RU2269525C2 - Антибактериальные агенты - Google Patents
Антибактериальные агенты Download PDFInfo
- Publication number
- RU2269525C2 RU2269525C2 RU2002106409/04A RU2002106409A RU2269525C2 RU 2269525 C2 RU2269525 C2 RU 2269525C2 RU 2002106409/04 A RU2002106409/04 A RU 2002106409/04A RU 2002106409 A RU2002106409 A RU 2002106409A RU 2269525 C2 RU2269525 C2 RU 2269525C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- carbonyl
- mmol
- acid
- methyl
- formylhydroxyamino
- Prior art date
Links
- 0 **C(CC1)CCN1C(C(*)NC(C(*)CC(NO)=O)=O)=O Chemical compound **C(CC1)CCN1C(C(*)NC(C(*)CC(NO)=O)=O)=O 0.000 description 2
- NANHSGWUHGVADX-UHFFFAOYSA-N CC(C)(C)C(C(N(CC1)CCN1C(c(cc1)cc2c1OCO2)=O)=O)NC(OCc1ccccc1)=O Chemical compound CC(C)(C)C(C(N(CC1)CCN1C(c(cc1)cc2c1OCO2)=O)=O)NC(OCc1ccccc1)=O NANHSGWUHGVADX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FFUMIESWYOUXIE-UHFFFAOYSA-N CC(C)(C)C(C(N(CC1)CCN1C(c1ccc2OCOc2c1)=O)=O)N Chemical compound CC(C)(C)C(C(N(CC1)CCN1C(c1ccc2OCOc2c1)=O)=O)N FFUMIESWYOUXIE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YBSNEMFNEXSFGR-UHFFFAOYSA-N CC(C)(C)C(C(N1CCNCC1)=O)NC(OCc1ccccc1)=O Chemical compound CC(C)(C)C(C(N1CCNCC1)=O)NC(OCc1ccccc1)=O YBSNEMFNEXSFGR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LYPBKCUXTNWMJS-UFUCKMQHSA-N CC(C)C(C(N(CC1)CCC1Oc(cc1)ccc1C(OC)=O)=O)NC([C@H](CC1CCCC1)CN(C=O)O)=O Chemical compound CC(C)C(C(N(CC1)CCC1Oc(cc1)ccc1C(OC)=O)=O)NC([C@H](CC1CCCC1)CN(C=O)O)=O LYPBKCUXTNWMJS-UFUCKMQHSA-N 0.000 description 1
- QEMIMGROJUKDKP-UHFFFAOYSA-N ONC(CC(CC1CCCC1)C(N(CC1)CCN1c(cc1Cl)ccc1Cl)=O)=O Chemical compound ONC(CC(CC1CCCC1)C(N(CC1)CCN1c(cc1Cl)ccc1Cl)=O)=O QEMIMGROJUKDKP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Landscapes
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
Abstract
Изобретение относится к N-[1S-(4-бензо[1,3]диоксол-5-илметилпиперазин-1-карбонил)-2,2-диметилпропил]-2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)пропионамиду формулы
или его фармацевтически приемлемой или приемлемой в ветеринарии соли, гидрату или сольвату. Также предложена фармацевтическая или ветеринарная композиция, обладающая антибактериальной активностью, содержащая указанное соединение вместе с фармацевтически приемлемым или приемлемым в ветеринарии носителем. Технический результат - производное гидроксамовой кислоты, обладающее антибактериальной активностью. 2 н.з. п. ф-лы, 9 табл.
Description
Данное изобретение относится к новым производным гидроксамовой кислоты и N-формилгидроксиламина, обладающим антибактериальной активностью, способам лечения с использованием таких соединений и к фармацевтическим и ветеринарным композициям, содержащим такие соединения.
Предпосылки создания изобретения.
Известны многие классы антибактериальных агентов, включая пенициллины и цефалоспорины, тетрациклины, сульфонамиды, монобактамы, фторхинолоны и хинолоны, аминогликозиды, гликопептиды, макролиды, полимиксины, линкозамиды, триметоприм, хлорамфеникол. Фундаментальные механизмы действия этих антибактериальных классов отличаются друг от друга.
Резистентность бактерий ко многим известным антибактериальным агентам представляет собой все большие затруднения. В соответствии с этим существует необходимость создания альтернативных антибактериальных агентов, особенно таких, механизм действия которых значительно отличается от механизма действия известных классов таких агентов. Среди грамположительных патогенов, таких как Staphylococci, Streptococci, Mycobacteria и Enterococci, появились резистентные штаммы, что особенно затрудняет их уничтожение. Примерами таких штаммов являются резистентный к метициллину Staphylococcus aureus (MRSA), резистентный к метициллину, отрицательный по отношению к коагулозе Staphylococci (MRCNS), резистентный к пенициллину Streptococcus pneumoniae и множественно резистентный Enterococcus faecium.
Патогенные бактерии часто являются резистентными к аминогликозидам, β-лактамам (пенициллинам и цефалоспоринам) и хлорамфеникольным типам антибиотика. Эта резистентность включает ферментативную инактивацию антибиотика путем гидролиза или образования неактивных производных. Бета-лактамное семейство антибиотиков (пенициллины и цефалоспорин) характеризуются наличием β-лактамного кольца. Резистентность по отношению к этому семейству антибиотиков в клинических изолятах в большинстве случаев обусловлена образованием фермента «пенициллиназы» (β-лактамазы) резистентными бактериями, которые гидролизуют β-лактамное кольцо, тем самым устраняя его антибактериальную активность.
Недавно появились резистентные к ванкомицину штаммы enterococci (Woodford N. 1998 Glycopeptide - resistant enterococci: a decade of experience. Journal of Medical Microbiology, 41(10): 849-62). Резистентные к ванкомицину enterococci особенно опасны тем, что они часто являются причиной инфекций в больницах и резистентны к большинству антибиотиков. Ванкомицин связывает концевые D-Ala-D-Ala остатки стенки клеток предшественника пептидиогликана. Высокая резистентность к ванкомицину известна как VanA, она обусловлена генами, расположенными на транспозиционном элементе, который изменяет концевые остатки, образуя D-Ala-D-lac, уменьшая тем самым сродство к ванкомицину.
Вследствие быстрого возникновения резистентных ко многим лекарствам бактерий создание антибактериальных агентов с новыми механизмами действия, которые эффективны против возрастающего числа резистентных бактерий, особенно резистентных к ванкомицину enterococci и резистентных к β-лактамным антибиотикам бактерий, таким как резистентные к метициллину Staphylococcus aureus, имеет огромное значение.
Краткое описание изобретения.
Данное изобретение основано на обнаружении того факта, что некоторые производные гидроксамовой кислоты и N-формилгидроксиламина имеют антибактериальную активность, и обеспечивает новую группу антибактериальных агентов. Было обнаружено, что соединения, которых касается данное изобретение, являются антибактериальными по отношению к ряду бактерий, причем активность против грамположительных организмов обычно больше, чем по отношению к грамотрицательным организмам. Многие соединения по изобретению обнаруживают активность против бактерий, ответственных за инфекцию дыхательных путей, таких как Streptococcus pneumoniae и Haemophilus influenzae.
Хотя установление механизма действия соединений, которых касается данное изобретение, представляет интерес, пригодными их делает способность ингибировать рост бактерий. Однако в настоящее время полагают, что их антибактериальная активность обусловлена, по меньшей мере частично, внутриклеточным ингибированием бактериальной полипептид-деформилазы (PDF; ЕС 3.5.1.31).
Все реакции синтеза белков, опосредованного рибосомами, начинаются с остатка метионина. В прокариотах метионильная группа, которую несет инициатор тРНК, N-формилируется до ее введения в полипептид. Вследствие этого на N-конце возникающего бактериального полипептида всегда имеется N-формилметионин. Однако наиболее зрелые белки не сохраняют N-формильную группу концевого остатка метионина. Перед удалением метионина требуется деформилирование, так как аминопептидаза метионина не распознает пептиды с N-концевым остатком формилметионина (Solbiati et al., J. Mol. Biol. 290:607-614, 1999). Следовательно, деформилирование является важной стадией в процессе биосинтеза бактериального белка, и PDF, отвечающая за фермент, требуется для нормального роста бактерий. Хотя кодирующая ген PDF (def) имеется во всех патогенных бактериях, для которых известны последовательности (MeinneletaL, J. Mol. Biol. 266:939-49, 1997), у нее нет эукериомической противочасти, что делает ее привлекательной мишенью для антибактериальной химиотерапии.
Выделение и характеризация PDF облегчаются, если ясна важность иона металла в активном центре (Croche et al., Biophys. Biochem. Res. Commun., 246:324-6, 1998).
Форма Fe2+ очень активна in vivo, но нестабильна, будучи выделенной, вследствие окислительного разложения (Rajagopalan et al., J. Biol. Chem. 273:22305-10, 1998).
Na2+ форма фермента имеет сдецифическую активность, сравнимую с Fe-ферментом, но нечувствительна к кислороду (Ragusa et al, J. Mol. Biol. 1998,280:515-23, 1998).
Zn2+ форма фермента также является стабильной, но почти лишена каталитической активности (Rajagopalan et al., J. Am. Chem. Soc. 119:12418-12419, 1997).
Некоторые дифракционные кристаллические структуры и ЯМР структуры Е.coli PDF со связанными ингибиторами или без них описаны (Chan et al., Biochemistry, 36:13904-9, 1997; Becker et al., Nature Struct. Biol. 5:1053-58,1998; Becker et al., J. Biol. Chem. 273:11413-6, 1998; Hao et al., Biochemistry, 38:4712-9,1999; Dardel et al., J. Mol. Biol. 280:501-13, 1998; O'Connell et al., J. Biomol. NMR, 13:311-24, 1999), у них геометрия активных сайтов подобна геометрии сайтов металлопротеиназ, таких как термолизин и метзинцины.
В последнее время специфичность PDF к субстрату подробно изучалась (Ragusa et al., J. Mol. Biol. 289:1445-57, 1999; Hu et al., Biochemistry, 38:643-50, 1999; Meinnel et al., Biochemistry, 38:4287-95, 1999). Указанные авторы пришли к выводу, что в положении Р1' предпочтительной является неразветвленная гидрофобная цепь; в то время как в положении Р2' приемлемы разнообразные заместители и в положении Р3' может быть предпочтительным ароматический заместитель. Сообщалось также, что небольшие пептидные соединения, содержащие Н-фосфатные (Ни et al., Bioorg. Med.Chem. Lett., 8:2479-82, 1998) или тиольные (Meinnel et al., Biochemistry, 38:4287-95, 1999), связывающие металл группы, являются микромолярные ингибиторы PDF. Было также обнаружено, что пептидные альдегиды, такие как калпептин (N-Cbz-Leu-норлейкиновый), ингибируют PDF (Durand et al., Arch. Biochem. Biophys., 367:297-302, 1999). Однако идентичность связывающих металл групп и их расположение в пространстве по отношению к остальной части молекулы («фрагмент распознавания») не были подробно изучены. Кроме того, не пептидные ингибиторы PDF, которые могут быть желательными с точки зрения проницаемости стенок бактериальной клетки или биодоступности при оральном введении в клетку-хозяина, не были идентифицированы.
Предшествующий уровень техники.
В заявках на патент, указанных ниже, уже были описаны некоторые производные N-формилгидроксиламина, хотя очень немногие представители таких соединений были специально получены и описаны:
ЕР-В-0236872 | (Roche) |
WO 92/09563 | (Glycomed) |
WO 92/04735 | (Syntex) |
WO 95/19965 | (Glycomed) |
WO 95/22966 | (Sanofi Winthrop) |
WO 95/33709 | (Roche) |
WO 96/23791 | (Syntex) |
WO 96/16027 | (Syntex/Agouron) |
WO 97/03783 | (British Biotech) |
WO 97/18207 | (DuPont Merck) |
WO 98/38179 | (Glaxo Wellcome) |
WO 98/47863 | (Labs Jaques Logeais) |
Фармацевтическая полезность, приписываемая производным N-формилгидроксиламина в этих публикациях, заключается в способности ингибировать матриксные металлопротеиназы (MMPs) и в некоторых случаях высвобождать фактор некроза опухолей (TNF) и, следовательно, лечить болезни или состояния, опосредованные этими ферментами, такие как рак и ревматоидный артрит. В добавление к указанным источникам можно назвать патент США 473 8803 (Roques et al.), в котором также описаны производные N-формилгидроксиламина, однако эти соединения описаны как ингибиторы энкефалиназы и предложены для использования в качестве антидепрессантов и гипотензивных агентов. Кроме того, в заявке WO 97/38705 (Bristol-Myers Squibb) описаны некоторые производные N-формилгидроксиламина в качестве ингибиторов ферментов, превращающих энкефалиназу и ангиотензин.
В заявке WO 99/39704 описано и заявляется, наряду с прочими объектами, применение соединения формулы (I) или его фармацевтически приемлемой или приемлемой в ветеринарии соли для приготовления антибактериальной композиции:
где R1 обозначает водород, C1-C6 алкил или C1-C6 алкил, замещенный одним или несколькими атомами галогена; R2 обозначает замещенный или незамещенный С1-С6 алкил, циклоалкил(С1-C6 алкил)- или арил(С1-C6 алкил)-; и А обозначает группу формулы (IA) или (IB):
где R4 обозначает боковую цепь природной или неприродной альфа-аминокислоты и R5 и R6, взятые вместе с атомом азота, к которому они присоединены, образуют возможно замещенное насыщенное гетероциклическое кольцо, содержащее 3-8 атомов, причем это кольцо возможно сконденсировано с карбоциклическим или вторым гетероциклическим кольцом.
Известны очень многие производные гидроксамовой кислоты. Многие из них, как описано, обладают активностью ингибировать матриксные металлопротеиназы (ММР) и, следовательно, могут быть пригодны для лечения болезней, опосредованных MMPs, например рака, артрита и состояний, включающих повторное формирование тканей, таких как заживление ран и рестеноз. Кроме того, в заявке WO 99/59568 описано применение аналогов производных N-формилгидроксиламина, описанных в WO 99/39704 (где N-формилгидроксиламинная группа замещена группой гидроксамовой кислоты), для приготовления антибактериальной композиции.
Краткое описание изобретения.
Данное изобретение относится к группе антибактериально активных гидроксамовой кислоты и N-формилгидроксиламинов, которые отличаются по структуре от описанных в международных заявках WO 99/59568 и WO 99/39704, в основном, природой -NR5R6-группы (см. формулы (I), (IA) и (IB) выше и их аналоги гидроксамовой кислоты). В этих заявках термин «возможно замещенное», используемый в отношении насыщенного гетероциклического кольца, образованного R5, R6 и атомом азота, к которому он присоединены, означает некоторые специфические заместители. В заявленных в данной заявке соединениях группа -NR5R6 также представляет собой возможно замещенное насыщенное гетероциклическое 3-8-членное кольцо, причем это кольцо может быть сконденсировано с карбоциклическим или вторым гетероциклическим кольцом, но заместители отличаются от описанных в WO 99/59568 и WO 99/39704. Считается, что группа -NR5R6 N-формилгидроксиламинов и гидроксамовых кислот по изобретению также отличает заявленные соединения от соединений, известных в области ингибирования ММТ, TNF, АСЕ и энкефалиназы.
Подробное описание изобретения.
Данное изобретение относится к соединению формулы (II) или его фармацевтически приемлемой соли, приемлемой в ветеринарии соли, гидрату или сольвету
где
Q обозначает радикал формулы -N(OH)CH(=O) или формулы -С(=O)NH(ОН);
R1 обозначает водород, C1-C6 алкил или C1-C6 алкил, замещенный одним или несколькими атомами галогена, или, за исключением случая, когда Q обозначает -N(OH)CH(=O), гидрокси, C1-С6алкокси, C1-С6алкенилокси, амино, С1-C6алкиламино или ди(С1-С6 алкил)амино;
R2 обозначает замещенный или незамещенный C1-С6-алкил, циклоалкил(С1-C6-алкил)- или арил(С1-С6алкил);
А обозначает группу формулы (IIA) или (IIB):
где R4 обозначает боковую цепь природной или неприродной альфа-аминокислоты и R5 и R6, взятые вместе с атомом азота, к которому они присоединены, образуют насыщенное гетероциклическое 5-7-членное кольцо, которое может быть сконденсировано с насыщенным или ненасыщенным карбоциклическим или вторым гетероциклическим 5-7-членным кольцом, отличающемуся тем, что (а) указанное второе кольцо замещено (С1-С6)алкилом, (С2-С6)алкенилом, (С2-С6)алкинилом, (С1-С6)алкокси, гидрокси, меркапто, (С1-С6)алкилтио, галоидом, амино, трифторметилом, оксо, нитро, -СООН, -CONH2, -CORA, -COORA, -NHCORA, -CONHRA, -NHRA, -NRARB, или -CONRARB, где RA и RB независимо обозначают (С1-С6)алкил; и/или
(б) указанное первое или второе кольцо замещено группой (IIC), при условии, что первое кольцо не замещено фенокси, бензилом или бензилом, замещенным (С1 -С6)алкилом, (С1-С6)алкокси, фенокси, гидрокси, меркапто, (С1-С6)алкилтио, амино, галоидом, трифторметилом, нитро, -СООН, -CONH2, -CORA, -COORA, -NHCORA, -CONHRA, -NHRA, -NRARB, или -CONRARB, где RA и RB независимо обозначают (С1-С6)алкил;
где m, р и n независимо равны 0 или 1;
Z обозначает гидрокси или фенил или гетероциклическое 5-7-членное кольцо, которое может быть сконденсировано с насыщенным или ненасыщенным карбоциклическим или гетероциклическим вторым 5-7-членным кольцом;
Alk1 и Alk2 независимо обозначают двухвалентные C1-C3 алкиленовые радикалы;
Х обозначает -О-, -S-, -S(O)-, -S(O2)-, -C(O)-, -NH-, -NR7-, где R7 обозначает С1-C3 алкил;
и где
Alk1, Alk2 и Z, когда Z не является гидрокси, независимо могут быть замещены
(С1-С6)алкилом, (С2-С6)алкенилом или (С2-С6)алкинилом,
фенилом или галоидфенилом,
трифторметилом,
моноциклическим 5-или 6-членным гетероциклом,
бензилом или галоидфенилметилом,
гидрокси, фенокси, (С1-С6)алкокси или гидрокси(С1-С6)алкилом,
меркапто, (С1-С6)алкилтио или меркапто(С1-С6)алкилом,
оксо,
нитро,
циано (-CN),
галоидом (бромом, хлором, фтором или йодом),
-СООН или -COORA,
-CONH2, -CONRA или -CONRARB,
-CORA, -SO2RA,
-NHCORA,
-NH2, -NHRA или -NRARB,
где RA и RB независимо обозначают (С1-С6)алкил, RA и RB вместе с атомом азота, к которому они присоединены, образуют 5-или 6-членное гетероциклическое кольцо, которое может быть замещено (C1-С3)алкилом, гидрокси или гидрокси(С1-С3)алкилом.
Подгруппа соединений согласно данному изобретению состоит из соединений формулы (II), охарактеризованных выше, где
(а) указанное второе кольцо замещено (С1-С6)алкилом, (С2-С6)алкенилом, (С2-С6)алкинилом, (С1-С6)алкокси, гидрокси, меркапто, (С1-С6)алкилтио, амино, трифторметилом, оксо, нитро, -СООН, -CONH2, -CORA, -COORA, -NHCORA, -CONHRA, -NHRA, -NRARB, или -CONRARB, где RA и RB независимо обозначают (С1-С6)алкил; и/или
(б) указанное первое или второе кольцо замещено группой (IIC), при условии, что первое кольцо не замещено фенокси, бензилом или бензилом, замещенным (C1-С6)алкилом, (C1-С6)алкокси, фенокси, гидрокси, меркапто, (C1-С6)алкилтио, амино, галоидом, трифторметилом, нитро, -СООН, -CONH2, -CORA, -COORA, -NHCORA, -CONHRA, -NHRA, -NRARB, или -CONRARB, где RA и RB независимо обозначают (С1-С6)алкил,
где
m, р и n независимо равны 0 или 1;
Z обозначает гидрокси или фенил или гетероциклическое 5-7-членное кольцо, которое может быть сконденсировано с насыщенным или ненасыщенным карбоциклическим или гетероциклическим вторым 5-7-членным кольцом;
Alk1 и Alk2 независимо обозначают двухвалентные С1-С3 алкиленовые радикалы;
Х обозначает -О-, -S-, -S(O)-, -S(O2)-, -C(O)-, -NH-, -NR7-, где R7 обозначает С1-C3 алкил;
и где
Alk1, Alk2 и Z, когда Z не является гидрокси, независимо могут быть замещены
(С1-С6)алкилом, (С2-С6)алкенилом или (С2-С6)алкинилом,
фенилом или галоидфенилом,
трифторметилом,
моноциклическим 5-или 6-членным гетероциклом,
бензилом,
гидрокси, фенокси или (С1-С6)алкокси,
меркапто или (С1-С6)алкилтио,
оксо,
нитро,
-СООН или -COORA,
-CONH2, -CONHRA или -CONRARB,
-CORA,
-NHCORA,
-NH2, -NHRA или -NRARB,
где RA и RB независимо обозначают (С1-С6)алкил.
Согласно другому аспекту данное изобретение предусматривает способ лечения бактериальных инфекций у людей и млекопитающих, не являющихся людьми, который включает введение субъекту, страдающему от такой инфекции, антибактериально эффективной дозы соединения формулы (II), описанного выше. Согласно еще одному аспекту данного изобретения предусмотрен способ обработки бактериального обсеменения путем нанесения антибактериально эффективного количества соединения формулы (II), охарактеризованного выше на место обсеменения.
Соединения формулы (II), описанные выше, могут использоваться в качестве компонента(-ов) антибактериальных чистящих или дезинфицирующих материалов. На основании гипотезы о том, что соединения формулы (II) действуют путем ингибирования внутриклеточной PDF, можно предположить, что наиболее сильный антибактериальный эффект может быть достигнут при использовании соединений, которые эффективно проникают через стенку бактериальной клетки. Поэтому соединения, являющиеся высокоактивными ингибиторами PDF in vitro, проникающие в клетки бактерий, предпочтительны для использования согласно изобретению. Следует ожидать, что антибактериальная активность соединений, являющихся активными ингибиторами PDF in vitro, но плохо проникающих в клетки, может быть повышена при использовании их в виде пролекарства, а именно структурно модифицированного аналога, который превращается в родительскую молекулу формулы (II), например, под действием фермента, после того, как он проникает через стенку клетки.
Используемый в данном описании термин «(С1-С6)алкил» обозначает линейный или разветвленный алкил, содержащий от 1 до 6 атомов углерода, включая, например, метил, этил, н-пропил, изопропил, н-бутил, изобутил, втор.бутил, трет.бутил, н-пентил и н-гексил.
Используемый термин «двухвалентный (С1-С3)алкиленовый радикал» означает насыщенную углеводородную цепь, содержащую от 1 до 3 атомов углерода и две валентности.
Используемый термин «(С2-С6)алкенил» означает линейный или разветвленный алкенил, содержащий 2-6 атомов углерода, содержащий, по меньшей мере, одну двойную связь с Е или Z стереохимией, где это возможно. Этот термин охватывает, например, винил, аллил, 1-и 2-бутенил и 2-метил-2-пропенил.
Термин «С2-С6алкинил» относится к линейной или разветвленной углеводородной группе, содержащей от 2 до 6 атомов углерода и, кроме этого, одну тройную связь.
Этот термин охватывает, например, этинил, 1-пропинил, 1 -и 2-бутенил, 2-метил-2-пропинил, 2-пентинил, 3-пентинил, 4-пентинил, 2-гексинил, 3-гексинил, 4-гексинил и 5-гексинил.
Используемый термин «циклоалкил» означает насыщенную алициклическую группу, содержащую 3-8 атомов углерода, и включает, например, циклопропил, циклобутил, циклопентил, циклогексил, циклогептил и циклооктил.
Используемый термин «гетероарил» относится к 5- или 6-членному ароматическому кольцу, содержащему один или несколько гетероатомов. Примерами таких групп являются тиенил, фурил, пирролил, имидазолил, бензимидазолил, тиазолил, пиразолил, изоксазолил, изотиазолил, триазолил, тиадиазолил, оксадиазолил, пиридинил, пиридазинил, пиримидинил, пиразинил, триазинил.
Используемый в данном описании термин «гетероциклил» или «гетероциклический» включает гетероарил, охарактеризованный выше, и в частности, означает 5-7-членное ароматическое или неароматическое гетероциклическое кольцо, содержащее один или несколько гетероатомов, выбранных из S, N и O, включая, например, пирролил, фуранил, тиенил, пиперидинил, имидазолил, оксазолил, изоксазолил, тиазолил, тиадиазолил, пиразолил, пиридинил, пирролидинил, пиримидинил, морфолинил, пиперазинил, индолил, морфолинил, бензофуранил, пиранил, изоксазолил, бензимидазолил, метилендиоксифенил, малеимидо и сукцинимидо. Если иное не оговорено в контексте данного описания, термин «замещенный» в применении к любой группе, означает наличие до 4-х заместителей, каждый из которых независимо может представлять собой (С1-С6)алкил, (С1-С6)алкокси, гидрокси, меркапто, (С1-С6)алкилтио, амино, галоид (включая фтор, хлор, бром и йод), трифторметил, нитро, -СООН, -CONH2, -CORA, -COORA, -NHCORA, -CONHRA, -NHRA, -NRARB, или -CONRARB, где RA и RB независимо обозначают (С1-С6)алкил.
Используемые термины «боковая цепь природной аминокислоты» и «боковая цепь неприродной аминокислоты» означает группу RX в соответственно природной и неприродной аминокислоте формулы NH2-CH(RX)СООН. Примеры боковых цепей природных аминокислот включают цепи аланина, аргинина, аспарагина, аспартовой кислоты, цистеина, цистина, глутаминовой кислоты, гистидина, 5-гидроксилизина, 4-гидроксипролина, изолейкина, лейкина, лизина, метионина, фенилаланина, пролина, серина, треонина, триптофана, тирозина, валина, α-аминоадипиновой кислоты, α-амино-н-масляной кислоты, 3,4-дигидроксифенилаланина, гомосериина, α-метилсерина, орнитина, пипеколевой кислоты и тироксина.
В боковых цепях природных альфа-аминокислот имеющиеся функциональные заместители, например амино, карбоксил, гидрокси, меркапто, гуанидил, имидазолил или индолил, как, например, в аргинине, лизине, глутамовой кислоте, аспартовой кислоте, триптофане, гистидине, серине, треонине, тиразине и цистине, могут быть защищены.
Точно также содержащиеся в боковых цепях неприродных альфа-аминокислот функциональные заместители, например амино, карбоксил, гидрокси, меркапто, гуанидил, имидазолил или индолил, могут быть защищены.
Термин «защищенный», используемый по отношению к функциональному заместителю в боковой цепи природной или неприродной альфа-аминокислоты, означает производное такого заместителя, которое не является функциональным. Сведения по этому вопросу можно найти в общеупотребительной книге T.W. Greene and P.G. Wuts «Protective Groups in Organic Synthesis», Second Edition, Wiley, New York, 1991. Например, карбоксильные группы могут быть этерифицированы (например, с получением C1-C6 алкилового эфира), аминогруппы могут быть превращены в амиды (например, с получением NHCO(С1-С6)алкиламида), или в карбаматы (например, с получением NHC(=O)O(С1-С6)алкил- или NHC(=O)ОСН2Ph-карбаматов), гидроксильные группы могут быть превращены в группы простого эфира (например, O(С1-С6)алкилового или O(С1-С6алкил)фенилового эфира) или в сложно эфирные группы (например, ОС(=O)(С1-С6)алкиловый эфир), а тиольные группы могут быть превращены в простые тиоэфирные (например, трет.бутиловые или бензиловый тиоэфир) или сложные тиоэфирные (например, SC(=O)(C1-C6) алкилтиоэфир).
В соединениях по изобретению содержится несколько действительных или потенциальных хиральных центров вследствие наличия асимметричных атомов углерода. Наличие нескольких асимметричных атомов углерода порождает появление ряда диастереоизомеров с R или S стереохимией в каждом хиральном центре. Изобретение включает все такие диастереоизомеры и их смеси. Предпочтительной стереоконфигурацией атома углерода, несущего группу R2, является R-конфигурация; а атома углерода, несущего группу R4 (когда он является асимметричным), -S-конфигурация, в случае атома углерода, несущего группу R1 (когда он является асимметричным), предпочтительной является R-конфигурация.
В соединениях по изобретению:
R1 может быть, например, водородом, метилом или трифторметилом.
Предпочтительным является водород.
R2 может обозначать, например,
возможно замещенный С1-С6 алкил, С3-С6 алкенил, C3-C6 алкинил или циклоалкил; фенил(С1-С6алкил), фенил(С3-С6алкенил) или фенил(С3-С6 алкинил), возможно замещенные в фенильном кольце;
циклоалкил(С1-С6алкил), циклоалкил(С3-С6алкенил) или циклоалкил(С3-С6алкинил), возможно замещенные в циклоалкильном кольце;
гетероциклил(С1-С6алкил), гетероциклил(С3-С6алкенил) или гетероциклил(С3-С6алкинил), возможно замещенные в гетероцикле; или
СН3(СН2)pО(СН2)q или СН3(СН2)pS(CH2)q, где р=0, 1, 2 или 3 и q=1, 2 или 3.
Конкретные примеры групп R2 включают метил, этил, н- и изо-пропил, н- и изо-бутил, н-пентил, изо-пентил, 3-метилбут-1-ил, н-гесил, н-гептил, н-ацетил, н-октил, метилсульфанилэтил, этилсульфанилметил, 2-метоксиэтил, 2-этоксиэтил, 2-этоксиметил, 3-гидроксипропил, аллил, 3-фенилпроп-3-ен-1-ил, проп-2-ин-1-ил, 3-фенилпроп-2-ин-1-ил, 3-(2-хлорфенил)проп-2-ин-1-ил, бут-2-ин-1-ил, циклопентил, циклогексил, циклопентилметил, циклопентилэтил, циклопентилпропил, циклогексилметил, циклогексилэтил, циклогексилпропил, фуран-2-илметил, фуран-3-метил, тетрагидрофуран-2-илметил, пиперидинил-метил, фенилпропил, 4-хлорфенилпропил, 4-метилфенилпропил, 4-метоксифенил-пропил, бензил, 4-хлорбензил, 4-метилбензил и 4-метоксибензил.
Предпочтительными группами R2 являются (С1-С6)алкил, циклоалкилметил, (C1-С3)алкил-S-(С1-С3)алкил или (С1-С3)алкил-O-(С1-С3)алкил, особенно н-пропил, н-бутил, н-пентил, циклопентилметил, циклопентилэтил, циклогексилметил или циклогексилэтил.
R4 может представлять собой, например:
характерную группу природной альфа-аминокислоты, например бензил или 4-метоксифенилметил, в которой любая функциональная группа может быть защищена, любая амино группа может быть ацилирована и любая имеющаяся карбоксильная группа может быть амидирована; или
группу -[Alk]nRg, где Alk обозначает(С1-C6)алкилен или (С2-С6)алкенилен, возможно содержащие один или более гетероатомов: О или S, или групп -N(R12) (где R12 обозначает атом водорода или (С1-С6)алкил), n равен 0 или 1 и R9 обозначает водород или возможно замещенный фенил, арил, гетероциклил, циклоалкил или циклоалкенил или (только когда n равен 1) R9 может быть гидрокси, меркапто, (С1-С6)алкилтио, амино, галоидом, трифторметилом, нитро, -СООН, -CONH2, -COORA, -NHCORA, -CONHRA, -NHRA, -NRARB, или -CONRARB, где RA и RB независимо обозначают (С1-С6)алкил; или
бензил, замещенный в фенильном кольце группой формулы OCH2COR8, где R8 обозначает гидроксил, амино, (С1-С6)алкокси, фенил(С1-С6)алкокси, (С1-С6)алкиламино, ди((С1-С6)алкил)амино, фенил(С1-С6)алкиламино; или
гетероциклил(С1-С6)алкил, незамещенный или моно- или дизамещенный в гетероциклическом кольце галоидом, нитро, карбокси, (С1-С6)алкокси, циано, (С1-С6)алканоилом, трифторметил(С1-С6)алкилом, гидрокси, формилом, амино, (С1-С6)алкиламино, ди(С1-С6)алкиламино, меркапто, (С1-С6)алкилтио, гидрокси(С1-С6)алкилом, меркапто(С1-С6)алкилом или (С1-С6)алкилфенил-метилом; или
группу -CRaRbRc, в которой:
каждый из Ra, Rb и Rc независимо представляет собой водород, (C1-С6)алкил, (С2-С6)алкенил, (С2-С6)алкинил, фенил(С1-С6)алкил, (С3-С8)циклоалкил; или Rc является водородом и Ra и Rb независимо обозначают фенил или гетероарил, например пиридил; или
Rc представляет собой водород, (С1-С6)алкил, (С2-С6)алкенил, (С2-С6)алкинил, фенил(С1-С6)алкил или (С3-С8)циклоалкил, и Ra и Rb вместе с атомом углерода, к которому они присоединены, образуют 3-8-членное циклоалкильное или 5-6-членное гетероциклическое кольцо; или
Ra, Rb или Rc вместе с атомом углерода, к которому они присоединены, образуют трициклическое кольцо (например, адамантил); или
Ra и Rb каждый независимо обозначает(С1-С6)алкил, (С2-С6)алкенил, (С2-С6)алкинил, фенил(С1-С6)алкил или группу, указанную ниже для Rc, кроме водорода, или Ra и Rb вместе с атомом углерода, к которому они присоединены, образуют циклоалкильное или гетероциклическое кольцо, и Rc обозначает водород, ОН, SH, галоген, CN, СО2Н, (С1-С4)перфторалкил, СН2ОН, -СО2(С1-С6)алкил, -O(С1-С6)алкил, -O(С2-С6)алкенил, -S(С1-С6)алкил, -SO(C1-С6)алкил, -SO2(С1-С6)алкил, -S(С2-С6)алкенил, -SO(С2-С6)алкенил, SO2(C2-С6)алкенил или группу -Q-W, где Q обозначает связь или O, S, SO или SO2 и W обозначает фенил, фенилалкил, (С3-С8)циклоалкил, (С3-С8)циклоалкилалкил, (С4-С8)циклоалкенил, (С4-С8)циклоалкенилалкил, гетероарил или гетероарилалкил, причем группа W может быть замещена одним или несколькими заместителями, независимо выбранными из гидроксила, галогена, CN, СО2Н, СО2(С1-С6)алкила, CONH2, CONH(С1-С6)алкила, CONH(C1-С6алкила)2, СНО, СН2ОН, (С1-С4)перфторалкила, O(С1-С6)алкила, S(C1-C6)алкила, SO(C1-C6)алкила, SO2(C1-C6)алкила, NO2, NH2, NH(C1-C6)алкила, N((C1-С6)алкила)2, NHCO(C1-С6)алкила, (С1-С6)алкила, (С2-С6)алкенила, (С2-С6)алкинила, (С3-С8)циклоалкила, (С4-С8)циклоалкенила, фенила или бензила.
Примеры конкретных групп R4 включают метил, этил, бензил, 4-хлорбензил, 4-гидроксибензил, фенил, циклогексил, циклогексилметил, пиридин-3-илметил, трет.бутоксиметил, нафтилметил, изо-бутил, втор.бутил, трет.бутил, 1-бензилтио-1-метилэтил, 1-метилтио-1-метилэтил, 1-меркапто-1-метилэтил, 1-метокси-1-метилэтил, 1-гидрокси-1-метилэтил, 1-фтор-1-метилэтил, гидроксиметил, 2-гидроксиэтил, 2-карбоксиэтил, 2-метилкарбамоилэтил, 2-карбамоилэтил и 4-аминобутил. Предпочтительные группы R4 включают трет, бутил, изобутил, бензил, изопропил и метил.
R5 и R6, взятые вместе с атомом азота, к которому они присоединены, образуют насыщенное 5-7-членное моноциклическое N-гетероциклическое первое кольцо, которое присоединено через атом азота и которое может быть конденсированным с насыщенным или ненасыщенным карбоциклическим или гетероциклическим вторым 5-7-членным кольцом. В первом кольце может быть один или несколько гетероатомов, например азот. Примеры таких первых колец включают 1-пирролидинил, пиперидин-1-ил, 1-пиперазинил, гексагидро-1-пиридазинил, морфолин-4-ил, тетрагидро-1,4-тиазин-4-ил, тетрагидро-1,4-тиазин-4-ила 1-окись, тетрагидро-1,4-тиазин-4-ила 1,1-диокись, гексагидроазипино, тиоморфолино, диазепино, тиазолидинил или октагидроазоцино. Предпочтительными являются пиперидин-1-ил и 1-пиперазинил. Заместитель (IIC) может быть у атома углерода в кольце или у атома азота в кольце первого или второго колец.
В составе заместителя (IIC) (из определения, в котором исключены некоторые замещенные бензилы и фенокси) Alk1 и Alk2 могут обозначать независимо, например, (СН2) или (СН2СН2). В случае, когда m=0 и р=1, Х может обозначать, например, С(=O)- или -SO2-. В таких случаях n может быть равен 0 или 1, и когда первое кольцо -NR5R6 содержит второй атом азота в кольце, группы С(=O)- или -SO2- в соединении (IIC) могут быть связаны с этим атомом азота в амидной или сульфонамидной группе.
В заместителе (IIC) m, n и р все могут быть равны 0, в этом случае группа Z непосредственно связана с первым кольцом -NR5R6.
В предпочтительной подгруппе соединений по изобретению заместитель (IIC) имеет формулу -CH2Z, -OZ или -C(=O)Z, где (за исключением бензила, некоторых замещенных бензилов и фенокси) Z обозначает фенил, 3,4-метилен-диоксифенил, морфолинил, пиримидинил, 1,2,3-тиадиазолил, 1,4-тиазолил, бензофуранил, фуранил, тиенил, пиранил, пирролил, пиразолил, изоксазолил или пиридил, которые могут быть замещены. В частности, Z может быть фенил, 3,4-метилендиоксифенил, морфолинил, пиримидин-2-ил, 1,2,3-тиадиазол-5-ил, 1,4-тиазол-5-ил, бензофуран-2-ил, 2- или 3-фуранил, 2-или 3-тиенил, 2- или 3-пиранил, 2-, 3- или 4-пирролил, 3-, 4- или 5-пиразолил, 3-, 4- или 5-изоксазолил или 2-, 3- или 4-пиридил, каждый из которых может быть замещен заместителями, указанными при описании соединений по изобретению.
В соединениях формулы (II), описанных выше, где Q обозначает радикал формулы C(=O)NH(OH), радикалы R1, R2 и А могут быть любыми из описанных выше в отношении соединений (II), когда Q обозначает радикал формулы -N(OH)CH(=O).
Однако, кроме того, R1 может обозначать, например, гидрокси, метокси, этокси, н-пропилокси, аллилокси, амино, метиламино, диметиламино, этиламино или диэтиламиногруппу.
Конкретные примеры заместителей (IIC) включают заместители, указанные в указанных в данном описании соединениях и/или в примерах.
Примеры конкретных соединений по изобретению приведены в примерах. В этих примерах, когда описано соединение вышеуказанной формулы (II), где Q означает N-формилгидроксиламиновый радикал -N(OH)CH(=O), следует иметь в виду, что соединением по изобретению является также эквивалентное соединение, где Q обозначает гидроксаматный радикал -C(=O)NH(OH) и vice versa.
Предпочтительные соединения по изобретению включают выбранные из группы, состоящей из соединений формул (IID)-(IIG) и (IIW)-(IIZ):
где
R2 обозначает н-пропил, н-бутил, н-пентил, циклопентилметил, циклопентилэтил, циклогексилметил или циклогексилэтил;
R4 обозначает трет. бутил, изобутил, бензил или метил;
Y обозначает -СН2-, -О-или -(С=O)-; и
Z обозначает фенил, 3,4-метилендиоксифенил, морфолинил, пиримидинил, 1,2,3-тиадиазолил, 1,4-тиазолил, бензофуранил, фуранил, тиенил, пиранил, пирролил, пиразолил, изоксазолил или пиридил, в частности фенил, 3,4-метилендиоксифенил, морфолинил, пиримидин-2-ил, 1,2,3-тиадиазол-5-ил, 1,4-тиазол-5-ил, бензофуран-2-ил, 2- или 3-фуранил, 2- или 3-тиенил, 2- или 3-пиранил, 2-, 3- или 4-пирролил, 3-, 4- или 5-пиразолил, 3-, 4- или 5-изоксазолил или 2-, 3- или 4-пиридил, каждый из которых может быть замещен заместителями, указанными при описании соединений по изобретению.
Конкретные соединения по изобретению, предпочитаемые из-за их активности в отношении организмов, инфицирующих дыхательные пути, включают N-[1S-(4-бензо[1,3]диоксол-5-илметил-пиперазин-1-карбонил)-2,2-диметилпропил]-2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)пропионамид или N-[1S-(4-бензо[1,3]диоксол-5-илметилпиперазин-1-карбонил)-2,2-диметилпропил]-2R-циклопентилметил-N-гидроксисукцинамид.
Соединения по изобретению, у которых Q обозначает N-формилгидроксиламино-группу, могут быть получены при снятии защиты с O-защищенного N-формил-N-гидроксиаминосоединения формулы (III):
где R1, R2 и А имеют значения, указанные для общей формулы (I) и R25 обозначает группу, защищающую гидроксил, удаляемую для освобождения гидроксильной группы путем гидрогенолиза или гидролиза. Бензил является предпочтительной R25 с группой для удаления путем гидрогенолиза, и трет. бутил и тетрагидропиранил являются предпочтительными группами для удаления путем кислотного гидролиза.
Соединения по изобретению, у которых Q обозначает группу гидроксамовой кислоты, могут быть получены взаимодействием соединения (IIIA), где Q обозначает карбоксильную группу,
с гидроксиламином или N- и/или O-защищенным гидроксиламином и затем удалением любой О- или N-защитной группы.
Соединения формулы (III) или (IIIA) могут быть получены по реакции кислоты формулы (IV) или (IVC) или ее активированного производного с амином формулы (IVA) или (IVB)
где R1, R2, R4, R5 и R6 определены при описании радикалов в соединениях формулы (II), за исключением того, что любые заместители у R1, R2, R4, R5 и R6, которые потенциально являются реакционноспособными в реакции сочетания, могут быть защищены от такой реакции и R25 имеет значения, указанные при описании соединений формулы (III) выше, путем возможного удаления защищающих групп R1, R2, R4, R5 и R6.
Соединения формул (IVA), (IVB) и (IVC) получают стандартными, описанными в литературе способами и многие из них коммерчески доступны.
Соединения формулы (IV) могут быть получены N-формилированием, например, с использованием уксусного ангидрида и муравьиной кислоты или 1-формил-бензотриазола, соединений формулы (V)
где R1, R2, R25 имеют значения, указанные для соединений формулы (III), и Y обозначает хиральный вспомогательный фрагмент или OR26, где R26 обозначает водород или группу, защищающую гидроксил. В том случае, когда Y обозначает OR26 или хиральный вспомогательный фрагмент, защищающая гидроксил группа или вспомогательный хиральный фрагмент удаляются после стадии формилирования с получением соединения формулы (IV). Подходящие хиральные вспомогательные фрагменты включают замещенные оксазолидиноны, которые могут быть удалены путем гидролиза в присутствии основания.
Соединения общей формулы (V) можно получить восстановлением оксима общей формулы (VII):
где R1, R2 и R25 определены выше и Y обозначает группу OR26, определенную выше, или хиральный вспомогательный фрагмент. Восстановители включают некоторые гидриды металлов (например, цианоборгидрид натрия в уксусной кислоте, триэтилсилан или боран/пиридин) и водород в присутствии подходящего катализатора. После восстановления, если Y обозначает хиральный вспомогательный фрагмент, он может быть превращен в группу OR26.
Соединения общей формулы (VII) можно получить взаимодействием β-кетокарбонильного соединения общей формулы (VIII):
где R1, R2 и Y определены выше, с O-защищенным гидроксиламином.
β-Кетокарбонильные соединения (VIII) можно получить в виде рацемата путем формилирования или ацилирования карбонильного соединения общей формулы (IX):
где R2 и Y определены выше, с соединением общей формулы (X):
где R1 определен выше и Q обозначает отщепляемую группу, такую как галоген или алкокси, в присутствии основания.
Приводимые ниже примеры описывают подробности осуществления способов получения соединений по изобретению.
Соли соединений по изобретению включают физиологически приемлемые соли присоединения к кислотам, например гидрохлориды, гидробромиды, сульфаты, метансульфонаты, п-толуолсульфонаты, фосфаты, ацетаты, цитраты, сукцинаты, лактаты, тартраты, фумараты и малеаты. Могут быть также получены соли с основаниями, например натриевые, калиевые, магниевые и кальциевые соли. Композиции, которых касается данное изобретение, могут быть приготовлены для введения любым путем, согласующимся с фармакокинетическими свойствами активного ингредиента(-ов).
Вводимые перорально композиции могут быть в виде таблеток, капсул, порошков, гранул, леденцов, жидких препаратов или гелей, таких как пероральные, локальные или стерильные парентеральные растворы или суспензии. Таблетки и капсулы для перорального введения могут быть в виде единичных доз и могут содержать обычные эксципиенты, такие как связующие, например жидкие смолы, смола акации, желатин, сорбит, трагакант или поливинилпирролидон; наполнители, например лактозу, сахар, маисовый крахмал, фосфат кальция, сорбит или глицин; смазочные агенты, например стеарат магния, тальк, полиэтиленгликоль или двуокись кремния; агенты, способствующие измельчению, например картофельный крахмал, или приемлемые смачивающие агенты, такие как лаурилсульфат натрия. Таблетки могут содержать покрытие, нанесенное способами, хорошо известными в обычной фармацевтической практике. Пероральные жидкие препараты могут быть в виде, например, водной или масляной суспензии, растворов, эмульсий, сиропов или эликсиров или могут быть в виде сухого продукта для воссоздания при добавлении воды или другого подходящего носителя перед применением. Такие жидкие препараты могут содержать обычные добавки, такие как суспендирующие агенты, например сорбит, жидкую смолу, метилцеллюлозу, сироп глюкозы, желатин, гидрированные съедобные масла; эмульгаторы, например лецитин, сорбитанмоноолеат, или смола акации; неводные носители (которые могут включать съедобные масла), например миндальное масло, фракционированное кокосовое масло, сложные эфиры масел, такие как глицериновые, пропиленгликолевые или этиловые; консерванты, например метил- или пропил-п-гидроксибензоат или сорбиновая кислота, и, если это желательно, обычные ароматизирующие агенты или красители.
Безопасные и эффективные дозы для различных пациентов и различных болезней определяются клинически, как это требуется. Следует иметь в виду, что конкретные дозы для любого конкретного пациента зависят от различных факторов, включая активность используемого конкретного соединения, возраст, вес, общее состояние здоровья, пол, диету, время введения, способ введения, скорость выделения, сочетание с другими лекарствами и серьезность конкретного заболевания, подлежащего лечению.
Следующие примеры иллюстрируют изобретение. Следует отметить, что «Препаративный пример А» не описывает получение соединения по изобретению, но включен для описания деталей синтеза и способов получения соединений по изобретению.
1Н и 13С ЯМР спектры были сняты с использованием спектрометра Bruker DPX 250 при 250,1 и 62,9 МГц, соответственно. Масс-спектры были получены с использованием спектрометра Perkin Elmer Sciex API 165 с применением методов положительной и отрицательной ионизации. ИК-спектры записывали на спектрометре Perkin Elmer РЕ 1600 FTIR. Аналитическая ЖХВР осуществлялась на Beckman System Gold с использованием Waters Nova Pak C18 колонки (150 мм, 3,9 мм) с градиентом 20-90% растворителя В (1 мл/мин) в качестве мобильной фазы. [Растворитель А: 0,05% ТФК в 10% воды - 90% метанола; Растворитель В: 0,05% ТФК в 10% метанола 90%], длина волны равна 230 нм. Препаративную ЖХВР осуществляли на приборе Gilson, с использованием С 18 Waters delta prep-pak картриджа (15 мкм, 300 А, 25 мм, 10 мм) с градиентом 20-90% растворителя В (6 мл/мин) в качестве мобильной фазы. [Растворитель А: вода; Растворитель В: метанол]. УФ-спектры снимали при 230 нм.
В описании используются следующие сокращения:
DCM | дихлорметан, |
DEAD | диэтилазодихлоркарбоксилат, |
EDC | N-этил-N'-(3-диметиламинопропил)карбодиимида гидрохлорид, |
HOAt | 1-гидрокси-7-аза-бензотриазол, |
HOBt | 1-гидроксибензотриазол, |
HPLC | жидкостная хроматография высокого разрешения, |
LRMS | масс-спектрометрия низкого разрешения, |
NMR | ядерный магнитный резонанс, |
RT | время удерживания, |
TLC | тонкослойная хроматография, |
TFA | трифторуксусная кислота, |
THF | тетрагидрофуран. |
Пример 1.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(4-метоксибензол)пиперидин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Указанное в заголовке соединение получали, как описано ниже (см. также схему 1).
Схема 1.
Реагенты и условия: А. пиперидин, НСНО, EtOH, 80°C, O/N; В. трет.BuCOCl, Et3N, затем 3-литий-4-бензил-5,5-диметилоксазолидин-2-он; С. H2NOBzl, комн. темп., O/N, затем п-TsOH, EtOAc; D. LiOH, водн. THF, 0°С; Е. муравьиный, уксусный ангидрид, Et3N, THF; F. PfpOH, EDC, HOBt, THF; G. амин, CH2Cl2; H. циклогексен, Pd/C, EtOH.
Стадия А: 2-бутилакриловая кислота.
К раствору н-бутилмалоновой кислоты (17,2 г, 107 ммол) в этаноле (200 мл) добавляли пиперидин (12,76 мл, 129 ммол) и 37% водный формальдегид (40,3 мл, 538 ммол).
Раствор нагревали до 80°C, в это время появлялся осадок, и он постепенно вновь растворялся через 1 час. Реакционную смесь перемешивали при 80°С в течение ночи, затем охлаждали при комнатной температуре. Растворители удаляли при пониженном давлении и остаток растворяли в этилацетате (200 мл), промывали последовательно 1М соляной кислотой и соляным раствором, сушили над безводным сульфатом магния и отфильтровывали. Фильтрат концентрировали, получая соединение, указанное в заголовке в виде прозрачного масла (13,37 г, 97%). 1H-NMR; δ (CDCl3), 6,29 (1Н, s), 5,65 (1H, s), 2,34-2,28 (2H, m), 1,54-1,26 (4Н, m), 0,94 (3Н, t, J=7,1 Гц).
Стадия В: 4S-бензил-3-(2-бутилакрилоил)-5,5-диметилоксазолидин-2-он.
2-бутилакриловую кислоту (21,5 г, 168 ммол) растворяли в сухом THF (500 мл) и охлаждали до -78°С в атмосфере аргона. Триэтиламин (30 мл, 218 ммол) и пивалоилхлорид(21 мл, 168 ммол) добавляли с такой скоростью, чтобы температура оставалась ниже -60°С. Смесь перемешивали при -78°С в течение 30 минут, нагревали в течение 2 часов до комнатной температуры и, наконец, охлаждали снова до -78°С.
В отдельной колбе в сухом THF (500 мл) растворяли 4S-бензил-5,5-диметилоксазолидин-2-он и охлаждали раствор до -78°С в атмосфере аргона. Медленно добавляли н-бутиллитий (2,4М раствор в смеси изомеров гексана, 83 мл, 200 ммол) и полученную смесь перемешивали в течение 30 минут при комнатной температуре. Полученный анион помещали при помощи канюли в первый реакционный сосуд. Смеси дали нагреться до комнатной температуры и перемешивали в течение ночи при комнатной температуре. Реакцию обрывали 1М раствором кислого углекислого калия (200 мл) и удаляли растворители при пониженном давлении. Остаток распределяли между этилацетатом и водой. Органический слой промывали соляным раствором, сушили над безводным сульфатом магния, отфильтровывали и концентрировали при пониженном давлении с получением оранжевого масла. TLC показала наличие непрореагировавшего хирального вспомогательного компонента помимо желательного продукта. Часть полученного продукта (30 г) растворяли в дихлорметане и пропускали через двуокись кремния, получая чистое указанное в заголовке соединение в виде желтого масла (25,3 г). 1H-NMR; δ (CDCl3), 7,31-7,19 (5Н, m), 5,41 (2Н, s), 4,51 (1Н, dd, J=9,7 & 4,2 Гц), 3,32 (1Н, dd, J=14,2 & 4,2 Гц), 2,82 (1Н, dd, J=14,2 & 9,7 Гц), 2,40-2,34 (2Н, m), 1,48-1,32 (4Н, m), 1,43 (3Н, s), 1,27 (3Н, s), 0,91 (3Н, t, J=7,1 Гц). Некоторое количество хирального компонента было выделено при промывке двуокиси кремния метанолом.
Стадия С: 4S-бензил-3-[2-(бензилоксиаминометил)гексаноил]-5,5-диметил-оксазолидин-2-он (соль п-толуолсульфокислоты).
4S-бензил-3-(2-бутилакрилоил)-5,5-диметилоксазолидин-2-он (19,8 г, 62,8 ммол) смешивали с O-бензилгидроксиламином (15,4 г, 126 ммол) и перемешивали в течение ночи при комнатной температуре. Смесь растворяли в этилацетате и промывали раствор 1М соляной кислотой, 1М карбонатом натрия и соляным раствором, сушили над безводным сульфатом магния и отфильтровывали. Фильтрат концентрировали при пониженном давлении с получением бледно-желтого масла (25,3 г), которое, как показали NMR и HPLC, содержит 4S-бензил-3-[2-(бензилоксиаминометил)гексаноил]-5,5-диметилоксазолидин-2-он (примерно, 82% d.e.) вместе со следами исходного материала. Продукт соединяли с другой порцией (26,9 г, 76% d.e.) и растворяли в этилацетате (200 мл). Добавляли п-толуолсульфокислоту (22,7 г, 119 ммол) и смесь охлаждали до 0°С. Указанное в заголовке соединение получали в виде белого кристаллического вещества методом затравки. Выход: 25,2 г (34%, единственный диастереомер). Получали также вторую порцию продукта (14,7 г, 20% единственный диастереомер). 1H-NMR; δ (CDCl3), 7,89 (2Н, d, J=8,2 Гц), 7,37-7,12 (10Н, m), 7,02 (2Н, d, J=6,9 Гц), 5,28-5,19 (2Н, m), 4,55 (1Н, m), 4,23 (1H, m), 3,93 (1H, m), 3,58 (1H, m), 2,58 (1H, m), 2,35 (3H, s), 1,67-1,51 (2H, m), 1,29-1,16 (4H, m), 1,25 (3H, s), 1,11 (3H, s), 0,80-0,75 (2Н, m).
Стадия D: 2R-(бензилоксиаминометил)гексановая кислота.
Соль 4S-бензил-3-[2R-(бензилоксиаминометил)гексаноил]-5,5-диметилоксазолидин-2-она и п-толуолсульфокислоты (25,2 г, 40,2 ммол) распределяли между этилацетатом и 1М карбонатом натрия. Органическую фазу высушивали над безводным сульфатом магния, отфильтровывали и выпаривали при пониженном давлении. Остаточное масло растворяли в THF (150 мл) и воде (50 мл), охлаждали до 0°С и обрабатывали гидроокисью лития (1,86 г, 44,2 ммол). Раствор перемешивали в течение 30 минут при 0°С, затем при комнатной температуре в течение ночи. Реакционную смесь подкисляли до рН 4 1М лимонной кислотой и удаляли растворители. Остаток распределяли между дихлорэтаном и 1М карбонатом натрия. Основной водный слой подкисляли до рН 4 1М лимонной кислотой и экстрагировали три раза этилацетатом. Соединенные органические слои высушивали над безводным сульфатом магния, отфильтровывали и концентрировали с получением указанного в заголовке соединения в виде бесцветного масла (7,4 г, 73%). 1H-NMR; δ (CDCl3), 8,42 (2H, br.s), 7,34-7,25 (5Н, m), 4.76-4,66 (2H, m), 3,20-3,01 (2H, m), 2,73 (1H, m), 1,70-1,44 (2H, m), 1,34-1,22 (4H, m) и 0,92-0,86 (3H, m).
Стадия Е: 2R-[(бензилоксиформиламино)метил)]гексановая кислота.
К раствору 2R-(бензилоксиаминометил)гексановой кислоты (30,6 г, 0,12 ммол) в сухом THF (300 мл) добавляли муравьиноуксусный ангидрид (26,8 мл, 0,31 мол) при 0°С. Добавляли триэтиламин (18,5 мл, 0,13 мол) и перемешивали смесь в течение 1 часа при 0°С и в течение 60 часов при комнатной температуре. Удаляли под вакуумом растворитель и получали указанное в заголовке соединение в виде желтого масла (33,6 г, 99%), которое использовали на стадии F без очистки. 1H-NMR; δ (CDCl3, rotamers), 8,20-8,08 (0,7Н, br.s), 8,07-7,92 (0,3H, br.s), 7,50-7,25 (5Н, br m), 5,07-4,70 (2H, br m), 3,95-3,52 (2H, br m), 2,90-2,66 (1H, br s), 1,72-1,20 (6H, br m), 1,00-0,78 (3H, br.s). LRMS: +ve ион 280 [M+1].
Стадия F: 2R-[(бензилоксиформиламино)метил]гексановой кислоты пента-фторфениловый эфир.
К раствору 2R-[(бензилоксиформиламино)метил)]гексановой кислоты (7,8 г, 19,9 ммол) в сухом THF (500 мл) добавляли пентафторфенол (44,3 г, 0,24 мол), EDC (27,7 г, 0,14 ммол) и HOBt (16,2 г, 0,12 ммол). Реакционную смесь перемешивали в течение ночи при комнатной температуре. Удаляли под вакуумом растворитель, остаток растворяли в этилацетате, последовательно промывали 1М карбонатом натрия (3×500 мл) и водой (1×500 мл), высушивали над безводным сульфатом магния и отфильтровывали. Растворитель удаляли под вакуумом с получением желтого масла (60 г), которое очищали флэш-хроматографией (5:1, гексан:этилацетат → 1:2, гексан:этилацетат) с получением прозрачного масла (42,0 г, 79%). 1H-NMR; δ (CDCl3, rotamers), 8,20-8,09 (0,7H, br.s), 8.09-7,92 (0,3H. br.s), 7,60-7,21 (5Н, br m), 5,00-4,70 (2H, br m), 4,04-3,72 (2H, br m), 3,18-3,00 (1H, br s), 1,85-1,57 (2H, br m), 1,50-1,26 (4H, br m), 1,00-0,82 (3H, br m); LRMS: 466 [M+H].
Стадия G: 2R-[(бензилоксиформиламино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(4-метоксибензоил)пиперидин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пентафторфениловый эфир 2R-[(бензилоксиформиламино)метил]гексановой кислоты (231 мг, 0,52 ммол) и 2S-амино-1-[4-(4-метоксибензоил)пиперидин-1-ил]-3,3-диметилбутан-1-он (полученный из N-бензилоксикарбонил-L-трет.лейкина) (259 мг, 0,78 ммол) растворяли в дихлорметане (6 мл) и перемешивали в течение ночи при 27°С. Добавляли избыток ионообменной смолы Amberlyst A-21 и перемешивали в течение 2,5 часов с последующей фильтрацией. Полученный раствор обрабатывали затем полистиролметилизоцианатной смолой в течение 5 часов. Смесь отфильтровывали и удаляли растворитель при пониженном давлении. Данные масс-спектрометрии показали наличие пентафторфенола, поэтому остаток растворяли в ментоле (5 мл) и добавляли избыток карбонатной смолы А-26. Смесь перемешивали в течение ночи с последующим фильтрованием и удалением растворителя при пониженном давлении с получением соединения, указанного в заголовке, в виде коричневого масла (358 мг, 0,60 ммол). LRMS: +ve ион 594 [M+H].
Стадия Н: 2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(4-метоксибензоил)пиперидин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
{1S-[4-(4-метоксибензоил)пиперидин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид 2R-[(бензилоксиформиламино)метил]гексановой кислоты (358 мг, 0,60 ммол) растворяли в этаноле (6 мл). Добавляли циклогексен (0,60 мл) и помещали смесь в атмосферу аргона. Добавляли суспензию 10% палладия на угле (40 мг) в этилацетате (1 мл) и перемешивали смесь при 70°С в течение 5 часов. Реакционную смесь охлаждали и удаляли фильтрованием катализатор. Фильтрат концентрировали с получением соединения, указанного в заголовке, в виде коричневого масла (294 мг, 0,58 ммол). Свойства представлены в Таблице 1.
Соединения по примерам 2-13 получали способом, отраженным на схеме 1 и описанным подробно в Примере 1. Стадии G и Н осуществляли параллельно во всех примерах. Производные L-трет.лейкина получали известными из литературы способами. Очистку конечных соединений, если это было необходимо, осуществляли методом препаративной химии.
# 1H-NMR; δ (CD3OD, ротамеры), 8,26 (0,4Н, s), 7,84 (0,6Н, s), 7,69 (2Н, m), 7,39 (2Н, m), 6,49 (0,4H, s), 6,42 (0,6Н, s), 5,01 (0,6H, s), 4,96 (0,4H, s), 4,64 (0,6H, d, J=13,1 Гц), 4,51 (0,4H, d, J=13,2 Гц), 4,36 (0,6H, d, J=13,2 Гц), 4,29 (0,4H, d, J=13,6 Гц), 3,10 (1Н, m), 3,43 (0,4H, m), 3.32 (0,6H, m), 3,00 (2Н, m), 2,86 (2Н, m), 2,09 (2Н, m), 1,59 (4Н, m), 1,27 (4Н, m), 1,02 (9Н, m), 0,90 (1Н, s) и 0,79 (1,6H, s).
Соединения по Примерам 18-40 были получены из 2R-[(бензилоксиформил-амино)метил]гексановой кислоты пентафторфенилового эфира способом, подобным способам, описанным в Примере 1, но с указанными ниже модификациями.
Стадия G: Общие принципы способа синтеза амидов.
Сочетание аминов с пентафторфениловым эфиром осуществляли с использованием лабораторного робота Zymate XPII. К раствору пентафторфенилового эфира (55,8 мг, 0,12 ммол) в дихлорметане (2 мл) добавляли индивидуальные амины (0,25 ммол) и перемешивали реакционные смеси при комнатной температуре в течение 60 часов. Очистку проводили путем удаления избытка амина и пентафторфенола с использованием поглощающих смол. Пентафторфенол удаляли, применяя 3-кратный избыток (0,36 ммол) карбонатной смолы А-26 (загрузка 3,5 ммол). К реакционным смесям добавляли смолу и перемешивали в течение 24 часов, после чего осуществляли фильтрацию. Избыток аминов удаляли с использованием 3-кратного избытка (0,36 ммол) полистиролметилизоцианатной смолы (1,2 ммол). К реакционным смесям добавляли смолу и перемешивали в течение 4 часов с последующим фильтрованием. Растворитель удаляли под вакуумом, используя Savant Speed Vac Plus, с получением продуктов сочетания. Выход продуктов не определялся, а чистота и достоверность получения каждого соединения определялись с использованием методов HPLC и LRMS.
Стадия Н: Общие принципы процесса гидрирования.
Продукты сочетания со Стадии G растворяли в этанольно-циклогексеновом растворе (3 мл, 10% в циклогексене) и добавляли Pd/C (20% вес./вес.) и реакционную смесь перемешивали при 80°С в течение 24 часов. Отфильтровывали Pd/C и удаляли растворитель под вакуумом, используя Savant Speed Vac Plus, с получением целевых соединений (Примеры 18-40, Таблица 2). Выход продуктов не рассчитывался, а чистота и достоверность получения каждого соединения определялись с использованием методов HPLC и LRMS.
Соединения по Примерам 1-40 указаны ниже:
Пример 1.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты 51{1S-[4-(4-метоксибензоил)пиперидин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 2.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты [1S-(4-бензотриазол-1-ил-пиперидин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил]амид.
Пример 3.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты [1S-[4-бензо[1,3]диоксол-5-илметилпиперазин-1-карбонил)-2,2-диметилпропил]амид.
Пример 4.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты [2,2-диметил-1S-(4-фенил-пиперидин-1-карбонил)пропил]амид.
Пример 5.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты [1S-(6,7-диметокси-3,4-дигидро-1Н-изохинолин-2-карбонил)-2,2-диметилпропил]амид.
Пример 6.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(4-фторфенил)-пиперидин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 7.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {2,2-диметил-1S-[4-(2-оксо-2,3-дигидробензоимидазол-1-ил)пиперидин-1-карбонил]пропиламид.
Пример 8.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты [1S-(4-бензоилпиперидин-1-карбонил)-2,2-диметилпропил]амид.
Пример 9.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты [1S-(4-бензогидрил-пиперазин-1-карбонил)-2,2-диметилпропил]амид.
Пример 10.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(2,5-диметил-фенил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 11.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(2-метоксифенил)-пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 12.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(фуран-3-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 13.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(5-фуран-2-ил-2Н-пиразол-3-ил)пиперидин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 14.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты (2,2-диметил-1S-[4-(5-фенил-2Н-пиразол-3-ил)пиперидин-1-карбонил]пропил}амид.
Пример 15.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(4-метоксифенил)-3-метилпиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 16.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты (1S-[1-(3,4-диметоксибензил)-6,7-диметокси-3,4-дигидро-1Н-изохинолин-2-карбонил]-2,2-диметилпропил}-амид.
Пример 17.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты (1S-{4-[5-(2-хлорфенил)-2Н-пиразол-3-ил]пиперидин-1-карбонил}-2,2-диметилпропил)амид.
Пример 18.
N-гидрокси-N-[2R-(4-пиримидин-2-ил-пиперазин-1-карбонил)гексил]формамид.
Пример 19.
N-{2R-[4-(4-хлорфенил)пиперазин-1-карбонил]гексил}-N-гидроксиформамид.
Пример 20.
N-[2R-(4-бензо[1,3]диоксол-5-илметилпиперазин-1-карбонил)гексил]-N-гидроксиформамид.
Пример 21.
N-гидрокси-N{2R-[4-(4-метоксифенил)-3-метилпиперазин-1-карбонил]-гексил}-формамид.
Пример 22.
N-{2R-[4-(4-ацетилфенил)пиперазин-1-карбонил]гексил}-N-гидроксиформамид.
Пример 23.
N-[2R-(4-бензгидрилпиперазин-1-карбонил)гексил]-N-гидроксиформамид.
Пример 24.
N-гидрокси-N-[2R-(4-фенилпиперидин-1-карбонил)гексил]формамид.
Пример 25.
N-гидрокси-N-{2R-[4-(гидроксидифенилметил)пиперидин-1-карбонил]гексил}-формамид.
Пример 26.
N-гидрокси-N-[2R-(4-фенилпиперазин-1-карбонил)гексил]формамид.
Пример 27.
N-(2R-{4-[(4-хлорфенил)фенилметил]пиперазин-1-карбонил}гексил)-N-гидроксиформамид.
Пример 28.
N-{2R-[4-(3-хлорфенил)пиперазин-1-карбонил]гексил}-N-гидроксиформамид.
Пример 29.
N-гидрокси-N-(2R{4-[2-(2-гидроксиэтокси)этил]пиперазин-1-карбонил}гексил)-формамид.
Пример 30.
N-гидрокси-N-{2R-[4-(3-гидроксипропил)-пиперазин-1-карбонил]гексил}-формамид.
Пример 31.
N-гидрокси-N-{2R-[2-(2-гидроксиэтил)пиперазин-1-карбонил]гексил}формамид.
Пример 32.
N-[2R-[4-(3,4-дихлорфенил)пиперазин-1-карбонил]гексил}-N-гидроксиформамид.
Пример 33.
N-гидрокси-N-{2R-[4-(4-метоксифенил)пиперазин-1-карбонил]гексил}формамид.
Пример 34.
N-гидрокси-N-{2R-[4-(3-трифторметилпиперидин-2-ил)пиперазин-1-карбонил]гексил}формамид.
Пример 35.
N-гидрокси-N-{2R-[4-(1Н-индол-7-ил)пиперазин-1-карбонил]гексил}формамид.
Пример 36.
N-(2R-{4-[бис-(4-фторфенил)метил]пиперазин-1-карбонил}гексил)-N-гидроксиформамид.
Пример 37.
N-гидрокси-N-{2R-[4-(4-нитрофенил)пиперазин-1-карбонил]гексил)формамид.
Пример 38.
N-{2R-[4-(4-фторфенил)пиперазин-1-карбонил]гексил}-N-гидроксиформамид.
Пример 39.
N-{2R-[4-(фуран-2-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-гексил}-N-гидроксиформамид.
Пример 40.
N-{2R-[4-(2,5-диметилфенил)пиперазин-1-карбонил]гексил}-N-гидроксиформамид.
Соединения по Примерам 41 и 42 ниже были получены в растворе методом параллельного синтеза. Общая схема синтеза (Схема В) описана подробно ниже в Примере 41. 4-трет.бутиловый эфир 2-R-циклопентилметилсукциновой кислоты получали способом, аналогичным описанному в заявке WO 92/13831.
Схема В.
Реагенты и условия: Стадия А: амин, РуВОР, HOAt, DIPEA, CH2Cl2; Стадия В: TFA, CH2Cl2; Стадия С: NH2OH, NMM, DMF, РуВОР, HOAt, Et3N, CH2Cl2;
Пример 41.
Получение 3R-циклопентилметил-4-[4-(4-фторфенил)пиперазин-1-ил]-N-гидрокси-4-оксобутирамида.
Стадия А: 3R-циклопентилметил-4-[4-(4-фторфенил)пиперазин-1-ил]-4-оксомасляной кислоты трет.бутиловый эфир.
К раствору 2R-циклопентилметилсукциновой кислоты 4-трет. бутилового эфира 1 (250 мг, 1,0 ммол) в дихлорметане (5 мл) добавляли РуВОР (670 мг, 1,3 ммол), HOAt (145 мг, 1,0 ммол), DIPEA (278 мкл, 1,7 ммол) и амин (211 мг, 1,2 ммол) и перемешивали реакционную смесь при комнатной температуре в течение 24 часов.
Растворитель удаляли под вакуумом и получали оранжевое масло (800 мг), которое растворяли в этилацетате (50 мл) и промывали 1М карбонатом натрия (2×50 мл), водой (1×50 мл) и высушивали над безводным сульфатом магния. Растворитель удаляли под вакуумом с получением соединения, указанного в заголовке, в виде желтого масла (600 мг), которое очищали методом препаративной HPLC.
Стадия В: 3R-циклопентилметил-4-[4-(4-фторфенил)пиперазин-1-ил]-4-оксомасляная кислота.
К раствору 3R-циклопентилметил-4-[4-(4-фторфенил)пиперазин-1-ил]-4-оксомасляной кислоты трет. бутилового эфира в дихлорметане (3 мл) добавляли TFA (2 мл) при 0°С, реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 0,5 ч и при комнатной температуре в течение 1,5 часов, после чего исходное вещество не обнаруживается. Растворитель удаляли под вакуумом и TFA подвергали азеотропной отгонке вместе с толуолом с получением указанного в заголовке соединения в виде оранжевого масла (364 мг), которое использовали на следующей стадии без дальнейшей очистки.
Стадия С: 3R-циклопентилметил-4-[4-(4-фторфенил)пиперазин-1-ил]-N-гидрокси-4-оксобутирамид.
К раствору 3R-циклопентилметил-4-[4-(4-фторфенил)пиперазин-1-ил]-4-оксомасляной кислоты (364 мг, 1,0 ммол) в дихлорметане (3 мл) добавляли РуВОР (575 мг, 1,1 ммол), HOAt (14 мг, 0,1 ммол) и Et3N (279 мкл, 2,0 ммол). К раствору гидрохлорида гидроксиламина (105 мг, 1,5 ммол) в DMF (2 мл) в отдельной колбе добавляли NMM (161 мкл, 1,5 ммол). Затем этот раствор добавляли к раствору кислоты и перемешивали реакционную смесь при RT в течение 60 часов. Растворитель удаляли в вакууме и полученный остаток обрабатывали дихлорметаном (5 мл) и промывали 1М карбонатом натрия (1×5 мл), водой (1×5 мл), сушили над безводным сульфатом магния и удаляли растворитель в вакууме с получением желтого масла (520 мг). Этот продукт очищали методом препаративной HPLC. LRMS: - ve ион: 376 ([М-1], 80%), Р; +ve ион 345 ([М+1]-32,40%), P-NHOH; данные HPLC: RT 5,6 мин, 97%.
Нижеследующее соединение получали способом, идентичным способу, описанному в Примере 41, из 4-трет. бутилового эфира 2R-циклопентил-метилсукциновой кислоты и 3,4-дихлорфенилпиперазина.
Пример 42.
3R-циклопентилметил-4-[4-(3,4-дихлорфенил)пиперазин-1-ил]-N-гидрокси-4-оксобутирамид.
У казанное соединение очищали методом препаративной HPLC. LRMS: -ve ион: 326 (М-1, 40%); +ve ион 395 ([М+1]-32,40%), P-NHOH; HPLC: RT 6,4 мин, 98%.
Пример 43.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(4-цианобензил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Это соединение было получено, как подробно описано ниже (см. Схему 2) из 2R-[(бензоилоксиформиламино)метил]гексановой кислоты (см. Схему 1).
Схема 2.
Реагенты и условия: A: EDC, HOAt, DMF, амин. В: Pd/C, EtOH, H2(г) С: Et3N, DCM, п-нитрилбензилбромид.
Стадия А: 2R-[(бензилоксиформиламино)метил]гексановой кислоты {2,2-диметил-1S-[4-(2-феноксиацетил)пиперазин-1-карбонил]пропил)амид.
К раствору 2R-[(бензоилоксиформиламино)метил]гексановой кислоты (7,0 г, 25 ммол) в DMF добавляли EDC (5,3 г, 27,5 ммол), 4-(2S-амино-3,3-диметилбутирил)пиперазин-1-карбоновой кислоты бензиловый эфир (10,0 г, 30 ммол) и HOAt (0,34 г, 2,5 ммол). Реакционную смесь перемешивали в течение ночи при комнатной температуре. Растворитель удаляли под вакуумом и остаток растворяли в этилацетате, промывали последовательно 1М соляной кислотой, 1М карбонатом натрия и насыщенным раствором хлорида натрия, сушили над безводным сульфатом магния и отфильтровывали. Растворитель удаляли под вакуумом с получением желтого масла (9,6 г), которое очищали флэш-хроматографией (3% метанола/DCM) с получением белой пены (6,7 г, 45%). 1Н-NMR; δ (CDCl3, ротамеры), 8,13 (0,6Н, s), 7,89 (0,4Н, s), 7,36 (10Н, m), 6,26 (1Н, d, J=9,2 Гц), 5,15 (2Н, s), 4,88 (2Н, m), 4,82 (1H, d, J=9,3 Гц), 3,56 (10Н, m), 2,54 (1H, m), 1,25 (6H, m), 0,94 (9Н, s), 0,83 (3Н, t, J=6,9 Гц), LRMS: +ve ион 617 [M+Na]. Стадия В: 2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты [2,2-диметил-1S-(пиперазин-1-карбонил)пропил]амид.
К раствору 2R-[(бензоилоксиформиламино)метил]гексановой кислоты {2,2-диметил-1S-[4-(2-феноксиацетил)пиперазин-1-карбонил]пропил}амида (6,5 г, 11 ммол) в этаноле (100 мл) в атмосфере аргона добавляли суспензию 10% палладия на угле (670 мг) в этилацетате (15 мл). Через суспензию в течение 30 минут пропускают водород и затем перемешивают реакционную смесь в атмосфере водорода в течение 3 часов 45 минут. Палладиевый катализатор отфильтровывали и удаляли растворитель под вакуумом с получением белой пены (4,28 г, 100%). 1H-NMR; δ (CDCl3, ротамеры), 8,39 (0,3Н, s), 7,80 (0,7H, s), 6,82 (1H, m), 4,90 (1H, m), 3,87 (3Н, m), 3,50 (3Н, m), 2,80 (5Н, m), 1,39 (6H, m), 0,99 (3Н, s), 0,95 (6H, s), 0,87 (3Н, t, J=6,7 Гц). LRMS +ve ион 397 [М+1], 419 [M+Na], -ve ион 395 [М-1].
Стадия С: 2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(4-цианобензил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
К перемешиваемому раствору [2,2-диметил-1S-(пиперазин-1-карбонил)пропил]-амид 2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты в дихлорметане (4 мл) добавляли триэтиламин (85 мкл, 0,6 ммол) и п-нитрилбензилбромид (110 мг, 0,56 ммол). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение ночи. Растворитель удаляли под вакуумом с получением желтого масла, которое очищали методом препаративной HPLC с получением белой пены (108 мг, 44%). Характеристики соединения приведены в Таблице 2. Соединения по Примерам 44-48 получали по схеме 2, как описано подробно в Примере 43. Стадию С осуществляли параллельно во всех примерах. Характеристики соединений приведены в Таблице 2. Соединения по Примерам 49-54 получали из 2R-[(бензилоксиформиламино)метил]-3-циклопентилпропионовой кислоты аналогичным способом. Характеристики соединений приведены в Таблице 3. Производные L-трет.лейкина получали известными из литературы методами. Очистку конечных соединений, если это было необходимо, осуществляли методом препаративной HPLC.
Соединения по Примерам 44-54 имеют следующие названия:
Пример 44.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(2-цианобензил)-пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 45.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(3-цианобензил)-пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 46.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты [1S-(4-бифенил-4-илметилпиперазин-1-карбонил)-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 47.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты [1S-(4-бифенил-2-илметилпиперазин-1-карбонил)-2,2-диметилпропил]амид.
Пример 48.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты [2,2-диметил-1S-(4-нафталин-2-илметилпиперазин-1-карбонил)пропил]амид.
Пример 49.
N-{1S-[4-(4-цианобензил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}-2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)пропионамид.
Пример 50.
N-{1S-[4-(2-цианобензил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}-2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)пропионамид.
Пример 51.
N-{1S-[4-(3-цианобензил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}-2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)пропионамид.
Пример 52.
N-[1S-(4-бифенил-4-илметилпиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил]-2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)пропионамид.
Пример 53.
N-[1S-(4-бифенил-2-илметилпиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил]-2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)пропионамид.
Пример 54.
2R-циклопентилметил-N-[2,2-диметил-1S-(4-нафталин-2-илметилпиперазин-1-карбонил)пропил]-3-(формилгидроксиамино)пропионамид.
Пример 55.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(3а,7а-дигидробензо[1,3]диоксол-5-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Соединение по Примеру 55 получали из 2R-[(бензилоксиформиламино)метил]-гексановой кислоты по схеме 1. 2-Амино-1S-[4-(3а,7а-дигидробензо[1,3]диоксол-5-карбонил)пиперазин-1-ил]-3,3-диметилбутан-1-он получили, как подробно описано ниже (Схема 3).
Схема 3.
Реагенты и условия: A. Et3N, 3,4-метилендиоксибензоилхлорид, СН2Cl2; В. Pd/C, EtOH, Н2(г).
Стадия А: {1S-[4-(3а,7а-дигидробензо[1,3]диоксол-5-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}карбаминовой кислоты бензиловый эфир.
К раствору бензилового эфира [2,2-диметил-1S-(пиперазин-1-карбонил)пропил]-карбаминовой кислоты (3,2 г, 9,6 ммол) в безводном дихлорметане (50 мл) в атмосфере аргона добавляли триэтиламин (2,8 мл, 20 ммол) и 3,4-метилендиоксибензоилхлорид(2,0 г, 10,8 ммол). Реакционную смесь перемешивали в течение ночи при комнатной температуре. Полученную реакционную смесь разбавляли дихлорметаном, промывали последовательно 1М соляной кислотой, 1М карбонатом натрия, насыщенным раствором хлористого натрия, сушили над безводным сульфатом магния и отфильтровывали. Растворитель удаляли в вакууме с получением желтого масла, которое очищали флэш-хроматографией (5% метанола/дихлорметан) с получением белой пены (3,5 г, 76%). LRMS: +ve ион 504 [M+Na]. 1H-NMR; δ (CDCl3), 7,35 (5Н, s), 6,93 (2Н, m), 6,84 (1Н, m), 6,01 (2Н, s), 5,55 (1h, d, J=9,5 Гц), 5,06 (2Н, m), 4,54 (1Н, d, J=9,7 Гц), 3,65 (8Н, m), 0,99 (9Н, s).
Стадия В: 2-амино-1S-[4-(3а,7а-дигидробензо[1,3]диоксол-5-карбонил)-пиперазин-1-ил]-3,3-диметилбутан-1-он
К раствору бензилового эфира {1S-[4-(3а,7а-дигидробензо[1,3]диоксол-5-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}карбаминовой кислоты (3,5 г, 7,3 ммол) в этаноле (70 мл) в атмосфере аргона добавляли 10% палладия на угле (350 мг). Через суспензию пропускали в течение 1 часа водород и затем перемешивали реакционную смесь в атмосфере водорода в течение 2 часов. Палладиевый катализатор отфильтровывали и удаляли в вакууме растворитель, получая белую пену (2,5 г, 99%). LRMS: +ve ион 348 [М+1], 370 [M+Na]. 1H-NMR; δ (CDCl3), 6,94 (2Н, m), 6,84 (1H, m), 6,01 (2H, s), 3,64 (9Н, m), 1,61 (2Н, s), 0,98 (9Н, s).
Пример 56 осуществляли как Пример 55, за исключением того, что вместо метилендиоксибензоилхлорида использовали 3-(бромметил)пиридин.
Пример 56.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты [2,2-диметил-1S-(4-пиридин-3-илметилпиперазин-1-карбонил)пропил]амид.
1H-NMR; δ (CDCl3, ротамеры), 8,62 (2H, m), 8,39 (0,4H, s), 7,82 (0,6H, s), 7,67 (1Н, d, J=7,7 Гц), 7,28 (1H, m), 6.92 (0,4H, m), 6,76 (0,6H, m), 4,91 (1Н, m), 4,02 (0,4H, m), 3,82 (3Н, m), 3,51 (4,6H, m), 2,84 (0,6H, m), 2,68 (0,4H, m), 2,36 (4Н, m), 1,53 (2H, m), 1,25 (4Н, m), 0,97 (3Н, s), 0,93 (6Н, s), 0,88 (3Н, t, J=7,0 Гц). 13C-NMR; δ (CDCl3), 175,5, 173,3, 170,3, 170,2, 150,6, 149,1, 147,2, 133,6, 123,9, 66,2, 60,3, 54,8, 54,5, 53,7, 53,5, 53,4, 53,3, 53,1, 52,9, 52,8, 52,5, 48,9, 47,3, 47,1, 46,1, 45,1, 2,5 и 42,4. LRMS: +ve ион 484 [M+Na].
Пример 57.
N-[1S-(4-бензо[1,3]диоксол-5-илметилпиперазин-1-карбонил)-2,2-диметил-пропил]-2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)пропионамид.
Указанное в заголовке соединение получали по Схеме 1 из 2S-амино-1-(4-бензо[1,3]диоксол-5-илметилпиперазин-1-ил]-3,3-диметилбутан-1-она (см. Схему 3, пиперонилпиперазин является коммерчески доступным) и пентафтор-фенилового эфира 2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)пропионовой кислоты. 1H-NMR; δ (CDCl3, ротамеры), 8,40 (0,4Н, bs), 7,82 (0,6Н, bs), 6,83 (1Н, bs), 6,76-6,63 (2Н, m), 6,58-6,54 (1Н, m), 5,94 (2Н, s), 4,87 (1Н, m), 4,10-3,28 (9Н, m), 2,87-2,16 (7Н, m), 1,85-1,33 (10Н, m), 1,09 (1Н, m), 0,98 (3,6H, m), 0,93 (5,4H, m); LRMS: +ve ион 531 [M+H], 553 [M+Na]. -ve ион 529 [М-1]. HPLC: RT=4,91 мин, 97% чистота.
Соединения по Примерам 58-67 получали методами, аналогичными описанному в Примере 55, используя соответствующий хлорангидрид кислоты или карбоновую кислоту, как на Стадии А Схемы 3. Соединения синтезировали параллельно и очистку конечных соединений, если это было необходимо, осуществляли методом препаративной HPLC. Характеристика полученных соединений приведена в Таблице 4.
Соединения по Примерам 68-79 получали методами, аналогичными описанному в Примере 43, но с использованием хлорангидрида кислоты, карбоновой кислоты или сульфонилхлорида вместо бромида на Стадии С Схемы 2. Очистку конечных соединений, если это было необходимо, проводили методом HPLC. Характеристики полученных соединений приведены в Таблице 5.
В примерах 58-79 были получены следующие соединения:
Пример 58:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {2,2-диметил-1S-[4-(5-метилпиразин-2-карбонил)пиперазин-1-карбонил]пропил}амид.
Пример 59:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(4-ацетил-3,5-диметил-Н-пиррол-2-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 60:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты{2,2-диметил-1S-[4-(5-метил-1Н-пиразол-3-карбонил)пиперазин-1-карбонил]пропил}амид.
Пример 61:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(2,5-диметил-2Н-пиразол-3-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 62:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {2,2-диметил-1S-[4-(1Н-пиррол-2-карбонил)пиперазин-1-карбонил]пропил}амид.
Пример 63:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {2,2-диметил-1S-[4-(пиридин-3-карбонил)пиперазин-1-карбонил]пропил}амид.
Пример 64:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(2-гидроксипиридин-3-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 65:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(2,6-дигидроксипиримидин-4-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 66:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {2,2-диметил-1S-[4-(пиразин-2-карбонил)пиперазин-1-карбонил]пропил}амид.
Пример 67:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {2,2-диметил-1S-[4-(5-метилизоксазол-3-карбонил)пиперазин-1-карбонил]пропил}амид.
Пример 68:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {2,2-диметил-1S-[4-(тиофен-2-карбонил)пиперазин-1-карбонил]пропил}амид.
Пример 69:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {2,2-диметил-1S-[4-(4-метил-[1,2,3]тиадиазол-5-карбонил)пиперазин-1-карбонил]пропил}амид.
Пример 70:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(3,5-диметил-изоксазол-4-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 71:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(изоксазол-5-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 72:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {2,2-диметил-1S-[4-(2-пиридин-4-ил-тиазол-4-карбонил)пиперазин-1-карбонил]пропил}амид.
Пример 73:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(5-метансульфонилтиофен-2-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 74:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(2,4-диметилтиазол-5-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 75:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(2-хлорпиридин-3-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил} амид.
Пример 76:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {2,2-диметил-1S-[4-(пиридин-2-карбонил)пиперазин-1-карбонил]пропил}амид.
Пример 77:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {2,2-диметил-1S-[4-(1-метил-1Н-пиррол-2-карбонил)пиперазин-1-карбонил]пропил}амид.
Пример 78:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(бифенил-4-сульфонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Пример 79:
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(бифенил-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}амид.
Соединения по Примерам 80 и 81 получали способом, аналогичным описанному в Примере 43, из 2R-[(бензилоксиформиламино)метил]-3-циклопентилпропионовой кислоты.
Пример 80.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты (2,2-диметил-1S-{4-[4-(морфолинил-4-карбонил)бензил]пиперазин-1-карбонил}пропил)амид.
1H-NMR; δ (CDCl3, ротамеры), 8,38 (0,4Н, s), 7,81 (0,6Н, s), 7,36 (4Н, s), 6,77 (0,4Н, d, J=8,9 Гц), 6,62 (0,6H, d, J=9,3 Гц), 4,88 (1H, m), 4,03 (0,4H, dd, J=14,6, 7,1 Гц), 3,91 (1Н, m), 3,76 (8Н, m), 3,51 (5,6H, m), 3,38 (1H, m), 2,84 (0,6H, m), 2,69 (0,4H, m), 2,55 (2Н, m), 2,30 (2Н, m), 1,57 (9Н, m), 1,05 (2Н, m), 0,98 (3Н, s), 0,94 (6Н, s). 13C-NMR; δ (CDCl3, ротамеры), 176,0, 173,3, 170,7, 170,1, 156,5, 140,2, 134,8, 129,5, 127,7, 67,3, 62,8, 55,0, 54,5, 53,8, 53,6, 53,2, 53,1, 52,2, 49,0, 47,4, 47,2, 46,0, 44,9, 42,7, 42,4, 38,5, 38,2, 36,9, 36,7, 35,9, 33,2, 27,0, 25,6 и 25,5. LRMS: +ve ион 600 [М+Н], 622 [M+Na]. HPLC: RT=4,63 мин, 100% чист.
Пример 81.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты [2,2-диметил-1S-(4-пиридин-3-илметилпиперазин-1-карбонил)пропил]амид.
1H-NMR; δ (CDCl3, ротамеры), 8,53 (2Н, m), 8,40 (0,3H, s), 7,81 (0,7H, s), 7,65 (1Н, d, J=7,7 Гц), 7,27 (1H, m), 6,76 (0,3H, d, J=8,8 Гц), 6,67 (0,7Н, d, J=8,9 Гц), 4,89 (1Н, m), 4,03 (0,3H, m), 3,92 (1H, m), 3,77 (1,7H, m), 3,47 (5Н, m), 2,86 (0,7H, m), 2,69 (0,3Н, m), 2,56 (2Н, m), 2,31 (2Н, m), 1,64 (9Н, m), 1,07 (2Н, m), 0,98 (3Н, s), 0,93 (6Н, s). 13C-NMR; δ (CDCl3, ротамеры), 175,5, 173,0, 169,8, 150,3, 148,8, 136,7, 133,1, 123,4, 60,0, 54,6, 54,1, 53,4, 53,2, 52,8, 52,7 52,1, 48,7, 46,9, 46,8, 45,6, 44,5, 42,2, 42,0, 38,2, 37,9, 36,5, 36,3, 5,6, 32,8, 32,7, 6,7, 25,3 и 25,2, LRMS: +ve ион 488 [М+Н], 510 [M+Na]. HPLC: RT=4,48 мин, 98% чист.
Пример 82.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты {1S-[4-(4-гидроксиметилфенил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпротил}амид.
LRMS: +ve ион 485 [М-ОН]+, -ve ион 501 [М-Н]. HPLC: RT=5,8 мин, 95% чист.
Это соединение получали из 3-(бензилоксиформиламино)-2R-циклопентилметил-пропионовой кислоты пентафторфенилового эфира и 4-(4-бензилпиперазин-1-ил)бензойной кислоты этилового эфира, являющегося известным соединением. Бензиловый эфир {1-[4-(4-гидроксиметилфенил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}карбаминовой кислоты подвергали обработке с целью снятия защиты и сочетали с пентафторфениловым эфиром методом, показанным на Схеме 1.
Схема 4
Реагенты и условия: A. LiAlH4, THF, 75°С; В. Pd/C, EtOH, Н2 (г); С. EDC, HOAt, Et3N, CH2Cl2.
Стадия А: [4-(4-бензилпиперазин-1-ил)фенил]метанол.
К раствору литийалюминийгидрида (88 мг, 2,3 ммол) в сухом THF (20 мл) добавляли этиловый эфир 4-(4-бензилпиперазин-1-ил)бензойной кислоты (500 мг, 1,5 ммол). Суспензию перемешивали при 75°С в течение 4 часов. Реакционной смеси давали охладиться и добавляли несколько капель воды и затем 1-2 капли 1М гидроокиси натрия. Образовавшийся белый осадок отфильтровывали и удаляли THF под вакуумом, после чего к остатку добавляли соляной раствор (10 мл). Полученную смесь промывали эфиром (2×50 мл), эфирные слои соединяли, сушили над безводным сульфатом магния и удаляли растворитель под вакуумом с получением желтого вещества (405 мг). Флэш-хроматография (3% MeOH/CH2Cl2) позволила выделить целевое соединение в виде белого вещества (331 мг, 76%). 1H-NMR; δ (CDCl3), 7,38-7,21 (7Н, m, ArH), 6,91-6,85 (2Н, m, ArH), 4,59 (2Н, s), 3,57 (2Н, s), 3,21-3,17 (4H, m) 2,61-2,58 (4Н, m). HPLC: 2,4 мин(94% @ 214 нм); LRMS: +ve: 283 (М+1, 80).
Стадия В: (4-пиперазин-1-илфенил)метанол.
К раствору [4-(4-бензилпиперазин-1-ил)фенил]метанола в EtOH (50 мл) в атмосфере аргона добавляли суспензию 10% палладия на угле (1,5 г) в EtOH (150 мл).Через суспензию в течение 1 часа пропускали водород и затем реакционную смесь перемешивали в атмосфере водорода в течение 60 часов при комнатной температуре. Катализатор отфильтровывали и удаляли растворитель под вакуумом с получением целевого соединения в виде белого вещества (48 г, 100%). 1H-NMR; δ (CDCl3), 7,30-7,21 (2Н, m, ArH), 6,94-6,88 (2Н, m, ArH), 4,59 (2Н, s), 3,18-2,98 (8Н, m). HPLC: 0,5 мин (37% @ 214 нм), 0,7 мин (55% @ 214 нм), множественные пики вследствие образования соли из буфера TFA; LRMS: +ve: 193 (М+1, 70).
Стадия С: {1-[4-(4-гидроксиметилфенил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}карбаминовой кислоты бензиловый эфир.
К раствору трет.лейкина, защищенного CBz (7,4 г, 28 ммол), в дихлорметане (20 мл) добавляли (4-пиперазин-1-илфенил)метанол в растворе DMF/дихлорметан (50:50,250 мл). Затем последовательно добавляли EDC (7,3 г, 38 ммол), HOAt(0,34r, 2,5 ммол) и триэтиламин (7,0 мл, 50 ммол). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 18 часов. Растворитель удаляли под вакуумом, получая желтое масло, которое обрабатывали дихлорметаном (300 мл) и промывали 1М карбонатом натрия (2×200 мл), 1М соляной кислотой (1×200 мл), соляным раствором (1×200 мл), сушили (безводный сульфат магния) и удаляли растворитель под вакуумом, получая белую пену (11,8 г). Флэш-хроматография (2% МеОН/дихлорметан) позволила выделить соединение, указанное в заголовке, в виде белой пены (7,01 г, 63%). HPLC:5,7 мин (100% @ 214 нм). LRMS: +ve 462 (M+Na, 60), 440 (M+1,20),422 (М-ОН, 100).
Пример 83.
2R-[(формилгидроксиамино)метил]гексановой кислоты [2,2-диметил-1S-(4-пиримидин-2-ил-пиперазин-1-карбонил]пропил]амид.
Получали методом, аналогичным описанному в Примере 82.
1H-NMR; δ (CDCl3), 8,40 (0,3Н, s), 8,33 (2Н, d, J=4,8 Гц), 7,82 (0,7H, s), 6,76 (1H, d, J=8,4 Гц), 6,55 (1H, t, J=4,7 Гц), 4,94 (1H, m), 4,09-3,37 (10Н, m), 2,86-2,78 (0,7H, m), 2,72-2,65 (0,3H, m), 1,63-1,18 (6Н, m), 1,02 (3Н, s), 0,97 (5Н, s), 0,85 (3Н, m). 13C-NMR; δ (CDCl3), 176,0, 173,3, 170,5, 161,9, 158,2, 111,1, 55,3, 54,7, 52,1, 48,7, 47,1, 47,0, 46,5, 45,1, 44,3, 44,2, 44,0, 43,9, 42,6, 42,4, 35,9, 30,3, 30,2, 29,7, 29,6, 27,1, 22,9 и 14,3. LRMS: +ve ион 449 [M+H], 471 [M+Na], -ve ион 447 [M-H]. HPLC:RT=4,99 мин, 100% чист.
Пример 84.
N1-{1S-[4-(бензо[1,3]диоксол-5-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}-2R-циклопентилметил-N4-гидроксисукцинамид.
Это соединение получали способом, описанным подробно ниже (см. Схему 5), из 4-трет. бутилового эфира 2R-циклопентилметилсукциновой кислоты, полученного по способу, описанному в заявке WO 92/13831, и 2-амино-1S-[4-бензо[1,3]диоксол-5-карбонил)пиперазин-1-ил]-3,3-диметилбутан-1-он, полученный способами, представленными на Схеме 3.
Схема 5.
Реагенты и условия: A. THF, CH2Cl2; В. EDC, DMF, HOAt, гидроксиламин. С. Pd/C, EtOH, Н2 (г). D, EDC, DMF. Е. МеОН, 1М HCl.
Стадия А: 2R-циклопентилметилсукциновой кислоты 1-бензиловый эфир.
К раствору 4-трет. бутилового эфира 2R-циклопентилметилсукциновой кислоты (960 мг, 2,7 ммол) в дихлорметане (30 мл) добавляли TFA (30 мл). Реакционную смесь оставляли при -4°С в течение 18 часов. Растворитель удаляли под вакуумом, TFA выпаривали вместе с толуолом и эфиром под вакуумом, получая желтое масло (810 мл, 100%). 1H-NMR; δ (CDCl3), 7,38-7,29 (5Н, m), 5,15 (5Н, s), 2,93-2,87 (1H, m), 2,78 (1h, dd, J1=9,485 J2=16,81), 2,52 (1H, dd, J1=4,92 J2=17,01), 1,84-1,63 (3H, m), 1,62-1,53 (2H, m), 1,52-1,40 (3H, m), 1,09-1,02 (2Н, m).
Стадия В: 2R-циклопентилметил-N-(1-изобутоксиэтокси)сукцинамовой кислоты бензиловый эфир.
К раствору 1-бензилового эфира 2R-циклопентилметилсукциновой кислоты (810 мг, 2,8 ммол) в DMF добавляли EDC (805 мг, 4,2 ммол), HOAt, (10% вес./вес.) и O-(1-изобутоксиэтилгидроксиламино) (745 мг, 5,6 ммол). Реакционную смесь оставляли при перемешивании в течение 60 часов при комнатной температуре. Растворитель удаляли под вакуумом, остаток обрабатывали этилацетатом и промывали последовательно 1М соляной кислотой, 1М карбонатом натрия и насыщенным раствором хлористого натрия. Органическую фазу высушивали над безводным сульфатом магния и концентрировали под вакуумом с получением желтого масла (1,07 г, 97%).
1H-NMR; δ (CDCl3), 8,05 (1Н, bs), 7,34-7,27 (5Н, m), 5,17:5,10 (2Н, AB q, J=12,36), 4,92-4,88 (1H, m), 3,52 (1H, dd, J1=6,643 J2=9,340), 3,271 (1H, dd, J1=6,734 J2=9,267), 3,06-2,95 (1H, m), 2,52-2,23 (2H, m), 1,89-1,41 (11H, m), 1,36 (3H, dd, J1=3,53 J2=5,303), 1,06 (2H, bs), 0,919 (6H, d, 6,63). ESMS; +ve ион 428 [M+Na].
Стадия С: 2R-циклопентилметил-N-(1-изобутоксиэтокси)сукцинамовая кислота.
К раствору бензилового эфира 2R-циклопентилметил-N-(1-изобутоксиэтокси)-сукцинамовой кислоты (925 мг, 2,3 ммол) в этаноле в атмосфере аргона добавляли палладий на угле (10% вес./вес.). Через полученную суспензию в течение 30 минут пропускали водород и перемешивали реакционную смесь в атмосфере водорода в течение 3 часов. Палладиевый катализатор отфильтровывали и удаляли растворитель под вакуумом с получением желтого масла (720 мг, 100%). 1H-NMR; δ (CDCl3), 4,93 (1H, m), 3,559 (1H, dd, J1=6,620 J2=9,292), 3,292 (1H, dd, J1=6,70 J2=9,330), 2,94 (1H, m), 2,49-2,29 (2H, m), 1,93-1,75 (5H, m), 1,61-1,44 (6H, m), 1,377 (3H, dd, J1=1,237 J2=5,237), 1,08 (2H, m), 0,919 (6H, d, J=6,65). ESMS;+ve ион 338 [M+Na], -ve ион 314 [М-1].
Стадия D: N1-{1S-[4-(бензо[1,3]диоксол-5-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}-2R-циклопентилметил-N4-(1-изобутоксиэтокси)сукцинамид.
К раствору 2R-циклопентилметил-N-(1-изобутоксиэтокси)сукцинамовой кислоты (150 мг, 0,48 ммол) в DMF (7,5 мл) добавляли 2-амино-1S-[4-бензо[1,3]диоксол-5-карбонил)пиперазин-1-ил]-3,3-диметилбутан-1-он (165 мг, 0,5 ммол) и перемешивали в течение 5 минут. Добавляли EDC (96 мг, 0,5 ммол) и перемешивали полученную смесь при комнатной температуре в течение уик-энда. Растворитель удаляли под вакуумом, остаток обрабатывали этилацетатом и промывали последовательно 1М соляной кислоты, 1М карбонатом натрия и насыщенным раствором хлористого натрия. Органическую фазу высушивали над безводным сульфатом магния и концентрировали под вакуумом с получением белого вещества (227 мг, 74%). 1H-NMR; δ (CDCl3), 6,87 (2Н, m), 6,01 (2H, s), 4,873 (1H, m), 3,94-3,67 (4Н, m), 3,64-3,23 (10Н, m), 2,773 (1Н, m), 2,43-2,19 (2Н, m), 1,89-1,39 (14Н, m), 1,357 (3Н, dd, J1=2,350 J2=5,306), 1,117 (2H, m), 0,987 (9Н, s), 0,913 (6Н, d, J=6,66). ESMS; +ve ион 667 [M+Na].
Стадия E: N1-{1S-[4-(бензо[1,3]диоксол-5-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}-2R-циклопентилметил-N4-гидроксисукцинамид
N1-{1S-[4-(бензо[1,3]диоксол-5-карбонил)пиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}-2R-циклопентилметил-N4-(1-изобутоксиэтокси)сукцинамид(198 мг, 0,31 ммол) растворяли в смеси 50/50 метанола и 1М соляной кислоты (16 мл) и перемешивали при комнатной температуре в течение 30 минут. Добавляли предварительно промытую смолу Amberlyst 95 до достижения рН 7 и затем отфильтровывали под вакуумом и промывали метанолом полученный продукт. Фильтрат концентрировали под вакуумом с этанолом и получали желтоватое вещество, которое очищали методом препаративной HPLC с получением соединения, указанного в заголовке в виде белой пены (62 мг). 1H-NMR; δ (MeOD), 6,935 (1H, s), 6,926 (2H, dd, J1=7,854 J2=34,375), 6,018 (2H, s), 4,863 (1H, s), 3,902-3,384 (8Н, m), 2,893 (1H, m), 2,323 (1H, dd, J1=7,863 J2=14,31), 2,193 (1H, dd, J1=6,23 J2=14,39), 1,824 (1H, m), 1,645 (5Н, m), 1,491 (2H, m), 1,374 (1H, m), 1,033 (11H, m). 13C-NMR; δ (MeOD), 177,7,172,8, 172,2, 171,0, 151,3, 149,7, 130,2, 123,3, 109,7, 103,5, 56,5, 48,1, 43,6, 43,4, 40,1, 39,8, 37,4, 36,4, 34,0, 27,5, 26,5; ESMS; +ve ион 567 [M+Na]. -ve ион 543 [М-1].
Препаративный пример А.
2R-циклопентилметил-N1-{2,2-диметил-1S-[4-(4-метилбензил)пиперазин-1-карбонил]пропил }-N4-гидроксисукцинамид.
Указанное соединение получали как описано ниже (см. Схему 6) из 2-циклопентилметил-N-(1-изобутоксиэтокси)сукцинамовой кислоты (см. Схему 5).
Схема 6.
Реагенты и условия: А. 4-(амино-3,3-диметилбутирил)пиперазин-1-карбоновой кислоты бензиловый эфир, WSC, NEt3, CH2Cl3; В. Pd/C, Н2, МеОН; С. 4-метилбромид, NEt3, CH2Cl2; D. HCl, 1N, MeOH.
Стадия А: 4-{2S-[2R-циклопентилметил-3-(1-изобутоксиэтоксикарбамоил)-пропиониламино]-3,3-диметилбутирил}пиперазин-1-карбоновой кислоты бензиловый эфир.
К холодному (0°С) раствору кислоты (6,8 г, 16,1 ммол) в дихлорметане (80 мл) добавляли гидрохлорид амина (8,65 г, 19,4 ммол) с последующим добавлением триэтиламина (2,92 мл, 21 ммол) и затем WSC (3,72 г, 19,4 ммол). Реакционную смесь перемешивали в течение ночи, при этом температура повышалась до комнатной. Затем реакционную смесь разбавляли дихлорметаном и промывали водой (80 мл), Na2CO3 и соляным раствором. Объединенные органические слои высушивали над сульфатом магния и удаляли под вакуумом растворитель, получая желтоватую пену, которую очищали методом флэш-хроматографии с получением 100% чистого соединения (8 г, 79% выход).
1H-NMR; δ (CDCl3), 8,20 (1Н, m), 7,32 (5Н, m), 6,45 (1Н, m), 5,11 (2Н, s), 4,91-4,82 (2Н, m), 3,87-3,21 (12H, m), 2,41 (1H, m), 2,73 (1H, m), 1,90-1,40 (14H, m), 1,36 (3H, m), 0,98 (9H, s), 0,90 (6H, d).
Стадия В: 2R-циклопентилметил-N1-[2,2-диметил-1S-(пиперазин-1-карбонил)пропил]-N4-(1-изобутоксиэтокси)сукцинамид.
К суспензии Z-защищенного пиперазина (8 г, 12,7 ммол) в МеОН (100 мл) добавляли Pd/C (0,8 г) и затем в течение 1 часа пропускают водород. Затем реакционную смесь перемешивали в атмосфере водорода еще час. Pd/C отфильтровывали через целит, получая желательный продукт с выходом 99%.
ESMS; +ve ион 498 [М+1], -ve ион 496[М-1]. HPLC: RT=5,21 мин.
Стадия С: 2R-циклопентилметил-N1-{2,2-диметил-1S-[4-(4-метилбензил)-пиперазин-1-карбонил]пропил}-N4-(1-изобутоксиэтокси)сукцинамид.
К раствору 4-метилбензилбромида(74 мг, 0,4 ммол) в дихлорметане (2 мл) добавляли раствор пиперазина в дихлорметане (1,2 мл, 0,33 ммол) и NEt3 (60 мл, 0,4 ммол). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 12 часов. Добавляли воду (1,5 мл) и полученный раствор отфильтровывали через гидрофобный полипропилен (фильтр 1 PS). Затем удаляли при пониженном давлении растворитель, получая желательный продукт.
Стадия D: 2R-циклопентилметил-N1-{2,2-диметил-1S-[4-(4-метилбензил)-пиперазин-1-карбонил]пропил}-N4-гидроксисукцинамид.
К раствору последнего в МеОН (4 мл) добавляли 1N HCl (600 мл) и перемешивали реакционную смесь в течение 2 часов. Затем добавляли 60 мл NEt3 и удаляли растворитель при пониженном давлении. Полученную смесь очищали методом HPLC.
Соединения в Примерах 85-87 получали способом, отраженным на схеме 5 и описанным подробно в Препаративном примере А. Стадию С и стадию D осуществляли во всех примерах параллельно. Характеристики соединений представлены в Таблице 6.
Таблица 6 | |||
Примеры | Структура | Масс-спектры | HPLC время удерживания (мин) |
85 | M+1=563 M-1=561 |
5.2 | |
86 | M+1=537 M-1=535 |
5.03 | |
87 | M+1=488 M-1=486 |
4.17 |
Соединения в Примерах 85-87 имеют следующие названия:
Пример 85.
N1-[1S-(4-бифенил-4-илметилпиперазин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил]-2R-циклопентилметил-N4-гидроксисукцинамид.
Пример 86.
2R-циклопентилметил-N1-[2,2-диметил-1S-(4-нафталин-2-илметилпиперазин-1-карбонил)пропил]-N4-гидроксисукцинамид.
Пример 87.
2R-циклопентилметил-N1-[2,2-диметил-1S-(4-пиридин-3-илметилпиперазин-1-карбонил)пропил]-N4-гидроксисукцинамид.
Пример 88.
4-(1-{2S-[3-(бензилоксиформиламино)-2R-циклопентилметилпропиониламино]-3,3-диметилбутирил}пиперидин-4-илокси)-N,N-диметилбензамид.
Указанное соединение получали как описано ниже (см. Схему 8) из 3-бензилоксиформиламино)-2R-циклопентилметилпропионовой кислоты пентафторфенилового эфира и 4-[1-(2S-бензилоксикарбониламино)-3,3-диметилбутирил)пиперидин-4-илокси]бензойной кислоты метилового эфира (см. Схему 7).
Схема 7.
Реагенты и условия: Стадия А: 4-гидроксипиперидин, WSC, HOAt, CH2Cl2; Стадия В: 4-гидроксиметилбензоат, DEAD, PPh3, THF; Стадия С: Н2, Pd/C, EtOH, обр. холодильник.
Стадия А: [1S-(4-гидроксипиперидин-1-карбонил)-2,2-диметилпропил]-карбаминовой кислоты бензиловый эфир.
К холодному раствору (0°С) Z-трет.лейцина (3,48 г, 13,1 ммол) и 4-гидроксипиперидина (1,4 г, 13,7 ммол) в CH2Cl2 (40 мл) добавляли WSC (2,75 г, 14,4 г) с последующим добавлением HOAt (18 мг, 0,13 ммол). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 12 часов и затем промывали водой и соляным раствором. Соединенные органические слои сушили над сульфатом магния и удаляли растворитель при пониженном давлении с получением желтого масла, которое очищали методом флэш-хроматографии. Желательное соединение получали с выходом 64%.
1H-NMR; δ (CDCl3), 7,34 (5Н, s), 5,58 (1H, m), 5,08 (2H, m), 4,60 (1H, m), 3,91 (3H, m), 3,49 -3,05 (2H, m), 1,91 (4Н, m), 0,98 (9Н, d, J=3,57); ESMS: +ve ион 371 [M+Na]; HPLC: RT=5,44 мин.
Стадия В: 4-[1-(2S-бензилоксикарбониламино-3,3-диметилбутирил)пиперидин-4-илокси]бензойной кислоты метиловый эфир.
К холодному раствору (0°С) соединения с предыдущей стадии (1,45 г, 4,2 ммол) по каплям добавляли 4-гидроксиметилбензоат (0,7 г, 4,6 ммол) и трифенилфосфин (1,48 г, 5,46 ммол) с последующим добавлением DEAD (0,86 мл, 5,46 ммол). Реакционную смесь перемешивали при 0°С в течение 2,5 часов. THF удаляли под вакуумом и остаток обрабатывали этилацетатом. Органический слой промывали водой и соляным раствором и сушили над сульфатом магния. После очистки методом флэш-хроматографии получали нужное соединение в виде белой чистой пены с выходом 70%.
1H-NMR; δ (CDCl3), 7,99 (2H, dd, J1=1,23 J2=8,82), 7,35 (5H, m), 6,92 (2H, dd, J1=1,18 J2=8,76), 5,58 (1H, m), 5,09 (2H, m), 4,62 (2H, m), 3,89 (4H, m), 3,72 (1H, m), 3,61 (2H, m), 1,90 (4H, m), 0,99 (9H, s); ESMS: +ve ион 505 [M+Na]; HPLC: RT=6,73 мин.
Стадия С: 4-[18-(2-амино-3,3-диметилбутирил)пиперидин-4-илокси]-бензойной кислоты метиловый эфир.
К раствору соединения с предыдущей стадии (650 мг, 1,35 ммол) в EtOH добавляли Pd/C (65 мг) и пропускали H2 через полученную суспензию в течение 4 часов. Затем удаляли Pd/C путем фильтрования через целит. Растворитель удаляли при пониженном давлении и получали желательное соединение с количественным выходом.
1H-NMR, δ (CDCl3), 7,99 (2Н, d, J=8,82), 6,92 (2Н, d, J=8,47), 4,65 (1H, m), 3,89 (3Н, s), 3,72 (2Н, m), 3,56 (1H, d, J=4,82), 1,95 (4H, m), 0,99 (9H, s); ESMS: +ve ион 349 [M+1].
Схема 8.
Реагенты и условия: Стадия A: RHS, NEt3, DMF; Стадия В: LiOH, THF, МеОН. Н2О; Стадия С: FAA, NEt3, THF; Стадия D: диметиламин, WSC, HOAt, CH2Cl2; Стадия Е: циклогексан, Pd/C, EtOH, обр. холодильник.
Стадия А: 4-(1-{2S-[3-(бензилоксиформиламино)-2R-циклопентилметилпропиониламино]-3,3-диметилбутирил}пиперидин-4-илокси)бензойной кислоты метиловый эфир.
К раствору амина (3,4 г, 9,70 ммол) в DMF добавляли PFP эфир (4 г, 8,50 ммол) с последующим добавлением NEt3 (1,3 мл, 9,34 ммол). Реакционную смесь перемешивали в течение ночи при комнатной температуре. Растворитель удаляли при пониженном давлении и остаток растворяли в этилацетате. Промывку осуществляли водой, карбонатом натрия, хлористым аммонием и соляным раствором. Соединенные органические слои сушили над сульфатом магния и удаляли растворитель при пониженном давлении, получая пену. Технический продукт очищали методом флэш-хроматографии, получая нужное соединение в виде белой пены с выходом 98%.
1H-NMR; δ (CDCl3, ротамеры), 8,01-7,96 (2Н, m), 7,38 (5Н, bs), 6,93-6,88 (2Н, m), 6,32-6,29 (1H, m), 5,01-4,52 (7H, m), 4,02-3,52 (7Н, m), 3,89 (3Н, s), 2,68-2,50 (1H, m), 1,98-1,34 (15H, m), 0,95 (9H, s); LRMS: +ve ион 436 [M+H], 658 [M+Na]. HPLC: RT=6,79 мин, 98% чистота.
Стадия В: 4-{1-[2S-(3-бензилоксиамино-2R-циклопентилметилпропиониламино)-3,3-диметилбутирил]пиперидин-4-илокси}бензойная кислота.
К холодному раствору (0°С) соединения с предыдущей стадии (100 мг, 0,16 ммол) в смеси THF/ МеОН/Н2О (3:1:1; 2,5 мл) добавляли LiOH (0,33 мг). Реакционную смесь перемешивали в течение 48 часов при комнатной температуре. Растворитель удаляли под вакуумом и остаток растворяли в воде. Водный слой экстрагировали Et2O и затем подкисляли до рН 1 при помощи 1 N HCl. Желательный продукт экстрагировали из Et2O. Органический слой высушивали над сульфатом магния и удалили растворитель при пониженном давлении, получая целевой продукт в виде белого вещества с выходом 61%.
1H-NMR; δ (CDCl3, ротамеры), 8,06-8,01 (2Н, m), 7,38-7,30 (5Н, m), 7,09-6,99 (1H, 2d, J=9,3 Гц), 6,94-6,89 (2Н, m), 5,02 (1H, d, J=9,4 Гц), 4,75 (2Н, s), 4,69-4,61 (1H, m), 4,08-3,67 (4H, m), 3,58-3,42 (2H, m), 3,17-3,01 (2H, m), 2,62 (1Н, m), 2,10-1,40 (15H, m), 1,01 (9H, s); LRMS: +ve ион 594 [M+H], -ve ион 592 [M-1]. HPLC: RT=5,92 мин, 98% чистота.
Стадия С: 4-(1-{2S-[3-(бензилоксиформиламино)-2R-циклопентилметилпропиониламино]-3,3-диметилбутирил]пиперидин-4-илокси)бензойная кислота.
К холодному (0°С) раствору кислоты (4,8 г, 8,1 ммол) в THF (100 мл) добавляли смешанный ангидрид (1,8 г, 20,3 ммол) и NEt3 (3,33 мл, 24,3 ммол). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 12 часов, затем удаляли при пониженном давлении растворитель и растворяли остаток в CH2Cl2. Органический слой промывали водой и соляным раствором и высушивали над MgSO4. Растворитель удаляли под вакуумом, получая желаемое производное. 1H-NMR; δ (CDCl3, ротамеры), 8,19-7,89 (3Н, bs), 7,46-7,30 (5Н, m), 7,02-6,85 (1H, m), 5,02-4,53 (4H, m), 4,04-3,37 (6Н, m), 2,70 (1H, m), 1,98-1,35 (15Н, m), 0,97 (9Н, s); LRMS: +ve ион 644 [M+Na], -ve ион 620 [M-1]. HPLC: RT=6,29 мин, 95% чистота.
Стадия D: 4-(1-{2S-[3-(бензилоксиформиламино)-2R-циклопентилметилпропиониламино]-3,3-диметилбутирил]пиперидин-4-илокси)-N,N-диметилбензамид.
К холодному (0°С) раствору исходной кислоты (35 г, 0,56 ммол) в CH2Cl2 (8 мл) добавляли диметиламин (0,67 ммол), WSC (118 мг, 0,61 ммол) и HOAt (8 мг, 0,06 ммол). Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 12 часов. Добавляли воду (3 мл) и полученный раствор отфильтровывали через полипропиленовые гидрофобные картриджи (фильтр 1 PS). Затем при пониженном давлении удаляли растворитель с получением желаемого аддукта. Технический продукт очищали затем методом флэш-хроматографии с получением соединения 100%-ной чистоты с выходом 55%. LRMS: +ve ион 671 [M+Na], HPLC: RT=6,32 мин, 100% чистота.
Стадия Е: 4-(1S-{2-[2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)-пропиониламино]-3,3-диметилбутирил}пиперидин-4-илокси)-N,N-диметил-бензамид.
К раствору последнего соединения (200 мг, 0,31 ммол) добавляли циклогексен (0,5 мол) и Pd/C (24 мг). Реакционную смесь перемешивали при нагревании с обратным холодильником в течение 3 часов. Затем отфильтровывали через целит. Растворитель удаляли при пониженном давлении с получением желаемого аддукта в виде чистого соединения. LRMS: +ve ион 581 [M+Na], HPLC: RT=5,49 мин, 100% чистоты.
Соединения по Примерам 88а-93 получали способом, отраженным на Схеме 9, как описано подробно в Примере 88. Стадии С и D осуществляли параллельно во всех примерах. Характеристики соединений приведены в Таблице 7.
Таблица 7 | |||
Примеры | Структура | Данные масс-спектра | HPLC RT (мин) |
88 | 581 (M+Na), 559 (М+1), 557 (М-1). |
5,5 | |
88а | 545 (M+1), 567(M+Na), 543 (М-1). |
5,3 | |
89 | 601 (М+1), 623 (M+Na), 599 (М-1). |
5,4 | |
90 | 614 (М+1), 636 (M+Na), 612 (М-1). |
4,8 | |
91 | 615 (М+1), 637 (M+Na), 613 (М-1). |
5,2 | |
92 | 615 (М+1), 637 (M+Na), 613 (М-1). |
5,4 |
Соединения по Примерам 88а-93 имеют следующие названия.
Пример 88а.
4-(1-{2S-[3-(бензилоксиформиламино)-2R-циклопентилметилпропиониламино]-3,3-диметилбутирил}пиперидин-4-илокси)-N-диметилбензамид.
Пример 89.
2R-циклопентилметил-N-(2,2-диметил-1S-{4-[4-(морфолин-4-карбонил)фенокси]-пиперидин-1-карбонил}пропил)-3-(формилгидроксиамино)пропионамид.
Пример 90.
2R-циклопентилметил-N-(2,2-диметил-1S-{4-[4-(4-метилпиперазин-1-карбонил)-фенокси]пиперидин-1-карбонил}пропил)-3-(формилгидроксиамино)пропионамид.
Пример 91.
2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)-N-(1S-{4-[4-(4-гидроксипиперидин-1-карбонил)фенокси]пиперидин-1-карбонил}-2,2-диметилпропил)-пропионамид.
Пример 92.
2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)-N-(1S-{4-[4-(2S-гидроксиметилпирролидин-1-карбонил)фенокси]пиперидин-1-карбонил}-2,2-диметилпропил)-пропионамид.
Пример 93.
4-(1-{2S-[2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)пропиониламино]-3,3-диметилбутирил}пиперидин-4-илокси)бензойная кислота.
Пример 94.
4-(1-{2S-[2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)пропиониламино]-3,3-диметилбутирил}пиперидин-4-илокси)бензойной кислоты метиловый эфир.
Это соединение получали, как описано ниже (см. Схему 9), из метилового эфира 4-(1-{2S-[3-(бензилоксиформиламино)-2R-циклопентилметилпропиониламино]-3,3-диметилбутирил}пиперидин-4-илокси)бензойной кислоты (схема 8).
Схема 9.
Реагенты и условия: Стадия А: Н2, Pd/C, EtOH, обр. холодильник.
К раствору метилового эфира 4-(1-{2S-[3-(бензилоксиформиламино)-2R-циклопентилметилпропиониламино]-3,3-диметилбутирил}пиперидин-4-илокси)-бензойной кислоты (80 мг, 0,125 ммол) в EtOH (4 мл) добавляли Pd/C (10 мг). В полученную суспензию пропускают в течение 2 часов Н2. Pd/C отфильтровывали через целит с получением желаемого соединения с выходом 88%. 1H-NMR; δ (CSCl3), 8,40 (0,3Н, s), 7,99 (2Н, dd, J1=3,04 J2=8,85), 7,81 (0,7H, s), 6,91 (2Н, dd, J1=4,87 J2=8,84), 6,78 (1H, m), 4,94 (1H, m), 4,64 (1H, m), 3,99 (2H, m), 3,89 (3H, s), 3,75 (2H, m), 3,48 (3H, m), 2,81 (1H, m), 2,10-1,32 (13H, m), 1,08 (2H, bs), 0,97 (9H, m). 13C-NMR; δ (CDCl3), 175,7, 173,6, 170,3, 167,1, 161,2, 132,1, 123,4, 115,5, 72,3, 58,7, 55,1, 54,8, 52,9, 52,3, 44,2, 43,6, 39,2, 39,1, 38,4, 36,6, 35,8, 33,2, 31,6, 31,2, 27,0, 25,5.
Пример 95.
2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)-N-{1S-[4-(4-гидроксиметилфенокси)пиперидин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}пропионамид.
Это соединение получали, как описано ниже (см. Схему 10), из 4-[1-(2S-бензилоксикарбониламино)-3,3-диметилбутирил)пиперидин-4-илокси]бензойной кислоты.
Схема 10.
Реагенты и условия: Стадия А: ВН3, THF; Стадия В: Н2, Pd/C, EtOH; Стадия С: PFP эфир, NEt8D; Стадия D: Н2, Pd/C, EtOH.
Стадия А: {1S-[4-(4-гидроксиметилфенокси)пиперидин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}карбаминовой кислоты бензиловый эфир. К холодному (10°С) раствору 4-[1-(2S-бензилоксикарбониламино)-3,3-диметил-бутирил)пиперидин-4-илокси]бензойной кислоты (750 мг, 1,6 ммол) в THF (10 мл) добавляли по каплям ВН3. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 12 часов. Затем добавляли по каплям воду и при пониженном давлении удаляли растворитель. Полученный продукт обрабатывали EtOAc. После фильтрования органический слой концентрировали, получая чистое соединение в виде белой пены с выходом 93%.
1H-NMR; δ (CDCl3), 7,35-7,28 (7Н, m), 6,89 (2Н, m), 5,60 (1H, m), 5,15-5,03 (2H, АВ система), 4,65-4,48 (3H, m), 3,91-3,51 (5Н, m), 1,95-1,25 (4Н, m), 1,00 (9Н, s); ESMS: +ve ион 477 [M+Na]. HPLC: RT=6,3 мин., 93% чистота.
Стадия В: 2S-амино-1-[4-(4-гидроксиметилфенокси)пиперидин-1-ил]-3,3-диметилбутан-1-он.
К раствору последнего соединения (680 мг, 1,49 ммол) в EtOH (10 мл) добавляли Pd/C (68 мг) и пропускали через полученную суспензию Н2 в течение 2 часов.
Реакционную смесь перемешивали в течение 2 часов в атмосфере Н2. Затем Pd/C фильтровали через целит. Растворитель удаляли при пониженном давлении с получением желаемого соединения с выходом 94% 1H-NMR; δ (CDCl3), 7,29-6,86 (4Н, АВ система), 4,62 (2H, s), 4,55 (1H, m), 3,82-3,58 (2H, m), 1,92-1,73 (11Н), 1,00 (9Н, s); ESMS: +ve ион 321 [М+1].
Стадия С: 3-(бензилоксиформиламино)-2R-циклопентилметил-N-{1S-[4-(4-гидроксиметилфенокси)пиперидин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}-пропионамид.
К раствору последнего соединения добавляли PFP эфир (635 мг, 1,35 ммол) и NEt3 (193 мл, 1,41 ммол). Реакционную смесь перемешивали в течение 12 часов. При пониженном давлении удаляли DMF и полученный продукт обрабатывали EtOAc, промывали водой, карбонатом натрия (1N), насыщенным водным раствором NH4Cl и соляным раствором. Объединенные органические слои высушивали над MgSO4 и удаляли растворитель при пониженном давлении. После очистки методом флэш-хроматографии получали желаемый аддукт в виде белой пены с выходом 63%. 1H-NMR; δ (CDCl3), 8,13 (0,25H, m), 7,88 (0,25H, m), 7,38 (5Н, s), 7,27 (2,5Н, m), 6,87 (2H, m), 6,32 (1H, m), 4,89 (3Н, m), 4,56 (3Н, m), 3,96 (1H, m), 3,73 (2H, m), 3,45 (1H, m), 2,60 (1H, m), 2,06-1,31 (15H, m), 1,06 (11H, m); ESMS: +ve ион 630 [M+Na]. HPLC: RT=6.31 мин, 100% чистота.
Стадия D: 2R-циклопентилметил-3-(формилгидроксиамино)-N-{1S-[4-(4-гидроксиметилфенокси)пиперидин-1-карбонил]-2,2-диметилпропил}-пропионамид.
К раствору последнего соединения (50 мг, 0,08 ммол) в МеОН (3 мл) добавляли НСО2NH4 (26 мг, 0,41 ммол) и Pd/C (5 мг). Полученную суспензию перемешивали в течение 2 часов. Pd/C отфильтровывали. Растворитель удаляли при пониженном давлении и полученный продукт обрабатывали EtOAc, промывали водой и соляным раствором. Объединенные органические слои высушивали над MgSO4 и удаляли растворитель при пониженном давлении с получением желаемого соединения с выходом 62%. 1H-NMR; δ (CDCl3), 8,39 (0,3H, m), 7,81 (0,7H, m), 7,29 (2H, dd, J1=3,47 J2=9,11), 6,89 (2Н, dd, J1=3,64 J2=8,55), 6,73 (1Н, m), 4,94 (1H, m), 4,62 (3Н, m), 4,01 (2Н, m), 3,76 (2Н, m), 3,48 (3Н, m), 2,74 (1H, m), 2,08-1,35 (19Н, m), 1,02 (13Н, m); ESMS: +ve ион 540 [M+Na], -ve ион 516 [M-1]. HPLC RT=5,49 мин, 100% чист.
Биологический пример.
Минимальные ингибирующие концентрации (MIC) соединений по изобретению в отношении Е.coli штамма DH5a (Genotype; F-j80d/acZDM15D(lacZYA-argF)U169 deoR recAl end Al hsdR17 (rk -, mk +)phoA supE441 thi-l gyrA96 relAl), полученного из GibcoBRL Life Technologies, или Staphylococcus capitis (American Type Culture Collection number 35661) определяли следующим образом. Маточные растворы каждого испытуемого соединения получали растворением соединения в диметилсульфоксиде с концентрацией 10 мМ. Для определения минимальной ингибирующей концентрации были приготовлены двукратно разбавленные серийные растворы в бульоне 2×YT (typtone 16 г/1, дрожжевой экстракт 10 г/1, хлористый натрий 5 г/1, получен от BIO 101 Inc, 1070 Joshua Way, Vista, CA92089, USA) с получением 0,05 мл среды, содержащей соединение, в лунке. Инокулы получали из культур, выращенных в течение ночи в бульоне 2×YT при 37°С. Плотность клеток регулировали до абсорбции при 660 нм (A660)=0,1; препараты со стандартизованной оптической плотностью были разбавлены 1:1000 в бульоне 2×YT; каждую лунку инокулировали 0,05 мл разбавленных бактерий. Микротитрационные планшеты инкубировали при 37°С в течение 18 часов в инкубаторе с определенной влажностью. MIC (мкМ) регистрировали как наименьшую концентрацию лекарства, ингибирующего видимый рост.
В общем соединения по примерам были более активны против грамположительных S.capitis, чем против грамотрицательных Е.coli. Результаты испытаний некоторых соединений по примерам приведены в Таблице 8.
Таблица 8 | ||
Пример № | Е.Coli MIC (мкМ) | S.capitis (мкМ) |
24 | >200, <400 | 100 |
29 | 100 | >200, <400 |
44 | 200 | 12 |
50 | 200 | 6.2 |
52 | 200 | 6.2 |
54 | 200 | 3.1 |
55 | 200 | 6.2 |
56 | 50 | 25 |
57 | 100 | 6.2 |
69 | 200 | 25 |
74 | 200 | 25 |
78 | >200, <400 | 200 |
79 | >200, <400 | 6.25 |
88 | 100 | 6.2 |
89 | 200 | 25 |
91 | 200 | 25 |
Используя вышеописанный протокол для определения величины MIC против S.capitis, установили, что в общем соединения формулы (II) по изобретению, где Q обозначает гидроксаматную группу, имеют активности, сравнимые с активностями соединений похожей структуры, где Q обозначает N-формилгидроксиламинную группу.
В другом опыте MIC соединения по Примеру 91 определяли в отношении некоторых патогенов дыхательных путей, используя Microdilution Broth Method в соответствии с одобренным стандартом National Committee for Clinical Laboratory Standards procedure (Methods for dilution antimicrobial susceptibility tests for bacteria that grow aerobically - Fourth Edition ISBN 1-56238-309-4). Результаты приведены в Таблице 9.
Таблица 9 | |
Организм | MIC (мкг/мл) |
Moraxella catarrhalis 2413 | 0,25 |
Moraxella catarrhalis 2412 | 0,5 |
Haemophilus Infuenzae 1414 | 4 |
Haemophilus Infuenzae 1390 | 1 |
Streptococcus pneumoniae (PRP) 2390 | 0,25 |
Streptococcus pneumoniae (PIP) 2391 | 0,25 |
Streptococcus pneumoniae (PSP) 2403 | 0,25 |
Claims (2)
2. Фармацевтическая или ветеринарная композиция, обладающая антибактериальной активностью, содержащая соединение по п.1 вместе с фармацевтически приемлемым или приемлемым в ветеринарии носителем.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2002106409/04A RU2269525C2 (ru) | 2000-08-10 | 2000-08-10 | Антибактериальные агенты |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
GB9918869.0 | 1999-08-10 | ||
GB9927093.6 | 1999-11-16 | ||
RU2002106409/04A RU2269525C2 (ru) | 2000-08-10 | 2000-08-10 | Антибактериальные агенты |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2002106409A RU2002106409A (ru) | 2003-09-20 |
RU2269525C2 true RU2269525C2 (ru) | 2006-02-10 |
Family
ID=36050088
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2002106409/04A RU2269525C2 (ru) | 2000-08-10 | 2000-08-10 | Антибактериальные агенты |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2269525C2 (ru) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2526511C2 (ru) * | 2007-09-25 | 2014-08-20 | Пасторал Гринхаус Гэз Рисерч Лтд | Проникающие в клетку пептиды и полипептиды для клеток микроорганизмов |
RU2733402C2 (ru) * | 2016-03-07 | 2020-10-01 | Мерк Шарп И Доум Корп. | Бициклические арильные монобактамовые соединения и способы их применения для лечения бактериальных инфекций |
-
2000
- 2000-08-10 RU RU2002106409/04A patent/RU2269525C2/ru not_active IP Right Cessation
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
BROUGHTON et al. Studies concerning the Antibiotic Actinonin. Journal of the Chemical society. PERKIN TRANSI. 1975, vol.9, pages 857-860. DELVIN JOHN P. et al. Antibiotic actinonin V. Journal of the Chemical society. PERKIN TRANSI. 1975, vol.9, pages 846-848. PENNING THOMAS D. et al. Kelatorphan and related analogs: potent and selective inhibitors of leukotriene A4 hydrolase. Bioorganic & medicinal chemistry letters. 1995, 5(21), p.2517-2522. * |
INAOKA et al. Propioxatins A and B, new enkephalinase В inhibitors. The journal of biochemistry. 1988, vol.104, p.706-711. BOUBOUTOU et al. Inhibition of porcine synovial collegenase by actinonin and derivatives. Colloque inserm. 1989, vol.174, p.341-344. INAOKA et al. Propioxatins A and B, new enkephalinase В inhibitors. The journal of antibiotics, 1986, vol.39, no 10, p.1382-1385. * |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2526511C2 (ru) * | 2007-09-25 | 2014-08-20 | Пасторал Гринхаус Гэз Рисерч Лтд | Проникающие в клетку пептиды и полипептиды для клеток микроорганизмов |
RU2733402C2 (ru) * | 2016-03-07 | 2020-10-01 | Мерк Шарп И Доум Корп. | Бициклические арильные монобактамовые соединения и способы их применения для лечения бактериальных инфекций |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US20100125075A1 (en) | Antibacterial Agents | |
US6716878B1 (en) | Antimicrobial agents | |
US6908911B1 (en) | Antibacterial agents | |
JP2001502348A (ja) | 金属タンパク質分解酵素阻害剤 | |
RU2533116C2 (ru) | Оксииндольные производные, обладающие агонистической активностью в отношении мотилинового рецептора | |
EP1165532B1 (en) | Antibacterial agents | |
RU2269525C2 (ru) | Антибактериальные агенты | |
EP1572630A1 (en) | Antibacterial agents | |
US20060089363A1 (en) | Antibacterial agents | |
US7323596B2 (en) | Antimicrobial agents | |
US6476067B1 (en) | N-formyl hydroxylamine derivatives as antibacterial agents | |
CN1330634C (zh) | 抗菌剂 | |
WO2007040289A1 (en) | Deformylase inhibitor, process for the preparation thereof, and composition comprising the same | |
KR100723539B1 (ko) | 데포르밀라제 저해제, 이의 제조방법, 및 이를 포함하는조성물 | |
RU2246941C2 (ru) | Антибактериальные агенты | |
EP1567504A1 (en) | Antibacterial agents |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20090811 |