RU2684904C1 - Способ оценки тяжести течения сепсиса - Google Patents

Способ оценки тяжести течения сепсиса Download PDF

Info

Publication number
RU2684904C1
RU2684904C1 RU2018108085A RU2018108085A RU2684904C1 RU 2684904 C1 RU2684904 C1 RU 2684904C1 RU 2018108085 A RU2018108085 A RU 2018108085A RU 2018108085 A RU2018108085 A RU 2018108085A RU 2684904 C1 RU2684904 C1 RU 2684904C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
bacteria
patient
probe
treated
blood sample
Prior art date
Application number
RU2018108085A
Other languages
English (en)
Inventor
Елена Алексеевна Щуплова
Михаил Дмитриевич Кузьмин
Юрий Александрович Хлопко
Сергей Викторович Черкасов
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Оренбургский федеральный исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Оренбургский федеральный исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Оренбургский федеральный исследовательский центр Уральского отделения Российской академии наук
Priority to RU2018108085A priority Critical patent/RU2684904C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2684904C1 publication Critical patent/RU2684904C1/ru

Links

Images

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области медицине и представляет собой способ оценки тяжести течения сепсиса, включающий подготовку образцов крови больных сепсисом для проведения флуоресцентной in situ гибридизации с последующим обнаружением бактерий в образцах крови с использованием люминесцентной микроскопии, отличающийся тем, что определяют количество адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий и рассчитывают интегральный показатель по формуле:ИП=1,527+0,333×X1-1,116×Х2-0,137×Х3+0,033×Х4+0,061×Х5-0,184×Х6+3,242×Х7+0,71×Х8+0,888×Х9+0,336×Х10, где: X1 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo1;Х2 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo2; Х3 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo3; Х4 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo4; Х5 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo5; Х6 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo1; Х7 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo2; Х8 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo3; Х9 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo4; Х10 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo5, при этом при значении интегрального показателя меньше 2,5 тяжесть течения сепсиса считают легкой, при значении от 2,5 до 5,6 - средней, а при значении больше 5,6 - тяжелой. Способ позволяет повысить точность ранней диагностики сепсиса и оценить тяжесть течения заболевания. 2 ил., 4 табл., 4 пр.

Description

Изобретение относится к медицине, а именно к медицинской микробиологии, и может быть использовано в клинической практике для оценки тяжести течения заболевания у септических больных.
Актуальность проблемы ранней диагностики бактериемии и сепсиса обуславливается тем, что генерализованные бактериальные инфекции являются тяжелыми осложнениями у больных.
Разработаны шкалы по оценке тяжести состояния пациентов такие, как Acute Physiology and Chronic Health Evaluation (APACHE) II, Simplified Acute Physiology Score (SAPS) II, SOFA, Surviving Sepsis Campaign (SSC), РАСХИ и др., которые включают для расчетов общепринятые клинические и лабораторные данные. Существующие шкалы для оценки тяжести и исхода сепсиса громоздки и неудобны, поэтому на практике чаще используют простые, сокращенные формулы прогнозирования, состоящие из 4-5 критериев [Рудное В.А. Сепсис: современные подходы к диагностике и интенсивной терапии // Вестник анестезиологии и реаниматологии, 2010. Т. 7, №1, С. 48-57].
В последнее время в клинической практике для ранней диагностики некоторых патологических процессов стали использовать определение специфических белков - биомаркеров [Рудное В.А. Сепсис: современные подходы к диагностике и интенсивной терапии // Вестник анестезиологии и реаниматологии, 2010, Т. 7, №1, С. 48-57].
Известно около 200 биомаркеров сепсиса, однако только немногие из них находят клиническое применение. [Чеботкевич В.К, Кайтанджан Е.И., Бурылев В.В., Щетинкина Е.Е. Современные методы лабораторной диагностики сепсиса // Клиническая микробиологическая антимикробная химиотерапия, 2013, Том 15, №4, С. 295-300].
Известен способ определения прокальцитонина при диагностике сепсиса, который начал применяться только в последние годы как маркер инфекционного процесса [Tang В.М., Eslick G.D., Craig J.С, McLean A.S. Accuracy of procalcitonin for sepsis diagnosis in critically ill patients: systematic review and metaanalysis // Lancet Infect Dis. 2007, Mar, 7 (3), p.210].
Недостатком использования определения прокальцитонина для диагностики сепсиса является несоответствие тяжести состояния, эффективности проводимой терапии и прогноза летального исхода. Отрицательным является его неспецифичность, так как прокальцитонин повышается не только при инфекционном процессе, но и при заболеваниях щитовидной железы и при некоторых опухолях [Cate С.С, Pettengill O.S., Sorenson G.D. Byosynthesis of Procalcitonin in small cell carcinoma of the lung Cancer Res. 1986, 46, p.812-8].
Известен способ обнаружения другого биомаркера инфекционного процесса - белка пресепсина, образующегося в результате бактериального фагоцитоза [Liu В, Chen YX, Yin Q, et al. Diagnostic value and prognostic evaluation of Presepsin for sepsis in an emergency department.// Crit Care, 2013, 17(5), R244]. Вместе с тем, известно о проникновении бактерий в эритроциты [Щуплова Е.А., Стадников А.А., Фадеев С.Б. Роль биологических свойств Staphylococcus epidermidis во внутриэритроцитарной инвазии и изменении активности каталазы и супероксиддисмутазы эритроцитов при экспериментальной генерализованной инфекции // Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2015, №1, С. 79-82], которые не являются фагоцитирующими клетками и поэтому пресепсин не образуется. В связи с чем, данный биомаркер не является надежным критерием для диагностики сепсиса и оценки тяжести состояния больных, что говорит о недостатке данного способа.
Таким образом, с помощью биомаркеров определяют биохимическое состояние крови септических больных, но наличие возбудителей и идентификацию микроорганизмов биомаркеры не показывают, а также их значения могут повышаться при других заболеваниях. В связи с чем, для постановки точного диагноза и оценки тяжести состояния септических больных необходимо использовать методы обнаружения гемокультуры.
В настоящее время «золотым стандартом» лабораторной диагностики бактериемий и сепсиса является бактериологический метод выделения гемо-культур. При подозрении на инфекцию кровотока у пациента, еще до начала эмпирической терапии антибиотиками широкого спектра действия, производится забор крови для бактериального посева. Забор крови рекомендуется проводить 2-3 раза по 20-30 мл (по 10-15 мл для двух параллельных высевов на аэробные и анаэробные среды). Исследования показывают, что при меньшем объеме забираемой крови частота выявления возбудителей существенно снижается. [Lin Н. - H., Liu Y. - F., Tien N. at al. Evaluation of the blood volume effect on the diagnosis of bacteremia in automated blood culture system // Journal of Microbiology, Immunology and Infection., 2013., Vol. 46., p. 46-52]. Недостатком бактериологического метода является длительность культивирования посевов до 5-7 суток, длительное время для идентификации чистой культуры с помощью различных биохимических тестов, а также проведение теста на выявление резистентности к антибиотикам. Кроме того, эффективность бактериологического метода составляет около 45% [Рудное В.А. Сепсис: современные подходы к диагностике и интенсивной терапии // Вестник анестезиологии и реаниматологии, 2010. Т. 7, №1, С. 48-57] и данный метод не приемлем для прихотливых и некультивируемых бактерий, таких как микоплазмы, нокардии, риккетсии, хламидии и ряд других микроорганизмов [Киселева Е.Е. Алгоритм выявления и видовой идентификации бактерий в крови с использованием ПЦР // Вестник гематологии, 2017, Т. XIII, №1, С. 19-24]. Бактериологический метод диагностики сепсиса позволяет обнаружить возбудителя заболевания, но не выявляет критерии для оценки тяжести течения сепсиса.
По сравнению с бактериологическим методом, методы молекулярной диагностики, основанные на анализе белков или нуклеиновых кислот микроорганизмов лишены вышеуказанных недостатков. Примером молекулярно-генетических методов являются методы ПЦР-анализа гемокультуры, метод мультиплексного ПЦР-анализа в режиме реального времени. Главное преимущество данных методов в сокращении длительности анализов до 5-12 часов, возможность выявления некультивируемых форм возбудителей и одновременное выявление нескольких разных мишеней (как генетических маркеров патогенов, так и маркеров их антибиотикорезистентности) в одном клиническом образце [Гаврилое С.Н., Скачкова Т.С., Шипулина О.Ю., Савочкина Ю.А., Шипулин Г.А., Малеев В.В. Современные молекулярно-генетические методы, используемые для этиологической диагностики сепсиса // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2016,№2, С. 91-99].
Недостатком данного метода является выделение ДНК транзиторных микроорганизмов, не имеющих клинического значения, что приводит к ложноположительным результатам диагностики сепсиса, а также сложность при очистке бактериальной ДНК от генетического материала в образце крови больного человека. Для реализации методов ПЦР-анализа гемокультуры и мультиплексного ПЦР-анализа в режиме реального времени необходимо дорогостоящее оборудование и более трудоемкую подготовку исследуемого материала.
Известен современный молекулярно-генетический метод флуоресцентной in situ гибридизации (FISH), в котором используются флуоресцирующие молекулы для детекции специфических фрагментов ДНК и РНК [Sladjana Malic et. al. Detection and identification of specific bacteria in wound biofilms using peptide nucleic acid fluorescent in situ hybridization (PNA FISH). // Microbiology. 2009, 155, р. 2603-2611]. Материалом для исследования методом FISH может служить кровь, костный мозг, биоптат, плацента и др. В исследуемых образцах FISH позволяет выявлять нуклеиновые кислоты в клеточных структурах, морфологию и одновременно проводить идентификацию микроорганизмов.
В качестве прототипа изобретения выбран способ ранней диагностики сепсиса, основанный на методе FISH [Gosiewski Т, Pietrzyk A, Brzychczy-Wloch М, Heczko P.Use of PCR and FISH methods for rapid identification of bacterial bloodstream infections. // Ann Acad Med Siles 2011, 65, p. 14-22]. Недостатком данного способа является то, что авторы предлагают на основе обнаруженной бактериальной ДНК делать заключение о ранней диагностике развития сепсиса в отсутствии критериев оценки тяжести течения заболевания у септических больных, что затрудняет принятие решения лечения их эффективными антибактериальными препаратами.
Задачей заявляемого технического решения является создание способа оценки тяжести течения заболевания септических состояний у больных по количеству адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий с использованием метода FISH.
Для решения указанной задачи в заявляемом способе оценки тяжести течения сепсиса осуществляют подготовку образцов крови больных сепсисом для проведения флуоресцентной in situ гибридизации с последующим обнаружением бактерий в образцах крови с использованием люминесцентной микроскопии, определяют количество адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий и рассчитывают интегральный показатель по формуле:
ИП=1,527+0,333×X1-1,116×Х2-0,137×Х3+0,033×Х4+0,061×Х5-0,184×Х6+3,242×Х7+0,71×Х8+0,888×Х9+0,336×Х10,
где: X1 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo1;
Х2 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo2;
Х3 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo3;
Х4 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo4;
Х5 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo5;
Х6 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo1;
Х7 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo2;
Х8 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo3;
Х9 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo4;
Х10 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo5,
при этом при значении интегрального показателя меньше 2,5 - тяжесть течения сепсиса считают легкой, при значении от 2,5 до 5,6 - средней, а при значении больше 5,6 - тяжелой.
Технический результат от реализации изобретения выражается в создании способа оценки тяжести течения заболевания у больных сепсисом с возможностью обнаружения и одновременной идентификации микроорганизмов, находящихся на поверхности эритроцитов и внутри эритроцитов крови больных сепсисом.
Новым в заявляемом способе является то, что с использованием метода FISH установлена взаимосвязь между количеством адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий и степенью тяжести течения заболевания больных сепсисом.
Авторы с помощью метода FISH с использованием нескольких видов ДНК-зондов, представленных в таблице 1, обработали образцы крови больных с предварительным диагнозом: «Сепсис». Авторы для работы использовали характерные виды олигонуклеотидных зондов, комплементарных видоспецифическим участкам гена 16S рРНК микроорганизмов, как наиболее часто встречающихся возбудителей при сепсисе. В исследуемых образцах крови авторы подсчитывали количество адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий.
На фигуре 1 изображена адгезия бактерий к поверхности эритроцита в образце крови больного сепсисом.
На фигуре 2 представлено внутриэритроцитарное проникновение бактерий в исследуемом образце крови больного сепсисом.
Figure 00000001
Для выявления моно- или полимикробной инфекции авторы использовали одновременно все виды олигонуклеотидных зондов при обработке одного образца крови обследуемого больного.
В результате работы авторы определили процент бактериальных клеток адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий с использованием данных ДНК-зондов.
Далее полученные данные сопоставили с клиническим анамнезом больных сепсисом и получили три группы, отличающиеся по степени тяжести течения заболевания. Результаты представлены в таблице 2.
Как видно из таблицы 2 с увеличением степени тяжести течения сепсиса возрастает доля адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий.
Figure 00000002
Далее авторы провели оценку тяжести течения сепсиса у больных согласно прототипу и заявляемому способу. Результаты представлены в таблице 3.
Figure 00000003
Как видно из таблицы 3, прототип изобретения позволяет только обнаружить микроорганизмы в образце крови септических больных, а с помощью заявляемого способа можно подсчитать количество как адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов, так и их внутриэритроцитарное расположение. Полученные данные можно использовать в качестве критерия для оценки тяжести течения заболевания.
Для комплексной оценки тяжести течения заболевания у больных сепсисом с использованием одновременно нескольких ДНК-зондов был проведен статистический анализ полученных данных, результаты которого позволили получить регрессионную модель, описывающую взаимосвязь количества адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий со степенью тяжести течения заболевания у больных сепсисом.
Регрессионная модель представляет собой интегральный показатель, значения которого позволили дифференцировать степень тяжести течения сепсиса.
Интегральный показатель (ИП) рассчитывается по формуле:
ИП=1,527+0,333×X1-1,116×Х2-0,137×Х3+0,033×Х4+0,061×Х5-0,184×Х6+3,242×Х7+0,71×Х8+0,888×Х9+0,336×Х10,
где: X1 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo1;
Х2 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo2;
Х3 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo3;
Х4 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo4;
Х5 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo5;
Х6 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo1;
Х7 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo2;
Х8 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo3;
Х9 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo4;
Х10 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo5.
По результатам значений ИП и клинически подтвержденных диагнозов авторы получили 3 группы, отличающиеся по степени тяжести течения сепсиса: легкая, средняя и тяжелая форма. Диапазоны дифференциации тяжести течения сепсиса представлены в таблице 4.
Figure 00000004
Как видно из таблицы 4, что чем выше значения интегрального показателя (количество адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий), тем тяжелее состояние больного.
Таким образом, авторы сделали заключение о том, что определение количества адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий с использованием метода FISH, а также расчет интегрального показателя позволяет оценить тяжесть течения заболевания у больных сепсисом. Необходимо отметить, что данный способ гораздо дешевле и более легкий в обработке исследуемого материала, чем ПЦР-анализ гемокультуры и метод мультиплексного ПЦР-анализа в режиме реального времени.
Эффективность заявляемого способа оценки тяжести течения заболевания у больных сепсисом составляет 99%.
Способ осуществляется следующим образом:
1) Кровь от обследуемого больного трехкратно отмывают фосфатно-солевым буфером (ФСБ) (рН=7,4) центрифугированием при 1000 об/мин в течение 5 мин и доводят до одномиллионной концентрации клеток в миллилитре.
2) Пробу объемом 1 мл осаждают центрифугированием при 1000 об/мин в течение 5 мин и ресуспендируют в 400 мкл 0,5% раствора глутарового альдегида, фиксируют в течение 30 мин при 25°С.
3) Фиксированные клетки промывают ФСБ (рН=7,4) и ресуспендируют в растворах этанола с восходящей концентрацией 50, 80 и 100% по 400 мкл каждого раствора с последующей инкубацией в течение 10 мин при 4°С.
4) Эритроциты промывают ФСБ (рН=7,4) центрифугированием при 1000 об/мин в течение 5 мин и ресуспендируют в 300 мкл дистиллированной воде.
5) Аликвоты по 100 мкл фиксированных клеток осаждают центрифугированием при 1000 об/мин в течение 5 мин и ресуспендируют в 100 мкл буферного раствора для гибридизации (0,9 М NaCl и 20 mM Tris-HCl, рН=7), содержащего 500 нМ соответствующего ДНК-зонда, меченного на 5'-конце флуо-ресцеина изотиоцианатом (FITC) (ООО «ДНК-синтез», Москва).
6) Проводят гибридизацию в течение 5 ч при температуре соответствующей температуре отжига для каждого вида зонда.
7) После гибридизации клетки центрифугируют при 1000 об/мин в течение 5 мин и добавляют 500 мкл промывочного раствора для удаления ДНК-зондов, не связавшихся с ДНК исследуемых бактерий, инкубируют в течение 30 мин при соответствующей температуре.
8) Пробу центрифугируют и ресуспендируют в 300 мкл ФСБ, эритроциты дополнительно окрашивают синим Эванса.
9) С помощью люминесцентной микроскопии определяют количество адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий, а также одновременно проводят идентификацию бактерий по соответствующим зондам в образцах крови обследуемого больного.
10)Рассчитывают интегральный показатель по формуле:
ИП=1,527+0,333×X1-1,116×Х2-0,137×Х3+0,033×Х4+0,061×Х5-0,184×Х6+3,242×Х7+0,71×Х8+0,888×Х9+0,336×Х10,
где: X1 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo1;
Х2 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo2;
Х3 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo3;
Х4 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo4;
Х5 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo5;
Х6 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo1;
Х7 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo2;
Х8 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo3;
Х9 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo4;
Х10 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo5.
11) Оценивают степень тяжести течения сепсиса, используя значения интегрального показателя (ИП): ИП меньше 2,5 - тяжесть течения сепсиса считают легкой, при значении ИП от 2,5 до 5,6 - средней, а при значении ИП больше 5,6 - тяжелой.
Примеры конкретного выполнения способа.
Пример 1. Больной X., 1960 г.р. поступил в ООКБ №1 с предварительным диагнозом: «Менингит, сепсис». При осмотре отмечалась выраженная вялость, сероватый оттенок кожных покровов, отечность стоп. Тахипноэ достигало 96 в мин, что свидетельствовало о наличии дыхательной недостаточности. Температура тела в течение трех дней держалась в пределах 38,7-39°С. Лабораторные показатели общего анализа крови были значительно ниже нормы: Hb - 76 г/л, ц.п. - 0,82, эритроцитов - 2,89×1012/л, лейкоцитов - 2,94×106/л. При использовании заявляемого способа подготовки эритроцитов возможно выявление бактерий на поверхности и внутри эритроцитов, а также одновременная их идентификация, что позволит подтвердить поставленный диагноз у больного, а также с помощью расчета интегрального показателя оценить тяжесть течения заболевания. Для этого кровь от обследуемого больного трехкратно отмывали фосфатно-солевым буфером (ФСБ) (рН=7,4) центрифугированием при 1000 об/мин в течение 5 мин и доводили до одномиллионной концентрации клеток в миллилитре. Пробу объемом 1 мл осаждали центрифугированием при 1000 об/мин в течение 5 мин и ресуспендировали в 400 мкл 0,5% раствора глутарового альдегида, фиксировали в течение 30 мин при 25°С. Фиксированные клетки промывали ФСБ (рН=7,4) и ресуспендировали в растворах этанола с восходящей концентрацией 50, 80 и 100% по 400 мкл каждого раствора с последующей инкубацией в течение 10 мин при 4°С. Эритроциты промывали ФСБ (рН=7,4) центрифугированием при 1000 об/мин в течение 5 мин и ресуспендировали в 300 мкл дистиллированной воде. Аликвоты по 100 мкл фиксированных клеток осаждали центрифугированием при 1000 об/мин в течение 5 мин и ресуспендировали в 100 мкл буферного раствора для гибридизации (0,9 М NaCl и 20 mM Tris-HCl, рН=7), содержащего 500 нМ соответствующего ДНК-зонда, меченного на 5'-конце флуоресцеина изотиоцианатом (FITC) (ООО «ДНК-синтез», Москва). Далее в исследуемой пробе проводили гибридизацию в течение 5 ч при температуре соответствующей температуре отжига для каждого вида зонда. После гибридизации клетки центрифугировали при 1000 об/мин в течение 5 мин и добавляли 500 мкл промывочного раствора для удаления ДНК-зондов, не связавшихся с ДНК исследуемых бактерий, инкубировали в течение 30 мин при соответствующей температуре. Пробу центрифугировали и ресуспендировали в 300 мкл ФСБ. Эритроциты дополнительно окрашивали синим Эванса. С помощью люминесцентной микроскопии определяли количество адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий, а также одновременно проводили идентификацию бактерий по соответствующим зондам в образцах крови обследуемого больного. Далее рассчитывали интегральный показатель по формуле:
ИП=1,527+0,333×X1-1,116×Х2-0,137×Х3+0,033×Х4+0,061×Х5-0,184×Х6+3,242×Х7+0,71×Х8+0,888×Х9+0,336×Х10,
где: X1=20 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo1;
Х2=0 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом O1igo2;
Х3=0 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом O1igo3;
Х4=0 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo4;
Х5=12 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo5;
Х6=5 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo1;
Х7=0 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo2;
Х8=0 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo3;
Х9=0 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo4;
Х10=16 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo5.
Полученные экспериментальные значения были использованы для расчета интегрального показателя по вышеуказанной формуле:
ИП=1,527+0,333×20-1,116×0-0,137×0+0,033×0+0,061×12-0,184×5+3,242×0+0,71×0+0,888×0+0,336×16=13,375
В результате расчета получили значение интегрального показателя равное 13,375, которое соответствует 3 группе - тяжелая степень заболевания. Специфическое свечение обнаружили с зондами Oligo1 и Oligo6, комплементарных видоспецифическим участкам гена 16S рРНК микроорганизмов Enterobacteriaceae и Staphylococcus spp. У больного выявили полимикробную инфекцию. Последующее наблюдение пациента на основе клинических и лабораторных показателей подтвердило раннее выставленный диагноз.
Было сделано заключение о том, что у больного подтвердился диагноз: «Сепсис», с помощью заявляемого способа оценили тяжелую степень течения заболевания и определили возбудителей сепсиса - Enterobacteriaceae и Staphylococcus spp.
Пример 2. Больная Ф., 1935 г.р. поступила в ООКБ №1 с диагнозом: «Септический эндокардит, ишемический инсульт». При поступлении состояние тяжелое, температура тела - 38,7°С. Пульс - 102 в минуту; частота дыхания - 34 в минуту. Лабораторные показатели общего анализа крови были ниже нормы: Hb - 102 г/л, ц.п. - 0,98, эритроциты - 4,34×1012/л, общее количество лейкоцитов - 18,5×109/л. У больной взяли образец крови и обработали согласно примеру 1. В результате применения заявляемого способа получили значение интегрального показателя равное 4,8, что соответствует 2 группе - средняя степень тяжести течения сепсиса. Специфическое свечение обнаружили с зондом Oligo3, комплементарного видоспецифическому участку гена 16S рРНК микроорганизма - Staphylococcus aureus. Последующее наблюдение пациентки на основе клинических и лабораторных показателей подтвердило раннее выставленный диагноз.
Было сделано заключение о средней тяжести течения заболевания по количеству адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий, возбудителем является S. aureus.
Пример 3. Больная Б., 1975 г.р. поступила в ООКБ №1 с диагнозом: «Гнойный перитонит, сепсис». При поступлении общее состояние средней тяжести, температура тела - 38,4°С, артериальное давление 130/90 мм рт.ст., пульс 88 в минуту. Показатели общего анализа крови находились в пределах нормы: Hb - 118 г/л; эр - 3,8×1012/л; ц.п.- 1,5. У больной взяли образец крови и обработали согласно примеру 1. В результате применения заявляемого способа получили значение интегрального показателя равное 2,009, что соответствует 1 группе - легкая степень тяжести течения сепсиса. Специфическое свечение обнаружили с зондом Oligo1, комплементарного видоспецифическому участку гена 16S рРНК микроорганизма - представителя Enterobacteriaceae. Последующее наблюдение пациента на основе клинических и лабораторных показателей подтвердило раннее выставленный диагноз.
Было сделано заключение о легкой степени тяжести течения заболевания по количеству адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий.
Пример 4. Больной Н., 1957 г.р. поступил в ООКБ №1 с предполагаемым диагнозом «Сепсис». При осмотре общее состояние удовлетворительное, температура тела - 37,4°С, артериальное давление 130/90 мм рт.ст., пульс 68 в минуту. Показатели общего анализа крови находились в пределах нормы: Hb - 133 г/л; эр - 4,46×1012/л; ц.п. - 0,9. У больного взяли образец крови и обработали согласно примеру 1. В результате исследования в образце крови специфического свечения не обнаружили. Было сделано заключение о том, что у больного диагноз не подтвердился.
Таким образом, заявляемый способ оценки тяжести течения сепсиса позволяет повысить точность ранней диагностики и по количеству адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий оценить тяжесть течения заболевания у больных сепсисом. Данный способ гораздо дешевле и более легкий в обработке исследуемого материала, чем ПЦР-анализ гемокультуры и метод мультиплексного ПЦР-анализа в режиме реального времени, а также может достаточно широко применяться в условиях клинико-диагностических лабораторий.

Claims (13)

  1. Способ оценки тяжести течения сепсиса, включающий подготовку образцов крови больных сепсисом для проведения флуоресцентной in situ гибридизации с последующим обнаружением бактерий в образцах крови с использованием люминесцентной микроскопии, отличающийся тем, что определяют количество адгезированных на поверхности эритроцитов и внутриэритроцитарно расположенных бактерий и рассчитывают интегральный показатель по формуле:
  2. ИП=1,527+0,333×X1-1,116×Х2-0,137×Х3+0,033×Х4+0,061×Х5-0,184×Х6+3,242×Х7+0,71×Х8+0,888×Х9+0,336×Х10,
  3. где: X1 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo1;
  4. Х2 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo2;
  5. Х3 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo3;
  6. Х4 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo4;
  7. Х5 - количество адгезированных бактерий на поверхности эритроцитов в образце крови больного, обработанных зондом Oligo5;
  8. Х6 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo1;
  9. Х7 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo2;
  10. Х8 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo3;
  11. Х9 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo4;
  12. Х10 - количество внутриэритроцитарно расположенных бактерий в образце крови больного, обработанных зондом Oligo5,
  13. при этом при значении интегрального показателя меньше 2,5 тяжесть течения сепсиса считают легкой, при значении от 2,5 до 5,6 - средней, а при значении больше 5,6 - тяжелой.
RU2018108085A 2018-03-05 2018-03-05 Способ оценки тяжести течения сепсиса RU2684904C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2018108085A RU2684904C1 (ru) 2018-03-05 2018-03-05 Способ оценки тяжести течения сепсиса

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2018108085A RU2684904C1 (ru) 2018-03-05 2018-03-05 Способ оценки тяжести течения сепсиса

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2684904C1 true RU2684904C1 (ru) 2019-04-16

Family

ID=66168523

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2018108085A RU2684904C1 (ru) 2018-03-05 2018-03-05 Способ оценки тяжести течения сепсиса

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2684904C1 (ru)

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2236006C1 (ru) * 2002-12-11 2004-09-10 Новокузнецкий государственный институт усовершенствования врачей Способ прогнозирования неблагоприятного течения заболевания у больных с распространенным перитонитом и абдоминальным сепсисом
RU2016100626A (ru) * 2016-01-11 2017-07-14 Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Тихоокеанский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ГОУ ВПО ТГМУ Минздрава России) Способ прогнозирования тяжести течения и исхода заболевания у пациентов с хирургическим сепсисом

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2236006C1 (ru) * 2002-12-11 2004-09-10 Новокузнецкий государственный институт усовершенствования врачей Способ прогнозирования неблагоприятного течения заболевания у больных с распространенным перитонитом и абдоминальным сепсисом
RU2016100626A (ru) * 2016-01-11 2017-07-14 Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Тихоокеанский государственный медицинский университет" Министерства здравоохранения Российской Федерации (ГОУ ВПО ТГМУ Минздрава России) Способ прогнозирования тяжести течения и исхода заболевания у пациентов с хирургическим сепсисом

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
G.PILZ et al. Krankenplege-Journal, 1991, 29, pp. 483-492. Оперативная гинекология / Под ред. Кулакова В.И. М.: Медицина, 1990, с. 356-360. *
GOSIEWSKI Т et al. Use of PCR and FISH methods for rapid identification of bacterial bloodstream infections // Ann Acad Med Siles, 2011, 65, p. 14-22. *
P.P. GHILLANI et al. Identification and Measurement of Calci-tonin Precursors in Serum of Patients with Malignant Diseases. Cancer Research, 1989, vol. 49, pp. 6845-6851. *
P.P. GHILLANI et al. Identification and Measurement of Calci-tonin Precursors in Serum of Patients with Malignant Diseases. Cancer Research, 1989, vol. 49, pp. 6845-6851. G.PILZ et al. Krankenplege-Journal, 1991, 29, pp. 483-492. Оперативная гинекология / Под ред. Кулакова В.И. М.: Медицина, 1990, с. 356-360. *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US10910088B2 (en) Method and device for nucleic acid based diagnostic approaches including the determination of a deviant condition, especially a health condition and/or a pathogenic condition of a sample
Masaki et al. Nocardia elegans infection involving purulent arthritis in humans
CN113186309A (zh) 泌尿系统细菌感染检测体系及其试剂盒和应用
CN112391460A (zh) 用于脓毒症的生物标志物组及脓毒症判断方法和试剂盒
RU2362808C1 (ru) Способ диагностики дисбаланса микробиоты различных биотопов человека и степени его выраженности
Badiee et al. Molecular detection of invasive aspergillosis in hematologic malignancies
RU2684904C1 (ru) Способ оценки тяжести течения сепсиса
CN108034735B (zh) 一种关节假体感染诊断试剂盒
Badiee et al. Invasive fungal infection in renal transplant recipients demonstrated by panfungal polymerase chain reaction
US20090023181A1 (en) Method and Device for Detection of Erythromycin-Induced Clindamycin Resistance
CN113293221B (zh) 一种人类脓毒症病原体检测试剂盒及检测方法
CN110184371B (zh) 一种检测皮特不动杆菌的特异性引物及其方法和应用
CN115725742B (zh) 一种用于诊断痒螨病的pcr试剂盒及检测方法
RU2237248C1 (ru) Способ прогнозирования неблагоприятного течения острого ограниченного гнойно-воспалительного заболевания легких и плевры микробной этиологии
RU2821994C1 (ru) Способ определения показателя антибиотикорезистентности бактерий рода Desulfovibrio spp.
RU2685278C1 (ru) Способ оценки эффективности лечения урогенитального хламидиоза
RU2800821C1 (ru) Способ ранней диагностики сепсиса с помощью определения абсолютного количества нейтрофильных внеклеточных ловушек
KR20230131324A (ko) 핵산 기반의 측면 흐름 분석을 이용한 옴진드기 진단용 정보 제공 방법
RU2638453C1 (ru) Способ выявления и оценки уровня патогенности возбудителей оппортунистических инфекций у женщин репродуктивного возраста и новорожденных детей для прогнозирования течения и развития осложнений инфекционных заболеваний
Mussa The Asia Journal of Applied Microbiology
Nett et al. Review of techniques for diagnosis of catheter-related Candida biofilm infections
Kumar et al. Use of Procalcitonin for Optimizing Antimicrobial Therapy in Long Term ICU Patients
Townsend et al. What is Slough? A pilot study to define the proteomic and microbial composition of wound slough and its implications for wound healing.
Ghareeb et al. Detection of FsrB Quorum-Sensing Gene and Biofilm Production in Enterococcus faecalis Isolated from UTI Women
Mohammed et al. Loop-mediated isothermal amplification: A rapid and simple method for detection of fluconazole resistant Candida albicans vaginitis

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20210306