroxysuccinimide (NHS), and using carboxylates of polysaccharide uronic acid residues, to form a backbone polymer , which includes a biotinylated polysaccharide chemically linked to a non-biotinylated antigenic polysaccharide (i.e., a non-biotinylated O-antigenic polysaccharide). In some embodiments, the O-antigenic polysaccharide is chemically bonded to a CDAP-activated polymer (eg, polysaccharide) using a spacer. In some embodiments, the spacer is a short spacer. In some embodiments, the short spacer contains a primary amine at each end of the spacer. In some embodiments, the spacer may be adipic acid dihydrazide. In some embodiments, the polymer (eg, polysaccharide) is biotinylated and the chemically linked O-antigenic polysaccharide is not biotinylated.
В некоторых вариантах осуществления OPS, содержащий альдегид или кетон, аминируют на его восстанавливающем конце, с использованием короткого спейсера, содержащего первичный амин на каждом конце (например, дигидразид адипиновой кислоты ADH), путем восстановительного аминирования цианоборогидридом натрия (NaBH3CN), с получением дериватизированного гидразидом OPS. В некоторых вариантах осуществления каркас CPS KP19 биотинилируют одним или более остатками биотина, введенными в ортогональный сайт путем проведения реакции карбоксилатов остатков уроновой кислоты полисахарида с карбодиимидом (EDC), N-гидроксисукцинимидом (NHS) и производным биотина, содержащим первичный амин (таким как, например, амин-ПЭГ3-биотин). В некоторых вариантах осуществления биотинилированный полимер CPS KP 19 затем активируют CDAP, смешивают с дериватизированным гидразидом OPS, с получением каркасного полимера BP-1.3, содержащего один или более фрагментов биотина на остатках уроновой кислоты полимерного каркаса, и без биотина на O-антигенном полисахариде.In some embodiments, an OPS containing an aldehyde or ketone is aminated at its reducing end, using a short spacer containing a primary amine at each end (e.g., adipic acid dihydrazide ADH), by reductive amination with sodium cyanoborohydride (NaBH3CN), to produce a hydrazide-derivatized OPS. In some embodiments, the KP19 CPS backbone is biotinylated with one or more biotin residues introduced into the orthogonal site by reacting carboxylates of polysaccharide uronic acid residues with carbodiimide (EDC), N-hydroxysuccinimide (NHS), and a biotin derivative containing a primary amine (such as, for example, , amine-PEG3-biotin). In some embodiments, the biotinylated CPS KP 19 polymer is then activated with CDAP, mixed with derivatized OPS hydrazide, to form a BP-1.3 backbone polymer containing one or more biotin moieties on the backbone uronic acid residues, and no biotin on the O-antigenic polysaccharide.
Каркасный полимер 2a (BP-2a)
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает каркасный полимер, включающий полимер, конъюгированный с одним или более антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер включает первую аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин), конъюгированную (например, сшитую или ковалентно связанную) с полимером, и включает первую аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин), конъюгированную (например, сшитую или ковалентно связанную) с одним или более антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой полисахарид. В некоторых вариантах осуществления антигенный полисахарид представляет собой O-антигенный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер включает по меньшей мере один полимер (например, полисахарид), который является биотинилированным, и по меньшей мере один O-антигенный полисахарид, который является биотинилированным.In some embodiments, the implementation of the immunogenic complex described in the present invention includes a backbone polymer, including a polymer conjugated to one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, the backbone polymer comprises a first affinity molecule described herein (e.g., biotin) conjugated (e.g., crosslinked or covalently linked) to a polymer, and includes a first affinity molecule described herein (e.g., biotin) conjugated (eg, cross-linked or covalently linked) to one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, the implementation of the polymer is a polysaccharide. In some embodiments, the antigenic polysaccharide is an O-antigenic polysaccharide. In some embodiments, the backbone polymer includes at least one polymer (eg, polysaccharide) that is biotinylated and at least one O-antigenic polysaccharide that is biotinylated.
В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер, который включает по меньшей мере один биотинилированный полимер (например, биотинилированный полисахарид) и по меньшей мере один биотинилированный O-антигенный полисахарид, получают путем объединения O-антигенного полисахарида с частично окисленным полимером (например, полисахаридом), содержащим альдегидную группу, с получением смеси; и восстановительного аминирования смеси восстанавливающим реагентом для химического связывания O-антигенного полисахарида с полимером (например, полисахаридом), с получением каркасного полимера, который включает O-антигенный полисахарид и полимер (например, полисахарид); а также дериватизации каркасного полимера при помощи CDAP или другого цианилирующего реагента (например, CNBr) и биотина, содержащего первичный амин, с получением каркасного полимера, который включает биотинилированный полимер (например, биотинилированный полисахарид), химически связанный с биотинилированным O-антигеном и полимерным полисахаридом.In some embodiments, a backbone polymer that includes at least one biotinylated polymer (e.g., biotinylated polysaccharide) and at least one biotinylated O-antigenic polysaccharide is prepared by combining an O-antigenic polysaccharide with a partially oxidized polymer (e.g., polysaccharide) containing an aldehyde group to give a mixture; and reductively aminating the mixture with a reducing reagent for chemically bonding the O-antigenic polysaccharide to a polymer (eg, polysaccharide) to form a backbone polymer that includes the O-antigenic polysaccharide and the polymer (eg, polysaccharide); as well as derivatizing the backbone polymer with CDAP or another cyanylating reagent (e.g., CNBr) and biotin containing a primary amine to form a backbone polymer that includes a biotinylated polymer (e.g., a biotinylated polysaccharide) chemically bonded to a biotinylated O-antigen and a polymeric polysaccharide. .
В некоторых вариантах осуществления O-антигенный полисахарид химически связан с частично окисленным полисахаридным каркасом при помощи спейсера. В некоторых вариантах осуществления спейсер представляет собой короткий спейсер. В некоторых вариантах осуществления короткий спейсер содержит первичный амин на каждом конце спейсера. В некоторых вариантах осуществления спейсер может представлять собой дигидразид адипиновой кислоты.In some embodiments, the O-antigenic polysaccharide is chemically bonded to the partially oxidized polysaccharide backbone using a spacer. In some embodiments, the spacer is a short spacer. In some embodiments, the short spacer contains a primary amine at each end of the spacer. In some embodiments, the spacer may be adipic acid dihydrazide.
В некоторых вариантах осуществления O-антигенный полисахарид содержит первичную аминогруппу. В некоторых вариантах осуществления первичная аминогруппа представляет собой α-аминогруппу L-аланина внешнего ядра O-полисахарида P. aeruginosa или аминогруппу, которая была введена в восстанавливающий конец O-антигенного полисахарида за счет химического связывания короткой спейсерной молекулы, содержащей первичную группу на каждом конце, путем восстановительного аминирования восстанавливающим реагентом.In some embodiments, the implementation of the O-antigenic polysaccharide contains a primary amino group. In some embodiments, the primary amino group is the L-alanine α-amino group of the outer core of the P. aeruginosa O-polysaccharide, or an amino group that has been introduced into the reducing end of the O-antigenic polysaccharide by chemical bonding of a short spacer molecule containing a primary group at each end, by reductive amination with a reducing reagent.
В некоторых вариантах осуществления полимер (например, полисахарид) является частично окисленным окисляющим реагентом. В некоторых вариантах осуществления окисляющий реагент включает периодат натрия. В некоторых вариантах осуществления восстанавливающий реагент включает цианоборогидрид натрия или борогидрид натрия.In some embodiments, the polymer (eg, polysaccharide) is a partially oxidized oxidizing agent. In some embodiments, the oxidizing agent comprises sodium periodate. In some embodiments, the reducing agent comprises sodium cyanoborohydride or sodium borohydride.
Каркасный полимер 2b (BP-2b)
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает каркасный полимер, включающий полимер, конъюгированный с одним или более антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер включает первую аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин), конъюгированную (например, сшитую или ковалентно связанную) с антигенным полисахаридом. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой полисахарид. В некоторых вариантах осуществления антигенный полисахарид представляет собой O-антигенный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер включает по меньшей мере один полимер (например, полисахарид), который является не биотинилированным, и по меньшей мере один биотинилированный O-антигенный полисахарид.In some embodiments, the implementation of the immunogenic complex described in the present invention includes a backbone polymer, including a polymer conjugated to one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, the backbone polymer comprises a first affinity molecule described herein (eg, biotin) conjugated (eg, cross-linked or covalently linked) to an antigenic polysaccharide. In some embodiments, the implementation of the polymer is a polysaccharide. In some embodiments, the antigenic polysaccharide is an O-antigenic polysaccharide. In some embodiments, the backbone polymer includes at least one polymer (eg, polysaccharide) that is not biotinylated and at least one biotinylated O-antigenic polysaccharide.
В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер, который включает по меньшей мере один не биотинилированный полимер (например, не биотинилированный полисахарид) и по меньшей мере один биотинилированный O-антигенный полисахарид, получают путем биотинилирования O-антигенного полисахарида, содержащего O-полисахаридные повторы и один или более коровых альфа-KDO и/или гептозных фрагментов, при помощи CDAP и биотина, содержащего первичный амин, с получением смеси биотинилированного O-антигенного полисахарида; частичного окисления смеси биотинилированного OPS периодатом натрия для введения альдегидов в коровые KDO и/или гептозные фрагменты и/или остатки OPS; восстановительного аминирования биотинилированного полисахарида дигидразидом адипиновой кислоты; смешивания биотинилированного и аминированного OPS с частично окисленным полимером (например, полисахаридом), с получением смеси; и восстановительного аминирования смеси; с получением каркасного полимера, который включает полимер (например, полисахарид), который является не биотинилированным, и химически связанный O-антигенный полисахарид, который является биотинилированным.In some embodiments, a backbone polymer that includes at least one non-biotinylated polymer (e.g., a non-biotinylated polysaccharide) and at least one biotinylated O-antigenic polysaccharide is produced by biotinylation of an O-antigenic polysaccharide containing O-polysaccharide repeats and one or more core alpha-KDO and/or heptose fragments, using CDAP and biotin containing a primary amine, to obtain a mixture of biotinylated O-antigenic polysaccharide; partially oxidizing the biotinylated OPS mixture with sodium periodate to introduce aldehydes into core KDO and/or heptose fragments and/or OPS residues; reductive amination of the biotinylated polysaccharide with adipic acid dihydrazide; mixing biotinylated and aminated OPS with a partially oxidized polymer (eg, polysaccharide) to form a mixture; and reductive amination of the mixture; to provide a backbone polymer that includes a polymer (eg, polysaccharide) that is not biotinylated and a chemically linked O-antigenic polysaccharide that is biotinylated.
В некоторых вариантах осуществления O-антигенный полисахарид является частично окисленным окисляющим реагентом. В некоторых вариантах осуществления окисляющий реагент включает периодат натрия. В некоторых вариантах осуществления восстанавливающий реагент включает цианоборогидрид натрия или борогидрид натрия.In some embodiments, the O-antigenic polysaccharide is a partially oxidized oxidizing agent. In some embodiments, the oxidizing agent comprises sodium periodate. In some embodiments, the reducing agent comprises sodium cyanoborohydride or sodium borohydride.
Каркасный полимер 3 (BP-3)Framework Polymer 3 (BP-3)
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, включает каркасный полимер, включающий полимер, конъюгированный с одним или более антигенными полисахаридами. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер включает первую аффинную молекулу, описанную в настоящем изобретении (например, биотин), конъюгированную (например, сшитую или ковалентно связанную) с антигенным полисахаридом. В некоторых вариантах осуществления полимер представляет собой полимер поли-L-лизин (PLL). В некоторых вариантах осуществления антигенный полисахарид представляет собой O-антигенный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер включает по меньшей мере один биотинилированный O-антигенный полисахарид и полимер PLL.In some embodiments, the implementation of the immunogenic complex described in the present invention includes a backbone polymer, including a polymer conjugated to one or more antigenic polysaccharides. In some embodiments, the backbone polymer comprises a first affinity molecule described herein (eg, biotin) conjugated (eg, cross-linked or covalently linked) to an antigenic polysaccharide. In some embodiments, the polymer is a poly-L-lysine (PLL) polymer. In some embodiments, the antigenic polysaccharide is an O-antigenic polysaccharide. In some embodiments, the backbone polymer comprises at least one biotinylated O-antigenic polysaccharide and a PLL polymer.
В некоторых вариантах осуществления каркасный полимер, который включает по меньшей мере один не биотинилированный полимер (например, не биотинилированный полимер PLL) и по меньшей мере один биотинилированный O-антигенный полисахарид, получают путем восстановительного аминирования O-антигенного полисахарида, содержащего концевые альдегиды или KDO, с ε-NH2 группами полимера PLL, с получением полимера OPS-PLL; обработки, или не обработки, смеси ацилирующим реагентом для блокирования непрореагировавших ε-NH2 групп полимера PLL; дериватизации OPS при помощи CDAP, с получением смеси производных; и проведения реакции смеси производных с биотином, содержащим первичный амин; с получением каркасного полимера, при этом блокированный полимер N-ацетилированный-PLL или неблокированный PLL является не биотинилированным, и химически связанный O-антигенный полисахарид является биотинилированным.In some embodiments, a backbone polymer that includes at least one non-biotinylated polymer (e.g., a non-biotinylated PLL polymer) and at least one biotinylated O-antigenic polysaccharide is obtained by reductive amination of an O-antigenic polysaccharide containing terminal aldehydes or KDOs, with ε-NH 2 groups of the PLL polymer to form an OPS-PLL polymer; treating, or not treating, the mixture with an acylating agent to block unreacted ε-NH 2 groups of the PLL polymer; derivatizing OPS with CDAP to give a mixture of derivatives; and carrying out the reaction of a mixture of derivatives with biotin containing a primary amine; to form a backbone polymer, wherein the blocked N-acetylated-PLL or non-blocked PLL polymer is not biotinylated and the chemically bound O-antigenic polysaccharide is biotinylated.
В некоторых вариантах осуществления ацилирующий реагент представляет собой уксусный ангидрид или ацетилхлорид.In some embodiments, the acylating agent is acetic anhydride or acetyl chloride.
В некоторых вариантах осуществления реакцию «клик-химии» используют для связывания полимера (например, полисахарида), имеющего алкиновую функциональную группу на его карбоксилатных группах, с окисленными полисахаридными альдегидами на O-антигенном полисахариде, дериватизированном азидогруппой на его восстанавливающем конце. Связывание реакцией клик-химии 2 полисахаридов проводят с катализатором в водной среде. Связывание реакцией клик-химии O-антигенного полисахарида с полисахаридом можно использовать в обратимых вариантах, либо с азидогруппой, присоединенной к OPS и алкиновой группой, присоединенной к полисахариду, либо наоборот. Биотинирование можно проводить с использованием такой химии избирательно либо на полисахариде, с получением каркасного полимера 1, либо на O-антигенном полисахариде, с получением каркасного полимера 2b.In some embodiments, a click chemistry reaction is used to couple a polymer (e.g., a polysaccharide) having an alkyne functional group on its carboxylate groups to oxidized polysaccharide aldehydes on an O-antigenic polysaccharide derivatized with an azido group at its reducing end. The click-chemistry coupling of the 2 polysaccharides is carried out with a catalyst in an aqueous medium. Click chemistry coupling of the O-antigenic polysaccharide to the polysaccharide can be used in reversible ways, either with an azido group attached to the OPS and an alkyne group attached to the polysaccharide, or vice versa. Biotination can be carried out using such chemistry selectively either on the polysaccharide to form
В некоторых вариантах осуществления катализатором для алкин-азидного циклоприсоединения является сульфат меди. В некоторых вариантах осуществления алкиновую группу для дериватизации полисахарида выбирают из группы, состоящей из 1-амино-3-бутина, 1-амино-4-пентина, DBCO-амина и алкин-ПЭГ4-амина.In some embodiments, the catalyst for the alkyne azide cycloaddition is copper sulfate. In some embodiments, the alkyne group for derivatization of the polysaccharide is selected from the group consisting of 1-amino-3-butyne, 1-amino-4-pentine, DBCO-amine, and alkyne-PEG4-amine.
В некоторых вариантах осуществления азидную группу для дериватизации O-антигенного полисахарида на его восстанавливающем конце выбирают из группы, состоящей из амино-ПЭГ-азида, азидо-ПЭГ3-амина, азидопропиламина и азидобутиламина.In some embodiments, the azide group for derivatization of the O-antigenic polysaccharide at its reducing end is selected from the group consisting of amino-PEG-azide, azido-PEG3-amine, azidopropylamine, and azidobutylamine.
Применение иммуногенных комплексовThe use of immunogenic complexes
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, который включает один или более антигенных полисахаридов, характеризуется тем, что одно или более из потенциальной возможности опсонизации или иммуногенности одного или более антигенных полисахаридов увеличивается относительно ранее определенного уровня, при измерении методом ELISA и/или в функциональном анализе антител. В некоторых вариантах осуществления одно или более из потенциальной возможности опсонизации или иммуногенности одного или более антигенных полисахаридов увеличивается по меньшей мере в 1 раз, 2 раза, 3 раза, 4 раза или 5 раз относительно ранее определенного уровня, при измерении методом ELISA и/или в функциональном анализе антител. В некоторых вариантах осуществления ранее определенный уровень представляет собой преиммунный уровень. В некоторых вариантах осуществления эпитопная валентность одного или более антигенных полисахаридов превышает по меньшей мере в 1 раз, 2 раза, 3 раза, 4 раза или 5 раз таковую у нативного полисахарида. В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидных антигенов представляют собой белки-носители для одного или более антигенных полисахаридов.In some embodiments, the immunogenic complex described herein, which includes one or more antigenic polysaccharides, is characterized in that one or more of the potential for opsonization or immunogenicity of one or more antigenic polysaccharides is increased from a previously determined level, as measured by ELISA and/ or in a functional antibody assay. In some embodiments, one or more of the potential for opsonization or immunogenicity of one or more antigenic polysaccharides is increased by at least 1-fold, 2-fold, 3-fold, 4-fold, or 5-fold relative to a previously determined level, as measured by ELISA and/or functional analysis of antibodies. In some embodiments, the previously determined level is the pre-immune level. In some embodiments, the epitope valency of one or more antigenic polysaccharides is at least 1-fold, 2-fold, 3-fold, 4-fold, or 5-fold that of the native polysaccharide. In some embodiments, one or more polypeptide antigens are carrier proteins for one or more antigenic polysaccharides.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, после введения пациенту вызывает продуцирование антител против одного или более патогенов у пациента на уровне, превышающем уровень в случае композиции, содержащей только антигенный полисахарид, и не содержащий каркасный полимер, при измерении методом ELISA. В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, после введения пациенту вызывает продуцирование антител против одного или более патогенов у пациента на уровне, превышающем уровень в случае композиции, содержащей только каркасный полимер, и не содержащей антигенный полисахарид, при измерении методом ELISA.In some embodiments, the immunogenic complex of the present invention, upon administration to a patient, induces the production of antibodies against one or more pathogens in the patient at a level higher than that of a composition containing only the antigenic polysaccharide and no backbone polymer, as measured by ELISA. In some embodiments, the immunogenic complex of the present invention, upon administration to a patient, induces the production of antibodies against one or more pathogens in the patient at a level greater than that of a composition containing only the backbone polymer and no antigenic polysaccharide, as measured by ELISA.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, после введения пациенту индуцирует иммунный ответ против одного или более патогенов у пациента на уровне, превышающем уровень в случае композиции, содержащий только антигенный полисахарид, и не содержащей каркасный полимер. В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, после введения пациенту индуцирует иммунный ответ против одного или более патогенов у пациента на уровне, превышающем уровень в случае композиции, содержащей каркасный полимер, и не содержащей антигенный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления иммунный ответ представляет собой выработку антител или B-клеточный ответ. В некоторых вариантах осуществления иммунный ответ представляет собой CD4+ T-клеточный ответ, включая Th1, Th2, или Th17 ответ, или CD8+ T-клеточный ответ, или CD4+/CD8+ T-клеточный ответ. В некоторых вариантах осуществления иммунный ответ представляет собой выработку антител или B-клеточный ответ; и T-клеточный ответ.In some embodiments, the immunogenic complex of the present invention, upon administration to a patient, induces an immune response against one or more pathogens in the patient at a level greater than that of a composition containing only the antigenic polysaccharide and no backbone polymer. In some embodiments, the immunogenic complex of the present invention, upon administration to a patient, induces an immune response against one or more pathogens in the patient at a level greater than that of a composition containing a backbone polymer and no antigenic polysaccharide. In some embodiments, the implementation of the immune response is the production of antibodies or B-cell response. In some embodiments, the immune response is a CD4+ T cell response, including a Th1, Th2, or Th17 response, or a CD8+ T cell response, or a CD4+/CD8+ T cell response. In some embodiments, the implementation of the immune response is the production of antibodies or B-cell response; and T cell response.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, после введения пациенту вызывает продуцирование антител против одного или более патогенов у пациента на более высоком уровне, чем в случае композиции, содержащей только полипептидный антиген, и не содержащей каркасный полимер, при измерении методом ELISA. В некоторых вариантах осуществления один или более патогенов выбирают из K. pneumoniae, P. aeruginosa и E. coli. В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, после введения пациенту вызывает иммунный ответ против одного или более из K. pneumoniae, P. aeruginosa и E. coli.In some embodiments, the immunogenic complex of the present invention, upon administration to a patient, causes the production of antibodies against one or more pathogens in the patient at a higher level than a composition containing only a polypeptide antigen and not containing a backbone polymer, as measured by ELISA. . In some embodiments, one or more pathogens are selected from K. pneumoniae, P. aeruginosa, and E. coli . In some embodiments, the immunogenic complex described herein, upon administration to a patient, elicits an immune response against one or more of K. pneumoniae, P. aeruginosa, and E. coli .
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, после введения пациенту вызывает иммунный ответ против грамотрицательных и/или грамположительных бактерий. В некоторых вариантах осуществления грамотрицательные бактерии выбирают из K. pneumoniae, P. aeruginosa, E. coli., а также их сочетания. В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, после введения пациенту вызывает продуцирование антител, которые узнают нативный MrkA на экспрессирующих MrkA K. pneumoniae.In some embodiments, the implementation of the immunogenic complex described in the present invention, after administration to the patient, causes an immune response against gram-negative and/or gram-positive bacteria. In some embodiments, the Gram-negative bacteria are selected fromK. pneumoniae, P. aeruginosa, E. coli., as well as their combinations. In some embodiments, the immunogenic complex of the present invention, upon administration to a patient, causes the production of antibodies that recognize native MrkA on expressing MrkA.K. pneumoniae.
В некоторых вариантах осуществления иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, содержит один или более полипептидных антигенов. В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидных антигенов представляют собой бактериальный полипептид, грибковый полипептид и/или вирусный полипептид. В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидных антигенов представляют собой полипептид из Klebsiella, Pseudomonas и/или E. coli.In some embodiments, the implementation of the immunogenic complex described in the present invention contains one or more polypeptide antigens. In some embodiments, one or more of the polypeptide antigens is a bacterial polypeptide, a fungal polypeptide, and/or a viral polypeptide. In some embodiments, the one or more polypeptide antigens is a polypeptide from Klebsiella, Pseudomonas and/or E. coli .
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один из антигенных полисахаридов представляет собой экзополисахарид PsL P. aeruginosa. В некоторых вариантах осуществления PsL содержит по меньшей мере один эпитоп, который связывает моноклональное антитело, содержащее последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 4, и/или последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 5 (Cam-003). В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один полипептидный антиген содержит аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 1 (фимбриальный белок I типа K. pneumoniae). В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один полипептидный антиген содержит аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 2 (консервативный фимбриальный белок III типа MrkA K. pneumoniae), или аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 3 мономерного стабилизированного MrkA, или ее иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один полипептидный антиген представляет собой флагеллин подтипа A FliC P. aeruginosa, флагеллин подтипа B FliC P. aeruginosa, или его иммуногенный фрагмент. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один полипептидный антиген содержит аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 6 (подтип A1), аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 9 (подтип A2), или ее иммуногенный фрагмент.In some embodiments, at least one of the antigenic polysaccharides is a P. aeruginosa PsL exopolysaccharide. In some embodiments, PsL contains at least one epitope that binds a monoclonal antibody containing a sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 4, and/or a sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO : 5 (Cam-003). In some embodiments, at least one polypeptide antigen contains an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO : 1 ( K. pneumoniae type I fimbrial protein). In some embodiments, at least one polypeptide antigen contains an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO : 2 ( K. pneumoniae type III conserved fimbrial protein MrkA), or an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 3 monomeric stabilized MrkA, or immunogenic fragment. In some embodiments, the at least one polypeptide antigen is P. aeruginosa FliC subtype A flagellin, P. aeruginosa FliC subtype B flagellin, or an immunogenic fragment thereof. In some embodiments, at least one polypeptide antigen contains an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO : 6 (subtype A1), an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with the sequence of SEQ ID NO: 9 (subtype A2), or an immunogenic fragment thereof.
Получение иммуногенных комплексовPreparation of immunogenic complexes
Настоящее изобретение относится к способам получения иммуногенных комплексов, описанных в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления способ получения иммуногенных комплексов включает образование комплекса из по меньшей мере одного биотинилированного каркасного полимера с по меньшей мере одним биотин-связывающим слитым белком. В некоторых вариантах осуществления слитый белок содержит аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с любой из SEQ ID NO: 16-26.The present invention relates to methods for preparing the immunogenic complexes described in the present invention. In some embodiments, a method for making immunogenic complexes comprises complexing at least one biotinylated backbone polymer with at least one biotin-binding fusion protein. In some embodiments, the fusion protein contains an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with any of SEQ ID NOs: 16- 26.
Заболевания, нарушения и состоянияDiseases, disorders and conditions
В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении (например, композиция, содержащая иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении), вызывает продуцирование антител против одного или более патогенов у пациента на более высоком уровне, чем в случае композиции, содержащей антигенный полисахарид, и не содержащей каркасный полимер, при измерении методом ELISA. В некоторых вариантах осуществления один или более патогенов выбирают из Klebsiella, Pseudomonas и E. coli.In some embodiments, upon administration to a patient, an immunogenic complex of the present invention (e.g., a composition comprising an immunogenic complex of the present invention) causes the patient to produce antibodies against one or more pathogens at a higher level than a composition containing antigenic polysaccharide, and does not contain a backbone polymer, when measured by ELISA. In some embodiments, one or more pathogens are selected from Klebsiella, Pseudomonas , and E. coli .
В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении (например, композиция, содержащая иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении), вызывает иммунный ответ против одного или более патогенов у пациента. В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, вызывает иммунный ответ против одного или более патогенов у пациента на более высоком уровне, чем в случае композиции, содержащей антигенный полисахарид, и не содержащий каркасный полимер. В некоторых вариантах осуществления один или более патогенов выбирают из Klebsiella, Pseudomonas и E. coli.In some embodiments, upon administration to a patient, an immunogenic complex of the present invention (eg, a composition comprising an immunogenic complex of the present invention) elicits an immune response against one or more pathogens in the patient. In some embodiments, upon administration to a patient, the immunogenic complex of the present invention elicits an immune response against one or more pathogens in the patient at a higher level than a composition containing an antigenic polysaccharide and no backbone polymer. In some embodiments, one or more pathogens are selected from Klebsiella, Pseudomonas , and E. coli .
В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении (например, композицию, содержащую иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении), используют для лечения или предотвращения инфекции. В некоторых вариантах осуществления инфекция представляет собой инфекцию ожоговой раны, ЖК инфекцию, инфекцию операционного поля, инфекцию мочевыводящих путей, инфекцию роговицы, инфекцию кожи и/или мягких тканей, инфекцию диабетических язв, инфекцию, связанную с медицинским устройством (например, катетером, хирургическим имплантатом, протезом). В некоторых вариантах осуществления после введения пациенту иммуногенную композицию, описанную в настоящем изобретении, используют для лечения или предотвращения пневмонии, сепсиса и/или колонизации.In some embodiments, after administration to a patient, an immunogenic complex of the present invention (eg, a composition comprising an immunogenic complex of the present invention) is used to treat or prevent an infection. In some embodiments, the infection is a burn wound infection, GI infection, operative field infection, urinary tract infection, corneal infection, skin and/or soft tissue infection, diabetic ulcer infection, medical device (e.g., catheter, surgical implant) infection. , prosthesis). In some embodiments, after administration to a patient, the immunogenic composition described herein is used to treat or prevent pneumonia, sepsis, and/or colonization.
Иммуногенные композиции и составыImmunogenic Compositions and Formulations
Изобретение также относится к композициям, содержащим один или более иммуногенных комплексов, описанных в настоящем изобретении. Например, иммуногенная композиция, например, вакцинная композиция, может содержать один или более иммуногенных комплексов, описанных в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления такие композиции могут содержать множество иммуногенных комплексов одного типа, описанных в настоящем изобретении. Дополнительно или альтернативно, такие композиции могут содержать множество иммуногенных комплексов более, чем одного типа, описанных в настоящем изобретении. В некоторых вариантах осуществления иммуногенные комплексы, описанные в настоящем изобретении, составлены в фармацевтическую композицию. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция может представлять собой вакцину. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция содержит фармацевтически приемлемый носитель.The invention also relates to compositions containing one or more of the immunogenic complexes described in the present invention. For example, an immunogenic composition, such as a vaccine composition, may contain one or more of the immunogenic complexes described in the present invention. In some embodiments, such compositions may contain multiple immunogenic complexes of the same type described in the present invention. Additionally or alternatively, such compositions may contain a plurality of immunogenic complexes of more than one type described in the present invention. In some embodiments, the immunogenic complexes described herein are formulated into a pharmaceutical composition. In some embodiments, the pharmaceutical composition may be a vaccine. In some embodiments, the implementation of the pharmaceutical composition contains a pharmaceutically acceptable carrier.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция представляет собой поливалентную или мультивалентную вакцину. В некоторых вариантах осуществления валентность вакцинной композиции означает число типов иммуногенных комплексов, присутствующих в вакцинной композиции. Валентность вакцины, описанной в настоящем изобретении, не ограничена в отношении общего количества антигенов, присутствующих в указанной фармацевтической композиции, иммуногенном комплексе или вакцине, или в отношении числа штаммов патогенов, против которых введение указанной фармацевтической композиции, иммуногенного комплекса, иммуногенной композиции или вакцинной композиции, может индуцировать защитный иммунный ответ. В качестве неограничивающего примера 12-валентная вакцинная композиция может содержать более чем 12 антигенных компонентов (например, пептидных и/или полисахаридных компонентов), и может индуцировать защитный иммунный ответ против более чем 12 патогенов или патогенных штаммов.In some embodiments, the implementation of the vaccine composition is a polyvalent or multivalent vaccine. In some embodiments, the implementation of the valency of the vaccine composition means the number of types of immunogenic complexes present in the vaccine composition. The valence of the vaccine described in the present invention is not limited in relation to the total number of antigens present in the specified pharmaceutical composition, immunogenic complex or vaccine, or in relation to the number of strains of pathogens against which the introduction of the specified pharmaceutical composition, immunogenic complex, immunogenic composition or vaccine composition, can induce a protective immune response. As a non-limiting example, a 12-valent vaccine composition may contain more than 12 antigenic components (eg, peptide and/or polysaccharide components), and can induce a protective immune response against more than 12 pathogens or pathogenic strains.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит 1-50 типов иммуногенных комплексов. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит 1-25 типов иммуногенных комплексов. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит 1-15 типов иммуногенных комплексов. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит 1-10 типов иммуногенных комплексов. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит 1-5 типов иммуногенных комплексов. В некоторых вариантах осуществления вакцина представляет собой поливалентную вакцину.In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains 1-50 types of immunogenic complexes. In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains 1-25 types of immunogenic complexes. In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains 1-15 types of immunogenic complexes. In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains 1-10 types of immunogenic complexes. In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains 1-5 types of immunogenic complexes. In some embodiments, the implementation of the vaccine is a polyvalent vaccine.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49 или 50 типов иммуногенных комплексов. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит 1 тип иммуногенных комплексов. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит 2 типа иммуногенных комплексов. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит 4 типа иммуногенных комплексов. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит 6 типов иммуногенных комплексов. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит 8 типов иммуногенных комплексов. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит 10 типов иммуногенных комплексов. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит 12 типов иммуногенных комплексов. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит два или более типов иммуногенных комплексов в таких количествах, что масса OPS в вакцинной композиции из каждой иммуногенной композиции отличается, например, они присутствуют в массовом отношении, отличном от приблизительно 1:1. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит два или более типов иммуногенных комплексов в таких количествах, что масса OPS в вакцинной композиции из каждой иммуногенной композиции является приблизительно одинаковой, например, они присутствуют в массовом отношении приблизительно 1:1. В некоторых вариантах осуществления масса OPS в вакцине из каждой иммуногенной композиции составляет приблизительно 1 мкг. В некоторых вариантах осуществления масса OPS в вакцине из каждой иммуногенной композиции составляет приблизительно 2 мкг. В некоторых вариантах осуществления масса OPS в вакцине из каждой иммуногенной композиции составляет приблизительно 3 мкг. В некоторых вариантах осуществления масса OPS в вакцине из каждой иммуногенной композиции составляет приблизительно 4 мкг. В некоторых вариантах осуществления масса OPS в вакцине из каждой иммуногенной композиции составляет приблизительно 5 мкг.In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22 , 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47 , 48, 49 or 50 types of immunogenic complexes. In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains 1 type of immunogenic complexes. In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains 2 types of immunogenic complexes. In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains 4 types of immunogenic complexes. In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains 6 types of immunogenic complexes. In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains 8 types of immunogenic complexes. In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains 10 types of immunogenic complexes. In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains 12 types of immunogenic complexes. In some embodiments, the vaccine composition contains two or more types of immunogenic complexes in such amounts that the mass of OPS in the vaccine composition from each immunogenic composition is different, for example, they are present in a weight ratio other than about 1:1. In some embodiments, the vaccine composition contains two or more types of immunogenic complexes in such amounts that the weight of OPS in the vaccine composition from each immunogenic composition is approximately the same, for example, they are present in a weight ratio of approximately 1:1. In some embodiments, the mass of OPS in the vaccine from each immunogenic composition is approximately 1 μg. In some embodiments, the mass of OPS in the vaccine from each immunogenic composition is approximately 2 μg. In some embodiments, the mass of OPS in the vaccine from each immunogenic composition is approximately 3 μg. In some embodiments, the mass of OPS in the vaccine from each immunogenic composition is approximately 4 μg. In some embodiments, the mass of OPS in the vaccine from each immunogenic composition is approximately 5 μg.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит два или более типов иммуногенных комплексов в таких количествах, что суммарная масса OPS и CPS в вакцинной композиции из каждой иммуногенной композиции отличается, например, они присутствуют в массовом отношении, отличном от приблизительно 1:1. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит два или более типов иммуногенных комплексов в таких количествах, что суммарная масса OPS и CPS в вакцинной композиции из каждой иммуногенной композиции отличается, например, они присутствуют в массовом отношении, отличном от приблизительно 1:1. В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит два или более типов иммуногенных комплексов в таких количествах, что суммарная масса OPS и CPS в вакцинной композиции из каждой иммуногенной композиции является приблизительно одинаковой, например, они присутствуют в массовом отношении приблизительно 1:1. В некоторых вариантах осуществления суммарная масса OPS и CPS в вакцине из каждой иммуногенной композиции составляет приблизительно 1 мкг. В некоторых вариантах осуществления суммарная масса OPS и CPS в вакцине из каждой иммуногенной композиции составляет приблизительно 2 мкг. В некоторых вариантах осуществления суммарная масса OPS и CPS в вакцине из каждой иммуногенной композиции составляет приблизительно 3 мкг. В некоторых вариантах осуществления суммарная масса OPS и CPS в вакцине из каждой иммуногенной композиции составляет приблизительно 4 мкг. В некоторых вариантах осуществления суммарная масса OPS и CPS в вакцине из каждой иммуногенной композиции составляет приблизительно 5 мкг.In some embodiments, the vaccine composition contains two or more types of immunogenic complexes in such amounts that the total weight of OPS and CPS in the vaccine composition from each immunogenic composition is different, e.g., they are present in a weight ratio other than about 1:1. In some embodiments, the vaccine composition contains two or more types of immunogenic complexes in such amounts that the total weight of OPS and CPS in the vaccine composition from each immunogenic composition is different, e.g., they are present in a weight ratio other than about 1:1. In some embodiments, the vaccine composition contains two or more types of immunogenic complexes in such amounts that the total mass of OPS and CPS in the vaccine composition from each immunogenic composition is approximately the same, for example, they are present in a weight ratio of approximately 1:1. In some embodiments, the total mass of OPS and CPS in the vaccine from each immunogenic composition is approximately 1 μg. In some embodiments, the total mass of OPS and CPS in the vaccine from each immunogenic composition is approximately 2 μg. In some embodiments, the total mass of OPS and CPS in the vaccine from each immunogenic composition is approximately 3 μg. In some embodiments, the total mass of OPS and CPS in the vaccine from each immunogenic composition is approximately 4 μg. In some embodiments, the total mass of OPS and CPS in the vaccine from each immunogenic composition is approximately 5 μg.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит два или более типов иммуногенных композиций, выбранных изIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains two or more types of immunogenic compositions selected from
(a) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(a) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(b) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(b) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(b’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(b') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(c) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(c) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(d) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(d) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(d’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(d') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(e) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(e) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(e’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(e') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(f) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(f) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(f’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(f') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(g) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(g) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(g’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(g') an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(h) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(h) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(h’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(h') an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(i) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(i) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(j) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(j) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(k) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; и(k) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, PA O10 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; And
(l) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером.(l) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит два или более типов иммуногенных композиций, выбранных изIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains two or more types of immunogenic compositions selected from
(a) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(a) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(a’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(a') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(b) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(b) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(b’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(b') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(c) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(c) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(c’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; (c') an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(d) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(d) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(d’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(d') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(e) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(e) an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(e’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(e') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(f) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(f) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, PA O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(f’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(f') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(g) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(g) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(g’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(g') an immunogenic composition containing a backbone polymer, including a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(h) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(h) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(h’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(h') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, PA O4 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(i) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(i) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(i’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(i') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(j) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(j) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(j’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(j') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(k) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(k) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, PA O10 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(k’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(k') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(l) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(l) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(l’) иммуногенной композиции, содержащей каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером.(l') an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(a) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(b) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(b) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(c) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(c) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(d) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(d) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(e) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(e) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(f) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(f) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(g) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(g) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(h) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(h) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(i) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(i) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(j) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(j) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(k) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; и(k) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; And
(l) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером.(l) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and a Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(a) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O1 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(b) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(b) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(c) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(c) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(d) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(d) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, KP O5 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(e) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(e) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O1 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(f) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(f) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O2 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(g) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(g) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O3 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(h) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-PcrV в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(h) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O4 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and a Rhavi-FlaBD2-PcrV fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(i) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(i) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O5 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(j) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером;(j) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O6 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer;
(k) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером; и(k) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O10 OPS conjugated to Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19, and the Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer; And
(l) иммуногенную композицию, содержащую каркасный полимер, включающий полимер, представляющий собой биотинилированный капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS, конъюгированный с капсульным полисахаридом Klebsiella spp. K19, и слитый белок Rhavi-FlaBD2-MrkA в не ковалентном комплексе с биотинилированным каркасным полимером.(l) an immunogenic composition containing a backbone polymer comprising a polymer that is a biotinylated capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, PA O11 OPS conjugated to the capsular polysaccharide of Klebsiella spp. K19, and a Rhavi-FlaBD2-MrkA fusion protein in a non-covalent complex with a biotinylated backbone polymer.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит два или более типов иммуногенных композиций, выбранных изIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains two or more types of immunogenic compositions selected from
(a) иммуногенной композиции, содержащей KP O1 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA;(a) an immunogenic composition comprising a KP O1 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(a’) иммуногенной композиции, содержащей KP O1 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV;(a') an immunogenic composition comprising KP O1 OPS and a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(b) иммуногенной композиции, содержащей KP O2 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA;(b) an immunogenic composition comprising KP O2 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(b’) иммуногенной композиции, содержащей KP O2 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV;(b') an immunogenic composition comprising KP O2 OPS and a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(c) иммуногенной композиции, содержащей KP O3 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA;(c) an immunogenic composition comprising a KP O3 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(c’) иммуногенной композиции, содержащей KP O3 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV;(c') an immunogenic composition comprising KP O3 OPS and a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(d) иммуногенной композиции, содержащей KP O5 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA;(d) an immunogenic composition comprising a KP O5 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(d’) иммуногенной композиции, содержащей KP O5 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV;(d') an immunogenic composition comprising KP O5 OPS and a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(e) иммуногенной композиции, содержащей PA O1 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA;(e) an immunogenic composition comprising PA O1 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(e’) иммуногенной композиции, содержащей PA O1 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV;(e') an immunogenic composition comprising PA O1 OPS and a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(f) иммуногенной композиции, содержащей PA O2 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA;(f) an immunogenic composition comprising a PA O2 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(f’) иммуногенной композиции, содержащей PA O2 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV;(f') an immunogenic composition comprising PA O2 OPS and a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(g) иммуногенной композиции, содержащей PA O3 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA;(g) an immunogenic composition comprising PA O3 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(g’) иммуногенной композиции, содержащей PA O3 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV;(g') an immunogenic composition comprising PA O3 OPS and a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(h) иммуногенной композиции, содержащей PA O4 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA;(h) an immunogenic composition comprising a PA O4 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(h’) иммуногенной композиции, содержащей PA O4 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV;(h') an immunogenic composition comprising PA O4 OPS and a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(i) иммуногенной композиции, содержащей PA O5 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA;(i) an immunogenic composition comprising a PA O5 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(i’) иммуногенной композиции, содержащей PA O5 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV;(i') an immunogenic composition comprising PA O5 OPS and a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(j) иммуногенной композиции, содержащей PA O6 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA;(j) an immunogenic composition comprising a PA O6 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(j’) иммуногенной композиции, содержащей PA O6 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV;(j') an immunogenic composition containing PA O6 OPS and a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(k) иммуногенной композиции, содержащей PA O10 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA;(k) an immunogenic composition comprising PA O10 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(k’) иммуногенной композиции, содержащей PA O10 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV;(k') an immunogenic composition comprising PA O10 OPS and a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(l) иммуногенной композиции, содержащей PA O11 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA; и(l) an immunogenic composition comprising PA O11 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein; And
(l’) иммуногенной композиции, содержащей PA O11 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV.(l') immunogenic composition containing PA O11 OPS and FlaBD2-PcrV fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления один или более из типов иммуногенных композиций дополнительно включают один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more types of immunogenic compositions further comprise one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит иммуногенную композицию, выбранную изIn some embodiments, the vaccine composition comprises an immunogenic composition selected from
(a) иммуногенной композиции, содержащей сочетание OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae и слитый белок FlaBD2-MrkA; и(a) an immunogenic composition comprising a combination of K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein; And
(b) иммуногенной композиции, содержащей сочетание OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa и слитый белок FlaBD2-MrkA.(b) an immunogenic composition containing a combination of P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS and a FlaBD2-MrkA fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления один или более из типов иммуногенных композиций дополнительно включают один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS K. pneumoniae конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more types of immunogenic compositions further comprise one or more polymers. In some embodiments , the K. pneumoniae OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) иммуногенную композицию, содержащую(a) an immunogenic composition comprising
(i) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae и любое их сочетание; и(i) one or more of K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, and any combination thereof; And
(ii) слитый белок FlaBD2-MrkA; и/или(ii) FlaBD2-MrkA fusion protein; and/or
(b) иммуногенную композицию, содержащую(b) an immunogenic composition containing
(i) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa и любое их сочетание; и(i) one or more of O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa OPS, and any combination thereof; And
(ii)слитый белок FlaBD2-MrkA.(ii) FlaBD2-MrkA fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления один или более из типов иммуногенных композиций дополнительно включают один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more types of immunogenic compositions further comprise one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит иммуногенную композицию, выбранную изIn some embodiments, the vaccine composition comprises an immunogenic composition selected from
(a) иммуногенной композиции, содержащей сочетание OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, слитый белок FlaBD2-PcrV и слитый белок FlaBD2-MrkA; и(a) an immunogenic composition comprising a combination of K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, a FlaBD2-PcrV fusion protein, and a FlaBD2-MrkA fusion protein; And
(b) иммуногенной композиции, содержащей сочетание OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, слитый белок FlaBD2-PcrV и слитый белок FlaBD2-MrkA.(b) an immunogenic composition comprising a combination of P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS , a FlaBD2-PcrV fusion protein, and a FlaBD2-MrkA fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления вакцина дополнительно включает один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с полимером. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с полимером. В некоторых вариантах осуществления полимер включает капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the implementation of the vaccine further includes one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to a polymer. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to a polymer. In some embodiments, the implementation of the polymer includes a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae; и (a) one or more OPS types O1, O2, O3, O5 of K. pneumoniae ; And
(b) один или более полипептидов, содержащих аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с одной или более из последовательностей SEQ ID NO: 1-3, 6-12 или 16-26.(b) one or more polypeptides comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with one or more of the SEQ sequences ID NO: 1-3, 6-12 or 16-26.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция дополнительно включает один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления один или более OPS конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидов конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и один или более полипептидов конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления полимер включает капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the vaccine composition further comprises one or more polymers. In some embodiments, one or more OPS are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polypeptides are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and one or more polypeptides are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the implementation of the polymer includes a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(a) one or more OPS types O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa ; And
(b) один или более полипептидов, содержащих аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с одной или более из последовательностей SEQ ID NO: 1-3, 6-12 или 16-26.(b) one or more polypeptides comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with one or more of the SEQ sequences ID NO: 1-3, 6-12 or 16-26.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция дополнительно включает один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидов конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и один или более полипептидов конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the vaccine composition further comprises one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polypeptides are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and one or more polypeptides are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae;(a) one or more OPS types O1, O2, O3, O5 of K. pneumoniae ;
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(b) one or more of P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS; And
(c) один или более полипептидов, содержащих аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с одной или более из последовательностей SEQ ID NO: 1-3, 6-12 или 16-26.(c) one or more polypeptides comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with one or more of the SEQ sequences ID NO: 1-3, 6-12 or 16-26.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция дополнительно включает один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидов конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и один или более полипептидов конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the vaccine composition further comprises one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polypeptides are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and one or more polypeptides are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae; и(a) one or more OPS types O1, O2, O3, O5 of K. pneumoniae ; And
(b) слитый белок FlaBD2-MrkA.(b) FlaBD2-MrkA fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция дополнительно включает один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the vaccine composition further comprises one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(a) one or more OPS types O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa ; And
(b) слитый белок FlaBD2-MrkA.(b) FlaBD2-MrkA fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция дополнительно включает один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the vaccine composition further comprises one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae;(a) one or more OPS types O1, O2, O3, O5 of K. pneumoniae ;
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(b) one or more of P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS; And
(c) слитый белок FlaBD2-MrkA.(c) FlaBD2-MrkA fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция дополнительно включает один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the vaccine composition further comprises one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae; и(a) one or more OPS types O1, O2, O3, O5 of K. pneumoniae ; And
(b) слитый белок FlaBD2-PcrV.(b) FlaBD2-PcrV fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция дополнительно включает один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the vaccine composition further comprises one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(a) one or more OPS types O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa ; And
(b) слитый белок FlaBD2-PcrV.(b) FlaBD2-PcrV fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция дополнительно включает один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the vaccine composition further comprises one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae;(a) one or more OPS types O1, O2, O3, O5 of K. pneumoniae ;
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(b) one or more of P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS; And
(c) слитый белок FlaBD2-PcrV.(c) FlaBD2-PcrV fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция дополнительно включает один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the vaccine composition further comprises one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae;(a) one or more OPS types O1, O2, O3, O5 of K. pneumoniae ;
(b) слитый белок FlaBD2-MrkA; и(b) FlaBD2-MrkA fusion protein; And
(c) слитый белок FlaBD2-PcrV.(c) FlaBD2-PcrV fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция дополнительно включает один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS, слитый белок FlaBD2-MrkA и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the vaccine composition further comprises one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some OPS embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(a) one or more OPS types O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa ; And
(b) слитый белок FlaBD2-MrkA; и(b) FlaBD2-MrkA fusion protein; And
(c) слитый белок FlaBD2-PcrV.(c) FlaBD2-PcrV fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция дополнительно включает один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS, слитый белок FlaBD2-MrkA и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the vaccine composition further comprises one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some OPS embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae;(a) one or more OPS types O1, O2, O3, O5 of K. pneumoniae ;
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(b) one or more of P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS; And
(c)слитый белок FlaBD2-MrkA; и(c) FlaBD2-MrkA fusion protein; And
(d) слитый белок FlaBD2-PcrV.(d) FlaBD2-PcrV fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция дополнительно включает один или более полимеров. В некоторых вариантах осуществления OPS конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS, слитый белок FlaBD2-MrkA и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the vaccine composition further comprises one or more polymers. In some embodiments, the OPS is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some OPS embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae конъюгирован с одним или более полимерами; и(a) one or more of O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae OPS , wherein the K. pneumoniae OPS is conjugated to one or more polymers; And
(b) один или более полипептидов, содержащих аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с одной или более из последовательностей SEQ ID NO: 1-3, 6-12 или 16-26.(b) one or more polypeptides comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with one or more of the SEQ sequences ID NO: 1-3, 6-12 or 16-26.
В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидов конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и один или более полипептидов конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, one or more polypeptides are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and one or more polypeptides are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa конъюгирован с одним или более полимерами; и(a) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is conjugated to one or more polymers; And
(b) один или более полипептидов, содержащих аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с одной или более из последовательностей SEQ ID NO: 1-3, 6-12 или 16-26.(b) one or more polypeptides comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with one or more of the SEQ sequences ID NO: 1-3, 6-12 or 16-26.
В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидов конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и один или более полипептидов конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, one or more polypeptides are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and one or more polypeptides are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae конъюгирован с одним или более первыми полимерами;(a) one or more K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, wherein the K. pneumoniae OPS is conjugated to one or more first polymers;
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa конъюгирован с одним или более вторыми полимерами; и(b) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is conjugated to one or more second polymers; And
(c) один или более полипептидов, содержащих аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с одной или более из последовательностей SEQ ID NO: 1-3, 6-12 или 16-26.(c) one or more polypeptides comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with one or more of the SEQ sequences ID NO: 1-3, 6-12 or 16-26.
В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидов конъюгированы с одним или более первыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидов конъюгированы с одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полипептидов конъюгированы с одним или более первыми полимерами и одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров и один или более вторых полимеров являются одинаковыми. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров и один или более вторых полимеров являются разными. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров включают капсульный полисахарид из первого патогена. В некоторых вариантах осуществления один или более вторых полимеров включают капсульный полисахарид из второго патогена. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются разными бактериями. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются одинаковыми бактериями одного и того же серотипа. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются одинаковыми бактериями разных серотипов. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров включают PLL. В некоторых вариантах осуществления один или более вторых полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polypeptides are conjugated to one or more first polymers. In some embodiments, one or more polypeptides are conjugated to one or more second polymers. In some embodiments, one or more polypeptides are conjugated to one or more first polymers and one or more second polymers. In some embodiments, one or more of the first polymers and one or more of the second polymers are the same. In some embodiments, one or more of the first polymers and one or more of the second polymers are different. In some embodiments, one or more of the first polymers comprise a capsular polysaccharide from a first pathogen. In some embodiments, the one or more second polymers comprise a capsular polysaccharide from a second pathogen. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are different bacteria. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are the same bacteria of the same serotype. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are the same bacteria of different serotypes. In some embodiments, one or more first polymers include PLL. In some embodiments, one or more of the second polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae конъюгирован с одним или более полимерами; и(a) one or more of O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae OPS , wherein the K. pneumoniae OPS is conjugated to one or more polymers; And
(b) слитый белок FlaBD2-MrkA.(b) FlaBD2-MrkA fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa конъюгирован с одним или более полимерами; и(a) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is conjugated to one or more polymers; And
(b) слитый белок FlaBD2-MrkA.(b) FlaBD2-MrkA fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae конъюгирован с одним или более полимерами;(a) one or more of O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae OPS , wherein the K. pneumoniae OPS is conjugated to one or more polymers;
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa конъюгирован с одним или более вторыми полимерами; и(b) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is conjugated to one or more second polymers; And
(c) слитый белок FlaBD2-MrkA.(c) FlaBD2-MrkA fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более первыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более первыми полимерами и одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров и один или более вторых полимеров являются одинаковыми. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров и один или более вторых полимеров являются разными. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров включают капсульный полисахарид из первого патогена. В некоторых вариантах осуществления один или более вторых полимеров включают капсульный полисахарид из второго патогена. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются разными бактериями. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются одинаковыми бактериями одного и того же серотипа. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются одинаковыми бактериями разных серотипов. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров включают PLL. В некоторых вариантах осуществления один или более вторых полимеров включают PLL.In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more first polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more second polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more first polymers and one or more second polymers. In some embodiments, one or more of the first polymers and one or more of the second polymers are the same. In some embodiments, one or more of the first polymers and one or more of the second polymers are different. In some embodiments, one or more of the first polymers comprise a capsular polysaccharide from a first pathogen. In some embodiments, the one or more second polymers comprise a capsular polysaccharide from a second pathogen. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are different bacteria. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are the same bacteria of the same serotype. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are the same bacteria of different serotypes. In some embodiments, one or more first polymers include PLL. In some embodiments, one or more of the second polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa конъюгирован с одним или более полимерами; и(a) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is conjugated to one or more polymers; And
(b) слитый белок FlaBD2-PcrV.(b) FlaBD2-PcrV fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae конъюгирован с одним или более первыми полимерами;(a) one or more K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, wherein the K. pneumoniae OPS is conjugated to one or more first polymers;
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa конъюгирован с одним или более вторыми полимерами; и(b) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is conjugated to one or more second polymers; And
(c) слитый белок FlaBD2-PcrV.(c) FlaBD2-PcrV fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более первыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более первыми полимерами и одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров и один или более вторых полимеров являются одинаковыми. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров и один или более вторых полимеров являются разными. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров включают капсульный полисахарид из первого патогена. В некоторых вариантах осуществления один или более вторых полимеров включают капсульный полисахарид из второго патогена. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются разными бактериями. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются одинаковыми бактериями одного и того же серотипа. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются одинаковыми бактериями разных серотипов. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров включают PLL. В некоторых вариантах осуществления один или более вторых полимеров включают PLL.In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more first polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more second polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more first polymers and one or more second polymers. In some embodiments, one or more of the first polymers and one or more of the second polymers are the same. In some embodiments, one or more of the first polymers and one or more of the second polymers are different. In some embodiments, one or more of the first polymers comprise a capsular polysaccharide from a first pathogen. In some embodiments, the one or more second polymers comprise a capsular polysaccharide from a second pathogen. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are different bacteria. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are the same bacteria of the same serotype. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are the same bacteria of different serotypes. In some embodiments, one or more first polymers include PLL. In some embodiments, one or more of the second polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae конъюгирован с одним или более полимерами;(a) one or more of O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae OPS , wherein the K. pneumoniae OPS is conjugated to one or more polymers;
(b) слитый белок FlaBD2-MrkA; и(b) FlaBD2-MrkA fusion protein; And
(c) слитый белок FlaBD2-PcrV.(c) FlaBD2-PcrV fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS, слитый белок FlaBD2-MrkA и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some OPS embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa конъюгирован с одним или более полимерами;(a) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is conjugated to one or more polymers;
(b) слитый белок FlaBD2-MrkA; и(b) FlaBD2-MrkA fusion protein; And
(c) слитый белок FlaBD2-PcrV.(c) FlaBD2-PcrV fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления OPS, слитый белок FlaBD2-MrkA и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгированы с одним или более полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-MrkA fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the OPS and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some OPS embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein and the FlaBD2-PcrV fusion protein are conjugated to one or more polymers. In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae конъюгирован с одним или более первыми полимерами;(a) one or more K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, wherein the K. pneumoniae OPS is conjugated to one or more first polymers;
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa конъюгирован с одним или более вторыми полимерами;(b) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is conjugated to one or more second polymers;
(c) слитый белок FlaBD2-MrkA; и(c) FlaBD2-MrkA fusion protein; And
(d) слитый белок FlaBD2-PcrV.(d) FlaBD2-PcrV fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров и один или более вторых полимеров являются одинаковыми. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров и один или более вторых полимеров являются разными. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров включают капсульный полисахарид из первого патогена. В некоторых вариантах осуществления один или более вторых полимеров включают капсульный полисахарид из второго патогена. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются разными бактериями. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются одинаковыми бактериями одного и того же серотипа. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются одинаковыми бактериями разных серотипов. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров включают PLL. В некоторых вариантах осуществления один или более вторых полимеров включают PLL. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более первыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более первыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более первыми полимерами и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более первыми полимерами и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более первыми полимерами и одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более первыми полимерами и одним или более вторыми полимерами.In some embodiments, one or more of the first polymers and one or more of the second polymers are the same. In some embodiments, one or more of the first polymers and one or more of the second polymers are different. In some embodiments, one or more of the first polymers comprise a capsular polysaccharide from a first pathogen. In some embodiments, the one or more second polymers comprise a capsular polysaccharide from a second pathogen. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are different bacteria. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are the same bacteria of the same serotype. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are the same bacteria of different serotypes. In some embodiments, one or more first polymers include PLL. In some embodiments, one or more of the second polymers include PLL. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more first polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more first polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more second polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more second polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more first polymers and the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more second polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more first polymers and the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more second polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more first polymers and one or more second polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more first polymers and one or more second polymers.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит два или более типов иммуногенных композиций, выбранных изIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains two or more types of immunogenic compositions selected from
(a) иммуногенной композиции, содержащей KP O1 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-MrkA;(a) an immunogenic composition comprising a KP O1 OPS covalently linked to a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(a’) иммуногенной композиции, содержащей KP O1 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-PcrV;(a') an immunogenic composition comprising a KP O1 OPS covalently linked to a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(b) иммуногенной композиции, содержащей KP O2 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-MrkA;(b) an immunogenic composition comprising a KP O2 OPS covalently linked to a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(b’) иммуногенной композиции, содержащей KP O2 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-PcrV;(b') an immunogenic composition comprising a KP O2 OPS covalently linked to a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(c) иммуногенной композиции, содержащей KP O3 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-MrkA; (c) an immunogenic composition comprising a KP O3 OPS covalently linked to a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(c’) иммуногенной композиции, содержащей KP O3 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-PcrV;(c') an immunogenic composition comprising a KP O3 OPS covalently linked to a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(d) иммуногенной композиции, содержащей KP O5 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-MrkA;(d) an immunogenic composition comprising a KP O5 OPS covalently linked to a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(d’) иммуногенной композиции, содержащей KP O5 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-PcrV;(d') an immunogenic composition comprising a KP O5 OPS covalently linked to a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(e) иммуногенной композиции, содержащей PA O1 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-MrkA;(e) an immunogenic composition comprising a PA O1 OPS covalently linked to a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(e’) иммуногенной композиции, содержащей PA O1 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-PcrV;(e') an immunogenic composition comprising a PA O1 OPS covalently linked to a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(f) иммуногенной композиции, содержащей PA O2 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-MrkA;(f) an immunogenic composition comprising a PA O2 OPS covalently linked to a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(f’) иммуногенной композиции, содержащей PA O2 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-PcrV;(f') an immunogenic composition comprising a PA O2 OPS covalently linked to a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(g) иммуногенной композиции, содержащей PA O3 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-MrkA;(g) an immunogenic composition comprising a PA O3 OPS covalently linked to a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(g’) иммуногенной композиции, содержащей PA O3 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-PcrV;(g') an immunogenic composition comprising a PA O3 OPS covalently linked to a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(h) иммуногенной композиции, содержащей PA O4 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-MrkA;(h) an immunogenic composition comprising a PA O4 OPS covalently linked to a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(h’) иммуногенной композиции, содержащей PA O4 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-PcrV;(h') an immunogenic composition comprising a PA O4 OPS covalently linked to a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(i) иммуногенной композиции, содержащей PA O5 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-MrkA;(i) an immunogenic composition comprising a PA O5 OPS covalently linked to a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(i’) иммуногенной композиции, содержащей PA O5 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-PcrV;(i') an immunogenic composition comprising a PA O5 OPS covalently linked to a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(j) иммуногенной композиции, содержащей PA O6 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-MrkA;(j) an immunogenic composition comprising a PA O6 OPS covalently linked to a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(j’) иммуногенной композиции, содержащей PA O6 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-PcrV;(j') an immunogenic composition comprising a PA O6 OPS covalently linked to a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(k) иммуногенной композиции, содержащей PA O10 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-MrkA;(k) an immunogenic composition comprising a PA O10 OPS covalently linked to a FlaBD2-MrkA fusion protein;
(k’) иммуногенной композиции, содержащей PA O10 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-PcrV;(k') an immunogenic composition comprising PA O10 OPS covalently linked to a FlaBD2-PcrV fusion protein;
(l) иммуногенной композиции, содержащей PA O11 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-MrkA; и(l) an immunogenic composition comprising PA O11 OPS covalently linked to a FlaBD2-MrkA fusion protein; And
(l’) иммуногенной композиции, содержащей PA O11 OPS, ковалентно связанный со слитым белком FlaBD2-PcrV.(l') an immunogenic composition containing PA O11 OPS covalently linked to a FlaBD2-PcrV fusion protein.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит два или более типов иммуногенных композиций, выбранных изIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains two or more types of immunogenic compositions selected from
(a) иммуногенной композиции, содержащей полимер, KP O1 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или KP O1 OPS;(a) an immunogenic composition comprising a polymer, KP O1 OPS, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or KP O1 OPS;
(a’) иммуногенной композиции, содержащей полимер, KP O1 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или KP O1 OPS;(a') an immunogenic composition comprising a polymer, KP O1 OPS, and a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or KP O1 OPS;
(b) иммуногенной композиции, содержащей полимер, KP O2 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или KP O2 OPS;(b) an immunogenic composition comprising a polymer, KP O2 OPS, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or KP O2 OPS;
(b’) иммуногенной композиции, содержащей полимер, KP O2 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или KP O2 OPS;(b') an immunogenic composition comprising a polymer, KP O2 OPS, and a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or KP O2 OPS;
(c) иммуногенной композиции, содержащей полимер, KP O3 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или KP O3 OPS;(c) an immunogenic composition comprising a polymer, KP O3 OPS, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or KP O3 OPS;
(c’) иммуногенной композиции, содержащей полимер, KP O3 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или KP O3 OPS;(c') an immunogenic composition comprising a polymer, KP O3 OPS, and a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or KP O3 OPS;
(d) иммуногенной композиции, содержащей полимер, KP O5 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или KP O5 OPS;(d) an immunogenic composition comprising a polymer, KP O5 OPS, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or KP O5 OPS;
(d’) иммуногенной композиции, содержащей полимер, KP O5 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или KP O5 OPS;(d') an immunogenic composition comprising a polymer, KP O5 OPS, and a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or KP O5 OPS;
(e) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O1 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или the PA O1 OPS;(e) an immunogenic composition comprising a polymer, PA O1 OPS, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or the PA O1 OPS;
(e’) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O1 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или the PA O1 OPS;(e') an immunogenic composition comprising a polymer, PA O1 OPS, and a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or the PA O1 OPS;
(f) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O2 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или the PA O2 OPS;(f) an immunogenic composition comprising a polymer, PA O2 OPS, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or the PA O2 OPS;
(f’) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O2 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или PA O2 OPS;(f') an immunogenic composition comprising a polymer, PA O2 OPS, and a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or PA O2 OPS;
(g) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O3 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или PA O3 OPS;(g) an immunogenic composition comprising a polymer, PA O3 OPS, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or PA O3 OPS;
(g’) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O3 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или PA O3 OPS;(g') an immunogenic composition comprising a polymer, PA O3 OPS, and a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or PA O3 OPS;
(h) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O4 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или PA O4 OPS;(h) an immunogenic composition comprising a polymer, PA O4 OPS, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or PA O4 OPS;
(h’) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O4 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или PA O4 OPS;(h') an immunogenic composition comprising a polymer, PA O4 OPS, and a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or PA O4 OPS;
(i) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O5 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или PA O5 OPS;(i) an immunogenic composition comprising a polymer, PA O5 OPS, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or PA O5 OPS;
(i’) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O5 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или PA O5 OPS;(i') an immunogenic composition comprising a polymer, PA O5 OPS, and a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or PA O5 OPS;
(j) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O6 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или PA O6 OPS;(j) an immunogenic composition comprising a polymer, PA O6 OPS, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or PA O6 OPS;
(j’) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O6 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или PA O6 OPS;(j') an immunogenic composition comprising a polymer, PA O6 OPS, and a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or PA O6 OPS;
(k) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O10 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или PA O10 OPS;(k) an immunogenic composition comprising a polymer, PA O10 OPS, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or PA O10 OPS;
(k’) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O10 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или PA O10 OPS;(k') an immunogenic composition comprising a polymer, PA O10 OPS, and a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or PA O10 OPS;
(l) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O11 OPS и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или PA O11 OPS; и(l) an immunogenic composition comprising a polymer, PA O11 OPS, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or PA O11 OPS; And
(l’) иммуногенной композиции, содержащей полимер, PA O11 OPS и слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или PA O11 OPS.(l') an immunogenic composition comprising a polymer, PA O11 OPS, and a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to the polymer and/or PA O11 OPS.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один полимер включает капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, at least one polymer comprises a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит иммуногенную композицию, выбранную изIn some embodiments, the vaccine composition comprises an immunogenic composition selected from
(a) иммуногенной композиции, содержащей полимер, сочетание OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или по меньшей мере одним из типов OPS; и(a) an immunogenic composition comprising polymer, combination of OPS types O1, O2, O3, O5K. pneumoniae and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to a polymer and/or at least one of the OPS types; And
(b) иммуногенной композиции, содержащей полимер, сочетание OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок ковалентно связан с полимером и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(b) an immunogenic composition comprising polymer, combination of OPS types O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11P. aeruginosa and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the fusion protein is covalently linked to a polymer and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один полимер включает капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления полимер включает PLL.In some embodiments, at least one polymer comprises a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, the implementation of the polymer includes PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит иммуногенную композицию, выбранную изIn some embodiments, the vaccine composition comprises an immunogenic composition selected from
(a) иммуногенной композиции, содержащей один или более первых полимеров, сочетание OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более первых полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS, и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более первых полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS; и(a) an immunogenic composition comprising one or more first polymers, a combination of K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more first polymers and/or at least one of the OPS types, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more first polymers and/or at least one of the OPS types; And
(b) иммуногенной композиции, содержащей один или более вторых полимеров, сочетание OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более вторых полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS, и слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более вторых полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(b) an immunogenic composition comprising one or more second polymers, a combination of OPS type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa , a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked with at least a portion of one or more second polymers and/or at least one of the OPS types, and a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more second polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более первыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более первыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более первыми полимерами и слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более первыми полимерами и слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-MrkA конъюгирован с одним или более первыми полимерами и одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления слитый белок FlaBD2-PcrV конъюгирован с одним или более первыми полимерами и одним или более вторыми полимерами. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров и один или более вторых полимеров являются одинаковыми. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров и один или более вторых полимеров являются разными. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров включают капсульный полисахарид из первого патогена. В некоторых вариантах осуществления один или более вторых полимеров включают капсульный полисахарид из второго патогена. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются разными бактериями. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются одинаковыми бактериями одного и того же серотипа. В некоторых вариантах осуществления первый патоген и второй патоген являются одинаковыми бактериями разных серотипов. В некоторых вариантах осуществления один или более первых полимеров включают PLL. В некоторых вариантах осуществления один или более вторых полимеров включают PLL.In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more first polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more first polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more second polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more second polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more first polymers and the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more second polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more first polymers and the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more second polymers. In some embodiments, the FlaBD2-MrkA fusion protein is conjugated to one or more first polymers and one or more second polymers. In some embodiments, the FlaBD2-PcrV fusion protein is conjugated to one or more first polymers and one or more second polymers. In some embodiments, one or more of the first polymers and one or more of the second polymers are the same. In some embodiments, one or more of the first polymers and one or more of the second polymers are different. In some embodiments, one or more of the first polymers comprise a capsular polysaccharide from a first pathogen. In some embodiments, the one or more second polymers comprise a capsular polysaccharide from a second pathogen. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are different bacteria. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are the same bacteria of the same serotype. In some embodiments, the first pathogen and the second pathogen are the same bacteria of different serotypes. In some embodiments, one or more first polymers include PLL. In some embodiments, one or more second polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более полимеров;(a) one or more polymers;
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae; и (b) one or more of O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae OPS; And
(c) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с одной или более из последовательностей SEQ ID NO: 1-3, 6-12 или 16-26, при этом полипептид ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(c) a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with one or more of the sequences of SEQ ID NO: 1-3, 6-12, or 16-26, wherein the polypeptide is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более полимеров,(a) one or more polymers,
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(b) one or more of P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS; And
(c) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с одной или более из последовательностей SEQ ID NO: 1-3, 6-12 или 16-26, при этом полипептид ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(c) a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with one or more of the sequences of SEQ ID NO: 1-3, 6-12, or 16-26, wherein the polypeptide is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более полимеров,(a) one or more polymers,
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae;(b) one or more of O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae OPS;
(c) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(c) one or more of OPS types O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa ; And
(d) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с одной или более из последовательностей SEQ ID NO: 1-3, 6-12 или 16-26, при этом полипептид ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(d) a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with one or more of the sequences of SEQ ID NO: 1-3, 6-12, or 16-26, wherein the polypeptide is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более полимеров,(a) one or more polymers,
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae; и(b) one or more of O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae OPS; And
(c) слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(c) a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более полимеров,(a) one or more polymers,
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(b) one or more of P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS; And
(c) слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(c) a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более полимеров,(a) one or more polymers,
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae;(b) one or more of O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae OPS;
(c) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(c) one or more of OPS types O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa ; And
(d) слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(d) a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более полимеров,(a) one or more polymers,
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae; и(b) one or more of K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS; And
(c) слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(c) a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более полимеров,(a) one or more polymers,
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(b) one or more of P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS; And
(c) слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(c) a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более полимеров,(a) one or more polymers,
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae;(b) one or more of K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS;
(c) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(c) one or more of OPS types O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa ; And
(d) слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(d) a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более полимеров,(a) one or more polymers,
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae;(b) one or more of K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS;
(c) слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS; и(c) a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types; And
(d) слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(d) a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более полимеров,(a) one or more polymers,
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(b) one or more of OPS types O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa ; And
(c) слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS; и(c) a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types; And
(d) слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(d) a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более полимеров,(a) one or more polymers,
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae;(b) one or more of K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS;
(c) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa; и(c) one or more of OPS types O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa ; And
(d) слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS; и(d) a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types; And
(e) слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(e) a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae ковалентно связан с одним или более полимерами; и(a) one or more K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, wherein the K. pneumoniae OPS is covalently linked to one or more polymers; And
(b) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с одной или более из последовательностей SEQ ID NO: 1-3, 6-12 или 16-26, при этом полипептид ковалентно связан с по меньшей мере частью полимера и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(b) a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with one or more of the sequences of SEQ ID NO: 1-3, 6-12 or 16-26, wherein the polypeptide is covalently linked to at least a portion of the polymer and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa ковалентно связан с одним или более полимерами; и(a) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is covalently linked to one or more polymers; And
(b) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с одной или более из последовательностей SEQ ID NO: 1-3, 6-12 или 16-26, при этом полипептид ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(b) a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, or 100% identity with one or more of the sequences of SEQ ID NO: 1-3, 6-12, or 16-26, wherein the polypeptide is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae ковалентно связан с одним или более полимерами;(a) one or more K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, wherein the K. pneumoniae OPS is covalently linked to one or more polymers;
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa ковалентно связан с одним или более полимерами; и(b) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is covalently linked to one or more polymers; And
(c) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичности с одной или более из последовательностей SEQ ID NO: 1-3, 6-12 или 16-26, при этом полипептид ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(c) a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% or 100% identity with one or more of the sequences of SEQ ID NO: 1-3, 6-12, or 16-26, wherein the polypeptide is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae ковалентно связан с одним или более полимерами; и(a) one or more K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, wherein the K. pneumoniae OPS is covalently linked to one or more polymers; And
(b) слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(b) a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa ковалентно связан с одним или более полимерами; и(a) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is covalently linked to one or more polymers; And
(b) слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(b) a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae ковалентно связан с одним или более полимерами;(a) one or more K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, wherein the K. pneumoniae OPS is covalently linked to one or more polymers;
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa ковалентно связан с одним или более полимерами; и(b) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is covalently linked to one or more polymers; And
(c) слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(c) a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более полимеров,(a) one or more polymers,
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae; и(b) one or more of K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS; And
(c) слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(c) a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa ковалентно связан с одним или более полимерами; и(a) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is covalently linked to one or more polymers; And
(b) слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(b) a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae ковалентно связан с одним или более полимерами;(a) one or more K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, wherein the K. pneumoniae OPS is covalently linked to one or more polymers;
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa ковалентно связан с одним или более полимерами; и(b) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is covalently linked to one or more polymers; And
(c) слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(c) a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae ковалентно связан с одним или более полимерами;(a) one or more K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, wherein the K. pneumoniae OPS is covalently linked to one or more polymers;
(b) слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS; и(b) a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types; And
(c) слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(c) a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa ковалентно связан с одним или более полимерами;(a) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is covalently linked to one or more polymers;
(b) слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS; и(b) a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types; And
(c) слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(c) a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержитIn some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains
(a) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O5 K. pneumoniae, при этом OPS K. pneumoniae ковалентно связан с одним или более полимерами;(a) one or more K. pneumoniae type O1, O2, O3, O5 OPS, wherein the K. pneumoniae OPS is covalently linked to one or more polymers;
(b) один или более из OPS типа O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 P. aeruginosa, при этом OPS P. aeruginosa ковалентно связан с одним или более полимерами;(b) one or more P. aeruginosa type O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 OPS, wherein the P. aeruginosa OPS is covalently linked to one or more polymers;
(c) слитый белок FlaBD2-MrkA, при этом слитый белок FlaBD2-MrkA ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS; и(c) a FlaBD2-MrkA fusion protein, wherein the FlaBD2-MrkA fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types; And
(d) слитый белок FlaBD2-PcrV, при этом слитый белок FlaBD2-PcrV ковалентно связан с по меньшей мере частью одного или более полимеров и/или по меньшей мере одним из типов OPS.(d) a FlaBD2-PcrV fusion protein, wherein the FlaBD2-PcrV fusion protein is covalently linked to at least a portion of one or more polymers and/or at least one of the OPS types.
В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, one or more polymers include a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
В некоторых вариантах осуществления вакцинная композиция содержит:In some embodiments, the implementation of the vaccine composition contains:
(a) первую иммуногенную композицию, содержащую полимер, KP O1 OPS, конъюгированный с полимером, и слитый белок FlaBD2-MrkA, ковалентно связанный с полимером;(a) a first immunogenic composition comprising a polymer, KP O1 OPS, conjugated to a polymer, and a FlaBD2-MrkA fusion protein covalently linked to the polymer;
(b) вторую иммуногенную композицию, содержащую полимер, KP O2 OPS, конъюгированный с полимером, и слитый белок FlaBD2-PcrV, ковалентно связанный с полимером;(b) a second immunogenic composition comprising a polymer, KP O2 OPS, conjugated to a polymer, and a FlaBD2-PcrV fusion protein covalently linked to the polymer;
(c) третью иммуногенную композицию, содержащую полимер, KP O3 OPS, конъюгированный с полимером, и слитый белок FlaBD2-MrkA, ковалентно связанный с полимером;(c) a third immunogenic composition comprising a polymer, KP O3 OPS, conjugated to a polymer, and a FlaBD2-MrkA fusion protein covalently linked to the polymer;
(d) четвертую иммуногенную композицию, содержащую полимер, KP O5 OPS, конъюгированный с полимером, и слитый белок FlaBD2-PcrV, ковалентно связанный с полимером;(d) a fourth immunogenic composition comprising a polymer, KP O5 OPS, conjugated to a polymer, and a FlaBD2-PcrV fusion protein covalently linked to the polymer;
(e) пятую иммуногенную композицию, содержащую полимер, PA O1 OPS, конъюгированный с полимером, и слитый белок FlaBD2-PcrV, ковалентно связанный с полимером;(e) a fifth immunogenic composition comprising a polymer, PA O1 OPS conjugated to a polymer, and a FlaBD2-PcrV fusion protein covalently linked to the polymer;
(f) шестую иммуногенную композицию, содержащую полимер, PA O2 OPS, конъюгированный с полимером, и слитый белок FlaBD2-PcrV, ковалентно связанный с полимером;(f) a sixth immunogenic composition comprising a polymer, PA O2 OPS conjugated to a polymer, and a FlaBD2-PcrV fusion protein covalently linked to the polymer;
(g) седьмую иммуногенную композицию, содержащую полимер, PA O3 OPS, конъюгированный с полимером, и слитый белок FlaBD2-PcrV, ковалентно связанный с полимером;(g) a seventh immunogenic composition comprising a polymer, PA O3 OPS conjugated to a polymer, and a FlaBD2-PcrV fusion protein covalently linked to the polymer;
(h) восьмую иммуногенную композицию, содержащую полимер, PA O4 OPS, конъюгированный с полимером, и слитый белок FlaBD2-PcrV, ковалентно связанный с полимером;(h) an eighth immunogenic composition comprising a polymer, PA O4 OPS conjugated to the polymer, and a FlaBD2-PcrV fusion protein covalently linked to the polymer;
(i) девятую иммуногенную композицию, содержащую полимер, PA O5 OPS, конъюгированный с полимером, и слитый белок FlaBD2-MrkA, ковалентно связанный с полимером;(i) a ninth immunogenic composition comprising a polymer, PA O5 OPS conjugated to a polymer, and a FlaBD2-MrkA fusion protein covalently linked to the polymer;
(j) десятую иммуногенную композицию, содержащую полимер, PA O6 OPS, конъюгированный с полимером, и слитый белок FlaBD2-MrkA, ковалентно связанный с полимером;(j) a tenth immunogenic composition comprising a polymer, PA O6 OPS conjugated to a polymer, and a FlaBD2-MrkA fusion protein covalently linked to the polymer;
(k) одиннадцатую иммуногенную композицию, содержащую полимер, PA O10 OPS, конъюгированный с полимером, и слитый белок FlaBD2-MrkA, ковалентно связанный с полимером; и(k) an eleventh immunogenic composition comprising a polymer, PA O10 OPS conjugated to a polymer, and a FlaBD2-MrkA fusion protein covalently linked to the polymer; And
(l) двенадцатую иммуногенную композицию, содержащую полимер, PA O11 OPS, конъюгированный с полимером, и слитый белок FlaBD2-MrkA, ковалентно связанный с полимером.(l) a twelfth immunogenic composition comprising a polymer, PA O11 OPS conjugated to a polymer, and a FlaBD2-MrkA fusion protein covalently linked to the polymer.
В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере один из полимеров включает капсульный полисахарид. В некоторых вариантах осуществления капсульный полисахарид представляет собой капсульный полисахарид Klebsiella spp. K19. В некоторых вариантах осуществления один или более полимеров включают PLL.In some embodiments, at least one of the polymers includes a capsular polysaccharide. In some embodiments, the capsular polysaccharide is a Klebsiella spp. capsular polysaccharide. K19. In some embodiments, one or more polymers include PLL.
Оптимальные количества компонентов для конкретной вакцины могут быть установлены в стандартных исследованиях, включающих наблюдение соответствующих иммунных ответов у пациентов. После начальной вакцинации пациенты могут получать одну или несколько бустер-иммунизаций через адекватные временные интервалы.The optimal amounts of components for a particular vaccine can be established in standard studies, including the observation of appropriate immune responses in patients. After the initial vaccination, patients may receive one or more booster immunizations at appropriate time intervals.
Иммуногенные комплексы, описанные в настоящем изобретении, и/или их препараты, могут быть составлены в стандартной лекарственной форме для легкости введения и однородности доз. Конкретный терапевтически эффективный уровень дозы для любого конкретного пациента или микроорганизма может зависеть от различных факторов, включая степень тяжести или степень риска инфицирования; активность конкретной используемой вакцины или вакцинной композиции; другие характеристики конкретной используемой вакцины или вакцинной композиции; возраст, массу тела, общее состояние здоровья, пол пациента, диету пациента, фармакокинетическое состояние пациента, время введения (например, относительно других видов деятельности пациента, таких как прием пищи, сон, прием других лекарственных препаратов, в том числе доз других вакцин, и так далее), путь введения, скорость экскреции конкретной используемой вакцины или вакцинной композиции; вакцины, используемые в сочетании или параллельно с используемой вакцинной композицией; и аналогичные факторы, хорошо известные в области медицины.The immunogenic complexes described in the present invention and/or preparations thereof can be formulated in unit dosage form for ease of administration and uniformity of doses. The specific therapeutically effective dose level for any particular patient or microorganism may depend on various factors, including the severity or risk of infection; the activity of the particular vaccine or vaccine composition used; other characteristics of the particular vaccine or vaccine composition used; age, body weight, general health, gender of the patient, diet of the patient, pharmacokinetic state of the patient, time of administration (eg, in relation to other activities of the patient such as eating, sleeping, taking other medications, including doses of other vaccines, and etc.), route of administration, rate of excretion of the specific vaccine or vaccine composition used; vaccines used in combination or in parallel with the used vaccine composition; and similar factors well known in the medical field.
Иммуногенные комплексы для использования по настоящему изобретению могут быть составлены в композиции (например, фармацевтические композиции) известными методами. Вакцинный препарат в общих чертах описан в Vaccine Design (Powell and Newman, 1995). Например, иммуногенное количество вакцинного препарата может быть составлено с одним или более органическими или неорганическими, жидкими или твердыми, фармацевтически приемлемыми материалами носителя. Получение пневмококковых полисахаридных и конъюгатных вакцин описано, например, в патенте USSN 11/395593, выпущенном 31 марта 2006 г., содержание которого включено в настоящий документ посредством ссылки.Immunogenic complexes for use in the present invention may be formulated into compositions (eg, pharmaceutical compositions) by known methods. The vaccine formulation is described in general terms in Vaccine Design (Powell and Newman, 1995). For example, an immunogenic amount of a vaccine preparation may be formulated with one or more organic or inorganic, liquid or solid, pharmaceutically acceptable carrier materials. The production of pneumococcal polysaccharide and conjugate vaccines is described, for example, in
Как правило, фармацевтически приемлемый носитель(и) включает растворители, дисперсионные среды и тому подобное, которые сочетаются с фармацевтическим введением. Например, материалы, которые служат в качестве фармацевтически приемлемых носителей, включают, но без ограничения, сахара, такие как лактоза, глюкоза, декстроза и сахароза; крахмалы, такие как кукурузный крахмал и картофельный крахмал; целлюлозу и ее производные, такие как натрий-карбоксиметилцеллюлоза, этилцеллюлоза и ацетат целлюлозы; порошковый трагакант; солод; желатин; тальк; эксципиенты, такие как масло какао и суппозиторные воски; масла, такие как арахисовое масло, хлопковое масло, сафлоровое масло, кунжутное масло, оливковое масло, кукурузное масло и соевое масло; полиолы, такие как глицерин, пропиленгликоль и жидкий полиэтиленгликоль; сложные эфиры, такие как этилолеат и этиллаурат; агар; буферные средства, такие как гидроксид магния; альгиновую кислоту; апирогенную воду; изотонический солевой раствор; раствор Рингера; этиловый спирт и фосфатные буферные растворы, а также другие нетоксичные совместимые смазывающие средства, такие как лаурилсульфат натрия и стеарат магния, кроме того, консерванты и антиоксиданты также могут присутствовать в композиции, в соответствии с решением формулирующего препарат специалиста (Martin, 1975).Typically, the pharmaceutically acceptable carrier(s) includes solvents, dispersion media, and the like that are compatible with pharmaceutical administration. For example, materials that serve as pharmaceutically acceptable carriers include, but are not limited to, sugars such as lactose, glucose, dextrose, and sucrose; starches such as corn starch and potato starch; cellulose and its derivatives such as sodium carboxymethyl cellulose, ethyl cellulose and cellulose acetate; powder tragacanth; malt; gelatin; talc; excipients such as cocoa butter and suppository waxes; oils such as peanut oil, cottonseed oil, safflower oil, sesame oil, olive oil, corn oil and soybean oil; polyols such as glycerol, propylene glycol and liquid polyethylene glycol; esters such as ethyl oleate and ethyl laurate; agar; buffering agents such as magnesium hydroxide; alginic acid; pyrogen-free water; isotonic saline; Ringer's solution; ethyl alcohol and phosphate buffer solutions, as well as other non-toxic compatible lubricants such as sodium lauryl sulfate and magnesium stearate, in addition, preservatives and antioxidants may also be present in the composition, in accordance with the decision of the formulation specialist (Martin, 1975).
Вакцины могут быть составлены путем объединения одного или более иммуногенных комплексов, раскрытых в настоящем изобретении, с носителями и/или другими необязательными компонентами любыми доступными способами, включая, например, общепринятое смешивание, гранулирование, растворение, лиофилизацию или аналогичные методы.Vaccines can be formulated by combining one or more immunogenic complexes disclosed in the present invention with carriers and/or other optional components by any available means, including, for example, conventional mixing, granulation, dissolution, lyophilization, or similar methods.
Вакцинные композиции, которые могут быть использованы в предложенных способах, могут находиться в лиофилизированном состоянии вплоть до приблизительно того времени, когда они будут использованы, в этот момент они могут быть восстановлены растворителем непосредственно перед введением. В некоторых вариантах осуществления вакцинные компоненты или композиции лиофилизируют в присутствии одного или более других компонентов (например, адъювантов) и восстанавливают солевым раствором непосредственно перед введением. Альтернативно, индивидуальные компоненты, или наборы компонентов, можно отдельно лиофилизировать и/или хранить (например, в наборе для вакцинации); компоненты восстанавливают и либо смешивают перед использованием, либо вводят отдельно пациенту.Vaccine compositions that can be used in the proposed methods can be in a freeze-dried state up to about the time they are used, at which point they can be reconstituted with a solvent just prior to administration. In some embodiments, the vaccine components or compositions are lyophilized in the presence of one or more other components (eg, adjuvants) and reconstituted with saline just prior to administration. Alternatively, individual components, or kits of components, can be separately lyophilized and/or stored (eg, in a vaccination kit); the components are reconstituted and either mixed prior to use or administered separately to the patient.
Лиофилизация может способствовать большей стабильности композиции (например, за счет предотвращения или уменьшения разрушения полисахаридных антигенов). Лиофилизация вакцин или вакцинных компонентов хорошо известна в данной области. Как правило, жидкую вакцину, или вакцинный компонент, лиофилизируют, часто в присутствии предотвращающего слеживание средства (такого как, например, сахара, например, сахароза или лактоза). В некоторых вариантах осуществления предотвращающее слеживание средство присутствует, например, в начальной концентрации 10-200 мг/мл. Лиофилизацию, как правило, выполняют в виде серии этапов, например, цикл начинают при -69°C, постепенно доводят до -24°C в течение 3 ч, затем поддерживают эту температуру в течение 18 ч, после чего постепенно доводят до -16°C в течение 1 ч, затем поддерживают эту температуру в течение 6 ч, после чего постепенно доводят до +34°C в течение 3 ч, и в завершение поддерживают эту температуру в течение 9 ч.Lyophilization can contribute to greater stability of the composition (for example, by preventing or reducing the destruction of polysaccharide antigens). Lyophilization of vaccines or vaccine components is well known in the art. Typically, a liquid vaccine, or vaccine component, is lyophilized, often in the presence of an anti-caking agent (such as, for example, a sugar, such as sucrose or lactose). In some embodiments, the anti-caking agent is present, for example, at an initial concentration of 10-200 mg/mL. Lyophilization is usually carried out in a series of steps, for example, the cycle starts at -69°C, gradually brought to -24°C over 3 hours, then maintained at this temperature for 18 hours, after which it is gradually brought to -16°C. C for 1 h, then maintained at this temperature for 6 h, after which it was gradually brought to +34°C for 3 h, and finally maintained at this temperature for 9 h.
Вакцины, или вакцинные компоненты, для использования по настоящему изобретению могут быть заключены в липосомы, кохлеаты, биоразлагаемые полимеры, такие как полилактид, полигликолид и полимеры на основе лактида и гликолида, или иммуностимулирующие комплексы (ISCOMS).Vaccines, or vaccine components, for use in the present invention may be incorporated into liposomes, cochleates, biodegradable polymers such as polylactide, polyglycolide, and lactide-glycolide polymers, or immunostimulatory complexes (ISCOMS).
В некоторых ситуациях может быть желательным пролонгированное действие вакцины, используемой по настоящему изобретению, например, путем замедления абсорбции одного или более вакцинных компонентов. Такое замедление абсорбции можно осуществлять, например, путем использования жидкой суспензии кристаллического или аморфного материала с плохой растворимостью в воде. Скорость абсорбции продукта зависит от скорости его растворения, которая, в свою очередь, может зависеть от размера и формы. Альтернативно или дополнительно, замедление абсорбции можно осуществлять путем растворения или суспендирования одного или более вакцинных компонентов в масляной среде. Инъекционные формы депо также можно использовать для замедления абсорбции. Такие формы депо можно получать путем формирования микрокапсульных матриц из одного или более вакцинных компонентов в сети биоразлагаемых полимеров. В зависимости от соотношения полимера и вакцинного компонента, а также от природы конкретного используемого полимера(ов), можно контролировать скорость высвобождения.In some situations, it may be desirable to prolong the action of the vaccine used according to the present invention, for example, by slowing down the absorption of one or more vaccine components. Such delay in absorption can be accomplished, for example, by using a liquid suspension of crystalline or amorphous material with poor water solubility. The rate of absorption of the product depends on the rate of its dissolution, which, in turn, may depend on the size and shape. Alternatively or additionally, slowing absorption can be accomplished by dissolving or suspending one or more vaccine components in an oil medium. Depot injectables can also be used to delay absorption. Such depot forms can be obtained by forming microcapsular matrices from one or more vaccine components in a network of biodegradable polymers. Depending on the ratio of polymer to vaccine component, as well as the nature of the particular polymer(s) used, the release rate can be controlled.
Примеры биоразлагаемых полимеров, которые можно использовать по настоящему изобретению, включают, например, поли(ортоэфиры) и поли(ангидриды). Одним конкретным иллюстративным полимером является полилактид-полигликолид.Examples of biodegradable polymers that can be used in the present invention include, for example, poly(orthoesters) and poly(anhydrides). One specific illustrative polymer is polylactide-polyglycolide.
Инъекционные препараты-депо также могут быть получены путем заключения препарата в липосомы или микроэмульсии, которые совместимы с тканями тела.Depot injectables can also be prepared by encapsulating the drug in liposomes or microemulsions that are compatible with body tissues.
Полимерные системы доставки также можно использовать в препаратах, не являющихся депо, включая, например, пероральные препараты. Например, в пероральных препаратах можно использовать биоразлагаемые, биосовместимые полимеры, такие как этиленвинилацетат, полиангидриды, полигликолевая кислота, коллаген, полиортоэфиры, полимолочная кислота и так далее. Полисахаридные антигены или конъюгаты могут быть составлены с такими полимерами, например, для получения частиц, микрочастиц, экструдатов, твердых дисперсий, смесей, или других сочетаний, с целью облегчения получения полезных препаратов (например, пероральных препаратов).Polymeric delivery systems can also be used in non-depot formulations, including, for example, oral formulations. For example, biodegradable, biocompatible polymers such as ethylene vinyl acetate, polyanhydrides, polyglycolic acid, collagen, polyorthoesters, polylactic acid, and so on, can be used in oral preparations. Polysaccharide antigens or conjugates can be formulated with such polymers, for example, to form particles, microparticles, extrudates, solid dispersions, mixtures, or other combinations, to facilitate the preparation of useful preparations (eg, oral preparations).
Вакцины для использования по настоящему изобретению включают иммуногенные композиции и, кроме того, могут включать одно или более дополнительных активных средств (то есть, средств, которые оказывают биологический эффект - не инертных ингредиентов). Следует понимать, что такие дополнительные средства можно формулировать вместе с одним или более другими вакцинными компонентами, или можно хранить отдельно и объединять в момент, или приблизительно в момент, введения. В некоторых вариантах осуществления такие дополнительные компоненты можно вводить отдельно от некоторых, или от всех, других вакцинных компонентов, в соответствующем временном окне для достижения соответствующего эффекта.Vaccines for use in the present invention include immunogenic compositions and, in addition, may include one or more additional active agents (ie, agents that have a biological effect - not inert ingredients). It should be understood that such additional agents may be formulated together with one or more other vaccine components, or may be stored separately and combined at or about the time of administration. In some embodiments, such additional components can be administered separately from some, or all, other vaccine components, in an appropriate time window to achieve the appropriate effect.
Например, при изготовлении вакцин принято включать один или более адъювантов. Адъюванты, как правило, представляют собой средства, которые усиливают иммунный ответ на антиген. В некоторых вариантах осуществления используют адъюванты, которые усиливают иммунный ответ Th1-типа.For example, in the manufacture of vaccines, it is common to include one or more adjuvants. Adjuvants are generally agents that enhance the immune response to an antigen. In some embodiments, adjuvants are used that enhance the Th1-type immune response.
В некоторых вариантах осуществления используют адъюванты, которые усиливают иммунный ответ Th17-типа.In some embodiments, adjuvants are used that enhance a Th17-type immune response.
АдъювантыAdjuvants
В некоторых вариантах осуществления иммуногенные комплексы, описанные в настоящем изобретении, составляют и/или вводят в комбинации с адъювантом. В некоторых вариантах осуществления адъювант выбирают из группы, состоящей из гидроксида алюминия, фосфатированного гидроксида алюминия, фосфата алюминия, агониста TLR, агониста TLR2 (например, сапонина (например, QS21 и так далее), порина и так далее), агониста TLR3 (например, дцРНК, полиI:полиC, поли-ICLC, Hiltonol® и так далее), агониста TLR4 (например, монофосфориллипида A (MPL A)), агониста TLR5 (например, флагеллина); агониста TLR 7, 8 или 9 (например, CpG-олигонуклеотида и так далее).In some embodiments, the immunogenic complexes described herein are formulated and/or administered in combination with an adjuvant. In some embodiments, the adjuvant is selected from the group consisting of aluminum hydroxide, phosphated aluminum hydroxide, aluminum phosphate, TLR agonist, TLR2 agonist (e.g., saponin (e.g., QS21, etc.), porin, etc.), TLR3 agonist (e.g., dsRNA, polyI:polyC, poly-ICLC, Hiltonol® , etc.), TLR4 agonist (eg, monophosphoryl lipid A (MPL A)), TLR5 agonist (eg, flagellin); a
В некоторых вариантах осуществления адъюванты, подходящие для использования по настоящему изобретению, включают, но без ограничения:In some embodiments, adjuvants suitable for use in the present invention include, but are not limited to:
(1) соли алюминия (квасцы), такие как гидроксид алюминия, фосфат алюминия, сульфат алюминия и так далее;(1) aluminum salts (alum) such as aluminum hydroxide, aluminum phosphate, aluminum sulfate, and so on;
(2) эмульсионные препараты типа масло в воде (с добавлением или без добавления других специфических иммуностимулирующих средств, таких как мурамилпептиды (описанные ниже) или компоненты клеточной стенки бактерий, такие как, например,(2) oil-in-water emulsion formulations (with or without the addition of other specific immunostimulatory agents such as muramyl peptides (described below) or bacterial cell wall components such as, for example,
(a) MF59 (PCT публикация № WO 90/14837), содержащий 5% сквалена, 0,5% Tween 80 и 0,5% Span 85 (необязательно, содержащий различные количества MTP-PE (смотри ниже, хотя и не обязательно)), составленный в субмикронные частицы с использованием микрофлюидизатора, такого как микрофлюидизатор модели 110Y (Microfluidics, Newton, MA),(a) MF59 (PCT Publication No. WO 90/14837) containing 5% squalene, 0.5
(b) SAF, содержащий 10% сквалена, 0,4% Tween 80, 5% блок-сополимера плюроника L121 и thr-MDP (смотри ниже), либо микрофлюидизированный в субмикронную эмульсию, либо перемешанный на вихревой мешалке для получения эмульсии с более крупными частицами, и(b) SAF containing 10% squalene, 0.4
(c) адъювантная система Ribi™ (RAS), (Corixa, Hamilton, MT) содержащая 2% сквалена, 0,2% Tween 80 и один или более компонентов клеточной стенки бактерий, из группы, состоящей из 3-O-дезацил-монофосфолипида A (MPL™), описанного в патенте США № 4912094 (Corixa), димиколата трегалозы (TDM) и скелета клеточной стенки (CWS), предпочтительно, MPL+CWS (Detox™);(c) Ribi™ adjuvant system (RAS), (Corixa, Hamilton, MT) containing 2% squalene, 0.2
(3) адъюванты на основе сапонинов, такие как Quil A или STIMULON™ QS-21 (Antigenics, Framingham, MA) (патент США № 5057540), могут быть использованы, или полученные из них частицы, такие как ISCOM (иммуностимулирующие комплексы);(3) saponin-based adjuvants such as Quil A or STIMULON™ QS-21 (Antigenics, Framingham, MA) (US Pat. No. 5,057,540) can be used, or particles derived therefrom, such as ISCOM (Immunostimulatory Complexes);
(4) бактериальные липополисахариды, синтетические аналоги липида A, такие как соединения аминоалкилглюкозаминфосфата (AGP), или их производные или аналоги, которые доступны от компании Corixa и которые описаны в патенте США № 6113918; одним таким AGP является 2-[(R)-3-тетрадеканоилокситетрадеканоиламино]этил-2-дезокси-4-O-фосфоно-3-O-[(R)-3-тетрадеканоилокситетрадеканоил]-2-[(R)-3-тетрадеканоилокситетрадеканоиламино]-b-D-глюкопиранозид, который также известен как 529 (прежнее название RC529), который составляют в водной форме или в форме стабильной эмульсии, синтетические полинуклеотиды, такие как олигонуклеотиды, содержащие мотив(ы) CpG (патент США № 6207646); агонисты TLR3 (синтетическая дцРНК, полиI:полиC, Hiltonol®, которые доступны от компании InvivoGen);(4) bacterial lipopolysaccharides, synthetic lipid A analogues such as aminoalkylglucosamine phosphate (AGP) compounds, or derivatives or analogues thereof, available from Corixa and described in US Pat. No. 6,113,918; one such AGP is 2-[(R)-3-tetradecanoyloxytetradecanoylamino]ethyl-2-deoxy-4-O-phosphono-3-O-[(R)-3-tetradecanoyloxytetradecanoyl]-2-[(R)-3- tetradecanoyloxytetradecanoylamino]-bD-glucopyranoside, which is also known as 529 (formerly RC529), which is formulated in aqueous or stable emulsion form, synthetic polynucleotides such as oligonucleotides containing CpG motif(s) (US Pat. No. 6,207,646); TLR3 agonists (synthetic dsRNA, polyI:polyC, Hiltonol ® available from InvivoGen);
(5) цитокины, такие как интерлейкины (например, IL-1, IL-2, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-12, IL-15, IL-18 и так далее), интерфероны (например, гамма-интерферон), гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (GM-CSF), макрофагальный колониестимулирующий фактор (M-CSF), фактор некроза опухоли (TNF), костимулирующие молекулы B7-1 и B7-2 и так далее;(5) cytokines such as interleukins (eg IL-1, IL-2, IL-4, IL-5, IL-6, IL-7, IL-12, IL-15, IL-18 and so on) , interferons (eg, interferon gamma), granulocyte macrophage colony stimulating factor (GM-CSF), macrophage colony stimulating factor (M-CSF), tumor necrosis factor (TNF), co-stimulatory molecules B7-1 and B7-2, and so on;
(6) обезвреженные мутанты бактериального АДФ-рибозилирующего токсина, такие как холерный токсин (CT), либо дикого типа, либо мутантная форма, например, в которой глутаминовая кислота в аминокислотном положении 29 заменена другой аминокислотой, предпочтительно, гистидином, в соответствии с опубликованной международной патентной заявкой номер WO 00/18434 (смотри также WO 02/098368 и WO 02/098369), коклюшный токсин (PT) или термолабильный токсин E. coli (LT), в частности LT-K63, LT-R72 и новый мутант LT, обозначенный LT(R192G/L211A) или dmLT, могут вызывать Th17-ответы на вакцинные антигены (Andreasen, 2009; Norton, 2011; Norton, 2012; Leach, 2012; Toprani, 2017), CT-S109, PT-K9/G129 (смотри, например, WO 93/13302 и WO 92/19265); и(6) inactivated mutants of bacterial ADP-ribosylating toxin, such as cholera toxin (CT), either wild-type or mutated, for example, in which the glutamic acid at
(7) другие вещества, которые действуют как иммуностимулирующие средства, повышая эффективность композиции, например, дельта-инулин (Advax®), Matrix M.(7) other substances that act as immunostimulatory agents, increasing the effectiveness of the composition, for example, delta-inulin (Advax ® ), Matrix M.
Мурамилпептиды включают, но без ограничения, N-ацетил-мурамил-L-треонил-D-изоглутамин (thr-MDP), N-ацетил-нормурамил-L-аланин-2-(1’-2’-дипальмитоил-sn-глицеро-3-гидроксифосфорилокси)этиламин (MTP-PE) и так далее.Muramyl peptides include, but are not limited to, N-acetyl-muramyl-L-threonyl-D-isoglutamine (thr-MDP), N-acetyl-normuramyl-L-alanine-2-(1'-2'-dipalmitoyl- sn -glycero -3-hydroxyphosphoryloxy)ethylamine (MTP-PE) and so on.
Вакцины для использования по настоящему изобретению могут включать, или быть введены одновременно с другими противомикробными терапевтическими средствами. Например, такие вакцины могут включать, или быть введены с одним или более средствами, которые уничтожают или замедляют рост патогена. Такие средства включают, например, пенициллин, ванкомицин, эритромицин, азитромицин и кларитромицин, цефотаксим, цефтриаксон, левофлаксин, гатифлоксацин.Vaccines for use in the present invention may include, or be administered simultaneously with, other antimicrobial therapeutic agents. For example, such vaccines may include, or be administered with, one or more agents that kill or slow the growth of the pathogen . Such agents include, for example, penicillin, vancomycin, erythromycin, azithromycin and clarithromycin, cefotaxime, ceftriaxone, levoflaxin, gatifloxacin.
Альтернативно или дополнительно, вакцины для использования по настоящему изобретению могут включать, или быть введены с одной или более другими вакцинами или вариантами терапии. Например, один или более не пневмококковых антигенов могут быть включены, или введены вместе с вакцинами.Alternatively or additionally, vaccines for use in the present invention may include, or be administered with, one or more other vaccines or therapy options. For example, one or more non-pneumococcal antigens may be included, or administered with vaccines.
ВведениеIntroduction
В некоторых вариантах осуществления иммуногенные комплексы вводят пациенту, имеющему риск развития заболевания, например, госпитализированным пациентам. Следует понимать, что индивидуум может считаться имеющим риск развития заболевания без диагностирования каких-либо симптомов заболевания. Например, если известно, что индивидуум находился, или планирует находиться, в ситуациях, связанных с относительно высоким риском воздействия инфекции, этот индивидуум будет считаться имеющим высокий риск развития заболевания (например, госпитализированный пациент, пожилой пациент, живущий в доме для престарелых, и так далее).In some embodiments, the immunogenic complexes are administered to a patient at risk of developing a disease, such as hospitalized patients. It should be understood that an individual may be considered at risk of developing a disease without being diagnosed with any symptoms of the disease. For example, if an individual is known to have been, or plans to be, in situations of relatively high risk of exposure to an infection, that individual would be considered to be at high risk of developing the disease (e.g. hospitalized patient, elderly patient living in a nursing home, etc.). Further).
Можно использовать эффективные пути введения, такие как, например, пероральный, назальный, энтеральный, парентеральный, внутримышечный или внутривенный, подкожный, внутрикожный, ректальный, вагинальный, топический, внутриглазной, легочный пути введения или контактное нанесение. В некоторых вариантах осуществления вакцинные композиции можно вводить инъекцией (например, внутримышечной, внутрибрюшинной, внутрикожной и/или подкожной); или доставлять через слизистую оболочку (например, в ротовую полость/пищеварительный тракт, дыхательные и/или мочеполовые пути). Интраназальное введение вакцин может быть особенно полезным в некоторых контекстах, например, для лечения пневмонии или среднего отита (поскольку носоглоточное носительство пневмококков может быть более эффективно предотвращено, результатом чего является ослабление инфекции на самой ранней стадии). В некоторых вариантах осуществления изобретения может быть желательным введение разных доз вакцины разными путями; в некоторых вариантах осуществления может быть желательным введение разных компонентов одной дозы разными путями.Effective routes of administration can be used, such as, for example, oral, nasal, enteral, parenteral, intramuscular or intravenous, subcutaneous, intradermal, rectal, vaginal, topical, intraocular, pulmonary, or contact application. In some embodiments, the vaccine compositions can be administered by injection (eg, intramuscular, intraperitoneal, intradermal, and/or subcutaneous); or delivered via a mucosal (eg, oral/alimentary, respiratory and/or urogenital tract). Intranasal vaccines may be particularly useful in some contexts, such as for the treatment of pneumonia or otitis media (because nasopharyngeal carriage of pneumococci may be more effectively prevented, resulting in attenuation of infection at a very early stage). In some embodiments of the invention, it may be desirable to administer different doses of the vaccine in different ways; in some embodiments, it may be desirable to administer different components of a single dose via different routes.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения фармацевтические композиции (например, вакцины) вводят внутрикожно. Общепринятая методика внутрикожной инъекции, «процедура манту», включает стадии очистки кожи, с последующим вытягиванием одной руки и введением иглы небольшого калибра (калибра 26-31), со скосом иглы, направленным вверх, под углом 10-15°. После введения скошенной части иглы ствол иглы опускают и продвигают вперед, обеспечивая небольшое давление для поднятия его под кожей. Затем жидкость вводят инъекцией очень медленно, создавая пузырь или вздутие на поверхности кожи, а затем медленно вынимают иглу.In some embodiments of the present invention, pharmaceutical compositions (eg, vaccines) are administered intradermally. A common intradermal injection technique, the "mantoux procedure", involves the steps of clearing the skin, followed by extension of one arm and insertion of a small gauge needle (26-31 gauge), with the needle beveled upward at a 10-15° angle. After insertion of the beveled part of the needle, the needle shaft is lowered and pushed forward, providing slight pressure to lift it under the skin. The fluid is then injected very slowly, creating a bubble or swelling on the surface of the skin, and then the needle is slowly withdrawn.
Устройства, специально разработанные для введения жидких средств в, или через, кожу описаны, например, в WO 99/34850 и EP 1092444, кроме того, устройства для струйных инъекций описаны, например, в WO 01/13977; патенте США № 5480381, патенте США № 5599302, патенте США № 5334144, патенте США № 5993412, патенте США № 5649912, патенте США № 5569189, патенте США № 5704911, патенте США № 5383851, патенте США № 5893397, патенте США № 5466220, патенте США № 5339163, патенте США № 5312335, патенте США № 5503627, патенте США № 5064413, патенте США № 5520639, патенте США № 4596556, патенте США № 4790824, патенте США № 4941880, патенте США № 4940460, WO 97/37705 и WO 97/13537. Другие способы внутрикожного введения вакцинных препаратов могут включать использование обычных шприцев и игл, или устройств, разработанных для баллистической доставки твердых вакцин (WO 99/27961), или чрескожных пластырей (WO 97/48440; WO 98/28037); или нанесение на поверхность кожи (трансдермальная или чрескожная доставка, WO 98/20734; WO 98/28037).Devices specially designed for the administration of liquid agents into or through the skin are described in, for example, WO 99/34850 and EP 1092444, in addition devices for jet injection are described in, for example, WO 01/13977; U.S. Patent No. 5,480,381 U.S. Patent No. 5,599,302 U.S. Patent No. 5,334,144 U.S. Patent No. 5,993,412 U.S. Patent No. 5,649,912 U.S. Patent No. 5,569,189 U.S. Patent No. 5,704,911 US Pat. No. 5,339,163, US Pat. No. 5,312,335, US Pat. No. 5,503,627, US Pat. WO 97/13537. Other methods of intradermal administration of vaccine preparations may include the use of conventional syringes and needles, or devices designed for ballistic delivery of solid vaccines (WO 99/27961) or transdermal patches (WO 97/48440; WO 98/28037); or application to the surface of the skin (transdermal or transdermal delivery, WO 98/20734; WO 98/28037).
Как описано выше, фармацевтические композиции (например, вакцины) можно вводить в виде одной дозы или нескольких доз. Следует понимать, что введение представляет собой введение в одной «дозе», при условии, что все соответствующие компоненты вводят пациенту в пределах временного окна; нет необходимости в том, чтобы каждый компонент присутствовал в одной композиции. Например, введение двух разных иммуногенных композиций в течение менее 24 ч считается введением в одной дозе. В качестве примера иммуногенные композиции, имеющие разные антигенные компоненты, могут быть введены в разных композициях, но в виде части одной дозы. Как отмечено выше, такие отдельные композиции могут быть введены разными путями или одним и тем же путем. Альтернативно или дополнительно, в вариантах осуществления, в которых вакцина содержит сочетание иммуногенных композиций и дополнительные виды активных средств, иммуногенные композиции могут быть введены одним путем, а второе активное средство может быть введено тем же путем, или иным путем.As described above, pharmaceutical compositions (eg, vaccines) can be administered as a single dose or multiple doses. It should be understood that administration is a single "dose" administration, provided that all relevant components are administered to the patient within the time window; it is not necessary that each component be present in one composition. For example, administration of two different immunogenic compositions within less than 24 hours is considered to be a single dose administration. By way of example, immunogenic compositions having different antigenic components may be administered in different compositions but as part of a single dose. As noted above, such separate compositions may be administered by different routes or by the same route. Alternatively or additionally, in embodiments where the vaccine comprises a combination of immunogenic compositions and additional types of active agents, the immunogenic compositions may be administered by one route and the second active agent may be administered by the same route or by another route.
Фармацевтические композиции (например, вакцины) вводят в таких количествах и в течение таких периодов времени, которые необходимы для достижения желаемого результата. В конкретных вариантах осуществления настоящего изобретения вакцинная композиция содержит терапевтически эффективное количество по меньшей мере одной иммуногенной композиции. Точное количество, необходимое для достижения терапевтически эффективного количества, может варьировать в зависимости от иммуногенной композиции, а также для разных пациентов, в зависимости от биологического вида, возраста и общего состояния здоровья пациента, стадии заболевания, конкретной фармацевтической смеси, способа введения и тому подобного.Pharmaceutical compositions (eg, vaccines) are administered in such amounts and for such periods of time as are necessary to achieve the desired result. In specific embodiments, implementation of the present invention, the vaccine composition contains a therapeutically effective amount of at least one immunogenic composition. The exact amount necessary to achieve a therapeutically effective amount may vary depending on the immunogenic composition, as well as for different patients, depending on the species, age and general health of the patient, stage of the disease, particular pharmaceutical mixture, route of administration, and the like.
Количество полисахаридного антигена(ов) или конъюгата(ов) в каждой дозе фармацевтической композиции (например, вакцины) выбирают таким образом, чтобы вакцина при введении, как описано в настоящем изобретении, могла индуцировать соответствующий защитный иммунный ответ без значительных неблагоприятных побочных эффектов. Используемый в настоящем изобретении термин «защитный иммунный», или «иммунопротективный», ответ означает иммунный ответ, достаточный для защиты иммунизированного пациента от эффективного инфицирования конкретным патогеном или патогенами, против которых направлена вакцина (например, инфицирования K. pneumoniae). Такие количества могут варьировать в зависимости от используемой конкретной иммуногенной композиции, или композиций, и от ее представления.The amount of polysaccharide antigen(s) or conjugate(s) in each dose of a pharmaceutical composition (e.g., vaccine) is chosen such that the vaccine, when administered as described herein, can induce an appropriate protective immune response without significant adverse side effects. As used herein, the term "protective immune" or "immunoprotective" response means an immune response sufficient to protect an immunized patient from effective infection with the specific pathogen or pathogens against which the vaccine is directed (eg, K. pneumoniae infections). Such amounts may vary depending on the particular immunogenic composition or compositions used and on its presentation.
В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция, содержащая иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, вызывает Th1 и/или Th17 клеточный ответ после введения пациенту. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция, содержащая иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, вызывает опсонический/бактерицидный ответ против одной или более из K. pneumoniae, P. aeruginosa и E. coli после введения пациенту. В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция, содержащая иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, приводит к уменьшению скорости передачи инфекции и/или колонизации слизистых поверхностей одной или более из K. pneumoniae, P. aeruginosa и E. coli после введения пациенту.In some embodiments, a pharmaceutical composition comprising an immunogenic complex described herein induces a Th1 and/or Th17 cellular response upon administration to a patient. In some embodiments, a pharmaceutical composition comprising an immunogenic complex described herein elicits an opsonic/bactericidal response against one or more of K. pneumoniae , P. aeruginosa , and E. coli upon administration to a patient . In some embodiments, a pharmaceutical composition comprising an immunogenic complex of the present invention results in a reduction in the rate of transmission of infection and/or colonization of the mucosal surfaces of one or more of K. pneumoniae , P. aeruginosa , and E. coli after administration to a patient.
В некоторых вариантах осуществления фармацевтическая композиция, содержащая иммуногенный комплекс, описанный в настоящем изобретении, приводит к уменьшению скорости передачи инфекции и/или колонизации ЖК тракта одной или более из K. pneumoniae, P. aeruginosa и E. coli при заражении.In some embodiments, a pharmaceutical composition comprising an immunogenic complex described herein results in a reduction in the rate of transmission of infection and/or colonization of the GI tract by one or more of K. pneumoniae , P. aeruginosa , and E. coli upon infection.
Некоторые варианты осуществления относятся к способу иммунизации пациента против инфекции, вызываемой K. pneumoniae, включающему введение пациенту эффективного количества иммуногенного комплекса, описанного в настоящем изобретении. Некоторые варианты осуществления относятся к способу иммунизации пациента против инфекции, вызываемой K. pneumoniae, включающему введение пациенту эффективного количества фармацевтической композиции, описанной в настоящем изобретении.Some embodiments relate to a method of immunizing a patient against an infection caused by K. pneumoniae , comprising administering to the patient an effective amount of the immunogenic complex described in the present invention. Some embodiments relate to a method of immunizing a patient against an infection caused by K. pneumoniae , comprising administering to the patient an effective amount of a pharmaceutical composition described in the present invention.
Некоторые варианты осуществления относятся к способу иммунизации пациента против инфекции, вызываемой P. aeruginosa, включающему введение пациенту эффективного количества иммуногенного комплекса, описанного в настоящем изобретении. Некоторые варианты осуществления относятся к способу иммунизации пациента против инфекции, вызываемой P. aeruginosa, включающему введение пациенту эффективного количества фармацевтической композиции.Some embodiments relate to a method of immunizing a patient against an infection caused by P. aeruginosa , comprising administering to the patient an effective amount of the immunogenic complex described in the present invention. Some embodiments relate to a method of immunizing a patient against a P. aeruginosa infection, comprising administering to the patient an effective amount of a pharmaceutical composition.
Некоторые варианты осуществления относятся к способу иммунизации пациента против инфекции, вызываемой E. coli, включающему введение пациенту эффективного количества иммуногенного комплекса, описанного в настоящем изобретении. Некоторые варианты осуществления относятся к способу иммунизации пациента против инфекции, вызываемой E. coli, включающему введение пациенту эффективного количества фармацевтической композиции.Some embodiments relate to a method for immunizing a patient against an infection caused byE. coli, comprising administering to the patient an effective amount of the immunogenic complex described in the present invention. Some embodiments relate to a method for immunizing a patient against an infection caused byE. coli, comprising administering to the patient an effective amount of the pharmaceutical composition.
ДозированиеDosing
В соответствии с настоящим изобретением, введение фармацевтической композиции (например, вакцины) может включать доставку только одной дозы или, альтернативно, может включать введение начальной дозы, с последующим введением одной или нескольких дополнительных иммунизирующих доз через адекватные временных интервалы. Схема иммунизации представляет собой программу для введения одной или более конкретных доз одной или более конкретных пневмококковых вакцин, одним или более конкретными путями введения, пациенту одного или более конкретного возраста.In accordance with the present invention, the administration of a pharmaceutical composition (eg, a vaccine) may include the delivery of only one dose, or, alternatively, may include the administration of an initial dose, followed by the administration of one or more additional immunizing doses at appropriate time intervals. An immunization regimen is a program for administering one or more specific doses of one or more specific pneumococcal vaccines, by one or more specific routes of administration, to a patient of one or more specific ages.
Настоящее изобретение относится к способам иммунизации, включающим введение по меньшей мере одной дозы вакцины молодому пациенту. В некоторых вариантах осуществления молодой пациент имеет возраст 18 лет или менее. В некоторых вариантах осуществления молодой пациент ранее получал одну или более доз конъюгатной пневмококковой полисахаридной вакцины; в других вариантах осуществления молодой пациент ранее не получал пневмококковые вакцины. В некоторых вариантах осуществления молодой пациент ранее был инфицирован или подвергался воздействию инфекции, вызываемой Klebsiella, Pseudomonas и/или E. coli.The present invention relates to methods of immunization comprising administering at least one dose of vaccine to a young patient. In some embodiments, the young patient is 18 years of age or less. In some embodiments, the young patient has previously received one or more doses of a pneumococcal polysaccharide conjugate vaccine; in other embodiments, the young patient has not previously received pneumococcal vaccines. In some embodiments, the young patient has previously been infected with or exposed to a Klebsiella, Pseudomonas , and/or E. coli infection.
Настоящее изобретение относится к способам иммунизации, включающим введение по меньшей мере одной дозы вакцины взрослому пациенту. В некоторых вариантах осуществления взрослый пациент имеет возраст более приблизительно 50 лет. В некоторых вариантах осуществления взрослый пациент имеет возраст более приблизительно 65 лет. В некоторых вариантах осуществления взрослый пациент ранее получал одну или более доз конъюгатной пневмококковой полисахаридной вакцины; в других вариантах осуществления взрослый пациент ранее не получал пневмококковые вакцины. В некоторых вариантах осуществления взрослый пациент ранее был инфицирован или подвергался воздействию инфекции, вызываемой Klebsiella, Pseudomonas и/или E. coli.The present invention relates to methods of immunization comprising administering at least one dose of a vaccine to an adult patient. In some embodiments, the adult patient is greater than about 50 years of age. In some embodiments, the adult patient is greater than about 65 years of age. In some embodiments, the adult patient has previously received one or more doses of a pneumococcal polysaccharide conjugate vaccine; in other embodiments, the adult patient has not previously received pneumococcal vaccines. In some embodiments, the adult patient has previously been infected with or exposed to a Klebsiella, Pseudomonas , and/or E. coli infection.
Схемы иммунизации настоящее раскрытие относится к для вызывания или индукции у пациента иммунного ответа (например, защитного иммунного ответа), достаточного для уменьшения по меньшей мере одного показателя, выбранного из группы, состоящей из заболеваемости, распространенности, частоты случаев и/или степени тяжести по меньшей мере одной инфекции, заболевания или нарушения, и/или по меньшей мере одного суррогатного маркера инфекции, заболевания или нарушения, в популяции и/или субпопуляции пациентов. Дополнительная схема иммунизации представляет собой схему, эффект которой связан с эффектом стандартной схемы, которую она дополняет. Дополнительная схема может требовать дополнительных введений и/или сверхиммуногенных доз иммуногенных композиций, описанных в настоящем изобретении, которые имеют место в стандартной схеме, или введения вакцин, не являющихся частью стандартной схемы. Полная схема иммунизации по настоящему изобретению может включать как стандартную схему, так и дополнительную схему. Иллюстративные примеры схем вакцинации приведены для иллюстративных целей. Подробное описание способов оценки иммуногенного ответа, приведенное в настоящем изобретении, позволяет разрабатывать альтернативы иллюстративным схемам иммунизации без излишнего экспериментирования.Immunization regimens The present disclosure relates to eliciting or inducing an immune response (e.g., a protective immune response) in a patient sufficient to reduce at least one indicator selected from the group consisting of incidence, prevalence, incidence, and/or severity of at least at least one infection, disease, or disorder, and/or at least one surrogate marker for infection, disease, or disorder, in a patient population and/or subpopulation. A supplementary immunization regimen is one whose effect is related to the effect of the standard regimen it supplements. An additional regimen may require additional administrations and/or superimmunogenic doses of the immunogenic compositions described in the present invention, which take place in a standard regimen, or administration of vaccines that are not part of a standard regimen. The complete immunization regimen of the present invention may include both a standard regimen and a supplementary regimen. Illustrative examples of vaccination schedules are provided for illustrative purposes. The detailed description of the methods for assessing the immunogenic response given in the present invention allows the development of alternatives to exemplary immunization regimens without undue experimentation.
В одном варианте осуществления настоящего изобретения первое введение пневмококковой вакцины, как правило, производят, когда пациент имеет возраст более приблизительно 50 лет, более приблизительно 55 лет, более приблизительно 60 лет, более приблизительно 65 лет или более приблизительно 70 лет. In one embodiment of the present invention, the first pneumococcal vaccine administration is typically given when the patient is over about 50 years old, over about 55 years old, over about 60 years old, over about 65 years old, or over about 70 years old.
В некоторых вариантах осуществления изобретения используют одно введение вакцины. Возможно, что цели по настоящему изобретению могут быть достигнуты при использовании одного введения, особенно когда один или более используемых вакцинных полисахаридов и/или конъюгатов, или их сочетания, является/являются сильным(и), и в такой ситуации схема с введением одной дозы является достаточной для индукции долгосрочного защитного иммунного ответа.In some embodiments, a single vaccine administration is used. It is possible that the objectives of the present invention can be achieved using a single administration, especially when one or more of the vaccine polysaccharides and/or conjugates used, or combinations thereof, is/are potent(s), and in such a situation, the regimen with the introduction of a single dose is sufficient to induce a long-term protective immune response.
В конкретных вариантах осуществления желательно вводить две или более доз вакцины для большей эффективности и охвата защитного иммунного ответа. Таким образом, в некоторых вариантах осуществления число доз составляет по меньшей мере две, по меньшей мере три, или более доз. Максимальное число доз не определено, однако в клинической практике рекомендуется не проводить иммунизацию чаще, чем это необходимо для достижения желаемого эффекта.In specific embodiments, it is desirable to administer two or more doses of a vaccine for greater efficacy and coverage of a protective immune response. Thus, in some embodiments, the number of doses is at least two, at least three, or more doses. The maximum number of doses is not defined, but in clinical practice it is recommended not to immunize more often than necessary to achieve the desired effect.
Без связи с конкретной теорией, первую дозу вакцины, вводимой в соответствии с изобретением, можно считать «примирующей» дозой. В конкретных вариантах осуществления схема иммунизации включает более одной дозы. В такой ситуации последующую дозу можно считать «бустерной» дозой.Without wishing to be bound by a particular theory, the first dose of a vaccine administered in accordance with the invention may be considered a "priming" dose. In specific embodiments, the immunization schedule includes more than one dose. In such a situation, the subsequent dose can be considered a "booster" dose.
Примирующую дозу можно вводить не получавшему ранее лечение пациенту (пациенту, который никогда ранее не получал полисахаридную вакцину). В некоторых вариантах осуществления примирующую дозу можно вводить пациенту, который ранее получал полисахаридную вакцину по меньшей мере за пять или более лет до введения начальной дозы вакцины по изобретению. В других вариантах осуществления примирующую дозу можно вводить пациенту, который ранее получал конъюгатную вакцину по меньшей мере за двадцать или более лет до введения примирующей дозы вакцины по изобретению.A priming dose can be administered to a previously untreated patient (a patient who has never previously received a polysaccharide vaccine). In some embodiments, a tame dose may be administered to a patient who has previously received a polysaccharide vaccine at least five or more years prior to the initial dose of the vaccine of the invention. In other embodiments, a priming dose may be administered to a patient who previously received a conjugate vaccine at least twenty years or more prior to the priming dose of a vaccine of the invention.
Если схема иммунизации требует введения двух или более отдельных доз, принимают решение об интервале между дозами. Интервал между двумя последовательными дозами может быть одним и тем же во всей схеме иммунизации или может быть изменен по мере увеличения возраста пациента. В схемах иммунизации по настоящему изобретению после введения первой дозы вакцины выдерживают первый интервал до введения следующей дозы. Первый интервал, как правило, составляет по меньшей мере приблизительно 2 недели, 1 месяц, 6 недель, 2 месяца, 3 месяца, 6 месяцев, 9 месяцев, 12 месяцев или более. Если впоследствии вводят более одной дозы, вторые (или более) интервалы могут быть выдержаны между такими последующими дозами. В некоторых вариантах осуществления все интервалы между последующими дозами имеют одинаковую продолжительность; в других вариантах осуществления вторые интервалы могут отличаться по продолжительности. В некоторых вариантах осуществления интервал между последующими дозами может составлять по меньшей мере приблизительно 12 месяцев, по меньшей мере приблизительно 15 месяцев, по меньшей мере приблизительно 18 месяцев, по меньшей мере приблизительно 21 месяц или по меньшей мере приблизительно 2 года. В конкретных вариантах осуществления интервал между дозами может составлять вплоть до 3 лет, вплоть до приблизительно 4 лет или вплоть до приблизительно 5 лет или 10 лет, или более. В конкретных вариантах осуществления интервалы между последующими дозами могут уменьшаться по мере увеличения возраста пациента.If the immunization schedule requires the administration of two or more separate doses, decide on the interval between doses. The interval between two consecutive doses may be the same throughout the entire immunization schedule or may be changed as the age of the patient increases. In the immunization schedules of the present invention, following the first dose of vaccine, a first interval is maintained until the next dose is given. The first interval is typically at least about 2 weeks, 1 month, 6 weeks, 2 months, 3 months, 6 months, 9 months, 12 months or more. If more than one dose is subsequently administered, second (or more) intervals may be maintained between such subsequent doses. In some embodiments, all intervals between successive doses are of the same length; in other embodiments, the implementation of the second intervals may differ in duration. In some embodiments, the interval between successive doses may be at least about 12 months, at least about 15 months, at least about 18 months, at least about 21 months, or at least about 2 years. In specific embodiments, the interval between doses can be up to 3 years, up to about 4 years, or up to about 5 years or 10 years, or more. In specific embodiments, the implementation of the intervals between subsequent doses may decrease as the age of the patient increases.
Специалисты в данной области понимают, что можно использовать различные возможные комбинации и подкомбинации различных временных условий для первого введения, самого короткого интервала, самого длинного интервала и общего количества введений (в абсолютном выражении или в пределах указанного периода), и все такие комбинации и подкомбинации следует считать предусмотренными авторами изобретения, даже если они специально не перечислены в настоящем изобретении.Those skilled in the art will appreciate that various possible combinations and subcombinations of different time conditions for the first administration, the shortest interval, the longest interval, and the total number of administrations (in absolute terms or within a specified period) can be used, and all such combinations and subcombinations should be considered as provided by the inventors, even if they are not specifically listed in the present invention.
Анализы для определения иммуногенного ответаAssays to determine the immunogenic response
В некоторых вариантах осуществления способ оценки иммуногенности и/или эффективности иммуногенного комплекса (и/или композиции, содержащей иммуногенный комплекс) включает оценку иммунного ответа на иммуногенную композицию. В некоторых вариантах осуществления оценку осуществляют путем проведения одного или более из серии in vitro анализов. В некоторых вариантах осуществления оцениваемый иммунный ответ представляет собой B-клеточный или T-клеточный ответ.In some embodiments, a method for evaluating the immunogenicity and/or efficacy of an immunogenic complex (and/or a composition comprising the immunogenic complex) comprises evaluating an immune response to the immunogenic composition. In some embodiments, the evaluation is carried out by conducting one or more of a series of in vitro assays. In some embodiments, the immune response being assessed is a B-cell or T-cell response.
В некоторых вариантах осуществления in vitro анализ выбирают из одного или более из ELISA, проточной цитометрии, оценки Th1/Th17 клеточного ответа, измерения уровней цитокинов и функциональных уровней антител методами ОФУ, определения уничтожения бактерий в сыворотке (SBA), агглютинации, подвижности, цитотоксичности, адгезии, агглютинации.In some embodiments, the in vitro assay is selected from one or more of ELISA, flow cytometry, Th1/Th17 cell response assessment, measurement of cytokine and functional antibody levels by PFU, serum kill bacteria (SBA), agglutination, motility, cytotoxicity, adhesion, agglutination.
В некоторых вариантах осуществления оценку осуществляют путем проведения одного или более из серии in vitro анализов. В некоторых вариантах осуществления для in vivo анализа используют животную модель внутрибольничного заболевания. В некоторых вариантах осуществления животная модель представляет собой модель одного или более из пневмонии, сепсиса, ожоговых ран, ЖК инфекции или инфекции операционного поля. В некоторых вариантах осуществления в in vivo анализе определяют одно или более из бактериального клиренса, колонизации или смертности, с пассивной защитой после заражения одним или более целевыми патогенами или активной защитой после заражения одним или более целевыми патогенами. В некоторых вариантах осуществления целевой патоген представляет собой внутрибольничный патоген.In some embodiments, the evaluation is carried out by conducting one or more of a series of in vitro assays. In some embodiments, an animal model of nosocomial disease is used for the in vivo assay. In some embodiments, the animal model is a model of one or more of pneumonia, sepsis, burn wounds, GI infection, or surgical site infection. In some embodiments, the in vivo assay determines one or more of bacterial clearance, colonization, or mortality, with passive protection after infection with one or more target pathogens, or active protection after infection with one or more target pathogens. In some embodiments, the target pathogen is a nosocomial pathogen.
В целом, может быть желательно оценивать гуморальные ответы, клеточные ответы и/или взаимодействие между ними. При оценке гуморальных ответов можно определять титры и/или типы антител (например, суммарные IgG, IgG1, IgG2, IgM, IgA и так далее) к конкретным серотипам патогена, например, до и/или после введения начальной или бустерной дозы вакцины (и/или в сравнении с уровнями антител в отсутствие антигенной стимуляции). Клеточные ответы можно оценивать путем мониторинга таких реакций, как гиперчувствительность замедленного типа, и так далее, на белок-носитель. Клеточные ответы также можно определять непосредственно путем оценки ответа моноцитов мононуклеарных клеток периферической крови (МКПК) на стимуляцию интересующими антигенами. Популяции B-клеточных предшественников и клеток памяти можно оценивать в клеточных иммуноферментных анализах (ELISpot) с использованием CPS и/или OPS конкретных патогенов.In general, it may be desirable to evaluate humoral responses, cellular responses and/or the interaction between them . When assessing humoral responses, antibody titers and/or types (e.g., total IgG, IgG1, IgG2, IgM, IgA, etc.) to specific pathogen serotypes can be determined, for example, before and/or after administration of an initial or booster dose of vaccine (and/ or compared with antibody levels in the absence of antigen challenge). Cellular responses can be assessed by monitoring responses such as delayed type hypersensitivity, and so on, to the carrier protein. Cellular responses can also be determined directly by assessing the response of peripheral blood mononuclear cell (PBMC) monocytes to stimulation with antigens of interest. Populations of B-cell progenitors and memory cells can be assessed in cellular enzyme-linked immunosorbent assays (ELISpot) using CPS and/or OPS of specific pathogens.
Любой из множества анализов можно использовать для определения уровней и/или активности антител в сыворотке у пациента. Подходящие анализы включают, например, анализы связывания лиганда, такие как радиоиммунные анализы (РИА), ELISA и мультиплексные анализы (Luminex, Bioplex); функциональные анализы, анализы опсонофагоцитирующей активности (ОФА); а также in vivo анализы защиты (анализы защиты у новорожденных крыс и в моделях колонизации легких у взрослых мышей и ЖКТ у грызунов, а также смертности).Any of a variety of assays can be used to determine serum antibody levels and/or activity in a patient. Suitable assays include, for example, ligand binding assays such as radioimmunoassays (RIAs), ELISAs, and multiplex assays (Luminex, Bioplex); functional assays, opsonophagocytic activity (OPA) assays; and in vivo protection assays (protection assays in neonatal rats and in adult mouse lung colonization and rodent GI tract and mortality assays).
В РИА обнаруживают специфические для типа антитела путем инкубации сыворотки с радиоактивно мечеными специфическими для типа полисахаридами в суспензии (например, Schiffiman et al., 1980). Комплексы антиген-антитело затем осаждают сульфатом аммония, и радиоактивно меченые осадки анализируют, определяя число импульсов в минуту (имп/мин).Type-specific antibodies are detected in RIA by incubating serum with radiolabeled type-specific polysaccharides in suspension (eg, Schiffiman et al., 1980). The antigen-antibody complexes are then precipitated with ammonium sulfate and the radioactively labeled precipitates are analyzed by counts per minute (ppm).
В методе обнаружения ELISA серотип-специфические антитела из сыворотки вакцинированных пациентов количественно определяют путем инкубации с серотип-специфическими полисахаридами, которые были адсорбированы на твердой подложке (например, Koskela and Leinonen (1981); Kojima et al., 1990; Concepcion and Frasch, 2001). Связанное антитело обнаруживают с использованием конъюгированных с ферментом вторичных обнаруживающих антител. ELISA также позволяет определять изотип и подкласс антител иммунного ответа (то есть, IgM против IgG или IgG1 против IgG2) с использованием специфических для изотипа или подкласса вторичных антител, и этот анализ может быть адаптирован для оценки авидности серотип-специфических антител (Anttila, et al., 1998; Romero-Steiner, et al., 2005). Мультиплексные анализы (например, Luminex, Bioplex) позволяют одновременно обнаруживать антитела к нескольким серотипам. Серотип-специфические CPS и/или OPS конъюгируют со спектрально отличающимися микросферами, которые смешивают и инкубируют с разбавленной сывороткой. Связанное антитело обнаруживают при помощи фикоэритрин-конъюгированного вторичного антитела, и количественно определяют в специализированном проточном цитометре, в котором используют один лазер для идентификации типа гранул (серотип) и второй лазер для количественного определения связанного вторичного антитела (Pickering, et al., 2002; Lal, et al. 2005).In the ELISA detection method, serotype-specific antibodies from the sera of vaccinated patients are quantified by incubation with serotype-specific polysaccharides that have been adsorbed onto a solid support (e.g., Koskela and Leinonen (1981); Kojimaet al., 1990; Conception and Frasch, 2001). Bound antibody is detected using enzyme-conjugated secondary detection antibodies. ELISA also allows the determination of the isotype and subclass of immune response antibodies (i.e., IgM versus IgG or IgG1 versus IgG2) using isotype- or subclass-specific secondary antibodies, and this assay can be adapted to assess the avidity of serotype-specific antibodies (Anttila,et al., 1998; Romero Steiner,et al., 2005). Multiplex analyzes (for example, Luminex, Bioplex) allow simultaneous detection of antibodies to several serotypes. Serotype-specific CPS and/or OPS conjugated with spectrally different microspheres, which are mixed and incubated with diluted serum. Bound antibody is detected with a phycoerythrin-conjugated secondary antibody and quantified on a specialized flow cytometer that uses one laser to identify the bead type (serotype) and a second laser to quantify the bound secondary antibody (Pickering,et al., 2002; lol,et al. 2005).
Подходом для оценки функционального антитела в сыворотке является ОФА, который позволяет количественно определять только антитела, которые способны опсонизировать бактерии, что приводит к поглощению и уничтожению бактерий. В стандартном анализе используют человеческую фагоцитирующую эффекторную клетку, источник комплемента, бактерии и разбавленную сыворотку. Определяемым показателем анализа является конечный титр сыворотки, при котором имеет место ≥50% уничтожение, в сравнении с бактериями, инкубированными только с комплементом и человеческими клетками (Romero-Steiner, et al., 1997). Этот ОФА уничтожения также может быть мультиплексирован за счет использования целевых штаммов патогенов, которые несут различные маркеры устойчивости к антибиотику (Kim, et al., 2003). Конечный титр 1:8, или более, считают положительным результатом в этих ОФА на уничтожение. Другим типом мультиплексного анализа опсонофагоцитирующей активности является анализ без уничтожения, в котором поглощение фагоцитирующими эффекторными клетками флуоресцентно окрашенного инкапсулированного патогена или флуоресцентных микросфер, конъюгированных с антигенными CPS и/или OPS из целевого патогена в присутствии разбавленной сыворотки плюс источник комплемента оценивают методом ПЦ (Martinez, et al., 1999). Опсоническую активность сывороточного антитела плюс комплемент также можно оценивать путем измерения окислительного ответа фагоцитирующих человеческих эффекторных клеок на поглощенный патоген (Munro, et al. 1985; Ojo-Amaize, et al. 1995).An approach for assessing functional antibody in serum is OFA, which only quantifies antibodies that are capable of opsonizing bacteria, resulting in engulfment and killing of the bacteria. The standard assay uses a human phagocytic effector cell, complement source, bacteria, and diluted serum. The assay measure is the final serum titer at which ≥50% kill occurs compared to bacteria incubated with complement and human cells alone (Romero-Steiner, et al., 1997). This kill OFA can also be multiplexed by using targeted pathogen strains that carry different antibiotic resistance markers (Kim, et al., 2003). A final titer of 1:8 or more is considered a positive result in these kill ROAs. Another type of multiplex opsonophagocytic activity assay is the no-kill assay, in which uptake by phagocytic effector cells of a fluorescently stained encapsulated pathogen or fluorescent microspheres conjugated to antigenic CPS and/or OPS from a target pathogen in the presence of diluted serum plus a complement source is assessed by the PC method (Martinez, et al . al., 1999). Opsonic activity of serum antibody plus complement can also be assessed by measuring the oxidative response of phagocytic human effector cells to an ingested pathogen (Munro, et al. 1985; Ojo-Amaize, et al. 1995).
Некоторые in vivo модельные системы можно использовать для оценки защиты, обеспечиваемой сывороточными антителами, продуцирование которых вызвано вакцинами по настоящему изобретению. В таких системах пассивной защиты мышам или крысам вводят патоген с разбавленной сывороткой, и определяют конечный титр сыворотки, который обеспечивает защиту от бактериемии, колонизации органов или тканей, или смертности (Stack, et al. 1998; Saeland, et al. 2000).Several in vivo model systems can be used to evaluate the protection afforded by serum antibodies elicited by the vaccines of the present invention. In such passive defense systems, mice or rats are injected with a dilute serum pathogen and a final serum titer is determined that provides protection against bacteremia, organ or tissue colonization, or mortality (Stack, et al. 1998; Saeland, et al. 2000).
Композиции антителAntibody compositions
Некоторые варианты осуществления относятся к композиции антител, содержащей антитела, выработанные в организме млекопитающего, иммунизированного иммуногенным комплексом по изобретению. В некоторых вариантах осуществления антитело включает по меньшей мере одно антитело, выбранное из группы, состоящей из мАт и антиидиотипических антител. В некоторых вариантах осуществления композиция антител содержит выделенную фракцию гамма-глобулина.Some embodiments relate to an antibody composition comprising antibodies produced in a mammal immunized with an immunogenic complex of the invention. In some embodiments, the antibody comprises at least one antibody selected from the group consisting of mAbs and anti-idiotypic antibodies. In some embodiments, the antibody composition contains an isolated fraction of gamma globulin.
НаборыSets
Настоящее изобретение также относится к наборам для получения иммуногенного комплекса, описанного в настоящем изобретении, которые позволяют исследователю создавать иммуногенный комплекс с предпочтительными антигенами, например, в исследовательских целях для оценки эффекта антигена, или сочетания антигенов, на иммунный ответ. Такие наборы можно готовить из легко доступных материалов и реагентов. Например, такие наборы могут включать любые один или более из следующих материалов: контейнер, содержащий каркасный полимер, сшитый с множеством первых аффинных молекул; и контейнер, содержащий комплементарную аффинную молекулу, которая связывается с первой аффинной молекулой, при этом комплементарная аффинная молекула связывается с антигеном.The present invention also relates to kits for preparing the immunogenic complex described in the present invention, which allow the researcher to create an immunogenic complex with preferred antigens, for example, for research purposes to evaluate the effect of an antigen, or combination of antigens, on an immune response. Such kits can be prepared from readily available materials and reagents. For example, such kits may include any one or more of the following: a container containing a backbone polymer crosslinked with a plurality of first affinity molecules; and a container containing a complementary affinity molecule that binds to the first affinity molecule, wherein the complementary affinity molecule binds to an antigen.
В другом варианте осуществления набор может включать контейнер, содержащий полимер, например, полисахарид, контейнер, содержащий множество первых аффинных молекул, и контейнер, содержащий сшивающий реагент для сшивания первых аффинных молекул с каркасным полимером.In another embodiment, the kit may include a container containing a polymer, such as a polysaccharide, a container containing a plurality of first affinity molecules, and a container containing a crosslinker for crosslinking the first affinity molecules to the backbone polymer.
В некоторых вариантах осуществления набор также включает средства для присоединения комплементарной аффинной молекулы к антигену, при этом присоединение может происходить при помощи сшивающего реагента или при помощи какого-либо промежуточного слитого белка. В некоторых вариантах осуществления набор может включать по меньшей мере один костимулирующий фактор, который может быть добавлен к полимеру. В некоторых вариантах осуществления набор включает сшивающий реагент, например, но без ограничения, CDAP (1-циано-4-диметиламинопиридиния тетрафторборат), EDC (1-этил-3-[3-диметиламинопропил]карбодиимида гидрохлорид), цианоборогидрид натрия; цианоген бромид; бикарбонат аммония/иодуксусная кислота, для связывания кофактора с полимером.In some embodiments, the kit also includes means for attaching a complementary affinity molecule to an antigen, which attachment can be by a crosslinker or by some intermediate fusion protein. In some embodiments, the kit may include at least one costimulatory factor that may be added to the polymer. In some embodiments, the kit includes a crosslinking reagent, for example, but not limited to, CDAP (1-cyano-4-dimethylaminopyridinium tetrafluoroborate), EDC (1-ethyl-3-[3-dimethylaminopropyl]carbodiimide hydrochloride), sodium cyanoborohydride; cyanogen bromide; ammonium bicarbonate/ioacetic acid, to bind the cofactor to the polymer.
Различные наборы и компоненты могут быть созданы для использования в способах, описанных в настоящем изобретении, в зависимости от запланированного применения набора, конкретного целевого антигена и потребностей пользователя.Various kits and components can be created for use in the methods described in the present invention, depending on the intended use of the kit, the specific target antigen and the needs of the user.
ПРИМЕРЫEXAMPLES
Для более полного понимания изобретения, описанного в настоящем изобретении, приведены следующие примеры. Репрезентативные примеры включают информацию, пояснение на примере и руководство, которое можно адаптировать для осуществления на практике настоящего изобретения в его различных вариантах осуществления и его эквивалентах. Следует понимать, что данные примеры предназначены исключительно для иллюстративных целей и не должны восприниматься, как ограничивающие настоящее изобретения каким-либо образом.For a more complete understanding of the invention described in the present invention, the following examples are given. Representative examples include information, exemplary explanation, and guidance that can be adapted to practice the present invention in its various embodiments and equivalents. It should be understood that these examples are for illustrative purposes only and should not be taken as limiting the present invention in any way.
Пример 1: Бактериальные штаммыExample 1: Bacterial strains
Штаммы-реагенты пересевали три раза на среде, не содержащей продукты животного происхождения, для удаления любых возможных примесей продуктов животного происхождения. Характеристики штаммов сравнивали перед пересевом, в процессе пересева и после пересева. Для Pseudomonas: окрашивание по Граму, морфология колоний, АФС, оксидазный тест, рост на агаре Мак-Конки, серотипирование IATS, кинетика роста. Для Klebsiella: окрашивание по Граму, морфология колоний, АФС, молекулярное серотипирование методом полимеразной цепной реакции (ПЦР), подтверждение мутаций методом ПЦР и секвенирования (по мере необходимости), K-типирование (методом ПЦР), кинетика роста.Reagent strains were subcultured three times on media free of animal products to remove any possible animal product impurities. The characteristics of the strains were compared before passage, during passage and after passage. For Pseudomonas : Gram stain, colony morphology, APS, oxidase test, growth on McConkey agar, IATS serotyping, growth kinetics. For Klebsiella : Gram stain, colony morphology, API, molecular serotyping by polymerase chain reaction (PCR), confirmation of mutations by PCR and sequencing (as required), K-typing (by PCR), growth kinetics.
Таблица 2: Штаммы Table 2: Strains Klebsiella Klebsiella и штаммы-реагенты, используемые в исследованииand reagent strains used in the study
Δwzabc ∆guaBA
Δwzabc
b Klebsiella oxytoca a ΔguaBA=guanine biosynthetic mutant (attenuated); Δwzabc=capsule mutant
b Klebsiella oxytoca
Гены guaBA и wzabc были делетированы с использованием Red-рекомбинации лямбда. Вкратце, проводили слияние ДНК выше и ниже генов guaBA и wzabc с кассетой устойчивости к канамицину, и линейную ДНК вводили трансформацией в штаммы K. pneumoniae, которые также содержали хелперную плазмиду, способную экспрессировать гены рекомбиназы фага лямбда. После индукции эти гены стимулируют гомологичную рекомбинацию, которая позволяет заменять гены guaBA и wzabc кассетой устойчивости к канамицину. Кассету устойчивости к канамицину впоследствии удаляли с использованием фермента флиппазы, который стимулирует рекомбинацию между сайтами FRT, фланкирующими кассету. Было подтверждено, что мутанты являются чувствительными к канамицину, и делеция была подтверждена методом ПЦР и секвенированием делеции. The guaBA and wzabc genes were deleted using Lambda Red recombination. Briefly, the DNA upstream and downstream of the guaBA and wzabc genes was fused to the kanamycin resistance cassette, and the linear DNA was introduced by transformation into K. pneumoniae strains that also contained a helper plasmid capable of expressing the lambda phage recombinase genes. Upon induction, these genes stimulate homologous recombination, which allows the replacement of the guaBA and wzabc genes with a kanamycin resistance cassette. The kanamycin resistance cassette was subsequently removed using the Flippase enzyme, which stimulates recombination between FRT sites flanking the cassette. The mutants were confirmed to be susceptible to kanamycin and the deletion was confirmed by PCR and deletion sequencing.
Таблица 3: Штаммы Table 3: Strains Pseudomonas aeruginosa Pseudomonas aeruginosa (PA), используемые в исследовании(PA) used in the study
Создание штамма PA, избыточно продуцирующего экзополисахарид PsLCreation of a PA strain that overproduces PsL exopolysaccharide
Иллюстративные генетические подходы к реконструкции восприимчивого к индукции PsL штамма P. aeruginosa PAO1 Δpsl/pBAD-psl с использованием 1886-п.н. синтетической ДНК от компании Genscript, Piscataway, NJ, представлены на Фигуре 9B.Exemplary genetic approaches to reconstruct a PsL-responsive P. aeruginosa strain PAO1 Δpsl /pBAD- psl using 1886-bp synthetic DNA from Genscript, Piscataway, NJ, are presented in Figure 9B.
Промотор araC-pBAD вводили выше гена pslA P. aeruginosa PAO1 путем гомологичной рекомбинации. Фактически, ДНК выше pslA амплифицировали из P. aeruginosa PAO1 и лигировали выше кассеты устойчивости к гентамицину. Конструкт, состоящий из синтетической ДНК, содержащей промотор araC-pBAD и ген pslA, лигировали ниже кассеты устойчивости к гентамицину. Весь этот конструкт вставляли в плазмиду pEX100T для мутагенеза Pseudomonas. Мутагенез выполняли, как описано ранее (Schweizer et al., 1992). Ген устойчивости к гентамицину впоследствии удаляли, и вставку промотора araC-pBAD подтверждали методом ПЦР и секвенирования.The araC-pBAD promoter was introduced upstream of the P. aeruginosa PAO1 pslA gene by homologous recombination. In fact, DNA upstream of pslA was amplified from P. aeruginosa PAO1 and ligated upstream of the gentamicin resistance cassette. A construct consisting of synthetic DNA containing the araC-pBAD promoter and the pslA gene was ligated downstream of the gentamicin resistance cassette. This entire construct was inserted into the pEX100T plasmid for Pseudomonas mutagenesis. Mutagenesis was performed as previously described (Schweizer et al., 1992). The gentamicin resistance gene was subsequently deleted and the insertion of the araC-pBAD promoter was confirmed by PCR and sequencing.
Пример 2: Получение O- и K-полисахаридных антигеновExample 2 Preparation of O- and K-Polysaccharide Antigens
Выращивание штаммов Growing strains KlebsiellaKlebsiella spp. и spp. And P. aeruginosaP. aeruginosa
Все штаммы-реагенты Klebsiella и PA пересевали три раза на среде, не содержащей продукты животного происхождения, для удаления любых возможных примесей продуктов животного происхождения. Исследовательские банки клеток (ИБК) выращивали во встряхиваемых колбах в бульоне Hy-Soy® и асептически переносили аликвотами во флаконы с глицерином в конечной концентрации 15%. Бактерии выращивали в 8-л ферментере BioFlo 415 в среде с определенным химическим составом (CDM), содержащей одноосновный фосфат калия, фосфат аммония, лимонную кислоту, моногидрат, сульфат магния (MgSO4), полипропиленгликоль (ППГ) (пеногаситель), 3% глицерин в качестве источника углерода, витамины и микроэлементы, а также отдельные аминокислоты, по мере необходимости. Растворенный кислород поддерживали на уровне 30% с каскадным режимом, установленным на минимальную скорость перемешивания 200 об/мин, и pH доводили до 7 гидроксидом аммония. В процессе ферментации в среду добавляли в порционном режиме, по мере необходимости, 50% глицерин, MgSO4, следовые количества витаминов и микроэлементы. Бактерии выращивали в течение 12-18 ч до стационарной фазы, после чего культуры клеток собирали для получения полисахарида.All Klebsiella and PA reagent strains were subcultured three times on media free of animal products to remove any possible animal product contaminants. Research Cell Banks (RPBs) were grown in shake flasks in Hy- Soy® broth and aliquoted aseptically into 15% glycerol vials . Bacteria were grown in an 8 L BioFlo 415 fermenter in chemically defined medium (CDM) containing monobasic potassium phosphate, ammonium phosphate, citric acid, monohydrate, magnesium sulfate (MgSO 4 ), polypropylene glycol (PPG) (antifoam), 3% glycerol as a source of carbon, vitamins and trace elements, as well as individual amino acids, as needed. Dissolved oxygen was maintained at 30% with cascade set to a minimum stirring speed of 200 rpm and the pH was adjusted to 7 with ammonium hydroxide. During fermentation, 50% glycerol, MgSO 4 , trace amounts of vitamins and microelements were added to the medium in portions, as needed. Bacteria were grown for 12-18 hours to stationary phase, after which cell cultures were harvested to obtain the polysaccharide.
Очистка O-полисахарида KP и корового O-полисахарида PAPurification of O-polysaccharide KP and core O-polysaccharide PA
Схема последовательности операций последующего процесса очистки OPS из KP и PA представлена на Фигуре 8A. Вкратце, после завершения ферментации всю ферментационную культуру обрабатывали либо 1% уксусной кислотой при 100°C в течение 4 ч в случае клеточной культуры P. aeruginosa, либо нитритом натрия в уксусной кислоте при 4°C в случае клеточной культуры K. Pneumoniae, в течение 12 ч. После осветления методом центрифугирования и глубинной фильтрации (0,45-мкм) осветленный раствор, содержащий гидролизованный и высвобожденный OPS, подвергали проточной фильтрации вдоль потока (TFF) УФ-ДФ с 10 кДа или 30 кДа NMWCO мембраной, проводя диафильтрацию против 1M NaCl, а затем Tris-буфера. Ретентат затем пропускали через сильную анионообменную мембрану для проведения ионообменной хроматографии (ИОХ) в Tris-буфере. Отрицательно заряженные PA OPS были захвачены на мембране (Фигура 8A), а затем элюированы хлоридом натрия. Нейтральные KP OPS и нейтральные или слабокислые PA OPS получали в проточной фазе (ПФ) через ИОХ мембрану. Проточную фазу или элюат после ИОХ затем осаждали сульфатом аммония для удаления остаточного белка. KP OPS в супернатанте сульфата аммония затем подвергали двум последовательным TFF фильтрациям, начиная с 300 кДа NMWCO мембраны, после которой ПФ концентрировали и проводили диафильтрацию с использованием 5 или 10 кДа NMWCO мембраны. Ретентат этой более поздней ПФ TFF содержал очищенные нейтральные KP OPS (Фигура 8A). Очищенные нейтральные и кислые PA OPS в супернатанте сульфата аммония (NH4SO4) подвергали TFF с 5-10 кДа мембраной (Фигура 8A), после которой они находились в ретентате. Конечный продукт OPS имел среднюю ММ при измерении методом ЭХ-многоуглового рассеяния лазерного излучения (ЭХ-MALLS) в диапазоне 10-30 кДа в зависимости от O-типа, и имел низкое содержание эндотоксина, белка и нуклеиновых кислот.The sequence diagram of the subsequent purification process of OPS from KP and PA is presented in Figure 8A. Briefly, after fermentation was complete, the entire fermentation culture was treated with either 1% acetic acid at 100°C for 4 h in the case of a P. aeruginosa cell culture, or with sodium nitrite in acetic acid at 4°C in the case of a K. pneumoniae cell culture, for 12 hours. After clarification by centrifugation and depth filtration (0.45-μm), the clarified solution containing hydrolyzed and released OPS was subjected to flow filtration along the flow (TFF) of UV-DF with a 10 kDa or 30 kDa NMWCO membrane, diafiltration against 1M NaCl and then Tris buffer. The retentate was then passed through a strong anion exchange membrane for ion exchange chromatography (IOC) in Tris buffer. Negatively charged PA OPS were captured on the membrane (Figure 8A) and then eluted with sodium chloride. Neutral KP OPS and neutral or slightly acidic PA OPS were obtained in a flow phase (FP) through an IOC membrane. The flow phase or eluate after the IOC was then precipitated with ammonium sulfate to remove residual protein. KP OPS in the ammonium sulfate supernatant was then subjected to two consecutive TFF filtrations starting with a 300 kDa NMWCO membrane, after which the PF was concentrated and diafiltered using a 5 or 10 kDa NMWCO membrane. The retentate of this later PF TFF contained purified neutral KP OPS (Figure 8A). Purified neutral and acidic PA OPS in ammonium sulfate (NH 4 SO 4 ) supernatant were subjected to TFF with a 5-10 kDa membrane (Figure 8A), after which they were in retentate. The final OPS product had an average MW measured by EC-Multi-Angle Laser Light Scattering (EC-MALLS) in the range of 10-30 kDa depending on the O-type, and was low in endotoxin, protein, and nucleic acids.
Очистка капсульного полисахарида Purification of the capsular polysaccharide Klebsiella oxytocaKlebsiella oxytoca K19 (KP K19 CPS) K19 (KP K19 CPS)
Иллюстративная схема последовательности операций последующего процесса очистки KP K19 CPS представлена на Фигуре 9A. Вкратце, после инактивации формальдегидом и осветления методом прерывистого центрифугирования и поверхностной фильтрации (0,45-мкм) осветленный раствор, содержащий CPS, концентрировали и проводили диафильтрацию методом TFF с 30 кДа NMWCO мембраной. 30-кДа ретентат осаждали CTAB. Осадок повторно растворяли хлоридом кальция и осаждали 20% этанолом для удаления примесей нуклеиновых кислот и белка. После центрифугирования собранный супернатант осаждали 80% этанолом. Содержащий CPS осадок повторно растворяли в Tris-буфере и захватывали на слабой анионообменной смоле. K19 CPS, элюированный со смолы, дополнительно обрабатывали (обезвреживали) 0,1 M NaOH в 90% этаноле для удаления любого остаточного концевого липида, участвующего в его агрегации, и эндотоксина (что определяли по активности лизата амебоцитов мечехвоста (LAL)) (Фигура 9A). Конечный полисахаридный продукт K19 имел среднюю ММ 220 кДа при измерении методом ЭХ-MALLS, и имел низкое содержание эндотоксина, белка и нуклеиновых кислот.An exemplary flow diagram of the subsequent purification process KP K19 CPS is shown in Figure 9A. Briefly, after formaldehyde inactivation and clarification by intermittent centrifugation and surface filtration (0.45 μm), the clarified solution containing CPS was concentrated and TFF diafiltered with a 30 kDa NMWCO membrane. The 30 kDa retentate was precipitated with CTAB. The precipitate was redissolved with calcium chloride and precipitated with 20% ethanol to remove nucleic acid and protein impurities. After centrifugation, the collected supernatant was precipitated with 80% ethanol. The CPS-containing pellet was redissolved in Tris buffer and captured on a weak anion exchange resin. K19 CPS eluted from the resin was further treated (decontaminated) with 0.1 M NaOH in 90% ethanol to remove any residual terminal lipid involved in its aggregation and endotoxin (as determined by horseshoe crab amoebocyte lysate (LAL) activity) (Figure 9A ). The final polysaccharide product K19 had an average MW of 220 kDa as measured by SEC-MALLS and was low in endotoxin, protein and nucleic acids.
Очистка экзополисахарида PsL PAPurification of the exopolysaccharide PsL PA
Схема последовательности операций последующего процесса очистки экзополисахарида PsL представлена на Фигуре 9C. Вкратце, бактериальную культуру PA осветляли центрифугированием при 10000 x g в течение 40 минут при RT, и супернатант фильтровали через 0,5-0,3-мкм глубинный фильтр. Фильтрованный супернатант подвергали диафильтрации TFF с использованием 100 кДа MWCO PES мембраны с 10 диаобъемами воды для инъекций (WFI), пермеат собирали и концентрировали с использованием 2 кДа мембраны Hydrosart 10-20x УФ, проводили диафильтрацию с 10 диаобъемами 50 мМ Tris HCl, 50 мМ NaCl, pH 7,5. Концентрированный элюат затем подвергали хроматографии на сильной анионообменной смоле (IEX), используя GE Q-Sepharose Fast Flow, и проточную фазу собирали, промывая еще одним объемом колонки элюэнта. Элюат концентрировали и подвергали диафильтрации с WFI, используя 2 кДа мембрану Hydrosart, а затем осаждали 80% этанолом при RT в течение 18 ч. После центрифугирования при 4000 x g в течение 30 мин осадок растворяли в WFI, стерилизовали фильтрованием через 0,2-мкм фильтр и лиофилизировали. Конечный очищенный полисахаридный материал анализировали методом HPAEC/PAD (высокоэффективной аниононообменной хроматографии с импульсным электрохимическим детектированием), используя капиллярный прибор Dionex ICS-4000 и колонку CarboPac PA10, а также коммерчески доступные стандарты моносахаридов, для определения моносахаридного состава, остаточный белок определяли методом Бредфорд, остаточные нуклеиновые кислоты определяли при помощи набора Q-bit Life Technologies quant-IT kit, эндотоксин определяли в анализе LAL, и общее содержание углеводов определяли в анализе с антроновым реактивом. Конечный материал также анализировали методом H-ЯМР с высоким разрешением для подтверждения его структуры и методом ЭХ-ВЭЖХ для оценки молекулярной массы.The sequence diagram of the subsequent purification process of the PsL exopolysaccharide is shown in Figure 9C. Briefly, the PA bacterial culture was clarified by centrifugation at 10,000 x g for 40 minutes at RT and the supernatant was filtered through a 0.5-0.3 μm depth filter. The filtered supernatant was diafiltered with TFF using a 100 kDa MWCO PES membrane with 10 diavolumes of water for injection (WFI), the permeate was collected and concentrated using a 2 kDa Hydrosart 10-20x UV membrane, diafiltered with 10 diavolumes of 50 mM Tris HCl, 50 mM NaCl , pH 7.5. The concentrated eluate was then subjected to strong anion exchange resin (IEX) chromatography using GE Q-Sepharose Fast Flow and the flow phase was collected by washing with another column volume of eluent. The eluate was concentrated and diafiltered with WFI using a 2 kDa Hydrosart membrane and then precipitated with 80% ethanol at RT for 18 h. and lyophilized. The final purified polysaccharide material was analyzed by HPAEC/PAD (high performance anion exchange chromatography with pulsed electrochemical detection) using a Dionex ICS-4000 capillary instrument and a CarboPac PA10 column, as well as commercially available monosaccharide standards, to determine the monosaccharide composition, residual protein was determined by the Bradford method, residual nucleic acids were determined using the Q-bit Life Technologies quant-IT kit, endotoxin was determined in the LAL assay, and total carbohydrates were determined in the anthrone reagent assay. The final material was also analyzed by high resolution H-NMR to confirm its structure and by SEC-HPLC to estimate the molecular weight.
Аналитические методы определения характеристик O- и K-антигеновAnalytical methods for characterizing O- and K-antigens
Чистоту и природу OPS и CPS, полученных методами, описанными выше, определяли следующим образом. Концентрацию остаточного белка определяли методом Бредфорд и/или BCA; концентрацию нуклеиновых кислот определяли в анализе с пико зеленым или на основании поглощения при 260 нм; уровни эндотоксина определяли с использованием анализа LAL; и сахарный состав полисахаридов определяли методом кислотного гидролиза с последующим разделением отдельных моносахаридов методом HPAEC-PAD (Dionex), как описано выше. Физическую целостность полисахаридов определяли методом 1H-ЯМР с высоким разрешением при 500, 800 или 950 МГц с использованием спектрофотометра Bruker для записи спектров и сравнения полученных спектров со спектрами, опубликованными в литературе. Природу полисахаридов и целостность эпитопов на очищенных нативных и химически дериватизированных полисахаридах в процессе и в конечных продуктах подтверждали методом ELISA с использованием специфических моноклональных антител к OPS и CPS, а также поликлональной кроличьей иммунной сыворотки против убитых нагреванием характерных для типа бактерий. Присутствие O-ацетильных групп на полисахаридах определяли в колориметрическом анализе Хестрина и методом 1H-ЯМР. Размер полисахаридов определяли методом ЭХ-ВЭЖХ (Фигуры 8B и 8C) и ЭХ-MALLS, используя колонки соответствующего размера. Концентрацию полисахаридов определяли в анализе с антроновым реактивом.The purity and nature of the OPS and CPS obtained by the methods described above was determined as follows. Residual protein concentration was determined by the Bradford and/or BCA method; nucleic acid concentration was determined in pico green assay or based on absorbance at 260 nm; endotoxin levels were determined using LAL assay; and the sugar composition of the polysaccharides was determined by acid hydrolysis followed by separation of individual monosaccharides by HPAEC-PAD (Dionex) as described above. The physical integrity of the polysaccharides was determined by high resolution 1H-NMR at 500, 800 or 950 MHz using a Bruker spectrophotometer to record spectra and compare the resulting spectra with spectra published in the literature. The nature of the polysaccharides and the integrity of the epitopes on the purified native and chemically derivatized polysaccharides in the process and in the final products were confirmed by ELISA using specific monoclonal antibodies to OPS and CPS, as well as polyclonal rabbit immune sera against heat-killed type-specific bacteria. The presence of O-acetyl groups on the polysaccharides was determined by Hestrin colorimetric analysis and 1H-NMR. The size of the polysaccharides was determined by SEC-HPLC (Figures 8B and 8C) and SEC-MALLS using appropriately sized columns. The concentration of polysaccharides was determined in the analysis with the anthrone reagent.
Пример 3: Общий способ биотинилирования OPS и CPSExample 3 General Procedure for Biotinylation of OPS and CPS
Биотинилирование полисахаридов (PS), содержащих гидроксильные группы, осуществляли с использованием CDAP в качестве активирующего реагента. Полисахариды растворяли в не содержащей LPS воде (категории «для клеточных культур»; HyClone) до конечной концентрации 1-5 мг/мл. В момент времени 0 некоторый объем CDAP (свежеприготовленного в концентрации 100 мг/мл в ацетонитриле) добавляли в конечном соотношении 1 мг CDAP на 1 мг PS при перемешивании на вихревой мешалке. Через 30 с добавляли некоторый объем 0,2 M триэтиламина (TEA; Sigma-Aldrich) для повышения pH до 8 (в случае нейтральных PS объем TEA равен объему CDAP; в случае кислых PS объем TEA удвоен). Через 2,5 мин некоторый объем производного биотина (Pierce EZ-Link амин-ПЭГ3-биотин, 20 мг/мл в воде) добавляли до конечного соотношения 1 мг биотина на 1 мг PS, с последующей инкубацией при комнатной температуре в течение 1-4 ч. Для более разбавленных образцов (<1 мг/мл) использовали инкубацию в течение ночи. Реакцию останавливали добавлением 25 мМ глицина, и избыток биотина удаляли путем интенсивного диализа против PBS.Biotinylation of polysaccharides (PS) containing hydroxyl groups was carried out using CDAP as an activating reagent. The polysaccharides were dissolved in LPS-free water (cell culture category; HyClone) to a final concentration of 1-5 mg/mL. At
В случае каркасного полимера BP-1.2 биотинилирование полимера K19 CPS продолжали путем активации карбоксилатных групп остатков уроновой кислоты 1-этил-3-[3-диметиламинопропил]карбодиимид гидрохлоридом (EDC, Pierce) и N-гидроксисукцинимидом (NHS) для повышения эффективности или создания стабильных сухих (аминореактивных) промежуточных соединений. EDC соединяет NHS с карбоксилами, с получением NHS сложного эфира, который значительно более стабилен, чем промежуточное соединение O-ацилизомочевины, при этом допуская эффективную конъюгацию с первичными аминами при физиологических значениях pH. Амино-производное биотина (Pierce EZ-Link амин-ПЭГ3-биотин) затем использовали для биотинилирования NHS сложноэфирных промежуточных соединений K19 CPS.In the case of backbone polymer BP-1.2, biotinylation of polymer K19 CPS was continued by activating the carboxylate groups of uronic acid residues of 1-ethyl-3-[3-dimethylaminopropyl]carbodiimide hydrochloride (EDC, Pierce) and N -hydroxysuccinimide (NHS) to increase efficiency or create stable dry (amino-reactive) intermediates. EDC couples NHS to carboxyls to form an NHS ester that is significantly more stable than the O-acylisourea intermediate while allowing efficient conjugation to primary amines at physiological pH. An amino derivative of biotin (Pierce EZ-Link amine-PEG3-biotin) was then used to biotinylate NHS ester intermediates K19 CPS.
Общую концентрацию сахара определяли либо в анализе с антроновым реактивом в случае OPS/CPS Klebsiella, либо в анализе с резорцинолом в случае PA OPS.Total sugar concentration was determined either in an anthrone assay for OPS/CPS Klebsiella or in a resorcinol assay for PA OPS.
Пример 4: Конструирование антигенов рекомбинантного ризавидина и слитого белка ризавидинаExample 4: Construction of Recombinant Rizavidin and Rizavidin Fusion Protein Antigens
Дизайн и конструирование экспрессионных конструктов слитых белков ризавидина из Design and construction of rizavidin fusion protein expression constructs from K. pneumoniaeK. pneumoniae и And P. aeruginosaP. aeruginosa
В случае флагеллинов Pseudomonas (FliC) A (FlaA) и B (FlaB), in silico конструкция жгутикового волокна на основе упаковки FliC Pseudomonas в кристалле указывает на то, что домен 2 (D2) был бы экспонирован в раствор и мог бы играть важную роль в иммуногенности (Song, 2014). Кроме того, FliC Pseudomonas активирует врожденные иммунные реакции за счет его узнавания TLR5, что, вероятно, приводит к реакционной способности, вследствие этого, авторы изобретения создали и оценили некоторые из флагеллинов Pseudomonas, в которых были удалены TLR5-связывающий домен и прилегающие области, и оставлен лишь домен 2. Полученные последовательности FlaA2-Домен2 и FlaB-Домен2, лишенные TLR5-связывающего домена, были экспрессированы либо в виде слитого белка только с ризавидином, либо с ризавидином и MrkA или PcrV Klebsiella. Схематическое изображение созданных и экспрессированных вариантов слитых белков ризавидин-антиген, полученных из Pseudomonas (FlaB; FlaA1; FlaA2; PcrV; FlaB-PcrV; FlaB-D2; FlaA2-D2; FlaB-D2-PcrV), и гибридных слитых белков ризавидина, полученных как из Klebsiella, так и из Pseudomonas (FlaB-D2-MrkA; PcrV-MrkA), представлены на Фигуре 12A.In the case of Pseudomonas flagellins (FliC) A (FlaA) and B (FlaB), the in silico flagellar fiber design based on Pseudomonas FliC packaging in crystal indicates that domain 2 (D2) would be exposed to solution and could play an important role. in immunogenicity (Song, 2014). In addition, Pseudomonas FliC activates innate immune responses through its recognition of TLR5, which likely results in reactivity, therefore, the inventors created and evaluated some of the Pseudomonas flagellins in which the TLR5-binding domain and adjacent regions were removed, and
В случае P. aeruginosa, флагеллин был выбран в качестве вероятного белка-носителя и защитного антигена, поскольку он является основным компонентом жгутиков; кроме того, как известно, антитела к флагеллину ингибируют подвижность, необходимую для диссеминированный инфекции, и, как было показано, оказывают защитное действие в животной модели инфекции. В случае флагеллина, серотип A2 является высоко консервативным, однако слегка отличается от A1 и значительно по домену 2 от серотипа B. Для оценки активности этих вариантов флагеллины серотипов A1 (FlaA1), A2 (FlaA2) и B (FlaB) клонировали и экспрессировали в виде полноразмерных белков. Домен 2 только из флагеллинов A2 и B также клонировали и экспрессировали, поскольку этот домен находится на поверхности собранных жгутиков и, вероятно, является мишенью для нейтрализующих антител. Это позволило отдельно оценить вклад TLR5-связывающего домена для адаптивного иммунного ответа. Выбранные последовательности были синтезированы и клонированы в плазмиды для прямой экспрессии в E. coli с амино-концевым слитым белком ризавидина и меткой из шести остатков гистидина для начальной аффинной очистки (Фигура 12A).In the case of P. aeruginosa , flagellin was chosen as the likely carrier protein and protective antigen because it is a major component of the flagella; in addition, anti-flagellin antibodies are known to inhibit the motility required for disseminated infection and have been shown to be protective in an animal model of infection. In the case of flagellin, serotype A2 is highly conserved, but differs slightly from A1 and significantly in
В случае P. aeruginosa, PcrV также был выбран, поскольку он кодирует концевой белок секреторного аппарата III типа. Он также известен в качестве защитного антигена, поскольку антитела, специфические для PcrV, способны защищать против инвазивной инфекции. Последовательность является высоко консервативной, в ней аминокислотные изменения имеют место лишь в 4 положениях из 294 аминокислот в 18 разных штаммах P. aeruginosa. Последовательность была синтезирована и клонирована в плазмиду для прямой экспрессии в E. coli с амино-концевым слитым белком ризавидина и меткой из шести остатков гистидина для начальной аффинной очистки (Фигура 12A).In the case of P. aeruginosa , PcrV was also chosen because it encodes a type III secretory terminal protein. It is also known as a protective antigen, since antibodies specific for PcrV are able to protect against invasive infection. The sequence is highly conserved, with amino acid changes occurring at only 4 positions out of 294 amino acids in 18 different strains of P. aeruginosa . The sequence was synthesized and cloned into an E. coli direct expression plasmid with an amino-terminal rizavidin fusion protein and a six-residue histidine tag for initial affinity purification (Figure 12A).
В случае K. pneumoniae, был выбран MrkA, поскольку он кодирует основную фимбриальную субъединицу пилей 3 типа и иммунологически доминантную часть фимбрий. Фимбрии 3 типа необходимы для образования биопленок, и MrkA играет основную роль в образовании биопленок и адгезии, это свидетельствует о том, что данный антиген может обеспечивать защиту в вакцинной композиции. Установлено, что MrkA является высоко консервативным в 9 разных генотипах K. pneumoniae, с аминокислотным изменением лишь в 1 положении среди 180 аминокислот. В одном дополнительном генотипе имеет место несколько более высокое число изменений, в 9 положениях среди 180 аминокислот (Таблица 4). Для других фимбриальных субъединиц пилей 3 типа была разработана стратегия для стабилизации мономера в процессе экспрессии, называемая методом комплементации донорской цепи (Walczak, 2014). Согласно данной стратегии аминоконцевую последовательность повторяют на карбоксильном конце, так что последовательность может складываться назад и связываться в ориентации бета-цепи, обычно обеспечиваемой соседней субъединицей в структуре. Авторы изобретения попытались применить эту стратегию к субъединице MrkA пилей 3 типа K. Pneumoniae, удаляя сначала сигнальную последовательность секреции, поскольку они планировали сконцентрироваться на цитоплазматической экспрессии их слитых белков с ризавидином. Модель Ленгмюра для предполагаемого сигнала секреции приведена в публикации Chan et al. 2012, на основании выравнивания с аминокислотами 1-24 FimA E. coli. Авторы изобретения затем добавили линкер из шести остатков глицина к карбоксильному концу, с последующим повтором первых 20 аминокислот из N-конца MrkA (без сигнальной последовательности) для обеспечения комплементации донорской цепи. Последовательность была синтезирована и клонирована в плазмиду для управления экспрессией в E. coli, с амино-концевым слитым белком ризавидина и меткой из шести остатков гистидина для начальной аффинной очистки (Фигура 12A).In the case of K. pneumoniae , MrkA was chosen because it encodes the major pili
Таблица 4: Множественное выравнивание последовательностей MrkATable 4: Multiple alignment of MrkA sequences K. pneumoniae K. pneumoniae с использованием Clustal 0 (1.2.1) using Clustal 0 (1.2.1)
Для белка MrkA K. pneumoniae, который является высоко консервативным, последовательность AEO27492 (выделена жирным шрифтом) в Таблице 4 использовали в качестве исходной последовательности для создания синтетического гена.For the K. pneumoniae MrkA protein, which is highly conserved, the AEO27492 sequence (in bold) in Table 4 was used as the starting sequence to generate the synthetic gene.
Рекомбинантный ризавидин (rRhavi), используемый в этих исследованиях, включает аминокислоты 45-179 белка, закодированного в геноме, поскольку предсказанные сигнальные последовательности (аминокислоты 1-44) не включены. Для оптимизации уровня экспрессии rRhavi в E. coli последовательность гена, кодирующего полипептид ризавидина (45-179; SEQ ID NO: 14), модифицировали с использованием кодонов, предпочтительных для экспрессии в E. coli, и синтезировали. Кодон-оптимизированный ген клонировали в вектор pET21b для управления экспрессией белка. С целью облегчения правильного сворачивания и образования дисульфидных связей в ризавидине, для экспрессии выбирали штамм E. coli, который способствует образованию дисульфидных связей в цитоплазме, T7 SHuffle express (NEB).The recombinant rhavidin (rRhavi) used in these studies includes amino acids 45-179 of the genome-encoded protein because the predicted signal sequences (amino acids 1-44) are not included. To optimize the expression level of rRhavi in E. coli , the sequence of the gene encoding the rizavidin polypeptide (45-179; SEQ ID NO: 14) was modified with codons preferred for expression in E. coli and synthesized. The codon-optimized gene was cloned into the pET21b vector to control protein expression. In order to facilitate proper folding and disulfide bonding in rizavidin, an E. coli strain that promotes cytoplasmic disulfide bonding, T7 SHuffle express (NEB), was chosen for expression.
Для конструирования слитых белков ризавидин-антиген последовательность ДНК, кодирующую область гибкого линкера, состоящего из семи аминокислот (GGGGSSS; SEQ ID NO: 15), непосредственно вставляли в 3'-конец синтетического гена rRhavi для обеспечения отделения от rRhavi и стимуляции правильного сворачивания образующегося слитого белка. Гены, кодирующие антигены-кандидаты (полноразмерные или нужные фрагменты), синтезировали и вставляли в экспрессионный вектор rRhavi сразу за областью линкера. Для облегчения очистки на конце конструкта добавляли метку из шести остатков гистидина.To construct the rhizavidin-antigen fusion proteins, the DNA sequence encoding the seven amino acid flexible linker region (GGGGSSS; SEQ ID NO: 15) was directly inserted into the 3' end of the synthetic rRhavi gene to ensure separation from rRhavi and promote proper folding of the resulting fusion. squirrel. Genes encoding candidate antigens (full-length or desired fragments) were synthesized and inserted into the rRhavi expression vector immediately after the linker region. To facilitate purification, a label of six histidine residues was added at the end of the construct.
Содержащие ДНК плазмиды, управляющие экспрессией слитых белков rRhavi, вводили трансформацией в T7 shuffle express E. coli в соответствии с инструкциями производителя. Культивирование начинали с одной колонии, которую инокулировали в 30 мл среды Луриа-Бертани (LB), содержащей ампициллин (Amp+), и культивировали в течение ночи при 30°C. В день 2, 5 мл исходной культуры инокулировали в 1 литр среды LB/Amp+ и выращивали при 30°C до достижения OD600 ~1,2-1,6. После охлаждения культуры до 16°C добавляли IPTG до конечной концентрации 0,1 мМ. Индуцированную культуру инкубировали при 16°C со встряхиванием в течение 16-20 ч. Бактерии собирали центрифугированием при 5000 x g в течение 20 мин, и осадок замораживали при -20°C.DNA-containing plasmids driving the expression of rRhavi fusion proteins were introduced by transformation into E. coli T7 shuffle express according to the manufacturer's instructions. Cultivation was started with a single colony, which was inoculated into 30 ml of Luria-Bertani (LB) medium containing ampicillin (Amp+) and cultured overnight at 30°C. On
Иллюстративные слитые белкиExemplary fusion proteins
Иллюстративные слитые белки ризавидина по настоящему изобретению приведены в следующем далее списке последовательностей. Для удобства аминокислотные последовательности слитых белков в однобуквенном коде приведены далее:Exemplary rizavidin fusion proteins of the present invention are shown in the following sequence listing. For convenience, the amino acid sequences of the fusion proteins in the one-letter code are given below:
Rhavi-PcrV-His, SEQ ID NO: 16Rhavi-PcrV-His, SEQ ID NO: 16
MFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMEVRNLNAARELFLDELLAASAAPASAEQEELLALLRSERIVLAHAGQPLSEAQVLKALAWLLAANPSAPPGQGLEVLREVLQARRQPGAQWDLREFLVSAYFSLHGRLDEDVIGVYKDVLQTQDGKRKALLDELKALTAELKVYSVIQSQINAALSAKQGIRIDAGGIDLVDPTLYGYAVGDPRWKDSPEYALLSNLDTFSGKLSIKDFLSGSPKQSGELKGLSDEYPFEKDNNPVGNFATTVSDRSRPLNDKVNEKTTLLNDTSSRYNSAVEALNRFIQKYDSVLRDILSAIGSGHHHHHHMFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMEVRNLNAARELFLDELLAASAAPASAEQEELLALLRSERIVLAHAGQPLSEAQVLKALAWLLAANPSAPPGQGLEVLREVLQARRQPGAQWDLREFLVSAYFSLHGRLDEDVIGVYKDVLQTQDGKRKALLDELKALTAELKVYSVIQSQINAALSAKQGIRIDAGGIDLVDPTLYGYAVGDPRWKDSPEYALLSNLDTFSGKLSIKDFLSGSPKQSGELKGLSDEYPFEKDNNPVGNFATTVSDRSRPLNDKVNEKTTLLNDTSSRYNSAVEALNRFIQKYDSVLRDILSAIGSGHHHHHH
Rhavi-MrkA-комплементация донорской цепи-His, SEQ ID NO: 17Rhavi-MrkA-donor strand complementation-His, SEQ ID NO: 17
MFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMADTTVGGGQVNFFGKVTDVSCTVSVNGQGSDANVYLSPVTLTEVKAAAADTYLKPKSFTIDVSNCQAADGTKQDDVSKLGVNWTGGNLLAGATSKQQGYLANTEASGAQNIQLVLSTDNATALTNKIIPGDSTQPKAKGDASAVADGARFTYYVGYATSAPTTVTTGVVNSYATYEITYQGGGGGGADTTVGGGQVNFFGKVTDVSGSGHHHHHHMFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMADTTVGGGQVNFFGKVTDVSCTVSVNGQGSDANVYLSPVTLTEVKAAAADTYLKPKSFTIDVSNCQAADGTKQDDVSKLGVNWTGGNLLAGATSKQQGYLANTEASGAQNIQLVLSTDNATALTNKIIPGDSTQPKAKGDASAVADGARFTYYVGYATSAPTTVTTGVVNSYATYEITYQGGGGGGADTTVGGGQVNFFGKVTDVSGSGHHHHHH
Rhavi-FlaA1-His, SEQ ID NO: 18Rhavi-FlaA1-His, SEQ ID NO: 18
MFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMALTVNTNIASLNTQRNLNNSSASLNTSLQRLSTGSRINSAKDDAAGLQIANRLTSQVNGLNVATKNANDGISLAQTAEGALQQSTNILQRMRDLSLQSANGSNSDSERTALNGEVKQLQKELDRISNTTTFGGRKLLDGSFGVASFQVGSAANEIISVGIDEMSAESLNGTYFKADGGGAVTAATASGTVDIAIGITGGSAVNVKVDMKGNETAEQAAAKIAAAVNDANVGIGAFSDGDTISYVSKAGKDGSGAITSAVSGVVIADTGSTGVGTAAGVTPSATAFAKTNDTVAKIDISTAKGAQSAVLVIDEAIKQIDAQRADLGAVQNRFDNTINNLKNIGENVSAARGRIEDTDFAAETANLTKNQVLQQAGTAILAQANQLPQSVLSLLRGSGHHHHHHMFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMALTVNTNIASLNTQRNLNNSSASLNTSLQRLSTGSRINSAKDDAAGLQIANRLTSQVNGLNVATKNANDGISLAQTAEGALQQSTNILQRMRDLSLQSANGSNSDSERTALNGEVKQLQKELDRISNTTTFGGRKLLDGSFGVASFQVGSAANEIISVGIDEMSAESLNGTYFKADGGGAVTAATASGTVDIAIGITGGSAVNVKVDMKGNETAEQAAAKIAAAVNDANVGIGAFSDGDTISYVSKAGKDGSGAITSAVSGVVIADTGSTGVGTAAGVTPSATAFAKTNDTVAKIDISTAKGAQSAVLVIDEAIKQIDAQRADLGAVQNRFDNTINNLKNIGENVSAARGRIEDTDFAAETANLTKNQVLQQAGTAILAQANQLPQSVLSLLRGSGHHHHHH
Rhavi-FlaA2-His, SEQ ID NO: 19Rhavi-FlaA2-His, SEQ ID NO: 19
MFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMALTVNTNIASLNTQRNLNNSSASLNTSLQRLSTGSRINSAKDDAAGLQIANRLTSQVNGLNVATKNANDGISLAQTAEGALQQSTNILQRMRDLSLQSANGSNSDSERTALNGEVKQLQKELDRISNTTTFGGRKLLDGSFGVASFQVGSAANEIISVGIDEMSAESLNGTYFTATGGGAVTAATASGTVDIAIGITGGSAVNVKVDMKGNETAEQAAAKIAAAVNDANVGIGAFTDGAQISYVSKASADGTTSAVSGVAITDTGSTGAGTAAGTTTFTEANDTVAKIDISTAKGAQSAVLVIDEAIKQIDAQRADLGAVQNRFDNTINNLKNIGENVSAARGRIEDTDFAAETANLTKNQVLQQAGTAILAQANQLPQSVLSLLRGSGHHHHHHMFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMALTVNTNIASLNTQRNLNNSSASLNTSLQRLSTGSRINSAKDDAAGLQIANRLTSQVNGLNVATKNANDGISLAQTAEGALQQSTNILQRMRDLSLQSANGSNSDSERTALNGEVKQLQKELDRISNTTTFGGRKLLDGSFGVASFQVGSAANEIISVGIDEMSAESLNGTYFTATGGGAVTAATASGTVDIAIGITGGSAVNVKVDMKGNETAEQAAAKIAAAVNDANVGIGAFTDGAQISYVSKASADGTTSAVSGVAITDTGSTGAGTAAGTTTFTEANDTVAKIDISTAKGAQSAVLVIDEAIKQIDAQRADLGAVQNRFDNTINNLKNIGENVSAARGRIEDTDFAAETANLTKNQVLQQAGTAILAQANQLPQSVLSLLRGSGHHHHHH
Rhavi-FlaB-His, SEQ ID NO: 20Rhavi-FlaB-His, SEQ ID NO: 20
MFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMALTVNTNIASLNTQRNLNASSNDLNTSLQRLTTGYRINSAKDDAAGLQISNRLSNQISGLNVATRNANDGISLAQTAEGALQQSTNILQRIRDLALQSANGSNSDADRAALQKEVAAQQAELTRISDTTTFGGRKLLDGSFGTTSFQVGSNAYETIDISLQNASASAIGSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSGTGTQASQVFGNASAAQKSSVASVDISTADGAQNAIAVVDNALAAIDAQRADLGAVQNRFKNTIDNLTNISENATNARSRIKDTDFAAETAALSKNQVLQQAGTAILAQANQLPQAVLSLLRGSGHHHHHHMFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMALTVNTNIASLNTQRNLNASSNDLNTSLQRLTTGYRINSAKDDAAGLQISNRLSNQISGLNVATRNANDGISLAQTAEGALQQSTNILQRIRDLALQSANGSNSDADRAALQKEVAAQQAELTRISDTTTFGGRKLLDGSFGTTSFQVGSNAYETIDISLQNASASAIGSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSGTGTQASQVFGNASAAQKSSVASVDISTADGAQNAIAVVDNALAAIDAQRADLGAVQNRFKNTIDNLTNISENATNARSRIKDTDFAAETAALSKNQVLQQAGTAILAQANQLPQAVLSLLRGSGHHHHHH
Rhavi-FlaB-Домен2-His, SEQ ID NO: 21Rhavi-FlaB-Domain2-His, SEQ ID NO: 21
MFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMGSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSGTGTQASQVFGNASAAQKSSGSGHHHHHHMFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMGSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSGTGTQASQVFGNASAAQKSSGSGHHHHHH
Rhavi-FlaA2-Домен2-His, SEQ ID NO: 22Rhavi-FlaA2-Domain2-His, SEQ ID NO: 22
MFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMNGTYFTATGGGAVTAATASGTVDIAIGITGGSAVNVKVDMKGNETAEQAAAKIAAAVNDANVGIGAFTDGAQISYVSKASADGTTSAVSGVAITDTGSTGAGTAAGTTTFTEANDTGSGHHHHHHMFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMNGTYFTATGGGAVTAATASGTVDIAIGITGGSAVNVKVDMKGNETAEQAAAKIAAAVNDANVGIGAFTDGAQISYVSKASADGTTSAVSGVAITDTGSTGAGTAAGTTTFTEANDTGSGHHHHHH
Rhavi-FlaB-PcrV-His, SEQ ID NO: 23Rhavi-FlaB-PcrV-His, SEQ ID NO: 23
MFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMALTVNTNIASLNTQRNLNASSNDLNTSLQRLTTGYRINSAKDDAAGLQISNRLSNQISGLNVATRNANDGISLAQTAEGALQQSTNILQRIRDLALQSANGSNSDADRAALQKEVAAQQAELTRISDTTTFGGRKLLDGSFGTTSFQVGSNAYETIDISLQNASASAIGSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSGTGTQASQVFGNASAAQKSSVASVDISTADGAQNAIAVVDNALAAIDAQRADLGAVQNRFKNTIDNLTNISENATNARSRIKDTDFAAETAALSKNQVLQQAGTAILAQANQLPQAVLSLLRAAAAMEVRNLNAARELFLDELLAASAAPASAEQEELLALLRSERIVLAHAGQPLSEAQVLKALAWLLAANPSAPPGQGLEVLREVLQARRQPGAQWDLREFLVSAYFSLHGRLDEDVIGVYKDVLQTQDGKRKALLDELKALTAELKVYSVIQSQINAALSAKQGIRIDAGGIDLVDPTLYGYAVGDPRWKDSPEYALLSNLDTFSGKLSIKDFLSGSPKQSGELKGLSDEYPFEKDNNPVGNFATTVSDRSRPLNDKVNEKTTLLNDTSSRYNSAVEALNRFIQKYDSVLRDILSAIGSGHHHHHHMFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMALTVNTNIASLNTQRNLNASSNDLNTSLQRLTTGYRINSAKDDAAGLQISNRLSNQISGLNVATRNANDGISLAQTAEGALQQSTNILQRIRDLALQSANGSNSDADRAALQKEVAAQQAELTRISDTTTFGGRKLLDGSFGTTSFQVGSNAYETIDISLQNASASAIGSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSGTGTQASQVFGNASAAQKSSVASVDISTADGAQNAIAVVDNALAAIDAQRADLGAVQNRFKNTIDNLTNISENATNARSRIKDTDFAAETAALSKNQVLQQAGTAILAQANQLPQAVLSLLRAAAAMEVRNLNAARELFLDELLAASAAPASAEQEELLALLRSERIVLAHAGQPLSEAQVLKALAWLLAANPSAPPGQGLEVLREVLQARRQPGAQWDLREFLVSAYFSLHGRLDEDVIGVYKDVLQTQDGKRKALLDELKALTAELKVYSVIQSQINAALSAKQGIRIDAGGIDLVDPTLYGYAVGDPRWKDSPEYALLSNLDTFSGKLSIKDFLSGSPKQSGELKGLSDEYPFEKDNNPVGNFATTVSDRSRPLNDKVNEKTTLLNDTSSRYNSAVEALNRFIQKYDSVLRDILSAIGSGHHHHHH
Rhavi-FlaB-Домен2-MrkA-комплементация донорской цепи-His, SEQ ID NO: 24Rhavi-FlaB-Domain2-MrkA-donor strand complementation-His, SEQ ID NO: 24
MFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMGSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSGTGTQASQVFGNASAAQKSSAAAAMADTTVGGGQVNFFGKVTDVSCTVSVNGQGSDANVYLSPVTLTEVKAAAADTYLKPKSFTIDVSNCQAADGTKQDDVSKLGVNWTGGNLLAGATSKQQGYLANTEASGAQNIQLVLSTDNATALTNKIIPGDSTQPKAKGDASAVADGARFTYYVGYATSAPTTVTTGVVNSYATYEITYQGGGGGGADTTVGGGQVNFFGKVTDVSGSGHHHHHHMFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMGSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSGTGTQASQVFGNASAAQKSSAAAAMADTTVGGGQVNFFGKVTDVSCTVSVNGQGSDANVYLSPVTLTEVKAAAADTYLKPKSFTIDVSNCQAADGTKQDDVSKLGVNWTGGNLLAGATSKQQGYLANTEASGAQNIQLVLSTDNATALTNKIIPGDSTQPKAKGDASAVADGARFTYYVGYATSAPTTVTTGVVNSYATYEITYQGGGGGGADTTVGGGQVNFFGKVTDVSGSGHHHHHH
Rhavi-MrkA-комплементация донорской цепи-PcrV-His, SEQ ID NO: 25Rhavi-MrkA-donor strand complementation-PcrV-His, SEQ ID NO: 25
MFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMADTTVGGGQVNFFGKVTDVSCTVSVNGQGSDANVYLSPVTLTEVKAAAADTYLKPKSFTIDVSNCQAADGTKQDDVSKLGVNWTGGNLLAGATSKQQGYLANTEASGAQNIQLVLSTDNATALTNKIIPGDSTQPKAKGDASAVADGARFTYYVGYATSAPTTVTTGVVNSYATYEITYQGGGGGGADTTVGGGQVNFFGKVTDVSAAAAMEVRNLNAARELFLDELLAASAAPASAEQEELLALLRSERIVLAHAGQPLSEAQVLKALAWLLAANPSAPPGQGLEVLREVLQARRQPGAQWDLREFLVSAYFSLHGRLDEDVIGVYKDVLQTQDGKRKALLDELKALTAELKVYSVIQSQINAALSAKQGIRIDAGGIDLVDPTLYGYAVGDPRWKDSPEYALLSNLDTFSGKLSIKDFLSGSPKQSGELKGLSDEYPFEKDNNPVGNFATTVSDRSRPLNDKVNEKTTLLNDTSSRYNSAVEALNRFIQKYDSVLRDILSAIGSGHHHHHHMFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMADTTVGGGQVNFFGKVTDVSCTVSVNGQGSDANVYLSPVTLTEVKAAAADTYLKPKSFTIDVSNCQAADGTKQDDVSKLGVNWTGGNLLAGATSKQQGYLANTEASGAQNIQLVLSTDNATALTNKIIPGDSTQPKAKGDASAVADGARFTYYVGYATSAPTTVTTGVVNSYATYEITYQGGGGGGADTTVGGGQVNFFGKVTDVSAAAAMEVRNLNAARELFLDELLAASAAPASAEQEELLALLRSERIVLAHAGQPLSEAQVLKALAWLLAANPSAPPGQGLEVLREVLQARRQPGAQWDLREFLVSAYFSLHGRLDEDVIGVYKDVLQTQDGKRKALLDELKALTAELKVYSVIQSQINAALSAKQGIRIDAGGIDLVDPTLYGYAVGDPRWKDSPEYALLSNLDTFSGKLSIKDFLSGSPKQSGELKGLSDEYPFEKDNNPVGNFATTVSDRSRPLNDKVNEKTTLLNDTSSRYNSAVEALNRFIQKYDSVLRDILSAIGSGHHHHHH
Rhavi-FlaB-Домен2-PcrV-His, SEQ ID NO: 26Rhavi-FlaB-Domain2-PcrV-His, SEQ ID NO: 26
MFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMGSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSGTGTQASQVFGNASAAQKSSAAAAMEVRNLNAARELFLDELLAASAAPASAEQEELLALLRSERIVLAHAGQPLSEAQVLKALAWLLAANPSAPPGQGLEVLREVLQARRQPGAQWDLREFLVSAYFSLHGRLDEDVIGVYKDVLQTQDGKRKALLDELKALTAELKVYSVIQSQINAALSAKQGIRIDAGGIDLVDPTLYGYAVGDPRWKDSPEYALLSNLDTFSGKLSIKDFLSGSPKQSGELKGLSDEYPFEKDNNPVGNFATTVSDRSRPLNDKVNEKTTLLNDTSSRYNSAVEALNRFIQKYDSVLRDILSAIGSGHHHHHHMFDASNFKDFSSIASASSSWQNQSGSTMIIQVDSFGNVSGQYVNRAQGTGCQNSPYPLTGRVNGTFIAFSVGWNNSTENCNSATGWTGYAQVNGNNTEIVTSWNLAYEGGSGPAIEQGQDTFQYVPTTENKSLLKDGGGGSSSMGSYQVGSNGAGTVASVAGTATASGIASGTVNLVGGGQVKNIAIAAGDSAKAIAEKMDGAIPNLSARARTVFTADVSGVTGGSLNFDVTVGSNTVSLAGVTSTQDLADQLNSNSSKLGITASINDKGVLTITSATGENVKFGAQTGTATAGQVAVKVQGSDGKFEAAAKNVVAAGTAATTTIVTGYVQLNSPTAYSVSGTGTQASQVFGNASAAQKSSAAAAMEVRNLNAARELFLDELLAASAAPASAEQEELLALLRSERIVLAHAGQPLSEAQVLKALAWLLAANPSAPPGQGLEVLREVLQARRQPGAQWDLREFLVSAYFSLHGRLDEDVIGVYKDVLQTQDGKRKALLDELKALTAELKVYSVIQSQINAALSAKQGIRIDAGGIDLVDPTLYGYAVGDPRWKDSPEYALLSNLDTFSGKLSIKDFLSGSPKQSGELKGLSDEYPFEKDNNPVGNFATTVSDRSRPLNDKVNEKTTLLNDTSSRYNSAVEALNRFIQKYDSVLRDILSAIGSGHHHHHH
Очистка слитых белковPurification of fusion proteins
Очистку начинали с ресуспендирования бактериальных осадков в 4 мл охлажденного 20 мМ Tris, pH 8,0, содержащего 500 мМ NaCl, 20 мМ имидазол, 10 мМ MgCl2 и 2X коктейль ингибиторов протеаз Halt (Thermo Fisher), на грамм клеточного осадка. Бактерии разрушали обработкой ультразвуком, с последующим добавлением ДНКазы I до конечной концентрации 25 мкг/мл. Нерастворимый детрит удаляли центрифугированием при 5000 x g в течение 20 мин. Осветленный лизат разбавляли эквивалентным объемом 20 мМ Tris, pH 8,0, содержащего 500 мМ NaCl, для доведения конечной концентрации буфера до 20 мМ Tris, 500 мМ NaCl, 10 мМ имидазол, 5 мМ MgCl2 и 1x коктейль ингибиторов протеаз. Белки очищали путем связывания с никелевой аффинной смолой, промывали 20 мМ Tris, содержащим 500 мМ NaCl, 20 мМ имидазол, и элюировали связанный белок 20 мМ Tris, содержащим 500 мМ NaCl, 500 мМ имидазол. Фракции, соответствующие пикам элюции ожидаемого димера целевого белка, объединяли и концентрировали. Белки, элюируемые с этих колонок, дополнительно очищали гель-фильтрацией и/или ЭХ. Затем эти белки анализировали методом SDS-ПААГ, вестерн-блоттинга и ЭХ. Все слитые белки мигрировали в SDS-ПААГ в соответствии с ожидаемой ММ. Концентрацию белка в каждом образце измеряли с использованием набора для анализа белка BCA (BioRad). Очищенные белки разделяли на аликвоты, быстро замораживали в жидком азоте и хранили при -80°C до будущего использования.Purification was started by resuspension of bacterial pellets in 4 ml chilled 20 mM Tris, pH 8.0, containing 500 mM NaCl, 20 mM imidazole, 10 mM MgCl 2 and 2X Halt protease inhibitor cocktail (Thermo Fisher), per gram of cell pellet. Bacteria were destroyed by sonication, followed by the addition of DNase I to a final concentration of 25 μg/ml. Insoluble detritus was removed by centrifugation at 5000 xg for 20 min. The clarified lysate was diluted with an equivalent volume of 20 mM Tris, pH 8.0 containing 500 mM NaCl to bring the final buffer concentration to 20 mM Tris, 500 mM NaCl, 10 mM imidazole, 5 mM MgCl 2 and 1x protease inhibitor cocktail. Proteins were purified by binding to a nickel affinity resin, washed with 20 mM Tris containing 500 mM NaCl, 20 mM imidazole, and the bound protein was eluted with 20 mM Tris containing 500 mM NaCl, 500 mM imidazole. Fractions corresponding to the elution peaks of the expected target protein dimer were pooled and concentrated. Proteins eluting from these columns were further purified by gel filtration and/or SEC. These proteins were then analyzed by SDS-PAGE, Western blotting and SEC. All fusion proteins migrated to SDS-PAGE according to the expected MW. Protein concentration in each sample was measured using a BCA protein assay kit (BioRad). Purified proteins were aliquoted, flash frozen in liquid nitrogen and stored at -80°C until future use.
Краткая сводка физических характеристик иллюстративных слитых белков ризавидина и вариантов по изобретению приведена в Таблице 5. Все слитые белки ризавидина по изобретению были экспрессированы и, как показано, представляли собой димерные белки на основании результатов эксклюзионной хроматографии (ЭХ) (Таблица 5).A summary of the physical characteristics of exemplary rizavidin fusion proteins and variants of the invention is provided in Table 5. All rizavidin fusion proteins of the invention were expressed and shown to be dimeric proteins based on size exclusion chromatography (SEC) results (Table 5).
Таблица 5: Физические характеристики экспрессированных в Table 5: Physical characteristics of the expressed in E. coliE. coli слитых белков ризавидина fusion proteins of rizavidin по изобретениюaccording to the invention
K. pneumoniaeK. pneumoniae
K. pneumoniaeK. pneumoniae
Оценка активности в отношении TLR5 слитых белков флагеллинаAssessing activity against TLR5 flagellin fusion proteins
Для оценки правильности укладки слитых белков клетки HEK293-NFkB: Luc стимулировали путем инкубации в течение 4 часов с титрованным каждым из тестируемых белков, или комплексов, как показано на Фигуре 12B. Клетки HEK293-NFkB: Luc, как было описано ранее, отвечают на флагеллин, но не на LPS или Salmonella без жгутиков (Simon and Samuel, 2007). После лизиса клеток определяли люциферазную активность при помощи люциферазы светляков от компании Promega. В анализе измеряют активацию NF-kB (Simon and Samuel, 2007).To evaluate the correct folding of the fusion proteins, HEK293-NFkB:Luc cells were stimulated by incubation for 4 hours with each of the tested proteins, or complexes, titrated as shown in Figure 12B. HEK293-NFkB: Luc cells, as previously described, respond to flagellin but not to LPS or flagellaless Salmonella (Simon and Samuel, 2007) . After cell lysis, luciferase activity was determined using firefly luciferase from Promega. The assay measures NF-kB activation (Simon and Samuel, 2007).
Результаты определения биологической активности в отношении TLR5 в анализе с использованием клеток HEK293-NFkB: Luc, а также нативных флагеллинов Pseudomonas и слитых белков Rhavi, отдельно или в виде комплекса MAPS с PnPS 6B, представлены на Фигуре 12B. Эти результаты четко показывают, что конструкты ризавидина и флагеллина FlaB, FlaA1, FlaA2 стимулировали активность TLR5 сами по себе или в виде комплекса MAPS с PnPS 6B и, следовательно, имели правильную укладку.The results of the determination of biological activity against TLR5 in the assay using HEK293-NFkB: Luc cells, as well as native Pseudomonas flagellins and Rhavi fusion proteins, alone or complexed with MAPS with
Иммуногенность иллюстративных слитых белковImmunogenicity of exemplary fusion proteins
Были получены сыворотки с высокими титрами к вариантам слитых белков для оценки in vitro активности белок-специфических антител. Определенные методом ELISA титры IgG к соответствующему иммуногену для каждого из следующих слитых белков (СБ): Rhavi-FlaB-D2; Rhavi-FlaA2-D2; Rhavi-FlaB-PcrV; Rhavi-FlaB-D2-MrkA и Rhavi-PcrV-MrkA представлены на Фигуре 14. Все СБ являются очень иммуногенными и вызывают продуцирование СБ-специфических IgG антител с высокими титрами.Serums with high titers to variants of the fusion proteins were obtained to assess the in vitro activity of protein-specific antibodies. ELISA-determined IgG titers to the respective immunogen for each of the following fusion proteins (FPs): Rhavi-FlaB-D2; Rhavi-FlaA2-D2; Rhavi-FlaB-PcrV; Rhavi-FlaB-D2-MrkA and Rhavi-PcrV-MrkA are shown in Figure 14. All SBs are highly immunogenic and produce high titers of SB-specific IgG antibodies.
Результаты определения перекрестной реактивности для FlaB и FlaA1 кроличьей сыворотки, полученной против FlaB-содержащих слитых белков ризавидина, приведены в Таблице 6.The results of the determination of cross-reactivity for FlaB and FlaA1 of rabbit serum obtained against the FlaB-containing rizavidin fusion proteins are shown in Table 6.
Таблица 6: Перекрестная реактивность сыворотки от кроликов, иммунизированных FlaB-содержащими слитыми белками ризавидина, для нативного FlaB, очищенного из PA PAO1, или FlaA1, очищенного из PA PAKTable 6: Cross-reactivity of sera from rabbits immunized with FlaB-containing rhizavidin fusion proteins for native FlaB purified from PA PAO1 or FlaA1 purified from PA PAK
Как анти-Rhavi-FlaB-D2, так и анти-Rhavi-FlaB-PcrV, кроличьи сыворотки имели высокие титры FlaB-специфического антитела, однако анти-Rhavi-FlaB-D2-MrkA сыворотки имели сравнительно низкие титры FlaB-специфического антитела. Анти-Rhavi-FlaB-PcrV сыворотки имели значительную перекрестную реактивность FlaA1-специфического антитела, это свидетельствовало о том, что компонент FlaB слитого белка имеет правильную укладку, и что перекрестно реактивные эпитопы FlaA1 предположительно находятся за пределами домена 2 флагеллина, в общих консервативных доменах D0 и D1 (Song and Yoon, 2014), которые не экспрессируются ни в Rhavi-FlaB-D2, ни в FlaB-D2-MrkA. Таким образом, вследствие его значительной перекрестной реактивности с FlaA1, Rhavi-FlaB-PcrV является превосходным слитым белком-кандидатом, который может обеспечивать широкий основанный на флагеллине иммунитет против инфекции Pseudomonas.Both anti-Rhavi-FlaB-D2 and anti-Rhavi-FlaB-PcrV rabbit sera had high titers of FlaB-specific antibody, but anti-Rhavi-FlaB-D2-MrkA sera had relatively low titers of FlaB-specific antibody. The anti-Rhavi-FlaB-PcrV sera had significant cross-reactivity with the FlaA1-specific antibody, indicating that the FlaB component of the fusion protein is correctly folded and that the cross-reactive FlaA1 epitopes are presumably outside
Пример 5: Получение иммуногенных комплексовExample 5 Preparation of Immunogenic Complexes
Получение каркасных полимеров из нативного OPSObtaining framework polymers from native OPS
Нативные OPSNative OPS
O-полисахариды (OPS) K. pneumoniae (KP OPS) серотипов O1, O2, O3 и O5 и коровый OPS P. aeruginosa (PA OPS) серотипов O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 выделяли из ферментационной биомассы микроорганизмов, выращенных в CDM, после обработки либо кипячением при 100°C в однопроцентной уксусной кислоте в случае PA OPS, или либо уксусной кислотой и нитритом натрия (NaNO2) в случае KP OPS. В случае PA LPS, обработка уксусной кислотой приводит к расщеплению связи KDO внутреннего ядра LPS и липида A (Фигура 1A) и получению фрагмента KDO на восстанавливающем конце COPS. В случае KP LPS, дезаминирование азотистой кислотой приводит к расщеплению связи между остатком глюкозамина внутреннего ядра и остальной частью липида A внутреннего ядра LPS и получению восстанавливающего остатка 2,5-ангидроманнозы с альдегидом на атоме углерода 1 (Фигура 1C). Структуры PA OPS (Knirel et al., 2006) и KP OPS (Vinogradov et al., 2002) представлены на Фигурах 1B и 1D, соответственно. Процесс последующей очистки PA и KP OPS показан на Фигуре 8A. Эти методы очистки приводят к получению высоких количеств (>50-100 мг/л очищенного материала) высокочистого OPS с низкими уровнями остаточного белка, нуклеиновых кислот и эндотоксина. Химическую и иммунохимическую природу ОПС подтверждали методами деполимеризации ТФУ и Dionex HPAEC-PAD, сравнением ЯМР-спектров, полученных методом 1H-ЯМР с высоким разрешением (химические связи и константы взаимодействия), с данными, опубликованными в литературе, и определением методом ELISA иммунологической реактивности со специфическими для типов KP OPS и PA OPS моноклональными антителами или иммунной сывороткой, полученной при иммунизации убитыми нагреванием целыми бактериями (Фигура 6C). Средняя ММ OPS при измерении методом ЭХ и ЭХ-MALLS находилась в диапазоне приблизительно от 10 кДа до 30 кДа, в зависимости от типа, при этом PA OPS, как правило, имеет больший размер, чем KP OPS. Совокупные результаты анализа HPAEC-PAD (Dionex) моносахаридного состава очищенных KP OPS и PA OPS приведены в Таблице 7.O-polysaccharides (OPS) of K. pneumoniae (KP OPS) of serotypes O1, O2, O3 and O5 and core OPS of P. aeruginosa (PA OPS) of serotypes O1, O2, O3, O4, O5, O6, O10, O11 were isolated from the fermentation biomass of microorganisms grown in CDM after treatment either by boiling at 100° C. in 1% acetic acid in the case of PA OPS, or either in acetic acid and sodium nitrite (NaNO 2 ) in the case of KP OPS. In the case of PA LPS, treatment with acetic acid resulted in cleavage of the KDO bond between the LPS inner core and lipid A (Figure 1A) and a KDO moiety at the reducing end of the COPS. In the case of LPS KP, deamination with nitrous acid results in cleavage of the bond between the inner core glucosamine residue and the rest of the inner core lipid A of the LPS to produce a reducing 2,5-anhydromannose residue with an aldehyde at carbon 1 (Figure 1C). The structures of PA OPS (Knirel et al., 2006) and KP OPS (Vinogradov et al., 2002) are presented in Figures 1B and 1D, respectively. The post purification process of PA and KP OPS is shown in Figure 8A. These purification methods result in high amounts (>50-100 mg/l purified material) of highly pure OPS with low levels of residual protein, nucleic acids and endotoxin. The chemical and immunochemical nature of OPS was confirmed by TFA depolymerization and Dionex HPAEC-PAD, comparison of high-resolution 1H-NMR spectra (chemical bonds and interaction constants) with data published in the literature, and ELISA determination of immunological reactivity with monoclonal antibodies specific for KP OPS and PA OPS types or immune sera obtained by immunization with heat-killed whole bacteria (Figure 6C). The average MM OPS as measured by SEC and SEC-MALLS ranged from approximately 10 kDa to 30 kDa, depending on the type, with PA OPS generally larger than KP OPS. The combined results of the HPAEC-PAD (Dionex) analysis of the monosaccharide composition of purified KP OPS and PA OPS are shown in Table 7.
Таблица 7. Анализ методом HPAEC-PAD моносахаридного состава очищенных KP OPS и PA COPSTable 7. HPAEC-PAD Analysis of the Monosaccharide Composition of Purified KP OPS and PA COPS
bKnirel et al. 2006
cопределено после 4M ТФУ/100°C/18 часов a The instrument detects only neutral saccharides, not uronic acid; polysaccharides depolymerized in 2M TFA/100°C/4 hours unless otherwise noted
b Knirel et al. 2006
c determined after 4M TFA/100°C/18 hours
Каркасный полимер OPSFrame resin OPS
На Фигуре 1E представлена химическая структура повторяющейся единицы капсульного полисахарида (CPS) K. oxytoca (KO) K19, который идентичен CPS K. pneumoniae K19. На Фигуре 1F представлен H-ЯМР спектр при 950 МГц очищенного KP K19 CPS. Природные KP OPS и PA OPS со средней молекулярной массой ММ 10-30 кДа были ковалентно связаны с более крупным K19 CPS (средняя ММ 218 кДа) с целью увеличения как их эффективной ММ, так и их эпитопной валентности. Каркасные полимеры OPS были биотинилированы после, или в процессе, этапа укрупнения, либо избирательно на каркасном полимере K19 CPS, с получением BP-1, BP-1.2 или BP-1.3 (Фигуры 2A-2C), либо случайным образом как на OPS, так и на CPS, с получением BP-2a (Фигура 3), либо избирательно на OPS, с получением BP-2b (Фигура 4).Figure 1E shows the chemical structure of the capsular polysaccharide repeating unit (CPS)K. oxytoca(KO) K19 which is identical to CPSK. pneumoniae K19. Figure 1F shows the H-NMR spectrum at 950 MHz of purified KP K19 CPS. Natural KP OPS and PA OPS with an average molecular weight of 10-30 kDa were covalently linked to the larger K19 CPS (average MM of 218 kDa) to increase both their effective MM and their epitope valency. The OPS framework polymers were biotinylated after, or during, the enlargement step, either selectively on the K19 CPS framework polymer to give BP-1, BP-1.2, or BP-1.3 (Figures 2A-2C), or randomly on both OPS and and on CPS, to obtain BP-2a (Figure 3), or selectively on OPS, to obtain BP-2b (Figure 4).
Каркасные полимеры элюируются значительно раньше на колонке для эксклюзионной хроматографии, чем отдельные K19 CPS или OPS, это указывает на то, что они значительно увеличены в размерах по сравнению с отдельными компонентами, и демонстрируют уменьшение уровня свободного OPS в сравнении с количеством в исходном материале, что указывает на включение его в каркасный полимер.The framework polymers elute significantly earlier on the size exclusion chromatography column than the individual K19 CPS or OPS, indicating that they are significantly enlarged compared to the individual components and show a decrease in free OPS compared to the amount in the starting material, which indicates its inclusion in the framework polymer.
Этот процесс укрупнения с использованием CPS, например, K19 CPS, в качестве каркасного полимера является универсальным процессом, который может быть применен к любым CPS/OPS или низкомолекулярным бактериальным полисахаридам и может приводить к четко определенному и воспроизводимому продукту, и при этом создает минимальные, или не создает, изменения эпитопов OPS/CPS. Как показано на Фигуре 6C, это было четко продемонстрировано после анализов антигенности методом ELISA с нативными PA OPS O1, O2, O3, O6, O10 и O11 и соответствующими конструктами PA OPS: K19 BP-1, с использованием кроличьей гипериммунной сыворотки после иммунизации УН PA (Фигура 6C). В данных экспериментах не наблюдали какие-либо отличия в антигенности между нативным PA OPS и соответствующим каркасным полимером OPS, это свидетельствовало о том, что эпитопы OPS сохранялись в процессе укрупнения.This upscaling process using CPS, e.g. K19 CPS, as the backbone polymer is a versatile process that can be applied to any CPS/OPS or low molecular weight bacterial polysaccharides and can result in a well-defined and reproducible product while creating minimal, or does not create changes in OPS/CPS epitopes. As shown in Figure 6C, this was clearly demonstrated after antigenicity assays by ELISA with native PA OPS O1, O2, O3, O6, O10 and O11 and the corresponding constructs PA OPS: K19 BP-1, using hyperimmune rabbit sera after immunization with PA CN (Figure 6C). In these experiments, no difference in antigenicity was observed between native OPS PA and the corresponding OPS backbone polymer, indicating that OPS epitopes were conserved during enlargement.
Биотинилирование каркасных полимеров (BP)Biotinylation of backbone polymers (BP)
BP-1BP-1
Сначала на восстанавливающем конце OPS добавляли короткий спейсер, содержащий первичный амин на каждом конце (например, ADH) путем восстановительного аминирования при помощи NaBH3CN. Реакционноспособные альдегиды на KP OPS были размещены на концевых остатках 2,5-ангидроманнозы (2,5-anМan) в процессе процедуры экстракции путем обработки целого LPS нитритом натрия (Фигура 8A), при этом реакционноспособные кетоны на PA OPS были размещены на восстанавливающих концевых остатках KDO внутреннего ядра PA OPS путем обработки LPS уксусной кислотой, как показано на Фигуре 8A. ADH-дериватизированные OPS впоследствии смешивали с частично окисленным периодатом каркасом KP 19 CPS (иллюстративные хроматограммы ЭХ-ВЭЖХ этих производных представлены на Фигурах 6A и 6B) и биотином, содержащим первичный амин (таким как амин-ПЭГ3-биотин), и проводили восстановительное аминирование смеси, с получением каркасного полимера OPS, биотинилированного только на полисахаридном каркасе, который авторы изобретения назвали каркасным полимером 1 (BP-1) (Фигура 2A).First, a short spacer containing a primary amine at each end (eg ADH) was added at the reducing end of the OPS by reductive amination with NaBH 3 CN. Reactive aldehydes on KP OPS were placed at the 2,5-anhydromannose (2,5-anMan) terminal residues during the extraction procedure by treating whole LPS with sodium nitrite (Figure 8A), while reactive ketones on PA OPS were placed on reducing terminal residues KDO of the PA OPS inner core by treating the LPS with acetic acid as shown in Figure 8A. ADH-derivatized OPS were subsequently mixed with a partially oxidized periodate backbone KP 19 CPS (illustrative SEC-HPLC chromatograms of these derivatives are shown in Figures 6A and 6B) and biotin containing a primary amine (such as amine-PEG3-biotin) and the mixture was reductively aminated , resulting in an OPS backbone polymer biotinylated only on the polysaccharide backbone, which the inventors called backbone polymer 1 (BP-1) (Figure 2A).
BP-1.2BP-1.2
Альтернативно, реакционноспособные карбоксилатные группы каркаса KP 19 CPS можно сначала биотинилировать при помощи 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимида (EDC) и N-гидроксисукцинимида (NHS), и биотина, содержащего первичный амин (такого как амин-ПЭГ-биотин), затем окислять периодатом, смешивать с ADH-дериватизированным OPS и проводить восстановительное аминирование смеси, с получением каркасного полимера OPS, биотинилированного только на полисахаридном каркасе, который авторы изобретения назвали BP-1.2 (Фигура 2B). Альтернативно, этап с ADH можно опускать в случае PA OPS, поскольку они содержат заместитель аминокислоты аланина со свободной α-аминогруппой на атоме углерода 2 их остатков галактозамина внешнего ядра (Фигура 1A). Таким образом, эти доступные аминогруппы можно с легкостью использовать для прямого связывания путем восстановительного аминирования с окисленным периодатом полимером K19 CPS вместе с биотином, содержащим амин, с получением биотинилированного BP-1 (Фигура 2A) или BP-1.2 (Фигура 2B).Alternatively, the reactive carboxylate groups of the KP 19 CPS backbone can first be biotinylated with 1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide (EDC) and N-hydroxysuccinimide (NHS), and biotin containing a primary amine (such as amine-PEG- biotin), then oxidized with periodate, blended with ADH-derivatized OPS, and reductively aminated the mixture to produce an OPS backbone polymer biotinylated on the polysaccharide backbone only, which the inventors named BP-1.2 (Figure 2B). Alternatively, the ADH step can be omitted in the case of PA OPS since they contain an alanine amino acid substituent with a free α-amino group on
Альтернативно, OPS, содержащие альдегид или кетон на их восстанавливающем конце, дериватизируют соединением азидо-амина в присутствии восстанавливающего реагента, с получением OPS с азидогруппой на их конце. Полисахаридный каркас затем снабжают алкиновыми группами через полисахаридные карбоксилатные группы и EDC. Каркасный полисахарид затем биотинилируют с использованием CDAP и биотин-гидразидного соединения, с получением биотинилированного и алкинилированного полисахарида. Дериватизированный азидо-OPS и биотинилированный алкин-CPS затем связывают реакцией клик-химии с медным катализатором, с получением (OPS)n-CPS BP-1, в котором каркасный полимер является биотинилированным, и OPS является не биотинилированным (Фигура 5B; схема 1). С использованием этого связывания в реакции клик-химии OPS BP-1 также можно получать, сначала вводя алкиновые группы в CPS с использованием карбоксилатных групп и EDC, а затем проводя аминирование с использованием амино-ПЭГ-азида и катализатора сульфата меди, биотинилирование CPS с использованием CDAP и гидразида биотина; биотинилированный CPS, содержащий первичные аминогруппы, смешивают с нативными OPS (содержащими альдегидные или кетонные группы на их восстанавливающих концах) и поводят восстановительное аминирование восстанавливающим реагентом, с получением OPS/CPS BP-1 (Фигура 5B; схема 2). BP-2b можно получать такой реакцией клик-химии, сначала избирательно вводя остатки биотина в OPS, дериватизированные азидогруппами на их конце, а затем проводя биотинилирование с использованием CDAP химии и гидразида биотина; и второе связывание в реакции клик-химии биотинилированного азидо-дериватизированного OPS с алкинилированным CPS, как показано на Фигуре 5B; схеме 3.Alternatively, OPS containing an aldehyde or ketone at their reducing end are derivatized with an azido-amine compound in the presence of a reducing agent to give OPS with an azido group at their end. The polysaccharide backbone is then provided with alkyne groups via polysaccharide carboxylate groups and EDC. The backbone polysaccharide is then biotinylated using CDAP and a biotin hydrazide compound to produce a biotinylated and alkynylated polysaccharide. The derivatized azido-OPS and biotinylated alkyne-CPS are then coupled by copper catalyzed click chemistry to give (OPS) n -CPS BP-1 in which the backbone polymer is biotinylated and OPS is not biotinylated (Figure 5B; Scheme 1) . Using this coupling in a click chemistry reaction, OPS BP-1 can also be prepared by first introducing alkyne groups into CPS using carboxylate groups and EDC, and then aminating using amino PEG azide and copper sulfate catalyst, biotinylating CPS using CDAP and biotin hydrazide; biotinylated CPS containing primary amino groups is mixed with native OPS (containing aldehyde or ketone groups at their reducing ends) and reductively aminated with a reducing reagent to give OPS/CPS BP-1 (Figure 5B; Scheme 2). BP-2b can be generated by such a click chemistry reaction by first selectively introducing biotin residues into OPS derivatized with azido groups at their terminus, and then biotinylating using CDAP chemistry and biotin hydrazide; and a second click chemistry coupling of the biotinylated azido-derivatized OPS to the alkynylated CPS as shown in Figure 5B;
BP-2aBP-2a
Альтернативно, ADH-дериватизированный OPS или не дериватизированный OPS смешивают с частично окисленным периодатом каркасом CPS KP штамма 19 и проводят восстановительное аминирование, с получением каркасного полимера OPS; каркасный полимер затем дериватизируют с использованием CDAP и биотин-ПЭГ-амина, с получением каркасного полимера, случайным образом биотинилированного биотином, как на каркасном полисахариде, так и на OPS, который авторы изобретения назвали BP-2a (BP-2a) (Фигура 3).Alternatively, ADH-derivatized OPS or non-derivatized OPS is mixed with a periodate-partially oxidized CPS KP strain 19 backbone and reductively aminated to form an OPS backbone polymer; the framework polymer is then derivatized using CDAP and biotin-PEG-amine to produce a framework polymer randomly biotinylated with biotin on both the framework polysaccharide and OPS, which the inventors named BP-2a (BP-2a) (Figure 3) .
BP-2bBP-2b
Альтернативно, OPS сначала биотинилируют с использованием CDAP и амин-ПЭГ-биотина; полученный биотинилированный OPS частично окисляют периодатом для введения альдегидов в его фрагменты KDO или гептозы внутреннего ядра и проводят восстановительное аминирование с использованием ADH; биотинилированный и аминированный OPS затем смешивают с частично окисленным периодатом каркасом KP 19 CPS и проводят восстановительное аминирование, с получением каркасного полимера OPS, избирательно биотинилированного на его OPS; авторы изобретения назвали его BP-2b (Фигура 4 и Фигура 5B, схема 3).Alternatively, OPS is first biotinylated using CDAP and amine-PEG-biotin; the resulting biotinylated OPS is partially oxidized with periodate to introduce aldehydes into its KDO fragments or inner core heptoses and reductive amination is carried out using ADH; the biotinylated and aminated OPS is then mixed with a partially oxidized periodate backbone KP 19 CPS and reductively aminated to produce an OPS backbone polymer selectively biotinylated on its OPS; the inventors named it BP-2b (Figure 4 and Figure 5B, scheme 3).
BP-3BP-3
Альтернативно, сначала проводят восстановительное аминирование ADH-дериватизированного OPS ε-NH2 группами каркаса PLL, с получением каркасного полимера OPS-PLL. Полученный OPS-PLL обрабатывают ацилирующим реагентом, таким как уксусный ангидрид, для блокирования непрореагировавших аминогрупп (ε-NH2) каркаса PLL, с получением каркасного полимера OPS-поли-N-ацетил-лизина (OPS-PNAcLL). Этот каркасный полимер OPS-PNAcLL затем биотинилируют на его OPS, сначала обрабатывая CDAP, а затем амин-ПЭГ-биотином. Этот каркасный полимер, избирательно биотинилированный на его OPS, называют BP-3 (Фигура 5A).Alternatively, reductive amination of the ADH-derivatized OPS with ε-NH 2 with PLL backbone groups is first carried out to form an OPS-PLL backbone polymer. The resulting OPS-PLL is treated with an acylating agent such as acetic anhydride to block the unreacted amino groups (ε-NH 2 ) of the PLL backbone to form an OPS-poly-N-acetyl-lysine (OPS-PNAcLL) backbone polymer. This OPS-PNAcLL backbone polymer is then biotinylated on its OPS by first being treated with CDAP and then with amine-PEG-biotin. This backbone polymer, selectively biotinylated on its OPS, is referred to as BP-3 (Figure 5A).
Непрореагировавшие OPS, биотин, CPS и остаточные реактивы для конъюгации удаляли методом ЖХБР-ЭХ с Superdex 200 или методом 50-300 кДа TFF УФ-ДФ.Unreacted OPS, biotin, CPS and residual conjugation reagents were removed by FLC-SEC with Superdex 200 or 50-300 kD TFF UV-DF.
Получение и очистка иллюстративных иммуногенных комплексовPreparation and Purification of Exemplary Immunogenic Complexes
Комплексы MAPS или вариантные комплексы MAPS получали путем добавления слитого белка-кандидата rRhavi-антиген к биотинилированному полисахариду в 20 мМ Tris, pH 8,0, 150 мМ NaCl, в выбранном соотношении (как правило, 3:1, белок:PS, по массе), с 0,01% тимеросала, добавленным для ингибирования микробного роста. Образец инкубировали с переворачиванием при 25°C в течение ночи, с последующим центрифугированием при 10000 x g в течение 5 мин для удаления любого нерастворимого материала (Zhang et al., 2013). Растворимый материал собирали, и комплексы MAPS или вариантные комплексы MAPS очищали эксклюзионной хроматографией на колонке Superdex 75 (нативные OPS PS MAPS) или колонке Superdex 200 (CPS MAPS и каркасный полимер-PS варианты MAPS) с 2 мМ Tris, pH 8,0, 150 мМ NaCl (Zhang et al., 2013). Соответствующие пикам фракции анализировали на содержание белка методом SDS-ПААГ восстановленных образцов без нагревания и визуализировали окрашиванием на общий белок. Фракции, содержащие комплексы MAPS или вариантные комплексы MAPS, идентифицировали в геле как окрашенные белки, задерживающиеся в геле в высокомолекулярных комплексах, а не как белки, ожидаемо мигрирующие в геле в соответствии с размером белкового димера (Zhang et al., 2013). Фракции, содержащие комплексы MAPS, объединяли, и соотношение белок/полисахарид в MAPS или варианте MAPS определяли с использованием набора для анализа белков BCA и в анализе с антроновым реактивом для полисахарида (Zhang et al., 2013). Целостность комплексов MAPS или вариантных комплексов MAPS оценивали методом SDS-ПААГ восстановленных образцов без нагревания, с визуализацией окрашиванием на общий белок (Zhang et al., 2013). Содержание свободного белка в комплексах MAPS или вариантных комплексах MAPS количественно определяли методом денситометрии содержания белковых димеров при SDS-ПААГ комплексов MAPS или вариантных комплексов MAPS без нагревания в сравнении со стандартным количеством контрольного белкового димера (Zhang et al., 2013). Молекулярную массу белка, включенного в комплексы MAPS или вариантные комплексы MAPS, анализировали методом SDS-ПААГ восстановленных, прокипяченных образцов, с визуализацией окрашиванием на общий белок и использованием стандартных белков-маркеров молекулярной массы.MAPS or variant MAPS complexes were generated by adding a candidate rRhavi-antigen fusion protein to a biotinylated polysaccharide in 20 mM Tris, pH 8.0, 150 mM NaCl, in a selected ratio (typically 3:1, protein:PS, by weight). ), with 0.01% thimerosal added to inhibit microbial growth. The sample was incubated with inversion at 25°C overnight, followed by centrifugation at 10,000 xg for 5 min to remove any insoluble material (Zhang et al., 2013). Soluble material was collected and MAPS or variant MAPS complexes were purified by size exclusion chromatography on a Superdex 75 column (Native OPS PS MAPS) or a Superdex 200 column (CPS MAPS and backbone polymer-PS variants of MAPS) with 2 mM Tris, pH 8.0, 150 mM NaCl (Zhang et al., 2013). Peak-corresponding fractions were analyzed for protein content by SDS-PAGE of the reconstituted samples without heating and visualized by staining for total protein. Fractions containing MAPS or variant MAPS complexes were identified in the gel as stained proteins retained in the gel in high molecular weight complexes, rather than as proteins expected to migrate in the gel according to the size of the protein dimer (Zhang et al., 2013). Fractions containing MAPS complexes were pooled and the protein/polysaccharide ratio in MAPS or MAPS variant was determined using the BCA protein assay kit and in the anthrone polysaccharide assay (Zhang et al., 2013). The integrity of MAPS or variant MAPS complexes was assessed by SDS-PAGE of reconstituted samples without heating, visualized by total protein staining (Zhang et al., 2013). The content of free protein in MAPS or variant MAPS complexes was quantified by SDS-PAGE densitometry of the content of protein dimers in the SDS-PAGE of MAPS complexes or variant MAPS complexes without heating in comparison with the standard amount of control protein dimer (Zhang et al., 2013). The molecular weight of protein incorporated into MAPS or variant MAPS complexes was analyzed by SDS-PAGE of reconstituted, boiled samples, visualized by staining for total protein and using standard molecular weight marker proteins.
KP/PA OPS получали в виде различных форм каркасных полимеров OPS (1, 2a, 2b) с использованием K19 CPS в качестве каркасного полимера, и получали вариантные комплексы MAPS со следующими продуктами слияния рекомбинантно полученного в E. coli ризавидина с белками из генома KP и PA: Rhavi-PcrV; Rhavi-MrkA; Rhavi-FlaA1; Rhavi-FlaA2; Rhavi-FlaB; Rhavi-FlaB-Домен2; Rhavi-FlaA2-Домен2; Rhavi-FlaB-PcrV; Rhavi-FlaB-Домен2-MrkA; Rhavi-MrkA-PcrV; Rhavi-FlaB-Домен2-PcrV, имеющими SEQ ID NO: 16-26, и с использованием PRO-CN в качестве контрольного белка.KP/PA OPS were prepared as different forms of OPS backbone polymers (1, 2a, 2b) using K19 CPS as the backbone polymer, and variant MAPS complexes were made with the following fusion products of E. coli recombinantly produced rizavidin with proteins from the KP genome and PA: Rhavi-PcrV; Rhavi-MrkA; Rhavi-FlaA1; Rhavi-FlaA2; Rhavi FlaB; Rhavi-FlaB-Domain2; Rhavi-FlaA2-Domain2; Rhavi-FlaB-PcrV; Rhavi-FlaB-Domain2-MrkA; Rhavi-MrkA-PcrV; Rhavi-FlaB-Domen2-PcrV having SEQ ID NOs: 16-26 and using PRO-CN as a control protein.
Иллюстративные характеристики некоторых лотов MAPS, полученных со слитым белком ризавидина по изобретению и в комплексе с биотинилированными пневмококковыми полисахаридами PS типов 6B, 7F и 19A, приведены в Таблице 8. Иллюстративные результаты очистки для вариантных комплексов MAPS представлены на Фигурах 10 и 11. Вариантные комплексы MAPS очищали от непрореагировавшего белка методом ЭХ, и элюированные с геля фракции анализировали методом SDS-ПААГ, типичный анализ показан на Фигуре 10, где свободный белок показан элюируемым с геля в поздних фракциях, и он может быть отделен от вариантного комплекса MAPS, как исходно описано для комплексов MAPS в публикации Zhang et al., 2013. На Фигурах 11A-11C показаны результаты анализа методом SDS-ПААГ очищенных комплексов K19-PA O1 OPS BP-1 MAPS, комплексов K19-PA O2 OPS BP-1 MAPS и комплексов K19-PA O10 OPS BP-1 MAPS с PRO-CN (Фигура 11A); Rhavi-FlaB-PcrV (Фигура 11B); Rhavi-FlaB-D2-MrkA (Фигура 11C). Каждый из очищенных образцов вариантных MAPS отдельно обрабатывали с кипячением и без нагревания. Вариантные комплексы MAPS не разрушались без нагревания, и белок в вариантных комплексах MAPS оставался в самой верхней части геля (Zhang et al., 2013). При кипячении вариантные комплексы MAPS разрушались, белок высвобождался, и белковый димер, образовавшийся за счет межмолекулярного взаимодействия ризавидина, также диссоциировал (Zhang et al., 2013). Затем определяли содержание белка вариантных MAPS в анализе BCA, и содержание полисахарида определяли в анализе с антроновым реактивом. Соотношение белка и полисахарида рассчитывали, как соотношение по массе и как молярное соотношение.Exemplary characteristics of some MAPS lots prepared with the rhizavidin fusion protein of the invention and complexed with
Все конечные очищенные MAPS и вариантные MAPS поддавались стерилизации фильтрованием через 0,22-мкм фильтр (Таблица 8 и данные не представлены).All final purified MAPS and variant MAPS were amenable to filter sterilization through a 0.22 µm filter (Table 8 and data not shown).
Таблица 8: Характеристики слитых белков ризавидина очищенных MAPSTable 8: Characteristics of MAPS Purified Rhizavidin Fusion Proteins
белок:PS (по массе)protein:PS (by weight)
Пример 6: Исследования иммунизацииExample 6 Immunization Studies
Иммунизация животныхAnimal Immunization
Перед иммунизацией кроликов комплексы MAPS или вариантные комплексы MAPS, или только PS, формулировали с адъювантом приблизительно за 48 ч до инъекции. MAPS или вариантные MAPS адсорбировали на адъюванте при конечной концентрации 10 мкг/мл PS каждого серотипа, либо отдельно, либо в виде мультивалентной смеси, с 40 мМ гистидином, pH 5,5, 150 мМ NaCl и 0,25 мг/мл гелем фосфата алюминия, с перемешиванием путем переворачивания в течение ночи при 4°C. Эту составленную смесь использовали непосредственно для иммунизаций в объеме 0,5 мл для дозы 5 мкг PS. Для более низких доз PS проводили соответствующее разбавление 40 мМ гистидином, pH 5,5, 150 мМ NaCl. Выполняли две в/м иммунизации (0,5 мл) с 2- или 4-недельным интервалом 4-месячным кроликам линии New Zealand White (Cocalico Biologicals, n=8-10 на группу). Образцы крови собирали через 2 недели после первой и второй иммунизации с 2-недельным интервалом дозирования. Образцы собирали через 2 и 4 недели после первой иммунизации и 2 недели после второй иммунизации с 4-недельным интервалом дозирования.Prior to immunization of rabbits, MAPS or variant MAPS or PS alone was formulated with an adjuvant approximately 48 hours prior to injection. MAPS or variant MAPS were adsorbed to adjuvant at a final concentration of 10 μg/ml PS of each serotype, either alone or as a multivalent mixture, with 40 mM histidine, pH 5.5, 150 mM NaCl and 0.25 mg/ml aluminum phosphate gel , with stirring by turning over night at 4°C. This formulated mixture was used directly for immunizations in a volume of 0.5 ml for a dose of 5 μg PS. For lower doses of PS, an appropriate dilution was performed with 40 mM histidine, pH 5.5, 150 mM NaCl. Two IM immunizations (0.5 ml) were performed 2 or 4 weeks apart in 4 month old New Zealand White rabbits (Cocalico Biologicals, n=8-10 per group). Blood samples were collected 2 weeks after the first and second immunizations with a 2 week dosing interval. Samples were collected 2 and 4 weeks after the first immunization and 2 weeks after the second immunization with a 4 week dosing interval.
Для получения более высокого титра антител против носителей-кандидатов слитых белков использовали полный адъювант Фрейнда для первой иммунизации и неполный адъювант Фрейнда для второй и третьей иммунизации, соответственно. Каждый белок-носитель (0,1 мг) отдельно смешивали с адъювантом Фрейнда до конечного объема 1 мл, 0,2 мл вводили подкожной инъекцией в 4 разных участка, и 0,2 мл вводили в/м каждому кролику при каждой иммунизации. Иммунизации проводили 4-месячным кроликам линии New Zealand White (Cocalico Biologicals), (n=3 на группу) в день 0, день 14 и день 21, и образцы крови собирали через 2 недели после второй и третьей иммунизации.To obtain a higher antibody titer against candidate fusion protein carriers, complete Freund's adjuvant was used for the first immunization and incomplete Freund's adjuvant for the second and third immunizations, respectively. Each carrier protein (0.1 mg) was separately mixed with Freund's adjuvant to a final volume of 1 ml, 0.2 ml was injected subcutaneously at 4 different sites, and 0.2 ml was injected intramuscularly into each rabbit at each immunization. Immunizations were given to 4-month-old New Zealand White rabbits (Cocalico Biologicals), (n=3 per group) on
Измерение уровня антителMeasurement of antibody levels
Анализы для определения антител к капсульным полисахаридам (CPS) или OPS, или разным белковым антигенам выполняли в 96-луночных планшетах Immulon 2 HB или Greneir Bio-one средней степени связывания (Thermo Scientific Waltham Mass), покрытых (1 мкг CPS или OPS, или PS, конъюгированных с HSA/мл PBS) или белковыми антигенами (1 мкг белка/мл PBS). Планшеты блокировали 1% BSA в PBS. Добавляли антитела, разбавленные в PBS-T, и инкубировали при комнатной температуре в течение 2 ч. Планшеты промывали PBS-T, добавляли вторичное HRP-конъюгированное антитело против кроличьего иммуноглобулина G (от компании Sigma) и инкубировали при комнатной температуре в течение 1 ч. Планшеты промывали и обрабатывали для развития окраски субстратом пероксидазы SureBlue TMB Microwell (KPL, Gaithersburg, MD).Assays for detection of antibodies to capsular polysaccharides (CPS) or OPS, or various protein antigens, were performed in medium binding
Титр кроличьих IgG в образцах сыворотки, специфичных для разных белковых антигенов, определяли методом ELISA и строили стандартную кривую на основании результатов для поликлональной сыворотки, используя условные единицы. Белковыми антигенами покрывали в течение ночи при комнатной температуре 96-луночные планшеты Immulon 2 HB (Thermo Scientific), используя 0,5-1 мкг белка/мл PBS и 100 мкл на лунку. Белковый раствор удаляли, планшеты блокировали PBS+1,0% BSA в течение 1 ч при комнатной температуре и промывали фосфатно-солевым буфером Дульбекко с 0,05% Tween-20 (PBS-T). Кроличью сыворотку разбавляли в PBS-T, добавляли в лунки планшета и инкубировали при комнатной температуре в течение 2 ч. Планшеты промывали PBS-T, добавляли вторичные антитела осла против IgG кролика, конъюгированные с HRP (Santa Cruz Biotechnology), разбавленные 1 к 20000 в PBS-T, по 100 мкл в лунку и инкубировали при комнатной температуре в течение 1 ч. Планшеты промывали и обрабатывали для развития окраски субстратом пероксидазы SureBlue TMB Microwell (KPL, Gaithersburg, MD). Реакцию останавливали равным объемом 1 Н HCl, и поглощение определяли при 450 нм на планшетном ридере Spectramax (Molecular Devices). Величину УЕ, равную 12500 УЕ/мл присваивали стандартной поликлональной сыворотке, используемой в каждом планшете, и уравнение на основе 4-параметрической кривой использовали для определения величины в УЕ для каждого разбавленного образца сыворотки, основанное на поглощении при 450 нм и скорректированное на коэффициент разбавления. Критерием приемлемости стандартной кривой для поликлональной сыворотки (AFV160, специфической для PRO-CN, ризавидина и 6-гистидиновой метки) было значение R2 для 4-параметрической кривой, составляющее 0,99 или более, и менее 10% КВ между дубликатами. Внутреннюю контрольную сыворотку (AFV151, специфическую для PRO-CN, ризавидина и 6-гистидиновой метки) также использовали в каждом планшете, и КВ для присвоенной величины должен был быть равен, или менее, 20% между планшетами для приемлемости данных.The titer of rabbit IgG in serum samples specific for different protein antigens was determined by ELISA and a standard curve was built based on the results for polyclonal serum using arbitrary units. Protein antigens were coated overnight at room temperature in
Оценка функции носителяCarrier function evaluation
Способность слитых белков ризавидина в качестве носителя вызывать повышенный иммунный ответ на полисахариды в комплексах MAPS оценивали и сравнивали с отдельным ризавидином и контрольным белком-носителем (PRO-CN), который ранее вызывал сильные иммунные ответы на находящиеся в комплексе полисахариды. Различные полученные слитые белки были включены в комплекс с полисахаридами с известной иммуногенностью (6B, 7F и 19A S. pneumoniae) (Zhang et al., 2013), и было проведено сравнение с контрольным сильным функциональным белком-носителем (PRO-CN). Все слитые белки были способны к объединению в комплекс с биотинилированным PS и образованию высокомолекулярных комплексов, которые могли быть очищены и впоследствии использованы для иммунизации кроликов и оценки функции носителя.The ability of rhizavidin carrier fusion proteins to elicit an increased immune response to the polysaccharides in the MAPS complexes was evaluated and compared to rhizavidin alone and a control carrier protein (PRO-CN) that had previously elicited strong immune responses to the complexed polysaccharides. Various resulting fusion proteins were complexed with polysaccharides of known immunogenicity (
Кроликов иммунизировали комплексами MAPS, образованными пневмококковыми полисахаридами (PnPS) 6B и 19A с различными слитыми белками ризавидина. Сыворотки собирали через 2 недели после первой иммунизации (P1) и второй иммунизации (P2). Уровни кроличьих IgG к PnPS 19A и 6B в каждом образце определяли методом ELISA и выражали в УЕ, которые определяли из стандартной кривой, построенной для поликлональной сыворотки, которой было присвоено значение УЕ, равное 12500 УЕ/мл. На Фигурах 13A и 13B показано, что флагеллин B (FlaB) Pseudomonas в виде слитого белка с ризавидином (Rhavi-FlaB) и FlaB Pseudomonas, слитый с PcrV Pseudomonas в виде слитого белка с ризавидином (Rhavi-FlaB-PcrV), были способны индуцировать выработку IgG к пневмококковым полисахаридам (PnPS) 6B и 19A с титрами, аналогичными титрам в случае ранее идентифицированного белка-носителя, PRO-CN. FlaA1 и FlaA2 Pseudomonas в виде слитых белков с ризавидином (Rhavi-FlaA1 и Rhavi-FlaA2) и FlaB-Домен2 Pseudomonas, слитый с MrkA Klebsiella в виде слитого белка с ризавидином (Rhavi-FlaBD2-MrkA), продемонстрировали титры, которые были аналогичны, или в пределах 2-кратного превышения, титрам в случае Rhavi-FlaB и PRO-CN. MrkA Klebsiella и PcrV Pseudomonas продемонстрировали очень низкие, вплоть до неопределяемых, титры IgG для введенного 19A PS и низкие титры для 6B и 7F при дозе 0,044 мкг. Для преодоления слабого функционирования MrkA в качестве носителя и, в то же время, для выработки антител, направленных на MrkA, проводили его слияние с сильным носителем белком FlaB-Домен2 с целью сохранения функции носителя (Rhavi-FlaBD2-MrkA).Rabbits were immunized with MAPS complexes formed by pneumococcal polysaccharides (PnPS) 6B and 19A with various rhizavidin fusion proteins. Sera were collected 2 weeks after the first immunization (P1) and the second immunization (P2). The levels of rabbit IgG to
В Таблице 9 приведены сводные характеристики носителей иллюстративных слитых белков ризавидина по изобретению. Функцию носителя каждого слитого белка выражали в процентах от функции белка-носителя PRO-CN и сравнивали с отдельным белком ризавидином, который приводил лишь к 4% иммунного ответа на 6B и 5% иммунного ответа на 19A, в сравнении с показателями для PRO-CN. Rhavi-FlaB-PcrV, белок с двойной патогенной специфичностью (химерный белок из двух антигенов Pseudomonas, FlaB и PcrV, слитых с ризавидином), проявил себя как сильный носитель в отношении вызывания сильного PnPS-специфического иммунного ответа у кроликов на тип 6B (62%) и 19A (102%), в сравнении с PRO-CN (100%). Rhavi-FlaB также продемонстрировал сильную функцию носителя, с сильными иммунными ответами как на 6B (66%), так и на 19A (49%), в сравнении с PRO-CN. Rhavi-MrkA имел более слабую функцию в качестве белка-носителя для 6B (27%) и 19A (2%), в сравнении с PRO-CN, соответственно. Rhavi-FlaBD2 имел сильную функцию в качестве носителя для 6B (66%), и более слабую функцию в качестве носителя для 19A (20%). Химерный Rhavi-FlaBD2-MrkA, содержащий антигены как Pseudomonas (FlaBD2), так и Klebsiella (MrkA), обеспечивал функцию носителя как для 6B (34%), так и для 19A (45%), которая была приблизительно в 2-раза слабее, чем функция белка-носителя PRO-CN и превышала таковую у отдельного ризавидина. Поскольку к обоим PnPS был индуцирован иммунный ответ, который превышал 30% ответа в случае PRO-CN, и поскольку было представлено большое число специфических для патогенов белков, как Rhavi-FlaB-PcrV, так и Rhavi-FlaBD2-MrkA, варианты были выбраны в качестве потенциальных белков-носителей для образования комплекса в вариантных MAPS с каркасным полимером OPS по изобретению. В дополнение к продемонстрированной функции носителя, IgG к белку-носителю, специфические для высоко консервативного PcrV Pseudomonas и, в некоторой степени, FlaB (то есть, приблизительно 45 процентов штаммов Pseudomonas экспрессируют FlaB), а также для консервативного MrkA Klebsiella, выработанные против этих СБ, могут обеспечивать значительное дополнительное широкое защитное покрытие против заболевания, вызываемого этими 2 патогенами.Table 9 summarizes the characteristics of carriers of exemplary rizavidin fusion proteins of the invention. The carrier function of each fusion protein was expressed as a percentage of the function of the PRO-CN carrier protein and compared to the single protein rizavidin, which resulted in only a 4% immune response to 6B and a 5% immune response to 19A compared to PRO-CN. Rhavi-FlaB-PcrV, a protein with dual pathogenic specificity (a chimeric protein from two Pseudomonas antigens, FlaB and PcrV, fused to rizavidin), was shown to be a strong vehicle in inducing a strong PnPS-specific immune response in rabbits to type 6B (62% ) and 19A (102%), compared to PRO-CN (100%). Rhavi-FlaB also showed strong carrier function, with strong immune responses to both 6B (66%) and 19A (49%), compared to PRO-CN. Rhavi-MrkA had a weaker function as a carrier protein for 6B (27%) and 19A (2%) compared to PRO-CN, respectively. Rhavi-FlaBD2 had a strong function as a carrier for 6B (66%), and a weaker function as a carrier for 19A (20%). Chimeric Rhavi-FlaBD2-MrkA, containing both Pseudomonas (FlaBD2) and Klebsiella (MrkA) antigens, provided a carrier function for both 6B (34%) and 19A (45%), which was approximately 2-fold weaker than the function of the PRO-CN carrier protein and exceeded that of a single rizavidin. Since an immune response was induced to both PnPS that exceeded 30% of the response in the case of PRO-CN, and since a large number of pathogen-specific proteins, both Rhavi-FlaB-PcrV and Rhavi-FlaBD2-MrkA, were presented, the variants were selected in as potential carrier proteins for complexation in variant MAPS with the OPS backbone polymer of the invention. In addition to the demonstrated carrier function, anti-carrier protein IgGs specific for the highly conserved Pseudomonas PcrV and, to some extent, FlaB (i.e., approximately 45 percent of Pseudomonas strains express FlaB), as well as for the conserved MrkA Klebsiella , are raised against these SBs. , may provide significant additional broad protective coverage against disease caused by these 2 pathogens.
Таблица 9: Характеристики белка-носителя иллюстративных слитых белков ризавидина и вариантовTable 9: Carrier protein characteristics of exemplary rizavidin fusion proteins and variants
K. pneumoniaeK. pneumoniae
K. pneumoniaeK. pneumoniae
Оценка иммуногенностиAssessment of immunogenicity
Результаты сравнительного исследования иммуногенности у кроликов различных препаратов нативных PA O6 и O10 OPS в виде комплексов MAPS со слитым белком ризавидина PRO-CN, или ризавидином, представлены на Фигуре 15. Титры OPS-специфических IgG в анализе ELISA представлены в единицах ELISA. Титры OPS-специфических IgG антител, более чем в 100 раз превышающие титры P0, не были достигнуты ни с одним из этих препаратов после 2 иммунизаций (P2). Это свидетельствует о том, что молекулярный размер нативных PA OPS (10-30 кДа) был слишком мал, эпитопная валентность была слишком низкой или молекулярная структура была неподходящей для вызывания ответа даже при использовании комплексов MAPS с белком-носителем, PRO-CN.The results of a comparative study of immunogenicity in rabbits of different preparations of native PA O6 and O10 OPS in the form of MAPS complexes with the rizavidin PRO-CN fusion protein, or rizavidin, are presented in Figure 15. OPS-specific IgG titers in the ELISA assay are presented in ELISA units. OPS-specific IgG antibody titers greater than 100 times P0 titers were not achieved with any of these drugs after 2 immunizations (P2). This suggests that the molecular size of the native PA OPS (10-30 kDa) was too small, the epitope valency was too low, or the molecular structure was not suitable to elicit a response even when MAPS was complexed with the carrier protein, PRO-CN.
Исследование иммуногенности, в котором сравнивали различные варианты каркасного полимера KP-O1 OPS в виде вариантных комплексов MAPS, проводили на кроликах. BP-1, BP-2a и BP-2b варианты KP O1 OPS, связанные с капсульным полисахаридом (CPS) Klebsiella K19, оценивали на иммуногенность. Также оценивали BP-1 вариант KP O5, связанный с K19. Сравнивали иммуногенность четырех смесей вариантных комплексов MAPS; 2-валентного KP-O1 и -O5 OPS BP-1 (схематическое изображение которого представлено на Фигуре 2A); KP-O1 BP-2a (Фигура 3) и KP-O1 BP-2b (Фигура 4). Все эти полисахариды были включены в вариантные комплексы MAPS с белком-носителем PRO-CN и составлены с квасцами перед инъекцией. Титры анти-KP-O1 OPS IgG показаны в единицах ELISA для преиммунной сыворотки (P0), сывороток после первой (P1) или 2 иммунизаций (P2) на Фигуре 16. BP-2a OPS (12000 единиц EIA) приводил к титрам O1 OPS-специфических IgG, более чем в 100 раз превышающим титры P0. O1 OPS BP-1 и O5 OPS BP-1 приводили к титрам, в 10 раз превышающим титры P0.An immunogenicity study comparing different variants of the KP-O1 OPS backbone polymer as variant MAPS complexes was performed in rabbits. BP-1, BP-2a and BP-2b variants of KP O1 OPS associated with Klebsiella K19 capsular polysaccharide (CPS) were evaluated for immunogenicity. The BP-1 variant of KP O5 associated with K19 was also evaluated. The immunogenicity of four mixtures of variant MAPS complexes was compared; 2-valent KP-O1 and -O5 OPS BP-1 (schematic representation of which is shown in Figure 2A); KP-O1 BP-2a (Figure 3) and KP-O1 BP-2b (Figure 4). All of these polysaccharides were incorporated into MAPS variant complexes with the PRO-CN carrier protein and formulated with alum prior to injection. Anti-KP-O1 OPS IgG titers are shown in ELISA units for pre-immune sera (P0), sera after first (P1) or 2 immunizations (P2) in Figure 16. BP-2a OPS (12,000 EIA units) resulted in O1 OPS- specific IgG, more than 100 times higher than P0 titers. O1 OPS BP-1 and O5 OPS BP-1 resulted in
В аналогичном исследовании иммуногенности на кроликах сравнивали различные препараты PA-O6 и -O10 OPS BP-1: 2-валентный PA-O6,-O10 OPS BP-1 PRO-CN MAPS с квасцами; 2-валентный PA-O6,-O10 OPS BP-1 PRO-CN MAPS без адъюванта (без квасцов); 2-валентный PA-O6,-O10 OPS BP-1 только полисахарид (квасцы, без белка); 2-валентный PA-O6,-O10 OPS BP-1 в смеси с PRO-CN без образования комплекса (не биотинилированный; квасцы; без образования вариантного MAPS); и одновалентный PA-IATS O6 OPS BP-1 PRO-CN MAPS с квасцами (дополнительный источник OPS штамма PA O6). Титры анти-PA-O6 и PA-O10 OPS IgG показаны в единицах ELISA для преиммунной сыворотки (P0), сывороток после одной (P1) или 2 иммунизаций (P2) на Фигуре 17. Титры PA-O6 и PA-O10 OPS-специфических IgG, более чем 100 раз превышающие титры P0, могли быть достигнуты (5000-11000 диапазон в единицах ELISA) только, когда каркасный полимер OPS присутствовал в вариантном комплексе MAPS с квасцами.A similar immunogenicity study in rabbits compared different preparations of PA-O6 and -O10 OPS BP-1: 2-valent PA-O6, -O10 OPS BP-1 PRO-CN MAPS with alum; 2-valent PA-O6,-O10 OPS BP-1 PRO-CN MAPS without adjuvant (no alum); 2-valent PA-O6,-O10 OPS BP-1 polysaccharide only (alum, no protein); 2-valent PA-O6,-O10 OPS BP-1 mixed with PRO-CN without complex formation (not biotinylated; alum; without variant MAPS formation); and monovalent PA-IATS O6 OPS BP-1 PRO-CN MAPS with alum (additional source of PA O6 strain OPS). Anti-PA-O6 and PA-O10 OPS IgG titers are shown in ELISA units for pre-immune sera (P0), sera after one (P1) or 2 immunizations (P2) in Figure 17. Titers of PA-O6 and PA-O10 OPS-specific IgG greater than 100-fold P0 titers could only be achieved (5000-11000 range in ELISA units) when the OPS backbone polymer was present in the variant MAPS complex with alum.
Размер KP OPS, полученного с использованием стандартизированных лабораторных условий роста в среде с определенным химическим составом, находится в диапазоне 10-15 кДа, сравнительно меньше, чем размер PA OPS (20-30 кДа), полученного в аналогичных условиях, эти различия в размерах могут, частично, служить объяснением, почему в этих сравнительных исследованиях иммуногенности PA OPS BP-1 были более иммуногенными, чем KP OPS BP-1. Конструкты KP OPS BP-2b, с другой стороны, были в значительной степени иммуногенными (Фигура 16). Другие структурные отличия в повторяющихся единицах OPS также могли оказывать влияние, например, заряд; повторяющиеся единицы как PA-O6, так и -O10, являются отрицательно заряженными, тогда как KP-O1 OPS является нейтральным.The size of KP OPS obtained using standardized laboratory growth conditions in a medium with a certain chemical composition is in the range of 10-15 kDa, relatively smaller than the size of PA OPS (20-30 kDa) obtained under similar conditions, these size differences can , in part, to explain why, in these comparative immunogenicity studies, PA OPS BP-1 were more immunogenic than KP OPS BP-1. The KP OPS BP-2b constructs, on the other hand, were largely immunogenic (Figure 16). Other structural differences in OPS repeating units could also have an effect, such as charge; the repeat units of both PA-O6 and -O10 are negatively charged, while KP-O1 OPS is neutral.
Пример 7: Функциональные анализы антителExample 7 Functional Antibody Assays
Анализ опсонофагоцитарного уничтоженияOpsonophagocytic killing assay
Анализы опсонофагоцитарного уничтожения (ОФУ) с HL-60: Анализы проводили, как описано ранее, с модификациями (Ramachandran et al., 2016). Вкратце, анализы проводили в 96-луночных круглодонных планшетах с использованием штаммов P. aeruginosa и K. pneumoniae из культур в логарифмической фазе роста, разбавленных до 3×105 клеток/мл; комплемента крольчонка (BRC); PMA-дифференцированных клеток HL-60 (2×107 клеток/мл) в качестве источника полиморфноядерных лейкоцитов; и кроличьей преиммунной/иммунной сыворотки в нескольких разведениях. После 45 мин инкубации при 37°C аликвоты отбирали из лунок и помещали на чашки с бактериологическим агаром (5% экстракт Hy-Yeast [Kerry Bio-Science], 10% сойтон без продуктов животного происхождения [Teknova], 5% NaCl [Americanbio] и 1,4% агар [Americanbio], называемым далее в настоящем изобретении HySoy агаром или HSA). После инкубации в течение ночи на HSA подсчитывали КОЕ. Положительный ОФУ-ответ был получен, когда показатель КОЕ для бактерий, обработанных иммунной сывороткой, уменьшался в сравнении с обработкой преиммунной сывороткой в аналогичном разведении.Opsonophagocytic killing (OPK) assays with HL-60: Assays were performed as previously described with modifications (Ramachandran et al., 2016). Briefly, assays were performed in 96-well round bottom plates using P. aeruginosa and K. pneumoniae strains from log phase cultures diluted to 3×10 5 cells/ml; rabbit complement (BRC); PMA-differentiated HL-60 cells (2×10 7 cells/ml) as a source of polymorphonuclear leukocytes; and rabbit preimmune/immune serum in several dilutions. After a 45 min incubation at 37°C, aliquots were removed from the wells and plated on bacteriological agar plates (5% Hy-Yeast extract [Kerry Bio-Science], 10% soyton without animal products [Teknova], 5% NaCl [Americanbio] and 1.4% agar [Americanbio], hereinafter referred to as HySoy agar or HSA). After overnight incubation on HSA, CFUs were counted. A positive OFV response was obtained when the CFU for bacteria treated with immune serum was reduced compared to treatment with pre-immune serum at the same dilution.
На Фигуре 18A приведено сравнение ОФУ Klebsiella штамма KP 12-0581 (O1: K62) с клетками HL-60 и кроличьей иммунной сывороткой к: KP-O1 OPS BP-1 PRO-CN MAPS до иммунизации и после второй иммунизации (слева), а также KP-O1 OPS BP-2a/ризавидин PRO-CN MAPS до иммунизации и после второй иммунизации (справа). Значительное уничтожение KP наблюдали в случае анти-BP-2a иммунной сыворотки (P2) в сравнении с преиммунной сывороткой (P0) от того же кролика. Значительное уничтожение отсутствовало в случае анти-BP-1 иммунной сыворотки, что согласовалось с титрами O1-OPS-специфических IgG, полученными при использовании данных конструктов, то есть BP-2a> BP-1 в отношении соответствующих титров.Figure 18A compares CFU of Klebsiella strain KP 12-0581 (O1: K62) with HL-60 cells and rabbit immune serum to: KP-O1 OPS BP-1 PRO-CN MAPS before immunization and after the second immunization (left), and also KP-O1 OPS BP-2a/rizavidin PRO-CN MAPS before immunization and after the second immunization (right). Significant killing of KP was observed with anti-BP-2a immune sera (P2) compared to pre-immune sera (P0) from the same rabbit. There was no significant killing in the case of anti-BP-1 immune sera, which was consistent with the O1-OPS-specific IgG titers obtained using these constructs, ie BP-2a > BP-1 in relation to the respective titers.
Результаты ОФУ Pseudomonas штамма PA IATS O6 с клетками HL-60 и кроличьей иммунной сывороткой к двухвалентному PA O6, O10-OPS BP-1 PRO-CN MAPS и одновалентному PA IATSO6-OPS BP-1 PRO-CN MAPS представлены на Фигуре 18B. 2 отдельные кроличьи сыворотки P2 (AFV 624; AFV 625) к PA O6, O10-BP-1 MAPS приводили к значительному ОФУ PA IATSO6 (левая панель), кроличья иммунная сыворотка (P2) против PA IATSO6-BP-1 MAPS также приводила к значительному ОФУ PA IATS O6, при этом сыворотка AFV643 (P2) создавала эффект прозоны, свидетельствующий о сильном титре анти-OPS антитела.The results of PFU of Pseudomonas strain PA IATS O6 with HL-60 cells and rabbit immune sera to bivalent PA O6, O10-OPS BP-1 PRO-CN MAPS and monovalent PA IATSO6-OPS BP-1 PRO-CN MAPS are shown in Figure 18B. 2 separate rabbit sera P2 (AFV 624; AFV 625) to PA O6, O10-BP-1 MAPS resulted in significant RFU of PA IATSO6 (left panel), rabbit immune sera (P2) against PA IATSO6-BP-1 MAPS also resulted in significant OFU PA IATS O6, with AFV643 (P2) serum producing a prozone effect indicative of a strong anti-OPS antibody titer.
Четыре отдельные кроличьи иммунные сыворотки (P2), полученные с использованием 2-валентной PA-O6, -O10 OPS BP-1-PRO-CN-MAPS вакцины, вызывали надежное ОФУ бактерий Pseudomonas O10 клетками HL-60 (Фигура 18C).Four separate rabbit immune sera (P2) prepared using the 2-valent PA-O6, -O10 OPS BP-1-PRO-CN-MAPS vaccine elicited reliable OFU of Pseudomonas O10 bacteria in HL-60 cells (Figure 18C).
ОФУ целевого штамма P. aeruginosa штамма PAO1 (O5: экспрессирующего FlaB) объединенной кроличьей анти-Rhavi-FlaB-His сывороткой и клетками HL-60 показано на Фигуре 22. В этом эксперименте имело место некоторое ОФУ (разведение до 1/100), вызываемое анти-Rhavi-FlaB-His сывороткой. Сильное ОФУ было отмечено с человеческими в/в IG, индуцированными вакциной Pseudomonas, и сывороткой против FlaB Pseudomonas. Контрольная (-) сыворотка не индуцировала ОФУ.The RFU of the target P. aeruginosa strain PAO1 (O5: FlaB expressing) with pooled rabbit anti-Rhavi-FlaB-His serum and HL-60 cells is shown in Figure 22. In this experiment, there was some RFU (1/100 dilution) caused by anti-Rhavi-FlaB-His serum. Severe OFU has been noted with human IV IG induced by Pseudomonas vaccine and anti- Pseudomonas FlaB sera. Control (-) serum did not induce OFU.
Анализы ОФУ с человеческими PMNCFU assays with human PMN
Анализы проводили, как описано ранее, с модификациями (Cross et al., 1986). Вкратце, анализы проводили в 96-луночных планшетах с использованием полиморфноядерных лейкоцитов (PMN), свежевыделенных из крови здоровых людей-доноров путем осаждения декстраном и центрифугирования в градиенте плотности Ficoll-Hypaque. Маточную суспензию PMN доводили до 23×106 клеток/мл в HBSS с кальцием/магнием. Шестьдесят мкл маточной суспензии PMN добавляли в лунку планшета вместе с 10-20 мкл либо комплемента крольчонка, либо свежей нормальной человеческой сыворотки (NHS), 10 мкл бактерий (~106 КОЕ для MOI ~1:1) в присутствии или в отсутствие 10 мкл инактивированной нагреванием пре- или пост-иммунной сыворотки в разных разведениях. В момент времени 0 образец отбирали, разбавляли и высевали на чашки с HySoy, затем 96-луночный планшет инкубировали в течение 2 ч при 37°C со встряхиванием. Через 2 ч образцы вновь отбирали, разбавляли и высевали. После инкубации в течение ночи при 37°C производили подсчет клеток в чашках. Количество клеток в момент времени 2 ч для каждой лунки делили на количество клеток в момент времени 0, и % уничтожения рассчитывали по формуле 1,0-T2h КОЕ/T0 КОЕ. Альтернативно, авторы изобретения переводили КОЕ для каждой лунки в log КОЕ, вычитали log числа КОЕ для 2 ч образца из log числа КОЕ для момента времени 0, и выражали разницу в уничтожении в виде «дельта log КОЕ». Затем авторы изобретения сравнивали уничтожение в лунках, содержащих преиммунную и иммунную сыворотки, с контролем без антитела.Analyzes were performed as previously described, with modifications (Cross et al., 1986). Briefly, assays were performed in 96-well plates using polymorphonuclear leukocytes (PMN) freshly isolated from the blood of healthy human donors by dextran precipitation and Ficoll-Hypaque density gradient centrifugation. The PMN stock suspension was adjusted to 23×10 6 cells/ml in HBSS with calcium/magnesium. Sixty µl of PMN stock suspension was added to a well of the plate along with 10-20 µl of either rabbit complement or fresh normal human serum (NHS), 10 µl of bacteria (~10 6 cfu for ~1:1 MOI) in the presence or absence of 10 µl heat-inactivated pre- or post-immune serum in various dilutions. At
Анализы связывания методом проточной цитометрииBinding assays by flow cytometry
Штаммы P. aeruginosa и K. pneumoniae в середине логарифмической фазы роста концентрировали в PBS до OD600 0,8. В случае полисахаридных антигенов бактерии фиксировали 1% формальдегидом перед добавлением антитела. В случае белковых антигенов бактерии не фиксировали формальдегидом перед добавлением антитела с целью сохранения клеточных поверхностных антигенов. Бактерии инкубировали с кроличьей преиммунной/иммунной сывороткой в разных разведениях в течение 1 ч при комнатной температуре. Несвязанное антитело удаляли путем осаждения бактерий центрифугированием и промывания PBS, промытые клетки инкубировали с меченым Alexa Fluor 488 антителом козы против IgG кролика (Invitrogen) в течение 1 ч при комнатной температуре. Несвязанное вторичное антитело удаляли путем осаждения бактерий центрифугированием и промывания PBS. Иммунологически окрашенные бактерии фиксировали в 1% формальдегиде для уничтожения любых жизнеспособных микроорганизмов. Образцы инжектировали в проточный цитометр LSR II (BD) и анализировали с использованием FACS Diva (v. 6.1.3; BD) и FlowJo (v. 9.2; Tree Star). P. aeruginosa and K. pneumoniae strains in the middle of the logarithmic growth phase were concentrated in PBS to an OD 600 of 0.8. For polysaccharide antigens, bacteria were fixed with 1% formaldehyde before antibody addition. In the case of protein antigens, the bacteria were not fixed with formaldehyde prior to the addition of the antibody in order to preserve the cell surface antigens. Bacteria were incubated with rabbit pre-immune/immune serum in various dilutions for 1 h at room temperature. Unbound antibody was removed by pelleting the bacteria by centrifugation and washing with PBS, washed cells were incubated with Alexa Fluor 488 labeled goat anti-rabbit IgG (Invitrogen) for 1 hour at room temperature. Unbound secondary antibody was removed by pelleting the bacteria by centrifugation and washing with PBS. Immunologically stained bacteria were fixed in 1% formaldehyde to kill any viable microorganisms. Samples were injected into an LSR II flow cytometer (BD) and analyzed using FACS Diva (v. 6.1.3; BD) and FlowJo (v. 9.2; Tree Star).
Определенные методом ПЦ результаты связывания Klebsiella штамма B5055 (O1: K2) с кроличьей сывороткой к K-19: O1-и O5-OPS BP-1 и BP-2a PRO-CN MAPS показаны на Фигуре 19A. Показаны определенные методом ПЦ результаты связывания целых бактерий Klebsiella штамма B5055 с отдельными кроличьими сыворотками к 2-валентному KP O1, O5 OPS BP-1 (№651-655) (слева) и KP O1 OPS BP-2a (№666-670) (справа).The results of binding of Klebsiella strain B5055 (O1:K2) with rabbit serum to K-19:O1- and O5-OPS BP-1 and BP-2a PRO-CN MAPS determined by the PC method are shown in Figure 19A. The results of binding of whole bacteria Klebsiella strain B5055 with individual rabbit sera to 2-valent KP O1, O5 OPS BP-1 (#651-655) (left) and KP O1 OPS BP-2a (#666-670) are shown by PC method ( on right).
Эти определенные методом ПЦ результаты для целых бактерий хорошо коррелируют с соответствующими ELISA титрами IgG к очищенному KP O1 OPS, приведенными в Таблице 10, то есть низкий титр соответствует низкому уровню связывания при определении методом ПЦ, небольшое количество дважды положительных событий указывает на слабое связывание антитела или ограниченный доступ для антитела к OPS на поверхности KP B5055.These QC results for whole bacteria correlate well with the corresponding ELISA titers of IgG to purified KP O1 OPS shown in Table 10, i.e. a low titer corresponds to a low level of binding as determined by QC, a small number of double positive events indicates poor antibody binding, or limited access for anti-OPS antibody on the surface of KP B5055.
Таблица 10: ELISA титры анти-KP O1-OPS IgG к O1-OPS с каркасным полимером в конструктах BP-1 MAPS и BP-2a MAPSTable 10: Anti-KP O1-OPS IgG anti-O1-OPS backbone polymer ELISA titers in BP-1 MAPS and BP-2a MAPS constructs
№651-655KP 2-in O1, O5 BP-1
№651-655
№666-670KP O1 BP-2a
№666-670
На Фигуре 19B приведено сравнение диаграмм разброса данных ПЦ для трех штаммов Klebsiella O1 с кроличьей иммунной сывороткой (AFV667), индуцированной комплексом KP O1 OPS BP-2a PRO-CN MAPS; на верхних панелях наблюдается слабое связывание с KP B5055 (слева), слабое связывание с K. caroli (центр) и сильное связывание с не инкапсулированным штаммом KP CVD 3001 (справа) при определении методом ПЦ. На нижней панели (Фигура 19B) приведено сравнение определенных методом ПЦ суммарных событий связывания с одними и теми же 3 штаммами Klebsiella O1 для сыворотки от кролика, вакцинированного 2-валентным KP O1, O5 OPS BP-1 (AFV651) PRO-CN MAPS, и кроличьей сыворотки (AFV667), индуцированной одновалентным KP O1 OPS BP-2a PRO-CN MAPS. Следует отметить, что имеет место значительно большее связывание антитела с конструктом O1 OPS BP-2a, чем с соответствующим конструктом BP-1 OPS, при определении методом ПЦ, и эти данные, судя по всему, коррелируют с титрами IgG к O1 OPS, то есть, KP O1 OPS BP-2a является более иммуногенным, чем его эквивалент BP-1. Эти данные по связыванию также свидетельствуют о том, что количество CPS, влияющее на экспонирование OPS для антитела, возможно, зависит от условий выращивания.Figure 19B compares the scatterplots of the data PC for three strainsKlebsiella O1 with rabbit immune serum (AFV667) induced by KP complex O1 OPS BP-2a PRO-CN MAPS; top panels show weak binding to KP B5055 (left), weak binding toK. caroli (center) and strong binding to non-encapsulated strain KP CVD 3001 (right) as determined by the PC method. The lower panel (Figure 19B) compares the total binding events determined by the QC method with the same 3 strains.Klebsiella O1 for sera from rabbit vaccinated with 2-valent KP O1, O5 OPS BP-1 (AFV651) PRO-CN MAPS, and rabbit sera (AFV667) induced with univalent KP O1 OPS BP-2a PRO-CN MAPS. Of note, there is significantly more antibody binding to the O1 OPS BP-2a construct than to the corresponding BP-1 OPS construct as determined by the QC method, and these data appear to correlate with anti-O1 OPS IgG titers, i.e. , KP O1 OPS BP-2a is more immunogenic than its equivalent BP-1. These binding data also suggest that the amount of CPS that affects the OPS exposure of the antibody may be dependent on growth conditions.
Сравнение определенного методом ПЦ связывания антитела с целыми бактериями Pseudomonas штамма PAK (O6:FlaA1) показано на Фигуре 20: с кроличьей сывороткой (объединенная сыворотка от 3 кроликов, после второй иммунизации) к 2-валентному PA-O6, -O10 нативному OPS-PRO-CN-MAPS (слева); кроличьей сывороткой (объединенная сыворотка от 3 кроликов, после второй иммунизации) к 2-валентному PA O6, O10-OPS BP-1-PRO-CN MAPS (центр); кроличьей сывороткой (объединенная сыворотка от 3 кроликов, после второй иммунизации) к одновалентному PAO6-IATS-OPS BP-1-PRO-CN MAPS; более сильное определенное методом ПЦ связывание антитела со штаммом PAK наблюдали в случае PAO6 OPS BP-1 PRO-CN MAPS при сравнении с нативной формой PA O6 OPS MAPS, это указывало на то, что существует минимальный размер OPS, критический для его иммуногенности, то есть, размер нативного PA OPS слишком мал и должен быть увеличен за счет химического связывания с каркасным полисахаридом для увеличения его эпитопной валентности, а также его размера.Comparison of PC-Determined Antibody Binding to Whole BacteriaPseudomonas strain PAK (O6:FlaA1) shown in Figure 20: with rabbit serum (pooled serum from 3 rabbits, after the second immunization) to 2-valent PA-O6, -O10 native OPS-PRO-CN-MAPS (left); rabbit serum (pooled serum from 3 rabbits, after the second immunization) to 2-valent PA O6, O10-OPS BP-1-PRO-CN MAPS (center); rabbit serum (pooled serum from 3 rabbits, after the second immunization) to monovalent PAO6-IATS-OPS BP-1-PRO-CN MAPS; a stronger PC-determined binding of the antibody to the PAK strain was observed in the case of PAO6 OPS BP-1 PRO-CN MAPS when compared with the native form PA O6 OPS MAPS, indicating that there is a minimum OPS size that is critical for its immunogenicity, i.e. , the size of native PA OPS is too small and must be increased by chemical bonding to the backbone polysaccharide to increase its epitope valence as well as its size.
Связывание Pseudomonas штамма PAO1 (O5, экспрессирующего FlaB) отдельными кроличьими анти-FlaB антителами, индуцированными различными вариантами СБ ризавидина, содержащими эпитопы FlaB, изучали методом ПЦ, и результаты приведены в Таблице 11. Связывание, в процентах, превышающее пороговое значение, и высокая степень связывания преиммунной сыворотки (P0) в сравнении с сывороткой после третьей иммунизации (P3) показаны для 3 отдельных кроличьих сывороток к антигенам слитых белков. Эти данные по связыванию демонстрируют, что слитые белки FlaB-D2 и FlaB-PcrV с ризавидином могут индуцировать сильное связывание и узнавание антителом целых Pseudomonas штамма PAO1, экспрессирующих FlaB жгутиков, это свидетельствует о том, что эти 2 белка продуцируются с правильной укладкой и способны индуцировать выработку анти-FlaB антител со специфичностью для эпитопов естественных жгутиков B на целых бактериях Pseudomonas. Сыворотка против слитого белка RhaviFlaB-D2-MrkA не узнает в значительной степени (или, в лучшем случае, узнает слабо) жгутики на целых Pseudomonas штамма PAO1, это указывает на то, что FlaB-часть конструкта ризавидина либо не имеет правильную укладку, либо не является в достаточно степени иммуногенной в контексте слитого белка с MrkA, при оценке иммунизации одним белком с адъювантом Фрейнда.Binding of Pseudomonas strain PAO1 (O5 expressing FlaB) to individual rabbit anti-FlaB antibodies induced by various rizavidin SB variants containing FlaB epitopes was studied by CV and the results are shown in Table 11. Binding, in percent above threshold, and high bindings of pre-immune sera (P0) versus sera after the third immunization (P3) are shown for 3 separate rabbit sera to fusion protein antigens. These binding data demonstrate that FlaB-D2 and FlaB-PcrV fusion proteins with rizavidin can induce strong binding and antibody recognition of whole Pseudomonas strain PAO1 expressing FlaB flagella, suggesting that these 2 proteins are produced in a properly folded manner and are able to induce production of anti-FlaB antibodies with specificity for natural B flagella epitopes on whole Pseudomonas bacteria. Serum against the RhaviFlaB-D2-MrkA fusion protein does not significantly (or at best only weakly recognize) flagella on intact Pseudomonas strain PAO1, indicating that the FlaB portion of the rhizavidin construct is either misfolded or not is sufficiently immunogenic in the context of a fusion protein with MrkA, as assessed by immunization with one protein with Freund's adjuvant.
Диаграммы разброса данных ПЦ для некоторых из отдельных кроличьих сывороток (№792, №798 и №800), приведенных в Таблице 11, также показанные на Фигуре 21B (верхняя панель), демонстрируют определенное методом ПЦ сильное связывание для отдельной кроличьей сыворотки № 792 (образец после P3) с ризавидин-FlaB-D2; (центральная панель) промежуточное связывание для кроличьей сыворотки № 798 (образец после P3) с ризавидин-FlaB-PcrV; и (низ) слабое связывание для отдельной кроличьей сыворотки № 800 (образец после P3) с ризавидин-FlaB-D2-MrkA. На Фигуре 21A объединенная кроличья сыворотка от кроликов, иммунизированных слитым белком ризавидин-FlaB-Домен2 (лишенным TL5-связывающей области) (P3) демонстрирует высокую процентную долю меченой популяции Pseudomonas штамма PAO1 (диаграмма разброса данных, правая панель) в сравнении с преиммунной сывороткой (P0).Scatterplots The QCs for some of the individual rabbit sera (#792, #798, and #800) shown in Table 11, also shown in Figure 21B (top panel), show strong binding by the QC method for the individual rabbit serum #792 (sample after P3) with rizavidin-FlaB-D2; (center panel) intermediate binding for rabbit serum #798 (sample after P3) with rizavidin-FlaB-PcrV; and (bottom) weak binding for separate rabbit serum no. 800 (sample after P3) to rizavidin-FlaB-D2-MrkA. In Figure 21A pooled rabbit sera from rabbits immunized with the rizavidin-FlaB-Domain2 fusion protein (lacking the TL5 binding region) (P3) shows a high percentage of labeled populationPseudomonas PAO1 strain (scatterplot, right panel) versus pre-immune serum (P0).
Таблица 11: Определенные методом ПЦ результаты связывания кроличьих анти-FlaB антител к Table 11: Binding results of rabbit anti-FlaB antibodies to PseudomonasPseudomonas штамма PAO1 (O5, экспрессирующего FlaB) strain PAO1 (O5 expressing FlaB)
Эти полученные методами ELISA и ПЦ данные по связыванию свидетельствуют в пользу того, что слитые белки ризавидина, содержащие FlaB, такие как ризавидин-FlaB-Домен2 и ризавидин-FlaB-PcrV, могут быть получены с правильной укладкой и индуцировать выработку функциональных антител, способных узнавать естественные жгутики B на целых микроорганизмах Pseudomonas.These ELISA and PC binding data suggest that FlaB-containing rizavidin fusion proteins, such as rizavidin-FlaB-Domain2 and rizavidin-FlaB-PcrV, can be properly folded and induce the production of functional antibodies capable of recognizing natural B flagella on whole Pseudomonas microorganisms.
Подвижность и анализы ингибирования подвижностиMotility and Motility Inhibition Assays
P. aeruginosa штамма PAO1 (O5: экспрессирующего FlaB) выращивали до середины логарифмической фазы в бульоне HySoy. Бактерии осаждали центрифугированием и суспендировали в PBS до показателя OD600 0,3, затем разбавляли в 100 раз в PBS. Мягкий агар заливали в 24-луночные планшеты в присутствии или в отсутствие иммунной сыворотки к флагеллину в разных разведениях. Разведения иммунной сыворотки повторяли в лунках трехкратно. Обожженную в пламени иглу погружали в бактериальную суспензию, затем использовали для инокуляции центра агаровой пробки. Планшеты инкубировали при 30°C в течение 14 ч, или дольше, или до тех пор, когда бактерии распространялись от участка инокуляции по поверхности агара. Изображения планшетов получали при помощи цифровой камеры для регистрации диаметра бактериальной колонии. Результаты теста ингибирования подвижности являются положительными, когда размер колонии на агаре с сывороткой к флагеллину значительно уменьшается в сравнении с преиммунной сывороткой. P. aeruginosa strain PAO1 (O5: expressing FlaB) was grown to mid-log phase in HySoy broth. The bacteria were pelleted by centrifugation and suspended in PBS to an OD 600 of 0.3, then diluted 100-fold in PBS. Soft agar was poured into 24-well plates in the presence or absence of immune serum to flagellin in different dilutions. Dilutions of immune serum were repeated three times in the wells. The flame-fired needle was immersed in the bacterial suspension, then used to inoculate the center of the agar plug. The plates were incubated at 30° C. for 14 hours or longer, or until the bacteria spread from the inoculation site over the surface of the agar. The plates were imaged using a digital camera to record the diameter of the bacterial colony. Motility inhibition test results are positive when colony size on anti-flagellin serum agar is significantly reduced compared to pre-immune serum.
Результаты ELISA и соответствующие ингибирующие подвижность титры сыворотки от кроликов, вакцинированных конструктами ризавидин-FlaB: Rhavi-FlaB-D2; Rhavi-FlaB-PcrV и Rhavi-FlaB-D2-MrkA, приведены в Таблице 12. В данной таблице ELISA титры к FlaA1 и FlaB показаны для иммунных сывороток после третьей иммунизации (P3), и также показаны ингибирующие подвижность титры для соответствующих иммунных сывороток P3 при использовании P. aeruginosa штамма PAO1 (O5: экспрессирующего FlaB). Имеет место сильная корреляция между уровнями анти-FlaB антитела (ELISA титры) и соответствующими ингибирующими подвижность титрами, то есть, обе иммунные сыворотки против Rhavi-FlaB-D2 и Rhavi-FlaB-PcrV с высокими титрами специфического анти-FlaB антитела приводили к высоким уровням ингибирования подвижности PAO1, в отличие от сыворотки к конструкту слитого белка Rhavi-FlaB-D2-MrkA, предположительно, вследствие низких уровней анти-FlaB антитела, вероятно, либо вследствие либо неправильной укладки компонента белка FlaB в конструкте, либо отсутствия иммунного ответа в контексте слитого белка с MrkA при оценке иммунизации одним белком с адъювантом Фрейнда.ELISA results and corresponding motility-inhibiting titers of sera from rabbits vaccinated with the rhavidin-FlaB constructs: Rhavi-FlaB-D2; Rhavi-FlaB-PcrV and Rhavi-FlaB-D2-MrkA are shown in Table 12. In this ELISA table, the titers for FlaA1 and FlaB are shown for immune sera after the third immunization (P3), and the motility-inhibiting titers for the corresponding P3 immune sera are also shown. using P. aeruginosa strain PAO1 (O5: expressing FlaB). There is a strong correlation between anti-FlaB antibody levels (ELISA titers) and corresponding motility-inhibiting titers, i.e. both anti-Rhavi-FlaB-D2 and Rhavi-FlaB-PcrV immune sera with high specific anti-FlaB antibody titers resulted in high levels inhibition of PAO1 mobility, as opposed to serum, to the Rhavi-FlaB-D2-MrkA fusion protein construct, presumably due to low levels of anti-FlaB antibody, likely either due to either misfolding of the FlaB protein component in the construct or lack of immune response in the context of the fusion protein with MrkA when evaluating immunization with one protein with Freund's adjuvant.
Таблица 12: ELISA титры и титры ингибирования подвижности для различных конструктов, содержащих ризавидин-FlaBTable 12: ELISA titers and motility inhibition titers for various constructs containing rizavidin-FlaB
ELISAELISA
ELISAELISA
Анализы цитотоксичности (для конструктов с белком PcrV Cytotoxicity assays (for constructs with PcrV protein PseudomonasPseudomonas ))
Анализы проводили следующим образом. Вкратце, кроличью иммунную сыворотку, полученную против белка PcrV бактериальной секреторной системы, добавляли к клеткам A549, высеянным в плоскодонные 96-луночные планшеты (Corning Costar). Все разведения иммунной сыворотки и бактериальных культур выполняли в среде RPMI без антибиотика. P. aeruginosa штамм PAK, способный экспрессировать ExoU, в логарифмической фазе роста добавляли при показателе MOI приблизительно 10 и инкубировали в течение 2 ч при 37°/5% CO2, за это время клетки A549 подвергались интоксикации и становились нежизнеспособными. Количество жизнеспособных клеток в каждой лунке оценивали на основании поглощения клетками прижизненного красителя нейтрального красного (Pseudomonas также метаболизирует аламаровый синий, и он не может быть использован). Процентную долю жизнеспособных клеток в каждой лунке оценивали путем измерения поглощения нейтрального красного и сравнения этих значений со значениями для клеток, который не были заражены бактериями. Результаты данного анализа являются положительными, когда иммунная сыворотка против PcrV приводит к увеличению количества жизнеспособных клеток (то есть клеток, способных поглощать нейтральный красный) в сравнении с преиммунной сывороткой в эквивалентном разведении.The analyzes were carried out as follows. Briefly, rabbit immune sera raised against the PcrV protein of the bacterial secretory system was added to A549 cells seeded in flat-bottomed 96-well plates (Corning Costar). All dilutions of immune serum and bacterial cultures were performed in RPMI medium without antibiotic. A P. aeruginosa strain of PAK capable of expressing ExoU in logarithmic growth phase was added at an MOI of approximately 10 and incubated for 2 hours at 37°/5% CO 2 , during which time the A549 cells were intoxicated and became non-viable. The number of viable cells in each well was estimated based on cell uptake of the intravital dye neutral red ( Pseudomonas also metabolizes alamar blue and cannot be used). The percentage of viable cells in each well was assessed by measuring the absorbance of neutral red and comparing these values with the values for cells that were not infected with bacteria. The results of this assay are positive when PcrV immune sera results in an increase in viable cells (ie, cells capable of absorbing neutral red) compared to equivalent dilution preimmune sera.
Модель предотвращения клеточной цитотоксичности, вызываемой бактериями Pseudomonas (Warrener et al., 2014), использовали для тестирования эффективности анти-Rhavi-FlaB-PcrV СБ кроличьего антитела, и результаты представлены на Фигуре 24A. Защиту анти-PcrV антителом клеток A549 (карцинома легкого) от интоксикации Pseudomonas штамма PAK (O6:FlaA1) оценивали следующим образом. Монослои A549 инфицировали Pseudomonas штамма PAK (O6:FlaA1) в течение 4 ч в присутствии 10% сыворотки от кроликов (объединенные 3 сыворотки, после третьей иммунизации, P3), вакцинированных слитым белком Rhavi-FlaB-PcrV. Анти-Rhavi-FlaB-PcrV сыворотка защищала клетки от интоксикации Pseudomonas штамма PAK, в сравнении с преиммунной сывороткой, о чем свидетельствует меньшее количество округлившихся и отделившихся клеток. В следующем эксперименте (Фигура 24B) монослой клеток A549 инфицировали Pseudomonas штамма PAK в течение 4 ч в присутствии сыворотки против Rhavi-FlaB-PcrV (объединенные 3 сыворотки, P3) в разных разведениях. Клетки промывали PBS и инкубировали в течение 1 ч с нейтральным красным. Клетки лизировали, и регистрировали поглощение красителя в каждой лунке. Анти-Rhavi-FlaB-PcrV (P3) сыворотка защищала клетки от интоксикации PAK в сравнении с преиммунной сывороткой в разведении 1 к 40.The Pseudomonas cellular cytotoxicity prevention model (Warrener et al., 2014) was used to test the efficacy of anti-Rhavi-FlaB-PcrV BP rabbit antibody and the results are shown in Figure 24A. Protection of anti-PcrV antibody of A549 cells (lung carcinoma) against Pseudomonas strain PAK (O6:FlaA1) intoxication was assessed as follows. A549 monolayers were infected with Pseudomonas strain PAK (O6:FlaA1) for 4 hours in the presence of 10% sera from rabbits (pooled 3 sera, after third immunization, P3) vaccinated with the Rhavi-FlaB-PcrV fusion protein. Anti-Rhavi-FlaB-PcrV serum protected cells from Pseudomonas strain PAK intoxication compared to pre-immune serum, as evidenced by fewer rounded and detached cells. In the following experiment (Figure 24B), a monolayer of A549 cells was infected with Pseudomonas strain PAK for 4 h in the presence of anti-Rhavi-FlaB-PcrV sera (pooled 3 sera, P3) at various dilutions. Cells were washed with PBS and incubated for 1 h with neutral red. Cells were lysed and dye uptake was recorded in each well. Anti-Rhavi-FlaB-PcrV (P3) serum protected cells from PAK intoxication compared to pre-immune serum at a dilution of 1:40.
Без связи с какой-либо теорией, поликлональный характер ответа на Rhavi-FlaB-PcrV, а также его конфигурация в слитом белке, может являться причиной увеличения аффинности антитела к компоненту PcrV слитого белка. Несколько штаммов Pseudomonas тестировали в этом анализе цитотоксичности с использованием клеток A549 и анти-FlaB-PcrV кроличьей сыворотки (после третьей иммунизации; P3) (Фигура 25): в случае высокотоксичной PA IATS O1 (замкнутые ромбы) сывороточная защита от цитотоксичности отсутствовала; в случае цитотоксического штамма PA M2 O5 (замкнутые кружки) сывороточная защита также отсутствовала; в случае не цитотоксической PA IATS O6 (замкнутые треугольники) токсичность отсутствовала; в случае цитотоксической PA 17002 (O10) (замкнутые треугольники) четко наблюдалась сывороточная защита; эти отличия в сывороточной защите в зависимости от штамма могут отражать экспрессию и уровень целевого белка PcrV на штаммах Pseudomonas.Without wishing to be bound by theory, the polyclonal nature of the Rhavi-FlaB-PcrV response, as well as its configuration in the fusion protein, may account for the increased affinity of the antibody for the PcrV component of the fusion protein. Several strains of Pseudomonas were tested in this cytotoxicity assay using A549 cells and anti-FlaB-PcrV rabbit serum (after the third immunization; P3) (Figure 25): in the case of highly toxic PA IATS O1 (closed diamonds), there was no serum protection against cytotoxicity; in the case of the cytotoxic strain PA M2 O5 (closed circles), serum protection was also absent; in the case of non-cytotoxic PA IATS O6 (closed triangles), there was no toxicity; in the case of cytotoxic PA 17002 (O10) (closed triangles), serum protection was clearly observed; these strain-dependent differences in serum protection may reflect the expression and level of target PcrV protein on Pseudomonas strains.
Анализ адгезии к клеткамCell adhesion assay
Адгезию Klebsiella к клеткам A549 анализировали, как описано (Clements et al., 2008), с некоторыми модификациями. Кроличью иммунную сыворотку, полученную против фимбриального белка MrkA, разбавляли в буфере RPMI (без добавок) и добавляли к клеткам A549, высеянным в 96-луночные планшеты. Равный объем K. pneumoniae O5 штамма 6997 (104 КОЕ/мл) смешивали с иммунной сывороткой в разных разведениях. Инфицированные клетки инкубировали в течение 1 ч при 37°C и 5% CO2, после чего лунки промывали 6 раз стерильным PBS для удаления несвязанных бактерий. Клетки лизировали 0,1% Triton X-100 в PBS, и аликвоту раствора наносили на HSA. Планшеты инкубировали в течение ночи, и количество КОЕ подсчитывали. Результаты анализа являются положительными, когда количество прикрепившихся Klebsiella уменьшается при использовании анти-MrkA иммунной сыворотки в сравнении с преиммунной сывороткой в таком же разведении. Klebsiella adhesion to A549 cells was analyzed as described (Clements et al., 2008), with some modifications. Rabbit immune sera prepared against MrkA fimbrial protein were diluted in RPMI buffer (no additives) and added to A549 cells seeded in 96-well plates. An equal volume of K. pneumoniae O5 strain 6997 (10 4 CFU/ml) was mixed with immune serum in various dilutions. Infected cells were incubated for 1 h at 37°C and 5% CO 2 after which the wells were washed 6 times with sterile PBS to remove unbound bacteria. Cells were lysed with 0.1% Triton X-100 in PBS and an aliquot of the solution was applied to HSA. The plates were incubated overnight and the CFU counted. Assay results are positive when the number of adherent Klebsiella is reduced by using anti-MrkA immune sera compared to pre-immune sera at the same dilution.
Блокирование адгезии Klebsiella KP O5 6997 (место происхождения Южная Африка) к клеткам A549 анти-Rhavi-FlaBD2-MrkA кроличьей сывороткой показано на Фигуре 23. Специфическая для Rhavi-FlaBD2-MrkA сыворотка с высоким титром (после третьей иммунизации, P3) значительно ингибировала связывание KP штамма 6997 с клетками A549 при разведении вплоть до 1/1000, в отличие от преиммунной сыворотки (P0). Это указывало на то, что компонент белка MrkA в СБ Rhavi-FlaBD2-MrkA имел правильную укладку и был способен вызывать продуцирование функциональных блокирующих антител, специфических для нативного MrkA на поверхности бактерий KP. Второй эксперимент проводили с использованием отдельных анти-MrkA кроличьих иммунных сывороток, полученных в результате иммунизации двумя слитыми белками MrkA-ризавидин: Rhavi-FlaB-D2-MrkA и Rhavi-PcrV-MrkA, результаты эксперимента приведены в Таблице 13. Все кроличьи сыворотки против СБ MrkA (за исключением одной № 804) были способны уменьшать адгезию Klebsiella O5 штамма 6997 к клеткам A549, это указывало на то, что эти 2 СБ ризавидина обладали потенциалом вызывать продуцирование функциональных MrkA-специфических антител.Blocking the adhesion of Klebsiella KP O5 6997 (origin South Africa) to A549 cells with anti-Rhavi-FlaBD2-MrkA rabbit serum is shown in Figure 23. High titer Rhavi-FlaBD2-MrkA specific serum (after third immunization, P3) significantly inhibited binding
Таблица 13: Ингибирование анти-MrkA сывороткой связывания Table 13: Serum Inhibition of Anti-MrkA Binding
Klebsiella
Анализ продуцирования антител к MrkAAnti-MrkA antibody production assay
Анти-MrkA антитело вызывает агглютинацию Klebsiella, экспрессирующей MrkA/фимбрию 3 типа, приводя к образованию кластеров бактерий, которые выпадают из раствора. Оценивали преиммунную или иммунную сыворотки от кроликов, которые были инокулированы белками носителями Rhavi-MrkA-his, Rhavi-FlaB-D2-MrkA-his или Rhavi-PcrV-MrkA-his. Klebsiella штамма 4425 (O5: K57) инкубировали с сыворотками в разных разведениях в PBS при 25°C в течение 1 ч в 96-луночных круглодонных планшетах для титрования. Планшеты осторожно встряхивали для суспендирования не агглютинированных бактерий. Супернатант из каждой лунки осторожно отбирали и переносили в новый планшет для титрования и измеряли светорассеяние при 600 нм для оценки мутности раствора. Результат является положительным, когда поглощение уменьшается в сравнении с контрольной лункой без антитела, это указывает на уменьшение количества бактерий в супернатанте вследствие вызываемой антителом агглютинации. Результат анализа регистрировали как наибольшее разведение антитела (наименьшая концентрация), при котором происходила агглютинация K. pneumoniae из-за иммунной сыворотки в большей степени, чем из-за преиммунной сыворотки, при измерении разницы в поглощении при 600 нм.The anti-MrkA antibody agglutinates Klebsiella expressing MrkA/
Результаты оценки агглютинации Klebsiella pneumoniae O5K57, штамма 4425, и O1 K22, штамма 170381, за счет кроличьей иммунной сыворотки к разным конструктам слитого белка MrkA-ризавидина: Rhavi-FlaB-D2-MrkA и Rhavi-PcrV-MrkA приведены в Таблице 14. Титры для 3 отдельных кроличьих иммунных сывороток, специфических для каждого конструкта, после второй (P2) и третьей (P3) иммунизаций представляют собой максимальное разведение сыворотки с поддающейся обнаружению агглютинацией. В этом эксперименте агглютинированным комкам позволяют оседать, и количество оставшихся (не агглютинированных) бактерий измеряют на основании оптической плотности (OD) при 600 нм. MrkA-специфические антитела, индуцированные 2 конструктами, Rhavi-FlaB-D2-MrkA и Rhavi-PcrV-MrkA, узнавали MrkA, экспрессированный на обоих штаммах Klebsiella, это указывало на то, что компонент MrkA в этих 2 слитых белках имеет правильную укладку и вызывает ответ в виде продуцирования функциональных антител.The results of the assessment of agglutination of Klebsiella pneumoniae O5K57, strain 4425, and O1 K22, strain 170381, due to rabbit immune serum to different constructs of the MrkA-rhizavidin fusion protein: Rhavi-FlaB-D2-MrkA and Rhavi-PcrV-MrkA are shown in Table 14. Titers for 3 separate rabbit immune sera specific for each construct, after the second (P2) and third (P3) immunizations represent the maximum dilution of serum with detectable agglutination. In this experiment, the agglutinated clumps are allowed to settle and the number of remaining (non-agglutinated) bacteria is measured based on optical density (OD) at 600 nm. MrkA-specific antibodies induced by the 2 constructs, Rhavi-FlaB-D2-MrkA and Rhavi-PcrV-MrkA, recognized MrkA expressed on both strains of Klebsiella , indicating that the MrkA component of these 2 fusion proteins is correctly folded and causes response in the form of production of functional antibodies.
Таблица 14: Агглютинация бактерий Table 14: Agglutination of bacteria Klebsiella, klebsiella, вызываемая антителами, специфическими для MrkA СБ ризавидинаcaused by antibodies specific for MrkA SB of rizavidin
Пример 8: Мышиные модели термического ожога и бактериемии, вызываемой Example 8: Mouse Models of Thermal Burn and Bacteremia Caused by P. aeruginosaP. aeruginosa
Модели термического ожога и бактериемии создавали, как описано, с модификациями (Neely et al., 2002). Для термического ожога 11-недельным аутбредным мышам CD-1 выбривали спину, и использовали анестезию кетамином и ксилазином перед наложением шаблона из термоустойчивого полимера с отверстием размером 1 на 1,5 дюйма. Эта платформа была разработана для создания термического ожога 12-15% поверхности тела. Этанол (0,5 мл, 100%) равномерно распределяли по поверхности спины, ограниченной окном, поджигали и оставляли гореть в течение ровно 10 секунд, после чего пламя гасили. Сразу после ожога мыши получали 0,5 мл стерильного нормального солевого раствора для гидратации. P. aeruginosa затем инъецировали п/к под ожоговую рану. Рану оставляли без покрытия. Животных внимательно наблюдали в течение 14 дней после инфицирования в отношении смертности и нагрузки органов (то есть отдаленное распространение инфекции).Thermal burn and bacteremia models were created as described, with modifications (Neely et al., 2002). For thermal burn, 11-week-old outbred CD-1 mice were shaved at the back and anaesthetized with ketamine and xylazine prior to application of a 1 x 1.5 inch heat resistant polymer template. This platform has been designed to create a thermal burn of 12-15% of the body surface. Ethanol (0.5 ml, 100%) was evenly distributed over the surface of the back defined by the window, ignited and left to burn for exactly 10 seconds, after which the flame was extinguished. Immediately after the burn, mice received 0.5 ml of sterile normal saline for hydration. P. aeruginosa was then injected sc under the burn wound. The wound was left uncovered. Animals were closely monitored for 14 days post-infection for mortality and organ burden (i.e., distant spread of infection).
Для оценки эффективности кроличьих антител против FlaB Pseudomonas использовали мышиную модель сепсиса от ожоговой раны (Cryz et al., 1984). В данной модели мышам CD1 наносили ожог, как описано выше, и 28 КОЕ P. aeruginosa штамма M2 (O5:FlaB) (инфекция ожоговой раны LD50 <1×102) вводили инъекцией в ожоговую рану. Мышам CD-1 вводили в/б инъекцией PBS, преиммунную или анти-FlaB сыворотку перед инфицированием ожоговой раны. Как показано на графиках Каплана-Мейера выживаемости на Фигуре 26, мыши были защищены за счет анти-FlaB в течение 10 дней или более после заражения раны FlaB-экспрессирующей Pseudomonas штамма M-2, в то время как все мыши из других групп погибли вследствие заражения раны.A mouse model of burn wound sepsis was used to evaluate the efficacy of rabbit antibodies against Pseudomonas FlaB (Cryz et al., 1984). In this model, CD1 mice were burned as described above and 28 cfu of P. aeruginosa strain M2 (O5:FlaB) (burn wound infection LD 50 <1x10 2 ) was injected into the burn wound. CD-1 mice were injected ip with PBS, pre-immune or anti-FlaB serum prior to infection of the burn wound. As shown in the Kaplan-Meier survival plots in Figure 26, mice were protected by anti-FlaB for 10 days or more after wound infection with FlaB-expressing Pseudomonas strain M-2, while all mice from other groups died due to infection. wounds.
В модели бактериемии 7-недельным мышам BALB/c вводили контрольные IgG или индуцируемое вакциной антитело в/б инъекцией за 24 ч до в/в заражения K. pneumoniae или P. aeruginosa. В зависимости от микроорганизма у животных собирали кровь с определенными интервалами в течение 1-4 ч для контролирования клиренса из крови, с последующей эвтаназией мышей и сбором печени и селезенки через 1-24 ч после инфицирования.In a bacteremia model, 7-week-old BALB/c mice were treated with control IgG or vaccine-inducible antibody by ip injection 24 h prior to iv challenge with K. pneumoniae or P. aeruginosa . Depending on the microorganism, the animals were bled at regular intervals for 1-4 hours to control clearance from the blood, followed by euthanasia of mice and collection of the liver and spleen 1-24 hours after infection.
Пример 9: Анализы защиты мышейExample 9 Mice Defense Assays
Мышиная модель клиренса и нагрузки органовMouse Model of Organ Clearance and Loading
Способность KP OPS-специфического антитела предотвращать инфекцию Klebsiella тестировали в мышиной модели клиренса и нагрузки органов. Мышам CD1 (группы из 3) вводили в/б инъекцией кроличью сыворотку против KPO1 BP-2a OPS-PRO-CN MAPS, а затем вводили (в/в) Klebsiella KP B5055 O1 (9×104 КОЕ). Количество жизнеспособных KP в селезенке измеряли через 14 ч после заражения. Наблюдали значительное уменьшение количества жизнеспособных KP в селезенке мышей, получавших иммунную сыворотку (P2), в сравнении с селезенкой мышей, получавших преиммунную сыворотку (P0) (Фигура 27). Эти данные указывают на то, что O1 OPS-специфическое антитело, индуцированное OPS BP-2a MAPS вакциной, обладало способностью вызывать клиренс микроорганизмов из селезенки мышей, таким образом, оно является защитным против инфекции, вызываемой Klebsiella.The ability of the KP OPS-specific antibody to prevent Klebsiella infection was tested in a mouse model of organ clearance and loading. CD1 mice (groups of 3) were injected ip with rabbit anti-KPO1 BP-2a OPS-PRO-CN MAPS serum followed by (iv) Klebsiella KP B5055 O1 (9×10 4 cfu). The number of viable KP in the spleen was measured 14 hours after infection. A significant decrease in the number of viable KPs was observed in the spleen of mice treated with immune serum (P2) compared to the spleens of mice treated with pre-immune serum (P0) (Figure 27). These data indicate that the O1 OPS-specific antibody induced by the OPS BP-2a MAPS vaccine was able to induce clearance of microorganisms from the spleens of mice, thus being protective against Klebsiella infection.
KP (O1: K2), выращенные в салицилате натрияKP(O1:K2) grown in sodium salicylate
Klebsiella pneumoniae штамма B5055 (O1: K2) выращивали в течение ночи в бульоне HySoy, содержащем 2,5 мМ салицилат натрия (Sigma), для уменьшения экспрессии CPS (Domenico, 1989). 12 мл бульона HySoy с 2,5 мМ салицилатом натрия инокулировали 5% ночной культуры, которую затем выращивали до середины логарифмической фазы роста (37 C со встряхиванием). Бактерии осаждали центрифугированием, затем ресуспендировали в стерильном PBS до концентрации приблизительно 1×108 КОЕ/мл. Концентрированные бактерии разбавляли в PBS до 2×105 КОЕ/мл. Через 1 ч после в/б введения 0,1 мл кроличьей сыворотки самкам мышей CD-1 в возрасте 8-12 недель вводили в/б инъекцией 2×104 КОЕ B5055 в 0,1 мл. Мышей контролировали в отношении смертности в течение 7 дней. Klebsiella pneumoniae strain B5055 (O1:K2) was grown overnight in HySoy broth containing 2.5 mM sodium salicylate (Sigma) to reduce CPS expression (Domenico, 1989). 12 ml HySoy broth with 2.5 mM sodium salicylate was inoculated with a 5% overnight culture which was then grown to mid-log phase growth (37° C. with shaking). Bacteria were pelleted by centrifugation, then resuspended in sterile PBS to a concentration of approximately 1×10 8 cfu/ml. The concentrated bacteria were diluted in PBS to 2×10 5 cfu/ml. 1 hour after i.p. administration of 0.1 ml of rabbit serum, female CD-1 mice aged 8-12 weeks were injected i.p. with 2×10 4 cfu of B5055 in 0.1 ml. Mice were monitored for mortality for 7 days.
В эксперименте 1 мышам CD1 вводили 0,1 мл кроличьей иммунной сыворотки против KP O1 OPS BP-1; BP-2a PRO-CN MAPS или УН KP O1: K2 (разведение 1/10) в/б за 1 ч до в/б введения 2×104 бактерий KP O1 B5055. Результаты эксперимента приведены в Таблице 15.In
Таблица 15: Пассивная защита мышей в случае микроорганизмов KP O1: K2, выращенных в салицилате натрияTable 15: Passive protection of mice against KP O1:K2 organisms grown in sodium salicylate
В эксперименте 1 иммунная сыворотка против УН бактерий KP O1 в качестве положительного контроля и иммунная сыворотка против KP O1 OPS BP-2 PRO-CN MAPS обеспечивали полную защиту против заражения KP O1: K2 (B5055), в то время как контроль PBS и иммунная сыворотка против KP O1 OPS BP-1 PRO-CN MAPS не защищали мышей.In
В эксперименте 2 мышам CD1 (5/группу) вводили в/б инъекцией 0,1 мл объединенной кроличьей иммунной или преиммунной сыворотки, с последующим в/б бактериальным заражением 2×104 бактериями KP O1 B5055. Мыши получали PBS и сыворотку против УН KP O1 (разведение 1/10) в качестве отрицательного и положительного контроля, соответственно. Все сыворотки против KP O1 OPS PRO-CN MAPS были способны оказывать защитный эффект в данной модели, хотя мыши, которые получали BP-2a (4 из 5) значительно лучше выживали при заражении. Сыворотка против KP O1 OPS BP-1 PRO-CN MAPS оказывала некоторый защитный эффект, с выживанием 2 из 5 мышей. Ни одна из мышей, получавших PBS, не выжила при заражении. Эти результаты выживаемости хорошо согласуются и хорошо коррелируют с уровнями анти-KP O1 OPS-специфических IgG при определении титров методом ELISA (то есть, более высокую степень защиты наблюдали при более высоких уровнях антитела).In
Пассивная защита от микроорганизма Passive protection against microorganism Pseudomonas Pseudomonas в мышиной моделиin mouse model
Способность PA OPS-специфического антитела предотвращать инфекцию Pseudomonas тестировали в мышиной модели выживания при пассивной защите, с использованием мышей CD1, зараженных в/б введением PA штамма 17002 (O10), наряду с D-галактозамином для сенсибилизации животных к летальным эффектам эндотоксина (Galanos et al., 1979) и для придания им большей чувствительности к инфекции. Мыши получали кроличьи антитела против 2-валентного PA O6/O10 BP-1 PRO-CN MAPS (кролик AFV624 или AFV629, в/б введение) за 1 ч до заражения (1×106 КОЕ) и D-галактозамин. Результаты приведены в Таблице 16. В этом исследовании защиты иммунная сыворотка против PA O6/O10 2-в BP-1 PRO-CN MAPS (AFV624; P2) защищала на 40% больше мышей от PA O10 штамма 17002, в сравнении с преиммунной сывороткой (AFV624 P0). Аналогично, иммунная сыворотка против PA O6/O10 2-в BP-1 PRO-CN MAPS (AFV629; P2) защищала на 40% больше мышей от PA O10 штамма 17002, в сравнении с преиммунной сывороткой (AFV629 P0). Кроличья иммунная сыворотка с высокими титрами, полученная против убитых нагреванием бактерий PA O10, в качестве положительного контроля оказывала значительный защитный эффект в сравнении с контролем PBS. Преиммунная сыворотка от некоторых кроликов, возможно, обеспечивала некоторую защиту в сравнении с PBS (AFV624 P0). Судя по всему, наблюдалась некоторая корреляция между уровнями защиты (выживание) и уровнями индуцированного вакциной PA O10 OPS-специфического IgG антитела при измерении методом ELISA (Таблица 16).The ability of the PA OPS-specific antibody to prevent Pseudomonas infection was tested in a passive defense survival mouse model using CD1 mice challenged ip with PA strain 17002 (O10) along with D-galactosamine to sensitize the animals to the lethal effects of endotoxin (Galanos et al., 1979) and to make them more susceptible to infection. Mice received rabbit antibodies against 2-valent PA O6/O10 BP-1 PRO-CN MAPS (rabbit AFV624 or AFV629, i.p.) 1 hour before challenge (1×10 6 cfu) and D-galactosamine. The results are shown in Table 16. In this protection study, anti-PA O6/O10 2-b BP-1 PRO-CN MAPS immune sera (AFV624; P2) protected 40% more mice against
Таблица 16: Пассивная защита у мышей, которым вводили PA O10 штамма 17002 и D-галактозамин, в группе с антителами против 2-валентного PA O6/O10 BP-1 PRO-CN MAPS.Table 16: Passive protection in mice treated with PA O10
PA O10 OPS (ELISA ед./мл)PA O10 OPS (ELISA units/ml)
На Фигуре 28 представлен график Каплана-Мейера выживаемости при пассивной защите мышей введенной кроличьей сывороткой против KPO1 BP-1 OPS-PRO-CN MAPS перед инфицированием их Klebsiella штамма B5055 (O1: K2), выращенными в салицилате для уменьшения экспрессии капсулы. Мышам CD1 (5/группу) вводили в/б 0,1 мл объединенной кроличьей иммунной (P2) или преиммунной (P0) сыворотки, с последующим в/б бактериальным заражением 2×104 КОЕ Klebsiella штамма B5055 (O1: K2). Показаны графики Каплана-Мейера выживаемости для мышей, получавших P0 или P2 сыворотку против KPO1 BP-1 OPS-PRO-CN MAPS. Сыворотка P2 защищала животных в модели, с выживанием мышей, получавших сыворотку против KPO1 BP-1 OPS-PRO-CN MAPS, в большем количестве и в течение более длительного времени, чем мышей, получавших сыворотку P0.Figure 28 is a Kaplan-Meier plot of survival when mice are passively protected with administered rabbit anti-KPO1 BP-1 OPS-PRO-CN MAPS serum prior to infection with Klebsiella strain B5055 (O1:K2) grown in salicylate to reduce capsule expression. CD1 mice (5/group) were injected ip with 0.1 ml of pooled rabbit immune (P2) or pre-immune (P0) serum, followed by ip bacterial challenge with 2x10 4 CFU of Klebsiella strain B5055 (O1:K2). Shown are Kaplan-Meier plots of survival for mice treated with P0 or P2 serum against KPO1 BP-1 OPS-PRO-CN MAPS. Serum P2 protected animals in the model, with mice treated with serum against KPO1 BP-1 OPS-PRO-CN MAPS surviving in greater numbers and for a longer time than mice treated with serum P0.
Пример 10: Иллюстративные мультивалентные иммуногенные композицииExample 10 Exemplary Multivalent Immunogenic Compositions
Иллюстративная 4-валентная KP вакцинаIllustrative 4-valent KP vaccine
Отдельно готовили 4 разных иммуногенных комплекса, а затем формулировали совместно, получая иллюстративную 4-валентную KP вакцину.Separately prepared 4 different immunogenic complexes, and then formulated together, receiving an exemplary 4-valent KP vaccine.
Каждый комплекс включал полимер BP-1, полученный путем конъюгации OPS из одного бактериального серотипа KP с окисленным полисахаридом K19, с последующим биотинилированием полисахарида K19. Затем их объединяли в комплексе со слитым белком-носителем ризавидина. Компоненты каждого из этих комплексов приведены в Таблице 17.Each complex included a BP-1 polymer obtained by conjugation of OPS from one KP bacterial serotype with an oxidized K19 polysaccharide, followed by biotinylation of the K19 polysaccharide. They were then combined in complex with the rizavidin carrier fusion protein. The components of each of these complexes are shown in Table 17.
Таблица 17: Компоненты комплексов, включенных в иллюстративную 4-валентную KP вакцину.Table 17: Components of complexes included in an exemplary 4-valent KP vaccine.
Эти четыре комплекса формулировали совместно с адъювантом, как описано ниже в Таблице 21.These four complexes were co-formulated with an adjuvant as described in Table 21 below.
Иллюстративная 8-валентная PA вакцинаIllustrative 8-valent PA vaccine
Отдельно готовили 8 разных иммуногенных комплексов, а затем формулировали совместно, получая иллюстративную 8-валентную PA вакцину.Separately prepared 8 different immunogenic complexes, and then formulated together, receiving an exemplary 8-valent PA vaccine.
Каждый комплекс включал полимер BP-1, полученный путем конъюгации OPS из одного бактериального серотипа PA с окисленным полисахаридом K19, с последующим биотинилированием полисахарида K19. Затем их объединяли в комплексе со слитым белком-носителем ризавидина. Компоненты каждого из этих комплексов приведены в Таблице 18.Each complex included a BP-1 polymer obtained by conjugation of OPS from one bacterial serotype PA with an oxidized K19 polysaccharide, followed by biotinylation of the K19 polysaccharide. They were then combined in complex with the rizavidin carrier fusion protein. The components of each of these complexes are shown in Table 18.
Таблица 18: Компоненты комплексов, включенных в иллюстративную 8-валентную PA вакцину.Table 18: Components of complexes included in an exemplary 8-valent PA vaccine.
Эти восемь комплексов формулировали совместно с адъювантом, как описано ниже в Таблице 21.These eight complexes were co-formulated with an adjuvant as described in Table 21 below.
Иллюстративная 12-валентная KP/PA вакцина 1Illustrative 12-valent KP/
Отдельно готовили 12 разных иммуногенных комплексов, а затем формулировали совместно, получая иллюстративную 12-валентную KP/PA вакцину 1.Separately, 12 different immunogenic complexes were prepared and then co-formulated to give an exemplary 12-valent KP/
Каждый комплекс включал полимер BP-1, полученный путем конъюгации OPS с окисленным полисахаридом K19, с последующим биотинилированием полисахарида K19. Затем их объединяли в комплексе со слитым белком-носителем ризавидина. Компоненты каждого из этих комплексов приведены в Таблице 19.Each complex included a BP-1 polymer obtained by conjugation of OPS with an oxidized K19 polysaccharide, followed by biotinylation of the K19 polysaccharide. They were then combined in complex with the rizavidin carrier fusion protein. The components of each of these complexes are listed in Table 19.
Таблица 19: Компоненты комплексов, включенных в иллюстративную 12-валентную KP/PA вакцину 1.Table 19: Components of the complexes included in the exemplary 12-valent KP/
Эти двенадцать комплексов формулировали совместно с адъювантом, как описано ниже в Таблице 21.These twelve complexes were co-formulated with an adjuvant as described in Table 21 below.
Иллюстративная 12-валентная KP/PA вакцина 2Illustrative 12-valent KP/
Отдельно готовили 12 разных иммуногенных комплексов, а затем формулировали совместно, получая иллюстративную 12-валентную KP/PA вакцину 2.Separately, 12 different immunogenic complexes were prepared and then co-formulated to give an exemplary 12-valent KP/
Каждый комплекс включал полимер BP-1, полученный путем конъюгации OPS с окисленным полисахаридом K19, с последующим биотинилированием полисахарида K19. Затем их объединяли в комплексе со слитым белком-носителем ризавидина. Компоненты каждого из этих комплексов приведены в Таблице 20.Each complex included a BP-1 polymer obtained by conjugation of OPS with an oxidized K19 polysaccharide, followed by biotinylation of the K19 polysaccharide. They were then combined in complex with the rizavidin carrier fusion protein. The components of each of these complexes are shown in Table 20.
Таблица 20: Компоненты комплексов, включенных в иллюстративную 12-валентную KP/PA вакцину 2.Table 20: Components of complexes included in an exemplary 12-valent KP/
Эти двенадцать комплексов формулировали совместно с адъювантом, как описано ниже в Таблице 21.These twelve complexes were co-formulated with an adjuvant as described in Table 21 below.
Пример 11: Исследования иммунизации кроликов 12-валентной вакциной против Example 11 Immunization studies of rabbits with a 12-valent vaccine against P. aeruginosa/K. pneumoniaeP. aeruginosa/K. pneumoniae
Иммунизация животныхAnimal Immunization
Перед иммунизацией кроликов иллюстративную 4-валентную KP вакцину, иллюстративную 8-валентную PA вакцину, иллюстративную 12-валентную KP/PA вакцину 1 и иллюстративную 12-валентную KP/PA вакцину 2 формулировали с адъювантом приблизительно за 48 ч до инъекции. Комплексы адсорбировали на адъюванте в конечной концентрации 10 мкг/мл для дозы PS 5 мкг, и 2 мкг/мл для дозы PS 1 мкг, каждого серотипа BP-1, либо отдельно, либо в виде мультивалентной смеси, с 40 мМ гистидином, pH 5,5, 150 мМ NaCl и 1,25 мг/мл гелем фосфата алюминия, с перемешиванием путем переворачивания в течение ночи при 4°C. Эти составленные смеси использовали непосредственно для иммунизации в объеме 0,5 мл на дозу. Сводная информация по составу иллюстративной 4-валентной KP вакцины, иллюстративной 8-валентной PA вакцины, иллюстративной 12-валентной KP/PA вакцины 1 и иллюстративной 12-валентной KP/PA вакцины 2 приведена в Таблице 21.Prior to immunization of rabbits, exemplary 4-valent KP vaccine, exemplary 8-valent PA vaccine, exemplary 12-valent KP/
Таблица 21: Сводная информация по вакцинным препаратам, используемым в исследовании NCB012 на кроликах.Table 21: Summary of vaccine preparations used in the NCB012 study in rabbits.
5 мкг PS на BP12-valent KP/
5 µg PS per BP
(60 мкг)5 mcg
(60 mcg)
(180 мкг)3:1
(180 mcg)
1 мкг PS на BP12-valent KP/
1 µg PS per BP
(12 мкг)1 mcg
(12 mcg)
(36 мкг)3:1
(36 mcg)
(40 мкг)5 mcg
(40 mcg)
(120 мкг)3:1
(120 mcg)
(20 мкг)5 mcg
(20 mcg)
(60 мкг)3:1
(60 mcg)
5 мкг PS на BP12-valent KP/
5 µg PS per BP
(60 мкг)5 mcg
(60 mcg)
(180 мкг)3:1
(180 mcg)
1 мкг PS на BP12-valent KP/
1 µg PS per BP
(12 мкг)1 mcg
(12 mcg)
(36 мкг)3:1
(36 mcg)
12-валентную KP/PA вакцину 1 вводили экспериментальным группам 5 и 6 (с FlaBD2-MrkA и FlaBD2-PcrV в качестве белков-носителей), и 12-валентную KP/PA вакцину 2 вводили экспериментальным группам 1 и 2 (с FlaBD2-MrkA в качестве белка-носителя). Для сравнения в данное исследование были включены две дополнительные экспериментальные группы, которые получали 8-валентную PA вакцину или 4-валентную KP вакцину. Экспериментальная группа 3 получала 8-валентную PA вакцину, и экспериментальная группа 4 получала 4-валентную KP вакцину. Группы 1, 3, 4 и 5 получали 5 мкг каждого полисахарида (PS) в вакцине, и экспериментальные группы 2 и 6 получали более низкую дозу 1 мкг каждого PS в вакцине. Все вакцины содержали одинаковое количество фосфата алюминия в качестве адъюванта (625 мкг).12-valent KP/
Проводили две в/м иммунизации (0,5 мл) с 4-недельным интервалом 4-месячным кроликам линии New Zealand White (Cocalico Biologicals, n=10 на группу). Образцы крови собирали через 4 недели после первой иммунизации и через 2 недели после второй иммунизации.Two IM immunizations (0.5 ml) were given 4 weeks apart to 4 month old New Zealand White rabbits (Cocalico Biologicals, n=10 per group). Blood samples were collected 4 weeks after the first immunization and 2 weeks after the second immunization.
Иммунные ответы на OPSImmune responses to OPS
Иммунные ответы на KP OPS в 12-валентной KP/PA вакцине 1 в сравнении с 4-валентной KP вакцинойImmune responses to KP OPS in 12-valent KP/
На Фигуре 29 представлены результаты конечных ELISA титров IgG против KP OPS в объединенной сыворотке от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 (доза 5 мкг, экспериментальная группа 5), в сравнении с 4-валентной KP вакциной (доза 5 мкг, экспериментальная группа 4).Figure 29 shows the results of the final ELISA titers of anti-KP OPS IgG in pooled sera from rabbits immunized with 12-valent KP/PA vaccine 1 (
Был продемонстрирован сильный IgG-ответ на все серотипы KP OPS вакцины (а также на KP19 CPS), без существенных различий в титрах для KP OPS каждого типа в 4-валентной KP вакцине, и в титрах IgG для каждого из соответствующих KP OPS в 12-валентной KP/PA вакцине 1. Наблюдалась тенденция к слегка более сильному ответу на KP OPS, индуцированному 12-валентной KP/PA вакциной 1. Эти результаты также указывают на то, что отсутствует какая-либо отрицательная интерференция в иммунных ответах на каждый из KP OPS в 4-валентной KP вакцине при ее объединении с дополнительными 8 PA OPS, которые включены в 12-валентную KP/PA вакцину 1 (все изготовлены в виде BP-1 MAPS).A strong IgG response was demonstrated to all KP OPS vaccine serotypes (as well as to KP19 CPS), with no significant differences in KP OPS titers of each type in the 4-valent KP vaccine, and in IgG titers for each of the respective KP OPS in 12-valent KP/
Иммунные ответы на PA OPS в 12-валентной KP/PA вакцине 1 в сравнении с 8-валентной PA вакцинойImmune responses to PA OPS in 12-valent KP/
На Фигуре 30 представлены результаты конечных ELISA титров IgG против PA OPS в объединенной сыворотке от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 (доза 5 мкг, экспериментальная группа 5), в сравнении с 8-валентной PA вакциной (доза 5 мкг, экспериментальная группа 3).Figure 30 shows the results of the final ELISA titers of anti-PA OPS IgG in pooled sera from rabbits immunized with 12-valent KP/PA vaccine 1 (
Как наблюдалось в случае ответа на KP OPS, были продемонстрированы сильные IgG-ответы на все серотипы PA OPS вакцины, без существенных различий в титрах для PA OPS каждого типа в 8-валентной PA MAPS вакцине, и в титрах IgG для каждого из соответствующих PA OPS в 12-валентной KP/PA вакцине 1. Эти результаты также указывают на то, что отсутствует какая-либо отрицательная интерференция в иммунных ответах на каждый из PA OPS 8-валентной вакцины при ее объединении с дополнительными 4 KP OPS в 12-валентной KP/PA вакцине 1 (все изготовлены в виде BP-1 MAPS). Сильные IgG-ответы также были продемонстрированы на каждый из PA OPS после одной иммунизации (P1) без существенного возрастания после второй иммунизации (P2).As observed in response to KP OPS, strong IgG responses were demonstrated to all serotypes of the PA OPS vaccine, with no significant differences in titers for each type of PA OPS in the 8-valent PA MAPS vaccine, and in IgG titers for each of the respective PA OPS vaccines. in the 12-valent KP/
Иммунные ответы на 12-валентную KP/PA вакцину 1 при двух разных уровнях дозыImmune responses to 12-valent KP/
На Фигуре 31 представлены результаты ELISA конечных титров IgG против PA OPS в объединенной сыворотке от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 в дозе 5 мкг PS от каждого типа BP в дозе вакцины (экспериментальная группа 5) в сравнении с 12-валентной KP/PA вакциной 1 в дозе 1 мкг PS от каждого типа BP в вакцине (экспериментальная группа 6).Figure 31 shows ELISA results of end-point anti-PA OPS IgG titers in pooled sera from rabbits immunized with 12-valent KP/
Никаких существенных отличий в титрах IgG к PA и KP OPS не наблюдали в случае 12-валентной KP/PA вакцины 1 при сравнении экспериментальных групп, получавших дозу 5 мкг и дозу 1 мкг, после одной (P1) или после двух иммунизаций (P2), за исключением KP O3, когда после второй иммунизации наблюдали улучшенный IgG-ответ.No significant differences in IgG titers to PA and KP OPS were observed for the 12-valent KP/
Отдельные результаты ELISA титров OPS-специфических IgG для 12-валентной KP/PA вакцины 1 через 28 дней после первой иммунизации (P1) и через 14 дней после второй иммунизации (P2) представлены на Фигуре 32 и Фигуре 33. Сильные IgG-ответы на все 12 серотипов OPS вакцины, а также на KP K19 CPS, продемонстрированы для 12-валентной KP/PA вакцины 1 в дозе 5 мкг (Фигура 32) и в дозе 1 мкг (Фигура 33). Однако, хотя ответы были сильными, интенсивность IgG-ответа на OPS KPO2 и KPO3 не была такой сильной, как в случае ответа на KPO1 и KPO5, особенно после первой иммунизации. Наиболее сильный ответ наблюдали для KO K19.Separate ELISA results of OPS-specific IgG titers for 12-valent KP/
Сравнение индивидуальной x-кратной индукции анти-OPS IgG при использовании 12-валентной KP/PA вакцины 1 проводили для экспериментальной группы с дозой 5 мкг. Результаты представлены на Фигуре 34. За исключением двух отклоняющихся результатов, у всех животных наблюдали по меньшей мере 4-кратную индукцию ELISA титров относительно исходного уровня (P2/P0) для каждого из серотипов OPS. В среднем, 20-кратная индукция была превышена для всех серотипов OPS в случае 12-валентной KP/PA вакцины 1. Наибольшую индукцию наблюдали для KO 19.Comparison of individual x-fold induction of anti-OPS IgG using 12-valent KP/
На Фигура 35 приведены результаты сравнения индивидуальной x-кратности индукции анти-OPS IgG, при определении титров методом ELISA, относительно исходного уровня (P2/P0) для 12-валентной KP/PA вакцины 1 в дозе 5 мкг и дозе 1 мкг. Интересно, что у всех животных из экспериментальной группы с дозой 1 мкг наблюдали по меньшей мере 4-кратное увеличение относительно исходного уровня, как уже описано для экспериментальной группы с дозой 5 мкг. Средняя x-кратность увеличения титров IgG для всех серотипов OPS, включенных в 12-валентную KP/PA вакцину 1, превышала 20-кратное увеличение относительно исходного уровня для всех серотипов OPS при дозе 5 мкг, а также дозе 1 мкг, введенных животным. Наибольшую кратность индукции наблюдали для KO K19 при обоих уровнях дозы, и наименьшие показатели x-кратности индукции наблюдали для KP O2 и KP O3.Figure 35 compares the individual x-fold induction of anti-OPS IgG, as determined by ELISA titers, versus baseline (P2/P0) for 12-valent KP/
Иммунные ответы на 12-валентную KP/PA вакцину 2 при двух разных уровнях дозыImmune responses to 12-valent KP/
На Фигуре 36 представлены результаты сравнения ответов на KP/PA OPS в объединенной сыворотке через 28 дней после первой вакцинации (P1) и через 14 дней после второй вакцинации (P2) от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 2. Примечательно, что в экспериментальной группе с дозой 5 мкг вакцина индуцировала сильный IgG-ответ на все серотипы OPS после первой иммунизации, без существенного увеличения титров после второй иммунизации, за исключением KP O2 и KP O3 OPS. Для этих серотипов OPS вторая иммунизация приводила к значительному увеличению титров. IgG-ответы на OPS были эквивалентными в экспериментах группах с дозой 5 мкг и дозой 1 мкг, за исключением KP O3 OPS, когда наблюдали меньший иммунный ответ при более низкой дозе.Figure 36 shows the results of a comparison of responses to KP/PA OPS in pooled
Индивидуальные полученные методом ELISA титры OPS-специфических IgG для 12-валентной KP/PA вакцины 2 через 28 дней после первой иммунизации (P1) и через 14 дней после второй иммунизации (P2) представлены на Фигуре 37 и Фигуре 38. Сильные IgG-ответы на все 12 серотипов OPS вакцины, а также на KP K19 CPS, продемонстрированы для 12-валентной KP/PA вакцины 2 в дозе 5 мкг (Фигура 37) и в дозе 1 мкг (Фигура 38). Титры для каждого из серотипов OPS дополнительно возрастали через 14 дней после второй вакцинации. Однако величина этого увеличения была незначительной, за исключением KP O3. Как наблюдали в случае 12-валентной KP/PA вакцины 1, различие в иммунном ответе между экспериментальными группами с дозой 5 мкг и дозой 1 мкг было минимальным. Самые высокие титры наблюдали для серотипа OPS KO K19, и самые низкие титры наблюдали для KP O2 и KP O3.Individual ELISA-derived OPS-specific IgG titers for the 12-valent KP/
Резюме результатов определения иммунного ответа на OPS для 12-валентной KP/PA вакцины 1 и 12-валентной KP/PA вакцины 2Summary of OPS Immune Response Results for 12-valent KP/
Анти-OPS иммунные ответы на все PA OPS 12-валентной KP/PA вакцины 1 в объединенной кроличьей сыворотке были эквивалентны тем, которые наблюдали в случае 8-валентной PA MAPS вакцины.Anti-OPS immune responses to all PA OPS of the 12-valent KP/
Анти-OPS иммунные ответы на все KP OPS 12-валентной KP/PA вакцины 1 в объединенной кроличьей сыворотке были аналогичными, или слегка лучшими, чем ответы в случае 4-валентной KP MAPS вакцины.Anti-OPS immune responses to all KP OPS of the 12-valent KP/
Приблизительно 200-кратное увеличение относительно исходного уровня наблюдали для антител против PA OPS, и приблизительно 50-кратное увеличение относительно исходного уровня наблюдали для антител против KP OPS.An approximately 200-fold increase from baseline was observed for anti-PA OPS antibodies, and an approximately 50-fold increase from baseline was observed for anti-KP OPS antibodies.
Антитела в экспериментальных группах с 5 мкг PS на дозу BP и 1 мкг PS на дозу BP в объединенных сыворотках были аналогичными в случае 12-валентной KP/PA вакцины 1 и 12-валентной KP/PA вакцины 2, за исключением KP O3.Antibodies in the experimental groups with 5 μg PS per dose of BP and 1 μg PS per dose of BP in pooled sera were similar for 12-valent KP/
Анализ индивидуальных сывороток в экспериментальных группах с 5 мкг PS на дозу BP и 1 мкг PS на дозу BP в случае 12-валентной KP/PA вакцины 1 показал сильный ответ на все KP и PA OPS после одной иммунизации, с очень небольшим увеличением после второй иммунизации, за исключением ответа на KP O2 и KP O3 OPS, где вторая иммунизация приводила к значительному увеличению титров IgG антител.Analysis of individual sera in experimental groups with 5 μg PS per dose of BP and 1 μg PS per dose of BP in the case of 12-valent KP/
Анализ индивидуальных сывороток в экспериментальных группах с 5 мкг PS на дозу BP и 1 мкг PS на дозу BP в случае 12-валентной KP/PA вакцины 2 также показал сильный ответ на все KP и PA OPS после одной иммунизации, с очень небольшим увеличением после второй иммунизации, за исключением ответа на KP O3 OPS, где вторая иммунизация приводила к значительному увеличению титров IgG.Analysis of individual sera in experimental groups with 5 μg PS per dose of BP and 1 μg PS per dose of BP in the case of the 12-valent KP/
Эффективность белка-носителяCarrier protein efficiency
Ответ в виде выработки антител на белки-носителиAntibody response to carrier proteins
Были оценены ответы в виде выработки антител на белок-носитель, индуцированные 12-валентной KP/PA вакциной 1 с FlaBD2-MrkA и FlaBD2-PcrV в качестве белков-носителей и 12-валентной KP/PA вакциной 2 только с FlaBD2-MrkA в качестве белка-носителя. Ответы на белки-носители у отдельных кроликов выражали в виде ELISA единиц IgG для преиммунных (P0) уровней и уровней, достигнутых после одной (P1) и двух иммунизаций (P2). Анализ методом ELISA IgG у отдельных кроликов на белки-носители определяли с использованием соответствующих индивидуальных рекомбинантных белков в качестве покрывающих антигенов (то есть, FlaBD2, MrkA и PcrV). В каждом анализе ответы на компоненты белков-носителей сравнивали для вакцин 1 и 2 с ответами на 8-валентную PA FlaBD2-MrkA вакцину и 4-валентную KP FlaBD2-MrkA вакцину. Информация о дозах вакцин и экспериментальных группах приведена в Таблице 21.Carrier protein antibody responses induced by 12-valent KP/
(a) Результаты ELISA для различных белков-носителей(a) ELISA results for various carrier proteins
Результаты ELISA для титров IgG к FlaB-D2 представлены на Фигуре 39. Сильное увеличение титров IgG наблюдали после первой иммунизации, с последующим вторым увеличением титров после второй иммунизации, во всех сравниваемых группах. Уровни антител после каждой вакцинации были сходными у всех групп, двух групп с разными дозами (1 мкг или 5 мкг суммарных PS от комплекса каждого типа, присутствующего в вакцинной композиции, например, всего 12 мкг или 60 мкг PS в композициях 12-валентной KP/PA вакцины 1 и вакцины 2) для 12-валентной KP/PA вакцины 1 и 12-валентной KP/PA вакцины 2, а также групп 8-валентной PA вакцины и 4-валентной KP вакцины (каждая с 5 мкг каждого PS в вакцине, например, всего 40 мкг или 20 мкг PS в вакцине, соответственно).ELISA results for anti-FlaB-D2 IgG titers are shown in Figure 39. A strong increase in IgG titers was observed after the first immunization, followed by a second increase in titers after the second immunization, in all compared groups. Antibody levels after each vaccination were similar across all groups, two different dose groups (1 µg or 5 µg total PS from each type of complex present in the vaccine formulation, e.g. total 12 µg or 60 µg PS in 12-valent KP/
Результаты ELISA для титров IgG к MrkA представлены на Фигуре 40. Как и в случае FlaBD2, сильное увеличение титров IgG наблюдали после первой иммунизации у всех групп, с аналогичным увеличением в каждой группе, двух групп с разными дозами (1 мкг или 5 мкг суммарных PS от комплекса каждого типа, присутствующего в вакцине) для 12-валентной KP/PA вакцины 1 и 12-валентной KP/PA вакцины 2, а также групп 8-валентной PA вакцины и 4-валентной KP вакцины (каждая с 5 мкг PS от комплекса каждого типа в вакцине).ELISA results for anti-MrkA IgG titers are shown in Figure 40. As with FlaBD2, a strong increase in IgG titers was observed after the first immunization in all groups, with a similar increase in each group, between the two dose groups (1 μg or 5 μg total PS of each type of complex present in the vaccine) for the 12-valent KP/
На Фигуре 41 представлены результаты ответа в виде выработки антител против PcrV после иммунизации 12-валентной KP/PA вакциной 1 в дозе 1 мкг и дозе 5 мкг каждого PS в вакцине. IgG-ответ был сильным после первой иммунизации, с дополнительным возрастанием титров после второй вакцинации. Однако ответы были сходными в группах двух доз.Figure 41 shows the results of the anti-PcrV antibody response following immunization with 1 μg 12-valent KP/
Ответы на белок-носитель, индуцированные 12-валентной KP/PA вакциной 1 с FlaBD2-MrkA и FlaBD2-PcrV в качестве белков-носителей, 12-валентной KP/PA вакциной 2 с FlaBD2-MrkA в качестве белка-носителя, 8-валентной PA вакциной (FlaBD2-MrkA) и 4-валентной KP вакциной (FlaBD2-MrkA), выраженные в виде x-кратности изменения титров, определенных методом ELISA, относительно преиммунных (P0) уровней, после одной (P1) и двух иммунизаций (P2) представлены на Фигуре 42.Carrier protein responses induced by 12-valent KP/
Были продемонстрированы сильные ответы на каждый из белков-носителей FlaBD2, MrkA и PcrV в 12-валентной KP/PA вакцине 1, с более чем 30-кратным изменением после первой иммунизации и 500-кратным изменением после второй иммунизации. Никакие существенные отличия в иммуногенности трех белков не были обнаружены между группами с дозой 5 мкг и дозой 1 мкг.Strong responses were demonstrated to each of the FlaBD2, MrkA and PcrV carrier proteins in the 12-valent KP/
Наблюдали сильный IgG-ответ на каждый из двух белковых компонентов уже после одной иммунизации, с увеличением, превышающим 30-кратное, для двух компонентов слитого белка FlaBD2 и MrkA в 12-валентной KP/PA вакцине 2. Дополнительное значительное увеличение наблюдали после второй иммунизации, которое превышало 1000-кратное увеличение. Никакие существенные отличия не наблюдали в x-кратности изменений для FlaBD2 и MrkA между группами с дозой 5 мкг и дозой 1 мкг.A strong IgG response to each of the two protein components was observed already after one immunization, with an increase exceeding 30-fold for the two components of the FlaBD2 and MrkA fusion protein in the 12-valent KP/
Не наблюдали никакие существенные отличия в иммуногенности двух компонентов FlaBD2 и MrkA между группами, которые получали 8-валентную PA вакцину или 4-валентную KP вакцину. Однако эти ответы были слегка ниже в группе 4-валентной вакцины в сравнении с ответами в группе 12-валентной KP/PA вакцины 2 и группе 8-валентной PA вакцины.No significant differences were observed in the immunogenicity of the two components FlaBD2 and MrkA between the groups that received the 8-valent PA vaccine or the 4-valent KP vaccine. However, these responses were slightly lower in the 4-valent vaccine group compared to the responses in the 12-valent KP/
(b) Сравнение x-кратности изменения IgG-ответов на различные белки-носители в трех исследованиях(b) Comparison of x-fold change in IgG responses to different carrier proteins in three studies
Сравнение x-кратности изменения IgG-ответов на FlaB проводили для результатов, полученных в трех исследованиях иммуногенности на кроликах: NCB007, NCB008 и NCB012. В NCB007 дозу 5 мкг 6-валентной PA FlaBD2-MrkA (содержащей PA O1, O2, O3, O6, O10 и O11 OPS) сравнивали с эквивалентной дозой 6-валентной PA FlaB-PcrV, в NCB008 дозу 5 мкг сравнивали между 4-валентной (O1, O2, O3, O5) KP FlaBD2-MrkA и 4-валентной KP FlaB-PcrV, и в NCB012 дозу 5 мкг сравнивали между 12-валентной KP/PA вакциной 2 с FlaBD2-MrkA и 12-валентной KP/PA вакциной 1 с FlaBD2-MrkA и FlaBD2-PcrV. Все вакцины имели каркас типа BP-1. Результаты в виде x-кратности изменений представлены на Фигуре 43, Фигуре 44 и Фигуре 45.Comparison of the x-fold change in IgG responses to FlaB was performed for the results obtained in three immunogenicity studies in rabbits: NCB007, NCB008 and NCB012. In NCB007, a dose of 5 μg of 6-valent PA FlaBD2-MrkA (containing PA O1, O2, O3, O6, O10 and O11 OPS) was compared with an equivalent dose of 6-valent PA FlaB-PcrV, in NCB008 a dose of 5 μg was compared between 4-valent (O1, O2, O3, O5) KP FlaBD2-MrkA and 4-valent KP FlaB-PcrV, and in NCB012, a dose of 5 µg was compared between 12-valent KP/
На Фигуре 43 показана x-кратность изменения IgG-ответов на FlaB, с максимальным увеличением ответа на 12-валентную KP/PA вакцину 1 и 12-валентную KP/PA вакцину 2. Хороший ответ наблюдали уже после первой иммунизации, с дополнительным увеличением после второй иммунизации. Изучение ответов на 4-валентный KP FlaBD2-MrkA и 4-валентный FlaB-PcrV комплексы в NCB008 показало хороший ответ после первой иммунизации, с небольшим дополнительным увеличением после второй иммунизации, на FlaBD-2-MrkA, и практически полное отсутствие ответа после любой иммунизации на FlaB-PcrV. Слабый ответ на FlaB также наблюдали в случае 6-валентного комплекса PA FlaBD2-MrkA в NCB007 после первой иммунизации, однако значительное увеличение имело место после второй вакцинации. Ответ на FlaB-PcrV в NCB007 был сильным после первой иммунизации, без дополнительного увеличения после второй иммунизации.Figure 43 shows x-fold change in IgG responses to FlaB, with a maximum increase in response to 12-valent KP/
На Фигуре 44 показаны ответы на MrkA, с максимальным изменением ответа относительно исходного уровня в случае 12-валентной KP/PA вакцины 2 и 12-валентной KP/PA вакцины 1 в NCB012, в сравнении с ответами на 4-валентную KP FlaBD2-MrkA в NCB008 и 6-валентную PA FlaBD2-MrkA в NCB007. Почти никакого ответа не наблюдали для MrkA в NCB008 после первой и второй вакцинации, в то время как сильный ответ на MrkA наблюдали при использовании 6-валентной PA FlaBD2-MrkA после первой иммунизации и дополнительное увеличение ответа после второй иммунизации.Figure 44 shows responses to MrkA, with maximum change in response from baseline for 12-valent KP/
На Фигуре 45 показана x-кратность изменения IgG-ответа на PcrV, с максимальным увеличением в случае 12-валентной KP/PA вакцины 1 в исследовании NCB012 после первой и второй иммунизации. Почти никакого ответа на PcrV не наблюдали в случае 4-валентной KP FlaB-PcrV в исследовании NCB008. Сильный ответ на PcrV наблюдали после первой и второй иммунизации в исследовании NCB007.Figure 45 shows the x-fold change in IgG response to PcrV, with a maximum increase for the 12-valent KP/
(c) Краткое изложение результатов(c) Summary of results
- Сильный ответ в виде IgG антител на все три белка-носителя был продемонстрирован в случае 12-валентной KP/PA вакцины 1 и 12-валентной KP/PA вакцины 2.- A strong IgG antibody response to all three carrier proteins was demonstrated with 12-valent KP/
- Ответы на белки-носители были аналогичными в группах с дозами 1 мкг и 5 мкг s.- Responses to carrier proteins were similar in the 1 µg and 5 µg s dose groups.
- x-кратность изменения, полученная для каждого из трех белков-носителей, составляла приблизительно от 500 до 1000-кратного изменения в случае 12-валентной KP/PA вакцины 1.- x-fold change obtained for each of the three carrier proteins was approximately 500 to 1000-fold change in the case of the 12-valent KP/
- Имело место постоянное усиление ответа между первой и второй дозой у не подвергавшихся ранее воздействию животных. Без связи с какой-либо теорией, у взрослых, которые ранее подвергались воздействию, приблизительно максимальные ответы ожидаются после одной дозы и в пределах 7-10 дней.- There was a persistent increase in response between the first and second doses in naive animals. Without wishing to be bound by any theory, in previously exposed adults, approximately maximal responses are expected after a single dose and within 7-10 days.
- Имеющаяся ранее проблема с низкими ответами на MrkA и PcrV у животных, иммунизированных 4-валентной KP вакциной, отсутствовала в случае животных, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 или 12-валентной KP/PA вакциной 2.- The previous problem with low responses to MrkA and PcrV in animals immunized with 4-valent KP vaccine was not present in animals immunized with 12-valent KP/
Отсутствие биологической активности агониста TLR5 у белков-носителей, содержащих только FlaB2Lack of TLR5 agonist biological activity in carrier proteins containing only FlaB2
На Фигуре 12B показана биологическая активность в отношении TLR5 у слитых белков и комплексов MAPS, содержащих белки FlaA и FlaB, с использованием клеток HEK293, экспрессирующих управляемый NF-kB люциферазный репортер. Активация TLR5 флагеллином вызывает усиление экспрессии репортера.Figure 12B shows the TLR5 bioactivity of MAPS fusion proteins and complexes containing FlaA and FlaB proteins using HEK293 cells expressing the NF-kB driven luciferase reporter. Activation of TLR5 by flagellin causes an increase in reporter expression.
Установлено, что белки-носители KP/PA MAPS, содержащие только домен 2 FlaB (FlaBD2), лишены биологической активности агониста TLR5, как видно из результатов люциферазного анализа для FlaBD2-MrkA и FlaBD2-PcrV, представленных на Фигуре 46. FlaBD2-MrkA и FlaBD2-PcrV являются двумя белками-носителями в 12-валентной KP/PA вакцине 1.MAPS KP/PA carrier proteins containing only FlaB domain 2 (FlaBD2) were found to lack TLR5 agonist biological activity as seen in the luciferase assay results for FlaBD2-MrkA and FlaBD2-PcrV shown in Figure 46. FlaBD2-MrkA and FlaBD2-PcrV are the two carrier proteins in the 12-valent KP/
Контрольный FlaB и слитый белок Rhavi-FlaB-his демонстрировали сильную биологическую активность агониста TLR5, в то время как FlaBD2, FlaBD2-MrkA и FlaBD2-PcrV, все содержащие лишь домен 2 FlaB (FlaBD2), не проявляли активность в этом анализе.Control FlaB and the Rhavi-FlaB-his fusion protein showed strong TLR5 agonist biological activity, while FlaBD2, FlaBD2-MrkA and FlaBD2-PcrV, all containing only FlaB domain 2 (FlaBD2), showed no activity in this assay.
Широта спектра связывания в анализе FACS и агглютинация для не-OPS вакцинных штаммовFACS Binding Spectrum Width and Agglutination for Non-OPS Vaccine Strains
Штаммы KP и PA, не относящиеся к вакцинным серотипам OPS, тестировали методом проточной цитометрии и в анализах агглютинации для изучения широты покрытия антителами к 12-валентной KP/PA вакцине 1.Non-OPS vaccine serotypes KP and PA were tested by flow cytometry and agglutination assays to study the coverage of antibodies to the 12-valent KP/
В Таблице 22 приведены результаты связывания в анализе FACS и бактериальной агглютинации не-OPS штаммов KP, полученные с объединенной сывороткой (AFV1502-1511) от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 в дозе 5 мкг каждого BP-1. Двенадцать из 14 протестированных штаммов демонстрировали явные отличия в узнавании P0 и P2 сыворотками в анализе агглютинации и в увеличении связывания бактерий, измеряемого методом проточной цитометрии при разведении сыворотки 1:100.Table 22 shows the results of FACS binding and bacterial agglutination of non-OPS KP strains obtained with pooled sera (AFV1502-1511) from rabbits immunized with 12-valent KP/
Таблица 22: Ответ на 12-валентную KP/PA вакцину 1 - связывание и агглютинация не-OPS вакцинных штаммов KPTable 22: Response to 12-valent KP/PA Vaccine 1 - Binding and Agglutination of Non-OPS KP Vaccine Strains
В Таблице 23 приведены результаты анализа методом FACS связывания, а также бактериальной агглютинации не-OPS штаммов PA, полученные с объединенной сывороткой (AFV1502-1511) от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 в дозе 5 мкг каждого BP-1. В случае флагеллина B имела место агглютинация 6 из 7 штаммов, и для 7 из 7 наблюдали связывание антитела методом проточной цитометрии. В случае флагеллина A1 для 3 из 4 штаммов наблюдали связывание антитела методом проточной цитометрии. В случае флагеллина A2 отсутствовали признаки узнавания антителом для 4 штаммов.Table 23 shows the results of FACS binding as well as bacterial agglutination of non-OPS PA strains obtained with pooled sera (AFV1502-1511) from rabbits immunized with 12-valent KP/
Таблица 23: Ответ на 12-валентную KP/PA вакцину 1 - связывание и агглютинация не-OPS вакцинных штаммов PATable 23: Response to 12-valent KP/PA Vaccine 1 - Binding and Agglutination of Non-OPS PA Vaccine Strains
Четырнадцать штаммов KP и 15 штаммов PA, не относящихся к вакцинным серотипам OPS, были протестированы для определения широты покрытия антителами, полученными у кроликов к 12-валентной KP/PA вакцине 1. Краткое изложение:Fourteen KP strains and 15 PA strains other than OPS vaccine serotypes were tested to determine the breadth of antibody coverage obtained in rabbits to 12-valent KP/
- Выработанные антитела связывают и обеспечивают агглютинацию 12 из 14 не-OPS штаммов KP- Generated antibodies bind and agglutinate 12 out of 14 non-OPS KP strains
- Серотипы, не содержащие ген MrkA, не связывают антитела- Serotypes that do not contain the MrkA gene do not bind antibodies
- Связывание этих штаммов, вероятно, происходит за счет направленных на MrkA антител- Binding of these strains is probably due to antibodies directed to MrkA
- Выработанные антитела связывают 10 из 15 не относящихся к вакцинным серотипам OPS штаммов PA:- Developed antibodies bind 10 out of 15 non-OPS vaccine serotypes of PA strains:
- Связывание имеет место для штаммов с FlaB и некоторых штаммов с FlaA1- Binding occurs for FlaB strains and some FlaA1 strains
- Связывание, скорее всего, происходит за счет направленных на FlaB антител и вследствие перекрестной реактивности с FlaA1- Binding is most likely due to antibodies directed to FlaB and due to cross-reactivity with FlaA1
- Антитела, направленные на белки-носители (FlaBD2 и MrkA), имеют широту покрытия, распространяющуюся на не-вакцинные OPS серотипы.- Antibodies directed to carrier proteins (FlaBD2 and MrkA) have coverage extending to non-vaccine OPS serotypes.
Пассивная защита у животных, обеспечиваемая антителами к белкам-носителямPassive protection in animals by antibodies to carrier proteins
Потенциальную способность белков-носителей обеспечивать пассивную защиту у мышей оценивали в модели инфекции ожоговой раны, вызываемой Klebsiella KP B5055 (O1: K2), с использованием анти-O1 сыворотки и анти-MrkA сыворотки, как указано в Таблице 24.The potential ability of carrier proteins to confer passive protection in mice was evaluated in a Klebsiella KP B5055 (O1:K2) burn wound infection model using anti-O1 sera and anti-MrkA sera as indicated in Table 24.
Результаты свидетельствуют о том, что существует тенденция к защитной роли MrkA (FlaBD2-MrkA) в предотвращении гибели животных, инфицированных инкапсулированным штаммом KP. В день 6 после заражения 60% (3/5) животных были все еще живы. Антитела к OPS O1 не обеспечивали защиту от инфекции в этом эксперименте.The results suggest that there is a trend towards a protective role for MrkA (FlaBD2-MrkA) in preventing the death of animals infected with the encapsulated KP strain. On
Таблица 24: Защита от инфекции ожоговой раны, вызываемой KP B5055 (O1: K2), с использованием анти-O1 и анти-MrkA сыворотокTable 24: Protection against KP B5055 (O1:K2) burn wound infection using anti-O1 and anti-MrkA sera
(12 КОЕ/мышь)B5055
(12 cfu/mouse)
*Мышам дважды пассивно переносили 200 мкл сыворотки, инфицировали п/к 12 КОЕ B5055 после нанесения ожоговой раны.*Mice were passively transferred twice with 200 µl of serum, infected sc with 12 CFU B5055 after burn wound.
KPO1 антитело: Пул из 3 сывороток с наивысшим титром из NCB008 с FlaB-PcrV 4-валентным KP MAPSKPO1 antibody: Pool of 3 highest titer sera from NCB008 with FlaB-PcrV 4-valent KP MAPS
MrkA антитело: Пул из 10 сывороток из NCB010 с FlaBD2-MrkA 1-в PA MAPS.MrkA antibody: Pool of 10 sera from NCB010 with FlaBD2-MrkA 1-in PA MAPS.
Краткое изложение результатов изучения эффективности двух белков-носителей в вакцинном препаратеSummary of the results of the study of the effectiveness of two carrier proteins in a vaccine preparation
- Показано, что белки-носители FlaBD2-MrkA и FlaBD2-PcrV в 12-валентной KP/PA вакцине 1 и 12-валентной KP/PA вакцине 2 являются сильными носителями для KP/PA OPS.- The carrier proteins FlaBD2-MrkA and FlaBD2-PcrV in 12-valent KP/
- Сильный ответ на белок наблюдали для FlaBD2-MrkA и FlaBD2-PcrV в 12-валентной KP/PA вакцине 1, а также для FlaBD2-MrkA в 12-валентной KP/PA вакцине 2.- A strong protein response was observed for FlaBD2-MrkA and FlaBD2-PcrV in 12-valent KP/
- Широта покрытия для антител, направленных на белки-носители в 12-валентной KP/PA вакцине 1, распространялась на не-вакцинные OPS серотипы.- The breadth of coverage for antibodies directed to carrier proteins in the 12-valent KP/
- В соответствии с экспериментальным дизайном FlaB, содержащего лишь домен 2 FlaB (FlaBD2), полное устранение активности агониста TLR5 было продемонстрировано для слитых белков-носителей FlaBD2.- Following an experimental design of FlaB containing only FlaB domain 2 (FlaBD2), complete abolition of TLR5 agonist activity was demonstrated for FlaBD2 carrier fusion proteins.
- Первые результаты заражения в мышиной модели ожоговой раны, инфицированной Klebsiella, продемонстрировали тенденцию к защитной роли антител против MrkA.- The first results of infection in a mouse model of a burn wound infected with Klebsiella showed a trend towards a protective role of anti-MrkA antibodies.
Пример 12: Функциональные анализы 12-валентной Example 12 Functional Assays for 12-valent P. aeruginosa/K. pneumoniaeP. aeruginosa/K. pneumoniae вакцины vaccines
Анализы опсонофагоцитарного уничтожения (ОФУ)Opsonophagocytic kill assays (OPAs)
Анализы ОФУ с человеческими нейтрофиламиCFU analyzes with human neutrophils
Анализ опсонофагоцитарного уничтожения (ОФУ) с человеческими нейтрофилами использовали для оценки функционального ответа объединенной кроличьей сыворотки (P2), полученной против 12-валентной KP/PA вакцины 1 в дозе 5 мкг (NCB012, Таблица 21), с использованием бескапсульной KP серотипа O2 (KP O2 K-) штамма 7380. Результаты анализа ОФУ представлены на Фигуре 47.An opsonophagocytic killing (OPK) assay with human neutrophils was used to assess the functional response of pooled rabbit serum (P2) raised against 12-valent KP/
Иммунная сыворотка обеспечивала 100% уничтожение бактерий KP O2 при разведении 1/10 после 24 часов инкубации, при этом сыворотка в разведении 1/100 не обладала активностью уничтожения бактерий. Обеспечивающая уничтожение активность сыворотки могла быть связана либо с KP O2 OPS, либо с MrkA, или с сочетанием двух вакцинных компонентов.The immune serum provided 100% killing of KP O2 bacteria at a 1/10 dilution after 24 hours of incubation, while the serum at a 1/100 dilution had no bacterial killing activity. The killing activity of the serum could be related to either KP O2 OPS or MrkA or a combination of the two vaccine components.
Анализ ОФУ с клеточной линией J774 макрофаговAnalysis of CFU with macrophage cell line J774
В этом анализе ОФУ для оценки функциональной активности использовали клеточную линию J774 макрофагов в присутствии или в отсутствие антибиотика гентамицина. Некоторые антибиотики не могут проникать в эукариотические клетки. Таким образом, эти антибиотики не могут наносить вред бактериям, которые уже интернализованы. Использование таких антибиотиков позволяет различать бактерии, которые смогли проникнуть в эукариотические клетки, и те, которые не смогли. Применение такого антибиотика в культуре эукариотических клеток, инфицированных бактериями, привело бы к уничтожению бактерий, которые остаются вне клеток, но не затронуло бы бактерии, которые проникли в клетки. Антибиотиком, выбранным для этого анализа, был аминогликозид гентамицин.In this RFU assay, the J774 macrophage cell line was used to evaluate functional activity in the presence or absence of the antibiotic gentamicin. Some antibiotics cannot enter eukaryotic cells. Thus, these antibiotics cannot harm bacteria that are already internalized. The use of such antibiotics makes it possible to distinguish between bacteria that were able to enter eukaryotic cells and those that could not. The use of such an antibiotic in a culture of eukaryotic cells infected with bacteria would kill bacteria that remain outside the cells, but would not affect the bacteria that entered the cells. The antibiotic of choice for this assay was the aminoglycoside gentamicin.
Объединенную кроличью сыворотку от кроликов в экспериментальной группе 5, получавших дозу 5 мкг 12-валентной KP/PA вакцины 1 в NCB012 и имевших самые высокие титры против OPS (1502, 1506, 1508, 1511), использовали в анализе ОФУ с клеточной линией J774 макрофагов для оценки эффекта сыворотки на фагоцитарное поглощение Klebsiella штаммов KP O1, KP O2, KP O3 и KP O5.Pooled rabbit sera from rabbits in
Макрофаги клеточной линии J774 высевали в 96-луночные планшеты за 24 часа до эксперимента. Штаммы Klebsiella разных O-типов выращивали до середины логарифмической фазы роста в бульоне, и использовали объединенную сыворотку в анализе на уничтожение. Приблизительно 1×105 КОЕ бактерий инкубировали с объединенной преиммунной (P0) или иммунной (P2) сывороткой в течение 30 мин. Опсонизированные бактерии инкубировали с клетками J774 в течение 15 минут при комнатной температуре, времени, достаточного для осуществления опосредованного антителом фагоцитоза. Несвязанные бактерии удаляли с клеток и добавляли свежий буфер ±50 мкг/мл гентамицина еще на 20 минут. Клетки промывали два раза PBS, затем лизировали путем добавления чистой воды. По десять мл из каждой лунки в двух повторах высевали на чашки, и колониеобразующие единицы (КОЕ) подсчитывали на следующий день.Macrophages of the J774 cell line were seeded in 96-well plates 24 hours before the experiment. Klebsiella strains of different O-types were grown to mid-log growth phase in broth and pooled sera were used in a kill assay. Approximately 1×10 5 cfu of bacteria were incubated with pooled pre-immune (P0) or immune (P2) sera for 30 minutes. The opsonized bacteria were incubated with J774 cells for 15 minutes at room temperature, sufficient time for antibody-mediated phagocytosis to occur. Unbound bacteria were removed from the cells and fresh buffer ±50 μg/ml gentamicin was added for another 20 minutes. Cells were washed twice with PBS, then lysed by adding pure water. Ten ml from each well were plated in duplicate on plates and colony forming units (CFU) were counted the next day.
Результаты данного исследования представлены на Фигурах 48A и 48B. Результаты фагоцитарного поглощения клетками J774 бактерий Klebsiella, опсонизированных иммунной или преиммунной сывороткой в разведении 1/20, 1/100 и 1/500, показали увеличенное поглощение KP O1, KP O2, KP O3 и KP O5 в присутствии иммунной сыворотки и в присутствии гентамицина (Фигура 48A). Максимальное поглощение наблюдали при разведении 1/100 для KP O1, KP O2 и KP O3. В случае KP O5 поглощение было сходным при разведениях 1/20 и 1/100.The results of this study are presented in Figures 48A and 48B. The results of phagocytic uptake by J774 cells of Klebsiella bacteria opsonized with immune or pre-immune serum at 1/20, 1/100 and 1/500 dilutions showed increased uptake of KP O1, KP O2, KP O3 and KP O5 in the presence of immune serum and in the presence of gentamicin ( Figure 48A). Maximum absorption was observed at a 1/100 dilution for KP O1, KP O2 and KP O3. In the case of KP O5, the absorbance was similar at 1/20 and 1/100 dilutions.
В отсутствие гентамицина значительное поглощение клетками J774 KP O1, KP O3 и KP O5 также наблюдали при использовании P2 сыворотки, в сравнении с преиммунной сывороткой, при использовании которой поглощение бактерий происходило в меньшей степени. Результаты для KP O2 не представлены, поскольку количество КОЕ было слишком высоким для подсчета (Фигура 48B). В случае KP O1 и KP O3 поглощение уменьшалось при более высоком разведении, и в случае KP O5 максимальное поглощение наблюдали при разведении 1/100, слегка меньшее поглощение при разведении 1/20 и минимальное поглощение при разведении 1/500.In the absence of gentamicin, significant uptake by J774 cells of KP O1, KP O3, and KP O5 was also observed with P2 serum, compared to pre-immune serum, which had less bacterial uptake. Results for KP O2 are not shown because the number of CFUs was too high to count (Figure 48B). For KP O1 and KP O3, absorbance decreased at higher dilution, and for KP O5, maximum absorbance was observed at 1/100 dilution, slightly less absorbance at 1/20 dilution, and minimum absorbance at 1/500 dilution.
Объединенную сыворотку от кроликов, получавших дозу 5 мкг 12-валентной KP/PA вакцины 1 в NCB012 и имевших самые высокие титры против OPS (1502, 1506, 1508, 1511), также использовали в анализе ОФУ с клеточной линией J774 макрофагов для оценки эффекта сыворотки на фагоцитарное поглощение как Pseudomonas PA (O5:FlaB и O6:FlaA1), так и Klebsiella штамма KP O5 (штамм 6997). Анализ выполняли, как описано выше для тестирования в анализе ОФУ с J774 Klebsiella штаммов KP O1, KP O2, KP O3 и KP O5.Pooled sera from rabbits dosed with 5 µg of 12-valent KP/
Результаты данного анализа представлены на Фигурах 49, 50 и 51. Иммунная сыворотка (P0) опосредовала поглощение каждого из этих бактериальных штаммов путем фагоцитоза, как показано на Фигуре 49. Поглощение бактерий макрофаг-подобными клетками J774 также продемонстрировано методом микроскопии с использованием GFP-меченых PA (PA O1, PA O5 FlaB), как проиллюстрировано на Фигуре 50. PA, подвергнутые воздействию иммунной сыворотки, активно поглощались клетками. Несколько P2-обработанных изолятов PA в каждой клетке J774 показаны в увеличенном виде на Фигуре 50. На Фигуре 51 показано, что большую процентную долю клеток (левая панель) и большее число бактерий на клетку (правая панель) наблюдали в случае клеток, обработанных иммунной сывороткой, в сравнении с клетками, обработанными преиммунной сывороткой.The results of this assay are shown in Figures 49, 50 and 51. Immune serum (P0) mediated the uptake of each of these bacterial strains by phagocytosis as shown in Figure 49. Uptake of the bacteria by J774 macrophage-like cells was also demonstrated by microscopy using GFP-labeled PA (PA O1, PA O5 FlaB) as illustrated in Figure 50. PA exposed to immune serum was actively taken up by the cells. Several P2-treated PA isolates in each J774 cell are shown enlarged in Figure 50. Figure 51 shows that a higher percentage of cells (left panel) and a higher number of bacteria per cell (right panel) were observed for cells treated with immune serum compared to cells treated with pre-immune serum.
Анализ ОФУ с HL-60CFU analysis with HL-60
В этом анализе бактерии KP O2 штамма 7380 были сначала опсонизированы сывороткой, а затем к смеси добавляли клетки HL-60. После инкубации смеси в течение 45 минут жизнеспособные бактерии подсчитывали. Титр ОФУ определяли как титр, при котором менее 50% бактерий выживали в сравнении с отрицательным контролем (только бактерии+клетки HL-60).In this assay, KP O2 strain 7380 bacteria were first opsonized with serum and then HL-60 cells were added to the mixture. After the mixture was incubated for 45 minutes, viable bacteria were counted. The OFU titer was defined as the titer at which less than 50% of the bacteria survived compared to the negative control (bacteria+HL-60 cells only).
На Фигуре 52 и в Таблице 25 представлены результаты анализа ОФУ клетками HL60 с использованием KP O2 штамма 7380 и объединенной сыворотки от кроликов, иммунизированных дозой 5 мкг 12-валентной KP/PA вакцины 1. Кроличья сыворотка против убитых нагреванием (УН) KP O2 до и после иммунизации служила положительным контролем. Анализ выполняли с использованием сывороток в разведениях от 1/200 до 1/204800.Figure 52 and Table 25 show the results of HL60 PFU analysis using KP O2 strain 7380 and pooled sera from rabbits immunized with a 5 μg dose of 12-valent KP/
Сыворотки от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1, продемонстрировали значительную активность ОФУ в отношении KP O2 штамма 7380, в то время как соответствующие преиммунные сыворотки проявляли значительно более слабый эффект уничтожения бактерий. Обеспечивающая уничтожение активность сыворотки могла быть связана с антителами либо к KP O2 OPS, либо к MrkA, или к обоим компонентам. Информация о титрах ОФУ для сыворотки до и после иммунизации, а также для положительных контролей, приведена в Таблице 25. Имело место значительное отличие (>15-кратное увеличение) в обеспечивающей уничтожение активности между сыворотками до (1/800) и после иммунизации (1/12800).Sera from rabbits immunized with the 12-valent KP/
Таблица 25: Титр ОФУ для KP O2 штамма 7380 в анализе с HL-60Table 25: OFU titer for KP O2 strain 7380 in HL-60 assay
Аналогичный анализ выполняли с использованием KP O5 штамма 6997. Бактерии смешивали либо с преиммунной (P0), либо с иммунной (P2), объединенными сыворотками из исследования NCB012 и добавляли к клеткам HL-60 в присутствии комплемента (Таблица 26). Наблюдали на 50 процентов меньшую выживаемость в случае иммунной сыворотки до титра 1:1280, в то время как объединенная преиммунная сыворотка приводила к умеренному уменьшению выживаемости при разведении сыворотки 1:40.A similar assay was performed using
Таблица 26: Выживаемость, в процентах, KP O5 штамма 6997 в клетках HL-60 при использовании объединенной сывороткиTable 26: Percent Survival KP O5 of 6997 Strain in HL-60 Cells Using Pooled Serum
Выводы для разных анализов ОФУFindings for different analyzes of FFU
Использовали три разных анализа ОФУ для оценки эффективности антител, индуцированных у кроликов после двух введений 12-валентной KP/PA вакцины 1. Значительная активность ОФУ могула быть продемонстрирована в отношении KP серотипов O1, O2, O3 и O5 в анализах с использованием либо человеческих PMN, клеток J774 макрофагов, либо дифференцированных клеток HL60. Активность ОФУ могла быть связана или с OPS-специфическими антителами и/или с антителами к белку-носителю MrkA. Поглощение KP и PA фагоцитирующими клетками, стимулированное 12-валентной иммунной сывороткой, вероятно, было связано с анти-OPS антителом.Three different OFU assays were used to assess the efficacy of antibodies induced in rabbits following two administrations of the 12-valent KP/
Защита от клеточной токсичностиProtection against cellular toxicity
В соответствии с протоколом, описанным в примере 7, (Анализы цитотоксичности для конструктов с белком PcrV Pseudomonas ), Pseudomonas штамма PAK (O6 FlaA1) выращивали в течение ночи и использовали для инфицирования монослоев клеток A549 легочного эпителия человека в присутствии сыворотки в разных концентрациях (10%, 5%, 2,5% или нуль) от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1, содержащей анти-PcrV антитело, выработанное в результате иммунного ответа на белок-носитель MAPS, или в присутствии преиммунной сыворотки от тех же кроликов в том же диапазоне концентраций сыворотки. Вызываемая Pseudomonas цитотоксичность для A549 характеризуется округлением клеток, поскольку клетки становятся апоптозными и отделяются от поверхности планшета для культивирования ткани. На опосредованную анти-PcrV антителом защиту от цитотоксичности указывает уменьшение числа округлившихся (апоптозных) клеток в поле микроскопа, в сравнении с клетками, обработанными преиммунной сывороткой в аналогичной концентрации. Максимальное различие в количестве округлившихся (апоптозных) клеток между образцами, обработанными иммунной и преиммунной сыворотками, наблюдали при концентрации сыворотки 2,5% (Фигура 53, левый график). Микрофотографии репрезентативных PAK-инфицированных клеток A549, обработанных 2,5% сывороткой, демонстрируют эти различия как уменьшение количества округлых клеток с высоким лучепреломлением в образце, обработанном иммунной сывороткой (Фигура 53, правая панель). Аналогичные изображения были использованы для оценки числа пораженных клеток при каждой концентрации сыворотки (Фигура 53, левый график).Following the protocol described in Example 7, (Cytotoxicity Assays for Pseudomonas PcrV Protein Constructs ), Pseudomonas strain PAK (O6 FlaA1) was grown overnight and used to infect human lung epithelial A549 cell monolayers in the presence of different concentrations of serum (10 %, 5%, 2.5%, or none) from rabbits immunized with 12-valent KP/
Уменьшение подвижности P. aeruginosa за счет антител к FlaBDecrease in P. aeruginosa motility due to anti-FlaB antibodies
Как показано на Фигуре 54, в клетках, обработанных объединенной сывороткой от кроликов, иммунизированных дозой 5 мкг каждого PS (например, всего 60 мкг PS в вакцине; 5 мкг PS от каждого типа BP в вакцине) в 12-валентной KP/PA вакцине 1, наблюдали сниженную подвижность штамма PA O5 FlaB за счет антитела к FlaB, в сравнении с обработкой преиммунной сывороткой.As shown in Figure 54, in cells treated with pooled sera from rabbits immunized with 5 μg of each PS (e.g. total 60 μg of PS in the vaccine; 5 μg of PS from each BP type in the vaccine) in a 12-valent KP/
Агрегация Aggregation P. aeruginosaP. aeruginosa за счет антител к FlaB due to antibodies to FlaB
P. aeruginosa штамма PAO1 (O5 FlaB) выращивали в течение ночи и суспендировали в PBS до концентрации 107 КОЕ/мл, затем инкубировали с 1% сывороткой от кроликов, вакцинированных 4-валентной KP вакциной, или с преиммунной сывороткой от тех же кроликов, в течение 1 часа при комнатной температуре. Анти-FlaB антитело в сыворотке, полученной в результате иммунного ответа на белок-носитель Rhavi-FlaBD2-MrkA-His, было способно вызывать агглютинацию FlaB-экспрессирующих Pseudomonas, о чем свидетельствуют кластеры бактерий, которые видны на микрофотографиях в виде черных палочек (Фигура 55, правая панель) с пометкой «агрегация», в то время как такие агрегаты отсутствовали у бактерий, обработанных преиммунной сывороткой (Фигура 55, левая панель). FlaBD2 был единственным антигеном Pseudomonas в этом вакцинном препарате, и наличие перекрестно связанных бактерий указывает на то, что белок-носитель вызывает продуцирование функционального антитела, способного узнавать нативный эпитоп в бактериальном флагеллине. Сыворотка от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA MAPS вакциной 1, была способна вызывать агглютинацию FlaB-экспрессирующих Pseudomonas с O-типом, отсутствующим в вакцине (данные не представлены), что уверенно свидетельствует о том, что содержащий FlaBD2 белок-носитель вызывал продуцирование функционального анти-FlaB антитела при использовании 12-валентного препарата, хотя нельзя исключать вклад в наблюдаемую агглютинацию, который вносит перекрестная реактивность между O-типами Pseudomonas. P. aeruginosa strain PAO1 (O5 FlaB) was grown overnight and suspended in PBS to a concentration of 10 7 CFU/ml, then incubated with 1% serum from rabbits vaccinated with a 4-valent KP vaccine, or with preimmune serum from the same rabbits, for 1 hour at room temperature. Anti-FlaB antibody in sera resulting from an immune response to the Rhavi-FlaBD2-MrkA-His carrier protein was able to agglutinate FlaB-expressing Pseudomonas as evidenced by bacterial clusters that are visible in black rod micrographs (Figure 55 , right panel) labeled "aggregation", while such aggregates were absent in bacteria treated with pre-immune serum (Figure 55, left panel). FlaBD2 was the only Pseudomonas antigen in this vaccine preparation and the presence of cross-linked bacteria indicates that the carrier protein causes the production of a functional antibody capable of recognizing the native epitope in bacterial flagellin. Sera from rabbits immunized with the 12-valent KP/
Анализ ингибирования адгезииAdhesion inhibition assay
В этом анализе объединенную сыворотку из исследования NCB012 использовали для оценки ингибирования адгезии антителами, полученными к разным иллюстративным вакцинам. Экспрессирующие фимбрии 3 типа бактериальные клетки KP O5 штамма 6997 смешивали с преиммунной и иммунной сывороткой (10%) и инкубировали с эпителиальными клетками линии A549. Не прикрепившиеся бактерии смывали с клеток, с последующим лизисом клеток и определением количества прикрепившихся бактерий. Ингибирование адгезии приводило к меньшему количеству КОЕ на планшете. На Фигуре 56 показано, что объединенная сыворотка от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1, объединенная сыворотка от кроликов, иммунизированных 8-валентной PA вакциной (MrkA является единственным антигеном KP в 8-валентной PA вакцине), объединенная сыворотка от кроликов, иммунизированных 4-валентной KP вакциной, блокировали адгезию KP O5 штамма 6997 к клеткам A549. Без связи с какой-либо теорией, поскольку объединенная сыворотка от кроликов, иммунизированных только 8-валентной PA OPS вакциной, также ингибировала адгезию, это свидетельствовало о том, что анти-MrkA антитело, индуцированное белком-носителем, обладает защитным эффектом.In this assay, pooled sera from the NCB012 study were used to evaluate adhesion inhibition by antibodies raised against various exemplary vaccines.
Пример 13: Анализ защиты мышейExample 13: Mice Protection Analysis
Исследования пассивной иммунизации проводили на мышах с использованием иммунной сыворотки, полученной от кроликов, иммунизированных KP/PA вакцинами. В Таблице 21 приведена информация о вакцинных препаратах, которые использовали для иммунизации кроликов. Преиммунную и иммунную сыворотку кроликов (в виде объединенной сыворотки) использовали для пассивной иммунизации мышей, как описано для других моделей. Информация о разных используемых для заражения штаммах также приведена для каждого исследования.Passive immunization studies were performed in mice using immune sera obtained from rabbits immunized with KP/PA vaccines. Table 21 provides information on the vaccine formulations used to immunize rabbits. Preimmune and immune rabbit sera (as pooled sera) were used to passively immunize mice as described for other models. Information on the different strains used for challenge is also provided for each study.
Исследование пассивной защиты мышей от летальной инфекции, вызываемой PA, с использованием сыворотки от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1Study of passive protection of mice against lethal PA infection using sera from rabbits immunized with 12-valent KP/
Исследование пассивной защиты мышей проводили с использованием объединенной сыворотки от кроликов, иммунизированных дозой 5 мкг каждого PS (например, всего 60 мкг PS в вакцине; 5 мкг PS от каждого типа BP в вакцине) в 12-валентной KP/PA вакцине 1 (Таблица 21, группа 5) в исследовании NCB012. Мышам предварительно вводили либо преиммунную, либо иммунную, сыворотку (объединенную кроличью сыворотку) и в/б заражали PA разных штаммов.A passive protection study in mice was performed using pooled sera from rabbits immunized with 5 µg of each PS (e.g. total 60 µg PS in vaccine; 5 µg PS from each BP type in vaccine) in 12-valent KP/PA vaccine 1 (Table 21 , group 5) in study NCB012. Mice were pre-injected with either pre-immune or immune serum (pooled rabbit serum) and challenged ip with different strains of PA.
При летальных дозах заражения PA иммунная сыворотка защищала мышей от инфекции, вызываемой PA O5 и PA O6. Наблюдалась тенденция к защитному эффекту при заражении PA O10 и O11, однако заметное отличие в выживаемости мышей, получавших преиммунную сыворотку и зараженных 1×108 КОЕ и лишь в 3 раза меньшей дозой, показывает, насколько крутой может быть кривая доза-ответ для многих грамотрицательных бактерий. Это часто создает проблемы при проведении таких анализов. Информация о показателях выживаемости приведена в Таблице 27.At lethal doses of PA challenge, immune sera protected mice from infection with PA O5 and PA O6. There was a trend towards a protective effect when challenged with PA O10 and O11, however, the marked difference in survival of mice treated with pre-immune serum and challenged with 1×10 8 CFU and only 3 times lower dose shows how steep the dose-response curve can be for many gram-negative bacteria. This often creates problems in conducting such analyses. Information on survival rates is shown in Table 27.
Таблица 27: Показатели выживаемости мышей в исследовании летального заражения PATable 27: Survival rates of mice in a lethal PA challenge study
Исследование пассивной защиты мышей от Study of the passive defense of mice against
KlebsiellaKlebsiella
KP O3 с использованием сыворотки от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 KP O3 using sera from rabbits immunized with 12-valent KP/
Сыворотку от четырех кроликов с самыми высокими титрами анти-KP-O3 (кролики 1502, 1506, 1508 и 1511; Таблица 28), иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 в дозе 5 мкг каждого PS (например, всего 60 мкг PS в вакцине; 5 мкг PS от каждого типа BP в вакцине) (группа 5) в исследовании NCB012, объединяли и вводили в/б инъекцией (преиммунную или иммунную сыворотку) за 20 часов и 2 часа до в/в заражения KP O3 штамма 700603 в дозе 50000 КОЕ в 0,1 мл.Serum from the four rabbits with the highest anti-KP-O3 titers (rabbits 1502, 1506, 1508, and 1511; Table 28) immunized with 12-valent KP/
Таблица 28: Титры преиммунных и иммунных кроличьих сывороток, включенных в объединенные образцыTable 28: Titres of preimmune and immune rabbit sera included in pooled samples
образец сывороткиserum sample
Через четыре часа после заражения мышей подвергали эвтаназии, кровь, печень и селезенку собирали, и определяли количество колоний. Результаты приведены в Таблице 29. У мышей, получавших объединенную иммунную сыворотку, наблюдали клиренс из крови и меньшее количество бактерий в печени и селезенке в сравнении с мышами, получавшими преиммунную сыворотку от тех же кроликов. Эти результаты были аналогичны результатам бактериального клиренса при использовании сыворотки с эквивалентным титром от кроликов, иммунизированных 4-валентным KP MAPS в исследовании NCB008.Four hours after infection, mice were euthanized, blood, liver and spleen were collected, and the number of colonies was determined. The results are shown in Table 29. Mice treated with pooled immune sera showed clearance from the blood and fewer bacteria in the liver and spleen compared to mice treated with pre-immune sera from the same rabbits. These results were similar to those for bacterial clearance using equivalent titer sera from rabbits immunized with 4-valent MAPS KP in study NCB008.
Таблица 29: Среднее геометрическое количество КОЕ для клиренса из крови и жизнеспособных бактерий в органах после заражения Table 29: Geometric Mean Number of CFU for Clearance from Blood and Viable Bacteria in Organs after Infection KlebsiellaKlebsiella KP O3 KP O3
Исследование пассивной защиты мышей от Study of the passive defense of mice against
KlebsiellaKlebsiella
KP O1 штамма B5055 с использованием сыворотки от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 KP O1 strain B5055 using sera from rabbits immunized with 12-valent KP/
В этом исследовании трем мышам на группу вводили инъекцией объединенную сыворотку от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 в дозе 5 мкг каждого PS (например, всего 60 мкг PS в вакцине; 5 мкг PS от каждого типа BP в вакцине) (Таблица 21, группа 5) в исследовании NCB012 (преиммунная и иммунная сыворотка), с последующим внутривенным (в/в) заражением KP O1 штамма B5055 в дозе 5×106. Результаты анализа клиренса из крови через 1 и 4 часа после заражения приведены в Таблице 30 в виде среднего геометрического значения КОЕ/мл крови, и представлены на Фигуре 57 для отдельных мышей.In this study, three mice per group were injected with pooled sera from rabbits immunized with 12-valent KP/
Через четыре часа после заражения в крови у мышей в группе с иммунной сывороткой наблюдали значительное уменьшение количества КОЕ/мл, в то время как количество КОЕ/мл у мышей, получавших преиммунную сыворотку, оставалось повышенным.Four hours after challenge, mice in the immune serum group showed a significant decrease in CFU/ml in the blood, while CFU/ml in mice treated with pre-immune serum remained elevated.
Таблица 30: Результаты анализа клиренса из крови в виде среднего геометрического значения КОЕ/мл у мышей после заражения KP O1 штамма B5055Table 30: Results of analysis of blood clearance as geometric mean cfu/ml in mice after challenge with KP O1 strain B5055
Результаты определения нагрузки органов в селезенке и печени у этих мышей приведены в Таблице 31 в виде среднего геометрического значения КОЕ/г ткани для трех мышей. На Фигуре 58 представлены результаты определения нагрузки органов в селезенке и печени трех мышей через 20 часов после заражения.The results of determining the load of organs in the spleen and liver of these mice are shown in Table 31 as the geometric mean of CFU/g of tissue for three mice. Figure 58 shows the results of determining the load of organs in the spleen and liver of three
У двух из трех мышей, получавших иммунную сыворотку, наблюдали уменьшение среднего геометрического значения КОЕ в печени, в сравнении с мышами, получавшими преиммунную сыворотку. Результаты для селезенки показывают аналогичную картину у мышей, предварительно получавших иммунную сыворотку, свидетельствующую о значительном уменьшении показателя через 20 часов после заражения в сравнении с мышами, получавшими преиммунную сыворотку, которые имели значительно более высокое количество бактерий.Two of the three mice treated with immune serum showed a decrease in geometric mean CFU in the liver compared to mice treated with preimmune serum. The results for the spleen show a similar pattern in mice pre-treated with immune sera, indicating a significant decrease in the score at 20 hours post-challenge compared to mice treated with pre-immune sera, which had a significantly higher bacterial count.
Таблица 31: Нагрузка органов у мышей в виде среднего геометрического значения КОЕ/г ткани после заражения KP O1 штамма B5055Table 31: Organ loading in mice as geometric mean cfu/g tissue after infection with KP O1 strain B5055
Исследование пассивной защиты мышей от Study of the passive defense of mice against
KlebsiellaKlebsiella
KP O5 штамма 6997 с использованием сыворотки от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1
В этом исследовании трем мышам на группу вводили инъекцией объединенную сыворотку от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 в дозе 5 мкг каждого PS (например, всего 60 мкг PS в вакцине; 5 мкг PS от каждого типа BP в вакцине) в исследовании NCB012 (Таблица 21, группа 5, преиммунная и иммунная сыворотка), с последующим в/в заражением KP O5 штамма 6997 в дозе 5×106. Результаты анализа клиренса из крови через 1 и 4 часа после заражения приведены в Таблице 32 в виде среднего значения КОЕ/мл крови, и представлены на Фигуре 59 для отдельных мышей.In this study, three mice per group were injected with pooled sera from rabbits immunized with 12-valent KP/
Через четыре часа после заражения кровь у 2 из 3 мышей в группе с иммунной сывороткой была очищена от бактерий, со значительным уменьшением нагрузки КОЕ у третьей мыши, в то время как количество КОЕ у мышей, получавших преиммунную сыворотку, оставалось повышенным (у 2 из 3 мышей) через четыре часа после заражения.Four hours after challenge, the blood of 2 of 3 mice in the immune serum group was cleared of bacteria, with a significant decrease in CFU load in the third mouse, while the number of CFU in mice treated with preimmune serum remained elevated (in 2 of 3 mice) four hours after infection.
Таблица 32: Результаты анализа клиренса из крови в виде среднего геометрического значения КОЕ/мл у мышей после заражения KP O5 штамма 6997Table 32: Results of analysis of blood clearance as geometric mean cfu/ml in mice after challenge with
Результаты определения нагрузки органов в селезенке у этих мышей приведены в Таблице 33 в виде среднего геометрического значения КОЕ/г ткани для трех мышей, и на Фигуре 60 представлены результаты определения нагрузки органов в селезенке трех мышей через 20 часов после заражения.The spleen organ loading results of these mice are shown in Table 33 as geometric mean cfu/g tissue for three mice, and Figure 60 shows the spleen organ loading results of three
Было обнаружено, что в селезенке у мышей, получавших иммунную сыворотку, было гораздо меньше бактерий через 20 часов после заражения, чем у мышей, получавших преиммунную сыворотку.It was found that the spleen of mice treated with immune serum had much
Таблица 33: Нагрузка органов у мышей в виде среднего геометрического значения КОЕ/г ткани после заражения KP O5 штамма 6997Table 33: Organ loading in mice as geometric mean cfu/g tissue after infection with
Исследование пассивной защиты мышей от Study of the passive defense of mice against
KlebsiellaKlebsiella
KP O2 (штамма KPN 12) с использованием сыворотки от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1 KP O2 (strain KPN 12) using sera from rabbits immunized with 12-valent KP/
В этом исследовании мышам CD-1 (3/группу) вводили 0,2 мл объединенной преиммунной, или иммунной, сыворотки (объединенная сыворотка от 10 кроликов, исследование NCB012) за 24 часа и 2 часа до в/в введения 2×105 КОЕ KP O2 штамма KPN-12. Селезенки собирали через 72 часа после инфицирования и определяли бактериальную нагрузку на грамм ткани. У мышей, получавших иммунную сыворотку, наблюдали меньшее количество жизнеспособных бактерий в сравнении с мышами, получавшими преиммунную сыворотку (7978 против 114687, среднее количество КОЕ; Фигура 61). Объединенная иммунная сыворотка стимулировала клиренс KP O2 (штамма KPN-12) из системы кровообращения.In this study, CD-1 mice (3/group) were injected with 0.2 ml of pooled pre-immune or immune serum (pooled serum from 10 rabbits, study NCB012) 24 hours and 2 hours prior to 2 x 10 5 cfu IV administration. KP O2 strain KPN-12. Spleens were harvested 72 hours after infection and the bacterial load per gram of tissue was determined. Mice treated with immune serum had fewer viable bacteria compared to mice treated with pre-immune serum (7978 vs 114687, mean cfu; Figure 61). The pooled immune serum stimulated the clearance of KP O2 (strain KPN-12) from the circulatory system.
Проводили несколько экспериментов с преиммунной и иммунной сыворотками из исследования NCB012 для разработки и оптимизации протокола пассивной защиты в модели летального заражения Klebsiella KP O2. Аналогичные эксперименты можно проводить для разработки и оптимизации протокола пассивной защиты для других организмов, других вакцин или иммуногенных композиций, и/или других патогенов/штаммов. Были изучены такие переменные, как доза бактерий для заражения, доставка инокулята (например, опсонизация бактерий перед инъекцией), а также количество, время введения и концентрация сыворотки для пассивной защиты (например, сыворотка, полученная с дозой полисахарида либо 5 мкг, либо 1 мкг). Иллюстративные тестируемые параметры и результаты представлены на Фигуре 62.Several experiments were performed with pre-immune and immune sera from the NCB012 study to develop and optimize a passive protection protocol in a Klebsiella KP O2 lethal challenge model. Similar experiments can be performed to develop and optimize a passive protection protocol for other organisms, other vaccines or immunogenic compositions, and/or other pathogens/strains. Variables such as dose of bacteria for challenge, delivery of the inoculum (eg, opsonization of bacteria prior to injection), and the amount, time of administration, and serum concentration for passive protection (eg, serum obtained with a polysaccharide dose of either 5 µg or 1 µg) were studied. ). Exemplary test parameters and results are shown in Figure 62.
Th17-ответ и колонизация у мышей CD-1 - при зараженииTh17 response and colonization in CD-1 mice - upon challenge
Этот эксперимент был разработан для определения способности KP O1 MAPS вакцины с FlaBD2 и MrkA в трех дозах, введенной мышам, при этом каждую дозу вводили через четырнадцать дней после предыдущей дозы, уменьшать бактериальную колонизацию после бактериального заражения через две недели после последней иммунизации. Двум группам мышей CD-1 предстояло проводить бактериальное заражение; в одной группе животные были иммунизированы KPO1/FlaBD2-MrkA MAPS вакциной, а в другой группе животные были иммунизированы одним буфером (PBS).This experiment was designed to determine the ability of KP O1 MAPS vaccine with FlaBD2 and MrkA at three doses administered to mice, with each dose administered fourteen days after the previous dose, to reduce bacterial colonization following bacterial challenge two weeks after the last immunization. Two groups of CD-1 mice were to undergo bacterial challenge; in one group, animals were immunized with KPO1/FlaBD2-MrkA MAPS vaccine, and in the other group, animals were immunized with buffer alone (PBS).
Пяти мышам на группу вводили 3-5×103 КОЕ KP B5055 (O1:K2) интратрахеально (и/т). Через 48 часов после бактериального заражения легкие животных собирали и взвешивали, гомогенаты высевали для подсчета бактерий, а затем центрифугировали. Супернатанты оценивали на уровни IL-17a. Параллельно, клетки селезенки совместно культивировали с PBS, FlaBD2 и MrkA, как описано выше, и через три дня супернатанты оценивали на уровни IL-17a.Five mice per group were injected with 3-5×10 3 CFU of KP B5055 (O1:K2) intratracheally (i/t). 48 hours after bacterial infection, the lungs of the animals were collected and weighed, the homogenates were plated for bacteria count, and then centrifuged. Supernatants were evaluated for IL-17a levels. In parallel, spleen cells were co-cultured with PBS, FlaBD2 and MrkA as described above and supernatants were assessed for IL-17a levels three days later.
На Фигуре 63 показана индукция IL-17a в стимулированных клетках селезенки после бактериального заражения. Значительную индукцию наблюдали для стимулированных FlaBD2 клеток селезенки (p=0,02).Figure 63 shows the induction of IL-17a in stimulated spleen cells after bacterial challenge. Significant induction was observed for FlaBD2-stimulated spleen cells (p=0.02).
Эффект иммунизации на колонизацию ЖК тракта Effect of immunization on colonization of the GI tract P. aeruginosaP. aeruginosa
Был разработан следующий экспериментальный протокол для изучения эффекта иммунизации одновалентной PA O6 MAPS вакциной на колонизацию желудочно-кишечного (ЖК) тракта P. aeruginosa.The following experimental protocol was developed to study the effect of immunization with a monovalent PA O6 MAPS vaccine on colonization of the gastrointestinal (GI) tract by P. aeruginosa .
Восемь крыс Sprague-Dawley иммунизировали два раза по 0,5 мл п/к с двухнедельными интервалами одновалентной MAPS вакциной, MA6-93-PAO6 (Klebsiella pneumoniae K19: Pseudomonas aeruginosa O6/Rhavi-FlaBD2-MrkA-his BP-1). Семь крыс иммунизировали только буфером. Через четырнадцать дней после второй иммунизации крысам вводили цефтриаксон (50 мг/кг в/м) и продолжали вводить один раз в сутки дозы антибиотика в течение девяти дней. Крысам вводили антибиотики для преодоления сопротивляемости колонизации в ЖК тракте оппортунистических бактерий, таких как PA и для имитации клинической ситуации. После четырех дней приема только антибиотика крысам вводили P. aeruginosa (PA, IATS O6) в дозе 108 КОЕ через желудочный зонд всего в течение пяти дней. После пяти суточных доз PA и девяти суточных доз цефтриаксона крыс подвергали эвтаназии, слепую кишку удаляли, взвешивали, а затем культивировали. Кровь собирали для оценки уровней антител до введения антибиотиков, вводили бактерии, и получали образцы экскрементов для культивирования PA за день до, и через два дня после, введения первой дозы PA. Подробное описание можно найти в верхней части Фигуры 64.Eight Sprague-Dawley rats were immunized twice with 0.5 ml sc at two-week intervals with a monovalent MAPS vaccine, MA6-93-PAO6 ( Klebsiella pneumoniae K19: Pseudomonas aeruginosa O6/Rhavi-FlaBD2-MrkA-his BP-1). Seven rats were immunized with buffer alone. Fourteen days after the second immunization, rats were injected with ceftriaxone (50 mg/kg IM) and continued to receive once daily antibiotic doses for nine days. Rats were treated with antibiotics to overcome resistance to colonization in the GI tract by opportunistic bacteria such as PA and to mimic the clinical situation. After four days of antibiotic use alone, rats were administered P. aeruginosa (PA, IATS O6) at a dose of 10 8 CFU by gavage for a total of five days. After five daily doses of PA and nine daily doses of ceftriaxone, rats were euthanized, the caecum was removed, weighed, and then cultured. Blood was collected to assess antibody levels prior to antibiotic administration, bacteria were injected, and stool samples were obtained for PA culture one day before and two days after the first dose of PA. A detailed description can be found at the top of Figure 64.
Результаты исследования на крысах колонизации с использованием двух доз PA O6 FlaBD2-MrkA MAPS вакцины представлены в нижней части Фигуры 64. Крысы, получавшие PA O6 вакцину, имели повышенный определенный методом ELISA титр IgG в сравнении с крысами, получавшими PBS (слева в нижней части фигуры). У вакцинированных крыс также обнаруживали, в среднем, менее 103 КОЕ/г бактерий в сравнении с контрольными крысами, которые имели, в среднем, >104 КОЕ/г (справа в нижней части фигуры). Результаты исследования свидетельствуют об уменьшении колонизации PA O6 слепой кишки после двух иммунизаций одновалентной PA O6 MAPS вакциной.The results of a colonization study in rats using two doses of the PA O6 FlaBD2-MrkA MAPS vaccine are shown at the bottom of Figure 64. The rats that received the PA O6 vaccine had an elevated IgG titer as determined by the ELISA method compared to the rats that received PBS (lower left of the figure). ). Vaccinated rats also showed, on average, less than 10 3 CFU/g of bacteria compared to control rats, which had, on average, >10 4 CFU/g (bottom right of the figure). The results of the study show a reduction in caecal PA O6 colonization after two immunizations with the monovalent PA O6 MAPS vaccine.
Пример 14: Анти-OPS антитело к карбапенем-устойчивым штаммам KP (CRKP), экспрессирующим эпитоп Gal-IIIExample 14 Anti-OPS Antibody to Carbapenem-Resistant KP Strains (CRKP) Expressing the Gal-III Epitope
В отличие от других классов бактериальных карбапенемaз (например, окса-48 или металло-бета-лактамаз), распространение KPC (карбапенемaза K. pneumoniae), судя по всему, является по меньшей мере частично клональным явлением. Показано, что определенная линия, называемая типом последовательности (ST) 258, ответственна за большинство инфекций KPC-продуцирующих Klebsiella, которые являются эндемичными в нескольких географических регионах. В настоящее время в северо-восточных штатах США >30% всех внутрибольничных инфекций K. pneumoniae вызваны CRKP, и приблизительно 70% из них принадлежат к KPC-продуцирующему клону ST258. Аналогично, этот клон (включая однолокусные варианты ST) вызывают эпидемии в других частях света, включая Израиль, Польшу, Италию, Грецию, Южную Америку и Китай. Недавно исследование молекулярной эволюции ST258 выявило две клады, которые связаны с экспрессией различных капсульных полисахаридов (Chen 2014a, Chen 2014b, DeLeo 2014). Klebsiella pneumoniae ST258 представляет собой глобально распространенный, обладающий чрезвычайно сильной лекарственной устойчивостью внутрибольничный клон, с ограниченной возможностью лечения.Unlike other classes of bacterial carbapenemases (eg, oxa-48 or metallo-beta-lactamases), distribution of KPC ( K. pneumoniae carbapenemase) appears to be at least partially clonal. A particular lineage, termed sequence type (ST) 258, has been shown to be responsible for the majority of KPC-producing Klebsiella infections that are endemic in several geographic regions. Currently, >30% of all nosocomial K. pneumoniae infections in the northeastern United States are due to CRKP, and approximately 70% of these belong to the KPC-producing ST258 clone. Similarly, this clone (including single-locus ST variants) causes epidemics in other parts of the world, including Israel, Poland, Italy, Greece, South America, and China. Recently, a study of the molecular evolution of ST258 has identified two clades that are associated with the expression of different capsular polysaccharides (Chen 2014a, Chen 2014b, DeLeo 2014). Klebsiella pneumoniae ST258 is a globally widespread, highly drug-resistant nosocomial clone with limited treatment options.
Антигены KP O1 и KP O2 состоят из гомополимеров галактозы, то есть, галактанов. Антиген KP O2, называемый d-галактан-I (gal-I), состоит из дисахаридных повторяющихся единиц галактозы. В случае KP O1 gal-I закрыт повторяющимися единицами антигенно отличающегося дисахарида галактозы, называемого d-галактан-II (gal-II), который определяет специфику серотипа. Редкий серотип KP O2ac имеет аналогичную структуру, то есть повторы субъединиц gal-I закрыты полимером из других, в данном случае, не-галактановых, повторяющихся единиц. Соответственно, все штаммы KP O1, KP O2 и KP O2ac имеют общий антиген gal-I, однако, если в KP O2 это единственная O-антигенная детерминанта, в случае KP O1 и KP O2ac gal-I экранирован внешними повторяющимися единицами. Кроме того, дисахаридные повторяющиеся единицы gal-I могут иметь добавленные в стехиометрических и не стехиометрических количествах O-ацетильные или галактозильные группы, за счет которых создаются подтипы в серогруппе KP O2 (Фигура 65). Явное большинство изолятов ST258 экспрессируют модифицированный липополисахаридный O-антиген d-галактан-I с содержащим галактозильные группы Gal-I, далее в настоящем изобретении называемый d-галактан-III (Szijártó V. et al., 2016). The KP O1 and KP O2 antigens are composed of galactose homopolymers, that is, galactans. The KP O2 antigen, called d-galactan-I (gal-I), is composed of disaccharide repeat units of galactose. In the case of KP O1, gal-I is covered by repeating units of an antigenically distinct galactose disaccharide called d-galactan-II (gal-II), which determines serotype specificity. The rare serotype KP O2ac has a similar structure, i.e. the repeats of the gal-I subunits are covered by a polymer from other, in this case non-galactan, repeat units. Accordingly, all KP O1, KP O2, and KP O2ac strains have a common gal-I antigen; however, if in KP O2 this is the only O-antigenic determinant, in the case of KP O1 and KP O2ac, gal-I is shielded by external repeating units. In addition, gal-I disaccharide repeat units can have stoichiometric and non-stoichiometric additions of O-acetyl or galactosyl groups, which create subtypes in the KP O2 serogroup (Figure 65). A clear majority of ST258 isolates express the modified lipopolysaccharide O antigen d-galactan-I with galactosyl group-containing Gal-I, hereinafter referred to as d-galactan-III (Szijártó V. et al., 2016) .
KP O1 OPS состоит из короткого «праймерного» участка D-Gal-I или D-Gal-III, за которым следует длинный участок D-Gal-II. KP O2 OPS состоит только из D-Gal-I или D-Gal-III (Фигура 65). Эпитоп Gal-II характерен только для серотипа KP O1.KP O1 OPS consists of a short D-Gal-I or D-Gal-III "primer" region followed by a long D-Gal-II region. KP O2 OPS consists only of D-Gal-I or D-Gal-III (Figure 65). The Gal-II epitope is characteristic only for the KP O1 serotype.
B5055 OPS, который является источником антигена KP O1 в MAPS вакцине, имеет короткий участок DGal-III, за которым следует длинный полимер D-Gal-II. KP 7380 (источник вакцинного антигена KP O2) имеет только D-Gal-I.B5055 OPS, which is the source of the KP O1 antigen in the MAPS vaccine, has a short DGal-III region followed by a long D-Gal-II polymer. KP 7380 (source of vaccine antigen KP O2) has only D-Gal-I.
Было исследовано, способна ли KP/PA MAPS вакцина вызывать выработку антител к эпитопу Gal-III и, таким образом, обладать потенциалом для предотвращения инфекций, вызываемых клональными штаммами KPCR ST 258. Объединенную сыворотку (P2) от кроликов, иммунизированных 4-валентной KP PRO-CN MAPS вакциной в дозе 5 мкг, использовали в анализе проточной цитометрии для демонстрации способности связывания с бактериями, экспрессирующими эпитопы KP D-Gal-III и KP D-Gal-I. В данном случае единственным адекватным ответом было бы узнавание D-Gal-I O2 и D-Gal-III O2 OPS, D-Gal-II O1 OPS. Результаты показали увеличение связывания, в сравнении с соответствующей преиммунной сывороткой (P0), в отношении как KP O1, так и KP O2, с D-Gal III и D-Gal I OPS (Фигура 66). Таким образом, вероятно, что антитела были выработаны против всех трех типов KP D-Gal.Whether the KP/PA MAPS vaccine was able to induce antibodies to the Gal-III epitope and thus have the potential to prevent infections caused by clonal strains of KPCR ST 258 was investigated. Pooled sera (P2) from rabbits immunized with 4-valent KP PRO -CN MAPS vaccine at a dose of 5 μg was used in a flow cytometric assay to demonstrate the ability to bind to bacteria expressing KP D-Gal-III and KP D-Gal-I epitopes. In this case, the only adequate response would be the recognition of D-Gal-I O2 and D-Gal-III O2 OPS, D-Gal-II O1 OPS. The results showed increased binding, compared to the corresponding pre-immune serum (P0), for both KP O1 and KP O2, to D-Gal III and D-Gal I OPS (Figure 66). Thus, it is likely that antibodies have been developed against all three types of KP D-Gal.
Результаты анализа проточной цитометрии, приведенные в Таблице 34 и на Фигуре 67, показывают, что антитела в объединенной сыворотке от кроликов, иммунизированных 12-валентной KP/PA вакциной 1, связывали два из трех штаммов ST258 из бактериемических изолятов. Иммунная сыворотка, полученная к 12-валентной KP/PA вакцине 1, связывала три из четырех штаммов серотипов, не включенных в вакцину, в том числе, штаммы с аллелями MrkA с небольшими вариациями последовательности (Фигура 67). Без связи с какой-либо теорией, эти данные свидетельствуют о том, что большинство штаммов KP, а не только те, которые имеют серотипы компонентов OPS, включенных в 12-валентную KP/PA вакцину 1, будут узнаваться антителами, индуцированными вакциной, за счет компонента слитого белка MrkA.The results of the flow cytometry analysis shown in Table 34 and Figure 67 show that antibodies in pooled sera from rabbits immunized with 12-valent KP/
Таблица 34: Результаты определения методом проточной цитометрии связывания сыворотки, индуцированной 12-валентной вакциной 1, со штаммами Table 34: Results of determination by flow cytometry of the binding of serum induced by 12-
Результаты определения способности связывания 4-валентной KP MAPS вакцины с KP, экспрессирующими эпитопы D-Gal-I и D-Gal-III, указывают на то, что 12-валентная KP/PA вакцина обладает потенциалом приводить к выработке антител к эпитопу Gal-III и к предотвращению инфекции, вызываемой KPCR ST 258 клональными штаммами.Results of determining the binding ability of the 4-valent KP MAPS vaccine to KPs expressing D-Gal-I and D-Gal-III epitopes indicate that the 12-valent KP/PA vaccine has the potential to generate antibodies to the Gal-III epitope. and to the prevention of infection caused by KPCR ST 258 clonal strains.
Пример 15: Получение BP-1.2Example 15: Receive BP-1.2
Полезные свойства BP-1 заключаются в наличии остатков биотина, расположенных исключительно на аспекте CPS в BP, что может оказаться предпочтительным с точки зрения характеризации продукта и минимального нарушения эпитопов OPS. Был разработан вариант способа получения такого каркаса, который основан на связывании остатков биотина с CPS в ортогональном участке, с использованием карбоксилатов остатков уроновой кислоты полисахарида вместо альдегида. Эта реакция, которая включает использование карбодиимида (EDC) и N-гидроксисукцинимида (NHS), является в высокой степени управляемой и обеспечивает постоянный уровень биотинилирования в CPS и конечном BP. BP, полученный таким способом, назван BP-1.2. Схема иллюстративного процесса получения BP-1.2 представлена на Фигуре 2B.The beneficial properties of BP-1 are the presence of biotin residues located exclusively on the CPS aspect of the BP, which may be advantageous in terms of product characterization and minimal disruption of OPS epitopes. A variant of the method for obtaining such a scaffold was developed, which is based on the binding of biotin residues to CPS in an orthogonal region, using carboxylates of polysaccharide uronic acid residues instead of aldehyde. This reaction, which includes the use of carbodiimide (EDC) and N-hydroxysuccinimide (NHS), is highly controlled and provides a constant level of biotinylation in CPS and final BP. The BP obtained in this way is called BP-1.2. A diagram of an exemplary process for obtaining BP-1.2 is presented in Figure 2B.
Некоторые из преимуществ данного способа включают обеспечение воспроизводимого биотинилирования с лучшим контролем над уровнем дериватизации биотином и лучшей воспроизводимостью продукта, поскольку все BP происходят из одной и той же партии биотинилированных CPS, результатом чего является стабильное биотинилированное промежуточное соединение, которое можно хранить большими партиями, и возможность достижения более высокого соотношения OPS/CPS в BP, поскольку больше альдегидных групп доступны на CPS, что приводит к меньшей конкуренции за одни и те же сайты связывания.Some of the advantages of this method include providing reproducible biotinylation with better control over the level of biotin derivatization and better product reproducibility since all BPs come from the same batch of biotinylated CPS, resulting in a stable biotinylated intermediate that can be stored in large batches and the ability to achieving a higher OPS/CPS ratio in the BP as more aldehyde groups are available on the CPS resulting in less competition for the same binding sites.
Пример 16: Исследования иммунизации иммуногенными комплексами BP-1 и BP-1.2Example 16 Immunization Studies with BP-1 and BP-1.2 Immunogenic Complexes
4-валентные вакцины готовили в виде либо BP-1 MAPS, либо BP-1.2 MAPS, и формулировали в соответствии с Таблицей 35. Эти композиции вводили кроликам с использованием протоколов, описанных выше, например, в Примерах 6 и 11.Quadruple vaccines were prepared as either MAPS BP-1 or MAPS BP-1.2 and formulated according to Table 35. These formulations were administered to rabbits using the protocols described above, for example, in Examples 6 and 11.
Таблица 35: Совокупные данные о вакцинных препаратах, используемых в сравнительном исследовании для BP-1 и BP-1.2.Table 35: Aggregate data on vaccine formulations used in the comparison study for BP-1 and BP-1.2.
BP-1
5 мкг на дозу PS4-valent KP/PA vaccine
BP-1
5 μg per dose PS
(20 мкг)5 mcg
(20 mcg)
(60 мкг)3:1
(60 mcg)
BP-1.2
5 мкг на дозу PS4-valent KP/PA vaccine
BP-1.2
5 μg per dose PS
(20 мкг)5 mcg
(20 mcg)
(60 мкг)3:1
(60 mcg)
Сильный ответ в виде выработки IgG антител к KP и PA OPS наблюдали в обеих группах BP-1 и BP-1.2. Индивидуальные титры IgG на OPS и CPS K19 для группы 1 и группы 2 представлены на Фигуре 68. Анти-OPS иммунные ответы как на PA O6, так и на PA O11, OPS были эквивалентны для конструктов BP-1 и BP-1.2 MAPS. Аналогично, эквивалентные ответы наблюдали на KP O3 и KP O5 OPS, хотя и значительно более высокие титры в случае KP O3 с конструктом BP-1.2 MAPS (приблизительно в 5-6 раз более высокие средние геометрические значения титра). Титры IgG к K19 CPS были эквивалентны для обоих конструктов BP-1 и BP-1.2 MAPS. Сильный ответ в виде выработки IgG антител к белкам носителям как FlaB-D2, так и MrkA, также наблюдали в обеих группах BP-1 и BP-1.2. Ответы в виде выработки антител (объединенная сыворотка) на оба белка-носителя были сопоставимы в обеих группах BP-1 и BP-1.2 (Фигура 69). Сводные результаты приведены в Таблице 36.A strong response in the form of production of IgG antibodies to KP and PA OPS was observed in both groups BP-1 and BP-1.2. Individual IgG titers for OPS and CPS K19 for
Таблица 36: Сравнение иммуногенности BP-1 MAPS (Группа 1) и BP-1.2 MAPS (Группа 2): IgG-ответ на OPSTable 36: Comparison of the immunogenicity of BP-1 MAPS (Group 1) and BP-1.2 MAPS (Group 2): IgG response to OPS
Индивидуальные титры IgG на OPS и CPS K19 для группы 1 и группы 2 представлены на Фигуре 68. Анти-OPS иммунные ответы как на PA O6, так и на PA O11, OPS были эквивалентны для конструктов BP-1 и BP-1.2 MAPS. Аналогично, эквивалентные ответы наблюдали на KP O3 и KP O5 OPS, хотя и значительно более высокие титры в случае KP O3 с конструктом BP-1.2 MAPS (приблизительно в 5-6 раз более высокие средние геометрические значения титра). Титры IgG к K19 CPS были эквивалентны для обоих конструктов BP-1 и BP-1.2 MAPS.Individual IgG titers for OPS and CPS K19 for
В исследовании NCB013 было проведено сравнение 2-валентных KP/PA вакцин с BP-1 (каркас 1) и BP-1.2 (каркас 1.2) у кроликов (смотри также Таблицу 35 для информации о вакцинных препаратах). На Фигуре 70 и Фигуре 71 показаны индивидуальные ответы в виде выработки антител на два белка-носителя FlaBD2 и MrkA в случае BP-1 и BP-1.2 (KP/PA, 4-валентная), соответственно. Значительное увеличение титров антител наблюдали после первой иммунизации в случае обоих белков-носителей и обоих каркасов. Титры антител дополнительно возрастали после второй иммунизации. Наблюдали сильный ответ в виде выработки антител в группах для обоих белков FlaBD2 и MrkA, и обоих каркасов BP-1 и BP-1.2, и выработка антител к обоим белкам была сопоставимой в группах BP-1 и BP-1.2.Study NCB013 compared 2-valent KP/PA vaccines with BP-1 (framework 1) and BP-1.2 (framework 1.2) in rabbits (see also Table 35 for information on vaccine preparations). Figure 70 and Figure 71 show individual antibody responses to the two carrier proteins FlaBD2 and MrkA for BP-1 and BP-1.2 (KP/PA, 4-valent), respectively. A significant increase in antibody titers was observed after the first immunization for both carrier proteins and both scaffolds. Antibody titers increased further after the second immunization. A strong response in the form of antibody production in the groups for both FlaBD2 and MrkA proteins, and both scaffolds BP-1 and BP-1.2 was observed, and the production of antibodies to both proteins was comparable in groups BP-1 and BP-1.2.
ПоследовательностиSequences
ЛитератураLiterature
Agodi A, Voulgari E, Barchitta M, Politi L, Koumaki V, et al. Containment of an outbreak of KPC-3-producing Klebsiella pneumoniae in Italy. J Clin Microbiol. 2011 Nov;49(11):3986-9. Agodi A, Voulgari E, Barchitta M, Politi L, Koumaki V, et al. Containment of an outbreak of KPC-3-producing Klebsiella pneumoniae in Italy. J Clin Microbiol. 2011 Nov;49(11):3986-9.
Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ. Basic local alignment search tool. J Mol Biol. 1990 Oct 5;215(3):403-10.Altschul SF, Gish W, Miller W, Myers EW, Lipman DJ. Basic local alignment search tool. J Mol Biol. 1990
Altschul SF, Madden TL, Schäffer AA, Zhang J, Zhang Z, et al. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Res. 1997 Sep 1;25(17):3389-402.Altschul SF, Madden TL, Schäffer AA, Zhang J, Zhang Z, et al. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Res. 1997
Andreasen C., Powell DA., Carbonetti N. Pertussis Toxin Stimulates IL-17 Production in Response to Bordetella pertussis Infection in Mice. PloS One 2009 4:Issue 9 e7079.Andreasen C., Powell DA., Carbonetti N. Pertussis Toxin Stimulates IL-17 Production in Response to Bordetella pertussis Infection in Mice. PloS One 2009 4:
Anttila M, Eskola J, Ahman H, Käyhty H. Avidity of IgG for Streptococcus pneumoniae type 6B and 23F polysaccharides in infants primed with pneumococcal conjugates and boosted with polysaccharide or conjugate vaccines. J Infect Dis. 1998 Jun;177(6):1614-21.Anttila M, Eskola J, Ahman H, Käyhty H. Avidity of IgG for
Baer M, Sawa T, Flynn P, Luehrsen K, Martinez D, et al. An engineered human antibody fab fragment specific for Pseudomonas aeruginosa PcrV antigen has potent antibacterial activity. Infect Immun. 2009 Mar;77(3):1083-90.Baer M, Sawa T, Flynn P, Luehrsen K, Martinez D, et al. An engineered human antibody fab fragment specific for Pseudomonas aeruginosa PcrV antigen has potent antibacterial activity. Infect Immun. 2009 Mar;77(3):1083-90.
Baraniak, A., Grabowska, A., Izdebski, R., Fiett, J., Herda, M., Bojarska, K., Zabicka, D., Kania-Pudlo, M., Mlynarczyk, G., Zak-Pulawska, Z., Hryniewicz, W., Gniadkowski, M., 2011. Molecular characteristics of KPC-producing Enterobacteriaceae at the early stage of their dissemination in Poland, 2008-2009. Antimicrob. Agents Chemother. 55, 5493-5499.Baraniak, A., Grabowska, A., Izdebski, R., Fiett, J., Herda, M., Bojarska, K., Zabicka, D., Kania-Pudlo, M., Mlynarczyk, G., Zak-Pulawska , Z., Hryniewicz, W., Gniadkowski, M., 2011. Molecular characteristics of KPC-producing Enterobacteriaceae at the early stage of their dissemination in Poland, 2008-2009. Antimicrob. Agents Chemother. 55, 5493-5499.
Barnea Y, Carmeli Y, Gur E, Kuzmenko B, Gat A, et al. Efficacy of antibodies against the N-terminal of Pseudomonas aeruginosa flagellin for treating infections in a murine burn wound model. Plast Reconstr Surg. 2006 Jun;117(7):2284-91.Barnea Y, Carmeli Y, Gur E, Kuzmenko B, Gat A, et al. Efficacy of antibodies against the N-terminal of Pseudomonas aeruginosa flagellin for treating infections in a murine burn wound model. Plast Reconstr Surg. 2006 Jun;117(7):2284-91.
Barnea Y, Carmeli Y, Neville LF, Kahel-Reifer H, Eren R, et al. Therapy with anti-flagellin A monoclonal antibody limits Pseudomonas aeruginosa invasiveness in a mouse burn wound sepsis model. Burns. 2009 May;35(3):390-6.Barnea Y, Carmeli Y, Neville LF, Kahel-Reifer H, Eren R, et al. Therapy with anti-flagellin A monoclonal antibody limits Pseudomonas aeruginosa invasiveness in a mouse burn wound sepsis model. Burns. 2009 May;35(3):390-6.
Baumgartner JD. Monoclonal anti-endotoxin antibodies for the treatment of gram-negative bacteremia and septic shock. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 1990 Oct;9(10):711-6.Baumgartner JD. Monoclonal anti-endotoxin antibodies for the treatment of gram-negative bacteremia and septic shock. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 1990 Oct;9(10):711-6.
Baxevanis AD and Ouellette BF, Eds., Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. New York, NY: Wiley-Interscience, 1998. Baxevanis AD and Ouellette BF, Eds., Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. New York, NY: Wiley-Interscience, 1998.
Bergogne-Bérézin E. [Nosocomial infections: new agents, incidence, prevention]. Presse Med. 1995 Jan 14;24(2):89-97. Review. French.Bergogne-Bérézin E. [Nosocomial infections: new agents, incidence, prevention]. Press Med. 1995
Brisse S. et al., wzi Gene Sequencing, a Rapid Method for Determination of Capsular Type for Klebsiella Strains. J Clin Microbiol. 2013 51(12):4073-4078.Brisse S. et al., wzi Gene Sequencing, a Rapid Method for Determination of Capsular Type for Klebsiella Strains. J Clin Microbiol. 2013 51(12):4073-4078.
Bryan CS, Reynolds KL, Brenner ER. Analysis of 1,186 episodes of gram-negative bacteremia in non-university hospitals: the effects of antimicrobial therapy. Rev Infect Dis. 1983 Jul-Aug;5(4):629-38.Bryan CS, Reynolds KL, Brenner ER. Analysis of 1,186 episodes of gram-negative bacteremia in non-university hospitals: the effects of antimicrobial therapy. Rev Infect Dis. 1983 Jul-Aug;5(4):629-38.
Burmølle M, Bahl MI, Jensen LB, Sørensen SJ, Hansen LH. Type 3 fimbriae, encoded by the conjugative plasmid pOLA52, enhance biofilm formation and transfer frequencies in Enterobacteriaceae strains. Microbiology. 2008 Jan;154(Pt 1):187-95. Burmølle M, Bahl MI, Jensen LB, Sørensen SJ, Hansen LH.
Campodónico VL, Llosa NJ, Grout M, Döring G, Maira-Litrán T, et al. Evaluation of flagella and flagellin of Pseudomonas aeruginosa as vaccines. Infect Immun. 2010 Feb;78(2):746-55.Campodónico VL, Llosa NJ, Grout M, Döring G, Maira-Litrán T, et al. Evaluation of flagella and flagellin of Pseudomonas aeruginosa as vaccines. Infect Immun. 2010 Feb;78(2):746-55.
Campodónico VL, Llosa NJ, Bentancor LV, Maira-Litran T, Pier GB. Efficacy of a conjugate vaccine containing polymannuronic acid and flagellin against experimental Pseudomonas aeruginosa lung infection in mice. Infect Immun. 2011 Aug;79(8):3455-64.Campodónico VL, Llosa NJ, Bentancor LV, Maira-Litran T, Pier GB. Efficacy of a conjugate vaccine containing polymannuronic acid and flagellin against experimental Pseudomonas aeruginosa lung infection in mice. Infect Immun. 2011 Aug;79(8):3455-64.
Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Antibiotic Resistance Threats in the United States, 2013. http://www.cdc.gov/drugresistance/pdf/ar-threats-2013-508.pdf. 2013.Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Antibiotic Resistance Threats in the United States, 2013. http://www.cdc.gov/drugresistance/pdf/ar-threats-2013-508.pdf. 2013.
Chaloupka I, Schuler A, Marschall M, Meier-Ewert H. Comparative analysis of six European influenza vaccines. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 1996 Feb;15(2):121-7.Chaloupka I, Schuler A, Marschall M, Meier-Ewert H. Comparative analysis of six European influenza vaccines. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 1996 Feb;15(2):121-7.
Chang HH, Cohen T, Grad YH, Hanage WP, O'Brien TF, et al. Origin and proliferation of multiple-drug resistance in bacterial pathogens. Microbiol Mol Biol Rev. 2015 Mar;79(1):101-16.Chang HH, Cohen T, Grad YH, Hanage WP, O'Brien TF, et al. Origin and proliferation of multiple-drug resistance in bacterial pathogens. Microbiol Mol Biol Rev. 2015 Mar;79(1):101-16.
Chen K, McAleer JP, Lin Y, Paterson DL, Zheng M, et al. Th17 cells mediate clade-specific, serotype-independent mucosal immunity. Immunity. 2011 Dec 23;35(6):997-1009.Chen K, McAleer JP, Lin Y, Paterson DL, Zheng M, et al. Th17 cells mediate clade-specific, serotype-independent mucosal immunity. immunity. 2011 Dec 23;35(6):997-1009.
Chen, L., Chavda, K.D., Findlay, J., Peirano, G., Hopkins, K., Pitout, J.D., Bonomo, R.A., Woodford, N., DeLeo, F.R., Kreiswirth, B.N., 2014a. Multiplex PCR for identification of two capsular types in epidemic KPC-producing Klebsiella pneumoniae sequence Type 258 strains. Antimicrob. Agents Chemother. 58, 4196-4199.Chen, L., Chavda, KD, Findlay, J., Peirano, G., Hopkins, K., Pitout, JD, Bonomo, RA, Woodford, N., DeLeo, FR, Kreiswirth, BN, 2014a. Multiplex PCR for identification of two capsular types in epidemic KPC-producing Klebsiella pneumoniae sequence Type 258 strains. Antimicrob. Agents Chemother. 58, 4196-4199.
Chen, L., Mathema, B., Pitout, J.D., DeLeo, F.R., Kreiswirth, B.N., 2014b. Epidemic Klebsiella pneumoniae ST258 is a hybrid strain. mBio 5, e01355-14.Chen, L., Mathema, B., Pitout, J.D., DeLeo, F.R., Kreiswirth, B.N., 2014b. Epidemic Klebsiella pneumoniae ST258 is a hybrid strain.
Clegg S, Gerlach G F. Enterobacterial fimbriae. J Bacteriol. 1987;169:934-938.Clegg S, Gerlach G F. Enterobacterial fimbriae. J Bacteriol. 1987;169:934-938.
Clements A, Gaboriaud F, Duval JF, Farn JL, Jenney AW, et al. The major surface-associated saccharides of Klebsiella pneumoniae contribute to host cell association. PLoS One. 2008;3(11):e3817.Clements A, Gaboriaud F, Duval JF, Farn JL, Jenney AW, et al. The major surface-associated saccharides of Klebsiella pneumoniae contribute to host cell association. PLOS One. 2008;3(11):e3817.
Collignon P. Resistant Escherichia coli--we are what we eat. Clin Infect Dis. 2009 Jul 15;49(2):202-4.Collignon P. Resistant Escherichia coli --we are what we eat. Clin Infect Dis. 2009
Concepcion NF, Frasch CE. Pneumococcal type 22f polysaccharide absorption improves the specificity of a pneumococcal-polysaccharide enzyme-linked immunosorbent assay. Clin Diagn Lab Immunol. 2001 Mar;8(2):266-72.Conception NF, Frasch CE. Pneumococcal type 22f polysaccharide absorption improves the specificity of a pneumococcal-polysaccharide enzyme-linked immunosorbent assay. Clin Diagn Lab Immunol. 2001 Mar;8(2):266-72.
Cross AS, Zollinger W, Mandrell R, Gemski P, Sadoff J. Evaluation of immunotherapeutic approaches for the potential treatment of infections caused by K1-positive Escherichia coli. J Infect Dis. 1983 Jan;147(1):68-76.Cross AS, Zollinger W, Mandrell R, Gemski P, Sadoff J. Evaluation of immunotherapeutic approaches for the potential treatment of infections caused by K1-positive Escherichia coli . J Infect Dis. 1983 Jan;147(1):68-76.
Cross AS, Gemski P, Sadoff JC, Orskov F, Orskov I. The importance of the K1 capsule in invasive infections caused by Escherichia coli. J Infect Dis. 1984 Feb;149(2):184-93.Cross AS, Gemski P, Sadoff JC, Orskov F, Orskov I. The importance of the K1 capsule in invasive infections caused by Escherichia coli . J Infect Dis. 1984 Feb;149(2):184-93.
Cross AS, Kim KS, Wright DC, Sadoff JC, Gemski P. Role of lipopolysaccharide and capsule in the serum resistance of bacteremic strains of Escherichia coli. J Infect Dis. 1986 Sep; 154(3):497-503.Cross AS, Kim KS, Wright DC, Sadoff JC, Gemski P. Role of lipopolysaccharide and capsule in the serum resistance of bacteremic strains of Escherichia coli. J Infect Dis. 1986 Sep; 154(3):497-503.
Cross A, Artenstein A, Que J, Fredeking T, Furer E, et al. Safety and immunogenicity of a polyvalent Escherichia coli vaccine in human volunteers. J Infect Dis. 1994 Oct;170(4):834-40.Cross A, Artenstein A, Que J, Fredeking T, Furer E, et al. Safety and immunogenicity of a polyvalent Escherichia coli vaccine in human volunteers. J Infect Dis. 1994 Oct;170(4):834-40.
Crowe BA, Enzersberger O, Schober-Bendixen S, Mitterer A, Mundt W, et al. The first clinical trial of immuno's experimental Pseudomonas aeruginosa flagellar vaccines. Antibiot Chemother (1971). 1991;44:143-56.Crowe BA, Enzersberger O, Schober-Bendixen S, Mitterer A, Mundt W, et al. The first clinical trial of immuno's experimental Pseudomonas aeruginosa flagellar vaccines. Antibiot Chemother (1971). 1991;44:143-56.
Cryz SJ Jr, Fürer E, Germanier R. Protection against fatal Pseudomonas aeruginosa burn wound sepsis by immunization with lipopolysaccharide and high-molecular-weight polysaccharide. Infect Immun. 1984 Mar;43(3):795-9.Cryz SJ Jr, Fürer E, Germanier R. Protection against fatal Pseudomonas aeruginosa burn wound sepsis by immunization with lipopolysaccharide and high-molecular-weight polysaccharide. Infect Immun. 1984 Mar;43(3):795-9.
Cryz S J, Jr, Fürer E, Germanier R. Safety and immunogenicity of Klebsiella pneumoniae K1 capsular polysaccharide vaccine in humans. J Infect Dis. 1985;151:665-671.Cryz SJ, Jr, Fürer E, Germanier R. Safety and immunogenicity of Klebsiella pneumoniae K1 capsular polysaccharide vaccine in humans. J Infect Dis. 1985;151:665-671.
Cryz SJ Jr, Mortimer P, Cross AS, Fürer E, Germanier R. Safety and immunogenicity of a polyvalent Klebsiella capsular polysaccharide vaccine in humans. Vaccine. 1986 Mar; 4(1):15-20.Cryz SJ Jr, Mortimer P, Cross AS, Fürer E, Germanier R. Safety and immunogenicity of a polyvalent Klebsiella capsular polysaccharide vaccine in humans. Vaccine. 1986 Mar; 4(1):15-20.
Cryz SJ Jr, Mortimer PM, Mansfield V, Germanier R. Seroepidemiology of Klebsiella bacteremic isolates and implications for vaccine development. J Clin Microbiol. 1986 Apr; 23(4):687-90.Cryz SJ Jr, Mortimer PM, Mansfield V, Germanier R. Seroepidemiology of Klebsiella bacteremic isolates and implications for vaccine development. J Clin Microbiol. 1986 Apr; 23(4):687-90.
Cryz SJ Jr, Wedgwood J, Lang AB, Ruedeberg A, Que JU, et al. Immunization of noncolonized cystic fibrosis patients against Pseudomonas aeruginosa. J Infect Dis. 1994 May; 169(5):1159-62.Cryz SJ Jr, Wedgwood J, Lang AB, Ruedeberg A, Que JU, et al. Immunization of noncolonized cystic fibrosis patients against Pseudomonas aeruginosa . J Infect Dis. May 1994; 169(5):1159-62.
DeLeo, F.R., Chen, L., Porcella, S.F., Martens, C.A., Kobayashi, S.D., Porter, A.R., Chavda, K.D., Jacobs, M.R., Mathema, B., Olsen, R.J., Bonomo, R.A., Musser, J.M., Kreiswirth, B.N., 2014. Molecular dissection of the evolution of carbapenem-resistant multilocus sequence type 258 Klebsiella pneumoniae. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A 111, 4988-4993.DeLeo, FR, Chen, L., Porcella, SF, Martens, CA, Kobayashi, SD, Porter, AR, Chavda, KD, Jacobs, MR, Mathema, B., Olsen, RJ, Bonomo, RA, Musser, JM, Kreiswirth, BN, 2014. Molecular dissection of the evolution of carbapenem-resistant multilocus sequence type 258 Klebsiella pneumoniae . Proc. Natl. Acad. sci. US A 111, 4988-4993.
Deng JC, Moore TA, Newstead MW, Zeng X, Krieg AM, et al. CpG oligodeoxynucleotides stimulate protective innate immunity against pulmonary Klebsiella infection. J Immunol. 2004 Oct 15;173(8):5148-55.Deng JC, Moore TA, Newstead MW, Zeng X, Krieg AM, et al. CpG oligodeoxynucleotides stimulate protective innate immunity against pulmonary Klebsiella infection. J Immunol. 2004
DiGiandomenico A, Sellman BR. Antibacterial monoclonal antibodies: the next generation?. Curr Opin Microbiol. 2015 Oct; 27:78-85.DiGiandomenico A, Sellman BR. Antibacterial monoclonal antibodies: the next generation?. Curr Opin Microbiol. 2015 Oct; 27:78-85.
DiGiandomenico A, Rao J, Goldberg JB. Oral vaccination of BALB/c mice with Salmonella enterica serovar Typhimurium expressing Pseudomonas aeruginosa O antigen promotes increased survival in an acute fatal pneumonia model. Infect Immun. 2004 Dec;72(12):7012-21.DiGiandomenico A, Rao J, Goldberg JB. Oral vaccination of BALB/c mice with Salmonella enterica serovar Typhimurium expressing Pseudomonas aeruginosa O antigen promotes increased survival in an acute fatal pneumonia model. Infect Immun. 2004 Dec;72(12):7012-21.
DiGiandomenico A, Rao J, Harcher K, Zaidi TS, Gardner J, et al. Intranasal immunization with heterologously expressed polysaccharide protects against multiple Pseudomonas aeruginosa infections. Proc Natl Acad Sci U S A. 2007 Mar 13;104(11):4624-9.DiGiandomenico A, Rao J, Harcher K, Zaidi TS, Gardner J, et al. Intranasal immunization with heterologously expressed polysaccharide protects against multiple Pseudomonas aeruginosa infections. Proc Natl Acad Sci US A. 2007
DiGiandomenico A, Warrener P, Hamilton M, Guillard S, Ravn P, et al. Identification of broadly protective human antibodies to Pseudomonas aeruginosa exopolysaccharide Psl by phenotypic screening. J Exp Med. 2012 Jul 2;209(7):1273-87.DiGiandomenico A, Warrener P, Hamilton M, Guillard S, Ravn P, et al. Identification of broadly protective human antibodies to Pseudomonas aeruginosa exopolysaccharide Psl by phenotypic screening. J Exp Med. 2012
DiGiandomenico A, Keller AE, Gao C, Rainey GJ, Warrener P, et al. A multifunctional bispecific antibody protects against Pseudomonas aeruginosa. Sci Transl Med. 2014 Nov 12;6(262):262ra155.DiGiandomenico A, Keller AE, Gao C, Rainey GJ, Warrener P, et al. A multifunctional bispecific antibody protects against Pseudomonas aeruginosa . Sci Transl Med. 2014
Domenico P, Schwartz S, Cunha BA. Reduction of capsular polysaccharide production in Klebsiella pneumoniae by sodium salicylate. Infect Immun. 1989 Dec;57(12):3778-82.Domenico P, Schwartz S, Cunha BA. Reduction of capsular polysaccharide production in Klebsiella pneumoniae by sodium salicylate. Infect Immun. 1989 Dec;57(12):3778-82.
Döring G, Dorner F. A multicenter vaccine trial using the Pseudomonas aeruginosa flagella vaccine IMMUNO in patients with cystic fibrosis. Behring Inst Mitt. 1997 Feb; Döring G, Dorner F. A multicenter vaccine trial using the Pseudomonas aeruginosa flagella vaccine IMMUNO in patients with cystic fibrosis. Behring Inst Mitt. Feb 1997;
Döring G, Pier GB. Vaccines and immunotherapy against Pseudomonas aeruginosa. Vaccine. 2008 Feb 20;26(8):1011-24.Döring G, Pier GB. Vaccines and immunotherapy against Pseudomonas aeruginosa . Vaccine. 2008
Döring G, Pfeiffer C, Weber U, Mohr-Pennert A, Dorner F. Parenteral application of a Pseudomonas aeruginosa flagella vaccine elicits specific anti-flagella antibodies in the airways of healthy individuals. Am J Respir Crit Care Med. 1995 Apr;151(4):983-5.Döring G, Pfeiffer C, Weber U, Mohr-Pennert A, Dorner F. Parenteral application of a Pseudomonas aeruginosa flagella vaccine elicits specific anti-flagella antibodies in the airways of healthy individuals. Am J Respir Crit Care Med. 1995 Apr;151(4):983-5.
Döring G, Meisner C, Stern M. A double-blind randomized placebo-controlled phase III study of a Pseudomonas aeruginosa flagella vaccine in cystic fibrosis patients. Proc Natl Acad Sci U S A. 2007 Jun 26;104(26):11020-5.Döring G, Meisner C, Stern M. A double-blind randomized placebo-controlled phase III study of a Pseudomonas aeruginosa flagella vaccine in cystic fibrosis patients. Proc Natl Acad Sci US A. 2007
Du H, Chen L, Tang YW, Kreiswirth BN. Emergence of the mcr-1 colistin resistance gene in carbapenem-resistant Enterobacteriaceae. Lancet Infect Dis. 2016 Mar;16(3):287-8.Du H, Chen L, Tang YW, Kreiswirth BN. Emergence of the mcr-1 colistin resistance gene in carbapenem-resistant Enterobacteriaceae. Lancet Infect Dis.
Edelman R, Taylor DN, Wasserman SS, McClain JB, Cross AS, et al. Phase 1 trial of a 24-valent Klebsiella capsular polysaccharide vaccine and an eight-valent Pseudomonas O-polysaccharide conjugate vaccine administered simultaneously. Vaccine. 1994 Nov;12(14):1288-94.Edelman R, Taylor DN, Wasserman SS, McClain JB, Cross AS, et al.
Faezi S, Sattari M, Mahdavi M, Roudkenar MH. Passive immunisation against Pseudomonas aeruginosa recombinant flagellin in an experimental model of burn wound sepsis. Burns. 2011 Aug; 37(5):865-72. Faezi S, Sattari M, Mahdavi M, Roudkenar MH. Passive immunization against Pseudomonas aeruginosa recombinant flagellin in an experimental model of burn wound sepsis. Burns. 2011 Aug; 37(5):865-72.
Faezi S, Safarloo M, Amirmozafari N, Nikokar I, Siadat SD, et al. Protective efficacy of Pseudomonas aeruginosa type-A flagellin in the murine burn wound model of infection. APMIS. 2014 Feb;122(2):115-27.Faezi S, Safarloo M, Amirmozafari N, Nikokar I, Siadat SD, et al. Protective efficacy of Pseudomonas aeruginosa type-A flagellin in the murine burn wound model of infection. APMIS. 2014 Feb;122(2):115-27.
Feldman MF, Wacker M, Hernandez M, Hitchen PG, Marolda CL, et al. Engineering N-linked protein glycosylation with diverse O antigen lipopolysaccharide structures in Escherichia coli. Proc Natl Acad Sci U S A. 2005 Feb 22;102(8):3016-21.Feldman MF, Wacker M, Hernandez M, Hitchen PG, Marolda CL, et al. Engineering N-linked protein glycosylation with diverse O antigen lipopolysaccharide structures in Escherichia coli . Proc Natl Acad Sci US A. 2005
Fine PE. Herd immunity: history, theory, practice. Epidemiol Rev. 1993;15(2):265-302.fine PE. Herd immunity: history, theory, practice. Epidemiol Rev. 1993;15(2):265-302.
Foglia G, Shah S, Luxemburger C, Pietrobon PJ. Clostridium difficile: development of a novel candidate vaccine. Vaccine. 2012 Jun 19;30(29):4307-9.Foglia G, Shah S, Luxemburger C, Pietrobon PJ. Clostridium difficile : development of a novel candidate vaccine. Vaccine. 2012 Jun 19;30(29):4307-9.
Fowler VG Jr, Proctor RA. Where does a Staphylococcus aureus vaccine stand?. Clin Microbiol Infect. 2014 May; 20 Suppl 5:66-75.Fowler VG Jr, Proctor RA. Where does a Staphylococcus aureus vaccine stand?. Clin Microbiol Infect. May 2014; 20 Suppl 5:66-75.
B, Luyt CE, Dugard A, Wolff M, Diehl JL, et al. Safety and pharmacokinetics of an anti-PcrV PEGylated monoclonal antibody fragment in mechanically ventilated patients colonized with Pseudomonas aeruginosa: a randomized, double-blind, placebo-controlled trial. Crit Care Med. 2012 Aug; 40(8):2320-6. B, Luyt CE, Dugard A, Wolff M, Diehl JL, et al. Safety and pharmacokinetics of an anti-PcrV PEGylated monoclonal antibody fragment in mechanically ventilated patients colonized with Pseudomonas aeruginosa : a randomized, double-blind, placebo-controlled trial. Crit Care Med. 2012 Aug; 40(8):2320-6.
Frank DW, Vallis A, Wiener-Kronish JP, Roy-Burman A, Spack EG, et al. Generation and characterization of a protective monoclonal antibody to Pseudomonas aeruginosa PcrV. J Infect Dis. 2002 Jul 1;186(1):64-73.Frank DW, Vallis A, Wiener-Kronish JP, Roy-Burman A, Spack EG, et al. Generation and characterization of a protective monoclonal antibody to Pseudomonas aeruginosa PcrV. J Infect Dis. 2002
Galanos C, Freudenberg MA, Reutter W. Galactosamine-induced sensitization to the lethal effects of endotoxin. Proc Natl Acad Sci U S A. 1979 Nov;76(11):5939-43.Galanos C, Freudenberg MA, Reutter W. Galactosamine-induced sensitization to the lethal effects of endotoxin. Proc Natl Acad Sci U S A. 1979 Nov;76(11):5939-43.
Gerding DN, Meyer T, Lee C, Cohen SH, Murthy UK, et al. Administration of spores of nontoxigenic Clostridium difficile strain M3 for prevention of recurrent C difficile infection: a randomized clinical trial. JAMA. 2015 May 5;313(17):1719-27.Gerding DN, Meyer T, Lee C, Cohen SH, Murthy UK, et al. Administration of spores of nontoxigenic Clostridium difficile strain M3 for prevention of recurrent C difficile infection: a randomized clinical trial. JAMA. 2015 May 5;313(17):1719-27.
Gerlach GF, Clegg S, Allen BL. Identification and characterization of the genes encoding the type 3 and type 1 fimbrial adhesins of Klebsiella pneumoniae. J Bacteriol. 1989 Mar;171(3):1262-70.Gerlach GF, Clegg S, Allen BL. Identification and characterization of the genes encoding the
Giakkoupi, P., Papagiannitsis, C.C., Miriagou, V., Pappa, O., Polemis, M., Tryfinopoulou, K., Tzouvelekis, L.S., Vatopoulos, A.C., 2011. An update of the evolving epidemic of blaKPC-2-carrying Klebsiella pneumoniae in Greece (2009-10). J. Antimicrob. Chemother. 66, 1510-1513.Giakkoupi, P., Papagiannitsis, CC, Miriagou, V., Pappa, O., Polemis, M., Tryfinopoulou, K., Tzouvelekis, LS, Vatopoulos, AC, 2011. An update of the evolving epidemic of blaKPC-2- carrying Klebsiella pneumoniae in Greece (2009-10). J. Antimicrob. Chemother. 66, 1510-1513.
Giani, T., Pini, B., Arena, F., Conte, V., Bracco, S., Migliavacca, R., Pantosti, A., Pagani, L., Luzzaro, F., Rossolini, G.M., 2013. Epidemic diffusion of KPC carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae in Italy: results of the first countrywide survey, 15 May to 30 June 2011. Eurosurveillance, 18.Giani, T., Pini, B., Arena, F., Conte, V., Bracco, S., Migliavacca, R., Pantosti, A., Pagani, L., Luzzaro, F., Rossolini, GM, 2013 Epidemic diffusion of KPC carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae in Italy: results of the first countrywide survey, 15 May to 30 June 2011. Eurosurveillance, 18.
Gransden WR, Eykyn SJ, Phillips I, Rowe B. Bacteremia due to Escherichia coli: a study of 861 episodes. Rev Infect Dis. 1990 Nov-Dec; 12(6):1008-18.Gransden WR, Eykyn SJ, Phillips I, Rowe B. Bacteremia due to Escherichia coli : a study of 861 episodes. Rev Infect Dis. 1990 Nov-Dec; 12(6):1008-18.
Greenberger MJ, Kunkel SL, Strieter RM, Lukacs NW, Bramson J, et al. IL-12 gene therapy protects mice in lethal Klebsiella pneumonia. J Immunol. 1996 Oct 1;157(7):3006-12.Greenberger MJ, Kunkel SL, Strieter RM, Lukacs NW, Bramson J, et al. IL-12 gene therapy protects mice in lethal Klebsiella pneumonia . J Immunol. 1996
Hansen DS, Mestre F, Alberti S, Hernández-Allés S, Alvarez D, et al. Klebsiella pneumoniae lipopolysaccharide O typing: revision of prototype strains and O-group distribution among clinical isolates from different sources and countries. J Clin Microbiol. 1999 Jan; 37(1):56-62. Hansen DS, Mestre F, Alberti S, Hernández-Allés S, Alvarez D, et al. Klebsiella pneumoniae lipopolysaccharide O typing: revision of prototype strains and O-group distribution among clinical isolates from different sources and countries. J Clin Microbiol. 1999 Jan; 37(1):56-62.
Henriques-Normark B, Normark S. Bacterial vaccines and antibiotic resistance. Ups J Med Sci. 2014 May;119(2):205-8.Henriques-Normark B, Normark S. Bacterial vaccines and antibiotic resistance. Ups J Med Sci. May 2014;119(2):205-8.
Holder IA, Naglich JG. Experimental studies of the pathogenesis of infections due to Pseudomonas aeruginosa: immunization using divalent flagella preparations. J Trauma. 1986 Feb;26(2):118-22.Holder IA, Naglich JG. Experimental studies of the pathogenesis of infections due to Pseudomonas aeruginosa : immunization using divalent flagella preparations. J Trauma. 1986 Feb;26(2):118-22.
Holder IA, Wheeler R, Montie TC. Flagellar preparations from Pseudomonas aeruginosa: animal protection studies. Infect Immun. 1982 Jan;35(1):276-80.Holder IA, Wheeler R, Montie TC. Flagellar preparations from Pseudomonas aeruginosa : animal protection studies. Infect Immun. 1982 Jan;35(1):276-80.
Holder IA, Neely AN, Frank DW. PcrV immunization enhances survival of burned Pseudomonas aeruginosa-infected mice. Infect Immun. 2001 Sep;69(9):5908-10.Holder IA, Neely AN, Frank DW. PcrV immunization enhances survival of burned Pseudomonas aeruginosa -infected mice. Infect Immun. 2001 Sep;69(9):5908-10.
Holliger P, Prospero T, Winter G. "Diabodies": small bivalent and bispecific antibody fragments. Proc Natl Acad Sci U S A. 1993 Jul 15;90(14):6444-8.Holliger P, Prospero T, Winter G. "Diabodies": small bivalent and bispecific antibody fragments. Proc Natl Acad Sci U S A. 1993
Horan T, Culver D, Jarvis W, Emori G, Banerjee S, Martone W, Thornsberry C. Pathogens Causing Nosocomial Infections. Antimicrobic Newsl. 1988 Sep;5(9):65-68.Horan T, Culver D, Jarvis W, Emori G, Banerjee S, Martone W, Thornsberry C. Pathogens Causing Nosocomial Infections. Antimicrobial Newsl. 1988 Sep;5(9):65-68.
Hornick DB, Allen BL, Horn MA, Clegg S. Adherence to respiratory epithelia by recombinant Escherichia coli expressing Klebsiella pneumoniae type 3 fimbrial gene products. Infect Immun. 1992 Apr;60(4):1577-88.Hornick DB, Allen BL, Horn MA, Clegg S. Adherence to respiratory epithelia by recombinant Escherichia coli expressing
Hu R. et al., Outer Membrane Protein A (OmpA) Conferred Immunoprotection against Enterobacteriaceae Infection in Mice. Israel Journal of Veterinary Medicine. 2103. Vol. 68 (1):48-55.Hu R. et al., Outer Membrane Protein A (OmpA) Conferred Immunoprotection against Enterobacteriaceae Infection in Mice. Israel Journal of Veterinary Medicine. 2103. Vol. 68(1):48-55.
Jansen KU, Girgenti DQ, Scully IL, Anderson AS. Vaccine review: "Staphyloccocus aureus vaccines: problems and prospects". Vaccine. 2013 Jun 7;31(25):2723-30.Jansen KU, Girgenti DQ, Scully IL, Anderson AS. Vaccine review: " Staphyloccocus aureus vaccines: problems and prospects". Vaccine. 2013
Jones RJ, Roe EA, Lowbury EJ, Miler JJ, Spilsbury JF. A new Pseudomonas vaccine: preliminary trial on human volunteers. J Hyg (Lond). 1976 Jun;76(3):429-39.Jones RJ, Roe EA, Lowbury EJ, Miler JJ, Spilsbury JF. A new Pseudomonas vaccine: preliminary trial on human volunteers. J Hyg (Lond). 1976 Jun;76(3):429-39.
Jones RJ, Roe EA, Gupta JL. Low mortality in burned patients in a Pseudomonas vaccine trial. Lancet. 1978 Aug 19;2(8086):401-3.Jones RJ, Roe EA, Gupta JL. Low mortality in burned patients in a Pseudomonas vaccine trial. Lancet. 1978 Aug 19;2(8086):401-3.
Jones RJ, Roe EA, Gupta JL. Controlled trials of a polyvalent pseudomonas vaccine in burns. Lancet. 1979 Nov 10;2(8150):977-82.Jones RJ, Roe EA, Gupta JL. Controlled trials of a polyvalent pseudomonas vaccine in burns. Lancet. 1979
Jones RJ, Roe EA, Gupta JL. Controlled trial of Pseudomonas immunoglobulin and vaccine in burn patients. Lancet. 1980 Dec 13;2(8207):1263-5.Jones RJ, Roe EA, Gupta JL. Controlled trial of Pseudomonas immunoglobulin and vaccine in burn patients. Lancet. 1980
Kaijser B, Ahlstedt S. Protective capacity of antibodies against Escherichia coli and K antigens. Infect Immun. 1977 Aug; 17(2):286-9.Kaijser B, Ahlstedt S. Protective capacity of antibodies against Escherichia coli and K antigens. Infect Immun. 1977 Aug; 17(2):286-9.
Kelly, RF et al., 1995. Structures of the O-antigens of Klebsiella serotypes 02 (2a,2e), 02 (2a,2e,2h), and 02 (2a,2f,2g), members of a family of related D-galactan O-antigens in Klebsiella spp. J. Endotoxin Res. 2:131-140.Kelly, RF et al., 1995. Structures of the O-antigens of Klebsiella serotypes 02 (2a,2e), 02 (2a,2e,2h), and 02 (2a,2f,2g), members of a family of related D-galactan O-antigens in Klebsiella spp. J. Endotoxin Res. 2:131-140.
Kim KH, Yu J, Nahm MH. Efficiency of a pneumococcal opsonophagocytic killing assay improved by multiplexing and by coloring colonies. Clin Diagn Lab Immunol. 2003 Jul; 10(4):616-21.Kim KH, Yu J, Nahm MH. Efficiency of a pneumococcal opsonophagocytic killing assay improved by multiplexing and by coloring colonies. Clin Diagn Lab Immunol. 2003 Jul; 10(4):616-21.
Knirel YA, Bystrova OV, Kocharova NA, Zähringer U, Pier GB. Conserved and variable structural features in the lipopolysaccharide of Pseudomonas aeruginosa. J Endotoxin Res. 2006;12(6):324-36.Knirel YA, Bystrova OV, Kocharova NA, Zahringer U, Pier GB. Conserved and variable structural features in the lipopolysaccharide of Pseudomonas aeruginosa . J Endotoxin Res. 2006;12(6):324-36.
Kojima K, Ishizaka A, Oshika E, Taguchi Y, Tomizawa K, et al. Quantitation of IgG subclass antibodies to pneumococcal capsular polysaccharides by ELISA, using Pneumovax-specific antibodies as a reference. Tohoku J Exp Med. 1990 Jul;161(3):209-15.Kojima K, Ishizaka A, Oshika E, Taguchi Y, Tomizawa K, et al. Quantitation of IgG subclass antibodies to pneumococcal capsular polysaccharides by ELISA, using Pneumovax-specific antibodies as a reference. Tohoku J Exp Med. 1990 Jul;161(3):209-15.
Kol, O., Wieruszeski, J.M., Strecker, G., Fournet, B., Zalisz, R., Smets, P., 1992. Structure of the O-specific polysaccharide chain of Klebsiella pneumoniae O1K2 (NCTC 5055) lipopolysaccharide. A complementary elucidation. Carbohydr. Res. 236, 339-344.Kol, O., Wieruszeski, JM, Strecker, G., Fournet, B., Zalisz, R., Smets, P., 1992. Structure of the O-specific polysaccharide chain of Klebsiella pneumoniae O1K2 (NCTC 5055) lipopolysaccharide. A complementary elucidation. Carbohydr. Res. 236, 339-344.
Koskela M, Leinonen M. Comparison of ELISA and RIA for measurement of pneumococcal antibodies before and after vaccination with 14-valent pneumococcal capsular polysaccharide vaccine. J Clin Pathol. 1981 Jan;34(1):93-8.Koskela M, Leinonen M. Comparison of ELISA and RIA for measurement of pneumococcal antibodies before and after vaccination with 14-valent pneumococcal capsular polysaccharide vaccine. J Clin Pathol. 1981 Jan;34(1):93-8.
Kreger BE, Craven DE, Carling PC, McCabe WR. Gram-negative bacteremia III Reassessment of etiology, epidemiology and ecology in 612 patients. Am J Med. 1980 Mar; 68(3):332-43.Kreger BE, Craven DE, Carling PC, McCabe WR. Gram-negative bacteremia III Reassessment of etiology, epidemiology and ecology in 612 patients. Am J Med. 1980 Mar; 68(3):332-43.
Lal G, Balmer P, Stanford E, Martin S, Warrington R, et al. Development and validation of a nonaplex assay for the simultaneous quantitation of antibodies to nine Streptococcus pneumoniae serotypes. J Immunol Methods. 2005 Jan;296(1-2):135-47.Lal G, Balmer P, Stanford E, Martin S, Warrington R, et al. Development and validation of a nonaplex assay for the simultaneous quantitation of antibodies to nine Streptococcus pneumoniae serotypes. J Immunol Methods. 2005 Jan;296(1-2):135-47.
Landman, D., Babu, E., Shah, N., Kelly, P., Olawole, O., Backer, M., Bratu, S., Quale, J., 2012. Transmission of carbapenem-resistant pathogens in New York City hospitals: progress and frustration. J. Antimicrob. Chemother. 67, 1427-1431.Landman, D., Babu, E., Shah, N., Kelly, P., Olawole, O., Backer, M., Bratu, S., Quale, J., 2012. Transmission of carbapenem-resistant pathogens in New York City hospitals: progress and frustration. J. Antimicrob. Chemother. 67, 1427-1431.
Lang AB, Schaad UB, Rüdeberg A, Wedgwood J, Que JU, et al. Effect of high-affinity anti-Pseudomonas aeruginosa lipopolysaccharide antibodies induced by immunization on the rate of Pseudomonas aeruginosa infection in patients with cystic fibrosis. J Pediatr. 1995 Nov; 127(5):711-7.Lang AB, Schaad UB, Rüdeberg A, Wedgwood J, Que JU, et al. Effect of high-affinity anti-Pseudomonas aeruginosa lipopolysaccharide antibodies induced by immunization on the rate of Pseudomonas aeruginosa infection in patients with cystic fibrosis. J Pediatr. Nov 1995; 127(5):711-7.
Langford DT, Hiller J. Prospective, controlled study of a polyvalent pseudomonas vaccine in cystic fibrosis--three year results. Arch Dis Child. 1984 Dec;59(12):1131-4.Langford DT, Hiller J. Prospective, controlled study of a polyvalent pseudomonas vaccine in cystic fibrosis--three year results. Arch DisChild. 1984 Dec;59(12):1131-4.
Langstraat J, Bohse M, Clegg S. Type 3 fimbrial shaft (MrkA) of Klebsiella pneumoniae, but not the fimbrial adhesin (MrkD), facilitates biofilm formation. Infect Immun. 2001 Sep; 69(9):5805-12. Langstraat J, Bohse M,
Leach S, Clements JD, Kaim J, Lundgren A. The adjuvant double mutant Escherichia coli heat labile toxin enhances IL-17A production in human T cells specific for bacterial vaccine antigens. PLoS One. 2012;7(12):e51718. doi: 10.1371.Leach S, Clements JD, Kaim J, Lundgren A. The adjuvant double mutant Escherichia coli heat labile toxin enhances IL-17A production in human T cells specific for bacterial vaccine antigens. PLOS One. 2012;7(12):e51718. doi: 10.1371.
Levin BR, Cornejo OE. The population and evolutionary dynamics of homologous gene recombination in bacterial populations. PLoS Genet. 2009 Aug; 5(8):e1000601.Levin BR, Cornejo OE. The population and evolutionary dynamics of homologous gene recombination in bacterial populations. PLoS Genet. 2009 Aug; 5(8):e1000601.
Levin BR, Stewart FM, Rice VA. The kinetics of conjugative plasmid transmission: fit of a simple mass action model. Plasmid. 1979 Apr;2(2):247-60.Levin BR, Stewart FM, Rice VA. The kinetics of conjugative plasmid transmission: fit of a simple mass action model. Plasmid. 1979 Apr;2(2):247-60.
Lipsitch M, Siber GR. How Can Vaccines Contribute to Solving the Antimicrobial Resistance Problem?. MBio. 2016 Jun 7;7(3) Lipsitch M, Siber GR. How Can Vaccines Contribute to Solving the Antimicrobial Resistance Problem?. MBio. 2016
Liu Y, Filler SG. Candida albicans Als3, a multifunctional adhesin and invasin. Eukaryot Cell. 2011 Feb;10(2):168-73.Liu Y, Filler S.G. Candida albicans Als3, a multifunctional adhesin and invasin. Eukaryots Cell. 2011 Feb;10(2):168-73.
Liu YY, Wang Y, Walsh TR, Yi LX, Zhang R, et al. Emergence of plasmid-mediated colistin resistance mechanism MCR-1 in animals and human beings in China: a microbiological and molecular biological study. Lancet Infect Dis. 2016 Feb;16(2):161-8.Liu YY, Wang Y, Walsh TR, Yi LX, Zhang R, et al. Emergence of plasmid-mediated colistin resistance mechanism MCR-1 in animals and human beings in China: a microbiological and molecular biological study. Lancet Infect Dis. 2016 Feb;16(2):161-8.
Ma L, Jackson KD, Landry RM, Parsek MR, Wozniak DJ. Analysis of Pseudomonas aeruginosa conditional psl variants reveals roles for the psl polysaccharide in adhesion and maintaining biofilm structure post attachment. J Bacteriol. 2006 Dec;188(23):8213-21.Ma L, Jackson KD, Landry RM, Parsek MR, Wozniak DJ. Analysis of Pseudomonas aeruginosa conditional psl variants reveals roles for the psl polysaccharide in adhesion and maintaining biofilm structure post attachment. J Bacteriol. 2006 Dec;188(23):8213-21.
Magill SS, Edwards JR, Bamberg W, Beldavs ZG, Dumyati G, et al. Multistate point-prevalence survey of health care-associated infections. N Engl J Med. 2014 Mar 27;370(13):1198-208.Magill SS, Edwards JR, Bamberg W, Beldavs ZG, Dumyati G, et al. Multistate point-prevalence survey of health care-associated infections. N Engl J Med. 2014
Mandine E, Salles MF, Zalisz R, Guenounou M, Smets P. Murine monoclonal antibodies to Klebsiella pneumoniae protect against lethal endotoxemia and experimental infection with capsulated K pneumoniae. Infect Immun. 1990 Sep;58(9):2828-33.Mandine E, Salles MF, Zalisz R, Guenounou M, Smets P. Murine monoclonal antibodies to Klebsiella pneumoniae protect against lethal endotoxemia and experimental infection with capsulated K pneumoniae. Infect Immun. 1990 Sep;58(9):2828-33.
Martin, EW, Ed. Remington’s Pharmaceutical Sciences. 15th ed. Easton, PA: Mack Publishing Company, 1975.Martin, EW, Ed. Remington's Pharmaceutical Sciences. 15th ed. Easton, PA: Mack Publishing Company, 1975.
Martinez JE, Romero-Steiner S, Pilishvili T, Barnard S, Schinsky J, et al. A flow cytometric opsonophagocytic assay for measurement of functional antibodies elicited after vaccination with the 23-valent pneumococcal polysaccharide vaccine. Clin Diagn Lab Immunol. 1999 Jul;6(4):581-6.Martinez JE, Romero-Steiner S, Pilishvili T, Barnard S, Schinsky J, et al. A flow cytometric opsonophagocytic assay for measurement of functional antibodies elicited after vaccination with the 23-valent pneumococcal polysaccharide vaccine. Clin Diagn Lab Immunol. 1999 Jul;6(4):581-6.
McCabe WR, Kaijser B, Olling S, Uwaydah M, Hanson LA. Escherichia coli in bacteremia: K and O antigens and serum sensitivity of strains from adults and neonates. J Infect Dis. 1978 Jul;138(1):33-41.McCabe WR, Kaijser B, Olling S, Uwaydah M, Hanson LA. Escherichia coli in bacteremia: K and O antigens and serum sensitivity of strains from adults and neonates. J Infect Dis. 1978 Jul;138(1):33-41.
McGann P, Chahine S, Okafor D, Ong AC, Maybank R, et al. Detecting 16S rRNA Methyltransferases in Enterobacteriaceae by Use of Arbekacin. J Clin Microbiol. 2016 Jan; 54(1):208-11. McGann P, Chahine S, Okafor D, Ong AC, Maybank R, et al. Detecting 16S rRNA Methyltransferases in Enterobacteriaceae by Use of Arbekacin. J Clin Microbiol.
Meir A, Helppolainen SH, Podoly E, Nordlund HR, Hytönen VP, et al. Crystal structure of rhizavidin: insights into the enigmatic high-affinity interaction of an innate biotin-binding protein dimer. J Mol Biol. 2009 Feb 20;386(2):379-90.Meir A, Helppolainen SH, Podoly E, Nordlund HR, Hytönen VP, et al. Crystal structure of rhizavidin: insights into the enigmatic high-affinity interaction of an innate biotin-binding protein dimer. J Mol Biol. 2009
Milla CE, Chmiel JF, Accurso FJ, VanDevanter DR, Konstan MW, et al. Anti-PcrV antibody in cystic fibrosis: a novel approach targeting Pseudomonas aeruginosa airway infection. Pediatr Pulmonol. 2014 Jul;49(7):650-8.Milla CE, Chmiel JF, Accurso FJ, VanDevanter DR, Konstan MW, et al. Anti-PcrV antibody in cystic fibrosis: a novel approach targeting Pseudomonas aeruginosa airway infection. Pediatric Pulmonol. 2014 Jul;49(7):650-8.
Misener S and Krawetz SA, Eds., Bioinformatics: Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology, Volume 132). Totowa, NJ: Humana Press, 1999.Misener S and Krawetz SA, Eds., Bioinformatics: Methods and Protocols (Methods in Molecular Biology, Volume 132). Totowa, NJ: Humana Press, 1999.
Montie TC, Drake D, Sellin H, Slater O, Edmonds S. Motility, virulence, and protection with a flagella vaccine against Pseudomonas aeruginosa infection. Antibiot Chemother (1971). 1987;39:233-48.Montie TC, Drake D, Sellin H, Slater O, Edmonds S. Motility, virulence, and protection with a flagella vaccine against Pseudomonas aeruginosa infection. Antibiot Chemother (1971). 1987;39:233-48.
Moore TA, Perry ML, Getsoian AG, Newstead MW, Standiford TJ. Divergent role of gamma interferon in a murine model of pulmonary versus systemic Klebsiella pneumoniae infection. Infect Immun. 2002 Nov;70(11):6310-8.Moore TA, Perry ML, Getsoian AG, Newstead MW, Standiford TJ. Divergent role of gamma interferon in a murine model of pulmonary versus systemic Klebsiella pneumoniae infection. Infect Immun. 2002 Nov;70(11):6310-8.
Moriel DG, Bertoldi I, Spagnuolo A, Marchi S, Rosini R, et al. Identification of protective and broadly conserved vaccine antigens from the genome of extraintestinal pathogenic Escherichia coli. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 May 18;107(20):9072-7.Moriel DG, Bertoldi I, Spagnuolo A, Marchi S, Rosini R, et al. Identification of protective and broadly conserved vaccine antigens from the genome of extraintestinal pathogenic Escherichia coli . Proc Natl Acad Sci US A. 2010 May 18;107(20):9072-7.
Munro CS, Stanley PJ, Cole PJ. Assessment of biological activity of immunoglobulin preparations by using opsonized micro-organisms to stimulate neutrophil chemiluminescence. Clin Exp Immunol. 1985 Jul;61(1):183-8.Munro CS, Stanley PJ, Cole PJ. Assessment of biological activity of immunoglobulin preparations by using opsonized micro-organisms to stimulate neutrophil chemiluminescence. ClinExp Immunol. 1985 Jul;61(1):183-8.
Murphy CN, Clegg S. Klebsiella pneumoniae and type 3 fimbriae: nosocomial infection, regulation and biofilm formation. Future Microbiol. 2012 Aug;7(8):991-1002.Murphy CN, Clegg S. Klebsiella pneumoniae and
Navon-Venezia, S., Leavitt, A., Schwaber, M.J., Rasheed, J.K., Srinivasan, A., Patel, J.B., Carmeli, Y., 2009. First report on a hyperepidemic clone of KPC-3-producing Klebsiella pneumoniae in Israel genetically related to a strain causing outbreaks in the United States. Antimicrob. Agents Chemother. 53, 818-820.Navon-Venezia, S., Leavitt, A., Schwaber, MJ, Rasheed, JK, Srinivasan, A., Patel, JB, Carmeli, Y., 2009. First report on a hyperepidemic clone of KPC-3-producing Klebsiella pneumoniae in Israel genetically related to a strain causing outbreaks in the United States. Antimicrob. Agents Chemother. 53, 818-820.
Neely AN, Bhattacharjee AK, Babcock GF, Holder IA, Cross AS. Differential effects of two different routes of immunization on protection against gram-negative sepsis by a detoxified Escherichia coli J5 lipopolysaccharide group B meningococcal outer membrane protein complex vaccine in a burned mouse model. J Burn Care Rehabil. 2002 Sep-Oct;23(5):333-40.Neely AN, Bhattacharjee AK, Babcock GF, Holder IA, Cross AS. Differential effects of two different routes of immunization on protection against gram-negative sepsis by a detoxified Escherichia coli J5 lipopolysaccharide group B meningococcal outer membrane protein complex vaccine in a burned mouse model. J Burn Care Rehabil. 2002 Sep-Oct;23(5):333-40.
Nesta B, Spraggon G, Alteri C, Moriel DG, Rosini R, et al. FdeC, a novel broadly conserved Escherichia coli adhesin eliciting protection against urinary tract infections. MBio. 2012;3(2) Nesta B, Spraggon G, Alteri C, Moriel DG, Rosini R, et al. FdeC, a novel broadly conserved Escherichia coli adhesin eliciting protection against urinary tract infections. MBio. 2012;3(2)
Norton EB et al., Characterization of a Mutant Escherichia coli Heat-Labile Toxin, LT(R192G/L211A), as a Safe and Effective Oral Adjuvant. Clin Vaccine Immunol. 2011 18:546-551.Norton EB et al., Characterization of a Mutant Escherichia coli Heat-Labile Toxin, LT(R192G/L211A), as a Safe and Effective Oral Adjuvant. Clin Vaccine Immunol. 2011 18:546-551.
Norton EB et al., The A Subunit of Escherichia coli Heat-Labile Enterotoxin Functions as a Mucosal Adjuvant and Promotes IgG2a, IgA, and Th17 Responses to Vaccine Antigens. Infection and Immunity 2012, 80:2426-2435.Norton EB et al., The A Subunit of Escherichia coli Heat-Labile Enterotoxin Functions as a Mucosal Adjuvant and Promotes IgG2a, IgA, and Th17 Responses to Vaccine Antigens. Infection and Immunity 2012, 80:2426-2435.
Ojo-Amaize EA, Church JA, Barka NE, Agopian MS, Peter JB. A rapid and sensitive chemiluminescence assay for evaluation of functional opsonic activity of Haemophilus influenzae type b-specific antibodies. Clin Diagn Lab Immunol. 1995 May;2(3):286-90.Ojo-Amaize EA, Church JA, Barka NE, Agopian MS, Peter JB. A rapid and sensitive chemiluminescence assay for evaluation of functional opsonic activity of Haemophilus influenzae type b-specific antibodies. Clin Diagn Lab Immunol. 1995 May;2(3):286-90.
Old DC, Adegbola RA. Antigenic relationships among type-3 fimbriae of Enterobacteriaceae revealed by immunoelectronmicroscopy. J Med Microbiol. 1985 Aug; 20(1):113-21.Old DC, Adegbola RA. Antigenic relationships among type-3 fimbriae of Enterobacterioscopy revealed by immunoelectronmicr. J Med Microbiol. 1985 Aug; 20(1):113-21.
Pereira, P.S., de Araujo, C.F., Seki, L.M., Zahner, V., Carvalho-Assef, A.P., Asensi, M.D., 2013. Update of the molecular epidemiology of KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae in Brazil: spread of clonal complex 11 (ST11 ST437 and ST340). J. Antimicrob. Chemother. 68, 312-316.Pereira, PS, de Araujo, CF, Seki, LM, Zahner, V., Carvalho-Assef, AP, Asensi, MD, 2013. Update of the molecular epidemiology of KPC-2-producing Klebsiella pneumoniae in Brazil: spread of clonal complex 11 (ST11 ST437 and ST340). J. Antimicrob. Chemother. 68, 312-316.
Pickering JW, Martins TB, Greer RW, Schroder MC, Astill ME, et al. A multiplexed fluorescent microsphere immunoassay for antibodies to pneumococcal capsular polysaccharides. Am J Clin Pathol. 2002 Apr; 117(4):589-96.Pickering JW, Martins TB, Greer RW, Schroder MC, Astill ME, et al. A multiplexed fluorescent microsphere immunoassay for antibodies to pneumococcal capsular polysaccharides. Am J Clin Pathol. 2002 Apr; 117(4):589-96.
Podschun R, Ullmann U. Klebsiella spp as nosocomial pathogens: epidemiology, taxonomy, typing methods, and pathogenicity factors. Clin Microbiol Rev. 1998 Oct;11(4):589-603.Podschun R, Ullmann U. Klebsiella spp as nosocomial pathogens: epidemiology, taxonomy, typing methods, and pathogenicity factors. Clin Microbiol Rev. 1998 Oct;11(4):589-603.
Poljak RJ. Production and structure of diabodies. Structure. 1994 Dec 15;2(12):1121-3.Poljak RJ. Production and structure of diabodies. structure. 1994
Poolman JT, Wacker M. Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli, a Common Human Pathogen: Challenges for Vaccine Development and Progress in the Field. J Infect Dis. 2016 Jan 1;213(1):6-13.Poolman JT, Wacker M. Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli , a Common Human Pathogen: Challenges for Vaccine Development and Progress in the Field. J Infect Dis. 2016
Powell MF and Newman MJ, Eds. Vaccine Design: The Subunit and Adjuvant Approach. New York, NY: Plenum Press, 1995.Powell M.F. and Newman M.J., Eds. Vaccine Design: The Subunit and Adjuvant Approach. New York, NY: Plenum Press, 1995.
Priebe GP, Walsh RL, Cederroth TA, Kamei A, Coutinho-Sledge YS, et al. IL-17 is a critical component of vaccine-induced protection against lung infection by lipopolysaccharide-heterologous strains of Pseudomonas aeruginosa. J Immunol. 2008 Oct 1;181(7):4965-75.Priebe GP, Walsh RL, Cederroth TA, Kamei A, Coutinho-Sledge YS, et al. IL-17 is a critical component of vaccine-induced protection against lung infection by lipopolysaccharide-heterologous strains of Pseudomonas aeruginosa . J Immunol. 2008
Qi, Y., Wei, Z., Ji, S., Du, X., Shen, P., Yu, Y., 2011. ST11, the dominant clone of KPC-producing Klebsiella pneumoniae in China. J. Antimicrob. Chemother. 66, 307-312.Qi, Y., Wei, Z., Ji, S., Du, X., Shen, P., Yu, Y., 2011. ST11, the dominant clone of KPC-producing Klebsiella pneumoniae in China. J. Antimicrob. Chemother. 66, 307-312.
Ramachandran G, Boyd MA, MacSwords J, Higginson EE, Simon R, et al. Opsonophagocytic Assay To Evaluate Immunogenicity of Nontyphoidal Salmonella Vaccines. Clin Vaccine Immunol. 2016 Jun;23(6):520-3.Ramachandran G, Boyd MA, MacSwords J, Higginson EE, Simon R, et al. Opsonophagocytic Assay To Evaluate Immunogenicity of Nontyphoidal Salmonella Vaccines. Clin Vaccine Immunol. 2016 Jun;23(6):520-3.
Rappuoli R. Reverse vaccinology. Curr Opin Microbiol. 2000 Oct;3(5):445-50. Rappuoli R. Reverse vaccinology. Curr Opin Microbiol. 2000 Oct;3(5):445-50.
Rayner BL, Willcox PA. Community-acquired bacteraemia; a prospective survey of 239 cases. Q J Med. 1988 Nov;69(259):907-19.Rayner BL, Willcox PA. Community-acquired bacteremia; a prospective survey of 239 cases. Q J Med. 1988 Nov;69(259):907-19.
Robbins JB, McCracken GH Jr, Gotschlich EC, Orskov F, Orskov I, et al. Escherichia coli K1 capsular polysaccharide associated with neonatal meningitis. N Engl J Med. 1974 May 30;290(22):1216-20.Robbins JB, McCracken GH Jr, Gotschlich EC, Orskov F, Orskov I, et al. Escherichia coli K1 capsular polysaccharide associated with neonatal meningitis. N Engl J Med. 1974 May 30;290(22):1216-20.
Romero-Steiner S, Libutti D, Pais LB, Dykes J, Anderson P, et al. Standardization of an opsonophagocytic assay for the measurement of functional antibody activity against Streptococcus pneumoniae using differentiated HL-60 cells. Clin Diagn Lab Immunol. 1997 Jul;4(4):415-22.Romero-Steiner S, Libutti D, Pais LB, Dykes J, Anderson P, et al. Standardization of an opsonophagocytic assay for the measurement of functional antibody activity against Streptococcus pneumoniae using differentiated HL-60 cells. Clin Diagn Lab Immunol. 1997 Jul;4(4):415-22.
Romero-Steiner S, Holder PF, Gomez de Leon P, Spear W, Hennessy TW, et al. Avidity determinations for Haemophilus influenzae Type b anti-polyribosylribitol phosphate antibodies. Clin Diagn Lab Immunol. 2005 Sep;12(9):1029-35.Romero-Steiner S, Holder PF, Gomez de Leon P, Spear W, Hennessy TW, et al. Avidity determinations for Haemophilus influenzae Type b anti-polyribosylribitol phosphate antibodies. Clin Diagn Lab Immunol. 2005 Sep;12(9):1029-35.
Ross PJ, Sutton CE, Higgins S, Allen AC, Walsh K, et al. Relative contribution of Th1 and Th17 cells in adaptive immunity to Bordetella pertussis: towards the rational design of an improved acellular pertussis vaccine. PLoS Pathog. 2013;9(4):e1003264.Ross PJ, Sutton CE, Higgins S, Allen AC, Walsh K, et al. Relative contribution of Th1 and Th17 cells in adaptive immunity to Bordetella pertussis : towards the rational design of an improved acellular pertussis vaccine. PLoS Pathog. 2013;9(4):e1003264.
Saeland E, Vidarsson G, Jonsdottir I. Pneumococcal pneumonia and bacteremia model in mice for the analysis of protective antibodies. Microb Pathog. 2000 Aug;29(2):81-91.Saeland E, Vidarsson G, Jonsdottir I. Pneumococcal pneumonia and bacteremia model in mice for the analysis of protective antibodies. microbe pathogen. 2000 Aug;29(2):81-91.
Saha S, Takeshita F, Matsuda T, Jounai N, Kobiyama K, et al. Blocking of the TLR5 activation domain hampers protective potential of flagellin DNA vaccine. J Immunol. 2007 Jul 15;179(2):1147-54.Saha S, Takeshita F, Matsuda T, Jounai N, Kobiyama K, et al. Blocking of the TLR5 activation domain hampers protective potential of flagellin DNA vaccine. J Immunol. 2007
Sambrook J, Maniatis T and Fritsch EF. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 2nd ed. Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989.Sambrook J, Maniatis T and Fritsch EF. Molecular Cloning: A Laboratory Manual. 2nd ed. Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989.
Sawa T, Yahr TL, Ohara M, Kurahashi K, Gropper MA, et al. Active and passive immunization with the Pseudomonas V antigen protects against type III intoxication and lung injury. Nat Med. 1999 Apr;5(4):392-8.Sawa T, Yahr TL, Ohara M, Kurahashi K, Gropper MA, et al. Active and passive immunization with the Pseudomonas V antigen protects against type III intoxication and lung injury. Nat Med. 1999 Apr;5(4):392-8.
Schaad UB, Lang AB, Wedgwood J, Ruedeberg A, Que JU, et al. Safety and immunogenicity of Pseudomonas aeruginosa conjugate A vaccine in cystic fibrosis. Lancet. 1991 Nov 16;338(8777):1236-7.Schaad UB, Lang AB, Wedgwood J, Ruedeberg A, Que JU, et al. Safety and immunogenicity of Pseudomonas aeruginosa conjugate A vaccine in cystic fibrosis. Lancet. 1991
Schaberg DR, Culver DH, Gaynes RP. Major trends in the microbial etiology of nosocomial infection. Am J Med. 1991 Sep 16;91(3B):72S-75S.Schaberg DR, Culver DH, Gaynes RP. Major trends in the microbial etiology of nosocomial infection. Am J Med. 1991
Schmidt AC, McAuliffe JM, Murphy BR, Collins PL. Recombinant bovine/human parainfluenza virus type 3 (B/HPIV3) expressing the respiratory syncytial virus (RSV) G and F proteins can be used to achieve simultaneous mucosal immunization against RSV and HPIV3. J Virol. 2001 May;75(10):4594-603.Schmidt AC, McAuliffe JM, Murphy BR, Collins PL. Recombinant bovine/human parainfluenza virus type 3 (B/HPIV3) expressing the respiratory syncytial virus (RSV) G and F proteins can be used to achieve simultaneous mucosal immunization against RSV and HPIV3. J Virol. 2001 May;75(10):4594-603.
Schmidt CS, White CJ, Ibrahim AS, Filler SG, Fu Y, et al. NDV-3, a recombinant alum-adjuvanted vaccine for Candida and Staphylococcus aureus, is safe and immunogenic in healthy adults. Vaccine. 2012 Dec 14;30(52):7594-600.Schmidt CS, White CJ, Ibrahim AS, Filler SG, Fu Y, et al. NDV-3, a recombinant alum-adjuvanted vaccine for Candida and Staphylococcus aureus , is safe and immunogenic in healthy adults. Vaccine. 2012
Schweizer HP. Allelic exchange in Pseudomonas aeruginosa using novel ColE1-type vectors and a family of cassettes containing a portable oriT and the counter-selectable Bacillus subtilis sacB marker. Mol Microbiol. 1992 May;6(9):1195-204.Schweizer HP. Allelic exchange in Pseudomonas aeruginosa using novel ColE1-type vectors and a family of cassettes containing a portable oriT and the counter-selectable Bacillus subtilis sacB marker. Mol Microbiol. 1992 May;6(9):1195-204.
Scully IL, Liberator PA, Jansen KU, Anderson AS. Covering all the Bases: Preclinical Development of an Effective Staphylococcus aureus Vaccine. Front Immunol. 2014 Mar 24;5:109.Scully IL, Liberator PA, Jansen KU, Anderson AS. Covering all the Bases: Preclinical Development of an Effective Staphylococcus aureus Vaccine. Front Immunol. 2014 Mar 24;5:109.
Shime N, Sawa T, Fujimoto J, Faure K, Allmond LR, et al. Therapeutic administration of anti-PcrV F(ab')(2) in sepsis associated with Pseudomonas aeruginosa. J Immunol. 2001 Nov 15;167(10):5880-6.Shime N, Sawa T, Fujimoto J, Faure K, Allmond LR, et al. Therapeutic administration of anti-PcrV F(ab')(2) in sepsis associated with Pseudomonas aeruginosa . J Immunol. 2001
Simon R, Samuel CE. Activation of NF-kappaB-dependent gene expression by Salmonella flagellins FliC and FljB. Biochem Biophys Res Commun. 2007 Mar 30;355(1):280-5.Simon R, Samuel C.E. Activation of NF-kappaB-dependent gene expression by Salmonella flagellins FliC and FljB. Biochem Biophys Res Commun. 2007
Song WS, Yoon SI. Crystal structure of FliC flagellin from Pseudomonas aeruginosa and its implication in TLR5 binding and formation of the flagellar filament. Biochem Biophys Res Commun. 2014 Feb 7;444(2):109-15.Song W.S., Yoon S.I. Crystal structure of FliC flagellin from Pseudomonas aeruginosa and its implication in TLR5 binding and formation of the flagellar filament. Biochem Biophys Res Commun. 2014
Stack AM, Malley R, Thompson CM, Kobzik L, Siber GR, et al. Minimum protective serum concentrations of pneumococcal anti-capsular antibodies in infant rats. J Infect Dis. 1998 Apr;177(4):986-90.Stack AM, Malley R, Thompson CM, Kobzik L, Siber GR, et al. Minimum protective serum concentrations of pneumococcal anti-capsular antibodies in infant rats. J Infect Dis. 1998 Apr;177(4):986-90.
Szijártó V. et al., 2016. Both clades of the epidemic KPC-producing Klebsiella pneumoniae clone ST258 share a modified galactan O-antigen type. International Journal of Medical Microbiology 306:89-98.Szijártó V. et al., 2016. Both clades of the epidemic KPC-producing Klebsiella pneumoniae clone ST258 share a modified galactan O-antigen type. International Journal of Medical Microbiology 306:89-98.
Tarkkanen AM, Virkola R, Clegg S, Korhonen TK. Binding of the type 3 fimbriae of Klebsiella pneumoniae to human endothelial and urinary bladder cells. Infect Immun. 1997 Apr;65(4):1546-9. Tarkkanen AM, Virkola R, Clegg S, Korhonen TK. Binding of the
Tarkkanen AM, Allen BL, Westerlund B, Holthöfer H, Kuusela P, et al. Type V collagen as the target for type-3 fimbriae, enterobacterial adherence organelles. Mol Microbiol. 1990 Aug;4(8):1353-61.Tarkkanen AM, Allen BL, Westerlund B, Holthöfer H, Kuusela P, et al. Type V collagen as the target for type-3 fimbriae, enterobacterial adherence organelles. Mol Microbiol. 1990 Aug;4(8):1353-61.
Thammavongsa V, Kim HK, Missiakas D, Schneewind O. Staphylococcal manipulation of host immune responses. Nat Rev Microbiol. 2015 Sep;13(9):529-43. Thammavongsa V, Kim HK, Missiakas D, Schneewind O. Staphylococcal manipulation of host immune responses. Nat Rev Microbiol. 2015 Sep;13(9):529-43.
Therasse P, Arbuck SG, Eisenhauer EA, Wanders J, Kaplan RS, et al. New Guidelines to Evaluate the Response to Treatment in Solid Tumors. J Natl Cancer Inst. 2000 Feb 2;92(3):205-216.Therasse P, Arbuck SG, Eisenhauer EA, Wanders J, Kaplan RS, et al. New Guidelines to Evaluate the Response to Treatment in Solid Tumors. J Natl Cancer Inst. 2000
Tomas JM, Camprubi S, Williams P. Surface exposure of the O-antigen in Klebsiella pneumoniae O1:K1 serotype strains. Microb Pathog. 1988 Aug;5(2):141-7.Tomas JM, Camprubi S, Williams P. Surface exposure of the O-antigen in Klebsiella pneumoniae O1:K1 serotype strains. microbe pathogen. 1988 Aug;5(2):141-7.
Toprani VS. et al., Development of a candidate stabilizing formulation for bulk storage of a double mutant heat labile toxin (dmLT) protein based adjuvant. Vaccine. 2017. 35:5471-548.Toprani VS. et al., Development of a candidate stabilizing formulation for bulk storage of a double mutant heat labile toxin (dmLT) protein based adjuvant. Vaccine. 2017. 35:5471-548.
Trautmann, M., et al., 1997. O-Antigen Seroepidemiology of Klebsiella Clinical Isolates and Implications for Immunoprophylaxis of Klebsiella Infections. Clinical and Diagnostic Laboratory Immnuology 4:550-555.Trautmann, M., et al., 1997. O-Antigen Seroepidemiology of Klebsiella Clinical Isolates and Implications for Immunoprophylaxis of Klebsiella Infections. Clinical and Diagnostic Laboratory Immunology 4:550-555.
Westritschnig K, Hochreiter R, Wallner G, Firbas C, Schwameis M, Jilma B. 2014. A randomized, placebo-controlled phase I study assessing the safety and immunogenicity of a Pseudomonas aeruginosa hybrid outer membrane protein OprF/I vaccine (IC43) in healthy volunteers. Hum Vaccin Immunother 10:170-183.Westritschnig K, Hochreiter R, Wallner G, Firbas C, Schwameis M, Jilma B. 2014. A randomized, placebo-controlled phase I study assessing the safety and immunogenicity of a Pseudomonas aeruginosa hybrid outer membrane protein OprF/I vaccine (IC43) in healthy volunteers. Hum Vaccin Immunother 10:170-183.
Ullmann U. [Bacterial infection agents in hospitalized patients]. Zentralbl Bakteriol Mikrobiol Hyg B. 1986 Dec;183(2-3):103-13.Ullmann U. [Bacterial infection agents in hospitalized patients]. Zentralbl Bakteriol Mikrobiol Hyg B. 1986 Dec;183(2-3):103-13.
Vaudaux P and Waldvogel FA (1979). Gentamicin antibacterial activity in the presence of human polymorphonuclear leukocytes. Antimicrob Agents Chemother. 16 (6): 743-749.Vaudaux P and Waldvogel F. A. (1979). Gentamicin antibacterial activity in the presence of human polymorphonuclear leukocytes. Antimicrobial Agents Chemother. 16(6): 743-749.
Vinogradov E, Frirdich E, MacLean LL, Perry MB, Petersen BO, et al. Structures of lipopolysaccharides from Klebsiella pneumoniae Eluicidation of the structure of the linkage region between core and polysaccharide O chain and identification of the residues at the non-reducing termini of the O chains. J Biol Chem. 2002 Jul 12;277(28):25070-81. Vinogradov E, Frirdich E, MacLean LL, Perry MB, Petersen BO, et al. Structures of lipopolysaccharides from Klebsiella pneumoniae Eluicidation of the structure of the linkage region between core and polysaccharide O chain and identification of the residues at the non-reducing termini of the O chains. J Biol Chem. 2002
Wang Q, Chang CS, Pennini M, Pelletier M, Rajan S, et al. Target-Agnostic Identification of Functional Monoclonal Antibodies Against Klebsiella pneumoniae Multimeric MrkA Fimbrial Subunit. J Infect Dis. 2016 Jun 1;213(11):1800-8.Wang Q, Chang CS, Pennini M, Pelletier M, Rajan S, et al. Target-Agnostic Identification of Functional Monoclonal Antibodies Against Klebsiella pneumoniae Multimeric MrkA Fimbrial Subunit. J Infect Dis. 2016
Walczak MJ, Puorger C, Glockshuber R, Wider G. Intramolecular donor strand complementation in the E. coli type 1 pilus subunit FimA explains the existence of FimA monomers as off-pathway products of pilus assembly that inhibit host cell apoptosis. J Mol Biol. 2014 Feb 6;426(3):542-9. Walczak MJ, Puorger C, Glockshuber R, Wider G. Intramolecular donor strand complementation in the
Warfel JM, Zimmerman LI, Merkel TJ. Acellular pertussis vaccines protect against disease but fail to prevent infection and transmission in a nonhuman primate model. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Jan 14;111(2):787-92.Warfel JM, Zimmerman LI, Merkel TJ. Acellular pertussis vaccines protect against disease but fail to prevent infection and transmission in a nonhuman primate model. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014
Warrener P, Varkey R, Bonnell JC, DiGiandomenico A, Camara M, et al. A novel anti-PcrV antibody providing enhanced protection against Pseudomonas aeruginosa in multiple animal infection models. Antimicrob Agents Chemother. 2014 Aug;58(8):4384-91.Warrener P, Varkey R, Bonnell JC, DiGiandomenico A, Camara M, et al. A novel anti-PcrV antibody providing enhanced protection against Pseudomonas aeruginosa in multiple animal infection models. Antimicrobial Agents Chemother. 2014 Aug;58(8):4384-91.
Welch WD, Martin WJ, Stevens P, Young LS. Relative opsonic and protective activities of antibodies against K1, O and lipid A antigens of Escherichia coli. Scand J Infect Dis. 1979;11(4):291-301.Welch WD, Martin WJ, Stevens P, Young LS. Relative opsonic and protective activities of antibodies against K1, O and lipid A antigens of Escherichia coli . Scand J Infect Dis. 1979;11(4):291-301.
Whitfield, C., Perry, M.B., MacLean, L.L., Yu, S.H., 1992. Structural analysis of the O-antigen side chain polysaccharides in the lipopolysaccharides of Klebsiella serotypes O2(2a) O2(2a, 2b), and O2(2a, 2c). J. Bacteriol. 174, 4913-4919.Whitfield, C., Perry, M.B., MacLean, L.L., Yu, S.H., 1992. Structural analysis of the O-antigen side chain polysaccharides in the lipopolysaccharides of Klebsiella serotypes O2(2a) O2(2a, 2b), and O2(2a , 2c). J. Bacteriol. 174, 4913-4919.
Whitfield, C., Richards, J.C., Perry, M.B., Clarke, B.R., MacLean, L.L., 1991. Expression of two structurally distinct d-galactan O antigens in the lipopolysaccharide of Klebsiella pneumoniae serotype O1. J. Bacteriol. 173, 1420-1431.Whitfield, C., Richards, JC, Perry, MB, Clarke, BR, MacLean, LL, 1991. Expression of two structurally distinct d-galactan O antigens in the lipopolysaccharide of Klebsiella pneumoniae serotype O1. J. Bacteriol. 173, 1420-1431.
Woodford N, Turton JF, Livermore DM. Multiresistant Gram-negative bacteria: the role of high-risk clones in the dissemination of antibiotic resistance. FEMS Microbiol Rev. 2011 Sep;35(5):736-55.Woodford N, Turton JF, Livermore DM. Multiresistant Gram-negative bacteria: the role of high-risk clones in the dissemination of antibiotic resistance. FEMS Microbiol Rev. 2011 Sep;35(5):736-55.
World Health Organization (WHO). Antimicrobial Resistance - Global Report on Surveillance. 2014.World Health Organization (WHO). Antimicrobial Resistance - Global Report on Surveillance. 2014.
Wu W, Huang J, Duan B, Traficante DC, Hong H, et al. Th17-stimulating protein vaccines confer protection against Pseudomonas aeruginosa pneumonia. Am J Respir Crit Care Med. 2012 Sep 1;186(5):420-7.Wu W, Huang J, Duan B, Traficante DC, Hong H, et al. Th17-stimulating protein vaccines confer protection against Pseudomonas aeruginosa pneumonia. Am J Respir Crit Care Med. 2012
Würker M, Beuth J, Ko HL, Przondo-Mordarska A, Pulverer G. Type of fimbriation determines adherence of Klebsiella bacteria to human epithelial cells. Zentralbl Bakteriol. 1990 Nov;274(2):239-45Würker M, Beuth J, Ko HL, Przondo-Mordarska A, Pulverer G. Type of fimbriation determines adherence of Klebsiella bacteria to human epithelial cells. Zentralbl Bakteriol. 1990 Nov;274(2):239-45
Zhang F, Lu YJ, Malley R. Multiple antigen-presenting system (MAPS) to induce comprehensive B- and T-cell immunity. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013 Aug 13;110(33):13564-9.Zhang F, Lu YJ, Malley R. Multiple antigen-presenting system (MAPS) to induce comprehensive B- and T-cell immunity. Proc Natl Acad Sci U S A. 2013
ЭквивалентыEquivalents
Специалисты в данной области смогут обнаружить, или разработать с использованием не более чем рутинного экспериментирования, множество эквивалентов конкретных вариантов осуществления изобретения, описанных в настоящем изобретении. Объем настоящего изобретения не должен быть ограничен вышеприведенным описанием, но лишь следующей далее формулой изобретения.Those skilled in the art will be able to discover, or develop using no more than routine experimentation, many equivalents to the specific embodiments of the invention described in the present invention. The scope of the present invention is not to be limited by the above description, but only by the following claims.
Claims (143)
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201762524315P | 2017-06-23 | 2017-06-23 | |
US62/524,315 | 2017-06-23 | ||
US201862633807P | 2018-02-22 | 2018-02-22 | |
US62/633,807 | 2018-02-22 | ||
PCT/US2018/038907 WO2018237221A1 (en) | 2017-06-23 | 2018-06-22 | Immunogenic compositions |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2020102449A RU2020102449A (en) | 2021-07-26 |
RU2020102449A3 RU2020102449A3 (en) | 2022-03-24 |
RU2791256C2 true RU2791256C2 (en) | 2023-03-06 |
Family
ID=
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0118831A2 (en) * | 1983-03-14 | 1984-09-19 | Miles Inc. | Vaccines for gram-negative bacteria and method for the preparation thereof |
WO2007067681A2 (en) * | 2005-12-08 | 2007-06-14 | University Of Louisville Research Foundation, Inc. | Immunostimulatory compositions and methods |
WO2011103588A1 (en) * | 2010-02-22 | 2011-08-25 | Liquidia Technologies, Inc. | Polysaccharide particle vaccines |
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP0118831A2 (en) * | 1983-03-14 | 1984-09-19 | Miles Inc. | Vaccines for gram-negative bacteria and method for the preparation thereof |
WO2007067681A2 (en) * | 2005-12-08 | 2007-06-14 | University Of Louisville Research Foundation, Inc. | Immunostimulatory compositions and methods |
WO2011103588A1 (en) * | 2010-02-22 | 2011-08-25 | Liquidia Technologies, Inc. | Polysaccharide particle vaccines |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Mettu et al. | Synthetic carbohydrate-based vaccines: challenges and opportunities | |
Micoli et al. | Potential targets for next generation antimicrobial glycoconjugate vaccines | |
Döring et al. | Vaccines and immunotherapy against Pseudomonas aeruginosa | |
Sharma et al. | Recent developments for Pseudomonas vaccines | |
Emmadi et al. | A Streptococcus pneumoniae type 2 oligosaccharide glycoconjugate elicits opsonic antibodies and is protective in an animal model of invasive pneumococcal disease | |
US20230414740A1 (en) | Immunogenic compositions | |
TW201103557A (en) | Immunogenic compositions of Staphylococcus aureus antigens | |
CN110730670A (en) | Multi-antigen presentation system (MAPS) -based staphylococcus aureus vaccines, immunogenic compositions, and uses thereof | |
TW200823230A (en) | Protein matrix vaccines and methods of making and administering such vaccines | |
BR112021004193A2 (en) | multivalent pneumococcal vaccines | |
US20230089151A1 (en) | Pneumococcal fusion protein vaccines | |
RU2791256C2 (en) | Immunogenic compositions | |
CN111065417B (en) | Immunogenic compositions | |
JP2015071630A (en) | Polysaccharide conjugation with detoxified e. coli heat labile enterotoxin (lt) used as vaccine | |
RU2815390C2 (en) | Polyvalent pneumococcal vaccines | |
US20230091255A1 (en) | Multivalent pneumococcal vaccines | |
WO2024081871A1 (en) | Shigella multiple antigen presenting immunogenic composition and fusion proteins thereof | |
WO2023102359A9 (en) | A maps vaccine targeting salmonella enterica serovars | |
WO2023192997A2 (en) | Immunogenic compositions for b-cell recall response to a polysaccharide antigen | |
Palmieri | Investigazione di tecnologie alternative per lo sviluppo di vaccini basati su polisaccaridi | |
WO2024081906A1 (en) | A maps vaccine targeting group b streptococcus (gbs) | |
Singh | Investigation of Gram-negative bacterial surface glycans: characterisation of Moraxella bovis lipooligosaccharide and progress towards developing a Nontypeable Haemophilus influenzae/Moraxella catarrhalis vaccine candidate |