RU2188234C2 - Method of preparing recombinant thymidine phosphorylase, recombinant plasmid dna pertpho1 and strain escherichia coli bl21(de3)/pertpho1 as producer of thymidine phosphorylase - Google Patents
Method of preparing recombinant thymidine phosphorylase, recombinant plasmid dna pertpho1 and strain escherichia coli bl21(de3)/pertpho1 as producer of thymidine phosphorylase Download PDFInfo
- Publication number
- RU2188234C2 RU2188234C2 RU2000120946A RU2000120946A RU2188234C2 RU 2188234 C2 RU2188234 C2 RU 2188234C2 RU 2000120946 A RU2000120946 A RU 2000120946A RU 2000120946 A RU2000120946 A RU 2000120946A RU 2188234 C2 RU2188234 C2 RU 2188234C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- pertpho1
- thymidine phosphorylase
- producer
- coli
- escherichia coli
- Prior art date
Links
Images
Landscapes
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Description
Изобретение относится к биотехнологии, в частности к генной и белковой инженерии. Оно включает сконструированную in vitro рекомбинантную плазмидную ДНК pERTPHO1, обусловливающую биосинтез тимидин-фосфорилазы Е. coli, штамм Е. coli BL21(DE3)/pERTPHO1 - суперпродуцент тимидин-фосфорилазы и способ получения тимидин-фосфорилазы на основе вышеуказанной рекомбинантной ДНК и штамма-продуцента. The invention relates to biotechnology, in particular to genetic and protein engineering. It includes an in vitro recombinant plasmid DNA pERTPHO1 designed for biosynthesis of E. coli thymidine phosphorylase biosynthesis, E. coli strain BL21 (DE3) / pERTPHO1, a thymidine phosphorylase superproducer and a method for producing thymidine phosphorylase based on the aforementioned recombinant DNA recombinant.
Тимидин-фосфорилаза Escherichia coli (КФ 2.4.2.4) катализирует катаболическую реакцию фосфоролиза пиримидиновых нуклеозидов в клетках Е. coli [1,2]. Она представляет собой белок с мол.массой 47,3 кДа, функционирующий в виде димера с мол. массой 94,6 кДа [1]. Ферментативная активность тимидин-фосфорилазы позволяет использовать ее в реакции трансгликозилирования при синтезе модифицированных нуклеозидов, которые находят применение в медицине в качестве терапевтических препаратов [3,4], или в качестве компонента смешанных противоопухолевых препаратов [5]. Escherichia coli thymidine phosphorylase (EC 2.4.2.4) catalyzes the catabolic phosphorolysis reaction of pyrimidine nucleosides in E. coli cells [1,2]. It is a protein with a molar mass of 47.3 kDa, functioning as a dimer with a mol. mass of 94.6 kDa [1]. The enzymatic activity of thymidine phosphorylase allows its use in the transglycosylation reaction in the synthesis of modified nucleosides, which are used in medicine as therapeutic drugs [3,4], or as a component of mixed antitumor drugs [5].
Для практических целей до последнего времени использовали главным образом ферментативную активность целых бактериальных клеток Е. coli [6], а также изолированную из Е. coli тимидин-фосфорилазу [7,8], или фермент в иммобилизованной форме [9]. For practical purposes, until recently, the enzymatic activity of whole bacterial cells of E. coli [6], as well as thymidine phosphorylase isolated from E. coli [7.8], or an enzyme in immobilized form [9], were mainly used.
Известно клонирование гена тимидин-фосфорилазы Е. coli (deoA) в плазмиде рКК-226 [7] со сравнительно невысокой эффективностью биосинтеза (до 0,4 г/л культуры). The cloning of the E. coli thymidine phosphorylase gene (deoA) in plasmid pKK-226 is known [7] with a relatively low biosynthesis efficiency (up to 0.4 g / l of culture).
Известен наиболее близкий к заявленному продуцент тимидин-фосфорилазы Е. coli с плазмидой pUTPP, позволяющий получать при индуцированном ИПТГ биосинтезе высокий выход фермента (содержание в клетках до 51% тотального белка), и способ его выделения [8]. Настоящее изобретение решает задачу получения высокопродуктивного рекомбинантного бактериального штамма-продуцента фермента, позволяющего получать рекомбинантную тимидин-фосфорилазу с высоким выходом и по упрощенной технологии. The closest to the claimed producer of thymidine phosphorylase E. coli with plasmid pUTPP is known, which allows obtaining high enzyme yield (up to 51% total protein content in cells) with IPTG-induced biosynthesis and a method for its isolation [8]. The present invention solves the problem of obtaining a highly productive recombinant bacterial strain-producer of the enzyme, allowing to obtain recombinant thymidine phosphorylase in high yield and by simplified technology.
Поставленная задача решается за счет того, что штамм-продуцент, полученный трансформацией клеток Escherichia coli плазмидной ДНК, культивируют до накопления рекомбинантной тимидин-фосфорилазы в количестве 60-70% от суммарного белка клеток, разрушают клетки в буферном растворе и отделяют растворимую фракцию. Содержание в этой фракции тимидин-фосфорилазы составляет до 80% суммарного содержания белка, который может быть использован без дополнительной очистки, либо очищен до гомогенного состояния гель-хроматографией, либо его ферментативная активность может быть повышена в условиях рефолдинга. The problem is solved due to the fact that the producer strain obtained by transformation of Escherichia coli cells with plasmid DNA is cultured to the accumulation of recombinant thymidine phosphorylase in the amount of 60-70% of the total cell protein, the cells are destroyed in the buffer solution and the soluble fraction is separated. The thymidine phosphorylase content in this fraction is up to 80% of the total protein content, which can be used without further purification, either purified to a homogeneous state by gel chromatography, or its enzymatic activity can be increased under refolding conditions.
Используют штамм-продуцент Escherichia coli BL21(DE3), содержащий плазмидную ДНК pERTPHO1 - суперпродуцент тимидин-фосфорилазы. A producer strain Escherichia coli BL21 (DE3) containing plasmid DNA pERTPHO1, a superproducer of thymidine phosphorylase, is used.
Используют рекомбинантную плазмидную ДНК pERTPHO1
- кодирующую аминокислотную последовательность тимидин-фосфорилазы Е. coli;
- имеющую молекулярную массу 2,98 МДа;
- состоящую из:
NdeI/SalI-фрагмента ДНК плазмиды рЕТ20b(+), содержащего промотор и терминатор транскрипции Т7-РНК-полимеразы, усилитель трансляции гена 10 фага Т7, ген β-лактамазы, и NdeI/SаlI-фрагмента ДНК, содержащего адаптированную к этим сайтам последовательность гена тимидин-фосфорилазы Escherichia coli;
- содержащую:
в качестве генетического маркера ген β-лактамазы, детерминирующей устойчивость трансформированных плазмидой pERTPHO1 клеток E.coli к пенициллиновым антибиотикам; уникальные сайты узнавания рестрикционных эндонуклеаз, расположенные на следующем расстоянии вправо от сайта NdeI: XbaI - 38 п.о., BglII - 96 п.о., PvuII - 741 п.о., PstI - 2288 п.о, PvuI - 2413 п.о., SalI - 4918 п.о.Use recombinant plasmid DNA pERTPHO1
- the coding amino acid sequence of thymidine phosphorylase E. coli;
- having a molecular weight of 2.98 MDa;
- consisting of:
An NdeI / SalI DNA fragment of plasmid pET20b (+) containing a promoter and terminator of transcription of T7 RNA polymerase, a translation enhancer of T7 phage 10 gene, β-lactamase gene, and an NdeI / SalI DNA fragment containing a gene sequence adapted to these sites thymidine phosphorylases of Escherichia coli;
- containing:
as a genetic marker, the β-lactamase gene determining the resistance of penicillin antibiotics transformed with plasmid pERTPHO1 to E. coli; unique recognition sites for restriction endonucleases located to the right of the NdeI site: XbaI - 38 bp, BglII - 96 bp, PvuII - 741 bp, PstI - 2288 bp, PvuI - 2413 p . o., SalI - 4918 bp
Используют штамм-продуцент Escherichia сoli BL21(DE3), содержащий рекомбинантную плазмидную ДНК pERTPHO1 - продуцент тимидин-фосфорилазы. Use the producer strain Escherichia coli BL21 (DE3) containing the recombinant plasmid DNA pERTPHO1, a producer of thymidine phosphorylase.
Предлагаемое изобретение позволяет получать рекомбинантную тимидин-фосфорилазу по простой технологии и с высоким выходом. The present invention allows to obtain recombinant thymidine phosphorylase by simple technology and in high yield.
Конструкция рекомбинантной плазмидной ДНК pERTPHO1 обеспечивает высокий уровень экспрессии клонированного в ней гена тимидин-фосфорилазы. The design of recombinant plasmid DNA pERTPHO1 provides a high level of expression of the thymidine phosphorylase gene cloned therein.
Для конструирования плазмиды использован химический подход, позволяющий использовать для экспрессии клонированного структурного гена оптимальные регуляторные элементы, контролирующие его экспрессию. A chemical approach was used to construct the plasmid, which allows the use of optimal regulatory elements that control its expression for the expression of the cloned structural gene.
Источником структурного гена тимидин-фосфорилазы служит хромосомная ДНК Е. сoli. Рекомбинантный ген выделяют с помощью ПЦР с синтетическими олигонуклеотидными праймерами и затем клонируют в векторную плазмиду рЕТ-20b. The source of the structural gene for thymidine phosphorylase is E. coli chromosomal DNA. The recombinant gene is isolated by PCR with synthetic oligonucleotide primers and then cloned into the vector plasmid pET-20b.
Предлагаемый штамм-продуцент Escherichia coli BL21(DE3)/pERTPHO1 характеризуется следующими признаками:
Морфологические признаки. Клетки палочковидной формы, грамотрицательные, неспороносные.The proposed producer strain Escherichia coli BL21 (DE3) / pERTPHO1 is characterized by the following features:
Morphological signs. The cells are rod-shaped, gram-negative, non-spore.
Культуральные признаки. Клетки хорошо растут на простых питательных средах. При росте на агаре "Дифко" - колонии круглые, гладкие, мутные, блестящие серые, край ровный. При росте на жидких средах (на минимальной среде с глюкозой или YT-бульоне) образуют интенсивную ровную муть. Cultural signs. Cells grow well on simple nutrient media. When growing on Difco agar, the colonies are round, smooth, cloudy, shiny gray, the edge is even. When growing on liquid media (on a minimal medium with glucose or YT-broth) they form an intense smooth turbidity.
Физико-биологические признаки. Клетки растут при температуре от 4oС до 40oС при оптимуме рН от 6,8 до 7,5. В качестве источника азота используют как минеральные соли в аммонийной форме, так и органические соединения в виде пептона, триптона, дрожжевого экстракта, аминокислот и т.д. В качестве источника углерода используют аминокислоты, глицерин, углеводы.Physico-biological signs. Cells grow at a temperature of from 4 o C to 40 o With an optimum pH of 6.8 to 7.5. As a source of nitrogen, both mineral salts in ammonium form and organic compounds in the form of peptone, tryptone, yeast extract, amino acids, etc. are used. Amino acids, glycerin, carbohydrates are used as a carbon source.
Устойчивость к антибиотикам. Клетки проявляют устойчивость к пенициллиновым антибиотикам (до 500 мкг/мл). Antibiotic resistance. Cells are resistant to penicillin antibiotics (up to 500 μg / ml).
Штамм-продуцент Е. сoli BL21(DE3)/pERTPHO1 отличается от штамма-реципиента Е. сoli BL21(DE3) только наличием рекомбинантной плазмидной ДНК pERTPHO1, которая и придает ему устойчивость к пенициллиновым антибиотикам. The strain producing E. coli BL21 (DE3) / pERTPHO1 differs from the recipient strain E. coli BL21 (DE3) only in the presence of recombinant plasmid DNA pERTPHO1, which gives it resistance to penicillin antibiotics.
Штаммы-продуценты получают путем трансформации компетентных клеток E. coli BL21(DE3) соответствующей рекомбинантной плазмидной ДНК. Producer strains are obtained by transformation of competent E. coli BL21 (DE3) cells with the corresponding recombinant plasmid DNA.
Клетки Е. сoli BL21(DE3)/pERTPHO1 являются суперпродуцентом тимидин-фосфорилазы. При индукции изопропилтио-β-D-галактозидом, а также и без индукции происходит эффективный биосинтез тимидин-фосфорилазы, которая накапливается в клетках в количестве более 60% суммарного белка бактерий. E. coli cells BL21 (DE3) / pERTPHO1 are a superproducer of thymidine phosphorylase. With the induction of isopropylthio-β-D-galactoside, as well as without induction, an effective biosynthesis of thymidine phosphorylase occurs, which accumulates in the cells in an amount of more than 60% of the total bacterial protein.
Штамм-продуцент депонирован во Всероссийской коллекции промышленных микроорганизмов, ВКПМ В-7976 от 25 мая 2000 г. The producer strain was deposited in the All-Russian Collection of Industrial Microorganisms, VKPM B-7976 dated May 25, 2000.
Изобретение осуществляют следующим образом. Конструируют рекомбинантную плазмидную ДНК pERTPHO1, для чего ген тимидин-фосфорилазы выделяют из хромосомной ДНК Е. coli с помощью ПЦР с синтетическими олигонуклеотидными праймерами (чертеж), содержащими сайты рестриктаз NdeI (N-конец гена, праймер А1) и SalI (С-конец гена, праймер В1), полученную ДНК расщепляют соответствующими рестриктазами и затем лигируют с расщепленной по тем же сайтам векторной плазмидой рЕТ-20b. The invention is as follows. Recombinant plasmid DNA pERTPHO1 was constructed, for which the thymidine phosphorylase gene was isolated from E. coli chromosomal DNA using PCR with synthetic oligonucleotide primers (drawing) containing NdeI restriction enzyme sites (N-terminus of the gene, primer A1) and SalI (C-terminus of the gene , primer B1), the obtained DNA was digested with the corresponding restriction enzymes and then ligated with the pET-20b vector plasmid cleaved at the same sites.
Лигазной смесью трансформируют компетентные клетки Е. coli BL21(DE3) и высевают на YT-агар, содержащий 50 мкг/мл ампициллина или другого пенициллинового антибиотика. Полученные клоны анализируют гибридизацией 32Р-мечеными олигонуклеотидами А1 и В1 (чертеж), и из гибридизующихся клонов выделяют плазмидную ДНК, которую подвергают рестриктному анализу с помощью рестриктаз NdeI и SalI. Штамм-продуцент Е. coli BL21(DE3)/pERTPHO1 выращивают в богатой среде (YT-, LB-бульон и др.) (или индуцируют изопропилтио-β-D-галактозидом, и снова выращивают) до достижения максимальной плотности культуры.The competent E. coli BL21 (DE3) cells are transformed with the ligase mixture and plated on YT agar containing 50 μg / ml ampicillin or another penicillin antibiotic. The resulting clones were analyzed by hybridization with 32 P-labeled oligonucleotides A1 and B1 (drawing), and plasmid DNA was isolated from hybridizing clones, which was subjected to restriction analysis using restriction enzymes NdeI and SalI. The E. coli producing strain BL21 (DE3) / pERTPHO1 is grown in a rich medium (YT-, LB-broth, etc.) (or isopropylthio-β-D-galactoside is induced and grown again) until the culture density is reached.
Выделение тимидин-фосфорилазы из клеток продуцента включает следующие стадии:
- разрушение выращенных клеток при помощи ультразвука;
- отделение растворимой фракции центрифугированием; содержание в этой фракции тимидин-фосфорилазы составляет до 80% суммарного содержания белка, и фермент может быть использован без дополнительной очистки;
- из растворимой фракции целевой белок может быть очищен до гомогенного состояния стандартными методами.Isolation of thymidine phosphorylase from producer cells involves the following steps:
- destruction of the grown cells using ultrasound;
- separation of the soluble fraction by centrifugation; the content of thymidine phosphorylase in this fraction is up to 80% of the total protein content, and the enzyme can be used without further purification;
- from the soluble fraction, the target protein can be purified to a homogeneous state by standard methods.
На чертеже изображена структура гена тимидин-фосфорилазы и синтетических праймеров, использованных для выделения гена с помощью ПЦР и отбора клонов путем гибридизации. The drawing shows the structure of the thymidine phosphorylase gene and synthetic primers used to isolate the gene by PCR and select clones by hybridization.
Изобретение иллюстрируется нижеследующими примерами. The invention is illustrated by the following examples.
Пример 1. Конструирование рекомбинантной плазмидной ДНК pERTPHO1
Химический синтез олигонуклеотидов выполняют твердофазным фосфоамидитным методом на ДНК-синтезаторе ASM-102U (БИОССЕТ, Новосибирск) с наращиванием олигонуклеотидной цепи в направлении от 3'-конца к 5'-концу с помощью защищенных фосфамидитов - 5'-диметокситритил-N-ацил-2'-дезоксинуклеозид-3'-O-(β-цианэтил- диизопропиламино)-фосфитов, активированных тетразолом. Синтез проводят в масштабе 0,5-0,7 мкмоль, используя в качестве носителя пористое стекло (размер пор 500 А), к которому через 3'-сукцинатную связь присоединяют первое нуклеозидное звено (нагрузка 20-30 мкмоль/г). Используют синтетический цикл, описанный в работе [10].Example 1. Construction of recombinant plasmid DNA pERTPHO1
Chemical synthesis of oligonucleotides is carried out by the solid-state phosphoamidite method on an ASM-102U DNA synthesizer (BIOSSET, Novosibirsk) with the oligonucleotide chain being expanded from the 3'-end to the 5'-end using protected phosphamidites - 5'-dimethoxytrityl-N-acyl-2 '-deoxynucleoside-3'-O- (β-cyanethyl-diisopropylamino) -phosphites activated by tetrazole. The synthesis is carried out on a scale of 0.5-0.7 μmol, using porous glass (pore size 500 A) as a support, to which the first nucleoside unit (load 20-30 μmol / g) is connected via a 3'-succinate bond. The synthetic cycle described in [10] is used.
Для приготовления вектора ДНК плазмиды рЕТ-20b (3 мкг, 1 пмоль) обрабатывают в 40 мкл буфура R (10 мМ трис-HCl, рН 8,5, 10 мМ MgCl2, 100 мМ КСl, 0,1 мг/мл BSA) рестриктазой NdeI (10 ед.акт.), а затем - в 40 мкл буфера О (50 мМ трис-HCl, рН 7,5, 10 мМ MgCl2, 100 мМ NaCl 1 мМ DTT, 0,1 мг/мл BSA) рестриктазой SalI(10 ед.акт.) в течение 1 ч при 37oС. Векторный фрагмент величиной 3,6 т.п.о. после электрофореза в 1% агарозном геле электрофоретически перемещают в слой DEAE-бумаги, затем элюируют 1М NaCl и осаждают ДНК из раствора этанолом.To prepare the vector of the plasmid pET-20b DNA (3 μg, 1 pmol), it is treated with 40 μl of Buffer R (10 mM Tris-HCl, pH 8.5, 10 mM MgCl 2 , 100 mM KCl, 0.1 mg / ml BSA) restriction enzyme NdeI (10 units), and then in 40 μl of buffer O (50 mm Tris-HCl, pH 7.5, 10 mm MgCl 2 , 100 mm NaCl 1 mm DTT, 0.1 mg / ml BSA) restriction enzyme SalI (10 units) for 1 hour at 37 ° C. A vector fragment of 3.6 kbp. after electrophoresis in a 1% agarose gel, it is electrophoretically transferred to a layer of DEAE paper, then 1M NaCl is eluted and DNA is precipitated from the solution with ethanol.
Для приготовления фрагмента гена тимидин-фосфорилазы проводят амплификацию с помощью ПЦР, используя в качестве матрицы хромосомную ДНК Е. coli (0,01 мкг в образце), а в качестве праймеров - синтетические олигонуклеотиды А1 и В1 (по 60 пмоль каждого). ПЦР проводят в ДНК-амплификаторе, в буферном растворе, содержащем каждый из четырех dNTP в концентрации 0,5 мМ и 5 ед. акт. Taq-ДНК-полимеразы, в следующем режиме: денатурация - 1 мин при 94oС, отжиг - 30 сек при 60oС, элонгация - 40 сек при 72oС, 30 циклов ПЦР. После этого реакционную смесь депротеинизируют хлороформом, упаривают досуха, остаток растворяют в 20 мкл воды, затем расщепляют теми же рестриктазами, которые использовались при приготовлении вектора, и выделяют целевой фрагмент из агарозного геля.To prepare the thymidine phosphorylase gene fragment, PCR amplification is carried out using E. coli chromosomal DNA (0.01 μg in the sample) as a template, and synthetic oligonucleotides A1 and B1 (60 pmol each) as primers. PCR is carried out in a DNA amplifier, in a buffer solution containing each of the four dNTPs at a concentration of 0.5 mM and 5 units. Act. Taq DNA polymerase, in the following mode: denaturation - 1 min at 94 ° C, annealing - 30 sec at 60 ° C, elongation - 40 sec at 72 ° C, 30 PCR cycles. After this, the reaction mixture was deproteinized with chloroform, evaporated to dryness, the residue was dissolved in 20 μl of water, then digested with the same restriction enzymes used in the preparation of the vector, and the target fragment was isolated from the agarose gel.
Полученный синтетический фрагмент с геном тимидин-фосфорилазы в количестве 2 пмоль прибавляют к раствору 1 мкг описанного выше векторного фрагмента в 10 мкл буфера (20 мМ трис-HCl, рН 7,56, 10 мМ MgCl2, 0,2 мМ rАТР, 10 мМ дитиотреит) и лигируют с помощью 10 ед.акт. Т4-ДНК-лигазы в течение 12 ч при 10oС.The resulting synthetic fragment with the thymidine phosphorylase gene in an amount of 2 pmol is added to a solution of 1 μg of the above vector fragment in 10 μl of buffer (20 mm Tris-HCl, pH 7.56, 10 mm MgCl 2 , 0.2 mm rATP, 10 mm dithiothreitis) and are ligated with 10 units of act. T4-DNA ligase for 12 hours at 10 o C.
Аликвоту реакционной смеси используют для трансформации компетентных клеток Е. coli BL21(DE3). Трансформанты высевают на чашки с YT-агаром, содержащим 50 мкг/мл ампициллина. Скрининг рекомбинантов проводят с помощью гибридизации колоний in situ с 32Р-меченым олигонуклеотидом А1 (чертеж). Из гибридизующихся клонов выделяют ДНК плазмиды pERTPHO1 и анализируют с помощью эндонуклеаз NdeI и SalI.An aliquot of the reaction mixture is used to transform competent E. coli BL21 cells (DE3). Transformants are plated on YT agar plates containing 50 μg / ml ampicillin. Recombinants are screened by in situ hybridization of the colonies with 32 P-labeled oligonucleotide A1 (Figure). The pERTPHO1 plasmid DNA was isolated from hybridizing clones and analyzed using NdeI and SalI endonucleases.
Пример 2. Получение штамма Е. coli BL21(DE3)/ pERTPHO1 (ВКПМ В-7976) - продуцента тимидин-фосфорилазы и определение его продуктивности. Example 2. Obtaining a strain of E. coli BL21 (DE3) / pERTPHO1 (VKPM B-7976) - producer of thymidine phosphorylase and determination of its productivity.
Клетки Е. сoli BL21(DE3), несущие плазмиду pERTPHO1, структура которой подтверждена данными анализа (см. пример 1), являются суперпродуцентом тимидин-фосфорилазы. E. coli BL21 (DE3) cells carrying the plasmid pERTPHO1, the structure of which is confirmed by the analysis data (see Example 1), are a superproducer of thymidine phosphorylase.
Штамм продуцента Е. coli BL21(DE3)/pERTPHO1 выращивают при 37oС в 100 мл YT-бульона (рН 7,0) с 50 мкг/мл ампициллина в течение 2 ч на качалке со скоростью вращения 190 об/мин до мутности А550 0,7-0,8, прибавляют изопропилтио-β-D-галактозид до концентрации 0,2 мМ и продолжают процесс еще 6 ч. Каждый час отбирают пробу по 2 мл, определяют А550 и количество культуры, соответствующее 1 мл с А550 1,0,центрифугируют 5 мин при 6000 об/мин. Осажденные клетки в 100 мкл лизирующего буфера с красителем бромфеноловым синим обрабатывают 20 сек ультразвуком, нагревают 3 мин при 100oС и пробы по 1 мкл используют для электрофореза в 15% SDS-ПААГ. Гель прокрашивают кумасси R-250 по стандартной методике и сканируют для определения относительного количества белка в полосе целевого белка.The producer strain E. coli BL21 (DE3) / pERTPHO1 was grown at 37 ° C. in 100 ml of YT broth (pH 7.0) with 50 μg / ml ampicillin for 2 hours on a shaker at a speed of 190 rpm until turbidity A 550 0.7-0.8, isopropylthio-β-D-galactoside is added to a concentration of 0.2 mM and the process is continued for another 6 hours. Each hour, a 2 ml sample is taken, A 550 is determined and the amount of culture corresponding to 1 ml with A 550 1.0, centrifuged for 5 minutes at 6000 rpm. Precipitated cells in 100 μl of lysing buffer with bromphenol blue dye are sonicated for 20 seconds, heated for 3 minutes at 100 ° C and 1 μl samples are used for electrophoresis in 15% SDS-PAGE. The gel was stained with Coomassie R-250 according to a standard procedure and scanned to determine the relative amount of protein in the target protein band.
Пример 3. Получение тимидин-фосфорилазы. Example 3. Obtaining thymidine phosphorylase.
Влажные клетки (10 г) суспендируют в 20 мл буфера (30 мМ Na-фосфат, рН 7,0, 5% глицерин) и разрушают ультразвуком с помощью ультразвукового дезинтегратора Sonifier 240 (Branson) (3 импульса по 20 сек при А 2,0 и 0oС). Гомогенат центрифугируют 10 мин при 10000 g и полученный супернатант с содержанием фермента до 80% от суммарного белка используют для реакции трансгликозилирования.Wet cells (10 g) are suspended in 20 ml of buffer (30 mM Na-phosphate, pH 7.0, 5% glycerol) and destroyed by ultrasound using an ultrasonic disintegrator Sonifier 240 (Branson) (3 pulses of 20 sec at A 2.0 and 0 o C). The homogenate is centrifuged for 10 min at 10,000 g and the obtained supernatant with an enzyme content of up to 80% of the total protein is used for the transglycosylation reaction.
Источники информации
1. O'Donovan G.A., Neuhard Y.// Bacteriol.Revs., 1970, v.34, p.278.Sources of information
1. O'Donovan GA, Neuhard Y. // Bacteriol. Revs., 1970, v. 34, p. 278.
2. Миронов А.С., Смирнов Ю.В., Суходолец В.В.// Генетика, 1975, т.11, с. 97. 2. Mironov A.S., Smirnov Yu.V., Sukhodolets V.V. // Genetics, 1975, v. 11, p. 97.
3. Chae W.G., Cauchon N.S., Kozlowski J.F., Chang C.//J.Org.Chem., 1992, v.57, p. 1002-1005. 3. Chae W. G., Cauchon N. S., Kozlowski J. F., Chang C. // J. Org. Chem., 1992, v. 57, p. 1002-1005.
4. Schinazi R.F., Peck A., Sommadossi J.P.// Biochem.Pharmacol., 1992, v.44, p. 199-204. 4. Schinazi R.F., Peck A., Sommadossi J.P. // Biochem. Pharmacol., 1992, v. 44, p. 199-204.
5. WO Pat. 9308273, 29.04.93. 5. WO Pat. 9308273, 04.29.93.
6. Khachatourians G. G., Brosseau J.D., Child J.J.// Biotechnol.Lett., 1982, v.4, p.735-740. 6. Khachatourians G. G., Brosseau J. D., Child J. J. // Biotechnol. Lett., 1982, v. 4, p. 735-740.
7. Barbac. III, C.F., Wong C.-H.//Bioorgan.Chem., 1991, v.l9, p.261-269. 7. Barbac. III, C.F., Wong C.-H. // Bioorgan.Chem., 1991, v.l9, p. 261-269.
8. Вейко В.П., Сипрашвили 3.3., Ратманова К.И., Гулько Л.Б., Андрюхина Р.В., Дебабов В.Г.//Биотехнология, 1994, т.4, с.2-4. 8. Veiko V.P., Siprashvili 3.3., Ratmanova K.I., Gulko LB, Andryukhina R.V., Debabov V.G. // Biotechnology, 1994, v.4, p.2-4 .
9. Гаевая Л.В., Жуков В.Н.// Прикл. Биохим. Микробиол., 1987, т.23, с. 309-316. 9. Gaevaya L.V., Zhukov V.N.//App. Biochem. Microbiol., 1987, v. 23, p. 309-316.
10. Atkinson Т., Smith M.// in: Oligonucleotide synthesis; a practical approach. 1984. Ed. Gait M.J. p.35-81. IRL Press, Oxford. 10. Atkinson, T., Smith M. // in: Oligonucleotide synthesis; a practical approach. 1984. Ed. Gait M.J. p. 35-81. IRL Press, Oxford.
Claims (3)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2000120946A RU2188234C2 (en) | 2000-08-11 | 2000-08-11 | Method of preparing recombinant thymidine phosphorylase, recombinant plasmid dna pertpho1 and strain escherichia coli bl21(de3)/pertpho1 as producer of thymidine phosphorylase |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
RU2000120946A RU2188234C2 (en) | 2000-08-11 | 2000-08-11 | Method of preparing recombinant thymidine phosphorylase, recombinant plasmid dna pertpho1 and strain escherichia coli bl21(de3)/pertpho1 as producer of thymidine phosphorylase |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2000120946A RU2000120946A (en) | 2002-08-20 |
RU2188234C2 true RU2188234C2 (en) | 2002-08-27 |
Family
ID=20238884
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2000120946A RU2188234C2 (en) | 2000-08-11 | 2000-08-11 | Method of preparing recombinant thymidine phosphorylase, recombinant plasmid dna pertpho1 and strain escherichia coli bl21(de3)/pertpho1 as producer of thymidine phosphorylase |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU2188234C2 (en) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2478708C1 (en) * | 2011-11-11 | 2013-04-10 | Учреждение Российской академии наук Институт физико-химических и биологических проблем почвоведения РАН (ИФХиБПП РАН) | RECOMBINANT PLASMID DNA pEstPc, ENCODING POLYPEPTIDE WITH PROPERTIES OF ESTERASE Psychrobacter cryohalolentis K5T, Escherichia coli BACTERIA STRAIN - PRODUCER OF POLYPEPTIDE WITH PROPERTIES OF ESTERASE Psychrobacter cryohalolentis K5T |
-
2000
- 2000-08-11 RU RU2000120946A patent/RU2188234C2/en not_active IP Right Cessation
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
ВЕЙКО В.П. и др. Клонирование и экспрессия в E. coli тимидинфосфорилазы под контролем промотора уридинфосфорилазы, Биотехнология, 1994, т. 4, с. 2-4. * |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
RU2478708C1 (en) * | 2011-11-11 | 2013-04-10 | Учреждение Российской академии наук Институт физико-химических и биологических проблем почвоведения РАН (ИФХиБПП РАН) | RECOMBINANT PLASMID DNA pEstPc, ENCODING POLYPEPTIDE WITH PROPERTIES OF ESTERASE Psychrobacter cryohalolentis K5T, Escherichia coli BACTERIA STRAIN - PRODUCER OF POLYPEPTIDE WITH PROPERTIES OF ESTERASE Psychrobacter cryohalolentis K5T |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN101240285B (en) | Cephalosporin C acrylase and its vector and application | |
CN113774036B (en) | Imine reductase mutant and application thereof | |
JP4505011B2 (en) | Enzymatic synthesis of 3'-phosphoadenosine-5'-phosphosulfate | |
JPH10229885A (en) | New alcohol/aldehyde dehydrogenase | |
KR20080067145A (en) | Inosine producing microorganism and a method of producing inosine using the same | |
KR20050074313A (en) | Cephalosporin c acylases | |
Xue et al. | Soluble expression of (+)-γ-lactamase in Bacillus subtilis for the enantioselective preparation of abacavir precursor | |
KR100244066B1 (en) | Process for producing d-n-carbamoyl-alpha-amino acid | |
CN110592037B (en) | Phenylalanine dehydrogenase for catalyzing and preparing unnatural amino acid and application thereof | |
RU2188234C2 (en) | Method of preparing recombinant thymidine phosphorylase, recombinant plasmid dna pertpho1 and strain escherichia coli bl21(de3)/pertpho1 as producer of thymidine phosphorylase | |
RU2177998C2 (en) | Method of preparing recombinant uridine phosphorylase, recombinant plasmid dna perurph01 and strain of escherichia coli bl 21(dez)/perurph01 for its realization | |
CN105950595B (en) | (-)-gamma-lactam enzyme, gene, mutant, carrier and its preparation and application | |
CN112375725B (en) | Metabolic engineering strain for producing vitamin B6 and construction method and application thereof | |
RU2179188C2 (en) | Method of producing recombinant purine nucleoside phosphory-lase, recombinant plasmid dna perpupho1 and strain escherichia coli bl21(de3)perpuho1 for its realization | |
JP4437170B2 (en) | Microorganism, lactamase enzyme obtained from the microorganism, and use thereof | |
CN114736884A (en) | Cytidine monophosphate kinase mutant and gene and application thereof | |
RU2700452C1 (en) | Recombinant plasmid dna of ptrx-tevrs-pth coding a hybrid protein capable of proteolytic splitting to form a fragment of endogenous human parathyroid hormone (1-34), an escherichia coli bl21(de3)/ptrx-tevrs-pth strain - producer of said protein and a method of producing recombinant pth (1-34) | |
CA2392463C (en) | Novel use of uridine diphosphate glucose 4-epimerase | |
RU2593172C2 (en) | RECOMBINANT PLASMID DNA pER-TA1 GyrA-AcSer CODING SERINE ACETYLTRANSFERASE CAPABLE OF in vivo ACETYLATION OF N-TERMINAL SERINE DEACETYL-THYMOSIN α1 AND HYBRID PROTEIN CAPABLE OF AUTOCATALYTIC BREAKDOWN TO FORM HUMAN THYMOSIN α1, STRAIN OF Eschrichia coli C3030/pER-TA1GyrA-AcSer PRODUCER OF SAID PROTEINS AND METHOD OF PRODUCING GENETICALLY ENGINEERED HUMAN THYMOSIN | |
RU2302465C2 (en) | METHOD FOR PRODUCTION OF HUMAN GENE ENGINEERED GLUCAGONE, RECOMBINANT PLASMIDE DNA pER-Gl, ENCODING AUTOCATALITICALLY CLEAVABLE HYBRID PROTEIN FORMING HUMAN GLUCAGONE AND STRAIN OF Escherichia coli ER-2566/pER-Gl AS PRODUCER OF SAID PROTEIN | |
KR101677755B1 (en) | Mutant alpha-amino acid ester hydrolase with enhanced productivity of amoxicillin | |
CN113462704B (en) | Biosynthetic gene cluster of plant cytokinin angustmycin, biological material of biosynthetic gene cluster and application of biosynthetic gene cluster in synthesis of angustmycin | |
RU2099421C1 (en) | Method of preparing the human recombinant interleukin-3, recombinant plasmid dna p3pteil3 encoding the human recombinant interleukin-3, strain of bacterium escherichia coli - a producer of the human recombinant interleukin-3 | |
Wen et al. | Expression, purification, and characterization of His-tagged penicillin G acylase from Kluyvera citrophila in Escherichia coli | |
KR0184755B1 (en) | Thermostable tyrosine phenol-lyase and the preparation process of l-dopa using it |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PD4A | Correction of name of patent owner | ||
QB4A | Licence on use of patent |
Free format text: LICENCE Effective date: 20131024 |
|
MM4A | The patent is invalid due to non-payment of fees |
Effective date: 20160812 |