RU2651488C2 - Pis s 3 pea allergen for diagnostics and therapy of food allergy and method of its release from natural raw materials - Google Patents

Pis s 3 pea allergen for diagnostics and therapy of food allergy and method of its release from natural raw materials Download PDF

Info

Publication number
RU2651488C2
RU2651488C2 RU2016129502A RU2016129502A RU2651488C2 RU 2651488 C2 RU2651488 C2 RU 2651488C2 RU 2016129502 A RU2016129502 A RU 2016129502A RU 2016129502 A RU2016129502 A RU 2016129502A RU 2651488 C2 RU2651488 C2 RU 2651488C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
pea
allergen
pis
polypeptide
seq
Prior art date
Application number
RU2016129502A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2016129502A (en
Inventor
Иван Владимирович Богданов
Екатерина Ивановна Финкина
Дарья Николаевна Мельникова
Татьяна Владимировна Овчинникова
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение науки институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН) filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение науки институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН)
Priority to RU2016129502A priority Critical patent/RU2651488C2/en
Publication of RU2016129502A publication Critical patent/RU2016129502A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2651488C2 publication Critical patent/RU2651488C2/en

Links

Images

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/35Allergens

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Coloring Foods And Improving Nutritive Qualities (AREA)

Abstract

FIELD: biotechnology.
SUBSTANCE: invention is the Pis s 3 pea allergen - a polypeptide having the amino acid sequence of SEQ ID No. 1 or a sequence which is 80% identical to the sequence of SEQ ID No. 1. Pis s 3 pea allergen - a polypeptide having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 can be isolated from pea and obtained by chemical synthesis or recombinant DNA technology. Method for isolating a polypeptide from a natural raw material according to par. 1, involves homogenizing the pea seeds and extracting the polypeptide from the pea seeds with a buffer solution, clarification of the extract obtained by centrifugation, heat treatment of the extract, dialysis, sequential ultrafiltration, cation exchange and high performance liquid chromatography with the release of Pis s 3 pea allergen - a polypeptide having the amino acid sequence of SEQ ID No. 1.
EFFECT: Pis s 3 pea allergen is used for the diagnosis of IgE-mediated food allergy on peas and for the treatment of IgE-mediated food allergy on peas, including for allergen-specific immunotherapy, namely to the identification of a new food allergen, namely to the Pis s 3 pea allergen.
5 cl, 7 dwg, 4 ex

Description

Область техники, к которой относится изобретениеFIELD OF THE INVENTION

Настоящее изобретение относится к области аллергологии, а именно к идентификации нового пищевого аллергена, способу его получения из природного сырья и использования для диагностики пищевой аллергии и терапии аллергических заболеваний.The present invention relates to the field of allergology, in particular to the identification of a new food allergen, a method for its production from natural raw materials and use for the diagnosis of food allergies and the treatment of allergic diseases.

Уровень техникиState of the art

Для проведения аллергодиагностики традиционно используются суммарные аллергенные экстракты, часто дающие ложные и плохо воспроизводимые результаты. Причиной этого является сложность стандартизации суммарных экстрактов, вариабельность их состава и изменение содержания в них различных белков и небелковых компонентов, способных вызывать аллергическую реакцию. Нередко мажорный аллерген присутствует в экстракте лишь в небольших количествах, и его биологическая активность сильно зависит от других компонентов экстракта. Кроме того, аллергодиагностика с использованием суммарных экстрактов не позволяет выявить индивидуальные аллергены, вызывающие развитие аллергических реакций. Существенную проблему при серологической диагностике аллергии представляют также перекрестные аллергические реакции.For allergy diagnostics, total allergenic extracts are often used, often giving false and poorly reproducible results. The reason for this is the difficulty in standardizing the total extracts, the variability of their composition and the change in their content of various proteins and non-protein components that can cause an allergic reaction. Often, a major allergen is present in the extract only in small quantities, and its biological activity is highly dependent on other components of the extract. In addition, allergic diagnostics using total extracts does not allow to identify individual allergens that cause the development of allergic reactions. Cross-allergic reactions are also a significant problem in the serological diagnosis of allergies.

Современным направлением развития аллергодиагностики является замена суммарных экстрактов индивидуальными аллергенами, хорошо охарактеризованными как биохимически, так и иммунологически. Индивидуальные аллергены могут быть использованы для составления молекулярного профиля чувствительности пациента, изучения перекрестной реактивности, а также для проведения безопасной и эффективной аллерген-специфической иммунотерапии (АСИТ). Использование индивидуальных аллергенов снижает риск возникновения перекрестных аллергических реакций.A modern direction in the development of allergic diagnostics is the replacement of total extracts with individual allergens that are well characterized both biochemically and immunologically. Individual allergens can be used to compile the molecular profile of patient sensitivity, study cross-reactivity, and to conduct safe and effective allergen-specific immunotherapy (ASIT). The use of individual allergens reduces the risk of cross-allergic reactions.

Горох Pisum sativum - основная зернобобовая продовольственная культура, используемая также в виде фуражного зерна, зеленого корма для сельскохозяйственных животных, силоса и сена. Широкое распространение гороха обусловлено высоким содержанием белка в зерне (в среднем 20-27%), сбалансированностью его аминокислотного состава, отличными вкусовыми качествами и хорошей урожайностью в зонах возделывания. Однако массовое пищевое применение гороха ограничено его сравнительно высокой аллергизирующей способностью. В настоящее время идентифицировано и охарактеризовано всего два аллергена (вицилин и конвицилин) данной продовольственной культуры, являющихся фрагментами одного белка-предшественника, которые занесены в международную базу данных по аллергенам Международного союза иммунологических обществ (WHO/IUIS) (www.allergen.org) [Sanchez-Monge R.,

Figure 00000001
G., Pascual C.Y., Varela J., Martin-Esteban M., Salcedo G. Vicilin and convicilin are potential major allergens from pea // Clin. Exp. Allergy. - 2004. - Vol. 34 (11). - P. 1747-1753]. Однако данные аллергены являются источниками развития аллергических реакций лишь у части пациентов с пищевой аллергией на горох. Для разработки универсальной тест-системы для компонентной аллергодиагностики нового поколения и последующего лечения аллергии, опосредованной антителами класса IgE, необходимо использование всей панели аллергенов данной продовольственной культуры. Настоящее изобретение решает задачу расширения ассортимента аллергенных белков, предназначенных, главным образом, для применения в диагностике и терапии аллергии за счет выделения и характеристики нового пищевого аллергена гороха посевного.Pea Pisum sativum is the main leguminous food crop, also used as feed grain, green feed for farm animals, silage and hay. The wide distribution of peas is due to the high protein content in the grain (an average of 20-27%), the balance of its amino acid composition, excellent taste and good yield in cultivated areas. However, the massive nutritional use of peas is limited by its relatively high allergenic ability. Currently, only two allergens (vicilin and convicillin) of this food crop have been identified and characterized, which are fragments of a single precursor protein that are listed in the international allergen database of the International Union of Immunological Societies (WHO / IUIS) (www.allergen.org) [ Sanchez-Monge R.,
Figure 00000001
G., Pascual CY, Varela J., Martin-Esteban M., Salcedo G. Vicilin and convicilin are potential major allergens from pea // Clin. Exp. Allergy. - 2004. - Vol. 34 (11). - P. 1747-1753]. However, these allergens are sources of the development of allergic reactions in only a part of patients with food allergies to peas. In order to develop a universal test system for component allergy diagnostics of a new generation and subsequent treatment of allergies mediated by IgE antibodies, it is necessary to use the entire panel of allergens of this food culture. The present invention solves the problem of expanding the range of allergenic proteins, intended mainly for use in the diagnosis and treatment of allergies due to the isolation and characterization of a new food allergen of pea.

Сущность изобретенияSUMMARY OF THE INVENTION

Настоящее изобретение по сравнению с предшествующим уровнем техники, по меньшей мере, частично удовлетворяет потребность в расширении ассортимента известных пищевых аллергенов, так как касается нового аллергена гороха для применения в диагностике и лечении IgE-опосредованной аллергии у людей, а также способа его выделения из природного сырья.The present invention, compared with the prior art, at least partially satisfies the need to expand the range of known food allergens, as it relates to a new pea allergen for use in the diagnosis and treatment of IgE-mediated allergies in humans, as well as a method for its isolation from natural raw materials .

В первом аспекте изобретение относится к полипептиду, представляющему собой новый пищевой аллерген Pis s 3 гороха, а также к его фрагментам или аналогам, имеющим эпитопы, распознаваемые антителами на этот пищевой аллерген. Аллерген Pis s 3 представляет собой полипептид, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID No. 1.In a first aspect, the invention relates to a polypeptide representing a new food allergen Pis s 3 of peas, as well as fragments or analogs thereof having epitopes recognized by antibodies to this food allergen. The Pis s 3 allergen is a polypeptide containing the amino acid sequence of SEQ ID No. one.

Во втором аспекте изобретение относится к способу выделения полипептида, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID No. 1, из природного сырья, включающему гомогенизацию семян гороха и экстракцию полипептида из семян гороха буферным раствором, осветление полученного экстракта центрифугированием, термическую обработку экстракта, диализ, последовательную ультрафильтрацию, катионообменную и высокоэффективную жидкостную хроматографии.In a second aspect, the invention relates to a method for isolating a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID No. 1, from natural raw materials, including homogenization of pea seeds and extraction of the polypeptide from pea seeds with a buffer solution, clarification of the obtained extract by centrifugation, heat treatment of the extract, dialysis, sequential ultrafiltration, cation exchange and high performance liquid chromatography.

В третьем аспекте изобретение относится к полипептиду, обладающему идентичностью с SEQ ID No. 1 либо антигенными детерминантами, присущими SEQ ID No. 1, для применения в терапии или диагностике, предпочтительно в терапии или диагностике IgE-опосредованной аллергии, такой как пищевая аллергия на горох.In a third aspect, the invention relates to a polypeptide having identity with SEQ ID No. 1 or antigenic determinants inherent in SEQ ID No. 1, for use in therapy or diagnosis, preferably in therapy or diagnosis of an IgE-mediated allergy, such as pea food allergy.

В еще одном аспекте изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей полипептид, обладающий идентичностью с SEQ ID No. 1 либо антигенными детерминантами, присущими SEQ ID No. 1, или к его гипоаллергенной форме, модифицированной для того, чтобы отменить или ослабить связывание с IgE-антителами. Гипоаллергенная форма полипептида, обладающего идентичностью с SEQ ID No. 1 либо антигенными детерминантами, присущими SEQ ID No. 1, может быть получена посредством фрагментации, укорочения молекулы или делеции ее внутренних участков, перестановки доменов, замены аминокислотных остатков, разрушения дисульфидных мостиков, образования олигомерных и гибридных молекул и др.In yet another aspect, the invention relates to a pharmaceutical composition comprising a polypeptide having identity with SEQ ID No. 1 or antigenic determinants inherent in SEQ ID No. 1, or its hypoallergenic form, modified in order to cancel or weaken binding to IgE antibodies. Hypoallergenic form of a polypeptide that is identical with SEQ ID No. 1 or antigenic determinants inherent in SEQ ID No. 1, can be obtained by fragmentation, shortening of a molecule or deletion of its internal regions, rearrangement of domains, replacement of amino acid residues, destruction of disulfide bridges, formation of oligomeric and hybrid molecules, etc.

Изобретение, кроме того, относится к способу in vitro диагностики аллергии, опосредованной антителами класса IgE, включающему стадии анализа образца физиологической жидкости, например крови, плазмы или сыворотки человека, у которого предполагается наличие IgE-опосредованной аллергии, такой как пищевая аллергия на горох, путем контакта с полипептидом, обладающим идентичностью с SEQ ID No. 1 либо антигенными детерминантами, присущими SEQ ID No. 1, и выявления присутствия в образце IgE-антител, которые специфично связываются с полипептидом, его фрагментами или аналогами, защищаемыми формулой изобретения. Присутствие таких антител, специфично связывающихся с полипептидом, его фрагментами или аналогами, обладающим идентичностью с SEQ ID No. 1 либо антигенными детерминантами, присущими SEQ ID No. 1, является показателем IgE-опосредованной аллергии.The invention further relates to an in vitro method for diagnosing an allergy mediated by IgE antibodies, comprising the steps of analyzing a sample of a physiological fluid, for example, blood, plasma or human serum, which is suspected of having an IgE-mediated allergy, such as pea food allergy, by contact with a polypeptide having identity with SEQ ID No. 1 or antigenic determinants inherent in SEQ ID No. 1, and detecting the presence in the sample of IgE antibodies that specifically bind to the polypeptide, its fragments or analogs protected by the claims. The presence of such antibodies that specifically bind to the polypeptide, its fragments or analogs, which are identical with SEQ ID No. 1 or antigenic determinants inherent in SEQ ID No. 1 is an indicator of IgE-mediated allergy.

В следующем аспекте изобретение относится к способу лечения IgE-опосредованной аллергии у человека, такой как пищевая аллергия на горох. В одном варианте способ включает введение пациенту, чувствительному к такому лечению, полипептида, обладающего идентичностью с SEQ ID No. 1, либо его фрагмента, или аналога, обладающего антигенными детерминантами, присущими SEQ ID No. 1 Другой вариант способа лечения включает введение пациенту, чувствительному к такому лечению, фармацевтической композиции согласно одному из предыдущих аспектов.In a further aspect, the invention relates to a method for treating an IgE-mediated allergy in humans, such as a pea food allergy. In one embodiment, the method comprises administering to a patient sensitive to such treatment a polypeptide identical with SEQ ID No. 1, or a fragment thereof, or an analogue having antigenic determinants inherent in SEQ ID No. 1 Another embodiment of a treatment method comprises administering to a patient sensitive to such treatment a pharmaceutical composition according to one of the preceding aspects.

ОпределенияDefinitions

Следует считать, что аналоги и фрагменты полипептида, защищенного формулой изобретения, означают белки или пептиды разной длины, идентичные по аминокислотной последовательности с указанным полипептидом, или гомологичные ему по меньшей мере на 80%, а в случае укороченных вариантов по меньшей мере на 80% совпадающие по первичной структуре с соответствующими фрагментами пептида с последовательностью SEQ ID No. 1.It should be considered that the analogues and fragments of the polypeptide protected by the claims mean proteins or peptides of different lengths, identical in amino acid sequence with the specified polypeptide, or homologous to it by at least 80%, and in the case of shortened variants, by at least 80% matching on the primary structure with the corresponding fragments of the peptide with the sequence SEQ ID No. one.

Модифицированный аналог полипептида в контексте настоящего изобретения следует толковать как полипептид, который был химически или генетически модифицирован для того, чтобы изменить его иммунологические свойства, например, чтобы отменить или ослабить связывание с IgE-антителами.A modified analog of a polypeptide in the context of the present invention should be construed as a polypeptide that has been chemically or genetically modified in order to change its immunological properties, for example, to cancel or weaken binding to IgE antibodies.

Аналоги или фрагменты полипептида, имеющие общие с указанным полипептидом эпитопы, распознаваемые антителами на этот пищевой аллерген, следует толковать как такие фрагменты и аналоги, связывание которых с IgE-антителами из образца сыворотки пациента, сенсибилизированного пищевыми аллергенами гороха, может быть в значительной степени ингибировано полипептидом с последовательностью SEQ ID No. 1.Analogs or fragments of a polypeptide that have epitopes common to the polypeptide recognized by antibodies to this food allergen should be interpreted as fragments and analogues whose binding to IgE antibodies from a patient serum sample sensitized with pea food allergens can be substantially inhibited by the polypeptide with the sequence SEQ ID No. one.

Гипоаллергенный модифицированный полипептид или его аналог или фрагмент полипептида следует толковать как модифицированный полипептид или его аналог или фрагмент полипептида, который не способен или обладает значительно менее выраженной способностью связывать антитела класса IgE, реактивные к указанному полипептиду, из образца сыворотки пациента, сенсибилизированного пищевыми аллергенами гороха, либо не проявляет или проявляет гораздо более низкую аллергизирующую способность, которую определяют с использованием анализа активации клеток, например анализа высвобождения гистамина базофилами.A hypoallergenic modified polypeptide or its analogue or fragment of a polypeptide should be interpreted as a modified polypeptide or its analogue or fragment of a polypeptide that is not capable or has a significantly less pronounced ability to bind IgE antibodies reactive to the specified polypeptide from a patient serum sample sensitized with pea food allergens, either does not show or exhibits a much lower allergenic ability, which is determined using analysis of activation cells, for example, histamine release analysis by basophils.

Изобретение иллюстрируют следующие фигуры.The invention is illustrated by the following figures.

На фиг. 1 отображена хроматограмма разделения белков из экстракта семян гороха Pisum sativum на катионообменной колонке HiTrap SP FF и электрофореграмма фракции 2 после катионообменной хроматографии; М - смесь белков-стандартов молекулярных масс.In FIG. 1 shows a chromatogram of the separation of proteins from Pisum sativum pea seed extract on a HiTrap SP FF cation exchange column and an electrophoregram of fraction 2 after cation exchange chromatography; M is a mixture of molecular weight protein standards.

На фиг. 2 отображена хроматограмма ОФ-ВЭЖХ очистки Pis s 3 на колонке Vydac С4 (Pis s 3 присутствует в пике 1).In FIG. Figure 2 shows an RP-HPLC chromatogram of Pis s 3 purification on a Vydac C 4 column (Pis s 3 is present at peak 1).

Фиг. 3 иллюстрирует масс-спектрометрический анализ: (А) - Pis s 3; (Б) - Pis s 3 в присутствии йодацетамида; (В) - восстановленный Pis s 3 в присутствии йодацетамида.FIG. 3 illustrates mass spectrometric analysis: (A) Pis s 3; (B) Pis s 3 in the presence of iodoacetamide; (B) - reduced Pis s 3 in the presence of iodoacetamide.

На фиг. 4 отображена электрофореграмма очищенного природного Pis s 3.In FIG. 4 shows an electrophoregram of purified natural Pis s 3.

Фиг. 5 отображает спектр КД природного Pis s 3 из семян гороха Pisum sativum.FIG. 5 shows the CD spectrum of natural Pis s 3 from pea seeds of Pisum sativum.

Фиг. 6 иллюстрирует моделирование расщепления Pis s 3 в желудочно-кишечном тракте под действием пищеварительных ферментов: желудочного пепсина (слева), кишечных трипсина и химотрипсина (справа).FIG. Figure 6 illustrates the modeling of Pis s 3 cleavage in the gastrointestinal tract under the influence of digestive enzymes: gastric pepsin (left), intestinal trypsin and chymotrypsin (right).

Фиг. 7 отображает результаты ELISA с использованием сывороток пациентов с пищевой аллергией (разведение 1:2); в скобках под номерами сывороток указано значение общего уровня IgE (kU/L)FIG. 7 displays ELISA results using sera of patients with food allergies (1: 2 dilution); in parentheses, the serum numbers indicate the total IgE level (kU / L)

Изобретение иллюстрируют следующие примеры:The invention is illustrated by the following examples:

Пример 1.Example 1

Выделение природного аллергена Pis s 3 из семян гороха посевного Pisum sativum.Isolation of the natural allergen Pis s 3 from the seeds of pea inoculum Pisum sativum.

100 г сортовых семян гороха (сорт «Сахарный 2», семена ГОСТ 3 52171-2003) гомогенизируют в 300 мл буферного раствора [0,15 М ацетат аммония, 0,2 М NaCl, 2 мМ ЭДТА, 1,5% поливилполипирролидон, коктейль ингибиторов протеаз (Sigma)] и проводят экстракцию при температуре 4°С в течение 2 ч при постоянном перемешивании. Осветленный методом центрифугирования (40000 g, 50 мин, 4°С) экстракт подвергают тепловой обработке в течение 20 мин при 80°С в твердотельном термостате. Выпавший осадок отделяют центрифугированием (15000 g, 20 мин). После повторного центрифугирования полученный экстракт подвергают диализу (Spectra/Por 1 Dialysis Tubing) против 100-кратного объема 50 мМ ацетата аммония (рН 5,3) в течение ночи при 4°С при постоянном перемешивании. Полученный диализат фильтруют через фильтр TYPE GVPP 0,22 мкм и проводят ультрафильтрацию полученного фильтрата в среде инертного газа (Amicon 0850). Сначала ультрафильтрацию осуществляют с использованием мембраны YM100 (Millipore), а затем с помощью РМ30 (Millipore). Полученный фильтрат наносят на катионообменную колонку нормального давления HiTrap SP FF (GE Healthcare), уравновешенную 50 мМ ацетатом аммония (рН 5,3). Элюцию проводят, используя линейный градиент концентрации NaCl от 0 до 500 мМ за 72 мин при скорости потока 0,7 мл/мин. Детектирование ведут при длине волны 280 нм (фиг. 1). Очистку Pis s 1 проводят методом обращенно-фазовой высокоэффективной жидкостной хроматографии (ОФ-ВЭЖХ) на колонке Vydac С4 (Grace) при скорости потока 0,5 мл/мин, используя градиент концентрации ацетонитрила от 5 до 65% за 45 мин в присутствии 0,1% ТФУ. Детектирование ведут при длине волны 214 нм (фиг. 2). Степень очистки полипептида может быть повышена путем повторной хроматографии методом обращенно-фазовой ВЭЖХ. Гомогенность полученного полипептида устанавливают методами МАЛДИ-времяпролетной масс-спектрометрии (фиг. 3А) и SDS-электрофореза в ПААГ (фиг. 4). Спектры кругового дихроизма измеряют при комнатной температуре с помощью спектрополяриметра J-810 (Jasco) в кювете с длиной оптического пути 0,01 см в диапазоне длин волн 180-250 нм с шагом 1 нм. Исследуют конформацию полипептида, растворенного в воде в концентрации 1 мг/мл (фиг. 5).100 g of varietal pea seeds (cultivar Sugar 2, seeds GOST 3 52171-2003) are homogenized in 300 ml of buffer solution [0.15 M ammonium acetate, 0.2 M NaCl, 2 mm EDTA, 1.5% polyvylpolypyrrolidone, cocktail protease inhibitors (Sigma)] and carry out extraction at a temperature of 4 ° C for 2 hours with constant stirring. The extract clarified by centrifugation (40,000 g, 50 min, 4 ° C) is subjected to heat treatment for 20 min at 80 ° C in a solid state thermostat. The precipitate was separated by centrifugation (15,000 g, 20 min). After centrifugation again, the extract obtained was dialyzed (Spectra / Por 1 Dialysis Tubing) against a 100-fold volume of 50 mM ammonium acetate (pH 5.3) overnight at 4 ° C. with constant stirring. The resulting dialysate is filtered through a 0.22 μm TYPE GVPP filter and the filtrate is ultrafiltered in an inert gas medium (Amicon 0850). First, ultrafiltration is carried out using a YM100 membrane (Millipore), and then using PM30 (Millipore). The resulting filtrate was applied to a HiTrap SP FF normal pressure cation exchange column (GE Healthcare) equilibrated with 50 mM ammonium acetate (pH 5.3). Elution is carried out using a linear NaCl concentration gradient from 0 to 500 mM in 72 minutes at a flow rate of 0.7 ml / min. Detection is carried out at a wavelength of 280 nm (Fig. 1). Pis s 1 was purified by reverse phase high performance liquid chromatography (RP-HPLC) on a Vydac C 4 column (Grace) at a flow rate of 0.5 ml / min using an acetonitrile concentration gradient of 5 to 65% in 45 min in the presence of 0 , 1% TFU. Detection is carried out at a wavelength of 214 nm (Fig. 2). The degree of purification of the polypeptide can be increased by repeated chromatography by reverse phase HPLC. The homogeneity of the obtained polypeptide is established by the methods of MALDI-time-of-flight mass spectrometry (Fig. 3A) and SDS-electrophoresis in SDS page (Fig. 4). Circular dichroism spectra are measured at room temperature using a J-810 spectropolarimeter (Jasco) in a cuvette with an optical path length of 0.01 cm in the wavelength range of 180-250 nm in steps of 1 nm. The conformation of a polypeptide dissolved in water at a concentration of 1 mg / ml is examined (FIG. 5).

Пример 2.Example 2

Определение числа цистеиновых остатков и дисульфидных связей в Pis s 3.Determination of the number of cysteine residues and disulfide bonds in Pis s 3.

Число цистеиновых остатков и дисульфидных связей в Pis s 3 определяют с помощью реакции алкилирования йодацетамидом до и после восстановления белка дитиотреитолом (ДТТ). Навески Pis s 3 (по 10 мкг) растворяют в 90 мкл буфера 50 мМ NH4HCO3, рН 8,0 с добавлением 2 мМ ДТТ и без него, после чего пробирки с образцами инкубируют в течение 2 ч при 37°С. Затем в каждый образец добавляется по 10 мкл йодацетамида до конечной концентрации 20 мМ, после чего реакционные смеси инкубируют без доступа света при комнатной температуре в течение 1 ч. Затем образцы подвергают ОФ-ВЭЖХ очистке и исследуют методом МАЛДИ-времяпролетной масс-спектрометрии (фиг. 3Б, В).The number of cysteine residues and disulfide bonds in Pis s 3 is determined by the alkylation reaction with iodoacetamide before and after protein reduction with dithiothreitol (DTT). Samples of Pis s 3 (10 μg each) were dissolved in 90 μl of 50 mM NH 4 HCO 3 buffer, pH 8.0 with and without 2 mM DTT, after which the sample tubes were incubated for 2 hours at 37 ° C. Then, 10 μl of iodoacetamide was added to each sample to a final concentration of 20 mM, after which the reaction mixtures were incubated without light at room temperature for 1 h. Then, the samples were subjected to RP-HPLC purification and examined by MALDI-time-of-flight mass spectrometry (Fig. 3B, C).

Алкилирование Pis s 3 йодацетамидом после предварительного восстановления приводит к изменению молекулярной массы белка на 464 Да, что свидетельствует о наличии 8 остатков цистеина. Алкилирование полипептида без предварительного восстановления не приводит к изменению его молекулярной массы и свидетельствовует о том, что 8 остатков цистеина в Pis s 3 вовлечены в образование 4 дисульфидных связей.Alkylation of Pis s 3 with iodoacetamide after preliminary reduction leads to a change in the molecular weight of the protein by 464 Da, which indicates the presence of 8 cysteine residues. Alkylation of the polypeptide without preliminary reduction does not change its molecular weight and suggests that 8 cysteine residues in Pis s 3 are involved in the formation of 4 disulfide bonds.

Пример 3.Example 3

Моделирование переваривания Pis s 3 in vitro ферментами пищеварительного тракта.Simulation of digestion of Pis s 3 in vitro by digestive tract enzymes.

Для моделирования пищеварения в желудке используют пепсин (Sigma) при соотношении фермент-субстрат 1:20 (w/w). Ферментативную реакцию проводят в 0,1 М HCl (рН 2,0) при 37°С в течение 2 ч. Затем рН смеси доводят до 8,0 с помощью NH4HCO3, добавляют 2,5 нг трипсина (Promega) и 10 нг α-химотрипсина (Sigma) на каждый мкг субстрата и продолжают инкубировать в течение следующих 24 ч, моделируя кишечное пищеварение. В качестве контроля расщепления используют чувствительный к протеолизу субстрат - α-казеин коровьего молока (Sigma-Aldrich), который полностью расщепляется в первые 5 мин обработки пепсином. Pis s 3 обладает очень высокой устойчивостью к перевариванию желудочным пепсином (расщепление на ~19% за 2 ч) и смесью кишечных ферментов (расщепление на ~47% после инкубирования в течение еще 24 ч) (фиг. 6).To model digestion in the stomach, pepsin (Sigma) is used with an enzyme-substrate ratio of 1:20 (w / w). The enzymatic reaction is carried out in 0.1 M HCl (pH 2.0) at 37 ° C for 2 hours. Then the pH of the mixture is adjusted to 8.0 with NH 4 HCO 3 , 2.5 ng of trypsin (Promega) and 10 are added. ng of α-chymotrypsin (Sigma) for each μg of substrate and continue to incubate for the next 24 hours, simulating intestinal digestion. As a control of cleavage, a proteolysis sensitive substrate, cow's milk casein α-casein (Sigma-Aldrich), which is completely cleaved in the first 5 minutes of treatment with pepsin, is used. Pis s 3 has a very high resistance to digestion by gastric pepsin (cleavage by ~ 19% in 2 hours) and a mixture of intestinal enzymes (cleavage by ~ 47% after incubation for another 24 hours) (Fig. 6).

Пример 4.Example 4

Определение уровня специфических к Pis s 3 антител класса IgE в сыворотках пациентов с пищевой аллергией методом ELISA.Determination of the level of IgE class specific antibodies to Pis s 3 in the sera of patients with food allergy by ELISA.

Для определения уровня специфических к Pis s 3 антител класса IgE белок-антиген (0,5 мкг) вносят в ячейки 96-луночного планшета (Costar) в 50 мкл трис-солевого буферного раствора (TBS) и инкубируют в течение 1 ч при 37°С. После промывки тем же буферным раствором, содержащим твин-20 (TBST), планшет инкубируют в течение 2 ч при 37°С с 1% раствором бычьего сывороточного альбумина (BSA) в TBS. Далее планшет инкубируют в течение 2 ч при 37°С с серийными разведениями сывороток пациентов с аллергией (1:2-1:16) в TBS. После промывки TBST в лунки вносят раствор конъюгированных с пероксидазой хрена козьих антивидовых антител к IgE человека (Sigma) и инкубируют планшет при температуре 37°С в течение 1 ч. Детектирование связавшихся антител проводят после промывки лунок TBST, используя 3,3',5,5'-тетраметилбензидин для ИФА (Sigma). Ферментативную реакцию останавливают добавлением 4 н H2SO4 и измеряют оптическую плотность в лунках при 450 нм. В исследовании использовали сыворотки 20 пациентов с пищевой аллергией на фрукты, орехи и бобовые, из числа которых в 9 сыворотках (45%) пациентов присутствовали специфические антитела, способные связываться с Pis s 3, а следовательно, вызывать аллергические реакции при попадании Pis s 3 в организм сенсибилизированных пациентов (фиг. 7).To determine the level of IgE class specific antibodies to Pis s 3, protein-antigen (0.5 μg) is added to the cells of a 96-well plate (Costar) in 50 μl of Tris-buffered saline (TBS) and incubated for 1 h at 37 ° FROM. After washing with the same buffer solution containing tween-20 (TBST), the plate was incubated for 2 hours at 37 ° C with 1% solution of bovine serum albumin (BSA) in TBS. The plate is then incubated for 2 hours at 37 ° C with serial dilutions of the sera of patients with allergies (1: 2-1: 16) in TBS. After washing with TBST, a solution of horseradish peroxidase conjugated goat anti-human IgE antibodies (Sigma) was added to the wells and the plate was incubated at 37 ° C for 1 h. Detection of bound antibodies was carried out after washing the TBST wells using 3.3 ', 5, 5'-tetramethylbenzidine for ELISA (Sigma). The enzymatic reaction is stopped by adding 4 n H 2 SO 4 and the absorbance in the wells is measured at 450 nm. The study used the sera of 20 patients with food allergies to fruits, nuts, and legumes, among which specific antibodies were able to bind to Pis s 3 in 9 sera (45%) of patients and, therefore, cause allergic reactions when Pis s 3 enters the body of sensitized patients (Fig. 7).

Аминокислотная последовательностьAmino Acid Sequence

SEQ ID No. 1SEQ ID No. one

Figure 00000002
Figure 00000002

Figure 00000003
Figure 00000003

Figure 00000004
Figure 00000004

Claims (5)

1. Аллерген гороха Pis s 3 - полипептид, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID No 1 или последовательность, на 80% идентичную последовательности SEQ ID No 1.1. The pea allergen Pis s 3 is a polypeptide having the amino acid sequence of SEQ ID No 1 or a sequence 80% identical to the sequence of SEQ ID No 1. 2. Полипептид по п. 1 может быть выделен из гороха, получен с помощью химического синтеза или технологии рекомбинантных ДНК.2. The polypeptide according to claim 1 can be isolated from peas, obtained using chemical synthesis or recombinant DNA technology. 3. Способ выделения из природного сырья полипептида по п. 1, включающий гомогенизацию семян гороха и экстракцию полипептида из семян гороха буферным раствором, осветление полученного экстракта центрифугированием, термическую обработку экстракта, диализ, последовательную ультрафильтрацию, катионообменную и высокоэффективную жидкостную хроматографии с выделением полипептида по п. 1.3. A method for isolating a polypeptide according to Claim 1 from natural raw materials, including homogenizing pea seeds and extracting a polypeptide from pea seeds with a buffer solution, clarifying the obtained extract by centrifugation, heat treatment of the extract, dialysis, sequential ultrafiltration, cation exchange and high-performance liquid chromatography with isolation of the polypeptide according to p . one. 4. Применение аллергена гороха Pis s 3 по п. 1 для диагностики IgE-опосредованной пищевой аллергии на горох.4. The use of pea allergen Pis s 3 according to claim 1 for the diagnosis of IgE-mediated food allergy to peas. 5. Применение аллергена гороха Pis s 3 по п. 1 для лечения IgE-опосредованной пищевой аллергии на горох, в том числе для аллерген-специфической иммунотерапии.5. The use of pea allergen Pis s 3 according to claim 1 for the treatment of IgE-mediated food allergies to peas, including allergen-specific immunotherapy.
RU2016129502A 2016-07-19 2016-07-19 Pis s 3 pea allergen for diagnostics and therapy of food allergy and method of its release from natural raw materials RU2651488C2 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2016129502A RU2651488C2 (en) 2016-07-19 2016-07-19 Pis s 3 pea allergen for diagnostics and therapy of food allergy and method of its release from natural raw materials

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2016129502A RU2651488C2 (en) 2016-07-19 2016-07-19 Pis s 3 pea allergen for diagnostics and therapy of food allergy and method of its release from natural raw materials

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2016129502A RU2016129502A (en) 2017-01-10
RU2651488C2 true RU2651488C2 (en) 2018-04-19

Family

ID=57955907

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016129502A RU2651488C2 (en) 2016-07-19 2016-07-19 Pis s 3 pea allergen for diagnostics and therapy of food allergy and method of its release from natural raw materials

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2651488C2 (en)

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
БОГДАНОВ И.В. и др. Получение и исследование новых растительных аллергенов класса LTP. Международная научно-практическая конференция "Биотехнология и качество жизни", 2014, c.209. *
БОГДАНОВ И.В. и др. Получение и исследование новых растительных аллергенов класса LTP. Международная научно-практическая конференция "Биотехнология и качество жизни", 2014, c.209. ТЮТЯЕВА В.В. и др. Выделение рекомбинантного белка, содержащего антигенные эпитопы актуального аллерена BETV2 Березы повислой. Иммунология, N 4, 2013, с.215-217. БОРИСОВА И.В. и др. Пищевая аллергия у детей. Красноярск, 2011, с.19-20, 23. *
БОРИСОВА И.В. и др. Пищевая аллергия у детей. Красноярск, 2011, с.19-20, 23. *
ТЮТЯЕВА В.В. и др. Выделение рекомбинантного белка, содержащего антигенные эпитопы актуального аллерена BETV2 Березы повислой. Иммунология, N 4, 2013, с.215-217. *

Also Published As

Publication number Publication date
RU2016129502A (en) 2017-01-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Lupinek et al. Advances in allergen-microarray technology for diagnosis and monitoring of allergy: the MeDALL allergen-chip
Taheri-Kafrani et al. Effects of heating and glycation of β-lactoglobulin on its recognition by IgE of sera from cow milk allergy patients
Burks et al. Identification of a major peanut allergen, Ara h I, in patients with atopic dermatitis and positive peanut challenges
Helm et al. Cellular and molecular characterization of a major soybean allergen
You et al. Development of a monoclonal antibody-based competitive ELISA for detection of β-conglycinin, an allergen from soybean
US10871493B2 (en) Assay for the diagnosis of peanut allergy
Caira et al. Allergenicity of milk proteins
Sélo et al. Allergy to Bovine â–Lactoglobulin: Specificity of Human IgE Using Cyanogen Bromide–Derived Peptides
TWI690537B (en) Novel macadamia allergen
CN109942689B (en) Epitope
US20140154257A1 (en) Materials and methods for diagnosing and treating asthma and dietary Fru-AGEs related disorders including auto-immune and other diseases found to be associated with elevated RAGE. The specification describes methods to identify and make dietary derived advanced glycation end-products, known as Fru-AGEs, Fru-AGE-haptens, and Fru-AGE immune complexes, and to make monoclonal and polyclonal antibodies to this plurality of bio-molecules for use in immunoassays and for use as therapeutic agents
CN112079909A (en) Antigens and epitopes of allergy
US20100129409A1 (en) Novel Prostate Kallikrein Allergen
Su et al. Immunologic and physicochemical studies of Bermuda grass pollen antigen BG60
CN111051336A (en) Antigens and epitopes of allergy
RU2651488C2 (en) Pis s 3 pea allergen for diagnostics and therapy of food allergy and method of its release from natural raw materials
JP2022538691A (en) new allergen
US20140037661A1 (en) Wheat Antigens and Peptides for Diagnosis of Wheat Induced Hypersensitivity
Wang et al. Cow milk αs1-casein induces allergic responses in a mouse model of atopy
JP3983260B2 (en) Atopic dermatitis attractant
Castro et al. Proteomic analysis of food allergens
Keet et al. Overview of mucosal immunity and development of oral tolerance
CN111132734A (en) Veterinary product
Castroa et al. Proteomic analysis of food allergens
Liu Extensive dry heating-induced changes in physicochemical and immunological properties of whey proteins