PT97387A - Test for detection of c-myc protein - Google Patents

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PT97387A
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Robert E Kingston
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Abstract

The present invention relates to a method for detecting and classifying compounds as inhibitors of the action of c-myc protein, which detects the ability of a compound to inhibit or in some other way interfere with the formation of c-myc heterodimers. Said method involves the evaluation of the ability of said compound to alter the expression of a reporter gene in a host cell, in which the expression of said reporter gene is operationally bound to the DNA bond by said heterodimer to the sequence μE2.

Description

1 ί1 ì

CAMPO DO INVENTOFIELD OF THE INVENTION

Este invento é dirigido a métodos para a. identificação de compostos que inibem a actividade transcricional de c-myc e especificamente compostos que inibem a ligação de completos heterodiméricos de c—myc a sequências de DNA específicas.This invention is directed to methods for a. identification of compounds that inhibit c-myc transcriptional activity and specifically compounds that inhibit the binding of complete c-myc heterodimeric to specific DNA sequences.

FUNDAMENTO DO INVENTOBACKGROUND OF THE INVENTION

Pensa-se que a indução de muitos tipos de cancro seja causada pela activaçao de oncogenes celulares (Bishop, J„M,, Science 235s305-310 {1987)¾ Barbacid, M., Ann« Rev. Biochem. 56s779—827 ¢1987)¾ Cole, H.D., Ann. Rev» Benet. 20»361—384 (1986)¾ e Neinberg, R»A«, Science 23Θs770-776 (1985))« Tais oncogenes expressara oncoproteínas que residem na célula, muitas vezes localizadas num sítio específica tal como o núcleo, cito-plasma ou membrana celular. c—myc« A de txpos na cu!tu (1985)sThe induction of many types of cancer is thought to be caused by the activation of cellular oncogenes (Bishop, J., Science 235, 305-310 (1987)). Barbacid, M., Ann. Rev. Biochem. 56, 779-827 (1987)) Cole, H.D., Ann. Rev. Benet. 20, 361-384 (1986), and Neinberg, R.A., Science 23, 770-776 (1985)). Such oncogenes will express oncoproteins residing in the cell, often located at a specific site such as nucleus, cytoplasm or cell membrane. (1985) s

Por exemplo, o gene c-myc celular codifica a proteína e X pressão de grandes quantidades de c—myc numa variedade celulares permite que a s c e 1 u. 1 a s c resçam i nd e f i nxdamen te ra celular (revisto em Bishop, J.M. , Ce11 42s23-38 s"3o de c e Weinberg, R.A., Science 230s/70-776 (1985))» A expres-—myc tem sido implicada como um factor em pelo menos 10% de todos os cancros humanos. f i b ro b1astos produto do concede—1hes , H« et ai., 3®4s 602—606For example, the c-myc cell gene encodes the protein and X-pressure of large amounts of c-myc in a cell variety allows the expression of c-myc. (Reviewed in Bishop, JM, Ce11 42s23-38 s " 3rd of Weinberg, RA, Science 230s / 70-776 (1985)). Express-myc has been implicated as a factor in at least 10% of all human cancers. The title compound was prepared according to the procedure described in Examples 1 and 2,

Ainda, a super-expressão de c-myc em normais de rato, juntamente com expressão de um oncogsne ras activado, transforma os fibroblastos e a capacidade de formar tumores em animais vivos (Land Nature 3Θ4s506—60i (1983)¾ Ruley, H.E. , N-atureFurthermore, c-myc overexpression in rat normal, together with expression of an activated oncogenesis, transforms fibroblasts and the ability to form tumors in live animals (Land Nature, 1984, 506-60i) N-ature

II <1983)) rII < 1983)) r

I A função da proteína c~myc permanece desconhecida apesar da evidência que sugere possíveis- papéis na regulação da. transcrição, processamento de RNA e replicação. Estudos recentes sugerem que oncoproteínas tais como c-myc alteram a expressão de genes e imortalizam células através da regulação da actividade de promotores de genes alvo específicos e portanto a activação ou repressão da transcrição daqueles genes alvo (ver, por exemplo, Varmus H.E., Science 238s1337—1339 (1987)); Kingston. R.E. et al«, Cell 41:3-5 (1985); Bishop, J.M., Ce11 42:23-38 (1985); Weinberg, R«A«, Science 230:770—776 (19S5))·The function of c-myc protein remains unknown despite evidence suggesting possible roles in the regulation of mycoplasma. transcription, RNA processing and replication. Recent studies suggest that oncoproteins such as c-myc alter the expression of genes and immortalize cells by regulating the activity of specific target gene promoters and thus activating or repressing the transcription of those target genes (see, for example, Varmus HE, Science 238: 1337-1339 (1987)); Kingston. R.E. et al., Cell 41: 3-5 (1985); Bishop, J. M., et al., 42: 23-38 (1985); Weinberg, R.A., Science 230: 770-776 (19S5)).

Foi proposto que as proteínas c-myc sejam proteínas de ligação a DNA específicas de sequências,. No entanto, foram divulgadas apenas interseções inespecíficas com DNA para c-myc e par-a N-myc. (Donner, P. et al., Nature 296:262-265 (1982); Persson, H» et al,, Science 225:718-721 (1984); Ramsay, 6. et al., Proc. Natl. Acad, Sei, USA 81: 7742-7746 (1984); Ikegaki, N. et al,, Proc, Natl. Acad, Sei, USA 83:5929-5933 (1986)).It has been proposed that c-myc proteins are sequence-specific DNA binding proteins. However, only nonspecific intersections with c-myc and par-N-myc DNA were reported. (Donner, P. et al., Nature 296: 262-265 (1982); Persson, H. et al., Science 225: 718-721 (1984); Ramsay, 6. et al., Proc Natl Acad , Sei, USA 81: 7742-7746 (1984); Ikegaki, N. et al., Proc., Natl Acad, Sci, USA 83: 5929-5933 (1986)).

As cadeias pesadas de imunoglobulina contêm sítios específicos potenciadores de ligação a proteínas conhecidos como motivos E. Os motivos E são geralmente variantes da sequência consensus 5J—CASSTBBC-35. Por exemplo, o motivo μΕΙ é STCAA0ATGGC, o motiva μΕ2 é AGCAGCT8SC, a motivo μ£3 é STCATGTGB, μΕ5 é TBBCABGTGT (Murre, C. et al., Cell 56:777-783 (1989). Num artigo não foi encontrada ligação de W-myc a qualquer uma das sequências de caixas E (Murre, C, et al,, Cell 56:777-783 (1989)), serImmunoglobulin heavy chains contain specific binding sites known as E motifs. E motifs are generally variants of the consensus sequence 5J-CASSTBBC-35. For example, the motif μΕΙ is STCAA0ATGGC, the motif μΕ2 is AGCAGCT8SC, the μβ motif is STCATGTGB, μΕ5 is TBBCABGTGT (Murre, C. et al., Cell 56: 777-783 (1989)). W-myc binding to any of the E-box sequences (Murre, C, et al., Cell 56: 777-783 (1989)), to be

Assim, se bem* que se seja desejável identificar compostos que inibem a actividade da oncoproteína c-myc, tal não foi até agora possível. Através da inibição da actividade c-myc, pode - conseguida inibição e/ou controle do crescimento celular induzido por c-myc» A administração de tais inibidores proporcio-naré benefícios terapêuticos no tratamento de doenças em que a eKpressão e actividade de c-myc é um factor na promoção do crescimento celular ou na manutenção das células num estado transformado.Thus, while it is desirable to identify compounds that inhibit c-myc oncoprotein activity, this has not been possible so far. By inhibiting c-myc activity, inhibition and / or control of c-myc-induced cell growth can be achieved. Administration of such inhibitors will provide therapeutic benefits in the treatment of diseases in which e -pression and c-myc activity is a factor in promoting cell growth or maintaining the cells in a transformed state.

No entanto até à data não foram identificados quaisquer inibidores de c-myc. A identificação de tais inibidores sofreu pela ausência de identificação de uma sequência de ligação a DNA específica à qual se liga c-myc e pela ausência de um ensaio de detecção barato e reprodutível que pudesse rapidamente identificar potenciais inibidores e seus derivados activados.However to date no c-myc inhibitors have been identified. The identification of such inhibitors was due to the absence of identification of a specific DNA binding sequence to which c-myc binds and the absence of an inexpensive and reproducible detection assay that could readily identify potential inhibitors and their activated derivatives.

Persiste assim a necessidade de ensaios de detecção rápidos e económicos que identifiquem inibidores específicos da actividade de c-myc.There remains a need for rapid and inexpensive detection assays that identify specific inhibitors of c-myc activity.

SUMÁRIO DO INVENTO 0 reconhecimento da potencial importância dos inibidores da actividade da ancoproteina c-myc no tratamento terapêutico de muitas formas de cancro e sabendo da ausência de um sistema de ensaio simples em que tais inibidores possam ser identificados, os presentes inventores investigaram a ligação de c-myc a DNA. Estes estudos resultaram na descoberta de que c-myc, quando na forma de heterodímero, liga-se especialmente â sequência μΕ2 A8CABCT68C e não a qualquer outro motivo E« Os homodímeros de c-myc não se ligam ao motivo μΕ2.SUMMARY OF THE INVENTION Recognizing the potential importance of inhibitors of c-myc anoprotein activity in the therapeutic treatment of many forms of cancer and knowing of the absence of a simple assay system in which such inhibitors can be identified, the present inventors have investigated the binding of c-myc to DNA. These studies have led to the discovery that c-myc, when in the form of a heterodimer, binds especially to the sequence μΕ2 A8CABCT68C and not to any other motif E 'The c-myc homodimers do not bind to the motif μΕ2.

Estes esforços tornaram possível a identificação de um ensaio simples, rápido e pouco dispendioso para a detecção de compostos que interferem com a capacidade dos heterodímeros c-myc para se ligarem a sequências de DMA especificas e portanto inibem a actividade transcricional da oncoproteína c~myc. 0 invento proporciona um método reprodutível e preciso para classificar objectivamente compostos,, incluindo compostos farmacêuticos humanos, coroo um inibidor da actividade c-rayc. 0 invento ainda proporciona um método para identificação e classificação do mecanismo de acção de um composto bio--activo inibidor de c-myc. 0 invento proporciona ainda um ensaia para o controle do isolamento e/ou purificação de um composto inibidor de c-myc ou misturas de tais compostos a partir de uma preparação bruta.These efforts have made it possible to identify a simple, rapid and inexpensive assay for the detection of compounds that interfere with the ability of the c-myc heterodimers to bind to specific DMA sequences and thus inhibit the transcriptional activity of the c-myc oncoprotein. The invention provides a reproducible and precise method for objectively classifying compounds, including human pharmaceutical compounds, as an inhibitor of c-rayc activity. The invention further provides a method for identifying and classifying the mechanism of action of a bio-active c-myc inhibitor compound. The invention further provides an assay for the control of the isolation and / or purification of a c-myc inhibitor compound or mixtures of such compounds from a crude preparation.

DESCRIcao DAS REALIZAÇÕES PREFERIDASDESCRIPTION OF THE PREFERRED EMBODIMENTS

Na descrição que se segue, são extensivaments usadas uma série de termos usados em tecnologia de DNA recombinante. Para proporcionar uma compreensão mais clara e consistente da especificação e reivindicações, incluindo o 'âmbito de tais termos, são proporcionadas as definições que se seguem,In the following description, a number of terms used in recombinant DNA technology are extensively used. To provide a clearer and more consistent understanding of the specification and claims, including the scope of such terms, the following definitions are provided,

Ligado ooeracionalmente» Como aqui ê usado, dois elementos macramoleculares estão ligados operacionalmente quando os dois elementos macromoleculares estão fisicamente arranjados de tal modo que os factares que influenciam a actividade do primeiro elemento fasem com que o primeiro elemento induza um efeito no segundo elemento. Por exemplo, a. transcrição de uma sequência codificadora qu.e está operacionalmente ligada a um elemento promotor é induzida por fac tares que "activam" a actividade do promotor? transcrição de uma sequência codificadora que está operacianalmente ligada a um elemento promotor é inibida porAs used herein, two macromolecular elements are operatively linked when the two macromolecular elements are physically arranged such that the features influencing the activity of the first element cause the first element to induce an effect on the second element. For example, a. transcription of a coding sequence which is operably linked to a promoter element is induced by facets which " the activity of the promoter? transcription of a coding sequence that is operably linked to a promoter element is inhibited by

LuTiS f actares que "reprimem" a actividade do promotor» Assim, região do promotor estará operacionalmente ligada a uma sequência codificadora de uma proteína se a transcrição da actividade da sequência codificadora for influenciada pela actividade do promotor.LuTiS acts that " repress " promoter activity. Thus, the promoter region will be operably linked to a coding sequence of a protein if the transcription of the activity of the coding sequence is influenced by the activity of the promoter.

Resposta. Como aqui é usado, o termo "resposta" desti-na~se a referir uma alteração em qualquer parâmetro que possa ser usado para medir, indicar ou de outra forma descrever a ligação do heterodímero c-myc à sequência de DMA μΕ2. A resposta pode ser evelada como uma alteração física (como seja uma alteração no fenótipo) ou pode ser revelada como uma alteração molecular (como seja uma alteração numa velocidade de reacção ou constante de afinidade). A detecção da resposta pode ser realizada por meios adequados.Answer. As used herein, the term " response " it is intended to refer to a change in any parameter that can be used to measure, indicate or otherwise describe the binding of the c-myc heterodimer to the DMA sequence μΕ2. The response may be elucidated as a physical change (such as a change in phenotype) or may be revealed as a molecular change (such as a change in a reaction rate or affinity constant). Detection of the response can be performed by suitable means.

Composto. 0 termo "composto" destina-se a referir uma entidade química, na fase sólida, líquida ou gasosa. 0 termo deverá ser lido para incluir compostos sintéticos, produtos naturais e entidades macromoleculares tais como polipeptídeos, polinucleótidos ou lípidos e também entidades pequenas tias como neurotransmissores, ligandos, hormonas ou compostos elementares.Compound. The term " compound " is intended to refer to a chemical entity in the solid, liquid or gaseous phase. The term should be read to include synthetic compounds, natural products and macromolecular entities such as polypeptides, polynucleotides or lipids and also small entities such as neurotransmitters, ligands, hormones or elemental compounds.

Composta bioac tiva. 0 termo "composto bioactivo" destina-se a referir qualquer composto que induza uma resposta detectável ou mensurável nos métodos do invento.Composed of bioactives. The term " bioactive compound " is intended to refer to any compound which induces a detectable or measurable response in the methods of the invention.

PromotorUm "promotor" é uma sequência de DNA localizada perto do inicio da transcrição no estremo S·" da sequência transcrita. 0 promotor pode contar múltiplos elementos reguladores que interactuam na modulação da transcrição do gene operacio-nalmente ligado. s rPromoterA " promoter " is a DNA sequence located near the start of the S-terminal transcript " of the transcribed sequence. The promoter can count on multiple regulatory elements that interact in the modulation of transcription of the operably linked gene. s r

Empressãoπ A expressão é um processo pelo qual a informação codificada dentro de um gene é revelada. Se o gene codificar uma proteína? a expressão envolve transcrição do DNA em mRNA, o processamento do mRNA (se necessário) num produto mRNA maduro e tradução do mRNA maduro em proteína.Empression A Expression is a process by which information encoded within a gene is revealed. If the gene encodes a protein? the expression involves transcription of the mRNA into DNA, processing of the mRNA (if necessary) into a mature mRNA product and translation of the mature mRNA into protein.

Uma molécula de ácido nucleico como seja um DNA ou gen é referido coma "sendo capas de expressar" um polipeptídeo se o DNA possuir as sequências codificadoras do polipeptídeo e sequências de controle da expressão que? no ambiente do hospedeiro adequado, proporciona a capacidade para transcrever, processar e traduzir a informação genética contida no DNA num produto proteico e se tais sequências de controle da expressão estiverem operacionalmente ligadas à sequência de nucieátidos que codificam o po1i pept ídeo.A nucleic acid molecule such as a DNA or gene is referred to as " expressing layers " a polypeptide if the DNA has the polypeptide coding sequences and expression control sequences which? in the environment of the appropriate host provides the ability to transcribe, process and translate the genetic information contained in the DNA into a protein product and if such expression control sequences are operably linked to the nucleotide sequence encoding the peptide.

Veículo de clonagem,, Um "veículo ds clonagem" é qualquer entidade molecular que é capaz de libertar uma sequência de ácido nucleico numa célula hospedeira para fins de clonagem» Exemplos de veículos de clonagem incluem plasmídeos ou genomas de •fagos» Um plasmídea que se pode replicar autonomamente na célula hospedeira é especial menta pretendido. Como alternativa, u.ma molécula de ácido nucleico que pode ser inserida no DNA cromossá-mico da célula hospedeira é especialmente útil.Cloning vehicle, A " cloning vehicle " is any molecular entity that is capable of releasing a nucleic acid sequence in a host cell for cloning purposes. Examples of cloning vehicles include plasmids or phage genomes. A plasmid that can be replicated autonomously in the host cell is especially desired mint. Alternatively, a nucleic acid molecule that can be inserted into the host cell's chromosomal DNA is especially useful.

Os veículos de clonagem são muitas vezes caracterizados por um ou número pequeno de de sítios de reconhecimento por endonucleases nos quais tais sequências de DNA podem ser cortadas de uma determinada forma sem perda de uma função biológica essencial do veículo e no qual o DNA se pode inserir para ser replicado e clonado. -- 3 0 veículo de clonagers pode ainda conter tuna marca adequada para usar na identificação de células transformadas com o veículo de tetraciclina c 1 onageni» As marcas são, por exempla, ou è. ampicilina. A palavra "vector” é resistência ã algumas vezes usada para 1 "veículo de clonagem"»Cloning vehicles are often characterized by one or a small number of endonuclease recognition sites in which such DNA sequences can be cut in a certain way without loss of an essential biological function of the carrier and in which the DNA can be inserted to be replicated and cloned. The carrier vehicle may further contain a label suitable for use in identifying cells transformed with the tetracycline carrier. The tags are, for example, or è. ampicillin. The word " vector " is resistance sometimes used for " cloning vehicle "

Veículo de expressão. Um "veículo de expressão" é um veículo ou vector semelhante a um vector de clonaqem mas destina--se especia Intente a proporcionar sequências capazes de expressar o qene clonado após transformação num hospedeiro.Expression vehicle. An " expression vehicle " is a vehicle or vector similar to a clone vector but is intended to provide sequences capable of expressing the cloned qene after transformation into a host.

Num veículo de expressão, o gene a ser clonado está geralmente operacionalmente ligado a certas sequências de controle tais como sequências de promotor. As sequências de controle da expressão variarão dependendo se o vector se destina a expressar o gene operacionalmente ligado num hospedeiro procariótico ou eucariótico e pode adicionalmente conter elementos da transcrição tais como elementos potsnciadores, sequências de terminação, elementos específicos de tecidos e/ou sítios de iniciação e terminação da tradução»In an expression vehicle, the gene to be cloned is generally operably linked to certain control sequences such as promoter sequences. Expression control sequences will vary depending on whether the vector is intended to express the operably linked gene in a prokaryotic or eukaryotic host and may additionally contain transcription elements such as potentiating elements, termination sequences, tissue specific elements and / or initiation sites and termination of translation »

Hospedeiro.. Por "hospedeiro” pretende—se significar qualquer organismo que é o recipiente de um veículo de clonaqem ou expressão»Host. By " host " is meant any organism which is the recipient of a cloning or expression vehicle.

Nos hospedeiros do invento, foram utilizadas pelo menos duas construções genéticas» Primeiro urna construção recombinante ) capaz de expressar c—myc, e segundo um qene repórter cuja expressão está operacional mente ligada ao heterodírnero c—myc que se liga à sequência μΕ2. Caso se pretenda pode também usar-se uma construção recombinante capaz de expressar uma proteína parceira de c-myc . 9In the hosts of the invention, at least two genetic constructs have been used. First is a recombinant construct) capable of expressing c-myc, and according to a reporter whose expression is operably linked to the c-myc heterodimer that binds to the sequence μΕ2. If desired, a recombinant construct capable of expressing a c-myc partner protein may also be used. 9

As construções que são capazes de expressar a proteína c-myc podem ser construídas utilizando as directrizes descritas abaixo ou adquiridas comercialmente. A sequência do motivo pE2 pode ser operacionalmente ligada a qualquer gene que confira uma marca seleccionável em levedura. Numa realização preferida usa-se um qsne de uma marca que permita a selecçlo fenotípica em Baccharomvces cerevisiae.Constructs that are capable of expressing c-myc protein can be constructed using the guidelines described below or commercially acquired. The pE2 motif sequence may be operably linked to any gene which confers a yeast selectable marker. In a preferred embodiment a labeling is used which allows for phenotypic selection in Baccharomvces cerevisiae.

A levedura que pode ser cotransforroada com um gene c-myc e com a sequência de ligação a μΕΞ pode ser usada para (1) identificar a presença ou ausência de proteínas endógenas do hospedeiro que interactuam com c-myc de forma a que permita a sua ligação è sequência μΕ2? {2) classificar uma proteína como uma proteína parceira de c-myc? e <3> identificar ε classificar compostos como agentes que destroem a formação de heterodímeros entre c-myc e os seus parceiros proteicos. >Yeast that can be co-transfected with a c-myc gene and the binding sequence at μΕΞ can be used to (1) identify the presence or absence of host endogenous proteins that interact with c-myc in a manner that allows their connection è sequence μΕ2? (2) classify a protein as a c-myc partner protein? and < 3 > identify ε classify compounds as agents that destroy the formation of heterodimers between c-myc and its protein partners. >

As três aplicações baseiam-se no mesmo princípios na presença de uma proteína parceira de c-myc, forma-se um complexo de c-myc e a proteína parceira. 0 compleKO de c-myc com o seu parceira liga-se ao seu motivo μΕ2 e a expressão do gene da marca será alterada. Na ausência da proteína parceira de c—myc, não se dá a formação do complexo -de heterodímero ε a expressão da proteína da marca não será alterada. A proteína parceira pode ligar-se endogenamente à sequência μ.Ε2 mesmo na ausência de c-myc. No entanto, quando c-myc está presente na célula, a quantidade e força da ligação do heterodímero c—myc proteína parceira é aumentada e a força da ligação a μΕ2 é maior. 10 10All three applications are based on the same principles in the presence of a c-myc partner protein, a c-myc complex and the partner protein are formed. The complement of c-myc with its partner binds to its motif μΕ2 and the expression of the brand gene will be changed. In the absence of the c-myc partner protein, the formation of the ε-heterodimer complex does not occur, the expression of the tag protein will not be altered. The partner protein can bind endogenously to the μ.Ε2 sequence even in the absence of c-myc. However, when c-myc is present in the cell, the amount and strength of binding of the c-myc heterodimer partner protein is increased and the binding strength at μΕ2 is greater. 10 10

Hospedeiras que têm sida catransfarmadas com um gene c-myc expressável e com uma sequência de ligação a μΕ2 podem ser usadas para identificar a presença ou ausência de proteínas endógenas do hospedeiro que interactuam com c—myc de forma a permitir que c—myc se ligue à sequência μΕ2 se a expressão de c-myc em tais hospedeiros for suficientemente baixa para que as moles de c-myc que são expressas não se sobreponham às moles da proteína parceira que está endógena na célula» Se tais análises revelarem que o hospedeiro contem proteínas de ligação a c-myc que induzam a ligação do heterodímero de c—myc à sequência μΕ2, tal proteína parceira poderá ser isolada usando técnicas conhecidas como sejam análise da alteração de mobilidade em gel, vecto-res de cloagme e expressão de cDNA tais como por exempla, lambda gil'3 e lambda gtil, ou outros sistemas de clonagem e expressão de cDNA de tamanho completo em levedura tais como, por exemplo, pBi e pTRPSó, todos eles podendo ser adquiridos comercialmente (Clontech, Pala Alta, Califórnia). NSo é necessário que o hospedeiro seja completamente deficiente nas proteínas parceiras de c-myc para serem úteis no método do invento. Como descrito abaixo, se c—myc for expresso em níveis muito superiores aos encontrados no hospedeiro, a transcrição do gene repórter a partir de proteínas parceiras endógenas pode ser neglígivel ou em quantidades tão baixas que não inviabilize a utilidade dos métodos do invento.Hosts who have AIDS transfused with an expressible c-myc gene and a binding sequence to μΕ2 can be used to identify the presence or absence of host endogenous proteins that interact with c-myc in order to allow c-myc to bind to the sequence μΕ2 if the expression of c-myc in such hosts is sufficiently low so that the moles of c-myc that are expressed do not overlap the moles of the partner protein that is endogenous in the cell. If such analyzes reveal that the host contains proteins c-myc binding sites that induce binding of the c-myc heterodimer to the μΕ2 sequence, such a partner protein may be isolated using techniques known as gel mobility alteration analysis, cloacal vectors and cDNA expression such as for example, lambda gil'3 and lambda gtil, or other full-length cDNA cloning and expression systems in yeast such as, for example, pBi and pTRP Only, all of them can be purchased commercially (Clontech, Pala Alta, California). It is not necessary for the host to be completely deficient in the c-myc partner proteins to be useful in the method of the invention. As described below, if c-myc is expressed at levels much higher than those found in the host, transcription of the reporter gene from endogenous partner proteins may be negligible or in such low amounts as not to render the utility of the methods of the invention unfeasible.

Se a expressão de c-myc for transcrita a partir de um promotor forte, e/ou se a cassete de expressão de c-myc for fornecida num vector de elevado número de cópias, os níveis de c-myc serão suficientemente altos para ultrapassar um nível baixo de fundo e tais construções de c-osyc podem ser usadas para analisar a capacidade dos parceiros de c-myc clonados para influenciar a ligação do DMA a c-myc. Alguém familiarizado com a iíIf c-myc expression is transcribed from a strong promoter, and / or if the c-myc expression cassette is provided in a high copy number vector, the c-myc levels are high enough to exceed one low background level and such c-osyc constructs can be used to analyze the ability of cloned c-myc partners to influence the binding of DMA to c-myc. Someone familiar with it

cl O matéria pode adaptar o sistema de expressão ao nível de expre pretendido usando métodos conhecidos»The material can adapt the expression system to the desired level by using known methods.

Conhece-se a sequfncia de c-aiyc (Battey, J. et al., C-ell 34s779—787 i 1983) ) e sondas que são capazes de identificar um clone c-myc podem ser adquiridas comercialmente <New England Nuclear/Dupont Biotechnology Boston, MA).The sequence of c-myc is known (Battey, J. et al., C-3447779-787 and 1983)) and probes that are able to identify a c-myc clone can be purchased commercially from New England Nuclear / Dupont Biotechnology Boston, MA).

A proteína parceira, casa seja fornecida como uma construção recombinante se fDr fornecida como uma construção recombinante à célula hospedeira, deverá ser expressa em níveis comparáveis aos da proteína c-myc. As proteínas parceiras de c-myc podem ser identificadas através da utilização de um ensaio de placas íágicas, como descrito no pedido de patente U.B. copendente do inventar entitulado “Pratein Partner Screening Assays and Uses Thereof", MS de Série 67/510,254, entregue no mesmo dia deste pedida, 19 de Abril de 1996 e aqui incluído como referência» As proteínas itientifiçadas pelo ensaio de despiste podem ser subclonadas em vectores de expressão ©ucarióticos conhecidos de forma a proporcionar uma fonte recombinante da expressão do gene da proteína parceira.The partner, host protein is provided as a recombinant construct if fDr supplied as a recombinant construct to the host cell should be expressed at levels comparable to those of c-myc protein. C-myc partner proteins can be identified through the use of an iest plaque assay, as described in U.S. patent application Ser. The invention relates to a method for the preparation of a pharmaceutical composition comprising the preparation of a pharmaceutical composition comprising a pharmaceutical composition comprising a pharmaceutical composition comprising a pharmaceutically acceptable carrier and a pharmaceutically acceptable carrier. The proteins intended by the screening assay may be subcloned into known expression vectors to provide a recombinant source of the expression of the partner protein gene.

As construções genéticas do invento podem ser colocadas era diferentes plasmídeos ou combinadas num plasmídeo. Uma construção pode também ser inserida no genoma de uma célula hospedeira. De preferência, a construção codificadora da proteína c-myc e a construção codificadora da proteína parceira slo proporcionadas ao hospedeira em dois plasmídeos diferentes. é devido a um um efeito na efeito pode ser importante estabelecer que o efeito do composto é efeito na formação do heterodímero de c-myc e não a activida.de do produto do gene repórter per se. Tal ser estabelecido por comparação dos resultados encontrados de c-myc ou em hospedeiros que não possuem o vector de expressão o vector d© expressão da parceira de c-myc ou ambos» 0 motivo μΕ2 pode estar localizado em qualquer sitio na cassete de transcrição -jp gene repóter que permita que a transcrição daquele gene esteja operacionaimente ligada ao complexo de liagação c--myc—parceiro, Assim, tal motivo pode estar localizado no extremo 5’ relativamente ao sitio de iniciação da transcrição ou. 35 relativamente ao sitio de iniciação da transcrição, por exemplo num intrão, semelhante à sua localização relativamente à região do promotor nos genes da imunoglobulina· 0 gene repórter cuja expressão está operacionalmente ligada ao heterodimero de c—myc que se liga à sequência μΕ2 pod© ser qualquer gene cuja expressão possa ser controlada» Qualquer alteração fenotipica detectável pode servir como base para os métodos do invento» Numa realização preferida, o gene repórter é um gene que nlo e expresso normalmente pelo hospedeiro ou um gene que substitui o gene endógeno do hospedeiro» Pode ser usado qualquer gene repórter que seja capaz de ser operacionalmente ligado a um promotor capaz de responder á ligação dos heterodíme— ros c-myc-proteína parceira a μΕ2. São especialmente ateis, por exempla, genes que dotem o hospedeiro da capacidade de crescer num meio selectivo, Por exemplo em levedura a utilização do gene LEU2 de levedura como gene repórter em estirpes que normalmente não possuem LEU2 permite que tal levedura cresça em leucina como única fonte de carbono, ft espresslo do gene repórter é controlada pela mera observação se o hospeãS;j-ra retem a capacidade para crescer em leucina. De um modo semelhante, a utilização do gene suc2 como gene repórter permitirá o crescimento de um hospedeiro levedura suc2 em sucrose a ser usado como método de detecção» Em ambos os exemplos, o crescimento no substrato indicado é indicador da ligação ao DNA μΕ2 do heterodímeroc~-tnyc"-proteína parceira e ausência de tal crescimento indica a ausência de ligação ou. ausência d-a formação do heterodimero.The genetic constructs of the invention may be placed on different plasmids or combined into a plasmid. A construct may also be inserted into the genome of a host cell. Preferably, the c-myc protein coding construct and the partner protein coding construct are provided to the host on two different plasmids. is due to an effect on the effect it may be important to establish that the effect of the compound is effect on the formation of the c-myc heterodimer and not the activity of the reporter gene product per se. Such is established by comparing the results found for c-myc or in hosts which do not have the expression vector the c-myc partner expression vector or both motif μΕ2 can be located anywhere on the transcription cassette - which can allow the transcription of that gene to be operably linked to the c-myc-partner binding complex. Thus, such a motif may be located at the 5 'end relative to the transcription initiation site. 35 relative to the transcription initiation site, for example in an intron, similar to its location relative to the promoter region in the immunoglobulin genes. The reporter gene whose expression is operably linked to the c-myc heterodimer that binds to the sequence μΕ2 can be any gene whose expression can be controlled. Any detectable phenotypic change may serve as a basis for the methods of the invention. In a preferred embodiment, the reporter gene is a gene which is not normally expressed by the host or a gene that replaces the endogenous host gene Any reporter gene that is capable of being operably linked to a promoter capable of responding to the binding of the c-myc-partner partner heterodimers to μΕ2 can be used. For example, in yeast the use of the yeast LEU2 gene as a reporter gene in strains which do not normally have LEU2 allows such a yeast to grow in leucine as a single carbon source, the expression of the reporter gene is controlled by the mere observation that the host cells retain the ability to grow in leucine. Similarly, use of the suc2 gene as a reporter gene will allow the growth of a sucrose yeast host in sucrose to be used as a detection method. In both examples, growth on the indicated substrate is indicative of binding to the Î ± 2 DNA of the heterodimer and the absence of such growth indicates the absence of or binding. absence of the formation of the heterodimer.

Num outro exemplo, uma construção Ce hospedeiro) que é gal i+gal ίθ~ responderá a galactose no meios uma construção <e hospedeiro) que seja lac2 gali será sensível à lactose» Outros genes repórteres incluem h.is3, ura3 e trp5. Alguém familiarizado com a matéria pode imaginar muitos outros sistemas repóter adequados que revelarão a presença ou inibição da activida.de biológica dos heterodimeros c-myc«In another example, a host construct which is galactose will respond to galactose in the media, a host construct which is lac2 gali will be sensitive to lactose. Other reporter genes include hista3, ura3 and trp5. One skilled in the art can envisage many other suitable reporter systems which will reveal the presence or inhibition of the biological activity of the c-myc heterodimers.

As construções repórteres em que o motivo μ.Ε2 e o gene repórter lacZ estão operacional mente ligados expressarão jl-galac-tosidase como resposta á ligação de um complexo c-myc-proteína parceira» Tal expressão pode ser facilmente avaliada controlando a capacidade do hospedeiro para produzir β-galactosidase (Man ia tis» T» et al.... Molecular Cloninq (A Laboratorv Manual)., 2.§ edição, Cold Spring Harbor Laboratory, 1989). A produção de fs-g&iac tosidase pode ser controlada visualmente através da detecção da sua actividade para reduzir o corante cromóforo, X-gal (que pode ser adquirido à International Biotechnologiers, Inc», New Haven, CD» β-galactosidase reduz X-gal para uma forma que possui uma cor azul» Numa outra realização, a sequência codificadora do cloranfenicol—acetiltransferase (CAT) foi usada como gene repórter»Reporter constructs in which the motif μ.Ε2 and the lacZ reporter gene are operably linked will express β-galactosidase in response to binding of a partner c-myc-protein complex. Such expression can be easily assessed by controlling the capacity of the host to produce β-galactosidase (Maniatis et al., Molecular Cloninq (A Laboratorv Manual), 2nd edition, Cold Spring Harbor Laboratory, 1989). The production of β-galactosidase can be monitored visually by detecting its activity to reduce the chromophore dye, X-gal (available from International Biotechnologists, Inc., New Haven, CD, β-galactosidase reduces X -gal to a form having a blue color. In another embodiment, the chloramphenicol acetyltransferase (CAT) coding sequence was used as the reporter gene.

Pode ser usado qualquer método de detecção que possa identificar a expressão do gene repórter» Par exemplo, níveis do produto do gene repórter podem ser testados direciamente com um imunoensaio. Tais imunoensaios incluem aqueles em que o anticorpo está numa fase líquida ou ligado a um veículo de fase sólida. Em 14 adição, o gene repórter pode ser marcado de forma detectável de várias maneiras para usar em imunoensaios» Os imunoensaios preferidos para a detecção de uma proteína repórter incluem os radioimunoensaios, ensaios imunos serventes ligados a enzimas (ELISA?, ou outros ensaios conhecidos, como sejam imunoensaios de imunoíluoressência, ensaios de quimioluminescência ou ensaios de hioluminescência«Any detection method that can identify expression of the reporter gene may be used. For example, reporter gene product levels can be tested directly with an immunoassay. Such immunoassays include those in which the antibody is in a liquid phase or bound to a solid phase carrier. In addition, the reporter gene may be detectably labeled in various ways for use in immunoassays. Preferred immunoassays for the detection of a reporter protein include radioimmunoassays, enzyme linked immunosorbent assays (ELISA's, or other known assays, such as immunoassay immunoassays, chemiluminescence assays or hioluminescence assays'

Num ensaio para fazer o despiste da capacidade de um composto para alterar a aciivida.de do heterodímero c-myc, estirpes de levedura que expressam tais heterodímeros e que confim □ sítio de ligação a μΕ2, podem ser semeadas e cultivadas e o composto a ser testado pode ser aplicado ès placas num disco de papel de filtro que pode ser impregnado com tal composto. Como alternativa, o composto pode ser incorporado no meio em que estão a crescer as células hospedeiras.In an assay for screening for the ability of a compound to alter the c-myc heterodimer's activity, yeast strains expressing such heterodimers and which contain the .beta.2 binding site, can be seeded and cultured and the compound to be isolated. can be applied to plates on a filter paper disc which can be impregnated with such a compound. Alternatively, the compound may be incorporated into the medium in which the host cells are growing.

Pode-se ser capaz de detectar a capacidade de um composto para alterar a activida.de de activação da. transcrição do heterodímero de c-myc através do aparecimento de uma zona, a qual muitas vezes se assemelha a um halo, à volta do disco impregnada com o composto. Se por exemplo, o composto for tóxico para a sobrevivência do hospedeiro per se„ o hospedeiro não cresce na. zona contendo o composto.One may be able to detect the ability of a compound to alter the activation activity of the compound. transcription of the c-myc heterodimer through the appearance of a zone, which often resembles a halo, around the disc impregnated with the compound. If for example, the compound is toxic to host survival per se, the host does not grow on the host. zone containing the compound.

Os métodos do invento podem ser usados para fazer o despiste de compostos na sua formai pura, numa variedade de concentrções e também na sua forma impura» Os métodos do invento podem também ser usados para identificar a presença de tais inibidores em extractos brutos e para seguir a purificação dos úteis como inibidores a partir deles. Os métodos do invento são também na avaliação da estabilidade dos inibidores identificados atrás , para avaliar a eficácia de várias preparações. S. A permeabilidade das células a vários compostos pode ser aumentada se necessário, através da utilização de uma estirpe celular mutante que possui uma maior permeabilidade ou usando compostos que se sabe aumentarem a permeabilidade» Por exemplo, em levedura compostos tais como α nonapeptídeo pol imi;;ina B podem ser usados para aumentar a permeabilidade de levedura a compostos orgânicos pequenos» Em células de eucariotas superiores, o dimetilsulfóKido pode ser usado para aumentar a permeabilidade. Análogos de tais compostos que slo mais permeáveis através das membranas de leveduras podem também ser usados. Por esíemplo, derivados de dibutirilo muitas vezes apresentam uma maior permea— bi1idade.The methods of the invention may also be used to screen for the presence of such inhibitors in crude extracts and to follow the methods of the invention. the purification of the useful ones as inhibitors from them. The methods of the invention are also in the evaluation of the stability of the inhibitors identified above, to evaluate the effectiveness of various preparations. S. The permeability of the cells to various compounds may be increased if necessary through the use of a mutant cell line having increased permeability or using compounds known to increase permeability. For example, in yeast compounds such as α-nonapeptide polym in B cells can be used to increase yeast permeability to small organic compounds. In higher eukaryote cells, dimethylsulfoxide can be used to increase permeability. Analogs of such compounds which are more permeable through the yeast membranes may also be used. For example, dibutyryl derivatives often have a higher permeability.

Numa realização preferida, as construções genéticas e os métodos para as usar são utilizados em hospedeiros eucarióti-cos e especialmente em leveduras, células de insectos e de mamíferos, A sequência introduzida é incorporada num plasmídeo ou vector capaz de se replicar autónomamente ou ter actividade integrativa. A sequência de DMA da proteína de fusão e/ou gene alvo pode ser quimicamente construída caso não se pretenda utilizar um clone do genoms ou mRNA como fonte de informação genética. Os métodos de síntese de DMA são bem conhecidos (Oligonucleotide Synthesis, A Praticai Approach, M„J» Sail, ecl„, IRL Press, Washington, D.C», 1094; Synthesis and Applications of DNAand RNA, S»A» Marang, ed» Academic Press-, San Diego, CA, 1937)« Devido ao código genético ser degenerado pode ser usado mais de um codão para construir a sequência de DMA codificadora de um aminoácido particular CWatson, J»D», Em; Molecular Biology of the Sene, 3é edição, W»A. Benjamín, Inc«, Menlo Park, CA, 1977, pp„ 356-357)» 16 -In a preferred embodiment, the genetic constructs and methods of using them are used in eukaryotic hosts and especially in yeast, insect and mammalian cells. The introduced sequence is incorporated into a plasmid or vector capable of replicating autonomously or having integrative activity . The DMA sequence of the fusion protein and / or target gene may be chemically constructed if a genomic or mRNA clone is not to be used as a source of genetic information. The methods of DMA synthesis are well known (Oligonucleotide Synthesis, A Practical Approach, M.J. Sail, ed., IRL Press, Washington, DC, 1094; Synthesis and Applications of DNA and RNA, S. Marang, ed. Academic Press, San Diego, CA, 1937). Because the genetic code is degenerate, more than one codon can be used to construct the DMA sequence encoding a particular amino acid CWatson, J, D, Em; Molecular Biology of the Sene, 3rd edition, Vol. Benjamin, Inc, Menlo Park, CA, 1977, pp. 356-357)

16 - J16 - J

Para expressar as contruções de fusões recombinantes da invento, slo necessários sinais de transcrição e tradução reconhecíveis pelo hospedeiro. Uma proteína clanada codificadora da sequência de DNA, obtida através dos métodos descritos atrás Cde preferência numa forma de cadeia dupla), podem ser operacional-mente ligados a sequências que controlam a expressão transeri— cional num vector de expressão e introduzidas, por exemplo por transformação, numa célula hospedeira para produzir proteínas recombinantes úteis nos métodos do inventa ou seus derivados funcionais, tais técnicas slo bem conhecidas (Recomhinant DNA Methodology, Wu, R, et al., eds., Academic Press, (í909> 5 Maniatis, T. et a1,. Molecular Cloninq <A Laboratorv Manual), segunda edição, Cold Spring Barbar Laboratorv,1989).In order to express the constructs of recombinant fusions of the invention, transcription and translation signals recognizable by the host are required. A cloned protein encoding the DNA sequence, obtained by the methods described above, preferably in a double-stranded form), may be operably linked to sequences that control trans-expression in an expression vector and introduced, for example by transformation , in a host cell to produce recombinant proteins useful in the methods of the invention or functional derivatives thereof, such techniques are well known (Recommant DNA Methodology, Wu, R, et al., Academic Press, (1990), 5 Maniatis, T. et al., Molecular Cloninq < A Laboratorv Manual), Second Edition, Cold Spring Barbar Laboratorv, 1989).

Sinais reguladores da iniciação da transcrição podem ser seleccionados de forma a permitirem a repressão ou activação da expressão da construção c-myc ou da construção da proteína parceira ou ambas, de forma que a expressão de tais construções possa ser modulada caso se pretenda. São de interesse os sinais reguladores que são sensíveis à temperatura de tal modo que variando a temperatura, a expressão pode ser reprimida ou iniciada ou sujeitos a regulação química, por exemplo por um metaba-lito, sal ou substrato adicionado ao meio de crescimento.Transcriptional initiation regulatory signals may be selected so as to allow repression or activation of expression of the c-myc construct or the partner protein construct or both, so that the expression of such constructs can be modulated if desired. Of interest are those regulatory signals which are temperature sensitive in such a way that by varying the temperature, the expression can be repressed or initiated or subjected to chemical regulation, for example by a metabolite, salt or substrate added to the growth medium.

Sempre que os sinais das sequências de controle da expressão nativas não funcionem satisfatoriamente então as sequências funcionais na célula hospedeira podem ser substituídas. A expressão das construções do invento em diferentes hospedeiros pode resultar em diferentes modificações pás-tradução que podem alterar as propriedades das proteínas expressas por estas construções, é necessário expressar as proteínas num a sua hospedeiro em que a capacidade da proteína parai reter função biológica não é inibida. A expressão de proteínas em hospedeiros leveduras é preferencialmente conseguido usando sinais reguladores de levedura. Os vectores do invento podem conter elementos reguladores operacionalmente ligados como sejam sequências activadoras a montante em levedura ou elementos de DNA que conferem expressão especifica de espécie, tecido ou célula num gene operacionalmente ligado.Where the signals of the native expression control sequences do not function satisfactorily then the functional sequences in the host cell may be substituted. Expression of the constructs of the invention in different hosts may result in different paddle-translation modifications which may alter the properties of the proteins expressed by these constructs, it is necessary to express the proteins in a host wherein the ability of the protein to retain biological function is not inhibited. Expression of proteins in yeast hosts is preferably achieved using yeast regulatory signals. Vectors of the invention may contain operably linked regulatory elements such as upstream activating sequences in yeast or DNA elements that confer species, tissue or cell specific expression in an operably linked gene.

Em geral, vectores de expressão contendo sequências reguladoras da transcrição, tais como sequências de promotor e sequências de terminação da transcrição, são usados en* ligação com um hospedeiro» Estas sequências facilitam a transcrição eficaz do fragmenta de gene que lhes estão c»per acionai mente ligadas. Em adição, os vectores de expressão também contêm tipicamente elementos discretos de DNA tais como, por exemplo. Ca) uma origem de replicação que permite a replicação autónoma do vector ou elementos que promovam a inserção do vector no cromossoma do hospedeiro de uma forma estável e Cfo) genes específicos que são capazes de proporcionar selecção fenotípica em células transformadas. Os vectores de expressão eucarióticos podem conter também elementos que permitem a sua manutenção em hospedeiros procarióticos; tais vectores são conhecidos como vectores vai--vem. A natureza precisa da regiões reguladoras necessárias para a expressão de genes variara entre espécies ou tipos celulares e existem muitos sistemas vectores de expressão adequados. que podem ser adquiridos comercialmente.In general, expression vectors containing transcriptional regulatory sequences, such as promoter sequences and transcription termination sequences, are used in conjunction with a host. These sequences facilitate efficient transcription of gene fragments which are useful for them linked. In addition, expression vectors also typically contain discrete DNA elements such as, for example. Ca) an origin of replication that allows autonomous replication of the vector or elements that promote vector insertion into the host chromosome in a stable manner and (c) specific genes that are capable of providing phenotypic selection in transformed cells. Eukaryotic expression vectors may also contain elements that allow their maintenance in prokaryotic hosts; such vectors are known as shuttle vectors. The precise nature of the regulatory regions necessary for the expression of genes will vary between species or cell types and there are many suitable expression vector systems. which can be purchased commercially.

Numa realização especialmesnte preferida, as leveduras são usadas como células hospedeiras. Os elementos necessários a expressão transcricicnal de um gene em levedura foramIn a particularly preferred embodiment yeasts are used as host cells. The elements necessary for the transcriptional expression of a gene in yeast were

iB recentemente revistos (Struhl, 1< = Ann» Rev» Biuchem. 58ϊαΘ51-1Θ7/ < 1989)),, Em levedura a maior parte dos promotores contêm três elementos de DMA básicas; (1) uma sequência de activador a montante (UAS)j (2) um elemento TATAj e (3) um elemento de iniciação (I). Alguns promotores também contêm elementos operadores» Os métodos em genética de leveduras são bem conhecidos <Stru.hl, 1<„ Nature 385;391-397 (1983)? Sherman, et al „, Methods in Yeast Genetics, Cold Spring Harbor Laboratory <1983)).In the yeast most of the promoters contain three basic DMA elements; in the yeast, most of the promoters contain three basic DMA elements; (1) an upstream activator sequence (UAS) j (2) a TATAj element and (3) an initiation element (I). Some promoters also contain functional elements. Methods in yeast genetics are well known " Stru.hl, 1 " Nature 385; 391-397 (1983); Sherman, et al., Methods in Yeast Genetics, Cold Spring Harbor Laboratory, 1983)).

Numa outra realização foram usadas células de mamífera como células hospedeiras» Pode—se conseguir derivar uma grande variedade de sinais reguladores da transcrição e da tradução para expressão de proteína em células de mamífero e especialmente a partir de sequências genómicas de vírus que infectam células eucsrióticas.In another embodiment mammalian cells have been used as host cells. A variety of transcriptional and translational regulatory signals may be derived for expression of protein in mammalian cells and especially from genomic sequences of viruses infecting eukaryotic cells.

Uma vez preparado o vector ou sequência de DMA contendo a < s) construção < Ses), a < s) construção(Ses > de DMA é < são) introdu-zidaís) numa célula hospedeira adequada através de qualquer uma tíe uma variedade de meios adequados, por exemplo por transformação» Após a introdução do vector, as células recipientes são cultivadas num meio selectivo, o qual selecciona o crescimento de células contendo vector» A expressão da(s) sequênciaCs) de genes clonados resulta na produção da proteína. Esta expressão pode tomar lugar de uma forma contínua nas células transformadas ou de uma forma controlada. sxOnce the vector or DMA sequence containing < s) construction < Ses), a < s) construct (Ses) is introduced into a suitable host cell through any one of a variety of suitable means, for example by transformation. After introduction of the vector, the recipient cells are cultured in a suitable host cell. selective medium, which selects the growth of vector-containing cells. The expression of the clones (s) of cloned genes results in the production of the protein. This expression may take place continuously in the transformed cells or in a controlled manner. sx

Os transformantes geneticamente estáveis podem ser construídos com sistemas de vectores epissomais ou com os sistemas vectores integrados pelos quais o DMA da proteína de fusão é integrada no cromossoma do hospedeiro. Tal integração pode ocorrer de novo dentro da célula ou pode ser auxiliada por transformação com um vector que funcionalmente insere-se a vectores promovam próprio no croínossofiia do hospedeiro, por exemplo, com retrevirai5, transposões ou outros elementos de DNA que a integração de sequências de DNA em cromossomas.Genetically stable transformants can be constructed with episomal vector systems or the integrated vector systems by which the DMA of the fusion protein is integrated into the host chromosome. Such integration may occur again within the cell or may be aided by transformation with a vector which functionally inserts into the host's own host vectors, for example, with transcripts, transposons or other DNA elements, which integration of sequences from DNA on chromosomes.

As células que foram transformadas com os vectores de DNA do inventa foram selsccionadas através da introdução de uma ou mais marcas que permitem a selecçSo das células hospedeiras que confim o vector, por exemplo, a marca pode proporcionar resistência a biocidas, e,g. resistência a antibióticos ou. a metais pesados tais como cobre ou similares. A célula hospedeira transformada pode ser fermentada ou cultivada de acorda com com meios conhecidos na área para se conseguir um crescimento celular óptimo e também para se conseguir a expressão óptima dos fragmentos clonados da sequência da proteína de fusão» Como descrito abaixo, pode ser conseguido um nível elevado de expressão de proteína de fusão para as sequências danadas codificadoras das proteínas de fusão segundo um processo preferido deste invento.Cells that have been transformed with the inventive DNA vectors have been screened by introducing one or more tags that allow the selection of host cells that contain the vector, for example, the label may provide resistance to biocides, e.g. resistance to antibiotics or. to heavy metals such as copper or the like. The transformed host cell may be fermented or cultured according to means known in the art to achieve optimum cell growth and also to achieve optimum expression of the cloned fragments of the fusion protein sequence. As described below, a high level of fusion protein expression for the damaging sequences encoding the fusion proteins according to a preferred process of this invention.

Os exemplos que se seguem descrevem ainda os meteriais e métodos usados na realização do invento, Os exemplos não se destinam a limitar tíe forma alguma o invento.The following examples further describe the methods and methods used in the practice of the invention. The examples are not intended to limit the invention in any way.

20 ~ EXEMPLOSEXAMPLES

Exemplo IExample I

Despiste de uma biblioteca de expressão de cDNft para proteínas capa?.es de in te» ac tuarçom o domínio hélice-ansa—hélice de c-mve tuar cadofScreening of a cDNft expression library for helix-helix-domain proteins of the host cell

Para fazei" o despiste de proteínas com a hélix-ansa-hélix CHLH) de DNA de c dos aminoácidos 255-410 CSattey, J. st capazes de in terac--myc humano codifiai., Ce11 34s779-787To do " the deletion of proteins with the helix-ansa-helix CHLH) of c-DNA from amino acids 255-410 CSattey, J. st capable of human mycobacteria codified, Ce11 34s779-787

(1983)), que contem s repilo básica © a HLH da proteína c-myc foi ligado, na mesma grelha de leitura com um fragmento codificador dos 112 aminoácidos N-terminais da proteína repressor de lambda (cl). A expressão desta proteína quimérica foi colocada sob o controle do promotor muito fraco da $—lactamase e o operador lactose. Esta unidade de expressão foi. subclanada em pACYC 177, um plasmídeo de número de cópias baixo (10-15 cópias/célula) com u.m R gene de canamicina que pode ser adquirido comercialmente,(1983)), which contains the basic β-HLH repand of the c-myc protein was ligated, in the same reading frame with a fragment encoding the N-terminal 112 amino acids of the lambda (cl) repressor protein. Expression of this chimeric protein was placed under the control of the very weak β-lactamase promoter and the lactose operator. This unit of expression was. subcloned into pACYC 177, a low copy number plasmid (10-15 copies / cell) with a commercially available kanamycin gene,

Observou-se que as células transformadas com esta construção são resistentes à infecção por fago lambda através de um ensaio de "dots" de placas. A construção acima, p¥C192cIHLH, tornaram as células resistentes à infecção por fagos em mais de 10“ pfu, ) enquanto as células que expressam a região N-terminal de cl sózinho foram infectadas a <1®*" pfu. foi usada A estirpe Y para fazer 1©V0 de E. coli transformada com pYC192cIHLH o despiste de uma biblioteca de expressão de amígdala humana/células B em lambda gtil. 5 x 1©^ pfu foram transformada atrás referida, Y1©90::1ambda. Nas p1acas fez-se uma purificação por isolada e ressuspendeu-se em s purificadas foram agrupadas despistados em duplicado na estirpe assim como uma estirpe lisogánica testemunhas onde não havia placas plaqueamento e repicou-se uma placa meio de suspensão (SM). As 16© placa da acordo cora o tamanho da placass 2â pequenas, 70 médias, 70 grandes. (Quatro do grupo "pequeno" não formaram placas no passo de purificação de placas)» Cada uma destas foi então despistadas por um ensaio de "dois" de placas numa estirpe de E. coli, 3M109, transformada com o plasmideo pJH370, a qual expressa uma proteína quimérica consistindo no extremo N de cl fundido com o domínio em fecho de leucinas de GGN4. Cada um das fagos foi também testado na estirpe atrás referida usada no despiste primário, assim como na estirpe lisogénica para lambda e na estirpe parental ¥1090.Cells transformed with this construct were found to be resistant to phage lambda infection by a " dots " of plates. The above construct, p ¥ C192cIHLH, made the cells resistant to phage infection by more than 10 "pfu, while cells expressing the N-terminal region of the monkey were infected at < 1® * " pfu. The Y strain was used to make E. coli transformed with E. coli transformed with pYC192CIHLH and screened a human amygdala / B cell expression library in lambda gtil. 5 x 105 pfu were transformed above, Y190 :: 1bda. Purification was performed on isolated plates and resuspended in purified sera were pooled in duplicate in the strain as well as a lysogenic strain where there were no plaque plates and a suspension medium plate (SM) was peeled off. The 16 plate of the agreement has the size of the small, 70 medium, 70 large placings. (Four from the " small group " did not form plaques in the plaque purification step). Each of these was then screened by an assay of " two " of plaques in a strain of E. coli, 3M109, transformed with plasmid pJH370, which expresses a chimeric protein consisting of the N-terminus of the fused G-terminal domain of GGN4. Each of the phages was also tested in the above-mentioned strain used in primary screening, as well as in the lysogenic strain for lambda and the parental strain ¥ 1090.

Os fagos que formaram placas na estirpe parental V109Θ e na estirpe que expressa. d-Myc, mas não na estirpe lisogénica ou na estirpe que expressa cI~SCM4 foram definidos como "positivos", Qs "positivos" foram despistados num total de duas vezes nestas quatro estirpes. No ensaio de "dots" de placas 5-20 μΐ do fago "positivo" dão tipicamente 50-100 placas» Mesmo que se possa ver uma única placa muito pequena em cI-6CN4 então o fago é definido como "negativo"» Através deste ensaio, encontrou-se um total de 10 "positivos” dos 156 fagos testados. Destes, 3 eram do grupo "pequeno" e 7 eram do grupo "médio". Tais positivos podem ser su.hclonados usando métodos conhecidos para a expressão em hospedeiros eucarièticos úteis nos métodos da -invento»Phages that formed plaques in parent strain V109Θ and in the strain it expresses. d-Myc but not in the lysogenic strain or in the cI-SCM4-expressing strain were defined as " positives ", ", " positives " were screened twice in these four strains. In the " dots " of plaques 5-20 μΐ of " positive " typically give 50-100 plaques. Even if a very small plaque in cI-6CN4 can be seen then the phage is defined as " negative ". Through this assay, a total of 10 " positives " of the 156 phages tested. Of these, 3 were from the " small " and 7 were from the " medium " group. Such positives can be synthesized using known methods for expression in eukaryotic hosts useful in the -invent 'methods.

Exemplo 2Example 2

Identificação de um inibidor da formação de heterodímeros de c.-Myc em células de levedura Células hospedeiras de levedura foram transformadas com plasmídeos portadores de c-royc (hospedeiro "a"); ou c-myc e tuna proteína parceira de 46 000 dal tons identificada como atrás (hospedeiro "b">. Em adição todas as estirpes de levedura foram cotransformadas com um plasmideo que contem a sequência 1 * sIdentification of an inhibitor of the formation of c-Myc heterodimers in yeast cells Yeast host cells were transformed with plasmids bearing c-royc (host " a "); or c-myc and a 46,000 dal tone partner protein identified as above (host " b " >). In addition all yeast strains were cotransformed with a plasmid containing the sequence 1 * s

codificadora da {3-galactosidase operacionalmente ligada à sequência μΕ2 como descrito atrás»encoding the β-galactosidase operably linked to the sequence μΕ2 as described above.

Espalhou-se um tapete de cada uma das estirpes de levedura transformadas em placas de agar contendo ®-qaí no meio e pequenos filtros circulares contendo o composta W, X, Y ou. Z foram colocados nos tapetes» A levedura cresceu e as placas foram controladas relativamente ao crescimento de colónias e c8r das colónias por observação visual» Na Tabela i estão apresentados resultados típicos de tal experiência» k t 4A carpet of each of the yeast strains transformed into agar plates containing β-β in the medium and small circular filters containing the compound W, X, Y or. Z were placed on the mats. The yeast grew and the plaques were controlled for colony and colon growth by visual observation. Typical results of such experiment are shown in Table 1.

í «ÃfcfSl 3 1 Ϊ Identificação de inibidorss da proteina c-myc Composto Levedura Crescimento de colónias Cor derivada do ensaio β—gal com X-gal nenhum à 4- Branca b + Azul W a + Branca b + Branca Λ a - - b - Y 5 4* Branca b + Azul z s + Azul b + AzulIdentification of inhibitors of c-myc protein Compound Yeast Colony growth Color derived from the β-gal assay with X-gal None 4- White b + Blue W a + White b + White Λ a - - b - Y 5 4 * White b + Blue zs + Blue b + Blue

Os resultados da tabela acima indicam que α composto W evita a indução da β—aalactosidase nas céulas hospedeiras "b". Assim, o composto W é um inibidor da formação de heterodimeros e um inibidor da activida.de biológica de c-myc. 0 composto X inibe o crescimento de levedura per se e portanto não será um composto com interesse. 24 «The results from the above table indicate that α-compound W avoids the induction of β-aalactosidase in the host cells " b ". Thus, compound W is an inhibitor of the formation of heterodimers and an inhibitor of the biological activity of c-myc. Compound X inhibits yeast growth per se and therefore will not be a compound of interest. 24

0 campasto Υ não evita a indução da actividade de β-galactosidase nas células hospedeiras "b**. Assim, d composto Y não é um inibidor da formação de heterodímeros» 0 composto Z apresenta um efeito interessante de indução da actividade "a" que não contêm a hospedeiros "b”, ara de β-galactosidase nas células hospedeiras proteína parceira usada de c-myc usada nos além de evitar a formação de heterodímeros.Campaste Υ does not prevent the induction of β-galactosidase activity in host cells " b **. Thus, compound Y is not an inhibitor of the formation of heterodimers. Compound Z has an interesting effect of inducing the activity " a " which do not contain β-galactosidase β-host hosts in the host cells used c-myc partner protein in addition to preventing the formation of heterodimers.

Isto sugere que o proteína parceira cé1u1as hospedei ra proteína. composto Z pode induzir a síntese de que de outro modo não estará presente í de levedura ou que possa ser (ou simular) uma nas tal A partir destes resultados o composto W será identifi cado como um inibidor da formação de heterodímeros de c-myc e portanto da actividads transcricional de c.-myc in vivo.This suggests that the partner protein hosts host protein. compound Z may induce the synthesis that otherwise will not be present in yeast or which may be (or will be) one in the same. From these results compound W will be identified as an inhibitor of the formation of c-myc heterodimers and therefore the transcriptional activity of c.-myc in vivo.

II

Todas as referências aqui citadas são incluídas como referência. Tendo descrito total atente o invento, será entendido pelos faffli1iarizados com a área que o âmbito do invento insere-se numa gama larga e equivalente de condições, parâmetros e similares, sem afectar o espirito ou âmbito do inventa ou qualquer rea1icação sua.All references cited herein are hereby incorporated by reference. Having fully described the invention, it will be understood by those skilled in the art that the scope of the invention is within a wide and equivalent range of conditions, parameters and the like, without affecting the spirit or scope of the invention or any of the embodiments thereof.

Claims (1)

*75 -* 75 - REIVIΠΏICflCSES s iã. - Método para a identificação e classificação de um composta coma um inibidor da ligação a DMA de heterodímeros de c-íiívc, caracterizado por compreender s avaliação da capacidade do referida composto para alterar a expressão de um gene repórter numa célula hospedeira? em que a expressão do referido gene repórter está operacionalmente ligada à ligação a DMA pelo referido heterodímero à sequência μΕ2» I 2ã» ~ Método de acordo com a reivindicação í, caracte-rizado por a expressão do referido gene repórter induzir uma alteração fenatípica numa célula hospedeira. 3â. - Método de acordo com a reivindicação i, caracte-rizado por o referido gene repórter ser lacZ. 4ã. - Método de acordo com a reivindicação 1, caracte-rizado por o referido gene repórter ser CAT„ ,J—* Método de acordo cum a reivindicação í, caracte™ rizado por o referido gene repórter ser U2J2» 6â. - Método de acordo com a reivincilcaç*0 2, caracte-riaado por a referida alteraçgo fenotiplca ssr detectada por observação visual da célula hospedeira. 71» - Método de acorda com a v.- ^ , indlldCÃij.âO 1 «i LSI rizado por o referido hospedeiro ser 8» rerevi =iaí= aã Método de acordo 'Om a reivindicação uma célula de mamif caracterizado por o referido hospedeiro ser ro , Lisboaj 17 de Abril de 1991REHABILITATION. A method for the identification and classification of a compound as a DMA-binding inhibitor of C-10 heterodimers, characterized in that it comprises evaluating the ability of said compound to alter the expression of a reporter gene in a host cell - wherein the expression of said reporter gene is operably linked to the binding to DMA by said heterodimer to the sequence μΕ2. The method of claim 1, wherein the expression of said reporter gene induces a phenotypic change in a cell hostess. 3â. 5. A method according to claim 1, wherein said reporter gene is lacZ. 4ã. A method according to claim 1, wherein said reporter gene is CAT2. A method according to claim 1, wherein said reporter gene is U2. A method according to claim 8, characterized in that said phenotype is detected by visual observation of the host cell. The method of claim 1 wherein said host is a mammalian cell wherein said host is a mammalian cell, wherein said mammalian cell is a mammalian cell. ro, Lisboaj April 17, 1991 J. PEREIRA DA CRUZ Agente Oficial da Propriedade Industrial RUA VICTOR CORDON, 10- A 3* 1200 USBOAJ. PEREIRA DA CRUZ Official Agent of Industrial Property RUA VICTOR CORDON, 10- A 3 * 1200 USBOA
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