RU2636620C1 - Способ оптической оценки концентрации микробных клеток в суспензии - Google Patents

Способ оптической оценки концентрации микробных клеток в суспензии Download PDF

Info

Publication number
RU2636620C1
RU2636620C1 RU2016141859A RU2016141859A RU2636620C1 RU 2636620 C1 RU2636620 C1 RU 2636620C1 RU 2016141859 A RU2016141859 A RU 2016141859A RU 2016141859 A RU2016141859 A RU 2016141859A RU 2636620 C1 RU2636620 C1 RU 2636620C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
suspension
microorganisms
concentration
microbial cells
cells
Prior art date
Application number
RU2016141859A
Other languages
English (en)
Inventor
Олег Анатольевич Симонов
Екатерина Олеговна Симонова
Владимир Алексеевич Мальчевский
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки "Тюменский научный центр Сибирского отделения РАН" (ТюмНЦ СО РАН)
Олег Анатольевич Симонов
Екатерина Олеговна Симонова
Владимир Алексеевич Мальчевский
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение науки "Тюменский научный центр Сибирского отделения РАН" (ТюмНЦ СО РАН), Олег Анатольевич Симонов, Екатерина Олеговна Симонова, Владимир Алексеевич Мальчевский filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение науки "Тюменский научный центр Сибирского отделения РАН" (ТюмНЦ СО РАН)
Priority to RU2016141859A priority Critical patent/RU2636620C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2636620C1 publication Critical patent/RU2636620C1/ru

Links

Landscapes

  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

Изобретение относится к области анализа материалов путем определения их физических свойств и может быть использовано в микробиологии, а также в биотехнологическом производстве. Это достигается тем, что выполняется определение значения волнового экспонента (n) для суспензии микроорганизмов в двух дисперсионных средах с различными показателями преломления, на основе полученных его значений вычисляется для данного штамма микроорганизмов в данных конкретных условиях показатель преломления бактерий (μ) и средний радиус (Rcp) микробных тел, затем, применяя асимптотическое приближение, находится коэффициент светорассеяния (К), с использованием которого по измеренной оптической плотности суспензии определяется концентрация микроорганизмов (N). Изобретение может быть использовано для определения концентрации микробных клеток в суспензии в микробиологических исследованиях и биотехнологическом производстве.

Description

Техническое решение относится к области анализа материалов путем определения их физических свойств, а именно к способу определения концентрации микробных клеток в суспензии, и может быть использовано в микробиологии, а также в биотехнологическом производстве.
Известен способ определения общего числа микробных клеток в 1 мл суспензии путем их подсчета под микроскопом с использованием счетной камеры Горяева [1]. Счетная камера Горяева представляет собой специальное предметное стекло, в центральной части которого имеется углубление, глубина которого во всех своих частях одинакова. На дне этого углубления выгравирована сетка, разделенная на квадраты определенной площади. По обе стороны от центрального углубления расположены две другие площадки с уровнем на 0,1 мм выше. Их плоскости служат для притирания покровного стекла до появления так называемых Ньютоновских колец. После притирания покровного стекла создается камера, закрытая с двух боковых сторон, а с двух других имеющая капиллярные пространства, через которые камеру заполняют разведением взвеси микроорганизмов с помощью пастеровской пипетки.
Подсчет клеток проводят под микроскопом, который настраивают таким образом, чтобы была видна нанесенная на камеру сетка и клетки микроорганизма, равномерно распределенные на ней. Считают число клеток в 5 горизонтальных и 15 диагональных ячейках, после чего по формуле определяют число клеток в 1 мл исследуемой взвеси.
Figure 00000001
, где:
x - число клеток в 1 мл исследуемой взвеси;
а - число клеток в 20 квадратах;
b - разведение исходной взвеси микроорганизма.
Недостатком данного способа подсчета является его не высокая точность и большая трудоемкость.
Известен способ турбидиметрии для определения общего числа клеток в 1 мл суспензии путем измерения оптической плотности взвесей микроорганизмов при определенной длине волны [2]. Действие турбидиметра основано на сопоставлении интенсивности света, рассеянного средой, с интенсивностью рассеяния эталона. При испытании пробу освещают, а затем измеряют интенсивность прошедшего излучения или излучения, рассеянного под определенным углом. Для определения количества клеток в среде используют калибровочную кривую, отображающую зависимость между величиной светорассеяния и числом клеток в единице объема взвеси. Для построения калибровочной кривой измеряют величину светорассеяния в ряде проб с известным содержанием клеток. Калибровочные кривые индивидуальны для каждого микроорганизма.
Недостатком данного способа подсчета является длительная подготовка к его использованию. Необходимо выполнить калибровку для каждого микроорганизма, что достаточно трудоемко и долго. Кроме этого, для калибровки необходимы образцы с известным количеством клеток в единице объема, что может быть определено достаточно неточными методами, допустим, с использованием метода последовательных разведений или камеры Горяева. Еще одним недостатком данного метода является его зависимость от условий, в которых проведена калибровка, действительно, если калибровка проведена при одних условиях, а измерения проводятся при других (температура, свойства растворителя и пр.), то точность измерений будет очень невысокой.
Задачей технического решения является совершенствование способа оценки концентрации микробных клеток в суспензии, направленного на увеличение скорости анализа, снижение его трудоемкости и себестоимости, а также уровня погрешности.
Поставленная задача решается благодаря тому, что способ оптической оценки концентрации микробных клеток в суспензии включает в себя определение значения волнового экспонента (n) для суспензии микроорганизмов в двух дисперсионных средах с различными показателями преломления, индивидуальный расчет показателя преломления бактерий (μb) данной конкретной суспензии и вычисление среднего радиуса находящихся в ней микробных тел (Rcp), затем, применяя асимптотическое приближение, находится коэффициент светорассеяния (Кs), с использованием которого по измеренной оптической плотности суспензии определяется концентрация микроорганизмов (N).
В предлагаемом способе оценки концентрации микробных клеток в суспензии предусмотрены следующие отличия от существующих, а именно проводится определение значения волнового экспонента (n) для суспензии микроорганизмов в двух дисперсионных средах с различными показателями преломления, на основе полученных его значений вычисляется для данного штамма микроорганизмов в данных конкретных условиях показатель преломления бактерий (μb) и средний радиус (Rcp) микробных тел, затем, применяя асимптотическое приближение, находится коэффициент светорассеяния (Кs), с использованием которого по измеренной оптической плотности суспензии определяется концентрация микроорганизмов (N).
Между совокупностью существенных признаков заявляемого объекта и достигаемым техническим результатом существует причинно-следственная связь, которую можно продемонстрировать на примере 1.
Пример 1
Нами был проведен сравнительный эксперимент по определению концентрации микроорганизмов в суспензии способом с использованием камеры Горяева и "Способом оптической оценки концентрации микробных клеток в суспензии". Для эксперимента выбран из коллекции ТюмНЦ СО РАН штамм 10-50-TS2, определенный до вида Achromobacter spanius с помощью анализа генов, кодирующих 16S РНК. Род Achromobacter являются аэробными гетеротрофами, представляют собой грамотрицательные, не спорообразующие удлиненные палочки. Бактерии высевали на в пробирки на скошенный мясопептонный агар (ТУ 9385-001-64786015-2012, г. Углич) и культивировали 24 часа в термостате при температуре 26°C, после чего микроорганизмы смывали с поверхности питательной среды дистиллированной водой в объеме 5 мл. В камеру Горяева помещалась суспензия, полученная методом последовательных разведений, концентрацией 1/10000 от концентрации смыва. Далее проводилась фотофиксация сеток камеры, подсчет количества микроорганизмов на полученных снимках и обработка данных по методике [1]. Размеры бактериальных клеток не оценивались, так как на снимках они были очень малы. По полученным данным можно было лишь констатировать, что их средний размер значительно меньше 1 мкм. Точность этого метода определяется точностью серийных разведений (она невысока при использовании пипетки Пастера), аккуратностью подготовки камеры Горяева к работе, жизнедеятельностью микроорганизмов в процессе длительного эксперимента, а также точностью подсчета микроорганизмов в камере. Для штамма 10-50-TS2 концентрация микроорганизмов в неразбавленной суспензии составила x=(5,3±0,1)⋅1011. Трудоемкость составила четыре чел./дня.
При использовании "Способа оптической оценки концентрации микробных клеток в суспензии" аналогичный объем материала был обработан нами, с использованием рефрактометра RL3 и спектрофотометра ПЭ - 5400УФ, в течение часа. Значение показателя преломления бактерий определено μb=1,46, средний размер оценен Rcp=0,37 мкм, концентрация составила x=2×1011.
Предлагаемый нами способ «Способ определения концентрации микробных клеток в суспензии» увеличивает скорость определения концентрации микробных клеток в суспензии почти в 32 раз по сравнению с применяемым сегодня способами и не требует наличия для его выполнения специализированного дорогостоящего оборудования.
Нами предлагается следующий "Способ оптической оценки концентрации микробных клеток в суспензии".
Подготавливаются две дисперсионные среды с различными показателями преломления, а именно 10% и 40% раствор глюкозы (применяются в медицине и фармацевтике). Подготавливается суспензии микроорганизмов. Для этого в 9 частей дисперсионной среды помещают одну часть микробной суспензии. Суспензию хорошо перемешивают. Далее, измеряем показатели преломления полученных суспензий с использованием рефрактометра Аббе по методике, изложенной в инструкции по эксплуатации. Получаем значения μs1 и μs2.
Помещаем полученные суспензии в кюветы спектрофотометра и устанавливаем их в измерительную камеру спектрофотометра. В качестве базы в третью кювету помещаем дистиллированную воду.
Проводим измерения оптической плотности суспензий (относительно базовой кюветы) на двух длинах волн λ1=450 нм и λ2=600 нм, получаем значения Dλ1 и Dλ2. Используя определение волнового экспонента [5], можем записать: n=-(lgDλ1-lgDλ2)/(lgλ1-lgλ2), и по этой формуле рассчитываем волновые экспоненты для исследуемых суспензий n1 и n2.
Далее, применяя асимптотическое приближение, определяем безразмерный параметр ρ [5] для каждой из двух дисперсионных сред, используя формулы [4]:
ρ(n)=a/(b+n-2)+c, для 2≤n≤3,5
ρ(n)=3⋅(y+n⋅q/(h+у))1/2, для -1≤n≤2
в этих формулах y, a, b, c, d, e, q, h определяются следующим образом (m1=m-1; m=μbs) [3]:
y=2-n-(2-n)2/20
a=b⋅d
b=1,5⋅(d/e-1)
q=m1⋅(1-0,8⋅exp(-11⋅m1))/3
h=(2⋅q)1/3
c=3⋅h-d
d=e⋅(3⋅h-ρ1)⋅(1,5-ρ1)/(1,5⋅(3⋅h-ρ1)-e⋅ρ1)
e=3⋅h-2⋅m1⋅(0,22+0,58⋅m)
ρ1=0,1+m1⋅(3,9-5⋅m1+0,5/(1+1000⋅(m1-0,05)2))
To есть по известным n1 и n2 рассчитываем значения ρ(n1) и ρ(n2).
Так как, по определению, ρ=4⋅π⋅Rcp⋅μs⋅(μbs-1)/λ [4], при одинаковой длине волны этот параметр зависит только от соотношений показателей преломлений бактерий и среды, то по известным значениям ρ(n1) и ρ(n2) можно однозначно определить значение показателя преломления бактерий:
ρ(n1)/ρ(n2)=(μbs1)/(μbs2), откуда находим
μbs2⋅(ρ(n1)/ρ(n2)-μs1s2)/(ρ(n1)/ρ(n2)-1),
где μs1 - показатель преломления первой дисперсионной среды; μs2 - показатель преломления второй дисперсионной среды; ρ(n1) - безразмерный параметр ρ для первой дисперсионной среды, определенный по волновому экспоненту n1; ρ(n2) - безразмерный параметр ρ для второй дисперсионной среды, определенный по волновому экспоненту n2; μb - показатель преломления бактерий.
Используя значение параметра ρ и найденный показатель преломления бактерий, для любой из дисперсионных сред можно оценить средний размер бактерий исходя из определения ρ [5]: Rcp=ρ-λ/(4⋅π⋅(μbs)),
Далее, используя асимптотическое приближение [4], находим коэффициент светорассеяния:
Кs=K2⋅{1+(0,3724-0,2974⋅m)/[α+4⋅(α-0,8)3-0,744]}, для 2≤n≤3,3
Ks=Q(ρ)⋅(m-m1 2)/[1+(0,3⋅m-0,28)⋅(3h/ρ)3], для -1≤n≤2,
где К2=А⋅α⋅[(3,25m+1,55)⋅α-3,4], и А=[(m2-1)/(m2+2)]2,
α=2⋅π⋅Rcp⋅μs
Затем определяем концентрацию микроорганизмов в исследуемой суспензии, для чего, используя формулу τ=π⋅r2⋅Ks(r,λ,m)⋅N [3], запишем: N=τπ⋅Rcp2⋅Ks, где мутность суспензии τ либо измеряется на спектрофотометре, либо вычисляется по ранее измеренной оптической плотности среды (для используемого спектрофотометра равняется τ=2,3⋅D (1/см)). Проведя вычисления, оцениваем концентрацию микроорганизмов в исследуемой суспензии - N.
Концентрацию микроорганизмов в неразведенной суспензии рассчитываем по формуле: x=10⋅N.
Следует отметить, что предлагаемый нами способ не требует точного совпадения концентраций микроорганизмов в двух исследуемых суспензиях с различными показателями преломления и позволяет, используя определенные значения показателя преломления бактерий, применять турбодиметрические методы определения концентраций с большей точностью.
Технико-экономическая эффективность предлагаемого способа определения концентрации микробных клеток в суспензии обусловлена увеличением почти в 32 раза скорости анализа по сравнению с применяемыми сегодня способами, отсутствием необходимости наличия для его выполнения специального дорогостоящего оборудования, что безусловно существенно снизит себестоимость получаемого биотехнологического продукта и увеличит его количество.
Используемые обозначения:
- x - число клеток в 1 мл исследуемой суспензии;
- Rcp - средний размер микроорганизмов в суспензии;
- μb - показатель преломления микроорганизмов;
- μs1, μs2 - показатели преломления первой и второй дисперсионных сред;
- D - оптическая плотность суспензии;
- λ - длина волны светового излучения;
- Кs - коэффициент светорассеяния;
- N - концентрация микроорганизмов в исследуемой на спектрофотометре суспензии;
- τ - мутность исследуемой на спектрофотометре суспензии.
Источники информации
1. Государственная Фармакопея Российской Федерации, XIII издание, М., 2015. - Т. 2. - С. 624-627. Определение концентрации микробных клеток ОФС.1.7.2.0008.15 [электронный ресурс]: - Режим доступа: http://femb.ru/feml?1850324. Федеральная электронная медицинская библиотека Министерства здравоохранения Российской Федерации. - (Дата обращения 12.08.2016).
2. Государственная Фармакопея Российской Федерации, XIII издание, М., 2015. - Т. 2. - С. 628-629. Определение концентрации микробных клеток ОФС.1.7.2.0008.15 [электронный ресурс]: - Режим доступа: http://femb.ru/feml?1850324. Федеральная электронная медицинская библиотека Министерства здравоохранения Российской Федерации. - (Дата обращения 12.08.2016).
3. Нестеров А.Н. Кинетика и механизм гидратообразования газов в присутствии поверхностно-активных веществ: дис. … д-ра хим. наук: 02.00.04 / Нестеров Анатолий Николаевич. - Тюмень, 2006. - 279 с.
4. Характеристические функции светорассеяния полидисперсных систем [Текст] / К.Р. Рамазанов [и др.] // Коллоидный журнал. - 1983. - Т. XLV, №3. - С. 473-479.
5. Щеголев С.Ю. Определение параметров сложных дисперсных полимерных систем из спектра мутности [Текст] / С.Ю. Щёголев, В.И. Кленин // Высокомолекулярные соединения. - 1971. - Т. А13, №12. - С. 2809-2015.

Claims (1)

  1. Способ оптической оценки концентрации микробных клеток в суспензии, отличающийся тем, что проводится определение значения волнового экспонента (n) для суспензии микроорганизмов в двух дисперсионных средах с различными показателями преломления, на основе полученных его значений вычисляется для данного штамма микроорганизмов в данных конкретных условиях показатель преломления бактерий (μb) и средний радиус (Rcp) микробных тел, затем, применяя асимптотическое приближение, находится коэффициент светорассеяния (Кs), с использованием которого по измеренной оптической плотности суспензии определяется концентрация микроорганизмов (N).
RU2016141859A 2016-10-25 2016-10-25 Способ оптической оценки концентрации микробных клеток в суспензии RU2636620C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2016141859A RU2636620C1 (ru) 2016-10-25 2016-10-25 Способ оптической оценки концентрации микробных клеток в суспензии

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2016141859A RU2636620C1 (ru) 2016-10-25 2016-10-25 Способ оптической оценки концентрации микробных клеток в суспензии

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2636620C1 true RU2636620C1 (ru) 2017-11-24

Family

ID=63853260

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016141859A RU2636620C1 (ru) 2016-10-25 2016-10-25 Способ оптической оценки концентрации микробных клеток в суспензии

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2636620C1 (ru)

Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SU1689807A1 (ru) * 1989-06-09 1991-11-07 Всесоюзный научно-исследовательский институт прикладной микробиологии Способ определени концентрации суспендированных клеток эллипсоидальных и палочкообразных форм
WO1993021511A1 (en) * 1992-04-08 1993-10-28 Combact Imaging Systems, Ltd. Detection of microorganisms and determination of their sensitivity to antibiotics
RU2273840C1 (ru) * 2004-07-15 2006-04-10 Общество с ограниченной ответственностью ООО "ВИНТЕЛ" Способ непрерывного определения концентрации микробных клеток в суспензиях и устройство для его осуществления
RU2379691C1 (ru) * 2008-07-07 2010-01-20 Закрытое акционерное общество "ИММУНОСКРИН" (ЗАО "ИММУНОСКРИН") Способ многоаналитного иммуноанализа с использованием микрочастиц
WO2013143508A2 (es) * 2012-03-30 2013-10-03 Centro Nacional De Biopreparados (Biocen) Método para la detección, recuperación, identificación y enumeración simultánea de microorganismos y dispositivos para su ejecución

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
SU1689807A1 (ru) * 1989-06-09 1991-11-07 Всесоюзный научно-исследовательский институт прикладной микробиологии Способ определени концентрации суспендированных клеток эллипсоидальных и палочкообразных форм
WO1993021511A1 (en) * 1992-04-08 1993-10-28 Combact Imaging Systems, Ltd. Detection of microorganisms and determination of their sensitivity to antibiotics
RU2273840C1 (ru) * 2004-07-15 2006-04-10 Общество с ограниченной ответственностью ООО "ВИНТЕЛ" Способ непрерывного определения концентрации микробных клеток в суспензиях и устройство для его осуществления
RU2379691C1 (ru) * 2008-07-07 2010-01-20 Закрытое акционерное общество "ИММУНОСКРИН" (ЗАО "ИММУНОСКРИН") Способ многоаналитного иммуноанализа с использованием микрочастиц
WO2013143508A2 (es) * 2012-03-30 2013-10-03 Centro Nacional De Biopreparados (Biocen) Método para la detección, recuperación, identificación y enumeración simultánea de microorganismos y dispositivos para su ejecución

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Mira et al. Estimating microbial population data from optical density
Welch et al. A method for quantitative determination of biofilm viability
Xi et al. Hyperspectral differentiation of phytoplankton taxonomic groups: a comparison between using remote sensing reflectance and absorption spectra
Jia et al. Multi-wavelength based optical density sensor for autonomous monitoring of microalgae
Green et al. Flow cytometric determination of size and complex refractive index for marine particles: comparison with independent and bulk estimates
Wu et al. Hydrogel-based fluorescent dual pH and oxygen sensors loaded in 96-well plates for high-throughput cell metabolism studies
Pédron et al. Comparison of environmental and culture-derived bacterial communities through 16S metabarcoding: a powerful tool to assess media selectivity and detect rare taxa
Colin et al. Spatially heterogeneous dynamics in a thermosensitive soft suspension before and after the glass transition
Al-Soufi et al. A surfactant concentration model for the systematic determination of the critical micellar concentration and the transition width
Meleppat et al. Quantitative optical coherence microscopy for the in situ investigation of the biofilm
Loske et al. Escherichia coli viability determination using dynamic light scattering: a comparison with standard methods
Bali et al. Microbiome signatures in a fast-and slow-progressing gastric cancer murine model and their contribution to gastric carcinogenesis
Melnikov et al. Optical Oxygen Sensing and Clark Electrode: Face-to-Face in a Biosensor Case Study
Bedrossian et al. Quantifying microorganisms at low concentrations using digital holographic microscopy (DHM)
Jones et al. Immature platelet indices alongside procalcitonin for sensitive and specific identification of bacteremia in the intensive care unit
Lain et al. The fundamental contribution of phytoplankton spectral scattering to ocean colour: implications for satellite detection of phytoplankton community structure
Takeuchi et al. Establishment of a dual-wavelength spectrophotometric method for analysing and detecting carbapenemase-producing Enterobacteriaceae
Kulmaganbetov et al. Textural feature analysis of optical coherence tomography phantoms
Anzini et al. Light scattering and turbidimetry techniques for the characterization of nanoparticles and nanostructured networks
Mahlmann et al. Rapid determination of the dry weight of single, living cyanobacterial cells using the Mach-Zehnder double-beam interference microscope
RU2636620C1 (ru) Способ оптической оценки концентрации микробных клеток в суспензии
Klagisa et al. Evaluation of Staphylococcus aureus Colonization in Adult Patients Undergoing Tonsillectomy for Recurrent Tonsillitis
Vu et al. A Glass-Fiber-Optic Turbidity Sensor for Real-Time In Situ Water Quality Monitoring
Romanov et al. Luminal and tumor-associated gut microbiome features linked to precancerous lesions malignancy risk: a compositional approach
Radunovic et al. Antifungal Susceptibility of Candida albicans Isolated from Tongue and Subgingival Biofilm of Periodontitis Patients

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20191026