PL165020B1 - Sposób oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu i test diagnostyczny do oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu PL - Google Patents
Sposób oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu i test diagnostyczny do oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu PLInfo
- Publication number
- PL165020B1 PL165020B1 PL30054690A PL30054690A PL165020B1 PL 165020 B1 PL165020 B1 PL 165020B1 PL 30054690 A PL30054690 A PL 30054690A PL 30054690 A PL30054690 A PL 30054690A PL 165020 B1 PL165020 B1 PL 165020B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- fragment
- antibodies
- thr
- ser
- glu
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 45
- 239000000427 antigen Substances 0.000 title claims abstract description 17
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 title claims abstract description 17
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 title claims abstract description 17
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 title claims abstract description 7
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 title abstract description 8
- 102000001938 Plasminogen Activators Human genes 0.000 title description 5
- 108010001014 Plasminogen Activators Proteins 0.000 title description 5
- 229940127126 plasminogen activator Drugs 0.000 title description 5
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract description 91
- 239000002797 plasminogen activator inhibitor Substances 0.000 claims abstract description 45
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 30
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 30
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 30
- 102000003978 Tissue Plasminogen Activator Human genes 0.000 claims abstract description 22
- 108090000373 Tissue Plasminogen Activator Proteins 0.000 claims abstract description 22
- 229960000187 tissue plasminogen activator Drugs 0.000 claims abstract description 21
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims abstract description 9
- 239000007791 liquid phase Substances 0.000 claims abstract description 3
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract 5
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 14
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 9
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 claims description 4
- 239000007787 solid Substances 0.000 claims description 4
- 102000010752 Plasminogen Inactivators Human genes 0.000 description 38
- 108010077971 Plasminogen Inactivators Proteins 0.000 description 38
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 22
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 21
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 19
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 19
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 18
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 12
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 11
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 11
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 11
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 10
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 10
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N Glycerine Chemical compound OCC(O)CO PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M Sodium laurylsulphate Chemical compound [Na+].CCCCCCCCCCCCOS([O-])(=O)=O DBMJMQXJHONAFJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 8
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 8
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 7
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 7
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 7
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 6
- 108010022233 Plasminogen Activator Inhibitor 1 Proteins 0.000 description 6
- 102100039418 Plasminogen activator inhibitor 1 Human genes 0.000 description 6
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 6
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 6
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 6
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 6
- 102000013415 peroxidase activity proteins Human genes 0.000 description 6
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 6
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- ZKHQWZAMYRWXGA-UHFFFAOYSA-N Adenosine triphosphate Natural products C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1OC(COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)C(O)C1O ZKHQWZAMYRWXGA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 101000609255 Homo sapiens Plasminogen activator inhibitor 1 Proteins 0.000 description 5
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 5
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 5
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 5
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 5
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 5
- 235000019441 ethanol Nutrition 0.000 description 5
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 5
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 5
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 5
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 5
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 5
- BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N Borate Chemical compound [O-]B([O-])[O-] BTBUEUYNUDRHOZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 4
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 4
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 4
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 4
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 4
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 4
- 102000043283 human SERPINE1 Human genes 0.000 description 4
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 4
- 239000000047 product Substances 0.000 description 4
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 4
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 4
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 4
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 3
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 3
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 3
- 108010021757 Polynucleotide 5'-Hydroxyl-Kinase Proteins 0.000 description 3
- 102000008422 Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase Human genes 0.000 description 3
- HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M Sodium hydroxide Chemical compound [OH-].[Na+] HEMHJVSKTPXQMS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 239000007984 Tris EDTA buffer Substances 0.000 description 3
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 3
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 3
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 3
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 3
- 229940098773 bovine serum albumin Drugs 0.000 description 3
- 239000007979 citrate buffer Substances 0.000 description 3
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 3
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 3
- 125000003835 nucleoside group Chemical group 0.000 description 3
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 3
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 3
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 3
- 230000008569 process Effects 0.000 description 3
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 3
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N L-aspartic acid Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 2
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 2
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000013566 Plasminogen Human genes 0.000 description 2
- 108010051456 Plasminogen Proteins 0.000 description 2
- CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L Sodium Carbonate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]C([O-])=O CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Chemical compound CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229960000583 acetic acid Drugs 0.000 description 2
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 2
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 2
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 2
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 2
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 2
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 2
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 2
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 2
- 239000007975 buffered saline Substances 0.000 description 2
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 2
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 2
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 2
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 210000003000 inclusion body Anatomy 0.000 description 2
- PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N isoamylol Chemical compound CC(C)CCO PHTQWCKDNZKARW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- -1 isopropoxyacetyl group Chemical group 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 description 2
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 2
- SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M potassium acetate Chemical compound [K+].CC([O-])=O SCVFZCLFOSHCOH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 2
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 2
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000009987 spinning Methods 0.000 description 2
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LOTKRQAVGJMPNV-UHFFFAOYSA-N 1-fluoro-2,4-dinitrobenzene Chemical compound [O-][N+](=O)C1=CC=C(F)C([N+]([O-])=O)=C1 LOTKRQAVGJMPNV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MXVMRHIWTSFDPU-UHFFFAOYSA-N 2-chlorobenzenecarboximidamide Chemical compound NC(=N)C1=CC=CC=C1Cl MXVMRHIWTSFDPU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N 2-deoxy-D-ribose Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)CC=O ASJSAQIRZKANQN-CRCLSJGQSA-N 0.000 description 1
- 102100027324 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1 Human genes 0.000 description 1
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZKHQWZAMYRWXGA-KQYNXXCUSA-J ATP(4-) Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](COP([O-])(=O)OP([O-])(=O)OP([O-])([O-])=O)[C@@H](O)[C@H]1O ZKHQWZAMYRWXGA-KQYNXXCUSA-J 0.000 description 1
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 1
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010088751 Albumins Proteins 0.000 description 1
- 102000009027 Albumins Human genes 0.000 description 1
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L Carbonate Chemical compound [O-]C([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 108010054576 Deoxyribonuclease EcoRI Proteins 0.000 description 1
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- 102000009123 Fibrin Human genes 0.000 description 1
- 108010073385 Fibrin Proteins 0.000 description 1
- BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N Fibrin monomer Chemical compound CNC(=O)CNC(=O)CN BWGVNKXGVNDBDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000008946 Fibrinogen Human genes 0.000 description 1
- 108010049003 Fibrinogen Proteins 0.000 description 1
- 102000002464 Galactosidases Human genes 0.000 description 1
- 108010093031 Galactosidases Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 101001009252 Homo sapiens 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1 Proteins 0.000 description 1
- 108010001336 Horseradish Peroxidase Proteins 0.000 description 1
- AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N Hydroxylamine Chemical compound ON AVXURJPOCDRRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010042653 IgA receptor Proteins 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N L-tryptophane Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000003960 Ligases Human genes 0.000 description 1
- 108090000364 Ligases Proteins 0.000 description 1
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 102000016943 Muramidase Human genes 0.000 description 1
- 108010014251 Muramidase Proteins 0.000 description 1
- 108010062010 N-Acetylmuramoyl-L-alanine Amidase Proteins 0.000 description 1
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100034014 Prolyl 3-hydroxylase 3 Human genes 0.000 description 1
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 1
- 229920005654 Sephadex Polymers 0.000 description 1
- 239000012507 Sephadex™ Substances 0.000 description 1
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010071390 Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 102000007562 Serum Albumin Human genes 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 1
- QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N Tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(N)C(O)=O)=CNC2=C1 QIVBCDIJIAJPQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000003990 Urokinase-type plasminogen activator Human genes 0.000 description 1
- 108090000435 Urokinase-type plasminogen activator Proteins 0.000 description 1
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000013019 agitation Methods 0.000 description 1
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 1
- 150000001299 aldehydes Chemical class 0.000 description 1
- 150000001412 amines Chemical group 0.000 description 1
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N ammonia Natural products N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 1
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011148 calcium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 231100000504 carcinogenesis Toxicity 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 239000008004 cell lysis buffer Substances 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000013375 chromatographic separation Methods 0.000 description 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 1
- 230000035602 clotting Effects 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 230000021615 conjugation Effects 0.000 description 1
- 239000005289 controlled pore glass Substances 0.000 description 1
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 1
- 230000009260 cross reactivity Effects 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 1
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 1
- 239000007857 degradation product Substances 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 1
- 230000032692 embryo implantation Effects 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 229940071106 ethylenediaminetetraacetate Drugs 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 229950003499 fibrin Drugs 0.000 description 1
- 229940012952 fibrinogen Drugs 0.000 description 1
- 230000020764 fibrinolysis Effects 0.000 description 1
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000012362 glacial acetic acid Substances 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000789 guanidine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N guanidinium chloride Chemical compound [Cl-].NC(N)=[NH2+] PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000023597 hemostasis Effects 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 239000004325 lysozyme Substances 0.000 description 1
- 229960000274 lysozyme Drugs 0.000 description 1
- 235000010335 lysozyme Nutrition 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 230000010309 neoplastic transformation Effects 0.000 description 1
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 1
- 230000016087 ovulation Effects 0.000 description 1
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 1
- OJMIONKXNSYLSR-UHFFFAOYSA-N phosphorous acid Chemical group OP(O)O OJMIONKXNSYLSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000035479 physiological effects, processes and functions Effects 0.000 description 1
- 230000035790 physiological processes and functions Effects 0.000 description 1
- 229940012957 plasmin Drugs 0.000 description 1
- 229920003023 plastic Polymers 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 235000011056 potassium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 239000012460 protein solution Substances 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 230000008929 regeneration Effects 0.000 description 1
- 238000011069 regeneration method Methods 0.000 description 1
- 235000015067 sauces Nutrition 0.000 description 1
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 1
- 239000013049 sediment Substances 0.000 description 1
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 1
- 230000035939 shock Effects 0.000 description 1
- 238000010583 slow cooling Methods 0.000 description 1
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000012279 sodium borohydride Substances 0.000 description 1
- 229910000033 sodium borohydride Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910000029 sodium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000008279 sol Substances 0.000 description 1
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 1
- 239000012086 standard solution Substances 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 1
- GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N triton Chemical compound [3H+] GPRLSGONYQIRFK-MNYXATJNSA-N 0.000 description 1
- 239000012137 tryptone Substances 0.000 description 1
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002604 ultrasonography Methods 0.000 description 1
- 229960005356 urokinase Drugs 0.000 description 1
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
- 239000003643 water by type Substances 0.000 description 1
- 238000010626 work up procedure Methods 0.000 description 1
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
Landscapes
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
1. Sposób oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego akty- watora plazminogenu w próbce zawierajacej ten antygen, z zastosowaniem przeciwcial i odczyn- nika dajacego sie oznaczyc analitycznie, znamienny tym, ze badana próbke kontaktuje sie z przeciwcialami dla polipeptydu odpowiadajacego fragmentowi o wzorze (Y )a-A-(Z)b, w którym Y oznacza sekwencje aminokwasów kodowana przez fragment polilinkera, korzystnie Glu, Ser, Z oznacza sekwencje Glu, Ser i/lub sekwencje kodowana przez fragment polilinkera, a = 0 lub 1, b = 0, 1 lub 2, natomiast A oznacza fragment A sn1 7 2 - Thr232 ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu, po czym oznacza sie wytworzony kompleks antygen-przeciwcialo. 5. Test diagnostyczny do oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu, z zastosowaniem przeciwcial i odczynnika dajacego sie oznaczyc analitycznie, znamienny tym, ze zawiera przeciwciala dla polipeptydu odpo- wiadajacego fragmentowi o wzorze (Y )a-A-(Z)b, w którym Y oznacza sekwencje aminokwa- sów kodowana przez fragment polilinkera, korzystnie Glu, Ser, Z oznacza sekwencje Glu, Ser i/lub sekwencje kodowana przez fragment polilinkera, a = 0 lub 1, b = 0,1 lub 2, natomiast A oznacza fragment A sn1 7 2 - Thr232 ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazmino- genu, ewentualnie unieruchomione na stalym nosniku lub rozpuszczone w fazie cieklej, przy czym przeciwciala sa zwiazane z odczynnikiem dajacym sie wykryc analitycznie. PL
Description
Przedmiotem wynalazku jest sposób oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu /PAI-1/ i test diagnostyczny do oznaczania i/lub wykrywania inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu.
Aktywatory plazminogenu /PAI-1/ pełnią ważną rolę podczas procesu fibrynolizy, a także w różnych innych procesach fizjologicznych, włączając proces regeneracji, owulacji, implantacji embrionu, różnicowania tkanek, transformacji nowotworowej. Precyzyjna regulacja aktywności aktywatorów plazminogenu, stanowi krytyczny element wielu biologicznych systemów. Taka regulacja może odbywaó się na poziomie tworzenia i rozpuszczania skrzepu lub na poziomie interakcji aktywatorów plazminogenu z komórkami czy też przez działanie specyficznych inhibitorów.
Większość oznaczeń aktywności tkankowego aktywatora plazminogenu jest dwuetapowa, zależy od obecności plazminy i nie odróżnia odmiennych rodzajów inhibitorów. Określenie inhibitorowej aktywności PAI mierzy się ilościowo przez zdolność do hamowania lizy włóknika znakowanego 125
J, pośredniczonej aktywacją plazminogenu przez urokinazę /Loskutoff and Edington, Proc. Nat.Acad.Sci. USA, 74, 3903-3909, 1977/. W tej metodzie jedną jednostkę aktywności PAI określa się jako ilość białka wymaganą do zredukowania aktywności 2IU UK do 50%. W celu oznaczenia ilości PAI używa się metody wiązania aktywatora plazminogenu do ihibitora /Schleef R.R., Wagner N.V., Loskutoff D.J., J.of Cellular Physiology, 134, 269-274, 1989/. Aktywność PAI można oznaczyć również posługując się metodą Verheijena, w której używa się wzrastających stężeń tPA /0-25 IU/ml/, 1pM plazminogenu, oraz 1 pM fibrynogenu degradowanego bromocyjanem. W tych warunkach 1 IU PAI-1 określa ilość inhibitora, która hamuje 1IU tPA /Verheijen J.H., Millast D., Chang G.T.G., Kluft C., Wijngards G., Thromb. Haemostasis, 48, 266-269, 1982/. W niektórych badaniach określających poziom PAI we krwi stosuje się oznaczenia, w których podstawą jest neutralizacja tPA dodanego do próbek osocza, a mierzy się pozostałą aktywność tPA. Metody te są metodami pośrednimi i nie pozwalają precyzyjnie określić poziomu tego inhibitora .
Ostatnio opracowano metodę enzymoimmunologicznego oznaczania ludzkiego PAI-1 w teście ELISA z wykorzystaniem przeciwciał dla tego białka. Test ten polega na tym, że inkubuje się przeciwciała dla PAI-1 z badaną próbką, w której oznacza się ten antygen i po odmyciu nieswoiście związanych białek, inkubuje się kompleks antygen-przeciwciało z przeciwciałami dla PAI-1 związanymi z peroksydazą chrzanową, po czym oznacza się antygen wykrywając znacznik.
Wszystkie te metody wymagają zastosowania rodzimego białka PAI-1, zarówno do uzyskania krzywej wzorcowej, jak i swoistych przeciwciał. PAI-1 występuje w ilościach śladowych w płynach ustrojowych i komórkach, a uzyskanie tego białka metodami klasycznymi przez wyodrębnienie w ilościach wystarczających do przygotowania testu Elisa jest niezwykle skomplikowane i czasochłonne. Z drugiej strony otrzymywane dotychczas ludzkie białko PAI-1 jest niezwykle drogie i niezbyt dostępne.
Wszystkie omówione metody otrzymywania rodzimego PAI-1 są niezwykle skomplikowane, pracochłonne i kosztowne, co zawyża w znacznym stopniu koszty całego testu.
Nieoczekiwanie okazało się, że możliwe jest oznaczanie białka rodzimego PAI-1, w oparciu o metodę, w której stosuje się przeciwciała dla odpowiedniego fragmentu peptydowego. Stwierdzono, że można wykorzystać pełną reakcję krzyżową w teście immunologicznym przeciwciał otrzymanych dla fragmentu białka oraz rodzimej cząsteczki PAI-1.
W odróżnieniu od znanych metod oznaczania PAI-1, odpowiedni fragment peptydowy, a nie całe białko, może służyć do produkcji swoistych przeciwciał stosowanych w sposobie według wynalazku, rozpoznających w ten sam sposób zarówno fragment peptydowy, jak i rodzime białko PAI-1. Fragment ten również stosuje się do uzyskania krzywej wzorcowej.
165 020
Sposób oznaczania 1/lub wykrywana antygenu ludzkiego Inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu w próbce zawierającej ten antygen, z zastosowaniem przeciwciał i odczynnika dającego się oznaczyć analitycznie, polega według wynalazku na tym, że badaną próbkę kontaktuje się z przeciwciałami dla polipeptydu odpowiadającego fragmentowi o wzorze /Ya-A-/Z/b, “ którym Y oznacza sekwencję aminokwasów kodowaną przez fragment polilinkera, korzystnie Glu, Ser.
Z oznacza sekwencję Glu, Ser i/lub sekwencję kodowaną przez fragment polilinkera, a · 0 lubi, b = 0, 1 lub 2, natomiast A oznacza fragment Asn^^ - Thr2j2 ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu, po czym oznacza się wytworzony kompleks antygen-przeclwclało.
W sposobie według wynalazku stosuje się przeciwciała dla fragmentu polipeptydowego, korzystnie otrzymanego przez ekspresję zrekombinowanego DNA .
W sposobie według wynalazku stosuje się przeciwciała dla, fragmentu polipeptydowego, korzystnie otrzymanego przez ekspresję zsyntetyzowanego chemicznie.
ONA o sekwencji:
( X )„AACGGCCAGTGGAAGACACCATTCCCAGACAGTAGCACCCACCGCCGCCTCTT
CCACAAATCAGACGGAAGCACTGTCTCTGTGCCAATGATGGCTGAGACCAACAAATT
CAACTATACTGAATTCACCACGCCAGATGGACATTACTACGACATCCTGGAACTGCC
ATACCACGGAGACACT(X)m,
Zrekombinowany wektor otrzymuje się łącząc znanymi metodami wektor z fragmentem DNA kodującym polipeptyd o wzorze /Y/a -A-/Z/&, w którym symbole mają wyżej podane znaczenie. W sposobie według wynalazku stosuje się przeciwciała dla fragmentu polipeptydowego zawierającego epitopy antygenowe rozpoznawane przez przeciwciała również w rodzimej cząsteczce PAI-1. Korzystnie w sposobie według wynalazku stosuje się przeciwciała dla polipeptydu odpowiadającego fragmentowi cząsteczki PAI-1 od 172 do 232 aminokwasu od N-końca o sekwencji:
172 177 1Θ2
Asn-Gly-Gln-Trp-Ly»-Thr-Pro-Phe-Pro-Asp-Ser-Ser-Thr-Hie-Arg187 19? 197
Arg-Leu-Phe-His-LyB-Ser-Asp-Gly-Ser-Thr-Val-Ser-Val-Pro-Met202 207 212
Met-Ala-Glu-Thr—Asn-Lye-Phe-Asn-Tyr—Thr-Glu-Phe-Thr-Thr-Pro217 222 227
Asp-Gly-His-Tyr—Tyr-A6p-Ile-Leu-Glu-Leu-Pro-Tyr-Hie-Gly-Aap232
Thr.
Gen kodujący fragment polipeptydowy odpowiadający fragmentowi ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu można na przykład otrzymać z oligonukleotydowych fragmentów ligowanych in vitro.
Oligonukleotydowe fragmenty można zsyntetyzować chemicznie na nośniku poprzez kolejne przyłączanie nukleozydów z zablokowanymi grupami czynnymi. Korzystnie do ochrony funkcji aminowej stosuje się grupę izopropoksyacetylową, co przedstawiono w opisie patentowym RP nr 159 234.
Fragmenty oligonukleotydowe zsyntetyzowane chemicznie poddaje się enzymatrycznej reakcji kinazowania, w trakcie której wprowadza się fosforan na końcach 5'za pomocą kinazy polinukleotydowej i ATP. Kinazowane oligonukleotydy liguje się in vitro w dwuniciowe odcinki ograniczone sekwencjami rozpoznawanymi przez enzymy restrykcyjne. Zligowane odcinki klonuje się w wektorze pomocniczym, stosując właściwe miejsce restrykcyjne polilinkera. Poprawność sekwencji produktów ligowania i klonowania tych fragmentów sprawdza się poprzez sekwencjonowanie metodą MaxamaGilberta. Można stosować różne wektory pomocnicze, np. plazmidowe lub fagowe, przy czym korzystne są plazmidy, np. pUC19. Sklonowane w wektorze odcinki DNA namnaża się w komórkach gospodarza, którymi mogą być bakterie, drożdże i inne. Wektory z wklonowanymi odcinkami izoluje się, a następnie odcinki odzyskuje się po trawieniu restryktazami na drodze elektroforezy w żelu poliakrylomidowym. Odzyskane odcinki włącza się do wektora ekspresyjnego po trawieniu odpowiednimi enzymami restrykcyjnymi. Na tym etapie stosuje się różne wektory ekspresyjne, korzystnie plazmidowe lub fagowe. Przykładowo plazmid ekspresyjny pWR 450.1. zawiera gen kodujący B-galaktozydazę. Komórki gospodarcza, korzystnie bakterii transformowane zrekombinowanym wektorem, są po namnożeniu źródłem fragmentu białka ludzkiego PAI-1.
165 020
Wytworzony w ten sposób fragment białka PAI-1 można używać do otrzymywania stosowanych w sposobie według wynalazku przeciwciał, różnymi znanymi metodami, a także do wykreślenia krzywej wzorcowej niezbędnej do ilościowego oznaczania PAI-1.
Przykładowy sposób wytwarzania przeciwciał poliklonalnych reagujących specyficznie z białkiem ludzkiego tkankowego aktywatora plazminogenu polega na tym, że immunizuje się zwierzęta polipeptydem odpowiadającym fragmentowi o wzorze /Y/a-A-ZZ/^, w którym symbole mają wyżej podane znaczenie, pobiera się krew i odzyskuje przeciwciała.
Otrzymane w ten sposób przeciwciała można zastosować w sposobie według wynalazku, do oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu oraz do otrzymania testu diagnostycznego według wynalazku.
Wykrywanie i oznaczanie sposobem według wynalazku dogodnie jest prowadzić za pomocą testu diagnostycznego według wynalazku.
Test diagnostyczny według wynalazku charakteryzuje się tym, Ze zawiera przeciwciała dla polipeptydu odpowiadającego fragmentowi o wzorze /Υ/θ^-^^/, w którym Y oznacza sekwencję aminokwasów kodowaną przez fragment polilinkera, korzystnie Glu, Ser, Z oznacza sekwencję Glu, Ser i/lub sekwencję kodowaną przez fragment polilinkera, a = 0 lub 1, b = 0, 1 lub 2, natmiast A oznacza fragment Asn^2 - Thr2j2 ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu, ewentualnie unieruchomione na stałym nośniku lub rozpuszczone w fazie ciekłej. Przeciwciała są związane z odczynnikiem dającym się wykryć analitycznie.
Test według wynalazku zawiera przeciwciała dla fragmentu polipeptydowego, korzystnie otrzymanego przez ekspresję zrekombinowanego DNA.
Test według wynalazku zawiera przeciwciała dla fragmentu polipeptydowego, korzystnie otrzymanego przez ekspresję zsyntetyzowanego chemicznie DNA o sekwencji:
(X)nAACGGCCAGTGGAAGACACCATTCCCAGACAGTAGCACCCACCGCCGCCTCTT
CCACAAATCAGACGGAAGCACTGTCTCTGTGCCAATGATGGCTGAGACCAACAAATT
CAACTATACTGAATTCACCACGCCAGATGGACATTACTACGACATCCTGGAACTGCC
ATACCACGGAGACACT(X)„,
Zrekombinowany wektor, do ekspresji fragmentu polipeptydowego służącego do wytworzenia zawartych w teście według wynalazku przeciwciał, otrzymuje się łącząc znanymi metodami wektor z fragmentem DNA kodującym polipeptyd o wzorze /Y/z-A-/ZZb, “ którym symbole mają wyżej podane znaczenie.
Korzystnie test według wynalazku zawiera przeciwciała dla polipeptydu odpowiadającego fragmentowi cząsteczki PAI-1 od 172 do 232 aminokwasu od N-końca o sekwencji:
172 1177 182
Asn-Gly-Gln-Trp-Lye-Thr-Pro-Phe-Pro-Aep-Ser-Ser-Thr-His-Arg187 192 197
Arg-Leu-Phe-His-Lys-Ser-Asp-Gly-Ser-Thr-Val-Ser-Val-Pro-Met202 207 212
Met-Al a-G l u-Thr-Asn-Lys-Phe-Asn-T yr-Thr—Glu-Phe-Thr-Thr-Pro217 222 227
Asp-Gly-His-Tyr-Tyr-Asp-Ile-Leu-Glu-Leu-Pro-Tyr-His-Gly-Asp232
Thr.
Test według wynalazku zawiera przeciwciała dla fragmentu polipeptydowego zawierającego epitopy antygenowe rozpoznawane przez przeciwciała również w rodzimej cząsteczce PAI-1.
125
Do znakowania można stosować enzym, biotynę izotop promieniotwórczy J lub inne znane odczynniki. Wykrywanie i oznaczanie prowadzi się za pomocą sygnału wytwarzanego przez znacznik.
W tak prowadzonym procesie oznaczania lub wykrywania badaną próbkę, oznaczany antygen lub przeciwciało, unieruchamia się na stałym nośniku takim jak płytka plastikowa, bibuła nitrocelulozowa lub inne.
W sposobie i testach do oznaczania ludzkiego tkankowego aktywatora plazminogenu można stosować przeciwciała dla polipeptydu odpowiadającego fragmentowi o wzorze /Y/a-A-/Z/b, w którym symbole mają wyżej podane znaczenie, wytworzone różnymi metodami.
| 6 | 165 020 |
| Celem uproszczenia w opisie | i przykładach uZywane są następujące skróty: |
| A: adenina | Leu: leucyna |
| CC: cytozyna | Lys: lizyna |
| G: guanina | Met: metionina |
| T: tymina | Phe: f cnyloalanina |
| Ala: alanina | Pro: prolina |
| Arg: arginina | Ssr: seryna |
| Asn: asparagina | Thr·: treonina |
| Asp: kwas asparaginowy | Ττρ: tryptofan |
| Cys: cysteina | Tt^: tyrozyna |
| Gln: glutamina | Val: walina |
| Glu: kwasi glattmicnoy | DDN: kwas deoksyrybonuWleCnowy |
Gly: glicyna cDNA: komplementarny DNA
His: histydyna Tris-HcL: chlorowodorek trdjhydroksymetylo-amCnometanu
Ile: izoleucyna EDTA: kwas etylenodwuaminoczterooctowy
| 10xbufor | Eco R1 | 100mM | Tris-HCL pH 7,5 |
| 1 M NaCL | |||
| 10 mM | B-merkaptoetanol | ||
| 10xbufor | do kknazowania | 0,7 M | Tris HCL pH 7,6 |
| 0,1 M | MgCL2 | ||
| 50 mM | d^i^re^al |
| 10xbufor | llgacyjny: | 660 | mM | Tris-HCL pH 7,6 |
| 50 | mM | MgCL2 | ||
| 50 | mM | dCtCotpeitol | ||
| 10 | mM | ATP | ||
| Bufor do | ekstrakcji | 50 | mM | Tris-HCL pH 8,0 |
300 mM octan sodu
PoZywka LB
Bufor TE
Bufor z SDS
Bufor do lizy komórek
Bufor R I
Bufor R II
| 0,2% | SDS | |
| 4 mM | EDTA | |
| 10 g | Bacto | Trypton |
| 5 g | Yeast | Extract |
| 5 g | NaCL | |
| na | 1 litr | roztworu |
mM Tris^Ht^L pH 8,0 mM EDTA g Tris-HCL pH 8,0 g glicyny g SDS na 1 litr roztworu 150 mg Tris 400 mg SDS ml B-merkaptoetanol ml glicerolu 7 ml wody mM glukoza 10 mM EDTA mM Tris-HCL pH 8,0 4 mg/ml lizozymu /Pharmacia/ 0,2 M NaOH
1% SDS
165 020
Bufor R III 60 ml 5 M octan potasu
11, 5 ml kwas octowy lodowaty 28,5 ml H20
DTT: ditiotreitol
PMSF: fluorek kwasu fenylometylosulfonowego
SDS: siarczan dodecylu sodu
BSA: albumina surowicy wołu /Bovine Serum Albumin/
PBS: zbuforowany roztwór soli fizjologicznej
ATP: trdjfosforan adenozyny.
HPCL: wysokociśnieniowa chromatografia cieczowa.
EDTA: etylenodiaminotetraoctan
Na załączonych rysunkach fig. 1 przedstawia wykres hydrofobowości łańcucha polipeptydowego PAI-1. Fig. 2 przedstawia sekwencję fragmentu genu ludzkiego PAI-1 podzieloną na fragmenty syntetyzowane chemicznie. Fig. 3 przedstawia schemat konstrukcji fragmentu genu dla PAI-1 sklonowanego w wektorze rekombinacyjnym pUC-19 oraz ekspresyjnym pWR 450. Fig. 4 przedstawia elektroforezę w żelu poliakryloamidowym zawierającym SDS ekstraktów białkowych otrzymanych z komórek E.coli oraz oczyszczonego kompleksu białkowego PAI-1 z B-galaktozydazą: 1 - ciałka inkluzyjne rozpuszczone w zbuforowanym roztworze 6 molowego mocznika, 2 - oczyszczone białko hydrobowe B - galaktozydaza - fragment peptydowy PAI-1. Fig. 5 przedstawia schemat rozbicia kompleksu białkowego i oczyszczania fragmentu Asn172-Thr232 PAI-1· Przedstawione odcinki b-galaktozydazy przypadają na długość od 4 do 182 aminokwasów. Fragment PAI-1 po rozbiciu kompleksu składa się z 61 aminokwasów.
Wynalazek jest bliżej wyjaśniony w przykładach wykonania nie ograniczających jego zakresu.
Przykład I.
Etap 1.
A. Synteza oligonukleotydów.
Syntezę 10 oligonukleotydowych fragmentów /fig. 2/ przeprowadza się metodą amidofosforynową na stałym nośniku. Jako nośnik stosuje się szkło o kontrolowanej porowatości, typu LCA-CPG, ze związaną pierwszą Jednostką nukleozydową. Jednostka ta ma przyłączoną na końcu 5'-OH deoksyrybozy blokującą grupę kwasolabilną - dimetoksytrityl /DMT/, którą usuwa się w środowisku kwaśnym. Odsłonięta w ten sposób grupa 5'-OH jednostki nukleozydowej przyłącza prekursor kolejnej jednostki: 3'- amidofosforyn odpowiedniego nukleozydu. Za pomocą jodu w obecności wody dokonuje się utlenienia grupy fosforynowej do fosforanu. Następnie usuwa się DMT z przyłączonej jednostki - tym samym cykl rozpoczyna się na nowo. W celu usunięcia nieprzereagowanych jednostek z wolnymi grupami 5‘-OH stosuje się t.zw. capping, tj. zablokowanie pomyłkowych sekwencji przez acetylowania bezwodnikiem octowym w obecności aktywatorów. Po utworzeniu żądanego oligonukleotydu odcina się go od złoża i usuwa inne grupy wodnym roztworem amoniaku, oczyszcza elektroforetycznie następnie odsala metodą HPLC. /Waters C-18 RP, 10pm/. Oligonukleotydy przechowuje się w porcjach po ok. 0,5 OD.
B. Proces kinazowania i ligacji.
Poszczególne fragmenty nici DNA rozpuszcza się w wodzie destylowanej, tak aby w 5 pl znajdował się 1 pg fragmentu. Miesza się po 5 pl roztworu fragmentów od 1 do 5 /I nić DNA/ i od 5 do 10 /II nić DNA/. Do mieszaniny fragmentów dodaje się 0,1 objętości buforu do kinazowania /50 mM Tris-HCL, 5 pM MgCL2® 5 pl 20 mM ATP, 1 pl kinazy polinukleotydowej B /T4 polinukleotide kinase/. Reakcję prowadzi się przez 4 godziny w temperaturze 37°C. Miesza się obie nici i inkubuje przez 20 minut w temperaturze 100°C. Po powolnym ostudzeniu dodaje się do każdej próbki po 0,1 objętości buforu do ligacji, po 1 pl 200 mM ATP, i pl ligazy T4. Po dokładnym wymieszaniu reakcję prowadzi się przez 12 godzin w temperaturze 4°C.
C. Hydroliza enzymami.
Do rozpussczooeeg ONA /88 pl/ dodaje się 10xi0pi buforr EcoRi, 2U restrrytaaz EccRI /firmy Pharmacia/ oraz wody do objętości 100pl. Mieszaninę ęnksbuee się w temperaturze 37°C przez 2 ggdziny. Po ttm czasie DNA sstąca ssę etanolem, dodając 3 objętości alkoholu etylowego /99,8%/, wymraża się w -20°C przez 5 minut, a następnie odwirowuje się przy 15 tys. obr., przez
165 020 minut. Osad rozpuszcza się w 20 μΐ buforu TE. W ten sam sposób postępuje się podczas hydrolizy restryktazą Pst I.
D. Rozdział elektroforetyczny.
W celu sprawdzenia czy zligowane fragmenty DNA mają odpowiednią długość, rozdziela się je w 8\ żelu poliakryloamidowym z SDS w TBE. Rozdział prowadzi się przy napięciu 130 V w ciągu 3 godzin. Żel. zzbarwia się bbrmkiem ettdyny /0,3 pg/ml - fiimy SSrra/ przez 20 minut w temperaturze pokojowej, następnie płucze się 0 x wodą destylowaną. Rozdzielone produkty obserwuje się pod lampą UV. W celu oceny wielkości fragmentów DNA podczas elektroforezy używa się następujących wzorców: pUC 19 trawiony Msp, pUC 19 trawiony Bsp RI. Zligowane fragmenty posiadają oczekiwaną długość. Po elektroforezie sprawdzającej wykonuje się elektroforezę preparatywną i uzyskuje się tą drogą fragment, który następnie liguje się z plaa-iyt- pUC 19 trawionym Eco ki i Pst I w sposób wyżej opisany.
E. Przygotowanie kompetentnych komórek.
Z płytki z wysianymi bakteriami DH5, pobiera się jedną kolonię, którą szczepi się na 5 ml pożywki LB. Bakterie hoduje się w etmreraturzt 37°C przez 18 godzin. Do 100 ml pożywki LB dodaje się 0 ml otrzymanej hodowli i prowadzi się hodowlę do gęstości optycznej OD 600=0,3. Zawiesinę bakterii zwirowoje się /5 tys. obr. 00-in./, a osad bakteryjny schładza się i zawiesza w 50 ml buforu SB i umieszcza w temperaturze 0°C. Zwirowuje się jak wyżej, a osad zawiesza w 1/10 objętości wyjściowej buforem SB. Inkubuje się 00 minut w temperaturze o°C. Po tym czasie z zawieszonych komórek pobiera się do sterylnych probówek po 000 gl zawiesiny komórek i inkubuje 30 minut w 0°C. Dodaje się 7 gl DTT i plazmidy /00 gl/. Inkubuje się w lodzie /o°C/ 30 minut, a następnie 45 sekund w 45°C. Ochładza się w lodzie i dodaje 800 gl pożywki LB a następnie inkubuje 1 godzinę w 37°C. Po tym czasie posiewa się na płytki. Wylewa się 000 gl mieszaniny ligacyjnej na płytkę i inkubuje się w 37°C przez 18 godz.
F. Analiza otrzymanych transformatorów.
Po 18 godzinach na płytce z wysianą mieszaniną transformacyjną obserwuje się pojedyńcze kolonie. Do dalszej analizy wybiera się 10 kolonii. 5 ml pożywki szczepi się pojedynczymi koloniami i hoduje w 37°C przez 18 godzin, a następnie izoluje plazmidowy ONA. Preparaktyka plazmi dowego DNA z 5 ml pożywki przebiega w następujący sposób:
Bakterie zwirowuje się /5 minut 5 obr./^n./. Osad bakteryjny zawiesza się w 000 gl buforu RI i przetrzymuje 5 minut w temperaturze 0°C. Dodaje się 400 gl RII /0°C/, a następnie 300 gl RIII /0°C/. Całość zwirowuje się /15 tys. obr./min., 5 minut/. Supernatant przenosi się znad osadu do nowej probówki i dodaje się 0,5 objętości izopropanolu. Wymraża się w -00°C, zwirowuje, osad płucze 70% etanolem i suszy pod próżnią. Osad rozpuszcza się w 000 gl TE i dodaje 00 gl roztworu RNazy o stężeniu 1 mg/ml. Inkubuje się 30 minut w 37°C. Dodaje się 000 gl fenolu. Zbiera się fazę wodną i dodaje 000 gl mieszaniny chloroform/alkohol izo amylowy /04:1, a/a/. Zwirowuje się, zbiera supernatant, czynności powtarza się jeszcze raz. Do fazy wodnej dodaje się 0,1 objętości 3 M objętości 3 M octanu sosu /pH=5.0/ oraz 0,5 objętości etanolu i wymraża 30 minut w -00°C. Zwirowuje się /15 tys. obr./min/, a osad przemywa 70% etanolem i suszy. Osad plazmidowego ONA rozpuszcza się w 40 gl buforu TE.
W celu wybrania klonu zawierającego plazmid pUC 19 z wklonowanym dwuniciowym fragmentem, przeprowadza się analizę otrzymanych ONA plazmidowych przy użyciu enzymów restrykcyjnych EcoRI i Pss I, a ppodduky ttawiieii rozayaetl ssi w ζθΙι prdlekryloamidowym. Τ^κΙ^ιι pp^epowadza się Jak w punkcie C, a rozdział tlektaoforetycany jak w D.
C. Sprawdzenie sekwencji sklonowanych fragmentów.
W celu upewnienia się czy sekwencja sklonowanego fragmentu Jest prawidłowa, fragmenty sekwencjonuje się metodą Maxama i Gilberta /Maxam & Gilbert, Methods in Enzymo^gy, 1980, 65 /.
H. Konstrukcja wektora ekspresyjnego.
Sprawdzony ywunicidwy fragment DNA kodujący rdllptpeyy Asnl72-Thr2l2» liguje się z wektorem ekspresyjnym pWR.450 trawionym enzymami restrykcyjnymi EcoRI i Pst.I. Uzyskuje się aaekdmbinowany plazmid ekspresyjny pW-PAI-1. Transformowanie komórek bakteryjnych prowadzi się Jak w punkcie E.
165 020
I. Oczyszczanie ciałek inkuzyjnych.
Bakterie z kolonii bakteryjnej zawierającej zrekombinowany plazmid przenosi się do probówki zawierającej 1 ml pożywki LB ° 5 pl ampicyliny o stężeniu 100 pg/ml i inkubuje przez 2 - 5 godzin w temperaturze 07°C z ciągłym wytrząsaniem. Zawiesinę bakterii namnożonych w tej probówce przenosi się do kolby zawierającej 1 l pożywki LB ° 1 ml ampicyliny o stężeniu 100 pg/ml. Hodowlę prowadzi się 14 godzin, w temperaturze 57°C z ciągłym wytrząsaniem. Następnie bakterie zwirowuje się /15 min., 5000 obr./min./ i osad zawiesza się w 200 ml 0,1 N CaC^ /buforowanym Trisem, pH=7,5/. Po inkubacji przez 2 0 minut w łaźni lodowej, zawiesŁnę wiruje się przez 20 minut przy 12000 obr./min. w temeeraturze +4°C i osad ponownie zawiesza się w 220 ml 0,1 M
CaCl£. Po kolejnej inkubacji pnee 2 ęgodiny w jaźni loodoee zzwieesnę wiruje ssę /w dwóch probówkach elrowylzzych/ j.w. Osad o awieszz się w 02 ol j/o oob .probówe MoooW^ ssi ęo 20 ml/ buforu fosforanowego, pH 6.2, a następnie dodaje się po 200 pl 1 N glicerolu i 400 pl 1% glicerolu do obu probówek. Ogrzewa się je do temperatury pokojowej, dodaje pp 44 pl o,, M EDTA, pH B.0 i po krótkiej inkubacji, schładza w łaźni lodowej do temperatury około 0°C. Następnie próbówki wstawia się na 1 minutę do łaźni o temperaturze 42°C /szok tarmeczyy/. Wiruje jak wyżej. Osad po schłodzeniu zawiesza się w 100 ml 100 mN Tris-HCl, pH B.0, zzwinarWjąym 10 mN EDTA, lykzbuje przez 5 minut w temperaturze 0°C i odwirowuje. Osad zawiesza się w 55 mm H0 oM TrtesHCI, 10 eP EDTA, 100 pM B-ME, 1 pM PMS,, 1% Triton Χ-100 , ęB 8.0. Poddaj® się go działaniu ultradźwięków - 10 razy pp 50 sse.. pp czzm odwioewuje jeę i20 200 00r./min., 0emp. o 4 °C/ otrzymując w ten sposób osad ciałek inkluzyjnych, które następnie przemywa się zawieszając je w ml buforu 5 0 mM Τ^β-ΗΙ,Ο , pH 7.4, 1 mM PMS, , 0 i-M EOAA, oo ponownym ich żwirowaniu r^o^pu szcza się je w 9 N moczniku. W celu pozbycia się reszty zanieczyszczeń /neatoiruszczonych ciałek ^^uzyjnych/ zawiesinę ponownie wiruje się /20 000 obr,/een, 00 min, temp. ° 4°C/. W supernatwnzle winna znajdować się główna część białka. Dalsze oczyszczania białka hybrydowego zawierającego fragment Asn172-Dhr202 PAI-1 przeprowadza się na kolumnie EEAE-Marhwcel.
Białka zawarte w ciałkach ^^uzyjnych rozpuszczone w 9 N moczniku dializuje się do roztworu 6 P mocznika, 50 mN Drii-HCl, pH 7.5, zawierającego 10 eP EDTA, 1 mP PNSS. Tye samym buforem równoważy się dwie kolumny wypełnione złożem DETE-MephαceO /o wymiarach 2,5 x 10 cm/. Na jedną z nich nanosi się roztwór białek. Część białka, która po przejściu przez kolumnę nie zwiąże się ze złożem, nanosi się /po 2-3 krotnym rozcieńczeniu tym samym buforem/ na drugą kolumnę. Czysty koniugat wymywa się ze złoża 0,1 P NaCl.
J. Rozbicie kompleksu na drodze reakcji chemicznej.
Oczyszczone białko hybrydowe złożone z fragmentu B-gaOakrozmOwiy oraz fragmentu Asy172-Dhr202
PAI-1 dializuje się wobec buforu 10 eP Trei-HC0, pH 7.5 w celu usunięcia mocznika, a następnie liofilizuje. Rozszczepienie wiązania Ain-G0m przeprowadza się stosując 2P hydroksyloaminę w 6N chlorowodorku guanidyny, pH 9.0. Reakcję prowadzi się w temperaturze 45°C. Rozbicie koniugatu sprawdzana alekrroUoretycznie.
Produkty powstałe w wyniku tej reakcji analizuje się w żelu poOiakryOoaMiOoeym po elektroforezie.
K. Sposób wyodrębniania fragmentu Asn^-Thr232 /PAI-1/ ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora pOazeenogeyz za pomocą HPLC.
Fragment po01pertyOowy odpowiadający fragmentowi Asnw^2-Dht232 /PAI-1/ ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plαiminoganu izoluje się z hydrolizatu otrzymanego w sposób jak opisano w punkcie I za pomocą HPLC. Rozdział chromatograficzny przeprowadzono na kolumnie semlptarαrαtywyeJ TSK G0000SW firey LKB, Szwecja.
Etap 2.
A. Otrzymanie przeciwciał przy wykorzystaniu wytworzonego fragmentu polirartmOowego.
W celu otrzymania surowicy poligonalnej dla fragmentu białka ludzkiego PAI-1 iemunizuje się tym, białkiem króliki. Śródskórnie podaje się na drodze 00 - 40 iyjakcji dawki 50 pg antygenu w 0.5 ml PBS i wymieszanego z 0.5 el kompletnego a01ueaytu Freuda. Po 7 dniach od każdego szczepienia pobiera się krew z żyły usznej królików. Po wyk^epieniu w temperaturze 07°C przez 0.5 - 1.0 godziny, skrzep oddziela się od ścianek probówki i całość pozostawia w temperaturze 4°C na 12 - 24 godziny. Następnie surowicę odciąga się do jałowych probówek wirówkowych i wiruje przy 0 000 obr/min przez 20 minut. Surowicę iyαkrmwzje się podczas inkubacji
165 020 przez 30 minut w temperaturze 56°C. Miano poszczególnych próbek surowic określa się metodę radiolmmunologiczną, oznaczając ich zdolność do wiązania znakowanego antygenu. Surowice o najwyższym mianie przeciwciał przechowuje się w temperaturze -20°C.
B. Oczyszczanie przeciwciał.
Przeciwciała dla fragmentu PAI-1 oczyszcza się z surowicy odpornościowej za pomocą chromatografii powinowactwa. ImmunoadsorDent zawiera fragment białka PAI-1 związany ze zło2em CNBr-Sepharose 4B /Pharmacia/. W celu przygotowania immunoadsorbentu 1 g złoża przemywa się 200 ml roztworu 0.001 mol/l HCl i następnie zawiesza w buforze boranowym /pH 8.3/. Natychmiast dodaje się 20 mg fragmentu białka PAI-1 rozpuszczonego w PBS i delikatnie miesza w temperaturze 4°C przez 2 godz. Po odwirowaniu sprawdza się stężenie białka w supernatancie. Złoże zawiesza się następnie w roztworze glicyny /2 mol/l/ w buforze boranowym o pH 8.3. Po 1-godzinnej inkubacji odwirowuje się je /10 min. 4 000 obr/min/ i przemywa się je 3x buforem boranowym /pH 8.3/, 1x wodą destylowaną, 3x buforem boranowym /pH 8.3/. Z otrzymanym w ten sposób złożem inkubuje się 15 ml surowicy otrzymanej po immunizacji fragmentem białka PAI-1, delikatnie mieszając przez 12 - 14 godzin w temperaturze 4°C. Do mieszaniny dodaje się 1 mM PMSF /Sigma/ oraz 1 mM chlorku benzamidyny /Biochemical/. Po odwirowaniu /10 min., 3 000 obr/min / złoże przemywa się buforem /PBS z 1% Tween 20/, a następnie 4x buforem /1 M/1 NaCl z 1% tween 20 w PBS/. Po każdym wirowaniu sprawdza się zawartość białek w supernantancie poprzez pomiar adsorpcji światła przy 400 nm. Następnie złoże umieszcza się w kolumnie /0,7 x 10 cm/. Przeciwciała specyficznie związane z unieruchomionym na złożu białkiem eluuje się roztworem 0,5 mol/l kwasu octowego i zbiera się do probówek zawierających 100 pl roztworu 2 mol/l Tris Frakcje o dużej zawartości białka łączy się i dializuje wobec PBS rzeez 44 godziny w 4°C.
C. Sprzęganie przeciwciał z peroksydazą.
Użyskane w ten sposób przeciwciała dla fragmentu białka PAI-1 sprzęga się z peroksydazą. W tym celu rozpuszcza się 5 mg HRPO w 1m1 świeżo przygotowanego 0.3 M kwaśnego węglanu sodu /NaHCOj/, pH 8.1. Następnie dodaje się 0.1 ml 1% FDNB w alkoholu absolutnym. Delikatnie wytrząsa się przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej. Dodaje 0.0 4 - 0.0Β M NaJO4 /rozpuszcza w wodzie destyl./, delikatnie miesza przez 30 min. w temperaturze pokojowej. Kolor tego roztworu wwiiie stać się zielonożółty. Następnie dodaje się 1.0 ml 0.16 M glikolu etylenowego /rozp. w wwozzi dest./ i delikatnie miesza w temperaturze pokojowej przez 1 godzinę. Po zakończeniu inkubacji roztwór dializuje się wobec 0.01 M węglanu sodu, pH 9.5, temperatura 4°C /co najmniej 3 1-litrowe zmiany/. Do 3 ml roztworu tak przygotowanego aldehydu peroksydazy /HRPO/ dodaje się 5 mg IgG i delikatnie miesza przez 2-3 godzin w temperaturze pokojowej. IgG rozpuszcza się w 1 ml buforu węglanowego przed zmieszaniem lub dodaje w postaci zllofllizdwanegd proszku wolnego od soli. Po dodaniu IgG wprowadza się 5 mg NaBH4 i pozostawia w 4°C od 3 do 12 godzin. Następnie roztwór dializuje się w 4°C wobec PBS. Jeśli powstaje precypitat, usuwa się go przez wirowanie. Próbkę nanosi się na kolumnę /85 x 1.5 cm/, Sephadex G-100, zrównoważoną PBS. Zbiera się frakcje po 1.5 ml i poziom białka w poszczególnych frakcjach oznacza spektrofotometrycznie. Frakcja IgG znakowanych HRPO schodzi w pierwszym szczycie. Roztwory tego koniugatu przechowuje się w obecności albuminy surowicy wołowej o stężeniu 10 mg/ml w temperaturze -20°C. Etap 3.
Opłaszczanie płytki przeciwciałami i wykonanie testu ELISA.
Studzienki w płytce do testu ELISA opłaszcza się przeciwciałami poliklonalnymi dla fragmentu polipeptydowego Asn^2-Thr232 białka PAI-1 o stężeniu 10 pg/ml, zawieszonymi w 50 mM buforze fosforanowym o pH 7.5. Niezwiązane białko odmywa się, a powierzchnię studzienek opłaszcza albuminą. Testowane próbki osocza rozcieńcza się przed oznaczeniem 50 mM buforem fosforanowym, pH 7.5, zawierającym 0.15 M NACl, 10 mM EDTA, 1% Tween 20 i 1% BSA i dodaje się po 200 pl/dołek. Inkubuje się przez 2 godziny w temperaturze pokojowej. Po zakończeniu inkubacji płytki 5-krotnie przemywa się 0.15 M NaCl zawierającym 0.1% Tween 20. Następnie dodaje
165 020
200 pl koniugatu IgG-HRP / przeciwciała poliklonalne dla całej cząsteczki PAI-1 związane z peroksydazą/ o stężeniu 5 pg/ml. Inkubuje 2 godziny w temperaturze pokojowej i ponownie 5-krotnie przemywa. W celu wywołania reakcji enzymatycznej dodaje 9ię po 200 pl roztworu substratu /0.4 mg/ml ortofenylodiaminy w 0.05 M buforze cytrynianowym, pH 5.0, zawierającym 0.02% H^Oj/. Po 15 minutach inkubacji pojawia się zabarwienie i reakcję hamuje się przez dodanie 50 pl 3 M kwasu siarkowego. Adsorbancję mierzy się przy 490 nm.
Przykład II. Detekcja antygenu PAI-1 w badanej próbce za pomocą przeciwciał dla fragmentu polipeptydowego odpowiadającego fragmentowi Asnj72-Thr 02 dokie^on inhiborooa tkankowego aktywatora plazminogenu.
Do unieruchomionego antygenu dodaje się wyznakowane peroksydazą przeciwciała dla fragmentu polipeptydowego odpowiadającego fragmentowi ASn172-THr2j2 ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu i inkubuje się przez 2 godziny w temperaturze pokojowej. Do wywołania reakcji enzymatycznej stosuje się roztwór substratu - 0.4. mg/ml ortofenylodiaminy w 0.05 M buforze cytrynianowym, pH 5.0, zawierającym 0.02% H2O2/. Po 6 minutach inkubacji pojawia się zabarwienie i reakcję hamuje się przez dodanie 50 pl 3 M kwasu siarkowego. Adsorbancję mierzy się przy 490 nm. Wynik odczytuje się z krzywej wzorcowej dla standartowego roztworu PAI-1.
Przykład III. Diagnostyczny zestaw testowy dla oznaczania poziomu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu składa się z: pojemnika zawierającego zbuforowany roztwór soli fizjologicznej /PBS/, pH 7.5, EDTA, Tween 20; pojemniczka z albuminą surowiczą; pojemniczka z przeciwciałami dla fragmentu polipeptydowego odpowiadającego fragmentowi Asn172Thr232 ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu; pojemniczka z wyznakowanymi peroksydazą przeciwciałami dla PAI-1; pojemniczka z substratem /ortofenylodiaminą/; pojemniczka z buforem cytrynianowym, pH 5.0 i pojemniczka z 3 M kwasem siarkowym.
165 020
GAATCTAACGGCCAGTGGAAGACACCATTCCCAGACAGTAGCACCCACCGCCGCCTCTTCCA
GATTGCCGGTCACCTTCTCTGGTAACGGTCTGTCATCGTGGCTGGCGGCGGAGAAGOT
CAAATCAGACGGAAGCACTGTCTCTGTGCCAATGATGGCTGAGACCAACAA ATTCAACTATA
GTTTAGTCTGCCTTCGTGACAGAGACACGGTTACTACCGACTGTGGTTGTTTAAGTTGATAT
CTGAATTCACCACGCCAGATGGACATTACTACGACATCCTGGAACTGCCATACCACGGAGAC
GACTTAAGTGGTGCGGTCT ACCTGTA ATGATGCTGTAGGACCTTGACGGTATGGTGCCTCTG
ACT
TGAATCT
3‘
5’
1.CGGTCACCTTCTGTGGTAAGGGTCTGTC
ATCGTGGGTGGCGGCGGACAAGGTGTTlAGTCTGCCTTCG dolna nić
3.TGACAGAGACACGGTTACTACCGACTCTGCTTG
TTTAAGTTGATATGACTTAAGTGGTGCGGTCTAC.CTGTAA
5. TGATGCTGTAGGACCTTGACGGTATGGTGCCTCTGTGAATCT
«.TCACAGAGGCACCAΓACCGTCAAGGTCCTACAGCATCATTAC
7.AGGTAGACCGCACCACTTAAGTCATATCAACT
0.TAAACAACCAGAGTCGGTAGTAACCGTGTCTCTGTCACGA górna nić
9. AGGCAGACTAAACACCTTCTCCGCCGCCACCCAC
10. GATGACAGACCCTTACCACAGAAGGTGACCGGCAATCTAAG.
Fig. 2
165 020
Eco RI Pst I
Fig. 3
165 020
Fig.4
165 020
BETA - GALAKTOZYDAZA : BIAŁKO ΡΛ1
produkty degradacji beta-galaktozydazy białko PAI
oczyszczenie produktów hydrolizy
Fig.5
165 020
Δ
Fig.l
Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 90 egz. Cena 10 000 zł
Claims (7)
- Zastrzeżenia patentowe1. Sposób oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu w próbce zawierającej ten antygen, z zastosowaniem przeciwciał i odczynnika dającego się oznaczyć analitycznie, znamienny tym, że badaną próbkę kontaktuje się z przeciwciałami dla polipeptydu odpowiadającego fragmentowi o wzorze /Y/a-A-/Z//b> w którym Y oznacza sekwencję aminokwasów kodowaną przez fragment polilinkera, korzystnie Glu, Ser, Z oznacza sekwencję Glu, Ser i/lub sekwencję kodowaną przez fragment polilinkera, a = 0 lub 1, b = 0, 1 lub 2, natomiast A oznacza fragment Asn^? - Thrj^ ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu, po czym oznacza się wytworzony kompleks antygen-przeciwciało.
- 2. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że stosuje się przeciwciała dla fragmentu polipeptydowego, otrzymanego przez ekspresję zrekombinowanego DNA.
- 3. Sposób według zastrz. 2, znamienny tym, że stosuje się przeciwciała dla fragmentu polipeptydowego otrzymanego przez ekspresję zsyntetyzowanego chemicznie DNA o sekwencji.(X)„AACGGCCAGTGGAAGACACCATTCCCAGACAGTAGCACCCACCGCCGCCTCTT CCACAAATCAGACGGAAGCACTGTCTCTGTGCCAATGATGGCTGAGACCAACAAATT CAACTATACTGAATTCACCACGCCAGATGGACATTACTACGACATCCTGGAACTGCCATACCACGGAGACACT(X)„,
- 4. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że stosuje się przeciwciała dla fragmentu polipeptydowego o sekwencji aminokwasów:Asn-Gly-Gln-Trp-Lys-Thr—Pro-Phe-Pro-Aap-Sei—Se» Thr-His-ArgArg-Leu-Phe-His-Lye-Ser-Asp-Gly-Sei—Thr—Val-Ser-Val-Pro-MetNet-Ala-Glu-Thr-Asn-Lys-Phe-Asn-Tyr-Thr-Glu-Phe-Thr-Thr-ProAsp-Gly-Hls-Tyι—Tyr—Asp-Ile-Leu-Glu-Leu-Pro-Tyr His-Gly-AspThr.
- 5. Test diagnostyczny do oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu, z zastosowaniem przeciwciał i odczynnika dającego się oznaczyć analitycznie, znamienny tym, że zawiera przeciwciała dla polipeptydu odpowiadającego fragmentowi o wzorze /Y/a-A-/Z/b, w którym Y oznacza sekwencję aminokwasów kodowaną przez fragment polilinkera, korzystnie Glu, Ser, Z oznacza sekwencję Glu, Ser i/lub sekwencję kodowaną przez fragment polilinkera, a = 0 lub 1, b = 0, 1 lub 2, natomiast A oznacza fragment Asn172 - Thr232 ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu, ewentualnie unieruchomione na stałym nośniku lub rozpuszczone w fazie ciekłej, przy czym przeciwciała są związane z odczynnikiem dającym się wykryć analitycznie.
- 6. Test według zastrz. 5, znamienny tym, że zawiera przeciwciała dla fragmentu polipeptydowego, otrzymanego przez ekspresję zrekombinowanego DNA.
- 7. Test według zastrz. 6, znamienny tym, że zawiera przeciwciała dla fragmentu polipeptydowego otrzymanego przez ekspresję zsyntetyzowanego chemicznie DNA o sekwencji:(X)„AACGGCCAGTGGAAGACACCATTCCCAGACAGTAGCACCCACCGCCGCCTCTTCCACAAATCAGACGGAAGCACTGTCTCTGTGCCAATGATGGCTGAGACCAACAAATTCAACTATACTGAATTCACCACGCCAGATGGACATTACTACGACATCCTGGAACTGCC ATACCACGGAGACACT (X )m,B. Test według zastrz. 5, znamienny tym, że zawiera przeciwciała dla fragmentu polipeptydowego o sekwencji:165 020A»n-Gly-Gln-Trp-Lys-Thr-Pro~Phe-Pro-Asp-Ser-Ser-Thr-His-ArgArg-Leu-PhB-His-Lys-Ser-Aep-Gly-Sei—Thr-Va l -Ser—Val-Pro-MetMet-Ala-Glu-Thr-Asn-LyR-Phe-Asn-Tyr-Thr-Glu-Phe-Thr-Thł—ProAep-Gly-His-Tyr-Tyf—Asp-Ile-Leu-Glu-Leu-Pro-Tyr-His-Gly-AepThr.* * *
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PL30054690A PL165020B1 (pl) | 1990-04-25 | 1990-04-25 | Sposób oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu i test diagnostyczny do oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu PL |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| PL30054690A PL165020B1 (pl) | 1990-04-25 | 1990-04-25 | Sposób oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu i test diagnostyczny do oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu PL |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PL165020B1 true PL165020B1 (pl) | 1994-10-31 |
Family
ID=20060941
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL30054690A PL165020B1 (pl) | 1990-04-25 | 1990-04-25 | Sposób oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu i test diagnostyczny do oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu PL |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| PL (1) | PL165020B1 (pl) |
-
1990
- 1990-04-25 PL PL30054690A patent/PL165020B1/pl unknown
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| KR101067817B1 (ko) | Aimp1 폴리펩티드에 대한 항체를 포함하는 관절염 진단용 조성물 | |
| Rittenhouse et al. | Peptide mapping by polyacrylamide gel electrophoresis after cleavage at aspartyl-prolyl peptide bonds in sodium dodecyl sulfate-containing buffers | |
| Burlingame et al. | Subnucleosome structures as substrates in enzyme-linked immunosorbent assays | |
| Schröder et al. | Purification of brain tubulin-tyrosine ligase by biochemical and immunological methods. | |
| ES2240979T3 (es) | Enzima para la escision de la region de anclaje de las proteinas superficiales de bacterias gram positivas. | |
| Bulinski et al. | Peptide antibody specific for the amino terminus of skeletal muscle alpha-actin. | |
| BENGTSSON‐OLIVECRONA et al. | Lipoprotein lipases from cow, guinea‐pig and man: Structural characterization and identification of protease‐sensitive internal regions | |
| Costa-Rodrigues et al. | Pex5p, the peroxisomal cycling receptor, is a monomeric non-globular protein | |
| US5445820A (en) | Streptolysin O peptide antigens and methods for the determination of streptolysin antibodies | |
| US5457029A (en) | Nuclear antigen La | |
| Donahue et al. | Three-dimensional structure of the platelet integrin recognition segment of the fibrinogen gamma chain obtained by carrier protein-driven crystallization. | |
| JPH07191024A (ja) | イムノアッセイ用合成スタンダード | |
| Schulze et al. | Structural and cell-adhesive properties of three recombinant fragments derived from perlecan domain II | |
| Dardik et al. | The structure of endothelial cell thrombospondin: Characterization of the heparin‐binding domains | |
| US5789382A (en) | Retro-peptide fibroblast growth factor which blocks FGF receptor | |
| Gibson et al. | Structural differences in the catalytic subunits of form I and form II ribulose 1, 5-bisphosphate carboxylase/oxygenase from Rhodopseudomonas sphaeroides | |
| Pozzi et al. | Chemical synthesis and characterization of wild‐type and biotinylated N‐terminal domain 1–64 of β2‐glycoprotein I | |
| PT98589A (pt) | Processo de preparacao de um peptido derivado da alfa1-microglobulina humana e de anticorpos de determinacao da alfa1-microbulina humana num liquido e de producao de fita de teste | |
| PL165020B1 (pl) | Sposób oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu i test diagnostyczny do oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu PL | |
| Holland et al. | Deriving the generic structure of the fibronectin type II domain from the prothrombin Kringle 1 crystal structure. | |
| ES2316911T3 (es) | Anticuerpos dirigidos contra el gragmento f1+2 de la protrombina, su preparacion y uso. | |
| PL164992B1 (pl) | Sposób konstruowania zrekombinowanego wektora do klonowania i/lub ekspresji w komórkach gospodarza bakteryjnego do wytworzenia polipeptydu zdolnego do produkcji przeciwcial reagujacych specyficznie z bialkiem ludzkiego inhibitora tkankowegoaktywatora plazminogenu PL | |
| PL164952B1 (pl) | Sposób oznaczania i/lub wykrywania antygenu ludzkiego Inhibitora tkankowego aktywatora plazmlnogenu i test diagnostyczny do oznaczania l/lub wykrywania antygenu ludzkiego Inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu PL | |
| PL165793B1 (pl) | Sposób wytwarzania polipeptydu, zdolnego do produkcji przeciwciał reagujących specyficznie z białkiem ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu | |
| PL164991B1 (pl) | Sposób wytwarzania przeciwcial poliklonalnych reagujacych specyficznie z bialkiem ludzkiego Inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu PL |