RU2777606C2 - Compositions and methods for fusarium control - Google Patents
Compositions and methods for fusarium control Download PDFInfo
- Publication number
- RU2777606C2 RU2777606C2 RU2020136616A RU2020136616A RU2777606C2 RU 2777606 C2 RU2777606 C2 RU 2777606C2 RU 2020136616 A RU2020136616 A RU 2020136616A RU 2020136616 A RU2020136616 A RU 2020136616A RU 2777606 C2 RU2777606 C2 RU 2777606C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- leu
- ala
- fusarium
- plant
- gly
- Prior art date
Links
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims abstract description 140
- 241000223218 Fusarium Species 0.000 title claims abstract description 110
- 230000000813 microbial Effects 0.000 claims abstract description 122
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims abstract description 117
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 claims abstract description 34
- 238000011161 development Methods 0.000 claims abstract description 33
- 239000002689 soil Substances 0.000 claims abstract description 27
- 230000001629 suppression Effects 0.000 claims abstract description 17
- 240000005979 Hordeum vulgare Species 0.000 claims abstract description 15
- 239000001963 growth media Substances 0.000 claims abstract description 6
- 241000193744 Bacillus amyloliquefaciens Species 0.000 claims abstract description 3
- 240000008529 Triticum aestivum Species 0.000 claims abstract 2
- 241000223195 Fusarium graminearum Species 0.000 claims description 51
- 230000001717 pathogenic Effects 0.000 claims description 46
- 210000004027 cells Anatomy 0.000 claims description 45
- 244000052769 pathogens Species 0.000 claims description 39
- 210000004215 spores Anatomy 0.000 claims description 37
- 239000000969 carrier Substances 0.000 claims description 29
- 230000012010 growth Effects 0.000 claims description 28
- 230000000855 fungicidal Effects 0.000 claims description 27
- 239000000417 fungicide Substances 0.000 claims description 23
- 239000000575 pesticide Substances 0.000 claims description 20
- 229920001850 Nucleic acid sequence Polymers 0.000 claims description 15
- 239000000843 powder Substances 0.000 claims description 13
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims description 12
- 239000000243 solution Substances 0.000 claims description 12
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 11
- 239000003337 fertilizer Substances 0.000 claims description 9
- 239000008187 granular material Substances 0.000 claims description 9
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 claims description 9
- 239000000839 emulsion Substances 0.000 claims description 8
- 239000007921 spray Substances 0.000 claims description 8
- 235000007319 Avena orientalis Nutrition 0.000 claims description 5
- 244000075850 Avena orientalis Species 0.000 claims description 5
- 230000000844 anti-bacterial Effects 0.000 claims description 5
- 239000008199 coating composition Substances 0.000 claims description 5
- 230000000749 insecticidal Effects 0.000 claims description 5
- 239000002917 insecticide Substances 0.000 claims description 4
- 239000005645 nematicide Substances 0.000 claims description 4
- 230000000895 acaricidal Effects 0.000 claims description 3
- 239000000642 acaricide Substances 0.000 claims description 3
- 239000003899 bactericide agent Substances 0.000 claims description 3
- 230000003641 microbiacidal Effects 0.000 claims description 3
- 239000011324 bead Substances 0.000 claims description 2
- 239000000084 colloidal system Substances 0.000 claims description 2
- 239000002855 microbicide agent Substances 0.000 claims description 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims description 2
- 235000007558 Avena sp Nutrition 0.000 claims 1
- 241000602080 Dracaena fragrans Species 0.000 claims 1
- 206010017533 Fungal infection Diseases 0.000 claims 1
- 239000000428 dust Substances 0.000 claims 1
- 235000021307 wheat Nutrition 0.000 abstract description 64
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 abstract description 46
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 34
- 239000002609 media Substances 0.000 abstract description 29
- 201000009910 diseases by infectious agent Diseases 0.000 abstract description 25
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 16
- 235000007340 Hordeum vulgare Nutrition 0.000 abstract description 14
- 230000002265 prevention Effects 0.000 abstract description 2
- 230000003042 antagnostic Effects 0.000 description 83
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 78
- 241000209140 Triticum Species 0.000 description 65
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 51
- 230000001580 bacterial Effects 0.000 description 51
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 42
- 241000894007 species Species 0.000 description 35
- 238000000034 method Methods 0.000 description 27
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 27
- 241001467578 Microbacterium Species 0.000 description 26
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 26
- 229920003013 deoxyribonucleic acid Polymers 0.000 description 25
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 24
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 24
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 24
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 24
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 23
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 23
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 22
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 21
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 20
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 20
- 230000002538 fungal Effects 0.000 description 20
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 19
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 19
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 19
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 19
- 108020004465 16S Ribosomal RNA Proteins 0.000 description 18
- 241001478283 Variovorax Species 0.000 description 17
- 230000000443 biocontrol Effects 0.000 description 17
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 16
- 239000000047 product Substances 0.000 description 16
- UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N Val-Glu Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UPJONISHZRADBH-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 15
- 108010015792 glycyllysine Proteins 0.000 description 15
- -1 however Substances 0.000 description 15
- 239000000463 material Substances 0.000 description 15
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 14
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 14
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 14
- YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 13
- VYZAGTDAHUIRQA-WHFBIAKZSA-N L-alanyl-L-glutamic acid Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O VYZAGTDAHUIRQA-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 13
- LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O LESXFEZIFXFIQR-LURJTMIESA-N 0.000 description 13
- 210000001519 tissues Anatomy 0.000 description 13
- 208000004770 Fusariosis Diseases 0.000 description 12
- 108010002311 N-glycylglutamic acid Proteins 0.000 description 12
- 241001646398 Pseudomonas chlororaphis Species 0.000 description 12
- 108010089804 glycyl-threonine Proteins 0.000 description 12
- 230000002906 microbiologic Effects 0.000 description 12
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 12
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 12
- 239000001965 potato dextrose agar Substances 0.000 description 12
- 238000005507 spraying Methods 0.000 description 12
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 206010051919 Fusarium infection Diseases 0.000 description 11
- NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 11
- XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N Leu-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XGDCYUQSFDQISZ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 11
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 11
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 11
- 108010061238 threonyl-glycine Proteins 0.000 description 11
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 10
- JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N Glu-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JSIQVRIXMINMTA-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 10
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 10
- 241000880493 Leptailurus serval Species 0.000 description 10
- 241000500375 Microbacterium sp. Species 0.000 description 10
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 10
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 10
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 10
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 10
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 10
- 108010055341 glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 10
- STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N gly-val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN STKYPAFSDFAEPH-LURJTMIESA-N 0.000 description 10
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 10
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 10
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- KTGFOCFYOZQVRJ-UHFFFAOYSA-N 2-[(2-amino-3-methylpentanoyl)amino]pentanedioic acid Chemical compound CCC(C)C(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCC(O)=O KTGFOCFYOZQVRJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N 2-[[(2S)-2-amino-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]amino]acetic acid Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N XUUXCWCKKCZEAW-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 9
- CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N Ala-Gly Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)NCC([O-])=O CXISPYVYMQWFLE-VKHMYHEASA-N 0.000 description 9
- FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N Asp-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FRYULLIZUDQONW-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 9
- IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N Gly-Glu Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IEFJWDNGDZAYNZ-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 9
- OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 9
- 101710002875 TYRO3 Proteins 0.000 description 9
- 102000004965 antibodies Human genes 0.000 description 9
- 108090001123 antibodies Proteins 0.000 description 9
- 108010040443 aspartyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 9
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 9
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 9
- 230000035784 germination Effects 0.000 description 9
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 9
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 9
- 230000002934 lysing Effects 0.000 description 9
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 9
- IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N val-gly Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NCC(O)=O IOUPEELXVYPCPG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 230000017260 vegetative to reproductive phase transition of meristem Effects 0.000 description 9
- RDIKFPRVLJLMER-BQBZGAKWSA-N Ala-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N RDIKFPRVLJLMER-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 8
- DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N Asp-Ser Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DWBZEJHQQIURML-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 8
- SJUXYGVRSGTPMC-UHFFFAOYSA-N Asparaginyl-Alanine Chemical compound OC(=O)C(C)NC(=O)C(N)CC(N)=O SJUXYGVRSGTPMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N Gly-Asp Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O SCCPDJAQCXWPTF-VKHMYHEASA-N 0.000 description 8
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 8
- 206010061217 Infestation Diseases 0.000 description 8
- WKXVAXOSIPTXEC-UHFFFAOYSA-N Isoleucyl-Aspartate Chemical compound CCC(C)C(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC(O)=O WKXVAXOSIPTXEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 8
- 241000131448 Mycosphaerella Species 0.000 description 8
- WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N Ser-Gly Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O WOUIMBGNEUWXQG-VKHMYHEASA-N 0.000 description 8
- IBIDRSSEHFLGSD-YUMQZZPRSA-N Val-Arg Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N IBIDRSSEHFLGSD-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 8
- JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN JKHXYJKMNSSFFL-IUCAKERBSA-N 0.000 description 8
- 108010013835 arginine glutamate Proteins 0.000 description 8
- 108010060035 arginylproline Proteins 0.000 description 8
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 8
- 244000052616 bacterial pathogens Species 0.000 description 8
- 230000003115 biocidal Effects 0.000 description 8
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 8
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine zwitterion Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 108010040030 histidinoalanine Proteins 0.000 description 8
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 8
- 229920000023 polynucleotide Polymers 0.000 description 8
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 8
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 8
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 8
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 8
- QXRNAOYBCYVZCD-BQBZGAKWSA-N (2S)-6-amino-2-[[(2S)-2-aminopropanoyl]amino]hexanoic acid Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN QXRNAOYBCYVZCD-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 7
- 229920001670 16S ribosomal RNA Polymers 0.000 description 7
- XNSKSTRGQIPTSE-UHFFFAOYSA-N Arginyl-Threonine Chemical compound CC(O)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCCNC(N)=N XNSKSTRGQIPTSE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- DVUFTQLHHHJEMK-IMJSIDKUSA-N Asp-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O DVUFTQLHHHJEMK-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 7
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 description 7
- NTQDELBZOMWXRS-UHFFFAOYSA-N Aspartyl-Threonine Chemical compound CC(O)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(O)=O NTQDELBZOMWXRS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N Gly-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN OLIFSFOFKGKIRH-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 7
- QOOWRKBDDXQRHC-BQBZGAKWSA-N L-lysyl-L-alanine Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN QOOWRKBDDXQRHC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 7
- VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 7
- NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N Lys-Arg Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N NPBGTPKLVJEOBE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 7
- ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N Lys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ATIPDCIQTUXABX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 7
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 7
- FELJDCNGZFDUNR-WDSKDSINSA-N Pro-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 FELJDCNGZFDUNR-WDSKDSINSA-N 0.000 description 7
- BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N Thr-Gly Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O BIYXEUAFGLTAEM-WUJLRWPWSA-N 0.000 description 7
- GIAZPLMMQOERPN-YUMQZZPRSA-N Val-Pro Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O GIAZPLMMQOERPN-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 7
- 241000209149 Zea Species 0.000 description 7
- 235000002017 Zea mays subsp mays Nutrition 0.000 description 7
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 7
- 108010044940 alanylglutamine Proteins 0.000 description 7
- 108010087924 alanylproline Proteins 0.000 description 7
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 7
- 235000005822 corn Nutrition 0.000 description 7
- 235000005824 corn Nutrition 0.000 description 7
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 7
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 7
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 7
- SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N α-Glu-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SITLTJHOQZFJGG-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 7
- WPWUFUBLGADILS-WDSKDSINSA-N Ala-Pro Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O WPWUFUBLGADILS-WDSKDSINSA-N 0.000 description 6
- OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 6
- JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N JQFZHHSQMKZLRU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 6
- IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N Arg-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N IJYZHIOOBGIINM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 6
- PSZNHSNIGMJYOZ-WDSKDSINSA-N Asp-Arg Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N PSZNHSNIGMJYOZ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 6
- ZVDPYSVOZFINEE-UHFFFAOYSA-N Aspartyl-Leucine Chemical compound CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(O)=O ZVDPYSVOZFINEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 101710044578 At3g10140 Proteins 0.000 description 6
- KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N Glu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O KOSRFJWDECSPRO-WDSKDSINSA-N 0.000 description 6
- ARPVSMCNIDAQBO-UHFFFAOYSA-N Glutaminyl-Leucine Chemical compound CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(N)=O ARPVSMCNIDAQBO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N Gly-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N JLXVRFDTDUGQEE-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 6
- KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 6
- BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N Gly-Ser Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BCCRXDTUTZHDEU-VKHMYHEASA-N 0.000 description 6
- 229920000084 Gum arabic Polymers 0.000 description 6
- UCGDDTHMMVWVMV-FSPLSTOPSA-N Ile-Gly Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O UCGDDTHMMVWVMV-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 6
- BCVIOZZGJNOEQS-XKNYDFJKSA-N Ile-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)[C@@H](C)CC BCVIOZZGJNOEQS-XKNYDFJKSA-N 0.000 description 6
- JYOAXOMPIXKMKK-UHFFFAOYSA-N Leucyl-Glutamine Chemical compound CC(C)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCC(N)=O JYOAXOMPIXKMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- OAPNERBWQWUPTI-YUMQZZPRSA-N Lys-Gln Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O OAPNERBWQWUPTI-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 6
- ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 6
- 241001633954 Microbacterium oxydans Species 0.000 description 6
- VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N Ser-Asp Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O VBKBDLMWICBSCY-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 6
- LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N Ser-Glu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LAFKUZYWNCHOHT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 6
- WBAXJMCUFIXCNI-WDSKDSINSA-N Ser-Pro Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O WBAXJMCUFIXCNI-WDSKDSINSA-N 0.000 description 6
- HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N Thr-Arg Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N HYLXOQURIOCKIH-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 6
- BWUHENPAEMNGQJ-ZDLURKLDSA-N Thr-Gln Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O BWUHENPAEMNGQJ-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 6
- GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXDLGHLJTHMDII-WISUUJSJSA-N 0.000 description 6
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 6
- WITCOKQIPFWQQD-FSPLSTOPSA-N Val-Asn Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O WITCOKQIPFWQQD-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 6
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 6
- 108010092854 aspartyllysine Proteins 0.000 description 6
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M buffer Substances [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000004927 clay Substances 0.000 description 6
- 229910052570 clay Inorganic materials 0.000 description 6
- 231100000676 disease causative agent Toxicity 0.000 description 6
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 6
- 108010000761 leucylarginine Proteins 0.000 description 6
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 6
- 108010017391 lysylvaline Proteins 0.000 description 6
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- QLROSWPKSBORFJ-BQBZGAKWSA-N pro glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 QLROSWPKSBORFJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 6
- 238000007790 scraping Methods 0.000 description 6
- FAQVCWVVIYYWRR-WHFBIAKZSA-N (2S)-2-[[(2S)-2,5-diamino-5-oxopentanoyl]amino]propanoic acid Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O FAQVCWVVIYYWRR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 5
- 244000215068 Acacia senegal Species 0.000 description 5
- HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N Ala-Gln Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 5
- ZSOICJZJSRWNHX-ACZMJKKPSA-N Ala-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@H](C)[NH3+] ZSOICJZJSRWNHX-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 5
- BUQICHWNXBIBOG-LMVFSUKVSA-N Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N BUQICHWNXBIBOG-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 5
- 241000190633 Cordyceps Species 0.000 description 5
- MRVYVEQPNDSWLH-UHFFFAOYSA-N Glutaminyl-Valine Chemical compound CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(N)=O MRVYVEQPNDSWLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 5
- FRJIAZKQGSCKPQ-FSPLSTOPSA-N His-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 FRJIAZKQGSCKPQ-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 5
- HYXQKVOADYPQEA-CIUDSAMLSA-N Ile-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N HYXQKVOADYPQEA-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 5
- BBIXOODYWPFNDT-CIUDSAMLSA-N Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O BBIXOODYWPFNDT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 5
- TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N Ile-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O TWVKGYNQQAUNRN-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 5
- UWBDLNOCIDGPQE-UHFFFAOYSA-N Isoleucyl-Lysine Chemical compound CCC(C)C(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCCN UWBDLNOCIDGPQE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- SENJXOPIZNYLHU-IUCAKERBSA-N Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N SENJXOPIZNYLHU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 5
- MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 5
- XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 5
- HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N 0.000 description 5
- JPNRPAJITHRXRH-UHFFFAOYSA-N Lysyl-Asparagine Chemical compound NCCCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC(N)=O JPNRPAJITHRXRH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 241001655310 Microbacteriaceae Species 0.000 description 5
- GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N Phe-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 GLUBLISJVJFHQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 5
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 5
- 108020001027 Ribosomal DNA Proteins 0.000 description 5
- NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO NFDYGNFETJVMSE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 5
- ILVGMCVCQBJPSH-WDSKDSINSA-N Ser-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO ILVGMCVCQBJPSH-WDSKDSINSA-N 0.000 description 5
- OBTCMSPFOITUIJ-FSPLSTOPSA-N Val-Asp Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O OBTCMSPFOITUIJ-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 5
- GVRKWABULJAONN-UHFFFAOYSA-N Valyl-Threonine Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NC(C(C)O)C(O)=O GVRKWABULJAONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 241001478284 Variovorax paradoxus Species 0.000 description 5
- 235000010489 acacia gum Nutrition 0.000 description 5
- 239000000205 acacia gum Substances 0.000 description 5
- 108010008355 arginyl-glutamine Proteins 0.000 description 5
- 230000001488 breeding Effects 0.000 description 5
- 229920001577 copolymer Polymers 0.000 description 5
- 108010078144 glutaminyl-glycine Proteins 0.000 description 5
- 101700013200 gyrB1 Proteins 0.000 description 5
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 5
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 5
- 239000002054 inoculum Substances 0.000 description 5
- 101700072042 parE Proteins 0.000 description 5
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 5
- 229920002689 polyvinyl acetate Polymers 0.000 description 5
- 229920002451 polyvinyl alcohol Polymers 0.000 description 5
- 235000019422 polyvinyl alcohol Nutrition 0.000 description 5
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 5
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 5
- 108010053725 prolylvaline Proteins 0.000 description 5
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 5
- 235000002639 sodium chloride Nutrition 0.000 description 5
- 235000015112 vegetable and seed oil Nutrition 0.000 description 5
- 239000008158 vegetable oil Substances 0.000 description 5
- LQJAALCCPOTJGB-YUMQZZPRSA-N (2S)-1-[(2S)-2-amino-5-(diaminomethylideneamino)pentanoyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O LQJAALCCPOTJGB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 4
- GJSURZIOUXUGAL-UHFFFAOYSA-N 2-((2,6-Dichlorophenyl)imino)imidazolidine Chemical compound ClC1=CC=CC(Cl)=C1NC1=NCCN1 GJSURZIOUXUGAL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- SNFUTDLOCQQRQD-UHFFFAOYSA-N 2-[(2-amino-4-carboxybutanoyl)amino]-3-methylpentanoic acid Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O SNFUTDLOCQQRQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 4-amino-5-[(1-carboxy-2-phenylethyl)amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 XMBSYZWANAQXEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- CCUAQNUWXLYFRA-IMJSIDKUSA-N Ala-Asn Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC(N)=O CCUAQNUWXLYFRA-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 4
- SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N Alanyl-Arginine Chemical compound CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- BNODVYXZAAXSHW-UHFFFAOYSA-N Arginyl-Histidine Chemical compound NC(=N)NCCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CN=CN1 BNODVYXZAAXSHW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- QCWJKJLNCFEVPQ-WHFBIAKZSA-N Asn-Gln Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O QCWJKJLNCFEVPQ-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 4
- CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N Asp-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 4
- NPDLYUOYAGBHFB-UHFFFAOYSA-N Asparaginyl-Arginine Chemical compound NC(=O)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N NPDLYUOYAGBHFB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- OWOFCNWTMWOOJJ-WDSKDSINSA-N Gln-Glu Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OWOFCNWTMWOOJJ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O BBBXWRGITSUJPB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 4
- YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N Glu-Pro Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- UQHGAYSULGRWRG-WHFBIAKZSA-N Glu-Ser Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UQHGAYSULGRWRG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 4
- YSWHPLCDIMUKFE-QWRGUYRKSA-N Glu-Tyr Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 YSWHPLCDIMUKFE-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 4
- IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN IKAIKUBBJHFNBZ-LURJTMIESA-N 0.000 description 4
- MMFKFJORZBJVNF-UWVGGRQHSA-N His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 MMFKFJORZBJVNF-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- CNPNWGHRMBQHBZ-ZKWXMUAHSA-N Ile-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O CNPNWGHRMBQHBZ-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 4
- HFKJBCPRWWGPEY-BQBZGAKWSA-N L-arginyl-L-glutamic acid Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HFKJBCPRWWGPEY-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- CIOWSLJGLSUOME-BQBZGAKWSA-N Lys-Asp Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O CIOWSLJGLSUOME-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 4
- FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N Lys-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN FMIIKPHLJKUXGE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 4
- YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N Lys-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN YQAIUOWPSUOINN-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N Met-Ser Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WEDDFMCSUNNZJR-WDSKDSINSA-N 0.000 description 4
- 241000186359 Mycobacterium Species 0.000 description 4
- 231100000678 Mycotoxin Toxicity 0.000 description 4
- BXNGIHFNNNSEOS-UWVGGRQHSA-N Phe-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 BXNGIHFNNNSEOS-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 4
- JXWLMUIXUXLIJR-QWRGUYRKSA-N Phe-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 JXWLMUIXUXLIJR-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 4
- NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N Phe-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 NYQBYASWHVRESG-MIMYLULJSA-N 0.000 description 4
- ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- RVQDZELMXZRSSI-IUCAKERBSA-N Pro-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 RVQDZELMXZRSSI-IUCAKERBSA-N 0.000 description 4
- 229920002288 RpoB Polymers 0.000 description 4
- SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N Ser-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CO SSJMZMUVNKEENT-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 4
- XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N Ser-Ser Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O XZKQVQKUZMAADP-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 4
- RZEQTVHJZCIUBT-UHFFFAOYSA-N Serinyl-Arginine Chemical compound OCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N RZEQTVHJZCIUBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- LDEBVRIURYMKQS-UHFFFAOYSA-N Serinyl-Threonine Chemical compound CC(O)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CO LDEBVRIURYMKQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 4
- HPYDSVWYXXKHRD-VIFPVBQESA-N Tyr-Gly Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CC=C(O)C=C1 HPYDSVWYXXKHRD-VIFPVBQESA-N 0.000 description 4
- QJKMCQRFHJRIPU-XDTLVQLUSA-N Tyr-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 QJKMCQRFHJRIPU-XDTLVQLUSA-N 0.000 description 4
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Natural products NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- LINOMUASTDIRTM-LZTLOYDTSA-N Vomitoxin Chemical compound C([C@]12[C@@]3(C[C@@H](O)[C@H]1O[C@@H]1C=C(C([C@@H](O)[C@@]13CO)=O)C)C)O2 LINOMUASTDIRTM-LZTLOYDTSA-N 0.000 description 4
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 4
- 239000000853 adhesive Substances 0.000 description 4
- 230000001070 adhesive Effects 0.000 description 4
- 108010070944 alanylhistidine Proteins 0.000 description 4
- 108010011559 alanylphenylalanine Proteins 0.000 description 4
- 108010093581 aspartyl-proline Proteins 0.000 description 4
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 description 4
- 235000013312 flour Nutrition 0.000 description 4
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 4
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 4
- VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N gly ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 4
- 230000002363 herbicidal Effects 0.000 description 4
- XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N iron Chemical compound [Fe] XEEYBQQBJWHFJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 244000144972 livestock Species 0.000 description 4
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 4
- 108010056582 methionylglutamic acid Proteins 0.000 description 4
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L mgso4 Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 4
- 239000002636 mycotoxin Substances 0.000 description 4
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 4
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 4
- 101710007479 pkk2A Proteins 0.000 description 4
- 101700063125 ppk Proteins 0.000 description 4
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 4
- 230000002633 protecting Effects 0.000 description 4
- 230000002829 reduced Effects 0.000 description 4
- 230000004044 response Effects 0.000 description 4
- 101700034421 rpoB Proteins 0.000 description 4
- 101700002805 rpoB2 Proteins 0.000 description 4
- 108010048818 seryl-histidine Proteins 0.000 description 4
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 4
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 4
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 238000009331 sowing Methods 0.000 description 4
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 4
- OPINTGHFESTVAX-UHFFFAOYSA-N γ-glutamyl-Arginine Chemical compound NC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N OPINTGHFESTVAX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- CXRCVCURMBFFOL-FXQIFTODSA-N (2S)-1-[(2S)-2-[[(2S)-2-azaniumylpropanoyl]amino]propanoyl]pyrrolidine-2-carboxylate Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O CXRCVCURMBFFOL-FXQIFTODSA-N 0.000 description 3
- ZJZNLRVCZWUONM-JXUBOQSCSA-N (2S)-2-[[(2S,3R)-2-[[(2S)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-3-hydroxybutanoyl]amino]propanoic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O ZJZNLRVCZWUONM-JXUBOQSCSA-N 0.000 description 3
- XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N (2S)-2-[[2-[(2-azaniumylacetyl)amino]acetyl]amino]-4-methylpentanoate Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)CN XPJBQTCXPJNIFE-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 3
- AUTNXSQEVVHSJK-YVNDNENWSA-N (2S,3S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-carboxybutanoyl]amino]-4-carboxybutanoyl]amino]-3-methylpentanoic acid Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O AUTNXSQEVVHSJK-YVNDNENWSA-N 0.000 description 3
- KIUYPHAMDKDICO-WHFBIAKZSA-N (3S)-3-[[(2S)-2-aminopropanoyl]amino]-4-(carboxymethylamino)-4-oxobutanoic acid Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O KIUYPHAMDKDICO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- MGHKSHCBDXNTHX-UHFFFAOYSA-N 4-amino-5-[(4-amino-1-carboxy-4-oxobutyl)amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CCC(N)=O)C(O)=O MGHKSHCBDXNTHX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- MPZWMIIOPAPAKE-UHFFFAOYSA-N 4-amino-5-[[1-carboxy-4-(diaminomethylideneamino)butyl]amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N MPZWMIIOPAPAKE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OMNVYXHOSHNURL-WPRPVWTQSA-N Ala-Phe Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 OMNVYXHOSHNURL-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 3
- QYLJIYOGHRGUIH-CIUDSAMLSA-N Arg-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N QYLJIYOGHRGUIH-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- JSLGXODUIAFWCF-UHFFFAOYSA-N Arginyl-Asparagine Chemical compound NC(N)=NCCCC(N)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O JSLGXODUIAFWCF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- KLKHFFMNGWULBN-VKHMYHEASA-N Asn-Gly Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O KLKHFFMNGWULBN-VKHMYHEASA-N 0.000 description 3
- SONUFGRSSMFHFN-IMJSIDKUSA-N Asn-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SONUFGRSSMFHFN-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 3
- GSMPSRPMQQDRIB-WHFBIAKZSA-N Asp-Gln Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O GSMPSRPMQQDRIB-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- MQLZLIYPFDIDMZ-UHFFFAOYSA-N Asparaginyl-Isoleucine Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(N)=O MQLZLIYPFDIDMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N Aspartyl-Isoleucine Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(O)=O BSWHERGFUNMWGS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000002028 Biomass Substances 0.000 description 3
- 229940041514 Candida albicans extract Drugs 0.000 description 3
- FYYSIASRLDJUNP-WHFBIAKZSA-N Glu-Asp Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O FYYSIASRLDJUNP-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 3
- SXGAGTVDWKQYCX-BQBZGAKWSA-N Glu-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SXGAGTVDWKQYCX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- PFMUCCYYAAFKTH-YFKPBYRVSA-N Gly-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN PFMUCCYYAAFKTH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 3
- IDXZDKMBEXLFMB-UHFFFAOYSA-N Histidinyl-Isoleucine Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 IDXZDKMBEXLFMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- JWBXCSQZLLIOCI-GUBZILKMSA-N Ile-Leu Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C JWBXCSQZLLIOCI-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- MUFXDFWAJSPHIQ-XDTLVQLUSA-N Ile-Tyr Chemical compound CC[C@H](C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CC=C(O)C=C1 MUFXDFWAJSPHIQ-XDTLVQLUSA-N 0.000 description 3
- BCXBIONYYJCSDF-CIUDSAMLSA-N Ile-Val Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O BCXBIONYYJCSDF-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- 229920002424 Internal transcribed spacer Polymers 0.000 description 3
- DRCKHKZYDLJYFQ-UHFFFAOYSA-N Isoleucyl-Threonine Chemical compound CCC(C)C(N)C(=O)NC(C(C)O)C(O)=O DRCKHKZYDLJYFQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000005909 Kieselgur Substances 0.000 description 3
- RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N L-prolylglycine Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 3
- AZLASBBHHSLQDB-GUBZILKMSA-N Leu-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C AZLASBBHHSLQDB-GUBZILKMSA-N 0.000 description 3
- UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N Lys-Glu Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- ADHNYKZHPOEULM-BQBZGAKWSA-N Met-Glu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O ADHNYKZHPOEULM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 3
- DZMGFGQBRYWJOR-YUMQZZPRSA-N Met-Pro Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O DZMGFGQBRYWJOR-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 3
- 241000244206 Nematoda Species 0.000 description 3
- 241001024327 Oenanthe <Aves> Species 0.000 description 3
- MIDZLCFIAINOQN-WPRPVWTQSA-N Phe-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 MIDZLCFIAINOQN-WPRPVWTQSA-N 0.000 description 3
- HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N Phe-Asp Chemical compound OC(=O)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 HWMGTNOVUDIKRE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- JWBLQDDHSDGEGR-DRZSPHRISA-N Phe-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 JWBLQDDHSDGEGR-DRZSPHRISA-N 0.000 description 3
- PYOHODCEOHCZBM-RYUDHWBXSA-N Phe-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 PYOHODCEOHCZBM-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 3
- KLAONOISLHWJEE-UHFFFAOYSA-N Phenylalanyl-Glutamine Chemical compound NC(=O)CCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 KLAONOISLHWJEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N Phenylalanyl-Lysine Chemical compound NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FADYJNXDPBKVCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004372 Polyvinyl alcohol Substances 0.000 description 3
- HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N Pro-Arg Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 HMNSRTLZAJHSIK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N Pro-Pro Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 3
- STJLVHWMYQXCPB-UHFFFAOYSA-N Propiconazole Chemical compound O1C(CCC)COC1(C=1C(=CC(Cl)=CC=1)Cl)CN1N=CN=C1 STJLVHWMYQXCPB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 3
- PPQRSMGDOHLTBE-UWVGGRQHSA-N Ser-Phe Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PPQRSMGDOHLTBE-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- BXLYSRPHVMCOPS-UHFFFAOYSA-N Serinyl-Isoleucine Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CO BXLYSRPHVMCOPS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 3
- NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N Sulfizole Chemical compound CC1=NOC(NS(=O)(=O)C=2C=CC(N)=CC=2)=C1C NHUHCSRWZMLRLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N Thr-Asp Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O IOWJRKAVLALBQB-IWGUZYHVSA-N 0.000 description 3
- BECPPKYKPSRKCP-ZDLURKLDSA-N Thr-Glu Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O BECPPKYKPSRKCP-ZDLURKLDSA-N 0.000 description 3
- WXVIGTAUZBUDPZ-DTLFHODZSA-N Thr-His Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 WXVIGTAUZBUDPZ-DTLFHODZSA-N 0.000 description 3
- UQTNIFUCMBFWEJ-UHFFFAOYSA-N Threoninyl-Asparagine Chemical compound CC(O)C(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC(N)=O UQTNIFUCMBFWEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- YKRQRPFODDJQTC-UHFFFAOYSA-N Threoninyl-Lysine Chemical compound CC(O)C(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCCN YKRQRPFODDJQTC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- CKHWEVXPLJBEOZ-UHFFFAOYSA-N Threoninyl-Valine Chemical compound CC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)C(C)O CKHWEVXPLJBEOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 231100000765 Toxin Toxicity 0.000 description 3
- HWKQNAWCHQMZHK-UHFFFAOYSA-N Trolnitrate Chemical compound [O-][N+](=O)OCCN(CCO[N+]([O-])=O)CCO[N+]([O-])=O HWKQNAWCHQMZHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- PDSLRCZINIDLMU-QWRGUYRKSA-N Tyr-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 PDSLRCZINIDLMU-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 3
- BNQVUHQWZGTIBX-IUCAKERBSA-N Val-His Chemical compound CC(C)[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC1=CN=CN1 BNQVUHQWZGTIBX-IUCAKERBSA-N 0.000 description 3
- PNVLWFYAPWAQMU-CIUDSAMLSA-N Val-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)C(C)C PNVLWFYAPWAQMU-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 3
- STTYIMSDIYISRG-WDSKDSINSA-N Val-Ser Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O STTYIMSDIYISRG-WDSKDSINSA-N 0.000 description 3
- 241000607479 Yersinia pestis Species 0.000 description 3
- 108010041407 alanylaspartic acid Proteins 0.000 description 3
- 235000010443 alginic acid Nutrition 0.000 description 3
- 229920000615 alginic acid Polymers 0.000 description 3
- 210000004666 bacterial spores Anatomy 0.000 description 3
- 239000000440 bentonite Substances 0.000 description 3
- 229910000278 bentonite Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 3
- 238000006065 biodegradation reaction Methods 0.000 description 3
- 239000003124 biologic agent Substances 0.000 description 3
- 229920001222 biopolymer Polymers 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 3
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 230000001332 colony forming Effects 0.000 description 3
- 230000001276 controlling effect Effects 0.000 description 3
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 3
- 230000000875 corresponding Effects 0.000 description 3
- 229930002954 deoxynivalenol Natural products 0.000 description 3
- 239000002270 dispersing agent Substances 0.000 description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 3
- 229940079593 drugs Drugs 0.000 description 3
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 3
- 235000013305 food Nutrition 0.000 description 3
- 230000002068 genetic Effects 0.000 description 3
- 150000004676 glycans Polymers 0.000 description 3
- 108010010147 glycylglutamine Proteins 0.000 description 3
- 108010087823 glycyltyrosine Proteins 0.000 description 3
- 239000004009 herbicide Substances 0.000 description 3
- 108010036413 histidylglycine Proteins 0.000 description 3
- 238000005286 illumination Methods 0.000 description 3
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 3
- 108010044374 isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 3
- 108010078274 isoleucylvaline Proteins 0.000 description 3
- 235000021374 legumes Nutrition 0.000 description 3
- 108010044056 leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 3
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 3
- 238000006011 modification reaction Methods 0.000 description 3
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 3
- 230000000361 pesticidal Effects 0.000 description 3
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 3
- 229920001282 polysaccharide Polymers 0.000 description 3
- 239000005017 polysaccharide Substances 0.000 description 3
- 150000004804 polysaccharides Polymers 0.000 description 3
- 239000011118 polyvinyl acetate Substances 0.000 description 3
- 108010079317 prolyl-tyrosine Proteins 0.000 description 3
- 108010004914 prolylarginine Proteins 0.000 description 3
- 108010015796 prolylisoleucine Proteins 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 description 3
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000008247 solid mixture Substances 0.000 description 3
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 3
- 239000011550 stock solution Substances 0.000 description 3
- 239000000454 talc Substances 0.000 description 3
- 229910052623 talc Inorganic materials 0.000 description 3
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 3
- 108020003112 toxins Proteins 0.000 description 3
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 3
- 108010078580 tyrosylleucine Proteins 0.000 description 3
- 239000010455 vermiculite Substances 0.000 description 3
- 229910052902 vermiculite Inorganic materials 0.000 description 3
- 235000019354 vermiculite Nutrition 0.000 description 3
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 3
- NJMYZEJORPYOTO-UHFFFAOYSA-N γ-glutamyl-Proline Chemical compound NC(=O)CCC(N)C(=O)N1CCCC1C(O)=O NJMYZEJORPYOTO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- LNAZSHAWQACDHT-XIYTZBAFSA-N (2R,3R,4S,5R,6S)-4,5-dimethoxy-2-(methoxymethyl)-3-[(2S,3R,4S,5R,6R)-3,4,5-trimethoxy-6-(methoxymethyl)oxan-2-yl]oxy-6-[(2R,3R,4S,5R,6R)-4,5,6-trimethoxy-2-(methoxymethyl)oxan-3-yl]oxyoxane Chemical compound CO[C@@H]1[C@@H](OC)[C@H](OC)[C@@H](COC)O[C@H]1O[C@H]1[C@H](OC)[C@@H](OC)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](OC)[C@H](OC)O[C@@H]2COC)OC)O[C@@H]1COC LNAZSHAWQACDHT-XIYTZBAFSA-N 0.000 description 2
- ZRLUISBDKUWAIZ-CIUDSAMLSA-N (2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]propanoyl]amino]butanedioic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O ZRLUISBDKUWAIZ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N (2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-aminopropanoyl]amino]propanoyl]amino]-3-hydroxypropanoic acid Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- LDVVMCZRFWMZSG-OLQVQODUSA-N (3aR,7aS)-2-(trichloromethylsulfanyl)-3a,4,7,7a-tetrahydroisoindole-1,3-dione Chemical compound C1C=CC[C@H]2C(=O)N(SC(Cl)(Cl)Cl)C(=O)[C@H]21 LDVVMCZRFWMZSG-OLQVQODUSA-N 0.000 description 2
- INGJLBQKTRJLFO-UKJIMTQDSA-N (4S)-4-amino-5-[[(2S,3S)-1-[[(1S)-1-carboxy-2-methylpropyl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)CC)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O INGJLBQKTRJLFO-UKJIMTQDSA-N 0.000 description 2
- UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 1-[(1S,2R,3R,4S,5R,6R)-3-carbamimidamido-6-{[(2R,3R,4R,5S)-3-{[(2S,3S,4S,5R,6S)-4,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)-3-(methylamino)oxan-2-yl]oxy}-4-formyl-4-hydroxy-5-methyloxolan-2-yl]oxy}-2,4,5-trihydroxycyclohexyl]guanidine Chemical compound CN[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@](C=O)(O)[C@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@@H](NC(N)=N)[C@H](O)[C@H]1O UCSJYZPVAKXKNQ-HZYVHMACSA-N 0.000 description 2
- RFCVXVPWSPOMFJ-UHFFFAOYSA-N 2-[(2-azaniumyl-3-phenylpropanoyl)amino]-4-methylpentanoate Chemical compound CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 RFCVXVPWSPOMFJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AAKRWBIIGKPOKQ-ONGXEEELSA-N 2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-3-methylbutanoyl]amino]acetic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O AAKRWBIIGKPOKQ-ONGXEEELSA-N 0.000 description 2
- RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N 2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-azaniumylpropanoyl]amino]propanoyl]amino]acetate Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O RLMISHABBKUNFO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- ZWEHNKRNPOVVGH-UHFFFAOYSA-N 2-butanone Chemical compound CCC(C)=O ZWEHNKRNPOVVGH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N 4-Hydroxybenzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 FJKROLUGYXJWQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- TUTIHHSZKFBMHM-UHFFFAOYSA-N 4-amino-5-[(3-amino-1-carboxy-3-oxopropyl)amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O TUTIHHSZKFBMHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XZWXFWBHYRFLEF-FSPLSTOPSA-N Ala-His Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 XZWXFWBHYRFLEF-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 2
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- 239000005995 Aluminium silicate Substances 0.000 description 2
- PZZYQPZGQPZBDN-UHFFFAOYSA-N Aluminium silicate Chemical compound O=[Al]O[Si](=O)O[Al]=O PZZYQPZGQPZBDN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PMGDADKJMCOXHX-BQBZGAKWSA-N Arg-Gln Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O PMGDADKJMCOXHX-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- PQBHGSGQZSOLIR-RYUDHWBXSA-N Arg-Phe Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 PQBHGSGQZSOLIR-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- XTWSWDJMIKUJDQ-RYUDHWBXSA-N Arg-Tyr Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XTWSWDJMIKUJDQ-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- 240000002922 Armillaria mellea Species 0.000 description 2
- RJUHZPRQRQLCFL-IMJSIDKUSA-N Asn-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O RJUHZPRQRQLCFL-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 2
- FFMIYIMKQIMDPK-BQBZGAKWSA-N Asn-His Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CN=CN1 FFMIYIMKQIMDPK-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- UKGGPJNBONZZCM-WDSKDSINSA-N Aspartyl-L-proline Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O UKGGPJNBONZZCM-WDSKDSINSA-N 0.000 description 2
- DYDKXJWQCIVTMR-UHFFFAOYSA-N Aspartyl-Methionine Chemical compound CSCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(O)=O DYDKXJWQCIVTMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000194106 Bacillus mycoides Species 0.000 description 2
- 239000005745 Captan Substances 0.000 description 2
- 229940117949 Captan Drugs 0.000 description 2
- 229920002134 Carboxymethyl cellulose Polymers 0.000 description 2
- 229940105329 Carboxymethylcellulose Drugs 0.000 description 2
- 241001337994 Cryptococcus <scale insect> Species 0.000 description 2
- WXOFKRKAHJQKLT-UHFFFAOYSA-N Cysteinyl-Lysine Chemical compound NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CS WXOFKRKAHJQKLT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N D-Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 2
- 108010090461 DFG peptide Proteins 0.000 description 2
- 238000007399 DNA isolation Methods 0.000 description 2
- 229920001353 Dextrin Polymers 0.000 description 2
- 239000004375 Dextrin Substances 0.000 description 2
- 108020000161 EC 2.7.4.1 Proteins 0.000 description 2
- 108010067770 Endopeptidase K Proteins 0.000 description 2
- 241001529716 Entomophaga Species 0.000 description 2
- 229940088598 Enzyme Drugs 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 241000122692 Fusarium avenaceum Species 0.000 description 2
- 241000896533 Gliocladium Species 0.000 description 2
- JEFZIKRIDLHOIF-BYPYZUCNSA-N Gln-Gly Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JEFZIKRIDLHOIF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 2
- JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N Glu-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JZDHUJAFXGNDSB-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- VHLZDSUANXBJHW-UHFFFAOYSA-N Glutaminyl-Phenylalanine Chemical compound NC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 VHLZDSUANXBJHW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HHSJMSCOLJVTCX-UHFFFAOYSA-N Glutaminyl-Threonine Chemical compound CC(O)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(N)=O HHSJMSCOLJVTCX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 235000010469 Glycine max Nutrition 0.000 description 2
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N HCl Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229940031574 HYDROXYMETHYL CELLULOSE Drugs 0.000 description 2
- LNCFUHAPNTYMJB-IUCAKERBSA-N His-Pro Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C1=CN=CN1 LNCFUHAPNTYMJB-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- VLDVBZICYBVQHB-IUCAKERBSA-N His-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])CC1=CN=CN1 VLDVBZICYBVQHB-IUCAKERBSA-N 0.000 description 2
- NIKBMHGRNAPJFW-UHFFFAOYSA-N Histidinyl-Arginine Chemical compound NC(=N)NCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 NIKBMHGRNAPJFW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- RCFDOSNHHZGBOY-ACZMJKKPSA-N Ile-Ala Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O RCFDOSNHHZGBOY-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- WMDZARSFSMZOQO-DRZSPHRISA-N Ile-Phe Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 WMDZARSFSMZOQO-DRZSPHRISA-N 0.000 description 2
- 229920001204 Intergenic region Polymers 0.000 description 2
- QCZYYEFXOBKCNQ-STQMWFEESA-N Lys-Phe Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QCZYYEFXOBKCNQ-STQMWFEESA-N 0.000 description 2
- OGGRSJFVXREKOR-CIUDSAMLSA-N Met-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCSC OGGRSJFVXREKOR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N Met-Thr Chemical compound CSCC[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C([O-])=O KAKJTZWHIUWTTD-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 2
- PESQCPHRXOFIPX-RYUDHWBXSA-N Met-Tyr Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 PESQCPHRXOFIPX-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- BJFJQOMZCSHBMY-YUMQZZPRSA-N Met-Val Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O BJFJQOMZCSHBMY-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- JMEWFDUAFKVAAT-UHFFFAOYSA-N Methionyl-Asparagine Chemical compound CSCCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC(N)=O JMEWFDUAFKVAAT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960002900 Methylcellulose Drugs 0.000 description 2
- 241000203815 Microbacterium testaceum Species 0.000 description 2
- 241000223196 Microdochium nivale Species 0.000 description 2
- UQOFGTXDASPNLL-XHNCKOQMSA-N Muscarine Chemical compound C[C@@H]1O[C@H](C[N+](C)(C)C)C[C@H]1O UQOFGTXDASPNLL-XHNCKOQMSA-N 0.000 description 2
- 241001645776 Muscodor Species 0.000 description 2
- 241000344256 Mycosphaerellaceae Species 0.000 description 2
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108010066427 N-valyltryptophan Proteins 0.000 description 2
- 240000007594 Oryza sativa Species 0.000 description 2
- 235000007164 Oryza sativa Nutrition 0.000 description 2
- 241000179039 Paenibacillus Species 0.000 description 2
- 108010013639 Peptidoglycan Proteins 0.000 description 2
- 235000010627 Phaseolus vulgaris Nutrition 0.000 description 2
- 240000005158 Phaseolus vulgaris Species 0.000 description 2
- WEQJQNWXCSUVMA-RYUDHWBXSA-N Phe-Pro Chemical compound C([C@H]([NH3+])C(=O)N1[C@@H](CCC1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 WEQJQNWXCSUVMA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- 241000233647 Phytophthora nicotianae var. parasitica Species 0.000 description 2
- 241000209504 Poaceae Species 0.000 description 2
- OCYROESYHWUPBP-CIUDSAMLSA-N Pro-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 OCYROESYHWUPBP-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 2
- IWIANZLCJVYEFX-RYUDHWBXSA-N Pro-Phe Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]1NCCC1)C1=CC=CC=C1 IWIANZLCJVYEFX-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 2
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 2
- 206010039509 Scab Diseases 0.000 description 2
- YZMPDHTZJJCGEI-BQBZGAKWSA-N Ser-His Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 YZMPDHTZJJCGEI-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 240000001016 Solanum tuberosum Species 0.000 description 2
- 235000002595 Solanum tuberosum Nutrition 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IQHUITKNHOKGFC-MIMYLULJSA-N Thr-Phe Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 IQHUITKNHOKGFC-MIMYLULJSA-N 0.000 description 2
- WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N Thr-Tyr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WCRFXRIWBFRZBR-GGVZMXCHSA-N 0.000 description 2
- 241000223259 Trichoderma Species 0.000 description 2
- GSEJCLTVZPLZKY-UHFFFAOYSA-N Tris Chemical compound OCCN(CCO)CCO GSEJCLTVZPLZKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- OHGNSVACHBZKSS-KWQFWETISA-N Trp-Ala Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](C)C([O-])=O)=CNC2=C1 OHGNSVACHBZKSS-KWQFWETISA-N 0.000 description 2
- PWIQCLSQVQBOQV-AAEUAGOBSA-N Trp-Glu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 PWIQCLSQVQBOQV-AAEUAGOBSA-N 0.000 description 2
- DZHDVYLBNKMLMB-ZFWWWQNUSA-N Trp-Lys Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O)=CNC2=C1 DZHDVYLBNKMLMB-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 2
- KBUBZAMBIVEFEI-UHFFFAOYSA-N Tryptophyl-Histidine Chemical compound C=1NC2=CC=CC=C2C=1CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CN=CN1 KBUBZAMBIVEFEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- NLKUJNGEGZDXGO-XVKPBYJWSA-N Tyr-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 NLKUJNGEGZDXGO-XVKPBYJWSA-N 0.000 description 2
- AUEJLPRZGVVDNU-STQMWFEESA-N Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AUEJLPRZGVVDNU-STQMWFEESA-N 0.000 description 2
- ONWMQORSVZYVNH-UHFFFAOYSA-N Tyrosyl-Asparagine Chemical compound NC(=O)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 ONWMQORSVZYVNH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZSXJENBJGRHKIG-UHFFFAOYSA-N Tyrosyl-Serine Chemical compound OCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 ZSXJENBJGRHKIG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MFEVVAXTBZELLL-UHFFFAOYSA-N Tyrosyl-Threonine Chemical compound CC(O)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 MFEVVAXTBZELLL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Natural products O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XXDVDTMEVBYRPK-XPUUQOCRSA-N Val-Gln Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O XXDVDTMEVBYRPK-XPUUQOCRSA-N 0.000 description 2
- MBMQEIFVQACCCH-QBODLPLBSA-N Zearalenone Chemical compound O=C1O[C@@H](C)CCCC(=O)CCC\C=C\C2=CC(O)=CC(O)=C21 MBMQEIFVQACCCH-QBODLPLBSA-N 0.000 description 2
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 2
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 2
- 108010076324 alanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 229940072056 alginate Drugs 0.000 description 2
- 229910052784 alkaline earth metal Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000012211 aluminium silicate Nutrition 0.000 description 2
- 150000003863 ammonium salts Chemical class 0.000 description 2
- 230000003698 anagen phase Effects 0.000 description 2
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 2
- 108010001271 arginyl-glutamyl-arginine Proteins 0.000 description 2
- 108010059459 arginyl-threonyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 2
- 108010068265 aspartyltyrosine Proteins 0.000 description 2
- VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L calcium carbonate Chemical compound [Ca+2].[O-]C([O-])=O VTYYLEPIZMXCLO-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 239000002775 capsule Substances 0.000 description 2
- 150000004657 carbamic acid derivatives Chemical class 0.000 description 2
- 235000013877 carbamide Nutrition 0.000 description 2
- 239000001768 carboxy methyl cellulose Substances 0.000 description 2
- 235000010948 carboxy methyl cellulose Nutrition 0.000 description 2
- 239000008112 carboxymethyl-cellulose Substances 0.000 description 2
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 2
- 235000010980 cellulose Nutrition 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- GUTLYIVDDKVIGB-UHFFFAOYSA-N cobalt Chemical compound [Co] GUTLYIVDDKVIGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052803 cobalt Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000010941 cobalt Substances 0.000 description 2
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 2
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 2
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 2
- 238000003967 crop rotation Methods 0.000 description 2
- 235000013365 dairy product Nutrition 0.000 description 2
- 230000004059 degradation Effects 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000001809 detectable Effects 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 235000019425 dextrin Nutrition 0.000 description 2
- 239000008121 dextrose Substances 0.000 description 2
- 238000007865 diluting Methods 0.000 description 2
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 2
- 238000009826 distribution Methods 0.000 description 2
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N edta Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002255 enzymatic Effects 0.000 description 2
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 2
- 239000003925 fat Substances 0.000 description 2
- 230000002349 favourable Effects 0.000 description 2
- 238000011049 filling Methods 0.000 description 2
- 238000005755 formation reaction Methods 0.000 description 2
- 244000053095 fungal pathogens Species 0.000 description 2
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 2
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 2
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 2
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 2
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 2
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 2
- 108010084389 glycyltryptophan Proteins 0.000 description 2
- 238000003306 harvesting Methods 0.000 description 2
- 230000036541 health Effects 0.000 description 2
- 108010028295 histidylhistidine Proteins 0.000 description 2
- 108010085325 histidylproline Proteins 0.000 description 2
- 108010018006 histidylserine Proteins 0.000 description 2
- 239000010903 husk Substances 0.000 description 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 2
- 229920003063 hydroxymethyl cellulose Polymers 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000003973 irrigation Methods 0.000 description 2
- 230000002262 irrigation Effects 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 108010077158 leucinyl-arginyl-tryptophan Proteins 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- 239000012139 lysis buffer Substances 0.000 description 2
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 2
- 108010044655 lysylproline Proteins 0.000 description 2
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 2
- PWHULOQIROXLJO-UHFFFAOYSA-N manganese Chemical compound [Mn] PWHULOQIROXLJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052748 manganese Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011572 manganese Substances 0.000 description 2
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 2
- 229920000609 methyl cellulose Polymers 0.000 description 2
- 239000001923 methylcellulose Substances 0.000 description 2
- 238000009629 microbiological culture Methods 0.000 description 2
- 235000010755 mineral Nutrition 0.000 description 2
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 2
- LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N n-butanol Chemical compound CCCCO LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000001069 nematicidal Effects 0.000 description 2
- 235000016709 nutrition Nutrition 0.000 description 2
- 239000003921 oil Substances 0.000 description 2
- 150000002894 organic compounds Chemical class 0.000 description 2
- RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N p-acetaminophenol Chemical compound CC(=O)NC1=CC=C(O)C=C1 RZVAJINKPMORJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003208 petroleum Substances 0.000 description 2
- 108010084525 phenylalanyl-phenylalanyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010024607 phenylalanylalanine Proteins 0.000 description 2
- 230000003032 phytopathogenic Effects 0.000 description 2
- 230000000885 phytotoxic Effects 0.000 description 2
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 2
- 239000004033 plastic Substances 0.000 description 2
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 2
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M potassium chloride Chemical compound [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 239000003223 protective agent Substances 0.000 description 2
- 238000000163 radioactive labelling Methods 0.000 description 2
- 238000007894 restriction fragment length polymorphism technique Methods 0.000 description 2
- 229920002973 ribosomal RNA Polymers 0.000 description 2
- 235000009566 rice Nutrition 0.000 description 2
- 239000004576 sand Substances 0.000 description 2
- 238000007480 sanger sequencing Methods 0.000 description 2
- 230000007226 seed germination Effects 0.000 description 2
- 108010071207 serylmethionine Proteins 0.000 description 2
- BPQQTUXANYXVAA-UHFFFAOYSA-N silicate Chemical compound [O-][Si]([O-])([O-])[O-] BPQQTUXANYXVAA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KEAYESYHFKHZAL-UHFFFAOYSA-N sodium Chemical compound [Na] KEAYESYHFKHZAL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000011343 solid material Substances 0.000 description 2
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 2
- 238000003892 spreading Methods 0.000 description 2
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 2
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 2
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic Effects 0.000 description 2
- 108010031491 threonyl-lysyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 2
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 150000003327 trichothecene derivatives Chemical class [H][C@]12O[C@]3([H])[C@H]([*])[C@@H]([*])[C@@](C)(C33CO3)C1(C[*])C([*])C([*])C(C)=C2 0.000 description 2
- 229930013292 trichothecenes Natural products 0.000 description 2
- 239000012137 tryptone Substances 0.000 description 2
- 108010029384 tryptophyl-histidine Proteins 0.000 description 2
- 108010020532 tyrosyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 238000009827 uniform distribution Methods 0.000 description 2
- 229920002554 vinyl polymer Polymers 0.000 description 2
- 239000002699 waste material Substances 0.000 description 2
- 239000000080 wetting agent Substances 0.000 description 2
- 239000002023 wood Substances 0.000 description 2
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 2
- XITLYYAIPBBHPX-UHFFFAOYSA-N γ-glutamyl-Isoleucine Chemical compound CCC(C)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(N)=O XITLYYAIPBBHPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JSZMKEYEVLDPDO-ACZMJKKPSA-N (2R)-2-[[(2S,3S)-2-amino-3-methylpentanoyl]amino]-3-sulfanylpropanoic acid Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O JSZMKEYEVLDPDO-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N (2S)-1-[(2S)-2-azaniumyl-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]pyrrolidine-2-carboxylate Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 VNYDHJARLHNEGA-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- QBJCJWAZOPCNIX-JPLJXNOCSA-N (2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-3-carboxypropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-3-methylbutanoic acid Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QBJCJWAZOPCNIX-JPLJXNOCSA-N 0.000 description 1
- BUZMZDDKFCSKOT-CIUDSAMLSA-N (2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-carboxybutanoyl]amino]-4-carboxybutanoyl]amino]pentanedioic acid Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BUZMZDDKFCSKOT-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- VKVDRTGWLVZJOM-DCAQKATOSA-N (2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-3-methylbutanoyl]amino]-3-hydroxypropanoic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O VKVDRTGWLVZJOM-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- ZAVCJRJOQKIOJW-KKUMJFAQSA-N (2S)-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]butanedioic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 ZAVCJRJOQKIOJW-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- KYPMKDGKAYQCHO-RYUDHWBXSA-N (2S)-2-[[(2S)-2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-4-methylsulfanylbutanoic acid Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 KYPMKDGKAYQCHO-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- LZDNBBYBDGBADK-KBPBESRZSA-N (2S)-2-[[(2S)-2-amino-3-methylbutanoyl]amino]-3-(1H-indol-3-yl)propanoic acid Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 LZDNBBYBDGBADK-KBPBESRZSA-N 0.000 description 1
- NIZKGBJVCMRDKO-KWQFWETISA-N (2S)-2-[[2-[[(2S)-2-aminopropanoyl]amino]acetyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoic acid Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NIZKGBJVCMRDKO-KWQFWETISA-N 0.000 description 1
- NBTGEURICRTMGL-WHFBIAKZSA-N (2S)-2-[[2-[[(2S)-2-aminopropanoyl]amino]acetyl]amino]-3-hydroxypropanoic acid Chemical compound C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NBTGEURICRTMGL-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- BIZNDKMFQHDOIE-KKUMJFAQSA-N (2S)-4-amino-2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 BIZNDKMFQHDOIE-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- BUDNAJYVCUHLSV-ZLUOBGJFSA-N (3S)-3-[[(2S)-2-aminopropanoyl]amino]-4-[[(1S)-1-carboxy-2-hydroxyethyl]amino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O BUDNAJYVCUHLSV-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- KXTAGESXNQEZKB-DZKIICNBSA-N (4S)-4-amino-5-[[(2S)-1-[[(1S)-1-carboxy-2-methylpropyl]amino]-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KXTAGESXNQEZKB-DZKIICNBSA-N 0.000 description 1
- WTMZXOPHTIVFCP-QEWYBTABSA-N (4S)-4-amino-5-[[(2S,3S)-1-[[(1S)-1-carboxy-2-phenylethyl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 WTMZXOPHTIVFCP-QEWYBTABSA-N 0.000 description 1
- 229920000160 (ribonucleotides)n+m Polymers 0.000 description 1
- LGXVIGDEPROXKC-UHFFFAOYSA-N 1,1-Dichloroethene Chemical compound ClC(Cl)=C LGXVIGDEPROXKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AAILEWXSEQLMNI-UHFFFAOYSA-N 1H-pyridazin-6-one Chemical class OC1=CC=CN=N1 AAILEWXSEQLMNI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SVPKNMBRVBMTLB-UHFFFAOYSA-N 2,3-dichloronaphthalene-1,4-dione Chemical compound C1=CC=C2C(=O)C(Cl)=C(Cl)C(=O)C2=C1 SVPKNMBRVBMTLB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CGNBQYFXGQHUQP-UHFFFAOYSA-N 2,3-dinitroaniline Chemical class NC1=CC=CC([N+]([O-])=O)=C1[N+]([O-])=O CGNBQYFXGQHUQP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GQWWGRUJOCIUKI-UHFFFAOYSA-N 2-[3-(2-methyl-1-oxopyrrolo[1,2-a]pyrazin-3-yl)propyl]guanidine Chemical compound O=C1N(C)C(CCCN=C(N)N)=CN2C=CC=C21 GQWWGRUJOCIUKI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WNGVUZWBXZKQES-YUMQZZPRSA-N 2-[[(2S)-2-[[(2S)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]propanoyl]amino]acetic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)NCC(O)=O WNGVUZWBXZKQES-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N 2-[[2-[[(2S)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]acetyl]amino]acetic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)NCC(=O)NCC(O)=O VWHGTYCRDRBSFI-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- LFSAPCRASZRSKS-UHFFFAOYSA-N 2-methylcyclohexan-1-one Chemical compound CC1CCCCC1=O LFSAPCRASZRSKS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CMLFRMDBDNHMRA-UHFFFAOYSA-N 2H-1,2-benzoxazine Chemical compound C1=CC=C2C=CNOC2=C1 CMLFRMDBDNHMRA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BCHZICNRHXRCHY-UHFFFAOYSA-N 2H-oxazine Chemical compound N1OC=CC=C1 BCHZICNRHXRCHY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AGIJRRREJXSQJR-UHFFFAOYSA-N 2H-thiazine Chemical compound N1SC=CC=C1 AGIJRRREJXSQJR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QZHXKQKKEBXYRG-UHFFFAOYSA-N 4-N-(4-aminophenyl)benzene-1,4-diamine Chemical compound C1=CC(N)=CC=C1NC1=CC=C(N)C=C1 QZHXKQKKEBXYRG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HKTRDWYCAUTRRL-UHFFFAOYSA-N 4-amino-5-[[1-carboxy-2-(1H-imidazol-5-yl)ethyl]amino]-5-oxopentanoic acid Chemical compound OC(=O)CCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CN=CN1 HKTRDWYCAUTRRL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940090248 4-hydroxybenzoic acid Drugs 0.000 description 1
- 108010036211 5-HT-moduline Proteins 0.000 description 1
- PNEYBMLMFCGWSK-UHFFFAOYSA-N AI2O3 Inorganic materials [O-2].[O-2].[O-2].[Al+3].[Al+3] PNEYBMLMFCGWSK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N Acridine Chemical compound C1=CC=CC2=CC3=CC=CC=C3N=C21 DZBUGLKDJFMEHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- XAEWTDMGFGHWFK-IMJSIDKUSA-M Ala-Asp(1-) Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C([O-])=O)CC([O-])=O XAEWTDMGFGHWFK-IMJSIDKUSA-M 0.000 description 1
- 108010040956 Ala-Asp-Glu-Leu Proteins 0.000 description 1
- 108010076441 Ala-His-His Proteins 0.000 description 1
- FSHURBQASBLAPO-WDSKDSINSA-N Ala-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N FSHURBQASBLAPO-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- WUGMRIBZSVSJNP-UFBFGSQYSA-N Ala-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(O)=O)=CNC2=C1 WUGMRIBZSVSJNP-UFBFGSQYSA-N 0.000 description 1
- 241000251169 Alopias vulpinus Species 0.000 description 1
- 241000609240 Ambelania acida Species 0.000 description 1
- 241000501812 Ampelomyces Species 0.000 description 1
- RZVHIXYEVGDQDX-UHFFFAOYSA-N Anthraquinone Chemical compound C1=CC=C2C(=O)C3=CC=CC=C3C(=O)C2=C1 RZVHIXYEVGDQDX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940064005 Antibiotic throat preparations Drugs 0.000 description 1
- 229940083879 Antibiotics FOR TREATMENT OF HEMORRHOIDS AND ANAL FISSURES FOR TOPICAL USE Drugs 0.000 description 1
- 229940042052 Antibiotics for systemic use Drugs 0.000 description 1
- 229940042786 Antitubercular Antibiotics Drugs 0.000 description 1
- 241000219194 Arabidopsis Species 0.000 description 1
- 240000005781 Arachis hypogaea Species 0.000 description 1
- 241000239223 Arachnida Species 0.000 description 1
- SIFXMYAHXJGAFC-WDSKDSINSA-N Arg-Asp Chemical compound NC(=N)NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O SIFXMYAHXJGAFC-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- ROWCTNFEMKOIFQ-YUMQZZPRSA-N Arg-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N ROWCTNFEMKOIFQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- DAQIJMOLTMGJLO-YUMQZZPRSA-N Arg-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N DAQIJMOLTMGJLO-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- HZYFHQOWCFUSOV-IMJSIDKUSA-N Asn-Asp Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O HZYFHQOWCFUSOV-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- IIFDPDVJAHQFSR-WHFBIAKZSA-N Asn-Glu Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IIFDPDVJAHQFSR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- GADKFYNESXNRLC-WDSKDSINSA-N Asn-Pro Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O GADKFYNESXNRLC-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- KWBQPGIYEZKDEG-FSPLSTOPSA-N Asn-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O KWBQPGIYEZKDEG-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- HSPSXROIMXIJQW-BQBZGAKWSA-N Asp-His Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 HSPSXROIMXIJQW-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N Asp-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O OAMLVOVXNKILLQ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- YZQCXOFQZKCETR-UWVGGRQHSA-N Asp-Phe Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 YZQCXOFQZKCETR-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N Asp-Tyr Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 NALWOULWGHTVDA-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- CPMKYMGGYUFOHS-FSPLSTOPSA-N Asp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CPMKYMGGYUFOHS-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- HXWUJJADFMXNKA-UHFFFAOYSA-N Asparaginyl-Leucine Chemical compound CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(N)=O HXWUJJADFMXNKA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QJMCHPGWFZZRID-UHFFFAOYSA-N Asparaginyl-Lysine Chemical compound NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(N)=O QJMCHPGWFZZRID-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OMSMPWHEGLNQOD-UHFFFAOYSA-N Asparaginyl-Phenylalanine Chemical compound NC(=O)CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 OMSMPWHEGLNQOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VBKIFHUVGLOJKT-UHFFFAOYSA-N Asparaginyl-Threonine Chemical compound CC(O)C(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC(N)=O VBKIFHUVGLOJKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VGRHZPNRCLAHQA-UHFFFAOYSA-N Aspartyl-Asparagine Chemical compound OC(=O)CC(N)C(=O)NC(CC(N)=O)C(O)=O VGRHZPNRCLAHQA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FKBFDTRILNZGAI-UHFFFAOYSA-N Aspartyl-Cysteine Chemical compound OC(=O)CC(N)C(=O)NC(CS)C(O)=O FKBFDTRILNZGAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000223651 Aureobasidium Species 0.000 description 1
- 241001112741 Bacillaceae Species 0.000 description 1
- 241000193738 Bacillus anthracis Species 0.000 description 1
- 241000678616 Bacillus coahuilensis Species 0.000 description 1
- 241000906059 Bacillus pseudomycoides Species 0.000 description 1
- 240000008371 Bacillus subtilis Species 0.000 description 1
- 229940075615 Bacillus subtilis Drugs 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 241000193388 Bacillus thuringiensis Species 0.000 description 1
- 241000223679 Beauveria Species 0.000 description 1
- 241000751139 Beauveria bassiana Species 0.000 description 1
- RIOXQFHNBCKOKP-UHFFFAOYSA-N Benomyl Chemical compound C1=CC=C2N(C(=O)NCCCC)C(NC(=O)OC)=NC2=C1 RIOXQFHNBCKOKP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N Benzoic acid Natural products OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000219310 Beta vulgaris subsp. vulgaris Species 0.000 description 1
- 240000002791 Brassica napus Species 0.000 description 1
- 240000007124 Brassica oleracea Species 0.000 description 1
- 235000011301 Brassica oleracea var capitata Nutrition 0.000 description 1
- 235000001169 Brassica oleracea var oleracea Nutrition 0.000 description 1
- 235000004977 Brassica sinapistrum Nutrition 0.000 description 1
- 241000555281 Brevibacillus Species 0.000 description 1
- 238000009631 Broth culture Methods 0.000 description 1
- 229940105657 CATALASE Drugs 0.000 description 1
- 229960005069 Calcium Drugs 0.000 description 1
- 229960003563 Calcium Carbonate Drugs 0.000 description 1
- 241000222120 Candida <Saccharomycetales> Species 0.000 description 1
- 235000002566 Capsicum Nutrition 0.000 description 1
- JHRWWRDRBPCWTF-OLQVQODUSA-N Captafol Chemical compound C1C=CC[C@H]2C(=O)N(SC(Cl)(Cl)C(Cl)Cl)C(=O)[C@H]21 JHRWWRDRBPCWTF-OLQVQODUSA-N 0.000 description 1
- 210000002421 Cell Wall Anatomy 0.000 description 1
- 241001157813 Cercospora Species 0.000 description 1
- 240000001817 Cereus hexagonus Species 0.000 description 1
- 241000221955 Chaetomium Species 0.000 description 1
- 229920002101 Chitin Polymers 0.000 description 1
- DJHJJVWPFGHIPH-OODMECLYSA-N Chitin Chemical compound O[C@@H]1C(NC(=O)C)[C@H](O)OC(CO)[C@H]1COC[C@H]1C(NC(C)=O)[C@@H](O)[C@H](COC[C@H]2C([C@@H](O)[C@H](O)C(CO)O2)NC(C)=O)C(CO)O1 DJHJJVWPFGHIPH-OODMECLYSA-N 0.000 description 1
- 229920001661 Chitosan Polymers 0.000 description 1
- 241000309104 Chlorochromatium aggregatum Species 0.000 description 1
- CRQQGFGUEAVUIL-UHFFFAOYSA-N Chlorothalonil Chemical compound ClC1=C(Cl)C(C#N)=C(Cl)C(C#N)=C1Cl CRQQGFGUEAVUIL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000008733 Citrus aurantifolia Nutrition 0.000 description 1
- 241000248757 Cordyceps brongniartii Species 0.000 description 1
- 241001266001 Cordyceps confragosa Species 0.000 description 1
- 241001264174 Cordyceps militaris Species 0.000 description 1
- 229920000742 Cotton Polymers 0.000 description 1
- 241000195493 Cryptophyta Species 0.000 description 1
- 241001626319 Culicinomyces Species 0.000 description 1
- HAYVTMHUNMMXCV-UHFFFAOYSA-N Cysteinyl-Alanine Chemical compound OC(=O)C(C)NC(=O)C(N)CS HAYVTMHUNMMXCV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RGTVXXNMOGHRAY-UHFFFAOYSA-N Cysteinyl-Arginine Chemical compound SCC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N RGTVXXNMOGHRAY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010054814 DNA Gyrase Proteins 0.000 description 1
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 1
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 description 1
- 239000003155 DNA primer Substances 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 240000002860 Daucus carota Species 0.000 description 1
- 235000002767 Daucus carota Nutrition 0.000 description 1
- 206010012735 Diarrhoea Diseases 0.000 description 1
- YRMLFORXOOIJDR-UHFFFAOYSA-N Dichlormid Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N(CC=C)CC=C YRMLFORXOOIJDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CZZYITDELCSZES-UHFFFAOYSA-N Diphenylmethane Chemical compound C=1C=CC=CC=1CC1=CC=CC=C1 CZZYITDELCSZES-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000016938 EC 1.11.1.6 Human genes 0.000 description 1
- 108010053835 EC 1.11.1.6 Proteins 0.000 description 1
- 240000006775 Enicostema verticillatum Species 0.000 description 1
- 241000147181 Entomophaga grylli Species 0.000 description 1
- 241000147179 Entomophaga maimaiga Species 0.000 description 1
- 241001480508 Entomophthora Species 0.000 description 1
- XDBBZHXTFQZTEO-ZWNOBZJWSA-N Ergoline Chemical compound C1C([C]23)=CN=C3C=CC=C2[C@@H]2[C@@H]1NCCC2 XDBBZHXTFQZTEO-ZWNOBZJWSA-N 0.000 description 1
- DNVPQKQSNYMLRS-APGDWVJJSA-N Ergosterol Chemical compound C1[C@@H](O)CC[C@]2(C)[C@@H](CC[C@@]3([C@@H]([C@H](C)/C=C/[C@H](C)C(C)C)CC[C@H]33)C)C3=CC=C21 DNVPQKQSNYMLRS-APGDWVJJSA-N 0.000 description 1
- DNVPQKQSNYMLRS-LNHMRCHQSA-N Ergosterol Natural products O[C@@H]1CC=2[C@@](C)([C@@H]3C([C@H]4[C@@](C)([C@H]([C@@H](/C=C/[C@H](C(C)C)C)C)CC4)CC3)=CC=2)CC1 DNVPQKQSNYMLRS-LNHMRCHQSA-N 0.000 description 1
- 241000588698 Erwinia Species 0.000 description 1
- 239000001856 Ethyl cellulose Substances 0.000 description 1
- ZZSNKZQZMQGXPY-UHFFFAOYSA-N Ethyl cellulose Chemical compound CCOCC1OC(OC)C(OCC)C(OCC)C1OC1C(O)C(O)C(OC)C(CO)O1 ZZSNKZQZMQGXPY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005977 Ethylene Substances 0.000 description 1
- 230000036809 Fabs Effects 0.000 description 1
- 239000005781 Fludioxonil Substances 0.000 description 1
- 241000223194 Fusarium culmorum Species 0.000 description 1
- 241000223197 Fusarium lateritium Species 0.000 description 1
- 241001489200 Fusarium poae Species 0.000 description 1
- 208000008665 Gastrointestinal Disease Diseases 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- 241000626621 Geobacillus Species 0.000 description 1
- LOJYQMFIIJVETK-WDSKDSINSA-N Gln-Gln Chemical compound NC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O LOJYQMFIIJVETK-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- 241000235503 Glomus Species 0.000 description 1
- SSHIXEILTLPAQT-UHFFFAOYSA-N Glutaminyl-Aspartate Chemical compound NC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CC(O)=O)C(O)=O SSHIXEILTLPAQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N Gly-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- AJHCSUXXECOXOY-NSHDSACASA-N Gly-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)CN)C(O)=O)=CNC2=C1 AJHCSUXXECOXOY-NSHDSACASA-N 0.000 description 1
- 240000007842 Glycine max Species 0.000 description 1
- XDDAORKBJWWYJS-UHFFFAOYSA-N Glyphosate Chemical compound OC(=O)CNCP(O)(O)=O XDDAORKBJWWYJS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 240000006962 Gossypium hirsutum Species 0.000 description 1
- 229940093922 Gynecological Antibiotics Drugs 0.000 description 1
- 229940093915 Gynecological Organic acids Drugs 0.000 description 1
- 206010018987 Haemorrhage Diseases 0.000 description 1
- 241000208818 Helianthus Species 0.000 description 1
- 235000003222 Helianthus annuus Nutrition 0.000 description 1
- 241000143459 Hirsutella Species 0.000 description 1
- 241001492549 Hirsutella citriformis Species 0.000 description 1
- LYCVKHSJGDMDLM-LURJTMIESA-N His-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 LYCVKHSJGDMDLM-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- KRBMQYPTDYSENE-BQBZGAKWSA-N His-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CNC=N1 KRBMQYPTDYSENE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- HTOOKGDPMXSJSY-STQMWFEESA-N His-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CN=CN1 HTOOKGDPMXSJSY-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- MAJYPBAJPNUFPV-UHFFFAOYSA-N Histidinyl-Cysteine Chemical compound SCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 MAJYPBAJPNUFPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010020400 Hostility Diseases 0.000 description 1
- 229920002153 Hydroxypropyl cellulose Polymers 0.000 description 1
- TUYOFUHICRWDGA-CIUDSAMLSA-N Ile-Met Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCSC TUYOFUHICRWDGA-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- RSAZYXZUJROYKR-UHFFFAOYSA-N Indophenol Chemical compound C1=CC(O)=CC=C1N=C1C=CC(=O)C=C1 RSAZYXZUJROYKR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000030456 Isaria farinosa Species 0.000 description 1
- 241000188153 Isaria fumosorosea Species 0.000 description 1
- 239000005908 Isaria fumosorosea Apopka strain 97 (formely Paecilomyces fumosoroseus) Substances 0.000 description 1
- PWWVAXIEGOYWEE-UHFFFAOYSA-N Isophenergan Chemical compound C1=CC=C2N(CC(C)N(C)C)C3=CC=CC=C3SC2=C1 PWWVAXIEGOYWEE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000026993 Jeotgalibacillus Species 0.000 description 1
- TYQCGQRIZGCHNB-JLAZNSOCSA-N L-ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(O)=C(O)C1=O TYQCGQRIZGCHNB-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 1
- JVTAAEKCZFNVCJ-REOHCLBHSA-N L-lactic acid Chemical compound C[C@H](O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N L-ornithine Chemical compound NCCC[C@H](N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- JXNRXNCCROJZFB-RYUDHWBXSA-N L-tyrosyl-L-arginine Chemical compound NC(=N)NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 JXNRXNCCROJZFB-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- 241001149420 Laccaria bicolor Species 0.000 description 1
- 241001112724 Lactobacillales Species 0.000 description 1
- 229940039696 Lactobacillus Drugs 0.000 description 1
- 241000186660 Lactobacillus Species 0.000 description 1
- 240000008415 Lactuca sativa Species 0.000 description 1
- 235000003228 Lactuca sativa Nutrition 0.000 description 1
- DVCSNHXRZUVYAM-BQBZGAKWSA-N Leu-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O DVCSNHXRZUVYAM-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- HIZYETOZLYFUFF-BQBZGAKWSA-N Leu-Cys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O HIZYETOZLYFUFF-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N Leu-Phe Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 KFKWRHQBZQICHA-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- BQVUABVGYYSDCJ-ZFWWWQNUSA-N Leu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 241000209510 Liliopsida Species 0.000 description 1
- 241000186781 Listeria Species 0.000 description 1
- 235000007688 Lycopersicon esculentum Nutrition 0.000 description 1
- NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N Lys-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN NVGBPTNZLWRQSY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- AIXUQKMMBQJZCU-IUCAKERBSA-N Lys-Pro Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O AIXUQKMMBQJZCU-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N Lys-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YSZNURNVYFUEHC-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- MYTOTTSMVMWVJN-STQMWFEESA-N Lys-Tyr Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 MYTOTTSMVMWVJN-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 229920002774 Maltodextrin Polymers 0.000 description 1
- 241000908212 Mariannaea Species 0.000 description 1
- JHKXZYLNVJRAAJ-WDSKDSINSA-N Met-Ala Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O JHKXZYLNVJRAAJ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- UASDAHIAHBRZQV-YUMQZZPRSA-N Met-Arg Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCNC(N)=N UASDAHIAHBRZQV-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- QTZXSYBVOSXBEJ-WDSKDSINSA-N Met-Asp Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(O)=O QTZXSYBVOSXBEJ-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- MUMXFARPYQTTSL-BQBZGAKWSA-N Met-Gln Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O MUMXFARPYQTTSL-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N Met-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- IMTUWVJPCQPJEE-IUCAKERBSA-N Met-Lys Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN IMTUWVJPCQPJEE-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- 241000223201 Metarhizium Species 0.000 description 1
- 241000223250 Metarhizium anisopliae Species 0.000 description 1
- 241001303988 Metarhizium rileyi Species 0.000 description 1
- FQPSGWSUVKBHSU-UHFFFAOYSA-N Methacrylamide Chemical compound CC(=C)C(N)=O FQPSGWSUVKBHSU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NDYNTQWSJLPEMK-UHFFFAOYSA-N Methionyl-Cysteine Chemical compound CSCCC(N)C(=O)NC(CS)C(O)=O NDYNTQWSJLPEMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NTIZESTWPVYFNL-UHFFFAOYSA-N Methyl isobutyl ketone Chemical compound CC(C)CC(C)=O NTIZESTWPVYFNL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L MgCl2 Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 241000983403 Microbacterium luteolum Species 0.000 description 1
- 241000856658 Microbacterium maritypicum Species 0.000 description 1
- 241001555224 Microdochium majus Species 0.000 description 1
- 229920000881 Modified starch Polymers 0.000 description 1
- 239000004368 Modified starch Substances 0.000 description 1
- 241001661277 Moelleriella libera Species 0.000 description 1
- 241001645777 Muscodor albus Species 0.000 description 1
- 241001557906 Mycosphaerella sp. Species 0.000 description 1
- GRSMWKLPSNHDHA-UHFFFAOYSA-N Naphthalic anhydride Chemical class C1=CC(C(=O)OC2=O)=C3C2=CC=CC3=C1 GRSMWKLPSNHDHA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000366215 Neozygites floridana Species 0.000 description 1
- 240000008962 Nicotiana tabacum Species 0.000 description 1
- 235000002637 Nicotiana tabacum Nutrition 0.000 description 1
- 241000495841 Oenanthe oenanthe Species 0.000 description 1
- 229920000272 Oligonucleotide Polymers 0.000 description 1
- 241000855107 Ophiocordyceps entomorrhiza Species 0.000 description 1
- 241000006065 Ophiocordyceps gracilis Species 0.000 description 1
- 241000005758 Ophiocordyceps myrmecophila Species 0.000 description 1
- 241000530426 Ophiocordyceps ravenelii Species 0.000 description 1
- 241001248610 Ophiocordyceps sinensis Species 0.000 description 1
- 241000124210 Ophiocordyceps unilateralis Species 0.000 description 1
- 241000530427 Ophiocordyceps variabilis Species 0.000 description 1
- 229960003104 Ornithine Drugs 0.000 description 1
- XAPRFLSJBSXESP-UHFFFAOYSA-N Oxycinchophen Chemical compound N=1C2=CC=CC=C2C(C(=O)O)=C(O)C=1C1=CC=CC=C1 XAPRFLSJBSXESP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001236817 Paecilomyces <Clavicipitaceae> Species 0.000 description 1
- 241001289560 Pandora neoaphidis Species 0.000 description 1
- 241000520272 Pantoea Species 0.000 description 1
- 241000364057 Peoria Species 0.000 description 1
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 description 1
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 description 1
- 241000534579 Persoonia Species 0.000 description 1
- OZILORBBPKKGRI-RYUDHWBXSA-N Phe-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 OZILORBBPKKGRI-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- OHUXOEXBXPZKPT-STQMWFEESA-N Phe-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 OHUXOEXBXPZKPT-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- GKZIWHRNKRBEOH-HOTGVXAUSA-N Phe-Phe Chemical compound C([C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C([O-])=O)C1=CC=CC=C1 GKZIWHRNKRBEOH-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 1
- ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N Phe-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 ROHDXJUFQVRDAV-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- 229940067631 Phospholipids Drugs 0.000 description 1
- IEQIEDJGQAUEQZ-UHFFFAOYSA-N Phthalocyanine Chemical compound N1C(N=C2C3=CC=CC=C3C(N=C3C4=CC=CC=C4C(=N4)N3)=N2)=C(C=CC=C2)C2=C1N=C1C2=CC=CC=C2C4=N1 IEQIEDJGQAUEQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000235648 Pichia Species 0.000 description 1
- 241000758706 Piperaceae Species 0.000 description 1
- 229920003171 Poly (ethylene oxide) Polymers 0.000 description 1
- 241001085205 Prenanthella exigua Species 0.000 description 1
- JQOHKCDMINQZRV-WDSKDSINSA-N Pro-Asn Chemical compound NC(=O)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 JQOHKCDMINQZRV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- SHAQGFGGJSLLHE-BQBZGAKWSA-N Pro-Gln Chemical compound NC(=O)CC[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 SHAQGFGGJSLLHE-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N Pro-Ser Chemical compound OC[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 AFWBWPCXSWUCLB-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- HXNYBZQLBWIADP-UHFFFAOYSA-N Prolyl-Cysteine Chemical compound OC(=O)C(CS)NC(=O)C1CCCN1 HXNYBZQLBWIADP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BEPSGCXDIVACBU-UHFFFAOYSA-N Prolyl-Histidine Chemical compound C1CCNC1C(=O)NC(C(=O)O)CC1=CN=CN1 BEPSGCXDIVACBU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010009736 Protein Hydrolysates Proteins 0.000 description 1
- 241000899394 Pseudocercospora Species 0.000 description 1
- 102000009572 RNA Polymerase II Human genes 0.000 description 1
- 108010009460 RNA Polymerase II Proteins 0.000 description 1
- 108010025216 RVF peptide Proteins 0.000 description 1
- 241000173767 Ramularia Species 0.000 description 1
- 241000167716 Ramularia endophylla Species 0.000 description 1
- 241001468870 Ramularia pratensis Species 0.000 description 1
- 241000589180 Rhizobium Species 0.000 description 1
- 229920002049 Ribosomal DNA Polymers 0.000 description 1
- 241000282849 Ruminantia Species 0.000 description 1
- 240000000111 Saccharum officinarum Species 0.000 description 1
- 235000007201 Saccharum officinarum Nutrition 0.000 description 1
- 235000007238 Secale cereale Nutrition 0.000 description 1
- 240000002057 Secale cereale Species 0.000 description 1
- 241001533598 Septoria Species 0.000 description 1
- LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N Ser-Asn Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O LTFSLKWFMWZEBD-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- UJTZHGHXJKIAOS-WHFBIAKZSA-N Ser-Gln Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O UJTZHGHXJKIAOS-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- PBUXMVYWOSKHMF-WDSKDSINSA-N Ser-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO PBUXMVYWOSKHMF-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- SBMNPABNWKXNBJ-UHFFFAOYSA-N Serinyl-Lysine Chemical compound NCCCCC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CO SBMNPABNWKXNBJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LZLREEUGSYITMX-UHFFFAOYSA-N Serinyl-Tryptophan Chemical compound C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(CO)N)C(O)=O)=CNC2=C1 LZLREEUGSYITMX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000607720 Serratia Species 0.000 description 1
- 229920001800 Shellac Polymers 0.000 description 1
- PTLRDCMBXHILCL-UHFFFAOYSA-M Sodium arsenite Chemical compound [Na+].[O-][As]=O PTLRDCMBXHILCL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- SUKJFIGYRHOWBL-UHFFFAOYSA-N Sodium hypochlorite Chemical compound [Na+].Cl[O-] SUKJFIGYRHOWBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005708 Sodium hypochlorite Substances 0.000 description 1
- 240000003768 Solanum lycopersicum Species 0.000 description 1
- 240000003829 Sorghum propinquum Species 0.000 description 1
- 235000011684 Sorghum saccharatum Nutrition 0.000 description 1
- 241000212346 Spermolepis Species 0.000 description 1
- 241000222068 Sporobolomyces <Sporidiobolaceae> Species 0.000 description 1
- 241000191940 Staphylococcus Species 0.000 description 1
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 description 1
- 229960005322 Streptomycin Drugs 0.000 description 1
- 241000228341 Talaromyces Species 0.000 description 1
- 239000005839 Tebuconazole Substances 0.000 description 1
- PXMNMQRDXWABCY-UHFFFAOYSA-N Tebuconazole Chemical compound C1=NC=NN1CC(O)(C(C)(C)C)CCC1=CC=C(Cl)C=C1 PXMNMQRDXWABCY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000005842 Thiophanate-methyl Substances 0.000 description 1
- 239000005843 Thiram Substances 0.000 description 1
- KUAZQDVKQLNFPE-UHFFFAOYSA-N Thiram Chemical compound CN(C)C(=S)SSC(=S)N(C)C KUAZQDVKQLNFPE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VPZKQTYZIVOJDV-LMVFSUKVSA-N Thr-Ala Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O VPZKQTYZIVOJDV-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 1
- APIDTRXFGYOLLH-VQVTYTSYSA-N Thr-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)[C@@H](C)O APIDTRXFGYOLLH-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N Thr-Pro Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O QOLYAJSZHIJCTO-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- 235000015450 Tilia cordata Nutrition 0.000 description 1
- 235000011941 Tilia x europaea Nutrition 0.000 description 1
- 241001515878 Tolypocladium cylindrosporum Species 0.000 description 1
- 241001149960 Tolypocladium inflatum Species 0.000 description 1
- 229940024982 Topical Antifungal Antibiotics Drugs 0.000 description 1
- WURBVZBTWMNKQT-UHFFFAOYSA-N Triadimefon Chemical compound C1=NC=NN1C(C(=O)C(C)(C)C)OC1=CC=C(Cl)C=C1 WURBVZBTWMNKQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DQJCHOQLCLEDLL-UHFFFAOYSA-O Tricyclazole Chemical compound CC1=CC=CC2=C1N1C=N[NH+]=C1S2 DQJCHOQLCLEDLL-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- 235000019714 Triticale Nutrition 0.000 description 1
- LCPVBXOHXMBLFW-JSGCOSHPSA-N Trp-Arg Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O)=CNC2=C1 LCPVBXOHXMBLFW-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- UYKREHOKELZSPB-JTQLQIEISA-N Trp-Gly Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O)=CNC2=C1 UYKREHOKELZSPB-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- MYVYPSWUSKCCHG-JQWIXIFHSA-N Trp-Ser Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)=CNC2=C1 MYVYPSWUSKCCHG-JQWIXIFHSA-N 0.000 description 1
- TYYLDKGBCJGJGW-WMZOPIPTSA-N Trp-Tyr Chemical compound C([C@H](NC(=O)[C@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)N)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 TYYLDKGBCJGJGW-WMZOPIPTSA-N 0.000 description 1
- LWFWZRANSFAJDR-JSGCOSHPSA-N Trp-Val Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 LWFWZRANSFAJDR-JSGCOSHPSA-N 0.000 description 1
- DXYQIGZZWYBXSD-UHFFFAOYSA-N Tryptophyl-Proline Chemical compound C=1NC2=CC=CC=C2C=1CC(N)C(=O)N1CCCC1C(O)=O DXYQIGZZWYBXSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YBRHKUNWEYBZGT-UHFFFAOYSA-N Tryptophyl-Threonine Chemical compound C1=CC=C2C(CC(N)C(=O)NC(C(O)C)C(O)=O)=CNC2=C1 YBRHKUNWEYBZGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N Tyr-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AOLHUMAVONBBEZ-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- CGWAPUBOXJWXMS-HOTGVXAUSA-N Tyr-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=C(O)C=C1 CGWAPUBOXJWXMS-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 1
- BMPPMAOOKQJYIP-WMZOPIPTSA-N Tyr-Trp Chemical compound C([C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C([O-])=O)C1=CC=C(O)C=C1 BMPPMAOOKQJYIP-WMZOPIPTSA-N 0.000 description 1
- QZOSVNLXLSNHQK-UHFFFAOYSA-N Tyrosyl-Aspartate Chemical compound OC(=O)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 QZOSVNLXLSNHQK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940029983 VITAMINS Drugs 0.000 description 1
- VEYJKJORLPYVLO-RYUDHWBXSA-N Val-Tyr Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 VEYJKJORLPYVLO-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- WPSXZFTVLIAPCN-UHFFFAOYSA-N Valyl-Cysteine Chemical compound CC(C)C(N)C(=O)NC(CS)C(O)=O WPSXZFTVLIAPCN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000084929 Variovorax boronicumulans Species 0.000 description 1
- 241000721373 Variovorax dokdonensis Species 0.000 description 1
- 241000168661 Variovorax soli Species 0.000 description 1
- 241000056137 Variovorax sp. Species 0.000 description 1
- 241000607598 Vibrio Species 0.000 description 1
- FSCWZHGZWWDELK-UHFFFAOYSA-N Vinclozolin Chemical compound O=C1C(C)(C=C)OC(=O)N1C1=CC(Cl)=CC(Cl)=C1 FSCWZHGZWWDELK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241001659629 Virgibacillus Species 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 229940021016 Vitamin IV solution additives Drugs 0.000 description 1
- 206010047700 Vomiting Diseases 0.000 description 1
- GJCOSYZMQJWQCA-UHFFFAOYSA-N Xanthene Chemical compound C1=CC=C2CC3=CC=CC=C3OC2=C1 GJCOSYZMQJWQCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920002494 Zein Polymers 0.000 description 1
- 235000005042 Zier Kohl Nutrition 0.000 description 1
- 241000142944 Zoophthora radicans Species 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K [O-]P([O-])([O-])=O Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 230000036579 abiotic stress Effects 0.000 description 1
- 150000003869 acetamides Chemical class 0.000 description 1
- NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-M acrylate Chemical compound [O-]C(=O)C=C NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 150000001252 acrylic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 238000007792 addition Methods 0.000 description 1
- 239000002998 adhesive polymer Substances 0.000 description 1
- 238000009632 agar plate Methods 0.000 description 1
- 108010008685 alanyl-glutamyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010066829 alanyl-glutamyl-aspartylprolyine Proteins 0.000 description 1
- 108010039538 alanyl-glycyl-aspartyl-valine Proteins 0.000 description 1
- 108010024078 alanyl-glycyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 108010069020 alanyl-prolyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010086434 alanyl-seryl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010045350 alanyl-tyrosyl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 description 1
- 150000001338 aliphatic hydrocarbons Chemical class 0.000 description 1
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 description 1
- XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N aluminum Chemical compound [Al] XAGFODPZIPBFFR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000540 analysis of variance Methods 0.000 description 1
- 125000000129 anionic group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 239000007900 aqueous suspension Substances 0.000 description 1
- 108010052670 arginyl-glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010009111 arginyl-glycyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010038850 arginyl-isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 1
- 108010043240 arginyl-leucyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010084758 arginyl-tyrosyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010036533 arginylvaline Proteins 0.000 description 1
- 239000012237 artificial material Substances 0.000 description 1
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 description 1
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 description 1
- 229960000892 attapulgite Drugs 0.000 description 1
- 125000000751 azo group Chemical group [*]N=N[*] 0.000 description 1
- 239000010905 bagasse Substances 0.000 description 1
- 239000002585 base Substances 0.000 description 1
- 238000002869 basic local alignment search tool Methods 0.000 description 1
- 235000010233 benzoic acid Nutrition 0.000 description 1
- 150000001558 benzoic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 150000001559 benzoic acids Chemical class 0.000 description 1
- 239000003139 biocide Substances 0.000 description 1
- 238000010170 biological method Methods 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 230000037348 biosynthesis Effects 0.000 description 1
- 230000000740 bleeding Effects 0.000 description 1
- 231100000319 bleeding Toxicity 0.000 description 1
- BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N borate Chemical compound [O-]B([O-])[O-] BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZOXJGFHDIHLPTG-UHFFFAOYSA-N boron Chemical compound [B] ZOXJGFHDIHLPTG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052796 boron Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000010633 broth Nutrition 0.000 description 1
- 230000001680 brushing Effects 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 239000006172 buffering agent Substances 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L cacl2 Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N calcium Chemical compound [Ca] OYPRJOBELJOOCE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011575 calcium Substances 0.000 description 1
- 229910052791 calcium Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910000019 calcium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 229920005551 calcium lignosulfonate Polymers 0.000 description 1
- 239000005018 casein Substances 0.000 description 1
- 235000021240 caseins Nutrition 0.000 description 1
- 230000035569 catabolism Effects 0.000 description 1
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 241000902900 cellular organisms Species 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M chloride anion Chemical compound [Cl-] VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000003593 chromogenic compound Substances 0.000 description 1
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 1
- 235000016213 coffee Nutrition 0.000 description 1
- 235000013353 coffee beverage Nutrition 0.000 description 1
- 230000001427 coherent Effects 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 238000002856 computational phylogenetic analysis Methods 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 235000008504 concentrate Nutrition 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 239000012531 culture fluid Substances 0.000 description 1
- XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N cyclohexane Chemical compound C1CCCCC1 XDTMQSROBMDMFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010060199 cysteinylproline Proteins 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 238000001784 detoxification Methods 0.000 description 1
- 230000001627 detrimental Effects 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 201000008286 diarrhea Diseases 0.000 description 1
- 125000000664 diazo group Chemical group [N-]=[N+]=[*] 0.000 description 1
- BIXZHMJUSMUDOQ-UHFFFAOYSA-N dichloran Chemical compound NC1=C(Cl)C=C([N+]([O-])=O)C=C1Cl BIXZHMJUSMUDOQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000014113 dietary fatty acids Nutrition 0.000 description 1
- 235000015872 dietary supplement Nutrition 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 1
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KARVSHNNUWMXFO-UHFFFAOYSA-N dioxosilane;oxo(oxoalumanyloxy)alumane;hydrate Chemical compound O.O=[Si]=O.O=[Si]=O.O=[Si]=O.O=[Si]=O.O=[Al]O[Al]=O KARVSHNNUWMXFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000006073 displacement reaction Methods 0.000 description 1
- 230000024346 drought recovery Effects 0.000 description 1
- 238000010410 dusting Methods 0.000 description 1
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 1
- 235000013399 edible fruits Nutrition 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000004495 emulsifiable concentrate Substances 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 238000009585 enzyme analysis Methods 0.000 description 1
- 238000001952 enzyme assay Methods 0.000 description 1
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 1
- 238000005530 etching Methods 0.000 description 1
- TUCNEACPLKLKNU-UHFFFAOYSA-N ethanone Chemical class C[C]=O TUCNEACPLKLKNU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N ethene Chemical compound C=C VGGSQFUCUMXWEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002170 ethers Chemical class 0.000 description 1
- 235000019325 ethyl cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 229920001249 ethyl cellulose Polymers 0.000 description 1
- 229960004667 ethyl cellulose Drugs 0.000 description 1
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 239000005038 ethylene vinyl acetate Substances 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000000194 fatty acid Substances 0.000 description 1
- 150000004665 fatty acids Chemical class 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 1
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 1
- 238000007667 floating Methods 0.000 description 1
- MUJOIMFVNIBMKC-UHFFFAOYSA-N fludioxonil Chemical compound C=12OC(F)(F)OC2=CC=CC=1C1=CNC=C1C#N MUJOIMFVNIBMKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 238000001215 fluorescent labelling Methods 0.000 description 1
- 239000000727 fraction Substances 0.000 description 1
- 241000957301 fungal endophyte Species 0.000 description 1
- 108010006664 gamma-glutamyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 238000007429 general method Methods 0.000 description 1
- 108010057083 glutamyl-aspartyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010008237 glutamyl-valyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010079547 glutamylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 150000002314 glycerols Chemical class 0.000 description 1
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003899 glycosylation Effects 0.000 description 1
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 1
- 108010090037 glycyl-alanyl-isoleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010026364 glycyl-glycyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010051307 glycyl-glycyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010066198 glycyl-leucyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010079413 glycyl-prolyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010043293 glycyl-prolyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010048994 glycyl-tyrosyl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 108010081551 glycylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010077515 glycylproline Proteins 0.000 description 1
- 239000005431 greenhouse gas Substances 0.000 description 1
- 239000003630 growth substance Substances 0.000 description 1
- 229920000591 gum Polymers 0.000 description 1
- 239000010440 gypsum Substances 0.000 description 1
- 229910052602 gypsum Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910001385 heavy metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 244000038280 herbivores Species 0.000 description 1
- 150000002402 hexoses Chemical class 0.000 description 1
- 108010045383 histidyl-glycyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 239000003906 humectant Substances 0.000 description 1
- 239000003864 humus Substances 0.000 description 1
- 239000001863 hydroxypropyl cellulose Substances 0.000 description 1
- 235000010977 hydroxypropyl cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 229940071676 hydroxypropylcellulose Drugs 0.000 description 1
- 238000007654 immersion Methods 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 238000003125 immunofluorescent labeling Methods 0.000 description 1
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 1
- 239000000750 industrial fungicide Substances 0.000 description 1
- 238000009776 industrial production Methods 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 229910001959 inorganic nitrate Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 229940079866 intestinal antibiotics Drugs 0.000 description 1
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 1
- PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N iodine Chemical compound II PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002563 ionic surfactant Substances 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 239000003621 irrigation water Substances 0.000 description 1
- 108010027338 isoleucylcysteine Proteins 0.000 description 1
- 150000002576 ketones Chemical class 0.000 description 1
- 230000002147 killing Effects 0.000 description 1
- 108010053037 kyotorphin Proteins 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N lactic acid Chemical compound CC(O)C(O)=O JVTAAEKCZFNVCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004310 lactic acid Substances 0.000 description 1
- 235000014655 lactic acid Nutrition 0.000 description 1
- 108010087810 leucyl-seryl-glutamyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010012058 leucyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 238000007834 ligase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 239000004571 lime Substances 0.000 description 1
- 230000000670 limiting Effects 0.000 description 1
- 238000009630 liquid culture Methods 0.000 description 1
- FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N magnesium Chemical compound [Mg] FYYHWMGAXLPEAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011777 magnesium Substances 0.000 description 1
- 229910052749 magnesium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000000391 magnesium silicate Substances 0.000 description 1
- 235000012243 magnesium silicates Nutrition 0.000 description 1
- 239000002075 main ingredient Substances 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 235000013372 meat Nutrition 0.000 description 1
- 230000001404 mediated Effects 0.000 description 1
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 1
- VNWKTOKETHGBQD-UHFFFAOYSA-N methane Chemical compound C VNWKTOKETHGBQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001434 methanylylidene group Chemical group [H]C#[*] 0.000 description 1
- 108010085203 methionylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 108010068488 methionylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 1
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000012569 microbial contaminant Substances 0.000 description 1
- 239000002480 mineral oil Substances 0.000 description 1
- 150000007522 mineralic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000019426 modified starch Nutrition 0.000 description 1
- 235000013379 molasses Nutrition 0.000 description 1
- 238000007479 molecular analysis Methods 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- MEFBJEMVZONFCJ-UHFFFAOYSA-N molybdate Chemical compound [O-][Mo]([O-])(=O)=O MEFBJEMVZONFCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZOKXTWBITQBERF-UHFFFAOYSA-N molybdenum Chemical compound [Mo] ZOKXTWBITQBERF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052750 molybdenum Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011733 molybdenum Substances 0.000 description 1
- 238000009343 monoculture Methods 0.000 description 1
- 229910052901 montmorillonite Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000000877 morphologic Effects 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 229940042880 natural phospholipids Drugs 0.000 description 1
- 239000005445 natural product Substances 0.000 description 1
- 229930014626 natural products Natural products 0.000 description 1
- 230000001264 neutralization Effects 0.000 description 1
- 125000000449 nitro group Chemical group [O-][N+](*)=O 0.000 description 1
- 125000000018 nitroso group Chemical group N(=O)* 0.000 description 1
- 239000002736 nonionic surfactant Substances 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic Effects 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 238000010899 nucleation Methods 0.000 description 1
- CTQNGGLPUBDAKN-UHFFFAOYSA-N o-xylene Chemical compound CC1=CC=CC=C1C CTQNGGLPUBDAKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000019198 oils Nutrition 0.000 description 1
- 238000001543 one-way ANOVA Methods 0.000 description 1
- 229940005935 ophthalmologic Antibiotics Drugs 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- 125000000160 oxazolidinyl group Chemical class 0.000 description 1
- 150000002923 oximes Chemical class 0.000 description 1
- 235000019629 palatability Nutrition 0.000 description 1
- 229910052625 palygorskite Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000003071 parasitic Effects 0.000 description 1
- 230000008506 pathogenesis Effects 0.000 description 1
- 235000020232 peanut Nutrition 0.000 description 1
- 239000003415 peat Substances 0.000 description 1
- 230000000149 penetrating Effects 0.000 description 1
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 description 1
- 230000002688 persistence Effects 0.000 description 1
- 239000003209 petroleum derivative Substances 0.000 description 1
- 238000002205 phenol-chloroform extraction Methods 0.000 description 1
- 125000000951 phenoxy group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(O*)C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 108010074082 phenylalanyl-alanyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010058453 phenylalanyl-glutamyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010070409 phenylalanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010024654 phenylalanyl-prolyl-alanine Proteins 0.000 description 1
- 108010018625 phenylalanylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010073101 phenylalanylleucine Proteins 0.000 description 1
- 108010051242 phenylalanylserine Proteins 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 150000003904 phospholipids Chemical class 0.000 description 1
- 150000003018 phosphorus compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000000865 phosphorylative Effects 0.000 description 1
- 230000000243 photosynthetic Effects 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 231100000208 phytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 239000005648 plant growth regulator Substances 0.000 description 1
- 239000010908 plant waste Substances 0.000 description 1
- 239000002798 polar solvent Substances 0.000 description 1
- 229920001084 poly(chloroprene) Polymers 0.000 description 1
- 229920001200 poly(ethylene-vinyl acetate) Polymers 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 229920000036 polyvinylpyrrolidone Polymers 0.000 description 1
- 235000013855 polyvinylpyrrolidone Nutrition 0.000 description 1
- 230000004481 post-translational protein modification Effects 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000012015 potatoes Nutrition 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating Effects 0.000 description 1
- 108010031719 prolyl-serine Proteins 0.000 description 1
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003230 pyrimidines Chemical class 0.000 description 1
- 239000010453 quartz Substances 0.000 description 1
- 229910052904 quartz Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000018612 quorum sensing Effects 0.000 description 1
- 238000003044 randomized block design Methods 0.000 description 1
- 238000004064 recycling Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory Effects 0.000 description 1
- 230000000754 repressing Effects 0.000 description 1
- 230000001850 reproductive Effects 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 108091007521 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 238000005096 rolling process Methods 0.000 description 1
- 108060007146 rpoE Proteins 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 1
- 230000001568 sexual Effects 0.000 description 1
- 235000013874 shellac Nutrition 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 1
- 238000003530 single readout Methods 0.000 description 1
- 238000002791 soaking Methods 0.000 description 1
- 239000004328 sodium tetraborate Substances 0.000 description 1
- 235000010339 sodium tetraborate Nutrition 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 230000028070 sporulation Effects 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 229910001220 stainless steel Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010935 stainless steel Substances 0.000 description 1
- 239000010904 stalk Substances 0.000 description 1
- 230000003068 static Effects 0.000 description 1
- 239000008223 sterile water Substances 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising Effects 0.000 description 1
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 239000010902 straw Substances 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004546 suspension concentrate Substances 0.000 description 1
- 230000002195 synergetic Effects 0.000 description 1
- 235000020357 syrup Nutrition 0.000 description 1
- 239000006188 syrup Substances 0.000 description 1
- FZWLAAWBMGSTSO-UHFFFAOYSA-N thiazole Chemical compound C1=CSC=N1 FZWLAAWBMGSTSO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001984 thiazolidinyl group Chemical class 0.000 description 1
- 239000002562 thickening agent Substances 0.000 description 1
- 150000003558 thiocarbamic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- QGHREAKMXXNCOA-UHFFFAOYSA-N thiophanate-methyl Chemical compound COC(=O)NC(=S)NC1=CC=CC=C1NC(=S)NC(=O)OC QGHREAKMXXNCOA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960002447 thiram Drugs 0.000 description 1
- 238000003971 tillage Methods 0.000 description 1
- RTAQQCXQSZGOHL-UHFFFAOYSA-N titanium Chemical compound [Ti] RTAQQCXQSZGOHL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000010936 titanium Substances 0.000 description 1
- 229910052719 titanium Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000002588 toxic Effects 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 150000003918 triazines Chemical class 0.000 description 1
- RROQIUMZODEXOR-UHFFFAOYSA-N triforine Chemical compound O=CNC(C(Cl)(Cl)Cl)N1CCN(C(NC=O)C(Cl)(Cl)Cl)CC1 RROQIUMZODEXOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010080629 tryptophan-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010015666 tryptophyl-leucyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010084932 tryptophyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010044292 tryptophyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 238000005429 turbidity Methods 0.000 description 1
- 108010051110 tyrosyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 1
- 108010003885 valyl-prolyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010009962 valyltyrosine Proteins 0.000 description 1
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 description 1
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 description 1
- 229930003231 vitamins Natural products 0.000 description 1
- 239000001993 wax Substances 0.000 description 1
- 230000004580 weight loss Effects 0.000 description 1
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 1
- 239000004563 wettable powder Substances 0.000 description 1
- 239000002759 woven fabric Substances 0.000 description 1
- 241000228158 x Triticosecale Species 0.000 description 1
- 239000008096 xylene Substances 0.000 description 1
- 150000003751 zinc Chemical class 0.000 description 1
- AMHNZOICSMBGDH-UHFFFAOYSA-L zinc;N-[2-(sulfidocarbothioylamino)ethyl]carbamodithioate Chemical compound [Zn+2].[S-]C(=S)NCCNC([S-])=S AMHNZOICSMBGDH-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- UKKNTTCNGZLJEX-UHFFFAOYSA-N γ-glutamyl-Serine Chemical compound NC(=O)CCC(N)C(=O)NC(CO)C(O)=O UKKNTTCNGZLJEX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Abstract
Description
[0001] Содержание прилагаемого Перечня последовательностей включено здесь во всей его полноте посредством ссылки. Прилагаемый файл под наименованием «SGI1520-lWO_ST25.txt» был создан 24 июля 2012 г. и имеет размер 55 Kб. Этот файл открыт для доступа с помощью Microsoft Word на компьютере с операционной системой Window OS.[0001] The contents of the attached Sequence Listing are incorporated herein in their entirety by reference. The attached file named "SGI1520-lWO_ST25.txt" was created on July 24, 2012 and is 55 KB in size. This file is accessible with Microsoft Word on a computer running Window OS.
ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ, К КОТОРОЙ ОТНОСИТСЯ ИЗОБРЕТЕНИЕFIELD OF TECHNOLOGY TO WHICH THE INVENTION RELATES
[0002] Настоящее изобретение относится к биологическим методам борьбы с фитопатогенными болезнями. В частности, изобретение относится к композициям и способам, которые могут использоваться в борьбе с фузариозом злаковых растений, таких как пшеница и ячмень.[0002] The present invention relates to biological methods for combating phytopathogenic diseases. In particular, the invention relates to compositions and methods that can be used in the control of Fusarium on cereals such as wheat and barley.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИBACKGROUND OF THE INVENTION
[0003] Фузариоз, известный также как парша, плесневидная розовая гниль и фузариоз, является болезнью, опустошающей сельскохозяйственные угодья пшеницы, ячменя и многих других злаковых культур во всем мире и, особенно, в США, Европе и Китае. Эта болезнь может достигать эпидемических масштабов и наносить обширные уроны зерновым культурам, особенно пшенице и ячменю, во влажных и полувлажных ареалах выращивания хлебных злаков, включая Индию, Россию, Францию, Германию и Великобританию. В частности, фузариоз или фузариоз пшеницы является одной из наиболее убыточных болезней пшеницы в Соединенных Штатах. В общенациональных масштабах эта болезнь, развившаяся на Среднем Западе и на Высоких Равнинах, принесла производству пшеницы потери, достигающие миллионов долларов, и стала, таким образом, главным препятствием для успешного функционирования этой индустрии в последние годы. Фузариоз, помимо пшеницы, поражает также ячмень, овес, кукурузу и множество других зерновых культур, и репродуцируется на них.[0003] Fusarium, also known as scab, pink mold and Fusarium, is a disease that devastates the agricultural land of wheat, barley and many other cereals around the world and especially in the United States, Europe and China. This disease can reach epidemic proportions and cause extensive damage to cereals, especially wheat and barley, in humid and semi-humid cereal growing areas, including India, Russia, France, Germany and the United Kingdom. In particular, fusarium or Fusarium wheat is one of the most detrimental wheat diseases in the United States. Nationwide, this disease, which has developed in the Midwest and the High Plains, has cost the wheat industry millions of dollars, and has thus become a major obstacle to the successful functioning of this industry in recent years. Fusarium, in addition to wheat, also affects barley, oats, corn and many other crops, and reproduces on them.
[0004] Эта болезнь может вызываться множеством различных фитопатогенов и, в первую очередь, несколькими видами грибов рода Fusarium. В число вероятных возбудителей фузариоза пшеницы входит множество различных видов Fusarium, например, F. culmorum, F. graminearum (телеоморф, Gibberella zeae), F. avenaceum (телеоморф, G. avenacea), F. poae, а также патогены, не относящиеся к роду Fusarium, такие как Microdochium nivale (телеоморф, Monographella nivalis), и Microdochium majus. В Соединенных Штатах, Европе и других наиболее важных агрономических ареалах мира доминирующим возбудителем фузариоза выступает Fusarium graminearum (телеоморф, Gibberella zeae в буквальном смысле).[0004] This disease can be caused by many different plant pathogens and, first of all, by several species of fungi of the genus Fusarium. Potential causative agents of wheat fusarium include many different Fusarium species, such as F. culmorum , F. graminearum (teleomorph, Gibberella zeae) , F. avenaceum (teleomorph, G. avenacea) , F. poae , as well as pathogens other than genus Fusarium , such as Microdochium nivale (teleomorph, Monographella nivalis) , and Microdochium majus. In the United States, Europe and other most important agronomic areas of the world, Fusarium graminearum (literally Gibberella zeae ) is the dominant causative agent of Fusarium.
[0005] Эти патогены, как правило, выживают на растительных остатках. На колоски злаков они попадают и поражают их во время цветения, останавливая или частично задерживая развитие зерна в колосе злака. В результате, попавший на растение патоген может убить часть колоса либо весь колос. Некоторые инфицированные семена имеют настолько низкую энергию прорастания, что зачастую не могут прорасти. Проросшие инфицированные семена часто рано погибают в фазе прорастания вследствие пелликуляриоза или корневой гнили, вызывающих плохой хлебостой выросшего злака. Здоровые сеянцы могут инфицироваться также в фазе появления всходов. Помимо плохого, неэкономичного хлебостоя, потери урожая вследствие поражения патогеном могут быть довольно высокими, если условия благоприятствуют развитию болезни.[0005] These pathogens typically survive on plant debris. They fall on the spikelets of cereals and infect them during flowering, stopping or partially delaying the development of grain in the cereal spike. As a result, a pathogen that has entered the plant can kill part of the ear or the entire ear. Some infected seeds have such low germination vigor that they often fail to germinate. Germinated infected seeds often die early in the germination phase due to pellicularia or root rot causing poor growth of the grown cereal. Healthy seedlings can also become infected during the emergence phase. In addition to poor, uneconomical growing, crop losses due to pathogen attack can be quite high if conditions are favorable for disease development.
[0006] Грибные патогены рода Fusarium распространяются по ареалам культивирования злаков во всем мире и наносят особенно большой ущерб в местах выпадения больших осадков в период между цветением и наливом зерна. Если возбудителем заболевания является Fusarium graminearum, то данная болезнь требует первоочередного вмешательства, не только потому что она снижает коммерческие показатели пораженного зерна, вдобавок к прямым потерям урожая, но также потому, что заражение грибом Fusarium может приводить к накоплению микотоксинов, трихотеценов, в зернах, создавая, таким образом, угрозу здоровью людей и скота. Трихотецены представляют собой главное микотоксиновое загрязнение зерновых культур во всем мире, способное у нежвачных животных вызывать отказ от пищи, рвоту, диарею и потерю веса и создавать угрозу здоровью для других животных и людей в случаях высоких уровней воздействия этих токсинов. В Соединенных Штатах эта угроза возросла еще больше вследствие недавно произошедшего смещения в штаммах F. graminearum в сторону повышения выработки и силы токсинов. Микотоксинами, обнаруживаемыми чаще всего, являются дезоксиниваленол (DON, известный также как вомитоксин) и зеараленон (ZEA). Дезоксиниваленол является особенно опасным токсином, вызывающим желудочно-кишечные расстройства, которые сопровождаются кровотечениями и другими тяжелыми состояниями у людей и животных, принявших в пищу инфицированные зерна, и в некоторых случаях могут привести к смерти. Поскольку дезоксиниваленол в общем случае является стойким к изменениям pH и к высоким температурам, дезинтоксикация может проходить очень тяжело. Таким образом, зерна, загрязненные выше определенного уровня, не могут использоваться в пивоварении, переработке, корме для скота и, следовательно, должны удаляться в отходы.[0006] Fungal pathogens of the genus Fusarium spread throughout cereal cultivation areas throughout the world and cause particularly great damage in areas of high rainfall between flowering and grain filling. If the causative agent is Fusarium graminearum , then the disease requires priority intervention, not only because it reduces the commercial performance of the affected grain, in addition to direct yield losses, but also because Fusarium infection can lead to the accumulation of mycotoxins, trichothecenes, in grains, thus endangering human and livestock health. Trichothecenes are the major mycotoxin contamination of cereals worldwide, capable of causing food refusal, vomiting, diarrhea and weight loss in non-ruminant animals and posing a health risk to other animals and humans when exposed to these toxins at high levels. In the United States, this threat has increased even more due to the recent shift in F. graminearum strains towards greater toxin production and potency. The most frequently detected mycotoxins are deoxynivalenol (DON, also known as vomitoxin) and zearalenone (ZEA). Deoxynivalenol is a particularly virulent toxin that causes gastrointestinal disturbances, which are accompanied by bleeding and other serious conditions in humans and animals that have eaten infected grains, and in some cases can lead to death. Because deoxynivalenol is generally resistant to pH changes and high temperatures, detoxification can be very difficult. Thus, grains contaminated above a certain level cannot be used in brewing, processing, livestock feed and therefore must be disposed of.
[0007] На сегодняшний день разработано множество различных стратегий по борьбе с фузариозом у сельскохозяйственных культур. Наиболее перспективными среди них являются химические методы, разработка стойких сортов культур, а также традиционные методы севооборота и обработки полей. Среди этих направлений определенную эффективность в снижении заражения фузариозом можно получить от применения химических пестицидов, однако остатки фунгицидов, использованных на поздних стадиях роста культур, как правило, в периоды цветения, всего за несколько недель до сбора урожая, снижают привлекательность этих методов. С другой стороны, альтернативный подход в борьбе с этой болезнью представляют методы традиционной селекции и генной инженерии, благодаря которым происходит заметный прогресс в разработках стойких сортов агрокультур. Генная инженерия позволяет изменять продуцирование фитогормона и осуществлять манипуляции в его сигнальном пути. Достигнутый в последние годы прогресс в области традиционной селекции позволил значительно продвинуться в понимании генетических основ стойкости к фузариозу и получить сведения о множестве генов и локусах количественных признаков (QTL: quantitative trait loci), придающих этой стойкости. Однако прогресс в повышении стойкости агрокультур к фузариозу был медленным, что объясняется, в первую очередь, трудностью изучения данной болезни. Фактически о механизмах, определяющих стойкость или восприимчивость растений к фузариозу, в настоящее время известно сравнительно мало. Кроме того, генетическое разнообразие грибов вида Fusarium, которые являются преобладающими возбудителями болезни, часто создает проблемы в определении того, насколько длительной должна быть эффективность химических фунгицидов и насколько стойкими должны быть защищаемые агрокультуры. В результате, в настоящее время практически все сорта пшеницы в агропромышленном производстве остаются уязвимыми для инфицирования.[0007] To date, many different strategies have been developed to control Fusarium in crops. The most promising among them are chemical methods, the development of resistant crop varieties, as well as traditional methods of crop rotation and field cultivation. Among these avenues, some effectiveness in reducing Fusarium infection can be obtained from the use of chemical pesticides, however, fungicide residues used in the late stages of crop growth, usually during flowering periods, just a few weeks before harvest, reduce the attractiveness of these methods. On the other hand, an alternative approach to combating this disease is represented by traditional breeding and genetic engineering methods, thanks to which there is a noticeable progress in the development of resistant varieties of agricultural crops. Genetic engineering allows you to change the production of phytohormone and to manipulate its signaling pathway. The progress achieved in recent years in the field of traditional breeding has made it possible to make significant progress in understanding the genetic basis of resistance to Fusarium and to obtain information about the many genes and quantitative trait loci (QTL: quantitative trait loci) that confer this resistance. However, progress in increasing the resistance of agricultural crops to Fusarium has been slow, which is explained, first of all, by the difficulty of studying this disease. In fact, relatively little is currently known about the mechanisms that determine plant resistance or susceptibility to Fusarium. In addition, the genetic diversity of Fusarium species, which are the predominant pathogens, often creates problems in determining how long the effectiveness of chemical fungicides should be and how resistant the crops to be protected should be. As a result, at present, almost all varieties of wheat in agro-industrial production remain vulnerable to infection.
[0008] Кроме того, несмотря на определенный успех в борьбе с фузариозом, который могут давать традиционные методы пахотной обработки с закапыванием пожнивных остатков, инфицированных возбудителем, например, F. graminearum, обычная вспашка почвы после жнив является несовместимой с устоявшейся практикой охраны почв, то есть с условием минимальной пахотной обработки. Принимая во внимание вероятность разброса инокулята на большие расстояния и то, что различные культуры могут становиться альтернативными хозяевами патогенов, метод севооборота нередко оказывается неприемлемым. Помимо загрязнения окружающей среды пестицидами, их использование может порождать проблемы, связанные с пестицидостойкостью. Кроме того, с их использованием могут быть связаны также зарегистрированные случаи роста содержания DON в зернах. Помимо этого, расходы и растущие проблемы как в государственном, так и в частном секторах, связанные с загрязнением пестицидами окружающей среды и требованиями к безопасности пищевых продуктов, делают данный способ борьбы с такими болезнями менее привлекательным и заставляют в уходе за агрокультурами применять пестициды как можно меньше.[0008] In addition, despite some success in the fight against Fusarium, which can give traditional methods of arable tillage with burying of crop residues infected with the pathogen, for example, F. graminearum , conventional plowing of the soil after stubble is inconsistent with the established practice of soil conservation, then there is with the condition of minimum arable cultivation. Given the potential for spreading inoculum over long distances and the potential for different crops to become alternative hosts for pathogens, crop rotation is often unacceptable. In addition to polluting the environment with pesticides, their use can give rise to pesticide resistance problems. In addition, registered cases of an increase in the content of DON in grains may also be associated with their use. In addition, the costs and growing problems in both the public and private sectors associated with pesticide pollution and food safety requirements make this method of controlling such diseases less attractive and force the use of pesticides in crop care as little as possible. .
[0009] Подводя итог, можно сказать, что, несмотря на существенное продвижение в области разработок способов борьбы с фузариозом, уменьшение влияния этой губительной болезни на производство и качество зерна пока остается нерешенной проблемой. Следовательно, для повышения продуктивности производства и качества многих зерновых культур важно вести поиск и разработку новых способов борьбы с фузариозом. Эти проблемы требуют срочного решения не только в Соединенных Штатах, но и на всем земном шаре, включая Азию и Европу.[0009] Summing up, we can say that, despite significant progress in the development of ways to combat Fusarium, reducing the impact of this devastating disease on the production and quality of grain remains an unresolved problem. Therefore, in order to increase the productivity and quality of many grain crops, it is important to search for and develop new ways to combat Fusarium. These problems need to be urgently addressed not only in the United States, but throughout the globe, including Asia and Europe.
[0010] Борьба с фузариозом с помощью биологических агентов стала привлекать к себе внимание, начиная с середины 1990-х годов. Биологические агенты для такой борьбы (BCA: Biological control agents), несмотря на то что количество их в настоящее время весьма ограничено, могут, при своей невраждебности к окружающей среде, быть очень эффективными в снижении уровня заболеваемости, инициируемой патогенами рода Fusarium. Общественное признание, совместимость с другими средствами борьбы с болезнями агрокультур, долговечность и стойкость - все это, наряду с другими положительными факторами, говорит о необходимости разработок стратегий биологической борьбы с фузариозом. Средства такой биологической борьбы могут сыграть важную роль в органической зерновой индустрии. В обычном производстве зерна такие средства могут продлить защиту колосков на время после фазы цветения, когда химические фунгициды применяться больше не могут. На сегодняшний день, в области биологической борьбы уже достигнут значительный прогресс. Так, например, некоторые штаммы споро-продуцирующих бактерий (например, видов Bacillus и Pseudomonas) и дрожжей (например, вида Cryptococcus) демонстрируют качества, требующиеся для борьбы с фузариозом и для снижения микотоксинового загрязнения. Однако, несмотря на этот прогресс, остается неудовлетворенной потребность в улучшенных микроорганизмах для их использования в борьбе с фузариозом. Хотя сами по себе BCA-средства уже признаны более подходящим инструментом для борьбы с фитопатогенами, а BCA-продукты находят на рынке значительно более широкий сбыт, чем когда-либо ранее, все же на сегодняшний день было предпринято совсем мало попыток разработать стратегии и антагонистический микроорганизм для биологической борьбы с фузариозом. Кроме того, жизненный цикл рода Fusarium и других возбудителей фузариоза указывает на то, что эти патогены потенциально могут быть подходящими для использования их в методах биоборьбы с помощью антагонистических микроорганизмов на различных фазах роста и развития. Таким образом, существует потребность в поиске новых средств биологической борьбы, желательно с различными способами активности, а также способов биоборьбы, которые бы позволяли эффективно предотвращать или подавлять развитие фузариоза.[0010] Fighting fusarium with biological agents has received attention since the mid-1990s. Biological agents for such control (BCA: Biological control agents), despite the fact that their number is currently very limited, can, in their hostility to the environment, be very effective in reducing the level of morbidity initiated by pathogens of the genus Fusarium. Public acceptance, compatibility with other crop disease control agents, longevity and persistence, along with other positive factors, all point to the need for development of Fusarium biological control strategies. Means of such biological control can play an important role in the organic grain industry. In conventional grain production, such products can extend the protection of spikelets beyond the flowering phase, when chemical fungicides can no longer be applied. To date, significant progress has already been made in the field of biological control. For example, some strains of spore-producing bacteria (eg Bacillus and Pseudomonas spp .) and yeasts (eg Cryptococcus spp .) exhibit the qualities required to control Fusarium and reduce mycotoxin contamination. However, despite this progress, there remains an unmet need for improved microorganisms for use in Fusarium control. Although BCA agents themselves are already recognized as a more suitable tool for combating plant pathogens, and BCA products are on the market much more widely than ever before, still very few attempts have been made to date to develop strategies and an antagonistic microorganism. for biological control of Fusarium. In addition, the life cycle of the genus Fusarium and other Fusarium pathogens indicates that these pathogens may potentially be suitable for use in biocontrol methods using antagonistic microorganisms in various phases of growth and development. Thus, there is a need to find new biological control agents, preferably with different methods of activity, as well as biocontrol methods that would effectively prevent or suppress the development of Fusarium.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯSUMMARY OF THE INVENTION
[0011] Изобретение относится к композициям, содержащим микробиологические штаммы и культуры. Некоторые штаммы, культуры и их композиции могут использоваться для борьбы с фузариозом, например, различных сельскохозяйственных культур, включая пшеницу и другие зерновые. Изобретение также относится к композициям для биологической борьбы и способам использования этих композиций для предотвращения возникновения, подавления развития или лечения вызванной патогенами болезни и для сохранения урожая. Изобретение также относится к способам использования таких композиций в качестве средств биологической борьбы в комбинации с другими эффективными в сельском хозяйстве соединениями или композициями для борьбы с вредными фитопатогенами.[0011] The invention relates to compositions containing microbiological strains and cultures. Some strains, cultures and their compositions can be used to control Fusarium, for example, various crops, including wheat and other cereals. The invention also relates to biological control compositions and methods of using these compositions to prevent, control, or treat a disease caused by pathogens and to preserve crops. The invention also relates to methods for using such compositions as biological control agents in combination with other agriculturally effective compounds or compositions for controlling harmful plant pathogens.
[0012] В одном из аспектов настоящее изобретение относится к выделенным микробным штаммам, обладающим супрессорной активностью по отношению к фузариозу. Микробные штаммы в соответствии с этим аспектом выбираются из группы, состоящей из видов Microbacterium, Bacillus, Mycosphaerella и Variovorax. В некоторых предпочтительных вариантах осуществления изобретения микробные штаммы выбираются из группы, состоящей из вида Mycosphaerella штамм SGI-010-HI 1 (депозит NRRL 50471), вида Microbacterium штамм SGI-014-C06 (депозит NRRL B-50470), вида Variovorax штамм SGI-014-G01 (депозит NRRL B-50469), вида Bacillus штамм SGI-Q15-F03 (депозит NRRL B-50760), вида Bacillus штамм SGI-015-H06 (депозит NRRL B-50761) и их вариантов, обладающих пестицидной активностью. Микробный штамм в соответствии с другими предпочтительными вариантами осуществления может содержать последовательность ДНК, демонстрирующую по меньшей мере 85% идентичность любой из нуклеотидных последовательностей, приведенных в прилагаемом Перечне последовательностей. Изобретение также относится к биологически чистым культурам и обогащенным культурам описанных здесь микробных штаммов.[0012] In one aspect, the present invention relates to isolated microbial strains with suppressive activity against Fusarium. The microbial strains according to this aspect are selected from the group consisting of Microbacterium , Bacillus , Mycosphaerella and Variovorax species. In some preferred embodiments, the microbial strains are selected from the group consisting of Mycosphaerella species strain SGI-010-HI 1 (deposit NRRL 50471), Microbacterium species strain SGI-014-C06 (deposit NRRL B-50470), Variovorax species strain SGI- 014-G01 (deposit NRRL B-50469), Bacillus species strain SGI-Q15-F03 (deposit NRRL B-50760), Bacillus species strain SGI-015-H06 (deposit NRRL B-50761) and variants thereof having pesticidal activity. The microbial strain according to other preferred embodiments may contain a DNA sequence showing at least 85% identity to any of the nucleotide sequences shown in the accompanying Sequence Listing. The invention also relates to biologically pure cultures and enriched cultures of the microbial strains described here.
[0013] В соответствии с другим аспектом настоящее изобретение относится к композициям, содержащим микробный штамм по изобретению или его культуру и эффективное для сельскохозяйственного производства количество соединения или композиции, выбранных из группы, состоящей из акарицида, бактерицида, фунгицида, инсектицида, микробицида, нематицида, пестицида и удобрения. Указанные композиции в некоторых вариантах осуществления этого аспекта могут быть получены в форме препарата, выбранного из группы, состоящей из эмульсии, коллоида, пылевидного препарата, частицы, гранулы, порошка, спрея и раствора; в некоторых других вариантах осуществления указанные композиции могут содержать носитель. В одном из предпочтительных вариантов носитель является приемлемым для сельскохозяйственного производства. В одном из особенно предпочтительных вариантов осуществления изобретения носителем является семя растения. В других предпочтительных вариантах композицией является препарат покрытия семени. Кроме того, изобретение относится к семенам, покрытым композицией в соответствии с настоящим изобретением.[0013] According to another aspect, the present invention relates to compositions comprising a microbial strain of the invention or a culture thereof and an agriculturally effective amount of a compound or composition selected from the group consisting of an acaricide, a bactericide, a fungicide, an insecticide, a microbicide, a nematicide, pesticide and fertilizer. These compositions in some embodiments of this aspect can be obtained in the form of a preparation selected from the group consisting of an emulsion, colloid, pulverulent preparation, particles, granules, powder, spray and solution; in some other embodiments, these compositions may contain a carrier. In one preferred embodiment, the carrier is agriculturally acceptable. In one particularly preferred embodiment of the invention, the carrier is the seed of a plant. In other preferred embodiments, the composition is a seed coating preparation. In addition, the invention relates to seeds coated with a composition in accordance with the present invention.
[0014] В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам предотвращения, ингибирования или обработки против развития фитопатогена. Эти способы включают выращивание микробного штамма по изобретению или его культуры в питательной среде или почве растения-хозяина перед или одновременно с выращиванием растения-хозяина в питательной среде или почве, где в некоторых предпочтительных вариантах осуществления данного аспекта изобретения, фитопатоген вызывает фузариоз. В одном из особенно предпочтительных вариантов осуществления фитопатогеном является Fusarium graminearum. [0014] In another aspect, the present invention relates to methods for preventing, inhibiting or treating the development of a plant pathogen. These methods include growing the microbial strain of the invention or a culture thereof in the nutrient medium or soil of the host plant before or simultaneously with the cultivation of the host plant in the nutrient medium or soil, where in some preferred embodiments of this aspect of the invention, the phytopathogen causes fusarium. In one particularly preferred embodiment, the phytopathogen is Fusarium graminearum.
[0015] В другом аспекте настоящее изобретение относится к способам предотвращения, ингибирования или обработки против развития фузариоза растения. Эти способы включают поставку к растению или к среде, окружающей растение, эффективного количества микробного штамма по изобретению или его культуры. В одном из вариантов осуществления изобретения такой фузариоз вызывается грибом Fusarium graminearum. В некоторых вариантах осуществления этого аспекта микробный штамм или его культуру поставляют к почве, семени, корням, цветку, листу, части растения или всему растению, где в предпочтительном варианте растение является восприимчивым к Fusarium graminearum. В некоторых других предпочтительных вариантах осуществления изобретения растением является пшеница, кукуруза, ячмень или овес, в другом предпочтительном варианте осуществления микробный штамм по изобретению или его культуру вводят в растение в качестве эндофита.[0015] In another aspect, the present invention relates to methods for preventing, inhibiting or treating the development of plant Fusarium. These methods include the delivery to the plant or to the environment surrounding the plant, an effective amount of the microbial strain of the invention or its culture. In one of the embodiments of the invention, such fusarium is caused by the fungus Fusarium graminearum. In some embodiments of this aspect, the microbial strain or culture thereof is provided to soil, seed, roots, flower, leaf, plant part, or entire plant, where in a preferred embodiment, the plant is susceptible to Fusarium graminearum. In some other preferred embodiments of the invention, the plant is wheat, corn, barley or oats, in another preferred embodiment, the microbial strain of the invention or its culture is introduced into the plant as an endophyte.
[0016] В следующем аспекте изобретение относится к растениям неприродного происхождения. Растения неприродного происхождения искусственно инфицируются микробным штаммом по изобретению или его культурой. Кроме того, в некоторых предпочтительных вариантах осуществления этого аспекта изобретение относится к семени, репродуктивной ткани, вегетативной ткани, частям растения и потомству растения неприродного происхождения.[0016] In the following aspect, the invention relates to plants of non-natural origin. Plants of non-natural origin are artificially infected with the microbial strain according to the invention or its culture. In addition, in some preferred embodiments of this aspect, the invention relates to seed, reproductive tissue, vegetative tissue, plant parts and plant progeny of non-natural origin.
[0017] В другом аспекте изобретение относится к способу получения сельскохозяйственной композиции. Этот способ включает инокуляцию микробного штамма в соответствии с настоящим изобретением или его культуры в субстрат или на субстрат и выращивание его при температуре 1-37°C до получения клеток или спор в количестве по меньшей мере 102-103 на миллилитр или на грамм.[0017] In another aspect, the invention relates to a method for producing an agricultural composition. This method includes inoculating a microbial strain according to the present invention or a culture thereof into or onto a substrate and growing it at a temperature of 1-37°C to produce cells or spores in an amount of at least 10 2 -10 3 per milliliter or per gram.
[0018] Этим и другим целям и признакам данного изобретения дано более полное разъяснение в нижеследующем подробном описании и формуле изобретения.[0018] These and other objects and features of the present invention are more fully explained in the following detailed description and claims.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯDETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION
ОпределенияDefinitions
[0019] Если не указано иного, то все используемые в настоящем описании термины, относящиеся к данной области техники, условные обозначения и другие научные термины несут общепринятые значения, известные специалистам в области техники, к которой относится настоящее изобретение. Некоторым терминам с общеизвестными значениями здесь даны определения в целях избегания разночтения и/или для облегчения ссылок, и включение здесь таких определений не должно рассматриваться как представляющее существенное отличие от значений, общепринятых среди специалистов. Многие способы и процедуры, которые здесь описаны или на которые делаются ссылки, должны быть специалистам хорошо известными и широко используемыми ими в соответствии с обычными методологиями.[0019] Unless otherwise indicated, all technical terms, conventions, and other scientific terms used herein have their conventional meanings known to those skilled in the art to which the present invention pertains. Certain terms with commonly known meanings are defined here for the purposes of avoidance of confusion and/or for ease of reference, and the inclusion of such definitions here should not be construed as representing a material difference from the meanings generally accepted among those skilled in the art. Many of the methods and procedures that are described here or to which reference is made should be well known to those skilled in the art and widely used by them in accordance with conventional methodologies.
[0020] Если из контекста данного описания ясно не вытекает иного, то единственное число существительных предполагает равным образом их значения во множественном числе. Например, термин «клетка» может означать как одну, так и множество клеток, включая их смеси.[0020] Unless the context of this description clearly implies otherwise, the singular number of nouns also assumes their meanings in the plural. For example, the term "cell" can mean either one or multiple cells, including mixtures thereof.
[0021] Выражения «антагонистический микроорганизм» и «микробный антагонист» - оба означают микроорганизм, штамм которого показывает степень ингибирования фузариоза, которая на статистически значимом уровне превышает степень ингибирования от необработанного контроля.[0021] The expressions "antagonistic microorganism" and "microbial antagonist" both mean a microorganism whose strain shows a degree of inhibition of Fusarium that is at a statistically significant level greater than the degree of inhibition from an untreated control.
[0022] Антибиотик: термин «антибиотик» в данном описании означает субстанцию, способную убить или ингибировать рост микроорганизма. Антибиотики могут продуцироваться по меньшей мере одним из таких источников: 1) микроорганизмом, 2) процессом синтеза и 3) процессом полусинтеза. Антибиотиком может быть микроорганизм, выделяющий летучее органическое соединение. Кроме того, антибиотиком может быть летучее органическое соединение, выделяемое микроорганизмом.[0022] Antibiotic: The term "antibiotic" as used herein means a substance capable of killing or inhibiting the growth of a microorganism. Antibiotics can be produced by at least one of these sources: 1) a microorganism, 2) a synthetic process, and 3) a semi-synthetic process. The antibiotic may be a microorganism that produces a volatile organic compound. In addition, the antibiotic may be a volatile organic compound released by the microorganism.
[0023] Бактерицидный: термин «бактерицидный» в данном описании означает способность композиции или субстанции повысить смертность бактерий или ингибировать скорость их роста. Ингибирование скорости роста бактерий в большинстве случаев может оцениваться по уменьшению количества жизнеспособных бактериальных клеток с течением времени.[0023] Bactericidal: The term "bactericidal" as used herein means the ability of a composition or substance to increase the mortality of bacteria or to inhibit their rate of growth. Inhibition of the growth rate of bacteria in most cases can be measured by the decrease in the number of viable bacterial cells over time.
[0024] Биологическая борьба: термин «биологическая борьба» и его сокращенная форма «биоборьба» в данном описании означают борьбу с патогенном, либо с насекомым, либо с любым другим нежелательным организмом с помощью по меньшей мере одного другого организма, не являющегося человеком. В качестве примера известного механизма биологической борьбы можно привести использование микроорганизмов, которые борются с корневой гнилью путем вытеснения грибов из конкуренции за пространство на поверхности корня, или микроорганизмов, которые либо ингибируют рост патогена, либо убивают его. «Растением-хозяином» в контексте биологической борьбы является растение, восприимчивое к болезни, вызываемой данным патогеном. «Растением-хозяином» в контексте отделения принадлежащего к виду грибов организма от его естественной среды является такое растение, которое поддерживает рост гриба, то есть, например, растение вида, для которого гриб является эндофитом.[0024] Biological control: The term "biological control" and its abbreviated form "bio control" as used herein means combating a pathogen, or an insect, or any other undesirable organism with the help of at least one other non-human organism. An example of a known biological control mechanism is the use of microorganisms that fight root rot by outcompeting fungi for space on the root surface, or microorganisms that either inhibit the growth of the pathogen or kill it. A "host plant" in the context of biological control is a plant susceptible to a disease caused by a given pathogen. A "host plant" in the context of separating an organism belonging to a fungal species from its natural environment is a plant that supports the growth of the fungus, that is, for example, a plant of a species for which the fungus is an endophyte.
[0025] Термин «зерновой» в данном описании означает любой зерновой вид, который может быть восприимчивым к фузариозу. К числу таких восприимчивых зерновых культур относятся пшеница, ячмень, овес и тритикале; при этом пшеница и ячмень являются двумя культурами, для которых данная болезнь представляет особенно значительную экономическую проблему.[0025] The term "cereal" as used herein means any cereal species that may be susceptible to Fusarium. Such susceptible crops include wheat, barley, oats and triticale; however, wheat and barley are two crops for which the disease is a particularly significant economic problem.
[0026] Термин «эффективное количество» означает количество, достаточное для получения полезных или целевых результатов. В отношении борьбы с болезнью, к лечебной обработке, ингибированию болезни или защиты от нее, эффективным является количество, достаточное для подавления, стабилизации, поворота хода болезни вспять, замедления или задержания развития инфекции-мишени или болезненного состояния. Таким образом, выражение «эффективное количество» в данном описании означает такое количество антагонистической обработки, которое является необходимым для снижения уровня развития патогена и/или уровня вызванной патогеном болезни по сравнению с уровнем, который наблюдается у необработанного контроля. Как правило, эффективное количество данной антагонистической обработки дает снижение по меньшей мере на: 20%; как правило, от 30 до 40% и больше; как правило, от 50 до 60% и больше; как правило, от 70 до 80% и больше; или, как правило, от 90 до 95% по сравнению с уровнем болезни и/или уровнем развития патогена, наблюдаемым у необработанного контроля в соответствующих условиях лечебной обработки. Эффективное количество может поставляться за один или больше приемов. Фактическая скорость поставки жидкого препарата обычно лежит в пределах приблизительно от минимум 1×103 до 1×1010 жизнеспособных клеток/мл и предпочтительно приблизительно от 1×106 до 5×109 жизнеспособных клеток/мл. В большинстве состояний антагонистические микробные штаммы по изобретению, описанные в Примерах ниже, будут оптимально эффективными при скорости поставки в интервале приблизительно от 1×106 до 1×109 жизнеспособных клеток/мл, если при поставке обеспечивается практически однородный контакт по меньшей мере приблизительно 50% тканей растения. Если антагонисты поставляются в форме твердого препарата, то скорость поставки должна регулироваться таким образом, чтобы обеспечивать количество жизнеспособных клеток на единицу площади поверхности ткани растения, сравнимое с получаемым при вышеупомянутых величинах скорости обработки жидкостью. Как правило, средства биологической борьбы согласно изобретению являются биологически эффективными, если они поставляются в концентрации выше 106 КОЕ/г (колониеобразующих единиц на грамм), предпочтительно, если выше 107 КОЕ/г, еще предпочтительнее, если выше 108 КОЕ/г, и наиболее предпочтительно, если в концентрации 109 КОЕ/г.[0026] The term "effective amount" means an amount sufficient to obtain useful or intended results. With respect to controlling a disease, treating, inhibiting or protecting a disease, an effective amount is an amount sufficient to suppress, stabilize, reverse the course of the disease, slow or delay the development of the target infection or disease state. Thus, the expression "effective amount" in this description means that amount of antagonistic treatment, which is necessary to reduce the level of development of the pathogen and/or the level of disease caused by the pathogen compared to the level observed in the untreated control. Typically, an effective amount of a given antagonistic treatment results in a reduction of at least: 20%; as a rule, from 30 to 40% and more; as a rule, from 50 to 60% and more; as a rule, from 70 to 80% and more; or, as a rule, from 90 to 95% compared with the level of disease and/or the level of pathogen development observed in the untreated control under the corresponding treatment conditions. An effective amount may be delivered in one or more doses. The actual delivery rate of the liquid preparation usually lies in the range of at least 1x10 3 to 1x10 10 viable cells/ml and preferably from about 1x10 6 to 5x10 9 viable cells/ml. Under most conditions, the antagonistic microbial strains of the invention described in the Examples below will be optimally effective at a delivery rate in the range of about 1×10 6 to 1×10 9 viable cells/mL, if delivery provides substantially uniform contact of at least about 50 % plant tissues. If the antagonists are supplied in the form of a solid formulation, then the rate of delivery should be controlled to provide a number of viable cells per unit area of plant tissue surface comparable to that obtained at the above liquid treatment rates. Generally, the biological control agents of the invention are biologically effective when supplied at concentrations above 10 6 cfu/g (colony forming units per gram), preferably above 10 7 cfu/g, even more preferably above 10 8 cfu/g , and most preferably, if at a concentration of 10 9 CFU / g.
[0027] Далее, выражение «эффективный микробный антагонист», используемое по отношению к микроорганизму, означает, что данный микробный штамм демонстрирует степень ингибирования фузариоза, которая на статистически значимом уровне превышает степень ингибирования, наблюдаемую у необработанного контроля. Как правило, эффективный микробный антагонист обладает способностью давать снижение по меньшей мере на: 20% и больше; как правило, от 30 до 40% и больше; как правило, от 50 до 60% и больше; как правило, от 70 до 80% и больше; как правило, от 90 до 95% относительно уровня болезни и/или уровня развития патогена, имеющего место в необработанном контроле при соответствующих условиях лечебной обработки.[0027] Further, the expression "effective microbial antagonist" when used with respect to a microorganism means that a given microbial strain exhibits a degree of inhibition of Fusarium that is statistically significantly greater than that observed in an untreated control. Typically, an effective microbial antagonist is capable of producing a reduction of at least: 20% or more; as a rule, from 30 to 40% and more; as a rule, from 50 to 60% and more; as a rule, from 70 to 80% and more; typically 90 to 95% relative to the level of disease and/or the level of pathogen development present in the untreated control under appropriate treatment conditions.
[0028] Композиция: термин «композиция» означает комбинацию активного агента по меньшей мере с другим соединением, носителем или композицией, инертным(-й) (например, детектируемым агентом или меткой, жидким носителем и т.п.) или активным, например, пестицидом.[0028] Composition: The term "composition" means the combination of an active agent with at least another compound, carrier or composition, inert(s) (e.g., detectable agent or label, liquid carrier, etc.) or active, for example, pesticide.
[0029] Выделенный микробный штамм, выделенная культура, биологически чистая культура и обогащенная культура: используемый в данном описании термин «выделенный» в применении к микроорганизму (например, бактерии или микрогрибу) означает микроорганизм, который был отделен и/или очищен от среды, где он природно возникает. Аналогично этому, термин «выделенный штамм» микроба означает штамм, который был отделен и/или очищен от своей естественной среды. Таким образом, термин «выделенный микроорганизм» не включает в свое значение микроорганизм, пребывающий в среде, в которой он нормально возникает. Кроме того, термин «выделенный» не обязательно отражает степень, до которой данный микроб был очищен. Термин «по существу чистая культура» микробного штамма означает культуру, которая по существу не содержит других микробов, кроме целевого микробного штамма или штаммов. Другими словами, «по существу чистая культура» микробного штамма по существу не содержит загрязнений, которые могут включать микробные загрязнения, а также нежелательные химические загрязнения. Кроме того, используемый здесь термин «биологически чистый» штамм означает штамм, выделенный из материалов, с которыми он нормально ассоциируется в природных условиях. Следует заметить, что штамм, ассоциированный с другими штаммами или соединениями, или материалами, которые в природных условиях нормально не встречаются, также имеет определение «биологически чистый». Вполне понятно, что монокультура того или иного штамма является «биологически чистой». Используемый здесь термин «обогащенная культура» выделенного микробного штамма означает микробную культуру, содержащую более 50%, 60%, 70%, 80%, 90% или 95% выделенного штамма.[0029] Isolated microbial strain, isolated culture, biologically pure culture, and enriched culture: As used herein, the term "isolated" when applied to a microorganism (e.g., bacteria or microfungus) means a microorganism that has been isolated and/or purified from a medium where it comes naturally. Similarly, the term "isolated strain" of a microbe means a strain that has been isolated and/or purified from its natural environment. Thus, the term "isolated microorganism" does not include in its meaning a microorganism present in an environment in which it normally occurs. In addition, the term "isolated" does not necessarily reflect the extent to which a given microbe has been purified. The term "substantially pure culture" of a microbial strain means a culture that is substantially free of other microbes other than the target microbial strain or strains. In other words, a "substantially pure culture" of a microbial strain is essentially free of contaminants, which may include microbial contaminants as well as unwanted chemical contaminants. In addition, as used herein, the term "biologically pure" strain means a strain isolated from materials with which it is normally associated in nature. It should be noted that a strain associated with other strains or compounds or materials that do not normally occur under natural conditions is also defined as "biologically pure". It is quite clear that the monoculture of a particular strain is "biologically pure". The term "enriched culture" of an isolated microbial strain as used herein means a microbial culture containing more than 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, or 95% of the isolated strain.
[0030] Используемый здесь термин «эндофит» означает эндосимбионт, живущий внутри растения на протяжении по меньшей мере части своей жизни, не вызывая очевидной болезни. Трансмиссия эндофитов может происходить либо по вертикали (непосредственно от родителя к потомству) либо по горизонтали (от индивида к неродственному индивиду). Переданные по вертикали грибные эндофиты являются, как правило, бесполыми и переносятся от материнского растения к потомству путем проникновения в семена хозяина через грибные гифы. Бактериальные эндофиты могут переноситься по вертикали также от семян к саженцам (Ferreira et al., 2008). В противоположность этому, горизонтально передаваемые эндофиты, как правило, имеют пол и переносятся спорами ветром и/или насекомыми-переносчиками. Эндофиты возделываемых зерновых привлекли к себе большое внимание в связи с их способностью бороться как с болезнью, так и с заражением насекомыми, а также активировать рост растений.[0030] As used herein, the term "endophyte" means an endosymbiont that lives within a plant for at least part of its life without causing obvious disease. Transmission of endophytes can occur either vertically (directly from parent to offspring) or horizontally (from individual to unrelated individual). Vertically transmitted fungal endophytes are usually asexual and are transferred from the mother plant to the offspring by penetrating the host seeds through the fungal hyphae. Bacterial endophytes can also be transferred vertically from seeds to seedlings (Ferreira et al. , 2008). In contrast, horizontally transmitted endophytes are generally sexed and carried by wind-borne spores and/or insect vectors. Endophytes in cultivated cereals have received much attention due to their ability to fight both disease and insect infestation, as well as to promote plant growth.
[0031] Функционально сравнимый протеин: используемый здесь термин «функционально сравнимый протеин» относится к протеинам, имеющим по меньшей мере одну общую характеристику. Такими характеристиками могут быть подобие друг другу последовательностей, биохимическая активность, подобие друг другу схем транскрипции и фенотипичная активность. Как правило, функционально сравнимые протеины имеют некоторое подобие между собой последовательностей или являются подобными по меньшей мере по одному биохимическому признаку. В рамках этого определения функционально сравнимыми считаются гомологи, ортологи, паралоги и аналоги. Кроме того, функционально сравнимые протеины, в общем случае, имеют схожую по меньшей мере одну биохимическую и/или фенотипичную активность. Функционально сравнимые протеины придают одной и той же характеристике подобие, но не обязательно в одинаковой степени. Как правило, функционально сравнимые протеины дают одни и те же характеристики, которые в количественном измерении у одного из сравниваемых протеинов, составляют по меньшей мере 20% от таковых у другого, чаще от 30 до 40%; еще чаще от 50 до 60%, еще чаще от 70 до 80%, еще чаще от 90 до 95% и, как правило, от 98 до 100% от таковых у другого.[0031] Functionally comparable protein: As used herein, the term "functionally comparable protein" refers to proteins that have at least one common characteristic. Such characteristics can be sequence similarity to each other, biochemical activity, transcription pattern similarity to each other, and phenotypic activity. As a rule, functionally comparable proteins have some sequence similarity among themselves or are similar in at least one biochemical trait. Within the framework of this definition, homologs, orthologs, paralogs, and analogs are considered functionally comparable. In addition, functionally comparable proteins, in General, have similar at least one biochemical and/or phenotypic activity. Functionally comparable proteins confer similarity on the same characteristic, but not necessarily to the same extent. As a rule, functionally comparable proteins give the same characteristics, which, in quantitative terms, in one of the compared proteins, are at least 20% of those of the other, more often from 30 to 40%; more often from 50 to 60%, even more often from 70 to 80%, even more often from 90 to 95% and, as a rule, from 98 to 100% of those of another.
[0032] Фунгицидный: используемый здесь термин «фунгицидный» означает способность композиции или субстанции снизить скорость роста грибов или повысить смертность грибов.[0032] Fungicidal: As used herein, the term "fungicidal" refers to the ability of a composition or substance to reduce the growth rate of fungi or increase the mortality of fungi.
[0033] Гриб Fusarium: в контексте данного изобретения термин «гриб Fusarium» включает в себя как половую (телеоморфную) фазу этого организма, так и бесполую (анаморфную) его фазу, называемые также фазами, соответственно, совершенных и несовершенных грибов. Например, анаморфной фазой гриба Fusarium graminearum является Gibberella zeae, то есть возбудитель фузариоза. Эта болезнь, как правило, возникает, когда цветок или семенная шапка инокулируется конидиями, выпускаемыми несовершенной формой, или аскоспорами, выпускаемыми совершенной формой этого гриба.[0033] Fusarium fungus: In the context of this invention, the term " Fusarium fungus" includes both the sexual (teleomorphic) phase of this organism and its asexual (anamorphic) phase, also called perfect and imperfect fungal phases, respectively. For example, the anamorphic phase of the fungus Fusarium graminearum is Gibberella zeae , i.e. the causative agent of Fusarium. This disease usually occurs when a flower or seedcap is inoculated with conidia released by the imperfect form or ascospores released by the perfect form of this fungus.
[0034] Мутант: используемый здесь термин «мутант» или «вариант» по отношению к микроорганизму означает модификацию родительского штамма, в котором целевая биологическая активность является подобной активности, выражаемой родительским штаммом. Например, в случае Microbacterium «родительским штаммом» называется оригинальный штамм Microbacterium до мутагенеза. Мутанты или варианты могут возникать в природе без вмешательства человека. Они могут быть получены также путем обработки одним или множеством способов и составов, известных специалистам в данной отрасли. Например, родительский штамм может быть обработан химикатом, таким как N-метил-N'-нитро-N-нитрозогуанид, этилметансульфон, или же гамма-, рентгеновским либо ультрафиолетовым излучением, или любыми другими средствами, хорошо известными специалистам в данной отрасли.[0034] Mutant: As used herein, the term "mutant" or "variant" in relation to a microorganism means a modification of the parent strain in which the target biological activity is similar to that expressed by the parent strain. For example, in the case of Microbacterium , the "parent strain" refers to the original strain of Microbacterium prior to mutagenesis. Mutants or variants can occur naturally without human intervention. They can also be obtained by processing one or more methods and compositions known to experts in this industry. For example, the parent strain may be treated with a chemical such as N-methyl-N'-nitro-N-nitrosoguanide, ethyl methanesulfone, or with gamma, x-ray, or ultraviolet radiation, or any other means well known to those skilled in the art.
[0035] Нематоцидный: термин «нематоцидный» в данном описании означает способность субстанции или композиции повысить смертность или ингибировать скорость роста нематодов.[0035] Nematicidal: The term "nematicidal" as used herein means the ability of a substance or composition to increase mortality or inhibit the growth rate of nematodes.
[0036] Патоген: термин «патоген» в данном описании означает организм, такой как водоросль, паукообразное, бактерия, гриб, насекомое, нематод, растение-паразит, дрожжи, простейшее животное или вирус, способный продуцировать болезнь у растения или животного. Термин «фитопатоген» в данном описании означает патогенный организм, инфицирующий растение.[0036] Pathogen: The term "pathogen" as used herein means an organism, such as an algae, arachnid, bacterium, fungus, insect, nematode, parasitic plant, yeast, protozoan, or virus capable of producing a disease in a plant or animal. The term "phytopathogen" as used herein means a pathogenic organism that infects a plant.
[0037] Процент идентичности: «процент идентичности последовательности», в соответствии с данным описанием, определяют путем локального сопоставления двух оптимально выровненных последовательностей на участке выравнивания, определяемом длиной локального выравнивания двух последовательностей. При оптимальном выравнивании двух последовательностей данная аминокислотная последовательность на участке выравнивания может содержать добавки или делеции (например, пробелы или оверхэнги) в сравнении с эталонной последовательностью (которая не содержит добавок или делеций). Локальное выравнивание двух последовательностей проводится только по тем сегментам каждой последовательности, которые предположительно являются достаточно подобными по определенному критерию, выбираемому в соответствии с алгоритмом, используемым для выравнивания (например, программой BLAST). Процент идентичности вычисляют путем определения количества совпадений позиций, в которых в обеих последовательностях размещаются идентичные основания нуклеиновых кислот или остатки аминокислот, деления полученной величины совпадений на общее количество позиций на данном участке выравнивания и умножения полученного результата на 100. Оптимальное выравнивание последовательностей может осуществляться с помощью алгоритма локальной гомологии Смита-Ватермана (Smith and Waterman, Add. APL. Math. 2:482, 1981) или алгоритма глобальной гомологии Нидлмана-Вунша (Needleman and Wunsch, J. Mol. Biol. 48:443, 1970), методом исследования подобия Пирсона-Липмана (Pearson and Lipman, Proc. Natl Acad. Sci. USA 85: 2444, 1988), эвристической имплементации этих алгоритмов (NCBI BLAST, WU-BLAST, BLAT, SIM, BLASTZ) или путем визуальных исследований. Если две последовательности были выбраны для выравнивания, то для проведения их оптимального выравнивания предпочтительно использовать алгоритмы GAP и BESTFIT. Как правило, по умолчанию задают величины 5.00 для веса пробелов и 0.30 для длины веса пробелов. Термин «существенная идентичность последовательностей» между полинуклеотидными или полипептидными последовательностями относится к полинуклеотиду или полипептиду, содержащему последовательность, которая имеет по меньшей мере 50% идентичность, предпочтительно по меньшей мере 70%, предпочтительно по меньшей мере 80%, более предпочтительно по меньшей мере 85%, более предпочтительно по меньшей мере 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере 95%, и наиболее предпочтительно по меньшей мере 96%, 97%, 98% или 99% идентичность в сравнении с эталонной идентичностью, определенную с помощью компьютерной программы.[0037] Percent identity: "Percent sequence identity", as used herein, is determined by locally matching two optimally aligned sequences in an alignment region determined by the length of the local alignment of the two sequences. When two sequences are optimally aligned, a given amino acid sequence at the alignment site may contain additions or deletions (eg, gaps or overhangs) compared to a reference sequence (which contains no additions or deletions). Local alignment of two sequences is carried out only on those segments of each sequence that are supposed to be sufficiently similar according to a certain criterion, selected in accordance with the algorithm used for alignment (for example, the BLAST program). Percent identity is calculated by determining the number of matches at positions where identical nucleic acid bases or amino acid residues are located in both sequences, dividing the resulting match by the total number of positions in a given alignment region, and multiplying the result by 100. Optimal sequence alignment can be performed using the algorithm Smith-Waterman local homology (Smith and Waterman, Add. APL. Math. 2:482, 1981) or Needleman-Wunsch global homology algorithm (Needleman and Wunsch, J. Mol. Biol. 48:443, 1970), similarity study method Pearson-Lipman (Pearson and Lipman, Proc. Natl Acad. Sci. USA 85: 2444, 1988), heuristic implementation of these algorithms (NCBI BLAST, WU-BLAST, BLAT, SIM, BLASTZ) or through visual studies. If two sequences have been chosen for alignment, then it is preferable to use the GAP and BESTFIT algorithms to perform their optimal alignment. Typically, the default values are 5.00 for the weight of spaces and 0.30 for the length of the weight of spaces. The term "substantial sequence identity" between polynucleotide or polypeptide sequences refers to a polynucleotide or polypeptide containing a sequence that has at least 50% identity, preferably at least 70%, preferably at least 80%, more preferably at least 85% , more preferably at least 90%, even more preferably at least 95%, and most preferably at least 96%, 97%, 98% or 99% identity compared to a reference identity determined by a computer program.
[0038] Анализ нуклеинокислотных и аминокислотных последовательностей может проводиться путем сопоставления их с соответствующими нуклеинокислотными или аминокислотными последовательностями, хранящимися в публичных или частных базах данных. Такие исследования могут проводиться с помощью программы NCBI BLAST v 2.18 Национального центра информации по биотехнологиями (National Center for Biotechnology Information Basic Local Alignment Search Tool). Программа NCBI BLAST доступна в сети Интернет по адресу blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi (National Center for Biotechnology Information). В программе NCBI BLAST могут использоваться, как правило, следующие параметры: Опции фильтров устанавливают по умолчанию «default»; Матрицу выравнивания (Comparison Matrix) устанавливают на «BLOSUM62»; Издержки на пробелы (Gap Costs) устанавливают на «Existence: 11, Extension: 1», Размер слова (Word Size) устанавливают на 3, Порог ожидания Expect (E threshold) устанавливают на 1e-3, а минимальную длину локального выравнивания устанавливают на 50% длины анализируемой последовательности. Идентичность и сходство последовательности могут определяться также с помощью программы GenomeQuest™ (Gene-IT, Worcester Mass. USA).[0038] The analysis of nucleic acid and amino acid sequences can be carried out by comparing them with the corresponding nucleic acid or amino acid sequences stored in public or private databases. Such studies can be carried out using the NCBI BLAST v 2.18 program of the National Center for Biotechnology Information Basic Local Alignment Search Tool. The NCBI BLAST program is available online at blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi (National Center for Biotechnology Information). In the NCBI BLAST program, the following parameters can generally be used: Filter options set to "default" by default; The alignment matrix (Comparison Matrix) is set to "BLOSUM62"; Gap Costs are set to "Existence: 11, Extension: 1", Word Size is set to 3, Expect Threshold (E threshold) is set to 1e-3, and Local Alignment Minimum Length is set to 50 % length of the analyzed sequence. Sequence identity and similarity can also be determined using the GenomeQuest™ program (Gene-IT, Worcester Mass. USA).
[0039] Термин «пестицидный» в данном описании означает способность данной субстанции или композиции снизить скорость роста организма-вредителя, то есть нежелаемого организма, или повысить смертность организма-вредителя.[0039] The term "pesticidal" as used herein means the ability of a given substance or composition to reduce the growth rate of a pest, ie an unwanted organism, or to increase the mortality of the pest.
[0040] Под «супрессорной активностью» средства биологической борьбы с данным фитопатогеном понимают способность данного средства (агента) подавлять, ингибировать, стабилизировать, поворачивать ход болезни вспять, замедлять или задерживать развитие самого патогена или прогрессирование инфекции или болезненного состояния, вызванного данным патогеном.[0040] By "suppressive activity" of a biological control agent against a given plant pathogen is meant the ability of the agent to suppress, inhibit, stabilize, reverse, slow or delay the development of the pathogen itself or the progression of the infection or disease state caused by the pathogen.
[0041] Вариант: термин «вариант», используемый в данном описании по отношению к микроорганизму, означает штамм, имеющий идентифицирующие характеристики вида, к которому он принадлежит, и при этом по меньшей мере одну вариацию нуклеотидной последовательности или идентифицируемую отличительную особенность, относящуюся к родительскому штамму и являющуюся генетически (наследуемой). Например, штамм SGI-SGI-014-CQ6 вида Microbacterium, обладающий фунгицидной активностью и имеющий идентифицируемые особенности, включающие 1) способность подавлять рост гриба Fusarium graminearum и его телеоморфа Gibberella zeae, 2) способность подавлять развитие фузариоза, 3) наличие обязательных генов с идентичностью более 95%, более 96%, более 97%, более 98% или более 99% с обязательными генами SGI-014-C06 вида Microbacterium, может использоваться для подтверждения того, что анализируемый вариант является SGI-014-C06 вида Microbacterium.[0041] Variant: The term "variant" as used herein in relation to a microorganism means a strain having the identifying characteristics of the species to which it belongs, and at least one nucleotide sequence variation or identifiable distinguishing feature related to the parent strain and being genetically (inherited). For example, strain SGI-SGI-014-CQ6 of the species Microbacterium , which has fungicidal activity and has identifiable features, including 1) the ability to suppress the growth of the fungus Fusarium graminearum and its teleomorph Gibberella zeae , 2) the ability to suppress the development of fusarium, 3) the presence of mandatory genes with identity Greater than 95%, Greater than 96%, Greater than 97%, Greater than 98%, or Greater than 99% with mandatory SGI-014-C06 Microbacterium species genes can be used to confirm that the analyzed variant is Microbacterium SGI-014-C06 species.
[0042] В отношении нуклеиновых кислот и полипептидов термин «вариант» используется здесь для обозначения полипептидной, протеиновой или полинуклеотидной молекулы с некоторыми отличиями, созданными искусственно или природным путем, в их аминокислотных или нуклеинокислотных последовательностях от эталонных полипептидов или полинуклеотидов, соответственно. Этими отличиями могут быть, например, замены, инсерции, делеции или любые целевые комбинации таких изменений в эталонном полипептиде или полипептиде. Полипептидные и протеиновые варианты могут, кроме того, состоять из изменений в заряде и/или посттрансляционных модификаций (например, гликозилирования, метилирования, фосфорилирования и др.).[0042] With respect to nucleic acids and polypeptides, the term "variant" is used herein to refer to a polypeptide, protein, or polynucleotide molecule with some artificial or natural difference in its amino acid or nucleic acid sequences from reference polypeptides or polynucleotides, respectively. These differences may be, for example, substitutions, insertions, deletions, or any targeted combination of such changes in the reference polypeptide or polypeptide. Polypeptide and protein variants may also consist of changes in charge and/or post-translational modifications (eg, glycosylation, methylation, phosphorylation, etc.).
[0043] Все публикации и патентные заявки, упомянутые в данном описании, включены здесь посредством ссылки так, как если бы каждая из публикаций или патентных заявок была индивидуально включена посредством ссылки.[0043] All publications and patent applications mentioned in this specification are incorporated herein by reference as if each of the publications or patent applications were individually incorporated by reference.
[0044] Ссылки не означают признания их известным уровнем техники или прототипом. Обсуждением ссылок констатируется, что их авторы декларируют, а заявители имеют право, оспаривать точность и релевантность цитированных документов. Вполне понятно, что, хотя здесь сделаны ссылки на множество публикаций известного уровня техники, эти ссылки не означают признания того, что любой из этих документов образует собой часть общеизвестных сведений в данной отрасли.[0044] References do not imply recognition of prior art or prior art. By discussing the references, it is stated that their authors declare, and the applicants have the right, to challenge the accuracy and relevance of the cited documents. It is understood that although references are made herein to numerous prior art publications, these references do not constitute an acknowledgment that any of these documents form part of the general knowledge in the art.
Методы таксономической идентификацииTaxonomic identification methods
[0045] Микроорганизмы часто можно различать путем прямого микроскопического исследования (ведь все клетки в образце выглядят под микроскопом по-разному), по характеристикам окрашивания, путем простого молекулярного анализа (например, просто путем определения полиморфизма длины рестрикционных фрагментов (ПДРФ) и т.д. В дополнение к иллюстративным примерам таких методов таксономического анализа, описанных ниже, в Примерах 2-3, в таксономической идентификации того или иного микроорганизма может использоваться до нескольких различных уровней анализа, и каждый анализ может основываться на отличающихся от других характеристиках данного организма. В число таких разновидностей таксономического анализа могут входить анализ на основе нуклеиновых кислот (например, анализ индивидуальных специфических генов по уровню их присутствия или по их точной последовательности, либо по экспрессии конкретного гена или семейства генов), протеиновый анализ (например, на функциональном уровне с помощью прямого или косвенного ферментного анализа или на структурном уровне с помощью методов иммунодетектирования) и т.д.[0045] Microorganisms can often be distinguished by direct microscopic examination (because all cells in a sample look different under a microscope), by staining characteristics, by simple molecular analysis (for example, simply by determining restriction fragment length polymorphism (RFLP), etc. In addition to the illustrative examples of such taxonomic analysis methods described in Examples 2-3 below, up to several different levels of analysis can be used in the taxonomic identification of a particular microorganism, and each analysis can be based on distinct characteristics of that organism. such taxonomic analyzes may include nucleic acid-based analysis (for example, analysis of individual specific genes by their level of presence or by their exact sequence, or by the expression of a particular gene or family of genes), protein analysis (for example, at a functional level using direct and whether indirect enzymatic analysis or at the structural level using immunodetection methods), etc.
[0046] a. Анализ посредством нуклеиновых кислот. Специалистам в данной отрасли хорошо известно, что в таксономической идентификации данного микроорганизма могут использоваться самые различные методы нуклеинокислотного анализа. Эти методы могут использоваться для идентификации клеток по нуклеотидной последовательности гена или для идентификации клетки, имеющей конкретные гены или семейства генов. Подходящими для таксономических исследований общими семействами генов могут быть семейство генов 16S, семейство актиновых генов и семейство генов рекомбиназы A (recA). В число этих методов, как правило, входят амплификация и секвенирование генов из очень малых количеств клеток, что зачастую позволяет преодолеть проблемы, связанные с концентрированием клеток и их ДНК из разбавленных суспензий. Термин «амплификация нуклеиновых кислот», в общем случае, относится к методам увеличения количества копий нуклеинокислотной молекулы в образце или препарате. Техника амплификации нуклеиновых кислот хорошо известна. Амплификацию нуклеиновых кислот можно осуществлять, например, с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР), в которой взятый у субъекта биологический образец приводят в контакт с парой олигонуклеотидных праймеров в условиях, позволяющих осуществлять гибридизацию праймеров c нуклеинокислотной матрицей в данном образце. Праймеры в подходящих условиях удлиняются, отделяются от матрицы и затем отжигаются, удлиняются и отделяются, увеличивая число копий нуклеиновых кислот. Амплификация in vitro может проводиться также методом смещения нитей, изотермическим методом без транскрипции, методом амплификации с реакцией репарации цепей, методом лигазной цепной реакции, методом лигазной цепной реакции с заполнением разрывов, спаренным методом лигазной детекции и ПЦР; и методом амплификации без транскрипции РНК.[0046] a. Analysis by nucleic acids. It is well known to those skilled in the art that a wide variety of nucleic acid analysis methods can be used in the taxonomic identification of a given microorganism. These methods can be used to identify cells by the nucleotide sequence of a gene, or to identify a cell that has specific genes or gene families. Common gene families suitable for taxonomic studies may be the 16S gene family, the actin gene family, and the recombinase A ( recA) gene family. These methods typically involve the amplification and sequencing of genes from very small numbers of cells, which often overcomes the problems associated with concentrating cells and their DNA from dilute suspensions. The term "nucleic acid amplification" generally refers to methods for increasing the copy number of a nucleic acid molecule in a sample or preparation. Nucleic acid amplification techniques are well known. Amplification of nucleic acids can be carried out, for example, using the polymerase chain reaction (PCR), in which a biological sample taken from a subject is brought into contact with a pair of oligonucleotide primers under conditions that allow the primers to hybridize with a nucleic acid template in this sample. Primers, under the right conditions, elongate, detach from the template, and then anneal, elongate, and detach to increase the copy number of the nucleic acids. In vitro amplification can also be carried out by the strand displacement method, the isothermal method without transcription, the amplification method with the chain repair reaction, the ligase chain reaction method, the ligation chain reaction method with gap filling, the coupled method of ligase detection and PCR; and an amplification method without RNA transcription.
[0047] Кроме праймеров, приведенных в иллюстративных Примерах 2-3 и прилагаемом Перечне последовательностей, авторами в ходе лабораторных экспериментов были сконструированы также другие праймеры и, кроме того, непрерывно продолжается конструирование новых праймеров для индивидуальных биологических видов и филогенетических групп микроорганизмов. Такие узконаправленные праймеры могут находить применение в описанных здесь способах для отбора и/или специфической идентификации конкретных, целевых микроорганизмов.[0047] In addition to the primers shown in illustrative Examples 2-3 and the accompanying Sequence Listing, other primers have also been designed by the authors during laboratory experiments, and, in addition, the design of new primers for individual biological species and phylogenetic groups of microorganisms is ongoing. Such highly targeted primers may find use in the methods described herein for the selection and/or specific identification of specific, target microorganisms.
[0048] Методы приготовления и использования нуклеинокислотных праймеров описаны, например, в [Sambrook et al. (In Molecular Cloning: A Laboratory Manual, CSHL, New York, 1989], Ausubel et al. (ed.) (In Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York, 1998]. Пары праймеров для амплификации могут быть получены из известной последовательности, например, с помощью специальной компьютерной программы «Primer», разработанной Институтом фузариоза, г. Кембридж, шт. Массачусетс, США (Whitehead Institute for Biomedical Research, Cambridge, Mass.). Специалисту в данной отрасли хорошо известно, что специфичность зонда или праймера возрастает с его длиной. Так, например, праймер, содержащий 30 последовательных нуклеотидов его рРНК-кодирующего нуклеотидного или фланкирующего участка, будет отжигаться до целевой последовательности с более высокой специфичностью, чем соответствующий праймер, состоящий только из 15 нуклеотидов. Таким образом, для получения большей специфичности можно отбирать зонды и праймеры, содержащие по меньшей мере 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50 или больше последовательных нуклеотидов целевой нуклеотидной последовательности, такие как 16S рРНК.[0048] Methods for the preparation and use of nucleic acid primers are described, for example, in [Sambrook et al. (In Molecular Cloning: A Laboratory Manual, CSHL, New York, 1989], Ausubel et al. (ed.) (In Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York, 1998]. Amplification primer pairs can be obtained from a known sequence, for example, using a special computer program "Primer", developed by the Fusarium Institute, Cambridge, Massachusetts, USA (Whitehead Institute for Biomedical Research, Cambridge, Mass.). It is well known to a person skilled in the art that the specificity of a probe or primer increases with its length.For example, a primer containing 30 consecutive nucleotides of its rRNA-coding nucleotide or flanking region will anneal to the target sequence with higher specificity than a corresponding primer consisting of only 15 nucleotides.Thus , probes and primers containing at least 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50 or more consecutive nucleotides of the target nucleotide sequence, such as 16S rRNA.
[0049] Нуклеиновые кислоты, подходящие для нуклеинокислотных манипуляций (например, ПЦР), можно получать с помощью таких общеизвестных технологий, как экстрагирование фенол-хлороформом, или с помощью одного из множества продажных комплектов экстрагирования ДНК. Альтернативным путем амплификации ДНК может быть присаживание клеток непосредственно в реакционную смесь для амплификации нуклеиновых кислот и проведение всех остальных манипуляций на стадии денатурации с лизисом клеток и выделением ДНК.[0049] Nucleic acids suitable for nucleic acid manipulation (eg, PCR) can be obtained using well-known technologies such as phenol-chloroform extraction, or using one of the many commercial DNA extraction kits. An alternative way of DNA amplification can be to attach cells directly to the reaction mixture for nucleic acid amplification and carry out all other manipulations at the stage of denaturation with cell lysis and DNA isolation.
[0050] Полученный продукт реакций амплификации нуклеиновых кислот анализируют с помощью стандартных методов, включая электрофорез, картины расщепления рестрикционной эндонуклеазой, гибридизацию или лигирование олигонуклеотидов и/или секвенирование нуклеиновых кислот. Если методы гибридизации используются для всех целей идентификации клеток, то подходящими для этого могут быть самые различные способы мечения зондов, включая флуоресцентное мечение, радиоактивное мечение и нерадиоактивное мечение. При использовании методов секвенирования нуклеиновых кислот может проводиться исследование гомологии нуклеотидных последовательностей амплифицированных нуклеинокислотных молекул с помощью различных баз данных известных последовательностей, включая, например, базы данных DDBJ/GenBank/EMBL.[0050] The resulting product of nucleic acid amplification reactions is analyzed using standard methods, including electrophoresis, restriction endonuclease digestion patterns, oligonucleotide hybridization or ligation, and/or nucleic acid sequencing. If hybridization methods are used for all purposes of cell identification, a wide variety of probe labeling methods may be suitable, including fluorescent labeling, radioactive labeling, and non-radioactive labeling. When using nucleic acid sequencing techniques, the homology of the nucleotide sequences of the amplified nucleic acid molecules can be conducted using various databases of known sequences, including, for example, the DDBJ/GenBank/EMBL databases.
[0051] b. Протеин-опосредованный анализ. В дополнение к анализу нуклеиновых кислот, микроорганизмы могут характеризоваться с помощью таксономии и идентифицироваться непосредственно по присутствию (или отсутствию) специфических протеинов. В таком анализе за основу может приниматься активность определенного протеина, например, в ферментном анализе, или ответ совместно культивируемых организмов, или просто присутствие специфицированного протеина (которое может определяться, например, с помощью иммунологических методов, таких как иммунофлуоресцентное окрашивание антителами in situ).[0051]b. Protein-mediated analysis. In addition to nucleic acid analysis, microorganisms can be characterized by taxonomy and identified directly by the presence (or absence) of specific proteins. Such an assay may be based on the activity of a particular protein, such as in an enzyme assay, or the response of co-cultured organisms, or simply the presence of a specified protein (which may be determined, for example, by immunological methods such as in situ antibody immunofluorescence staining).
[0052] Ферментный анализ. Для проведения такого анализа, в питательную среду (например, культуры на микротитровальном планшете) включают флуоресцентные или хромогенные аналоги субстрата, а затем проводят инкубацию и скрининг по продуктам реакции, идентифицируя, таким образом, культуры по их ферментативной активности.[0052] Enzyme analysis. To perform such an assay, fluorescent or chromogenic substrate analogs are included in the nutrient medium (eg, cultures on a microtiter plate), and then incubated and screened for reaction products, thus identifying the cultures by their enzymatic activity.
[0053] Ответ при совместной культивации. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения активность фермента, несомого микробным изолятом, можно определять по ответу (или степени ответа) совместно культивируемого организма (например, организма-репортера).[0053] Co-cultivation response. In some embodiments of the present invention, the activity of an enzyme carried by a microbial isolate can be determined by the response (or rate of response) of a co-cultured organism (eg, a reporter organism).
[0054] Для идентификации микроорганизмов, выбранных и выделенных из окружающей среды-источника путем связывания по меньшей мере одного антитела или одной молекулы, полученной из антитела, с определенной молекулой, а точнее - с эпитопом молекулы, микроорганизма, также могут применяться самые различные способы.[0054] A variety of methods can also be used to identify microorganisms selected and isolated from the source environment by binding at least one antibody or one molecule derived from an antibody to a specific molecule, and more precisely, to an epitope of a molecule, a microorganism.
[0055] Антитела к белкам микроорганизмов могут быть получены с помощью стандартных методик, описанных во многих литературных источниках, например, (Harlow and Lane, (Antibodies, A Laboratory Manual, CSHL, New York, 1988). Определить то, связывается ли данный агент по существу только с протеином целевого микроорганизма, можно легко с помощью обычных или адаптированных методик. Одной из таких методик, подходящих для анализа in vitro, является процедура вестерн-блоттинга, описанная во многих известных работах, включая (Harlow and Lane, Antibodies, A Laboratory Manual, CSHL, New York, 1988).[0055] Antibodies to microbial proteins can be prepared using standard techniques described in many literature sources, for example, (Harlow and Lane, (Antibodies, A Laboratory Manual , CSHL, New York, 1988). Determine if a given agent binds essentially only with the protein of the target microorganism can easily be done using conventional or adapted techniques.One such technique, suitable for in vitro analysis, is the Western blotting procedure described in many well-known works, including (Harlow and Lane, Antibodies, A Laboratory Manual , CSHL, New York, 1988).
[0056] Более короткие фрагменты антител (молекул, полученных из антител, например, FAbs, Fvs и одноцепочечные Fvs (SCFvs)) также могут служить специфически связывающими агентами. Способы приготовления таких фрагментов широко известны.[0056] Shorter fragments of antibodies (molecules derived from antibodies, for example, FAbs, Fvs and single chain Fvs (SCFvs)) can also serve as specific binding agents. Methods for preparing such fragments are widely known.
[0057] Детекция антител, связывающихся с клетками в соответствии с изобретением, может осуществляться с помощью стандартных методов, например, иммуноферментного анализа (ИФА), позволяющих получать детектируемый, например, флуоресцентный или люминесцентный, сигнал.[0057] The detection of antibodies that bind to cells in accordance with the invention can be carried out using standard methods, for example, enzyme immunoassay (ELISA), which allows you to get a detectable, for example, fluorescent or luminescent signal.
Выделенные культуры в соответствии с изобретениемIsolated cultures according to the invention
[0058] Как более подробно описано в разделе ПРИМЕРЫ, авторами было обнаружено несколько полезных для сельского хозяйства новых микроорганизмов, способных, например, эффективно подавлять фузариоз. Указанные новые антагонистические микроорганизмы, в частности, являются эффективным средством для уменьшения тяжести заболевания фузариозом и для ингибирования роста гриба Fusarium graminearum, главного возбудителя фузариоза в пшенице. Эти микробные антагонисты были идентифицированы из пула, составляющего приблизительно 5000 микробных штаммов, полученных из образцов диких растений, собранных в нескольких местах на территории Соединенных Штатов. Начальный отбор антагонистического микроорганизма производился по способности микроорганизмов подавлять развитие патогена F. graminearum и его телеоморфа Gibberella zeae в испытаниях на антагонизм in vitro. Отобранные микробные антагонисты подвергались затем биологическим испытаниям в теплице на сеянцах пшеницы, где проводилась инокуляция сеянцев микробными штаммами, а затем - повторные инокуляции спор F. graminearum, на способность этих микробных штаммов уменьшать тяжесть инфицирования грибом и на их способность сохранять выход семян. Отобранные таким образом антагонистические микроорганизмы продемонстрировали в тепличных испытаниях свою эффективность в уменьшении тяжести фузариоза.[0058] As described in more detail in the EXAMPLES section, the authors have discovered several new microorganisms useful for agriculture, capable of, for example, effectively suppressing Fusarium. These new antagonistic microorganisms are particularly effective in reducing the severity of Fusarium disease and in inhibiting the growth of the fungus Fusarium graminearum , the main causative agent of Fusarium in wheat. These microbial antagonists were identified from a pool of approximately 5,000 microbial strains obtained from wild plant samples collected from several locations throughout the United States. The initial selection of the antagonistic microorganism was based on the ability of the microorganism to inhibit the development of the pathogen F. graminearum and its teleomorph Gibberella zeae in in vitro antagonism tests. The selected microbial antagonists were then subjected to greenhouse biological testing on wheat seedlings, where the seedlings were inoculated with microbial strains and then re-inoculated with F. graminearum spores, for the ability of these microbial strains to reduce the severity of infection by the fungus and for their ability to maintain seed yield. The antagonistic microorganisms thus selected have been shown in greenhouse trials to be effective in reducing the severity of Fusarium.
[0059] Кроме того, таксономический анализ показал, что каждый из описанных здесь антагонистических микроорганизмов имеет близкое родство либо с бактериальным родом Microbacterium, бактериальным родом Bacillus, бактериальным родом Variovorax, либо с родом грибов Mycosphaerella. [0059] In addition, taxonomic analysis has shown that each of the antagonistic microorganisms described herein is closely related to either the bacterial genus Microbacterium , the bacterial genus Bacillus , the bacterial genus Variovorax , or the fungal genus Mycosphaerella.
[0060] Род Microbacterium, типичный род семейства Microbacteriaceae, в общем случае относится к приспосабливающимся, грамположительным, неспорообразующим, палочковидным бактериям, которые изначально, на ранних стадиях исследований, были выделены на бактериях, вырабатывающих молочную кислоту. Члены рода Microbacterium поначалу широко характеризовались своей заметной теплостойкостью, присутствием в молочных продуктах и продуцированием небольших количеств L(+) молочной кислоты из глюкозы. В противоположность этим родам семейства Microbacteriaceae, виды которого отличаются когерентным пептидогликановым типом, вид Microbacterium имеет орнитин или лизин либо во межпептидном мостике, либо в позиции 3 пептидогликана B-типа. В других хемотаксономических свойствах, таких как изопреноидные хиноны (MK-11, MK-12, MK-13), полярные липиды, жирные кислоты и основной состав ДНК, члены этого семейства демонстрируют обычный диапазон разнообразия, наблюдаемый в других родах Microbacteriaceae. По результатам некоторых таксономических исследований два бактериальных рода Microbacterium и Aureo бактерия могут быть объединены. На сегодняшний день род Microbacterium включает по меньшей мере 33 вида, которые были выделены из широкого диапазона мест обитания, включая почву, молочные продукты, растительные галлы, насекомых и клинические образцы. Различные аспекты их экологии, филогении, таксономии, культивирования и условий долговременного хранения недавно были подсумированы Евтушенко и Такэути (Evtushenko и Takeuchi, 2006). Вполне понятно, что микроорганизм рода Microbacterium может быть вполне надежно идентифицирован любыми таксономическими методами, описанными выше, включая хемотаксономический анализ пептидогликанов клеточной стенки и анализ последовательностей методом выравнивания с 16S рДНК, как описано (Evtushenko и Takeuchi, 2006) и цитированных ими ссылках, а также в ссылках, цитированных в Примерах 2-3 настоящего описания. Как более подробно рассмотрено ниже, ранее сообщалось об обнаружении антагонистической активности против фузариоза у нескольких микроорганизмов природного происхождения. Однако, о том, что такой антагонистической активностью обладает микроорганизм рода Mycobacterium, до настоящего изобретения сообщений не было. Кроме того, до настоящего изобретения его авторам не были известны способы и процессы использования бактериального штамма рода Mycobacterium как агента биоборьбы для предотвращения, ингибирования или обработки против развития патогена, вызывающего фузариоз.[0060] The genus Microbacterium , an exemplary genus of the family Microbacteriaceae , generally refers to opportunistic, Gram-positive, non-spore-forming, rod-shaped bacteria that were originally isolated from lactic acid-producing bacteria in early research. Members of the genus Microbacterium were initially widely characterized by their marked heat tolerance, presence in dairy products, and production of small amounts of L(+) lactic acid from glucose. In contrast to these genera of the family Microbacteriaceae , whose species are distinguished by a coherent peptidoglycan type, the species Microbacterium has ornithine or lysine either in the interpeptide bridge or in position 3 of the B-type peptidoglycan. In other chemotaxonomic properties, such as isoprenoid quinones (MK-11, MK-12, MK-13), polar lipids, fatty acids, and core DNA composition, members of this family show the usual range of diversity seen in other Microbacteriaceae genera. Based on the results of some taxonomic studies, the two bacterial genera Microbacterium and Aureo bacterium can be combined. To date, the genus Microbacterium includes at least 33 species that have been isolated from a wide range of habitats, including soil, dairy products, plant galls, insects, and clinical specimens. Various aspects of their ecology, phylogeny, taxonomy, cultivation, and long-term storage conditions have recently been summarized by Evtushenko and Takeuchi (Evtushenko and Takeuchi, 2006). It is quite clear that a microorganism of the genus Microbacterium can be quite reliably identified by any of the taxonomic methods described above, including chemotaxonomic analysis of cell wall peptidoglycans and sequence analysis by the 16S rDNA alignment method, as described (Evtushenko and Takeuchi, 2006) and the references cited by them, as well as in the references cited in Examples 2-3 of this description. As discussed in more detail below, the discovery of antagonistic activity against Fusarium in several microorganisms of natural origin has previously been reported. However, such antagonistic activity was not reported before the present invention by a microorganism of the genus Mycobacterium . In addition, prior to the present invention, methods and processes for using a bacterial strain of the genus Mycobacterium as a biocontrol agent to prevent, inhibit, or treat the development of a Fusarium pathogen were not known to the present inventors.
[0061] Bacillus является родом грамположительных вариабельных, спорообразующих палочковидных бактерий. Подобно другим родам, ассоциирующимся с ранней историей развития микробиологии, таким как Pseudomonas или Vibrio, около 266 видовых членов рода Bacillus обнаруживаются повсюду, и он широко признан как один из родов с наибольшим многообразием 16S и окружающей среды. Виды Bacillus могут быть обязательными аэробами или факультативными анаэробами, и иметь положительный тест на каталазу. Убиквист по своей природе, род Bacillus включает в себя как свободноживущие, так и патогенные виды. В тяжелых окружающих условиях эти клетки продуцируют овальные эндоспоры, которые длительное время могут пребывать в состоянии покоя. Эти характеристики изначально определяли данный род, однако не все такие виды имеют близкое родство, и многие переместились к другим родам. Фактически было предпринято несколько попыток реконструировать филогению этого рода. Bacillus-специфические исследования с наибольшим многообразием были проведены в работе (Xu and Cote, Intl. J. of Syst. Evol. Microbiol. 53 (3): 695-704; 2003) с использованием 16S и участка ITS (внутреннего транскрибированного спейсера), где авторы разделили род на 10 групп, которые включают гнездовые роды Paenibacillus, Brevibacillus, Geobacillus, Marinibacillus и Virgibacillus. Однако, согласно более поздним исследованиям род Bacillus содержит очень большое число гнездовых таксонов и особенно как в 16S, так и в 23S, он считается парафилетическим к Lactobacillales (Lactobacillus, Streptococcus, Staphylococcus, Listeria и др.) благодаря Bacillus coahuilensis и др., например, (Yarda et al, Syst. Appl. Microbiol. 31 (4): 241-250, 2008; Yarda et al, Syst. Appl. Microbiol. 33 (6): 291-299, 2010). Одна из клад, образованная видами B. anthracis, B. cereus, B. mycoides, B. pseudomycoides, B. thuringiensis и B. weihenstephanensis в соответствии с современными стандартами классификации, должна быть единичного вида (с 97% 16S идентичностью), однако по медицинским соображениям, их считают отдельными видами. В дополнение к методам таксономического анализа, описанным в Примерах 2-3, филогенетический и таксономический анализы вида Bacillus могут проводиться с помощью ряда различных методов, включая подробно описанные в (Xu and Cote, 2003; Yarda et al., 2008; Yarda et al., 2010).[0061] Bacillus is a genus of Gram-positive variable, spore-forming, rod-shaped bacteria. Like other genera associated with the early history of microbiology, such as Pseudomonas or Vibrio , about 266 species members of the genus Bacillus are found throughout, and it is widely recognized as one of the genera with the greatest 16S and environmental diversity. Bacillus species can be obligatory aerobes or facultative anaerobes, and test positive for catalase. Ubiquist in nature, the genus Bacillus includes both free-living and pathogenic species. Under severe environmental conditions, these cells produce oval endospores, which can remain dormant for a long time. These characteristics originally defined the genus, however, not all such species are closely related, and many have moved to other genera. In fact, several attempts have been made to reconstruct the phylogeny of this genus. Bacillus -specific studies with the greatest diversity were carried out in (Xu and Cote, Intl. J. of Syst. Evol. Microbiol. 53 (3): 695-704; 2003) using 16S and the ITS region (internal transcribed spacer), where the authors divided the genus into 10 groups which include the nested genera Paenibacillus, Brevibacillus, Geobacillus, Marinibacillus and Virgibacillus. However, according to more recent studies, the genus Bacillus contains a very large number of nesting taxa, and especially in both 16S and 23S, it is considered paraphyletic to Lactobacillales (Lactobacillus, Streptococcus, Staphylococcus, Listeria, etc.) due to Bacillus coahuilensis , etc., for example , (Yarda et al , Syst. Appl. Microbiol. 31 (4): 241-250, 2008; Yarda et al , Syst. Appl. Microbiol. 33 (6): 291-299, 2010). One of the clades, formed by the species B. anthracis , B. cereus , B. mycoides , B. pseudomycoides , B. thuringiensis and B. weihenstephanensis according to modern classification standards, should be a single species (with 97% 16S identity), however, according to medical reasons, they are considered separate species. In addition to the taxonomic analysis methods described in Examples 2-3, phylogenetic and taxonomic analyzes of the Bacillus species can be carried out using a number of different methods, including those detailed in (Xu and Cote, 2003; Yarda et al. , 2008; Yarda et al. , 2010).
[0062] Род Variovorax изначально был создан реклассификацией рода Alcaligenes paradoxus на Variovoraxparadoxus (Willems et al., 1991), который считается типичным видом этого рода. V. paradoxus был широко исследован как модель для новых биодеградационных агентов, а также взаимодействий микроб-микроб и микроб-растение. Другими видами этого рода являются V. dokdonensis, V. soli (Kim et al., 2006), и V. boronicumulans (Miwa et al., 2008). Виды Variovorax в плане катаболизма очень разнятся и вступают во взаимовыгодные взаимодействия с другими бактериальными видами во многих процессах биологического разложения и, следовательно, являются экологически значимыми и имеют высокий потенциал практического применения. Например, почвенный метанотроф, только при совместном культивировании со штамом V. paradoxus демонстрирует высокую афинность к метану (мощному тепличному газу) - особенность, которая обычно не наблюдается у лабораторных культур. Подобным образом было обнаружено, что его близкий родственник Variovorax является центральным, нефотосинтетическим партнером в рамках фототрофной консорции «Chlorochromatium aggregatum». Некоторые виды рода Variovorax обладают также способностью вмешиваться в коммуникацию других бактерий. Кроме того, некоторые виды рода Variovorax могут тесно взаимодействовать с другой биотой (например, растениями) в различных экосистемах. Более того, некоторые виды Variovorax, находясь на площади за пределами корней растения и/или внутри растения, проявляли способность активировать рост растения путем снижения уровней этилена, репрессии патогенеза, регулируемого чувством кворума, и повышения стойкости к тяжелым металлам, что очень полезно для фиторемедиации. В дополнение к методам анализа таксономии, описанным в Примерах 2-3, филогенетический и таксономический анализы вида Variovorax могут проводиться всевозможными методами, включая подробно рассмотренные в настоящем описании.[0062] The genus Variovorax was originally created by the reclassification of the genus Alcaligenes paradoxus to Variovoraxparadoxus (Willems et al. , 1991), which is considered to be the typical species of the genus. V. paradoxus has been extensively studied as a model for novel biodegradation agents as well as microbe-microbe and microbe-plant interactions. Other species in this genus are V. dokdonensis , V. soli (Kim et al. 2006), and V. boronicumulans (Miwa et al. 2008). Variovorax species are very diverse in terms of catabolism and have mutually beneficial interactions with other bacterial species in many biodegradation processes and are therefore ecologically significant and have a high potential for practical applications. For example, a soil methanotroph, only when co-cultivated with a V. paradoxus strain, exhibits a high affinity for methane (a potent greenhouse gas), a feature that is not commonly observed in laboratory cultures. Similarly, its close relative Variovorax was found to be a central, non-photosynthetic partner within the phototrophic consortium "Chlorochromatium aggregatum". Some species of the genus Variovorax also have the ability to interfere with the communication of other bacteria. In addition, some species of the genus Variovorax may interact closely with other biota (eg plants) in different ecosystems. Moreover, some species of Variovorax , when found outside the plant roots and/or inside the plant, have shown the ability to promote plant growth by reducing ethylene levels, repressing quorum sensing pathogenesis, and increasing heavy metal tolerance, which is very beneficial for phytoremediation. In addition to the methods of taxonomy analysis described in Examples 2-3, phylogenetic and taxonomic analyzes of the species Variovorax can be carried out by a variety of methods, including those discussed in detail in this description.
[0063] Mycosphaerella является очень большим родом грибов с более чем 2000 наименованиями видов и по меньшей мере 500 видами, ассоциированными с более чем 40 анаморфными родами (в частности, Cercospora, Pseudocercospora, Septoria, Ramularia и др.). Кроме того, несколько тысяч анаморфов не имеют телеморфов. Род Mycosphaerella включает виды, которые являются патогенами, сапробами, эндофитами или мутуалистическими ассоциациями. Разнообразные аспекты их экологии, происхождения, таксономии, методов культивирования и условий долговременного хранения недавно были описаны в (Crous et al., Persoonia, 23:119-146, 2009). Таксономическая идентификация микроорганизмов рода Mycosphaerella может производиться любым из вышеописанных соответствующих методов или их комбинацией. Наиболее общими из таких методов являются анализ последовательностей путем выравнивания с последовательностями 16S рДНК и участков внутренних транскрибированных спейсеров, как описано, например, в (Crous et al., Studies in Mycology, 55:235-253,2006; Crous et al, 2009, supra; Goodwin et al, Phytopathology 91: 648-658, 2001), а также методы, описанные в Примерах 2-3 ниже.[0063] Mycosphaerella is a very large fungal genus with over 2,000 species names and at least 500 species associated with over 40 anamorphic genera (specifically, Cercospora , Pseudocercospora , Septoria , Ramularia , and others ). In addition, several thousand anamorphs do not have telemorphs. The genus Mycosphaerella includes species that are pathogenic, saprobic, endophytic, or mutualistic associations. Various aspects of their ecology, origin, taxonomy, cultivation methods and long-term storage conditions have recently been described in (Crous et al. , Persoonia , 23:119-146, 2009). Taxonomic identification of microorganisms of the genus Mycosphaerella can be made by any of the above-described appropriate methods or a combination thereof. The most common of these methods are sequence analysis by alignment with 16S rDNA sequences and internal transcribed spacer regions, as described, for example, in (Crous et al. , Studies in Mycology , 55:235-253,2006; Crous et al , 2009, supra; Goodwin et al , Phytopathology 91: 648-658, 2001), as well as the methods described in Examples 2-3 below.
Депозиты биологических материаловDeposits of biological materials
[0064] Очищенные культуры микробных штаммов, которые согласно их идентификации обладают супрессорной активностью против фузариоза, были депонированы в коллекцию агрокультур для исследований (Agricultural Research Service Culture Collection, размещенную по адресу 1815 N. University Street, Peoria, IL 61604, USA (NRRL)) в соответствии с «Будапештским договором о международном признании депонирования микроорганизмов для целей патентной процедуры» и вытекающими из него нормативными положениями (Budapest Treaty). Эти депозиты размещены под следующими номерами: [0064] Purified cultures of microbial strains identified as having suppressive activity against Fusarium were deposited with the Agricultural Research Service Culture Collection located at 1815 N. University Street, Peoria, IL 61604, USA (NRRL) ) in accordance with the "Budapest Treaty on the International Recognition of the Deposit of Microorganisms for the Purposes of Patent Procedure" and the regulations arising from it (Budapest Treaty). These deposits are placed under the following numbers:
SGI штаммаIdentification
SGI strain
[0065] Данные микробные штаммы были депонированы с условием обеспечения доступа к этой культуре в течение нахождения данной заявки в процессе рассмотрения и принятия решения по ней руководителем Патентного ведомства США согласно 37 C.F.R. §1.14 и 35 U.S.C. §122. Эти депозиты представляют по существу чистые культуры депонированных штаммов. Доступ к депозитам обеспечивается в соответствии с патентными законодательствами стран, где зарегистрированы противоположные стороны данной заявки или их наследники. Вполне понятно, что доступ к депозитам не означает разрешения на практическое применение предмета изобретения в нарушение патентных прав, гарантированных государством.[0065] These microbial strains were deposited with the condition of providing access to this culture during this application is in the process of consideration and decision on it by the head of the US Patent Office in accordance with 37 C.F.R. §1.14 and 35 U.S.C. §122. These deposits represent essentially pure cultures of the deposited strains. Access to deposits is provided in accordance with the patent laws of the countries where the opposing parties to this application or their heirs are registered. It is quite clear that access to deposits does not mean permission to practice the subject matter of the invention in violation of patent rights guaranteed by the state.
[0066] Предпочтительные микроорганизмы в соответствии с изобретением имеют все идентификационные характеристики депонированных штаммом и, в частности, идентификационные характеристики, касающиеся способности подавлять развитие фузариоза, как указано в данном описании, и способности подавлять развитие патогена Fusarium graminearum и его телеоморфа Gibberella zeae. В частности, предпочтительные микроорганизмы в соответствии с изобретением относятся к депонированным микроорганизмам, описанным выше, и их мутантам.[0066] Preferred microorganisms in accordance with the invention have all the identification characteristics deposited by the strain and, in particular, the identification characteristics regarding the ability to inhibit the development of Fusarium, as described herein, and the ability to inhibit the development of the pathogen Fusarium graminearum and its teleomorph Gibberella zeae . In particular, preferred microorganisms according to the invention relate to the deposited microorganisms described above and their mutants.
Микробиологические композицииMicrobiological compositions
[0067] Микробиологические композиции в соответствии с изобретением, содержащие выделенные микробные штаммы или их культуры, могут иметь самые различные формы, включая, в том числе, формы стационарной культуры, цельной культуры, сохраняемого клеточного штамма, мицелия и/или гифы (особенно, исходных глицериновых растворов), агаровых полосок, агаровые комплексы в водно-глицериновой смеси, высушенных вымораживанием маточных растворов и высушенных маточных растворов, таких как лиофилизаты или мицелии, высушенные на фильтровальной бумаге или на посевном зерне. В соответствии с определением, данным в настоящем описании, термин «выделенная культура» или используемые здесь его грамматические эквиваленты означают, что данная культура представляет собой культуральную жидкость, гранулу, соскоб, высушенный образец, лиофилат или срез (например, гифа или мицелия); или подложку, контейнер или среду, например, планшет, бумагу, фильтр, матрицу, солому, пипетку или острие пипетки, волокно, иглу, гель, тампон, пробирку, флакончик, частицу и др., которая содержит один тип организма. В настоящем изобретении выделенной культурой микробного антагониста является культуральная жидкость или соскоб, гранула, высушенный препарат, лиофилат или срез микроорганизма, или подложка, контейнер, или среда, которая содержит микроорганизм в отсутствие других организмов.[0067] Microbiological compositions in accordance with the invention, containing isolated microbial strains or cultures thereof, can take a wide variety of forms, including, but not limited to, stationary culture forms, whole culture forms, stored cell strain, mycelium and/or hyphae (especially, initial glycerol solutions), agar strips, agar complexes in water-glycerol mixture, freeze-dried mother liquors, and dried mother liquors such as lyophilisates or mycelia dried on filter paper or seed. In accordance with the definition given in the present description, the term "isolated culture" or its grammatical equivalents as used herein means that this culture is a culture liquid, pellet, scraping, dried sample, lyophilate or section (for example, hyphae or mycelium); or a support, container, or medium, such as a plate, paper, filter, matrix, straw, pipette or pipette tip, fiber, needle, gel, swab, tube, vial, particle, etc., that contains one type of organism. In the present invention, an isolated culture of a microbial antagonist is a culture fluid or scraping, pellet, dried preparation, lyophilate, or slice of a microorganism, or a support, container, or medium that contains the microorganism in the absence of other organisms.
[0068] Настоящим изобретением предлагаются также композиции, содержащие по меньшей мере один выделенный микробный штамм или его культуру в соответствии с изобретением и носитель. Носителем может быть любой один носитель или множество носителей, удовлетворяющий(-щие) разнообразным свойствам, таким как повышенная стойкость, смачиваемость, диспергируемость и др. Композиция согласно изобретению может включать в себя смачивающие агенты, такие как природные или искусственные поверхностно-активные вещества, которыми могут быть неионные или ионные поверхностно-активные вещества либо их комбинации. В состав композиции могут входить также эмульсии типа вода-в-масле, которые содержат по меньшей мере один выделенный микроорганизм в соответствии с изобретением (U.S. Patent No. 7485451), включенный здесь посредством ссылки. Требуемые препараты могут быть приготовлены из смачиваемых порошков, гранул, гелей, агаровые полосок или гранул, загустителей и т.п., заключенных в микрокапсулы частиц и т.п., жидкостей, таких как водные текучие среды, водные суспензии, эмульсии типа вода-в-масле и др. Препарат может содержать зерновые или бобовые продукты (например, дробленое зерно или бобы, бульон или муку, приготовленные из зерна или бобов), крахмал, сахар или растительное масло. Носителем может быть сельскохозяйственный носитель. В некоторых предпочтительных вариантах осуществления изобретения носителем является семя, а композиция может наноситься на это семя или покрывать либо пропитывать его.[0068] The present invention also provides compositions comprising at least one isolated microbial strain or culture thereof in accordance with the invention and a carrier. The carrier may be any one carrier or a plurality of carriers, satisfying a variety of properties, such as increased stability, wettability, dispersibility, etc. The composition according to the invention may include wetting agents, such as natural or artificial surfactants, which may be non-ionic or ionic surfactants or combinations thereof. The composition may also include water-in-oil emulsions that contain at least one isolated microorganism in accordance with the invention (U.S. Patent No. 7485451), incorporated here by reference. Desired formulations may be prepared from wettable powders, granules, gels, agar strips or granules, thickeners, and the like, microencapsulated particles, and the like, liquids such as aqueous fluids, aqueous suspensions, emulsions such as water- in oil, etc. The preparation may contain grains or legumes (for example, crushed grains or beans, broth or flour made from grains or beans), starch, sugar or vegetable oil. The carrier may be an agricultural carrier. In some preferred embodiments, the carrier is a seed and the composition can be applied to, or coated or impregnated with, the seed.
[0069] В некоторых вариантах осуществления изобретения сельскохозяйственным носителем может быть почва или среда для выращивания растений. Другими подходящими сельскохозяйственными носителями являются вода, удобрения, растительные масла, увлажнители и их комбинации. В альтернативном варианте сельскохозяйственным носителем может быть твердый материал, такой как инфузорная земля, суглинок, кремнезем, альгинат, глина, бентонит, вермикулит, семенные капсулы, другие растительные и животное продукты или их комбинации, включая гранулы, окатыши и суспензии. Носителями могут служить также смеси любых вышеуказанных ингредиентов, такие как, например, песта (pesta: мука и каолиновая глина), агаровые или мучные гранулы в суглинке, песке или глине и др. Препараты могут включать в себя пищевые источники для культивированных организмов, такие как ячмень, рис или другие биологические материалы, например, семена, части растений, багасса сахарного тростника, шелуха или черешки от обработки зерна, дробленый растительный материал (например «отходы складирования») или древесина из строительных отходов, опилки или мелкие волокна от повторной переработки бумаги, тканых материалов или древесины. Специалистам в данной отрасли могут быть известны также другие подходящие материалы для этой цели.[0069] In some embodiments, the agricultural carrier may be soil or a plant growing medium. Other suitable agricultural carriers are water, fertilizers, vegetable oils, humectants, and combinations thereof. Alternatively, the agricultural carrier may be a solid material such as diatomaceous earth, loam, silica, alginate, clay, bentonite, vermiculite, seed capsules, other plant and animal products, or combinations thereof, including granules, pellets, and suspensions. The carriers may also be mixtures of any of the above ingredients, such as, for example, pesta (pesta: flour and kaolin clay), agar or flour granules in loam, sand or clay, etc. Formulations may include food sources for cultured organisms, such as barley, rice, or other biological materials, such as seeds, plant parts, sugarcane bagasse, husks or stalks from grain processing, crushed plant material (such as “stockpiling waste”) or wood from construction waste, sawdust or fine fibers from paper recycling , woven fabrics or wood. Other suitable materials for this purpose may also be known to those skilled in the art.
[0070] В жидкой форме, например, растворов или суспензий, микроорганизмы могут смешиваться или суспендироваться в воде или в водных растворах. Подходящими жидкими разбавителями или носителями при этом являются вода, водные растворы, нефтяные дистилляты и другие жидкие носители.[0070] In liquid form, such as solutions or suspensions, microorganisms can be mixed or suspended in water or in aqueous solutions. Suitable liquid diluents or carriers are water, aqueous solutions, petroleum distillates and other liquid carriers.
[0071] Твердые композиции могут готовиться путем диспергирования антагонистических микроорганизмов в или на соответствующим образом разделенном твердом носителе, таком как торф, пшеница, отруби, вермикулит, глина, тальк, бентонит, инфузорная земля, сукновальная глина, пастеризованная почва и т.п. Если такие препараты используются в качестве смачиваемых порошков, то могут применяться биологически совместимые диспергаторы, такие как неионные, анионные, амфотерные или катионные диспергаторы и эмульсификаторы.[0071] Solid compositions can be prepared by dispersing antagonistic microorganisms in or on an appropriately divided solid carrier such as peat, wheat, bran, vermiculite, clay, talc, bentonite, diatomaceous earth, fuller, pasteurized soil, and the like. When such formulations are used as wettable powders, biocompatible dispersants such as non-ionic, anionic, amphoteric or cationic dispersants and emulsifiers may be used.
[0072] В предпочтительном варианте осуществления изобретения рассматриваемые здесь композиции предотвращают поражение фузариозом растений и, особенно, зерновых, таких как пшеница, ячмень, овес и кукуруза, а при использовании их в достаточных количествах действуют как микробные антагонисты. Подобно другим средствам биологической борьбы, эти композиции имеют высокий порог безопасности, поскольку они, как правило, не обжигают и не повреждают растение.[0072] In a preferred embodiment of the invention, the compositions herein prevent Fusarium damage to plants and especially cereals such as wheat, barley, oats and corn, and when used in sufficient amounts act as microbial antagonists. Like other biological control agents, these compositions have a high margin of safety because they generally do not burn or damage the plant.
[0073] Как подробно показано в настоящем описании, борьба с фузариозом может осуществляться путем нанесения одной или больше микробиологических композиций в соответствии с изобретением на растение-хозяина или на его части. Эти композиции могут наноситься в количестве, эффективном для понижения уровня фузариоза по сравнению с его уровнем в необработанном контроле. Активные компоненты при этом используются в концентрации, достаточной для ингибирования развития целевого фитопатогена, когда они приложены к зерновой культуре. Для специалиста должно быть очевидно, что эффективные концентрации могут быть различными и зависеть от следующих факторов: (a) типа растения или сельскохозяйственного продукта; (b) физиологического состояния растения или сельскохозяйственного продукта; (c) концентрации патогенов, поражающих растение или сельскохозяйственный продукт; (d) типа болезни, поражающей растение или сельскохозяйственный продукт; (e) погодных условий (например, температуры, влажности); и (f) стадии развития болезни растения. Согласно изобретению, типичные величины концентрации лежат выше уровня 1×102 КОЕ/мл носителя. Предпочтительные уровни концентрации лежат в интервале приблизительно от 1×104 до 1×109 КОЕ/мл, а еще лучше - в интервале от 1×106 до 1×108 КОЕ/мл. Более предпочтительным является интервал концентрации приблизительно от 35 до 150 мг сухой микробной массы на грамм носителя (сухой препарат) или на миллилитр носителя (жидкая композиция). У твердых препаратов скорость поставки должна регулироваться так, чтобы получать число жизнеспособных клеток на единицу площади поверхности ткани растения, сравнимое с получаемым от применения вышеуказанных концентраций жидкой обработки. Как правило, агенты биологического метода борьбы в соответствии с изобретением являются биологически эффективными, когда они поставляются в концентрации выше 106 КОЕ/г (колониеобразующих единиц на грамм), предпочтительно - выше 107 КОЕ/г, еще предпочтительнее - в концентрации 108 КОЕ/г, и наиболее предпочтительно - в концентрации 109 КОЕ/г.[0073] As detailed herein, Fusarium can be controlled by applying one or more of the microbiological compositions of the invention to, or parts of, the host plant. These compositions can be applied in an amount effective to reduce the level of fusarium compared to its level in the untreated control. The active ingredients are used at a concentration sufficient to inhibit the development of the target phytopathogen when they are applied to the crop. It will be apparent to those skilled in the art that effective concentrations may vary and depend on the following factors: (a) the type of plant or agricultural product; (b) the physiological state of the plant or agricultural product; (c) concentrations of pathogens affecting the plant or agricultural product; (d) the type of disease affecting the plant or agricultural product; (e) weather conditions (eg temperature, humidity); and (f) stages of development of the plant disease. According to the invention, typical concentration values lie above the level of 1×10 2 cfu/ml of carrier. Preferred concentration levels are in the range of approximately 1×10 4 to 1×10 9 cfu/ml, and even better in the range of 1×10 6 to 1×10 8 cfu/ml. More preferred is a concentration range of approximately 35 to 150 mg dry microbial mass per gram of carrier (dry preparation) or per milliliter of carrier (liquid composition). For solid preparations, the delivery rate should be adjusted to obtain a number of viable cells per unit area of plant tissue surface comparable to that obtained from the above liquid treatment concentrations. Generally, the biological control agents of the invention are biologically effective when they are supplied at a concentration above 10 6 cfu/g (colony forming units per gram), preferably above 10 7 cfu/g, even more preferably at a concentration of 10 8 cfu /g, and most preferably at a concentration of 10 9 CFU/g.
[0074] В некоторых вариантах осуществления изобретения количество одного или больше агентов биологической борьбы в микробной композиции в соответствии с изобретением может варьировать в зависимости от конечного препарата, а также размеров и типа растения или используемых семян. В предпочтительном варианте один или больше агентов биологической борьбы в микробной композиции находится в количестве приблизительно от 2% (мас.) до 80% (мас.) от всего количества препарата. В предпочтительном варианте один или больше агентов биологической борьбы в микробной композиции находится в количестве приблизительно от 5% (мас.) до 65% (мас.), а в наиболее предпочтительном - приблизительно от 10% (мас.) до 60% (мас.) от всего количества препарата.[0074] In some embodiments of the invention, the amount of one or more biological control agents in the microbial composition in accordance with the invention may vary depending on the final preparation, as well as the size and type of plant or seeds used. In a preferred embodiment, one or more biological control agents in the microbial composition is in an amount of from about 2% (wt.) to 80% (wt.) of the total amount of the drug. In a preferred embodiment, one or more biological control agents in the microbial composition is in an amount of from about 5% (wt.) to 65% (wt.), and most preferably from about 10% (wt.) to 60% (wt.) ) of the total amount of the drug.
[0075] Микробиологические композиции согласно изобретению могут наноситься на пшеницу или другую зерновую культуру с помощью самых различных, хорошо известных специалистам способов, таких как опыление, создание покрытия, вливание, втирание, прикатывание, протравливание погружением, распыление, обтирка щеткой и другие подходящие способы, которые не вызывают существенных повреждений у пшеницы и других зерновых культур при их обработке. Особенно приемлемым является способ распыления.[0075] The microbiological compositions of the invention may be applied to wheat or other cereal crops by a variety of methods well known to those skilled in the art, such as dusting, coating, pouring, rubbing, rolling, dip dressing, spraying, brushing, and other suitable methods, which do not cause significant damage to wheat and other cereals during their processing. Particularly suitable is the spray method.
[0076] Композиции в соответствии с изобретением, как правило, являются химически инертными; поэтому они являются совместимыми по существу с любыми другими компонентами схемы распыления. Они могут использоваться также в сочетании с биологически совместимыми пестицидными активными агентами, например, с гербицидами, нематицидами, фунгицидами, инсектицидами и т.п. Они могут использоваться также в сочетании с субстанциями регуляции роста растений, такими как удобрения, регуляторы роста растений и т.п., если только такие соединения или субстанции являются биологически совместимыми.[0076] Compositions in accordance with the invention, as a rule, are chemically inert; therefore, they are substantially compatible with any other components of the spray pattern. They can also be used in combination with biologically compatible pesticidal active agents, eg herbicides, nematicides, fungicides, insecticides and the like. They can also be used in combination with plant growth regulating substances such as fertilizers, plant growth regulators and the like, provided that such compounds or substances are biologically compatible.
[0077] Если пестициды или фунгициды используются в их продажных препаратах и в формах, приготовленных из этих препаратов, то активные микробные антагонисты и композиции в соответствии с настоящим изобретением могут, тем более, использоваться вместе с ними в форме синергетической смеси. Компоненты такой смеси, являясь синергистами, повышают эффективность активной композиции без необходимости добавлять в смесь специальные синергисты.[0077] If pesticides or fungicides are used in their commercial preparations and in forms prepared from these preparations, then active microbial antagonists and compositions in accordance with the present invention can, moreover, be used together with them in the form of a synergistic mixture. The components of such a mixture, being synergists, increase the effectiveness of the active composition without the need to add special synergists to the mixture.
[0078] Используемые в качестве пестицидов в их продажных препаратах и в формах, приготовленных из этих препаратов, активные микробные антагонисты и композиции в соответствии с настоящим изобретением могут, тем более, использоваться вместе с ними в форме смеси с ингибиторами, которые снижают деградацию активных композиций после их применения в месте произрастания растения, на поверхности частей растения или в его тканях.[0078] Used as pesticides in their commercial preparations and in forms prepared from these preparations, active microbial antagonists and compositions in accordance with the present invention can, moreover, be used together with them in the form of a mixture with inhibitors that reduce the degradation of active compositions after their application in the place where the plant grows, on the surface of parts of the plant or in its tissues.
[0079] Активные микробные антагонисты и композиции согласно изобретению, в своем исходном состоянии или в препаратах, могут использоваться также в форме смеси с известными акарицидами, бактерицидами, фунгицидами, инсектицидами, микробицидами, нематицидами, пестицидами или их комбинациями, например, с целью расширения их спектра действия или для предотвращения развития стойкости этим путем. Во многих случаях, синергетика дает положительный результат, то есть активность такой смеси может превышать активность ее индивидуальных компонентов. Смесь с другими известными активными соединениями, такими как удобрения, регуляторы роста, защитные агенты и/или химикалии сигнализации также охватываются объемом изобретения.[0079] Active microbial antagonists and compositions according to the invention, in their original state or in preparations, can also be used in the form of a mixture with known acaricides, bactericides, fungicides, insecticides, microbicides, nematicides, pesticides or combinations thereof, for example, to expand their spectrum of action or to prevent the development of resistance in this way. In many cases, synergy gives a positive result, that is, the activity of such a mixture may exceed the activity of its individual components. A mixture with other known active compounds such as fertilizers, growth regulators, protective agents and/or signaling chemicals are also within the scope of the invention.
[0080] В предпочтительном варианте осуществления изобретения композиции могут содержать также по меньшей мере один химический или биологический пестицид. Количество по меньшей мере одного химического или биологического пестицида, используемого в данной композиции, может варьировать в зависимости от конечного препарата, а также размеров обрабатываемого растения и семени. В предпочтительном варианте количество по меньшей мере одного используемого химического или биологического пестицида составляет приблизительно от 0,1% (мас.) до 80% (мас.) от всего количества препарата. В более предпочтительном варианте, количество по меньшей мере одного используемого химического или биологического пестицида составляет приблизительно от 1% (мас.) до 60% (мас.), а в наиболее предпочтительном - приблизительно от 10% (мас.) до 50% (мас.).[0080] In a preferred embodiment, the compositions may also contain at least one chemical or biological pesticide. The amount of at least one chemical or biological pesticide used in a given composition may vary depending on the final preparation, as well as the size of the treated plant and seed. In a preferred embodiment, the amount of at least one used chemical or biological pesticide is from about 0.1% (wt.) to 80% (wt.) of the total amount of the drug. More preferably, the amount of at least one chemical or biological pesticide used is from about 1% (wt.) to 60% (wt.), and most preferably from about 10% (wt.) to 50% (wt.). .).
[0081] В изобретении могут использоваться любые пестициды, известные специалистам в данной отрасли. Это могут быть, например, химические пестициды, принадлежащие к классам карбаматов, органофосфатов, хлорорганических соединений и пиретроидов. Изобретением предусмотрены также химические агенты биоборьбы, такие как, например: беномил; боракс; каптафол; каптан; хлорталонил; медьсодержащие препараты; препараты, содержащие дихлон, дихлоран, йод, цинк; фунгициды, ингибирующие биосинтез эргостерола, такие как, например, бластидидин, цимоксанил, фенаримол, флузилазол, фолпет, имазалил, ипордион, манеб, манокоцеб, металаксил, оксикарбоксин, миклобутанил, окситетрациклин, ПХНБ (пентахлорнитробензол), пентахлорфенол, прохлораз, пропиконазол, хинометионат, арсенит натрия, натрий DNOC (динитроокрезол), натрий гипохлорит, натрий фенилфенат, стрептомицин, сера, тебуконазол, тербутразол, тиабендозол, тиофанат-метил, триадимефон, трициклазол, трифорин, валидимицин, винклозолин, цинеб и цирам. В композициях согласно изобретению могут использоваться самые различные инсектицидные соединения, включая, например, указанные в заявке (U.S. Pat. Appl. No. 20110033432A1).[0081] Any pesticide known to those skilled in the art can be used in the invention. These can be, for example, chemical pesticides belonging to the classes of carbamates, organophosphates, organochlorines and pyrethroids. The invention also provides for chemical biocontrol agents such as, for example: benomyl; borax; captafol; captan; chlorthalonil; copper-containing preparations; preparations containing dichlon, dichloran, iodine, zinc; fungicides that inhibit the biosynthesis of ergosterol, such as e.g. sodium arsenite, sodium DNOC (dinitroocresol), sodium hypochlorite, sodium phenylphenate, streptomycin, sulfur, tebuconazole, terbutrazol, thiabendozole, thiophanate-methyl, triadimefon, tricyclazole, triforin, validimycin, vinclozolin, cineb and cyram. A wide variety of insecticidal compounds can be used in the compositions of the invention, including, for example, those specified in the application (U.S. Pat. Appl. No. 20110033432A1).
[0082] Микробиологические композиции в соответствии с изобретением в предпочтительном варианте содержат по меньшей мере один биологический пестицид. Типовыми биологическими пестицидами, которые являются подходящими для использования в соответствии с изобретением и могут входить в микробиологическую композицию в соответствии с изобретением для предотвращения фитопатогенной болезни, являются микробы, животные, бактерии, грибы, генетический материал, растение и природные продукты живых организмов. В этих композициях микроорганизм в соответствии с изобретением выделяется перед приготовлением препарата дополнительным организмом. В композиции с антагонистическими микроорганизмами согласно изобретению могут использоваться микробы, например, видов Ampelomyces, Aureobasidium, Bacillus, Beauveria, Candida, Chaetomium, Cordyceps, Cryptococcus, Dabaryomyces, Erwinia, Exophilia, Gliocladium, Mariannaea, Paecilomyces, Paenibacillus, Pantoea, Pichia, Pseudomonas, Sporobolomyces, Talaromyces и Trichoderma, где особенно предпочтительными являются грибные штаммы рода Muscodor. Особенно предпочтительным является также использование микробиологических композиций в соответствии с настоящим изобретением в комбинации с микробными антагонистами, описанными в (US Patent No. 7518040; US Patent No. 7601346; US Patent No. 6312940).[0082] Microbiological compositions in accordance with the invention preferably contain at least one biological pesticide. Typical biological pesticides that are suitable for use in accordance with the invention and may be included in the microbiological composition in accordance with the invention for the prevention of phytopathogenic disease are microbes, animals, bacteria, fungi, genetic material, plant and natural products of living organisms. In these compositions, the microorganism according to the invention is isolated prior to formulation by the additional organism. In the composition with antagonistic microorganisms according to the invention, microbes can be used, for example, species of Ampelomyces , Aureobasidium , Bacillus , Beauveria , Candida , Chaetomium , Cordyceps , Cryptococcus , Dabaryomyces , Erwinia , Exophilia , Gliocladium , Mariannaea , Paecilomyces , Paenibacillus , Pantoea , Pichia , Pseudomyces , Sporobolomyces , Talaromyces and Trichoderma , where fungal strains of the genus Muscodor are particularly preferred. Particularly preferred is also the use of microbiological compositions in accordance with the present invention in combination with microbial antagonists described in (US Patent No. 7518040; US Patent No. 7601346; US Patent No. 6312940).
[0083] В качестве примеров грибов, которые могут использоваться в комбинациях с микробными антагонистами и композициями в соответствии с изобретением, можно назвать виды Muscodor, Aschersonia aleyrodis, Beauveria bassiana («белый мускарин»), Beauveria brongniartii, Chladosporium herbarum, Cordyceps clavulata, Cordyceps entomorrhiza, Cordyceps fads, Cordyceps gracilis, Cordyceps melolanthae, Cordyceps militaris, Cordyceps myrmecophila, Cordyceps ravenelii, Cordyceps sinensis, Cordycepshecocephala, Cordyceps subsessilis, Cordyceps unilateralis, Cordyceps variabilis, Cordyceps washingtonensis, Culicinomyces clavosporus, Entomophaga grylli, Entomophaga maimaiga, Entomophaga muscae, Entomophaga praxibulli, Entomophthora plutettae, Fusarium lateritium, Hirsutella citriformis, Hirsutella thompsoni, Metarhizium anisopliae («зеленый мускарин»), Metarhizium flaviride, Muscodor albus, Neozygitesfloridana, Nomuraea rileyi, Paecilomyces farinosus, Paecilomyces fumosoroseus, Pandora neoaphidis, Tolypocladium cylindrosporum, Verticillium lecanii, Zoophthora radicans, и микоризные виды грибов, например, Laccaria bicolor. Подходящими могут быть также другие микопестицидные виды, известные специалистам в данной отрасли.[0083] Examples of fungi that can be used in combination with microbial antagonists and compositions according to the invention include Muscodor species, Aschersonia aleyrodis , Beauveria bassiana ("white muscarine"), Beauveria brongniartii , Chladosporium herbarum , Cordyceps clavulata , Cordyceps entomorrhiza , Cordyceps fads , Cordyceps gracilis , Cordyceps melolanthae , Cordyceps militaris , Cordyceps myrmecophila , Cordyceps ravenelii , Cordyceps sinensis , Cordycepshecocephala , Cordyceps subsessilis , Cordyceps unilateralis , Cordyceps variabilis , Cordyceps washingtonensis , Culicinomyces clavosporus , Entomophaga grylli , Entomophaga maimaiga , Entomophaga muscae , Entomophaga praxibulli , Entomophthora plutettae , Fusarium lateritium , Hirsutella citriformis , Hirsutella thompsoni , Metarhizium anisopliae ("green muscarine"), Metarhizium flaviride , Muscodor albus , Neozygitesfloridana , Nomuraea rileyi , Paecilomyces farinosus , Paecilomyces fumoso roseus , Pandora neoaphidis , Tolypocladium cylindrosporum , Verticillium lecanii , Zoophthora radicans , and mycorrhizal fungi such as Laccaria bicolor. Other mycopesticidal species known to those skilled in the art may also be suitable.
[0084] Настоящим изобретением предлагаются также способы лечебной обработки растения путем нанесения любого из множества обычных препаратов в эффективном количестве либо на почву (то есть, в борозды), на части растения (то есть опрыскиванием), либо на семена до их посадки (то есть нанесением покрытия или протравливанием). Обычными препаратами могут быть растворы, эмульсифицируемый концентрат, смачиваемые порошки, суспензионный концентрат, растворимые порошки, гранулы, суспензионно-эмульсионный концентрат, природные и искусственные материалы, пропитанные активным соединением, и очень мелкие полимерные капсулы с управляемым высвобождением. В некоторых вариантах осуществления изобретения композиции для биологической борьбы готовят в порошках, которые поступают в продажу либо в препаратах, готовых к употреблению, либо смешиваются друг с другом во время их употребления. В обоих случаях порошок может добавляться в почву перед посадкой или во время посадки. В альтернативном варианте агент биоборьбы и агент борьбы с насекомыми могут быть оба, или один из них, жидкими препаратами и смешиваться друг с другом во время лечебной обработки. Для специалиста понятно, что эффективное количество композиции согласно изобретению зависит от конечного препарата композиции, а также от размеров обрабатываемых растений или семян.[0084] The present invention also provides methods for treating a plant by applying any of a variety of conventional formulations in an effective amount to either the soil (i.e. furrows), parts of the plant (i.e. spraying), or seeds prior to planting (i.e. coating or etching). Common formulations can be solutions, emulsifiable concentrate, wettable powders, suspension concentrate, soluble powders, granules, suspension emulsion concentrate, natural and artificial materials impregnated with the active compound, and very small controlled release polymer capsules. In some embodiments, biological control compositions are formulated in powders that are either marketed as ready-to-use formulations or mixed together at the time of use. In both cases, the powder can be added to the soil before planting or during planting. Alternatively, the biocontrol agent and the insect control agent may be both, or one of them, liquid preparations and mixed with each other during treatment. It will be understood by those skilled in the art that the effective amount of the composition according to the invention depends on the final preparation of the composition, as well as on the size of the plants or seeds being treated.
[0085] В зависимости от конечного препарата и способа его нанесения, композиция согласно изобретению может включать в себя одну или больше подходящих добавок. Такими добавками в данные композиции могут быть, например, адгезивы, такие как карбоксиметилцеллюлоза и природные либо искусственные полимеры в форме порошков, гранул или латексов, такие как гуммиарабик, хитин, поливиниловый спирт и поливинилацетат, а также природные фосфолипиды, такие как цефалины и лектицины, и искусственные фосфолипиды.[0085] Depending on the final preparation and method of its application, the composition according to the invention may include one or more suitable additives. Such additives in these compositions can be, for example, adhesives such as carboxymethyl cellulose and natural or artificial polymers in the form of powders, granules or latexes, such as gum arabic, chitin, polyvinyl alcohol and polyvinyl acetate, as well as natural phospholipids such as cephalins and lecticins, and artificial phospholipids.
[0086] В одном из предпочтительных вариантов осуществления изобретения микробиологические композиции готовят в едином стабильном растворе, эмульсии или суспензии. Для изготовления растворов активные химические соединения (то есть агенты биоборьбы с вредителями) перед добавлением агента биоборьбы, как правило, растворяют в растворителях. Подходящими жидкими растворителями могут быть, например, ароматические вещества из нефти, такие как ксилол, толуол или алкилнафталины, алифатические углеводороды, такие как циклогексан или парафины, например, нефтяные фракции, минеральные и растительные масла, спирты, такие как бутанол или гликоль, а также их простые и сложные эфиры, кетоны, такие как метилэтилкетон, метилизобутилкетон или циклогексанон, сильные полярные растворителями, такие как диметилформамид и диметилсульфоксид. Жидкой средой для эмульсии или суспензии является вода. В одном из вариантов осуществления изобретения агент химической борьбы и агент биологической борьбы суспендируются в жидкостях отдельно друг от друга и смешиваются во время употребления. В предпочтительном варианте приготовления суспензии агент борьбы с насекомыми и биологический агент объединяются в препарате, готовом к употреблению, имеющем срок хранения по меньшей мере два года. При употреблении жидкость может распыляться или наносится в форме пленки с помощью распылителя, либо в борозду во время посева культуры. Жидкая композиция может вводиться в почву перед прорастанием семян или непосредственно в почву в контакте с корнями с помощью разнообразных средств и методов, хорошо известных в данной отрасли, включая, например, капельное орошение, разбрызгиватели, инжекцию в почву или пропитывание почвы.[0086] In one of the preferred embodiments of the invention, microbiological compositions are prepared in a single stable solution, emulsion or suspension. To make solutions, active chemicals (ie, biocontrol agents) are typically dissolved in solvents prior to addition of the biocontrol agent. Suitable liquid solvents can be, for example, petroleum aromatics such as xylene, toluene or alkylnaphthalenes, aliphatic hydrocarbons such as cyclohexane or paraffins, for example petroleum fractions, mineral and vegetable oils, alcohols such as butanol or glycol, as well as their ethers and esters, ketones such as methyl ethyl ketone, methyl isobutyl ketone or cyclohexanone, strong polar solvents such as dimethylformamide and dimethyl sulfoxide. The liquid medium for the emulsion or suspension is water. In one embodiment of the invention, the chemical control agent and the biological control agent are suspended in liquids separately from each other and mixed at the time of consumption. In a preferred embodiment of the suspension, the insect control agent and the biological agent are combined in a ready-to-use formulation having a shelf life of at least two years. When used, the liquid can be sprayed or applied in the form of a film with a sprayer, or in the furrow during crop sowing. The liquid composition may be applied to the soil prior to seed germination, or directly to the soil in contact with the roots, by a variety of means and methods well known in the art, including, for example, drip irrigation, sprinklers, soil injection, or soil soaking.
[0087] При необходимости могут добавляться стабилизаторы и буферы, включая соли щелочных и щелочноземельных металлов и органические кислоты, такие как лимонная кислота и аскорбиновая кислота, неорганические кислоты, такие как соляная кислота или серная кислота. Могут добавляться также биоциды, например, формальдегиды или формальдегид-выделяющие агенты, и производные бензойной кислоты, такие как p-гидроксибензойная кислота[0087] Stabilizers and buffers may be added as needed, including alkali and alkaline earth metal salts and organic acids such as citric acid and ascorbic acid, inorganic acids such as hydrochloric acid or sulfuric acid. Biocides such as formaldehyde or formaldehyde releasing agents and benzoic acid derivatives such as p-hydroxybenzoic acid may also be added.
Препараты для нанесения покрытий на семенаSeed Coating Products
[0088] В некоторых, особенно предпочтительных вариантах осуществления изобретения, композиции для биоборьбы в соответствии с изобретением составляются для лечебной обработки семян. Композиция для лечебной обработки семян содержит по меньшей мере один агент борьбы с насекомыми и по меньшей мере один агент биологической борьбы. Предполагается, что семена могут по существу равномерно покрываться одним или больше слоями описанных здесь композиций для биоборьбы, используя для этого обычные методы смешивания и распыления или их комбинации и специально сконструированные и изготовленные устройства для создания покрытий, обеспечивающие требуемые точность, безопасность и эффективность нанесения на семена продуктов обработки. В таких устройствах используются различные технологии создания покрытий, например, роторного типа, барабанного типа, методы псевдоожиженного шара, фонтанирующего шара, роторного распыления или их комбинации. Жидкая обработка семян в соответствии с изобретением может осуществляться с помощью либо центрифужного дискового «распылителя», либо спрея, обеспечивающего равномерное распределение покрытия на семенах при их движении через профиль распыления. После этого семена в предпочтительном варианте перемешивают или ворошат в течение некоторого времени с целью дополнительного выравнивания распределения и сушат. Перед нанесением покрытия композицией согласно изобретению семена могут быть подвергнуты праймированию (стимуляции прорастания) для повышения равномерности прорастания и выпускания всходов. В альтернативном варианте сухой порошковый препарат может подаваться в определенных дозах на перемешиваемые семена и перемешиваться с ними до получения однородного распределения.[0088] In some particularly preferred embodiments of the invention, the biocontrol compositions of the invention are formulated for therapeutic seed treatment. The therapeutic seed treatment composition contains at least one insect control agent and at least one biological control agent. It is contemplated that seeds can be substantially uniformly coated with one or more layers of the biocontrol compositions described herein, using conventional mixing and spraying techniques, or combinations thereof, and specially designed and manufactured coating devices to provide the desired accuracy, safety, and efficiency of seed application. processing products. Such devices use a variety of coating technologies, such as rotary type, drum type, fluidized ball, gushing ball, rotary spray, or combinations thereof. The liquid seed treatment according to the invention can be carried out using either a centrifugal disc “sprayer” or a spray that provides a uniform distribution of the coating on the seeds as they move through the spray pattern. After that, the seeds are preferably mixed or stirred for some time in order to further even out the distribution and dried. Prior to coating with the composition according to the invention, the seeds may be primed (germination stimulation) to increase the uniformity of germination and emergence. Alternatively, the dry powder preparation may be dosed to the seeds being stirred and mixed with them until a homogeneous distribution is obtained.
[0089] В другом аспекте согласно изобретению предлагаются семена, обработанные микробиологическими композициями в соответствии с изобретением. В одном из вариантов по меньшей мере часть поверхности семян является покрытой микробиологической композицией по изобретению. В одном из специфических вариантов осуществления обработанные микроорганизмами семена имеют концентрацию спор или микробных клеток приблизительно от 106 до 109 на одно семя. Семена могут иметь также большее количество спор или микробных клеток, например, 1010, 1011 или 1012 спор на семя. Микробные споры и/или клетки могут покрывать семена в свободном состоянии или, предпочтительно, наносится на них в предварительно приготовленной жидкой или твердой композиции. Твердая композиция, содержащая микроорганизмы, может готовиться путем перемешивания твердого носителя с суспензией спор до тех пор, пока твердые носители не будут пропитаны этой споровой или клеточной суспензией. После этого смесь просушивают, получая в результате требуемые частицы.[0089] In another aspect, the invention provides seeds treated with the microbiological compositions of the invention. In one embodiment, at least a portion of the seed surface is coated with the microbiological composition of the invention. In one specific embodiment, the microorganism-treated seeds have a concentration of spores or microbial cells of about 10 6 to 10 9 per seed. Seeds may also have higher numbers of spores or microbial cells, such as 10 10 , 10 11 or 10 12 spores per seed. The microbial spores and/or cells may coat the seeds in a free state or, preferably, be applied to them in a pre-formulated liquid or solid composition. A solid composition containing microorganisms can be prepared by mixing the solid carrier with the spore suspension until the solid carriers are impregnated with the spore or cell suspension. After that, the mixture is dried, resulting in the desired particles.
[0090] В некоторых других вариантах осуществления предполагается, что твердые или жидкие композиции для биоборьбы в соответствии с изобретением, кроме того, содержат функциональные агенты, способные защищать семена от вредного воздействия селективных гербицидов, такие как активированный уголь, питательные вещества (удобрения) и другие агенты, способные улучшать прорастание и качество продукции.[0090] In some other embodiments, it is contemplated that the solid or liquid biocontrol compositions of the invention further comprise functional agents capable of protecting seeds from the harmful effects of selective herbicides, such as activated charcoal, nutrients (fertilizers), and others. agents capable of improving germination and product quality.
[0091] Известные способы и композиции для нанесения покрытий на семена могут быть особенно полезными, когда они модифицируются путем добавления одного из вариантов осуществления данного изобретения. Такие подходящие для применения способы и устройства для нанесения покрытий описаны, например, в (U.S. Pat Nos. 5918413; 5554445; 5389399; 4759945; 4465017). Всевозможные композиции для создания покрытий на семенах описаны, например, в (U.S. Pat. Appl. Nos. US20110033432, US20100154299, U.S. Pat. Nos. 5939356; 5876739, 5849320; 5791084, 5661103; 5580544, 5328942; 4735015; 4634587; 4372080, 4339456; и 4245432).[0091] Known methods and compositions for coating seeds can be especially useful when they are modified by adding one of the embodiments of this invention. Such suitable coating methods and apparatuses are described, for example, in (U.S. Pat Nos. 5918413; 5554445; 5389399; 4759945; 4465017). Всевозможные композиции для создания покрытий на семенах описаны, например, в (U.S. Pat. Appl. Nos. US20110033432, US20100154299, U.S. Pat. Nos. 5939356; 5876739, 5849320; 5791084, 5661103; 5580544, 5328942; 4735015; 4634587; 4372080, 4339456 ; and 4245432).
[0092] В препараты для обработки семян, содержащие композиции согласно изобретению, могут вводиться самые различные добавки. Такими добавками могут быть, например, связующие, состоящие предпочтительно адгезивного полимера, который может быть природным или искусственным и не должен оказывать фитотоксического воздействия на покрываемые семена. Связующее может выбираться среди следующих материалов: поливинилацетатов; coполимеров поливинилацетатов; coполимеров этиленвинилацетата (ЭВА); поливинилового спирта; coполимеров поливинилового спирта; целлюлоз, включая этилцеллюлозу, метилцеллюлозу, гидроксиметилцеллюлозу, гидроксипропилцеллюлозу и карбоксиметилцеллюлозу; поливинилпиролидонов; полисахаридов, включая крахмал, модифицированный крахмал, декстрины, мальтодекстрины, альгинат и хитозаны; жиров; растительных масел; протеинов, включая желатин и зеины; гуммиарабиков; шеллаков; винилиденхлорида и сополимеров винилиденхлорида; лигносульфонатов кальция; акриловых coполимеров; поливинилакрилатов; полиэтиленоксида; акриламидных полимеров и coполимеров; полигидроксиэтилакрилата, метилакриламидных мономеров; и полихлоропрена.[0092] A wide variety of additives can be incorporated into seed treatment formulations containing the compositions of the invention. Such additives may be, for example, binders, preferably consisting of an adhesive polymer, which may be natural or artificial and should not have a phytotoxic effect on the seeds to be coated. The binder may be selected from the following materials: polyvinyl acetates; polyvinyl acetate copolymers; copolymers of ethylene vinyl acetate (EVA); polyvinyl alcohol; polyvinyl alcohol copolymers; celluloses, including ethylcellulose, methylcellulose, hydroxymethylcellulose, hydroxypropylcellulose and carboxymethylcellulose; polyvinyl pyrolidones; polysaccharides, including starch, modified starch, dextrins, maltodextrins, alginate, and chitosans; fats; vegetable oils; proteins, including gelatin and zeins; gum arabic; shellacs; vinylidene chloride and vinylidene chloride copolymers; calcium lignosulfonates; acrylic copolymers; polyvinyl acrylates; polyethylene oxide; acrylamide polymers and copolymers; polyhydroxyethyl acrylate, methylacrylamide monomers; and polychloroprene.
[0093] Могут использоваться любые красители, включая органические хромофоры, относящиеся к классу нитрозо; нитро; азо, включая моназо, бизазо и полиазо; акридин, антрахинон, азин, дифенилметан, индамин, индофенол, метин, оксазин, фталоцианин, тиазин, тиазол, триарилметан, ксантен. Среди других допустимых добавок можно назвать следовые питательные добавки, такие как соли железа, марганца, бора, меди, кобальта, молибдена и цинка. Для удержания этих веществ на поверхности семян могут добавлять полимерные или другие пылевидные средства.[0093] Any dye can be used, including organic chromophores belonging to the nitroso class; nitro; azo, including monazo, bisazo and polyazo; acridine, anthraquinone, azine, diphenylmethane, indamine, indophenol, methine, oxazine, phthalocyanine, thiazine, thiazole, triarylmethane, xanthene. Other acceptable additives include trace nutritional supplements such as iron, manganese, boron, copper, cobalt, molybdenum and zinc salts. To hold these substances on the surface of the seeds, polymeric or other dust-like agents can be added.
[0094] В некоторых специфических вариантах осуществления изобретения нанесенные покрытия, помимо микробных клеток или спор, могут содержать также слой адгезива. Адгезив должен быть нетоксичным, биоразлагаемым и клейким. Подходящими для него материалами являются, например: поливинилацетаты; coполимеры поливинилацетатов; поливиниловые спирты; coполимеры поливиниловых спиртов; целлюлозы, такие как метилцеллюлоза, гидроксиметилцеллюлоза и гидроксиметилпропилцеллюлоза; декстрины; альгинаты; сахара; меляссы; поливинилпирролидоны; полисахариды; протеины; жиры; растительные масла; гуммиарабики; желатины; сиропы; и крахмалы. Подходящими могут быть также материалы, описанные в (U.S. Pat. No. 7213367 и U.S. Pat. Appln. No. US20100189693).[0094] In some specific embodiments of the invention, the applied coatings, in addition to microbial cells or spores, may also contain an adhesive layer. The adhesive must be non-toxic, biodegradable and tacky. Suitable materials are, for example: polyvinyl acetates; polyvinyl acetate copolymers; polyvinyl alcohols; copolymers of polyvinyl alcohols; celluloses such as methylcellulose, hydroxymethylcellulose and hydroxymethylpropylcellulose; dextrins; alginates; Sahara; molasses; polyvinylpyrrolidones; polysaccharides; proteins; fats; vegetable oils; gum arabic; gelatins; syrups; and starches. The materials described in (U.S. Pat. No. 7213367 and U.S. Pat. Appln. No. US20100189693) may also be suitable.
[0095] В препарат для обработки семян также могут входить различные добавки, такие как адгезивы, диспергаторы, поверхностно-активные вещества, питательные и буферные ингредиенты. Обычными добавками в препарат для обработки семян являются, например, агенты для нанесения покрытия, смачивающие агенты, буферные агенты и полисахариды, а также по меньшей мере один подходящий для сельского хозяйства носитель, такой как вода, твердые тела или сухие порошки. Сухие порошки можно готовить из самых различных материалов, таких как карбонат кальция, гипс, вермикулит, тальк, гумус, активированный уголь и всевозможные соединения фосфора.[0095] Various additives such as adhesives, dispersants, surfactants, nutritional and buffer ingredients may also be included in the seed treatment preparation. Common additives in a seed treatment formulation are, for example, coating agents, wetting agents, buffering agents and polysaccharides, as well as at least one agriculturally suitable carrier such as water, solids or dry powders. Dry powders can be prepared from a wide variety of materials such as calcium carbonate, gypsum, vermiculite, talc, humus, activated carbon and various phosphorus compounds.
[0096] В одном из вариантов осуществления изобретения композиция для нанесение покрытия на семена может содержать по меньшей мере один наполнитель, являющийся органическим или неорганическим, природным или искусственным компонентом, с которым объединяются активные компоненты для облегчения их нанесения на семена. Желательно, чтобы наполнитель был инертным, твердым материалом, таким как глина, природный или искусственный силикат, кремнезем, смола, воск, твердое удобрение (например, соль аммония), природным почвенным минералом, таким как каолин, глина, тальк, известь, кварц, аттапульгит, монтмориллонит, бентонит или инфузорная земля, или искусственным минералом, таким как кремнезем, глинозем или силикат, из которых особенно подходящими являются силикаты алюминия или магния.[0096] In one embodiment, the seed coating composition may comprise at least one organic or inorganic, natural or artificial excipient with which the active ingredients are combined to facilitate their application to the seed. Desirably, the filler is an inert, solid material such as clay, natural or artificial silicate, silica, resin, wax, solid fertilizer (e.g. ammonium salt), natural soil mineral such as kaolin, clay, talc, lime, quartz, attapulgite, montmorillonite, bentonite or diatomaceous earth, or an artificial mineral such as silica, alumina or silicate, of which aluminum or magnesium silicates are particularly suitable.
[0097] Препарат для обработки семян может содержать, кроме того, один или больше следующих ингредиентов: другие пестициды, включая соединения, действующие только под землей; фунгициды, такие как каптан, тирам, метаксил, флудиоксонил, оксадилил и изомеры каждого из этих материалов, и т.п.; гербициды, включая соединения, выбранные среди глифосфата, карбаматов, тиокарбаматов, ацетамидов, триазинов, динитроанилинов, глицериновых эфиров, пиридазинонов, урацилов, фенокси, мочевин и бензойных кислот; гербицидные защитные агенты, такие как бензоксазин, производные бензгидрила, N,N-диаллилдихлорацетамид, различные соединения дигалоацилов, оксазолидинилов и тиазолидинилов, этанон, соединения нафталевых ангидридов, и производные оксимов; удобрения; и агенты биоборьбы, такие как другие природные или рекомбинантные бактерии и грибы родов Rhizobium, Bacillus, Pseudomonas, Serratia, Trichoderma, Glomus, Gliocladium и микоризные грибы. Эти ингредиенты могут добавляться в форме отдельного слоя на семенах или, в альтернативном варианте, в качестве части композиции для покрытия семян согласно изобретению.[0097] The seed treatment may additionally contain one or more of the following ingredients: other pesticides, including compounds that act only underground; fungicides such as captan, thiram, metaxyl, fludioxonil, oxadilyl and isomers of each of these materials, and the like; herbicides, including compounds selected from glyphosphate, carbamates, thiocarbamates, acetamides, triazines, dinitroanilines, glycerol esters, pyridazinones, uracils, phenoxy, ureas and benzoic acids; herbicidal protective agents such as benzoxazine, benzhydryl derivatives, N,N-diallyldichloroacetamide, various dihaloacyl, oxazolidinyl and thiazolidinyl compounds, ethanone, naphthalic anhydride compounds, and oxime derivatives; fertilizers; and biocontrol agents such as other natural or recombinant bacteria and fungi of the genera Rhizobium , Bacillus , Pseudomonas , Serratia , Trichoderma , Glomus , Gliocladium and mycorrhizal fungi. These ingredients may be added in the form of a separate layer on the seed or, alternatively, as part of a seed coating composition according to the invention.
[0098] В предпочтительном варианте, количество новой композиции или других ингредиентов, используемых для обработки семян, не должно ингибировать прорастание семян или вызывать у них фитотоксические повреждения.[0098] Preferably, the amount of new composition or other ingredients used in the seed treatment should not inhibit seed germination or cause phytotoxic damage to the seed.
[0099] Обработанные микроорганизмами семена могут быть далее покрыты пленкой поверх нанесенного на них покрытия для защиты последнего. Такие поверхностные покрытия являются хорошо известными и могут наноситься методами псевдоожиженного слоя и во вращающемся барабане.[0099] Microorganism-treated seeds can be further coated with a film on top of the coating applied to them to protect the latter. Such surface coatings are well known and can be applied by fluidized bed and rotary drum techniques.
[0100] В принципе, любые семена растений, способные прорастать и образовывать растение, восприимчивое к воздействию нематодов и/или патогенных грибов, могут обрабатываться в соответствии с изобретением. Подходящими для этого являются семена зерновых культур, кофе, капустных культур, волокнистых культур, цветов, фруктов, бобовых, масличных культур, деревьев, клубнеплодных культур, овощей, а также других растений однодольных и двудольных видов. Предпочтительными для покрытия являются семена, например, бобовых, моркови, кукурузы, хлопка, трав, салата, арахиса, перца, картофеля, рапса, риса, ржи, сорго, сои, сахарной свеклы, подсолнуха, табака и томатов. В наиболее предпочтительными для покрытия композициями согласно изобретению являются семена ячменя или пшеницы (яровой пшеницы или озимой пшеницы).[0100] In principle, any plant seed capable of germinating and producing a plant susceptible to attack by nematodes and/or pathogenic fungi can be treated in accordance with the invention. Seeds of cereals, coffee, cabbage crops, fiber crops, flowers, fruits, legumes, oilseeds, trees, tubers, vegetables, and other plants of monocot and dicotyledonous species are suitable for this. Preferred seeds for coating are, for example, legumes, carrots, corn, cotton, grasses, lettuce, peanuts, peppers, potatoes, rapeseed, rice, rye, sorghum, soybeans, sugar beets, sunflowers, tobacco and tomatoes. In the most preferred coating compositions according to the invention are barley or wheat (spring wheat or winter wheat) seeds.
[0101] В другом аспекте настоящего изобретения предлагается новое зерновое растение, созданное путем искусственного введения микробного эндофита по изобретению в зерновое растение, не содержащее эндофитных микроорганизмов. В некоторых вариантах осуществления данного аспекта микробным эндофитом, введенным в зерновое растение, может быть эндофитный антагонист, обладающий супрессорной активностью против фузариоза или возбудителя фузариоза. Кроме того, эндофитным антагонистом, введенным в зерновое растение, может быть грибной штамм SGI-010-H11. Известно множество способов, продемонстрировавших свою эффективность для введения микробного эндофита в зерновые травы. Примеры таких способов можно найти в (U.S. Pat. Appl. No. 20030195117A1, U.S. Pat. Appl. No. 20010032343A1, U.S. Pat. No. 7084331). Для специалиста в данной отрасли должно быть вполне понятным, что многие из вышеупомянутых способов могут использоваться в культивировании нового зернового растения согласно изобретению.[0101] In another aspect of the present invention, there is provided a novel cereal plant created by artificially introducing a microbial endophyte of the invention into a cereal plant free of endophytic microorganisms. In some embodiments of this aspect, the microbial endophyte introduced into the cereal plant may be an endophytic antagonist having suppressive activity against Fusarium or Fusarium blight. In addition, the endophytic antagonist introduced into the cereal plant may be the fungal strain SGI-010-H11. There are many methods that have demonstrated their effectiveness for the introduction of microbial endophyte in cereal grasses. Examples of such methods can be found in (U.S. Pat. Appl. No. 20030195117A1, U.S. Pat. Appl. No. 20010032343A1, U.S. Pat. No. 7084331). One skilled in the art would appreciate that many of the above methods can be used in the cultivation of the new cereal plant according to the invention.
[0102] После искусственной инфикации желательно ДНК выделенного эндофитного антагониста амплифицировать с помощью ПЦР реакции, и подтвердить его антагонистичность путем проведения исследований гомологии для амплифицированной ДНК. Далее, желательно в вышеупомянутый эндофитный антагонист ввести инородный ген, экспрессирующий идентифицируемое средство, и подтвердить наличие колонизации данного эндофитного антагониста, инфицирующего растение, вышеупомянутым идентифицирующим средством с помощью этого инородного гена.[0102] After artificial infection, it is desirable to amplify the DNA of the isolated endophytic antagonist by a PCR reaction, and confirm its antagonism by performing homology studies on the amplified DNA. Further, it is desirable to introduce a foreign gene expressing an identifiable agent into the aforementioned endophytic antagonist, and confirm that the aforementioned identification agent has colonized the plant-infecting endophytic antagonist with the aforementioned foreign gene.
Получение композиции для биоборьбы в соответствии с настоящим изобретениемPreparation of a biocontrol composition according to the present invention
[0103] Культуры микробных антагонистов могут быть получены для использования в композициях биоборьбы согласно изобретению с помощью известных методов стандартной статической сушки и жидкой ферментации. Культивирование, как обычно, проводят в биореакторе.[0103] Cultures of microbial antagonists can be prepared for use in the biocontrol compositions of the invention using known standard static drying and liquid fermentation techniques. Cultivation, as usual, is carried out in a bioreactor.
[0104] Биореактором называется любое устройство, обеспечивающее условия биологически активной окружающей среды. В контексте данного описания биореактором является сосуд, в котором можно выращивать микроорганизмы, включая микробные антагонисты, согласно изобретению. Биореактор может иметь любую форму и размеры, подходящие для культивирования микроорганизмов. Биореактор может иметь размеры от 10 мл до литров и кубических метров. Он может быть изготовлен из нержавеющей стали или любого другого подходящего материала. Биореактор может быть периодического действия или непрерывного действия (например, с непрерывным перемешиванием). По своему типу биореактор может относиться к хемостатам, какие используются в микробиологии для выращивания и сбора бактерий. Среди поступающих в продажу подходящих биореакторов можно назвать, например, аппараты, выпускаемые фирмой Bioreactor System Design, Asenjo & Merchuk, CRC Press, 1995.[0104] A bioreactor is any device that provides the conditions for a biologically active environment. In the context of this description, a bioreactor is a vessel in which microorganisms, including microbial antagonists, according to the invention can be grown. The bioreactor may be of any shape and size suitable for culturing microorganisms. The bioreactor can range in size from 10 ml to liters and cubic meters. It can be made of stainless steel or any other suitable material. The bioreactor may be batch-acting or continuous (eg, continuously agitated). By its type, a bioreactor can refer to chemostats, which are used in microbiology for growing and collecting bacteria. Suitable commercially available bioreactors include, for example, those manufactured by Bioreactor System Design, Asenjo & Merchuk, CRC Press, 1995.
[0105] Для маломасштабных нужд, например, для тестирования и разработки новых процессов и процессов, которые не могут быть преобразованы в непрерывные, можно использовать биореактор периодического действия.[0105] For small scale needs, such as testing and developing new processes and processes that cannot be converted to continuous, a batch bioreactor can be used.
[0106] Микроорганизмы, культивируемые в биореакторе, могут суспендироваться или иммобилизироваться. Культивация в биореакторе в общем случае осуществляется в аэробных условиях при соответствующих температурах и pH. Для получения организмов согласно изобретению культивация клеток осуществляется при температурах в интервале 5-37°C, в котором предпочтительными являются температуры в интервалах 15-30°C, 15-28°C, 20-30°C и 15-25°C. Величина pH питательной среды может варьировать от 4,0 до 9,0, однако предпочтительным является рабочий интервал от немного кисловатого до нейтрального с pH 4,0-7,0, или 4,5-6,5, или pH 5,0-6,0. Как правило, максимальный клеточный выход получают в период 20-72 часов после инокуляция.[0106] Microorganisms cultured in the bioreactor may be suspended or immobilized. Cultivation in a bioreactor is generally carried out under aerobic conditions at appropriate temperatures and pH. To obtain organisms according to the invention, cell culture is carried out at temperatures in the range of 5-37°C, in which temperatures in the ranges of 15-30°C, 15-28°C, 20-30°C and 15-25°C are preferred. The pH value of the nutrient medium can vary from 4.0 to 9.0, but the preferred operating range is from slightly sour to neutral with a pH of 4.0-7.0, or 4.5-6.5, or pH 5.0- 6.0. As a rule, the maximum cell output is obtained in the period of 20-72 hours after inoculation.
[0107] Вполне понятно, что оптимальные условия культивации антагонистов согласно изобретению зависят от конкретного штамма. Однако главные ингредиенты и условия питания можно будет определить, исходя из условий, применяемых в процессе селекции, и общих требований для большинства микроорганизмов. Микробные антагонисты, как правило, должны выращиваться в аэробных жидких культурах на среде, содержащей источники углерода, азота и неорганических солей, которые могут ассимилироваться микроорганизмом и содействовать эффективному росту клеток. Предпочтительными источниками углерода являются гексозы, такие как глюкоза. Однако их могут заменить другие, легкоассимилируемые источники, такие как аминокислоты. Источниками азота в процессе выращивания могут служить многие неорганические и белковые материалы. Предпочтительными источниками азота являются аминокислоты и мочевины, однако могут использоваться также газообразный аммиак, неорганические соли нитрата и аммония, витамины, чистые питательные вещества, пиримидины, дрожжевой экстракт, мясной экстракт, протеоз пептона, соевая мука, гидролизаты казеина, фильтрат барды и т.п. Среди неорганических минералов, которые могут вводиться в питательную среду, можно назвать обычные соли, способные поставлять ионы кальция, цинка, железа, марганца, магния, меди, кобальта, калия, натрия, молибдата, фосфата, сульфата, хлорида, бората и др. Предпочтительной питательной средой для грибных антагонистов является жидкая картофельная декстроза, а для бактериальных штаммов - бульон премикс R2A.[0107] It is clear that the optimal conditions for the cultivation of antagonists according to the invention depend on the particular strain. However, the main ingredients and nutritional conditions can be determined based on the conditions used in the selection process and the general requirements for most microorganisms. Microbial antagonists should generally be grown in aerobic liquid cultures on a medium containing sources of carbon, nitrogen, and inorganic salts that can be assimilated by the microorganism and promote efficient cell growth. Preferred carbon sources are hexoses such as glucose. However, they can be replaced by other, easily assimilated sources such as amino acids. Numerous inorganic and protein materials can serve as sources of nitrogen during the growing process. Preferred sources of nitrogen are amino acids and ureas, but gaseous ammonia, inorganic nitrate and ammonium salts, vitamins, pure nutrients, pyrimidines, yeast extract, meat extract, peptone proteose, soy flour, casein hydrolysates, vinasse filtrate, etc. can also be used. . Among the inorganic minerals that can be introduced into the nutrient medium, one can name common salts that can supply calcium, zinc, iron, manganese, magnesium, copper, cobalt, potassium, sodium, molybdate, phosphate, sulfate, chloride, borate, etc. ions. Preferred the nutrient medium for fungal antagonists is liquid potato dextrose, and for bacterial strains, R2A premix broth.
[0108] В настоящем описании указаны и включены посредством ссылок различные источники информации, среди которых, например, статьи из научных журналов, патентные документы, учебные пособия и адреса интернет-страниц. Ссылки на эти источники служат исключительно для целей показать общее состояние уровня техники на время подачи заявки. В то время как содержание и идеи, изложенные во всех и каждом из этих источников, могут послужить основой и использоваться для реализации и применения вариантов осуществления изобретения на практике, ни одно из обсуждений и ни один из комментариев в конкретном источнике информации не может считаться признанием того, что такой комментарий был в широком смысле принят в качестве общего мнения в данной отрасли.[0108] In the present description, various sources of information are identified and incorporated by reference, including, for example, articles from scientific journals, patent documents, tutorials, and Internet page addresses. References to these sources are for the sole purpose of showing the general state of the art at the time of filing. While the content and ideas set forth in each and every one of these sources can serve as a basis and be used to implement and apply embodiments of the invention in practice, none of the discussions and none of the comments in a particular source of information can be considered an admission that that such a comment was broadly accepted as the general opinion of the industry.
[0109] Приведенное здесь описание общих способов имеет исключительно иллюстративные цели. Вполне очевидными могут быть вытекающие из этого описания другие альтернативные способы и варианты осуществления изобретения, которые также лежат в рамках идеи и сферы применения настоящей заявки.[0109] The description of general methods provided herein is for illustrative purposes only. Other alternative methods and embodiments of the invention may follow from this description and are also within the spirit and scope of the present application.
[0110] Ниже приведены примеры, которые служат также исключительно для иллюстрации данного изобретения и не предполагают каких бы то ни было его ограничений.[0110] The following are examples that also serve solely to illustrate the invention and are not intended to be limiting in any way.
ПРИМЕРЫEXAMPLES
ПРИМЕР 1. Описание антагонистических микроорганизмов, способных подавлять развитие Fusarium graminaerum и Gibberella zeae , являющихся возбудителями фузариоза EXAMPLE 1.Description of antagonistic microorganisms capable of suppressing the development Fusarium graminaerum and Gibberella zeae , which are the causative agents of fusarium
[0111] В данном примере описан высокопроизводительный процесс сбора и скрининга микроорганизмов-кандидатов, разработанный фирмой Synthetic Genomics, Inc. для выделения штаммов микроорганизмов, обладающих супрессорной активностью против возбудителей фузариоза и, в частности, против Fusarium graminearum. Новые микробные антагонистические штаммы были выделены из образцов растительной ткани, собранных в нескольких местах на территории Соединенных Штатов. Из тканей корней растений, собранных в заповеднике Eagle Peak Preserve вблизи Julian, CA, были выделены бактериальные штаммы SGI-014-C06, SGI-014-G01, SGI-015-F03 и SGI-015-H06. Из тканей стеблей двух образцов различных растений, собранных в San Elijo Lagoon, Encinitas, CA, были выделены грибной штамм SGI-010-H11 и бактериальный штамм SGI-005-G08.[0111] This example describes a high-throughput process for the collection and screening of candidate microorganisms developed by Synthetic Genomics, Inc. for the isolation of strains of microorganisms with suppressive activity against Fusarium pathogens and, in particular, against Fusarium graminearum . New microbial antagonistic strains have been isolated from plant tissue samples collected from several locations throughout the United States. Bacterial strains SGI-014-C06, SGI-014-G01, SGI-015-F03, and SGI-015-H06 were isolated from plant root tissue collected at the Eagle Peak Preserve near Julian, CA. The fungal strain SGI-010-H11 and bacterial strain SGI-005-G08 were isolated from stem tissue from two different plant samples collected at San Elijo Lagoon, Encinitas, CA.
[0112] Выделение этих микроорганизмов производили следующим образом. Для выделения бактериального штамма ткани корней растений облучали ультразвуком и последовательно разбавляли на планшетах с 2xYT (дрожжевым экстрактом с триптоном) и с безазотистой агаровой средой. После этого по морфологическим характеристикам были отобраны индивидуальные колонии, которые индивидуально культивировали в жидкой бульонной среде. Для выделения грибов растительную ткань сначала подвергали поверхностной стерилизации погружением в 70% этанол и кратковременной обработкой в пламени. Затем ткань рассекали и помещали на картофельно-декстрозный агар (ПДА), после чего ее инкубировали при комнатной температуре. Когда начинал наблюдаться рост мицелия, сегмент мицелиальной культуры переносили на другой ПДА планшет. Штаммы микроорганизмов выделяли, очищали и хранили при -80°C в 15% глицероле для бактериальных штаммов и на высушенных семенах ячменя для грибных штаммов.[0112] The isolation of these microorganisms was performed as follows. To isolate the bacterial strain, plant root tissues were irradiated with ultrasound and serially diluted on plates with 2xYT (yeast extract with tryptone) and nitrogen-free agar medium. After that, according to morphological characteristics, individual colonies were selected, which were individually cultivated in a liquid broth medium. To isolate the fungi, the plant tissue was first subjected to surface sterilization by immersion in 70% ethanol and a brief flame treatment. The tissue was then dissected and placed on potato dextrose agar (PDA), after which it was incubated at room temperature. When mycelial growth began to be observed, the mycelial culture segment was transferred to another PDA plate. Microbial strains were isolated, purified and stored at -80°C in 15% glycerol for bacterial strains and on dried barley seeds for fungal strains.
[0113] У выделенных штаммов микроорганизмов определяли способность подавлять рост мицелия F. graminearum в испытаниях на антагонизм in vitro, которые проводили на агаровых планшетах с картофельно-декстрозной агаровой (ПДА) питательной средой в соответствии с методикой высокоэффективного скрининга с небольшими модификациями, описанной в заявке (U.S. Pat. Appl. No. US20120107915A1), включенной здесь посредством ссылки. Вкратце, выделенные штаммы микроорганизмов выращивали на трипсин-соевом бульоновом агаре (ТСБА/5) с одной пятой нормальной концентрации в течение 24 ч перед употреблением. Конидиальный инокулят F. graminearum NRRL-5883 продуцировали путем гифального прищипывания активно растущей колонии гриба и переноса гифальных нитей в ПДА агаровую среду. После инкубирования планшетов в течение 7 дней при 25°C с 12 ч/день фотопериодом, конидии отмывали от ПДА планшетов с помощью слабого фосфатного буфера (0,004% фосфатный буфер, pH 7,2 с 0,019% MgCl2). Затем суспензию конидий F. graminearum в слабом фосфатном буфере (1×105 конидий/мл) сразу же распределяли по поверхности агара, и затем планшеты инкубировали при 25°C в течение 48-72 ч. Для инициации теста на антагонизм, клетки выделенных микробных штаммов точечно инокулировали на равных расстояниях внутри периметра планшета. Через пять дней штаммы отмечали как антибиоз-положительные, когда по периметру микробных колоний визуально наблюдалась светлая площадь, на которой отсутствовал мицелиальный рост.[0113] The isolated strains of microorganisms were determined for their ability to inhibit the growth of F. graminearum mycelium in in vitro antagonism tests, which were carried out on agar plates with potato dextrose agar (PDA) nutrient medium in accordance with the high throughput screening method with slight modifications described in the application (US Pat. Appl. No. US20120107915A1), incorporated here by reference. Briefly, the isolated strains of microorganisms were grown on trypsin-soy broth agar (TSBA/5) at one-fifth normal concentration for 24 hours before consumption. A conidial inoculum of F. graminearum NRRL-5883 was produced by hyphal pinching of an actively growing colony of the fungus and transferring the hyphal filaments to PDA agar medium. After incubating the plates for 7 days at 25° C. with a 12 h/day photoperiod, the conidia were washed from the PDA plates with a weak phosphate buffer (0.004% phosphate buffer, pH 7.2 with 0.019% MgCl 2 ). Then, a suspension of F. graminearum conidia in weak phosphate buffer (1×10 5 conidia/ml) was immediately spread over the surface of the agar, and then the plates were incubated at 25°C for 48-72 hours. To initiate the antagonism test, cells of the isolated microbial strains were pointwise inoculated at equal distances within the perimeter of the plate. Five days later, the strains were marked as antibiosis-positive, when a light area was visually observed along the perimeter of the microbial colonies, on which there was no mycelial growth.
[0114] По вышеописанной методике было выделено и проанализировано более 4000 микробных штаммов. Среди них шесть штаммов проявляли способность существенно подавлять мицелиальный рост F. graminearum NRRL-5883 на ПДА среде. Эти новые микробные антагонисты получили следующие наименования: SGI-005-G08, SGI-010-H11, SGI-014-C06, SGI-014-G01, SGI-015-F03 и SGI-015-H06.[0114] More than 4000 microbial strains were isolated and analyzed according to the above method. Among them, six strains showed the ability to significantly suppress the mycelial growth of F. graminearum NRRL-5883 on PDA medium. These new microbial antagonists have been named SGI-005-G08, SGI-010-H11, SGI-014-C06, SGI-014-G01, SGI-015-F03 and SGI-015-H06.
[0115] Вышеуказанные новые микробные антагонисты подвергались также тестированию на антагонизм по их способности подавлять рост грибного патогена Gibberella zeae, который является телеоморфным видом гриба Fusarium graminearum. Все используемые при этом методики были идентичными вышеописанным, за исключением того, что тестированным таким способом патогенным штаммом был патогенный штамм гриба Gibberella zeae. Среди этих шести микробных антагонистов четыре штамма SGI-010-H11, SGI-014-C06, SGI-015-F03 и SGI-015-H06 продемонстрировали способность существенно подавлять мицелиальный рост гриба Gibberella zeae. [0115] The above novel microbial antagonists were also tested for antagonism for their ability to inhibit the growth of the fungal pathogen Gibberella zeae , which is a teleomorphic species of the fungus Fusarium graminearum. All methods used were identical to those described above, except that the pathogenic strain tested in this way was a pathogenic strain of the fungus Gibberella zeae. Among these six microbial antagonists, four strains SGI-010-H11, SGI-014-C06, SGI-015-F03 and SGI-015-H06 showed the ability to significantly inhibit the mycelial growth of the fungus Gibberella zeae.
ПРИМЕР 2. Экстрагирование ДНК. Секвенирование и таксономия EXAMPLE 2 Extraction of DNA. Sequencing and taxonomy
Лизис грибных клеток и получение информации о последовательности ITS-5.8S рДНКLysis of fungal cells and obtaining information on the ITS-5.8S rDNA sequence
[0116] Грибную биомассу переносили на 96-луночный ПЦР микропланшет, содержащий 50 мкл 2× буфера для лизиса (100 мM Tris HCL, pH 8,0, 2 мM EDTA, pH 8,0, 1% SDS, 400 мкг/мл протеиназы K). Лизис проводили в следующих условиях: 55°C в течение 60 минут, 94°C в течение 4 минут. Аликвоту лизисного продукта использовали в качестве источника матричной ДНК для ПЦР амплификации. Последовательность ITS-5.8S рДНК амплифицировали с помощью ПЦР реакции с двумя праймерами M13-ITS1 (SEQ ID NO: 15) и ITS4 M13-хвост (SEQ ID NO: 16).[0116] Fungal biomass was transferred to a 96-well PCR microplate containing 50 μl of 2x lysis buffer (100 mM Tris HCL, pH 8.0, 2 mM EDTA, pH 8.0, 1% SDS, 400 μg/ml proteinase K). The lysis was carried out under the following conditions: 55°C for 60 minutes, 94°C for 4 minutes. An aliquot of the lysis product was used as a source of template DNA for PCR amplification. The ITS-5.8S rDNA sequence was amplified by PCR reaction with two primers M13-ITS1 (SEQ ID NO: 15) and ITS4 M13-tail (SEQ ID NO: 16).
[0117] Для амплификации участка ITS-5.8S рДНК каждую ПЦР смесь готовили в реакционной смеси с конечным объемом 20 мкл, содержащей 4 мкл из реакционной смеси грибного лизиса, 0,2 мкM каждого праймера (ITS1/ITS4), 6% Tween-20 и 10 мкл 2× ImmoMix (Bioline USA Inc, Taunton, MA). ПЦР проводили в следующих условиях: 94°C в течение 10 минут; 94°C в течение 30 секунд, 52°C в течение 30 секунд, 72°C в течение 75 секунд в течение 30 циклов; 72°C в течение 10 минут. 2-мкл аликвоту ПЦР продукта помещали на 1,0% агарозный гель для подтверждения одинарной полосы ожидаемого размера. Положительные полосы направляли на секвенирование по Сэнгеру в прямом и обратном направлениях с помощью M13 праймеров. Последовательность 5.8S межгенного участка (ITS) грибного штамма SGI-010-H11 представлена в Перечне последовательностей под номером SEQ ID NO: 11. Исследование гомологии для определенной нуклеотидной последовательности 5.8 S межгенного участка (ITS) проводили с помощью базы данных DDBJ/GenBank/EMBL. После этого была проанализирована филогенетическая взаимосвязь нуклеотидной последовательности 5.8S межгенного участка (ITS) среди описанного здесь выделенного грибного антагониста SGI-010-H11, микроорганизмов родов и видов, демонстрирующих высокие гомологии последовательностей с выделенным грибным антагонистом SGI-010-H11, и другими разнообразными родами и видами микроорганизмов с помощью программы ClustalW строительства филогенетического дерева. Грибной штамм SGI-010-H11 считается родственным семейству Mycosphaerellaceae, если судить по ~97% сходству его последовательности ITS-5.8S рДНК с таковой у Mycosphaerellapunctiformis (GenBank EU343182) и Ramulariapratensis (GenBank EUO19284), 5.8S ITS последовательности которых демонстрируют явное родство с Mycosphaerellaceae. [0117] For amplification of the ITS-5.8S rDNA region, each PCR mixture was prepared in a 20 μl final volume reaction mixture containing 4 μl from the fungal lysis reaction mixture, 0.2 μM of each primer (ITS1/ITS4), 6% Tween-20 and 10 µl 2x ImmoMix (Bioline USA Inc, Taunton, MA). PCR was performed under the following conditions: 94°C for 10 minutes; 94°C for 30 seconds, 52°C for 30 seconds, 72°C for 75 seconds for 30 cycles; 72°C for 10 minutes. A 2 µl aliquot of the PCR product was placed on a 1.0% agarose gel to confirm a single band of the expected size. Positive bands were sent for forward and reverse Sanger sequencing using M13 primers. The sequence of the 5.8S intergenic region (ITS) of fungal strain SGI-010-H11 is shown in the Sequence Listing under SEQ ID NO: 11. Homology studies for a specific nucleotide sequence of the 5.8S intergenic region (ITS) were performed using the DDBJ/GenBank/EMBL database. . After that, the phylogenetic relationship of the nucleotide sequence of the 5.8S intergenetic region (ITS) was analyzed among the isolated fungal antagonist SGI-010-H11 described here, microorganisms of genera and species showing high sequence homologies with the isolated fungal antagonist SGI-010-H11, and other diverse genera. and microbial species using the ClustalW program for building a phylogenetic tree. The fungal strain SGI-010-H11 is considered to be related to the family Mycosphaerellaceae , based on ~97% similarity of its ITS-5.8S rDNA sequence with that of Mycosphaerellapunctiformis (GenBank EU343182) and Ramulariapratensis (GenBank EUO19284), whose 5.8S ITS sequences show a clear relationship with Mycosphaerellaceae.
Лизис бактериальных клеток и получение информации о последовательности 16S рРНКLysis of bacterial cells and obtaining information about the 16S rRNA sequence
[0118] 20 мкл аликвоту клеточной суспензия перенесли на 96-луночный ПЦР планшет, содержащей 20 мкл 2х буфера для лизиса (100 мM Tris HCL, pH 8,0,2 мM EDTA, pH 8,0,1% SDS, 400 мкг/мл Протеиназы K). Лизис проводили в следующих условиях: 55°C в течение 30 минут, 94°C в течение 4 минут. Аликвоту лизисного продукта использовали в качестве источника матричной ДНК для ПЦР амплификации. Последовательность 16S рРНК амплифицировали с помощью ПЦР реакции с праймерами M13-27F (SEQ ID NO: 17) и 1492R M13-хвост (SEQ ID NO: 18).[0118] A 20 µl aliquot of the cell suspension was transferred to a 96-well PCR plate containing 20 µl of 2x lysis buffer (100 mM Tris HCL, pH 8.0.2 mM EDTA, pH 8.0.1% SDS, 400 µg/ ml Proteinase K). The lysis was carried out under the following conditions: 55°C for 30 minutes, 94°C for 4 minutes. An aliquot of the lysis product was used as a source of template DNA for PCR amplification. The 16S rRNA sequence was amplified by PCR reaction with primers M13-27F (SEQ ID NO: 17) and 1492R M13 tail (SEQ ID NO: 18).
[0119] Для амплификации участка 16S рРНК каждую ПЦР смесь готовили в реакционной смеси с конечным объемом 20 мкл, содержащей 4 мкл из реакционной смеси бактериального лизиса, 2 мкM каждого праймера (27F/1492R), 6% Tween-20 и 10 мкл 2x ImmoMix (Bioline USA Inc, Taunton, MA). ПЦР реакцию проводили в следующих условиях: 94°C в течение 10 минут; 94°C в течение 30 секунд, 52°C в течение 30 секунд, 72°C в течение 75 секунд в течение 30 циклов; 72°C в течение 10 минут. 2-мкл аликвоту ПЦР продукта поместили на 1,0% агарозный гель для подтверждения одиночной полосы ожидаемого размера. Положительные полосы направляли на секвенирование по Сэнгеру в прямом и обратном направлениях с Ml3 праймерами. Последовательности 16S рРНК бактериальных штаммов SGI-014-C06, SG1-005-G08, SGI-014-G01, SGI-015-F03 и SGI-015-H06 имели длину приблизительно 1,4 Kb и представлены в Перечне последовательностей под номерами SEQ ID NO: 1, 10, 12, 13 и 14, соответственно. Исследование гомологии для определенных нуклеотидных последовательностей проводили с помощью базы данных DDBJ/GenBank/EMBL. После этого анализировали филогенетическую взаимосвязь нуклеотидной последовательности 16 рРНК генов среди описанных здесь выделенных бактериальных антагонистов, бактерий родов и видов, проявляющих высокие гомологии последовательностей с выделенными бактериальными антагонистами, и других разнообразных бактериальных родов и видов с помощью программы ClustalW строительства филогенетического дерева. Идентичность последовательностей и сходство определяли также с помощью программы GenomeQuest™ (Gene-IT, Worcester Mass. USA). Результаты анализа последовательностей показали, что бактериальный изолят SGI-014-G01 может считаться родственным роду Variovorax на основании ~99% сходства его 16S рРНК последовательности с таковыми у нескольких видов Variovorax, включая Variovorax. R-21938 (GenBank AJ786799) и Variovoraxparadoxus (GenBank GUI 86109), 16S рРНК последовательности которых демонстрируют явную родственность с видом Variovorax. Кроме того, результаты анализа последовательностей показали, что два бактериальных изолята SGI-015-F03 и SGI-015-H06 могут считаться родственными семейству Bacillaceae на основании >99% сходства их соответствующих 16S последовательностей таковым у нескольких видов Bacillus.[0119] For amplification of the 16S rRNA region, each PCR mixture was prepared in a reaction mix with a final volume of 20 µl containing 4 µl of the bacterial lysis reaction mixture, 2 µl of each primer (27F/1492R), 6% Tween-20 and 10 µl of 2x ImmoMix (Bioline USA Inc, Taunton, MA). PCR reaction was carried out under the following conditions: 94°C for 10 minutes; 94°C for 30 seconds, 52°C for 30 seconds, 72°C for 75 seconds for 30 cycles; 72°C for 10 minutes. A 2 µl aliquot of the PCR product was placed on a 1.0% agarose gel to confirm a single band of the expected size. Positive bands were sent for forward and reverse Sanger sequencing with Ml3 primers. The 16S rRNA sequences of bacterial strains SGI-014-C06, SG1-005-G08, SGI-014-G01, SGI-015-F03, and SGI-015-H06 were approximately 1.4 Kb in length and are listed in the Sequence Listing under SEQ ID numbers NO: 1, 10, 12, 13 and 14, respectively. Homology studies for certain nucleotide sequences were performed using the DDBJ/GenBank/EMBL database. After that, the phylogenetic relationship of the nucleotide sequence of the 16 rRNA genes among the isolated bacterial antagonists described here, bacteria genera and species showing high sequence homology with the isolated bacterial antagonists, and other diverse bacterial genera and species was analyzed using the ClustalW phylogenetic tree construction program. Sequence identity and similarity were also determined using the GenomeQuest™ program (Gene-IT, Worcester Mass. USA). Sequence analysis results indicated that the bacterial isolate SGI-014-G01 could be considered related to the genus Variovorax based on ~99% similarity of its 16S rRNA sequence to those of several Variovorax species, including Variovorax . R-21938 (GenBank AJ786799) and Variovoraxparadoxus (GenBank GUI 86109), whose 16S rRNA sequences show a clear relationship to the Variovorax species. In addition, sequence analysis results indicated that the two bacterial isolates SGI-015-F03 and SGI-015-H06 can be considered related to the Bacillaceae family based on >99% similarity of their respective 16S sequences to those of several Bacillus species.
[0120] Результаты анализа последовательностей показали, что два бактериальных изолята SGI-014-C06 и SGI-055-G08 могут считаться родственными семейству Microbacteriaceae на основании >99% сходства их соответствующих 16S последовательностей таковым у нескольких видов Microbacterium. А именно, 1430 нт последовательность 16S рРНК гена SGI-014-C06 (SEQ ID NO: 1) является идентичной 16S рРНК гена штамма DSM 20578 Microbacterium oxydans и нескольких других штаммов Microbacterium (например, последовательностям Y17227.1, FJ200406, EU086800 и EU714335 из GenBank) на всей 1430 нт длине.[0120] The results of sequence analysis showed that the two bacterial isolates SGI-014-C06 and SGI-055-G08 can be considered related to the family Microbacteriaceae based on >99% similarity of their respective 16S sequences to those of several Microbacterium species. Namely, the 1430 nt 16S rRNA sequence of the SGI-014-C06 gene (SEQ ID NO: 1) is identical to the 16S rRNA gene of Microbacterium oxydans strain DSM 20578 and several other strains of Microbacterium (e.g. sequences Y17227.1, FJ200406, EU086800 and EU714335 from GenBank) over the entire 1430 nt length.
[0121] В частности, среди тысяч микробных штаммов, которые были выделены и протестированы на способность подавлять развитие Fusarium в анализе на антагонизм, как описано в Примере 1, восемьдесят восемь штаммов были вслед за этим идентифицированы как вид Microbacterium на основании подобия их 16S последовательностей таковым у известных видов Microbacterium. Однако, авторами было установлено, что супрессорной активностью против Fusarium graminearum обладали только два штамма - SGI-014-C06 и SGI-055-G08 Microbacterium. Как указывалось выше, на сегодняшний день сообщалось о нескольких микробах природного происхождения, обладающих антагонистической активностью против фузариоза. Однако до настоящего изобретения не было сообщений о микроорганизме рода Mycobacterium, обладающем антагонистической активностью. Кроме того, до настоящего изобретения его авторам не были известны способы или процессы, в которых бы использовался бактериальный штамм рода Mycobacterium в качестве агента биоборьбы по предотвращению, ингибированию или лечебной обработке по отношению к развитию патогена, являющегося возбудителем фузариоза.[0121] In particular, among the thousands of microbial strains that were isolated and tested for their ability to inhibit the development of Fusarium in the antagonism assay as described in Example 1, eighty-eight strains were thereafter identified as a species of Microbacterium based on the similarity of their 16S sequences to those in known Microbacterium species. However, the authors found that only two strains, SGI-014-C06 and SGI-055-G08 Microbacterium , had suppressive activity against Fusarium graminearum . As mentioned above, several microbes of natural origin have been reported to date with antagonistic activity against Fusarium. However, prior to the present invention, there have been no reports of a microorganism of the genus Mycobacterium having antagonistic activity. In addition, prior to the present invention, no method or process was known to the present inventors that utilizes a bacterial strain of the genus Mycobacterium as a biocontrol agent to prevent, inhibit, or treat the development of a Fusarium pathogen.
ПРИМЕР 3. Анализ последовательностей обязательных генов из изолята SGI-014-C06 EXAMPLE 3 Sequence Analysis of Mandatory Genes from Isolate SGI-014-C06
[0122] Недавно в работе (Richert et al. Syst. Appl. Microbiol. 30:102-108, 2007) сообщалось о филогенетических исследованиях нескольких обязательных генов из 27 видов рода Microbacterium. В этих исследованиях было сделано заключение, что хотя достоинства анализа 16S рРНК последовательностей для систематической таксономии являются непревзойденными, фокусирование внимания только на единственном таксономическом параметре не приведет к систематическим выводам. Как указывалось выше, нуклеотидная последовательность 16S рРНК гена штамма SGI-014-C06 (SEQ ID NO: 1) является идентичной 16S рРНК гена нескольких штаммов Microbacterium, включая нуклеотидную последовательность 16S рРНК гена штамма DSM 20578 Microbacterium oxydans, который был включен в исследования (Richert et al. (2007) (GenBank Accession Y17227.1)). Авторы изобретения распространили далее филогенетический анализ на четыре обязательные гена изолята SGI-014-C06, которыми являются субъединица B ДНК-гиразы (gyrB), субъединица B РНК-полимеразы (rpoE), рекомбиназа A (recA), и полифосфат-киназа (ppk). В направлении этого конца весь геном изолята SGI-014-C06 был секвенирован методом «шотган», собран и аннотирован в соответствии с методиками, описанными в (PCT Patent Application No. WO2010115156A2). Геномная ДНК была приготовлена из свежей культуры SGI-014-C06. Для экстрагирования высокомолекулярной ДНК использовались клеточная гранула и комплект для выделения ДНК UltraClean® Mega Soil DNA Isolation Kit (Cat. No 12900-10), выпускаемый MO BIO Laboratories, Inc., согласно протоколу, рекомендованному изготовителем. После этого была приготовлена геномная ДНК из SGI-014-C06 для «шотган» 454-пиросеквенирования. Геномная ДНК (7,5 мкг) использовалась для конструирования библиотеки в соответствии с рекомендованным протоколом (454 Life Sciences) для одиночных длинных ридов. Последовательности были генерированы двумя последовательными проходами секвенирования GS FLX Titanium.[0122] Recently, (Richert et al. Syst. Appl. Microbiol. 30:102-108, 2007) reported phylogenetic studies of several mandatory genes from 27 species of the genus Microbacterium . These studies concluded that although the merits of 16S rRNA sequence analysis for systematic taxonomy are unsurpassed, focusing only on a single taxonomic parameter will not lead to systematic conclusions. As stated above, the nucleotide sequence of the 16S rRNA gene of strain SGI-014-C06 (SEQ ID NO: 1) is identical to the 16S rRNA gene of several Microbacterium strains, including the nucleotide sequence of the 16S rRNA gene of Microbacterium oxydans strain DSM 20578, which was included in the study (Richert et al (2007) (GenBank Accession Y17227.1)). The inventors further extended the phylogenetic analysis to the four mandatory genes of the SGI-014-C06 isolate, which are DNA gyrase B subunit ( gyrB) , RNA polymerase B subunit ( rpoE) , recombinase A ( recA) , and polyphosphate kinase ( ppk) . Towards this end, the entire genome of isolate SGI-014-C06 was shotgun sequenced, assembled and annotated according to the methods described in (PCT Patent Application No. WO2010115156A2). Genomic DNA was prepared from a fresh culture of SGI-014-C06. High molecular weight DNA was extracted using a cell bead and the UltraClean® Mega Soil DNA Isolation Kit (Cat. No. 12900-10) available from MO BIO Laboratories, Inc. according to the protocol recommended by the manufacturer. After that, genomic DNA was prepared from SGI-014-C06 for shotgun 454 pyrosequencing. Genomic DNA (7.5 µg) was used to construct the library according to the recommended protocol (454 Life Sciences) for single long reads. Sequences were generated by two consecutive GS FLX Titanium sequencing passes.
[0123] Получены последовательности четырех обязательных генов gyrB, rpoB, recA, andppk изолята SGI-014-C06, приведенные в Перечне последовательностей. Исследования гомологии для определенных нуклеотидных последовательностей проводились с помощью базы данных DDBJ/GenBank/EMBL. Идентичность последовательностей и сходство также определялись с помощью программы GenomeQuest™ (Gene-IT, Worcester Mass. USA). Ниже более подробно показано, что результат секвенирования обязательных генов выявил новизну описанного здесь изолята SGI-014-C06, который является новым бактериальным штаммом и может считаться родственным семейству Microbacteriaceae. [0123] The sequences of the four mandatory genes gyrB , rpoB , recA , andppk of the SGI-014-C06 isolate, shown in the Sequence Listing, have been obtained. Homology studies for certain nucleotide sequences were performed using the DDBJ/GenBank/EMBL database. Sequence identity and similarity were also determined using the GenomeQuest™ program (Gene-IT, Worcester Mass. USA). It is shown below in more detail that the result of binding gene sequencing revealed the novelty of the SGI-014-C06 isolate described here, which is a novel bacterial strain and can be considered related to the Microbacteriaceae family.
[0124] Полинуклеотидная последовательность гена gyrB штамма SGI-014-C06 имеет наибольшую идентичность с последовательностью гена gyrB штамма Microbacterium testaceum с номером доступа AP012052 в GenBank (82,69% по выравниванию 936/2172 нуклеотидов). По сравнению с геном gyrB штамма DSM 20578 Microbacterium oxydans (GenBank AMI 81493; Richert et al., 2007), гомологии последовательностей между этими двумя генами были на ~62% идентичными на нуклеотидном уровне и на ~37% идентичными на аминокислотном уровне.[0124] The polynucleotide sequence of the gyrB gene of strain SGI-014-C06 has the highest identity with the sequence of the gyrB gene of strain Microbacterium testaceum with accession number AP012052 in GenBank (82.69% by alignment of 936/2172 nucleotides). Compared to the gyrB gene of Microbacterium oxydans strain DSM 20578 (GenBank AMI 81493; Richert et al. , 2007), the sequence homologies between the two genes were ~62% identical at the nucleotide level and ~37% identical at the amino acid level.
[0125] Полинуклеотидная последовательность гена rpoB штамма SGI-014-C06 имеет наибольшую идентичность с последовательностью гена rpoB штамма Microbacterium maritypicum с номером доступа AM181582 в GeneBank (96,98% по выравниванию 1093/3504 нуклеотидов). По сравнению с геном rpoB штамма DSM 20578 Microbacterium oxydans (GenBank AM181583; Richert et al., 2007), гомологии последовательностей между этими двумя генами были на ~96% идентичными на нуклеотидном уровне и на 99% идентичными на аминокислотном уровне.[0125] The polynucleotide sequence of the rpoB gene of strain SGI-014-C06 has the highest identity with the rpoB gene sequence of the Microbacterium maritypicum strain accession number AM181582 in GeneBank (96.98% by alignment of 1093/3504 nucleotides). Compared to the rpoB gene of Microbacterium oxydans strain DSM 20578 (GenBank AM181583; Richert et al. , 2007), the sequence homologies between the two genes were ~96% identical at the nucleotide level and 99% identical at the amino acid level.
[0126] Полинуклеотидная последовательность гена recA штамма SGI-014-C06 имеет наибольшую идентичность с последовательностью гена recA штамма Microbacterium testaceum с номером доступа AP012052 в GeneBank (85,45% по выравниванию 962/1188 нуклеотидов). По сравнению с геном recA штамма DSM 20578 Microbacterium oxydans (GenBank AMI 81527; Richert et al., 2007), гомологии последовательностей между этими двумя генами были на ~92% идентичными на нуклеотидном уровне и на 100% идентичными на аминокислотном уровне.[0126] The polynucleotide sequence of the recA gene of strain SGI-014-C06 has the highest identity with the sequence of the recA gene of strain Microbacterium testaceum accession number AP012052 in GeneBank (85.45% in alignment of 962/1188 nucleotides). Compared to the recA gene of Microbacterium oxydans strain DSM 20578 (GenBank AMI 81527; Richert et al. , 2007), the sequence homologies between the two genes were ~92% identical at the nucleotide level and 100% identical at the amino acid level.
[0127] Полинуклеотидная последовательность гена ppk штамма SGI-014-C06 имеет наибольшую идентичность с последовательностью гена ppk штамма Microbacterium luteolum с номером доступа AM181554 в GenBank (91,38% по выравниванию 1380/2175 нуклеотидов). По сравнению с геном ppk штамма DSM 20578 Microbacterium oxydans (GenBank AMI 81556; Richert et al., 2007), гомологии последовательностей между этими двумя генами были на ~91% идентичными на нуклеотидном уровне и на ~98% идентичными на аминокислотном уровне.[0127] The polynucleotide sequence of the ppk gene of strain SGI-014-C06 has the highest identity with the sequence of the ppk gene of strain Microbacterium luteolum with accession number AM181554 in GenBank (91.38% by alignment of 1380/2175 nucleotides). Compared to the ppk gene of Microbacterium oxydans strain DSM 20578 (GenBank AMI 81556; Richert et al. , 2007), the sequence homologies between the two genes were ~91% identical at the nucleotide level and ~98% identical at the amino acid level.
ПРИМЕР 4. Защита пшеницы от инфекции Fusarium graminearum с помощью микробных антагонистов Microbacterium . (NRRL B-50470) Mycophaerella . fNRRL 50471) и Variovorax . (NRRL B-50469) EXAMPLE 4 Protection of Wheat from Fusarium graminearum Infection with Microbacterium.beta . Microbial Antagonists . (NRRL B-50470) Mycophaerella . fNRRL 50471) and Variovorax . (NRRL B-50469)
[0128] Описанные в Примере 1 микробные штаммы, продемонстрировавшие положительную пробу на антибиоз в скрининге по антагонизму, далее были подвергнуты биоиспытаниям на растениях, в которых клетки микробных штаммов наносились непосредственно на семена восприимчивого зернового культивара с последующей инокуляцией конидиальными спорами гриба F. graminearum. Микробные штаммы выращивались до достаточной мутности и разбавлялись в воде. Два грамма семян пшеницы восприимчивого сорта (Hank; WestBred LLC, Bozeman, MT) высеивали в однолитровые горшки с пастеризованной почвенной средой. После высеивания, поверх семян распределяли 20 мл раствора микробной культуры. Семена пшеницы выдерживали в тепличных условиях для проращивания под флуоресцентным освещением в течение 14 ч фотопериода. В начале цветения колос пшеницы подвергали заражению путем распыления конидиальных спор NRRL 5883 F. graminearum. Конидиальные споры собирали с ПДА планшетов пятидневного возраста путем выливания на планшеты воды с 0,01% Tween 20 и соскабливания спор в суспензию. После распыления спор пшеничные растения переносили в туманную камеру с 100% влажностью и выдерживали в ней в течение трех дней для инфицирования. Таким образом готовили следующие образцы:[0128] The microbial strains described in Example 1 that showed a positive antibiosis test in an antagonism screen were further subjected to plant bioassays in which cells of the microbial strains were applied directly to the seeds of a susceptible cereal cultivar followed by inoculation with conidial spores of the fungus F. graminearum . Microbial strains were grown to sufficient turbidity and diluted in water. Two grams of susceptible wheat seeds (Hank; WestBred LLC, Bozeman, MT) were sown in one liter pots of pasteurized soil medium. After sowing, 20 ml of microbial culture solution was spread over the seeds. Wheat seeds were kept under greenhouse conditions for germination under fluorescent lighting for a 14 h photoperiod. At the beginning of flowering, the ear of wheat was infected by spraying conidial spores NRRL 5883 F. graminearum. Conidial spores were harvested from five day old PDA plates by pouring 0.01% Tween 20 water onto the plates and scraping the spores into the suspension. After spraying the spores, the wheat plants were transferred to a fog chamber with 100% humidity and kept there for three days for infection. Thus, the following samples were prepared:
[0129] 1. Необработанные образцы: без обработки микробным или химическим фунгицидом + заражение Fusarium.[0129] 1. Untreated samples: no microbial or chemical fungicide treatment + Fusarium infestation.
[0130] 2. Неинфицированные образцы: без обработки микробным или химическим фунгицидом, без заражения Fusarium.[0130] 2. Uninfected specimens: no microbial or chemical fungicide treatment, no Fusarium infestation.
[0131] 3. SGI-010-H11: грибная обработка + заражение Fusarium.[0131] 3. SGI-010-H11: mushroom treatment + Fusarium challenge.
[0132] 4. SGI-014-GO1: бактериальная обработка + заражение Fusarium.[0132] 4. SGI-014-GO1: bacterial treatment + Fusarium challenge.
[0133] 5. SGI-014-C06: бактериальная обработка + заражение Fusarium.[0133] 5. SGI-014-C06: bacterial treatment + Fusarium challenge.
[0134] Через двадцать дней после инфицирования орошение прекращали, и пшеничным растениям давали высохнуть в течение трех недель перед сбором урожая. Затем каждый колос пшеницы срезали и собирали индивидуально. Тяжесть болезни определяли для каждого колоса, имевшего симптомы фузариоза. Численно тяжесть болезни определяли путем деления числа пораженных колосков на общее число колосков, приходившееся на один колос. Полученные результаты (таблица 2) показали, что пшеница, обработанная любым из трех микробных антагонистов SGI-014-C06 (NRRL B-50470), SGI-010-H11 (NRRL 50471) и SGI-014-G01 (NRRL B-50469), имела значительно меньшие тяжесть болезни и количество заражений Fusarium graminearum, чем «необработанный» контроль, выращиваемый в тех же самых условиях (P<0,05).[0134] Twenty days after infection, irrigation was stopped and the wheat plants were allowed to dry for three weeks before harvest. Each ear of wheat was then cut and harvested individually. The severity of the disease was determined for each ear that had symptoms of Fusarium. The severity of the disease was numerically determined by dividing the number of affected spikelets by the total number of spikelets per spike. The results (Table 2) showed that wheat treated with any of the three microbial antagonists SGI-014-C06 (NRRL B-50470), SGI-010-H11 (NRRL 50471), and SGI-014-G01 (NRRL B-50469) , had significantly lower disease severity and Fusarium graminearum infestations than untreated controls grown under the same conditions (P<0.05).
[0135] Семена с каждого колоса собирали вручную и взвешивали. Определяли средний вес семян на горшок и в каждом режиме обработки. Как показано в таблице 3, все микробные антагонисты дали значительное снижение потерь урожая, обусловленных инфицированием фузариозом.[0135] Seeds from each ear were collected by hand and weighed. The average weight of seeds per pot and in each treatment mode was determined. As shown in Table 3, all microbial antagonists produced a significant reduction in crop losses due to Fusarium infection.
Эффективность микробных антагонистов в снижении количества заболеваний пшеницы фузариозомtable 2
Efficiency of microbial antagonists in reducing the incidence of Fusarium disease in wheat
Эффективность микробных антагонистов в сохранении выхода семян в пшенице, зараженной фузариозомTable 3
Efficacy of microbial antagonists in maintaining seed yield in Fusarium-infected wheat
ПРИМЕР 5. Ингибирование роста Fusarium graminearum микробными антагонистами на сеянцах пшеницы EXAMPLE 5.growth inhibition Fusarium graminearum microbial antagonists on wheat seedlings
[0136] Микробные штаммы, продемонстрировавшие супрессорную активность против F. graminearum в лабораторном тесте на антагонизм, были исследованы также на их способность снижать заболеваемость фузариозом семян пшеницы. Семена восприимчивого сорта пшеницы (Hank; WestBred LLC, Bozeman, MT) высеивали в 1-литровые пластмассовые горшки диметром 20 см с пастеризованной почвенной средой. Микробные клеточные суспензии готовили следующим образом. 2YT или другую подобную питательную среду инокулировали бульонными культурами из матричных глицериновых растворов изолятов или штриховых планшетов. Как правило, культуры инициировались за 48-72 ч до помещения их в камеру для культивирования, теплицу или на поле, где они достигали поздней экспоненциальной фазы роста. Изоляты с более длительным временем удвоения инициировались, кроме того, заранее. Культуры инкубировали при 30°C на роторном шейкере при 200 об./мин. После культивирования клетки формировались в гранулы 10000×г в течение 15 мин. при 4°C и ресуспендировались в 10 мM MgSO4 буфере (pH 7,0). Плотность клеток нормировали для каждого изолята в единицах КОЕ/мл (клеткообразующих единицах на миллилитр). Как правило, готовили ~109 КОЕ/мл суспензии для каждого изолята, которую доставляли к месту инокуляция на льду. Инокуляцию проводили путем разбавления этих клеточных суспензий в отношении 1/20 в ирригационной воде до конечной плотности 5×107 КОЕ/мл. Для опытов в 1 литровых горшках 20 мл этой разбавленной клеточной суспензии равномерно распределяли по культивационной поверхности каждого горшка. Для экспериментов в микрогоршках клеточные суспензии не разбавлялись, и 1 мл каждой 109 КОЕ/мл суспензии помещали пипеткой на культивационную поверхность каждого горшка подобно опрыскиванию по верху погруженных семян. Семена и растения выдерживались в теплице при комнатной температуре с 14-ти часовым фотопериодом освещения.[0136] Microbial strains that demonstrated suppressor activity against F. graminearum in a laboratory antagonism test were also investigated for their ability to reduce the incidence of Fusarium seed blight in wheat. Seeds of a susceptible wheat variety (Hank; WestBred LLC, Bozeman, MT) were sown in 1 liter 20 cm diameter plastic pots with pasteurized soil medium. Microbial cell suspensions were prepared as follows. 2YT or other similar nutrient medium was inoculated with broth cultures from glycerol matrix solutions of isolates or streak plates. Typically, cultures were initiated 48-72 hours prior to placing them in a culture chamber, greenhouse, or field, where they reached the late exponential growth phase. Isolates with longer doubling times were also initiated in advance. Cultures were incubated at 30°C on a rotary shaker at 200 rpm. After culturing, the cells were formed into 10,000×g granules for 15 min. at 4°C and resuspended in 10 mm MgSO 4 buffer (pH 7.0). Cell density was normalized for each isolate in units of CFU/mL (cell-forming units per milliliter). As a rule, ~10 9 cfu/ml suspension was prepared for each isolate, which was delivered to the inoculation site on ice. Inoculation was carried out by diluting these cell suspensions 1/20 in irrigation water to a final density of 5×10 7 cfu/ml. For experiments in 1 liter pots, 20 ml of this diluted cell suspension was evenly distributed over the cultivation surface of each pot. For the micropot experiments, the cell suspensions were not diluted and 1 ml of each 10 9 cfu/ml suspension was pipetted onto the cultivation surface of each pot like a spray over the top of submerged seeds. Seeds and plants were kept in a greenhouse at room temperature with a 14-hour light photoperiod.
[0137] Мицелий штамма NRRL-5883 вида Fusarium graminearum выращивали на ПДА планшетах в течение 5 дней при непрерывном освещении. Гифы и конидии собирали путем выливания нескольких миллилитров стерильной воды (0,01% Tween 20) на планшеты и соскабливания поверхности агара стерильным шпателем. Концентрация спор в инокуляте составляла приблизительно 2×105 спор/мл, однако концентрация гифального фрагмента не определялась.[0137] Fusarium graminearum strain NRRL-5883 mycelium was grown on PDA plates for 5 days under continuous illumination. Hyphae and conidia were harvested by pouring a few milliliters of sterile water (0.01% Tween 20) onto the plates and scraping the surface of the agar with a sterile spatula. The spore concentration in the inoculum was approximately 2×10 5 spores/ml, however, the concentration of the hyphal fragment was not determined.
[0138] Инокуляцию видом F. graminearum начинали после выхода коротких ростков из семян и повторяли каждый второй вечер на протяжении 10 дней. Инокулят F. graminearum наносили путем разбрызгивания в количестве приблизительно 30 мл на горшок. Сразу после инокуляции, всякий раз растения опрыскивали сверху с помощью туманообразователя. При использовании химического фунгицида его готовили путем разбавления 2 мл фунгицидного исходного раствора (Banner Maxx, Syngenta) в 1 л дистиллированной воды и наносили с помощью разбрызгивателя в количестве приблизительно 30 мл на горшок.[0138] Inoculation with the F. graminearum species was started after the emergence of short shoots from the seeds and was repeated every other evening for 10 days. The F. graminearum inoculum was applied by spraying in an amount of approximately 30 ml per pot. Immediately after inoculation, each time the plants were sprayed from above with a fogger. When using a chemical fungicide, it was prepared by diluting 2 ml of a fungicide stock solution (Banner Maxx, Syngenta) in 1 L of distilled water and applied with a sprayer in an amount of approximately 30 ml per pot.
[0139] Фузариозное поражение оценивали по степени Fusarium инфицирования, определяя ее числом Fusarium колониеобразующих единиц на грамм (КОЕ/г) растительных тканей. Все операции обработки выполнялись в четырех блоках по четыре горшка в каждом. Проводились следующие виды обработки:[0139] Fusarium damage was assessed by the degree of Fusarium infection, determining it by the number of Fusarium colony forming units per gram (CFU/g) of plant tissues. All processing operations were performed in four blocks of four pots each. The following types of processing were carried out:
[0140] 1. Необработанный: без обработки микробным или химическим фунгицидом + заражение Fusarium.[0140] 1. Untreated: no microbial or chemical fungicide treatment + Fusarium infestation.
[0141] 2. Неинфицированный: без обработки микробным или химическим фунгицидом и без заражения Fusarium.[0141] 2. Uninfected: no microbial or chemical fungicide treatment and no Fusarium infestation.
[0142] 3. Фунгицид: обработка химическим фунгицидом + заражение Fusarium.[0142] 3. Fungicide: chemical fungicide treatment + Fusarium infection.
[0143] 4. SGI-010-H11: грибная обработка + заражение Fusarium.[0143] 4. SGI-010-H11: fungal treatment + Fusarium challenge.
[0144] 5. SGI-014-G01: бактериальная обработка + заражение Fusarium.[0144] 5. SGI-014-G01: bacterial treatment + Fusarium challenge.
[0145] 6. SGI-014-C06: бактериальная обработка + заражение Fusarium.[0145] 6. SGI-014-C06: bacterial treatment + Fusarium challenge.
[0146] Полученные результаты, которые приведены в таблице 4, показали, что все три микробные обработки дали значительное снижение тяжести фузариоза по сравнению с неинфицированным контролем. В частности, два микробных антагониста, SGI-014-C06 и SGI-010-H11, значительно снизили инфицирование пшеницы видом Fusarium graminearum по сравнению с необработанным контролем, выращиваемым в таких же самых условиях. Защита пшеницы от Fusarium-инфицирования, осуществляемая любым из двух микроорганизмов - SGI-014-C06 или SGI-010-H11, была статистически сравнимой с защитой продажным химическим фунгицидом. При использовании микроорганизма SGI-014-G01 наблюдаемая защита пшеницы от Fusarium-инфицирования была намного менее заметной, а ее эффективность существенно изменялась от одного культивационного горшка к другому.[0146] the Results, which are shown in table 4, showed that all three microbial treatments gave a significant reduction in the severity of fusarium compared with uninfected control. In particular, two microbial antagonists, SGI-014-C06 and SGI-010-H11, significantly reduced Fusarium graminearum infection in wheat compared to an untreated control grown under the same conditions. Protection of wheat against Fusarium infection by either of the two microorganisms, SGI-014-C06 or SGI-010-H11, was statistically comparable to that of a commercial chemical fungicide. When using the microorganism SGI-014-G01, the observed protection of wheat against Fusarium infection was much less noticeable, and its effectiveness varied significantly from one cultivation pot to another.
Действие микробных антагонистов на инфицирование грибом Fusarium Table 4
Effect of microbial antagonists on Fusarium infection
ПРИМЕР 6. Культивирование и хранение микробных антагонистов EXAMPLE 6 Cultivation and storage of microbial antagonists
[0147] Вид Mycosphaerella. Для хранения выделенного гриба в качестве чистой культуры использовали несколько способов, в одном из которых применяли фильтровальную бумагу. В другом случае, после культивирования гриба на ПДА его разрезали на маленькие квадраты, которые помещали во флакончики с 15% раствором глицерола и сохраняли в них при -70°C. В аналогичном опыте этот гриб хранили при 4°C, но не в глицероле, а в дистиллированной воде. Однако одним из предпочтительных способов было хранение на инфицированных стерильных семенах ячменя при -80°C.[0147] Species Mycosphaerella . Several methods were used to store the isolated fungus as a pure culture, one of which used filter paper. In another case, after cultivation of the fungus on PDA, it was cut into small squares, which were placed in vials with 15% glycerol solution and stored at -70°C. In a similar experiment, this fungus was stored at 4°C, but not in glycerol, but in distilled water. However, one of the preferred methods was storage on infected sterile barley seeds at -80°C.
[0148] Виды Bacillus, Microbacterium и Variovorax. Выделенные бактерии сохранялись как чистая культура. Бактериальную колонию переносили в флакончик с жидкой бульонной средой R2A (Tecknova) и культивировали в нем при 30°C на шейкере при скорости 250 об./мин. в течение двух дней. После этого культуру переносили во флакончики с 15% раствором глицерола и сохраняли в них при -80°C.[0148] Bacillus , Microbacterium and Variovorax species . The isolated bacteria were kept as a pure culture. The bacterial colony was transferred into a vial with R2A liquid broth medium (Tecknova) and cultured there at 30°C on a shaker at 250 rpm. during two days. After that, the culture was transferred into vials with 15% glycerol solution and kept in them at -80°C.
ПРИМЕР 7. Обработка для продуцирования спор и нанесения покрытия на семена EXAMPLE 7 Treatment for Spore Production and Seed Coating
[0149] Продуцирование спор. В соответствии с типовой методикой продуцирования спор, один литр питательной среды 2xYT (16 г/л триптона, 10 г/л дрожжевого экстракта, 5 г/л NaCl) инокулировали стартерной культурой в количестве 5 мл или соскобом чашки Петри и инкубировали в течение ночи при 30°C в ротационном шейкере со скоростью 225 об./мин. Бактериальные клетки гранулировали путем центрифугирования и промывали 1x ЗФР буфером (8 г/л NaCl; 0,2 г/л KC1; 1,44 г/л Na2HPO4; 0,24 г KH2PO4; pH 7,4). Клетки ресуспендировали в среде CDSM (Hageman et al, J. Bacterial., 438-441, 1984), и культивировали еще в течение четырех ночей при 30°C в ротационном шейкере. Споруляцию в бактериальной культуре контролировали ежедневно с помощью фазоконтрастного микроскопа до тех пор, пока не образовалась вся культура из свободно плавающих спор. Продолжительность такого инкубирования, как правило, не превышает четырех дней или же длится более шести дней, в зависимости от культивируемого вида. Под фазоконтрастным микроскопом эндоспоры видны внутри клеток в виде ярко-белых сплющенных сфероидов. Бактериальные споры гранулировали путем центрифугирования в режиме 10000 X г в течение 15 минут, дважды промывали стерильной dH2О и, при необходимости, концентрировали до 50 мл, и могли либо сразу использоваться, либо охлаждаться для использования в будущем. Концентрацию спор измеряли по методике OD600. Эта методика, как правило, давала по меньшей мере 2000 OD бактериальных спор.[0149] Spore production . Following a typical spore production protocol, one liter of 2xYT culture medium (16 g/L tryptone, 10 g/L yeast extract, 5 g/L NaCl) was inoculated with 5 ml of starter culture or scraping from a Petri dish and incubated overnight at 30°C in a rotary shaker at 225 rpm. Bacterial cells were pelleted by centrifugation and washed with 1x PBS buffer (8 g/l NaCl; 0.2 g/l KC1; 1.44 g/l Na 2 HPO 4 ; 0.24 g KH 2 PO 4 ; pH 7.4) . Cells were resuspended in CDSM medium (Hageman et al , J. Bacterial. , 438-441, 1984) and cultured for an additional four nights at 30° C. in a rotary shaker. Sporulation in the bacterial culture was monitored daily using a phase contrast microscope until the entire culture was formed from free floating spores. The duration of such incubation usually does not exceed four days or lasts more than six days, depending on the cultivated species. Under a phase-contrast microscope, endospores are visible inside cells as bright white, flattened spheroids. Bacterial spores were granulated by centrifugation at 10,000 X g for 15 minutes, washed twice with sterile dH 2 O and, if necessary, concentrated to 50 ml, and could either be used immediately or refrigerated for future use. Spore concentration was measured by the OD 600 method. This technique typically produced at least 2000 OD of bacterial spores.
[0150] В частности, несколько бактериальных штаммов в соответствии с изобретением, например, SGI-015-F03 вида Bacillus, могут продуцировать большие количества спор после 4 дней инкубации с простой инокуляцией большой, росшей в течение ночи стартерной культурой (~15 мл) в 1 л 2хSG питательной среды с последующей 4-дневной инкубацией при соответствующей температуре в ротационном шейкере в режиме 225 об./мин. Использовалась питательная среда 2хSG следующего состава: 16 г/л питательный бульон; 0,25 г/л MgSO4; 2,0 г/л KCl; 0,15 г/л CaCl2.2H2O; 0,025 г/л MnCl2.2H2O; 0,28 мг/л FeSO4-7H2O; 1,0 г/л декстрозы.[0150] In particular, several bacterial strains in accordance with the invention, for example, SGI-015-F03 of the Bacillus species, can produce large numbers of spores after 4 days of incubation with a simple inoculation of a large overnight growing starter culture (~15 ml) in 1 liter of 2xSG culture medium followed by 4 days of incubation at the appropriate temperature in a rotary shaker at 225 rpm. The nutrient medium 2xSG of the following composition was used: 16 g/l nutrient broth; 0.25 g/l MgSO 4 ; 2.0 g/l KCl; 0.15 g/l CaCl 2 .2H 2 O; 0.025 g/l MnCl 2 .2H 2 O; 0.28 mg/l FeSO 4 -7H 2 O; 1.0 g/l dextrose.
[0151] Нанесение покрытия на семена пшеницы и кукурузы. Проводили маломасштабный эксперимент по обработке семян в соответствии с минимально модифицированной методикой, описанной в (Sudisha et al., 2009). Как правило, готовили маточный раствор биополимера путем добавления 6 г порошка гуммиарабика (MP Biomedical) в 36 мл воды в 50 мл пробирке Falcon и последующего перемешивания до гомогенности с помощью колесного миксера. Для перемешивания больших количеств покрываемых семян, где необходимо, использовали смесительную плиту.[0151] Coating of wheat and corn seeds. A small scale seed treatment experiment was carried out according to the minimally modified procedure described in (Sudisha et al. , 2009). Typically, a biopolymer stock solution was prepared by adding 6 g of gum arabic powder (MP Biomedical) to 36 ml of water in a 50 ml Falcon tube and then mixing until homogeneous using a wheeled mixer. A mixing plate was used to mix large quantities of coated seeds where necessary.
[0152] Если использовали растительные клетки, то мутные культуры активно растущих микробных клеток промывали ЗФР (забуференным фосфатом физиологическим раствором) и доводили до OD600~5,0. В альтернативном варианте микробные споровые суспензии готовили так, как описано выше. Бактериальные споры и/или растительные клетки тщательно ресуспендировали в ~32 мл гуммиарабик-биoполимерного маточного раствора, приготовленного так, как описано выше, и полученную суспензию тщательно перемешивали в 1 л бутыли. В бутыль добавляли приблизительно 400 г семян (пшеницы или кукурузы) и интенсивно перемешивали на шейкере или вихревом встряхивателе до достижения равномерного распределения гумми/клеточной суспензии. Затем покрытые семена распределяли по пластмассовым блюдцам для сушки в ламинарном потоке до устранения липкости, в общем случае в течение 3-6 ч с периодическим перемешиванием. В некоторых случаях, покрытые спорами семена можно сушить в течение ночи. Однако, семена, покрытые растительными культурами, как правило, отправлялись на хранение до того, как они полностью обезвоживались. Тест на жизнеспособность, которому периодически подвергались микробы, используемые в препаратах покрытий на семенах, показал, что эти микробы сохраняли жизнеспособность в течение по меньшей мере трех месяцев. Скорость прорастания покрытых семян была практически идентичной таковой у непокрытых контрольных семян.[0152] If plant cells were used, then cloudy cultures of actively growing microbial cells were washed with PBS (phosphate buffered saline) and adjusted to OD 600 ~5.0. Alternatively, microbial spore suspensions were prepared as described above. Bacterial spores and/or plant cells were thoroughly resuspended in ~32 ml of gum arabic-biopolymer stock solution prepared as described above, and the resulting suspension was thoroughly mixed in a 1 liter bottle. Approximately 400 g of seeds (wheat or corn) were added to the bottle and mixed vigorously on a shaker or vortex shaker until a uniform distribution of the gum/cell suspension was achieved. The coated seeds were then spread over plastic trays for laminar flow drying until detackified, generally for 3-6 hours with occasional agitation. In some cases, spore-covered seeds can be dried overnight. However, crop-covered seeds were generally stored before they were completely dehydrated. A viability test periodically subjected to microbes used in seed coating preparations showed that these microbes remained viable for at least three months. The germination rate of coated seeds was almost identical to that of uncoated control seeds.
ПРИМЕР 8. Влияние микробной обработки семян на развитие фузариоза в пшенице EXAMPLE 8. Effect of microbial seed treatment on the development of Fusarium in wheat
[0153] Семена восприимчивого к фузариозу сорта (RB07) пшеницы покрывались микроорганизмами SGI-014-C06 или SGI-015-F03, или SGI-015-H06 в соответствии с методикой, описанной в Примере 8. Покрытые семена высевали в 1 л горшки с пастеризованной почвенной средой [(Metromix-Mix 200; Scotts-Sierra Horticultural Products, Marysville, OH; и 3 грамма удобрения 14-14-14 (N-P-K)]. Горшки засеменялись по 7-8 растений в каждом, после чего, в фазу роста 3-го листа, их засеменение уменьшали до 5 растений на горшок. Горшки объединяли в рандомизированные блоки по 5 горшков на обработку. Далее, покрытые семена ставили для прорастания в тепличные условия с флуоресцентным освещением в течение 16 ч в сутки. Когда началось цветение пшеницы, ее путем разбрызгивания на колос заражали макроконидиальными спорами штамма NRRL 5883 вида F. graminearum в концентрации 100000 спор/мл. После разбрызгивания спор пшеницу помещали в климатическую камеру с 100% влажностью и образованием росы, и выдерживали в этих благоприятных для инфицирования условиях в течение трех дней. Проводили такие виды обработки образцов:[0153] Seeds of Fusarium-susceptible variety (RB07) wheat were coated with microorganisms SGI-014-C06 or SGI-015-F03 or SGI-015-H06 in accordance with the procedure described in Example 8. Coated seeds were sown in 1 liter pots with pasteurized soil media [(Metromix-Mix 200; Scotts-Sierra Horticultural Products, Marysville, OH; and 3 grams of 14-14-14 (NPK) fertilizer]. Pots were seeded with 7-8 plants each, after which, in the growth phase 3rd leaf, their seeding was reduced to 5 plants per pot.Pots were combined into randomized blocks of 5 pots per treatment.Further, the coated seeds were placed to germinate in greenhouse conditions with fluorescent lighting for 16 hours per day.When the wheat began to bloom, it was infected by spraying on the ear with macroconidial spores of strain NRRL 5883 of the species F. graminearum at a concentration of 100,000 spores/ml After spraying the spores, the wheat was placed in a climatic chamber with 100% humidity and dew formation, and kept in these favorable conditions. conditions suitable for infection within three days. The following types of sample processing were carried out:
[0154] 1. Необработанный: без микробной или химической фунгицидной обработки + заражение Fusarium.[0154] 1. Untreated: no microbial or chemical fungicidal treatment + Fusarium infestation.
[0155] 2. SGI-014-C06: бактериальная обработка семян + заражение Fusarium.[0155] 2. SGI-014-C06: bacterial seed treatment + Fusarium challenge.
[0156] 3. SGI-015-F03: бактериальная обработка семян + заражение Fusarium.[0156] 3. SGI-015-F03: bacterial seed treatment + Fusarium challenge.
[0157] 4. SGI-015-H06: бактериальная обработка семян + заражение Fusarium.[0157] 4. SGI-015-H06: bacterial seed treatment + Fusarium challenge.
[0158] Тяжесть фузариоза оценивали визуально на десятый день и двадцать первый день после инфицирования. Степень инфицирования определяли для каждого колоска, проявляющего симптомы фузариоза, и вычисляли процент симптоматических колосков, то есть умноженное на 100 число колосков, демонстрирующих симптомы фузариоза, делили на общее число колосков. Полученные результаты (таблица 5) показали, что семена пшеницы, покрытые любым из трех тестируемых микробных антагонистов - SGI-014-C06, SGI-015-F03, SGI-015-H06, имели значительно пониженную степень инфицирования грибом Fusarium graminearum по сравнению с «необработанным» контролем, выращиваемым в таких же самых условиях (P<0,05).[0158] The severity of Fusarium was assessed visually on the tenth day and twenty-first day after infection. The degree of infection was determined for each spikelet showing Fusarium symptoms, and the percentage of symptomatic spikelets was calculated, that is, the number of spikelets showing symptoms of Fusarium multiplied by 100 was divided by the total number of spikelets. The results obtained (Table 5) showed that wheat seeds coated with any of the three tested microbial antagonists - SGI-014-C06, SGI-015-F03, SGI-015-H06 - had a significantly reduced infection rate with the fungus Fusarium graminearum compared to " untreated control grown under the same conditions (P<0.05).
Развитие симптомов фузариоза в пшенице после обработки семян антагонистическими микроорганизмамиTable 5
Development of Fusarium symptoms in wheat after seed treatment with antagonistic microorganisms
ПРИМЕР 9. Биоборьба с фузариозом пшеницы в тепличных испытаниях EXAMPLE 9 Biocontrol of Wheat Fusarium in Greenhouse Trials
[0159] Каждый из микроорганизмов SGI-014-C06, SGI-015-F03 и SGI-015-H06 тестировали в тепличных испытаниях большего масштаба. Испытания проводили в «теплице для культивирования растений» (PGCR: plant growth containment room) при фирме Synthetic Genomics, Inc., и включали такие виды лечебной обработки: инфицированный контроль, неинфицированный контроль, а также обработку промышленными фунгицидами четырех марок. Среди них были: химические фунгициды марок Banner MAXX® (Syngenta) с концентрацией 2 мл/л и Prosaro® (Bayer CropScience) с концентрацией 3 мл/л, которые наносились путем распыления на листья в соответствии с рекомендациями изготовителя, и биологические фунгициды марок Actinovate® (Natural Industries) и RhizoVital® (ABiTEP GmbH), которые наносились путем опрыскивания почвы также в соответствии с рекомендациями изготовителя.[0159] Each of the microorganisms SGI-014-C06, SGI-015-F03, and SGI-015-H06 was tested in a larger greenhouse trial. The trials were conducted in a "plant growth containment room" (PGCR: plant growth containment room) of Synthetic Genomics, Inc., and included the following treatments: infected control, uninfected control, and treatment with industrial fungicides of four brands. These included chemical fungicides Banner MAXX® (Syngenta) at 2 ml/L and Prosaro® (Bayer CropScience) at 3 ml/L, which were sprayed on the leaves according to the manufacturer's recommendations, and biological fungicides of the Actinovate brands. ® (Natural Industries) and RhizoVital® (ABiTEP GmbH), which were applied by spraying the soil also in accordance with the manufacturer's recommendations.
[0160] Препарат для микробной обработки наносили либо путем опрыскивания почвы, либо путем покрытия семени. Когда микробную обработку проводили путем опрыскивания почвы, клеточные суспензии каждого микроорганизма индивидуально наносили на семена перед покрытием их большим количеством питательной среды. Для этого, свежеприготовленные культуры гранулировали, удаляя с них питательные вещества, и повторно суспендировали в 10 мM сульфат-магниевого (MgSO4) буфера. После этого клеточные суспензии добавляли путем пипетирования и равномерного распределения 20 миллилитров суспензии по семенам при общем количестве ~109 клеток на горшок. В случае микробной обработки путем нанесения покрытий на семена, микроорганизмы (клетки/споры) готовили по существу так, как описано выше, в Примере 8. Покрытые семена получали путем введения в клеточную суспензию раствора гуммиарабика и, таким образом, создания липкой смеси для последующего нанесения ее на семена. После этого микробное покрытие семян просушивали, в результате чего образовывался твердый, но водорастворимый, биополимер захватывающий микроорганизмы (клетки/споры). Цель этих манипуляций состояла в том чтобы обеспечить титр клеток по меньшей мере 106-107 жизнеспособных клеток/семя. В этом тепличном эксперименте покрытие на семена наносили за день до посева.[0160] The microbial treatment preparation was applied either by spraying the soil or by coating the seed. When the microbial treatment was carried out by spraying the soil, cell suspensions of each microorganism were individually applied to the seeds before covering them with a large amount of nutrient medium. For this, freshly prepared cultures were granulated to remove nutrients and resuspended in 10 mM magnesium sulfate (MgSO 4 ) buffer. Thereafter, cell suspensions were added by pipetting and spreading 20 ml of the suspension evenly over the seeds for a total of ~10 9 cells per pot. In the case of microbial seed coating treatment, microorganisms (cells/spores) were prepared essentially as described above in Example 8. Coated seeds were obtained by incorporating a solution of gum arabic into the cell suspension and thus creating a sticky mixture for subsequent application. her for seeds. After that, the microbial coating of the seeds was dried, resulting in the formation of a solid, but water-soluble, microorganism-capturing biopolymer (cells/spores). The aim of these manipulations was to provide a cell titer of at least 10 6 -10 7 viable cells/seed. In this greenhouse experiment, the seeds were coated the day before sowing.
[0161] Для каждого вида обработки было предусмотрено четыре одинаковых комплекта образцов, размещенных по рандомизированной полнооблочной схеме проведения эксперимента (RCBD: Randomized Complete Block Design) на трехуровневых полках, расположенных в два ряда вдоль боковых сторон теплицы. Полки были оборудованы флуоресцентной системой освещения (Agrosun, 5850K), которая обеспечивала освещенность в среднем 800 мкмоль, измеренную на поверхности горшка. Каждый комплект образцов состоял из четырех неподвижно установленных 1 л горшков. Горшки наполняли искусственной питательной средой, состоящей из питательной среды на основе резуховидки Arabidopsis Growth Medium AIS (от фирмы Lehle Seeds) и крупного промытого песка в объемном соотношении 3:1. Во всех горшках по поверхности питательной среды распределяли по два грамма семян яровой пшеницы (Hank, WestBred). Горшки имели донную подачу воды с поддержанием ~2 см уровня воды и визуально контролировались на прорастание и рост.[0161] For each type of treatment, four identical sets of samples were provided, placed according to a randomized full block design of the experiment (RCBD: Randomized Complete Block Design) on three-level shelves located in two rows along the sides of the greenhouse. The shelves were equipped with a fluorescent lighting system (Agrosun, 5850K) that provided an average illumination of 800 µmol measured on the surface of the pot. Each set of samples consisted of four fixed 1 L pots. The pots were filled with an artificial nutrient medium consisting of Arabidopsis Growth Medium AIS (from Lehle Seeds) and washed coarse sand in a 3:1 volume ratio. In all pots, two grams of spring wheat seeds (Hank, WestBred) were spread over the surface of the nutrient medium. The pots had a bottom water supply with maintenance of ~2 cm water level and were visually controlled for germination and growth.
[0162] В фазу цветения (по системе идентификации роста и развития зерновых культур Feekes 10.5.1) колос пшеницы инфицировали распылением суспензии конидиальных спор Fusarium graminearum. Для этого тепличного эксперимента споры грибов готовили путем посадки гомогенизированного мицелия штамма NRRL 5883 F. graminearum на большие ПДА планшеты и последующей пятидневной инкубации в условиях непрерывного освещения при комнатной температуре. После этого грибные споры собирали путем заливки планшетов магний-сульфатным буфером (10 мM MgSО4; 0,01% Tween 20) и соскабливания поверхности агара стерильным шпателем. После регулирования концентрации спор, их в количестве приблизительно 50000 конидиальных спор на один колос наносили на растения с помощью ручного распылителя. Относительную влажность в теплице повышали до 90% и выдерживали в течение трех дней для инфицирования, а затем возвращали на нормальный уровень. После того как семена пшеницы завязались, подачу воды прекратили и колоскам дали возможность полностью высохнуть. Затем колосья пшеницы собирали каждый индивидуально. Тяжесть заболевания определяли для каждого колоса, имевшего симптомы фузариоза, путем подсчета числа пораженных колосков и деления его на общее число колосков, приходящееся на один колос. Полученные результаты (таблица 6) показали, что пшеница, обработанная любым из трех тестируемых микробных антагонистов, SGI-014-C06, SGI-015-F03, SGI-015-H06, имела значительно меньшую тяжесть и количество инфикаций Fusarium graminearum по сравнению с «необработанным» контролем, выращиваемым в таких же самых условиях (P<0,05).[0162] In the flowering phase (Feekes 10.5.1 cereal growth and development identification system), a wheat ear was infected by spraying a Fusarium graminearum conidial spore suspension. For this greenhouse experiment, fungal spores were prepared by planting homogenized mycelium of F. graminearum strain NRRL 5883 on large PDA plates and then incubating for five days under continuous illumination at room temperature. Thereafter, fungal spores were collected by flooding the plates with magnesium sulfate buffer (10 mM MgSO 4 ; 0.01% Tween 20) and scraping the surface of the agar with a sterile spatula. After adjusting the spore concentration, approximately 50,000 conidial spores per spike were applied to the plants using a hand sprayer. The relative humidity in the greenhouse was raised to 90% and kept for three days for infection, and then returned to normal levels. After the wheat seeds had set, the water supply was stopped and the spikelets were allowed to dry completely. Then the ears of wheat were collected individually. The severity of the disease was determined for each spike that had Fusarium symptoms by counting the number of affected spikelets and dividing it by the total number of spikelets per spike. The results (Table 6) showed that wheat treated with any of the three microbial antagonists tested, SGI-014-C06, SGI-015-F03, SGI-015-H06, had a significantly lower severity and number of Fusarium graminearum infections compared to " untreated control grown under the same conditions (P<0.05).
Эффективность микробных антагонистов в уменьшении заболеваемости пшеницы фузариозомTable 6
The effectiveness of microbial antagonists in reducing the incidence of Fusarium in wheat
[0163] Для определения выхода семян, каждый колос пшеницы срезали вручную, семена собирали и очищали от шелухи и других детритов, посчитывали и взвешивали. Общий выход семян определяли как общую массу семян, полученных от растений в 16 горшках для каждого вида обработки. Как показано в таблице 7, все три тестированных микробных антагониста продемонстрировали существенное сохранение выхода семян, то есть потери семян, обусловленные фузариозной инфикацией, были значительно снижены.[0163] To determine the yield of seeds, each ear of wheat was cut by hand, the seeds were collected and cleaned of husks and other detritus, counted and weighed. The total seed yield was defined as the total weight of seeds obtained from plants in 16 pots for each treatment. As shown in Table 7, all three microbial antagonists tested showed significant retention of seed yield, ie seed losses due to Fusarium infection were significantly reduced.
Эффективность микробных антагонистов в сохранении выхода семян пшеницы, пораженной фузариозомTable 7
The effectiveness of microbial antagonists in maintaining the yield of wheat seeds affected by Fusarium
[0164] Таким образом, обработка пшеницы любым из рассмотренных микроорганизмов позволила заметно предохранить выход семян от потерь, вызываемых Fusarium инфицированием. В частности, пшеница, обработанная любым из штаммов SGI-014-C06 или SGI-015-F03, продемонстрировала существенное улучшение общего выхода семян, то есть 110% и 120%, соответственно, по сравнению с неинфицированным контролем. В противоположность этому, продажные фунгициды марок Actinovate®, RhizoVital® и Prosario® не продемонстрировали существенной защиты урожая обработанной ими пшеницы от потерь, вызываемых инфикацией Fusarium.[0164] Thus, the treatment of wheat with any of the considered microorganisms made it possible to significantly protect the yield of seeds from losses caused by Fusarium infection. In particular, wheat treated with either of the SGI-014-C06 or SGI-015-F03 strains showed a significant improvement in overall seed yield, ie 110% and 120%, respectively, compared to the uninfected control. In contrast, commercial fungicides of the Actinovate®, RhizoVital® and Prosario® brands have not shown significant yield protection in their treated wheat against losses caused by Fusarium infection.
ПРИМЕР 10. Биоборьба с фузариозом пшеницы в полевых условиях EXAMPLE 10. Biocontrol with fusarium wheat in the field
[0165] Антагонистические микроорганизмы, проявившие свою супрессорную активность против патогена F. graminearum и фузариоза в анализе на антагонизм in vitro и в тепличных исследованиях, описанных в Примерах 4-9, продолжают исследоваться далее, в серии полевых испытаний в различных географических ареалах на территории Соединенных Штатов. Некоторые эксперименты проводятся на сельскохозяйственных площадях, которые используются для микробиологической борьбы с фузариозом пшеницы, где происходит природное инфицирование этим заболеванием. В этих испытаниях используются сорта пшеницы, чувствительные к заражению грибом F. graminearum. В этих испытаниях, пшеницу, обработанную различными методами, высевают на небольших участках из 12 рядов, длиной около 3 метров. Промежуток между рядами равен приблизительно 20 см. Обработанные участки в каждом эксперименте вносятся в рандомизированную блочную схему. Оценивается также эффективность различных композиций из смачиваемых порошков, содержащих микробные антагонисты в соответствии с изобретением, в снижении тяжести и количества случаев инфицирования фузариозом. В этих экспериментах, микробные антагонисты оцениваются как индивидуально, так и в комбинациях.[0165] Antagonistic microorganisms that have shown their suppressive activity against the pathogen F. graminearum and Fusarium in the in vitro antagonism assay and in the greenhouse studies described in Examples 4-9 continue to be investigated further, in a series of field trials in various geographical areas throughout the United States. States. Some experiments are carried out on agricultural areas that are used for microbiological control of Fusarium wheat, where natural infection with this disease occurs. These tests use wheat varieties that are susceptible to F. graminearum infection. In these trials, wheat treated with different methods is sown in small plots of 12 rows, about 3 meters long. Row spacing is approximately 20 cm. The treated areas in each experiment are entered into a randomized block design. The efficacy of various wettable powder compositions containing microbial antagonists according to the invention in reducing the severity and incidence of Fusarium infections is also being evaluated. In these experiments, microbial antagonists are evaluated both individually and in combinations.
[0166] В этих испытаниях антагонистические микроорганизмы оцениваются в различных покрытиях на семенах и/или в полевых условиях, где микробные суспензии наносят непосредственно на цветущие пшеничные колосья. В каждом из этих экспериментов микроорганизмы оцениваются на идентичных участках. В экспериментах могут использоваться антагонисты, патогены и методы аграрного производства, описанные в Примерах 4-9.[0166] In these tests, antagonistic microorganisms are evaluated in various coatings on seeds and/or in the field, where microbial suspensions are applied directly to flowering wheat ears. In each of these experiments, microorganisms are evaluated at identical sites. The experiments can use antagonists, pathogens and agricultural production methods described in Examples 4-9.
[0167] Нанесение покрытия на семена. Помимо способов нанесения покрытий на семена, описанных выше, в Примере 7, могут приспосабливаться самые различные известные технологии и препараты для обработки семян пшеницы микробными антагонистами, например, описанные в работах (Fernando et al, 2002; Bello et al., 2002; Kim et al, 1997). В общем случае, семена пшеницы вначале увлажняют и выдерживают при комнатной температуре для инициации прорастания. Перед высеванием проросшие семена можно погружать в микробные суспензии. Патогенные споры можно инокулировать либо до бактериальной инокуляции либо после нее. Способы приготовления антагонистов, патогенов и растений для такой обработки семян могут быть такими, как описано в Примерах 4 и 5.[0167] Coating the seeds. In addition to the seed coating methods described above in Example 7, a wide variety of known technologies and formulations for treating wheat seeds with microbial antagonists, such as those described in (Fernando et al , 2002; Bello et al. , 2002; Kim et al. al , 1997). In general, wheat seeds are first moistened and kept at room temperature to initiate germination. Before sowing, germinated seeds can be immersed in microbial suspensions. Pathogenic spores can be inoculated either before or after bacterial inoculation. Methods for preparing antagonists, pathogens and plants for this seed treatment may be as described in Examples 4 and 5.
[0168] Оценка тяжести заболевания и выхода семян. [0168] Assessment of disease severity and seed yield.
Антагонисты поддаются дальнейшим оценкам в тепличных условиях на их супрессорную активность против фузариоза на пшенице и ячмене в фазе цветения с помощью самых различных способов и методик, включая описанные, например, в (Schisler, Plant Disease, Vol 86(12), 1350-1356, 2002; Schisler et al. Biological Control, 39:497-506,2006; and Khan and Doohan, Biological Control, 48:42-47,2009). В одном из таких экспериментов инокуляты штамма G. zeae готовят на стерильной, желтозерновой кукурузе, как описано в (Khan et al. Biological Control, 29:245-255, 2004). Полностью колонизированные липидные культуры (48-часовая культивация) микробных штаммов разбавляют до одной четвертой концентрации фосфатным буфером. Конечное число КОЕ на мл для антагонистической обработки составляет от 1×109 КОЕ/мл до 6×109 КОЕ/мл. После этого к колосьям цветущей пшеницы применяется обработка суспензиями с помощью CO2 ручного распылителя. Обработку, как правило, производят после захода солнца для снижения до минимума возможную УФ деградацию антагонистических клеток. Готовят 5 репликатов (групп образцов-копий) на одну обработку, вносимых в рандомизированную блок-схему. Первым контролем обработки являются растения, обработанные буферным раствором. Вторым контролем обработки являются необработанные растения. Оценка тяжести инфицирования и заболеваемости фузариозом в полевых условиях производится путем подсчета 60 колосьев на репликат (то есть 300 колосьев/обработку), где развитие растения происходит от фазы средней молочной спелости и до фазы мягкой восковой спелости. Когда зерна достигают полной зрелости, колосья пшеницы собирают вручную и обмолачивают с помощью молотилки марки Almaco для единичных растений и колосьев (Almaco, IA). Образцы зерен, полученные из каждого ряда репликатов, оцениваются по весу 100 зерновок. Данные по тяжести заболевания, заболеваемости и весу 100 зерновок анализируют методом однофакторного дисперсионного анализа (ANOVA).Antagonists are amenable to further evaluation in greenhouse conditions for their suppressive activity against Fusarium on flowering wheat and barley using a variety of methods and techniques, including those described, for example, in (Schisler, Plant Disease, Vol 86(12), 1350-1356, 2002; Schisler et al Biological Control, 39:497-506, 2006; and Khan and Doohan, Biological Control, 48:42-47, 2009). In one such experiment, G. zeae strain inoculums are prepared on sterile, yellow grain corn as described in (Khan et al. Biological Control , 29:245-255, 2004). Fully colonized lipid cultures (48 hour culture) of microbial strains are diluted to one-fourth the concentration with phosphate buffer. The final number of CFU per ml for antagonistic treatment ranges from 1×10 9 CFU/ml to 6×10 9 CFU/ml. After that, suspension treatment is applied to the flowering wheat ears using a CO 2 hand sprayer. The treatment is usually carried out after sunset to minimize possible UV degradation of the antagonistic cells. Prepare 5 replicates (groups of sample copies) per treatment, introduced into a randomized block diagram. The first treatment control are the plants treated with the buffer solution. The second treatment control is the untreated plants. Infection severity and incidence of Fusarium in the field are assessed by counting 60 ears per replicate (i.e. 300 ears/treatment) where the plant develops from a medium milky phase to a soft waxy phase. When the grains reach full maturity, the wheat ears are harvested by hand and threshed using an Almaco brand single plant and ear thresher (Almaco, IA). Samples of grains obtained from each row of replicates are evaluated by weight of 100 grains. Data on disease severity, incidence and weight of 100 caryopses are analyzed by one-way analysis of variance (ANOVA).
[0169] Композиции, содержащие микробные антагонисты согласно изобретению, индивидуально или в комбинации, демонстрируют значительное снижение заболеваемости. Эти результаты являются свидетельством того, что биологический метод борьбы с помощью данных активных микробных агентов может играть важную роль в борьбе с паршой зерновых растений, таких как пшеница.[0169] Compositions containing microbial antagonists according to the invention, alone or in combination, demonstrate a significant reduction in morbidity. These results indicate that biological control with these active microbial agents can play an important role in the control of scab in cereal plants such as wheat.
ПРИМЕР 11. Разработка культиваров неприродного происхождения и программ по их селекционированию EXAMPLE 11 Development of non-natural cultivars and their breeding programs
[0170] Эндофитные микроорганизмы в соответствии с изобретением вводятся в культурные растения, включая зерновые культуры, различных генотипов и географического происхождения. Однако подобные им эндофитные микроорганизмы, с которыми бы можно было создавать растение-эндофитных комбинации с улучшенными агрономическими характеристиками с помощью методик, аналогичных известным в данной отрасли методикам, включая, среди прочих, методики, описанные в (U.S. Pat Appl. No. 20030195117A1; U.S. Pat. Appl. No. 20010032343A1; и U.S. Pat. No. 7084331), отсутствуют. Таким образом, требуемые искусственные растение-эндофитные комбинации могут создаваться и селектироваться по программе селекции и разработке культиваров на базе их способности образовывать и поддерживать мутуалистическую комбинацию, дающую в итоге агрономический эффект. В такой селекционной программе может использоваться также рейтинг агрономических характеристик данной комбинации. В число этих характеристик могут входить, например, засухоустойчивость, аккумулирование биомассы, стойкость к инфицированию насекомыми, поедаемость скотом (например, травоядными), легкость репродукции, выход семян и др. Такие комбинации могут различаться по уровню аккумулирования микробных метаболитов, являющихся токсичными к сельскохозяйственным вредителям и сорнякам, включая уровни эргот-алкалоидов, уровни лолина, уровни перамина или уровни лолитрема, и демонстрировать при этом требуемые агрономические характеристики возделываемых растений, включая стойкость к инфицированию или поеданию насекомыми, стойкость к абиотическому стрессу, поедаемость скотом, аккумулирование биомассы, легкость размножения и выход семян и др.[0170] Endophytic microorganisms in accordance with the invention are introduced into cultivated plants, including crops, of various genotypes and geographical origin. However, similar endophytic microorganisms with which it would be possible to create plant-endophyte combinations with improved agronomic characteristics using methods similar to those known in the industry, including, among others, those described in (U.S. Pat Appl. No. 20030195117A1; U.S. Pat. Appl. No. 20010032343A1; and U.S. Pat. No. 7084331) are missing. Thus, desired artificial plant-endophyte combinations can be created and selected by a breeding and cultivar development program based on their ability to form and maintain a mutualistic combination resulting in an agronomic effect. Such a breeding program may also use a ranking of the agronomic characteristics of a given combination. These characteristics may include, for example, drought tolerance, biomass accumulation, resistance to insect infestation, edibility by livestock (e.g., herbivores), ease of reproduction, seed yield, etc. Such combinations may differ in the level of accumulation of microbial metabolites that are toxic to agricultural pests. and weeds, including ergot alkaloid levels, lolin levels, peramine levels, or lolitrem levels, while demonstrating the required agronomic characteristics of cultivated plants, including resistance to infection or eating by insects, resistance to abiotic stress, livestock palatability, biomass accumulation, ease of propagation and seed output, etc.
[0171] Здесь дано описание множества вариантов осуществления изобретения. Тем не менее, вполне понятно, что элементы описанных здесь вариантов осуществления изобретения могут объединяться в комбинации, образовывая новые варианты осуществления изобретения и его различные модификации, которые не выходят за рамки идеи и объема настоящего изобретения. Следовательно, все другие варианты осуществления изобретения, альтернативы и эквиваленты охватываются объемом изобретения в соответствии с данным описанием изобретения и его формулой.[0171] Here is a description of many embodiments of the invention. However, it is understood that the elements of the embodiments of the invention described herein may be combined in combination to form new embodiments of the invention and various modifications thereof, which do not go beyond the spirit and scope of the present invention. Therefore, all other embodiments of the invention, alternatives and equivalents are covered by the scope of the invention in accordance with this description of the invention and its claims.
[0172] Заглавие в настоящей заявке дано исключительно для облегчения восприятия читателем и никоим образом не ограничивает объема изобретения или вариантов его осуществления.[0172] The title in this application is given solely for ease of understanding by the reader and in no way limits the scope of the invention or its embodiments.
[0173] Все публикации и патентные заявки, упомянутые в настоящем описании, включены здесь посредством ссылки в такой же мере, как если бы каждая публикация или патентная заявка индивидуально указывалась как включенная посредством ссылки.[0173] All publications and patent applications mentioned in the present description are incorporated here by reference to the same extent as if each publication or patent application is individually indicated as incorporated by reference.
--->--->
СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙSEQUENCE LIST
<110> SYNTHETIC GENOMICS, INC.<110> SYNTHETIC GENOMICS, INC.
GRANDLIC, CHRISTOPHER J.GRANDLIC, CHRISTOPHER J.
GREEN, WAYNE A.GREEN, WAYNE A.
KEROVUO, JANNE S.KEROVUO, JANNE S.
MCCANN, RYAN T. MCCANN, Ryan T.
<120> КОМПОЗИЦИИ И СПОСОБЫ ДЛЯ БОРЬБЫ С ФУЗАРИОЗОМ<120> COMPOSITIONS AND METHODS FOR FIGHTING FUSARIA
<130> SGI1520-1WO<130> SGI1520-1WO
<150> US 61/511,467<150> US 61/511,467
<151> 2011-07-25<151> 2011-07-25
<160> 18 <160> 18
<170> PatentIn version 3.5<170>PatentIn version 3.5
<210> 1<210> 1
<211> 1430<211> 1430
<212> ДНК<212> DNA
<213> Microbacterium sp.<213> Microbacterium sp.
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-014-C06<223> SGI bacterial isolate SGI-014-C06
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> кодирует 16S рибосомную РНК<223> encodes 16S ribosomal RNA
<400> 1<400> 1
acgctggcgg cgtgcttaac acatgcaagt cgaacggtga acacggagct tgctctgtgg60acgctggcgg cgtgcttaac acatgcaagt cgaacggtga acacggagct tgctctgtgg60
gatcagtggc gaacgggtga gtaacacgtg agcaacctgc ccctgactct gggataagcg 120gatcagtggc gaacgggtga gtaacacgtg agcaacctgc ccctgactct gggataagcg 120
ctggaaacgg cgtctaatac tggatatgtg acgtgaccgc atggtctgcg tctggaaaga 180ctggaaacgg cgtctaatac tggatatgtg acgtgaccgc atggtctgcg tctggaaaga 180
atttcggttg gggatgggct cgcggcctat cagcttgttg gtgaggtaat ggctcaccaa 240atttcggttg gggatgggct cgcggcctat cagcttgttg gtgaggtaat ggctcaccaa 240
ggcgtcgacg ggtagccggc ctgagagggt gaccggccac actgggactg agacacggcc 300ggcgtcgacg ggtagccggc ctgagagggt gaccggccac actgggactg agacacggcc 300
cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag 360cagactccta cgggaggcag cagtggggaa tattgcacaa tgggcgcaag cctgatgcag 360
caacgccgcg tgagggacga cggccttcgg gttgtaaacc tcttttagca gggaagaagc 420caacgccgcg tgagggacga cggccttcgg gttgtaaacc tcttttagca gggaagaagc 420
gaaagtgacg gtacctgcag aaaaagcgcc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat 480gaaagtgacg gtacctgcag aaaaagcgcc ggctaactac gtgccagcag ccgcggtaat 480
acgtagggcg caagcgttat ccggaattat tgggcgtaaa gagctcgtag gcggtttgtc 540acgtagggcg caagcgttat ccggaattat tgggcgtaaa gagctcgtag gcggtttgtc 540
gcgtctgctg tgaaatccgg aggctcaacc tccggcctgc agtgggtacg ggcagactag 600gcgtctgctg tgaaatccgg aggctcaacc tccggcctgc agtgggtacg ggcagactag 600
agtgcggtag gggagattgg aattcctggt gtagcggtgg aatgcgcaga tatcaggagg 660agtgcggtag gggagattgg aattcctggt gtagcggtgg aatgcgcaga tatcaggagg 660
aacaccgatg gcgaaggcag atctctgggc cgtaactgac gctgaggagc gaaagggtgg 720aacaccgatg gcgaaggcag atctctgggc cgtaactgac gctgaggagc gaaagggtgg 720
ggagcaaaca ggcttagata ccctggtagt ccaccccgta aacgttggga actagttgtg 780ggagcaaaca ggcttagata ccctggtagt ccaccccgta aacgttggga actagttgtg 780
gggtccattc cacggattcc gtgacgcagc taacgcatta agttccccgc ctggggagta 840gggtccattc cacggattcc gtgacgcagc taacgcatta agttccccgc ctggggagta 840
cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg cggagcatgc 900cggccgcaag gctaaaactc aaaggaattg acggggaccc gcacaagcgg cggagcatgc 900
ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt accaaggctt gacatatacg agaacgggcc 960ggattaattc gatgcaacgc gaagaacctt accaaggctt gacatatacg agaacgggcc 960
agaaatggtc aactctttgg acactcgtaa acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt 1020agaaatggtc aactctttgg acactcgtaa acaggtggtg catggttgtc gtcagctcgt 1020
gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc ctcgttctat gttgccagca 1080gtcgtgagat gttgggttaa gtcccgcaac gagcgcaacc ctcgttctat gttgccagca 1080
cgtaatggtg ggaactcatg ggatactgcc ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac 1140cgtaatggtg ggaactcatg ggatactgcc ggggtcaact cggaggaagg tggggatgac 1140
gtcaaatcat catgcccctt atgtcttggg cttcacgcat gctacaatgg ccggtacaaa 1200gtcaaatcat catgcccctt atgtcttggg cttcacgcat gctacaatgg ccggtacaaa 1200
gggctgcaat accgcgaggt ggagcgaatc ccaaaaagcc ggtcccagtt cggattgagg 1260gggctgcaat accgcgaggt ggagcgaatc ccaaaaagcc ggtcccagtt cggattgagg 1260
tctgcaactc gacctcatga agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg 1320tctgcaactc gacctcatga agtcggagtc gctagtaatc gcagatcagc aacgctgcgg 1320
tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcaagt catgaaagtc ggtaacacct 13801380
gaagccggtg gcctaaccct tgtggaggga gccgtcgaag gtgggatcgg 14301430
<210> 2<210> 2
<211> 2172<211> 2172
<212> ДНК<212> DNA
<213> Microbacterium sp.<213> Microbacterium sp.
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-014-C06<223> SGI bacterial isolate SGI-014-C06
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI Ген ID SG1MICG850682<223> SGI Gene ID SG1MICG850682
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> кодирует пептидную последовательность SED ID NO 3<223> encodes the peptide sequence SED ID NO 3
<400> 2<400> 2
gtgtctgcgg ccggagagcg gctgtcgaga atagactcgg agattgtgaa tgccgagtat60gtgtctgcgg ccggagagcg gctgtcgaga atagactcgg agattgtgaa tgccgagtat60
tccgcccatc atctccaggt gcttgagggg ctcgaagctg tccgcaagcg cccgggcatg 120tccgcccatc atctccaggt gcttgagggg ctcgaagctg tccgcaagcg ccggggcatg 120
tacatcgggt cgaacggctc gccgggcctc atgcactgcc tttgggagat catcgacaac 180tacatcgggt cgaacggctc gccgggcctc atgcactgcc tttgggagat catcgacaac 180
tctgtcgacg aggcggtggc aggcaacggc acgaagatcg acatcatcct gcactccgac 240tctgtcgacg aggcggtggc aggcaacggc acgaagatcg acatcatcct gcactccgac 240
ggcagcgtcg aggtgcacga ccgcggtcgc ggcatccctg tcgacgtcga gccgcgcacc 300ggcagcgtcg aggtgcacga ccgcggtcgc ggcatccctg tcgacgtcga gccgcgcacc 300
ggtctcaccg gtgtcgaggt cgtctacacc aagctgcacg ccggaggaaa gttcggcggc 360ggtctcaccg gtgtcgaggt cgtctacacc aagctgcacg ccggaggaaa gttcggcggc 360
ggctcgtacg cggcatccgg tggactgcac ggtgtcggcg cctccgtcgt gaacgcgctc 420ggctcgtacg cggcatccgg tggactgcac ggtgtcggcg cctccgtcgt gaacgcgctc 420
tccgagcgcc tcgacgtcga ggtcgaccgc gggggcaaga cctacgcgat gtcgttccat 480tccgagcgcc tcgacgtcga ggtcgaccgc gggggcaaga cctacgcgat gtcgttccat 480
cgcggtgagc ccggcatctt cacggactcc ggcgagaagc ggccggacgc cccgttcacg 540cgcggtgagc ccggcatctt cacggactcc ggcgagaagc ggccggacgc cccgttcacg 540
ccgttcgagg agaacagcga gctgcgcgtc atcggcaagg cgccgcgtgg cgtgaccggc 600ccgttcgagg agaacagcga gctgcgcgtc atcggcaagg cgccgcgtgg cgtgaccggc 600
acccgggtgc gctactgggc cgaccggcag atcttcacca aggatgcggc gttccagctc 660acccgggtgc gctactgggc cgaccggcag atcttcacca aggatgcggc gttccagctc 660
tcggagctcg agacccgcgc acgccagacg gcgttcctcg ttcccggtct cgagatcgtc 720tcggagctcg agacccgcgc acgccagacg gcgttcctcg ttcccggtct cgagatcgtc 720
gtcaaggacg cacgggcggc cggtcaggtc atccccgtcc cggactccga cggcgagacg 780gtcaaggacg cacgggcggc cggtcaggtc atccccgtcc cggactccga cggcgagacg 780
accgtcgtcg ggaccgatga gacctcgtac ctctacgagg gcggcatctc cgagttcgtc 840accgtcgtcg ggaccgatga gacctcgtac ctctacgagg gcggcatctc cgagttcgtc 840
gagtacctcg ccatcgaccc tcccgtgacc gacacctggc gtatccaggg cgagggcatg 900gagtacctcg ccatcgaccc tcccgtgacc gacacctggc gtatccaggg cgagggcatg 900
ttcaaggaga ccgtgcccgt cctgcaggca gacggccaca tggtcgccac cgaggtggag 960ttcaaggaga ccgtgcccgt cctgcaggca gacggccaca tggtcgccac cgaggtggag 960
cgtgtgtgcg ccgtcgacat cgcgctgcgc tgggggaccg gctacgacac ccgtgtgcgc 1020cgtgtgtgcg ccgtcgacat cgcgctgcgc tgggggaccg gctacgacac ccgtgtgcgc 1020
tccttcgtga acatcatcgc gacgcccaag ggcggaaccc accagcaggg cttcgagcag 1080tccttcgtga acatcatcgc gacgcccaag ggcggaaccc accagcaggg cttcgagcag 1080
gagctcctga aggtgctgcg ctcccaggtc gagcagaacg cccgccgtct gaaggtcggc 1140gagctcctga aggtgctgcg ctcccaggtc gagcagaacg cccgccgtct gaaggtcggc 1140
aacgacaagc tggagaagga cgacgtcctc gccggcctca ccgccgtgct cacggtcaac 1200aacgacaagc tggagaagga cgacgtcctc gccggcctca ccgccgtgct cacggtcaac 1200
gtgccggagc cgcagttcga gggccagacc aaggaagtgc tcggcacccc cgcggtgcgg 1260gtgccggagc cgcagttcga gggccagacc aaggaagtgc tcggcacccc cgcggtgcgg 1260
cagatcgtgg cgcaggtgat ccgtaaggat ctggcgcagc gcttcagctc gaccaagcgc 13201320
gacgacaaga accaggccac acagctgctc gacaagatcg tctccgagat gaaggcccgt 13801380
gtctcggcgc gcgcccacaa ggagacgcag cgccgcaaga acgcgctgga gtcgtcgacg 14401440
ctgccgacca agctcgtcga ctgccgcacg aacgaggtcg agcgcagcga gctcttcatc 1500ctgccgacca agctcgtcga ctgccgcacg aacgaggtcg agcgcagcga gctcttcatc 1500
gtggagggcg actcggctct cggcaccgcc aagaacgcgc gcaacagcga gttccaggcg 1560gtggagggcg actcggctct cggcaccgcc aagaacgcgc gcaacagcga gttccaggcg 1560
ctgctcccga tccgagggaa gatcctcaac gtgcagaagg cctctgtcgg cgacatgctg 1620ctgctcccga tccgagggaa gatcctcaac gtgcagaagg cctctgtcgg cgacatgctg 1620
tcgaacaccg agtgcgcgtc gatcatccag gtgatcggcg ccggatccgg acgcaccttc 1680tcgaacaccg agtgcgcgtc gatcatccag gtgatcggcg ccggatccgg acgcaccttc 1680
gacatcgatg cggcgcgcta cggcaaggtg atcctgatga gcgacgccga tgtcgacggc 1740gacatcgatg cggcgcgcta cggcaaggtg atcctgatga gcgacgccga tgtcgacggc 1740
gcgcacatcc gtaccctgct gctcacgctg ttcttccgct acatgcgacc gctgatcgag 1800gcgcacatcc gtaccctgct gctcacgctg ttcttccgct acatgcgacc gctgatcgag 1800
cacgggcgtg tgttcgccgc ggtgccgccg ttgcaccggg tgatcgtgat gaacccgggg 1860cacgggcgtg tgttcgccgc ggtgccgccg ttgcaccgggg tgatcgtgat gaacccgggg 1860
tccaagccga acgagacgat ctacacctac agcgagcagg agatgcacgc gctgctggcg 1920tccaagccga acgagacgat ctacacctac agcgagcagg agatgcacgc gctgctggcg 1920
aagctccgca aggccggcaa gcgctggcac gagccgatcc agcgctacaa gggtctcggt 1980aagctccgca aggccggcaa gcgctggcac gagccgatcc agcgctacaa gggtctcggt 1980
gagatggacg cggaacagct cgcgaacacc accatggacc gctccggccg tctgctgcgc 2040gagatggacg cggaacagct cgcgaacacc accatggacc gctccggccg tctgctgcgc 2040
cgtgtgcgca tggaagacgc cgaggccgcc ggtcgcgtgt tcgagctgct gatgggcaac 2100cgtgtgcgca tggaagacgc cgaggccgcc ggtcgcgtgt tcgagctgct gatgggcaac 2100
gaggtcgcgc cgcgccgcga gttcatcatc gactcctccg accggttgtc gcgcgagtcc 2160gaggtcgcgc cgcgccgcga gttcatcatc gactcctccg accggttgtc gcgcgagtcc 2160
atcgacgcct ga 2172atcgacgcct ga 2172
<210> 3<210> 3
<211> 723<211> 723
<212> ПРОТЕИН<212> PROTEIN
<213> Microbacterium sp.<213> Microbacterium sp.
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-014-C06<223> SGI bacterial isolate SGI-014-C06
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI пептид ID SG1MICT850682<223> SGI peptide ID SG1MICT850682
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> субъединица гиразы B<223> gyrase B subunit
<400> 3<400> 3
Met Ser Ala Ala Gly Glu Arg Leu Ser Arg Ile Asp Ser Glu Ile Val Met Ser Ala Ala Gly Glu Arg Leu Ser Arg Ile Asp Ser Glu Ile Val
1 5 10 15 1 5 10 15
Asn Ala Glu Tyr Ser Ala His His Leu Gln Val Leu Glu Gly Leu Glu Asn Ala Glu Tyr Ser Ala His His Leu Gln Val Leu Glu Gly Leu Glu
20 25 30 20 25 30
Ala Val Arg Lys Arg Pro Gly Met Tyr Ile Gly Ser Asn Gly Ser Pro Ala Val Arg Lys Arg Pro Gly Met Tyr Ile Gly Ser Asn Gly Ser Pro
35 40 45 35 40 45
Gly Leu Met His Cys Leu Trp Glu Ile Ile Asp Asn Ser Val Asp Glu Gly Leu Met His Cys Leu Trp Glu Ile Ile Asp Asn Ser Val Asp Glu
50 55 60 50 55 60
Ala Val Ala Gly Asn Gly Thr Lys Ile Asp Ile Ile Leu His Ser Asp Ala Val Ala Gly Asn Gly Thr Lys Ile Asp Ile Ile Leu His Ser Asp
65 70 75 80 65 70 75 80
Gly Ser Val Glu Val His Asp Arg Gly Arg Gly Ile Pro Val Asp Val Gly Ser Val Glu Val His Asp Arg Gly Arg Gly Ile Pro Val Asp Val
85 90 95 85 90 95
Glu Pro Arg Thr Gly Leu Thr Gly Val Glu Val Val Tyr Thr Lys Leu Glu Pro Arg Thr Gly Leu Thr Gly Val Glu Val Val Tyr Thr Lys Leu
100 105 110 100 105 110
His Ala Gly Gly Lys Phe Gly Gly Gly Ser Tyr Ala Ala Ser Gly Gly His Ala Gly Gly Lys Phe Gly Gly Gly Ser Tyr Ala Ala Ser Gly Gly
115 120 125 115 120 125
Leu His Gly Val Gly Ala Ser Val Val Asn Ala Leu Ser Glu Arg Leu Leu His Gly Val Gly Ala Ser Val Val Asn Ala Leu Ser Glu Arg Leu
130 135 140 130 135 140
Asp Val Glu Val Asp Arg Gly Gly Lys Thr Tyr Ala Met Ser Phe His Asp Val Glu Val Asp Arg Gly Gly Lys Thr Tyr Ala Met Ser Phe His
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Gly Glu Pro Gly Ile Phe Thr Asp Ser Gly Glu Lys Arg Pro Asp Arg Gly Glu Pro Gly Ile Phe Thr Asp Ser Gly Glu Lys Arg Pro Asp
165 170 175 165 170 175
Ala Pro Phe Thr Pro Phe Glu Glu Asn Ser Glu Leu Arg Val Ile Gly Ala Pro Phe Thr Pro Phe Glu Glu Asn Ser Glu Leu Arg Val Ile Gly
180 185 190 180 185 190
Lys Ala Pro Arg Gly Val Thr Gly Thr Arg Val Arg Tyr Trp Ala Asp Lys Ala Pro Arg Gly Val Thr Gly Thr Arg Val Arg Tyr Trp Ala Asp
195 200 205 195 200 205
Arg Gln Ile Phe Thr Lys Asp Ala Ala Phe Gln Leu Ser Glu Leu Glu Arg Gln Ile Phe Thr Lys Asp Ala Ala Phe Gln Leu Ser Glu Leu Glu
210 215 220 210 215 220
Thr Arg Ala Arg Gln Thr Ala Phe Leu Val Pro Gly Leu Glu Ile Val Thr Arg Ala Arg Gln Thr Ala Phe Leu Val Pro Gly Leu Glu Ile Val
225 230 235 240 225 230 235 240
Val Lys Asp Ala Arg Ala Ala Gly Gln Val Ile Pro Val Pro Asp Ser Val Lys Asp Ala Arg Ala Ala Gly Gln Val Ile Pro Val Pro Asp Ser
245 250 255 245 250 255
Asp Gly Glu Thr Thr Val Val Gly Thr Asp Glu Thr Ser Tyr Leu Tyr Asp Gly Glu Thr Thr Val Val Gly Thr Asp Glu Thr Ser Tyr Leu Tyr
260 265 270 260 265 270
Glu Gly Gly Ile Ser Glu Phe Val Glu Tyr Leu Ala Ile Asp Pro Pro Glu Gly Gly Ile Ser Glu Phe Val Glu Tyr Leu Ala Ile Asp Pro Pro
275 280 285 275 280 285
Val Thr Asp Thr Trp Arg Ile Gln Gly Glu Gly Met Phe Lys Glu Thr Val Thr Asp Thr Trp Arg Ile Gln Gly Glu Gly Met Phe Lys Glu Thr
290 295 300 290 295 300
Val Pro Val Leu Gln Ala Asp Gly His Met Val Ala Thr Glu Val Glu Val Pro Val Leu Gln Ala Asp Gly His Met Val Ala Thr Glu Val Glu
305 310 315 320 305 310 315 320
Arg Val Cys Ala Val Asp Ile Ala Leu Arg Trp Gly Thr Gly Tyr Asp Arg Val Cys Ala Val Asp Ile Ala Leu Arg Trp Gly Thr Gly Tyr Asp
325 330 335 325 330 335
Thr Arg Val Arg Ser Phe Val Asn Ile Ile Ala Thr Pro Lys Gly Gly Thr Arg Val Arg Ser Phe Val Asn Ile Ile Ala Thr Pro Lys Gly Gly
340 345 350 340 345 350
Thr His Gln Gln Gly Phe Glu Gln Glu Leu Leu Lys Val Leu Arg Ser Thr His Gln Gln Gly Phe Glu Gln Glu Leu Leu Lys Val Leu Arg Ser
355 360 365 355 360 365
Gln Val Glu Gln Asn Ala Arg Arg Leu Lys Val Gly Asn Asp Lys Leu Gln Val Glu Gln Asn Ala Arg Arg Leu Lys Val Gly Asn Asp Lys Leu
370 375 380 370 375 380
Glu Lys Asp Asp Val Leu Ala Gly Leu Thr Ala Val Leu Thr Val Asn Glu Lys Asp Asp Val Leu Ala Gly Leu Thr Ala Val Leu Thr Val Asn
385 390 395 400 385 390 395 400
Val Pro Glu Pro Gln Phe Glu Gly Gln Thr Lys Glu Val Leu Gly Thr Val Pro Glu Pro Gln Phe Glu Gly Gln Thr Lys Glu Val Leu Gly Thr
405 410 415 405 410 415
Pro Ala Val Arg Gln Ile Val Ala Gln Val Ile Arg Lys Asp Leu Ala Pro Ala Val Arg Gln Ile Val Ala Gln Val Ile Arg Lys Asp Leu Ala
420 425 430 420 425 430
Gln Arg Phe Ser Ser Thr Lys Arg Asp Asp Lys Asn Gln Ala Thr Gln Gln Arg Phe Ser Ser Thr Lys Arg Asp Asp Lys Asn Gln Ala Thr Gln
435 440 445 435 440 445
Leu Leu Asp Lys Ile Val Ser Glu Met Lys Ala Arg Val Ser Ala Arg Leu Leu Asp Lys Ile Val Ser Glu Met Lys Ala Arg Val Ser Ala Arg
450 455 460 450 455 460
Ala His Lys Glu Thr Gln Arg Arg Lys Asn Ala Leu Glu Ser Ser Thr Ala His Lys Glu Thr Gln Arg Arg Lys Asn Ala Leu Glu Ser Ser Thr
465 470 475 480 465 470 475 480
Leu Pro Thr Lys Leu Val Asp Cys Arg Thr Asn Glu Val Glu Arg Ser Leu Pro Thr Lys Leu Val Asp Cys Arg Thr Asn Glu Val Glu Arg Ser
485 490 495 485 490 495
Glu Leu Phe Ile Val Glu Gly Asp Ser Ala Leu Gly Thr Ala Lys Asn Glu Leu Phe Ile Val Glu Gly Asp Ser Ala Leu Gly Thr Ala Lys Asn
500 505 510 500 505 510
Ala Arg Asn Ser Glu Phe Gln Ala Leu Leu Pro Ile Arg Gly Lys Ile Ala Arg Asn Ser Glu Phe Gln Ala Leu Leu Pro Ile Arg Gly Lys Ile
515 520 525 515 520 525
Leu Asn Val Gln Lys Ala Ser Val Gly Asp Met Leu Ser Asn Thr Glu Leu Asn Val Gln Lys Ala Ser Val Gly Asp Met Leu Ser Asn Thr Glu
530 535 540 530 535 540
Cys Ala Ser Ile Ile Gln Val Ile Gly Ala Gly Ser Gly Arg Thr Phe Cys Ala Ser Ile Ile Gln Val Ile Gly Ala Gly Ser Gly Arg Thr Phe
545 550 555 560 545 550 555 560
Asp Ile Asp Ala Ala Arg Tyr Gly Lys Val Ile Leu Met Ser Asp Ala Asp Ile Asp Ala Ala Arg Tyr Gly Lys Val Ile Leu Met Ser Asp Ala
565 570 575 565 570 575
Asp Val Asp Gly Ala His Ile Arg Thr Leu Leu Leu Thr Leu Phe Phe Asp Val Asp Gly Ala His Ile Arg Thr Leu Leu Leu Thr Leu Phe Phe
580 585 590 580 585 590
Arg Tyr Met Arg Pro Leu Ile Glu His Gly Arg Val Phe Ala Ala Val Arg Tyr Met Arg Pro Leu Ile Glu His Gly Arg Val Phe Ala Ala Val
595 600 605 595 600 605
Pro Pro Leu His Arg Val Ile Val Met Asn Pro Gly Ser Lys Pro Asn Pro Pro Leu His Arg Val Ile Val Met Asn Pro Gly Ser Lys Pro Asn
610 615 620 610 615 620
Glu Thr Ile Tyr Thr Tyr Ser Glu Gln Glu Met His Ala Leu Leu Ala Glu Thr Ile Tyr Thr Tyr Ser Glu Gln Glu Met His Ala Leu Leu Ala
625 630 635 640 625 630 635 640
Lys Leu Arg Lys Ala Gly Lys Arg Trp His Glu Pro Ile Gln Arg Tyr Lys Leu Arg Lys Ala Gly Lys Arg Trp His Glu Pro Ile Gln Arg Tyr
645 650 655 645 650 655
Lys Gly Leu Gly Glu Met Asp Ala Glu Gln Leu Ala Asn Thr Thr Met Lys Gly Leu Gly Glu Met Asp Ala Glu Gln Leu Ala Asn Thr Thr Met
660 665 670 660 665 670
Asp Arg Ser Gly Arg Leu Leu Arg Arg Val Arg Met Glu Asp Ala Glu Asp Arg Ser Gly Arg Leu Leu Arg Arg Val Arg Met Glu Asp Ala Glu
675 680 685 675 680 685
Ala Ala Gly Arg Val Phe Glu Leu Leu Met Gly Asn Glu Val Ala Pro Ala Ala Gly Arg Val Phe Glu Leu Leu Met Gly Asn Glu Val Ala Pro
690 695 700 690 695 700
Arg Arg Glu Phe Ile Ile Asp Ser Ser Asp Arg Leu Ser Arg Glu Ser Arg Arg Glu Phe Ile Ile Asp Ser Ser Asp Arg Leu Ser Arg Glu Ser
705 710 715 720 705 710 715 720
Ile Asp Ala Ile Asp Ala
<210> 4<210> 4
<211> 3504<211> 3504
<212> ДНК<212> DNA
<213> Microbacterium sp.<213> Microbacterium sp.
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-014-C06<223> SGI bacterial isolate SGI-014-C06
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI Ген ID SG1MICG850290<223> SGI Gene ID SG1MICG850290
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> кодирует пептидную последовательность SEQ ID NO 5<223> encodes the peptide sequence of SEQ ID NO 5
<400> 4<400> 4
ttggctgctg ctcgcaacgc atccacatcc accaccacca agaacggacg cggagcttcc60ttggctgctg ctcgcaacgc atccacatcc accaccacca agaacggacg cggagcttcc60
cgtctttcgt tcgccaagat ctccgacacg ctgacggtcc ctgaccttct cgccctgcag 120cgtctttcgt tcgccaagat ctccgacacg ctgacggtcc ctgaccttct cgccctgcag 120
accgaatcct tcggttggct ggtcggcaac gacgcctgga aggcgcgcgt ggccgaggcc 180accgaatcct tcggttggct ggtcggcaac gacgcctgga aggcgcgcgt ggccgaggcc 180
aagaagcagg ggcgcaccga cgtcaacgag aacagcggtc tgggcgagat cttcgaggag 240aagaagcagg ggcgcaccga cgtcaacgag aacagcggtc tgggcgagat cttcgaggag 240
atctctccga tcgaggacct cggcgagacg atgcagctgt cgttcacgaa cccctacctc 300atctctccga tcgaggacct cggcgagacg atgcagctgt cgttcacgaa cccctacctc 300
gagccggaga agtactccat cgaggagtgc aaggagcgtg gcaagaccta cgccgctccg 360gagccggaga agtactccat cgaggagtgc aaggagcgtg gcaagaccta cgccgctccg 360
ctgtacgtcg aggccgagtt catgaaccac ctcacgggtg agatcaagac ccagacggtc 420ctgtacgtcg aggccgagtt catgaaccac ctcacgggtg agatcaagac ccagacggtc 420
ttcatgggcg acttcccgct gcagaccgac aagggaacgt tcatcatcaa cggctccgag 480ttcatgggcg acttcccgct gcagaccgac aagggaacgt tcatcatcaa cggctccgag 480
cgcgtcgtcg tctcgcagct ggtgcgttcg cccggtgtct acttcgacaa gacccccgac 540cgcgtcgtcg tctcgcagct ggtgcgttcg cccggtgtct acttcgacaa gacccccgac 540
aagacgtccg acaaggacat cgtctcggca cgcgtcatcc cgagccgtgg tgcctggctc 600aagacgtccg acaaggacat cgtctcggca cgcgtcatcc cgagccgtgg tgcctggctc 600
gagttcgaga tcgacaagcg cgaccaggtc ggcgtgcgcg tcgaccgcaa gcgcaagcag 660gagttcgaga tcgacaagcg cgaccaggtc ggcgtgcgcg tcgaccgcaa gcgcaagcag 660
tcggtcacgg tcttcctcaa ggcgctgggc atgaccagcg aggagatcct cgccgagttc 720tcggtcacgg tcttcctcaa ggcgctgggc atgaccagcg aggagatcct cgccgagttc 720
gccggctaca cctcgatcga ggagacgctc gcgaaggaca cgatcgtcac gaaggaagat 780gccggctaca cctcgatcga ggagacgctc gcgaaggaca cgatcgtcac gaaggaagat 780
gcgctccgcg acatctaccg caagctccgt ccgggcgagc aggtcgccgc cgaggccgcc 840gcgctccgcg acatctaccg caagctccgt ccgggcgagc aggtcgccgc cgaggccgcc 840
cgcgcgctcc tggacaactt ctacttcaac ccgaagcgct acgacctggc caaggtcggt 900cgcgcgctcc tggacaactt ctacttcaac ccgaagcgct acgacctggc caaggtcggt 900
cgctacaaga tcaaccacaa gctgggcctg gaccagccgc tgaactcgtc ggtcctgacc 960cgctacaaga tcaaccacaa gctgggcctg gaccagccgc tgaactcgtc ggtcctgacc 960
gtcgaagaca tcgtggccac gatcaagtac ctggtgcgtc tgcacgccgg caccgaggag 1020gtcgaagaca tcgtggccac gatcaagtac ctggtgcgtc tgcacgccgg caccgaggag 1020
accttcacgg gcatccgcgg tggtaagaag gccgagatcc gtctcgcgac cgacgacatc 1080accttcacgg gcatccgcgg tggtaagaag gccgagatcc gtctcgcgac cgacgacatc 1080
gacaacttcg gcaaccgtcg catccgcgcg gtcggcgagc tgatccagaa ccaggtccgc 1140gacaacttcg gcaaccgtcg catccgcgcg gtcggcgagc tgatccagaa ccaggtccgc 1140
accggtctct cccgcatgga gcgcgtcgtc cgcgagcgca tgaccacgca ggacatcgag 1200accggtctct cccgcatgga gcgcgtcgtc cgcgagcgca tgaccacgca ggacatcgag 1200
gcgatcacgc cgcagaccct gatcaacgtg cgccccgtcg tcgccgcgat caaggagttc 1260gcgatcacgc cgcagaccct gatcaacgtg cgccccgtcg tcgccgcgat caaggagttc 1260
ttcggaacgt cgcagctgtc gcagttcatg gaccagaaca acccgctcgc gggtctgacg 1320ttcggaacgt cgcagctgtc gcagttcatg gaccagaaca acccgctcgc gggtctgacg 1320
aacaagcgtc gtctgtctgc gctcggcccc ggtggtctct cgcgagaccg cgccggcgtc 1380aacaagcgtc gtctgtctgc gctcggcccc ggtggtctct cgcgagaccg cgccggcgtc 1380
gaggtccgtg acgtccaccc ctcgcactac ggccgcatgt gcccgatcga gactccggaa 1440gaggtccgtg acgtccaccc ctcgcactac ggccgcatgt gcccgatcga gactccggaa 1440
ggcccgaaca tcggtctgat cggtgctctc gcgaccttcg cgcgcatcaa ctcgttcgga 1500ggcccgaaca tcggtctgat cggtgctctc gcgaccttcg cgcgcatcaa ctcgttcgga 1500
ttcatcgaga ccccgtaccg caaggtcgtc gacggtgtcg tgaccgacca gatcgactac 1560ttcatcgaga ccccgtaccg caaggtcgtc gacggtgtcg tgaccgacca gatcgactac 1560
ctgacggctt ccgaagaggt cgacttcaac atcgcgcagg ccaacgcccc gctcgatgcc 1620ctgacggctt ccgaagaggt cgacttcaac atcgcgcagg ccaacgcccc gctcgatgcc 1620
aagggtcgct tccgcgagag ccacgtcctg gcccgcccca agggtggcag cggcgaggtc 16801680
gacctgttcg tccccgagga gatcggctac atcgacgtct ccccgcgcca gatggtgtcg 1740gacctgttcg tccccgagga gatcggctac atcgacgtct ccccgcgcca gatggtgtcg 1740
gtcgcgacct cgctcgtgcc cttcctcgag cacgacgacg cacagcgcgc cctcatgggt 1800gtcgcgacct cgctcgtgcc cttcctcgag cacgacgacg cacagcgcgc cctcatgggt 1800
gccaacatgc agcgtcaggc tgtgccgctg ctgcgcagcg actcgccgct cgtcggaacc 1860gccaacatgc agcgtcaggc tgtgccgctg ctgcgcagcg actcgccgct cgtcggaacc 1860
ggtatggagg gctacacggc catcgacgcc ggtgacgtgc tcaccgccga gaaggccggt 1920ggtatggagg gctacacggc catcgacgcc ggtgacgtgc tcaccgccga gaaggccggt 1920
gtcgtctccg aggtctccgc agaccgcgtc gtcgtcatgc tcgacgaggg cggaacgcag 1980gtcgtctccg aggtctccgc agaccgcgtc gtcgtcatgc tcgacgaggg cggaacgcag 1980
gagtaccacc tgcgcaagtt cgaccgctcc aaccagggca cgtcgtacaa ccagaaggtc 2040gagtaccacc tgcgcaagtt cgaccgctcc aaccagggca cgtcgtacaa ccagaaggtc 2040
gtcgtcaccg ccggtgagcg cgtcgaggtc ggagaggtca tcgccgatgg ccccgccacc 2100gtcgtcaccg ccggtgagcg cgtcgaggtc ggagaggtca tcgccgatgg ccccgccacc 2100
gagaacggcg agctggccct cggaaagaac ctcctcgtcg cgttcatgac gtgggagggc 2160gagaacggcg agctggccct cggaaagaac ctcctcgtcg cgttcatgac gtgggaggggc 2160
tacaacttcg aggacgcgat catcctgagc caggacctgg tgaaggacga caccctctcc 2220tacaacttcg aggacgcgat catcctgagc caggacctgg tgaaggacga caccctctcc 2220
tcgatccaca tcgaggagta cgaggtcgat gctcgcgaca ccaagctcgg caaggaggag 2280tcgatccaca tcgaggagta cgaggtcgat gctcgcgaca ccaagctcgg caaggaggag 2280
atcacgcgtg acctccccaa cgtcagcccg gagctgctga aggacctcga cgagcgcggc 2340atcacgcgtg acctccccaa cgtcagcccg gagctgctga aggacctcga cgagcgcggc 2340
atcatccgca tcggtgccga ggtccgccct ggcgacatcc tcgtcggcaa ggtcacgccg 2400atcatccgca tcggtgccga ggtccgccct ggcgacatcc tcgtcggcaa ggtcacgccg 2400
aagggtgaga ccgagctgtc ggccgaggag cgcctgctcc gcgcgatctt caacgagaag 2460aagggtgaga ccgagctgtc ggccgaggag cgcctgctcc gcgcgatctt caacgagaag 2460
agccgcgaag tccgtgacac ctcgctgaag gtgccccacg gtgagcaggg cacgatcatc 2520agccgcgaag tccgtgacac ctcgctgaag gtgccccacg gtgagcaggg cacgatcatc 2520
gccgtcaagg agttcaacgc tgaggacggc gacgacgagc tcggctccgg cgtcaaccgc 2580gccgtcaagg agttcaacgc tgaggacggc gacgacgagc tcggctccgg cgtcaaccgc 2580
cgcgtcgtgg tctacatcgc ccagaagcgc aagatcaccg agggtgacaa gctcgccggc 2640cgcgtcgtgg tctacatcgc ccagaagcgc aagatcaccg agggtgacaa gctcgccggc 2640
cgtcacggca acaagggtgt catcgcgaag atcctcccga tcgaggacat gccgttcctt 2700cgtcacggca acaagggtgt catcgcgaag atcctcccga tcgaggacat gccgttcctt 2700
tcggacggta ccccggtcga catcgtgctg aacccgctcg gtatccccgg tcgaatgaac 2760tcggacggta ccccggtcga catcgtgctg aacccgctcg gtatccccgg tcgaatgaac 2760
ttcggtcagg tcctggagac ccacctcggg tggatcgcga agcagggctg gaaggtcgag 2820ttcggtcagg tcctggagac ccacctcggg tggatcgcga agcagggctg gaaggtcgag 2820
ggcaacccgg agtgggctgt gaagctcccg aaggacgcat tcgaggccgc ccccggcacg 2880ggcaacccgg agtgggctgt gaagctcccg aaggacgcat tcgaggccgc ccccggcacg 2880
aaggtcgcca ccccggtgtt cgacggtgcg agcgaggagg agatcgctgg tctcctcgac 2940aaggtcgcca ccccggtgtt cgacggtgcg agcgaggagg agatcgctgg tctcctcgac 2940
gcgaccaccc cgacccgtga cggcgtccgc ctgatcgact cgagcggcaa gacgcagctg 3000gcgaccaccc cgacccgtga cggcgtccgc ctgatcgact cgagcggcaa gacgcagctg 3000
ttcgacggtc gttcgggtga gccgttcccg gcgccgatct ccgtgggcta catgtacatc 3060ttcgacggtc gttcgggtga gccgttcccg gcgccgatct ccgtgggcta catgtacatc 3060
ctgaagctgc accacctggt cgacgacaag atccacgcac gttccacggg tccgtactcg 3120ctgaagctgc accacctggt cgacgacaag atccacgcac gttccacggg tccgtactcg 3120
atgatcaccc agcagccgct cggtggtaag gcgcagttcg gtggacagcg cttcggtgag 3180atgatcaccc agcagccgct cggtggtaag gcgcagttcg gtggacagcg cttcggtgag 3180
atggaggtgt gggccctcga ggcctacggc gccgcatacg cgctccagga gctcctcacg 3240atggaggtgt gggccctcga ggcctacggc gccgcatacg cgctccagga gctcctcacg 3240
atcaagtccg acgacatcct cggccgcgtc aaggtgtacg aggcgatcgt caagggcgag 3300atcaagtccg acgacatcct cggccgcgtc aaggtgtacg aggcgatcgt caagggcgag 3300
aacatccagg agcccggcat ccccgagtcg ttcaaggtgc tcatgaagga gatgcagtcg 3360aacatccagg agccggcat ccccgagtcg ttcaaggtgc tcatgaagga gatgcagtcg 3360
ctctgcctga acgtcgaggt cctctcggcc gacggcacgc tggtcaacct ccgcgacacc 3420ctctgcctga acgtcgaggt cctctcggcc gacggcacgc tggtcaacct ccgcgacacc 3420
gacgacgagg cgttccgcgc cgcggaagag ctcggtatca acatctccag ccgcttcgag 3480gacgacgagg cgttccgcgc cgcggaagag ctcggtatca acatctccag ccgcttcgag 3480
gccgcctcga tcgacgagat ctaa 3504gccgcctcga tcgacgagat ctaa 3504
<210> 5<210> 5
<211> 1167<211> 1167
<212> ПРОТЕИН<212> PROTEIN
<213> Microbacterium sp.<213> Microbacterium sp.
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-014-C06<223> SGI bacterial isolate SGI-014-C06
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI пептид ID SG1MICT850290<223> SGI peptide ID SG1MICT850290
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> Субъединица В РНК-полимеразы<223> Subunit B of RNA polymerase
<400> 5<400> 5
Met Ala Ala Ala Arg Asn Ala Ser Thr Ser Thr Thr Thr Lys Asn Gly Met Ala Ala Ala Arg Asn Ala Ser Thr Ser Thr Thr Thr Lys Asn Gly
1 5 10 15 1 5 10 15
Arg Gly Ala Ser Arg Leu Ser Phe Ala Lys Ile Ser Asp Thr Leu Thr Arg Gly Ala Ser Arg Leu Ser Phe Ala Lys Ile Ser Asp Thr Leu Thr
20 25 30 20 25 30
Val Pro Asp Leu Leu Ala Leu Gln Thr Glu Ser Phe Gly Trp Leu Val Val Pro Asp Leu Leu Ala Leu Gln Thr Glu Ser Phe Gly Trp Leu Val
35 40 45 35 40 45
Gly Asn Asp Ala Trp Lys Ala Arg Val Ala Glu Ala Lys Lys Gln Gly Gly Asn Asp Ala Trp Lys Ala Arg Val Ala Glu Ala Lys Lys Gln Gly
50 55 60 50 55 60
Arg Thr Asp Val Asn Glu Asn Ser Gly Leu Gly Glu Ile Phe Glu Glu Arg Thr Asp Val Asn Glu Asn Ser Gly Leu Gly Glu Ile Phe Glu Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Ile Ser Pro Ile Glu Asp Leu Gly Glu Thr Met Gln Leu Ser Phe Thr Ile Ser Pro Ile Glu Asp Leu Gly Glu Thr Met Gln Leu Ser Phe Thr
85 90 95 85 90 95
Asn Pro Tyr Leu Glu Pro Glu Lys Tyr Ser Ile Glu Glu Cys Lys Glu Asn Pro Tyr Leu Glu Pro Glu Lys Tyr Ser Ile Glu Glu Cys Lys Glu
100 105 110 100 105 110
Arg Gly Lys Thr Tyr Ala Ala Pro Leu Tyr Val Glu Ala Glu Phe Met Arg Gly Lys Thr Tyr Ala Ala Pro Leu Tyr Val Glu Ala Glu Phe Met
115 120 125 115 120 125
Asn His Leu Thr Gly Glu Ile Lys Thr Gln Thr Val Phe Met Gly Asp Asn His Leu Thr Gly Glu Ile Lys Thr Gln Thr Val Phe Met Gly Asp
130 135 140 130 135 140
Phe Pro Leu Gln Thr Asp Lys Gly Thr Phe Ile Ile Asn Gly Ser Glu Phe Pro Leu Gln Thr Asp Lys Gly Thr Phe Ile Ile Asn Gly Ser Glu
145 150 155 160 145 150 155 160
Arg Val Val Val Ser Gln Leu Val Arg Ser Pro Gly Val Tyr Phe Asp Arg Val Val Val Ser Gln Leu Val Arg Ser Pro Gly Val Tyr Phe Asp
165 170 175 165 170 175
Lys Thr Pro Asp Lys Thr Ser Asp Lys Asp Ile Val Ser Ala Arg Val Lys Thr Pro Asp Lys Thr Ser Asp Lys Asp Ile Val Ser Ala Arg Val
180 185 190 180 185 190
Ile Pro Ser Arg Gly Ala Trp Leu Glu Phe Glu Ile Asp Lys Arg Asp Ile Pro Ser Arg Gly Ala Trp Leu Glu Phe Glu Ile Asp Lys Arg Asp
195 200 205 195 200 205
Gln Val Gly Val Arg Val Asp Arg Lys Arg Lys Gln Ser Val Thr Val Gln Val Gly Val Arg Val Asp Arg Lys Arg Lys Gln Ser Val Thr Val
210 215 220 210 215 220
Phe Leu Lys Ala Leu Gly Met Thr Ser Glu Glu Ile Leu Ala Glu Phe Phe Leu Lys Ala Leu Gly Met Thr Ser Glu Glu Ile Leu Ala Glu Phe
225 230 235 240 225 230 235 240
Ala Gly Tyr Thr Ser Ile Glu Glu Thr Leu Ala Lys Asp Thr Ile Val Ala Gly Tyr Thr Ser Ile Glu Glu Thr Leu Ala Lys Asp Thr Ile Val
245 250 255 245 250 255
Thr Lys Glu Asp Ala Leu Arg Asp Ile Tyr Arg Lys Leu Arg Pro Gly Thr Lys Glu Asp Ala Leu Arg Asp Ile Tyr Arg Lys Leu Arg Pro Gly
260 265 270 260 265 270
Glu Gln Val Ala Ala Glu Ala Ala Arg Ala Leu Leu Asp Asn Phe Tyr Glu Gln Val Ala Ala Glu Ala Ala Arg Ala Leu Leu Asp Asn Phe Tyr
275 280 285 275 280 285
Phe Asn Pro Lys Arg Tyr Asp Leu Ala Lys Val Gly Arg Tyr Lys Ile Phe Asn Pro Lys Arg Tyr Asp Leu Ala Lys Val Gly Arg Tyr Lys Ile
290 295 300 290 295 300
Asn His Lys Leu Gly Leu Asp Gln Pro Leu Asn Ser Ser Val Leu Thr Asn His Lys Leu Gly Leu Asp Gln Pro Leu Asn Ser Ser Val Leu Thr
305 310 315 320 305 310 315 320
Val Glu Asp Ile Val Ala Thr Ile Lys Tyr Leu Val Arg Leu His Ala Val Glu Asp Ile Val Ala Thr Ile Lys Tyr Leu Val Arg Leu His Ala
325 330 335 325 330 335
Gly Thr Glu Glu Thr Phe Thr Gly Ile Arg Gly Gly Lys Lys Ala Glu Gly Thr Glu Glu Thr Phe Thr Gly Ile Arg Gly Gly Lys Lys Ala Glu
340 345 350 340 345 350
Ile Arg Leu Ala Thr Asp Asp Ile Asp Asn Phe Gly Asn Arg Arg Ile Ile Arg Leu Ala Thr Asp Asp Ile Asp Asn Phe Gly Asn Arg Arg Ile
355 360 365 355 360 365
Arg Ala Val Gly Glu Leu Ile Gln Asn Gln Val Arg Thr Gly Leu Ser Arg Ala Val Gly Glu Leu Ile Gln Asn Gln Val Arg Thr Gly Leu Ser
370 375 380 370 375 380
Arg Met Glu Arg Val Val Arg Glu Arg Met Thr Thr Gln Asp Ile Glu Arg Met Glu Arg Val Val Arg Glu Arg Met Thr Thr Gln Asp Ile Glu
385 390 395 400 385 390 395 400
Ala Ile Thr Pro Gln Thr Leu Ile Asn Val Arg Pro Val Val Ala Ala Ala Ile Thr Pro Gln Thr Leu Ile Asn Val Arg Pro Val Val Ala Ala
405 410 415 405 410 415
Ile Lys Glu Phe Phe Gly Thr Ser Gln Leu Ser Gln Phe Met Asp Gln Ile Lys Glu Phe Phe Gly Thr Ser Gln Leu Ser Gln Phe Met Asp Gln
420 425 430 420 425 430
Asn Asn Pro Leu Ala Gly Leu Thr Asn Lys Arg Arg Leu Ser Ala Leu Asn Asn Pro Leu Ala Gly Leu Thr Asn Lys Arg Arg Leu Ser Ala Leu
435 440 445 435 440 445
Gly Pro Gly Gly Leu Ser Arg Asp Arg Ala Gly Val Glu Val Arg Asp Gly Pro Gly Gly Leu Ser Arg Asp Arg Ala Gly Val Glu Val Arg Asp
450 455 460 450 455 460
Val His Pro Ser His Tyr Gly Arg Met Cys Pro Ile Glu Thr Pro Glu Val His Pro Ser His Tyr Gly Arg Met Cys Pro Ile Glu Thr Pro Glu
465 470 475 480 465 470 475 480
Gly Pro Asn Ile Gly Leu Ile Gly Ala Leu Ala Thr Phe Ala Arg Ile Gly Pro Asn Ile Gly Leu Ile Gly Ala Leu Ala Thr Phe Ala Arg Ile
485 490 495 485 490 495
Asn Ser Phe Gly Phe Ile Glu Thr Pro Tyr Arg Lys Val Val Asp Gly Asn Ser Phe Gly Phe Ile Glu Thr Pro Tyr Arg Lys Val Val Asp Gly
500 505 510 500 505 510
Val Val Thr Asp Gln Ile Asp Tyr Leu Thr Ala Ser Glu Glu Val Asp Val Val Thr Asp Gln Ile Asp Tyr Leu Thr Ala Ser Glu Glu Val Asp
515 520 525 515 520 525
Phe Asn Ile Ala Gln Ala Asn Ala Pro Leu Asp Ala Lys Gly Arg Phe Phe Asn Ile Ala Gln Ala Asn Ala Pro Leu Asp Ala Lys Gly Arg Phe
530 535 540 530 535 540
Arg Glu Ser His Val Leu Ala Arg Pro Lys Gly Gly Ser Gly Glu Val Arg Glu Ser His Val Leu Ala Arg Pro Lys Gly Gly Ser Gly Glu Val
545 550 555 560 545 550 555 560
Asp Leu Phe Val Pro Glu Glu Ile Gly Tyr Ile Asp Val Ser Pro Arg Asp Leu Phe Val Pro Glu Glu Ile Gly Tyr Ile Asp Val Ser Pro Arg
565 570 575 565 570 575
Gln Met Val Ser Val Ala Thr Ser Leu Val Pro Phe Leu Glu His Asp Gln Met Val Ser Val Ala Thr Ser Leu Val Pro Phe Leu Glu His Asp
580 585 590 580 585 590
Asp Ala Gln Arg Ala Leu Met Gly Ala Asn Met Gln Arg Gln Ala Val Asp Ala Gln Arg Ala Leu Met Gly Ala Asn Met Gln Arg Gln Ala Val
595 600 605 595 600 605
Pro Leu Leu Arg Ser Asp Ser Pro Leu Val Gly Thr Gly Met Glu Gly Pro Leu Leu Arg Ser Asp Ser Pro Leu Val Gly Thr Gly Met Glu Gly
610 615 620 610 615 620
Tyr Thr Ala Ile Asp Ala Gly Asp Val Leu Thr Ala Glu Lys Ala Gly Tyr Thr Ala Ile Asp Ala Gly Asp Val Leu Thr Ala Glu Lys Ala Gly
625 630 635 640 625 630 635 640
Val Val Ser Glu Val Ser Ala Asp Arg Val Val Val Met Leu Asp Glu Val Val Ser Glu Val Ser Ala Asp Arg Val Val Val Met Leu Asp Glu
645 650 655 645 650 655
Gly Gly Thr Gln Glu Tyr His Leu Arg Lys Phe Asp Arg Ser Asn Gln Gly Gly Thr Gln Glu Tyr His Leu Arg Lys Phe Asp Arg Ser Asn Gln
660 665 670 660 665 670
Gly Thr Ser Tyr Asn Gln Lys Val Val Val Thr Ala Gly Glu Arg Val Gly Thr Ser Tyr Asn Gln Lys Val Val Val Thr Ala Gly Glu Arg Val
675 680 685 675 680 685
Glu Val Gly Glu Val Ile Ala Asp Gly Pro Ala Thr Glu Asn Gly Glu Glu Val Gly Glu Val Ile Ala Asp Gly Pro Ala Thr Glu Asn Gly Glu
690 695 700 690 695 700
Leu Ala Leu Gly Lys Asn Leu Leu Val Ala Phe Met Thr Trp Glu Gly Leu Ala Leu Gly Lys Asn Leu Leu Val Ala Phe Met Thr Trp Glu Gly
705 710 715 720 705 710 715 720
Tyr Asn Phe Glu Asp Ala Ile Ile Leu Ser Gln Asp Leu Val Lys Asp Tyr Asn Phe Glu Asp Ala Ile Ile Leu Ser Gln Asp Leu Val Lys Asp
725 730 735 725 730 735
Asp Thr Leu Ser Ser Ile His Ile Glu Glu Tyr Glu Val Asp Ala Arg Asp Thr Leu Ser Ser Ile His Ile Glu Glu Tyr Glu Val Asp Ala Arg
740 745 750 740 745 750
Asp Thr Lys Leu Gly Lys Glu Glu Ile Thr Arg Asp Leu Pro Asn Val Asp Thr Lys Leu Gly Lys Glu Glu Ile Thr Arg Asp Leu Pro Asn Val
755 760 765 755 760 765
Ser Pro Glu Leu Leu Lys Asp Leu Asp Glu Arg Gly Ile Ile Arg Ile Ser Pro Glu Leu Leu Lys Asp Leu Asp Glu Arg Gly Ile Ile Arg Ile
770 775 780 770 775 780
Gly Ala Glu Val Arg Pro Gly Asp Ile Leu Val Gly Lys Val Thr Pro Gly Ala Glu Val Arg Pro Gly Asp Ile Leu Val Gly Lys Val Thr Pro
785 790 795 800 785 790 795 800
Lys Gly Glu Thr Glu Leu Ser Ala Glu Glu Arg Leu Leu Arg Ala Ile Lys Gly Glu Thr Glu Leu Ser Ala Glu Glu Arg Leu Leu Arg Ala Ile
805 810 815 805 810 815
Phe Asn Glu Lys Ser Arg Glu Val Arg Asp Thr Ser Leu Lys Val Pro Phe Asn Glu Lys Ser Arg Glu Val Arg Asp Thr Ser Leu Lys Val Pro
820 825 830 820 825 830
His Gly Glu Gln Gly Thr Ile Ile Ala Val Lys Glu Phe Asn Ala Glu His Gly Glu Gln Gly Thr Ile Ile Ala Val Lys Glu Phe Asn Ala Glu
835 840 845 835 840 845
Asp Gly Asp Asp Glu Leu Gly Ser Gly Val Asn Arg Arg Val Val Val Asp Gly Asp Asp Glu Leu Gly Ser Gly Val Asn Arg Arg Val Val Val
850 855 860 850 855 860
Tyr Ile Ala Gln Lys Arg Lys Ile Thr Glu Gly Asp Lys Leu Ala Gly Tyr Ile Ala Gln Lys Arg Lys Ile Thr Glu Gly Asp Lys Leu Ala Gly
865 870 875 880 865 870 875 880
Arg His Gly Asn Lys Gly Val Ile Ala Lys Ile Leu Pro Ile Glu Asp Arg His Gly Asn Lys Gly Val Ile Ala Lys Ile Leu Pro Ile Glu Asp
885 890 895 885 890 895
Met Pro Phe Leu Ser Asp Gly Thr Pro Val Asp Ile Val Leu Asn Pro Met Pro Phe Leu Ser Asp Gly Thr Pro Val Asp Ile Val Leu Asn Pro
900 905 910 900 905 910
Leu Gly Ile Pro Gly Arg Met Asn Phe Gly Gln Val Leu Glu Thr His Leu Gly Ile Pro Gly Arg Met Asn Phe Gly Gln Val Leu Glu Thr His
915 920 925 915 920 925
Leu Gly Trp Ile Ala Lys Gln Gly Trp Lys Val Glu Gly Asn Pro Glu Leu Gly Trp Ile Ala Lys Gln Gly Trp Lys Val Glu Gly Asn Pro Glu
930 935 940 930 935 940
Trp Ala Val Lys Leu Pro Lys Asp Ala Phe Glu Ala Ala Pro Gly Thr Trp Ala Val Lys Leu Pro Lys Asp Ala Phe Glu Ala Ala Pro Gly Thr
945 950 955 960 945 950 955 960
Lys Val Ala Thr Pro Val Phe Asp Gly Ala Ser Glu Glu Glu Ile Ala Lys Val Ala Thr Pro Val Phe Asp Gly Ala Ser Glu Glu Glu Ile Ala
965 970 975 965 970 975
Gly Leu Leu Asp Ala Thr Thr Pro Thr Arg Asp Gly Val Arg Leu Ile Gly Leu Leu Asp Ala Thr Thr Pro Thr Arg Asp Gly Val Arg Leu Ile
980 985 990 980 985 990
Asp Ser Ser Gly Lys Thr Gln Leu Phe Asp Gly Arg Ser Gly Glu Pro Asp Ser Ser Gly Lys Thr Gln Leu Phe Asp Gly Arg Ser Gly Glu Pro
995 1000 1005 995 1000 1005
Phe Pro Ala Pro Ile Ser Val Gly Tyr Met Tyr Ile Leu Lys Leu Phe Pro Ala Pro Ile Ser Val Gly Tyr Met Tyr Ile Leu Lys Leu
1010 1015 1020 1010 1015 1020
His His Leu Val Asp Asp Lys Ile His Ala Arg Ser Thr Gly Pro His His Leu Val Asp Asp Lys Ile His Ala Arg Ser Thr Gly Pro
1025 1030 1035 1025 1030 1035
Tyr Ser Met Ile Thr Gln Gln Pro Leu Gly Gly Lys Ala Gln Phe Tyr Ser Met Ile Thr Gln Gln Pro Leu Gly Gly Lys Ala Gln Phe
1040 1045 1050 1040 1045 1050
Gly Gly Gln Arg Phe Gly Glu Met Glu Val Trp Ala Leu Glu Ala Gly Gly Gln Arg Phe Gly Glu Met Glu Val Trp Ala Leu Glu Ala
1055 1060 1065 1055 1060 1065
Tyr Gly Ala Ala Tyr Ala Leu Gln Glu Leu Leu Thr Ile Lys Ser Tyr Gly Ala Ala Tyr Ala Leu Gln Glu Leu Leu Thr Ile Lys Ser
1070 1075 1080 1070 1075 1080
Asp Asp Ile Leu Gly Arg Val Lys Val Tyr Glu Ala Ile Val Lys Asp Asp Ile Leu Gly Arg Val Lys Val Tyr Glu Ala Ile Val Lys
1085 1090 1095 1085 1090 1095
Gly Glu Asn Ile Gln Glu Pro Gly Ile Pro Glu Ser Phe Lys Val Gly Glu Asn Ile Gln Glu Pro Gly Ile Pro Glu Ser Phe Lys Val
1100 1105 1110 1100 1105 1110
Leu Met Lys Glu Met Gln Ser Leu Cys Leu Asn Val Glu Val Leu Leu Met Lys Glu Met Gln Ser Leu Cys Leu Asn Val Glu Val Leu
1115 1120 1125 1115 1120 1125
Ser Ala Asp Gly Thr Leu Val Asn Leu Arg Asp Thr Asp Asp Glu Ser Ala Asp Gly Thr Leu Val Asn Leu Arg Asp Thr Asp Asp Glu
1130 1135 1140 1130 1135 1140
Ala Phe Arg Ala Ala Glu Glu Leu Gly Ile Asn Ile Ser Ser Arg Ala Phe Arg Ala Ala Glu Glu Leu Gly Ile Asn Ile Ser Ser Arg
1145 1150 1155 1145 1150 1155
Phe Glu Ala Ala Ser Ile Asp Glu Ile Phe Glu Ala Ala Ser Ile Asp Glu Ile
1160 1165 1160 1165
<210> 6<210> 6
<211> 1188<211> 1188
<212> ДНК<212> DNA
<213> Microbacterium sp.<213> Microbacterium sp.
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-014-C06<223> SGI bacterial isolate SGI-014-C06
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI Ген ID SG1MICG851004<223> SGI Gene ID SG1MICG851004
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> кодирует пептидную последовательность SEQ ID NO 7<223> encodes the peptide sequence of SEQ ID NO 7
<400> 6<400> 6
ttgccgactc gatgtcggtg gcctctccta cggtggaaaa caagccgaag agccattacg60ttgccgactc gatgtcggtg gcctctccta cggtggaaaa caagccgaag agccattacg60
ccttgtcgga gagttgctcc caaccgggag cgccgcgaca gcctacaggc ggcaccacgc 120ccttgtcgga gagttgctcc caaccgggag cgccgcgaca gcctacaggc ggcaccacgc 120
gcgcagaagg agcacatcat gccatcaccc gccgaccgcg agaagtccct cgagaccgcc 180gcgcagaagg agcacatcat gccatcaccc gccgaccgcg agaagtccct cgagaccgcc 180
ctcgcccaga tcgaccgcca gttcggaaag ggctcggtca tgcggctggg cagcgatgag 240ctcgcccaga tcgaccgcca gttcggaaag ggctcggtca tgcggctggg cagcgatgag 240
cgcgcccccg tggccgtcat ccccaccggc tccatcgccc tcgacgtcgc cctcggcgtc 300300
ggaggactcc cgcgtggtcg catcgtcgag atctacggac cggagtcctc cggtaagacg 360ggaggactcc cgcgtggtcg catcgtcgag atctacggac cggagtcctc cggtaagacg 360
acgctcaccc tgcacgcgat cgcgaacgca cagcgtgccg gtggcatcgc ggcgttcatc 420acgctcaccc tgcacgcgat cgcgaacgca cagcgtgccg gtggcatcgc ggcgttcatc 420
gacgccgagc acgcgctcga ccccgactac gccgccaagc tcggcgtcga catcgatgcg 480gacgccgagc acgcgctcga ccccgactac gccgccaagc tcggcgtcga catcgatgcg 480
ctcctggtct cgcagcccga cacgggtgag caggcgctcg agatcgccga catgctcgtg 540ctcctggtct cgcagcccga cacgggtgag caggcgctcg agatcgccga catgctcgtg 540
cgctccggtg cgatcgacct catcgtcatc gactccgtcg cggccctcgt gccgcgcgcc 600cgctccggtg cgatcgacct catcgtcatc gactccgtcg cggccctcgt gccgcgcgcc 600
gagatcgagg gcgagatggg tgactcgcac gtcggtctgc aggctcgcct catgtcgcag 660gagatcgagg gcgagatggg tgactcgcac gtcggtctgc aggctcgcct catgtcgcag 660
gcgctgcgaa agctcaccgg tggtctgaac cagacgaaca ccacgatgat cttcatcaac 720gcgctgcgaa agctcaccgg tggtctgaac cagacgaaca ccacgatgat cttcatcaac 720
cagctccgcg agaagatcgg tgtcttcttc ggttcgccgg agaccactgc cggcggtaag 780cagctccgcg agaagatcgg tgtcttcttc ggttcgccgg agaccactgc cggcggtaag 780
gcgctcaagt tctacgcctc ggtccgcatg gacatccgtc gtatcgagac gctcaaggac 840gcgctcaagt tctacgcctc ggtccgcatg gacatccgtc gtatcgagac gctcaaggac 840
ggtactgacg ctgtcggtaa ccgcaccagg gtcaaggtcg tcaagaacaa gatggctccg 900ggtactgacg ctgtcggtaa ccgcaccagg gtcaaggtcg tcaagaacaa gatggctccg 900
cctttcaagc aggccgagtt cgacatcctc tacggcgtcg gcatctcgcg cgagggaagc 960cctttcaagc aggccgagtt cgacatcctc tacggcgtcg gcatctcgcg cgagggaagc 960
ctgatcgact tcggtgtcga gcatgcgatc gtcaagaagt ccggttcctg gtatacgtac 1020ctgatcgact tcggtgtcga gcatgcgatc gtcaagaagt ccggttcctg gtatacgtac 1020
gacggtgacc agctgggtca gggcaaggag aacgcgcgga cgttcctgct caacaacccc 1080gacggtgacc agctgggtca gggcaaggag aacgcgcgga cgttcctgct caacaacccc 1080
gacatcgcgc tggcgatcga gacgcagatc aagcagaagc tcggcatcgg cggtcccgcc 1140gacatcgcgc tggcgatcga gacgcagatc aagcagaagc tcggcatcgg cggtcccgcc 1140
gcggcgcctg ctgcggcaga cgagctcgct gagcgtcgtc cggcctga 1188gcggcgcctg ctgcggcaga cgagctcgct gagcgtcgtc cggcctga 1188
<210> 7<210> 7
<211> 395<211> 395
<212> ПРОТЕИН<212> PROTEIN
<213> Microbacterium sp.<213> Microbacterium sp.
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-014-C06<223> SGI bacterial isolate SGI-014-C06
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI пептид ID SG1MICT851004<223> SGI peptide ID SG1MICT851004
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> рекомбиназа A<223> recombinase A
<400> 7<400> 7
Met Pro Thr Arg Cys Arg Trp Pro Leu Leu Arg Trp Lys Thr Ser Arg Met Pro Thr Arg Cys Arg Trp Pro Leu Leu Arg Trp Lys Thr Ser Arg
1 5 10 15 1 5 10 15
Arg Ala Ile Thr Pro Cys Arg Arg Val Ala Pro Asn Arg Glu Arg Arg Arg Ala Ile Thr Pro Cys Arg Arg Val Ala Pro Asn Arg Glu Arg Arg
20 25 30 20 25 30
Asp Ser Leu Gln Ala Ala Pro Arg Ala Gln Lys Glu His Ile Met Pro Asp Ser Leu Gln Ala Ala Pro Arg Ala Gln Lys Glu His Ile Met Pro
35 40 45 35 40 45
Ser Pro Ala Asp Arg Glu Lys Ser Leu Glu Thr Ala Leu Ala Gln Ile Ser Pro Ala Asp Arg Glu Lys Ser Leu Glu Thr Ala Leu Ala Gln Ile
50 55 60 50 55 60
Asp Arg Gln Phe Gly Lys Gly Ser Val Met Arg Leu Gly Ser Asp Glu Asp Arg Gln Phe Gly Lys Gly Ser Val Met Arg Leu Gly Ser Asp Glu
65 70 75 80 65 70 75 80
Arg Ala Pro Val Ala Val Ile Pro Thr Gly Ser Ile Ala Leu Asp Val Arg Ala Pro Val Ala Val Ile Pro Thr Gly Ser Ile Ala Leu Asp Val
85 90 95 85 90 95
Ala Leu Gly Val Gly Gly Leu Pro Arg Gly Arg Ile Val Glu Ile Tyr Ala Leu Gly Val Gly Gly Leu Pro Arg Gly Arg Ile Val Glu Ile Tyr
100 105 110 100 105 110
Gly Pro Glu Ser Ser Gly Lys Thr Thr Leu Thr Leu His Ala Ile Ala Gly Pro Glu Ser Ser Gly Lys Thr Thr Leu Thr Leu His Ala Ile Ala
115 120 125 115 120 125
Asn Ala Gln Arg Ala Gly Gly Ile Ala Ala Phe Ile Asp Ala Glu His Asn Ala Gln Arg Ala Gly Gly Ile Ala Ala Phe Ile Asp Ala Glu His
130 135 140 130 135 140
Ala Leu Asp Pro Asp Tyr Ala Ala Lys Leu Gly Val Asp Ile Asp Ala Ala Leu Asp Pro Asp Tyr Ala Ala Lys Leu Gly Val Asp Ile Asp Ala
145 150 155 160 145 150 155 160
Leu Leu Val Ser Gln Pro Asp Thr Gly Glu Gln Ala Leu Glu Ile Ala Leu Leu Val Ser Gln Pro Asp Thr Gly Glu Gln Ala Leu Glu Ile Ala
165 170 175 165 170 175
Asp Met Leu Val Arg Ser Gly Ala Ile Asp Leu Ile Val Ile Asp Ser Asp Met Leu Val Arg Ser Gly Ala Ile Asp Leu Ile Val Ile Asp Ser
180 185 190 180 185 190
Val Ala Ala Leu Val Pro Arg Ala Glu Ile Glu Gly Glu Met Gly Asp Val Ala Ala Leu Val Pro Arg Ala Glu Ile Glu Gly Glu Met Gly Asp
195 200 205 195 200 205
Ser His Val Gly Leu Gln Ala Arg Leu Met Ser Gln Ala Leu Arg Lys Ser His Val Gly Leu Gln Ala Arg Leu Met Ser Gln Ala Leu Arg Lys
210 215 220 210 215 220
Leu Thr Gly Gly Leu Asn Gln Thr Asn Thr Thr Met Ile Phe Ile Asn Leu Thr Gly Gly Leu Asn Gln Thr Asn Thr Thr Met Ile Phe Ile Asn
225 230 235 240 225 230 235 240
Gln Leu Arg Glu Lys Ile Gly Val Phe Phe Gly Ser Pro Glu Thr Thr Gln Leu Arg Glu Lys Ile Gly Val Phe Phe Gly Ser Pro Glu Thr Thr
245 250 255 245 250 255
Ala Gly Gly Lys Ala Leu Lys Phe Tyr Ala Ser Val Arg Met Asp Ile Ala Gly Gly Lys Ala Leu Lys Phe Tyr Ala Ser Val Arg Met Asp Ile
260 265 270 260 265 270
Arg Arg Ile Glu Thr Leu Lys Asp Gly Thr Asp Ala Val Gly Asn Arg Arg Arg Ile Glu Thr Leu Lys Asp Gly Thr Asp Ala Val Gly Asn Arg
275 280 285 275 280 285
Thr Arg Val Lys Val Val Lys Asn Lys Met Ala Pro Pro Phe Lys Gln Thr Arg Val Lys Val Val Lys Asn Lys Met Ala Pro Pro Phe Lys Gln
290 295 300 290 295 300
Ala Glu Phe Asp Ile Leu Tyr Gly Val Gly Ile Ser Arg Glu Gly Ser Ala Glu Phe Asp Ile Leu Tyr Gly Val Gly Ile Ser Arg Glu Gly Ser
305 310 315 320 305 310 315 320
Leu Ile Asp Phe Gly Val Glu His Ala Ile Val Lys Lys Ser Gly Ser Leu Ile Asp Phe Gly Val Glu His Ala Ile Val Lys Lys Ser Gly Ser
325 330 335 325 330 335
Trp Tyr Thr Tyr Asp Gly Asp Gln Leu Gly Gln Gly Lys Glu Asn Ala Trp Tyr Thr Tyr Asp Gly Asp Gln Leu Gly Gln Gly Lys Glu Asn Ala
340 345 350 340 345 350
Arg Thr Phe Leu Leu Asn Asn Pro Asp Ile Ala Leu Ala Ile Glu Thr Arg Thr Phe Leu Leu Asn Asn Pro Asp Ile Ala Leu Ala Ile Glu Thr
355 360 365 355 360 365
Gln Ile Lys Gln Lys Leu Gly Ile Gly Gly Pro Ala Ala Ala Pro Ala Gln Ile Lys Gln Lys Leu Gly Ile Gly Gly Pro Ala Ala Ala Pro Ala
370 375 380 370 375 380
Ala Ala Asp Glu Leu Ala Glu Arg Arg Pro Ala Ala Ala Asp Glu Leu Ala Glu Arg Arg Pro Ala
385 390 395 385 390 395
<210> 8<210> 8
<211> 2175<211> 2175
<212> ДНК<212> DNA
<213> Microbacterium sp.<213> Microbacterium sp.
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-014-C06<223> SGI bacterial isolate SGI-014-C06
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI Ген ID SG1MICG849768<223> SGI Gene ID SG1MICG849768
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> кодирует пептидную последовательность SEQ ID NO 9<223> encodes the peptide sequence of SEQ ID NO 9
<400> 8<400> 8
atgtacccca tgatcgatcc cgcactcgcc gacgccggcc tcggtgacgc cgaagacgac60atgtacccca tgatcgatcc cgcactcgcc gacgccggcc tcggtgacgc cgaagacgac60
gacttcgacg ccatcgagtc tcccgactcc cagctcccgg accaccgcta cctggatcgc 120gacttcgacg ccatcgagtc tcccgactcc cagctcccgg accaccgcta cctggatcgc 120
gagctgagct ggctcgcctt caaccagcgc gtaatggagc tcgccgagga tccgtcactg 180gagctgagct ggctcgcctt caaccagcgc gtaatggagc tcgccgagga tccgtcactg 180
cccgaactcg agcgggcgaa cttcctggcg atcttcgcca gcaacctcga cgagttcttc 240cccgaactcg agcgggcgaa cttcctggcg atcttcgcca gcaacctcga cgagttcttc 240
atggtgcgcg tcgccggcct caagcgccgc atcatgaccg gcctggccgt gccgacgaac 300atggtgcgcg tcgccggcct caagcgccgc atcatgaccg gcctggccgt gccgacgaac 300
atcggccgct cccccgtcga cgcgctcgcc gacatctccc gcgaagcgca cgccctgcag 360atcggccgct cccccgtcga cgcgctcgcc gacatctccc gcgaagcgca cgccctgcag 360
ctgcgtcacg ccgaggcctg gacctcgctc gtgcgccccg ccctggccga ctccggcatc 420ctgcgtcacg ccgaggcctg gacctcgctc gtgcgccccg ccctggccga ctccggcatc 420
gagatcacgg actggtccga gctgaccgac gacgagcgct ccggattgtc cgagtacttc 480gagatcacgg actggtccga gctgaccgac gacgagcgct ccggattgtc cgagtacttc 480
cagctccagg tcttcccggt gctgatgccg ctcgcggtcg acccggcgca tccgttcccc 540cagctccagg tcttcccggt gctgatgccg ctcgcggtcg acccggcgca tccgttcccc 540
tacatctccg gcctgtcgct gaacctcgcg atccgcatcc gcaatgcccg caccgggcgc 600tacatctccg gcctgtcgct gaacctcgcg atccgcatcc gcaatgcccg caccgggcgc 600
caggagttcg cgcgcctcaa ggtgccgccc atgctccccc gcttcgtgga ggtgccgggc 660caggagttcg cgcgcctcaa ggtgccgccc atgctccccc gcttcgtgga ggtgccgggc 660
ggcggcgaga tcaagcgctt cctgcgcctg gaggaactga tcgcgaacca cctcggcgac 720ggcggcgaga tcaagcgctt cctgcgcctg gaggaactga tcgcgaacca cctcggcgac 720
ctgttccccg gcatggaggt gctcgaccac cacgcgttcc gcctcacccg caacgaagac 780ctgttccccg gcatggaggt gctcgaccac cacgcgttcc gcctcacccg caacgaagac 780
gtggagatcg aggaagacga gagcgagaac ctcatccagg cgctcgaggc cgagctgctg 840gtggagatcg aggaagacga gagcgagaac ctcatccagg cgctcgaggc cgagctgctg 840
cgccgtcgat tcggcccgcc gatccgcctc gagatcacgg acgacatgga cgaggtcacg 900cgccgtcgat tcggcccgcc gatccgcctc gagatcacgg acgacatgga cgaggtcacg 900
atggacctgc tcgtccgcga gctcgacatc accgacctgg aggtctaccg cctccccggt 960atggacctgc tcgtccgcga gctcgacatc accgacctgg aggtctaccg cctccccggt 960
ccgctcgacc tgcgcggact gttcgatctg tcccgcatcg accgtcccga cctgcgctac 1020ccgctcgacc tgcgcggact gttcgatctg tcccgcatcg accgtcccga cctgcgctac 1020
ccgccgcacc tgcccaccac ggccgtggcc ttccagcccg caggatcgag caaccgcgcc 10801080
gacatcttca aagcgatccg caagtcggat gtgctcgtgc accacccgta cgagtcgttc 1140gacatcttca aagcgatccg caagtcggat gtgctcgtgc accacccgta cgagtcgttc 1140
acgaccagcg tgcaggcgtt cctcgaacag gccgcccgcg acccgcacgt gctcgccatc 1200acgaccagcg tgcaggcgtt cctcgaacag gccgcccgcg acccgcacgt gctcgccatc 1200
aagcagaccc tgtaccgcac ctcgggcgac agcccggtcg tgcaggcgct gatcgacgcg 12601260
gccgaagccg gcaagcaggt gctggccctc gtcgaggtga aggcccgttt cgacgaggcc 1320gccgaagccg gcaagcaggt gctggccctc gtcgaggtga aggcccgttt cgacgaggcc 1320
aacaacatcg tctgggcacg caagctcgag aaggccggcg tgcacgtggt ctacggtctc 1380aacaacatcg tctgggcacg caagctcgag aaggccggcg tgcacgtggt ctacggtctc 1380
gtcggactca agacccactg caagctcgcc ctcgtcatcc gcgaggaaga ggggatgctg 1440gtcggactca agacccactg caagctcgcc ctcgtcatcc gcgaggaaga ggggatgctg 1440
cgccactact cgcacgtcgg caccggcaac tacaacccca agaccagccg catctacgag 1500cgccactact cgcacgtcgg caccggcaac tacaacccca agaccagccg catctacgag 1500
gacttcggtc tgttcaccgc agacgcgcag gtcggcaaag acctgacacg cctgttcaac 1560gacttcggtc tgttcaccgc agacgcgcag gtcggcaaag acctgacacg cctgttcaac 1560
gagctcagcg gctacgcgat cgagaagaag ttcaagcgcc tgctggtcgc cccgctgcac 1620gagctcagcg gctacgcgat cgagaagaag ttcaagcgcc tgctggtcgc cccgctgcac 1620
ctgcgcaagg gcctcatccg ccagatcgac gccgagcgca ggaacgccga ggcggggatc 1680ctgcgcaagg gcctcatccg ccagatcgac gccgagcgca ggaacgccga ggcggggatc 1680
cccgcgcaca tccgcatcaa ggtgaactcg atggtcgatg aggagatcat cgacgcgctc 1740cccgcgcaca tccgcatcaa ggtgaactcg atggtcgatg aggagatcat cgacgcgctc 1740
taccgcgcga gcgcggccgg ggtgaaggtc gacgtgtggg tgcgcggcat ctgcagcctg 1800taccgcgcga gcgcggccgg ggtgaaggtc gacgtgtggg tgcgcggcat ctgcagcctg 1800
cgcaccgacc tcgacggcat cagtgacaac atcacggtgc gcagcatcct cggccgctac 1860cgcaccgacc tcgacggcat cagtgacaac atcacggtgc gcagcatcct cggccgctac 1860
ctcgagcact cccgcatctt cgcgttcgag aacgccggcg acccgcaggt gtacatcggc 1920ctcgagcact cccgcatctt cgcgttcgag aacgccggcg acccgcaggt gtacatcggc 1920
agcgccgaca tgatgcaccg caacctcgac cgtcgtgtgg aggcgctggt gcgcgtcacc 1980agcgccgaca tgatgcaccg caacctcgac cgtcgtgtgg aggcgctggt gcgcgtcacc 1980
gacgccgacc acctcaagga actgcaggcg ttcttcgacc tcgcgatgga cgacggaacc 2040gacgccgacc acctcaagga actgcaggcg ttcttcgacc tcgcgatgga cgacggaacc 2040
tcgtcgtggc atctcggcgc cggcggcgtc tgggagcgcc acgccgtgaa cgccgacggc 2100tcgtcgtggc atctcggcgc cggcggcgtc tgggagcgcc acgccgtgaa cgccgacggc 2100
aagccgctga tcgacctgca ggataagacc atggggttga tccagcggcg ccgccgcgcg 2160aagccgctga tcgacctgca ggataagacc atggggttga tccagcggcg ccgccgcgcg 2160
cgggcggttc gatga 2175cgggcggttc gatga 2175
<210> 9<210> 9
<211> 724<211> 724
<212> ПРОТЕИН<212> PROTEIN
<213> Microbacterium sp.<213> Microbacterium sp.
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-014-C06<223> SGI bacterial isolate SGI-014-C06
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI пептид ID SG1MICT849768<223> SGI peptide ID SG1MICT849768
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> полифосфат киназа<223> polyphosphate kinase
<400> 9<400> 9
Met Tyr Pro Met Ile Asp Pro Ala Leu Ala Asp Ala Gly Leu Gly Asp Met Tyr Pro Met Ile Asp Pro Ala Leu Ala Asp Ala Gly Leu Gly Asp
1 5 10 15 1 5 10 15
Ala Glu Asp Asp Asp Phe Asp Ala Ile Glu Ser Pro Asp Ser Gln Leu Ala Glu Asp Asp Asp Phe Asp Ala Ile Glu Ser Pro Asp Ser Gln Leu
20 25 30 20 25 30
Pro Asp His Arg Tyr Leu Asp Arg Glu Leu Ser Trp Leu Ala Phe Asn Pro Asp His Arg Tyr Leu Asp Arg Glu Leu Ser Trp Leu Ala Phe Asn
35 40 45 35 40 45
Gln Arg Val Met Glu Leu Ala Glu Asp Pro Ser Leu Pro Glu Leu Glu Gln Arg Val Met Glu Leu Ala Glu Asp Pro Ser Leu Pro Glu Leu Glu
50 55 60 50 55 60
Arg Ala Asn Phe Leu Ala Ile Phe Ala Ser Asn Leu Asp Glu Phe Phe Arg Ala Asn Phe Leu Ala Ile Phe Ala Ser Asn Leu Asp Glu Phe Phe
65 70 75 80 65 70 75 80
Met Val Arg Val Ala Gly Leu Lys Arg Arg Ile Met Thr Gly Leu Ala Met Val Arg Val Ala Gly Leu Lys Arg Arg Ile Met Thr Gly Leu Ala
85 90 95 85 90 95
Val Pro Thr Asn Ile Gly Arg Ser Pro Val Asp Ala Leu Ala Asp Ile Val Pro Thr Asn Ile Gly Arg Ser Pro Val Asp Ala Leu Ala Asp Ile
100 105 110 100 105 110
Ser Arg Glu Ala His Ala Leu Gln Leu Arg His Ala Glu Ala Trp Thr Ser Arg Glu Ala His Ala Leu Gln Leu Arg His Ala Glu Ala Trp Thr
115 120 125 115 120 125
Ser Leu Val Arg Pro Ala Leu Ala Asp Ser Gly Ile Glu Ile Thr Asp Ser Leu Val Arg Pro Ala Leu Ala Asp Ser Gly Ile Glu Ile Thr Asp
130 135 140 130 135 140
Trp Ser Glu Leu Thr Asp Asp Glu Arg Ser Gly Leu Ser Glu Tyr Phe Trp Ser Glu Leu Thr Asp Asp Glu Arg Ser Gly Leu Ser Glu Tyr Phe
145 150 155 160 145 150 155 160
Gln Leu Gln Val Phe Pro Val Leu Met Pro Leu Ala Val Asp Pro Ala Gln Leu Gln Val Phe Pro Val Leu Met Pro Leu Ala Val Asp Pro Ala
165 170 175 165 170 175
His Pro Phe Pro Tyr Ile Ser Gly Leu Ser Leu Asn Leu Ala Ile Arg His Pro Phe Pro Tyr Ile Ser Gly Leu Ser Leu Asn Leu Ala Ile Arg
180 185 190 180 185 190
Ile Arg Asn Ala Arg Thr Gly Arg Gln Glu Phe Ala Arg Leu Lys Val Ile Arg Asn Ala Arg Thr Gly Arg Gln Glu Phe Ala Arg Leu Lys Val
195 200 205 195 200 205
Pro Pro Met Leu Pro Arg Phe Val Glu Val Pro Gly Gly Gly Glu Ile Pro Pro Met Leu Pro Arg Phe Val Glu Val Pro Gly Gly Gly Glu Ile
210 215 220 210 215 220
Lys Arg Phe Leu Arg Leu Glu Glu Leu Ile Ala Asn His Leu Gly Asp Lys Arg Phe Leu Arg Leu Glu Glu Leu Ile Ala Asn His Leu Gly Asp
225 230 235 240 225 230 235 240
Leu Phe Pro Gly Met Glu Val Leu Asp His His Ala Phe Arg Leu Thr Leu Phe Pro Gly Met Glu Val Leu Asp His His Ala Phe Arg Leu Thr
245 250 255 245 250 255
Arg Asn Glu Asp Val Glu Ile Glu Glu Asp Glu Ser Glu Asn Leu Ile Arg Asn Glu Asp Val Glu Ile Glu Glu Asp Glu Ser Glu Asn Leu Ile
260 265 270 260 265 270
Gln Ala Leu Glu Ala Glu Leu Leu Arg Arg Arg Phe Gly Pro Pro Ile Gln Ala Leu Glu Ala Glu Leu Leu Arg Arg Arg Phe Gly Pro Pro Ile
275 280 285 275 280 285
Arg Leu Glu Ile Thr Asp Asp Met Asp Glu Val Thr Met Asp Leu Leu Arg Leu Glu Ile Thr Asp Asp Met Asp Glu Val Thr Met Asp Leu Leu
290 295 300 290 295 300
Val Arg Glu Leu Asp Ile Thr Asp Leu Glu Val Tyr Arg Leu Pro Gly Val Arg Glu Leu Asp Ile Thr Asp Leu Glu Val Tyr Arg Leu Pro Gly
305 310 315 320 305 310 315 320
Pro Leu Asp Leu Arg Gly Leu Phe Asp Leu Ser Arg Ile Asp Arg Pro Pro Leu Asp Leu Arg Gly Leu Phe Asp Leu Ser Arg Ile Asp Arg Pro
325 330 335 325 330 335
Asp Leu Arg Tyr Pro Pro His Leu Pro Thr Thr Ala Val Ala Phe Gln Asp Leu Arg Tyr Pro Pro His Leu Pro Thr Thr Ala Val Ala Phe Gln
340 345 350 340 345 350
Pro Ala Gly Ser Ser Asn Arg Ala Asp Ile Phe Lys Ala Ile Arg Lys Pro Ala Gly Ser Ser Asn Arg Ala Asp Ile Phe Lys Ala Ile Arg Lys
355 360 365 355 360 365
Ser Asp Val Leu Val His His Pro Tyr Glu Ser Phe Thr Thr Ser Val Ser Asp Val Leu Val His His Pro Tyr Glu Ser Phe Thr Thr Ser Val
370 375 380 370 375 380
Gln Ala Phe Leu Glu Gln Ala Ala Arg Asp Pro His Val Leu Ala Ile Gln Ala Phe Leu Glu Gln Ala Ala Arg Asp Pro His Val Leu Ala Ile
385 390 395 400 385 390 395 400
Lys Gln Thr Leu Tyr Arg Thr Ser Gly Asp Ser Pro Val Val Gln Ala Lys Gln Thr Leu Tyr Arg Thr Ser Gly Asp Ser Pro Val Val Gln Ala
405 410 415 405 410 415
Leu Ile Asp Ala Ala Glu Ala Gly Lys Gln Val Leu Ala Leu Val Glu Leu Ile Asp Ala Ala Glu Ala Gly Lys Gln Val Leu Ala Leu Val Glu
420 425 430 420 425 430
Val Lys Ala Arg Phe Asp Glu Ala Asn Asn Ile Val Trp Ala Arg Lys Val Lys Ala Arg Phe Asp Glu Ala Asn Asn Ile Val Trp Ala Arg Lys
435 440 445 435 440 445
Leu Glu Lys Ala Gly Val His Val Val Tyr Gly Leu Val Gly Leu Lys Leu Glu Lys Ala Gly Val His Val Val Tyr Gly Leu Val Gly Leu Lys
450 455 460 450 455 460
Thr His Cys Lys Leu Ala Leu Val Ile Arg Glu Glu Glu Gly Met Leu Thr His Cys Lys Leu Ala Leu Val Ile Arg Glu Glu Glu Gly Met Leu
465 470 475 480 465 470 475 480
Arg His Tyr Ser His Val Gly Thr Gly Asn Tyr Asn Pro Lys Thr Ser Arg His Tyr Ser His Val Gly Thr Gly Asn Tyr Asn Pro Lys Thr Ser
485 490 495 485 490 495
Arg Ile Tyr Glu Asp Phe Gly Leu Phe Thr Ala Asp Ala Gln Val Gly Arg Ile Tyr Glu Asp Phe Gly Leu Phe Thr Ala Asp Ala Gln Val Gly
500 505 510 500 505 510
Lys Asp Leu Thr Arg Leu Phe Asn Glu Leu Ser Gly Tyr Ala Ile Glu Lys Asp Leu Thr Arg Leu Phe Asn Glu Leu Ser Gly Tyr Ala Ile Glu
515 520 525 515 520 525
Lys Lys Phe Lys Arg Leu Leu Val Ala Pro Leu His Leu Arg Lys Gly Lys Lys Phe Lys Arg Leu Leu Val Ala Pro Leu His Leu Arg Lys Gly
530 535 540 530 535 540
Leu Ile Arg Gln Ile Asp Ala Glu Arg Arg Asn Ala Glu Ala Gly Ile Leu Ile Arg Gln Ile Asp Ala Glu Arg Arg Asn Ala Glu Ala Gly Ile
545 550 555 560 545 550 555 560
Pro Ala His Ile Arg Ile Lys Val Asn Ser Met Val Asp Glu Glu Ile Pro Ala His Ile Arg Ile Lys Val Asn Ser Met Val Asp Glu Glu Ile
565 570 575 565 570 575
Ile Asp Ala Leu Tyr Arg Ala Ser Ala Ala Gly Val Lys Val Asp Val Ile Asp Ala Leu Tyr Arg Ala Ser Ala Ala Gly Val Lys Val Asp Val
580 585 590 580 585 590
Trp Val Arg Gly Ile Cys Ser Leu Arg Thr Asp Leu Asp Gly Ile Ser Trp Val Arg Gly Ile Cys Ser Leu Arg Thr Asp Leu Asp Gly Ile Ser
595 600 605 595 600 605
Asp Asn Ile Thr Val Arg Ser Ile Leu Gly Arg Tyr Leu Glu His Ser Asp Asn Ile Thr Val Arg Ser Ile Leu Gly Arg Tyr Leu Glu His Ser
610 615 620 610 615 620
Arg Ile Phe Ala Phe Glu Asn Ala Gly Asp Pro Gln Val Tyr Ile Gly Arg Ile Phe Ala Phe Glu Asn Ala Gly Asp Pro Gln Val Tyr Ile Gly
625 630 635 640 625 630 635 640
Ser Ala Asp Met Met His Arg Asn Leu Asp Arg Arg Val Glu Ala Leu Ser Ala Asp Met Met His Arg Asn Leu Asp Arg Arg Val Glu Ala Leu
645 650 655 645 650 655
Val Arg Val Thr Asp Ala Asp His Leu Lys Glu Leu Gln Ala Phe Phe Val Arg Val Thr Asp Ala Asp His Leu Lys Glu Leu Gln Ala Phe Phe
660 665 670 660 665 670
Asp Leu Ala Met Asp Asp Gly Thr Ser Ser Trp His Leu Gly Ala Gly Asp Leu Ala Met Asp Asp Gly Thr Ser Ser Trp His Leu Gly Ala Gly
675 680 685 675 680 685
Gly Val Trp Glu Arg His Ala Val Asn Ala Asp Gly Lys Pro Leu Ile Gly Val Trp Glu Arg His Ala Val Asn Ala Asp Gly Lys Pro Leu Ile
690 695 700 690 695 700
Asp Leu Gln Asp Lys Thr Met Gly Leu Ile Gln Arg Arg Arg Arg Ala Asp Leu Gln Asp Lys Thr Met Gly Leu Ile Gln Arg Arg Arg Arg Ala
705 710 715 720 705 710 715 720
Arg Ala Val Arg Arg Ala Val Arg
<210> 10<210> 10
<211> 1390<211> 1390
<212> ДНК<212> DNA
<213> Microbacterium sp.<213> Microbacterium sp.
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-005-G08<223> SGI bacterial isolate SGI-005-G08
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> кодирует 16S рибосомную РНК<223> encodes 16S ribosomal RNA
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<222> (29)..(36)<222> (29)..(36)
<223> n есть a, c, g, t и другие<223> n is a, c, g, t and others
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<222> (38)..(41)<222> (38)..(41)
<223> n есть a, c, g, t и другие<223> n is a, c, g, t and others
<400> 10<400> 10
aacggtgaac acggagcttg ctctgtggnn nnnnnngnnn ncgggtgagt aacacgtgag60aacggtgaac acggagcttg ctctgtggnn nnnnnngnnn ncgggtgagt aacacgtgag60
caacctgccc ctgactctgg gataagcgct ggaaacggcg tctaatactg gatacgagta 120caacctgccc ctgactctgg gtaagcgct ggaaacggcg tctaatactg gatacgagta 120
gcgatcgcat ggtcagctac tggaaagatt ttttggttgg ggatgggctc gcggcctatc 180gcgatcgcat ggtcagctac tggaaagatt ttttggttgg ggatgggctc gcggcctatc 180
agcttgttgg tgaggtaatg gctcaccaag gcgtcgacgg gtagccggcc tgagagggtg 240agcttgttgg tgaggtaatg gctcaccaag gcgtcgacgg gtagccggcc tgagagggtg 240
accggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 300accggccaca ctgggactga gacacggccc agactcctac gggaggcagc agtggggaat 300
attgcacaat gggcggaagc ctgatgcagc aacgccgcgt gagggatgac ggccttcggg 360360
ttgtaaacct cttttagcag ggaagaagcg aaagtgacgg tacctgcaga aaaagcgccg 420ttgtaaacct cttttagcag ggaagaagcg aaagtgacgg tacctgcaga aaaagcgccg 420
gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggcgc aagcgttatc cggaattatt 480gctaactacg tgccagcagc cgcggtaata cgtagggcgc aagcgttatc cggaattatt 480
gggcgtaaag agctcgtagg cggtttgtcg cgtctgctgt gaaatcccga ggctcaacct 540gggcgtaaag agctcgtagg cggtttgtcg cgtctgctgt gaaatcccga ggctcaacct 540
cgggcctgca gtgggtacgg gcagactaga gtgcggtagg ggagattgga attcctggtg 600cgggcctgca gtgggtacgg gcagactaga gtgcggtagg ggagattgga attcctggtg 600
tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga acaccgatgg cgaaggcaga tctctgggcc 660tagcggtgga atgcgcagat atcaggagga acaccgatgg cgaaggcaga tctctgggcc 660
gtaactgacg ctgaggagcg aaagggtggg gagcaaacag gcttagatac cctggtagtc 720gtaactgacg ctgaggagcg aaaggggtggg gagcaaacag gcttagatac cctggtagtc 720
caccccgtaa acgttgggaa ctagttgtgg ggtccattcc acggattccg tgacgcagct 780caccccgtaa acgttgggaa ctagttgtgg ggtccattcc acggattccg tgacgcagct 780
aacgcattaa gttccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga 840aacgcattaa gttccccgcc tggggagtac ggccgcaagg ctaaaactca aaggaattga 840
cggggacccg cacaagcggc ggagcatgcg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta 900cggggacccg cacaagcggc ggagcatgcg gattaattcg atgcaacgcg aagaacctta 900
ccaaggcttg acatatacga gaacgggcca gaaatggtca actctttgga cactcgtaaa 960ccaaggcttg acatatacga gaacggggcca gaaatggtca actctttggga cactcgtaaa 960
caggtggtgc atggttgtcg tcagctcgtg tcgtgagatg ttgggttaag tcccgcaacg 10201020
agcgcaaccc tcgttctatg ttgccagcac gtaatggtgg gaactcatgg gatactgccg 1080agcgcaaccc tcgttctatg ttgccagcac gtaatggtgg gaactcatgg gatactgccg 1080
gggtcaactc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtcttgggc 1140gggtcaactc ggaggaaggt ggggatgacg tcaaatcatc atgcccctta tgtcttgggc 1140
ttcacgcatg ctacaatggc cggtacaaag ggctgcaata ccgtgaggtg gagcgaatcc 1200ttcacgcatg ctacaatggc cggtacaaag ggctgcaata ccgtgaggtg gagcgaatcc 1200
caaaaagccg gtcccagttc ggattgaggt ctgcaactcg acctcatgaa gtcggagtcg 1260caaaaagccg gtcccagttc ggattgaggt ctgcaactcg acctcatgaa gtcggagtcg 1260
ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc 1320ctagtaatcg cagatcagca acgctgcggt gaatacgttc ccgggtcttg tacacaccgc 1320
ccgtcaagtc atgaaagtcg gtaacacctg aagccggtgg cctaaccctt gtggagggag 1380ccgtcaagtc atgaaagtcg gtaacacctg aagccggtgg cctaaccctt gtggagggag 1380
ccgtcgaagg 1390ccgtcgaagg 1390
<210> 11<210> 11
<211> 532<211> 532
<212> ДНК<212> DNA
<213> Mycosphaerella sp.<213> Mycosphaerella sp.
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-010-H11<223> SGI bacterial isolate SGI-010-H11
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> Внутренний транскрибированный спейсер 1_5.8S рибосомная ДНК<223> Internal transcribed spacer 1_5.8S ribosomal DNA
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<222> (43)..(43)<222> (43)..(43)
<223> n представляет собой a, c, g или t<223> n is a, c, g or t
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<222> (526)..(526)<222> (526)..(526)
<223> n представляет собой a, c, g или t<223> n is a, c, g or t
<400> 11<400> 11
cggagggatc attaatgagt gagggggcca cccccaacct ccnacccttt gtgaacgcat60cggagggatc attaatgagt gagggggcca cccccaacct ccnacccttt gtgaacgcat60
catgttgctt cgggggcgac cctgccgttc gcggcattcc ccccggaggt catcaaaaca 120catgttgctt cgggggcgac cctgccgttc gcggcattcc ccccgggaggt catcaaaaca 120
ctgcattctt acgtcggagt aaaaagttaa tttaataaaa ctttcaacaa cggatctctt 180ctgcattctt acgtcggagt aaaaagttaa tttaataaaa ctttcaacaa cggatctctt 180
ggttctggca tcgatgaaga acgcagcgaa atgcgataag taatgtgaat tgcagaattc 240ggttctggca tcgatgaaga acgcagcgaa atgcgataag taatgtgaat tgcagaattc 240
agtgaatcat cgaatctttg aacgcacatt gcgccccctg gtattccggg gggcatgcct 300agtgaatcat cgaatctttg aacgcacatt gcgccccctg gtattccggg gggcatgcct 300
gttcgagcgt catttcacca ctcaagcctc gcttggtatt gggcgtcgcg agtctctcgc 360gttcgagcgt catttcacca ctcaagcctc gcttggtatt gggcgtcgcg agtctctcgc 360
gcgcctcaaa gtctccggct gttcggttcg tctcccagcg ttgtggcaac tatttcgcag 420gcgcctcaaa gtctccggct gttcggttcg tctcccagcg ttgtggcaac tatttcgcag 420
tggagtacga gtcgtggcgg ccgttaaatc tttcaaaggt tgacctcgga tcaggtaggg 480tggagtacga gtcgtggcgg ccgttaaatc tttcaaaggt tgacctcgga tcaggtaggg 480
atacccgctg aacttaagca tatcaataag cggaggaggt catagntgtt tc532atacccgctg aacttaagca tatcaataag cggaggaggt catagntgtt tc532
<210> 12<210> 12
<211> 1431<211> 1431
<212> ДНК<212> DNA
<213> Variovorax sp.<213> Variovorax sp.
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-014-G01<223> SGI bacterial isolate SGI-014-G01
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> кодирует 16S рибосомную РНК<223> encodes 16S ribosomal RNA
<400> 12<400> 12
tgccttacac atgcaagtcg aacggcagcg cgggagcaat cctggcggcg agtggcgaac60tgccttacac atgcaagtcg aacggcagcg cgggagcaat cctggcggcg agtggcgaac60
gggtgagtaa tacatcggaa cgtgcccaat cgtgggggat aacgcagcga aagctgtgct 120gggtgagtaa tacatcggaa cgtgcccaat cgtgggggat aacgcagcga aagctgtgct 120
aataccgcat acgatctacg gatgaaagca ggggatcgca agaccttgcg cgaatggagc 180aataccgcat acgatctacg gatgaaagca ggggatcgca agaccttgcg cgaatggagc 180
ggccgatggc agattaggta gttggtgagg taaaggctca ccaagccttc gatctgtagc 240ggccgatggc agattaggta gttggtgagg taaaggctca ccaagccttc gatctgtagc 240
tggtctgaga ggacgaccag ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag 300tggtctgaga ggacgaccag ccacactggg actgagacac ggcccagact cctacgggag 300
gcagcagtgg ggaattttgg acaatgggcg aaagcctgat ccagccatgc cgcgtgcagg 360gcagcagtgg ggaattttgg acaatgggcg aaagcctgat ccagccatgc cgcgtgcagg 360
atgaaggcct tcgggttgta aactgctttt gtacggaacg aaacggcctt ttctaataaa 420atgaaggcct tcgggttgta aactgctttt gtacggaacg aaacggcctt ttctaataaa 420
gagggctaat gacggtaccg taagaataag caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg 480gagggctaat gacggtaccg taagaataag caccggctaa ctacgtgcca gcagccgcgg 480
taatacgtag ggtgcaagcg ttaatcggaa ttactgggcg taaagcgtgc gcaggcggtt 540540
atgtaagaca gttgtgaaat ccccgggctc aacctgggaa ctgcatctgt gactgcatag 600atgtaagaca gttgtgaaat ccccggggctc aacctgggaa ctgcatctgt gactgcatag 600
ctagagtacg gtagaggggg atggaattcc gcgtgtagca gtgaaatgcg tagatatgcg 660ctagagtacg gtagaggggg atggaattcc gcgtgtagca gtgaaatgcg tagatatgcg 660
gaggaacacc gatggcgaag gcaatcccct ggacctgtac tgacgctcat gcacgaaagc 720gaggaacacc gatggcgaag gcaatcccct ggacctgtac tgacgctcat gcacgaaagc 720
gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cctaaacgat gtcaactggt 780gtggggagca aacaggatta gataccctgg tagtccacgc cctaaacgat gtcaactggt 780
tgttgggtct tcactgactc agtaacgaag ctaacgcgtg aagttgaccg cctggggagt 840tgttgggtct tcactgactc agtaacgaag ctaacgcgtg aagttgaccg cctggggagt 840
acggccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggatgatg 900acggccgcaa ggttgaaact caaaggaatt gacggggacc cgcacaagcg gtggatgatg 900
tggtttaatt cgatgcaacg cgaaaaacct tacccacctt tgacatgtac ggaattcgcc 960tggtttaatt cgatgcaacg cgaaaaacct tacccacctt tgacatgtac ggaattcgcc 960
agagatggct tagtgctcga aagagaaccg taacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc 1020agagatggct tagtgctcga aagagaaccg taacacaggt gctgcatggc tgtcgtcagc 1020
tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgct 1080tcgtgtcgtg agatgttggg ttaagtcccg caacgagcgc aacccttgtc attagttgct 1080
acattcagtt gggcactcta atgagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga 1140acattcagtt gggcactcta atgagactgc cggtgacaaa ccggaggaag gtggggatga 1140
cgtcaagtcc tcatggccct tataggtggg gctacacacg tcatacaatg gctggtacaa 1200cgtcaagtcc tcatggccct tataggtggg gctacacacg tcatacaatg gctggtacaa 1200
agggttgcca acccgcgagg gggagctaat cccataaaac cagtcgtagt ccggatcgca 1260agggttgcca acccgcgagg gggagctaat cccataaaac cagtcgtagt ccggatcgca 1260
gtctgcaact cgactgcgtg aagtcggaat cgctagtaat cgtggatcag aatgtcacgg 1320gtctgcaact cgactgcgtg aagtcggaat cgctagtaat cgtggatcag aatgtcacgg 1320
tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagcg ggttctgcca 1380tgaatacgtt cccgggtctt gtacacaccg cccgtcacac catgggagcg ggttctgcca 1380
gaagtagtta gcttaaccgc aaggagggcg attaccacgg cagggttcgt g1431gaagtagtta gcttaaccgc aaggaggggcg attaccacgg cagggttcgt g1431
<210> 13<210> 13
<211> 1424<211> 1424
<212> ДНК<212> DNA
<213> Bacillus amyloliquefaciens<213> Bacillus amyloliquefaciens
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-015-F03<223> SGI bacterial isolate SGI-015-F03
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> кодирует 16S рибосомную РНК<223> encodes 16S ribosomal RNA
<400> 13<400> 13
ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga gcggacagat gggagcttgc tccctgatgt60ctggcggcgt gcctaataca tgcaagtcga gcggacagat gggagcttgc tccctgatgt60
tagcggcgga cgggtgagta acacgtgggt aacctgcctg taagactggg ataactccgg 120120
gaaaccgggg ctaataccgg atggttgtct gaaccgcatg gttcagacat aaaaggtggc 180gaaaccgggg ctaataccgg atggttgtct gaaccgcatg gttcagacat aaaaggtggc 180
ttcggctacc acttacagat ggacccgcgg cgcattagct agttggtgag gtaacggctc 240ttcggctacc acttacagat ggacccgcgg cgcattagct agttggtgag gtaacggctc 240
accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag agggtgatcg gccacactgg gactgagaca 300accaaggcga cgatgcgtag ccgacctgag agggtgatcg gccacactgg gactgagaca 300
cggcccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc cgcaatggac gaaagtctga 360cggcccagac tcctacggga ggcagcagta gggaatcttc cgcaatggac gaaagtctga 360
cggagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggtt ttcggatcgt aaagctctgt tgttagggaa 420cggagcaacg ccgcgtgagt gatgaaggtt ttcggatcgt aaagctctgt tgttagggaa 420
gaacaagtgc cgttcaaata gggcggcacc ttgacggtac ctaaccagaa agccacggct 480gaacaagtgc cgttcaaata gggcggcacc ttgacggtac ctaaccagaa agccacggct 480
aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg aattattggg 540aactacgtgc cagcagccgc ggtaatacgt aggtggcaag cgttgtccgg aattatgggg 540
cgtaaagggc tcgcaggcgg tttcttaagt ctgatgtgaa agcccccggc tcaaccgggg 600600
agggtcattg gaaactgggg aacttgagtg cagaagagga gagtggaatt ccacgtgtag 660agggtcattg gaaactgggg aacttgagtg cagagagga gagtggaatt ccacgtgtag 660
cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca ccagtggcga aggcgactct ctggtctgta 720cggtgaaatg cgtagagatg tggaggaaca ccagtggcga aggcgactct ctggtctgta 720
actgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccac 780actgacgctg aggagcgaaa gcgtggggag cgaacaggat tagataccct ggtagtccac 780
gccgtaaacg atgagtgcta agtgttaggg ggtttccgcc ccttagtgct gcagctaacg 840gccgtaaacg atgagtgcta agtgttaggg ggtttccgcc ccttagtgct gcagctaacg 840
cattaagcac tccgcctggg gagtacggtc gcaagactga aactcaaagg aattgacggg 900cattaagcac tccgcctggg gagtacggtc gcaagactga aactcaaagg aattgacggg 900
ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag 960ggcccgcaca agcggtggag catgtggttt aattcgaagc aacgcgaaga accttaccag 960
gtcttgacat cctctgacaa tcctagagat aggacgtccc cttcgggggc agagtgacag 1020gtcttgacat cctctgacaa tcctagagat aggacgtccc cttcgggggc agagtgacag 1020
gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc 1080gtggtgcatg gttgtcgtca gctcgtgtcg tgagatgttg ggttaagtcc cgcaacgagc 1080
gcaacccttg atcttagttg ccagcattca gttgggcact ctaaggtgac tgccggtgac 1140gcaacccttg atcttagttg ccagcattca gttgggcact ctaaggtgac tgccggtgac 1140
aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac 1200aaaccggagg aaggtgggga tgacgtcaaa tcatcatgcc ccttatgacc tgggctacac 1200
acgtgctaca atggacagaa caaagggcag cgaaaccgcg aggttaagcc aatcccacaa 1260acgtgctaca atggacagaa caaagggcag cgaaaccgcg aggttaagcc aatcccacaa 1260
atctgttctc agttcggatc gcagtctgca actcgactgc gtgaagctgg aatcgctagt 1320atctgttctc agttcggatc gcagtctgca actcgactgc gtgaagctgg aatcgctagt 1320
aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca 1380aatcgcggat cagcatgccg cggtgaatac gttcccgggc cttgtacaca ccgcccgtca 1380
caccacgaga gtttgtaaca cccgaagtcg gtgaggtaac cttt 1424caccacgaga gtttgtaaca cccgaagtcg gtgaggtaac cttt 1424
<210> 14<210> 14
<211> 1425<211> 1425
<212> ДНК<212> DNA
<213> Bacillus subtilis<213> Bacillus subtilis
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> SGI бактериальный изолят SGI-015-H06<223> SGI bacterial isolate SGI-015-H06
<220><220>
<221> разнообразные признаки<221> various signs
<223> кодирует 16S рибосомную РНК<223> encodes 16S ribosomal RNA
<400> 14<400> 14
gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg agcggacaga tgggagcttg ctccctgatg60gctggcggcg tgcctaatac atgcaagtcg agcggacaga tgggagcttg ctccctgatg60
ttagcggcgg acgggtgagt aacacgtggg taacctgcct gtaagactgg gataactccg 120ttagcggcgg acgggtgagt aacacgtggg taacctgcct gtaagactgg gataactccg 120
ggaaaccggg gctaataccg gatggttgtt tgaaccgcat ggttcagaca taaaaggtgg 180ggaaaccggg gctaataccg gatggttgtt tgaaccgcat ggttcagaca taaaaggtgg 180
cttcggctac cacttacaga tggacccgcg gcgcattagc tagttggtga ggtaacggct 240cttcggctac cacttacaga tggacccgcg gcgcattagc tagttggtga ggtaacggct 240
caccaaggca acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc ggccacactg ggactgagac 300caccaaggca acgatgcgta gccgacctga gagggtgatc ggccacactg ggactgagac 300
acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt ccgcaatgga cgaaagtctg 360acggcccaga ctcctacggg aggcagcagt agggaatctt ccgcaatgga cgaaagtctg 360
acggagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt tttcggatcg taaagctctg ttgttaggga 420acggagcaac gccgcgtgag tgatgaaggt tttcggatcg taaagctctg ttgttaggga 420
agaacaagtg ccgttcaaat agggcggcac cttgacggta cctaaccaga aagccacggc 480agaacaagtg ccgttcaaat agggcggcac cttgacggta cctaaccaga aagccacggc 480
taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtggcaa gcgttgtccg gaattattgg 540taactacgtg ccagcagccg cggtaatacg taggtggcaa gcgttgtccg gaattattgg 540
gcgtaaaggg ctcgcaggcg gtttcttaag tctgatgtga aagcccccgg ctcaaccggg 600gcgtaaaggg ctcgcaggcg gtttcttaag tctgatgtga aagcccccgg ctcaaccggg 600
gagggtcatt ggaaactggg gaacttgagt gcagaagagg agagtggaat tccacgtgta 660gagggtcatt ggaaactggg gaacttgagt gcagaagagg agagtggaat tccacgtgta 660
gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaac accagtggcg aaggcgactc tctggtctgt 720gcggtgaaat gcgtagagat gtggaggaac accagtggcg aaggcgactc tctggtctgt 720
aactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca 780aactgacgct gaggagcgaa agcgtgggga gcgaacagga ttagataccc tggtagtcca 780
cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttagg gggtttccgc cccttagtgc tgcagctaac 840cgccgtaaac gatgagtgct aagtgttagg gggtttccgc cccttagtgc tgcagctaac 840
gcattaagca ctccgcctgg ggagtacggt cgcaagactg aaactcaaag gaattgacgg 900gcattaagca ctccgcctgg ggagtacggt cgcaagactg aaactcaaag gaattgacgg 900
gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca 960gggcccgcac aagcggtgga gcatgtggtt taattcgaag caacgcgaag aaccttacca 960
ggtcttgaca tcctctgaca atcctagaga taggacgtcc ccttcggggg cagagtgaca 1020ggtcttgaca tcctctgaca atcctagaga taggacgtcc ccttcggggg cagagtgaca 1020
ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag 1080ggtggtgcat ggttgtcgtc agctcgtgtc gtgagatgtt gggttaagtc ccgcaacgag 1080
cgcaaccctt gatcttagtt gccagcattc agttgggcac tctaaggtga ctgccggtga 1140cgcaaccctt gatcttagtt gccagcattc agttgggcac tctaaggtga ctgccggtga 1140
caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca 1200caaaccggag gaaggtgggg atgacgtcaa atcatcatgc cccttatgac ctgggctaca 1200
cacgtgctac aatggacaga acaaagggca gcgaaaccgc gaggttaagc caatcccaca 1260cacgtgctac aatggacaga acaaagggca gcgaaaccgc gaggttaagc caatcccaca 1260
aatctgttct cagttcggat cgcagtctgc aactcgactg cgtgaagctg gaatcgctag 1320aatctgttct cagttcggat cgcagtctgc aactcgactg cgtgaagctg gaatcgctag 1320
taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc 1380taatcgcgga tcagcatgcc gcggtgaata cgttcccggg ccttgtacac accgcccgtc 1380
acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc ggtgaggtaa ccttt1425acaccacgag agtttgtaac acccgaagtc ggtgaggtaa ccttt1425
<210> 15<210> 15
<211> 37<211> 37
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> ПЦР праймер M13-ITS1<223> PCR primer M13-ITS1
<400> 15<400> 15
tgtaaaacga cggccagttt cgtaggtgaa cctgcgg 37tgtaaaacga cggccagttt cgtaggtgaa cctgcgg 37
<210> 16<210> 16
<211> 38<211> 38
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> ПЦР праймер ITS4-M13<223> PCR primer ITS4-M13
<400> 16<400> 16
caggaaacag ctatgacctc ctccgcttat tgatatgc 38caggaaacag ctatgacctc ctccgcttat tgatatgc 38
<210> 17<210> 17
<211> 39<211> 39
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> ПЦР праймер M13-27F Bac<223> PCR primer M13-27F Bac
<400> 17<400> 17
tgtaaaacga cggccagtta gagtttgatc ctggctcag 39tgtaaaacga cggccagtta gagtttgatc ctggctcag 39
<210> 18<210> 18
<211> 37<211> 37
<212> ДНК<212> DNA
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220><220>
<223> ПЦР праймер 1492R-M13 Bac<223> PCR primer 1492R-M13 Bac
<400> 18<400> 18
caggaaacag ctatgaccgg ttaccttgtt acgactt 37caggaaacag ctatgaccgg ttaccttgtt acgactt 37
<---<---
Claims (19)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US61/511,467 | 2011-07-25 |
Related Parent Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2019133657A Division RU2736382C1 (en) | 2011-07-25 | 2019-10-23 | Compositions and methods for fusarium disease control |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2022120989A Division RU2022120989A (en) | 2011-07-25 | 2022-08-02 | COMPOSITIONS AND METHODS FOR COMBATING FUSARIOSIS |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2020136616A RU2020136616A (en) | 2022-05-11 |
RU2777606C2 true RU2777606C2 (en) | 2022-08-08 |
Family
ID=
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6312940B1 (en) * | 1999-10-07 | 2001-11-06 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of Agriculture | Bacillus species for reducing fusarium head blight in cereals |
RU2284353C1 (en) * | 2005-05-05 | 2006-09-27 | Общество с ограниченной ответственностью "БИО-АГРО" | Strain of microorganism bacillus mycoides var. b. a. for preparing biopreparation used in stimulation of plant growth and protection against diseases |
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6312940B1 (en) * | 1999-10-07 | 2001-11-06 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of Agriculture | Bacillus species for reducing fusarium head blight in cereals |
RU2284353C1 (en) * | 2005-05-05 | 2006-09-27 | Общество с ограниченной ответственностью "БИО-АГРО" | Strain of microorganism bacillus mycoides var. b. a. for preparing biopreparation used in stimulation of plant growth and protection against diseases |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
PEREIRA P. et al. Efficacy of bacterial seed treatments for the control of Fusarium verticillioides in maize, BioControl, 2009, v.54, p.103-111. * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2736382C1 (en) | Compositions and methods for fusarium disease control | |
CN117604062A (en) | Platform for developing soil-borne plant pathogen-inhibiting microbial flora | |
RU2777606C2 (en) | Compositions and methods for fusarium control | |
ADETUNJI et al. | Production of phytotoxic metabolite using biphasic fermentation system from strain C1136 of Lasiodiplodia pseudotheobromae, a potential bioherbicidal agent | |
KR20230105465A (en) | Development of a multifunctional biopesticide controlling anthracnose and bacterial diseases with plant growth stimulating effects | |
NZ704721B2 (en) | Compositions and methods for controlling head blight disease | |
NZ620577B2 (en) | Compositions and methods for controlling head blight disease | |
NZ712059B2 (en) | Compositions and methods for controlling head blight disease | |
NZ709801B2 (en) | Compositions and methods for controlling head blight disease | |
NZ715042B2 (en) | Compositions and methods for controlling head blight disease | |
MX2011013051A (en) | Autonomous system for evaluating the stability in humans using the movements of the head. | |
MX2011013044A (en) | Strain of streptomyces sp. with antagonist capacity, composition containing the same and use thereof. |