RU2745626C1 - Method of creating a live vaccine against covid-19 based on the probiotic strain enterococcus faecium l3 and a live vaccine enterococcus faecium l3-pentf-covid-19 - Google Patents
Method of creating a live vaccine against covid-19 based on the probiotic strain enterococcus faecium l3 and a live vaccine enterococcus faecium l3-pentf-covid-19 Download PDFInfo
- Publication number
- RU2745626C1 RU2745626C1 RU2020139986A RU2020139986A RU2745626C1 RU 2745626 C1 RU2745626 C1 RU 2745626C1 RU 2020139986 A RU2020139986 A RU 2020139986A RU 2020139986 A RU2020139986 A RU 2020139986A RU 2745626 C1 RU2745626 C1 RU 2745626C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- covid
- pentf
- dna
- enterococcus faecium
- cov
- Prior art date
Links
Images
Classifications
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/12—Viral antigens
- A61K39/215—Coronaviridae, e.g. avian infectious bronchitis virus
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Virology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Oncology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pulmonology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Description
Изобретение относится к области медицины, вирусологии, микробиологии, молекулярной генетики и биотехнологии и может быть использовано в медицинской промышленности при производстве живых вакцин для профилактики и лечения инфекций, вызванных коронавирусом. Коронавирусы (Coronaviridae) — семейство вирусов, включающее на январь 2020 года 40 видов РНК-содержащих вирусов, объединённых в четыре подсемейства, которые поражают человека и животных. Название связано со строением вируса, который имеет шиповидные отростки. Они напоминают солнечную корону и содержат рецептор-связывающие белки на поверхности, которые связывают трансмембранные рецепторы клеток.The invention relates to the field of medicine, virology, microbiology, molecular genetics and biotechnology and can be used in the medical industry in the production of live vaccines for the prevention and treatment of infections caused by coronavirus. Coronaviruses ( Coronaviridae ) are a family of viruses that as of January 2020 includes 40 types of RNA viruses, combined into four subfamilies that infect humans and animals. The name is associated with the structure of the virus, which has spiny processes. They resemble the sun's corona and contain receptor-binding proteins on the surface that bind to transmembrane receptors in cells.
Известно, что ученые из Китая расшифровали и опубликовали 12 января 2020 г. в международной базе данных геном нового коронавируса [1- Guo YR, Cao QD, Hong ZS, Tan YY, Chen SD, Jin HJ, Tan KS, Wang DY, Yan Y. The origin, transmission and clinical therapies on coronavirus disease 2019 (COVID-19) outbreak - an update on the status. Mil Med Res. 2020 Mar 13;7(1):11. doi: 10.1186/s40779-020-00240-0. PMID: 32169119; PMCID: PMC7068984.] и что в настоящее время во всем мире учеными ведутся интенсивные исследования по разработке вакцины от коронавируса SARS-CoV-2 и их лабораторные и тестовые испытании (краткая информация о коронавирусе человека представлена в Приложении к описанию изобретения).It is known that scientists from China have decoded and published on January 12, 2020 in the international database the genome of the new coronavirus [ 1- Guo YR, Cao QD, Hong ZS, Tan YY, Chen SD, Jin HJ, Tan KS, Wang DY, Yan Y . The origin, transmission and clinical therapies on coronavirus disease 2019 (COVID-19) outbreak - an update on the status. Mil Med Res. 2020 Mar 13; 7 (1): 11. doi: 10.1186 / s40779-020-00240-0. PMID: 32169119; PMCID: PMC7068984.] And that scientists around the world are currently conducting intensive research on the development of a vaccine against the SARS-CoV-2 coronavirus and their laboratory and test tests (brief information on human coronavirus is presented in the Appendix to the description of the invention).
Известен пробиотический штамм Enterococcus faecium L3 ND-79 ВНИИСХМ, предназначенный для изготовления лечебно-профилактических средств и продуктов питания лечебно-профилактического назначения, обладающий устойчивостью к широкому спектру антибиотиков, более выраженным антагонизмом к патогенным бактериям, высокой жизнеспособностью и высоким уровнем продукции витаминов группы "В" и фолиевой кислоты; известный штамм положен в основу заявляемого изобретения [2 – патент РФ №2220199 на штамм энтерококков Enterococcus faecium l-3 для изготовления лечебно-профилактических средств (патентообладатели и авторы Алехина Г.Г. и Суворов А.Н.)]. Known probiotic strain Enterococcus faecium L3 ND-79 VNIISHM, intended for the manufacture of therapeutic and prophylactic agents and food for therapeutic purposes, is resistant to a wide range of antibiotics, more pronounced antagonism to pathogenic bacteria, high viability and a high level of production of vitamins of group "B "and folic acid; the known strain is the basis of the claimed invention [2 - RF patent No. 2220199 for a strain of enterococci Enterococcus faecium l-3 for the manufacture of therapeutic and prophylactic agents (patent holders and authors Alekhina GG and Suvorov AN)].
Известна созданная на основе этого штамма [2] живая вакцина для профилактики вагинальной инфекции, вызванной Streptococcus agalactiae (СГВ). На основе штамма пробиотика Еnterococcus faecium L3 была сконструирована первая генно-инженерная живая вакцина со встроенным в хромосому участком гена белка патогенного СГВ. [3-Т.В.Гупалова, Г.Ф.Леонтьева, Е.И.Ермоленко, К.Б.Грабоская, Т.А. Крамская, А.Н.Цапиева, И.В.Королева, А.Н.Суворов. Создание и опыт применения живой вакцины на основе штамма пробиотика Enterococcus Faecium L3 для профилактики вагинальной инфекции, вызванной Streptococcus agalactiae, Медицинский академический журнал, 2013, 13(2), С. 64-70].Known created on the basis of this strain [2] live vaccine for the prevention of vaginal infection caused by Streptococcus agalactiae (GBS). On the basis of the probiotic strain Enterococcus faecium L3, the first genetically engineered live vaccine with the pathogenic GBS protein gene inserted into the chromosome was designed. [3-T.V. Gupalova, G.F. Leontieva, E.I. Ermolenko, K.B. Grabovskaya, T.A. Kramskaya, A.N. Tsapieva, I.V. Koroleva, A.N.Suvorov. Creation and experience of using a live vaccine based on the probiotic strain Enterococcus Faecium L3 for the prevention of vaginal infection caused by Streptococcus agalactiae , Medical Academic Journal, 2013, 13 (2), pp. 64-70].
Известен способ, основанный на введении bac гена патогенных СГВ в хромосомную ДНК в области кодирования белков пилей пробиотического штамма Enterococcus faecium L3 с последующей экспрессией белка Bac, кодируемого этим геном, в пилях. Пили энтерококков выступают за пределы бактериальных клеток и способны проникать сквозь капсулу, которая экранирует большинство бактериальных белков-антигенов. Пили состоят из белковых мономеров, способных к агрегации. За счет этого процесса может увеличиваться доза чужеродного антигена, встроенного в белок пилей. Последнее должно способствовать увеличению титров антител, специфичных к встраиваемому в структуру поверхностного белка энтерококка полипептидного фрагмента штамма патогенного СГВ. The known method is based on the introduction of the bac gene of pathogenic GBS into chromosomal DNA in the coding region of pili proteins of the probiotic strain Enterococcus faecium L3, followed by expression of the Bac protein encoded by this gene in pili. Pili enterococci protrude beyond the bacterial cells and are able to penetrate the capsule, which screens most bacterial antigen proteins. Pili are composed of protein monomers capable of aggregation. Due to this process, the dose of a foreign antigen embedded in the pili protein can be increased. The latter should contribute to an increase in the titers of antibodies specific to the polypeptide fragment of the pathogenic GBS strain inserted into the structure of the surface protein of enterococcus.
Известный способ введения гена патогенных стрептококков в пили пробиотического штамма Enterococcus faecium L3 интересен тем, что рекомбинантный белок экспрессируется не в цитоплазме, а на поверхности бактерии [4- патент РФ №2640250 «Способ введения генов патогенных стрептококков в хромосомную ДНК пробиотического штамма Еnterococcus faecium l3 для экспрессии в пилях», МПК:A61K39/092; авторы- Суворов А.Н. и др.].The known method of introducing the gene of pathogenic streptococci into pili of the probiotic strain Enterococcus faecium L3 is interesting in that the recombinant protein is expressed not in the cytoplasm, but on the surface of the bacterium [4-RF patent No. 2640250 "Method of introducing genes of pathogenic streptococci into the chromosomal DNA of the probiotic strain Enterciumoco3 expression in pilas ", IPC: A61K39 / 092; authors - Suvorov A.N. and etc.].
Известно, что штамм Еnterococcus faecium L3 обладает выраженной антагонистической активностью в отношении грамположительных и грамотрицательных бактерий, способностью восстанавливать микробиоценоз кишечника на фоне дисбиотических состояний [5 - Yermolenko E., Suvorov A., Chernush A., et al. International Congress Series, 1289: 363-366 (2006)], а также оказывать иммуномодулирующее действие на организм хозяина [6 - TarasovaE., YermolenkoE. , DonetsV., SundukovaZ. , BochkarevaA. , BorsсhevI. , SuvorovaM. , Ilyasov. I., Simanenkov V., Suvorov A. The influence of probiotic enetrococci on the microbiota and cytokines expression in rats with dysbiosis induced by antibiotics// Beneficial Microbes. -2010- Т. 1. -№ 3.- С. 265-270].It is known that the strain Enterococcus faecium L3 has a pronounced antagonistic activity against gram-positive and gram-negative bacteria, the ability to restore intestinal microbiocenosis against the background of dysbiotic conditions [5 - Yermolenko E., Suvorov A., Chernush A., et al. International Congress Series, 1289: 363-366 (2006)], and also have an immunomodulatory effect on the host organism [6 - Tarasova E., Yermolenko E. , Donets V., SundukovaZ. , Bochkareva A. , BorshevI. , Suvorova M. , Ilyasov. I., Simanenkov V., Suvorov A. The influence of probiotic enetrococci on the microbiota and cytokines expression in rats with dysbiosis induced by antibiotics // Beneficial Microbes. -2010- T. 1. -No. 3.- S. 265-270].
Осуществлено физическое картирование штамма Еnterococcus faecium L3 [7 - Suvorov A., Simanenkov V., Gromova L. et al. Prebiotics and probiotics potencial for human health, 104-112, (2011)]. В экспериментах на здоровых самках мышей показано, что интравагинальное введение высоких доз штамма Еnterococcus faecium L3 не только не оказывает токсического действия на организм, но не влияет на состояние слизистой оболочки влагалища [8 - Суворов А., Алехина Г.Г., Пигаревский П.В. и др. Гастробюллетень, 4: 29-31, (2001)] и способствует экспрессии IL-10 клетками слизистой оболочки влагалища крыс с экспериментальным вагинитом, вызванном S.agalactiae и Staphylococcus aureus [6 - TarasovaE., YermolenkoE. , DonetsV., SundukovaZ. , BochkarevaA. , BorsсhevI. , SuvorovaM. , IlyasovI., SimanenkovV., SuvorovA. The influence of probiotic enetrococci on the microbiota and cytokines expression in rats with dysbiosis induced by antibiotics// Beneficial Microbes. -2010.- Т. 1. -№ 3.- С. 265-270]. Physical mapping of the Enterococcus faecium L3 strain [7 - Suvorov A., Simanenkov V., Gromova L. et al. Prebiotics and probiotics potencial for human health, 104-112, (2011)]. In experiments on healthy female mice, it was shown that intravaginal administration of high doses of the Enterococcus faecium L3 strain not only does not have a toxic effect on the body, but does not affect the state of the vaginal mucosa [8 - A. Suvorov, G. Alekhina, P. Pigarevsky. IN. et al. Gastro-Bulletin, 4: 29-31, (2001)] and promotes the expression of IL-10 by cells of the vaginal mucosa of rats with experimental vaginitis caused by S.agalactiae and Staphylococcus aureus [6 - TarasovaE., YermolenkoE. , Donets V., SundukovaZ. , Bochkareva A. , BorshevI. , Suvorova M. , Ilyasov I., Simanenkov V., Suvorov A. The influence of probiotic enetrococci on the microbiota and cytokines expression in rats with dysbiosis induced by antibiotics // Beneficial Microbes. -2010.- T. 1. -No. 3.- S. 265-270].
В штамме Еnterococcus faecium L3, как и у других грамположительных бактерий, имеются пили, которые представляют собой фимбрии длиной 0,3-3 μm и диаметром 2-10nm [9 - Telford JL, Barocchi MA, Margarit I, Rappuoli R, Grandi G. Pili in gram-positive pathogens. Nat Rev Microbiol. -2006- T.4, №7-С. 509-519. doi: 10.1038/nrmicro1443. PMID: 16778837]. Это длинные белок-подобные полимеры, тянущиеся на поверхности бактерий, представляют собой субъединицы белка пилина, соединенные ковалентной связью. Они играют большую роль в адгезии колонизации хозяина. Пили являются высокоиммуногенными структурами, которые находятся под селективным давлением иммунных реакций хозяина [10 - Danne C, Dramsi S. Pili of gram-positive bacteria: roles in host colonization. Res Microbiol. 2012 Nov-Dec;163(9-10):645-58. doi: 10.1016/j.resmic.2012.10.012. Epub 2012 Oct 29. PMID: 23116627]. Принцип модификации пилей энтерококков вакцинными антигенами является приоритетным подходом при создании эффективных живых вакцин благодаря экспозиции целевого антигена на поверхности энтерококка.In the Enterococcus faecium L3 strain, like other gram-positive bacteria, there are pili, which are fimbriae 0.3-3 μm in length and 2-10 nm in diameter [9 - Telford JL, Barocchi MA, Margarit I, Rappuoli R, Grandi G. Pili in gram-positive pathogens. Nat Rev Microbiol. -2006- T.4, No. 7-C. 509-519. doi: 10.1038 / nrmicro1443. PMID: 16778837]. These long protein-like polymers stretching on the surface of bacteria are subunits of the pilin protein linked by a covalent bond. They play a large role in host colonization adhesion. Pili are highly immunogenic structures that are under the selective pressure of host immune responses [10 - Danne C, Dramsi S. Pili of gram-positive bacteria: roles in host colonization. Res Microbiol. 2012 Nov-Dec; 163 (9-10): 645-58. doi: 10.1016 / j.resmic.2012.10.012. Epub 2012 Oct 29. PMID: 23116627]. The principle of modification of pili enterococci with vaccine antigens is a priority approach when creating effective live vaccines due to exposure of the target antigen on the surface of enterococcus.
Известен способ создания живой вакцины за счет введения генов патогенных стрептококков в хромосомную ДНК пробиотического штамма Enterococcus faecium L3 для экспрессии в пилях, и живая вакцины на основе модифицированного штамма пробиотиков Еnterococcus faecium L3 для профилактики инфекции, вызванной Streptococcus pneumonie [11 - Суворов А.Н., Гупалова Т.В., Кулешевич Е.В., Леонтьева Г.Ф., Крамская Т.А, Патент РФ№ 2701733], который принят в качестве прототипа.A known method of creating a live vaccine by introducing genes of pathogenic streptococci into the chromosomal DNA of a probiotic strain Enterococcus faecium L3 for expression in pili, and a live vaccine based on a modified strain of probiotics Enterococcus faecium L3 for the prevention of infection caused by Streptococcus pneumonie H. [11 - Suvorov A. , Gupalova TV, Kuleshevich EV, Leontyeva GF, Kramskaya TA, RF Patent No. 2701733], which was adopted as a prototype.
Недостатком известного способа [11]является сложность конструирования такой вакцины за счет большого количества стадий необходимых для создания суммарного фрагмента ДНК, состоящего из двух отдельных фрагментов гена пробиотика Enterococcus faecium L3 и химерного гена Streptococcus pneumonie-pspf. The disadvantage of the known method [11] is the complexity of the design of such a vaccine due to the large number of steps required to create a total DNA fragment consisting of two separate fragments of the probiotic Enterococcus faecium L3 gene and the chimeric Streptococcus pneumonie gene - pspf.
Указанный недостаток устраняется в заявленном способе создания живой вакцины за счет замены химерного гена Streptococcus pneumoniae-pspf на фрагмент гена covid-19 методом клонирования, что сокращает получение вакцины в отличие от прототипа, а также позволяет создавать любые другие вакцинные кандидаты на этой платформе. Существенно, что созданный вакцинный кандидат в отличие от вакцины-прототипа, предназначен для обеспечения специфической профилактики заболеваний, вызванных вирусом SARS-Cov-2, а не Streptococcus pneumoniae.This drawback is eliminated in the claimed method for creating a live vaccine by replacing the chimeric Streptococcus pneumoniae - pspf gene with a covid-19 gene fragment by cloning, which reduces the production of a vaccine, in contrast to the prototype, and also allows you to create any other vaccine candidates on this platform. It is essential that the created vaccine candidate, in contrast to the prototype vaccine, is intended to provide specific prevention of diseases caused by the SARS-Cov-2 virus, and not by Streptococcus pneumoniae .
Техническим результатом изобретения является значительное упрощение способа получения живой вакцины против коронавирусной инфекции.The technical result of the invention is a significant simplification of the method for producing a live vaccine against coronavirus infection.
Указанный технический результат достигается тем, что в способе создания живой вакцины против коронавирусной инфекции COVID-19 на основе пробиотического штамма Enterococcus faecium L3 (по патенту РФ №2220199), модифицированного в результате электропорации культуры энтерококков штамма Enterococcus faecium L3 рекомбинантной плазмидной ДНК pentF-covid-19, содержащей последовательность SEQ ID No:1 в соответствии с заявленным изобретением, для создания SEQ ID No:1 в плазмиде pentF-pspf (по патенту РФ №2701733), участок pspf был заменен на фрагмент гена шиповидного белка SARS-CoV-2, при этом ДНК pentF-covid-19 кодирует аминокислотную последовательность SEQ ID No:2, которая выполняет функцию шиповидного белка вируса SARS-CoV-2, способного осуществлять стимуляцию гуморального и клеточного иммунитета в отношении вируса SARS-CoV-2 .При этом задача генетической части работы состояла в осуществлении интеграции участка ДНК вируса в структуру гена поверхностного белка пробиотика без нарушения открытой рамки считывания и повреждения участков кодирования компонентов, участвующих в процессинге поверхностного белка PilF. The specified technical result is achieved by the fact that in the method of creating a live vaccine against coronavirus infection COVID-19 based on the probiotic strain Enterococcus faecium L3 (according to RF patent No. 2220199), modified as a result of electroporation of the culture of enterococci strain Enterococcus faecium L3 recombinant plasmid DNA pentF-
Кроме того, указанный технический результат достигается тем, что живая вакцина Enterococcus faecium L3-pentF-covid-19, в которой штамм Enterococcus faecium экспрессирует ген слитого белка, способного индуцировать образование антител, причем образующиеся специфические антитела классов А и G в отношении инфекции, в соответствии с заявленным изобретением, в плазмидную ДНК вводят фрагмент гена, кодирующего шиповидный белок вируса SARS-CoV-2, способного осуществлять стимуляцию гуморального и клеточного иммунитета в отношении вируса SARS-CoV-2, т.е созданием живой вакцины против коронавируса SARS-CoV-2, обладающей выраженным иммуногенным эффектом.In addition, this technical result is achieved by the fact that the live vaccine Enterococcus faecium L3-pentF-covid-19, in which the Enterococcus faecium strain expresses a gene of a fusion protein capable of inducing the formation of antibodies, and the resulting specific antibodies of classes A and G against infection, in In accordance with the claimed invention, a fragment of the gene encoding the spike protein of the SARS-CoV-2 virus is introduced into the plasmid DNA, capable of stimulating humoral and cellular immunity against the SARS-CoV-2 virus, i.e. creating a live vaccine against the SARS-CoV-
В известном способе, использованном в качестве прототипа[11], на основе штамма пробиотика Еnterococcus faecium L3 была сконструирована генно-инженерная живая вакцина со встроенным в хромосому, в области, кодирующей ген пилей, участком химерного гена pspf, сконструированного на основе генов патогенности Streptococcus pneumoniae. Штамм Еnterococcus faecium L3-PSPF+ был получен в результате трансформации плазмидой pentF-pspf штамма Enterococcus faecium L3.In the known method, used as a prototype [11], on the basis of the probiotic strain Enterococcus faecium L3, a genetically engineered live vaccine was constructed with an inserted chromosome, in the region encoding the pili gene, a portion of the chimeric pspf gene, constructed on the basis of the pathogenicity genes of Streptococcus pneumonia ... The Enterococcus faecium L3-PSPF + strain was obtained by transformation with the pentF-pspf plasmid of the Enterococcus faecium L3 strain.
Интраназальное введение вакцины Еnterococcus faecium L3-PSPF+ стимулировало развитие специфического системного и местного иммунного ответа. На модели интраназальной летальной пневмококковой инфекции у мышей линии СВА было показано, что трехкратная интраназальная вакцинация созданной живой пробиотической вакциной повышала защиту от летальной пневмококковой инфекции. Intranasal administration of the Enterococcus faecium L3-PSPF + vaccine stimulated the development of a specific systemic and local immune response. In a model of intranasal lethal pneumococcal infection in CBA mice, it was shown that three-fold intranasal vaccination with the created live probiotic vaccine increased protection against lethal pneumococcal infection.
При реализации заявленного способа создания живой вакцины на основе пробиотического штамма Еnterococcus faecium L3 был использован синтезированный фрагмент ДНК шиповидного белка коронавируса, который был смоделирован авторами патента, а затем синтезирован компанией Евроген. При этом в плазмиде pentF-pspf участок гена pspf был заменен на фрагмент гена шиповидного белка.When implementing the claimed method for creating a live vaccine based on the probiotic strain Enterococcus faecium L3, a synthesized DNA fragment of the coronavirus spike protein was used, which was modeled by the authors of the patent, and then synthesized by the Evrogen company. In this case, in the pentF-pspf plasmid, the pspf gene fragment was replaced with a spike protein gene fragment.
В итоге реализации этого способа достигается решение конечной технической задачи заявленного изобретения, заключающееся в создании живой вакцины против коронавируса SARS-CoV-2, обладающей выраженными иммуногенными свойствам, на основе биологически активного штамма Еnterococcus faecium L3 за счет замещения в структуре участка его гена пилей на участок гена корановируса SARS-CoV-2. Создание такой вакцины против инфекции, вызываемой корановирусом, основано на введении участка ДНК, кодирующего антигенный фрагмент иммуногенных эпитопов вируса SARS-CoV-2, в структуру гена пилей пробиотика. As a result of the implementation of this method, a solution to the final technical problem of the claimed invention is achieved, which consists in creating a live vaccine against the SARS-CoV-2 coronavirus, which has pronounced immunogenic properties, based on a biologically active strain of Enterococcus faecium L3 due to the replacement of the pili gene in the structure of a section of its gene by a site gene of coranovirus SARS-CoV-2. The creation of such a vaccine against an infection caused by a coranovirus is based on the introduction of a DNA fragment encoding an antigenic fragment of the immunogenic epitopes of the SARS-CoV-2 virus into the structure of the probiotic pili gene.
Реализация указанной технической задачи поясняется конкретными примерами введения гена covid-19 коронавируса в хромосомную ДНК в области, кодирующей ген пилей, пробиотического штамма Еnterococcus faecium L3 для экспрессии в пилях иммуногенного участка шиповидного белка SARS-CoV-2:The implementation of this technical problem is illustrated by specific examples of the introduction of the covid - 19 gene of the coronavirus into the chromosomal DNA in the region encoding the pili gene of the probiotic strain Enterococcus faecium L3 for expression in the pili of the immunogenic region of the SARS-CoV-2 spike protein:
а) получение слитого гена entF-covid-19 и его клонированиеa) obtaining the fusion gene entF-covid - 19 and cloning it
б) выявление бактериальных клонов, содержащих ген слитого белка COVID-19+ в хромосоме b) identification of bacterial clones containing the gene for the fusion protein COVID-19 + in the chromosome
в) пероральная вакцинация мышей живой пробиотической вакцинойc) oral vaccination of mice with live probiotic vaccine
г) определение COVID19+-специфических антител в крови и вагинальных смывах. d) determination of COVID19 + -specific antibodies in blood and vaginal swabs.
д) выявление клеточного звена специфического иммунного ответа на пероральную вакцинацию живой противовирусной вакциной.e) identification of the cellular link of a specific immune response to oral vaccination with a live antiviral vaccine.
Технической сущностью предлагаемого изобретения является создание живой вакцины против коронавируса SARS-CoV-2, обладающей выраженными иммуногенными свойствами.The technical essence of the proposed invention is the creation of a live vaccine against the coronavirus SARS-CoV-2, which has pronounced immunogenic properties.
Пероральное введение вакцины Еnterococcus faecium L3 с геном вируса SARS-CoV-2 стимулировало развитие специфического системного и местного иммунного ответа. На модели интраназальной летальной коронавирусной инфекции у мышей было показано, что трехкратная пероральная вакцинация созданной живой пробиотической вакциной повышала защиту от летальной коронавирусной инфекции.Oral administration of the Enterococcus faecium L3 vaccine with the SARS-CoV-2 virus gene stimulated the development of a specific systemic and local immune response. In a model of intranasal lethal coronavirus infection in mice, it was shown that three-fold oral vaccination with the created live probiotic vaccine increased protection against lethal coronavirus infection.
Конструирование живой вакцины на основе биологически активного пробиотического штамма Еnterococcus faecium L3 за счет включения в его пили антигена SARS-CoV-2 позволило объединить в одном препарате эффективность полезных свойств пробиотика и специфического антигенного стимула. The design of a live vaccine based on the biologically active probiotic strain Enterococcus faecium L3 due to the inclusion of the SARS-CoV-2 antigen in its pili made it possible to combine the effectiveness of the beneficial properties of the probiotic and a specific antigenic stimulus in one preparation.
Для получения слитого гена entF-covid-19 и его клонирования были сконструированы ДНК праймеры, представленные в таблице «Олигонуклеотидные праймеры», в которой в графе 1 приведены 8 названий. праймеров; в графе 2 приведена их ориентация по отношению к положительной цепочке ДНК.; а в графе 3 приведены нуклеотидные последовательности, которые были сконструированы в соответствии с направлением цепочки ДНК последовательность от 5' к 3'. To obtain the fusion gene entF-covid - 19 and its cloning, DNA primers were designed, presented in the table "Oligonucleotide primers", in which 8 names are given in
Олигонуклеотидные праймерыOligonucleotide primers
Таблица Table
Нуклеотидные последовательности в графе 3 с названиями К1 и К2 (в графе 1), с участками, выделенными подчеркиванием, указывают на соответствующие им сайты гидролиза рестрикционными эндонуклеазами.Nucleotide sequences in
Фрагмент гена covid-19 был синтезирован с последующим клонированием в векторную плазмидную ДНК pAL2-T, фирмой Евроген. Для удобства последующего клонирования сайты рестрикции для NdEI и EcoRI были вставлены во фрагмент гена covid-19 при его синтезе.A fragment of the covid - 19 gene was synthesized with subsequent cloning into vector plasmid DNA pAL2-T by Evrogen. For the convenience of subsequent cloning, restriction sites for NdEI and EcoRI were inserted into the covid - 19 gene fragment during its synthesis.
Рекомбинантная плазмидная ДНК pentF-pspf, представляющая собой плазмидную ДНК, полученную в результате вставки суммарного фрагмента ДНК, состоящего из двух отдельных фрагментов гена пробиотика Enterococcus faecium L3 и фрагмента гена pspf, описанная в прототипе [11-патент РФ 2701733], была использована для заявляемой конструкции. Из плазмидной ДНК pentF-pspf была удалена вставка гена пневмококка pspf и заменена на вставку гена covid-19. Для этого плазмидную ДНК pentF-psp гидролизовали ферментами NdEI и EcoRI, сайты для которых ограничивают последовательность гена pspf (Фиг.1). Такие же сайты рестрикции были заложены в синтезированный фрагмент гена covid-19. Полученный верхний фрагмент после гидролиза был использован для дальнейшего клонирования.Recombinant plasmid DNA pentF-pspf , which is a plasmid DNA obtained by inserting a total DNA fragment consisting of two separate fragments of the probiotic Enterococcus faecium L3 gene and a pspf gene fragment described in the prototype [11-RF patent 2701733], was used for the claimed constructions. From plasmid DNA pentF-pspf pneumococcal insert has been removed and replaced by a gene pspf covid to insert genes - 19. For this, plasmid DNA pentF-psp was digested with NdEI and EcoRI enzymes, the sites for which limit the pspf gene sequence (Fig. 1). The same restriction sites were incorporated into the synthesized fragment of the covid - 19 gene. The resulting upper fragment after hydrolysis was used for further cloning.
Плазмидная ДНК pAL2-T, содержащая фрагмент гена covid-19, была гидролизована ферментами NdEI и EcoRI. Клонирование рестрицированного фрагмента, кодирующего COVID-19, осуществлялся использованием верхнего фрагмента после гидролиза плазмиды pentF-pspf. Продукты рестрикции разделялись с помощью электрофореза в 1% агарозном геле. ДНК рестрикты выделялись из агарозы с помощью набора «QIAquick Gel Extraction Kit» (Qiagen, USA), которые затем лигировали и трансформировали в гетерологичную систему E.coli DH5α. Среда для отбора содержала 500 мкг/мл эритромицина. В результате трансформации был получен один клон. Из этого клона была выделена плазмидная ДНК. Наличие вставки подтверждалось гидролизом плазмиды ферментами NdEI и EcoRI (Фиг.2).Plasmid DNA pAL2-T containing a fragment of the covid - 19 gene was digested with NdEI and EcoRI. Cloning of the restricted fragment encoding COVID-19 was carried out using the upper fragment after hydrolysis of the pentF-pspf plasmid. Restriction products were separated by electrophoresis in 1% agarose gel. Restricted DNA was isolated from agarose using a QIAquick Gel Extraction Kit (Qiagen, USA), which were then ligated and transformed into a heterologous E. coli DH5α system. The selection medium contained 500 μg / ml erythromycin. As a result of the transformation, one clone was obtained. Plasmid DNA was isolated from this clone. The presence of the insert was confirmed by hydrolysis of the plasmid with the enzymes NdEI and EcoRI (Fig. 2).
Продукты ПЦР плазмидной ДНК, полученные с праймерами K1 и K2,и SeqF и K2 были просеквенированы. Результаты сиквенса показали правильность последовательности плазмидной ДНК, которая содержала нужные фрагмнты ДНК энтерококка и ДНК коронавируса (перечень последовательностей SEQIDNo:1).PCR products of plasmid DNA obtained with primers K1 and K2, and SeqF and K2 were sequenced. The sequencing results showed the correctness of the plasmid DNA sequence, which contained the desired Enterococcus DNA and coronavirus DNA fragments (SEQ ID NO: 1).
В результате клонирования были получена плазмида pentF-covid-19 спрогнозируемой вставкой и геном устойчивости к эритромицину. As a result of cloning, the p ent F- covid - 19 plasmid was obtained with the predicted insert and the erythromycin resistance gene.
В результате электропорации энтерококков созданной интегративной плазмидой было получено 14 трансформантов. Они были проверены в реакции ПЦР с праймерами K1 и K2. Для этого из трансформантов выделяли ДНК, используя набор ДНК-экспресс (Литех, Россия). Положительный ответ дали 13трансформантов, все кроме 12. (Фиг3, верхний ряд)As a result of electroporation of enterococci with the created integrative plasmid, 14 transformants were obtained. They were tested in a PCR reaction with primers K1 and K2. For this, DNA was isolated from transformants using a DNA express kit (Litekh, Russia). 13 transformers gave a positive answer, all but 12. (Fig. 3, top row)
Для определения интеграции плазмидной ДНК pentF-covid-19 в хромосомную ДНК энтерококка была проведена амплификация ДНК, выделенных из 13 клонов с праймерами B1 и K2. Интеграция плазмидной ДНК pentF-covid-19 в хромосомную ДНК энтерококка была обнаружена только у двух трансформантов (Фиг3, дорожки 22 и 23,нижний ряд). Секвенирование ДНК, выделенной из одного из положительных клонов, обозначенного, как COVID 19+,было проведено с праймерами, соответствующими последовательности гена covid-19 (праймер K2) и последовательности хромосомной ДНК энтерококков (праймер B1) для подтверждения интеграции плазмидной ДНК pentF-covid-19 в хромосомную ДНК энтерококка (перечень последовательностей SEQIDNo:1).To determine the integration of plasmid DNA pentF-covid - 19 into the chromosomal DNA of enterococcus, DNA amplification was carried out, isolated from 13 clones with primers B1 and K2. Integration of plasmid DNA pentF-covid - 19 into chromosomal DNA of enterococcus was found in only two transformants (Fig. 3,
На Фиг.4 показан результат после проведения ПЦР с ДНК клона COVID 19+ с разными парами праймеров. На Фиг. 4 приведены результаты ПЦР с хромосомной ДНК энтерококка и плазмидной ДНК pentF-covid-19. Figure 4 shows the result after PCR with DNA from the
Клон COVID 19+, экспрессирующий ген COVID-19 белка, был выбран в качестве вакцинного препарата для дальнейшего исследования. A
Ниже приведены конкретные примеры, подтверждающие экспериментально проведение стадий получения живой вакцины против коронавирусной инфекцииBelow are specific examples confirming the experimental implementation of the stages of obtaining a live vaccine against coronavirus infection.
Пример 1. Example 1.
Синтез фрагмента ДНК коронавируса и его клонирование в плазмидный вектор pAL2-TSynthesis of a DNA fragment of a coronavirus and its cloning into the pAL2-T plasmid vector
Синтез фрагмента ДНК коронавируса и его клонирование в плазмидный вектор pAL2-T было проведено фирмой Евроген. Для удобства последующего клонирования сайты рестрикции для NdEI и EcoRI были вставлены во фрагмент гена covid-19 при его синтезе.The synthesis of the DNA fragment of the coronavirus and its cloning into the plasmid vector pAL2-T was carried out by Evrogen. For the convenience of subsequent cloning, restriction sites for NdEI and EcoRI were inserted into the covid - 19 gene fragment during its synthesis.
Пример 2. Example 2.
Получение слитого гена Obtaining a fusion gene entF-covidentF-covid -- 19nineteen и его клонирование. and cloning it.
Рекомбинантная плазмидная ДНК pentF-pspf, представляющая собой плазмидную ДНК, полученную в результате вставки суммарного фрагмента ДНК, состоящего из двух отдельных фрагментов гена пробиотика Enterococcus faecium L3 и фрагмента гена pspf, описанная в прототипе [11- патент РФ 2701733], была использована для создания слитого гена entF-covid-19. Для этого из плазмидной ДНК pentF-psp f была вырезана вставка гена пневмококка pspf, проведен гидролиз плазмидной ДНК pentF-pspf ферментами NdEI и EcoRI (Фиг.1). Полученный верхний фрагмент после гидролиза был использован для дальнейшего клонирования. Recombinant plasmid DNA pentF-pspf , which is a plasmid DNA obtained by inserting a total DNA fragment consisting of two separate fragments of the probiotic Enterococcus faecium L3 gene and a pspf gene fragment described in the prototype [11-RF patent 2701733], was used to create fusion gene entF-covid - 19 . For this, an insert of the pspf gene of pneumococcus was cut from the plasmid DNA pentF-psp f , and the plasmid DNA pentF-pspf was hydrolyzed with the enzymes NdEI and EcoRI (Fig. 1). The resulting upper fragment after hydrolysis was used for further cloning.
На Фиг. 1 представлена электрофореграмма рестрицированной плазмидной ДНК pentF-pspf ферментами NdEI и EcoRI., где:FIG. 1 shows an electrophoretogram of the pentF-pspf plasmid DNA restricted by the enzymes NdEI and EcoRI., Where:
1 - плазмида pentF-pspf - исходная1 - plasmid pentF-pspf - initial
2 - плазмида pentF-pspf рестрицированная2 - plasmid pentF -pspf restricted
3 - 100 п.н. ДНК - маркер (сверху вниз: 3000, 2000, 1000, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200 и 100 нуклеотидных пар).3 - 100 bp DNA - marker (from top to bottom: 3000, 2000, 1000, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200 and 100 nucleotide pairs).
Плазмидная ДНК pAL2-T, содержащая фрагмент гена covid-19, была гидролизована ферментами NdEI и EcoRI (Фиг.2). Клонирование рестрицированного фрагмента гена, кодирующего COVID-19, осуществлялось с использованием верхнего фрагмента после гидролиза плазмиды pentF-pspf. Продукты гидролиза рестрикионными эндонуклеазами были разделены с помощью электрофореза в 1% агарозном геле. ДНК гидролизаты были выделены из агарозы с помощью набора «QIAquick Gel Extraction Kit» (Qiagen, USA), лигированы и трансформированы в гетерологичную систему E.coli DH5α. Среда для отбора клонов E.coli с плазмидой содержала 500 мкг/мл эритромицина. В результате трансформации был получен один клон. Из этого клона была выделена плазмидная ДНК. Наличие вставки подтверждалось гидролизом плазмиды ферментами NdEI и EcoRI (Фиг.2).Plasmid DNA pAL2-T containing the covid - 19 gene fragment was digested with NdEI and EcoRI (Figure 2). Cloning of the restricted fragment of the gene encoding COVID-19 was carried out using the upper fragment after hydrolysis of the pentF-pspf plasmid. The products of restriction endonuclease hydrolysis were separated by electrophoresis in 1% agarose gel. DNA hydrolysates were isolated from agarose using the QIAquick Gel Extraction Kit (Qiagen, USA), ligated and transformed into the heterologous E. coli DH5α system. The medium for the selection of clones of E. coli with the plasmid contained 500 μg / ml of erythromycin. As a result of the transformation, one clone was obtained. Plasmid DNA was isolated from this clone. The presence of the insert was confirmed by hydrolysis of the plasmid with the enzymes NdEI and EcoRI (Fig. 2).
На Фиг. 2 представлена электрофореграмма рестрицированных пазмид NdEI и EcoRI, где:FIG. 2 shows an electropherogram of the restricted pasmids NdEI and EcoRI, where:
1 - плазмидная ДНК pAL2-T, содержащая фрагмент гена covid-19 1 - pAL2-T plasmid DNA containing a fragment of the covid gene - 19
2 - плазмидная ДНК pentF-covid-19 2 - plasmid DNA p ent F -covid - 19
3 - 100 п.н. ДНК - маркер (сверху вниз: 3000, 2000, 1000, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200 и 100 нуклеотидных пар).3 - 100 bp DNA - marker (from top to bottom: 3000, 2000, 1000, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200 and 100 nucleotide pairs).
Пример 3. Example 3.
Трансформация энтерококков методом электропорации.Transformation of enterococci by electroporation.
Для электропорации энтерококков культуру Еnterococcus faecium L3 сеяли в 3 мл бульона Tood-Hewitt (THB) («HiMedia», Индия) и выращивали в течение ночи при 37°С, затем пересевали в 50 мл бульона THB 1 мл ночной культуры и выращивали ее до оптической плотности при длине волны 650 нм 0.3. После этого культуру помещали в лед и затем отмывали трижды в 20 мл 10% глицерола при температуре 4°С, полученный осадок суспендировали в 0.5 мл стерильного раствора глицерола, переосаждали и конечный осадок ресуспендировали в 0.3 мл того же раствора, разлили по 50 мкл в пробирки и проводили электропорацию в кювете с расстоянием между электродами 1 мм при напряжении 2100 В. Во льду к клеткам добавили ДНК (полученную интегративную плазмиду pentF-covid-19 плазмиду, 300 нг). Оптимальная продолжительность импульса составила 4-5 миллисекунд. После проведения разряда тока в кювету добавляли 1 мл THB, инкубировали 1 час и высевали на чашки с селективной средой, которая содержала 10 мкг/мл эритромицина. Затем ожидали появления трансформантов через 24 часа. For electroporation of enterococci, the culture of Enterococcus faecium L3 was seeded in 3 ml of Tood-Hewitt broth (THB) (HiMedia, India) and grown overnight at 37 ° C, then subcultured in 50 ml of THB broth with 1 ml of overnight culture and grown to optical density at a wavelength of 650 nm 0.3. After that, the culture was placed on ice and then washed three times in 20 ml of 10% glycerol at a temperature of 4 ° C, the resulting precipitate was suspended in 0.5 ml of sterile glycerol solution, reprecipitated and the final precipitate was resuspended in 0.3 ml of the same solution, poured 50 μL into test tubes and electroporation was performed in a cuvette with a distance between the electrodes of 1 mm at a voltage of 2100 V. DNA was added to the cells on ice (the resulting integrative plasmid p entF-covid - 19 plasmid, 300 ng). The optimal pulse duration was 4-5 milliseconds. After conducting a current discharge, 1 ml of THB was added to the cuvette, incubated for 1 hour and plated on plates with a selective medium containing 10 μg / ml of erythromycin. The transformants were then expected to appear after 24 hours.
В результате электропорации энтерококков, созданной интегративной плазмидой, было получено 14 клонов трансформантов. Они были проверены в реакции ПЦР с праймерами K1 и K2. Для этого из трансформантов выделяли ДНК, используя набор ДНК-экспресс (Литех, Россия). Положительный ответ дали 13трансформантов (Фиг. 3, верхний ряд). As a result of electroporation of enterococci created by an integrative plasmid, 14 transformant clones were obtained. They were tested in a PCR reaction with primers K1 and K2. For this, DNA was isolated from transformants using a DNA express kit (Litekh, Russia). A positive response was given by 13 transformants (Fig. 3, top row).
На Фиг. 3 в верхнем ряду представлена электрофореграмма амплифицированных ДНК-фрагментов с праймерами К1 и К2.FIG. 3, the top row shows an electrophoretogram of amplified DNA fragments with primers K1 and K2.
1 – 14 – продукты ПЦР ДНК из полученных 14 клонов.1 - 14 - PCR products of DNA from the obtained 14 clones.
15 - 100 п.н. ДНК - маркер (сверху вниз: 3000, 2000, 1000, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200 и 100 нуклеотидных пар).15 - 100 bp DNA - marker (from top to bottom: 3000, 2000, 1000, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200 and 100 nucleotide pairs).
16 – продукт ПЦР плазмидной ДНК pentF-covid-19 16 - PCR product of plasmid DNA p ent F -covid - 19
17 - продукт ПЦР без добавления ДНК. 17 - PCR product without added DNA.
Была проведена амплификация ДНК, выделенных из 13 клонов для определения интеграции плазмидной ДНК pentF- covid-19 в хромосомную ДНК энтерококка с праймерами B1 и K2. Интеграция плазмидной ДНК pentF- covid-19 в хромосомную ДНК энтерококка была обнаружена только у двух трансформантов (Фиг. 3, нижний ряд). Amplification of DNA isolated from 13 clones was carried out to determine the integration of plasmid DNA pentF-covid - 19 into chromosomal DNA of enterococcus with primers B1 and K2. Integration of plasmid DNA pentF-covid - 19 into chromosomal DNA of enterococcus was found in only two transformants (Fig. 3, lower row).
На. Фиг. 3 в нижнем ряду представлена электрофореграмма амплифицированных ДНК-фрагментов с праймерами В1 и К2.On the. FIG. 3, the bottom row shows an electrophoretogram of amplified DNA fragments with primers B1 and K2.
18 – 31 – продукты ПЦР ДНК из полученных 14 клонов.18 - 31 - PCR products of DNA from the obtained 14 clones.
32 - 100 п.н. ДНК - маркер (сверху вниз: 3000, 2000, 1000, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200 и 100 нуклеотидных пар).32 - 100 bp DNA - marker (from top to bottom: 3000, 2000, 1000, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200 and 100 nucleotide pairs).
33 - продукт ПЦР без добавления ДНК. 33 - PCR product without added DNA.
Секвенирование ДНК, выделенной из одного из положительных клонов, обозначенного, как COVID 19+,было проведено с ДНК праймерами, соответствующими последовательности гена covid-19 (праймер K2) и последовательности хромосомной ДНК энтерококков (праймер B1) для подтверждения интеграции плазмидной ДНК pentF- covid-19 в хромосомную ДНК энтерококка (перечень последовательностей SEQ ID No: 1).Sequencing of DNA isolated from one of the positiveoops cloneov, designated as
На Фиг. 4 показан результат, полученный после проведения ПЦР с использованием ДНК клона COVID 19+ с разными парами праймеров. На Фиг. 4 приведены результаты ПЦР с хромосомной ДНК энтерококка и плазмидной ДНК pentF- covid-19. FIG. 4 shows the result obtained after PCR using DNA from the
На Фиг. 4 представлена электрофореграмма амплифицированных ДНК-фрагментов с разными парами праймеров, где:FIG. 4 shows an electrophoretogram of amplified DNA fragments with different pairs of primers, where:
1 – ДНКклона COVID 19+ с праймерами K1 и K21 -
2 - ДНКклона COVID 19+ с праймерами А1 и D22 -
3 – ДНКклона COVID 19+ с праймерами B1и K23 -
4 – ДНКклона COVID 19+ с праймерами K1 и E24 -
5 – ДНКклона COVID 19+ с праймерами E1 и K25 -
6 – ДНКклона COVID 19+ с праймерами E1 и E26 -
7 – ДНКклона COVID 19+ с праймерами seq F и K27 -
8 – ДНКклона COVID 19+ с праймерами B1 и E28 -
9 – ДНК L3 с праймерами B1 и E29 - DNA L3 with primers B1 and E2
10 – ДНК L3 с праймерами E1 и E210 - DNA L3 with primers E1 and E2
11 – ДНК pentF- covid-19 с праймерами K1 и K211 - DNA pentF-covid - 19 with primers K1 and K2
12 – ДНК pentF- covid-19 с праймерами seqF и K212 - DNA pentF-covid - 19 with primers seqF and K2
13 – ДНК pentF- covid-19 с праймерами E1 и E213 - DNA pentF-covid - 19 with primers E1 and E2
14 - 100 п.н. ДНК - маркер (сверху вниз: 3000, 2000, 1000, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200 и 100 нуклеотидных пар).14 - 100 bp DNA - marker (from top to bottom: 3000, 2000, 1000, 900, 800, 700, 600, 500, 400, 300, 200 and 100 nucleotide pairs).
Клон COVID 19+, экспрессирующий ген COVID-19белка, выбран в качестве вакцинного препарата для дальнейшего исследования.A
Пример 4. Example 4.
Пероральная вакцинация мышей живой пробиотической вакциной.Oral vaccination of mice with a live probiotic vaccine.
Мышам, линии Balb/c (n=10), самкам в возрасте 9-10 недель с помощью адаптера вводили перорально E.faecium L3 (n=10) и COVID 19+ (n=10). Курс вакцинации состоял из трех циклов иммунизации с интервалом в две недели. Каждый цикл включал трехкратное ежедневное введение 0,5 мл взвеси бактерий в дозе 109 КОЕ/мышь. Для вакцинации исходный и модифицированный варианты E.faecium культивировали в среде BL в течение 18 часов при 37°С в аэробных условиях. E.faecium, модифицированный участком гена коронавируса, культивировали в присутствии эритромицина в концентрации 5 мкг/мл. Суспензию клеток отмывали дважды в ЗФФР и вводили мышам.Balb / c mice (n = 10), females aged 9-10 weeks using an adapter were orally administered E. faecium L3 (n = 10) and
Пример 5.Example 5.
Определение COVID-19+ - специфических антител в крови мышей и анализ специфических Determination of COVID-19 + - specific antibodies in the blood of mice and analysis of specific цитотоксических лимфоцитовcytotoxic lymphocytes (ЦТЛ). (CTL).
Через две недели после окончания второго этапа иммунизации, то есть через шесть недель от начала иммунизации, у мышей забирали кровь для оценки уровня специфического гуморального иммунного ответа и получали селезенки для анализа специфических ЦТЛ.Two weeks after the end of the second stage of immunization, that is, six weeks after the start of immunization, blood was taken from mice to assess the level of a specific humoral immune response and spleens were obtained for analysis of specific CTLs.
Уровень специфических IgG и IgA определяли общепринятым методом ИФА. На дно 96-луночного планшета сорбировали рекомбинантный белок S (аналог вирусной вставки в энтерококк) в концентрации 0,5 мкг/мл в течение ночи при 4°С. Последовательные 4-кратные разведения сыворотки вносили в лунки в объеме 100 мкл и инкубировали 1 час при 37°С. Избыток антител отмывали ЗФФР с 0,5% Tween 20. Специфические антитела выявляли с помощью вторичных антител, конъюгированных с пероксидазой хрена. Для идентификации антител класса A использовали козий анти мышь –IgA-HRP конъюгат (Sigma), антител класса G - козий анти мышь–IgG-HRP конъюгат (Sigma). Раствор конъюгата вносили в объеме 100 мкл и инкубировали 1 час при 37°С. Планшеты отмывали четыре раза в ЗФФР с 0,5% Tween 20, связанный конъюгат выявляли в цветной реакции с ТМБ, интенсивность окраски оценивали при длине волны 450 нм. The level of specific IgG and IgA was determined by the conventional ELISA method. Recombinant protein S (analog of the viral insert in Enterococcus) was sorbed to the bottom of a 96-well plate at a concentration of 0.5 μg / ml overnight at 4 ° C. Serial 4-fold dilutions of serum were added to the wells in a volume of 100 μl and incubated for 1 hour at 37 ° C. Excess antibodies were washed with PBS with 0.5
Анализ сывороток показал, что в крови вакцинированных животных присутствовали антитела класса G, специфичные в отношении вирусного белка S, аналогичного вставке в энтерококк. Титры антител колебались в пределах 1: 400- 1:25600.The analysis of sera showed that the blood of the vaccinated animals contained antibodies of class G, specific for the viral protein S, similar to the insert in enterococcus. Antibody titers ranged from 1: 400 to 1: 25600.
На Фиг. 5 представлено содержание иммуноглобулинов класса G в сыворотке мышей через 6 недель после начала вакцинации.FIG. 5 shows the content of class G immunoglobulins in the serum of
А – средние кривые титрованияA - average titration curves
На графике 1 - представлена кривая титрования сыворотки, полученной от мышей, получавших COVID 19+Graph 1 - shows the titration curve of serum obtained from mice treated with
На графике 2 представлена кривая титрования сыворотки, полученной от мышей, получавших штамм E.faecium L3.
Б – средние титры специфического IgGB - average titers of specific IgG
Столбец 1 – титр специфического IgG из сыворотки мышей, получавших COVID 19+Column 1 - titer of specific IgG from the serum of mice treated with
Столбец 2 - титр специфического IgG из сыворотки мышей, получавших E.faecium L3Column 2 - titer of specific IgG from the serum of mice treated with E.faecium L3
* - отличия между группами достоверны р≤0,05* - differences between groups are significant p≤0.05
Определение уровня специфических антител класса А позволило установить, что вакцинация приводит к появлению в сыворотке крови мышей специфических IgA в высоких титрах, значения колеблются в пределах 1: 10000- 1: 500000, что существенно превышает показатели для специфических IgG.Determination of the level of specific antibodies of class A made it possible to establish that vaccination leads to the appearance of specific IgA in the blood serum of mice in high titers, the values range from 1: 10000-1: 500000, which significantly exceeds the indicators for specific IgG.
На Фиг. 6 представлено содержание иммуноглобулинов класса A в сыворотке мышей через 6 недель после начала вакцинации, где в столбце 1 представлены средние титры специфического IgA из сыворотки мышей, получавших COVID 19+; в столбце 2 средний титр специфического IgA из сыворотки мышей, получавших E.faecium L3FIG. 6 shows the content of class A immunoglobulins in the serum of
* - отличия между группами достоверны р≤0,05.* - the differences between the groups are significant p≤0.05.
Анализ клеточного звена специфического иммунного ответа на пероральную вакцинацию живой противовирусной вакциной проводили по оценке интенсивности индукции интерферона гамма после контакта суспензии клеток селезенки с S белком SARS-Cov-2.The analysis of the cellular component of the specific immune response to oral vaccination with a live antiviral vaccine was carried out by assessing the intensity of the induction of interferon gamma after the contact of a suspension of spleen cells with the S protein SARS-Cov-2.
Суспензии отдельных клеток селезенки иммунизированных мышей готовили путем протирания селезенок через сито BD Falcon (BD Biosciences, Бедфорд, США). Клетки отмывали средой RPMI-1640 (2000 об/мин, 5 мин) и ресуспендировали в полной среде RPMI-1640, содержащей 10 % фетальной телячьей сыворотки. Подсчет числа клеток и их жизнеспособность проводили, используя метод с 0.4% трипановым синим. Пул клеток от трех мышей, рассевали в 24-луночные планшеты в посевной дозе 105 клеток/мл в трех повторах. После этого клетки стимулировали рекомбинантным пептидом COVID 19+ в дозе 1-0,5-0,1 мкг/мл. После 6 дней культивирования при 37°С в атмосфере CO2 супернатанты собирали и содержание интерферона (IFN) -гамма определяли с помощью ИФА набора (Invitrogen, Waltham, Massachusetts, USA) в соответствии с инструкциями производителя.Single cell suspensions of the spleen of immunized mice were prepared by rubbing the spleens through a BD Falcon sieve (BD Biosciences, Bedford, USA). The cells were washed with RPMI-1640 medium (2000 rpm, 5 min) and resuspended in complete RPMI-1640 medium containing 10% fetal calf serum. The counting of the number of cells and their viability was performed using the method with 0.4% trypan blue. A pool of cells from three mice were plated into 24-well plates at a seeding dose of 105 cells / ml in triplicate. Thereafter, the cells were stimulated with the
На Фиг. 7 представлена концентрация внеклеточного ИФН-γ в супернатанте культуры клеток.FIG. 7 shows the concentration of extracellular IFN-γ in the cell culture supernatant.
А - стимуляция рекомбинантным пептидом COVID 19+ в дозе 1 мкг/мл.A - stimulation with the
Столбец 1 – концентрация внеклеточного ИФН-γ в супернатанте культуры клеток мышей, получавших COVID 19+Column 1 - concentration of extracellular IFN-γ in the cell culture supernatant of mice treated with
Столбец 2 – концентрация внеклеточного ИФН-γ в супернатанте культуры клеток мышей, получавших L3Column 2 - concentration of extracellular IFN-γ in the cell culture supernatant of mice treated with L3
Столбец 3 - концентрация внеклеточного ИФН-γ в супернатанте культуры клеток интактных мышейColumn 3 - concentration of extracellular IFN-γ in the cell culture supernatant of intact mice
Б - стимуляция рекомбинантным пептидом COVID 19+ в дозе 0,1мкг/млB - stimulation with the
Столбец 1 – концентрация внеклеточного ИФН-γ в супернатанте культуры клеток мышей, получавших COVID 19+Column 1 - concentration of extracellular IFN-γ in the cell culture supernatant of mice treated with
Столбец 2 – концентрация внеклеточного ИФН-γ в супернатанте культуры клеток мышей, получавших L3Column 2 - concentration of extracellular IFN-γ in the cell culture supernatant of mice treated with L3
Столбец 3 - концентрация внеклеточного ИФН-γ в супернатанте культуры клеток интактных мышейColumn 3 - concentration of extracellular IFN-γ in the cell culture supernatant of intact mice
В - концентрация внеклеточного ИФН-γ в супернатанте культуры клеток в отсутствие стимуляции рекомбинантным пептидом COVID 19+B - the concentration of extracellular IFN-γ in the cell culture supernatant in the absence of stimulation with the
Столбец 1 – концентрация внеклеточного ИФН-γ в супернатанте культуры клеток мышей, получавших COVID 19+Column 1 - concentration of extracellular IFN-γ in the cell culture supernatant of mice treated with
Столбец 2 – концентрация внеклеточного ИФН-γ в супернатанте культуры клеток мышей, получавших L3Column 2 - concentration of extracellular IFN-γ in the cell culture supernatant of mice treated with L3
Столбец 3 - концентрация внеклеточного ИФН-γ в супернатанте культуры клеток интактных мышей.Column 3 - concentration of extracellular IFN-γ in the cell culture supernatant of intact mice.
Полученные данные указывают на то, что на 6 день после внесения специфического антигена в суспензию спленоцитов мышей, вакцинированных живой пробиотической вакциной, в среде накапливается интерферон гамма в количестве, которое достоверно превышает аналогичный показатель для контрольных проб. Последнее свидетельствует о том, что курс пероральной вакцинации живой пробиотической вакциной стимулирует цитотоксические лимфоциты Th1, которые координируют специфические клеточные реакции, в частности, активность, специфичную в отношении S белка вируса.The data obtained indicate that on the 6th day after the introduction of a specific antigen into the suspension of splenocytes of mice vaccinated with a live probiotic vaccine, interferon gamma accumulates in the medium in an amount that reliably exceeds that for the control samples. The latter indicates that the course of oral vaccination with a live probiotic vaccine stimulates cytotoxic Th1 lymphocytes, which coordinate specific cellular responses, in particular, the activity specific to the S protein of the virus.
Как показывают результаты экспериментов, заявленное изобретение позволяет создать эффективную живую вакцину с профилактическим эффектом в отношении инфекции COVID-19.As shown by the experimental results, the claimed invention makes it possible to create an effective live vaccine with a preventive effect against COVID-19 infection.
Список используемых источников информацииList of used sources of information
1. Guo YR, Cao QD, Hong ZS, Tan YY, Chen SD, Jin HJ, Tan KS, Wang DY, Yan Y. The origin, transmission and clinical therapies on coronavirus disease 2019 (COVID-19) outbreak - an update on the status. Mil Med Res. 2020 Mar 13;7(1):11. doi: 10.1186/s40779-020-00240-0. PMID: 32169119; PMCID: PMC7068984.1. Guo YR, Cao QD, Hong ZS, Tan YY, Chen SD, Jin HJ, Tan KS, Wang DY, Yan Y. The origin, transmission and clinical therapies on coronavirus disease 2019 (COVID-19) outbreak - an update on the status. Mil Med Res. 2020
2. Патент РФ №2220199 «Штамм энтерококков enterococcus faeciuml-3 для изготовления лечебно-профилактических средств и продуктов питания лечебно-профилактического назначения»; МПК: A23C 9/12, A61K 35/74 (патентообладатели и авторы: Алехина Г.Г. и Суворов А.Н.).2. RF patent No. 2220199 "Strain of enterococci enterococcus faeciuml-3 for the manufacture of therapeutic and prophylactic agents and food products for therapeutic and prophylactic purposes"; IPC:
3. Гупалова Т.В. и др. «Создание и опыт применения живой вакцины на основе штамма пробиотика Enterococcus faecium L3 для профилактики вагинальной инфекции, вызванной Streptococcus agalactiae». Медицинский академический журнал, 2013.3. Gupalova T.V. and others. "Development and experience of using a live vaccine based on the probiotic strain Enterococcus faecium L3 for the prevention of vaginal infection caused by Streptococcus agalactiae." Medical Academic Journal, 2013.
4. Патент РФ №2640250 «Способ введения генов патогенных стрептококков в хромосомную днк пробиотического штамма Еnterococcus faecium l3 для экспрессии в пилях», МПК: A61K39/092; (авторы Суворов А.Н. и др.).4. RF patent No. 2640250 "Method of introducing genes of pathogenic streptococci into the chromosomal DNA of the probiotic strain Enterococcus faecium l3 for expression in pili", IPC: A61K39 / 092; (authors Suvorov A.N. and others).
5. Yermolenko E., Suvorov A., Chernush A., et al. International Congress Series, 1289: 363-366; 2006.5. Yermolenko E., Suvorov A., Chernush A., et al. International Congress Series, 1289: 363-366; 2006.
6. Tarasova E., Yermolenko E., Donets V. et al. Beneficial Microbs, 1: 265-270, (2010). 6. Tarasova E., Yermolenko E., Donets V. et al. Beneficial Microbs 1: 265-270, (2010).
7. Suvorov A., Simanenkov V., Gromova L. et al. Prebiotics and probiotics potencial for human health, 104-112, (2011).7. Suvorov A., Simanenkov V., Gromova L. et al. Prebiotics and probiotics potencial for human health, 104-112, (2011).
8. Суворов А., Алехина Г.Г., Пигаревский П.В. и др. Гастробюллетень, 4: 29-31, (2001).8. Suvorov A., Alekhina G.G., Pigarevsky P.V. et al. Gastro-Bulletin, 4: 29-31, (2001).
9. Telford JL, Barocchi MA, Margarit I et al. Nature Reviews Microbiology 4: 509-519, (2006).9. Telford JL, Barocchi MA, Margarit I et al. Nature Reviews Microbiology 4: 509-519, (2006).
10. Camille Danne, Shaynoor Dramsi. Research in Microbiology, 163: 645-658, (2012).10. Camille Danne, Shaynoor Dramsi. Research in Microbiology 163: 645-658, (2012).
11. Патент РФ № 2701733 (Авторы – Суворов А.Н., Гупалова Т.В., Кулешевич Е.В., Леонтьева Г.Ф., Крамская Т.А.) - прототип.11. RF patent No. 2701733 (Authors - Suvorov A.N., Gupalova T.V., Kuleshevich E.V., Leontyeva G.F., Kramskaya T.A.) - prototype.
--->--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙLIST OF SEQUENCES
<110> <110>
<120> Способ создания живой вакцины против коронавирусной инфекции COVID-19<120> Method for making live vaccine against COVID-19 coronavirus infection
на основе пробиотического штамма Enterococcus faecium L3 и живая вакцинаbased on probiotic strain Enterococcus faecium L3 and live vaccine
Enterococcus faecium L3-pentF-covid-19 Enterococcus faecium L3 -pentF-covid-19
<140> <140>
<141> <141>
<150> <150>
<151> <151>
<160> 1 <160> 1
<170> <170>
<210> 1 <210> 1
<211> 1599<211> 1599
<212> Нуклеотидная последовательность<212> Nucleotide sequence
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220> <220>
<223> Нуклеотидная последовательность гена covid-19 коронавируса COVID-19,<223> Nucleotide sequence of the covid- 19 gene of the coronavirus COVID-19,
экспрессированная в системе Escherichia coli expressed in the Escherichia coli system
<400> 1<400> 1
Atgagagcagctggtattgagttgaatgatacatttctatctatttacagtttaaatgga 60Atgagagcagctggtattgagttgaatgatacatttctatctatttacagtttaaatgga 60
cagtatcagcaacgtgtgtcttggtataatgacaataatgaatctgtcggtgaacgtaat 120
attgatatgagagaatttgttgggtatgaaaaaatgggtagcttaccttattttgtcaca 180attgatatgagagaatttgttgggtatgaaaaaatgggtagcttaccttattttgtcaca 180
acagatacagcatgtgcagaatacaaagctcctgcgttatcaacaaacaatttaacttca 240acagatacagcatgtgcagaatacaaagctcctgcgttatcaacaaacaatttaacttca 240
aaagtagtgggaggacgtgcagaaaaggcttatagctcgaatgatcatttcaccgatgtt 300
gtaggagctgatacttatcacagaagtggtgtaacgtatacgcttcaaggcgcttcccca 360gtaggagctgatacttatcacagaagtggtgtaacgtatacgcttcaaggcgcttcccca 360
acattcatgattggcgcaaatacgaatagtatgatgtttagctttgatactgcattgcta 420acattcatgattggcgcaaatacgaatagtatgatgtttagctttgatactgcattgcta 420
tggacaccacaaccatcgaagcctacaaaagaagtgtttaacaaagctaatactgaagag 480tggacaccacaaccatcgaagcctacaaaagaagtgtttaacaaagctaatactgaagag 480
gcagcacacaatattgacaaaaaagtgattccacaaggatcagatgtttactatcatatt 540gcagcacacaatattgacaaaaaagtgattccacaaggatcagatgtttactatcatatt 540
catcaaaagtttgatgcattaacagtcaacacaatgaacaaatacaaatcatttaaaatc 600catcaaaagtttgatgcattaacagtcaacacaatgaacaaatacaaatcatttaaaatc 600
actgatacctttgacagcaaaaattttgatatggtatcggatgggaaaaactatgatggc 660actgatacctttgacagcaaaaattttgatatggtatcggatgggaaaaactatgatggc 660
gcattgcatatgggtttccaacccactaatggtgttggttaccaaccatacagagtagta 720gcattgcatatgggtttccaacccactaatggtgttggttaccaaccatacagagtagta 720
gtactttcttttgaacttctacatgcaccagcaactgtttgtggacctaaaaagtctact 780gtactttcttttgaacttctacatgcaccagcaactgtttgtggacctaaaaagtctact 780
aatttggttaaaaacaaatgtgtcaatttcaacttcaatggtttaacaggcacaggtgtt 840aatttggttaaaaacaaatgtgtcaatttcaacttcaatggtttaacaggcacaggtgtt 840
cttactgagtctaacaaaaagtttctgcctttccaacaatttggcagagacattgctgac 900cttactgagtctaacaaaaagtttctgcctttccaacaatttggcagagacattgctgac 900
actactgatgctgtccgtgatccacagacacttgagattcttgacattacaccatgttct 960actactgatgctgtccgtgatccacagacacttgagattcttgacattacaccatgttct 960
tttggtggtgtcagtgttataacaccaggaacaaatacttctaaccaggttgctgttctt 1020tttggtggtgtcagtgttataacaccaggaacaaatacttctaaccaggttgctgttctt 1020
tatcaggatgttaactgcacagaagtccctgttgctattcatgcagatcaacttactcct 1080tatcaggatgttaactgcacagaagtccctgttgctattcatgcagatcaacttactcct 1080
acttggcgtgtttattctacaggttctaatgtttttcaaacacgtgcaggctgtttaata 1140acttggcgtgtttattctacaggttctaatgtttttcaaacacgtgcaggctgtttaata 1140
ggggctgaacatgtcaacaacgaattctacgaaaaaaacctgaaagaatacaccgacaag 1200ggggctgaacatgtcaacaacgaattctacgaaaaaaacctgaaagaatacaccgacaag 1200
ctggataaactcgagaaaggttctgcgcgagtgatagatatgagtacaggaaaagatatt 1260ctggataaactcgagaaaggttctgcgcgagtgatagatatgagtacaggaaaagatatt 1260
acttcagaaggtacactaacctatgatagcaatttaagaacgctgaaatgggaagcttcc 1320acttcagaaggtacactaacctatgatagcaatttaagaacgctgaaatgggaagcttcc 1320
gctgatttcttaagtaaaaatcttttagatggacgagaaattcaactgatatttacagct 1380gctgatttcttaagtaaaaatcttttagatggacgagaaattcaactgatatttacagct 1380
aaaactccactacagtcagaaaaaaatattgataaccaagccgtagcagcagtagagaat 1440aaaactccactacagtcagaaaaaaatattgataaccaagccgtagcagcagtagagaat 1440
gtttctaataaaacgaatgttgtaacaattggtgttgatcctaacttaccacaagtcatt 1500gtttctaataaaacgaatgttgtaacaattggtgttgatcctaacttaccacaagtcatt 1500
gttcctagaacaggttctacacatttagtaacaattttagtggttagcttagtattactt 1560gttcctagaacaggttctacacatttagtaacaattttagtggttagcttagtattactt 1560
gtgttagctactcttagttatgtggctctgaagttcaat 1599gtgttagctactcttagttatgtggctctgaagttcaat 1599
<210> 2 <210> 2
<211> 533 <211> 533
<212> Аминокислотная последовательность<212> Amino acid sequence
<213> Искусственная последовательность<213> Artificial sequence
<220> <220>
<223> Аминокислотная последовательность <223> Amino Acid Sequence
<400> 2 <400> 2
MetArgAlaAlaGlyIleGluLeuAsnAspThrPheLeuSerIleTyrMetArgAlaAlaGlyIleGluLeuAsnAspThrPheLeuSerIleTyr
5 10 15 5 10 15
SerLeuAsnGlyGlnTyrGlnGlnArgValSerTrpTyrAsnAspAsnSerLeuAsnGlyGlnTyrGlnGlnArgValSerTrpTyrAsnAspAsn
20 25 30 20 25 30
AsnGluSerValGlyGluArgAsnIleAspMetArgGluPheValGlyAsnGluSerValGlyGluArgAsnIleAspMetArgGluPheValGly
35 40 45 35 40 45
TyrGluLysMetGlySerLeuProTyrPheValThrThrAspThrAlaTyrGluLysMetGlySerLeuProTyrPheValThrThrAspThrAla
50 55 60 50 55 60
CysAlaGluTyrLysAlaProAlaLeuSerThrAsnAsnLeuThrSerCysAlaGluTyrLysAlaProAlaLeuSerThrAsnAsnLeuThrSer
65 70 75 8065 70 75 80
LysValValGlyGlyArgAlaGluLysAlaTyrSerSerAsnAspHisLysValValGlyGlyArgAlaGluLysAlaTyrSerSerAsnAspHis
85 90 95 85 90 95
PheThrAspValValGlyAlaAspThrTyrHisArgSerGlyValThrPheThrAspValValGlyAlaAspThrTyrHisArgSerGlyValThr
100 105 110 100 105 110
TyrThrLeuGlnGlyAlaSerProThrPheMetIleGlyAlaAsnThrTyrThrLeuGlnGlyAlaSerProThrPheMetIleGlyAlaAsnThr
115 120 125 115 120 125
AsnSerMetMetPheSerPheAspThrAlaLeuLeuTrpThrProGlnAsnSerMetMetPheSerPheAspThrAlaLeuLeuTrpThrProGln
130 135 140 130 135 140
ProSerLysProThrLysGluValPheAsnLysAlaAsnThrGluGluProSerLysProThrLysGluValPheAsnLysAlaAsnThrGluGlu
145 150 155 160145 150 155 160
AlaAlaHisAsnIleAspLysLysValIleProGlnGlySerAspValAlaAlaHisAsnIleAspLysLysValIleProGlnGlySerAspVal
165 170 175 165 170 175
TyrTyrHisIleHisGlnLysPheAspAlaLeuThrValAsnThrMetTyrTyrHisIleHisGlnLysPheAspAlaLeuThrValAsnThrMet
180 185 190 180 185 190
AsnLysTyrLysSerPheLysIleThrAspThrPheAspSerLysAsnAsnLysTyrLysSerPheLysIleThrAspThrPheAspSerLysAsn
195 200 205 195 200 205
PheAspMetValSerAspGlyLysAsnTyrAspGlyAlaLeuHisMetPheAspMetValSerAspGlyLysAsnTyrAspGlyAlaLeuHisMet
210 215 220 210 215 220
GlyPheGlnProThrAsnGlyValGlyTyrGlnProTyrArgValValGlyPheGlnProThrAsnGlyValGlyTyrGlnProTyrArgValVal
225 230 235 240225 230 235 240
ValLeuSerPheGluLeuLeuHisAlaProAlaThrValCysGlyProValLeuSerPheGluLeuLeuHisAlaProAlaThrValCysGlyPro
245 250 255 245 250 255
LysLysSerThrAsnLeuValLysAsnLysCysValAsnPheAsnPheLysLysSerThrAsnLeuValLysAsnLysCysValAsnPheAsnPhe
260 265 270 260 265 270
AsnGlyLeuThrGlyThrGlyValLeuThrGluSerAsnLysLysPheAsnGlyLeuThrGlyThrGlyValLeuThrGluSerAsnLysLysPhe
275 280 285 275 280 285
LeuProPheGlnGlnPheGlyArgAspIleAlaAspThrThrAspAlaLeuProPheGlnGlnPheGlyArgAspIleAlaAspThrThrAspAla
290 295 300 290 295 300
ValArgAspProGlnThrLeuGluIleLeuAspIleThrProCysSerValArgAspProGlnThrLeuGluIleLeuAspIleThrProCysSer
305 310 315 320305 310 315 320
PheGlyGlyValSerValIleThrProGlyThrAsnThrSerAsnGlnPheGlyGlyValSerValIleThrProGlyThrAsnThrSerAsnGln
325 330 335 325 330 335
ValAlaValLeuTyrGlnAspValAsnCysThrGluValProValAlaValAlaValLeuTyrGlnAspValAsnCysThrGluValProValAla
340 345 350 340 345 350
IleHisAlaAspGlnLeuThrProThrTrpArgValTyrSerThrGlyIleHisAlaAspGlnLeuThrProThrTrpArgValTyrSerThrGly
355 360 365 355 360 365
SerAsnValPheGlnThrArgAlaGlyCysLeuIleGlyAlaGluHisSerAsnValPheGlnThrArgAlaGlyCysLeuIleGlyAlaGluHis
370 375 380 370 375 380
ValAsnAsnGluPheTyrGluLysAsnLeuLysGluTyrThrAspLysValAsnAsnGluPheTyrGluLysAsnLeuLysGluTyrThrAspLys
385 390 395 400385 390 395 400
LeuAspLysLeuGluLysGlySerAlaArgValIleAspMetSerThrLeuAspLysLeuGluLysGlySerAlaArgValIleAspMetSerThr
405 410 415 405 410 415
GlyLysAspIleThrSerGluGlyThrLeuThrTyrAspSerAsnLeuGlyLysAspIleThrSerGluGlyThrLeuThrTyrAspSerAsnLeu
420 425 430 420 425 430
ArgThrLeuLysTrpGluAlaSerAlaAspPheLeuSerLysAsnLeuArgThrLeuLysTrpGluAlaSerAlaAspPheLeuSerLysAsnLeu
435 440 445 435 440 445
LeuAspGlyArgGluIleGlnLeuIlePheThrAlaLysThrProLeuLeuAspGlyArgGluIleGlnLeuIlePheThrAlaLysThrProLeu
450 455 460 450 455 460
GlnSerGluLysAsnIleAspAsnGlnAlaValAlaAlaValGluAsnGlnSerGluLysAsnIleAspAsnGlnAlaValAlaAlaValGluAsn
465 470 475 480465 470 475 480
ValSerAsnLysThrAsnValValThrIleGlyValAspProAsnLeuValSerAsnLysThrAsnValValThrIleGlyValAspProAsnLeu
485 490 495 485 490 495
ProGlnValIleValProArgThrGlySerThrHisLeuValThrIleProGlnValIleValProArgThrGlySerThrHisLeuValThrIle
500 505 510 500 505 510
LeuValValSerLeuValLeuLeuValLeuAlaThrLeuSerTyrValLeuValValSerLeuValLeuLeuValLeuAlaThrLeuSerTyrVal
515 520 525 515 520 525
AlaLeuLysPheAsnAlaLeuLysPheAsn
530 533 530533
<---<---
Claims (2)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2020139986A RU2745626C1 (en) | 2020-12-05 | 2020-12-05 | Method of creating a live vaccine against covid-19 based on the probiotic strain enterococcus faecium l3 and a live vaccine enterococcus faecium l3-pentf-covid-19 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2020139986A RU2745626C1 (en) | 2020-12-05 | 2020-12-05 | Method of creating a live vaccine against covid-19 based on the probiotic strain enterococcus faecium l3 and a live vaccine enterococcus faecium l3-pentf-covid-19 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2745626C1 true RU2745626C1 (en) | 2021-03-29 |
Family
ID=75353177
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2020139986A RU2745626C1 (en) | 2020-12-05 | 2020-12-05 | Method of creating a live vaccine against covid-19 based on the probiotic strain enterococcus faecium l3 and a live vaccine enterococcus faecium l3-pentf-covid-19 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2745626C1 (en) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2776484C1 (en) * | 2021-07-02 | 2022-07-21 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Институт экспериментальной медицины" (ФГБНУ "ИЭМ") | Recombinant dna ensuring production of the recombinant protein cov1 exhibiting immunogenic properties against sars-cov-2 virus |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3000473B1 (en) * | 2014-09-23 | 2017-07-05 | Velleja Research SRL | Probiotic composition for use in the prevention of birth-acquired bacterial and fungal infections in newborns |
RU2640250C2 (en) * | 2015-10-23 | 2017-12-27 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Институт экспериментальной медицины" (ФГБНУ "ИЭМ") | Method for introgression of pathogenic streptococcus genes in chromosomal dna of probiotic strain of enterococcus faecium l3 for expression in piles |
RU2701733C1 (en) * | 2018-12-14 | 2019-10-01 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Институт экспериментальной медицины" (ФГБНУ "ИЭМ") | Live vaccine based on enterococcus faecium l3 probiotic strain for prevention of infection caused by streptococcus pneumonie |
RU2733834C1 (en) * | 2020-07-28 | 2020-10-07 | Федеральное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора) | Artificial ectos_sc2 gene encoding an ectodomain of the sars-cov-2 coronavirus s glycoprotein with a c-terminal trimerization domain, a recombinant plasmid pstem-rvsv-ectos_sc2, which provides expression of the artificial gene, and a recombinant strain of vesicular stomatitis virus rvsv-ectos_sc2, used to create a vaccine against sars-cov-2 coronavirus |
-
2020
- 2020-12-05 RU RU2020139986A patent/RU2745626C1/en active
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3000473B1 (en) * | 2014-09-23 | 2017-07-05 | Velleja Research SRL | Probiotic composition for use in the prevention of birth-acquired bacterial and fungal infections in newborns |
RU2640250C2 (en) * | 2015-10-23 | 2017-12-27 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Институт экспериментальной медицины" (ФГБНУ "ИЭМ") | Method for introgression of pathogenic streptococcus genes in chromosomal dna of probiotic strain of enterococcus faecium l3 for expression in piles |
RU2701733C1 (en) * | 2018-12-14 | 2019-10-01 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Институт экспериментальной медицины" (ФГБНУ "ИЭМ") | Live vaccine based on enterococcus faecium l3 probiotic strain for prevention of infection caused by streptococcus pneumonie |
RU2733834C1 (en) * | 2020-07-28 | 2020-10-07 | Федеральное бюджетное учреждение науки Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора) | Artificial ectos_sc2 gene encoding an ectodomain of the sars-cov-2 coronavirus s glycoprotein with a c-terminal trimerization domain, a recombinant plasmid pstem-rvsv-ectos_sc2, which provides expression of the artificial gene, and a recombinant strain of vesicular stomatitis virus rvsv-ectos_sc2, used to create a vaccine against sars-cov-2 coronavirus |
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2776484C1 (en) * | 2021-07-02 | 2022-07-21 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Институт экспериментальной медицины" (ФГБНУ "ИЭМ") | Recombinant dna ensuring production of the recombinant protein cov1 exhibiting immunogenic properties against sars-cov-2 virus |
RU2782529C1 (en) * | 2021-12-23 | 2022-10-28 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Институт экспериментальной медицины" (ФГБНУ "ИЭМ") | Method for creating live strain of enterococcus l3-sars based on biologically active strain of e. faecium l3 |
RU2820058C1 (en) * | 2022-12-15 | 2024-05-28 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Институт экспериментальной медицины" (ФГБНУ "ИЭМ") | Method for creating recombinant enterococcus l3-sarsn1 strain based on biologically active enterococcus faecium l3 strain |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
ES2199932T3 (en) | RECOMBINANT POXVIRUS AND STREPTOCOCIC VACCINE CONTAINING PROTEIN M. | |
KR101460551B1 (en) | Compositions and methods of enhancing immune responses | |
CN104593397B (en) | A kind of enterotoxigenic escherichia coil polyvalent antigen gene order of optimization and its application in preventing post-weaning diarrhea | |
RU2677799C2 (en) | Modified supercoiled proteins with improved properties | |
KR101638661B1 (en) | Vaccine vectors and methods of enhancing immune responses | |
TWI621627B (en) | Vaccine compositions against porcine reproductive and respiratory syndrome and porcine circovirus associated diseases | |
Huang et al. | Construction and immunogenicity analysis of Lactobacillus plantarum expressing a porcine epidemic diarrhea virus S gene fused to a DC-targeting peptide | |
KR102379951B1 (en) | Influenza nucleoprotein vaccines | |
AU674311B2 (en) | Delivery and expression of a hybrid surface protein on the surface of gram positive bacteria | |
RU2745626C1 (en) | Method of creating a live vaccine against covid-19 based on the probiotic strain enterococcus faecium l3 and a live vaccine enterococcus faecium l3-pentf-covid-19 | |
CN107501414B (en) | Streptococcus mutans CAT-SYI antigen and antibody | |
WO2022127820A1 (en) | Pathogen-like antigen-based vaccine and preparation method therefor | |
CN109289046A (en) | A kind of Fusobacterium nucleatum FomA protein vaccine and preparation method and application | |
JP2023531842A (en) | Recombinant protein resistant to multiple sclerosis and its preparation method and use | |
RU2640250C2 (en) | Method for introgression of pathogenic streptococcus genes in chromosomal dna of probiotic strain of enterococcus faecium l3 for expression in piles | |
RU2701733C1 (en) | Live vaccine based on enterococcus faecium l3 probiotic strain for prevention of infection caused by streptococcus pneumonie | |
RU2782529C1 (en) | Method for creating live strain of enterococcus l3-sars based on biologically active strain of e. faecium l3 | |
RU2776479C1 (en) | LIVE PROBIOTIC VACCINE CONTAINING CONSERVATIVE INFLUENZA A VIRUS EPITOPES (LAH+4M2e) FOR THE PREVENTION OF INFLUENZA INFECTION | |
RU2777061C2 (en) | Live probiotic vaccine for prevention of infection caused by influenza virus | |
CN116284454B (en) | Fusion protein composition for preventing porcine reproductive and respiratory syndrome, and related biological material and application thereof | |
KR102542601B1 (en) | Novel porcine epidemic diarrhea virus isolate and use thereof | |
JP2777894B2 (en) | Cholera vaccine | |
WO2008069598A1 (en) | Method for preparing antigen of hepatitis a virus using transformed insect cells | |
Byeon et al. | Generation of an attenuated Salmonella-delivery strains expressing adhesin and toxin antigens for progressive atrophic rhinitis, and evaluation of its immune responses in a murine model | |
KR20240058026A (en) | A ferritin protein construct that simultaneously displays a SARS-CoV-2 S1-derived protein and an antibody Fc region protein on a surface, and its use as a vaccine against the coronavirus SARS-CoV-2 |