RU2657769C1 - Способ прогнозирования наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества на основании оценки транскрипционного профиля в кумулюсных клетках в программе экстракорпорального оплодотворения - Google Patents

Способ прогнозирования наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества на основании оценки транскрипционного профиля в кумулюсных клетках в программе экстракорпорального оплодотворения Download PDF

Info

Publication number
RU2657769C1
RU2657769C1 RU2017118943A RU2017118943A RU2657769C1 RU 2657769 C1 RU2657769 C1 RU 2657769C1 RU 2017118943 A RU2017118943 A RU 2017118943A RU 2017118943 A RU2017118943 A RU 2017118943A RU 2657769 C1 RU2657769 C1 RU 2657769C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
embryos
satisfactory
chromosomal abnormalities
poor quality
cumulus cells
Prior art date
Application number
RU2017118943A
Other languages
English (en)
Inventor
Наталья Александровна Сафонова
Андрей Евгеньевич Донников
Елена Анатольевна Калинина
Наталья Петровна Макарова
Ольга Владимировна Бурменская
Наталья Витальевна Долгушина
Виктория Константиновна Горшинова
Геннадий Тихонович Сухих
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова" Министерства здравоохранения Российской Федерации
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова" Министерства здравоохранения Российской Федерации filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение "Национальный медицинский исследовательский центр акушерства, гинекологии и перинатологии имени академика В.И. Кулакова" Министерства здравоохранения Российской Федерации
Priority to RU2017118943A priority Critical patent/RU2657769C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2657769C1 publication Critical patent/RU2657769C1/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6834—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
    • C12Q1/6837—Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase using probe arrays or probe chips
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/58—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
    • G01N33/582—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with fluorescent label
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B25/00—ICT specially adapted for hybridisation; ICT specially adapted for gene or protein expression
    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B40/00—ICT specially adapted for biostatistics; ICT specially adapted for bioinformatics-related machine learning or data mining, e.g. knowledge discovery or pattern finding

Abstract

Изобретение относится к области медицины и предназначено для прогнозирования наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества в программе экстракорпорального оплодотворения (ЭКО). На основании анализа уровня экспрессии мРНК гена PFKP в кумулюсных клетках определяют вероятность наличия анеуплоидий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества по формуле. При значениях р выше 0,5 прогнозируют наличие хромосомных аномалий в данной группе эмбрионов. Изобретение обеспечивает создание модели предсказания наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества на основании анализа транскрипционной активности в кумулюсных клетках у пациенток при лечении бесплодия в программе ЭКО. 1 табл., 3 пр.

Description

В последние годы в области методов лечения бесплодия были достигнуты большие успехи. Несмотря на постоянное совершенствование методик вспомогательных репродуктивных технологий (ВРТ), эффективность одной попытки экстракорпорального оплодотворения (ЭКО) не превышает 33%, а частота родов живым плодом - 24,8% [1]. Основным фактором, определяющим вероятность наступления клинической беременности и рождения живого здорового ребенка, является качество переносимых в полость матки эмбрионов [2].
В настоящее время выбор эмбрионов для переноса осуществляется, в основном, на основании морфологических критериев оценки качества. Несмотря на то, что в рутинной клинической практике морфологическая оценка качества эмбрионов является простым и неинванизивным методом, данный метод диагностики является субъективным и не позволяет оценить наличие хромосомных аномалий у переносимых эмбрионов, что, в свою очередь, снижает шансы наступления клинической беременности [3, 4, 5, 6].
На сегодняшний день стало возможным проведение предимплантационного генетического скрининга (ПГС) эмбрионов в циклах ЭКО. Данный метод позволяет диагностировать генетическую патологию эмбриона на этапе до переноса в полость матки [5]. И хотя перенос эуплоидного эмбриона не является 100% гарантией наступления клинической беременности, он существенно повышает ее шансы, вплоть до 70-75% [7].
Предимплантационный генетический скрининг в последние годы активно развивается, показания к его проведению постоянно расширяются, однако данное исследование является дорогостоящим, что приводит к ограничению его использования в широкой практике.
Таким образом, развитие точных малоинвазивных объективных методов оценки качества эмбрионов с высоким потенциалом к имплантации и отсутствием хромосомных аномалий является одним из наиболее важных направлений репродуктивной медицины [8].
Достаточно многообещающе выглядят исследования последнего десятилетия, показывающие возможность оценки качества ооцитов по состоянию окружающих его клеток, получаемых при выделении кумулюсооцитарного комплекса после пункции фолликула при лечении в программе ЭКО [9,10, 11].
Кумулюсные клетки находятся в непосредственной близости к ооциту и постоянно реагируют на изменения, происходящие в интра-фолликулярной среде, что обуславливает возможность получения информации о состоянии ооцита посредством обнаружения молекулярно-генетических изменений в кумулюсных клетках. Например, модели экспрессии определенных генов отражают процессы, происходящие в клетке в данный момент времени, в том числе и ответ клеток на различные воздействия окружающей среды. Таким образом, анализ экспрессии генов в кумулюсных клетках может выявить данные об условиях внутри фолликула и качестве полученных ооцитов, определяя их способность к дальнейшему созреванию, успешному оплодотворению и последующему эмбриональному развитию.
В связи с этим, нами было проведено ретроспективное исследование транскрипционной активности в кумулюсных клетках эмбрионов различного качества согласно морфологическим критериям оценки у пациенток, проходивших лечение бесплодия методом ЭКО/ИКСИ с последующим проведением предимплантационного генетического скрининга. Данное исследование позволило охарактеризовать взаимосвязь уровня экспрессии мРНК изучаемых генов в кумулюсных клетках с наличием хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества.
Результат изобретения - создание модели предсказания наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества на основании анализа транскрипционной активности в кумулюсных клетках у пациенток при лечении бесплодия в программе ЭКО.
После проведения трансвагинальной пункции под контролем стереомикроскопа Nikon клиническим эмбриологом осуществлялся просмотр аспирированной фолликулярной жидкости с целью идентификации ооциткумулюсных комплексов (ОКК). Стерильными иглами проводили отрезание клеток кумулюса от ОКК под контролем стереомикроскопа в культуральной чашке Петри с буферным раствором (COOК, Ирландия). Производили маркировку образцов кумулюсных клеток соответственно ооциту. Во избежание деградации РНК взятие материала (кумулюсные клетки) осуществляли в пробирки с раствором гуанидинтиоционата (лизирующий раствор наборы "Проба НК"), помещали в холодильную камеру на -20°С, а затем отдавали генетику на анализ.
На 5-е сутки культивирования эмбрионам проводилась биопсия клеток трофэктодермы, материал отправляли в лабораторию молекулярно-генетических методов для анализа хромосомных нарушений методом сравнительной геномной гибридизации. После проведения биопсии все эмбрионы витрифицировались.
Сравнительная геномная гибридизация (CGH) генетического материала эмбриона проводилась с использованием оборудования фирмы Agilent (США). Полногеномную амплификацию ДНК исследуемых клеток проводили с помощью набора для проведения WGA-PCR PicoPlex SingleCell WGA Kit (Rubicon Genomics,CШA) и набора для проведения MDA GenetiSure Pre-Screen Amplification and Labeling Kit (Agilent,CШA). Качество и количество полученной в ходе амплификации ДНК контролировали с помощью 1,2% агарозного электрофореза. Мечение ампликонов проводили с помощью набора SureTag DNA labeling Kit Agilent (США) согласно прилагаемой инструкции. Мечение ампликоны наносили на биочип Sure Print G3 8×60 aCGH Agilent (США), гибридизировали 16 часов, после чего проводили отмывку и сканирование на сканере биологических чипов SureScan Microarray Scanner. Интерпретацию полученных результатов проводили с помощью программного продукта Agilent CytoGenomics.
После получения результатов предимплантационного генетического скрининга проводился анализ транскрипционного профиля в кумулюсных клетках. Осаждение РНК проводили изопропанолом в присутствии соосадителя, с последующими отмывками промывочными растворами. В реакции обратной транскрипции использовали смесь специфических олигонуклеотидов всех исследуемых генов. Амплификацию осуществляли в режиме реального времени с измерением уровня флуоресценции по каналу FAM на каждом цикле при температуре отжига праймеров. Реализация «горячего старта» обеспечивалась использованием Taq-полимеразы, активность которой блокировалась антителами и восстанавливалась при прогреве. Реакцию ставили в двух повторах для каждой точки. Уровень экспрессии измеряли в относительных единицах (о.е.) относительно референсных генов ТВР, В2М, GUSB методом сравнения пороговых циклов (ΔCq).
С помощью бинарной логистической регрессии возможно рассчитать вероятность наступления события (в данном случае наличие хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества) в зависимости от значений независимой переменной (уровня экспрессии мРНК гена PFKP).
Вероятность наступления события (вероятность наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества) (р) рассчитывается по формуле, имеющий общий вид:
p=exp(logit)/(1+exp(logit)
где р - искомая вероятность наступления события.
При значениях р менее 0,5 можно предположить, что измеряемое событие не наступит; в противном случае предполагается наступление события.
Согласно результатам логистической регрессии построено уравнение для предсказания вероятности наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества:
logit=-2,59+0,48*PFKP
где PFKP - уровень экспрессии мРНК гена PFKP.
Построенная модель является статистически значимой (χ2=6,99, р=0,008).
Средняя точность прогнозирования вероятности наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества составляет 84,3%, ОШ равно 29,3.
Таким образом, можно оценить вероятность наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества в программе ЭКО на основании оценки транскрипционного профиля в кумулюсных клетках (уровня экспрессии мРНК гена PFKP).
Таблица 1.
Классификация предсказания наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества в программе ЭКО/ИКСИ
Figure 00000001
Пример
I. Прогнозирование наличия хромосомных аномалий в эмбрионах провели у пациентки М. 32 лет с трубным фактором бесплодия, обратившейся для проведения программы ЭКО/ИКСИ + ПГС. В анамнезе 3 беременности, две из которых - внематочные, в связи с чем в 2009 и 2011 гг пациентке были выполнены операции в объеме лапароскопии, левосторонней и правосторонней тубэктомии, соответственно. Третья беременность наступила в результате программы ЭКО и ПЭ, завершилась самопроизвольным выкидышем в сроке 8 недель. Кариотип абортуса - мозаичная форма трисомии по хромосоме 13. Данная попытка ЭКО вторая.
Отрезание клеток кумулюса от ОКК проводили после трансвагинальной пункции стерильными иглами под контролем стереомикроскопа в культуральной чашке Петри с буферным раствором.
На 5-е сутки культивирования эмбрионам проводилась биопсия клеток трофэктодермы, материал отправляли в лабораторию молекулярно-генетических методов для анализа хромосомных нарушений методом сравнительной геномной гибридизации.
Анализ транскрипционного профиля в кумулюсных клетках проводился после получения результатов ПГС.
Результат проведенного исследования у пациентки М:
Уровень экспрессии мРНК гена PFKP - 8,77 о.е.
Вероятность (р) наличия хромосомных аномалий у исследуемого эмбриона рассчитывали по вышеописанной формуле:
logit=2,59-0,48* PFKP=2,59-0,48* 8,77=1,62
p=exp(logit)/(1+exp(logit)=0,15
Рассчитанная вероятность р указывает на низкую вероятность наличия хромосомных аномалий у исследуемого эмбриона.
Результат проведения предимплантационного генетического скрининга - N, XX (нормальный женский кариотип).
II. Прогнозирование наличия хромосомных аномалий в эмбрионах провели у пациентки Г. 37 лет с трубно-перитонеальным фактором бесплодия, обратившейся для проведения программы ЭКО/ИКСИ + ПГС. В анамнезе 2 беременности, одна из которых завершилась самопроизвольным выкидышем на малом сроке, вторая - правосторонняя внематочная беременность, в связи с чем пациентке в 2012 году была проведена лапароскопия, правосторонняя тубэктомия. Показанием к проведению предимплантационного генетического скрининга послужил старший репродуктивный возраст супругов (Муж, 42 лет, спермограмма-нормозооспермия). Данная попытка ЭКО первая.
Отрезание клеток кумулюса от ОКК проводили после трансвагинальной пункции стерильными иглами под контролем стереомикроскопа в культуральной чашке Петри с буферным раствором.
На 5-е сутки культивирования эмбрионам проводилась биопсия клеток трофэктодермы, материал отправляли в лабораторию молекулярно-генетических методов для анализа хромосомных нарушений методом сравнительной геномной гибридизации.
Анализ транскрипционного профиля в кумулюсных клетках проводился после получения результатов ПГС.
Результат проведенного исследования у пациентки Г:
Уровень экспрессии мРНК гена PFKP - 0,19 о.е.
Вероятность (р) наличия хромосомных аномалий у исследуемого эмбриона рассчитывали по вышеописанной формуле:
logit=2,59-0,48* PFKP=2,59-0,48* 0,19=2,5
p=exp(logit)/(1+exp(logit)=0,92
Рассчитанная вероятность р указывает на возможность того, что истинное значение результативного показателя попадет в расчетный прогнозируемый исход, в данном случае - на наличие анеуплоидий у исследуемого эмбриона.
Результат проведения предимплантационного генетического скрининга - гетероплоидный эмбрион.
III. Прогнозирование наличия хромосомных аномалий в эмбрионах провели у пациентки Ш. 25 лет с мужским фактором бесплодия, обратившейся для проведения программы ЭКО/ИКСИ + ПГС. Муж, 63 лет, спермограмма: олигоастенотератозооспермия. В анамнезе 3 неудачные попытки ЭКО. Беременности, гинекологические заболевания и оперативные вмешательства на органах малого таза отрицает. Показанием к проведению предимплантационного генетического скрининга послужили множественные неудачные попытки ЭКО в анамнезе и старший репродуктивный возраст супруга. Данная попытка ЭКО четвертая.
Отрезание клеток кумулюса от ОКК проводили после трансвагинальной пункции стерильными иглами под контролем стереомикроскопа в культуральной чашке Петри с буферным раствором.
На 5-е сутки культивирования эмбрионам проводилась биопсия клеток трофэктодермы, материал отправляли в лабораторию молекулярно-генетических методов для анализа хромосомных нарушений методом сравнительной геномной гибридизации.
Анализ транскрипционного профиля в кумулюсных клетках проводился после получения результатов ПГС.
Результат проведенного исследования у пациентки Г:
Уровень экспрессии мРНК гена PFKP - 0,95 о.е.
Вероятность (р) наличия хромосомных аномалий у исследуемого эмбриона рассчитывали по вышеописанной формуле:
logit=2,59-0,48* PFKP=2,59-0,48* 0,95=2,13
p=exp(logit)/(1+exp(logit)=0,89.
Рассчитанная вероятность р указывает на высокую вероятность наличия хромосомных аномалий у исследуемого эмбриона.
Результат проведения предимплантационного генетического скрининга - -17, XX (анеуплоидный эмбрион).
Согласно полученным данным прогноз оценки вероятности наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества при проведении программ ЭКО/ИКСИ + ПГС носит достоверный характер. Следовательно, способ прогнозирования наличия анеуплоидий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества с использованием оценки транскрипционного профиля в кумулюсных клетках может быть использован в клинико-лабораторной практике с целью минимизации экономических затрат в процессе лечения в программе ЭКО.
Список использованной литературы
1) Lifestyle factors and reproductive health: taking control of your fertility / R. Sharma [et al.] // Reprod Biol Endocrinol. - 2013. - Vol. 16, №11. - p. 66.
2) Краснощока, O.E. Возможности неинвазивной оценки состояния ооцита и эмбриона при проведении программ ВРТ по профилю экспрессии мРНК факторов роста в фолликулярной жидкости / О.Е. Краснощока, В.Ю. Смольникова, Е.А. Калинина // Журнал Акушерство и Гинекология. - 2014. - №9. - С. 36-43.
3) Correlation between aneuploidy, standard morphology evaluation and morphokinetic development in 1730 biopsied blastocysts: a consecutive case series study / M.G. Minasi [et al.] // Hum Reprod. - 2016. - Vol. 31, №10. - C. 2245-2254.
4) Morphokinetic analysis of cleavage stage embryos and its relationship to aneuploidy in a retrospective time-lapse imaging study / M. Chawla [et al.] // J Assist Reprod Genet. - 2015. - Vol. 32, №1. - C. 69-75.
5) ESHRE PGD consortium best practice guidelines for organization of a PGD centre for PGD/preimplantation genetic screening. / G. Harton [et al.] // Hum. Reprod. - 2011. - Vol. 26, №1. - P. 14-24.
6) Effect of infertility, maternal age, and number of previous miscarriages on the outcome of preimplantation genetic diagnosis for idiopathic recurrent pregnancy loss. / J.G. Garrisi [et al.] // Fertil. Steril. - 2009. - Vol. 92, №1. -P. 288-295.
7) Blastocyst biopsy with comprehensive chromosome screening and fresh embryo transfer significantly increases in vitro fertilization implantation and delivery rates: A randomized controlled trial / R.T. Scott [et al.] // Fertil. Steril. - 2013. - Vol. 100, №3. - P. 697-703.
8) Transcriptomic Analysis and Meta-Analysis of Human Granulosa and Cumulus Cells. / T. Burnik-Papler [et al.] // PLoS One. - 2015. - Vol. 10, №8. - P. e0136473.
9) Human cumulus cell gene expression as a biomarker of pregnancy outcome after single embryo transfer. / K.M. Gebhardt [et al.] // Fertil. Steril. - 2011. -Vol. 96, №l. - P. 47-52.
10) Specific gene expression differences in cumulus cells as potential biomarkers of pregnancy. / T. Burnik-Papler [et al.] // Reprod. Biomed. Online. - 2015. - Vol. 30, №4. - P. 426-433.
11) Alteration of gene expression in human cumulus cells as a potential indicator of oocyte aneuploidy. / E. Fragouli [et al.] // Hum. Reprod. - 2012. - Vol. 27, №8. - P. 2559-2568.

Claims (5)

  1. Способ прогнозирования наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества на основании оценки транскрипционного профиля в кумулюсных клетках в программе экстракорпорального оплодотворения, характеризующийся тем, что на основании анализа уровня экспрессии мРНК гена PFKP в кумулюсных клетках определяют вероятность наличия анеуплоидий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества по формуле:
  2. p=exp(logit)/(1+exp(logit),
  3. где logit=-2,59+0,48*PFKP,
  4. где PFKP - уровень экспрессии мРНК гена PFKP;
  5. р - искомая вероятность наличия анеуплоидий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества, и при значениях р выше 0,5 прогнозируют наличие хромосомных аномалий в данной группе эмбрионов.
RU2017118943A 2017-05-31 2017-05-31 Способ прогнозирования наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества на основании оценки транскрипционного профиля в кумулюсных клетках в программе экстракорпорального оплодотворения RU2657769C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2017118943A RU2657769C1 (ru) 2017-05-31 2017-05-31 Способ прогнозирования наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества на основании оценки транскрипционного профиля в кумулюсных клетках в программе экстракорпорального оплодотворения

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2017118943A RU2657769C1 (ru) 2017-05-31 2017-05-31 Способ прогнозирования наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества на основании оценки транскрипционного профиля в кумулюсных клетках в программе экстракорпорального оплодотворения

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2657769C1 true RU2657769C1 (ru) 2018-06-15

Family

ID=62620460

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017118943A RU2657769C1 (ru) 2017-05-31 2017-05-31 Способ прогнозирования наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества на основании оценки транскрипционного профиля в кумулюсных клетках в программе экстракорпорального оплодотворения

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2657769C1 (ru)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110363218A (zh) * 2019-06-06 2019-10-22 张孝东 一种胚胎无创评估方法及装置

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2012108920A1 (en) * 2011-02-09 2012-08-16 Natera, Inc Methods for non-invasive prenatal ploidy calling

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2012108920A1 (en) * 2011-02-09 2012-08-16 Natera, Inc Methods for non-invasive prenatal ploidy calling

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
FRAGOULI E. et al. The transcriptome of follicular cells: biological insights and clinical implications for the treatment of infertility. Hum Reprod Update. 2014 Jan-Feb; 20(1): 1-11. Epub 2013 Sep 29. *
FRAGOULI E. et al. The transcriptome of follicular cells: biological insights and clinical implications for the treatment of infertility. Hum Reprod Update. 2014 Jan-Feb; 20(1): 1-11. Epub 2013 Sep 29. КРАСНОЩОКА O.E. и др. Возможности неинвазивной оценки состояния ооцита и эмбриона при проведении программ ВРТ по профилю экспрессии мРНК факторов роста в фолликулярной жидкости. Акушерство и Гинекология. 2014; 9: 36-43. *
КРАСНОЩОКА O.E. и др. Возможности неинвазивной оценки состояния ооцита и эмбриона при проведении программ ВРТ по профилю экспрессии мРНК факторов роста в фолликулярной жидкости. Акушерство и Гинекология. 2014; 9: 36-43. *

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN110363218A (zh) * 2019-06-06 2019-10-22 张孝东 一种胚胎无创评估方法及装置
CN110363218B (zh) * 2019-06-06 2023-07-11 张孝东 一种胚胎无创评估方法及装置

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Ho et al. Pushing the limits of detection: investigation of cell-free DNA for aneuploidy screening in embryos
Rubio et al. Embryonic cell-free DNA versus trophectoderm biopsy for aneuploidy testing: concordance rate and clinical implications
Liu et al. Endometrial microbiota in infertile women with and without chronic endometritis as diagnosed using a quantitative and reference range-based method
Moreno et al. Evidence that the endometrial microbiota has an effect on implantation success or failure
Rodrigo et al. New tools for embryo selection: comprehensive chromosome screening by array comparative genomic hybridization
Galliano et al. MicroRNA and implantation
EP2678675B1 (en) Methods of detecting aneuploidy in human embryos
ES2796224T3 (es) Evaluación de embriones previa a la implantación a través de la detección de ADN embrionario libre
Bradley et al. Clinical use of monopronucleated zygotes following blastocyst culture and preimplantation genetic screening, including verification of biparental chromosome inheritance
CN109504784B (zh) 用于预测人辅助生殖技术中早期胚胎质量的miRNA分子标志及其应用
Kimelman et al. Non-invasive prenatal testing in the context of IVF and PGT-A
Shitara et al. Cell-free DNA in spent culture medium effectively reflects the chromosomal status of embryos following culturing beyond implantation compared to trophectoderm biopsy
Chen et al. Successful application of the strategy of blastocyst biopsy, vitrification, whole genome amplification, and thawed embryo transfer for preimplantation genetic diagnosis of neurofibromatosis type 1
RU2657769C1 (ru) Способ прогнозирования наличия хромосомных аномалий в эмбрионах удовлетворительного и плохого качества на основании оценки транскрипционного профиля в кумулюсных клетках в программе экстракорпорального оплодотворения
RU2550965C1 (ru) Способ прогнозирования наступления беременности в программе экстракорпорального оплодотворения при селективном переносе эмбрионов путем оценки молекулярно-генетического профиля гамет с помощью пцр-рв
Martinhago et al. Accuracy of fetal gender determination in maternal plasma at 5 and 6 weeks of pregnancy
Mutia et al. microRNAs as a biomarker to predict embryo quality assessment in in vitro fertilization
Debrock et al. Preimplantation genetic screening (PGS) for aneuploidy in embryos after in vitro fertilization (IVF) does not improve reproductive outcome in women over 35: a prospective controlled randomized study
Wang et al. Preimplantation genetic screening: an effective testing for infertile and repeated miscarriage patients?
Mortimer et al. Preimplantation Genetic Testing for Aneuploidy: Has the Controversy Settled? A Review
US20110124511A1 (en) Gene Expression Profile-Facilitated In Vitro Fertilization
Esmaeili et al. Noninvasive sexing of human preimplantation embryos using RT-PCR in the spent culture media: a proof-of-concept study
Kearns et al. Comprehensive genetic analyses using a modified whole genome amplification protocol and microarrays to identify genetic disorders and determine embryo implantation from single cells
CN113755571B (zh) 用于胚胎着床成功率检测的生物标志物及应用
Adinolfi et al. Prenatal diagnosis of genetic disorders in preimplantation embryos: invasive and non-invasive approaches

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20190601

NF4A Reinstatement of patent

Effective date: 20220120