RU2765686C1 - Method for prediction of risks of severe course of respiratory diseases of viral nature - Google Patents
Method for prediction of risks of severe course of respiratory diseases of viral nature Download PDFInfo
- Publication number
- RU2765686C1 RU2765686C1 RU2021119516A RU2021119516A RU2765686C1 RU 2765686 C1 RU2765686 C1 RU 2765686C1 RU 2021119516 A RU2021119516 A RU 2021119516A RU 2021119516 A RU2021119516 A RU 2021119516A RU 2765686 C1 RU2765686 C1 RU 2765686C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- gene
- risk
- genotype
- points
- viral
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
Область техникиTechnical field
Изобретение относится к молекулярной биологии и генетике и может быть использовано в вирусологии, иммунологии и медицине для прогнозирования генетической предрасположенности человека к тяжелому или осложненному течению респираторного заболевания вирусной природы и повышенной или пониженной предрасположенности к нему.The invention relates to molecular biology and genetics and can be used in virology, immunology and medicine to predict a person's genetic predisposition to a severe or complicated course of a respiratory disease of a viral nature and an increased or decreased predisposition to it.
Уровень техникиState of the art
Респираторные заболевания вирусной природы вызываются как РНК- содержащими вирусами (семейства Orthomyxoviridae, Paramyxoviridae, Picobirnaviridae, Picornaviridae, Coronaviridae), так и ДНК-содержащими вирусами (семейства Adenoviridae, Parvoviridae). Эти заболевания остаются основной причиной смертности, инвалидности и социальных и экономических волнений для миллионов людей в мире. Бедность, отсутствие надлежащего доступа к медицинскому обслуживанию, миграция людей, появление новых возбудителей болезней и применение антибиотикотерапии к вирусным инфекциям – все это способствует усилению воздействия этих болезней.Respiratory diseases of a viral nature are caused by both RNA-containing viruses (families Orthomyxoviridae , Paramyxoviridae , Picobirnaviridae , Picornaviridae , Coronaviridae ) and DNA-containing viruses (families Adenoviridae , Parvoviridae ). These diseases remain the leading cause of death, disability and social and economic unrest for millions of people around the world. Poverty, lack of adequate access to health care, human migration, the emergence of new pathogens and the use of antibiotics for viral infections all contribute to the increased impact of these diseases.
Идентификация специфических полиморфизмов в генах человека, которые связаны с восприимчивостью или устойчивостью к вирусным заболеваниям, является перспективным направлением в медицинской диагностике. Человеческое знание о генетических факторах, вовлеченные в патогенез вирусные инфекции, и особенно - в патогенез развития их осложнений, продолжает расти. Основная цель генетических исследований в области инфекционных заболеваний - прогнозирование восприимчивости, предотвращение осложнений и своевременно подобранная терапия для снижения тяжести течения заболевания (AdamD.Kenney, JamesA. Dowdle, LeoniaBozzacco, ThemetM. McMichael, CorineSt. Gelais, AmandaR. Panfil, YanSun, LarryS. Schlesinger, MatthewZ. Anderson, PatrikL. Green, CarolinaB. Lopez, BradR. Rosenberg, LiWuandJacobS. Yount. HUMAN GENETIC DETERMINANTS OF VIRAL DISEASES.Annu Rev Genet.2017 November 27; 51: 241 – 263).Identification of specific polymorphisms in human genes that are associated with susceptibility or resistance to viral diseases is a promising direction in medical diagnostics. Human knowledge of the genetic factors involved in the pathogenesis of viral infections, and especially in the pathogenesis of their complications, continues to grow. The main goal of genetic research in the field of infectious diseases is to predict susceptibility, prevent complications and timely selected therapy to reduce the severity of the disease (Adam D. Kenney, James A. Dowdle, Leonia Bozzacco, Themet M. McMichael, Corine St. Gelais, Amanda R. Panfil, YanSun, LarryS. Schlesinger, Matthew Z. Anderson, Patrik L. Green, Carolina B. Lopez, Brad R. Rosenberg, LiWuand Jacob S. Yount. HUMAN GENETIC DETERMINANTS OF VIRAL DISEASES.Annu Rev Genet.2017 November 27;51:241-263).
Известно решение по заявке USA № US20160273044 A1, C12Q1/6883, заключающееся в идентификации, диагностике и прогнозировании системной красной волчанки, включая методы лечения, построенное на основе точечного генотипирования полиморфизмов в генах, связанных с иммунитетом, включая полиморфизм rs1990760 (IFIH1), где T аллель является фактором риска. Ген IFIH1 принадлежит к семейству паттерн-распознающих рецепторов, является сенсором вирусных нуклеиновых кислот в цитоплазме и играет главную роль в распознавании вирусной инфекции и активации каскада антивирусных ответов: стимуляция выброса интерферонов I типа и провоспалительных цитокинов.Known solution according to the application USA No. US20160273044 A1, C12Q1/6883, which consists in the identification, diagnosis and prognosis of systemic lupus erythematosus, including treatment methods, built on the basis of point genotyping of polymorphisms in genes associated with immunity, including polymorphism rs1990760 ( IFIH1 ), where T the allele is a risk factor. The IFIH1 gene belongs to the family of pattern recognition receptors, is a sensor of viral nucleic acids in the cytoplasm, and plays a major role in recognizing a viral infection and activating a cascade of antiviral responses: stimulating the release of type I interferons and pro-inflammatory cytokines.
Однако этот способ относится только к аутоиммунным заболеваниям, и хотя и затрагивает большинство генов сигнальных путей вирусного патогенеза, не является инфекционным. However, this method applies only to autoimmune diseases, and although it affects most of the genes of the signaling pathways of viral pathogenesis, it is not infectious.
Известны также решения, касающиеся оценки риска тяжести инфекционного заболевания на основе определения различныхбиомаркеров. Solutions are also known regarding the risk assessment of the severity of an infectious disease based on the determination of various biomarkers.
Заявка WO 2017/050988 Al описывает способ прогнозирования тяжелого протекания гриппа на основе детекции белкового маркера - альфа-интерферон-индуцируемого протеина 27. Application WO 2017/050988 Al describes a method for predicting the severity of influenza based on the detection of a protein marker, interferon-alpha-inducible protein 27.
Также, в заявке WO2014/008545A1 рассматривается уровень этого же белка как диагностический критерий вирусной пневмонии и как прогностический критерий тяжести заболевания. Also, in the application WO2014/008545A1, the level of the same protein is considered as a diagnostic criterion for viral pneumonia and as a prognostic criterion for the severity of the disease.
Недостатком данного способа является то, что альфа-интерферон-индуцируемый белок 27 - это маркер только одного из сигнальных путей иммунного ответа. Также недостатком является то, что данный белок детектируется уже на стадии развития заболевания, и выявление риска осложнений может произойти слишком поздно.The disadvantage of this method is that alpha-interferon-inducible protein 27 is a marker of only one of the signaling pathways of the immune response. Also, the disadvantage is that this protein is detected already at the stage of the development of the disease, and the identification of the risk of complications may occur too late.
Генетические маркеры, как критерий риска тяжести заболевания, являются перспективными, так как они могут быть проанализированы в любой момент и в любом возрасте и выбор терапии в соответствии с генотипом может быть сделан в самом начале заболевания, без дополнительных анализов. Genetic markers, as a risk criterion for the severity of the disease, are promising, since they can be analyzed at any time and at any age, and the choice of therapy according to the genotype can be made at the very beginning of the disease, without additional analyzes.
Некоторые генетические маркеры тяжести вирусной респираторной инфекции описаны в научной литературе. Some genetic markers of the severity of viral respiratory infection are described in the scientific literature.
Например, при инфекции H1N1 в 2009 году выявлена значительно более высокая частота генотипа TNF rs1800629 G/A в тяжелых и летальных случаях (ChoudharyM.L., AlagarasuK., ChaudharyU., KawaleS., MalasaneP., GuravY.K., PadbidriV., KadamD., SangleS.A., SalviS., BavdekarA.R., D'costaP., ChadhaM.S.AssociationofSingleNucleotidePolymorphismsinTNFAandIL10 GeneswithDiseaseSeverityinInfluenzaA/H1N1pdm09 VirusInfections: AStudyfromWesternIndia. ViralImmunol.2018 Dec;31(10):683-688). For example, in H1N1 infection in 2009, a significantly higher frequency of the TNF rs1800629 G/A genotype was found in severe and fatal cases (ChoudharyM.L., AlagarasuK., ChaudharyU., KawaleS., MalasaneP., GuravY.K., PadbidriV., KadamD., SangleS.A., SalviS., BavdekarA.R., D'costaP., ChadhaM.S.AssociationofSingleNucleotidePolymorphismsinTNFAandIL10 GeneswithDiseaseSeverityinInfluenzaA/H1N1pdm09 VirusInfections: AStudyfromWesternIndia.ViralImmunol.2018 Dec;31(108):683).
Известно решение по патенту RU №2339701, в котором рассматривается способ для определения предрасположенности человека к различным видам физической работы на основе генетической панели, включающей ряд полиморфизмов. Но рассматриваемый в данном патенте способ не пригоден для определения предрасположенности к вирусным инфекциям, так как гены, включенные в панель, не связаны с иммунной системой человека либо с регуляцией воспалительного процессаA solution is known according to patent RU No. 2339701, which considers a method for determining a person's predisposition to various types of physical work based on a genetic panel that includes a number of polymorphisms. But the method considered in this patent is not suitable for determining predisposition to viral infections, since the genes included in the panel are not associated with the human immune system or with the regulation of the inflammatory process.
Известно решение по патенту RU №2494400, в котором рассматривается способ для прогнозирования патологий беременности на основании определения полиморфизма в гене PAI-1. A decision is known according to patent RU No. 2494400, which discusses a method for predicting pregnancy pathologies based on the determination of polymorphism in the PAI-1 gene.
Но рассматриваемый в данном патенте способ не пригоден для определения предрасположенности к вирусным инфекциям, так как хотя ген PAI-1 связан с развитием воспалительного процесса, в том числе при инфекционных заболеваниях, для данного полиморфизма не известна связь с риском возникновения респираторной вирусной инфекции либо с её тяжестью.But the method considered in this patent is not suitable for determining predisposition to viral infections, since although the PAI-1 gene is associated with the development of an inflammatory process, including in infectious diseases, this polymorphism is not known to be associated with the risk of a respiratory viral infection or with its heaviness.
Раскрытие изобретенияDisclosure of invention
Задачей изобретения является создание способа прогнозирования рисков тяжелого течения респираторных заболеваний вирусной природы у человека и предрасположенности к ним, а также создание генетической панели для осуществления способа путем проведения генетического анализа сразу нескольких полиморфизмов.The objective of the invention is to create a method for predicting the risks of severe viral respiratory diseases in humans and predisposition to them, as well as to create a genetic panel for implementing the method by performing a genetic analysis of several polymorphisms at once.
Технический результат достигается за счет созданной авторами генетической панели, в которую включены полиморфизмы, достоверно связанные с риском возникновения респираторной вирусной инфекции или с её тяжелым течением, позволяющей осуществить способ прогнозирования рисков тяжелого течения респираторных заболеваний вирусной природы у человека и предрасположенности к ним путем проведения генетического анализа в области полиморфизмов в геноме человека сразу нескольких полиморфизмов в 10 генах. При этом оценка риска производится по генотипу в области полиморфизмов, включенных в данную панель.The technical result is achieved due to the genetic panel created by the authors, which includes polymorphisms that are significantly associated with the risk of a respiratory viral infection or its severe course, which makes it possible to implement a method for predicting the risks of severe respiratory diseases of a viral nature in humans and predisposition to them by conducting genetic analysis. in the field of polymorphisms in the human genome, several polymorphisms in 10 genes at once. In this case, risk assessment is performed by genotype in the area of polymorphisms included in this panel.
Техническая задача осуществляется за счет того, что создана генетическая панель для прогнозирования рисков тяжелого течения респираторных заболеваний вирусной природы и предрасположенности к ним на основе методов генетических исследований, включающая генотип в области патогенных или протективных аллелей полиморфизмов в геноме человека: rs1990760 в гене IFIH1, rs12252 в гене IFITM3, rs1800629 в гене TNF, rs75603675 в гене TMPRSS2, rs7842 в гене C3AR1, rs744166 в гене STAT3, rs324011 в гене STAT6, rs179008 в гене TLR7, rs1799864 в гене CCR2, rs1898830 в гене TLR2, при этом,The technical task is carried out due to the fact that a genetic panel has been created to predict the risks of severe respiratory diseases of a viral nature and predisposition to them based on genetic research methods, including the genotype in the field of pathogenic or protective alleles of polymorphisms in the human genome: rs1990760 in the IFIH1 gene, rs12252 in The IFITM3 , RS1800629 gene in the TNF gene, RS75603675 in the gene TMPRSS2 , RS7842 in the C3AR1 , RS744166 gene in the STAT3 gene, RS324011 gene in the GENE 6 , RS179008 in the CCR2 gene, RS1898830 gene in the TLR2 gene, while
Создан способ прогнозирования рисков тяжелого течения респираторных заболеваний вирусной природы и предрасположенности к ним, заключающийся в выделении ДНК человека, определении последовательности ДНК в области полиморфизмов в геноме человека: rs1990760 в гене IFIH1, rs12252 в гене IFITM3, rs1800629 в гене TNF, rs75603675 в гене TMPRSS2, rs7842 в гене C3AR1, rs744166 в гене STAT3, rs324011 в гене STAT6, rs179008 в гене TLR7, rs1799864 в гене CCR2, rs1898830 в гене TLR2 по п.1, после чего полученный генотип анализируют с учетом возможных аллельных вариантов полиморфизмов, анализируют генетическую панель предрасположенности путем суммирования эффектов разных патогенных или протективных аллелей полиморфизмов из п.1, затем выявленный генотип оценивают согласно патогенной или протективной роли аллелей в развитии инфекционного заболевания, суммируют и оценивают общий результат.При этом определение последовательности ДНК в области полиморфизмов в геноме человека проводят методом секвенирования или методом ПЦР в реальном времени, или методом анализа длины рестрикционных фрагментов, а риски тяжелого течения респираторных заболеваний вирусной природы и предрасположенности к ним оценивают путем присвоения баллов генотипу в области каждого полиморфизма, суммирования этих баллов и оценки рисков в зависимости от суммы баллов, при этом сумма баллов = «0» - риск общепопуляционный, сумма баллов меньше «0» – риск повышен, сумма баллов больше «0» – риск снижен, причем,A method for predicting the risks of severe course of respiratory diseases of a viral nature and predisposition to them has been created, which consists in isolating human DNA, determining the DNA sequence in the field of polymorphisms in the human genome: rs1990760 in the IFIH1 gene, rs12252 in the IFITM3 gene, rs1800629 in the TNF gene, rs75603675 in the TMPRSS2 gene , rs7842 in the C3AR1 gene, rs744166 in the STAT3 gene, rs324011 in the STAT6 gene, rs179008 in the TLR7 gene, rs1799864 in the CCR2 gene, rs1898830 in the TLR2 gene according to claim 1, after which the resulting genotype is analyzed taking into account possible allelic variants of polymorphism. predisposition by summing up the effects of different pathogenic or protective alleles of polymorphisms from claim 1, then the identified genotype is evaluated according to the pathogenic or protective role of alleles in the development of an infectious disease, summarized and evaluated the overall result. either by real-time PCR or by analysis of the length of restriction fragments, and the risks of severe respiratory diseases of a viral nature and predisposition to them are assessed by assigning points to the genotype in the area of each polymorphism, summing these points and assessing risks depending on the sum of points, with In this case, the sum of points = "0" - the risk is general population, the sum of points is less than "0" - the risk is increased, the sum of points is more than "0" - the risk is reduced, and,
Реализация изобретенияImplementation of the invention
В основу изобретения положен способ для определения предрасположенности человека к респираторной вирусной инфекции, а также к тяжелому или осложненному течению респираторного вирусного заболевания с использованием созданной авторами генетической панели, позволяющей проведение генетического анализа в области полиморфизмов в геноме человекасразу нескольких полиморфизмовв 10 генах. The invention is based on a method for determining a person's predisposition to a respiratory viral infection, as well as to a severe or complicated course of a respiratory viral disease using a genetic panel created by the authors, which allows genetic analysis in the field of polymorphisms in the human genome, several polymorphisms in 10 genes at once.
Повышение точности, более полные рекомендации основываются на введении в рассмотрение большего количества полиморфизмов в большем количестве генов и интерпретации на основании суммирования эффектов влияния разных генотипов по мере увеличения выборки обследуемых людей.Improved accuracy, more complete recommendations are based on the introduction of more polymorphisms in more genes and interpretation based on the summation of the effects of the influence of different genotypes as the sample of examined people increases.
В механизме иммунного ответа организма на вирусы-возбудители респираторных инфекций можно выделить следующие сигнальные пути, проанализированные авторами. In the mechanism of the body's immune response to viruses that cause respiratory infections, the following signaling pathways analyzed by the authors can be distinguished.
Первый путь - инициируемый мембранными толл-подобными рецепторами TLR2 и TLR4, являющимися образ-распознающими молекулами в отношении патогенов. Этот путь в конечном итоге приводит к активации генов провоспалительных цитокинов (интерлейкин 1-бета, интерлейкин-6, альфа-ФНО) и обеспечивает развитие ранних воспалительных реакций.The first pathway is initiated by membrane toll-like receptors TLR2 and TLR4, which are pattern-recognizing molecules in relation to pathogens. This pathway ultimately leads to the activation of genes for pro-inflammatory cytokines (interleukin 1-beta, interleukin-6, alpha-TNF) and ensures the development of early inflammatory reactions.
Второй сигнальный путь начинается с распознавания вирусных нуклеиновых кислот внутриклеточными толл-подобными рецепторами TLR3, TLR7 и TLR8. Этот путь приводит к активации антивирусной защиты и позднего воспалительного ответа за счет выработки интерферонов альфа и бета. The second signaling pathway begins with the recognition of viral nucleic acids by intracellular toll-like receptors TLR3, TLR7, and TLR8. This pathway leads to the activation of antiviral protection and a late inflammatory response due to the production of interferons alpha and beta.
Третий путь – путь активации системы комплемента. Гены, кодирующие компоненты этого пути, также были включены в исследование.The third way is the way of activation of the complement system. The genes encoding components of this pathway were also included in the study.
То есть, все элементы этих сигнальных путей играют роль в развитии своевременного иммунного ответа, поэтому мутации в генах, кодирующих белки сигнальных цепочек или регулирующих активность сигнальных белков могут быть ответственны за протекание вирусного заболевания. That is, all elements of these signaling pathways play a role in the development of a timely immune response, so mutations in the genes encoding signal chain proteins or regulating the activity of signaling proteins may be responsible for the course of a viral disease.
Антивирусные белкиAntiviral proteins
Передача сигнала от патогена в клетку, активация ответа иммунной системы (в том числе антивирусного ответа) зависит от иммунных модуляторов, одним из которых является продукт гена IFIH1. Этот белок способен проявлять антивирусный ответ непосредственно в ответ на вирусную инфекцию, выбрасывая интерфероны I типа и стимулируя выброс цитокинов. При наличии минорного генотипа C/C в области полиморфизма rs1990760 гена IFIH1 происходит нарушение функциональности белка, приводящее к недостатку интерферона-альфа. Недостаток интерферона способен вызывать задержку в первичном иммунном ответе и увеличение скорости репликации вируса и его распространение. Transmission of a signal from a pathogen into a cell, activation of the response of the immune system (including the antiviral response) depends on immune modulators, one of which is the product of the IFIH1 gene. This protein is able to elicit an antiviral response directly in response to a viral infection by releasing type I interferons and stimulating the release of cytokines. In the presence of a minor C/C genotype in the region of the rs1990760 polymorphism of the IFIH1 gene, protein functionality is impaired, leading to a lack of interferon-alpha. A lack of interferon can cause a delay in the primary immune response and an increase in the rate of virus replication and its spread.
На структуру продукта гена IFITM3, также являющегося регулятором выброса интерферонов, влияет генотип в области полиморфизма rs12252. Генотип GG в результате альтернативного сплайсинга дает белок, укороченный на 21 аминокислоту с N-концевого участка. Такой белок не функционален и, посколькуявляется индуктором интерферона, приводит к облегченному входу вируса в клетку и риску более тяжелого течения респираторного заболевания. The structure of the IFITM3 gene product, which is also a regulator of interferon release, is affected by the genotype in the region of the rs12252 polymorphism. The GG genotype, as a result of alternative splicing, produces a protein truncated by 21 amino acids from the N-terminal region. Such a protein is not functional and, since it is an interferon inducer, leads to an easier entry of the virus into the cell and the risk of a more severe course of the respiratory disease.
В патогенезе осложнений респираторных заболеваний участвует ген C3AR1. Аллель С (генотип ТС или C/С) в области полиморфизма rs7842 способствует сосудистой проницаемости и выходе лейкоцитов из сосудистого русла при абсцессе легкого, являющегося осложнением пневмонии. Это может привести к сепсису. The C3AR1 gene is involved in the pathogenesis of complications of respiratory diseases. The C allele (TC or C/C genotype) in the region of rs7842 polymorphism promotes vascular permeability and the release of leukocytes from the vascular bed in lung abscess, which is a complication of pneumonia. This can lead to sepsis.
Ген TMPRSS2 кодирует белок из семейства трансмембранных протеаз. Аллель А в области полиморфизма rs75603675 является фактором риска тяжелого течения COVID-19, так как белок TMPRSS2 связан с облегчением прохождения вируса SARS-CoV-2.The TMPRSS2 gene encodes a protein from the family of transmembrane proteases. The A allele in the rs75603675 polymorphism region is a risk factor for severe COVID-19, since the TMPRSS2 protein is associated with facilitating the passage of the SARS-CoV-2 virus.
Транскрипционные факторыTranscription factors
Ген STAT3 кодирует белок, являющийся активатором транскрипции из семейства STAT и выполняющий роль регулятора экспрессии ряда генов в ответ на цитокины и факторы роста. Кроме того, STAT3 участвует в регуляции ответа организма на вирусные и бактериальные инфекции, поскольку взаимодействие интерлейкина-6 с соответствующими рецепторами запускает процесс фосфорилирования STAT3. Уровень интерлейкина-6 связан с тяжестью инфекционного заболевания и риском осложнений. Генотип G/G в области полиморфизма rs744166 в гене STAT3 играет протективную роль. STAT6 активируется внутри клетки чужеродными нуклеиновыми кислотами, которые приводят к активации врожденного иммунитета. Активированный таким образом, STAT6 регулирует определенный набор генов, необходимых для рекрутирования различных иммунных клеток в очаг инфекции. Минорный генотип ТТ в области полиморфизма rs324011 в гене STAT6 является фактором риска тяжелого течения заболевания вирусной природы.The STAT3 gene encodes a protein that is a transcription activator from the STAT family and acts as a regulator of the expression of a number of genes in response to cytokines and growth factors. In addition, STAT3 is involved in the regulation of the body's response to viral and bacterial infections, since the interaction of interleukin-6 with the corresponding receptors triggers the process of STAT3 phosphorylation. The level of interleukin-6 is associated with the severity of the infectious disease and the risk of complications. The G/G genotype in the region of the rs744166 polymorphism in the STAT3 gene plays a protective role. STAT6 is activated inside the cell by foreign nucleic acids, which lead to the activation of innate immunity. Activated in this way, STAT6 regulates a specific set of genes necessary for the recruitment of various immune cells to the site of infection. The minor TT genotype in the region of the rs324011 polymorphism in the STAT6 gene is a risk factor for the severe course of a viral disease.
РецепторыReceptors
Семейство толл-подобных рецепторов является важным компонентом врожденного иммунитета, отвечая за взаимодействие компонентов вирусных частиц (белков или генетического материала) с клеточными структурами. К этому семейству относятся белки TLR2, TLR3, TLR4, TLR7, TLR9. Они играют фундаментальную роль в распознавании патогенов и активации врожденного иммунитета. Активация TLR-зависимых сигнальных путей, приводящая к секреции провоспалительных цитокинов (интерлейкин-1, интерлейкин-6, фактор некроза опухоли-α, интерферон 1 типа), происходит при проникновении в организм различных инфекционных агентов. TLR2/6 и 4 локализуются на клеточной мембране, а TLR3, TLR7/8 и 9 - на поверхности эндосом. Минорный генотип GG в области полиморфизма rs1898830 в гене TLR2 обладает протективнымхаракетром, так как, теоретически, может усиливать иммунный ответ. Минорный генотип GG в области rs179008 в гене TLR7 является фактором риска перерастания легкой либо бессимптомной формы заболевания в более тяжелую.The family of toll-like receptors is an important component of innate immunity, being responsible for the interaction of components of viral particles (proteins or genetic material) with cellular structures. This family includes proteins TLR2, TLR3, TLR4, TLR7, TLR9. They play a fundamental role in pathogen recognition and activation of innate immunity. Activation of TLR-dependent signaling pathways, leading to the secretion of pro-inflammatory cytokines (interleukin-1, interleukin-6, tumor necrosis factor-α, interferon type 1), occurs when various infectious agents enter the body. TLR2/6 and 4 are localized on the cell membrane, while TLR3, TLR7/8 and 9 are localized on the surface of endosomes. The minor GG genotype in the region of the rs1898830 polymorphism in the TLR2 gene has a protective character, since, theoretically, it can enhance the immune response. The minor GG genotype in the rs179008 region in the TLR7 gene is a risk factor for the development of a mild or asymptomatic form of the disease into a more severe one.
Цитокины и хемокиныCytokines and chemokines
CCR2 – ключевой функциональный рецептор для хемокина CCL2, который, в свою очередь, регулирует экспрессию Т-клеточных воспалительных цитокинов и Т-клеточную дифференциацию и способствует дифференциации Т-клеток в Т-хелпер 17 (Th17) во время воспаления. Аллель А в области полиморфизма rs1799864 в гене CCR2 является фактором риска в отношении вирусных респираторных инфекций. CCR2 is a key functional receptor for the chemokine CCL2, which in turn regulates T cell inflammatory cytokine expression and T cell differentiation and promotes T cell differentiation into T helper 17 (Th17) during inflammation. Allele A in the region of the rs1799864 polymorphism in the CCR2 gene is a risk factor for viral respiratory infections.
Фактор некроза опухолей (ФНО, TNF) - провоспалительный цитокин, секретируемый моноцитами и макрофагами(не только). Является пирогеном, вызывает лихорадочное состояние, в т.ч. кахексию, напрямую или через стимуляцию секрецией IL-1. Ключевой медиатор клеточной смерти и участник цитокинового шторма. Аллель А в области полиморфизма rs1800629 в гене TNF является фактором риска в отношении вирусных респираторных инфекций.Tumor necrosis factor (TNF, TNF) is a pro-inflammatory cytokine secreted by monocytes and macrophages (not only). It is a pyrogen, causes a feverish state, incl. cachexia, directly or through stimulation by IL-1 secretion. A key mediator of cell death and a participant in the cytokine storm. Allele A in the rs1800629 polymorphism region in the TNF gene is a risk factor for viral respiratory infections.
Таблица 1. Полиморфизмы, связанные с предрасположенностью к тяжелому течению заболеваний вирусной природыTable 1. Polymorphisms associated with predisposition to severe viral diseases
Продолжительность использования подачи кислородаBronchiolitis (RSV), cytomegalovirus infection
Duration of use of oxygen supply
Пример №1Example #1
Анализ полиморфизмов в 30 генах, связанных с возникновением и развитием COVID-19 с целью выявления ключевых факторов патогенезакоронавирусной инфекции.Analysis of polymorphisms in 30 genes associated with the emergence and development of COVID-19 in order to identify key factors in the pathogenesis of coronavirus infection.
Авторами было прогенотипировано 319 образцов геномной ДНК от пациентов с различными степенями тяжести заболевания COVID-19 и 78 образцов контрольной ДНК от людей, регулярно или длительно контактировавшими с больными COVID-19, но не имевших клинических проявлений и/или антител к SARS-CoV-2. Генотипирование проводилось в области 34 полиморфизмов, находящихся в 30 генах. Было выявлено 8 полиморфных маркеров, достоверно связанных с риском возникновения заболевания либо его тяжелого течения - rs1799864 в гене CCR2 (OR = 2.21), rs1990760 в гене IFIH1 (OR = 1.8), rs1800629 в гене TNF (OR = 1.98), rs75603675 в гене TMPRSS2 (OR = 1.86), rs7842 в гене C3AR1 (OR = 2.08), rs179008 в гене TLR7 (OR = 1.85), rs12252 в гене IFIH3 (OR = 2.37) и rs324011 в гене STAT6 (OR = 1.83), а также два протективных в отношении COVID-19 варианта - rs744166 в гене STAT3 (OR = 0.36) и rs1898830 в гене TLR2 (OR = 0.47).The authors genotyped 319 genomic DNA samples from patients with varying degrees of severity of COVID-19 disease and 78 control DNA samples from people who had regular or long-term contact with patients with COVID-19, but did not have clinical manifestations and/or antibodies to SARS-CoV-2 . Genotyping was carried out in the area of 34 polymorphisms located in 30 genes. Eight polymorphic markers were identified that were significantly associated with the risk of the disease or its severe course - rs1799864 in the CCR2 gene (OR = 2.21), rs1990760 in the IFIH1 gene (OR = 1.8), rs1800629 in the TNF gene (OR = 1.98), rs75603675 in the gene TMPRSS2 (OR = 1.86), rs7842 in the C3AR1 gene (OR = 2.08), rs179008 in the TLR7 gene (OR = 1.85), rs12252 in the IFIH3 gene (OR = 2.37), and rs324011 in the STAT6 gene (OR = 1.83), as well as two protective against COVID-19 variant - rs744166 in the STAT3 gene (OR = 0.36) and rs1898830 in the TLR2 gene (OR = 0.47).
Данный пример позволил спрогнозировать риск тяжелого течения респираторного вирусного заболевания COVID-19 (10 полиморфизмов в 10 генах) и повысить качество рекомендаций по терапии заболевания. This example made it possible to predict the risk of a severe course of the respiratory viral disease COVID-19 (10 polymorphisms in 10 genes) and improve the quality of recommendations for the treatment of the disease.
Таблица 2. Генетическая предрасположенность человека к тяжелому течению вирусных респираторных инфекцийTable 2. Genetic predisposition of a person to a severe course of viral respiratory infections
На основании анализа, представленного в таблицах 1 и 2 создана генетическая панель для определения предрасположенности человека к тяжелому течению респираторных инфекций, которая включает соотношение риска в зависимости наличия тех или иных аллелей и генотипов в полиморфизмах генов IFIH1, IFITM3, TNF, TMPRSS2, C3AR1, STAT3, STAT6, TLR7, CCR2, TLR2. Based on the analysis presented in tables 1 and 2, a genetic panel was created to determine a person's predisposition to a severe course of respiratory infections, which includes a risk ratio depending on the presence of certain alleles and genotypes in polymorphisms of the IFIH1 , IFITM3 , TNF , TMPRSS2 , C3AR1 , STAT3 genes , STAT6 , TLR7 , CCR2 , TLR2 .
Таблица 3. Генетическая панель для прогнозирования рисков тяжелого течения респираторных заболеваний вирусной природы и предрасположенности к нимTable 3. Genetic panel for predicting the risks of severe viral respiratory diseases and predisposition to them
Пример №2Example #2
Подтверждение связи выявленных в примере 1полиморфзмов с риском вирусных респираторных заболеваний.Confirmation of the relationship identified in example 1 polymorphisms with the risk of viral respiratory diseases.
Авторами было прогенотипировано 98 медицинских работников (врачи и медсёстры инфекционных отделений и отделений интенсивной терапии), регулярно контактирующих с пациентами с респираторными вирусными инфекциями. Из них у 52 наблюдалась сниженная частота заболеваемости респираторными заболеваниями (ОРВИ, грипп) - от 0 до 2 раз на протяжении 5 лет (в среднем 1.21 раза). У оставшихся 46 заболеваемость составила от 3 до 4 раз на протяжении 5 лет (в среднем 3.75 раз).The authors genotyped 98 medical workers (doctors and nurses of infectious diseases departments and intensive care units) who regularly contact patients with respiratory viral infections. Of these, 52 had a reduced incidence of respiratory diseases (ARVI, influenza) - from 0 to 2 times over 5 years (average 1.21 times). In the remaining 46, the incidence was 3 to 4 times over 5 years (average 3.75 times).
Таблица 4. Результаты исследования частоты встречаемости минорных аллелей полиморфизмов по примеру 1 у групп с разной частотой вирусной инфекцииTable 4. The results of the study of the frequency of occurrence of minor alleles of polymorphisms according to example 1 in groups with different frequencies of viral infection
Выявлено, что у группы с пониженной заболеваемостью отличается частота встречаемости минорногоаллеля у 5 полиморфизмов. Это подтверждает связь генотипа анализируемых полиморфных маркеров с риском респираторных вирусных заболеванийIt was revealed that the frequency of occurrence of the minor allele in 5 polymorphisms differs in the group with a reduced incidence. This confirms the association of the genotype of the analyzed polymorphic markers with the risk of respiratory viral diseases.
Пример №3Example #3
Прогноз риска возникновения или тяжелого течения респираторной вирусной инфекции либо устойчивости к респираторной вирусной инфекции на основании анализа полученного разными способами генотипа в области полиморфизмов, приводимых в примере 1.Prediction of the risk of occurrence or severe course of a respiratory viral infection or resistance to a respiratory viral infection based on the analysis of the genotype obtained by various methods in the field of polymorphisms given in example 1.
Таблица 5.Прогноз риска возникновения, тяжелого течения или устойчивости к респираторным вирусным инфекциям на основе анализа генотипа вобласти полиморфизмов из примера1.Table 5. Prediction of the risk of occurrence, severity or resistance to respiratory viral infections based on the analysis of the genotype in the area of polymorphisms from example 1.
Из цельной крови пациента №1 была выделена геномная ДНК и проанализирована в области полиморфизмов из примера 1 методом капиллярного секвенирования по Сэнгеру. Был получен следующий генотип:From the whole blood of patient No. 1, genomic DNA was isolated and analyzed in the field of polymorphisms from example 1 by the method of capillary sequencing according to Sanger. The following genotype was obtained:
1) C3AR1 rs7842 генотип T/T - 0 баллов;1) C3AR1 rs7842 genotype T/T - 0 points;
2) CCR2 rs1799864 генотип G/A – -2 балла;2) CCR2 rs1799864 genotype G/A – -2 points;
3) TLR7 rs179008 генотип A/A – 0 баллов;3) TLR7 rs179008 genotype A/A - 0 points;
4) IFIH1 rs1990760 генотип C/T – 0 баллов;4) IFIH1 rs1990760 genotype C/T - 0 points;
5) IFITM3 rs12252 генотип A/A – 0 баллов.5) IFITM3 rs12252 genotype A/A - 0 points.
6) TMPRSS2 rs75603675 генотип С/A – -1 балл.6) TMPRSS2 rs75603675 genotype С/A – -1 point.
7) TNFrs1800629 генотип G/G – 0 баллов;7) TNFrs1800629 genotype G/G – 0 points;
8) STAT6 rs324011 генотип T/T – -1 балл.8) STAT6 rs324011 genotype T/T – -1 point.
9) TLR2 rs1898830 генотип A/G – 0 баллов9) TLR2 rs1898830 genotype A/G – 0 points
10)STAT3 rs744166 генотипА/А - 0 баллов.10) STAT3 rs744166 genotype A/A - 0 points.
Суммарный балл: -4.Total score: -4.
Заключение:Conclusion:
Пациент №1 обладает повышенным (относительно общепопуляционного) риском в отношении возникновения либо тяжелого течения респираторной вирусной инфекции. Patient No. 1 has an increased (relative to the general population) risk for the occurrence or severe course of a respiratory viral infection.
Из цельной крови пациента №2 была выделена геномная ДНК и проанализирована в области полиморфизмов из примера 1 методом ПЦР с флуоресцентными зондами с детекцией в режиме реального времени. Был получен следующий генотип:From the whole blood of patient No. 2, genomic DNA was isolated and analyzed for polymorphisms from example 1 by PCR with fluorescent probes with real-time detection. The following genotype was obtained:
1) C3AR1 rs7842 генотип T/T - 0 баллов;1) C3AR1 rs7842 genotype T/T - 0 points;
2) CCR2 rs1799864 генотип G/G – -2 балла;2) CCR2 rs1799864 genotype G/G – -2 points;
3) TLR7 rs179008 генотип A/A – 0 баллов;3) TLR7 rs179008 genotype A/A - 0 points;
4) IFIH1 rs1990760 генотип C/T – 0 баллов;4) IFIH1 rs1990760 genotype C/T – 0 points;
5) IFITM3 rs12252 генотип A/A – 0 баллов.5) IFITM3 rs12252 genotype A/A - 0 points.
6) TMPRSS2 rs75603675 генотип С/C – -1 балл.6) TMPRSS2 rs75603675 genotype C/C – -1 point.
7) TNFrs1800629 генотип G/G – 0 баллов;7) TNFrs1800629 genotype G/G – 0 points;
8) STAT6 rs324011 генотип C/C – -1 балл.8) STAT6 rs324011 genotype C/C – -1 point.
9) TLR2 rs1898830 генотип G/G – +1 балл9) TLR2 rs1898830 genotype G/G – +1 point
10) STAT3 rs744166 генотип А/А - 0 баллов.10) STAT3 rs744166 genotype A/A - 0 points.
Суммарный балл: +1.Total score: +1.
Заключение:Conclusion:
Пациент №2 обладает повышенной устойчивостью в отношении возникновения либо тяжелого течения респираторной вирусной инфекции либо склонностью к бессимптомному протеканию респираторной вирусной инфекции.Patient No. 2 has an increased resistance to the occurrence of either a severe course of a respiratory viral infection or a tendency to an asymptomatic course of a respiratory viral infection.
Способ прогнозирования рисков тяжелого течения респираторных заболеваний вирусной природы и предрасположенности к ним можно осуществлять как на стадии развития заболевания, так и до развития заболевания. The method for predicting the risks of a severe course of respiratory diseases of a viral nature and predisposition to them can be carried out both at the stage of the development of the disease and before the development of the disease.
Выводы о решении поставленной технической задачи.Conclusions about the solution of the set technical problem.
1) Разработана генетическая панельдля прогнозирования рисков тяжелого течения респираторных заболеваний вирусной природы и предрасположенности к таким заболеваниям на основе методов генетических исследований, включающая генотип в области полиморфизмов в генах : rs1990760 в гене IFIH1, rs12252 в гене IFITM3, rs1800629 в гене TNF, rs75603675 в гене TMPRSS2, rs7842 в гене C3AR1, rs744166 в гене STAT3, rs324011 в гене STAT6, rs179008 в гене TLR7, rs1799864 в гене CCR2, rs1898830 в гене TLR2.1) A genetic panel has been developed to predict the risks of severe viral respiratory diseases and predisposition to such diseases based on genetic research methods, including the genotype in the area of polymorphisms in genes: rs1990760 in the IFIH1 gene, rs12252 in the IFITM3 gene, rs1800629 in the TNF gene, rs75603675 in the gene TMPRSS2, rs7842 in the C3AR1 gene, rs744166 in the STAT3 gene, rs324011 in the STAT6 gene, rs179008 in the TLR7 gene, rs1799864 in the CCR2 gene, rs1898830 in the TLR2 gene.
2) Показана возможность определения генотипа в области полиморфизмов rs1990760 в гене IFIH1, rs12252 в гене IFITM3, rs1800629 в гене TNF, rs75603675 в гене TMPRSS2, rs7842 в гене C3AR1, rs744166 в гене STAT3, rs324011 в гене STAT6, rs179008 в гене TLR7, rs1799864 в гене CCR2, rs1898830 в гене TLR2 различными методами, включающими в себя ПЦР с флуоресцентными зондами в режиме реального времени и секвенирование ДНК.2) The possibility of determining the genotype in the field of polymorphisms RS1990760 in the IFIH1, RS1800625 gene in the IFITM3 gene, RS1800629 in the TNF gene, RS75603675 in the C3AR1, RS744166 gene in the STAT3 gene, RS324011 gene in the STAT6 gene, RS17998864 gene in the TLR7 gene in the CCR2 gene, rs1898830 in the TLR2 gene by various methods, including real-time PCR with fluorescent probes and DNA sequencing.
3) Показана связь генотипа в области полиморфизмов rs1990760 в гене IFIH1, rs12252 в гене IFITM3, rs1800629 в гене TNF, rs75603675 в гене TMPRSS2, rs7842 в гене C3AR1, rs744166 в гене STAT3, rs324011 в гене STAT6, rs179008 в гене TLR7, rs1799864 в гене CCR2, rs1898830 в гене TLR2 с риском возникновения или тяжелого протекания респираторной вирусной инфекции или с устойчивостью к респираторной вирусной инфекции.3) The genotype is shown in the RS1990760 polymorphism area in the IFIH1, RS1800622 gene in the IFITM3 gene, RS1800629 in the TNF gene, RS75603675 in the TMPRSS2 gene, RS744166 gene in the STAT3 gene, RS324011 gene in the STAT6 gene, RS179008 gene in the TLR7, RS1799864 gene CCR2 gene, rs1898830 in the TLR2 gene with a risk of occurrence or severe course of a respiratory viral infection or with resistance to a respiratory viral infection.
4) Разработан метод интерпретации результатов генотипирования в области полиморфизмов rs1990760 в гене IFIH1, rs12252 в гене IFITM3, rs1800629 в гене TNF, rs75603675 в гене TMPRSS2, rs7842 в гене C3AR1, rs744166 в гене STAT3, rs324011 в гене STAT6, rs179008 в гене TLR7, rs1799864 в гене CCR2, rs1898830 в гене TLR2 на основе присвоения баллов генотипу в области каждого полиморфизма, суммирования этих баллов и заключения на основе итоговой суммы - сумма баллов = «0»- риск общепопуляционный, сумма баллов меньше «0» –риск повышен, сумма баллов больше «0» – риск снижен.4) The method of interpreting the results of genotyping in the field of polymorphisms RS1990760 in the IFIH1, RS12252 gene in the iFitm3 gene, RS1800629 in the TNF gene, RS75603675 in the gene TMPRSS2, RS7842 in the C3AR1 gene, RS744166 gene in the STAT6 gene, RS179008 gene in the TLR7 gene, rs1799864 in the CCR2 gene, rs1898830 in the TLR2 gene based on assigning points to the genotype in the area of each polymorphism, summing these points and concluding on the basis of the final sum - sum of points = "0" - general population risk, sum of points less than "0" - increased risk, sum points greater than "0" - the risk is reduced.
Таким образом поставленная задача, а именно создание способа прогнозирования рисков тяжелого течения респираторных заболеваний вирусной природы у человека и предрасположенности к ним, а также создание генетической панели для осуществления способа путем проведения генетического анализа сразу нескольких полиморфизмов, решена.Thus, the task set, namely the creation of a method for predicting the risks of severe respiratory diseases of a viral nature in humans and predisposition to them, as well as the creation of a genetic panel for implementing the method by performing a genetic analysis of several polymorphisms at once, has been solved.
Промышленная применимостьIndustrial Applicability
Все приведенные примеры подтверждают промышленную применимость данного изобретения.All of the above examples confirm the industrial applicability of this invention.
Claims (3)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2021119516A RU2765686C1 (en) | 2021-07-02 | 2021-07-02 | Method for prediction of risks of severe course of respiratory diseases of viral nature |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2021119516A RU2765686C1 (en) | 2021-07-02 | 2021-07-02 | Method for prediction of risks of severe course of respiratory diseases of viral nature |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2765686C1 true RU2765686C1 (en) | 2022-02-03 |
Family
ID=80214744
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2021119516A RU2765686C1 (en) | 2021-07-02 | 2021-07-02 | Method for prediction of risks of severe course of respiratory diseases of viral nature |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2765686C1 (en) |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2448163C2 (en) * | 2010-06-09 | 2012-04-20 | Учреждение Российской академии наук Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН | Method for detecting 17 gjb2 and gjb6 gene mutations accompanying nonsyndromic deafness |
CN111690733A (en) * | 2020-06-22 | 2020-09-22 | 复旦大学附属中山医院 | Hormone-induced femoral head necrosis susceptibility gene panel |
US10867134B2 (en) * | 2016-09-02 | 2020-12-15 | Hitachi High-Tech Corporation | Method for generating text string dictionary, method for searching text string dictionary, and system for processing text string dictionary |
-
2021
- 2021-07-02 RU RU2021119516A patent/RU2765686C1/en active
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2448163C2 (en) * | 2010-06-09 | 2012-04-20 | Учреждение Российской академии наук Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН | Method for detecting 17 gjb2 and gjb6 gene mutations accompanying nonsyndromic deafness |
US10867134B2 (en) * | 2016-09-02 | 2020-12-15 | Hitachi High-Tech Corporation | Method for generating text string dictionary, method for searching text string dictionary, and system for processing text string dictionary |
CN111690733A (en) * | 2020-06-22 | 2020-09-22 | 复旦大学附属中山医院 | Hormone-induced femoral head necrosis susceptibility gene panel |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Zhou et al. | Heightened innate immune responses in the respiratory tract of COVID-19 patients | |
Postal et al. | Type I interferon in the pathogenesis of systemic lupus erythematosus | |
Zhou et al. | Overly exuberant innate immune response to SARS-CoV-2 infection | |
Breen et al. | Non-Hodgkin's B cell lymphoma in persons with acquired immunodeficiency syndrome is associated with increased serum levels of IL10, or the IL10 promoter− 592 C/C genotype | |
Kaiser et al. | Differential cytokine responses following Marek's disease virus infection of chickens differing in resistance to Marek's disease | |
Gao et al. | Targeted deep sequencing identifies rare loss-of-function variants in IFNGR1 for risk of atopic dermatitis complicated by eczema herpeticum | |
Seelbinder et al. | Triple RNA-seq reveals synergy in a human virus-fungus co-infection model | |
Ajdary et al. | Toll-like receptor 4 polymorphisms predispose to cutaneous leishmaniasis | |
Lee et al. | Interleukin-18/-607 gene polymorphism in allergic rhinitis | |
Kabuye et al. | Association between CLEC4E gene polymorphism of mincle and pulmonary tuberculosis infection in a northern Chinese population | |
KR20030093328A (en) | New Polynucleotides and Polypeptides of the IFNα-17 Gene | |
Abbood et al. | Association between interleukin-10 gene polymorphisms (rs1800871, rs1800872, and rs1800896) and severity of infection in different SARS-CoV-2 variants | |
Martínez-Aguilar et al. | Effect of genetic polymorphisms on therapeutic response in multiple sclerosis relapsing-remitting patients treated with interferon-beta | |
Radhakrishnan et al. | Single nucleotide polymorphism in the promoter of the human interleukin-13 gene is associated with asthma in Malaysian adults | |
Mou et al. | Association between TIM-1 gene polymorphisms and allergic rhinitis in a Han Chinese population | |
Wang et al. | A DNA-methylated sight on autoimmune inflammation network across RA, pSS, and SLE | |
RU2765686C1 (en) | Method for prediction of risks of severe course of respiratory diseases of viral nature | |
Baluni et al. | Association of ICAM-1 (K469E) and MCP-1-2518 A> G polymorphism with risk of Japanese encephalitis in North Indian population | |
Shen et al. | Association between JAK1 gene polymorphisms and susceptibility to allergic rhinitis | |
Sivaprasad et al. | The distribution of genotype and allelic frequency of IL28B gene polymorphism in Andhra Pradesh, India | |
Chen et al. | Transcriptomic profiles of human foreskin fibroblast cells in response to orf virus | |
Hernández-Rivera et al. | NRAMP1 Polymorphisms like susceptibility marker in Mexican focus of cutaneous leishmaniasis | |
Uchiumi | The putative implications of duplicated GGAA-motifs located in the human interferon regulated genes (ISGs) | |
JP2005500029A (en) | Novel polynucleotides and polypeptides of IFNα-7 gene | |
RU2469737C1 (en) | Method of treating chronic rhinosinusitis |