RU2650867C1 - Method for determining genetic predisposition to develop panic disorder - Google Patents
Method for determining genetic predisposition to develop panic disorder Download PDFInfo
- Publication number
- RU2650867C1 RU2650867C1 RU2017117885A RU2017117885A RU2650867C1 RU 2650867 C1 RU2650867 C1 RU 2650867C1 RU 2017117885 A RU2017117885 A RU 2017117885A RU 2017117885 A RU2017117885 A RU 2017117885A RU 2650867 C1 RU2650867 C1 RU 2650867C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- panic disorder
- gene
- pcr
- cckar
- htr1a
- Prior art date
Links
- 208000019906 panic disease Diseases 0.000 title claims abstract description 75
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 31
- 208000034826 Genetic Predisposition to Disease Diseases 0.000 title description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 claims abstract description 23
- 101000946804 Homo sapiens Cholecystokinin receptor type A Proteins 0.000 claims abstract description 15
- 102000017911 HTR1A Human genes 0.000 claims abstract description 13
- 101000822895 Homo sapiens 5-hydroxytryptamine receptor 1A Proteins 0.000 claims abstract description 13
- 108010012996 Serotonin Plasma Membrane Transport Proteins Proteins 0.000 claims abstract description 12
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims abstract description 12
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims abstract description 12
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims abstract description 12
- 102220171941 rs3813034 Human genes 0.000 claims abstract description 11
- 102220090096 rs6295 Human genes 0.000 claims abstract description 11
- 101150081010 CCKAR gene Proteins 0.000 claims abstract description 5
- 101150015707 HTR1A gene Proteins 0.000 claims abstract description 4
- 101150028423 Slc6a4 gene Proteins 0.000 claims abstract description 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 20
- 102000019208 Serotonin Plasma Membrane Transport Proteins Human genes 0.000 claims description 11
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 9
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims description 7
- 238000007894 restriction fragment length polymorphism technique Methods 0.000 claims description 7
- 238000007844 allele-specific PCR Methods 0.000 claims description 6
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 claims description 6
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 claims description 5
- 238000000018 DNA microarray Methods 0.000 claims description 4
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims description 3
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 3
- 238000007481 next generation sequencing Methods 0.000 claims description 3
- 238000012175 pyrosequencing Methods 0.000 claims description 3
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 claims description 3
- 238000002493 microarray Methods 0.000 claims 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 abstract description 17
- 102100034927 Cholecystokinin receptor type A Human genes 0.000 abstract description 12
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 abstract description 7
- 238000001514 detection method Methods 0.000 abstract description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 2
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 19
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 19
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 15
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 10
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 9
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 7
- 208000020016 psychiatric disease Diseases 0.000 description 7
- 102100040999 Catechol O-methyltransferase Human genes 0.000 description 6
- 108020002739 Catechol O-methyltransferase Proteins 0.000 description 6
- 206010033664 Panic attack Diseases 0.000 description 6
- 239000012620 biological material Substances 0.000 description 6
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 6
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 5
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 5
- 208000019901 Anxiety disease Diseases 0.000 description 4
- 102100025841 Cholecystokinin Human genes 0.000 description 4
- 101800001982 Cholecystokinin Proteins 0.000 description 4
- 206010071602 Genetic polymorphism Diseases 0.000 description 4
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 4
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 4
- 229940107137 cholecystokinin Drugs 0.000 description 4
- IZTQOLKUZKXIRV-YRVFCXMDSA-N sincalide Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)C1=CC=C(OS(O)(=O)=O)C=C1 IZTQOLKUZKXIRV-YRVFCXMDSA-N 0.000 description 4
- 206010010904 Convulsion Diseases 0.000 description 3
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 3
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 3
- 108010072564 5-HT2A Serotonin Receptor Proteins 0.000 description 2
- 108090000715 Brain-derived neurotrophic factor Proteins 0.000 description 2
- 108091005932 CCKBR Proteins 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 102100033156 Dopamine beta-hydroxylase Human genes 0.000 description 2
- 101000927562 Homo sapiens Dopamine beta-hydroxylase Proteins 0.000 description 2
- 101000830742 Homo sapiens Tryptophan 5-hydroxylase 1 Proteins 0.000 description 2
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 2
- 102100024971 Tryptophan 5-hydroxylase 1 Human genes 0.000 description 2
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 2
- 230000036506 anxiety Effects 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 238000002651 drug therapy Methods 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 2
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 2
- 102000054766 genetic haplotypes Human genes 0.000 description 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 2
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 2
- 239000002858 neurotransmitter agent Substances 0.000 description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 2
- 201000000980 schizophrenia Diseases 0.000 description 2
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 2
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 2
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 2
- 102000049773 5-HT2A Serotonin Receptor Human genes 0.000 description 1
- 102100036321 5-hydroxytryptamine receptor 2A Human genes 0.000 description 1
- 101150007969 ADORA1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102100035990 Adenosine receptor A2a Human genes 0.000 description 1
- 101150051188 Adora2a gene Proteins 0.000 description 1
- 208000008811 Agoraphobia Diseases 0.000 description 1
- 102000004219 Brain-derived neurotrophic factor Human genes 0.000 description 1
- -1 CCK Proteins 0.000 description 1
- 208000024172 Cardiovascular disease Diseases 0.000 description 1
- 208000036086 Chromosome Duplication Diseases 0.000 description 1
- 208000017667 Chronic Disease Diseases 0.000 description 1
- 206010010356 Congenital anomaly Diseases 0.000 description 1
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 description 1
- 102100031780 Endonuclease Human genes 0.000 description 1
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 102100036016 Gastrin/cholecystokinin type B receptor Human genes 0.000 description 1
- 208000011688 Generalised anxiety disease Diseases 0.000 description 1
- 108091027305 Heteroduplex Proteins 0.000 description 1
- 101000783617 Homo sapiens 5-hydroxytryptamine receptor 2A Proteins 0.000 description 1
- 101000783751 Homo sapiens Adenosine receptor A2a Proteins 0.000 description 1
- 101000787964 Homo sapiens Transmembrane protein 132D Proteins 0.000 description 1
- 101000988424 Homo sapiens cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B Proteins 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 208000019693 Lung disease Diseases 0.000 description 1
- 108091092878 Microsatellite Proteins 0.000 description 1
- 108091062170 Mir-22 Proteins 0.000 description 1
- 102000010909 Monoamine Oxidase Human genes 0.000 description 1
- 108010062431 Monoamine oxidase Proteins 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- 206010041250 Social phobia Diseases 0.000 description 1
- 101150075360 Tmem132d gene Proteins 0.000 description 1
- 102100025898 Transmembrane protein 132D Human genes 0.000 description 1
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 1
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 1
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 230000008033 biological extinction Effects 0.000 description 1
- 238000010170 biological method Methods 0.000 description 1
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 1
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 1
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- 102100029168 cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B Human genes 0.000 description 1
- 210000000748 cardiovascular system Anatomy 0.000 description 1
- 208000015606 cardiovascular system disease Diseases 0.000 description 1
- 230000003196 chaotropic effect Effects 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- 239000003398 denaturant Substances 0.000 description 1
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 1
- 210000000750 endocrine system Anatomy 0.000 description 1
- ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N ethidium bromide Chemical compound [Br-].C12=CC(N)=CC=C2C2=CC=C(N)C=C2[N+](CC)=C1C1=CC=CC=C1 ZMMJGEGLRURXTF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960005542 ethidium bromide Drugs 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 230000009760 functional impairment Effects 0.000 description 1
- 208000029364 generalized anxiety disease Diseases 0.000 description 1
- 230000007614 genetic variation Effects 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- ZJYYHGLJYGJLLN-UHFFFAOYSA-N guanidinium thiocyanate Chemical compound SC#N.NC(N)=N ZJYYHGLJYGJLLN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 230000003340 mental effect Effects 0.000 description 1
- 238000010197 meta-analysis Methods 0.000 description 1
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 1
- 230000000869 mutational effect Effects 0.000 description 1
- 210000000653 nervous system Anatomy 0.000 description 1
- 230000002974 pharmacogenomic effect Effects 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 1
- 230000008707 rearrangement Effects 0.000 description 1
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 1
- 230000010076 replication Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 230000000862 serotonergic effect Effects 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 238000011477 surgical intervention Methods 0.000 description 1
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 238000012800 visualization Methods 0.000 description 1
- 230000036642 wellbeing Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
Изобретение относится к биомедицине, молекулярно-генетической диагностике и медицине и может найти применение в неврологии и психиатрии для прогнозирования риска развития панического расстройства у человека. В частности, в изобретении раскрыт способ выявления предрасположенности к паническому расстройству у человека путем анализа генотипов четырех однонуклеотидных замен (SNV) в трех генах CCKAR (rs1800908 и rs1799723), HTR1A (rs6295), SLC6A4 (rs3813034) и выявления сочетаний генотипов и аллелей данных генов, которые могут быть использованы в качестве диагностического признака, имеющего высокую прогностическую силу.The invention relates to biomedicine, molecular genetic diagnostics and medicine, and may find application in neurology and psychiatry to predict the risk of panic disorder in humans. In particular, the invention discloses a method for detecting a predisposition to panic disorder in humans by analyzing the genotypes of four single nucleotide substitutions (SNVs) in three genes CCKAR (rs1800908 and rs1799723), HTR1A (rs6295), SLC6A4 (rs3813034) and identifying combinations of genotypes and al that can be used as a diagnostic feature with high predictive power.
Предшествующий уровень техники.The prior art.
Термины и определения:Terms and Definitions:
Наследуемость - доля фенотипической изменчивости в популяции, обусловленная генетической изменчивостью (в отношении к определенному качественному или количественному признаку)Inheritance - the proportion of phenotypic variation in a population due to genetic variation (in relation to a specific qualitative or quantitative trait)
Наследственная предрасположенность к развитию заболевания - наличие в геноме субъекта определенных наследственных влияний (мутаций или сочетаний аллелей), которые, в сочетании с факторами внешней среды, приводят к развитию определенного заболевания/функционального нарушения.A hereditary predisposition to the development of a disease is the presence of certain hereditary influences (mutations or combinations of alleles) in the subject's genome, which, combined with environmental factors, lead to the development of a specific disease / functional impairment.
Относительный риск заболеваемости - мера риска появления определенного события в одной группе по сравнению с риском такого же события в другой группе (наличие/отсутствие признака или заболевание).The relative risk of morbidity is a measure of the risk of a particular event in one group compared to the risk of the same event in another group (presence / absence of a sign or disease).
Генетический полиморфизм - в популяции обычно встречается несколько вариантов (аллелей) каждого гена. Если частота таких вариантов достаточно высока и не может быть объяснена случайным возникновением одинаковых мутаций в разных семьях, то говорят о полиморфизме данного локуса.Genetic polymorphism - in a population, several variants (alleles) of each gene are usually found. If the frequency of such variants is high enough and cannot be explained by the random occurrence of identical mutations in different families, then we speak of the polymorphism of this locus.
Однонуклеотидная замена - генетический полиморфизм или мутация определенного локусаSingle nucleotide substitution - genetic polymorphism or mutation of a specific locus
Диагностический признак (показатель) - это биологический феномен, который ассоциирован с определенным физиологическим состоянием организма и может быть выявленным при помощи стандартизированного диагностического метода. Один показатель можно определить при помощи нескольких методов, которые отличаются по аналитическим характеристикам; из-за этого разными являются «границы нормы» и диагностическое значение показателя.A diagnostic sign (indicator) is a biological phenomenon that is associated with a certain physiological state of the body and can be detected using a standardized diagnostic method. One indicator can be determined using several methods that differ in analytical characteristics; because of this, the “normal limits” and the diagnostic value of the indicator are different.
Диагностический тест - определение конкретного диагностического признака (показателя) при помощи конкретного метода, аналитические параметры которого остаются неизменными при условии контроля качества его выполнения.Diagnostic test - determination of a specific diagnostic feature (indicator) using a specific method, the analytical parameters of which remain unchanged under the condition of quality control of its implementation.
Диагностический метод - клинический, лабораторный, инструментальный или морфологический - описывает определенный биологический феномен в организме человека.The diagnostic method - clinical, laboratory, instrumental or morphological - describes a specific biological phenomenon in the human body.
Паническое расстройство - одно из самых распространенных тревожных расстройств, часто являющееся хроническим (Bruce et al., 2005; Kessler et al., 2006). Оно характеризуется паническими атаками и упреждающей тревогой. Многие исследователи сообщают о том, что болезнь вызывает сильное снижение качества жизни у пациентов (Davidoff et al., 2012). Ко всему прочему, Sherbourne et al. (1996) сообщает о том, что у пациентов с паническим расстройством это снижение даже существеннее, чем у пациентов с другими хроническими заболеваниями, например с диабетом, заболеваниями сердечно-сосудистой системы и заболеваниями легких.Panic disorder is one of the most common anxiety disorders, often chronic (Bruce et al., 2005; Kessler et al., 2006). It is characterized by panic attacks and preemptive anxiety. Many researchers report that the disease causes a dramatic decrease in the quality of life in patients (Davidoff et al., 2012). In addition, Sherbourne et al. (1996) reports that in patients with panic disorder this decrease is even more significant than in patients with other chronic diseases, such as diabetes, diseases of the cardiovascular system and lung diseases.
Распространенность панического расстройства оценивается в 1-3%, причем женщины страдают от этого заболевания в два раза чаще мужчин (Eaton et al., 1994). Семейные и близнецовые исследования выявили, что наследуемость панического расстройства равна 0,43 (Hettema et al., 2001), а относительный риск заболеваемости у родственников пробанда, страдающего паническим расстройством, при родстве первой степени примерно в 6-17 раз выше, чем в целом по популяции (Crowe et al., 1983 и Goldstein et al., 1997). Конкордантность у монозиготных близнецов равна приблизительно 20,7-73,0% (Hettema et al., 2001). Считается, что и факторы внешней среды, и генетические факторы вовлечены в развитие панического расстройства.The prevalence of panic disorder is estimated at 1-3%, with women suffering from this disease twice as often as men (Eaton et al., 1994). Family and twin studies have shown that the heritability of panic disorder is 0.43 (Hettema et al., 2001), and the relative risk of morbidity among relatives of a proband suffering from panic disorder is approximately 6-17 times higher in first degree relatives than in general by population (Crowe et al., 1983 and Goldstein et al., 1997). Concordance in monozygotic twins is approximately 20.7-73.0% (Hettema et al., 2001). It is believed that environmental factors and genetic factors are involved in the development of panic disorder.
Психологическое же обследование позволяет только диагностировать уже резвившееся заболевание, а не выявлять предрасположенность к развитию панического расстройства. Именно поэтому разработка панели молекулярно-генетических маркеров предрасположенности к паническому расстройству позволит предсказывать возможность возникновения заболевания, что является существенным для людей, работающих в сфере, связанной со стрессовыми ситуациями, способных спровоцировать развитие заболевание. Показано, что нахождение в стрессовых условиях способно провоцировать панические атаки у предрасположенных к тревожности людей (Schmidt etal., 1997).Psychological examination allows only to diagnose a frolic disease, and not to identify a predisposition to the development of panic disorder. That is why the development of a panel of molecular genetic markers of predisposition to panic disorder will make it possible to predict the possibility of a disease, which is essential for people working in the field of stressful situations that can provoke the development of the disease. It has been shown that being under stressful conditions can provoke panic attacks in people predisposed to anxiety (Schmidt etal., 1997).
Главным достоинством ДНК-диагностики является возможность определения предрасположенности к заболеванию на пресимптоматической стадии. В ряде случаев это дает возможность путем хирургического вмешательства, лекарственной терапии или изменения стиля жизни пациента предотвратить развитие самой болезни. В некоторых случаях генотипирование, т.е. выявление соответствующего генетического маркера, также позволяет выбрать наиболее адекватное лекарство. По мере развития фармакогенетики лекарственная терапия будет все больше опираться на анализ генотипа пациента.The main advantage of DNA diagnostics is the ability to determine the predisposition to the disease at the pre-symptomatic stage. In some cases, this makes it possible to prevent the development of the disease itself through surgical intervention, drug therapy, or changing the patient's lifestyle. In some cases, genotyping, i.e. the identification of an appropriate genetic marker also allows you to choose the most appropriate medicine. As pharmacogenetics develops, drug therapy will increasingly rely on the analysis of the patient’s genotype.
Задачей данного изобретения является разработка способа выявления у человека высокого риска развития панического расстройства путем выявления у него молекулярно-генетических маркеров предрасположенности к паническому расстройству.The objective of the invention is to develop a method for identifying a person at high risk of developing a panic disorder by identifying molecular genetic markers of a predisposition to panic disorder.
В качестве прототипа изобретения может быть назван способ диагностики предрасположенности к паническому расстройству, раскрытый в документе US 6225057 (В1), опубл. 01.05.2001, который основан на выявлении у испытуемых врожденной хромосомной дупликации 15q24-25.As a prototype of the invention can be called a method for diagnosing a predisposition to panic disorder, disclosed in document US 6225057 (B1), publ. 05/01/2001, which is based on the identification of 15q24-25 congenital chromosome duplication in subjects.
Документом, наиболее подробно раскрывающим способы определения полиморфизмов, связанных с диагностикой психических заболеваний, может быть назван US 6844432 (В2).The document that most fully discloses methods for determining polymorphisms associated with the diagnosis of mental illness can be called US 6844432 (B2).
В основе заявленного в настоящем изобретении способа лежат следующие предпосылки.The basis of the claimed in the present invention method are the following premises.
Ранее был обнаружен ряд генов-кандидатов, предположительно ассоциированных с паническим расстройством. Среди них МАО A (Deckert et al., 1999), СОМТ (Hamilton et al., 2002, Woo et al., 2002, Domschke et al., 2004 и Rothe et al., 2006), ADORA2A (Deckert et al., 1998 и Hamilton et al., 2004), HTR1A (Rothe et al., 2004a), HTR2A (Inada et al., 2003, Rothe et al, 2004b и Maron et al., 2005) и CCK (Wang et al., 1998, Hattori et al., 2001 и Ebihara et al., 2003). Тем не менее, многие из этих ассоциаций не подтверждаются при практических исследованиях, направленных на поиск маркеров, обладающих предсказательной силой. Развитие методов полногеномных исследований (genome-wide association studies - GWASs) и ДНК-микрочипов позволило проводить всесторонний анализ генома, не ограничиваясь несколькими генами-мишенями. Полногеномные исследования имеющих европейское происхождение пациентов с паническим расстройством позволили выдвинуть TMEM132D на роль гена-кандидата, ответственного за развитие панического расстройства. Этот результат удалось повторить на других европейских выборках, но не удалось повторить на японских (Erhardt et al., 2012). Причины таких расхождений могут быть различными, однако несомненным является необходимость практического подтверждения значимости каждого маркера. Значение OR (отношение шансов), полученное авторами в исследованиях, слишком мало, чтобы ген TMEM132D маркером панического расстройства.A number of candidate genes have been discovered previously that are thought to be associated with panic disorder. Among them are MAO A (Deckert et al., 1999), COMT (Hamilton et al., 2002, Woo et al., 2002, Domschke et al., 2004 and Rothe et al., 2006), ADORA2A (Deckert et al. , 1998 and Hamilton et al., 2004), HTR1A (Rothe et al., 2004a), HTR2A (Inada et al., 2003, Rothe et al, 2004b and Maron et al., 2005) and CCK (Wang et al. , 1998, Hattori et al., 2001 and Ebihara et al., 2003). However, many of these associations are not supported by practical research aimed at finding predictive markers. The development of genome-wide association studies (GWASs) and DNA microarrays has allowed a comprehensive analysis of the genome, not limited to a few target genes. Full-genomic studies of European-born patients with panic disorder have allowed TMEM132D to be put forward as the candidate gene responsible for the development of panic disorder. This result was able to be repeated in other European samples, but could not be repeated in Japanese (Erhardt et al., 2012). The reasons for such discrepancies may be different, but the need for practical confirmation of the significance of each marker is indisputable. The OR value (odds ratio) obtained by the authors in the studies is too low for the TMEM132D gene to be a marker of panic disorder.
Таким образом, до настоящего времени не выявлено значимых молекулярно-генетических маркеров панического расстройства, обладающих достаточными критериями прогнозирования высоких рисков развития заболевания. Следует отметить, что поиск генетических маркеров в российской популяции пациентов проводится только коллективом авторов патента (Коробейникова и др., 2011, Коробейникова и др. 2012).Thus, to date, no significant molecular genetic markers of panic disorder have been identified that have sufficient criteria for predicting high risks of developing the disease. It should be noted that the search for genetic markers in the Russian patient population is carried out only by a team of patent authors (Korobeinikova et al., 2011, Korobeynikova et al. 2012).
Сущность изобретенияSUMMARY OF THE INVENTION
Предложенный в настоящем изобретении способ прогнозирования степени риска развития панического расстройства заключается в отборе биоматериала для выделения ДНК и проведении генотипирования ДНК любым из методов анализа последовательности ДНК. Для осуществления способа выявляют наличие у человека определенных полиморфизмов генов CCKAR (по сайтам rs1800908 и rs1799723), HTR1A (по сайту rs6295) и SLC6A4 (по сайту rs3813034), при этом высокую степень риска развития панического расстройства прогнозируют при наличии следующих сочетаний аллелей и генотипов однонуклеотидных вариантов: CCKAR_rs1799723:A+CCKAR_rs1800908:Т и HTR1A_rs6295:C+SLC6A4_rs3813034:CC. Определение данных полиморфизмов возможно проводить при помощи ряда молекулярно-генетических методов, которые лучше всего приспособлены к использованию в клинической практике, т.е. отвечающих следующим требованиям: достаточная чувствительность выявления мутаций, хорошая воспроизводимость, невысокая стоимость и возможность автоматизации. Данные методы хорошо известны специалистам, и разработка адаптированного варианта, позволяющего выявить у человека наличие раскрытых в данной заявке генетических маркеров с высокой прогностической значимостью является рутинной процедурой. К данным методам могут быть отнесены: мутационный скрининг, анализ макроперестроек ДНК-блоттингом, гетеродуплексный анализ, анализ полиморфизма конформации одноцепочечной ДНК, электрофорез двухцепочечной ДНК в градиенте денатуранта, денатурирующая высокоэффективная жидкостная хроматография, химическое обнаружение неспаренных нуклеотидов, защита от рнказы, скрининг мутаций, рестрикционный анализ, аллель-специфическая ПЦР, молекулярные бакены, гибридизация с аллель-специфическими олигонуклеотидами, аллель-специфическая лигазная реакция, мини-секвенирование.Proposed in the present invention a method for predicting the degree of risk of panic disorder is the selection of biomaterial for DNA extraction and DNA genotyping by any of the DNA sequence analysis methods. To implement the method, the presence of certain polymorphisms of the CCKAR genes (at the sites rs1800908 and rs1799723), HTR1A (at the site rs6295) and SLC6A4 (at the site rs3813034) is detected in humans, while a high risk of panic disorder is predicted in the presence of the following combinations of alleles and single nucleotide genotypes options: CCKAR_rs1799723: A + CCKAR_rs1800908: T and HTR1A_rs6295: C + SLC6A4_rs3813034: CC. The determination of these polymorphisms can be carried out using a number of molecular genetic methods that are best suited for use in clinical practice, i.e. meeting the following requirements: sufficient sensitivity to detect mutations, good reproducibility, low cost and the ability to automate. These methods are well known to specialists, and the development of an adapted option to detect a person’s presence of the genetic markers disclosed in this application with high prognostic significance is a routine procedure. These methods may include: mutational screening, analysis of macro rearrangements by DNA blotting, heteroduplex analysis, analysis of polymorphism of single-stranded DNA conformation, electrophoresis of double-stranded DNA in a denaturant gradient, denaturing high-performance liquid chromatography, chemical detection of unpaired nucleotides, protection against mnuclease, restriction from rnase analysis, allele-specific PCR, molecular buoys, hybridization with allele-specific oligonucleotides, allele-specific ligase p event, mini-sequencing.
Авторы патента впервые экспериментальным путем доказали статистически значимую ассоциацию данных генетических маркеров с паническим расстройством (Таблица 1) и предложили их использовать в качестве основного диагностического признака. Ассоциированные однонуклеотидные полиморфные варианты (SNV) локализованы в генах, участвующих в функционировании нейромедиаторных систем головного мозга и запускающих молекулярные сигнальные пути, ведущие к модуляции поведения и психических функций человека. Способ позволяет выявить объективно существующую у индивидуума генетическую предрасположенность к развитию панического расстройства. В источниках патентной информации не выявлено документов, раскрывающих заданные полиморфизмы, в комплексе или по отдельности, в связи с диагностикой панического расстройства, хотя связь данных генов с психическими заболеваниями изучалась (см, например, документы WO/1998/048785, WO/2014/20999).The authors of the patent for the first time experimentally proved a statistically significant association of these genetic markers with panic disorder (Table 1) and proposed to use them as the main diagnostic feature. Associated single nucleotide polymorphic variants (SNVs) are localized in genes involved in the functioning of the neurotransmitter systems of the brain and trigger molecular signaling pathways leading to the modulation of human behavior and mental functions. The method allows to identify an objectively existing genetic predisposition in an individual to develop panic disorder. The patent information sources did not reveal any documents revealing the specified polymorphisms, in whole or in isolation, in connection with the diagnosis of panic disorder, although the relationship of these genes with mental illness was studied (see, for example, documents WO / 1998/048785, WO / 2014/20999 )
Одним из востребованных технических результатов изобретения является разработка новых объективных и информативных критериев, позволяющих прогнозировать высокий риск развития панического расстройства, таким образом расширяя арсенал технических средств, применяемых для диагностики наследственной предрасположенности к развитию психических нарушений.One of the claimed technical results of the invention is the development of new objective and informative criteria to predict a high risk of developing a panic disorder, thus expanding the arsenal of technical tools used to diagnose a hereditary predisposition to the development of mental disorders.
В проведенное нами исследование мы включили наиболее перспективные с нашей точки зрения генетические маркеры (Таблица 1). В связи с поставленной задачей был произведен отбор генов и их полиморфных вариантов для сравнения частот генотипов и аллелей в группе пациентов с паническим расстройством (n=131) и контрольной группе (популяционный контроль, n=363). Критериями включения пациентов в исследование были:In our study, we included the most promising genetic markers from our point of view (Table 1). In connection with the task, genes and their polymorphic variants were selected for comparing the frequencies of genotypes and alleles in the group of patients with panic disorder (n = 131) and the control group (population control, n = 363). The criteria for inclusion of patients in the study were:
- диагноз “паническое расстройство”, соответствующий критериям DSM-IV;- A diagnosis of panic disorder that meets the criteria of DSM-IV;
- отсутствие других психических заболеваний, а также заболеваний нервной и эндокринной систем;- the absence of other mental diseases, as well as diseases of the nervous and endocrine systems;
- наличие у них панических атак не реже 1 раза в месяц.- the presence of panic attacks at least 1 time per month.
В исследовании были проанализировано 11 генов (BDNF, DBH, CCKAR, CCKBR, CCK, MIR22, HTR1A, СОМТ, SLC6A4, ТРН1, PDE4B), содержащих в общей сложности 17 полиморфных вариантов ДНК. Генотипирование обеих выборок позволило выявить частоты генотипов и аллелей данных 17 полиморфных вариантов.The study analyzed 11 genes (BDNF, DBH, CCKAR, CCKBR, CCK, MIR22, HTR1A, COMT, SLC6A4, TPH1, PDE4B) containing a total of 17 polymorphic DNA variants. Genotyping of both samples revealed the frequencies of genotypes and alleles of data from 17 polymorphic variants.
Следующие гены, анализированные в нашей работе, не были ранее исследованы в связи с паническим расстройством: DBH, HTR1A, SLC6A4, ТРН1, однако молекулярные каскады, в которые они вовлечены, позволяют предположить, что они могут иметь связь с психиатрическими заболеваниями. В протокол обследования в т.ч. включено генотипирование на предмет выявления полиморфных вариантов генов HTR1A (rs6295), SLC6A4 (rs3813034), CCKAR (rs1799723 и rs1800908).The following genes analyzed in our work were not previously investigated in connection with panic disorder: DBH, HTR1A, SLC6A4, TPH1, however, the molecular cascades in which they are involved suggest that they may be associated with psychiatric diseases. In the examination protocol, incl. genotyping for identification of polymorphic variants of the HTR1A (rs6295), SLC6A4 (rs3813034), CCKAR (rs1799723 and rs1800908) genes is included.
Значимые ассоциации сочетаний генотипов и аллелей были выявлены только для 3х генов (Таблица 1а).Significant associations of combinations of genotypes and alleles were identified only for 3 genes (Table 1a).
В таблице 1а представлены данные по ассоциации выявленных авторами биомаркеров панического расстройства. Для всех указано название гена, регистрационный номер замены и ассоциированный генотип. В таблице также даны следующие статистические параметры:Table 1a presents data on the association of panic disorder biomarkers identified by the authors. For all, the name of the gene, registration number of the replacement, and the associated genotype are indicated. The table also gives the following statistical parameters:
Fi - значение p-value по Фишеру (двухзначный),Fi - F-value p-value (two-digit),
OR - отношение шансов,OR - odds ratio,
CI95% - доверительный интервал,CI95% - confidence interval,
RR - относительный риск развития заболевания,RR - the relative risk of developing the disease,
SE - чувствительность маркера (доля носителей маркера среди больных),SE - marker sensitivity (proportion of marker carriers among patients),
AUC - прогностическая эффективность маркера,AUC - prognostic marker efficacy,
PPV - диагностическую ценность маркера (вероятность заболеть при носительстве маркера).PPV - the diagnostic value of the marker (the probability of getting sick when the marker is carried).
Данные, представленные в таблице 1а, позволяют предсказывать относительный риск развития панического расстройства у носителей данных генотипов (RR). Прогностическая эффективность (AUC) для обоих маркеров примерно одинакова - более 0,6 (средний классификатор).The data presented in table 1A, allow to predict the relative risk of panic disorder in carriers of these genotypes (RR). Predictive efficiency (AUC) for both markers is approximately the same - more than 0.6 (average classifier).
Выявленные комплексные маркеры панического расстройства определяют предрасположенность к заболеванию независимо друг от друга. Это объясняется независимым нарушением двух нейромедиаторных систем, приводящим к развитию панического расстройства, - серотонинергической (HTR1A и SLC6A4) и холецистокининергической (CCKAR). Таким образом, генотипирование по четырем SNV и определение сочетания аллелей и генотипов позволяет предсказывать риск развития панического расстройства: сочетание HTR1A_rs6295:C+SLC6A4_rs3813034:CC увеличивает риск развития в 2 раза, а сочетание аллелей CCKAR_rs 1799723:А+CCKAR_rs1800908:Т - более чем в 3 раза.Identified complex markers of panic disorder determine the predisposition to the disease independently of each other. This is due to an independent violation of two neurotransmitter systems, leading to the development of panic disorder - serotonergic (HTR1A and SLC6A4) and cholecystokininergic (CCKAR). Thus, genotyping by four SNVs and determining the combination of alleles and genotypes allows us to predict the risk of panic disorder: the combination of HTR1A_rs6295: C + SLC6A4_rs3813034: CC increases the risk of development by 2 times, and the combination of alleles CCKAR_rs 1799723: A + CCKAR_rs1800908: more than 3 times.
Заявленный способ позволяет выявить индивидов с высокой степенью риска развития панического расстройства.The claimed method allows to identify individuals with a high degree of risk of panic disorder.
Осуществление изобретенияThe implementation of the invention
Авторами изобретения было обнаружено, что большая часть генетических маркеров, которые, по данным из различных источников, ассоциированы с развитием психических заболеваний у их носителей, не могут быть использованы для осуществления диагностики предрасположенности к паническому расстройству. Авторы предлагают выявлять аллельные генотипы (однонуклеотидные замены) в 4-х генах: (rs1800908 и rs1799723 в гене CCKAR, rs6295 в гене HTR1A, rs3813034 в гене SLC6A4), для которых ими была показана высокая степень ассоциации наличия определенного генотипа с относительным риском заболеваемости психическим расстройством. Выявление замен может быть осуществлено с использованием известных методов молекулярной генетики (ПЦР, ПЦР-ПДРФ, аллель-специфичная ПЦР, аллель-специфичная ПЦР в реальном времени, ПЦР в реальном времени с использованием флуоресцентно-меченых зондов и/или праймеров, секвенирование, секвенирование нового поколения, пиросеквенирование, биочипы и др.).The inventors found that most of the genetic markers, which, according to various sources, are associated with the development of mental illness in their carriers, cannot be used to diagnose a predisposition to panic disorder. The authors propose identifying allelic genotypes (single nucleotide substitutions) in 4 genes: (rs1800908 and rs1799723 in the CCKAR gene, rs6295 in the HTR1A gene, rs3813034 in the SLC6A4 gene), for which they showed a high degree of association of the presence of a particular genotype with a relative risk of illness upset. Identification of substitutions can be carried out using known methods of molecular genetics (PCR, PCR-RFLP, allele-specific PCR, allele-specific real-time PCR, real-time PCR using fluorescently-labeled probes and / or primers, sequencing, sequencing of a new generations, pyrosequencing, biochips, etc.).
На начальном этапе генотипирования производится сбор биологических образцов, которыми может служить указанные в таблице 2 биоматериалы. 
ДНК выделяют из цельной данных образцов с помощью набора Magna™ DNA Prep 100, основанного на использовании гуанидинтиоционата и магнитных намагниченных стеклянных шариков в присутствии высокой концентрации хаотропного агента (ООО «Лаборатория Изоген», Россия).DNA is isolated from whole sample data using the Magna ™ DNA Prep 100 kit, based on the use of guanidine thiocyanate and magnetic magnetized glass beads in the presence of a high concentration of a chaotropic agent (Isogen Laboratory LLC, Russia).
Для проведения ПЦР-ПДРФ используют лиофилизированные готовые наборы GenPak® PCR Core (ООО «Лаборатория Изоген», Россия) или готовую смесь для ПЦР ScreenMix-HS (ЗАО «Евроген», Россия). Праймеры и условия ПЦР реакции, а также ферменты рестрикции и условия рестрикции описаны в таблице 3. Амплификацию проводят в амплификаторе Applied Biosystems 9700 (GeneAmp® PCR System 9700) или T-100 (Bio-Rad, USA). Визуализацию результатов ПЦР-ПДРФ осуществляют в 2% (rs3813034) и 2.5% (rs1799723 и rs1800908) агарозном геле с добавлением бромистого этидия.To carry out PCR-RFLP, lyophilized ready-made sets of GenPak® PCR Core (Isogen Laboratory LLC, Russia) or ScreenMix-HS ready-mix for PCR (ZAO Evrogen, Russia) are used. Primers and PCR reaction conditions, as well as restriction enzymes and restriction conditions are described in Table 3. Amplification is carried out in an Applied Biosystems 9700 (GeneAmp® PCR System 9700) or T-100 (Bio-Rad, USA) thermocycler. Visualization of the results of PCR-RFLP is carried out in 2% (rs3813034) and 2.5% (rs1799723 and rs1800908) agarose gel with the addition of ethidium bromide.
Замены в гене CCKAR (rs1799723 и rs1800908) детектируются одновременно за счет внесения в оба праймера замен, образующих при наличии аллеля rs1800908_G и аллеля rs1799723_G сайты узнавания рестриктазы HinfI (НПО «СибЭнзим», Россия). Теоретически можно выявить девять различных генотипов по двум исследуемым заменам. Однако в ходе эксперимента в анализированной нами выборке удалось обнаружить только четыре генотипа (I - GG, АА; II - GT, АА; III - GT, AG; IV -,GG, AG). На электрофореграмме генотипу I - соответствует одна полоса 103 п.н., II генотипу - три полосы 103, 70 и 33 п.н., III генотипу, - четыре полосы 103, 50, 33 и 20 п.н. и IV генотипу - три полосы 103, 83 и 20 п.н. Картина электрофоретического разделения рестрикционных фрагментов представлена на Фиг. 1.Substitutions in the CCKAR gene (rs1799723 and rs1800908) are detected simultaneously by making substitutions in both primers that form HinfI restriction enzyme recognition sites in the presence of the rs1800908_G allele and the rs1799723_G allele (SibEnzyme, Russia). Theoretically, nine different genotypes can be identified by two studied substitutions. However, during the experiment in the sample we analyzed, only four genotypes were found (I - GG, AA; II - GT, AA; III - GT, AG; IV -, GG, AG). On the electrophoregram, genotype I - corresponds to one band of 103 bp, II genotype - three bands of 103, 70 and 33 bp, III genotype - four bands of 103, 50, 33 and 20 bp and IV genotype - three bands 103, 83 and 20 bp The picture of electrophoretic separation of restriction fragments is shown in FIG. one.
Замена rs6295 в гене HTR1A не попадает ни на один известный сайт рестрикции, поэтому для ее детекции сконструирован измененный обратный праймер. Внесенная в праймер замена приводит к появлению сайта ACGT, узнаваемого эндонуклеазой HpySE526 I (НПО «СибЭнзим», Россия).The replacement of rs6295 in the HTR1A gene does not fall on any known restriction site; therefore, a modified reverse primer was designed for its detection. The replacement introduced into the primer leads to the appearance of the ACGT site recognized by the endonuclease HpySE526 I (NPO SibEnzyme, Russia).
Для проведения ПЦР в реальном времени используют лиофилизированные готовые наборы GenPak® PCR Core (ООО «Лаборатория Изоген», Россия) или готовую смесь для ПЦР ScreenMix-HS (ЗАО «Евроген», Россия) или SsoAdvanced Universal Probes Supermix (BioRad, США). Последовательности праймеров и зондов, а также условия ПЦР описаны в таблице 3. Амплификацию проводят в амплификаторе CFX-96 (Bio-Rad, USA) или 7500 Real Time PCR System (Applied Biosystems, США) с использованием протокола Allelic discrimination test, входящим в стандартное программное обеспечение к прибору.For real-time PCR, lyophilized ready-made GenPak® PCR Core kits (Isogen Laboratory LLC, Russia) or ScreenMix-HS PCR ready mix (CJSC Evrogen, Russia) or SsoAdvanced Universal Probes Supermix (BioRad, USA) are used. The sequences of primers and probes, as well as the PCR conditions are described in table 3. Amplification is carried out in a CFX-96 amplifier (Bio-Rad, USA) or 7500 Real Time PCR System (Applied Biosystems, USA) using the standard Allelic discrimination test protocol included in the standard software for the device.
Для выявления сочетаний аллелей и генотипов, ассоциированных с паническим расстройством, была использована программа APSampler 3.6.1 (Favorov et al., 2005).To identify combinations of alleles and genotypes associated with panic disorder, the APSampler 3.6.1 program was used (Favorov et al., 2005).
Табл. 5.Tab. 5.
Последовательности нуклеотидов праймеров и зондов (от 5' к 3' концу), которые могут применяться для выявления однонуклеотидных замен согласно изобретению в методах ПЦР, ПЦР-ПДРФ, аллель-специфичной ПЦР, аллель-специфичной ПЦР в реальном времени, ПЦР в реальном времени с использованием флуоресцентно-меченых зондов и/или праймеров, секвенировании, секвенировании нового поколения, пиросеквенировании, биочипах и других известных молекулярно-биологических методах, требующих гибридизации исследуемой ДНК с олигонуклеотидными фрагментами длиной 15-90 н.о.The nucleotide sequences of primers and probes (from 5 'to 3' end) that can be used to detect single nucleotide substitutions according to the invention in the methods of PCR, PCR-RFLP, allele-specific PCR, allele-specific PCR in real time, real-time PCR with using fluorescently-labeled probes and / or primers, sequencing, next-generation sequencing, pyrosequencing, biochips and other known molecular biological methods requiring hybridization of the studied DNA with oligonucleotide length fragments oh 15-90 n.o.
В нижеследующих примерах приведены доказательства возможности реализации заявленного назначения и достижения указанного технического результата.The following examples provide evidence of the feasibility of the claimed purpose and the achievement of the specified technical result.
Пример 1. Пациент из исследованной группы (образец №085).Example 1. A patient from the studied group (sample No. 085).
Диагноз: паническое расстройствоDiagnosis: panic disorder
Возраст: 43 годаAge 43 years old
Длительность заболевания: 8 летDuration of illness: 8 years
Частота приступов в месяц за последние полгода: 1,7The frequency of seizures per month over the past six months: 1.7
Провокаторы приступа: нет закономерностиAttack provocateurs: no pattern
Время возникновения приступа: нет закономерностиThe time of occurrence of the attack: there is no pattern
Представленность симптомов панических атак: 4 симптома и болееRepresentation of symptoms of panic attacks: 4 symptoms or more
Биоматериал: венозная кровьBiomaterial: venous blood
Генотип пациента:Patient Genotype:
HTR1A (rs6295): CGHTR1A (rs6295): CG
SLC6A4 (rs3813034): ССSLC6A4 (rs3813034): SS
CCKAR (rs1799723): AGCCKAR (rs1799723): AG
CCKAR (rs1800908): GTCCKAR (rs1800908): GT
Присутствуют оба маркера: HTR1A_rs6295: C + SLC6A4_rs3813034: CC и CCKAR_rs1799723: A + CCKAR_rs1800908: TBoth markers are present: HTR1A_rs6295: C + SLC6A4_rs3813034: CC and CCKAR_rs1799723: A + CCKAR_rs1800908: T
Сделан вывод о генетически обусловленной предрасположенности к развитию панического расстройства.The conclusion is made about a genetically determined predisposition to the development of panic disorder.
Пример 2. Пациент не входит в исследованную группу по причине несоответствия критериям включения в исследование.Example 2. The patient is not included in the study group due to non-compliance with the criteria for inclusion in the study.
Диагноз: паническое расстройствоDiagnosis: panic disorder
Возраст: 36 летAge 36 years old
Длительность заболевания: 11 летDuration of illness: 11 years
Частота приступов в месяц за последние полгода: 0,8The frequency of seizures per month over the past six months: 0.8
Провокаторы приступа: публичные выступленияAttack provocateurs: public speaking
Время возникновения приступа: день, рабочее времяSeizure time: day, working hours
Представленность симптомов панических атак: 3-4 симптомаRepresentation of symptoms of panic attacks: 3-4 symptoms
Биоматериал: букальный эпителийBiomaterial: buccal epithelium
Генотип пациента:Patient Genotype:
HTR1A (rs6295): CGHTR1A (rs6295): CG
SLC6A4 (rs3813034): ССSLC6A4 (rs3813034): SS
CCKAR (rs1799723): ААCCKAR (rs1799723): AA
CCKAR (rs1800908): GGCCKAR (rs1800908): GG
Присутствует один маркер: HTR1A_rs6295: C + SLC6A4_rs3813034: CC.One marker is present: HTR1A_rs6295: C + SLC6A4_rs3813034: CC.
Сделан вывод о генетически обусловленной предрасположенности к развитию панического расстройства.The conclusion is made about a genetically determined predisposition to the development of panic disorder.
Пример 3. Индивид из группы контроля (№003).Example 3. An individual from the control group (No. 003).
Диагноз: неизвестенDiagnosis: unknown
Возраст: 27 летAge 27 years old
Биоматериал: венозная кровьBiomaterial: venous blood
Генотип пациента:Patient Genotype:
HTR1A (rs6295): CGHTR1A (rs6295): CG
SLC6A4 (rs3813034): ACSLC6A4 (rs3813034): AC
CCKAR (rs1799723): AACCKAR (rs1799723): AA
CCKAR (rs1800908): GGCCKAR (rs1800908): GG
Ассоциированных с паническим расстройством маркеров не выявлено, сделан вывод об отсутствии у пациента наследственной предрасположенности к развитию данного заболевания.No markers associated with panic disorder have been identified, it is concluded that the patient has no hereditary predisposition to the development of this disease.
Пример 3. Здоровый индивид (нет панического расстройства).Example 3. A healthy individual (no panic disorder).
Возраст: 39 летAge 39 years old
Биоматериал: букальный эпителийBiomaterial: buccal epithelium
Генотип пациента:Patient Genotype:
HTR1A (rs6295): CGHTR1A (rs6295): CG
SLC6A4 (rs3813034): ААSLC6A4 (rs3813034): AA
CCKAR (rs1799723): ААCCKAR (rs1799723): AA
CCKAR (rs1800908): GGCCKAR (rs1800908): GG
Ассоциированных с паническим расстройством маркеров не выявлено, сделан вывод об отсутствии у пациента наследственной предрасположенности к развитию данного заболевания.No markers associated with panic disorder have been identified, it is concluded that the patient has no hereditary predisposition to the development of this disease.
СПИСОК ЦИТИРУЕМОЙ ЛИТЕРАТУРЫLIST OF REFERENCES
1. Коробейникова Л.А., Азимова Ю.Э., Фокина Н.М., Рудько О.И., Климов Е.А. Частоты аллелей генов ССК, CCK1R и CCK2R у жителей Москвы, страдающих паническими расстройствами // Медицинская генетика. - 2011. - Т. 10, №3. - С. 37-42.1. Korobeinikova L.A., Azimova Yu.E., Fokina N.M., Rudko O.I., Klimov E.A. Allele frequencies of the CCK, CCK1R, and CCK2R genes in Moscow residents suffering from panic disorders // Medical Genetics. - 2011. - T. 10, No. 3. - S. 37-42.
2. Коробейникова Л.А., Рудько О.И., Азимова Ю.Э., Фокина Н.М., Климов Е.А. Генетические основы предрасположенности к паническому расстройству // Успехи современной биологии. - 2012. - Т. 132, №1. - С. 21-35.2. Korobeinikova L.A., Rudko O.I., Azimova Yu.E., Fokina N.M., Klimov E.A. Genetic basis of predisposition to panic disorder // Successes in modern biology. - 2012. - T. 132, No. 1. - S. 21-35.
3. Bruce S.Е., Yonkers K.A., Otto М.W., Eisen J.L., Weisberg R.В., Pagano M., Shea M.Т., Keller M.B. Influence of psychiatric comorbidity on recovery and recurrence in generalized anxiety disorder, social phobia, and panic disorder: a 12-year prospective study // Am J Psychiatry. - 2005. - T. 162, №6. - С. 1179-87.3. Bruce S.E., Yonkers K.A., Otto M.W., Eisen J.L., Weisberg R.V., Pagano M., Shea M.T., Keller M..B. Influence of psychiatric comorbidity on recovery and recurrence in generalized anxiety disorder, social phobia, and panic disorder: a 12-year prospective study // Am J Psychiatry. - 2005. - T. 162, No. 6. - S. 1179-87.
4. Crowe R.R., Noyes R., Pauls D.L., Slymen D.A family study of panic disorder // Arch Gen Psychiatry. - 1983. - T. 40, №10. - C. 1065-9.4. Crowe R.R., Noyes R., Pauls D.L., Slymen D.A. family study of panic disorder // Arch Gen Psychiatry. - 1983. - T. 40, No. 10. - C. 1065-9.
5. Davidoff J., Christensen S., Khalili D.N., Nguyen J., IsHak W.W. Quality of life in panic disorder: looking beyond symptom remission // Qual Life Res. - 2012. - T. 21, №6. - C. 945-59.5. Davidoff J., Christensen S., Khalili D.N., Nguyen J., IsHak W.W. Quality of life in panic disorder: looking beyond symptom remission // Qual Life Res. - 2012. - T. 21, No. 6. - C. 945-59.
6. Deckert J., Catalano M., Syagailo Y.V., Bosi M., Okladnova O., Di Bella D., Nothen M.M., Maffei P., Franke P., Fritze J., Maier W., Propping P., Beckmann H., Bellodi L., Lesch K.P. Excess of high activity monoamine oxidase A gene promoter alleles in female patients with panic disorder // Hum Mol Genet. - 1999. - T. 8, №4. - C. 621-4.6. Deckert J., Catalano M., Syagailo YV, Bosi M., Okladnova O., Di Bella D., Nothen MM, Maffei P., Franke P., Fritze J., Maier W., Propping P., Beckmann H., Bellodi L., Lesch KP Excess of high activity monoamine oxidase A gene promoter alleles in female patients with panic disorder // Hum Mol Genet. - 1999. - T. 8, No. 4. - C. 621-4.
7. Deckert J., Nothen M.M., Franke P., Delmo C, Fritze J., Knapp M, Maier W., Beckmann H., Propping P. Systematic mutation screening and association study of the A1 and A2a adenosine receptor genes in panic disorder suggest a contribution of the A2a gene to the development of disease // Mol Psychiatry. - 1998. - T. 3, №1. - C. 81-5.7. Deckert J., Nothen MM, Franke P., Delmo C, Fritze J., Knapp M, Maier W., Beckmann H., Propping P. Systematic mutation screening and association study of the A1 and A2a adenosine receptor genes in panic disorder suggest a contribution of the A2a gene to the development of disease // Mol Psychiatry. - 1998. - T. 3, No. 1. - C. 81-5.
8. Domschke K., Freitag С.M., Kuhlenbaumer G., Schirmacher A., Sand P., Nyhuis P., Jacob C., Fritze J., Franke P., Rietschel M., Garritsen H.S., Fimmers R., Nothen M.M., Lesch K.P., Stogbauer F., Deckert J. Association of the functional V158M catechol-O-methyl-transferase polymorphism with panic disorder in women // Int J Neuropsychopharmacol. - 2004. - T. 7, №2. - C. 183-8.8. Domschke K., Freitag C. M., Kuhlenbaumer G., Schirmacher A., Sand P., Nyhuis P., Jacob C., Fritze J., Franke P., Rietschel M., Garritsen HS, Fimmers R. , Nothen MM, Lesch KP, Stogbauer F., Deckert J. Association of the functional V158M catechol-O-methyl-transferase polymorphism with panic disorder in women // Int J Neuropsychopharmacol. - 2004. - T. 7, No. 2. - C. 183-8.
9. Eaton W.W., Kessler R.C., Wittchen H.U., Magee W.J. Panic and panic disorder in the United States // Am J Psychiatry. - 1994. - T. 151, №3. - C. 413-20.9. Eaton W.W., Kessler R.C., Wittchen H.U., Magee W.J. Panic and panic disorder in the United States // Am J Psychiatry. - 1994. - T. 151, No. 3. - C. 413-20.
10. Ebihara M., Ohba H., Hattori E., Yamada K., Yoshikawa T. Transcriptional activities of cholecystokinin promoter haplotypes and their relevance to panic disorder susceptibility // Am J Med Genet В Neuropsychiatr Genet. - 2003. - Т. 118B, №1. - C. 32-5.10. Ebihara M., Ohba H., Hattori E., Yamada K., Yoshikawa T. Transcriptional activities of cholecystokinin promoter haplotypes and their relevance to panic disorder susceptibility // Am J Med Genet In Neuropsychiatr Genet. - 2003. - T. 118B, No. 1. - C. 32-5.
11. Erhardt A., Akula N., Schumacher J., Czamara D., Karbalai N., Muller-Myhsok В., Mors O., Borglum A., Kristensen A.S., Woldbye D.P., Koefoed P., Eriksson E., Maron E., Metspalu A., Nurnberger J., Philibert R.A., Kennedy J., Domschke K., Reif A., Deckert J., Otowa Т., Kawamura Y., Kaiya H., Okazaki Y., Tanii H., Tokunaga K., Sasaki Т., Ioannidis J.P., McMahon F.J., Binder E.B. Replication and meta-analysis of TMEM132D gene variants in panic disorder // Transl Psychiatry. - 2012. - T. 2. - C. e156.11. Erhardt A., Akula N., Schumacher J., Czamara D., Karbalai N., Muller-Myhsok B., Mors O., Borglum A., Kristensen AS, Woldbye DP, Koefoed P., Eriksson E., Maron E., Metspalu A., Nurnberger J., Philibert RA, Kennedy J., Domschke K., Reif A., Deckert J., Otowa T., Kawamura Y., Kaiya H., Okazaki Y., Tanii H. , Tokunaga K., Sasaki T., Ioannidis JP, McMahon FJ, Binder EB Replication and meta-analysis of TMEM132D gene variants in panic disorder // Transl Psychiatry. - 2012. - T. 2. - C. e156.
12. Erhardt A., Czibere L., Roeske D., Lucae S., Unschuld P. G., Ripke S., Specht M., Kohli M.A., Kloiber S., Ising M., Heck A., Pfister H., Zimmermann P., Lieb R., Putz B., Uhr M., Weber P., Deussing J.M., Gonik M., Bunck M., Kebler M.S., Frank E., Hohoff C, Domschke K., Krakowitzky P., Maier W., Bandelow В., Jacob C, Deckert J., Schreiber S., Strohmaier J., Nothen M., Cichon S., Rietschel M., Bettecken Т., Keck М.Е., Landgraf R., Muller-Myhsok В., Holsboer F., Binder E.B. TMEM132D, a new candidate for anxiety phenotypes: evidence from human and mouse studies // Mol Psychiatry. - 2011. - T. 16, №6. - C. 647-63.12. Erhardt A., Czibere L., Roeske D., Lucae S., Unschuld PG, Ripke S., Specht M., Kohli MA, Kloiber S., Ising M., Heck A., Pfister H., Zimmermann P ., Lieb R., Putz B., Uhr M., Weber P., Deussing JM, Gonik M., Bunck M., Kebler MS, Frank E., Hohoff C, Domschke K., Krakowitzky P., Maier W. , Bandelow B., Jacob C, Deckert J., Schreiber S., Strohmaier J., Nothen M., Cichon S., Rietschel M., Bettecken T., Keck M.E., Landgraf R., Muller-Myhsok B ., Holsboer F., Binder EB TMEM132D, a new candidate for anxiety phenotypes: evidence from human and mouse studies // Mol Psychiatry. - 2011. - T. 16, No. 6. - C. 647-63.
13. Favorov A.V., Andreewski Т.V., Sudomoina M.A., Favorova О.O., Parmigiani G., Ochs M.F.A Markov chain Monte Carlo technique for identification of combinations of allelic variants underlying complex diseases in humans // Genetics. - 2005. - T. 171, №4. - C. 2113-21.13. Favorov A.V., Andreewski T.V., Sudomoina M.A., Favorova O.O., Parmigiani G., Ochs M.F.A Markov chain Monte Carlo technique for identification of combinations of allelic variants underlying complex diseases in humans // Genetics. - 2005. - T. 171, No. 4. - C. 2113-21.
14. Goldstein R.В., Wickramaratne P.J., Horwath E., Weissman M.M. Familial aggregation and phenomenology of 'early'-onset (at or before age 20 years) panic disorder // Arch Gen Psychiatry. - 1997. - T. 54, №3. - C. 271-8.14. Goldstein R.V., Wickramaratne P.J., Horwath E., Weissman M.M. Familial aggregation and phenomenology of 'early'-onset (at or before age 20 years) panic disorder // Arch Gen Psychiatry. - 1997. - T. 54, No. 3. - C. 271-8.
15. Hamilton S.P., Slager S.L., De Leon А.В., Heiman G.A., Klein D.F., Hodge S.E., Weissman M.M., Fyer A.J., Knowles J.A. Evidence for genetic linkage between a polymorphism in the adenosine 2A receptor and panic disorder // Neuropsychopharmacology. - 2004. - T. 29, №3. - C. 558-65.15. Hamilton S.P., Slager S.L., De Leon A.V., Heiman G.A., Klein D.F., Hodge S.E., Weissman M.M., Fyer A.J., Knowles J.A. Evidence for genetic linkage between a polymorphism in the adenosine 2A receptor and panic disorder // Neuropsychopharmacology. - 2004. - T. 29, No. 3. - C. 558-65.
16. Hamilton S.P., Slager S.L., Heiman G.A., Deng Z., Haghighi F., Klein D.F., Hodge S.E., Weissman M.M., Fyer A.J., Knowles J.A. Evidence for a susceptibility locus for panic disorder near the catechol-O-methyltransferase gene on chromosome 22 // Biol Psychiatry. - 2002. - T. 51, №7. - C. 591-601.16. Hamilton S.P., Slager S.L., Heiman G.A., Deng Z., Haghighi F., Klein D.F., Hodge S.E., Weissman M.M., Fyer A.J., Knowles J.A. Evidence for a susceptibility locus for panic disorder near the catechol-O-methyltransferase gene on chromosome 22 // Biol Psychiatry. - 2002. - T. 51, No. 7. - C. 591-601.
17. Han E.J., Kim Y.K., Hwang J.A., Kim S.H., Lee H.J., Yoon H.K., Na K.S. Evidence for Association between the Brain-Derived Neurotrophic Factor Gene and Panic Disorder: A Novel Haplotype Analysis // Psychiatry Investig. - 2015. - T. 12, №1. C. 112-7.17. Han E.J., Kim Y.K., Hwang J.A., Kim S.H., Lee H.J., Yoon H.K., Na K.S. Evidence for Association between the Brain-Derived Neurotrophic Factor Gene and Panic Disorder: A Novel Haplotype Analysis // Psychiatry Investig. - 2015. - T. 12, No. 1. C. 112-7.
18. Hattori E., Ebihara M., Yamada K., Ohba H., Shibuya H., Yoshikawa T. Identification of a compound short tandem repeat stretch in the 5'-upstream region of the cholecystokinin gene, and its association with panic disorder but not with schizophrenia // Mol Psychiatry. - 2001. - T. 6, №4. - C. 465-70.18. Hattori E., Ebihara M., Yamada K., Ohba H., Shibuya H., Yoshikawa T. Identification of a compound short tandem repeat stretch in the 5'-upstream region of the cholecystokinin gene, and its association with panic disorder but not with schizophrenia // Mol Psychiatry. - 2001. - T. 6, No. 4. - C. 465-70.
19. Hattori E., Yamada K., Toyota Т., Yoshitsugu K., Tom M., Shibuya H., Yoshikawa T. Association studies of the CT repeat polymorphism in the 5' upstream region of the cholecystokinin В receptor gene with panic disorder and schizophrenia in Japanese subjects // Am J Med Genet. - 2001. - T. 105, №8. - C. 779-82.19. Hattori E., Yamada K., Toyota T., Yoshitsugu K., Tom M., Shibuya H., Yoshikawa T. Association studies of the CT repeat polymorphism in the 5 'upstream region of the cholecystokinin B receptor gene with panic disorder and schizophrenia in Japanese subjects // Am J Med Genet. - 2001. - T. 105, No. 8. - C. 779-82.
20. Hettema J.M., Neale M.C, Kendler K.S. A review and meta-analysis of the genetic epidemiology of anxiety disorders // Am J Psychiatry. - 2001. - T. 158, №10. - C. 1568-78.20. Hettema J.M., Neale M.C., Kendler K.S. A review and meta-analysis of the genetic epidemiology of anxiety disorders // Am J Psychiatry. - 2001. - T. 158, No. 10. - C. 1568-78.
21. Hosing V.G., Schumacher A., Kuhlenbaumer G., Freitag C, Sand P., Schlesiger C, Jacob C, Fritze J., Franke P., Rietschel M., Garritsen H., Nothen M.M., Fimmers R., Stogbauer F., Deckert J. Cholecystokinin- and cholecystokinin-B-receptor gene polymorphisms in panic disorder // J Neural Transm Suppl. - 2004. №68. - C. 147-56.21. Hosing VG, Schumacher A., Kuhlenbaumer G., Freitag C, Sand P., Schlesiger C, Jacob C, Fritze J., Franke P., Rietschel M., Garritsen H., Nothen MM, Fimmers R., Stogbauer F., Deckert J. Cholecystokinin- and cholecystokinin-B-receptor gene polymorphisms in panic disorder // J Neural Transm Suppl. - 2004. No. 68. - C. 147-56.
22. Inada Y., Yoneda H., Koh J., Sakai J., Himei A., Kinoshita Y., Akabame K., Hiraoka Y., Sakai T. Positive association between panic disorder and polymorphism of the serotonin 2A receptor gene // Psychiatry Res. - 2003. - Т. 118, №1. - C. 25-31.22. Inada Y., Yoneda H., Koh J., Sakai J., Himei A., Kinoshita Y., Akabame K., Hiraoka Y., Sakai T. Positive association between panic disorder and polymorphism of the serotonin 2A receptor gene // Psychiatry Res. - 2003. - T. 118, No. 1. - C. 25-31.
23. Karacetin G., Bayoglu В., Cengiz M., Demir Т., Kocabasoglu N., Uysal O., Bayar R., Balcioglu I. Serotonin-2A receptor and catechol-O-methyltransferase polymorphisms in panic disorder // Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry. - 2012. - T. 36, №1. - C. 5-10.23. Karacetin G., Bayoglu B., Cengiz M., Demir T., Kocabasoglu N., Uysal O., Bayar R., Balcioglu I. Serotonin-2A receptor and catechol-O-methyltransferase polymorphisms in panic disorder // Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry. - 2012. - T. 36, No. 1. - C. 5-10.
24. Kennedy J.L., Bradwejn J., Koszycki D., King N., Crowe R., Vincent J., Fourie O. Investigation of cholecystokinin system genes in panic disorder // Mol Psychiatry. - 1999. - T. 4, №3. - C. 284-5.24. Kennedy J.L., Bradwejn J., Koszycki D., King N., Crowe R., Vincent J., Fourie O. Investigation of cholecystokinin system genes in panic disorder // Mol Psychiatry. - 1999. - T. 4, No. 3. - C. 284-5.
25. Kessler R.C, Chiu W.Т., Jin R., Ruscio A.M., Shear K., Walters E.E. The epidemiology of panic attacks, panic disorder, and agoraphobia in the National Comorbidity Survey Replication // Arch Gen Psychiatry. - 2006. - T. 63, №4. - C. 415-24.25. Kessler R.C., Chiu W.T., Jin R., Ruscio A.M., Shear K., Walters E.E. The epidemiology of panic attacks, panic disorder, and agoraphobia in the National Comorbidity Survey Replication // Arch Gen Psychiatry. - 2006. - T. 63, No. 4. - C. 415-24.
26. Koefoed P., Woldbye D.P., Hansen Т.O., Hansen E.S., Knudsen G.M., Bolwig T.G., Rehfeld J.F. Gene variations in the cholecystokinin system in patients with panic disorder // Psychiatr Genet. - 2010. - T. 20, №2. - C. 59-64.26. Koefoed P., Woldbye D.P., Hansen T.O., Hansen E.S., Knudsen G.M., Bolwig T.G., Rehfeld J.F. Gene variations in the cholecystokinin system in patients with panic disorder // Psychiatr Genet. - 2010. - T. 20, No. 2. - C. 59-64.
27. Konishi Y., Tanii H., Otowa Т., Sasaki Т., Tochigi M., Umekage Т., Motomura E., Shiroyama Т., Kaiya H., Okazaki Y., Okada M. Genexgenexgender interaction of BDNF and COMT genotypes associated with panic disorder // Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry. - 2014. - T. 51. - С. 119-25.27. Konishi Y., Tanii H., Otowa T., Sasaki T., Tochigi M., Umekage T., Motomura E., Shiroyama T., Kaiya H., Okazaki Y., Okada M. Genexgenexgender interaction of BDNF and COMT genotypes associated with panic disorder // Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry. - 2014 .-- T. 51. - S. 119-25.
28. Maron E., Lang A., Tasa G., Liivlaid L., Tom I., Must A., Vasar V., Shlik J. Associations between serotonin-related gene polymorphisms and panic disorder // Int J Neuropsychopharmacol. - 2005. - T. 8, №2. - C. 261-6.28. Maron E., Lang A., Tasa G., Liivlaid L., Tom I., Must A., Vasar V., Shlik J. Associations between serotonin-related gene polymorphisms and panic disorder // Int J Neuropsychopharmacol. - 2005. - T. 8, No. 2. - C. 261-6.
29. Muinos-Gimeno M., Espinosa-Parrilla Y., Guidi M., Kagerbauer В., Sipila Т., Maron E., Pettai K., Kananen L., Navines R., Martin-Santos R., Gratacos M., Metspalu A., Hovatta I., Estivill X. Human microRNAs miR-22, miR-138-2, miR-148a, and miR-488 are associated with panic disorder and regulate several anxiety candidate genes and related pathways // Biol Psychiatry. - 2011. - T. 69, №6. - C. 526-33.29. Muinos-Gimeno M., Espinosa-Parrilla Y., Guidi M., Kagerbauer B., Sipila T., Maron E., Pettai K., Kananen L., Navines R., Martin-Santos R., Gratacos M ., Metspalu A., Hovatta I., Estivill X. Human microRNAs miR-22, miR-138-2, miR-148a, and miR-488 are associated with panic disorder and regulate several anxiety candidate genes and related pathways // Biol Psychiatry. - 2011. - T. 69, No. 6. - C. 526-33.
30. Na H.R., Kang E.H., Lee J.H., Yu В.H. The genetic basis of panic disorder // J Korean Med Sci. - 2011. - T. 26, №6. - C. 701 -10.30. Na H.R., Kang E.H., Lee J.H., Yu B.H. The genetic basis of panic disorder // J Korean Med Sci. - 2011. - T. 26, No. 6. - C. 701-10.
31. Otowa Т., Kawamura Y., Sugaya N., Yoshida E., Shimada Т., Liu X., Tochigi M., Umekage Т., Miyagawa Т., Nishida N., Kaiya H., Okazaki Y., Tokunaga K., Sasaki T. Association study of PDE4B with panic disorder in the Japanese population // Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry. - 2011. - T. 35, №2. - C. 545-9.31. Otowa T., Kawamura Y., Sugaya N., Yoshida E., Shimada T., Liu X., Tochigi M., Umekage T., Miyagawa T., Nishida N., Kaiya H., Okazaki Y., Tokunaga K., Sasaki T. Association study of PDE4B with panic disorder in the Japanese population // Prog Neuropsychopharmacol Biol Psychiatry. - 2011. - T. 35, No. 2. - C. 545-9.
32. Rothe C, Gutknecht L., Freitag C., Tauber R., Mossner R., Franke P., Fritze J., Wagner G., Peikert G., Wenda В., Sand P., Jacob C., Rietschel M., Nothen M.M., Garritsen H., Fimmers R., Deckert J., Lesch K.P. Association of a functional 1019C>5-HT1A receptor gene polymorphism with panic disorder with agoraphobia // Int J Neuropsychopharmacol. - 2004. - T. 7, №2. - C. 189-92.32. Rothe C, Gutknecht L., Freitag C., Tauber R., Mossner R., Franke P., Fritze J., Wagner G., Peikert G., Wenda B., Sand P., Jacob C., Rietschel M., Nothen MM, Garritsen H., Fimmers R., Deckert J., Lesch KP Association of a functional 1019C> 5-HT1A receptor gene polymorphism with panic disorder with agoraphobia // Int J Neuropsychopharmacol. - 2004. - T. 7, No. 2. - C. 189-92.
33. Rothe C., Koszycki D., Bradwejn J., King N., De Luca V., Shaikh S., Franke P., Garritsen H., Fritze J., Deckert J., Kennedy J. L. Association study of serotonin-2A receptor gene polymorphism and panic disorder in patients from Canada and Germany // Neurosci Lett. - 2004. - T. 363, №3. - C. 276-9.33. Rothe C., Koszycki D., Bradwejn J., King N., De Luca V., Shaikh S., Franke P., Garritsen H., Fritze J., Deckert J., Kennedy JL Association study of serotonin- 2A receptor gene polymorphism and panic disorder in patients from Canada and Germany // Neurosci Lett. - 2004. - T. 363, No. 3. - C. 276-9.
34. Rothe C, Koszycki D., Bradwejn J., King N., Deluca V., Tharmalingam S., Macciardi F., Deckert J., Kennedy J. L. Association of the Vall58Met catechol O-methyltransferase genetic polymorphism with panic disorder // Neuropsychopharmacology. - 2006. - T. 31, №10. - C. 2237-42.34. Rothe C, Koszycki D., Bradwejn J., King N., Deluca V., Tharmalingam S., Macciardi F., Deckert J., Kennedy JL Association of the Vall58 Met catechol O-methyltransferase genetic polymorphism with panic disorder // Neuropsychopharmacology. - 2006. - T. 31, No. 10. - C. 2237-42.
35. Schmidt N.В., Trakowski J.H., Staab J.P. Extinction of panicogenic effects of a 35% CO2 challenge in patients with panic disorder // J Abnorm Psychol. - 1997. - T. 106, №4. - C. 630-8.35. Schmidt N.V., Trakowski J.H., Staab J.P. Extinction of panicogenic effects of a 35% CO2 challenge in patients with panic disorder // J Abnorm Psychol. - 1997. - T. 106, No. 4. - C. 630-8.
36. Sherbourne C.D., Wells K.В., Judd L.L. Functioning and well-being of patients with panic disorder // Am J Psychiatry. - 1996. - T. 153, №2. - C. 213-8.36. Sherbourne C.D., Wells K.V., Judd L.L. Functioning and well-being of patients with panic disorder // Am J Psychiatry. - 1996. - T. 153, No. 2. - C. 213-8.
37. Wang Z., Valdes J., Noyes R., Zoega Т., Crowe R.R. Possible association of a cholecystokinin promotor polymorphism (CCK-36CT) with panic disorder // Am J Med Genet. - 1998. - T. 81, №3. - C. 228-34.37. Wang Z., Valdes J., Noyes R., Zoega T., Crowe R.R. Possible association of a cholecystokinin promotor polymorphism (CCK-36CT) with panic disorder // Am J Med Genet. - 1998. - T. 81, No. 3. - C. 228-34.
38. Wilson J., Markie D., Fitches A. Cholecystokinin system genes: associations with panic and other psychiatric disorders // J Affect Disord. - 2012. - T. 136, №3. - C. 902-8.38. Wilson J., Markie D., Fitches A. Cholecystokinin system genes: associations with panic and other psychiatric disorders // J Affect Disord. - 2012. - T. 136, No. 3. - C. 902-8.
39. Woo J.M., Yoon K.S., Choi Y.H., Oh K.S., Lee Y.S., Yu В.H. The association between panic disorder and the L/L genotype of catechol-O-methyltransferase // J Psychiatr Res. - 2004. - T. 38, №4. - C. 365-70.39. Woo J.M., Yoon K.S., Choi Y.H., Oh K.S., Lee Y.S., Yu B.H. The association between panic disorder and the L / L genotype of catechol-O-methyltransferase // J Psychiatr Res. - 2004. - T. 38, No. 4. - C. 365-70.
40. Woo J.M., Yoon K.S., Yu В.H. Catechol O-methyltransferase genetic polymorphism in panic disorder // Am J Psychiatry. - 2002. - T. 159, №10. - C. 1785-7.40. Woo J.M., Yoon K.S., Yu B.H. Catechol O-methyltransferase genetic polymorphism in panic disorder // Am J Psychiatry. - 2002. - T. 159, No. 10. - C. 1785-7.
Claims (6)
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2017117885A RU2650867C1 (en) | 2017-05-23 | 2017-05-23 | Method for determining genetic predisposition to develop panic disorder |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| RU2017117885A RU2650867C1 (en) | 2017-05-23 | 2017-05-23 | Method for determining genetic predisposition to develop panic disorder |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2650867C1 true RU2650867C1 (en) | 2018-04-17 |
Family
ID=61976655
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2017117885A RU2650867C1 (en) | 2017-05-23 | 2017-05-23 | Method for determining genetic predisposition to develop panic disorder |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| RU (1) | RU2650867C1 (en) |
Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6844432B2 (en) * | 2000-12-08 | 2005-01-18 | Riken | Polymorphic DNAs and their use for diagnosis of susceptibility to panic disorder |
-
2017
- 2017-05-23 RU RU2017117885A patent/RU2650867C1/en not_active IP Right Cessation
Patent Citations (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6844432B2 (en) * | 2000-12-08 | 2005-01-18 | Riken | Polymorphic DNAs and their use for diagnosis of susceptibility to panic disorder |
Non-Patent Citations (4)
| Title |
|---|
| BLAYA C. et al. Panic disorder and serotonergic genes (SLC6A4, HTR1A and HTR2A): association and interaction with childhood trauma and parenting, Neuroscience letters, 2010. * |
| KLIMOV E.A. et al. Associations of Polymorphic Variants of CCK, CCKAR, and CCKBR Genes with Panic Disorder, SOP Transactions on Inheritance and Genetic Engineering, 2015. * |
| KLIMOV E.A. et al. Associations of Polymorphic Variants of CCK, CCKAR, and CCKBR Genes with Panic Disorder, SOP Transactions on Inheritance and Genetic Engineering, 2015. КОРОБЕЙНИКОВА Л.А. и др. Генетические основы предрасположенности к паническому расстройству, Успехи современной биологии, 2012. BLAYA C. et al. Panic disorder and serotonergic genes (SLC6A4, HTR1A and HTR2A): association and interaction with childhood trauma and parenting, Neuroscience letters, 2010. * |
| КОРОБЕЙНИКОВА Л.А. и др. Генетические основы предрасположенности к паническому расстройству, Успехи современной биологии, 2012. * |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| Elmore et al. | Identification of a genetic variant associated with abdominal aortic aneurysms on chromosome 3p12. 3 by genome wide association | |
| US20120015838A1 (en) | Method and Kit for Diagnosing Autism Using Gene Expression Profiling | |
| KR20100016525A (en) | Method for determination of progression risk of glaucoma | |
| KR101722107B1 (en) | Diabetes diagnosis and prediction methods using single nucleotide polymorphism based-Genetic Risk Score in Korean | |
| US20210024999A1 (en) | Method of identifying risk for autism | |
| US20110312516A1 (en) | Diagnostic and prognostic use of human bladder cancer-associated micro rnas | |
| KR20190059018A (en) | Method for providing information of prediction and diagnosis of obesity using methylation level of CYP2E1 gene and composition therefor | |
| JP2013520185A (en) | Genetic markers for diagnosis of Lewy body dementia | |
| CN111676283B (en) | Application of mitochondrial DNA single nucleotide polymorphism related to occurrence of high altitude pulmonary edema | |
| CN111560428B (en) | Application of substance for detecting single nucleotide polymorphism of mitochondrial DNA rs3937033 | |
| KR101992792B1 (en) | Method for providing information of prediction and diagnosis of obesity using methylation level of AKR1E2 gene and composition therefor | |
| WO2022183011A9 (en) | Circular rnas for diagnosis of depression and prediction of response to antidepressant treatment | |
| Nishigaki et al. | Mitochondrial haplogroup A is a genetic risk factor for atherothrombotic cerebral infarction in Japanese females | |
| WO2012017867A1 (en) | Method for testing for psychiatric disorder, test kit for psychiatric disorder, and method for evaluating therapeutic agent and/or prevention agent for psychiatric disorder | |
| JP5427352B2 (en) | A method for determining the risk of developing obesity based on genetic polymorphisms associated with human body fat mass | |
| RU2650867C1 (en) | Method for determining genetic predisposition to develop panic disorder | |
| US20080108076A1 (en) | Genes associated with unipolar depression | |
| CN115873947A (en) | Nasopharyngeal darcinoma genetic risk assessment system | |
| JP2011135838A (en) | Marker, method and kit for judging liability to age-related macular degeneration | |
| US20140194310A1 (en) | Genes dysregulated in autism as biomarkers and targets for therapeutic pathways | |
| CN113166810A (en) | SNP marker for diagnosing cerebral aneurysm including single base polymorphism of GBA gene | |
| CN107385076B (en) | A kind of hypothyroidism Disease-causing gene mutation and the diagnostic reagent based on this gene mutation | |
| US20140045717A1 (en) | Single Nucleotide Polymorphism Biomarkers for Diagnosing Autism | |
| CN105765077B (en) | Detection method for determining risk of anti-thyroid drug-induced agranulocytosis and kit for determination | |
| WO2023112946A1 (en) | Data collection method and kit for determining likelihood of developing alzheimer's disease |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20190524 |