Claims (29)
1. Способ определения чувствительности клеток трижды негативной опухоли к терапии противоопухолевым средством, способ включающий:1. A method for determining the sensitivity of cells of a triple negative tumor to antitumor therapy, a method comprising:
(a) лизирование клеток опухоли для получения клеточного экстракта;(a) lysing tumor cells to obtain a cell extract;
(b) определение уровня экспрессии VEGFR2, c-KIT, HER1 и/или IGF-1R в клеточном экстракте; и(b) determining the expression level of VEGFR2, c-KIT, HER1 and / or IGF-1R in the cell extract; and
(c) сравнение уровня экспрессии VEGFR2, c-KIT, HER1 и/или IGF-1R в клеточном экстракте, полученном на стадии (b) с эталонным уровнем экспрессии VEGFR2, с-K1T, HER1 и/или IGF-1R,(c) comparing the expression level of VEGFR2, c-KIT, HER1 and / or IGF-1R in the cell extract obtained in step (b) with a reference expression level of VEGFR2, c-K1T, HER1 and / or IGF-1R,
согласно которому наличие низкого уровня экспрессии VEGFR2, низкого уровня экспрессии с-K1T, высокого уровня экспрессии HER1 и/или низкого уровня экспрессии IGF-1R в клеточном экстракте по сравнению с эталонным уровнем экспрессии указывает, что клетка опухоли является чувствительной к противоопухолевому средству.according to which the presence of a low level of VEGFR2 expression, a low level of c-K1T expression, a high level of HER1 expression and / or a low level of IGF-1R expression in a cell extract compared to a reference expression level indicates that the tumor cell is sensitive to an antitumor agent.
2. Способ по п.1, согласно которому противоопухолевое средство выбирают из группы, состоящей из моноклонального антитела, тирозинкиназного ингибитора, химиотерапевтического средства, гормонального терапевтического средства, радиотерапевтического средства, вакцины и их комбинаций.2. The method according to claim 1, wherein the antitumor agent is selected from the group consisting of a monoclonal antibody, a tyrosine kinase inhibitor, a chemotherapeutic agent, a hormonal therapeutic agent, a radiotherapeutic agent, a vaccine, and combinations thereof.
3. Способ по п.1, согласно которому противоопухолевое средство представляет собой комбинацию бевацизумаба (Авастин®), карбоплатина и паклитакселя.3. The method according to claim 1, whereby the antitumor agent is a combination of bevacizumab (Avastin ® ), carboplatin and paclitaxel.
4. Способ по п.1, согласно которому уровень эталонной экспрессии вычисляют на основе стандартной кривой, полученной на линии раковых клеток.4. The method according to claim 1, according to which the level of reference expression is calculated based on a standard curve obtained on the line of cancer cells.
5. Способ по п.4, согласно которому стандартную кривую получают, исходя из множества концентраций серийно разведенного клеточного экстракта, приготовленного из линии раковых клеток.5. The method according to claim 4, according to which a standard curve is obtained based on multiple concentrations of serially diluted cell extract prepared from a cancer cell line.
6. Способ по п.1, согласно которому наличие от умеренного до высокого уровня экспрессии VEGFR2, от умеренного до высокого уровня экспрессии c-KIT, от низкого до умеренного уровня экспрессии HER1 и/или от умеренного до высокого уровня экспрессии IGF-1R в клеточном экстракте по сравнению с эталонным уровнем экспрессии указывает, что опухолевая клетка является резистентной к противоопухолевому средству.6. The method according to claim 1, whereby the presence of moderate to high levels of VEGFR2 expression, moderate to high levels of c-KIT expression, low to moderate levels of HER1 expression and / or moderate to high levels of IGF-1R expression in cellular extract compared to a reference expression level indicates that the tumor cell is resistant to the antitumor agent.
7. Способ по п.1, согласно которому способ дополнительно включает определение уровня активации VEGFR2, c-KIT, HER1, IGF-1R и/или АКТ в клеточном экстракте.7. The method according to claim 1, whereby the method further includes determining the level of activation of VEGFR2, c-KIT, HER1, IGF-1R and / or ACT in the cell extract.
8. Способ по п.1, согласно которому способ дополнительно включает определение уровня экспрессии и/или активации одной или более дополнительных молекул сигнальной трансдукции в клеточном экстракте.8. The method according to claim 1, whereby the method further includes determining the level of expression and / or activation of one or more additional signal transduction molecules in the cell extract.
9. Способ по п.8, согласно которому одну или более дополнительных молекул сигнальной трансдукции выбирают из группы, состоящей из HER2, p95HER2, HER3, HER4, РБК, АКТ, МЕК, PTEN, SGK3, 4Е-ВР1, ERK2 (MAPK1), ERK1 (MAPK3), PDK1, P70S6K, GSK-3P, She, с-МЕТ, VEGFR1, VEGFR3, димера рецептора и их комбинаций.9. The method of claim 8, wherein one or more additional signal transduction molecules are selected from the group consisting of HER2, p95HER2, HER3, HER4, RBC, ACT, MEK, PTEN, SGK3, 4E-BP1, ERK2 (MAPK1), ERK1 (MAPK3), PDK1, P70S6K, GSK-3P, She, c-MET, VEGFR1, VEGFR3, receptor dimer, and combinations thereof.
10. Способ по п.1, согласно которому опухолевая клетка представляет собой клетку рака молочной железы.10. The method according to claim 1, wherein the tumor cell is a breast cancer cell.
11. Способ по п.1, согласно которому способ дополнительно включает контактирование опухолевой клетки с противоопухолевым средством до стадии (а).11. The method according to claim 1, whereby the method further comprises contacting the tumor cell with an antitumor agent to stage (a).
12. Способ по п.1, согласно которому уровень экспрессии VEGFR2, c-KIT, HER1 и/или IGF-1R определяют с помощью двойного обнаружения «сближения».12. The method according to claim 1, whereby the expression level of VEGFR2, c-KIT, HER1 and / or IGF-1R is determined using double detection of "proximity".
13. Способ по п.12, согласно которому метод двойного обнаружения «сближения» представляет собой Совместный усиленный ферментом иммуноанализ (CEER).13. The method according to item 12, according to which the method of double detection of "proximity" is a Joint enzyme-enhanced immunoassay (CEER).
14. Способ предсказания ответа трижды негативного рака молочной железы на терапию противоопухолевым средством, способ включающий:14. A method for predicting the response of triple negative breast cancer to antitumor therapy, a method comprising:
(a) лизирование опухолевых клеток, взятых от трижды негативной опухоли молочной железы, для получения клеточного экстракта;(a) lysing tumor cells taken from a triply negative breast tumor to obtain a cell extract;
(b) определение уровня экспрессии VEGFR2, c-KIT, HER1 и/или IGF-1R в клеточном экстракте; и(b) determining the expression level of VEGFR2, c-KIT, HER1 and / or IGF-1R in the cell extract; and
(c) сравнение уровня экспрессии VEGFR2, c-KIT, HER1 и/или IGF-1R в клеточном экстракте, полученном на стадии (b), с эталонным уровнем экспрессии VEGFR2, с-K1T, HER1 и/или IGF-1R,(c) comparing the expression level of VEGFR2, c-KIT, HER1 and / or IGF-1R in the cell extract obtained in step (b) with a reference expression level of VEGFR2, c-K1T, HER1 and / or IGF-1R,
согласно которому наличие низкого уровня экспрессии VEGFR2, низкого уровня экспрессии с-K1T, высокого уровня экспрессии HER1 и/или низкого уровня экспрессии IGF-1R в клеточном экстракте по сравнению с эталонным уровнем экспрессии предсказывает ответ на терапию противоопухолевьш средством.according to which the presence of a low level of expression of VEGFR2, a low level of expression of c-K1T, a high level of expression of HER1 and / or a low level of expression of IGF-1R in a cell extract compared with a reference level of expression predicts a response to antitumor agent therapy.
15. Способ по п.14, согласно которому противоопухолевое средство выбирают из группы, состоящей из моноклонального антитела, тирозинкиназного ингибитора, химиотерапевтического средства, гормонального терапевтического средства, радиотерапевтического средства, вакцины и их комбинаций.15. The method of claim 14, wherein the antitumor agent is selected from the group consisting of a monoclonal antibody, a tyrosine kinase inhibitor, a chemotherapeutic agent, a hormonal therapeutic agent, a radiotherapeutic agent, a vaccine, and combinations thereof.
16. Способ по п.14, согласно которому противоопухолевое средство представляет собой комбинацию бевацизумаба (Авастин®), карбоплатина и паклитакселя.16. The method according to 14, according to which the antitumor agent is a combination of bevacizumab (Avastin ® ), carboplatin and paclitaxel.
17. Способ по п.14, согласно которому уровень эталонной экспрессии вычисляют исходя из стандартной кривой, полученной на линии раковых клеток.17. The method according to 14, according to which the level of reference expression is calculated based on the standard curve obtained on the line of cancer cells.
18. Способ по п.17, согласно которому стандартную кривую получают исходя из множества концентраций серийно разведенного клеточного экстракта, приготовленного из линии раковых клеток.18. The method according to 17, according to which a standard curve is obtained on the basis of multiple concentrations of serially diluted cell extract prepared from a cancer cell line.
19. Способ по п.14, согласно которому наличие от умеренного до высокого уровня экспрессии VEGFR2, от умеренного до высокого уровня экспрессии с-К1Т, от низкого до умеренного уровня экспрессии HER1 и/или от умеренного до высокого уровня экспрессии IGF-1R в клеточном экстракте предсказывает отсутствие ответа на лечение противоопухолевым средством.19. The method according to 14, according to which the presence of moderate to high levels of VEGFR2 expression, moderate to high levels of c-K1T expression, low to moderate levels of HER1 expression and / or moderate to high levels of IGF-1R expression in cellular The extract predicts a lack of response to anticancer treatment.
20. Способ по п.14, согласно которому способ дополнительно включает определение уровня активации VEGFR2, c-KIT, HER1, IGF-1R и/или АКТ в клеточном экстракте.20. The method according to 14, according to which the method further includes determining the level of activation of VEGFR2, c-KIT, HER1, IGF-1R and / or ACT in the cell extract.
21. Способ по п.14, согласно которому способ дополнительно включает определение уровня экспрессии и/или активации одной или более дополнительных молекул сигнальной трансдукции в клеточном экстракте.21. The method according to 14, according to which the method further includes determining the level of expression and / or activation of one or more additional signal transduction molecules in the cell extract.
22. Способ по п.21, согласно которому одну или более дополнительных молекул сигнальной трансдукции выбирают из группы, состоящей из HER2, p95HER2, HER3, HER4, PI3K, АКТ, МЕК, PTEN, SGK3, 4Е-ВР1, ERK2 (MAPK1), ERK1 (MAPK3), PDK1, P70S6K, GSK-3р, She, с-МЕТ, VEGFR1, VEGFR3, димера рецептора и их комбинаций.22. The method according to item 21, according to which one or more additional signal transduction molecules are selected from the group consisting of HER2, p95HER2, HER3, HER4, PI3K, ACT, MEK, PTEN, SGK3, 4E-BP1, ERK2 (MAPK1), ERK1 (MAPK3), PDK1, P70S6K, GSK-3p, She, c-MET, VEGFR1, VEGFR3, receptor dimer, and combinations thereof.
23. Способ по п.14, согласно которому наличие низкого уровня экспрессии VEGFR2 предсказывает более продолжительную выживаемость без прогрессирования (PFS).23. The method according to 14, according to which the presence of a low level of expression of VEGFR2 predicts a longer survival without progression (PFS).
24. Способ по п.14, согласно которому наличие низкого уровня экспрессии c-KIT предсказывает более продолжительную выживаемость без прогрессирования (PFS).24. The method of claim 14, wherein the presence of a low level of c-KIT expression predicts longer progression-free survival (PFS).
25. Способ по п.14, согласно которому наличие высокого уровня экспрессии HER1 предсказывает более продолжительную выживаемость без прогрессирования (PFS).25. The method according to 14, according to which the presence of a high level of expression of HER1 predicts a longer survival without progression (PFS).
26. Способ по п.14, согласно которому наличие низкого уровня экспрессии VEGFR2 в сочетании с наличием низкого уровня экспрессии c-KIT и/или высокого уровня экспрессии HER1 предсказывает более продолжительную выживаемость без прогрессирования (PFS) по сравнению с уровнем экспрессии VEGFR2, c-KIT или HER1 по отдельности.26. The method of claim 14, wherein the presence of a low level of VEGFR2 expression in combination with a low level of c-KIT expression and / or a high level of HER1 expression predicts longer progression-free survival (PFS) compared to the level of VEGFR2 expression, c- KIT or HER1 individually.
27. Способ по п.14, согласно которому способ дополнительно включает инкубирование опухолевой клетки, полученной из трижды негативного рака молочной железы, с противоопухолевым средством до стадии (а).27. The method of claim 14, wherein the method further comprises incubating the tumor cell obtained from triply negative breast cancer with an antitumor agent to step (a).
28. Способ по п.14, согласно которому уровень экспрессии VEGFR2, c-KIT, HER1 и/или IGF-1R определяют с помощью двойного обнаружения «сближения».28. The method according to 14, according to which the expression level of VEGFR2, c-KIT, HER1 and / or IGF-1R is determined using double detection of "proximity".
29. Способ по п.28, согласно которому метод двойного обнаружения «сближения» представляет собой Совместный усиленный ферментом иммуноанализ (CEER).
29. The method according to p, according to which the method of double detection of "proximity" is a joint enzyme-enhanced immunoassay (CEER).