RU2315310C1 - Method for diagnosing 3-m syndrome yakut population - Google Patents
Method for diagnosing 3-m syndrome yakut population Download PDFInfo
- Publication number
- RU2315310C1 RU2315310C1 RU2006118727/15A RU2006118727A RU2315310C1 RU 2315310 C1 RU2315310 C1 RU 2315310C1 RU 2006118727/15 A RU2006118727/15 A RU 2006118727/15A RU 2006118727 A RU2006118727 A RU 2006118727A RU 2315310 C1 RU2315310 C1 RU 2315310C1
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- syndrome
- gene
- diagnosis
- yakut
- population
- Prior art date
Links
Images
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
Description
Область применения относится к медицине, а именно к молекулярно-генетическим методам диагностики наследственных заболеваний.The scope refers to medicine, namely to molecular genetic methods for the diagnosis of hereditary diseases.
Наиболее близким аналогом метода диагностики 3-М синдрома в якутской популяции является молекулярно-генетический способ идентификации мутации в гене Куллин 7 (CUL7) при 3-М синдроме, включающий определение методом ПЦР в гене CUL7, картированием в хромосоме 6р21.1., 25 различных мутаций у обследуемых из 29 семей с 3-М синдромом. В результате найдены нонсенс и миссенс - мутации R1445X и Н1464Р, играющие важную роль в задержке внутриутробного роста у человека (Huber С. et al. Identification of mutations in 3-M syndrome / Nat. Genet. - 2005. - Oct.37 (10). - P.1119-24).The closest analogue of the diagnostic method for 3-M syndrome in the Yakut population is the molecular genetic method for identifying a mutation in the Cullin 7 gene (CUL7) in the 3-M syndrome, including PCR determination in the CUL7 gene, mapping in chromosome 6p21.1., 25 different mutations in subjects from 29 families with 3-M syndrome. As a result, nonsense and missense mutations R1445X and H1464P were found, which play an important role in the inhibition of intrauterine growth in humans (Huber C. et al. Identification of mutations in 3-M syndrome / Nat. Genet. - 2005. - Oct.37 (10 ). - P.1119-24).
Метод диагностики 3-М синдрома, описанный Huber и др., был применен для диагностики 3-М синдрома в якутской популяции на 39 больных с 3-М синдромом. Ни одна из описанных в данном источнике мутаций не характерна для якутской популяции. В гене CUL7 выявлена другая мутация 4582 insT (Arg 1528 Ser), характерная для якутской популяции. Данный метод не позволяет выявить мутацию 4582 insT (Arg 1528 Ser), характерную для якутской популяции, тем самым не позволяет выставить точный и окончательный диагноз заболевания, дать точный генетический риск заболевания для потомства в семье.The diagnostic method for 3-M syndrome described by Huber et al. Was used to diagnose 3-M syndrome in the Yakut population in 39 patients with 3-M syndrome. None of the mutations described in this source is characteristic of the Yakut population. Another mutation 4582 insT (Arg 1528 Ser), characteristic of the Yakut population, was revealed in the CUL7 gene. This method does not allow to identify the mutation 4582 insT (Arg 1528 Ser), characteristic of the Yakut population, thereby does not allow to make an accurate and final diagnosis of the disease, to give an accurate genetic risk of the disease for offspring in the family.
С целью устранения недостатков метода, описанного Huber и др., предложен способ диагностики 3-М синдрома путем молекулярно-генетического анализа посредством ПЦР реакции с применением оригинальных праймеров F-GTATGCACTTAGGGCCAGAG; R-CACACTCCTACAGGCTACAC для выявления мутации 4582 insT (Arg 1528Ser) в гене Куллин 7 (CUL7), характерной для якутской популяции, с последующим проведением анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов с использованием эндонуклеазы HinfI и при наличии фрагментов длиной 218 п.н. и 175, 26 п.н. диагностируют носительство мутантного гена в гомозиготном состоянии (больной), при наличии фрагментов - 218, 175, 114, 104 и 26 п.н. диагностируют носительство мутантного гена в гетерозиготном состоянии (здоровый носитель мутации), а при длине фрагментов 175, 114, 104, 26 п.н. - норма (здоровый).In order to eliminate the shortcomings of the method described by Huber et al., A method for the diagnosis of 3-M syndrome by molecular genetic analysis by PCR reaction using original F-GTATGCACTTAGGGCCAGAG primers is proposed; R-CACACTCCTACAGGCTACAC for detecting the 4582 insT mutation (Arg 1528Ser) in the
Описание методаMethod Description
Предложенный способ диагностики 3-М синдрома в якутской популяции осуществляется следующим образом.The proposed method for the diagnosis of 3-M syndrome in the Yakut population is as follows.
У больного производится забор крови из локтевой вены в пробирку, содержащую ЭДТА в количестве 7-10 мл.The patient takes blood from the cubital vein into a test tube containing EDTA in the amount of 7-10 ml.
Выделение ДНК из лейкоцитов периферической крови выполняют стандартным методом с помощью фенол - хлороформного метода.Isolation of DNA from peripheral blood leukocytes is performed by the standard method using the phenol - chloroform method.
Для диагностики 3-М синдрома в якутской популяции (быстрой идентификации мутации 4582 insT (Arg 1528 Ser) в гене CUL7, характерной для якутской популяции) амплификация необходимых фрагментов ДНК проводится методом ПЦР на программируемом термоциклере MJ Research РТС-200 в 25 мкл объеме реакционной смеси следующего состава: 0,1-1 мкг геномной ДНК; по 25 пкмоль оригинального олигопраймера (F-GTATGCACTTAGGGCCAGAG; R-CACACTCCTACAGGCTACAC), по 200 мкМ каждого нуклеозидтрифосфата; 0,5 единиц активности ДНК-полимеразы (Applied Biosystems), буфер для ПНР-реакции фирмы «Applied Biosystems» (500 мМ KCI, 100 мМ Tris-HCI, pH 8,3; 15 мМ МСI2; 0,01% gelatin), бетаин 1:2, 20-30 мкл минерального масла. ПНР проводится при следующих условиях: первоначальная денатурация - 95° - 15 минут, 35 циклов амплификации-: 94° - 1 минута, 50-55° - 1 минута, 72° - 1 минута. Заключительная элонгация - 72° - 10 минут. Результаты ПЦР оцениваются в 1% агарозном геле.For the diagnosis of the 3-M syndrome in the Yakut population (rapid identification of the 4582 insT mutation (Arg 1528 Ser) in the CUL7 gene characteristic of the Yakut population), the necessary DNA fragments are amplified by PCR on a MJ Research RTS-200 programmable thermal cycler in 25 μl of the reaction mixture the following composition: 0.1-1 μg of genomic DNA; 25 pmol of the original oligoprimer (F-GTATGCACTTAGGGCCAGAG; R-CACACTCCTACAGGCTACAC), 200 μM of each nucleoside triphosphate; 0.5 units of DNA polymerase activity (Applied Biosystems), a buffer for the PNR reaction of Applied Biosystems (500 mM KCI, 100 mM Tris-HCI, pH 8.3; 15 mM MCI2; 0.01% gelatin), betaine 1: 2, 20-30 μl of mineral oil. NDP is carried out under the following conditions: initial denaturation - 95 ° - 15 minutes, 35 amplification cycles -: 94 ° - 1 minute, 50-55 ° - 1 minute, 72 ° - 1 minute. Final elongation - 72 ° - 10 minutes. PCR results are evaluated on a 1% agarose gel.
Установление гетерозиготного носительства мутантного гена у родственников пробанда проводится методом анализа полиморфизма длин рестрикционных фрагментов с использованием эндонуклеазы Hinf I (Toyobo). Реакция проводится согласно протоколу фирмы-производителя. Результаты амплификации после ПДРФ - анализа оцениваются методом электрофореза в 2% агарозном Nusieve геле (чертеж).The establishment of a heterozygous carriage of a mutant gene in relatives of a proband is carried out by the method of analysis of polymorphism of lengths of restriction fragments using endonuclease Hinf I (Toyobo). The reaction is carried out according to the protocol of the manufacturer. Amplification results after RFLP analysis are evaluated by electrophoresis in 2% agarose Nusieve gel (drawing).
В норме должны образовываться фрагменты 175, 114, 104, 26 п.н., в случае носительства в гомозиготном состоянии (больной) - вместо фрагментов 114 и 104 образуются фрагменты длиной 218 п.н. и 175, 26 п.н. В случае гетерозиготного носительства мутации (здоровый носитель) длины фрагментов будут 218, 175, 114, 104 и 26 п.н.Normally, fragments of 175, 114, 104, 26 bp should be formed, in the case of carriage in a homozygous state (patient), instead of fragments 114 and 104,
Быстрый способ диагностики 3-М синдрома испытан на 39 больных с 3-М синдромом, 35 их родственниках и 20 здоровых индивидах якутской национальности. Все больные были гомозиготами по данной мутации и имели аллели длиной 218 п.н. и 175, 26 п.н., 30 родственников из 35 были гетерозиготными носителями мутации и имели длины фрагментов 218, 175, 114, 104 и 26 п.н., остальные 5 из группы родственников и 20 здоровых имели фрагменты длиной 175, 114, 104, 26 п.н. Чертеж.A quick way to diagnose 3-M syndrome was tested on 39 patients with 3-M syndrome, 35 of their relatives and 20 healthy individuals of Yakut nationality. All patients were homozygotes for this mutation and had
Данный способ диагностики 3-М синдрома в якутской популяции позволяет выставить точный диагноз, проводить пренатальную ДНК - диагностику и проспективное медико-генетическое консультирование для вступающих в брак. Предлагаемый нами способ диагностики 3-М синдрома прост в выполнении, точен и доступен для выполнения в молекулярно-генетической лаборатории.This method of diagnosing 3-M syndrome in the Yakut population allows you to make an accurate diagnosis, conduct prenatal DNA diagnostics and prospective medical and genetic counseling for married people. Our proposed method for the diagnosis of 3-M syndrome is simple to perform, accurate and available for execution in the molecular genetic laboratory.
Клинические примеры заболевания:Clinical examples of the disease:
Пример 1Example 1
Пациент К.Р., 14 - 09 - 2001 г.р.Patient K.R., 14 - 09 - 2001 year of birth
Адрес: Республика Саха, г.Якутск, ул. Крупская 3, кв.3Address: Republic of Sakha, Yakutsk, st. Krupskaya 3, apt. 3
Национальность: сахаNationality: Sakha
Жалобы на низкий рост, отставание в физическом развитии с рождения.Complaints of short stature, physical developmental lag since birth.
Анамнез болезни: Впервые был осмотрен в отделении патологии новорожденных врачами-генетиками медико-генетической консультации и выставлен диагноз: Метафизарная хондродистрофия, тип Маккьюсика. До 2006 года ребенок наблюдался в медико-генетической консультации Республиканской больницы №1 - НЦМ Минздрава Республики Саха(Якутия) с клиническим диагнозом: Метафизарная хондродистрофия, тип Маккьюсика. После проведения молекулярно-генетического анализа был выставлен окончательный диагноз: 3-М синдром с аутосомно-рецессивным типом наследования.Anamnesis of the disease: For the first time was examined in the neonatal pathology department by geneticists of the medical genetic consultation and diagnosed with Metaphysical chondrodystrophy, type McCusick. Until 2006, the child was observed in the medical-genetic consultation of the Republican Hospital No. 1 - NTC of the Ministry of Health of the Republic of Sakha (Yakutia) with a clinical diagnosis: Metaphysical chondrodystrophy, type McCusick. After molecular genetic analysis, the final diagnosis was made: 3-M syndrome with an autosomal recessive type of inheritance.
Анамнез жизни: Ребенок от 3 беременности, протекавшей без патологии, 2 физиологических родов в сроке 38 недель беременности с ростом - 44 см, весом - 2,980 кг. Закричал после реанимационных мероприятий, к груди приложен на 5 сутки, переведен на 5 сутки в отделение патологии новорожденных Республиканской больницы №1 - НЦМ.Anamnesis of life: A child from 3 pregnancies without a pathology, 2 physiological births in the period of 38 weeks of pregnancy with an increase of 44 cm, weight - 2,980 kg. He screamed after resuscitation, was applied to the chest on the 5th day, transferred on the 5th day to the neonatal pathology unit of Republican Hospital No. 1 - NTC.
Перенесенные заболевания: ОРВИ, ожоговая болезнь в 2, 5 года.Past diseases: SARS, burn disease at 2, 5 years.
Аллергологический анамнез: спокоен.Allergic history: calm.
Психомоторное развитие: головку удерживает с 5 месяцев, ходит с 12 месяцев. Говорит с 2,5 лет.Psychomotor development: keeps the head from 5 months, walks from 12 months. He speaks from 2.5 years.
По родословной: наследственность не отягощена, родители не являются родственниками, в семье еще 1 ребенок - здоровый, от первого брака. Родители по национальности оба саха. Рост родителей- средний.By pedigree: heredity is not burdened, parents are not relatives, in the family another 1 child is healthy, from his first marriage. Parents are both Saha. Parents' growth is average.
ФенотипPhenotype
Телосложение непропорциональное, голова большая по отношению к туловищу. Рост низкий, нанизм. Голова гидроцефальной формы, лицо треугольное, большие миндалевидные глаза, гипоплазия средней трети лица, толстые губы, гипотелоризм, длинный фильтр. Короткий нос, гипоплазия скуловых костей. Деформация грудной клетки по типу «груди сапожника», широкая и укороченная грудина. Конечности пропорциональные, микромелия верхняя и нижняя. Поясничный гиперлордоз. Выступающие пятки на стопах. Мышечная гипотония. Сердечные тоны ритмичные, ясные. Живот большой, мягкий, безболезненный. Печень и селезенка не увеличены. НПО по мужскому типу. Стул и диурез в норме.The physique is disproportionate, the head is large in relation to the body. Low growth, dwarfism. The head is hydrocephalic, the face is triangular, large almond-shaped eyes, hypoplasia of the middle third of the face, thick lips, hypotelorism, a long filter. Short nose, cheekbone hypoplasia. Chest deformity of the “cobbler’s chest” type, wide and shortened sternum. The limbs are proportional; the micromelia are upper and lower. Lumbar hyperlordosis. Protruding heels on the feet. Muscle hypotension. Heart tones are rhythmic, clear. The abdomen is large, soft, painless. The liver and spleen are not enlarged. Male type NGOs. Stool and diuresis are normal.
Результаты лабораторных исследований:Laboratory test results:
Заключение № 21Conclusion No. 21
по молекулярно - генетическому исследованию геномной ДНКon molecular genetic research of genomic DNA
На базе отделения неврологии Института мозга Университета г.Ниигаты (Япония) проведена косвенная ДНК-диагностика следующих заболеваний:On the basis of the Department of Neurology of the Brain Institute of the University of Niigata (Japan), an indirect DNA diagnosis of the following diseases was performed:
1. Метафизарной хондродистрофии Маккьюсика (в гене RMPR, с использованием полиморфных динуклеотидных маркеров D9S163, 99АС, СА1, D9S1804).1. McCusick metaphysical chondrodystrophy (in the RMPR gene, using polymorphic dinucleotide markers D9S163, 99AC, CA1, D9S1804).
2. Нанизма Мюллибрея (в локусе гена MUL с использованием полиморфных динуклеотидных маркеров D17S1606, 95-СА, 272а-СА, 52-CA, D17S924).2. Mulibray nanism (at the MUL gene locus using polymorphic dinucleotide markers D17S1606, 95-CA, 272a-CA, 52-CA, D17S924).
3. Болезни Ларона (в гене GH с использованием полиморфных динуклеотидных маркеров D5S628, D5S634).3. Laron's disease (in the GH gene using polymorphic dinucleotide markers D5S628, D5S634).
Пациент в локусах генов этих заболеваний по данным полиморфным маркерам не является гомозиготой, следовательно, все эти заболевания исключены молекулярно-генетическим методом.The patient in the loci of the genes of these diseases according to these polymorphic markers is not homozygous, therefore, all these diseases are excluded by the molecular genetic method.
Проведено полное секвенирование гена Куллин 7 (Cullin7, CUL7). В 25 экзоне гена Куллин 7 (Cullin7, CUL7), вызывающего наследственное заболевание 3-М Синдром выявлена нонсенс мутация - инсерция Т (тимина) в положении 4582. Проведена ДНК-диагностика методом ПНР с последующим проведением ПДРФ - анализа и использованием рестриктазы HinfI и выявлено наличие фрагментов длиной 218 п.н. и 175, 26 п.н., что является показателем носительства мутантного гена в гомозиготном состоянии (больной).Complete sequencing of the gene Cullin 7 (Cullin7, CUL7). In exon 25 of the
Заключение: Таким образом, по результатам молекулярно-генетического анализа диагноз метафизарной хондродисплазии Маккьюсика снят. В результате молекулярно-генетического анализа (найдена мутации в гене CULT) выставлен окончательный диагноз: 3 - М синдром (OMIM-273750).Conclusion: Thus, according to the results of molecular genetic analysis, the diagnosis of metaphysical chondrodysplasia of McCusick has been removed. As a result of molecular genetic analysis (mutations were found in the CULT gene), the final diagnosis was made: 3 - M syndrome (OMIM-273750).
Медицинское заключениеMedical report
Диагноз метафизарной хондродисплазии, тип Маккьюсика на основании результатов ДНК-диагностики снят. Учитывая клинические данные(пренатальную и постнатальную гипоплазию, пропорционально низкий рост, лицевые дизморфии, нормальный интеллект и отсутствие эндокринных нарушений), лабораторно- функциональные исследования, молекулярно-генетический анализ (идентифицирована точковая мутацию - инсерцию тимина в 25 экзоне гена CUL7, ответственного за развитие 3-М синдрома) выставленThe diagnosis of metaphysical chondrodysplasia, McCusick type, based on the results of DNA diagnostics, has been removed. Taking into account clinical data (prenatal and postnatal hypoplasia, proportionally low growth, facial dysmorphies, normal intelligence and the absence of endocrine disorders), laboratory and functional studies, molecular genetic analysis (point mutation was identified - insertion of thymine in exon 25 of the CUL7 gene, responsible for development 3 -M syndrome) exposed
ЗАКЛЮЧИТЕЛЬНЫЙ ДИАГНОЗ: 3-М синдром с аутосомно-рецессивным типом наследования (наследственный нанизм (OMIM - 73750). Генетический риск для сибсов 25%.FINAL DIAGNOSIS: 3-M syndrome with an autosomal recessive type of inheritance (hereditary nanism (OMIM - 73750). Genetic risk for siblings 25%.
Пример 2.Example 2
Пациентка М.Т.Patient M.T.
Дата рождения: 27-07-1999Date of birth: 27-07-1999
Адрес: Республики Саха(Якутия), Верхневилюйский улус, село Хоро.Address: Republic of Sakha (Yakutia), Verkhnevilyuysky ulus, Khoro village.
Жалобы на низкий рост, резкое отставание в росте с рождения.Complaints of low growth, a sharp lag in growth since birth.
Анамнез заболевания: Ребенок был осмотрен в возрасте 2 недель в медико-генетической консультации и выставлен диагноз: Метафизарная хондродистрофия, тип Маккьюсика. До 2006 года ребенок наблюдался в медико-генетической консультации Республиканской больницы - НЦМ Минздрава Республики Саха(Якутия) с клиническим диагнозом: Метафизарная хондродистрофия, тип Маккьюсика. После проведения молекулярно-генетического анализа был выставлен окончательный диагноз: 3-М синдром.Anamnesis of the disease: The child was examined at the age of 2 weeks in a medical genetic consultation and diagnosed with Metaphysical chondrodystrophy, type McCusick. Until 2006, the child was observed in the medical-genetic consultation of the Republican Hospital - the NTC of the Ministry of Health of the Republic of Sakha (Yakutia) with a clinical diagnosis: Metaphysical chondrodystrophy, type McCusick. After conducting molecular genetic analysis, the final diagnosis was made: 3-M syndrome.
Анамнез жизни: Ребенок от 2 беременности, протекавшей во 2 половине с гестозом. Была направлена на стационарное лечение в сроке 37 недель, по УЗИ плода - задержка внутриутробного развития. От 2 оперативных родов на 38 неделе с весом - 1860, ростом - 35 см, Апгар - 2/6 баллов. Состояние при рождении тяжелое, переведен в отделение патологии новорожденных РБ №1-НЦМ.Anamnesis of life: A child from 2 pregnancies in the 2nd half with gestosis. She was sent to inpatient treatment for a period of 37 weeks, by ultrasound of the fetus - intrauterine growth retardation. From 2 operative births at 38 weeks with a weight of 1860, a growth of 35 cm, Apgar 2/6 points. The condition at birth is serious, transferred to the department of pathology of newborns of the Republic of Belarus No. 1-NCM.
Перенесенные заболевания: ОРВИ.Past diseases: SARS.
Аллергологический анамнез: спокоен.Allergic history: calm.
Психомоторное развитие: Головку держит с 5 месяцев, сидит - с 8 месяцев, самостоятельно ходит - с 14 месяцев, первые зубы - с 6 месяцев.Psychomotor development: Holds the head from 5 months, sits - from 8 months, walks independently - from 14 months, first teeth - from 6 months.
Из родословной: Беременность-1 завершилась мертворожденным плодом женского пола, с весом - 1700 и гидроцефальной формой головы. Сибс с таким же фенотипом.From the pedigree: Pregnancy-1 ended with a stillborn fetus of a female, with a weight of 1700 and a hydrocephalic head shape. Sibs with the same phenotype.
ФенотипPhenotype
Телосложение непропорциональное, голова большая относительно туловища, макроцефалия, туловище укорочено. Низкий рост, нанизм. Кожные покровы смуглые, чистые. Голова ближе к гидроцефальной форме. Лоб выступает. Волосы темные. Лицо треугольное, переносье упрощено. Нос короткий с выступающими носовыми ходами. Фильтр длинный. Шея короткая. Грудная клетка широкая, укорочена. Микромелия верхняя и нижняя. ЧПС на обеих кистях. Сердечные тоны ритмичные, ясные, шумов нет. Живот увеличен, печень и селезенка не увеличены. Поясничный гиперлордоз. Выступающие пятки на стопах. НПО по женскому типу. Стул и диурез в нормеThe physique is disproportionate, the head is large relative to the trunk, macrocephaly, the trunk is shortened. Short stature, dwarfism. The skin is dark, clean. Head closer to hydrocephalic form. The forehead stands out. The hair is dark. The face is triangular, the nose is simplified. The nose is short with protruding nasal passages. The filter is long. The neck is short. The chest is wide, shortened. Micromelia upper and lower. NPV on both hands. Heart tones are rhythmic, clear, no noise. The abdomen is enlarged, the liver and spleen are not enlarged. Lumbar hyperlordosis. Protruding heels on the feet. Female NGOs. Stool and diuresis are normal
Результаты лабораторных исследований:Laboratory test results:
Заключение N 23Conclusion N 23
по молекулярно-генетическому исследованию геномной ДНКfor molecular genetic research of genomic DNA
На базе отделения неврологии Института мозга Университета г.Ниигаты (Япония) проведена косвенная ДНК-диагностика следующих заболеваний:On the basis of the Department of Neurology of the Brain Institute of the University of Niigata (Japan), an indirect DNA diagnosis of the following diseases was performed:
1. Метафизарной хондродистрофии Маккьюсика (в гене RMPR, с использованием полиморфных динуклеотидных маркеров D9S163, 99АС, СА1, D9S1804).1. McCusick metaphysical chondrodystrophy (in the RMPR gene, using polymorphic dinucleotide markers D9S163, 99AC, CA1, D9S1804).
2. Нанизма Мюллибрея (в локусе гена MUL с использованием полиморфных динуклеотидных маркеров D17S1606, 95-СА, 272а-СА, 52-CA, D17S924).2. Mulibray nanism (at the MUL gene locus using polymorphic dinucleotide markers D17S1606, 95-CA, 272a-CA, 52-CA, D17S924).
3. Болезни Ларона (в гене GH с использованием полиморфных динуклеотидных маркеров D5S628, D5S634).3. Laron's disease (in the GH gene using polymorphic dinucleotide markers D5S628, D5S634).
Пациент в локусах генов этих заболеваний по данным полиморфным маркерам не является гомозиготой, следовательно, все эти заболевания исключены молекулярно-генетическим методом.The patient in the loci of the genes of these diseases according to these polymorphic markers is not homozygous, therefore, all these diseases are excluded by the molecular genetic method.
Проведено полное секвенирование гена Куллин 7 (Cullin7, CUL7). В 25 экзоне гена Куллин 7 (Cullin7, CUL7), вызывающего наследственное заболевание 3-М Синдром, выявлена нонсенс мутация - инсерция Т (тимина) в положении 4582. Проведена ДНК-диагностика методом ПЦР с последующим проведением ПДРФ - анализа и использованием рестриктазы Hinfl и выявлено наличие фрагментов длиной 218 п.н. и 175, 26 п.н., что является показателем носительства мутантного гена в гомозиготном состоянии (больной).Complete sequencing of the gene Cullin 7 (Cullin7, CUL7). In exon 25 of the
Заключение: Таким образом, по результатам молекулярно-генетического анализа диагноз метафизарной хондродисплазии Маккьюсика снят. В результате молекулярно-генетического анализа (найдена мутации в гене CUL7) выставлен окончательный диагноз: 3-М синдром (OMIM-273750).Conclusion: Thus, according to the results of molecular genetic analysis, the diagnosis of metaphysical chondrodysplasia of McCusick has been removed. As a result of molecular genetic analysis (mutations were found in the CUL7 gene), the final diagnosis was made: 3-M syndrome (OMIM-273750).
Медицинское заключениеMedical report
Диагноз метафизарной хондродисплазии, тип Маккьюсика на основании ДНК-диагностики снят. Учитывая клинические данные исследований (пренатальную и постнатальную гипоплазию, пропорционально низкий рост, лицевые дизморфии, нормальный интеллект и отсутствие эндокринных нарушений), лабораторно-функциональные и молекулярно-генетический анализ (идентифицированную точковую мутацию - инсерцию тимина в 25 экзоне гена CUL 7, ответственного за развитие 3-М синдрома) выставленThe diagnosis of metaphysical chondrodysplasia, McCusick type based on DNA diagnostics is removed. Given the clinical data of the studies (prenatal and postnatal hypoplasia, proportionally low growth, facial dysmorphies, normal intelligence and the absence of endocrine disorders), laboratory-functional and molecular genetic analysis (identified point mutation - insertion of thymine in the 25 exon of the
ЗАКЛЮЧИТЕЛЬНЫЙ ДИАГНОЗ: 3-М синдром с аутосомно-рецессивным рецессивным типом наследования (наследственный нанизм (OMIM - 273750). Генетический риск для сибсов 25%.FINAL DIAGNOSIS: 3-M syndrome with an autosomal recessive recessive type of inheritance (hereditary dwarfism (OMIM - 273750). Genetic risk for siblings 25%.
Пациент М. Д, сибс М.Т.Patient M. D, siblings M.T.
Дата рождения: 27-07-1999Date of birth: 27-07-1999
Адрес: Республики Саха(Якутия), Верхневилюйский улус, село Хоро,Address: Republic of Sakha (Yakutia), Verkhnevilyuysky ulus, village of Khoro,
Жалобы на низкий рост, резкое отставание в росте с рождения.Complaints of low growth, a sharp lag in growth since birth.
Анамнез заболевания: Ребенок был осмотрен в возрасте 4 месяцев в медико-генетической консультации и выставлен диагноз: Метафизарная хондродистрофия, тип Маккьюсика. До 2006 года ребенок наблюдался в медико-генетической консультации Республиканской больницы - НЦМ Минздрава Республики Саха(Якутия) с клиническим диагнозом: Метафизарная хондродистрофия, тип Маккьюсика. После проведения молекулярно-генетического анализа был выставлен окончательный диагноз: 3-М синдром.Anamnesis of the disease: The child was examined at the age of 4 months in a medical genetic consultation and was diagnosed with Metaphysical chondrodystrophy, McCusick type. Until 2006, the child was observed in the medical-genetic consultation of the Republican Hospital - the NTC of the Ministry of Health of the Republic of Sakha (Yakutia) with a clinical diagnosis: Metaphysical chondrodystrophy, type McCusick. After conducting molecular genetic analysis, the final diagnosis was made: 3-M syndrome.
Анамнез жизни: Ребенок от 3 беременности, протекавшей во 1 половине - с токсикозом, во 2 половине с гестозом. От 3 оперативных родов на 38 неделе с весом - 1860, ростом - 35 см, Апгар - 2/6 баллов. Состояние при рождении тяжелое, переведен в отделение патологии новорожденных РБ №1 - НЦМ.Anamnesis of life: A child from 3 pregnancies, proceeding in the 1st half - with toxicosis, in the 2nd half with gestosis. From 3 operative births at 38 weeks with a weight of 1860, an increase of 35 cm, Apgar - 2/6 points. The condition at birth is serious, he was transferred to the neonatal pathology department of the Republic of Belarus No. 1 - NTC.
Перенесенные заболевания: ОРВИPast diseases: ARVI
Аллергологический анамнез: спокоен.Allergic history: calm.
Психомоторное развитие: Головку держит с 3 месяцев, сидит - с 7 месяцев, самостоятельно ходит - с 14 месяцев, первые зубы - с 6 месяцев.Psychomotor development: Holds the head from 3 months, sits - from 7 months, walks independently - from 14 months, first teeth - from 6 months.
Из родословной: Беременность - 1 завершилась мертворожденным плодом женского пола, с весом - 1700 и гидроцефальной формой головы. Сибс с таким же фенотипом.From the pedigree: Pregnancy - 1 ended with a stillborn female fetus, with a weight of 1700 and a hydrocephalic head shape. Sibs with the same phenotype.
ФенотипPhenotype
Телосложение непропорциональное, голова большая относительно туловища, макроцефалия, туловище укорочено. Низкий рост, нанизм. Кожные покровы смуглые, чистые. Голова ближе к гидроцефальной форме. Лоб выступает. Волосы темные. Лицо треугольное, переносье упрощено, гипоплазия средней части лица. Нос короткий с выступающими носовыми ходами. Фильтр длинный. Шея короткая. Грудная клетка широкая, укорочена. Микромелия верхняя и нижняя. ЧПС на обеих кистях. Выступающие пятки на стопах. Сердечные тоны ритмичные, ясные, шумов нет. Живот увеличен, печень и селезенка не увеличены. Поясничный гиперлордоз. НПО по мужскому типу. Стул и диурез в норме.The physique is disproportionate, the head is large relative to the trunk, macrocephaly, the trunk is shortened. Short stature, dwarfism. The skin is dark, clean. Head closer to hydrocephalic form. The forehead stands out. The hair is dark. The face is triangular, the nose is simplified, hypoplasia of the middle part of the face. The nose is short with protruding nasal passages. The filter is long. The neck is short. The chest is wide, shortened. Micromelia upper and lower. NPV on both hands. Protruding heels on the feet. Heart tones are rhythmic, clear, no noise. The abdomen is enlarged, the liver and spleen are not enlarged. Lumbar hyperlordosis. Male type NGOs. Stool and diuresis are normal.
Результаты лабораторных исследований:Laboratory test results:
Заключение N 24Conclusion N 24
по молекулярно-генетическому исследованию геномной ДНКfor molecular genetic research of genomic DNA
На базе отделения неврологии Института мозга Университета г.Ниигаты (Япония) проведена косвенная ДНК-диагностика следующих заболеваний:On the basis of the Department of Neurology of the Brain Institute of the University of Niigata (Japan), an indirect DNA diagnosis of the following diseases was performed:
1. Метафизарной хондродистрофии Маккьюсика (в гене RMPR, с использованием полиморфных динуклеотидных маркеров D9S163, 99АС, СА1, D9S1804).1. McCusick metaphysical chondrodystrophy (in the RMPR gene, using polymorphic dinucleotide markers D9S163, 99AC, CA1, D9S1804).
2. Нанизма Мюллибрея (в локусе гена MUL с использованием полиморфных динуклеотидных маркеров D17S1606, 95-СА, 272а-СА, 52-CA, D17S924).2. Mulibray nanism (at the MUL gene locus using polymorphic dinucleotide markers D17S1606, 95-CA, 272a-CA, 52-CA, D17S924).
3. Болезни Ларона (в гене GH с использованием полиморфных динуклеотидных маркеров D5S628, D5S634).3. Laron's disease (in the GH gene using polymorphic dinucleotide markers D5S628, D5S634).
Пациент в локусах генов этих заболеваний по данным полиморфным маркерам не является гомозиготой, следовательно, все эти заболевания исключены молекулярно-генетическим методом.The patient in the loci of the genes of these diseases according to these polymorphic markers is not homozygous, therefore, all these diseases are excluded by the molecular genetic method.
Проведено полное секвенирование гена Куллин 7 (Cullin7, CUL7). В 25 экзоне гена Куллин 7 (Cullin7, CUL7), вызывающего наследственное заболевание 3-М Синдром выявлена нонсенс мутация - инсерция Т (тимина) в положении 4582 / Проведена ДНК-диагностика методом ПЦР с последующим проведением ПДРФ - анализа и использованием рестриктазы Hinfl и выявлено наличие фрагментов длиной 218 п.н. и 175, 26 п.н., что является показателем носительства мутантного гена в гомозиготном состоянии (больной).Complete sequencing of the gene Cullin 7 (Cullin7, CUL7). In exon 25 of the
Заключение: Таким образом, по результатам молекулярно-генетического анализа диагноз метафизарной хондродисплазии Маккьюсика снят. В результате молекулярно-генетического анализа (найдена мутации в гене CUL7) выставлен окончательный диагноз: 3 М синдром (OMIM-273750).Conclusion: Thus, according to the results of molecular genetic analysis, the diagnosis of metaphysical chondrodysplasia of McCusick has been removed. As a result of molecular genetic analysis (mutations found in the CUL7 gene), the final diagnosis was made: 3 M syndrome (OMIM-273750).
Медицинское заключениеMedical report
Диагноз метафизарной хондродисплазии, тип Маккьюсика на основании ДНК-диагностики снят.Учитывая клинические данные (пренатальную и постнатальную гипоплазию, пропорционально низкий рост, лицевые дизморфии, нормальный интеллект и отсутствие эндокринных нарушений), лабораторно- функциональные исследований и молекулярно-генетический анализ (идентифицированную точковую мутацию - инсерцию тимина в 25 экзоне гена CUL7, ответственного за развитие 3-М синдрома) выставлен ЗАКЛЮЧИТЕЛЬНЫЙ ДИАГНОЗ: 3-М синдром с аутосомно-рецессивным типом наследования, (наследственный нанизм (OMIM - 273750). Генетический риск для сибсов 25%.The diagnosis of metaphysical chondrodysplasia, McCusick's type, based on DNA diagnostics, has been made. Based on clinical data (prenatal and postnatal hypoplasia, proportionally low growth, facial dysmorphies, normal intelligence and the absence of endocrine disorders), laboratory and functional studies and molecular genetic analysis (identified point mutation - insertion of thymine in exon 25 of the CUL7 gene, responsible for the development of 3-M syndrome) FINAL DIAGNOSIS is set: 3-M syndrome with an autosomal recessive inheritance type Nia, (hereditary dwarfism (OMIM -. 273750) Genetic risk to the sibs of 25%.
Claims (1)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2006118727/15A RU2315310C1 (en) | 2006-05-30 | 2006-05-30 | Method for diagnosing 3-m syndrome yakut population |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2006118727/15A RU2315310C1 (en) | 2006-05-30 | 2006-05-30 | Method for diagnosing 3-m syndrome yakut population |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2315310C1 true RU2315310C1 (en) | 2008-01-20 |
Family
ID=39108769
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2006118727/15A RU2315310C1 (en) | 2006-05-30 | 2006-05-30 | Method for diagnosing 3-m syndrome yakut population |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2315310C1 (en) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN115851899A (en) * | 2022-07-13 | 2023-03-28 | 湖南家辉生物技术有限公司 | Application of 3M syndrome pathogenic gene CUL7 composite heterozygous mutation site and diagnostic reagent thereof |
-
2006
- 2006-05-30 RU RU2006118727/15A patent/RU2315310C1/en not_active IP Right Cessation
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
HUBER С. et al., Identification of mutations in CUL7 in 3-M syndrome, Nat. Genet, 2005, oct., 37 (10), 1119-1124. БОЧКОВ Н.П., Клинико-генеалогический метод диагностики - сочетание общего (стандартного) клинического и генеалогических методов, Клиническая генетика. Учебник для студентов медицинских Вузов, 2001, с.59-60, 84-85. ELLIOT AM. et al., Spectrum of dolichospondylic dysplasia: two new patients with distinctive finding. Am. J. Med. Genet., 2002, dec., 113 (4), 351-361. * |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN115851899A (en) * | 2022-07-13 | 2023-03-28 | 湖南家辉生物技术有限公司 | Application of 3M syndrome pathogenic gene CUL7 composite heterozygous mutation site and diagnostic reagent thereof |
CN115851899B (en) * | 2022-07-13 | 2024-04-23 | 湖南家辉生物技术有限公司 | Application of 3M syndrome pathogenic gene CUL7 compound heterozygous mutation site and diagnostic reagent thereof |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Andrew et al. | Huntington disease without CAG expansion: phenocopies or errors in assignment? | |
Jäkälä et al. | Fragile-X: neuropsychological test performance, CGG triplet repeat lengths, and hippocampal volumes. | |
Young et al. | X-linked high myopia associated with cone dysfunction | |
Elmas et al. | Success of face analysis technology in rare genetic diseases diagnosed by whole-exome sequencing: a single-center experience | |
El Khattabi et al. | Clinical and molecular delineation of tetrasomy 9p syndrome: report of 12 new cases and literature review | |
RU2315310C1 (en) | Method for diagnosing 3-m syndrome yakut population | |
Albarwani et al. | Heritability of ambulatory and beat-to-beat office blood pressure in large multigenerational Arab pedigrees: the ‘Oman Family study’ | |
Rittinger et al. | The changing phenotype in diploid/triploid mosaicism may mimic genetic syndromes with aberrant genomic imprinting: follow up in a 14-year-old girl | |
Bijlsma et al. | Increased nuchal translucency and split‐hand/foot malformation in a fetus with an interstitial deletion of chromosome 2q that removes the SHFM5 locus | |
Hassan et al. | Genome-wide linkage analysis of hemodynamic parameters under mental and physical stress in extended Omani Arab pedigrees: The Oman family study | |
Łoniewska et al. | Association of functional genetic variants of A-kinase anchoring protein 10 with QT interval length in full-term Polish newborns | |
RU2784293C1 (en) | Method for diagnostics of neuronal ceroid lipofuscinosis type 6 | |
Walencka et al. | Clinical expression of Holt-Oram syndrome on the basis of own clinical experience considering prenatal diagnosis | |
Milachich et al. | e-Posters EP01 Reproductive Genetics | |
ES2269651T3 (en) | POLYMORPHISMS IN GEN ZF9 LINKED TO A PRE-DEPOSITION FOR THE DEVELOPMENT OF AN INAPPROPRIATE FORMATION OF CYCLATRIZAL FABRIC OR FIBROSIS. | |
Horgan et al. | The history of new devices and technology on the labor floor | |
RU2285921C1 (en) | Method for predicting clinical course of diabetes mellitus type 1 in bashkortostan people populations | |
Tan | SUPPLEMENTAL NOTE | |
Esmaeilzadeh et al. | Lethal Congenital Contracture Syndromes (LCCS): An In-Depth | |
Morris | Genotype-phenotype correlations: Lessons from Williams syndrome research | |
Lion-François et al. | Developmental trajectories of 31 French Creatine Transporter Deficiency (SLC6A8) patients: New insights into outcome measures selection | |
Ластівка et al. | WILLIAMS-BEUREN SYNDROME AND COMBINED PATHOLOGY IN MONOCHORIAL TWINS (LITERATURE REVIEW AND CLINICAL CASE) | |
BR102020006119A2 (en) | MICROCEPHALY PREDICTION PROCESS THROUGH PERIPHERAL BLOOD COMPONENTS | |
van der Burgt | Clinical and genetic studies in Noonan syndrome | |
Shravya et al. | Comprehensive phenotyping of fetuses with trisomy 18: a perinatal center experience |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20080531 |
|
NF4A | Reinstatement of patent |
Effective date: 20100910 |
|
MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20130531 |