RU2000108487A - Genes - Google Patents

Genes

Info

Publication number
RU2000108487A
RU2000108487A RU2000108487/13A RU2000108487A RU2000108487A RU 2000108487 A RU2000108487 A RU 2000108487A RU 2000108487/13 A RU2000108487/13 A RU 2000108487/13A RU 2000108487 A RU2000108487 A RU 2000108487A RU 2000108487 A RU2000108487 A RU 2000108487A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
polypeptide
sulfated fucose
polysaccharide
sequences
seq
Prior art date
Application number
RU2000108487/13A
Other languages
Russian (ru)
Other versions
RU2246539C2 (en
Inventor
Масанори ТАКАЯМА
Нобуто Кояма
Икуносин Като
Такеси Сакаи
Original Assignee
Такара Сузо Ко., Лтд.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Такара Сузо Ко., Лтд. filed Critical Такара Сузо Ко., Лтд.
Publication of RU2000108487A publication Critical patent/RU2000108487A/en
Application granted granted Critical
Publication of RU2246539C2 publication Critical patent/RU2246539C2/en

Links

Claims (10)

1. Выделенный ген, содержащий последовательность ДНК, кодирующую полипептид, который выбран из следующих полипептидов, обладающих расщепляющей активностью по отношению к полисахариду, содержащему сульфатированную фукозу, или имеющих функционально идентичную активность:1. An isolated gene containing a DNA sequence encoding a polypeptide that is selected from the following polypeptides having cleavage activity towards a polysaccharide containing sulfated fucose, or having functionally identical activity: (1) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, представленную или SEQ ID NO:l, или SEQ ID NO:2 в списке последовательностей; или полипептид, содержащий часть указанной последовательности или содержащий аминокислотную последовательность, в которой произведена по крайней мере, одна делеция, добавление, вставка или замещение в одной или нескольких из указанных последовательностей; и обладающий расщепляющей активностью по отношению к полисахариду, содержащему сульфатированную фукозу, имеющему следующие физико-химические свойства:(1) a polypeptide containing the amino acid sequence represented by either SEQ ID NO: l or SEQ ID NO: 2 in the list of sequences; or a polypeptide containing a portion of a specified sequence or containing an amino acid sequence in which at least one deletion, addition, insertion or substitution has been made in one or more of these sequences; and having cleavage activity against a polysaccharide containing sulfated fucose, having the following physicochemical properties: (а) составляющие сахариды, по существу, не содержит уроновую кислоту и(a) the constituent saccharides are essentially free of uronic acid and (б) по существу не способен расщепляться под действием фукоиданазы, продуцируемой Flavobacterium sp. SA-0082 (FERM BP-5402),(b) is essentially incapable of cleaving under the action of fucoidanase produced by Flavobacterium sp. SA-0082 (FERM BP-5402), (2) полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, представленную или SEO ID NO:3, или SEQ ID NO:4 в списке последовательностей; или полипептид, содержащий часть указанной последовательности или содержащий аминокислотную последовательность, в которой произведена, по крайней мере, одна деления, добавление, вставка или замещение в одной или нескольких из указанных последовательностей; и обладающий расщепляющей активностью по отношению к полисахариду, содержащему сульфатированную фукозу, имеющему следующие физико-химические свойства, и расщепляющий указанный полисахарид, содержащий сульфатированную фукозу, вследствие чего высвобождается, по крайней мере, одно из соединений, представленных следующими формулами [I], [II], [III] и [IV]:(2) a polypeptide containing the amino acid sequence represented by either SEO ID NO: 3 or SEQ ID NO: 4 in the list of sequences; or a polypeptide containing a portion of a specified sequence or containing an amino acid sequence in which at least one division, addition, insertion or substitution has been made in one or more of these sequences; and having cleavage activity towards a polysaccharide containing sulfated fucose, having the following physicochemical properties, and cleaving said polysaccharide containing sulfated fucose, thereby releasing at least one of the compounds represented by the following formulas [I], [II ], [III] and [IV]: (в) составляющие сахариды: содержит уроновую кислоту(c) constituent saccharides: contains uronic acid (г) способен расщепляться под действием фукоиданазы, продуцируемой Favobacterium sp. SA-0082 (FERM 8P-5402).(d) is capable of being cleaved by the action of fucoidanase produced by Favobacterium sp. SA-0082 (FERM 8P-5402).
Figure 00000001
Figure 00000001
Figure 00000002
Figure 00000002
Figure 00000003
Figure 00000003
Figure 00000004
Figure 00000004
 2. Ген по п.1, где полипептид получен из бактерий, принадлежащих к роду Alteromonas.2. The gene according to claim 1, where the polypeptide is obtained from bacteria belonging to the genus Alteromonas. 3. Ген по п.1, где полипептид получен из бактерий, принадлежащих к роду Flavobacterium.3. The gene according to claim 1, where the polypeptide is obtained from bacteria belonging to the genus Flavobacterium. 4. Ген по п.1, отличающийся тем, что содержит последовательность ДНК, представленную любой из SEQ ID NO:5 -SEQ ID NO:8 в списке последовательностей; или содержит указанную последовательность ДНК, в которой произведена, по крайней мере, одна делеция, добавление, вставка или замещение в одной или нескольких из указанных нуклеотидных последовательностей.4. The gene according to claim 1, characterized in that it contains a DNA sequence represented by any of SEQ ID NO: 5 -SEQ ID NO: 8 in the list of sequences; or contains the specified DNA sequence in which at least one deletion, addition, insertion or substitution in one or more of these nucleotide sequences has been performed. 5. Ген, отличающийся тем, что способен гибридизоваться с геном, охарактеризованным в пп.1-4, в жестких условиях и кодирует один из следующих полипептидов (1) или (2), обладающих расщепляющей активностью по отношение к полисахариду, содержащему сульфатированную фукозу:5. A gene, characterized in that it is able to hybridize with the gene described in claims 1 to 4, under stringent conditions, and encodes one of the following polypeptides (1) or (2), which have cleaving activity towards a polysaccharide containing sulfated fucose: (1) полипептид, обладающий расщепляющей активностью по отношению к полисахариду, содержащему сульфатированную фукозу, имеющему следующие физико-химические свойства:(1) a polypeptide having a cleaving activity with respect to a polysaccharide containing sulfated fucose, having the following physicochemical properties: (а) составляющие сахариды: по существу, не содержит уроновую кислоту и(a) constituent saccharides: essentially free of uronic acid and (б) по существу, не способен расщепляться под действием фукоиданазы, продуцируемой Flavobacterium sp SA-0082 (FERM BP-5402),(b) is essentially incapable of cleaving under the action of fucoidanase produced by Flavobacterium sp SA-0082 (FERM BP-5402), (2) полипептид. обладающий расщепляющей активностью который взаимодействует с полисахаридом, содержащим сульфатированную фукозу имеющему следующие физико-химические свойства, и расщепляет указанный полисахарид, содержащий сульфатированную фукозу- вследствие чего высвобождаются по крайней мере, одно из соединений, представленных следующими формулами [I], [II], [III] и [IV]:(2) a polypeptide. possessing cleavage activity which interacts with a polysaccharide containing sulfated fucose, having the following physicochemical properties, and cleaves said polysaccharide containing sulfated fucose — at least one of the compounds represented by the following formulas [I], [II], [ III] and [IV]: (в) составляющие сахариды: содержит уроновую кислоту(c) constituent saccharides: contains uronic acid (г) способен расщепляться под действием фукоиданазы, продуцируемой Flavobacterium sp. SA-0082 (FERM BP-5402).(d) is capable of being cleaved by the action of fucoidanase produced by Flavobacterium sp. SA-0082 (FERM BP-5402).
Figure 00000005
Figure 00000005
Figure 00000006
Figure 00000006
Figure 00000007
Figure 00000007
Figure 00000008
Figure 00000008
 6. Рекомбинантная ДНК, содержащая ген, охарактеризованный в любом из пп.1-5.6. Recombinant DNA containing a gene characterized in any one of claims 1 to 5. 7. Экспрессирующий вектор, где в качестве клеток-хозяев применяют микроорганизмы, животные клетки или растительные клетки, в которые внедрена рекомбинантная ДНК, охарактеризованная в п.6.7. An expression vector where microorganisms, animal cells or plant cells into which the recombinant DNA described in claim 6 has been introduced are used as host cells. 8. Трансформант, трансформированный экспрессирующим вектором, охарактеризованным в п.7.8. A transformant transformed with an expression vector described in claim 7. 9. Способ получения полипептида, обладающего расщепляющей активностью по отношению к полисахариду, содержащему сульфатированную фукозу, или полипептида, имеющего функционально идентичную активность, отличающийся тем, что культивируют трансформант, охарактеризованный в п. 8, и из продукта инкубации собирают полипептид, обладающий расщепляющей активностью по отношению к полисахариду, содержащему сульфатированную фукозу, или полипептид, имеющий функционально идентичную активность.9. A method of producing a polypeptide having cleavage activity with respect to a polysaccharide containing sulfated fucose, or a polypeptide having functionally identical activity, characterized in that the transformant described in clause 8 is cultured, and a polypeptide having cleavage activity according to with respect to a polysaccharide containing sulfated fucose, or a polypeptide having functionally identical activity. 10. Полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, представленную любой из SEQ ID NO:l - SEQ ID NO:4 в списке последовательностей; или содержащий часть указанной последовательности или содержащий аминокислотную последовательность, в которой произведена, по крайней мере, одна делеция, добавление, вставка или замещение в одной или нескольких из указанных последовательностей, и обладающий расщепляющей активностью полипептидов (1) или (2), по отношению к полисахариду, содержащему сульфатированную фукозу:10. The polypeptide having the amino acid sequence represented by any of SEQ ID NO: l - SEQ ID NO: 4 in the list of sequences; or containing part of the specified sequence or containing the amino acid sequence in which at least one deletion, addition, insertion or substitution was made in one or more of these sequences, and having the cleaving activity of polypeptides (1) or (2), in relation to sulfated fucose polysaccharide: (1) обладающий расщепляющей активностью полипептид, который расщепляет полисахарид, содержащий сульфатированную фукозу, имеющий следующие физико-химические свойства:(1) a cleavable polypeptide that cleaves a polysaccharide containing sulfated fucose, having the following physicochemical properties: (а) составляющие сахариды: по существу, не содержит уроновую кислоту и(a) constituent saccharides: essentially free of uronic acid and (б) по существу, не способен расщепляться под действием фукоиданазы, продуцируемой Flavobacterium sp. SA-0082 (FERM BP-5402).(b) is essentially incapable of cleaving under the action of fucoidanase produced by Flavobacterium sp. SA-0082 (FERM BP-5402). (2) полипептид, обладающий расщепляющей активностью, который взаимодействует с полисахаридом, содержащим сульфатированную фукозу, имеющим следующие физико-химические свойства, и расщепляет указанный полисахарид, содержащий сульфатированную фукозу, вследствие чего высвобождается, по крайней мере, одно из соединений, представленных следующими формулами [I], [II], [III] и [IV]:(2) a polypeptide having cleavage activity, which interacts with a sulfated fucose containing polysaccharide having the following physicochemical properties, and cleaves said sulfated fucose containing polysaccharide, whereby at least one of the compounds represented by the following formulas is released [ I], [II], [III] and [IV]: (в) составляющие сахариды: содержит уроновую кислоту и(c) constituent saccharides: contains uronic acid and (г) способен расщепляться под действием фукоиданазы, продуцируемой Flavobacterium sp. SA-0082 (FERM BP-5402).(d) is capable of being cleaved by the action of fucoidanase produced by Flavobacterium sp. SA-0082 (FERM BP-5402).
Figure 00000009
Figure 00000009
Figure 00000010
Figure 00000010
Figure 00000011
Figure 00000011
Figure 00000012
Figure 00000012
RU2000108487/13A 1997-09-03 1998-05-26 Polysaccharide-cleaving polypeptide comprising sulfated fucose, dna encoding its, method for its preparing, expressing vector, method for preparing transformed escherichia coli RU2246539C2 (en)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP9/252624 1997-09-03
JP25262497 1997-09-03

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2000108487A true RU2000108487A (en) 2003-07-27
RU2246539C2 RU2246539C2 (en) 2005-02-20

Family

ID=17239958

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2000108487/13A RU2246539C2 (en) 1997-09-03 1998-05-26 Polysaccharide-cleaving polypeptide comprising sulfated fucose, dna encoding its, method for its preparing, expressing vector, method for preparing transformed escherichia coli
RU2004133974/13A RU2004133974A (en) 1997-09-03 2004-11-22 A POLYEPEPTIDE Possessing Cleavage Activity Against a Polysaccharide Containing Sulphated Fucose, A Method for Its Production, Encoding Its Sequence of a Blue-Helium-Blue-Anlumine

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2004133974/13A RU2004133974A (en) 1997-09-03 2004-11-22 A POLYEPEPTIDE Possessing Cleavage Activity Against a Polysaccharide Containing Sulphated Fucose, A Method for Its Production, Encoding Its Sequence of a Blue-Helium-Blue-Anlumine

Country Status (11)

Country Link
US (1) US6489155B1 (en)
EP (2) EP1826272A3 (en)
KR (2) KR100479533B1 (en)
CN (1) CN1162544C (en)
AT (1) ATE380245T1 (en)
AU (1) AU757992B2 (en)
CA (1) CA2300797A1 (en)
DE (1) DE69838810D1 (en)
RU (2) RU2246539C2 (en)
TW (1) TW570979B (en)
WO (1) WO1999011797A1 (en)

Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2002086116A1 (en) * 2001-04-18 2002-10-31 Takara Bio Inc. Sulfated fucoglucuronomannan
EP1424396A4 (en) * 2001-09-05 2006-08-16 Takara Bio Inc Sulfated fucogalactan digesting enzyme gene
DE60202427T2 (en) * 2001-10-24 2005-12-29 Takara Bio Inc., Otsu Sulfated fucan oligosaccharide
WO2004001031A1 (en) * 2002-06-20 2003-12-31 Takara Bio Inc. Enzyme for decomposition of sulfated fucan derived from sea cucumber
ES2601577T3 (en) * 2007-03-28 2017-02-15 Syngenta Participations Ag Insecticidal proteins
US9522937B2 (en) 2007-03-28 2016-12-20 Syngenta Participations Ag Insecticidal proteins
RU2571274C2 (en) * 2013-09-24 2015-12-20 Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего профессионального образования "Воронежский государственный университет инженерных технологий" (ФГБОУ ВПО "ВГУИТ") Method for producing fucose and fucose-containing hydrolysate from brown algal biomass
CN108531470B (en) * 2017-11-01 2020-04-14 中国科学院过程工程研究所 Fucoidin lyase TFLFM and preparation method and application thereof
CN109055460B (en) * 2018-09-13 2021-06-29 青岛创通生物科技有限公司 Low molecular weight fucoidin and application thereof in preparing cosmetics

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH0662852A (en) 1992-08-21 1994-03-08 Tousa Kogaku Kenkyusho:Kk Fucoidanase
EP0870771B1 (en) * 1995-04-28 2008-11-12 Takara Bio Inc. Sugar compounds

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2206611C2 (en) DNA FRAGMENT, PLASMID VECTOR, METHOD FOR PREPARING POLYPEPTIDE AND POLYPEPTIDE ELICITING IL-1β PROTEASE ACTIVITY
KR960016560B1 (en) Polypeptide derivatives of human granulocyte colony stimulating factor and dna, plasmid , microorganism
CA2307842A1 (en) Hyaluronan synthase gene and uses thereof
CA2309133A1 (en) Nucleic acid molecules which encode proteins having fructosyl transferase activity and methods for producing long-chain inulin
RU2006101328A (en) METHOD FOR PRODUCING L-LYSINE OR L-THREONIN USING ESCHERICHIA BACTERIA HAVING ATTENUATED ACTIVITY OF MALEIN ENZYME
KR910003101A (en) DNA sequence encoding a polypeptide having β-1, 3-glucanase activity
KR920701449A (en) Α-amylase of variant microorganisms with increased stability to temperature, acid and / or alkali
IE53311B1 (en) Deoxynucleotide linkers to be attached to a cloned dna coding sequence
JP2001521757A5 (en)
AU4634396A (en) Dna sequences encoding carbohydrate polymer synthesizing enzymes and method for producing transgenic plants
AU7891498A (en) Flower organ-specific gene and its promoter sequence
AU3607695A (en) An attenuated vaccination and gene-transfer virus, a method to make the virus and a pharmaceutical composition comprisingthe virus
DE59209981D1 (en) RECOMBINANT CORE STREPTAVIDINE
RU2000108487A (en) Genes
KR970701199A (en) Growth Arrest Homeobox Gene
CA2326821A1 (en) Nucleic acid encoding hyaluronan synthase and methods of use
AU3230797A (en) Dna encoding dp. 75 and a process for its use
CA2327266A1 (en) Pesticidal toxins and nucleotide sequences which encode these toxins
CA2266421A1 (en) Genes coding for a protein having glycoside transfer activity
CA2252493A1 (en) .beta.-galactoside - .alpha. 2,6-sialyltransferase gene
KR960037830A (en) Lacto-N-biosidez gene
BR9903253A (en) Protein, dna, cell, and, processes for the production of xylitol dehydrogenase and xylitol
EP1335020A4 (en) Polypeptides having alpha-isomaltosyl transferase activity
CA2384122A1 (en) Cyclic depsipeptide synthetase and gene thereof, and mass production system for cyclic depsipeptide
RU2004133974A (en) A POLYEPEPTIDE Possessing Cleavage Activity Against a Polysaccharide Containing Sulphated Fucose, A Method for Its Production, Encoding Its Sequence of a Blue-Helium-Blue-Anlumine