RU2016122778A - Набор синтетических олигонуклеотидных проб для определения генотипа митохондриальной днк человека - Google Patents

Набор синтетических олигонуклеотидных проб для определения генотипа митохондриальной днк человека Download PDF

Info

Publication number
RU2016122778A
RU2016122778A RU2016122778A RU2016122778A RU2016122778A RU 2016122778 A RU2016122778 A RU 2016122778A RU 2016122778 A RU2016122778 A RU 2016122778A RU 2016122778 A RU2016122778 A RU 2016122778A RU 2016122778 A RU2016122778 A RU 2016122778A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
mitochondrial dna
human mitochondrial
synthetic oligonucleotide
determination
genotype
Prior art date
Application number
RU2016122778A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2652895C2 (ru
Inventor
Мария Владимировна Голубенко
Надежда Петровна Бабушкина
Степан Вячеславович Буйкин
Мария Евгеньевна Глушкова
Владимир Николаевич Харьков
Вадим Анатольевич Степанов
Original Assignee
Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт медицинской генетики" (НИИМГ)
Общество с ограниченной ответственностью "Геномная диагностика" (ООО "Геномная диагностика")
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт медицинской генетики" (НИИМГ), Общество с ограниченной ответственностью "Геномная диагностика" (ООО "Геномная диагностика") filed Critical Федеральное государственное бюджетное научное учреждение "Научно-исследовательский институт медицинской генетики" (НИИМГ)
Priority to RU2016122778A priority Critical patent/RU2652895C2/ru
Publication of RU2016122778A publication Critical patent/RU2016122778A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2652895C2 publication Critical patent/RU2652895C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Claims (7)

  1. Набор синтетических олигонуклеотидных проб для определения генотипа митохондриальной ДНК человека, характеризующийся тем, что данный набор позволяет определить генотип митохондриальной ДНК человека в 38 однонуклеотидных сайтах, расположенных в различных участках митохондриального генома и полиморфных в популяциях населения России различного этнического происхождения, с помощью метода ферментативного однонуклеотидного удлинения гибридизированной пробы, причем структура олигонуклеотидных проб учитывает вариабельность ДНК в близлежащих сайтах и группировку генотипируемых сайтов в 3 панели для мультиплексных реакций и имеет следующие характеристики:
  2. Панель 1:
  3. C3594T-F: 5'-CCCATACCCAACCCCCTGGT-3' G3010A-F: 5'-TCGATGTTGGATCAGGACATCCC-3' С14766T-F: 5'-GАСТСАССAATGACCCCAATACGCAAAА-3' A12308G-F: 5'-GACTCTATCCATTGGTCTTAGGCCCCAA-3' C7028T-F: 5'-GACTCGTACTACACGACACGTACTACGTTGTAGC-3' G15301A-F: 5'-GACTTCACACGATTCTTTACCTTTCACTTCATCTT-3' С12705T-F: 5'-CTCAGACCCAAACATTAATCAGTTCTTCAAATATCTACTCAT-3' A10398G-F1: 5'-TAAGTCTGGCCTATGAGTGACTACAAAAAGGATTAGACTGA-3' А10398G-F2: 5'-ТАAGTCTGGCCTATGAGTGACTACAAAAAGGATTAGACTGG-3' G13708A-R: 5'-GACTGACTGACTGACTGACTGACTCTGCGAATAGGCTTCCGGCTG-3' С10400T-R: 5'-TTAATGAGTCGАААТСATTCGTTTTGTTTAAACTATATACCAATTC-3' А13263G-R: 5'-GACTGACTGACTGACTGACTTGATGCCGATTGTAACTATTATGAGTCCTAG-3' G13368A-F: 5'-GACTGACTGACTGACTGACTGACTCAAAGCCATACTATTTATGTGCTCCGG-3'
  4. Панель 2:
  5. T16362C-R: 5'-AGGGGGGTCATCCATGGGG-3' Т16519C-F: 5'-CCGACATCTGGTTCCTACTTCAGGG-3' Т16189C-R1: 5'-GCTGTACTTGCTTGTAAGCATGGGG-3' T16189C-R2: 5'-GCTGTACTTGCTTGTAAGCATGAGG-3' G8251A-R: 5'-GACTGGGGGTGCTATAGGGTAAATACGGG-3' T16356C-R1: 5'-GACTGACTGACTGTCATCCATGGGGACGAGA-3' T16356C-R2: 5'-GACTGACTGACTGTCATCCATGGGGACGAGG-3' G11914A-R: 5'-CCTGTAAGTAGGAGAGTGATATTTGATCAGGAGAA-3' G1888A-F: 5'-GACTGACTGACTGAGGTTTCGGGGGTCTTAGCTTTGG-3' T16093C-R: 5'-GACTGACTGACTGAATGGTGGCTGGCAGTAATGTACGA-3' G709A-F: 5'-GACTGACTGACTGAGGTGATTTAGAGGGTGAACTCACTGGAA-3' Т16311C-R: 5'-GACTGACTGACTATGTGCTATGTACGGTAAATGGCTTTATGT-3' T16304C-R1: 5'-GACTGACTGACTTGCTATGTACGGTAAATGGCTTTATGTACTATGT-3' T16304C-R2: 5'-GACTGACTGACTTGCTATGTACGGTAAATGGCTTTATGTGCTATGT-3' G16129A, C-R: 5'-GACTGACTGACTGGGTTTTTATGTACTACAGGTGGTCAAGTATTTATGGTAC-3'
  6. Панель 3:
  7. 595insC-F: 5'-CCCCCCACAGTTTATGTAGCTTACCTCC-3' A3816G-F: 5'-CTCCACCCTTATCACAACACAAGA-3' A6047G-R: 5'-TGACTCGATAACGTTGTAGATGTGGTCGTTACC-3' A12672G-F: 5'-AGAATTCTCACTGTGATATATAAACTCAGACCC-3' A16162G-F: 5'-GACTGGTACCATAAATACTTGACCACCTGTAGTACAT-3' A4769G-R: 5'-GACTGACTGGGCTATTCCTAGTTTTATTGCTATAGC-3' T4336C-F: 5'-GACTGACTGACTGGAGCTTAAACCCCCTTATTTCTAGGAC-3' T14182C-R: 5'-GACTGACTGACTGTTACTGGTTGAACATTGTTTGTTGGTGT-3' C5178A-F: 5'-ACTATCTCGCACCTGAAACAAG-3' A4833G-R: 5'-CTGACTGACTGACTGACTGACTGACTGACTGACTGAAGGCCGGATGTCAGAGGGG-3' A14793G-F: 5'-GACTGACTGACTGACTGCAAAACTAACCCCCTAATAAAATTAATTAACC-3' A14233G-R: 5'-GACTGACTGACTGACTGACTGACTGACTGACTGGTGCGGGGGCTTTGTATGA-3' G4580A-F: 5'-GACTGACTGACTGACTGACTGATTTTTTACCTGAGTAGGCCTAGAAATAAACAT-3' T9090C-F: 5'-GACTGACTGACTGACTCTAGCAATATCAACCATTAACCTTCCCTC-3'
RU2016122778A 2016-06-08 2016-06-08 Набор синтетических олигонуклеотидных проб для определения генотипа митохондриальной днк человека RU2652895C2 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2016122778A RU2652895C2 (ru) 2016-06-08 2016-06-08 Набор синтетических олигонуклеотидных проб для определения генотипа митохондриальной днк человека

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2016122778A RU2652895C2 (ru) 2016-06-08 2016-06-08 Набор синтетических олигонуклеотидных проб для определения генотипа митохондриальной днк человека

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2016122778A true RU2016122778A (ru) 2017-12-13
RU2652895C2 RU2652895C2 (ru) 2018-05-03

Family

ID=60718278

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016122778A RU2652895C2 (ru) 2016-06-08 2016-06-08 Набор синтетических олигонуклеотидных проб для определения генотипа митохондриальной днк человека

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2652895C2 (ru)

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2422536C1 (ru) * 2009-10-19 2011-06-27 Российская Федерация, от имени которой выступает Федеральное Агентство по науке и инновациям НАБОР СИНТЕТИЧЕСКИХ ОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ДНК В КРОВИ И ДРУГИХ БИОМАТЕРИАЛАХ ВОЗБУДИТЕЛЯ ЛАТЕНТНОЙ ВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ - ВИРУСА Torque teno virus СЕМЕЙСТВА Circoviridae МЕТОДОМ ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ

Also Published As

Publication number Publication date
RU2652895C2 (ru) 2018-05-03

Similar Documents

Publication Publication Date Title
USD778105S1 (en) Inclined cereal bowl stand
USD961111S1 (en) Assay processing system
GB201717171D0 (en) Multiplexed analysis of nucleic acid hybridization thermodynamics using integrated arrays
ZA201807405B (en) Multiplex nucleic acid assay methods capable of detecting closely related alleles, and reagents therefor
WO2015073978A3 (en) Methods for multiplex detection of alleles associated with ophthalmic conditions
TW200619431A (en) Workpiece hanger in electroplating device
JP2011198131A5 (ru)
TWI404658B (ru)
MX2017014309A (es) Aparatos y metodos para mantenimiento, retencion y/o procesamiento de articulos de cristaleria.
CA169361S (en) Wire frame rack for dishwasher
IL286495A (en) Reducing inter-sample analysis variability in complex biological matrices
Watanabe et al. Oxytocin receptor (OXTR) gene and risk of schizophrenia: case-control and family-based analyses and meta-analysis in a Japanese population.
RU2016122778A (ru) Набор синтетических олигонуклеотидных проб для определения генотипа митохондриальной днк человека
USD745934S1 (en) Set of educational building blocks to model nucleic acid structures
IL288014A (en) Controlling inter-sample test substance variability in complex biological matrices
CA150837S (en) Clip for hanging curtains
WO2016156576A9 (en) Method of treatment using genetic predictors of a response to treatment with crhr1 antagonists
USD940992S1 (en) Glove upper
USD787085S1 (en) Head for a mixing apparatus
WO2016156575A3 (en) Genetic predictors of a response to treatment with crhr1 antagonists
CL2016000299A1 (es) Metodo para la deteccion de resistencia a piretroides en crustaceos usando secuencias oligonucleotidas utiles en la deteccion de resistencia a piretroide.
WO2016209772A3 (en) Snp arrays
Salzberg Assembly of a pan-genome from deep sequencing of 910 humans of African descent
DE602009000278D1 (de) Vorrichtung zum automatischen Geraderütteln von Postartikeln
USD742489S1 (en) Drain pan for heat exchanger

Legal Events

Date Code Title Description
HZ9A Changing address for correspondence with an applicant
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20190609

NF4A Reinstatement of patent

Effective date: 20210315