RU1770358C - Method for plant nucleic acids separation by electrophoresis - Google Patents
Method for plant nucleic acids separation by electrophoresisInfo
- Publication number
- RU1770358C RU1770358C SU894754649A SU4754649A RU1770358C RU 1770358 C RU1770358 C RU 1770358C SU 894754649 A SU894754649 A SU 894754649A SU 4754649 A SU4754649 A SU 4754649A RU 1770358 C RU1770358 C RU 1770358C
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nucleic acid
- nucleic acids
- gel
- electrophoresis
- electromagnetic field
- Prior art date
Links
Landscapes
- Saccharide Compounds (AREA)
Abstract
Использование: биохими и молекул рна биологи . Сущность: с целью регулировани скорости движени фрагментов нуклеиновых кислот в электрофоретической системе, препарат перед внесением в гель обрабатывают соединением кремни , например метасиликатом натри в концентрации - М. Следствием этого вл етс уменьшение скорости движени фрагментов нуклеиновых кислот в электромагнитном поле на 20% по сравнению с контролем. 1 табл.Usage: biochemistry and molecular biology. Essence: in order to control the speed of movement of nucleic acid fragments in the electrophoretic system, the drug is treated with a silicon compound, for example, sodium metasilicate at a concentration of M, before being added to the gel. This results in a 20% decrease in the speed of movement of nucleic acid fragments in the electromagnetic field compared to control. 1 tab.
Description
Изобретение относитс к области биохимии и молекул рной биологии растений и может быть использовано в оценке исходного материала при селекции риса; в решении генно-инженерных задач: в лабораторной практике молекул рно-биологических исследований .The invention relates to the field of plant biochemistry and molecular biology and can be used in the assessment of starting material in rice selection; in solving genetic engineering problems: in the laboratory practice of molecular biological research.
Известен способ электрофореза биологических макромолекул на бумаге, в крахмальных гел х (1), в полиакриламидных гел х (2).A known method of electrophoresis of biological macromolecules on paper, in starch gels (1), in polyacrylamide gels (2).
Эти способы мало пригодны дл электрофореза нуклеиновых кислот (НК), так как не позвол ют эффективно раздел ть макромолекулы последних; в случае их использовани затруднено выделение очищенных фрагментов нуклеиновых кислот из самого гел .These methods are of little use for electrophoresis of nucleic acids (NKs), since they do not allow efficient separation of the macromolecules of the latter; if used, it is difficult to isolate purified nucleic acid fragments from the gel itself.
Известны также способы электрофоре- тического разделени нуклеиновых кислот с использованием полиакриламидно-агарозных , агаровых гелей (3), а также агарозных гелей (4).Methods for electrophoretic separation of nucleic acids using polyacrylamide-agarose, agar gels (3) as well as agarose gels (4) are also known.
Недостатками вышеуказанных способов вл ютс :The disadvantages of the above methods are:
-невозможность направленно регулировать скорость движени фрагментов нуклеиновых кислот в электрофоретической системе, котора вызвана низкой разрешающей способностью способа;- the inability to directionally control the speed of movement of nucleic acid fragments in the electrophoretic system, which is caused by the low resolution of the method;
-дополнительные затраты времени и средств, св занные с повторными и последующими операци ми по разделению близких по молекул рным характеристикам фрагментов нуклеиновых кислот.-additional costs of time and money associated with repeated and subsequent operations to separate nucleic acid fragments that are close in molecular characteristics.
Наиболее близким к предлагаемому вл етс способ электрофоретического разде- лени нуклеиновых кислот (5). заключающийс в том, что исследуемый препарат НК внос т в лунку горизонтального подводного (затопленного трис-борат- ным буфером рН 8,0) агаризованного гел (концентраци агарозы 0.9%, толщина гел 2 мм, длина 20 см), после чего на электрофо- ретическую систему при помощи источника питани воздействуют в течение 5 часовClosest to the proposed is a method for electrophoretic separation of nucleic acids (5). which consists in the fact that the studied NA preparation is introduced into the well of a horizontal underwater (flooded with Tris-borate buffer pH 8.0) agarized gel (agarose concentration 0.9%, gel thickness 2 mm, length 20 cm), followed by electrophoresis the reticulum system with a power source is exposed for 5 hours
ЁYo
VIVI
МM
ЮYU
;w; w
слcl
iOOiOO
электромагнитными полем с параметрами: сила тока - 194 мА, напр жение - 82 мВ. Затем процесс прекращают и изучают результаты на трансиллюминаторе.electromagnetic field with parameters: current strength - 194 mA, voltage - 82 mV. Then the process is stopped and the results are studied on a transilluminator.
Недостатками способа вл ютс :The disadvantages of the method are:
-низка разрешающа способность относительно фрагментов, близких по молекул рной массе;-low resolution with respect to fragments close in molecular weight;
-невозможность направленного регулировани фрагментов НК в электромагнит- ном поле;- the impossibility of directional regulation of fragments of NK in an electromagnetic field;
-дополнительные затраты времени и средств, св занных с повторными и последующими операци ми по разделению близких по молекул рным характеристикам фрагментов НК.-additional costs of time and money associated with repeated and subsequent operations to separate fragments of nanocrystals close in molecular characteristics.
Целью изобретени вл етс увеличение разрешающей способности способа за счетснижени скорости движени фрагментов нуклеиновых кислот в электромагнит- ном поле.The aim of the invention is to increase the resolution of the method by reducing the speed of movement of nucleic acid fragments in an electromagnetic field.
Поставленна цель достигаетс тем, что в известном способе электрофоретического разделени нуклеиновых кислот, заключающемс в помещении препарата НК в затоп- л емый буфером агарозный гель и воздействии на указанный преперат электромагнитным полем, перед внесением в гель препарат обрабатывают метасиликатом натри в концентрации 10 - 10This goal is achieved by the fact that in the known method of electrophoretic separation of nucleic acids, which consists in placing the NK preparation in an agarose gel flooded with a buffer and exposing the said preparation to an electromagnetic field, the drug is treated with sodium metasilicate at a concentration of 10-10 before it is introduced into the gel
М. M.
Предлагаемый способ осуществл етс следующим образом.The proposed method is carried out as follows.
Исследуемый препарат дезоксирибо- нуклеиновой кислоты (ДНК) из 12-дневных проростков риса сорта Краснодарский 424 выдерживали врастворе , 10 М, М, М, 10 М метасиликата натри , в зависимости от варианта опыта, в течение 24 часов, затем раствор ли в 8% растворе сахарозы, содержащей 0,1% бромфеноло- гового синего, вносили в лунку горизонтального подводного агарозного гел . ГельThe studied preparation of deoxyribonucleic acid (DNA) from 12-day-old rice seedlings of the Krasnodar 424 variety was kept in solution, 10 M, M, M, 10 M sodium metasilicate, depending on the experimental version, for 24 hours, then dissolved in 8% a solution of sucrose containing 0.1% bromophenol blue was added to the well of a horizontal underwater agarose gel. Gel
затоплен слоем трис-боратного буфера, рН 8,0. Концентраци агарозы в геле 0,9%, толщина гел 2 мм, длина 20 см. Затем в элек- трофоретическую систему при помощи источника питани воздействовали в течение 5 часов электромагнитным полем с параметрами: сила тока 194 мА, напр жение 82 мВ. За ходом электрофореза следили по движению бромфенолового синего. По окончании процесса гель прокрашивали в растворе этидиум бромида и просматривали на трансиллюминаторе. Результаты электролиза представлены в таблице. Как следует из приведенных данных, обработка НК ,10, 10 М раствором метасиликата натри приводит к изменению электро- форетических показателей: уменьшению пройденного пути и снижению скорости движени фрагментов НК. Это, в свою очередь , позвол ет раздел ть фрагменты НК, близкие по электрофоретическим свойствам (масса, зар д и т.д.); выдел ть из совокупности фрагментов тот, который необходим дл биохимических и генноин- женерных целей.flooded with a layer of Tris-borate buffer, pH 8.0. The agarose concentration in the gel is 0.9%, the gel thickness is 2 mm, and the length is 20 cm. Then, the electromagnetic field was applied to the electrophoretic system using a power source for 5 hours with the following parameters: current strength 194 mA, voltage 82 mV. The progress of electrophoresis was monitored by the movement of bromphenol blue. At the end of the process, the gel was stained in ethidium bromide solution and viewed on a transilluminator. The electrolysis results are presented in the table. As follows from the data presented, treatment of NK with a 10, 10 M sodium metasilicate solution leads to a change in electrophoretic parameters: a decrease in the distance traveled and a decrease in the speed of motion of NK fragments. This, in turn, allows one to separate NC fragments that are close in electrophoretic properties (mass, charge, etc.); isolate from the aggregate of fragments one that is necessary for biochemical and genetically engineered purposes.
Claims (1)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
SU894754649A RU1770358C (en) | 1989-11-01 | 1989-11-01 | Method for plant nucleic acids separation by electrophoresis |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
SU894754649A RU1770358C (en) | 1989-11-01 | 1989-11-01 | Method for plant nucleic acids separation by electrophoresis |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU1770358C true RU1770358C (en) | 1992-10-23 |
Family
ID=21477298
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
SU894754649A RU1770358C (en) | 1989-11-01 | 1989-11-01 | Method for plant nucleic acids separation by electrophoresis |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
RU (1) | RU1770358C (en) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2002044400A3 (en) * | 2000-11-28 | 2003-02-20 | Pe Corp Ny | Compositions and methods for extracting a nucleic acid |
-
1989
- 1989-11-01 RU SU894754649A patent/RU1770358C/en active
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
LKB 2012. Maxiphop Submarine Electrophoresis Unit. Laboratory Manual, LKB, Sweden. * |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2002044400A3 (en) * | 2000-11-28 | 2003-02-20 | Pe Corp Ny | Compositions and methods for extracting a nucleic acid |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Tabak et al. | A method for the recovery of DNA from agarose gels | |
Cohen et al. | Rapid separation and purification of oligonucleotides by high-performance capillary gel electrophoresis. | |
Lischwe et al. | Proteins C23 and B23 are the major nucleolar silver staining proteins | |
EP0395319B1 (en) | Process for the separation of macromolecules | |
Gaillard et al. | Ethanol precipitation of DNA with linear polyacrylamide as carrier. | |
FI84518B (en) | ANALYTICAL CHARACTERISTICS FOERFARANDE SOM ANVAENDER VAEXLANDE, TVAERGAOENDE ELFAELT OCH ELEKTROFORESANORDNING. | |
Korn et al. | The reactivation of developmentally inert 5S genes in somatic nuclei injected into Xenopus oocytes | |
EP0359589A2 (en) | Pulsed oriented electrophoresis | |
Olins et al. | Translational regulation by ribosomal protein S8 in Escherichia coli: structural homology between rRNA binding site and feedback target on mRNA | |
Eneas-Filho et al. | Pea chloroplast ribosomal proteins: characterization and site of synthesis | |
FR2392033A1 (en) | RECOMBINANT DNA TRANSFER VECTOR AND MICROORGANISM CONTAINING A GENE FROM A HIGHER ORGANISM | |
ATE293633T1 (en) | HYPOXIA-REGULATED GENES | |
RU1770358C (en) | Method for plant nucleic acids separation by electrophoresis | |
ATE449843T1 (en) | ELECTROPHORETIC SEPARATION OF NUCLEIC ACIDS FROM BIOLOGICAL SAMPLES AT LOW PH | |
Barent et al. | Two-dimensional gels: an easy method for large quantities of proteins | |
US5028308A (en) | Apparatus for the electrophoretic separation of high-molecular DNA in gel | |
Bielka et al. | Characterization of ribosomal proteins from different tissues and species of animals by electrophoresis on polyacrylamide gel | |
Zhai et al. | Aqueous two-phase electrophoresis for separation of amino acids | |
Lipps et al. | The histones of the ciliated protozoan Stylonychia mytilus | |
Friesen et al. | A transducing bacteriophage λ carrying the structural gene for elongation factor Ts | |
Belenky et al. | Sequencing of antisense DNA analogues by capillary gel electrophoresis with laser-induced fluorescence detection | |
Traub et al. | Interaction in vitro of the neurofilament triplet proteins from porcine spinal cord with natural RNA and DNA | |
Neumann et al. | Nucleosome-associated proteins and phosphoproteins of differentiating Friend erythroleukemia cells | |
Umetsu et al. | The polymorphism of desialyzed α 2 HS-glycoptein (AHS): isoelectric focusing in 2.5 M urea as a method for identification of genetic variants | |
CN112553274B (en) | Method for cutting DNA by soybean extract Bowman-Birk inhibitor |