LT6331B - New recombinant antibody against human carbonic anhydrase xii - Google Patents
New recombinant antibody against human carbonic anhydrase xii Download PDFInfo
- Publication number
- LT6331B LT6331B LT2014140A LT2014140A LT6331B LT 6331 B LT6331 B LT 6331B LT 2014140 A LT2014140 A LT 2014140A LT 2014140 A LT2014140 A LT 2014140A LT 6331 B LT6331 B LT 6331B
- Authority
- LT
- Lithuania
- Prior art keywords
- antibody
- seq
- xii
- carbonic anhydrase
- amino acid
- Prior art date
Links
Landscapes
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
Description
Išradimo sritisField of the Invention
Išradimas priskirtinas baltymų biotechnologijos sričiai; jis aprašo rekombinantinio antikūno, kuris atpažįsta ir specifiškai jungiasi prie žmogaus karboanhidrazės XII ir ją neutralizuoja, gavimą bei unikalių imunoglobulino molekulės aminorūgščių sekų, būtinų antikūno-antigeno sąveikai, apibūdinimą.The invention relates to the field of protein biotechnology; it describes the preparation of a recombinant antibody that recognizes and specifically binds to and neutralizes human carbonic anhydrase XII, and describes unique amino acid sequences of the immunoglobulin molecule required for antibody-antigen interaction.
Išradimo technikos lygisBACKGROUND OF THE INVENTION
Karboanhidrazės (CA) yra cinko metalo fermentai randami beveik visuose gyvuose organizmuose, dėl savo katalizuojamos reakcijos svarbos dalyvaujantys įvairiuose fiziologiniuose procesuose. Žmogaus organizme aptikta 15 α-CA šeimos izoformų, kurios paplitusios įvairių organų ir audinių ląstelėse (eritrocituose, žarnyne, riebaliniame audinyje, inkstuose, plaučiuose, virškinamajame trakte, smegenyse, akyse, kapiliarų endotelyje, kepenyse, seilėse) [Gilmour K. M. Biochem Physiol A Mol Integr Physiol. 2010, 157, pp.193-197].Carbonic anhydrase (CA) is a zinc metal enzyme found in almost every living organism, due to the importance of its catalyzed reaction in various physiological processes. 15 isoforms of the α-CA family have been detected in the human body and are found in cells of various organs and tissues (erythrocytes, intestines, adipose tissue, kidneys, lungs, gastrointestinal tract, brain, eyes, capillary endothelium, liver, saliva) [Gilmour KM Biochem Physiol Integr Physiol. 2010, 157, pp.193-197].
CA IX ir CA XII- membraniniai fermentai, kurių raiška padidėja esant vėžiniams pakitimams, ypač susidarius hipoksijos sąlygoms, kurios būdingos kietiems navikams. Dėl šios priežasties CA IX ir CA XII raiška siejama su vėžio vystymusi. Manoma, kad šie fermentai tiesiogiai veikia naviko progresavimą, nes prisideda prie naviko aplinkos rūgštėjimo, viduląstelinio pH reguliavimo - todėl vėžinės ląstelės lengviau išgyvena hipoksijos sąlygomis, gali lengviau metastazuoti. [Kailio H. J Cancer Mol. 2010, 5, pp.73-78],CA IX and CA XII are membrane enzymes with increased expression in cancerous lesions, particularly under conditions of hypoxia that are characteristic of solid tumors. For this reason, CA IX and CA XII expression is associated with cancer development. These enzymes are thought to have a direct effect on tumor progression by contributing to the acidification of the tumor environment, the regulation of intracellular pH - making cancer cells more susceptible to hypoxia and more likely to metastasize. [Kailio H. J Cancer Mol. 2010, 5, pp.73-78],
CA IX šiuo metu pripažintas šviesiųjų inkstų ląstelių karcinomos biožymuo. Šio baltymo raiškos nustatymas yra svarbus inkstų vėžio diagnostikai, kadangi CA IX sintetinamas tik vėžinėse, bet ne normaliose ląstelėse. Taip pat atliekami tyrimai, kuriais stengiamasi parodyti prognostinę fermento vertę, o tai palengvintų numatyti, ar vėžys linkęs metastazuoti, jo atsparumą terapijai ir atsistatymo tikimybę [Tostain J. Eur J Cancer. 2010, 46, pp. 3141-3148].CA IX is currently recognized as a biomarker of light renal cell carcinoma. Determining the expression of this protein is important for the diagnosis of kidney cancer since CA IX is only synthesized in cancerous cells and not in normal cells. Studies are also being conducted to show the prognostic value of the enzyme, which will help predict the cancer's tendency to metastasize, its resistance to therapy and its likelihood of recovery [Tostain J. Eur J Cancer. 2010, 46, p. 3141-3148].
CA XII yra intensyviai tyrinėjamas fermentas, norint patvirtinti jo, kaip vėžinių ląstelių žymens, vertę. Parodyta, kad CA XII raiška yra susijusi su labiau pažengusia burnos ertmės suregėjusių ląstelių karcinoma, didesniu auglio dydžiu bei blogesnėmis paciento išgyvenamumo prognozėmis [Chien M. H. Orai Oncol. 2012, 48, pp. 4172CA XII is an intensively studied enzyme to confirm its value as a marker for cancer cells. CA XII expression has been shown to be associated with more advanced oral carcinoma of the oral cavity, larger tumor size, and poorer patient survival [Chien M.H., Oncol. 2012, 48, p. 4172
423], Platesni tyrimai reikalingi, norint patobulinti įvairių audinių vėžių diagnostiką, o tai skatina kurti naujus diagnostinius reagentus ir sistemas, skirtas tyrinėti CA XII raišką klinikiniuose mėginiuose.423], more extensive research is needed to improve the diagnostics of cancers of various tissues, which encourages the development of novel diagnostic reagents and systems for studying CA XII expression in clinical samples.
Monokloniniai antikūnai (MAk) yra itin populiarūs diagnostiniai reagentai, taikomi klinikiniuose tyrimuose įvairiose srityse: kraujo grupių, virusinių infekcijų nustatymui, vėžio, kraujagyslių ir širdies ligų diagnostikoje. Šiuo metu sparčiai plečiasi kita svarbi antikūnų (Ak) pritaikymo sfera - imunoterapija. Pelės MAk, taikant genų inžinerijos technologiją, yra pakeičiami taip, kad jų savybės atpažinti antigeną išliktų nepakitusios, tačiau jie nesukeltų imuninio atsako žmogaus organizme. Modifikuoti arba rekombinantiniai antikūnai gali turėti įvairią struktūrą, pavyzdžiui, chimeriniai Ak sudaryti iš pelės MAk variabilaus regiono (V), kuris svarbus atpažįstant antigeną, ir žmogaus imunoglobulino pastovaus domeno (C), atsakingo už efektorines antikūno funkcijas; viengrandžiai Ak fragmentai (scFv), turintys tik antigeną surišančią sritį ir pan. Tokių rekombinantinių antikūnų gamybai naudojamos bakterijos, mielės, augalai, žinduolių ląstelės ar fagų ekspozicijos sistemos [Frenzel A. Front Immunol. 2013, 4, pp. 1-20],Monoclonal Antibodies (MAks) are extremely popular diagnostic reagents used in clinical trials in a variety of fields: blood group, viral infections, cancer, vascular and heart disease diagnostics. Immunotherapy, another important area of antibody (Ak) application, is currently expanding rapidly. Mouse MAk are engineered to be engineered to retain their antigen recognition properties without triggering an immune response in the human body. Modified or recombinant antibodies may have various structures, such as the chimeric Ak composed of the murine MAk variable region (V), which is important for antigen recognition, and the human immunoglobulin constant domain (C) responsible for effector antibody functions; single-stranded Ak fragments (scFv) containing only the antigen-binding region and so on. Bacteria, yeast, plants, mammalian cells, or phage display systems are used to produce such recombinant antibodies [Frenzel A. Front Immunol. 2013, 4, p. 1-20],
Fig 1. parodo rekombinantinių antikūnų (scFv ir scFv-Fc) schematinę struktūrą ir jų skirtumus nuo pilno IgG klasės imunoglobulino [pritaikyta iš Frenzel A. Front Immunol. 2013, 4, pp. 1-20].Fig. 1 shows a schematic structure of recombinant antibodies (scFv and scFv-Fc) and their differences from full IgG class immunoglobulin [adapted from Frenzel A. Front Immunol. 2013, 4, p. 1-20].
Ak gali aktyvinti imuninę sistemą, sukeliant Ak nulemtą ląstelinį citotoksiškumą (angį. antibody-dependent cellular cytotoxicity, ADCC), komplemento nulemtą citotoksiškumą (angį. complement-dependent cytotoxicity, CDC)), arba sukelti vėžinės ląstelės apoptozę, sustabdyti proliferaciją, angiogenezę ar sumažinti metastazių plitimą. Dažnai Ak efektas yra padidinamas juos naudojant kartu su chemoterapija ir medžiagomis, kurios aktyvina imuninę sistemą. Geriausi gydymo Ak rezultatai gaunami juos naudojant ankstyvoje ligos stadijoje. Rituximab - Ak atpažįstantis CD20 molekulę-yra pirmasis registruotas chimerinis MAk (1997 m.), naudojamas leukemijai gydyti [Mellstedt H. Drugs Today (Bare). 2003, 39, pp. 1-16].Ak may activate the immune system by inducing Ak-induced cell-dependent cytotoxicity (ADCC), complement-dependent cytotoxicity (CDC), or induce apoptosis, arrest proliferation, angiogenesis, or decrease cancer cell. spread of metastases. Often, the Ak effect is enhanced when used in combination with chemotherapy and substances that activate the immune system. The best results of AK treatment are obtained when used early in the disease. Rituximab, an Ak recognizing CD20 molecule, is the first registered chimeric MAk (1997) used to treat leukemia [Mellstedt H. Drugs Today (Bare). 2003, 39, p. 1-16].
RENCAREX® (Girentuximab) yra trečios fazės klinikinių tyrimų kandidatas, skirtas gydyti nemetastazuojančias šviesiųjų inkstų ląstelių karcinomas. Girentuximab yra chimerinis MAk, kuris atpažįsta CA IX. Tai vienintelis Ak prieš karboanhidrazes, pasiekęs klinikinius tyrimus.RENCAREX® (Girentuximab) is a candidate for Phase 3 clinical trials for the treatment of non-metastatic light renal cell carcinomas. Girentuximab is a chimeric MAk that recognizes CA IX. It is the only Ak against carbonic anhydrase that has reached clinical trials.
Rekombinantiniai antikūnai prieš CA XII nėra aprašyti.Recombinant antibodies against CA XII are not described.
Vaistinių preparatų, pagrįstų antikūnais prieš CA XII, taip pat nėra aprašyta.Drugs based on CA XII antibodies are also not described.
Lietuvos ir užsienio patentai bei publikacijos, kuriuose aprašyti artimiausi išradimo analogaiLithuanian and foreign patents and publications describing the nearest analogs of the invention
human recombinant CA XII. Biomed Res Int. 2014;2014:309307. doi:human recombinant CA XII. Biomed Res Int. 2014; 2014: 309307. doi:
10.1155/2014/309307.10.1155 / 2014/309307.
2) Dekaminaviciute D, Kairys V, Zilnyte M, Petrikaite V, Jogaite V, Matuliene J, Gudleviciene Z, Vullo D, Supuran CT, Žvirbliene A. Monoclonal antibodies raised against 167-180 aa sequence of human carbonic anhydrase XII inhibit its enzymatic activity. J Enzyme Inhib Med Chem. 2014 Jan 9.2) Dekaminaviciute D, Kairys V, Zilnyte M, Petrikaite V, Yoga V, Matuliene J, Gudleviciene Z, Vullo D, Supuran CT, Žvirbliene A. Monoclonal antibodies raised against 167-180 aa sequence of human carbonic anhydrase XII inhibit its enzymatic activity. . J Enzyme Inhib Med Chem. January 9, 2014
ankstesnėse mūsų publikacijose nepaminėta. Be to, publikacijose minimi tik monokloniniai antikūnai, bet ne rekombinantiniai antikūnai, Monokloniniai antikūnai skiriasi nuo rekombinantinių antikūnų, nes jie kuriami kitais metodais ir turi skirtingą struktūrą.not mentioned in our previous publications. In addition, the publications mention only monoclonal antibodies but not recombinant antibodies. Monoclonal antibodies differ from recombinant antibodies in that they are generated by other methods and have different structures.
Išradimo esmėThe essence of the invention
Išradimo tikslas - gauti naują rekombinantinį antikūną, atpažjstantį karboanhidrazę XII. Šis išradimas pateikia imunoglobulino sunkiosios ir lengvosios grandinių kintančiųjų sričių hiperkaičiasias sekas (CDR) gautas, naudojant genetinę medžiagą iš 14D6 hibridomos ląstelių linijos, gaminančios natyvų CAXII baltymą atpažjstantį ir neutralizuojantį monokloninį antikūną prieš CA XII.The object of the present invention is to provide a novel recombinant antibody recognizing carbonic anhydrase XII. The present invention provides immunoglobulin heavy and light chain variable region (CDR) sequences obtained using genetic material from a 14D6 hybridoma cell line producing a native CAXII protein recognizing and neutralizing monoclonal antibody to CA XII.
Toks antikūnas turiSuch an antibody has
a) aminorūgščių sekas SEQ ID: Nr. 1 (CDR 1), 2 (CDR 2), 3 (CDR 3), kurios apibrėžia sunkiosios grandinės kintančiąją sritį (VH), ir/arba aminorūgščių sekos SEQ ID: Nr. 4 (CDR 1), 5 (CDR 2), 4 (CDR 3), kurios apibrėžia lengvosios grandinės kintančiąją sritį (VL);(a) the amino acid sequences of SEQ ID NO. 1 (CDR 1), 2 (CDR 2), 3 (CDR 3), which define the heavy chain variable region (VH), and / or the amino acid sequence of SEQ ID NO. 4 (CDR 1), 5 (CDR 2), 4 (CDR 3), which define the light chain variable region (VL);
arbaor
b) aminorūgščių sekas iš (a) dalies, kuriose bent viena aminorūgštis yra konservatyviai pakeista kita panašaus poliariškumo aminorūgštimi bet kurioje iš aminorūgščių sekų SEQ ID Nr. 1 - 6.b) the amino acid sequences of part (a) wherein at least one amino acid is conservatively substituted with another amino acid of similar polarity in any one of SEQ ID NOs. 1-6.
SEQ ID Nr. 1: GFTFSDYG. Ilgis: 8 aminorūgštys;SEQ ID NO: 1: GFTFSDYG. Length: 8 amino acids;
SEQ ID Nr. 2: ISNLAYRI. Ilgis: 8 aminorūgštys;SEQ ID NO: 2: ISNLAYRI. Length: 8 amino acids;
SEQ ID Nr. 3: VRATEYALDY. Ilgis: 10 aminorūgščių;SEQ ID NO: 3: VRATEYALDY. Length: 10 amino acids;
SEQ ID Nr. 4: RASODINNYLN. Ilgis: 11 aminorūgščių;SEQ ID NO: 4: RASODINNYLN. Length: 11 amino acids;
SEQ ID Nr. 5: YTSKLHS. Ilgis: 7 aminorūgštys;SEQ ID NO: 5: YTSKLHS. Length: 7 amino acids;
SEQ ID Nr. 6: OOGNTLPFTF. Ilgis: 10 aminorūgščių.SEQ ID NO: 6: OOGNTLPFTF. Length: 10 amino acids.
Pateikiamas išradimas parodo, kad antikūnas 14D6 atpažįsta tokią aminorūgščių seką (CA XII baltymo fragmentą nuo 27-valino iki 130-glicino)The present invention demonstrates that the 14D6 antibody recognizes the following amino acid sequence (CA-XII protein fragment from 27-valine to 130-glycine)
SEQ ID: Nr. 7:SEQ ID No: 7:
VNGSKWTYFGPDGENSWSKKYPSCGGLLQSPIDLHSDILQYDASLTPLEFQVNGSKWTYFGPDGENSWSKKYPSCGGLLQSPIDLHSDILQYDASLTPLEFQ
GYNLSANKQFLLTNNGHSVKLNLPSDMHIQGLQSRYSATQLHLHWGNPNDPHG arba panašias aminorūgščių sekas, kurių identiškumas yra bent 95 % [Basic Local Alignment Search Tool: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgnGYNLSANKQFLLTNNGHSVKLNLPSDMHIQGLQSRYSATQLHLHWGNPNDPHG or similar amino acid sequences with at least 95% identity [Basic Local Alignment Search Tool: http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgn
Antikūnas 14D6 ar jo fragmentas pagal siūlomą išradimą yra skirtas naudoti karboanhidrazės XII biologinio aktyvumo slopinimui arba neutralizavimui. Šis antikūnas gali būti chemiškai arba genetiškai konjuguotas su fermentu, kitu baltymu arba cheminiu junginiu ir naudojamas kaip diagnostinis arba terapinis agentas.The 14D6 antibody or fragment thereof according to the present invention is for use in inhibiting or neutralizing the biological activity of carbonic anhydrase XII. This antibody may be chemically or genetically conjugated to an enzyme, other protein or chemical compound and used as a diagnostic or therapeutic agent.
Trumpas brėžiniu aprašymasBrief description of the drawings
Fig 1. parodo rekombinantinių antikūnų (scFv ir scFv-Fc) schematinę struktūrą ir jų skirtumus nuo pilno IgG klasės imunoglobulino [pritaikyta iš Frenzel A. Front Immunol. 2013, 4, pp. 1-20].Fig. 1 shows a schematic structure of recombinant antibodies (scFv and scFv-Fc) and their differences from full IgG class immunoglobulin [adapted from Frenzel A. Front Immunol. 2013, 4, p. 1-20].
Fig. 2 parodo imunoblotingo vaizdą, gautą su rekombinantine CA XII susintetinta E. coli ir HEK 293 ląstelėse bei HEK 293 ląstelių lizatu.FIG. 2 shows an immunoblotting image obtained with recombinant CA XII synthesized in E. coli and HEK 293 cells and HEK 293 cell lysate.
Fig. 3 atkartoja IFA rezultatus, gautus kaip antigeną naudojant rekombinantinę CA XII susintetintą bakterijose E. coli (CA XII bakt.) arba žinduolių ląstelių linijoje HEK 293 (CA XII žind.).FIG. 3 replicates the IFA results obtained using recombinant CA XII synthesized in E. coli (CA XII bacterium) or in the mammalian cell line HEK 293 (CA XII mammalian) as antigen.
Fig. 4 parodo 14D6 antikūno sąveiką su natyviu baltymu esančiu ląstelės membranoje.FIG. 4 shows the interaction of the 14D6 antibody with the native protein present in the cell membrane.
Fig. 5 parodo, kad monokloninis antikūnas atpažįsta baltymo N-gale esančią aminorūgščių dalį ir jo linijinis epitopas gali būti tarp aminorūgšties valino (27 pozicija) ir aminorūgšties glicino (130 pozicija).FIG. 5 shows that the monoclonal antibody recognizes the amino acid moiety at the N-terminus of the protein and may have a linear epitope between the amino acid valine (position 27) and the amino acid glycine (position 130).
Fig. 6 parodo antikūno 14D6 slopinantį poveikį rekombinantinei CA XII - jo disociacijos konstanta (~42nM) artima klasikinio karboanhidrazių inhibitoriaus acetazolamido Kd (-37,5 nM).FIG. 6 shows the inhibitory effect of 14D6 on recombinant CA XII, its dissociation constant (~ 42nM) close to that of the classic carbonic anhydrase inhibitor acetazolamide Kd (-37.5 nM).
Fig. 7 parodo imunoglobulino sunkiosios (VH) ir lengvosios (VL) grandinių kintančiųjų sričių hiperkaičiųjų regionų (CDR) nukleotidų ir aminorūgščių sekas (pabraukta).FIG. 7 shows the nucleotide and amino acid sequences of the variable regions of the immunoglobulin heavy (VH) and light (VL) chain variable regions (underlined).
Fig. 8 iliustruoja konstrukcijų VL-(G4S)4-VH ir VH-(G4S)4-VL, apimančių antikūno 14D6 kintamosios dalies fragmentus su žmogaus imunoglobulinų Fc fragmentu (atitinkamai scFv-Fc-1 ir scFv-Fc-2), schematinį vaizdą.FIG. 8 illustrates a schematic representation of the constructs VL- (G4S) 4-VH and VH- (G4S) 4-VL comprising the variable region fragments of antibody 14D6 with the human immunoglobulin Fc fragment (scFv-Fc-1 and scFv-Fc-2, respectively).
Fig. 9 parodo imunoblotingo vaizdą, gautą su rekombinantiniu antikūnu, susintetintu HEK 293 ląstelėse.FIG. 9 shows an immunoblotting image obtained with a recombinant antibody synthesized in HEK 293 cells.
Detalus išradimo aprašymasDetailed Description of the Invention
Šiame išradime aprašomas rekombinantinis antikūnas, kurį sudaro monokloninio antikūno prieš karboanhidrazę XII, kurį produkuoja sukurta nauja hibridomų linija 14D$, sunkiosios ir lengvosios grandinių kintančiųjų sričių hiperkaičiosios sekos (CDR). Atlikti tyrimai parodė, kad sukurtasis monokloninis antikūnas 14D6 reaguoja tiek su rekombinantiniais CA XII baltymais, susintetintais bakterijose E. coli ar žinduolių ląstelių linijoje HEK 293, tiek su natyvia CA XII, sintetinama įvairių žmogaus vėžinių ląstelių linijų ląstelių membranose. Taip pat buvo parodyta, kad sukurtasis monokloninis antikūnas neutralizuoja rekombinantinio CAXII baltymo biologinį veikimą in vitro - blokuoja fermentinę anglies dioksido hidratacijos reakciją.The present invention describes a heavy and light chain variable region (CDR) heavy chain and light chain antibody recombinant antibody consisting of a monoclonal antibody against carbonic anhydrase XII produced by a novel hybridoma line 14D $. Studies have shown that the resulting monoclonal antibody 14D6 reacts with both recombinant CA XII proteins synthesized in E. coli or the mammalian cell line HEK 293 and native CA XII synthesized in the cell membranes of various human cancer cell lines. The monoclonal antibody produced has also been shown to neutralize the biological activity of the recombinant CAXII protein in vitro by blocking the enzymatic reaction of carbon dioxide hydration.
Šiame išradime siūlomas rekombinantinis antikūnas yra naujas ir skiriasi nuo analogų iš kitų šaltinių bei anksčiau aprašytų monokloninių antikūnų prieš CA XII.The recombinant antibody of the present invention is novel and different from analogs from other sources and the monoclonal antibody against CA XII described above.
Siekiant sukurti naują hibridomų liniją 14D6, gaminančią monokloninį antikūną prieš CA XII, buvo panaudota rekombinantinė CA XII susintetinta žmogaus embrioninėse inkstų ląstelėse HEK 293 ir atliktos įprastos, žinomos šios srities specialistams procedūrūs, būtent:Recombinant CA XII synthesized in human embryonic kidney cells HEK 293 was used to create a new hybridoma line 14D6 producing a monoclonal antibody to CA XII and routine procedures known to those of ordinary skill in the art were performed, namely:
atliekama imunizacija - rekombinantinė CA XII (antigenas) buvo suleidžiamas BALB/c linijos pelėms po oda. Prieš injekciją antigeno tirpalas buvo lygiu tūriu sumaišomas du pilnu Freund'o adjuvantu;immunization - recombinant CA XII (antigen) was injected subcutaneously in BALB / c line mice. Prior to injection, the antigen solution was mixed in equal volume with two complete Freund's adjuvant;
atliekama pakartotinė imunozacija - po 4 savaičių pelėms dar kartą buvo suleidžiama tokia pat antigeno dozė be adjuvanto; prieš imunizuojant antrą kartą iš pelių uodegos kraujagyslės paimama šiek tiek kraujo atliekama pakartotinė imunizacija - dar po 4 savaičių palėms dar kartą buvo suleidžiama tokia pat antigeno dozė be adjuvanto. prieš imunizuojant trečią kartą iš pelių uodegos kraujagyslės paimama šiek tiek kraujo, taip pat kraujo paimama ir po 4 savaičių po trečiosios imunizacijos. Žinomu metodu - imunofermentine analize (IFA) buvo patikrinta ar pelių kraujo serume atsirado antikūnų prieš antigeną.re-immunization - after 4 weeks, mice were re-injected with the same dose of antigen without adjuvant; a small amount of blood is re-immunized from the tail vein of mice prior to the second immunization - again after 4 weeks, the same dose of antigen without adjuvant was injected again into the female. a small amount of blood is drawn from the tail vein of mice prior to the third immunization, and 4 weeks after the third immunization. By a known method, the enzyme-linked immunosorbent assay (IFA) was used to test for the presence of antibodies against the antigen in mouse serum.
pelės blužnies hibridizacija - praėjus 5 savaitėms po trečiosios imunizacijos, pelei su didžiausiu antikūnų prieš antigeną kiekiu buvo suleista ta pati antigeno dozė be adjuvanto ir po 3 dienų buvo atliekama blužnies ląstelių hibridizacija, suliejant jas su pelės vėžinėmis ląstelėmis - mieloma Sp2/0, suliejimo agentu buvo naudotas polietilenglikolis (PEG) [Sigma, JAV]. Ši ir kitos procedūros buvo atliekamos pagal žinomą procedūrą, naudojamą hibridomų gavimui [Kohler, Milstein, Nature 1975;256, pp. 495-497].mouse spleen hybridization - 5 weeks after the third immunization, the mouse with the highest amount of antigen antibody was injected with the same dose of antigen without adjuvant and 3 days later spleen cell hybridization was performed with mouse cancer cells - myeloma Sp2 / 0, fusion agent polyethylene glycol (PEG) [Sigma, USA] was used. This and other procedures were performed according to a known procedure used to obtain hybridomas [Kohler, Milstein, Nature 1975; 256, p. 495-497].
praėjus 2 savaitėms po hibridizacijos ir gavus hibridinių ląstelių klonus (hibridomas) buvo tikrinamas jų specifiškumas, t. y. nustatoma, ar jie gamina antikūnus prieš CA XII. tam buvo naudojamas IFA metodas;2 weeks after hybridization and receipt of hybrid cell clones (hybridomas), their specificity was tested, i. y. determining whether they produce antibodies against CA XII. the IFA method was used;
gautos hibridimos buvo charakterizuojamos pagal įvairius požymius:the resulting hybridima were characterized by various traits:
nustatant jų gaminamų monokloninių antikūnų izotipą;determining the isotype of the monoclonal antibody they produce;
ištiriant antikūno specifiškumą IFA ir imunoblotingo metodais;testing antibody specificity by IFA and immunoblotting;
identifikavus hibridomas, kurios gamina monokloninius antikūnus prieš CAXII, jos buvo klonuojamos, padauginamos ir užšaldomos tolimesniam saugojimui;after identification of the hybridomas producing the monoclonal antibody to CAXII, they were cloned, propagated and frozen for further storage;
hibridomų gaminami monokloniniai antikūnai buvo charakterizuojami anksčiau aprašytais būdais:monoclonal antibodies produced by the hybridomas were characterized as follows:
IFA ir imunoblotingu, naudojant rekombinantinę CA XII kaip antigeną, tėkmės citometrija, naudojant vėžinių ląstelių linijų ląsteles, tikrinamas monokloninių antikūnų neutralizuojantis poveikis, naudojant rekombinantinę CAXII.Flow cytometry using IFA and immunoblotting using recombinant CA XII as antigen tests for the neutralizing effect of monoclonal antibodies using recombinant CAXII.
Aprašytu būdu buvo gauta nauja hibridomų linija, kuri deponuota Vilniaus universiteto Biotechnologijos institute (Vilnius) Imunologijos ir ląstelės biologijos skyriuje:A new hybridoma line was deposited as described above and deposited at the Institute of Biotechnology, Vilnius University, Vilnius, Department of Immunology and Cell Biology:
Hibridoma 14D6, deponavimo numeris CAXII-001, kuri gamina lgG1 poklasio (subtipo) antikūnus prieš CA XII.Hybridoma 14D6, accession number CAXII-001, which produces an IgG1 subclass (subtype) antibody against CA XII.
Paminėta nauja hibridoma 14D6 produkuoja monokloninj antikūną, iš kurio buvo sukurtas rekombinantinis antikūnas prieš CA XII, kuris ir yra šio išradimo objektas.Said novel hybridoma 14D6 produces a monoclonal antibody from which a recombinant antibody against CA XII, which is the subject of the present invention, was generated.
Hibridomų produktu charakteristikaCharacterization of hybridoma products
Naujos hibridomos 14D6 ir jos gaminamo monokloninio antikūno savybes iliustruoja informacija pateikta Fig. 2-6.The properties of the novel hybridoma 14D6 and the monoclonal antibody it produces are illustrated in Figs. 2-6.
Fig. 2 parodo imunoblotingo vaizdą, gautą su rekombinantine CA XII susintetinta E. coli ir HEK 293 ląstelėse bei HEK 293 ląstelių lizatu.FIG. 2 shows an immunoblotting image obtained with recombinant CA XII synthesized in E. coli and HEK 293 cells and HEK 293 cell lysate.
Fig. 3 atkartoja IFA rezultatus, gautus kaip antigeną naudojant rekombinantinę CA XII susintetintą bakterijose E. coli (CA XII bakt.) arba žinduolių ląstelių linijoje HEK 293 (CA XII žind.). Taip pat tikrintas kryžminis specifiškumas su karboanhidrazės IX izoformos rekombinantiniu HEK 293 ląstelėse susintetintu baltymu.FIG. 3 replicates the IFA results obtained using recombinant CA XII synthesized in E. coli (CA XII bacterium) or in the mammalian cell line HEK 293 (CA XII mammalian) as antigen. Cross-specificity with the recombinant HEK 293 recombinant protein of carbonic anhydrase IX was also tested.
Fig. 4 parodo 14D6 antikūno sąveiką su natyviu baltymu esančiu ląstelės membranoje. Sąveika buvo tirta srautinės citometrijos metodu naudojant A498 ląstelių liniją (literatūroje patvirtinta, kad šiose ląstelėse yra padidėjusi CA XII raiška) ir HEK 293 ląstelių liniją (šiose ląstelėse CA XII raiška nenustatyta kitais metodais).FIG. 4 shows the interaction of the 14D6 antibody with the native protein present in the cell membrane. The interaction was investigated by flow cytometry using the A498 cell line (confirmed in the literature to have increased CA XII expression) and the HEK 293 cell line (CA XII expression was not detected in these cells by other methods).
Fig. 5 parodo, kad monokloninis antikūnas atpažįsta baltymo N-gale esančią aminorūgščių dalį ir jo linijinis epitopas gali būti tarp aminorūgšties valino (27 pozicija) ir aminorūgšties glicino (130 pozicija).FIG. 5 shows that the monoclonal antibody recognizes the amino acid moiety at the N-terminus of the protein and may have a linear epitope between the amino acid valine (position 27) and the amino acid glycine (position 130).
Fig. 6 parodo antikūno 14D6 slopinantį poveikį rekombinantinei CA XII - jo disociacijos konstanta (~42nM) artima klasikinio karboanhidrazių inhibitoriaus acetazolamido Kd (~37,5 nM).FIG. 6 shows the inhibitory effect of 14D6 on recombinant CA XII, with a dissociation constant (~ 42nM) close to the Kd (~ 37.5 nM) of the classical carbonic anhydrase inhibitor acetazolamide.
Naujų monokloninių antikūnų gavimo būdas, jų savybės detaliau aprašomi toliau pateiktuose 1-4 pavyzdžiuose ir lentelėse, kurie iliustruoja, bet neapriboja išradimo esmės.The method of obtaining the novel monoclonal antibodies and their properties are described in more detail in Examples 1-4 below and in the tables which illustrate but do not limit the scope of the invention.
pavyzdysexample
Hibridomų, gaminančių monokloninius antikūnus prieš karboanhidrazę XII, sukūrimasDevelopment of hybridomas producing monoclonal antibodies against carbonic anhydrase XII
Pagrindiniai hibridomų ir MAk gavimo etapai: imunizacija; mielomos ląstelių kultivavimas; ląstelių suliejimas; kraujo serumo surinkimas; hibridinių ląstelių selekcija ir klonavimas; hibridomų kultivavimas in vitro; hibridomų šaldymas/atšildymas ir saugojimas.The main steps in obtaining hybridomas and MAk are: immunization; culturing myeloma cells; cell fusion; blood serum collection; selection and cloning of hybrid cells; culturing hybridomas in vitro; freezing / thawing and storage of hybridomas.
ImunizacijaImmunization
Imunizacijai buvo naudojamos 6-8 savaičių BALB/c linijos pelės, augintos Inovatyvios medicinos centre Imunologijos departamente. Rekombinantiniu CA XII baltymu, susintetintu žinduolinėse HEK293 ląstelėse, buvo imunizuotos 3 pelės, suleidžiant po 50 pg antigeno. Atliekama poodinė injekcija. Pirmos imunizacijos metu antigenas buvo ištirpintas fosfatiniame buferiniame tirpale (PBS) ir suspenduotas lygiu tūriu su pilnu Freund’o adjuvantu (PFA). Antra imunizacija atlikta po 28 d., naudojant tokį patį kiekį baltymo, kuris buvo ištirpintas PBS. Po 28 d. pelės imunizuojamos trečią kartą tuo pačiu antigeno kiekiu ištirpintu PBS. Po kiekvienos imunizacijos buvo surinktas pelių kraujas antikūnų kiekiui nustatyti (8 pi kraujo sumaišomi su 192 pi PBS). Pelė, kurios serume antikūnų buvo daugiausiai, praėjus 5 savaitėm po trečiosios imunizacijos, buvo dar kartą imunizuota 50 pg baltymo. Hibridizacija buvo atlikta po 3 dienų nuo paskutinės imunizacijos.6- to 8-week-old BALB / c line mice bred at the Innovative Medical Center in the Department of Immunology were used for immunization. 3 mice were immunized with 50 pg antigen by recombinant CA XII protein synthesized in mammalian HEK293 cells. Subcutaneous injection. During the first immunization, the antigen was dissolved in phosphate buffered saline (PBS) and suspended in an equal volume with Freund's complete adjuvant (PFA). A second immunization was performed after 28 days using the same amount of protein dissolved in PBS. After 28 days mice were immunized a third time with the same amount of antigen in PBS. After each immunization, mouse blood was collected for antibody levels (8 pi blood mixed with 192 pi PBS). The mouse with the highest serum antibody levels was re-immunized with 50 pg of protein 5 weeks after the third immunization. Hybridization was performed 3 days after the last immunization.
Mielomos ląstelių kultivavimasCulturing myeloma cells
Hibridizacijai buvo naudojama Sp2/0 mielomos ląstelių linija, kurios ląstelės neturi fermento hipoksantin-guanin-foforiboziltransferazės, neauga selektyvioje hipoksantino-aminopterino-timidino (HAT) terpėje ir negaminaimunoglobullnų ar jų grandinių. Iki hibridizacijos ląstelės buvo auginamos Dulbecco modifikuotoje Eagl'o (DMEM) terpėje su 9 % fetalinio veršiuko serumo (FBS), persėtos 3 kartus. Suliejimui buvo naudojamos gyvos, logaritminėje augimo fazėje esančios ląstelės.The Sp2 / 0 myeloma cell line, which does not contain hypoxanthine-guanine-phosphoribosyltransferase, does not grow on selective hypoxanthine-aminopterin-thymidine (HAT) medium, and does not produce immunoglobulins or their chains, was used for hybridization. Prior to hybridization, the cells were grown in Dulbecco's modified Eagl's (DMEM) medium with 9% fetal calf serum (FBS) inoculated 3 times. Live cells in the logarithmic growth phase were used for fusion.
Ląstelių suliejimasCell fusion
Antigenu imunizuotos pelės blužnis buvo steriliai išimta ir sutraiškyta, norint gauti blužnies ląstelių suspensiją. Suspenduotos mielomos ir blužnies ląstelės supiltos į vieną mėgintuvėlį santykiu 1:5, tuomet lėtai per minutę sulašintas 1 ml ląstelių suliejimo agento 50 % polietilenglikolio (PEG-4000) tirpalo. Per kitas 3 minutes ląstelės buvo inkubuojamos ir lėtai pridedama 10 ml terpės be serumo. Ląstelės po suliejimo buvo suspenduotos jau paruoštoje selektyvioje HAT terpėje turinčioje 15 % FBS, kurioje auga tik hibridinės ląstelės. Geresniam ląstelių augimui reikalingi makrofagai, kurie hibridizacijos metu buvo surinkti iš pelės pilvo ertmės, pradūrus peritoniumą. Ląstelės sėjamos į sterilias audinių kultūroms skirtas 96 šulinėlių plokšteles, po 150 tūkst. į šulinėlį.The spleen of a mouse immunized with antigen was sterile removed and crushed to obtain a spleen cell suspension. Suspended myeloma and spleen cells were added to a single tube at a ratio of 1: 5, then slowly infused with 1 ml of cell fusion agent 50% polyethylene glycol (PEG-4000) solution. Over the next 3 minutes, the cells were incubated and 10 ml of serum-free medium was slowly added. After fusion, cells were suspended in already prepared selective HAT medium containing 15% FBS in which only hybrid cells grow. Macrophages harvested from the peritoneal cavity of the mouse during hybridization are required for better cell growth. Cells are seeded in sterile tissue culture 96-well plates at 150,000. into the well.
Nesusiliejusios mielomos ląstelės dėl aminopterino veikimo pradeda žūti praėjus kelioms dienoms po hibridizacijos. Makrofagai pradeda fagocituoti jų nuolaužas ir atsirandantys klonai tampa daug geriau pastebimi.Non-fused myeloma cells begin to die a few days after hybridization due to the action of aminopterin. Macrophages begin to phagocyte their debris and the resulting clones become much more noticeable.
Praėjus 10-12 d po hibridizacijos, hibridinių klonų augimo terpė buvo testuojama imunofermentinės analizės (IFA) metodu, naudojant antigeną, kuriuo buvo imunizuotos pelės. Buvo atrinkti hibridiniai klonai, gaminantys stipriausiai veikiančius antikūnus (tokius, kurių optinis tankis didžiausias), ir išklonuoti ribinio praskiedimo metodu. Po klonavimo dar kartą tikrinamas klonų specifiškumas ir aktyvumas, tuomet jie auginami didesniuose šulinėliuose MAk dauginimui ir ląstelių šaldymui.10-12 days after hybridization, growth media of hybrid clones were assayed by immunoenzyme assay (IFA) using the antigen used to immunize the mice. Hybrid clones producing the most potent antibodies (those with the highest optical density) were selected and cloned by limiting dilution. After cloning, the specificity and activity of the clones is checked again and then grown in larger wells for MAk propagation and cell freezing.
Hibridomos kultivuojamos DMEM augimo terpėje, turinčioje 2 mM L-glutamino, 200 pg/ml gentamicino ir 15 % FBS, inkubatoriuje, kurio ore yra 5 % CO2, 98 % drėgnumas, esant +37 °C temperatūrai.The hybridomas were cultured in DMEM growth medium containing 2 mM L-glutamine, 200 pg / ml gentamycin and 15% FBS in a 5% CO 2 incubator with 98% humidity at + 37 ° C.
Buvo gauta keletas hibridomų klonų, gaminančių monokloninius antikūnus prieš karboanhidrazę XII. Buvo ištirtas jų specifiškumas, neutralizuojantis aktyvumas, nustatyti antikūnų izotipai. Hibridoma, gaminanti neutralizuojančius monokloninius antikūnus prieš CA XII buvo pavadinta 14D6 ir deponuota Vilniaus universiteto Biotechnologijos instituto (Vilnius, LT) kolekcijoje.Several hybridoma clones were obtained that produced monoclonal antibodies against carbonic anhydrase XII. Their specificity, neutralizing activity and antibody isotypes were investigated. The hybridoma producing neutralizing monoclonal antibodies against CA XII was named 14D6 and deposited in the collection of the Institute of Biotechnology (Vilnius, LT), Vilnius University.
pavyzdys.example.
Monokloninių antikūnų specifiškumo tyrimas ir izotipų nustatytasMonoclonal antibody specificity assay and isotype determination
Fig. 2 parodo imunoblotingo vaizdą, gautą su rekombinantine CA XII susintetinta E. coli ir HEK 293 ląstelėse bei HEK 293 ląstelių lizatu. Kairėje denatūruojančios baltymų elektroforezės nuotrauka, dešinėje - imunoblotingo su monokloniniu antikūnu 14D6 nuotrauka (naudota hibridomų augimo terpė, neskiesta).FIG. 2 shows an immunoblotting image obtained with recombinant CA XII synthesized in E. coli and HEK 293 cells and HEK 293 cell lysate. Photograph of denaturing protein electrophoresis on the left and 14D6 monoclonal antibody immunoblotting (hybridoma growth medium, undiluted).
M takelis -dažytas baltymų molekulinio svorio standartas (kDa);Lane M - stained protein molecular weight standard (kDa);
takelis - rekombinantine išgryninta CA XII susintetinta HEK 293 ląstelėse;lane - recombinant purified CA XII synthesized in HEK 293 cells;
takelis - rekombinantine išgryninta CA XII susintetinta E. coli bakterijose;lane - recombinant purified CA XII synthesized in E. coli;
takelis - HEK 293 ląstelių lizatas be CA XII;lane - HEK 293 cell lysate without CA XII;
Fig. 3 atkartoja IFA rezultatus, gautus kaip antigeną naudojant rekombinantinę CA XII susintetintą bakterijose E. coli (CA XII bakt.) arba žinduolių ląstelių linijoje HEK 293 (CA XII žind.). Taip pat tikrintas kryžminis specifiškumas su karboanhidrazės IX izoformos rekombinantiniu HEK 293 ląstelėse susintetintu baltymu. Naudota 3 kartus praskiesta hibridomų augimo terpė.FIG. 3 replicates the IFA results obtained using recombinant CA XII synthesized in E. coli (CA XII bacterium) or in the mammalian cell line HEK 293 (CA XII mammalian) as antigen. Cross-specificity with the recombinant HEK 293 recombinant protein of carbonic anhydrase IX was also tested. Hybridoma growth medium diluted 3 times was used.
Fig. 4 parodo 14D6 antikūno sąveiką su natyviu baltymu esančiu ląstelės membranoje. Sąveika buvo tirta srautinės citometrijos metodu naudojant A498 ląstelių liniją (literatūroje patvirtinta, kad šiose ląstelėse yra padidėjusi CA XII raiška) ir HEK 293 ląstelių liniją (šiose ląstelėse CA XII raiška nenustatyta kitais metodais). Kaip pirminiai antikūnai naudoti: 1) juoda linija - 14D6 antikūnas; 2) raudona linija kontrolinis lgG1 poklasio antikūnas prieš kiaulių parvovirusą, kuris sukurtas Vilniaus universiteto Biotechnologijos instituto Imunologijos ir ląstelės biologijos skyriuje (neigiama kontrolė). Antriniai antikūnai: komerciniai ožkos antikūnai prieš pelės imunoglobulinus, konjuguoti su FITC (BD Biosciences, JAV). Signalo intensyvumas padidėja dėl FITC švytėjimo ir registruojamas kaip kreivės poslinkis, vykstant antikūno 14D6 sąveikai su A498 ląstelėmis (paveikslas kairėje).FIG. 4 shows the interaction of the 14D6 antibody with the native protein present in the cell membrane. The interaction was investigated by flow cytometry using the A498 cell line (confirmed in the literature to have increased CA XII expression) and the HEK 293 cell line (CA XII expression was not detected in these cells by other methods). The primary antibodies used were: 1) black line - 14D6 antibody; 2) red line control IgG1 subclass antibody to porcine parvovirus, developed at the Department of Immunology and Cell Biology, Institute of Biotechnology, Vilnius University (negative control). Secondary antibodies: Commercial goat antibodies against mouse immunoglobulins conjugated to FITC (BD Biosciences, USA). The signal intensity is increased by FITC glow and is recorded as a shift in the curve during the interaction of 14D6 with A498 cells (Figure left).
Fig. 5 parodo, kad monokloninis antikūnas atpažįsta baltymo N-gale esančią aminorūgščių dalį ir jo linijinis epitopas gali būti tarp aminorūgšties valino (27 pozicija) ir aminorūgšties glicino (130 pozicija). Viršuje - CA XII pilno ilgio aminorūgščių sekos palyginimas su #1 fragmento aminorūgščių sekos palyginimu; apačioje imunoblotingo vaizdas, gautas su CA XII fragmentais, susintetintais E. coli. Kairėje denatūruojančios baltymų elektroforezės nuotrauka, dešinėje - imunoblotingo su 14D6 monokloniniu antikūnu nuotrauka (naudota 5 kartus skiesta hibridomų augimo terpė).FIG. 5 shows that the monoclonal antibody recognizes the amino acid moiety at the N-terminus of the protein and may have a linear epitope between the amino acid valine (position 27) and the amino acid glycine (position 130). Above is a comparison of the full length amino acid sequence of CA XII with the amino acid sequence of fragment # 1; bottom immunoblotting image obtained with CA XII fragments synthesized in E. coli. Photograph of denaturing protein electrophoresis on the left and immunoblotting with 14D6 monoclonal antibody on the right (5 times diluted hybridoma growth medium).
M takelis - dažytas baltymų molekulinio svorio standartas (kDa);Lane M - stained protein molecular weight standard (kDa);
takelis - #1 fragmentas, E. coli lizatas;lane # 1 fragment, lysate of E. coli;
takelis - #2 fragmentas, E. coli lizatas;lane - fragment # 2, E. coli lysate;
takelis - #3 fragmentas, E. coli lizatas;lane # 3 fragment, lysate of E. coli;
takelis - rekombinantinė išgryninta CA XII susintetinta HEK 293 ląstelėse.lane - recombinant purified CA XII synthesized in HEK 293 cells.
pavyzdysexample
CA XII slopinimo tyrimasCA XII Inhibition Assay
Karboanhidrazės fermentinio aktyvumo matavimams buvo naudotas žinduolių ląstelių linijoje pagamintas rekombinantinis CAXII baltymas. CAXII hidratacinis aktyvumas matuotas sustabdytos tėkmės metodu [Khalifah. J Biol Chem 1971, 246, pp. 2561-2673] naudojant Applied Photophysics SX.18MV-R“ spektrofotometrą 25 °C temperatūroje. Indikatoriumi naudotas 30 μΜ fenolio raudonasis, kurio absorbcija stebėta 557 nm bangos ilgyje, esant 40 nM CAXII, ~17 mM CO2, 25 mM Hepes, 50 mM NaCI, pH 7,5 ir skirtingiems kiekiams (0-2 μΜ) antikūno ar mažamolekulinio slopiklio (acetazolamido). Katalizuojamos reakcijos greitis lygintas su savaiminės CO2 reakcijos greičiu. Prieš matuojant CAXII - antikūno/slopiklio kompleksas inkubuotas ~1 vai. 25 °C temperatūroje. Disociacijos konstantos apskaičiuotos taikant Morrison lygtįFig. 6 parodo antikūno 14D6 slopinantį poveikį rekombinantinei CA XII - jo disociacijos konstanta (~42nM) artima klasikinio karboanhidrazių inhibitoriaus acetazolamido Kd (-37,5 nM).A recombinant CAXII protein produced in a mammalian cell line was used to measure the enzyme activity of carbonic anhydrase. CAXII hydration activity was measured by the stopped flow method [Khalifah. J Biol Chem 1971, 246, p. 2561-2673] using an Applied Photophysics SX.18MV-R spectrophotometer at 25 ° C. The indicator used was 30 μΜ phenol red, the absorbance of which was observed at 557 nm in the presence of 40 nM CAXII, 1717 mM CO2, 25 mM Hepes, 50 mM NaCl, pH 7.5 and different amounts (0-2 μΜ) of antibody or small molecule inhibitor. (acetazolamide). The rate of the catalyzed reaction was compared with that of the spontaneous CO2 reaction. The CAXII - antibody / suppressor complex was incubated for ~ 1 h before measurement. At 25 ° C. Dissociation constants were calculated using the Morrison equationFig. 6 shows the inhibitory effect of 14D6 on recombinant CA XII, its dissociation constant (~ 42nM) close to that of the classic carbonic anhydrase inhibitor acetazolamide Kd (-37.5 nM).
pavyzdys.example.
Antikūno sekų identifikavimas ir rekombinantinio antikūno konstravimasIdentification of antibody sequences and construction of recombinant antibody
Rekombinantinio antikūno konstravimas buvo pradėtas nuo monokloninio antikūno sunkiosios ir lengvosios grandinių kintančiųjų sričių hiperkaičiųjų sekų (CDR) identifikavimo ir genetinės medžiagos (RNR) išskyrimo iš hibridomos 14D6. Buvo naudotos tokios procedūros:Construction of the recombinant antibody began with the identification of the heavy chain and light chain variable region (CDR) sequences of the monoclonal antibody and the isolation of genetic material (RNA) from hybridoma 14D6. The following procedures were used:
1) RNR išskyrimas iš hibridomos 14D6 - totalinė RNR buvo išskirta iš hibridomos 14D6 ląstelių, naudojant vienos stadijos techniką kaip aprašytas anksčiau [Chomczynski and Sacchi, Anai. Biochem., 1987, 162, pp. 156-159; Boom R., J. Clin. Microbiol. 1990, 28 pp. 495-503]. Ląstelės suardomos ir homogenizuojamos buferiniame tirpale su guanidino tiocianatu. Ląstelių lizatas sumaišomas su etanoliu ir užnešamas ant gryninimui skirtų kolonėlių su silicio membrana - prie jos prikimba RNR. Kolonėlė tuomet praplaunama, o gryna RNR atkabinama vandeniu be nukleazių.1) Isolation of RNA from Hybridoma 14D6 - Total RNA was isolated from Hybridoma 14D6 cells using a single-step technique as described previously [Chomczynski and Sacchi, Anai. Biochem., 162, 1987, p. 156-159; Boom R., J. Clin. Microbiol. 1990, 28 pp. 495-503]. Cells are disrupted and homogenized in buffer with guanidine thiocyanate. The cell lysate is mixed with ethanol and applied to silica gel purification columns, where RNA is attached. The column is then rinsed and the pure RNA is unleashed with nuclease-free water.
2) Pirmosios kopijinės DNR (kDNR) grandinės sintezė - pirmoji kDNR grandinė yra sintetinama naudojant nuo RNR priklausomą DNR polimerazę (atvirkštinę transkriptazę), kartu su matrica poli(A) iRNR ir atsitiktiniais heksameriniais pradmenimis, naudojant komercinį rinkinį „RevertAid2) Synthesis of the first copy DNA (cDNA) strand - The first cDNA strand is synthesized using RNA-dependent DNA polymerase (reverse transcriptase) in combination with poly (A) iRNA and random hexamer primers using the commercially available RevertAid
H Minus First Strand cDNA Synthesis Kit“, [Thermo Fisher Scientific, Vilnius].H Minus First Strand cDNA Synthesis Kit, [Thermo Fisher Scientific, Vilnius].
3) Galutinė kDNR buvo padauginta polimerazės grandininės reakcijos (PGR) metodu, naudojant specifinius pradmenis pelių imunoglobulinų sunkiosios ir lengvosios grandinių variabilaus (kintamojo) domeno sekoms (VH ir VL atitinkamai):3) Final cDNA was amplified by polymerase chain reaction (PCR) using specific primers for murine immunoglobulin heavy and light chain variable domain (VH and VL, respectively):
a) Pelių imunoglobulinų sunkiosios grandinės pastovios srities pradmuo 5‘TTAATAGACAGATGGGGGTGTCGTTTTGGC;(a) Mouse immunoglobulin heavy chain constant region primer 5'TTAATAGACAGATGGGGGTGTCGTTTTGGC;
b) Pelių imunoglobulinų sunkiosios grandinės FR1 srities stipriai degeneruotas pradmuo 5-CATATGSARGTNMAGCTGSAGSAGTC (R - žymi A/G; S - C/G; N A/C/G/T);b) Heavy degenerate primer 5-CATATGSARGTNMAGCTGSAGSAGTC (R - denotes A / G; S - C / G; N A / C / G / T) in the murine immunoglobulin heavy chain FR1 region;
c) Pelių imunoglobulinų lengvosios kappa grandinės pastoviosios srities pradmuo 5-TTAGGATACAGTTGGTGCAGCATC;c) Mouse immunoglobulin light kappa constant region primer 5-TTAGGATACAGTTGGTGCAGCATC;
d) Pelių imunoglobulinų lengvosios kappa grandinės pastovaus FR1 regiono universalus degeneruotas pradmuo 5‘CATATGGAYATTGTGMTSACMCARVVCTMCA (R- žymi A/G; S - C/G; W - A/T; M 14d) Universal degenerate primer 5'CATATGGAYATTGTGMTSACMCARVVCTMCA (R- denotes A / G; S-C / G; W-A / T; M-14) in the murine immunoglobulin light kappa constant region constant region.
A/C; Y - C/T).A / C; Y - C / T).
4) PGR produktai buvo klonuoti į vektorinę plazmidę ir sekoskaitos būdu buvo nustatyta nukleotidų seka. Sekos analizuotos, naudojant BLASTN, pDRAW32 ir Chromas Lite programas bei GenBank ir IgBLAST duomenų bazes. Buvo nustatytos imunoglobulino sekos SEQ ID: Nr. 1 (CDR 1), 2 (CDR 2), 3 (CDR 3), kurios apibrėžia sunkiosios grandinės kintančiąją sritį (VH), ir aminorūgščių sekos SEQ ID: Nr. 4 (CDR 1), 5 (CDR 2), 4 (CDR 3), kurios apibrėžia lengvosios grandinės kintančiąją sritį (VL) (Fig. 7).4) The PCR products were cloned into a vector plasmid and the nucleotide sequence was sequenced. Sequences were analyzed using BLASTN, pDRAW32, and Chrome Lite programs, and GenBank and IgBLAST databases. Immunoglobulin sequences of SEQ ID: no. 1 (CDR 1), 2 (CDR 2), 3 (CDR 3), which define the heavy chain variable region (VH), and the amino acid sequence of SEQ ID NO. 4 (CDR 1), 5 (CDR 2), 4 (CDR 3), which define the light chain variable region (VL) (Fig. 7).
Fig. 7 parodo imunoglobulino sunkiosios (VH) ir lengvosios (VL) grandinių kintančiųjų sričių hiperkaičiųjų regionų (CDR) nukleotidų ir aminorūgščių sekas (pabraukta).FIG. 7 shows the nucleotide and amino acid sequences of the variable regions of the immunoglobulin heavy (VH) and light (VL) chain variable regions (underlined).
Klonavus iš hibridomos 14D6 šias sekas, buvo sukonstruotas viengrandis antikūno fragmentas (scFv), įvedant linkerinę (jungtuko) seką (G4S)4 tarp domeno VL (SEQ ID Nr. 9) ir VH (SEQ ID Nr. 8). Galutinė konstrukcija koduojanti VL-(G4S)4-VH arba VH-(G4S)4-VL buvo įklonuota į raiškos vektorių pCEP4dS [„FreeStyle Max 293 expression system“, Invitrogen, Life Technologies, Karlsbadas, Kalifornija, JAV]. Konstrukcija apima žmogaus imunoglobulino Fc domeną. Baltymo N-gale yra sekrecijos signalo (SS) seka. Galutine plazmidę buvo transfekuotos žmogaus embrioninės inkstų HEK 293 linijos ląstelės. Laikina transfekcija ir baltymo indukcija atlikta pagal gamintojo rekomendacijas.By cloning these sequences from hybridoma 14D6, a single-stranded antibody fragment (scFv) was constructed by introducing a linker (linker) sequence (G4S) 4 between VL (SEQ ID NO: 9) and VH (SEQ ID NO: 8). The final construct encoding VL- (G4S) 4-VH or VH- (G4S) 4-VL was cloned into the expression vector pCEP4dS [FreeStyle Max 293 expression system, Invitrogen, Life Technologies, Carlsbad, California, USA]. The construct comprises the human immunoglobulin Fc domain. The N-terminus of the protein contains the secretion signal (SS) sequence. The final plasmid was transfected with human embryonic kidney HEK 293 line cells. Transient transfection and protein induction were performed according to the manufacturer's recommendations.
Fig. 8 iliustruoja konstrukcijų VL-(G4S)4-VH ir VH-(G4S)4-VL, apimančių antikūno 14D6 kintamosios dalies fragmentus su žmogaus imunoglobulinų Fc fragmentu (atitinkamai scFv-Fc-1 ir scFv-Fc-2), schematinį vaizdą. VH imunoglobulino sunkiosios grandinės kintančiosios srities hiperkaitusis regionas (SEQ ID Nr. 8); VL -imunoglobulino lengvosios grandinės kintančiosios srities hiperkaitusis regionas (SEQ ID Nr. 9); (G4S)4 - linkeris (jungtukas) tarp VL ir VH, susidedantis iš 4 glicinų ir 1 serino sekos, kuri pasikartoja 4 kartus; Fc - žmogaus imunoglobulino sunkiosios grandinės C-galinė dalis.FIG. 8 illustrates a schematic representation of the constructs VL- (G4S) 4-VH and VH- (G4S) 4-VL comprising the variable region fragments of antibody 14D6 with the human immunoglobulin Fc fragment (scFv-Fc-1 and scFv-Fc-2, respectively). VH immunoglobulin heavy chain variable region hyper reading region (SEQ ID NO: 8); VL-immunoglobulin light chain variable region hyper reading region (SEQ ID NO: 9); (G4S) 4 - Linker (linker) between VL and VH consisting of 4 glycines and 1 serine sequence repeating 4 times; Fc is the C-terminal portion of the human immunoglobulin heavy chain.
Fig. 9 parodo imunoblotingo vaizdą, gautą su rekombinantiniu antikūnu, susintetintu HEK 293 ląstelėse. Kairėje - denatūruojančios baltymų elektroforezės nuotrauka, dešinėje - imunoblotingo su polikloniniais triušio antikūnais, atpažįstančiais žmogaus imunoglobulino Fc grandinę, konjuguotais su krienų peroksidaze, skiesti 1000 kartų [Dako, Agilent Technologies, Danija, Glostrupas].FIG. 9 shows an immunoblotting image obtained with a recombinant antibody synthesized in HEK 293 cells. On the left, photo of denaturing protein electrophoresis, on the right, immunoblotting with polyclonal rabbit antibodies recognizing human immunoglobulin Fc chain conjugated to horseradish peroxidase, diluted 1000-fold [Dako, Agilent Technologies, Denmark, Glostrup].
M takelis - dažytas baltymų molekulinio svorio standartas (kDa);Lane M - stained protein molecular weight standard (kDa);
takelis - HEK 293 ląstelių, gaminančių rekombinantinį antikūną VL-(G4S)4VH-Fc, lizatas;lane Lysate of HEK 293 cells producing recombinant antibody VL- (G4S) 4VH-Fc;
takelis - HEK 293 ląstelių, gaminančių rekombinantinį antikūną VH-(G4S)4VL-Fc, lizatas;lane Lysate of HEK 293 cells producing recombinant antibody VH- (G4S) 4VL-Fc;
takelis - HEK 293 ląstelių, gaminančių rekombinantinį žmogaus imunoglobulino Fc fragmentą, lizatas;lane Lysate of HEK 293 cells producing the recombinant human immunoglobulin Fc fragment;
takelis - HEK 293 ląstelių lizatas;lane HEK 293 cell lysate;
takelis - Žmogaus imunoglobulinai IgG iš serumo [Sigma-Aldrich Co., JAV, Misūris, Sent Luisas].lane - Human immunoglobulins IgG from serum [Sigma-Aldrich Co., USA, Missouri, St. Louis].
Imunoblotingo vaizdas rodo, kad po transfekcijos ląstelėse HEK 293 vyksta rekombinantiniu antikūnų, sudarytų iš konstrukcijų VL-(G4S)4-VH ir VH-(G4S)4-VL, apimančių antikūno 14D6 kintamosios dalies fragmentus su žmogaus imunoglobulinų Fc fragmentu, raiška.Immunoblotting shows that HEK 293 is transfected into cells after transfection with recombinant expression of antibodies consisting of the constructs VL- (G4S) 4-VH and VH- (G4S) 4-VL, comprising antibody 14D6 variable region fragments with the human immunoglobulin Fc fragment.
6) Nustatyta tokia antikūno aminorūgščių seka, kuri skiriasi nuo PCT/EP2011/05696 aprašytos antikūno sekos:6) The amino acid sequence of the antibody, which differs from the antibody sequence described in PCT / EP2011 / 05696, has been determined as follows:
Literatūros sąrašasReferences
Gilmour K. M. Perspectives on carbonic anhydrase, Comp Biochem Physiol A Mol Integr Physiol. 2010;157:193-197.Gilmour K. M. Perspectives on Carbonic Anhydrase, Comp Biochem Physiol A Mol Integr Physiol. 2010; 157: 193-197.
Kailio H., Martinez A. R., Hilvo M., Hyrskyluoto A., Parkkila S. CancerAssociated Carbonic Anhydrases IX and XII: Effect of Growth Factors on Gene Expression in Human Cancer Cell Lines, J. Cancer Mol. 5: 73-78, 2010Kailio H., Martinez A.R., Hilvo M., Hyrskyluoto A., Parkkila S. CancerAssociated Carbonic Anhydrases IX and XII: Effect of Growth Factors on Gene Expression in Human Cancer Cell Lines, J. Cancer Mol. 5: 73-78, 2010
Tostain J., Li G., Gentil-Perret A., Gigante M. Carbonic anhydrase 9 in clear cell renal cell carcinoma: a marker for diagnosis, prognosis and treatment. Eur J Cancer. 2010 Dec; 46(18): 3141-8.Tostain J., Li G., Gentil-Perret A., Gigante M. Carbonic anhydrase 9 in clear cell renal cell carcinoma: a marker for diagnosis, prognosis and treatment. Eur J Cancer. Dec 2010; 46 (18): 3141-8.
Chien M. H., Ying T. H., Hsieh Y. H., Lin C. H., Shih C. H., Wei L. H., Yang S. F. Tumor-associated carbonic anhydrase XII is linked to the growth of primary orai squamous cell carcinoma and its poor prognosis. Orai Oncol. 2012 May;48(5):417-23.Chien M.H., Ying T.H., Hsieh Y.H., Lin C.H., Shih C.H., Wei L.H., Yang S.F. Tumor-associated carbonic anhydrase XII is linked to the growth of primary weather squamous cell carcinoma and its poor prognosis. Weather in Oncol. 2012 May; 48 (5): 417-23.
Frenzel A., Hust M., Schirrmann T. Expression of Recombinant Antibodies Front Immunol. 2013; 4: 217.Frenzel A., Hust M., Schirrmann T. Expression of Recombinant Antibodies Front Immunol. 2013; 4: 217.
Mellstedt H. Monoclonal antibodies in human cancer. Drugs Today (Bare). 2003;39 Suppl C:1-16.Mellstedt H. Monoclonal antibodies in human cancer. Drugs Today (Bare). 2003; 39 Suppl C: 1-16.
Chomczynski, P. Sacchi. N. Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction. Anai. Biochem. 1987,162:156159.Chomczynski, P. Sacchi. N. Single-step method for RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction. Anna. Biochem. 1987,162: 156159.
Boom R., Sol C. J., Salimans M. M., Jansen C. L., Wertheim-van Dillen P. M., van der Noordaa J. Rapid and simple method for purification of nucleic acids. J Clin Microbiol. 1990 Mar;28(3):495-503.Boom R., Sol C. J., Salimans M. M., Jansen C. L., Wertheim-van Dillen P. M., van der Noordaa J. Rapid and simple method for purification of nucleic acids. J Clin Microbiol. 1990 Mar; 28 (3): 495-503.
The National Center for Biotechnology Information (NCBI) duomenų bazės: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Databases of The National Center for Biotechnology Information (NCBI): http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Pleckaityte M., Žvirbliene A., Sezaite I., Gedvilaite A. Production in yeast of pseudotype virus-like particles harboring functionally active antibody fragments neutralizing the cytolytic activity of vaginolysin. Microb Cell Fact. 2011 Dec 15;10:109.Pleckaitte M., Žvirbliene A., Sezaite I., Gedvilaite A. Production of yeast of pseudotype virus-like particles harboring functionally active antibody fragments by neutralizing the cytolytic activity of vaginolysin. Microb Cell Fact. 2011 Dec 15; 10: 109.
Slibinskas R., Samuel D., Gedvilaite A., Staniulis J., Sasnauskas K. Synthesis of the measles virus nueleoprotein in yeast Pichia pastoris and Saccharomyces cerevisiae. J Biotechnol. 2004 Jan 22; 107(2): 115-24.Slibinskas R., Samuel D., Gedvilaite A., Staniulis J., Sasnauskas K. Synthesis of the measles viral nueleoprotein in yeast Pichia pastoris and Saccharomyces cerevisiae. J Biotechnol. 2004 Jan 22; 107 (2): 115-24.
Kohler G, Milstein C. Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predefined specificity. Nature. 1975 Aug 7;256(5517):495-7.Kohler G, Milstein C. Continuous cultures of fused cells secreting antibody of predefined specificity. Nature. 1975 Aug 7; 256 (5517): 495-7.
Khalifah RG. The carbon dioxide hydration activity of carbonic anhydrase. I. Stop-flow kinetic studies on the native human isoenzymes B and C. J Biol Chem (1971) 246(8):2561-73.Khalifah RG. Carbon dioxide hydration activity of carbonic anhydrase. I. Stop-flow kinetic studies on native human isoenzymes B and C. J Biol Chem (1971) 246 (8): 2561-73.
Claims (14)
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
LT2014140A LT6331B (en) | 2014-12-12 | 2014-12-12 | New recombinant antibody against human carbonic anhydrase xii |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
LT2014140A LT6331B (en) | 2014-12-12 | 2014-12-12 | New recombinant antibody against human carbonic anhydrase xii |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
LT2014140A LT2014140A (en) | 2016-06-27 |
LT6331B true LT6331B (en) | 2016-11-10 |
Family
ID=56134742
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
LT2014140A LT6331B (en) | 2014-12-12 | 2014-12-12 | New recombinant antibody against human carbonic anhydrase xii |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
LT (1) | LT6331B (en) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3543259A4 (en) * | 2016-11-14 | 2020-07-22 | Aprogen Kic Inc. | Antibody binding to carbonic anhydrase and use thereof |
-
2014
- 2014-12-12 LT LT2014140A patent/LT6331B/en not_active IP Right Cessation
Non-Patent Citations (12)
Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP3543259A4 (en) * | 2016-11-14 | 2020-07-22 | Aprogen Kic Inc. | Antibody binding to carbonic anhydrase and use thereof |
US11192959B2 (en) | 2016-11-14 | 2021-12-07 | Aprogen Medicines Inc. | Antibody binding to carbonic anhydrase and use thereof |
US11820831B2 (en) | 2016-11-14 | 2023-11-21 | Aprogen Inc. | Antibody binding to carbonic anhydrase and use thereof |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
LT2014140A (en) | 2016-06-27 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP7029401B2 (en) | Anti-ROR1 antibody and its use | |
CN110914304B (en) | CD96 antibody, antigen binding fragment thereof and medical application | |
TW201915026A (en) | Tigit antibody, antigen-binding fragments and pharmaceutical use thereof | |
TW201837056A (en) | B7-h3 antibody, antigen-binding fragment thereof and medical application thereof | |
CN113906053B (en) | anti-CEA antibodies and uses thereof | |
CN111533805A (en) | High-affinity nano antibody for resisting carcinoembryonic antigen and application thereof | |
JPWO2012176765A1 (en) | Anti-human P-cadherin (CDH3) gene recombinant antibody | |
WO2021098822A1 (en) | Bispecific antibodies | |
JP2021500916A5 (en) | ||
US8501179B2 (en) | Antibody against PcrV | |
US20240190986A1 (en) | Mesothelin binding molecule and application thereof | |
CN107108734B (en) | Monoclonal anti-GPC-1 antibodies and uses thereof | |
CN113402607B (en) | anti-LAP monoclonal antibody, antigen binding fragment thereof and application thereof | |
ES2695151T3 (en) | TLR3 binding agents | |
KR20210010411A (en) | Antibodies specifically binding to WRS protein and uses thereof | |
LT6331B (en) | New recombinant antibody against human carbonic anhydrase xii | |
CN106674350B (en) | Preparation and application of liver cancer marker single-chain antibody | |
WO2021238854A1 (en) | Monoclonal antibody against sars-cov-2 spike protein, preparation method therefor, and application thereof | |
CN106589128B (en) | Preparation and application of liver cancer marker monoclonal antibody | |
CN106749661B (en) | anti-PSMP monoclonal antibody and application thereof | |
WO2011052753A1 (en) | Antibody binding to mansc1 protein and having anticancer activity | |
US20230159652A1 (en) | Transferrin receptor 1 targeting for carcinogenesis prevention | |
WO2023125349A1 (en) | Anti-gucy2c antibody and application thereof | |
CN105017424B (en) | EGFR antibody variable region and application thereof | |
CN105001331B (en) | VEGF (vascular endothelial growth factor) monoclonal antibody and application thereof |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
BB1A | Patent application published |
Effective date: 20160627 |
|
FG9A | Patent granted |
Effective date: 20161110 |
|
MM9A | Lapsed patents |
Effective date: 20201212 |