RU2689699C1 - Amycolatopsis umgeniensis strain - producer of uremycin antibiotic - Google Patents
Amycolatopsis umgeniensis strain - producer of uremycin antibiotic Download PDFInfo
- Publication number
- RU2689699C1 RU2689699C1 RU2018120699A RU2018120699A RU2689699C1 RU 2689699 C1 RU2689699 C1 RU 2689699C1 RU 2018120699 A RU2018120699 A RU 2018120699A RU 2018120699 A RU2018120699 A RU 2018120699A RU 2689699 C1 RU2689699 C1 RU 2689699C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- strain
- eremomycin
- umgeniensis
- amycolatopsis
- antibiotic
- Prior art date
Links
- 241000386202 Amycolatopsis umgeniensis Species 0.000 title claims abstract description 17
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 title claims abstract description 16
- 108010013356 eremomycin Proteins 0.000 claims abstract description 23
- UECIPBUIMXSXEI-BNSVOVDNSA-N eremomycin Chemical compound O([C@@H]1C2=CC=C(C=C2)OC=2C=C3C=C(C=2O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)O[C@@H]2O[C@@H](C)[C@H](O)[C@@](C)(N)C2)OC2=CC=C(C=C2Cl)[C@@H](O)[C@H](C(N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H]3C(=O)N[C@H]2C(=O)N[C@@H]1C(N[C@@H](C1=CC(O)=CC(O)=C1C=1C(O)=CC=C2C=1)C(O)=O)=O)=O)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)NC)[C@H]1C[C@](C)(N)[C@@H](O)[C@H](C)O1 UECIPBUIMXSXEI-BNSVOVDNSA-N 0.000 claims abstract description 23
- UECIPBUIMXSXEI-UHFFFAOYSA-N eremomycin Natural products C=1C2=CC=C(O)C=1C1=C(O)C=C(O)C=C1C(C(O)=O)NC(=O)C1NC(=O)C2NC(=O)C2NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(CC(C)C)NC)C(O)C(C=C3Cl)=CC=C3OC(C=3OC4C(C(O)C(O)C(CO)O4)OC4OC(C)C(O)C(C)(N)C4)=CC2=CC=3OC(C=C2)=CC=C2C1OC1CC(C)(N)C(O)C(C)O1 UECIPBUIMXSXEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 23
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L Sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 abstract description 8
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 5
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 2
- 244000005700 microbiome Species 0.000 abstract description 2
- 229910021653 sulphate ion Inorganic materials 0.000 abstract 1
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 8
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 6
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 6
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 5
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 5
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 4
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 4
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 description 3
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 3
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 241001430312 Amycolatopsis orientalis Species 0.000 description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N D-xylopyranose Chemical compound O[C@@H]1COC(O)[C@H](O)[C@H]1O SRBFZHDQGSBBOR-IOVATXLUSA-N 0.000 description 2
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 2
- 241000192125 Firmicutes Species 0.000 description 2
- 241000191938 Micrococcus luteus Species 0.000 description 2
- 241000191967 Staphylococcus aureus Species 0.000 description 2
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 2
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 2
- 230000000844 anti-bacterial effect Effects 0.000 description 2
- PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N arabinose Natural products OCC(O)C(O)C(O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N beta-D-Pyranose-Lyxose Natural products OC1COC(O)C(O)C1O SRBFZHDQGSBBOR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012531 culture fluid Substances 0.000 description 2
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 238000000034 method Methods 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 239000003910 polypeptide antibiotic agent Substances 0.000 description 2
- 239000002689 soil Substances 0.000 description 2
- 229960004793 sucrose Drugs 0.000 description 2
- 241001446247 uncultured actinomycete Species 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 100676-05-9 Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OCC1C(O)C(O)C(O)C(OC2C(OC(O)C(O)C2O)CO)O1 OWEGMIWEEQEYGQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HUTBITLDXCEAPZ-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxypropane-1,2,3-tricarboxylic acid;iron Chemical compound [Fe].OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O HUTBITLDXCEAPZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N Alpha-Lactose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)O[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-XLOQQCSPSA-N 0.000 description 1
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonium chloride Substances [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000194106 Bacillus mycoides Species 0.000 description 1
- 108010006654 Bleomycin Proteins 0.000 description 1
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000193163 Clostridioides difficile Species 0.000 description 1
- 206010009657 Clostridium difficile colitis Diseases 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N D-mannomethylose Natural products CC1OC(O)C(O)C(O)C1O SHZGCJCMOBCMKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 1
- HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N D-ribofuranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H]1O HMFHBZSHGGEWLO-SOOFDHNKSA-N 0.000 description 1
- 229930091371 Fructose Natural products 0.000 description 1
- 239000005715 Fructose Substances 0.000 description 1
- RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N Fructose Chemical compound OC[C@H]1O[C@](O)(CO)[C@@H](O)[C@@H]1O RFSUNEUAIZKAJO-ARQDHWQXSA-N 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 206010053759 Growth retardation Diseases 0.000 description 1
- SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N L-rhamnopyranose Chemical compound C[C@@H]1OC(O)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O SHZGCJCMOBCMKK-JFNONXLTSA-N 0.000 description 1
- PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N L-rhamnose Natural products CC(O)C(O)C(O)C(O)C=O PNNNRSAQSRJVSB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N Lactose Natural products OC[C@H]1O[C@@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)C(O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QKKXKWKRSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N Maltose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@@H](CO)OC(O)[C@H](O)[C@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-PICCSMPSSA-N 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 241000544912 Melanoides Species 0.000 description 1
- RJQXTJLFIWVMTO-TYNCELHUSA-N Methicillin Chemical compound COC1=CC=CC(OC)=C1C(=O)N[C@@H]1C(=O)N2[C@@H](C(O)=O)C(C)(C)S[C@@H]21 RJQXTJLFIWVMTO-TYNCELHUSA-N 0.000 description 1
- 208000003100 Pseudomembranous Enterocolitis Diseases 0.000 description 1
- 206010037128 Pseudomembranous colitis Diseases 0.000 description 1
- 239000006004 Quartz sand Substances 0.000 description 1
- MUPFEKGTMRGPLJ-RMMQSMQOSA-N Raffinose Natural products O(C[C@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O[C@@]2(CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O2)O1)[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-RMMQSMQOSA-N 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N Ribose Natural products OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-LMVFSUKVSA-N 0.000 description 1
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000062793 Sorghum vulgare Species 0.000 description 1
- 229920002472 Starch Polymers 0.000 description 1
- MUPFEKGTMRGPLJ-UHFFFAOYSA-N UNPD196149 Natural products OC1C(O)C(CO)OC1(CO)OC1C(O)C(O)C(O)C(COC2C(C(O)C(O)C(CO)O2)O)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010059993 Vancomycin Proteins 0.000 description 1
- 230000002009 allergenic effect Effects 0.000 description 1
- HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N alpha-D-Furanose-Ribose Natural products OCC1OC(O)C(O)C1O HMFHBZSHGGEWLO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000011114 ammonium hydroxide Nutrition 0.000 description 1
- 230000003042 antagnostic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N arabinose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)C=O PYMYPHUHKUWMLA-WDCZJNDASA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N beta-maltose Chemical compound OC[C@H]1O[C@H](O[C@H]2[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)O[C@@H]2CO)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O GUBGYTABKSRVRQ-QUYVBRFLSA-N 0.000 description 1
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 1
- 229960001561 bleomycin Drugs 0.000 description 1
- OYVAGSVQBOHSSS-UAPAGMARSA-O bleomycin A2 Chemical compound N([C@H](C(=O)N[C@H](C)[C@@H](O)[C@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)NCCC=1SC=C(N=1)C=1SC=C(N=1)C(=O)NCCC[S+](C)C)[C@@H](O[C@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](CO)O1)O[C@@H]1[C@H]([C@@H](OC(N)=O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1)O)C=1N=CNC=1)C(=O)C1=NC([C@H](CC(N)=O)NC[C@H](N)C(N)=O)=NC(N)=C1C OYVAGSVQBOHSSS-UAPAGMARSA-O 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- -1 carboxyl cation Chemical class 0.000 description 1
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 1
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 1
- 235000013339 cereals Nutrition 0.000 description 1
- 229920001429 chelating resin Polymers 0.000 description 1
- 230000000973 chemotherapeutic effect Effects 0.000 description 1
- 235000013681 dietary sucrose Nutrition 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 238000002329 infrared spectrum Methods 0.000 description 1
- 239000008101 lactose Substances 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 229960003085 meticillin Drugs 0.000 description 1
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 1
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 1
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 1
- 235000019713 millet Nutrition 0.000 description 1
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 1
- 150000002823 nitrates Chemical class 0.000 description 1
- 150000002826 nitrites Chemical class 0.000 description 1
- 238000010899 nucleation Methods 0.000 description 1
- 235000015097 nutrients Nutrition 0.000 description 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000000049 pigment Substances 0.000 description 1
- 125000003367 polycyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- MUPFEKGTMRGPLJ-ZQSKZDJDSA-N raffinose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO[C@@H]2[C@@H]([C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O2)O)O1 MUPFEKGTMRGPLJ-ZQSKZDJDSA-N 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical group 0.000 description 1
- 239000002594 sorbent Substances 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 238000009331 sowing Methods 0.000 description 1
- 239000008107 starch Substances 0.000 description 1
- 235000019698 starch Nutrition 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 1
- 238000002211 ultraviolet spectrum Methods 0.000 description 1
- 229960003165 vancomycin Drugs 0.000 description 1
- MYPYJXKWCTUITO-UHFFFAOYSA-N vancomycin Natural products O1C(C(=C2)Cl)=CC=C2C(O)C(C(NC(C2=CC(O)=CC(O)=C2C=2C(O)=CC=C3C=2)C(O)=O)=O)NC(=O)C3NC(=O)C2NC(=O)C(CC(N)=O)NC(=O)C(NC(=O)C(CC(C)C)NC)C(O)C(C=C3Cl)=CC=C3OC3=CC2=CC1=C3OC1OC(CO)C(O)C(O)C1OC1CC(C)(N)C(O)C(C)O1 MYPYJXKWCTUITO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-O vancomycin(1+) Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=C2C=C3C=C1OC1=CC=C(C=C1Cl)[C@@H](O)[C@H](C(N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H]3C(=O)N[C@H]1C(=O)N[C@H](C(N[C@@H](C3=CC(O)=CC(O)=C3C=3C(O)=CC=C1C=3)C([O-])=O)=O)[C@H](O)C1=CC=C(C(=C1)Cl)O2)=O)NC(=O)[C@@H](CC(C)C)[NH2+]C)[C@H]1C[C@](C)([NH3+])[C@H](O)[C@H](C)O1 MYPYJXKWCTUITO-LYRMYLQWSA-O 0.000 description 1
- 229940099259 vaseline Drugs 0.000 description 1
- 230000003313 weakening effect Effects 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
- C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P1/00—Preparation of compounds or compositions, not provided for in groups C12P3/00 - C12P39/00, by using microorganisms or enzymes
- C12P1/06—Preparation of compounds or compositions, not provided for in groups C12P3/00 - C12P39/00, by using microorganisms or enzymes by using actinomycetales
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Mycology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Virology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
Штамм Amycolatopsis umgeniensis - продуцент антибиотика эремомицинаStrain Amycolatopsis umgeniensis - producing antibiotic eremomycin
Область техники, к которой относится изобретениеThe technical field to which the invention relates.
Изобретение относится к медицине и биотехнологической промышленности и касается нового штамма актиномицета, образующего противобактериальный антибиотик эремомицин.The invention relates to medicine and the biotechnology industry and relates to a new strain of actinomycete forming the antibacterial antibiotic eremomycin.
Антибиотик эремомицин по химическому строению относится к полициклическим антибиотикам группы ванкомицина-ристомицина (далбагептидам), являющимся жизнеспасающими средствами при лечении особо тяжелых инфекций.The chemical structure of the antibiotic eremomycin belongs to the polycyclic antibiotics of the vancomycin-ristomycin group (dal-peptides), which are life-saving drugs in the treatment of very serious infections.
Структура антибиотика эремомицина сульфатStructure of antibiotic eremomycin sulfate
Эремомицин эффективен при лечении заболеваний, вызываемых грамположительными бактериями, включая метициллинрезистентные штаммы золотистого стафилококка (MRSA) и анаэробного возбудителя псевдомембранного колита Clostridium difficile. Эремомицин служит также исходной субстанцией в получени полусинтетических производных природной структуры для улучшения химиотерапевтических показателей (1), в том числе ослабления аллергизирующего действия, характерного для гликопептидных антибиотиков.Eremomycin is effective in the treatment of diseases caused by gram-positive bacteria, including methicillin-resistant strains of Staphylococcus aureus (MRSA) and the anaerobic pathogen of pseudomembranous colitis Clostridium difficile. Eremomycin is also used as an initial substance in obtaining semi-synthetic derivatives of a natural structure for improving chemotherapeutic parameters (1), including the weakening of the allergenic effect characteristic of glycopeptide antibiotics.
Предшествующий уровень техникиPrior art
Известен штамм Amycolatopsis orientalis subsp. eremomycini ВКПМ Ac 807 - продуцент антибиотика эремомицина [2], принятый в качестве прототипа. Недостатком данного штамма является невысокая антибиотическая активность - 2300 мкг в 1 мл ферментационной жидкости.A known strain of Amycolatopsis orientalis subsp. eremomycini VKPM Ac 807 - producing the antibiotic eremomycin [2], adopted as a prototype. The disadvantage of this strain is low antibiotic activity - 2300 μg in 1 ml of fermentation liquid.
Раскрытие изобретенияDISCLOSURE OF INVENTION
Сущность изобретения состоит в том, что получен новый штамм-продуцент эремомицина путем селекционного преобразования свойств почвенной культуры Amycolatopsis umgeniensis в результате последовательного многоступенчатого воздействия N-метилнитрозомочевины и гамма-лучей 60Со на споры исходной культуры и отбора оригинального мутантного штамма №1472 с повышенной антибиотической активностью среди мутагенизированной популяции колоний актиномицета, выросших на селективном фоне устойчивости к гликопептидным антибиотикам ванкомицину и блеомицину.The essence of the invention is that a new producing strain of eremomycin has been obtained by selectively transforming the properties of the Amycolatopsis umgeniensis soil culture as a result of sequential multi-step exposure to N-methylnitrosacrea and gamma rays 60 Co to dispute the original culture and select the original mutant strain No. 1472 with increased antibiotic activity among the mutagenized population of actinomycete colonies grown on a selective background of resistance to the glycopeptide antibiotics vancomycin and bleomycin.
Полученный новый штамм Amycolatopsis umgeniensis №1472 депонирован в коллекции культур ГосНИИ «Генетика» под номером штамм ВКПМ Ас-1978.The resulting new strain Amycolatopsis umgeniensis No. 1472 is deposited in the culture collection of the State Research Institute of Genetics under the strain VKPM Ac-1978 number.
Штамм Amycolatopsis umgeniensis ВКПМ Ас-1978 обладает повышенной антибиотической активностью образования эремомицина (3300 мкг в 1 мл ферментационной жидкости) и характеризуется следующими таксономическими, культурально-морфологическими и физиолого-химическими признаками.The strain Amycolatopsis umgeniensis VKPM Ac-1978 has a high antibiotic activity of eremomycin formation (3300 mcg in 1 ml of fermentation liquid) and is characterized by the following taxonomic, cultural-morphological and physiological-chemical characteristics.
Таксономические, культурально-морфологические и физиологические признаки штамма Amycolatopsis umgeniensis ВКПМ Ас-1978Taxonomic, cultural-morphological and physiological signs of the strain Amycolatopsis umgeniensis VKPM Ac-1978
Таксономические признаки. Длительность выращивания для изучения таксономических признаков (7-21) суток при температуре 28°С. Для засева диагностических сред используется споровый посевной материал десятидневной культуры штамма, выращенной на глюкозо-аспарагиновом агаре или на среде Линденбайна. Цвет определен по таблице Бондарцева и Праузера. Данные приведены в таблице №1.Taxonomic features. Duration of cultivation for the study of taxonomic characters (7-21) days at a temperature of 28 ° C. For seeding diagnostic media, spore seed of a ten-day culture of a strain grown on glucose-aspartic agar or Lindenbein medium is used. The color is determined by the table Bondartseva and Prauzera. The data are given in table №1.
Морфологические признаки. Гифы воздушного мицелия слегка извилистые, распадающиеся на фрагменты различной длины; поверхность спор гладкая.Morphological signs. Hyphae of aerial mycelium are slightly sinuous, breaking into fragments of various lengths; spore surface is smooth.
Физиолого-биохимические свойства. Аэроб. Растет при (24-37)°С, оптимум роста 28°С и в диапазоне значений рН (5,0-10,0) с оптимумом роста при рН 7,0; желатину разжижает, молоко пептонизирует. Сахарозу инвертирует. Крахмал гидролизует. На клетчатке не растет. Восстанавливает нитраты до нитритов. Меланоидные пигменты не образует при росте на провокационной среде Треснера с лимонно-кислым железом.Physiological and biochemical properties. Aerobe. Grows at (24-37) ° С, growth optimum is 28 ° С and in the range of pH values (5.0-10.0) with growth optimum at pH 7.0; thins gelatin, milk peptonized. Saccharose inverts. Starch hydrolyzes. Fiber is not growing. Restores nitrates to nitrites. Melanoid pigments do not form when grown on Tresner's provocative medium with citric acid iron.
Использование источников углерода. Хорошо утилизирует глюкозу, фруктозу, лактозу, рамнозу, ксилозу, рибозу, арабинозу, маннит, мальтозу; не утилизирует сахарозу, рафинозу, сорбит, маннозу, целлюлозу.Use of carbon sources. Well utilizes glucose, fructose, lactose, rhamnose, xylose, ribose, arabinose, mannitol, maltose; does not utilize sucrose, raffinose, sorbitol, mannose, cellulose.
Антагонистические свойства. Штамм Amycolatopsis umgeniensis ВКПМ Ас-1978 при росте на агаровых средах умеренно угнетает рост грамположительных бактерий Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Bacillus mycoides, Micrococcus luteus и не действует на грамотрицательные бактерии Escherichia coli, Comamonas terrigena, Providencia stuartii.Antagonistic properties. The strain Amycolatopsis umgeniensis VKPM Ac-1978 with growth on agar media moderately inhibits the growth of gram-positive bacteria, Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Bacillus mycoides, Micrococcus luteus, and does not act on Gram-negative bacteria Escherichia coli, Comamonas-iurea-nauri-hygiene, and the anthropology of the anthracidae, irius, and the anthracididae, which doesn’t affect the gram-negative bacteria Escherichia coli, Micrococcus luteus.
Хранение штамма Amycolatopsis umgeniensis ВКПМ Ас-1978. Штамм хранится в виде спор на стерильной почве с кварцевым песком или на зернах пшена, а также в виде зрелой культуры на агаровых средах под вазелиновым маслом. Антибиотическая активность штамма Amycolatopsis umgeniensis ВКПМ Ас-1978 при глубинном культивировании определяется луночным методом диффузии в агар (среда №2 Гаузе) с использованием в качестве тест-микроорганизма Bacillus subtilis АТСС 6633 и сравнением зон подавления роста образцами ферментационной жидкости с калибровочной кривой стандарта эремомицина сульфата (100 мкг, 50 мкг, 25 мкг, 12,5 мкг). Биологическая активность получаемой биосинтезом и химически очищенной субстанции антибиотика определяется трехдозным вариантом метода (ГФХ, стр. 949).Storage of strain Amycolatopsis umgeniensis VKPM Ac-1978. The strain is stored in the form of spores on sterile soil with quartz sand or on millet grains, as well as in the form of a mature culture on agar media under vaseline oil. The antibiotic activity of Amycolatopsis umgeniensis VKPM Ac-1978 strain during deep cultivation is determined by the well method of diffusion into agar (Gauze medium No. 2) using Bacillus subtilis ATCC 6633 as a test microorganism and by comparing growth suppression zones of fermentation liquid samples with the calibration standard of eremomycin sulfate ( 100 µg, 50 µg, 25 µg, 12.5 µg). The biological activity of the resulting biosynthesis and chemically purified antibiotic substance is determined by the three-dose variant of the method (GFH, p. 949).
Штамм Amycolatopsis umgeniensis ВКПМ Ас-1978 поясняется следующим примером.The strain Amycolatopsis umgeniensis VKPM Ac-1978 is illustrated by the following example.
Пример 1. Споровым материалом с мицелием культуры Amycolatopsis umgeniensis ВКПМ-Ас-1978, выращенной в течение (10-14) суток при 28°С на среде Линденбайна, засевают питательную среду (150 мл в колбах Эрленмейера объемом 0,75 л), и выращивают при 28°С в течение (24-36) часов на круговой качалке при скорости вращения 220-240 об/мин.Example 1. Spore material with mycelium culture Amycolatopsis umgeniensis VKPM-Ac-1978, grown for (10-14) days at 28 ° C in Lindenbein medium, seeded with culture medium (150 ml in Erlenmeyer flasks with a volume of 0.75 l), and grown at 28 ° C for (24-36) hours on a circular rocking chair at a rotation speed of 220-240 rev / min.
Состав посевной среды, %:The composition of the sowing medium,%:
Среда стерилизуется в течение 30 мин. при давлении 0,6 атм. при 120°С.The medium is sterilized for 30 minutes. at a pressure of 0.6 atm. at 120 ° C.
Выросшим мицелием в количестве (5-10) % засевают питательную среду (100 мл в колбах Эрленмейера объемом 0,75 л) следующего состава, %:The grown mycelium in the amount of (5-10)% seeded nutrient medium (100 ml in Erlenmeyer flasks with a volume of 0.75 l) of the following composition,%:
Стерилизация среды в течение 30 мин. при давлении 0,6 атм. при 120°С.Sterilize the medium for 30 min. at a pressure of 0.6 atm. at 120 ° C.
Ферментационное культивирование проводят при 28°С в течение 120 часов на качалке при скорости вращения 220-240 об/мин. Эремомицин накапливается в культуральной жидкости продуцента. Антибиотическую активность определяют методом диффузии в агар с использованием тест-культуры Bacillus subtilis АТСС 6633. Содержание эремомицина в культуральной жидкости штамма Amycolatopsis umgeniensis ВКПМ Ас-1978 к окончанию ферментации составляет 3300 мкг/мл.Fermentation cultivation is carried out at 28 ° C for 120 hours on a rocking chair at a rotation speed of 220-240 rev / min. Eremomycin accumulates in the culture fluid of the producer. Antibiotic activity was determined by diffusion into agar using the Bacillus subtilis ATCC 6633 test culture. The content of eremomycin in the culture fluid of the Amycolatopsis umgeniensis strain VKPM Ac-1978 by the end of fermentation is 3300 μg / ml.
Для выделения эремомицина (3) проводят его сорбцию из нативного раствора (отфильтрованной от мицелия культуральной жидкости) на карбоксильном катионите КБ-2 в солевой форме, элюируют раствором аммиака, элюат нейтрализуют, обеззоливают, пропускают через сорбент Амберлит XAD-2, колонку промывают водой, антибиотик элюируют 4%-ным раствором изопропилового спирта в 0,2 М уксусной кислоте, элюат концентрируют в вакууме до содержания эремомицина (120-140) мг/мл и кристаллизуют в форме сульфата.To isolate eremomycin (3), it is sorbed from the native culture solution (filtered from the mycelium) on the carboxyl cation exchanger of CB-2 in salt form, eluted with ammonia solution, the eluate is neutralized, desalted, passed through Amberlite XAD-2 sorbent, the column is washed with water, the antibiotic is eluted with a 4% solution of isopropyl alcohol in 0.2 M acetic acid, the eluate is concentrated in vacuo to contain eremomycin (120-140) mg / ml and crystallized in the form of sulfate.
Эремомицина сульфат, полученный путем биосинтеза новым штаммом-продуцентом Amycolatopsis umgeniensis ВКПМ Ас-1978, представляет собой белый кристаллический порошок, легко растворимый в воде и нерастворимый в органических растворителях. Показатели, характеризующие эремомицина сульфат (физико-химические свойства, антибактериальная активность и токсичность) полностью соответствует показателям, которые определены для эремомицина сульфата, защищенного патентом РФ №2110578 (брутто-формула: C73H89N10ClO26XH2SO4. Мол. масса 1656 а.е.м.Eremomycin sulfate, obtained by biosynthesis with a new strain-producer of Amycolatopsis umgeniensis VKPM Ac-1978, is a white crystalline powder, readily soluble in water and insoluble in organic solvents. The indicators characterizing eremomycin sulfate (physicochemical properties, antibacterial activity and toxicity) fully correspond to the indicators that are defined for eremomycin sulfate protected by the RF patent №2110578 (gross formula: C 73 H 89 N 10 ClO 26 XH 2 SO 4. Mol weight is 1656 amu
УФ-спектр: λmax (0,01 н. HCl) нм (E1% 1 см): 280 (42); λmax (0,01 н. NaOH) нм (E1% 1 см): 300 (60);UV spectrum: λ max (0.01 N HCl) nm (E 1% 1 cm ): 280 (42); λ max (0.01 N. NaOH) nm (E 1% 1 cm ): 300 (60);
ИК-спектр (KBr), νmax, см-1: 3350, 1650, 1500, 1200-1000; [α]20 D = -100° (с 1,0, H2O).IR Spectrum (KBr), ν max , cm -1 : 3350, 1650, 1500, 1200-1000; [α] 20 D = -100 ° (c 1.0, H 2 O).
Выход целевого продукта - очищенного (97% чистоты) кристаллического препарата эремомицина сульфата от содержания в нативном растворе составляет 65,0%, т.е. 2,1 г с 1 л нативного раствора (отфильтрованной ферментационной жидкости).The yield of the target product - purified (97% purity) of the crystalline preparation of eremomycin sulfate from the content in the native solution is 65.0%, i.e. 2.1 g with 1 liter of native solution (filtered fermentation liquid).
Таким образом, получен новый мутантный штамм Amycolatopsis umgeniensis ВКПМ Ас-1978, отличающийся от известного продуцента по способности антибиотикообразования, которая более чем на 40% превосходит активность продуцента-прототипа Amycolatopsis orientalis subsp. eremomycini ВКПМ-807 (Таблица 2). Использование нового штамма Amycolatopsis umgeniensis ВКПМ Ас-1978 позволяет увеличить выход целевого продукта. Выход эремомицина составляет 2,1 г с 1 литра нативного раствора.Thus, a new mutant strain of Amycolatopsis umgeniensis VKPM Ac-1978 was obtained, which differs from a well-known producer in its antibiotic formation capacity, which is more than 40% higher than the activity of the prototype producer Amycolatopsis orientalis subsp. eremomycini VKPM-807 (Table 2). The use of a new strain of Amycolatopsis umgeniensis VKPM Ac-1978 allows you to increase the yield of the target product. The yield of eremomycin is 2.1 g from 1 liter of the native solution.
Источники информации.Information sources.
1. M.N. Preobrazhenskaya, E.N. Olsufyeva, O.V. Miroshnikova et al., G. Antib. 60 (4): 235-244, 20071. M.N. Preobrazhenskaya, E.N. Olsufyeva, O.V. Miroshnikova et al., G. Antib. 60 (4): 235-244, 2007
2. Патент RU 2352631 от 10.2008 г.2. Patent RU 2352631 dated 10.2008
3. Патент RU 2110578 от 10.1998 г.3. Patent RU 2110578 dated 10.1998
*/ +++ - хороший; ++ - умеренный; + - слабый.* / +++ - good; ++ - moderate; + - weak.
Claims (1)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2018120699A RU2689699C1 (en) | 2018-06-05 | 2018-06-05 | Amycolatopsis umgeniensis strain - producer of uremycin antibiotic |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2018120699A RU2689699C1 (en) | 2018-06-05 | 2018-06-05 | Amycolatopsis umgeniensis strain - producer of uremycin antibiotic |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2689699C1 true RU2689699C1 (en) | 2019-05-28 |
Family
ID=67037265
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2018120699A RU2689699C1 (en) | 2018-06-05 | 2018-06-05 | Amycolatopsis umgeniensis strain - producer of uremycin antibiotic |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2689699C1 (en) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2761482C1 (en) * | 2021-04-14 | 2021-12-08 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт по изысканию новых антибиотиков имени Г.Ф. Гаузе" | Streptomyces olivaceiscleroticus strain - producer of the antitumor antibiotic olivomycin |
Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2110578C1 (en) * | 1997-06-18 | 1998-05-10 | Научно-исследовательский институт по изысканию новых антибиотиков РАМН | Strain amycolatopsis orientalis subspecies eremomycini vkpm-s892 - a producer of antibiotic eremomycin and a method of antibiotic eremomycin producing |
RU2352631C2 (en) * | 2007-03-26 | 2009-04-20 | Государственное учреждение научно-исследовательский институт по изысканию новых антибиотиков имени Г.Ф. Гаузе РАМН (ГУ НИИНА им.Г.Ф.Гаузе РАМН) | STRAIN Amycolatopsis orientalis SUBSP EREMOMYCINI ALL-RUSSIAN COLLECTION OF INDUSTRIAL MICROORGANISMS Ac-807 EREMOMYCIN PRODUCENT |
RU2621866C1 (en) * | 2016-04-12 | 2017-06-07 | Общество С Ограниченной Ответственностью "Технология Лекарств" | Amycolatopsis orientalis strain - producers of ehremomitcin antibiotic and method for ehremomitcin production |
-
2018
- 2018-06-05 RU RU2018120699A patent/RU2689699C1/en active
Patent Citations (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2110578C1 (en) * | 1997-06-18 | 1998-05-10 | Научно-исследовательский институт по изысканию новых антибиотиков РАМН | Strain amycolatopsis orientalis subspecies eremomycini vkpm-s892 - a producer of antibiotic eremomycin and a method of antibiotic eremomycin producing |
RU2352631C2 (en) * | 2007-03-26 | 2009-04-20 | Государственное учреждение научно-исследовательский институт по изысканию новых антибиотиков имени Г.Ф. Гаузе РАМН (ГУ НИИНА им.Г.Ф.Гаузе РАМН) | STRAIN Amycolatopsis orientalis SUBSP EREMOMYCINI ALL-RUSSIAN COLLECTION OF INDUSTRIAL MICROORGANISMS Ac-807 EREMOMYCIN PRODUCENT |
RU2621866C1 (en) * | 2016-04-12 | 2017-06-07 | Общество С Ограниченной Ответственностью "Технология Лекарств" | Amycolatopsis orientalis strain - producers of ehremomitcin antibiotic and method for ehremomitcin production |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
ДЖАВАХИЯ В.В., ГЛАГОЛЕВА Е.В. и др. Разработка нового высокопродуктивного штамма Amycolatopsis orientalis - продуцента антибиотика эремомицина, Биотехнология, 2017, Т. 33, N 1, с. 42-52. * |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2761482C1 (en) * | 2021-04-14 | 2021-12-08 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт по изысканию новых антибиотиков имени Г.Ф. Гаузе" | Streptomyces olivaceiscleroticus strain - producer of the antitumor antibiotic olivomycin |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Kerr | Bacterial inhibition of fungal growth and pathogenicity | |
Ji et al. | Two new members of streptothricin class antibiotics from Streptomyces qinlingensis sp. nov | |
RU2689699C1 (en) | Amycolatopsis umgeniensis strain - producer of uremycin antibiotic | |
JPH02142800A (en) | Novel antibiotics mersacidin and its manufacture | |
RU2352631C2 (en) | STRAIN Amycolatopsis orientalis SUBSP EREMOMYCINI ALL-RUSSIAN COLLECTION OF INDUSTRIAL MICROORGANISMS Ac-807 EREMOMYCIN PRODUCENT | |
CA1338085C (en) | Antibiotics bu-3608d and bu-3608e from actinomadura | |
US20090209452A1 (en) | Substantially pure glycopeptide antibiotics ac-98-1; ac-98-2; ac-98-3; ac-98-4 and ac-98-5 | |
O'SULLIVAN et al. | JANTHINOCINS A, B AND C, NOVEL PEPTIDE LACTONE ANTIBIOTICS PRODUCED BY JANTHINOBACTERIUM LIVIDUM I. TAXONOMY, FERMENTATION, ISOLATION, PHYSICO-CHEMICAL AND BIOLOGICAL CHARACTERIZATION | |
RU2633511C1 (en) | Amycolatopsis orientalis strain - dimethylvancomycin antibiotic producer and method for antibiotic production | |
RU2710733C1 (en) | Strain streptomyces tendae - producer of antibacterial antibiotic ina 5812 | |
RU2621866C1 (en) | Amycolatopsis orientalis strain - producers of ehremomitcin antibiotic and method for ehremomitcin production | |
JP2766421B2 (en) | New compound thiomarinol | |
RU2228337C2 (en) | Vancoresmycin (variants), its application, strain amycolatopsis of species hil-006734 for its preparing | |
RU2572341C2 (en) | ANTIBIOTIC INA 5812, STRAIN-PRODUCER Streptomyces roseoflavus INA-As-5812 AND METHOD FOR ANTIBIOTIC OBTAINING | |
RU2110578C1 (en) | Strain amycolatopsis orientalis subspecies eremomycini vkpm-s892 - a producer of antibiotic eremomycin and a method of antibiotic eremomycin producing | |
KR100221687B1 (en) | A novel antibiotic, balhimycin, a process for its production and its use as pharmaceutical | |
RU2761482C1 (en) | Streptomyces olivaceiscleroticus strain - producer of the antitumor antibiotic olivomycin | |
RU2464319C1 (en) | Streptomyces coeruleorubidus strain - antibiotic daunorubicin producer | |
US5451570A (en) | Antibiotic, balhimycin, a process for its production and its use as pharmaceutical | |
RU2392311C2 (en) | Strain of streptoalloteichus cremeus subsp tobramycini vkpm s-1084- producer of apramicyne and method of apramicyne obtaining | |
RU2392325C2 (en) | Amycolatopsis fructiferi subsp ristomycini strain - producer of antibiotic ristomycin | |
RU2358008C2 (en) | Streptomyces griseocarneus subsp bleomycini strain vkpm-s1086 producing bleomycetin and method of antibiotic bleomycetin obtainment | |
CA2444907C (en) | Substantially pure glycopeptide antibiotics ac-98-1; ac-98-2; ac-98-3; ac-98-4 and ac-98-5 | |
RU2355758C2 (en) | Streptomyces griseocarneus subsp bleomycini ALL RUSSIAN COLLECTION OF INDUSTRIAL MICROORGANISMS S887 STRAIN - PRODUCER OF BLEOMYCINE A2 AND METHOD OF OBTAINING BLEOMYCINE A2 ANTIBIOTIC | |
US5459141A (en) | Compounds 31668P and 31668U, a process for their production and their use |