RU2619739C2 - Способ диагностики и прогноза при гиперпролиферативных заболеваниях молочной железы - Google Patents

Способ диагностики и прогноза при гиперпролиферативных заболеваниях молочной железы Download PDF

Info

Publication number
RU2619739C2
RU2619739C2 RU2012122157A RU2012122157A RU2619739C2 RU 2619739 C2 RU2619739 C2 RU 2619739C2 RU 2012122157 A RU2012122157 A RU 2012122157A RU 2012122157 A RU2012122157 A RU 2012122157A RU 2619739 C2 RU2619739 C2 RU 2619739C2
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
breast
breast cancer
level
expression
diagnosis
Prior art date
Application number
RU2012122157A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2012122157A (ru
Inventor
Владимир Константинович Боженко
Надежда Ивановна Рожкова
Елена Александровна Кудинова
Иван Дмитриевич Троценко
Ольга Эдмундовна Якобс
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное учреждение "Российский научный центр рентгенорадиологии" Министерства здравоохранения российской федерации (ФГБУ "РНЦРР" Минздрава России)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное учреждение "Российский научный центр рентгенорадиологии" Министерства здравоохранения российской федерации (ФГБУ "РНЦРР" Минздрава России) filed Critical Федеральное государственное бюджетное учреждение "Российский научный центр рентгенорадиологии" Министерства здравоохранения российской федерации (ФГБУ "РНЦРР" Минздрава России)
Priority to RU2012122157A priority Critical patent/RU2619739C2/ru
Publication of RU2012122157A publication Critical patent/RU2012122157A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2619739C2 publication Critical patent/RU2619739C2/ru

Links

Images

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor

Landscapes

  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к медицине, а точнее к онкологии и лабораторной диагностике, и может быть использовано для диагностирования рака молочной железы. Сущность способа: определяют уровень экспрессии генов: MGB1, Ki67, Aurca, BIRC5, CCNB1, MMP11 в ткани молочной железы и при превышении уровня экспрессии значений для вышеперечисленных генов соответственно: 13120,05; 21,1; 52,54; 15,96; 13,89; 18,51 делают заключение о злокачественной природе процесса и рекомендуется провести биопсию ткани для получения морфологического подтверждения и/или проведения специфического лечения. Предлагаемое изобретение позволяет получить заключение о злокачественной природе ткани молочной железы и рекомендовать проведение повторной биопсии и/или специфического лечения. 2 табл., 1 ил.

Description

ОБЛАСТЬ НАУКИ, К КОТОРОЙ ОТНОСИТСЯ ИЗОБРЕТЕНИЕ.
Изобретение относиться к области медицины, в частности онкологии, и наиболее эффективно может быть предназначено для лабораторной диагностики рака молочной железы.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ.
Рак молочной железы на сегодняшний день является одним из наиболее распространенных онкологических заболеваний в женской популяции. Данное заболевание также лидирует в причине смертности от злокачественных новообразований у женщин и составляет 17,1%, обусловливая основную долю онкологической смертности в возрастных группах 40-69 лет, 85 лет и старше (Давыдов М.И., Аксель Е.М. 2011). Одновременно необходимо отметить, что достаточно большие успехи достигнуты в ранней диагностике и скрининге РМЖ, что позволило значительно увеличить количество заболеваний, выявляемых на ранних стадиях (Харченко В.П., Рожкова Н.И.).
В настоящее время клиницисты располагают достаточно широким арсеналом диагностических возможностей, однако, в целом необходимо признать, что существующие сегодня методы как дооперационной оценки характера и распространенности заболевания, так и послеоперационной верификации и стадирования РМЖ малоэффективны в отношении прогноза безрецидивной и общей выживаемости, что, несомненно, предопределяет интуитивный выбор клинициста в пользу более агрессивной тактики терапии как попытку компенсировать системные прогностические ошибки при использовании «классических факторов прогноза» (Ст Гален, 2011). Именно поэтому все большее внимание уделяется изучению биологии опухоли и поиску более чувствительных молекулярных маркеров для дифференциальной диагностики, прогноза прогрессирования и рецидивирования РМЖ.
Наиболее сложным для дифференциальной диагностики злокачественного процесса в молочной железе, а именно рака молочной железы, представляются заболевания, сопровождающиеся гиперпролипролиферативными процессами, поскольку типичные критерии для злокачественных заболеваний для них нехарактерны. Малая невыраженная симптоматика требует дополнительных критериев диагностики. Именно к ним можно отнести ряд молекулярно-генетических показателей, характерных для гиперпролиферативных процессов. Спектр подобных состояний достаточно широко представлен в классификации ВОЗ (гистологическая классификация ВОЗ 2003 год).
Одним из фундаментальных свойств злокачественной клетки является нарушение контроля пролиферативной активности и апоптоза, проявляющаяся, в частности, в повышении активности генов активаторов пролиферации и ингибиторов апоптоза. Изменение активности экспрессии генов, определяемое на уровне мРНК или белка, описано, например, в патенте US 2009/0286856 A1 «Method of diagnosing breast cancer», основанном на анализе-710 генов, в патенте US 2010/ 7,662,580 Tissue diagnostics for breast cancer, где для диагностики рака молочной железы используются 4 гена fcytokeratin 19, cathepsin D, ezrin, and slc9a3rl, а в патенте US2008/ 7,348,142 Cancer diagnostic panel - приводится способ создания панели для диагностики злокачественной патологии.
НЕДОСТАТКИ ИЗВЕСТНОГО СПОСОБА: недостатком способа, описанного в патенте US 2009/0286856 A1, является необходимость использования технологии «чипов», в основе которой лежит метод гибридизации, для которого характерна относительно низкая чувствительность, что обусловливает низкую эффективность диагностики, Недостатком способа, описанного в патенте US2010/ 7,662,580, является также низкая диагностическая чувствительность, связанная, по-видимому, с характеристиками входящих в диагностический комплекс генов.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ.
Изобретение относится к онкологии области медицины. Предназначено для диагностики начала развития злокачественного опухолевого процесса молочных желез на основе определения относительного уровня мРНК генов: Ki67, Aurca, BIRC5, CCNB1, ММР11, MGB1.
Общий алгоритм использования молекулярно-генетических исследований уровня экспрессии мРНК генов заключается в следующем. После получения биопсийного, операционного материала или жидкости из образования проводится определение уровня экспрессии генов Ki67, Aurca, BIRC5, CCNB1, ММР1, MGB1. Параллельно проводится цитологическое или гистологическое исследование полученного материала.
1. При получении заключения о злокачественной природе процесса (раке молочной железы) по данным морфологических методов далее поступают согласно имеющимся клиническим стандартам для лечения данной нозологии.
2. При получении морфологического заключения о доброкачественной природе процесса или «не информативности» полученного материала анализируют данные молекулярно-генетических исследований. В случае увеличения экспрессии одного и более генов из группы: Ki67, Aurca, BIRC5, CCNB1, ММР1, MGB1 в два и более раза по сравнению со средними значениями, приведенными в таблице 2 для группы фиброаденом, делается заключение о возможной злокачественной природе процесса и назначается проведение повторного забора биопсийного материала (а в случае операционного материала более тщательное его исследование). При многократном получении неинформативных морфологических исследований может быть дана рекомендация на проведение минимального хирургического вмешательства со срочным гистологическим исследованием или проведение динамического наблюдения с периодичностью не реже раза в 3 месяца.
Определение уровня экспрессии (относительного количества мРНК соответствующего гена) осуществляется относительно гена HPRT1 с использованием наборов производства фирмы ЗАО «ДНК Технология» Россия согласно инструкции производителя с использованием количественного амплификатора ДТ96, производства ЗАО «ДНК Технология».
Существенным отличием заявляемого решения от известного является использование шести высокоспецифических для ткани рака молочной железы гена-маркера.
СВЕДЕНИЯ, ПОДТВЕРЖДАЮЩИЕ ВОЗМОЖНОСТЬ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ ИЗОБРЕТЕНИЯ.
В основу изобретения положено исследование 154 образцов ткани молочной железы, из них 57 образцов рака молочной железы (РМЖ) 1-1 V стадии, 57 образцов неизмененной ткани молочной железы в качестве контрольной группы и 40 образцов ткани фиброаденомы и простой протоковой гиперплазии (далее ФА). В группу больных раком молочной железы вошли больные в возрасте от 36 до 87 лет, средний возраст составил 57,2±11,6 лет. По гистологическому строению в 63% случаев опухоль представляла собой инфильтративный протоковый рак. Более чем в 70% размер первичной опухоли не превышал 5 см. Все пациентки проходили обследование и получали лечение в хирургических отделениях ФГБУ Российский Научный Центр Рентгенрадиологии в период с ноября 2008 по июль 2011 года. Патоморфологическое исследование проводилось в соответствии с гистологической классификацией опухолей молочной железы (ВОЗ, 2004 г.). Оценка степени злокачественности РМЖ проводилась в соответствие с критериями Elston-Ellis Scarff-Bloom-Richardson.
Выделение РНК проводили согласно инструкции с помощью наборов реагентов для выделения РНК RNeasy Plus Mini Kit (Qiagen, USA). Реакцию обратной транскрипции ставили, используя наборы НПО «ДНК Технология» согласно инструкции. Для контроля отсутствия амплификации на геномной ДНК ставили ПЦР с образцами, не прошедшими реакцию обратной транскрипции (ОТ). Уровень экспрессии генов определялся в относительных единицах по сравнению с уровнем экспрессии референсного гена HPRT с помощью наборов для количественного ПЦР фирмы ЗАО «ДНК Технология» согласно инструкции производителя на ДНК амплификаторе ДТ96 производства ЗАО «ДНК Технология.
Таблица 1
Наименование исследованных генов согласно номенклатуре HUGO Gene Nomenclature Committee (HGNC) database и их идентификационный номер GCID.
Наименование гена в тексте Наименование в базе HUGO Идентификационный номер GCID
MGB1 (маммаглобин) secretoglobin, family 2A GC11P062038
ММР11 matrix metallopeptidase 11 (stromelysin 3) GC22P024110
Aurca aurora kinase A, STK15 GC20M054377
CCNB1 cyclinBl GC05P068462
BIRC5 baculoviral IAP repeat containing 5 GC17P076210
Ki67 antigen identified by monoclonal antibody Ki67 GC10M129824
В таблице 1 приводятся характеристики используемых генов, включенных в диагностическую панель.
Нами было получено, что для ткани РМЖ характерно увеличение уровня экспрессии мРНК генов, ответственных за процессы пролиферации -Ki67, Aurca, CCNB1.
Уровень экспрессии гена ММР11 также повышается в ткани РМЖ. ММР1 (матриксная металлопротеаза) - поверхностная молекула клетки способна расщеплять элементы межклеточного матрикса, принимает участие в активации/инактивации цитокинов и регулировании апоптоза. Однако основной функцией ММР11 является участие в процессах миграции и клеточной адгезии.
При РМЖ происходит также увеличение экспрессии маммаглобина, особенно важно, что наибольшее повышение уровня экспрессии характерно для 1-2 стадии РМЖ, что делает этот показатель важным для дифференцировки начальных стадий рака. Уровень BIRC5 антиапоптотического гена возрастает и достоверно выше, чем в неизмененной ткани молочной железы. BIRC5 кодирует белок, который принадлежит к семейству ингибиторов апоптоза, действуя путем инактивации каспаз. Повышенная экспрессия белка описана для большого количества злокачественных опухолей, но практически отсутствует в дифференцированных клетках.
Таким образом, данная панель генов отражает основные характеристики процессов, происходящие в клетках эпителия молочной железы при злокачественной трансформации: в группе РМЖ увеличивается уровень экспрессии генов, ответственных за процессы пролиферации (Ki67, Аurса, CCNB1), увеличивается уровень экспрессии проапоптотического гена, что является молекулярной основой развития злокачественных пролиферативных заболеваний.
В таблице 2 приводятся средние значения относительной экспрессии генов Ki67, Aurca, BIRC5, CCNB1, ММР1, BCL2, NDRG1 и достоверность их отличия в ткани РМЖ и фиброаденомы и простой протокой гиперплазии (ФА).
Показатель (ген) Среднее РМЖ Среднее ФА t-value P
MGB 1 (маммаглобин) 77683,78 13120,05 2,244351 0,026849
KI 67 115,34 21,10 2,972018 0,004125
Aurca(STK15) 230,16 52,54 2,093814 0,040122
BIRC5 (survivm) 113,66 15,96 2,090608 0,040478
CCNB1 (cyclinBl) 54,45 13,89 2,016180 0,047854
MМР1 (stromolysin3) 237,78 18,51 2,051907 0,044090
На рисунке 1 проиллюстрированы отличия значений уровней экспрессии в нормальной ткани молочной железы, ткани фиброаденомы и рака молочной железы.

Claims (1)

  1. Способ диагностики рака молочной железы на основании анализа уровня экспрессии 6 генов MGB1, Ki67, Aurca, BIRC5, CCNB1, ММР11 в ткани молочной железы, при этом, если уровень относительной экспрессии относительно гена HPRT1 для одного или нескольких из этих генов превышает значения соответственно: 13120,05; 21,1; 52,54; 15,96; 13,89; 18,51, делается заключение о злокачественной природе процесса и рекомендуется провести биопсию ткани для получения морфологического подтверждения и/или проведения специфического лечения.
RU2012122157A 2012-05-30 2012-05-30 Способ диагностики и прогноза при гиперпролиферативных заболеваниях молочной железы RU2619739C2 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2012122157A RU2619739C2 (ru) 2012-05-30 2012-05-30 Способ диагностики и прогноза при гиперпролиферативных заболеваниях молочной железы

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2012122157A RU2619739C2 (ru) 2012-05-30 2012-05-30 Способ диагностики и прогноза при гиперпролиферативных заболеваниях молочной железы

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2012122157A RU2012122157A (ru) 2013-12-10
RU2619739C2 true RU2619739C2 (ru) 2017-05-17

Family

ID=49682593

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2012122157A RU2619739C2 (ru) 2012-05-30 2012-05-30 Способ диагностики и прогноза при гиперпролиферативных заболеваниях молочной железы

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2619739C2 (ru)

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2002088750A2 (en) * 2001-05-02 2002-11-07 Oxford Glycosciences (Uk) Ltd Proteins, genes and their use for diagnosis and treatment of breast cancer
US20090286856A1 (en) * 2003-09-24 2009-11-19 Oncotherapy Science, Inc. Method of Diagnosing Breast Cancer
RU2464570C2 (ru) * 2010-11-19 2012-10-20 Федеральное государственное учреждение "Российский научный центр рентгенрадиологии" Министерства здравоохранения и социального развития России Метод диагностики цервикальных интраэпителиальных неоплазий
RU2470998C2 (ru) * 2006-06-22 2012-12-27 Ян Любински Определение предрасположенности к раку путем идентификации генотипических комбинаций специфичных вариантов генов cyp1b1, brca2 и снек2
RU2522923C1 (ru) * 2012-10-23 2014-07-20 Федеральное Государственное Автономное Образовательное Учреждение Высшего Профессионального Образования "Московский Физико-Технический Институт (Государственный Университет)" Комплексный способ определения циркулирующих опухолевых клеток в крови больных раком молочной железы
RU2547583C2 (ru) * 2013-08-30 2015-04-10 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН) Способ диагностики рака молочной железы

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2002088750A2 (en) * 2001-05-02 2002-11-07 Oxford Glycosciences (Uk) Ltd Proteins, genes and their use for diagnosis and treatment of breast cancer
US20090286856A1 (en) * 2003-09-24 2009-11-19 Oncotherapy Science, Inc. Method of Diagnosing Breast Cancer
RU2470998C2 (ru) * 2006-06-22 2012-12-27 Ян Любински Определение предрасположенности к раку путем идентификации генотипических комбинаций специфичных вариантов генов cyp1b1, brca2 и снек2
RU2464570C2 (ru) * 2010-11-19 2012-10-20 Федеральное государственное учреждение "Российский научный центр рентгенрадиологии" Министерства здравоохранения и социального развития России Метод диагностики цервикальных интраэпителиальных неоплазий
RU2522923C1 (ru) * 2012-10-23 2014-07-20 Федеральное Государственное Автономное Образовательное Учреждение Высшего Профессионального Образования "Московский Физико-Технический Институт (Государственный Университет)" Комплексный способ определения циркулирующих опухолевых клеток в крови больных раком молочной железы
RU2547583C2 (ru) * 2013-08-30 2015-04-10 Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова Российской академии наук (ИБХ РАН) Способ диагностики рака молочной железы

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Боженко В.К. и др. Профиль экспрессии генов как фактор прогноза при раке молочной железы. Вестник РНЦРР МЗ РФ N11. Найдено в Google: http://vestnik.rncrr.ru/vestnik/v11/papers/bozh2_v11.htm. *

Also Published As

Publication number Publication date
RU2012122157A (ru) 2013-12-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Amaro et al. Validation of proposed prostate cancer biomarkers with gene expression data: a long road to travel
Park et al. Molecular profiling of single circulating tumor cells from lung cancer patients
Jones et al. Gene signatures of progression and metastasis in renal cell cancer
JP6140202B2 (ja) 乳癌の予後を予測するための遺伝子発現プロフィール
Jaeger et al. Gene expression signatures for tumor progression, tumor subtype, and tumor thickness in laser-microdissected melanoma tissues
Ma et al. Gene expression profiles of human breast cancer progression
Riester et al. Combination of a novel gene expression signature with a clinical nomogram improves the prediction of survival in high-risk bladder cancer
Brase et al. ERBB2 and TOP2A in breast cancer: a comprehensive analysis of gene amplification, RNA levels, and protein expression and their influence on prognosis and prediction
True et al. A molecular correlate to the Gleason grading system for prostate adenocarcinoma
Stratford et al. A six-gene signature predicts survival of patients with localized pancreatic ductal adenocarcinoma
JP5725274B2 (ja) 乳癌の予後の検査方法
Knudsen et al. Application of a clinical whole-transcriptome assay for staging and prognosis of prostate cancer diagnosed in needle core biopsy specimens
Paradis et al. Molecular profiling of hepatocellular carcinomas (HCC) using a large-scale real-time RT-PCR approach: determination of a molecular diagnostic index
Huang et al. Overexpression of S100B, TM4SF4, and OLFM4 genes is correlated with liver metastasis in Taiwanese colorectal cancer patients
Agell et al. A 12-gene expression signature is associated with aggressive histological in prostate cancer: SEC14L1 and TCEB1 genes are potential markers of progression
US20070065859A1 (en) Methods and materials for identifying the origin of a carcinoma of unknown primary origin
US20170211155A1 (en) Method for predicting risk of metastasis
US20100021886A1 (en) Methods and Materials for Identifying the Origin of a Carcinoma of Unknown Primary Origin
US8911940B2 (en) Methods of assessing a risk of cancer progression
EP2971177B1 (en) Compositions and methods for detecting and determining a prognosis for prostate cancer
JP2016500512A (ja) 肝臓サンプルの分類ならびに限局性結節性異形成、肝細胞腺腫および肝細胞癌の診断のための新規方法
Marín-Aguilera et al. Molecular profiling of peripheral blood is associated with circulating tumor cells content and poor survival in metastatic castration-resistant prostate cancer
Huang et al. Molecular gene signature and prognosis of non-small cell lung cancer
Constâncio et al. MiRNA biomarkers in cancers of the male reproductive system: are we approaching clinical application?
Nakajima et al. Ribonucleic acid microarray analysis from lymph node samples obtained by endobronchial ultrasonography-guided transbronchial needle aspiration

Legal Events

Date Code Title Description
HZ9A Changing address for correspondence with an applicant
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20170609