RU2014153301A - Modified biosensor for intracellular pH detection - Google Patents

Modified biosensor for intracellular pH detection Download PDF

Info

Publication number
RU2014153301A
RU2014153301A RU2014153301A RU2014153301A RU2014153301A RU 2014153301 A RU2014153301 A RU 2014153301A RU 2014153301 A RU2014153301 A RU 2014153301A RU 2014153301 A RU2014153301 A RU 2014153301A RU 2014153301 A RU2014153301 A RU 2014153301A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
cell
nucleic acid
expression
genome
biosensor
Prior art date
Application number
RU2014153301A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2603060C2 (en
Inventor
Всеволод Вадимович Белоусов
Михаил Егорович Матлашов
Елена Вадимовна Загайнова
Юлия Геннадьевна Ермакова
Сергей Анатольевич Лукьянов
Original Assignee
Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Нижегородская государственная медицинская академия" Министерства Здравоохранения Российской Федерации (ГБОУ ВПО НижГМА Минздрава России)
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Нижегородская государственная медицинская академия" Министерства Здравоохранения Российской Федерации (ГБОУ ВПО НижГМА Минздрава России) filed Critical Государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Нижегородская государственная медицинская академия" Министерства Здравоохранения Российской Федерации (ГБОУ ВПО НижГМА Минздрава России)
Priority to RU2014153301/10A priority Critical patent/RU2603060C2/en
Publication of RU2014153301A publication Critical patent/RU2014153301A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2603060C2 publication Critical patent/RU2603060C2/en

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6897—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids involving reporter genes operably linked to promoters
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

1. Нуклеиновая кислота, кодирующая флуоресцентный биосенсор для регистрации изменения рН, аминокислотная последовательность которого показана в SEQ ID No: 4.2. Кассета экспрессии, которая будучи интегрированной в геном клетки или при введении в клетку в виде внехромосомного элемента, способна обеспечить экспрессию флуоресцентного биосенсора по п. 1 под контролем регуляторных элементов, необходимых для экспрессии нуклеиновой кислоты в клетке-хозяине.3. Эукариотическая клетка, продуцирующая биосенсор, кодируемый нуклеиновой кислотой по п. 1, содержащая кассету экспрессии по п. 2 в виде внехромосомного элемента или элемента, интегрированного в геном этой клетки.4. Нуклеиновая кислота, кодирующая химерный белок, аминокислотная последовательность которого выбрана из SEQ ID NOs:6 и 8, где химерный белок включает флуоресцентный биосенсор по п. 1.5. Кассета экспрессии, которая будучи интегрированной в геном клетки или при введении в клетку в виде внехромосомного элемента, способна обеспечить экспрессию флуоресцентного биосенсора по п. 4 под контролем регуляторных элементов, необходимых для экспрессии нуклеиновой кислоты в клетке-хозяине.6. Эукариотическая клетка, продуцирующая биосенсор, кодируемый нуклеиновой кислотой по п. 4, содержащая кассету экспрессии по п. 5 в виде внехромосомного элемента или элемента, интегрированного в геном этой клетки.1. Nucleic acid encoding a fluorescent biosensor for detecting pH changes, the amino acid sequence of which is shown in SEQ ID No: 4.2. An expression cassette, which, when integrated into the cell’s genome or when introduced into the cell as an extrachromosomal element, is capable of expressing the fluorescent biosensor according to claim 1 under the control of regulatory elements necessary for expression of the nucleic acid in the host cell. 3. A eukaryotic cell producing a biosensor encoded by a nucleic acid according to claim 1, containing an expression cassette according to claim 2 in the form of an extrachromosomal element or an element integrated into the genome of this cell. A nucleic acid encoding a chimeric protein, the amino acid sequence of which is selected from SEQ ID NOs: 6 and 8, where the chimeric protein includes a fluorescent biosensor according to claim 1.5. An expression cassette, which, when integrated into the genome of a cell or when introduced into the cell as an extrachromosomal element, is capable of providing expression of the fluorescent biosensor according to claim 4 under the control of the regulatory elements necessary for expression of the nucleic acid in the host cell. 6. A eukaryotic cell producing a biosensor encoded by a nucleic acid according to claim 4, containing an expression cassette according to claim 5 in the form of an extrachromosomal element or an element integrated into the genome of this cell.

Claims (6)

1. Нуклеиновая кислота, кодирующая флуоресцентный биосенсор для регистрации изменения рН, аминокислотная последовательность которого показана в SEQ ID No: 4.1. Nucleic acid encoding a fluorescent biosensor for detecting pH changes, the amino acid sequence of which is shown in SEQ ID No: 4. 2. Кассета экспрессии, которая будучи интегрированной в геном клетки или при введении в клетку в виде внехромосомного элемента, способна обеспечить экспрессию флуоресцентного биосенсора по п. 1 под контролем регуляторных элементов, необходимых для экспрессии нуклеиновой кислоты в клетке-хозяине.2. An expression cassette, which, when integrated into the genome of a cell or when introduced into the cell as an extrachromosomal element, is capable of providing expression of the fluorescent biosensor according to claim 1 under the control of regulatory elements necessary for expression of the nucleic acid in the host cell. 3. Эукариотическая клетка, продуцирующая биосенсор, кодируемый нуклеиновой кислотой по п. 1, содержащая кассету экспрессии по п. 2 в виде внехромосомного элемента или элемента, интегрированного в геном этой клетки.3. A eukaryotic cell producing a biosensor encoded by a nucleic acid according to claim 1, containing an expression cassette according to claim 2 in the form of an extrachromosomal element or an element integrated into the genome of this cell. 4. Нуклеиновая кислота, кодирующая химерный белок, аминокислотная последовательность которого выбрана из SEQ ID NOs:6 и 8, где химерный белок включает флуоресцентный биосенсор по п. 1.4. A nucleic acid encoding a chimeric protein, the amino acid sequence of which is selected from SEQ ID NOs: 6 and 8, where the chimeric protein includes a fluorescent biosensor according to claim 1. 5. Кассета экспрессии, которая будучи интегрированной в геном клетки или при введении в клетку в виде внехромосомного элемента, способна обеспечить экспрессию флуоресцентного биосенсора по п. 4 под контролем регуляторных элементов, необходимых для экспрессии нуклеиновой кислоты в клетке-хозяине.5. An expression cassette, which, when integrated into the genome of the cell or when introduced into the cell as an extrachromosomal element, is capable of ensuring the expression of the fluorescent biosensor according to claim 4 under the control of the regulatory elements necessary for expression of the nucleic acid in the host cell. 6. Эукариотическая клетка, продуцирующая биосенсор, кодируемый нуклеиновой кислотой по п. 4, содержащая кассету экспрессии по п. 5 в виде внехромосомного элемента или элемента, интегрированного в геном этой клетки. 6. A eukaryotic cell producing a biosensor encoded by a nucleic acid according to claim 4, containing an expression cassette according to claim 5 in the form of an extrachromosomal element or an element integrated into the genome of this cell.
RU2014153301/10A 2014-12-25 2014-12-25 Modified biosensor for detecting intracellular ph RU2603060C2 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2014153301/10A RU2603060C2 (en) 2014-12-25 2014-12-25 Modified biosensor for detecting intracellular ph

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2014153301/10A RU2603060C2 (en) 2014-12-25 2014-12-25 Modified biosensor for detecting intracellular ph

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2014153301A true RU2014153301A (en) 2016-07-20
RU2603060C2 RU2603060C2 (en) 2016-11-20

Family

ID=56413252

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014153301/10A RU2603060C2 (en) 2014-12-25 2014-12-25 Modified biosensor for detecting intracellular ph

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2603060C2 (en)

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2493260C2 (en) * 2011-11-30 2013-09-20 ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ПРОФЕССИОНАЛЬНОГО ОБРАЗОВАНИЯ "НИЖЕГОРОДСКАЯ ГОСУДАРСТВЕННАЯ МЕДИЦИНСКАЯ АКАДЕМИЯ" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ И СОЦИАЛЬНОГО РАЗВИТИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ (ГБОУ ВПО "НижГМА" МИНЗДРАВСОЦРАЗВИТИЯ РОССИИ) Isolated nucleic acid coding fluorescent biosensor for detection of hydrogen peroxide, expression cassette, cell that produces biosensor, isolated fluorescent biosensor for detection of hydrogen peroxide, isolated nucleic acid that codes fluorescent biosensor, efficiently fused with nucleic acid that codes signal of intracellular localisation
RU2515903C2 (en) * 2012-03-30 2014-05-20 ГОСУДАРСТВЕННОЕ БЮДЖЕТНОЕ ОБРАЗОВАТЕЛЬНОЕ УЧРЕЖДЕНИЕ ВЫСШЕГО ПРОФЕССИОНАЛЬНОГО ОБРАЗОВАНИЯ "НИЖЕГОРОДСКАЯ ГОСУДАРСТВЕННАЯ МЕДИЦИНСКАЯ АКАДЕМИЯ" МИНИСТЕРСТВА ЗДРАВООХРАНЕНИЯ И СОЦИАЛЬНОГО РАЗВИТИЯ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ (ГБОУ ВПО "НижГМА" МИНЗДРАВСОЦРАЗВИТИЯ РОССИИ) Isolated nucleic acid coding fluorescent biosensor, expression cassette, cell, producing fluorescent biosensor, isolated fluorescent biosensor
RU2535336C1 (en) * 2013-09-24 2014-12-10 федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Московский физико-технический институт (государственный университет) Red fluorescent biosensor for detection of hydrogen peroxide in living cells

Also Published As

Publication number Publication date
RU2603060C2 (en) 2016-11-20

Similar Documents

Publication Publication Date Title
MX2020004578A (en) Casz compositions and methods of use.
PH12017501115A1 (en) Anti-myostatin antibodies, polypeptides containing variant fc regions, and method of use
MX2018007145A (en) Anti-myostatin antibodies, polypeptides containing variant fc regions, and methods of use.
EP4303314A3 (en) Polypeptide tagged nucleotides and use thereof in nucleic acid sequencing by nanopore detection
EA201891001A1 (en) VACCINES ON THE BASIS OF NUCLEIC ACIDS AGAINST WINDSHEAD VIRUS (VZV)
EP3741848A3 (en) Protease variants and polynucleotides encoding same
MX2017014125A (en) Alpha-amylase variants and polynucleotides encoding same.
MX2020013127A (en) Mutant p-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, and coding nucleic acid and use thereof.
MY193497A (en) Anti-myostatin antibodies and methods of use
EA201590488A1 (en) METHODS OF MODIFICATION OF CELL-OWNERS
EA201291024A1 (en) COMPOSITIONS OF ENDORIBONUCLEAS AND METHODS OF THEIR USE
EA201490216A1 (en) ALPHA-AMILASE VARIANTS AND THEIR POLYNUCLEOTIDE CODE
CL2013001124A1 (en) Isolated antibody or a protein comprising an antigen binding portion of an antibody directed against a cd40 polypeptide; pharmaceutical composition comprising said antibody; nucleic acid encoding the antibody; cloning vector; antibody production process.
SG10201909180SA (en) Humanized anti-c1s antibodies and methods of use thereof
MX2011007467A (en) Modular dna-binding domains and methods of use.
EA201490568A1 (en) GLUCOAMYLASE VARIANTS AND THEIR POLYNUCLEOTIDE CODE
EA201491655A1 (en) NEW FGFR3 FUSED
EA202090540A1 (en) GENE GIVING RESISTANCE TO PATHOGENIC MUSHROOM
EA201400964A1 (en) CX3CR1-BONDING POLYPEPTIDES
EA201591593A1 (en) ARTIFICIAL TRANSCRIPTION FACTORS CONSTRUCTED TO PREVENT ENDOSOMES
WO2013163590A3 (en) Gh61 polypeptide variants and polynucleotides encoding same
EA201590845A1 (en) OPTIONS FC-GAMMA-RECEPTOR IIB
RU2017102986A (en) NEW LUCIFERASES AND METHODS FOR USING THEM
NZ713602A (en) Method for refining protein including self-cutting cassette and use thereof
MX2017007105A (en) Lipase variants and polynucleotides encoding same.

Legal Events

Date Code Title Description
HZ9A Changing address for correspondence with an applicant
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20161226