RU2660360C2 - СПОСОБ ОЦЕНКИ РИСКА ПРОГРЕССИРОВАНИЯ ИНТРАЭПИТЕЛИАЛЬНОЙ ЦЕРВИКАЛЬНОЙ НЕОПЛАЗИИ И РАЗВИТИЯ РАКА ШЕЙКИ МАТКИ НА ОСНОВЕ ОПРЕДЕЛЕНИЯ УРОВНЕЙ мРНК ГЕНОВ ЧЕЛОВЕКА - Google Patents
СПОСОБ ОЦЕНКИ РИСКА ПРОГРЕССИРОВАНИЯ ИНТРАЭПИТЕЛИАЛЬНОЙ ЦЕРВИКАЛЬНОЙ НЕОПЛАЗИИ И РАЗВИТИЯ РАКА ШЕЙКИ МАТКИ НА ОСНОВЕ ОПРЕДЕЛЕНИЯ УРОВНЕЙ мРНК ГЕНОВ ЧЕЛОВЕКА Download PDFInfo
- Publication number
- RU2660360C2 RU2660360C2 RU2015103190A RU2015103190A RU2660360C2 RU 2660360 C2 RU2660360 C2 RU 2660360C2 RU 2015103190 A RU2015103190 A RU 2015103190A RU 2015103190 A RU2015103190 A RU 2015103190A RU 2660360 C2 RU2660360 C2 RU 2660360C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- progression
- risk
- intraepithelial neoplasia
- cervical
- cervical intraepithelial
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 27
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 title claims abstract description 19
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims description 14
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 title abstract description 5
- 238000011161 development Methods 0.000 title description 14
- 208000006105 Uterine Cervical Neoplasms Diseases 0.000 title description 13
- 206010008342 Cervix carcinoma Diseases 0.000 title description 12
- 201000010881 cervical cancer Diseases 0.000 title description 12
- 230000009826 neoplastic cell growth Effects 0.000 title description 2
- 206010008263 Cervical dysplasia Diseases 0.000 claims abstract description 64
- 208000007951 cervical intraepithelial neoplasia Diseases 0.000 claims abstract description 49
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims abstract description 17
- 102100021569 Apoptosis regulator Bcl-2 Human genes 0.000 claims abstract description 13
- 101000945496 Homo sapiens Proliferation marker protein Ki-67 Proteins 0.000 claims abstract description 10
- 108091012583 BCL2 Proteins 0.000 claims abstract description 9
- 108090000468 progesterone receptors Proteins 0.000 claims abstract description 9
- 108010009392 Cyclin-Dependent Kinase Inhibitor p16 Proteins 0.000 claims abstract description 8
- 102000003998 progesterone receptors Human genes 0.000 claims abstract description 8
- 230000003902 lesion Effects 0.000 claims abstract description 7
- WVAKRQOMAINQPU-UHFFFAOYSA-N 2-[4-[2-[5-(2,2-dimethylbutyl)-1h-imidazol-2-yl]ethyl]phenyl]pyridine Chemical compound N1C(CC(C)(C)CC)=CN=C1CCC1=CC=C(C=2N=CC=CC=2)C=C1 WVAKRQOMAINQPU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 5
- 102000004000 Aurora Kinase A Human genes 0.000 claims abstract description 5
- 108090000461 Aurora Kinase A Proteins 0.000 claims abstract description 5
- 102100037152 BAG family molecular chaperone regulator 1 Human genes 0.000 claims abstract description 5
- 102100021663 Baculoviral IAP repeat-containing protein 5 Human genes 0.000 claims abstract description 5
- 102100038595 Estrogen receptor Human genes 0.000 claims abstract description 5
- 102100032340 G2/mitotic-specific cyclin-B1 Human genes 0.000 claims abstract description 5
- 101000740062 Homo sapiens BAG family molecular chaperone regulator 1 Proteins 0.000 claims abstract description 5
- 101000882584 Homo sapiens Estrogen receptor Proteins 0.000 claims abstract description 5
- 101000868643 Homo sapiens G2/mitotic-specific cyclin-B1 Proteins 0.000 claims abstract description 5
- 108010011536 PTEN Phosphohydrolase Proteins 0.000 claims abstract description 5
- 108010002687 Survivin Proteins 0.000 claims abstract description 5
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims abstract description 5
- 101000934372 Homo sapiens Macrosialin Proteins 0.000 claims abstract description 4
- 101000979748 Homo sapiens Protein NDRG1 Proteins 0.000 claims abstract description 4
- 102100025136 Macrosialin Human genes 0.000 claims abstract description 4
- 102100024980 Protein NDRG1 Human genes 0.000 claims abstract description 4
- 102100024458 Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A Human genes 0.000 claims abstract 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 5
- 102000014160 PTEN Phosphohydrolase Human genes 0.000 claims description 4
- 230000032361 posttranscriptional gene silencing Effects 0.000 claims 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 abstract description 3
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 2
- 230000036210 malignancy Effects 0.000 abstract description 2
- 102100027308 Apoptosis regulator BAX Human genes 0.000 abstract 1
- 108050006685 Apoptosis regulator BAX Proteins 0.000 abstract 1
- 108010037462 Cyclooxygenase 2 Proteins 0.000 abstract 1
- 102100032543 Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN Human genes 0.000 abstract 1
- 102100038280 Prostaglandin G/H synthase 2 Human genes 0.000 abstract 1
- -1 SCUBE Proteins 0.000 abstract 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract 1
- 208000022361 Human papillomavirus infectious disease Diseases 0.000 description 22
- 210000003679 cervix uteri Anatomy 0.000 description 14
- 230000018109 developmental process Effects 0.000 description 12
- 230000002380 cytological effect Effects 0.000 description 10
- 102100034836 Proliferation marker protein Ki-67 Human genes 0.000 description 8
- 102100033254 Tumor suppressor ARF Human genes 0.000 description 7
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 7
- 238000002573 colposcopy Methods 0.000 description 6
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 6
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 6
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 6
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 6
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 5
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 5
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 5
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 5
- 108050006400 Cyclin Proteins 0.000 description 4
- 206010058314 Dysplasia Diseases 0.000 description 4
- 101000971171 Homo sapiens Apoptosis regulator Bcl-2 Proteins 0.000 description 4
- 208000009608 Papillomavirus Infections Diseases 0.000 description 4
- 102100036691 Proliferating cell nuclear antigen Human genes 0.000 description 4
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 4
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 4
- 230000008569 process Effects 0.000 description 4
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 3
- 108010006785 Taq Polymerase Proteins 0.000 description 3
- 230000008030 elimination Effects 0.000 description 3
- 238000003379 elimination reaction Methods 0.000 description 3
- 210000005081 epithelial layer Anatomy 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 230000004660 morphological change Effects 0.000 description 3
- 108700042657 p16 Genes Proteins 0.000 description 3
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 3
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 3
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 3
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 2
- 241000701806 Human papillomavirus Species 0.000 description 2
- TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L Magnesium chloride Chemical compound [Mg+2].[Cl-].[Cl-] TWRXJAOTZQYOKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 2
- 230000006907 apoptotic process Effects 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 210000002469 basement membrane Anatomy 0.000 description 2
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 2
- 230000006866 deterioration Effects 0.000 description 2
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 2
- 230000006525 intracellular process Effects 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 230000000394 mitotic effect Effects 0.000 description 2
- 230000010309 neoplastic transformation Effects 0.000 description 2
- 239000012188 paraffin wax Substances 0.000 description 2
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 2
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 2
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 2
- 230000022983 regulation of cell cycle Effects 0.000 description 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 2
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 230000007704 transition Effects 0.000 description 2
- 230000005748 tumor development Effects 0.000 description 2
- 230000005740 tumor formation Effects 0.000 description 2
- 210000003741 urothelium Anatomy 0.000 description 2
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 1
- YPSXFMHXRZAGTG-UHFFFAOYSA-N 4-methoxy-2-[2-(5-methoxy-2-nitrosophenyl)ethyl]-1-nitrosobenzene Chemical compound COC1=CC=C(N=O)C(CCC=2C(=CC=C(OC)C=2)N=O)=C1 YPSXFMHXRZAGTG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940088872 Apoptosis inhibitor Drugs 0.000 description 1
- 208000007879 Atypical Squamous Cells of the Cervix Diseases 0.000 description 1
- 101150061050 CIN1 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000007399 DNA isolation Methods 0.000 description 1
- 102000016911 Deoxyribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010053770 Deoxyribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 1
- 208000008636 Neoplastic Processes Diseases 0.000 description 1
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 208000037273 Pathologic Processes Diseases 0.000 description 1
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 1
- 102000004005 Prostaglandin-endoperoxide synthases Human genes 0.000 description 1
- 108090000459 Prostaglandin-endoperoxide synthases Proteins 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 230000035508 accumulation Effects 0.000 description 1
- 238000009825 accumulation Methods 0.000 description 1
- BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N ammonium sulfate Chemical compound N.N.OS(O)(=O)=O BFNBIHQBYMNNAN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052921 ammonium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011130 ammonium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 230000001640 apoptogenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000000158 apoptosis inhibitor Substances 0.000 description 1
- 108700041737 bcl-2 Genes Proteins 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 1
- 210000003855 cell nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000002621 cervical conization Methods 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 101150005988 cin2 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 1
- 238000013399 early diagnosis Methods 0.000 description 1
- 229940011871 estrogen Drugs 0.000 description 1
- 239000000262 estrogen Substances 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 230000004034 genetic regulation Effects 0.000 description 1
- 239000003163 gonadal steroid hormone Substances 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 238000012165 high-throughput sequencing Methods 0.000 description 1
- 238000010562 histological examination Methods 0.000 description 1
- 108091008039 hormone receptors Proteins 0.000 description 1
- 208000021145 human papilloma virus infection Diseases 0.000 description 1
- 230000000215 hyperchromic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002991 immunohistochemical analysis Methods 0.000 description 1
- 238000012151 immunohistochemical method Methods 0.000 description 1
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 238000009830 intercalation Methods 0.000 description 1
- 208000020082 intraepithelial neoplasia Diseases 0.000 description 1
- 238000007477 logistic regression Methods 0.000 description 1
- 229910001629 magnesium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 238000010208 microarray analysis Methods 0.000 description 1
- 238000012775 microarray technology Methods 0.000 description 1
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 1
- 210000004400 mucous membrane Anatomy 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 231100000590 oncogenic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002246 oncogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000009054 pathological process Effects 0.000 description 1
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 1
- 230000002688 persistence Effects 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 1
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 230000003449 preventive effect Effects 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 1
- 150000003180 prostaglandins Chemical class 0.000 description 1
- 238000012797 qualification Methods 0.000 description 1
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 1
- 230000001850 reproductive effect Effects 0.000 description 1
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 1
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 1
- 238000007790 scraping Methods 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 238000001228 spectrum Methods 0.000 description 1
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 239000006163 transport media Substances 0.000 description 1
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 description 1
- 208000024719 uterine cervix neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/58—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
- G01N33/582—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with fluorescent label
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Изобретение относится к области медицины, в частности к гинекологии. Предложен способ оценки риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии. Измеряют уровень экспрессии мРНК генов человека MKI67, CDKN2A, CCNB1, BIRC5, AURKA, ESR1, PGR, BCL2, ВАХ, BAG1, NDRG1, PTEN, CD68, SCUBE, PTGS2 в образцах из мест поражений. Полученные в ходе реакции значения подставляют в формулу. Если значение р менее или равно пороговому значению (р≤cut-off), делают заключение об отсутствии риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплази. Если значение р>cut-off, делают заключение о высоком риске прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии. Изобретение позволяет оценить вероятность риска прогрессии цервикальной интраэпителиальной неоплазии и последующей малигнизации. 2 ил., 2 пр.
Description
1. Область техники.
Изобретение относится к области медицины (в частности, гинекологии и онкологии), а также к области науки (в частности, генетики и молекулярной биологии) и может быть использовано для оценки риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии с целью выбора метода профилактики неоплазии и последующего рака шейки матки, выбора метода лечения и оценки эффективности проводимой терапии.
2. Уровень техники.
Цервикальная интраэпителиальная неоплазия (ЦИН) представляет собой заболевание шейки матки, сопровождающееся морфологическими изменениями тканей шейки матки, которые характеризуются интенсивным, патологическим размножением клеток с признаками атипии. Постепенно эти нарушенные клеточные элементы становятся основой будущей (возможной) опухоли шейки матки. Дисплазия шейки матки не имеет выраженных клинических признаков и не может быть определена во время осмотра врачом. Диагноз может быть поставлен только на основании данных цитологического и гистологического исследования. В настоящее время рекомендуется использовать классификацию ВОЗ, согласно которой цервикальная интраэпителиальная неоплазия имеет 3 степени.
1. CIN 1 (дисплазия слабой степени) характеризуется невыраженными изменениями строения эпителия с умеренной пролиферацией клеток базального слоя. Характерными признаками является наличие морфологических признаков папилломавирусной инфекции - койлоцитоз и дискератоз. Эти изменения не должны охватывать более одной трети толщины эпителиального пласта, начиная от базальной мембраны. Это создает условия для затрудненной диагностики, поскольку забор материала для цитологического исследования во время скрининговых исследований не во всех случаях может быть большим по объему и глубине.
2. CIN 2 (дисплазия средней степени) имеет более выраженные морфологические изменения. При этом поражается половина толщины эпителиального слоя, начиная от базальной мембраны.
3. CIN 3 (дисплазия тяжелой степени) характеризуется поражением более двух третей эпителиального пласта. Морфологические изменения весьма выражены. Для данной стадии характерно появление патологических митозов, а также наличие огромных гиперхромных ядер клеток.
Установлено, что разные стадии цервикальной интраэпителиальной неоплазии являются единым процессом развития рака шейки матки. При этом CIN 1 и CIN 2 представляют собой взаимно переходящие друг в друга процессы, поскольку существуют доказательства, что в ходе лечения возможен регресс опухолеобразования.
Патологичесий процесс напрямую связан с активностью вируса папилломы человека. Тем не менее, само по себе наличие высокоонкогенного типа вируса не является достаточным прогностическим маркером, особенно у молодых сексуально активных женщин ввиду высокой вероятности самопроизвольной элиминации вируса. Хотя бы раз в жизни 80-90% всех сексуально-активных людей заражаются HPV. При этом в 80% случаев вирус элиминируется из организма в течение 2-х лет и не имеет клинического значения. Поэтому ВПЧ-тестирование, являющееся на сегодня наиболее частым предиктором развития рака шейки матки, признано неинформативным у молодых женщин и не проводится до 30 лет.
В то же время поражения, характерные для CIN 1, могут быть обусловлены не только папилломавирусной инфекцией. Причины многообразны. Это могут быть и инфекционно-воспалительные процессы, вызванные различными урогенитальными инфекциями, и дистрофические процессы в шейке матки и состояния, связанные с недостаточностью уровня эстрогенов.
Сегодня существует три варианта лечения цервикальной интраэпителиальной неоплазии: 1) немедленное лечение, 2) активное лечение и 3) вариант выжидательной тактики. К сожалению, до настоящего времени не выделены надежные молекулярно-генетические предикторы, на основании которых можно было бы с высокой прогностической значимостью предсказать развитие процесса от спонтанной регрессии до прогрессии в рак, что существенно затрудняет развитие профилактического направления и дифференцированных подходов к ведению больных.
Основная задача диагностического метода должна состоять в том, чтобы научиться выделять из огромной когорты пациенток с CIN1 и CIN2 и ВПЧ-инфицированных женщин тех, кто действительно находится в зоне высокого риска прогрессии опухолеобразования и развития рака шейки матки. Особенно актуален поиск маркеров, не связанных с наличием вируса папилломы человека.
Базируясь на современных знаниях о генетической регуляции внутриклеточных процессов можно утверждать, что маркерами высокого риска неопластической трансформации при предраковых поражениях шейки матки может быть огромное число молекулярно-генетических факторов, отражающих функциональное состояние генома. В настоящее время для оценки функционального состояния генома используют микрочиповые технологии, позволяющие определять уровень (относительную концентрацию в клетке) мРНК тысяч и сотен генов. Однако в силу высокой стоимости подобных исследований этот метод пока не получил широкого распространения в клинической практике. По аналогии с другими внутриклеточными процессами можно предположить, что для эффективной оценки риска развития опухоли может оказаться достаточным исследования 5-6 генетических маркеров из различных «физиологических» групп генов.
Измеряя экспрессионный профиль отдельных генов человека сравнительно недорогим методом ПЦР «в реальном времени», можно по уровню представленности транскриптов этих (маркерных) генов, дать прогноз развития заболевания и оценить вероятность риска прогрессии цервикальной интраэпителиальной неоплазии и последующей малигнизации.
На момент подачи заявки из открытых источников было известно о следующих близких аналогах.
- Способ прогнозирования варианта развития цервикальной интраэпителиальной неоплазии шейки матки I степени (ЦИН I) (патент РФ №2409322) от 20.01.2011. Для прогнозирования варианта развития цервикальной интраэпителиальной неоплазии I степени (ЦИН I) определяют экспрессию P16ink4(CDKN2A). Дополнительно оценивают кольпоскопическую картину с использованием индекса Reid, системы Coppleson, определяют степень распространенности койлоцитоза в биоптате. Оценку исследуемых показателей проводят с помощью прогностических коэффициентов (ПК). При кольпоскопическом индексе Reid 0-2 балла значение ПК=-3, 3 балла - ПК=+2, 4 балла - ПК=+1. При регистрации значащих кольпоскопических картин по Coppleson ПК=+2, незначащих - ПК=-2. При наличии распространенного койлоцитоза ПК=+4, при его отсутствии ПК=-1. При уровне цитоплазматической метки P16ink4α 1-10% ПК=-4, при уровне P16ink4α 11-50% - ПК-2, при уровне P16ink4α, равном 51% и более, - ПК=+5. Суммируют прогностические коэффициенты, и если сумма прогностических коэффициентов достигает конечного значения со знаком "+", выносят решение о риске неблагоприятного варианта развития ЦИН I и рекомендуют хирургическое лечение шейки матки, при достижении порога со знаком "-" - о благоприятном варианте развития ЦИН I и рекомендуют консервативное ведение пациентки. Способ позволяет определить вариант развития ЦИН I для обоснованного осуществления врачебной тактики при лечении данного заболевания.
- Способ прогнозирования предраковых заболеваний шейки матки у женщин с папилломавирусной инфекцией (патент РФ №2310197), от 10.11.2007. Способ состоит в том, что серийные срезы слизистой оболочки шейки матки женщин с папилломавирусной инфекцией исследуют иммуногистохимическим методом: обрабатывают по стрептавидин-биотиновомупероксидазному методу и инкубируют с антителами к антигену ядер пролиферирующих клеток - PCNA и к ингибитору апоптоза BCL-2. Определяют митотический индекс, апоптозный индекс (АИ), индекс метки PCNA (ИМ PCNA) и индекс метки BCL-2 (ИМ BCL-2), после чего рассчитывают коррелятивный индекс пролиферации (КИП) по формуле: КИП=Митотический индекс (ИМ PCNA (ИМ BCL - 2/АИ. Если у больных с цервикальной интраэпителиальнй неоплазией I степени значение КИП превышает 114,0, то предполагают высокую вероятность перехода заболевания в стадию цервикальной интраэпителиальной неоплазии II степени, а если значение КИП превышает 208,0, предполагают высокую вероятность перехода заболевания в стадию цервикальной интраэпителиальной неоплазии III степени или развития онкологической патологии шейки матки. Использование способа позволяет осуществить раннюю диагностику продолжения опухолевого роста и скорректировать индивидуальное лечение.
Описанные способы основаны на методах иммуногистохимического анализа с использованием поликлональных антител, не обеспечивающих высокую специфичность анализа, либо высокоспецифичных дорогостоящих зарубежных моноклональных антител. Результаты анализа в значительной степени зависят от квалификации врача-лаборанта и являются субъективными. Помимо этого в первом приведенном аналоге учитываются результаты кольпоскопии и степень распространенности койлоцитоза в биоптате.
В отличие от представленных аналогов предлагаемый способ основан на использовании метода обратной транскрипции и полимеразной цепной реакции и комплексно позволяет оценить функциональное состояние эпителия цервикального канала: степень пролиферации клеток и регуляции клеточного цикла (MKI67, CDKN2A, CCNB1, BIRC5, AURKA, SCUBE), уровень апоптоза (BCL2, В АХ, BAG1, NDRG1, PTEN), синтеза простагландинов (PTGS2), рецепторный аппарат к половым гормонам (ESR1, PGR) и иммунокомпетентных клеток (CD68).
3. Описание изобретения.
Предложен способ оценки риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии по уровню транскриптов генов пролиферации и регуляции клеточного цикла (MKI67, CDKN2A, CCNB1, BIRC5, AURKA, SCUBE), апоптоза (BCL2, ВАХ, BAG1, NDRG1, PTEN), рецепторного аппарата (ESR1, PGR, CD68) и циклооксигеназы PTGS2, в образцах из мест поражений.
Уровень представленности транскриптов определяют любым пригодным для этого методом, например методом обратной транскрипции с последующей ПЦР «в реальном времени», методом микроматричного анализа или методом высокопроизводительного секвенирования (NGS).
Полученные значения уровней представленности транскриптов используют для расчета риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии, например, по формуле
где р - риск прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии;
z - значение регрессионной функции, определяется по формуле
где X1…Xn - уровень представленности мРНК отдельных генов или индекс их соотношения;
b1…bn - регрессионные коэффициенты;
а - константа.
Если значение р менее или равно пороговому значению (p≤cut-off), делают заключение об отсутствии риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии; если значение p>cut-off, делают заключение о высоком риске прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии. Пороговое значение определяют на основе экспериментальных данных с помощью ROC-анализа.
4. Реализация изобретения
Взятие материала из локусов с поражениями осуществляют путем соскобов, биопсии или во время оперативного вмешательства. Фрагменты тканей толщиной не более 0,3-0,5 мм или образцы клеток помещают в пластиковую пробирку объемом 1,5 мл, в которую предварительно внесено 500 мкл стандартной транспортной среды (например: IntactRNA, Евроген, Россия, кат № NL001), обрабатывают и хранят согласно Инструкции производителя. Выделение РНК проводят любым стандартным методом, например согласно Инструкции к Комплекту реагентов для выделения РНК и ДНК «ПРОБА-НК/ПРОБА-НК-ПЛЮС» (ЗАО "НПФ ДНК-Технология", Россия, регистрационное удостоверение № ФСР 2010/08867 от 21.09.2010 г, ТУ 9398-035-46482062-2009). Полученные препараты РНК желательно сразу использовать для постановки реакции обратной транскрипции.
Обратную транскрипцию проводят любым стандартным методом, например, согласно Инструкции к набору реагентов с использованием AMV-обратной транскриптазы (Fermentas, Литва, кат № ЕР0641) в комплектации с 5 х буфером для обратной транскрипции (состав: 250 mM Tris-HCl (рН 8.5 at 25°С), 40 mM MgCl2, 150 mM KCl, 5 mM DTT). В состав ОТ-смеси входят дНТФ в конечной концентрации 0,2 мМ каждого и смесь случайных гексамеров в конечной концентрации 0,5 рМ.
Для определения уровня представленности мРНК исследуемых генов используют стандартный метод ПЦР «в реальном времени» в стандартных условиях с праймерами, специфичными к последовательностям определяемых РНК. Обычно праймеры для ПЦР-амплификации подбирают с учетом структуры генов с целью исключения коамплификации геномной ДНК, чтобы избежать необходимости использования стадии обработки образцов ДНКазой. Например, можно использовать следующий подход: на конечный объем реакционной смеси 35 мкл состав реакционной смеси: 66 мМ трис-HCl, рН 8,8, 16,6 мМ аммония сульфат, 0,01% Tween-20, 0,001% желатин, 3 мМ хлористый магний, по 250 мкМ каждого из дНТФ по 12.5 пмоль каждого праймера и зонда, 0,8 единиц Taq-полимеразы.
Для повышения чувствительности и специфичности реакции желательно использовать «горячий» старт, который обеспечивается либо использованием Taq-полимеразы, активируемой при высокой температуре, либо методикой приготовления реакционной смеси, состоящей из двух слоев, разделенных слоем парафина. Нижний слой содержит дНТФ, праймеры и зонд, верхний - матрицу и Taq-полимеразу. Смешение слоев и превращение их в реакционную смесь происходит только при плавлении парафина, что исключает неспецифический отжиг праймеров на ДНК-мишени при начальном прогреве пробирки.
Проявку накопления продуктов реакции проводят с помощью флуоресцентно-меченых олигонуклеотидов (зондов) или интекалирующих красителей. Соотношение уровней представленности транскриптов можно рассчитывать с помощью метода ΔCq.
Риск прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии определяется по формуле
где р - риск прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии;
z - значение регрессионной функции, определяется по формуле
X1…Xn - уровень экспрессии мРНК генов или индекс соотношения уровня экспрессии генов;
b1…bn - регрессионные коэффициенты;
а-константа.
Примеры использования изобретения
Пример 1. В ходе исследования 225 образцов переходного эпителия цервикального канала женщин репродуктивного возраста без поражений эпителия шейки матки (n=45), с HSIL (n=55), LSIL (n=50), РШМ (n=19) и ВПЧ-носительством (n=56) был исследован весь спектр исследуемых генов.
В группе женщин с РШМ по сравнению с образцами контрольной группы была повышена экспрессия мРНК генов CDKN2A в 10,9 (р=1,7×10-5), MKI67 в 10,3 (1,6×10-8), BIRC5 в 4,4 (р=1,0×10-4), CCNB1 в 4,2 (р=1,0×10-4), AURKA в 2,6 (р=0,025) раза и снижена экспрессия мРНК генов PTEN в 1,4 (р=0,0014), ВАХ в 1,9 (р=0,016), BAG1 в 2 (р=0,0075), SCUBE в 2,5 (р=0,025), PTGS2 в 2,5 (р=2,5×10-4), BCL2 в 3,6 (р=2,2×10-4), ESR1 в 24,3 (р=3,2×10-4), PGR в 25,7 (р=3,2×10-5) раз (фиг. 1).
При сравнении образцов женщин контрольной группы и группы с РШМ путем статистического анализа (метод бинарной логистической регрессии) выбраны наиболее информативные маркеры неопластической транформации и предложен способ оценки риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии путем определения соотношения представленности транскриптов [MKI67]/[PGR] и [CDKN2A]/[BCL2].
Риск прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии определяли по формуле 1.
Уравнение регрессии имело вид
где [MKI67]/[PGR] - индекс соотношения уровней экспрессии мРНК генов MKI67 и PGR,
[CDKN2A]/[BCL2] - индекс соотношения уровней экспрессии мРНК генов CDKN2A и BCL2.
На основании полученной функции для каждого образца был рассчитан риск прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии по формуле 1. Для определения критического значения вероятности (точка cutoff) был выполнен ROC-анализ. Площадь под ROC-кривой составила AUC=0,975±0,025, р=2,4×10-9, что позволило оценить модель как отличную. Пороговое значение функции в точке cut-off составило 57%. Образцы, где рассчитанный риск был больше порогового значения, оценивались как имеющие риск прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии Чувствительность и специфичность предложенной модели в области порогового значения составила 94,7% и 100.
Результаты рассчитанных значений функции приведены на фиг. 2. Все пациентки контрольной группы были определены в свою группу. В группу высокого риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии эпителия шейки матки попали 29 женщин: 5 (8.9%) - из группы ВПЧ-носительства, 9 (18%) - из группы LSIL, 15 (27.3%) - из группы HSIL.
С точки зрения прогнозирования риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии для нас интерес представляли 5 пациенток из групп ВПЧ-носительства, 9 (18%) - из группы LSIL, в связи с чем они были обследованы в динамике через 6 и 12 месяцев. Обследование включало цитологическое исследование мазков с шейки матки, определение ВПЧ и расширенную кольпоскопию.
В группе ВПЧ-носительства с высоким риском прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии через 12 месяцев у всех пациенток ВПЧ сохранялся, т.е. наблюдалась персистенция ВПЧ с вирусной нагрузкой более 5 lg/100 тыс. клеток. Во всех случаях цитологический диагноз изменился на более неблагоприятный: ASCUS у 20%, LSIL - 80% (р<0,05), при кольпоскопии ухудшений не было ни в одном случае. Таким образом, молекулярно-генетические маркеры могут рассматриваться как ранние предикторы прогнозирования прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии.
В группе LSIL с высоким риском прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии через 12 месяцев ВПЧ выявлялся у всех пациенток, при цитологическом исследовании диагноз LSIL сохранился у 6 (66,6%), изменился на более неблагоприятный - HSIL у 3(33,3%) (р<0,05). Не нормальная кольпоскопическая картина (плотный АБЭ, грубая пунктация) была у 4 (44,4%).
У пациенток группы ВПЧ-носительства, которые не попали в группу высокого риска, элиминация ВПЧ произошла в 24 (54,5%) случаев и только в 20 (45,5%) случаях ВПЧ сохранялся, цитологические заключения были нормальными.
У пациенток группы LSIL, которые не попали в группу высокого риска, через 12 мес.диагноз LSIL сохранился у 16 (39%), у остальных 25 (61%) - цитологические заключения были нормальными. В 21 (51,2%) случаях ВПЧ был сохранен, у 1(2,4%) пациентки выявлен другой тип ВПЧ. В даннойгруппе элиминация ВПЧ произошла в 20 (50%) случаев. Согласно данным ряда исследователей ВПЧ элиминируется самостоятельно в среднем в течение 2,5 лет. По результатам цитологии и кольпоскопии ухудшения не было выявлено ни в одной из этих групп низкого риска.
Таким образом, только у пациенток группы риска наблюдалось развитие и прогрессирование цервикальной интраэпителиальной неоплазии.
Пример 2. Пациентка Б., 32 года. Первичный визит: обнаружен ВПЧ 33 типа, вирусная нагрузка 6,1 lg копий вируса в образце; цитологическое заключение LSIL; нормальная кольпоскопическая картина.
По данным клинико-лабораторных параметров риск прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии легкой степени, вычисленный в соответствии с формулами 1 и 3, по данным соотношения транскриптов [MKI67]/[PGR] и [CDKN2A]/[BCL2], был высоким и составил 98 баллов. В связи этим она была обследована в динамике через 6 и 12 месяцев. Обследование включало цитологическое исследование мазков с шейки матки, определение ВПЧ и расширенную кольпоскопию.
Через 6 и 12 мес у пациентки сохранялась персистенция ВПЧ с вирусной нагрузкой более 5 копий вируса в образце; цитологическое заключение через 12 мес изменилось на более неблагоприятное - HSIL, при расширенной кольпоскопии наблюдался плотный АБЭ с пунктацией исходящий из цервикального канала. Пациентке была произведена прицельная биопсия шейки матки, гистологически верифицирована цервикальная интраэпителиальная неоплазия шейки матки тяжелой степени. Пациентке была своевременно произведена конизация шейки матки, и таким образом, предотвращено развитие рака шейки матки.
Представленный клинический пример показывает, что у пациентки с высоким уровнем экспрессии мРНК генов MKI67, CDKN2A и выраженным снижением уровня экспрессии мРНК генов BCL2, PGR, был дан прогноз прогрессирования неопластического процесса шейки матки еще до развития клинических признаков. Таким образом, при уровнях интегрального критерия р выше порогового значения следует сокращать интервалы динамического наблюдения или отдавать предпочтение более доказательным методам диагностики - биопсии шейки матки с гистологическим исследованием материала, что способствует своевременному началу лечения и получению удовлетворительных результатов.
СПИСОК ЛИТЕРАТУРЫ
1. Baak JP, Mutter GL, Robboy S, van Diest PJ, Uyterlinde AM, Orbo A, Palazzo J, Fiane B, Løvslett K, Burger C, Voorhorst F, Verheijen RH. The molecular genetics and morphometry-based endometrial intraepithelial neoplasia classification system predicts disease progression in endometrial hyperplasia more accurately than the 1994 World Health Organization classification system. Cancer. 2005 Jun 1; 103 (11): 2304-12.
2. Clark TJ, Neelakantan D, Gupta JK. The management of endometrial hyperplasia: an evaluation of current practice. Eur J Obstet Gynecol Reprod Biol 2006; 125 (2): 259-64.
3. Espindola D, Kennedy KA, Fischer E.G. Management of Abnormal Uterine Bleeding and the Pathology of Endometrial Hyperplasia. Obstet Gynecol Clin N Am 2007; 34: 717-737.
4. Kimberly H. Allison, Elizabeth Tenpenny, Susan D. Reed, Elizabeth M. Swisher, Rochelle L. Garica. Immunohistochemical Markers in Endometrial Hyperplasia: Is There a Panel With Promise? A Review Appl Immunohistochem Mol Morphol Volume 16, Number 4, July 2008.
5. Steinbakk A, Gudlaugsson E, Aasprong OG, et al. Molecular biomarkers in endometrial hyperplasias predict cancer progression. Am J Obstet Gynecol 2011; 204.
6. James V. Lacey Jr., Victoria M. Chia, Endometrial hyperplasia and the risk of progression to carcinoma, Maturitas 63 (2009) 39-44.
7. Walboomers, J.M., et al., Human papillomavirus is a necessary cause of invasive cervical cancer worldwide. J Pathol, 1999. 189 (1): p. 12-9.
Описание фигур
Фиг. 1. Профиль представленности мРНК функциональных генов в мазках переходного эпителия цервикального канала женщин с РШМ относительно здорового контроля. По оси «х» перечислены гены. Значение медианы уровня экпрессии мРНК в контрольной группе принято за 1 о.е. По оси «у» отложено значение медианы уровня экспрессии мРНК в группе с РШМ (данная величина показывает во сколько раз количество мРНК выше, чем в контрольной группе). Столбцы, направленные вверх, свидетельствуют о повышении экспрессии, вниз - о понижении.
Фиг. 2. Экспериментально полученные значения функции для мазков цервикального канала женщин с РШМ, HSIL, LSIL, ВПЧ-носительством и здорового контроля. По оси «у» отложены значения функции, по оси «х» - группа исследования.
Claims (9)
- Способ оценки риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии, характеризующийся тем, что измеряют уровень экспрессии мРНК генов человека MKI67, CDKN2A, CCNB1, BIRC5, AURKA, ESR1, PGR, BCL2, ВАХ, BAG1, NDRG1, PTEN, CD68, SCUBE, PTGS2 в образцах из мест поражений и полученные в ходе реакции значения уровней мРНК подставляют в формулу
- ,
- где р - риск прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии;
- z - значение регрессионной функции, определяют по формуле
- z=b1*Х1+b2*Х2+…+bn*Xn+а,
- где X1…Xn - уровень экспрессии мРНК генов или индекс соотношения уровня экспрессии генов;
- b1…bn - регрессионные коэффициенты;
- а - константа;
- при этом если значение р менее или равно пороговому значению (р≤cut-off), делают заключение об отсутствии риска прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплази; если значение р>cut-off, делают заключение о высоком риске прогрессирования цервикальной интраэпителиальной неоплазии; пороговое значение определяют на основе экспериментальных данных с помощью ROC-анализа.
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2015103190A RU2660360C2 (ru) | 2015-02-02 | 2015-02-02 | СПОСОБ ОЦЕНКИ РИСКА ПРОГРЕССИРОВАНИЯ ИНТРАЭПИТЕЛИАЛЬНОЙ ЦЕРВИКАЛЬНОЙ НЕОПЛАЗИИ И РАЗВИТИЯ РАКА ШЕЙКИ МАТКИ НА ОСНОВЕ ОПРЕДЕЛЕНИЯ УРОВНЕЙ мРНК ГЕНОВ ЧЕЛОВЕКА |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2015103190A RU2660360C2 (ru) | 2015-02-02 | 2015-02-02 | СПОСОБ ОЦЕНКИ РИСКА ПРОГРЕССИРОВАНИЯ ИНТРАЭПИТЕЛИАЛЬНОЙ ЦЕРВИКАЛЬНОЙ НЕОПЛАЗИИ И РАЗВИТИЯ РАКА ШЕЙКИ МАТКИ НА ОСНОВЕ ОПРЕДЕЛЕНИЯ УРОВНЕЙ мРНК ГЕНОВ ЧЕЛОВЕКА |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2015103190A RU2015103190A (ru) | 2016-08-20 |
| RU2660360C2 true RU2660360C2 (ru) | 2018-07-05 |
Family
ID=56694704
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2015103190A RU2660360C2 (ru) | 2015-02-02 | 2015-02-02 | СПОСОБ ОЦЕНКИ РИСКА ПРОГРЕССИРОВАНИЯ ИНТРАЭПИТЕЛИАЛЬНОЙ ЦЕРВИКАЛЬНОЙ НЕОПЛАЗИИ И РАЗВИТИЯ РАКА ШЕЙКИ МАТКИ НА ОСНОВЕ ОПРЕДЕЛЕНИЯ УРОВНЕЙ мРНК ГЕНОВ ЧЕЛОВЕКА |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2660360C2 (ru) |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2719581C1 (ru) * | 2019-06-17 | 2020-04-21 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Томский национальный исследовательский медицинский центр" Российской академии наук ("Томский НИМЦ") | Способ прогнозирования риска рецидивирования у ВПЧ16-позитивных больных с плоскоклеточным интраэпителиальным поражением тяжелой степени на основе определения физического статуса вируса |
| RU2789500C1 (ru) * | 2022-07-05 | 2023-02-03 | федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр онкологии" Министерства здравоохранения Российской Федерации | Способ прогнозирования прогрессирования рака шейки матки у больных IIB стадии |
Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20090269768A1 (en) * | 2003-06-09 | 2009-10-29 | Vysis, Inc. | Detection of high grade dysplasia in cervical cells |
| RU2466390C2 (ru) * | 2011-02-15 | 2012-11-10 | Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации (ГОУ ВПО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздравсоцразвития России) | Способ прогнозирования развития рака тела матки при патологических процессах эндометрия у женщин репродуктивного возраста |
| RU2466392C2 (ru) * | 2011-02-15 | 2012-11-10 | Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации (ГОУ ВПО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздравсоцразвития России) | Способ прогнозирования рака шейки матки при доброкачественных и предраковых процессах шейки матки у женщин репродуктивного возраста |
| RU2532344C2 (ru) * | 2012-04-11 | 2014-11-10 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова" Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации | Способ диагностики гиперпролиферативных состояний и оценки риска развития рака шейки матки при цервикальной интраэпителиальной неоплазии и папилломавирусном носительстве на основе определения уровней мрнк функционального комплекса генов человека |
-
2015
- 2015-02-02 RU RU2015103190A patent/RU2660360C2/ru not_active IP Right Cessation
Patent Citations (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US20090269768A1 (en) * | 2003-06-09 | 2009-10-29 | Vysis, Inc. | Detection of high grade dysplasia in cervical cells |
| RU2466390C2 (ru) * | 2011-02-15 | 2012-11-10 | Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации (ГОУ ВПО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздравсоцразвития России) | Способ прогнозирования развития рака тела матки при патологических процессах эндометрия у женщин репродуктивного возраста |
| RU2466392C2 (ru) * | 2011-02-15 | 2012-11-10 | Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования Первый Московский государственный медицинский университет им. И.М. Сеченова Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации (ГОУ ВПО Первый МГМУ им. И.М. Сеченова Минздравсоцразвития России) | Способ прогнозирования рака шейки матки при доброкачественных и предраковых процессах шейки матки у женщин репродуктивного возраста |
| RU2532344C2 (ru) * | 2012-04-11 | 2014-11-10 | Федеральное государственное бюджетное учреждение "Научный центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова" Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации | Способ диагностики гиперпролиферативных состояний и оценки риска развития рака шейки матки при цервикальной интраэпителиальной неоплазии и папилломавирусном носительстве на основе определения уровней мрнк функционального комплекса генов человека |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| RU2719581C1 (ru) * | 2019-06-17 | 2020-04-21 | Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Томский национальный исследовательский медицинский центр" Российской академии наук ("Томский НИМЦ") | Способ прогнозирования риска рецидивирования у ВПЧ16-позитивных больных с плоскоклеточным интраэпителиальным поражением тяжелой степени на основе определения физического статуса вируса |
| RU2789500C1 (ru) * | 2022-07-05 | 2023-02-03 | федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр онкологии" Министерства здравоохранения Российской Федерации | Способ прогнозирования прогрессирования рака шейки матки у больных IIB стадии |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| RU2015103190A (ru) | 2016-08-20 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| DE69830927T2 (de) | Bewertung von humaner papillomvirus verwandter krankheit | |
| Kucera et al. | Is high-risk human papillomavirus infection associated with cervical intraepithelial neoplasia eliminated after conization by large-loop excision of the transformation zone? | |
| Zhu et al. | MiR-21-5p, miR-34a, and human telomerase RNA component as surrogate markers for cervical cancer progression | |
| Golob et al. | High HPV infection prevalence in men from infertile couples and lack of relationship between seminal HPV infection and sperm quality | |
| Liu et al. | Diagnostic validity of human papillomavirus E6/E7 mRNA test in cervical cytological samples | |
| Ueda et al. | Monoclonal expansion with integration of high-risk type human papillomaviruses is an initial step for cervical carcinogenesis: association of clonal status and human papillomavirus infection with clinical outcome in cervical intraepithelial neoplasia | |
| Abu-Lubad et al. | Human papillomavirus as an independent risk factor of invasive cervical and endometrial carcinomas in Jordan | |
| Michopoulou et al. | Detection of human papillomavirus (HPV) DNA prevalence and p53 codon 72 (Arg72Pro) polymorphism in prostate cancer in a Greek group of patients | |
| Resende et al. | A portrait of single and multiple HPV type infections in Brazilian women of different age strata with squamous or glandular cervical lesions | |
| Carolis et al. | Liquid biopsy in the diagnosis of HPV DNA in breast lesions | |
| Bhatla et al. | Human papillomavirus deoxyribonucleic acid testing in developed countries | |
| Ueda et al. | Fas gene promoter− 670 polymorphism (A/G) is associated with cervical carcinogenesis | |
| Mes et al. | Development and validation of a novel and rapid molecular detection method for high-risk human papillomavirus in formalin-fixed, paraffin-embedded tumor tissue | |
| Faja et al. | Molecular study of the presence and transcriptional activity of HPV in semen | |
| Abreu et al. | Human Papillomavirus E6/E7 mRNA detection by in situ hybridization in oral cavity squamous cell carcinoma | |
| RU2660360C2 (ru) | СПОСОБ ОЦЕНКИ РИСКА ПРОГРЕССИРОВАНИЯ ИНТРАЭПИТЕЛИАЛЬНОЙ ЦЕРВИКАЛЬНОЙ НЕОПЛАЗИИ И РАЗВИТИЯ РАКА ШЕЙКИ МАТКИ НА ОСНОВЕ ОПРЕДЕЛЕНИЯ УРОВНЕЙ мРНК ГЕНОВ ЧЕЛОВЕКА | |
| Giannella et al. | Age‐related changes in pre‐and post‐conization HPV genotype distribution among women with high‐grade cervical intraepithelial neoplasia | |
| Kim et al. | HPV E6/E7, hTERT, and Ki67 mRNA RT‐qPCR Assay for Detecting High‐Grade Cervical Lesion with Microscope Slides | |
| Stamatopoulos et al. | C hlamydia trachomatis in fallopian tubes of women undergoing laparoscopy for ectopic pregnancy | |
| Xi et al. | Human papillomavirus type 18 DNA load and 2-year cumulative diagnoses of cervical intraepithelial neoplasia grades 2–3 | |
| Veo et al. | Clinical characteristics of women diagnosed with carcinoma who tested positive for cervical and anal high-risk human papillomavirus DNA and E6 RNA | |
| Lu et al. | Detection of high‑risk human papillomavirus DNA in sentinel lymph nodes of patients with cervical cancer | |
| RU2719581C1 (ru) | Способ прогнозирования риска рецидивирования у ВПЧ16-позитивных больных с плоскоклеточным интраэпителиальным поражением тяжелой степени на основе определения физического статуса вируса | |
| Tisi et al. | Role of HPV DNA, HPV mRNA and cytology in the follow‐up of women treated for cervical dysplasia | |
| Zhao et al. | Comparison of the cervista HPV HR test and luminex XMAP technology for the diagnosis of cervical intraepithelial neoplasia |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| HZ9A | Changing address for correspondence with an applicant | ||
| HZ9A | Changing address for correspondence with an applicant | ||
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20180718 |